RU2005140664A - Просматривающий мутагенез - Google Patents

Просматривающий мутагенез Download PDF

Info

Publication number
RU2005140664A
RU2005140664A RU2005140664/13A RU2005140664A RU2005140664A RU 2005140664 A RU2005140664 A RU 2005140664A RU 2005140664/13 A RU2005140664/13 A RU 2005140664/13A RU 2005140664 A RU2005140664 A RU 2005140664A RU 2005140664 A RU2005140664 A RU 2005140664A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
library
polypeptide
amino acid
polynucleotides
region
Prior art date
Application number
RU2005140664/13A
Other languages
English (en)
Inventor
Роберто КРЕА (US)
Роберто КРЕА
Original Assignee
Байорен, Инк. (Us)
Байорен, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Байорен, Инк. (Us), Байорен, Инк. filed Critical Байорен, Инк. (Us)
Publication of RU2005140664A publication Critical patent/RU2005140664A/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
    • C12N15/1093—General methods of preparing gene libraries, not provided for in other subgroups
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/005—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies constructed by phage libraries
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/12—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria
    • C07K16/1267—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria from Gram-positive bacteria
    • C07K16/1282—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria from Gram-positive bacteria from Clostridium (G)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/24—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against cytokines, lymphokines or interferons
    • C07K16/241—Tumor Necrosis Factors
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/44—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material not provided for elsewhere, e.g. haptens, metals, DNA, RNA, amino acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/102—Mutagenizing nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/55—Fab or Fab'
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/56—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
    • C07K2317/565—Complementarity determining region [CDR]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/60—Immunoglobulins specific features characterized by non-natural combinations of immunoglobulin fragments
    • C07K2317/62—Immunoglobulins specific features characterized by non-natural combinations of immunoglobulin fragments comprising only variable region components
    • C07K2317/622—Single chain antibody (scFv)
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
    • Y02P20/00—Technologies relating to chemical industry
    • Y02P20/50—Improvements relating to the production of bulk chemicals
    • Y02P20/582—Recycling of unreacted starting or intermediate materials

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
  • Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Claims (65)

