KR960703937A - 고체 지지체상에서 핵산을 합성하는 방법 및 이 방법에서 고체 지지체로서 유용한 화합물(process for solid support nucleic acid synthesis and compounds useful as solid supports in said process) - Google Patents

고체 지지체상에서 핵산을 합성하는 방법 및 이 방법에서 고체 지지체로서 유용한 화합물(process for solid support nucleic acid synthesis and compounds useful as solid supports in said process)

Info

Publication number
KR960703937A
KR960703937A KR1019960700059A KR19960700059A KR960703937A KR 960703937 A KR960703937 A KR 960703937A KR 1019960700059 A KR1019960700059 A KR 1019960700059A KR 19960700059 A KR19960700059 A KR 19960700059A KR 960703937 A KR960703937 A KR 960703937A
Authority
KR
South Korea
Prior art keywords
group
solid support
compound
nucleotide
nucleic acid
Prior art date
Application number
KR1019960700059A
Other languages
English (en)
Inventor
루드밀라 바라노바
프랑스와 샤트렝
빅토르 쿠마레프
Original Assignee
파스칼 브랑뒤
쟝세
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 파스칼 브랑뒤, 쟝세 filed Critical 파스칼 브랑뒤
Publication of KR960703937A publication Critical patent/KR960703937A/ko

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Catalysts (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Steroid Compounds (AREA)
  • Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)

Abstract

본 발명은 고체상 핵산을 합성하는 방법에 관한 것으로서, 이 방법은 2가의 탄화수소 라디칼에 의해 에폭시 또는 글리콜형 기에 결합된 무기 또는 유기 중합체를 고체 지지체로서 사용하며, 상기 에폭시 또는 글리콜형기는 OH기와 친핵성기가 치환되는 두 개의 인접한 포화 탄소를 포함하는 것을 특징으로 한다. 본 발명은 또한 상기한 바와 같은 에폭시 또는 글리콜형 기를 포함하는 화합물에 관한 것으로서, 이들은 예를 들면 고체 지지체 핵산 합성 방법에서 고체 지지체로서 유용하다.

Description

고체 지지체상에서 핵산을 합성하는 방법 및 이 방법에서 고체 지지체로서 유용한 화합물(PROCESS FOR SOLID SUPPORT NUCLEIC ACID SYNTHESIS AND COMPOUNDS USEFUL AS SOLID SUPPORTS IN SAID PROCESS)
본 내용은 요부공개 건이므로 전문내용을 수록하지 않았음

Claims (17)

