KR20230141885A - 식도암의 검출 키트 또는 디바이스 및 검출 방법 - Google Patents

식도암의 검출 키트 또는 디바이스 및 검출 방법 Download PDF

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도레이 카부시키가이샤
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Abstract

식도암의 검출용 키트 또는 디바이스, 및 검출 방법을 제공한다. 피검체의 검체 중의 miRNA와 특이적으로 결합 가능한 핵산을 포함하는 식도암 검출용 키트 또는 디바이스, 및 상기 miRNA를 in vitro에서 측정하는 것을 포함하는 식도암을 검출하는 방법.

Description

식도암의 검출 키트 또는 디바이스 및 검출 방법{ESOPHAGEAL CANCER DETECTION KIT OR DEVICE, AND DETECTION METHOD}
본 발명은 피험체에 있어서 식도암으로의 이환(罹患)의 유무의 검사를 위해서 사용되는 특정 miRNA와 특이적으로 결합 가능한 핵산을 포함하는 식도암의 검출용 키트 또는 디바이스, 및 상기 핵산을 사용하여 상기 miRNA의 발현량을 측정하는 것을 포함하는 식도암의 검출 방법에 관한 것이다.
식도는 입으로부터 위로 음식물을 보내는 관형상의 장기이며, 기관과 등뼈 사이에 위치한다. 식도의 벽은 내측으로부터 외측을 향하여 점막, 점막하층, 고유근층, 외막의 4개층으로 나뉘어 있으며, 음식물을 입으로부터 위로 보내기 위한 기능을 각각 부담한다(비특허문헌 1). 국립연구개발법인 고쿠리츠간켄큐센터 암대책정보센터가 개시하는 2012년의 일본국내에 있어서의 부위별 암의 통계에 의하면 식도암에 의한 사망자 수는 11,592명으로 올라 부위별 암 사망 원인의 제 10 위이다. 또한, 일본에 있어서의 식도암에 의한 사망 리스크는 남성쪽이 여성보다 5.6배 높고, 또한 흡연이나 알콜 섭취가 식도암의 리스크 인자가 된다(비특허문헌 1). 또한, 미국에서는 남성에서는 125명당 1명, 여성에서는 435명당 1명의 비율로 식도암이 발병하는 것으로 말해지고 있고, 2014년의 추정 식도암 이환자 수는 18,170명으로도 올라 그 중 약 15,450명이 사망하는 것으로 된다(비특허문헌 1).
식도암의 진행도는 비특허문헌 2에 정해져 있으며, 종양의 크기(Tis, T1~3 및 T4a~b), 림프절 전이(N1~3), 원격 전이(M0~1) 등에 의해 스테이지 0(Tis/N0/M0), 스테이지 IA(T1/N0/M0), 스테이지 IB(T2/N0/M0), 스테이지 IIA(T3/N0/M0), 스테이지 IIB(T1~2/N1/M0), 스테이지 IIIA(T4a/N0/M0, T3/N1/M0, 및 T1~2/N2/M0), 스테이지 IIIB(T3/N2/M0), 스테이지 IIIC(T4a/N1~2/M0, T4b/M0, 및 N3/M0), 및 스테이지 IV(M1)로 분류된다.
식도암의 5년 상대 생존율은 암의 진행도에 크게 의존하여 식도 조직에 국한된 암에서는 39%, 인접 조직까지 머무르고 있는 암에서는 21%, 원격 전이된 암에서는 4%로 보고되어 있다(비특허문헌 1). 따라서, 식도암을 조기에 발견하는 것은 생존율의 대폭적인 향상으로 연결되기 때문에 조기 발견을 가능하게 하는 수단의 제공이 강하게 요망되어 있다.
식도암의 치료법은 암의 진행도와 전신 상태로부터 결정되며, 주로 내시경 치료, 수술, 방사선 치료와 항암제가 있다. 어느 정도 진행된 암에서는 이들 치료를 조합하여 각각의 특징을 살리면서 상승 효과를 내기 위한 집학적 치료가 행해진다(비특허문헌 1). 또한, 스테이지 0이나 1 등의 조기의 식도암에서는 환자에게 부담이 적은 내시경 치료나 광선역학적 치료를 적응할 수 있는 경우가 있다(비특허문헌 1).
비특허문헌 1에 의하면, 식도암의 일반적인 검사는 X선에 의한 식도조영검사와 내시경검사이다. 그 밖에 암의 확산 상태를 보기 위해서 CT검사, MRI검사, 내시경초음파검사, 초음파검사 등을 행한다. 이들 1차 검사에서 식도암이 의심되는 소견이 나왔을 경우에는 2차 검사로서 병변에 바늘을 찔러 세포나 조직을 채취하여 현미경으로 조사하는 병리검사를 실시한다. 또한, 식도암 검출을 위한 혈중 종양 마커에는, 예를 들면 CEA나 SCC 등이 알려져 있다(비특허문헌 3).
연구 단계이지만, 특허문헌 1에 나타내어지는 바와 같이 혈액을 비롯한 생체 샘플 중의 마이크로RNA(miRNA)의 발현량, 또는 miRNA의 발현량과 다른 단백질 마커의 발현량을 조합함으로써 식도암을 검출한다는 보고가 있다.
특허문헌 1에는 혈청 중의 miR-663a, miR-92a-3p, miR-575 등의 miRNA를 측정하여 식도암을 검출하는 방법이 나타내어져 있다.
미국특허출원공개 제 2014/031246호 명세서
American Cancer Society 「Esophagus Cancer」, 2014년 감수, p.2~8, 19~20, 29~41 Sobin, L. 외, 「TNM Classification of Malignant Tumours 제 7 판 일본어판」 2009년, p.63~68 Terada, T. 외, 2013년, International Journal of Clinical and Experimental Medicine, 제 6(3)권, p.219-26
본 발명의 과제는 신규인 식도암 종양 마커를 발견하고, 상기 마커에 특이적으로 결합 가능한 핵산을 사용하여 식도암을 효과적으로 검출할 수 있는 방법을 제공하는 것이다.
비특허문헌 1에 기재되어 있는 바와 같이 식도암의 일반적인 검사는 X선에 의한 식도조영검사와 내시경검사이다. 그러나 일반적인 검진에서는 위암 검사에 중점이 두어져 식도는 충분히 관찰되지 않는 경우가 많다. 또한, 이들 검사가 일반적으로 보급된 오늘날에 있어서도 본국의 식도암에 의한 사망수는 증가의 일로를 걷고 있어, 반드시 화상 진단이 식도암을 억제할 수 있다고는 할 수 없다. 또한, CT검사나 MRI검사는 고성능이며 식도암을 검출하는 것이 가능하지만, 특수한 장치가 필요하며, 검사 비용도 고가이기 때문에 1차검사로서 널리 보급되기 위해서는 부적합하다.
식도암 검출을 위한 혈중 종양 마커에는, 예를 들면 CEA나 SCC 등이 알려져 있지만(비특허문헌 3), 이들 마커는 식도암 이외의 암에서도 상승하는 등, 정밀도상의 문제가 있기 때문에 그 유용성은 확립되어 있지 않다. 만일 이들 마커의 사용에 의해 다른 암을 식도암으로 오진했을 경우, 적절한 치료의 기회를 놓치거나, 잘못된 의료를 적용하게 되어 환자에게 불필요한 경제적, 체력적 부담을 강요하게 된다. 그러므로 미국 암협회의 식도암의 가이드에도 이들 마커에 관한 기재는 없다(비특허문헌 1).
또한, 연구 단계이지만 혈액을 비롯한 생체 샘플 중의 마이크로RNA(miRNA)의 발현량을 사용하여 식도암을 판별한다는 보고가 하기와 같이 있지만, 모두 실용화에 이르러 있지 않다.
특허문헌 1에는 혈청 중의 miR-663a, miR-92a-3p, miR-575 등의 miRNA를 측정하여 식도암을 검출하는 방법이 나타내어져 있다. 구체적으로는 건상자 12명과 비교하여 식도암 환자 16명의 혈청에서 변동되는 miRNA 리스트가 나타내어져 있고, 그 miRNA의 발현량을 측정하여 식도암인지의 여부를 판별한다. 그러나, 본 검출법은 식도암을 판별하는 구체적인 정밀도, 감도, 특이도 등의 검출 성능에 대한 실시예 및 기재가 거의 없어 산업적 실용성이 부족하다. 유일하게 검증되어 있는 hsa-miR-345는 AUC가 0.814이며, 단독으로의 식도암의 판별이 어렵다는 기재도 있다.
이와 같이, 식도암의 검출에 있어서 기존의 종양 마커는 그 성능이 낮거나, 또는 연구 단계의 마커에 대해서는 성능이나 검출의 방법이 구체적으로 나타내어져 있지 않기 때문에 이들을 이용했을 경우에는 건상체를 식도암 환자로 오검출하는 것에 의한 쓸데없는 추가 검사의 실시나, 식도암 환자를 못보고 넘기는 것에 의한 치료 기회의 면실이 일어날 가능성이 있다. 또한, 수십개~수백개로 이루어지는 miRNA를 측정하는 것은 검사 비용을 증대시키기 때문에 건강진단과 같은 대규모인 스크리닝에는 사용하기 어렵다. 또한, 종양 마커를 측정하기 위해서 식도 조직을 채취하는 것은 환자에레 부여하는 침습성이 높아 바람직하지 않기 때문에 저침습으로 채취할 수 있는 혈액으로부터의 검출이 가능하며, 또한 식도암 환자를 식도암 환자로서, 또한 건상체를 건상체로서 정확하게 판별할 수 있는 정밀도가 높은 식도암 마커가 요구된다. 특히, 식도암은 조기에 발견하여 치료함으로써 생존율을 대폭 향상할 수 있고, 또한 치료 선택에 있어서도 환자에게 부담이 적은 내시경 치료나 광선역학적 치료가 적응에 가능하게 되는 점에서 진행도가 낮은 식도암에서도 검출할 수 있는 감도의 높은 식도암 마커가 요망되어 있다.
본 발명자들은 상기 과제를 해결하기 위해서 예의 검토한 결과 혈액으로부터 식도암의 검출 마커에 사용 가능한 수개의 유전자를 발견하고, 이것에 특이적으로 결합 가능한 핵산을 사용함으로써 식도암을 유의하게 검출할 수 있는 것을 발견하여 본 발명을 완성하기에 이르렀다.
<발명의 개요>
즉, 본 발명은 이하의 특징을 갖는다.
(1) 식도암 마커인 miR-204-3p, miR-1247-3p, miR-6875-5p, miR-6857-5p, miR-6726-5p, miR-3188, miR-8069, miR-4257, miR-1343-3p, miR-7108-5p, miR-6825-5p, miR-7641, miR-3185, miR-4746-3p, miR-6791-5p, miR-6893-5p, miR-4433b-3p, miR-3135b, miR-6781-5p, miR-1908-5p, miR-4792, miR-7845-5p, miR-4417, miR-3184-5p, miR-1225-5p, miR-1231, miR-1225-3p, miR-150-3p, miR-4433-3p, miR-6125, miR-4513, miR-6787-5p, miR-6784-5p, miR-615-5p, miR-6765-3p, miR-5572, miR-6842-5p, miR-8063, miR-6780b-5p, miR-187-5p, miR-128-1-5p, miR-6729-5p, miR-6741-5p, miR-6757-5p, miR-7110-5p, miR-7975, miR-1233-5p, miR-6845-5p, miR-3937, miR-4467, miR-7109-5p, miR-6088, miR-6782-5p, miR-5195-3p, miR-4454, miR-6724-5p, miR-8072, miR-4516, miR-6756-5p, miR-4665-3p, miR-6826-5p, miR-6820-5p, miR-6887-5p, miR-3679-5p, miR-7847-3p, miR-6721-5p, miR-3622a-5p, miR-939-5p, miR-602, miR-7977, miR-6749-5p, miR-1914-3p, miR-4651, miR-4695-5p, miR-6848-5p, miR-1228-3p, miR-642b-3p, miR-6746-5p, miR-3620-5p, miR-3131, miR-6732-5p, miR-7113-3p, miR-23a-3p, miR-3154, miR-4723-5p, miR-3663-3p, miR-4734, miR-6816-5p, miR-4442, miR-4476, miR-423-5p, miR-1249, miR-6515-3p, miR-887-3p, miR-4741, miR-6766-3p, miR-4673, miR-6779-5p, miR-4706, miR-1268b, miR-4632-5p, miR-3197, miR-6798-5p, miR-711, miR-6840-3p, miR-6763-5p, miR-6727-5p, miR-371a-5p, miR-6824-5p, miR-4648, miR-1227-5p, miR-564, miR-3679-3p, miR-2861, miR-6737-5p, miR-4725-3p, miR-6716-5p, miR-4675, miR-1915-3p, miR-671-5p, miR-3656, miR-6722-3p, miR-4707-5p, miR-4449, miR-1202, miR-4649-5p, miR-744-5p, miR-642a-3p, miR-451a, miR-6870-5p, miR-4443, miR-6808-5p, miR-4728-5p, miR-937-5p, miR-135a-3p, miR-663b, miR-1343-5p, miR-6822-5p, miR-6803-5p, miR-6805-3p, miR-128-2-5p, miR-4640-5p, miR-1469, miR-92a-2-5p, miR-3940-5p, miR-4281, miR-1260b, miR-4758-5p, miR-1915-5p, miR-5001-5p, miR-4286, miR-6126, miR-6789-5p, miR-4459, miR-1268a, miR-6752-5p, miR-6131, miR-6800-5p, miR-4532, miR-6872-3p, miR-718, miR-6769a-5p, miR-4707-3p, miR-6765-5p, miR-4739, miR-4525, miR-4270, miR-4534, miR-6785-5p, miR-6850-5p, miR-4697-5p, miR-1260a, miR-4486, miR-6880-5p, miR-6802-5p, miR-6861-5p, miR-92b-5p, miR-1238-5p, miR-6851-5p, miR-7704, miR-149-3p, miR-4689, miR-4688, miR-125a-3p, miR-23b-3p, miR-614, miR-1913, miR-16-5p, miR-6717-5p, miR-3648, miR-3162-5p, miR-1909-3p, miR-8073, miR-6769b-5p, miR-6836-3p, miR-4484, miR-6819-5p 및 miR-6794-5p로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합 가능한 핵산을 포함하는 식도암의 검출용 키트.
(2) (1)에 있어서, miR-204-3p가 hsa-miR-204-3p이며, miR-1247-3p가 hsa-miR-1247-3p이며, miR-6875-5p가 hsa-miR-6875-5p이며, miR-6857-5p가 hsa-miR-6857-5p이며, miR-6726-5p가 hsa-miR-6726-5p이며, miR-3188이 hsa-miR-3188이며, miR-8069가 hsa-miR-8069이며, miR-4257이 hsa-miR-4257이며, miR-1343-3p가 hsa-miR-1343-3p이며, miR-7108-5p가 hsa-miR-7108-5p이며, miR-6825-5p가 hsa-miR-6825-5p이며, miR-7641이 hsa-miR-7641이며, miR-3185가 hsa-miR-3185이며, miR-4746-3p가 hsa-miR-4746-3p이며, miR-6791-5p가 hsa-miR-6791-5p이며, miR-6893-5p가 hsa-miR-6893-5p이며, miR-4433b-3p가 hsa-miR-4433b-3p이며, miR-3135b가 hsa-miR-3135b이며, miR-6781-5p가 hsa-miR-6781-5p이며, miR-1908-5p가 hsa-miR-1908-5p이며, miR-4792가 hsa-miR-4792이며, miR-7845-5p가 hsa-miR-7845-5p이며, miR-4417이 hsa-miR-4417이며, miR-3184-5p가 hsa-miR-3184-5p이며, miR-1225-5p가 hsa-miR-1225-5p이며, miR-1231이 hsa-miR-1231이며, miR-1225-3p가 hsa-miR-1225-3p이며, miR-150-3p가 hsa-miR-150-3p이며, miR-4433-3p가 hsa-miR-4433-3p이며, miR-6125가 hsa-miR-6125이며, miR-4513이 hsa-miR-4513이며, miR-6787-5p가 hsa-miR-6787-5p이며, miR-6784-5p가 hsa-miR-6784-5p이며, miR-615-5p가 hsa-miR-615-5p이며, miR-6765-3p가 hsa-miR-6765-3p이며, miR-5572가 hsa-miR-5572이며, miR-6842-5p가 hsa-miR-6842-5p이며, miR-8063이 hsa-miR-8063이며, miR-6780b-5p가 hsa-miR-6780b-5p이며, miR-187-5p가 hsa-miR-187-5p이며, miR-128-1-5p가 hsa-miR-128-1-5p이며, miR-6729-5p가 hsa-miR-6729-5p이며, miR-6741-5p가 hsa-miR-6741-5p이며, miR-6757-5p가 hsa-miR-6757-5p이며, miR-7110-5p가 hsa-miR-7110-5p이며, miR-7975가 hsa-miR-7975이며, miR-1233-5p가 hsa-miR-1233-5p이며, miR-6845-5p가 hsa-miR-6845-5p이며, miR-3937이 hsa-miR-3937이며, miR-4467이 hsa-miR-4467이며, miR-7109-5p가 hsa-miR-7109-5p이며, miR-6088이 hsa-miR-6088이며, miR-6782-5p가 hsa-miR-6782-5p이며, miR-5195-3p가 hsa-miR-5195-3p이며, miR-4454가 hsa-miR-4454이며, miR-6724-5p가 hsa-miR-6724-5p이며, miR-8072가 hsa-miR-8072이며, miR-4516이 hsa-miR-4516이며, miR-6756-5p가 hsa-miR-6756-5p이며, miR-4665-3p가 hsa-miR-4665-3p이며, miR-6826-5p가 hsa-miR-6826-5p이며, miR-6820-5p가 hsa-miR-6820-5p이며, miR-6887-5p가 hsa-miR-6887-5p이며, miR-3679-5p가 hsa-miR-3679-5p이며, miR-7847-3p가 hsa-miR-7847-3p이며, miR-6721-5p가 hsa-miR-6721-5p이며, miR-3622a-5p가 hsa-miR-3622a-5p이며, miR-939-5p가 hsa-miR-939-5p이며, miR-602가 hsa-miR-602이며, miR-7977이 hsa-miR-7977이며, miR-6749-5p가 hsa-miR-6749-5p이며, miR-1914-3p가 hsa-miR-1914-3p이며, miR-4651이 hsa-miR-4651이며, miR-4695-5p가 hsa-miR-4695-5p이며, miR-6848-5p가 hsa-miR-6848-5p이며, miR-1228-3p가 hsa-miR-1228-3p이며, miR-642b-3p가 hsa-miR-642b-3p이며, miR-6746-5p가 hsa-miR-6746-5p이며, miR-3620-5p가 hsa-miR-3620-5p이며, miR-3131이 hsa-miR-3131이며, miR-6732-5p가 hsa-miR-6732-5p이며, miR-7113-3p가 hsa-miR-7113-3p이며, miR-23a-3p가 hsa-miR-23a-3p이며, miR-3154가 hsa-miR-3154이며, miR-4723-5p가 hsa-miR-4723-5p이며, miR-3663-3p가 hsa-miR-3663-3p이며, miR-4734가 hsa-miR-4734이며, miR-6816-5p가 hsa-miR-6816-5p이며, miR-4442가 hsa-miR-4442이며, miR-4476이 hsa-miR-4476이며, miR-423-5p가 hsa-miR-423-5p이며, miR-1249가 hsa-miR-1249이며, miR-6515-3p가 hsa-miR-6515-3p이며, miR-887-3p가 hsa-miR-887-3p이며, miR-4741이 hsa-miR-4741이며, miR-6766-3p가 hsa-miR-6766-3p이며, miR-4673이 hsa-miR-4673이며, miR-6779-5p가 hsa-miR-6779-5p이며, miR-4706이 hsa-miR-4706이며, miR-1268b가 hsa-miR-1268b이며, miR-4632-5p가 hsa-miR-4632-5p이며, miR-3197이 hsa-miR-3197이며, miR-6798-5p가 hsa-miR-6798-5p이며, miR-711이 hsa-miR-711이며, miR-6840-3p가 hsa-miR-6840-3p이며, miR-6763-5p가 hsa-miR-6763-5p이며, miR-6727-5p가 hsa-miR-6727-5p이며, miR-371a-5p가 hsa-miR-371a-5p이며, miR-6824-5p가 hsa-miR-6824-5p이며, miR-4648이 hsa-miR-4648이며, miR-1227-5p가 hsa-miR-1227-5p이며, miR-564가 hsa-miR-564이며, miR-3679-3p가 hsa-miR-3679-3p이며, miR-2861이 hsa-miR-2861이며, miR-6737-5p가 hsa-miR-6737-5p이며, miR-4725-3p가 hsa-miR-4725-3p이며, miR-6716-5p가 hsa-miR-6716-5p이며, miR-4675가 hsa-miR-4675이며, miR-1915-3p가 hsa-miR-1915-3p이며, miR-671-5p가 hsa-miR-671-5p이며, miR-3656이 hsa-miR-3656이며, miR-6722-3p가 hsa-miR-6722-3p이며, miR-4707-5p가 hsa-miR-4707-5p이며, miR-4449가 hsa-miR-4449이며, miR-1202가 hsa-miR-1202이며, miR-4649-5p가 hsa-miR-4649-5p이며, miR-744-5p가 hsa-miR-744-5p이며, miR-642a-3p가 hsa-miR-642a-3p이며, miR-451a가 hsa-miR-451a이며, miR-6870-5p가 hsa-miR-6870-5p이며, miR-4443이 hsa-miR-4443이며, miR-6808-5p가 hsa-miR-6808-5p이며, miR-4728-5p가 hsa-miR-4728-5p이며, miR-937-5p가 hsa-miR-937-5p이며, miR-135a-3p가 hsa-miR-135a-3p이며, miR-663b가 hsa-miR-663b이며, miR-1343-5p가 hsa-miR-1343-5p이며, miR-6822-5p가 hsa-miR-6822-5p이며, miR-6803-5p가 hsa-miR-6803-5p이며, miR-6805-3p가 hsa-miR-6805-3p이며, miR-128-2-5p가 hsa-miR-128-2-5p이며, miR-4640-5p가 hsa-miR-4640-5p이며, miR-1469가 hsa-miR-1469이며, miR-92a-2-5p가 hsa-miR-92a-2-5p이며, miR-3940-5p가 hsa-miR-3940-5p이며, miR-4281이 hsa-miR-4281이며, miR-1260b가 hsa-miR-1260b이며, miR-4758-5p가 hsa-miR-4758-5p이며, miR-1915-5p가 hsa-miR-1915-5p이며, miR-5001-5p가 hsa-miR-5001-5p이며, miR-4286이 hsa-miR-4286이며, miR-6126이 hsa-miR-6126이며, miR-6789-5p가 hsa-miR-6789-5p이며, miR-4459가 hsa-miR-4459이며, miR-1268a가 hsa-miR-1268a이며, miR-6752-5p가 hsa-miR-6752-5p이며, miR-6131이 hsa-miR-6131이며, miR-6800-5p가 hsa-miR-6800-5p이며, miR-4532가 hsa-miR-4532이며, miR-6872-3p가 hsa-miR-6872-3p이며, miR-718이 hsa-miR-718이며, miR-6769a-5p가 hsa-miR-6769a-5p이며, miR-4707-3p가 hsa-miR-4707-3p이며, miR-6765-5p가 hsa-miR-6765-5p이며, miR-4739가 hsa-miR-4739이며, miR-4525가 hsa-miR-4525이며, miR-4270이 hsa-miR-4270이며, miR-4534가 hsa-miR-4534이며, miR-6785-5p가 hsa-miR-6785-5p이며, miR-6850-5p가 hsa-miR-6850-5p이며, miR-4697-5p가 hsa-miR-4697-5p이며, miR-1260a가 hsa-miR-1260a이며, miR-4486이 hsa-miR-4486이며, miR-6880-5p가 hsa-miR-6880-5p이며, miR-6802-5p가 hsa-miR-6802-5p이며, miR-6861-5p가 hsa-miR-6861-5p이며, miR-92b-5p가 hsa-miR-92b-5p이며, miR-1238-5p가 hsa-miR-1238-5p이며, miR-6851-5p가 hsa-miR-6851-5p이며, miR-7704가 hsa-miR-7704이며, miR-149-3p가 hsa-miR-149-3p이며, miR-4689가 hsa-miR-4689이며, miR-4688이 hsa-miR-4688이며, miR-125a-3p가 hsa-miR-125a-3p이며, miR-23b-3p가 hsa-miR-23b-3p이며, miR-614가 hsa-miR-614이며, miR-1913이 hsa-miR-1913이며, miR-16-5p가 hsa-miR-16-5p이며, miR-6717-5p가 hsa-miR-6717-5p이며, miR-3648이 hsa-miR-3648이며, miR-3162-5p가 hsa-miR-3162-5p이며, miR-1909-3p가 hsa-miR-1909-3p이며, miR-8073이 hsa-miR-8073이며, miR-6769b-5p가 hsa-miR-6769b-5p이며, miR-6836-3p가 hsa-miR-6836-3p이며, miR-4484가 hsa-miR-4484이며, miR-6819-5p가 hsa-miR-6819-5p이며, 및 miR-6794-5p가 hsa-miR-6794-5p인 키트.
(3) (1) 또는 (2)에 있어서, 상기 핵산이 하기 (a)~(e)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
(a) 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(b) 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(c) 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(d) 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(e) 상기 (a)~(d) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드
로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드인 키트.
(4) (1) 내지 (3) 중 어느 하나에 있어서, 상기 키트가 별도의 식도암 마커인 miR-575 및 miR-24-3p로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합 가능한 핵산을 더 포함하는 키트.
(5) (4)에 있어서, miR-575가 hsa-miR-575이며, miR-24-3p가 hsa-miR-24-3p인 키트.
(6) (4) 또는 (5)에 있어서, 상기 핵산이 하기 (f)~(j)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
(f) 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(g) 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(h) 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(i) 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(j) 상기 (f)~(i) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드
로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드인 키트.
(7) (1) 내지 (6) 중 어느 하나에 있어서, 상기 키트가 별도의 식도암 마커인 miR-675-5p, miR-486-3p, miR-6777-5p, miR-4497, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-4731-5p, miR-6889-5p, miR-6786-5p, miR-92a-3p, miR-4294, miR-4763-3p, miR-6076, miR-663a, miR-760, miR-4667-5p, miR-6090, miR-4730, miR-7106-5p, miR-3196, miR-5698, miR-6087, miR-4665-5p, miR-8059 및 miR-6879-5p로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합 가능한 핵산을 더 포함하는 키트.
(8) (7)에 있어서, miR-675-5p가 hsa-miR-675-5p이며, miR-486-3p가 hsa-miR-486-3p이며, miR-6777-5p가 hsa-miR-6777-5p이며, miR-4497이 hsa-miR-4497이며, miR-296-3p가 hsa-miR-296-3p이며, miR-6738-5p가 hsa-miR-6738-5p이며, miR-4731-5p가 hsa-miR-4731-5p이며, miR-6889-5p가 hsa-miR-6889-5p이며, miR-6786-5p가 hsa-miR-6786-5p이며, miR-92a-3p가 hsa-miR-92a-3p이며, miR-4294가 hsa-miR-4294이며, miR-4763-3p가 hsa-miR-4763-3p이며, miR-6076이 hsa-miR-6076이며, miR-663a가 hsa-miR-663a이며, miR-760이 hsa-miR-760이며, miR-4667-5p가 hsa-miR-4667-5p이며, miR-6090이 hsa-miR-6090이며, miR-4730이 hsa-miR-4730이며, miR-7106-5p가 hsa-miR-7106-5p이며, miR-3196이 hsa-miR-3196이며, miR-5698이 hsa-miR-5698이며, miR-6087이 hsa-miR-6087이며, miR-4665-5p가 hsa-miR-4665-5p이며, miR-8059가 hsa-miR-8059이며, 및 miR-6879-5p가 hsa-miR-6879-5p인 키트.
(9) (7) 또는(8)에 있어서, 상기 핵산이 하기 (k)~(o)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
(k) 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(l) 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(m) 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(n) 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(o) 상기 (k)~(n) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드
로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드인 키트.
(10) (1) 내지 (9) 중 어느 하나에 있어서, 상기 키트가 (1) 또는 (2)에 기재된 모든 식도암 마커로부터 선택되는 적어도 2개의 폴리뉴클레오티드의 각각과 특이적으로 결합 가능한 적어도 2개의 핵산을 포함하는 키트.
(11) 식도암 마커인 miR-204-3p, miR-1247-3p, miR-6875-5p, miR-6857-5p, miR-6726-5p, miR-3188, miR-8069, miR-4257, miR-1343-3p, miR-7108-5p, miR-6825-5p, miR-7641, miR-3185, miR-4746-3p, miR-6791-5p, miR-6893-5p, miR-4433b-3p, miR-3135b, miR-6781-5p, miR-1908-5p, miR-4792, miR-7845-5p, miR-4417, miR-3184-5p, miR-1225-5p, miR-1231, miR-1225-3p, miR-150-3p, miR-4433-3p, miR-6125, miR-4513, miR-6787-5p, miR-6784-5p, miR-615-5p, miR-6765-3p, miR-5572, miR-6842-5p, miR-8063, miR-6780b-5p, miR-187-5p, miR-128-1-5p, miR-6729-5p, miR-6741-5p, miR-6757-5p, miR-7110-5p, miR-7975, miR-1233-5p, miR-6845-5p, miR-3937, miR-4467, miR-7109-5p, miR-6088, miR-6782-5p, miR-5195-3p, miR-4454, miR-6724-5p, miR-8072, miR-4516, miR-6756-5p, miR-4665-3p, miR-6826-5p, miR-6820-5p, miR-6887-5p, miR-3679-5p, miR-7847-3p, miR-6721-5p, miR-3622a-5p, miR-939-5p, miR-602, miR-7977, miR-6749-5p, miR-1914-3p, miR-4651, miR-4695-5p, miR-6848-5p, miR-1228-3p, miR-642b-3p, miR-6746-5p, miR-3620-5p, miR-3131, miR-6732-5p, miR-7113-3p, miR-23a-3p, miR-3154, miR-4723-5p, miR-3663-3p, miR-4734, miR-6816-5p, miR-4442, miR-4476, miR-423-5p, miR-1249, miR-6515-3p, miR-887-3p, miR-4741, miR-6766-3p, miR-4673, miR-6779-5p, miR-4706, miR-1268b, miR-4632-5p, miR-3197, miR-6798-5p, miR-711, miR-6840-3p, miR-6763-5p, miR-6727-5p, miR-371a-5p, miR-6824-5p, miR-4648, miR-1227-5p, miR-564, miR-3679-3p, miR-2861, miR-6737-5p, miR-4725-3p, miR-6716-5p, miR-4675, miR-1915-3p, miR-671-5p, miR-3656, miR-6722-3p, miR-4707-5p, miR-4449, miR-1202, miR-4649-5p, miR-744-5p, miR-642a-3p, miR-451a, miR-6870-5p, miR-4443, miR-6808-5p, miR-4728-5p, miR-937-5p, miR-135a-3p, miR-663b, miR-1343-5p, miR-6822-5p, miR-6803-5p, miR-6805-3p, miR-128-2-5p, miR-4640-5p, miR-1469, miR-92a-2-5p, miR-3940-5p, miR-4281, miR-1260b, miR-4758-5p, miR-1915-5p, miR-5001-5p, miR-4286, miR-6126, miR-6789-5p, miR-4459, miR-1268a, miR-6752-5p, miR-6131, miR-6800-5p, miR-4532, miR-6872-3p, miR-718, miR-6769a-5p, miR-4707-3p, miR-6765-5p, miR-4739, miR-4525, miR-4270, miR-4534, miR-6785-5p, miR-6850-5p, miR-4697-5p, miR-1260a, miR-4486, miR-6880-5p, miR-6802-5p, miR-6861-5p, miR-92b-5p, miR-1238-5p, miR-6851-5p, miR-7704, miR-149-3p, miR-4689, miR-4688, miR-125a-3p, miR-23b-3p, miR-614, miR-1913, miR-16-5p, miR-6717-5p, miR-3648, miR-3162-5p, miR-1909-3p, miR-8073, miR-6769b-5p, miR-6836-3p, miR-4484, miR-6819-5p 및 miR-6794-5p로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합 가능한 핵산을 포함하는 식도암의 검출용 디바이스.
(12) (11)에 있어서, miR-204-3p가 hsa-miR-204-3p이며, miR-1247-3p가 hsa-miR-1247-3p이며, miR-6875-5p가 hsa-miR-6875-5p이며, miR-6857-5p가 hsa-miR-6857-5p이며, miR-6726-5p가 hsa-miR-6726-5p이며, miR-3188이 hsa-miR-3188이며, miR-8069가 hsa-miR-8069이며, miR-4257이 hsa-miR-4257이며, miR-1343-3p가 hsa-miR-1343-3p이며, miR-7108-5p가 hsa-miR-7108-5p이며, miR-6825-5p가 hsa-miR-6825-5p이며, miR-7641이 hsa-miR-7641이며, miR-3185가 hsa-miR-3185이며, miR-4746-3p가 hsa-miR-4746-3p이며, miR-6791-5p가 hsa-miR-6791-5p이며, miR-6893-5p가 hsa-miR-6893-5p이며, miR-4433b-3p가 hsa-miR-4433b-3p이며, miR-3135b가 hsa-miR-3135b이며, miR-6781-5p가 hsa-miR-6781-5p이며, miR-1908-5p가 hsa-miR-1908-5p이며, miR-4792가 hsa-miR-4792이며, miR-7845-5p가 hsa-miR-7845-5p이며, miR-4417이 hsa-miR-4417이며, miR-3184-5p가 hsa-miR-3184-5p이며, miR-1225-5p가 hsa-miR-1225-5p이며, miR-1231이 hsa-miR-1231이며, miR-1225-3p가 hsa-miR-1225-3p이며, miR-150-3p가 hsa-miR-150-3p이며, miR-4433-3p가 hsa-miR-4433-3p이며, miR-6125가 hsa-miR-6125이며, miR-4513이 hsa-miR-4513이며, miR-6787-5p가 hsa-miR-6787-5p이며, miR-6784-5p가 hsa-miR-6784-5p이며, miR-615-5p가 hsa-miR-615-5p이며, miR-6765-3p가 hsa-miR-6765-3p이며, miR-5572가 hsa-miR-5572이며, miR-6842-5p가 hsa-miR-6842-5p이며, miR-8063이 hsa-miR-8063이며, miR-6780b-5p가 hsa-miR-6780b-5p이며, miR-187-5p가 hsa-miR-187-5p이며, miR-128-1-5p가 hsa-miR-128-1-5p이며, miR-6729-5p가 hsa-miR-6729-5p이며, miR-6741-5p가 hsa-miR-6741-5p이며, miR-6757-5p가 hsa-miR-6757-5p이며, miR-7110-5p가 hsa-miR-7110-5p이며, miR-7975가 hsa-miR-7975이며, miR-1233-5p가 hsa-miR-1233-5p이며, miR-6845-5p가 hsa-miR-6845-5p이며, miR-3937이 hsa-miR-3937이며, miR-4467이 hsa-miR-4467이며, miR-7109-5p가 hsa-miR-7109-5p이며, miR-6088이 hsa-miR-6088이며, miR-6782-5p가 hsa-miR-6782-5p이며, miR-5195-3p가 hsa-miR-5195-3p이며, miR-4454가 hsa-miR-4454이며, miR-6724-5p가 hsa-miR-6724-5p이며, miR-8072가 hsa-miR-8072이며, miR-4516이 hsa-miR-4516이며, miR-6756-5p가 hsa-miR-6756-5p이며, miR-4665-3p가 hsa-miR-4665-3p이며, miR-6826-5p가 hsa-miR-6826-5p이며, miR-6820-5p가 hsa-miR-6820-5p이며, miR-6887-5p가 hsa-miR-6887-5p이며, miR-3679-5p가 hsa-miR-3679-5p이며, miR-7847-3p가 hsa-miR-7847-3p이며, miR-6721-5p가 hsa-miR-6721-5p이며, miR-3622a-5p가 hsa-miR-3622a-5p이며, miR-939-5p가 hsa-miR-939-5p이며, miR-602가 hsa-miR-602이며, miR-7977이 hsa-miR-7977이며, miR-6749-5p가 hsa-miR-6749-5p이며, miR-1914-3p가 hsa-miR-1914-3p이며, miR-4651이 hsa-miR-4651이며, miR-4695-5p가 hsa-miR-4695-5p이며, miR-6848-5p가 hsa-miR-6848-5p이며, miR-1228-3p가 hsa-miR-1228-3p이며, miR-642b-3p가 hsa-miR-642b-3p이며, miR-6746-5p가 hsa-miR-6746-5p이며, miR-3620-5p가 hsa-miR-3620-5p이며, miR-3131이 hsa-miR-3131이며, miR-6732-5p가 hsa-miR-6732-5p이며, miR-7113-3p가 hsa-miR-7113-3p이며, miR-23a-3p가 hsa-miR-23a-3p이며, miR-3154가 hsa-miR-3154이며, miR-4723-5p가 hsa-miR-4723-5p이며, miR-3663-3p가 hsa-miR-3663-3p이며, miR-4734가 hsa-miR-4734이며, miR-6816-5p가 hsa-miR-6816-5p이며, miR-4442가 hsa-miR-4442이며, miR-4476이 hsa-miR-4476이며, miR-423-5p가 hsa-miR-423-5p이며, miR-1249가 hsa-miR-1249이며, miR-6515-3p가 hsa-miR-6515-3p이며, miR-887-3p가 hsa-miR-887-3p이며, miR-4741이 hsa-miR-4741이며, miR-6766-3p가 hsa-miR-6766-3p이며, miR-4673이 hsa-miR-4673이며, miR-6779-5p가 hsa-miR-6779-5p이며, miR-4706이 hsa-miR-4706이며, miR-1268b가 hsa-miR-1268b이며, miR-4632-5p가 hsa-miR-4632-5p이며, miR-3197이 hsa-miR-3197이며, miR-6798-5p가 hsa-miR-6798-5p이며, miR-711이 hsa-miR-711이며, miR-6840-3p가 hsa-miR-6840-3p이며, miR-6763-5p가 hsa-miR-6763-5p이며, miR-6727-5p가 hsa-miR-6727-5p이며, miR-371a-5p가 hsa-miR-371a-5p이며, miR-6824-5p가 hsa-miR-6824-5p이며, miR-4648이 hsa-miR-4648이며, miR-1227-5p가 hsa-miR-1227-5p이며, miR-564가 hsa-miR-564이며, miR-3679-3p가 hsa-miR-3679-3p이며, miR-2861이 hsa-miR-2861이며, miR-6737-5p가 hsa-miR-6737-5p이며, miR-4725-3p가 hsa-miR-4725-3p이며, miR-6716-5p가 hsa-miR-6716-5p이며, miR-4675가 hsa-miR-4675이며, miR-1915-3p가 hsa-miR-1915-3p이며, miR-671-5p가 hsa-miR-671-5p이며, miR-3656이 hsa-miR-3656이며, miR-6722-3p가 hsa-miR-6722-3p이며, miR-4707-5p가 hsa-miR-4707-5p이며, miR-4449가 hsa-miR-4449이며, miR-1202가 hsa-miR-1202이며, miR-4649-5p가 hsa-miR-4649-5p이며, miR-744-5p가 hsa-miR-744-5p이며, miR-642a-3p가 hsa-miR-642a-3p이며, miR-451a가 hsa-miR-451a이며, miR-6870-5p가 hsa-miR-6870-5p이며, miR-4443이 hsa-miR-4443이며, miR-6808-5p가 hsa-miR-6808-5p이며, miR-4728-5p가 hsa-miR-4728-5p이며, miR-937-5p가 hsa-miR-937-5p이며, miR-135a-3p가 hsa-miR-135a-3p이며, miR-663b가 hsa-miR-663b이며, miR-1343-5p가 hsa-miR-1343-5p이며, miR-6822-5p가 hsa-miR-6822-5p이며, miR-6803-5p가 hsa-miR-6803-5p이며, miR-6805-3p가 hsa-miR-6805-3p이며, miR-128-2-5p가 hsa-miR-128-2-5p이며, miR-4640-5p가 hsa-miR-4640-5p이며, miR-1469가 hsa-miR-1469이며, miR-92a-2-5p가 hsa-miR-92a-2-5p이며, miR-3940-5p가 hsa-miR-3940-5p이며, miR-4281이 hsa-miR-4281이며, miR-1260b가 hsa-miR-1260b이며, miR-4758-5p가 hsa-miR-4758-5p이며, miR-1915-5p가 hsa-miR-1915-5p이며, miR-5001-5p가 hsa-miR-5001-5p이며, miR-4286이 hsa-miR-4286이며, miR-6126이 hsa-miR-6126이며, miR-6789-5p가 hsa-miR-6789-5p이며, miR-4459가 hsa-miR-4459이며, miR-1268a가 hsa-miR-1268a이며, miR-6752-5p가 hsa-miR-6752-5p이며, miR-6131이 hsa-miR-6131이며, miR-6800-5p가 hsa-miR-6800-5p이며, miR-4532가 hsa-miR-4532이며, miR-6872-3p가 hsa-miR-6872-3p이며, miR-718이 hsa-miR-718이며, miR-6769a-5p가 hsa-miR-6769a-5p이며, miR-4707-3p가 hsa-miR-4707-3p이며, miR-6765-5p가 hsa-miR-6765-5p이며, miR-4739가 hsa-miR-4739이며, miR-4525가 hsa-miR-4525이며, miR-4270이 hsa-miR-4270이며, miR-4534가 hsa-miR-4534이며, miR-6785-5p가 hsa-miR-6785-5p이며, miR-6850-5p가 hsa-miR-6850-5p이며, miR-4697-5p가 hsa-miR-4697-5p이며, miR-1260a가 hsa-miR-1260a이며, miR-4486이 hsa-miR-4486이며, miR-6880-5p가 hsa-miR-6880-5p이며, miR-6802-5p가 hsa-miR-6802-5p이며, miR-6861-5p가 hsa-miR-6861-5p이며, miR-92b-5p가 hsa-miR-92b-5p이며, miR-1238-5p가 hsa-miR-1238-5p이며, miR-6851-5p가 hsa-miR-6851-5p이며, miR-7704가 hsa-miR-7704이며, miR-149-3p가 hsa-miR-149-3p이며, miR-4689가 hsa-miR-4689이며, miR-4688이 hsa-miR-4688이며, miR-125a-3p가 hsa-miR-125a-3p이며, miR-23b-3p가 hsa-miR-23b-3p이며, miR-614가 hsa-miR-614이며, miR-1913이 hsa-miR-1913이며, miR-16-5p가 hsa-miR-16-5p이며, miR-6717-5p가 hsa-miR-6717-5p이며, miR-3648이 hsa-miR-3648이며, miR-3162-5p가 hsa-miR-3162-5p이며, miR-1909-3p가 hsa-miR-1909-3p이며, miR-8073이 hsa-miR-8073이며, miR-6769b-5p가 hsa-miR-6769b-5p이며, miR-6836-3p가 hsa-miR-6836-3p이며, miR-4484가 hsa-miR-4484이며, miR-6819-5p가 hsa-miR-6819-5p이며, 및 miR-6794-5p가 hsa-miR-6794-5p인 디바이스.
