RU2003129062A - Модифицированный протамин с уменьшенной иммуногенностью - Google Patents
Модифицированный протамин с уменьшенной иммуногенностью Download PDFInfo
- Publication number
- RU2003129062A RU2003129062A RU2003129062/15A RU2003129062A RU2003129062A RU 2003129062 A RU2003129062 A RU 2003129062A RU 2003129062/15 A RU2003129062/15 A RU 2003129062/15A RU 2003129062 A RU2003129062 A RU 2003129062A RU 2003129062 A RU2003129062 A RU 2003129062A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- amino acid
- molecule
- peptide
- modified
- acid residues
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P3/00—Drugs for disorders of the metabolism
- A61P3/08—Drugs for disorders of the metabolism for glucose homeostasis
- A61P3/10—Drugs for disorders of the metabolism for glucose homeostasis for hyperglycaemia, e.g. antidiabetics
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Diabetes (AREA)
- Zoology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Endocrinology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Hematology (AREA)
- Obesity (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Emergency Medicine (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
Claims (31)
1. Модифицированная молекула, обладающая биологической активностью протамина лосося и являющаяся существенно неиммуногенной или менее иммуногенной, чем любая немодифицированная молекула, которая имеет такую же биологическую активность при использовании in vivo.
2. Молекула по п.1, в которой указанная потеря иммуногенности достигается путем удаления одного или более эпитопов Т-клеток, имеющих происхождение от исходно немодифицированной молекулы.
3. Молекула по п.1 или 2, в которой указанная потеря иммуногенности достигается путем уменьшения числа аллотипов МНС, способных связывать пептиды, имеющие происхождение от указанной молекулы.
4. Молекула по п.2 или 3, в которой удален один эпитоп Т-клеток.
5. Молекула по любому из пп.2-4, в которой указанные изначально присутствующие эпитопы Т-клеток являются лигандами МНС класса II или пептидными последовательностями, которые демонстрируют способность стимулировать или связывать Т-клетки через презентацию на классе II.
6. Молекула по п.5, в которой указанные пептидные последовательности выбраны из группы, как представлено в таблице 1.
7. Молекула по любому из пп.2-6, в которой 1-9 аминокислотных остатков в любом из исходно присутствующих эпитопов Т-клеток изменены.
8. Молекула по п.7, в которой один аминокислотный остаток изменен.
9. Молекула по п.7 или 8, в которой изменение аминокислотных остатков представляет собой замену исходно присутствующего(их) аминокислотного(ных) остатка(ков) другим(ими) аминокислотным(ыми) остатком(ами) в специфическом(их) положении(ях).
10. Молекула по п.9, в которой одна или более замен аминокислотных остатков выполнены так, как показано в таблице 2.
11. Молекула по п.10, в которой дополнительно одна или более замен аминокислотных остатков выполнены так, как показано в таблице 3, для уменьшения числа аллотипов МНС, способных связывать пептиды, имеющие происхождение от указанной молекулы.
12. Молекула по п.9, в которой одна или более аминокислотных замен выполнены так, как показано в таблице 3.
13. Молекула по п.7 или 8, в которой изменение аминокислотных остатков представляет собой делецию исходно присутствующего(их) аминокислотного(ных) остатка(ов) в специфическом(их) положении(ях).
14. Молекула по п.7 или 8, в которой изменение аминокислотных остатков представляет собой добавление аминокислоты(от) в специфическом(их) положении(ях) к тем, что изначально присутствуют.
15. Молекула по любому из пп.7-14, в которой также дополнительно создают изменение для того, чтобы восстановить биологическую активность указанной молекулы.
16. Молекула по п.15, в которой дополнительное изменение представляет собой замену, добавление или делецию специфической аминокислоты(от).
17. Модифицированная молекула по любому из пп.7-16, в которой изменение аминокислоты сделано в соответствии с гомологичной белковой последовательностью.
18. Модифицированная молекула по любому из пп.7-16, в которой изменение аминокислоты сделано в соответствии со способами моделирования in silico.
19. Модифицированная молекула по любому из пп.1-17, которая была модифицирована в положениях 12 и/или 20 и/или 28, считая от N-конца.