  1. 고체 지지체상에서의 합성에 의해 핵산을 제조하는 방법에 있어서, 고체 지지체로서 무기 또는 유기 중합체를 사용하며, 이 중합체는 2가의 탄화수소 라디칼을 통해 에폭사이드기 또는 글리콜형기에 연결되고, 글리콜형기는 OH기와 친핵성기가 치환되는 두 개의 인접한 포화 탄소로 구성되는 것을 특징으로 하는 방법.
  2. 제 1항에 있어서, 지지체에 결합된 제1뉴클레오티드로 제2뉴클레오티드를 축합시켰을 때와 동일한 단량체 시약 및 동일한 조건하에 제1뉴클레오티드를 고체 지지체에 용이하게 부착시키는데, 상기 조건은 고체 지지체상의 핵산 합성시 사용되는 통상의 조건 및 통상의 단량체 시약일 수 있으며, 상기 제1뉴클레오티드는 상기 핵산의 서열내 제1뉴클레오티드에 상응하는 것을 특징으로 하는 방법.
  3. 제 1항 또는 제 2항에 있어서, 하기 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 방법; 1) 제1뉴클레오티드 또는 상기 고체 지지체에 그 다른 3′ 또는 5′ 단부에 연결된 올리고뉴클레오티드의 5′ 또는 OH 기를 커플링제를 사용하여 3′및5′위치에서 보호된 뉴클레오티드 단량체 시약의 3′ 또는 5′위치에서 임의로 치환된 포스페이트 기와 축합시키는 단계; 2) 단계 1)에서 수득한 포스파이트 유형의 뉴클레오티드간 결합을 각각 포스페이트 또는 포스포로티오에이트 결합으로 산화 또는 황화시키는 단계; 3) 단계 2)에서 수득한 생성물의 5′-O 또는 3′-O 단부의 탈보호 단계; 4) 핵산을 합성하기 위하여 첨가하여야 할 뉴클레오티드 수 만큼 단계 1) 내지 3)을 반복하는 단계.
  4. 제 1항 또는 제 2항에 있어서, 하기 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 방법; 1) 커플링제를 사용하여 상기 고체 지지체의 글리콜형의 상기 기의 상기 OH 기를 5′-O 및 3′-O 위치에서 보호된 뉴클레오티드 단량체 시약의 3′ 또는 5′위치에서 임의로 치환된 포스페이트 또는 포스파이트 기와 축합시키는 단계; 2) 단계 1)에서 수득한 제1뉴클레오티드와 고체 지지체 사이의 포스파이트 유형의 공유 결합을 산화 또는 황화시키는 단계; 3) 단계 2)에서 수득한 생성물의 5′-O 또는 3′-O 단부의 탈보호 단계; 4) 단계 3)에서 수득한 생성물의 5′OH 또는 3′OH 기를 단계 1)에서의 축합과 동일한 조건하에 상기 커플링제를 사용하여 각각 5′-O 또는 3′-O 위치에서 보호된 뉴클레오티드 단량체 시약의 3′ 또는 5′ 위치에서 임의로 치환된 포스페이트, 포스포로티오에이트 또는 포스파이트 기와 축합시키는 단계; 5) 상기 단계에서 생성된 포스파이트 유형의 뉴클레오티드간 기를 각각 포스페이트 또는 포스포로티오에이트 유형의 기로 산화 또는 황화시키는 단계; 6) 단계 5)에서 수득한 생성물의 5′-O 또는 3′-O 단부의 탈보호 단계; 7) 제조할 핵산을 얻기 위하여 첨가하여야 할 뉴클레오티드 수 만큼 단계 4) 내지 6)을 반복하는 단계.
  5. 제 4항에 있어서, 지지체로부터 핵산을 탈착시키고, 염기로부터 그리고 적합한 경우, 핵산의 2′-O 위치로부터 보호기를 제거하는 최종 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 방법.
  6. 제 4항 또는 제 5항에 있어서, 고체 지지체의 글리콜 유형의 상기 기를 수득하기 위한 5′ 또는 3′OH 기의 탈보호에 통상의 조건하에서, 무수 산성 매질에서 상기 고체 지지체의 상기 에폭사이드 기를 개환하는 사전단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 방법.
  7. 하기 일반식으로 표시되는 화합물 :
    상기 식에서, R1,R1′,R1″,R2및R2′중 하나는 무기 또는 유기 중합체, 또는 무기 또는 유기 중합체로 치환된 탄화수소 라디칼을 의미하며, 다른 것들은 구체적으로 하나 이상의 할로겐(들)로 임의로 치환되는 알킬기와 같은 불활성기 또는 H를 각각 독립적으로 의미하고, Nu는 NH2, 할로겐, -OAlK, -SAlK, -NHAlK, -NHAc, -OAc, -SAc, 또는 -N(AlK)2와 같은 친핵성 기이며, 이때, AlK 및 Ac는 각각 구체적으로 하나이상의 할로겐(들)로 임의로 치환되는 알킬 및 아실기이다.
