RU2012120722A - Способы выявления онкогенных слитых белков, основанные на анализе близкого взаимного расположения - Google Patents

Способы выявления онкогенных слитых белков, основанные на анализе близкого взаимного расположения Download PDF

Info

Publication number
RU2012120722A
RU2012120722A RU2012120722/15A RU2012120722A RU2012120722A RU 2012120722 A RU2012120722 A RU 2012120722A RU 2012120722/15 A RU2012120722/15 A RU 2012120722/15A RU 2012120722 A RU2012120722 A RU 2012120722A RU 2012120722 A RU2012120722 A RU 2012120722A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
fusion protein
cell extract
full
oncogenic fusion
protein
Prior art date
Application number
RU2012120722/15A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2558797C2 (ru
Inventor
Шарат СИНГХ
Ксиньдзунь ЛИУ
Original Assignee
Нестек С.А.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Нестек С.А. filed Critical Нестек С.А.
Publication of RU2012120722A publication Critical patent/RU2012120722A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2558797C2 publication Critical patent/RU2558797C2/ru

Links

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57407—Specifically defined cancers
    • G01N33/57426—Specifically defined cancers leukemia
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A61P35/02—Antineoplastic agents specific for leukemia
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/5005—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
    • G01N33/5008—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
    • G01N33/5011—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics for testing antineoplastic activity
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/5748—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving oncogenic proteins
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/52—Predicting or monitoring the response to treatment, e.g. for selection of therapy based on assay results in personalised medicine; Prognosis
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/56—Staging of a disease; Further complications associated with the disease

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)

Abstract

1. Способ определения уровня или анионного состояния онкогенного слитого белка, который включает:(a) контактирование клеточного экстракта с первой связывающей молекулой, специфичной к первому домену полноразмерного первого белка в условиях, подходящих для преобразования первого полноразмерного белка, присутствующего в клеточном экстракте, в комплекс, включающий первый полноразмерный белок и первую связывающую молекулу, причем первый домен первого полноразмерного белка отсутствует в соответствующем онкогенном слитом белке, содержащем второй, другой домен первого полноразмерного белка, слитый с первым доменом второго, другого полноразмерного белка;(b) удаление из клеточного экстракта комплекса из стадии (а) с получением клеточного экстракта, лишенного первого полноразмерного белка;(c) контактирование клеточного экстракта из стадии (b) со второй связывающей молекулой, специфичной ко второму, другому домену первого полноразмерного белка в условиях, подходящих для преобразования онкогенного слитого белка, присутствующего в клеточном экстракте, в комплекс, содержащий онкогенный слитый белок и вторую связывающую молекулу; и(d) определение уровня или активационного состояния комплекса из стадии (с), тем самым определяя уровень или активационное состояние онкогенного слитого белка.2. Способ по п.1, в котором клеточный экстракт включает экстракт клеток, выделенных из образца.3. Способ по п.2, в котором образец выбирается из группы, состоящей из цельной крови, сыворотки, плазмы, мочи, мокроты, смывной жидкости бронхов, слез, аспирата из сосков, лимфы, слюны, тонкоигольного аспирационного биоптата (FNA) и их комбинаций.

Claims (30)