1. Способ получения библиотеки полипептидных аналогов, в которых предопределенная аминокислота появляется в каждом положении в определенной области полипептида, включающий в себя
выбор определенной области в аминокислотной последовательности полипептида;
определение аминокислотного остатка, подлежащего замене, в каждом аминокислотном положении внутри определенной области;
синтез индивидуальных полинуклеотидов, кодирующих определенную область, где полинуклеотиды совместно представляют собой возможные варианты полинуклеотидов по следующим критериям:
i) каждый полинуклеотид содержит в каждом положении кодона в определенной области либо кодон, необходимый для аминокислотного остатка полипептида, либо кодон для предопределенного аминокислотного остатка, и
ii) каждый полинуклеотид содержит не более одного кодона для предопределенного аминокислотного остатка,
получение таким образом библиотеки полинуклеотидов, в которых предопределенный аминокислотный остаток появляется в положении каждой аминокислоты в определенной области.
2. Способ по п.1, где полинуклеотиды объединены вместе.
3. Способ по п.1, где две или более определенных областей в полипептиде подвергают мутагенезу.
4. Способ по п.3, где одну и ту же предопределенную аминокислоту выбирают для замены внутри каждой из двух или более определенных областей.
5. Способ по п.3, где для замены внутри каждой из двух или более определенных областей выбирают соответственно различные предопределенные аминокислоты.
6. Способ по п.1, где определенная область или определенные области включают в себя функциональный домен полипептида.
7. Способ по п.6, где функциональный домен выбирают из группы, состоящей из участка связывания антитела, каркасной области антитела, эффекторной области антитела, участка связывания рецептора и каталитического участка.
8. Способ по п.7, где участок связывания антитела или его часть включает в себя домен CDR, выбранный из группы, состоящей из CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5, CDR6 и их сочетаний.
9. Способ по п.7, где каркасная область антитела включает в себя домен, выбранный из группы, состоящей из FR1, FR2, FR3, FR4 и их сочетаний.
10. Способ по п.7, где эффекторная область антитела включает в себя домен, выбранный из группы, состоящей из участка связывания комплемента и области связывания Fc.
11. Способ по п.1, где предопределенный аминокислотный остаток выбирают из группы, состоящей из Ser, Thr, Asn, Gln, Tyr, Cys, His, Glu, Asp, Lys, Arg, Ala, Gly, Ile, Leu, Met, Phe, Pro, Trp и Val.
12. Способ по п.1, где определенная область включает в себя по меньшей мере приблизительно от 3 до 40 аминокислот.
13. Способ по п.12, где полинуклеотиды синтезируют в виде экспрессирующей библиотеки.
14. Способ по п.13, где полинуклеотиды синтезируют способами с применением ферментов.
15. Способ по п.14, где полинуклеотиды синтезируют с применением полимеразной цепной реакции.
16. Способ по п.13, где экспрессирующую библиотеку выбирают из группы, состоящей из библиотеки фагового дисплея, библиотеки рибосомного/полисомного дисплея, библиотеки дрожжевого дисплея, библиотеки бактериального дисплея и упорядоченной библиотеки.
17. Библиотека полипептидных аналогов, полученная способом по п.1.
18. Способ идентификации полипептида, имеющего желаемую структуру или функцию, включающий в себя
выбор определенной области аминокислотной последовательности полипептида;
определение аминокислотного остатка, подлежащего замене, в каждом аминокислотном положении внутри определенной области;
синтез полинуклеотидов, кодирующих определенную область, где полинуклеотиды совместно представляют собой возможные варианты полинуклеотидов в соответствии со следующими критериями:
i) каждый полинуклеотид содержит в каждом положении кодона в определенной области либо кодон, необходимый для синтеза аминокислотного остатка полипептида, либо кодон для одного из предопределенных аминокислотных остатков, и
ii) каждый полинуклеотид содержит не более одного кодона для предопределенного аминокислотного остатка,
получение таким образом экспрессирующей библиотеки, содержащей полинуклеотиды;
экспрессию экспрессирующей библиотеки для получения полипептидных аналогов; и
