PL185779B1 - Sposób oceniania ryzyka rozwoju zaburzeń związanych ze złą regulacją białka G - Google Patents
Sposób oceniania ryzyka rozwoju zaburzeń związanych ze złą regulacją białka GInfo
- Publication number
- PL185779B1 PL185779B1 PL97330014A PL33001497A PL185779B1 PL 185779 B1 PL185779 B1 PL 185779B1 PL 97330014 A PL97330014 A PL 97330014A PL 33001497 A PL33001497 A PL 33001497A PL 185779 B1 PL185779 B1 PL 185779B1
- Authority
- PL
- Poland
- Prior art keywords
- gly
- ala
- leu
- val
- asp
- Prior art date
Links
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims abstract description 26
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 title description 18
- 201000010099 disease Diseases 0.000 title description 8
- 238000012239 gene modification Methods 0.000 title description 7
- 230000005017 genetic modification Effects 0.000 title description 7
- 235000013617 genetically modified food Nutrition 0.000 title description 7
- 102000003839 Human Proteins Human genes 0.000 title 1
- 108090000144 Human Proteins Proteins 0.000 title 1
- 108091006027 G proteins Proteins 0.000 claims abstract description 27
- 108091000058 GTP-Binding Proteins 0.000 claims abstract description 25
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 22
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 12
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 claims abstract description 8
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 claims abstract description 6
- 101000887490 Homo sapiens Guanine nucleotide-binding protein G(z) subunit alpha Proteins 0.000 claims abstract description 5
- 102000052301 human GNAZ Human genes 0.000 claims abstract description 5
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims abstract description 3
- 102000030782 GTP binding Human genes 0.000 claims abstract 4
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 claims description 9
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 claims description 7
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims description 3
- 238000001976 enzyme digestion Methods 0.000 claims description 2
- 235000013351 cheese Nutrition 0.000 description 24
- 102000034286 G proteins Human genes 0.000 description 23
- 206010020772 Hypertension Diseases 0.000 description 20
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 10
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 9
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 9
- 230000001631 hypertensive effect Effects 0.000 description 8
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 8
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 6
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108010081690 Pertussis Toxin Proteins 0.000 description 5
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 5
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 5
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 5
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 5
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 4
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 4
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 4
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 description 3
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 3
- PEEAINPHPNDNGE-JQWIXIFHSA-N Trp-Asp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 PEEAINPHPNDNGE-JQWIXIFHSA-N 0.000 description 3
- SUGRIIAOLCDLBD-ZOBUZTSGSA-N Val-Trp-Asp Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N SUGRIIAOLCDLBD-ZOBUZTSGSA-N 0.000 description 3
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 3
- 102000034345 heterotrimeric G proteins Human genes 0.000 description 3
- 108091006093 heterotrimeric G proteins Proteins 0.000 description 3
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 3
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 3
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 3
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 3
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 2
- MCKSLROAGSDNFC-ACZMJKKPSA-N Ala-Asp-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O MCKSLROAGSDNFC-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- KRHRBKYBJXMYBB-WHFBIAKZSA-N Ala-Cys-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(O)=O KRHRBKYBJXMYBB-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- PBSOQGZLPFVXPU-YUMQZZPRSA-N Arg-Glu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O PBSOQGZLPFVXPU-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- RYQSYXFGFOTJDJ-RHYQMDGZSA-N Arg-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O RYQSYXFGFOTJDJ-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 2
- 208000024172 Cardiovascular disease Diseases 0.000 description 2
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 2
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 2
- IZUNQDRIAOLWCN-YUMQZZPRSA-N Cys-Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N IZUNQDRIAOLWCN-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- NMWZMKLDGZXRKP-BZSNNMDCSA-N Cys-Phe-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O NMWZMKLDGZXRKP-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- 208000007530 Essential hypertension Diseases 0.000 description 2
- PVBBEKPHARMPHX-DCAQKATOSA-N Glu-Gln-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O PVBBEKPHARMPHX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- VKVDRTGWLVZJOM-DCAQKATOSA-N Leu-Val-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VKVDRTGWLVZJOM-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- GFWLIJDQILOEPP-HSCHXYMDSA-N Lys-Ile-Trp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N GFWLIJDQILOEPP-HSCHXYMDSA-N 0.000 description 2
- VHTOGMKQXXJOHG-RHYQMDGZSA-N Lys-Thr-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O VHTOGMKQXXJOHG-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 2
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 2
- XALFIVXGQUEGKV-JSGCOSHPSA-N Phe-Val-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 XALFIVXGQUEGKV-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 2
- NJEMRSFGDNECGF-GCJQMDKQSA-N Thr-Ala-Asp Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O NJEMRSFGDNECGF-GCJQMDKQSA-N 0.000 description 2
- QWMPARMKIDVBLV-VZFHVOOUSA-N Thr-Cys-Ala Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O QWMPARMKIDVBLV-VZFHVOOUSA-N 0.000 description 2
- GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N 0.000 description 2
- CDRYEAWHKJSGAF-BPNCWPANSA-N Tyr-Ala-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O CDRYEAWHKJSGAF-BPNCWPANSA-N 0.000 description 2
- OOEUVMFKKZYSRX-LEWSCRJBSA-N Tyr-Ala-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N OOEUVMFKKZYSRX-LEWSCRJBSA-N 0.000 description 2
- KKHRWGYHBZORMQ-NHCYSSNCSA-N Val-Arg-Glu Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N KKHRWGYHBZORMQ-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 2
- PGBJAZDAEWPDAA-NHCYSSNCSA-N Val-Gln-Met Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)N PGBJAZDAEWPDAA-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 2
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 2
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 2
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 2
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 2
- 238000009585 enzyme analysis Methods 0.000 description 2
- 230000006870 function Effects 0.000 description 2
- 108010020688 glycylhistidine Proteins 0.000 description 2
- 208000026278 immune system disease Diseases 0.000 description 2
- 108010027338 isoleucylcysteine Proteins 0.000 description 2
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 2
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 2
- 208000030159 metabolic disease Diseases 0.000 description 2
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 2
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 2
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 2
- 230000035935 pregnancy Effects 0.000 description 2
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 2
- 239000000047 product Substances 0.000 description 2
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 2
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 2
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 2
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 2
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 2
- 208000001072 type 2 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 2
- 230000003313 weakening effect Effects 0.000 description 2
- 108010027345 wheylin-1 peptide Proteins 0.000 description 2
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 1
- KKJUPNGICOCCDW-UHFFFAOYSA-N 7-N,N-Dimethylamino-1,2,3,4,5-pentathiocyclooctane Chemical compound CN(C)C1CSSSSSC1 KKJUPNGICOCCDW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000010444 Acidosis Diseases 0.000 description 1
- NHCPCLJZRSIDHS-ZLUOBGJFSA-N Ala-Asp-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O NHCPCLJZRSIDHS-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- DECCMEWNXSNSDO-ZLUOBGJFSA-N Ala-Cys-Ala Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O DECCMEWNXSNSDO-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- BGNLUHXLSAQYRQ-FXQIFTODSA-N Ala-Glu-Gln Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O BGNLUHXLSAQYRQ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- XHNLCGXYBXNRIS-BJDJZHNGSA-N Ala-Lys-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O XHNLCGXYBXNRIS-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- YCRAFFCYWOUEOF-DLOVCJGASA-N Ala-Phe-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C)CC1=CC=CC=C1 YCRAFFCYWOUEOF-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N Ala-Ser Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- AUFACLFHBAGZEN-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ser-Cys Chemical compound N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O AUFACLFHBAGZEN-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- SOTXLXCVCZAKFI-FXQIFTODSA-N Ala-Val-Ala Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O SOTXLXCVCZAKFI-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- PMGDADKJMCOXHX-BQBZGAKWSA-N Arg-Gln Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O PMGDADKJMCOXHX-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- VDBKFYYIBLXEIF-GUBZILKMSA-N Arg-Gln-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VDBKFYYIBLXEIF-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- NKBQZKVMKJJDLX-SRVKXCTJSA-N Arg-Glu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NKBQZKVMKJJDLX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- AIFHRTPABBBHKU-RCWTZXSCSA-N Arg-Thr-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O AIFHRTPABBBHKU-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- CMLGVVWQQHUXOZ-GHCJXIJMSA-N Asn-Ala-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O CMLGVVWQQHUXOZ-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 1
