KR20240012480A - Kcnv2 변이체 및 그것들의 사용 - Google Patents
Kcnv2 변이체 및 그것들의 사용 Download PDFInfo
- Publication number
- KR20240012480A KR20240012480A KR1020237043981A KR20237043981A KR20240012480A KR 20240012480 A KR20240012480 A KR 20240012480A KR 1020237043981 A KR1020237043981 A KR 1020237043981A KR 20237043981 A KR20237043981 A KR 20237043981A KR 20240012480 A KR20240012480 A KR 20240012480A
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- vector
- seq
- sequence
- gene
- kcvn2
- Prior art date
Links
- 101000943985 Homo sapiens Potassium voltage-gated channel subfamily V member 2 Proteins 0.000 title description 84
- 102100033492 Potassium voltage-gated channel subfamily V member 2 Human genes 0.000 title description 74
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 46
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 149
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 133
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 46
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 45
- 108091008695 photoreceptors Proteins 0.000 claims description 43
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 34
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 33
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims description 23
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 19
- 239000013607 AAV vector Substances 0.000 claims description 18
- 241001492404 Woodchuck hepatitis virus Species 0.000 claims description 17
- 108091093126 WHP Posttrascriptional Response Element Proteins 0.000 claims description 16
- 108091034057 RNA (poly(A)) Proteins 0.000 claims description 11
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 claims description 11
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 9
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 claims description 9
- 108010006025 bovine growth hormone Proteins 0.000 claims description 8
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 claims description 7
- 230000001124 posttranscriptional effect Effects 0.000 claims description 7
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 claims description 5
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims description 4
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 claims description 3
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 claims description 3
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 claims description 3
- 230000000699 topical effect Effects 0.000 claims description 3
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 claims description 2
- 238000007911 parenteral administration Methods 0.000 claims 1
- 230000002685 pulmonary effect Effects 0.000 claims 1
- 208000017442 Retinal disease Diseases 0.000 abstract description 17
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 120
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 118
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 77
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 77
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 66
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 50
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 50
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 46
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 46
- 210000001508 eye Anatomy 0.000 description 46
- 108091004242 G-Protein-Coupled Receptor Kinase 1 Proteins 0.000 description 45
- 102000004437 G-Protein-Coupled Receptor Kinase 1 Human genes 0.000 description 45
- 108090000799 Rhodopsin kinases Proteins 0.000 description 45
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 45
- 208000020751 cone dystrophy with supernormal rod response Diseases 0.000 description 39
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 38
- 238000002571 electroretinography Methods 0.000 description 34
- 210000001525 retina Anatomy 0.000 description 33
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 description 31
- 235000020945 retinal Nutrition 0.000 description 29
- 230000002207 retinal effect Effects 0.000 description 29
- 239000011604 retinal Substances 0.000 description 28
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 27
- NCYCYZXNIZJOKI-UHFFFAOYSA-N vitamin A aldehyde Natural products O=CC=C(C)C=CC=C(C)C=CC1=C(C)CCCC1(C)C NCYCYZXNIZJOKI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 27
- 241000702423 Adeno-associated virus - 2 Species 0.000 description 25
- 230000006870 function Effects 0.000 description 25
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 25
- 108700019146 Transgenes Proteins 0.000 description 23
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 23
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 23
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 22
- 241001164825 Adeno-associated virus - 8 Species 0.000 description 21
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 21
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 19
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 17
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 17
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 17
- 239000000047 product Substances 0.000 description 17
- 210000000964 retinal cone photoreceptor cell Anatomy 0.000 description 17
- 238000012014 optical coherence tomography Methods 0.000 description 16
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 15
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 14
- 101100019761 Homo sapiens KCNV2 gene Proteins 0.000 description 14
- 101150049707 KCNV2 gene Proteins 0.000 description 14
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 14
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 14
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 14
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 14
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 description 14
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 13
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 13
- 230000004044 response Effects 0.000 description 13
- 210000000880 retinal rod photoreceptor cell Anatomy 0.000 description 13
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 13
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 12
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 11
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 11
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 11
- NCYCYZXNIZJOKI-IOUUIBBYSA-N 11-cis-retinal Chemical compound O=C/C=C(\C)/C=C\C=C(/C)\C=C\C1=C(C)CCCC1(C)C NCYCYZXNIZJOKI-IOUUIBBYSA-N 0.000 description 10
- 102000004330 Rhodopsin Human genes 0.000 description 10
- 108090000820 Rhodopsin Proteins 0.000 description 10
- 210000000234 capsid Anatomy 0.000 description 10
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 10
- 108050003620 Arrestin-C Proteins 0.000 description 9
- 102100026440 Arrestin-C Human genes 0.000 description 9
- 241000702421 Dependoparvovirus Species 0.000 description 9
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 9
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 9
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 9
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 9
- 230000004393 visual impairment Effects 0.000 description 9
- 201000004569 Blindness Diseases 0.000 description 8
- 208000034461 Progressive cone dystrophy Diseases 0.000 description 8
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 8
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 8
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 8
- 201000008615 cone dystrophy Diseases 0.000 description 8
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 8
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 8
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 8
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 8
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 8
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 8
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 8
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 7
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 7
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 7
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 7
- 210000000608 photoreceptor cell Anatomy 0.000 description 7
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 7
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 7
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 7
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 7
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 7
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 7
- 108091006146 Channels Proteins 0.000 description 6
- 101000997292 Homo sapiens Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 Proteins 0.000 description 6
- 102100034310 Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 Human genes 0.000 description 6
- KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N alpha-L-glutamyl-L-glutamic acid Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 102000047117 human KCNV2 Human genes 0.000 description 6
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 6
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 6
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 6
- 230000022532 regulation of transcription, DNA-dependent Effects 0.000 description 6
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 6
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 6
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 6
- -1 vectors Chemical class 0.000 description 6
- 108090000565 Capsid Proteins Proteins 0.000 description 5
- 102100023321 Ceruloplasmin Human genes 0.000 description 5
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 5
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 5
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 5
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 5
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 5
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 5
- 230000004243 retinal function Effects 0.000 description 5
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 5
- 241000894007 species Species 0.000 description 5
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 5
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 5
- 238000007492 two-way ANOVA Methods 0.000 description 5
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 5
- 241000287828 Gallus gallus Species 0.000 description 4
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 4
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 4
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 4
- 208000032430 Retinal dystrophy Diseases 0.000 description 4
- BGDKAVGWHJFAGW-UHFFFAOYSA-N Tropicamide Chemical compound C=1C=CC=CC=1C(CO)C(=O)N(CC)CC1=CC=NC=C1 BGDKAVGWHJFAGW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 4
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 4
- 238000013461 design Methods 0.000 description 4
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 4
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 4
- 230000004438 eyesight Effects 0.000 description 4
- 108010055341 glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 4
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 4
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 4
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 4
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 4
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 4
- HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N pentofuranose Chemical group OCC1OC(O)C(O)C1O HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 4
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 4
- 230000000750 progressive effect Effects 0.000 description 4
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 4
- 210000003583 retinal pigment epithelium Anatomy 0.000 description 4
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 4
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 4
- 238000010361 transduction Methods 0.000 description 4
- 230000026683 transduction Effects 0.000 description 4
- 230000004304 visual acuity Effects 0.000 description 4
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 4
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 3
- 108700024394 Exon Proteins 0.000 description 3
- 108700028146 Genetic Enhancer Elements Proteins 0.000 description 3
- 208000032578 Inherited retinal disease Diseases 0.000 description 3
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 3
- 206010038923 Retinopathy Diseases 0.000 description 3
- 208000004350 Strabismus Diseases 0.000 description 3
- 206010047531 Visual acuity reduced Diseases 0.000 description 3
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 3
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 3
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 3
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 3
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 3
- 210000003855 cell nucleus Anatomy 0.000 description 3
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 3
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 3
- 239000002552 dosage form Substances 0.000 description 3
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 3
- 108010048367 enhanced green fluorescent protein Proteins 0.000 description 3
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 3
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 3
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 3
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 3
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 3
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 3
- 239000000543 intermediate Substances 0.000 description 3
- 239000000463 material Substances 0.000 description 3
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 3
- 231100000252 nontoxic Toxicity 0.000 description 3
- 230000003000 nontoxic effect Effects 0.000 description 3
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 3
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 3
- 206010029864 nystagmus Diseases 0.000 description 3
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 3
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 3
- 238000010837 poor prognosis Methods 0.000 description 3
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 3
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 3
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 3
- 210000001747 pupil Anatomy 0.000 description 3
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 3
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 3
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 3
- 238000009256 replacement therapy Methods 0.000 description 3
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 3
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 3
- 238000002864 sequence alignment Methods 0.000 description 3
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 3
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 3
- 230000004382 visual function Effects 0.000 description 3
- HHRAXZAYZFFRAM-CIUDSAMLSA-N Ala-Leu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O HHRAXZAYZFFRAM-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- 206010003694 Atrophy Diseases 0.000 description 2
- 238000012935 Averaging Methods 0.000 description 2
- 102000034573 Channels Human genes 0.000 description 2
- 208000006992 Color Vision Defects Diseases 0.000 description 2
- 208000036693 Color-vision disease Diseases 0.000 description 2
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 2
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 2
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 2
- 101000829506 Homo sapiens Rhodopsin kinase GRK1 Proteins 0.000 description 2
- 241000598436 Human T-cell lymphotropic virus Species 0.000 description 2
- 241000701024 Human betaherpesvirus 5 Species 0.000 description 2
- 101001001300 Human cytomegalovirus (strain Towne) 65 kDa phosphoprotein Proteins 0.000 description 2
- 241000713666 Lentivirus Species 0.000 description 2
- 206010025421 Macule Diseases 0.000 description 2
- 108091027974 Mature messenger RNA Proteins 0.000 description 2
- 206010033546 Pallor Diseases 0.000 description 2
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 206010034960 Photophobia Diseases 0.000 description 2
- 108091036407 Polyadenylation Proteins 0.000 description 2
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 2
- ZTHYODDOHIVTJV-UHFFFAOYSA-N Propyl gallate Chemical compound CCCOC(=O)C1=CC(O)=C(O)C(O)=C1 ZTHYODDOHIVTJV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000011529 RT qPCR Methods 0.000 description 2
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102100038247 Retinol-binding protein 3 Human genes 0.000 description 2
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 2
- 206010039729 Scotoma Diseases 0.000 description 2
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 2
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 2
- RAHZWNYVWXNFOC-UHFFFAOYSA-N Sulphur dioxide Chemical compound O=S=O RAHZWNYVWXNFOC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NHQVWACSJZJCGJ-FLBSBUHZSA-N Thr-Thr-Ile Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O NHQVWACSJZJCGJ-FLBSBUHZSA-N 0.000 description 2
- 108091023045 Untranslated Region Proteins 0.000 description 2
- 208000036142 Viral infection Diseases 0.000 description 2
- 230000001594 aberrant effect Effects 0.000 description 2
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 2
- 230000005856 abnormality Effects 0.000 description 2
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 2
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 2
- 230000037444 atrophy Effects 0.000 description 2
- 238000002869 basic local alignment search tool Methods 0.000 description 2
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 2
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 2
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 2
- 208000002352 blister Diseases 0.000 description 2
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 2
- 230000006727 cell loss Effects 0.000 description 2
- OSASVXMJTNOKOY-UHFFFAOYSA-N chlorobutanol Chemical compound CC(C)(O)C(Cl)(Cl)Cl OSASVXMJTNOKOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 2
- 238000012411 cloning technique Methods 0.000 description 2
- 210000004087 cornea Anatomy 0.000 description 2
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 2
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 2
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 2
- CBOQJANXLMLOSS-UHFFFAOYSA-N ethyl vanillin Chemical compound CCOC1=CC(C=O)=CC=C1O CBOQJANXLMLOSS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 2
- 201000006321 fundus dystrophy Diseases 0.000 description 2
- 235000011187 glycerol Nutrition 0.000 description 2
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000036541 health Effects 0.000 description 2
- 230000003862 health status Effects 0.000 description 2
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 2
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 2
- 208000017532 inherited retinal dystrophy Diseases 0.000 description 2
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 2
- 108010048996 interstitial retinol-binding protein Proteins 0.000 description 2
- 238000007834 ligase chain reaction Methods 0.000 description 2
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 2
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 2
- HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L magnesium stearate Chemical compound [Mg+2].CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O.CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 230000034217 membrane fusion Effects 0.000 description 2
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 2
- 229940087766 mydriacyl Drugs 0.000 description 2
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 2
- 244000309711 non-enveloped viruses Species 0.000 description 2
- 210000001328 optic nerve Anatomy 0.000 description 2
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 2
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 2
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 2
- 108010073025 phenylalanylphenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 230000035790 physiological processes and functions Effects 0.000 description 2
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 description 2
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 2
- 239000013608 rAAV vector Substances 0.000 description 2
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 230000004254 retinal expression Effects 0.000 description 2
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 2
- 230000003595 spectral effect Effects 0.000 description 2
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 2
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 2
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 2
- 230000002123 temporal effect Effects 0.000 description 2
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000005030 transcription termination Effects 0.000 description 2
- 229960004791 tropicamide Drugs 0.000 description 2
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 2
- 238000010200 validation analysis Methods 0.000 description 2
- 230000009385 viral infection Effects 0.000 description 2
- JNYAEWCLZODPBN-JGWLITMVSA-N (2r,3r,4s)-2-[(1r)-1,2-dihydroxyethyl]oxolane-3,4-diol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@H]1OC[C@H](O)[C@H]1O JNYAEWCLZODPBN-JGWLITMVSA-N 0.000 description 1
- 102000043281 11-cis-retinal-binding protein Human genes 0.000 description 1
- 108010038155 11-cis-retinal-binding protein Proteins 0.000 description 1
- 101150028074 2 gene Proteins 0.000 description 1
- CHHHXKFHOYLYRE-UHFFFAOYSA-M 2,4-Hexadienoic acid, potassium salt (1:1), (2E,4E)- Chemical compound [K+].CC=CC=CC([O-])=O CHHHXKFHOYLYRE-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- ASJSAQIRZKANQN-CRCLSJGQSA-N 2-deoxy-D-ribose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)CC=O ASJSAQIRZKANQN-CRCLSJGQSA-N 0.000 description 1
- WXNZTHHGJRFXKQ-UHFFFAOYSA-N 4-chlorophenol Chemical compound OC1=CC=C(Cl)C=C1 WXNZTHHGJRFXKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150099190 ARR3 gene Proteins 0.000 description 1
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 1
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001655883 Adeno-associated virus - 1 Species 0.000 description 1
- 241000202702 Adeno-associated virus - 3 Species 0.000 description 1
- 241000580270 Adeno-associated virus - 4 Species 0.000 description 1
- 241001634120 Adeno-associated virus - 5 Species 0.000 description 1
- 241000972680 Adeno-associated virus - 6 Species 0.000 description 1
- 241001164823 Adeno-associated virus - 7 Species 0.000 description 1
- KVWLTGNCJYDJET-LSJOCFKGSA-N Ala-Arg-His Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N KVWLTGNCJYDJET-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 1
- TTXMOJWKNRJWQJ-FXQIFTODSA-N Ala-Arg-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C)CCCN=C(N)N TTXMOJWKNRJWQJ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- IXTPACPAXIOCRG-ACZMJKKPSA-N Ala-Glu-Cys Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N IXTPACPAXIOCRG-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- WKOBSJOZRJJVRZ-FXQIFTODSA-N Ala-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O WKOBSJOZRJJVRZ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- VWEWCZSUWOEEFM-WDSKDSINSA-N Ala-Gly-Ala-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O VWEWCZSUWOEEFM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- BEMGNWZECGIJOI-WDSKDSINSA-N Ala-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BEMGNWZECGIJOI-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- QHASENCZLDHBGX-ONGXEEELSA-N Ala-Gly-Phe Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 QHASENCZLDHBGX-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- DVJSJDDYCYSMFR-ZKWXMUAHSA-N Ala-Ile-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(O)=O DVJSJDDYCYSMFR-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- CHFFHQUVXHEGBY-GARJFASQSA-N Ala-Lys-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N CHFFHQUVXHEGBY-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- REWSWYIDQIELBE-FXQIFTODSA-N Ala-Val-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O REWSWYIDQIELBE-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- 102100027211 Albumin Human genes 0.000 description 1
- 108010088751 Albumins Proteins 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 1
- 206010002091 Anaesthesia Diseases 0.000 description 1
- 244000105975 Antidesma platyphyllum Species 0.000 description 1
- GXCSUJQOECMKPV-CIUDSAMLSA-N Arg-Ala-Gln Chemical compound C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O GXCSUJQOECMKPV-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- XPSGESXVBSQZPL-SRVKXCTJSA-N Arg-Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O XPSGESXVBSQZPL-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- PVSNBTCXCQIXSE-JYJNAYRXSA-N Arg-Arg-Phe Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PVSNBTCXCQIXSE-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- QAODJPUKWNNNRP-DCAQKATOSA-N Arg-Glu-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O QAODJPUKWNNNRP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- YNSGXDWWPCGGQS-YUMQZZPRSA-N Arg-Gly-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O YNSGXDWWPCGGQS-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- YBZMTKUDWXZLIX-UWVGGRQHSA-N Arg-Leu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O YBZMTKUDWXZLIX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- OGSQONVYSTZIJB-WDSOQIARSA-N Arg-Leu-Trp Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](Cc1c[nH]c2ccccc12)C(O)=O OGSQONVYSTZIJB-WDSOQIARSA-N 0.000 description 1
- BTJVOUQWFXABOI-IHRRRGAJSA-N Arg-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N BTJVOUQWFXABOI-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- UGZUVYDKAYNCII-ULQDDVLXSA-N Arg-Phe-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O UGZUVYDKAYNCII-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- VENMDXUVHSKEIN-GUBZILKMSA-N Arg-Ser-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O VENMDXUVHSKEIN-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- DNLQVHBBMPZUGJ-BQBZGAKWSA-N Arg-Ser-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O DNLQVHBBMPZUGJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- 102000003916 Arrestin Human genes 0.000 description 1
- 108090000328 Arrestin Proteins 0.000 description 1
- 241000756970 Artema Species 0.000 description 1
- UBGGJTMETLEXJD-DCAQKATOSA-N Asn-Leu-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O UBGGJTMETLEXJD-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- YUUIAUXBNOHFRJ-IHRRRGAJSA-N Asn-Phe-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O YUUIAUXBNOHFRJ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- UXHYOWXTJLBEPG-GSSVUCPTSA-N Asn-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O UXHYOWXTJLBEPG-GSSVUCPTSA-N 0.000 description 1
- LRCIOEVFVGXZKB-BZSNNMDCSA-N Asn-Tyr-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O LRCIOEVFVGXZKB-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- MJIJBEYEHBKTIM-BYULHYEWSA-N Asn-Val-Asn Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N MJIJBEYEHBKTIM-BYULHYEWSA-N 0.000 description 1
- JRBVWZLHBGYZNY-QEJZJMRPSA-N Asp-Gln-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O JRBVWZLHBGYZNY-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 1
- XAJRHVUUVUPFQL-ACZMJKKPSA-N Asp-Glu-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O XAJRHVUUVUPFQL-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- YTXCCDCOHIYQFC-GUBZILKMSA-N Asp-Met-Arg Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O YTXCCDCOHIYQFC-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- KPSHWSWFPUDEGF-FXQIFTODSA-N Asp-Pro-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CC(O)=O KPSHWSWFPUDEGF-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- KNDCWFXCFKSEBM-AVGNSLFASA-N Asp-Tyr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KNDCWFXCFKSEBM-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N Carbon dioxide Chemical compound O=C=O CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 201000006082 Chickenpox Diseases 0.000 description 1
- 108700010070 Codon Usage Proteins 0.000 description 1
- 108020004394 Complementary RNA Proteins 0.000 description 1
- 108091028732 Concatemer Proteins 0.000 description 1
- LHLSSZYQFUNWRZ-NAKRPEOUSA-N Cys-Arg-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O LHLSSZYQFUNWRZ-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- KABHAOSDMIYXTR-GUBZILKMSA-N Cys-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N KABHAOSDMIYXTR-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- WVLZTXGTNGHPBO-SRVKXCTJSA-N Cys-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O WVLZTXGTNGHPBO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- OZSBRCONEMXYOJ-AVGNSLFASA-N Cys-Phe-Glu Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N OZSBRCONEMXYOJ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- ZOKPRHVIFAUJPV-GUBZILKMSA-N Cys-Pro-Arg Chemical compound C1C[C@H](N(C1)C(=O)[C@H](CS)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O ZOKPRHVIFAUJPV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- IRDBEBCCTCNXGZ-AVGNSLFASA-N Cys-Tyr-Gln Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N)O IRDBEBCCTCNXGZ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 1
- 230000004543 DNA replication Effects 0.000 description 1
- 241000450599 DNA viruses Species 0.000 description 1
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 description 1
- 206010059866 Drug resistance Diseases 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 241001123946 Gaga Species 0.000 description 1
- 208000003098 Ganglion Cysts Diseases 0.000 description 1
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 1
- RGXXLQWXBFNXTG-CIUDSAMLSA-N Gln-Arg-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O RGXXLQWXBFNXTG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- QBLMTCRYYTVUQY-GUBZILKMSA-N Gln-Leu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O QBLMTCRYYTVUQY-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- YPMDZWPZFOZYFG-GUBZILKMSA-N Gln-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YPMDZWPZFOZYFG-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- MLSKFHLRFVGNLL-WDCWCFNPSA-N Gln-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O MLSKFHLRFVGNLL-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- RWQCWSGOOOEGPB-FXQIFTODSA-N Gln-Ser-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O RWQCWSGOOOEGPB-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- VOUSELYGTNGEPB-NUMRIWBASA-N Gln-Thr-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O VOUSELYGTNGEPB-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- BBFCMGBMYIAGRS-AUTRQRHGSA-N Gln-Val-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BBFCMGBMYIAGRS-AUTRQRHGSA-N 0.000 description 1
- QGWXAMDECCKGRU-XVKPBYJWSA-N Gln-Val-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O QGWXAMDECCKGRU-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 1
- WOMUDRVDJMHTCV-DCAQKATOSA-N Glu-Arg-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O WOMUDRVDJMHTCV-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- KKCUFHUTMKQQCF-SRVKXCTJSA-N Glu-Arg-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KKCUFHUTMKQQCF-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- YYOBUPFZLKQUAX-FXQIFTODSA-N Glu-Asn-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O YYOBUPFZLKQUAX-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- MNYNINSTBAKKFY-NAKRPEOUSA-N Glu-Asp-Gln-Gln Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O MNYNINSTBAKKFY-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- ZXQPJYWZSFGWJB-AVGNSLFASA-N Glu-Cys-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N ZXQPJYWZSFGWJB-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- OPAINBJQDQTGJY-JGVFFNPUSA-N Glu-Gly-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)C(=O)O OPAINBJQDQTGJY-JGVFFNPUSA-N 0.000 description 1
- ZJFNRQHUIHKZJF-GUBZILKMSA-N Glu-His-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O ZJFNRQHUIHKZJF-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- ATVYZJGOZLVXDK-IUCAKERBSA-N Glu-Leu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O ATVYZJGOZLVXDK-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- FBEJIDRSQCGFJI-GUBZILKMSA-N Glu-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FBEJIDRSQCGFJI-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- FMBWLLMUPXTXFC-SDDRHHMPSA-N Glu-Lys-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)C(=O)O FMBWLLMUPXTXFC-SDDRHHMPSA-N 0.000 description 1
- XNOWYPDMSLSRKP-GUBZILKMSA-N Glu-Met-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O XNOWYPDMSLSRKP-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- PMSDOVISAARGAV-FHWLQOOXSA-N Glu-Tyr-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 PMSDOVISAARGAV-FHWLQOOXSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- KRRMJKMGWWXWDW-STQMWFEESA-N Gly-Arg-Phe Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](NC(=O)CN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 KRRMJKMGWWXWDW-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- LURCIJSJAKFCRO-QWRGUYRKSA-N Gly-Asn-Tyr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O LURCIJSJAKFCRO-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- ZRZILYKEJBMFHY-BQBZGAKWSA-N Gly-Asp-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)CN ZRZILYKEJBMFHY-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- SOEATRRYCIPEHA-BQBZGAKWSA-N Gly-Glu-Glu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SOEATRRYCIPEHA-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- XTQFHTHIAKKCTM-YFKPBYRVSA-N Gly-Glu-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O XTQFHTHIAKKCTM-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- JSNNHGHYGYMVCK-XVKPBYJWSA-N Gly-Glu-Val Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O JSNNHGHYGYMVCK-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 1
- ZKLYPEGLWFVRGF-IUCAKERBSA-N Gly-His-Gln Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O ZKLYPEGLWFVRGF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- AAHSHTLISQUZJL-QSFUFRPTSA-N Gly-Ile-Ile Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O AAHSHTLISQUZJL-QSFUFRPTSA-N 0.000 description 1
- FEUPVVCGQLNXNP-IRXDYDNUSA-N Gly-Phe-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)CN)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 FEUPVVCGQLNXNP-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 1
- WNZOCXUOGVYYBJ-CDMKHQONSA-N Gly-Phe-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)NC(=O)CN)O WNZOCXUOGVYYBJ-CDMKHQONSA-N 0.000 description 1
- WDXLKVQATNEAJQ-BQBZGAKWSA-N Gly-Pro-Asp Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WDXLKVQATNEAJQ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- CSMYMGFCEJWALV-WDSKDSINSA-N Gly-Ser-Gln Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O CSMYMGFCEJWALV-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- UMBDRSMLCUYIRI-DVJZZOLTSA-N Gly-Trp-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)NC(=O)CN)O UMBDRSMLCUYIRI-DVJZZOLTSA-N 0.000 description 1
- HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N Heparin Chemical group OC1C(NC(=O)C)C(O)OC(COS(O)(=O)=O)C1OC1C(OS(O)(=O)=O)C(O)C(OC2C(C(OS(O)(=O)=O)C(OC3C(C(O)C(O)C(O3)C(O)=O)OS(O)(=O)=O)C(CO)O2)NS(O)(=O)=O)C(C(O)=O)O1 HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 1
- PDSUIXMZYNURGI-AVGNSLFASA-N His-Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 PDSUIXMZYNURGI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- FIMNVXRZGUAGBI-AVGNSLFASA-N His-Glu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O FIMNVXRZGUAGBI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- FFKJUTZARGRVTH-KKUMJFAQSA-N His-Ser-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O FFKJUTZARGRVTH-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- 101000785755 Homo sapiens Arrestin-C Proteins 0.000 description 1
- 101000609949 Homo sapiens Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta Proteins 0.000 description 1
- PHIXPNQDGGILMP-YVNDNENWSA-N Ile-Glu-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N PHIXPNQDGGILMP-YVNDNENWSA-N 0.000 description 1
- HUORUFRRJHELPD-MNXVOIDGSA-N Ile-Leu-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N HUORUFRRJHELPD-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 1
- RQJUKVXWAKJDBW-SVSWQMSJSA-N Ile-Ser-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)N RQJUKVXWAKJDBW-SVSWQMSJSA-N 0.000 description 1
- 108700005091 Immunoglobulin Genes Proteins 0.000 description 1
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 1