20. Последовательность ДНК, кодирующая модифицированный протамин, по любому из пп.1-19.
21. Фармацевтическая композиция, содержащая модифицированную молекулу, обладающую биологической активностью протамина, как определено в любом из приведенных выше пунктов, необязательно вместе с фармацевтически приемлемым носителем, разбавителем или наполнителем.
22. Способ производства модифицированной молекулы, обладающей биологической активностью протамина, как определено в любом из приведенных выше пунктов, который включает следующие стадии:
(i) определение аминокислотной последовательности полипептида или его части;
(ii) идентификацию одного или более потенциальных эпитопов Т-клеток в пределах аминокислотной последовательности белка с помощью любого способа, предполагающего определение связывания пептидов с молекулами МНС при использовании способов in vitro или in silico или биологических анализов;
(iii) разработку новых вариантов последовательностей с одной или более аминокислотами в пределах идентифицированных потенциальных эпитопов Т-клеток, модифицированных таким образом для существенного уменьшения или устранения активности Т-клеточного эпитопа, как определено путем связывания пептидов с молекулами МНС при использовании способов in vitro или in silico или биологических анализов, или путем связывания комплексов пептид-МНС с Т-клетками;
(iv) конструирование таких вариантов последовательностей с помощью способов рекомбинантной ДНК и тестирование указанных вариантов для того, чтобы идентифицировать один или более вариантов с желаемыми свойствами; и
(v) необязательное повторение стадий (ii)-(iv).
23. Способ по п.22, в котором стадию (iii) выполняют путем замены, добавления или делеции 1-9 аминокислотных остатков в любом из первоначально присутствующих эпитопов Т-клеток.
24. Способ по п.23, в котором изменение выполняют в соответствии с гомологичной белковой последовательностью и/или способами моделирования in sili со.
25. Способ по любому из пп.22-24, в котором стадию (ii) выполняют с помощью следующих этапов: (а) отбор участка пептида, имеющего известную последовательность аминокислотных остатков; (b) последовательный отбор перекрывающихся сегментов аминокислотных остатков с предварительно определенным одинаковым размером и состоящих, по крайней мере, из трех аминокислотных остатков выбранного участка; (с) подсчет значения связывания молекулы МНС класса II для каждого указанного выборочного сегмента путем суммирования определенных значений для каждой гидрофобной аминокислотной боковой цепи, которая присутствует в указанном дискретном сегменте аминокислотного остатка; и (d) идентификация, по крайней мере, одного из указанных сегментов, подходящих для модификации, основываясь на подсчитанном значении связывания молекулы МНС класса II для этого сегмента для изменения общего значения связывания МНС класса II для пептида, без существенного уменьшения терапевтической полезности пептида.
26. Способ по п.25, в котором этап (с) выполняют при использовании счетной функции Bohm, модифицированной для включения 12-6 составляющей отталкивания энергии комплекса лиганд-белок Ван-дер-Ваальса и составляющей конформационной энергии лиганда путем (1) обеспечения первой базы данных моделей молекулы МНС класса II; (2) обеспечения второй базы данных возможного пептидного скелета для указанных моделей молекул МНС класса II; (3) отбора модели из указанной первой базы данных; (4) отбора возможного пептидного скелета из указанной второй базы данных; (5) идентификации боковых цепей аминокислотных остатков, которые присутствуют в каждом выборочном сегменте; (6) определения значения связывающего сродства для всех боковых цепей, которые присутствуют в каждом выборочном сегменте; и повторения этапов от (1) до (5) для каждой указанной модели и каждого указанного скелета.
27. Тринадцатимерный пептид эпитопа Т-клеток, имеющий потенциальную связывающую активность МНС класса II и созданный из немодифицированного протамина, выбранный из группы, как показано в таблице 1.
28. Пептидная последовательность, состоящая, по крайней мере, из 9 последовательных аминокислотных остатков тринадцатимерного пептида эпитопа Т-клеток по п.27.
29. Применение тринадцатимерного пептидного эпитопа Т-клеток в соответствии с п.27 для производства протамина, который существенно не имеет иммуногенности или имеет меньшую иммуногенность, чем любая немодифицированная молекула с той же биологической активностью, при использовании in vivo.
