RU2013154275A

RU2013154275A - Способы, композиции и наборы для определения вируса гепатита а

Info

Publication number: RU2013154275A
Application number: RU2013154275/10A
Authority: RU
Inventors: Стефан БУРДЕ; Бретт БУНО; Данута ВРОНСКА
Original assignee: Грайфолз Терепьютикс Инк.
Priority date: 2011-09-07
Filing date: 2012-08-01
Publication date: 2015-06-20
Also published as: EP2643461A4; WO2013036332A2; CN103764829B; AU2012304839A1; ES2586678T3; BR112013031802A2; PL2643461T3; EP2643461A2; MX2013014390A; MX346501B; HUE027927T2; US20140193803A1; HK1195786A1; EP2643461B1; AU2012304839B2; WO2013036332A3; RU2595822C2; CN103764829A; PT2643461T

Abstract

1. Изолированная молекула нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность или ее комплемент, как представлено в:5′-GCG CCC GGC GGG GTC ААС ТСС АТ-3′ (SEQ ID NO: 1);5′-AGC CAA GTT ААС ACT GCA AGG-3′ (SEQ ID NO: 2); или5′-TTA GCA TGG AGC TGT AGG AGT СТА AAT TGG GG-3′ (SEQ ID NO: 3).2. Композиция, которая содержит пару олигонуклеотидных праймеров, включающую прямой праймер, который имеет последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 1, и обратный праймер, который имеет последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 2, где пара праймеров является способной к отжигу целевой последовательности при условиях ПЦР для амплификации целевой последовательности.3. Композиция по п. 2, которая дополнительно включает олигонуклеотидный зонд, который имеет последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 3, где зонд является способным к отжигу целевой последовательности.4. Способ амплификации целевой последовательности, где способ включает: осуществление ПЦР с целевой последовательностью в качестве матрицы, где осуществление включает обеспечение ПЦР прямым праймером, который включает последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 1, и обратным праймером, который включает последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 2.5. Способ по п. 4, где целевая последовательность соответствует кДНК, полученной из РНК образца, включающего HAV.6. Способ определения HAV в образце, где способ включает:а. осуществление ПЦР с матрицей нуклеиновой кислоты в образце при использовании прямого праймера, который включает последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 1, и обратного праймера, который включает последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 2; иb. определение ампликона, который образуется с помо�

Claims

1. Изолированная молекула нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность или ее комплемент, как представлено в:

5′-GCG CCC GGC GGG GTC ААС ТСС АТ-3′ (SEQ ID NO: 1);

5′-AGC CAA GTT ААС ACT GCA AGG-3′ (SEQ ID NO: 2); или

5′-TTA GCA TGG AGC TGT AGG AGT СТА AAT TGG GG-3′ (SEQ ID NO: 3).

2. Композиция, которая содержит пару олигонуклеотидных праймеров, включающую прямой праймер, который имеет последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 1, и обратный праймер, который имеет последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 2, где пара праймеров является способной к отжигу целевой последовательности при условиях ПЦР для амплификации целевой последовательности.

3. Композиция по п. 2, которая дополнительно включает олигонуклеотидный зонд, который имеет последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 3, где зонд является способным к отжигу целевой последовательности.

4. Способ амплификации целевой последовательности, где способ включает: осуществление ПЦР с целевой последовательностью в качестве матрицы, где осуществление включает обеспечение ПЦР прямым праймером, который включает последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 1, и обратным праймером, который включает последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 2.

5. Способ по п. 4, где целевая последовательность соответствует кДНК, полученной из РНК образца, включающего HAV.

6. Способ определения HAV в образце, где способ включает:

а. осуществление ПЦР с матрицей нуклеиновой кислоты в образце при использовании прямого праймера, который включает последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 1, и обратного праймера, который включает последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 2; и

b. определение ампликона, который образуется с помощью прямого и обратного праймеров, где присутствие ампликона определяет, является ли HAV присутствующим в образце.

7. Способ по п. 6, где определение включает обеспечение полинуклеотидного зонда для ПЦР, посредством чего ампликон, в случае присутствия, контактирует с зондом, где зонд включает последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 3, или ее комплемент.

8. Способ по п. 7, где зонд является меченным с помощью FAM/BHQ-1.

9. Набор, который включает одну или более изолированную молекулу нуклеиновой кислоты по п. 1.