- PIWKPBJCKXDKJR-UHFFFAOYSA-N Isoflurane Chemical compound FC(F)OC(Cl)C(F)(F)F PIWKPBJCKXDKJR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YQEZLKZALYSWHR-UHFFFAOYSA-N Ketamine Chemical compound C=1C=CC=C(Cl)C=1C1(NC)CCCCC1=O YQEZLKZALYSWHR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PMGDADKJMCOXHX-UHFFFAOYSA-N L-Arginyl-L-glutamin-acetat Natural products NC(=N)NCCCC(N)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(O)=O PMGDADKJMCOXHX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IBMVEYRWAWIOTN-UHFFFAOYSA-N L-Leucyl-L-Arginyl-L-Proline Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CCCN=C(N)N)C(=O)N1CCCC1C(O)=O IBMVEYRWAWIOTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SITWEMZOJNKJCH-UHFFFAOYSA-N L-alanine-L-arginine Natural products CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCNC(N)=N SITWEMZOJNKJCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RCFDOSNHHZGBOY-UHFFFAOYSA-N L-isoleucyl-L-alanine Natural products CCC(C)C(N)C(=O)NC(C)C(O)=O RCFDOSNHHZGBOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LHSGPCFBGJHPCY-UHFFFAOYSA-N L-leucine-L-tyrosine Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 LHSGPCFBGJHPCY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N L-leucyl-L-arginine Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 1
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 description 1
- CQQGCWPXDHTTNF-GUBZILKMSA-N Leu-Ala-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O CQQGCWPXDHTTNF-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- BQSLGJHIAGOZCD-CIUDSAMLSA-N Leu-Ala-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BQSLGJHIAGOZCD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- XBBKIIGCUMBKCO-JXUBOQSCSA-N Leu-Ala-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O XBBKIIGCUMBKCO-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 1
- GRZSCTXVCDUIPO-SRVKXCTJSA-N Leu-Arg-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O GRZSCTXVCDUIPO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- IBMVEYRWAWIOTN-RWMBFGLXSA-N Leu-Arg-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(O)=O IBMVEYRWAWIOTN-RWMBFGLXSA-N 0.000 description 1
- OIARJGNVARWKFP-YUMQZZPRSA-N Leu-Asn-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O OIARJGNVARWKFP-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- ULXYQAJWJGLCNR-YUMQZZPRSA-N Leu-Asp-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O ULXYQAJWJGLCNR-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- RRSLQOLASISYTB-CIUDSAMLSA-N Leu-Cys-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O RRSLQOLASISYTB-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- PPTAQBNUFKTJKA-BJDJZHNGSA-N Leu-Cys-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O PPTAQBNUFKTJKA-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- VFQOCUQGMUXTJR-DCAQKATOSA-N Leu-Cys-Met Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)N VFQOCUQGMUXTJR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- OXRLYTYUXAQTHP-YUMQZZPRSA-N Leu-Gly-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O OXRLYTYUXAQTHP-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- YOKVEHGYYQEQOP-QWRGUYRKSA-N Leu-Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O YOKVEHGYYQEQOP-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- ZRHDPZAAWLXXIR-SRVKXCTJSA-N Leu-Lys-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZRHDPZAAWLXXIR-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BGZCJDGBBUUBHA-KKUMJFAQSA-N Leu-Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O BGZCJDGBBUUBHA-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- PKKMDPNFGULLNQ-AVGNSLFASA-N Leu-Met-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O PKKMDPNFGULLNQ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- GCXGCIYIHXSKAY-ULQDDVLXSA-N Leu-Phe-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O GCXGCIYIHXSKAY-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- KWLWZYMNUZJKMZ-IHRRRGAJSA-N Leu-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KWLWZYMNUZJKMZ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- CGHXMODRYJISSK-NHCYSSNCSA-N Leu-Val-Asp Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O CGHXMODRYJISSK-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- 208000010415 Low Vision Diseases 0.000 description 1
- QUYCUALODHJQLK-CIUDSAMLSA-N Lys-Asp-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O QUYCUALODHJQLK-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- OJDFAABAHBPVTH-MNXVOIDGSA-N Lys-Ile-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O OJDFAABAHBPVTH-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 1
- PPNCMJARTHYNEC-MEYUZBJRSA-N Lys-Tyr-Thr Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 PPNCMJARTHYNEC-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 1
- 241000829100 Macaca mulatta polyomavirus 1 Species 0.000 description 1
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 1
- SLQDSYZHHOKQSR-QXEWZRGKSA-N Met-Gly-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCSC SLQDSYZHHOKQSR-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- KMSMNUFBNCHMII-IHRRRGAJSA-N Met-Leu-Lys Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN KMSMNUFBNCHMII-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- QLESZRANMSYLCZ-CYDGBPFRSA-N Met-Pro-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O QLESZRANMSYLCZ-CYDGBPFRSA-N 0.000 description 1
- 101100476480 Mus musculus S100a8 gene Proteins 0.000 description 1
- PESQCPHRXOFIPX-UHFFFAOYSA-N N-L-methionyl-L-tyrosine Natural products CSCCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 PESQCPHRXOFIPX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091007491 NSP3 Papain-like protease domains Proteins 0.000 description 1
- 108091061960 Naked DNA Proteins 0.000 description 1
- 208000001140 Night Blindness Diseases 0.000 description 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- 241000701945 Parvoviridae Species 0.000 description 1
- LBSARGIQACMGDF-WBAXXEDZSA-N Phe-Ala-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 LBSARGIQACMGDF-WBAXXEDZSA-N 0.000 description 1
- LGBVMDMZZFYSFW-HJWJTTGWSA-N Phe-Arg-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N LGBVMDMZZFYSFW-HJWJTTGWSA-N 0.000 description 1
- XMPUYNHKEPFERE-IHRRRGAJSA-N Phe-Asp-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 XMPUYNHKEPFERE-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- VZFPYFRVHMSSNA-JURCDPSOSA-N Phe-Ile-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 VZFPYFRVHMSSNA-JURCDPSOSA-N 0.000 description 1
- MCIXMYKSPQUMJG-SRVKXCTJSA-N Phe-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MCIXMYKSPQUMJG-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BPIMVBKDLSBKIJ-FCLVOEFKSA-N Phe-Thr-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 BPIMVBKDLSBKIJ-FCLVOEFKSA-N 0.000 description 1
- GCFNFKNPCMBHNT-IRXDYDNUSA-N Phe-Tyr-Gly Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CC=C(C=C2)O)C(=O)NCC(=O)O)N GCFNFKNPCMBHNT-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 1
- ZYNBEWGJFXTBDU-ACRUOGEOSA-N Phe-Tyr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)N ZYNBEWGJFXTBDU-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 1
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 description 1
- NPYPAHLBTDXSSS-UHFFFAOYSA-N Potassium ion Chemical compound [K+] NPYPAHLBTDXSSS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IFMDQWDAJUMMJC-DCAQKATOSA-N Pro-Ala-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IFMDQWDAJUMMJC-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- OLHDPZMYUSBGDE-GUBZILKMSA-N Pro-Arg-Cys Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O OLHDPZMYUSBGDE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- HPXVFFIIGOAQRV-DCAQKATOSA-N Pro-Arg-Gln Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O HPXVFFIIGOAQRV-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- LSIWVWRUTKPXDS-DCAQKATOSA-N Pro-Gln-Arg Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O LSIWVWRUTKPXDS-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- UEHYFUCOGHWASA-HJGDQZAQSA-N Pro-Glu-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 UEHYFUCOGHWASA-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- AQSMZTIEJMZQEC-DCAQKATOSA-N Pro-His-Ser Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O AQSMZTIEJMZQEC-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- WFIVLLFYUZZWOD-RHYQMDGZSA-N Pro-Lys-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O WFIVLLFYUZZWOD-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- 108020004412 RNA 3' Polyadenylation Signals Proteins 0.000 description 1
- 239000013614 RNA sample Substances 0.000 description 1
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 208000035977 Rare disease Diseases 0.000 description 1
- 206010038848 Retinal detachment Diseases 0.000 description 1
- 102100028001 Retinaldehyde-binding protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 101710101931 Retinaldehyde-binding protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 208000007014 Retinitis pigmentosa Diseases 0.000 description 1
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 102100039174 Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta Human genes 0.000 description 1
- 108091081021 Sense strand Proteins 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- ZUGXSSFMTXKHJS-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ala-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZUGXSSFMTXKHJS-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- DKKGAAJTDKHWOD-BIIVOSGPSA-N Ser-Asn-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)O DKKGAAJTDKHWOD-BIIVOSGPSA-N 0.000 description 1
- GHPQVUYZQQGEDA-BIIVOSGPSA-N Ser-Asp-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)O GHPQVUYZQQGEDA-BIIVOSGPSA-N 0.000 description 1
- HEQPKICPPDOSIN-SRVKXCTJSA-N Ser-Asp-Tyr Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 HEQPKICPPDOSIN-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- CRZRTKAVUUGKEQ-ACZMJKKPSA-N Ser-Gln-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O CRZRTKAVUUGKEQ-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- SNVIOQXAHVORQM-WDSKDSINSA-N Ser-Gly-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O SNVIOQXAHVORQM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- XXXAXOWMBOKTRN-XPUUQOCRSA-N Ser-Gly-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O XXXAXOWMBOKTRN-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- DLPXTCTVNDTYGJ-JBDRJPRFSA-N Ser-Ile-Cys Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O DLPXTCTVNDTYGJ-JBDRJPRFSA-N 0.000 description 1
- BEAFYHFQTOTVFS-VGDYDELISA-N Ser-Ile-His Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N BEAFYHFQTOTVFS-VGDYDELISA-N 0.000 description 1
- RIAKPZVSNBBNRE-BJDJZHNGSA-N Ser-Ile-Leu Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O RIAKPZVSNBBNRE-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- PURRNJBBXDDWLX-ZDLURKLDSA-N Ser-Thr-Gly Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)O PURRNJBBXDDWLX-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- NADLKBTYNKUJEP-KATARQTJSA-N Ser-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NADLKBTYNKUJEP-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- DYEGLQRVMBWQLD-IXOXFDKPSA-N Ser-Thr-Phe Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)O DYEGLQRVMBWQLD-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 1
- SNXUIBACCONSOH-BWBBJGPYSA-N Ser-Thr-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SNXUIBACCONSOH-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 1
- ZWSZBWAFDZRBNM-UBHSHLNASA-N Ser-Trp-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ZWSZBWAFDZRBNM-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- HSWXBJCBYSWBPT-GUBZILKMSA-N Ser-Val-Val Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CO)C(C)C)C(O)=O HSWXBJCBYSWBPT-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- 108091082496 Shab family Proteins 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 1
- 238000000692 Student's t-test Methods 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- 208000005400 Synovial Cyst Diseases 0.000 description 1
- 101150006914 TRP1 gene Proteins 0.000 description 1
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 1
- JBHMLZSKIXMVFS-XVSYOHENSA-N Thr-Asn-Phe Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O JBHMLZSKIXMVFS-XVSYOHENSA-N 0.000 description 1
- AQAMPXBRJJWPNI-JHEQGTHGSA-N Thr-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AQAMPXBRJJWPNI-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 1
- VTVVYQOXJCZVEB-WDCWCFNPSA-N Thr-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VTVVYQOXJCZVEB-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- NDXSOKGYKCGYKT-VEVYYDQMSA-N Thr-Pro-Asp Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O NDXSOKGYKCGYKT-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 1
- KPMIQCXJDVKWKO-IFFSRLJSSA-N Thr-Val-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KPMIQCXJDVKWKO-IFFSRLJSSA-N 0.000 description 1
- AKHDFZHUPGVFEJ-YEPSODPASA-N Thr-Val-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O AKHDFZHUPGVFEJ-YEPSODPASA-N 0.000 description 1
- LVTKHGUGBGNBPL-UHFFFAOYSA-N Trp-P-1 Chemical compound N1C2=CC=CC=C2C2=C1C(C)=C(N)N=C2C LVTKHGUGBGNBPL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CUHBVKUVJIXRFK-DVXDUOKCSA-N Trp-Trp-Ala Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=3C4=CC=CC=C4NC=3)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)=CNC2=C1 CUHBVKUVJIXRFK-DVXDUOKCSA-N 0.000 description 1
- 238000010162 Tukey test Methods 0.000 description 1
- CRWOSTCODDFEKZ-HRCADAONSA-N Tyr-Arg-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N)C(=O)O CRWOSTCODDFEKZ-HRCADAONSA-N 0.000 description 1
- AYPAIRCDLARHLM-KKUMJFAQSA-N Tyr-Asn-Lys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O AYPAIRCDLARHLM-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- NJLQMKZSXYQRTO-FHWLQOOXSA-N Tyr-Glu-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 NJLQMKZSXYQRTO-FHWLQOOXSA-N 0.000 description 1
- NKUGCYDFQKFVOJ-JYJNAYRXSA-N Tyr-Leu-Gln Chemical compound NC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 NKUGCYDFQKFVOJ-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- KHCSOLAHNLOXJR-BZSNNMDCSA-N Tyr-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KHCSOLAHNLOXJR-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- NHOVZGFNTGMYMI-KKUMJFAQSA-N Tyr-Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 NHOVZGFNTGMYMI-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- NUQZCPSZHGIYTA-HKUYNNGSSA-N Tyr-Trp-Gly Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC3=CC=C(C=C3)O)N NUQZCPSZHGIYTA-HKUYNNGSSA-N 0.000 description 1
- 241000700618 Vaccinia virus Species 0.000 description 1
- LTFLDDDGWOVIHY-NAKRPEOUSA-N Val-Ala-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C(C)C)N LTFLDDDGWOVIHY-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- AZSHAZJLOZQYAY-FXQIFTODSA-N Val-Ala-Ser Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O AZSHAZJLOZQYAY-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- MHAHQDBEIDPFQS-NHCYSSNCSA-N Val-Glu-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)C(C)C MHAHQDBEIDPFQS-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- BEGDZYNDCNEGJZ-XVKPBYJWSA-N Val-Gly-Gln Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O BEGDZYNDCNEGJZ-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 1
- PIFJAFRUVWZRKR-QMMMGPOBSA-N Val-Gly-Gly Chemical compound CC(C)[C@H]([NH3+])C(=O)NCC(=O)NCC([O-])=O PIFJAFRUVWZRKR-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- SYOMXKPPFZRELL-ONGXEEELSA-N Val-Gly-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N SYOMXKPPFZRELL-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- BVWPHWLFGRCECJ-JSGCOSHPSA-N Val-Gly-Tyr Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N BVWPHWLFGRCECJ-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- OTJMMKPMLUNTQT-AVGNSLFASA-N Val-Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N OTJMMKPMLUNTQT-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- OJPRSVJGNCAKQX-SRVKXCTJSA-N Val-Met-Arg Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N OJPRSVJGNCAKQX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- UZFNHAXYMICTBU-DZKIICNBSA-N Val-Phe-Gln Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N UZFNHAXYMICTBU-DZKIICNBSA-N 0.000 description 1
- SSYBNWFXCFNRFN-GUBZILKMSA-N Val-Pro-Ser Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SSYBNWFXCFNRFN-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- JAIZPWVHPQRYOU-ZJDVBMNYSA-N Val-Thr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O JAIZPWVHPQRYOU-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 1
- MIAZWUMFUURQNP-YDHLFZDLSA-N Val-Tyr-Asn Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N MIAZWUMFUURQNP-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- IECQJCJNPJVUSB-IHRRRGAJSA-N Val-Tyr-Ser Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O IECQJCJNPJVUSB-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- 206010046980 Varicella Diseases 0.000 description 1
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 1
- 108010052104 Viral Regulatory and Accessory Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000003734 Voltage-Gated Potassium Channels Human genes 0.000 description 1
- 108090000013 Voltage-Gated Potassium Channels Proteins 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000036982 action potential Effects 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 1
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 1
- 206010064930 age-related macular degeneration Diseases 0.000 description 1
- 108010028939 alanyl-alanyl-lysyl-alanine Proteins 0.000 description 1
- 238000012870 ammonium sulfate precipitation Methods 0.000 description 1
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 1
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 1
- 230000037005 anaesthesia Effects 0.000 description 1
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- 108010008355 arginyl-glutamine Proteins 0.000 description 1
- 108010001271 arginyl-glutamyl-arginine Proteins 0.000 description 1
- 108010043240 arginyl-leucyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010068380 arginylarginine Proteins 0.000 description 1
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010038633 aspartylglutamate Proteins 0.000 description 1
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010068265 aspartyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 230000003416 augmentation Effects 0.000 description 1
- 239000003855 balanced salt solution Substances 0.000 description 1
- 230000006399 behavior Effects 0.000 description 1
- 230000003542 behavioural effect Effects 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 230000031018 biological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 210000000601 blood cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 1
- 244000309464 bull Species 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 238000010805 cDNA synthesis kit Methods 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 1
- 235000011089 carbon dioxide Nutrition 0.000 description 1
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 1
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 1
- 239000006143 cell culture medium Substances 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 210000003986 cell retinal photoreceptor Anatomy 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 229960004926 chlorobutanol Drugs 0.000 description 1
- 230000004456 color vision Effects 0.000 description 1
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 1
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 1
- 238000004883 computer application Methods 0.000 description 1
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 1
- 239000013068 control sample Substances 0.000 description 1
- 238000013270 controlled release Methods 0.000 description 1
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 1
- 238000012937 correction Methods 0.000 description 1
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 description 1
- 108010004073 cysteinylcysteine Proteins 0.000 description 1
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 1
- 230000009849 deactivation Effects 0.000 description 1
- 230000007850 degeneration Effects 0.000 description 1
- 230000018044 dehydration Effects 0.000 description 1
- 238000006297 dehydration reaction Methods 0.000 description 1
- 230000003111 delayed effect Effects 0.000 description 1
- 238000002716 delivery method Methods 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 108010009297 diglycyl-histidine Proteins 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 1
- 230000003467 diminishing effect Effects 0.000 description 1
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 1
- 230000005750 disease progression Effects 0.000 description 1
- 238000006073 displacement reaction Methods 0.000 description 1
- POULHZVOKOAJMA-UHFFFAOYSA-M dodecanoate Chemical compound CCCCCCCCCCCC([O-])=O POULHZVOKOAJMA-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 230000003828 downregulation Effects 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- 239000003995 emulsifying agent Substances 0.000 description 1
- 239000002158 endotoxin Substances 0.000 description 1
- 206010015037 epilepsy Diseases 0.000 description 1
- HQPMKSGTIOYHJT-UHFFFAOYSA-N ethane-1,2-diol;propane-1,2-diol Chemical compound OCCO.CC(O)CO HQPMKSGTIOYHJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BEFDCLMNVWHSGT-UHFFFAOYSA-N ethenylcyclopentane Chemical compound C=CC1CCCC1 BEFDCLMNVWHSGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940073505 ethyl vanillin Drugs 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 238000010195 expression analysis Methods 0.000 description 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 238000013467 fragmentation Methods 0.000 description 1
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 1
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 1
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 1
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 1
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 1
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 1
- 238000001476 gene delivery Methods 0.000 description 1
- 238000002695 general anesthesia Methods 0.000 description 1
- 230000009395 genetic defect Effects 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 229960005150 glycerol Drugs 0.000 description 1
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 1
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 1
- XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N glycyl-L-tyrosine hemihydrate Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010051307 glycyl-glycyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010084760 glycyl-tyrosyl-glycyl-aspartate Proteins 0.000 description 1
- 108010037850 glycylvaline Proteins 0.000 description 1
- 235000009424 haa Nutrition 0.000 description 1
- 230000035876 healing Effects 0.000 description 1
- 229960002897 heparin Drugs 0.000 description 1
- 229920000669 heparin Polymers 0.000 description 1
- 108010036413 histidylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010025306 histidylleucine Proteins 0.000 description 1
- 108010018006 histidylserine Proteins 0.000 description 1
- 102000050172 human GRK1 Human genes 0.000 description 1
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 1
- 229920003088 hydroxypropyl methyl cellulose Polymers 0.000 description 1
- 238000005286 illumination Methods 0.000 description 1
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 1
- 230000002055 immunohistochemical effect Effects 0.000 description 1
- 238000003364 immunohistochemistry Methods 0.000 description 1
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 1
- 238000001361 intraarterial administration Methods 0.000 description 1
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 1
- 239000007928 intraperitoneal injection Substances 0.000 description 1
- 238000010253 intravenous injection Methods 0.000 description 1
- 229960002725 isoflurane Drugs 0.000 description 1
- 108010027338 isoleucylcysteine Proteins 0.000 description 1
- 229960003299 ketamine Drugs 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 1
- 229940070765 laurate Drugs 0.000 description 1
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 108010000761 leucylarginine Proteins 0.000 description 1
- 108010012058 leucyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 230000004301 light adaptation Effects 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 238000001638 lipofection Methods 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 208000018769 loss of vision Diseases 0.000 description 1
- 231100000864 loss of vision Toxicity 0.000 description 1
- 231100000053 low toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000004303 low vision Effects 0.000 description 1
- 239000000314 lubricant Substances 0.000 description 1
- 108010038320 lysylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 1
- 208000002780 macular degeneration Diseases 0.000 description 1
- 235000019359 magnesium stearate Nutrition 0.000 description 1
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 1
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- MYWUZJCMWCOHBA-VIFPVBQESA-N methamphetamine Chemical compound CN[C@@H](C)CC1=CC=CC=C1 MYWUZJCMWCOHBA-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 108010056582 methionylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010005942 methionylglycine Proteins 0.000 description 1
- 239000003607 modifier Substances 0.000 description 1
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 1
- 230000000877 morphologic effect Effects 0.000 description 1
- 230000008722 morphological abnormality Effects 0.000 description 1
- 230000004660 morphological change Effects 0.000 description 1
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 1
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 230000004379 myopia Effects 0.000 description 1
- 208000001491 myopia Diseases 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 210000002569 neuron Anatomy 0.000 description 1
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 1
- 239000002547 new drug Substances 0.000 description 1
- 238000007899 nucleic acid hybridization Methods 0.000 description 1
- 238000001543 one-way ANOVA Methods 0.000 description 1
- 230000003534 oscillatory effect Effects 0.000 description 1
- 239000006179 pH buffering agent Substances 0.000 description 1
- 229940090668 parachlorophenol Drugs 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 1
- 229960003742 phenol Drugs 0.000 description 1
- 108010084572 phenylalanyl-valine Proteins 0.000 description 1
- 108010051242 phenylalanylserine Proteins 0.000 description 1
- 125000002467 phosphate group Chemical group [H]OP(=O)(O[H])O[*] 0.000 description 1
- 150000004713 phosphodiesters Chemical class 0.000 description 1
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001766 physiological effect Effects 0.000 description 1
- 239000006187 pill Substances 0.000 description 1
- 229920001993 poloxamer 188 Polymers 0.000 description 1
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 1
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 1
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 description 1
- 239000004302 potassium sorbate Substances 0.000 description 1
- 235000010241 potassium sorbate Nutrition 0.000 description 1
- 229940069338 potassium sorbate Drugs 0.000 description 1
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 1
- 238000011321 prophylaxis Methods 0.000 description 1
- 239000000473 propyl gallate Substances 0.000 description 1
- 229940075579 propyl gallate Drugs 0.000 description 1
- 235000010388 propyl gallate Nutrition 0.000 description 1
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 1
- 238000001243 protein synthesis Methods 0.000 description 1
- 239000013646 rAAV2 vector Substances 0.000 description 1
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 description 1
- 101150066583 rep gene Proteins 0.000 description 1
- 230000002336 repolarization Effects 0.000 description 1
- 230000004264 retinal detachment Effects 0.000 description 1
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 210000003786 sclera Anatomy 0.000 description 1
- 230000004296 scotopic vision Effects 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 230000001953 sensory effect Effects 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 108010048397 seryl-lysyl-leucine Proteins 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 239000008247 solid mixture Substances 0.000 description 1
- 238000005063 solubilization Methods 0.000 description 1
- 230000007928 solubilization Effects 0.000 description 1
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 1
- 239000004334 sorbic acid Substances 0.000 description 1
- 235000010199 sorbic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229940075582 sorbic acid Drugs 0.000 description 1
- 229910001220 stainless steel Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010935 stainless steel Substances 0.000 description 1
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 1
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 1
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 229940044609 sulfur dioxide Drugs 0.000 description 1
- 235000010269 sulphur dioxide Nutrition 0.000 description 1
- 239000013589 supplement Substances 0.000 description 1
- 230000008093 supporting effect Effects 0.000 description 1
- 238000012353 t test Methods 0.000 description 1
- 239000003826 tablet Substances 0.000 description 1
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 1
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 1
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 1
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 1
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 1
- 230000004797 therapeutic response Effects 0.000 description 1
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 230000014621 translational initiation Effects 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 230000009452 underexpressoin Effects 0.000 description 1
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 1
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 1
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 1
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000009736 wetting Methods 0.000 description 1
- 239000000080 wetting agent Substances 0.000 description 1
- BPICBUSOMSTKRF-UHFFFAOYSA-N xylazine Chemical compound CC1=CC=CC(C)=C1NC1=NCCCS1 BPICBUSOMSTKRF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001600 xylazine Drugs 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
- A61K48/005—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'active' part of the composition delivered, i.e. the nucleic acid delivered
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
- A61K48/005—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'active' part of the composition delivered, i.e. the nucleic acid delivered
- A61K48/0058—Nucleic acids adapted for tissue specific expression, e.g. having tissue specific promoters as part of a contruct
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P27/00—Drugs for disorders of the senses
- A61P27/02—Ophthalmic agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
- C12N15/86—Viral vectors
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
- A01K2217/00—Genetically modified animals
- A01K2217/07—Animals genetically altered by homologous recombination
- A01K2217/075—Animals genetically altered by homologous recombination inducing loss of function, i.e. knock out
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
- A01K2227/00—Animals characterised by species
- A01K2227/10—Mammal
- A01K2227/105—Murine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
- C12N2750/00011—Details
- C12N2750/14011—Parvoviridae
- C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
- C12N2750/14122—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
- C12N2750/00011—Details
- C12N2750/14011—Parvoviridae
- C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
- C12N2750/14141—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
- C12N2750/14142—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector virus or viral particle as vehicle, e.g. encapsulating small organic molecule
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
- C12N2750/00011—Details
- C12N2750/14011—Parvoviridae
- C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
- C12N2750/14141—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
- C12N2750/14143—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
- C12N2750/00011—Details
- C12N2750/14011—Parvoviridae
- C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
- C12N2750/14141—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
- C12N2750/14145—Special targeting system for viral vectors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2800/00—Nucleic acids vectors
- C12N2800/22—Vectors comprising a coding region that has been codon optimised for expression in a respective host
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2830/00—Vector systems having a special element relevant for transcription
- C12N2830/008—Vector systems having a special element relevant for transcription cell type or tissue specific enhancer/promoter combination
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2830/00—Vector systems having a special element relevant for transcription
- C12N2830/48—Vector systems having a special element relevant for transcription regulating transport or export of RNA, e.g. RRE, PRE, WPRE, CTE
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2830/00—Vector systems having a special element relevant for transcription
- C12N2830/50—Vector systems having a special element relevant for transcription regulating RNA stability, not being an intron, e.g. poly A signal
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Virology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Ophthalmology & Optometry (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Separation Of Suspended Particles By Flocculating Agents (AREA)
Abstract
예를 들어, 망막 장애, 예컨대 CDSRR을 가진 대상체를 치료하는 방법에서 KCVN2의 신규한 변이체 및 그것들의 용도가 본원에서 개시된다.
Description
관련 출원에 대한 교차 참조
본 출원은 2021년 5월 20일에 출원된 미국 가출원 번호 63/191,106에 대한 우선권을 주장하며, 전문이 참고로 포함된다.
서열 목록
본 개시내용의 분야
본 발명은 대상체에서 망막 장애, 예컨대 원추체 이영양증을 치료하기 위한 신규한 뉴클레오타이드 및 단백질 서열, 예컨대 KCNV2 서열, 뿐만 아니라 재조합 핵산 분자 및 벡터, 및 관련된 사용 방법에 관한 것이다.
원추체 이영양증, 제한되는 것은 아니지만, 예를 들어, 초정상 간상체 반응을 동반한 원추체 이영양증 [cone dystrophy with supernormal rod response: CDSRR]은 그 중에서도, 예를 들어, 나쁜 시력, 시력 손실, 빛에 대한 민감성, 나쁜 색각, 안구진탕증(nystagmus) 및 사시증(strabismus)을 특징으로 할 수 있는 상염색체 열성 장애이다. 시각적 어려움은 유아기에 시작하며 20대까지, 예를 들어, 20/100 또는 그 이하의 시력을 갖는다. 환자들은 나중에 야맹증이 발생할 수 있고 다수의 또는 대부분의 환자들이 또한 근시가 발생할 수 있다. 시각 손실의 진행을 줄이거나 예방하기 위해 이용 가능한 특정한 치료가 없어서, 환자들은 나이가 들수록 불량한 예후를 갖게 되고 삶의 질이 저하된다. 따라서, 요법들을 확인할 필요가 있다.
발명자들은 초정상 간상체 반응을 동반한 원추체 이영양증 [CDSRR] (망막 원추체 이영양증 3B, OMIM 610356) 및 KCVN2로 표시되는 관련 병리상태를 치료하기 위한 신규한 재조합 핵산 분자, 단백질, 벡터, 및 관련된 사용 방법을 개시한다. CDSRR은 불량한 시력 (중심 암점(central scotoma)으로 인해), 광선공포증(photophobia), 심각한 색각 결함을 특징으로 하는 희귀하고, 열성이고, 유전적인 망막병증이고, 때때로, 안구진탕증 및 사시증이 또한 존재한다. 일부 환자에서, 안저는 정상으로 보이지만 중심와 또는 중심와 주위 위축증, 황반성 표적(macular bull's eye), 초형광 이상(hyperfluorescence anomalies), 및 전신성 미세 색소성 망막병증(generalized fine pigmentary retinopathy)이 보고되었다. 시신경에 약간의 일시적인 창백이 있을 수 있다.
제한되는 것은 아니지만, 원추 광수용체 및/또는 간상 광수용체를 포함하는, 망막 세포에서 유전자를 발현하기 위한 핵산, 전사 제어 유닛 (TCU), 최적화된 유전자 서열, 발현 작제물, 및 벡터가 본원에서 개시된다.
비변형된 KCVN2 유전자에서 핵산 대체를 포함하는 변형된 KCVN2 유전자가 본원에서 개시되며, 핵산 대체는 인간 KCVN2 유전자와 서열 번호: 2로 표시되는 코돈-최적화된 버전의 정렬에 의해 입증된 것들 중 하나 이상일 수 있다.
또한 광수용체, 예를 들어, 원추 광수용체 및/또는 간상 광수용체에서 유전자를 발현하기 위한 핵산, 전사 제어 유닛 (TCU), 최적화된 유전자 서열, 발현 작제물, 및 벡터가 제공된다.
또한 핵산 분자를 포함하는 벡터, 예컨대 아데노 연관 바이러스 (adeno-associated virus: AAV) 벡터, 뿐만 아니라 핵산 분자에 의해 암호화되는 단리된 Kv8.2 단백질이 제공된다.
또한 TCU의 제어 하에 변이체 인간 KCVN2 유전자를 포함하는 발현 작제물이 제공된다. 변형으로, KCVN2는 광수용체, 예를 들어, 원추 광수용체 또는 간상 광수용체에서 유전자를 발현하는데 최적화된 프로모터의 제어 하에 있다. 변형으로, 변이체 인간 KCVN2 유전자는 로돕신 키나아제 (RK) 프로모터의 제어 하에 있을 수 있다.
따라서, 한 변형으로 발명자들은 다음을 제공한다:
KCVN2 유전자의 발현을 지시할 수 있는 프로모터. 변형으로, 프로모터는 광수용체에 대한 전이유전자 발현을 표적으로 한다. 또 다른 변형으로, 프로모터는 광수용체에 대한 발현만을 제한한다. 또 다른 변형으로, 프로모터는 로돕신 키나아제 (RK) 프로모터이다.
광수용체에서 발현되는 서열. 변형으로 본 발명은 광수용체-특이적 방식으로 발현되는 서열을 포함하는 발현 작제물을 제공한다. 추가의 변형으로, 발현되는 서열은 Kv8.2를 암호화하는 유전자를 포함한다. 추가의 변형으로, 발현되는 서열은 서열 번호: 2를 포함한다.
본 개시내용의 상기 언급된 및 다른 특징 및 이점들은 첨부된 도면을 참조하여 진행되는 여러 구체예의 다음 상세한 설명으로부터 더 분명해질 것이다.
도 1은 제1 작제물의 개략적인 지도를 보여준다.
도 2는 제2 작제물의 개략적인 지도를 보여준다.
도 3은 제3 작제물의 개략적인 지도를 보여준다.
도 4는 제4 작제물의 개략적인 지도를 보여준다.
도 5는 망막 기능을 회복하는 예시의 방법을 나타낸다.
도 6은 I기 및 II기 조사 과정을 제공한다.
도 7은 III기 개념 증명 연구를 제공한다.
도 8은 개시된 방법, 시스템, 및 핵산 서열을 사용하여 처리된 마우스 및 미처리 마우스 간의 비교를 제공한다.
도 9는 야생형 (WT) 망막, 비주사 망막 대 처리된 망막에서 원추체 (a, 원추체 아레스틴) 및 간상체 (B, 로돕신) 표시의 상대적인 유전자 발현을 보여준다. *P<0.05; *P<0.01.
도 10은 처리 후 12주에 서열 번호: 3에 의해 전달된 것처럼 서열 번호: 2로 주사된 Kv8.2 KO 마우스의 망막에서 인간 Kv8.2 서브유닛의 망막 발현의 대표적인 이미지를 나타낸다.
도 11은 마우스 예비 연구를 위한 프로토콜을 입증하는 표이다.
도 12는 처리된 마우스 대 미처리 마우스의 a-파 진폭을 표시하는 데이터를 나타낸다.
