CZ369698A3 - Použití genetické modifikace v genu pro podjednotku ß3 lidského G-proteinu k diagnóze nemocí - Google Patents
Použití genetické modifikace v genu pro podjednotku ß3 lidského G-proteinu k diagnóze nemocí Download PDFInfo
- Publication number
- CZ369698A3 CZ369698A3 CZ983696A CZ369698A CZ369698A3 CZ 369698 A3 CZ369698 A3 CZ 369698A3 CZ 983696 A CZ983696 A CZ 983696A CZ 369698 A CZ369698 A CZ 369698A CZ 369698 A3 CZ369698 A3 CZ 369698A3
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- ser
- alas
- leo
- glee
- asp
- Prior art date
Links
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims abstract description 27
- 101000887490 Homo sapiens Guanine nucleotide-binding protein G(z) subunit alpha Proteins 0.000 title claims abstract description 11
- 102000052301 human GNAZ Human genes 0.000 title claims abstract description 11
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 title claims description 27
- 201000010099 disease Diseases 0.000 title claims description 17
- 238000012239 gene modification Methods 0.000 title claims description 13
- 230000005017 genetic modification Effects 0.000 title claims description 13
- 235000013617 genetically modified food Nutrition 0.000 title claims description 13
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 title description 4
- 108091006027 G proteins Proteins 0.000 claims description 19
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 18
- 108091000058 GTP-Binding Proteins 0.000 claims description 17
- 206010020772 Hypertension Diseases 0.000 claims description 17
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 14
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 claims description 7
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 claims description 7
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 6
- 230000008482 dysregulation Effects 0.000 claims description 6
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 claims description 4
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 claims description 4
- 208000024172 Cardiovascular disease Diseases 0.000 claims description 3
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 claims description 3
- 208000026278 immune system disease Diseases 0.000 claims description 3
- 208000030159 metabolic disease Diseases 0.000 claims description 3
- 230000007017 scission Effects 0.000 claims description 3
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 claims description 2
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims description 2
- 102000030782 GTP binding Human genes 0.000 claims 2
- 230000035772 mutation Effects 0.000 abstract description 3
- 102000034286 G proteins Human genes 0.000 description 17
- 241000282322 Panthera Species 0.000 description 16
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 11
- 230000001631 hypertensive effect Effects 0.000 description 10
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 9
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 9
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 6
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 5
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 5
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 5
- FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N Asp-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 4
- DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N Asp-Ser Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 4
- GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N 0.000 description 4
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 4
- WRPDZHJNLYNFFT-GEVIPFJHSA-N His-Thr Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N)O WRPDZHJNLYNFFT-GEVIPFJHSA-N 0.000 description 3
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 description 3
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 3
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 3
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 3
- 230000008859 change Effects 0.000 description 3
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 3
- 238000009585 enzyme analysis Methods 0.000 description 3
- 230000006870 function Effects 0.000 description 3
- 102000034345 heterotrimeric G proteins Human genes 0.000 description 3
- 108091006093 heterotrimeric G proteins Proteins 0.000 description 3
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 3
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 3
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 3
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 3
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 3
- XNSKSTRGQIPTSE-ACZMJKKPSA-N Arg-Thr Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)O XNSKSTRGQIPTSE-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- WXASLRQUSYWVNE-FXQIFTODSA-N Asp-Cys-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N WXASLRQUSYWVNE-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- OFYVKOXTTDCUIL-FXQIFTODSA-N Asp-Ser-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N OFYVKOXTTDCUIL-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- RSMZEHCMIOKNMW-GSSVUCPTSA-N Asp-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O RSMZEHCMIOKNMW-GSSVUCPTSA-N 0.000 description 2
- 101100281516 Caenorhabditis elegans fox-1 gene Proteins 0.000 description 2
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 2
- TULNGKSILXCZQT-IMJSIDKUSA-N Cys-Asp Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O TULNGKSILXCZQT-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- WYVKPHCYMTWUCW-YUPRTTJUSA-N Cys-Thr Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N)O WYVKPHCYMTWUCW-YUPRTTJUSA-N 0.000 description 2
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- MDCTVRUPVLZSPG-BQBZGAKWSA-N His-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CNC=N1 MDCTVRUPVLZSPG-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- GFWLIJDQILOEPP-HSCHXYMDSA-N Lys-Ile-Trp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N GFWLIJDQILOEPP-HSCHXYMDSA-N 0.000 description 2
- NKDSBBBPGIVWEI-RCWTZXSCSA-N Met-Arg-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O NKDSBBBPGIVWEI-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 2
- RMHHNLKYPOOKQN-FXQIFTODSA-N Met-Cys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RMHHNLKYPOOKQN-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- WSPQHZOMTFFWGH-XGEHTFHBSA-N Met-Thr-Cys Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O WSPQHZOMTFFWGH-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 2
- VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N Ser-Asp Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- MESDJCNHLZBMEP-ZLUOBGJFSA-N Ser-Asp-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O MESDJCNHLZBMEP-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- FFOKMZOAVHEWET-IMJSIDKUSA-N Ser-Cys Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O FFOKMZOAVHEWET-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- BLPYXIXXCFVIIF-FXQIFTODSA-N Ser-Cys-Arg Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CO)N)CN=C(N)N BLPYXIXXCFVIIF-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- SNNSYBWPPVAXQW-ZLUOBGJFSA-N Ser-Cys-Cys Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N)O SNNSYBWPPVAXQW-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- YZMPDHTZJJCGEI-BQBZGAKWSA-N Ser-His Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 YZMPDHTZJJCGEI-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- 208000034972 Sudden Infant Death Diseases 0.000 description 2
- 206010042440 Sudden infant death syndrome Diseases 0.000 description 2
- OHAJHDJOCKKJLV-LKXGYXEUSA-N Thr-Asp-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O OHAJHDJOCKKJLV-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 2
- NRUPKQSXTJNQGD-XGEHTFHBSA-N Thr-Cys-Arg Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O NRUPKQSXTJNQGD-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 2
- DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N Thr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N 0.000 description 2
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 2
