RU2014117018A - Аптамер против ngf и его применение - Google Patents

Аптамер против ngf и его применение Download PDF

Info

Publication number
RU2014117018A
RU2014117018A RU2014117018/10A RU2014117018A RU2014117018A RU 2014117018 A RU2014117018 A RU 2014117018A RU 2014117018/10 A RU2014117018/10 A RU 2014117018/10A RU 2014117018 A RU2014117018 A RU 2014117018A RU 2014117018 A RU2014117018 A RU 2014117018A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
aptamer according
group
aptamer
nucleotide
seq
Prior art date
Application number
RU2014117018/10A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2633510C2 (ru
Inventor
Лин ЦЗИНЬ
Хисанао ХИРАМАЦУ
Original Assignee
Рибомик Инк.
Фудзимото Фармасьютикал Корпорейшн
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Рибомик Инк., Фудзимото Фармасьютикал Корпорейшн filed Critical Рибомик Инк.
Publication of RU2014117018A publication Critical patent/RU2014117018A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2633510C2 publication Critical patent/RU2633510C2/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/115Aptamers, i.e. nucleic acids binding a target molecule specifically and with high affinity without hybridising therewith ; Nucleic acids binding to non-nucleic acids, e.g. aptamers
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P29/00Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • A61P37/04Immunostimulants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • C12N2310/16Aptamers
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/31Chemical structure of the backbone
    • C12N2310/317Chemical structure of the backbone with an inverted bond, e.g. a cap structure
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/34Spatial arrangement of the modifications
    • C12N2310/344Position-specific modifications, e.g. on every purine, at the 3'-end
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/35Nature of the modification
    • C12N2310/351Conjugate
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2320/00Applications; Uses
    • C12N2320/30Special therapeutic applications

Abstract

1. Аптамер, связывающийся с NGF и способный образовывать предполагаемую вторичную структуру, представленную формулой (I):где N является одним нуклеотидом, выбранным из группы, состоящей из A, G, C, U и T,N11-N13, N21-N23, N32-N38 и N42-N48 являются одинаковыми или разными, и каждый из них является связью или 1 или 2 нуклеотидами, выбранными из группы, состоящей из A, G, C, U и T,N14, N24, N31, N41, N39 и N49 являются одинаковыми или разными, и каждый из них является одним нуклеотидом, выбранным из группы, состоящей из A, G, C, U и T,каждый N14 и N24, N31 и N41, и N39 и N49 образуют уотсон-криковскую пару оснований,N11-N12-N13-N14 и N21-N22-N23-N24 являются нуклеотидными последовательностями, в комбинации способными образовывать структуру стебля, иN31-N32-N33-N34-N35-N36-N37-N38-N39 и N41-N42-N43-N44-N45-N46-N47-N48-N49 являются нуклеотидными последовательностями, в комбинации способными образовывать структуру стебля.2. Аптамер по п. 1, где N11-N13, N21-N23, N32-N38 и N42-N48 являются одинаковыми или разными, и каждый из них является одним нуклеотидом, выбранным из группы, состоящей из A, G, C, U и T.3. Аптамер по п. 1, где N14 является U, N24 является A, N31 является G, N41 является C, N39 является G и N49 является C.4. Аптамер по п. 1, где между N32-N33-N34-N35-N36-N37-N38 и N42-N43-N44-N45-N46-N47-N48 образуются не менее 4 уотсон-криковских пар оснований.5. Аптамер по п. 1, являющийся следующим (a) или (b):(a) нуклеиновой кислотой, состоящей из нуклеотидной последовательности, выбранной из SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 9-13, SEQ ID NO: 22-117 и SEQ ID NO: 152-168 (где урацил может являться тимином);(b) нуклеиновой кислотой, связывающейся с NGF и состоящей из нуклеотидной последовательности по приведенному выше (a), где от 1 до нескольких нуклеотидов подвергают замене, делеции, инсерции или добавлению.6. Аптамер по п. 1, имеющий длину н�

