RU2013132761A - Набор олигонуклеотидных зондов и способы профилирования микробиоты - Google Patents
Набор олигонуклеотидных зондов и способы профилирования микробиоты Download PDFInfo
- Publication number
- RU2013132761A RU2013132761A RU2013132761/10A RU2013132761A RU2013132761A RU 2013132761 A RU2013132761 A RU 2013132761A RU 2013132761/10 A RU2013132761/10 A RU 2013132761/10A RU 2013132761 A RU2013132761 A RU 2013132761A RU 2013132761 A RU2013132761 A RU 2013132761A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- disease
- specified
- oligonucleotide
- condition
- probes
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/689—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/16—Primer sets for multiplex assays
Abstract
1. Набор олигонуклеотидных зондов, где указанный набор включает:(a) олигонуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, выбранную из ACGCTTGCACCCT (SEQ ID NO: 1), последовательности, комплементарной ей (AGGGTGCAAGCGT; SEQ ID NO: 27), или последовательности, способной гибридизоваться с обеими последовательностями в строгих условиях гибридизации;(b) олигонуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, выбранную из CGATCCGAAAACCTTCTTCACT (SEQ ID NO: 2), последовательности, комплементарной ей (AGTGAAGAAGGTTTTCGGATCG; SEQ ID NO: 28), или последовательности, способной гибридизоваться с обеими последовательностями в строгих условиях гибридизации;(c) олигонуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, выбранную из GGACAACGCTTGCCAC (SEQ ID NO: 3), последовательности, комплементарной ей (GTGGCAAGCGTTGTCC; SEQ ID NO: 29), или последовательности, способной гибридизоваться с обеими последовательностями в строгих условиях гибридизации;(d) олигонуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, выбранную из CGTAGGCGGTTCGTCGCGT (SEQ ID NO: 4), последовательности, комплементарной ей (ACGCGACGAACCGCCTACG; SEQ ID NO: 30), или последовательности, способной гибридизоваться с обеими последовательностями в строгих условиях гибридизации; и(e) один или несколько олигонуклеотидов, содержащих нуклеотидную последовательность, выбранную из приведенных в таблице 1, или последовательность, способную гибридизоваться с любой из нуклеотидных последовательностей, приведенных в таблице 1, в строгих условиях гибридизации; и необязательно(f) один или несколько олигонуклеотидов, содержащих нуклеотидную последовательность, выбранную из приведенных в таблице 2 и таблице 3, или последовательность, способную гибридизоваться с л�
Claims (27)
1. Набор олигонуклеотидных зондов, где указанный набор включает:
(a) олигонуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, выбранную из ACGCTTGCACCCT (SEQ ID NO: 1), последовательности, комплементарной ей (AGGGTGCAAGCGT; SEQ ID NO: 27), или последовательности, способной гибридизоваться с обеими последовательностями в строгих условиях гибридизации;
(b) олигонуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, выбранную из CGATCCGAAAACCTTCTTCACT (SEQ ID NO: 2), последовательности, комплементарной ей (AGTGAAGAAGGTTTTCGGATCG; SEQ ID NO: 28), или последовательности, способной гибридизоваться с обеими последовательностями в строгих условиях гибридизации;
(c) олигонуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, выбранную из GGACAACGCTTGCCAC (SEQ ID NO: 3), последовательности, комплементарной ей (GTGGCAAGCGTTGTCC; SEQ ID NO: 29), или последовательности, способной гибридизоваться с обеими последовательностями в строгих условиях гибридизации;
(d) олигонуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, выбранную из CGTAGGCGGTTCGTCGCGT (SEQ ID NO: 4), последовательности, комплементарной ей (ACGCGACGAACCGCCTACG; SEQ ID NO: 30), или последовательности, способной гибридизоваться с обеими последовательностями в строгих условиях гибридизации; и
(e) один или несколько олигонуклеотидов, содержащих нуклеотидную последовательность, выбранную из приведенных в таблице 1, или последовательность, способную гибридизоваться с любой из нуклеотидных последовательностей, приведенных в таблице 1, в строгих условиях гибридизации; и необязательно
(f) один или несколько олигонуклеотидов, содержащих нуклеотидную последовательность, выбранную из приведенных в таблице 2 и таблице 3, или последовательность, способную гибридизоваться с любой из нуклеотидных последовательностей, приведенных в таблице 2 и таблице 3, в строгих условиях гибридизации.