- 108010018691 arginyl-threonyl-arginine Proteins 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 230000004064 dysfunction Effects 0.000 description 2
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 2
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 2
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 2
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 2
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 2
- 201000011461 pre-eclampsia Diseases 0.000 description 2
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 2
- 239000000047 product Substances 0.000 description 2
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 108010048818 seryl-histidine Proteins 0.000 description 2
- 108010027345 wheylin-1 peptide Proteins 0.000 description 2
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 1
- 208000010444 Acidosis Diseases 0.000 description 1
- 201000001320 Atherosclerosis Diseases 0.000 description 1
- RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N Copper Chemical compound [Cu] RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 1
- 208000002249 Diabetes Complications Diseases 0.000 description 1
- 206010012655 Diabetic complications Diseases 0.000 description 1
- 208000007530 Essential hypertension Diseases 0.000 description 1
- 108010080615 GTP-Binding Protein beta Subunits Proteins 0.000 description 1
- 102000000312 GTP-Binding Protein beta Subunits Human genes 0.000 description 1
- 206010070538 Gestational hypertension Diseases 0.000 description 1
- 208000031886 HIV Infections Diseases 0.000 description 1
- 208000037357 HIV infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 206010060378 Hyperinsulinaemia Diseases 0.000 description 1
- 206010022489 Insulin Resistance Diseases 0.000 description 1
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 1
- 102000004310 Ion Channels Human genes 0.000 description 1
- 208000007766 Kaposi sarcoma Diseases 0.000 description 1
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 description 1
- 208000031481 Pathologic Constriction Diseases 0.000 description 1
- 201000005702 Pertussis Diseases 0.000 description 1
- 108010081690 Pertussis Toxin Proteins 0.000 description 1
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 1
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 1
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 208000017442 Retinal disease Diseases 0.000 description 1
- 206010038923 Retinopathy Diseases 0.000 description 1
- RZEQTVHJZCIUBT-WDSKDSINSA-N Ser-Arg Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N RZEQTVHJZCIUBT-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 1
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 208000007536 Thrombosis Diseases 0.000 description 1
- 206010052779 Transplant rejections Diseases 0.000 description 1
- MMWCIQZXVOZEGG-HOZKJCLWSA-N [(1S,2R,3S,4S,5R,6S)-2,3,5-trihydroxy-4,6-diphosphonooxycyclohexyl] dihydrogen phosphate Chemical compound O[C@H]1[C@@H](O)[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](OP(O)(O)=O)[C@H](O)[C@H]1OP(O)(O)=O MMWCIQZXVOZEGG-HOZKJCLWSA-N 0.000 description 1
- 230000007950 acidosis Effects 0.000 description 1
- 208000026545 acidosis disease Diseases 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 1
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 1
- 230000037429 base substitution Effects 0.000 description 1
- 238000010170 biological method Methods 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 210000004204 blood vessel Anatomy 0.000 description 1
- 230000003915 cell function Effects 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 208000019425 cirrhosis of liver Diseases 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 229910052802 copper Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010949 copper Substances 0.000 description 1
- 238000007887 coronary angioplasty Methods 0.000 description 1
- 208000029078 coronary artery disease Diseases 0.000 description 1
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 206010012601 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 230000008034 disappearance Effects 0.000 description 1
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 1
- 238000012252 genetic analysis Methods 0.000 description 1
- 108091008039 hormone receptors Proteins 0.000 description 1
- 208000033519 human immunodeficiency virus infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 230000003451 hyperinsulinaemic effect Effects 0.000 description 1
- 201000008980 hyperinsulinism Diseases 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 230000010365 information processing Effects 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- 208000017169 kidney disease Diseases 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- XONPDZSGENTBNJ-UHFFFAOYSA-N molecular hydrogen;sodium Chemical group [Na].[H][H] XONPDZSGENTBNJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000000822 natural killer cell Anatomy 0.000 description 1
- 201000001119 neuropathy Diseases 0.000 description 1
- 230000007823 neuropathy Effects 0.000 description 1
- 208000033808 peripheral neuropathy Diseases 0.000 description 1
- 238000011533 pre-incubation Methods 0.000 description 1
- 230000035935 pregnancy Effects 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 208000037803 restenosis Diseases 0.000 description 1
- 230000000250 revascularization Effects 0.000 description 1
- 230000008054 signal transmission Effects 0.000 description 1
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 1
- 208000010110 spontaneous platelet aggregation Diseases 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 230000036262 stenosis Effects 0.000 description 1
- 208000037804 stenosis Diseases 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 1
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 1
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 1
- 230000005740 tumor formation Effects 0.000 description 1
- 208000001072 type 2 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
Description
Použití genetické modifikace pro podjednotku b-3 lidského G-proteinu k určení rizika vývinu poruchy spojené s disregulací G-proteinu spočívá v porovnání sekvence genu pro podjednotku b-3 lidského G-proteinu s danou sekvencí, přičemž zvýšené riziko vývinu choroby nastává v případě, že v pozici 825 je přítomen thymin.
CZ 3696-98 A3
• · ·· ·· ·· ·· • · · · · ·
Použití genetické modifikace v genu pro podjednotku β3 lidského G-proteinu k diagnóze nemocí
Oblast techniky
Vynález popisuje způsob diagnózy nemocí za využití genetické analýzy, především analýzy genů kódujících podjednotky lidských proteinů vázajících nukleotidy guaninu (Gproteiny).
Dosavadní stav techniky
Heterotrimerní proteiny vázající nukleotidy guaninu (Gproteiny) jsou velmi důležité při přenosu signálu uvnitř buňky. Zprostředkovávají přenos extracelulárních signálů po stimulaci hormonálních receptorů a dalších receptorů, které po aktivaci procházejí konformační změnou. Ta vede k aktivaci G-proteinů, které mohou následně aktivovat nebo inhibovat intracelulární efektory (například iontové kanály, enzymy). Heterotrimerní G-proteiny jsou složené ze tří podjednotek α, β a γ. K dnešnímu dni bylo biochemickými a molekulárně biologickými metodami charakterizováno několik různých podjednotek a, 5 podjednotek β a okolo 12 podjednotek γ (Birnbaumer L. a Birnbaumer Μ., Signál transduction by G proteins: vydáno v roce 1994, J. Recept. Res. 15:213 až 252, 1995; Offermanns S. a Schultz G., Complex Information Processing by the transmembrane signaling systém involving G proteins. Naunyn Schmiedebergs Arch. Pharmacol. 350:329 až 338, 1994; Núrnberg B., Gudermann T. a Schultz G., Receptors and G proteins as primary components of transmembrane signál transduction. 2. část G proteins: structure and function. J.
• ·· ·· β Β · Β · ·· • · · · · · · ···· • · · Β · · BBBB ·· · » * · ·· ······ • · · · · · · · Β
ΒΒΒ ΒΒ ΒΒ ΒΒ ·· ··
Mol. Med. 73:123 až 132, 1995; Neer E. J., Heterotrimeric G proteins: Organizers of Transmembrane Signals. Cell 80:249 až 257, 1995; Rens-Domiano S. a Hamm Η. E., Structural and functional relationships of heterotrimeric G-proteins. FASEB J. 9:1059 až 1066, 1995).
