MXPA03009731A - Polinucleotidos y polipeptidos novedosos del gen de ifnalfa-17. - Google Patents
Polinucleotidos y polipeptidos novedosos del gen de ifnalfa-17.Info
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Abstract
La presente invencion se refiere a polinucleotidos novedosos derivados de la secuencia de nucleotidos del gen de IFNa-17 que comprende SNPs novedosos, y polipeptidos novedosos derivados de la proteina IFN-17 natural de tipo silvestre que comprende por lo menos una mutacion causada por cuando menos un SNP de la invencion, asi como sus usos terapeuticos.
Description
POLINUCLEOTIDOS Y POLIPEPT1DOS NOVEDOSOS DEL GEN DE IFNa-17
REFERENCIA RECÍPROCA A LA SOLICITUD RELACIONADA
La presente invención reclama prioridad a la solicitud de patente francesa 0105516, presentada en abril 24, 2001 , titulada «Polinucleótidos y polipéptidos novedosos del gen IFNa-17».
ANTECEDENTES DE LA INVENCION
CAMPO DE LA INVENCION
La presente invención se refiere a polinucleótidos novedosos derivados de la secuencia de nucleótidos del gen de IFNa-17 que comprende nuevos SNPs, y polipéptidos novedosos derivados de la proteína IFNa-17 natural de tipo silvestre que comprende mutaciones causadas por estos SNPs, así como sus usos terapéuticos.
TECNICA RELACIONADA
El gen de interferón alfa 17, referido en lo sucesivo como IFNa- 7, se describe en las publicaciones: - Olopade et al.: "Mapping of the shortest región of overlap of deletions of the short arm of chromosome 9 associated with human neopiasia"; Genomics; 14: 437-443; 1992. - Lawn R. M. et al.; "DNA sequence of two closely linked human ieukocyte interferon genes"; Science 212 (4499), 1159-1162 (1981 ). La secuencia de nucleótidos de este gen, es accesible bajo el número de acceso V00532, en la base de datos del Banco de Genes. E! IFNcx se conoce por sus efectos antiproliferativos celulares y su intervención en respuestas antivirales y antiparasitarias. Se sabe también que el lFNcc inhibe la expresión de varias otras citocinas al nivel de las células madre hematopoyéticas, y que inhibe la proliferación celular de ciertos tumores. Se sabe también que el IFNa reduce la expresión de los receptores al EGF en carcinomas renales, inhibe la expresión de ciertos genes mitocondriales para inhibir la proliferación de fibroblastos, monocitos y linfocitos B, especialmente in vitro, y bloquea la síntesis de anticuerpos por linfocítos B. Se sabe también que el IFNa induce la expresión de antígenos específicos de tumores sobre la superficie de células tumorales, e induce también a los genes puestos bajo el control de regiones de promotor del tipo del ISRE (elemento de respuesta estimulado por interferón), actuando sobre los factores de transcripción específicos de estos ISRE. Se sabe que el IFNa interviene en diferentes trastornos y/o enfermedades humanas, tales como diferentes cánceres tales como, por ejemplo, carcinomas, melanomas, linfomas, leucemias, y cánceres del hígado, cuello, cabeza y ríñones, enfermedades cardiovasculares, enfermedades metabólicas tales como las que no están relacionadas con el sistema inmune tales como, por ejemplo, obesidad, enfermedades infecciosas tales como hepatitis B y C y SIDA, neumonías, colitis ulcerativa, enfermedades del sistema nervioso central tales como, por ejemplo, enfermedad de Alzheimer, esquizofrenia y depresión, el rechazo de injertos de tejidos u órganos, cicatrización de heridas, anemia en pacientes dializados, alergias, asma, esclerosis múltiple, osteoporosis, psoriasis, artritis reumatoide, enfermedad de Crohn, enfermedades y trastornos autoinmunes, trastornos gastrointestinales, o incluso trastornos relacionados con tratamientos quimioterapéuticos. El IFNa se usa particularmente para el tratamiento de ciertas leucemias, carcinomas renales metastásicos, así como tumores que parecen seguir una inmunodeficiencia, tal como sarcoma de Kaposi en el caso de SIDA. El IFNa es también efectivo contra otros tipos de tumores y contra ciertas infecciones virales. El IFNa es reconocido también por la FDA (Dirección de Alimentos y Medicamentos) para el tratamiento de verrugas genitales o enfermedades venéreas. Sin embargo, el IFNa, y en particular el IFNa-17, tiene numerosos efectos secundarios cuando se usa en composiciones farmacéuticas, tales como reacciones de hipersensibilidad aguda (urticaria, broncoconstricción, choque anafiláctico, etc.), arritmias cardiacas, presión sanguínea baja, ataques epilépticos, problemas con las funciones de la tiroides, síndromes tipo influenza (fiebres, sudoraciones, mialgias), etc. Además, los pacientes tratados con IFN pueden desarrollar anticuerpos que neutralizan estas moléculas, disminuyendo de esta manera su eficacia. El inventor ha encontrado análogos de polipéptidos y polinucleótidos novedosos para el gen de IFNa-17, capaces de tener una funcionalidad diferente a partir de la proteína IFNa-17 natural de tipo silvestre. Estos polipéptidos y polinucleótidos novedosos se pueden usar notablemente para tratar o prevenir los trastornos o enfermedades mencionados anteriormente, y evitar todas las desventajas, o la mayor parte de las mismas, que están vinculadas a los mismos.
BREVE DESCRIPCION DE LA INVENCION
La invención tiene como primer objetivo, polinucleótidos novedosos que difieren de la secuencia de nucleótidos del gen de IFNa-17 de referencia de tipo silvestre, ya que comprenden uno o varios SNPs (polimorfismos de nucleótidos individuales). La secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. 1 del gen de IFNa-17 de referencia de tipo silvestre humano se forma de 1873 nucleótidos, y comprende una secuencia de codificación de 570 nucleótidos, del nucleótido 639 (codón de inicio) al nucleótido 1208 (codón de detención).
El solicitante ha identificado 2 SNPs en la secuencia de nucleotidos del gen de IFNcc-17 de referencia de tipo silvestre. Estos SNPs son los siguientes: g771c y 808lns(a). Se entiende, en el sentido de la presente invención, que la numeración que corresponde al posicionamiento del SNP definido anteriormente, se refiere a la numeración de la secuencia de nucleotidos de SEQ ID NO. 1. Las letras a, t, c y g corresponden respectivamente a las bases nitrogenadas adenina, timina, citosina y guanina. La primer letra corresponde al nucleótido de tipo silvestre, mientras que la última letra corresponde al nucleótido mutado. De esta manera, el SNP g771c corresponde a una mutación del nucleótido guanina (g) en la posición 771 de la secuencia de nucleotidos de SEQ ID NO. 1 del gen de lFNa- 7 de referencia de tipo silvestre en una citosina (c). El SNP 808lns(a) corresponde a la inserción del nucleótido adenina (a) en la posición 808 de la secuencia de nucleotidos de SEQ ID NO. 1 del gen de IFNcc-17 de referencia de tipo silvestre. Estos SNPs fueron identificados por el solicitante usando el procedimiento de determinación descrito en la solicitud de patente del solicitante FR 00 22894, titulada "Process for the determination of one or several functional polymorphism(s) in the nucleotide sequence of a preselected functional candidate gene and its applications", y presentada en diciembre 6, 2000, citada en la presente como referencia. El procedimiento descrito en esta solicitud de patente, permite la identificación de un (o varios) SNP(s) preexistente(s) en por lo menos un individuo de una población aleatoria de individuos. En el alcance de la presente invención, un fragmento de la secuencia de nucleótidos del gen de IFNa-17 que comprende, por ejemplo, la secuencia de codificación, se aisló de diferentes individuos en una población de individuos seleccionada en forma aleatoria. La secuenciación de estos fragmentos se llevó a cabo entonces en algunas de estas muestras que tienen un perfil de heterodúplex (es decir, un perfil diferente del perfil de la secuencia de genes del IFNa-17 de referencia de tipo silvestre) después de análisis mediante DHPLC ("cromatografía de líquidos de alto rendimiento desnaturalizante"). El fragmento secuenciado de esta forma, se comparó entonces con la secuencia de nucleótidos del fragmento del gen de IFNa-17 de referencia de tipo silvestre, y los SNPs identificados de conformidad con la invención. De esta manera, los SNPs son naturales, y cada uno de ellos está presente en ciertos individuos de la población mundial. El gen de IFNa-17 de referencia de tipo silvestre, codifica para una proteína inmadura de 189 aminoácidos, que corresponde a la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2, que se convertirá en una proteína madura de 166 aminoácidos, mediante desdoblamiento del péptido de señal que incluye los primeros 23 aminoácidos. Los SNPs de codificación de la invención, a saber, g771c y 808lns(a), causan modificaciones, al nivel de la secuencia de aminoácidos, de la proteína codificada por la secuencia de nucleótidos del gen de IFN -17. Estas modificaciones son las siguientes: El SNP g771c causa una mutación del aminoácido glicina (G) en la posición 45 de la proteína inmadura del gen de IFNa-17, que corresponde a la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2, en arginina (R) y en la posición 22 de la proteína madura. En la descripción de la presente invención, se denominará indiferentemente G22R y G45R a la mutación codificada por este SNP de acuerdo a si se refiere, respectivamente, a la proteína madura o a la proteína inmadura. El SNP 808Ins(a) causa una mutación del aminoácido histidina (H) en la posición 57 en la proteína inmadura del gen de IFNa-17, que corresponde a la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2, en glutamina (Q) y en la posición 34 de la proteína madura. Además, la inserción de una adenina en la posición 808 en la secuencia de nucleótidos, causa un cambio del marco de lectura en la traducción de la proteína, que da como resultado la aparición de un codón de detención en la posición 58 de la secuencia de aminoácidos. De esta manera, el SNP 808lns(a) causa una interrupción de la traducción, poco después de la glutamina 57. Como consecuencia, la proteína inmadura resultante se acorta, y se forma sólo de 57 aminoácidos. Este polimorfismo se denomina también marco de lectura 57 de H57Q. En la descripción de la presente invención, se denominará indiferentemente marco de lectura 34 de H34Q y marco de lectura 57 de H57Q, a la mutación codificada por este SNP de acuerdo a si se refiere, respectivamente, a la proteína madura o a la proteína inmadura. La secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3 corresponde a la proteína inmadura mutada (marco de lectura 57 de H57Q) codificada por la secuencia de nucleótidos de ID SEQ ID NO. 1 que comprende el SNP 808lns(a). Cada uno de los SNPs de la invención causa modificaciones de la conformación espacial de los polipéptidos de conformidad con la invención, en comparación con el polipéptido codificado por la secuencia de nucleótidos del gen de IFNa-17 de referencia de tipo silvestre. Estas modificaciones se pueden observar mediante elaboración de modelos moleculares computacionales, de acuerdo a métodos que son bien conocidos por los expertos en la técnica, haciendo uso de, por ejemplo, herramientas de elaboración de modelos de novo (por ejemplo,
SEQFOLD/MSl), homología (por ejemplo, MODELER SI), minimización del campo de fuerza (por ejemplo, DISCOVER, DELPHI/MSI) y/o dinámica molecular (por ejemplo, CFF/MSI). Un ejemplo de dichos modelos, se da después en la sección experimental. La elaboración de modelos moleculares computacionales, muestra que la mutación G22R en la proteína madura mutada, implica una modificación y un desplazamiento del bucle AB alrededor de la posición 22, que causa la desaparición de enlaces de hidrógeno. Las figuras 1A y 1B muestran que el bucle AB está no plegado y sobresale. En el IFNa-17 natural de tipo silvestre, el residuo G22 está muy cerca del residuo R144. Se sabe que este residuo R144 interviene en la unión del interferón a-2 (IFNa-2) a su receptor. Siendo muy similar la estructura del IFNa-2 y IFNa-17, es probable que el residuo R144 en el IFNa-17 intervenga en la unión a su receptor. De esta manera, la proteína mutada G22R posee una conformación tridimensional diferente de la proteína IFNa-17 natural de tipo silvestre. La elaboración de modelos moleculares computacionales, permite también la predicción de que la presencia del aminoácido arginina en la posición 22 implica una modificación significativa de la estructura y función de la proteína IFNa-17 natural de tipo silvestre, notablemente al nivel de la unión del IFNa-17 a su receptor. La genotipificación de los poiinucleótidos de conformidad con la invención se puede llevar a cabo de tal forma, para determinar la frecuencia alélica de estos poiinucleótidos en una población. La determinación de la funcionalidad de los polipéptidos de la invención se puede llevar a cabo igualmente mediante una prueba de su actividad biológica.
A este respecto, es posible medir, por ejemplo, transducción de señales, maduración de células dendríticas, liberación de citocinas por linfocitos T, liberación de citocinas por monocitos, actividad antiviral in vitro o in vivo, actividad antiproliferativa celular sobre la línea de células de Daudi Burkitt y actividad antiproliferativa celular de la línea de células TF-1 de polipéptidos de conformidad con la invención, y comparar con el IFNa-17 de tipo silvestre o el IFNa-2 de tipo silvestre seleccionado, como representativo de Intron A, un producto comercial. La invención tiene también como objetivo el uso de polinucleótidos y polipéptidos de conformidad con la invención, así como de moléculas terapéuticas obtenidas y/o identificadas, partiendo de estos polinucleótidos y polipéptidos, notablemente para la prevención y el tratamiento de ciertos trastornos y/o enfermedades de humanos.
BREVE DESCRIPCION DE LOS DIBUJOS
La figura 1A representa un modelo de la proteína codificada de conformidad con la invención que comprende el SNP G45R y la proteína IFNa-17 de tipo silvestre. La figura 1B representa un acercamiento del modelo de la parte inferior de cada una de las proteínas representadas en la figura 1 A. En las figuras 1A y 1 B, el listón negro representa la estructura de la proteína IFNa-17 de tipo silvestre, y el listón blanco representa la estructura de la proteína IFNa-17 mutada G22R.
La figura 2 representa los resultados de la prueba para medir el efecto antiproliferativo del IFNa-17 mutado G45R, sobre la línea de células TF-1. En esta figura, las abscisas corresponden a la concentración del IFNcx (ng/mL), y las ordenadas corresponden a la inhibición de la proliferación celular (%). Se compara el efecto antiproliferativo del IFNa-17 mutado G45R (diamantes negros), con el del IFNa-2 de tipo silvestre (cuadros blancos). La figura 3 representa los resultados de la prueba para medir el efecto antiproliferativo del IFNa-17 mutado G45R, sobre la línea de células de Daudi Burkitt. En esta figura, las abscisas corresponden a la concentración del IFNa (ng/mL), y las ordenadas corresponden a la inhibición de la proliferación celular (%). Se compara el efecto antiproliferativo del IFNa-17 mutado G45R (diamantes negros), con el del IFNa-2 de tipo silvestre (cuadros blancos). La figura 4 representa el índice de supervivencia de ratones infectados previamente por VSV, y tratados con proteína IFNa- 7 mutada G45R, en comparación con ratones tratados con IFNa-2 de tipo silvestre, o ratones que no han sido tratados. En esta figura, las abscisas corresponden al tiempo de supervivencia (días), y las ordenadas corresponden al índice de supervivencia relativo de ratones infectados por VSV. Los diamantes negros representan los datos para ratones infectados por VSV tratados con IFNa-17 mutado G45R, los cuadros negros representan los datos para ratones infectados por VSV tratados con IFNa-2 de tipo silvestre, y los triángulos blancos representan los datos para ratones infectados por VSV que no han sido tratados.
