RU2007129672A - Биомаркеры для выявления эффективности тегасерода у пациентов с хроническим запором - Google Patents

Биомаркеры для выявления эффективности тегасерода у пациентов с хроническим запором Download PDF

Info

Publication number
RU2007129672A
RU2007129672A RU2007129672/15A RU2007129672A RU2007129672A RU 2007129672 A RU2007129672 A RU 2007129672A RU 2007129672/15 A RU2007129672/15 A RU 2007129672/15A RU 2007129672 A RU2007129672 A RU 2007129672A RU 2007129672 A RU2007129672 A RU 2007129672A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
gene
tegaserod
group
seq
chronic constipation
Prior art date
Application number
RU2007129672/15A
Other languages
English (en)
Inventor
ЛиАнне МАККЛИН (US)
ЛиАнне МАККЛИН
Original Assignee
Новартис АГ (CH)
Новартис Аг
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Новартис АГ (CH), Новартис Аг filed Critical Новартис АГ (CH)
Publication of RU2007129672A publication Critical patent/RU2007129672A/ru

Links

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/40—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having five-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom, e.g. sulpiride, succinimide, tolmetin, buflomedil
    • A61K31/403—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having five-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom, e.g. sulpiride, succinimide, tolmetin, buflomedil condensed with carbocyclic rings, e.g. carbazole
    • A61K31/404—Indoles, e.g. pindolol
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/711—Natural deoxyribonucleic acids, i.e. containing only 2'-deoxyriboses attached to adenine, guanine, cytosine or thymine and having 3'-5' phosphodiester links
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/10—Laxatives
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/14—Prodigestives, e.g. acids, enzymes, appetite stimulants, antidyspeptics, tonics, antiflatulents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P3/00—Drugs for disorders of the metabolism
    • A61P3/08—Drugs for disorders of the metabolism for glucose homeostasis
    • A61P3/10—Drugs for disorders of the metabolism for glucose homeostasis for hyperglycaemia, e.g. antidiabetics
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6827—Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/172—Haplotypes

Claims (16)