1. Способ определения уровня или анионного состояния онкогенного слитого белка, который включает:
(a) контактирование клеточного экстракта с первой связывающей молекулой, специфичной к первому домену полноразмерного первого белка в условиях, подходящих для преобразования первого полноразмерного белка, присутствующего в клеточном экстракте, в комплекс, включающий первый полноразмерный белок и первую связывающую молекулу, причем первый домен первого полноразмерного белка отсутствует в соответствующем онкогенном слитом белке, содержащем второй, другой домен первого полноразмерного белка, слитый с первым доменом второго, другого полноразмерного белка;
(b) удаление из клеточного экстракта комплекса из стадии (а) с получением клеточного экстракта, лишенного первого полноразмерного белка;
(c) контактирование клеточного экстракта из стадии (b) со второй связывающей молекулой, специфичной ко второму, другому домену первого полноразмерного белка в условиях, подходящих для преобразования онкогенного слитого белка, присутствующего в клеточном экстракте, в комплекс, содержащий онкогенный слитый белок и вторую связывающую молекулу; и
(d) определение уровня или активационного состояния комплекса из стадии (с), тем самым определяя уровень или активационное состояние онкогенного слитого белка.
2. Способ по п.1, в котором клеточный экстракт включает экстракт клеток, выделенных из образца.
3. Способ по п.2, в котором образец выбирается из группы, состоящей из цельной крови, сыворотки, плазмы, мочи, мокроты, смывной жидкости бронхов, слез, аспирата из сосков, лимфы, слюны, тонкоигольного аспирационного биоптата (FNA) и их комбинаций.
4. Способ по п.2, в котором выделенные клетки выбираются из группы, состоящей из циркулирующих раковых клеток, лейкоцитов и их комбинаций.
5. Способ по п.2, в котором выделенные клетки не подвергаются отмывке перед лизисом для получения клеточного экстракта.
6. Способ по п.1, в котором онкогенный слитый белок выбирается из группы, состоящей из BCR-ABL, DEK-CAN, E2A-PBX1, RARα-PML, IREL-URG, CBFβ-MYH11, AML1-MTG8, EWS-FLI, LYT-10-Cα1, HRX-ENL, HRX-AF4, NPM-ALK, IGH-MYC, RUNX1-ETO, TEL-TRKC, TEL-AML1, MLL-AF4, TCR-RBTN2, COL1A1-PDGF, E2A-HLF, PAX3-FKHR, ETV6-NTRK3, RET-PTC, TMRSS-ERG, TPR-MET и их комбинаций.
7. Способ по п.1, в котором онкогенный слитый белок представлен BCR-ABL.
8. Способ по п.7, в котором первый полноразмерный белок представлен BCR.
9. Способ по п.8, в котором первый домен первого полноразмерного белка включает С-концевой участок BCR (BCR-C).
10. Способ по п.9, в котором второй, другой домен первого полноразмерного белка включает N-концевой участок BCR (BCR-N).
11. Способ по п.7, в котором второй, другой полноразмерный белок представлен ABL.
12. Способ по п.11, в котором первый домен второго, другого полноразмерного белка включает С-концевой участок ABL (ABL-C).
13. Способ по п.1, в котором онкогенный слитый белок представлен BCR-ABL, a активационное состояние представлено состоянием фосфорилирования.
14. Способ по п.1, дополнительно включающий определение уровня или активационного состояния одной или нескольких молекул сигнальной трансдукции.
15. Способ по п.14, в котором одна или несколько молекул сигнальной трансдукции представлены субстратом BCR-ABL.
16. Способ по п.15, в котором субстрат BCR-ABL выбирается из группы, состоящей из CRKL, JAK2, STAT5, VAV, ВАР-1 и их комбинаций.
17. Способ по п.1, в котором стадии (с) и (d) включают ферментный иммуносорбентный анализ (ELISA), метод проточной цитометрии или метод сортировки по тегам.
18. Способ по п.1, в котором стадии (с) и (d) включают метод двойного детектирования сближения.
19. Способ по п.18, в котором стадия (с) дополнительно включает:
(с') контактирование клеточного экстракта из стадии (b) с третьей связывающей молекулой и четвертой связывающей молекулой в условиях, подходящих для преобразования онкогенного слитого белка, присутствующего с клеточном экстракте, в комплекс, включающий онкогенный слитый белок и вторую, третью и четвертую связывающие молекулы,
причем третья связывающая молекула помечена содействующей молекулой и специфична к одному из следующего: (i) первому домену второго, другого полноразмерного белка; (ii) второму, другому домену первого полноразмерного белка; или (iii) месту слияния между вторым, другим доменом первого полноразмерного белка и первым доменом второго, другого полноразмерного белка,
причем четвертая связывающая молекула помечена первым членом пары амплификации сигнала и специфична к первому домену второго, другого полноразмерного белка, и
при этом содействующая молекула вырабатывает окислитель, который канализируется к и реагирует с первым членом пары амплификации сигнала;
а стадия (d) дополнительно включает:
(d') инкубирование комплекса из стадии (с') со вторым членом пары амплификации сигнала с генерированием амплифицированного сигнала; и
(d'') детектирование амплифицированного сигнала, генерированного первым и вторым членами пары амплификации сигнала.
20. Способ по п.1, который дополнительно включает:
(e) контактирование клеточного экстракта с пятой связывающей молекулой, специфичной ко второму домену второго, другого полноразмерного белка в условиях, подходящих для преобразования второго, другого полноразмерного белка, присутствующего в клеточном экстракт, в комплекс, включающий второй, другой полноразмерный белок и пятую связывающую молекулу, причем второй домен второго, другого полноразмерного белка отсутствует в онкогенном слитом белке; и