DESCRIPCION DETALLADA DE LA INVENCION
Definiciones Por "secuencia de nucleótidos del gen de referencia de tipo silvestre", se entiende la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. 1 del gen de IFNa-17 humano. Esta secuencia es accesible en el Banco de Genes bajo el número de acceso V00532, y se describe en: - Olopade et al.: "Mapping of the shortest región of overlap of deletions of the short arm of chromosome 9 associated with human neoplasia"; Genomics; 14: 437-443; 1992. - Lawn R. M. et al.; "DNA sequence of two closely linked human leukocyte interferon genes"; Science 212 (4499), 1159-1162 (1981). Por "proteína IFNa-17 natural de tipo silvestre" o "proteína IFNa-17 de tipo silvestre", se entiende la proteína madura codificada por la secuencia de nucleótidos del gen de IFNa-17 de referencia de tipo silvestre. La proteína inmadura natural de tipo silvestre IFNa-17 corresponde a la secuencia de péptidos mostrada en SEQ ID NO. 2. Por "polinucleótido" se entiende un polirribonucleótido o un polidesoxirribonucleótido que puede ser un ADN o un ARN modificado o no modificado.
El término polinucleótido incluye, por ejemplo, un ADN de cadena sencilla o de doble cadena, un ADN formado de una mezcla de una o varias regiones de cadena sencilla y de una o varias regiones de doble cadena, un ARN de cadena sencilla o de doble cadena, y un ARN formado de una mezcla de una o varias regiones de cadena sencilla y de una o varias regiones de doble cadena. El término polinucleótido puede incluir también un ARN y/o un ADN que incluya una o varias regiones de triple cadena. Por polinucleótido se entiende igualmente moléculas de ARN o ADN que contienen una o varias bases modificadas de tal forma que tienen un esqueleto modificado por razones de estabilidad o por otras razones. Por base modificada se entiende, por ejemplo, las bases no usuales tales como inosina. Por "polipéptido" se entiende un péptido, un oligopéptido, un oligómero o una proteína que comprende por lo menos dos aminoácidos unidos entre sí por un enlace peptídico normal o modificado, tal como en los casos de los péptidos isostéricos, por ejemplo. Un polipéptido se puede formar de aminoácidos diferentes de los 20 aminoácidos definidos por el código genético. Un polipéptido se puede formar igualmente de aminoácidos modificados mediante procedimientos naturales, tales como procedimientos de maduración post-traducción, o mediante procedimientos químicos, los cuales son bien conocidos por los expertos en la técnica. Dichas modificaciones se describen en forma detallada en la literatura. Estas modificaciones pueden aparecer en cualquier punto en el polipéptido: en el esqueleto de péptidos, en la cadena de aminoácidos o incluso en los extremos carboxi o amino terminales. Un polipéptido puede ser ramificado después de ubiquitinación, o ser cíclico con o sin ramificación. Este tipo de modificación puede ser el resultado de procedimientos de post-traducción naturales o sintéticos que son bien conocidos por los expertos en la técnica. Por ejemplo, se entiende que las modificaciones de polipéptidos incluyen acetilación, acilación, ribosilación de ADP, amidación, fijación covalente de flavina, fijación covalente de hematina reducida, fijación covalente de un nucleótido o de un derivado de nucleótido, fijación covalente de un lípido o de un derivado lipídico, la fijación covalente de un fosfatidilinositol, entrelazamiento covalente o no covalente, ciclización, formación de enlaces disulfuro, desmetilación, formación de cisteína, formación de piroglutamato, formilacion, carboxíiacion gamma, glicosilacíón, incluyendo PEGilación, formación de ancla de GPI, hidroxiiación, yoduración, metilación, miristoilación, oxidación, procesos proteol ¡ticos, fosforilación, premiación, racemización, seneloilación, sulfatación, y adición de aminoácidos, tal como en arglnilación o ubiquitinación. Dichas modificaciones se describen en detalle en la literatura: véase PROTEINS-STRUCTURE AND MOLECULAR PROPERTIES, 2a. ed., T. E. Creighton, New York, 1993, POST-TRANS LATI ONAL COVALENT MODIFICARON OF PROTEINS, B. C. Johnson, ed., Academic Press, New York, 1983; Seifter et al. "Analysis for protein modifications and nonprotein cofactors", Meth. Enzymol. (1990) 182: 626-646; y Rattan et al. "Protein Synthesís: Post-translational Modifications and Aging", Ann NY Acad Sci (1992) 663: 48-62. Por "polinucleótido aislado" o "polipéptido aislado" se entiende, respectivamente, un polinucleótido o un polipéptido tal como se definió anteriormente, el cual se aisla del cuerpo humano, o de otra manera se produce mediante un procedimiento técnico. Por "identidad" se entiende la medición de la identidad de secuencias de nucleótidos o polipéptidos. La identidad es un término bien conocido por los expertos en la técnica, y se describe en detalle en la literatura. Véase COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY, Lesk, A. M., ed., Oxford University Press, New York, 1998; BIOCOMPUTING INFORMATICS AND GENOME PROJECT, Smith, D. W., ed., Academic Press, New York, 1993; COMPUTER ANALYSIS OF SEQUENCE DATA, PARTE I, Griffin, A. M. y Griffin H. G. eds., Humana Press, New Jersey, 1994; y SEQUENCE ANALYSIS IN MOLECULAR BIOLOGY, von Heinje, G., Academic Press, 1987. Los métodos que se usan comúnmente para determinar la identidad y la similitud entre dos secuencias, se describen igualmente bien en la literatura. Véase GUIDE TO HUGE COMPUTER, Martin J. Bishop, ed., Academic Press, San Diego, 1994, y Carillo H. y Lipton D., Siam J Applied Math (1988) 48: 1073. Un polinucleótido que tiene, por ejemplo, una identidad de por lo menos 95% con la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. 1 , es un polinucleótido que contiene cuando mucho 5 puntos de mutación sobre 100 nucleótidos, en comparación con dicha secuencia. Estos puntos de mutación pueden ser una o varias sustituciones, adiciones y/o deleciones, de uno o varios nucleótidos. De la misma forma, un polipéptido que tiene, por ejemplo, una identidad de por lo menos 95% con la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2, es un polipéptido que contiene cuando mucho 5 puntos de mutación sobre 100 aminoácidos, en comparación con dicha secuencia. Estos puntos de mutación pueden ser una o varias sustituciones, adiciones y/o deleciones, de uno o varios aminoácidos. Se considera como variantes de estas secuencias, los polinucleótidos y polipéptidos de conformidad con la invención que no son totalmente idénticos con, respectivamente: - la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. 1 que comprende por lo menos uno de los siguientes SNPs: g771c y 808lns(a) - la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2 que comprende el SNP G45R - la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3, que comprende posiblemente el SNP G45R. Usualmente, un polinucleótido de conformidad con la invención posee la misma o prácticamente la misma actividad biológica que la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. 1, que comprende por lo menos uno de los SNPs: g771c y 808lns(a). En forma similar, usualmente un polipéptido de conformidad con la invención, posee la misma o prácticamente la misma actividad biológica que: - la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2 que comprende el SNP G45R, y/o - la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3, que comprende posiblemente el SNP G45R. De conformidad con la invención, se puede obtener una variante, por ejemplo, mediante mutagénesis dirigida a sitio, o mediante síntesis directa. Por "SNP" se entiende cualquier variación natural de una base en una secuencia de nucleótidos. Un SNP, en una secuencia de nucleótidos, puede ser de codificación, silencioso o que no es de codificación. Un SNP de codificación es un polimorfismo incluido en la secuencia de codificación de una secuencia de nucleótidos que incluye una modificación de un aminoácido en la secuencia de aminoácidos codificada por esta secuencia de nucleótidos. En este caso, el término SNP se aplica igualmente, por extensión, a una mutación en una secuencia de aminoácidos. Un SNP silencioso, es un polimorfismo incluido en la secuencia de codificación de una secuencia de nucleótidos que no incluye una modificación de un aminoácido en la secuencia de aminoácidos codificada por esta secuencia de nucleótidos. Un SNP que no es de codificación, es un polimorfismo incluido en la secuencia que no es de codificación de una secuencia de nucleótidos.
Este polimorfismo se puede encontrar notablemente en un intrón, una zona de empalme, un promotor de transcripción o una secuencia intensificadora de sitio. Por "SNP funcional" se entiende un SNP, tal como se definió anteriormente, el cual se incluye en una secuencia de nucleótidos o una secuencia de aminoácidos, que tiene una funcionalidad. Por "funcionalidad" se entiende la actividad biológica de un polipéptido o de un polinucleótido. La funcionalidad de un polipéptido o de un polinucleótido de conformidad con la invención, puede consistir en una conservación, un aumento, una reducción o una supresión de la actividad biológica del polipéptido codificado por la secuencia de nucleótidos del gen de referencia de tipo silvestre, o de esta última secuencia de nucleótidos. La funcionalidad de un polipéptido o de un polinucleótido de conformidad con la invención, puede consistir igualmente en un cambio en la naturaleza de la actividad biológica del polipéptido codificado por la secuencia de nucleótidos del gen de referencia de tipo silvestre, o de esta última secuencia de nucleótidos. La actividad biológica puede vincularse notablemente a la afinidad o a la ausencia de afinidad de un polipéptido de conformidad con la invención con un receptor.
Polinucleótido La presente invención tiene como primer objetivo, un polinucleótido aislado que comprenda: a) una secuencia de nucleótidos que tenga por lo menos 90% de identidad, de preferencia por lo menos 95% de identidad, y más preferiblemente por lo menos 99% de identidad, con la secuencia de SEQ ID NO. 1 o su secuencia de codificación (del nucleótido 639 al nucleótido 1208), entendiéndose que esta secuencia de nucleótidos comprende por io menos uno de los siguientes SNPs de codificación: g771c y 808lns(a), o b) una secuencia de nucleótidos complementaria a una secuencia de nucleótidos bajo a). De conformidad con la presente invención, la secuencia de nucleótidos bajo a) puede comprender el SNP g771c o el SNP 808lns(a), o los SNPs g771c 808lns(a). Se entiende, en el sentido de la presente invención, que la numeración corresponde al posicionamiento de los SNPs en la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. . La presente invención se refiere igualmente a un polinucleótido aislado, que comprende: a) una secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. 1 o su secuencia de codificación, entendiéndose que cada una de estas secuencias comprende por lo menos uno de los siguientes SNPs de codificación: g771c y 808lns(a), o b) una secuencia de nucleótidos complementaria a una secuencia de nucleótidos bajo a). De preferencia, el polinudeótido de la invención consiste de la secuencia SEQ ID NO. 1 o su secuencia de codificación, entendiéndose que cada una de estas secuencias comprende por lo menos uno de los siguientes SNPs de codificación: g771c y 808lns(a). De conformidad con la invención, el polinudeótido definido anteriormente comprende un SNP de codificación individual seleccionado del grupo que consiste de: g771c y 808lns(a). La presente invención se refiere también a un polinudeótido aislado que consiste de una parte de: a) una secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. 1 o su secuencia de codificación, entendiéndose que cada una de estas secuencias comprende por lo menos uno de los siguientes SNPs: g771c y 808lns(a), o b) una secuencia de nucleótidos complementaria a una secuencia de nucleótidos bajo a), dicho polinudeótido aislado estando formado de por lo menos 10 nucleótidos. De preferencia, el polinudeótido aislado como se definió anteriormente, se forma de 10 a 40 nucleótidos. La presente invención tiene también como objetivo un polinudeótido aislado que codifique para un polipéptido, que comprenda: a) la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2, o b) la secuencia de aminoácidos que comprende los aminoácidos incluidos entre las posiciones 24 y 189 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2, entendiéndose que cada una de las secuencias de aminoácidos bajo a) y b), comprende el siguiente SNP de codificación: G45R. Se entiende, en el sentido de la presente invención, que la numeración que corresponde al posicionamiento del SNP G45R, es respecto a la numeración de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2. La presente invención tiene también como objetivo un polinucleótido aislado que codifique para un polipéptido, que comprenda: a) la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3, o b) la secuencia de aminoácidos que comprende los aminoácidos incluidos entre las posiciones 24 y 57 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3. Cada una de las secuencias de aminoácidos bajo a) y b) del polipéptido definido anteriormente, puede comprender también el SNP G45R. De conformidad con un objetivo preferido de la invención, el polipéptido definido anteriormente comprende un SNP de codificación individual, tal como el definido anteriormente. Más preferiblemente, un polinucleótido aislado de conformidad con la invención codifica para un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2 completa, o parte de la misma, y que tiene el SNP de codificación G45R. Más preferiblemente, un polinucleótido aislado de conformidad con la invención codifica para un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3 completa, o parte de la misma, teniendo también posiblemente el SNP de codificación G45R. De preferencia, un polinucleótido de conformidad con la invención se forma de una molécula de ADN o ARN. Un polinucleótido de conformidad con la invención se puede obtener mediante métodos normales de síntesis de ADN o ARN. Un polinucleótido de conformidad con la invención que comprende el SNP g771c, se puede obtener igualmente mediante mutagénesis dirigida a sitio, partiendo de la secuencia de nucleótidos del gen de IFNa-17, modificando el nucleotido guanina (g) de tipo silvestre por el nucleotido citosina (c) mutado en la posición 771 de la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. 1. Un polinucleótido de conformidad con la invención que comprende el SNP 808lns(a), se puede obtener igualmente mediante mutagénesis dirigida a sitio, partiendo de la secuencia de nucleótidos del gen de IFNa-17, añadiendo un nucleotido de adenina (a) en la posición 808 de la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. 1. Los procedimientos de mutagénesis dirigida a sitio que pueden implementarse de esta forma, son bien conocidos por los expertos en la técnica. Se puede mencionar notablemente la publicación de TA Kunkel en 1985 en Trac. Nati. Acad. Sci. USA" 82:488. Un polinucleótido aislado puede incluir igualmente, por ejemplo, secuencias de nucleótidos que codifiquen para las secuencias de aminoácidos de pre-, pro- o pre-pro-proteína, o secuencias de aminoácidos de marcadores, tales como el péptido de hexa-histidina. Un polinucleótido de la invención se puede asociar igualmente con secuencias de nucleótidos que codifiquen para otras proteínas o fragmentos de proteína, para obtener proteínas de fusión u otros productos de purificación. Un polinucleótido de conformidad con la invención puede incluir igualmente secuencias de nucleótidos tales como las secuencias que no son de codificación 5' y/o 3' tales como, por ejemplo, secuencias transcritas o no transcritas, secuencias traducidas o no traducidas, secuencias de señal de empalme, secuencias poliadeniladas, secuencias de unión a ribosomas, o incluso secuencias que estabilicen el ARN mensajero. Una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos o polinucleótidos, se define como una que puede hibridar con su secuencia de nucleótidos, bajo condiciones severas. Por "condiciones de hibridación severa", se entiende en general, pero no necesariamente, las condiciones químicas que permiten una hibridación cuando las secuencias de nucleótidos tienen una identidad de por lo menos 80%, de preferencia mayor que o igual a 90%, aún más preferiblemente mayor que o igual a 95%, y muy preferiblemente mayor que o igual a 97%. Las condiciones severas se pueden obtener de acuerdo a métodos bien conocidos por los expertos en la técnica y, por ejemplo, mediante una incubación de los polinucleótidos a 42°C, en una solución que comprenda formamida a 50%, 5x de SSC (150 mM de NaCI, 15 mM de citrato trisódico), 50 mM de fosfato de sodio (pH = 7.6), 5x de solución de Denhardt, sulfato de dextrán a 10% y 20 µg de ADN de esperma de salmón desnaturalizado, seguido de lavado de los filtros a 0.1 x de SSC a 65°C. Dentro del alcance de la invención, cuando las condiciones de hibridación severa permiten la hibridación de las secuencias de nucleótidos que tienen una identidad igual a 100%, se considera que la secuencia de nucleótidos es estrictamente complementaria a la secuencia de nucleótidos tal como se describió bajo a). Se entiende dentro del significado de la presente invención, que la secuencia de nucleótidos complementaria a una secuencia de nucleótidos, comprende por lo menos un SNP antisentido de conformidad con la invención. De esta manera, por ejemplo, si la secuencia de nucleótidos comprende el SNP g771c, su secuencia de nucleótidos complementaria comprende el nucleótido g al equivalente de la posición 77 .