30. Применение пептидной последовательности по п.28 для производства протамина, который существенно не имеет иммуногенности или имеет меньшую иммуногенность, чем любая немодифицированная молекула с той же биологической активностью, при использовании in vivo.
31. Модифицированная молекула, обладающая биологической активностью протамина лосося и являющаяся существенно неиммуногенной или менее иммуногенной, чем любая немодифицированная молекула, которая имеет такую же биологическую активность при использовании in vivo, указанная молекула состоит из аминокислотной формулы
MPRRRRSSSRPX1RRRRPRX2RRRRRRX3GRRRR,
в которой X1 и/или X2=V, А, С, D, Е, G, Н, К, N, P, Q, R, S, Т и/или X3=G, Т, где одновременно X1=V и X2=V и X3=G исключены.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| EP01105778 | 2001-03-08 | ||
| EP01105778.3 | 2001-03-08 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2003129062A true RU2003129062A (ru) | 2005-04-10 |
Family
ID=8176722
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2003129062/15A RU2003129062A (ru) | 2001-03-08 | 2002-03-01 | Модифицированный протамин с уменьшенной иммуногенностью |
Country Status (12)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20040121443A1 (ru) |
| EP (1) | EP1411969A1 (ru) |
| JP (1) | JP2004520836A (ru) |
| KR (1) | KR20030082961A (ru) |
| CN (1) | CN1494430A (ru) |
| BR (1) | BR0207905A (ru) |
| CA (1) | CA2439929A1 (ru) |
| HU (1) | HUP0303430A3 (ru) |
| PL (1) | PL362699A1 (ru) |
| RU (1) | RU2003129062A (ru) |
| WO (1) | WO2002069997A1 (ru) |
| ZA (1) | ZA200307831B (ru) |
Families Citing this family (10)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20090010966A1 (en) * | 2007-06-21 | 2009-01-08 | Angelica Therapeutics, Inc. | Modified diphtheria toxins |
| US20090163437A1 (en) * | 2007-10-16 | 2009-06-25 | Regado Biosciences, Inc. | Steady-state subcutaneous administration of aptamers |
| EP2268297A4 (en) * | 2008-02-29 | 2011-11-16 | Angelica Therapeutics Inc | MODIFIED TOXINS |
| AU2010256511B2 (en) | 2009-06-03 | 2016-01-14 | Tobira Therapeutics, Inc. | Nucleic acid modulators of glycoprotein VI |
| WO2011034583A2 (en) | 2009-09-16 | 2011-03-24 | Duke University | Inhibition of endosomal toll-like receptor activation |
| US20120095085A1 (en) | 2010-10-14 | 2012-04-19 | Layzer Juliana M | Nucleic acid modulators of clec-2 |
| AU2012231268B2 (en) | 2011-03-18 | 2017-02-02 | Duke University | Peptides for suppressing inflammation |
| US9303063B2 (en) | 2011-03-18 | 2016-04-05 | Duke University | Peptide compounds for suppressing inflammation |
| CN102993290B (zh) * | 2012-12-12 | 2014-10-01 | 青岛亚博生物科技有限公司 | 反胶团法分离萃取鱼精蛋白 |
| US10059750B2 (en) | 2013-03-15 | 2018-08-28 | Angelica Therapeutics, Inc. | Modified toxins |
Family Cites Families (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2685424B2 (ja) * | 1995-03-13 | 1997-12-03 | 日本水産株式会社 | プロタミンの製造方法 |
| US6624141B1 (en) * | 1999-03-17 | 2003-09-23 | The Regents Of The University Of Michigan | Protamine fragment compositions and methods of use |
-
2002
- 2002-03-01 PL PL02362699A patent/PL362699A1/xx unknown
- 2002-03-01 HU HU0303430A patent/HUP0303430A3/hu unknown
- 2002-03-01 JP JP2002569170A patent/JP2004520836A/ja not_active Withdrawn
- 2002-03-01 CN CNA028060652A patent/CN1494430A/zh active Pending
- 2002-03-01 CA CA002439929A patent/CA2439929A1/en not_active Abandoned
- 2002-03-01 EP EP02708339A patent/EP1411969A1/en not_active Withdrawn