Aktivace určitých podjednotek a prostřednictvím receptorů může být inhibována preinkubací s toxinem černého kašle (PTX-pertussis toxin). Mezi tyto podjednotky zahrnujeme především a izoformy ail, ai2 a ai3 a různé podjednotky ao. G-proteiny těchto typů jsou také označovány jako PTXsenzitivní G-proteiny.
Podstata vynálezu
Bylo zjištěno, že genetická modifikace v genu pro podjednotku β3 lidského G-proteinu je vhodná pro diagnózu nemocí. Tato genetická modifikace je obzvláště vhodná pro určování rizika vývinu poruchy spojené s poruchou regulace funkce G-proteinu.
Vynález rovněž popisuje způsob použitelný k určení relativního rizika vývinu nemocí spojených s poruchou regulace funkce G-proteinu u pacienta, kde tento způsob zahrnuje srovnání sekvence genu podjednotky β3 lidského G-proteinu pacienta se sekvencí genu zobrazenou jako SEK. ID. Č.:l. Přítomnost thyminu (T) v pozici 825 signalizuje u pacienta zvýšené riziko výskytu nemoci.
Nalezená genetická modifikace je situována v genu pro podjednotku β3 lidského G-proteinu. Tento gen byl popsán v článku Levine a další, Proč. Nati. Acad. Sci USA 87:2329 až 2333, 1990. Kódující oblast obsahuje kodon pro serin (TCC) v pozici 275, zatímco u pacientů se zvýšeným rizikem • ·· ·· ···· ·· ·· ···· · · · · ·· · ··· · · · · · · · • · · · · · · · ······ • · · ···· · · ····· · · · · · · ·· nemoci spojené s poruchou funkce G-proteinu se v této pozici nachází triplet TCT, který rovněž kóduje serin. Genetickou modifikací je záměna báze v pozici 825, kde je cytosin (C) nahrazen thyminem (T). Avšak tato záměna báze je „tichá na úrovni aminokyselin, což znamená, že nevede k zavedení jiné aminokyseliny v této pozici. Sekvence nalezená u pacientů se zvýšeným rizikem nemoci je v seznamu sekvencí zobrazena jako SEK. ID. Č.:1.
Nalezená genetická modifikace se obvykle vyskytuje v heterozygotní formě.
Poruchy spojené s poruchou funkce regulace G-proteinu jsou definovány jako nemoci, při kterých se G-protein podílí na přenosu signálu, ale nevykonává tuto svoji funkci fyziologickým způsobem.
Tato porucha regulace může mít mnoho příčin, jako například změnu strukturního genu nebo změněnou expresi genu.
Mezi tyto poruchy patří kardiovaskulární onemocnění, metabolické poruchy a poruchy imunitního systému.
Kardiovaskulárními onemocněními, které mohou být zmíněny , j sou:
Hypertenze, gravidní hypertenze (gestóza, hypertenze v těhotenství), nemoc srdečních věnčitých tepen, lokalizovaná a/nebo nelokalizovaná ateroskleróza, stenóza krevních cév, restenóza po revaskularizačních procedurách (např. PTCA-perkutánní transluminální koronární angioplastikas nebo bez implantovaného stentu), sklon k mrtvicím nebo trombózám a zvýšená agregace krevních destiček.
Metabolickými poruchami, které mohou být zmíněny, jsou:
Syndrom látkové výměny, inzulínová rezistence a hyperinzulinémie, diabetes II. typu, diabetické komplikace (např. nefropatie, neuropatie, retinopatie atd.), poruchy metabo3 • ·· ·· ···· ·· ·· ···· ·· · · · · · ··· · · · ···· • · ··· · ·· ······ • · · ···· · ·
999 99 99 99 99 . 99 lizmu lipidů, poruchy centrální chemorecepce (C02 tolerance, acidózní tolerance, syndrom náhlého úmrtí kojenců (SIDS)).
Poruchami imunitního systému, které mohou být zmíněny, jsou:
Snížená síla imunitní odpovědi organizmu (tvorba imunoglobulinů, agresivita T-buněk a NK-buněk), obecně snížená schopnost proliferace včetně snížené schopnosti hojit zranění, sklon ke vzniku nádorů a proliferace zahrnující možnost metastázování zhoubně přeměněných buněk, doba trvání latentní fáze po nákaze HIV, než se nemoc stane klinicky pozorovatelnou, Kaposiho sarkom, sklon k cirhóze jater, transplantační tolerance a odmítnutí transplantátu.
Ve výhodném provedení vynálezu je využití genetické mutace zvláště vhodné pro stanovení rizika vývinu hypertenze.
Vynález se dále týká přípravy transgenních zvířat nesoucích výše popsanou genetickou mutaci. Transgenní zvířata tohoto typu jsou velmi důležitá, zvláště jako živočišný model pro výzkum a léčbu poruch popsaných výše. Odborníkům j sou dobře známy způsoby přípravy transgenních zvířat.
Použití vynálezu pro stanovení relativního rizika vývinu nemoci předpokládá odebrání vzorku, který obsahuje genetickou informaci, z organizmu pacienta. Toho je zpravidla dosaženo odebráním krve, ze které je izolována nukleová kyselina.
Z izolované nukleové kyseliny pacienta je určena struktura genu pro podjednotku β3 G-proteinu a jeho sekvence je porovnána se sekvencí zobrazenou jako SEK. ID. Č.:l.
Struktura genu může být určena metodou sekvenování nukleové kyseliny. To může být provedeno bud' přímo z genomové DNA anebo po amplifikaci nukleové kyseliny například technikou polymerázové řetězové reakce (PCR).
• ·· ·· ···· fcfc ·· • · · · ·· · fcfcfcfc ··· · · · fcfcfcfc ·· · · · · · · ······ • · · fcfcfc· · · • fcfc fcfc fcfc fcfc fcfc fcfc
Struktura genu může být určena buď na úrovni genomové DNA anebo na úrovni mRNA nebo cDNA.
Ve výhodném provedení je sekvence stanovena po amplifikaci cDNA metodou PCR. Primery vhodné pro metodu PCR mohou být odborníky snadno vyvozeny ze sekvencí zobrazených jako SEK. ID. Č.:l. Ve výhodném provedení je v každém případě vybrán primer vázající se k řetězci a ke komplementárnímu řetězci před a za příslušnou pozicí 825.
Pro srovnávání genů mohou být použity i další metody, například metoda selektivní hybridizace nebo metoda mapování restrikčními enzymy. Změna báze C-->T v pozici 825 (popsaná výše) vede k zániku restrikčního místa pro enzym Dsa I, který je obecně používán pro zjištění tohoto genetického polymorf i zrnu.