(13) (11) 또는 (12)에 있어서, 상기 핵산이 하기 (a)~(e)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
(a) 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(b) 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(c) 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(d) 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(e) 상기 (a)~(d) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드
로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드인 디바이스.
(14) (11) 내지 (13) 중 어느 하나에 있어서, 상기 디바이스가 별도의 식도암 마커인 miR-575 및 miR-24-3p로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합 가능한 핵산을 더 포함하는 디바이스.
(15) (14)에 있어서, miR-575가 hsa-miR-575이며, miR-24-3p가 hsa-miR-24-3p인 디바이스.
(16) (14) 또는 (15)에 있어서, 상기 핵산이 하기 (f)~(j)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
(f) 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(g) 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(h) 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(i) 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(j) 상기 (f)~(i) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드
로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드인 디바이스.
(17) (11) 내지 (16) 중 어느 하나에 있어서, 상기 디바이스가 별도의 식도암 마커인 miR-675-5p, miR-486-3p, miR-6777-5p, miR-4497, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-4731-5p, miR-6889-5p, miR-6786-5p, miR-92a-3p, miR-4294, miR-4763-3p, miR-6076, miR-663a, miR-760, miR-4667-5p, miR-6090, miR-4730, miR-7106-5p, miR-3196, miR-5698, miR-6087, miR-4665-5p, miR-8059 및 miR-6879-5p로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합 가능한 핵산을 더 포함하는 디바이스.
(18) (17)에 있어서, miR-675-5p가 hsa-miR-675-5p이며, miR-486-3p가 hsa-miR-486-3p이며, miR-6777-5p가 hsa-miR-6777-5p이며, miR-4497이 hsa-miR-4497이며, miR-296-3p가 hsa-miR-296-3p이며, miR-6738-5p가 hsa-miR-6738-5p이며, miR-4731-5p가 hsa-miR-4731-5p이며, miR-6889-5p가 hsa-miR-6889-5p이며, miR-6786-5p가 hsa-miR-6786-5p이며, miR-92a-3p가 hsa-miR-92a-3p이며, miR-4294가 hsa-miR-4294이며, miR-4763-3p가 hsa-miR-4763-3p이며, miR-6076이 hsa-miR-6076이며, miR-663a가 hsa-miR-663a이며, miR-760이 hsa-miR-760이며, miR-4667-5p가 hsa-miR-4667-5p이며, miR-6090이 hsa-miR-6090이며, miR-4730이 hsa-miR-4730이며, miR-7106-5p가 hsa-miR-7106-5p이며, miR-3196이 hsa-miR-3196이며, miR-5698이 hsa-miR-5698이며, miR-6087이 hsa-miR-6087이며, miR-4665-5p가 hsa-miR-4665-5p이며, miR-8059가 hsa-miR-8059이며, 및 miR-6879-5p가 hsa-miR-6879-5p인 디바이스.
(19) (17) 또는 (18)에 있어서, 상기 핵산이 하기 (k)~(o)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
(k) 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(l) 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(m) 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(n) 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(o) 상기 (k)~(n) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드
로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드인 디바이스.
(20) (11) 내지 (19) 중 어느 하나에 있어서, 상기 디바이스가 하이브리다이제이션 기술에 의한 측정을 위한 디바이스인 디바이스.
(21) (20)에 있어서, 상기 하이브리다이제이션 기술이 핵산 어레이 기술인 디바이스.
(22) (11) 내지 (21) 중 어느 하나에 있어서, 상기 디바이스가 (11) 또는 (12)에 기재된 모든 식도암 마커로부터 선택되는 적어도 2개의 폴리뉴클레오티드의 각각과 특이적으로 결합 가능한 적어도 2개의 핵산을 포함하는 디바이스.
(23) (1) 내지 (10) 중 어느 하나에 기재된 키트 또는 (11) 내지 (22) 중 어느 하나에 기재된 디바이스를 사용하여 피험체의 검체에 있어서의 표적 핵산의 발현량을 측정하고, 상기 측정된 발현량과, 마찬가지로 측정된 건상체의 대조 발현량을 사용하여 피험체가 식도암에 이환되어 있는 것, 또는 식도암에 이환되어 있지 않은 것을 in vitro에서 평가하는 것을 포함하는 식도암의 검출 방법.
(24) (23)에 있어서, 상기 피험체가 인간인 방법.
(25) (23) 또는 (24)에 있어서, 상기 검체가 혈액, 혈청 또는 혈장인 방법.
<용어의 정의>
본 명세서 중에서 사용하는 용어는 이하의 정의를 갖는다.
뉴클레오티드, 폴리뉴클레오티드, DNA, RNA 등의 약호에 의한 표시는 「염기서열 또는 아미노산 서열을 포함하는 명세서 등의 작성을 위한 가이드라인」(일본국 특허청 편저) 및 당 기술분야에 있어서의 관용에 따르는 것으로 한다.
본 명세서에 있어서 「폴리뉴클레오티드」란 RNA, DNA, 및 RNA/DNA(키메라) 모두 포함하는 핵산에 대하여 사용된다. 또한, 상기 DNA에는 cDNA, 게놈DNA, 및 합성DNA 모두가 포함된다. 또한, 상기 RNA에는 total RNA, mRNA, rRNA, miRNA, siRNA, snoRNA, snRNA, 비코딩(non-coding)RNA 및 합성RNA 모두가 포함된다. 본 명세서에 있어서 「합성DNA」 및 「합성RNA」는 소정의 염기서열(천연형 서열 또는 비천연형 서열 중 어느 것이어도 좋음)에 의거하여, 예를 들면 자동핵산 합성기를 사용하여 인공적으로 제작된 DNA 및 RNA를 말한다. 본 명세서에 있어서 「비천연형 서열」은 광의의 의미로 사용하는 것을 의도하고 있고, 천연형 서열과 상이한, 예를 들면 1 이상의 뉴클레오티드의 치환, 결실, 삽입 및/또는 부가를 포함하는 서열(즉, 변이 서열), 1 이상의 수식 뉴클레오티드를 포함하는 서열(즉, 수식 서열) 등을 포함한다. 또한, 본 명세서에서는 폴리뉴클레오티드는 핵산과 호환적으로 사용된다.
본 명세서에 있어서 「단편」이란 폴리뉴클레오티드의 연속한 일부분의 염기서열을 갖는 폴리뉴클레오티드이며, 15염기 이상, 바람직하게는 17염기 이상, 보다 바람직하게는 19염기 이상의 길이를 갖는 것이 바람직하다.
본 명세서에 있어서 「유전자」란 RNA, 및 2본쇄 DNA뿐만 아니라 그것을 구성하는 정쇄(또는 센스쇄) 또는 상보쇄(또는 안티센스쇄) 등의 각 1본쇄 DNA를 포함하는 것을 의도하여 사용할 수 있다. 또한, 상기 길이에 의해 특별히 제한되는 것은 아니다. 따라서, 본 명세서에 있어서 「유전자」는 특별히 언급하지 않는 한, 인간게놈 DNA를 포함하는 2본쇄 DNA, cDNA를 포함하는 1본쇄 DNA(정쇄) 및 상기 정쇄와 상보적인 서열을 갖는 1본쇄 DNA(상보쇄), 마이크로RNA(miRNA), 및 이들의 단편, 및 그들의 전사산물 중 어느 것이나 포함한다. 또한, 상기 「유전자」는 특정 염기서열(또는 서열번호)로 나타내어지는 「유전자」뿐만 아니라 이들에 의해 코딩되는 RNA와 생물학적 기능이 동등한 RNA, 예를 들면 동족체(즉, 호몰로그 또는 오솔로그), 유전자다형 등의 변이체, 및 유도체를 코딩하는 「핵산」을 포함한다. 이러한 동족체, 변이체 또는 유도체를 코딩하는 「핵산」으로서는 구체적으로는 후에 기재한 스트린젠트한 조건 하에서 서열번호 1~700 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열의 상보서열과 하이브리다이징하는 염기서열을 갖는 「핵산」을 들 수 있다. 또한, 「유전자」는 기능 영역의 구별을 묻는 것은 아니고, 예를 들면 발현제어 영역, 코드 영역, 엑손 또는 인트론을 포함할 수 있다. 또한, 「유전자」는 세포에 포함되어 있어도 좋고, 세포 외로 방출되어 단독으로 존재하고 있어도 좋고, 또한 엑소좀이라고 불리는 소포에 내포된 상태에 있어도 좋다.
본 명세서에 있어서 「엑소좀」은 세포로부터 분비되는 지질2중막에 포함된 소포이다. 엑소좀은 다포 엔드솜으로부터 유래되고, 세포 외 환경으로 방출될 때에 RNA, DNA 등의 「유전자」나 단백질 등의 생체물질을 내부에 포함하는 경우가 있다. 엑소좀은 혈액, 혈청, 혈장, 림프액 등의 체액에 포함되는 것이 알려져 있다. 또한, 엑소좀은 일반적으로 「엑소좀」이라고 불리는 경우도 있다.
본 명세서에 있어서 「전사산물」이란 유전자의 DNA서열을 주형으로 하여 합성된 RNA를 말한다. RNA 폴리메라제가 유전자의 상류에 있는 프로모터로 불리는 부위에 결합하고, DNA의 염기서열에 상보적이 되도록 3'말단에 리보뉴클레오티드를 결합시켜 가는 형태로 RNA가 합성된다. 이 RNA에는 유전자 바로 그것뿐만 아니라 발현제어 영역, 코드 영역, 엑손 또는 인트론을 비롯한 전사 개시점으로부터 폴리A 서열의 말단에 이를 때까지의 모든 서열이 포함된다.
또한, 본 명세서에 있어서 「마이크로RNA(miRNA)」는 특별히 언급하지 않는 한, 헤어핀 모양 구조의 RNA 전구체로서 전사되고, RNase III 절단 활성을 갖는 dsRNA 절단 효소에 의해 절단되어 RISC라고 칭하는 단백질 복합체에 도입되고, mRNA의 번역 억제에 관여하는 15~25염기의 비코딩 RNA를 의도하여 사용된다.
또한, 본 명세서에서 사용하는 「miRNA」는 특정 염기서열(또는 서열번호)로 나타내어지는 「miRNA」뿐만 아니라 상기 「miRNA」의 전구체(pre-miRNA, pri-miRNA), 이들과 생물학적 기능이 동등한 miRNA, 예를 들면 동족체(즉, 호몰로그 또는 오솔로그), 유전자다형 등의 변이체, 및 유도체도 포함한다. 이러한 전구체, 동족체, 변이체 또는 유도체로서는 구체적으로는 miRBase release 20(http://www.mirbase.org/)에 의해 동정할 수 있고, 후에 기재한 스트린젠트한 조건 하에서 서열번호 1~700 중 어느 하나로 나타내어지는 어느 하나의 특정 염기서열의 상보서열과 하이브리다이징하는 염기서열을 갖는 「miRNA」를 들 수 있다. 또한, 본 명세서에서 사용하는 「miRNA」는 miR 유전자의 유전자산물이어도 좋고, 그러한 유전자산물은 성숙 miRNA(예를 들면, 상기와 같은 mRNA의 번역 억제에 관여하는 15~25염기 또는 19~25염기의 비코딩 RNA) 또는 miRNA 전구체(예를 들면, 상기와 같은 pre-miRNA 또는 pri-miRNA)를 포함한다.
본 명세서에 있어서 「프로브」란 유전자의 발현에 의해 발생한 RNA 또는 그로부터 유래되는 폴리뉴클레오티드를 특이적으로 검출하기 위해서 사용되는 폴리뉴클레오티드 및/또는 그에 상보적인 폴리뉴클레오티드를 포함한다.
본 명세서에 있어서 「프라이머」란 유전자의 발현에 의해 발생한 RNA 또는 그로부터 유래되는 폴리뉴클레오티드를 특이적으로 인식하여 증폭하는 폴리뉴클레오티드 및/또는 그에 상보적인 폴리뉴클레오티드를 포함한다. 여기에서 상보적인 폴리뉴클레오티드(상보쇄, 역쇄)란 서열번호 1~700 중 어느 하나에 의해 정의되는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 전장서열, 또는 그 부분서열(여기에서는 편의상 이것을 정쇄라고 칭함)에 대하여 A:T(U), G:C라는 염기쌍 관계에 의거하여 염기적으로 상보적인 관계에 있는 폴리뉴클레오티드를 의미한다. 단, 이러한 상보쇄는 대상으로 하는 정쇄의 염기서열과 완전히 상보서열을 형성하는 경우에 한정되지 않고, 대상으로 하는 정쇄와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징할 수 있을 정도의 상보 관계를 갖는 것이어도 좋다.
본 명세서에 있어서 「스트린젠트한 조건」이란 핵산 프로브가 다른 서열에 대한 보다 큰 정도(예를 들면, 백그라운드 측정값의 평균+백그라운드 측정값의 표준오차×2 이상의 측정값)로 그 표적서열에 대하여 하이브리다이징하는 조건을 말한다. 스트린젠트한 조건은 서열 의존성이며, 하이브리다이제이션이 행해지는 환경에 따라 상이하다. 하이브리다이제이션 및/또는 세정 조건의 스트린젠시를 제어함으로써 핵산 프로브에 대하여 100% 상보적인 표적서열이 동정될 수 있다. 「스트린젠트한 조건」의 구체예는 후술한다.
본 명세서에 있어서 「Tm값」이란 폴리뉴클레오티드의 2본쇄 부분이 1본쇄로 변성되고, 2본쇄와 1본쇄가 1:1의 비로 존재하는 온도를 의미한다.
본 명세서에 있어서 「변이체」란 핵산의 경우, 다형성, 돌연변이 등에 기인한 천연의 변이체 또는 서열번호 1~700 중 어느 하나의 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열, 또는 그 부분서열에 있어서 1 또는 2 이상의 염기의 결실, 치환, 부가 또는 삽입을 포함하는 변이체, 또는 상기 염기서열의 각각 또는 그 부분서열과 약 90% 이상, 약 95% 이상, 약 97% 이상, 약 98% 이상, 약 99% 이상의 동일성을 나타내는 변이체, 또는 상기 염기서열 또는 그 부분서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드 또는 올리고뉴클레오티드와 상기 정의된 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 핵산을 의미한다.
본 명세서에 있어서 「복수개」란 약 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3 또는 2개의 정수를 의미한다.
본 명세서에 있어서 변이체는 부위 특이적 돌연변이 유발법, PCR법을 이용한 돌연변이 도입법 등의 주지의 기술을 사용하여 제작할 수 있다.
본 명세서에 있어서 「동일성」은 상기 BLAST나 FASTA에 의한 단백질 또는 유전자의 검색 시스템을 사용하고, 갭을 도입하여 또는 갭을 도입하지 않고 결정할 수 있다(Zheng Zhang 외, 2000년, J.Comput.Biol., 7권, p203-214; Altschul, S.F.외, 1990년, Journal of Molecular Biology, 제 215 권, p403-410; Pearson, W.R. 외, 1988년, Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A., 제 85 권, p2444-2448).
본 명세서에 있어서 「유도체」란 수식 핵산, 비한정적으로, 예를 들면 형광단 등에 의한 라벨화 유도체, 수식 뉴클레오티드(예를 들면, 할로겐, 메틸 등의 알킬, 메톡시 등의 알콕시, 티오, 카르복시메틸 등의 기를 포함하는 뉴클레오티드 및 염기의 재구성, 2중결합의 포화, 탈아미노화, 산소 분자의 황 분자로의 치환 등을 받은 뉴클레오티드 등)를 포함하는 유도체, PNA(peptide nucleic acid; Nielsen, P.E. 외, 1991년, Science, 254권, p1497-500), LNA(locked nucleic acid; Obika, S. 외, 1998년, Tetrahedron Lett., 39권, p5401-5404) 등을 포함하는 것을 의미한다.
본 명세서에 있어서 상기 식도암 마커인 miRNA로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합 가능한 「핵산」은 합성 또는 조제된 핵산이며, 구체적으로는 「핵산 프로브」 또는 「프라이머」를 포함하고, 피험체 내의 식도암의 존재의 유무를 검출하기 위해서 또는 식도암의 이환의 유무, 이환의 정도, 식도암의 개선의 유무나 개선의 정도, 식도암의 치료에 대한 감수성을 진단하기 위해서 또는 식도암의 예방, 개선 또는 치료에 유용한 후보 물질을 스크리닝하기 위해서 직접 또는 간접적으로 이용된다. 이들에는 식도암의 이환에 관련하여 생체 내, 특히 혈액, 요 등의 체액 등의 검체에 있어서 서열번호 1~700 중 어느 하나로 나타내어지는 전사산물 또는 그 cDNA 합성 핵산을 특이적으로 인식하여 결합할 수 있는 뉴클레오티드, 올리고뉴클레오티드 및 폴리뉴클레오티드를 포함한다. 이들 뉴클레오티드, 올리고뉴클레오티드 및 폴리뉴클레오티드는 상기 성질에 의거하여 생체 내, 조직이나 세포 내 등에서 발현한 상기 유전자를 검출하기 위한 프로브로서, 또한 생체 내에서 발현한 상기 유전자를 증폭하기 위한 프라이머로서 유효하게 이용할 수 있다.
본 명세서에서 사용하는 「검출」이라는 용어는 검사, 측정, 검출 또는 판정 지원이라는 용어로 치환할 수 있다. 또한, 본 명세서에 있어서 「평가」라는 용어는 검사 결과 또는 측정 결과에 의거하여 진단 또는 평가를 지원하는 것을 포함하는 의미로 사용된다.
본 명세서에서 사용되는 「피험체」는 인간, 침팬지를 포함한 영장류, 개, 고양이 등의 애완동물, 소, 말, 양, 염소 등의 가축동물, 마우스, 래트 등의 설치 류등의 포유 동물을 의미한다. 또한, 「건상체」도 또한 이러한 포유동물이며, 검출하고자 하는 암, 즉 식도암에 이환되어 있지 않은 동물을 의미한다.
본 명세서에서 사용되는 「P」 또는 「P값」이란 통계학적 검정에 있어서 귀무가설 하에서 실제로 데이터로부터 계산된 통계량보다 극단적인 통계량이 관측될 확률을 나타낸다. 따라서, 「P」 또는 「P값」이 작을수록 비교대상 간에 유의차가 있는 것으로 간주된다.
본 명세서에 있어서 「감도」는 (진양성의 수)/(진양성의 수+위음성의 수)의 값을 의미한다. 감도가 높으면 식도암을 조기에 발견하는 것이 가능해져 완전한 암부의 절제나 재발률의 저하로 이어진다.
본 명세서에 있어서 「특이도」는 (진음성의 수)/(진음성의 수+위양성의 수)를 의미한다. 특이도가 높으면 건상체를 식도암 환자로 오판별하는 것에 의한 불필요한 추가 검사의 실시를 방지하여 환자 부담의 경감이나 의료비의 삭감으로 이어진다.
본 명세서에 있어서 「정밀도」는 (진양성의 수+진음성의 수)/(전체 증례수)의 값을 의미한다. 정밀도는 전체 검체에 대한 판별 결과가 옳았던 비율을 나타내고 있으며, 검출 성능을 평가하는 제 1 지표가 된다.
본 명세서에 있어서 판정, 검출 또는 진단의 대상이 되는 「검체」란 식도암의 발생, 식도암의 진행, 및 식도암에 대한 치료 효과의 발휘에 따라 본 발명의 유전자가 발현 변화하는 조직 및 생체 재료를 가리킨다. 구체적으로는 식도 조직 및 그 주변의 맥관, 림프절 및 장기, 또한 전이가 의심되는 장기, 피부, 및 혈액, 요, 타액, 땀, 조직 침출액 등의 체액, 혈액으로부터 조제된 혈청, 혈장, 그 외에 변, 모발 등을 가리킨다. 또한, 이들로부터 추출된 생체 시료, 구체적으로는 RNA나 miRNA 등의 유전자를 가리킨다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-204-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-204-3p」라는 용어는 서열번호 1로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-204-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0022693)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-204-3p 유전자는 Lim LP 외, 2003년, Science, 299권, p1540에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-204-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-204」(miRBase Accession No.MI0000284, 서열번호 215)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1247-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-1247-3p」라는 용어는 서열번호 2로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1247-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0022721)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1247-3p 유전자는 Morin RD 외, 2008년, Genome Res, 18권, p610-621에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1247-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1247」(miRBase Accession No.MI0006382, 서열번호 216)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6875-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6875-5p」라는 용어는 서열번호 3으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6875-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027650)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6875-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6875-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6875」(miRBase Accession No.MI0022722, 서열번호 217)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6857-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6857-5p」라는 용어는 서열번호 4로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6857-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027614)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6857-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6857-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6857」(miRBase Accession No.MI0022703, 서열번호 218)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6726-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6726-5p」라는 용어는 서열번호 5로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6726-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027353)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6726-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6726-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6726」(miRBase Accession No.MI0022571, 서열번호 219)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3188 유전자」 또는 「hsa-miR-3188」이라는 용어는 서열번호 6으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-3188 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0015070)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3188 유전자는 Stark MS 외, 2010년, PLoS One, 5권, e9685에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3188」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3188」(miRBase Accession No.MI0014232, 서열번호 220)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-8069 유전자」 또는 「hsa-miR-8069」이라는 용어는 서열번호 7로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-8069 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0030996)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-8069 유전자는 Wang HJ 외, 2013년, Shock, 39권, p480-487에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-8069」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-8069」(miRBase Accession No.MI0025905, 서열번호 221)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4257 유전자」 또는 「hsa-miR-4257」이라는 용어는 서열번호 8로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4257 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0016878)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4257 유전자는 Goff LA 외, 2009년, PLoS One, 4권, e7192에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4257」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4257」(miRBase Accession No.MI0015856, 서열번호 222)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1343-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-1343-3p」라는 용어는 서열번호 9로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1343-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019776)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1343-3p 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1343-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1343」(miRBase Accession No.MI0017320, 서열번호 223)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7108-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-7108-5p」라는 용어는 서열번호 10으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-7108-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0028113)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7108-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7108-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7108」(miRBase Accession No.MI0022959, 서열번호 224)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6825-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6825-5p」라는 용어는 서열번호 11로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6825-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027550)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6825-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6825-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6825」(miRBase Accession No.MI0022670, 서열번호 225)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7641 유전자」 또는 「hsa-miR-7641」이라는 용어는 서열번호 12로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-7641 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0029782)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7641 유전자는 Yoo JK 외, 2013년, Arch Pharm Res, 36권, p353-358에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7641」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7641-1, hsa-mir-7641-2」(miRBase Accession No.MI0024975, MI0024976, 서열번호 226, 227)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3185 유전자」 또는 「hsa-miR-3185」라는 용어는 서열번호 13으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-3185 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0015065)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3185 유전자는 Stark MS 외, 2010년, PLoS One, 5권, e9685에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3185」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3185」(miRBase Accession No.MI0014227, 서열번호 228)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4746-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-4746-3p」라는 용어는 서열번호 14로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4746-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019881)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4746-3p 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4746-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4746」(miRBase Accession No.MI0017385, 서열번호 229)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6791-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6791-5p」라는 용어는 서열번호 15로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6791-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027482)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6791-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6791-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6791」(miRBase Accession No.MI0022636, 서열번호 230)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6893-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6893-5p」라는 용어는 서열번호 16으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6893-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027686)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6893-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6893-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6893」(miRBase Accession No.MI0022740, 서열번호 231)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4433b-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-4433b-3p」라는 용어는 서열번호 17로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4433b-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0030414)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4433b-3p 유전자는 Ple H 외, 2012년, PLoS One, 7권, e50746에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4433b-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4433b」(miRBase Accession No.MI0025511, 서열번호 232)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3135b 유전자」 또는 「hsa-miR-3135b」라는 용어는 서열번호 18로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-3135b 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0018985)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3135b 유전자는 Jima DD 외, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3135b」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3135b」(miRBase Accession No.MI0016809, 서열번호 233)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6781-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6781-5p」라는 용어는 서열번호 19로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6781-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027462)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6781-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6781-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6781」(miRBase Accession No.MI0022626, 서열번호 234)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1908-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-1908-5p」라는 용어는 서열번호 20으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1908-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0007881)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1908-5p 유전자는 Bar M 외, 2008년, Stem Cells, 26권, p2496-2505에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1908-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1908」(miRBase Accession No.MI0008329, 서열번호 235)아 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4792 유전자」 또는 「hsa-miR-4792」라는 용어는 서열번호 21로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4792 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019964)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4792 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4792」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4792」(miRBase Accession No.MI0017439, 서열번호 236)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7845-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-7845-5p」라는 용어는 서열번호 22로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-7845-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0030420)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7845-5p 유전자는 Ple H 외, 2012년, PLoS One, 7권, e50746에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7845-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7845」(miRBase Accession No.MI0025515, 서열번호 237)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4417 유전자」 또는 「hsa-miR-4417」이라는 용어는 서열번호 23으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4417 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0018929)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4417 유전자는 Jima DD 외, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4417」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4417」(miRBase Accession No.MI0016753, 서열번호 238)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3184-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-3184-5p」라는 용어는 서열번호 24로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-3184-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0015064)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3184-5p 유전자는 Stark MS 외, 2010년, PLoS One, 5권, e9685에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3184-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3184」(miRBase Accession No.MI0014226, 서열번호 239)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1225-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-1225-5p」라는 용어는 서열번호 25로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1225-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0005572)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1225-5p 유전자는 Berezikov E 외, 2007년, Mol Cell, 28권, p328-336에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1225-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1225」(miRBase Accession No.MI0006311, 서열번호 240)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1231 유전자」 또는 「hsa-miR-1231」이라는 용어는 서열번호 26으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1231 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0005586)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1231 유전자는 Berezikov E 외, 2007년, Mol Cell, 28권, p328-336에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1231」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1231」(miRBase Accession No.MI0006321, 서열번호 241)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1225-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-1225-3p」라는 용어는 서열번호 27로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1225-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0005573)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1225-3p 유전자는 Berezikov E 외, 2007년, Mol Cell, 28권, p328-336에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1225-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1225」(miRBase Accession No.MI0006311, 서열번호 240)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-150-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-150-3p」라는 용어는 서열번호 28로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-150-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0004610)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-150-3p 유전자는 Lagos-Quintana M 외, 2002년, Curr Biol, 12권, p735-739에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-150-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-150」(miRBase Accession No.MI0000479, 서열번호 242)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4433-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-4433-3p」라는 용어는 서열번호 29로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4433-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0018949)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4433-3p 유전자는 Jima DD 외, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4433-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4433」(miRBase Accession No.MI0016773, 서열번호 243)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6125 유전자」 또는 「hsa-miR-6125」라는 용어는 서열번호 30으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6125 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0024598)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6125 유전자는 Smith JL 외, 2012년, J Virol, 86권, p5278-5287에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6125」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6125」(miRBase Accession No.MI0021259, 서열번호 244)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4513 유전자」 또는 「hsa-miR-4513」이라는 용어는 서열번호 31로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4513 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019050)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4513 유전자는 Jima DD 외, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4513」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4513」(miRBase Accession No.MI0016879, 서열번호 245)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6787-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6787-5p」라는 용어는 서열번호 32로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6787-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027474)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6787-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6787-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6787」(miRBase Accession No.MI0022632, 서열번호 246)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6784-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6784-5p」라는 용어는 서열번호 33으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6784-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027468)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6784-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6784-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6784」(miRBase Accession No.MI0022629, 서열번호 247)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-615-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-615-5p」라는 용어는 서열번호 34로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-615-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0004804)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-615-5p 유전자는 Cummins JM 외, 2006년, Proc Natl Acad Sci USA, 103권, p3687-3692에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-615-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-615」(miRBase Accession No.MI0003628, 서열번호 248)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6765-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-6765-3p」라는 용어는 서열번호 35로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6765-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027431)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6765-3p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6765-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6765」(miRBase Accession No.MI0022610, 서열번호 249)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-5572 유전자」 또는 「hsa-miR-5572」이라는 용어는 서열번호 36으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-5572 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0022260)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-5572 유전자는 Tandon M 외, 2012년, Oral Dis, 18권, p127-131에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-5572」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-5572」(miRBase Accession No.MI0019117, 서열번호 250)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6842-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6842-5p」라는 용어는 서열번호 37로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6842-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027586)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6842-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6842-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6842」(miRBase Accession No.MI0022688, 서열번호 251)가 알려져 있다.