скрининг полипептидных аналогов для выбора полипептида, имеющего желаемую структуру или функцию.
19. Способ по п.18, где способ дополнительно включает в себя стадию идентификации полинуклеотида, кодирующего выбранный полипептидный аналог.
20. Способ по п.18, где скрининг включает в себя
приведение полипептида в контакт с субстратом-мишенью, ассоциацию полипептида с полинуклеотидом, кодирующим полипептид, включение дополнительно в состав полипептида детектируемого фрагмента, так чтобы определять вариант полипептида, способный связывать субстрат-мишень, и таким образом идентифицировать его как кодируемый полинуклеотидом.
21. Способ по п.20, где детектируемый фрагмент выбирают из группы, состоящей из флюоресцентного фрагмента, УФ-фрагмента и поглощающего видимый свет фрагмента.
22. Способ по п.20, где детектируемый фрагмент выбирают из группы, состоящей из биотинового фрагмента, фрагмента GST и фрагмента с His-меткой.
23. Способ по п.20, где полинуклеотид ассоциирован с полипептидным аналогом с применением рибосомного дисплея.
24. Способ по п.18, где две или более определенных областей в полипептиде подвергают мутагенезу.
25. Способ по п.24, где одну и ту же предопределенную аминокислоту выбирают для замены внутри каждой из двух или более определенных областей.
26. Способ по п.24, где для замены внутри каждой из двух или более определенных областей выбирают различные предопределенные аминокислоты.
27. Способ по п.18, где полипептид представляет собой одноцепочечное антитело (sFV).
28. Способ по п.18, где определенная область включает в себя функциональный домен полипептида.
29. Способ по п.18, где определенная область включает в себя CDR или ее часть, выбранную из группы, состоящей из CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5, CDR6 и их сочетаний.
30. Способ по п.18, где определенная область представляет собой каркасную область антитела, включающую в себя домен, выбранный из группы, состоящей из FR1, FR2, FR3, FR4 и их сочетаний.
31. Способ по п.18, где определенная область представляет собой эффекторную область антитела, включающую в себя домен, выбранный из группы, состоящей из участка связывания комплемента и области связывания Fc.
32. Способ по п.18, где предопределенный аминокислотный остаток выбирают из группы, состоящей из Ser, Thr, Asn, Gln, Tyr, Cys, His, Glu, Asp, Lys, Arg, Ala, Gly, Ile, Leu, Met, Phe, Pro, Trp и Val.
33. Библиотека полинуклеотидов, кодирующих полипептидные аналоги, включающие в себя одну или более определенных областей, где в каждом положении аминокислоты внутри определенной области заменен предопределенный аминокислотный остаток, где полинуклеотиды совместно представляют все возможные варианты в соответствии со следующими критериями:
i) каждый полинуклеотид содержит в каждом положении кодона в определенной области либо кодон, требуемый для аминокислотного остатка полипептида, либо кодон для предопределенного аминокислотного остатка, и
ii) каждый полинуклеотид содержит не более одного кодона для предопределенного аминокислотного остатка.
34. Библиотека по п.33, где две или более определенные области в полипептиде подвергают мутагенезу.
35. Библиотека по п.33, где для замены внутри каждой из двух или более определенных областей выбирают одну и ту же предопределенную аминокислоту.
36. Библиотека по п.33, где для замены внутри каждой из двух или более определенных областей выбирают различные предопределенные аминокислоты.
37. Библиотека по п.33, представляющая собой экспрессирующую библиотеку.
38. Библиотека по п.33, где экспрессирующую библиотеку выбирают из группы, состоящей из библиотеки фагового дисплея, библиотеки рибосомного/полисомного дисплея, библиотеки дрожжевого дисплея, библиотеки бактериального дисплея и упорядоченной библиотеки.
39. Библиотека по п.33, где полинуклеотиды дополнительно содержат один или несколько транскрипционных регуляторных элементов.
40. Библиотека по п.39, где полинуклеотиды при транскрипции и трансляции in vitro ассоциированы с полипептидами, кодируемыми соответствующими полинуклеотидами.
41. Библиотека по п.40, где полинуклеотиды ассоциированы с полипептидами с применением рибосомного/полисомного дисплея.
42. Библиотека по п.41, где полинуклеотиды содержат РНК.