Má-li pacient v pozici 825 thymin (T), je u něj vyšší riziko onemocnění než u pacienta s cytosinem (C) v této pozici.
Vynález je dále ilustrován na následujících příkladech.
Příklady provedení vynálezu
Příklad 1
Detekce genetické modifikace u pacientů trpících hypertenzí prováděná sekvenováním
V předběžných výzkumech byl u pacientů s esenciální (primární) hypertenzí zjištěn zvýšený sklon k aktivaci PTXsenzitivních G-proteinů. Detekci lze provést v imortalizovaných buňkách, které mají jako fenotypický markér zvýšenou aktivitu Na/H měničů. Zvýšený sklon k aktivaci PTX-senzitivních G-proteinů má vážné důsledky pro • 44 ······ 44 ··
4 * 44 4 4944 • 49 44 4 ···· buněčné funkce. Mezi tyto řadíme zvýšenou tvorbu molekul intracelulárních druhých poslů (např. inositol-1,4,5trifosfát), zvýšené uvolňování intracelulárních iontů Ca2+, zvýšenou tvorbu imunoglobulinů a zvýšenou rychlost buněčného růstu. Jelikož tyto změny mohou být detekovány v imortalizovaných buňkách i po dlouhodobé kultivaci buněk, lze předpokládat, že tato modifikace je geneticky neměnná (Rosskopf D., Frómter E. a Siffert W., Hypertensive sodiumproton exchanger phenotype persists in immortalized lymphoblasts from essential hypertensive patients-a cell culture model for human hypertension. J. Clin. Invest. 92:2553 až 2559, 1993; Rosskopf D., Hartung K., Hense J. a Siffert W., Enhanced immunoglobulin formation of immortalized B cells from hypertensive patients. Hypertension 26:432 až 435,
1995; Rosskopf D., Schróder K.-J. a Siffert W., Role of sodium-hydrogen exchange in the proliferation of immortalised lymphoblasts from patients with essential hypertension
and normotensive | subjects. | Cardiovasc. Res | . 29:254 až | 259, | |
1995; Siffert W., | Rosskopf | D. , | Moritz A., | Wieland T., | Kal- |
denberg-Stasch S. | , Kettler | N. , | Hartung K., | Beckmann S | . a |
Jakobs K. H., Enhanced G protein activation in immortalized lymphoblasts from patients with essential hypertension. J. Clin. Invest. 96:759 až 766, 1995).
Z imortalizovaných buněčných linií odvozených z buněk pacientů trpících hypertenzí byla za použití standardních metod připravena RNA, která byla reverzní transkriptázou přepsána do cDNA. Použitím metody polymerázové řetězové reakce (PCR) byla namnožena cDNA genu pro podjednotku β3 Gproteinu a byla zjištěna její sekvence. Při této PCR byly použity následující oligonukleotidové primery:
5'-TGG GGG AGA TGG AGC AAC TG a
5'-CTG CTG AGT GTG TTC ACT GCC.
Porovnáním sekvence cDNA z buněk pacientů trpících hypertenzí se sekvencí publikovanou v práci Levine a další (Levine M. A., Smallwood P. M., Moen P. T., Jr., Helman L.
J. a Ahn T. G., Molecular cloning of β3 subunit, a third form of the G protein β-subunit polypeptide. Proč. Nati. Acad. Sci. USA 87(6):2329 až 2333, 1990) byly zjištěny následující rozdíly: nukleotid 825 cytosin (C) v oblasti kódující sekvence je nahrazen thyminem (T) (nukleotid 1 odpovídá bázi A ve startovním kodonu ATG). Tato záměna báze vede k tichému polymorfizmu, tzn. aminokyselina kódovaná příslušným tripletem bází (serin) není při srovnání s původní sekvencí změněna. Nalezená sekvence DNA je popsaná jako SEK.
ID. Č.:1.
Příklad 2
Detekce genetické modifikace u pacientů trpících hypertenzí prováděná pomocí restrikční enzymové analýzy
Přiložený obrázek zobrazuje srovnání genů z pacientů s normálním tlakem a pacientů se zvýšeným tlakem pomocí restrikční enzymové analýzy. cDNA genu pro β3 z buněk pacientů s normálním tlakem (NT) a pacientů se zvýšeným tlakem (HT), která byla amplifikována metodou PCR, byla podrobena restrikční enzymové analýze enzymem Dsa I. Reakční produkty byly rozděleny v agarózovém gelu, který je zobrazen na přiloženém obrázku.
Z obrázku je jasně patrné úplné rozštěpení cDNA genu β3 z buněk pacientů s normálním tlakem po štěpení restrikčním enzymem Dsa I. cDNA z buněk pacientů trpících hypertenzí je restrikčním enzymem Dsa I štěpena jen částečně. Mimo očekávaných produktů restrikčního štěpení byl rovněž přítomen i ·· ·· 9 9 9 9 9 9 · · • ·99 999
9
9 9 9 nerozštěpený produkt PCR. Pro porovnání velikosti byly na levou a pravou stranu gelu naneseny referenční fragmenty (markéry). Čtyři z pěti zde zobrazených sekvencí DNA z pacientů trpících hypertenzí vykazují záměnu báze popsanou výše a tato záměna se vyskytuje v heterozygotní formě.
• «· ·· 44 · · 44 44
4 4 4 · · 4 4 4 4 4
444 4 44 444 444
444444 4 4
44 44 44 44
SEZNAM SEKVENCÍ (1) OBECNE INFORMACE:
1. PŘIHLAŠOVATEL:
(A) Jméno: BASF Aktiengesellschaft (B) Ulice: Carl-Bosh-Strasse 38 (C) Město: Ludwigshaften (D) Stát: Spolková republika Německo (E) PSČ: D-67056 (F) Telefon: 0621/6048526 (G) Telefax: 0621/6043123 (H) Telex: 1762175170 (ii) NÁZEV VYNÁLEZU: Použití genetické modifikace v genu pro podjednotku β3 lidského G-proteinu k diagnóze nemocí.
(iii) POČET SEKVENCÍ: 2 (iv) ADRESA PRO KORESPONDENCI:
(A) ADRESÁT: ČERMÁK-HOŘEJŠ-VRBA, Advokátní a patentová kancelář (B) ULICE: Národní 32 (C) MĚSTO: Praha 1 (D) STÁT: Česká Republika (E) PSČ: 116 66 (v) STROJNĚ ČITELNÁ FORMA:
(A) TYP MÉDIA: Floppy disk (B) POČÍTAČ: IBM PC kompatibilní (C) OPERAČNÍ SYSTÉM: PC-DOS/MS-DOS (D) SOFTWARE: Patentln Release č. 1.0, Verze č.
