KR20240023127A - 망막 장애 - Google Patents

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Abstract

본 발명은 망막 장애, 및 유전자 작제물 및 이러한 작제물을 포함하는 재조합 벡터, 및 광범위한 망막 장애를 치료, 예방 또는 개선하기 위한 유전자 요법 방법에서의 이들의 용도에 관한 것이다. 상기 작제물 및 벡터는 습성 연령 관련 황반 변성(습성-AMD), 즉 신생혈관 연령 관련 황반 변성을 치료하는 데 특히 유용하다. 본 발명은 혈관 누출 및 망막 세포 손상을 감소시키기 위한 작제물 및 벡터의 용도로 확장된다. 본 발명은 또한 약제학적 조성물 자체 및 망막 장애를 치료, 예방 또는 개선하는 데 있어서, 그리고 혈관 누출 및 망막 세포 손상을 감소시키기 위한 이들의 용도로 확장된다.

Description

망막 장애
본 발명은 망막 장애(retinal disorder), 및 유전자 작제물(genetic construct) 및 이러한 작제물을 포함하는 재조합 벡터(recombinant vector), 및 광범위한 망막 장애를 치료, 예방 또는 개선하기 위한 유전자 치료 방법에서 이들의 용도에 관한 것이다. 상기 작제물 및 벡터는, 배타적이지는 않지만, 습성 연령 관련 황반 변성(wet age-related macular degeneration; 습성-AMD), 즉 신생혈관 연령 관련 황반 변성(neovascular age-related macular degeneration)을 치료하는 데 특히 유용하다. 본 발명은 또한 혈관 누출(vascular leakage) 및 망막 세포 손상을 감소시키기 위한 작제물 및 벡터의 용도로 확장된다. 본 발명은 또한 약제학적 조성물 그 자체, 및 망막 장애를 치료, 예방 또는 개선시키는 데 있어서, 그리고 혈관 누출 및 망막 세포 손상을 감소시키기 위한 이들의 용도로 확장된다.
연령 관련 황반 변성(AMD)으로도 알려진 황반 변성은 망막의 작은 부분인 황반에 영향을 미치는 50세 이상의 사람들에게 흔한 눈 상태이다[1-3]. 황반은 독서와 운전과 같은 활동에 필요한 중심 및 세부 시력에 사용된다. AMD는 선진국 성인 인구에서 영구적이고 비가역적인 시력 상실(sight loss)의 주요 원인이며[4], 영국에서 약 600,000명에게 영향을 미치고[5], 2013년에는 백내장(cataract), 조산(preterm birth) 및 녹내장(glaucoma)에 이어 네 번째로 흔한 실명(blindness)의 원인으로 추정된다[6]. 2015년에, AMD는 전 세계적으로 620만 명이 앓고 있는 것으로 추정된다[7]. 50 내지 60세 인구의 약 0.4%가 AMD를 앓고 있으며, 60 내지 70세 인구의 0.7%, 70 내지 80세 인구의 2.3%, 80세 이상 인구의 약 12%까지 증가한다[1]. 따라서, 인구 고령화에 따라 AMD 발병률도 증가하고 있다[8].  AMD는 '건성'(비신생혈관성) 또는 '습성'(삼출성 또는 신생혈관성) AMD로 진단될 수 있다[1,2]. 건성 AMD 또는 지도형 위축(geographic atrophy)은 가장 흔한 형태의 AMD이고, 사례의 90%를 차지한다. 건성 AMD는 일반적으로 더 느린 시력 상실을 유발하는 반면, 습성 AMD는 상대적으로 갑작스러운 시력 변화를 일으켜 상당한 시력 상실을 초래한다[1,2].
캐나다의 한 연구에 따르면, 중등도 AMD는 삶의 질의 40% 감소를 유발한다고 결론지었으며, 이는 영구적인 신장 투석(permanent renal dialysis)이나 심각한 심장 협심증(severe cardiac angina)과 관련된 감소와 비슷한 감소이다. 매우 심한 AMD는 삶의 질의 63% 감소를 유발하고, 이는 진행성 전립선암(prostatic cancer), 통제할 수 없는 통증 또는 침대에 누워있거나 요실금이 있고 지속적인 간호가 필요한 심한 뇌졸중(severe stroke) 환자와 비슷한 감소이다[9]. 특히 한쪽 눈에만 질환이 나타나는 경우에는 증상이 서서히 진행될 수 있지만, 상태가 진행됨에 따라 시력이 저하되어 시야에 틈새나 어두운 반점(안경의 얼룩과 유사)이 나타난다. 또한, 읽을 때 단어가 사라지거나 문틀이나 전등 기둥과 같은 직선이 왜곡되거나 구부러져 보일 수 있으며 색상이 희미하게 보일 수 있다. 대상체(subject)는 또한 어두운 환경에서 밝은 환경으로 이동할 때 적응하기 어려울 수도 있다. AMD가 완전한 실명을 초래하지는 않지만, 중심 시력의 손상은 일상적인 활동을 매우 어렵게 만든다. 예를 들어, 얼굴 인식, 운전 및 읽기가 어려워지고[1-3], 일부 개체는 시각적 환각(visual hallucination)을 경험하는 것으로 보고되었다[10].
습성-AMD는 황반 아래에서 새로운 혈관이 성장하는 결과이며(신생혈관 형성), 이는 이들의 형성 동안 혈액과 체액이 망막으로 누출되어 조직의 손상을 초래한다[11]. 예방 노력은 운동, 잘 먹기 및 금연을 포함한다[12]. 항산화 비타민과 미네랄은 효과가 제한적이며[13], 현재로서는 시력 상실을 회복할 수 있는 치유법 또는 치료는 없다[1-3].
VEGF-A는 눈의 망막 색소 상피(RPE)를 포함하는 신경교, 신경절 및 상피 세포와 성상세포에 의해 생산 및 분비되는 동형이량체 당단백질(homodimeric glycoprotein)이다[14,15]. 다양한 헤파린 결합 수준을 나타내는 네 가지 주요 형태인 VEGF-121, VEGF-165, VEGF-189 및 VEGF-206을 포함하여 단일 8-엑손 VEGF-A의 mRNA의 대체 스플라이싱으로부터 유래하는 VEGF-A의 여러 이소형(isoform)이 있다[14,15]. VEGF-A 이소형은 혈관 발달에 중요한 생리적 역할을 나타내며 신경세포 생존에 중요하다.
혈관 내피 성장 인자(vascular endothelial growth factor; VEGF) 경로를 표적화(targeting)하는 현재 치료에는 모노클로날 항체 또는 기타 VEGF 중화 단편(라니비주맙, Lucentis®/베바시주맙, Avastin®/브롤루시주맙/Beovu®), DNA 압타머(페갑타닙/Macugen®) 또는 재조합 VEGF 포획(capture) 단백질(아플리버셉트; Eylea®)이 포함되며, 이는 시력 상실을 제한하는 것으로 나타났다[16-19]. 이러한 치료는 현재 더 침습적인 레이저 응고 또는 광역학적 초기 치료 옵션보다 선호된다.
그러나, 일부 환자는 지속적인 체액 또는 재발성 삼출과 함께 항-VEGF 요법(therapy)에 대한 본질적인 불응성을 나타낸다[20]. 추가로, 진행 단계 질환은 망막 색소 상피(RPE) 손실, 망막하 또는 RPE하 출혈(haemorrhage) 뿐만 아니라 망막하 섬유증(subretinal fibrosis)의 국소 영역을 수반한다. VEGF 경로를 표적화하는 현재의 전략만으로는 이러한 문제를 해결하지 못하므로, 개선의 여지가 많다[20,21]. 
또한, 습성 AMD 환자 1185명에서 항-VEGF 요법의 효과를 조사하는 최근의 다기관 연구에 따르면, 1년차까지 항-VEGF 약물로 치료받은 눈의 약 1/3에서 망막하 흉터가 발생했으며, 2년째 말까지 환자의 약 절반으로 증가했음을 주시했다[21]. 신생혈관 형성의 유도는 염증 세포와 섬유아세포의 모집을 초래할 수 있으며, 손상은 상피 세포의 근섬유아세포로의 전환을 유발한다[22]. 함께, 이러한 세포는 상피-중간엽 전이(EMT)를 생성하고, 여기서 이들은 증식하고 손상 부위를 덮을 수 있다[22]. 만성 염증은 지속적인 흉터를 유발한다.
황반 섬유증(Macular fibrosis)은 항혈관 내피 세포 성장 인자(VEGF) 요법으로도 신생혈관 연령 관련 황반 변성(nAMD)에서 회복 불가능한 시력 상실을 유발한다. 섬유증 병태생리에 관여하는 인자는 결합 조직 성장 인자/세포 통신 네트워크-2(CTGF/CCN2)이다[23]. CTGF는 인간 제대 정맥 내피 세포에서 처음 식별된 38kDa 분비된 시스테인 풍부 단백질이고, 성장 인자의 CCN 계열의 구성원이다[24-27]. CTGF는 N-말단의 인슐린 유사 성장 인자 결합 단백질 도메인(IGFBP, 도메인 I), 폰 빌레브란트 타입(von Willebrand type)-C 반복 서열(vWC, 도메인 II)에 이어, 트롬보스폰딘 타입1 반복(TSP; 도메인 III) 및 마지막으로 시스테인 매듭 모티프(cysteine knot motif)를 갖는 C-말단 도메인 IV에 이르는 4개의 연결된 시스테인 풍부 도메인(I - IV)으로 구성된다[24-27].
CTGF는 섬유아세포 충전된 콜라겐 매트릭스의 수축을 유도하고 콜라겐과 피브로넥틴을 포함한 세포외 매트릭스의 성분을 증가시키는 것으로 나타났다[26,27]. CTGF 생산 및 방출은 형질전환 성장 인자 베타(TGF-β)에 의해 유도되어 담도 섬유증(biliary fibrosis) 및 당뇨병성 망막증(diabetic retinopathy)을 포함하는 상태에서 섬유증을 유발한다[28-30]. 섬유화 촉진 효과를 담당하는 특정 CTGF 수용체는 식별되지 않았지만, CTGF는 인슐린 성장 인자-2 수용체[31], 섬유아세포 성장 인자 수용체-2[32], 표피 성장 인자 수용체[33], 인테그린[34-36] 및 TrkA 수용체[37]와 같은 여러 다른 성장 인자 수용체에 비특이적으로 결합하는 것으로 나타났다. CTGF는 망막 박리 후 망막하 공간에 축적되는 체액 내에서 일관되게 발견된다[38]. 완전한 활성을 위해, 전장 CTGF는 세포외 엔도펩티다제에 의해 절단되어야 한다. 절단은 도메인 III-IV를 함유하는 단백질의 C-말단 부분과 도메인 I-II로 이루어지는 N-말단 부분을 유리시킨다. N-말단 도메인은 CTGF 활성의 억제제로 작용할 수 있다고 생각된다[39].
황반 섬유증의 발병에 보체가 관여한다는 증거가 증가하고 있다. AMD 환자에서 C3a, C3d, Bb 및 C5a의 혈장 수준의 증가가 관찰되었다[40-42]. 특히, 96명의 nAMD 환자를 대상으로 한 연구에서, 보체 C3a, C4a 및 C5a의 혈장 수준은 대조군, 특히 망막하 섬유증이 있는 개체에서 유의하게 더 높은 것으로 나타났다[42]. 또한, 항-VEGF 요법에 부분적으로 반응한 nAMD 환자에서 더 높은 혈장 수준의 C3a가 검출되었다.
또한, 보체 시스템(complement system; CS)은 미생물과 같은 외부 병원체를 방어하는 선천성 면역계의 일부이다[43-45]. 보체 시스템(CS)은 고전적 경로(classical pathway; CP), 렉틴 경로(lectin pathway; LP) 및 대체 경로(alternative pathway; AP)의 세 가지 생화학적 경로로 구성되며, 이들 각각은 뚜렷한 트리거(trigger)를 갖는다. 각 경로는 개별 성분에 의해 활성화될 수 있지만, 상기 경로는 보체 인자 3(C3)이라는 핵심 단백질 성분을 포함하도록 수렴된다. 
AP의 활성은 보체 인자 I(CFI)에 의해 조절될 수 있고[46,47], 이는 C3b 및 C4b의 세포 결합 또는 유체 상을 절단하기 때문에 C3b/C4b 비활성화제라고도 한다. 또 다른 조절 인자는 CD55 또는 붕괴 촉진 인자(DAF)이며[48-50], 이는 보체 매개 용해로부터 세포를 또한 보호하는 막 결합 단백질이다. CD55의 주요 기능은 C3 전환효소를 이들의 성분 단백질로 해리시켜 비활성화하는 것이다[48]. 보체 인자 H의 스플라이스 변이체인 보체 인자 H 관련 단백질-1(CFHR1)이라는 추가의 조절 단백질[51-53]도 C3b 및 인자 B로 구성되는 C3 전환효소의 붕괴를 표적화함으로써 보체 활성화를 감소시키는 데 관여한다. 보체 활성화를 감소시킬 수 있는 또 다른 인자는 막 결합된 막 보조 인자 단백질(Membrane Cofactor Protein) 또는 CD46이라고 불린다. 일단 C3b에 결합하면, 인자 H 및 CFHL-1은 C3b의 인자 B 결합 부위를 차지하고 붕괴를 촉진시키며 새로운 C3 전환효소의 형성을 방지한다. 또한, 인자 H, CFHL-1 및 CD46은 C3b를 iC3b로 절단하는 프로테아제 인자 I에 대한 보조 인자로서 작용할 뿐만 아니라 CD46의 경우 C4b에 대한 보조 인자로 작용한다. CFHR-1은 인자 I 보조 인자 활성의 붕괴 촉진을 매개하지 않는다. 인자 H와 마찬가지로, CFHR-1은 C3b에 결합하고 글리코사미노글리칸에 결합하여 자체 표면을 인식하고 C5 전환효소 및 말단 보체 복합체 형성을 억제한다[53]. 
따라서, AMD, 특히 습성 연령 관련 황반 변성(습성-AMD)과 같은 망막 장애의 치료를 위한 개선된 요법이 절실히 필요하고, 이는 VEGF를 중화시키고 염증 및 망막하 섬유증의 발생을 예방할 수 있다.
본 발명자들은 상당한 발명적 노력을 이용하여, 단일 프로모터의 제어 하에, 즉 바이시스트론성(bicistronic)인 항-VEGF 단백질과 항섬유화 단백질을 인코딩(encoding)하는 새로운 유전자 작제물을 조심스럽게 설계하고 작제했다. 작제물의 프로모터는 항-VEGF 단백질과 항섬유화 단백질이 모두 최대로 발현되어 혈관 누출, 섬유증(fibrosis), 흉터(scarring) 및 염증을 감소시킨다는 것을 보장하기 위해 사용될 수 있다.
따라서, 본 발명의 제1 양태에 따르면, 항-VEGF 단백질을 인코딩하는 제1 코딩 서열(first coding sequence), 및 항섬유화 단백질을 인코딩하는 제2 코딩 서열에 작동 가능하게 연결된 프로모터를 포함하는 유전자 작제물이 제공된다.
실시예에 기재된 바와 같이, 본 발명자들은 놀랍게도 단일 유전자 작제물에서 항-VEGF 단백질과 항섬유화 단백질을 모두 코딩하는 개방 판독 프레임(ORF)을 결합하는 것이 가능하다는 것을 입증했다. 이는 각 성분의 큰 크기를 감안할 때 특히 어려웠다. 단일 프로모터의 제어 하에 단일 발현 카세트에서 생리적으로 유용한 농도로 이러한 큰 단백질 모두를 공동 발현하고, 그 발현 카세트를 AAV 벡터(예: rAAV-2 벡터)에 의해 수용되는 것이 가능할 것이라고 예측할 수 없었기 때문이다. 유리하게는, 본 발명의 작제물을 사용하면, 종래 기술에 기재된 바와 같은 재조합 단백질을 주입할 필요가 없다. 또한, 종래 기술에서는 여전히 눈에 단백질의 정기적인 주입을 수행하는 것이 필요하고, 이는 명백하게 단점인 반면, 본 발명의 작제물은 놀랍게도 장기적인 치료 효과를 달성하기 위해 단일 투여만을 필요로 함으로써 환자에게 상당한 이점을 제공한다.
바람직하게는, 본 발명의 유전자 작제물은 발현 카세트를 포함하며, 이의 하나의 구현예가 도 2에 도시되어 있다. 도 2에서 알 수 있는 바와 같이, 하나의 구현예에서, 상기 작제물은 프로모터, 항-VEGF 단백질을 인코딩하는 제1 뉴클레오티드 서열 및 항섬유화 단백질을 인코딩하는 제2 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 따라서, 바람직하게는, 유전자 작제물 및 발현 카세트는 바이시스트론성으로 지칭될 수 있다.
항-VEGF 단백질 및 항섬유화 단백질을 인코딩하는 제1 및 제2 코딩 서열은 5'에서 3'까지 임의의 순서로 배치될 수 있다. 예를 들어, 하나의 구현예에서, 항-VEGF 단백질에 대한 코딩 서열은 항섬유화 단백질에 대한 코딩 서열의 5'에 배치되며, 바람직하게는 그 사이에 스페이서 서열분석기가 배치된다. 대안적으로, 또 다른 구현예에서, 항섬유화 단백질에 대한 코딩 서열은 항-VEGF 단백질에 대한 코딩 서열의 5'에 배치될 수 있으며, 바람직하게는 그 사이에 스페이서 서열이 배치될 수 있다. 
제1 양태의 유전자 작제물에서의 프로모터는 RNA 중합효소가 제1 및 제2 코딩 서열에 결합하여 전사하도록 유도할 수 있는 임의의 뉴클레오티드 서열일 수 있다. 
프로모터는 구성적 또는 조직 특이적일 수 있다. 
적합한 구성적 프로모터는 사이토메갈로바이러스 프로모터일 수 있다. 사이토메갈로바이러스(CMV) 프로모터를 인코딩하는 뉴클레오티드 서열(508 bp)의 하나의 구현예는 본원에서 다음과 같이 서열번호 1로 지칭된다:
또 다른 구현예에서, 프로모터는 바람직하게는 CMV 프로모터의 절단된 형태이다. CMV 프로모터의 절단된 형태를 인코딩하는 뉴클레오티드 서열(60 bp)의 하나의 구현예는 본원에서 다음과 같이 서열번호 2로 지칭된다:
또 다른 구현예에서, 프로모터는 사이토메갈로바이러스(CMV) 초기 인핸서 요소(early enhancer element)와 닭 베타-액틴 유전자(chicken beta-actin gene; CAG)의 제1 인트론의 융합체(fusion)이다. 사이토메갈로바이러스 초기 인핸서 요소와 닭 베타-액틴 유전자의 제1 인트론을 인코딩하는 뉴클레오티드 서열(583 bp)의 하나의 구현예는 본원에서 다음과 같이 서열번호 3으로 지칭된다:
적합한 조직 특이적 프로모터는 유리체 황반 이영양증(vitelliform macular dystrophy) 단백질-2(VMD2) 프로모터(때때로 베스트로핀-1로 지칭됨)일 수 있다. 유리하게는, 이러한 프로모터는 도입유전자 발현을 RPE 세포로 제한한다. VMD2 프로모터를 인코딩하는 뉴클레오티드 서열(2039 bp)의 하나의 구현예는 본원에서 다음과 같이 서열번호 4로 지칭된다:
추가의 바람직한 구현예에서, 프로모터는 VMD2 프로모터의 절단된 형태이다. VMD2 프로모터의 절단된 형태를 인코딩하는 뉴클레오티드 서열(623 bp)의 하나의 구현예는 본원에서 다음과 같이 서열번호 5로 지칭된다:
또 다른 바람직한 구현예에서, VMD2 프로모터의 절단된 형태를 인코딩하는 뉴클레오티드 서열(462 bp)은 본원에서 다음과 같이 서열번호 6으로 지칭된다:
또 다른 구현예에서, 프로모터는 인간 포스포글리세레이트 키나제-1(PGK) 프로모터이다. 인간 PGK-1 프로모터를 인코딩하는 뉴클레오티드 서열(500 bp)의 하나의 구현예는 본원에서 다음과 같이 서열번호 7로 지칭된다:
또 다른 구현예에서, 프로모터는 진핵 신장 인자 1의 알파 서브유닛을 발현하는 인간 EEF1A1 유전자로부터 유래된 EF1α이다. EF1α 프로모터를 인코딩하는 뉴클레오티드 서열(1182 bp)의 하나의 구현예는 본원에서 다음과 같이 서열번호 8로 지칭된다:
추가의 구현예에서, 프로모터는 큰 인트론이 없는 EF1α이다. EF1α 프로모터를 인코딩하는 뉴클레오티드 서열(230 bp)의 하나의 구현예는 본원에서 다음과 같이 서열번호 9로 지칭된다:
따라서, 바람직하게는 프로모터는 실질적으로 서열번호 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 또는 9에 제시된 바와 같은 핵산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다.
본 발명자들은 항-VEGF 단백질의 서열을 신중하게 고려했으며, 제1 양태의 유전자 작제물에서 제1 코딩 서열에 의해 인코딩될 수 있는 단백질의 몇 가지 바람직한 구현예를 생성했다.
바람직하게는, 항-VEGF 단백질은 VEGF-A, VEGF-B, VEGF-C, VEGF-D 및/또는 태반 성장 인자(placenta growth factor; PIGF)를 포함하는, VEGF의 모든 가용성 형태를 포획할 수 있다. 더욱 바람직하게는, 항-VEGF 단백질은 VEGF-A를 특이적으로 포획한다. 바람직하게는, 본 구현예에서, 항-VEGF 단백질은 VEGF-121, VEGF-145, VEGF-165, VEGF-183, VEGF-189 및/또는 VEGF-206을 포함하는, VEGF-A의 모든 이소형을 포획한다.
바람직하게는, 항-VEGF 단백질은 항-VEGF 항체, 또는 이의 항원 결합 단편이다.
이의 항원-결합 단편은 VEGF와 결합하는 VH, VL, Fd, Fv, Fab, Fab', scFv, F (ab')2 및 Fc 단편으로 이루어진 그룹으로부터 선택된 임의의 단편을 포함하거나 이로 구성될 수 있다. 항원 결합 단편은 VEGF 에피토프에 결합하는 상보성 결정 영역(complementarity Determining Region; CDR)을 포함할 수 있다.
하나의 바람직한 구현예에서, 항-VEGF 단백질은 단일 쇄 가변 단편(single chain variable fragment; SCVF)이다. 즉, 본 바람직한 구현예에서, 항-VEGF 단백질은 항-VEGF 단일 쇄 가변 단편이다.