2. Набор олигонуклеотидных зондов по п.1, где компонент (f) включен в набор зондов и представляет собой один или несколько олигонуклеотидов, содержащих нуклеотидную последовательность, выбранную из приведенных в таблице 2.
3. Набор олигонуклеотидных зондов по п.1 или 2, где один или несколько из указанных олигонуклеотидов мечены фрагментом для обеспечения обнаружения или манипуляций.
4. Набор олигонуклеотидных зондов по п.3, где указанный фрагмент является колориметрической, хемилюминесцентной, хромогенной, радиоактивной, флуоресцентной, ферментом, фрагментом антитела, His-меткой, биотином или стрептавидином.
5. Набор олигонуклеотидных зондов по п.1, где один или несколько из указанных олигонуклеотидов иммобилизованы на одной или нескольких твердых подложках, предпочтительно выбранных из частиц, полосок, гелей, фильтров, мембран, волокон, капилляров, чипов, микротитровальных полосок, стекол, трубочек, пластинок или камер.
6. Набор олигонуклеотидных зондов по п.5, где указанная твердая подложка представляет собой магнитную частицу, предпочтительно магнитный микроноситель.
7. Набор олигонуклеотидных зондов по п.5, где указанная твердая подложка мечена красителем или множеством красителей, предпочтительно люминесцентным красителем.
8. Способ профилирования микробиоты ЖКТ индивидуума, где указанный способ включает:
(i) взаимодействие образца из ЖКТ указанного индивидуума с набором олигонуклеотидных зондов, как указано в любом из п.п.1-7;
(ii) воздействие на образец и набор зондов условиями, обеспечивающими гибридизацию зондов с их нуклеотидными последовательностями-мишенями в составе молекул нуклеиновой кислоты в указанном образце; и
(iii) для каждого олигонуклеотида в указанном наборе зондов определение количества его нуклеотидной последовательности-мишени в указанном образце.
9. Способ по п.8, где каждый олигонуклеотид несет прикрепленную к нему метку, а этап (iii) включает определение для каждого меченого олигонуклеотида количества указанной метки, связанной с указанным образцом, посредством определения силы сигнала метки, исходящего от образца.
10. Способ по п.8, где этап (iii) включает
(а) селективное мечение олигонуклеотидных зондов из набора зондов при гибридизации с их нуклеотидной последовательностью-мишенью; и
(b) определение количества каждого меченого олигонуклеотидного зонда, полученного на этапа (а).
11. Способ по п.10, где селективное мечение проводят посредством удлинения цепи олигонуклеотидного зонда меченым нуклеотидом, предпочтительно меченым дидезоксинуклеотидом.
12. Способ по п.11, где указанный меченый нуклеотид мечен ддЦТФ, предпочтительно ддЦТФ, меченным биотином.
13. Способ по п.10, где этап (b) включает гибридизацию олигонуклеотидов, полученных на этапе мечения (а), с нуклеотидными последовательностями, комплементарными олигонуклеотидным зондам.
14. Способ по п.13, где одна или несколько указанных нуклеотидных последовательностей, комплементарных олигонуклеотидным зондам, иммобилизованы на одной или нескольких твердых подложках, предпочтительно выбранных из частиц, полосок, гелей, фильтров, мембран, волокон, капилляров, чипов, микротитровальных полосок, стекол, трубочек, пластинок или камер.
15. Способ по п.14, где указанная твердая подложка представляет собой магнитную частицу, предпочтительно магнитный микроноситель.