1.25
• | • · | 4 · | 4444 | • 4 | 44 | |
• 4 4 | • | 4 | 4 | 4 | • | 4 4 « |
4 4 | • | 4 4 | 4 | 4 | 4 4 4 | 4 4 4 1 |
4 4 | • | • | • | 4 4 | 4 1 | |
44« | ·· | • 4 | • 4 | 4 4 | 4 4 |
(2) INFORMACE O SEK. ID. Č.:l:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) | DÉLKA: 1517 | párů bázi | |
(B) | TYP: nukleová kyselina | ||
(C) | POČET ŘETĚZCŮ: dva | ||
(D) | TOPOLOGIE: | lineární | |
(ii) | TYP | MOLEKULY: cDNA pro mRNA | |
(iii) | HYPOTETICKÝ: NE | ||
(iv) | ANTISENSE: NE | ||
(vi) | PŮVODNÍ ZDROJ: | ||
(A) | ORGANIZMUS | : Homo Sapiens | |
(ix) | CHARAKTERISTICKÉ | ZNAKY: | |
(A) | NÁZEV/KLÍČ | : CDS | |
(B) | UMÍSTĚNÍ: | 1..1024 | |
(xi) | POPIS SEKVENCE: , | SEK. ID. Č.:1: |
ATG | GGG | GAG | ATG | GAG | CAA | CTG | CGT | CAG | GAA | GCG | GAG | CAG | CTC | AAG | AAG | 48 |
Met | Gly | Glu | Met | Glu | Gin | Leu | Arg | Gin | Glu | Ala | Glu | Gin | Leu | Lys | Lys | |
1 | 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
CAG | ATT | GCA | GAT | GCC | AGG | AAA | GCC | TGT | GCT | GAC | GTT | ACT | CTG | GCA | GAG | 96 |
Gin | Ile | Ala | Asp | Ala | Arg | Lys | Ala | Cys | Ala | Asp | Val | Thr | Leu | Ala | Glu | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
CTG | GTG | TCT | GGC | CTA | GAG | GTG | GTG | GGA | CGA | GTC | CAG | ATG | CGG | ACG | CGG | 144 |
Leu | Val | Ser | Gly | Leu | Glu | Val | Val | Gly | Arg | Val | Gin | Met | Arg | Thr | Arg | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
CGG | ACG | TTA | AGG | GGA | CAC | CTG | GCC | AAG | ATT | TAC | GCC | ATG | CAC | TGG | GCC | 192 |
Arg | Thr | Leu | Arg | Gly | His | Leu | Ala | Lys | Ile | Tyr | Ala | Met | His | Trp | Ala | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
ACT | GAT | TCT | AAG | CTG | CTG | GTA | AGT | GCC | TCG | CAA | GAT | GGG | AAG | CTG | ATC | 240 |
Thr | Asp | Ser | Lys | Leu | Leu | Val | Ser | Ala | Ser | Gin | Asp | Gly | Lys | Leu | Ile | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
GTG | TGG | GAC | AGC | TAC | ACC | ACC | AAC | AAG | GTG | CAC | GCC | ATC | CCA | CTG | CGC | 288 |
Val | Trp | Asp | Ser | Tyr | Thr | Thr | Asn | Lys | Val | His | Ala | Ile | Pro | Leu | Arg | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
TCC | TCC | TGG | GTC | ATG | ACC | TGT | GCC | TAT | GCC | CCA | TCA | GGG | AAC | TTT | GTG | 336 |
Ser | Ser | Trp | Val | Met | Thr | Cys | Ala | Tyr | Ala | Pro | Ser | Gly | Asn | Phe | Val |
1Q0 | 105 | • • · · • · • · ··· | ·· • • · .ilo | ·· • · • · • · ·· | · • · • '· • · | ·· ·· «1 · · · ··· ··· • · ·· ·· | ||||||||||
GCA | TGT | GGG | GGG | CTG | GAC | AAC | ATG | TGT | TCC | ATC | TAC | AAC | CTC | AAA | TCC | 384 |
Ala | Cys | Gly | Gly | Leu | Asp | Asn | Met | Cys | Ser | Ile | Tyr | Asn | Leu | Lys | Ser | |
115 | 120 | 125 | ||||||||||||||
CGT | GAG | GGC | AAT | GTC | AAG | GTC | AGC | CGG | GAG | CTT | TCT | GCT | CAC | ACA | GGT | 432 |
Arg | Glu | Gly | Asn | Val | Lys | Val | Ser | Arg | Glu | Leu | Ser | Ala | His | Thr | Gly | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
TAT | CTC | TCC | TGC | TGC | CGC | TTC | CTG | GAT | GAC | AAC | AAT | ATT | GTG | ACC | AGC | 480 |
Tyr | Leu | Ser | Cys | Cys | Arg | Phe | Leu | Asp | Asp | Asn | Asn | Ile | Val | Thr | Ser | |
145 | 150 | 155 | 160 | |||||||||||||
TCG | GGG | GAC | ACC | ACG | TGT | GCC | TTG | TGG | GAC | ATT | GAG | ACT | GGG | CAG | CAG | 528 |
Ser | Gly | Asp | Thr | Thr | Cys | Ala | Leu | Trp | Asp | Ile | Glu | Thr | Gly | Gin | Gin | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
AAG | ACT | GTA | TTT | GTG | GGA | CAC | ACG | GGT | GAC | TGC | ATG | AGC | CTG | GCT | GTG | 576 |
Lys | Thr | Val | Phe | Val | Gly | His | Thr | Gly | Asp | Cys | Met | Ser | Leu | Ala | Val | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
TCT | CCT | GAC | TTC | AAT | CTC | TTC | ATT | TCG | GGG | GCC | TGT | GAT | GCC | AGT | GCC | 624 |
Ser | Pro | Asp | Phe | Asn | Leu | Phe | Ile | Ser | Gly | Ala | Cys | Asp | Ala | Ser | Ala | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
AAG | CTC | TGG | GAT | GTG | CGA | GAG | GGG | ACC | TGC | CGT | CAG | ACT | TTC | ACT | GGC | 672 |
Lys | Leu | Trp | Asp | Val | Arg | Glu | Gly | Thr | Cys | Arg | Gin | Thr | Phe | Thr | Gly | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
CAC | GAG | TCG | GAC | ATC | AAC | GCC | ATC | TGT | TTC | TTC | CCC | AAT | GGA | GAG | GCC | 720 |
His | Glu | Ser | Asp | Ile | Asn | Ala | Ile | Cys | Phe | Phe | Pro | Asn | Gly | Glu | Ala | |
225 | 230 | 235 | 240 | |||||||||||||
ATC | TGC | ACG | GGC | TCG | GAT | GAC | GCT | TCC | TGC | CGC | TTG | TTT | GAC | CTG | CGG | 768 |
Ile | Cys | Thr | Gly | Ser | Asp | Asp | Ala | Ser | Cys | Arg | Leu | Phe | Asp. | Leu | Arg | |
245 | 250 | 255 | ||||||||||||||
GCA | GAC | CAG | GAG | CTG | ATC | TGC | TTC | TCC | CAC | GAG | AGC | ATC | ATC | TGC | GGC | 816 |
Ala | Asp | Gin | Glu | Leu | Ile | Cys | Phe | Ser | His | Glu | Ser | Ile | Ile | Cys | Gly | |
260 | 265 | 270 | ||||||||||||||
ATC | ACG | TCT | GTG | GCC | TTC | TCC | CTC | AGT | GGC | CGC | CTA | CTA | TTC | GCT | GGC | 864 |
