RU2009129091A - Искусственная последовательность днк с оптимизированной лидерной функцией на 5 (5-utr) для улучшенной эспрессии гетерологичных белков в растениях - Google Patents

Искусственная последовательность днк с оптимизированной лидерной функцией на 5 (5-utr) для улучшенной эспрессии гетерологичных белков в растениях Download PDF

Info

Publication number
RU2009129091A
RU2009129091A RU2009129091/10A RU2009129091A RU2009129091A RU 2009129091 A RU2009129091 A RU 2009129091A RU 2009129091/10 A RU2009129091/10 A RU 2009129091/10A RU 2009129091 A RU2009129091 A RU 2009129091A RU 2009129091 A RU2009129091 A RU 2009129091A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
sequence
sequence according
sequences
synthesis
combination
Prior art date
Application number
RU2009129091/10A
Other languages
English (en)
Inventor
Стефано МАРКЕТТИ (IT)
Стефано МАРКЕТТИ
АМИЧИС Франческа ДЕ (IT)
АМИЧИС Франческа ДЕ
Тамара ПАТТИ (IT)
Тамара Патти
Original Assignee
Университа` Дельи Студи Ди Удине (It)
Университа` Дельи Студи Ди Удине
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Университа` Дельи Студи Ди Удине (It), Университа` Дельи Студи Ди Удине filed Critical Университа` Дельи Студи Ди Удине (It)
Publication of RU2009129091A publication Critical patent/RU2009129091A/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8216Methods for controlling, regulating or enhancing expression of transgenes in plant cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01HNEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H1/00Processes for modifying genotypes ; Plants characterised by associated natural traits
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01HNEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H6/00Angiosperms, i.e. flowering plants, characterised by their botanic taxonomy
    • A01H6/46Gramineae or Poaceae, e.g. ryegrass, rice, wheat or maize
    • A01H6/4636Oryza sp. [rice]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/66General methods for inserting a gene into a vector to form a recombinant vector using cleavage and ligation; Use of non-functional linkers or adaptors, e.g. linkers containing the sequence for a restriction endonuclease

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Developmental Biology & Embryology (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Environmental Sciences (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Physiology (AREA)
  • Natural Medicines & Medicinal Plants (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)

Abstract

1. Искусственная нуклеотидная ДНК последовательность, обладающая функцией лидерной последовательности в 5'-UTR, причем указанная лидерная последовательность в 5'-UTR включает элементы, способствующие экспрессии генов, такие как, повторяющиеся тринуклеотидные элементы CAA в комбинации с повторяющимися динуклеотидными элементами СТ. ! 2. Последовательность по п.1, содержащая поли(САА) область, означая олигонуклеотид, состоящий из двух или нескольких копий элемента CAA, предпочтительно, но не обязательно, смежных друг с другом. ! 3. Последовательность по п.1, содержащая поли(СТ) область, означая олигонуклеотид, состоящий из двух или нескольких копий элемента СТ, предпочтительно, но не обязательно смежных друг с другом. ! 4. Последовательность по п.1, содержащая одну или несколько копий октамера ACAATTAC. ! 5. Последовательность по п.1, включая комбинацию последовательностей по пп.2 и 3. ! 6. Последовательность по п.1, включая комбинацию последовательностей по пп.2 и 4. ! 7. Последовательность по п.1, включая комбинацию последовательностей по пп.3 и 4. ! 8. Последовательность по п.1, включая комбинацию последовательностей по пп.2, 3 и 4. ! 9. Последовательность по п.1, включая комбинацию последовательностей по любому из пп.2-8 с сайтом Inr CaMV 35S, то есть сайтом инициации транскрипции 35S промотора вируса мозаики цветной капусты. ! 10. Последовательность по п.1, включая последовательность, представленную в SEQ ID NO: 1. ! 11. Конструкция 5'-UTR экспрессируемых в растениях векторов, в которых одновременно присутствуют следующие элементы: сайт Inr 35S CaMV, поли(CAA)n, октамер ACAATTAC, поли(СТ)n, где n - любое число, больше, чем или равное 2. ! 12. Последовательность по п.1, включающая

