BG63214B1 - Приложение на мутация в гена на човешката g-протеинова бета 3-субединица за диагностициране на заболявания - Google Patents
Приложение на мутация в гена на човешката g-протеинова бета 3-субединица за диагностициране на заболявания Download PDFInfo
- Publication number
- BG63214B1 BG63214B1 BG102878A BG10287898A BG63214B1 BG 63214 B1 BG63214 B1 BG 63214B1 BG 102878 A BG102878 A BG 102878A BG 10287898 A BG10287898 A BG 10287898A BG 63214 B1 BG63214 B1 BG 63214B1
- Authority
- BG
- Bulgaria
- Prior art keywords
- sir
- ala
- protein
- leu
- gly
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
Abstract
Изобретението се отнася до използване на генетична промяна в гена на човешкия G-протеин 3-подединица за диагностика на заболявания.
Description
Изобретението се отнася до метод за диагностика на заболявания с помощта на генетичен анализ, по-специално на анализ на гени за субединици на човешките свързващи гуаниннуклеотид протеини (G-протеини).
Предшестващо състояние на техниката
Хетеротримерните свързващи гуаниннуклеотид протеини (G-протеини) имат изключително значение при вътрешноклетьчната трансдукция на сигнали. Те спомагат за предаването на външноклетъчни сигнали след стимулацията на хормонални и други рецептори, които след активирането на рецепторите претърпяват конформационна промяна. Това води до активиране на G-протеини, които впоследствие могат да активират или възпират вътрешноклетьчни ефектори (например йонни канали, ензими). Хетеротримерните G-протеини са съставени от три субединици, а именно субединици α, β и γ. Досега с помощта на биохимични и молекулярно-биологични методи е доказано съществуването на няколко различни а-субединици, на 5 β-субединици и на около 12 γ-субединици (Bimbaumer, L. и Bimbaumer, М. Signal trandsduction by G proteins: 1994 edition. J. Recept. Res. 15:213β252, 1995; Offermanns, S. and Schultz, G. Complex information processing by the transmembrane signaling system involving G proteins. Naunyn Schmiedebergs Arch. Pharmacol. 350:329-338,1994; Numberg, B., Gudermann, T., and Schultz, G. Receptors and G proteins as primery components of transmembrane signal transduction. Part 2. G proteins: structure and function. J. Mol. Med. 73:123-132, 1995; Neer, E. J. Heterotrimeric G proteins: Organizers of Transmembrane Signals. Cell 80:249-257, 1995; Rens-Domiano, S. and Hamm, Η. E. Structural and functional relationships of heterotrimeric Gproteins. FASEB J. 9:1059-1066, 1995).
Същност на изобретението
Медиираното от рецептори активиране на определени субединици може да бъде възпряно чрез предварителна обработка с пертусистоксин (РТХ). Към тях се числят по-специално α-изоформите ail, ai2 и ai3, както и различни о-субединици. Тези G-протеини се наричат и “чувствителни към РТХ G-протеини”.
Установено е, че една мутация в гена на човешката G-протеинова бЗ-субединица е подходяща за диагностика на заболявания. Тази мутация е подходяща най-вече за определяне на риска от заболяване от болест, свързана с погрешното управление на G-протеините.
Друг обект на изобретението е метод за определяне на относителния риск от заболявания, свързани с неправилно управление на Gпротеина при лице, подложено на пробни тестове, състоящ се в това, че се сравнява генетичната последователност на човешката G-протеинова 63-субединица на лицето, подложено на пробни тестове с генетичната последователност SEQ ID NO: 1 и в случай, че на позиция 825 е налице тимин (Т), за лицето, подложено на пробни тестове, се определя висок риск от заболяване.
Установената мутация е разположена в гена на човешката G-протеинова 63-субединица. Този ген е описан от Levine et al. (Proc. Natl. Acad. Sci USA, Vol 87, стр. 2329-2333, (1990). Кодиращият обсег е в позиция 275 Ser-Codon (ТСТ), докато лица, подложени на пробни тестове и показали повишен риск от заболяване, което е свързано с погрешно управление на G-протеина, имат на тази позиция също кодиращия за Ser Codon ТСТ. Мутацията е обмен на бази в позиция 825, при което Cytosin (С) се замества с Thymin (Т). На аминокиселинно ниво този обмен на бази е все пак “ням”, т.е. не води до вграждането на друга аминокиселина в тази позиция. Откритата при лица, подложени на пробни тестове и имащи повишен риск от заболяване, последователност е представена в SEQ ID N0:1 от секвенционния листинг.
Мутацията се появява по правило в хетерозиготна форма.
Под болести, свързани с погрешно управление на G-пртеина, следва да се разбират такива заболявания, при които G-протеинът е включен в трансдукцията на сигнали и не изпълнява своята функция по физиологичен начин.
Погрешното управление може да се дъл жи на редица причини, например промяна в структурния ген или променена генетична експресия.
В случая става дума за заболявания на сърдечно-свдовата система, за смущения на обмяната на веществата и за имунни заболявания.