명세서에서 사용되는 「hsa-miR-8063 유전자」 또는 「hsa-miR-8063」이라는 용어는 서열번호 38로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-8063 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0030990)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-8063 유전자는 Wang HJ 외, 2013년, Shock, 39권, p480-487에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-8063」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-8063」(miRBase Accession No.MI0025899, 서열번호 252)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6780b-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6780b-5p」라는 용어는 서열번호 39로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6780b-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027572)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6780b-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6780b-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6780b」(miRBase Accession No.MI0022681, 서열번호 253)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-187-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-187-5p」라는 용어는 서열번호 40으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-187-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0004561)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-187-5p 유전자는 Lim LP 외, 2003년, Science, 299권, p1540에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-187-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-187」(miRBase Accession No.MI0000274, 서열번호 254)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-128-1-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-128-1-5p」라는 용어는 서열번호 41로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-128-1-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0026477)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-128-1-5p 유전자는 Lagos-Quintana M 외, 2002년, Curr Biol, 12권, p735-739에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-128-1-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-128-1」(miRBase Accession No.MI0000447, 서열번호 255)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6729-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6729-5p」라는 용어는 서열번호 42로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6729-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027359)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6729-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6729-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6729」(miRBase Accession No.MI0022574, 서열번호 256)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6741-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6741-5p」라는 용어는 서열번호 43으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6741-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027383)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6741-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6741-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6741」(miRBase Accession No.MI0022586, 서열번호 257)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6757-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6757-5p」라는 용어는 서열번호 44로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6757-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027414)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6757-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6757-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6757」(miRBase Accession No.MI0022602, 서열번호 258)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7110-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-7110-5p」라는 용어는 서열번호 45로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-7110-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0028117)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7110-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7110-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7110」(miRBase Accession No.MI0022961, 서열번호 259)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7975 유전자」 또는 「hsa-miR-7975」라는 용어는 서열번호 46으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-7975 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0031178)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7975 유전자는 Velthut-Meikas A 외, 2013년, Mol Endocrinol, 온라인판으로 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7975」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7975」(miRBase Accession No.MI0025751, 서열번호 260)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1233-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-1233-5p」라는 용어는 서열번호 47로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1233-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0022943)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1233-5p 유전자는 Berezikov E 외, 2007년, Mol Cell, 28권, p328-336에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1233-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1233-1, hsa-mir-1233-2」(miRBase Accession No.MI0006323, MI0015973, 서열번호 261, 262)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6845-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6845-5p」라는 용어는 서열번호 48로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6845-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027590)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6845-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6845-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6845」(miRBase Accession No.MI0022691, 서열번호 263)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3937 유전자」 또는 「hsa-miR-3937」이라는 용어는 서열번호 49로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-3937 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0018352)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3937 유전자는 Liao JY 외, 2010년, PLoS One, 5권, e10563에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3937」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3937」(miRBase Accession No.MI0016593, 서열번호 264)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4467 유전자」 또는 「hsa-miR-4467」이라는 용어는 서열번호 50으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4467 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0018994)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4467 유전자는 Jima DD 외, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4467」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4467」(miRBase Accession No.MI0016818, 서열번호 265)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7109-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-7109-5p」라는 용어는 서열번호 51로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-7109-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0028115)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7109-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7109-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7109」(miRBase Accession No.MI0022960, 서열번호 266)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6088 유전자」 또는 「hsa-miR-6088」이라는 용어는 서열번호 52로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6088 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0023713)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6088 유전자는 Yoo JK 외, 2012년, Stem Cells Dev, 21권, p2049-2057에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6088」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6088」(miRBase Accession No.MI0020365, 서열번호 267)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6782-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6782-5p」라는 용어는 서열번호 53으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6782-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027464)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6782-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6782-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6782」(miRBase Accession No.MI0022627, 서열번호 268)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-5195-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-5195-3p」라는 용어는 서열번호 54로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-5195-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0021127)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-5195-3p 유전자는 Schotte D 외, 2011년, Leukemia, 25권, p1389-1399에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-5195-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-5195」(miRBase Accession No.MI0018174, 서열번호 269)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4454 유전자」 또는 「hsa-miR-4454」라는 용어는 서열번호 55로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4454 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0018976)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4454 유전자는 Jima DD 외, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4454」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4454」(miRBase Accession No.MI0016800, 서열번호 270)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6724-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6724-5p」라는 용어는 서열번호 56으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6724-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0025856)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6724-5p 유전자는 Li Y 외, 2012년, Gene, 497권, p330-335에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6724-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6724」(miRBase Accession No.MI0022559, 서열번호 271)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-8072 유전자」 또는 「hsa-miR-8072」라는 용어는 서열번호 57로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-8072 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0030999)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-8072 유전자는 Wang HJ 외, 2013년, Shock, 39권, p480-487에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-8072」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-8072」(miRBase Accession No.MI0025908, 서열번호 272)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4516 유전자」 또는 「hsa-miR-4516」이라는 용어는 서열번호 58로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4516 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019053)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4516 유전자는 Jima DD 외, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4516」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4516」(miRBase Accession No.MI0016882, 서열번호 273)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6756-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6756-5p」라는 용어는 서열번호 59로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6756-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027412)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6756-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6756-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6756」(miRBase Accession No.MI0022601, 서열번호 274)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4665-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-4665-3p」라는 용어는 서열번호 60으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4665-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019740)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4665-3p 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4665-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4665」(miRBase Accession No.MI0017295, 서열번호 275)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6826-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6826-5p」라는 용어는 서열번호 61로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6826-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027552)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6826-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6826-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6826」(miRBase Accession No.MI0022671, 서열번호 276)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6820-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6820-5p」라는 용어는 서열번호 62로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6820-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027540)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6820-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6820-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6820」(miRBase Accession No.MI0022665, 서열번호 277)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6887-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6887-5p」라는 용어는 서열번호 63으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6887-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027674)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6887-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6887-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6887」(miRBase Accession No.MI0022734, 서열번호 278)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3679-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-3679-5p」라는 용어는 서열번호 64로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-3679-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0018104)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3679-5p 유전자는 Creighton CJ 외, 2010년, PLoS One, 5권, e9637에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3679-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3679」(miRBase Accession No.MI0016080, 서열번호 279)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7847-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-7847-3p」라는 용어는 서열번호 65로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-7847-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0030422)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7847-3p 유전자는 Ple H 외, 2012년, PLoS One, 7권, e50746에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7847-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7847」(miRBase Accession No.MI0025517, 서열번호 280)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6721-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6721-5p」라는 용어는 서열번호 66으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6721-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0025852)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6721-5p 유전자는 Li Y 외, 2012년, Gene, 497권, p330-335에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6721-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6721」(miRBase Accession No.MI0022556, 서열번호 281)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3622a-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-3622a-5p」라는 용어는 서열번호 67로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-3622a-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0018003)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3622a-5p 유전자는 Witten D 외, 2010년, BMC Biol, 8권, p58에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3622a-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3622a」(miRBase Accession No.MI0016013, 서열번호 282)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-939-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-939-5p」라는 용어는 서열번호 68로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-939-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0004982)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-939-5p 유전자는 Lui WO 외, 2007년, Cancer Res, 67권, p6031-6043에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-939-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-939」(miRBase Accession No.MI0005761, 서열번호 283)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-602 유전자」 또는 「hsa-miR-602」라는 용어는 서열번호 69로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-602 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0003270)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-602 유전자는 Cummins JM 외, 2006년, Proc Natl Acad Sci USA, 103권, p3687-3692에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-602」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-602」(miRBase Accession No.MI0003615, 서열번호 284)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7977 유전자」 또는 「hsa-miR-7977」이라는 용어는 서열번호 70으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-7977 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0031180)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7977 유전자는 Velthut-Meikas A 외, 2013년, Mol Endocrinol, 온라인판으로 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7977」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7977」(miRBase Accession No.MI0025753, 서열번호 285)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6749-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6749-5p」라는 용어는 서열번호 71로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6749-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027398)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6749-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6749-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6749」(miRBase Accession No.MI0022594, 서열번호 286)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1914-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-1914-3p」라는 용어는 서열번호 72로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1914-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0007890)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1914-3p 유전자는 Bar M 외, 2008년, Stem Cells, 26권, p2496-2505에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1914-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1914」(miRBase Accession No.MI0008335, 서열번호 287)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4651 유전자」 또는 「hsa-miR-4651」이라는 용어는 서열번호 73으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4651 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019715)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4651 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4651」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4651」(miRBase Accession No.MI0017279, 서열번호 288)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4695-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4695-5p」라는 용어는 서열번호 74로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4695-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019788)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4695-5p 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4695-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4695」(miRBase Accession No.MI0017328, 서열번호 289)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6848-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6848-5p」라는 용어는 서열번호 75로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6848-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027596)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6848-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6848-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6848」(miRBase Accession No.MI0022694, 서열번호 290)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1228-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-1228-3p」라는 용어는 서열번호 76으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1228-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0005583)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1228-3p 유전자는 Berezikov E 외, 2007년, Mol Cell, 28권, p328-336에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1228-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1228」(miRBase Accession No.MI0006318, 서열번호 291)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-642b-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-642b-3p」라는 용어는 서열번호 77로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-642b-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0018444)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-642b-3p 유전자는 Witten D 외, 2010년, BMC Biol, 8권, p58에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-642b-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-642b」(miRBase Accession No.MI0016685, 서열번호 292)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6746-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6746-5p」라는 용어는 서열번호 78로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6746-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027392)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6746-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6746-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6746」(miRBase Accession No.MI0022591, 서열번호 293)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3620-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-3620-5p」라는 용어는 서열번호 79로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-3620-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0022967)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3620-5p 유전자는 Witten D 외, 2010년, BMC Biol, 8권, p58에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3620-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3620」(miRBase Accession No.MI0016011, 서열번호 294)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3131 유전자」 또는 「hsa-miR-3131」이라는 용어는 서열번호 80으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-3131 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0014996)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3131 유전자는 Stark MS 외, 2010년, PLoS One, 5권, e9685에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3131」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3131」(miRBase Accession No.MI0014151, 서열번호 295)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6732-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6732-5p」라는 용어는 서열번호 81로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6732-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027365)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6732-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6732-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6732」(miRBase Accession No.MI0022577, 서열번호 296)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7113-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-7113-3p」라는 용어는 서열번호 82로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-7113-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0028124)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7113-3p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7113-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7113」(miRBase Accession No.MI0022964, 서열번호 297)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-23a-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-23a-3p」라는 용어는 서열번호 83으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-23a-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0000078)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-23a-3p 유전자는 Lagos-Quintana M 외, 2001년, Science, 294권, p853-858에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-23a-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-23a」(miRBase Accession No.MI0000079, 서열번호 298)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3154 유전자」 또는 「hsa-miR-3154」라는 용어는 서열번호 84로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-3154 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0015028)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3154 유전자는 Berezikov E 외, 2006년, Genome Res, 16권, p1289-1298에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3154」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3154」(miRBase Accession No.MI0014182, 서열번호 299)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4723-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4723-5p」라는 용어는 서열번호 85로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4723-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019838)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4723-5p 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4723-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4723」(miRBase Accession No.MI0017359, 서열번호 300)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3663-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-3663-3p」라는 용어는 서열번호 86으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-3663-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0018085)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3663-3p 유전자는 Liao JY 외, 2010년, PLoS One, 5권, e10563에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3663-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3663」(miRBase Accession No.MI0016064, 서열번호 301)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4734 유전자」 또는 「hsa-miR-4734」라는 용어는 서열번호 87로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4734 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019859)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4734 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4734」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4734」(miRBase Accession No.MI0017371, 서열번호 302)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6816-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6816-5p」라는 용어는 서열번호 88로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6816-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027532)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6816-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6816-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6816」(miRBase Accession No.MI0022661, 서열번호 303)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4442 유전자」 또는 「hsa-miR-4442」라는 용어는 서열번호 89로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4442 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0018960)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4442 유전자는 Jima DD 외, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4442」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4442」(miRBase Accession No.MI0016785, 서열번호 304)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4476 유전자」 또는 「hsa-miR-4476」이라는 용어는 서열번호 90으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4476 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019003)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4476 유전자는 Jima DD 외, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4476」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4476」(miRBase Accession No.MI0016828, 서열번호 305)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-423-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-423-5p」라는 용어는 서열번호 91로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-423-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0004748)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-423-5p 유전자는 Kasashima K 외, 2004년, Biochem Biophys Res Commun, 322권, p403-410에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-423-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-423」(miRBase Accession No.MI0001445, 서열번호 306)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1249 유전자」 또는 「hsa-miR-1249」이라는 용어는 서열번호 92로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1249 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0005901)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1249 유전자는 Morin RD 외, 2008년, Genome Res, 18권, p610-621에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1249」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1249」(miRBase Accession No.MI0006384, 서열번호 307)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6515-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-6515-3p」라는 용어는 서열번호 93으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6515-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0025487)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6515-3p 유전자는 Joyce CE 외, 2011년, Hum Mol Genet, 20권, p4025-4040에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6515-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6515」(miRBase Accession No.MI0022227, 서열번호 308)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-887-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-887-3p」라는 용어는 서열번호 94로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-887-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0004951)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-887-3p 유전자는 Berezikov E 외, 2006년, Genome Res, 16권, p1289-1298에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-887-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-887」(miRBase Accession No.MI0005562, 서열번호 309)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4741 유전자」 또는 「hsa-miR-4741」이라는 용어는 서열번호 95로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4741 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019871)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4741 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4741」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4741」(miRBase Accession No.MI0017379, 서열번호 310)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6766-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-6766-3p」라는 용어는 서열번호 96으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6766-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027433)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6766-3p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6766-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6766」(miRBase Accession No.MI0022611, 서열번호 311)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4673 유전자」 또는 「hsa-miR-4673」이라는 용어는 서열번호 97로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4673 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019755)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4673 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4673」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4673」(miRBase Accession No.MI0017304, 서열번호 312)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6779-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6779-5p」라는 용어는 서열번호 98로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6779-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027458)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6779-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6779-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6779」(miRBase Accession No.MI0022624, 서열번호 313)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4706 유전자」 또는 「hsa-miR-4706」이라는 용어는 서열번호 99로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4706 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019806)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4706 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4706」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4706」(miRBase Accession No.MI0017339, 서열번호 314)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1268b 유전자」 또는 「hsa-miR-1268b」이라는 용어는 서열번호 100으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1268b 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0018925)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1268b 유전자는 Jima DD 외, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1268b」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1268b」(miRBase Accession No.MI0016748, 서열번호 315)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4632-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4632-5p」라는 용어는 서열번호 101로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4632-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0022977)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4632-5p 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4632-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4632」(miRBase Accession No.MI0017259, 서열번호 316)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3197 유전자」 또는 「hsa-miR-3197」이라는 용어는 서열번호 102로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-3197 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0015082)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3197 유전자는 Stark MS 외, 2010년, PLoS One, 5권, e9685에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3197」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3197」(miRBase Accession No.MI0014245, 서열번호 317)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6798-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6798-5p」라는 용어는 서열번호 103으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6798-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027496)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6798-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6798-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6798」(miRBase Accession No.MI0022643, 서열번호 318)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-711 유전자」 또는 「hsa-miR-711」이라는 용어는 서열번호 104로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-711 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0012734)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-711 유전자는 Artzi S 외, 2008년, BMC Bioinformatics, 9권, p39에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-711」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-711」(miRBase Accession No.MI0012488, 서열번호 319)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6840-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-6840-3p」라는 용어는 서열번호 105로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6840-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027583)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6840-3p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6840-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6840」(miRBase Accession No.MI0022686, 서열번호 320)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6763-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6763-5p」라는 용어는 서열번호 106으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6763-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027426)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6763-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6763-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6763」(miRBase Accession No.MI0022608, 서열번호 321)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6727-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6727-5p」라는 용어는 서열번호 107로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6727-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027355)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6727-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6727-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6727」(miRBase Accession No.MI0022572, 서열번호 322)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-371a-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-371a-5p」라는 용어는 서열번호 108로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-371a-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0004687)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-371a-5p 유전자는 Suh MR 외, 2004년, Dev Biol, 270권, p488-498에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-371a-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-371a」(miRBase Accession No.MI0000779, 서열번호 323)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6824-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6824-5p」라는 용어는 서열번호 109로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6824-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027548)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6824-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6824-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6824」(miRBase Accession No.MI0022669, 서열번호 324)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4648 유전자」 또는 「hsa-miR-4648」이라는 용어는 서열번호 110으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4648 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019710)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4648 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4648」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4648」(miRBase Accession No.MI0017275, 서열번호 325)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1227-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-1227-5p」라는 용어는 서열번호 111로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1227-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0022941)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1227-5p 유전자는 Berezikov E 외, 2007년, Mol Cell, 28권, p328-336에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1227-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1227」(miRBase Accession No.MI0006316, 서열번호 326)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-564 유전자」 또는 「hsa-miR-564」라는 용어는 서열번호 112로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-564 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0003228)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-564 유전자는 Cummins JM 외, 2006년, Proc Natl Acad Sci USA, 103권, p3687-3692에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-564」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-564」(miRBase Accession No.MI0003570, 서열번호 327)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3679-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-3679-3p」라는 용어는 서열번호 113으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-3679-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0018105)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3679-3p 유전자는 Creighton CJ 외, 2010년, PLoS One, 5권, e9637에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3679-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3679」(miRBase Accession No.MI0016080, 서열번호 279)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-2861 유전자」 또는 「hsa-miR-2861」이라는 용어는 서열번호 114로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-2861 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0013802)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-2861 유전자는 Li H 외, 2009년, J Clin Invest, 119권, p3666-3677에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-2861」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-2861」(miRBase Accession No.MI0013006, 서열번호 328)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6737-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6737-5p」라는 용어는 서열번호 115로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6737-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027375)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6737-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6737-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6737」(miRBase Accession No.MI0022582, 서열번호 329)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-575 유전자」 또는 「hsa-miR-575」라는 용어는 서열번호 116으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-575 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0003240)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-575 유전자는 Cummins JM 외, 2006년, Proc Natl Acad Sci USA, 103권, p3687-3692에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-575」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-575」(miRBase Accession No.MI0003582, 서열번호 330)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4725-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-4725-3p」라는 용어는 서열번호 117로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4725-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019844)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4725-3p 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4725-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4725」(miRBase Accession No.MI0017362, 서열번호 331)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6716-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6716-5p」라는 용어는 서열번호 118로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6716-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0025844)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6716-5p 유전자는 Li Y 외, 2012년, Gene, 497권, p330-335에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6716-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6716」(miRBase Accession No.MI0022550, 서열번호 332)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4675 유전자」 또는 「hsa-miR-4675」라는 용어는 서열번호 119로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4675 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019757)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4675 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4675」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4675」(miRBase Accession No.MI0017306, 서열번호 333)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1915-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-1915-3p」라는 용어는 서열번호 120으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1915-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0007892)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1915-3p 유전자는 Bar M 외, 2008년, Stem Cells, 26권, p2496-2505에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1915-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1915」(miRBase Accession No.MI0008336, 서열번호 334)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-671-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-671-5p」라는 용어는 서열번호 121로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-671-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0003880)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-671-5p 유전자는 Berezikov E 외, 2006년, Genome Res, 16권, p1289-1298에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-671-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-671」(miRBase Accession No.MI0003760, 서열번호 335)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3656 유전자」 또는 「hsa-miR-3656」이라는 용어는 서열번호 122로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-3656 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0018076)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3656 유전자는 Meiri E 외, 2010년, Nucleic Acids Res, 38권, p6234-6246에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3656」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3656」(miRBase Accession No.MI0016056, 서열번호 336)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6722-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-6722-3p」라는 용어는 서열번호 123으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6722-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0025854)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6722-3p 유전자는 Li Y 외, 2012년, Gene, 497권, p330-335에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6722-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6722」(miRBase Accession No.MI0022557, 서열번호 337)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4707-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4707-5p」라는 용어는 서열번호 124로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4707-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019807)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4707-5p 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4707-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4707」(miRBase Accession No.MI0017340, 서열번호 338)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4449 유전자」 또는 「hsa-miR-4449」라는 용어는 서열번호 125로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4449 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0018968)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4449 유전자는 Jima DD 외, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4449」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4449」(miRBase Accession No.MI0016792, 서열번호 339)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1202 유전자」 또는 「hsa-miR-1202」이라는 용어는 서열번호 126으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1202 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0005865)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1202 유전자는 Marton S 외, 2008년, Leukemia, 22권, p330-338에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1202」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1202」(miRBase Accession No.MI0006334, 서열번호 340)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4649-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4649-5p」라는 용어는 서열번호 127로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4649-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019711)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4649-5p 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4649-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4649」(miRBase Accession No.MI0017276, 서열번호 341)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-744-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-744-5p」라는 용어는 서열번호 128로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-744-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0004945)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-744-5p 유전자는 Berezikov E 외, 2006년, Genome Res, 16권, p1289-1298에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-744-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-744」(miRBase Accession No.MI0005559, 서열번호 342)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-642a-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-642a-3p」라는 용어는 서열번호 129로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-642a-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0020924)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-642a-3p 유전자는 Cummins JM 외, 2006년, Proc Natl Acad Sci USA, 103권, p3687-3692에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-642a-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-642a」(miRBase Accession No.MI0003657, 서열번호 343)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-451a 유전자」 또는 「hsa-miR-451a」라는 용어는 서열번호 130으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-451a 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0001631)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-451a 유전자는 Altuvia Y 외, 2005년, Nucleic Acids Res, 33권, p2697-2706에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-451a」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-451a」(miRBase Accession No.MI0001729, 서열번호 344)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6870-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6870-5p」라는 용어는 서열번호 131로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6870-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027640)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6870-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6870-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6870」(miRBase Accession No.MI0022717, 서열번호 345)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4443 유전자」 또는 「hsa-miR-4443」이라는 용어는 서열번호 132로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4443 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0018961)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4443 유전자는 Jima DD 외, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4443」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4443」(miRBase Accession No.MI0016786, 서열번호 346)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6808-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6808-5p」라는 용어는 서열번호 133으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6808-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027516)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6808-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6808-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6808」(miRBase Accession No.MI0022653, 서열번호 347)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4728-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4728-5p」라는 용어는 서열번호 134로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4728-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019849)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4728-5p 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4728-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4728」(miRBase Accession No.MI0017365, 서열번호 348)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-937-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-937-5p」라는 용어는 서열번호 135로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-937-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0022938)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-937-5p 유전자는 Lui WO 외, 2007년, Cancer Res, 67권, p6031-6043에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-937-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-937」(miRBase Accession No.MI0005759, 서열번호 349)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-135a-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-135a-3p」라는 용어는 서열번호 136으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-135a-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0004595)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-135a-3p 유전자는 Lagos-Quintana M 외, 2002년, Curr Biol, 12권, p735-739에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-135a-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-135a-1」(miRBase Accession No.MI0000452, 서열번호 350)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-663b 유전자」 또는 「hsa-miR-663b」라는 용어는 서열번호 137로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-663b 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0005867)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-663b 유전자는 Takada S 외, 2008년, Leukemia, 22권, p1274-1278에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-663b」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-663b」(miRBase Accession No.MI0006336, 서열번호 351)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1343-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-1343-5p」라는 용어는 서열번호 138로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1343-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027038)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1343-5p 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1343-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1343」(miRBase Accession No.MI0017320, 서열번호 223)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6822-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6822-5p」라는 용어는 서열번호 139로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6822-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027544)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6822-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6822-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6822」(miRBase Accession No.MI0022667, 서열번호 352)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6803-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6803-5p」라는 용어는 서열번호 140으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6803-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027506)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6803-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6803-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6803」(miRBase Accession No.MI0022648, 서열번호 353)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6805-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-6805-3p」라는 용어는 서열번호 141로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6805-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027511)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6805-3p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6805-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6805」(miRBase Accession No.MI0022650, 서열번호 354)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-128-2-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-128-2-5p」라는 용어는 서열번호 142로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-128-2-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0031095)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-128-2-5p 유전자는 Lagos-Quintana M 외, 2002년, Curr Biol, 12권, p735-739에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-128-2-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-128-2」(miRBase Accession No.MI0000727, 서열번호 355)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4640-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4640-5p」라는 용어는 서열번호 143으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4640-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019699)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4640-5p 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4640-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4640」(miRBase Accession No.MI0017267, 서열번호 356)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1469 유전자」 또는 「hsa-miR-1469」라는 용어는 서열번호 144로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1469 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0007347)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1469 유전자는 Kawaji H 외, 2008년, BMC Genomics, 9권, p157에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1469」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1469」(miRBase Accession No.MI0007074, 서열번호 357)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-92a-2-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-92a-2-5p」라는 용어는 서열번호 145로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-92a-2-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0004508)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-92a-2-5p 유전자는 Mourelatos Z 외, 2002년, Genes Dev, 16권, p720-728에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-92a-2-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-92a-2」(miRBase Accession No.MI0000094, 서열번호 358)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3940-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-3940-5p」라는 용어는 서열번호 146으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-3940-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019229)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3940-5p 유전자는 Liao JY 외, 2010년, PLoS One, 5권, e10563에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3940-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3940」(miRBase Accession No.MI0016597, 서열번호 359)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4281 유전자」 또는 「hsa-miR-4281」이라는 용어는 서열번호 147로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4281 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0016907)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4281 유전자는 Goff LA 외, 2009년, PLoS One, 4권, e7192에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4281」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4281」(miRBase Accession No.MI0015885, 서열번호 360)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1260b 유전자」 또는 「hsa-miR-1260b」라는 용어는 서열번호 148로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1260b 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0015041)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1260b 유전자는 Stark MS 외, 2010년, PLoS One, 5권, e9685에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1260b」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1260b」(miRBase Accession No.MI0014197, 서열번호 361)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4758-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4758-5p」라는 용어는 서열번호 149로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4758-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019903)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4758-5p 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4758-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4758」(miRBase Accession No.MI0017399, 서열번호 362)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1915-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-1915-5p」라는 용어는 서열번호 150으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1915-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0007891)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1915-5p 유전자는 Bar M 외, 2008년, Stem Cells, 26권, p2496-2505에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1915-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1915」(miRBase Accession No.MI0008336, 서열번호 334)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-5001-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-5001-5p」라는 용어는 서열번호 151로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-5001-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0021021)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-5001-5p 유전자는 Hansen TB 외, 2011년, RNA Biol, 8권, p378-383에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-5001-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-5001」(miRBase Accession No.MI0017867, 서열번호 363)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4286 유전자」 또는 「hsa-miR-4286」이라는 용어는 서열번호 152로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4286 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0016916)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4286 유전자는 Goff LA 외, 2009년, PLoS One, 4권, e7192에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4286」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4286」(miRBase Accession No.MI0015894, 서열번호 364)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6126 유전자」 또는 「hsa-miR-6126」이라는 용어는 서열번호 153으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6126 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0024599)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6126 유전자는 Smith JL 외, 2012년, J Virol, 86권, p5278-5287에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6126」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6126」(miRBase Accession No.MI0021260, 서열번호 365)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6789-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6789-5p」라는 용어는 서열번호 154로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6789-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027478)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6789-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6789-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6789」(miRBase Accession No.MI0022634, 서열번호 366)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4459 유전자」 또는 「hsa-miR-4459」라는 용어는 서열번호 155로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4459 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0018981)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4459 유전자는 Jima DD 외, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4459」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4459」(miRBase Accession No.MI0016805, 서열번호 367)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1268a 유전자」 또는 「hsa-miR-1268a」라는 용어는 서열번호 156으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1268a 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0005922)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1268a 유전자는 Morin RD 외, 2008년, Genome Res, 18권, p610-621에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1268a」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1268a」(miRBase Accession No.MI0006405, 서열번호 368)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6752-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6752-5p」라는 용어는 서열번호 157로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6752-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027404)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6752-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6752-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6752」(miRBase Accession No.MI0022597, 서열번호 369)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6131 유전자」 또는 「hsa-miR-6131」이라는 용어는 서열번호 158로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6131 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0024615)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6131 유전자는 Dannemann M 외, 2012년, Genome Biol Evol, 4권, p552-564에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6131」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6131」(miRBase Accession No.MI0021276, 서열번호 370)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6800-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6800-5p」라는 용어는 서열번호 159로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6800-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027500)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6800-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6800-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6800」(miRBase Accession No.MI0022645, 서열번호 371)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4532 유전자」 또는 「hsa-miR-4532」라는 용어는 서열번호 160으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4532 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019071)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4532 유전자는 Jima DD 외, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4532」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4532」(miRBase Accession No.MI0016899, 서열번호 372)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6872-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-6872-3p」라는 용어는 서열번호 161로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6872-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027645)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6872-3p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6872-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6872」(miRBase Accession No.MI0022719, 서열번호 373)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-718 유전자」 또는 「hsa-miR-718」이라는 용어는 서열번호 162로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-718 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0012735)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-718 유전자는 Artzi S 외, 2008년, BMC Bioinformatics, 9권, p39에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-718」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-718」(miRBase Accession No.MI0012489, 서열번호 374)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6769a-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6769a-5p」라는 용어는 서열번호 163으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6769a-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027438)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6769a-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6769a-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6769a」(miRBase Accession No.MI0022614, 서열번호 375)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4707-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-4707-3p」라는 용어는 서열번호 164로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4707-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019808)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4707-3p 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4707-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4707」(miRBase Accession No.MI0017340, 서열번호 338)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6765-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6765-5p」라는 용어는 서열번호 165로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6765-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027430)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6765-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6765-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6765」(miRBase Accession No.MI0022610, 서열번호 249)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4739 유전자」 또는 「hsa-miR-4739」라는 용어는 서열번호 166으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4739 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019868)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4739 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4739」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4739」(miRBase Accession No.MI0017377, 서열번호 376)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4525 유전자」 또는 「hsa-miR-4525」라는 용어는 서열번호 167로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4525 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019064)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4525 유전자는 Jima DD 외, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4525」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4525」(miRBase Accession No.MI0016892, 서열번호 377)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4270 유전자」 또는 「hsa-miR-4270」이라는 용어는 서열번호 168로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4270 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0016900)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4270 유전자는 Goff LA 외, 2009년, PLoS One, 4권, e7192에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4270」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4270」(miRBase Accession No.MI0015878, 서열번호 378)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4534 유전자」 또는 「hsa-miR-4534」라는 용어는 서열번호 169로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4534 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019073)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4534 유전자는 Jima DD 외, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4534」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4534」(miRBase Accession No.MI0016901, 서열번호 379)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6785-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6785-5p」라는 용어는 서열번호 170으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6785-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027470)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6785-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6785-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6785」(miRBase Accession No.MI0022630, 서열번호 380)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6850-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6850-5p」라는 용어는 서열번호 171로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6850-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027600)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6850-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6850-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6850」(miRBase Accession No.MI0022696, 서열번호 381)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4697-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4697-5p」라는 용어는 서열번호 172로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4697-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019791)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4697-5p 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4697-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4697」(miRBase Accession No.MI0017330, 서열번호 382)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1260a 유전자」 또는 「hsa-miR-1260a」라는 용어는 서열번호 173으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1260a 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0005911)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1260a 유전자는 Morin RD 외, 2008년, Genome Res, 18권, p610-621에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1260a」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1260a」(miRBase Accession No.MI0006394, 서열번호 383)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4486 유전자」 또는 「hsa-miR-4486」이라는 용어는 서열번호 174로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4486 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019020)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4486 유전자는 Jima DD 외, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4486」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4486」(miRBase Accession No.MI0016847, 서열번호 384)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6880-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6880-5p」라는 용어는 서열번호 175로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6880-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027660)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6880-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6880-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6880」(miRBase Accession No.MI0022727, 서열번호 385)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6802-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6802-5p」라는 용어는 서열번호 176으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6802-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027504)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6802-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6802-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6802」(miRBase Accession No.MI0022647, 서열번호 386)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6861-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6861-5p」라는 용어는 서열번호 177로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6861-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027623)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6861-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6861-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6861」(miRBase Accession No.MI0022708, 서열번호 387)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-92b-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-92b-5p」라는 용어는 서열번호 178로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-92b-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0004792)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-92b-5p 유전자는 Cummins JM 외, 2006년, Proc Natl Acad Sci USA, 103권, p3687-3692에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-92b-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-92b」(miRBase Accession No.MI0003560, 서열번호 388)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1238-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-1238-5p」라는 용어는 서열번호 179로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1238-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0022947)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1238-5p 유전자는 Berezikov E 외, 2007년, Mol Cell, 28권, p328-336에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1238-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1238」(miRBase Accession No.MI0006328, 서열번호 389)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6851-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6851-5p」라는 용어는 서열번호 180으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6851-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027602)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6851-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6851-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6851」(miRBase Accession No.MI0022697, 서열번호 390)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7704 유전자」 또는 「hsa-miR-7704」라는 용어는 서열번호 181로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-7704 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0030019)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7704 유전자는 Swaminathan S 외, 2013년, Biochem Biophys Res Commun, 434권, p228-234에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7704」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7704」(miRBase Accession No.MI0025240, 서열번호 391)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-149-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-149-3p」라는 용어는 서열번호 182로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-149-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0004609)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-149-3p 유전자는 Lagos-Quintana M 외, 2002년, Curr Biol, 12권, p735-739에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-149-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-149」(miRBase Accession No.MI0000478, 서열번호 392)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4689 유전자」 또는 「hsa-miR-4689」라는 용어는 서열번호 183으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4689 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019778)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4689 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4689」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4689」(miRBase Accession No.MI0017322, 서열번호 393)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4688 유전자」 또는 「hsa-miR-4688」이라는 용어는 서열번호 184로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4688 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019777)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4688 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4688」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4688」(miRBase Accession No.MI0017321, 서열번호 394)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-125a-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-125a-3p」라는 용어는 서열번호 185로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-125a-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0004602)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-125a-3p 유전자는 Lagos-Quintana M 외, 2002년, Curr Biol, 12권, p735-739에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-125a-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-125a」(miRBase Accession No.MI0000469, 서열번호 395)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-23b-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-23b-3p」라는 용어는 서열번호 186으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-23b-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0000418)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-23b-3p 유전자는 Lagos-Quintana M 외, 2002년, Curr Biol, 12권, p735-739에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-23b-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-23b」(miRBase Accession No.MI0000439, 서열번호 396)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-614 유전자」 또는 「hsa-miR-614」라는 용어는 서열번호 187로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-614 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0003282)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-614 유전자는 Cummins JM 외, 2006년, Proc Natl Acad Sci USA, 103권, p3687-3692에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-614」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-614」(miRBase Accession No.MI0003627, 서열번호 397)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1913 유전자」 또는 「hsa-miR-1913」이라는 용어는 서열번호 188로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1913 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0007888)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1913 유전자는 Bar M 외, 2008년, Stem Cells, 26권, p2496-2505에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1913」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1913」(miRBase Accession No.MI0008334, 서열번호 398)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-16-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-16-5p」라는 용어는 서열번호 189로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-16-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0000069)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-16-5p 유전자는 Lagos-Quintana M 외, 2001년, Science, 294권, p853-858에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-16-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-16-1, hsa-mir-16-2」(miRBase Accession No.MI0000070, MI0000115, 서열번호 399, 400)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-675-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-675-5p」라는 용어는 서열번호 190으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-675-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0004284)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-675-5p 유전자는 Cai X 외, 2007년, RNA, 13권, p313-316에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-675-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-675」(miRBase Accession No.MI0005416, 서열번호 401)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-486-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-486-3p」라는 용어는 서열번호 191로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-486-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0004762)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-486-3p 유전자는 Fu H 외, 2005년, FEBS Lett, 579권, p3849-3854에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-486-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-486, hsa-mir-486-2」(miRBase Accession No.MI0002470, MI0023622, 서열번호 402, 403)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6777-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6777-5p」라는 용어는 서열번호 192로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6777-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027454)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6777-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6777-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6777」(miRBase Accession No.MI0022622, 서열번호 404)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4497 유전자」 또는 「hsa-miR-4497」이라는 용어는 서열번호 193으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4497 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019032)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4497 유전자는 Jima DD 외, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4497」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4497」(miRBase Accession No.MI0016859, 서열번호 405)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-296-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-296-3p」라는 용어는 서열번호 194로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-296-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0004679)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-296-3p 유전자는 Houbaviy HB 외, 2003년, Dev Cell, 5권, p351-358에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-296-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-296」(miRBase Accession No.MI0000747, 서열번호 406)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6738-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6738-5p」라는 용어는 서열번호 195로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6738-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027377)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6738-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6738-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6738」(miRBase Accession No.MI0022583, 서열번호 407)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4731-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4731-5p」라는 용어는 서열번호 196으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4731-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019853)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4731-5p 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4731-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4731」(miRBase Accession No.MI0017368, 서열번호 408)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6889-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6889-5p」라는 용어는 서열번호 197로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6889-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027678)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6889-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6889-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6889」(miRBase Accession No.MI0022736, 서열번호 409)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6786-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6786-5p」라는 용어는 서열번호 198로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6786-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027472)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6786-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6786-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6786」(miRBase Accession No.MI0022631, 서열번호 410)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-92a-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-92a-3p」라는 용어는 서열번호 199로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-92a-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0000092)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-92a-3p 유전자는 Mourelatos Z 외, 2002년, Genes Dev, 16권, p720-728에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-92a-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-92a-1, hsa-mir-92a-2」(miRBase Accession No.MI0000093, MI0000094, 서열번호 411, 358)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4294 유전자」 또는 「hsa-miR-4294」라는 용어는 서열번호 200으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4294 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0016849)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4294 유전자는 Goff LA 외, 2009년, PLoS One, 4권, e7192에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4294」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4294」(miRBase Accession No.MI0015827, 서열번호 412)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4763-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-4763-3p」라는 용어는 서열번호 201로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4763-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019913)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4763-3p 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4763-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4763」(miRBase Accession No.MI0017404, 서열번호 413)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6076 유전자」 또는 「hsa-miR-6076」이라는 용어는 서열번호 202로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6076 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0023701)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6076 유전자는 Voellenkle C 외, 2012년, RNA, 18권, p472-484에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6076」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6076」(miRBase Accession No.MI0020353, 서열번호 414)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-663a 유전자」 또는 「hsa-miR-663a」라는 용어는 서열번호 203으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-663a 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0003326)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-663a 유전자는 Cummins JM 외, 2006년, Proc Natl Acad Sci USA, 103권, p3687-3692에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-663a」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-663a」(miRBase Accession No.MI0003672, 서열번호 415)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-760 유전자」 또는 「hsa-miR-760」이라는 용어는 서열번호 204로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-760 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0004957)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-760 유전자는 Berezikov E 외, 2006년, Genome Res, 16권, p1289-1298에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-760」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-760」(miRBase Accession No.MI0005567, 서열번호 416)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4667-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4667-5p」라는 용어는 서열번호 205로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4667-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019743)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4667-5p 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4667-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4667」(miRBase Accession No.MI0017297, 서열번호 417)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6090 유전자」 또는 「hsa-miR-6090」이라는 용어는 서열번호 206으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6090 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0023715)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6090 유전자는 Yoo JK 외, 2012년, Stem Cells Dev, 21권, p2049-2057에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6090」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6090」(miRBase Accession No.MI0020367, 서열번호 418)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4730 유전자」 또는 「hsa-miR-4730」이라는 용어는 서열번호 207로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4730 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019852)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4730 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4730」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4730」(miRBase Accession No.MI0017367, 서열번호 419)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7106-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-7106-5p」라는 용어는 서열번호 208로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-7106-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0028109)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7106-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7106-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7106」(miRBase Accession No.MI0022957, 서열번호 420)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3196 유전자」 또는 「hsa-miR-3196」이라는 용어는 서열번호 209로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-3196 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0015080)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3196 유전자는 Stark MS 외, 2010년, PLoS One, 5권, e9685에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3196」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3196」(miRBase Accession No.MI0014241, 서열번호 421)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-5698 유전자」 또는 「hsa-miR-5698」이라는 용어는 서열번호 210으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-5698 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0022491)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-5698 유전자는 Watahiki A 외, 2011년, PLoS One, 6권, e24950에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-5698」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-5698」(miRBase Accession No.MI0019305, 서열번호 422)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6087 유전자」 또는 「hsa-miR-6087」이라는 용어는 서열번호 211로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6087 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0023712)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6087 유전자는 Yoo JK 외, 2012년, Stem Cells Dev, 21권, p2049-2057에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6087」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6087」(miRBase Accession No.MI0020364, 서열번호 423)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4665-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4665-5p」라는 용어는 서열번호 212로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4665-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019739)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4665-5p 유전자는 Persson H 외, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4665-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4665」(miRBase Accession No.MI0017295, 서열번호 275)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-8059 유전자」 또는 「hsa-miR-8059」이라는 용어는 서열번호 213으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-8059 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0030986)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-8059 유전자는 Wang HJ 외, 2013년, Shock, 39권, p480-487에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-8059」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-8059」(miRBase Accession No.MI0025895, 서열번호 424)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6879-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6879-5p」라는 용어는 서열번호 214로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6879-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027658)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6879-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6879-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6879」(miRBase Accession No.MI0022726, 서열번호 425)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6717-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6717-5p」라는 용어는 서열번호 666으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6717-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0025846)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등이 포함된다. hsa-miR-6717-5p 유전자는 Li Y 외, 2012년, Gene, 497권, p330-335에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6717-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6717」(miRBase Accession No.MI0022551, 서열번호 677)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3648 유전자」 또는 「hsa-miR-3648」이라는 용어는 서열번호 667로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-3648 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0018068)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등이 포함된다. hsa-miR-3648 유전자는 Meiri E 외, 2010년, Nucleic Acids Res, 38권, p6234-6246에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3648」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3648」(miRBase Accession No.MI0016048, 서열번호 678)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3162-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-3162-5p」라는 용어는 서열번호 668로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-3162-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0015036)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등이 포함된다. hsa-miR-3162-5p 유전자는 Stark MS 외, 2010년, PLoS One, 5권, e9685에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3162-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3162」(miRBase Accession No.MI0014192, 서열번호 679)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1909-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-1909-3p」라는 용어는 서열번호 669로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1909-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0007883)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등이 포함된다. hsa-miR-1909-3p 유전자는 Bar M 외, 2008년, Stem Cells, 26권, p2496-2505에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1909-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1909」(miRBase Accession No.MI0008330, 서열번호 680)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-8073 유전자」 또는 「hsa-miR-8073」이라는 용어는 서열번호 670으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-8073 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0031000)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등이 포함된다. hsa-miR-8073 유전자는 Wang HJ 외, 2013년, Shock, 39권, p480-487에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-8073」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-8073」(miRBase Accession No.MI0025909, 서열번호 681)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6769b-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6769b-5p」라는 용어는 서열번호 671로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6769b-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027620)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등이 포함된다. hsa-miR-6769b-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6769b-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6769b」(miRBase Accession No.MI0022706, 서열번호 682)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6836-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-6836-3p」라는 용어는 서열번호 672로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6836-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027575)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등이 포함된다. hsa-miR-6836-3p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6836-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6836」(miRBase Accession No.MI0022682, 서열번호 683)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4484 유전자」 또는 「hsa-miR-4484」라는 용어는 서열번호 673으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-4484 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0019018)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등이 포함된다. hsa-miR-4484 유전자는 Jima DD 외, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4484」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4484」(miRBase Accession No.MI0016845, 서열번호 684)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6819-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6819-5p」라는 용어는 서열번호 674로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6819-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027538)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등이 포함된다. hsa-miR-6819-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6819-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6819」(miRBase Accession No.MI0022664, 서열번호 685)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6794-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6794-5p」라는 용어는 서열번호 675로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-6794-5p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0027488)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등이 포함된다. hsa-miR-6794-5p 유전자는 Ladewig E 외, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6794-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6794」(miRBase Accession No.MI0022639, 서열번호 686)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-24-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-24-3p」라는 용어는 서열번호 676으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-24-3p 유전자(miRBase Accession No.MIMAT0000080)나 그 타생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등이 포함된다. hsa-miR-24-3p 유전자는 Lagos-Quintana M 외, 2001년, Science, 294권, p853-858에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-24-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-24-1, hsa-mir-24-2」(miRBase Accession No.MI0000080, MI0000081, 서열번호 687, 688)가 알려져 있다.
또한, 성숙형의 miRNA는 헤어핀 모양 구조를 취하는 RNA 전구체로부터 성숙형 miRNA로서 절출될 때에 서열의 전후 1~수 염기가 짧고, 또는 길게 절출되는 경우나, 염기의 치환이 발생하여 변이체가 되는 경우가 있고, isomiR로 칭해진다(Morin RD. 외, 2008년, Genome Res., 제 18 권, p.610-621). miRBase Release 20에서는 서열번호 1~214 및 666~676 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 이외에 수많은 isomiR로 불리는 서열번호 426~665 및 689~700 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열의 변이체 및 단편도 나타내어져 있다. 이들 변이체도 또한 서열번호 1~214 및 666~676 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열을 갖는 miRNA로서 얻을 수 있다.
즉, 본 발명의 서열번호 1, 2, 6, 9, 13, 18, 20, 21, 23, 28, 29, 30, 31, 34, 36, 40, 41, 46, 47, 50, 52, 54, 55, 56, 58, 64, 66, 67, 68, 72, 73, 74, 76, 77, 79, 80, 83, 84, 85, 87, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 97, 99, 100, 101, 102, 104, 108, 110, 112, 113, 114, 117, 118, 120, 121, 122, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 132, 134, 135, 136, 137, 142, 143, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 155, 156, 158, 160, 162, 164, 166, 167, 173, 174, 178, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 193, 194, 196, 199, 201, 203, 204, 205, 207, 209, 210, 211, 212, 666, 667, 668, 669, 673 및 676으로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 변이체 중, 예를 들면 miRBase Release 20에 등록되어 있는 가장 긴 변이체로서 각각 서열번호 426, 428, 430, 432, 434, 436, 438, 440, 442, 444, 446, 448, 450, 452, 454, 456, 458, 460, 462, 464, 466, 468, 470, 472, 474, 476, 478, 480, 482, 484, 486, 488, 490, 492, 494, 496, 498, 500, 502, 504, 506, 508, 510, 512, 514, 516, 518, 520, 522, 524, 526, 528, 530, 532, 534, 536, 538, 540, 542, 544, 546, 548, 550, 552, 554, 556, 558, 560, 562, 564, 566, 568, 570, 572, 574, 576, 578, 580, 582, 584, 586, 588, 590, 592, 594, 596, 598, 600, 602, 604, 606, 608, 610, 612, 614, 616, 618, 620, 622, 624, 626, 628, 630, 632, 634, 636, 638, 640, 642, 644, 646, 648, 650, 652, 654, 656, 658, 660, 662, 664, 689, 691, 693, 695, 697 및 699로 나타내어지는 폴리뉴클레오티드를 들 수 있다. 또한, 본 발명의 서열번호 1, 2, 6, 9, 13, 18, 20, 21, 23, 28, 29, 30, 31, 34, 36, 40, 41, 46, 47, 50, 52, 54, 55, 56, 58, 64, 66, 67, 68, 72, 73, 74, 76, 77, 79, 80, 83, 84, 85, 87, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 97, 99, 100, 101, 102, 104, 108, 110, 112, 113, 114, 117, 118, 120, 121, 122, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 132, 134, 135, 136, 137, 142, 143, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 155, 156, 158, 160, 162, 164, 166, 167, 173, 174, 178, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 193, 194, 196, 199, 201, 203, 204, 205, 207, 209, 210, 211, 212, 666, 667, 668, 669, 673 및 676으로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 변이체 중, 예를 들면 miRBase Release 20에 등록되어 있는 가장 짧은 변이체로서 각각 서열번호 427, 429, 431, 433, 435, 437, 439, 441, 443, 445, 447, 449, 451, 453, 455, 457, 459, 461, 463, 465, 467, 469, 471, 473, 475, 477, 479, 481, 483, 485, 487, 489, 491, 493, 495, 497, 499, 501, 503, 505, 507, 509, 511, 513, 515, 517, 519, 521, 523, 525, 527, 529, 531, 533, 535, 537, 539, 541, 543, 545, 547, 549, 551, 553, 555, 557, 559, 561, 563, 565, 567, 569, 571, 573, 575, 577, 579, 581, 583, 585, 587, 589, 591, 593, 595, 597, 599, 601, 603, 605, 607, 609, 611, 613, 615, 617, 619, 621, 623, 625, 627, 629, 631, 633, 635, 637, 639, 641, 643, 645, 647, 649, 651, 653, 655, 657, 659, 661, 663, 665, 690, 692, 694, 696, 698 및 700으로 나타내어지는 서열의 폴리뉴클레오티드를 들 수 있다. 또한, 이들의 변이체 및 단편 이외에도 miRBase에 등록된 서열번호 1~214 및 666~676으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 수많은 isomiR인 폴리뉴클레오티드를 들 수 있다. 또한, 서열번호 1~214 및 666~676 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드의 예로서는 각각 전구체인 서열번호 215~425 및 677~688 중 어느 하나로 나타내어지는 폴리뉴클레오티드를 들 수 있다.
서열번호 1~700으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 유전자의 명칭과 miRBase Accession No.(등록 번호)를 표 1에 기재했다.
본 명세서에 있어서 「특이적으로 결합 가능한」이란 본 발명에서 사용하는 핵산 프로브 또는 프라이머가 특정 표적 핵산과 결합하고, 다른 핵산과 실질적으로 결합할 수 없는 것을 의미한다.
본 명세서는 본원의 우선권의 기초인 일본국특허출원 2014-125036호, 2015-070379호의 명세서 및/또는 도면에 기재되는 내용을 포함한다.
(발명의 효과)
본 발명에 의해 식도암을 용이하며 또한 높은 정밀도로 검출하는 것이 가능해졌다. 예를 들면, 저침습적으로 채취할 수 있는 환자의 혈액, 혈청 및 또는 혈장 중 수개의 miRNA 측정값을 지표로 하여 용이하게 환자가 식도암인지의 여부를 검출할 수 있다.
도 1은 전구체인 서열번호 223으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-mir-1343으로부터 생성되는 서열번호 9로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1343-3p, 및 서열번호 138로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 hsa-miR-1343-5p의 관계를 나타낸다.
도 2의 좌측 도면은 학습 검체군으로서 선택한 건상체(100명)와 식도암 환자(34명)의 hsa-miR-204-3p(서열번호 1)의 발현량 측정값을 세로축으로 하여 각각 나타낸 것이다. 도면 중의 수평선은 피셔의 판별분석에 의해 최적화된 양쪽 군을 판별하는 임계값(12.3)을 나타낸다. 도 2의 우측 도면은 테스트 검체군으로서 선택한 건상체(50명)와 식도암 환자(16명)의 hsa-miR-204-3p(서열번호 1)의 발현량 측정값을 세로축으로 하여 각각 나타낸 것이다. 도면 중의 수평선은 학습 검체군에서 설정한 양쪽 군을 판별하는 임계값(12.3)을 나타낸다.
도 3의 좌측 도면은 학습 검체군으로서 선택한 건상체(100명, 원)와 식도암 환자(34명, 삼각)의 hsa-miR-1247-3p(서열번호 2)의 발현량 측정값을 가로축으로 하고, hsa-miR-6857-5p(서열번호 4)의 발현량 측정값을 세로축으로 하여 각각 나타낸 것이다. 도면 중의 선은 피셔의 판별분석에 의해 최적화된 양쪽 군을 판별하는 판별 함수(0=2.42x+y-21.17)를 나타낸다. 도 3의 우측 도면은 테스트 검체군으로서 선택한 건상체(50명, 원)와 식도암 환자(34명, 삼각)의 hsa-miR-1247-3p(서열번호 2)의 발현량 측정값을 가로축으로 하고, hsa-miR-6857-5p(서열번호 4)의 발현량 측정값을 세로축으로 하여 각각 나타낸 것이다. 도면 중의 선은 학습 검체군에서 설정한 양쪽 군을 판별하는 임계값(0=2.42x+y-21.17)을 나타낸다.