Identificación, hibridación y/o amplificación de un polinucleótido que comprende un SNP La presente invención tiene también como objetivo el uso de todo o parte de: a) un polinucleótido que tenga 80 a 100% de identidad (de preferencia por lo menos 90% de identidad, más preferiblemente 95% de identidad, y en particular 100% de identidad) con la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. 1 , y/o b) un polinucleótido de conformidad con la invención que comprenda por lo menos un SNP, para identificar, hibridar y/o amplificar un polinucleótido completo o parte del mismo que tiene 80 a 00% de identidad (de preferencia por lo menos 90% de identidad, más preferiblemente 95% de identidad, y en particular 100% de identidad) con la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. 1 o, si es necesario, su secuencia de codificación (del nucleótido 639 al nucleótido 1208), entendiéndose que cada una de estas secuencias comprende por lo menos uno de los siguientes SNPs: g771c y 808lns(a).
Genotipificación y determinación de la frecuencia de un SNP La presente invención tiene igualmente como objetivo el uso de todo o parte de: a) un polinucleótido que tenga 80 a 100% de identidad (de preferencia por lo menos 90% de identidad, más preferiblemente 95% de identidad, y en particular 100% de identidad) con la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. 1 , y/o b) un polinucleótido de conformidad con la invención que comprenda por lo menos un SNP, para genotipificar un polinucleótido completo o parte del mismo que tiene 80 a 100% de identidad (de preferencia por lo menos 90% de identidad, más preferiblemente 95% de identidad, y en particular 100% de identidad) con la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. 1 o, si es necesario, su secuencia de codificación (del nucleótido 639 al nucleótido 1208), entendiéndose que cada una de estas secuencias comprende por lo menos uno de los siguientes SNPs: g771c y 808lns(a). De conformidad con la invención, la genotipificación se puede llevar a cabo en un individuo o una población de individuos. Dentro del significado de la invención, la genotipicación se define como un procedimiento para la determinación de un genotipo de un individuo o de una población de individuos. El genotipo consiste de los alelos presentes en uno o más loci específicos. Por "población de individuos" se entiende un grupo de individuos seleccionados en forma aleatoria o no aleatoria. Estos individuos pueden ser humanos, animales, microorganismos o plantas. Usualmente, el grupo de individuos comprende por lo menos 10 individuos, de preferencia de 100 a 300 individuos. Los individuos pueden seleccionarse de acuerdo a su etnicidad o de acuerdo a su fenotipo, notablemente los que son afectados por los siguientes trastornos y/o enfermedades: carcinomas, melanomas, linfomas, leucemias, y cánceres del hígado, cuello, cabeza y ríñones, enfermedades cardiovasculares, enfermedades meíabólicas tales como las que no están relacionadas con el sistema inmune tales como, por ejemplo, obesidad, enfermedades infecciosas, en particular infecciones virales tales como hepatitis B y C y SIDA, neumonías, colitis ulcerativa, enfermedades del sistema nervioso central tales como, por ejemplo, enfermedad de Alzheimer, esquizofrenia y depresión, el rechazo de injertos de tejidos u órganos, cicatrización de heridas, anemia en pacientes dializados, alergias, asma, esclerosis múltiple, osteoporosis, psoriasis, artritis reumatoide, enfermedad de Crohn, enfermedades y trastornos autoinmunes, trastornos gastrointestinales, o incluso trastornos relacionados con tratamientos quimioterapéuticos. Un SNP funcional de conformidad con la invención, se genotipifica de preferencia en una población de individuos. Existen tecnologías múltiples que pueden ¡mplementarse para genotipificar SNPs (véase notablemente Kwok Pharmacogenomics, 2000, vol. 1 , pp 95-100. "High-throughput genotyping assay approaches"). Estas tecnologías se basan en uno de los cuatro siguientes principios: hibridación de oligonucleótidos específica de alelos, elongación de oligonucleótidos por didesoxinucleótidos, opcionalmente en presencia de desoxinucleótidos, ligación de oligonucleótidos específicos de alelos o desdoblamiento de oligonucleótidos específicos de alelos. Cada una de estas tecnologías puede acoplarse a un sistema de detección tal como medición de fluorescencia directa o polarizada, o espectrometría de masas. La genotipificación se puede llevar a cabo notablemente mediante minisecuenciación con ddNTPs en caliente (2 ddNTPs diferentes marcados mediante fluoróforos diferentes) y ddNTPs en frío (2 ddNTPs diferentes no marcados), con relación a un escáner de fluorescencia polarizada. El protocolo de minisecuenciación con lectura de fluorescencia polarizada (tecnología de FP-TDI o molde de polarización de fluorescencia-colorante directo-incorporación de terminador), es bien conocido por los expertos en la técnica. Se puede llevar a cabo en un producto obtenido después de amplificación mediante reacción en cadena de polimerasa (PCR) del ADN de cada individuo. Este producto de PCR se selecciona para cubrir la región génica de polinucleótidos que contiene al SNP estudiado. Después del último paso en el termociclizador de PCR, la placa se coloca en un escáner de fluorescencia polarizada para una lectura de las bases marcadas usando excitación específica de fluoróforos y filtros de emisión. Los valores de intensidad de las bases marcadas, se reportan en una gráfica. Para la amplificación de PCR, en el caso de un SNP de la invención, los iniciadores sentido y antisentido pueden ser seleccionados, respectivamente, por el experto en la técnica, de acuerdo a la posición de los SNPs de la invención. Por ejemplo, las secuencias de nucleótidos sentido y antisentido para los iniciadores de amplificación de PCR pueden ser, respectivamente: SEQ ID NO. 4: iniciador sentido: TTCAAGGTTACCCATCTCAA SEQ ID NO. 5: iniciador antisentido: TTAGTCAATCAGGATCATTGC. Las secuencias de nucleótidos permiten la amplificación de un fragmento que tiene una longitud de 655 nucleótidos, del nucleótido 591 al nucleótido 1245 en la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. 1. Se realiza entonces un análisis estadístico de la frecuencia de cada alelo (frecuencia alélica) codificado por el gen que comprende el SNP en la población de individuos, lo cual permite la determinación de la importancia de su impacto, y su distribución en los diferentes subgrupos y notablemente, si es necesario, los grupos étnicos diversos que constituyen esta población de individuos. Los datos de genotipificación se analizan para calcular (a frecuencia de distribución de los diferentes alelos observados en las poblaciones estudiadas. Los cálculos de las frecuencias alélicas se pueden llevar a cabo usando programas tales como SAS-suite® (SAS) o SPLUS (MathSoft). La comparación de las distribuciones alélicas de un SNP de la invención a través de diferentes grupos étnicos de la población de individuos, se puede llevar a cabo mediante los programas ARLEQUIN® y SAS-suite®.
SNPs de la invención como marcadores genéticos Aunque es probable que SNPs que modifican secuencias funcionales de genes (por ejemplo, promotor, sitios de empalme, región de codificación) se relacionan directamente con susceptibilidad o resistencia a enfermedades, todos los SNPs (funcionales o no) pueden proveer marcadores valiosos para la identificación de uno o varios genes que intervienen en estos estados de enfermedad y, por consiguiente, pueden relacionarse indirectamente con estos estados de enfermedad. Véase Cargill et al. (1999), Nature Genetícs 22: 231-238; Riley et al. (2000), Pharmacogenomics 1 : 39-47; Roberts L. (2000), Science 287: 1898-1899.
De esta manera, la presente invención se refiere también a un banco de datos que comprende por lo menos uno de los siguientes SNPs: g771c y 808lns(a), en un polinucleótido del gen de IFNa-17. Es bien sabido que dichos SNPs se enumeran de acuerdo a la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. 1. Este banco de datos puede analizarse para determinar asociaciones estadísticamente relevantes entre: (i) por lo menos uno de los siguientes SNPs: g771c y 808lns(a), en un polinucleótido del gen de IFNa-17, y (ii) una enfermedad o una resistencia a una enfermedad. Más preferiblemente, la presente invención se refiere a un método para determinar asociaciones estadísticamente relevantes entre por lo menos un SNP seleccionado del grupo que consiste de g771c y 808lns(a), en el gen de IFNa-17, y una enfermedad o resistencia a enfermedad, que comprende: a) genotipificación de un grupo de individuos; b) determinación de la distribución de dicha enfermedad o resistencia a enfermedad dentro de dicho grupo de individuos; c) comparación de los datos del genotipo con la distribución de dicha enfermedad o resistencia a enfermedad; y d) análisis de dicha comparación para asociaciones estadísticamente relevantes. La presente invención se refiere también al uso de por lo menos uno de los siguientes SNPs: g771c y 808lns(a), en un polinucleótido del gen de IFNa-17, para el desarrollo de equipos de diagnóstico y de pronóstico para una enfermedad o una resistencia a una enfermedad. Un SNP de la invención, tal como se definió anteriormente, puede asociarse directamente o indirectamente a una enfermedad o una resistencia a una enfermedad. De preferencia, estas enfermedades pueden ser las que se definieron como se mencionó anteriormente.
Vector de expresión y células hospederas La presente invención tiene también como objetivo un vector recombinante que comprenda por lo menos un polinucleótido de conformidad con la invención. Se pueden usar numerosos sistemas de expresión incluyendo, sin limitación, cromosomas, episomas y virus derivados. Más particularmente, los vectores recombínantes usados se pueden derivar de plásmidos bacterianos, transposones, episomas dé levadura, elementos de inserción, elementos cromosómicos de levadura, virus tales como baculovirus, virus del papiloma tales como SV40, virus vaccinia, adenovirus, poxvirus, virus de pseudorrabia y retrovirus. Estos vectores recombínantes pueden ser igualmente derivados de cósmidos o fagémidos. La secuencia de nucleótidos se puede insertar en el vector de expresión recombinante mediante métodos bien conocidos por los expertos en la técnica tales como, por ejemplo, los que se describen en MOLECULAR CLONING: A LABORATORY MANUAL, Sambrook et al., 4a. ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y. 2001. El vector recombinante puede incluir secuencias de nucleótidos que controlen la regulación de la expresión del polinucleótido, así como secuencias de nucleótidos que permitan la expresión y la transcripción de un polinucleótido de la invención y la traducción de un polipéptido de la invención, estas secuencias siendo seleccionadas de acuerdo a las células hospederas que se usan. De esta manera, por ejemplo, una señal de secreción adecuada se puede integrar en el vector recombinante, de modo que el polipéptido, codificado por el polinucleótido de la invención, será dirigido hacia el lumen del retículo endoplásmico, hacia el espacio periplásmico, sobre la membrana, o hacia el ambiente extracelular. La presente invención tiene también como objetivo una célula hospedera que comprenda un vector recombinante de conformidad con la invención. La introducción del vector recombinante en una célula hospedera se puede llevar a cabo de acuerdo a métodos que son bien conocidos por los expertos en la técnica, tales como los que se describen en BASIC METHODS IN MOLECULAR BIOLOGY, Davis et al., 2a. ed., McGraw-Hill Professional Publishing, 1995, y MOLECULAR CLONING: A LABORATORY MANUAL, citado anteriormente, tales como transfección por fosfato de calcio, transfección por DEAE dextrán, transfección, microinyección, transfección por lípidos catiónicos, electroporación, transducción o infección. La célula hospedera puede ser, por ejemplo, células bacterianas tales como células de estreptococos, estafilococos, E. coli o BacHIus subtilis, células de hongos tales como células de levadura y células de Aspergillus o Streptomyces, células de insecto tales como células S2 de Drosophila y Sf9 de Spodoptera, células animales tales como células CHO, COS, HeLa, C127, BHK, HEK 293, y células humanas del sujeto por tratar, o incluso células vegetales. Las células hospederas se pueden usar, por ejemplo, para expresar un polipéptido de la invención, o como producto activo en composiciones farmacéuticas, como se verá más adelante.
Polipéptido La presente invención tiene también como objetivo un polipéptido aislado que comprenda una secuencia de aminoácidos que tenga por lo menos 80% de identidad, de preferencia por lo menos 90% de identidad, más preferiblemente por lo menos 95% de identidad, y aún más preferiblemente por lo menos 99% de identidad, con toda o parte de: a) la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2, o b) la secuencia de aminoácidos que comprende los aminoácidos incluidos entre las posiciones 24 y 189 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2, entendiéndose que cada una de las secuencias de aminoácidos bajo a) y b), contiene el siguiente SNP de codificación: G45R. El polipéptido de la invención, puede comprender igualmente toda o parte de: a) la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2, o b) la secuencia de aminoácidos que contiene los aminoácidos
Incluidos entre las posiciones 24 y 189 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2, entendiéndose que cada una de las secuencias de aminoácidos bajo a) y b), contiene el siguiente SNP de codificación: G45R. El polipéptido de la invención puede consistir más particularmente, de toda o parte de: a) la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2, o b) la secuencia de aminoácidos que contiene los aminoácidos incluidos entre las posiciones 24 y 189 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2, entendiéndose que cada una de las secuencias de aminoácidos bajo a) y b), contiene el siguiente SNP de codificación: G45R. La presente invención tiene también como objetivo un polipéptido aislado que comprenda una secuencia de aminoácidos que tenga por lo menos 80% de identidad, de preferencia por lo menos 90% de identidad, más preferiblemente por lo menos 95% de identidad, y aún más preferiblemente por lo menos 99% de identidad, con toda o parte de: a) la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3, o b) la secuencia de aminoácidos que comprende los aminoácidos Incluidos entre las posiciones 24 y 57 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3, entendiéndose que cada una de las secuencias de aminoácidos bajo a) y b), contiene el siguiente SNP de codificación: marco de lectura 57 de H57Q. El polipéptido de la invención puede comprender igualmente toda o parte de: a) la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3, o b) la secuencia de aminoácidos que comprende los aminoácidos incluidos entre las posiciones 24 y 57 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3. El polipéptido de la invención puede consistir más particularmente de toda o parte de: a) la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3, o b) la secuencia de aminoácidos que comprende los aminoácidos incluidos entre las posiciones 24 y 57 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3. Cada una de las secuencias de aminoácidos bajo a) y b) de dicho polipéptido, puede comprender también el SNP G45R. De preferencia, un polipéptido de conformidad con la invención contiene un SNP de codificación individual seleccionado del grupo que consiste de: G45R, marco de lectura 57 de H57Q. Más preferiblemente, el polipéptido de conformidad con la invención comprende los aminoácidos 24 a 189 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2, y tiene el SNP de codificación G45R.