43. Библиотека по п. 42, где полинуклеотиды дополнительно содержат детектируемый фрагмент.
44. Библиотека по п.43, где детектируемый фрагмент содержит флюоресцентный фрагмент.
45. Библиотека по п.33, содержащая по меньшей мере 106 различных полинуклеотидов.
46. Библиотека по п.33, содержащая по меньшей мере 45-1012 различных полинуклеотидов.
47. Библиотека по п.33, где полинуклеотид кодирует связывающий полипептид.
48. Библиотека по п. 47, где связывающий полипептид выбирают из группы, состоящей из вариабельной области тяжелой цепи (VH), вариабельной области легкой цепи (VL) и одноцепочечного антитела (sFv).
49. Библиотека по п.33, где полинуклеотид кодирует фермент.
50. Библиотека по п.33, где полинуклеотид кодирует ингибитор фермента.
51. Библиотека по п.33, где полинуклеотид кодирует каталитический полипептид.
52. Библиотека по п.33, иммобилизованная на твердой подложке.
53. Библиотека по п.33, где твердая подложка представляет собой микрочип.
54. Библиотека по п. 33, представляющая собой упорядоченную библиотеку.
55. Микрочип, содержащий упорядоченный массив иммобилизованных полинуклеотидов, соответствующий библиотеке по п. 33.
56. Полипептидный аналог, идентифицируемый на основании библиотеки по п.33, где полипептид связывается с молекулой-мишенью и содержит связывающую область, выбранную из группы, состоящей из вариабельной области тяжелой цепи (VH), вариабельной области легкой цепи (VL) и одноцепочечного антитела (sFv).
57. Молекула по п.56, где специфическая молекула-мишень представляет собой TNFα.
58. Молекула по п.56, где полипептид по меньшей мере на 70% идентичен аминокислотной последовательности SEQ ID № 1, 2, 3, 4, 5 или 6.
59. Способ идентификации подгруппы полипептидных аналогов, имеющих желаемую структуру или функцию, включающий в себя
выбор определенной области аминокислотной последовательности полипептида;
определение аминокислотного остатка, подлежащего замене, в каждом аминокислотном положении внутри определенной области;
синтез полинуклеотидов, кодирующих определенную область, причем указанные выше полинуклеотиды совместно представляют собой возможные варианты полинуклеотидов по следующим критериям:
i) каждый полинуклеотид содержит в каждом положении кодона в определенной области либо кодон, необходимый для синтеза аминокислотного остатка полипептида, либо кодон для предопределенного аминокислотного остатка, и
ii) каждый полинуклеотид содержит не более одного кодона для предопределенного аминокислотного остатка,
получение таким образом экспрессирующей библиотеки, содержащей полинуклеотиды;
инкубацию экспрессирующей библиотеки в условиях, при которых библиотека экспрессируется;
скрининг экспрессированной библиотеки для идентификации полипептида, имеющего желаемую структуру или функцию;
сравнение структуры или функции полипептида по отношению к контрольному критерию, где полипептид, соответствующий контрольному критерию или превышающий его, классифицируют как реагирующий, а полипептид, не удовлетворяющий контрольному критерию, классифицируют как не реагирующий;
классификацию в базе данных на реагирующие и не реагирующие; и
обращение к базе данных для определения последовательности подгруппы полипептидов, подлежащих синтезу.
60. Способ по п.59, где одну или более указанных выше стадий проводят с применением компьютера.
61. Способ по п.59, где контрольный критерий выбирают из группы, состоящей из аффинности связывания, стабильности и эффекторной функции.
62. Способ по п.59, где контрольный критерий представляет собой каталитическую активность на специфическом субстрате.
63. Способ по п.59, где полипептид выбирают из группы, состоящей из вариабельной области тяжелой цепи (VH), вариабельной области легкой цепи (VL) и одноцепочечного антитела (sFv).
64. Носитель информации, пригодный для применения в электронном устройстве, содержащий инструкции для проведения одной или нескольких стадий способа по п.59.
65. Устройство для проведения одной или нескольких стадий способа по п.59.
RU2005140664/13A 2003-06-27 2004-06-25 Просматривающий мутагенез RU2005140664A (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US48328203P 2003-06-27 2003-06-27
US60/483,282 2003-06-27