  8. 제 7항에 있어서, Nu가 -N(AlK)2, -NHAC, -OAc, -SAc 또는 할로겐을 의미하며, 여기서, AlK 및 Ac는 각각 하나 이상의 할로겐(들)로 임의로 치환되는 C1내지 C4알킬 및 아실기를 의미하는 것을 특징으로 하는 방법.
  9. 제 7항 또는 제 8항에 있어서, 상기 고체 지지체가 하기 일반식의 화합물에 해당하는 것을 특징으로 하는 화합물 :
    상기 식에서, R1, R2및 Nu는 제 7항에 제시한 의미와 동일하다.
  10. 제 9항에 있어서, 상기 화합물이 하기 일반식의 화합물중 하나인 화합물 :
  11. 제 7항 내지 제 9항 중 어느 한 항에 있어서, (R1및 R2) 또는 (R1′ 및 R2′)은 함께 고리, 구체적으로 중합체가 치환된 채로 나타나는 헤테로고리를 형성하는 것을 특징으로 하는 화합물.
  12. 제11항에 있어서, (R1및 R2) 또는 (R1′ 및 R2′)가 함께 리보스를 형성하며 Nu가와 같은 보호기로 보호된 2′-O 작용기를 의미하는 것을 특징으로 하는 화합물.
  13. 제 1항 내지 제 6항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 고체 지지체가 제 7항 내지 제10항 중 어느 한 항에 따른 화합물로 구성되는 것을 특징으로 하는 화합물.
  14. 제 2항 내지 제 6항 또는 제13항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 뉴클레오티드 단량체 시약이 하기 일반식의 화합물에 해당하는 것을 특징으로 하는 방법 :
    상기 일반식에서, A는 H 또는 임의로 보호된 히드록실기를 의미하고, B는 그 외부고리 아민 작용기가 임의로 보호된 퓨린 또는 피리미딘 염기이며, C는 5′-OH 작용기의 통상의 보호기이고, x는 0 또는 1이며, 이때, ⒜ x가 1이면, R3은 H를 나타내고, R4는 음으로 하전된 산소 원자를 의미하거나, 또는 R3은 산소 원자이고 R4는 산소 원자 또는 보호기를 보유한 산소 원자를 의미하며, ⒝ x가 0이면, R3은 보호기를 보유한 산소 원자이고, R4는 할로겐 또는 이치환된 아민기이다.
  15. 제 1항에 있어서, 단량체 시약이 x가 0이고, R3가 보호기를 보유한 산소 원자이고, R4는 이치환된 아민기인 일반식(Ⅲ)에 해당하는 화합물인 포스포르아미다이트 합성 방법인 방법.
  16. 제 1항 내지 제 6항 또는 제13항 내지 제15항 중 어느 한 항에 있어서, 중합체가 유리 미소비드 또는 미소섬유, 구체적으로 다공성인 유리 미소비드 또는 미소섬유, 실리카, 금속 산화물, 셀룰로스 또는 유기 중합체, 특히 셀룰로스 형태인 것을 특징으로 하는 방법.
  17. 제 1항 내지 제 6항 또는 제13항 내지 제16항 중 어느 한 항에 있어서, 중합체가 특히 유리 또는 실리카기재로 이루어진 무기 중합체인 것을 특징으로 하는 방법.
    ※ 참고사항 : 최초출원 내용에 의하여 공개하는 것임.
KR1019960700059A 1993-07-09 1994-07-07 고체 지지체상에서 핵산을 합성하는 방법 및 이 방법에서 고체 지지체로서 유용한 화합물(process for solid support nucleic acid synthesis and compounds useful as solid supports in said process) KR960703937A (ko)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR93/08498 1993-07-09
FR9308498A FR2707296B1 (fr) 1993-07-09 1993-07-09 Procédé de synthèse d'acides nucléiques sur support solide et composés utiles notamment comme support solide dans ledit procédé.
PCT/FR1994/000842 WO1995001987A1 (fr) 1993-07-09 1994-07-07 Procede de synthese d'acides nucleiques sur support solide et comoposes utiles notamment comme support solide dans ledit procede