Като заболявания на сърдечно-съдовата система могат да се посочат: хипертонията, хипертонията при бременност (гестоза, “hypertensions in pregnancy”), коронарните сърдечни заболявания, локализираната и/или генерализираната артеросклероза, стенозите на кръвоносните съдове, рестенозите след реваскуларизиращи съдови операции (напр. РТСА със и без стент-имплантация), склонността към апоплексия, към тромбоза и повишеното натрупване на тромбоцити.
Като смущения в обмяната на веществата могат да се посочат: метаболичния синдром, инсулиновата резистентност и хиперинсулинемията, Тур П-Diabetes mellitus, усложненията при диабета (напр. нефропатията, невропатията, ретинопатията и др.), смущенията на обмена на мастните вещества, нарушената централна хеморецепция (СО2-толерантност, ацидозната толерантност, внезапната смърт при децата (SIDS)).
Като имунни заболявания могат да се посочат: нарушената устойчивост на телесната имунна реакция (образуването на имуноглобулини, агресивността на Т-клетките и на NK-клетките), нарушената обща склонност към пролиферация, вкл. способността на заздравяване на рани, склонността към образуване на тумори и пролиферация, вкл. потенциала към метастазиране на злокачествено трансформирани клетки, продължителността на латентния период след HIV-инфекция до клиничното развитие на заболяването, Kaposi-Sarkom, склонността към цироза на черния дроб, толерантността при трансплантации и отхвърлянето на трансплантанти.
Използването на мутацията съгласно изобретението е особено подходящо за определяне на риска от заболяване от хипертония.
Друг обект на изобретението е създаването на трансгенни животни, носещи посочената генетична мутация. Такива трансгенни животни са от голямо значение преди всичко като животински модели за изследване и терапия на посочените заболявания. Методите за създаване на трансгенни животни са общоизвестни за специалистите.
При метода за определяне на относителния риск от заболявания съгласно изобретението на лице, подложено на пробни тестове, се взима материал от тялото, съдържащ генетична информация за лицето. Това се постига по правило чрез взимане на кръв и изолирането от нея на нуклеинова киселина.
От изолираната нуклеинова киселина на лицето, подложено на пробни тестове, се определя генната структура на G-протеинова β3субединица и се сравнява с посочената в SEQ ID N0:1 последователност.
Определянето на генната структура може да се извърши чрез секвениране на нуклеинова киселина. То може да се извърши или директно от геномната ДНК, или след амплификация на нуклеиновата киселина например с помощта на PCR-техника.
Генната структура може да се извърши на геномно равнище или също и на шРНК или на сДНК равнище.
За предпочитане е определянето чрез секвениране след PCR-амплификация на сДНК. Подходящите за PCR-реакция примери могат лесно да се извлекат от специалиста от представените в SEQ ID N0:1 последователности. Препоръчително е да се действа така, че да се избере съответно по един щранг и противоположен щранг от свързващи примери преди и след съществената основна (базисна) позиция 825.
Генетичното сравнение може да се извърши и по други методи, например чрез селективната хибридизация или чрез съответното картиране (изобразяване на карта) с рестрикционни ензими. Основният (базисен) обмен С -» Т в посочената позиция 825 води до загуба на една пресечна точка за рестрикционния ензим Dsa I, което също служи за доказване на този генетичен полиморфизъм.
В случай, че лицето, подложено на пробни тестове, е носител на тимин (Т) в позиция 825, се определя повишен риск от заболяване в сравнение с лице, носител на Cytosin (С) в тази позиция.
Примери
Изобретението се пояснява със следните примери.
Пример 1. Доказване на мутация при хипертоници чрез секвениране.
При предварителни изследвания е доказана повишената способност за активиране на чувствителните към РТХ G-протеини при пациенти с есенциална хипертония. Това доказателство се получава в имортализирани клетки на такива пациенти, имащи като фенотипичен маркер повишена активност на Na/Н-обменителя. Повишената способност за активиране на чувствителните към РТХ G-протеини има важни последици за клетъчната функция. Тук се числят повишеното образуване на вътрешноклетъчни молекули “second messenger” (напр. инозитол-1,4,5-трисфосфат), повишеното освобождаване на вътрешноклетъчни Сан-йони, повишеното образуване на имунни глобулини и ускореното нарастване на клетките. Тъй като тези промени трябва да се докажат в имортализирани клетки и след дълга продължителност на клетъчната култура, може да се изходи оттам, че тази промяна е генетично фиксирана (Rosskopf, D., Fromter, Е. and Siffett, W. Hypertensive sodium-proton exchanger phenotype persists in immortalized lymphoblasts from essential hypertensitive patients-a cell culture model for human hypertension. J. Clin. Invest. 92:2553-2559, 1993; Rosskopf, D., Hartung, K., Hense, J., and Siffert, W. Enhanced immunoglobulin formation of immortalized B cells from hypertensive patients. Hypertension 26:432-435, 1995; Rosskopf, D., Schroder, K.-J., and Siffert, W. Role of sodiumhydrogen exchange in the proliferation of immortalised lymphoblasts from patients with essential hypertension and normotensive subjects. Cardiovasc. Res. 29:254-259, 1995; Siffert, W„ Rosskopf, D., Moritz, A., Wieland, T., KaldenbergStasch, S., Kettler, N., Hartung, K., Beckmann, S., and Jakobs, K. H. Enhanced G protein activation in immortalized lymphoblasts from patients with essential hypertension. J. Clin. Invest. 96:759-766, 1995).