도 4A는 학습 검체군으로서 선택한 식도암 환자 34명, 건상체 103명, 췌장암 환자 69명, 담도암 환자 66명, 대장암 환자 30명, 위암 환자 33명, 간암 환자 32명, 및 췌담도 양성질환 환자 15명의 hsa-miR-204-3p(서열번호 1), hsa-miR-6726-5p(서열번호 5), hsa-miR-4723-5p(서열번호 85), hsa-miR-1343-5p(서열번호 138), hsa-miR-4739(서열번호 166), hsa-miR-6717-5p(서열번호 666)의 발현량 측정값으로부터 피셔의 판별분석을 사용하여 판별식을 작성하고(-2.65xhsa-miR-4739-3.01xhsa-miR-1343-5p+0.69xhsa-miR-204-3p+0.95xhsa-miR-4723-5p-0.56xhsa-miR-6726-5p-0.99xhsa-miR-6717-5p+57.33), 그 판별식으로부터 얻어진 판별 득점을 세로축으로 하고, 검체군을 가로축으로 하여 나타낸 것이다. 도면 중의 점선은 판별 득점이 0이 되는 양쪽 군을 판별하는 판별 경계를 나타낸다. 도 4B는 테스트 검체군으로서 선택한 식도암 환자 16명, 건상체 47명, 췌장암 환자 30명, 담도암 환자 33명, 대장암 환자 20명, 위암 환자 17명, 간암 환자 20명, 및 췌담도 양성질환 환자 6명의 hsa-miR-204-3p(서열번호 1), hsa-miR-6726-5p(서열번호 5), hsa-miR-4723-5p(서열번호 85), hsa-miR-1343-5p(서열번호 138), hsa-miR-4739(서열번호 166), hsa-miR-6717-5p(서열번호 666)의 발현량 측정값에 대하여 학습 검체군에서 작성한 상기 판별식으로부터 얻어진 판별 득점을 세로축으로 하고, 검체군을 가로축으로 하여 나타낸 것이다. 도면 중의 점선은 판별 득점이 0이 되는 양쪽 군을 판별하는 판별 경계를 나타낸다.
이하에 본 발명을 더 구체적으로 설명한다.
1. 식도암의 표적 핵산
본 발명의 상기 정의된 식도암 검출용의 핵산 프로브 또는 프라이머를 사용하여 식도암 또는 식도암 세포의 존재 및/또는 부존재를 검출하기 위한 식도암 마커로서의 주요한 표적 핵산에는 hsa-miR-204-3p, hsa-miR-1247-3p, hsa-miR-6875-5p, hsa-miR-6857-5p, hsa-miR-6726-5p, hsa-miR-3188, hsa-miR-8069, hsa-miR-4257, hsa-miR-1343-3p, hsa-miR-7108-5p, hsa-miR-6825-5p, hsa-miR-7641, hsa-miR-3185, hsa-miR-4746-3p, hsa-miR-6791-5p, hsa-miR-6893-5p, hsa-miR-4433b-3p, hsa-miR-3135b, hsa-miR-6781-5p, hsa-miR-1908-5p, hsa-miR-4792, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-4417, hsa-miR-3184-5p, hsa-miR-1225-5p, hsa-miR-1231, hsa-miR-1225-3p, hsa-miR-150-3p, hsa-miR-4433-3p, hsa-miR-6125, hsa-miR-4513, hsa-miR-6787-5p, hsa-miR-6784-5p, hsa-miR-615-5p, hsa-miR-6765-3p, hsa-miR-5572, hsa-miR-6842-5p, hsa-miR-8063, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-187-5p, hsa-miR-128-1-5p, hsa-miR-6729-5p, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-6757-5p, hsa-miR-7110-5p, hsa-miR-7975, hsa-miR-1233-5p, hsa-miR-6845-5p, hsa-miR-3937, hsa-miR-4467, hsa-miR-7109-5p, hsa-miR-6088, hsa-miR-6782-5p, hsa-miR-5195-3p, hsa-miR-4454, hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-8072, hsa-miR-4516, hsa-miR-6756-5p, hsa-miR-4665-3p, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-6820-5p, hsa-miR-6887-5p, hsa-miR-3679-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-6721-5p, hsa-miR-3622a-5p, hsa-miR-939-5p, hsa-miR-602, hsa-miR-7977, hsa-miR-6749-5p, hsa-miR-1914-3p, hsa-miR-4651, hsa-miR-4695-5p, hsa-miR-6848-5p, hsa-miR-1228-3p, hsa-miR-642b-3p, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-3620-5p, hsa-miR-3131, hsa-miR-6732-5p, hsa-miR-7113-3p, hsa-miR-23a-3p, hsa-miR-3154, hsa-miR-4723-5p, hsa-miR-3663-3p, hsa-miR-4734, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR-4442, hsa-miR-4476, hsa-miR-423-5p, hsa-miR-1249, hsa-miR-6515-3p, hsa-miR-887-3p, hsa-miR-4741, hsa-miR-6766-3p, hsa-miR-4673, hsa-miR-6779-5p, hsa-miR-4706, hsa-miR-1268b, hsa-miR-4632-5p, hsa-miR-3197, hsa-miR-6798-5p, hsa-miR-711, hsa-miR-6840-3p, hsa-miR-6763-5p, hsa-miR-6727-5p, hsa-miR-371a-5p, hsa-miR-6824-5p, hsa-miR-4648, hsa-miR-1227-5p, hsa-miR-564, hsa-miR-3679-3p, hsa-miR-2861, hsa-miR-6737-5p, hsa-miR-4725-3p, hsa-miR-6716-5p, hsa-miR-4675, hsa-miR-1915-3p, hsa-miR-671-5p, hsa-miR-3656, hsa-miR-6722-3p, hsa-miR-4707-5p, hsa-miR-4449, hsa-miR-1202, hsa-miR-4649-5p, hsa-miR-744-5p, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-451a, hsa-miR-6870-5p, hsa-miR-4443, hsa-miR-6808-5p, hsa-miR-4728-5p, hsa-miR-937-5p, hsa-miR-135a-3p, hsa-miR-663b, hsa-miR-1343-5p, hsa-miR-6822-5p, hsa-miR-6803-5p, hsa-miR-6805-3p, hsa-miR-128-2-5p, hsa-miR-4640-5p, hsa-miR-1469, hsa-miR-92a-2-5p, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-4281, hsa-miR-1260b, hsa-miR-4758-5p, hsa-miR-1915-5p, hsa-miR-5001-5p, hsa-miR-4286, hsa-miR-6126, hsa-miR-6789-5p, hsa-miR-4459, hsa-miR-1268a, hsa-miR-6752-5p, hsa-miR-6131, hsa-miR-6800-5p, hsa-miR-4532, hsa-miR-6872-3p, hsa-miR-718, hsa-miR-6769a-5p, hsa-miR-4707-3p, hsa-miR-6765-5p, hsa-miR-4739, hsa-miR-4525, hsa-miR-4270, hsa-miR-4534, hsa-miR-6785-5p, hsa-miR-6850-5p, hsa-miR-4697-5p, hsa-miR-1260a, hsa-miR-4486, hsa-miR-6880-5p, hsa-miR-6802-5p, hsa-miR-6861-5p, hsa-miR-92b-5p, hsa-miR-1238-5p, hsa-miR-6851-5p, hsa-miR-7704, hsa-miR-149-3p, hsa-miR-4689, hsa-miR-4688, hsa-miR-125a-3p, hsa-miR-23b-3p, hsa-miR-614, hsa-miR-1913, hsa-miR-16-5p, hsa-miR-6717-5p, hsa-miR-3648, hsa-miR-3162-5p, hsa-miR-1909-3p, hsa-miR-8073, hsa-miR-6769b-5p, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-4484, hsa-miR-6819-5p, 및 hsa-miR-6794-5p로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개의 miRNA를 사용할 수 있다. 또한, 이들 miRNA와 조합시킬 수 있는 다른 식도암 마커, 즉 hsa-miR-575 및 hsa-miR-24-3p로 이루어지는 miRNA도 표적 핵산으로서 바람직하게 사용할 수 있다. 또한, 이들 miRNA와 조합시킬 수 있는 다른 식도암 마커, 즉 hsa-miR-675-5p, hsa-miR-486-3p, hsa-miR-6777-5p, hsa-miR-4497, hsa-miR-296-3p, hsa-miR-6738-5p, hsa-miR-4731-5p, hsa-miR-6889-5p, hsa-miR-6786-5p, hsa-miR-92a-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-4763-3p, hsa-miR-6076, hsa-miR-663a, hsa-miR-760, hsa-miR-4667-5p, hsa-miR-6090, hsa-miR-4730, hsa-miR-7106-5p, hsa-miR-3196, hsa-miR-5698, hsa-miR-6087, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-8059 및 hsa-miR-6879-5p로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개의 miRNA도 표적 핵산으로서 바람직하게 사용할 수 있다.
상기 miRNA에는, 예를 들면 서열번호 1~214 및 666~676 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열을 포함하는 인간 유전자(즉, 각각 hsa-miR-204-3p, hsa-miR-1247-3p, hsa-miR-6875-5p, hsa-miR-6857-5p, hsa-miR-6726-5p, hsa-miR-3188, hsa-miR-8069, hsa-miR-4257, hsa-miR-1343-3p, hsa-miR-7108-5p, hsa-miR-6825-5p, hsa-miR-7641, hsa-miR-3185, hsa-miR-4746-3p, hsa-miR-6791-5p, hsa-miR-6893-5p, hsa-miR-4433b-3p, hsa-miR-3135b, hsa-miR-6781-5p, hsa-miR-1908-5p, hsa-miR-4792, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-4417, hsa-miR-3184-5p, hsa-miR-1225-5p, hsa-miR-1231, hsa-miR-1225-3p, hsa-miR-150-3p, hsa-miR-4433-3p, hsa-miR-6125, hsa-miR-4513, hsa-miR-6787-5p, hsa-miR-6784-5p, hsa-miR-615-5p, hsa-miR-6765-3p, hsa-miR-5572, hsa-miR-6842-5p, hsa-miR-8063, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-187-5p, hsa-miR-128-1-5p, hsa-miR-6729-5p, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-6757-5p, hsa-miR-7110-5p, hsa-miR-7975, hsa-miR-1233-5p, hsa-miR-6845-5p, hsa-miR-3937, hsa-miR-4467, hsa-miR-7109-5p, hsa-miR-6088, hsa-miR-6782-5p, hsa-miR-5195-3p, hsa-miR-4454, hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-8072, hsa-miR-4516, hsa-miR-6756-5p, hsa-miR-4665-3p, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-6820-5p, hsa-miR-6887-5p, hsa-miR-3679-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-6721-5p, hsa-miR-3622a-5p, hsa-miR-939-5p, hsa-miR-602, hsa-miR-7977, hsa-miR-6749-5p, hsa-miR-1914-3p, hsa-miR-4651, hsa-miR-4695-5p, hsa-miR-6848-5p, hsa-miR-1228-3p, hsa-miR-642b-3p, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-3620-5p, hsa-miR-3131, hsa-miR-6732-5p, hsa-miR-7113-3p, hsa-miR-23a-3p, hsa-miR-3154, hsa-miR-4723-5p, hsa-miR-3663-3p, hsa-miR-4734, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR-4442, hsa-miR-4476, hsa-miR-423-5p, hsa-miR-1249, hsa-miR-6515-3p, hsa-miR-887-3p, hsa-miR-4741, hsa-miR-6766-3p, hsa-miR-4673, hsa-miR-6779-5p, hsa-miR-4706, hsa-miR-1268b, hsa-miR-4632-5p, hsa-miR-3197, hsa-miR-6798-5p, hsa-miR-711, hsa-miR-6840-3p, hsa-miR-6763-5p, hsa-miR-6727-5p, hsa-miR-371a-5p, hsa-miR-6824-5p, hsa-miR-4648, hsa-miR-1227-5p, hsa-miR-564, hsa-miR-3679-3p, hsa-miR-2861, hsa-miR-6737-5p, hsa-miR-4725-3p, hsa-miR-6716-5p, hsa-miR-4675, hsa-miR-1915-3p, hsa-miR-671-5p, hsa-miR-3656, hsa-miR-6722-3p, hsa-miR-4707-5p, hsa-miR-4449, hsa-miR-1202, hsa-miR-4649-5p, hsa-miR-744-5p, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-451a, hsa-miR-6870-5p, hsa-miR-4443, hsa-miR-6808-5p, hsa-miR-4728-5p, hsa-miR-937-5p, hsa-miR-135a-3p, hsa-miR-663b, hsa-miR-1343-5p, hsa-miR-6822-5p, hsa-miR-6803-5p, hsa-miR-6805-3p, hsa-miR-128-2-5p, hsa-miR-4640-5p, hsa-miR-1469, hsa-miR-92a-2-5p, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-4281, hsa-miR-1260b, hsa-miR-4758-5p, hsa-miR-1915-5p, hsa-miR-5001-5p, hsa-miR-4286, hsa-miR-6126, hsa-miR-6789-5p, hsa-miR-4459, hsa-miR-1268a, hsa-miR-6752-5p, hsa-miR-6131, hsa-miR-6800-5p, hsa-miR-4532, hsa-miR-6872-3p, hsa-miR-718, hsa-miR-6769a-5p, hsa-miR-4707-3p, hsa-miR-6765-5p, hsa-miR-4739, hsa-miR-4525, hsa-miR-4270, hsa-miR-4534, hsa-miR-6785-5p, hsa-miR-6850-5p, hsa-miR-4697-5p, hsa-miR-1260a, hsa-miR-4486, hsa-miR-6880-5p, hsa-miR-6802-5p, hsa-miR-6861-5p, hsa-miR-92b-5p, hsa-miR-1238-5p, hsa-miR-6851-5p, hsa-miR-7704, hsa-miR-149-3p, hsa-miR-4689, hsa-miR-4688, hsa-miR-125a-3p, hsa-miR-23b-3p, hsa-miR-614, hsa-miR-1913, hsa-miR-16-5p, hsa-miR-6717-5p, hsa-miR-3648, hsa-miR-3162-5p, hsa-miR-1909-3p, hsa-miR-8073, hsa-miR-6769b-5p, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-4484, hsa-miR-6819-5p, hsa-miR-6794-5phsa-miR-575, hsa-miR-24-3p, hsa-miR-675-5p, hsa-miR-486-3p, hsa-miR-6777-5p, hsa-miR-4497, hsa-miR-296-3p, hsa-miR-6738-5p, hsa-miR-4731-5p, hsa-miR-6889-5p, hsa-miR-6786-5p, hsa-miR-92a-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-4763-3p, hsa-miR-6076, hsa-miR-663a, hsa-miR-760, hsa-miR-4667-5p, hsa-miR-6090, hsa-miR-4730, hsa-miR-7106-5p, hsa-miR-3196, hsa-miR-5698, hsa-miR-6087, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-8059 및 hsa-miR-6879-5p), 그 동족체, 그 전사산물, 및 그 변이체 또는 유도체가 포함된다. 여기에서, 유전자, 동족체, 전사산물, 변이체 및 유도체는 상기 정의와 같다.
바람직한 표적 핵산은 서열번호 1~700 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열을 포함하는 인간 유전자, 또는 그 전사산물이며, 보다 바람직하게는 상기 전사산물, 즉 miRNA, 그 전구체 RNA인 pri-miRNA 또는 pre-miRNA이다.
제 1 표적 유전자는 hsa-miR-204-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 2 표적 유전자는 hsa-miR-1247-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 3 표적 유전자는 hsa-miR-6875-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 4 표적 유전자는 hsa-miR-6857-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 5 표적 유전자는 hsa-miR-6726-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 6 표적 유전자는 hsa-miR-3188 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 7 표적 유전자는 hsa-miR-8069 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 8 표적 유전자는 hsa-miR-4257 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 9 표적 유전자는 hsa-miR-1343-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 10 표적 유전자는 hsa-miR-7108-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 11 표적 유전자는 hsa-miR-6825-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 12 표적 유전자는 hsa-miR-7641 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 13 표적 유전자는 hsa-miR-3185 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 14 표적 유전자는 hsa-miR-4746-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 15 표적 유전자는 hsa-miR-6791-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 16 표적 유전자는 hsa-miR-6893-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 17 표적 유전자는 hsa-miR-4433b-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 18 표적 유전자는 hsa-miR-3135b 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 19 표적 유전자는 hsa-miR-6781-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 20 표적 유전자는 hsa-miR-1908-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 21 표적 유전자는 hsa-miR-4792 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 22 표적 유전자는 hsa-miR-7845-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 23 표적 유전자는 hsa-miR-4417 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 24 표적 유전자는 hsa-miR-3184-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 25 표적 유전자는 hsa-miR-1225-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 26 표적 유전자는 hsa-miR-1231 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 27 표적 유전자는 hsa-miR-1225-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 28 표적 유전자는 hsa-miR-150-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 29 표적 유전자는 hsa-miR-4433-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 30 표적 유전자는 hsa-miR-6125 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 31 표적 유전자는 hsa-miR-4513 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 32 표적 유전자는 hsa-miR-6787-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 33 표적 유전자는 hsa-miR-6784-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 34 표적 유전자는 hsa-miR-615-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 35 표적 유전자는 hsa-miR-6765-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 36 표적 유전자는 hsa-miR-5572 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 37 표적 유전자는 hsa-miR-6842-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 38 표적 유전자는 hsa-miR-8063 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 39 표적 유전자는 hsa-miR-6780b-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 40 표적 유전자는 hsa-miR-187-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 41 표적 유전자는 hsa-miR-128-1-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 42 표적 유전자는 hsa-miR-6729-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 43 표적 유전자는 hsa-miR-6741-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 44 표적 유전자는 hsa-miR-6757-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 45 표적 유전자는 hsa-miR-7110-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 46 표적 유전자는 hsa-miR-7975 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 47 표적 유전자는 hsa-miR-1233-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 48 표적 유전자는 hsa-miR-6845-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 49 표적 유전자는 hsa-miR-3937 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 50 표적 유전자는 hsa-miR-4467 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 51 표적 유전자는 hsa-miR-7109-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 52 표적 유전자는 hsa-miR-6088 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 53 표적 유전자는 hsa-miR-6782-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 54 표적 유전자는 hsa-miR-5195-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 55 표적 유전자는 hsa-miR-4454 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 56 표적 유전자는 hsa-miR-6724-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 57 표적 유전자는 hsa-miR-8072 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 58 표적 유전자는 hsa-miR-4516 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 59 표적 유전자는 hsa-miR-6756-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 60 표적 유전자는 hsa-miR-4665-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 61 표적 유전자는 hsa-miR-6826-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 62 표적 유전자는 hsa-miR-6820-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 63 표적 유전자는 hsa-miR-6887-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 64 표적 유전자는 hsa-miR-3679-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 65 표적 유전자는 hsa-miR-7847-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 66 표적 유전자는 hsa-miR-6721-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 67 표적 유전자는 hsa-miR-3622a-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 68 표적 유전자는 hsa-miR-939-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 69 표적 유전자는 hsa-miR-602 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 70 표적 유전자는 hsa-miR-7977 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 71 표적 유전자는 hsa-miR-6749-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 72 표적 유전자는 hsa-miR-1914-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 73 표적 유전자는 hsa-miR-4651 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 74 표적 유전자는 hsa-miR-4695-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 75 표적 유전자는 hsa-miR-6848-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 76 표적 유전자는 hsa-miR-1228-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 77 표적 유전자는 hsa-miR-642b-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 78 표적 유전자는 hsa-miR-6746-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 79 표적 유전자는 hsa-miR-3620-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 80 표적 유전자는 hsa-miR-3131 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 81 표적 유전자는 hsa-miR-6732-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 82 표적 유전자는 hsa-miR-7113-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 83 표적 유전자는 hsa-miR-23a-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 84 표적 유전자는 hsa-miR-3154 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 85 표적 유전자는 hsa-miR-4723-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 86 표적 유전자는 hsa-miR-3663-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 87 표적 유전자는 hsa-miR-4734 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 88 표적 유전자는 hsa-miR-6816-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 89 표적 유전자는 hsa-miR-4442 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 90 표적 유전자는 hsa-miR-4476 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 91 표적 유전자는 hsa-miR-423-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 92 표적 유전자는 hsa-miR-1249 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 93 표적 유전자는 hsa-miR-6515-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 94 표적 유전자는 hsa-miR-887-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 95 표적 유전자는 hsa-miR-4741 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 96 표적 유전자는 hsa-miR-6766-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 97 표적 유전자는 hsa-miR-4673 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 98 표적 유전자는 hsa-miR-6779-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 99 표적 유전자는 hsa-miR-4706 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 100 표적 유전자는 hsa-miR-1268b 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 101 표적 유전자는 hsa-miR-4632-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 102 표적 유전자는 hsa-miR-3197 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 103 표적 유전자는 hsa-miR-6798-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 104 표적 유전자는 hsa-miR-711 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 105 표적 유전자는 hsa-miR-6840-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 106 표적 유전자는 hsa-miR-6763-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 107 표적 유전자는 hsa-miR-6727-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 108 표적 유전자는 hsa-miR-371a-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 109 표적 유전자는 hsa-miR-6824-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 110 표적 유전자는 hsa-miR-4648 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 111 표적 유전자는 hsa-miR-1227-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 112 표적 유전자는 hsa-miR-564 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 113 표적 유전자는 hsa-miR-3679-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 114 표적 유전자는 hsa-miR-2861 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 115 표적 유전자는 hsa-miR-6737-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 116 표적 유전자는 hsa-miR-575 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있다(특허문헌 1).
제 117 표적 유전자는 hsa-miR-4725-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 118 표적 유전자는 hsa-miR-6716-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 119 표적 유전자는 hsa-miR-4675 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 120 표적 유전자는 hsa-miR-1915-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 121 표적 유전자는 hsa-miR-671-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 122 표적 유전자는 hsa-miR-3656 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 123 표적 유전자는 hsa-miR-6722-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 124 표적 유전자는 hsa-miR-4707-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 125 표적 유전자는 hsa-miR-4449 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 126 표적 유전자는 hsa-miR-1202 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 127 표적 유전자는 hsa-miR-4649-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 128 표적 유전자는 hsa-miR-744-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 129 표적 유전자는 hsa-miR-642a-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 130 표적 유전자는 hsa-miR-451a 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 131 표적 유전자는 hsa-miR-6870-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 132 표적 유전자는 hsa-miR-4443 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 133 표적 유전자는 hsa-miR-6808-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 134 표적 유전자는 hsa-miR-4728-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 135 표적 유전자는 hsa-miR-937-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 136 표적 유전자는 hsa-miR-135a-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 137 표적 유전자는 hsa-miR-663b 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 138 표적 유전자는 hsa-miR-1343-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 139 표적 유전자는 hsa-miR-6822-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 140 표적 유전자는 hsa-miR-6803-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 141 표적 유전자는 hsa-miR-6805-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 142 표적 유전자는 hsa-miR-128-2-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 143 표적 유전자는 hsa-miR-4640-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 144 표적 유전자는 hsa-miR-1469 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 145 표적 유전자는 hsa-miR-92a-2-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 146 표적 유전자는 hsa-miR-3940-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 147 표적 유전자는 hsa-miR-4281 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 148 표적 유전자는 hsa-miR-1260b 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 149 표적 유전자는 hsa-miR-4758-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 150 표적 유전자는 hsa-miR-1915-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 151 표적 유전자는 hsa-miR-5001-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 152 표적 유전자는 hsa-miR-4286 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 153 표적 유전자는 hsa-miR-6126 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 154 표적 유전자는 hsa-miR-6789-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 155 표적 유전자는 hsa-miR-4459 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 156 표적 유전자는 hsa-miR-1268a 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 157 표적 유전자는 hsa-miR-6752-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 158 표적 유전자는 hsa-miR-6131 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 159 표적 유전자는 hsa-miR-6800-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 160 표적 유전자는 hsa-miR-4532 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 161 표적 유전자는 hsa-miR-6872-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 162 표적 유전자는 hsa-miR-718 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 163 표적 유전자는 hsa-miR-6769a-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 164 표적 유전자는 hsa-miR-4707-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 165 표적 유전자는 hsa-miR-6765-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 166 표적 유전자는 hsa-miR-4739 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 167 표적 유전자는 hsa-miR-4525 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 168 표적 유전자는 hsa-miR-4270 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 169 표적 유전자는 hsa-miR-4534 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 170 표적 유전자는 hsa-miR-6785-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 171 표적 유전자는 hsa-miR-6850-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 172 표적 유전자는 hsa-miR-4697-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 173 표적 유전자는 hsa-miR-1260a 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 174 표적 유전자는 hsa-miR-4486 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 175 표적 유전자는 hsa-miR-6880-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 176 표적 유전자는 hsa-miR-6802-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 177 표적 유전자는 hsa-miR-6861-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 178 표적 유전자는 hsa-miR-92b-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 179 표적 유전자는 hsa-miR-1238-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 180 표적 유전자는 hsa-miR-6851-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 181 표적 유전자는 hsa-miR-7704 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 182 표적 유전자는 hsa-miR-149-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 183 표적 유전자는 hsa-miR-4689 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 184 표적 유전자는 hsa-miR-4688 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 185 표적 유전자는 hsa-miR-125a-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고가 알려져 있지 않다.
제 186 표적 유전자는 hsa-miR-23b-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고가 알려져 있지 않다.
제 187 표적 유전자는 hsa-miR-614 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고가 알려져 있지 않다.
제 188 표적 유전자는 hsa-miR-1913 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고가 알려져 있지 않다.
제 189 표적 유전자는 hsa-miR-16-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고가 알려져 있지 않다.
제 190 표적 유전자는 hsa-miR-675-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 191 표적 유전자는 hsa-miR-486-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 192 표적 유전자는 hsa-miR-6777-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 193 표적 유전자는 hsa-miR-4497 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 194 표적 유전자는 hsa-miR-296-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 195 표적 유전자는 hsa-miR-6738-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 196 표적 유전자는 hsa-miR-4731-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 197 표적 유전자는 hsa-miR-6889-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 198 표적 유전자는 hsa-miR-6786-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 199 표적 유전자는 hsa-miR-92a-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고가 알려져 있다(특허문헌 1).
제 200 표적 유전자는 hsa-miR-4294 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 201 표적 유전자는 hsa-miR-4763-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 202 표적 유전자는 hsa-miR-6076 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 203 표적 유전자는 hsa-miR-663a 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고가 알려져 있다(특허문헌 1).
제 204 표적 유전자는 hsa-miR-760 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 205 표적 유전자는 hsa-miR-4667-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 206 표적 유전자는 hsa-miR-6090 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 207 표적 유전자는 hsa-miR-4730 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 208 표적 유전자는 hsa-miR-7106-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 209 표적 유전자는 hsa-miR-3196 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 210 표적 유전자는 hsa-miR-5698 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 211 표적 유전자는 hsa-miR-6087 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 212 표적 유전자는 hsa-miR-4665-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 213 표적 유전자는 hsa-miR-8059 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 214 표적 유전자는 hsa-miR-6879-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 215 표적 유전자는 hsa-miR-6717-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 216 표적 유전자는 hsa-miR-3648 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 217 표적 유전자는 hsa-miR-3162-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 218 표적 유전자는 hsa-miR-1909-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 219 표적 유전자는 hsa-miR-8073 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 220 표적 유전자는 hsa-miR-6769b-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 221 표적 유전자는 hsa-miR-6836-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 222 표적 유전자는 hsa-miR-4484 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 223 표적 유전자는 hsa-miR-6819-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 224 표적 유전자는 hsa-miR-6794-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 식도암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 225 표적 유전자는 hsa-miR-24-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고가 알려져 있다(특허문헌 1).
2. 식도암의 검출용의 핵산 프로브 또는 프라이머
본 발명에 있어서는 상기 식도암 마커로서의 표적 핵산에 특이적으로 결합 가능한 핵산을 식도암을 검출 또는 진단하기 위한 핵산, 예를 들면 핵산 프로브 또는 프라이머로서 사용할 수 있다.
본 발명에 있어서, 식도암을 검출하기 위한 또는 식도암을 진단하기 위해서 사용 가능한 핵산 프로브 또는 프라이머는 상기 식도암 마커로서의 표적 핵산, 예를 들면 인간 유래의 hsa-miR-204-3p, hsa-miR-1247-3p, hsa-miR-6875-5p, hsa-miR-6857-5p, hsa-miR-6726-5p, hsa-miR-3188, hsa-miR-8069, hsa-miR-4257, hsa-miR-1343-3p, hsa-miR-7108-5p, hsa-miR-6825-5p, hsa-miR-7641, hsa-miR-3185, hsa-miR-4746-3p, hsa-miR-6791-5p, hsa-miR-6893-5p, hsa-miR-4433b-3p, hsa-miR-3135b, hsa-miR-6781-5p, hsa-miR-1908-5p, hsa-miR-4792, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-4417, hsa-miR-3184-5p, hsa-miR-1225-5p, hsa-miR-1231, hsa-miR-1225-3p, hsa-miR-150-3p, hsa-miR-4433-3p, hsa-miR-6125, hsa-miR-4513, hsa-miR-6787-5p, hsa-miR-6784-5p, hsa-miR-615-5p, hsa-miR-6765-3p, hsa-miR-5572, hsa-miR-6842-5p, hsa-miR-8063, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-187-5p, hsa-miR-128-1-5p, hsa-miR-6729-5p, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-6757-5p, hsa-miR-7110-5p, hsa-miR-7975, hsa-miR-1233-5p, hsa-miR-6845-5p, hsa-miR-3937, hsa-miR-4467, hsa-miR-7109-5p, hsa-miR-6088, hsa-miR-6782-5p, hsa-miR-5195-3p, hsa-miR-4454, hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-8072, hsa-miR-4516, hsa-miR-6756-5p, hsa-miR-4665-3p, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-6820-5p, hsa-miR-6887-5p, hsa-miR-3679-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-6721-5p, hsa-miR-3622a-5p, hsa-miR-939-5p, hsa-miR-602, hsa-miR-7977, hsa-miR-6749-5p, hsa-miR-1914-3p, hsa-miR-4651, hsa-miR-4695-5p, hsa-miR-6848-5p, hsa-miR-1228-3p, hsa-miR-642b-3p, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-3620-5p, hsa-miR-3131, hsa-miR-6732-5p, hsa-miR-7113-3p, hsa-miR-23a-3p, hsa-miR-3154, hsa-miR-4723-5p, hsa-miR-3663-3p, hsa-miR-4734, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR-4442, hsa-miR-4476, hsa-miR-423-5p, hsa-miR-1249, hsa-miR-6515-3p, hsa-miR-887-3p, hsa-miR-4741, hsa-miR-6766-3p, hsa-miR-4673, hsa-miR-6779-5p, hsa-miR-4706, hsa-miR-1268b, hsa-miR-4632-5p, hsa-miR-3197, hsa-miR-6798-5p, hsa-miR-711, hsa-miR-6840-3p, hsa-miR-6763-5p, hsa-miR-6727-5p, hsa-miR-371a-5p, hsa-miR-6824-5p, hsa-miR-4648, hsa-miR-1227-5p, hsa-miR-564, hsa-miR-3679-3p, hsa-miR-2861, hsa-miR-6737-5p, hsa-miR-4725-3p, hsa-miR-6716-5p, hsa-miR-4675, hsa-miR-1915-3p, hsa-miR-671-5p, hsa-miR-3656, hsa-miR-6722-3p, hsa-miR-4707-5p, hsa-miR-4449, hsa-miR-1202, hsa-miR-4649-5p, hsa-miR-744-5p, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-451a, hsa-miR-6870-5p, hsa-miR-4443, hsa-miR-6808-5p, hsa-miR-4728-5p, hsa-miR-937-5p, hsa-miR-135a-3p, hsa-miR-663b, hsa-miR-1343-5p, hsa-miR-6822-5p, hsa-miR-6803-5p, hsa-miR-6805-3p, hsa-miR-128-2-5p, hsa-miR-4640-5p, hsa-miR-1469, hsa-miR-92a-2-5p, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-4281, hsa-miR-1260b, hsa-miR-4758-5p, hsa-miR-1915-5p, hsa-miR-5001-5p, hsa-miR-4286, hsa-miR-6126, hsa-miR-6789-5p, hsa-miR-4459, hsa-miR-1268a, hsa-miR-6752-5p, hsa-miR-6131, hsa-miR-6800-5p, hsa-miR-4532, hsa-miR-6872-3p, hsa-miR-718, hsa-miR-6769a-5p, hsa-miR-4707-3p, hsa-miR-6765-5p, hsa-miR-4739, hsa-miR-4525, hsa-miR-4270, hsa-miR-4534, hsa-miR-6785-5p, hsa-miR-6850-5p, hsa-miR-4697-5p, hsa-miR-1260a, hsa-miR-4486, hsa-miR-6880-5p, hsa-miR-6802-5p, hsa-miR-6861-5p, hsa-miR-92b-5p, hsa-miR-1238-5p, hsa-miR-6851-5p, hsa-miR-7704, hsa-miR-149-3p, hsa-miR-4689, hsa-miR-4688, hsa-miR-125a-3p, hsa-miR-23b-3p, hsa-miR-614, hsa-miR-1913, hsa-miR-16-5p, hsa-miR-6717-5p, hsa-miR-3648, hsa-miR-3162-5p, hsa-miR-1909-3p, hsa-miR-8073, hsa-miR-6769b-5p, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-4484, hsa-miR-6819-5p 또는 hsa-miR-6794-5p 또는 그들의 조합, 또는 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 그들의 변이체 또는 유도체, 및 그들과 경우에 따라 조합시킬 수 있는, hsa-miR-575 또는 hsa-miR-24-3p, 또는 그들의 조합, 또는 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 그들의 변이체 또는 유도체, 및 그들과 경우에 따라 조합시킬 수 있는, hsa-miR-675-5p, hsa-miR-486-3p, hsa-miR-6777-5p, hsa-miR-4497, hsa-miR-296-3p, hsa-miR-6738-5p, hsa-miR-4731-5p, hsa-miR-6889-5p, hsa-miR-6786-5p, hsa-miR-92a-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-4763-3p, hsa-miR-6076, hsa-miR-663a, hsa-miR-760, hsa-miR-4667-5p, hsa-miR-6090, hsa-miR-4730, hsa-miR-7106-5p, hsa-miR-3196, hsa-miR-5698, hsa-miR-6087, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-8059 또는 hsa-miR-6879-5p, 또는 그들의 조합, 또는 그들의 동족체, 그들의 전사산물, 그들의 변이체 또는 유도체의, 존재, 발현량 또는 존재량을 정성적 및/또는 정량적으로 측정하는 것을 가능하게 한다.
상기 표적 핵산은 건상체에 비해 식도암에 이환된 피험체에 있어서 상기 표적 핵산의 종류에 따라 그들의 발현량이 증가하는 것도 있으면 또는 저하하는 것도 있다(이하, 「증가/저하」라고 칭함). 그 때문에 본 발명의 핵산은 식도암의 이환이 의심되는 피험체(예를 들면, 인간) 유래의 체액과 건상체 유래의 체액에 대하여 상기 표적 핵산의 발현량을 측정하고, 그들을 비교하여 식도암을 검출하기 위해서 유효하게 사용할 수 있다.
본 발명에서 사용 가능한 핵산 프로브 또는 프라이머는 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 적어도 1개로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합 가능한 핵산 프로브, 또는 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 적어도 1개로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 증폭하기 위한 프라이머이다.
본 발명에서 사용 가능한 핵산 프로브 또는 프라이머는 또한 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합 가능한 핵산 프로브, 또는 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 증폭하기 위한 프라이머를 포함할 수 있다.
본 발명에서 사용 가능한 핵산 프로브 또는 프라이머는 서열번호 190~214 중 적어도 1개로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합 가능한 핵산 프로브, 또는 서열번호 190~214 중 적어도 1개로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 증폭하기 위한 프라이머를 더 포함할 수 있다.
구체적으로는 상기 핵산 프로브 또는 프라이머는 서열번호 1~700 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드군 및 상보적 폴리뉴클레오티드군, 상기 염기서열에 상보적인 염기서열로 이루어지는 DNA와 스트린젠트한 조건(후술)에서 각각 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드군 및 그 상보적 폴리뉴클레오티드군, 및 그들의 폴리뉴클레오티드군의 염기서열에 있어서 15 이상, 바람직하게는 17 이상의 연속한 염기를 포함하는 폴리뉴클레오티드군으로부터 선택된 1 또는 복수의 폴리뉴클레오티드의 조합을 포함한다. 이들 폴리뉴클레오티드는 표적 핵산인 상기 식도암 마커를 검출하기 위한 핵산 프로브 및 프라이머로서 사용할 수 있다.
더 구체적으로는 본 발명에서 사용 가능한 핵산 프로브 또는 프라이머의 예는 이하의 폴리뉴클레오티드(a)~(e)로 이루어지는 군으로부터 선택되는 1 또는 복수의 폴리뉴클레오티드이다.
(a) 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(b) 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(c) 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(d) 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(e) 상기 (a)~(d) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드.
본 발명에서 사용 가능한 핵산 프로브 또는 프라이머는 상기 폴리뉴클레오티드(a)~(e)로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개의 폴리뉴클레오티드 이외에 하기 (f)~(j)로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드를 더 포함할 수 있다.
(f) 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(g) 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(h) 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(i) 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(j) 상기 (f)~(i) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드.
본 발명에서 사용 가능한 핵산 프로브 또는 프라이머는 상기 폴리뉴클레오티드(a)~(j)로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개의 폴리뉴클레오티드 이외에 하기 (k)~(o)로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드를 더 포함할 수 있다.
(k) 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(l) 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(m) 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(n) 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(o) 상기 (k)~(n) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드.
상기 폴리뉴클레오티드에 있어서 「15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편」은 각 폴리뉴클레오티드의 염기서열에 있어서, 예를 들면 연속하는 15로부터 서열의 전체 염기수 미만, 17로부터 서열의 전체 염기수 미만, 19로부터 서열의 전체 염기수 미만 등의 범위의 염기수를 포함할 수 있지만, 이들에 한정되지 않는 것으로 한다.
본 발명에서 사용되는 상기 폴리뉴클레오티드류 또는 그 단편류는 모두 DNA이어도 좋고 RNA이어도 좋다.
본 발명에서 사용 가능한 상기 폴리뉴클레오티드는 DNA 재조합 기술, PCR법, DNA/RNA 자동 합성기에 의한 방법 등의 일반적인 기술을 사용하여 제작할 수 있다.
DNA 재조합 기술 및 PCR법은, 예를 들면 Ausubel 외, Current Protocols in Molecular Biology, John Willey&Sons, US(1993); Sambrook 외, Molecular Cloning A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, US(1989) 등에 기재되는 기술을 사용할 수 있다.