도 13은 처리된 마우스 대 미처리 마우스의 양성 b-파 진폭을 표시하는 데이터를 나타낸다.
도 14는 처리된 마우스 및 미처리 마우스의 OCT 데이터를 나타낸다.
도 15는 야생형 (WT) 눈, Kv8.2 KO 미처리 (비주사) 눈 및 Kv8.2 KO 눈의 c-파의 정량화를 입증한다.
도 16 및 도 17은 처리 후 12주에 처리된 Kv8.2 KO 마우스의 개선된 명소시 및 암소시 시력과 암소시 대비 민감도를 입증한다.
도 18은 망막하로 주사된 눈의 망막 절편의 개요이며 처리된 영역은 인간 Kv8.2 서브유닛의 발현 (초록색)을 나타내고 미처리된 영역은 Kv8.2 발현을 나타내지 않는다.
도 19는 Kv8.2 발현 (초록색), Kv2.1 발현 (빨간색) 및 세포핵 (파란색)을 나타내는 처리된 영역 및 미처리 영역의 고배율 이미지를 제공한다. 스케일 막대 = 50μm.
도 20은 야생형에 대해 표준화된 처리된 눈에서 인간 KCNV2 유전자의 발현을 나타내는 실시간 정량 PCR의 데이터를 제공한다.
도 21 및 도 22는, 종합해보면, 인간 KCVN2 (서열 번호: 11) 및 그것의 코돈-최적화된 변이체 (서열 번호: 2)의 서열 정렬을 보여준다.
도 2는 제2 작제물의 개략적인 지도를 보여준다.
도 3은 제3 작제물의 개략적인 지도를 보여준다.
도 4는 제4 작제물의 개략적인 지도를 보여준다.
도 5는 망막 기능을 회복하는 예시의 방법을 나타낸다.
도 6은 I기 및 II기 조사 과정을 제공한다.
도 7은 III기 개념 증명 연구를 제공한다.
도 8은 개시된 방법, 시스템, 및 핵산 서열을 사용하여 처리된 마우스 및 미처리 마우스 간의 비교를 제공한다.
도 9는 야생형 (WT) 망막, 비주사 망막 대 처리된 망막에서 원추체 (a, 원추체 아레스틴) 및 간상체 (B, 로돕신) 표시의 상대적인 유전자 발현을 보여준다. *P<0.05; *P<0.01.
도 10은 처리 후 12주에 서열 번호: 3에 의해 전달된 것처럼 서열 번호: 2로 주사된 Kv8.2 KO 마우스의 망막에서 인간 Kv8.2 서브유닛의 망막 발현의 대표적인 이미지를 나타낸다.
도 11은 마우스 예비 연구를 위한 프로토콜을 입증하는 표이다.
도 12는 처리된 마우스 대 미처리 마우스의 a-파 진폭을 표시하는 데이터를 나타낸다.
도 13은 처리된 마우스 대 미처리 마우스의 양성 b-파 진폭을 표시하는 데이터를 나타낸다.
도 14는 처리된 마우스 및 미처리 마우스의 OCT 데이터를 나타낸다.
도 15는 야생형 (WT) 눈, Kv8.2 KO 미처리 (비주사) 눈 및 Kv8.2 KO 눈의 c-파의 정량화를 입증한다.
도 16 및 도 17은 처리 후 12주에 처리된 Kv8.2 KO 마우스의 개선된 명소시 및 암소시 시력과 암소시 대비 민감도를 입증한다.
도 18은 망막하로 주사된 눈의 망막 절편의 개요이며 처리된 영역은 인간 Kv8.2 서브유닛의 발현 (초록색)을 나타내고 미처리된 영역은 Kv8.2 발현을 나타내지 않는다.
도 19는 Kv8.2 발현 (초록색), Kv2.1 발현 (빨간색) 및 세포핵 (파란색)을 나타내는 처리된 영역 및 미처리 영역의 고배율 이미지를 제공한다. 스케일 막대 = 50μm.
도 20은 야생형에 대해 표준화된 처리된 눈에서 인간 KCNV2 유전자의 발현을 나타내는 실시간 정량 PCR의 데이터를 제공한다.
도 21 및 도 22는, 종합해보면, 인간 KCVN2 (서열 번호: 11) 및 그것의 코돈-최적화된 변이체 (서열 번호: 2)의 서열 정렬을 보여준다.
서열 목록
첨부된 서열 목록에서 나열된 핵산 및 아미노산 서열은 37 C.F.R. 1.822에서 정의된 바와 같이 뉴클레오타이드 염기에 대해 표준 문자 축약형, 및 아미노산에 대해 3문자 코드를 사용하여 나타나있다. 각각의 핵산 서열의 하나의 가닥만이 나타나있지만, 표시된 가닥에 대한 참조를 통해 상보적 가닥이 포함되는 것으로 이해된다. 서열 목록은 2022년 5월 18일에 생성된 "Sequence.txt"라는 명칭의 파일 형태의 ASCII 텍스트 파일 (~40 kb)로 제출되며, 이것은 본원에 참고로 포함된다.
상세한 설명
발명자들은 초정상 간상체 반응을 동반한 원추체 이영양증 [CDSRR] (망막 원추체 이영양증 3B, OMIM 610356) 및 및 KCVN2로 표시되는 관련 병리상태를 치료하기 위한 신규한 재조합 핵산 분자, 단백질, 벡터, 및 관련된 사용 방법을 개시한다. CDSRR은 불량한 시력 (중심 암점으로 인해), 광선공포증, 심각한 색각 결함을 특징으로 하는 희귀하고, 열성이고, 유전적인 망막병증이고, 때때로, 안구진탕증 및 사시증이 또한 존재한다. 일부 환자에서, 안저는 정상으로 보이지만 중심와 또는 중심와 주위 위축증, 황반성 표적, 초형광 이상, 및 전신성 미세 색소성 망막병증이 보고되었다. 시신경에 약간의 일시적인 창백이 있을 수 있다.
임상 증상은 시각 손실로 제한될 수 있으며 다른 조직 또는 장기가 영향을 받지 않는다. 대부분의 정부 기관은 법적맹(legal blindness)을 가장 잘 보이는 눈에서 20/200 또는 그 이하의 교정 시력 (중심 시력)으로 규정한다. 이것은 법적 맹인이 20 피트에서 볼 수 있는 것을 보통 사람은 200 피트에서 또렷하게 볼 수 있다는 것을 의미한다. CDSRR 연구에서 시력은 사람마다 다를 수 있지만 평균적으로 대략 20/160이지만 결국 법적맹 수준으로 진행할 수 있는 것으로 나타났다. 시각 손실의 진행을 줄이거나 예방하기 위해 이용 가능한 특정한 치료가 없어서, 환자들은 나이가 들수록 불량한 예후를 갖게 되고 삶의 질이 저하된다. 예후는 병태를 치유하거나(heal), 치료하거나, 또는 치유할(cure) 가능성과 관련이 있기 때문에, CDSRR 및 다른 KCVN2 연관된 병리상태에 대한 불량한 예후는 현재 이용 가능한 치유 또는 치료가 없으므로 회복 가능성이 거의 없다는 것을 의미한다. 저시력 보조기 및 착색 렌즈가 환자가 시력 손실 증상을 개선하도록 노력하는데 이용 가능한 유일한 자원이다. 여러 연구에서 CDSRR 환자에서 중심 시력 손실의 진행성인 성질이 나타났지만, 질환 진행의 전체 범위를 평가하기 위한 대규모 자연사 연구는 아직 완료되지 않았다.
이 질환의 희귀성 (전세계적으로 영향을 받은 개체의 추정 수치는 1,000,000명 중의 1명이다)은 희귀 질환 정의에 적합하며, 그것이 제약 업계에 의해 해결되는 것을 방지하는데 민간 부문이 그것을 치료하거나 예방하기 위해 신약을 제조하고 판매하는데 경제적 장려책을 거의 제공하지 않기 때문이다. 하지만, 망막전위도검사 (electroretinography: ERG) 및 유전자 검사의 이용 가능성이 정확한 초기 CDSRR 진단을 가능하게 하고 이 장애에 대한 치료의 개발을 지원한다. CDSRR에 대한 열성 유전 방식 및 느린 진행 성질로 인해 1회성 바이러스-기반 유전자 요법 (유전자 보충) 치료에 대한 좋은 후보가 된다.
CDSRR의 원인 인자 중에는 칼륨 채널, 전압 개폐식, 서브패밀리 V, 구성원 2 유전자 (KCVN2)의 돌연변이가 있다. 일부 CDSRR 환자에서, Kv8.2 전압 개폐식 칼륨 (K+) 채널 서브유닛을 암호화하는 KCNV2 유전자의 돌연변이가 존재한다. 현재 전세계적으로 KCNV2에서 95개가 넘는 다양한 CDSRR-유발 변이체가 확인되었고 다른 변이체들 중에서도 미스센스(missense), 넌센스(nonsense), 유전자 내 결실, 프레임 밖(out-of-frame) 삽입을 포함한다. 다양한 변이체는 Kv8.2에 다르게 영향을 미치는 것으로 나타났으며, 일부 돌연변이는 비-전도성 채널을 생성하는 반면에, 다른 돌연변이는 채널 형성을 완전히 방지하였다. 이는 질환 병리상태와 관련된 별개의 메커니즘의 존재를 시사하지만 또한 모든 변이체가 비-기능적 단백질을 생성하여, CDSRR을 유전자 대체 요법에 대한 양호한 후보로 만든다는 것을 시사한다.
Kv8.2는 스스로 채널을 형성하지 않지만 동족 파트너를 필요로 하는 "변경자/침묵" 채널 단백질의 군의 구성원이며; Kv8.2의 경우, 이것은 활동 전위의 재분극(repolarization)의 속도를 조절하는 지연된 정류기 전류를 생성하는 서브유닛의 Shab 패밀리의 구성원인 Kv2.1 (KCNB1에 의해 암호화됨)이다. 눈에서, Kv8.2 및 Kv2.1 서브유닛은 둘 다 시각 반응의 광 변환 캐스케이드(cascade)를 시작하는 역할을 하는 원추체 및 간상 광수용체 세포의 내절의 세포질막에만 위치한다. 하지만, KCNV2의 미스센스 돌연변이가 또한 인간에서 뇌전증(epilepsy)을 유발하는 것으로 알려져 있으며, 그것이 뇌에서도 발현될 수 있다는 것을 나타낸다. 망막전위도 (electroretinogram: ERG) 질환 표현형은 KCNV2의 돌연변이가 Kv2.1/Kv8.2 헤테로머(heteromer)의 기능적 폐지로 이어지는 Kv8.2 서브유닛의 기능 상실을 초래한다는 것을 나타낸다. 궁극적으로, 이것은 빛에 대한 망막의 민감도를 변화시키고 이로 인해 시야의 동적 범위가 다양한 수준의 조명 하에서 조절되는 근본적인 생리학적 과정을 변화시킨다.
증거에 따르면 KCNV2의 돌연변이가 원추체 및 간상 광수용체 둘 다에 영향을 미치며, 이것은 두 광수용체 모두에 대한 비정상적인 ERG 기록에 반영되고 망막 전반에 걸쳐 널리 퍼져있지만, 일부 환자에서는 관찰된 형태학적 변화가 원추체에서 더 두드러지는 것으로 보인다. CDSRR 환자의 스펙트럼 영역 광 간섭 단층 촬영 (spectral domain optical coherence tomography: SD-OCT)을 사용한 망막의 고해상도 이미지화는 보통 중심 망막에서 심한 형태학적 이상을 나타냈다. 이것들은 내절/외절 (IS/OS) 접합부, 엄청난 중심와 깊이 감소, 부재의 원추체 패치로 원추 광수용체 모자이크 붕괴 및 전체적인 원추체 밀도 감소를 포함한다. 하지만, CDSRR 망막 내 광수용체 세포 손실의 메커니즘은 아직 알려져 있지 않다. 게다가, 어떻게 질환이 원추체 및 간상체에 차등적으로 영향을 미치는지는 분명하지 않다. 동공측정법(pupillometry)으로 측정될 때 CDSRR 환자의 이상에 대한 최근의 연구는 망막 내부의 기능이 보존될 수 있다는 것을 나타낸다. 변형으로, 망막 외부 기능을 회복시키도록 설계된 요법이 성공적일 수 있다.
제한되는 것은 아니지만, 원추 광수용체 및/또는 간상 광수용체를 포함하는 망막 세포에서 유전자를 발현시키기 위한 핵산, 전사 제어 유닛 (TCU), 최적화된 유전자 서열, 발현 작제물, 및 벡터가 본원에서 개시된다.
비변형된 KCVN2 유전자 (서열 번호: 12)에서 핵산 대체를 포함하는 변형된 KCVN2 유전자가 본원에서 개시되며, 핵산 대체는 인간 KCVN2 유전자와 서열 번호: 2로 표시되는 코돈-최적화된 버전의 정렬에 의해 입증된 것들 중 하나 이상일 수 있다.
광수용체, 예를 들어, 원추 광수용체 및/또는 간상 광수용체에서 유전자를 발현시키기 위한 핵산, 전사 제어 유닛 (TCU), 최적화된 유전자 서열, 발현 작제물, 및 벡터가 또한 제공된다.
핵산 분자를 포함하는 벡터, 예컨대 아데노 연관 바이러스 (AAV) 벡터, 뿐만 아니라 핵산 분자에 의해 암호화된 단리된 Kv8.2 단백질이 또한 제공된다.
TCU의 제어 하에 변이체 인간 KCVN2 유전자 (서열 번호: 2)를 포함하는 발현 작제물이 또한 제공된다. 변형으로, KCVN2는 광수용체, 예를 들어, 원추 광수용체 또는 간상 광수용체에서 유전자를 발현시키기 위해 최적화된 프로모터의 제어 하에 있다. 변형으로, 변이체 인간 KCVN2 유전자는 로돕신 키나아제 (RK) 프로모터 (서열 번호: 6)의 제어 하에 있을 수 있다.
상응하는 고유한 인간 KCVN2 유전자 (서열 번호: 12)에 비해 유전자 발현이 증가된 KCVN2 유전자의 변이체, 예를 들어 서열 번호: 2가 또한 제공된다. KCVN2 유전자의 변이체는 야생형과 비교하여 최대 평균 대략 8배 유전자 발현 증가를 포함하는 개선된 발현, 미처리된 눈과 비교하여 ERG 양성 b-파 데이터의 더 큰 차이 및 유의한 감소, 및 다른 제품들에 의해 얻어진 것과 비교하여 ERG 양성 b-파 데이터의 더 큰 차이 및 유의한 감소를 포함하는 개선된 치료 성질을 갖는다. 개시된 KCVN2 변이체 (예를 들어, 서열 번호: 2)의 개선된 성질은 상응하는 고유한 인간 KCVN2 유전자 (서열 번호: 12)와 비교하여 증가된 발현, 상응하는 야생형 KCVN2 유전자 (서열 번호: 12)와 비교하여 증가된 발현, 및/또는 상응하는 고유한 인간 KCVN2 유전자 (서열 번호: 12)와 비교하여 개선된 약물동역학적 성질을 포함하지만, 이에 제한되는 것은 아니다. 개선된 성질은 개선된 전사물 안정성 및 최소화된 비정상적인 전사물 스플라이싱(splicing)을 포함할 수 있다.
망막 장애 또는, 제한되는 것은 아니지만, CDSRR을 포함하는, 이영양증의 치료 및/또는 예방을 위해 핵산, 전사 제어 유닛 (TCU), 최적화된 유전자 서열, 발현 작제물, 및 벡터 중 하나 이상을 사용하는 방법이 또한 개시된다.
초정상 간상체 반응을 동반한 KCNV2 연관 원추체 이영양증에 대한 AAV-매개된 유전자 강화(gene augmentation) 요법이 또한 개시된다.
따라서, 한 변형으로 발명자들은 다음을 제공한다:
KCVN2 유전자의 발현을 지시할 수 있는 프로모터. 변형으로, 프로모터는 광수용체에 대한 전이유전자 발현을 표적으로 한다. 또 다른 변형으로, 프로모터는 광수용체에 대한 발현만을 제한한다. 또 다른 변형으로, 프로모터는 로돕신 키나아제 (RK) 프로모터 (서열 번호: 6)이다.
광수용체에서 발현되는 서열. 변형으로 본 발명은 광수용체-특이적 방식으로 발현되는 서열을 포함하는 발현 작제물을 제공한다. 추가의 변형으로, 발현되는 서열은 Kv8.2를 암호화하는 유전자를 포함한다. 추가의 변형으로, 발현되는 서열은 서열 번호: 2를 포함한다.
본 개시내용의 상기 언급된 및 다른 특징 및 이점들은 첨부된 도면을 참조하여 진행되는 여러 구체예의 다음 상세한 설명으로부터 더 분명해질 것이다.
용어
달리 언급되지 않는 한, 기술적인 용어들은 통상적인 용법에 따라 사용된다. 분자생물학의 일반적인 용어들의 정의는 Krebs et al. (eds.), Lewin's genes XII, Jones & Bartlett Learning에 의해 발표됨, 2017; Kendrew et al. (eds.), The Encyclopedia of Molecular Biology, Blackwell Science Ltd.에 의해 발표됨, 2009 (ISBN 9780632021826)에서 발견될 수 있다. 단수형 "하나", "하나", 및 "그"는 문맥상 달리 분명하게 지시되지 않는 한 복수의 지시대상을 포함한다. "A 또는 B를 포함하는" 것은 A, 또는 B, 또는 A 및 B를 포함하는 것을 의미한다. 본원에서 기재된 것들과 유사하거나 동등한 방법 및 재료가 본 개시내용을 실시하거나 테스트하는데 사용될 수 있지만, 적합한 방법 및 재료가 아래 기재된다. 이에 더하여, 재료, 방법, 및 예는 단지 예시일 뿐이고 제한하려는 의도는 없다. 분쟁의 경우에, 용어의 설명을 포함한 본 명세가 통제할 것이다. 본 개시내용의 다양한 구체예의 검토를 용이하게 하기 위해서, 특정 용어들의 다음 설명이 제공된다:
5' 및/또는 3': 핵산 분자 (예컨대 DNA 및 RNA)는 모노뉴클레오타이드가 하나의 모노뉴클레오타이드 펜토오스 고리의 5' 포스페이트가 포스포다이에스터 연결을 통해 한 방향으로 이웃의 3' 산소에 부착되는 방식으로 폴리뉴클레오타이드를 제조하도록 반응되기 때문에 "5' 단부" 및 "3' 단부"를 갖는다고 한다. 그러므로, 선형 폴리뉴클레오타이드의 한 단부는 그것의 5' 포스페이트가 모노뉴클레오타이드 펜토오스 고리의 3' 산소에 연결되지 않을 때 "5' 단부"라고 불린다. 폴리뉴클레오타이드의 다른 단부는 그것의 3' 산소가 또 다른 모노뉴클레오타이드 펜토오스 고리의 5' 포스페이트에 연결되지 않을 때 "3' 단부"라고 불린다. 그럼에도 하나의 모노뉴클레오타이드 펜토오스 고리의 5' 포스페이트는 이웃의 3' 산소에 부착되며, 내부의 핵산 서열은 또한 5' 및 5' 단부를 갖는다고 할 수 있다.
선형 또는 원형 핵산 분자에서, 별개의 내부 요소는 "다운스트림(downstream)" 또는 3' 요소의 "업스트림(upstream)" 또는 5'이라고 불린다. DNA에 관하여, 이 전문용어는 전사가 DNA 가닥을 따라 5'에서 3' 방향으로 진행되고있다는 것을 반영한다. 연결된 유전자의 전사를 지시하는 프로모터 및 인핸서 요소는 일반적으로 암호화 영역의 5' 또는 업스트림에 위치한다. 하지만, 인핸서 요소는 프로모터 요소 및 암호화 영역의 3'에 위치할 때에도 효과를 발휘할 수 있다. 전사 종결 및 폴리아데닐화 신호는 암호화 영역의 3' 또는 다운스트림에 위치한다.
아데노 연관 바이러스 (AAV): 인간과 일부 다른 영장류 종을 감염시키는 작은 복제 결함 비-외피성 바이러스. AAV는 질환을 유발하지 않는 것으로 알려져 있으며 매우 가벼운 면역 반응을 유도한다. AAV를 활용하는 유전자 요법 벡터는 분화 세포 및 정지(quiescent) 세포 둘 다를 감염시킬 수 있고 숙주 세포의 게놈으로 통합되지 않고 염색체 외 상태를 지속할 수 있다. 이 특징들은 AAV를 유전자 요법에 매력적인 바이러스 벡터로 만든다. 현재 11개의 AAV의 혈청형이 인정되고 있다.
투여/투여하다: 임의의 효과적인 경로에 의해 대상체에게 작용제, 예컨대 치료제 (예를 들어, 재조합 AAV)를 제공하거나 주는 것. 예시의 투여 경로는 주사 (예컨대 피하, 근육내, 피내, 복강내, 및 정맥내), 경구, 관내, 설하, 직장, 경피, 비강내, 질 및 흡입 경로를 포함하지만, 이에 제한되는 것은 아니다.
cDNA (상보적 DNA): 내부의 비-암호화 분절 (인트론(intron)) 및 전사를 결정하는 조절 서열이 결여된 DNA 조각. cDNA는 세포로부터 추출된 메신저(messenger) RNA로부터 역전사에 의해 실험실에서 합성된다. cDNA는 또한 상응하는 RNA 분자에서 번역 제어의 역할을 하는 비번역 영역 (UTR)을 포함할 수 있다.
KCNV2: 인간 KCNV2 유전자 (NCBI 참조 서열: NM_133497.4; Ensembl 유전자 ENSG00000168263.9 및 전사물 KCNV2-201 ENST00000382082.4)(서열 번호: 1)는 선택된 전이유전자이다. KCNV2 전사물은 단 하나의 스플라이스(splice) 변이체를 갖고 2개의 엑손(exon)으로 구성된다. 전체 전사물 길이는 2178개 염기쌍 염기쌍 길이이고, 발명자들의 연구에 염기로 사용된 암호화 서열 (CDS)은 1638개 염기쌍 길이이다.
코돈-최적화된: "코돈-최적화된" 핵산은 코돈이 특정 시스템 (예컨대 특정 종 또는 종의 군)에서 발현에 최적이 되도록 변화된 핵산 서열을 나타낸다. 예를 들어, 핵산 서열은 포유류 세포 또는 특정 포유류 종 (예컨대 인간 세포)에서 발현에 최적화될 수 있다. 코돈 최적화는 암호화된 단백질의 아미노산 서열을 변화시키지 않는다.
대조군: 참조 표준. 일부 구체예에서, 대조군은 건강한 환자로부터 얻은 음성 대조군 샘플이다. 다른 구체예에서, 대조군은 CDSRR로 진단된 환자로부터 얻은 양성 대조군 샘플이다. 다른 구체예에서, 대조군은 과거 대조군(historical control) 또는 표준 참조 값 또는 값의 범위이다 (예컨대 이전에 테스트된 대조군 샘플, 예컨대 공지된 예후 또는 결과를 가진 환자의 군, 또는 베이스라인 또는 정상 값을 나타ㅏ내는 샘플의 군).
테스트 샘플과 대조군의 차이는 증가 또는 반대로 감소일 수 있다. 차이는 질적인 차이 또는 양적인 차이, 예를 들어, 통계적으로 유의한 차이일 수 있다. 일부 예에서, 차이는 대조군에 관하여 적어도 약 5%, 예컨대 적어도 약 10%, 적어도 약 20%, 적어도 약 30%, 적어도 약 40%, 적어도 약 50%, 적어도 약 60%, 적어도 약 70%, 적어도 약 80%, 적어도 약 90%, 적어도 약 100%, 적어도 약 150%, 적어도 약 200%, 적어도 약 250%, 적어도 약 300%, 적어도 약 350%, 적어도 약 400%, 적어도 약 500%, 또는 500% 초과의 증가 또는 감소이다.
DNA (데옥시리보핵산): DNA는 대부분의 살아있는 유기체의 유전 물질을 포함하는 긴 사슬 폴리머이다 (일부 바이러스는 리보핵산 (RNA)을 포함하는 유전자를 갖는다). DNA 폴리머의 반복 유닛은 4개의 상이한 뉴클레오타이드이며, 이것들 각각은 포스페이트 기가 부착된 데옥시리보오스 당에 결합된 4개의 염기, 아데닌 (A), 구아닌 (G), 시토신 (C), 및 티민 (T) 중 하나를 포함한다. 뉴클레오타이드의 트리플릿(triplet) (코돈이라고 불림)은 폴리펩타이드의 각각의 아미노산, 또는 종결 신호를 암호화한다. 용어 코돈은 DNA 서열이 전사되는 mRNA에서 3개의 뉴클레오타이드의 상응하는 (및 상보적) 서열에도 사용된다.
달리 명시되지 않는 한, DNA 분자에 대한 언급은 상기 DNA 분자의 역보체(reverse complement)를 포함하도록 의도된다. 단일 가닥이 본원의 본문에서 요구되는 경우를 제외하면, DNA 분자는, 단일 가닥만을 묘사하도록 작성되었음에도, 이중 가닥 DNA 분자의 두 가닥 모두를 포함한다. 따라서, 특정 단백질, 또는 그 단편을 암호화하는 핵산 분자에 대한 언급은 센스(sense) 가닥 및 그것의 역보체 둘 다를 포함한다. 예를 들어, 개시된 핵산 분자의 역보체 서열로부터 프로브 또는 프라이머를 생성하는 것이 적절하다.
발현: 핵산 서열의 전사 또는 번역. 예를 들어, 암호화 핵산 서열 (예컨대 유전자)은 그것의 DNA가 RNA 또는 RNA 단편으로 전사될 때 발현될 수 있으며, 그것은 일부 예에서 mRNA가 되도록 처리된다. 암호화 핵산 서열 (예컨대 유전자)은 또한 그것의 mRNA가 아미노산 서열, 예컨대 단백질 또는 단백질 단편으로 번역될 때 발현될 수 있다. 특정 예에서, 이종성 유전자는 그것의 RNA로 전사될 때 발현된다. 또 다른 예에서, 이종성 유전자는 그것의 RNA가 아미노산 서열로 번역될 때 발현된다. 발현의 조절은 전사, 번역, RNA 수송 및 처리, 중간 분자, 예컨대 mRNA의 분해에 대한 제어, 또는 특정 단백질 분자가 생성된 후 그것들의 활성화, 비활성화, 구획화 또는 분해를 통한 제어를 포함한다.
발현 제어 서열: 작동 가능하게 연결된 이종성 핵산 서열의 발현을 조절하는 핵산 서열. 발현 제어 서열이 전사 및, 적절하게는, 핵산 서열의 번역을 제어하고 조절할 때 발현 제어 서열은 핵산 서열에 작동 가능하게 연결된다. 따라서, 발현 제어 서열은 적절한 프로모터, 인핸서, 전사 종결자, 단백질-암호화 유전자 앞에 개시 코돈 (ATG), 인트론에 대한 스플라이스 신호, mRNA의 적절한 번역을 허용하기 위해 상기 유전자의 올바른 리딩 프레임(reading frame)의 유지, 및 종결 코돈을 포함할 수 있다. 용어 "대조군 서열"은 최소한 그 존재가 발현에 영향을 미칠 수 있는 구성요소를 포함하도록 의도되고, 또한 그 존재가 이로운 추가적인 구성요소, 예를 들어, 선도 서열 및 융합 파트너 서열을 포함할 수 있다. 발현 제어 서열은 프로모터를 포함할 수 있다.
유전자: mRNA든 그렇지 않든, RNA의 전사에 필요한 제어 및 암호화 서열을 포함하는 핵산 서열, 전형적으로는 DNA 서열. 예를 들어, 유전자는 프로모터, 하나 이상의 인핸서 또는 사일런서(silencer), RNA 및/또는 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산 서열, 다운스트림 조절 서열 및, 가능한 대로, mRNA의 발현의 조절에 관련된 다른 핵산 서열을 포함할 수 있다.
해당 분야에 공지된 바와 같이, 대부분의 진핵 유전자는 엑손과 인트론 둘 다를 포함한다. 용어 "엑손"은 인접한 서열을 성숙한 mRNA 전사물에 제공하는 것으로 생물정보학적으로 예상되고 및/또는 실험적으로 확인된 게놈 DNA에서 발견된 핵산 서열을 나타낸다. 용어 "인트론"은 성숙한 mRNA 전사물에 기여하지 않지만 대신에 전사물의 처리 중에 "스플라이싱"되는 것으로 예상되고 및/또는 확인된 게놈 DNA에서 발견된 핵산 서열을 나타낸다.
유전자 요법: 하나 이상의 수용 세포로의 이종성 핵산 분자의 도입으로서, 수용 세포에서 이종성 핵산의 발현은 세포의 기능에 영향을 미치고 대상체에서 치료 효과를 초래한다. 예를 들어, 이종성 핵산 분자는 수용 세포의 기능에 영향을 미치는 단백질을 암호화할 수 있다.
혼성체화: 본원에서 제공된 핵산 서열에 대해 특정 수준의 동일성을 가진 핵산의 특성화를 위한 혼성체화 검정이 해당 분야에 널리 공지되어 있으며; 예를 들어, Sambrook, Russell "Molecular Cloning, A Laboratory Manual", Cold Spring Harbor Laboratory, N.Y. (2001); Ausubel, "Current Protocols in Molecular Biology", Green Publishing Associates and Wiley Interscience, N.Y. (1989)를 참조하면 된다. 용어 "혼성체화" 또는 "혼성체화하다"는 본원에서 사용된 바와 같이 엄중 또는 비-엄중 조건 하에서의 혼성체화와 관련이 있을 수 있다. 상기 혼성체화 조건은, 예를 들어, Sambrook (2001) loc. cit.; Ausubel (1989) loc. cit., 또는 Higgins and Hames (Eds.) "Nucleic acid hybridization, a practical approach" IRL Press Oxford, Washington D.C., (1985)에서 기재된 통상적인 프로토콜에 따라 확립될 수 있다. 조건의 설정은 당업자의 기술범위 내에 있고 해당 분야에서 기재된 프로토콜에 따라 결정될 수있다. 따라서, 혼성체화 서열의 검출은 보통 엄중 혼성체화 및 세척 조건, 예를 들어, 65℃에서 0.1×SSC, 0.1% SDS 또는 2×SSC, 60℃, 0.1% SDS에서, 예를 들어, 65℃에서 6×SSC, 1% SDS까지의 범위에 있는 조건을 필요로 할 것이다. 널리 공지된 바와 같이, 결정되어야 하는 프로브의 길이 및 핵산의 조성이 혼성체화 조건의 추가의 파라미터를 구성한다.