Ile | Thr | Ser | Val | Ala | Phe | Ser | Leu | Ser | Gly | Arg | Leu | Leu | Phe | Ala | Gly | |
275 | 280 | 285 | ||||||||||||||
TAC | GAC | GAC | TTC | AAC | TGC | AAT | GTC | TGG | GAC | TCC | ATG | AAG | TCT | GAG | CGT | 912 |
Tyr | Asp | Asp | Phe | Asn | Cys | Asn | Val | Trp | Asp | Ser | Met | Lys | Ser | Glu | Arg | |
290 | 295 | 300 | ||||||||||||||
GTG | GGC | ATC | CTC | TCT | GGC | CAC | GAT | AAC | AGG | GTG | AGC | TGC | CTG | GGA | GTC | 960 |
Val | Gly | Ile | Leu | Ser | Gly | His | Asp | Asn | Arg | Val | Ser | Cys | Leu | Gly | Val | |
305 | 310 | 315 | 320 | |||||||||||||
ACA | GCT | GAC | GGG | ATG | GCT | GTG | GCC | ACA | GGT | TCC | TGG | GAC | AGC | TTC | CTC | 1008 |
Thr | Ala | Asp | Gly | Met | Ala | Val | Ala | Thr | Gly | Ser | Trp | Asp | Ser | Phe | Leu |
325 330 335
AAA ATC TGG AAC TGA G GAGGCTGGAG AAAGGGAAGT GGAAGGCAGT GAACACACTC 1064 Lys Ile Trp Asn *
340
AGCAGCCCCC TGCCCGACCC CATCTCATTC AGGTGTTCTC TTCTATATTC CGGGTGCCAT 1124
TCCCACTAAG CTTTCTCCTT TGAGGGCAGT GGGGAGCATG GGACTGTGCC TTTGGGAGGC 1184
AGCATCAGGG ACACAGGGGC AAAGAACTGC CCCATCTCCT CCCATGGCCT TCCCTCCCCA 1244
CAGTCCTCAC AGCCTCTCCC TTAATGAGCA AGGACAACCT GCCCCTCCCC AGCCCTTTGC 1304
AGGCCCAGCA GACTTGAGTC TGAGGCCCCA GGCCCTAGGA TTCCTCCCCC AGAGCCACTA 1364
CCTTTGTCCA GGCCTGGGTG GTATAGGGCG TTTGGCCCTG TGACTATGGC TCTGGCACCA 1424
CTAGGGTCCT GGCCCTCTTC TTATTCATGC TTTCTCCTTT TTCTACCTTT TTTTCTCTCC 1484
TAAGACACCT GCAATAAAGT GTAGCACCCT GGT 1517 • ♦♦ ·· ··»· ·« *· ·· · · · · · · · · » ··· ·· · · · · · ·· · · · · · * ··· ««. »····»· · « ··· ·· ·· ·· ·· ·· (2) INFORMACE O SEK. ID. Č.:2:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 341 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: protein
(xi) POPIS SEKVENCE: | SEK, | . ID. | Č. :2 : | ||||||||||||
Met | Gly | Glu | Met | Glu | Gin | Leu | Arg | Gin | Glu | Ala | Glu | Gin | Leu | Lys | Lys |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Gin | Ile | Ala | Asp | Ala | Arg | Lys | Ala | Cys | Ala | Asp | Val | Thr | Leu | Ala | Glu |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Leu | Val | Ser | Gly | Leu | Glu | Val | Val | Gly | Arg | Val | Gin | Met | Arg | Thr | Arg |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Arg | Thr | Leu | Arg | Gly | His | Leu | Ala | Lys | Ile | Tyr | Ala | Met | His | Trp | Ala |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Thr | Asp | Ser | Lys | Leu | Leu | Val | Ser | Ala | Ser | Gin | Asp | Gly | Lys | Leu | Ile |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Val | Trp | Asp | Ser | Tyr | Thr | Thr | Asn | Lys | Val | His | Ala | Ile | Pro | Leu | Arg |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Ser | Ser | Trp | Val | Met | Thr | Cys | Ala | Tyr | Ala | Pro | Ser | Gly | Asn | Phe | Val |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Ala | Cys | Gly | Gly | Leu | Asp | Asn | Met | Cys | Ser | Ile | Tyr | Asn | Leu | Lys | Ser |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Arg | Glu | Gly | Asn | Val | Lys | Val | Ser | Arg | Glu | Leu | Ser | Ala | His | Thr | Gly |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Tyr | Leu | Ser | Cys | Cys | Arg | Phe | Leu | Asp | Asp | Asn | Asn | Ile | Val | Thr | Ser |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Ser | Gly | Asp | Thr | Thr | Cys | Ala | Leu | Trp | Asp | Ile | Glu | Thr | Gly | Gin | Gin |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Lys | Thr | Val | Phe | Val | Gly | His | Thr | Gly | Asp | Cys | Met | Ser | Leu | Ala | Val |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Ser | Pro | Asp | Phe | Asn | Leu | Phe | Ile | Ser | Gly | Ala | Cys | Asp | Ala | Ser | Ala |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Lys | Leu | Trp | Asp | Val | Arg | Glu | Gly | Thr | Cys | Arg | Gin | Thr | Phe | Thr | Gly |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
His | Glu | Ser | Asp | Ile. | Asn | Ala | Ile | Cys | Phe | Phe | Pro | Asn | Gly | Glu | Ala |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Ile | Cys | Thr | Gly | Ser | Asp | Asp | Ala | Ser | Cys | Arg | Leu | Phe | Asp | Leu | Arg |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Ala | Asp | Gin | Glu | Leu | Ile | Cys | Phe | Ser | His | Glu | Ser | Ile | Ile | Cys | Gly |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Ile | Thr | Ser | Val | Ala | Phe | Ser | Leu | Ser | Gly | Arg | Leu | Leu | Phe | Ala | Gly |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Tyr | Asp | Asp | Phe | Asn | Cys | Asn | Val | Trp | Asp | Ser | Met | Lys | Ser | Glu | Arg |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Val | Gly | Ile | Leu | Ser | Gly | His | Asp | Asn | Arg | Val | Ser | Cys | Leu | Gly | Val |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Thr | Ala | Asp | Gly | Met | Ala | Val | Ala | Thr | Gly | Ser | Trp | Asp | Ser | Phe | Leu |
325 | 330 | 335 |
Lys Ile Trp Asn * 340 /
·· 0000 • ·
0000 • ·
00
Claims (12)
- 000 00 00PATENTOVÉ NÁROKY1. Použití genetické modifikace v genu pro podjednotku β3 lidského G-proteinu k určení rizika vývinu choroby.