- 2002-03-01 US US10/471,074 patent/US20040121443A1/en not_active Abandoned
- 2002-03-01 KR KR10-2003-7011660A patent/KR20030082961A/ko not_active Application Discontinuation
- 2002-03-01 RU RU2003129062/15A patent/RU2003129062A/ru not_active Application Discontinuation
- 2002-03-01 WO PCT/EP2002/002241 patent/WO2002069997A1/en not_active Application Discontinuation
- 2002-03-01 BR BR0207905-4A patent/BR0207905A/pt not_active IP Right Cessation
-
2003
- 2003-10-07 ZA ZA200307831A patent/ZA200307831B/en unknown
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO2002069997A1 (en) | 2002-09-12 |
| JP2004520836A (ja) | 2004-07-15 |
| CN1494430A (zh) | 2004-05-05 |
| CA2439929A1 (en) | 2002-09-12 |
| BR0207905A (pt) | 2004-07-27 |
| HUP0303430A2 (hu) | 2004-01-28 |
| ZA200307831B (en) | 2004-07-21 |
| US20040121443A1 (en) | 2004-06-24 |
| EP1411969A1 (en) | 2004-04-28 |
| KR20030082961A (ko) | 2003-10-23 |
| PL362699A1 (en) | 2004-11-02 |
| HUP0303430A3 (en) | 2005-11-28 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2004110239A (ru) | Модифицированный фактор ix | |
| RU2003125637A (ru) | Модифицированный нейтрофический фактор выделенный из мозга человека (bdnf) с уменьшенной иммуногенностью | |
| RU2003127410A (ru) | Модифицированные анти egpr антитела с уменьшенной иммуногенностью | |
| RU2003129072A (ru) | Модифицированный интерферон бета с уменьшенной иммуногенностью | |
| Vasquez et al. | Computed conformational states of the 20 naturally occurring amino acid residues and of the prototype residue α-aminobutyric acid | |
| Stawikowski et al. | Introduction to peptide synthesis | |
| Sternberg et al. | On the conformation of proteins: the handedness of the β-strand-α-helix-β-strand unit | |
| Johnson et al. | Molecular anatomy: phyletic relationships derived from three-dimensional structures of proteins | |
| KR100899970B1 (ko) | Ｔ-세포 에피토프의 동정 방법 및 감소된 면역원성을 갖는분자의 제조를 위한 용도 | |
| RU2003125638A (ru) | Модифицированный лептин с уменьшенной иммуногенностью | |
| Kochoyan et al. | Alternating zinc fingers in the human male associated protein ZFY: 2D NMR structure of an even finger and implications for jumping-linker DNA recognition | |
| RU2003125654A (ru) | Модифицированный эритропоэтин (еро) с уменьшенной иммуногенностью | |
| RU2014118461A (ru) | Модуляция специфичности структурированных белков | |
| RU2003129062A (ru) | Модифицированный протамин с уменьшенной иммуногенностью | |
| RU2003125640A (ru) | Модифицированный антагонист рецептора интерлейкина 1 (1l-1ra) с уменьшенной иммуногенностью | |
| RU2003129056A (ru) | Модифицированный интерферон альфа с уменьшенной иммуногенностью | |
| RU2003129069A (ru) | Модифицированный цилиарный нейротрофический фактор (cntf) с уменьшенной иммуногенностью | |
| RU2003129058A (ru) | Модифицированный колониестимулирующий гранулоцитарно-макрофагальный фактор (gm-csf) с уменьшенной иммуногенностью | |
| Gō | Protein structures and split genes | |
| RU2004133761A (ru) | Модифицированный фактор viii | |
| RU2004110238A (ru) | Модифицированный человеческий гормон роста | |
| RU2005106841A (ru) | Эпитопы т-клеток в эритропоэтине | |
| RU2003127409A (ru) | Модифицированный тромбопоэтин с уменьшенной иммуногенностью | |
| RU2003125643A (ru) | Модифицированный фактор роста кератиноцита (kgf) с уменьшенной иммуногенностью | |
| RU2003125641A (ru) | Модифицированный колониестимулирующий гранулоцитарный фактор (g-csf) с уменьшенной иммуногенностью |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20060717 |