(f) удаление из клеточного экстракта комплекса из стадии (е) для получения клеточного экстракта, лишенного второго, другого полноразмерного белка,
причем стадия (е) проводится до, во время или после стадии (а).
21. Способ оптимизации терапии и/или снижения токсичности у субъекта, страдающего раком и получающего курс терапии для лечения рака, который включает:
(a) выделение раковых клеток после введения противоракового препарата;
(b) лизирование выделенных клеток для получения клеточного экстракта;
(c) измерение уровня экспрессии и/или активации онкогенного слитого белка в клеточном экстракте в соответствии со способом по п.1;
(d) сравнение измеренного уровня экспрессии и/или активации онкогенного слитого белка с уровнем экспрессии и/или активации онкогенного слитого белка, измеренным ранее во время курса терапии; и
(e) определение последующей дозы в курсе терапии для субъекта или же того, следует ли назначить субъекту другой курс лечения, исходя из сравнения на стадии (d).
22. Способ по п.21, в котором в клеточном экстракте измеряется и уровень экспрессии, и уровень активации онкогенного слитого белка.
23. Способ по п.22, в котором стадия (с) дополнительно включает вычисление отношения активированного к общему уровню онкогенного слитого белка.
24. Способ по п.23, в котором стадия (d) включает сравнение рассчитанного отношения активированного к общему уровню онкогенного слитого белка с отношением активированного к общему уровню онкогенного слитого белка, рассчитанным для субъекта ранее.
25. Способ по п.23, в котором рассчитанное отношение активированного к общему уровню онкогенного слитого белка коррелирует со степенью ингибирования активированного онкогенного слитого белка при лечении противораковым препаратом.
26. Способ по п.21, в котором стадии (с)-(е) альтернативно включают:
(с') измерение в клеточном экстракте уровня экспрессии и/или активации онкогенного слитого белка и одной или нескольких молекул сигнальной трансдукции в этом пути;
(d') сравнение измеренного уровня экспрессии и/или активации онкогенного слитого белка и молекул сигнальной трансдукции с уровнем экспрессии и/или активации онкогенного слитого белка и молекул сигнальной трансдукции, измеренным ранее во время курса терапии; и
(е') определение последующей дозы в курсе терапии для субъекта или же того, следует ли назначить субъекту другой курс терапии, исходя из сравнения на стадии (d').
27. Способ выбора подходящего противоракового препарата для лечения рака, который включает:
(a) выделение раковых клеток после введения противоракового препарата или перед инкубацией с противораковым препаратом;
(b) лизирование выделенных клеток для получения клеточного экстракта;
(c) определение в клеточном экстракте уровня экспрессии и/или активации онкогенного слитого белка в соответствии со способом по п.1; и
(d) определение того, подходит или не подходит противораковый препарат для лечения рака путем сравнения выявленного уровня экспрессии и/или активации онкогенного слитого белка с контрольным профилем экспрессии и/или активации, полученным в отсутствие противоракового препарата.
28. Способ определения реакции рака на лечение противораковым препаратом, который включает:
(a) выделение раковых клеток после введения противоракового препарата или перед инкубацией с противораковым препаратом;
(b) лизирование выделенных клеток для получения клеточного экстракта;
(c) определение в клеточном экстракте уровня экспрессии и/или активации (например, фосфорилирования) онкогенного слитого белка в соответствии со способом по п.1; и
(d) идентификацию рака как реагирующего или не реагирующего на лечение противораковым препаратом путем сравнения выявленного уровня экспрессии и/или активации онкогенного слитого белка с контрольным профилем экспрессии и/или активации, полученным в отсутствие противоракового препарата.
29. Способ предсказания реакции субъекта, страдающего раком, на лечение противораковым препаратом, который включает:
(a) выделение раковых клеток после введения противоракового препарата или перед инкубацией с противораковым препаратом;
(b) лизирование выделенных клеток для получения клеточного экстракта;
(c) определение в клеточном экстракте уровня экспрессии и/или активации онкогенного слитого белка в соответствии со способом по п.1; и
(d) предсказание вероятности того, что субъект будет реагировать на лечение противораковым препаратом, путем сравнения выявленного уровня экспрессии и/или активации онкогенного слитого белка с контрольным профилем экспрессии и/или активации, полученным в отсутствие противоракового препарата.
30. Способ определения того, что субъект, страдающий раком, не поддается лечению противораковым препаратом, который включает:
(a) выделение раковых клеток после введения противоракового препарата или перед инкубацией с противораковым препаратом;
(b) лизирование выделенных клеток для получения клеточного экстракта;
(c) определение в клеточном экстракте уровня экспрессии и/или активации онкогенного слитого белка в соответствии со способом по п.1; и
(d) определение того, что субъект не поддается или поддается лечению противораковым препаратом, путем сравнения выявленного уровня экспрессии и/или активации онкогенного слитого белка с контрольным профилем экспрессии и/или активации полученным в отсутствие противоракового препарата или в присутствии противоракового препарата в более раннее время.
RU2012120722/15A 2009-10-20 2010-10-20 Способы выявления онкогенных слитых белков, основанные на анализе близкого взаимного расположения RU2558797C2 (ru)