서열번호 1~214 및 666~676으로 나타내어지는 인간 유래의 hsa-miR-204-3p, hsa-miR-1247-3p, hsa-miR-6875-5p, hsa-miR-6857-5p, hsa-miR-6726-5p, hsa-miR-3188, hsa-miR-8069, hsa-miR-4257, hsa-miR-1343-3p, hsa-miR-7108-5p, hsa-miR-6825-5p, hsa-miR-7641, hsa-miR-3185, hsa-miR-4746-3p, hsa-miR-6791-5p, hsa-miR-6893-5p, hsa-miR-4433b-3p, hsa-miR-3135b, hsa-miR-6781-5p, hsa-miR-1908-5p, hsa-miR-4792, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-4417, hsa-miR-3184-5p, hsa-miR-1225-5p, hsa-miR-1231, hsa-miR-1225-3p, hsa-miR-150-3p, hsa-miR-4433-3p, hsa-miR-6125, hsa-miR-4513, hsa-miR-6787-5p, hsa-miR-6784-5p, hsa-miR-615-5p, hsa-miR-6765-3p, hsa-miR-5572, hsa-miR-6842-5p, hsa-miR-8063, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-187-5p, hsa-miR-128-1-5p, hsa-miR-6729-5p, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-6757-5p, hsa-miR-7110-5p, hsa-miR-7975, hsa-miR-1233-5p, hsa-miR-6845-5p, hsa-miR-3937, hsa-miR-4467, hsa-miR-7109-5p, hsa-miR-6088, hsa-miR-6782-5p, hsa-miR-5195-3p, hsa-miR-4454, hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-8072, hsa-miR-4516, hsa-miR-6756-5p, hsa-miR-4665-3p, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-6820-5p, hsa-miR-6887-5p, hsa-miR-3679-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-6721-5p, hsa-miR-3622a-5p, hsa-miR-939-5p, hsa-miR-602, hsa-miR-7977, hsa-miR-6749-5p, hsa-miR-1914-3p, hsa-miR-4651, hsa-miR-4695-5p, hsa-miR-6848-5p, hsa-miR-1228-3p, hsa-miR-642b-3p, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-3620-5p, hsa-miR-3131, hsa-miR-6732-5p, hsa-miR-7113-3p, hsa-miR-23a-3p, hsa-miR-3154, hsa-miR-4723-5p, hsa-miR-3663-3p, hsa-miR-4734, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR-4442, hsa-miR-4476, hsa-miR-423-5p, hsa-miR-1249, hsa-miR-6515-3p, hsa-miR-887-3p, hsa-miR-4741, hsa-miR-6766-3p, hsa-miR-4673, hsa-miR-6779-5p, hsa-miR-4706, hsa-miR-1268b, hsa-miR-4632-5p, hsa-miR-3197, hsa-miR-6798-5p, hsa-miR-711, hsa-miR-6840-3p, hsa-miR-6763-5p, hsa-miR-6727-5p, hsa-miR-371a-5p, hsa-miR-6824-5p, hsa-miR-4648, hsa-miR-1227-5p, hsa-miR-564, hsa-miR-3679-3p, hsa-miR-2861, hsa-miR-6737-5p, hsa-miR-575, hsa-miR-4725-3p, hsa-miR-6716-5p, hsa-miR-4675, hsa-miR-1915-3p, hsa-miR-671-5p, hsa-miR-3656, hsa-miR-6722-3p, hsa-miR-4707-5p, hsa-miR-4449, hsa-miR-1202, hsa-miR-4649-5p, hsa-miR-744-5p, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-451a, hsa-miR-6870-5p, hsa-miR-4443, hsa-miR-6808-5p, hsa-miR-4728-5p, hsa-miR-937-5p, hsa-miR-135a-3p, hsa-miR-663b, hsa-miR-1343-5p, hsa-miR-6822-5p, hsa-miR-6803-5p, hsa-miR-6805-3p, hsa-miR-128-2-5p, hsa-miR-4640-5p, hsa-miR-1469, hsa-miR-92a-2-5p, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-4281, hsa-miR-1260b, hsa-miR-4758-5p, hsa-miR-1915-5p, hsa-miR-5001-5p, hsa-miR-4286, hsa-miR-6126, hsa-miR-6789-5p, hsa-miR-4459, hsa-miR-1268a, hsa-miR-6752-5p, hsa-miR-6131, hsa-miR-6800-5p, hsa-miR-4532, hsa-miR-6872-3p, hsa-miR-718, hsa-miR-6769a-5p, hsa-miR-4707-3p, hsa-miR-6765-5p, hsa-miR-4739, hsa-miR-4525, hsa-miR-4270, hsa-miR-4534, hsa-miR-6785-5p, hsa-miR-6850-5p, hsa-miR-4697-5p, hsa-miR-1260a, hsa-miR-4486, hsa-miR-6880-5p, hsa-miR-6802-5p, hsa-miR-6861-5p, hsa-miR-92b-5p, hsa-miR-1238-5p, hsa-miR-6851-5p, hsa-miR-7704, hsa-miR-149-3p, hsa-miR-4689, hsa-miR-4688, hsa-miR-125a-3p, hsa-miR-23b-3p, hsa-miR-614, hsa-miR-1913, hsa-miR-16-5p, hsa-miR-6717-5p, hsa-miR-3648, hsa-miR-3162-5p, hsa-miR-1909-3p, hsa-miR-8073, hsa-miR-6769b-5p, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-4484, hsa-miR-6819-5p, hsa-miR-6794-5phsa-miR-675-5p, hsa-miR-24-3p, hsa-miR-486-3p, hsa-miR-6777-5p, hsa-miR-4497, hsa-miR-296-3p, hsa-miR-6738-5p, hsa-miR-4731-5p, hsa-miR-6889-5p, hsa-miR-6786-5p, hsa-miR-92a-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-4763-3p, hsa-miR-6076, hsa-miR-663a, hsa-miR-760, hsa-miR-4667-5p, hsa-miR-6090, hsa-miR-4730, hsa-miR-7106-5p, hsa-miR-3196, hsa-miR-5698, hsa-miR-6087, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-8059 및 hsa-miR-6879-5p는 공지이며, 상술한 바와 같이 그 취득 방법도 알려져 있다. 이 때문에 이 유전자를 클로닝함으로써 본 발명에서 사용 가능한 핵산 프로브 또는 프라이머로서의 폴리뉴클레오티드를 제작할 수 있다.
그와 같은 핵산 프로브 또는 프라이머는 DNA 자동 합성 장치를 사용하여 화학적으로 합성할 수 있다. 이 합성에는 일반적으로 포스포라미디트법이 사용되며, 이 방법에 의해 약 100염기까지의 1본쇄 DNA를 자동 합성할 수 있다. DNA 자동 합성 장치는, 예를 들면 Polygen사, ABI사, Applied BioSystems사 등으로부터 시판되어 있다.
또는 본 발명의 폴리뉴클레오티드는 cDNA 클로닝법에 의해 제작할 수도 있다. cDNA클로닝 기술은, 예를 들면 microRNA Cloning Kit Wako 등을 이용할 수 있다.
여기에서, 서열번호 1~214 및 666~676 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 검출하기 위한 핵산 프로브 및 프라이머의 서열은 miRNA 또는 그 전구체로서는 생체 내에 존재하지 않고 있다. 예를 들면, 서열번호 9 및 서열번호 138로 나타내어지는 염기서열은 서열번호 223으로 나타내어지는 전구체로부터 생성되지만, 이 전구체는 도 1에 나타내어지는 헤어핀 모양 구조를 갖고 있고, 서열번호 9 및 서열번호 138로 나타내어지는 염기서열은 서로 미스매치 서열을 갖고 있다. 마찬가지로, 서열번호 9 또는 서열번호 138로 나타내어지는 염기서열에 대한 완전히 상보적인 염기서열이 생체 내에서 자연히 생성되는 일은 없다. 이 때문에 서열번호 1~214 및 666~676 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열을 검출하기 위한 핵산 프로브 및 프라이머는 생체 내에 존재하지 않는 인공적인 염기서열을 갖게 된다.
3. 식도암 검출용 키트 또는 디바이스
본 발명은 또한 식도암 마커인 표적 핵산을 측정하기 위한 본 발명에 있어서 핵산 프로브 또는 프라이머로서 사용 가능한 폴리뉴클레오티드(이것에는 변이체, 단편, 또는 유도체를 포함함; 이하, 검출용 폴리뉴클레오티드라고 칭하는 경우가 있음)의 1개 또는 복수를 포함하는 식도암 검출용 키트 또는 디바이스를 제공한다.
본 발명에 있어서의 식도암 마커인 표적 핵산은 이하의 A군으로부터 선택된다.
(A군) hsa-miR-204-3p, hsa-miR-1247-3p, hsa-miR-6875-5p, hsa-miR-6857-5p, hsa-miR-6726-5p, hsa-miR-3188, hsa-miR-8069, hsa-miR-4257, hsa-miR-1343-3p, hsa-miR-7108-5p, hsa-miR-6825-5p, hsa-miR-7641, hsa-miR-3185, hsa-miR-4746-3p, hsa-miR-6791-5p, hsa-miR-6893-5p, hsa-miR-4433b-3p, hsa-miR-3135b, hsa-miR-6781-5p, hsa-miR-1908-5p, hsa-miR-4792, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-4417, hsa-miR-3184-5p, hsa-miR-1225-5p, hsa-miR-1231, hsa-miR-1225-3p, hsa-miR-150-3p, hsa-miR-4433-3p, hsa-miR-6125, hsa-miR-4513, hsa-miR-6787-5p, hsa-miR-6784-5p, hsa-miR-615-5p, hsa-miR-6765-3p, hsa-miR-5572, hsa-miR-6842-5p, hsa-miR-8063, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-187-5p, hsa-miR-128-1-5p, hsa-miR-6729-5p, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-6757-5p, hsa-miR-7110-5p, hsa-miR-7975, hsa-miR-1233-5p, hsa-miR-6845-5p, hsa-miR-3937, hsa-miR-4467, hsa-miR-7109-5p, hsa-miR-6088, hsa-miR-6782-5p, hsa-miR-5195-3p, hsa-miR-4454, hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-8072, hsa-miR-4516, hsa-miR-6756-5p, hsa-miR-4665-3p, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-6820-5p, hsa-miR-6887-5p, hsa-miR-3679-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-6721-5p, hsa-miR-3622a-5p, hsa-miR-939-5p, hsa-miR-602, hsa-miR-7977, hsa-miR-6749-5p, hsa-miR-1914-3p, hsa-miR-4651, hsa-miR-4695-5p, hsa-miR-6848-5p, hsa-miR-1228-3p, hsa-miR-642b-3p, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-3620-5p, hsa-miR-3131, hsa-miR-6732-5p, hsa-miR-7113-3p, hsa-miR-23a-3p, hsa-miR-3154, hsa-miR-4723-5p, hsa-miR-3663-3p, hsa-miR-4734, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR-4442, hsa-miR-4476, hsa-miR-423-5p, hsa-miR-1249, hsa-miR-6515-3p, hsa-miR-887-3p, hsa-miR-4741, hsa-miR-6766-3p, hsa-miR-4673, hsa-miR-6779-5p, hsa-miR-4706, hsa-miR-1268b, hsa-miR-4632-5p, hsa-miR-3197, hsa-miR-6798-5p, hsa-miR-711, hsa-miR-6840-3p, hsa-miR-6763-5p, hsa-miR-6727-5p, hsa-miR-371a-5p, hsa-miR-6824-5p, hsa-miR-4648, hsa-miR-1227-5p, hsa-miR-564, hsa-miR-3679-3p, hsa-miR-2861, hsa-miR-6737-5p, hsa-miR-4725-3p, hsa-miR-6716-5p, hsa-miR-4675, hsa-miR-1915-3p, hsa-miR-671-5p, hsa-miR-3656, hsa-miR-6722-3p, hsa-miR-4707-5p, hsa-miR-4449, hsa-miR-1202, hsa-miR-4649-5p, hsa-miR-744-5p, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-451a, hsa-miR-6870-5p, hsa-miR-4443, hsa-miR-6808-5p, hsa-miR-4728-5p, hsa-miR-937-5p, hsa-miR-135a-3p, hsa-miR-663b, hsa-miR-1343-5p, hsa-miR-6822-5p, hsa-miR-6803-5p, hsa-miR-6805-3p, hsa-miR-128-2-5p, hsa-miR-4640-5p, hsa-miR-1469, hsa-miR-92a-2-5p, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-4281, hsa-miR-1260b, hsa-miR-4758-5p, hsa-miR-1915-5p, hsa-miR-5001-5p, hsa-miR-4286, hsa-miR-6126, hsa-miR-6789-5p, hsa-miR-4459, hsa-miR-1268a, hsa-miR-6752-5p, hsa-miR-6131, hsa-miR-6800-5p, hsa-miR-4532, hsa-miR-6872-3p, hsa-miR-718, hsa-miR-6769a-5p, hsa-miR-4707-3p, hsa-miR-6765-5p, hsa-miR-4739, hsa-miR-4525, hsa-miR-4270, hsa-miR-4534, hsa-miR-6785-5p, hsa-miR-6850-5p, hsa-miR-4697-5p, hsa-miR-1260a, hsa-miR-4486, hsa-miR-6880-5p, hsa-miR-6802-5p, hsa-miR-6861-5p, hsa-miR-92b-5p, hsa-miR-1238-5p, hsa-miR-6851-5p, hsa-miR-7704, hsa-miR-149-3p, hsa-miR-4689, hsa-miR-4688, hsa-miR-125a-3p, hsa-miR-23b-3p, hsa-miR-614, hsa-miR-1913, hsa-miR-16-5p, hsa-miR-6717-5p, hsa-miR-3648, hsa-miR-3162-5p, hsa-miR-1909-3p, hsa-miR-8073, hsa-miR-6769b-5p, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-4484, hsa-miR-6819-5p 및 hsa-miR-6794-5p
경우에 따라 측정에 사용할 수 있는 추가의 표적 핵산은 이하의 B군으로부터 선택된다.
(B군) hsa-miR-575 및 hsa-miR-24-3p
경우에 따라 측정에 더 사용할 수 있는 추가의 표적 핵산은 이하의 C군으로부터 선택된다.
(C군) hsa-miR-675-5p, hsa-miR-486-3p, hsa-miR-6777-5p, hsa-miR-4497, hsa-miR-296-3p, hsa-miR-6738-5p, hsa-miR-4731-5p, hsa-miR-6889-5p, hsa-miR-6786-5p, hsa-miR-92a-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-4763-3p, hsa-miR-6076, hsa-miR-663a, hsa-miR-760, hsa-miR-4667-5p, hsa-miR-6090, hsa-miR-4730, hsa-miR-7106-5p, hsa-miR-3196, hsa-miR-5698, hsa-miR-6087, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-8059 및 hsa-miR-6879-5p
본 발명의 키트 또는 디바이스는 상기 식도암 마커인 표적 핵산과 특이적으로 결합 가능한 핵산, 바람직하게는 상기 2에 기재한 폴리뉴클레오티드류로부터 선택되는 1 또는 복수의 폴리뉴클레오티드 또는 그 변이체 등을 포함한다.
구체적으로는 본 발명의 키트 또는 디바이스는 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열을 포함하는(또는 로 이루어지는) 폴리뉴클레오티드, 그 상보적 서열을 포함하는(또는 로 이루어지는) 폴리뉴클레오티드, 그들의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드, 또는 그들의 폴리뉴클레오티드 서열의 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 변이체 또는 단편을 적어도 1개 포함할 수 있다.
본 발명의 키트 또는 디바이스는 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열을 포함하는(또는 로 이루어지는) 폴리뉴클레오티드, 그 상보적 서열을 포함하는(또는 로 이루어지는) 폴리뉴클레오티드, 그들의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드, 또는 그들의 폴리뉴클레오티드 서열의 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 변이체 또는 단편을 1개 이상 더 포함할 수 있다.
본 발명의 키트 또는 디바이스는 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열을 포함하는(또는 로 이루어지는) 폴리뉴클레오티드, 그 상보적 서열을 포함하는(또는 로 이루어지는) 폴리뉴클레오티드, 그들의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드, 또는 그들의 폴리뉴클레오티드 서열의 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 변이체 또는 단편을 1개 이상 더 포함할 수 있다.
본 발명의 키트 또는 디바이스에 포함할 수 있는 단편은, 예를 들면 하기 (1)~(3)로 이루어지는 군으로부터 선택되는 1개 이상, 바람직하게는 2개 이상의 폴리뉴클레오티드이다.
(1) 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열 또는 그 상보적 서열에 있어서, 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 폴리뉴클레오티드.
(2) 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열 또는 그 상보적 서열에 있어서, 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 폴리뉴클레오티드.
(3) 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열 또는 그 상보적 서열에 있어서, 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 폴리뉴클레오티드.
바람직한 실시형태에서는 상기 폴리뉴클레오티드가 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그들의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드, 또는 그들의 15 이상, 바람직하게는 17 이상, 보다 바람직하게는 19 이상의 연속한 염기를 포함하는 변이체이다.
또한, 바람직한 실시형태에서는 상기 폴리뉴클레오티드가 서열번호 116 및 676 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그들의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드, 또는 그들의 15 이상, 바람직하게는 17 이상, 보다 바람직하게는 19 이상의 연속한 염기를 포함하는 변이체이다.
또한, 바람직한 실시형태에서는 상기 폴리뉴클레오티드가 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그들의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드, 또는 그들의 15 이상, 바람직하게는 17 이상, 보다 바람직하게는 19 이상의 연속한 염기를 포함하는 변이체이다.
바람직한 실시형태에서는 상기 단편은 15 이상, 바람직하게는 17 이상, 보다 바람직하게는 19 이상의 연속한 염기를 포함하는 폴리뉴클레오티드일 수 있다.
본 발명에 있어서, 폴리뉴클레오티드의 단편의 사이즈는 각 폴리뉴클레오티드의 염기서열에 있어서, 예를 들면 연속하는 15로부터 서열의 전체 염기수 미만, 17로부터 서열의 전체 염기수 미만, 19로부터 서열의 전체 염기수 미만 등의 범위의 염기수이다.
본 발명의 키트 또는 디바이스를 구성하는 상기 폴리뉴클레오티드의 조합으로서는 구체적으로는 표 1에 나타내어지는 서열번호 1~214 및 666~676의 조합에 관한 상기 폴리뉴클레오티드를 2개, 3개, 4개, 5개, 6개, 7개, 8개, 9개, 10개 또는 그 이상을 조합시켰을 경우를 들 수 있지만, 그들은 어디까지나 예시이며, 다른 여러 가지 가능한 조합 모두가 본 발명에 포함되는 것으로 한다.
예를 들면, 본 발명에 있어서 식도암와 건상체를 판별하기 위한 키트 또는 디바이스를 구성하는 상기 조합으로서는 표 1에 나타내어지는 서열번호 1~214 및 666~676으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 상기 폴리뉴클레오티드를 2개 이상 조합시키는 것이 바람직하고, 통상에서는 2개의 조합에 의해 충분한 성능을 얻을 수 있다.
구체적으로 식도암와 건상체를 판별하기 위한 폴리뉴클레오티드의 2개의 조합으로서 서열번호 1~214 및 666~676에 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 상기 폴리뉴클레오티드로 구성되는 2개의 조합 중, 신규로 발견된 서열번호 1~115, 117~189 및 666~675로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 조합이 바람직하다.
또한, 식도암을 건상체뿐만 아니라 다른 암과도 판별할 수 있는 암 종특이성이 있는 폴리뉴클레오티드의 조합으로서, 예를 들면 서열번호 1, 2, 5, 8, 22, 32, 33, 35, 43, 44, 56, 85, 98, 106, 109, 115, 121, 126, 133, 138, 155, 157, 166, 177, 179, 185, 202, 212, 666, 667, 668, 669, 670, 671, 672, 673, 674, 675, 및 676으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군(이하, 본 군을 「암 종특이성 폴리뉴클레오티드군 1」로 함)으로부터 선택되는 적어도 1개의 폴리뉴클레오티드와, 그 외의 서열번호의 폴리뉴클레오티드의 2개의 조합이 바람직하다.
암 종특이성이 있는 폴리뉴클레오티드의 조합으로서 보다 바람직한 조합은 암 종특이성 폴리뉴클레오티드군 1로부터 선택되는 복수개의 폴리뉴클레오티드의 조합이다.
또한, 암 종특이성이 있는 폴리뉴클레오티드의 조합으로서 더 바람직한 조합은 암 종특이성 폴리뉴클레오티드군 1로부터 선택되는 복수개의 폴리뉴클레오티드의 조합 중, 암 종특이성 폴리뉴클레오티드군 1에 포함되는 서열번호 1, 22, 85, 109, 121, 126, 133, 138, 166 및 666으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리튜클레오티드로 이루어지는 군(이후, 본 군을 「암 종특이성 폴리뉴클레오티드군 2」로 함)으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 조합이다.
상기 암 종특이성이 있는 폴리뉴클레오티드의 조합의 개수로서는 1개, 2개, 3개, 4개, 5개, 6개, 7개, 8개, 9개, 10개 또는 그 이상의 개수를 조합이 가능하지만, 보다 바람직하게는 6개 이상의 조합이며, 통상에서는 6개의 조합으로 충분한 성능을 얻을 수 있다.
이하에 비한정적으로 서열번호 1로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 암 종특이성 폴리뉴클레오티드군 1로부터 선택되는 5개의 폴리뉴클레오티드의 서열번호로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합을 예시한다.
(1) 서열번호 1, 85, 138, 166, 666, 및 668(마커: hsa-miR-4739, hsa-miR-1343-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4723-5p, hsa-miR-3162-5p, 및 hsa-miR-6717-5p)로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(2) 서열번호 1, 85, 98, 138, 166, 및 666(마커: hsa-miR-4739, hsa-miR-1343-5p, hsa-miR-6779-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4723-5p, 및 hsa-miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(3) 서열번호 1, 85, 138, 155, 166, 및 666(마커: hsa-miR-4739, hsa-miR-1343-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4723-5p, hsa-miR-4459, 및 hsa-miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(4) 서열번호 1, 5, 85, 138, 166, 및 666(마커: hsa-miR-4739, hsa-miR-1343-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4723-5p, hsa-miR-6726-5p, 및 hsa-miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(5) 서열번호 1, 35, 85, 138, 166, 및 666(마커: hsa-miR-4739, hsa-miR-1343-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4723-5p, hsa-miR-6765-3p, 및 hsa-miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
또한, 비한정적으로 서열번호 22로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 암 종특이성 폴리뉴클레오티드군 1로부터 선택되는 5개의 폴리뉴클레오티드의 서열번호로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합을 예시한다.
(1) 서열번호 1, 22, 85, 138, 166, 및 666(마커: hsa-miR-4739, hsa-miR-1343-5p, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4723-5p, 및 hsa-miR-6717-5p)의 조합
(2) 서열번호 22, 32, 121, 133, 166, 및 666(마커: hsa-miR-4739, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-671-5p, hsa-miR-6787-5p, hsa-miR-6808-5p, 및 hsa-miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(3) 서열번호 1, 22, 126, 138, 166, 및 666(마커: hsa-miR-4739, hsa-miR-1202, hsa-miR-1343-5p, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-204-3p, 및 hsa-miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(4) 서열번호 1, 22, 121, 155, 166, 및 666(마커: hsa-miR-4739, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-671-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4459, 및 hsa-miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(5) 서열번호 22, 32, 109, 121, 666, 및 667(마커: hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-671-5p, hsa-miR-3648, hsa-miR-6787-5p, hsa-miR-6824-5p, 및 hsa-miR-6717-5p)로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
또한, 비한정적으로 서열번호 85로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 암 종특이성 폴리뉴클레오티드군 1로부터 선택되는 5개의 폴리뉴클레오티드의 서열번호로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합을 예시한다.
(1) 서열번호 85, 138, 166, 185, 666, 및 669(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-125a-3p, miR-4723-5p, miR-1909-3p, 및 miR-6717-5p)로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(2) 서열번호 85, 138, 166, 185, 666, 및 676(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-125a-3p, miR-4723-5p, miR-6717-5p, 및 miR-24-3p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(3) 서열번호 85, 138, 166, 177, 185, 및 666(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-125a-3p, miR-4723-5p, miR-6861-5p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(4) 서열번호 85, 138, 166, 185, 666, 및 667(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-3648, miR-125a-3p, miR-4723-5p, 및 miR-6717-5p)로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(5) 서열번호 33, 85, 138, 166, 185, 및 666(마커: miR-6784-5p, miR-4739, miR-1343-5p, miR-125a-3p, miR-4723-5p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
또한, 비한정적으로 서열번호 109로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 암 종특이성 폴리뉴클레오티드군 1로부터 선택되는 5개의 폴리뉴클레오티드의 서열번호로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합을 예시한다.
(1) 서열번호 109, 121, 126, 138, 166, 및 666(마커: miR-4739, miR-1202, miR-1343-5p, miR-671-5p, miR-6824-5p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(2) 서열번호 1, 85, 109, 138, 166, 및 666(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-204-3p, miR-4723-5p, miR-6824-5p, miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(3) 서열번호 1, 109, 121, 138, 166, 및 666(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-671-5p, miR-204-3p, miR-6824-5p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(4) 서열번호 109, 126, 138, 166, 666, 및 676(마커: miR-4739, miR-1202, miR-1343-5p, miR-6824-5p, miR-6717-5p, 및 miR-24-3p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(5) 서열번호 109, 126, 138, 166, 202, 및 666(마커: miR-4739, miR-1202, miR-1343-5p, miR-6824-5p, miR-6076, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
또한, 비한정적으로 서열번호 121로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 암 종특이성 폴리뉴클레오티드군 1로부터 선택되는 5개의 폴리뉴클레오티드의 서열번호로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합을 예시한다.
(1) 서열번호 1, 121, 138, 166, 666, 및 668(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-671-5p, miR-204-3p, miR-3162-5p, 및 miR-6717-5p)로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(2) 서열번호 1, 33, 121, 138, 166, 및 666(마커: miR-6784-5p, miR-4739, miR-1343-5p, miR-671-5p, miR-204-3p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(3) 서열번호 1, 85, 121, 138, 166, 및 666(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-671-5p, miR-204-3p, miR-4723-5p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(4) 서열번호 1, 121, 138, 166, 179, 및 666(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-671-5p, miR-204-3p, miR-1238-5p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(5) 서열번호 1, 121, 138, 166, 177, 및 666(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-671-5p, miR-204-3p, miR-6861-5p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
또한, 비한정적으로 서열번호 126으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 암 종특이성 폴리뉴클레오티드군 1로부터 선택되는 5개의 폴리뉴클레오티드의 서열번호로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합을 예시한다.
(1) 서열번호 32, 109, 126, 138, 166, 및 666(마커: miR-4739, miR-1202, miR-1343-5p, miR-6787-5p, miR-6824-5p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(2) 서열번호 1, 85, 126, 138, 166, 및 666(마커: miR-4739, miR-1202, miR-1343-5p, miR-204-3p, miR-4723-5p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(3) 서열번호 1, 109, 126, 138, 166, 및 666(마커: miR-4739, miR-1202, miR-1343-5p, miR-204-3p, miR-6824-5p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(4) 서열번호 22, 109, 126, 138, 166, 및 666(마커: miR-4739, miR-1202, miR-1343-5p, miR-7845-5p, miR-6824-5p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(5) 서열번호 109, 126, 138, 157, 166, 및 666(마커: miR-4739, miR-1202, miR-6752-5p, miR-1343-5p, miR-6824-5p, 및 miR-6717-5p)의 조합
또한, 비한정적으로 서열번호 133으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 암 종특이성 폴리뉴클레오티드군 1로부터 선택되는 5개의 폴리뉴클레오티드의 서열번호로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합을 예시한다.
(1) 서열번호 126, 133, 138, 166, 666, 및 672(마커: miR-4739, miR-1202, miR-1343-5p, miR-6808-5p, miR-6836-3p, 및 miR-6717-5p)로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(2) 서열번호 126, 133, 138, 166, 666, (마커: miR-4739, miR-1202, miR-1343-5p, miR-6808-5p, 및 miR-6717-5p,)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(3) 서열번호 109, 126, 133, 138, 166, 및 666(마커: miR-4739, miR-1202, miR-1343으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드-5p, miR-6824-5p, miR-6808-5p, 및 miR-6717-5p)의 조합
(4) 서열번호 126, 133, 138, 166, 666, 및 673(마커: miR-4739, miR-1202, miR-1343-5p, miR-4484, miR-6808-5p, 및 miR-6717-5p)의 조합
(5) 서열번호 126, 133, 138, 166, 666, 및 675(마커: miR-4739, miR-1202, miR-1343-5p, miR-6794-5p, miR-6808-5p, 및 miR-6717-5p)로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
또한, 비한정적으로 서열번호 138로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 암 종특이성 폴리뉴클레오티드군 1로부터 선택되는 5개의 폴리뉴클레오티드의 서열번호로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합을 예시한다.
(1) 서열번호 1, 85, 138, 166, 666, 및 669(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-204-3p, miR-4723-5p, miR-1909-3p, 및 miR-6717-5p)로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(2) 서열번호 8, 85, 138, 166, 185, 및 666(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-125a-3p, miR-4723-5p, miR-4257, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(3) 서열번호 1, 35, 121, 138, 166, 및 666(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-671-5p, miR-204-3p, miR-6765-3p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(4) 서열번호 1, 121, 126, 138, 166, 및 666(마커: miR-4739, miR-1202, miR-1343-5p, miR-671-5p, miR-204-3p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(5) 서열번호 1, 121, 138, 166, 666, 및 672(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-671-5p, miR-204-3p, miR-6836-3p, 및 miR-6717-5p)로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
또한, 비한정적으로 서열번호 166으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 암 종특이성 폴리뉴클레오티드군 1로부터 선택되는 5개의 폴리뉴클레오티드의 서열번호로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합을 예시한다.
(1) 서열번호 1, 85, 138, 166, 666, 및 672(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-204-3p, miR-4723-5p, miR-6836-3p, 및 miR-6717-5p)로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(2) 서열번호 56, 85, 138, 166, 185, 및 666(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-125a-3p, miR-6724-5p, miR-4723-5p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(3) 서열번호 1, 32, 121, 138, 166, 및 666(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-671-5p, miR-204-3p, miR-6787-5p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(4) 서열번호 1, 22, 121, 138, 166, 및 666(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-7845-5p, miR-671-5p, miR-204-3p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(5) 서열번호 5, 85, 138, 166, 185, 및 666(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-125a-3p, miR-4723-5p, miR-6726-5p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
또한, 비한정적으로 서열번호 666으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 암 종특이성 폴리뉴클레오티드군 1로부터 선택되는 5개의 폴리뉴클레오티드의 서열번호로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합을 예시한다.
(1) 서열번호 1, 121, 138, 157, 166, 및 666(마커: miR-4739, miR-6752-5p, miR-1343-5p, miR-671-5p, miR-204-3p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(2) 서열번호 1, 85, 133, 138, 166, 및 666(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-204-3p, miR-4723-5p, miR-6808-5p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(3) 서열번호 1, 121, 138, 166, 185, 및 666(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-671-5p, miR-204-3p, miR-125a-3p, 및 miR-6717-5p)으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(4) 서열번호 1, 121, 138, 166, 666, 및 667(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-671-5p, miR-3648, miR-204-3p, 및 miR-6717-5p)로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합
(5) 서열번호 85, 138, 166, 185, 및 666(마커: miR-4739, miR-1343-5p, miR-125a-3p, miR-4723-5p, 및 miR-6717-5p,)의 조합
본 발명의 키트 또는 디바이스에는 위에서 설명한 본 발명에 있어서의 폴리뉴클레오티드(이것에는 변이체, 단편 또는 유도체를 포함할 수 있음)에 추가하여 식도암 검출을 가능하게 하는 기지의 폴리뉴클레오티드 또는 장래 발견될 수 있는 폴리뉴클레오티드도 포함시킬 수 있다.
본 발명의 키트에는 위에서 설명한 본 발명에 있어서의 폴리뉴클레오티드 등에 추가하여 CEA나 SCC 등의 공지의 식도암 검사용 마커를 측정하기 위한 항체도 포함시킬 수 있다.
본 발명의 키트에 포함되는 상기 폴리뉴클레오티드는 개별적으로 또는 임의로 조합하여 다른 용기에 포장될 수 있다.
본 발명의 키트에는 체액, 세포 또는 조직으로부터 핵산(예를 들면, total RNA)을 추출하기 위한 키트, 표지용 형광물질, 핵산 증폭용 효소 및 배지, 사용 설명서 등을 포함시킬 수 있다.
본 발명의 디바이스는 위에서 설명한 본 발명에 있어서의 폴리뉴클레오티드 등의 핵산이, 예를 들면 고상에 결합 또는 부착된 암 마커 측정을 위한 디바이스이다. 고상의 재질의 예는 플라스틱, 종이, 유리, 실리콘 등이며, 가공의 용이함으로부터 바람직한 고상의 재질은 플라스틱이다. 고상의 형상은 임의이며, 예를 들면 사각형, 원형, 직사각형, 필름형 등이다. 본 발명의 디바이스는, 예를 들면 하이브리다이제이션 기술에 의한 측정을 위한 디바이스가 포함되고, 구체적으로는 블러팅 디바이스, 핵산 어레이(예를 들면, 마이크로 어레이, DNA칩, RNA칩 등) 등이 예시된다.
핵산 어레이 기술은 필요에 따라서 L리신 코트나 아미노기, 카르복실기 등의 관능기 도입 등의 표면 처리가 실시된 고상의 표면에 스팟터 또는 어레이어라고 불리는 고밀도 분주기를 사용하여 핵산을 스팟팅하는 방법, 노즐로부터 미소한 액적을 압전 소자 등에 의해 분사하는 잉크젯을 사용하여 핵산을 고상에 블로잉하는 방법, 고상 상에서 순차적으로 뉴클레오티드 합성을 행하는 방법 등의 방법을 사용하여 상기 핵산을 1개씩 결합 또는 부착시킴으로써 칩 등의 어레이를 제작하고, 이 어레이를 사용하여 하이브리다이제이션을 이용하여 표적 핵산을 측정하는 기술이다.
본 발명의 키트 또는 디바이스는 상기 군 1의 식도암 마커인 miRNA의 적어도 1개, 바람직하게는 적어도 2개, 더 바람직하게는 적어도 3개, 가장 바람직하게는 적어도 5개로부터 모든 폴리뉴클레오티드의 각각과 특이적으로 결합 가능한 핵산을 포함한다. 본 발명의 키트 또는 디바이스는 경우에 따라 상기 군 2의 식도암 마커인 miRNA의 적어도 1개, 바람직하게는 적어도 2개, 더 바람직하게는 적어도 3개, 가장 바람직하게는 적어도 5개로부터 전부의 폴리뉴클레오티드의 각각과 특이적으로 결합 가능한 핵산을 더 포함할 수 있다.
본 발명의 키트 또는 디바이스는 하기 4의 식도암의 검출을 위해서 사용할 수 있다.
4. 식도암의 검출 방법
본 발명은 상기 「3. 식도암 검출용 키트 또는 디바이스」에서 설명한 본 발명의 키트 또는 디바이스(본 발명에서 사용 가능한 상기 핵산을 포함함)를 사용하여 검체 중의 이하의 군 1로부터 선택되는 hsa-miR-204-3p, hsa-miR-1247-3p, hsa-miR-6875-5p, hsa-miR-6857-5p, hsa-miR-6726-5p, hsa-miR-3188, hsa-miR-8069, hsa-miR-4257, hsa-miR-1343-3p, hsa-miR-7108-5p, hsa-miR-6825-5p, hsa-miR-7641, hsa-miR-3185, hsa-miR-4746-3p, hsa-miR-6791-5p, hsa-miR-6893-5p, hsa-miR-4433b-3p, hsa-miR-3135b, hsa-miR-6781-5p, hsa-miR-1908-5p, hsa-miR-4792, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-4417, hsa-miR-3184-5p, hsa-miR-1225-5p, hsa-miR-1231, hsa-miR-1225-3p, hsa-miR-150-3p, hsa-miR-4433-3p, hsa-miR-6125, hsa-miR-4513, hsa-miR-6787-5p, hsa-miR-6784-5p, hsa-miR-615-5p, hsa-miR-6765-3p, hsa-miR-5572, hsa-miR-6842-5p, hsa-miR-8063, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-187-5p, hsa-miR-128-1-5p, hsa-miR-6729-5p, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-6757-5p, hsa-miR-7110-5p, hsa-miR-7975, hsa-miR-1233-5p, hsa-miR-6845-5p, hsa-miR-3937, hsa-miR-4467, hsa-miR-7109-5p, hsa-miR-6088, hsa-miR-6782-5p, hsa-miR-5195-3p, hsa-miR-4454, hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-8072, hsa-miR-4516, hsa-miR-6756-5p, hsa-miR-4665-3p, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-6820-5p, hsa-miR-6887-5p, hsa-miR-3679-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-6721-5p, hsa-miR-3622a-5p, hsa-miR-939-5p, hsa-miR-602, hsa-miR-7977, hsa-miR-6749-5p, hsa-miR-1914-3p, hsa-miR-4651, hsa-miR-4695-5p, hsa-miR-6848-5p, hsa-miR-1228-3p, hsa-miR-642b-3p, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-3620-5p, hsa-miR-3131, hsa-miR-6732-5p, hsa-miR-7113-3p, hsa-miR-23a-3p, hsa-miR-3154, hsa-miR-4723-5p, hsa-miR-3663-3p, hsa-miR-4734, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR-4442, hsa-miR-4476, hsa-miR-423-5p, hsa-miR-1249, hsa-miR-6515-3p, hsa-miR-887-3p, hsa-miR-4741, hsa-miR-6766-3p, hsa-miR-4673, hsa-miR-6779-5p, hsa-miR-4706, hsa-miR-1268b, hsa-miR-4632-5p, hsa-miR-3197, hsa-miR-6798-5p, hsa-miR-711, hsa-miR-6840-3p, hsa-miR-6763-5p, hsa-miR-6727-5p, hsa-miR-371a-5p, hsa-miR-6824-5p, hsa-miR-4648, hsa-miR-1227-5p, hsa-miR-564, hsa-miR-3679-3p, hsa-miR-2861, hsa-miR-6737-5p, hsa-miR-4725-3p, hsa-miR-6716-5p, hsa-miR-4675, hsa-miR-1915-3p, hsa-miR-671-5p, hsa-miR-3656, hsa-miR-6722-3p, hsa-miR-4707-5p, hsa-miR-4449, hsa-miR-1202, hsa-miR-4649-5p, hsa-miR-744-5p, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-451a, hsa-miR-6870-5p, hsa-miR-4443, hsa-miR-6808-5p, hsa-miR-4728-5p, hsa-miR-937-5p, hsa-miR-135a-3p, hsa-miR-663b, hsa-miR-1343-5p, hsa-miR-6822-5p, hsa-miR-6803-5p, hsa-miR-6805-3p, hsa-miR-128-2-5p, hsa-miR-4640-5p, hsa-miR-1469, hsa-miR-92a-2-5p, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-4281, hsa-miR-1260b, hsa-miR-4758-5p, hsa-miR-1915-5p, hsa-miR-5001-5p, hsa-miR-4286, hsa-miR-6126, hsa-miR-6789-5p, hsa-miR-4459, hsa-miR-1268a, hsa-miR-6752-5p, hsa-miR-6131, hsa-miR-6800-5p, hsa-miR-4532, hsa-miR-6872-3p, hsa-miR-718, hsa-miR-6769a-5p, hsa-miR-4707-3p, hsa-miR-6765-5p, hsa-miR-4739, hsa-miR-4525, hsa-miR-4270, hsa-miR-4534, hsa-miR-6785-5p, hsa-miR-6850-5p, hsa-miR-4697-5p, hsa-miR-1260a, hsa-miR-4486, hsa-miR-6880-5p, hsa-miR-6802-5p, hsa-miR-6861-5p, hsa-miR-92b-5p, hsa-miR-1238-5p, hsa-miR-6851-5p, hsa-miR-7704, hsa-miR-149-3p, hsa-miR-4689, hsa-miR-4688, hsa-miR-125a-3p, hsa-miR-23b-3p, hsa-miR-614, hsa-miR-1913, hsa-miR-16-5p, hsa-miR-6717-5p, hsa-miR-3648, hsa-miR-3162-5p, hsa-miR-1909-3p, hsa-miR-8073, hsa-miR-6769b-5p, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-4484, hsa-miR-6819-5p 및 hsa-miR-6794-5p로부터 선택되는 식도암 유래의 유전자의 발현량 및 경우에 따라 이하의 군 2로부터 선택되는 hsa-miR-575 및 hsa-miR-24-3p로부터 선택되는 식도암 유래의 유전자의 발현량, 및 경우에 따라 이하의 군 3으로부터 선택되는 hsa-miR-675-5p, hsa-miR-486-3p, hsa-miR-6777-5p, hsa-miR-4497, hsa-miR-296-3p, hsa-miR-6738-5p, hsa-miR-4731-5p, hsa-miR-6889-5p, hsa-miR-6786-5p, hsa-miR-92a-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-4763-3p, hsa-miR-6076, hsa-miR-663a, hsa-miR-760, hsa-miR-4667-5p, hsa-miR-6090, hsa-miR-4730, hsa-miR-7106-5p, hsa-miR-3196, hsa-miR-5698, hsa-miR-6087, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-8059 및 hsa-miR-6879-5p로부터 선택되는 식도암 유래의 유전자의 발현량 중 1개 이상으로 나타내어지는 식도암 유래의 유전자의 발현량을 in vitro에서 측정하고, 또한 식도암의 이환이 의심되는 피험체와, 건상체(비식도암 환자를 포함함)로부터 채취한 혈액, 혈청, 혈장 등의 검체에 대하여 검체 중의 상기 유전자의 발현량과, 건상체의 대조 발현량을 사용하여, 예를 들면 양쪽 발현량을 비교하여 상기 검체 중의 표적 핵산의 발현량에 차가 있을 경우, 피험체가 식도암에 이환되어 있는 것으로 평가하는 것을 포함하는 식도암의 검출 방법을 더 제공한다.
본 발명의 상기 방법은 저침습적으로 감도 및 특이도가 높은 암의 조기진단을 가능하게 하고, 이에 따라 조기의 치료 및 예후의 개선을 초래하고, 또한 질병증오의 모니터나 외과적, 방사선요법적, 및 화학요법적인 치료의 유효성의 모니터를 가능하게 한다.
본 발명의 혈액, 혈청, 혈장 등의 검체로부터 식도암 유래의 유전자를 추출하는 방법에서는 3D-Gene(등록상표) RNA extraction reagent from liquid sample kit(TORAY INDUSTRIES, INC.) 중의 RNA 추출용 시약을 첨가하여 조제하는 것이 특히 바람직하지만, 일반적인 산성 페놀법(Acid Guanidinium-Phenol-Chloroform(AGPC)법)을 사용해도 좋으며, Trizol(등록상표)(Life Technologies Corporation)을 사용해도 좋고, Trizol(Life Technologies Corporation)이나 Isogen(NIPPON GENE CO., LTD.) 등의 산성 페놀을 포함하는 RNA 추출용 시약을 첨가하여 조제해도 좋다. 또한, miRNeasy(등록상표) Mini Kit(QIAGEN) 등의 키트를 이용할 수 있지만, 이들의 방법에 한정되지 않는다.
본 발명은 또한 본 발명의 키트 또는 디바이스의 피험체 유래의 검체 중의 식도암 유래의 miRNA 유전자의 발현산물의 in vitro에서의 검출을 위한 사용을 제공한다.