16. Способ по п.14, где указанная твердая подложка помечена красителем или множеством красителей, предпочтительно люминесцентным красителем.
17. Способ по п.8, где этап (iii) включает
(а) проведение реакции амплификации нуклеиновой кислоты с применением праймеров; и
(b) для каждого олигонуклеотида из набора зондов определение количества продукта амплификации, полученного в ходе указанной реакции амплификации нуклеиновой кислоты с применением праймеров.
18. Способ по п.17, где указанная реакция амплификации нуклеиновой кислоты с применением праймеров представляет собой ПЦР.
19. Способ по п.17, где указанная реакция амплификации нуклеиновой кислоты с применением праймеров представляет собой множество реакций амплификации нуклеиновой кислоты с применением праймеров, которые проводят параллельно, где в каждой параллельной реакции амплификации применяют один олигонуклеотидный зонд, или одну или несколько мультиплексных реакций амплификации нуклеиновой кислоты с применением праймеров, которые проводят с применением двух или более олигонуклеотидных зондов, применяемых в одной мультиплексной реакции амплификации.
20. Способ получения стандартного профиля микробиоты ЖКТ, характерного для заболевания или состояния или их этапов или риска развития заболевания или состояния, где указанный способ включает:
(i) идентификацию индивидуума с указанным заболеванием или состоянием или их этапами или характеризующегося риском развития указанного заболевания или состояния, и
(ii) осуществление способа по любому из п.п.8-19 с применением образца из ЖКТ указанного индивидуума.
21. Способ по любому из п.п.8-20, где указанный образец из ЖКТ выбран из
(a) содержимого полости ЖКТ, предпочтительно содержимого желудка, содержимого кишечника, слизи и фекалий/кала или их сочетания,
(b) участков слизистой оболочки, подслизистой оболочки, наружного мышечного слоя, адвентициальной оболочки и/или серозной оболочки ткани/органа ЖКТ,
(c) нуклеиновой кислоты, полученной из (а) или (b), предпочтительно посредством обратной транскрипции и/или амплификации нуклеиновой кислоты.
22. Способ по любому из п.п.8-20, где указанный образец из ЖКТ получен из тонкой кишки, подвздошной кишки, слепой кишки, толстой кишки, прямой кишки или анального канала.
23. Способ диагностики или мониторинга заболевания или состояния у индивидуума или прогнозирования или оценки риска развития у индивидуума заболевания или состояния, где указанный способ включает:
(а) профилирование микробиоты ЖКТ индивидуума способом, указанным в любом из п.п.8-22;
(b1) сравнение указанного профиля со стандартным профилем микробиоты ЖКТ, характерным для заболевания или состояния или их этапов или риска развития заболевания или состояния; и/или
(b2) сравнение указанного профиля с более ранним профилем микробиоты ЖКТ индивидуума; и
(с) определение степени корреляции указанных профилей.
24. Способ диагностики или мониторинга заболевания или состояния у индивидуума или прогнозирования или оценки риска развития у индивидуума заболевания или состояния, где указанный способ включает:
(а1) сравнение результатов способа, указанного в любом из п.п.8-22, со стандартным профилем микробиоты ЖКТ, характерным для заболевания или состояния или их этапов или риска развития заболевания или состояния, и/или
(а2) сравнение результатов способа, указанного в любом из п.п.8-22, с более ранним профилем микробиоты ЖКТ индивидуума, и
(b) определение степени корреляции указанных профилей,
где степень корреляции является показателем наличия или отсутствия указанного заболевания или состояния или риска развития указанного заболевания или состояния или прогресса заболевания или состояния.