Applications Claiming Priority (9)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US25339309P 2009-10-20 2009-10-20
US61/253,393 2009-10-20
US30508410P 2010-02-16 2010-02-16
US61/305,084 2010-02-16
US32748710P 2010-04-23 2010-04-23
US61/327,487 2010-04-23
US38303710P 2010-09-15 2010-09-15
US61/383,037 2010-09-15
PCT/US2010/053386 WO2011050069A1 (en) 2009-10-20 2010-10-20 Proximity-mediated assays for detecting oncogenic fusion proteins

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2012120722A true RU2012120722A (ru) 2013-11-27
RU2558797C2 RU2558797C2 (ru) 2015-08-10

Family

ID=43242385

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2012120722/15A RU2558797C2 (ru) 2009-10-20 2010-10-20 Способы выявления онкогенных слитых белков, основанные на анализе близкого взаимного расположения

Country Status (16)

Country Link
US (1) US20120277109A1 (ru)
EP (1) EP2491385B1 (ru)
JP (3) JP5819307B2 (ru)
KR (1) KR20120110168A (ru)
CN (1) CN102667478B (ru)
AU (1) AU2010310746B2 (ru)
BR (1) BR112012009296A2 (ru)
CA (1) CA2777934A1 (ru)
DK (1) DK2491385T3 (ru)
ES (1) ES2637853T3 (ru)
IL (1) IL219313A (ru)
MX (1) MX337666B (ru)
NZ (1) NZ599460A (ru)
RU (1) RU2558797C2 (ru)
WO (1) WO2011050069A1 (ru)
ZA (1) ZA201202957B (ru)