본 발명의 상기 방법에 있어서, 상기 키트 또는 디바이스는 위에서 설명한 본 발명에서 사용 가능한 폴리뉴클레오티드를 단일이며 또는 모든 가능한 조합으로 포함하는 것이 사용된다.
본 발명의 식도암의 검출 또는 (유전자)진단에 있어서 본 발명의 키트 또는 디바이스에 포함되는 폴리뉴클레오티드는 프로브 또는 프라이머로서 사용할 수 있다. 프라이머로서 사용할 경우에는 Life Technologies Corporation의 TaqMan(등록상표) MicroRNA Assays, QIAGEN의 miScript PCR System 등을 이용할 수 있지만, 이들 방법에 한정되지 않는다.
본 발명의 키트 또는 디바이스에 포함되는 폴리뉴클레오티드는 노던블로팅법, 서던블로팅법, in situ 하이브리다이제이션법, 노던하이브리다이제이션법, 서던하이브리다이제이션법 등의 하이브리다이제이션 기술, 정량 RT-PCR법 등의 정량 증폭 기술 등의 특정 유전자를 특이적으로 검출하는 공지의 방법에 있어서 정법에 따라 프라이머 또는 프로브로서 이용할 수 있다. 측정 대상 검체로서는 사용하는 검출 방법의 종류에 따라 피험체의 혈액, 혈청, 혈장, 요 등의 체액을 채취한다. 또는 그러한 체액, 상기 방법에 의해 조제한 total RNA를 사용해도 좋고, 또한 상기 RNA을 기초로 하여 조제되는 cDNA를 포함하는 각종 폴리뉴클레오티드를 사용해도 좋다.
본 발명의 키트 또는 디바이스는 식도암의 진단 또는 이환의 유무의 검출을 위해서 유용하다. 구체적으로는 상기 키트 또는 디바이스를 사용한 식도암의 검출은 식도암의 이환이 의심되는 피험체로부터 혈액, 혈청, 혈장, 요 등의 검체를 사용하여 상기 키트 또는 디바이스에 포함되는 핵산 프로브 또는 프라이머에서 검출되는 유전자의 발현량을 in vitro에서 검출함으로써 행할 수 있다. 식도암의 이환이 의심되는 피험체의 혈액, 혈청, 혈장, 요 등의 검체 중의 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 적어도 1개로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열, 및 경우에 따라 서열번호 116 및 676 중 1개 이상으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열, 및 경우에 따라 서열번호 190~214 중 1개 이상으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드(그 변이체, 단편 또는 유도체를 포함함)에 의해 측정되는 표적 miRNA 마커의 발현량이 건상체의 혈액, 혈청, 또는 혈장, 요 등의 검체 중의 그들의 발현량과 비교하여 통계학적으로 유의하게 낮거나 또는 높을 경우, 상기 피험체는 식도암에 이환되어 있는 것으로 평가할 수 있다.
본 발명의 방법은 식도조영검사, 내시경검사, CT검사, MRI검사, 내시경초음파검사, 초음파검사 등의 화상진단법과 조합시킬 수 있다. 본 발명의 방법은 식도암을 특이적으로 검출하는 것이 가능하며, 식도암 이외의 암으로부터 실질적으로 식별할 수 있다.
본 발명의 키트 또는 디바이스를 이용한 검체 중에 식도암 유래의 유전자의 발현산물이 포함되지 않는 것, 또는 식도암 유래의 유전자의 발현산물이 포함되는 것의 검출 방법은 피험체의 혈액, 혈청, 혈장, 요 등의 체액을 채취하고, 거기에 포함되는 표적 유전자의 발현량을 본 발명의 폴리뉴클레오티드군으로부터 선택된 단수 또는 복수의 폴리뉴클레오티드(변이체, 단편 또는 유도체를 포함함)를 사용하여 측정함으로써 식도암의 유무를 평가하는 또는 식도암을 검출하는 것을 포함한다. 또한, 본 발명의 식도암의 검출 방법을 사용하여, 예를 들면 식도암 환자에 있어서 상기 질환의 개선을 위하여 치료약을 투여했을 경우에 있어서의 상기 질환의 개선의 유무 또는 개선의 정도를 평가 또는 진단할 수도 있다.
본 발명의 방법은, 예를 들면 이하의 (a), (b) 및 (c)의 스텝:
(a) 피험체 유래의 검체를 in vitro에서 본 발명의 키트 또는 디바이스 중의 폴리뉴클레오티드와 접촉시키는 스텝,
(b) 검체 중의 표적 핵산의 발현량을 상기 폴리뉴클레오티드를 핵산 프로브 또는 프라이머로서 사용하여 측정하는 스텝,
(c) (b)의 결과를 바탕으로 상기 피험체 내의 식도암(세포)의 존재 또는 부존재를 평가하는 스텝을 포함할 수 있다.
구체적으로는 본 발명은 miR-204-3p, miR-1247-3p, miR-6875-5p, miR-6857-5p, miR-6726-5p, miR-3188, miR-8069, miR-4257, miR-1343-3p, miR-7108-5p, miR-6825-5p, miR-7641, miR-3185, miR-4746-3p, miR-6791-5p, miR-6893-5p, miR-4433b-3p, miR-3135b, miR-6781-5p, miR-1908-5p, miR-4792, miR-7845-5p, miR-4417, miR-3184-5p, miR-1225-5p, miR-1231, miR-1225-3p, miR-150-3p, miR-4433-3p, miR-6125, miR-4513, miR-6787-5p, miR-6784-5p, miR-615-5p, miR-6765-3p, miR-5572, miR-6842-5p, miR-8063, miR-6780b-5p, miR-187-5p, miR-128-1-5p, miR-6729-5p, miR-6741-5p, miR-6757-5p, miR-7110-5p, miR-7975, miR-1233-5p, miR-6845-5p, miR-3937, miR-4467, miR-7109-5p, miR-6088, miR-6782-5p, miR-5195-3p, miR-4454, miR-6724-5p, miR-8072, miR-4516, miR-6756-5p, miR-4665-3p, miR-6826-5p, miR-6820-5p, miR-6887-5p, miR-3679-5p, miR-7847-3p, miR-6721-5p, miR-3622a-5p, miR-939-5p, miR-602, miR-7977, miR-6749-5p, miR-1914-3p, miR-4651, miR-4695-5p, miR-6848-5p, miR-1228-3p, miR-642b-3p, miR-6746-5p, miR-3620-5p, miR-3131, miR-6732-5p, miR-7113-3p, miR-23a-3p, miR-3154, miR-4723-5p, miR-3663-3p, miR-4734, miR-6816-5p, miR-4442, miR-4476, miR-423-5p, miR-1249, miR-6515-3p, miR-887-3p, miR-4741, miR-6766-3p, miR-4673, miR-6779-5p, miR-4706, miR-1268b, miR-4632-5p, miR-3197, miR-6798-5p, miR-711, miR-6840-3p, miR-6763-5p, miR-6727-5p, miR-371a-5p, miR-6824-5p, miR-4648, miR-1227-5p, miR-564, miR-3679-3p, miR-2861, miR-6737-5p, miR-4725-3p, miR-6716-5p, miR-4675, miR-1915-3p, miR-671-5p, miR-3656, miR-6722-3p, miR-4707-5p, miR-4449, miR-1202, miR-4649-5p, miR-744-5p, miR-642a-3p, miR-451a, miR-6870-5p, miR-4443, miR-6808-5p, miR-4728-5p, miR-937-5p, miR-135a-3p, miR-663b, miR-1343-5p, miR-6822-5p, miR-6803-5p, miR-6805-3p, miR-128-2-5p, miR-4640-5p, miR-1469, miR-92a-2-5p, miR-3940-5p, miR-4281, miR-1260b, miR-4758-5p, miR-1915-5p, miR-5001-5p, miR-4286, miR-6126, miR-6789-5p, miR-4459, miR-1268a, miR-6752-5p, miR-6131, miR-6800-5p, miR-4532, miR-6872-3p, miR-718, miR-6769a-5p, miR-4707-3p, miR-6765-5p, miR-4739, miR-4525, miR-4270, miR-4534, miR-6785-5p, miR-6850-5p, miR-4697-5p, miR-1260a, miR-4486, miR-6880-5p, miR-6802-5p, miR-6861-5p, miR-92b-5p, miR-1238-5p, miR-6851-5p, miR-7704, miR-149-3p, miR-4689, miR-4688, miR-125a-3p, miR-23b-3p, miR-614, miR-1913, miR-16-5p, miR-6717-5p, miR-3648, miR-3162-5p, miR-1909-3p, miR-8073, miR-6769b-5p, miR-6836-3p, miR-4484, miR-6819-5p 및 miR-6794-5p로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개, 바람직하게는 적어도 2개의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합 가능한 핵산을 사용하여 피험체의 검체에 있어서의 표적 핵산의 발현량을 측정하고, 상기 측정된 발현량과, 마찬가지로 측정된 건상체의 대조 발현량을 사용하여 피험체가 식도암에 이환되어 있는 것, 또는 식도암에 이환되어 있지 않은 것을 in vitro에서 평가하는 것을 포함하는 식도암의 검출 방법을 제공한다.
본 명세서에 있어서 「평가」한다란 의사에 의한 판정이 아니라 in vitro에서의 검사에 의한 결과에 의거한 평가 지원이다.
상기와 같이 본 발명의 방법의 바람직한 실시형태에 있어서, 구체적으로는 miR-204-3p가 hsa-miR-204-3p이며, miR-1247-3p가 hsa-miR-1247-3p이며, miR-6875-5p가 hsa-miR-6875-5p이며, miR-6857-5p가 hsa-miR-6857-5p이며, miR-6726-5p가 hsa-miR-6726-5p이며, miR-3188이 hsa-miR-3188이며, miR-8069가 hsa-miR-8069이며, miR-4257이 hsa-miR-4257이며, miR-1343-3p가 hsa-miR-1343-3p이며, miR-7108-5p가 hsa-miR-7108-5p이며, miR-6825-5p가 hsa-miR-6825-5p이며, miR-7641이 hsa-miR-7641이며, miR-3185가 hsa-miR-3185이며, miR-4746-3p가 hsa-miR-4746-3p이며, miR-6791-5p가 hsa-miR-6791-5p이며, miR-6893-5p가 hsa-miR-6893-5p이며, miR-4433b-3p가 hsa-miR-4433b-3p이며, miR-3135b가 hsa-miR-3135b이며, miR-6781-5p가 hsa-miR-6781-5p이며, miR-1908-5p가 hsa-miR-1908-5p이며, miR-4792가 hsa-miR-4792이며, miR-7845-5p가 hsa-miR-7845-5p이며, miR-4417이 hsa-miR-4417이며, miR-3184-5p가 hsa-miR-3184-5p이며, miR-1225-5p가 hsa-miR-1225-5p이며, miR-1231이 hsa-miR-1231이며, miR-1225-3p가 hsa-miR-1225-3p이며, miR-150-3p가 hsa-miR-150-3p이며, miR-4433-3p가 hsa-miR-4433-3p이며, miR-6125가 hsa-miR-6125이며, miR-4513이 hsa-miR-4513이며, miR-6787-5p가 hsa-miR-6787-5p이며, miR-6784-5p가 hsa-miR-6784-5p이며, miR-615-5p가 hsa-miR-615-5p이며, miR-6765-3p가 hsa-miR-6765-3p이며, miR-5572가 hsa-miR-5572이며, miR-6842-5p가 hsa-miR-6842-5p이며, miR-8063이 hsa-miR-8063이며, miR-6780b-5p가 hsa-miR-6780b-5p이며, miR-187-5p가 hsa-miR-187-5p이며, miR-128-1-5p가 hsa-miR-128-1-5p이며, miR-6729-5p가 hsa-miR-6729-5p이며, miR-6741-5p가 hsa-miR-6741-5p이며, miR-6757-5p가 hsa-miR-6757-5p이며, miR-7110-5p가 hsa-miR-7110-5p이며, miR-7975가 hsa-miR-7975이며, miR-1233-5p가 hsa-miR-1233-5p이며, miR-6845-5p가 hsa-miR-6845-5p이며, miR-3937이 hsa-miR-3937이며, miR-4467이 hsa-miR-4467이며, miR-7109-5p가 hsa-miR-7109-5p이며, miR-6088이 hsa-miR-6088이며, miR-6782-5p가 hsa-miR-6782-5p이며, miR-5195-3p가 hsa-miR-5195-3p이며, miR-4454가 hsa-miR-4454이며, miR-6724-5p가 hsa-miR-6724-5p이며, miR-8072가 hsa-miR-8072이며, miR-4516이 hsa-miR-4516이며, miR-6756-5p가 hsa-miR-6756-5p이며, miR-4665-3p가 hsa-miR-4665-3p이며, miR-6826-5p가 hsa-miR-6826-5p이며, miR-6820-5p가 hsa-miR-6820-5p이며, miR-6887-5p가 hsa-miR-6887-5p이며, miR-3679-5p가 hsa-miR-3679-5p이며, miR-7847-3p가 hsa-miR-7847-3p이며, miR-6721-5p가 hsa-miR-6721-5p이며, miR-3622a-5p가 hsa-miR-3622a-5p이며, miR-939-5p가 hsa-miR-939-5p이며, miR-602가 hsa-miR-602이며, miR-7977이 hsa-miR-7977이며, miR-6749-5p가 hsa-miR-6749-5p이며, miR-1914-3p가 hsa-miR-1914-3p이며, miR-4651이 hsa-miR-4651이며, miR-4695-5p가 hsa-miR-4695-5p이며, miR-6848-5p가 hsa-miR-6848-5p이며, miR-1228-3p가 hsa-miR-1228-3p이며, miR-642b-3p가 hsa-miR-642b-3p이며, miR-6746-5p가 hsa-miR-6746-5p이며, miR-3620-5p가 hsa-miR-3620-5p이며, miR-3131이 hsa-miR-3131이며, miR-6732-5p가 hsa-miR-6732-5p이며, miR-7113-3p가 hsa-miR-7113-3p이며, miR-23a-3p가 hsa-miR-23a-3p이며, miR-3154가 hsa-miR-3154이며, miR-4723-5p가 hsa-miR-4723-5p이며, miR-3663-3p가 hsa-miR-3663-3p이며, miR-4734가 hsa-miR-4734이며, miR-6816-5p가 hsa-miR-6816-5p이며, miR-4442가 hsa-miR-4442이며, miR-4476이 hsa-miR-4476이며, miR-423-5p가 hsa-miR-423-5p이며, miR-1249가 hsa-miR-1249이며, miR-6515-3p가 hsa-miR-6515-3p이며, miR-887-3p가 hsa-miR-887-3p이며, miR-4741이 hsa-miR-4741이며, miR-6766-3p가 hsa-miR-6766-3p이며, miR-4673이 hsa-miR-4673이며, miR-6779-5p가 hsa-miR-6779-5p이며, miR-4706이 hsa-miR-4706이며, miR-1268b가 hsa-miR-1268b이며, miR-4632-5p가 hsa-miR-4632-5p이며, miR-3197이 hsa-miR-3197이며, miR-6798-5p가 hsa-miR-6798-5p이며, miR-711이 hsa-miR-711이며, miR-6840-3p가 hsa-miR-6840-3p이며, miR-6763-5p가 hsa-miR-6763-5p이며, miR-6727-5p가 hsa-miR-6727-5p이며, miR-371a-5p가 hsa-miR-371a-5p이며, miR-6824-5p가 hsa-miR-6824-5p이며, miR-4648이 hsa-miR-4648이며, miR-1227-5p가 hsa-miR-1227-5p이며, miR-564가 hsa-miR-564이며, miR-3679-3p가 hsa-miR-3679-3p이며, miR-2861이 hsa-miR-2861이며, miR-6737-5p가 hsa-miR-6737-5p이며, miR-4725-3p가 hsa-miR-4725-3p이며, miR-6716-5p가 hsa-miR-6716-5p이며, miR-4675가 hsa-miR-4675이며, miR-1915-3p가 hsa-miR-1915-3p이며, miR-671-5p가 hsa-miR-671-5p이며, miR-3656이 hsa-miR-3656이며, miR-6722-3p가 hsa-miR-6722-3p이며, miR-4707-5p가 hsa-miR-4707-5p이며, miR-4449가 hsa-miR-4449이며, miR-1202가 hsa-miR-1202이며, miR-4649-5p가 hsa-miR-4649-5p이며, miR-744-5p가 hsa-miR-744-5p이며, miR-642a-3p가 hsa-miR-642a-3p이며, miR-451a가 hsa-miR-451a이며, miR-6870-5p가 hsa-miR-6870-5p이며, miR-4443이 hsa-miR-4443이며, miR-6808-5p가 hsa-miR-6808-5p이며, miR-4728-5p가 hsa-miR-4728-5p이며, miR-937-5p가 hsa-miR-937-5p이며, miR-135a-3p가 hsa-miR-135a-3p이며, miR-663b가 hsa-miR-663b이며, miR-1343-5p가 hsa-miR-1343-5p이며, miR-6822-5p가 hsa-miR-6822-5p이며, miR-6803-5p가 hsa-miR-6803-5p이며, miR-6805-3p가 hsa-miR-6805-3p이며, miR-128-2-5p가 hsa-miR-128-2-5p이며, miR-4640-5p가 hsa-miR-4640-5p이며, miR-1469가 hsa-miR-1469이며, miR-92a-2-5p가 hsa-miR-92a-2-5p이며, miR-3940-5p가 hsa-miR-3940-5p이며, miR-4281이 hsa-miR-4281이며, miR-1260b가 hsa-miR-1260b이며, miR-4758-5p가 hsa-miR-4758-5p이며, miR-1915-5p가 hsa-miR-1915-5p이며, miR-5001-5p가 hsa-miR-5001-5p이며, miR-4286이 hsa-miR-4286이며, miR-6126이 hsa-miR-6126이며, miR-6789-5p가 hsa-miR-6789-5p이며, miR-4459가 hsa-miR-4459이며, miR-1268a이 hsa-miR-1268a이며, miR-6752-5p가 hsa-miR-6752-5p이며, miR-6131이 hsa-miR-6131이며, miR-6800-5p가 hsa-miR-6800-5p이며, miR-4532가 hsa-miR-4532이며, miR-6872-3p가 hsa-miR-6872-3p이며, miR-718이 hsa-miR-718이며, miR-6769a-5p가 hsa-miR-6769a-5p이며, miR-4707-3p가 hsa-miR-4707-3p이며, miR-6765-5p가 hsa-miR-6765-5p이며, miR-4739가 hsa-miR-4739이며, miR-4525가 hsa-miR-4525이며, miR-4270이 hsa-miR-4270이며, miR-4534가 hsa-miR-4534이며, miR-6785-5p가 hsa-miR-6785-5p이며, miR-6850-5p가 hsa-miR-6850-5p이며, miR-4697-5p가 hsa-miR-4697-5p이며, miR-1260a이 hsa-miR-1260a이며, miR-4486이 hsa-miR-4486이며, miR-6880-5p가 hsa-miR-6880-5p이며, miR-6802-5p가 hsa-miR-6802-5p이며, miR-6861-5p가 hsa-miR-6861-5p이며, miR-92b-5p가 hsa-miR-92b-5p이며, miR-1238-5p가 hsa-miR-1238-5p이며, miR-6851-5p가 hsa-miR-6851-5p이며, miR-7704가 hsa-miR-7704이며, miR-149-3p가 hsa-miR-149-3p이며, miR-4689가 hsa-miR-4689이며, miR-4688이 hsa-miR-4688, miR-125a-3p가 hsa-miR-125a-3p이며, miR-23b-3p가 hsa-miR-23b-3p이며, miR-614가 hsa-miR-614이며, miR-1913이 hsa-miR-1913이며, miR-16-5p가 hsa-miR-16-5p이며, miR-6717-5p가 hsa-miR-6717-5p이며, miR-3648이 hsa-miR-3648이며, miR-3162-5p가 hsa-miR-3162-5p이며, miR-1909-3p가 hsa-miR-1909-3p이며, miR-8073이 hsa-miR-8073이며, miR-6769b-5p가 hsa-miR-6769b-5p이며, miR-6836-3p가 hsa-miR-6836-3p이며, miR-4484가 hsa-miR-4484이며, miR-6819-5p가 hsa-miR-6819-5p이며, 및 miR-6794-5p가 hsa-miR-6794-5p이다.
또한, 본 발명의 방법의 바람직한 실시형태에 있어서, 구체적으로는 핵산(구체적으로는 프로브 또는 프라이머)이 하기 (a)~(e)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
(a) 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(b) 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(c) 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(d) 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(e) 상기 (a)~(d) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군으로부터 선택된다.
본 발명의 방법에서는 miR-575 및 miR-24-3p로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합 가능한 핵산을 더 사용할 수 있다.
구체적으로는 miR-575가 hsa-miR-575이며, miR-24-3p가 hsa-miR-24-3p이다.
더 구체적으로는 핵산이 하기 (f)~(j)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
(f) 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(g) 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(h) 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(i) 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(j) 상기 (f)~(i) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군으로부터 선택된다.
본 발명의 방법에 있어서의 핵산에는 miR-675-5p, miR-486-3p, miR-6777-5p, miR-4497, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-4731-5p, miR-6889-5p, miR-6786-5p, miR-92a-3p, miR-4294, miR-4763-3p, miR-6076, miR-663a, miR-760, miR-4667-5p, miR-6090, miR-4730, miR-7106-5p, miR-3196, miR-5698, miR-6087, miR-4665-5p, miR-8059 및 miR-6879-5p로부터 선택되는 적어도 1개의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합 가능한 핵산을 더 포함할 수 있다.
바람직한 실시형태에서는 그와 같은 핵산은 구체적으로는 miR-675-5p가 hsa-miR-675-5p이며, miR-486-3p가 hsa-miR-486-3p이며, miR-6777-5p가 hsa-miR-6777-5p이며, miR-4497이 hsa-miR-4497이며, miR-296-3p가 hsa-miR-296-3p이며, miR-6738-5p가 hsa-miR-6738-5p이며, miR-4731-5p가 hsa-miR-4731-5p이며, miR-6889-5p가 hsa-miR-6889-5p이며, miR-6786-5p가 hsa-miR-6786-5p이며, miR-92a-3p가 hsa-miR-92a-3p이며, miR-4294가 hsa-miR-4294이며, miR-4763-3p가 hsa-miR-4763-3p이며, miR-6076이 hsa-miR-6076이며, miR-663a가 hsa-miR-663a이며, miR-760이 hsa-miR-760이며, miR-4667-5p가 hsa-miR-4667-5p이며, miR-6090이 hsa-miR-6090이며, miR-4730이 hsa-miR-4730이며, miR-7106-5p가 hsa-miR-7106-5p이며, miR-3196이 hsa-miR-3196이며, miR-5698이 hsa-miR-5698이며, miR-6087이 hsa-miR-6087이며, miR-4665-5p가 hsa-miR-4665-5p이며, miR-8059가 hsa-miR-8059이며, 및 miR-6879-5p가 hsa-miR-6879-5p이다.
더 바람직한 실시형태에서는 그와 같은 핵산은 구체적으로는 하기 (k)~(o)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
(k) 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(l) 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(m) 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
(n) 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(o) 상기 (k)~(n) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드이다.
본 발명방법에서 사용되는 검체로서 피험체의 생체 조직(바람직하게는 식도 조직), 혈액, 혈청, 혈장, 요 등의 체액 등으로부터 조제되는 검체를 들 수 있다. 구체적으로는 상기 조직으로부터 조제되는 RNA 함유 검체, 그것으로부터 조제되는 폴리뉴클레오티드를 더 포함하는 검체, 혈액, 혈청, 혈장, 요 등의 체액, 피험체의 생체 조직의 일부 또는 전부를 생체 검사 등으로 채취하거나 수술에 의해 적출한 생체 조직 등이며, 이들로부터 측정을 위한 검체를 조제할 수 있다.
본 명세서에서 피험체란 포유 동물, 예를 들면 비한정적으로 인간, 원숭이, 마우스, 래트 등을 가리키고, 바람직하게는 인간이다.
본 발명의 방법은 측정 대상으로 하여 사용하는 검체의 종류에 따라 스텝을 변경할 수 있다.
측정 대상물로서 RNA를 이용할 경우, 식도암(세포)의 검출은, 예를 들면 하기의 스텝(a), (b) 및 (c):
(a) 피험체의 검체로부터 조제된 RNA 또는 그것으로부터 전사된 상보적 폴리뉴클레오티드(cDNA)를 본 발명의 키트 또는 디바이스 중의 폴리뉴클레오티드와 결합시키는 스텝,
(b) 상기 폴리뉴클레오티드에 결합한 검체 유래의 RNA 또는 상기 RNA로부터 합성된 cDNA를 상기 폴리뉴클레오티드를 핵산 프로브로서 사용하는 하이브리다이제이션에 의해 또는 상기 폴리뉴클레오티드를 프라이머로서 사용하는 정량 RT-PCR에 의해 측정하는 스텝,
(c) 상기 (b)의 측정 결과에 의거하여 식도암(유래의 유전자의 발현)의 존재 또는 부존재를 평가하는 스텝을 포함할 수 있다.
본 발명에 의해 식도암(유래의 유전자의 발현)을 in vitro에서 검출, 검사, 평가 또는 진단하기 위해서, 예를 들면 여러 가지 하이브리다이제이션법을 사용할 수 있다. 이러한 하이브리다이제이션법에는, 예를 들면 노던블로팅법, 서던블로팅법, RT-PCR법, DNA칩 해석법, in situ 하이브리다이제이션법, 노던하이브리다이제이션법, 서던하이브리다이제이션법 등을 사용할 수 있다.
노던블로트법을 이용할 경우에는 본 발명에서 사용 가능한 상기 핵산 프로브를 사용함으로써 RNA 중의 각 유전자 발현의 유무나 그 발현량을 검출, 측정할 수 있다. 구체적으로는 핵산 프로브(상보쇄)를 방사성 동위원소(32P, 33P, 35S 등)나 형광물질 등으로 표지하고, 그것을 상법에 따라서 나일론 멤브레인 등에 트랜스퍼한 피검자의 생체 조직 유래의 RNA와 하이브리다이징시킨 후, 형성된 DNA/RNA 2중쇄의 표지물(방사성 동위원소 또는 형광물질)로부터 유래되는 시그널을 방사선 검출기(BAS-1800II(FUJIFILM CORPORATION) 등을 예시할 수 있음) 또는 형광 검출기(STORM 865(GE Healthcare) 등을 예시할 수 있음)로 검출, 측정하는 방법을 예시할 수 있다.
정량 RT-PCR법을 이용할 경우에는 본 발명에서 사용 가능한 상기 프라이머를 사용함으로써 RNA 중의 유전자 발현의 유무나 그 발현량을 검출, 측정할 수 있다. 구체적으로는 피검체의 생체 조직 유래의 RNA로부터 상법에 따라 cDNA를 조제하고, 이것을 주형으로서 표적의 각 유전자의 영역이 증폭할 수 있도록 본 발명의 1쌍의 프라이머(상기 cDNA에 결합하는 정쇄과 역쇄로 이루어짐)를 cDNA와 하이브리다이징시켜 상법에 따라 PCR법을 행하고, 얻어진 2본쇄 DNA를 검출하는 방법을 예시할 수 있다. 또한, 2본쇄 DNA의 검출법으로서는 상기 PCR를 미리 방사성 동위원소나 형광물질로 표지해 둔 프라이머을 사용하여 행하는 방법, PCR산물을 아가로오스겔로 전기 영동하고, 에티듐브로마이드 등으로 2본쇄 DNA를 염색하여 검출하는 방법, 생산된 2본쇄 DNA를 상법에 따라 나일론 멤브레인 등에 트랜스퍼시켜 표지한 핵산 프로브와 하이브리다이징시켜 검출하는 방법을 포함할 수 있다.
핵산 어레이 해석을 이용할 경우에는 본 발명의 핵산 프로브(1본쇄 또는 2본쇄)를 기판(고상)에 부착한 RNA칩 또는 DNA칩을 사용한다. 핵산 프로브를 부착한 영역을 프로브 스폿, 핵산 프로브를 부착하고 있지 않은 영역을 블랭크 스폿이라고 칭한다. 유전자군을 기판에 고상화한 것에는 일반적으로 핵산 칩, 핵산 어레이, 마이크로 어레이 등이라는 명칭이 있고, DNA 또는 RNA 어레이에는 DNA 또는 RNA 매크로 어레이와 DNA 또는 RNA 마이크로 어레이가 포함되지만, 본 명세서에서는 칩이라고 했을 경우, 그들 모두를 포함하는 것으로 한다. DNA칩으로서는 3D-Gene(등록상표) Human miRNA Oligo chip(TORAY INDUSTRIES, INC.)을 사용할 수 있지만, 이것에 한정되지 않는다.
DNA칩의 측정은 한정되지 않지만, 예를 들면 핵산 프로브의 표지물로부터 유래되는 시그널을 화상 검출기(Typhoon 9410(GE Healthcare), 3D-Gene(등록상표) 스캐너(TORAY INDUSTRIES, INC.) 등을 예시할 수 있음)로 검출, 측정하는 방법을 예시할 수 있다.
본 명세서 중에서 사용하는 「스트린젠트한 조건」이란 상술한 바와 같이 핵산 프로브가 다른 서열에 대한 보다 큰 정도(예를 들면, 백그라운드 측정값의 평균+백그라운드 측정값의 표준오차×2 이상의 측정값)로 그 표적서열에 대하여 하이브리다이징하는 조건이다.
스트린젠트한 조건은 하이브리다이제이션과 그 후의 세정 조건에 의해 규정된다. 그 하이브리다이제이션의 조건은 한정되지 않지만, 예를 들면 30℃~60℃이며, SSC, 계면활성제, 포름아미드, 덱스트란 황산염, 블로킹제 등을 포함하는 용액중으로 1~24시간의 조건으로 한다. 여기에서, 1×SSC는 150mM 염화나트륨 및 15mM 시트르산 나트륨을 포함하는 수용액(pH 7.0)이며, 계면활성제는 SDS(도데실황산나트륨), Triton 또는 Tween 등을 포함한다. 하이브리다이제이션 조건으로서는 보다 바람직하게는 3~10×SSC, 0.1~1% SDS를 포함한다. 스트린젠트한 조건을 규정하는 또하나의 조건인 하이브리다이제이션 후의 세정 조건으로서는, 예를 들면 30℃의 0.5×SSC와 0.1% SDS를 포함하는 용액, 및 30℃의 0.2×SSC와 0.1% SDS를 포함하는 용액, 및 30℃의 0.05×SSC 용액에 의한 연속한 세정 등의 조건을 들 수 있다. 상보쇄는 이러한 조건에서 세정해도 대상으로 하는 정쇄와 하이브리다이징 상태를 유지하는 것이 바람직하다. 구체적으로는 이러한 상보쇄로서 대상의 정쇄의 염기서열과 완전히 상보적인 관계에 있는 염기서열로 이루어지는 쇄, 및 상기 쇄와 적어도 80%, 바람직하게는 적어도 85%, 보다 바람직하게는 적어도 90% 또는 적어도 95%, 예를 들면 적어도 98% 또는 적어도 99%의 동일성을 갖는 염기서열로 이루어지는 쇄를 예시할 수 있다.
이들 하이브리다이제이션에 있어서의 「스트린젠트한 조건」의 다른 예에 대해서는, 예를 들면 Sambrook, J.&Russel, D.저, Molecular Cloning, A LABORATORY MANUAL, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001년 1월 15일 발행의 제 1 권 7.42~7.45, 제 2 권 8.9~8.17 등에 기재되어 있고, 본 발명에 있어서 이용할 수 있다.
본 발명의 키트 중의 폴리뉴클레오티드 단편을 프라이머로서 PCR를 실시할 때의 조건의 예로서는, 예를 들면 10mM Tris-HCL(pH8.3), 50mM KCL, 1~2mM MgCl2 등의 조성의 PCR 버퍼를 사용하여 상기 프라이머의 서열로부터 계산된 Tm값+5~10℃에 있어서 15초로부터 1분정도 처리하는 것 등을 들 수 있다. 이러한 Tm값의 계산 방법으로서 Tm값=2×(아데닌 잔기수+티민 잔기수)+4×(구아닌 잔기수+사이토신 잔기수) 등을 들 수 있다.
또한, 정량 RT-PCR법을 사용할 경우에는 TaqMan(등록상표) MicroRNA Assays(Life Technologies Corporation): LNA(등록상표)-based MicroRNA PCR(Exiqon): Ncode(등록상표) miRNA qRT-PCT 키트(invitrogen) 등의 miRNA를 정량적으로 측정하기 위하여 특별히 고안된 시판된 측정용 키트를 사용해도 좋다.
유전자 발현량의 산출에는 한정되지 않지만, 예를 들면 Statistical analysis of gene expression microarray data(Speed T.저, Chapman and Hall/CRC), 및 A beginner's guide Microarray gene expression data analysis(Causton H.C. 외 저, Blackwell publishing) 등에 기재된 통계학적 처리를 본 발명에 있어서 이용할 수 있다. 예를 들면, DNA칩 상의 블랭크 스폿의 측정값의 평균값에 블랭크 스폿의 측정값의 표준편차의 2배, 바람직하게는 3배, 보다 바람직하게는 6배를 가산하고, 그 값 이상의 시그널값을 갖는 프로브 스폿을 검출 스폿으로 간주할 수 있다. 또한, 블랭크 스폿의 측정값의 평균값을 백그라운드로 간주하고, 프로브 스폿의 측정값으로부터 감산하여 유전자 발현량으로 할 수 있다. 유전자 발현량의 결손값에 대해서는 해석 대상으로부터 제외하거나, 바람직하게는 각 DNA칩에 있어서의 유전자 발현량의 최소값으로 치환하거나, 보다 바람직하게는 유전자 발현량의 최소값의 대수값으로부터 0.1을 감산한 값으로 치환할 수 있다. 또한, 저시그널의 유전자를 제거하기 위해서 측정 샘플수의 20% 이상, 바람직하게는 50% 이상, 보다 바람직하게는 80% 이상에 있어서 2의 6승, 바람직하게는 2의 8승, 보다 바람직하게는 2의 10승 이상의 유전자 발현량을 갖는 유전자만을 해석 대상으로 하여 선택할 수 있다. 유전자 발현량의 정규화(노멀라이제이션)로서는 한정되지 않지만, 예를 들면 global normalization이나 quantile normalization(Bolstad, B.M. 외, 2003년, Bioinformatics, 19권, p185-193) 등을 들 수 있다.
본 발명은 또한 본 발명의 검출용 폴리뉴클레오티드, 키트, 디바이스(예를 들면, 칩), 또는 그들의 조합을 사용하여 피험체 유래의 검체 중의 표적 유전자 또는 유전자의 발현량을 측정하고, 식도암 환자 유래의 검체와 건상체 유래의 검체의 유전자 발현량을 교사 샘플로서 판별식(판별 함수)을 작성하여 검체가 식도암 유래의 유전자를 포함하는 것 및/또는 포함하지 않는 것을 결정 또는 평가하는 방법을 제공한다.
즉, 본 발명은 또한 본 발명의 검출용 폴리뉴클레오티드, 키트, 디바이스(예를 들면, 칩), 또는 그들의 조합을 사용하여 검체가 식도암 유래의 유전자를 포함하는 것/또는 식도암 유래의 유전자를 포함하지 않는 것을 결정 또는 평가하는 것이 기지의 복수의 검체 중의 표적 유전자(표적 핵산)의 발현량을 in vitro에서 측정하는 제 1 스텝, 상기 제 1 스텝에서 얻어진 상기 표적 유전자의 발현량의 측정값을 교사 샘플로 한 판별식을 작성하는 제 2 스텝, 피험체 유래의 검체 중의 상기 표적 유전자의 발현량을 제 1 스텝과 마찬가지로 in vitro에서 측정하는 제 3 스텝, 상기 제 2 스텝에서 얻어진 판별식에 제 3 스텝에서 얻어진 상기 표적 유전자의 발현량의 측정값을 대입하고, 상기 판별식으로부터 얻어진 결과에 의거하여 검체가 식도암 유래의 유전자를 포함하는 것/또는 식도암 유래의 유전자를 포함하지 않는 것을 결정 또는 평가하는 제 4 스텝을 포함하고, 여기에서 상기 표적 유전자가 상기 폴리뉴클레오티드, 키트 또는 디바이스(예를 들면, 칩)에 포함되는 검출용 폴리뉴클레오티드에 의해 검출 가능한 것인 방법을 제공한다. 여기에서, 피셔의 판별분석, 마할라노비스 거리에 의한 비선형판별분석, 뉴럴네트워크, Support Vector Machine(SVM) 등을 사용하여 판별식을 작성할 수 있지만, 이들에 한정되지 않는다.
선형판별분석은 군 분류의 경계가 직선 또는 초평면일 경우, 식 1을 판별식으로서 사용하여 군의 소속을 판별하는 방법이다. 여기에서, x는 설명 변수, w는 설명 변수의 계수, w0는 상수항으로 한다.
판별식으로 얻어진 값을 판별 득점이라고 부르고, 새롭게 부여된 데이터 세트의 측정값을 설명 변수로서 상기 판별식에 대입하고, 판별 득점의 부호로 군 분류를 판별할 수 있다.
선형판별분석의 일종인 피셔의 판별분석은 클래스 판별을 행하는데에 적합한 차원을 선택하기 위한 차원 삭감법이며, 합성 변수의 분산에 착안하여 같은 라벨을 갖는 데이터의 분산을 최소화함으로써 식별력이 높은 합성 변수를 구성한다(Venables, W.N. 외 저, Modern Applied Statistics with S.Fourth edition.Springer., 2002년). 피셔의 판별분석에서는 식 2를 최대로 하는 사영 방향 w를 구한다. 여기에서, μ는 입력의 평균, ng는 클래스 g에 속하는 데이터 수, μg는 클래스 g에 속하는 데이터의 입력의 평균으로 한다. 분자·분모는 각각 데이터를 벡터 w의 방향으로 사영했을 때의 클래스 간 분산, 클래스 내 분산으로 되어 있고, 이 비를 최대화함으로써 판별식 계수 wi를 구한다(Kanamori Takafumi 외 저, 「패턴인식」, Kyoritsu Shuppan Co., Ltd.(2009년), Richard O. 외 저, Pattern Classification Second Edition., Wiley-Interscience, 2000년).
마할라노비스 거리는 데이터의 상관을 고려한 식 3으로 산출되며, 각 군으로부터의 마할라노비스 거리의 가까운 군을 소속군으로서 판별하는 비선형판별분석으로서 사용할 수 있다. 여기에서, μ는 각 군의 중심 벡터, S-1은 그 군의 분산 공분산행렬의 역행열이다. 중심 벡터는 설명 변수 x로부터 산출되고, 평균 벡터나 중앙값 벡터 등을 사용할 수 있다.
SVM이란 V.Vapnik이 고안한 판별분석법이다(The Nature of Statistical Leaning Theory, Springer, 1995년). 분류해야 할 군 분류가 기지의 데이터 세트의 특정 데이터 항목을 설명 변수, 분류해야 할 군 분류를 목적 변수로 하고, 상기 데이터 세트를 기지의 군 분류로 바르게 분류하기 위한 초평면으로 불리는 경계면을 결정하고, 상기 경계면을 사용하여 데이터를 분류하는 판별식을 결정한다. 그리고 상기 판별식은 새롭게 부여되는 데이터 세트의 측정값을 설명 변수로 하여 상기 판별식에 대입함으로써 군 분류를 판별할 수 있다. 또한, 이때의 판별 결과는 분류해야 할 군이어도 좋고, 분류해야 할 군으로 분류될 수 있는 확률이어도 좋고, 초평면으로부터의 거리이어도 좋다. SVM에서는 비선형인 문제에 대응하기 위한 방법으로서 특징 벡터를 고차원으로 비선형 변환하고, 그 공간에서 선형의 식별을 행하는 방법이 알려져 있다. 비선형에 사상(寫像)한 공간에서의 2개의 요소의 내적(內積)이 각각의 원래의 공간에서의 입력만으로 표현되는 식을 커널이라고 부르고, 커널의 일례로서 리니어 커널, RBF(Radial Basis Function) 커널, 가우시안 커널을 들 수 있다. 커널에 의해 고차원으로 사상하면서 실제로는 사상된 공간에서의 특징의 계산을 피해서 커널의 계산만으로 최적인 판별식, 즉 판별식을 구성할 수 있다(예를 들면, Hideki ASOH 외 저, 통계과학의 프론티어 6 「패턴인식과 학습의 통계학 새로운 개념과 방법」, Iwanami Shoten, Publishers(2004년), Nello Cristianini 외 저, SVM 입문, Kyoritsu Shuppan Co., Ltd.(2008년)).
SVM법의 일종인 C-support vector classification(C-SVC)은 2군의 설명 변수로 학습을 행하여 초평면을 작성하고, 미지의 데이터 세트가 어느 군으로 분류되는지를 판별한다(C.Cortes 외, 1995년, Machine Learning, 20권, p273-297).
본 발명의 방법에서 사용 가능한 C-SVC의 판별식의 산출예를 이하에 나타낸다. 우선 전체 피험체를 식도암 환자와 건상체의 2군으로 군 분류한다. 피험체가 식도암 환자, 또는 건상체라고 판단하기 위해서는, 예를 들면 식도 조직검사를 사용할 수 있다.