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2005140664A true RU2005140664A (ru) 2007-08-27

Family

ID=33563915

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2005140664/13A RU2005140664A (ru) 2003-06-27 2004-06-25 Просматривающий мутагенез

Country Status (14)

Country Link
US (1) US20050136428A1 (ru)
EP (1) EP1660655B1 (ru)
JP (2) JP4791960B2 (ru)
KR (1) KR20060034650A (ru)
CN (1) CN1836041A (ru)
AU (1) AU2004254352A1 (ru)
BR (1) BRPI0412007A (ru)
CA (1) CA2542192C (ru)
ES (1) ES2609102T3 (ru)
IL (1) IL172736A0 (ru)
NO (1) NO20060108L (ru)
RU (1) RU2005140664A (ru)
WO (1) WO2005003345A2 (ru)
ZA (1) ZA200510460B (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2748231C2 (ru) * 2016-01-08 2021-05-21 Момотаро-Джин Инк. Комбинированная терапия с использованием гена reic/dkk-3 и ингибитора контрольной точки иммунного ответа

Families Citing this family (53)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7329725B1 (en) * 2003-10-29 2008-02-12 Nastech Pharmaceutical Company Inc. Phage displayed Trp cage ligands
ES2372503T3 (es) * 2004-07-06 2012-01-20 Bioren, Inc. Mutagénesis revisada para desarrollar polipéptidos alterados con propiedades potenciadas.
JP5143551B2 (ja) 2004-07-06 2013-02-13 バイオレン，インク． ユニバーサル抗体のライブラリー
BRPI0511448A (pt) * 2004-07-06 2007-12-26 Bioren Inc anticorpos anti-tnf-alfa de alta afinidade, método para a geração dos mesmos e biblioteca de seqüências
US20060234303A1 (en) * 2005-03-03 2006-10-19 Xencor, Inc. Methods for the design of libraries of protein variants
US20080207467A1 (en) * 2005-03-03 2008-08-28 Xencor, Inc. Methods for the design of libraries of protein variants
US20090215639A1 (en) * 2005-04-26 2009-08-27 Bioren, Inc. Method of Producing Human IgG Antibodies with Enhanced Effector Functions
CA2619244A1 (en) * 2005-08-15 2007-02-22 Arana Therapeutics Limited Engineered antibodies with new world primate framework regions
JP2009515516A (ja) * 2005-11-14 2009-04-16 バイオレン・インク 推定成熟ｃｄｒのブラスティングならびにコホートライブラリの作製およびスクリーニングによる抗体の超ヒト化
WO2007086994A1 (en) * 2005-11-15 2007-08-02 Balyasnikova Irina V Single chain fragment of monoclonal antibody 9b9 and uses thereof
WO2007070948A1 (en) 2005-12-20 2007-06-28 Arana Therapeutics Limited Anti-inflammatory dab
JP5259423B2 (ja) 2006-02-01 2013-08-07 セファロン・オーストラリア・ピーティーワイ・リミテッド ドメイン抗体構築物
US7704953B2 (en) * 2006-02-17 2010-04-27 Mdrna, Inc. Phage displayed cell binding peptides
US20070224627A1 (en) * 2006-03-23 2007-09-27 Lawrence Horowitz Facilitation of translocation of molecules through the gastrointestinal tract
US20080014205A1 (en) 2006-05-15 2008-01-17 Lawrence Horowitz Neutralizing Antibodies to Influenza Viruses
WO2007136840A2 (en) * 2006-05-20 2007-11-29 Codon Devices, Inc. Nucleic acid library design and assembly
CA2666599A1 (en) 2006-08-18 2008-02-21 Ablynx N.V. Amino acid sequences directed against il-6r and polypeptides comprising the same for the treatment of diseases and disorders associated with il-6-mediated signalling
US8131480B2 (en) * 2006-10-02 2012-03-06 Sea Lane Biotechnologies Llc Construction of diverse synthetic peptide and polypeptide libraries
EP2078077A2 (en) * 2006-10-04 2009-07-15 Codon Devices, Inc Nucleic acid libraries and their design and assembly
CN101784662B (zh) * 2007-06-06 2014-11-05 丹尼斯科美国公司 用于改善蛋白质特性的方法
WO2009009045A2 (en) * 2007-07-10 2009-01-15 The Scripps Research Institute Escape libraries of target polypeptides
US8680019B2 (en) * 2007-08-10 2014-03-25 Protelica, Inc. Universal fibronectin Type III binding-domain libraries
US8470966B2 (en) 2007-08-10 2013-06-25 Protelica, Inc. Universal fibronectin type III binding-domain libraries