Families Citing this family (40)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20120065092A1 (en) * 2010-09-14 2012-03-15 Wai Hobert Fusion analyte cytometric bead assay, and systems and kits for performing the same
MX2013007429A (es) 2010-12-23 2014-01-31 Nestec Sa Seleccion de farmacos para terapia de cancer maligno usando disposiciones a base de anticuerpos.
ES2530175T3 (es) 2011-02-17 2015-02-26 Nestec S.A. Ensayos para la detección de autoanticuerpos contra fármacos anti-TNF
ES2734673T3 (es) 2011-03-02 2019-12-11 Nestle Sa Predicción de la sensibilidad farmacológica de tumores de pulmón basándose en identificaciones moleculares y genéticas
CN102676648A (zh) * 2011-03-07 2012-09-19 重庆医科大学附属儿童医院 白血病诊疗的基因芯片
MX339340B (es) 2011-04-04 2016-05-20 Nestec Sa Metodos para predecir y mejorar la supervivencia de pacientes con cancer gastrico.
WO2012154987A1 (en) 2011-05-10 2012-11-15 Nestec Sa Methods of disease activity profiling for personalized therapy management
CA2833212C (en) * 2011-05-12 2020-06-09 Genentech, Inc. Multiple reaction monitoring lc-ms/ms method to detect therapeutic antibodies in animal samples using framework signature peptides
US9804160B2 (en) 2011-09-28 2017-10-31 H. Lee Moffitt Cancer Center And Research Institute, Inc. Protein-protein interaction as biomarkers
US9335292B2 (en) 2011-10-13 2016-05-10 Auburn University Electrochemical proximity assay
JP2015505959A (ja) 2011-12-05 2015-02-26 ネステク ソシエテ アノニム 癌を有する患者に治療を選択する方法
DK2812024T3 (en) * 2012-02-09 2018-07-23 Var2 Pharmaceuticals Aps TARGET ORIENTATION OF CHONDROITIN-SULPHATE GLYCANES
US10041950B2 (en) 2012-03-27 2018-08-07 Ventana Medical Systems, Inc. Signaling conjugates and methods of use
JP2014030572A (ja) * 2012-08-03 2014-02-20 Akira Sakai 抗がん剤投与装置
US9422602B2 (en) 2012-08-15 2016-08-23 Bio-Rad Laboratories, Inc. Methods and compositions for determining nucleic acid degradation
CN104838270A (zh) 2012-10-05 2015-08-12 雀巢产品技术援助有限公司 用于预测和监测粘膜愈合的方法
CN103792364B (zh) * 2012-10-31 2016-06-08 张宝弘 用于检测外周血中循环肿瘤细胞ror1蛋白的试剂及其应用
EP2954329A1 (en) 2013-02-05 2015-12-16 Nestec S.A. Methods of selecting combination therapy for colorectal cancer patients
EP2954328A1 (en) 2013-02-05 2015-12-16 Nestec S.A. Drug selection for colorectal cancer therapy using receptor tyrosine kinase profiling
EP2954068B8 (en) 2013-02-05 2018-10-31 Pierian Holdings, Inc. Drug selection for non-small cell lung cancer therapy
CN104007257B (zh) * 2013-02-24 2017-02-08 北京莱尔生物医药科技有限公司 一种检测非体液性稀有有核细胞的方法和试剂盒
WO2014141306A2 (en) * 2013-03-15 2014-09-18 Rajiv Gandhi Centre For Biotechnology Methods and materials for identifying therapeutic response in chronic myeloid leukemia
AU2014269946A1 (en) 2013-05-21 2015-12-03 Nestec S.A. Methods for predicting and improving the survival of colorectal cancer patients
WO2015110989A1 (en) 2014-01-23 2015-07-30 Nestec S.A. Biomarker panel for assessment of mucosal healing
GB2524519B (en) 2014-03-25 2019-11-06 Pelago Bioscience AB Methods for identifying a biomarker indicative of a reduced drug response using a thermal shift assay
JP2017520769A (ja) * 2014-06-30 2017-07-27 ネステク ソシエテ アノニム フローサイトメトリーを使用する協調的酵素増強反応性（ｃｅｅｒ）免疫アッセイ
MX2017004742A (es) 2014-10-20 2017-07-20 Nestec Sa Métodos para la predicción de niveles de farmacos anti-tnf alfa y formación de autoanticuerpos.
US11149299B2 (en) * 2015-06-25 2021-10-19 Ramesh Vallabhaneni Method and system for multiplex profiling of chromosomes in biological samples using target-specific DNA probes
TW202140776A (zh) * 2016-04-26 2021-11-01 美商美國泰福生技股份有限公司 細胞培養基
CN106645728A (zh) * 2016-11-09 2017-05-10 百奥森（江苏）食品安全科技有限公司 一种食品中氟喹诺酮类药物的检测试剂盒
EP3548007A4 (en) * 2016-12-01 2020-08-12 Ignyta, Inc. CANCER TREATMENT METHODS
US10852274B2 (en) 2017-03-09 2020-12-01 Auburn University Differential circuit for background correction in electrochemical measurements
KR20180117529A (ko) * 2017-04-19 2018-10-29 주식회사 프로티나 단백질-단백질 상호작용 분석에 의한 약물 반응성 예측 방법
KR20200009095A (ko) 2017-05-31 2020-01-29 프로메테우스 바이오사이언시즈, 인크. 크론병 환자에서 점막 치유를 평가하는 방법
US11505799B2 (en) 2017-07-07 2022-11-22 Innamed, Inc. Aptamers for measuring lipoprotein levels
US11560565B2 (en) 2018-06-13 2023-01-24 Auburn University Electrochemical detection nanostructure, systems, and uses thereof
CN109439759A (zh) * 2018-12-18 2019-03-08 武汉迪安医学检验实验室有限公司 一种用于检测CBFβ-MYH11融合基因的试剂盒
CN113498341A (zh) * 2019-01-02 2021-10-12 浙江冠科美博生物科技有限公司 使用多靶点激酶抑制剂结合蛋白激酶生物标志物的癌症治疗
WO2023286723A1 (ja) 2021-07-13 2023-01-19 キヤノン株式会社 検体の分析方法および検体分析装置
WO2023058624A1 (ja) * 2021-10-08 2023-04-13 コニカミノルタ株式会社 染色方法、評価方法および標本