Publications (1)

Publication Number Publication Date
KR960703937A true KR960703937A (ko) 1996-08-31

Family

ID=9449129

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR1019960700059A KR960703937A (ko) 1993-07-09 1994-07-07 고체 지지체상에서 핵산을 합성하는 방법 및 이 방법에서 고체 지지체로서 유용한 화합물(process for solid support nucleic acid synthesis and compounds useful as solid supports in said process)

Country Status (14)

Country Link
EP (1) EP0707592B1 (ko)
JP (1) JPH08512306A (ko)
KR (1) KR960703937A (ko)
AT (1) ATE157668T1 (ko)
AU (1) AU696421B2 (ko)
CA (1) CA2166765A1 (ko)
DE (1) DE69405396T2 (ko)
DK (1) DK0707592T3 (ko)
ES (1) ES2109005T3 (ko)
FR (1) FR2707296B1 (ko)
GR (1) GR3025420T3 (ko)
HK (1) HK1002731A1 (ko)
TW (1) TW397839B (ko)
WO (1) WO1995001987A1 (ko)

Families Citing this family (16)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
FR2714061B1 (fr) 1993-12-16 1996-03-08 Genset Sa Procédé de préparation de polynucléotides sur support solide et appareil permettant sa mise en Óoeuvre.
US5869696A (en) * 1996-04-22 1999-02-09 Beckman Instruments, Inc. Universal solid supports and methods for their use
US6590092B1 (en) 1998-05-19 2003-07-08 Nam Q. Ngo Process for preparing a “universal support” and the reagents used for generating such support
EP1006121B1 (en) * 1998-12-02 2003-05-02 Council of Scientific and Industrial Research A universal polymer support for the synthesis of oligonucleotides
AU779411B2 (en) 1999-02-12 2005-01-20 Serono Genetics Institute S.A. Biallelic markers derived from genomic regions carrying genes involved in arachidonic acid metabolism
AU2942100A (en) * 1999-03-11 2000-09-28 Kuraray Co., Ltd. Vitamin d derivatives and process for the preparation thereof
DE60000014T2 (de) * 2000-05-16 2002-05-02 Biochip Technologies Gmbh Linker-System zum Aktivieren von Oberflächen für die Biokonjugation und Verfahren zu ihrer Verwendung
US7211654B2 (en) 2001-03-14 2007-05-01 Regents Of The University Of Michigan Linkers and co-coupling agents for optimization of oligonucleotide synthesis and purification on solid supports
EP1925672A1 (en) 2001-06-22 2008-05-28 Syngeta Participations AG Abiotic stress responsive polynucleotides and polypeptides
US7858297B2 (en) 2001-12-18 2010-12-28 Centre National De La Recherche Scientifique Cnrs Chemokine-binding protein and methods of use
US7572886B2 (en) 2001-12-18 2009-08-11 Centre National De La Recherche Scientifique Death associated proteins, and THAP1 and PAR4 pathways in apoptosis control
EP1485408A2 (en) 2002-03-13 2004-12-15 Bayer CropScience S.A. Mutagenesis of aspergillus fungi and genes essential for growth
FR2900415B1 (fr) 2006-04-28 2010-08-13 Agronomique Inst Nat Rech Systeme genetique pour le controle du developpement du type floral d'une plante dicotyledone, et mise en oeuvre dans les procedes de detection et de selection
FR2954349A1 (fr) 2009-12-22 2011-06-24 Agronomique Inst Nat Rech Sulfatase modifiant selectivement les glycosaminoglycanes
US10865445B2 (en) 2010-08-18 2020-12-15 Fred Hutchinson Cancer Research Center Methods for alleviating facioscapulohumeral dystrophy (FSHD) by N siRNA molecule inhibiting the expression of DUX4-FL
WO2018013999A1 (en) 2016-07-15 2018-01-18 Am Chemicals Llc Non-nucleosidic solid supports and phosphoramidite building blocks for oligonucleotide synthesis

Family Cites Families (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0155950B1 (en) * 1983-09-02 1990-01-17 Molecular Biosystems, Inc. Oligonucleotide polymeric support system
US4739044A (en) * 1985-06-13 1988-04-19 Amgen Method for derivitization of polynucleotides
WO1991000868A1 (en) * 1989-07-07 1991-01-24 National Research Development Corporation Immobilised polynucleotides
WO1991008307A1 (en) * 1989-12-04 1991-06-13 Microprobe Corporation Enhanced capture of target nucleic acid by the use of oligonucleotides covalently attached to polymers
IE913762A1 (en) * 1990-10-26 1992-05-22 Genta Inc Non-aromatic organic polymeric reagents for solid phase¹synthesis of oligomers
JPH06509542A (ja) * 1990-10-26 1994-10-27 ジンタ・インコーポレイテッド オリゴマーを合成するための改良法