Claims (17)

1. Аптамер, связывающийся с NGF и способный образовывать предполагаемую вторичную структуру, представленную формулой (I):
Figure 00000001
где N является одним нуклеотидом, выбранным из группы, состоящей из A, G, C, U и T,
N11-N13, N21-N23, N32-N38 и N42-N48 являются одинаковыми или разными, и каждый из них является связью или 1 или 2 нуклеотидами, выбранными из группы, состоящей из A, G, C, U и T,
N14, N24, N31, N41, N39 и N49 являются одинаковыми или разными, и каждый из них является одним нуклеотидом, выбранным из группы, состоящей из A, G, C, U и T,
каждый N14 и N24, N31 и N41, и N39 и N49 образуют уотсон-криковскую пару оснований,
N11-N12-N13-N14 и N21-N22-N23-N24 являются нуклеотидными последовательностями, в комбинации способными образовывать структуру стебля, и
N31-N32-N33-N34-N35-N36-N37-N38-N39 и N41-N42-N43-N44-N45-N46-N47-N48-N49 являются нуклеотидными последовательностями, в комбинации способными образовывать структуру стебля.
2. Аптамер по п. 1, где N11-N13, N21-N23, N32-N38 и N42-N48 являются одинаковыми или разными, и каждый из них является одним нуклеотидом, выбранным из группы, состоящей из A, G, C, U и T.
3. Аптамер по п. 1, где N14 является U, N24 является A, N31 является G, N41 является C, N39 является G и N49 является C.
4. Аптамер по п. 1, где между N32-N33-N34-N35-N36-N37-N38 и N42-N43-N44-N45-N46-N47-N48 образуются не менее 4 уотсон-криковских пар оснований.
5. Аптамер по п. 1, являющийся следующим (a) или (b):
(a) нуклеиновой кислотой, состоящей из нуклеотидной последовательности, выбранной из SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 9-13, SEQ ID NO: 22-117 и SEQ ID NO: 152-168 (где урацил может являться тимином);
(b) нуклеиновой кислотой, связывающейся с NGF и состоящей из нуклеотидной последовательности по приведенному выше (a), где от 1 до нескольких нуклеотидов подвергают замене, делеции, инсерции или добавлению.
6. Аптамер по п. 1, имеющий длину не более 50 оснований.
7. Аптамер по п. 1, где по меньшей мере один нуклеотид модифицируют.
8. Аптамер по п. 7, модифицированный с использованием инвертированного dT или полиэтиленгликоля.
9. Аптамер по п. 8, где инвертированный dT или полиэтиленгликоль присоединяют к 5'-концу или 3'-концу аптамера.
10. Аптамер по п. 7, где гидроксильные группы в 2'-положении рибозы соответствующих пиримидиновых нуклеотидов являются одинаковыми или разными, и их не замещают или замещают атомом или группой, выбранной из группы, состоящей из атома водорода, атома фтора и метоксигруппы.
11. Аптамер по п. 7, где гидроксильные группы в 2'-положении рибозы соответствующих пуриновых нуклеотидов являются одинаковыми или разными, и их не замещают или замещают атомом или группой, выбранной из группы, состоящей из атома водорода, атома фтора и метоксигруппы.
12. Аптамер по п. 1, ингибирующий активность NGF в отношении роста нейритов и/или пролиферации клеток.
13. Фармацевтическая композиция, содержащая аптамер по любому из пп. 1-12.
14. Средство против боли, содержащее аптамер по любому из пп. 1-12.
15. Противовоспалительное средство, содержащее аптамер по любому из пп. 1-12.
16. Способ лечения или профилактики заболевания, сопровождающегося болью или воспалением, включающий введение аптамера по любому из пп. 1-12 нуждающемуся в этом индивидууму.
17. Аптамер по любому из пп. 1-12 для профилактики или лечения заболевания, сопровождающегося болью или воспалением.
RU2014117018A 2011-09-28 2012-09-28 Аптамер против ngf и его применение RU2633510C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2011-213585 2011-09-28
JP2011213585 2011-09-28
PCT/JP2012/075252 WO2013047844A1 (ja) 2011-09-28 2012-09-28 Ngfに対するアプタマー及びその用途