25. Способ по любому из п.п.8-20, 23 и 24, где указанное заболевание или состояние выбраны из воспалительного заболевания кишечника, болезни Крона, язвенного колита, синдрома раздраженного кишечника, злокачественных опухолей ЖКТ, предпочтительно злокачественной опухоли ротовой полости, глотки, пищевода, желудка, двенадцатиперстной кишки, тонкого кишечника, подвздошной кишки, слепой кишки, толстого кишечника, прямой кишки или анального канала, аллергических заболеваний, например, экземы, астмы, атопического дерматита, аллергического конъюнктивита, аллергического ринита и пищевых аллергий; нарушений обмена веществ, например, сахарного диабета (типа 1 и типа 2), ожирения и метаболического синдромома; нейрологических нарушений, например, депрессии, рассеянного склероза, деменции и болезни Альцгеймера; и аутизма.
26. Набор, включающий набор олигонуклеотидных зондов по п.п.1-7.
27. Набор по п.26, где указанный набор дополнительно включает, по меньшей мере, одно из следующего:
(a) средства для селективного мечения одного или нескольких олигонуклеотидов из набора зондов,
(b) твердые подложки, на которых можно иммобилизовать один или несколько олигонуклеотидов из набора зондов,
(c) средства для проведения амплификации и/или реакции удлинения праймера для одного или нескольких олигонуклеотидов из набора зондов,
(d) средства для проведения реакции обратной транскрипции,
(e) средства для получения образца из ЖКТ,
(f) средства для очистки или модификации образца из ЖКТ,
(g) средства для выделения нуклеиновой кислоты из образца из ЖКТ,
(h) средства для обнаружения амплифицированной нуклеиновой кислоты,
(i) один или несколько олигонуклеотидов, которые селективно гибридизуются с нуклеиновыми кислотами-мишенями, которые служат индикаторами любого другого заболевания или медицинского состояния, ассоциированного с желудочно-кишечной микробиотой, предпочтительно болезни Крона, воспалительного заболевания кишечника, язвенного колита и синдрома раздраженного кишечника.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
GB1021399.9 | 2010-12-16 | ||
GBGB1021399.9A GB201021399D0 (en) | 2010-12-16 | 2010-12-16 | Oligonucleotide probe set and methods of microbiota profiling |
PCT/GB2011/052509 WO2012080754A2 (en) | 2010-12-16 | 2011-12-16 | Oligonucleotide probe set and methods of microbiota profiling |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2013132761A true RU2013132761A (ru) | 2015-01-27 |
RU2605913C2 RU2605913C2 (ru) | 2016-12-27 |
Family
ID=43567352
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2013132761/10A RU2605913C2 (ru) | 2010-12-16 | 2011-12-16 | Наборы олигонуклеотидных зондов и способы профилирования микробиоты желудочно-кишечного тракта |
Country Status (14)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US9243297B2 (ru) |
EP (1) | EP2652145B1 (ru) |
AU (1) | AU2011342983B2 (ru) |
BR (1) | BR112013015082A2 (ru) |
CA (1) | CA2821884C (ru) |
DK (1) | DK2652145T3 (ru) |
ES (1) | ES2573133T3 (ru) |
GB (1) | GB201021399D0 (ru) |
MX (1) | MX343863B (ru) |
NZ (1) | NZ612010A (ru) |
PL (1) | PL2652145T3 (ru) |
RU (1) | RU2605913C2 (ru) |
WO (1) | WO2012080754A2 (ru) |