Claims (49)

1. Искусственная нуклеотидная ДНК последовательность, обладающая функцией лидерной последовательности в 5'-UTR, причем указанная лидерная последовательность в 5'-UTR включает элементы, способствующие экспрессии генов, такие как, повторяющиеся тринуклеотидные элементы CAA в комбинации с повторяющимися динуклеотидными элементами СТ.
2. Последовательность по п.1, содержащая поли(САА) область, означая олигонуклеотид, состоящий из двух или нескольких копий элемента CAA, предпочтительно, но не обязательно, смежных друг с другом.
3. Последовательность по п.1, содержащая поли(СТ) область, означая олигонуклеотид, состоящий из двух или нескольких копий элемента СТ, предпочтительно, но не обязательно смежных друг с другом.
4. Последовательность по п.1, содержащая одну или несколько копий октамера ACAATTAC.
5. Последовательность по п.1, включая комбинацию последовательностей по пп.2 и 3.
6. Последовательность по п.1, включая комбинацию последовательностей по пп.2 и 4.
7. Последовательность по п.1, включая комбинацию последовательностей по пп.3 и 4.
8. Последовательность по п.1, включая комбинацию последовательностей по пп.2, 3 и 4.
9. Последовательность по п.1, включая комбинацию последовательностей по любому из пп.2-8 с сайтом Inr CaMV 35S, то есть сайтом инициации транскрипции 35S промотора вируса мозаики цветной капусты.
10. Последовательность по п.1, включая последовательность, представленную в SEQ ID NO: 1.
11. Конструкция 5'-UTR экспрессируемых в растениях векторов, в которых одновременно присутствуют следующие элементы: сайт Inr 35S CaMV, поли(CAA)n, октамер ACAATTAC, поли(СТ)n, где n - любое число, больше, чем или равное 2.
12. Последовательность по п.1, включающая все возможные комбинации элементов, которые составляют лидерную последовательность 5'-UTR по п.1, независимо от относительного положения 5'-3'.
13. Последовательность по п.1, включая последовательности, комплементарные последовательностям по п.1.
14. Последовательность по п.1, имеющую длину от 20 до 200 нуклеотидов, предпочтительно от 40 до 150 нуклеотидов.
15. Последовательность по п.1, содержание G+C в которой составляет менее чем 60%, предпочтительно менее чем 50%.
16. Последовательность по п.1, которая может быть получена посредством: a) искусственного синтеза; b) природных или индуцированных методов рекомбинации в природных или искусственных последовательностях.
17. Праймер для амплификации, включающий нуклеотидную последовательность, выбранную из группы, представленной нуклеотидными последовательностями, показанными в SEQ ID NO: 2-7 или комплементарные им.
18. Возможно обнаруженные природные 5'-UTR лидерные последовательности, которые являются незначительно отличающимися вариантами, если они функционально подобны последовательности по п.1.
19. Последовательности, происходящие из мутаций последовательности по любому из вышеуказанных пунктов, которые, как считается, приводят к несущественно отличающимся вариантам, если они функционально подобны последовательности по любому из вышеуказанных пунктов, причем мутации независимо представлены делециями, вставками, транзициями, трансверсиями одного или нескольких нуклеотидов в последовательности по п.1 или в комплементарной ей последовательности.
20. Способ искусственного синтеза последовательности по п.1, характеризующийся тем, что он позволяет использовать один или несколько праймеров по п.17.
21. Бактериальные штаммы, несущие плазмиды, содержащие последовательность по п.1, в частности штаммы Escherichia coli, Agrobacterium tumefaciens и Agrobacterium rhizogenes.
22. Генно-инженерные вирусные штаммы, содержащие последовательность по п.1, независимо от организма хозяина.
23. Растительные клетки, трансформированные векторами для экспрессии, содержащими последовательность по п.1 под контролем конститутивного промотора.
24. Растительные клетки, трансформированные векторами для экспрессии, содержащими последовательность по п.1 под контролем тканеспецифичного промотора, и в частности промотора, специфичного для семени.