Más preferiblemente, el polipéptido de conformidad con la invención comprende los aminoácidos 24 a 57 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3. La presente invención tiene igualmente como objetivo un procedimiento para la preparación del polipéptido descrito anteriormente, en el cual una célula hospedera definida anteriormente se cultiva en un medio de cultivo, y dicho polipéptido se aisla del medio de cultivo. El polipéptido se puede purificar partiendo del medio de cultivo de las células hospederas, de acuerdo a métodos bien conocidos por los expertos en la técnica, tales como precipitación con la ayuda de agentes caotrópicos tales como sales, en particular sulfato de amonio, etanol, acetona o ácido tricloroacético; extracción con ácido; cromatografía de intercambio iónico; cromatografía de fosfocelulosa; cromatografía de interacción hidrofóbica; cromatografía de afinidad; cromatografía de hidroxiapatita o cromatografía de exclusión. Por "medio de cultivo" se entiende el medio en el cual el polipéptido de la invención se aisla o purifica. Este medio se puede formar del medio extracelular y/o el lisado celular. Técnicas bien conocidas por los expertos en la materia, le permiten igualmente al último dar de nuevo una conformación activa al polipéptido, si la conformación de dicho polipéptido se alteró durante el aislamiento o la purificación.
Anticuerpos La presente invención tiene también como objetivo un procedimiento para obtener un anticuerpo inmunoespecífico. Por "anticuerpo" se entiende los anticuerpos humanizados monoclonales, policlonales, quiméricos y de cadena sencilla, así como los fragmentos Fab, incluyendo productos de bibliotecas de expresión de inmunoglobuiina o Fab. Un anticuerpo inmunoespecífico se puede obtener inmunizando a un animal con un polipéptido de conformidad con la invención. La invención se refiere también a un anticuerpo inmunoespecífico para un polipéptido de conformidad con la invención, tal como se definió anteriormente. Un polipéptido de conformidad con la invención, uno de sus fragmentos, un análogo, una de sus variantes, o una célula que expresa este polipéptido, se puede usar también para producir anticuerpos inmunoespecíficos. El término "inmunoespecífico", significa que el anticuerpo posee una mejor afinidad por el polipéptido de la invención que por otros polipéptidos conocidos en la técnica anterior. Los anticuerpos inmunoespecíficos se pueden obtener mediante la administración de un polipéptido de la invención, de uno de sus fragmentos, de un análogo o de un fragmento epitópico, o de una célula que expresa este polinucleótido en un mamífero, de preferencia no humano, de acuerdo a métodos bien conocidos por los expertos en la técnica. Para la preparación de anticuerpos monoclonales, se pueden usar métodos típicos para la producción de anticuerpos, partiendo de líneas de células, tales como la técnica de hibridomas (Kohler et al., Nature (1975) 256: 495-497), la técnica de triomas, la técnica de hibridomas de células B humanas (Kozbor et al., Immunology Today (1983) 4: 72) y la técnica de hibridomas de EBV (Colé et al., "The EBV-hybridoma technique and its application to human lung cáncer", en Monoclonal Antibodies and Cáncer Therapy (Vol. 27, UCLA Symposia on Molecular and Cellular Biology, New Series) (eds. R. A. Reisfeld y S. Sell), pp. 77-96, Alan R. Liss, Inc. N.Y. 1985, pp. 77-96). Se pueden usar igualmente las técnicas de producción de anticuerpos de cadena sencilla tal como se describe, por ejemplo, en la patente de E.U.A. No. 4,946,778. Animales transgénícos tales como ratones, por ejemplo, se pueden usar igualmente para producir anticuerpos humanizados.
Agentes que interactúan con el polipéptido de la invención La presente invención tiene igualmente como objetivo un procedimiento para la identificación de un agente que activa o inhibe a un polipéptido de conformidad con la invención, el cual comprende: a) la preparación de un vector recombinante que comprende un polinucleótido de conformidad con la invención, que contiene por lo menos un SNP de codificación, b) la preparación de células hospederas que comprenden un vector recombinante de acuerdo a a), c) poner en contacto las células hospederas de acuerdo a b), con un agente que se pondrá a prueba, y d) la determinación del efecto de activación o inhibición generado por el agente que se pondrá a prueba. Un polipéptido de conformidad con la invención se puede usar también en un procedimiento para seleccionar compuestos que ¡nteractúen con el mismo. Estos compuestos pueden ser agentes de activación (agonistas) o inhibición (antagonistas) de la actividad intrínseca de un polipéptido de conformidad con la invención. Estos compuestos pueden ser igualmente ligandos o substratos de un polipéptido de la invención. Véase Coligan et al., Current Protocols in Immunology 1 (2), capítulo 5 (1991). En general, para implementar dicho procedimiento, es primero deseable producir células hospederas adecuadas que expresen un polipéptido de conformidad con la invención. Dichas células pueden ser, por ejemplo, células de mamíferos, levaduras, insectos tales como Drosophila, o bacterias tales como E. coli. Estas células o extractos de membrana de estas células, se ponen entonces en presencia de compuestos que se pondrán a prueba. Se puede observar entonces la capacidad de unión de los compuestos que se pondrán a prueba con el polipéptido de la invención, así como la inhibición o la activación de la respuesta funcional. El paso d) del procedimiento anterior, se puede implementar usando un agente que se pondrá a prueba que es marcado directamente o indirectamente. Puede incluir también una prueba de competencia, usando un agente marcado o no marcado y un agente competidor marcado. Puede determinarse igualmente si un agente que se pondrá a prueba genera una señal de activación o inhibición sobre células que expresan el polipéptido de la invención, usando medios de detección seleccionados adecuadamente de acuerdo a la señal que será detectada. Dichos agentes de activación o inhibición pueden ser polinucleótidos, y en ciertos casos oligonucleótidos o polipéptidos, tales como proteínas o anticuerpos, por ejemplo. La presente invención tiene también como objetivo un procedimiento para la identificación de un agente activado o inhibido por un polipéptido de conformidad con la invención, el cual comprende: a) la preparación de un vector recombinante que comprende un polinucleótido de conformidad con la invención, que contiene por lo menos un SNP de codificación, b) la preparación de células hospederas que comprenden un vector recombinante de acuerdo a a), c) la colocación de células hospederas de acuerdo a b) en presencia de un agente que se pondrá a prueba, y d) la determinación del efecto de activación o inhibición generado por el polipéptido sobre el agente que se pondrá a prueba. Un agente activado o inhibido por el polipéptido de la invención, es un agente que responde, respectivamente, mediante una activación o una inhibición en presencia de este polipéptido. Los agentes activados o inhibidos directamente o indirectamente por el polipéptido de la invención, pueden consistir de polipéptidos tales como, por ejemplo, receptores nucleares o de membrana, cinasas, y más preferiblemente tirosina cinasas, factores de transcripción o polinucleótidos.
Detección de enfermedades La presente invención tiene también como objetivo un procedimiento para analizar las características biológicas de un polinucleótido de conformidad con la invención, y/o de un polipéptido de conformidad con la invención en un sujeto, el cual comprende por lo menos uno de los siguientes pasos: a) determinar la presencia o ausencia de un polinucleótido de conformidad con la invención, en el genoma de un sujeto; b) determinar el nivel de expresión de un polinucleótido de conformidad con la invención en un sujeto; c) determinar la presencia o ausencia de un polipéptido de conformidad con la invención en un sujeto; d) determinar la concentración de un polipéptido de conformidad con la invención en un sujeto; y/o e) determinar la funcionalidad de un polipéptido de conformidad con la invención en un sujeto. Estas características biológicas se pueden analizar en un sujeto, o en una muestra de un sujeto. Estas características biológicas pueden permitir llevar a cabo un diagnóstico genético, y/o determinar si un sujeto es afectado o está en riesgo de ser afectado o, por el contrario, presenta una resistencia parcial al desarrollo de una enfermedad, una indisposición o un trastorno vinculado a la presencia de un polinucleótido de conformidad con la invención y/o un polipéptido de conformidad con la invención. Estas enfermedades pueden ser trastornos y/o enfermedades humanas tales como cánceres y tumores, enfermedades infecciosas, enfermedades venéreas, enfermedades inmunológicamente relacionadas y/o enfermedades y trastornos autoinmunes, enfermedades cardiovasculares, enfermedades metabólicas, enfermedades del sistema nervioso central, y trastornos relacionados con tratamientos quimioterapéuticos. Dichos cánceres y tumores incluyen carcinomas que comprenden carcinomas renales metastásicos, melanomas, linfomas que comprenden linfomas foliculares y linfoma cutáneo de células T, leucemias que comprenden leucemia de células pilosas, leucemia linfocítica crónica y leucemia mieloide crónica, cánceres del hígado, cuello, cabeza y ríñones, mielomas múltiples, tumores carcinoides, y tumores que aparecen después de una deficiencia inmune que comprende sarcoma de Kaposi en el caso de SIDA. Dichas enfermedades infecciosas incluyen infecciones virales que comprenden hepatitis B y C crónicas y VIH/SIDA, neumonías infecciosas, y enfermedades venéreas tales como verrugas genitales. Dichas enfermedades inmunológicamente y autoinmunológicamente relacionadas, pueden incluir el rechazo de injertos de órganos o tejidos, alergias, asma, psoriasis, artritis reumatoide, esclerosis múltiple, enfermedad de Crohn y colitis ulcerativa. Dichas enfermedades metabólicas pueden incluir enfermedades no inmunes asociadas, tales como obesidad. Dichas enfermedades del sistema nervioso central pueden incluir enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Parkinson, esquizofrenia y depresión. Dichas enfermedades y trastornos pueden incluir también cicatrización de heridas, anemia en paciente dializado, y osteoporosis. Este procedimiento permite también el diagnóstico genético de una enfermedad o de una resistencia a una enfermedad vinculada a la presencia, en un sujeto, de un alelo muíante codificado por un SNP de conformidad con la invención. De preferencia, en el paso a), se detectará la presencia o ausencia de un polinucleótido que contiene por lo menos un SNP de codificación, tal como se definió anteriormente.
La detección del polinucleótido se puede llevar a cabo partiendo de muestras biológicas del sujeto que será estudiado, tales como células, sangre, orina o saliva, o partiendo de una biopsia o una autopsia del sujeto que será estudiado. El ADN genómico se puede usar para la detección directamente o después de una amplificación de PCR, por ejemplo, se puede usar igualmente ARN o ADNc en forma similar. Entonces, es posible comparar la secuencia de nucleótidos de un polinucleótido de conformidad con la invención, con la secuencia de nucleótidos detectada en el genoma del sujeto. La comparación de las secuencias de nucleótidos se puede llevar a cabo mediante secuenciación, mediante métodos de hibridación de ADN, mediante diferencia de movilidad de los fragmentos de ADN sobre un gel de electrofóresis con o sin agentes desnaturalizantes, o mediante diferencia de temperatura de fusión (véase Myers et al., Science (1985) 230: 1242). Dichas modificaciones en la estructura de la secuencia de nucleótidos en un punto preciso se pueden revelar igualmente mediante pruebas de protección ante nucleasas tales como ribonucleasa y nucleasa S1 , mediante digestión enzimática o también mediante agentes de desdoblamiento químico. Véase Cotton et al., Proc. Nat. Acad. Sci. USA (1985) 85: 4397-4401. Se pueden usar igualmente sondas de oligonucleótidos que comprendan un fragmento de polinucleótido de la invención, para llevar a cabo la selección. Muchos métodos bien conocidos por los expertos en la técnica se pueden usar para determinar la expresión de un polinucleótido de la invención, y para identificar la variabilidad genética de este polinucleótido (véase Chee et al., Science (1996), Vol. 274, pp. 610-613). En el paso b), el nivel de expresión del polinucleótido se puede medir cuantificando el nivel de ARN codificado por este polinucleótido (y que codifica para un polipéptido), de acuerdo a métodos bien conocidos por los expertos en la técnica tales como, por ejemplo, mediante PCR, RT-PCR, protección ante ribonucleasa, Northern blot, y otros métodos de hibridación. En los pasos c) y d), se puede determinar la presencia o ausencia, así como la concentración de un polipéptido de conformidad con la invención en un sujeto o una muestra de un sujeto, mediante métodos bien conocidos tales como, por ejemplo, mediante radioinmunoensayo, pruebas de unión competitiva, Western blot y pruebas de ELISA. Después del paso d), se puede comparar la concentración determinada del polipéptido de conformidad con la invención, con la concentración de la proteína natural de tipo silvestre encontrada usualmente en un sujeto. El experto en la técnica puede identificar el umbral arriba o abajo del cual aparece la sensibilidad o, por el contrario, la resistencia a la enfermedad, la indisposición o el trastorno evocado anteriormente, con ayuda de publicaciones de la técnica anterior, o mediante pruebas convencionales, tales como las que se mencionaron anteriormente. En el paso e), se puede llevar a cabo la determinación de la funcionalidad de un polipéptido de conformidad con la invención mediante métodos bien conocidos por los expertos en la técnica tales como, por ejemplo, mediante pruebas in vitro tales como las mencionadas anteriormente, o mediante el uso de células hospederas que expresan dicho polipéptido.