От имортализирани клетъчни линии на хипертоници по стандартен метод се получава РНК, локализирана в сДНК с помощта на обратна транскриптаза. Чрез полимеразна верижна реакция (PCR), кодиращата G-протеина субединица на сДНК се амплифицира и секвенира. За PCR-реакцията са използвани следните олигонуклеотидни праймери:
5’-TGG GGG AGA TGG AGC AAC TG и 5’-CTG CTG AGT GTG TTC ACT GCC.
В сравнение c публикуваната от Levine et al последователност (Levine, M. A., Smallwood, P. M., Moen, P. T., Jr., Helman, L. J., and Ahn, T. G. Molecular cloning of β3 subunit, a third 5 from of the G protein β-subunit polypeptide. Proc. Natl. Acad. Sci„ USA 87(6):2329-2333, 1990) в сДНК от клетките на хипертоници се открива следното отклонение: нуклеотид 825 цитозин (С) в границите на кодиращата последовател10 ност се заменя от тимин (Т) (нуклеотид 1 съответства на основата А на старткодона ATG). Този обмен на бази води до ням полиморфизъм, т.е. кодираната чрез съответния основен триплет аминокиселина (серин) не се променя 15 спрямо оригиналната последователност. Откритата ДНК-последователност е описана в SEQ ID N0:1.
Пример 2. Доказване на мутация при хипертоници чрез анализ с рестрикционни ен20 зими.
На схемата е представено генетично сравнение на нормотоници и хипертоници чрез анализ с рестрикционни ензими. В случая амплифицираната с помощта на PCR и кодираща 25 G3 сДНК от клетки на нормотоници (NT) и на хипертоници (НТ) се подлага на анализ с рестрикционния ензим Dsa I. Продуктите от реакцията се отделят в агарозен гел, както е представено на схемата. На схемата ясно се вижда 30 пълната рестрикция на G3 сДНК от клетките на нормотоници по Verdau с Dsa I. сДНК от клетките на хипертоници се рестриктира само частично от Dsa I. Освен очакваните рестрикционни продукти, се получава и нерестрикци35 онен PCR-продукт. Отляво и отдясно са нанесени референтни фрагменти (маркери) за сравнение на размера. Четири от петте представени тук ДНК-последователности на хипертоници показват описания по-горе обмен на бази и 40 са хетерозиготни за тази промяна.
Секвенционен листинг (1) ОБЩА ИНФОРМАЦИЯ:
(i) ЗАЯВИТЕЛ:
(А) ИМЕ: BASF Aktiengesellschaft (В) УЛИЦА: Карл-Бош-Щрасе 38 (С) МЯСТО: Лудвигсхафен (E) ДЪРЖАВА: Федерална република Германия (F) ПОЩЕНСКИ КОД: D-67056 (G) ТЕЛЕФОН: 0621/6048526 (H) ТЕЛЕФАКС: 0621:6043123 (I) ТЕЛЕКС: 1762175170 (ii) НАИМЕНОВАНИЕ HA
ИЗОБРЕТЕНИЕТО: Метод за диагностика на заболявания с помощта на генетичен анализ (iii) БРОЙ НА ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТИТЕ: 2 (iv) КОМПЮТЪРНО-ЧИТАЕМА ФОРМА:
(A) УСТРОЙСТВО: флопи диск (B) КОМПЮТЪР: IBM PC compatible (C) РАБОТНА СИСТЕМА: PC-DOS/MSDOS (D) СОФТУЕР: Patentin Release # 1.0, версия # 1.25 (ЕРА) (2) ИНФОРМАЦИЯ ЗА SEQ ID N0:1 (i) ХАРАКТЕРИСТИКА НА ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТТА (A) ДЪЛЖИНА: 1517 основни чифтове (двойки) (B) ВИД: нуклеинова киселина (C) ФОРМА НА ВЕРИГАТА: двойна (D) ТОПОЛОГИЯ: линеарна (ii) ВИД НА МОЛЕКУЛАТА: eDNS към mRNS (iii) ХИПОТЕТИЧНОСТ: не (iv) АНТИЧУВСТВИТЕЛНОСТ: не (ν) ПЪРВОНАЧАЛЕН ПРОИЗХОД:
(А) ОРГАНИЗЪМ: Homo sapiens (ix) ОСОБЕНОСТИ:
(A) ИМЕ/КЛЮЧ: CDS (B) ПОЛОЖЕНИЕ: I 1024 (xi) ОПИСАНИЕ НА ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТТА: SEQ ID N0:1
ATG | GGG | GAG | ATG | GAG | CAA | CTG | CGT | CAG | GAA | GCG | GAG | CAG | CTC | AAG | AAG | 48 |
Met | Gly | Glu | Met | Glu | Gin | Leu | Arg | Gin | Glu | Ala | Glu | Gin | Leu | Lys | Lys | |
1 | 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
CAG | ATT | GCA | GAT | GCC | AGG | AAA | GCC | TGT | OCT | GAC | GTT | XCT | CTG | GCA | GAG | $6 |