따라서, 제1 구현예에서, 제1 코딩 서열은 VEGF-A의 가장 일반적인 이소형을 중화시킬 수 있는 항-VEGF 단일 쇄 가변 단편(SCVF-1)을 인코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 바람직하게는, SCVF-1은 본원에서 다음과 같이 서열번호 10으로 지칭되는 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
바람직하게는, 본 구현예에서, 제1 코딩 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 11로 지칭되는 뉴클레오티드 서열(756 bp) 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
제2의 바람직한 구현예에서, 제1 코딩 서열은 VEGF-A의 가장 일반적인 이소형을 중화시킬 수 있는 항-VEGF 단일 쇄 가변 단편(SCVF-2)을 인코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 바람직하게는, SCVF-2는 본원에서 다음과 같이 서열번호 12로 지칭되는 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
바람직하게는, 본 제2 구현예에서, 제1 코딩 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 13으로 지칭되는 뉴클레오티드 서열(756 bp), 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
제3의 바람직한 구현예에서, 제1 코딩 서열은 VEGF-A의 가장 일반적인 이소형을 중화시킬 수 있는 항-VEGF 단일 쇄 가변 단편(SCFV-3)을 인코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 바람직하게는, SCFV-3은 본원에서 다음과 같이 서열번호 14로 지칭되는 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
바람직하게는, 본 제3의 바람직한 구현예에서, 제1 코딩 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 15로 지칭되는 뉴클레오티드 서열(765 bp), 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
제4의 바람직한 구현예에서, 제1 코딩 서열은 VEGF-A의 가장 일반적인 이소형을 중화시킬 수 있는 항-VEGF 단일 쇄 가변 단편(SCVF-4)을 인코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 바람직하게는, SCVF-4는 본원에서 다음과 같이 서열번호 16으로 지칭되는 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:  
바람직하게는, 본 제4 구현예에서, 제1 코딩 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 17로 지칭되는 뉴클레오티드 서열(747 bp), 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
제5의 바람직한 구현예에서, 제1 코딩 서열은 VEGF의 모든 가용성 형태를 중화시킬 수 있는 단백질인 항-VEGF 단백질(VEGF 포획 단백질-1)을 인코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 바람직하게는, VEGF 포획 단백질-1은 본원에서 아래에 제시된 바와 같이 서열번호 18로 지칭되는 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
바람직하게는, 본 제5 구현예에서, 제1 코딩 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 19로 지칭되는 뉴클레오티드 서열(1293 bp), 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
제6의 바람직한 구현예에서, 제1 코딩 서열은 VEGF의 모든 가용성 형태를 중화시킬 수 있는 단백질인 항-VEGF 단백질(VEGF 포획 단백질-2)을 인코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 유리하게는, 그리고 바람직하게는, VEGF 포획 단백질-2는 인간 IgG-Fc-γ 수용체 I, II 및 III에 대한 결합에 대해 낮은 친화도를 갖는다. 바람직하게는, VEGF 포획 단백질-2는 본원에서 아래에 제시된 바와 같이 서열번호 20으로 지칭되는 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:  
바람직하게는, 본 제6 구현예에서, 제1 코딩 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 21로 지칭되는 뉴클레오티드 서열(1293 bp), 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
따라서, 바람직한 구현예에서, 제1 코딩 서열은 실질적으로 서열번호 11, 13, 15, 17, 19 또는 21 중 어느 하나에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다. 바람직하게는, 항-VEGF 단백질은 실질적으로 서열번호 10, 12, 14, 16, 18 또는 20에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다.
제2 코딩 서열은 항섬유화 단백질을 인코딩한다는 것이 인식될 것이다.
하나의 구현예에서, 항섬유화 단백질은 항-보체 단백질이다. 바람직하게는, 항-보체 단백질은 보체 활성화를 중화시키거나 약화시킬 수 있다. 더욱 더 바람직하게는, 항-보체 단백질은 보체 시스템의 대체 경로(AP)를 표적화할 수 있다. 바람직하게는, 항-보체 단백질은 보체 시스템의 고전적 경로(CP) 및/또는 렉틴 경로(LP)에 최소한으로 영향을 미친다. 바람직하게는, 항-보체 단백질은 보체 시스템의 고전적 경로(CP) 및/또는 렉틴 경로(LP)를 표적화하지 않는다.
바람직하게는, 항-보체 단백질은 보체 인자 C3b 및/또는 Bb를 중화시킬 수 있다. 따라서, 본 구현예에서, 항섬유화 단백질은 항-C3b 또는 항-Bb 항체, 또는 이의 항원 결합 단편이다. 
이의 항원-결합 단편은 C3b 및/또는 Bb에 결합하는 VH, VL, Fd, Fv, Fab, Fab', scFv, F (ab')2 및 Fc 단편으로 이루어진 그룹으로부터 선택된 임의의 단편을 포함하거나 이로 구성될 수 있다.  항원 결합 단편은 C3b 및/또는 Bb 에피토프에 결합하는 상보성 결정 영역(CDR)을 포함할 수 있다.
더욱 더 바람직하게는, 항-보체 단백질은 단일 쇄 가변 단편(SCVF)이다. 즉, 본 바람직한 구현예에서, 항-보체 단백질은 항-C3b 단일 쇄 가변 단편 또는 항-Bb 단일 쇄 가변 단편이다.
대안적으로, 또 다른 바람직한 구현예에서, 항-보체 단백질은 CD55(붕괴 촉진 인자; DAF)이다. 바람직하게는, 항-보체 단백질은 비-막 부착된 CD55이다. CD55(DAF)는 보체 단백질 복합체를 불안정하게 하여 이러한 생화학적 경로의 활성을 감소시킨다.
또 다른 바람직한 구현예에서, 항-보체 단백질은 보체 인자 H 관련 단백질-1(CFHR1)이다. 바람직하게는, CFHR1은 보체 시스템 활성 캐스케이드를 약화시킨다.
또 다른 바람직한 구현예에서, 항-보체 단백질은 CD46이다. 바람직하게는, 본 구현예에서, 항-보체 단백질은 가용성(비막 관련된) 인간 보체 조절 단백질 CD46(sCD46)이다.
또 다른 바람직한 구현예에서, 항-보체 단백질은 보체 인자 H-유사 단백질 1(CFHL1)이고, 이는 조절 도메인을 포함하고 중심 보체 성분 C3 및 그 이상의 수준에서 보체 활성화를 억제하는 인자 H의 스플라이스 변이체이다.
하나의 바람직한 구현예에서, 항-C3b 단일 쇄 가변 단편의 아미노산 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 22, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
바람직한 구현예에서, 항-C3b 단일 쇄 가변 단편을 인코딩하는 핵산 서열(726 bp)은 본원에서 다음과 같이 서열번호 23, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
또 다른 구현예에서, 항-Bb 단일 쇄 가변 단편의 아미노산 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 24, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
바람직한 구현예에서, 항-Bb 단일 쇄 가변 단편을 인코딩하는 핵산 서열(750 bp)은 본원에서 다음과 같이 서열번호 25, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
또 다른 구현예에서, CD55의 가용성 (비막 결합) 형태(sCD55, 또한 때때로 붕괴 촉진 인자; DAF로서 지칭됨)의 아미노산 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 26, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
바람직한 구현예에서, CD55의 가용성 (비막 결합) 형태(sCD55)(또한, 때때로 붕괴 촉진 인자; DAF로서 공지됨)를 인코딩하는 960개 핵산 서열(960 bp)은 본원에서 다음과 같이 서열번호 27, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
추가의 구현예에서, 인간 보체 인자 H 관련 단백질-1(CFHR1)의 아미노산 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 28, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
바람직한 구현예에서, 인간 보체 인자 H 관련 단백질-1(CFHR1)을 인코딩하는 핵산 서열(936 bp)은 본원에서 다음과 같이 서열번호 29, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
또 다른 구현예에서, 인간 보체 인자 H 관련 단백질-1(CFHR1)을 인코딩하는 코돈 최적화된 핵산 서열(936 bp)은 본원에서 다음과 같이 서열번호 30, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
추가의 구현예에서, CD46의 가용성 (비막 결합) 형태(sCD46)의 아미노산 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 31, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
바람직한 구현예에서, CD46의 가용성 (비막 결합) 형태(sCD46)를 인코딩하는 핵산 서열(930 bp)은 본원에서 다음과 같이 서열번호 32, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
바람직한 구현예에서, CFHL1의 아미노산 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 97, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
바람직한 구현예에서, CFHL1을 인코딩하는 핵산 서열(1278 bp)은 본원에서 다음과 같이 서열번호 98, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
대안적으로, 또 다른 구현예에서, 항섬유화 단백질은 결합 조직 성장 인자(CTGF)를 중화시킬 수 있다. 바람직하게는, 항섬유화 단백질은 항-결합 조직 성장 인자(항-CTGF) 항체, 또는 이의 항원 결합 단편이다. 바람직하게는, 항-CTGF 항체, 또는 이의 항원 결합 단편은 결합 조직 성장 인자(CTGF)를 중화시킬 수 있다.
이의 항원-결합 단편은 CTGF와 결합하는 VH, VL, Fd, Fv, Fab, Fab', scFv, F (ab')2 및 Fc 단편으로 이루어진 그룹으로부터 선택된 임의의 단편을 포함하거나 이로 구성될 수 있다. 항원 결합 단편은 CTGF 에피토프에 결합하는 상보성 결정 영역(CDR)을 포함할 수 있다.
가장 바람직하게는, 항-CTGF 항체는 항-CTGF 단일 쇄 가변 단편(항-CTGF SCVF)이다.
CTGF에 대한 특정 수용체나 결합 부위가 아직 식별되지 않았기 때문에, 본 발명자들은 전체 CTGF 서열을 중화시킬 수 있는 단일 쇄 가변 단편(SCVF)(항-CTGF SCVF-1) 또는 C-말단 CTGF 단편을 중화시킬 수 있는 SCVF(항-CTGF SCVF-2)를 활용했다.
본 발명자들은 CTGF를 중화시킬 수 있는 SCVF의 서열을 신중하게 고려했으며, 제1 양태의 유전자 작제물에서 제2 코딩 서열에 의해 인코딩될 수 있는 단백질의 바람직한 구현예를 생성했다.
하나의 바람직한 구현예에서, 항-CTGF 단일 쇄 가변 단편(항-CTGF SCVF-1)의 아미노산 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 33, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
바람직한 구현예에서, 항-CTGF SCVF-1을 인코딩하는 핵산 서열(747 bp)은 본원에서 다음과 같이 서열번호 34, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
또 다른 바람직한 구현예에서, 항-CTGF 단일 쇄 가변 단편(항-CTGF SCVF-2)의 아미노산 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 35, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
바람직한 구현예에서, 항-CTGF SCVF-2를 인코딩하는 핵산 서열(723 bp)은 본원에서 다음과 같이 서열번호 36, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭한다:
따라서, 바람직한 구현예에서, 제2 코딩 서열은 실질적으로 서열번호 23, 25, 27, 29, 30, 32, 34, 36 또는 98 중 어느 하나에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다. 바람직하게는, 항-보체 단백질은 실질적으로 서열번호 22, 24, 26, 28, 31, 33, 35 또는 97에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다.
과학 문헌에 제시된 두 개 이상의 유전자를 발현하는 많은 유전자 요법 작제물은 (i) 두 개 이상의 유전자의 발현을 개별적으로 유도하는 이중 프로모터 또는 (ii) 재조합 바이러스 벡터 내에서 단일 프로모터에 의해 구동되는 단일 전사체로부터 유전자의 번역을 가능하게 하는 뇌심근염 바이러스(encephalomyocarditis virus; EMCV)로부터의 것과 같은 유전자를 연결하는 내부 리보솜 진입 부위(internal ribosome entry site; IRES)를 갖는다. 그러나, IRES 의존적 번역의 효율은 상이한 세포와 조직에서 크게 다르며, IRES 의존적 번역은 캡 의존적 번역보다 현저히 낮을 수 있고, 이는 발현 카세트의 위치 하나의 유전자와 비교할 때 IRES의 다운스트림 유전자의 발현이 종종 더 낮다는 것을 의미한다. 더욱이, rAAV 벡터의 제한된 코딩 용량(일반적으로 <5kb)은, 이중 프로모터 및/또는 IRES 링커(EMCV IRES의 길이가 553 뉴클레오티드임)를 사용하는, 항-VEGF 단백질 및 항섬유화 단백질 중 하나의 코딩 서열과 같은, 대형 유전자/ORF의 혼입을 방지한다.
따라서, 바람직한 구현예에서, 유전자 작제물은 제1 코딩 서열과 제2 코딩 서열 사이에 배치된 스페이서 서열을 포함한다. 예를 들어, 스페이서 서열(v2A)이 제1 코딩 서열과 제2 코딩 서열 사이에 배치되어 있는 도 3을 참조한다. 이러한 스페이서 서열은 항-VEGF 단백질과 항섬유화 단백질을 별개의 분자로 생산하도록 구성된 펩티드 스페이서를 인코딩한다. 이는 스페이서가 선형 리보솜 서열 전사를 스키핑하여 별개의 분자 또는 펩티드를 생산하도록 구성되었기 때문에 가능하다. 별개의 분자가 활성인 것으로 인식될 것이다. 
바람직하게는, 스페이서 서열은 바이러스 펩티드 스페이서 서열, 가장 바람직하게는 바이러스-2A 펩티드 스페이서 서열을 포함하고 인코딩한다. 하나의 구현예에서, 이러한 바이러스-2A 펩티드 스페이서 서열은 F2A, E2A, T2A 또는 P2A 서열을 포함한다. 
바람직하게는, 바이러스-2A 펩티드 서열은 제1 코딩 서열을 제2 코딩 서열에 연결한다. 이는 작제물이 다양한 벡터에서 발현과 함께 발생하는 크기 제한을 극복할 수 있도록 하고, 제1 양태의 작제물에 의해 인코딩된 모든 펩티드의 발현이 단일 프로모터의 제어하에 단일 mRNA 전사체로서 일어날 수 있도록 한다. 
따라서, 하나의 구현예에서, 항-VEGF 단백질, 바이러스-2A 펩티드 및 항섬유화 단백질의 서열을 인코딩하는 단일 mRNA 전사체의 전사 후, 번역 스키핑(translational skipping)이 바이러스-2A 펩티드의 말단 글리신-프롤린 사이의 바이러스-2A 펩티드 서열에서 발생할 수 있다. 이러한 번역 스키핑으로 인해 두 개의 단백질, 즉 항-VEGF 단백질 및 항섬유화 단백질이 생성된다(도 3 참조).
본 발명자들은 스페이서 서열의 네 가지 구현예를 생성했다. 본원에 기재된 모든 구현예에 공통적인 펩티드 스페이서 서열의 하나의 중요한 섹션은 C-말단이다.
하나의 구현예에서, 펩티드 스페이서 서열은 P2A이다. 바람직하게는, P2A 펩티드 스페이서 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 37로 지칭되는 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다:
바람직하게는, 펩티드 스페이서 서열의 분해 또는 절단 부위는 서열번호 37에서 말단 글리신과 말단 프롤린 사이에 배치된다.
본 제1 구현예에서, P2A 펩티드 스페이서 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 38로 지칭되는 뉴클레오티드 서열(57 bp), 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
제2 구현예에서, 펩티드 스페이서 서열은 E2A이다. 바람직하게는, E2A 펩티드 스페이서 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 39로 지칭되는 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다:
바람직하게는, 펩티드 스페이서 서열의 분해 또는 절단 부위는 서열번호 39에서 말단 글리신과 말단 프롤린 사이에 배치된다.
본 제2 구현예에서, E2A 펩티드 스페이서 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 40으로 지칭되는 뉴클레오티드 서열(60 bp), 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
제3 구현예에서, 펩티드 스페이서 서열은 T2A이다. 바람직하게는, T2A 펩티드 스페이서 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 41로 지칭되는 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다:
바람직하게는, 펩티드 스페이서 서열의 분해 또는 절단 부위는 서열번호 41에서 말단 글리신과 말단 프롤린 사이에 배치된다.
이 제3 구현예에서, T2A 펩티드 스페이서 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 42로 지칭되는 뉴클레오티드 서열(54 bp), 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
제4의 바람직한 구현예에서, 펩티드 스페이서 서열은 F2A이다. 바람직하게는, F2A 펩티드 스페이서 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 43으로 지칭되는 아미노산 서열 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다:
바람직하게는, 펩티드 스페이서 서열의 분해 또는 절단 부위는 서열번호 43에서 말단 글리신과 말단 프롤린 사이에 배치된다.
본 제4 구현예에서, F2A 펩티드 스페이서 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 44로 지칭되는 뉴클레오티드 서열(66 bp), 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
따라서, 하나의 바람직한 구현예에서, 펩티드 스페이서 서열은 실질적으로 서열번호 38, 40, 42 또는 44 중 어느 하나에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다. 바람직하게는, 펩티드 스페이서 서열은 실질적으로 서열번호 37, 39, 41 또는 43에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다.
번역 스키핑 후, 바이러스-2A 펩티드 서열은 업스트림 단백질(예: 항-VEGF 단백질)의 C-말단에 융합된 상태로 유지되는 반면, 프롤린은 다운스트림 단백질(예: 항섬유화 단백질)의 N-말단에 융합된 상태로 유지된다. 이는 면역원성 위험을 초래하고, 잠재적으로 세포내 신호전달 능력을 방해할 수 있다. 따라서, 본 발명자들은 바이러스-2A 펩티드 서열의 바로 업스트림에 효소 절단 코딩 서열을 도입하여 인코딩된 단백질 모두(즉, 항-VEGF 단백질 및 항섬유화 단백질)로부터 잔류하는 바이러스-2A 펩티드 서열이 제거되도록 했다. 효소 절단 부위의 도입은 효소 퓨린의 경우 분비된 단백질의 방출 전에 세포내로, 또는 매트릭스 메탈로프로테인-2(MMP-2) 또는 레닌(renin)의 효소 인식 부위의 경우 단백질이 표적(망막) 세포로부터 분비된 직후에 바이러스-2A 펩티드를 제거하는 효과를 갖는다. MMP-2 및 퓨린은 뮐러 신경교 세포(Muller glial cell)로부터 분비되는 것으로 공지된 효소이고, 따라서 분비 후 신경 망막 내의 항-VEGF 단백질과 항섬유화 단백질로부터 바이러스-2A 펩티드 서열을 절단 및 제거하는 데 이용 가능하다.
따라서, 하나의 구현예에서, 작제물은 바이러스-2A 제거 서열을 추가로 포함한다. 바람직하게는, 바이러스-2A 제거 서열은 바이러스-2A 서열의 5'에 배치된다. 바람직하게는, 바이러스-2A 제거 서열은 트리펩티드 글리신-세린-글리신 서열(G-S-G)을 포함하는 링커 서열(linker sequence)에 의해 바이러스-2A 서열로부터 분리된다. 
본 발명자들은 단백질의 C-말단으로부터 바이러스-2A 펩티드 서열을 효소적으로 제거하기 위해 퓨린 인식 서열(furin recognition sequence)을 도입했다. 따라서, 하나의 구현예에서, 바이러스-2A 제거 서열은 퓨린 인식 서열이다.
현재, 퓨린 인식 서열은 일반적으로 위치 2에 임의의 비염기성 아미노산과 함께 3개 또는 4개의 염기성 아미노산(아르기닌 또는 리신)을 포함하는 것으로 인식되고, 마지막 염기성 아미노산 다음에 효소 퓨린에 의해 절단된다. 그러나, 다양한 플라스미드 작제물을 사용하여, 본 발명자들은 이러한 염기성 퓨린 인식 서열이 항상 효소 활성 및 바이러스-2A 서열의 분리를 초래하는 것은 아니라는 것을 결정했다. 이와 같이, 본 발명자들은 본 발명의 유전자 작제물에 사용하기 위한 바람직한 퓨린 인식 서열을 생성했다.
따라서, 바람직한 구현예에서, 유전자 작제물은 본원에서 다음과 같이 서열번호 45로 지칭되는 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩하는 바이러스-2A 제거 서열을 포함하며, 여기서 B = 염기성 아미노산, X = 친수성 아미노산 및 S = 세린이다:
바람직하게는, 친수성 아미노산(X)은 세린(S) 또는 트레오닌(T) 중 하나이다. 따라서, 하나의 구현예에서, 바이러스-2A 제거 서열은 실질적으로 서열번호 45에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다.
하나의 구현예에서, 바이러스-2A 제거 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 46으로 지칭되는 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다:
본 제1 구현예에서, 바이러스-2A 제거 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 47로 지칭되는 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
제2 구현예에서, 바이러스-2A 제거 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 48로 지칭되는 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다:
본 제2 구현예에서, 바이러스-2A 제거 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 49로 지칭되는 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
제3 구현예에서, 바이러스-2A 제거 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 50으로 지칭되는 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다:
본 제3 구현예에서, 바이러스-2A 제거 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 51로 지칭되는 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
따라서, 하나의 구현예에서, 바이러스-2A 제거 서열은 실질적으로 서열번호 47, 49 또는 51에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다. 바람직하게는, 바이러스-2A 제거 서열은 실질적으로 서열번호 46, 48 또는 50에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다.
대안적으로, 또 다른 구현예에서, 바이러스-2A 제거 서열은 젤라티나제 MMP-2 인식 서열이다. 바람직하게는, 이 구현예에서, 바이러스-2A 제거 서열은 아미노산 서열 GPQGIAGQ[서열번호 52], GPLGIAGA[서열번호 53] 또는 GPQGLLGQ[서열번호 54], 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다. 절단은 바람직하게는 제2 글리신 잔기 이후에 발생한다. 
본 발명자들은 본원에서 서열번호 55로 지칭되는 바람직한 아미노산 서열을 생성했으며, 이는 젤라티나아제 MMP-2 인식 서열 및 트리펩티드 GSG 링커 서열을 포함한다.
따라서, 하나의 구현예에서, 바이러스-2A 제거 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 55로 지칭되는 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다:
본 구현예에서, 바이러스-2A 제거 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 56으로 지칭되는 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
따라서, 하나의 구현예에서, 바이러스-2A 제거 서열은 실질적으로 서열번호 56에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다. 바람직하게는, 바이러스-2A 제거 서열은 실질적으로 서열번호 55에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다.
대안적으로, 또 다른 구현예에서, 바이러스-2A 제거 서열은 레닌 인식 서열이다. 바람직하게는, 이 구현예에서, 바이러스-2A 제거 서열은 아미노산 서열 HPFHLVYS[서열번호 57] 또는 HPFHLLVYS[서열번호 58], 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다. 절단은 바람직하게는 류신 잔기(들) 다음에 발생한다. 
본 발명자들은 본원에서 서열번호 59로 지칭되는 바람직한 아미노산 서열을 생성했고, 이는 레닌 인식 서열 및 트리펩티드 GSG 링커 서열을 포함한다.
따라서, 하나의 구현예에서, 바이러스-2A 제거 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 59로 지칭되는 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다:
본 구현예에서, 바이러스-2A 제거 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 60으로 지칭되는 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
따라서, 하나의 구현예에서, 바이러스-2A 제거 서열은 실질적으로 서열번호 60에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다. 바람직하게는, 바이러스-2A 제거 서열은 실질적으로 서열번호 59에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다.
도 2에 도시된 바와 같이, 발현 카세트는 간염 바이러스 전사 후 조절 요소(WPRE)를 인코딩하는 서열, 폴리-A 테일(poly-A tail)을 인코딩하는 서열 및 좌측 및 우측 역말단 반복 서열(ITR)을 추가로 포함한다. 바람직하게는, 유전자 작제물은 우드척 간염 바이러스(Woodchuck Hepatitis Virus; WHP) 전사 후 조절 요소(WPRE)를 인코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하며, 이는 도입유전자, 즉 항-VEGF 단백질 및 항섬유화 단백질의 발현을 향상시킨다. 바람직하게는, WPRE 코딩 서열은 도입유전자 코딩 서열의 3'에 배치된다.