ZA (1) | ZA201304546B (ru) |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2601132C1 (ru) * | 2015-11-27 | 2016-10-27 | федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Московский физико-технический институт (государственный университет)" (МФТИ) | Набор синтетических олигонуклеотидов для диагностики болезни крона и неспецифического язвенного колита путем выявления маркерных участков бактериальной днк методом полимеразной цепной реакции |
RU2630669C1 (ru) * | 2016-07-21 | 2017-09-11 | Федеральное бюджетное учреждение науки "Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" (ФБУН ГНЦ ВБ "Вектор") | Способ определения метилирования сайтов PuCGPy регуляторных областей генов-онкомаркеров колоректального рака методом GLAD-ПЦР-анализа и набор олигонуклеотидных праймеров и флуоресцентно-меченых зондов для осуществления указанного способа |
Families Citing this family (19)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
GB201021399D0 (en) | 2010-12-16 | 2011-01-26 | Genetic Analysis As | Oligonucleotide probe set and methods of microbiota profiling |
US20150211053A1 (en) * | 2012-08-01 | 2015-07-30 | Bgi-Shenzhen | Biomarkers for diabetes and usages thereof |
US11003041B2 (en) * | 2014-06-30 | 2021-05-11 | View, Inc. | Power management for electrochromic window networks |
WO2016014822A1 (en) * | 2014-07-25 | 2016-01-28 | Ge Healthcare Uk Limited | Screening and monitoring the progression of type 2 diabetes by the molecular identification of gut flora using fta as a faecal collection device |
GB201505364D0 (en) * | 2015-03-27 | 2015-05-13 | Genetic Analysis As | Method for determining gastrointestinal tract dysbiosis |
CN105199948A (zh) * | 2015-09-29 | 2015-12-30 | 窦晓鸣 | 大肠杆菌的快速检验试剂盒及检测方法 |
US11707493B2 (en) | 2016-05-23 | 2023-07-25 | California Institute Of Technology | Regulate gut microbiota to treat neurodegenerative disorders |
GB201617519D0 (en) * | 2016-10-14 | 2016-11-30 | Genetic Analysis As | A companion diagnostic method for use in the treatment of irritable bowel syndrome with dietary interventions or faecal microbiota transplant |
EA032051B1 (ru) * | 2017-03-22 | 2019-03-29 | Автономная Некоммерческая Организация "Научно-Исследовательский Центр Биотехнологии Антибиотиков И Других Биологически Активных Веществ "Биоан" | Способ идентификации в микробиомах и отдельных бактериальных геномах композиции бактериальных генов, участвующих в синтезе и метаболизме различных нейроактивных соединений |
EP3607096A1 (en) * | 2017-04-03 | 2020-02-12 | Bio-Me AS | Microorganism detection methods |
CA3097521C (en) | 2017-05-15 | 2023-10-17 | Axial Biotherapeutics, Inc. | Inhibitors of microbially induced amyloid |
CN110914458A (zh) * | 2017-05-17 | 2020-03-24 | 麦克罗比奥私人有限公司 | 生物标志物及其用途 |
CN110892081A (zh) | 2017-07-17 | 2020-03-17 | 智能Dna股份有限公司 | 诊断菌群失调的方法 |
WO2019027929A1 (en) * | 2017-08-01 | 2019-02-07 | Axial Biotherapeutics, Inc. | METHODS AND APPARATUS FOR DETERMINING THE RISK OF AUTISM SPECTRUM DISORDER |
GB201712459D0 (en) | 2017-08-02 | 2017-09-13 | Norges Miljø-Og Biovitenskapelige Univ | Treatment or prevention of gastrointestinal dysbiosis |
RU2702229C1 (ru) * | 2018-08-09 | 2019-10-07 | федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Башкирский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации | Способ лечения атопического дерматита у детей пробиотическими препаратами с учетом результатов микробиологического исследования кала |
GB201817889D0 (en) | 2018-11-01 | 2018-12-19 | Bio Me As | Microorganism detection methods |