단리된: "단리된" 생물학적 구성요소 (예컨대 핵산 분자, 단백질, 바이러스 또는 세포)는 구성요소가 자연 발생하는 유기체의 세포 또는 조직, 또는 유기체 그 자체의 다른 생물학적 구성요소, 예컨대 다른 염색체 및 염색체 외의 DNA 및 RNA, 단백질 및 세포로부터 실질적으로 분리되거나 정제되었다. "단리된" 핵산 분자 및 단백질은 표준 정제 방법에 의해 정제된 것들을 포함한다. 용어는 또한 숙주 세포에서 재조합 발현에 의해 제조된 핵산 분자 및 단백질, 뿐만 아니라 화학적으로 합성된 핵산 분자 및 단백질을 포괄한다.
핵산 분자: RNA, cDNA, 게놈 DNA의 센스 가닥 및 안티센스(antisense) 가닥 둘 다를 포함할 수 있는 뉴클레오타이드의 폴리머 형태, 및 합성 형태 및 상기의 혼합된 폴리머. 뉴클레오타이드는 리보뉴클레오타이드, 데옥시뉴클레오타이드 또는 뉴클레오타이드의 각각의 유형의 변형된 형태를 나타낸다. 용어 "핵산 분자"는 본원에서 사용된 바와 같이 "핵산" 및 "폴리뉴클레오타이드"와 동의어이다. 핵산 분자는 보통 달리 명시되지 않는 한 길이가 적어도 10개의 염기이다. 용어는 DNA의 단일 및 이중 가닥 형태를 포함한다. 폴리뉴클레오타이드는 자연 발생 및/또는 비-자연 발생 뉴클레오타이드 연결에 의해 함께 연결된 자연 발생 및 변형된 뉴클레오타이드 중 하나 또는 둘 다를 포함할 수 있다. "cDNA"는 mRNA와 상보적이거나 동일한, 단일 가닥 또는 이중 가닥 형태의 DNA를 나타낸다. "암호화"는 생물학적 과정에서 뉴클레오타이드 (즉, rRNA, tRNA 및 mRNA)의 정의된 서열 또는 아미노산의 정의된 서열 및 그것에 기인하는 생물학적 성질을 가진 다른 폴리머 및 거대분자의 합성에 대한 주형의 역할을 하는 폴리뉴클레오타이드의 뉴클레오타이드, 예컨대 유전자, cDNA, 또는 mRNA의 특정 서열의 내재된 성질을 나타낸다.
작동 가능하게 연결된: 제1 핵산 서열이 기능적인 관계로 제2 핵산 서열과 함께 배치될 때 제1 핵산 서열은 제2 핵산 서열과 작동 가능하게 연결된다. 예를 들어, 프로모터가 암호화 서열의 전사 또는 발현에 영향을 미치는 경우 프로모터는 암호화 서열에 작동 가능하게 연결된다. 일반적으로, 작동 가능하게 연결된 DNA 서열은 인접하고, 필요한 경우 동일한 리딩 프레임에서 2개의 단백질-암호화 영역을 결합시킨다.
약학적으로 허용 가능한 담체: 사용되는 약학적으로 허용 가능한 담체는 통상적이다. Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 22 nd ed., London, UK: Pharmaceutical Press, 2013에서 개시된 벡터의 약학적 전달에 적합한 조성물 및 제제가 기재되어 있다.
일반적으로, 담체의 성질은 이용되는 특정 투여 방식에 따라 달라질 것이다. 예를 들어, 비경구 제제는 보통 비히클(vehicle)로서 약학적으로 및 생리학적으로 허용 가능한 유체, 예컨대 물, 생리식염수, 평형염액(balanced salt solution), 수성 덱스트로오스, 글리세롤, 등을 포함하는 주사 가능한 유체를 포함한다. 고체 조성물 (예를 들어, 분말, 알약, 타블렛, 또는 캡슐 형태)에 대해, 통상적인 비-독성 고체 담체는, 예를 들어, 약학적 등급의 만니톨, 락토오스, 전분, 또는 마그네슘 스테아레이트를 포함할 수 있다. 생물학적으로 중성인 담체에 더하여, 투여되는 약학적 조성물 (예컨대 벡터 조성물)은 소량의 비-독성 보조 물질, 예컨대 습윤제 또는 에멀젼화제, 방부제, 및 pH 완충제 등, 예를 들어, 나트륨 아세테이트 또는 소르비탄 모노라우레이트를 포함할 수 있다. 특정 구체예에서, 대상체에게 투여하기에 적합하도록, 담체는 멸균되고, 및/또는 원하는 면역 반응을 유도하기에 적합한 조성물의 1회 이상의 측정 용량을 포함하는 단위 투약 형태로 현탁되거나 그렇지 않으면 포함될 수 있다. 그것은 또한 치료 목적으로 사용하기 위해 약을 동반할 수 있다. 단위 투약 형태는, 예를 들어, 멸균 내용물을 포함하는 밀봉된 바이알 또는 대상체로의 주사를 위한 주사기 내에 있을 수 있거나, 또는 이후의 가용화 및 투여를 위해 동결건조될 수 있거나 또는 고체 또는 제어된 방출 투약량으로 되어있을 수 있다.
정제된: 용어 정제된은 절대 순도를 요구하지 않고; 대신에, 상대적인 용어로서 의도된다. 따라서, 예를 들어, 정제된 단백질 조제물은 단백질 (예컨대 KCVN2 단백질)이 펩타이드 또는 단백질이 세포 내의 천연 환경에 있는 것보다 더 풍부한 것이다. 한 구체예에서, 조제물은 단백질이 조제물의 총 단백질 포함량의 적어도 50%를 나타내도록 정제된다.
폴리펩타이드: 길이 또는 번역 후 변형 (예를 들어, 글리코실화 또는 인산화)에 관계없는 아미노산의 임의의 사슬. "폴리펩타이드"는 자연 발생 아미노산 폴리머 및 비-자연 발생 아미노산 폴리머를 포함할 뿐만 아니라 하나 이상의 아미노산 잔기가 비-천연 아미노산, 예를 들어, 상응하는 자연 발생 아미노산의 인공의 화학적 모방체인 아미노산 폴리머에 적용된다. "잔기"는 아미드 결합 또는 아미드 결합 모방체에 의해 폴리펩타이드에 포함되는 아미노산 또는 아미노산 모방체를 나타낸다. 폴리펩타이드는 아미노 말단 (N-말단) 단부 및 카르복시 말단 (C-말단) 단부를 갖는다. "폴리펩타이드"는 펩타이드 또는 단백질과 교체 가능하게 사용되며, 본원에서 아미노산 잔기의 폴리머를 나타내는데 사용된다.
질환의 예방, 치료 또는 개선: 질환 (예컨대 망막 장애)의 "예방"은 질환의 완전한 발병을 억제하는 것을 나타낸다. "치료"는 질환 또는 병리학적 상태가 발병하기 시작한 후 질환 또는 병리학적 상태의 징후 또는 증상을 개선하는 치료적 개입을 나타낸다. "개선"은 질환의 징후 또는 증상의 횟수 또는 심각도의 감소를 나타낸다.
프로모터: 핵산 (예를 들어 유전자)의 전사를 지시/시작하는 DNA의 영역. 프로모터는 전사의 시작 부위 근처의 필요한 핵산 서열을 포함한다. 전형적으로, 프로모터는 그것들이 전사시키는 유전자 근처에 위치한다. 프로모터는 또한 선택적으로 전사의 시작 부위로부터 수천 개의 염기쌍만큼 떨어저 위치할 수 있는 원위 인핸서 또는 억제자 요소를 포함한다. 조직-특이적 프로모터는 주로 단일 유형의 조직 또는 세포에서 전사를 지시/시작하는 프로모터이다. 예를 들어, 광수용체-특이적 프로모터는 다른 세포 유형 보다 실질적으로 더 큰 정도로 광수용체 세포에서 전사를 지시/시작하는 프로모터이다.
단백질: 유전자 또는 다른 암호화 핵산 (예를 들어, cDNA)에 의해 발현되고 아미노산으로 구성된 생물학적 분자.
정제된: 용어 "정제된"은 절대 순도를 요구하지 않고; 대신에, 상대적인 용어로서 의도된다. 따라서, 예를 들어, 정제된 펩타이드, 단백질, 바이러스, 또는 다른 활성 화합물은 자연적으로 회합된 단백질 및 다른 오염물질로부터 전체적으로 또는 부분적으로 단리된 것이다. 특정 구체예에서, 용어 "실질적으로 정제된 것"은 세포, 세포 배양 배지, 또는 다른 미가공 조제물로부터 단리되고 초기 조제물의 다양한 구성요소, 예컨대 단백질, 세포 데브리(debris), 및 다른 구성요소를 제거하기 위해 분획화된 펩타이드, 단백질, 바이러스 또는 다른 활성 화합물을 나타낸다.
재조합: 재조합 핵산 분자는 자연 발생하지 않은, 예를 들어, 하나 이상의 핵산 치환, 결실 또는 삽입을 포함하는 서열을 갖고, 및/또는 서열의 2개의 분리된 분절의 인공적인 조합에 의해 제조된 서열을 갖는 것이다. 이 인공적인 조합은 화학적 합성 또는, 더 일반적으로는, 핵산의 단리된 분절의 인공적인 조작에 의해, 예를 들어, 유전 공학 기술에 의해 달성될 수 있다.
재조합 바이러스는 재조합 핵산 분자를 포함하는 게놈을 포함하는 것이다. 본원에서 사용된 바와 같이, "재조합 AAV"는 재조합 핵산 분자 (예컨대 Kv8.2를 암호화하는 재조합 핵산 분자)가 패키징된(packaged) AAV 입자를 나타낸다.
재조합 단백질은 자연 발생하지 않은 서열을 갖거나 또는 서열의 2개의 분리된 분절의 인공적인 조합에 의해 제조되는 서열을 갖는 것이다. 여러 구체예에서, 재조합 단백질은 숙주 세포, 예컨대 박테리아 또는 진핵 세포로, 또는 재조합 바이러스의 게놈으로 도입된 이종성 (예를 들어, 재조합) 핵산에 의해 암호화된다.
망막: 망막은 망막 색소 상피 (retinal pigment epithelium: RPE) 세포층 및 3개의 감각 신경 세포층; 즉 (외부에서 내부로), 외핵층 (간상체 및 15개의 원추 광수용체 세포를 포함함), 내핵층 (양극성 세포를 포함함), 및 신경절 세포층으로 구성된다. 망막 장애 또는 이영양증은 광수용체 세포의 진행성 상실 및 수반되는 시력 상실을 특징으로 하는 망막의 질환으로 정의될 수 있다. 망막 장애 또는 이영양증은 유전적 망막 장애 또는 이영양증일 수 있다.
서열 동일성: 2개 이상의 핵산 서열, 또는 2개 이상의 아미노산 서열 사이의 동일성 또는 유사성은 서열 사이의 동일성 또는 유사성에 관하여 표현된다. 서열 동일성은 퍼센트 동일성에 관하여 측정될 수 있으며; 퍼센트가 높을수록, 서열은 더 동일하다. 서열 유사성은 퍼센트 유사성에 관하여 측정될 수 있으며 (보존적 아미노산 치환을 고려한다); 퍼센트가 높을수록, 서열은 더 유사하다. 핵산 또는 아미노산 서열의 상동체 또는 이종상동체는 표준 방법을 사용하여 정렬될 때 상대적으로 높은 정도의 서열 동일성/유사성을 가지고 있다. 이 상동성은, 더 멀게 관련된 종 (예컨대 인간과 과 예쁜 꼬마 선충(C. elegans) 서열)과 비교하여, 이종상동성 단백질 또는 cDNA가 더 밀접하게 관련된 종 (예컨대 인간과 마우스 서열)으로부터 유래될 때 더 유의하다.
비교용 서열의 정렬 방법은 해당 분야에 널리 공지되어 있다. 다양한 프로그램 및 정렬 알고리즘이 Smith & Waterman, Adv. Appl. Math. 2:482, 1981; Needleman & Wunsch, J. Mol. Biol. 48:443, 1970; Pearson & Lipman, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:2444, 1988; Higgins & Sharp, Gene, 73:237-44, 1988; Higgins & Sharp, CABIOS 5:151-3, 1989; Corpet et al., Nuc. Acids Res. 16:10881-90, 1988; Huang et al. Computer Appls. in the Biosciences 8, 155-65, 1992; 및 Pearson et al., Meth. Mol. Bio. 24:307-31, 1994. Altschul et al., J. Mol. Biol. 215:403-10, 1990에 기재되어 있으며, 서열 정렬 방법 및 상동성 계산에 대한 상세한 고려사항을 제공한다.
NCBI 기본 로컬 정렬 검색 도구 (Basic Local Alignment Search Tool: BLAST) (Altschul et al., J. Mol. Biol. 215:403-10, 1990)은 서열 분석 프로그램 blastp, blastn, blastx, tblastn 및 tblastx와 함께 사용하기 위해 미국 국립 생물정보 센터 (National Center for Biological Information: NCBI) 및 인터넷을 포함하는 다양한 공급처로부터 이용 가능하다. 추가적인 정보는 NCBI 웹사이트에서 발견될 수 있다.
본원에서 사용된 바와 같이, "적어도 90% 동일성"에 대한 언급은 명시된 참조 서열에 대한 "적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 적어도 99%, 또는 심지어 100% 동일성"을 나타낸다.
대상체: 인간 및 비-인간 포유동물을 포함하는 범주인, 살아있는 다세포 척추동물 유기체.
치료적 유효량:
장애 또는 질환의 증상 및/또는 근본적인 원인을 예방하고, 치료하고 (예방을 포함함), 감소시키고 및/또는 개선하며, 예를 들어, 망막 장애를 예방하고, 억제하고, 및/또는 치료하기에 충분한 작용제, 예컨대 KCVN2를 암호화하는 개시된 재조합 AAV 벡터의 양. 예를 들어, 이것은 광수용체 기능을 회복시키기에 충분한 양의 KCVN2를 생성하는, 본원에서 기재된 바와 같이 신규한 KCVN2 유전자를 암호화하는 재조합 AAV 벡터의 양일 수 있다.
한 예에서, 원하는 반응은, 예를 들어, 망막전위도 (ERG) 기록에 의해 측정될 때, 대상체 (예컨대 CDSRR을 가진 대상체)에서 광수용체 기능을 회복시키는 것이다. ERG 기록 (a-파, b-파, c-파)은 방법이 효과적이도록 CDSRR이 없는 정상적인 건강한 대상체의 기록까지 완전히 회복될 필요는 없다. 예를 들어, 본원에서 기재된 바와 같이 벡터 (예컨대 KCVN2 암호화 벡터)의 치료적 유효량의 투여는 적합한 대조군과 비교하여, 원하는 양만큼, 예를 들어, 적어도 10%, 적어도 20%, 적어도 30%, 적어도 40%, 적어도 50%, 적어도 60%, 적어도 70%, 적어도 80%, 적어도 90%, 적어도 95%, 적어도 98%, 적어도 100% 또는 그 이상만큼 명소시 또는 암소시 ERG b-파를 증가시킬 수 있다.
질환 또는 병태에 대한 치료 반응을 얻기 위해서는 치료제의 다회수 투여를 필요로 할 수 있다는 것이 이해된다. 따라서, 치료적 유효량은 이전 또는 이후의 투여와 조합하여 환자에서 치료 결과를 획득하는데 기여하는 분할 용량을 포함한다. 예를 들어, 작용제의 치료적 유효량은 치료 과정 중에, 예를 들어, 매일 단일 용량으로, 또는 다회수 용량으로 투여될 수 있다. 하지만, 치료적 유효량은 치료되는 대상체, 치료되는 병태의 심각도 및 유형, 그리고 투여 방식에 따라 달라질 수 있다. 작용제의 단위 투약 형태는 치료량으로, 또는 치료량의 배수로, 예를 들어, 바이알 (예를 들어, 뚫을 수 있는 뚜껑이 있음) 또는 멸균 구성요소를 가진 주사기에 패키징될 수 있다.
벡터: 벡터는 숙주 세포에서 벡터가 복제하고 및/또는 통합하는 능력을 방해하지 않고 외래의 핵산의 삽입을 허용하는 핵산 분자이다. 벡터는 숙주 세포에서 복제하는 것을 허용하는 핵산 서열, 예컨대 복제의 기원을 포함할 수 있다. 벡터는 또한 하나 이상의 선택 가능한 마커 유전자 및 다른 유전 요소를 포함할 수 있다. 발현 벡터는 삽입된 유전자 또는 유전자의 전사 및 번역을 허용하기 위해 필요한 조절 서열을 포함하는 벡터이다. 본원의 일부 구체예에서, 벡터는 아데노 연관 바이러스 (AAV) 벡터이다. 일부 구체예에서, 벡터는 감마-레트로바이러스 벡터, 렌티바이러스 벡터, 또는 아데노바이러스 벡터이다.
신규한 KCVN2 유전자
서열 번호: 2로 제시된 뉴클레오타이드 서열, 또는 그것에 대해 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일한 핵산 서열을 포함하는 Kv8.2 활성을 가진 단백질을 암호화하는 핵산 분자가 제공된다.
혼성체화하다 엄중 조건 하에서 서열 번호: 2로 제시된 뉴클레오타이드 서열, 또는 그것에 대해 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일한 핵산 서열의 상보적 가닥에 혼성체화하는 핵산 분자가 제공된다.
서열 번호: 2로 제시된 뉴클레오타이드 서열, 또는 그것에 대해 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일한 핵산 서열에 대한 유전 암호의 결과로서 퇴화된 핵산 분자가 제공된다.
실시예 1에서 논의된 바와 같이, Kv8.2를 암호화하는 뉴클레오타이드 서열은 개선된 발현에 대해 코돈-최적화되었다. 예시의 최적화된 KCVN2 서열이 서열 번호: 2로 제공된다.
상응하는 고유한 인간 KCVN2에 비해 발현이 증가된 KCVN2 유전자의 변이체가 본원에서 개시된다. 서열 번호: 2는 서열 번호: 1로 개시된 인간 야생형 KCVN2 유전자, 서열 번호: 12에 개시된 암호화 영역을 포함하는 비변형된 KCVN2 유전자와 비교하여 개선된 광수용체 치료 성질을 포함하는 개선된 치료 성질을 갖는다. 개시된 KCVN2 변이체의 개선된 성질은 단백질 합성의 증가, 더 안정한 mRNA, 번역 신장 속도의 증가, 및/또는 개선된 약물동역학적 성질을 포함하지만, 이에 제한되는 것은 아니다. 개선된 성질은 안정한 전이유전자 및 단백질 발현, 회복의 향상 및 시각 기능의 개선을 포함할 수 있다.
KCVN2 폴리뉴클레오타이드의 변이체는 핵산 서열의 자연 발생 변이체를 포함하는 서열 번호: 2의 임의의 변이체로 정의될 수 있다. 변이체는 서열 번호: 2에 대해 적어도 약 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 서열 동일성을 갖는 것으로 정의될 수 있으며, 변이체 서열로부터 번역된 폴리펩타이드는 그 기능성을 유지한다. 변이체는 서열 번호: 2에 대해 적어도 약 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 서열 동일성을 갖는 것으로 정의될 수 있으며, 변이체 서열, 서열 번호: 11로부터 번역된 폴리펩타이드는 광수용체 기능을 구제할 수 있는 능력을 갖는다. 특정 변형으로, 변이체는 암호화 서열의 코돈 최적화된 버전이다.
본 개시내용에 의해 고려되는 발현 작제물은 원추 광수용체 기능을 구제할 수 있다. 원추 광수용체 기능을 구제하는 것은 원추 광수용체 기능의 적어도 약 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80% 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%를 회복하는 것으로 정의될 수 있다. 원추 광수용체 기능은 당업자에게 공지된 임의의 적합한 표준 기술에 의해, 예를 들어, 망막 반응의 망막전위도 (ERG) 분석에 의해 분석될 수 있다. 간상 광수용체 기능은 당업자에게 공지된 임의의 표준 기술에 의해, 예를 들어, 망막 반응의 ERG 분석에 의해 분석될 수 있다.
광수용체 기능을 구제하는 것은 또한 광수용체 생존을 연장시키는 것으로 정의될 수 있다. 광수용체 생존을 연장시키는 것은 광수용체 (예를 들어, 원추 광수용체 및/또는 간상 광수용체)가 기능적이거나 또는 이영양증에 의해 영향을 받은 광수용체와 비교하여 약 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 100% 또는 100% 이상만큼 존재하는 시간을 연장시키는 것으로 정의될 수 있다. 광수용체 생존 연장의 예는 또한 ERG 활성의 개선 또는 ERG 활성 손실의 둔화, 망막 민감도 개선 또는 망막 민감도의 진행성 손실의 둔화/중단 또는 광수용체 세포 손실의 둔화 또는 중단, 망막 외부층의 얇아짐의 둔화 또는 중단, 시력 개선 또는 시력 손실의 둔화/중단을 포함한다.
발현 작제물은 KCVN2 유전자에 작동 가능하게 연결된 하나 이상의 전사 제어 유닛을 포함할 수 있다. 변형으로, KCVN2 유전자는 서열 번호: 2이다. 일부 변형으로, KCVN2 유전자는 코돈 최적화된다.
따라서, Kv8.2, 뿐만 아니라 Kv8.2의 정제된 형태를 암호화하는 핵산 분자 (예를 들어, cDNA 또는 RNA 분자)가 제공된다. 여러 구체예에서, 핵산 분자는 숙주 세포 (예컨대 포유류 세포)에서 발현되어 Kv8.2를 생성할 수 있다.
유전 암호는 기능적으로 동등한 다양한 핵산 서열, 예컨대 서열은 다르지만 동일한 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산을 구성하는데 사용될 수 있다.
본원에서 개시된 핵산 분자는, 예를 들어, 적절한 서열의 클로닝을 포함하는 임의의 적합한 방법에 의해 또는 표준 방법에 의한 직접적인 화학적 합성에 의해 제조될 수 있다. 화학적 합성은 단일 가닥 올리고뉴클레오타이드를 생성한다. 이것은 이것은 상보적 서열과의 혼성체화에 의해 또는 주형으로 단일 가닥을 사용하여 DNA 폴리머라아제와의 폴리머화에 의해 이중 가닥 DNA로 반전될 수 있다.
예시의 핵산은 클로닝 기술에 의해 제조될 수 있다. 적절한 클로닝 및 시퀀싱 기술의 예는, 예를 들어, Green and Sambrook (Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 4th ed., New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2012) 및 Ausubel et al. (Eds.) (Current Protocols in Molecular Biology, New York: John Wiley and Sons, including supplements, 2017)에서 발견될 수 있다.
핵산은 또한 증폭 방법에 의해 제조될 수 있다. 증폭 방법은 폴리머라아제 연쇄 반응 (PCR), 리가아제 연쇄 반응 (LCR), 전사-기반 증폭 시스템 (TAS), 및 자가-지속 서열 복제 시스템 (3SR)을 포함한다.
핵산 분자는 재조합에 의해 조작된 세포, 예컨대 박테리아, 식물, 효모, 곤충 및 포유류 세포에서 발현될 수 있다. 본원에서 개시된 DNA 서열은 적합한 숙주 세포로의 DNA 전달에 의해 시험관 내에서(in vitro) 발현될 수 있다. 세포는 원핵세포 또는 진핵세포일 수 있다. 대장균(E. coli), 다른 박테리아 숙주, 효모, 및 다양한 고등 진핵 세포, 예컨대 COS, CHO, HeLa 및 골수종 세포주를 포함하는, 단백질 발현에 이용 가능한 많은 발현 시스템이 개시된 신규한 뉴클레오타이드 서열을 발현하는데 사용될 수 있다. 외래의 DNA가 숙주에서 지속적으로 유지된다는 것을 의미하는, 안정한 전달 방법은 해당 분야에 공지되어 있다.
개시된 핵산의 발현은 DNA 또는 cDNA를 프로모터 (구성성 또는 유도성)에 작동 가능하게 연결한 후 이어서, 발현 카세트로 통합시킴으로써 달성될 수 있다. 프로모터는 관심있는 어떠한 프로모터도 될 수 있으며, 광수용체-특이적 프로모터, 예컨대 로돕신 키나아제 (RK) 프로모터 (서열 번호: 6)를 포함한다. 다른 예시의 프로모터는 CAG (하이브리드(hybrid) CMV 초기 인핸서/닭 b-액틴 프로모터), CBA (닭 b-액틴 프로모터), CBh (CBA 프로모터의 하이브리드 형태), CMV (인간 시토메갈로바이러스 프로모터), CB (시토메갈로바이러스 (CMV) 급초기 인핸서, 제1 인트론/엑손 접합부를 가진 닭 b-액틴 프로모터, 하이브리드 닭 b-액틴 및 토끼 b-글로불린 인트론/엑손 접합부로 구성된 조절 요소), CBSB (CB 프로모터보다 더 짧은 CMV 즉시 인핸서 서열을 포함함), GRK1 (인간 G 단백질-결합된 수용체 키나아제 1 프로모터), pRLBP1 (단축된 인간 레틴알데하이드 결합 단백질 1 (RLBP1) 프로모터), hCAR (인간 원추체 아레스틴 프로모터, PRI.7 및 PR2.1 (인간 L-옵신 프로모터의 버전)), IRBP (인간 광수용체 간 레티노이드-결합 단백질 인핸서), RS/IRBP (인간 레티노스키신 근위 프로모터와 인간 광수용체 간 레티노이드-결합 단백질 인핸서의 조합), pRHO (로돕신 프로모터), 및 hPDE6b (짧은 인간 포스포다이에스터라아제 6b 프로모터)를 포함하지만, 이에 제한되는 것은 아니다.
선택적으로, 코자크 공통 서열(KOZAK consensus sequence) (서열 번호: 8), a 우드척 간염 바이러스 (Woodchuck Hepatitis virus: WHP) 전사 후 조절 요소 (WPRE)(서열 번호: 9); 및/또는 소 성장 호르몬 폴리아데닐화 (BGH 폴리(A))(서열 번호: 10) 중 하나 이상과 같은 조절 요소가 작제물에 포함된다. 카세트는 원핵생물 또는 진핵생물에서 복제 및 통합에 적합할 수 있다. 전형적인 발현 카세트는 단백질을 암호화하는 DNA의 발현을 조절하는데 유용한 특이적인 서열을 포함한다. 예를 들어, 발현 카세트는 적절한 프로모터, 인핸서, 전사 및 번역 종결자, 시작 서열, 단백질-암호화 유전자 앞에 개시 코돈 (즉, ATG), 인트론에 대한 스플라이싱 신호, mRNA의 절적한 번역을 허용하도록 상기 유전자의 올바른 리딩 프레임의 유지를 유한 서열, 및 종결 코돈을 포함할 수 있다. 벡터는 선택 가능한 마커, 예컨대 약물 저항성 (예를 들어, 앰피실린 또는 테트라사이클린 저항성)을 암호화하는 마커를 암호화할 수 있다.
클로닝된 유전자의 높은 발현 수준을 얻기 위해서, 예를 들어, 전사를 지시하는 강력한 프로모터, 번역 시작을 위한 리보솜 결합 부위 (예를 들어, 내부 리보솜 결합 서열), 및 전사/번역 종결자를 포함하는 발현 카세트를 구성하는 것이 바람직하다. 대장균에 대해, 이것은 프로모터, 예컨대 T7, trp, lac, 또는 람다(lambda) 프로모터, 리보솜 결합 부위, 및 바람직하게는 전사 종결 신호를 포함할 수 있다. 진핵 세포에 대해, 제어 서열은, 예를 들어, 면역글로불린 유전자, HTLV, SV40 또는 시토메갈로바이러스, 및 폴리아데닐화 서열로부터 유래된 프로모터 및/또는 인핸서를 포함할 수 있고, 스플라이스 공여체(donor) 및/또는 수령체(acceptor) 서열 (예를 들어, CMV 및/또는 HTLV 스플라이스 수령체 및 공여체 서열)을 더 포함할 수 있다. 카세트는 널리 공지된 방법, 예컨대 대장균에 대해 형질전환 또는 전기천공 및 포유류 세포에 대해 칼슘 포스페이트 처리, 전기천공 또는 리포펙션에 의해 선택된 숙주 세포로 전달될 수 있다. 카세트에 의해 형질전환된 세포는 카세트에 포함된 유전자, 예컨대 amp, GPt, neo, 및 hyg 유전자에 의해 부여되는 항생제에 대한 저항성에 의해 선택될 수 있다.
생물학적 활성을 약화시키지 않으면서 본원에서 기재된 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산에 대한 변형이 이루어질 수 있다. 클로닝, 발현, 또는 융합 단백질로의 표적화 분자의 통합을 용이하게 하기 위해 약간의 변형이 이루어질 수 있다. 이러한 변형은, 예를 들어, 종결 코돈, 편리하게 위치한 제한 부위를 생성하기 위한 서열, 및 시작 부위를 제공하기 위해 아미노 말단에 메티오닌을 추가하기 위한 서열, 또는 정제 단계를 돕기 위한 추가적인 아미노산 (예컨대 폴리 His)을 포함한다.
발현되면, 개시된 Kv8.2는 암모늄 설페이트 침전, 친화도 컬럼, 컬럼 크로마토그래피, 등을 포함하는 해당 분야의 표준 절차에 따라 정제될 수 있다 (일반적으로, Simpson et al. (Eds.), Basic methods in Protein Purification and Analysis: A Laboratory Manual, New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2009를 참조하면 된다). 개시된 폴리펩타이드는 100% 순수할 필요는 없다. 부분적으로 또는 원하는 만큼 균질하게 정제되면, 치료적으로 사용되어야 하는 경우, 폴리펩타이드는 내독소가 실질적으로 없어야 한다.
재조합 벡터 및 유전자 요법 적용
현재 실시에서, 유전자 요법은 기능을 회복시키는 야생형 카피(copy)로의 기능적 단백질이 생성되지 않는 기능 장애 유전자의 기능적 대체를 나타낸다. 유전자 요법은 망막의 유전적 및 일반적 복합 장애의 치료에서 유망한 접근법이고 전임상 및 임상 연구에서는 안전하고 효율적인 유전자 전달 비히클로서 아데노 연관된 바이러스 벡터 (AAV)의 사용이 검증되었다. AAV-매개된 유전자 대체 요법은 간, 근육, 혈액 세포 및 망막을 포함한 다양한 조직 및 계통에서 달성될 수 있다.