우드척 간염 바이러스 전사 후 조절 요소(WPRE)의 하나의 구현예는 감마-알파-베타 요소를 포함하여 592 뉴클레오티드 길이이며, 본원에서 다음과 같이 서열번호 61로 지칭된다:
바람직하게는, WPRE는 실질적으로 서열번호 61에 제시된 바와 같은 핵산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다. 
그러나, 바람직한 구현예에서, β-요소의 결실로 인해 길이가 247 뉴클레오티드이고, 본원에서 다음과 같이 서열번호 62로 지칭되는 절단된 WPRE가 사용된다:
따라서, 바람직하게는, 절단된 WPRE는 실질적으로 서열번호 62에 제시된 바와 같은 핵산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다.
유리하게는, 작제물에 사용된 절단된 WPRE 서열은 도입유전자 발현에 부정적인 영향을 미치지 않으면서 총 약 300개의 뉴클레오티드를 절약한다. 따라서, 바람직하게는, WPRE는 실질적으로 서열번호 62에 제시된 바와 같은 핵산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다. 
바람직하게는, 유전자 작제물은 폴리-A 테일을 인코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 바람직하게는, 폴리-A 테일 코딩 서열은 도입유전자 코딩 서열의 3', 바람직하게는 WPRE 코딩 서열의 3'에 배치된다. 폴리A 테일은 mRNA의 핵 수송, 번역 및 안정성에 중요하다. 테일은 시간이 지남에 따라 짧아지며, 충분히 짧아지면 mRNA는 효소적으로 분해된다.  
바람직하게는, 폴리-A 테일은 시미안 바이러스-40 폴리-A 224 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 폴리-A 테일의 하나의 구현예는 본원에서 다음과 같이 서열번호 63으로 지칭된다:
또 다른 구현예에서, 폴리-A 테일은 169개의 뉴클레오티드 서열 폴리A 성분을 포함하며, 이는 본원에서 다음과 같이 서열번호 64로 지칭된다:
추가의 구현예에서, 폴리-A 테일은 소 성장 호르몬 폴리-A 225 뉴클레오티드 서열을 포함하며, 이는 본원에서 다음과 같이 서열번호 99로 지칭된다:
따라서, 바람직하게는, 폴리-A 테일은 실질적으로 서열번호 63, 64 또는 99에 제시된 바와 같은 핵산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다. 
바람직하게는, 유전자 작제물은 좌측 및/또는 우측 역말단 반복 서열(ITR)을 포함한다. 바람직하게는, 각 ITR은 작제물의 5' 및/또는 3' 말단에 배치된다. ITR은 바이러스(예: AAV 또는 렌티바이러스) 혈청형(serotype)에 특이적일 수 있으며, 2차 구조에서 헤어핀 루프를 형성하는 한 임의의 서열일 수 있다.
ITR의 하나의 구현예의 DNA 서열(상업적으로 이용 가능한 재조합 AAV 게놈 플라스미드로부터 취한 좌측 ITR 서열)은 본원에서 다음과 같이 서열번호 65로 표시된다:
ITR의 또 다른 구현예의 DNA 서열(상업적으로 이용 가능한 재조합 AAV 게놈 플라스미드로부터 취한 우측 ITR 서열)은 본원에서 다음과 같이 서열번호 66으로 표시된다:
바람직하게는, 좌측 및/또는 우측 역말단 반복체(Repeats)는 실질적으로 서열번호 65 또는 66에 제시된 바와 같은 핵산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다.
최근에, 프로모터와 유전자 사이(프로모터의 3' 말단 및 유전자의 5' 말단 옆)에 위치한 비-코딩 인트론은 mRNA 축적을 통해 특정 게놈 서열에서 유전자 발현을 촉진할 수 있음이 발견되었다[51,52]. 따라서, 바이러스 벡터의 유전자 작제물에 인트론을 포함하면 구성적 또는 조절된 프로모터와 함께 사용될 때 더 큰 도입유전자 발현 및 성숙한 단백질의 후속 생성을 촉진할 수 있다. 
따라서, 하나의 구현예에서, 유전자 작제물은 비-코딩 인트론을 포함한다. 바람직하게는, 비-코딩 인트론은 프로모터와 제1 코딩 서열 사이에 위치한다. 즉, 비-코딩 인트론은 프로모터의 3' 및 제1 코딩 서열의 5'에 배치된다.
하나의 구현예에서, 비-코딩 인트론은 본원에서 다음과 같이 서열번호 67로 지칭되는 마우스의 미세한 바이러스(MVM) 작은(121 bp) 인트론[53]이다:
또 다른 구현예에서, 비-코딩 인트론은 인간 β-글로빈 유전자의 제1 인트론의 5'-공여체 부위 및 면역글로불린 유전자 중쇄 가변 영역의 인트론으로부터의 분지 및 3'-수용체 부위로부터의 서열(133 bp)로서, 본원에서 다음과 같이 서열번호 68로 지칭된다:
또 다른 구현예에서, 비-코딩 인트론은 토끼 β-글로불린 유전자 1의 스플라이스 수용체의 5' 및 3' 뉴클레오티드 성분의 융합체(210 bp)로서, 본원에서 다음과 같이 서열번호 69로 지칭된다:
따라서, 바람직하게는 비-코딩 인트론은 실질적으로 서열번호 67, 68 또는 69에 제시된 바와 같은 핵산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다.
표적 세포로부터의 항-VEGF 단백질 및 항섬유화 단백질의 유전자 작제물, 세포내 트래픽킹 및 분비에 의해 인코딩된 폴리펩티드의 올바른 중첩을 허용하기 위해, 이러한 단백질의 코딩 서열은 공지된 분비된 인간 단백질의 서열로부터 유래된 새로운 N-말단 최소 신호 펩티드 코딩 서열이 선행된다. 분비 신호 펩티드는 메티오닌 개시제 아미노산, 일련의 2개 이상의 염기성 아미노산(아르기닌 또는 리신)에 이어, 일련의 소수성 아미노산(류신, 이소류신, 발린 또는 페닐알라닌) 및 마지막으로 최종 성숙한 분비 단백질로부터 신호 펩티드의 절단을 허용하는 절단 서열로 구성된다. 
따라서, 하나의 구현예에서, 유전자 작제물은 신호 펩티드 코딩 서열을 포함한다. 유리하게는, 본 발명자들에 의해 생성된 이러한 새로운 신호 펩티드 코딩 서열은 세포 내에서 분비된 단백질의 세포내 절단 및 트래픽킹을 최적화한다. 바람직하게는, 유전자 작제물은 제1 코딩 서열 앞에 배치된 제1 신호 펩티드 코딩 서열, 및 제2 코딩 서열 앞에 배치된 제2 신호 펩티드 코딩 서열을 포함한다. 바람직하게는, 제1 신호 펩티드 코딩 서열 및 제2 신호 펩티드 코딩 서열은 각각 제1 코딩 서열 및 제2 코딩 서열의 5'에 배치된다.
하나의 구현예에서, 신호 펩티드 코딩 서열은 본원에서 아래에 제시된 바와 같이 본원에서 서열번호 70으로 지칭되는 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다:
바람직하게는, 본 구현예에서, 신호 펩티드 코딩 서열은 인간 트립신으로부터 유도되고, 바람직하게는 본원에서 아래에 제시된 바와 같이 서열번호 71로 지칭되는 뉴클레오티드 서열(57 bp), 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
대안적인 구현예에서, 신호 펩티드 코딩 서열은 표적 세포로부터의 분비를 향상시키기 위해 변형된다. 이 구현예에서, 신호 펩티드 코딩 서열은 본원에서 아래에 제시된 바와 같이 서열번호 72로 지칭되는 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다:  
바람직하게는, 본 구현예에서, 신호 펩티드 코딩 서열은 본원에서 아래에 제시된 바와 같이 서열번호 73으로 지칭되는 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
또 다른 구현예에서, 신호 펩티드 코딩 서열은 본원에서 아래에 제시된 바와 같이 서열번호 74로 지칭되는 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다:  
바람직하게는, 본 구현예에서, 신호 펩티드 코딩 서열은 본원에서 아래에 제시된 바와 같이 서열번호 75로 지칭되는 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:  
또 다른 구현예에서, 신호 펩티드 코딩 서열은 본원에서 아래에 제시된 바와 같이 서열번호 76으로 지칭되는 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다:  
바람직하게는, 본 구현예에서, 신호 펩티드 코딩 서열은 본원에서 아래에 제시된 바와 같이 서열번호 77로 지칭되는 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:  
또 다른 구현예에서, 신호 펩티드 코딩 서열은 본원에서 아래에 제시된 바와 같이 서열번호 78로 지칭되는 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다:
바람직하게는, 본 구현예에서, 신호 펩티드 코딩 서열은 본원에서 아래에 제시된 바와 같이 서열번호 79로 지칭되는 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:  
따라서, 바람직하게는, 신호 펩티드 코딩 서열은 실질적으로 서열번호 71, 73, 75, 77 또는 79 중 어느 하나에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다. 바람직하게는, 신호 펩티드 코딩 서열은 실질적으로 서열번호 70, 72, 74, 76 또는 78에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다.
바람직한 구현예에서, 유전자 작제물은, 이 지정된 순서대로, 5' 프로모터; 항-VEGF 단백질을 인코딩하는 제1 코딩 서열; 및 항섬유화 단백질을 인코딩하는 3' 제2 코딩 서열을 포함할 수 있다. 5' 및 3'의 사용은 특징이 업스트림 또는 다운스트림임을 나타내며, 특징이 반드시 말단 특징임을 나타내기 위한 것은 아님을 나타낸다. 또한, 당업자는 항-VEGF 단백질 및 항섬유화 단백질을 인코딩하는 제1 및 제2 코딩 서열이 임의의 5' 내지 3' 순서로 배치될 수 있음을 이해할 것이다.
특정 구현예에서, 유전자 작제물은 이 지정된 순서로 5' 프로모터; 항-VEGF 단백질을 인코딩하는 제1 코딩 서열; 스페이서 서열; 및 항섬유화 단백질을 인코딩하는 3' 제2 코딩 서열을 포함할 수 있다.
특정 구현예에서, 유전자 작제물은 이 지정된 순서로 5' 프로모터; 항-VEGF 단백질을 인코딩하는 제1 코딩 서열; 바이러스-2A 제거 서열; 스페이서 서열; 및 항섬유화 단백질을 인코딩하는 3' 제2 코딩 서열을 포함할 수 있다.
특정 구현예에서, 유전자 작제물은 이 지정된 순서로 5' ITR; 프로모터; 항-VEGF 단백질을 인코딩하는 제1 코딩 서열; 바이러스-2A 제거 서열; 스페이서 서열; 항섬유화 단백질을 인코딩하는 제2 코딩 서열; WPRE를 인코딩하는 서열; 폴리 A 테일을 인코딩하는 서열; 및 3' ITR을 포함할 수 있다.
특정 구현예에서, 유전자 작제물은 이 지정된 순서로 5' ITR; 프로모터; 비-코딩 인트론; 항-VEGF 단백질을 인코딩하는 제1 코딩 서열; 바이러스-2A 제거 서열; 스페이서 서열; 항섬유화 단백질을 인코딩하는 제2 코딩 서열; WPRE를 인코딩하는 서열; 폴리 A 테일을 인코딩하는 서열; 및 3' ITR을 포함할 수 있다.
특정 구현예에서, 유전자 작제물은 이 지정된 순서로 5' ITR; 프로모터; 비-코딩 인트론; 제1 신호 펩티드 코딩 서열; 항-VEGF 단백질을 인코딩하는 제1 코딩 서열; 바이러스-2A 제거 서열; 스페이서 서열; 제2 신호 펩티드 코딩 서열; 항섬유화 단백질을 인코딩하는 제2 코딩 서열; WPRE를 인코딩하는 서열; 폴리 A 테일을 인코딩하는 서열; 및 3' ITR을 포함할 수 있다.
전술한 바로부터, 당업자는 제1 양태의 작제물의 구현예의 뉴클레오티드 서열뿐만 아니라 인코딩된 도입유전자의 아미노산 서열을 이해할 것이다. 그러나, 의심의 여지를 피하기 위해, 하나의 구현예에서, [VEGF 포획 단백질-2-퓨린-P2A-항-CTGF SCVF-1]의 아미노산 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 80으로 지칭된다:
바람직하게는, 본 구현예에서, 작제물은 2241 뉴클레오티드 서열(플라스미드 IKC153P 내에 함유됨)을 포함하고, 이는 본원에서 다음과 같이 서열번호 81, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
또 다른 구현예에서, [VEGF 포획 단백질-2-퓨린-P2A-항-CTGF SCVF-2]의 아미노산 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 82, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
바람직하게는, 본 구현예에서, 작제물은 2217 뉴클레오티드 서열(플라스미드 IKC154P 내에 함유된 바와 같음)을 포함하고, 이는 본원에서 다음과 같이 서열번호 83, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
또 다른 구현예에서, [VEGF 포획 단백질 2-퓨린-P2A-항-C3b SCVF]의 아미노산 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 84, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
바람직하게는, 본 구현예에서, 작제물은 2220 뉴클레오티드 서열(플라스미드 IKC129P 내에 함유된 바와 같음)을 포함하고, 이는 본원에서 다음과 같이 서열번호 85, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
또 다른 구현예에서, [VEGF 포획 단백질-2-퓨린-P2A-항-Bb SCVF]의 아미노산 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 86, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
바람직하게는, 본 구현예에서, 작제물은 2244 뉴클레오티드 서열(플라스미드 IKC130P 내에 함유된 바와 같음)을 포함하고, 이는 본원에서 다음과 같이 서열번호 87, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
또 다른 구현예에서, [VEGF 포획 단백질 2-퓨린-P2A-sCD55의 아미노산 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 88 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
바람직하게는, 본 구현예에서, 작제물은 2454 뉴클레오티드 서열(플라스미드 IKC131P 내에 함유된 바와 같음)을 포함하고, 이는 본원에서 다음과 같이 서열번호 89, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
또 다른 구현예에서, [sCD55-퓨린-P2A-VEGF 포획 단백질 2]의 아미노산 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 90 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
바람직하게는, 본 구현예에서, 작제물은 2454 뉴클레오티드 서열(플라스미드 IKC132P 내에 함유된 바와 같음)을 포함하고, 이는 본원에서 다음과 같이 서열번호 91, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
또 다른 구현예에서, [VEGF 포획 단백질 2-퓨린-P2A-CFHR1]의 아미노산 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 92, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
바람직하게는, 본 구현예에서, 작제물은 2430 뉴클레오티드 서열(플라스미드 IKC133P 내에 함유된 바와 같음)을 포함하고, 이는 본원에서 다음과 같이 서열번호 93, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
또 다른 구현예에서, [CFHR1-퓨린-P2A-VEGF 포획 단백질 2]의 아미노산 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 94, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
바람직하게는, 본 구현예에서, 상기 작제물은 2430 뉴클레오티드 서열(플라스미드 IKC134P 내에 함유된 바와 같음)을 포함하며, 이는 본원에서 다음과 같이 서열번호 95, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
또 다른 구현예에서, [VEGF 포획 단백질 2-퓨린-P2A-CFHL1]의 아미노산 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 100, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
바람직하게는, 본 구현예에서, 작제물은 2769 뉴클레오티드 서열(플라스미드 IKC144P 내에 함유된 바와 같음)을 포함하고, 이는 본원에서 다음과 같이 서열번호 101, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
또 다른 구현예에서, [CFHL1-퓨린-P2A-VEGF 포획 단백질 2]의 아미노산 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 102, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
바람직하게는, 본 구현예에서, 작제물은 2766 뉴클레오티드 서열(플라스미드 IKC175P 내에 함유된 바와 같음)을 포함하고, 이는 본원에서 다음과 같이 서열번호 103, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
또 다른 구현예에서, [VEGF 포획 단백질 2-퓨린-P2A-sCD46]의 아미노산 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 104, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
바람직하게는, 본 구현예에서, 작제물은 2424 뉴클레오티드 서열(플라스미드 IKC176P 내에 함유된 바와 같음)을 포함하고, 이는 본원에서 다음과 같이 서열번호 105 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
또 다른 구현예에서, [sCD46-퓨린-P2A-VEGF 포획 단백질 2]의 아미노산 서열은 본원에서 다음과 같이 서열번호 106, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
바람직하게는, 본 구현예에서, 작제물은 2421 뉴클레오티드 서열(플라스미드 IKC177P 내에 함유된 바와 같음)을 포함하고, 이는 본원에서 다음과 같이 서열번호 107, 또는 이의 단편 또는 변이체로 지칭된다:
따라서, 바람직한 구현예에서, 작제물은 실질적으로 80, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 100, 102, 104 또는 106에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩한다.
바람직하게는, 작제물은 실질적으로 서열번호 81, 83, 85, 87, 89, 91, 93, 95, 101, 103, 105 또는 107에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다.
본 발명자들은 본 발명의 작제물을 포함하는 일련의 재조합 발현 벡터를 생성했다.
따라서, 제2 양태에 따르면, 제1 양태에 따른 유전자 작제물을 포함하는 재조합 벡터가 제공된다.
하나의 구현예에서, 재조합 벡터(예: "IKC153P"로 공지됨)는 본원에서 다음과 같이 서열번호 96으로 지칭되는 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다:
따라서, 하나의 구현예에서, 재조합 벡터는 실질적으로 서열번호 96에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함한다.
재조합 벡터는 재조합 AAV(rAAV) 벡터일 수 있다. rAAV는 천연 벡터 또는 하이브리드 AAV 혈청형을 갖는 벡터일 수 있다. rAAV는 AAV-1, AAV-2, AAV-2.7m8, AAV-3A, AAV-3B, AAV-4, AAV-5, AAV-6, AAV-7, AAV-8, AAV-9, AAV-10 및 AAV-11일 수 있다. 바람직하게는, rAAV는 rAAV 혈청형-2이다.
유리하게는, 재조합 AAV2는 숙주 유기체에서 최소한의 면역 반응을 유발하고, 벡터 투여 후 적어도 1년 동안 망막에서 지속될 수 있는 장기 도입유전자 발현을 매개한다.
용어 "재조합 AAV(rAAV) 벡터"는 재조합 AAV 유래 핵산을 의미할 수 있다. 이는 적어도 하나의 말단 반복 서열을 함유할 수 있다.
AAV 및 재조합 벡터의 캡시드 코트는 VP1, VP2 및 VP3이라고 하는 세 개의 캡시드 단백질로 구성되는 것으로 공지되어 있으며, 이들 모두는 이들 사이에 상당량의 중첩성 아미노산을 포함하지만, 고유한 N-말단 서열을 포함한다. AAV 바이러스는 VP1, VP2 및 VP3 캡시드 단백질 각각의 1:1:10 비율의 60개의 서브유닛을 함유하며, 이들은 함께 정이십면체 구조를 형성한다. 아미노산 조성이 상이하고, 따라서 숙주 세포의 수용체에 상이한 결합 특성을 부여하는 많은 AAV 혈청형이 식별되었다. AAV1, AAV2, AAV2.7m8, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AA7, AAV8, AAV9, AAV10, AAV11 및 AAV12와 같은 식별된 여러 가지 천연 AAV 혈청형 및 아미노산 서열에 대한 추가 변형이 캡시드 코딩 서열의 라이브러리로부터 DNA 변이체를 스크리닝하여 식별된 많은 인공 변이체가 있다. 따라서, 상이한 혈청형은 트로피즘(tropism)을 나타낼 수 있으며, 한 의사형(pseudotype)의 다양한 아미노산을 교환하면 상이한 표적 세포에 대한 트로피즘 또는 감염성을 변경할 수 있다. 따라서, 특정 AAV 의사형은 하나의 특정 세포 유형을 표적화하거나 특정 기관에 대한 감염성을 크게 제한하도록 설계될 수 있다. 일부 구현예에서, rAAV 벡터는 AAV1, AAV2, AAV2.7m8, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AA7, AAV8, AAV9, AAV10, AAV11 또는 AAV12를 포함하는, AAV 혈청형으로부터 유래된 벡터이다. rAAV 입자는 AAV1, AAV2, AAV2.7m8, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AA7, AAV8, AAV9, AAV10, AAVrh10, AAV11 또는 AAV12 캡시드를 포함하여 임의의 AAV 혈청형으로부터 유도된 캡시드 단백질을 포함할 수 있다. rAAV 입자는 동일한 혈청형 또는 혼합 혈청형의 바이러스 단백질과 바이러스 핵산을 포함할 수 있다.
본 발명의 캡시드 단백질 또는 재조합 바이러스 입자는 천연 단백질(예: 천연 AAV 캡시드 단백질, 예를 들어, AAV 혈청형 AAV1, AAV2, AAV2.7m8, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, AAV9, AAV10, AAVrh10, AAV11 또는 AAV12의 캡시드 단백질)의 아미노산 서열을 포함하거나 이로 이루어질 수 있거나, 천연 캡시드 단백질의 아미노산 서열과 비교하여, 예를 들어, 목적하는 조직 유형 또는 세포 유형(예: 망막 신경절 세포, 광수용체 또는 망막 색소 상피 세포)에 대한 트로피즘을 부여하거나 재조합 바이러스 입자의 면역원성을 감소시키기 위해 하나 이상의 아미노산 치환, 결실 또는 첨가를 포함하는 천연 캡시드 단백질의 유도체 또는 키메라일 수 있다.
일부 구현예에서, 본 발명의 재조합 바이러스 입자의 캡시드 단백질은 천연 캡시드 단백질, 예를 들어, 혈청형 AAV1, AAV2, AAV2.7m8, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AA7, AAV8, AAV9, AAV10, AAVrh10, AAV11 또는 AAV12의 천연 AAV 캡시드 단백질의 아미노산 서열에 대해 전체 길이를 따라 적어도 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99%의 아미노산 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는다.
본원에 기재된 작제물 및 발현 벡터는 망막 장애, 특히 습성 연령 관련 황반 변성, 또는 당뇨병성 황반 부종(diabetic macular oedema; DMO)을 포함한 당뇨병성 망막병증(diabetic retinopathy)을 치료하고, 보다 일반적으로 혈관 누출 및 망막 세포 손상을 감소시키는 데 사용될 수 있다.
따라서, 제3 양태에 따르면, 의약으로서 또는 요법에 사용하기 위한 제1 양태에 따른 유전자 작제물, 또는 제2 양태에 따른 재조합 벡터가 제공된다.
제4 양태에 따르면, 망막 장애를 치료, 예방 또는 개선하는 데 사용하기 위한, 또는 혈관 누출 및 망막 세포 손상을 감소시키기 위한 제1 양태에 따른 유전자 작제물, 또는 제2 양태에 따른 재조합 벡터가 제공된다.
제5 양태에 따르면, 대상체의 망막 장애를 치료, 예방 또는 개선하거나, 혈관 누출 및 망막 세포 손상을 감소시키기 위한 방법이 제공되며, 상기 방법은 이러한 치료가 필요한 대상체에게 제1 양태에 따른 유전자 작제물, 또는 제2 양태에 따른 재조합 벡터의 치료적 유효량을 투여하거나 투여한 단계를 포함한다. 