- 2. Použití podle nároku 1, kde chorobou je porucha spojená s dysregulací G-proteinu.
- 3. Použití podle nároku 2, kde genetická modifikace se nachází v SEK. ID. č.: 1, v kodonu pro aminokyselinu 275.
- 4. Použití podle nároku 3, kde se v pozici 825 v SEK. ID. Č.: 1 vyskytuje substituce thyminu za cytosin.
- 5. Použití podle nároku 2, kde poruchou je kardiovaskulární onemocnění, metabolická porucha nebo imunologická choroba.
- 6. Použití podle nároku 2, kde poruchou je hypertenze.
- 7. Způsob určování relativního rizika vývinu poruchy spojené s dysregulací G-proteinu u subjektu, vyznačující se tím, že se sekvence genu pro podjednotku β3 lidského G-proteinu subjektu porovná se sekvencí genu popsanou jako SEK. ID. Č.:l a v případě, že je v pozici 825 přítomen thymin (T), přizná se subjektu zvýšené riziko vývinu choroby.
- 8. Způsob podle nároku 7, vyznačující tím, že porovnání genů se provádí sekvenováním.s e ·· ·♦·« • · · • ··· «· ···· ·· ·· » · · · · · · » · · · · · ♦ · · » · · · · · · · · · » · · ♦ · ·· »·· ·· ··
- 9. Způsob podle nároku 8, vyzn se t í m, že úsek genu obsahující pozici vlastní sekvenací amplifikuje.a č u j í c í 825 se před
- 10.tím,Způsob podle nároku 7, v y z že porovnání genů se provádí n a č u j í c hybridizací.se t použití
- 11. Způsob podle nároku 7, v y z í m, že porovnání genů se provádí restrikčních enzymů.n a č u j í štěpením za
- 12. Způsob podle nároku 11,vyznačuj ící
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE19619362A DE19619362A1 (de) | 1996-05-14 | 1996-05-14 | Verwendung einer Genveränderung im Gen für humanes G-Protein beta-3-Untereinheit zur Diagnostik von Erkrankungen |
PCT/EP1997/002250 WO1997043442A1 (de) | 1996-05-14 | 1997-05-02 | VERWENDUNG EINER GENVERÄNDERUNG IM GEN FÜR DIE HUMANE G-PROTEIN β3-UNTEREINHEIT ZUR DIAGNOSTIK VON ERKRANKUNGEN |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CZ369698A3 true CZ369698A3 (cs) | 1999-08-11 |
CZ292691B6 CZ292691B6 (cs) | 2003-11-12 |
Family
ID=7794252
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CZ19983696A CZ292691B6 (cs) | 1996-05-14 | 1997-05-02 | Způsob určování rizika vývinu poruchy |
Country Status (23)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US6242181B1 (cs) |
EP (1) | EP0939833B1 (cs) |
JP (1) | JP2000509990A (cs) |
KR (1) | KR20000010988A (cs) |
CN (1) | CN1218515A (cs) |
AT (1) | ATE212066T1 (cs) |
AU (1) | AU732535B2 (cs) |
BG (1) | BG63214B1 (cs) |
BR (1) | BR9709245A (cs) |
CA (1) | CA2252921C (cs) |
CZ (1) | CZ292691B6 (cs) |
DE (2) | DE19619362A1 (cs) |
EA (1) | EA199800959A1 (cs) |
HU (1) | HUP9903661A3 (cs) |
IL (1) | IL126511A (cs) |
NO (1) | NO985280D0 (cs) |
NZ (1) | NZ332279A (cs) |
PL (1) | PL185779B1 (cs) |
SK (1) | SK282675B6 (cs) |
TR (1) | TR199802300T2 (cs) |
UA (1) | UA56164C2 (cs) |
WO (1) | WO1997043442A1 (cs) |
ZA (1) | ZA974102B (cs) |
Families Citing this family (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE19637518A1 (de) * | 1996-09-13 | 1998-04-09 | Winfried Siffert | PTX-sensitive G-Proteine, ihre Herstellung und Verwendung |
US6653073B1 (en) * | 1998-02-20 | 2003-11-25 | City Of Hope | Association of the serotonin transport (HTT) gene with cardiovascular disease and longevity |
ATE317436T1 (de) * | 1998-09-10 | 2006-02-15 | Siffert Winfried | Genveränderung im gen für die g$g(b)3- untereinheit des humanen g-proteins |
CA2399141A1 (en) * | 2000-02-03 | 2001-08-09 | Snip Biotech Gmbh & Co. Kg | Use of a mutation in the gene for the .beta.3-subunit of human g-protein |
JP4140329B2 (ja) * | 2002-09-25 | 2008-08-27 | 財団法人名古屋産業科学研究所 | 高血圧のリスク診断方法 |
EP2463384A3 (en) | 2010-12-07 | 2013-03-13 | Medtronic, Inc. | Diagnostic kits, genetic markers and methods for SCD or SCA therapy selection |
WO2019191010A1 (en) * | 2018-03-27 | 2019-10-03 | Aardvark Therapeutics Inc. | Personalized treatment method for congestive heart failure |
Family Cites Families (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE19637518A1 (de) * | 1996-09-13 | 1998-04-09 | Winfried Siffert | PTX-sensitive G-Proteine, ihre Herstellung und Verwendung |
ATE317436T1 (de) * | 1998-09-10 | 2006-02-15 | Siffert Winfried | Genveränderung im gen für die g$g(b)3- untereinheit des humanen g-proteins |
-
1996
- 1996-05-14 DE DE19619362A patent/DE19619362A1/de not_active Withdrawn
-
1997
- 1997-02-05 UA UA98116016A patent/UA56164C2/uk unknown
- 1997-05-02 TR TR1998/02300T patent/TR199802300T2/xx unknown
- 1997-05-02 EP EP97922940A patent/EP0939833B1/de not_active Expired - Lifetime
- 1997-05-02 CN CN97194612A patent/CN1218515A/zh active Pending
- 1997-05-02 US US09/180,783 patent/US6242181B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1997-05-02 NZ NZ33227997A patent/NZ332279A/xx unknown