25. Растительные клетки, трансформированные векторами для экспрессии, содержащими последовательность по п.1 под контролем индуцибельного промотора.
26. Растительные клетки, трансформированные векторами для экспрессии, содержащими последовательность по п.1 под контролем промотора с фаза-зависимой активацией транскрипции.
27. Растительные клетки, трансформированные векторами для экспрессии, содержащими последовательность по п.1 под контролем промотора, активного в хлоропласте.
28. Растительные клетки, трансформированные векторами для экспрессии, содержащими последовательность по п.1 под контролем промотора, активного в митохондрии.
29. Растения, характеризующиеся временной экспрессией любого белка, в котором матричная РНК содержит последовательность по п.1, причем под временной экспрессией понимается получение указанного белка посредством вирусных векторов, агроинфильтрации, доставки частицами, электропорации.
30. Двудольные растения, устойчиво трансформированные векторами для экспрессии, содержащими последовательность по п.1.
31. Растения по п.30, включающие один или несколько видов, принадлежащих семействам Solanaceae, Papilonaceae и Cruciferae.
32. Потомства двудольных растений по п.30.
33. Однодольные растения, трансформированные векторами для экспрессии, содержащими последовательность по п.1.
34. Растения по п.33, включающие один или несколько видов, принадлежащих семействам Graminaceae (Poaceae).
35. Потомства однодольных растений по п.33.
36. Применение последовательности по п.1 для биотехнологического получения молекул.
37. Применение последовательности по п.1 для синтеза рекомбинантных белков.
38. Применение последовательности по п.1 для синтеза рекомбинантных белков, способных вызывать устойчивость к вирусным, бактериальным или грибковым патогенам.
39. Применение последовательности по п.1 для синтеза рекомбинантных белков, способных вызывать устойчивость к гербицидам.
40. Применение последовательности по п.1 для синтеза рекомбинантных белков, способствующих получению модифицированной композиции в жирных кислотах необработанного сырья и продуктах, полученных из него.
41. Применение последовательности по п.1 для синтеза рекомбинантных белков, способствующих получению сырья с измененной питательной ценностью и продуктов, полученных из него.
42. Применение последовательности по п.1 для синтеза рекомбинантных белков, предназначенных для получения топлива, каучуков и биопластика.
43. Применение последовательности по п.1 для синтеза индустриальных ферментов и коммерческих белков.
44. Применение последовательности по п.1 для синтеза фармацевтических белков.
45. Применение последовательности по п.1 для получения вакцин для перорального введения, предназначенных для людей или животных.
46. Применение последовательности по п.1 для получения вакцин для инъекции, предназначенных для людей или животных.
47. Применение последовательности по п.1 для создания специфичных для конкретного пациента вакцин для инъекции, предпочтительно идиотип-специфичных для использования в лечении опухолей лимфатической системы.
48. Применение последовательности по п.1 для синтеза белков, вовлеченных в получение вторичных метаболитов.
49. Применение последовательности по п.1 для синтеза белков, напрямую или косвенно используемых в качестве факторов для идентификации и/или селекции трансформированных клеток.
RU2009129091/10A 2006-12-29 2007-12-27 Искусственная последовательность днк с оптимизированной лидерной функцией на 5 (5-utr) для улучшенной эспрессии гетерологичных белков в растениях RU2009129091A (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
IT000280A ITUD20060280A1 (it) 2006-12-29 2006-12-29 Sequenza artificiale di dna evente funzione di leader in 5' (5'-utr) ottimizzata per la sovraespressione di proteine eterologhe in pianta
ITUD2006A000280 2006-12-29

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2009129091A true RU2009129091A (ru) 2011-02-10