Gin | lie | Ala | Asp | Ala | Arg | Lys | Ala | Cys | Ala | Asp | Vai | Thr | Leu | Ala | Glu | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
CTG | GTG | TCT | GGC | CTA | GAG | GTG | GTG | GGA | CGA | GTC | CAG | ATG | CGG | ACG | CGG | 144 |
Leu | Vai | Ser | Gly | Leu | Glu | Vai | Vai | Gly | Arg | Vai | Gin | Met | Arg | Thr | Arg | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
CGG | ACG | TTA | AGG | GGA | CAC | CTG | GCC | AAG | ATT | TAC | GCC | ATG | CAC | TGG | GCC | 192 |
Arg | Thr | Leu | Arg | Gly | His | Leu | Ala | Lys | lie | Tyr | Ala | Met | His | Trp | Ala | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
ACT | GAT | TCT | AAG | CTG | CTG | GTA | AGT | GCC | TCG | CAA | GAT | GGG | AAG | CTG | ATC | 240 |
Thr | Asp | Ser | Lys | Leu | Leu | Vai | Ser | Ala | Ser | Glx | AS? | Gly | Lys | Leu | He | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
GTG | TGG | GAC | AGC | TAC | ACC | ACC | AAC | AAG | GTG | CAC | GCC | ATC | CCA | CTG | CGC | 238 |
Vai | Trp | Asp | Ser | Tyr | Thr | Thr | Asn | Lys | Vai | His | Ala | He | Pro | Leu | Arg | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
TCC | TCC | TGG | GTC | ATG | ACC | TGT | GCC | TAT | GCC | CCA | TCA | GGG | AAC | TTT | GTG | 336,. |
Ser | Ser | Trp | Vai | Met | Thr | cys | Ala | Tyr | Ala | Pro | Ser | Gly | Asn | Phe | Vai | |
100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
GCA | TGT | GGG | GGG | CTG | GAC | AAC | ACG | TGT | TCC | ATC | TAC | AAC | CTC | AAA | TCC | 334 |
Ala | Cys | Gly | Gly | Leu | Asp | Asn | Met | Cys | Ser | He | Tyr | Asn | Leu | Lys | Ser | |
115 | 120 | :25 | ||||||||||||||
CGT | GAG | GGC | AAT | GTC | AAG | GTC | AGC | CGG | GAG | CTT | TCT | GCT | CAC | ACA | GGT | 432 |
Arg | Glu | Gly | Asn | Vai | Lys | Vai | Ser | Arg | Glu | Leu | Ser | Ala | His | Thr | Gly | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
TAT | CTC | TCC | TGC | TGC | CGC | TTC | CTG | GAT | GAC | AAC | AAT | ATT | GTG | ACC | AGC | 480 |
Tyr | Leu | Ser | Cys | Cys | Arg | Phe | Leu | Asp | Asp | Asn | Asn | He | Vai | Thr | Ser | |
145 | 150 | 155 | 160 | |||||||||||||
TCG | GGG | GAC | ACC | ACG | TGT | GCC | TTG | TGG | GAC | ATT | GAG | ACT | GGG | CAG | CAG | 528 |
Ser | Gly | Asp | Thr | Thr | Cys | Ala | Leu | Trp | Asp | lie | Glu | Thr | Gly | Gin | Gin | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
AAG | ACT | GTA | TTT | GTG | GGA | CAC | ACG | GGT | GAC | TGC | ATG | AGC | CTG | GCT | GTG | 576 |
Lys | Thr | Vai | Phe | Vai | Gly | His | Thr | Gly | Asp | Cys | Met | Ser | Leu | Ala | Vai | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
TCT | CCT | GAC | TTC | AAT | CTC | TTC | ATT | TCG | GGG | GCC | TGT | GAT | GCC | AGT | GCC | 624 |
Ser | Pro | Asp | Phe | Asn | Leu | Phe | lie | Ser | Gly | Ala | Cys | Asp | Ala | Ser | Ala | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
AAG | CTC | TGG | GAT | GTG | CGA | GAG | GGG | ACC | TGC | CGT | CAG | ACT | TTC | ACT | GGC | 672 |
Lys | Leu | Trp | Asp | Vai | Arg | Glu | Gly | Thr | Cys | Arg | Gin | Thr | Phe | Thr | Gly |
672
AAG | CTC | TGG | GAT | GTG | CGA | GAG | GGG | ACC | TGC | CGT | CAG | ACT | TTC | ACT | GGC |
Lys | Leu | Trp | Asp | Vai | Arg | Glu | Gly | Thr | Cys | Arg | Gin | Thr | Phe | Thr | Gly |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
CAC | GAG | TCG | GAC | ATC | AAC | GCC | ATC | TGT | TTC | TTC | CCC | AAT | GGA | GAG | GCC |
His | Glu | Ser | Asp | He | Asn | Ala | Zle | Cys | Phe | Phe | Pro | Asn | Gly | Glu | Ala |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
ATC | TGC | ACG | GGC | TCG | GAT | GAC | GCT | TCC | TGC | CGC | TTG | TTT | GAC | CTG | CGG |