유전적인 광수용체 퇴화의 여러 동물 모델은 유전자 보충 요법에 의한 성곡적인 치료를 겪었고, 지금까지 형태학, 기능, 및 행동 수준에서 시각 구제가 달성되었다. 다양한 유형의 유전적 망막 장애에 대한 유전적 결점을 교정하는 수단으로서 AAV 전달 시스템을 사용하고 있거나 사용한 43개의 임상 시험이 진행 중이거나 완료되었다 (clinicaltrials.gov, 2020년 11월 16일에 검색 완료됨). 또 다른 5개의 임상 시험 (3개는 진행 중이고 2개는 완료됨)이 또한 연령-관련된 황반 변성에 대한 치료제를 전달하기 위해 AAV를 사용하고 있거나 사용하였다.
AAV 벡터는 효율성 및 특이성 모두에서 광수용체 세포 표적화를 위한 허용 가능한 전달 방법인 것으로 입증되었다. AAV 벡터는 광수용체 세포에 대한 높은 친화도를 갖는 한편 비-독성, 비-병원성 및 저면역원성 프로파일을 제공하는 것으로 나타났다. 이것은 망막 장애 및 시력 손실 모델에 유전자 요법의 성공적인 적용을 입증하였다. 현재이용 가능한 다양한 AAV 혈청형 중에서 망막 세포를 표적화하는데 가장 일반적으로 이용되는 것은 AAV2/2, AAV2/8, AAV2/9, AAV2/5, AAV2/7m8, AAV2/Anc80_L065 혈청형이었다.
상기 논의된 재조합 핵산 분자 중 어느 것도 숙주 또는 대상체에서 발현을 위한 벡터 (예컨대 AAV 벡터)에 포함될 수 있다.
본원에서 개시된 핵산 서열은 벡터 (예컨대 rAAV 벡터)의 생산에 유용하고, 안티센스 전달 벡터, 유전자 요법 벡터, 또는 백신 벡터에서도 유용하다. 특정 구체예에서, 본 개시내용은 유전자 전달 벡터, 및 본원에서 개시된 핵산 서열을 포함하는 숙주 세포를 제공한다. 일부 구체예에서, 선택된 벡터는 전이유전자를 대상체로 도입시키기 위해 정맥내 주사, 생체 외(ex-vivo) 형질도입, 트랜스펙션, 전기천공, 리포솜 전달, 막 융합 기술, 고속 DNA-코팅된 펠릿, 바이러스 감염, 또는 원형질 융합을 포함하는 임의의 적합한 방법에 의해 대상체에게 전달될 수 있다.
특정 구체예에서, 본 개시내용은 본원에서 개시된 KCVN2 핵산 서열 서열 번호: 2를 포함하는 바이러스 입자, 예를 들어, 캡시드(capsid)와 관련이 있다. 바이러스 입자, 캡시드, 및 재조합 벡터는 표적 세포로의 핵산 서열의 전달에 유용하다. 핵산은 다양한 벡터 시스템, 캡시드, 및 숙주 세포에서 쉽게 활용될 수 있다. 특정 구체예에서, 핵산은 cap 단백질을 포함하는 캡시드, 예컨대 AAV 캡시드 단백질 vp1, vp2, vp3 및 초가변 영역 내에 포함된 벡터 내에 있다.
특정 구체예에서, KCVN2 핵산 서열은 숙주 세포에 전달될 수 있는 임의의 유전 요소 (벡터)의 일부, 예를 들어, 운반된 서열을 전달하는 네이키드(naked) DNA, 플라스미드, 파지, 트랜스포손, 코스미드, 에피솜, 비-바이러스 전달 비히클 (예를 들어, 지질-기반 담체) 내 단백질, 바이러스, 등일 수 있다.
특정 구체예에서, 벡터는, 예를 들어, VSVG 또는 GP64 위형 또는 둘 다로부터 유래된 핵산 서열을 갖는 렌티바이러스 기반 (렌티바이러스 유전자 또는 서열을 포함하는) 벡터일 수 있다. 특정 구체예에서, VSVG 또는 GP64 위형으로부터 유래된 핵산 서열은 유전자 또는 단편에 대해 50, 60, 70, 80, 90, 95 또는 99 % 초과의 동일성을 갖는 1000, 500, 400, 300, 200, 100, 50, 또는 25개 초과의 연속적인 뉴클레오타이드 또는 뉴클레오타이드 서열의 적어도 하나 또는 둘 또는 그 이상의 유전자 또는 유전자 단편일 수 있다.
일부 구체예에서, 본원에서 개시된 핵산 및 프로모터 서열은 AAV 벡터의 생산에 유용하다. AAV는 파르보비리대(Parvoviridae) 과 및 데펜도바이러스(Dependovirus) 속에 속한다. AAV는 작은 선형 단일 가닥 DNA 게놈을 패키징하는 비-외피성 바이러스이다. AAV의 센스 및 안티센스 가닥 둘 다는 동일한 빈도로 AAV 캡시드로 패키징된다. AAV 게놈은 2개의 오픈 리딩 프레임 (open reading frame: ORF)에 측접하는 2개의 역위 말단 반복부위 (inverted terminal repeat: ITR)를 특징으로 한다. AAV2 게놈에서, 예를 들어, ITR의 처음 125개의 뉴클레오타이드는 팔린드롬(palindrome)이며, 이것은 그 자체로 폴딩되어 염기쌍 형성을 극대화하고 T-형상 헤파린 구조를 형성한다. D 서열이라고 불리는 ITR의 다른 20개의 염기는 쌍 형성되지 않은 채로 유지된다. ITR은 AAV DNA 복제에 중요한 cis-작용 서열이며; ITR은 복지 기원이고 DNA 폴리머라아제에 의한 제2 가닥 합성에 대한 프라이머의 역할을 한다. 복제 형태 모노머라고 불리는, 이 합성 중이 형성된 이중 가닥 DNA가 자가-프라이밍(priming) 복제의 제2 라운드에 사용되고 복제 형태 다이머를 형성한다. 이들 이중 가닥 중간물은 가닥 대체 메커니즘을 통해 가공되어, 패키징에 사용되는 단일 가닥 DNA 및 전사에 사용되는 이중 가닥 DNA를 발생시킨다. Rep 결합 요소 말단 분해 부위 (terminal resolution site: TRS)가 ITR 내에 위치한다. 이러한 특징들은 이중 가닥 중간물을 가공하기 위한 AAV 복제 중에 바이러스 조절 단백질 Rep에 의해 사용된다. AAV 복제에서의 그것들의 역할에 더하여, ITR은 또한 AAV 게놈 패키징, 전사, 비-허용 조건 하에서의 음성 조절, 및 부위-특이적 통합에 필수적이다 (Daya and Berns, Clin Microbiol Rev 21(4):583-593, 2008).
AAV 벡터는 전형적으로 ITR 사이에 rep 및 cap 유전자를 대체하는 전이유전자 발현 카세트를 포함한다. 벡터 입자는 벡터 게놈을 포함하는 플라스미드 및 트랜스(trans)로 rep 및 cap 단백질을 발현하는 패키징/헬퍼(helper) 작제물로 세포를 동시-트랜스펙션함으로써 생성된다. 감염 중에, AAV 벡터 게놈은 세포 핵으로 들어가서 다수의 분자 상태로 지속될 수 있다. 하나의 일반적인 결과는 제2-가닥 합성 또는 상보적 가닥 쌍 형성에 의한 이중 가닥 원형 에피솜으로의 AAV 게놈의 반전이다.
AAV 벡터의 맥락에서, 개시된 벡터는 전형적으로 다음 구조를 포함하는 재조합 게놈을 갖는다:
(5'AAV ITR) - (프로모터) - (전이유전자) - (3'AAV ITR)
상기 논의된 바와 같이, 이들 재조합 AAV 벡터는 rep 및 cap 유전자를 대체하는 ITR 사이에 전이유전자 발현 카세트를 포함한다. 벡터 입자는, 예를 들어, 재조합 벡터 게놈을 포함하는 플라스미드 및 트랜스로 rep 및 cap 단백질을 발현하는 패키징/헬퍼 작제물로 세포를 동시-트랜스펙션함으로써 생성된다.
전이유전자는 조절 서열, 예컨대 5' 코자크 서열 및/또는 3' 폴리아데닐화 신호에 의해 플랭킹될 수 있다.
본원에서 기재된 AAV ITR, 및 다른 선택된 AAV 구성요소는, 제한되는 것은 아니지만, AAV1, AAV2, AAV2-QuadyF, AAV2.7m8, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, AAV8(Y733F), AAV9, Anc80, AAV7m8, AAVrh10, AAV-PHP.eB, AAV-PHP.S, AAV-DJ, AAV-DJ/8, AAV2.GL, AAV2.NN, AAVAnc80_L065 및 이것들의 기능적 변이체를 포함하는 임의의 AAV 혈청형 중에서 쉽게 선택될 수 있다. 이들 ITR 또는 다른 AAV 구성요소는 당업자에게 이용 가능한 기술을 사용하여 AAV 혈청형으로부터 쉽게 단리될 수 있다. 이러한 AAV는 학교, 상업용, 또는 공용 공급처 (예를 들어, American Type Culture Collection, Manassas, Va.)로부터 단리되거나 얻어질 수 있다. 대안으로, AAV 서열은 공개되 서열을 참조하여 합성 또는 다른 적합한 수단을 통해 얻어질 수 있으며, 예컨대 문헌 또는 예를 들어, GenBank, PubMed, 등과 같은 데이터베이스에서 이용 가능하다. 본 개시내용은 아직 확인되거나 특성화되지 않았을 수 있는 다른 혈청형의 AAV 게놈의 사용을 포함하는 것으로 이해될 것이다.
일부 구체예에서, 재조합 AAV 벡터 게놈은 광수용체-특이적 프로모터, 예컨대 로돕신 키나아제 (RK) 또는 그것의 임의의 변형을 가질 수 있다. 재조합 AAV 벡터 게놈은 해당 분야에 공지된 임의의 프로모터를 가질 수 있으며 본원에서 개시된 것 및/또는 Kaneshiro, K., Wu, Z., Li, T., Sieving, P., & Colosi, P. (2011). Evaluation of Viral and Human Retinal Promoters in AAV8 Vectors. Investigative Ophthalmology & Visual Science, 52(14), 491에 개시된 것들을 포함한다.
AAV는 현재 유전자 요법에 가장 빈번하게 사용되는 바이러스 중 하나이다. AAV는 인간 및 일부 다른 영장류 종을 감염시키지만, 질환을 유발하지 않는 것으로 알려져 있고 매우 가벼운 면역 반응을 유도한다. AAV를 활용하는 유전자 요법 벡터는 AAV를 활용하는 유전자 요법 벡터는 분화 세포 및 정지 세포 둘 다를 감염시킬 수 있고 숙주 세포의 게놈으로 통합되지 않고 염색체 외 상태를 지속할 수 있다. AAV의 이로운 특징 때문에, 본 개시내용은 본원에서 개시된 재조합 핵산 분자 및 방법에 AAV의 사용을 고려한다.
AAV는 표적 세포에 결합하여 표적 세포로 들어가고, 핵에 들어가는 능력, 연장된 기간 동안 핵에서 발현되는 능력, 및 저독성을 포함한, 유전자 요법 벡터에 대한 여러 바람직한 특징들을 가지고 있다. 하지만, AAV 게놈의 작은 크기는 통합될 수 있는 이종성 DNA의 크기를 제한한다. 이 문제를 최소화하기 위해, Rep 및 통합 효율 요소 (integration efficiency element: IEE)를 암호화하지 않는 AAV 벡터가 구성되었다. ITR은 패키징에 필요한 cis 신호이기 때문에 유지된다 (Daya and Berns, Clin Microbiol Rev 21(4):583-593, 2008).
유전자 요법에 적합한 rAAV를 생성하기 위한 방법이 공지되어 있으며 (예를 들어, 미국 특허 출원 번호 2012/0100606; 2012/0135515; 2011/0229971; 및 2013/0072548; 및 Ghosh et al., Gene Ther 13(4):321-329, 2006을 참조하면 된다), 본원에서 개시된 재조합 핵산 분자 및 방법과 함께 활용될 수 있다.
일부 구체예에서, 본원에서 개시된 핵산은 발현 카세트 또는 전이유전자의 일부이다. 예를 들어, 미국 특허 출원 공보 20150139953을 참조하면 된다. 발현 카세트는 전이유전자 및 조절 서열, 예를 들어, 프로모터 및 5' 및 3' AAV 역위 말단 반복부위 (ITR)로 구성된다. 한 바람직한 구체예에서, AAV 혈청형 2 또는 8의 ITR이 사용된다. 하지만, 다른 적합한 혈청형의 ITR이 선택될 수도 있다. 발현 카세트는 전형적으로 캡시드 단백질로 패키징되고 선택된 숙주 세포에 전달된다.
일부 구체예에서, 본 개시내용은 AAV 혈청형 캡시드, 또는 이것의 일부를 가진 재조합 아데노 연관 바이러스 (AAV)를 생성하는 방법을 제공한다. 이러한 방법은 아데노 연관 바이러스 (AAV) 혈청형 캡시드 단백질을 암호화하는 핵산 서열; 기능적 rep 유전자; AAV 역위 말단 반복부위 (ITR) 및 전이유전자로 구성된 발현 카세트; 및 AAV 캡시드 단백질로의 발현 카세트의 패키징을 허용하기에 충분한 헬퍼 기능을 포함하는 숙주 세포를 배양하는 단계를 포함한다. 예를 들어, 미국 특허 출원 공보 20150139953을 참조하면 된다.
일부 구체예에서, 본 개시내용은 전이유전자와 작동 가능한 조합으로 광수용체 특이적 프로모터 핵산 서열을 포함하는 재조합 벡터와 관련이 있다. 전이유전자는 본원에서 개시된 바와 같이 Kv8.2, 및 선택적으로 하나 이상의 추가적인 관심있는 단백질을 암호화하는, 전이유전자에 측접한 벡터 서열에 이종성인, 핵산 서열이다. 핵산 암호화 서열은 숙주 세포에서 전이유전자 전사, 번역, 및/또는 발현을 허용하는 방식으로 조절 요소에 작동 가능하게 연결된다.
발현 카세트는 숙주 세포에 전달되는 임의의 적합한 벡터, 예를 들어, 플라스미드에서 운반될 수 있다. 본 개시내용에 유용한 플라스미드는 원핵 세포, 포유류 세포, 또는 둘 다에서의 복제 및, 선택적으로는, 통합에 적합한 방식으로 조작될 수 있다. 이들 플라스미드 (또는 5' AAV ITR-이종성 분자-3' ITR을 가지고 있는 다른 벡터)는 진핵세포 및/또는 원핵세포에서 발현 카세트의 복제를 허용하는 서열 및 이들 시스템을 위한 선택 마커를 포함한다. 바람직하게는, 발현 카세트를 가지고 있는 분자가 세포로 트랜스펙션되며, 그것은 일과성으로 존재할 수 있다. 대안으로, 발현 카세트 (5' AAV ITR-이종성 분자-3' ITR을 가지고 있음)는 염색체로 또는 에피솜으로서 숙주 세포의 게놈으로 안정하게 통합될 수 있다. 특정 구체예에서, 발현 카세트는 다수의 카피로, 선택적으로 머리 대 머리(head-to-head), 머리 대 꼬리(head-to-tail), 또는 꼬리 대 꼬리(tail-to-tail) 연쇄체로 존재할 수 있다. 적합한 트랜스펙션 기술이 공지되어 있으며 발현 카세트를 숙주 세포로 전달하는데 쉽게 활용될 수 있다.
일반적으로, 트랜스펙션에 의해 발현 카세트를 포함하는 벡터를 전달할 때, 벡터 및 숙주 세포에 대한 벡터 DNA의 상대적인 양은 선택된 벡터, 전달 방법 및 선택된 숙주 세포와 같은 요인들을 고려하여 조정될 수 있다. 발현 카세트에 더하여, 숙주 세포는 숙주 세포에서 AAV 캡시드 단백질의 발현을 구동시키는 서열 및 발현 카세트에서 발견되는 AAV ITR의 혈청형, 또는 교차 보충 혈청형과 같은 혈청형의 rep 서열을 포함한다. rep 및 cap을 제공하는 분자(들)은 숙주 세포 내에 일과성으로 존재할 수 있지만 (즉, 트랜스펙션을 통해), rep 및 cap 단백질 중 하나 또는 둘 다 및 그것들의 발현을 제어하는 프로모터(들)이, 예를 들어, 에피솜으로서 또는 숙주 세포의 염색체로의 통합에 의해 안정하게 발현되는 것이 바람직하다.
숙주 세포로의 벡터의 도입은, 다른 것들 중에서도, 트랜스펙션, 감염, 전기천공, 리포솜 전달, 막 융합 기술, 고속 DNA-코팅된 펠릿, 바이러스 감염 및 원형질 융합을 포함하는, 해당 분야에 공지된 임의의 수단에 의해 또는 상기 기재된 바와 같이 달성될 수 있다. 아데노바이러스 유전자 중 하나 이상은 숙주 세포의 게놈으로 안정하게 통합되거나, 에피솜으로서 안정하게 발현되거나, 또는 일과성으로 발현될 수 있다. 유전자 생성물은 모두 에피솜에서 일과성으로 발현되거나 안정하게 통합될 수 있거나, 또는 유전자 생성물 중 일부는 안정하게 발현될 수 있지만 다른 것들은 일과성으로 발현된다. 게다가, 아데노바이러스 유전자 각각에 대한 프로모터는 구성성 프로모터, 유도성 프로모터 또는 고유한 아데노바이러스 프로모터로부터 독립적으로 선택될 수 있다. 프로모터는 유기체 또는 세포의 특이적인 생리학적 상태에 의해 (즉, 분화 상태에 의해 또는 복제 세포나 정지 세포에서) 또는, 예를 들어, 외인성으로 추가된 인자에 의해 조절될 수 있다.
AAV 기술은 시험관 내, 생체 외 또는 생체 내(in vivo) 유전자 전달을 위한 이들 및 다른 바이러스 벡터 시스템에서의 사용을 위해 조정될 수 있다. 특정 구체예에서 본 개시내용은 다양한 rAAV 및 비-rAAV 벡터 시스템에서 본원에서 개시된 핵산 및 벡터의 사용을 고려한다. 이러한 벡터 시스템은, 다른 것들 중에서도, 예를 들어, 렌티바이러스, 레트로바이러스, 수두바이러스, 우두바이러스, 및 아데노바이러스 시스템을 포함할 수 있다.
일부 구체예에서, 본원에서 기재된 바이러스 입자, 핵산 및 벡터가 다양한 목적을 위해, 예컨대 치료 단백질의 유전자 발현을 위한 치료 분자의 전달을 위해 유용하다는 것이 고려된다.
본원에서 보고된 핵산 (예를 들어, 프로모터와 작동 가능하게 조합된)에 의해 암호화된 치료 단백질은 망막 장애의 치료에 사용된 것들을 포함한다.
일부 구체예에서, CDSRR을 가진 대상체에서 망막 기능을 회복시키는 방법이 개시된다. 방법은 본원에서 기재된 KCVN2 핵산 서열을 포함하는 벡터 (예컨대 AAV 벡터, 렌티바이러스 벡터, 또는 레트로바이러스 벡터)의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 단계를 포함한다. 일부 구체예에서, 대상체는 망막 장애, 예컨대 CDSRR을 가진 대상체이다.
변형으로, 발명자들은 일부 다른 공지된 캡시드와 비교하여 최대 100배 더 높은 형질도입 용량을 갖는 것으로 나타난 AAV2/8 혈청형에서 신규한 KCVN2 유전자의 전달을 나타냈다. 망막에서, AAV2/8은 AAV2/2 및 AAV2/5와 비교하여 더 효율적인 벡터인 것으로 나타났으며; 그것은 특히 광수용체에서 더 빠른 발병 및 더 강력하고 더 높은 전이유전자 발현 둘 다를 제공하였다.
일부 구체예에서, 본 개시내용은 코돈-최적화된 인간 KCVN2 (칼륨 전압 개폐식 채널 변경자 서브패밀리 V 구성원 2)를 가지고 있는 아데노 연관된 바이러스 혈청형 8 (AAV2/8) 벡터를 사용하여 CDSRR을 치료하기 위한 유전자 전달 방법과 관련이 있다. 추가의 변형으로, 본 개시내용은 로돕신 키나아제 (RK) 프로모터의 발현 하에 코돈-최적화된 인간 KCVN2를 가지고 있는 아데노 연관된 바이러스 혈청형 8 (AAV2/8) 벡터를 사용하여 CDSRR을 치료하기 위한 유전자 전달 방법과 관련이 있다. 이 벡터는 본원에서 AAV2/8.RK.hKCVN2라고 언급될 수 있다.
전이유전자를 암호화하는 벡터의 전달은, 예를 들어, 대상체로의 직접적인 투여에 의해, 예를 들어, 벡터의 망막하 주사에 의해 이루어질 수있다. 추가의 예에서, 벡터의 전달은, 예를 들어, 황반 및/또는 중심와 영역에서 임의의 질환 상태의 환자의 하나 또는 두 눈에 벡터를 주사함으로써 이루어질 수 있다.
추가의 변형으로, 전이유전자를 암호화하는 벡터의 전달은, 예를 들어, 대상체로의 직접적인 투여에 의해, 예를 들어, 벡터의 망막하 주사에 의해 이루어질 수 있다. 추가의 예에서, 벡터의 전달은, 예를 들어, 황반 및/또는 중심와 영역에서 임의의 질환 상태의 환자의 하나 또는 두 눈에 벡터를 주사함으로써 이루어질 수 있다. 이 변형으로, AAV2/8.RK.hKCVN2는 Pluronic F68 (0.001%), 0.10 ml, 5E9 내지 5E11 벡터 게놈의 용량 범위를 갖는 중성 포스페이트 완충된 식염수에서 전달될 수 있다.
일반적으로, 전달은 주사에 의한 핵산, 예컨대 본원에서 개시된 벡터의 직접적인 망막, 망막하 또는 유리체내 전달에 의해 이루어질 수 있다. 예에서, 전달은 망막, 망막하 공간 또는 유리체내 공간으로으 주사에 의해 이루어질 수 있다.
그러므로 발명자들은 또한 필요로 하는 환자에서 이영양증, 특히 CDSRR을 치료하거나 예방하는 방법을 제공하며, 직접적인 망막, 망막하 또는 유리체내 주사에 의해 핵산, 예컨대 본원에서 개시된 벡터의 치료적 유효량을 환자에게 투여하는 단계를 포함한다.
관련된 양태에서, 본 발명은 직접적인 망막, 망막하 또는 유리체내 주사에 의해 본원에서 개시된 핵산, 예컨대 벡터를 환자에게 투여함으로써 망막 장애, 예컨대 이영양증, 특히 CDSRR을 치료하거나 예방하는 방법에서 상기 벡터의 사용을 제공한다.
추가적으로, 발명자들은 직접적인 망막, 망막하 또는 유리체내 주사에 의해 망막 장애, 예컨대 이영양증, 특히 CDSRR을 치료하거나 예방하기 위한 의약의 제조에서 본원에서 개시된 핵산, 예컨대 벡터의 사용을 제공한다.
본 발명은 또한 망막 장애, 이영양증, 특히 CDSRR의 치료에 사용하기 위해 본원에서 개시된 핵산, 예컨대 벡터를 제공하며, 상기 벡터는 망막, 망막하 공간 또는 유리체내 공간으로 직접적으로 투여된다.
본원에서 개시된 핵산, 예컨대 벡터의 투여는 전형적으로 직접적인 망막 또는 망막하 주사에 의해 이루어진다. 이것은 원추 광수용체 세포 및/또는 간상 광수용체 세포로의 직접적인 전달을 포함한다.
선택적으로, 본 개시내용의 조성물은 다른 약학적으로 허용 가능한 부형제, 예컨대 방부제, 또는 화학적 안정화제를 포함할 수 있다. 적합한 예시의 방부제는 클로로부탄올, 칼륨 소르베이트, 소르브산, 이산화황, 프로필 갈레이트, 파라벤, 에틸 바닐린, 글리세린, 페놀, 및 파라클로로페놀을 포함한다. 적합한 화학적 안정화제는 젤라틴 및 알부민을 포함한다.
재조합 바이러스 입자, 캡시드, 또는 벡터는 세포를 트랜스펙션하고 충분한 수준의 유전자 전달 및 발현을 제공하여 과도한 역효과 없이, 또는 의학 분야의 당업자에 의해 결정될 수 있는 의학적으로 허용 가능한 생리학적 효과와 함께 치료적 이점을 제공하기에 충분한 양으로 투여된다. 통상적이고 약학적으로 허용 가능한 투여 경로는 원하는 장기 (예를 들어, 눈)로의 직접적인 전달, 경구, 흡입, 비강내, 기관내, 동맥내, 안구내, 정맥내, 근육내, 피하, 피내, 및 다른 비경구 투여 경로를 포함하지만, 이에 제한되는 것은 아니다. 투여 경로는, 원하는 경우, 조합될 수 있다.
재조합 바이러스 입자, 캡시드, 또는 벡터의 투약량은 주로 치료되는 병태, 환자의 연령, 체중 및 건강 상태와 같은 요인들에 따라 달라질 것이고, 따라서 환자들마다 다를 수 있다. 예를 들어, 바이러스 벡터의 치료적으로 유효한 인간 투약량은 일반적으로 약 1x109 내지 1x1016개 게놈 바이러스 벡터의 농도를 포함하는 용액의 약 0.1 ml 내지 약 100 ml의 범위에 있다.
본 개시내용의 재조합 바이러스 벡터는 유기체가 단백질에 대한 중화 항체를 갖는 경우에도 생체 내에서 또는 생체 외에서 선택된 숙주 세포에게 선택된 단백질을 전달할 수 있는 효율적인 유전자 전달 비히클을 제공한다. 한 구체예에서, 본원에서 개시된 벡터와 세포는 생체 외에서 혼합되며; 감염된 세포는 통상적인 방법론을 사용하여 배양되고; 형질도입된 세포는 환자에게 재주입된다.
도 1로 돌아가서, 개시된 벡터. 서열 번호: 2의 개시된 코돈 최적화된 KCVN2 유전자를 전달하기 위한 벡터는 다음 요소 중 하나 이상을 가질 수 있다:
혈청형 AAV2/8의 벡터
로돕신 키나아제 (RK) 프로모터 (서열 번호: 6)
서열 번호: 2의 코돈 최적화된 KCVN2 유전자
프로모터와 KCNV2 유전자 사이에 코자크 공통 서열 (서열 번호: 8), KCNV2 유전자 다음에 우드척 간염 바이러스 (WHP) 전사 후 조절 요소 (WPRE) (서열 번호: 9) 및 WPRE의 다운스트림에 소 성장 호르몬 폴리아데닐화 (BGH 폴리(A)) (서열 번호: 10) 신호를 포함하는 조절 요소. 개시된 벡터는 서열 번호: 3의 뉴클레오타이드 서열을 가질 수 있다.
도 2로 돌아가서, 제2의 개시된 벡터. 서열 번호: 2의 개시된 코돈 최적화된 KCVN2 유전자를 전달하기 위한 벡터는 다음 요소 중 하나 이상을 가질 수 있다:
AAV 벡터
로돕신 키나아제 (RK) 프로모터 (서열 번호: 6)
서열 번호: 2의 코돈 최적화된 KCVN2 유전자
EGFP 강화된 녹색 형광 단백질
프로모터와 KCNV2 유전자 (서열 번호: 2) 사이에 코자크 공통 서열 (서열 번호: 8), KCNV2 유전자 (서열 번호:2) 다음에 우드척 간염 바이러스 (WHP) 전사 후 조절 요소 (WPRE) (서열 번호: 9) 및 WPRE (서열 번호: 9)의 다운스트림에 소 성장 호르몬 폴리아데닐화 (BGH 폴리(A))(서열 번호: 10) 신호를 포함하는 조절 요소.
도 3으로 돌아가서, 제3의 개시된 벡터. 서열 번호: 2의 개시된 코돈 최적화된 KCVN2 유전자를 전달하기 위한 벡터는 다음 요소 중 하나 이상을 가질 수 있다:
AAV 벡터
로돕신 키나아제 (RK) 프로모터 (서열 번호: 6)
서열 번호: 2의 코돈 최적화된 KCVN2 유전자
EGFP 강화된 녹색 형광 단백질
프로모터와 KCNV2 유전자 (서열 번호: 2) 사이에 코자크 공통 서열 (서열 번호: 8), CMV 프로모터 (서열 번호: 7), KCNV2 유전자 다음에 우드척 간염 바이러스 (WHP) 전사 후 조절 요소 (WPRE)(서열 번호: 9) 및 WPRE (서열 번호: 9)의 다운스트림에 소 성장 호르몬 폴리아데닐화 (BGH 폴리(A)) 신호 (서열 번호: 10)를 포함하는 조절 요소.
도 4로 돌아가서, 제4의 개시된 벡터.
서열 번호: 2의 개시된 코돈 최적화된 KCVN2 유전자를 전달하기 위한 벡터는 다음 요소 중 하나 이상을 가질 수 있다:
AAV 벡터
로돕신 키나아제 (RK) 프로모터 (서열 번호: 6)
서열 번호: 2의 코돈 최적화된 KCVN2 유전자
EGFP 강화된 녹색 형광 단백질
프로모터와 KCNV2 유전자(서열 번호: 2) 사이에 코자크 공통 서열 (서열 번호: 8), CMV 프로모터 (서열 번호: 7), lac 프로모터, KCNV2 유전자 다음에 우드척 간염 바이러스 (WHP) 전사 후 조절 요소 (WPRE)(서열 번호: 9) 및 WPRE (서열 번호: 9)의 다운스트림에 소 성장 호르몬 폴리아데닐화 (BGH 폴리(A)) 신호 (서열 번호: 10)를 포함하는 조절 요소.
AAV 혈청형 선택
발명자들의 예시의 개시내용에서, 발명자들은 일부 다른 공지된 캡시드와 비교하여 최대 100배 더 높은 형질도입 용량을 갖는 것으로 나타난 AAV2/8 혈청형을 선택하였다. 발명자들은 또한 Anc80 혈청형을 선택하였다. 망막에서, AAV2/8은 AAV2/2 및 AAV2/5과 비교하여 더 효율적인 벡터인 것으로 나타났으며; 그것은 특히 광수용체에서 더 빠른 발병 및 더 강력하고 더 높은 전이유전자 발현 둘 다를 제공하였다. 하지만, Anc80 혈청형이 또한 AAV2/8을 대신해서 사용된다.