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2014117018A true RU2014117018A (ru) 2015-11-10
RU2633510C2 RU2633510C2 (ru) 2017-10-12

Family

ID=47995868

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2014117018A RU2633510C2 (ru) 2011-09-28 2012-09-28 Аптамер против ngf и его применение

Country Status (12)

Country Link
US (1) US9567589B2 (ru)
EP (1) EP2762569B1 (ru)
JP (1) JP6118724B2 (ru)
KR (1) KR102021626B1 (ru)
CN (1) CN103946381B (ru)
AU (1) AU2012317323B2 (ru)
CA (1) CA2850346C (ru)
DK (1) DK2762569T3 (ru)
ES (1) ES2687154T3 (ru)
HU (1) HUE039439T2 (ru)
RU (1) RU2633510C2 (ru)
WO (1) WO2013047844A1 (ru)

Families Citing this family (37)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2012088381A2 (en) 2010-12-22 2012-06-28 President And Fellows Of Harvard College Continuous directed evolution
US10323236B2 (en) 2011-07-22 2019-06-18 President And Fellows Of Harvard College Evaluation and improvement of nuclease cleavage specificity
US9163284B2 (en) 2013-08-09 2015-10-20 President And Fellows Of Harvard College Methods for identifying a target site of a Cas9 nuclease
US9359599B2 (en) 2013-08-22 2016-06-07 President And Fellows Of Harvard College Engineered transcription activator-like effector (TALE) domains and uses thereof
US9340799B2 (en) 2013-09-06 2016-05-17 President And Fellows Of Harvard College MRNA-sensing switchable gRNAs
US9737604B2 (en) 2013-09-06 2017-08-22 President And Fellows Of Harvard College Use of cationic lipids to deliver CAS9
US9322037B2 (en) 2013-09-06 2016-04-26 President And Fellows Of Harvard College Cas9-FokI fusion proteins and uses thereof
US20150165054A1 (en) 2013-12-12 2015-06-18 President And Fellows Of Harvard College Methods for correcting caspase-9 point mutations
KR20160147884A (ko) * 2014-04-24 2016-12-23 가부시키가이샤 리보믹 오토탁신에 결합하여 오토탁신의 생리 활성을 저해하는 압타머 및 그의 이용
US10077453B2 (en) 2014-07-30 2018-09-18 President And Fellows Of Harvard College CAS9 proteins including ligand-dependent inteins
JP6702938B2 (ja) * 2014-07-31 2020-06-03 アカデミア シニカAcademia Sinica アンタゴニストic ctla−4アプタマー及びその免疫活性増強への応用
US10920208B2 (en) 2014-10-22 2021-02-16 President And Fellows Of Harvard College Evolution of proteases
WO2016168631A1 (en) 2015-04-17 2016-10-20 President And Fellows Of Harvard College Vector-based mutagenesis system
WO2017015545A1 (en) 2015-07-22 2017-01-26 President And Fellows Of Harvard College Evolution of site-specific recombinases
US11524983B2 (en) 2015-07-23 2022-12-13 President And Fellows Of Harvard College Evolution of Bt toxins
US10612011B2 (en) 2015-07-30 2020-04-07 President And Fellows Of Harvard College Evolution of TALENs
WO2017070633A2 (en) 2015-10-23 2017-04-27 President And Fellows Of Harvard College Evolved cas9 proteins for gene editing
CA3011819A1 (en) 2016-01-20 2017-07-27 Vitrisa Therapeutics, Inc. Compositions and methods for inhibiting factor d
SG11201900907YA (en) 2016-08-03 2019-02-27 Harvard College Adenosine nucleobase editors and uses thereof
EP3497214B1 (en) 2016-08-09 2023-06-28 President and Fellows of Harvard College Programmable cas9-recombinase fusion proteins and uses thereof
WO2018039438A1 (en) 2016-08-24 2018-03-01 President And Fellows Of Harvard College Incorporation of unnatural amino acids into proteins using base editing
CA3039928A1 (en) 2016-10-14 2018-04-19 President And Fellows Of Harvard College Aav delivery of nucleobase editors
WO2018119359A1 (en) 2016-12-23 2018-06-28 President And Fellows Of Harvard College Editing of ccr5 receptor gene to protect against hiv infection
WO2018136827A1 (en) * 2017-01-20 2018-07-26 Vitrisa Therapeutics, Inc. Stem-loop compositions and methods for inhibiting factor d
US11898179B2 (en) 2017-03-09 2024-02-13 President And Fellows Of Harvard College Suppression of pain by gene editing
US11542496B2 (en) 2017-03-10 2023-01-03 President And Fellows Of Harvard College Cytosine to guanine base editor
IL306092A (en) 2017-03-23 2023-11-01 Harvard College Nucleic base editors that include nucleic acid programmable DNA binding proteins
US11560566B2 (en) 2017-05-12 2023-01-24 President And Fellows Of Harvard College Aptazyme-embedded guide RNAs for use with CRISPR-Cas9 in genome editing and transcriptional activation
WO2019010164A1 (en) 2017-07-06 2019-01-10 President And Fellows Of Harvard College EVOLUTION OF ARNT SYNTHÉTASES
US11732274B2 (en) 2017-07-28 2023-08-22 President And Fellows Of Harvard College Methods and compositions for evolving base editors using phage-assisted continuous evolution (PACE)
US11319532B2 (en) 2017-08-30 2022-05-03 President And Fellows Of Harvard College High efficiency base editors comprising Gam
US11624130B2 (en) 2017-09-18 2023-04-11 President And Fellows Of Harvard College Continuous evolution for stabilized proteins
WO2019079347A1 (en) 2017-10-16 2019-04-25 The Broad Institute, Inc. USES OF BASIC EDITORS ADENOSINE
WO2019241649A1 (en) 2018-06-14 2019-12-19 President And Fellows Of Harvard College Evolution of cytidine deaminases
AU2020242032A1 (en) 2019-03-19 2021-10-07 Massachusetts Institute Of Technology Methods and compositions for editing nucleotide sequences
CN112175945A (zh) * 2019-07-02 2021-01-05 苏州贝信生物技术有限公司 Ngf小干扰核酸分子及其应用
KR20230019843A (ko) 2020-05-08 2023-02-09 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 표적 이중 가닥 뉴클레오티드 서열의 두 가닥의 동시 편집을 위한 방법 및 조성물