AU2008287426B2 (en) * 2007-08-10 2014-06-26 Protelica, Inc. Universal fibronectin type III binding-domain libraries
BRPI0819656A2 (pt) 2007-11-27 2015-06-23 Ablynx Nv Seqüências de aminoácidos contras citocinas heterodiméricas e/ou seus receptores e polipeptídeos compreendendo as mesmas
CA2719201A1 (en) 2008-03-28 2009-10-01 Sea Lane Biotechnologies, Llc. Neutralizing molecules to viral antigens
EP2131245A3 (en) * 2008-06-02 2012-08-01 ASML Netherlands BV Lithographic apparatus and its focus determination method
EP2417162A2 (en) 2009-04-10 2012-02-15 Ablynx N.V. Improved amino acid sequences directed against il-6r and polypeptides comprising the same for the treatment of il-6r related diseases and disorders
CN102388069B (zh) 2009-04-10 2016-01-20 埃博灵克斯股份有限公司 用于治疗il-6r相关疾病和病症的改进的针对il-6r的氨基酸序列和包含其的多肽
RU2016103067A (ru) 2009-06-05 2018-11-20 Аблинкс Нв Улучшенные аминокислотные последовательности, направленные против респираторно-синцитиального вируса человека (hrsv), и полипептиды, включающие такие последовательности, для профилактики и/или лечения инфекций дыхательных путей
DK3406717T3 (da) * 2009-07-17 2020-03-16 Bioatla Llc Samtidig, integreret udvælgelse og udvikling af antistof/protein- performance og ekspression hos produktionsværter
GB0914691D0 (en) * 2009-08-21 2009-09-30 Lonza Biologics Plc Immunoglobulin variants
ES2691717T3 (es) 2009-10-30 2018-11-28 Novartis Ag Bibliotecas universales del dominio de unión del lado inferior de tipo iii de la fibronectina de tipo III
US9644022B2 (en) 2009-11-30 2017-05-09 Ablynx N.V. Amino acid sequences directed against human respiratory syncytial virus (HRSV) and polypeptides comprising the same for the prevention and/or treatment of respiratory tract infections
KR20130136443A (ko) 2010-07-30 2013-12-12 노파르티스 아게 피브로넥틴 크레이들 분자 및 그의 라이브러리
WO2012074029A1 (ja) 2010-12-01 2012-06-07 田辺三菱製薬株式会社 無細胞翻訳系でFabを提示しうるポリヌクレオチド構築物ならびにそれを用いたFabの製造方法およびスクリーニング方法
EP3311837A1 (en) 2011-09-23 2018-04-25 Ablynx NV Prolonged inhibition of interleukin-6 mediated signaling
US10072098B2 (en) 2012-03-02 2018-09-11 Ablynx N.V. Pseudomonas aeruginosa PCRV binding single variable domain antibodies
WO2013158217A1 (en) * 2012-04-20 2013-10-24 Thomas Jefferson University Engineered antibody for inhibition of fibrosis
ES2741723T5 (es) * 2012-05-25 2023-01-23 Chr Hansen As Variantes de quimosina con propiedades mejoradas de coagulación de leche
WO2014087010A1 (en) 2012-12-07 2014-06-12 Ablynx N.V. IMPROVED POLYPEPTIDES DIRECTED AGAINST IgE
CN104955961B (zh) * 2012-12-11 2017-03-08 塞勒密斯株式会社 利用密码子随机化和诱变来合成基因文库的方法
US20140314741A1 (en) * 2013-04-18 2014-10-23 Developmen Center For Biotechnology Human Antibody against Interleukin-20 and Treatment for Inflammatory Diseases
EP3062818B1 (en) * 2013-11-01 2019-09-11 IBC Pharmaceuticals, Inc. Bispecific antibodies that neutralize both tnf-alpha and il-6: novel therapeutic agent for autoimmune disease
CN104805507B (zh) * 2014-01-29 2019-01-22 杭州康万达医药科技有限公司 噬菌体展示文库及其应用和制备方法
UA121380C2 (uk) 2014-02-26 2020-05-25 Кр. Гансен А/С Поліпептид хімозину з удосконаленими властивостями щодо згортання молока
AU2015334984A1 (en) 2014-10-21 2017-04-13 Ablynx Nv Treatment of IL-6R related diseases
JP6856551B2 (ja) 2015-06-22 2021-04-07 セーホーエル．ハンセン アクティーゼルスカブ 改善された特性を有するキモシン変異体
EP3344049A1 (en) 2015-08-31 2018-07-11 Chr. Hansen A/S Variants of chymosin with improved properties
CN109640677A (zh) 2016-05-19 2019-04-16 科·汉森有限公司 具有改善的凝乳特性的凝乳酶的变体
AU2017267273B2 (en) 2016-05-19 2021-10-21 Chr. Hansen A/S Variants of Chymosin with improved milk-clotting properties
CN109843922B (zh) 2016-09-02 2023-10-03 莱蒂恩技术公司 用DuoCAR治疗癌症的组合物和方法
US11891426B2 (en) 2017-12-15 2024-02-06 Aleta Biotherapeutics Inc. CD19 variants