프로모터
망막 기능의 구제를 제공하는데 필요한 KCNV2 유전자 발현의 필요한 수준이 알려져 있지 않지만, KCVN2의 발현은 원추 광수용체 세포 및 간상 광수용체 세포 둘 다에 대해 제한될 수 있다고 생각된다. KCNV2 유전자가 채널 단백질을 암호화하기 때문에, 다양한 망막 세포에서의 편재한 발현은 의도되지 않은 결과일 수 있다. 발명자들의 치료 작제물에 대해 발명자들은 이미 공개된 로돕신 키나아제 (RK) 프로모터를 사용하기로 결정하였는데 광수용체에 대해서만 전이유전자 발현을 제한하기 때문이다.
KCNV2 유전자
인간 KCNV2 유전자 (NCBI 참조 서열: NM_133497.4; 앙상블(Ensemble) 유전자 ENSG00000168263.9 및 전사물 KCNV2-201 ENST00000382082.4) (서열 번호: 1)가 발명자들의 작제물에 대해 선택된 전이유전자였다. KCNV2 전사물은 단 하나의 스플라이스 변이체를 갖고 2개의 엑손으로 구성된다. 전체 전사물 길이는 2178개 염기쌍 길이이고, 발명자들의 연구에 대한 기초로 사용된 암호화 서열 (CDS)은 1638개 염기쌍 길이이다 (서열 번호: 12).
작제물 설계 전에, 인간 KCNV2 CDS의 코돈 최적화된 버전이 Integrated DNA Technologies (IDT)의 코돈 최적화 도구 (https://sg.idtdna.com)를 사용하여 생성되었다. 이것에 대한 근거는 코돈 사용을 tRNA 생성게 연결시키는 것, 전사물 안정성을 개선하는 것 및 비정상적인 전사물 스플라이싱에 대해 보호하는 것이다. 사용된 IDT 알고리즘은 복잡성을 낮추고 2차 구조를 최소화하기 위해 스크리닝 및 필터링에 의해 최고의 서열 옵션을 제공한다.
조절 요소
모든 발명자들의 전이유전자 작제물은 또한 프로모터와 KCNV2 유전자 (서열 번호: 2) 사이에 코자크 공통 서열 (서열 번호: 8), KCNV2 유전자 (서열 번호: 2) 다음에 우드척 간염 바이러스 (WHP) 전사 후 조절 요소 (WPRE)(서열 번호: 9) 및 WPRE (서열 번호: 9)의 다운스트림에 소 성장 호르몬 폴리아데닐화 (BGH 폴리(A))(서열 번호: 10) 신호를 포함하였다. 코자크 서열 (서열 번호: 8)은 진핵 mRNA 전사물에서 단백질 번역의 시작에 대해 기능한다. WPRE (서열 번호: 9)는, 전사될 때, 발현을 향상시키는 3차 구조를 생성하는 DNA 서열이다. 그것은 바이러스 벡터에 의해 전달된 유전자의 발현을 증가시키는데 사용된다. BGH 폴리(A) (서열 번호: 10)는 mRNA의 3' 단부에서 폴리(A) 꼬리의 형성을 초래하는, 진핵 세포내 단백질 발현을 위한 특수한 종결 서열이다. 이에 더하여, 핵에서 복제되는 포유류 DNA 바이러스는 세포의 폴리아데닐화 메커니즘을 활용한다. 폴리(A) 꼬리는 대부분의 mRNA의 안정성, 수송, 및 번역을 지지한다.
벡터의 제조
개시된 벡터는 요법을 위한 벡터의 공급을 위해 해당 분야에 공지된 표준 수단에 의해 제조될 수 있다. 따라서, 잘 확립된 공유 트랜스펙션, 패키징 및 정제 방법이 적합한 벡터 조제물을 제조하는데 사용될 수 있다.
작제물은 다음 단계에 의해 개발되었다:
1. 작제물 설계
원하는 발현 수준을 달성하기 위해 어떤 프로모터가 사용되어야 하는지, 유전자가 코돈 최적화되어야 하는지, 어떤 폴리A 부위가 사용되는지 및 임의의 다른 공지된 조절 서열이 사용되어야 하는지 여부를 고려하여 치료 작제물의 설계가 실시되었다.
2. 작제물 조립
최종 작제물의 DNA 단편은 Genewiz에 의해 합성된 다음 pAAV 백본(backbone) 플라스미드로 클로닝되었다.
3. AAV로의 패키징
발명자들의 작제물이 pAAV 백본으로 클로닝되면, 그것은 정제되고 Qiagen의 상업적 키트를 사용하여 더 많은 양의 플라스미드가 제조되었다. 정제된 플라스미드는 AAV로 패키징되도록 보내졌다. AAV의 생성은 표준 프로토콜을 따른다. AAV2/8의 배치(batch)는 발명자들의 치료 플라스미드를 사용하여 제조되었고 드라이아이스에 저장되었다.
실시예
다음 실시예는 특정한 특징 및/또는 구체예를 보여주기 위해 제공된다. 이들 예는 기재된 특정한 특징 또는 구체예로 본 개시내용을 제한하는 것으로 해석되어서는 안 된다.
실시예 1
선택된 치료제에 대한 개념 증명(Proof-of-concept) 연구 (PC) - AAV8.RK.hKCNV2 유전자 요법은 초정상 b-파 진폭을 감소시킨다
발명자들의 기초 연구의 데이터를 테스트된 3개의 잠재적인 치료 생성물 중 어느 것이 발명자들의 선택된 생성물이 될 것인지에 대한 발명자들의 결정을 안내하는데 사용하였다. 야생형과 비교하여 평균 8배의 유전자 발현 증가를 나타내는 유전자 발현 데이터, 및 다른 생성물과 비교하여 미처리된 눈에 비해 더 큰 차이 및 유의한 감소를 나타낸 ERG 양성 b-파 데이터에 기초하여, 발명자들은 하기 실시예에 대한 발명자들의 치료 생성물로서 AAV8.RK.hKCNV2 벡터를 선택하였다. 하지만, 제한되는 것은 아니지만, AAV Anc80을 포함하는 다른 AAV 혈청형이 또한 의도된다는 것을 이해해야 한다. 하기에서 발명자들은 검증 데이터를 제공한다.
하기 마우스 예비 연구에 대한 프로토콜. 도 11 참조
1. 바이러스 입자 희석 및 저장
원래의 스톡(stock) 벡터를 -80℃에 저장하였다. 작용 스톡을 멸균 PBS에서 1x1012개 벡터 게놈 (vg) / ml로 희석하고, 0.2 ml 멸균 PCR 튜브 (SSIbo UltraFlux Flat 캡 PCR 튜브, Cat# 3220-00)에 20 μl 앨리쿼트로 앨리쿼트하였고, -80℃에 저장하였다. 주사일에, 희석된 앨리쿼트(들)를 주사 전에 얼음 위에서 (4℃)에서 해동시켰다. 하루에 주사액의 각각의 배치마다 새로운 앨리쿼트를 사용하였다. 주사 중에 앨리쿼트를 얼음 위에서 유지하였다. 해동된 앨리쿼트의 임의의 잔류 벡터 현탁액을 본 연구에서 사용으로부터 폐기하였다.
2. 망막하 주사
두 성별 모두의 P28-35 K8.2 KO 마우스를 케타민 (100mg/kg) 및 자일라진 (20 mg/kg)의 복강내 주사를 이용한 전신 마취 하에 배치하였다. 국부적인(topical) 1% 트로피카미드 (MYDRIACYL; Alcon)를 이용하여 동공을 확장시켰다.
수술 현미경 하에서, 30 게이지 바늘의 끝을 사용하여 눈의 측두 공막을 통해 작은 절개부를 만들었다. NanoFil 주사기에 적합한 35 게이지 스테인레스 강 비스듬한(beveled) 또는 뭉툭한(blunt) 바늘을 절개부를 통해 삽입하고 Ultra-Micro-Pump (World Precision Instrument) (SOP #1.06.08)를 사용하여 바이러스 현탁액/PBS를 망막하 공간으로 주사하였다.
각각의 처리된 동물은 한쪽 눈에 (n=10, 왼쪽 또는 오른쪽 눈으로 무작위로 할당됨) rAAV2/8-hGRK1-hKCNV2 (1x1012 GC/mL) 벡터 (서열 번호: 3) 1μl 망막하 주사를 받았다. 다른 눈은 주사되지 않은 채로 유지되었다. 대조군 동물은 한쪽 눈에 (n=10, 왼쪽 또는 오른쪽 눈으로 무작위로 할당됨) 멸균 1X 포스페이트 완충 용액 (PBS) 1μl의 망막하 주사를 받았지만 다른 눈은 주사되지 않은 채로 유지되어 내부 대조군의 역할을 한다 (n=20).
수포성 (수포) 망막 망막 박리로 표시되는 주사의 위치 및 범위를 체크하기 위해 OCT 검증을 나중에 실행하였다.
3. 망막전위도검사 (ERG)
처리 후 a-파 및 b-파 진폭이 개선되었는지를 결정하기 위해 KCNV2 KO 마우스에서 특정 시간 간격 (주사 후 4, 8 및 12 wk)으로 암소시 ERG 테스트를 수행하였다.
마우스를 ERG 실험 전에 밤새도록 (적어도 8 h) 암 적응시키고, 이후에는 희미한 적색광 하에서만 처리하였다. ERG를 이전에 기재된 바와 같이 수행하였다 [6]. 마우스를 아이소플루란 흡입 마취를 사용하여 마취하고, 국부적인 1% 트로피카미드 (MYDRIACYL; Alcon)를 이용하여 동공을 확장시켰다. 각각의 눈에 ERG 전극을 배치하기 전에 탈수를 방지하고 접촉을 용이하게 하기 위해 인공 윤활제 (하이드록시 프로필 메틸셀룰로오스)를 각막에 도포하였다. 참고로, 피하 바늘 전극을 마우스의 각각의 볼에 또는 턱 윤곽을 따라 배치하고, 접지전극을 꼬리 밑부분 위에 피하로 배치하였다.
다음 강도 (모두 cd·s m-2 단위)에서 1-ms 플래시의 제공에 의한 암 적응된 단일 플래시 강도 시리즈를 사용하여 ERG 기록을 얻었다: 0.1, 0.3, 1, 3, 10, 및 25. 연이은 플래시 사이의 시간 간격 및 자극 강도에 따라 자극이 반복되고 (이후의 평균화를 위해) 달라지는 횟수; 0.1 내지 3 cd·s m-2에 대해 10 s 및 4회 반복, 및 10 내지 25 cd·s m-2에 대해 60 s 및 1회 반복. 일련의 광 플래시 사이에 60 sec의 공백이 있었다.
30 cd.s m-2의 배경 휘도에서 광 적응 후 주사 후 제4 주 및 제12 주에 명소시 ERG를 기록하였다. 다음 강도 (모두 cd·s m-2 단위)에서 1-ms 플래시의 제공에 의한 단일 플래시 강도 시리즈를 사용하여 ERG 기록을 얻었다: 0.3, 1, 3, 10, 및 25. 각각의 자극은 32회 반복되었으며 (이후의 평균화를 위해), 플래시 사이의 시간 간격은 0.5 s였다. 일련의 광 플래시 사이에 60 sec의 공백이 있었다. 그 전문이 본원에 참고로 포함된 (Collison, F.T., J.C. Park, G.A. Fishman, E.M. Stone, and J.J. McAnany, Two-color pupillometry in KCNV2 retinopathy. Doc Ophthalmol, 2019, 139(1), p. 11-20. doi:10.1007/s10633-019-09691-w)에서 상세히 설명된 바와 같이 ERG 반응으로부터 a-파 및 b-파에 대한 최대 진폭 및 암시적 시간(implicit time)을 추출하였다.
4. 광 간섭 단층 촬영 (OCT)
처리에 의해 미처리 또는 가처리된(sham treated) 눈과 비교하여 전체적인 망막층의 두께가 개선되었는지를 평가하기 위해 주사 후 0 내지 3일, 주사 후 2주 및 주사 후 12주에 OCT 이미지화를 수행하였다.
마우스를 마취시키고 앞서 기재된 바와 같이 동공을 확장시켰다. 스펙트럼 영역 광 간섭 단층 촬영 시스템 (Bioptigen Envisu R2200 SD-OCT 시스템)으로 OCT를 수행하였다. Bioptigen 및 ImageJ 소프트웨어를 사용하여 망막층 두께를 측정하였다.
5. 조직병리학
5.1 절편화
주사 후 12주에 처리된 마우스와 PBS 주사된 마우스로부터 눈을 수거하였다. 간략히 말하면, 눈을 4% PFA에서 얼음 위에서 1h 동안 고정하였다. 각막 및 수정체를 절개하고 눈을 20% 수크로오스에서 4℃에서 밤새도록 인큐베이션하였다. 다음 날 눈을 최적의 절단 온도의 화합물에서 냉동시키고 절편화 전에 -20℃에서 저장하였다. 망막 절편을 슈퍼 프로스트(super-frost) 슬라이드 (Hurst)에 수거하고 Leica Cryostat CM3050을 사용하여 14 μm로 절단하였다. 눈을 시상면(sagittal plane)으로 절편화하고 절편을 10개의 슬라이드에 걸쳐 순차적으로 수거하였다. 절편화 이후 추가의 분석 전에 슬라이드를 -20℃에서 저장하였다.
5.2 면역조직화학법
상응하는 연령의 처리군, 가주사, 비주사 KCNV2-/- 및 비주사 야생형 망막의 냉동 망막 절편에서 Kv8.2 단백질의 존재를 (Skarnes, W.C., B. Rosen, A.P. West, M. Koutsourakis, W. Bushell, V. Iyer, A.O. Mujica, M. Thomas, J. Harrow, T. Cox, D. Jackson, J. Severin, P. Biggs, J. Fu, M. Nefedov, P.J. de Jong, A.F. Stewart, and A. Bradley, A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function. Nature, 2011, 474(7351), p. 337-42. doi:10.1038/nature10163)에서 공개된 프로토콜에 따라 Kv8.2 항체 (Antibodies Inc, USA, Cat 75-435/73-435)를 사용하여 제자리에서(in situ) 평가하였다. 발명자들은 또한 로돕신 (Rho) (Abcam, Cat# Ab3424) 및 원추체 아레스틴 (Arr3) (Millipore, Cat# AB15282)의 제자리 발현을 평가하였다.
6.0 질적인 실시간 폴리머라아제 연쇄 반응 (qRT-PCR)을 통한 유전자 발현
처리된 마우스 및 가처리된 마우스의 망막의 전체 RNA를 Trizol 시약을 사용하여 그리고 공개된 프로토콜에 따라 주사 후 12주에 추출하였다. RNA 샘플을 제조사의 권장된 프로토콜에 따라 ProtoScript® II First Strand cDNA Synthesis Kit (NEB, Cat #E6560S) 또는 QuantiTect Reverse Transcription Kit (Qiagen Cat #205311)를 사용하여 역전사효소에 의해 상보적 DNA (cDNA)로 전사시켰다. cDNA를 qRT-PCR 반응에 대한 주형으로 사용하였다.
KCNV2, 원추체 아레스틴 및 로돕신 발현 수준을 Taqman 기반 검정 (Thermo Fisher) 및 Real-Time PCR 검출기 (Bio-Rad CFX Connect Real-Time System)를 사용하여 평가하였다.
데이터의 통계 분석
OCT 이미지화로부터의 망막층 두께, ERG 반응으로부터의 a-파 및 b-파에 대한 최대 진폭 및 암시적 시간, 조직학으로부터의 망막층 두께, 및 처리된 눈, PBS 처리된 눈 및 미처리된 눈으로부터의 qRT-PCR로부터 KCNV2, 원추체 아레스틴 및 로돕신의 mRNA 발현 수준을 평균 및 표준편차 값을 얻어서 비교하였다. 표준 t-테스트/일원(one way) ANOVA를 적용하여 통계적 유의성을 평가하였다.
실시예 2
도 5로 돌아가서, 발명자들은 망막 기능을 회복시키기 위한 예시의 방법을 보여준다. 예를 들어, KCVN2 유전자의 돌연변이로 인해, 초정상 간상체 반응을 동반한 원추체 이영양증이 표적 병태이다. 한 예에서, 치료적 개입은 AAV8.RK.hKCVN2 (서열 번호: 3)이며, 이 경우에는 서열 번호: 2로 개시된 코돈 최적화된 KCVN2일 것이다. 예시의 주입 양생법은 1회 이상의 망막하 주사로 전달되는 0.10ml 중의 5E9-5E11vg로 나타난다. 본원에서 논의된 바와 같이, 벡터의 설계는 구체적으로 광수용체 세포에 대한 유전자 발현 및 더 구체적으로는 망막의 황반 및/또는 중심와 영역에서의 발현을 표적으로 한다. 예상되는 결과는 양성 b-파 진폭의 감소이며 이는 시각 기능의 개선과 연관성이 있다.
실시예 3
도 6으로 돌아가서, 발명자들은 개념 증명 연구의 개요를 제공한다. 1기는 야생형 동물에 대한 기초 연구이다. 이것은 전달 접근법을 먼저 테스트하고 망막하 주사의 유용성을 검정하는 것을 포함한다 (FS1로 지정됨). 망막하 공간으로 액체를 주사하면 그것을 지지하는 망막 색소 상피 (RPE)의 광수용체의 일시적 및 중심적 분리인 수포가 생성된다. 수포 분해 시기는 광수용체 기능의 지표이다. 주사일, 뿐만 아니라 주사 후 2주 및 12주에 OCT 이미지화를 사용하여 결과를 측정한다. 광 간섭 단층 촬영 (OCT)은 비-침습성 이미지화 테스트이다. OCT 이미지화는 광 파(light wave)를 사용하여 망막의 단면도 사진을 촬영한다. 이것은 망막의 독특한 층의 시각화를 허용하고, 층의 맵핑(map)을 허용하고 층 두께를 측정하는 것을 허용한다.
전달 접근법의 검증 후, 광수용체를 표적으로 하는 원하는 프로모터가 확인된다 (FS2로 지정됨). RK 및 CMV 프로모터를 비교하여 광수용체를 표적으로 하는 각각의 능력을 결정하였다. 이 경우에 결과는 주사 후 12주에 망막의 조직학적 분석에 의해 측정된다.
기능적 안전성에 대한 평가를 수행하여 망막 기능에 대한 망막하 주사의 효과를 평가하였다 (FS3으로 지정됨). 결과는 주사 후 4, 8 및 12주에 망막전위도 (ERG) 기록에 의해 측정된다.
II기는 Kv8.2 KO 동물에서 조사 제품 선택 연구를 포함한다. 이 단계에서, 각각 상이한 AAV 혈청형 및 프로모터를 가진 3개의 치료 제품을 비교하였다. 3개의 치료 제품은, 예를 들어, AAV8.RK.hJCVN2, Anc80.RK.hKCVN2, 및 AAV8.CMV.hKCVN2이다. 주사 안전성에 관한 결과는 주사일, 주사 후 2 및 12주에 OCT 이미지화에 의해 측정된다. 기능적 평가에 관한 결과는 주사 후 4, 8, 및 12주에 ERG 기록에 의해 측정된다. 유전자 발현에 관한 결과는 주사 후 12주에 망막 KCVN2 유전자 발현 분석에 의해 측정된다.
도 7로 돌아가서, 발명자들은 III기, 개념 증명 연구를 요약한다. PC1에서 발명자들은 서열 번호: 2의 최적화된 KCVN2 유전자를 발현하는 벡터의 효능을 확립한다. 상기 실시예 1에 요약된 처리 프로토콜. 대조군은 비주사 마우스, 제품이 망막하로 주사된 야생형 마우스를 포함한다. 이것들을 AAV8.RK.hKCVN2 (예를 들어, 서열 번호: 3)의 처리로 주사된 Kv8.2 KO 동물과 비교한다. 결과는 OCT (주사 후 0, 3, 및 12주에), ERG (주사 후 4, 8, 및 12주에) 및 KCVN2 유전자 발현 데이터 (주사 후 12주에)에 의해 측정된다. PC2에, 시각 기능의 회복을 평가하여 더 높은 용량으로 처리를 전달하는 효과를 살펴보았다. 본원에서, AAV8.RK.hKCVN2 (예를 들어, 서열 번호: 3) 처리를 2회 투약 양생법으로 망막하로 주사한다: 2x10^9 vg 및 5x10^9 vg. 대조군은 비주사 마우스이다. 결과는 OCT (주사 후 0, 3, 및 12주에), ERG (주사 후 4, 8, 및 12주에) 및 KCVN2 유전자 발현 데이터 (주사 후 12주에)에 의해 측정된다. PC3에서, 안전성 및 생물학적 분배를 평가한다. 발명자들은 Kv8.2 KO 동물에서 AAV8.RK.hKCVN2 (예를 들어, 서열 번호: 3)의 일방적 망막하 주사의 안전성 및 생물학적 분배를 평가한다. 3개의 처리군이 망막하 주사에 의해 처리를 받는다: PBS인 비히클만을 받는 군 1; 1x10^9 vg/눈의 용량으로 처리를 받는 군 2; 및 5x10^9 vg/눈의 용량으로 처리를 받는 군 3. 모든 동물은 동형접합성 Kv8.2 KO이다. 결과는 안구 검사, ERG, 혈액학 및 임상화학, 안구 조직병리학, 및 주요 장기에서 vg의 생물학적 분배에 의해 측정된다. 동물을 주사 후 4 및 12주에 검사한다.
전체적으로, 이들 기초 연구의 데이터를 사용하여 3개의 잠재적인 치료 제품 중 어떤 것을 사용할지 결정하였다. 유전자 발현 데이터에 기초하여, 개시된 서열 번호: 2는 야생형 KCVN2와 비교하여 평균 8배의 유전자 발현 증가를 나타냈다. ERG 양성 b-파 데이터는 테스트된 다른 제품과 비교하여 미처리된 눈에 비해 더 큰 차이 및 유의한 감소를 나타냈다. 그러므로, AAV8.RK.hKCVN2 벡터 (서열 번호: 3)를 치료적 처리 제품으로 선택하였다.
선택된 결과
야생형과 비교하여 처리된 눈의 기능적 ERG 분석
도 8로 돌아가서, 논의된 바와 같이 도 8은 개시된 방법, 시스템, 및 핵산 서열을 사용하여 처리된 마우스와 미처리 마우스 간의 비교를 제공한다. 대상체 (예컨대 CDSRR을 가진 대상체)에서 광수용체 기능을 회복시키기 위한 서열 번호: 2 및 추가로 벡터 서열 번호: 3로의 처리의 효능을 평가하기 위해서, 양성 b-파 ERG 진폭을 처리된 눈 (Kv8.2 동물로 표시되는 CDSRR 동물), 미처리 눈 (Kv8.2 동물로 표시되는 CDSRR 동물), 및 야생형 눈 (야생형 동물) 사이에서 비교하였다. 주사 후 4, 8 및 12주에 AAV8.Rk.hKCNV2로 처리된 Kv8.2 KO 마우스 (Kv8.2 KO Tx), 미처리된 Kv8.2 KO 마우스 (Kv8.2 KO UTx) 및 미처리된 야생형 간의 평균 양성 b-파 진폭 비교. 데이터는 2개의 상이한 자극 강도 (10 및 25 cd.s/m2)로 나타난다. 데이터는 평균 ± SD로 나타나고 통계적 유의성은 터키 보정(Turkey's correction)과 함께 이원(two-way) ANOVA에 의해 실행된다. *P<0.024; **P<0.003, ***P<0.0003 및 P<0.0001. 이 도 8에서 나타난 바와 같이, 서열 번호: 2, 및 추가로, 서열 번호: 3의 1회의 망막하 주사는 미처리 눈과 비교하여 초정상 양성 b-파를 크게 감소시키에 충분하였다. b-파는 플래시와 반응 피크 사이의 시간 또는 광 자극에 반응하는 망막의 전기적 활성을 측정한다. Kc8.2 미처리 동물과 비교하여 처리된 Kv8.2 KO 동물에서 시간이 흐름에 따라 망막 반응 시간이 감소하기 때문에 이 데이터는 서열 번호: 2 및 추가로 서열 번호: 3에 의한 광수용체 기능의 회복을 지지한다.
처리 후 망막 유전자 발현
도 9는 처리된 망막에 대한 야생형 (WT), 비주사에서의 원추체 (a, 원추체 아레스틴) 및 간상체 (B, 로돕신) 표시의 상대적인 유전자 발현을 보여준다. *P<0.05; *P<0.01. 대상체 (예컨대 CDSRR을 가진 대상체)에서 광수용체 기능을 회복시키기 위한, 간상체 및 원추체 건강 상태에 대한 서열 번호: 2 및 추가로 벡터 서열 번호: 3으로의 처리의 효능을 추가로 평가하기 위해서, 로돕신 및 원추체 아레스틴에 대한 유전자 발현 수준을 평가하였다. 로돕신은 간상체 건강 상태에 대한 마커이다. 아레스틴은 원추체 건강 상태에 대한 마커이다. 도 9는 야생형, 비주사 Kv8.2 동물 및 주사된 Kv8.2 동물에서 로돕신 및 원추체 아레스틴의 발현 수준을 나타낸다. 이 데이터는 서열 번호: 2 및 추가로 서열 번호: 3으로의 처리가 원추체 아레스틴의 유전자 발현을 초래한다는 것을 입증한다. 원추체 아레스틴은 미처리 망막과 비교하여 처리 후 유전자 발현 수준의 통계적으로 유의한 증가를 나타냈다. 로돕신 수준은 처리된 망막 및 미처리 망막 둘 다에서 WT와 비교하여 감소되는 것으로 보였지만, 이것은 통계적으로 유의하지 않았다.
도 10으로 돌아가서, 인간 KCVN2 펩타이드에 대한 항체를 사용하는 Kv8.2 서브유닛의 조직학적 분석 및 면역조직화학적 표지는 망막의 주사된 부분 내에서의 발현을 나타냈지만 미처리 영역에서는 Kv8.2 단백질의 발현이 나타나지 않았다. 구체적으로, 도 10은 처리 후 12주에 서열 번호: 3에 의해 전달되는 것처럼 서열 번호: 2로 주사된 Kv8.2 KO 마우스의 망막에서 인간 Kv8.2 서브유닛의 망막 발현의 대표적인 이미지를 나타낸다. (A) 왼쪽에 처리된 영역 및 오른족에 미처리된 영역을 나타내는 망막 절편의 광시야도. 스케일 막대 = 200μM. (i) 인간 Kv8.2의 발현을 나타내는 처리된 영역의 고배율 삽도. (ii) Kv8.2 발현을 나타내지 않는 미처리 영역의 삽도. (i) 및 (ii)에 대한 스케일 막대 = 25μM.
야생형과 비교하여 처리된 눈의 기능적 ERG 분석
도 12 및 도 13은 개시된 방법, 시스템, 및 핵산 서열을 사용하여 처리된 마우스과 미처리 마우스 간의 비교를 제공한다. 대상체 (예컨대 CDSRR을 가진 대상체)에서 광수용체 기능을 회복시키기 위해 서열 번호: 2로의 처리 및 및 서열 번호: 3의 벡터에서 전달된 바와 같은 처리의 효능을 평가하기 위해, a-파 진폭 및 양성 b-파 ERG 진폭을 처리된 (Kv8.2 동물로 표시되는 CDSRR 동물), 미처리된 (Kv8.2 동물로 표시되는 CDSRR 동물), 및 야생형 눈 (야생형 동물) 사이에서 비교하였다. 야생형 (WT), Kv8.2 KO 미처리 (비주사) 눈 및 치료 제품 AAV8.RK.hKCNV2 (서열 번호: 3)의 5e9 바이러스 게놈이 망막하로 처리된 Kv8.2 KO 눈의 암소시 (간상체-매개됨) 망막전위도 (ERG) 기록의 정량화. 처리 후 4주 또는 동등한 연령-일치 대조군에서 기록을 얻었다. WT, n=12; 비주사, n=11; AAV8.RK.hKCNV2, n=12. 터키 다중 비교 테스트(Tukey's multiple comparison test)와 함께 이원 ANOVA, *p<0.05, **p<0.005, ***p<0.0005, ****p<0.0001. 데이터는 서열 번호: 3의 벡터에서 전달된 것처럼 서열 번호: 2로의 처리가 대상체, 예컨대 Kv8.2 KO 동물로 표시되는 CDSRR을 가진 대상체에서 광수용체 기능을 회복시킨다는 것을 입증한다.
도 14는 야생형 (WT), Kv8.2 KO 미처리 (비주사) 및 치료 제품 AAV8.RK.hKCNV2의 3e9 바이러스 게놈으로 망막하로 처리된 Kv8.2 KO 눈으로부터의 25 cd.s/m2에서 암소시 진동소파전위 1 (oscillatory potential 1: OP1)의 정량화를 입증한다. 처리 후 12주 또는 동등한 연령-일치 대조군에서 기록을 얻었다. WT, n=10; 비주사, n=6; AAV8.RK.hKCNV2, n=6. 터키 다중 비교 테스트와 함께 이원 ANOVA, ****p<0.0001. 데이터는 서열 번호: 3의 벡터에서 전달된 것처럼 서열 번호: 2로의 처리가 대상체, 예컨대 Kv8.2 KO 동물로 표시되는 CDSRR을 가진 대상체에서 광수용체 기능을 회복시킨다는 것을 입증한다.
도 15는 야생형 (WT), Kv8.2 KO 미처리 (비주사) 및 치료 제품 AAV8.RK.hKCNV2의 5e9 바이러스 게놈으로 망막하로 처리된 Kv8.2 KO 눈으로부터의 c-파의 정량화를 입증한다. 처리 후 4주에 또는 동등한 연령-일치 대조군에서 기록을 얻었다. WT, n=12; 비주사, n=9; AAV8.RK.hKCNV2, n=15. 터키 다중 비교 테스트와 함께 이원 ANOVA, ****p<0.0001. 데이터는 서열 번호: 3의 벡터에서 전달된 것처럼 서열 번호: 2로의 처리가 대상체, 예컨대 Kv8.2 KO 동물로 표시되는 CDSRR을 가진 대상체에서 광수용체 기능을 회복시킨다는 것을 입증한다.