Compuestos terapéuticos y tratamientos de enfermedades La presente invención tiene también como objetivo un compuesto terapéutico que contenga, a manera de agente activo, un polipéptido de conformidad con la invención. La invención se refiere también al uso de un polipéptido de conformidad con la invención, en la fabricación de un compuesto terapéutico destinado para la prevención o el tratamiento de diferentes enfermedades y/o trastornos humanos. Estas enfermedades pueden ser trastornos y/o enfermedades humanas tales como cánceres y tumores, enfermedades infecciosas, enfermedades venéreas, enfermedades inmunológícamente relacionadas y/o enfermedades y trastornos autoinmunes, enfermedades cardiovasculares, enfermedades metabólicas, enfermedades del sistema nervioso central, y trastornos relacionados con tratamientos quimioterapéuticos. Dichos cánceres y tumores incluyen carcinomas que comprenden carcinomas renales metastásicos, melanomas, Iinfomas que comprenden Iinfomas foliculares y linfoma cutáneo de células T, leucemias que comprenden leucemia de células pilosas, leucemia linfocítica crónica y leucemia mieloide crónica, cánceres del hígado, cuello, cabeza y ríñones, mielomas múltiples, tumores carcinoides, y tumores que aparecen después de una deficiencia inmune que comprende sarcoma de Kaposi en el caso de SIDA. Dichas enfermedades infecciosas incluyen infecciones virales que comprenden hepatitis B y C crónicas y VIH/SIDA, neumonías infecciosas, y enfermedades venéreas tales como verrugas genitales. Dichas enfermedades inmunológícamente y auto-inmunológícamente relacionadas, pueden incluir el rechazo de injertos de órganos o tejidos, alergias, asma, psoriasis, artritis reumatoide, esclerosis múltiple, enfermedad de Crohn y colitis ulcerativa. Dichas enfermedades metabólicas pueden incluir enfermedades no inmunes asociadas, tales como obesidad. Dichas enfermedades del sistema nervioso central pueden incluir enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Parkinson, esquizofrenia y depresión. Dichas enfermedades y trastornos pueden incluir también cicatrización de heridas, anemia en paciente dializado, y osteoporosis. De preferencia, un polipéptido de conformidad con la invención se puede usar también en la fabricación de un compuesto terapéutico destinado para la prevención o el tratamiento de diferentes enfermedades y/o trastornos humanos, tales como ciertas infecciones virales tales como hepatitis B y C crónicas, leucemias tales como leucemia de células pilosas y leucemia mieloide crónica, mielomas múltiples, linfomas foliculares, tumores carcinoides, melanomas malignos, carcinomas de células metastásicas, enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Parkinson, así como tumores que aparecen después de una deficiencia inmune tal como sarcoma de Kaposi en el caso de SIDA, y verrugas genitales o enfermedades venéreas. Algunos de los compuestos que permiten obtener el polipéptido de conformidad con la invención, así como los compuestos obtenidos o identificados por o a partir de este polipéptido, se pueden usar en forma similar para el tratamiento terapéutico del cuerpo humano, es decir, como un compuesto terapéutico. Esto es porque la presente invención tiene también como objetivo un medicamento que contenga, a manera de agente activo, un polinucleótido de conformidad con la invención que contiene por lo menos un SNP de codificación definido anteriormente, un vector recombinante definido anteriormente, una célula hospedera definida anteriormente, y/o un anticuerpo definido anteriormente. La invención se refiere también al uso de un polinucleótido de conformidad con la invención que contiene por lo menos un SNP de codificación definido anteriormente, un vector recombinante definido anteriormente, una célula hospedera definida anteriormente, yo un anticuerpo definido anteriormente, en la fabricación de un medicamento destinado para la prevención o el tratamiento de diferentes enfermedades y/o trastornos humanos. Estas enfermedades pueden ser trastornos y/o enfermedades humanas tales como cánceres y tumores, enfermedades infecciosas, enfermedades venéreas, enfermedades inmunológicamente relacionadas y/o enfermedades y trastornos autoinmunes, enfermedades cardiovasculares, enfermedades metabólicas, enfermedades del sistema nervioso central, y trastornos relacionados con tratamientos quimioterapéuticos. Dichos cánceres y tumores incluyen carcinomas que comprenden carcinomas renales metastásicos, melanomas, linfomas que comprenden linfomas foliculares y linfoma cutáneo de células T, leucemias que comprenden leucemia de células pilosas, leucemia linfocítica crónica y leucemia mieloide crónica, cánceres del hígado, cuello, cabeza y ríñones, mielomas múltiples, tumores carcinoides, y tumores que aparecen después de una deficiencia inmune que comprende sarcoma de Kaposí en el caso de SIDA. Dichas enfermedades infecciosas incluyen infecciones virales que comprenden hepatitis B y C crónicas y VIH/SIDA, neumonías infecciosas, y enfermedades venéreas tales como verrugas genitales. Dichas enfermedades inmunológicamente y auto-inmunológicamente relacionadas, pueden incluir el rechazo de injertos de órganos o tejidos, alergias, asma, psoriasis, artritis reumatoide, esclerosis múltiple, enfermedad de Crohn y colitis ulcerativa. Dichas enfermedades metabólicas pueden incluir enfermedades no inmunes asociadas, tales como obesidad. Dichas enfermedades del sistema nervioso central pueden incluir enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Parkinson, esquizofrenia y depresión. Dichas enfermedades y trastornos pueden incluir también cicatrización de heridas, anemia en paciente dializado, y osteoporosis. De preferencia, la invención se refiere al uso de un polinucleótido de conformidad con la invención que contiene por lo menos un SNP definido anteriormente, un vector recombinante definido anteriormente, una célula hospedera definida anteriormente, yo un anticuerpo definido anteriormente, en la fabricación de un medicamento destinado para la prevención o el tratamiento de diferentes enfermedades y/o trastornos humanos, tales como ciertas infecciones virales tales como hepatitis B y C crónicas, leucemias tales como leucemia de células pilosas y leucemia mieloide crónica, mielomas múltiples, linfomas foliculares, tumores carcinoides, melanomas malignos, carcinomas de células metastásicas, enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Parkinson, así como tumores que aparecen después de una deficiencia inmune tal como sarcoma de Kaposi en el caso de SIDA, y verrugas genitales o enfermedades venéreas. La dosificación de un polipéptido y de los otros compuestos de la invención, útiles como agente activo, depende de la elección del compuesto, la indicación terapéutica, el modo de administración, la naturaleza de la formulación, la naturaleza del sujeto, y el juicio del médico. Cuando se usa como agente activo, un polipéptido de conformidad con la invención se administra en general a dosificaciones que varían entre 1 y 15 M Ul (unidades internacionales). La dosis recomendada se puede administrar mediante la vía subcutánea o intramuscular, entre 1 a 5 veces por semana, durante 1 a 12 meses. La invención tiene también como objetivo una composición farmacéutica que contiene, como agente activo, por lo menos un compuesto mencionado anteriormente, tal como un polipéptido de conformidad con la invención, un polinucleótido de conformidad con la invención que contiene por lo menos un SNP definido anteriormente, un vector recombinante definido anteriormente, una célula hospedera definida anteriormente, y/o un anticuerpo definido anteriormente, así como un excipiente farmacéuticamente aceptable. En estas composiciones farmacéuticas, el agente activo está presente en forma ventajosa a dosis fisiológicamente efectivas. Estas composiciones farmacéuticas pueden ser, por ejemplo, sólidos o líquidos, y pueden estar presentes en formas farmacéuticas que se usan actualmente en medicina humana tales como, por ejemplo, tabletas simples o recubiertas, gelcaps (cápsulas de gel), gránulos, caramelos, supositorios, y de preferencia preparaciones inyectables y polvos para preparaciones inyectables. Estas formas farmacéuticas se pueden preparar de acuerdo a métodos usuales. Los agentes activos se pueden incorporar en excipientes que se usan usualmente en composiciones farmacéuticas, tales como talco, goma arábiga, lactosa, almidón, dextrosa, glicerol, etanol, estearato de magnesio, manteca de cacao, vehículos acuosos o no acuosos, sustancias grasas de origen animal o vegetal, derivados parafínicos, glicoles, varios agentes humectantes, dispersantes o emulsificantes, y conservadores. Los agentes activos de conformidad con la invención, se pueden usar solos o en combinación con otros compuestos tales como compuestos terapéuticos tales como otras citocinas tales como interleucinas o interferones, por ejemplo. Las diferentes formulaciones de las composiciones farmacéuticas, se adaptan de acuerdo al modo de administración. Las composiciones farmacéuticas se pueden administrar mediante diferentes vías de administración conocidas por los expertos en la técnica. La invención tiene igualmente como objetivo una composición de diagnóstico que contenga, como agente activo, por lo menos un compuesto mencionado anteriormente, tal como un polipéptido de conformidad con la invención, un polinucleótido completo o parte del mismo de conformidad con la invención, un vector recombinante definido anteriormente, una célula hospedera definida anteriormente, y/o un anticuerpo definido anteriormente, así como un excipiente farmacéuticamente aceptable. Esta composición de diagnóstico puede contener, por ejemplo, un excipiente adecuado tal como los que se usan en general en la composición de diagnóstico, tales como reguladores de pH y conservadores. La presente invención tiene igualmente como objetivo el uso: a) de una cantidad terapéuticamente efectiva de un polipéptido de conformidad con la invención, y/o b) de un polinucleótido de conformidad con la invención, y/o c) de una célula hospedera del sujeto que será tratado, definida anteriormente, para preparar un compuesto terapéutico destinado para incrementar la expresión o la actividad, en un sujeto, de un polipéptido de conformidad con la invención. De esta manera, para tratar a un sujeto que necesita un incremento en la expresión o en la actividad de un polipéptido de la invención, son posibles varios métodos. Es posible administrar al sujeto una cantidad terapéuticamente efectiva de un polipéptido de la invención, con un excipiente farmacéuticamente aceptable. Es igualmente posible incrementar la producción endógena de un polipéptido de la invención, mediante la administración al sujeto, de un polinucleótido de conformidad con la invención. Por ejemplo, este polinucleótido puede ser insertado en un vector de expresión retroviral. Dicho vector se puede aislar partiendo de células que han sido infectadas por un vector de plásmido retroviral que contiene ARN que codifica para el polipéptido de la invención, de tal forma que las células transducidas produzcan partículas virales infecciosas que contengan el gen de interés. Véase Gene Therapy and other Molecular Genetic-based Therapeutic Approaches, capítulo 20, en Human Molecular Genetics, Strachan and Read, BIOS Scientifics Publishers Ltd (1996). De conformidad con la invención, se usará de preferencia un polinucleótido que contenga por lo menos un SNP de codificación, tal como se definió anteriormente. Es igualmente posible administrar al sujeto células hospederas que pertenecen a él mismo, estas células hospederas habiendo sido tomadas preliminarmente, y modificadas para expresar el polipéptido de la invención, como se describió anteriormente. La presente invención se refiere igualmente al uso: a) de una cantidad terapéuticamente efectiva de un anticuerpo inmunospecífico definido anteriormente, y/o b) de un polinucleótido que permite la inhibición de la expresión de un polinucleótido de conformidad con la invención, para preparar un compuesto terapéutico destinado para reducir la expresión o la actividad, en un sujeto, de un polipéptido de conformidad con la invención. De esta manera, es posible administrar al sujeto una cantidad terapéuticamente efectiva de un agente inhibidor y/o de un anticuerpo tal como se definió anteriormente, quizá en combinación, con un excipiente farmacéuticamente aceptable. Es igualmente posible reducir la producción endógena de un polipéptido de la invención, mediante la administración al sujeto, de un polinucleótido complementario de conformidad con la invención, que permita la inhibición de la expresión de un polinucleótido de la invención. De preferencia, se puede usar un polinucleótido complementario que contenga por lo menos un SNP de codificación tal como se definió anteriormente. La presente invención se refiere también al uso de una proteína lFNa-17, en la preparación de un medicamento para la prevención o el tratamiento de un paciente que tiene una enfermedad o un trastorno causado por una variante de IFNoc-17 vinculada a la presencia, en el genoma de dicho paciente, de una secuencia de nucleótidos que tiene por lo menos 95% de identidad (de preferencia, 97% de identidad, más preferiblemente 99% de identidad, y en particular 00% de identidad) con la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. 1 , siempre que dicha secuencia de nucleótidos comprenda uno de los siguientes SNPs: g771c y 808lns(a). De preferencia, dicho medicamento se usa para la prevención o el tratamiento de una de las enfermedades seleccionadas del grupo que consiste de cánceres y tumores, enfermedades infecciosas, enfermedades venéreas, enfermedades inmunológicamente relacionadas y/o enfermedades y trastornos autoinmunes, enfermedades cardiovasculares, enfermedades metabólicas, enfermedades del sistema nervioso central, y trastornos relacionados con tratamientos quimioterapéuticos. Dichos cánceres y tumores incluyen carcinomas que comprenden carcinomas renales metastásicos, melanomas, linfomas que comprenden linfomas foliculares y linfoma cutáneo de células T, leucemias que comprenden leucemia de células pilosas, leucemia linfocítica crónica y leucemia mieloide crónica, cánceres del hígado, cuello, cabeza y ríñones, mielomas múltiples, tumores carcinoides, y tumores que aparecen después de una deficiencia inmune que comprende sarcoma de Kaposi en el caso de SIDA. Dichas enfermedades infecciosas incluyen infecciones virales que comprenden hepatitis B y C crónicas y VIH/SIDA, neumonías infecciosas, y enfermedades venéreas tales como verrugas genitales. Dichas enfermedades inmunologicamente y auto-inmunológicamente relacionadas, pueden incluir el rechazo de injertos de órganos o tejidos, alergias, asma, psoriasis, artritis reumatoide, esclerosis múltiple, enfermedad de Crohn y colitis ulcerativa. Dichas enfermedades metabólicas pueden incluir enfermedades no inmunes asociadas, tales como obesidad. Dichas enfermedades del sistema nervioso central pueden incluir enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Parkinson, esquizofrenia y depresión. Dichas enfermedades y trastornos pueden incluir también cicatrización de heridas, anemia en paciente dializado, y osteoporosis.
Compuestos miméticos de un polipéptido de IFN -17 que comprenden el SNP g771c de la invención La presente invención se refiere también a un compuesto novedoso que tiene una actividad biológica sustancialmente similar a la del polipéptido de: a) la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2, o b) la secuencia de aminoácidos que comprende los aminoácidos incluidos entre las posiciones 24 y 189 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2; siempre que dichas secuencias de aminoácidos bajo a) y b) comprendan el SNP G45R. Dicha actividad biológica se puede evaluar, por ejemplo, midiendo los aspectos de maduración de células dendríticas, liberación de citocinas por linfocitos T CD4+ o CD8+, liberación de citocinas por monocitos, actividad antiviral in vitro o in vivo, actividad antiproliferativa celular sobre la línea de células TF-1 , o la actividad antiproliferativa celular sobre la línea de células de Daudi Burkitt, como se describe en la parte experimental. Como se menciona en la sección experimental, en comparación con el IFNcc-2 de tipo silvestre, el IFNa-17 mutado G45R posee: una mayor capacidad para estimular la liberación de IFN-gamma por linfocitos T CD4+ una mayor capacidad para estimular la liberación de IFN-gamma e IL-10 por linfocitos T CD8+ una menor capacidad para estimular la liberación de IL-10 e IL-12 por monocitos una actividad antiproliferativa similar sobre células TF-1 una mayor actividad antiproliferativa sobre células de la línea de células de Daudi Burkitt una mayor actividad antiviral in vitro en cultivos de células infectados con VSV una mayor actividad antiviral ¡n vivo en el modelo de EMVC de ratón. Como se menciona también en la sección experimental, el IFNa-17 mutado G45R posee una menor actividad antiproliferativa celular sobre la línea de células de Daudi Burkitt en comparación con el IFNa-17 de tipo silvestre. Un compuesto novedoso de la invención, tal como se definió anteriormente, puede poseer una actividad biológica sustancialmente similar a la del IFNa-17 mutado G45R. Dicho compuesto puede tener también una actividad biológica tal como liberación de IFN-gamma por linfocitos T CD4+ o CD8+, liberación de IL-10 por linfocitos T CD8+, actividad antiviral in vitro o actividad antiviral ¡n vivo, la cual es incluso mayor que la del IFNa-17 mutado G45R. Dicho compuesto puede tener también una actividad biológica tal como liberación de IL-10 e IL-12 por monocitos, la cual es incluso menor que la del IFNa-17 mutado G45R. Dicho compuesto puede ser un compuesto bioquímico, tal como un polipéptido o un péptido, por ejemplo, o un compuesto químico orgánico, tal como un péptido sintético mimético, por ejemplo. La presente invención se refiere también al uso de un polipéptido de la invención que contiene al SNP G45R, en la identificación de un compuesto tal como se definió anteriormente. La presente invención se refiere también a un procedimiento para la identificación de un compuesto de la invención, el cual comprende los siguientes pasos: a) determinar la actividad biológica del compuesto que se pondrá a prueba, tal como maduración de células dendríticas, liberación de citocinas por linfocitos T CD4+ o CD8+, liberación de citocinas por monocitos, actividad antiproliferativa celular sobre la línea de células TF-1 , actividad antiproliferativa celular sobre la línea de células de Daudi Burkitt, o actividad antiviral in vitro o in vivo, por ejemplo; b) comparando: i) la actividad determinada en el paso a) del compuesto que se pondrá a prueba, con ii) la actividad del polipéptido de la secuencia de aminoácidos de
SEQ ID NO. 2, o de la secuencia de aminoácidos que comprende los aminoácidos incluidos entre las posiciones 24 y 189 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2; siempre que dichas secuencias de aminoácidos comprendan el SNP G45R; y c) determinar, con base en la comparación llevada a cabo en el paso b), si el compuesto que se pondrá a prueba tiene una actividad sustancialmente similar, o menor o mayor, en comparación con la del polipéptido de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2, o de la secuencia de aminoácidos que comprende los aminoácidos incluidos entre las posiciones 24 y 189 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2; siempre que dichas secuencias de aminoácidos comprendan el SNP G45R.