1. Применение тегасерода для получения лекарственного средства для лечения хронического запора у отобранных в группу пациентов, причем отбор пациентов проводился на основании генетических полиморфизмов в биомаркерных генах, имеющихся у пациента, причем генетические полиморфизмы являются показателем эффективности тегасерода в лечении хронического запора.
2. Способ определения реактивности индивидуума с желудочно-кишечным расстройством на лечение тегасеродом, включающий:
(а) определение для двух копий гена индивидуума идентичности нуклеотидной пары в полиморфном генетическом локусе, и
(б) отнесение индивидуума к «высоко отвечающей» группе, если нуклеотидная пара в полиморфном сайте в области гена указывает, что индивидуум способен отвечать на лечение тегасеродом при хроническом запоре.
3. Способ по п.2, в котором желудочно-кишечное расстройство выбрано из группы, включающей синдром раздраженной кишки с преобладанием запора (СРК-ПЗ), функциональную диспепсию, желудочно-пищеводный рефлюкс и диабетическую гастропатию.
4. Способ лечения хронического запора у субъекта, включающий стадии:
(а) определения генотипа субъекта в генетическом локусе, состоящем из одного или нескольких генов, являющихся показателями эффективности тегасерода в лечении хронического запора, в котором гены выбраны из группы, состоящей из гена рецептора 5-НТ4(HTR4), гена субъединицы В рецептора 5-НТ3(HTR3B), гена мотилина (MLN), гена водного канала аквапорина 3(AQP3), гена семейства растворимого носителя 12, представителя A2(SLC12A2), также называемого Na-K-Cl--котранспортером 1 (NKCC1, и гена альфа субъединицы не потенциал-зависимого натриевого канала, (SCNN1A), также называемой альфа субъединицей амилорид-чувствительного эпителиального натриевого канала (ENaC альфа), и
(б) либо (i) введения тегасерода субъекту, если генотип субъекта указывает на эффективность тегасерода в лечении хронического запора, либо (ii) применения по отношению к субъекту другой терапии, если генотип субъекта не указывает на эффективность тегасерода в лечении хронического запора.
5. Способ по п.4, в котором хронический запор является синдромом раздраженной кишки с преобладанием запора (СРК-ПЗ).
6. Способ по п.4, в котором ген HTR4 имеет последовательность, выбранную из группы, состоящей из нуклеотидных последовательностей SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 и SEQ ID NO: 6.
7. Способ по п.4, в котором ген HTR3B имеет последовательность, выбранную из группы, состоящей из нуклеотидных последовательностей SEQ ID NO: 7.
8. Способ по п.4, в котором ген MLN имеет последовательность, выбранную из группы, состоящей из нуклеотидных последовательностей SEQ ID NO: 8.
9. Способ по п.4, в котором ген AQP3 имеет последовательность, выбранную из группы, состоящей из нуклеотидных последовательностей SEQ ID NO: 9.
10. Способ по п.4, в котором ген SLC12A2 имеет последовательность, выбранную из группы, состоящей из нуклеотидных последовательностей SEQ ID NO: 10 и SEQ ID NO: 11.
11. Способ по п.4, в котором ген SCNN1A имеет последовательность, выбранную из группы, состоящей из нуклеотидных последовательностей SEQ ID NO: 12.
12. Способ лечения хронического запора у субъекта, включающий стадии:
(а) определения генотипа субъекта в генетическом локусе, состоящем из одного или нескольких генов, являющихся показателями эффективности тегасерода в лечении хронического запора, в котором гены выбраны из группы, состоящей из гена рецептора 5-НТ4(HTR4), гена субъединицы В рецептора 5-НТ3(HTR3B), гена мотилина (MLN), гена водного канала аквапорина 3(AQP3), гена семейства растворимого носителя 12, представителя А2(SLC12A2), также называемого Na-K-Cl--котранспортером 1(NKCC1), и гена альфа субъединицы не потенциал-зависимого натриевого канала (SCNN1A), также называемой альфа субъединицей амилорид-чувствительного эпителиального натриевого канала (ENaC альфа), гена триптофан гидроксилазы 1(ТРН1), и
(б) либо (i) введения тегасерода субъекту, если генотип субъекта указывает на эффективность тегасерода в лечении хронического запора, либо (ii) применения по отношению к субъекту другой терапии, если генотип субъекта не указывает на эффективность тегасерода в лечении хронического запора.
13. Способ по п.12, в котором хронический запор является синдром раздраженной кишки с преобладанием запора (СРК-ПЗ).
14. Способ по п.12, в котором ген ТРН1 имеет последовательность, выбранную из группы, включающей нуклеотидные последовательности SEQ ID NO: 13 и SEQ ID NO: 14.
15. Способ идентификации ассоциации между гаплотипом гена и особенностью желудочно-кишечного расстройства, предусматривающий сравнение частоты встречаемости гаплотипа в группе субъектов с желудочно-кишечными расстройствами с частотой гаплотипа в контрольной группе, в котором повышенная частота гаплотипа в группе субъектов с желудочно-кишечными расстройствами по сравнению с аналогичным показателем в контрольной группе свидетельствует, что гаплотип ассоциирован с желудочно-кишечными расстройством, причем гены выбраны из группы, состоящей из гена рецептора 5-НТ4(HTR4), гена субъединицы В рецептора 5-НТ3(HTR3B), гена мотилина (MLN), гена водного канала аквапорина 3(AQP3), гена семейства растворимого носителя 12, представителя А2(SLC12A2), также называемого Na-K-Cl--котранспортером 1(NKCC1), гена альфа субъединицы не потенциал-зависимого натриевого канала (SCNN1A), также называемой альфа субъединицей амилорид-чувствительного эпителиального натриевого канала (ENaC альфа), и гена триптофангидроксилазы 1(ТРН1).
16. Применение генного продукта гена, выбранного из группы, состоящей из гена рецептора 5-НТ4(HTR4), гена субъединицы В рецептора 5-НТ3(HTR3B), гена мотилина (MLN), гена водного канала аквапорина 3(AQP3), гена семейства растворимого носителя 12, представителя А2 (SLC12A2), также называемого Na-K-Cl--котранспортером 1(NKCC1), гена альфа субъединицы не потенциал-зависимого натриевого канала (SCNN1A), также называемой альфа субъединицей амилорид-чувствительного эпителиального натриевого канала (ENaC альфа), и гена триптофангидроксилазы 1(ТРН1) в качестве мишени для лекарственного средства, включающее стадии:
(а) контакта лекарственного средства с первым генным продуктом, кодируемым полинуклеотидом, содержащим нуклеотидную пару в полиморфном сайте в области выбранного гена, указывающего на высокую реактивность при лечении тегасеродом хронического запора,
(б) идентификации действия лекарственного средства на указанный первый генный продукт,
(в) контакта лекарственного средства со вторым генным продуктом, кодируемым полинуклеотидом, содержащим нуклеотидную пару в полиморфном сайте в области выбранного гена, указывающего на низкую реактивность при лечении тегасеродом хронического запора,
(г) идентификации действия лекарственного средства на указанный второй генный продукт,
(д) идентификации сходств и различий между активностью, выявляемой на стадии (б) и активностью, выявляемой на стадии (г).
RU2007129672/15A 2005-01-04 2006-01-03 Биомаркеры для выявления эффективности тегасерода у пациентов с хроническим запором RU2007129672A (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US64123805P 2005-01-04 2005-01-04
US60/641,238 2005-01-04