lie | Cys | Thr | Gly | Ser | Asp | Asp | Ala | Ser | Cys | Arg | Leu | Phe | Asp | Leu | Arg |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
GCA | GAC | CAG | GAG | CTG | ATC | TCC | TTC | TCC | CAC | GAG | AGC | ATC | ATC | TGC | GGC |
Ala | Asp | Gin | Glu | Leu | lie | Cys | ?he | Ser | His | Glu | Ser | lie | lie | Cys | Gly |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
ATC | ACG | TCT | GTG | GCC | TTC | TCC | CTC | AGT | GGC | CGC | CTA | CTA | TTC | GCT | GGC |
lie | Thr | Ser | Vai | Ala | Phe | Ser | Leu | Ser | Gly | Arg | Leu | Leu | Phe | Ala | Gly |
275 | 280 | 28S | |||||||||||||
TAC | GAC | GAC | TTC | AAC | TGC | AAT | GTC | TGG | GAC | TCC | ATG | AAG | TCT | GAG | CGT |
Tyr | Asp | Asp | Phe | Asn | Cys | Asn | Vai | Trp | Asp | Ser | Het | Lys | Ser | Glu | Arg |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
GIG | GGC | ATC | CTC | TCT | GGC | CAC | GAT | AAC | AGG | GTG | AGC | TGC | CTG | GGA | GTC |
Vai | Gly | Zle | Leu | Ser | Gly | His | Asp | Ask | Arg | Vai | Ser | cys | Leu | Gly | Vai |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
ACA | GCT | GAC | GGG | ATG | GCT | GTG | GCC | ACA | GGT | TCC | TGG | GAC | AGC | TTC | CTC |
Thr | Ala | Asp | Gly | Met | Ala | Vai | Ala | Thr | Gly | Ser | Trp Asp | Ser | Phe | Leu | |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
AAA | ATC | TGG | AAC | TGA | G GAGGCTGGAG AAAGGGAAGT | GGAAGGCAGT GAACACACTC | |||||||||
Lys | lie | Trp | Asn | * | |||||||||||
340 |
720
768
816
864
912
960
1003
1064
AGCAGCCCCC TGCCCGACCC CATCTCATTC AGGTGTTCTC TTCTATATTC CGGGTGCCAT TCCCACTAAG СТТГСТССТГ TGASGGCAGT GGGGAGCATG GGACTGTGCC TTTQGGAGGC AGCATCAGSG ACACAGGGQC AAAGAACTGC CCCATCTCCT CCCATGOCCT TCCCTCCCCA CAGTCCTCAC AGCCTCTCCC TTAATGAGCA AGGACAACCT GCCCCTCCCC AGCCCTTTGC AGGCCCAGCA GACTTGAGTC TGAGGCCCCA GGCCCTAGGA TTCCTCCCCC AGAGCCACTA CCTTTGTCCA GGCCTGGGTG GTATAGGGCG TTTGGCCCTG TGACTATGGC TCTGGCACCA CTAGGGTCCT GGCCCTCTTC TTATTCATGC TTTCTCCTTT TTCTACCTTT TTTTCTCTCC TAAGACACCT GCAATAAAGT GTAGCACCCT GGT
1124
1184
1244 i304
1364
1424
1484
1517 (i) ХАРАКТЕРИСТИКА HA ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТТА (A) ДЪЛЖИНА: 341 аминокиселини (B) ВИД: аминокиселина (D) ТОПОЛОГИЯ: линеарна (ii) ВИД НА МОЛЕКУЛАТА: протеин (xi) ОПИСАНИЕ НА ПОСЛЕДОВА ТЕЛНОСТТА: SEQ ID N0:2:
Met 1 | Gly Glu Met | Glu 5 | Gin Leu arg uxn uxu axa uxu »xn Leu Lys | Lys | |||||||||||
10 | 15 | ||||||||||||||
Gin | lie | Ala | Asp | Ala | Arg | Lys | Ala | Cys | Ala | Asp | Val | Thr | Leu | Ala | Glu |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Leu | Vai | Ser | Gly | Leu | Glu | Val | Val | Gly | Arg | Val | Gin | Met | Arg | Thr | Arg |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Arg | Thr | Leu | Arg | Gly | His | Leu | Ala | Lys | lie | Tyr | Ala | Met | His | Trp | Ala |
50 | 55 | 80 | |||||||||||||
Thr | Asp | Ser | Lys | Leu | Leu | Val | Ser | Ala | Ser | Gin | Asp | Gly | Lys | Leu | Zle |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Vai | Trp | Asp | Ser | Tyr | Thr | Thr | Asn | Lys | Val | His | Ala | Zle | Pro | Leu | Arg |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Ser | Ser | Trp | val | Met | Thr | Cys | Ala | Tyr | Ala | Pro | Ser | Gly | Aen | Phe | Val |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Ala | Cys | Gly | Gly | Leu | Asp | Asn | Met | Cys | Ser | He | Tyr | Asn | Leu | Lys | Ser |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Arg | Glu | Gly | Asn | Val | Lys | Val | Ser | Arg | Glu | Leu | Ser | Ala | His | Thr | Gly |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Tyr | Leu | Ser | Cys | Cys | Arg | Phe | Leu | Asp Asp | Asn | Asn | Zle | Val | Thr | Ser |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Ser | Gly | Asp | Thr | Thr | Cys | Ala | Leu | Trp Asp | lie | Glu | Thr | Gly | Gin | Gin | |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Lys | Thr | Vai | Phe | Vai | Gly | His | Thr | Gly Asp Cys | Met | Ser | Leu | Ala | Vai | ||