De preferencia, el compuesto que se pondrá a prueba puede identificarse previamente a partir de bibliotecas combinatorias de péptidos sintéticos, selección de alto rendimiento, o puede diseñarse mediante diseño de fármacos asistido por computadora, tal como para que tenga la misma estructura tridimensional del polipéptido de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2; o de la secuencia de aminoácidos que comprende los aminoácidos incluidos entre las posiciones 24 y 189 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2; siempre que dichas secuencias de aminoácidos comprendan el SNP G45R. Los métodos para identificar y diseñar compuestos, son bien conocidos por los expertos en la técnica. Publicaciones que se refieren a estos métodos pueden ser, por ejemplo: - Silverman R. B. (1992). "Organic Chemistry of Drug Design and Drug Action". Academic Press, 1a. edición (enero 15, 1992). - Anderson S y Chiplin J. (2002). "Structural genomics; shaping the future of drug design". Drug Discov. Today. 7(2): 105-107. - Selick HE, Beresford AP, Tarbit MH. (2002). "The emerging importance of predictive ADME simulation in drug discovery". Drug Discov. Today 7(2): 109- 6. Burbidge, R, Trotter M, Buxton B, Holden S. (2001 ). "Drug design by machine learning: support vector machines for pharmaceutical data analysis". Comput. Chem. 26 (1 ): 5-14.
- Kauvar L. M. (1996), "Peptide mimetic drugs: a comment on progress and prospects" 14(6): 709. Los compuestos de la invención se pueden usar en la preparación de un medicamento destinado para la prevención o el tratamiento de una de las enfermedades seleccionadas del grupo que consiste de cánceres y tumores, enfermedades infecciosas, enfermedades venéreas, enfermedades inmunológicamente relacionadas y/o enfermedades y trastornos autoinmunes, enfermedades cardiovasculares, enfermedades metabólicas, enfermedades del sistema nervioso central, y trastornos relacionados con tratamientos quimioterapéuticos. Dichos cánceres y tumores incluyen carcinomas que comprenden carcinomas renales metastásicos, melanomas, linfomas que comprenden linfomas foliculares y linfoma cutáneo de células T, leucemias que comprenden leucemia de células pilosas, leucemia linfocítica crónica y leucemia mieloide crónica, cánceres del hígado, cuello, cabeza y ríñones, mielomas múltiples, tumores carcinoides, y tumores que aparecen después de una deficiencia inmune que comprende sarcoma de Kaposi en el caso de SIDA. Dichas enfermedades infecciosas incluyen infecciones virales que comprenden hepatitis B y C crónicas y VIH/SIDA, neumonías infecciosas, y enfermedades venéreas tales como verrugas genitales. Dichas enfermedades inmunológicamente y auto-inmunológicamente relacionadas, pueden incluir el rechazo de injertos de órganos o tejidos, alergias, asma, psoriasis, artritis reumatoide, esclerosis múltiple, enfermedad de Crohn y colitis ulcerativa. Dichas enfermedades metabólicas pueden incluir enfermedades no inmunes asociadas, tales como obesidad. Dichas enfermedades del sistema nervioso central pueden incluir enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Parkinson, esquizofrenia y depresión. Dichas enfermedades y trastornos pueden incluir también cicatrización de heridas, anemia en paciente dializado, y osteoporosis. De preferencia, los compuestos de la invención se pueden usar en la preparación de un medicamento destinado para la prevención o el tratamiento de una de las enfermedades seleccionadas del grupo que consiste de ciertas infecciones virales tales como hepatitis B y C crónicas, leucemias tales como leucemia de células pilosas y leucemia mieloide crónica, mielomas múltiples, linfomas foliculares, tumores carcinoides, melanomas malignos, carcinomas de células metastásicas, enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Parkinson, así como tumores que aparecen después de una deficiencia inmune tal como sarcoma de Kaposi en el caso de SIDA, y verrugas genitales o enfermedades venéreas.
Sección experimental
EJEMPLO 1 Modelo de una proteína codificada por un polinucleótido de la secuencia de nucleótidos que contiene al SNP G45R. y de la proteína codificada por la secuencia de nucléotidos del gen de referencia de tipo silvestre
En un primer paso, se construyó la estructura tridimensional del IFNa-17 partiendo de la estructura del IFNcc-2, cuya estructura está disponible en la base de datos PDB (código 1 ITF), y usando el programa Modeler (MSI, San Diego, CA). El fragmento polipeptídico maduro se modificó entonces de tal forma, para reproducir la mutación G45R. Se llevaron a cabo mil pasos de minimización molecular en este fragmento mutado, usando los programas AMBER y DISCOVER (MSI: Molecular Simulations Inc.). Se llevaron a cabo entonces dos operaciones de cálculo dinámico molecular usando el mismo programa y los mismos campos de fuerza. En cada caso, se calcularon 50,000 pasos a 300°K, concluidos por 300 pasos de equilibrio. El resultado de este modelo se observa en las figuras 1A y 1B.
EJEMPLO 2 Expresión del IFNa-17 natural de tipo silvestre e IFNa-17 mutado G45R en levaduras
a) Clonación del IFNa-17 natural de tipo silvestre ß IFNa-17 mutado en el vector de expresión eucariótico pPicZa-topo Las secuencias de nucleótidos que codifican para la parte madura del IFNa-17 natural de tipo silvestre e IFNa-17 mutado G45R, se amplifican mediante PCR, usando como molde ADN genómico de un individuo que es heterocigótico para el SNP. Los iniciadores de PCR que permiten dicha amplificación, son: SEQ ID NO. 6: iniciador sentido: TGTG ATCTG CCTCAG ACCCAC
SEQ ID NO. 7: iniciador antisentido: TCAATCCTTCCTCCTTAATATTTTTTGC. Los productos de PCR se insertan en el vector de expresión eucariótico pPicZa-TOPO bajo el control del promotor híbrido AOX1 inducible por metanol (clonación por TOPO™; lnvitrogen Corp.). Este vector permite la expresión heteróloga de proteínas eucarióticas en la levadura Pichia pastorís. Después de verificar la secuencia de nucleótidos de la región del vector que codifica para las proteínas recombinantes, el vector es linealizado por la enzima de restricción Pme1 , y la cepa de la levadura P. pastorís (Invitrogen), es transformada con estos vectores de expresión recombinantes.
b) Expresión heteróloga en P. pastoris. y purificación del IFNa-17 de tipo silvestre y proteínas IFNa-17 mutadas G45R Se realizaron dos precultivos saturados de 50 mL de medio de
BMGY (peptona a 2%, extracto de levadura a 1%, YNB a 1.34%, glicerol a 1 %, fosfato de potasio a 100 mM, 0.4 mg por litro de biotina, pH 6.0) que contenían un clon que codificaba para la proteína IFNa- 7 de tipo silvestre, o que codificaba para la proteína IFNa-17 mutada G45R, durante 24-48 horas a 30°C, a una agitación de 200 rotaciones por minuto (rpm). Cuando el cultivo alcanza una densidad celular de saturación (que corresponde a una densidad óptica de 12, medida a una longitud de onda de 600 nm), se usa para inocular, a 5 OD/mL, 250 mL de medio de BMMY (peptona a 2%, extracto de levadura a 1 %, YNB a 1.34%, metanol a 0.5%, fosfato de potasio a 100 mM, 0.4 mg por litro de biotina, pH 6.0). La expresión de la proteína se induce entonces mediante el uso de metanol a una concentración final de 1%, durante 24 horas a 30°C, con una agitación del matraz de cultivo a 180 rpm. Debido a la presencia de la secuencia del péptido de señal del "factor alfa", hacia el extremo 5' de la secuencia de codificación, las proteínas son secretadas por las levaduras en el medio de cultivo. El factor alfa es desdoblado en forma natural durante el procesamiento. La suspensión se centrifuga, y la proteína se purifica mediante CLAR, partiendo del sobrenadante obtenido. En un paso de preinicio, una ultrafiltración (escala de laboratorio, fragmento de 5000 Da, Millipore), seguida de una diálisis, permite una concentración de diez veces el sobrenadante de levaduras en un regulador de pH de Tris-HCI a 50 mM, pH 9.0, NaCI a 25 mM. El primer paso cromatográfico, permite recuperar la proteína por afinidad sobre una columna de sefarosa azul (Amersham Pharmacia). La presencia de la proteína en las fracciones recogidas se verifica, por una parte, mediante electrofóresis del tipo de SDS PAGE, y por otra parte mediante inmunodetección, mediante un anticuerpo específico dirigido contra la proteína IFNa-17. En este paso, la pureza de la proteína de interés es mayor de 75%. En el segundo paso de purificación, una filtración en gel permite el intercambio del regulador de pH de las fracciones recogidas que corresponden a las proteínas IFNa-17, contra Tris a 50 mM, pH 9.0, NaCI a 25 mM. El último paso de la purificación, consiste de una separación de las proteínas sobre una columna de cromatografía de intercambio iónico. Las fracciones que contienen a la proteína recombinante, se inyectan en una columna de intercambio iónico (ResourceQ, 6.0 mL, Pharmacia), equilibrada de antemano en regulador de pH Tris a 50 mM, pH 9, NaCI a 25 mM. La elución de las proteínas se lleva a cabo mediante la migración del gradiente entre NaCI a 0.025 y 1 M, en el regulador de pH Tris a 50 mM, pH 9.
La pureza de la proteína de Interés, se determina sobre un gel de SDS/PAGE, y las concentraciones de proteína se miden mediante densitometría (una cantidad, Biorad) y prueba de BCA (ácido bicinconínico y sulfato de cobre, Sigma). Las proteínas IFNa-17 de tipo silvestre e IFNa-17 mutada G45R purificadas obtenidas de acuerdo a este protocolo, finalmente aumentadas en proporción para producir cantidades mayores de proteínas, se usan para las pruebas funcionales que se describen a continuación.
EJEMPLO 3 Evaluación de la actividad inmunomoduladora del IFNa-17 natural de tipo silvestre e IFNa-17 mutado G45R
Los IFNs tipo I (IFN alfa e IFN beta) son capaces de modular ciertas funciones del sistema inmune. Se ha demostrado que incrementan la maduración de células dendríticas (DC): aumentan la expresión de moléculas MHC clase I (HLA-ABC) y II (HLA-DR), aumentan la expresión de las moléculas que intervienen en la coestimulación de los linfocitos T, moléculas CD80, CD86 y CD83, y aumentan la función estimulante de linfocitos T.
a) Efecto del IFNa-17 mutado G45R sobre la maduración de
células dendríticas
Se investigó primero la actividad inmunomoduladora del IFNa-17
mutado G45R sobre la maduración de células dendríticas, y se comparó con
la del IFNa-2 de tipo silvestre seleccionado como representativo del producto
comercial Intron A. Para hacer esto, se generaron primero células dendríticas de monocitos de sangre periférica de adulto cultivadas en presencia de GM-CSF
y citocinas IL-4. Después de purificación usando un equipo de purificación de células CD14+, estas células dendríticas se pusieron en presencia de 100 ng/mL de IFNa-2 de tipo silvestre o IFNa-17 mutado G45R, y se determinó su
fenotipo mediante análisis FACS, enfocado a encontrar la expresión de las moléculas MHC clase I y II y los marcadores CD40, CD80, CD86, CD83 y CD1 a. El estado de maduración de estas células dendríticas, se ha
comparado también con el obtenido sin tratamiento con IFNa, para proveer un
control con células dendríticas no estimuladas. El valor medio de las mediciones de intensidad de fluorescencia para cada marcador y para las tres condiciones experimentales, expresadas como unidad arbitraria, se presentan en el cuadro siguiente: HLA HLA
CD40 CD80 CD86 CD83 CD a ABC DR Sin IFNa 142 155 246 40 24 21 65
IFNa-17 mutado 165 189 316 50 32 19 49
G45R IFNa-2 de 79 276 491 87 57 26 51 tipo silvestre Los resultados de esta prueba, demuestran que la proteína IFNa-17 mutada G45R, es capaz de estimular la maduración de células dendríticas.
b) Efecto del IFNa-17 mutado G45R sobre la liberación de citocinas por linfocitos T Se investigó también la actividad inmunomoduladora del IFNa-17 mutado G45R, midiendo la liberación de citocinas por linfocitos T puestos en presencia de proteína IFNa-17 mutada, y con o sin un antígeno fuerte (SEB), para simular una respuesta inmune contra una agresión. Esta prueba se llevó a cabo también en presencia de IFNa-2 de tipo silvestre usado como control, y seleccionado como representativo del producto comercial Intron A. Para hacer esto, se aislaron células mononucleares de sangre periférica (PBMC) de donadores sanos, y se estimularon durante 16 horas en un medio adecuado que contenía anticuerpos anti-CD3 y anti-CD28 o SEB. En cada cultivo, se añadieron 4 µg/mL de IFNa-2 de tipo silvestre o IFNa-17 mutado G45R. Después de la estimulación, se marcó extracelularmente a los linfocitos T con anticuerpos anti-CD3, anti-CD4 y anti-CD69 o anticuerpos anti-CD3, anti-CD8 y anti-CD96, y se marcó intracelularmente a los mismos con anticuerpos específicos dirigidos contra citocinas tipo Th1 (IFN-gamma) o citocinas Th2 (IL-10). Las células fluorescentes se analizaron usando FACScalibur y el programa CelIQuest. Los resultados obtenidos, indican que el IFNa-17 mutado G45R y el IFNa-2 de tipo silvestre no estimulan la liberación de IL-10 e IFN-gamma y, de esta manera, no activan a los linfocitos T en ausencia de SB. En contraste, el IFNa-17 mutado G45R y el IFNa-2 de tipo silvestre, estimulan la liberación de citocinas (IL-10 e IFN-gamma) por linfocitos T activados por SB, como se muestra en el cuadro siguiente. Este cuadro representa la liberación de citocinas por linfocitos T en presencia de SB, expresada como porcentaje de las células CD4+ CD69+ o células CD8+ CD69+ para los linfocitos T CD4+ y linfocitos CD8+, respectivamente, y el porcentaje de células CD69+ sobre el total de células.