Family Cites Families (14)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5660985A (en) 1990-06-11 1997-08-26 Nexstar Pharmaceuticals, Inc. High affinity nucleic acid ligands containing modified nucleotides
KR970002255B1 (ko) 1990-06-11 1997-02-26 넥스스타 파아마슈티컬드, 인크. 핵산 리간드
CA2145761C (en) 1992-09-29 2009-12-22 Larry M. Gold Nucleic acid ligands and methods for producing the same
AU692469B2 (en) 1993-09-08 1998-06-11 Gilead Sciences, Inc. Nucleic acid ligands and improved methods for producing the same
US20030054360A1 (en) 1999-01-19 2003-03-20 Larry Gold Method and apparatus for the automated generation of nucleic acid ligands
EP1481090A4 (en) 2002-02-15 2006-08-09 Somalogic Inc METHOD AND REAGENTS FOR DETECTING BINDING OF TARGET MOLECULES BY NUCLEIC ACID ELECTRODES
US7569364B2 (en) * 2002-12-24 2009-08-04 Pfizer Inc. Anti-NGF antibodies and methods using same
CA2628843A1 (en) * 2005-11-07 2007-05-10 Copenhagen University Neurotrophin-derived peptide sequences
CN101573446B (zh) * 2006-11-14 2013-07-17 力博美科股份有限公司 针对中期因子的适体及其应用
JP5223086B2 (ja) * 2007-03-26 2013-06-26 国立大学法人東京農工大学 血管内皮増殖因子結合性アプタマー
US10260070B2 (en) * 2008-09-24 2019-04-16 Ribomic Inc. Aptamer for NGF and use thereof
TWI532842B (zh) 2009-06-11 2016-05-11 力博美科股份有限公司 針對凝乳酶之適體及其用途
JP5673992B2 (ja) * 2009-10-30 2015-02-18 国立大学法人東京農工大学 血管内皮細胞増殖因子結合性アプタマー
EP2551346B1 (en) 2010-03-24 2016-01-27 Ribomic Inc. Aptamer for ngf and use thereof