Family Cites Families (74)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4197199A (en) 1977-10-25 1980-04-08 Manor Engineering Company Limited Filter presses
US4816567A (en) 1983-04-08 1989-03-28 Genentech, Inc. Recombinant immunoglobin preparations
US4676980A (en) 1985-09-23 1987-06-30 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Target specific cross-linked heteroantibodies
US5567610A (en) 1986-09-04 1996-10-22 Bioinvent International Ab Method of producing human monoclonal antibodies and kit therefor
US5223409A (en) 1988-09-02 1993-06-29 Protein Engineering Corp. Directed evolution of novel binding proteins
GB8823869D0 (en) 1988-10-12 1988-11-16 Medical Res Council Production of antibodies
US5175384A (en) 1988-12-05 1992-12-29 Genpharm International Transgenic mice depleted in mature t-cells and methods for making transgenic mice
US5532138A (en) 1990-04-26 1996-07-02 Behringwerke Ag Method and kits for determining peroxidatively active catalysts
US5229275A (en) 1990-04-26 1993-07-20 Akzo N.V. In-vitro method for producing antigen-specific human monoclonal antibodies
US5571894A (en) 1991-02-05 1996-11-05 Ciba-Geigy Corporation Recombinant antibodies specific for a growth factor receptor
WO1992021032A1 (en) 1991-05-24 1992-11-26 The Regents Of The University Of California Methods for the detection of bcr-abl and abnormal abl proteins in leukemia patients
US5565332A (en) 1991-09-23 1996-10-15 Medical Research Council Production of chimeric antibodies - a combinatorial approach
US5587458A (en) 1991-10-07 1996-12-24 Aronex Pharmaceuticals, Inc. Anti-erbB-2 antibodies, combinations thereof, and therapeutic and diagnostic uses thereof
WO1993008829A1 (en) 1991-11-04 1993-05-13 The Regents Of The University Of California Compositions that mediate killing of hiv-infected cells
CA2129663C (en) 1992-02-06 2005-07-05 James S. Huston Biosynthetic binding protein for cancer marker
ATE244763T1 (de) 1992-02-11 2003-07-15 Cell Genesys Inc Erzielen von homozygotem durch zielgerichtete genetische ereignisse
US5573905A (en) 1992-03-30 1996-11-12 The Scripps Research Institute Encoded combinatorial chemical libraries
US5332662A (en) 1992-07-31 1994-07-26 Syntex (U.S.A.) Inc. Methods for determining peroxidatively active substances
ATE149570T1 (de) 1992-08-17 1997-03-15 Genentech Inc Bispezifische immunoadhesine
US5618829A (en) 1993-01-28 1997-04-08 Mitsubishi Chemical Corporation Tyrosine kinase inhibitors and benzoylacrylamide derivatives
US5728868A (en) 1993-07-15 1998-03-17 Cancer Research Campaign Technology Limited Prodrugs of protein tyrosine kinase inhibitors
CA2166871A1 (en) * 1993-07-29 1995-02-09 Neill A. Giese Receptor function assays
DE69417242T2 (de) 1993-09-03 1999-07-08 Behringwerke Ag Fluoreszenz-sauerstoffkanalisation-immunteste
US5807522A (en) 1994-06-17 1998-09-15 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Methods for fabricating microarrays of biological samples
US5804396A (en) 1994-10-12 1998-09-08 Sugen, Inc. Assay for agents active in proliferative disorders
US6107457A (en) 1995-02-16 2000-08-22 Board Of Regents, The University Of Texas System Bcr-Abl directed compositions and uses for inhibiting Philadelphia chromosome stimulated cell growth
US5731168A (en) 1995-03-01 1998-03-24 Genentech, Inc. Method for making heteromultimeric polypeptides
US5641870A (en) 1995-04-20 1997-06-24 Genentech, Inc. Low pH hydrophobic interaction chromatography for antibody purification
US5639757A (en) 1995-05-23 1997-06-17 Pfizer Inc. 4-aminopyrrolo[2,3-d]pyrimidines as tyrosine kinase inhibitors
EP0892789B2 (en) 1996-04-12 2009-11-18 Warner-Lambert Company LLC Irreversible inhibitors of tyrosine kinases
US6057098A (en) 1997-04-04 2000-05-02 Biosite Diagnostics, Inc. Polyvalent display libraries
DE69822149T2 (de) 1997-05-20 2005-03-03 Erasmus Universiteit Rotterdam Erkennung von tmorspezifische genprodukte
US6686165B2 (en) 1997-05-20 2004-02-03 Erasmus Universiteit Rotterdam Recognition of tumor-specific gene products in cancer
ZA986732B (en) 1997-07-29 1999-02-02 Warner Lambert Co Irreversible inhibitiors of tyrosine kinases
US6100254A (en) 1997-10-10 2000-08-08 Board Of Regents, The University Of Texas System Inhibitors of protein tyrosine kinases