Estos resultados demuestran claramente que el IFNa-17 mutado G45R estimula fuertemente la liberación de citocinas (IFN gamma e IL-10) por linfocitos T CD4+ y linfocitos T CD8+, activados previamente por antígeno de SB. En esta prueba, la producción de interferón gamma por linfocitos T CD4+, es mayor en presencia de IFNa-17 mutado G45R que en presencia de IFNa-2 de tipo silvestre, y la producción de interferón gamma e IL-10 por linfocitos T CD8+, es mayor en presencia de IFNa-17 mutado G45R que en presencia de IFN -2 de tipo silvestre.
c) Efecto del IFNa-17 mutado G45R sobre la liberación de citocinas por monocitos Por último, se investigó la actividad inmunomoduladora del IFNa-17 mutado G45R midiendo la liberación de citocinas por monocitos en ausencia o en presencia de un agente tóxico bacteriano (LPS). Esta prueba se llevó a cabo también en presencia de IFNa-2 de tipo silvestre usado como control, y seleccionado como representativo del producto comercial Intron A. Para hacer esto, se aislaron células mononucleares de sangre periférica humana (PBMC) de donadores sanos, y se analizó su fenotipo para determinar la cantidad relativa de células CD64+ CD4dim (CD64 y CD4dim, son marcadores para monocitos sanguíneos). Después de cultivo la noche anterior, estos PBMC se incubaron en el medio de cultivo solos (sin células estimuladas) o en presencia de LPS (células estimuladas). En cada cultivo, se añadieron 4 µg/mL de IFNa-2 de tipo silvestre o IFNa-17 mutado G45R. Después del cultivo, se marcó extracelularmente a las células con anti-CD64 y anti-CD4dim, y se marcó intracelularmente a las mismas con anticuerpos específicos dirigidos contra citocinas tipo Th1 (FNT-alfa), IL- 2 e IL-10. Las células fluorescentes se analizaron usando FACScalibur y el programa CelIQuest.
Los resultados obtenidos, indican que el IFNa-17 mutado G45R y el IFNa-2 de tipo silvestre no estimulan la liberación de citocinas (IL-10, IL-12 y FNT-alfa) en ausencia de LPS. En contraste, en presencia de LPS, los monocitos liberan citocinas. La liberación de IL-10 e IL-12 por monocitos en presencia de LPS, se incrementa además en presencia de IFNa-2 de tipo silvestre, pero no en presencia del IFNa-17 mutado G45R, como se muestra en el cuadro siguiente. Este cuadro representa la liberación de citocinas por monocitos, en presencia de LPS, expresada como porcentaje de las células CD64+ CD4dim, y el porcentaje de células CD4dim CD64+ sobre el total de células.
De esta manera, la ausencia del efecto sinergístico observado en presencia del IFNa-17 mutado G45R y LPS, sugiere que el IFNa-17 mutado G45R puede tener una acción inmunosupresora.
EJEMPLO 4 Evaluación de la actividad antiproliferativa ¡n vitro del IFNg-17 mutado G45R sobre la línea de células de eritroleucemia TF-1
Se evaluó también el efecto del IFNa- 7 mutado G45R sobre la línea de células de eritroleucemia TF-1. Esta prueba se llevó a cabo también en presencia del IFNa-2 de tipo silvestre usado como control, y seleccionado como representativo del producto comercial Intron A. Para hacer esto, se pusieron en contacto células TF-1 de concentraciones crecientes de IFNa-21 mutado e IFNa-2 de tipo silvestre (0.001 a 100 ng/mL), y se midió la proliferación celular. Los resultados, presentados en la figura 2, indican que el IFNa- 7 mutado G45R tiene un efecto antiproliferativo débil sobre las células TF-1 , y este efecto es similar al del IFNa-2 de tipo silvestre, sugiriendo que la toxicidad hematológica del IFNa- 7 mutado G45R no es superior a la del IFNa-2 de tipo silvestre.
EJEMPLO 5 Evaluación de la capacidad del IFNa-17 mutado G45R para inducir la antiproliferación de la línea de células de linfoma de Daudi Burkitt humano
Estas pruebas se llevan a cabo en dos diferentes proteínas IFNa-17, a saber, IFNa-17 mutado G45R e IFNa-17 natural de tipo silvestre. Se inoculan células (línea de células de linfoma de Daudi Burkitt humano, denominadas en lo sucesivo "células de Daudi") cultivadas de antemano en medio RPMI 1640 (complementado con suero de ternera fetal a 10% y 2 mM de L-glutam¡na) en placas de 96 cavidades, a la densidad celular de 4.104 células por cavidad. En cada cavidad, se ponen en contacto células de Daudi de concentraciones crecientes de proteínas IFNa-17 natural de tipo silvestre o IFNa-17 mutada G45R. Las concentraciones del IFNa-17 estudiado (proteína natural mutada o de tipo silvestre), se incluyen entre 0.003 pM y 600 nM (concentraciones finales en las cavidades). Las células de Daudi se incuban entonces durante 66 horas a 37°C bajo CO2 a 5%, después de lo cual se añade el reactivo Uptiblue (Uptima) a los cultivos. La velocidad de proliferación celular se cuantifica midiendo la fluorescencia emitida a 590 nm (excitación a 560 nm) después de un período adicional de incubación de 4 horas.
La actividad antiproliferativa del IFNa-17 natural de tipo silvestre o el IFNa-17 mutado G45R, se basa en las mediciones de la IC50, que corresponden a la concentración de la proteína IFNa-17 en picomolar (pM), inhibiendo 50% del crecimiento celular. Se llevaron a cabo cuatro experimentos similares, cada uno siendo repetido cuatro veces. Para cada experimento, se mencionan los valores de la IC50 en el siguiente cuadro:
El valor promedio de la IC50 medido para el IFNa-17 de tipo silvestre es de 0.49 pM, mientras que el valor promedio de la IC50 medido para el IFNa-17 mutado G45R, es de 5.31 pM. De esta manera, la relación promedio que corresponde al valor de la IC50 para el IFNa-17 mutado sobre el valor para el IFNa-17 natural de tipo silvestre, alcanza 10.80 (con una desviación estándar de 3.46). Esta prueba demuestra que la actividad antiproliferativa celular es inhibida fuertemente (casi a una escala comprendida entre 5 a 15 veces menos) en el caso del IFNa-17 mutado G45R, en comparación con el IFNa-17 de tipo silvestre. Se han llevado a cabo también experimentos independientes similares con IFNa-2 de tipo silvestre, para comparar el efecto antiproliferativo del IFNa-17 mutado G45R sobre la proliferación de células de Daudi, con el efecto del IFNa-2 de tipo silvestre. Para hacer esto, se cultivaron células de Daudi en presencia de concentraciones de IFNa-17 mutado G45R o IFNa-2 de tipo silvestre, que variaban de 0.001 a 10 ng/mL. Se llevaron a cabo tres experimentos similares. Los resultados de un experimento representativo se presentan en la figura 3. Estos resultados demuestran que la actividad antiproliferativa celular del IFNa-17 mutado G45R sobre la línea de células de Daudi Burkitt, es mayor que la del IFNa-2 de tipo silvestre.
EJEMPLO 6 Evaluación de la actividad antiviral del IFNa-17 mutado G45R
Los IFNs desempeñan una función importante en la defensa antiviral. La actividad antiviral del IFN se debe en parte a sistemas enzimáticos inducidos por los IFNs, tales como: La 2'5' oligoadenilato sintetasa, una enzima que cataliza la síntesis de oligómeros de adenosina. Estos oligómeros activan la ribonucleasa L, una endorribonucleasa que destruye el ARN viral una vez activada. Las proteínas MX (GTPasas), que inhiben la síntesis y/o la maduración de transcritos virales. Esta actividad es ejercida principalmente sobre el virus de influenza.
La proteína PKR (o p68 cinasa), que es activada por el ARN de doble cadena. La PKR activada inhibe la síntesis de proteínas. La actividad antiviral de los IFNs es inducida también por otros mecanismos, tales como en el caso de retrovirus, la inhibición de la entrada de partículas virales en las células, la replicacion, la unión, la salida de las partículas, y la capacidad infecciosa de las partículas virales. Por último, los IFNs ejercen una actividad antiviral indirecta al modular ciertas funciones del sistema inmune, en particular favoreciendo la respuesta a la mediación celular (incluyendo un incremento en las moléculas MHC clase I y II, incremento de la producción de IL-12 e IFN gamma, e incremento de las actividades de CTL, entre otras). La actividad antiviral del IFN - 7 mutado G45R, se ha evaluado in vitro en cultivo de células, e in vivo en modelo de ratón. Ambas pruebas se han llevado a cabo en paralelo con IFN -2 de tipo silvestre usado como control, y seleccionado como representativo del producto comercial Intron A.
a) Actividad antiviral in vitro en cultivo de células Esta prueba permite la evaluación de la actividad antiviral del IFNa-17 mutado G45R y el IFNa-2 de tipo silvestre en cultivo de células, usando el virus de estomatitis vesicular (VSV). Para hacer esto, se cultivan células epiteliales humanas WISH durante 24 horas en presencia de concentraciones decrecientes de IFNa-17 mutado G45R o IFNa-2 de tipo silvestre. Entonces, las células son infectadas por el virus de estomatitis vesicular (VSV) durante otras 24 a 48 horas, y se mide la lisis celular. El efecto antiviral del IFNct diferente puesto a prueba, se determina comparando el valor de la IC50 que corresponde a la concentración de IFN que inhibe 50% de la lisis celular inducida por el VSV. Se ha llevado a cabo dos veces un experimento celular, y los valores de la IC50 medidos en un experimento representativo, se dan en el cuadro siguiente:
De esta manera, en cultivo de células infectado con VSV, el IFNoc-17 mutado G45R exhibe una actividad antiviral, esta actividad antiviral siendo mayor que la del IFNa-2 de tipo silvestre.
b) Actividad antiviral in vivo en modelo de ratón Esta prueba in vivo se lleva a cabo en modelo de ratón de EMCV (virus de encefalomiocarditis). Los IFNs humanos exhiben actividad antiviral dependiente de la dosis en el ratón, la cual es en general 100 a 1000 veces menor que la exhibida por la misma cantidad de IFN de ratón (Meister et al. (1986). J. Gen. Viral. 67, 1633-1644). La inyección intraperitoneal de ratones con el virus de encefalomiocarditis (EMCV), da lugar a una enfermedad fatal rápidamente progresiva caracterizada por compromiso del sistema nervioso central y encefalitis (Finter NB (1973). Front Biol. 2: 295-360). Se ha mostrado que el interferón-alfa humano y de ratón es efectivo para proteger a ratones contra la infección letal por el EMCV (Tovey y Maury (1999). J. IFN Cytokine Res. 19: 145-155). Grupos de 20 ratones suizos de seis semanas, fueron infectados ¡ntraperitonealmente (i.p.) con 100 x LD50 de EMCV, y tratados una hora después, y entonces una vez diariamente durante 3 días después, con 2 microgramos de preparaciones de IFNa-17 mutado G45R o IFNoc-2 de tipo silvestre. Se formó un grupo control con animales que habían sido tratados sólo con excipiente. Se observó diariamente a los animales para supervivencia durante 21 días. Los resultados se presentan en la figura 4, e indican que el índice de supervivencia relativo de los ratones que han sido tratados con IFNa-17 mutado G45R, es mucho mayor que el índice de supervivencia de los ratones no tratados, e incluso mayor que el observado para los ratones que han sido tratados con IFNa-2 de tipo silvestre. Estos datos demuestran la fuerte actividad antiviral del IFNa-17 mutado G45R ¡n vivo en el modelo de ratón. Todos estos resultados demuestran que el IFNa-17 mutado
G45R posee propiedades biológicas únicas.