- JEEFEQCRXKPQHC-KKUMJFAQSA-N Asn-Leu-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O JEEFEQCRXKPQHC-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- IQTUDDBANZYMAR-WDSKDSINSA-N Asn-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O IQTUDDBANZYMAR-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- HGGIYWURFPGLIU-FXQIFTODSA-N Asn-Met-Cys Chemical compound SC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O HGGIYWURFPGLIU-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- LMIWYCWRJVMAIQ-NHCYSSNCSA-N Asn-Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N LMIWYCWRJVMAIQ-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- NJIKKGUVGUBICV-ZLUOBGJFSA-N Asp-Ala-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O NJIKKGUVGUBICV-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- CASGONAXMZPHCK-FXQIFTODSA-N Asp-Asn-Arg Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)CN=C(N)N CASGONAXMZPHCK-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- UQBGYPFHWFZMCD-ZLUOBGJFSA-N Asp-Asn-Asn Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O UQBGYPFHWFZMCD-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- QOVWVLLHMMCFFY-ZLUOBGJFSA-N Asp-Asp-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O QOVWVLLHMMCFFY-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- PZXPWHFYZXTFBI-YUMQZZPRSA-N Asp-Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O PZXPWHFYZXTFBI-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- IDDMGSKZQDEDGA-SRVKXCTJSA-N Asp-Phe-Asn Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 IDDMGSKZQDEDGA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- VNXQRBXEQXLERQ-CIUDSAMLSA-N Asp-Ser-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N VNXQRBXEQXLERQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- NOCCABSVTRONIN-CIUDSAMLSA-N Cys-Ala-Leu Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N NOCCABSVTRONIN-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- RGTVXXNMOGHRAY-WDSKDSINSA-N Cys-Arg Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N RGTVXXNMOGHRAY-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- JTNKVWLMDHIUOG-IHRRRGAJSA-N Cys-Arg-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O JTNKVWLMDHIUOG-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- LDIKUWLAMDFHPU-FXQIFTODSA-N Cys-Cys-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O LDIKUWLAMDFHPU-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- CHRCKSPMGYDLIA-SRVKXCTJSA-N Cys-Phe-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O CHRCKSPMGYDLIA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- SRZZZTMJARUVPI-JBDRJPRFSA-N Cys-Ser-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CS)N SRZZZTMJARUVPI-JBDRJPRFSA-N 0.000 description 1
- ALNKNYKSZPSLBD-ZDLURKLDSA-N Cys-Thr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O ALNKNYKSZPSLBD-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 1
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 1
- 208000002249 Diabetes Complications Diseases 0.000 description 1
- 206010012655 Diabetic complications Diseases 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 206010016654 Fibrosis Diseases 0.000 description 1
- 206010071602 Genetic polymorphism Diseases 0.000 description 1
- 206010070538 Gestational hypertension Diseases 0.000 description 1
- MCAVASRGVBVPMX-FXQIFTODSA-N Gln-Glu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O MCAVASRGVBVPMX-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- XITLYYAIPBBHPX-ZKWXMUAHSA-N Gln-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O XITLYYAIPBBHPX-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- MPZWMIIOPAPAKE-BQBZGAKWSA-N Glu-Arg Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N MPZWMIIOPAPAKE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- VGBSZQSKQRMLHD-MNXVOIDGSA-N Glu-Leu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O VGBSZQSKQRMLHD-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 1
- MRWYPDWDZSLWJM-ACZMJKKPSA-N Glu-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O MRWYPDWDZSLWJM-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- GPSHCSTUYOQPAI-JHEQGTHGSA-N Glu-Thr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O GPSHCSTUYOQPAI-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 1
- GQGAFTPXAPKSCF-WHFBIAKZSA-N Gly-Ala-Cys Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O GQGAFTPXAPKSCF-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- JVACNFOPSUPDTK-QWRGUYRKSA-N Gly-Asn-Phe Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JVACNFOPSUPDTK-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N Gly-Asp Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- PMNHJLASAAWELO-FOHZUACHSA-N Gly-Asp-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O PMNHJLASAAWELO-FOHZUACHSA-N 0.000 description 1
- XLFHCWHXKSFVIB-BQBZGAKWSA-N Gly-Gln-Gln Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O XLFHCWHXKSFVIB-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- NTOWAXLMQFKJPT-YUMQZZPRSA-N Gly-Glu-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)CN NTOWAXLMQFKJPT-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- YIWFXZNIBQBFHR-LURJTMIESA-N Gly-His Chemical compound [NH3+]CC(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CN=CN1 YIWFXZNIBQBFHR-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- YTSVAIMKVLZUDU-YUMQZZPRSA-N Gly-Leu-Asp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O YTSVAIMKVLZUDU-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- ULZCYBYDTUMHNF-IUCAKERBSA-N Gly-Leu-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ULZCYBYDTUMHNF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- MHXKHKWHPNETGG-QWRGUYRKSA-N Gly-Lys-Leu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O MHXKHKWHPNETGG-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- OHUKZZYSJBKFRR-WHFBIAKZSA-N Gly-Ser-Asp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O OHUKZZYSJBKFRR-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- ZKJZBRHRWKLVSJ-ZDLURKLDSA-N Gly-Thr-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)CN)O ZKJZBRHRWKLVSJ-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- VPZXBVLAVMBEQI-VKHMYHEASA-N Glycyl-alanine Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 208000031886 HIV Infections Diseases 0.000 description 1
- 208000037357 HIV infectious disease Diseases 0.000 description 1
- WZOGEMJIZBNFBK-CIUDSAMLSA-N His-Asp-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O WZOGEMJIZBNFBK-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- UIRUVUUGUYCMBY-KCTSRDHCSA-N His-Trp-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)NC(=O)[C@H](CC3=CN=CN3)N UIRUVUUGUYCMBY-KCTSRDHCSA-N 0.000 description 1
- 206010060378 Hyperinsulinaemia Diseases 0.000 description 1
- APQYGMBHIVXFML-OSUNSFLBSA-N Ile-Val-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)N APQYGMBHIVXFML-OSUNSFLBSA-N 0.000 description 1
- 206010022489 Insulin Resistance Diseases 0.000 description 1
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 1
- 102000004310 Ion Channels Human genes 0.000 description 1
- 208000007766 Kaposi sarcoma Diseases 0.000 description 1
- PMGDADKJMCOXHX-UHFFFAOYSA-N L-Arginyl-L-glutamin-acetat Natural products NC(=N)NCCCC(N)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(O)=O PMGDADKJMCOXHX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZUKPVRWZDMRIEO-VKHMYHEASA-N L-cysteinylglycine Chemical compound SC[C@H]([NH3+])C(=O)NCC([O-])=O ZUKPVRWZDMRIEO-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- CQQGCWPXDHTTNF-GUBZILKMSA-N Leu-Ala-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O CQQGCWPXDHTTNF-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- KPYAOIVPJKPIOU-KKUMJFAQSA-N Leu-Lys-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O KPYAOIVPJKPIOU-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- VCHVSKNMTXWIIP-SRVKXCTJSA-N Leu-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VCHVSKNMTXWIIP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- ZDBMWELMUCLUPL-QEJZJMRPSA-N Leu-Phe-Ala Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 ZDBMWELMUCLUPL-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 1
- ZAVCJRJOQKIOJW-KKUMJFAQSA-N Leu-Phe-Asp Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 ZAVCJRJOQKIOJW-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- SYRTUBLKWNDSDK-DKIMLUQUSA-N Leu-Phe-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O SYRTUBLKWNDSDK-DKIMLUQUSA-N 0.000 description 1
- XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- KIZIOFNVSOSKJI-CIUDSAMLSA-N Leu-Ser-Cys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N KIZIOFNVSOSKJI-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- RGUXWMDNCPMQFB-YUMQZZPRSA-N Leu-Ser-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O RGUXWMDNCPMQFB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- PFZWARWVRNTPBR-IHPCNDPISA-N Lys-Leu-Trp Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N PFZWARWVRNTPBR-IHPCNDPISA-N 0.000 description 1
- YCUSPBPZVJDMII-YUMQZZPRSA-N Met-Gly-Glu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O YCUSPBPZVJDMII-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- 208000001145 Metabolic Syndrome Diseases 0.000 description 1
- SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-valine Natural products CC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XZFYRXDAULDNFX-UHFFFAOYSA-N N-L-cysteinyl-L-phenylalanine Natural products SCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XZFYRXDAULDNFX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010079364 N-glycylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010002311 N-glycylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- FPTXMUIBLMGTQH-ONGXEEELSA-N Phe-Ala-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 FPTXMUIBLMGTQH-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- UUWCIPUVJJIEEP-SRVKXCTJSA-N Phe-Asn-Cys Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N UUWCIPUVJJIEEP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- YKUGPVXSDOOANW-KKUMJFAQSA-N Phe-Leu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O YKUGPVXSDOOANW-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- XROLYVMNVIKVEM-BQBZGAKWSA-N Pro-Asn-Gly Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O XROLYVMNVIKVEM-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- GLEOIKLQBZNKJZ-WDSKDSINSA-N Pro-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 GLEOIKLQBZNKJZ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- HXOLCSYHGRNXJJ-IHRRRGAJSA-N Pro-Asp-Phe Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O HXOLCSYHGRNXJJ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 208000017442 Retinal disease Diseases 0.000 description 1
- 206010038923 Retinopathy Diseases 0.000 description 1
- DWUIECHTAMYEFL-XVYDVKMFSA-N Ser-Ala-His Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 DWUIECHTAMYEFL-XVYDVKMFSA-N 0.000 description 1
- BPMRXBZYPGYPJN-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O BPMRXBZYPGYPJN-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- ZFVFHHZBCVNLGD-GUBZILKMSA-N Ser-His-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O ZFVFHHZBCVNLGD-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- YUJLIIRMIAGMCQ-CIUDSAMLSA-N Ser-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YUJLIIRMIAGMCQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- IFLVBVIYADZIQO-DCAQKATOSA-N Ser-Met-Lys Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N IFLVBVIYADZIQO-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- OQSQCUWQOIHECT-YJRXYDGGSA-N Ser-Tyr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O OQSQCUWQOIHECT-YJRXYDGGSA-N 0.000 description 1
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 1
- 208000034972 Sudden Infant Death Diseases 0.000 description 1
- 206010042434 Sudden death Diseases 0.000 description 1
- 206010042440 Sudden infant death syndrome Diseases 0.000 description 1
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- JTEICXDKGWKRRV-HJGDQZAQSA-N Thr-Asn-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O JTEICXDKGWKRRV-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- OHAJHDJOCKKJLV-LKXGYXEUSA-N Thr-Asp-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O OHAJHDJOCKKJLV-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 1
- NIEWSKWFURSECR-FOHZUACHSA-N Thr-Gly-Asp Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O NIEWSKWFURSECR-FOHZUACHSA-N 0.000 description 1
- DJDSEDOKJTZBAR-ZDLURKLDSA-N Thr-Gly-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DJDSEDOKJTZBAR-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- MXNAOGFNFNKUPD-JHYOHUSXSA-N Thr-Phe-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O MXNAOGFNFNKUPD-JHYOHUSXSA-N 0.000 description 1
- 208000007536 Thrombosis Diseases 0.000 description 1
- 206010052779 Transplant rejections Diseases 0.000 description 1
- LWFWZRANSFAJDR-JSGCOSHPSA-N Trp-Val Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 LWFWZRANSFAJDR-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- KPEVFMGKBCMTJF-SZMVWBNQSA-N Trp-Val-Met Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N KPEVFMGKBCMTJF-SZMVWBNQSA-N 0.000 description 1
- AYHSJESDFKREAR-KKUMJFAQSA-N Tyr-Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AYHSJESDFKREAR-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- QZOSVNLXLSNHQK-UWVGGRQHSA-N Tyr-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 QZOSVNLXLSNHQK-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- BEIGSKUPTIFYRZ-SRVKXCTJSA-N Tyr-Asp-Asp Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N)O BEIGSKUPTIFYRZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- NSGZILIDHCIZAM-KKUMJFAQSA-N Tyr-Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N NSGZILIDHCIZAM-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- JFAWZADYPRMRCO-UBHSHLNASA-N Val-Ala-Phe Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JFAWZADYPRMRCO-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- SLLKXDSRVAOREO-KZVJFYERSA-N Val-Ala-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O SLLKXDSRVAOREO-KZVJFYERSA-N 0.000 description 1
- JTWIMNMUYLQNPI-WPRPVWTQSA-N Val-Gly-Arg Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N JTWIMNMUYLQNPI-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 1
- FEFZWCSXEMVSPO-LSJOCFKGSA-N Val-His-Ala Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](Cc1cnc[nH]1)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O FEFZWCSXEMVSPO-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 1
- GVRKWABULJAONN-VQVTYTSYSA-N Val-Thr Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GVRKWABULJAONN-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- 206010047139 Vasoconstriction Diseases 0.000 description 1
- MMWCIQZXVOZEGG-HOZKJCLWSA-N [(1S,2R,3S,4S,5R,6S)-2,3,5-trihydroxy-4,6-diphosphonooxycyclohexyl] dihydrogen phosphate Chemical compound O[C@H]1[C@@H](O)[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](OP(O)(O)=O)[C@H](O)[C@H]1OP(O)(O)=O MMWCIQZXVOZEGG-HOZKJCLWSA-N 0.000 description 1
- 201000000690 abdominal obesity-metabolic syndrome Diseases 0.000 description 1
- 230000007950 acidosis Effects 0.000 description 1
- 208000026545 acidosis disease Diseases 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 108010045350 alanyl-tyrosyl-alanine Proteins 0.000 description 1
- 108010041407 alanylaspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 1
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 1
- 108010008355 arginyl-glutamine Proteins 0.000 description 1
- 108010052670 arginyl-glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010018691 arginyl-threonyl-arginine Proteins 0.000 description 1
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 230000003915 cell function Effects 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 108091008690 chemoreceptors Proteins 0.000 description 1
- 230000007882 cirrhosis Effects 0.000 description 1
- 208000019425 cirrhosis of liver Diseases 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 208000029078 coronary artery disease Diseases 0.000 description 1
- 108010004073 cysteinylcysteine Proteins 0.000 description 1
- 108010016616 cysteinylglycine Proteins 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 201000006408 generalized atherosclerosis Diseases 0.000 description 1
- 238000012252 genetic analysis Methods 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 108010049041 glutamylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010079547 glutamylmethionine Proteins 0.000 description 1
- VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N glycyl-DL-alpha-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 1
- 108091008039 hormone receptors Proteins 0.000 description 1
- 208000033519 human immunodeficiency virus infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 230000003451 hyperinsulinaemic effect Effects 0.000 description 1
- 201000008980 hyperinsulinism Diseases 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 1
- 238000002513 implantation Methods 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 230000010365 information processing Effects 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- 230000004068 intracellular signaling Effects 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- 108010044374 isoleucyl-tyrosine Proteins 0.000 description 1
- 208000017169 kidney disease Diseases 0.000 description 1
- 230000037356 lipid metabolism Effects 0.000 description 1
- 108010017391 lysylvaline Proteins 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 108010056582 methionylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- XONPDZSGENTBNJ-UHFFFAOYSA-N molecular hydrogen;sodium Chemical compound [Na].[H][H] XONPDZSGENTBNJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000000822 natural killer cell Anatomy 0.000 description 1
- 201000001119 neuropathy Diseases 0.000 description 1
- 230000007823 neuropathy Effects 0.000 description 1
- 208000033808 peripheral neuropathy Diseases 0.000 description 1
- 231100000572 poisoning Toxicity 0.000 description 1
- 230000000607 poisoning effect Effects 0.000 description 1
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 1
- 201000011461 pre-eclampsia Diseases 0.000 description 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 1
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 1
- 108010090894 prolylleucine Proteins 0.000 description 1
- 208000037803 restenosis Diseases 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 108010048397 seryl-lysyl-leucine Proteins 0.000 description 1
- 208000010110 spontaneous platelet aggregation Diseases 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 238000010361 transduction Methods 0.000 description 1
- 230000026683 transduction Effects 0.000 description 1
- 230000005748 tumor development Effects 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- 230000025033 vasoconstriction Effects 0.000 description 1
- 230000029663 wound healing Effects 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
Abstract
1. Sposób oceniania ryzyka rozwoju zaburzen zwiazanych ze zla regulacja bial- ka G u pacjenta, znamienny tym, ze se- kwencje genu podjednostki ß3 ludzkiego bialka G pacjenta porównuje sie in vitro z sekwencja genu SEQ ID NO: 1 i w przy- padku gdy w pozycji 825 znajduje sie tymi- na (T), przypisuje sie pacjentowi zwiekszo- ne ryzyko rozwoju zaburzenia zwiazanego ze zla regulacja bialka G. PL PL PL PL PL PL PL PL PL
Description
Przedmiotem wynalazku jest sposób oceniania ryzyka rozwoju zaburzeń związanych ze złą regulacją białka G u pacjenta drogą analizy genetycznej, w szczególności analizy genów podjednostek ludzkich białek wiążących nukleotydy guaninowe (białek G).