TR201818373A2 (tr) * | 2018-12-03 | 2020-06-22 | T C Erciyes Ueniversitesi | Bağirsak mi̇krobi̇yomundan alzhei̇mer hastaliğinin teşhi̇si̇ i̇çi̇n mi̇ni̇mal bi̇yobeli̇rteçler ve i̇lgi̇li̇ yeni̇ nesi̇l di̇zi̇leme ki̇ti̇ |
WO2021016133A1 (en) * | 2019-07-19 | 2021-01-28 | Washington University | Particle-based method for defining a gut microbiota in humans or other animal species |
Family Cites Families (38)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4267234A (en) | 1978-03-17 | 1981-05-12 | California Institute Of Technology | Polyglutaraldehyde synthesis and protein bonding substrates |
US4267235A (en) | 1979-03-19 | 1981-05-12 | California Institute Of Technology | Polyglutaraldehyde microspheres |
IL63220A (en) | 1981-07-01 | 1985-09-29 | Yeda Res & Dev | Process for production of polyacrolein microspheres |
US4717655A (en) | 1982-08-30 | 1988-01-05 | Becton, Dickinson And Company | Method and apparatus for distinguishing multiple subpopulations of cells |
US4677138A (en) | 1983-10-19 | 1987-06-30 | Yeda Research And Development Co., Ltd. | High yield process for producing polyaldehyde microspheres |
US5073498A (en) | 1984-12-24 | 1991-12-17 | Caribbean Microparticles Corporation | Fluorescent alignment microbeads with broad excitation and emission spectra and its use |
US4774189A (en) | 1984-12-24 | 1988-09-27 | Flow Cytometry Standards Corp. | Fluorescent calibration microbeads simulating stained cells |
US5194300A (en) | 1987-07-15 | 1993-03-16 | Cheung Sau W | Methods of making fluorescent microspheres |
US5326692B1 (en) | 1992-05-13 | 1996-04-30 | Molecular Probes Inc | Fluorescent microparticles with controllable enhanced stokes shift |
US5723218A (en) | 1990-04-16 | 1998-03-03 | Molecular Probes, Inc. | Dipyrrometheneboron difluoride labeled flourescent microparticles |
FR2707658B1 (fr) | 1993-07-12 | 1995-11-24 | Prolabo Sa | Latex fluorescent comportant au moins deux fluorochromes, procédé d'obtention et application dudit latex comme marqueur, notamment en biologie. |
EP0852004B1 (en) | 1995-10-11 | 2011-01-19 | Luminex Corporation | Multiplexed analysis of clinical specimens |
US5786219A (en) | 1996-10-28 | 1998-07-28 | Molecular Probes, Inc. | Microspheres with fluorescent spherical zones |
GB9709728D0 (en) | 1997-05-13 | 1997-07-02 | Dynal As | Single step method |
US6800744B1 (en) * | 1997-07-02 | 2004-10-05 | Genome Therapeutics Corporation | Nucleic acid and amino acid sequences relating to Streptococcus pneumoniae for diagnostics and therapeutics |
AU1080999A (en) | 1997-10-14 | 1999-05-03 | Luminex Corporation | Precision fluorescently dyed particles and methods of making and using same |
GB9807045D0 (en) | 1998-04-01 | 1998-06-03 | Rudi Knut | Nucleic acid detection method |
US6429027B1 (en) | 1998-12-28 | 2002-08-06 | Illumina, Inc. | Composite arrays utilizing microspheres |
US7090973B1 (en) * | 1999-04-09 | 2006-08-15 | Oscient Pharmaceuticals Corporation | Nucleic acid sequences relating to Bacteroides fragilis for diagnostics and therapeutics |
EP1204869B1 (en) | 1999-08-17 | 2008-10-22 | Luminex Corporation | Method for analyzing a number of samples from a variety of sources for a single analyte |
ATE324588T1 (de) | 1999-08-17 | 2006-05-15 | Luminex Corp | Verkapselung von fluoreszierenden partikeln |