Also Published As

Publication number Publication date
JP6118724B2 (ja) 2017-04-19
AU2012317323B2 (en) 2017-10-05
AU2012317323A1 (en) 2014-04-24
HUE039439T2 (hu) 2018-12-28
CN103946381B (zh) 2017-06-23
CA2850346C (en) 2020-02-18
EP2762569B1 (en) 2018-06-13
JPWO2013047844A1 (ja) 2015-03-30
US20140235701A1 (en) 2014-08-21
CN103946381A (zh) 2014-07-23
KR102021626B1 (ko) 2019-09-16
DK2762569T3 (en) 2018-08-27
US9567589B2 (en) 2017-02-14
EP2762569A4 (en) 2015-06-24
RU2633510C2 (ru) 2017-10-12
ES2687154T3 (es) 2018-10-23
WO2013047844A1 (ja) 2013-04-04
EP2762569A1 (en) 2014-08-06
KR20140069216A (ko) 2014-06-09
CA2850346A1 (en) 2013-04-04

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2014117018A (ru) Аптамер против ngf и его применение
JP7007304B2 (ja) B型肝炎感染症治療用のPAPD5又はPAPD7のmRNA減少用核酸分子
RU2501803C2 (ru) Композиции и способы модуляции экспрессии рецептора фактора роста фибробластов 4 (fgfr4)
HRP20200042T1 (hr) Suprotne nukleinske kiseline za uporabu u liječenju duchennove mišićne distrofije
KR101985382B1 (ko) 톨-유사 수용체 기반 면역 반응을 조절하기 위한 면역 조절 올리고뉴클레오타이드(iro) 화합물
ES2651308T3 (es) Inhibidores antisentido de HBV
AU776268B2 (en) Immunostimulant oligonucleotide
IL300119A (en) Oligonucleotides to induce paternal UBE3A expression
RU2017127609A (ru) Антисмысловые олигомеры тау-белка и их применение
RU2016139108A (ru) Антисмысловые нуклеиновые кислоты
EP2773760B1 (en) Double-stranded rna for immunostimulation
JP2016521556A5 (ru)
JP2015529635A5 (ru)
CN101460178A (zh) 用于tlr7和tlr8的稳定化的免疫调节性rna(simra)化合物
ATE416183T1 (de) Oligonukleotide mit alternierenden segmenten und deren verwendungen
WO2010048552A2 (en) Methods of using oligomeric compounds comprising 2'-substituted nucleosides
EA200870401A1 (ru) КОМПОЗИЦИИ И СПОСОБЫ ИНГИБИРОВАНИЯ ЭКСПРЕССИИ ГЕНА Eg5
JP2009532392A5 (ru)
RU2016146819A (ru) Композиции и способы модулирования экспрессии рецептора гормона роста
JP2010536787A5 (ru)
EA201492148A1 (ru) Способ лечения немелкоклеточного рака легких
EA201500748A1 (ru) Ингибирующие олигонуклеотиды и их применение в терапии
RU2011116175A (ru) Аптамер к ngf и его применение
RU2012100248A (ru) Аптамер к химазе и его применение
JP2021500013A (ja) B型肝炎感染の治療用のPAPD5及びPAPD7 mRNAを低減させるための核酸分子