Family

ID=39205172

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2009129091/10A RU2009129091A (ru) 2006-12-29 2007-12-27 Искусственная последовательность днк с оптимизированной лидерной функцией на 5 (5-utr) для улучшенной эспрессии гетерологичных белков в растениях

Country Status (18)

Country Link
US (1) US9085775B2 (ru)
EP (1) EP2118291B1 (ru)
JP (2) JP2010514432A (ru)
KR (1) KR101596229B1 (ru)
CN (1) CN101617048B (ru)
AU (1) AU2007341217A1 (ru)
BR (1) BRPI0720641A8 (ru)
CA (1) CA2674170C (ru)
CY (1) CY1116649T1 (ru)
DK (1) DK2118291T3 (ru)
ES (1) ES2546184T3 (ru)
HU (1) HUE027484T2 (ru)
IT (1) ITUD20060280A1 (ru)
NZ (1) NZ578518A (ru)
PL (1) PL2118291T3 (ru)
PT (1) PT2118291E (ru)
RU (1) RU2009129091A (ru)
WO (1) WO2008080954A1 (ru)

Families Citing this family (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ITUD20080055A1 (it) * 2008-03-13 2009-09-14 Transactiva S R L Procedimento per la produzione di una proteina umana in pianta, in particolare un enzima lisosomiale umano ricombinante in endosperma di cereali
WO2013183863A1 (ko) * 2012-06-04 2013-12-12 대한민국(관리부서:국립수산과학원) 3'영역의 염기 변이를 통한 전체 단백질의 발현 조절 방법
ITUD20130002A1 (it) * 2013-01-16 2014-07-17 Transactiva S R L Sequenza artificiale di dna avente funzione di leader in 5' (5'-utr) ottimizzata per la sovraespressione di proteine ricombinanti in pianta e metodo per la produzione di proteine ricombinanti in pianta
JP6609551B2 (ja) * 2013-06-25 2019-11-20 ザ ユニバーシティー オブ ユタ リサーチ ファンデーション ポリメラーゼ連鎖反応を行う方法及びその関連する使用
IT201700042052A1 (it) 2017-04-14 2018-10-14 Transactiva S R L Vettore di espressione e metodo per la produzione di una proteina umana in pianta, in particolare un anticorpo ricombinante in endosperma di cereale

Family Cites Families (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB8613481D0 (en) * 1986-06-04 1986-07-09 Diatech Ltd Translation of mrna
GB9206016D0 (en) 1992-03-19 1992-04-29 Sandoz Ltd Improvements in or relating to organic compounds
US5362865A (en) 1993-09-02 1994-11-08 Monsanto Company Enhanced expression in plants using non-translated leader sequences
GB9515941D0 (en) 1995-08-03 1995-10-04 Zeneca Ltd DNA constructs
JP3761628B2 (ja) * 1995-07-14 2006-03-29 住友化学株式会社 植物プロモーターおよびその利用
GB9516241D0 (en) * 1995-08-08 1995-10-11 Zeneca Ltd Dna constructs
ZA9811228B (en) * 1997-12-12 1999-06-14 Mogen Int New constitutive plant promoters
US6376747B1 (en) * 1999-08-27 2002-04-23 Her Majesty The Queen In Right Of Canada As Represented By The Minister Of Agriculture And Agri-Food Canada Plant-derived map kinase kinase
FR2815969B1 (fr) * 2000-10-30 2004-12-10 Aventis Cropscience Sa Plantes tolerantes aux herbicides par contournement de voie metabolique
KR100474115B1 (ko) * 2001-06-01 2005-03-08 대한민국 유전자변형식물에 대한 pcr 검정용 프라이머
US7847064B2 (en) * 2004-07-09 2010-12-07 Donald Danforth Plant Science Center Methods and compositions for regulating gene expression in plant cells
US7517689B2 (en) * 2004-07-09 2009-04-14 Donald Danforth Plant Science Center Methods and compositions for regulating gene expression in plant cells
US8065093B2 (en) * 2004-10-06 2011-11-22 Agency For Science, Technology, And Research Methods, systems, and compositions for classification, prognosis, and diagnosis of cancers