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2007129672A true RU2007129672A (ru) 2009-02-20

Family

ID=36648087

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2007129672/15A RU2007129672A (ru) 2005-01-04 2006-01-03 Биомаркеры для выявления эффективности тегасерода у пациентов с хроническим запором

Country Status (12)

Country Link
US (1) US20090118350A1 (ru)
EP (1) EP1835909A2 (ru)
JP (1) JP2008526775A (ru)
KR (1) KR20070111475A (ru)
CN (1) CN101132791A (ru)
AU (1) AU2006204146A1 (ru)
BR (1) BRPI0606369A2 (ru)
CA (1) CA2593695A1 (ru)
IL (1) IL184029A0 (ru)
MX (1) MX2007008159A (ru)
RU (1) RU2007129672A (ru)
WO (1) WO2006074127A2 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2671495C2 (ru) * 2012-05-08 2018-11-01 Аэромикс, Инк. Новые способы

Families Citing this family (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20080085524A1 (en) * 2006-08-15 2008-04-10 Prometheus Laboratories Inc. Methods for diagnosing irritable bowel syndrome
KR101952965B1 (ko) 2010-05-25 2019-02-27 더 리젠츠 오브 더 유니버시티 오브 캘리포니아 Ｂａｍｂａｍ：고처리율 서열분석 데이터의 병렬 비교 분석
US9646134B2 (en) 2010-05-25 2017-05-09 The Regents Of The University Of California Bambam: parallel comparative analysis of high-throughput sequencing data
US10950326B2 (en) 2013-08-19 2021-03-16 Cipherome, Inc. Method for personalized selection of a drug for a subject
WO2015069948A1 (en) 2013-11-06 2015-05-14 Aeromics, Llc Novel methods
KR101760246B1 (ko) 2015-04-01 2017-07-31 인제대학교 산학협력단 신규한 slco2b1 다형성 마커 및 이의 용도
US11227692B2 (en) * 2017-12-28 2022-01-18 International Business Machines Corporation Neuron model simulation
CN113797197B (zh) * 2021-09-17 2023-12-12 中国海洋大学 替加色罗或其药学上可接受的盐在药物转运中的应用