Heterotrimeryczne białka wiążące nukleotydy guaninowe (białka G) odgrywają bardzo ważną rolę w wewnątrzkomórkowym przekazywaniu sygnałów. Pośredniczą one w przekazywaniu sygnałów zewnątrzkomórkowych po stymulacji receptorów hormonów lub innych receptorów przechodzących zmiany konformacyjne po aktywacji akceptora. Prowadzi to do aktywacji białek G, co w następstwie może doprowadzić do aktywacji lub hamowania efektorów wewnątrzkomórkowych (np. kanałów jonowych, enzymów). Heterotrimeryczne białka G składają się z trzech podjednostek α, β i γ. Do chwili obecnej wykryto metodami biochemicznymi i biologii molekularnej kilka różnych podjednostek a, 5 podjednostek β i około 12 podjednostek y (Bimbaumer, L. i Bimbaumer, M. Signal transduction by G proteins: wydanie z 1994 r.; J. Recept. Res. 15:213-252, 1995; Offermanns, S. i Schultz, G. Complex information processing by the transmembrane signaling system involving G proteins. Naunyn Schmiedebergs Arch. Pharmacol. 350:329-338, 1994; Nurnberg, B., Gudermann, T. i Schultz, G. Receptors and G proteins as primary components of transmembrane signal transduction. Część 2. G proteins: structure and function. J.Mol.Med. 73:123-132, 1995; Neer E. J. Heterotrimeric G proteins: Organizers of Transmembrane Signals. Cell 80:249-257, 1995; Rens-Domiano, S. i Hamm, H. E. Structural and functional relationships of heterotrimeric G-proteins. FASEBJ. 9:1059-1066, 1995).
Pośredniczona receptorami aktywacja pewnych podjednostek a może zostać zahamowana przez wcześniejsze potraktowanie toksyną krztuśca (PTX). Dotyczy to w szczególności izoform a, takich jak ail, α i2 i α i3 i różnych podjednostek o α. Białka G tych typów określa się też mianem białek G wrażliwych na PTX.
Stwierdzono, że genetyczna modyfikacja genu podjednostki β3, ludzkiego białka G jest przydatna przy diagnozowaniu chorób. Modyfikacja ta jest w szczególności odpowiednia do oceniania ryzyka rozwoju zaburzeń związanych ze złą regulacją białka G.
Tak więc zgodny z wynalazkiem sposób oceniania ryzyka rozwoju zaburzeń związanych ze złą regulacją białka G u pacjenta polega na tym, że sekwencję genu podjednostki β3 ludzkiego białka G pacjenta porównuje się in vitro z sekwencją genu SEQ ID NO: 1 i w przypad185 779 ku gdy w pozycji 825 znajduje się tymina (T), przypisuje się pacjentowi zwiększone ryzyko rozwoju zaburzenia związanego ze złą regulacją białka G.
Korzystnie porównanie genów prowadzi się przez sekwencjonowanie, przy czym obszar genu zawierający pozycję 825 amplifikuje się przed sekwencjonowaniem, albo przez hybrydyzację, względnie przez trawienie enzymami restrykcyjnymi, przy czym jako enzym restrykcyjny stosuje się Dsa I.
Znaleziona modyfikacja genetyczna znajduje się w genie podjednostki β3 ludzkiego białka G. Gen ten został opisany przez Levine i innych (Proc. Natl. Acad. Sei USA, 87, (1990) 2329-2333). Region kodujący ma kodon Ser (TCC) w pozycji 275, podczas gdy pacjenci z podwyższonym ryzykiem choroby związanej ze złą regulacją białka G mają w tej pozycji kodon TCT, który również koduje Ser. Modyfikacją genetyczną jest podstawienie zasady w pozycji 825, w której cytozyna (C) jest zastąpiona przez tyminę (T). Jednakże ta wymiana zasady jest „milcząca” na poziomie aminokwasowym, czyli nie prowadzi do wbudowania innego aminokwasu w tej pozycji. Sekwencja znaleziona u pacjentów z podwyższonym ryzykiem choroby jest przedstawiona jako SEQ ID NO: 1 w wykazie sekwencji.
Znaleziona modyfikacja genetyczna zazwyczaj występuje w postaci heterozygotycznej.
Zaburzenia związane ze zlą regulacją białka G określa się jako choroby, w których białko G bierze udział w przekazywaniu sygnałów i nie spełnia swojej funkcji w sposób fizjologiczny.
Zła regulacja może mieć wiele przyczyn, np. modyfikację w genie strukturalnym lub zmodyfikowaną ekspresję genu.
Zaburzenia te to choroby układu sercowo-naczyniowego, zaburzenia metabolizmu i choroby immunologiczne.
Chorobami układu sercowo-naczyniowego, które można tu wymienić, są: nadciśnienie, nadciśnienie ciążowe (zatrucie ciążowe, nadciśnienie w ciąży), choroba wieńcowa serca, miejscowa i/lub uogólniona miażdżyca tętnic, zwężenia naczyń krwionośnych, nawrót zwężenia po zabiegach ponownego unaczyniania (np. PTCA ewentualnie ze wszczepieniem protezy wewnątrznaczyniowej), tendencja do udarów lub zakrzepicy i zwiększonej agregacji płytek.
Zaburzeniami metabolicznymi, które można tu wymienić, są: zespół metaboliczny, oporność na insulinę i hiperinsulinemia, cukrzyca typu II, powikłania cukrzycowe (np. nefropatia, neuropatia, retinopatia, itd.), zaburzenia metabolizmu lipidów, zaburzenia ośrodkowych chemoreceptorów (tolerancja CO2, tolerancja kwasicy, nagła śmierć noworodków (SIDS)).
Chorobami immunologicznymi, które można tu wymienić, są: osłabienie siły odpowiedzi immunologicznej organizmu (tworzenie się immunoglobulin, agresywność komórek T i komórek NK), osłabienie ogólnej tendencji do proliferacji, włącznie ze zdolnością gojenia się ran, tendencja do rozwoju nowotworów i proliferacji, w tym skłonność do przerzutów złośliwie stransformowanych komórek, trwanie okresu utajenia po zakażeniu HIV do klinicznego ujawnienia się choroby, mięsak Kaposiego, skłonność do marskości wątroby, tolerancja przeszczepów i odrzucanie przeszczepów.
Na podstawie mutacji genetycznych można w szczególności ocenić ryzyko pojawienia się nadciśnienia.
Jako modele zwierzęce służące do badania terapii zaburzeń opisanych powyżej użyteczne są zwierzęta transgeniczne niosące opisaną powyżej mutację genetyczną. Sposoby produkcji zwierząt transgenicznych są ogólnie znane specjalistom.
W zgodnym z wynalazkiem sposobie oceniania ryzyka rozwoju choroby pobiera się z organizmu pacjenta materiał zawierający informację genetyczną pacjenta. Zazwyczaj wykonuje się to przez pobieranie krwi i izolowanie z niej kwasów nukleinowych.