바람직하게는, 본 발명에 따른 유전자 작제물 또는 재조합 벡터는 유전자 요법 기술에 사용된다. 작제물 또는 벡터에 의해 인코딩된 항-VEGF 단백질 및 항섬유화 단백질은 VEGF와 CTGF 또는 보체 단백질 모두를 중화시켜 신생혈관 형성을 방지하고, 혈관 누출을 감소시키고, 염증, 섬유증 및 흉터를 감소시킨다.
하나의 구현예에서, 치료되는 망막 장애는 습성 연령 관련 황반 변성일 수 있다. 대안적으로, 또 다른 구현예에서, 치료되는 망막 장애는 당뇨병성 망막병증, 또는 당뇨병과 관련된 임의의 다른 망막 장애, 예를 들어, 당뇨병성 황반 부종(DMO)일 수 있다. 또한, 치료되는 망막 장애는 혈관 누출 및 생성되는 망막 구조에 대한 손상을 수반하는 임의의 병태생리학적 상태일 수 있다.
또 다른 구현예에서, 작제물 및 벡터는 혈관 누출 활성화 및 망막 세포 손상을 감소시키는 데 사용될 수 있다. 작제물 및 벡터는 혈관 누출 및 다음 상태와 관련된 망막 세포 손상을 치료하는 데 사용될 수 있다; 당뇨병성 망막병증, 암(cancer), 전신 모세혈관 누출 증후군(systemic capillary leak syndrome; SCLS)/클락슨 증후군(Clarkson's syndrome), 혈관부종(angioedema), 중증 외상(severe trauma), 쇼크(shock), 패혈증(sepsis), 다발성 장기 기능 장애 증후군(multiple organ dysfunction syndrome; MODS), 만성 신장 질환(chronic kidney disease), 말기 신장 질환(end-stage renal disease), 가와사키병(Kawasaki disease), 중증 에볼라 바이러스 질환(severe Ebola virus disease), 뎅기열 바이러스 감염(Dengue virus infection) 및/또는 마이코박테리아 감염(mycobacterial infection).
제1 양태에 따른 유전자 작제물 또는 제2 양태에 따른 재조합 벡터는 망막 장애를 치료, 개선 또는 예방하거나, 혈관 누출 및 망막 세포 손상을 감소시키기 위한 단독요법(즉, 본 발명의 제1 양태에 따른 유전자 작제물 또는 제2 양태에 따른 벡터의 사용)으로서 사용될 수 있는 의약에 사용될 수 있는 것으로 인식될 것이다. 대안적으로, 본 발명에 따른 유전자 작제물 또는 재조합 벡터는 망막 장애를 치료, 개선 또는 예방하거나, 혈관 누출 및 망막 세포 손상을 감소시키기 위한 공지된 요법의 보조제로서, 또는 공지된 요법과 조합하여 사용될 수 있다.
효과적인 양의 재조합 바이러스 벡터가 치료 목적에 따라 투여된다. 예를 들어, 낮은 비율의 형질도입이 목적하는 치료 효과를 달성할 수 있는 경우, 치료 목적은 일반적으로 이러한 형질도입 수준을 충족하거나 초과하는 것이다. 일부 예에서, 이러한 수준의 형질도입은 표적 세포의 약 1 내지 5%만, 일부 구현예에서는 목적하는 조직 유형의 적어도 약 20%, 일부 구현예에서는 적어도 약 50%, 일부 구현예에서는 적어도 약 80%, 일부 구현예에서는 적어도 약 95%, 일부 구현예에서는 목적하는 조직 유형의 세포의 적어도 약 99%의 형질도입에 의해 달성될 수 있다. 본 발명의 일부 구현예에서, 대상체에게 투여되는 바이러스 입자의 용량은 1 x 108 내지 1 x 1014 게놈 카피 사이이다.
재조합 바이러스 입자는 동일한 절차 동안 또는 며칠, 몇 주, 몇 달 또는 몇 년 간격으로 하나 이상의 주사로 투여될 수 있다. 일부 구현예에서, 다수의 벡터가 대상체를 치료하는 데 사용될 수 있다. 일부 구현예에서, 표적 조직의 세포(예: 눈의 망막 세포) 중 적어도 2%, 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70% 또는 75%에서 최대 100%가 형질도입된다. 재조합 바이러스 입자 캡시드를 포함하는 재조합 바이러스 입자에 의해 형질도입된 세포를 식별하는 방법은 당업계에 공지되어 있다. 예를 들어, 면역조직화학(immunohistochemistry) 또는 강화된 녹색 형광 단백질(enhanced green fluorescent protein)과 같은 시장의 사용이 재조합 바이러스 입자의 형질도입을 검출하는 데 사용될 수 있다.
일부 구현예에서, 재조합 벡터는 목적하는 조직(예: 눈)의 하나 이상의 위치에 (예를 들어, 주사 또는 주입에 의해) 투여된다. 일부 구현예에서, 재조합 벡터는 조직 내의 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10개 또는 10개 이상의 위치 중 어느 하나에 (예를 들어, 주사 또는 주입에 의해) 투여된다. 일부 구현예에서, 재조합 벡터는 하나 이상의 위치에 동시에 또는 순차적으로 투여된다. 일부 구현예에서, 재조합 벡터의 다중 주사는 1시간, 2시간, 3시간, 4시간, 5시간, 6시간, 9시간, 12시간 또는 24시간 이하의 간격으로 이루어진다.
본 발명에 따른 유전자 작제물 또는 재조합 벡터는 특히 조성물이 사용되는 방식에 따라 다수의 상이한 형태를 갖는 조성물에 조합될 수 있다.  따라서, 예를 들어, 조성물은 분말, 정제, 캡슐, 액체, 연고, 크림, 겔, 하이드로겔, 에어로졸, 스프레이, 미셀 용액, 경피 패치, 리포좀 현탁액 또는 치료가 필요한 사람 또는 동물에게 투여될 수 있는 임의의 다른 적합한 형태의 형태일 수 있다. 본 발명에 따른 의약의 비히클(vehicle)은 그것이 투여되는 대상체에 의해 잘 허용되는 것이어야 한다는 것이 인식될 것이다.
본 발명에 따른 유전자 작제물 또는 재조합 벡터는 또한 서방출 또는 지연 방출 장치 내에 혼입될 수 있다. 이러한 장치는, 예를 들어, 피부 위 또는 피부 아래에 삽입될 수 있으며, 의약은 몇 주 또는 심지어 몇 달에 걸쳐 방출될 수 있다. 장치는 적어도 치료 부위에 인접하여 위치시킬 수 있다.  이러한 장치는 유전자 작제물 또는 재조합 벡터를 이용한 장기 치료가 필요하고 일반적으로 빈번한 투여(예: 적어도 매일 주사)가 필요한 경우에 특히 유리할 수 있다.
바람직한 구현예에서, 본 발명에 따른 의약은 혈류, 신경에 또는 치료가 필요한 부위에 직접 주사하여 대상체에게 투여될 수 있다. 예를 들어, 의약은 적어도 망막에 인접하여 주입될 수 있다. 주사는 유리체강내, 맥락막상, 망막하, 망막내, 정맥내(볼러스 또는 주입) 또는 피하(볼러스 또는 주입) 또는 피내(볼러스 또는 주입)일 수 있다.  
필요한 유전자 작제물 또는 재조합 벡터의 양은 생물학적 활성 및 생체이용률에 의해 결정되며, 이는 또한 투여 방식, 유전자 작제물 또는 재조합 벡터의 생화학적 특성 및 단독요법 또는 병용 요법으로 사용되는지 여부에 따라 달라지는 것으로 인식될 것이다. 투여 빈도는 또한 치료 대상체 내의 유전자도입 단백질의 반감기에 의해 영향을 받을 것이다. 투여될 최적 투여량은 당업자에 의해 결정될 수 있으며, 사용 중인 특정 유전자 작제물 또는 재조합 벡터, 약제학적 조성물의 강도, 투여 방식, 망막 부종(retinal oedema)의 진행 또는 망막 신경세포에서 생성되는 망막의 손상 또는 손실에 따라 달라질 것이다. 치료되는 특정 대상체에 따른 추가 요인은 대상체의 연령, 체중, 성별, 식이 및 투여 시간을 포함하여 투여량을 조정해야 할 수 있다.  
유전자 작제물 또는 재조합 벡터는 망막 장애가 발병하기 전, 발병 중 또는 발병 후에 투여될 수 있다. 1일 용량은 단일 투여(예: 단일 매일 주사 또는 비강 스프레이의 흡입)로 투여될 수 있다. 대안적으로, 유전자 작제물 또는 재조합 벡터는 하루 동안 2회 이상 투여를 필요로 할 수 있다. 예를 들어, 유전자 작제물 또는 재조합 벡터는 DNA 플라스미드의 0.001μg/kg 체중 내지 10mg/kg 체중 사이, 또는 바이러스 벡터의 1x108 GC/mL 내지 1x1013 GC/mL 사이(즉, 체중 70kg 가정)의 2개(또는 치료될 망막 장애 또는 망막 모세혈관 기능 장애의 중증도에 따라 그 이상)의 1일 용량으로서 투여될 수 있다. 치료를 받고 있는 환자는 기상시 첫 번째 용량을 복용한 다음 저녁에(2회 투여 섭생인 경우) 또는 그 후 3시간 또는 4시간 간격으로 두 번째 용량을 복용할 수 있다.  대안적으로, 서방출 장치는 반복 용량을 투여할 필요 없이 환자에게 본 발명에 따른 유전자 작제물 또는 재조합 벡터의 최적 용량을 제공하기 위해 사용될 수 있다.
공지된 절차, 예를 들어, 제약 산업에 의해 통상적으로 사용되는 것들(예: 생체내 실험, 임상 시험 등)이 본 발명에 따른 유전자 작제물 또는 재조합 벡터의 특정 제형 및 정확한 치료 섭생(예: 제제의 일일 용량 및 투여 빈도)을 형성하는 데 사용될 수 있다.  본 발명자들은 이들이 병태생리를 생성하는 수준 이하로 VEGF 농도를 감소시키는 동시에 CTGF 중화 또는 보체 활성화를 약화시켜 망막하 섬유증을 감소 또는 제거하는 코딩 서열에 작동 가능하게 연결된 프로모터를 인코딩하는 바이시스트론성 유전자 작제물을 최초로 제안한 것이라고 믿는다.
제6 양태에 따르면, 제1 양태에 따른 유전자 작제물, 또는 제2 양태에 따른 재조합 벡터, 및 약제학적으로 허용되는 비히클을 포함하는, 약제학적 조성물이 제공된다.
제7 양태에 따르면, 제6 양태에 따른 약제학적 조성물을 제조하는 방법이 제공되며, 상기 방법은 제1 양태에 따른 유전자 작제물, 또는 제2 양태에 따른 재조합 벡터를 약제학적으로 허용되는 비히클과 접촉시키는 단계를 포함한다.
"대상체"는 척추동물, 포유동물 또는 가축일 수 있다. 따라서, 본 발명에 따른 조성물 및 의약은 임의의 포유동물, 예를 들어, 가축(예: 말), 애완동물을 치료하는 데 사용될 수 있거나, 또는 다른 수의학적 적용에 사용될 수 있다.  그러나, 가장 바람직하게는, 대상체는 인간이다.
유전자 작제물, 재조합 벡터 또는 약제학적 조성물의 "치료적 유효량"은 대상체에게 투여될 때 건성 연령 관련 황반 부종(dry age-related macular oedema) 또는 GA를 치료하는 데 필요한 전술한 양인 임의의 양이다.
예를 들어, 사용된 유전자 작제물, 재조합 벡터 또는 약제학적 조성물의 치료적 유효량은 약 1x108 벡터 입자 내지 약 1x1015 벡터 입자, 바람직하게는 약 1x1011 벡터 입자 내지 약 1x1012 벡터 입자일 수 있다. 
일부 구현예에서, 본 발명의 약제학적 조성물의 바이러스 역가는 1밀리리터당 5 x 1010 내지 5 x 1013 게놈 카피 사이이다.
일부 구현예에서, 본 발명의 약제학적 조성물의 바이러스 역가는 1밀리리터당 5 x 1010 내지 5 x 1013 형질도입 단위 사이이다. 바이러스 역가와 관련하여 사용되는 용어 "형질도입 단위"는 [57, 58]에 기재된 바와 같은 기능적 검정에서 측정된 바와 같이 기능성 유전자도입 산물의 생산을 초래하는 감염성 재조합 벡터 입자의 수를 지칭한다.
본원에서 언급된 "약제학적으로 허용되는 비히클"은 당업자에게 약제학적 조성물을 제형화하는 데 유용하다고 공지된 임의의 공지된 화합물 또는 공지된 화합물의 조합이다.  
하나의 구현예에서, 약제학적으로 허용되는 비히클은 고체일 수 있고, 조성물은 분말 또는 정제의 형태일 수 있다. 약제학적으로 허용되는 고체 비히클은 또한 향미제, 윤활제, 가용화제, 현탁제, 염료, 충전제, 활탁제, 압축 보조제, 불활성 결합제, 감미제, 방부제, 염료, 코팅제 또는 정제 붕해제로서 작용할 수 있는 하나 이상의 물질을 포함할 수 있다. 비히클은 또한 캡슐화 물질일 수 있다. 분말에서, 비히클은 본 발명에 따라 미분된 활성제와 혼합물로 존재하는 미분된 고체이다. 정제에서, 활성제(예: 본 발명에 따른 유전자 작제물 또는 재조합 벡터)는 필요한 압축 특성을 갖는 비히클과 적절한 비율로 혼합하여 목적하는 형상 및 크기로 압축시킬 수 있다. 분말 및 정제는 바람직하게는 최대 99%의 활성제를 함유한다. 적합한 고체 비히클은, 예를 들어, 인산칼슘, 마그네슘 스테아레이트, 활석, 당, 락토스, 덱스트린, 전분, 젤라틴, 셀룰로스, 폴리비닐피롤리딘, 저융점 왁스 및 이온 교환 수지를 포함한다. 또 다른 구현예에서, 약제학적 비히클은 겔일 수 있고, 조성물은 크림 등의 형태일 수 있다.  
그러나, 약제학적 비히클은 액체일 수 있으며, 약제학적 조성물은 용액 중의 입자 현탁액의 형태이다. 액체 비히클은 용액, 현탁액, 에멀젼, 시럽, 엘릭서 및 가압 조성물을 제조하는 데 사용된다. 본 발명에 따른 유전자 작제물 또는 재조합 벡터는 물, 이온 완충 용액, 유기 용매, 이 둘의 혼합물 또는 약제학적으로 허용되는 오일 또는 지방과 같은 약제학적으로 허용되는 액체 비히클에 용해되거나 현탁될 수 있다. 액체 비히클은 가용화제, 유화제, 완충제, 방부제, 감미제, 향미제, 현탁제, 증점제, 색소, 점도 조절제, 안정화제 또는 삼투 조절제와 같은 기타 적합한 약제학적 첨가제를 함유할 수 있다. 경구 및 비경구 투여용 액체 비히클의 적절한 예로는 물(상기와 같은 첨가제, 예를 들어, 셀룰로스 유도체, 바람직하게는 나트륨 카르복시메틸 셀룰로스 용액을 부분적으로 함유), 알코올(1가 알코올 및 다가 알코올, 예를 들어, 글리콜 포함) 및 이들의 유도체, 및 오일(예: 분별 코코넛 오일 및 아라키스 오일)을 포함한다. 비경구 투여의 경우, 비히클은 또한 에틸 올레에이트 및 이소프로필 미리스테이트와 같은 유성 에스테르일 수 있다. 멸균 액체 비히클은 비경구 투여용 멸균 액체 형태 조성물에 유용하다. 가압 조성물을 위한 액체 비히클은 할로겐화 탄화수소 또는 기타 약제학적으로 허용되는 추진제일 수 있다.
멸균 용액 또는 현탁액인 액체 약제학적 조성물은, 예를 들어, 유리체강내, 맥락막상, 망막하, 망막내, 뇌실내, 근육내, 척수강내, 경막외, 복강내, 정맥내 및 특히 피하 주사에 의해 이용될 수 있다. 유전자 작제물 또는 재조합 벡터는 멸균수, 식염수 또는 기타 적절한 멸균 주사 가능한 배지를 사용하여 투여시 용해되거나 현탁될 수 있는 멸균 고체 조성물로서 제조될 수 있다.
약제학적으로 허용되는 담체, 부형제 및 희석제는 투여를 용이하게 하는 비교적 불활성 물질 또는 약제학적으로 효과적인 물질이고, 액체 용액 또는 현탁액, 에멀젼 또는 사용 전에 액체에서 용해 또는 현탁에 적합한 고체 형태로 공급될 수 있다. 예를 들어, 부형제는 적합한 형태 또는 조도(consistency)를 제공하거나 희석제 역할을 할 수 있다. 적합한 부형제는 안정화제, 습윤제 및 유화제, 다양한 삼투압(osmolarity)을 위한 염, 캡슐화제, pH 완충 물질 및 완충제를 포함하지만, 이에 제한되지 않는다. 이러한 부형제는 과도한 독성 없이 투여될 수 있는 대상체에게 직접 전달하기에(예: 유리체강내 또는 망막하에) 적합한 임의의 약제학적 제제를 포함한다. 약제학적으로 허용되는 부형제는 소르비톨, 임의의 다양한 TWEEN 화합물, 및 액체, 예를 들어, 물, 식염수, 글리세롤 및 에탄올을 포함하지만, 이에 제한되지 않는다. 약제학적으로 허용되는 염은, 예를 들어, 무기산 염, 예를 들어, 하이드로클로라이드, 하이드로브로마이드, 포스페이트, 설페이트 등; 및 유기산의 염, 예를 들어, 아세테이트, 프로피오네이트, 말로네이트, 또는 벤조에이트를 포함할 수 있다.
일부 구현예에서, 약제학적으로 허용되는 부형제는 약제학적으로 허용되는 담체를 포함할 수 있다. 이러한 약제학적으로 허용되는 담체는 석유, 동물성, 식물성 또는 합성 기원, 예를 들어, 땅콩 오일, 대두 오일, 미네랄 오일의 것들을 포함하여 물 및 오일과 같은 멸균 액체일 수 있다. 식염수 용액 및 수성 덱스트로스, 폴리에틸렌 글리콜(PEG) 및 글리세롤 용액은 또한 특히 주사 가능한 용액을 위한 액체 담체로서 사용될 수 있다. 추가 성분, 예를 들어, 방부제, 완충제, 강장제, 항산화제 및 안정화제, 비이온성 습윤제 또는 청정제, 또는 점도 증가제도 또한 사용될 수 있다. 약제학적으로 허용되는 부형제 및 담체에 대한 자세한 논의는 문헌[Remington's Pharmaceutical Sciences(Ed Remington JP and Gennaro AR; Mack Pub. Co. Easton, Pa 1990)]에서 이용 가능하다.
본 발명은 실질적으로 이의 변이체 또는 단편을 포함하여 본원에서 언급된 임의의 서열의 아미노산 또는 핵산 서열을 포함하는, 임의의 핵산 또는 펩티드 또는 이의 변이체, 유도체 또는 유사체로 확장되는 것으로 인식될 것이다.  용어 "실질적으로 아미노산/뉴클레오티드/펩티드 서열", "변이체" 및 "단편"은 본원에서 언급된 서열 중 어느 하나의 아미노산/뉴클레오티드/펩티드 서열과 적어도 40%의 서열 동일성(sequence identity)을 갖는 서열, 예를 들어, 서열번호 1-107로 식별된 서열과 40%의 동일성을 갖는 서열 등일 수 있다.
참조된 서열 중 임의의 서열과 65% 초과, 더욱 바람직하게는 70% 초과, 더욱 더 바람직하게는 75% 초과, 더욱 더 바람직하게는 80% 초과 서열 동일성인 서열 동일성을 갖는 아미노산/폴리뉴클레오티드/폴리펩티드 서열이 또한 예상된다. 바람직하게는, 아미노산/폴리뉴클레오티드/폴리펩티드 서열은 본원에서 언급된 임의의 서열과 적어도 85%의 동일성을 갖고, 더욱 바람직하게는 본원에 언급된 임의의 서열과 적어도 90%의 동일성, 더욱 더 바람직하게는 적어도 92%의 동일성, 더욱 더 바람직하게는 적어도 95%의 동일성, 더욱 바람직하게는 적어도 97%의 동일성, 더욱 더 바람직하게는 적어도 98%의 동일성, 가장 바람직하게는 적어도 99%의 동일성을 갖는다. 
당업자는 두 아미노산/폴리뉴클레오티드/폴리펩티드 서열 간의 동일성 백분율(percentage identity)을 계산하는 방법을 이해할 것이다. 두 아미노산/폴리뉴클레오티드/폴리펩티드 서열 간의 동일성 백분율을 계산하기 위해, 먼저 두 서열의 정렬을 준비한 다음, 서열 동일성 값을 계산해야 한다.  두 서열의 동일성 백분율은 (i) 서열을 정렬하는 데 사용되는 방법, 예를 들어, ClustalW, BLAST, FASTA, Smith-Waterman(상이한 프로그램에서 구현됨) 또는 3D 비교를 통한 구조적 정렬; 및 (ii) 정렬 방법에 의해 사용된 파라미터, 예를 들어, 로컬 정렬 대 글로벌 정렬, 사용된 쌍 점수 매트릭스(pair-score matrix)(예: BLOSUM62, PAM250, Gonnet 등), 및 갭 페널티(gap-penalty), 예를 들어, 기능적 형태 및 상수에 따라 상이한 값을 취할 수 있다. 
정렬이 완료되면, 두 서열 간의 동일성 백분율을 계산하는 다수의 상이한 방법이 있다. 예를 들어, 하나는 동일성의 수를 다음으로 나눌 수 있다: (i) 최단 서열의 길이; (ii) 정렬의 길이; (iii) 서열의 평균 길이; (iv) 비갭 위치의 수; 또는 (iv) 오버행을 제외한 등가 위치의 수. 또한, 동일성 백분율은 또한 매우 길이 의존적인 것으로 인식될 것이다. 따라서, 한 쌍의 서열이 짧을수록 우연히 발생할 것으로 예상되는 서열 동일성이 더 높아진다. 
따라서, 단백질 또는 DNA 서열의 정확한 정렬은 복잡한 과정이라는 것이 인식될 것이다. 널리 사용되는 다중 정렬 프로그램인 ClustalW[59,60]가 본 발명에 따라 단백질 또는 DNA의 다중 정렬을 생성하기 위한 바람직한 방법이다. ClustalW에 적합한 파라미터는 다음과 같을 수 있다: DNA 정렬의 경우: 갭 개방 페널티 = 15.0, 갭 확장 페널티 = 6.66, 및 매트릭스 = 동일성. 단백질 정렬의 경우: 갭 개방 페널티 = 10.0, 갭 확장 페널티 = 0.2, 및 매트릭스 = 고넷. DNA 및 단백질 정렬의 경우: 엔드갭(ENDGAP) = -1, 갭디스트(GAPDIST) = 4.  당업자는 최적의 서열 정렬을 위해 이러한 파라미터와 다른 파라미터를 변경할 필요가 있을 수도 있다는 것을 알고 있을 것이다.