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE00941722T1 (de) * 1999-06-25 2004-04-15 Genaissance Pharmaceuticals Inc., New Haven Verfahren für erhaltung und anwendung von haplotype daten
GB0307440D0 (en) * 2003-03-31 2003-05-07 Novartis Ag Organic compounds

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2671495C2 (ru) * 2012-05-08 2018-11-01 Аэромикс, Инк. Новые способы

Also Published As

Publication number Publication date
EP1835909A2 (en) 2007-09-26
CA2593695A1 (en) 2006-07-13
KR20070111475A (ko) 2007-11-21
BRPI0606369A2 (pt) 2009-06-23
MX2007008159A (es) 2007-10-11
CN101132791A (zh) 2008-02-27
AU2006204146A1 (en) 2006-07-13
WO2006074127A2 (en) 2006-07-13
JP2008526775A (ja) 2008-07-24
US20090118350A1 (en) 2009-05-07
IL184029A0 (en) 2008-12-29
WO2006074127A3 (en) 2007-06-07

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2007129672A (ru) Биомаркеры для выявления эффективности тегасерода у пациентов с хроническим запором
US20190382347A1 (en) Use of quinoline derivatives for the treatment of inflammatory diseases
JP2008526775A5 (ru)
Malek et al. Il-31 does not correlate to pruritus related to early stage cutaneous T-cell lymphomas but is involved in pathogenesis of the disease
Sellebjerg et al. Identification of new sensitive biomarkers for the in vivo response to interferon‐β treatment in multiple sclerosis using DNA‐array evaluation
JP6445984B2 (ja) Ｗｎｔ阻害剤に関連するマーカー
US11136625B2 (en) Gene expression signatures predictive of subject response to a multi-kinase inhibitor and methods of using the same
JP2005532077A (ja) 腸型胃腫瘍の診断法
Dakouras et al. P53Arg72 homozygosity and its increased incidence in left-sided sporadic colorectal adenocarcinomas, in a Greek-Caucasian population
WO2016042114A1 (en) Cxcl14 as a biomarker of hedgehog pathway activity for the diagnosis, prognosis and treatment of idiopathic pulmonary fibrosis
EP3126521A1 (en) Hnf4g-rspo2 fusion gene and use thereof in treatment of cancer
US7575928B2 (en) Genes for diagnosing colorectal cancer
CN101988124A (zh) 巣式pcr法扩增egfr基因外显子19片段的方法
KR101914183B1 (ko) Tmem182 유전자 다형성을 이용한 복부비만의 예후 또는 위험도를 평가하는 방법 및 키트
Ye et al. Circulating microRNAs act as fingerprints in patients after acuteaneurysmal subarachnoid hemorrhage
WO2009018209A1 (en) ENDOTHELIN SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS AND METHODS OF PREDICTING β-ADRENERGIC RECEPTOR TARGETING AGENT EFFICACY
TWI527906B (zh) 檢測心房顫動之風險的方法
KR20190052522A (ko) Gpc3 단백질에 특이적으로 결합하는 dna 앱타머 및 이의 용도
KR101148755B1 (ko) 양극성 장애 진단용 ＳＮＰｓ 및 이를 이용하여 양극성 장애를 진단하는 방법
WO2011014872A2 (en) Compositions and methods for diagnosing, treating or preventing neoplasias
JP2011045285A (ja) 抗てんかん薬による薬疹発症の診断マーカー及び薬疹発症の診断方法
van Santvoort et al. 475n Minimally invasive step-up approach versus open necrosectomy in necrotizing pancreatitis: a randomized controlled multicenter trial
CN110938697A (zh) 一种肺癌gnaq突变基因及其检测引物和应用
JP2002514440A (ja) 酸化窒素シンターゼ遺伝子における多形
Heagerty Vascular damage in hypertension and diabetes

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20100402