Strukturę genu podjednostki β3 białka G ustala się na podstawie wyizolowanych kwasów nukleinowych pacjenta i porównuje się ją z SEQ ID NO: 1.
Strukturę genu można ustalić przez sekwencjonowanie kwasów nukleinowych. Można to wykonać bezpośrednio z DNA genomowego lub po amplifikacji kwasów nukleinowych, np. metodą PCR.
Strukturę genu można ustalić na poziomie genomowym lub na poziomie mRNA lub cDNA.
185 779
Korzystne jest oznaczenie przez sekwencjonowanie po amplifikacji cDNA metodą
PCR. Startery odpowiednie do PCR może łatwo zaprojektować specjalista z sekwencji przedstawionych w SEQ ID NO: 1. Korzystna stosowana wówczas procedura polega na tym, że w każdym przypadku wybiera się starter wiążący nić i nić komplementarną przed i za odpowiednią zasadą w pozycji 825.
Jednakże można też stosować inne sposoby porównywania genów, np. selektywną hybrydyzację lub odpowiednie mapowanie enzymami restrykcyjnymi. Opisana powyżej wymiana zasad C^Tw pozycji 825 prowadzi do utraty miejsca cięcia dla enzymu restrykcyjnego Dsa I, który jest podobnie stosowany do wykrywania tego polimorfizmu genetycznego.
Jeżeli pacjent ma tyminę (T) w pozycji 825, należy ocenić go jako mającego większe ryzyko choroby niż pacjent z cytoz.yną(C) w tej pozycji.
Wynalazek dokładniej ilustrują następujące przykłady.
Przykład 1
Wykrywanie modyfikacji genetycznej pacjentów z nadciśnieniem przez sekwencjonowanie
Zwiększoną podatność na aktywację wrażliwych na PTX białek wykryto we wstępnych badaniach pacjentów z samoistnym nadciśnieniem. Można to było wykryć w unieśmiertelnionych komórkach pobranych od pacjentów mających jako znacznik fenotypowy wzmożoną aktywność wymieniacza Na/H. Wzmożona podatność na aktywację białek G wrażliwych na PTX ma istotne konsekwencje dla funkcji komórki. Wśród nich można wymienić wzmożone powstawanie wewnątrzkomórkowych cząsteczek wtórnych przekaźników sygnału (np. 1,4,5-trifosforanu inozytolu), wzmożone uwalnianie wewnątrzkomórkowe jonów Ca2+, zwiększone powstawanie immunoglobulin i zwiększoną szybkość wzrostu komórki. Ponieważ zmiany te można wykryć w unieśmiertelnianych komórkach i po długo trwającym okresie hodowli komórek, można stwierdzić, że modyfikacja jest genetycznie niezmienna (Rosskopf, D., Fromter, E. i Siffert, W.: Hypertensive sodium-proton exchanger phenotype persists in immortalized lymphoblasts from essential hypertensive patients - a cell culture model for human hypertension. J. Clin. Invest. 92:2553-2559, 1993; Rosskopf, D., Hartung, K., Hense, J. i Siffert, W.: Enhanced immunoglobulin formation of immortalized B cells from hypertensive patients. Hypertension. 26:432-435, 1995; Rosskopf, D. Schroder, K. -J. i Siffert, W.: Role of sodium-hydrogen exhange in the proliferation of immortalised lymphoblasts from patients with essential hypertension and normotensive subjects. Cardiova.sc. Res. 29:254-259, 1995; Siffert, W., Rosskopf, D., Moritz, A., Wieland, T., Kaldenberg-Stasch, S., Kettler, N., Hartung, K., Beckmann, S. i Jacobs, K. H.: Enhanced G protein activation in immortalized lymphoblasts from patients with essential hypertension. J. Clin. Invest. 96:759-766, 1995).
RNA wypreparowano znanymi sposobami z unieśmiertelnionych linii komórkowych pobranych od pacjentów z nadciśnieniem i transkrybowano na cDNA z użyciem odwrotnej transkryptazy. Drogą reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) zamplifikowano cDNA kodujący podjednostki β3 białka G i zsekwencjonowano go. Do PCR zastosowano następujące startery oligonukleotydowe :
5' -TGG GGG AGA TGG AGC AAC TG i
5' -CTG CTG AGT GTG TTC ACT GCC.
W porównaniu z sekwencją opublikowaną przez Levine'a i innych (Levine, M.A., Smallwood, P.M., Moen, P.T., Jr., Helman, L.J. i Ahn, T.G.: Molecular cloning of β3 subunit, a third form of the G protein (-subunit polypeptide. Proc. Natl. Acad. Sei. USA 87 (6): 23292333, 1990) znaleziono następującą różnicę w cDNA z komórek pacjentów z nadciśnieniem: nukleotyd 825, cytozyna (C), w regionie sekwencji kodującej jest zastąpiony tyminą (T) (nukleotyd 1 odpowiada zasadzie A w kodonie start ATG). Ta wymiana zasady prowadzi do milczącego polimorfizmu, co oznacza, że kodowany przez odpowiadającą trójkę zasad aminokwas (seryna) nie zmienia się w porównaniu z oryginalną sekwencją. Znalezioną sekwencję DNA przedstawiono jako SEQ ID NO: 1.
Przykład 2
Wykrywanie modyfikacji genetycznej u pacjentów z nadciśnieniem drogą analizy z użyciem enzymów restrykcyjnych
185 779
Figura przedstawia porównanie genów pacjentów mających normalne ciśnienie i pacjentów z nadciśnieniem wykonane drogą analizy z użyciem enzymów restrykcyjnych. W tym przypadku cDNA kodujący (53 z komórek pacjentów mających normalne ciśnienie (NT) i nadciśnienie (HT) zamplifikowano drogą PCR i poddano analizie z użyciem enzymu restrykcyjnego Dsa I. Produkty reakcji rozdzielono w żelu agarozowym, jak to przedstawiono na figurze.
Całkowita restrykcja β3 cDNA z komórek pacjentów o normalnym ciśnieniu po trawieniu Dsa I jest wyraźnie widoczna na figurze. cDNA komórek pacjentów z nadciśnieniem jest tylko częściowo cięty przez Dsa I. Oprócz produktów trawienia na żelu widać także nierozszczepiony produkt PCR. Fragmenty odniesienia (znaczniki) naniesiono po lewej i prawej stronie dla porównania rozmiarów. Pokazane cztery z pięciu sekwencji dNa pacjentów z nadciśnieniem wykazują zamianę zasady opisaną powyżej i są heterozygotami pod względem tej modyfikacji.