시운동 행동 반응
도 16 및 도 17은 처리 후 12주에 처리된 Kv8.2 KO 마우스의 명소시 및 암소시 시력과 암소시 대비 민감도의 개선을 입증한다. 처리된 동물에 AAV8.RK.hKCNV2의 3e9 바이러스 게놈 용량을 망막하로 제공하였고 (n=3-6) 연령-일치 미처리 (비주사, n=3-5) 및 WT (n=8) 동물과 비교하였다. 이원 ANOVA, 시닥 사후 다중 비교(Sidak's multiple comparison post-hoc), **p=0.0015, ****p<0.0001. 처리된 AAV8.RK.hKCNV2에 대한 WT는 유의하지 않았다.
유전자 및 단백질 발현 데이터
도 18, 도 19, 및 도 20은 처리 후 12주에 처리된 Kv8.2 KO 눈에서 Kv8.2 단백질 및 KCNV2 유전자 발현을 나타내는 조직학 데이터이다. 도 18은 망막하로 주사된 눈의 망막 절편의 개요이며 처리된 영역은 인간 Kv8.2 서브유닛 (초록색)의 발현을 나타내고 미처리된 영역은 Kv8.2 발현을 나타내지 않는다. 도 19는 처리된 영역 및 미처리 영역의 고배율 이미지를 제공하며 Kv8.2 발현 (초록색), Kv2.1 발현 (빨간색) 및 세포핵 (파란색)을 나타낸다. 스케일 막대 = 50μm. 도 20은 야생형에 대해 표준화된 처리된 눈에서의 인간 KCNV2 유전자의 발현을 나타내는 실시간 정량 PCR의 데이터를 제공한다. N = 3 눈.
도 21 및 도 22는 본원에서 개서된 인간 KCVN2 암호화 영역 (서열 번호: 12) 및 최적화된 KCVN2 (서열 번호: 2)의 비교를 입증하는 서열 정렬을 제공한다. 윗줄은 인간 KCVN2 (서열 번호: 12)의 핵산을 포함한다. 아랫줄은 서열 번호: 2의 핵산을 포함한다. 서열 번호: 2는 인간 서열 번호: 12와 대략 76% 동일성을 공유한다.
기재된 방법 또는 조성물의 정확한 상세한 설명은 기재된 구체예의 사상으로부터 벗어나지 않으면서 달라지거나 변형될 수 있다는 것은 분명하다. 발명자들은 하기 청구항의 범위 및 사상 내에 있는 이러한 모든 변형 및 변화를 주장한다.
SEQUENCE LISTING
<110> ARTEMA THERAPEUTICS INC.
<120> KCNV2 VARIANTS AND THEIR USE
<130> 209-301PCT
<150> US 63/191,106
<151> 2021-05-20
<160> 12
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 13728
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(13728)
<223> Human KCVN2 (full nucleotide sequence)
<400> 1
gccctaaaaa cgtcttccta ccattcctgg aattctacct tgaaacatgt ctctatcctt 60
taagagaaag ggaggagata aaaaggagag agagaagctg aagctgactc aaagatccga 120
ctggacctga acagtgcccc agggagaatc catttgaaaa aaaaaaaaaa atgtgatcat 180
gtgaatggac aagaaggaga tggctttaga tcttatatgc tctaaacgaa gagttacgct 240
gagagggaaa ctgacttgtc atgaagtcag ctttgttccg ttgctatgtg tcatccctgc 300
taatggtgag tttacctagg gcagaggcta ccatctcaac catgaagctg aagacacagg 360
catccgtatt ctatagctaa ttcagttgat ttcatctcag cacacataca ctgagcgctt 420
cctaagagcg aggttgaccg acatttttat tagcaataat ctctgccttc ttctgattac 480
ctagagattt aagaccacat aatcatcctc tacctcacag ggtcaaggga gtgggggagg 540
aaatgggcta agaggttcta aatccctcct aacacttgct tcttccaaat cagcaagatt 600
agagcagtca acagctgact gcgttcagac cctgcaggct gggctggcct gcccaggacc 660
tgagaagggg cagctccggt ggcaatgtct gagcccctag ctgtgctggt ccgggctggc 720
ctctctaaga cagtgcaggc cacgtgatcc atcctcctag aggcagtgag caggtgaggg 780
acccctacca cagccaggag gaaaaagcta ggcgtccact ttccgcagcc atgctcaaac 840
agagtgagag gagacggtcc tggagctaca ggccctggaa cacgacggag aatgagggca 900
gccaacaccg caggagcatt tgctccctgg gtgcccgttc cggctcccag gccagcatcc 960
acggctggac agagggcaac tataactact acatcgagga agacgaagac ggcgaggagg 1020
aggaccagtg gaaggacgac ctggcagaag aggaccagca ggcaggggag gtcaccaccg 1080
ccaagcccga gggccccagc gaccctccgg ccctgctgtc cacgctgaat gtgaacgtgg 1140
gtggccacag ctaccagctg gactactgcg agctggccgg cttccccaag acgcgcctag 1200
gtcgcctggc cacctccacc agccgcagcc gccagctaag cctgtgcgac gactacgagg 1260
agcagacaga cgaatacttc ttcgaccgcg acccggccgt cttccagctg gtctacaatt 1320
tctacctgtc cggggtgctg ctggtgctcg acgggctgtg tccgcgccgc ttcctggagg 1380
agctgggcta ctggggcgtg cggctcaagt acacgccacg ctgctgccgc atctgcttcg 1440
aggagcggcg cgacgagctg agcgaacggc tcaagatcca gcacgagctg cgcgcgcagg 1500
cgcaggtcga ggaggcggag gaactcttcc gcgacatgcg cttctacggc ccgcagcggc 1560
gccgcctctg gaacctcatg gagaagccat tctcctcggt ggccgccaag gccatcgggg 1620
tggcctccag caccttcgtg ctcgtctccg tggtggcgct ggcgctcaac accgtggagg 1680
agatgcagca gcactcgggg cagggcgagg gcggcccaga cctgcggccc atcctggagc 1740
acgtggagat gctgtgcatg ggcttcttca cgctcgagta cctgctgcgc ctagcctcca 1800
cgcccgacct gaggcgcttc gcgcgcagcg ccctcaacct ggtggacctg gtggccatcc 1860
tgccgctcta ccttcagctg ctgctcgagt gcttcacggg cgagggccac caacgcggcc 1920
agacggtggg cagcgtgggt aaggtgggtc aggtgttgcg cgtcatgcgc ctcatgcgca 1980
tcttccgcat cctcaagctg gcgcgccact ccaccggact gcgtgccttc ggcttcacgc 2040
tgcgccagtg ctaccagcag gtgggctgcc tgctgctctt catcgccatg ggcatcttca 2100
ctttctctgc ggctgtctac tctgtggagc acgatgtgcc cagcaccaac ttcactacca 2160
tcccccactc ctggtggtgg gccgcggtga gtacctttgc cctgggcttt cccatcctct 2220
tccccagccc agtgagctgc tcctccctcc cctggttatc agccaccagg ctttggcttc 2280
tgatcctcgt cttccccccc acccccaatc gccgcataca gctaacaaaa cggcgatgga 2340
tgtcaaaagt ggtggaaaga gaactcagca gatcagtaag taagtgaatt tgacttagtc 2400
gtagaaatct ccaaatctag atttcgtctt caaaccttta aaagacaggt tttaaagaag 2460
atgcgtcatc attactgtta tttaccagtt attgagcatc cagtgtcctg acaaagctta 2520
tctcattgtg gcatcacagc ctttgagatg gttatgacca ccattttttt ttaaggggac 2580
aagcagaaat ggcttcagtt tttgaaagaa actgtagatt tatacagaga aggaggtgag 2640
acttggctga accatgttga ctctaactga aatcccacca cctctggttc cacttaaatc 2700
tgagtgtgga aagaagcatc tcaaactgaa acttgctctg acttcactaa agttctttca 2760
ggaccctgta ttattgcccc attttacaga tagtgaaatt gaagtacaga gagtttgaat 2820
gtggactcac agctagaggt ggcaaagcca gaactgaaac tcagtcctgt ccatctccaa 2880
actccatgcc tttcccacac ccaagcacag tctctttcaa gttttagttc ttttgcatgc 2940
attgctgaat ttgtacagtt agtgtaacag ttattttttg tcattgtttt ctttggcctt 3000
tgccttttta taacttgtgc tgtttactca aatatctgta ttttgagctg tggtagctga 3060
atccctggaa ataaatgtta atcaggtctt ctcagatcga tgaataagtc ggcatatatg 3120
aaggaaagaa ttgaatgtat ggtttcctta gttttctttt gaaaagtaga ttgtaatacc 3180
tttaaagaca ttaagcaaat ataactagtt ttcccatgtc agaaagtaga tattttcaac 3240
attgtgtatg tcataaccca tagtctggtg tgcacttctg agacaaacca acccaaggcc 3300
actgacagtg caatgcagca taatagaaga tttagaaaac ctgattctag tcccagacct 3360
gtcaataatt aaccatgacc ctgaataatt aactgtgaaa ccttaatccc tcacttccag 3420
tcctgctttc tcacctctaa aaggggaggc tggacatgta aaagtctgca gttcagtgag 3480
tcttccttcc cttgaaagca gggagctcat atgtatagag gatatgtgag ctttcttcag 3540
tggcaggatg atacgatgtt cttctgaatg agctaggcaa attctgcttc tctgatcata 3600
ttccaagtga tgaaaggtca tccctatagt agataaacca tgtgtacaga tgaggctcat 3660
ggttgatgat ttgtccccag caaatgacat ttactttggg gtgactaaag caggaaagca 3720
gaagagtaaa tccacatgct gatgatatga tacaacactt gagagtcaaa tttctattca 3780
tctaaacatc tttaaaggct agtgcatgaa ggcactggag ctagtacact ctctgatact 3840
acagtttgaa cccacaaaag ttttttcgac cttttgtata ttaacaaata ctttgataaa 3900
agttatgtta ctttcaaacg gatatggcta gagaaaaaat tttaattaaa ataaaacaca 3960
taaagaataa tgttactcag gttgtatttt taccagtaaa tttttttgaa ctgaataccc 4020
attgatctca cttaaatttc tgatctgttc aatgtacaat gaagtctaaa cctttcaaat 4080
tatctctttt tatgttaact ggcactatgt aactcaaaat caatgttttt cataaatttt 4140
acaaaaattg aatcaccagt ttttgccaat cataaatgtt accaattatt gctcttatct 4200
gtatgaattt ccttttgaag ccattatctc tatcagccac tattttcata ggcccaattt 4260
tgcacattcc aaccatccca tttacaaacc ttacccttta tcaatggtct ttgtccattt 4320
tattctgaaa attatttata ccagtaaaat tcgttacaaa ttagataaaa gactgatcat 4380
ctgtatttat ttctaaacta atctatgaaa acaatgggag caattgccct tgaatattct 4440
aagaccgctc tgttccccag gactgctatg ttattaatcc agttcttctc tgtacttcta 4500
actacactcc ataatacaga ctaaaggttc atattctcaa tagagcaaag agaaaagaac 4560
acattgaatt gatgtggaca aaatgtcttg tttccggtat gtagatgcaa agtgaaaaga 4620
aacaaaacat taggaccaat ttgtcatata acccacaaaa attcacctta ttcattcatt 4680
gaacagtaag tttttgagca cctccaatgt gcccagtagt attcttaaca ctagggatac 4740
agggtaggag aagaaaaaac aatcaagttt tttctcttct ggagcttaca ttctaatgga 4800
gaaagacaga taataaataa tttcaggtat tggcatagct tgtgtgggat aacaagattg 4860
agagtgattc aggcagtaga gtctgtcttt agtgggatag tcagagaagc ccttttggag 4920
aagatgacat tgagataaag tttgaaagat gaaaagagac tcatctaaat gcacctgact 4980
caacagatat gacaatctga gaagaggatt cctaaaagta actgatctag tggtttctaa 5040
gcattttatt aatcatgcat cttattttta aaaatttggg gcacataccc atgataaatg 5100
tgtatttatt tataaataaa ttagaagtta tttatttata aataaattag aagttattta 5160
taaataaatt agaagttatt tataaataaa ttagaagtta tttataaata aattagaagt 5220
tatttataaa taaattagaa gttatttata aataaattag aagttattta taaataaaat 5280
agaagttatt tatttataaa taaattagaa gttatttatt tataaataaa ttagaagtta 5340
tttatttaca aattagaagt tatttattta caaattagaa gttatttata aattagaagt 5400
tatttataaa taaattagaa gttatttata aataaattag aagttattta taaataaatt 5460
agaagttatt tataaataaa ttagaagtta tttataaata agttatttat aaatagaagt 5520
tatttataaa taagttattt ataaatagaa gttatttata aataagttat ttataaatag 5580
aagttattta taaataagtt atttataaat aaaagttatt tataaataaa ttagaagtta 5640
tttataaata aattagaagt tatttattta taaattagaa gttatttatt tataaataaa 5700
ttagaagtta tttatttata aataaattag aagttcttta ttgccataat aacgatacat 5760
caccaaccac cctgaaattc aatggcttaa aacatcaagc gtttatttag ctcatgaatt 5820
taaaagtcag cgtatactct gatttcagct agaaggttct tctctttcat gaggctcttg 5880
ttactcattc acatgcctga tggtcaactg gcatgaaggg agagactagg ccacatgtct 5940
gcattcctct ggcagactcc agcagccaca tgtcgatggc tgtggcaaag aacaagagag 6000
agaatgcaag ccccatcatg caaacacttc ataagtttct tttcatggca tttgctcagc 6060
ccattggcca gagtaagtca catggccaag ctgcaagtca aagggcaggg caggttagcc 6120
cacccaccat aggagggcac tgcaaagtta tatggcaaac agcttagaca cagaaagatg 6180
taaagaatta gttccaataa tgcaatcttt ctcctgcagt aatatattac tgctcaaata 6240
tattacacat atcagaaagt atacactcac aaattgaaac tttaaagatg agataaagaa 6300
aaatataatt ggcattttat ttcaccattc tggggctgta tcctttgtga aatatgcatc 6360
ccacattaca gagagtttct cttatccatt cttttatgta tttttaatac tttcagacaa 6420
caccaaatct gacttgcttt taataatctt tcttctctct atgccaagga tcctgcaaac 6480
tttctctgta attcaactca aggatttaag aaaaatacag tagttttcat tactgtgaat 6540
tctcctgcag ctgcaaaaca aatccctcct ggacacttat gtctacaaat gctcatgtat 6600
taggatgtag gatagacctg tctttttcat ctgtcaaatg gaggttattt gtgagcacta 6660
atgtaatagg aaacatatgt aaactgctag cctatagtaa gtctgcaata aatagaagct 6720
accataactg actagttgat agtctttgtc acatggaagc aataaccttt gcttctacat 6780
tcatttggga agaaaataaa acagaaatga ttctttttct actgaggaaa agaaagaacc 6840
tataaaacat acgagaaggt cagctgttcc ctcatgggag aacttctgag agtccagata 6900
aacaggccca cgcctaaagc agctccagcc atcttggggc tctctggatt gcctgggggt 6960
aggaaatgca cggcacagct aaacaagaac aatgggctct atgatgaagc tgtaatcatt 7020
ggcctcctgt gtgggtatgg tttttttctt ttactttttt ttttttttta gcctcaacat 7080
atgaccacat ttttttttct tatttttttt ttgccggggg ttggggggtg gagggcatgg 7140
gtatgttttc aagtagaaaa gagtaagtag actttgaatg aaccatttcc ttctgagttt 7200
tccagggcaa gttaaagctg tagaaaccaa acaggaaact acggcatgaa ctcactcctt 7260
caaaaactaa cttctcaaaa agaaaattta tctctagttg aggcaccatt ttgtcccaga 7320
gaccttgctc ccatctttct ttccctaagg tatgttttca ttaccttgcc aataggtggc 7380
acttacaaga tcactgaaat tattttattt ttgttcattg attgctttga ggaaacccat 7440
ttgaaaaata aattaggttg cagtcaggaa aatagatacc aaggtgaata tttcaaacag 7500
ggaatttaat acaaggaaat agatagttgt tagaagacta gaagaagaaa aaaaagaaga 7560
ctggaaaagc agaaagagaa aactgagata atccagagat tggtaattgc agggagtagc 7620
tattggccct agaattggga gaataaatgg gaaaaggtgt tgccaccaga agctaagagt 7680
ccacaggagg ggcctctgtg tagctgttgc aaggactcct aaattggcac catgaggctg 7740
atgccaggaa tgccaaaaaa tgcctgaacc atagctattg gctgcaattg gaggaatgaa 7800
ggcagaaacc agaggcagga ttagagaccc ttatgtcctc ataccatctt ccagtctctc 7860
ataggcagaa cataactaga agacagtggg caagagaatc tgggaaatgt agtttgcaga 7920
ctcccagttc tggaattata aaataaaata cagaagggtg tcaggcttgg gactaagaga 7980
caacatataa atatctggca cagaaagtaa tagagttcta cctccttcag aagtagcaca 8040
ggagctatag acggggtaaa ggctcttagg cattgttact actttttatc ttatggattc 8100
ccaattttgg agtggtctcc ttttatgtct ttaaagtatg ttcctcattt tagccaatat 8160
gatgtgagtg gaacatgaca gcatcattga gggcacggag aaatgcaggg aagctgaggg 8220
tgtggacagc atcattattg cgcacctttc tgtggataga ttaatagatc tcaaacttac 8280
atttgtggct ttgctttagc tgtgcacacc taccgcttat tgtaccactt acaaacatgt 8340
cagaactgta atatacagat gagggttgtt attatcctga aggtagtcac ccatgacctc 8400
attctaacag tgattccact aatcaagaca ttctttgaat tccactgagg aattaccttc 8460
agagtttgtg acacatccac ttgtttctag gttgttaaat ctttgtcttt ttaaggctac 8520
attcagtatt ttaaaatagt taagacactt tagtttaaga tcgacactta gagtaaacca 8580
tcaaggtgga tatgaccgct tgctgctact gaatctactg tgcagactat aattcaaaag 8640
aggaattcca aatatacttg ttgcaataat agcatgagta agtacagcct ttgaagctgg 8700
atcctttgaa ggacaacacg tattgaggct tataataatt ttatccaaaa aagatccatc 8760
ttcaccacct ctaattcctt tggaaaacag aaagagtgtt attttgaaaa ataagtttta 8820
ttccctagga tcataaattc ctgaatgcat ggactactgg gtgccaagat tgattccatt 8880
ccttgttcat tatgagggaa acaaacttgt cttgttaaat gagaaatcca agtattctca 8940
agttttggag aaaaatttga tgcttatcct cataatatat ggcaggccag gatttgttgt 9000
ttagtgagta aactgccagg ggaaggtcac attctggctt tgggacccaa ggctaaggaa 9060
agtatgtacg tttacagcag aatggttaag cttccagttt gcagagttgc tgagctagcc 9120
agttttcttc agtatattaa gatggattgc ggaaattttg gtcacatttc caaacccaac 9180
tcctgctaat gtgacaactc attctgtgag gtcacttggg tcagtctggg gccttcagct 9240
tttaattccc atctagggag aaatggcttg gcctatggaa tgtggaaaaa aagttcccca 9300
aagccaagga atcctgagtt cctcctggag ccaaggaaca agaaacagat cacttgttga 9360
gtcaaattat tcacgaaata gacaacatat aaattaactg tacattttca acaaattatt 9420
ggggaccagt cacacatagc ctcctagcag aagagatctg ttctctaaaa atagagattg 9480
aagatataca aaaatatttg gatcatatta tacacatcag atatttattc ttctttaagc 9540
caattctctt tgcttttgac ttttcactca aagttcagcc aaaaaaaaaa gaagtttggc 9600
ttaagggtga agcaaagcca gtgtgcagaa tgatcaaaag ttgaaaataa gcagtttatc 9660
ttaattattt tcttcctcag tgtcttccta ctctctccca tccccgccat cctgaaccct 9720
taagtgactt gtttcctcca aggcctctgc attggacttc cgtggatgtc tcatgttcta 9780
aaccaggggt ccccaatccc gggctgtgga gtggtacttg tctgtggcct gttaggaacc 9840
cggccacaca gcaggagatg agtggagggc catcaatcat taccgcctaa gttctgcctc 9900
ctgtcagatc aaccacagcg ttagattctc ataggagtgg gaaccctatt gttaactgcg 9960
catgggaggg atctaggttg cttgctcctt atgagaatct aactaatacc tgacaacctg 10020
agatggagca gtttcatccc gaaaccatcc cctcccccaa ccccgtccat gggaaaaatg 10080
gtcgtccaca aaaccggtcc ctggtgccaa agaggttggg gaccgctgtt ctaaactacc 10140
ccttcctgtc actcactcct aaatccaaac tccctttagg cctcctccag ggaaggttga 10200
ctaaactttc atccagaggt gtgagtcatg gtgttagtga caaatgaaag ctattgttca 10260
gctcacacaa ctggagagag atcagcctgg ggttctttga cttttggtgt ggtcaatgac 10320
aagaaacaca cacccggaca caggaagggg aacatcacac accagggcct gttgtggggt 10380
gggggagggg ggaggggtag catttggaga tatacctaac gttaaatgac aagttactgg 10440
gtgcagcaca ccaacatggc acatgtatac atatgtaact aacctgcacg ttgtgcacat 10500
gtaccctaga acttaaataa aaaaaagaca cacccactca tgcaaccaag aggactttga 10560
gattaaccca caatctcact ttatcactgc ctcacatcac cccttggtcc agaagttggg 10620
agaaggatat tctctactgg agccagaggg cagagtcagg gaggagcttg tttccacagc 10680
ctgagggtct gataagcata acgtatatag agttgctggt gtagaatgca ctcaataaat 10740
gttggtcttt gcctcttctc agtggaggcc agcttcagca tgggggaccc tgggattgca 10800
tacatgatat atatataata atattattgc ttacacaccc tgtgccaggc actccttcaa 10860
ttcctataac aactctgtga ggtagatacc acacatttca aaagtagaaa ctgaggccaa 10920
gagaatttag gtgatctgcc caacttattc agctgggaag tggattcaga cccacaagtc 10980
tactgtagtc cgtttccttc agcttatcta caccacatta cctctcttgg atgcctgctt 11040
gtattttgac tctgcagaaa aaggctgcat gacctctcac aagagacagg gcagtgagtg 11100
acaggaggtg catcatcagc ctcaaaaagg aggcataccc ttcctttttt cgtgggctgg 11160
atggagctgt ggttctcatc agtgccctca gttttgtgca gctggctcac ttctccattt 11220
cattctaatc agtcaactgc actattccag gttcaaacta acccttacat catcaaaaca 11280
aaaatattta cactgctaag ctaacggcca cctcagcacg gatcaacaag atgaccatat 11340
gctttactgc cgtctgctgg aaaattatgg caacaactac ccaaatacac aaagcaaaga 11400
gtgcccccct ggagtagtgc aacgcaaaaa tgtttacaac tgtgaccaac agctctgctt 11460
aaaaggcttc tagtaattta gccaatactc tggggatcag agggagtaca tgaggcataa 11520
aaaacagtcc ccaaggaatt ttcacagggt tttctctggt aactgataac tagtcccatg 11580
gtatctgcat tttaaaacag aagcttgtta acctaaataa gtctccaatt agtgggattt 11640
aaatcagtat gacaagagta atgggaagta tttcatgcag gggtgaacat atttttggtg 11700
agtgatgtct tacaaaagtc cctttacaaa ataatgagag tgtttctcca gacatctgca 11760
attaaagcac cttcacataa agtctctcat ttgaactacg taacaacttt gaaaagtgtt 11820
ataactgtct tcattttaaa gatgagagga agacaatgga ggagtttcat gccttttgta 11880
tgcctggtac tgtgttcagt gctttatatt cattttctta tttagccttc acaagaatcc 11940
taagagttag atggttttct cctgttttaa ataaaaaaaa aaaaaaagaa aaaaagaaaa 12000
agagagagag agagtctgaa ggttttgccc caggtcactc aactggaaag gttcagagtc 12060
aggacttgaa cccaggtctg actgttctaa gcccaagatt tttccaatac atacagtgta 12120
caggcaaacc cagggacctg ctttcctgaa tctggtgcca gctgagttag ggaggcaaag 12180
atcatttact gagcacgttc tacatcaggt acttaacata ctattttaaa tgctctttac 12240
agcaaccatt tcaagtaggt attacctcct cctcccatat cttacattca aacatgcatg 12300
agtcgtagtc aggatttcag ccaaagtctt tcagctccat ccatagcttc tgttcttttc 12360
atgacacagg tcctagaggg agtcttcctg gtacctccta aagcaggctc cgtgggaagc 12420
cattacactt cccatgtgta cccacaggga ggacgcttcc ctgcttgctc ctctcccttt 12480
cttctcctcc ccgatcttag tgctaacaat tccatcctgc tttccttcct ctacaggtga 12540
gcatctccac cgtgggctac ggagacatgt acccagagac ccacctgggc aggttttttg 12600
ccttcctctg cattgctttt gggatcattc tcaacgggat gcccatttcc atcctctaca 12660
acaagttttc tgattactac agcaagctga aggcttatga gtataccacc atacgcaggg 12720
agaggggaga ggtgaacttc atgcagagag ccagaaagaa gatagctgag tgtttgcttg 12780
gaagcaaccc acagctcacc ccaagacaag agaattagta ttttatagga catgtggctg 12840
gtagattcca tgaacttcaa ggcttcattg ctcttttttt aatcattatg attggcagca 12900
aaaggaaatg tgaagcagac atacacaaag gccatttcgt tcacaaagta ctgcctctag 12960
aaatactcat tttggcccaa actcagaatg tctcatagtt gctctgtgtt gtgtgaaaca 13020
tctgaccttc tcaatgacgt tgatattgaa aacctgaggg gagcaacagc ttagattttt 13080
cttgtagctt ctcgtggcat ctagctcaat aaatattttt ggacttgagt tgacttgaga 13140
aaattttttt tactttaaat ttttctaaaa ttcttaactt tccagaggga gggagggtta 13200
cagcagaaat tatacaagct ttggagttag accaacctta gtcagaatcc cagagctacc 13260
agctgtatgc ttttaggcaa gcgactctaa ccctttaagc ctcagtttct tcaactgtga 13320
aatgtaggca atacttaccc tgccaggctg agcaatatag tgagaccctg cctctacaaa 13380
aacttattaa gaattatctg ggtgtgctgg cccacacctg tagtcccagc tacttggaag 13440
actgaggtga gatcacttga gcccaggagt ttgaggttag agtaagctat aaccacatta 13500
ctgcactcca atctagatgg cagagtaaga ccctgcctca aataaataaa taaataaata 13560
aataaataaa accacctgcc ttgtaaaatg agtctgggga taacagatat gtgtaaacgc 13620
tcaataaatg ataggtatta aaattgttta agtggatgtt atctagtgaa atctctagac 13680
cagtggttct caaaggcaaa ttcattcctc agaggccagc taatgcct 13728
<210> 2
<211> 1638
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic: Codon Optimized hKCVN2 (nucleotide sequence)
<400> 2
atgctgaagc agagtgagag gaggaggtca tggagttatc gaccttggaa cacgactgaa 60
aacgaaggca gccagcatcg cagatccatt tgctccctgg gggcgcgcag tggctcacaa 120
gcgtccatcc acggctggac tgaaggaaat tataactact atatagagga ggacgaagac 180
ggagaggagg aagaccaatg gaaagatgat ctggcggagg aagatcagca agccggtgaa 240
gtgaccactg ctaaacccga aggaccatct gacccacctg cactcttgag cacattgaat 300
gtaaatgttg ggggtcacag ctaccaattg gattactgcg agcttgccgg gtttcccaag 360
actcggctcg gaaggctcgc aacatccaca agcaggtccc ggcaattgtc actgtgcgat 420
gactatgaag aacaaacaga cgagtatttc tttgacaggg acccggctgt cttccagttg 480
gtctataact tctatctgtc aggtgttctc ctcgttctcg atggcctgtg tcctcggcga 540
ttcttggaag aactcgggta ctggggggtg aggttgaaat atacccctcg gtgctgccgc 600
atttgttttg aggaaaggcg agatgagctt tcagagcggt tgaagataca acacgaactt 660
agagcgcagg ctcaggtaga agaagctgaa gaattgtttc gagacatgag attttatggc 720
ccacagcgcc gccggctgtg gaacctcatg gaaaagcctt tctcaagtgt cgccgccaag 780
gctattggcg ttgccagcag cactttcgta cttgtgagcg tagtggcact ggcattgaat 840
actgtagagg agatgcagca gcacagcgga cagggtgaag gggggcctga ccttcggcct 900
atcctcgaac atgtcgaaat gctctgcatg gggtttttca ccttggagta ccttcttcga 960
cttgcatcta cgccagactt gcggagattt gctaggagcg ctcttaacct ggttgacctc 1020
gtcgcgatcc tgccgttgta cctccagctg cttctcgagt gttttacagg tgagggtcac 1080
caacgcggcc agactgtcgg gagcgtcgga aaggttggtc aggttctgcg cgtcatgaga 1140
ttgatgagga tatttagaat cctcaaattg gctagacata gtactgggtt gcgcgcattc 1200
ggtttcaccc ttcgacagtg ctatcagcaa gttgggtgct tgctcttgtt catcgctatg 1260
ggaatcttca ctttttccgc cgccgtatat tccgtagaac atgacgttcc ctccaccaat 1320
tttacaacaa tcccgcatag ctggtggtgg gctgctgtct ccatctctac ggtcggctac 1380
ggcgacatgt accccgaaac gcacctcggt aggttcttcg catttctgtg catcgcgttt 1440
ggaatcattc ttaatggtat gcctatttca atactttaca ataaattctc cgattactac 1500
agtaaattga aagcatacga gtatactacg attcggcgcg agaggggcga agtaaatttc 1560
atgcagcgag caagaaaaaa aattgccgag tgtctgctgg ggagtaatcc acagctcaca 1620
ccacgccaag aaaactag 1638
<210> 3
<211> 5971
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic: Complete DNA Sequence of Construct,
pAAV_RK_KOZAK_hKCNV2_WPRE-SV40 FULL SEQUENCE
<400> 3
gatatcctta agggatccag atctgaattc gggccccaga agcctggtgg ttgtttgtcc 60
ttctcagggg aaaagtgagg cggccccttg gaggaagggg ccgggcagaa tgatctaatc 120
ggattccaag cagctcaggg gattgtcttt ttctagcacc ttcttgccac tcctaagcgt 180
cctccgtgac cccggctggg atttagcctg gtgctgtgtc agccccggtc tcccaggggc 240