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Ser | Pro | Asp | Phe | Asn | Leu | Phe | lie | Ser | Gly | Ala | Cys | Asp | Ala | Ser | Ala |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Lys | Leu | Trp | Asp | Vai | Arg | Glu | Gly | Thr | Cys | Arg | Gin | Thr | Phe | Thr | Gly |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Sis | Glu | Ser | Asp | Xie | Asn | Ala | He | eye | Phe | Phe | Pro | Asn | Gly | Glu | Ala |
225 | 236 | 235 | 240 | ||||||||||||
He | Cys | Thr | Gly | Ser | Asp Asp | Ala | Ser | Cys | Arg | Lee | Phe | Asp | Leu | Arg | |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Ala | Asp | Gin | Glu | Leu | He | Cys | Phe | Ser | His | Glu | Ser | lie | He | Cys | Gly |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
lie | Thr | Ser | Vai | Ala | Phe | Ser | Leu | Ser | Gly | Arg | Leu | Leu | Phe | Ala | Gly |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Tyr | Asp | Asp | Phe | Asn | Cys | Ash | Vai | Trp Asp | Ser | Met | Lys | Ser | Glu | Arg | |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Vai | Gly | He | Leu | Ser | Gly | His | Asp | Asn | Arg | Vai | Ser | Cys | Leu | Gly | Vai |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Thr | Ala | Asp Gly | Het | Ala | Vai | Ala | Thr | Gly | Ser | Trp | Ser | РЪе | Lee | ||
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Lys | He | Trp Asn | * |
340
Claims (12)
1. Приложение на мутация в гена на човешката G-протеинова субединица за диагностика на заболявания, свързани с неправилно управление на G-протеина.
2. Приложение на мутация в гена на човешката G-протеинова субединица съгласно претенция 1, характеризиращо се с това, че се използва мутантна Р3-субединица на G-протеина.
3. Приложение съгласно претенция 2, характеризиращо се с това, че генетичната промяна е в кода за аминокиселина 275 в SEQ ID N0:1.
4. Приложение съгласно претенция 2, характеризиращо се с това, че на позиция 825 в SEQ ID N0:1 е налице заместване на цитозин с тимин.
5. Приложение съгласно претенция 2, характеризиращо се с това, че посочените заболявания са заболявания на сърдечно-съдовата система, смущение в обмяната или имунно заболяване.
6. Приложение съгласно претенция 2, характеризиращо се с това, че болестта е хипертония.
7. Метод за определяне на относителния риск от заболяване от болести, свързани с погрешно управление на G-протеин за лице, подложено на пробни тестове, характеризиращ се с това, че се сравнява генетичната последователност за човешката G-протеинова рЗ-субединица на лицето, подложено на пробни тестове с генетичната последователност от SEQ ID N0:1 и в случай, че на позиция 825 е налице тимин (Т), за лицето, подложено на пробни тестове, се определя повишен риск от заболяване.
8. Метод съгласно претенция 7, характеризиращ се с това, че генетичното сравнение се извършва чрез секвениране.
9. Метод съгласно претенция 8, характеризиращ се с това, че преди секвенирането се амплифицира един генетичен участък, който съдържа позиция 825.
10. Метод съгласно претенция 7, характеризиращ се с това, че генетичното сравнение се извършва чрез хибридизация.
11. Метод съгласно претенция 7, характеризиращ се с това, че генетичното сравнение се извършва чрез разделяне с рестрикционни ензими.
12. Метод съгласно претенция 11, ха7 рактеризиращ се с това, че се използва рестрикционният ензим Dsa I.