185 779
Wykaz sekwencji (1) Informacja ogólna:
(i) Zgłaszający:
(A) Nazwa: BASF Aktiengesellschaft (B) Ulica: Carl-Bosch-Strasse 38 (C) Miasto: Ludwigshafen (E) Kraj: Republika Federalna Niemiec (F) Kod pocztowy: D-67056 (G) Telefon: 0612/6048526 (H) Telefaks: 0612/6043212 (I) Teleks: 1762175170 (ii) Tytuł zgłoszenia: Sposób oceniania ryzyka rozwoju zaburzeń związanych ze złą regu lacją białka G (iii) Liczba sekwencji: 2 (iv) Postać odczytywana komputerowo:
(A) Typ nośnika: Dyskietka (B) Komputer: Kompatybilny z IBM PC (C) System operacyjny: PC-DOS/MS-DOS (D) Oprogramowanie: Patentln Release #1.0, wersja #1.25 (EPA) (2) Informacja dotycząca SEQ ID NO: 1:
(i) Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 1517 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Niciowość: podwójna (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki: cDNA dla mRNA (iii) Hipotetyczna: nie (iv) Antysensowność: nie (vi) Źródło pchhddzenia;
(A) Organizm: Homo sapiens (ix) Cechy:
(A) Nazwa/klucz: CDS (B) Lokalizacja: 1..1024 (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NO: 1:
185 779
| ATG GGG GAG ATG Met Gly Glu Met 1 | GGA CCA. CCG CGT CAG GJAA GCG GAG CAG CTC AAG AAG | 48 | ||||
| Glu 5 | CGi | Clu Arg Gln Glu Ala Glu Gln Leu Lys | Lys | |||
| 10 | 15 | |||||
| CTG TGG GOC GAT | GCC | CAG | CAA GCC TGT GCT | GAC GTT ACT CTG GCA | SAS | 06 |
| Gln Ile ATa Ατρ | AAu | CAg | Cls Ala Cys Ala | Asp Val Tiar Leu Ala | Glu | |
| 20 | 25 | 30 | ||||
| CTG GTG TCT GGC | CTA | CGA | CGG GTG GGA GGA | GTC CAG ATG CGG ACG | CGG | 144 |
| Leu Val Ser Gly | Llu | CGu | Cal Val Gly Arg | Val Gln Met; Arg Thr | Arg | |
| 35 | 4 0 | 45 | ||||
| CGG ACG TTA AGG | GGA | CAC | (CIG GCC AAG ATT | TAC GCC ATG CAC TGG | GCC | 102 |
| Arg Thr Leu Arg | Gly | Hls | Luu Ala Lys Ile | Tyr Ala Met His Trp | Ala | |
| 50 | 55 | 60 | ||||
| ACT GAT TCT AAG | CTG | CTG | GTA AGT GCC TCG | CAA GAT GGG AAG CTG | ATC | 240 |
| Thr Asp Ser Lys | Luu | Luu | Val Sur Ala Ser | Gin Asp Gly Lys Leu | Ile | |
| 65 | 70 | 10 | 80 | |||
| GTG TGG GAC AGC | TAC | ACC | ACC AAC AAG GTG | CAC GCC ATC CCA CTG | CGC | 288 |
| Val Trp Asp Ser | Tyr | Thr | Thr Asn Lys Val | His Ala Ilu Pro Luu | Arg | |
| 85 | 90 | 90 | ||||
| TCC TCC TGG GTC | ATG | ACC | GGG GCC TAT GCC | CCA TCA GGG AAC | GGC | 336 |
| Ser Ser Trp Val | Mut | Thr | Cys Ala Tyr Ala | Pro Ser Gly Asn Phe | Val | |
| 100 | 105 | 554 | ||||
| GCA TGT GGG GGG | CTG | GAC | AAC ATG TCT TCC | ATC TAC AAC CTC AAA | TCC | 384 |
| Ala Cys Gly Gly | Leu | Asp | Asn Met Cys Ser | Ilu Tyr Asn Leu Lys | Ser | |
| 115 | 120 | 115 | ||||
| CGT GAG GGC AAT | GTC | AAG | GTC AGC CGG GAG | CTT TCT GCT CAC ACA | CCT | 432 |
| Arg Glu Gly Asn | Val | Lys | Val Sur Arg Glu | Leu Ser Ala His Thr | Gly | |
| 130 | 135 | 140 | ||||
| TAT CTC TCC TGC | TGC | CGC | TTC CTG GAT GAC | AAC AAT ATT GTG ACC | AGC | 480 |
| Tyr Leu Ser Cys | Cys | Arg | Phe Leu Asp Asp | Asn Asn Ile Val Thr | Ser | |
| 145 | 150 | H5 | 110 | |||
| TCG GGG GAC ACC | ACG | TGT | GCC TTG GAC | ATT GAG ACT GGG CAG | CAG | 528 |
| Ser Gly Asp Thr | Thr | Cys | Ala Luu Trp Asp | Ile Glu Thr Gly Gin | Gin | |
| 165 | 110 | 110 | ||||
| AAG ACT GTA TTT | GTG | GGA | CAC ACG GGT GAC | TGC ATG AGC CTG GCT | GTG | 506 |
| Lys Thr Val Phe | Val | Gly | Hls Thr Gly Asp | Cys Met Ser Leu Ala | Val | |
| 180 | 118 | 190 | ||||
| TCT CCT GAC TTC | AAT | CTC | TTC ATT TCG GGG | GCC GGG GAT GCC AGT | GCC | 624 |
| Ser Pro Asp Phe | Asn | Leu | Phe Ile Sur Gly | Ala Cys Asp Ala Ser | Ala | |
| 195 | 200 | 205 | ||||
| AAG CTC TGG GAT | GTG | CGA | GAG GGG ACC TGC | CCT CAG ACT TTC ACT | GGC | 672 |
| Lys Leu Trp Asp | Val | Arg | Glu Gly Thr Cys | Arg Gin Thr Phe Thr | Gly | |
| 210 | 221 | 220 |
185 779
| CAC Hls 225 | GAG TCG GAC | ATC AAC GCC ATC TGT TTC TTC CCC AAT GG. (GAG GCC | 720 | |||||||
| Glu Ser | Asp | lle | Asn Ala Ile Cys Phe Phe | Pro Asn | Gly | Glu | Ala 220 | |||
| 230 | 235 | |||||||||
| ATC | TGC ACG | GGC | TCG | GAT GAC | GCT TCC TGC CGC | TTG TTT | an | CTG | CGG | 768 |
| IIe | Cys Thr | Gly | Ser 245 | Asp AAp | Ala Ser Cys Arg 250 | Leu Phe | Asp | Leu 255 | Arg | |
| GCA | GAC CAG | GAG | CTG | ATC TGC | TTC TCC CAC (GH | AGC ATC | ATC | TGC | GGG | 816 |
| Ala | Asp Gln | Glu 260 | Leu | lle Cys | Phe Ser Hls Glu 265 | Ser lle | Ile 270 | CyS | Gly | |
| ATC | ACG TCT | GTG | GCC | TTC TCC | CTC AGT AGC CCGC | CTA CTA | TTC | GGT | GGG | 864 |
| Ile | Thr Ser 275 | Val | Ala | Phe Ser | Leu Ser Gly Arg 280 | Leu Leu 285 | Phe | Ala | Gly | |
| TAC | GAC GAC | TTC | AAC | TGC AAT | GTC TGG GAC TCC | ATG AAG | TCT | (AC- | GGT | 912 |
| Tyr Asp Asp 290 | Phe | Asn | Cys Asn 295 | Val Trp Asp Ser | Met Lys 300 | Ser | Glu | Arg | ||
| GTG | GGC ATC | CTC | TCT | GGC CAC | GUT UC AGG GTG | AGC TGC | CTG | (GGA | GTC | 960 |
| Val 305 | Gly lle | Leu | Ser | Gly His 310 | Asp Asn Arg Val 335 | Ser Cys | Leu | Gly | Gal 332 | |
| ACA | GCT GAC | GGG | ATG | GCT GTG | GGC ACA GGT TCC | TGG GAC | AGC | TTC | CTC | 1008 |
| Thr | Ala Asp | Gly | Met 325 | Ala Val | ALa Thr Gly Ser 330 | Trp Asp | Ser | Phe 355 | LlU |
AAA ATC TGG AAC TGA G GAGGCTGGAG AAAGGGAAGT GGAAGGCAGT GAACACACTC 1064 Lys Ile Trp Asn *
340
| AGCAGCCCCC | TGCCCGACCC | CATCTCATTC AGGTGTTCTC | TTCTATATTC | CUmCCH | 1124 |
| TCTCACTlAG | CTTTCTCCTT | TGAUGCAGT GGHAGCATG | GGlTTlTGCC | TTTlGGAGlT | 1184 |
| AGCATCAGGG | lTATAlGGGC | AlAGlACTlT CTTlTCTCCT | CCTlTllCCT | TCTCTTTTTl | 1244 |
| CAlTCTTCAC | AGTCTCTCCC | TTAlTlAlTl llGACllCCT | GTCCCTCCCC | AGCCCTTTGC | 1304 |
| AlGTTCAlTA | GACTTGAGTC | TUGGCCCCA GGCCCTAGU | TTCCTCCCCC | AGllTTATTA | 1364 |
| CCTTTGTCCl | lGTTTlGGTl | GTATAGGGCG TTTGGTTCTG | TlATTATllC | TCTlGCATCA | 1424 |
| CTAGGGTCCT | GGCCCTCTTC | TTATTCATGC TTTCTCCTTT | TTCTACCTTT | TTITCTCTCC | 1484 |
| TAAGACACCT’ | GTlATAAlGT | GTAlTACTCT GGT | 1517 |
(2) Informacja dotycząca SEQ ID NO: 2:
(i) Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 341 aminokwasów (B) Typ: aminokwas (C) Niciowość: podwójna (D) Topologia: liniowa