US6897073B2 (en) 1998-07-14 2005-05-24 Zyomyx, Inc. Non-specific binding resistant protein arrays and methods for making the same
US6780582B1 (en) 1998-07-14 2004-08-24 Zyomyx, Inc. Arrays of protein-capture agents and methods of use thereof
US6197599B1 (en) 1998-07-30 2001-03-06 Guorong Chin Method to detect proteins
US6740665B1 (en) 1999-02-10 2004-05-25 Ramachandran Murali Tyrosine kinase inhibitors and methods of using the same
US6245759B1 (en) 1999-03-11 2001-06-12 Merck & Co., Inc. Tyrosine kinase inhibitors
JP2003503351A (ja) 1999-06-30 2003-01-28 メルク エンド カムパニー インコーポレーテッド Ｓｒｃキナーゼ阻害化合物
CA2376951A1 (en) 1999-06-30 2001-01-04 Peter J. Sinclair Src kinase inhibitor compounds
ATE253915T1 (de) 1999-06-30 2003-11-15 Merck & Co Inc Src-kinase hemmende verbindungen
US7179638B2 (en) 1999-07-30 2007-02-20 Large Scale Biology Corporation Microarrays and their manufacture by slicing
SK4772002A3 (en) 1999-09-10 2002-11-06 Merck & Co Inc Tyrosine kinase inhibitors, pharmaceutical composition containing the same and their use
DE60017179T2 (de) 1999-10-19 2006-01-05 Merck & Co., Inc. Tyrosin kinaseinhibitoren
ATE290865T1 (de) 1999-10-19 2005-04-15 Merck & Co Inc Tyrosin kinase inhibitoren
US6794393B1 (en) 1999-10-19 2004-09-21 Merck & Co., Inc. Tyrosine kinase inhibitors
US6420382B2 (en) 2000-02-25 2002-07-16 Merck & Co., Inc. Tyrosine kinase inhibitors
US6313138B1 (en) 2000-02-25 2001-11-06 Merck & Co., Inc. Tyrosine kinase inhibitors
WO2002012893A2 (en) 2000-08-03 2002-02-14 Massachusetts Institute Of Technology Microarrays of functional biomolecules, and uses therefor
US20020132274A1 (en) * 2001-01-17 2002-09-19 Nevalainen Marja T. Diagnostic and monitorings methods for cancer
US6777239B2 (en) 2001-04-17 2004-08-17 Xenoport, Inc. Epitope-captured antibody display
WO2003000687A1 (en) 2001-06-22 2003-01-03 Merck & Co., Inc. Tyrosine kinase inhibitors
WO2003011836A1 (en) 2001-08-01 2003-02-13 Merck & Co., Inc. Tyrosine kinase inhibitors
US6927293B2 (en) 2001-08-30 2005-08-09 Merck & Co., Inc. Tyrosine kinase inhibitors
US20030190689A1 (en) * 2002-04-05 2003-10-09 Cell Signaling Technology,Inc. Molecular profiling of disease and therapeutic response using phospho-specific antibodies
US20030153013A1 (en) 2002-11-07 2003-08-14 Ruo-Pan Huang Antibody-based protein array system
US7354773B2 (en) * 2003-05-14 2008-04-08 Beckman Coulter, Inc. Method and apparatus for preparing cell samples for intracellular antigen detection using flow cytometry
EP1507147A1 (en) * 2003-08-12 2005-02-16 Erasmus University Medical Center Rotterdam Method for detecting low levels of a fusion protein
US20050214301A1 (en) * 2004-03-24 2005-09-29 Cell Signaling Technology, Inc. Antibodies specific for BCR-ABL fusion protein and uses thereof
US20060263837A1 (en) 2004-06-17 2006-11-23 Liu George D Immunoassay system and method for detection of antigens
US7771955B2 (en) 2005-06-09 2010-08-10 University Of Maryland Affinity membrane for capture of a target biomolecule and formation thereof by site-directed immobilization of a capture biomolecule
DE212006000071U1 (de) * 2005-11-18 2008-07-24 Board of Regents, The University of Texas System, Austin Quantifizierung von Fusionsproteinen und ihrer Aktivität in Folge chromosomaler Translokation
BRPI0717416A2 (pt) 2006-09-21 2013-11-12 Prometheus Lab Inc Método para realizar um imunoensaio complexo de alta produtividade, e, arranjo
JP5154557B2 (ja) * 2006-09-21 2013-02-27 ネステク ソシエテ アノニム 希少循環細胞における多様なシグナル伝達物質検出のための抗体に基づくアレイ
JP2008261764A (ja) * 2007-04-13 2008-10-30 Kyowa Hakko Kogyo Co Ltd キナーゼ阻害物質の測定方法
ES2526211T3 (es) 2007-07-13 2015-01-08 Nestec S.A. Selección de fármacos para la terapia del cáncer de pulmón utilizando matrices basadas en anticuerpos
GB0714573D0 (en) * 2007-07-26 2007-09-05 Imp Innovations Ltd Marker gene
CN101802182A (zh) * 2007-08-21 2010-08-11 诺达利蒂公司 用于诊断、预后和治疗方法的方法
JP5228416B2 (ja) * 2007-09-12 2013-07-03 株式会社リコー 定電流出力制御型スイッチングレギュレータ
CN102016581B (zh) 2008-02-25 2014-07-30 雀巢产品技术援助有限公司 用抗体阵列选择乳腺癌治疗药物
EP2108956A1 (en) * 2008-04-07 2009-10-14 Erasmus University Medical Center Rotterdam Improved methods and kits for detecting tumor-specific fusion proteins
US8301258B2 (en) 2008-08-14 2012-10-30 The Chinese University Of Hong Kong Methods and devices for preventing ankle sprain injuries