Приложение: 1 фигура
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE19619362A DE19619362A1 (de) | 1996-05-14 | 1996-05-14 | Verwendung einer Genveränderung im Gen für humanes G-Protein beta-3-Untereinheit zur Diagnostik von Erkrankungen |
PCT/EP1997/002250 WO1997043442A1 (de) | 1996-05-14 | 1997-05-02 | VERWENDUNG EINER GENVERÄNDERUNG IM GEN FÜR DIE HUMANE G-PROTEIN β3-UNTEREINHEIT ZUR DIAGNOSTIK VON ERKRANKUNGEN |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
BG102878A BG102878A (bg) | 1999-05-31 |
BG63214B1 true BG63214B1 (bg) | 2001-06-29 |
Family
ID=7794252
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
BG102878A BG63214B1 (bg) | 1996-05-14 | 1998-10-29 | Приложение на мутация в гена на човешката g-протеинова бета 3-субединица за диагностициране на заболявания |
Country Status (23)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US6242181B1 (bg) |
EP (1) | EP0939833B1 (bg) |
JP (1) | JP2000509990A (bg) |
KR (1) | KR20000010988A (bg) |
CN (1) | CN1218515A (bg) |
AT (1) | ATE212066T1 (bg) |
AU (1) | AU732535B2 (bg) |
BG (1) | BG63214B1 (bg) |
BR (1) | BR9709245A (bg) |
CA (1) | CA2252921C (bg) |
CZ (1) | CZ292691B6 (bg) |
DE (2) | DE19619362A1 (bg) |
EA (1) | EA199800959A1 (bg) |
HU (1) | HUP9903661A3 (bg) |
IL (1) | IL126511A (bg) |
NO (1) | NO985280D0 (bg) |
NZ (1) | NZ332279A (bg) |
PL (1) | PL185779B1 (bg) |
SK (1) | SK282675B6 (bg) |
TR (1) | TR199802300T2 (bg) |
UA (1) | UA56164C2 (bg) |
WO (1) | WO1997043442A1 (bg) |
ZA (1) | ZA974102B (bg) |
Families Citing this family (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE19637518A1 (de) * | 1996-09-13 | 1998-04-09 | Winfried Siffert | PTX-sensitive G-Proteine, ihre Herstellung und Verwendung |
AU3304499A (en) * | 1998-02-20 | 1999-09-06 | City Of Hope | Association of the serotonin transport (htt) gene with cardiovascular disease and longevity |
AU6079999A (en) * | 1998-09-10 | 2000-04-03 | Winfried Siffert | Gene modification in the gene for the die gbeta3-sub-unit of human g-protein |
WO2001057246A1 (de) * | 2000-02-03 | 2001-08-09 | Winfried Siffert | VERWENDUNG EINER GENVERÄNDERUNG IM GEN FÜR DIE β3-UNTEREINHEIT DES HUMANEN G-PROTEINS |
JP4140329B2 (ja) * | 2002-09-25 | 2008-08-27 | 財団法人名古屋産業科学研究所 | 高血圧のリスク診断方法 |
EP2463384A3 (en) | 2010-12-07 | 2013-03-13 | Medtronic, Inc. | Diagnostic kits, genetic markers and methods for SCD or SCA therapy selection |
WO2019191010A1 (en) * | 2018-03-27 | 2019-10-03 | Aardvark Therapeutics Inc. | Personalized treatment method for congestive heart failure |
Family Cites Families (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE19637518A1 (de) * | 1996-09-13 | 1998-04-09 | Winfried Siffert | PTX-sensitive G-Proteine, ihre Herstellung und Verwendung |
AU6079999A (en) * | 1998-09-10 | 2000-04-03 | Winfried Siffert | Gene modification in the gene for the die gbeta3-sub-unit of human g-protein |
-
1996
- 1996-05-14 DE DE19619362A patent/DE19619362A1/de not_active Withdrawn
-
1997
- 1997-02-05 UA UA98116016A patent/UA56164C2/uk unknown
- 1997-05-02 CN CN97194612A patent/CN1218515A/zh active Pending
- 1997-05-02 EP EP97922940A patent/EP0939833B1/de not_active Expired - Lifetime
- 1997-05-02 AT AT97922940T patent/ATE212066T1/de active
- 1997-05-02 CZ CZ19983696A patent/CZ292691B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1997-05-02 DE DE59706027T patent/DE59706027D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1997-05-02 KR KR1019980709137A patent/KR20000010988A/ko not_active Application Discontinuation
- 1997-05-02 BR BR9709245A patent/BR9709245A/pt active Search and Examination
- 1997-05-02 US US09/180,783 patent/US6242181B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1997-05-02 CA CA 2252921 patent/CA2252921C/en not_active Expired - Fee Related
- 1997-05-02 NZ NZ33227997A patent/NZ332279A/xx unknown
- 1997-05-02 HU HU9903661A patent/HUP9903661A3/hu not_active Application Discontinuation
- 1997-05-02 TR TR1998/02300T patent/TR199802300T2/xx unknown
- 1997-05-02 SK SK1573-98A patent/SK282675B6/sk unknown
- 1997-05-02 IL IL12651197A patent/IL126511A/xx not_active IP Right Cessation
- 1997-05-02 AU AU28902/97A patent/AU732535B2/en not_active Ceased