ttcccagtgg tccccaggaa ccctcgacag ggcccggtct ctctcgtcca gcaagggcag 300
ggacgggcca caggccaagg gcggtacgcc gccaccatgc tgaagcagag tgagaggagg 360
aggtcatgga gttatcgacc ttggaacacg actgaaaacg aaggcagcca gcatcgcaga 420
tccatttgct ccctgggggc gcgcagtggc tcacaagcgt ccatccacgg ctggactgaa 480
ggaaattata actactatat agaggaggac gaagacggag aggaggaaga ccaatggaaa 540
gatgatctgg cggaggaaga tcagcaagcc ggtgaagtga ccactgctaa acccgaagga 600
ccatctgacc cacctgcact cttgagcaca ttgaatgtaa atgttggggg tcacagctac 660
caattggatt actgcgagct tgccgggttt cccaagactc ggctcggaag gctcgcaaca 720
tccacaagca ggtcccggca attgtcactg tgcgatgact atgaagaaca aacagacgag 780
tatttctttg acagggaccc ggctgtcttc cagttggtct ataacttcta tctgtcaggt 840
gttctcctcg ttctcgatgg cctgtgtcct cggcgattct tggaagaact cgggtactgg 900
ggggtgaggt tgaaatatac ccctcggtgc tgccgcattt gttttgagga aaggcgagat 960
gagctttcag agcggttgaa gatacaacac gaacttagag cgcaggctca ggtagaagaa 1020
gctgaagaat tgtttcgaga catgagattt tatggcccac agcgccgccg gctgtggaac 1080
ctcatggaaa agcctttctc aagtgtcgcc gccaaggcta ttggcgttgc cagcagcact 1140
ttcgtacttg tgagcgtagt ggcactggca ttgaatactg tagaggagat gcagcagcac 1200
agcggacagg gtgaaggggg gcctgacctt cggcctatcc tcgaacatgt cgaaatgctc 1260
tgcatggggt ttttcacctt ggagtacctt cttcgacttg catctacgcc agacttgcgg 1320
agatttgcta ggagcgctct taacctggtt gacctcgtcg cgatcctgcc gttgtacctc 1380
cagctgcttc tcgagtgttt tacaggtgag ggtcaccaac gcggccagac tgtcgggagc 1440
gtcggaaagg ttggtcaggt tctgcgcgtc atgagattga tgaggatatt tagaatcctc 1500
aaattggcta gacatagtac tgggttgcgc gcattcggtt tcacccttcg acagtgctat 1560
cagcaagttg ggtgcttgct cttgttcatc gctatgggaa tcttcacttt ttccgccgcc 1620
gtatattccg tagaacatga cgttccctcc accaatttta caacaatccc gcatagctgg 1680
tggtgggctg ctgtctccat ctctacggtc ggctacggcg acatgtaccc cgaaacgcac 1740
ctcggtaggt tcttcgcatt tctgtgcatc gcgtttggaa tcattcttaa tggtatgcct 1800
atttcaatac tttacaataa attctccgat tactacagta aattgaaagc atacgagtat 1860
actacgattc ggcgcgagag gggcgaagta aatttcatgc agcgagcaag aaaaaaaatt 1920
gccgagtgtc tgctggggag taatccacag ctcacaccac gccaagaaaa ctagaagctt 1980
atcgataatc aacctctgga ttacaaaatt tgtgaaagat tgactggtat tcttaactat 2040
gttgctcctt ttacgctatg tggatacgct gctttaatgc ctttgtatca tgctattgct 2100
tcccgtatgg ctttcatttt ctcctccttg tataaatcct ggttgctgtc tctttatgag 2160
gagttgtggc ccgttgtcag gcaacgtggc gtggtgtgca ctgtgtttgc tgacgcaacc 2220
cccactggtt ggggcattgc caccacctgt cagctccttt ccgggacttt cgctttcccc 2280
ctccctattg ccacggcgga actcatcgcc gcctgccttg cccgctgctg gacaggggct 2340
cggctgttgg gcactgacaa ttccgtggtg ttgtcgggga aatcatcgtc ctttccttgg 2400
ctgctcgcct gtgttgccac ctggattctg cgcgggacgt ccttctgcta cgtcccttcg 2460
gccctcaatc cagcggacct tccttcccgc ggcctgctgc cggctctgcg gcctcttccg 2520
cgtcttcgcc ttcgccctca gacgagtcgg atctcccttt gggccgcctc cccgcatcga 2580
taccgtcgac ctcgacccgg gcggccgctt cgagcagaca tgataagata cattgatgag 2640
tttggacaaa ccacaactag aatgcagtga aaaaaatgct ttatttgtga aatttgtgat 2700
gctattgctt tatttgtaac cattataagc tgcaataaac aagttgctag cctgcagact 2760
agttctagag atatcatctt cctagagcat ggctacgtag ataagtagca tggcgggtta 2820
atcattaact acaaggaacc cctagtgatg gagttggcca ctccctctct gcgcgctcgc 2880
tcgctcactg aggccgggcg accaaaggtc gcccgacgcc cgggctttgc ccgggcggcc 2940
tcagtgagcg agcgagcgcg cagccttaat taacctaatt cactggccgt cgttttacaa 3000
cgtcgtgact gggaaaaccc tggcgttacc caacttaatc gccttgcagc acatccccct 3060
ttcgccagct ggcgtaatag cgaagaggcc cgcaccgatc gcccttccca acagttgcgc 3120
agcctgaatg gcgaatggga cgcgccctgt agcggcgcat taagcgcggc gggtgtggtg 3180
gttacgcgca gcgtgaccgc tacacttgcc agcgccctag cgcccgctcc tttcgctttc 3240
ttcccttcct ttctcgccac gttcgccggc tttccccgtc aagctctaaa tcgggggctc 3300
cctttagggt tccgatttag tgctttacgg cacctcgacc ccaaaaaact tgattagggt 3360
gatggttcac gtagtgggcc atcgccctga tagacggttt ttcgcccttt gacgttggag 3420
tccacgttct ttaatagtgg actcttgttc caaactggaa caacactcaa ccctatctcg 3480
gtctattctt ttgatttata agggattttg ccgatttcgg cctattggtt aaaaaatgag 3540
ctgatttaac aaaaatttaa cgcgaatttt aacaaaatat taacgtttat aatttcaggt 3600
ggcatctttc ggggaaatgt gcgcggaacc cctatttgtt tatttttcta aatacattca 3660
aatatgtatc cgctcatgag acaataaccc tgataaatgc ttcaataata ttgaaaaagg 3720
aagagtatga gtattcaaca tttccgtgtc gcccttattc ccttttttgc ggcattttgc 3780
cttcctgttt ttgctcaccc agaaacgctg gtgaaagtaa aagatgctga agatcagttg 3840
ggtgcacgag tgggttacat cgaactggat ctcaatagtg gtaagatcct tgagagtttt 3900
cgccccgaag aacgttttcc aatgatgagc acttttaaag ttctgctatg tggcgcggta 3960
ttatcccgta ttgacgccgg gcaagagcaa ctcggtcgcc gcatacacta ttctcagaat 4020
gacttggttg agtactcacc agtcacagaa aagcatctta cggatggcat gacagtaaga 4080
gaattatgca gtgctgccat aaccatgagt gataacactg cggccaactt acttctgaca 4140
acgatcggag gaccgaagga gctaaccgct tttttgcaca acatggggga tcatgtaact 4200
cgccttgatc gttgggaacc ggagctgaat gaagccatac caaacgacga gcgtgacacc 4260
acgatgcctg tagtaatggt aacaacgttg cgcaaactat taactggcga actacttact 4320
ctagcttccc ggcaacaatt aatagactgg atggaggcgg ataaagttgc aggaccactt 4380
ctgcgctcgg cccttccggc tggctggttt attgctgata aatctggagc cggtgagcgt 4440
gggtctcgcg gtatcattgc agcactgggg ccagatggta agccctcccg tatcgtagtt 4500
atctacacga cggggagtca ggcaactatg gatgaacgaa atagacagat cgctgagata 4560
ggtgcctcac tgattaagca ttggtaactg tcagaccaag tttactcata tatactttag 4620
attgatttaa aacttcattt ttaatttaaa aggatctagg tgaagatcct ttttgataat 4680
ctcatgacca aaatccctta acgtgagttt tcgttccact gagcgtcaga ccccgtagaa 4740
aagatcaaag gatcttcttg agatcctttt tttctgcgcg taatctgctg cttgcaaaca 4800
aaaaaaccac cgctaccagc ggtggtttgt ttgccggatc aagagctacc aactcttttt 4860
ccgaaggtaa ctggcttcag cagagcgcag ataccaaata ctgtccttct agtgtagccg 4920
tagttaggcc accacttcaa gaactctgta gcaccgccta catacctcgc tctgctaatc 4980
ctgttaccag tggctgctgc cagtggcgat aagtcgtgtc ttaccgggtt ggactcaaga 5040
cgatagttac cggataaggc gcagcggtcg ggctgaacgg ggggttcgtg cacacagccc 5100
agcttggagc gaacgaccta caccgaactg agatacctac agcgtgagct atgagaaagc 5160
gccacgcttc ccgaagggag aaaggcggac aggtatccgg taagcggcag ggtcggaaca 5220
ggagagcgca cgagggagct tccaggggga aacgcctggt atctttatag tcctgtcggg 5280
tttcgccacc tctgacttga gcgtcgattt ttgtgatgct cgtcaggggg gcggagccta 5340
tggaaaaacg ccagcaacgc ggccttttta cggttcctgg ccttttgctg cggttttgct 5400
cacatgttct ttcctgcgtt atcccctgat tctgtggata accgtattac cgcctttgag 5460
tgagctgata ccgctcgccg cagccgaacg accgagcgca gcgagtcagt gagcgaggaa 5520
gcggaagagc gcccaatacg caaaccgcct ctccccgcgc gttggccgat tcattaatgc 5580
agctggcacg acaggtttcc cgactggaaa gcgggcagtg agcgcaacgc aattaatgtg 5640
agttagctca ctcattaggc accccaggct ttacacttta tgcttccggc tcgtatgttg 5700
tgtggaattg tgagcggata acaatttcac acaggaaaca gctatgacca tgattacgcc 5760
agatttaatt aaggctgcgc gctcgctcgc tcactgaggc cgcccgggca aagcccgggc 5820
gtcgggcgac ctttggtcgc ccggcctcag tgagcgagcg agcgcgcaga gagggagtgg 5880
ccaactccat cactaggggt tccttgtagt taatgattaa cccgccatgc tacttatcta 5940
cgtagccatg ctctaggaag atcggaattc g 5971
<210> 4
<211> 130
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic: 5 ITR nucleotide sequence
<400> 4
ctgcgcgctc gctcgctcac tgaggccgcc cgggcaaagc ccgggcgtcg ggcgaccttt 60
ggtcgcccgg cctcagtgag cgagcgagcg cgcagagagg gagtggccaa ctccatcact 120
aggggttcct 130
<210> 5
<211> 130
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic: 3 ITR nucleotide sequence
<400> 5
aggaacccct agtgatggag ttggccactc cctctctgcg cgctcgctcg ctcactgagg 60
ccgggcgacc aaaggtcgcc cgacgcccgg gctttgcccg ggcggcctca gtgagcgagc 120
gagcgcgcag 130
<210> 6
<211> 297
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic: RK Promoter
<400> 6
gggccccaga agcctggtgg ttgtttgtcc ttctcagggg aaaagtgagg cggccccttg 60
gaggaagggg ccgggcagaa tgatctaatc ggattccaag cagctcaggg gattgtcttt 120
ttctagcacc ttcttgccac tcctaagcgt cctccgtgac cccggctggg atttagcctg 180
gtgctgtgtc agccccggtc tcccaggggc ttcccagtgg tccccaggaa ccctcgacag 240
ggcccggtct ctctcgtcca gcaagggcag ggacgggcca caggccaagg gcggtac 297
<210> 7
<211> 583
<212> DNA
<213> Human cytomegalovirus
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(583)
<223> CMV Promoter nucleotide sequence
<400> 7
tagttattaa tagtaatcaa ttacggggtc attagttcat agcccatata tggagttccg 60
cgttacataa cttacggtaa atggcccgcc tggctgaccg cccaacgacc cccgcccatt 120
gacgtcaata atgacgtatg ttcccatagt aacgccaata gggactttcc attgacgtca 180
atgggtggag tatttacggt aaactgccca cttggcagta catcaagtgt atcatatgcc 240
aagtacgccc cctattgacg tcaatgacgg taaatggccc gcctggcatt atgcccagta 300
catgacctta tgggactttc ctacttggca gtacatctac gtattagtca tcgctattac 360
catggtgatg cggttttggc agtacatcaa tgggcgtgga tagcggtttg actcacgggg 420
atttccaagt ctccacccca ttgacgtcaa tgggagtttg ttttggcacc aaaatcaacg 480
ggactttcca aaatgtcgta acaactccgc cccattgacg caaatgggcg gtaggcgtgt 540
acggtgggag gtctatataa gcagagctgg tttagtgaac cgt 583
<210> 8
<211> 9
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic: KOZAK nucleotide seq
<400> 8
gccgccacc 9
<210> 9
<211> 542
<212> DNA
<213> Woodchuck Hepatitis Virus
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(542)
<223> Woodchuck Hepatitis Virus (WHP) Posttranscriptional Regulatory
Element (WPRE)
<400> 9
aatcaacctc tggattacaa aatttgtgaa agattgactg gtattcttaa ctatgttgct 60
ccttttacgc tatgtggata cgctgcttta atgcctttgt atcatgctat tgcttcccgt 120
atggctttca ttttctcctc cttgtataaa tcctggttgc tgtctcttta tgaggagttg 180
tggcccgttg tcaggcaacg tggcgtggtg tgcactgtgt ttgctgacgc aacccccact 240
ggttggggca ttgccaccac ctgtcagctc ctttccggga ctttcgcttt ccccctccct 300
attgccacgg cggaactcat cgccgcctgc cttgcccgct gctggacagg ggctcggctg 360
ttgggcactg acaattccgt ggtgttgtcg gggaaatcat cgtcctttcc ttggctgctc 420
gcctgtgttg ccacctggat tctgcgcggg acgtccttct gctacgtccc ttcggccctc 480
aatccagcgg accttccttc ccgcggcctg ctgccggctc tgcggcctct tccgcgtctt 540
cg 542
<210> 10
<211> 215
<212> DNA
<213> Bos taurus
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(215)
<223> Bovine growth hormone polyadenylation (BGH) poly(A)
<400> 10
gcctcgactg tgccttctag ttgccagcca tctgttgttt gcccctcccc cgtgccttcc 60
ttgaccctgg aaggtgccac tcccactgtc ctttcctaat aaaatgagga aattgcatcg 120
cattgtctga gtaggtgtca ttctattctg gggggtgggg tggggcagga cagcaagggg 180
gaggattggg aagacaatag caggcatgct gggga 215
<210> 11
<211> 545
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(545)
<223> KCVN2 Amino Acid Sequence
<400> 11
Met Leu Lys Gln Ser Glu Arg Arg Arg Ser Trp Ser Tyr Arg Pro Trp
1 5 10 15
Asn Thr Thr Glu Asn Glu Gly Ser Gln His Arg Arg Ser Ile Cys Ser
20 25 30
Leu Gly Ala Arg Ser Gly Ser Gln Ala Ser Ile His Gly Trp Thr Glu
35 40 45
Gly Asn Tyr Asn Tyr Tyr Ile Glu Glu Asp Glu Asp Gly Glu Glu Glu
50 55 60
Asp Gln Trp Lys Asp Asp Leu Ala Glu Glu Asp Gln Gln Ala Gly Glu
65 70 75 80
Val Thr Thr Ala Lys Pro Glu Gly Pro Ser Asp Pro Pro Ala Leu Leu
85 90 95
Ser Thr Leu Asn Val Asn Val Gly Gly His Ser Tyr Gln Leu Asp Tyr
100 105 110
Cys Glu Leu Ala Gly Phe Pro Lys Thr Arg Leu Gly Arg Leu Ala Thr
115 120 125
Ser Thr Ser Arg Ser Arg Gln Leu Ser Leu Cys Asp Asp Tyr Glu Glu
130 135 140
Gln Thr Asp Glu Tyr Phe Phe Asp Arg Asp Pro Ala Val Phe Gln Leu
145 150 155 160
Val Tyr Asn Phe Tyr Leu Ser Gly Val Leu Leu Val Leu Asp Gly Leu
165 170 175
Cys Pro Arg Arg Phe Leu Glu Glu Leu Gly Tyr Trp Gly Val Arg Leu
180 185 190
Lys Tyr Thr Pro Arg Cys Cys Arg Ile Cys Phe Glu Glu Arg Arg Asp
195 200 205
Glu Leu Ser Glu Arg Leu Lys Ile Gln His Glu Leu Arg Ala Gln Ala
210 215 220
Gln Val Glu Glu Ala Glu Glu Leu Phe Arg Asp Met Arg Phe Tyr Gly
225 230 235 240
Pro Gln Arg Arg Arg Leu Trp Asn Leu Met Glu Lys Pro Phe Ser Ser
245 250 255
Val Ala Ala Lys Ala Ile Gly Val Ala Ser Ser Thr Phe Val Leu Val
260 265 270
Ser Val Val Ala Leu Ala Leu Asn Thr Val Glu Glu Met Gln Gln His
275 280 285
Ser Gly Gln Gly Glu Gly Gly Pro Asp Leu Arg Pro Ile Leu Glu His
290 295 300
Val Glu Met Leu Cys Met Gly Phe Phe Thr Leu Glu Tyr Leu Leu Arg
305 310 315 320
Leu Ala Ser Thr Pro Asp Leu Arg Arg Phe Ala Arg Ser Ala Leu Asn
325 330 335
Leu Val Asp Leu Val Ala Ile Leu Pro Leu Tyr Leu Gln Leu Leu Leu
340 345 350
Glu Cys Phe Thr Gly Glu Gly His Gln Arg Gly Gln Thr Val Gly Ser
355 360 365
Val Gly Lys Val Gly Gln Val Leu Arg Val Met Arg Leu Met Arg Ile
370 375 380
Phe Arg Ile Leu Lys Leu Ala Arg His Ser Thr Gly Leu Arg Ala Phe
385 390 395 400
Gly Phe Thr Leu Arg Gln Cys Tyr Gln Gln Val Gly Cys Leu Leu Leu
405 410 415
Phe Ile Ala Met Gly Ile Phe Thr Phe Ser Ala Ala Val Tyr Ser Val
420 425 430
Glu His Asp Val Pro Ser Thr Asn Phe Thr Thr Ile Pro His Ser Trp
435 440 445
Trp Trp Ala Ala Val Ser Ile Ser Thr Val Gly Tyr Gly Asp Met Tyr
450 455 460
Pro Glu Thr His Leu Gly Arg Phe Phe Ala Phe Leu Cys Ile Ala Phe
465 470 475 480
Gly Ile Ile Leu Asn Gly Met Pro Ile Ser Ile Leu Tyr Asn Lys Phe
485 490 495
Ser Asp Tyr Tyr Ser Lys Leu Lys Ala Tyr Glu Tyr Thr Thr Ile Arg
500 505 510
Arg Glu Arg Gly Glu Val Asn Phe Met Gln Arg Ala Arg Lys Lys Ile
515 520 525
Ala Glu Cys Leu Leu Gly Ser Asn Pro Gln Leu Thr Pro Arg Gln Glu
530 535 540
Asn
545
<210> 12
<211> 1638
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(1638)
<223> Human KCVN2 (coding region nucleotide sequence)
<400> 12
atgctcaaac agagtgagag gagacggtcc tggagctaca ggccctggaa cacgacggag 60
aatgagggca gccaacaccg caggagcatt tgctccctgg gtgcccgttc cggctcccag 120
gccagcatcc acggctggac agagggcaac tataactact acatcgagga agacgaagac 180
ggcgaggagg aggaccagtg gaaggacgac ctggcagaag aggaccagca ggcaggggag 240
gtcaccaccg ccaagcccga gggccccagc gaccctccgg ccctgctgtc cacgctgaat 300
gtgaacgtgg gtggccacag ctaccagctg gactactgcg agctggccgg cttccccaag 360
acgcgcctag gtcgcctggc cacctccacc agccgcagcc gccagctaag cctgtgcgac 420
gactacgagg agcagacaga cgaatacttc ttcgaccgcg acccggccgt cttccagctg 480
gtctacaatt tctacctgtc cggggtgctg ctggtgctcg acgggctgtg tccgcgccgc 540
ttcctggagg agctgggcta ctggggcgtg cggctcaagt acacgccacg ctgctgccgc 600
atctgcttcg aggagcggcg cgacgagctg agcgaacggc tcaagatcca gcacgagctg 660
cgcgcgcagg cgcaggtcga ggaggcggag gaactcttcc gcgacatgcg cttctacggc 720
ccgcagcggc gccgcctctg gaacctcatg gagaagccat tctcctcggt ggccgccaag 780
gccatcgggg tggcctccag caccttcgtg ctcgtctccg tggtggcgct ggcgctcaac 840
accgtggagg agatgcagca gcactcgggg cagggcgagg gcggcccaga cctgcggccc 900
atcctggagc acgtggagat gctgtgcatg ggcttcttca cgctcgagta cctgctgcgc 960
ctagcctcca cgcccgacct gaggcgcttc gcgcgcagcg ccctcaacct ggtggacctg 1020
gtggccatcc tgccgctcta ccttcagctg ctgctcgagt gcttcacggg cgagggccac 1080
caacgcggcc agacggtggg cagcgtgggt aaggtgggtc aggtgttgcg cgtcatgcgc 1140
ctcatgcgca tcttccgcat cctcaagctg gcgcgccact ccaccggact gcgtgccttc 1200
ggcttcacgc tgcgccagtg ctaccagcag gtgggctgcc tgctgctctt catcgccatg 1260
ggcatcttca ctttctctgc ggctgtctac tctgtggagc acgatgtgcc cagcaccaac 1320
ttcactacca tcccccactc ctggtggtgg gccgcggtga gcatctccac cgtgggctac 1380
ggagacatgt acccagagac ccacctgggc aggttttttg ccttcctctg cattgctttt 1440
gggatcattc tcaacgggat gcccatttcc atcctctaca acaagttttc tgattactac 1500
agcaagctga aggcttatga gtataccacc atacgcaggg agaggggaga ggtgaacttc 1560
atgcagagag ccagaaagaa gatagctgag tgtttgcttg gaagcaaccc acagctcacc 1620
ccaagacaag agaattag 1638
Claims (14)
- 서열 번호: 2에 제시된 변형된 KCVN2 뉴클레오타이드 서열 또는 서열 번호:2에 대해 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 서열, 또는 서열 번호: 2에 대해 적어도 90% 서열 동일성을 갖는 서열로서, 상기 서열은 서열 번호: 11의 펩타이드를 암호화하며, 상기 서열은 광수용체 활성을 회복시킬 수 있는, 변형된 KCVN2 뉴클레오타이드 서열.
- 제1 항의 변형된 KCVN2 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터.
- 제2 항에 있어서, 벡터는 바이러스 벡터인 것을 특징으로 하는 벡터.
- 제3 항에 있어서, 바이러스 벡터는 AAV 벡터인 것을 특징으로 하는 벡터.
- 제2 항에 있어서, 벡터는 감마-레트로바이러스 벡터, 렌티바이러스 벡터, 또는 아데노바이러스 벡터인 것을 특징으로 하는 벡터.
- 제4 항에 있어서, 서열 번호: 3의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 것을 특징으로 하는 벡터.
- 제4 항에 있어서, 서열 번호: 2에 작동 가능하게 연결된 RK 프로모터를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 벡터.
- 제6 항에 있어서, 코자크 공통 서열, 우드척 간염 바이러스 (WHP) 전사 후 조절 요소 (WPRE), 및 소 성장 호르몬 폴리아데닐화 (BGH 폴리(A)) 신호 중 적어도 하나를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 벡터.
- 제7 항에 있어서, 요소들은 다음 순서로 5'에서 3'으로 배열되는 것을 특징으로 하는 벡터: RK 프로모터, 이어서 코자크 서열, 이어서 서열 번호: 2, 이어서 WPRE, 이어서 BGH 폴리(A) 신호.
- 엄중 조건 하에서, 서열 번호: 2에 혼성체화하고 광수용체 활성을 갖는 서열 번호: 11의 단백질을 암호화하는, KCVN2 뉴클레오타이드 서열.
- 제9 항에 있어서, RK 프로모터, 코자크 서열, WPRE, 및 BGH 폴리(A) 신호에 작동 가능하게 연결된 것을 특징으로 하는 KCVN2 뉴클레오타이드 서열.
- 약학적으로 허용 가능한 비히클에서 제2 항의 벡터를 포함하는 약학적 조성물.
- 제11 항에 있어서, 국소적, 전신적, 또는 국부적 투여를 위해 제제화되는 것을 특징으로 하는 약학적 조성물.
- 제12 항에 있어서, 경구, 비강, 폐, 볼, 경피, 피하, 십이지장내, 장, 비경구, 정맥내, 또는 근육내 투여를 위해 제제화되는 것을 특징으로 하는 약학적 조성물.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US202163191106P | 2021-05-20 | 2021-05-20 | |
US63/191,106 | 2021-05-20 | ||
PCT/US2022/030073 WO2022246089A1 (en) | 2021-05-20 | 2022-05-19 | Kcnv2 variants and their use |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
KR20240012480A true KR20240012480A (ko) | 2024-01-29 |
Family
ID=84102662
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
KR1020237043981A KR20240012480A (ko) | 2021-05-20 | 2022-05-19 | Kcnv2 변이체 및 그것들의 사용 |
Country Status (9)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20220372100A1 (ko) |
EP (1) | EP4341285A1 (ko) |
JP (1) | JP2024521713A (ko) |
KR (1) | KR20240012480A (ko) |
CN (1) | CN118076629A (ko) |
AU (1) | AU2022275948A1 (ko) |
BR (1) | BR112023024275A2 (ko) |
CA (1) | CA3217750A1 (ko) |
WO (1) | WO2022246089A1 (ko) |
Family Cites Families (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6727353B2 (en) * | 2000-04-14 | 2004-04-27 | Icagen, Inc. | Nucleic acid encoding Kv10.1, a voltage-gated potassium channel from human brain |
EP2283038A1 (en) * | 2008-04-30 | 2011-02-16 | Dublin City University | Compositions and methods for expressing in-frame multimeric proteins |
WO2013016418A2 (en) * | 2011-07-27 | 2013-01-31 | The Regents Of The University Of Michigan | Ion channel probes and methods of use thereof |
WO2016102677A1 (en) * | 2014-12-23 | 2016-06-30 | Max-Planck-Gesellschaft Zur Foerderung Der Wissenschaften E.V. | Mutant nq-rhodopsin kr 2 |
-
2022
- 2022-05-19 BR BR112023024275A patent/BR112023024275A2/pt unknown
- 2022-05-19 JP JP2023571843A patent/JP2024521713A/ja active Pending
- 2022-05-19 AU AU2022275948A patent/AU2022275948A1/en active Pending
- 2022-05-19 WO PCT/US2022/030073 patent/WO2022246089A1/en active Application Filing
- 2022-05-19 US US17/748,611 patent/US20220372100A1/en active Pending
- 2022-05-19 CA CA3217750A patent/CA3217750A1/en active Pending
- 2022-05-19 KR KR1020237043981A patent/KR20240012480A/ko unknown
- 2022-05-19 EP EP22805495.3A patent/EP4341285A1/en active Pending
- 2022-05-19 CN CN202280047873.0A patent/CN118076629A/zh active Pending
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CA3217750A1 (en) | 2022-11-24 |
WO2022246089A1 (en) | 2022-11-24 |
BR112023024275A2 (pt) | 2024-01-30 |
CN118076629A (zh) | 2024-05-24 |
AU2022275948A1 (en) | 2023-12-21 |
JP2024521713A (ja) | 2024-06-04 |
EP4341285A1 (en) | 2024-03-27 |
US20220372100A1 (en) | 2022-11-24 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
AU2018211212B2 (en) | Treatment of amd using AAV sFlt-1 | |
RU2727672C2 (ru) | Нацеливающие пептиды для направленной доставки аденоассоциированных вирусов (aav) | |
KR102240180B1 (ko) | 다중 벡터 시스템 및 이의 용도 | |
JP2019519221A (ja) | 加齢関連疾患及び症状の遺伝子治療法 | |
KR20200036912A (ko) | 안과 질환을 위한 세포 모델 및 치료요법 | |
KR20200051011A (ko) | 변형된 폐쇄-종결된 dna(cedna) | |
KR20200120649A (ko) | 비-바이러스 dna 벡터 및 항체 및 융합 단백질 생산을 위한 이의 용도 | |
KR20220006527A (ko) | 리소좀 장애에 대한 유전자 요법 | |
KR20210119416A (ko) | 폐쇄-말단 dna (cedna), 및 유전자 또는 핵산 치료 관련 면역 반응을 감소시키는 방법에서의 이의 용도 | |
US20240002462A1 (en) | Treatment of neuropathy with igf-1-encoding dna constructs and hgf-encoding dna constructs | |
CN116437968A (zh) | 用于神经退行性病症的基因疗法 | |
AU2024202693A1 (en) | Gene Therapy For Ocular Disorders | |
KR20220035107A (ko) | Arsa 유전자 전달을 위한 아데노-연관 바이러스 조성물 및 이의 사용 방법 | |
CN115885040A (zh) | 可用于治疗cdkl5缺乏症(cdd)的组合物 | |
JP2022524434A (ja) | Fviii治療薬を発現するための非ウイルス性dnaベクターおよびその使用 | |
EP4368203A1 (en) | Construction and use of anti-vegf antibody in-vivo expression system | |
KR20240012480A (ko) | Kcnv2 변이체 및 그것들의 사용 | |
KR20230088630A (ko) | 항-vegf 엔티티 및 음성 보체 조절인자를 코딩하는 핵산 및 연령-관련 황반 변성의 치료를 위한 그의 용도 | |
KR20230051529A (ko) | 리소좀 장애에 대한 유전자 요법 | |
CN114945583A (zh) | Α-肌聚糖的腺相关病毒载体递送和肌营养不良症的治疗 | |
RU2800914C2 (ru) | Невирусные днк-векторы и их применение для продуцирования антител и слитых белков | |
TW202235618A (zh) | 治療眼內壓相關疾患 | |
WO2023150743A2 (en) | Codon-optimized smad7 gene therapy to treat and prevent muscle wasting and to enhance muscle mass | |
CN117836420A (zh) | 重组tert编码病毒基因组和运载体 | |
KR20240023127A (ko) | 망막 장애 |