185 779
| (ii) | Typ cząsteczki: | Białko | |
| (xi ) | Opis sekwencji: | SEQ ID NO: 2: | |
| Met 1 | Gly Glu | Met Glu Gln Leu Arg 5 | Gln Glu Ala Glu Gln Leu Lys Lys 10 15 |
| Gln | Ile Ala | Asp Ala Aag Lau Aly 20 | ??ll .Cls Asa Val Thr Ulu ?lla Glu 25 30 |
| Leu | Val Ser 35 | Gly Leu Glu Val Val 40 | Gly Aug Val Gln Met Aug Thu Aug 45 |
| Arg | Thr Leu 50 | Arg G1a gis Lhu Ua 55 | a.? lig Tyr Ala Met His Tup AL a 60 |
| Thr 65 | Asp Ser | Lys Leu Leu Val Seu 70 | AAa Suu Gln lsp Gly Lys leu Ile 75 80 |
| Val | Trp Asp | Ser Tyr Thu Thu Asn 85 | Lys VaA Hls Ala 11? Pro Leu Ag 90 99 |
| Ser | Ser Trp | Val Met Thu? Ctys ALa 100 | Tyr Ala Pro Ser Gly Asn Phe Val 105 110 |
| Ala | Cys Gly 115 | Gly Leu Ap Asn Met 122 | Cys Ser Ile Ityr lsn leu Lys Ser 125 |
| Arg | Glu Gly 130 | Asn Vvl ?ys Vl1 Ser 115 | Aug Ulg Leu Ser Ali uSu SAu? dy 11(3 |
| Tyr 145 | Leu Ser | Cys Cys Arg Phe Leu 150 | Asp Asp Asn •lsn Ile Val TTu? Ser 155 110 |
| Ser | Gly Asj? | Ihr Thu Cys Ala Leu 165 | Tup lsp Ile Glu Tłu? Gly Gln Gln 170 117 |
| Lys | Thr Val | Phe Val Gly His Thr 180 | Gly Asp -tys Met Seu Leu Aa Val 185 119 |
| Ser | Pro Asp 195 | Phe An leu Phe Ile 220 | Ser Gly Ala Ctyi Asp Aa Ser Aa 205 |
| Lys | Leu TrT> Ap Val Arg Glu Glu 210 221 | Thr Cy? Arg Gln Ths ghu Thu GUy 220 | |
| Hls 225 | Glu Sei? | Ap Ile Asn .Ala Ile 230 | Cys Phe Phe Puo lsn lly Glu Aa 2133 220 |
| Ile | Cys Tłu? | Gly Ser Asp Asp Ala 205 | Ser Cys Arg Luu Phe lsp Llu VAu 220 225 |
| Ala | Asp Gln | Glu Leu Ile Cys Phe 260 | Ser His Gln SSr Ilu Ilu Vyi Gl265 227 |
185 779
| Ile | Thr Ser: 275 | Val ALa Phe Ser Leu Ser Gly Arg łLsu Leu Phe Ala GGy | |||||||||||
| 280 | 285 | ||||||||||||
| Tyr Asp 290 | Asp | Phe | Asn | C^y | Asn 295 | Val | Tip Asp | Ser Mee 300 | Lys | Ser | Glu | Asy | |
| Val 305 | Gly | Ile | Leu | Ser | GGy 330 | His | Asp Asn Arg | Val 315 | Ser | Cys | Leu | Gly | Val 320 |
| Thr | Ala | Asp | Gly | Met 325 | TAa | Val | ALa | Thr Gly 330 | Ser | Trp Asp | Ser | Phe 335 | Llu |
Lys Ile Trp Asn * 340
ΚΓμΤΝΤΜΤ HT HT W ΗΪ HT
Departament Wydawnictw UP RP. Nakład 50 egz.
Cena 2,00 zł.
Claims (6)
- Zastrzeżenia patentowe1. Sposób oceniania ryzyka rozwoju zaburzeń związanych ze złą regulacją białka G u pacjenta, znamienny tym, że sekwencję genu podjednostki β3 ludzkiego białka G pacjenta porównuje się in vitro z sekwencją genu SEQ ID NO: 1 i w przypadku gdy w pozycji 825 znajduje się tymina (T), przypisuje się pacjentowi zwiększone ryzyko rozwoju zaburzenia związanego ze złą regulacją białka G.
- 2. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że porównanie genów prowadzi się przez sekwencjonowanie.
- 3. Sposób według zastrz. 2, znamienny tym, że obszar genu zawierający pozycję 825 amplifikuje się przed sekwencjonowaniem.
- 4. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że porównanie genów prowadzi się przez hybrydyzację.
- 5. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że porównanie genów prowadzi się przez trawienie enzymami restrykcyjnymi.
- 6. Sposób według zastrz. 5, znamienny tym, że jako enzym restrykcyjny stosuje się Dsa I.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| DE19619362A DE19619362A1 (de) | 1996-05-14 | 1996-05-14 | Verwendung einer Genveränderung im Gen für humanes G-Protein beta-3-Untereinheit zur Diagnostik von Erkrankungen |
| PCT/EP1997/002250 WO1997043442A1 (de) | 1996-05-14 | 1997-05-02 | VERWENDUNG EINER GENVERÄNDERUNG IM GEN FÜR DIE HUMANE G-PROTEIN β3-UNTEREINHEIT ZUR DIAGNOSTIK VON ERKRANKUNGEN |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| PL330014A1 PL330014A1 (en) | 1999-04-26 |
| PL185779B1 true PL185779B1 (pl) | 2003-07-31 |
Family
ID=7794252
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| PL97330014A PL185779B1 (pl) | 1996-05-14 | 1997-05-02 | Sposób oceniania ryzyka rozwoju zaburzeń związanych ze złą regulacją białka G |
Country Status (23)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US6242181B1 (pl) |
| EP (1) | EP0939833B1 (pl) |
| JP (1) | JP2000509990A (pl) |
| KR (1) | KR20000010988A (pl) |
| CN (1) | CN1218515A (pl) |
| AT (1) | ATE212066T1 (pl) |
| AU (1) | AU732535B2 (pl) |
| BG (1) | BG63214B1 (pl) |
| BR (1) | BR9709245A (pl) |
| CA (1) | CA2252921C (pl) |
| CZ (1) | CZ292691B6 (pl) |
| DE (2) | DE19619362A1 (pl) |
| EA (1) | EA199800959A1 (pl) |
| HU (1) | HUP9903661A3 (pl) |
| IL (1) | IL126511A (pl) |
| NO (1) | NO985280D0 (pl) |
| NZ (1) | NZ332279A (pl) |
| PL (1) | PL185779B1 (pl) |
| SK (1) | SK282675B6 (pl) |
| TR (1) | TR199802300T2 (pl) |
| UA (1) | UA56164C2 (pl) |
| WO (1) | WO1997043442A1 (pl) |
| ZA (1) | ZA974102B (pl) |
Families Citing this family (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| DE19637518A1 (de) * | 1996-09-13 | 1998-04-09 | Winfried Siffert | PTX-sensitive G-Proteine, ihre Herstellung und Verwendung |
| AU3304499A (en) * | 1998-02-20 | 1999-09-06 | City Of Hope | Association of the serotonin transport (htt) gene with cardiovascular disease and longevity |
| JP2002525051A (ja) * | 1998-09-10 | 2002-08-13 | ジフェルト，ビンフリート | ヒトｇタンパク質のｇベータ３サブユニットのための遺伝子内の遺伝子変更 |
| WO2001057246A1 (de) * | 2000-02-03 | 2001-08-09 | Winfried Siffert | VERWENDUNG EINER GENVERÄNDERUNG IM GEN FÜR DIE β3-UNTEREINHEIT DES HUMANEN G-PROTEINS |
| JP4140329B2 (ja) | 2002-09-25 | 2008-08-27 | 財団法人名古屋産業科学研究所 | 高血圧のリスク診断方法 |
| EP2463384A3 (en) | 2010-12-07 | 2013-03-13 | Medtronic, Inc. | Diagnostic kits, genetic markers and methods for SCD or SCA therapy selection |
| WO2019191010A1 (en) * | 2018-03-27 | 2019-10-03 | Aardvark Therapeutics Inc. | Personalized treatment method for congestive heart failure |
Family Cites Families (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| DE19637518A1 (de) * | 1996-09-13 | 1998-04-09 | Winfried Siffert | PTX-sensitive G-Proteine, ihre Herstellung und Verwendung |
| JP2002525051A (ja) * | 1998-09-10 | 2002-08-13 | ジフェルト，ビンフリート | ヒトｇタンパク質のｇベータ３サブユニットのための遺伝子内の遺伝子変更 |
-
1996
- 1996-05-14 DE DE19619362A patent/DE19619362A1/de not_active Withdrawn