US6942968B1 (en) | 1999-08-30 | 2005-09-13 | Illumina, Inc. | Array compositions for improved signal detection |
GB0001450D0 (en) | 2000-01-21 | 2000-03-08 | Genpoint As | Cell isolation method |
EP1257805B1 (en) | 2000-02-10 | 2015-10-14 | Illumina, Inc. | Composition comprising a substrate with multiple assay locations for bead-based simultaneous processing of multiple samples, apparatus comprising the composition, and manufacturing method for the composition |
JP2004502138A (ja) | 2000-06-28 | 2004-01-22 | イルミナ インコーポレイテッド | ハイブリダイゼーションチャンバーと微小球を利用した複合アレイ |
EP1227152A1 (en) * | 2001-01-30 | 2002-07-31 | Société des Produits Nestlé S.A. | Bacterial strain and genome of bifidobacterium |
JP2005532053A (ja) * | 2002-07-01 | 2005-10-27 | ウエイン・ステイト・ユニバーシテイ | 抗生物質耐性を起こしやすくない抗生物質の同定のための方法および組成物 |
US7919277B2 (en) * | 2004-04-28 | 2011-04-05 | Danisco A/S | Detection and typing of bacterial strains |
EP2280085A3 (en) | 2004-11-01 | 2011-02-23 | George Mason University | Compositions and methods for diagnosing colon disorders |
AT501919B1 (de) * | 2005-06-14 | 2008-09-15 | Erber Ag | Probiotischer, gesundheits- bzw. leistungsfördernder futtermittel- und/oder trinkwasserzusatz für tiere sowie seine verwendung |
GB0601302D0 (en) | 2006-01-23 | 2006-03-01 | Semikhodskii Andrei | Diagnostic methods and apparatus |
KR100868760B1 (ko) * | 2006-09-28 | 2008-11-17 | 삼성전자주식회사 | 그람 음성 및 양성 박테리아를 구별하기 위한 프라이머세트, 프로브 세트, 방법 및 키트 |
KR20100134080A (ko) * | 2008-04-01 | 2010-12-22 | 메타메트릭스 클리니칼 레보러토리 | 위장의 미생물상을 모니터링하기 위한 공정과 방법 |
WO2010127304A2 (en) * | 2009-05-01 | 2010-11-04 | Illumina, Inc. | Sequencing methods |
CA2776420A1 (en) | 2009-10-05 | 2011-04-14 | Aak Patent B.V. | Methods for diagnosing irritable bowel syndrome |
GB2475226A (en) | 2009-11-03 | 2011-05-18 | Genetic Analysis As | Universal Prokaryote 16S ribosome PCR primer pair |
US8288137B2 (en) * | 2010-11-15 | 2012-10-16 | E I Du Pont De Nemours And Company | Recombinant Escherichia coli having enhanced acetyl-coenzyme a synthetase activity for producing glyerol and glycerol-derived products |
GB201021399D0 (en) | 2010-12-16 | 2011-01-26 | Genetic Analysis As | Oligonucleotide probe set and methods of microbiota profiling |
-
2010
- 2010-12-16 GB GBGB1021399.9A patent/GB201021399D0/en not_active Ceased
-
2011
- 2011-12-16 BR BR112013015082A patent/BR112013015082A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2011-12-16 WO PCT/GB2011/052509 patent/WO2012080754A2/en active Application Filing
- 2011-12-16 NZ NZ612010A patent/NZ612010A/en active IP Right Revival
- 2011-12-16 PL PL11804757.0T patent/PL2652145T3/pl unknown
- 2011-12-16 CA CA2821884A patent/CA2821884C/en active Active
- 2011-12-16 MX MX2013006669A patent/MX343863B/es active IP Right Grant
- 2011-12-16 DK DK11804757.0T patent/DK2652145T3/en active
- 2011-12-16 AU AU2011342983A patent/AU2011342983B2/en active Active
- 2011-12-16 RU RU2013132761/10A patent/RU2605913C2/ru active
- 2011-12-16 EP EP11804757.0A patent/EP2652145B1/en active Active
- 2011-12-16 ES ES11804757.0T patent/ES2573133T3/es active Active
-
2013
- 2013-06-17 US US13/919,056 patent/US9243297B2/en active Active
- 2013-06-20 ZA ZA2013/04546A patent/ZA201304546B/en unknown
-
2015
- 2015-11-18 US US14/944,289 patent/US9909191B2/en active Active