Also Published As

Publication number Publication date
US9085775B2 (en) 2015-07-21
AU2007341217A1 (en) 2008-07-10
BRPI0720641A8 (pt) 2017-12-19
HUE027484T2 (en) 2016-09-28
CN101617048A (zh) 2009-12-30
JP2014221040A (ja) 2014-11-27
EP2118291A1 (en) 2009-11-18
DK2118291T3 (en) 2015-08-31
NZ578518A (en) 2012-08-31
ES2546184T3 (es) 2015-09-21
CN101617048B (zh) 2012-11-07
CA2674170C (en) 2019-03-12
JP5913434B2 (ja) 2016-04-27
ITUD20060280A1 (it) 2008-06-30
KR20090102825A (ko) 2009-09-30
EP2118291B1 (en) 2015-06-03
CA2674170A1 (en) 2008-07-10
JP2010514432A (ja) 2010-05-06
PT2118291E (pt) 2015-09-24
KR101596229B1 (ko) 2016-03-07
CY1116649T1 (el) 2017-03-15
PL2118291T3 (pl) 2015-11-30
WO2008080954A1 (en) 2008-07-10
US20110041222A1 (en) 2011-02-17
BRPI0720641A2 (pt) 2014-03-18

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Egelkrout et al. Overproduction of recombinant proteins in plants
Desai et al. Production of heterologous proteins in plants: strategies for optimal expression
Hernandez-Garcia et al. High level transgenic expression of soybean (Glycine max) GmERF and Gmubi gene promoters isolated by a novel promoter analysis pipeline
DK2445928T3 (en) CHEMICAL INFLUENZA VIRUS-LIKE PARTICLES INCLUDING HEMAGGLUTIN
WO2005098004A2 (en) Inducible boost of integrated satellite rna viruses
EP3260542A1 (en) Protein production in plant cells
RU2009129091A (ru) Искусственная последовательность днк с оптимизированной лидерной функцией на 5 (5-utr) для улучшенной эспрессии гетерологичных белков в растениях
Greenham et al. Molecular strategies to engineer transgenic rice seed compartments for large-scale production of plant-made pharmaceuticals
JP2010514432A5 (ru)
CN102712929A (zh) 植物根特异表达启动子的鉴定和应用
CN103540592B (zh) 一种水稻胚乳特异性表达启动子及其应用
CN105061569A (zh) 一种与植物抗逆性相关的SiMYB107蛋白及其相关生物材料与应用
CN105820220A (zh) 抗逆相关蛋白及其编码基因在调控植物耐碱性中的应用
CN101684149B (zh) 一种羊草干旱诱导转录因子及其编码基因与应用
WO2001018192A2 (en) Synthetic vectors, transgenic plants containing them, and methods for obtaining them
Abdel-Ghany et al. Engineering of plants for the production of commercially important products: approaches and accomplishments
JP2006512067A (ja) 植物細胞においてdna配列を発現させるための人工プロモーター
CN103710344B (zh) 一种植物胚乳特异性表达启动子pENP2及其应用
Masood et al. Cloning and expression analysis of dhordein hybrid promoter isolated from barley (Hordeum vulgare L.)
Xie et al. Molecular cloning and characterization of an achene-seed-specific promoter from motherwort (Leonurus japonicus Houtt)
CN106674339A (zh) 蛋白质在调控植物抗逆性中的应用
US20130031664A1 (en) Regulatory region having increased expression and method of using same
CN105669847A (zh) 大豆蛋白GmVPS9a1在调控植物贮藏蛋白分选中的应用
Hajibehzad et al. Plant Molecular Pharming Methods, Tools, Challenges Ahead for Production of Recombinant Proteins, and Potential Solutions
CN105693834A (zh) 大豆蛋白GmVPS9a2在调控植物贮藏蛋白分选中的应用

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20131010