-
1997
- 1997-02-05 UA UA98116016A patent/UA56164C2/uk unknown
- 1997-05-02 WO PCT/EP1997/002250 patent/WO1997043442A1/de active IP Right Grant
- 1997-05-02 CA CA 2252921 patent/CA2252921C/en not_active Expired - Fee Related
- 1997-05-02 PL PL97330014A patent/PL185779B1/pl not_active IP Right Cessation
- 1997-05-02 SK SK1573-98A patent/SK282675B6/sk unknown
- 1997-05-02 NZ NZ33227997A patent/NZ332279A/xx unknown
- 1997-05-02 EA EA199800959A patent/EA199800959A1/ru unknown
- 1997-05-02 CN CN97194612A patent/CN1218515A/zh active Pending
- 1997-05-02 BR BR9709245A patent/BR9709245A/pt active Search and Examination
- 1997-05-02 DE DE59706027T patent/DE59706027D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1997-05-02 TR TR1998/02300T patent/TR199802300T2/xx unknown
- 1997-05-02 HU HU9903661A patent/HUP9903661A3/hu not_active Application Discontinuation
- 1997-05-02 AU AU28902/97A patent/AU732535B2/en not_active Ceased
- 1997-05-02 AT AT97922940T patent/ATE212066T1/de active
- 1997-05-02 KR KR1019980709137A patent/KR20000010988A/ko not_active Application Discontinuation
- 1997-05-02 JP JP54045197A patent/JP2000509990A/ja active Pending
- 1997-05-02 EP EP97922940A patent/EP0939833B1/de not_active Expired - Lifetime
- 1997-05-02 CZ CZ19983696A patent/CZ292691B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1997-05-02 IL IL12651197A patent/IL126511A/xx not_active IP Right Cessation
- 1997-05-02 US US09/180,783 patent/US6242181B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1997-05-13 ZA ZA974102A patent/ZA974102B/xx unknown
-
1998
- 1998-10-29 BG BG102878A patent/BG63214B1/bg unknown
- 1998-11-12 NO NO985280A patent/NO985280D0/no not_active Application Discontinuation
-
2001
- 2001-04-16 US US09/836,697 patent/US20020142311A1/en not_active Abandoned
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| TR199802300T2 (xx) | 1999-02-22 |
| AU2890297A (en) | 1997-12-05 |
| US20020142311A1 (en) | 2002-10-03 |
| CN1218515A (zh) | 1999-06-02 |
| BR9709245A (pt) | 1999-08-10 |
| DE59706027D1 (de) | 2002-02-21 |
| SK282675B6 (sk) | 2002-11-06 |
| AU732535B2 (en) | 2001-04-26 |
| JP2000509990A (ja) | 2000-08-08 |
| EP0939833B1 (de) | 2002-01-16 |
| BG63214B1 (bg) | 2001-06-29 |
| CA2252921A1 (en) | 1997-11-20 |
| CZ292691B6 (cs) | 2003-11-12 |
| ATE212066T1 (de) | 2002-02-15 |
| CA2252921C (en) | 2008-07-08 |
| ZA974102B (en) | 1998-11-13 |
| NO985280L (no) | 1998-11-12 |
| DE19619362A1 (de) | 1997-11-20 |
| US6242181B1 (en) | 2001-06-05 |
| HUP9903661A2 (hu) | 2000-03-28 |
| SK157398A3 (en) | 2000-01-18 |
| HUP9903661A3 (en) | 2000-09-28 |
| UA56164C2 (uk) | 2003-05-15 |
| BG102878A (en) | 1999-05-31 |
| EP0939833A1 (de) | 1999-09-08 |
| WO1997043442A1 (de) | 1997-11-20 |
| NZ332279A (en) | 2000-04-28 |
| EA199800959A1 (ru) | 1999-06-24 |
| NO985280D0 (no) | 1998-11-12 |
| IL126511A0 (en) | 1999-08-17 |
| KR20000010988A (ko) | 2000-02-25 |
| PL330014A1 (en) | 1999-04-26 |
| IL126511A (en) | 2003-11-23 |
| CZ369698A3 (cs) | 1999-08-11 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Menold et al. | Association analysis of chromosome 15 gabaa receptor subunit genes in autistic disorder | |
| AU760224B2 (en) | Isolated nucleic acid molecules which encode T cell inducible factors (TIFs), the proteins encoded, and uses thereof | |
| US20030092013A1 (en) | Diagnosis and treatment of vascular disease | |
| Bovolin et al. | Distinct Developmental Patterns of Expression of Rat α1, α5, γ2S, andα12Lγ‐Aminobutyric AcidA Receptor Subunit mRNAs In Vivo and In Vitro | |
| US20030087244A1 (en) | Diagnosis and treatment of vascular disease | |
| ES2331407T3 (es) | Composiciones, kits y procedimientos de identificacion y modulacion de diabetes tipo i. | |
| JP2003529315A (ja) | 病気の診断および治療のための成分および方法 | |
| EP2510115B9 (en) | Single nucleotide polymorphisms associated with dietary weight loss | |
| Bovolin et al. | Distinct developmental patterns of expression of rat al, a5, Y2S, and Y2L y-aminobutyric acidA receptor subunit mRNAs in vivo and in vitro | |
| PL185779B1 (pl) | Sposób oceniania ryzyka rozwoju zaburzeń związanych ze złą regulacją białka G | |
| Büscher et al. | Variability in phenylephrine response and essential hypertension: a search for human α1B-adrenergic receptor polymorphisms | |
| US20050147987A1 (en) | Polymorphisms in known genes associated with type II diabetes and obesity, methods of detection and uses thereof | |
| AU2006307640A2 (en) | Genetic variants of human inositol polyphosphate-4-phosphatase, type I (INPP4A) useful for prediction and therapy of immunological disorders | |
| US6458541B1 (en) | BDNF polymorphism and association with bipolar disorder | |
| US5869247A (en) | Natural resistance associated macrophage protein and uses thereof | |
| CA2278502A1 (en) | Genetic methods for identifying individuals for improving well being and performance through exercise | |
| Shinkai et al. | Genomic structure of eight porcine chemokine receptors and intergene sharing of an exon between CCR1 and XCR1 | |
| Dry et al. | The complete sequence of the human locus for NgCAM-related cell adhesion molecule reveals a novel alternative exon in chick and man and conserved genomic organization for the L1 subfamily | |
| CA2265467A1 (en) | Ptx sensitive g proteins, the production and use thereof | |
| US5882894A (en) | Nucleic acids encoding CR8 polypeptides, vector and transformed cell thereof, and expression thereof | |
| Öhman | The search for genes predisposing to obesity | |
| CA2531768A1 (en) | Chrna2 genetic markers associated with galantamine response | |
| Markel | A molecular genetic analysis of ethanol-induced anesthesia in the LSXSS recombinant-inbred strains | |
| Saeed | Genetics of early onset of severe obesity in a consanguineous population | |
| Lowe | Linkage mapping and molecular characterization of canine inherited eye diseases |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| LAPS | Decisions on the lapse of the protection rights |
Effective date: 20060502 |