Also Published As

Publication number Publication date
DE69405396D1 (de) 1997-10-09
WO1995001987A1 (fr) 1995-01-19
FR2707296B1 (fr) 1995-09-29
AU696421B2 (en) 1998-09-10
DK0707592T3 (da) 1998-03-30
ES2109005T3 (es) 1998-01-01
EP0707592B1 (fr) 1997-09-03
DE69405396T2 (de) 1998-03-26
HK1002731A1 (en) 1998-09-11
EP0707592A1 (fr) 1996-04-24
JPH08512306A (ja) 1996-12-24
ATE157668T1 (de) 1997-09-15
TW397839B (en) 2000-07-11
CA2166765A1 (fr) 1995-01-19
FR2707296A1 (fr) 1995-01-13
GR3025420T3 (en) 1998-02-27
AU7230994A (en) 1995-02-06

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR960703937A (ko) 고체 지지체상에서 핵산을 합성하는 방법 및 이 방법에서 고체 지지체로서 유용한 화합물(process for solid support nucleic acid synthesis and compounds useful as solid supports in said process)
EP0543889B1 (en) Incorporation of selectably clevable sites into oligonucleotide chains and reagents therefor
US5367066A (en) Oligonucleotides with selectably cleavable and/or abasic sites
US5536821A (en) Aminoalkylphosphorothioamidate oligonucleotide deratives
EP0711362B1 (en) Tag reagent and assay method
US5258506A (en) Photolabile reagents for incorporation into oligonucleotide chains
Kamer et al. An efficient approach toward the synthesis of phosphorothioate diesters via the Schönberg reaction
EP0543906B1 (en) Hydroxyl-protecting groups orthogonally removable by reduction and their use in the chemical synthesis of oligonucleotides
JP2511005B2 (ja) インビトロにおけるオリゴヌクレオチド合成法並びにそれに用いる試薬
EP1072679A3 (en) Method of producing nucleic acid molecules with reduced secondary structure
JPH07233188A (ja) 新規ヌクレオシドホスホルアミダイトおよびその製造方法
KR950703571A (ko) 적외선 염료로 표지화된 누클레오티드 및 핵산 검출에 있어 그 사용방법(infra-red dye -labelled nucleoftides and their use in nu-cleic acid detection)
EP0552185A1 (en) Synthesis of oligonucleotides
US5252760A (en) Method of using colored phosphorylating reagents
WO2008141799A1 (en) Oligophosphoramidates
Moore et al. Conceptual basis of the selective activation of bis (dialkylamino) methoxyphosphines by weak acids and its application toward the preparation of deoxynucleoside phosphoramidites in situ
KR960700262A (ko) 이합체 블록의 합성 및 그것의 올리고누클레오티드 어셈블리에의 사용 방법(synthesis of dimmer blocks and their use in assembling oligonucleotides)
Zain et al. Nucleoside H-phosphonates. 15. Preparation of nucleoside H-phosphonothioate monoesters from the corresponding nucleoside H-phosphonates
JPH0291088A (ja) ホスファイトおよびヌクレオシド‐3’‐ホスファイト誘導体およびこれを用いるオリゴヌクレオチドの合成法
WO1994012518A3 (de) Reagenz zur kupplung veschiedener substanzen an nukleinsäuren sowie verfahren zu dessen herstellung
US5332845A (en) Phosphorylating reagents
JPH08511678A (ja) 5’(oh)および/または3’(oh)部位に1以上の放射活性のない標識要素を導入するために5’(oh)および/または3’(oh)が化学的に修飾された核酸プローブ、およびそれらの製造方法
Marangoni et al. Synthesis and hybridization properties of inverse oligonucleotides
US5726301A (en) CAC H-phosphonate and its use in the synthesis of oligonucleotides
JP3485025B2 (ja) ヌクレオチド誘導体

Legal Events

Date Code Title Description
WITN Application deemed withdrawn, e.g. because no request for examination was filed or no examination fee was paid