바람직하게는, 두 아미노산/폴리뉴클레오티드/폴리펩티드 서열 간의 동일성 백분율의 계산은 이러한 정렬로부터 (N/T)*100으로 계산될 수 있고, 여기서 N은 서열이 동일한 잔기를 공유하는 위치의 수이고 T는 갭을 포함하고 오버행을 포함하거나 제외한 비교된 위치의 총 수이다. 바람직하게는, 오버행은 계산에 포함된다. 따라서, 두 서열 간의 동일성 백분율을 계산하기 위한 가장 바람직한 방법은 (i) 예를 들어, 상기 제시된 바와 같이 적절한 파라미터 세트를 사용하는 ClustalW 프로그램을 사용하여 서열 정렬을 준비하는 단계; 및 (ii) 다음 식에 N 및 T의 값을 삽입하는 단계를 포함한다: - 서열 동일성 = (N/T)*100.
 유사한 서열을 식별하기 위한 대안적인 방법은 당업자에게 공지될 것이다. 예를 들어, 실질적으로 유사한 뉴클레오티드 서열은 엄격한 조건 하에서 DNA 서열 또는 이들의 보체에 혼성화되는 서열에 의해 인코딩될 것이다. 엄격한 조건이란, 뉴클레오티드가 약 45℃에서 3x 염화나트륨/나트륨 시트레이트(SSC)에서 필터 결합 DNA 또는 RNA에 혼성화된 후 약 20-65℃에서 0.2x SSC/0.1% SDS로 적어도 한 번 세척하는 것을 의미한다. 대안적으로, 실질적으로 유사한 폴리펩티드는 본원에 제시된 서열과 적어도 1개, 그러나 5개, 10개, 20개, 50개 또는 100개 미만의 아미노산이 다를 수 있다. 
유전자 코드의 축퇴성(degeneracy)으로 인해, 본원에 기재된 임의의 핵산 서열은 이에 의해 인코딩되는 단백질의 서열에 실질적으로 영향을 미치지 않고 변경 또는 변화되어 이의 기능적 변이체를 제공할 수 있음이 명백하다.  적합한 뉴클레오티드 변이체는 서열 내에서 동일한 아미노산을 인코딩하는 상이한 코돈의 치환에 의해 변경되어 침묵 변화(silent change)를 생성하는 서열을 갖는 것들이다. 다른 적합한 변이체는 상동성 뉴클레오티드 서열을 갖지만 서열의 전부 또는 일부를 포함하는 것들이며, 이는 서열이 치환하는 아미노산과 유사한 생물물리학적 특성의 측쇄를 갖는 아미노산을 인코딩하는 상이한 코돈의 치환에 의해 변경되어 보존적인 변화를 생성한다. 예를 들어, 작은 비극성 소수성 아미노산은 글리신, 알라닌, 류신, 이소류신, 발린, 프롤린 및 메티오닌을 포함한다. 큰 비극성 소수성 아미노산은 페닐알라닌, 트립토판 및 티로신을 포함한다. 극성 중성 아미노산은 세린, 트레오닌, 시스테인, 아스파라긴 및 글루타민을 포함한다. 양전하를 띠는 (염기성) 아미노산은 리신, 아르기닌 및 히스티딘을 포함한다. 음전하를 띤 (산성) 아미노산은 아스파르트산 및 글루탐산을 포함한다. 따라서, 어떤 아미노산이 유사한 생물물리학적 특성을 갖는 아미노산으로 대체될 수 있는지를 인식할 것이며, 당업자는 이러한 아미노산을 인코딩하는 뉴클레오티드 서열을 알 것이다. 본원(임의의 첨부된 청구범위, 요약서 및 도면을 포함)에 기재된 모든 특징 및/또는 그렇게 개시된 임의의 방법 또는 공정의 모든 단계는, 그러한 특징 및/또는 단계 중 적어도 일부가 상호 배타적인 조합을 제외하고, 임의의 조합으로 상기 양태 중 임의의 것과 조합될 수 있다.
본원(임의의 첨부된 청구범위, 요약서 및 도면을 포함)에 기재된 모든 특징 및/또는 그렇게 개시된 임의의 방법 또는 공정의 모든 단계는, 그러한 특징 및/또는 단계 중 적어도 일부가 상호 배타적인 조합을 제외하고, 임의의 조합으로 상기 양태 중 임의의 것과 조합될 수 있다.
본 발명을 보다 잘 이해하고, 본 발명의 구현예들이 어떻게 수행될 수 있는지를 보여주기 위해, 이제 다음과 같은 첨부된 도면을 예로서 참조할 것이다:
도 1은 다양한 유전자도입 단백질, 즉 항-VEGF 단백질 및 항섬유화 단백질을 발현하는 본 발명에 따른 유전자 요법 바이러스 벡터(도면의 상단), 및 망막 장애, 예를 들어, 습성-AMD와 관련된 병태생리를 감소시키는 데 있어서 이들의 생물학적 효과의 하나의 구현예의 도이다. 도면에서, 항섬유화 단백질은 항-CTGF(결합 조직 성장 인자) 단백질 또는 항-보체 단백질인 것으로 나타난다.
도 2는 본 발명에 따른 유전자 작제물의 하나의 구현예의 개략도이다. 유전자도입 카세트는 본질적으로 2개의 독립적으로 분비된 단백질, 즉 VEGF 중화 성분과 항섬유화 성분이 생산되는 단일 mRNA 전사체를 인코딩한다. 이러한 성분은 효소 표적/바이러스 2A 절단/스키핑 부위를 통해 연결된 어느 위치(방향)에 있을 수 있다.
도 3 단일 mRNA 전사체에서 두 개의 성숙한 치료용 단백질로의 바이시스트론성 작제물의 세포내 생화학적 처리를 예시한다. 단계 1은 단일 프로모터를 통한 메신저 RNA의 전사에 이어, 단일 대형 코딩 서열의 번역이다. 단계 2는 두 개의 개별 프로단백질을 생성하기 위해 바이러스 2A 서열에 의해 지시된 리보솜에 의한 번역 스키핑이다. 단계 3은 골지(Golgi) 수준에서 발생하며, 여기서 바이러스 2A 서열은 업스트림 절단 부위에서 퓨린/효소의 활성을 통해 프로단백질로부터 절단된다. 단계 4는 분비 단백질 신호 펩티드의 제거이며, 이는 표적 망막 세포로부터 분비 전에 다운스트림 성분의 N-말단으로부터 잔류하는 프롤린 아미노산을 제거한다.
도 4는 상이한 프로모터 서열: 작은 닭 베타-액틴 프로모터/사이토메갈로바이러스 인핸서 프로모터(sCAG), 토끼 베타-글로불린 인트론의 5' 및 3'로부터 유래된 뉴클레오티드의 짧은 스트레치의 융합으로부터 생성된 인트론의 첨가가 이어지는 sCAG 프로모터(sCAG-인트론), 사이토메갈로바이러스 프로모터(CMV), 뮤린 포스포글리세레이트 키나제 프로모터(mPGK) 및 인간 시냅틴-1 프로모터(hSYN1)를 함유하는 rAAV2 벡터로 형질도입 24시간 후에 촬영한 HEK293 세포에서의 강화된 녹색 형광 단백질(eGFP) 리포터 유전자 발현의 이미지를 도시한다. 
도 5는 상이한 프로모터: 작은 닭 베타-액틴 프로모터/사이토메갈로바이러스 인핸서 프로모터(sCAG); 사이토메갈로바이러스 인핸서 요소와 닭 베타-액틴 프로모터 및 토끼 베타-글로불린 인트론의 5' 및 3'로부터 유래된 뉴클레오티드의 짧은 스트레치(sCAG-인트론); 사이토메갈로바이러스 프로모터(CMV); 뮤린 포스포글리세레이트 키나제-1 프로모터(mPGK); 및 인간 시냅틴-1(hSYN1) 프로모터를 함유하는 rAAV2 벡터를 유리체강내 주사 3주 후의 eGFP 발현 수준을 예시하기 위해 마우스 망막의 단면 이미지와 평면 이미지를 모두 도시한다. 기호 '*'는 신경절 세포 층을 나타낸다. 
도 6 일련의 발현 플라스미드(A 및 B)로 형질감염 또는 일련의 rAAV2/2 벡터(C 및 D)로 형질도입 24시간 후 HEK293T 세포에서 수거한 상청액에서 VEGF 포획-2 단백질의 발현을 예시하는 웨스턴 블롯을 도시한다. 도 6A 및 6C는 분비된 VEGF 포획-2 단백질을 검출하는 IgG-Fc 항체로 프로빙된 상청액의 결과를 도시한다. 도 6B 및 D는 바이러스-2A 단백질을 검출하는 항체로 프로빙된 상청액의 결과를 도시한다. 바이러스-2A 아미노산 서열이 여전히 부착된 VEGF 포획-2 단백질이 점선 위에 제시되어 있으며, 일부 레인에 존재한다.
도 7A 바이러스-2A 서열에 걸쳐 번역 스키핑 및 퓨린 효소적 절단을 통한 후속적 제거를 통해 각각 VEGF 포획-2 단백질과 항섬유화 성분인 항-CTGF SCVF-1 또는 CFHL1을 분비하는 IKC153P 및 IKC144P 플라스미드 형질감염된 HEK293T 세포로부의 발현 카세트의 세포내 처리를 예시하는 웨스턴 블롯을 도시한다. 도 7B는 VEGF 포획-2 단백질과 항-CTGF SCVF의 검출을 나타내기 위해 대조군(IKC166P) 또는 IKC154P(VEGFCap-2-퓨린-P2A-항-CTGF SCVF-2)로 형질감염된 HEK293T 세포에 대한 면역세포화학을 도시한다. 항섬유화 성분의 예는 항-CTGF SCVF-1 및 항-CTGF SCVF-2(IKC153P 및 IKC154P) 및 CFHL1 단백질(IKC144P)이다.
도 8은 일련의 플라스미드로 형질감염 24시간 후 HEK293T 세포에 의해 생성된 세포 배양 배지에서 ELISA로 측정된 VEGF-165 농도를 예시한다. VEGF-165를 중화할 수 있는 분비된 단백질을 임의의 플라스미드를 주입하지 않은 세포(플라스미드 없음) 또는 IKC036P(영 대조군 플라스미드)로 형질감염된 세포의 배지와 비교했다. IKC112P는 새로운 VEGF 포획 단백질-2만을 포함하고, IKC115P는 VEGF 포획 단백질-2-퓨린-바이러스 P2A-항-CTGF-SCVF-1을 포함하며, IKC116P는 VEGF 포획 단백질-2-퓨린-바이러스 P2A-항-CTGF-SCVF-2를 포함한다.
도 9는 증가된 MTS 흡광도에 의해 측정된 바와 같은 인간 제대 혈관 내피 세포(HUVEC)의 증식을 유도하는 VEGF-165A(도 9A) 또는 VEGF-121B(도 9B)의 능력을 입증한다. 이전에 다양한 플라스미드 작제물로 형질감염된 HEK293T 세포의 배양 배지의 첨가는 IKC053P, IKC112P, IKC115P 및 IKC116P 플라스미드로 형질감염된 HRK293T 세포로부터 방출된 유전자도입 단백질이 대조군 형질감염되지 않은 HEK293T 세포 또는 영 대조군 플라스미드(IKC036P) 또는 항-CTGF SCVF-1만을 발현하는 플라스미드(IKC118P)로 형질감염된 HEK293T 세포에 비해 외인성 VEGF-165A 또는 VEGF-121B 유도 HUVEC 세포 증식을 방지할 수 있음을 보여준다. HUVEC의 항증식 효능의 메커니즘은 IKC053P, IKC112P, IKC115P 및 IKC116P 형질감염된 HEK293T 세포로부터 VEGF 중화 단백질의 생산 및 방출을 통해 이루어진다.
도 10 인간 섬유아세포의 상(층)에서 성장되었을 때(HUVEC-섬유아세포 공동 배양) HUVEC 증식을 예방할 수 있는 단백질을 생산하는 플라스미드 작제물의 능력을 추가로 예시한다. 도 10A는 HUVEC가 eGFP 마커 단백질을 발현하고, 신호 대 노이즈가 항-eGFP 항체로 염색함으로써 개선되었음을 보여준다. 모두 항-VEGF 유전자도입 단백질을 발현하는 IKC115P 및 IKC116P 노출 그룹에 비해 IKC036P 대조군에서 더 긴 세뇨관이 형성된다. 도 10B 및 도 10C는 플라스미드로 형질감염된 HEK293T 세포의 배양 배지의 첨가로 현저히 억제되고 VEGF 중화 단백질(IKC112P, IKC115P 및 IKC116P)을 생성하는 10ng/mL의 VEGF-165A(대조군 및 IKC036P 영 대조군)의 존재 하에 분지가 있는(영향 하의) 긴 HUVEC 세뇨관의 형성을 도시한다.
도 11 IKC153P(전구체는 IKC115P임) 또는 IKC154P(전구체는 IKC116P임) 대 IKC036P 영 플라스미드로 형질감염 후 ARPE-19 세포에서 섬유화 마커의 수준을 비교하는 웨스턴 블롯의 정량화이다. 도 11A는 혈청 결핍 조건 하에 세포로부터 분비된 섬유화 촉진 효소 MMP2의 수준을 도시한다. 도 11B는 형질전환 성장 인자-베타2(TGF-β2)에 의한 자극 후 세포로부터 분비된 MMP2의 수준을 도시한다. 도 11C는 배양 배지에서 피브로넥틴의 분비 수준을 도시하고, 도 11D는 β-액틴으로 정규화된 세포(세포 용해물) 내의 α-평활근 액틴(α-SMA)의 수준을 도시한다.
도 12 IKC036V(영 대조군), IKC115V 또는 IKC116V로 형질도입 및 피브로넥틴 단백질(회색)로 염색한 후 합류 및 혈청 결핍 ARPE-19 단층이다. IKC115V 및 IKC116V 처리 세포 대 IKC036V 영 대조군에 침착된 감소된 피브로넥틴 스캐폴드를 유의한다.
도 13은 본 발명의 벡터의 플라스미드 맵(IKC153P)의 구현예를 도시한다.
도 14 IKC144P 플라스미드에서 CFHL1 성분의 활성을 입증하기 위한 C3b 절단 검정이다. HEK293T 세포는 영 대조군 플라스미드(IKC036P) 또는 CFHL1 바이시스트론성 플라스미드(IKC144P) 플라스미드로 형질감염시켰고, 형질감염되지 않은 HEK293T 세포는 추가 대조군(PBS)으로 사용했다. 형질감염 후, HEK293T 상청액을 수집하여 재조합 C3b 및 재조합 CFI 단백질과 함께 배양한 다음 웨스턴 블롯에서 실행하고 C3 항체로 프로빙했다. 도 14는 C3b 절단이 IKC144P 플라스미드의 존재하에서만 발생하고, 대조군(IKC036P 또는 PBS 단독)의 존재 하에서는 그렇지 않음을 보여준다.
도 15는 본 발명의 벡터의 플라스미드 맵(IKC115P)의 구현예를 도시한다.
도 16 마우스를 PBS 대조군 또는 IKC115V 또는 IKC116V 벡터로 유리체강내 처리한 마우스 레이저화 유도된 맥락막 신생혈관 형성(CNV) 연구의 결과를 도시한다. 도 16A는 각 레이저화 부위(원)로부터 누출 수준을 입증하기 위해 플루오레세인 투여 1분, 2분, 3분 후 맥락막 초점면에서의 일련의 이미지를 도시한다. 도 16B는 CNV 후 14일째의 플루오레세인 누출 면적을 보여주는 그래프이며, IKC115V 및 IKC116V 처리 그룹이 PBS 처리 그룹에 비해 CNV 누출 면적이 현저히 더 낮았음을 보여준다.
도 17은 벡터 투여 후 3주째에 채취된 샘플에서 IgG ELISA로 측정된 바와 같이(**** P<0.0001; 일원 ANOVA), 마우스에서 rAAV2 IKC151V 또는 IKC152V 바이시스트론성 벡터의 유리체강내 주사는 IKC166V 영 벡터 처리 마우스에 비해 VEGF-포획-2 단백질의 유리체 농도를 크게 증가시킨다는 것을 예시한다. 또한, 바이시스트론성 벡터 IKC151V 및 IKC152V에 의해 생산된 VEGF-포획-2의 유리체 농도는 아플리버셉트만 생성하는 모노시스트론성 벡터 IKC163V에 의해 생산된 것과 유사했다. 중요하게는, 발현된 VEGF-포획-2 단백질의 수준은 볼러스 주사 6주 후 측정된 환자에서 단일 아플리버셉트(2mg) 투여 후 모델링된 아플리버셉트 약동학 범위의 기준선 이상이다[61]. 이러한 연구는 망막하 섬유증의 발생을 약화시키고 잠재적으로 역전시키는 2차 코딩 성분의 포함이 가용성 VEGF의 일반적인 이소형을 중화시키는 벡터의 능력을 감소시키지 않는다는 것을 입증한다.
실시예
도 1 및 도 2를 참조하여, 본 발명자들은 단일 프로모터의 제어 하에 (i) 항-VEGF 단백질 및 (ii) 항섬유화 단백질(항-보체 단백질 또는 항-CTGF 단백질, 예를 들어, 항체, 또는 이의 항원 결합 단편)을 인코딩하는 새로운 유전자 작제물을 설계 및 작제했다. 도 2에 예시된 바와 같이, 본 발명자들은 또한 유전자 작제물에 스페이서 서열(예: 바이러스-2A 펩티드 스페이서 서열)을 도입하였고, 이는 유리하게는 작제물에 의해 인코딩된 모든 펩티드의 발현이 단일 프로모터의 제어 하에 단일 mRNA 전사체로서 일어나도록 할 수 있다. 추가로, 단백질의 C-말단으로부터 바이러스-2A 펩티드 서열을 효소적으로 제거하기 위해, 본 발명자들은 퓨린 인식 서열과 같은 바이러스-2A 제거 서열을 작제물에 도입했다. 
도 3에 예시된 바와 같이, 바이시스트론성 발현 카세트는 두 개의 성숙한 치료용 단백질인 항-VEGF 단백질과 항섬유화 단백질을 생산한다. 항-VEGF 단백질은 신생혈관 형성을 방지하고 혈관 누출을 줄이는 역할을 한다. 항섬유화 단백질은 섬유화, 흉터 및 염증을 감소시킨다.
그런 다음, 본 발명자들은 유전자 작제물을 rAAV2와 같은 재조합 발현 벡터에 도입했다(예: 도 13 및 15 참조).
재료 및 방법
DNA 플라스미드 설계 및 생산
DNA 서열의 코돈 최적화는 도구(http://www.jcat.de) 또는 Genscript 온라인 도구를 사용하여 수행했다. 합성 DNA 블록과 클로닝은 표준 분자 생물학 기술을 사용하여 수행했다. 모든 DNA 플라스미드는 최소한의 내독소 존재로 최대 사전 정제 후 밤새 SURE 적격 세포(Agilent Technologies)에서 스케일 업했다.
IKC036P는 영 대조군이고, IKC053P는 VEGF 포획 단백질-1만을 생산 및 분비하도록 설계된 참조 플라스미드이다. IKC112P는 새로운 VEGF-포획 단백질-2만을 포함하고, IKC115P는 VEGF 포획 단백질-2-퓨린-바이러스 P2A-항-CTGF-SCVF-1을 포함하고, IKC116P는 VEGF 포획 단백질-2-퓨린-바이러스 P2A-항-CTGF-SCVF-2를 포함하며, IKC097P는 VEGF 포획 단백질-2-퓨린-바이러스 P2A-항-CTGF-SCVF(비최적화됨)를 포함하고, IKC102P는 VEGF 포획 단백질-2-퓨린-바이러스 P2A-항-CTGF-SCVF-1(비최적화됨)을 포함하며, IKC118P는 항-CTGF-SCVF-1을 포함한다.
재조합 AAV 벡터 생산
재조합 AAV2 벡터는 DNA 플라스미드를 사용하여 제조했다. HEK293T 세포(2.5x108)를 총 500μg의 세 가지 플라스미드(Rep-2-Cap2, pHelper, 및 ORF와 ITR 함유 플라스미드)로 형질도입했다. HEK293T 세포를 동결 해동하여 바이러스 벡터 입자를 유리시킨 후, 요오딕사놀 구배 초원심분리 및 탈염을 수행했다. 벡터는 cGMP 표준에 따라 제조된 Thermo Fisher/Gibco의 둘베코 인산염 완충 식염수(DPBS) 완충제(칼슘 또는 마그네슘 없이 8g/L NaCl, 1.15g/L의 Na2HPO4, 0.2g/L의 KCl 및 0.2g/L의 K2HPO4로 이루어진 cat 번호 14190250; pH 7.0-7.3, 270-300mOsm/kg)에 현탁시키고, 후속 벡터 역가는 ITR 영역을 인식하는 프라이머를 사용하여 qPCR에 의해 수득하였다.
도 4는 상이한 프로모터 서열: sCAG, CMV, hSYN1, mPGK 및 sCAG-인트론을 함유하는 작제물로 플라스미드 형질감염 24시간 후 취한 HEK293T 세포에서 강화된 녹색 형광 단백질(eGFP) 리포터 유전자 발현을 도시한다. 도 4에 예시된 바와 같이, sCAG와 CMV는 모두 HEK293T 세포에서 높은 수준의 eGFP 도입유전자 발현을 나타낸다.
도 5는 상이한 프로모터 서열: sCAG, CMV, hSYN1, mPGK 및 sCAG-인트론을 함유하는 5x10^9 GC/눈 rAAV2 벡터를 유리체강내 주사 3주 후의 eGFP 발현 수준을 예시하기 위한 마우스 망막의 단면 이미지와 평면 이미지를 모두 도시한다. 도 5로부터 알 수 있는 바와 같이, sCAG-인트론 프로모터에 인트론의 첨가는 인트론이 없는 동일한 프로모터, 즉 sCAG에 비해 망막 발현을 증가시킨다. 
실시예 1 - 퓨린 활성 및 바이러스-2A 펩티드 절단의 검출
간단히 말해, DNA 플라스미드를 Opti-MEM(FisherSci) 및 리포펙타민 3000(FisherSci)과 플라스미드를 혼합하여 세포로 형질감염시켰다. HEK293T 세포를 6-웰 플레이트에서 80% 컨플루언시로 최적으로 형질감염시켜 각 웰에 2μg의 플라스미드 DNA와 3.75μL의 리포펙타민이 주입되도록 했다. 세포를 37℃, 5% CO2에서 24시간 동안 배양했다.
수거된 상청액의 웨스턴 블롯팅을 사용하여 항-CTGF/보체 단백질로부터 분비된 VEGF 포획-2 단백질의 분리를 시각화했다. 야생형 또는 인간 IgG-Fc 부분의 변형을 함유하는 VEGF 포획 단백질은 HRP-접합 항-인간 IgG Fc 항체(염소 항-IgG Fc(HRP 접합됨, ab98624; Abcam, 1:7000으로 희석됨)를 사용하여 검출했다. 항체(NBP2-59627, NovusBio, 1:1000;)를 사용하여 제1 유전자도입 단백질의 C-말단으로부터 바이러스-2A 펩티드 제거를 조사했다.