이어서, 분류된 2군의 혈청 유래의 검체의 망라적 유전자 발현량으로 이루어지는 데이터 세트(이하, 학습 검체군)를 준비하고, 상기 2군 사이에서 유전자 발현량에 명확한 차가 보이는 유전자를 설명 변수, 상기 군 분류를 목적 변수(예를 들면, -1과 +1)로 한 C-SVC에 의한 판별식을 결정한다. 식 4는 최적화하는 목적 함수이며, 여기에서, e는 모든 입력 벡터, y는 목적 변수, a는 Lagrange 미정승수 벡터, Q는 정정값 행렬, C는 제약 조건을 조정하는 파라미터를 나타낸다.
식 5는 최종적으로 얻어진 판별식이며, 판별식에 의해 얻어진 값의 부호에 의해 소속하는 군을 결정할 수 있다. 여기에서, x는 서포트 벡터, y는 군의 소속을 나타내는 라벨, a는 대응하는 계수, b은 상수항, K은 커널 함수이다.
커널 함수로서는, 예를 들면 식 6으로 정의되는 RBF 커널을 사용할 수 있다. 여기에서, x는 서포트 벡터, γ은 초평면의 복잡함을 조정하는 커널 파라미터를 나타낸다.
이들 이외에도 피험체 유래의 검체가 식도암 유래의 표적 유전자의 발현을 포함하는 것 및/또는 포함하지 않는 것을 결정 또는 평가하거나 또는 그 발현량을 건상체 유래의 대조와 비교하여 평가하는 방법으로서 뉴럴 네트워크, k-근방법, 결정목, 로지스틱 회귀분석 등의 방법을 선택할 수 있다.
본 발명의 방법은, 예를 들면 하기의 스텝(a), (b) 및 (c):
(a) 식도암 환자 유래의 식도암 유래 유전자를 포함하는 조직 및/또는 건상체 유래의 식도암 유래 유전자를 포함하지 않는 조직인 것이 이미 알려져 있는 검체 중의 표적 유전자의 발현량을 본 발명에 의한 검출용 폴리뉴클레오티드, 키트 또는 디바이스(예를 들면, DNA칩)를 사용하여 측정하는 스텝,
(b) (a)에서 측정된 발현량의 측정값으로부터 상기 식 1~3, 5 및 6의 판별식을 작성하는 스텝,
(c) 피험체 유래의 검체 중의 상기 표적 유전자의 발현량을 본 발명에 의한 진단(검출)용 폴리뉴클레오티드, 키트 또는 디바이스(예를 들면, DNA칩)를 사용하여 측정하고, (b)에서 작성한 판별식에 그들을 대입하여 얻어진 결과에 의거하여 검체가 식도암 유래의 표적 유전자의 발현을 포함하는 것 및/또는 포함하지 않는 것을 결정 또는 평가하거나, 또는 그 발현량을 건상체 유래의 대조와 비교하여 평가하는 스텝
을 포함할 수 있다. 여기에서, 식 1~3, 5 및 6의 식 중의 x는 설명 변수이며, 상기 2절에 기재한 폴리뉴클레오티드류로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드 또는 그 단편을 측정함으로써 얻어지는 값을 포함하고, 구체적으로는 본 발명의 식도암 환자와 건상체를 판별하기 위한 설명 변수는, 예를 들면 하기 (1)~(3)으로부터 선택되는 유전자 발현량이다.
(1) 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열에 있어서, 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 DNA 중 어느 하나에 의해 측정되는 식도암 환자 또는 건상체의 혈청에 있어서의 유전자 발현량.
(2) 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열에 있어서, 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 DNA 중 어느 하나에 의해 측정되는 식도암 환자 또는 건상체의 혈청에 있어서의 유전자 발현량.
(3) 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열에 있어서, 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 DNA 중 어느 하나에 의해 측정되는 식도암 환자 또는 건상체의 혈청에 있어서의 유전자 발현량.
이상에 나타내는 바와 같이 피험체 유래의 검체가 식도암 유래의 유전자를 포함하는 것 및/또는 포함하지 않는 것을 결정 또는 평가하는 방법으로서 판별식의 작성에는 학습 검체군으로부터 작성한 판별식이 필요하며, 상기 판별식의 판별 정밀도를 높이기 위해서는 학습 검체군 중의 2군 간에 명확한 차가 있는 유전자를 판별식에 사용하는 것이 필요하다.
또한, 판별식의 설명 변수에 사용하는 유전자의 결정은 다음과 같이 행하는 것이 바람직하다. 우선, 학습 검체군인 식도암 환자군의 망라적 유전자 발현량과 건상체군의 망라적 유전자 발현량을 데이터 세트로 하여 파라메트릭 해석인 t검정의 P값, 논파라메트릭 해석인 Mann-Whitney의 U검정의 P값, 또는 Wilcoxon검정의 P값 등을 이용하여 상기 2군 간에 있어서의 각 유전자의 발현량의 차의 크기를 구한다.
검정에 의해 얻어진 P값의 위험률(유의 수준)이, 예를 들면 5%, 1% 또는 0.01%보다 작을 경우에 통계학적으로 유의한 것으로 간주할 수 있다.
검정을 반복하여 행하는 것에 기인하는 제 1 종의 과오의 확률의 증대를 보정하기 위해서 공지의 방법, 예를 들면 본페로니, 홀름 등의 방법에 의해 보정할 수 있다(예를 들면, Nagata Yasushi 외 저, 「통계적다중비교법의 기초」, scientist사(2007년)). 본페로니 보정을 예시하면, 예를 들면 검정에 의해 얻어진 P값을 검정의 반복 횟수, 즉 해석에 사용하는 유전자 수로 곱하고, 소망의 유의수준과 비교함으로써 검정 전체에서의 제 1 종의 과오를 발생시킬 확률을 억제할 수 있다.
또한, 검정이 아니라 식도암 환자군의 유전자 발현량과 건상체군의 유전자 발현량 사이에서 각각의 유전자 발현량의 중앙값의 발현비의 절대값(Fold change)을 산출하고, 판별식의 설명 변수에 사용하는 유전자를 선택해도 좋다. 또한, 식도암 환자군과 건상체군의 유전자 발현량을 사용하여 ROC 곡선을 작성하고, AUROC값을 기준으로 하여 판별식의 설명 변수에 사용하는 유전자를 선택해도 좋다.
이어서, 여기에서 구한 유전자 발현량의 차가 큰 임의의 수의 유전자를 사용하여 상기 여러 가지 방법으로 산출할 수 있는 판별식을 작성한다. 최대의 판별 정밀도를 얻는 판별식을 구축하는 방법으로서, 예를 들면 P값의 유의 수준을 만족시킨 유전자의 모든 조합으로 판별식을 구축하는 방법이나, 판별식을 작성하기 위해서 사용하는 유전자를 유전자 발현량의 차가 큰 순서로 하나씩 늘리면서 반복하여 평가하는 방법 등이 있다(Furey TS. 외, 2000년, Bioinformatics., 16권, p906-14). 이 판별식에 대하여 별도의 독립된 식도암 환자 또는 건상체의 유전자 발현량을 설명 변수에 대입하여 이 독립된 식도암 환자 또는 건상체에 대해서 소속하는 군의 판별 결과를 산출한다. 즉, 발견한 진단용 유전자 세트 및 진단용 유전자 세트를 사용하여 구축한 판별식을 독립된 검체군에서 평가함으로써 보다 보편적인 식도암을 검출할 수 있는 진단용 유전자 세트 및 식도암을 판별하는 방법을 발견할 수 있다.
또한, 상기 판별식의 판별 성능(범화성)의 평가에는 Split-sample법을 사용하는 것이 바람직하다. 즉, 데이터 세트를 학습 검체군과 테스트 검체군으로 분할하고, 학습 검체군에서 통계학적 검정에 의한 유전자의 선택과 판별식 작성을 행하고, 상기 판별식으로 테스트 검체군을 판별한 결과와 테스트 검체군이 소속하는 참된 군을 사용하여 정밀도·감도·특이도를 산출하여 판별 성능을 평가한다. 한편, 데이터 세트를 분할하지 않고 전체 검체를 사용하여 통계학적 검정에 의한 유전자의 선택과 판별식 작성을 행하고, 신규로 준비한 검체를 상기 판별식으로 판별하여 정밀도·감도·특이도를 산출하여 판별 성능을 평가할 수도 있다.
본 발명은 식도암의 진단 및 치료에 유용한 검출용 또는 질환진단용 폴리뉴클레오티드, 상기 폴리뉴클레오티드를 사용한 식도암의 검출 방법, 및 상기 폴리뉴클레오티드를 포함하는 식도암의 검출 키트 및 디바이스를 제공한다. 특히, 기존의 종양 마커 CEA에 의한 식도암 진단법을 초과한 정밀도를 나타내는 진단용 유전자의 선정과 판별식의 작성을 실시하기 위해서 본 발명의 방법에 있어서, 예를 들면 CEA에 의해 음성으로 판단되었음에도 불구하고, 조영제를 사용한 컴퓨터 단층촬영 등의 정밀검사에 의해 최종적으로 식도암이 존재하는 것이 명확해진 환자 유래의 혈청 중의 발현 유전자와, 식도암이 존재하지 않는 환자 유래의 혈청 중의 발현 유전자를 비교함으로써 CEA를 초과하는 정밀도를 나타내는 진단용 유전자 세트 및 판별식을 구축할 수 있다.
예를 들면, 위에 기재한 서열번호 1~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열에 의거하는 1 또는 2 이상의 상기 폴리뉴클레오티드, 및 경우에 따라 서열번호 116 및 676으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열에 의거하는 1 또는 2 이상의 상기 폴리뉴클레오티드, 및 경우에 따라 서열번호 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열에 의거하는 1 또는 2 이상의 상기 폴리뉴클레오티드로부터의 임의의 조합을 진단용 유전자 세트로 한다. 또한, 조직 진단의 진단 결과가 클래스 I의 식도암 환자 유래의 검체와, 클래스 II의 건상체 유래의 검체에 있어서의 상기 진단용 유전자 세트의 발현량을 사용하여 판별식을 구축한다. 그 결과, 미지의 검체의 상기 진단용 유전자 세트의 발현량을 측정함으로써 미지의 검체가 식도암 유래 유전자를 포함하는 것 또는 식도암 유래 유전자를 포함하지 않는 것을 최고 100%의 정밀도로 분별할 수 있다.
실시예
본 발명을 이하의 실시예에 의해 구체적으로 더 설명한다. 그러나, 본 발명의 범위는 이 실시예에 의해 제한되지 않는 것으로 한다.
[참고예 1]
<식도암 환자와 건상체 검체의 채취>
사전동의를 얻은 건상체 100명과 식도암 이외의 원발암이 확인되어 있지 않은 식도암 환자 34명(스테이지 IB가 3례, 스테이지 IIA가 1례, 스테이지 IIB가 5례, 스테이지 IIIA가 4례, 스테이지 IIIB가 7례, 스테이지 IIIC가 2례, 또한 치료 후에 병리검사를 실시하여 스테이지 분류한 검체(yp)로서 yp스테이지 IA가 1례, yp스테이지 IIA가 3례, yp스테이지 IIB가 2례, yp스테이지 IIIA가 5례, yp스테이지 IIIC가 1례)으로부터 베노젝트II 진공 채혈관 VP-AS109K 60(TERUMO CORPORATION)을 사용하여 각각 혈청을 채취하여 학습 검체군으로 했다. 마찬가지로, 사전동의를 얻은 건상체 50명과 식도암 이외의 원발암이 확인되어 있지 않은 식도암 환자 16명(스테이지 IIA가 3례, 스테이지 IIIA가 2례, 스테이지 IIIC가 2례, 또한 치료 후에 병리검사를 실시하여 스테이지 분류한 검체(yp)로서 yp스테이지 0이 1례, yp스테이지 IA가 1례, yp스테이지 IIA가 2례, yp스테이지 IIIA가 2례, yp스테이지 IIIB가 1례, yp스테이지 IIIC가 1례, yp스테이지 IV가 1례)으로부터 베노젝트II 진공 채혈관 VP-AS109K 60(TERUMO CORPORATION)을 사용하여 각각 혈청을 채취하여 테스트 검체군으로 했다.
<total RNA의 추출>
검체로서 상기 학습 검체군, 테스트 검체군 합해 건상체 150명과 식도암 환자 50명의 합계 200명으로부터 각각 얻어진 혈청 300㎕로부터 3D-Gene(등록상표)RNA extraction reagent from liquid sample kit(TORAY INDUSTRIES, INC.) 중의 RNA 추출용 시약을 사용하여 동 사가 정한 프로토콜에 따라 total RNA를 얻었다.
<유전자 발현량의 측정>
검체로서 상기 학습 검체군, 테스트 검체군 합해 건상체 150명과 식도암 환자 50명의 합계 200명의 혈청으로부터 얻은 total RNA에 대하여 3D-Gene(등록상표) miRNA Labeling kit(TORAY INDUSTRIES, INC.)를 사용하여 동 사가 규정한 프로토콜(ver 2.20)에 의거하여 miRNA를 형광표지했다. 올리고DNA칩으로서 miRBase release 20에 등록되어 있는 miRNA 중에서 2,555종의 miRNA와 상보적인 서열을 갖는 프로브를 탑재한 3D-Gene(등록상표) Human miRNA Oligo chip(TORAY INDUSTRIES, INC.)을 사용하여 동 사가 정하는 프로토콜에 의거하여 스트린젠트한 조건에서 total RNA 중의 miRNA와 DNA칩 상의 프로브의 하이브리다이제이션 및 하이브리다이제이션 후의 세정을 행했다. DNA칩을 3D-Gene(등록상표) 스캐너(TORAY INDUSTRIES, INC.)를 사용하여 스캔하고, 화상을 취득하여 3D-Gene(등록상표) Extraction(TORAY INDUSTRIES, INC.)으로 형광강도를 수치화했다. 수치화된 형광강도를 밑이 2인 대수값으로 변환해서 유전자 발현량으로 하여 블랭크값의 감산을 행하고, 결손값은 각 DNA칩에 있어서의 유전자 발현량의 최소값의 대수값으로부터 0.1을 감산한 값으로 치환했다. 그 결과, 식도암 환자 50명의 혈청 및 건상체 150명의 혈청에 대한 망라적인 miRNA의 유전자 발현량을 얻었다. 수치화된 miRNA의 유전자 발현량을 사용한 계산 및 통계해석은 R언어 3.0.2(R Development Core Team(2013). R:A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, URL http://www.R-project.org/.) 및 MASS 패키지 7.3-30(Venables, W.N.&Ripley, B.D.(2002) Modern Applied Statistics with S.Fourth Edition.Springer, New York.ISBN 0-387-95457-0)을 사용해서 실시했다.
[참고예 2]
<식도암 이외의 암의 검체의 채취>
다른 장기에 암이 확인되어 있지 않은, 사전동의를 얻은 췌장암 환자 69명, 담도암 환자 66명, 대장암 환자 30명, 위암 환자 33명, 간암 환자 32명, 및 췌담도 양성질환 환자 15명으로부터 베노젝트II 진공 채혈관 VP-AS109K 60(TERUMO CORPORATION)을 사용하여 각각 혈청을 채취하고, 참고예 1의 식도암 환자 34명과 건상체 103명을 합하여 학습 검체군으로 했다.
마찬가지로 다른 장기에 암이 확인되어 있지 않은, 사전동의를 얻은 췌장암 환자 30명, 담도암 환자 33명, 대장암 환자 20명, 위암 환자 17명, 간암 환자 20명, 및 췌담도 양성질환 환자 6명으로부터 베노젝트II 진공 채혈관 VP-AS109K 60(TERUMO CORPORATION)을 사용하여 각각 혈청을 채취하고, 참고예 1의 식도 이외의 장기에 암이 확인되어 있지 않은 식도암 환자 16명, 건상체 47명과 합하여 테스트 검체군으로 했다. 이후의 조작은 참고예 1과 마찬가지로 행했다.
[실시예 1]
<학습 검체군의 검체를 사용한 유전자 마커의 선정과 테스트 검체군의 검체를 사용한 단독의 유전자 마커의 식도암 판별 성능의 평가 방법>
본 실시예에서는 학습 검체군으로부터 식도암을 건상체로 판별하기 위한 유전자 마커를 선정하고, 학습 검체군과는 독립된 테스트 검체군의 검체에 있어서 선정한 유전자 마커에 대해서 각각 단독으로의 식도암 판별 성능을 평가하는 방법을 검토했다.
구체적으로는 우선 상기 참고예에서 얻은 학습 검체군과 테스트 검체군의 miRNA 발현량을 합하여 quantile normalization로 정규화했다.
이어서, 학습 검체군을 사용하여 진단용 유전자의 선정을 행했다. 여기에서, 보다 신뢰성이 높은 진단 마커를 획득하기 위해서 학습 검체군의 식도암 환자군 또는 학습 검체군의 건상체군 중 어느 하나에 있어서 50% 이상의 검체에서 2의 6승 이상의 유전자 발현량을 갖는 유전자만을 선택했다. 또한, 식도암 환자군과 건상체군을 판별하기 위한 통계적 유의성이 있는 유전자로서 각각의 유전자 발현량에 대하여 등분산을 가정한 양측 t검정에서 얻어진 P값을 본페로니 보정하고, p＜0.01을 충족시키는 유전자를 판별식의 설명 변수에 사용하는 유전자 마커로서 획득하여 후술하는 표 2에 기재했다.
이렇게 해서 hsa-miR-204-3p, hsa-miR-1247-3p, hsa-miR-6875-5p, hsa-miR-6857-5p, hsa-miR-6726-5p, hsa-miR-3188, hsa-miR-8069, hsa-miR-4257, hsa-miR-1343-3p, hsa-miR-7108-5p, hsa-miR-6825-5p, hsa-miR-7641, hsa-miR-3185, hsa-miR-4746-3p, hsa-miR-6791-5p, hsa-miR-6893-5p, hsa-miR-4433b-3p, hsa-miR-3135b, hsa-miR-6781-5p, hsa-miR-1908-5p, hsa-miR-4792, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-4417, hsa-miR-3184-5p, hsa-miR-1225-5p, hsa-miR-1231, hsa-miR-1225-3p, hsa-miR-150-3p, hsa-miR-4433-3p, hsa-miR-6125, hsa-miR-4513, hsa-miR-6787-5p, hsa-miR-6784-5p, hsa-miR-615-5p, hsa-miR-6765-3p, hsa-miR-5572, hsa-miR-6842-5p, hsa-miR-8063, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-187-5p, hsa-miR-128-1-5p, hsa-miR-6729-5p, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-6757-5p, hsa-miR-7110-5p, hsa-miR-7975, hsa-miR-1233-5p, hsa-miR-6845-5p, hsa-miR-3937, hsa-miR-4467, hsa-miR-7109-5p, hsa-miR-6088, hsa-miR-6782-5p, hsa-miR-5195-3p, hsa-miR-4454, hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-8072, hsa-miR-4516, hsa-miR-6756-5p, hsa-miR-4665-3p, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-6820-5p, hsa-miR-6887-5p, hsa-miR-3679-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-6721-5p, hsa-miR-3622a-5p, hsa-miR-939-5p, hsa-miR-602, hsa-miR-7977, hsa-miR-6749-5p, hsa-miR-1914-3p, hsa-miR-4651, hsa-miR-4695-5p, hsa-miR-6848-5p, hsa-miR-1228-3p, hsa-miR-642b-3p, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-3620-5p, hsa-miR-3131, hsa-miR-6732-5p, hsa-miR-7113-3p, hsa-miR-23a-3p, hsa-miR-3154, hsa-miR-4723-5p, hsa-miR-3663-3p, hsa-miR-4734, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR-4442, hsa-miR-4476, hsa-miR-423-5p, hsa-miR-1249, hsa-miR-6515-3p, hsa-miR-887-3p, hsa-miR-4741, hsa-miR-6766-3p, hsa-miR-4673, hsa-miR-6779-5p, hsa-miR-4706, hsa-miR-1268b, hsa-miR-4632-5p, hsa-miR-3197, hsa-miR-6798-5p, hsa-miR-711, hsa-miR-6840-3p, hsa-miR-6763-5p, hsa-miR-6727-5p, hsa-miR-371a-5p, hsa-miR-6824-5p, hsa-miR-4648, hsa-miR-1227-5p, hsa-miR-564, hsa-miR-3679-3p, hsa-miR-2861, hsa-miR-6737-5p, hsa-miR-575, hsa-miR-4725-3p, hsa-miR-6716-5p, hsa-miR-4675, hsa-miR-1915-3p, hsa-miR-671-5p, hsa-miR-3656, hsa-miR-6722-3p, hsa-miR-4707-5p, hsa-miR-4449, hsa-miR-1202, hsa-miR-4649-5p, hsa-miR-744-5p, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-451a, hsa-miR-6870-5p, hsa-miR-4443, hsa-miR-6808-5p, hsa-miR-4728-5p, hsa-miR-937-5p, hsa-miR-135a-3p, hsa-miR-663b, hsa-miR-1343-5p, hsa-miR-6822-5p, hsa-miR-6803-5p, hsa-miR-6805-3p, hsa-miR-128-2-5p, hsa-miR-4640-5p, hsa-miR-1469, hsa-miR-92a-2-5p, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-4281, hsa-miR-1260b, hsa-miR-4758-5p, hsa-miR-1915-5p, hsa-miR-5001-5p, hsa-miR-4286, hsa-miR-6126, hsa-miR-6789-5p, hsa-miR-4459, hsa-miR-1268a, hsa-miR-6752-5p, hsa-miR-6131, hsa-miR-6800-5p, hsa-miR-4532, hsa-miR-6872-3p, hsa-miR-718, hsa-miR-6769a-5p, hsa-miR-4707-3p, hsa-miR-6765-5p, hsa-miR-4739, hsa-miR-4525, hsa-miR-4270, hsa-miR-4534, hsa-miR-6785-5p, hsa-miR-6850-5p, hsa-miR-4697-5p, hsa-miR-1260a, hsa-miR-4486, hsa-miR-6880-5p, hsa-miR-6802-5p, hsa-miR-6861-5p, hsa-miR-92b-5p, hsa-miR-1238-5p, hsa-miR-6851-5p, hsa-miR-7704, hsa-miR-149-3p, hsa-miR-4689, hsa-miR-4688, hsa-miR-125a-3p, hsa-miR-23b-3p, hsa-miR-614, hsa-miR-1913 및 hsa-miR-16-5p 유전자, 이들에 관련되는 서열번호 1~189로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 발견했다.
이 중, 식도암의 유무를 검사하는 마커로서 신규로 발견된 유전자는 서열번호 1~115, 117~189로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드이다.
또한, 이들 유전자의 발현량을 지표로 하여 피셔의 판별분석에 의해 식도암의 유무를 판별하는 판별식을 작성했다. 즉, 학습 검체군에 있어서 검출된 서열번호 1~189 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 식 2에 입력하여 판별식을 작성하고, 산출한 정밀도, 감도, 특이도를 후술하는 표 3에 나타냈다. 또한, 그 때의 판별식계수와 상수항을 표 4에 나타냈다.
여기에서, 예를 들면 서열번호 1, 3, 4, 5, 6, 9, 10, 13, 15, 17, 18, 19, 26, 28, 29, 30, 32, 33, 35, 40, 41, 43, 55, 58, 61, 63, 67, 68, 70, 76, 77, 80, 90, 92, 93, 95, 109, 116, 119, 122, 127 및 150으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 42개의 폴리뉴클레오티드는 학습 검체군에 포함되는 스테이지 I검체 3례도 모두 식도암으로 판별할 수 있는 마커로서 선정했다.
상기에서 작성한 판별식을 사용하여 테스트 검체군에 있어서의 정밀도·감도·특이도를 산출하고, 선정된 폴리뉴클레오티드의 판별 성능을 독립된 검체에서 검증했다(표 3). 예를 들면 서열번호 1로 나타내어지는 염기서열의 유전자 발현량의 측정값을 학습 검체군의 건상체(100명)와 식도암 환자(34명)에서 비교했을 경우, 건상체군에 대하여 식도암 환자군의 발현량 측정값이 유의하게 낮은 것이 나타내어지고(도 2 좌측 참조), 또한 이 결과는 테스트 검체군의 건상체(50명)와 식도암 환자(16명)에서도 재현할 수 있었다(도 2 우측 참조). 마찬가지로 서열번호 2~189로 나타내어지는 다른 폴리뉴클레오티드에 있어서도, 건상체군에 대하여 식도암 환자군의 발현량 측정값이 유의하게 낮거나(-) 또는 높은(+) 결과가 얻어지고(표 2), 이들 결과는 테스트 검체군에서 검증이 가능했다. 또한, 예를 들면 이 서열번호 1로 나타내어지는 염기서열에 관하여 학습 검체군에서 설정한 양쪽 군을 판별하는 역치(12.3)를 사용하여 테스트 검체군에 있어서의 식도암 검출의 적중률을 산출한 결과, 진양성 13례, 진음성 48례, 위양성 2례, 위음성 3례이며, 이들 값으로부터 검출 성능으로서 정밀도 92.4%, 감도 81.2%, 특이도 96%가 얻어졌다. 이렇게 하여 서열번호 1~189로 나타내어지는 모든 폴리뉴클레오티드의 검출 성능을 산출하여 표 3에 기재했다. 마찬가지로 표 2에 나타내는 서열번호 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 106, 107, 109, 110, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 119, 120, 130, 131, 134, 139, 143, 151, 159, 173, 182, 185, 186, 187, 188 및 189로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 129개의 폴리뉴클레오티드는 테스트 검체군에 있어서 각각 감도 81.2%, 87.5%, 93.8%, 100%, 87.5%, 87.5%, 81.2%, 75%, 87.5%, 100%, 100%, 87.5%, 81.2%, 75%, 87.5%, 87.5%, 81.2%, 93.8%, 93.8%, 81.2%, 100%, 87.5%, 68.8%, 87.5%, 81.2%, 75%, 87.5%, 81.2%, 81.2%, 87.5%, 75%, 68.8%, 81.2%, 75%, 68.8%, 100%, 68.8%, 87.5%, 87.5%, 81.2%, 68.8%, 75%, 75%, 87.5%, 68.8%, 62.5%, 93.8%, 75%, 81.2%, 62.5%, 56.2%, 56.2%, 56.2%, 75%, 68.8%, 62.5%, 62.5%, 62.5%, 68.8%, 68.8%, 68.8%, 56.2%, 56.2%, 56.2%, 81.2%, 56.2%, 50%, 68.8%, 75%, 56.2%, 56.2%, 56.2%, 62.5%, 43.8%, 50%, 56.2%, 56.2%, 68.8%, 62.5%, 62.5%, 68.8%, 56.2%, 43.8%, 62.5%, 56.2%, 43.8%, 43.8%, 75%, 56.2%, 56.2%, 62.5%, 56.2%, 87.5%, 43.8%, 50%, 43.8%, 50%, 56.2%, 43.8%, 50%, 43.8%, 68.8%, 62.5%, 56.2%, 43.8%, 43.8%, 56.2%, 56.2%, 62.5%, 56.2%, 62.5%, 50%, 68.8%, 56.2%, 43.8%, 62.5%, 43.8%, 43.8%, 43.8%, 43.8%, 50%, 56.2%, 43.8%, 43.8%, 75%, 62.5%, 43.8%, 50% 및 62.5%를 나타냈다(표 3). 여기에서, 후술하는 비교예로부터 테스트 검체군에 있어서의 식도암의 기존 마커 SCC의 감도는 37.5%이었던 점에서(표 5-2), 테스트 검체군에 있어서 서열번호 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 106, 107, 109, 110, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 119, 120, 130, 131, 134, 139, 143, 151, 159, 173, 182, 185, 186, 187, 188 및 189로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 129개의 폴리뉴클레오티드는 단독으로 SCC를 상회하는 감도로 식도암을 판별하는 것을 증명할 수 있었다.
따라서, 이들의 폴리뉴클레오티드는 조기의 식도암도 검출할 수 있어 식도암의 조기진단에 공헌한다.
[실시예 2]
<테스트 검체군 검체를 사용한 복수의 유전자 마커의 조합에 의한 식도암 판별 성능의 평가 방법>
본 실시예에서는 실시예 1에서 선정된 유전자 마커를 조합하여 식도암 판별 성능을 평가하는 방법을 검토했다. 구체적으로는 실시예 1에 있어서 선택된 서열번호 1~189로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드 중 어느 하나가 신규로 발견된 서열번호 1~115, 117~189로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 발현량 측정값 중 어느 2종의 조합 17,766가지에 대해서 피셔의 판별분석을 행하고, 식도암의 존재의 유무를 판별하는 판별식을 구축했다. 이어서, 상기에서 작성한 판별식을 사용하여 테스트 검체군에 있어서의 정밀도, 감도, 특이도를 산출하고, 선정된 폴리뉴클레오티드의 판별 성능을 독립된 검체에서 검증했다.
예를 들면, 서열번호 2와 서열번호 4로 나타내어지는 염기서열의 유전자 발현량의 측정값을 학습 검체군의 건상체(100명)와 식도암 환자(34명)에서 비교했을 경우, 건상체군과 식도암 환자군의 측정값이 유의하게 분리되는 산포도가 얻어지고(도 3 좌측 참조), 또한 이 결과는 테스트 검체군의 건상체(50명)와 식도암 환자(16명)에서도 재현할 수 있었다(도 3 우측 참조). 마찬가지로 신규로 발견된 서열번호 1~115, 및 117~189로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 유전자 발현량의 측정값 중 어느 2개의 다른 조합에 있어서도 건상체군과 식도암 환자군의 측정값을 유의하게 분리하는 산포도가 얻어지고, 이들 결과는 테스트 검체군에서 검증이 가능했다. 또한, 도 3에서 나타내는 바와 같이, 예를 들면 이 서열번호 2와 서열번호 4로 나타내어지는 염기서열에 관하여 학습 검체군에서 설정한 양쪽 군을 판별하는 함수(0=2.42x+y-21.17)를 사용하여 식도암 검출의 적중률을 산출한 결과, 진양성 15례, 진음성 49례, 위양성 1례, 위음성 1례이며, 이들 값으로부터 검출 성능으로서 정밀도 97%, 감도 93.8%, 특이도 98%가 얻어졌다. 이렇게 해서 서열번호 1~189로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 2개의 조합 모든 경우의 검출 성능을 산출했다. 이 중, 예로서 서열번호 1로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 발현량 측정값을 포함하는 조합 188가지와 그 검출 성능에 대해서 표 6에 기재했다. 예를 들면, 서열번호 1과 서열번호 6, 서열번호 1과 서열번호 9, 서열번호 1과 서열번호 13, 및 서열번호 1과 서열번호 14로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 발현량 측정값의 조합에 대해서는 모두 테스트 검체군에 있어서 감도 100%를 나타냈다. 마찬가지로 서열번호 1과 서열번호 2~189로 나타내어지는 2개의 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 나머지의 조합에 대해서도 모두 감도 81% 이상을 나타내고, 식도암의 기존 마커 SCC의 감도(37.5%)(표 5-2)를 상회했다. 또한, SCC의 감도를 상회하는 2개의 폴리뉴클레오티드의 발현량 측정값의 조합은 테스트 검체군에서 17,096가지 얻어지고, 이 조합에는 실시예 1에서 얻어진 표 2에 기재된 염기서열 1~189 모두가 적어도 1회는 사용되었다. 따라서, 서열번호 1~189로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드는 2개의 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 발현량 측정값을 조합시켰을 경우에 있어서도 우수한 식도암의 검출 감도가 얻어졌다.
또한, 서열번호 1~189로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 발현량 측정값을 3개, 4개, 5개, 6개, 7개, 8개, 9개, 10개 또는 그 이상의 개수를 조합시킴으로써 더 우수한 감도로 식도암을 검출하는 마커가 얻어진다. 예를 들면, 실시예 1에서 선택된 서열번호 1~189로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드 중 신규로 발견된 서열번호 1~115, 및 117~189로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드에 대하여 테스트 검체군에 있어서의 건상체군과 식도암 군 사이에서 측정된 발현량 값을 얻고, 군 간의 차의 통계적 유의성을 나타내는 Student's의 t-test에 의한 P값의 내림차순으로 전체 폴리뉴클레오티드를 순위를 매기고(P값이 가장 낮은 것이 1위가 됨), 상위의 폴리뉴클레오티드로부터 1개씩 조합에 추가함으로써 1개로부터 복수개의 폴리뉴클레오티드의 조합의 식도암 검출 감도를 평가했다. 즉, 이 평가에 있어서의 폴리뉴클레오티드의 조합의 순서는 서열번호로 나타내면 표 2에 나타내는 서열번호 189로부터 188, 187,로 순번에 거슬러 오른 순서가 된다. 그 결과, 테스트 검체군에 있어서의 감도는 1개의 폴리뉴클레오티드(서열번호 189)에서 31.2%, 2개의 폴리뉴클레오티드(서열번호 188 및 189)에서 56.2%, 3개의 폴리뉴클레오티드(서열번호 187~189)에서 75.0%, 5개의 폴리뉴클레오티드(서열번호 185~189)에서 93.8%, 11개의 폴리뉴클레오티드(서열번호 179~189)에서 100%, 30개의 폴리뉴클레오티드(서열번호 160~189)에서 100%, 50개의 폴리뉴클레오티드(서열번호 140~189)에서 100%, 100개의 폴리뉴클레오티드(서열번호 89~115, 및 117~189)에서 100%, 150개의 폴리뉴클레오티드(서열번호 39~115, 및 117~189)에서 100%, 189개의 폴리뉴클레오티드(서열번호 1~115, 117~189)에서 100%이었다.
즉, 단독의 폴리뉴클레오티드, 또는 보다 소수의 폴리뉴클레오티드보다 복수의 폴리뉴클레오티드를 조합시켰을 경우의 편이 높은 식도암 판별 성능을 얻는 것이 가능한 것이 나타내어졌다. 여기에서, 복수의 폴리뉴클레오티드의 조합은 상기한 바와 같이 통계적 유의차의 순으로 조합시키는 경우에 한정되지 않고, 어떤 복수개의 폴리뉴클레오티드의 조합을 사용해도 식도암의 검출에 사용할 수 있다.
이들의 결과로부터 서열번호 1~189로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 모든 폴리뉴클레오티드는 우수한 식도암의 검출용 마커라고 할 수 있다.
[실시예 3]
<전 검체를 사용했을 경우의 유전자 마커의 선정과 획득된 유전자 마커의 식도암 판별 성능의 평가 방법>
본 실시예에서는 상기 실시예 1 및 실시예 2에서 사용한 학습 검체군 및 테스트 검체군의 검체를 통합하여 전 검체를 사용하여 유전자 마커의 선정 및 그 식도암 판별 성능 평가를 행했다.
구체적으로는 상기 참고예에서 얻은 식도암 환자 50명의 혈청 및 건상체 150명의 혈청에 대한 miRNA 발현량에 대하여 quantile normalization으로 정규화했다. 보다 신뢰성이 높은 진단 마커를 획득하기 위해서 유전자 마커의 선정에서는 식도암 환자군 또는 건상체군 중 어느 하나에 있어서, 50% 이상의 검체에서 2의 6승 이상의 유전자 발현량을 갖는 유전자만을 선택했다. 또한, 식도암 환자군과 건상체군을 판별하기 위한 통계적 유의성을 얻기 위해서 각각의 유전자 발현량에 대해서 등분산을 가정한 양측 t검정에서 얻어진 P값을 본페로니 보정하고, p＜0.01을 충족시키는 유전자를 판별식의 설명 변수에 사용하는 유전자 마커로서 선택하여 표 7에 기재했다. 이렇게 하여 표 2에 기재한 유전자에 추가하여 hsa-miR-675-5p, hsa-miR-486-3p, hsa-miR-6777-5p, hsa-miR-4497, hsa-miR-296-3p, hsa-miR-6738-5p, hsa-miR-4731-5p, hsa-miR-6889-5p, hsa-miR-6786-5p, hsa-miR-92a-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-4763-3p, hsa-miR-6076, hsa-miR-663a, hsa-miR-760, hsa-miR-4667-5p, hsa-miR-6090, hsa-miR-4730, hsa-miR-7106-5p, hsa-miR-3196, hsa-miR-5698, hsa-miR-6087, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-8059 및 hsa-miR-6879-5p 유전자, 이들에 관련되는 서열번호 190~214로 나타내어지는 염기서열을 발견했다. 서열번호 1~189의 염기서열과 마찬가지로 서열번호 190~214의 염기서열로 나타내어지는 폴리뉴클레오티드에 있어서도 건상체군에 대하여 식도암 환자군의 측정값이 유의하게 낮거나(-) 또는 높은(+) 결과가 얻어지고(표 7), 이들 결과는 테스트 검체군에서 검증이 가능했다. 따라서, 표 7에 기재한 유전자의 발현량 측정값을 단독 또는 표 2에 기재된 유전자의 발현량 측정값과 조합하여 사용함으로써 실시예 1 및 실시예 2에 기재한 방법에서 신규로 얻은 검체를 판별할 수 있다.
[실시예 4]
<테스트 검체군의 검체를 사용한 복수의 유전자 마커의 조합에 의한 식도암 특이적인 판별 성능의 평가 방법>
본 실시예에서는 실시예 1에서 선정된 유전자 마커를 사용하고, 및 참고예 2에 기재한 학습 검체군을 대상으로 하여 실시예 1에 기재된 방법과 마찬가지의 방법에 의해 식도암 환자와, 건강체, 췌장암 환자, 담도암 환자, 대장암 환자, 위암 환자, 간암 환자 및 췌담도 양성질환 환자로 이루어지는 대조군의 혈청 중의 miRNA의 유전자 발현량의 비교를 행하여 진단용 유전자를 선택했다. 그 결과 새롭게 선택된 서열번호 666~676으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 서열번호 1~214로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 더 조합하여 식도암 특이적인 판별 성능을 평가하는 방법을 검토했다.
구체적으로는 우선 상기 참고예 2에서 얻은 학습 검체군과 테스트 검체군의 miRNA 발현량을 함께 quantile normalization으로 정규화했다. 이어서, 서열번호 1~214, 666~676으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 발현량 측정값을 적어도 1개 포함하는 1~6개의 조합에 대해서 피셔의 판별분석을 행하여 식도암의 존재의 유무를 판별하는 판별식을 구축했다. 이어서, 식도암 환자군을 양성검체군, 한편 건상체군, 췌장암 환자군, 담도암 환자군, 대장암 환자군, 위암 환자군, 간암 환자군 및 췌담도 양성질환 환자군을 음성검체군으로 하여 상기에서 작성한 판별식을 사용하여 테스트 검체군에 있어서의 정밀도·감도·특이도를 산출하고, 선정된 폴리뉴클레오티드의 판별 성능을 독립된 검체에서 검증했다.
상기 서열번호 1~214 및 666~676으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 대부분이 식도암의 존재의 유무의 판별에 있어서 비교적 높은 정밀도, 감도, 특이도를 제공할 수 있음과 아울러, 식도암을 기타 암으로부터 특이적으로 식별 가능했다. 예를 들면, 서열번호 1, 2, 5, 8, 22, 32, 33, 35, 43, 44, 56, 85, 98, 106, 109, 115, 121, 126, 133, 138, 155, 157, 166, 177, 179, 185, 202, 212, 666, 667, 668, 669, 670, 671, 672, 673, 674, 675 및 676으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군(암 종특이성 폴리뉴클레오티드군 1)으로부터 선택되는 적어도 1개의 폴리뉴클레오티드는 표적 마커와 특이적으로 결합 가능했다.
특히, 암 종특이성 폴리뉴클레오티드군 1로부터 선택되는 복수개의 폴리뉴클레오티드의 조합 중, 서열번호 1, 22, 85, 109, 121, 126, 133, 138, 166 및 666으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군(암 종특이성 폴리뉴클레오티드군 2)으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 조합에 있어서 고정밀도로 식도암을 기타 암으로부터 특이적으로 식별 가능했다.
상기 암 종특이성이 있는 폴리뉴클레오티드의 조합의 개수로서는 1개, 2개, 3개, 4개, 5개, 6개, 7개, 8개, 9개, 10개 또는 그 이상의 개수를 조합할 수 있지만, 6개 이상의 조합에 있어서 판별 정밀도 85% 이상을 나타낼 수 있었다. 암 종특이성 폴리뉴클레오티드군 2의 각각의 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 때의 판별 정밀도의 구체적 결과를 이하에서 설명한다.
서열번호 1로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 경우의 판별 정밀도를 표 8-1에 나타낸다. 서열번호 1로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 하나의 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 정밀도 65.4%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 65.4%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 1로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 2개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 78.3%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 77.7%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 1로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 3개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 85.9%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 79.8%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 1로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 4개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 89.2%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 88.8%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 1로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 5개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 91.1%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 90.4%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 1로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 6개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 92.7%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 93.1%를 나타냈다.
서열번호 22로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 경우의 판별 정밀도를 표 8-2에 나타낸다. 서열번호 22로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 하나의 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 정밀도 70.9%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 69.1%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 22로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 2개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 83.0%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 77.7%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 22로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 3개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 86.9%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 81.9%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 22로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 4개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 89.3%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 87.2%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 22로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 5개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 91.4%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 86.7%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 22로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 6개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 91.9%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 90.4%를 나타냈다.