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2601132C1 (ru) * | 2015-11-27 | 2016-10-27 | федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Московский физико-технический институт (государственный университет)" (МФТИ) | Набор синтетических олигонуклеотидов для диагностики болезни крона и неспецифического язвенного колита путем выявления маркерных участков бактериальной днк методом полимеразной цепной реакции |
RU2630669C1 (ru) * | 2016-07-21 | 2017-09-11 | Федеральное бюджетное учреждение науки "Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" (ФБУН ГНЦ ВБ "Вектор") | Способ определения метилирования сайтов PuCGPy регуляторных областей генов-онкомаркеров колоректального рака методом GLAD-ПЦР-анализа и набор олигонуклеотидных праймеров и флуоресцентно-меченых зондов для осуществления указанного способа |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
MX2013006669A (es) | 2013-11-04 |
WO2012080754A2 (en) | 2012-06-21 |
CA2821884A1 (en) | 2012-06-21 |
AU2011342983B2 (en) | 2017-03-30 |
EP2652145B1 (en) | 2016-03-09 |
DK2652145T3 (en) | 2016-06-13 |
ES2573133T3 (es) | 2016-06-06 |
RU2605913C2 (ru) | 2016-12-27 |
WO2012080754A3 (en) | 2013-06-20 |
BR112013015082A2 (pt) | 2019-09-17 |
US20160068891A1 (en) | 2016-03-10 |
ZA201304546B (en) | 2014-03-26 |
AU2011342983A1 (en) | 2013-07-04 |
GB201021399D0 (en) | 2011-01-26 |
US9909191B2 (en) | 2018-03-06 |
US20130303397A1 (en) | 2013-11-14 |
PL2652145T3 (pl) | 2016-09-30 |
CA2821884C (en) | 2022-07-05 |
EP2652145A2 (en) | 2013-10-23 |
NZ612010A (en) | 2015-05-29 |
US9243297B2 (en) | 2016-01-26 |
MX343863B (es) | 2016-11-25 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
RU2013132761A (ru) | Набор олигонуклеотидных зондов и способы профилирования микробиоты | |
US20230313300A1 (en) | Biomarkers of traumatic brain injury | |
US8008019B2 (en) | Use of dual-tags for the evaluation of genomic variable repeat regions | |
RU2009135270A (ru) | Способы выявления воспалительного заболевания кишечника | |
US9868995B2 (en) | Method for detecting Helicobacter pylori DNA in a stool sample | |
CN106399517A (zh) | 一种多交叉恒温扩增结合金纳米生物传感的核酸检测技术 | |
WO2012080753A1 (en) | Diagnosis of crohn's disease | |
Roy et al. | Diverse molecular techniques for early diagnosis of COVID-19 and other coronaviruses | |
JP2010535017A (ja) | 局所感染と全身感染を区別するための遺伝子活性検出用ポリヌクレオチドの使用 | |
US9376724B2 (en) | Method for identifying neonates at risk for necrotizing enterocolitis | |
Choi et al. | Point-of-care COVID-19 testing: colorimetric diagnosis using rapid and ultra-sensitive ramified rolling circle amplification | |
WO2021039777A1 (ja) | 関節リウマチを検査する方法 | |
JP7299765B2 (ja) | マイクロrna測定方法およびキット | |
RU2771757C2 (ru) | Биомаркеры травматического повреждения головного мозга | |
JP6672760B2 (ja) | 病原性大腸菌検出用担体、病原性大腸菌検出用キット、及び病原性大腸菌の検出方法 | |
RU2601132C1 (ru) | Набор синтетических олигонуклеотидов для диагностики болезни крона и неспецифического язвенного колита путем выявления маркерных участков бактериальной днк методом полимеразной цепной реакции | |
WO2018129988A1 (zh) | 用于检测肠癌的基因标志物的方法、用该方法筛选的基因标志物及其用途 | |
WO2023002491A1 (en) | Diagnosing inflammatory bowel diseases | |
JP2023020631A (ja) | 全身性エリテマトーデスを検査する方法 | |
WO2010013855A1 (en) | Biomarker for diagnosis of aspirin hypersensitivity, method for manufacturing the same, and method for diagnosis of aspirin hypersensitivity using the same |