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0527809B1 (en) * 1990-04-05 1995-08-16 CREA, Roberto Walk-through mutagenesis
JPH09509835A (ja) * 1994-03-04 1997-10-07 メルク エンド カンパニー インコーポレーテッド アラニン走査型突然変異誘発によるｉｎ ｖｉｔｒｏ抗体アフィニティー成熟
JP2003516755A (ja) * 1999-12-15 2003-05-20 ジェネンテック・インコーポレーテッド ショットガン走査、すなわち機能性タンパク質エピトープをマッピングするための組み合わせ方法

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2748231C2 (ru) * 2016-01-08 2021-05-21 Момотаро-Джин Инк. Комбинированная терапия с использованием гена reic/dkk-3 и ингибитора контрольной точки иммунного ответа
RU2767997C2 (ru) * 2016-01-08 2022-03-22 Момотаро-Джин Инк. КОМБИНИРОВАННАЯ ТЕРАПИЯ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ГЕНА REIC/Dkk-3 И ИНГИБИТОРА КОНТРОЛЬНОЙ ТОЧКИ ИММУННОГО ОТВЕТА

Also Published As

Publication number Publication date
CA2542192A1 (en) 2005-01-13
JP2011182794A (ja) 2011-09-22
JP5358604B2 (ja) 2013-12-04
KR20060034650A (ko) 2006-04-24
JP4791960B2 (ja) 2011-10-12
CA2542192C (en) 2013-05-28
CN1836041A (zh) 2006-09-20
EP1660655B1 (en) 2016-11-02
WO2005003345A2 (en) 2005-01-13
NO20060108L (no) 2006-03-24
JP2007524390A (ja) 2007-08-30
ES2609102T3 (es) 2017-04-18
US20050136428A1 (en) 2005-06-23
BRPI0412007A (pt) 2006-08-15
EP1660655A2 (en) 2006-05-31
IL172736A0 (en) 2006-04-10
ZA200510460B (en) 2006-11-29
AU2004254352A1 (en) 2005-01-13
WO2005003345A3 (en) 2005-03-24

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2005140664A (ru) Просматривающий мутагенез
CA2572917A1 (en) Look-through mutagenesis for developing altered polypeptides with enhanced properties
JP2011182794A5 (ru)
Li et al. Minimization of a polypeptide hormone
Goldman et al. Selection of phage displayed peptides for the detection of 2, 4, 6-trinitrotoluene in seawater
US7223547B2 (en) Polypeptides having a functional domain of interest and methods of identifying and using same
Hsu et al. Selective deamidation of recombinant human stem cell factor during in vitro aging: isolation and characterization of the aspartyl and isoaspartyl homodimers and heterodimers
JP2008173124A (ja) Ｗｗドメインを有する新規ポリペプチドの同定と単離およびその利用方法
Lee et al. Accurate MALDI-TOF/TOF Sequencing of One-Bead− One-Compound Peptide Libraries with Application to the Identification of Multiligand Protein Affinity Agents Using in Situ Click Chemistry Screening
JP2008506960A5 (ru)
RU2016149596A (ru) Новые полипептиды со специфическим связыванием и пути их применения
US20160054331A1 (en) Method for the detection and/or enrichment of analyte proteins and/or analyte peptides from a complex protein mixture
CA3120102A1 (en) Engineered cd25 polypeptides and uses thereof
Erdjument‐Bromage et al. High‐Sensitivity sequencing of large proteins: Partial structure of the rapamycin‐fkbp12 target
Suzuki et al. Anti-survivin single-domain antibodies derived from an artificial library including three synthetic random regions by in vitro selection using cDNA display
Pellegrini et al. Mapping the subsite preferences of protein tyrosine phosphatase PTP-1B using combinatorial chemistry approaches
US7091046B2 (en) Multiplexed protein expression and activity assay
US20090233812A1 (en) Target recognizing binding agents
WO2014152660A1 (en) Engineered antibody scaffolds
Zhao et al. A paradigm for drug discovery using a conformation from the crystal structure of a presentation scaffold
CN114555642A (zh) 提升抗体对于抗原的亲和性的方法及其利用
CN105399805B (zh) 木瓜功能着丝粒抗原多肽及其应用
Li et al. A rare monoclonal antibody discovery based on indirect competitive screening of a single hapten-specific rabbit antibody secreting cell
Napolitano et al. Glubodies: randomized libraries of glutathione transferase enzymes
Venegas et al. Reagents for detecting phosphosites within proteins

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20071009