- 1997-05-02 PL PL97330014A patent/PL185779B1/pl not_active IP Right Cessation
- 1997-05-02 IL IL12651197A patent/IL126511A/xx not_active IP Right Cessation
- 1997-05-02 EA EA199800959A patent/EA199800959A1/ru unknown
- 1997-05-02 BR BR9709245A patent/BR9709245A/pt active Search and Examination
- 1997-05-02 KR KR1019980709137A patent/KR20000010988A/ko not_active Application Discontinuation
- 1997-05-02 WO PCT/EP1997/002250 patent/WO1997043442A1/de active IP Right Grant
- 1997-05-02 DE DE59706027T patent/DE59706027D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1997-05-02 CA CA 2252921 patent/CA2252921C/en not_active Expired - Fee Related
- 1997-05-02 SK SK1573-98A patent/SK282675B6/sk unknown
- 1997-05-02 AU AU28902/97A patent/AU732535B2/en not_active Ceased
- 1997-05-02 HU HU9903661A patent/HUP9903661A3/hu not_active Application Discontinuation
- 1997-05-02 CZ CZ19983696A patent/CZ292691B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1997-05-02 AT AT97922940T patent/ATE212066T1/de active
- 1997-05-02 JP JP54045197A patent/JP2000509990A/ja active Pending
- 1997-05-13 ZA ZA974102A patent/ZA974102B/xx unknown
-
1998
- 1998-10-29 BG BG102878A patent/BG63214B1/bg unknown
- 1998-11-12 NO NO985280A patent/NO985280D0/no not_active Application Discontinuation
-
2001
- 2001-04-16 US US09/836,697 patent/US20020142311A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
NO985280L (no) | 1998-11-12 |
SK282675B6 (sk) | 2002-11-06 |
ATE212066T1 (de) | 2002-02-15 |
PL330014A1 (en) | 1999-04-26 |
CN1218515A (zh) | 1999-06-02 |
IL126511A (en) | 2003-11-23 |
US6242181B1 (en) | 2001-06-05 |
WO1997043442A1 (de) | 1997-11-20 |
HUP9903661A2 (hu) | 2000-03-28 |
AU2890297A (en) | 1997-12-05 |
EA199800959A1 (ru) | 1999-06-24 |
US20020142311A1 (en) | 2002-10-03 |
TR199802300T2 (xx) | 1999-02-22 |
DE59706027D1 (de) | 2002-02-21 |
BR9709245A (pt) | 1999-08-10 |
PL185779B1 (pl) | 2003-07-31 |
AU732535B2 (en) | 2001-04-26 |
CA2252921C (en) | 2008-07-08 |
CA2252921A1 (en) | 1997-11-20 |
NZ332279A (en) | 2000-04-28 |
BG102878A (en) | 1999-05-31 |
BG63214B1 (bg) | 2001-06-29 |
ZA974102B (en) | 1998-11-13 |
EP0939833A1 (de) | 1999-09-08 |
IL126511A0 (en) | 1999-08-17 |
HUP9903661A3 (en) | 2000-09-28 |
CZ292691B6 (cs) | 2003-11-12 |
SK157398A3 (en) | 2000-01-18 |
UA56164C2 (uk) | 2003-05-15 |
EP0939833B1 (de) | 2002-01-16 |
DE19619362A1 (de) | 1997-11-20 |
NO985280D0 (no) | 1998-11-12 |
JP2000509990A (ja) | 2000-08-08 |
KR20000010988A (ko) | 2000-02-25 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Frankel et al. | Nucleotide sequences in mouse DNA and RNA specific for Moloney sarcoma virus. | |
US6372431B1 (en) | Mammalian toxicological response markers | |
JP4382159B2 (ja) | 医学的診断及び治療法のための神経細胞突起局在mRNAの使用 | |
US20100047777A1 (en) | Methods for identifying mutations in coding and non-coding dna | |
CN101955943A (zh) | 影响转录和对炎性和传染性疾病的敏感性的白细胞介素-1基因座的功能多态性 | |
IL179751A (en) | Method for detecting the presence of autism or predisposition to autism or to an autism spectrum disorder in a subject and method for selecting biologically active compounds on autism or on autism spectrum disorder | |
CZ369698A3 (cs) | Použití genetické modifikace v genu pro podjednotku ß3 lidského G-proteinu k diagnóze nemocí | |
AU2005264056B2 (en) | Novel allelic variant of CYP2C19 associated with drug metabolism | |
US6417342B1 (en) | Macular degeneration diagnostics and therapeutics | |
US20040081981A1 (en) | Method of detecting risk factor for onset of diabetes | |
US20220349008A1 (en) | Novel genetic markers for postural orthostatic tachycardia syndrome (pots) and methods of use thereof for diagnosis and treatment of the same | |
US6251853B1 (en) | PTX sensitive G proteins, the production and use thereof | |
US20050037369A1 (en) | Panels of molecular targets differentially expressed during CD8+ T cell priming, and methods for therapy and diagnosis utilizing the same | |
US20090148430A1 (en) | Human obesity susceptibilty gene encoding potassium ion channels and uses thereof | |
EP1311528A2 (en) | Human cytidine monophosphate (cmp) kinase cdna | |
US20030027134A1 (en) | Method of detecting risk factor for onset of diabetes | |
Ashley Jr | Functional analysis of the murine and human FMR1 gene product, FMRP | |
Torres | Physical mapping and mutation analysis of the Wolfram Syndrome gene | |
WO2000075294A1 (en) | Glycogenin, glycogenin pseudogenes, and uses thereof to determine risk for developing type 2 diabetes | |
TW200300798A (en) | Mutatant CYP2D6 genes | |
JP2004229650A (ja) | 新規タンパク質及びそれをコードするdna | |
JP2004229652A (ja) | 新規タンパク質及びそれをコードするdna |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PD00 | Pending as of 2000-06-30 in czech republic | ||
MM4A | Patent lapsed due to non-payment of fee |
Effective date: 20070502 |