Also Published As

Publication number Publication date
CN102667478B (zh) 2018-06-01
ES2637853T3 (es) 2017-10-17
EP2491385A1 (en) 2012-08-29
EP2491385B1 (en) 2017-05-10
RU2558797C2 (ru) 2015-08-10
KR20120110168A (ko) 2012-10-09
JP2018119975A (ja) 2018-08-02
ZA201202957B (en) 2017-01-25
MX337666B (es) 2016-03-14
IL219313A (en) 2017-03-30
WO2011050069A1 (en) 2011-04-28
CN102667478A (zh) 2012-09-12
IL219313A0 (en) 2012-06-28
NZ599460A (en) 2014-07-25
AU2010310746A1 (en) 2012-05-03
CA2777934A1 (en) 2011-04-28
JP6301892B2 (ja) 2018-03-28
JP5819307B2 (ja) 2015-11-24
JP2013508728A (ja) 2013-03-07
JP2016028251A (ja) 2016-02-25
AU2010310746B2 (en) 2015-07-23
BR112012009296A2 (pt) 2021-02-02
US20120277109A1 (en) 2012-11-01
MX2012004619A (es) 2012-05-08
DK2491385T3 (en) 2017-08-28

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2012120722A (ru) Способы выявления онкогенных слитых белков, основанные на анализе близкого взаимного расположения
Chudziak et al. Clinical evaluation of a novel microfluidic device for epitope-independent enrichment of circulating tumour cells in patients with small cell lung cancer
Li et al. Discovery of Apo-A1 as a potential bladder cancer biomarker by urine proteomics and analysis
Zhang et al. SARS-CoV-2 detection using quantum dot fluorescence immunochromatography combined with isothermal amplification and CRISPR/Cas13a
JP2010533842A5 (ru)
RU2010105037A (ru) Выбор лекарственных средств для терапии рака легких с помощью матриц на основе антител
ATE538386T1 (de) Nachweis von krebs anhand von erhöhten bcl-2- konzentrationen
Shan et al. Gradually increased G olgi protein 73 expression in the progression of benign liver diseases to precancerous lesions and hepatocellular carcinoma correlates with prognosis of patients
CN103033619B (zh) 一种综合检测肺癌标志物的蛋白质芯片试剂盒及方法
CN105203760A (zh) Psmd4蛋白的elisa检测试剂盒及其检测方法与应用
Tyan et al. Urinary protein profiling by liquid chromatography/tandem mass spectrometry: ADAM28 is overexpressed in bladder transitional cell carcinoma
ATE489632T1 (de) Antigennachweis
ATE408829T1 (de) Verfahren und assaykits zum nachweis mononuklearer zellphänotypen
Shi et al. Multiplexed targeted mass spectrometry assays for prostate cancer-associated urinary proteins
CN102994638B (zh) 生物样品中待检物的夹心免疫pcr检测方法和试剂盒
CN108977582A (zh) 一种禽传染性支气管炎病毒的实时荧光定量rt-pcr检测方法
CN101565742A (zh) 引物特异荧光pcr检测egfr突变的试剂盒
DK2986985T3 (en) Automated method for identifying, quantifying and discriminating specific signals versus nonspecific signals in a detection method by detector
EP3676295B1 (en) Phenotypic profiling of hepatocellular carcinoma circulating tumor cells for treatment selection
WO2023014297A3 (en) Circulating microrna panel for the early detection of breast cancer and methods thereof
Vilella-Arias et al. Loss of caspase 7 expression is associated with poor prognosis in renal cell carcinoma clear cell subtype
CN114592047B (zh) 一种检测循环肿瘤细胞的方法及其应用
CN102507938A (zh) 一种肝癌转移预测定量抗体芯片及试剂盒
Ancin et al. The correlation of serum sPD-1 and sPD-L1 levels with clinical, pathological characteristics and lymph node metastasis in nonsmall cell lung cancer patients
WO2020179712A1 (en) Methods for predicting tumor response to eribulin

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20191021