HEK293T 세포를 상기 기재된 바와 같이 플라스미드로 형질감염시켰다. C-말단으로부터 바이러스-2A 펩티드의 절단을 확인하기 위해, IgG-Fc 항체를 사용하여 평가된 모든 상청액에서 분비된 VEGF 포획-2 단백질을 검출했다. 도 6A 및 6C에 예시된 바와 같이, 대부분의 VEGF 포획-2 단백질은 퓨린 부위에서 절단되어 바이러스-2A의 존재 없이 검출된다. 중요하게는, 절단된 VEGF 포획-2 단백질은 바이러스-2A 서열을 포함하지 않는 IKC112P 형질감염 세포로부터 유래된 VEGF 포획-2 단백질과 동일한 크기로 실행된다.
추가로, 도 6B에 도시된 바와 같이, 세포는 또한 바이러스-2A 단백질을 검출하는 항체로 프로빙했다. 교차 반응성(비특이적 염색)은 바이러스 2A 서열을 함유하지 않는 IKC112P 형질감염 세포로부터 유래된 VEGF 포획-2 단백질(IKC036P 및 IKC036V 영 벡터 레인)과 동일한 분자량에서 볼 수 있다. 바이러스 2A 항체는 또한 IKC115P 및 IKC116P 상청액에서 (2개의) 더 무거운 분자량 밴드를 포착하며(도 6B), 이는 바이러스 2A 서열의 전부는 아니지만 대부분이 퓨린 부위에서 절단되었음을 나타낸다. 밴드는 초기 발현 작제물인 IKC097P 및 IKC102P 상청액에서 더 약하고, 이는 바이러스-2A 서열이 퓨린 부위에서 절단되었음을 보여준다.
추가의 웨스턴 블롯팅 및 면역세포화학(도 7)은 바이시스트론성 플라스미드 작제물로 형질감염된 세포로부터 두 도입유전자의 발현 및 분리를 확인했다. 도 7A에서, IKC153P 및 IKC144P 플라스미드로 형질감염된 HEK293T 세포는 VEGF-포획-2 단백질(염소 항-IgG Fc(HRP 접합됨, ab98624; Abcam, 1:2000 희석됨) 및 이카로벡의뢰 항-CTGF SCVF-1(토끼 폴리클로날(펩티드 1); GenScript, 1:500 희석됨) 또는 CFHL-1(토끼 항-CFH, ab133536; Abcam, 1:1000 희석됨)을 각각 발현한다. 도 7B에서, 형질감염된 세포는 IgG Fc(1:1000) 또는 항-CTGF SCVF-1(1:1000)에 대한 상기 항체로 공동 표지하였다. 항-CTGF SCVF-1(토끼 폴리클로날(펩티드 1))은 플라스미드 IKC154P에서 항-CTGF SCVF-2를 면역표지하지 않았고, 비특이적 염색은 영 대조군(IKC166P)에서 검출되지 않았음에 유의한다.
실시예 2 - 다양한 플라스미드 작제물로 형질감염 후 HEK293T 세포에서 VEGF 농도
HEK293T 세포를 상기 기재된 바와 같이 플라스미드로 형질감염시켰다. HEK293T 세포 배양 배지를 수집하고 원심분리하여 임의의 세포 잔해를 제거한 다음, 세포로부터 생성된 VEGF-165 농도를 상용 인간 VEGF ELISA 키트(ab222510; Abcam)를 사용하여 측정했다. 결과는 플라스미드로 형질감염되지 않은 세포(플라스미드 없음)와 IKC036P(영 플라스미드)로 형질감염된 세포의 배지와 비교했다. VEGF-165 농도를 측정하고, 결과는 플라스미드로 형질감염되지 않은 세포(플라스미드 없음)와 IKC036P(영 플라스미드)로 형질감염된 세포의 배지(상청액)와 비교했다. 도 8에 예시된 바와 같이, VEGF 농도의 현저한 감소가 항-VEGF 단백질 성분을 포함하는 플라스미드로 형질감염된 세포에서 관찰되었다.
실시예 3 - 플라스미드 유전자도입 산물을 이용한 VEGF 유도 인간 제대 혈관내피 세포(HUVEC) 성장의 감소
이전에 Opti-MEM에서 플라스미드 없음(대조군) 또는 테스트 플라스미드 DNA로 6시간 동안 형질감염시킨 후, 무혈청 DMEM, 높은 글루코스, GlutaMAx(FisherSci)로 24시간 동안 교환한 HEK293T 세포 배양 배지로부터의 배지를 96웰 플레이트(3,000세포/웰)에 1x Pen-Strep을 함유하는 내피 세포 배지(ECM, C22010; PromoCell)에서 성장시킨 HUVEC에 첨가했다. 그런 다음, 각 웰에 재조합 추가 VEGF(5-100ng/mL; Caltag-Medsystems)를 첨가하고, HUVEC를 72시간 동안 배양했다. 세포 성장은 MTS(G3580, CellTitre 96® 수성 하나의 용액; Promega)를 사용한 분광광도계로 측정했다. 흡광도는 490nm에서 판독했다.
도 9에 예시된 바와 같이, 이전에 플라스미드로 형질감염된 HEK293T 세포의 배양 배지는 50ng/mL의 VEGF-165A 또는 VEGF-121B의 존재 하에 HUVEC의 증식을 나타내지 않았다(도 9C 및 D). 이는 항-VEGF 플라스미드 작제물에 의한 완전한 VEGF 중화를 입증한다.
실시예 4 - HUVEC -섬유아세포 공동 배양 및 혈관 네트워크의 생성
1:30의 비율의 eGFP 발현 HUVEC 및 인간 섬유아세포로 이루어지는 Caltag-Medsystems 혈관신생 내피/섬유아세포 공동 배양 키트를 사용했다. 내피 세포는 처음에 배양 매트릭스 내에 작은 섬을 형성하고, 이후 증식하고 결국 겔 매트릭스에서 실 모양의 세뇨관 구조를 형성하여 배양 10일 이내에 문합 세뇨관의 네트워크를 형성한다. 혈관신생 공동 배양은 공지된 미세 분자 및 거시 분자 억제제 및 혈관신생의 자극제에 반응하는 것으로 공지되어 있다. (상기 기재된 프로토콜을 사용하여) 이전에 플라스미드로 형질감염된 HEK293T 세포의 배지를 공동 배양물에 첨가하고, 2일째부터 2 내지 3일마다 10μg/mL의 재조합 인간 VEGF(ab9571; Abcam)를 보충했다. 대조군 배양물은 섬유아세포 성장 인자 및 섬유아세포에 의해 생성된 기타 성장 인자의 효과를 차단하는 수마린을 주입했다. 형광 현미경을 사용하여 eGFP 발현 세포에 대한 실험 종료시 세뇨관 HUVEC 구조를 고정시키고 이미지화하고, 추가로 항-GFP 항체(A11122; Invitrogen, 1:2,000 희석됨)로 염색했다. 평균 세뇨관 길이 및 분지는 MetaLabs FastTrack 세뇨관 형성 AI 프로그램을 사용하여 계산했다.
도 10A에 예시된 바와 같이, HUVEC 확장은 영 대조군 IKC036P에 비해 발현 플라스미드 IKC0115P 및 IKC116P로 형질감염된 HEK293T 세포의 배지에 노출 후 현저히 억제되었다. 추가로, 도 10B 및 10C에 예시된 바와 같이, HUVEC 세뇨관 길이와 분지는 대조군과 비교했을 때 IKC115P 및 IKC116P로 형질감염된 HEK293T 세포의 배지에 노출 후 현저히 감소되었다.
실시예 5 - 다양한 플라스미드로 형질감염 후 ARPE -19 세포에서 섬유화 마커 단백질 발현의 감소 
ARPE-19 세포는 Opti-MEM에서 상기 기재된 바와 같이 플라스미드로 24시간 동안 형질감염시켰다. 2일째에, 배지를 DMEM/F12 + 5% FBS로 교환한 다음, 3일째에 무혈청 DMEM/F12로 교환했다. 5일째에, TGF 베타 2(10ng/mL, ab84070, Abcam) 또는 신선한 무혈청 DMEM/F12를 합류, 형질감염된 세포에 첨가하고, 상청액 및 용해물을 7일째에 수집했다. 혈청 결핍 세포의 상청액의 웨스턴 블롯팅은 IKC154P(전구체는 IKC116P로서 공지됨)에 대해 제시된 유의성으로 피브로넥틴(ab268020; Abcam, 1:500 희석됨)(도 11A) 및 MMP2(ab92536; Abcam 1:1000 희석됨)(도 11C)의 감소를 나타냈다. MMP2의 유사한 감소는 IKC153P(전구체는 IKC115P로서 공지됨) 및 IKC154P(전구체는 IKC116P로서 공지됨) 모두에 대해 제시된 유의성으로 TGF 베타 2 자극 세포의 상청액에서 관찰되었다(도 11B). 용해물 샘플은 IKC036P(영 대조군)에 비해 플라스미드 IKC153P(전구체는 IKC115P로서 공지됨) 및 IKC154P(전구체는 IKC116P로서 공지됨)를 갖는 TGF 베타 2 자극 그룹에서 알파SMA(ab5694; Abcam, 1:500 희석됨)의 약간의 감소를 나타냈다(도 11D).
도 12에 예시된 바와 같이, 피브로넥틴(ab268020; Abcam, 1:200 희석됨) 면역표지의 감소는 형질도입 후 5일째에 IKC037V(영 대조군)에 비해 벡터 IKC115V 및 IKC116V로 형질도입된 ARPE-19에서 관찰할 수 있었다.
실시예 6 - CFHL1을 평가하는 C3b 절단 검정
HEK293T 세포를 상기 기재된 바와 같이 플라스미드로 형질감염시켰다. HEK293T 세포 배양 배지를 수집하고 원심분리하여 임의의 세포 잔해를 제거한 다음, 신선한 상청액 50μL를 42nM 재조합 C3b 및 1.2nM 재조합 CFI와 함께 37℃에서 1시간 동안 배양했다. 배양 후, 이어서 샘플을 C3 항체(염소-항인간-C3, AHP1752, 1:2000 및 2차 당나귀 항-염소, 705-035-147, 1:10,000)를 사용하여 웨스턴 블롯팅으로 평가했다.
도 14에 예시된 바와 같이, iC3b 68 및 43kDa 단편으로의 C3b 절단은 CFHL1 성분을 발현하는 IKC144P 플라스미드로 형질감염된 HEK293T 세포로부터 유도된 상청액의 존재 하에 발생했지만, 대조군(IKC036P) 또는 형질감염되지 않은 상청액의 존재 하에서는 그렇지 않았다. 이들은 바이시스트론성 IKC144P 플라스미드에 의해 발현된 CFHL1 성분이 효소적으로 활성임을 입증한다.
실시예 7 - 마우스 레이저 CNV 모델에서 바이시스트론성 rAAV 벡터의 효능
마우스는 rAAV 벡터 IKC115V(8.7x109  게놈 카피 (GC)/눈) 또는 IKC116V(8.7x109  GC/눈) 또는 대조군 PBS의 일방적 유리체강내 주사(2μL)를 투여했고, 3주 후 532nm 다이오드 레이저(스팟 크기: 10μm; 전력: 130mW; 시간: 120ms Oculight TX. Iridex Corp)를 사용하여 레이저 광응고에 의해 처리된 눈에서 맥락막 신생혈관 형성을 유도했다. Heidelberg Spectralis HRA 시스템(Heidelberg Engineering)과 피하 주사(30μL/10g)로 투여된 2.5% 나트륨 플루오레세인(Sigma-Aldrich) 용액을 사용하여 레이저 조사 2주 후 플루오레세인 혈관 조영술(FA)을 사용하여 마우스 눈을 이미징했다. 플루오레세인 투여 후 5분 동안 맥락막 초점 수준으로부터 60초마다 연속 형광 이미지(감도: 45, ART 평균: 5프레임)를 촬영했다.
도 16에 예시된 바와 같이, 바이시스트론성 rAAV인 IKC115V 및 IKC116V의 유리체강내 투여는 PBS 대조군 처리된 마우스에 비해 CNV 후 2주째에 FA 이미지로부터 검출된 CNV 누출 면적을 현저히 감소시켰다.
실시예 8 - 생체내 바이시스트론성 rAAV 벡터로부터 발현된 VEGF 포획-2의 임상적으로 관련된 수준의 검출 .
IKC151V 및 IKC152V rAAV 벡터의 유리체강내 전달 후 마우스 유리체 내 VEGF 포획-2 단백질의 농도가 아플리버셉트 단백질(IKC163V로부터 발현됨)의 농도와 비교하여 도 17에 도시되어 있다.
마우스는 IKC151V(2.3x1010 GC/눈), IKC152V(2.7x1010 GC/눈), IKC163V(7.8x109 GC/눈) 또는 IKC166V(2.1x1010 GC/눈)를 유리체강내로 주입했다(2μL). 21일 후, 눈을 재유롭게 해부하고, 유리체 샘플(4 내지 5μL)을 추출했다. 유리체내 VEGF 포획-2 또는 아플리버셉트 단백질의 농도는 상용 IgG ELISA 키트(Abcam)를 사용하여 측정했다. 주목할 점은, 바이시스트론성(IKC151V 및 IKC152V) 처리 눈에서 주사 3주 후 유리체내 VEGF 포획-2의 농도가 도 17에 점선으로 표시된, 환자에서 아플리버셉트 2mg 볼러스의 4주 및 6주째 데이터를 기준으로 아플리버셉트의 예측된 치료적으로 관련된 임상 수준 이상이다는 점이다. 이는 망막하 섬유증의 발달을 약화시키고 잠재적으로 역전시키는 제2 코딩 성분의 포함이 가용성 VEGF의 일반적인 이소형을 중화시키는 벡터의 능력을 감소시키지 않음을 입증한다.
토론 및 결론
실시예에서 예시된 바와 같이, 본 발명자들은 단일 유전자 작제물에서 항-VEGF 단백질과 항섬유화 단백질을 코딩하는 개방 판독 프레임(ORF)을 결합하는 것이 놀랍게도 가능하다는 것을 입증했다.  이는 유전자의 큰 크기를 감안할 때 특히 어려웠으며, 단일 발현 카세트로부터 생리적으로 유용한 농도로 이러한 성분을 공동 발현하고 해당 발현 카세트가 rAAV-2 벡터에 의해 수용되는 것이 가능할 것이라고는 예측할 수 없었다.
실시예에서 입증된 바와 같이, 청구된 작제물 및 벡터의 항-VEGF 단백질은 VEGF 농도를 감소시켜 신생혈관 형성을 방지하고 혈관 누출을 감소시킬 수 있다. 추가로, 항섬유화 단백질의 존재는 섬유증, 흉터 및 염증을 감소시킨다. 유리하게는, 본 발명의 작제물을 사용하면, 종래 기술에 기재된 바와 같은 재조합 단백질을 주입할 필요가 없으며, 작제물은 장기 치료 효과를 달성하기 위해 단일 투여만을 필요로 한다.
참고문헌
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vitelliform macular dystrophy protein-2 (VMD2) promoter <400> 4 aattctgtca ttttactagg gtgatgaaat tcccaagcaa caccatcctt ttcagataag 60 ggcactgagg ctgagagagg agctgaaacc tacccggcgt caccacacac aggtggcaag 120 gctgggacca gaaaccagga ctgttgactg cagcccggta ttcattcttt ccatagccca 180 cagggctgtc aaagacccca gggcctagtc agaggctcct ccttcctgga gagttcctgg 240 cacagaagtt gaagctcagc acagccccct aacccccaac tctctctgca aggcctcagg 300 ggtcagaaca ctggtggagc agatccttta gcctctggat tttagggcca tggtagaggg 360 ggtgttgccc taaattccag ccctggtctc agcccaacac cctccaagaa gaaattagag 420 gggccatggc caggctgtgc tagccgttgc ttctgagcag attacaagaa gggactaaga 480 caaggactcc tttgtggagg tcctggctta gggagtcaag tgacggcggc tcagcactca 540 cgtgggcagt gccagcctct aagagtgggc aggggcactg gccacagagt cccagggagt 600 cccaccagcc tagtcgccag accttctgtg ggatcatcgg acccacctgg aaccccacct 660 gtgagtacaa ggtgccccag gtggactggg ctggggcttt gaggccttca gggttggatg 720 gccatcttgc gtatttgtgt gggatatgca cacacaggca gcacatgcgc aggtgtgtgg 780 gcacctgtgt gtctgtgcaa 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360 ggtgttgccc taaattccag ccctggtctc agcccaacac cctccaagaa gaaattagag 420 gggccatggc caggctgtgc tagccgttgc ttctgagcag attacaagaa gggactaaga 480 caaggactcc tttgtggagg tcctggctta gggagtcaag tgacggcggc tcagcactca 540 cgtgggcagt gccagcctct aagagtgggc aggggcactg gccacagagt cccagggagt 600 cccaccagcc tagtcgccag acc 623 <210> 6 <211> 462 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> truncated form of the VMD2 promoter <400> 6 tcattctttc catagcccac agggctgtca aagaccccag ggcctagtca gaggctcctc 60 cttcctggag agttcctggc acagaagttg aagctcagca cagcccccta acccccaact 120 ctctctgcaa ggcctcaggg gtcagaacac tggtggagca gatcctttag cctctggatt 180 ttagggccat ggtagagggg gtgttgccct aaattccagc cctggtctca gcccaacacc 240 ctccaagaag aaattagagg ggccatggcc aggctgtgct agccgttgct tctgagcaga 300 ttacaagaag ggactaagac aaggactcct ttgtggaggt cctggcttag ggagtcaagt 360 gacggcggct cagcactcac gtgggcagtg ccagcctcta agagtgggca ggggcactgg 420 ccacagagtc ccagggagtc ccaccagcct agtcgccaga cc 462 <210> 7 <211> 500 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> human phosphoglycerate kinase-1 (PGK) promoter <400> 7 gggtagggga ggcgcttttc ccaaggcagt ctggagcatg cgctttagca gccccgctgg 60 gcacttggcg ctacacaagt ggcctctggc ctcgcacaca ttccacatcc accggtaggc 120 gccaaccggc tccgttcttt ggtggcccct tcgcgccacc ttctactcct cccctagtca 180 ggaagttccc ccccgccccg cagctcgcgt cgtgcaggac gtgacaaatg gaagtagcac 240 gtctcactag tctcgtgcag atggacagca ccgctgagca atggaagcgg gtaggccttt 300 ggggcagcgg ccaatagcag ctttgctcct tcgctttctg ggctcagagg ctgggaaggg 360 gtgggtccgg gggcgggctc aggggcgggc tcaggggcgg ggcgggcgcc cgaaggtcct 420 ccggaggccc ggcattctgc acgcttcaaa agcgcacgtc tgccgcgctg ttctcctctt 480 cctcatctcc gggcctttcg 500 <210> 8 <211> 1182 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EF1alpha promoter <400> 8 gctccggtgc ccgtcagtgg gcagagcgca catcgcccac agtccccgag aagttggggg 60 gaggggtcgg caattgaacc ggtgcctaga gaaggtggcg cggggtaaac tgggaaagtg 120 atgtcgtgta ctggctccgc ctttttcccg agggtggggg agaaccgtat ataagtgcag 180 tagtcgccgt gaacgttctt tttcgcaacg ggtttgccgc cagaacacag gtaagtgccg 240 tgtgtggttc ccgcgggcct ggcctcttta cgggttatgg cccttgcgtg ccttgaatta 300 cttccacgcc cctggctgca gtacgtgatt cttgatcccg agcttcgggt tggaagtggg 360 tgggagagtt cgaggccttg cgcttaagga gccccttcgc ctcgtgcttg agttgaggcc 420 tggcttgggc gctggggccg ccgcgtgcga atctggtggc accttcgcgc ctgtctcgct 480 gctttcgata agtctctagc catttaaaat ttttgatgac ctgctgcgac gctttttttc 540 tggcaagata gtcttgtaaa tgcgggccaa gatctgcaca ctggtatttc ggtttttggg 600 gccgcgggcg gcgacggggc ccgtgcgtcc cagcgcacat gttcggcgag gcggggcctg 660 cgagcgcggc caccgagaat cggacggggg tagtctcaag ctggccggcc tgctctggtg 720 cctggcctcg cgccgccgtg tatcgccccg ccctgggcgg caaggctggc ccggtcggca 780 ccagttgcgt gagcggaaag atggccgctt cccggccctg ctgcagggag ctcaaaatgg 840 aggacgcggc gctcgggaga gcgggcgggt gagtcaccca cacaaaggaa aagggccttt 900 ccgtcctcag ccgtcgcttc atgtgactcc acggagtacc gggcgccgtc caggcacctc 960 gattagttct cgagcttttg gagtacgtcg tctttaggtt ggggggaggg gttttatgcg 1020 atggagtttc cccacactga gtgggtggag actgaagtta ggccagcttg gcacttgatg 1080 taattctcct tggaatttgc cctttttgag tttggatctt ggttcattct caagcctcag 1140 acagtggttc aaagtttttt tcttccattt caggtgtcgt ga 1182 <210> 9 <211> 230 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EF1alpha without the large intron promoter <400> 9 gctccggtgc ccgtcagtgg gcagagcgca catcgcccac agtccccgag aagttggggg 60 gaggggtcgg caattgaacc ggtgcctaga gaaggtggcg cggggtaaac tgggaaagtg 120 atgtcgtgta ctggctccgc ctttttcccg agggtggggg agaaccgtat ataagtgcag 180 tagtcgccgt gaacgttctt tttcgcaacg ggtttgccgc cagaacacag 230 <210> 10 <211> 252 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> an anti-VEGF single chain variable fragment (SCVF-1) <400> 10 Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Ser Ala Ser Gln Asp Ile Ser Asn Tyr 20 25 30 Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Val Leu Ile 35 40 45 Tyr Phe Thr Ser Ser Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr 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cccttctagc ctgtccgcct ctgtgggcga cagggtgacc 60 atcacatgta gcgcctccca ggatatctcc aactatctga attggtacca gcagaagcca 120 ggcaaggccc ccaaggtgct gatctatttc acctcctctc tgcacagcgg cgtgccatcc 180 agattctctg gcagcggctc cggcaccgac tttaccctga caatcagctc cctgcagcca 240 gaggatttcg ccacatacta ttgccagcag tacagcaccg tgccctggac atttggccag 300 ggcaccaagg tggagatcaa gaggggagga ggaggaggat ctggaggagg aggcagcggc 360 ggcggcggct ccggcggcgg cggctctgag gtgcagctgg tggagtccgg aggaggcctg 420 gtgcagccag gaggatctct gaggctgagc tgtgccgcct ccggctatga cttcacccac 480 tacggaatga actgggtgcg ccaggcacct ggcaagggac tggagtgggt gggctggatc 540 aatacctata caggcgagcc aacctacgcc gccgacttta agcggcggtt caccttcagc 600 ctggatacct ctaagagcac agcctacctg cagatgaact ccctgagggc agaggacacc 660 gccgtgtact attgcgccaa gtatccttac tattacggca caagccactg gtacttcgac 720 gtgtggggac agggcaccct ggtgacagtg tctagc 756 <210> 12 <211> 252 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> anti-VEGF single chain variable fragment (SCVF-2) <400> 12 Asp Ile Gln 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ctggacacca gcaagagcac cgcctacctg cagatgaaca gcctgcgcgc cgaggacacc 660 gccgtgtact actgcgccaa gtacccccac tactacggca gcagccactg gtacttcgac 720 gtgtggggcc agggcaccct ggtgaccgtg agcagc 756 <210> 14 <211> 255 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> anti-VEGF single chain variable fragment (SCFV-3) <400> 14 Met Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ser Thr Leu Ser Ala Ser Val 1 5 10 15 Gly Asp Arg Val Ile Ile Thr Cys Gln Ala Ser Glu Ile Ile His Ser 20 25 30 Trp Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu 35 40 45 Ile Tyr Leu Ala Ser Thr Leu Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser 50 55 60 Gly Ser Gly Ser Gly Ala Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln 65 70 75 80 Pro Asp Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Asn Val Tyr Leu Ala Ser 85 90 95 Thr Asn Gly Ala Asn Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Gly 100 105 110 Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly 115 120 125 Gly Gly Gly Ser Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val 130 135 140 Gln Pro Gly Gly Ser 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Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser 245 <210> 34 <211> 747 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> nucleic acid sequence encoding anti-CTGF SCVF-1 <400> 34 gacatccaga tgacccagag ccccagcagc ctgagcgcca gcgtgggcga ccgcgtgacc 60 atcacctgcc gcgccagcca gggcatcagc agctggctgg cctggtacca gcagaagccc 120 gagaaggccc ccaagagcct gatctacgcc gccagcagcc tccagagcgg cgtgcccagc 180 cgcttcagcg gcagcggcag cggcaccgac ttcaccctga ccatcagcag cctccagccc 240 gaggacttcg ccacctacta ctgccagcag tacaacagct acccccccac cttcggccag 300 ggcaccaagc tggagatcaa gcgcggcggc ggcggcggca gcggcggcgg cggcagcggc 360 ggcggcggca gcggcggcgg cggcagcgag ggccagctgg tgcagagcgg cggcggcctg 420 gtgcaccccg gcggcagcct gcgcctgagc tgcgccggca gcggcttcac cttcagcagc 480 tacggcatgc actgggtgcg ccaggccccc ggcaagggcc tggagtgggt gagcggcatc 540 ggcaccggcg gcggcaccta cagcaccgac agcgtgaagg gccgcttcac catcagccgc 600 gacaacgcca agaacagcct gtacctccag atgaacagcc tgcgcgccga ggacatggcc 660 gtgtactact gcgcccgcgg cgactactac ggcagcggca gcttcttcga ctgctggggc 720 cagggcaccc tggtgaccgt gagcagc 747 <210> 35 <211> 241 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> anti-CTGF single chain variable fragment (anti-CTGF SCVF-2) <400> 35 Ala Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Arg Pro Gly 1 5 10 15 Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Asp 20 25 30 Tyr Gly Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp 35 40 45 Val Ser Tyr Ile Ser Ser Ser Gly Ser Thr Ile Tyr Tyr Ala Asp Ser 50 55 60 Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu 65 70 75 80 Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr 85 90 95 Cys Ala Arg Gly Ile Thr Glu Thr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr 100 105 110 Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Ser 115 120 125 Ala Leu Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Thr Pro 130 135 140 Gly Gln Arg Val Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly 145 150 155 160 Ser Asn Thr Val Asn Trp Tyr Gln Gln Leu Pro Gly Thr Ala Pro Lys 165 170 175 Leu Leu Ile Tyr Ser Asn Asn Gln Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg 180 185 190 Phe Ser Gly Ser Lys Ser Gly Thr Ser Ala Ser Leu Ala Ile Ser Gly 195 200 205 Leu Gln Ser Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ala