RU2015119440A

RU2015119440A - Стабильные и растворимые антитела

Info

Publication number: RU2015119440A
Application number: RU2015119440/10A
Authority: RU
Inventors: Леонардо БОРРАС; Дэвид УРЕХ
Original assignee: ИЭсБиЭйТЕК - Э НОВАРТИС КОМПАНИ ЭлЭлСи
Priority date: 2010-10-22
Filing date: 2011-10-24
Publication date: 2015-11-27
Also published as: AU2011318179A1; WO2012051734A1; BR112013010949B1; EP2630159B1; US9598487B2; ZA201302537B; CN103154033B; MX2013004295A; TWI702230B; CO6741152A2; UY33679A; JP2015193664A; TWI652068B; JP2013544078A; KR20190016137A; CN108359012B; RU2015119440A3; JP2019054814A; JP6245985B2; KR20170020558A

Abstract

1. Способ уменьшения способности агрегации антитела, которое представляет собой гетеродимерный комплекс, включающий вариабельный домен легкой цепи и вариабельный домен тяжелой цепи, где способ включает стадии:(а) обеспечения полного атомно-молекулярного представления антитела;(b) определения свободной энергии взаимодействия двух доменов;(c) выбора одного или более аминокислотных остатков, участвующих во взаимодействии, для замены посредством предоставления молекулярной модели антитела, содержащего одну или более замен в выбранных положениях, и определения свободной энергии взаимодействия в представлении молекулы с заменой(ами);(d) выбора аминокислотного остатка для замены, если свободная энергия взаимодействия в модели молекулы с заменой(ами) меньше свободной энергии взаимодействия в исходной молекулярной модели.2. Способ по п. 1, в котором свободную энергию взаимодействия определяют с помощью расчета разницы между энергией комплекса и суммой энергий отдельных доменов в рамках способа с использованием неявно заданного растворителя.3. Способ по п. 2, в котором растворителем является GBMV или PBSA.4. Способ по п. 1, дополнительно включающий стадию(i) моделирования распределения зарядов в белке, причем эту стадию выполняют в рамках стадии a и b.5. Способ по п. 4, в котором моделирование распределения зарядов осуществляют на основе электростатических сил или сил Ван-дер-Ваальса.6. Способ по п. 1, в котором стадия (c) включает дополнительную стадию минимизации энергии в области вокруг мутации.7. Способ по п. 1, в котором антителом является одноцепочечный Fv-фрагмент (scFv).

Claims

1. Способ уменьшения способности агрегации антитела, которое представляет собой гетеродимерный комплекс, включающий вариабельный домен легкой цепи и вариабельный домен тяжелой цепи, где способ включает стадии:

(а) обеспечения полного атомно-молекулярного представления антитела;

(b) определения свободной энергии взаимодействия двух доменов;

(c) выбора одного или более аминокислотных остатков, участвующих во взаимодействии, для замены посредством предоставления молекулярной модели антитела, содержащего одну или более замен в выбранных положениях, и определения свободной энергии взаимодействия в представлении молекулы с заменой(ами);

(d) выбора аминокислотного остатка для замены, если свободная энергия взаимодействия в модели молекулы с заменой(ами) меньше свободной энергии взаимодействия в исходной молекулярной модели.

2. Способ по п. 1, в котором свободную энергию взаимодействия определяют с помощью расчета разницы между энергией комплекса и суммой энергий отдельных доменов в рамках способа с использованием неявно заданного растворителя.

3. Способ по п. 2, в котором растворителем является GBMV или PBSA.

4. Способ по п. 1, дополнительно включающий стадию

(i) моделирования распределения зарядов в белке, причем эту стадию выполняют в рамках стадии a и b.

5. Способ по п. 4, в котором моделирование распределения зарядов осуществляют на основе электростатических сил или сил Ван-дер-Ваальса.

6. Способ по п. 1, в котором стадия (c) включает дополнительную стадию минимизации энергии в области вокруг мутации.

7. Способ по п. 1, в котором антителом является одноцепочечный Fv-фрагмент (scFv).