LISTADO DE SECUENCIAS
<110> GENODYSSEE <120> Polín ucleótidos y polipéptidos novedosos del gen de IFNa-17
<130> BIF PCT 022983 <140> PCT/EP/02/05229 <141> 23-04-2002 <150> FR 0105516 <151 > 24-04-2001 <160> 5
<170> Patentln versión 3.1 <210> 1 <211> 1873 <212> ADN <213> Homo sapiens <400> 1 agcttcatac actaagagaa aaattttaaa aaattattga ttcttatttt caggagtttt 60 gaatgatcag gtatgtaatt atattcatat tattaatgtg tatttatata gatttttatt 120 ttgcacaggt actttgatac aaaatttaca tgaacaaatt acactaaaag ttatttcaca 180 aatatactta tcaagttaag ttaaatgcaa tagctttaaa cttagatttt aatttaactt 240 tttctatcat cattctttac attaaataaa aaaagcaaac tttatagttt ttatctataa 300 agtagaggta tacatagtat acataaatac atatgccaaa tctgtgttat taaaacttca 360 tgaagatttc gattacaaaa aaataccgta aaagactttg agtgcagaag aaaaatgggc 420
aatgatgaaa aacaatgaaa aacattctta aacacatgta gagagtgcaa aaagaaagca 480 aaaacagaca tagaaagtaa aactagggca tttagaaaat ggaaattagt atgttcacta 540
tttaaggcct atgcacagag caaagtcttc agaaaaccta gaggccaaag ttcaaggtta 600 cccatctcaa gtagcctagc aacatttgca acatcccaat ggccctgtcc ttttctttac 660 tgatggccgt gctggtgctc agctacaaat ccatctgttc tctaggctgt gatctgcctc 720 agacccacag cctgggtaat aggagggcct tgatactcct ggcacaaatg ggaagaatct 780 ctcctttctc ctgcctgaag gacagacatg actttggact tccccaggag gagtttgatg 840 gcaaccagtt ccagaagact caagccatct ctgtcctcca tgagatgatc cagcagacct 900 tcaatctctt cagcacagag gactcatctg ctgcttggga acagagcctc ctagaaaaat 960 tttccactga actttaccag caactgaata acctggaagc atgtgtgata caggaggttg 1020 ggatggaaga gactcccctg atgaatgagg actccatcct ggctgtgagg aaatacttcc 1080 aaagaatcac tctttatcta acagagaaga aatacagccc ttgtgcctgg gaggttgtca 1 140 gagcagaaat catgagatct ctctcttttt caacaaactt gcaaaaaata ttaaggagga 200 aggattgaaa actggttcaa catggcaatg atcctgattg actaatacat tatctcacac 1260 tttcatgagt tcctccattt caaagactca cttctataac caccacgagt tgaatcaaaa 1320 ttttcaaatg ttttcagcag tgtaaagaag cgtcgtgtat acctgtgcag gcactagtac 1380 tttacagatg accatgctga tgtctctgtt catctattta tttaaatatt tatttaatta 1440 tttttaagat ttaaattatt tttttatgta atatcatgtg tacctttaca ttgtggtgaa 1500 tgtaacaata tatgttcttc atatttagcc aatatattaa tttccttttt cattaaattt 1560 ttactataca aaatttcttg tgtttgttta ttctttaaga taaaatgtcg aggctgactt 1620 tacaacctga cttaaaaata tatgatttaa ttaagttatc tatcataatt ttattcaagt 1680 tattaaaaaa acatttttct gttactggtt atatgttgcc ttcaagatat aaacgtgaac 740 ataaaatata cagtccctgt tctcttgtat ctttgatttt tgtcaggaaa gaaatctaaa 1800 aacaataata atgctgaatt aatatcagtg atgctaactg ctataatgtg aggaagtaaa 1860 atacaatgaa ttc 1873 <210> 2 <211> 189 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 2
Met Ala Leu Ser Phe Ser Leu Leu Met Ala Val Leu Val Leu Ser Tyr 1 5 10 15
Lys Ser lie Cys Ser Leu Gly Cys Asp Leu Pro Gln Thr His Ser Leu 20 25 30
Gly Asn Arg Arg Ala Leu lie Leu Leu Ala Gln Met Gly Arg He Ser 35 40 45
Pro Phe Ser Cys Leu Lys Asp Arg His Asp Phe Gly Leu Pro Gln Glu 50 55 60
Glu Phe Asp Gly Asn Gln Phe Gln Lys Thr Gln Ala lie Ser Val Leu 65 70 75 80
His Glu Met lie Gln Gln Thr Phe Asn Leu Phe Ser Thr Glu Asp Ser 85 90 95
Ser Ala Ala Trp Glu Gln Ser Leu Leu Glu Lys Phe Ser Thr Glu Leu 100 105 1 10
Tyr Gln Gln Leu Asn Asn Leu Glu Ala Cys Val lie Gln Glu Val Gly 115 120 125
Met Glu Glu Thr Pro Leu Met Asn Glu Asp Ser lie Leu Ala Val Arg 130 135 140
Lys Tyr Phe Gln Arg lie Thr Leu Tyr Leu Thr Glu Lys Lys Tyr Ser 145 150 155 160 Pro Cys Ala Trp Glu Val Val Arg Ala Glu lie Met Arg Ser Leu Ser 165 170 175
Phe Ser Thr Asn Leu GIn Lys lie Leu Arg Arg Lys Asp 180 185
<210> 3 <211> 57 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 3 Met Ala Leu Ser Phe Ser Leu Leu Met Ala Val Leu Val Leu Ser Tyr 1 5 10 15
Lys Ser lie Cys Ser Leu Gly Cys Asp Leu Pro GIn Thr His Ser Leu 20 25 30
Gly Asn Arg Arg Ala Leu lie Leu Leu Ala GIn Met Gly Arg lie Ser 35 40 45
Pro Phe Ser Cys Leu Lys Asp Arg GIn 50 55
<210> 4 <211> 20 <212> ADN <213> Homo sapiens <400> 4 ttcaaggtta cccatctcaa
<210> 5 <211> 21 <212> ADN <213> Homo sapiens
Claims (1)
1- Un polinucleótido aislado, que comprende: a) una secuencia de nucleótidos que tiene por lo menos 90% de identidad con la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. 1 , o su secuencia de codificación, siempre que dicha secuencia de nucleótidos comprenda por lo menos un SNP seleccionado del grupo que consiste de g771c y 808lns(a); o b) una secuencia de nucleótidos complementaria a una secuencia de nucleótidos bajo a). 2. - Un polinucleótido aislado, que comprende: a) una secuencia de nucleótidos que tiene por lo menos 95% de identidad, de preferencia por lo menos 99% de identidad, con la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. 1 , o su secuencia de codificación, siempre que dicha secuencia de nucleótidos comprenda por lo menos un SNP seleccionado del grupo que consiste de g771c y 808lns(a); o b) una secuencia de nucleótidos complementaria a una secuencia de nucleótidos bajo a). 3. - Un polinucleótidos aislado, que consiste de: a) i) la secuencia de nucleótidos completa o parte de la misma de SEQ ID NO. 1 , o su secuencia de codificación, siempre que dicha secuencia de nucleótidos comprenda por lo menos un SNP seleccionado del grupo que consiste de g771c y 808lns(a); o ¡i) una secuencia de nucleótidos complementaria a una secuencia de nucleótidos bajo a); dicho polinucleótido estando formado de por lo menos 10 nucleótidos, y teniendo por lo menos uno de dichos SNPs; o b) un polinucleótido aislado como se define bajo a), que comprende adicionalmente secuencias de nucleótidos tales como secuencias que no son de codificación 5' y/o 3', secuencias transcritas o no transcritas, secuencias traducidas o no traducidas, secuencias de señal de empalme, secuencias poliadeniladas, secuencias de unión a ribosoma, o secuencias que estabilizan ARN mensajero. 4 - Ei polinucleótido aislado de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, caracterizado además porque contiene el SNP g771c. 5. - Un polinucleótido aislado, que codifica para: a) un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2, y teniendo el SNP de codificación G45R; o b) una parte de dicho polipéptido comprendiendo dicho SNP, y teniendo la misma o prácticamente la misma actividad biológica. 6. - Un polinucleótido aislado, que codifica para: a) un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3; o b) una parte de dicho polipéptido, y teniendo la misma o prácticamente la misma actividad biológica. 7.- El polinucleótido de conformidad con la reivindicación 6, caracterizado además porque dicha secuencia de aminoácidos contiene también el siguiente SNP de codificación: G45R. 8.- El uso de un polinucleótido completo, o parte del mismo, según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7, para identificar, hibridar y/o amplificar un polinucleótido completo, o parte del mismo, que tiene 90 a 100% de identidad con la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. 1 , o su secuencia de codificación, siempre que cada una de estas secuencias comprenda por lo menos uno de los siguientes SNPs: g771 c y 808lns(a). 9. - El uso de un polinucleótido completo, o parte del mismo, según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7, para la genotipificación de un polinucleótido completo, o parte del mismo, que tiene 90 a 100% de identidad con la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO. 1 , o su secuencia de codificación, siempre que cada una de estas secuencias comprenda por lo menos uno de los siguientes SNPs: g771c y 808lns(a). 10. - Un vector recombinante, que comprende un polinucleótido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7. 11. - Una célula hospedera, que comprende un vector recombinante según la reivindicación 10. 12. - Un método para separar un polipéptido, que comprende cultivar una célula hospedera según la reivindicación 11 en un medio de cultivo, y separar dicho polipéptido del medio de cultivo. 13. - El polipéptido descrito que es codificado por el polinucleótido aislado según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4. 14. - Un polipéptido aislado que comprende una secuencia de aminoácidos que tiene por lo menos 90% de identidad con: a) la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2; o b) la secuencia de aminoácidos que comprende los aminoácidos incluidos entre las posiciones 24 y 189 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2; siempre que la secuencia de aminoácidos bajo a) o b) contenga el SNP G45R. 15. - Un polipéptido aislado, que comprende una secuencia de aminoácidos que tiene por lo menos 95% de identidad, más preferiblemente por lo menos 99% de identidad con: a) la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2; o b) la secuencia de aminoácidos que comprende los aminoácidos incluidos entre las posiciones 24 y 189 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2; siempre que la secuencia de aminoácidos bajo a) o b) contenga el SNP G45R. 16. - Un polipéptido aislado que comprende una secuencia de aminoácidos que tiene por lo menos 80% de identidad con: a) la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3; o b) la secuencia de aminoácidos que comprende los aminoácidos incluidos entre las posiciones 24 y 57 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3; siempre que la secuencia de aminoácidos bajo a) o b) contenga el SNP marco de lectura 57 de H57Q. 17. - Un polipéptido aislado que comprende una secuencia de aminoácidos que tiene por lo menos 90% de identidad, de preferencia por lo menos 95% de identidad, más preferiblemente por lo menos 99% de identidad con: a) la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3; o b) la secuencia de aminoácidos que comprende los aminoácidos incluidos entre las posiciones 24 y 57 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3; siempre que la secuencia de aminoácidos bajo a) o b) contenga el SNP marco de lectura 57 de H57Q. 18.- Un polipéptido aislado que comprende los aminoácidos 24 a 189 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2, y que tiene el SNP G45R. 9.- Un polipéptido aislado, que comprende los aminoácidos 24 a 57 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3. 20. - El polipéptido de conformidad con la reivindicación 19, caracterizado además porque tiene el SNP de codificación G45R. 21. - Un anticuerpo que es inmunoespecífico para un polipéptido según cualquiera de las reivindicaciones 13 a 20. 22. - Un método para identificar un agente entre uno o más compuestos que se pondrán a prueba, que activa o inhibe la actividad de un polipéptido aislado que comprende la secuencia completa de aminoácidos de SEQ ID NO. 2, o parte de la misma, y que tiene el SNP G45R, dicho método comprende: a) proveer células hospederas que comprenden el vector recombinante según la reivindicación 10; b) poner en contacto dichas células hospederas con dichos compuestos se pondrán a prueba; c) determinar el efecto de activación o inhibición sobre la actividad de dicho polipéptido, con lo cual se identifica al agente de activación o inhibición. 23.- Un método para identificar un agente entre uno o más compuestos que se pondrán a prueba, cuya actividad es potenciada o inhibida por un polipéptido aislado que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2 completa, o parte de la misma, y que tiene G45R, dicho método comprende: a) proveer células hospederas que comprenden el vector recombinante según la reivindicación 10; b) poner en contacto dichas células hospederas con dichos compuestos que se pondrán a prueba; c) determinar el efecto potenciador o inhibidor sobre la actividad de dicho agente, con lo cual se identifica dicho agente potenciado o inhibido. 24. - Un método para identificar un agente entre uno o más compuestos que se pondrán a prueba, que activa o inhibe la actividad de un polipéptido aislado que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3 completa, o parte de la misma, teniendo también posiblemente el SNP de codificación G45R, dicho método comprende: a) proveer células hospederas que comprenden el vector recombinante según la reivindicación 10; b) poner en contacto dichas células hospederas con dichos compuestos que se pondrán a prueba; c) determinar el efecto de activación o inhibición sobre la actividad de dicho polipéptido, con lo cual se identifica dicho agente de activación o inhibición. 25. - Un método para identificar un agente entre uno o más compuestos que se pondrán a prueba, cuya actividad es potenciada o inhibida por un polipéptido aislado que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 3 completa, o parte de la misma, teniendo también posiblemente el SNP de codificación G45R, dicho método comprende: a) proveer células hospederas que comprenden el vector recombinante según la reivindicación 10; b) poner en contacto dichas células hospederas con dichos compuestos que se pondrán a prueba; c) determinar el efecto potenciador o inhibidor sobre la actividad de dicho agente, con lo cual se identifica dicho agente potenciado o inhibido. 26. - Un método para analizar las características biológicas de un sujeto, que comprende llevar a cabo por lo menos uno de los siguientes pasos: a) determinar la presencia o ausencia del polinucleótido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7, en el genoma de un sujeto; b) determinar el nivel de expresión del polinucleótido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7 en un sujeto; c) determinar la presencia o ausencia del polipéptido según cualquiera de las reivindicaciones 13 a 20 en un sujeto; d) determinar la concentración del polipéptido según cualquiera de las reivindicaciones 13 a 20 en un sujeto; o e) determinar la funcionalidad del polipéptido según cualquiera de las reivindicaciones 13 a 20 en un sujeto. 27. - Un agente terapéutico que comprende uno o más compuestos seleccionados del grupo que consiste de: un polinucleótido aislado según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7; un vector recombinante según la reivindicación 10; una célula hospedera que comprende dicho vector recombinante, en donde dicha célula hospedera se puede obtener del sujeto que será tratado; un polipéptido aislado según cualquiera de las reivindicaciones 13 a 20; o un anticuerpo específico para uno de dichos polipéptidos. 28. - El uso de un agente terapéutico como el que se reclama en la reivindicación 27, en la preparación de un medicamento para prevenir o tratar en un sujeto una enfermedad seleccionada del grupo que consiste de cánceres y tumores, enfermedades infecciosas, enfermedades inmunológicamente y auto-inmunológicamente relacionadas, enfermedades cardiovasculares, enfermedades metabólicas, enfermedades del sistema nervioso central, y trastornos relacionados con tratamientos quimioterapéuticos, cicatrización de heridas, anemia en paciente dializado y/o osteoporosis. 29 - El uso como se reclama en la reivindicación 28, en donde dichas enfermedades infecciosas comprenden infecciones virales que incluyen hepatitis B y C crónicas y VIH/SIDA, neumonías infecciosas, y enfermedades venéreas tales como verrugas genitales. 30.- El uso de un agente terapéutico como el que se reclama en la reivindicación 27, en la preparación de un medicamento para aumentar o disminuir la actividad, en un sujeto, del polipéptido según cualquiera de las reivindicaciones 13 a 20. 31.- El uso de un agente terapéutico como el que se reclama en la reivindicación 27, en la preparación de un medicamento para prevenir o tratar, en un individuo, una enfermedad o trastorno vinculado a la presencia en el genoma de dicho individuo, de una secuencia de nucleótidos que tiene por lo menos 95% de identidad con el nucleótido de SEQ ID NO. 1, siempre que dicha secuencia de nucleótidos comprenda por lo menos un SNP seleccionado del grupo que consiste de g771c y 808lns(a). 32.- Un método para determinar asociaciones estadísticamente relevantes entre por lo menos un SNP seleccionado del grupo que consiste de g771c y 808lns(a), en el gen de IFNa-17, y una enfermedad o resistencia a enfermedad, que comprende: a) genotipificar un grupo de individuos; b) determinar la distribución de dicha enfermedad o resistencia a enfermedad dentro de dicho grupo de individuos; c) comparar los datos genotípicos con la distribución de dicha enfermedad o resistencia a enfermedad; y d) analizar dicha comparación para asociaciones estadísticamente relevantes. 33. - Un método para diagnosticar o determinar un pronóstico de una enfermedad o una resistencia a enfermedad que comprende detectar por lo menos un SNP seleccionado del grupo que consiste de g77 c y 808lns(a), en el gen de IFNa-17. 34. - Un método para identificar un compuesto entre uno o más compuestos que se pondrán a prueba, que tiene una actividad biológica sustancialmente similar a la actividad del producto del gen de IFNa-17 mutado G45R, dicho método comprende los pasos de: a) determinar la actividad biológica de dicho compuesto, tal como maduración de células dendríticas, liberación de citocinas por linfocitos T CD4+ o CD8+, liberación de citocinas por monocitos, actividad antiproliferativa celular sobre la línea de células TF-1 , actividad antiproliferativa celular sobre la línea de células de Daudi Burkitt, o actividad antiviral in vitro o in vivo; b) comparar la actividad determinada en el paso a) de dicho compuesto, con la actividad del producto del gen de IFNa-17 mutado G45R; c) determinar, con base en la comparación llevada a cabo en el paso b), si dicho compuesto tiene una actividad sustancialmente similar, o menor o mayor, en comparación con la del producto del gen de IFNa-17 mutado G45R. 35.- El método de conformidad con la reivindicación 34, caracterizado además porque dichos compuestos que se pondrán a prueba se identifican de bibliotecas combinatorias de péptidos sintéticos, selección de alto rendimiento, o se diseñan mediante diseño de fármacos asistido por computadora, para que tengan la misma estructura tridimensional de la del polipéptido de SEQ ID NO. 2, o de una secuencia de aminoácidos que comprenda los aminoácidos incluidos entre las posiciones 24 y 189 de la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO. 2, siempre que dichas secuencias de aminoácidos comprendan el SNP G45R.
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