- 1997-05-02 PL PL97330014A patent/PL185779B1/pl not_active IP Right Cessation
- 1997-05-02 EA EA199800959A patent/EA199800959A1/ru unknown
- 1997-05-02 WO PCT/EP1997/002250 patent/WO1997043442A1/de active IP Right Grant
- 1997-05-02 JP JP54045197A patent/JP2000509990A/ja active Pending
- 1997-05-13 ZA ZA974102A patent/ZA974102B/xx unknown
-
1998
- 1998-10-29 BG BG102878A patent/BG63214B1/bg unknown
- 1998-11-12 NO NO985280A patent/NO985280D0/no not_active Application Discontinuation
-
2001
- 2001-04-16 US US09/836,697 patent/US20020142311A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20020142311A1 (en) | 2002-10-03 |
KR20000010988A (ko) | 2000-02-25 |
HUP9903661A2 (hu) | 2000-03-28 |
SK282675B6 (sk) | 2002-11-06 |
AU732535B2 (en) | 2001-04-26 |
EP0939833A1 (de) | 1999-09-08 |
EP0939833B1 (de) | 2002-01-16 |
PL330014A1 (en) | 1999-04-26 |
ATE212066T1 (de) | 2002-02-15 |
IL126511A0 (en) | 1999-08-17 |
UA56164C2 (uk) | 2003-05-15 |
CN1218515A (zh) | 1999-06-02 |
NZ332279A (en) | 2000-04-28 |
CA2252921C (en) | 2008-07-08 |
JP2000509990A (ja) | 2000-08-08 |
CZ292691B6 (cs) | 2003-11-12 |
TR199802300T2 (xx) | 1999-02-22 |
HUP9903661A3 (en) | 2000-09-28 |
NO985280L (no) | 1998-11-12 |
DE59706027D1 (de) | 2002-02-21 |
NO985280D0 (no) | 1998-11-12 |
EA199800959A1 (ru) | 1999-06-24 |
WO1997043442A1 (de) | 1997-11-20 |
BR9709245A (pt) | 1999-08-10 |
DE19619362A1 (de) | 1997-11-20 |
ZA974102B (en) | 1998-11-13 |
IL126511A (en) | 2003-11-23 |
CZ369698A3 (cs) | 1999-08-11 |
CA2252921A1 (en) | 1997-11-20 |
US6242181B1 (en) | 2001-06-05 |
AU2890297A (en) | 1997-12-05 |
SK157398A3 (en) | 2000-01-18 |
PL185779B1 (pl) | 2003-07-31 |
BG102878A (bg) | 1999-05-31 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Tullio-Pelet et al. | Mutant WD-repeat protein in triple-A syndrome | |
Furuya et al. | Genetic polymorphism of CYP2C9 and its effect on warfarin maintenance dose requirement in patients undergoing anticoagulation therapy | |
Chinnery et al. | The mitochondrial ND6 gene is a hot spot for mutations that cause Leber's hereditary optic neuropathy | |
Gécz et al. | Characterization of the human glutamate receptor subunit 3 gene (GRIA3), a candidate for bipolar disorder and nonspecific X-linked mental retardation | |
JP4164128B2 (ja) | 脊髄小脳運動失調タイプ6の疾病の大規模遺伝子型表現及び診断テスト | |
Nakajima-Taniguchi et al. | Novel missense mutation in α-tropomyosin gene found in Japanese patients with hypertrophic cardiomyopathy | |
JP2003514538A (ja) | 哺乳動物毒物学的反応マーカー | |
Acland et al. | A novel retinal degeneration locus identified by linkage and comparative mapping of canine early retinal degeneration | |
US20040248092A1 (en) | Methods of screening for parkinsons's disease | |
US6458542B1 (en) | Method of screening for susceptibility to drug-induced cardiac arrhythmia | |
JP2003510349A (ja) | 線条体機能に必要な遺伝子、その使用、およびそれを調節するための化合物 | |
Wan et al. | Conserved Chromosomal Location and Genomic Structure of Human and Mouse Fatty-Acid Amide Hydrolase Genes and Evaluation ofclasperas a Candidate Neurological Mutation | |
BG63214B1 (bg) | Приложение на мутация в гена на човешката g-протеинова бета 3-субединица за диагностициране на заболявания | |
US20160282350A1 (en) | Methods of diagnosing cancer | |
US20040152106A1 (en) | Gene necessary for striatal function, uses thereof, and compounds for modulating same | |
US20040081981A1 (en) | Method of detecting risk factor for onset of diabetes | |
US6251853B1 (en) | PTX sensitive G proteins, the production and use thereof | |
US6458541B1 (en) | BDNF polymorphism and association with bipolar disorder | |
US20030157493A1 (en) | BDNF polymorphism and association with bipolar disorder | |
US6372900B1 (en) | Horse endothelin-B receptor gene and gene products | |
WO2001027312A2 (en) | Drug target isogenes: polymorphisms in the m1 muscarinic acetylcholine receptor gene | |
JP2001514887A (ja) | ヒトbrca2遺伝子のコード配列半数型 | |
Van der Merwe | Genetic heterogeneity in South African facioscapulohumeral muscular dystrophy (FSHD) families | |
Markel | A molecular genetic analysis of ethanol-induced anesthesia in the LSXSS recombinant-inbred strains | |
Candille | High-resolution linkage and physical mapping of the mouse nob gene |