Ala Trp Asp Asp 210 215 220 Ser Leu Gly Ala Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Gly 225 230 235 240 Ala <210> 36 <211> 723 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> nucleic acid sequence encoding the anti-CTGF SCVF-2 <400> 36 gccgaggtgc agctggtgga gagcggcggc ggcgtggtgc ggcctggcgg cagcctgcgc 60 ctgagctgcg ccgccagcgg cttcaccttc gacgactacg gcatgagctg ggtgcgccag 120 gctccaggca agggcctgga gtgggtgagc tacatcagca gcagcggcag caccatctac 180 tacgccgaca gcgtgaaggg ccgcttcacc atcagccgcg acaacgccaa gaacagcctg 240 tacctgcaga tgaacagcct gcgcgccgag gacaccgccg tgtactactg cgcacgaggc 300 atcaccgaga cctggggcca gggcaccctg gtgaccgtga gcagcggcgg cggcggcagc 360 ggcggcggcg gcagcggcgg cagcgccctg cagagcgtgc tgacccagcc acccagcgcc 420 agcggcaccc ctggccagcg cgtgaccatc agctgcagcg gcagcagcag caacatcggc 480 agcaacaccg tgaactggta ccagcagctg cccggcaccg cgcctaagct gctgatctac 540 agcaacaacc agcgccccag cggcgtgccc gaccgcttca gcggcagcaa gagcggcacc 600 agcgccagcc tggccatcag cggcctgcag agcgaggacg aggccgacta ctactgcgcc 660 gcctgggacg acagcctggg cgccgtgttc ggcggcggca ccaagctgac cgtgctgggc 720 gcc 723 <210> 37 <211> 19 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> P2A peptide spacer sequence <400> 37 Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn 1 5 10 15 Pro Gly Pro <210> 38 <211> 57 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> nucleic acid sequence encoding P2A peptide spacer sequence <400> 38 gccaccaact tcagcctgct gaagcaggcc ggcgacgtgg aggagaaccc cggcccc 57 <210> 39 <211> 20 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> E2A peptide spacer sequence <400> 39 Gln Cys Thr Asn Tyr Ala Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp Val Glu Ser 1 5 10 15 Asn Pro Gly Pro 20 <210> 40 <211> 60 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> nucleic acid sequence encoding E2A peptide spacer sequence <400> 40 cagtgcacca actacgccct gctgaagctg gccggcgacg tggagagcaa ccccggcccc 60 <210> 41 <211> 18 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> T2A peptide spacer sequence <400> 41 Glu Gly Arg Gly Ser Leu Leu Thr Cys Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro 1 5 10 15 Gly Pro <210> 42 <211> 54 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> nucleic acid sequence encoding T2A peptide spacer sequence <400> 42 gagggccgcg gcagcctgct gacctgcggc gacgtggagg agaaccccgg cccc 54 <210> 43 <211> 22 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> F2A peptide spacer sequence <400> 43 Val Lys Gln Thr Leu Asn Phe Asp Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp Val 1 5 10 15 Glu Ser Asn Pro Gly Pro 20 <210> 44 <211> 66 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> nucleic acid sequence encoding F2A peptide spacer sequence <400> 44 gtgaagcaga ccctgaactt cgacctgctg aagctggccg gcgacgtgga gagcaacccc 60 ggcccc 66 <210> 45 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> viral-2A removal sequence consensus sequence <220> <221> VARIANT <222> (1)..(1) <223> X = basic amino acid <220> <221> VARIANT <222> (2)..(2) <223> X = basic amino acid <220> <221> VARIANT <222> (3)..(3) <223> X = hydrophilic amino acid <220> <221> VARIANT <222> (4)..(4) <223> X = basic amino acid <220> <221> VARIANT <222> (5)..(5) <223> X = basic amino acid <400> 45 Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Ser 1 5 <210> 46 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> viral-2A removal sequence wherein the hydrophilic amino acid is serine (S) <400> 46 Arg Arg Ser Lys Arg Ser Gly Ser Gly 1 5 <210> 47 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> nucleic acid sequence encoding viral-2A removal sequence wherein the hydrophilic amino acid is serine (S) <400> 47 cgccgcagca agcgcagcgg cagcggc 27 <210> 48 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> viral-2A removal sequence wherein the hydrophilic amino acid is threonine (T) <400> 48 Arg Arg Thr Lys Arg Ser Gly Ser Gly 1 5 <210> 49 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> nucleic acid sequence encoding viral-2A removal sequence wherein the hydrophilic amino acid is threonine (T) <400> 49 cgccgcacca agcgcagcgg cagcggc 27 <210> 50 <211> 7 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> viral-2A removal sequence <400> 50 Arg Val Arg Arg Gly Ser Gly 1 5 <210> 51 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> nucleic acid sequence encoding viral-2A removal sequence of SEQ ID NO: 50 <400> 51 cgcgtgcgcc gcggcagcgg c 21 <210> 52 <211> 8 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> gelatinase MMP-2 recognition sequence <400> 52 Gly Pro Gln Gly Ile Ala Gly Gln 1 5 <210> 53 <211> 8 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> gelatinase MMP-2 recognition sequence <400> 53 Gly Pro Leu Gly Ile Ala Gly Ala 1 5 <210> 54 <211> 8 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> gelatinase MMP-2 recognition sequence <400> 54 Gly Pro Gln Gly Leu Leu Gly Gln 1 5 <210> 55 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> gelatinase MMP-2 recognition sequence and the tripeptide GSG linker sequence <400> 55 Gly Pro Gln Gly Ile Ala Gly Gln Gly Ser Gly 1 5 10 <210> 56 <211> 33 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> nucleic acid sequence encoding gelatinase MMP-2 recognition sequence and the tripeptide GSG linker sequence <400> 56 ggccccctgg gcatcgccgg ccagggcagc ggc 33 <210> 57 <211> 8 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> renin recognition sequence <400> 57 His Pro Phe His Leu Val Tyr Ser 1 5 <210> 58 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> renin recognition sequence <400> 58 His Pro Phe His Leu Leu Val Tyr Ser 1 5 <210> 59 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> renin recognition sequence and the tripeptide GSG linker sequence <400> 59 His Pro Phe His Leu Leu Val Tyr Ser Gly Ser Gly 1 5 10 <210> 60 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> nucleic acid sequence encoding renin recognition sequence and the tripeptide GSG linker sequence <400> 60 cgccccttcc acctgctggt catccacggc agcggc 36 <210> 61 <211> 592 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Woodchuck Hepatitis Virus Post-transcriptional Regulatory Element (WPRE) <400> 61 aatcaacctc tggattacaa aatttgtgaa agattgactg gtattcttaa ctatgttgct 60 ccttttacgc tatgtggata cgctgcttta atgcctttgt atcatgctat tgcttcccgt 120 atggctttca ttttctcctc cttgtataaa tcctggttgc tgtctcttta tgaggagttg 180 tggcccgttg tcaggcaacg tggcgtggtg tgcactgtgt ttgctgacgc aacccccact 240 ggttggggca ttgccaccac ctgtcagctc ctttccggga ctttcgcttt ccccctccct 300 attgccacgg cggaactcat cgccgcctgc cttgcccgct gctggacagg ggctcggctg 360 ttgggcactg acaattccgt ggtgttgtcg gggaagctga cgtcctttcc atggctgctc 420 gcctgtgttg ccacctggat tctgcgcggg acgtccttct gctacgtccc ttcggccctc 480 aatccagcgg accttccttc ccgcggcctg ctgccggctc tgcggcctct tccgcgtctt 540 cgccttcgcc ctcagacgag tcggatctcc ctttgggccg cctccccgcc tg 592 <210> 62 <211> 247 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> truncated WPRE <400> 62 aatcaacctc tggattacaa aatttgtgaa agattgactg gtattcttaa ctatgttgct 60 ccttttacgc tatgtggata cgctgcttta atgcctttgt atcatgctat tgcttcccgt 120 atggctttca ttttctcctc cttgtataaa tcctggttag ttcttgccac ggcggaactc 180 atcgccgcct gccttgcccg ctgctggaca ggggctcggc tgttgggcac tgacaattcc 240 gtggtgt 247 <210> 63 <211> 224 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> the simian virus-40 poly-A nucleotide sequence <400> 63 agcagacatg ataagataca ttgatgagtt tggacaaacc acaactagaa tgcagtgaaa 60 aaaatgcttt atttgtgaaa tttgtgatgc tattgcttta tttgtaacca ttataagctg 120 caataaacaa gttaacaaca acaattgcat tcattttatg tttcaggttc agggggaggt 180 gtgggaggtt ttttaaagca agtaaaacct ctacaaatgt ggta 224 <210> 64 <211> 169 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> nucleotide sequence polyA component <400> 64 ttcgagcaac ttgtttattg cagcttataa tggttacaaa taaagcaata gcatcacaaa 60 tttcacaaat aaagcatttt tttcactgca ttctagttgt ggtttgtcca aactcatcaa 120 tgtatcttat catgtctgga tcgtctagca tcgaagatcc cccgatctg 169 <210> 65 <211> 128 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> left ITR sequence taken from a commercially available recombinant AAV genome plasmid <400> 65 cgcgctcgct cgctcactga ggccgcccgg gcaaagcccg ggcgtcgggc gacctttggt 60 cgcccggcct cagtgagcga gcgagcgcgc agagagggag tggccaactc catcactagg 120 ggttcctt 128 <210> 66 <211> 128 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> right ITR sequence taken from a commercially available recombinant AAV genome plasmid <400> 66 aggaacccct agtgatggag ttggccactc cctctctgcg cgctcgctcg ctcactgagg 60 ccgggcgacc aaaggtcgcc cgacgcccgg gctttgcccg ggcggcctca gtgagcgagc 120 gagcgcgc 128 <210> 67 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> minute virus of mice (MVM) small intron <400> 67 aggtacgatg gcgcctccag ctaaaagagc taaaagaggt aagggtttaa gggatggttg 60 gttggtgggg tattaatgtt taattacctg ttttacaggc ctgaaatcac ttggttttag 120 g 121 <210> 68 <211> 133 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> sequence from the 5'-donor sites of the first intron of the human beta-globin gene and the branch and 3'-acceptor sites from the intron of an immunoglobulin gene heavy chain variable region <400> 68 gtaagtatca aggttacaag acaggtttaa ggagaccaat agaaactggg cttgtcgaga 60 cagagaagac tcttgcgttt ctgataggca cctattggtc ttactgacat ccactttgcc 120 tttctctcca cag 133 <210> 69 <211> 210 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> fusion of 5' and 3' nucleotide components of the splice acceptor of the rabbit beta-globulin gene 1 <400> 69 gtgagcgggc gggacggccc ttctcctccg ggctgtaatt agcgcttggt ttaatgacgg 60 cttgtttctt ttctgtggct gcgtgaaagc cttgaggggc tccgggaggc tagagcctct 120 gctaaccatg ttcatgcctt cttctttttc ctacagctcc tgggcaacgt gctggttatt 180 gtgctgtctc atcattttgg caaagaattc 210 <210> 70 <211> 19 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> signal peptide <400> 70 Met Arg Arg Phe Leu Thr Val Ile Ser Phe Leu Leu Tyr Phe Gly Cys 1 5 10 15 Ala Phe Ala <210> 71 <211> 57 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> nucleic acid sequence encoding signal peptide <400> 71 atgcgccgct tcctgaccgt gatcagcttc ctgctgtact tcggctgcgc cttcgcc 57 <210> 72 <211> 19 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> signal peptide modified to enhance secretion from target cells <400> 72 Met Arg Arg Leu Val Leu Leu Leu Cys Ile Gly Ala Leu Leu Gly His 1 5 10 15 Ser Lys Ala <210> 73 <211> 57 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> nucleic acid sequence encoding signal peptide modified to enhance secretion from target cells <400> 73 atgcgccgcc tggtgctgct gctgtgcatc ggcgccctgc tgggccacag caaggcc 57 <210> 74 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> signal peptide <400> 74 Met Arg Arg Leu Leu Thr Phe Ile Ser Ile Leu Ala 1 5 10 <210> 75 <211> 45 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> nucleic acid sequence encoding signal peptide of SEQ ID NO: 74 <400> 75 atgaagaagc tgctgatcct ggccctggtg ggcgccgccg tggcc 45 <210> 76 <211> 18 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> signal peptide <400> 76 Met Arg Arg Leu Leu Thr Phe Ile Ser Ile Leu Ala Leu Val Gly Ala 1 5 10 15 Phe Ala <210> 77 <211> 54 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> nucleic acid sequence encoding signal peptide of SEQ ID NO: 76 <400> 77 atgcgccgcc tgctgacctt catcagcatc ctggccctgg tgggcgcctt cgcc 54 <210> 78 <211> 19 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> signal peptide <400> 78 Met Arg Arg Leu Leu Thr Phe Ile Ser Ile Leu Ala Leu Val Gly Ala 1 5 10 15 Ala Phe Ala <210> 79 <211> 57 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> nucleic acid sequence encoding signal peptide of SEQ ID NO: 78 <400> 79 atgcgccgcc tgctgacctt catcagcatc ctggccctgg tgggcgccgc cttcgcc 57 <210> 80 <211> 746 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> VEGF capture protein-2-furin-P2A-anti-CTGF SCVF-1 <400> 80 Met Arg Arg Leu Leu Thr Phe Ile Ser Ile Leu Ala Leu Val Gly Ala 1 5 10 15 Ala Phe Ala Ser Asp Thr Gly Arg Pro Phe Val Glu Met Tyr Ser Glu 20 25 30 Ile Pro Glu Ile Ile His Met Thr Glu Gly Arg Glu Leu Val Ile Pro 35 40 45 Cys Arg Val Thr Ser Pro Asn Ile Thr Val Thr Leu Lys Lys Phe Pro 50 55 60 Leu Asp Thr Leu Ile Pro Asp Gly Lys Arg Ile Ile Trp Asp Ser Arg 65 70 75 80 Lys Gly Phe Ile Ile Ser Asn Ala Thr Tyr Lys Glu Ile Gly Leu Leu 85 90 95 Thr Cys Glu Ala Thr Val Asn Gly His Leu Tyr Lys Thr Asn Tyr Leu 100 105 110 Thr His Arg Gln Thr Asn Thr Ile Ile Asp Val Val Leu Ser Pro Ser 115 120 125 His Gly Ile Glu Leu Ser Val Gly Glu Lys Leu Val Leu Asn Cys Thr 130 135 140 Ala Arg Thr Glu Leu Asn Val Gly Ile Asp Phe Asn Trp Glu Tyr Pro 145 150 155 160 Ser Ser Lys His Gln His Lys Lys Leu Val Asn Arg Asp Leu Lys Thr 165 170 175 Gln Ser Gly Ser Glu Met Lys Lys Phe Leu Ser Thr Leu Thr Ile Asp 180 185 190 Gly Val Thr Arg Ser Asp Gln Gly Leu Tyr Thr Cys Ala Ala Ser Ser 195 200 205 Gly Leu Met Thr Lys Lys Asn Ser Thr Phe Val Arg Val His Glu Lys 210 215 220 Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly 225 230 235 240 Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met 245 250 255 Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser 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tacgtggacg gcgtggaggt gcacaacgcc aagaccaagc cccgcgagga gcagtacaac 1980 agcacctacc gcgtggtgag cgtgctgacc gtgctggccc aggactggct gaacggcaag 2040 gagtacaagt gcaaggtgag caacaaggcc ctgggcgccc ccatcgagaa gaccatcagc 2100 aaggccaagg gccagccccg cgagccccag gtgtacaccc tgccccccag ccgcgacgag 2160 ctgaccaaga accaggtgag cctgacctgc ctggtgaagg gcttctaccc cagcgacatc 2220 gccgtggagt gggagagcaa cggccagccc gagaacaact acaagaccac cccccccgtg 2280 ctggacagcg acggcagctt cttcctgtac agcaagctga ccgtggacaa gagccgctgg 2340 cagcagggca acgtgttcag ctgcagcgtg atgcacgagg ccctgcacaa cgcctacacc 2400 cagaagagcc tgagcctgag ccccggctaa 2430 <210> 96 <211> 4246 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> recombinant vector (e.g. known as "IKC153P") <400> 96 cgcgctcgct cgctcactga ggccgcccgg gcaaagcccg ggcggcctca gtgagcgagc 60 gagcgcgcag agagggagtg gccaactcca tcactagggg ttccttgtag ttaatgatta 120 acccgccatg ctacttatct acgtagccat gctctagaca tggctcgaca gatcgagctc 180 caccgggtac cctagttatt aatagtaatc aattacgggg tcattagttc atagcccata 240 tatggagttc cgcgttacat aacttacggt aaatggcccg cctggctgac cgcccaacga 300 cccccgccca ttgacgtcaa taatgacgta tgttcccata gtaacgccaa tagggacttt 360 ccattgacgt caatgggtgg actatttacg gtaaactgcc cacttggcag tacatcaagt 420 gtatcatatg ccaagtacgc cccctattga cgtcaatgac ggtaaatggc ccgcctggca 480 ttatgcccag tacatgacct tatgggactt tcctacttgg cagtacatct acgtattagt 540 catcgctatt accatggtcg aggtgagccc cacgttctgc ttcactctcc ccatctcccc 600 cccctcccca cccccaattt tgtatttatt tattttttaa ttattttgtg cagcgatggg 660 ggcggggggg gggggggggc gcgcgccagg cggggcgggg cggggcgagg ggcggggcgg 720 ggcgaggcgg agaggtgcgg cggcagccaa tcagagcggc gcgctccgaa agtttccttt 780 tatggcgagg cggcggcggc ggcggcccta taaaaagcga agcgcgcggc gggcgggagt 840 cgctgcgacg ctgccttcgc cccgtgcccc gctccgccgc cgcctcgcgc cgcccgcccc 900 ggctctgact gaccgcgtta ctcccacagg tgagcgggcg ggacggccct tctcctccgg 960 gctgtaatta gcgcttggtt taatgacggc ttgtttcttt tctgtggctg cgtgaaagcc 1020 ttgaggggct ccgggaggct agagcctctg ctaaccatgt tcatgccttc ttctttttcc 1080 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acaccctgat gatcagccgc acccccgagg tgacctgcgt ggtggtggac gtgagccacg 1980 aggaccccga ggtgaagttc aactggtacg tggacggcgt ggaggtgcac aacgccaaga 2040 ccaagccccg cgaggagcag tacaacagca cctaccgcgt ggtgagcgtg ctgaccgtgc 2100 tggcccagga ctggctgaac ggcaaggagt acaagtgcaa ggtgagcaac aaggccctgg 2160 gcgcccccat cgagaagacc atcagcaagg ccaagggcca gccccgcgag ccccaggtgt 2220 acaccctgcc ccccagccgc gacgagctga ccaagaacca ggtgagcctg acctgcctgg 2280 tgaagggctt ctaccccagc gacatcgccg tggagtggga gagcaacggc cagcccgaga 2340 acaactacaa gaccaccccc cccgtgctgg acagcgacgg cagcttcttc ctgtacagca 2400 agctgaccgt ggacaagagc cgctggcagc agggcaacgt gttcagctgc agcgtgatgc 2460 acgaggccct gcacaacgcc tacacccaga agagcctgag cctgagcccc ggccgccgca 2520 gcaagcgcag cggcagcggc gccaccaact tcagcctgct gaagcaggcc ggcgacgtgg 2580 aggagaaccc cggccccatg cgccgcttcc tgaccgtgat cagcttcctg ctgtacttcg 2640 gctgcgcctt cgccgacatc cagatgaccc agagccccag cagcctgagc gccagcgtgg 2700 gcgaccgcgt gaccatcacc tgccgcgcca gccagggcat cagcagctgg ctggcctggt 2760 accagcagaa gcccgagaag gcccccaaga gcctgatcta cgccgccagc agcctccaga 2820 gcggcgtgcc cagccgcttc agcggcagcg gcagcggcac cgacttcacc ctgaccatca 2880 gcagcctcca gcccgaggac ttcgccacct actactgcca gcagtacaac agctaccccc 2940 ccaccttcgg ccagggcacc aagctggaga tcaagcgcgg cggcggcggc ggcagcggcg 3000 gcggcggcag cggcggcggc ggcagcggcg gcggcggcag cgagggccag ctggtgcaga 3060 gcggcggcgg cctggtgcac cccggcggca gcctgcgcct gagctgcgcc ggcagcggct 3120 tcaccttcag cagctacggc atgcactggg tgcgccaggc ccccggcaag ggcctggagt 3180 gggtgagcgg catcggcacc ggcggcggca cctacagcac cgacagcgtg aagggccgct 3240 tcaccatcag ccgcgacaac gccaagaaca gcctgtacct ccagatgaac agcctgcgcg 3300 ccgaggacat ggccgtgtac tactgcgccc gcggcgacta ctacggcagc ggcagcttct 3360 tcgactgctg gggccagggc accctggtga ccgtgagcag ctaagtatac tactagtacg 3420 cggccgcacc ggtgtacaat caacctctgg attacaaaat ttgtgaaaga ttgactggta 3480 ttcttaacta tgttgctcct tttacgctat gtggatacgc tgctttaatg cctttgtatc 3540 atgctattgc ttcccgtatg gctttcattt tctcctcctt gtataaatcc tggttagttc 3600 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atcgagctga gcgtgggcga gaagctggtg 420 ctgaactgca ccgcccgcac cgagctgaac gtgggcatcg acttcaactg ggagtacccc 480 agcagcaagc accagcacaa gaagctggtg aaccgcgacc tgaagaccca gagcggcagc 540 gagatgaaga agttcctgag caccctgacc atcgacggcg tgacccgcag cgaccagggc 600 ctgtacacct gcgccgccag cagcggcctg atgaccaaga agaacagcac cttcgtgcgc 660 gtgcacgaga aggacaagac ccacacctgc cccccctgcc ccgcccccga ggccgccggc 720 ggccccagcg tgttcctgtt cccccccaag cccaaggaca ccctgatgat cagccgcacc 780 cccgaggtga cctgcgtggt ggtggacgtg agccacgagg accccgaggt gaagttcaac 840 tggtacgtgg acggcgtgga ggtgcacaac gccaagacca agccccgcga ggagcagtac 900 aacagcacct accgcgtggt gagcgtgctg accgtgctgg cccaggactg gctgaacggc 960 aaggagtaca agtgcaaggt gagcaacaag gccctgggcg cccccatcga gaagaccatc 1020 agcaaggcca agggccagcc ccgcgagccc caggtgtaca ccctgccccc cagccgcgac 1080 gagctgacca agaaccaggt gagcctgacc tgcctggtga agggcttcta ccccagcgac 1140 atcgccgtgg agtgggagag caacggccag cccgagaaca actacaagac cacccccccc 1200 gtgctggaca gcgacggcag cttcttcctg tacagcaagc 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Gln 645 650 655 Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu Ala Gln 660 665 670 Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala 675 680 685 Leu Gly Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro 690 695 700 Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr 705 710 715 720 Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser 725 730 735 Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr 740 745 750 Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr 755 760 765 Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe 770 775 780 Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn Ala Tyr Thr Gln Lys 785 790 795 800 Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly 805 <210> 107 <211> 2421 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> nucleic acid sequence encoding sCD46-furin-P2A-VEGF capture protein 2 <400> 107 atgcgccgct tcctgaccgt gatcagcttc ctgctgtact tcggctgcgc cttcgcctgc 60 gaggagcccc ccaccttcga ggccatggag ctgatcggca agcccaagcc ctactacgag 120 atcggcgagc gcgtggacta caagtgcaag aagggctact tctacatccc ccccctggcc 180 acccacacca tctgcgaccg caaccacacc tggctgcccg tgagcgacga cgcctgctac 240 cgcgagacct gcccctacat ccgcgacccc ctgaacggcc aggccgtgcc cgccaacggc 300 acctacgagt tcggctacca gatgcacttc atctgcaacg agggctacta cctgatcggc 360 gaggagatcc tgtactgcga gctgaagggc agcgtggcca tctggagcgg caagcccccc 420 atctgcgaga aggtgctgtg cacccccccc cccaagatca agaacggcaa gcacaccttc 480 agcgaggtgg aggtgttcga gtacctggac gccgtgacct acagctgcga ccccgccccc 540 ggccccgacc ccttcagcct gatcggcgag agcaccatct actgcggcga caacagcgtg 600 tggagccgcg ccgcccccga gtgcaaggtg gtgaagtgcc gcttccccgt ggtggagaac 660 ggcaagcaga tcagcggctt cggcaagaag ttctactaca aggccaccgt gatgttcgag 720 tgcgacaagg gcttctacct ggacggcagc gacaccatcg tgtgcgacag caacagcacc 780 tgggaccccc ccgtgcccaa gtgcctgaag gtgctgcccc ccagcagcac caagcccccc 840 gccctgagcc acagcgtgag caccagcagc accaccaaga gccccgccag cagcgccagc 900 ggcccccgcc ccacctacaa gccccccgtg agcaactacc ccggctaccc caagcccgag 960 gagggcatcc tggacagcct ggacgtgcgc cgcagcaagc gcagcggcag cggcgccacc 1020 aacttcagcc tgctgaagca ggccggcgac gtggaggaga accccggccc catgcgccgc 1080 ctgctgacct tcatcagcat cctggccctg gtgggcgccg ccttcgccag cgacaccggc 1140 cgccccttcg tggagatgta cagcgagatc cccgagatca tccacatgac cgagggccgc 1200 gagctggtga tcccctgccg cgtgaccagc cccaacatca ccgtgaccct gaagaagttc 1260 cccctggaca ccctgatccc cgacggcaag cgcatcatct gggacagccg caagggcttc 1320 atcatcagca acgccaccta caaggagatc ggcctgctga cctgcgaggc caccgtgaac 1380 ggccacctgt acaagaccaa ctacctgacc caccgccaga ccaacaccat catcgacgtg 1440 gtgctgagcc ccagccacgg catcgagctg agcgtgggcg agaagctggt gctgaactgc 1500 accgcccgca ccgagctgaa cgtgggcatc gacttcaact gggagtaccc cagcagcaag 1560 caccagcaca agaagctggt gaaccgcgac ctgaagaccc agagcggcag cgagatgaag 1620 aagttcctga gcaccctgac catcgacggc gtgacccgca gcgaccaggg cctgtacacc 1680 tgcgccgcca gcagcggcct gatgaccaag aagaacagca ccttcgtgcg cgtgcacgag 1740 aaggacaaga cccacacctg ccccccctgc cccgcccccg aggccgccgg cggccccagc 1800 gtgttcctgt tcccccccaa gcccaaggac accctgatga tcagccgcac ccccgaggtg 1860 acctgcgtgg tggtggacgt gagccacgag gaccccgagg tgaagttcaa ctggtacgtg 1920 gacggcgtgg aggtgcacaa cgccaagacc aagccccgcg aggagcagta caacagcacc 1980 taccgcgtgg tgagcgtgct gaccgtgctg gcccaggact ggctgaacgg caaggagtac 2040 aagtgcaagg tgagcaacaa ggccctgggc gcccccatcg agaagaccat cagcaaggcc 2100 aagggccagc cccgcgagcc ccaggtgtac accctgcccc ccagccgcga cgagctgacc 2160 aagaaccagg tgagcctgac ctgcctggtg aagggcttct accccagcga catcgccgtg 2220 gagtgggaga gcaacggcca gcccgagaac aactacaaga ccaccccccc cgtgctggac 2280 agcgacggca gcttcttcct gtacagcaag ctgaccgtgg acaagagccg ctggcagcag 2340 ggcaacgtgt tcagctgcag cgtgatgcac gaggccctgc acaacgccta cacccagaag 2400 agcctgagcc tgagccccgg c 2421

Claims (51)

  1. 항-VEGF 단백질을 인코딩(encoding)하는 제1 코딩 서열(first coding sequence), 및 항섬유화 단백질(anti-fibrotic protein)을 인코딩하는 제2 코딩 서열에 작동 가능하게 연결된 프로모터를 포함하는, 유전자 작제물(genetic construct).
  2. 제1항에 있어서, 상기 프로모터가 사이토메갈로바이러스(CMV) 프로모터, CMV 초기 인핸서 요소(early enhancer element)와 닭 베타-액틴 유전자(chicken beta-actin gene; CAG)의 제1 인트론의 융합체(fusion), 유리체 황반 이영양증 단백질-2(vitelliform macular dystrophy protein-2; VMD2) 프로모터, 인간 포스포글리세레이트 키나제-1(PGK-1) 프로모터 또는 EF1α 프로모터이며, 임의로 상기 프로모터가 실질적으로 서열번호 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 또는 9에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함하는, 유전자 작제물.
  3. 제1항 또는 제2항에 있어서, 상기 제1 코딩 서열이 VEGF-A, VEGF-B, VEGF-C, VEGF-D 및/또는 태반 성장 인자(placenta growth factor; PIGF)를 포함하는, VEGF의 모든 가용성 형태를 포획(capturing)할 수 있는 항-VEGF 단백질을 인코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는, 유전자 작제물. 
  4. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 제1 코딩 서열이 VEGF-A를 특이적으로 포획하는 항-VEGF 단백질을 인코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하고, 임의로 상기 항-VEGF 단백질이 VEGF-121, VEGF-145, VEGF-165, VEGF-183, VEGF-189 및/또는 VEGF-206을 포함하는, VEGF-A의 모든 이소형(isoform)을 포획할 수 있는, 유전자 작제물.
  5. 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항-VEGF 단백질이 항-VEGF 항체, 또는 이의 항원 결합 단편이며, 임의로 상기 항-VEGF 단백질이 단일 쇄 가변 단편(single chain variable fragment; SCVF)인, 유전자 작제물.
  6. 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 제1 코딩 서열이 실질적으로 서열번호 11, 13, 15, 17, 19 또는 21 중 어느 하나에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함하고/하거나, 상기 제1 코딩 서열이 실질적으로 서열번호 10, 12, 14, 16, 18 또는 20에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩하는, 유전자 작제물.
  7. 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항섬유화 단백질이 항-보체 단백질(anti-complement protein)인, 유전자 작제물.
  8. 제7항에 있어서, 상기 항-보체 단백질이 보체 활성화를 중화시키거나 약화시킬 수 있는, 유전자 작제물.
  9. 제7항 또는 제8항에 있어서, 상기 항-보체 단백질이 보체 시스템의 대체 경로(alternative pathway; AP)를 표적화(targeting)할 수 있고, 바람직하게는 상기 항-보체 단백질이 보체 시스템의 고전적 경로(classical pathway; CP) 및/또는 렉틴 경로(lectin pathway; LP)를 표적화하지 않는, 유전자 작제물.
  10. 제7항 내지 제9항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항-보체 단백질이 항-C3b 또는 항-Bb 항체, 또는 이의 항원 결합 단편이고, 임의로 상기 항-보체 단백질이 단일 쇄 가변 단편(SCVF)인, 유전자 작제물.
  11. 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 제2 코딩 서열이 실질적으로 서열번호 23 또는 25에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함하고/하거나, 상기 제2 코딩 서열이 실질적으로 서열번호 22 또는 24에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩하는, 유전자 작제물.
  12. 제7항에 있어서, 상기 항-보체 단백질이 CD55, 바람직하게는 가용성 CD55(sCD55)인, 유전자 작제물.
  13. 제12항에 있어서, 상기 제2 코딩 서열이 실질적으로 서열번호 27에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함하고/하거나, 상기 제2 코딩 서열이 실질적으로 서열번호 26에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩하는, 유전자 작제물.
  14. 제7항에 있어서, 상기 항-보체 단백질이 보체 인자 H 관련 단백질-1(CFHR1)인, 유전자 작제물.
  15. 제14항에 있어서, 상기 제2 코딩 서열이 실질적으로 서열번호 29 또는 30에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함하고/하거나, 상기 제2 코딩 서열이 실질적으로 서열번호 28에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩하는, 유전자 작제물.
  16. 제7항에 있어서, 상기 항-보체 단백질이 CD46, 바람직하게는 가용성 CD46(sCD46)인, 유전자 작제물.
  17. 제16항에 있어서, 상기 제2 코딩 서열이 실질적으로 서열번호 32에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함하고/하거나, 상기 제2 코딩 서열이 실질적으로 서열번호 31에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩하는, 유전자 작제물.
  18. 제7항에 있어서, 상기 항-보체 단백질이 보체 인자 H 유사 단백질 1(CFHL1)인, 유전자 작제물.
  19. 제18항에 있어서, 상기 제2 코딩 서열이 실질적으로 서열번호 98에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함하고/하거나, 상기 제2 코딩 서열이 실질적으로 서열번호 97에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩하는, 유전자 작제물.
  20. 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항섬유화 단백질이 결합 조직 성장 인자(connective tissue growth factor; CTGF)를 중화시킬 수 있는, 유전자 작제물.
  21. 제20항에 있어서, 상기 항섬유화 단백질이 항-결합 조직 성장 인자(항-CTGF) 항체, 또는 이의 항원 결합 단편이며, 바람직하게는 상기 항-CTGF 항체가 항-CTGF 단일 쇄 가변 단편(항-CTGF SCVF)인, 유전자 작제물.
  22. 제21항에 있어서, 상기 제2 코딩 서열이 실질적으로 서열번호 34 또는 36에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함하고/하거나, 상기 제2 코딩 서열이 실질적으로 서열번호 33 또는 35에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩하는, 유전자 작제물.
  23. 제1항 내지 제22항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 유전자 작제물이 제1 코딩 서열과 제2 코딩 서열 사이에 배치된 스페이서 서열(spacer sequence)을 포함하며, 이러한 스페이서 서열이 항-VEGF 단백질 및 항섬유화 단백질을 별개의 분자로서 생산하도록 구성된 펩티드 스페이서를 인코딩하는, 유전자 작제물.
  24. 제23항에 있어서, 상기 스페이서 서열이 바이러스 펩티드 스페이서 서열, 가장 바람직하게는 바이러스-2A 펩티드 스페이서 서열을 포함하고 인코딩하는, 유전자 작제물.
  25. 제24항에 있어서, 상기 바이러스-2A 펩티드 스페이서 서열이 F2A, E2A, T2A 또는 P2A 서열을 포함하는, 유전자 작제물.
  26. 제23항 내지 제25항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 스페이서 서열이 실질적으로 서열번호 38, 40, 42 또는 44에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함하고/하거나, 상기 스페이서 서열이 실질적으로 서열번호 37, 39, 41 또는 43에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩하는, 유전자 작제물.
  27. 제23항 내지 제25항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 유전자 작제물이 바이러스-2A 제거 서열을 포함하며, 임의로 상기 바이러스-2A 제거 서열이 바이러스-2A 서열의 5'에 배치되는, 유전자 작제물.
  28. 제27항에 있어서, 상기 바이러스-2A 제거 서열이 트리펩티드 글리신-세린-글리신 서열(G-S-G)을 포함하는 링커 서열(linker sequence)에 의해 바이러스-2A 펩티드 스페이서 서열로부터 분리되는, 유전자 작제물.
  29. 제27항 또는 제28항에 있어서, 상기 바이러스-2A 제거 서열이 퓨린 인식 서열(furin recognition sequence)이고, 임의로 상기 바이러스-2A 제거 서열이 실질적으로 서열번호 45에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩하는, 유전자 작제물.
  30. 제29항에 있어서, 상기 바이러스-2A 제거 서열이 실질적으로 서열번호 47, 49 또는 51에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함하고/하거나, 상기 바이러스-2A 제거 서열이 실질적으로 서열번호 46, 48 또는 50에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩하는, 유전자 작제물.
  31. 제27항 또는 제28항에 있어서, 상기 바이러스-2A 제거 서열이 젤라티나제 MMP-2 인식 서열이고, 임의로 상기 바이러스-2A 제거 서열이 실질적으로 서열번호 56에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함하고/하거나, 상기 바이러스-2A 제거 서열이 실질적으로 서열번호 55에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩하는, 유전자 작제물.
  32. 제27항 또는 제28항에 있어서, 상기 바이러스-2A 제거 서열이 레닌(renin) 인식 서열이고, 임의로 상기 바이러스-2A 제거 서열이 실질적으로 서열번호 60에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함하고/하거나, 상기 바이러스-2A 제거 서열이 실질적으로 서열번호 59에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩하는, 유전자 작제물.
  33. 제1항 내지 제32항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 유전자 작제물이 우드척 간염 바이러스 전사 후 조절 요소(Woodchuck Hepatitis Virus Post-transcriptional Regulatory Element; WPRE)를 인코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하며, 임의로 상기 WPRE가 실질적으로 서열번호 61 또는 62에 제시된 바와 같은 핵산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함하는, 유전자 작제물.
  34. 제1항 내지 제33항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 유전자 작제물이 폴리A 테일(polyA tail)을 인코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하며, 임의로 상기 폴리A 테일이 실질적으로 서열번호 63, 64 또는 99에 제시된 바와 같은 핵산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함하는, 유전자 작제물.
  35. 제1항 내지 제34항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 유전자 작제물이 좌측 및/또는 우측 역말단 반복 서열(Inverted Terminal Repeat sequence; ITR)을 인코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하며, 임의로 상기 좌측 및/또는 우측 역말단 반복체(Repeats)가 실질적으로 서열번호 65 또는 66에 제시된 바와 같은 핵산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함하는, 유전자 작제물.
  36. 제1항 내지 제35항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 유전자 작제물이 비-코딩 인트론(non-coding intron)을 포함하며, 임의로 상기 비-코딩 인트론이 프로모터와 제1 코딩 서열 사이에 위치하는, 유전자 작제물.
  37. 제36항에 있어서, 상기 비-코딩 인트론이 실질적으로 서열번호 67, 68 또는 69에 제시된 바와 같은 핵산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함하는, 유전자 작제물.
  38. 제1항 내지 제37항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 유전자 작제물이 신호 펩티드 코딩 서열을 포함하며, 임의로 상기 신호 펩티드 코딩 서열이 실질적으로 서열번호 71, 73, 75, 77 또는 70 중 어느 하나에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함하고/하거나, 상기 신호 펩티드 코딩 서열이 실질적으로 서열번호 70, 72, 74, 76 또는 78에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩하는, 유전자 작제물.
  39. 제1항 내지 제38항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 유전자 작제물이 실질적으로 서열번호 80, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 100, 102, 104 또는 106에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 인코딩하고/하거나, 상기 작제물이 실질적으로 서열번호 81, 83, 85, 87, 89, 91, 93, 95, 101, 103, 105 또는 107에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함하는, 유전자 작제물.
  40. 제1항 내지 제39항 중 어느 한 항에 따른 유전자 작제물을 포함하는, 재조합 벡터(recombinant vector).
  41. 제40항에 있어서, 상기 벡터가 재조합 AAV(rAAV) 벡터인, 재조합 벡터. 
  42. 제40항 또는 제41항에 있어서, 상기 rAAV가 AAV-1, AAV-2, AAV-3A, AAV-3B, AAV-4, AAV-5, AAV-6, AAV-7, AAV-8, AAV-9, AAV-10, AAV-11 또는 AAV-2.7m8인, 재조합 벡터. 
  43. 제41항 또는 제42항에 있어서, 상기 rAAV가 rAAV 혈청형-2(serotype-2)인, 재조합 벡터. 
  44. 제40항 내지 제43항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 재조합 벡터가 실질적으로 서열번호 96에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 이의 단편 또는 변이체를 포함하는, 재조합 벡터.
  45. 제1항 내지 제39항 중 어느 한 항, 또는 제40항 내지 제44항 중 어느 한 항에 있어서, 의약(medicament)으로서 또는 요법(therapy)에 사용하기 위한, 유전자 작제물, 또는 재조합 벡터.
  46. 제1항 내지 제39항 중 어느 한 항, 또는 제40항 내지 제44항 중 어느 한 항에 있어서, 망막 장애(retinal disorder)를 치료, 예방 또는 개선하는 데 사용하기 위한, 또는 혈관 누출(vascular leakage) 및 망막 세포 손상을 감소시키기 위한, 유전자 작제물, 또는 재조합 벡터.
  47. 제46항에 있어서, 치료되는 상기 망막 장애가 습성 연령 관련 황반 변성(wet age-related macular degeneration), 당뇨병성 망막증(diabetic retinopathy); 당뇨병과 관련된 임의의 망막 장애; 당뇨병성 황반 부종(diabetic macular oedema; DMO); 또는 혈관 누출 및 생성되는 망막 구조의 손상을 수반하는 병태생리학적 상태(pathophysiological condition)인, 유전자 작제물 또는 벡터. 
  48. 제47항에 있어서, 상기 망막 장애가 습성 연령 관련 황반 변성인, 유전자 작제물 또는 벡터.
  49. 제46항에 있어서, 상기 작제물 또는 벡터가 다음 상태 중 어느 하나와 관련된 혈관 누출 및 망막 세포 손상을 감소시키는 데 사용되는, 유전자 작제물 또는 벡터: 당뇨병성 망막증, 암(cancer), 전신 모세혈관 누출 증후군(systemic capillary leak syndrome; SCLS)/클락슨 증후군(Clarkson's syndrome), 혈관부종(angioedema), 중증 외상(severe trauma), 쇼크(shock), 패혈증(sepsis), 다발성 장기 기능 장애 증후군(multiple organ dysfunction syndrome; MODS), 만성 신장 질환(chronic kidney disease), 말기 신장 질환(end-stage renal disease), 가와사키병(Kawasaki disease), 중증 에볼라 바이러스 질환(severe Ebola virus disease), 뎅기 바이러스 감염(Dengue virus infection) 및/또는 마이코박테리아 감염(mycobacterial infection).
  50. 제1항 내지 제39항 중 어느 한 항에 따른 유전자 작제물, 또는 제40항 내지 제44항 중 어느 한 항에 따른 재조합 벡터, 및 약제학적으로 허용되는 비히클(vehicle)을 포함하는, 약제학적 조성물.
  51. 제50항에 따른 약제학적 조성물을 제조하는 방법으로서, 상기 방법이 제1항 내지 제39항 중 어느 한 항에 따른 유전자 작제물, 또는 제40항 내지 제44항 중 어느 한 항에 따른 재조합 벡터를 약제학적으로 허용되는 비히클과 접촉시키는 단계를 포함하는, 제50항에 따른 약제학적 조성물을 제조하는 방법.
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