서열번호 85로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 경우의 판별 정밀도를 표 8-3에 나타낸다. 서열번호 85로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 하나의 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 정밀도 65.2%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 61.2%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 85로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 2개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 79.1%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 77.1%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 85로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 3개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 84.3%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 78.1%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 85로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 4개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 88.5%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 88.8%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 85로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 5개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 90.8%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 91.0%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 85로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 6개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 91.6%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 91.0%를 나타냈다.
서열번호 109로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 경우의 판별 정밀도를 표 8-4에 나타낸다. 서열번호 109로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 하나의 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 정밀도 57.6%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 54.8%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 109로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 2개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 83.0%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 76.1%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 109로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 3개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 85.9%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 81.9%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 109로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 4개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 88.7%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 84.5%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 109로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 5개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 91.1%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 90.4%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 109로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 6개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 91.9%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 90.4%를 나타냈다.
서열번호 121로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 경우의 판별 정밀도를 표 8-5에 나타낸다. 서열번호 121로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 하나의 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 정밀도 72.3%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 67.6%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 121로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 2개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 81.9%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 73.9%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 121로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 3개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 86.1%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 79.7%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 121로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 4개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 89.0%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 83.0%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 121로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 5개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 91.4%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 86.2%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 121로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 6개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 91.6%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 89.9%를 나타냈다.
서열번호 126으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 경우의 판별 정밀도를 표 8-6에 나타낸다. 서열번호 126으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 하나의 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 정밀도 73.6%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 66.0%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 126으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 2개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 83.5%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 76.1%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 126으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 3개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 88.5%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 79.8%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 126으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 4개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 89.8%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 84.0%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 126으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 5개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 91.1%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 91.5%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 126으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 6개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 92.7%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 90.4%를 나타냈다.
서열번호 133으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 경우의 판별 정밀도를 표 8-7에 나타낸다. 서열번호 133으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 하나의 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 정밀도 52.9%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 54.8%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 133으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 2개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 81.7%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 79.3%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 133으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 3개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 86.1%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 83.5%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 133으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 4개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 89.0%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 86.1%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 133으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 5개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 90.8%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 89.4%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 133으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 6개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 91.3%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 89.4%를 나타냈다.
서열번호 138로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 경우의 판별 정밀도를 표 8-8에 나타낸다. 서열번호 138로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 하나의 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 정밀도 70.1%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 68.1%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 138로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 2개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 80.1%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 77.7%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 138로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 3개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 85.8%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 92.0%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 138로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 4개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 89.5%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 88.8%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 138로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 5개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 91.6%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 90.4%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 138로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 6개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 91.9%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 90.4%를 나타냈다.
서열번호 166으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 경우의 판별 정밀도를 표 8-9에 나타낸다. 서열번호 166으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 하나의 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 정밀도 71.7%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 72.3%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 166으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 2개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 80.9%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 77.7%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 166으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 3개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 86.9%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 81.9%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 166으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 4개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 90.1%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 87.2%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 166으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 5개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 92.1%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 90.4%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 166으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 6개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 91.6%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 91.5%를 나타냈다.
서열번호 666으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 경우의 판별 정밀도를 표 8-10에 나타낸다. 서열번호 666으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 하나의 폴리뉴클레오티드를 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 정밀도 56.0%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 53.2%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 666으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 2개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 81.2%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 78.2%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 666으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 3개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 85.9%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 81.4%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 666으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 4개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 89.2%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 89.9%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 666으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 5개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 91.3%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 91.0%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 666으로 나타내어지는 염기서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 6개의 조합을 사용하여 측정했을 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 92.1%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 91.5%를 나타냈다.
또한, 서열번호 1, 5, 85, 138, 166, 666으로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 발현량 측정값을 사용하여 학습 검체군의 식도암 환자 34명, 건상체 103명, 췌장암 환자 69명, 담도암 환자 66명, 대장암 환자 30명, 위암 환자 33명, 간암 환자 32명, 및 췌담도 양성질환 환자 15명을 비교했을 경우, 학습 검체군에서는 식도암 환자군과 기타 군의 판별 득점이 유의하게 분리되는 산포도가 얻어지고(도 4A 참조), 또한 이 결과는 테스트 검체군에서도 재현이 가능했다(도 4B 참조).
[비교예1]
<기존 혈중 종양 마커의 식도암 판별 성능>
상기 참고예에서 얻은 학습 검체군과 테스트 검체군에 대해서 기존의 식도암 종양 마커 CEA 및 SCC의 혈중농도를 측정했다. 이들 종양 마커는 원칙, 비특허문헌 3에 기재되는 기준값(CEA는 5ng/mL, SCC는 1.5ng/mL)보다 혈중농도가 높으면 암의 의심이 있는 것이 된다. 따라서, 각 검체마다 CEA 및 SCC의 혈중농도가 기준값을 초과하고 있는지의 여부를 확인하고, 그 결과가 식도암 환자를 암으로 판정하고 있는지 확인하여 학습 검체군 및 테스트 검체군에 있어서의 각 기존 마커의 감도를 산출했다. 이 결과를 표 5에 나타냈다. CEA의 감도는 학습 검체군에 있어서 12.1%, 테스트 검체군에 있어서는 18.8%밖에 되지 않으며, 한편 SCC의 감도는 학습 검체군에 있어서 36.4%, 테스트 검체군에 있어서는 37.5%에 머물러 어느 마커나 식도암의 검출에는 유용하지 않은 것을 알 수 있었다(표 5-1, 표 5-2).
한편, 상기 실시예 1 및 실시예 2의 표 3 및 표 6에 나타내는 바와 같이 서열번호 1~189로 나타내어지는 염기서열로 이루어지는 모든 폴리뉴클레오티드는 기존의 식도암 마커 이상의 감도를 나타내는 1개 또는 2개의 조합이 존재하여 우수한 진단 마커라고 할 수 있다.
이상의 실시예, 비교예에 나타내는 바와 같이 본 발명의 키트 등 및 방법에 의하면 기존의 종양 마커보다 식도암을 감도 좋게 검출할 수 있으므로 식도암을 조기에 발견하여 치료하는 것이 가능해지고, 그 결과, 생존율을 대폭 향상할 수 있으며, 또한 치료 선택에 있어서도 환자에게 부담이 적은 내시경 치료나 광선역학적 치료가 적응 가능해진다.
본 발명에 의해 간이하며 또한 저렴한 방법으로 식도암을 효과적으로 검출할 수 있기 때문에 식도암의 조기 발견, 진단 및 치료가 가능해진다. 또한, 본 발명의 방법에 의해 환자혈액을 사용하여 식도암을 저침습적으로 검출할 수 있기 때문에 식도암을 간편하며 또한 신속하게 검출하는 것이 가능해진다.
본 발명에서 인용한 모든 간행물, 특허 및 특허출원을 그대로 참고로 하여 본 명세서에 원용하는 것으로 한다.
SEQUENCE LISTING <110> Toray Industries, Inc. National Cancer Center <120> Kit and method for detecting esophageal cancer <130> PH-6237-PCT <150> JP 2014-125036 <151> 2014-06-18 <150> JP 2015-070379 <151> 2015-03-30 <160> 700 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 21 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 1 gcugggaagg caaagggacg u 21 <210> 2 <211> 24 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 2 ccccgggaac gucgagacug gagc 24 <210> 3 <211> 21 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 3 ugagggaccc aggacaggag a 21 <210> 4 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 4 uuggggauug ggucaggcca gu 22 <210> 5 <211> 21 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 5 cgggagcugg ggucugcagg u 21 <210> 6 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 6 agaggcuuug ugcggauacg ggg 23 <210> 7 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 7 ggaugguugg gggcggucgg cgu 23 <210> 8 <211> 18 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 8 ccagaggugg ggacugag 18 <210> 9 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 9 cuccuggggc ccgcacucuc gc 22 <210> 10 <211> 21 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 10 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ggagagggaa cc 22 <210> 130 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 130 aaaccguuac cauuacugag uu 22 <210> 131 <211> 19 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 131 ugggggagau ggggguuga 19 <210> 132 <211> 17 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 132 uuggaggcgu ggguuuu 17 <210> 133 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 133 caggcaggga ggugggacca ug 22 <210> 134 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 134 ugggagggga gaggcagcaa gca 23 <210> 135 <211> 20 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 135 gugagucagg guggggcugg 20 <210> 136 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 136 uauagggauu ggagccgugg cg 22 <210> 137 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 137 gguggcccgg ccgugccuga gg 22 <210> 138 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 138 uggggagcgg cccccgggug gg 22 <210> 139 <211> 20 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 139 cagggaacca guuggggcuu 20 <210> 140 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 140 cugggggugg ggggcugggc gu 22 <210> 141 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens 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ucugcccccu ccgcugcugc ca 22 <210> 189 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 189 uagcagcacg uaaauauugg cg 22 <210> 190 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 190 uggugcggag agggcccaca gug 23 <210> 191 <211> 21 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 191 cggggcagcu caguacagga u 21 <210> 192 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 192 acggggaguc aggcaguggu gga 23 <210> 193 <211> 17 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 193 cuccgggacg gcugggc 17 <210> 194 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 194 gaggguuggg uggaggcucu cc 22 <210> 195 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 195 cgagggguag aagagcacag ggg 23 <210> 196 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 196 ugcugggggc cacaugagug ug 22 <210> 197 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 197 ucggggaguc ugggguccgg aau 23 <210> 198 <211> 21 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 198 gcgguggggc cggaggggcg u 21 <210> 199 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 199 uauugcacuu gucccggccu gu 22 <210> 200 <211> 17 <212> RNA 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ggggaaagaa ca 102 <210> 233 <211> 68 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 233 ugcccaggcu ggagcgagug caguggugca gucaguccua gcucacugca gccucgaacu 60 ccugggcu 68 <210> 234 <211> 64 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 234 aaccccgggc cggaggucaa gggcgucgcu ucucccuaau guugccucuu uuccacggcc 60 ucag 64 <210> 235 <211> 80 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 235 cgggaaugcc gcggcgggga cggcgauugg uccguaugug uggugccacc ggccgccggc 60 uccgccccgg cccccgcccc 80 <210> 236 <211> 74 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 236 gcagcccggu gagcgcucgc uggccuggca gugcgucgga agaacagggc ggguggggcc 60 gcgcacaucu cugc 74 <210> 237 <211> 99 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 237 gcaagggaca gggagggucg uggcgacacu cgcgccagcu cccgggacgg cugggcucgg 60 gcuggucgcc gaccuccgac ccuccacuag augccuggc 99 <210> 238 <211> 73 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 238 gaaaacaacc aggugggcuu cccggagggc ggaacaccca gccccagcau ccagggcuca 60 ccuaccacgu uug 73 <210> 239 <211> 75 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 239 aagcaagacu gaggggccuc agaccgagcu uuuggaaaau agaaaagucu cgcucucugc 60 cccucagccu aacuu 75 <210> 240 <211> 90 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 240 guggguacgg cccagugggg gggagaggga cacgcccugg gcucugccca gggugcagcc 60 ggacugacug agccccugug ccgcccccag 90 <210> 241 <211> 92 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 241 gucagugucu gggcggacag cugcaggaaa gggaagacca aggcuugcug ucuguccagu 60 cugccacccu acccugucug uucuugccac ag 92 <210> 242 <211> 84 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 242 cuccccaugg cccugucucc caacccuugu accagugcug ggcucagacc cugguacagg 60 ccugggggac agggaccugg ggac 84 <210> 243 <211> 81 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 243 cauccuccuu acgucccacc ccccacuccu guuucuggug aaauauucaa acaggagugg 60 gggugggaca uaaggaggau a 81 <210> 244 <211> 96 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 244 gcucuggggc gugccgccgc cgucgcugcc accuccccua ccgcuagugg aagaagaugg 60 cggaaggcgg agcggcggau cuggacaccc agcggu 96 <210> 245 <211> 86 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 245 auucuaggug gggagacuga cggcuggagg cccauaagcu gucuaaaacu ucggccccca 60 gauuucuggu cuccccacuu cagaac 86 <210> 246 <211> 61 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 246 ucggcuggcg gggguagagc uggcugcagg cccggccccu cucagcugcu gcccucucca 60 g 61 <210> 247 <211> 67 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 247 uacaggccgg ggcuuugggu gagggacccc cggagucugu cacggucuca ccccaacucu 60 gccccag 67 <210> 248 <211> 96 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 248 cucgggaggg gcgggagggg gguccccggu gcucggaucu cgagggugcu uauuguucgg 60 uccgagccug ggucucccuc uuccccccaa cccccc 96 <210> 249 <211> 87 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 249 gugaggcggg gccaggaggg uguguggcgu gggugcugcg gggccgucag ggugccugcg 60 ggacgcucac cuggcuggcc cgcccag 87 <210> 250 <211> 137 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 250 agccagacaa gagggucaug gggagucacu gucaacccag agcaggcacu gccccugcga 60 ccagccuggg gcaucgguug gggugcaggg gucugcuggu gaugcuuucc aucucuuugc 120 uuuguccuga uuguagc 137 <210> 251 <211> 65 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 251 agcccugggg guggucucua gccaaggcuc uggggucuca cccuuggcug gucucugcuc 60 cgcag 65 <210> 252 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uuaaucccua auccccaaca cuggccuugc 60 uauccccag 69 <210> 259 <211> 86 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 259 ggggcugggg guguggggag agagagugca cagccagcuc agggauuaaa gcucuuucuc 60 ucucucucuc ucccacuucc cugcag 86 <210> 260 <211> 68 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 260 gugcaaagag caggaggaca ggggauuuau cucccaaggg agguccccug auccuaguca 60 cggcacca 68 <210> 261 <211> 82 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 261 gugaguggga ggccagggca cggcaggggg agcugcaggg cuaugggagg ggccccagcg 60 ucugagcccu guccucccgc ag 82 <210> 262 <211> 82 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 262 gugaguggga ggccagggca cggcaggggg agcugcaggg cuaugggagg ggccccagcg 60 ucugagcccu guccucccgc ag 82 <210> 263 <211> 61 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 263 aacugcgggg ccagagcaga gagcccuugc acaccaccag ccucuccucc cugugcccca 60 g 61 <210> 264 <211> 106 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 264 agaagaaugc ccaaccagcc cucaguugcu acaguucccu guuguuucag cucgacaaca 60 acaggcggcu guagcaaugg ggggcuggau gggcaucuca augugc 106 <210> 265 <211> 63 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 265 ugguggcggc gguaguuaug ggcuucucuu ucucaccagc agccccuggg ccgccgccuc 60 ccu 63 <210> 266 <211> 65 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 266 gucuccuggg gggaggagac ccugcucucc cuggcagcaa gccucuccug cccuuccaga 60 uuagc 65 <210> 267 <211> 51 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 267 agagaugaag cgggggggcg gggucuugcu cuauugccua cgcugaucuc a 51 <210> 268 <211> 69 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 268 ugggguaggg gugggggaau ucaggggugu cgaacucaug gcugccaccu uugugucccc 60 auccugcag 69 <210> 269 <211> 115 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 269 gagcaaaaac cagagaacaa caugggagcg uuccuaaccc cuaaggcaac uggaugggag 60 accugaccca uccaguucuc ugagggggcu cuuguguguu cuacaagguu guuca 115 <210> 270 <211> 55 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 270 ccggauccga gucacggcac caaauuucau gcguguccgu gugaagagac cacca 55 <210> 271 <211> 92 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 271 cgcugcgcuu cugggcccgc ggcgggcgug gggcugcccg ggccggucga ccagcgcgcc 60 guagcucccg aggcccgagc cgcgacccgc gg 92 <210> 272 <211> 80 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ccacuuuccu 60 ccuag 65 <210> 279 <211> 68 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 279 cguggugagg auauggcagg gaaggggagu uucccucuau ucccuucccc ccaguaaucu 60 ucaucaug 68 <210> 280 <211> 103 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 280 gugucggcug uggcgugacu gucccucugu gucccccacu aggcccacug cucaguggag 60 cguggaggac gaggaggagg ccguccacga gcaaugccag cau 103 <210> 281 <211> 87 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 281 cccucaucuc ugggcagggg cuuauuguag gagucucuga agagagcugu ggacugaccu 60 gcuuuaaccc uuccccaggu ucccauu 87 <210> 282 <211> 83 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 282 aauagagggu gcacaggcac gggagcucag gugaggcagg gagcugagcu caccugaccu 60 cccaugccug ugcacccucu auu 83 <210> 283 <211> 82 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 283 ugugggcagg gcccugggga gcugaggcuc uggggguggc cggggcugac ccugggccuc 60 ugcuccccag ugucugaccg cg 82 <210> 284 <211> 98 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 284 uucucacccc cgccugacac gggcgacagc ugcggcccgc uguguucacu cgggccgagu 60 gcgucuccug ucaggcaagg gagagcagag ccccccug 98 <210> 285 <211> 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Homo sapiens <400> 320 ugaccacccc cgggcaaaga ccugcagauc cccuguuaga gacgggccca ggacuuugug 60 cggggugccc a 71 <210> 321 <211> 65 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 321 uucuccuggg gaguggcugg ggagcagaca gacccaaccu caugcucccc ggccucugcc 60 cccag 65 <210> 322 <211> 65 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 322 gggugcucgg ggcaggcggc ugggagcggc ccucacauug auggcuccug ccaccuccuc 60 cgcag 65 <210> 323 <211> 67 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 323 guggcacuca aacugugggg gcacuuucug cucucuggug aaagugccgc caucuuuuga 60 guguuac 67 <210> 324 <211> 63 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 324 gagguguagg ggagguuggg ccagggaugc cuucacugug ucucucuggu cuugccaccc 60 cag 63 <210> 325 <211> 72 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 325 ugugggacug caaaugggag cucagcaccu gccugccacc cacgcagacc agccccugcu 60 cuguucccac ag 72 <210> 326 <211> 88 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 326 guggggccag gcgguggugg gcacugcugg ggugggcaca gcagccaugc agagcgggca 60 uuugaccccg ugccacccuu uuccccag 88 <210> 327 <211> 94 <212> RNA <213> Homo 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aaccauagcc cuggucagac ucuccggggc ugugauugac 60 cagcaggacu ucucaug 77 <210> 334 <211> 80 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 334 ugagaggccg caccuugccu ugcugcccgg gccgugcacc cgugggcccc agggcgacgc 60 ggcgggggcg gcccuagcga 80 <210> 335 <211> 118 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 335 gcaggugaac uggcaggcca ggaagaggag gaagcccugg aggggcugga ggugauggau 60 guuuuccucc gguucucagg gcuccaccuc uuucgggccg uagagccagg gcuggugc 118 <210> 336 <211> 69 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 336 cuuucggcca gcgggacggc auccgaggug ggcuaggcuc gggcccgugg cgggugcggg 60 ggugggagg 69 <210> 337 <211> 78 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 337 ggccucaggc aggcgcaccc gaccacaugc auggcuggug gcggcgugca ggggucgggu 60 gggccaggcu guggggcg 78 <210> 338 <211> 80 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 338 gguuccggag ccccggcgcg ggcggguucu gggguguaga cgcugcuggc cagcccgccc 60 cagccgaggu ucucggcacc 80 <210> 339 <211> 66 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 339 agcagcccuc ggcggcccgg ggggcgggcg gcggugcccg ucccggggcu gcgcgaggca 60 caggcg 66 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92 <210> 414 <211> 113 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 414 agcaugacag aggagaggug gagguaggcg agaguaauau aauuucucca ggagaacauc 60 ugagagggga aguugcuuuc cugcccuggc ccuuucaccc uccugaguuu ggg 113 <210> 415 <211> 93 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 415 ccuuccggcg ucccaggcgg ggcgccgcgg gaccgcccuc gugucugugg cggugggauc 60 ccgcggccgu guuuuccugg uggcccggcc aug 93 <210> 416 <211> 80 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 416 ggcgcgucgc cccccucagu ccaccagagc ccggauaccu cagaaauucg gcucuggguc 60 uguggggagc gaaaugcaac 80 <210> 417 <211> 66 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 417 ugacugggga gcagaaggag aacccaagaa aagcugacuu ggaggucccu ccuucugucc 60 ccacag 66 <210> 418 <211> 60 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 418 cgcugggucc gcgcgcccug ggccgggcga uguccgcuug ggggagcgag gggcggggcg 60 <210> 419 <211> 76 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 419 cgcaggccuc uggcggagcc cauuccaugc cagaugcuga gcgauggcug gugugugcug 60 cuccacaggc cuggug 76 <210> 420 <211> 65 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 420 gcuucuggga ggaggggauc uugggaguga ucccaacagc ugagcucccu gaaucccugu 60 cccag 65 <210> 421 <211> 64 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 421 gggugggggc ggggcggcag gggccucccc cagugccagg ccccauucug cuucucuccc 60 agcu 64 <210> 422 <211> 72 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 422 cugugcaccu gggggagugc agugauugug gaaugcaaag ucccacaauc acuguacucc 60 ccaggugcac ag 72 <210> 423 <211> 49 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 423 ggugaggcgg gggggcgagc ccugaggggc ucucgcuucu ggcgccaag 49 <210> 424 <211> 81 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 424 uacaggugca ggggaacugu agaugaaaag gcuuggcacu ugagggaaag ccucaguuca 60 uucucauuuu gcucaccugu u 81 <210> 425 <211> 66 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 425 cagagcaggg cagggaaggu gggagagggg cccagcugac ccuccuguca cccgcuccuu 60 gcccag 66 <210> 426 <211> 24 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 426 gaggcuggga aggcaaaggg acgu 24 <210> 427 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 427 gaaggaggcu gggaa 15 <210> 428 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 428 ccgggaacgu cgagacugga gc 22 <210> 429 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 429 cgggaacguc gagac 15 <210> 430 <211> 26 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 430 ccuucuggag aggcuuugug cggaua 26 <210> 431 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 431 ccuucuggag aggcu 15 <210> 432 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 432 cuccuggggc ccgcacucuc gcu 23 <210> 433 <211> 18 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 433 cuccuggggc ccgcacuc 18 <210> 434 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 434 agaagaaggc ggucggucug cgg 23 <210> 435 <211> 21 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 435 aagaaggcgg ucggucugcg g 21 <210> 436 <211> 21 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 436 cccaggcugg agcgagugca g 21 <210> 437 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 437 agcucacugc agccu 15 <210> 438 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 438 cgcggcgggg acggcgauug gu 22 <210> 439 <211> 17 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 439 cggcggggac ggcgauu 17 <210> 440 <211> 17 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 440 ggugagcgcu cgcuggc 17 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aguucc 26 <210> 513 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 513 gggaggaggg aggag 15 <210> 514 <211> 21 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 514 caacucugau cucuucaucu a 21 <210> 515 <211> 20 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 515 ucucuucauc uaccccccag 20 <210> 516 <211> 27 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 516 gugaacgggc gccaucccga ggcuuug 27 <210> 517 <211> 16 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 517 gugaacgggc gccauc 16 <210> 518 <211> 26 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 518 gcgggcuguc cggagggguc ggcuuu 26 <210> 519 <211> 16 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 519 gcuguccgga gggguc 16 <210> 520 <211> 24 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 520 caggcaggag ccggacugga ccuc 24 <210> 521 <211> 21 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 521 uccaggcagg agccggacug g 21 <210> 522 <211> 25 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 522 agcggggagg aagugggcgc ugcuu 25 <210> 523 <211> 21 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 523 agcggggagg aagugggcgc u 21 <210> 524 <211> 24 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 524 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gaggu 25 <210> 549 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 549 aggaagagga ggaag 15 <210> 550 <211> 19 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 550 uggcgggugc ggggguggg 19 <210> 551 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 551 uggcgggugc ggggg 15 <210> 552 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 552 gccccggcgc gggcggguuc ugg 23 <210> 553 <211> 16 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 553 ggagccccgg cgcggg 16 <210> 554 <211> 26 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 554 gucccggggc ugcgcgaggc acaggc 26 <210> 555 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 555 ggcccggggg gcggg 15 <210> 556 <211> 16 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 556 agcugcagug ggggag 16 <210> 557 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 557 gcugcagugg gggag 15 <210> 558 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 558 ucugggcgag gggug 15 <210> 559 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 559 ucugggcgag gggug 15 <210> 560 <211> 25 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 560 ugcggggcua gggcuaacag caguc 25 <210> 561 <211> 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<400> 669 cgcaggggcc gggugcucac cg 22 <210> 670 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 670 accuggcagc agggagcguc gu 22 <210> 671 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 671 uggugggugg ggaggagaag ugc 23 <210> 672 <211> 21 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 672 augccucccc cggccccgca g 21 <210> 673 <211> 20 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 673 aaaaggcggg agaagcccca 20 <210> 674 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 674 uuggggugga gggccaagga gc 22 <210> 675 <211> 20 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 675 cagggggacu gggggugagc 20 <210> 676 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 676 uggcucaguu cagcaggaac ag 22 <210> 677 <211> 73 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 677 cugguguuug aggcgaugug gggauguaga gacaacuucc cagucucauu uccucauccu 60 gccaggccac cau 73 <210> 678 <211> 180 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 678 cgcgacugcg gcggcggugg uggggggagc cgcggggauc gccgagggcc ggucggccgc 60 cccgggugcc gcgcggugcc gccggcggcg gugaggcccc gcgcgugugu cccggcugcg 120 gucggccgcg cucgaggggu ccccguggcg uccccuuccc cgccggccgc cuuucucgcg 180 <210> 679 <211> 82 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 679 cugacuuuuu uagggaguag aagggugggg agcaugaaca auguuucuca cucccuaccc 60 cuccacuccc caaaaaaguc ag 82 <210> 680 <211> 80 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 680 cauccaggac aauggugagu gccggugccu gcccuggggc cgucccugcg caggggccgg 60 gugcucaccg caucugcccc 80 <210> 681 <211> 72 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 681 gauuucagug accuggcagc agggagcguc gucaguguuu gacuguuuau gguaugucag 60 ggagcugguu cc 72 <210> 682 <211> 62 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 682 cuuccuggug gguggggagg agaagugccg uccucaugag ccccucucug ucccacccau 60 ag 62 <210> 683 <211> 63 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 683 ggcuccgcag ggcccuggcg caggcaucca gacagcgggc gaaugccucc cccggccccg 60 cag 63 <210> 684 <211> 83 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 684 ggguuuccuc ugccuuuuuu uccaaugaaa auaacgaaac cuguuauuuc ccauugaggg 60 ggaaaaaggc gggagaagcc cca 83 <210> 685 <211> 61 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 685 gaggguuggg guggagggcc aaggagcugg guggggugcc aagccucugu ccccacccca 60 g 61 <210> 686 <211> 68 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 686 gggcgcaggg ggacuggggg ugagcaggcc cagaacccag cucgugcuca cucucagucc 60 cucccuag 68 <210> 687 <211> 68 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 687 cuccggugcc uacugagcug auaucaguuc ucauuuuaca cacuggcuca guucagcagg 60 aacaggag 68 <210> 688 <211> 73 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 688 cucugccucc cgugccuacu gagcugaaac acaguugguu uguguacacu ggcucaguuc 60 agcaggaaca ggg 73 <210> 689 <211> 21 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 689 gaggcgaugu ggggauguag a 21 <210> 690 <211> 20 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 690 cccagucuca uuuccucauc 20 <210> 691 <211> 29 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 691 gggagccgcg gggaucgccg agggccggu 29 <210> 692 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 692 ggcggcggug guggg 15 <210> 693 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 693 agggaguaga agggugggga gca 23 <210> 694 <211> 16 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 694 uagggaguag aagggu 16 <210> 695 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 695 ugcgcagggg ccgggugcuc acc 23 <210> 696 <211> 19 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 696 cgcaggggcc gggugcuca 19 <210> 697 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 697 gaaaaaggcg ggagaagccc ca 22 <210> 698 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 698 gaaaaaggcg ggaga 15 <210> 699 <211> 24 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 699 acuggcucag uucagcagga acag 24 <210> 700 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 700 uggcucaguu cagca 15

Claims (20)

  1. 식도암 마커인 miR-1247-3p, miR-6875-5p, miR-6726-5p, miR-3188, miR-8069, miR-4257, miR-1343-3p, miR-7108-5p, miR-6825-5p, miR-7641, miR-3185, miR-4746-3p, miR-6791-5p, miR-6893-5p, miR-4433b-3p, miR-3135b, miR-6781-5p, miR-1908-5p, miR-4792, miR-7845-5p, miR-4417, miR-3184-5p, miR-1225-5p, miR-1231, miR-1225-3p, miR-150-3p, miR-4433-3p, miR-6125, miR-4513, miR-6787-5p, miR-6784-5p, miR-615-5p, miR-6765-3p, miR-5572, miR-6842-5p, miR-8063, miR-6780b-5p, miR-187-5p, miR-128-1-5p, miR-6729-5p, miR-6741-5p, miR-6757-5p, miR-7110-5p, miR-7975, miR-1233-5p, miR-6845-5p, miR-3937, miR-4467, miR-7109-5p, miR-6088, miR-6782-5p, miR-5195-3p, miR-4454, miR-6724-5p, miR-8072, miR-4516, miR-6756-5p, miR-4665-3p, miR-6826-5p, miR-6820-5p, miR-6887-5p, miR-3679-5p, miR-7847-3p, miR-6721-5p, miR-3622a-5p, miR-939-5p, miR-602, miR-7977, miR-6749-5p, miR-1914-3p, miR-4651, miR-4695-5p, miR-6848-5p, miR-1228-3p, miR-642b-3p, miR-6746-5p, miR-3620-5p, miR-3131, miR-6732-5p, miR-7113-3p, miR-23a-3p, miR-3154, miR-4723-5p, miR-3663-3p, miR-4734, miR-6816-5p, miR-4442, miR-4476, miR-423-5p, miR-1249, miR-6515-3p, miR-887-3p, miR-4741, miR-6766-3p, miR-4673, miR-6779-5p, miR-4706, miR-1268b, miR-4632-5p, miR-3197, miR-6798-5p, miR-711, miR-6840-3p, miR-6763-5p, miR-6727-5p, miR-371a-5p, miR-6824-5p, miR-4648, miR-1227-5p, miR-564, miR-3679-3p, miR-2861, miR-6737-5p, miR-4725-3p, miR-6716-5p, miR-4675, miR-1915-3p, miR-671-5p, miR-3656, miR-6722-3p, miR-4707-5p, miR-4449, miR-1202, miR-4649-5p, miR-744-5p, miR-642a-3p, miR-451a, miR-6870-5p, miR-4443, miR-6808-5p, miR-4728-5p, miR-937-5p, miR-135a-3p, miR-663b, miR-1343-5p, miR-6822-5p, miR-6803-5p, miR-6805-3p, miR-128-2-5p, miR-4640-5p, miR-1469, miR-92a-2-5p, miR-3940-5p, miR-4281, miR-1260b, miR-4758-5p, miR-1915-5p, miR-5001-5p, miR-4286, miR-6126, miR-6789-5p, miR-4459, miR-1268a, miR-6752-5p, miR-6131, miR-6800-5p, miR-4532, miR-6872-3p, miR-718, miR-6769a-5p, miR-4707-3p, miR-6765-5p, miR-4739, miR-4525, miR-4270, miR-4534, miR-6785-5p, miR-6850-5p, miR-4697-5p, miR-1260a, miR-4486, miR-6880-5p, miR-6802-5p, miR-6861-5p, miR-92b-5p, miR-1238-5p, miR-6851-5p, miR-7704, miR-149-3p, miR-4689, miR-4688, miR-125a-3p, miR-23b-3p, miR-614, miR-1913, miR-16-5p, miR-6717-5p, miR-3648, miR-3162-5p, miR-1909-3p, miR-8073, miR-6769b-5p, miR-6836-3p, miR-4484, miR-6819-5p 및 miR-6794-5p 로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합 가능한 핵산을 포함하는, 혈액, 혈청 또는 혈장을 검체로 하는 식도암의 검출용 키트.
  2. 제1항에 있어서,
    상기 핵산이 하기 (a)~(e) 중 어느 하나에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
    (a) 서열번호 2, 3, 5~115, 117~189, 및 666~675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 그 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
    (b) 서열번호 2, 3, 5-115, 117-189 및 666-675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
    (c) 서열번호 2, 3, 5-115, 117-189 및 666-675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 그 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
    (d) 서열번호 2, 3, 5-115, 117-189 및 666-675 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 그 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편, 및
    (e) 상기 (a)~(d) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드 또는 그 단편과 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드
    로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드인 키트.
  3. 제1항 또는 제2항에 있어서,
    상기 키트가 별도의 식도암 마커인 miR-575, miR-24-3p, miR-675-5p, miR-486-3p, miR-6777-5p, miR-4497, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-4731-5p, miR-6889-5p, miR-6786-5p, miR-92a-3p, miR-4294, miR-4763-3p, miR-6076, miR-663a, miR-760, miR-4667-5p, miR-6090, miR-4730, miR-7106-5p, miR-3196, miR-5698, miR-6087, miR-4665-5p, miR-8059 및 miR-6879-5p로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합 가능한 핵산을 더 포함하는 키트.
  4. 제3항에 있어서,
    상기 핵산이 하기 (f)~(j) 중 어느 하나에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
    (f) 서열번호 116, 676, 및 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 그 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
    (g) 서열번호 116, 676, 및 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
    (h) 서열번호 116, 676, 및 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 그 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
    (i) 서열번호 116, 676, 및 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 그 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편, 및
    (j) 상기 (f)~(i) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드 또는 그 단편과 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드
    로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드인 키트.
  5. 식도암 마커인 miR-1247-3p, miR-6875-5p, miR-6726-5p, miR-3188, miR-8069, miR-4257, miR-1343-3p, miR-7108-5p, miR-6825-5p, miR-7641, miR-3185, miR-4746-3p, miR-6791-5p, miR-6893-5p, miR-4433b-3p, miR-3135b, miR-6781-5p, miR-1908-5p, miR-4792, miR-7845-5p, miR-4417, miR-3184-5p, miR-1225-5p, miR-1231, miR-1225-3p, miR-150-3p, miR-4433-3p, miR-6125, miR-4513, miR-6787-5p, miR-6784-5p, miR-615-5p, miR-6765-3p, miR-5572, miR-6842-5p, miR-8063, miR-6780b-5p, miR-187-5p, miR-128-1-5p, miR-6729-5p, miR-6741-5p, miR-6757-5p, miR-7110-5p, miR-7975, miR-1233-5p, miR-6845-5p, miR-3937, miR-4467, miR-7109-5p, miR-6088, miR-6782-5p, miR-5195-3p, miR-4454, miR-6724-5p, miR-8072, miR-4516, miR-6756-5p, miR-4665-3p, miR-6826-5p, miR-6820-5p, miR-6887-5p, miR-3679-5p, miR-7847-3p, miR-6721-5p, miR-3622a-5p, miR-939-5p, miR-602, miR-7977, miR-6749-5p, miR-1914-3p, miR-4651, miR-4695-5p, miR-6848-5p, miR-1228-3p, miR-642b-3p, miR-6746-5p, miR-3620-5p, miR-3131, miR-6732-5p, miR-7113-3p, miR-23a-3p, miR-3154, miR-4723-5p, miR-3663-3p, miR-4734, miR-6816-5p, miR-4442, miR-4476, miR-423-5p, miR-1249, miR-6515-3p, miR-887-3p, miR-4741, miR-6766-3p, miR-4673, miR-6779-5p, miR-4706, miR-1268b, miR-4632-5p, miR-3197, miR-6798-5p, miR-711, miR-6840-3p, miR-6763-5p, miR-6727-5p, miR-371a-5p, miR-6824-5p, miR-4648, miR-1227-5p, miR-564, miR-3679-3p, miR-2861, miR-6737-5p, miR-4725-3p, miR-6716-5p, miR-4675, miR-1915-3p, miR-671-5p, miR-3656, miR-6722-3p, miR-4707-5p, miR-4449, miR-1202, miR-4649-5p, miR-744-5p, miR-642a-3p, miR-451a, miR-6870-5p, miR-4443, miR-6808-5p, miR-4728-5p, miR-937-5p, miR-135a-3p, miR-663b, miR-1343-5p, miR-6822-5p, miR-6803-5p, miR-6805-3p, miR-128-2-5p, miR-4640-5p, miR-1469, miR-92a-2-5p, miR-3940-5p, miR-4281, miR-1260b, miR-4758-5p, miR-1915-5p, miR-5001-5p, miR-4286, miR-6126, miR-6789-5p, miR-4459, miR-1268a, miR-6752-5p, miR-6131, miR-6800-5p, miR-4532, miR-6872-3p, miR-718, miR-6769a-5p, miR-4707-3p, miR-6765-5p, miR-4739, miR-4525, miR-4270, miR-4534, miR-6785-5p, miR-6850-5p, miR-4697-5p, miR-1260a, miR-4486, miR-6880-5p, miR-6802-5p, miR-6861-5p, miR-92b-5p, miR-1238-5p, miR-6851-5p, miR-7704, miR-149-3p, miR-4689, miR-4688, miR-125a-3p, miR-23b-3p, miR-614, miR-1913, miR-16-5p, miR-6717-5p, miR-3648, miR-3162-5p, miR-1909-3p, miR-8073, miR-6769b-5p, miR-6836-3p, miR-4484, miR-6819-5p 및 miR-6794-5p로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합 가능한 핵산을 포함하는, 혈액, 혈청 또는 혈장을 분석하는 식도암의 검출용 디바이스.
  6. 제5항에 있어서,
    상기 핵산이 하기 (a)~(e) 중 어느 하나에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
    (a) 서열번호 2, 3, 5~115, 117~189, 및 666~675중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 그 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
    (b) 서열번호 2, 3, 5~115, 117~189, 및 666~675중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
    (c) 서열번호 2, 3, 5~115, 117~189, 및 666~675중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 그 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
    (d) 서열번호 2, 3, 5~115, 117~189, 및 666~675중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 그 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편, 및
    (e) 상기 (a)~(d) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드 또는 그 단편과 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드
    로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드인 디바이스.
  7. 제5항 또는 제6항에 있어서,
    상기 디바이스가 별도의 식도암 마커인 miR-575, miR-24-3p, miR-675-5p, miR-486-3p, miR-6777-5p, miR-4497, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-4731-5p, miR-6889-5p, miR-6786-5p, miR-92a-3p, miR-4294, miR-4763-3p, miR-6076, miR-663a, miR-760, miR-4667-5p, miR-6090, miR-4730, miR-7106-5p, miR-3196, miR-5698, miR-6087, miR-4665-5p, miR-8059 및 miR-6879-5p로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합 가능한 핵산을 더 포함하는 디바이스.
  8. 제7항에 있어서,
    상기 핵산이 하기 (f)~(j) 중 어느 하나에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
    (f) 서열번호 116, 676, 및 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 그 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
    (g) 서열번호 116, 676, 및 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
    (h) 서열번호 116, 676, 및 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 그 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편,
    (i) 서열번호 116, 676, 및 190~214 중 어느 하나로 나타내어지는 염기서열 또는 그 염기서열에 있어서 u가 t인 염기서열에 상보적인 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 또는 15 이상의 연속한 염기를 포함하는 그 단편, 및
    (j) 상기 (f)~(i) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드 또는 그 단편과 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드
    로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드인 디바이스.
  9. 제5항 또는 제6항에 있어서,
    상기 디바이스는 하이브리다이제이션 기술에 의한 측정을 위한 디바이스인 것을 특징으로 하는, 디바이스.
  10. 제 9 항에 있어서,
    상기 하이브리다이제이션 기술이 핵산 어레이 기술인 디바이스.
  11. 제 1 항 또는 제 2 항에 기재된 키트 또는 제 5 항 또는 제 6 항에 기재된 디바이스를 사용하여 피험체의 혈액, 혈청, 또는 혈장에 있어서의 표적 핵산의 발현량을 측정하고, 그 측정된 발현량과, 마찬가지로 측정된 건상체의 대조 발현량을 비교하여, 피험체에 있어서의 식도암의 검출을 위한 정보를 제공하는 방법.
  12. 제 3 항에 기재된 키트를 사용하여 피험체의 혈액, 혈청, 또는 혈장에 있어서의 표적 핵산의 발현량을 측정하고, 그 측정된 발현량과, 마찬가지로 측정된 건상체의 대조 발현량을 비교하여, 피험체에 있어서의 식도암의 검출을 위한 정보를 제공하는 방법.
  13. 제 4 항에 기재된 키트를 사용하여 피험체의 혈액, 혈청, 또는 혈장에 있어서의 표적 핵산의 발현량을 측정하고, 그 측정된 발현량과, 마찬가지로 측정된 건상체의 대조 발현량을 비교하여, 피험체에 있어서의 식도암의 검출을 위한 정보를 제공하는 방법.
  14. 제 7 항에 기재된 디바이스를 사용하여 피험체의 혈액, 혈청, 또는 혈장에 있어서의 표적 핵산의 발현량을 측정하고, 그 측정된 발현량과, 마찬가지로 측정된 건상체의 대조 발현량을 비교하여, 피험체에 있어서의 식도암의 검출을 위한 정보를 제공하는 방법.
  15. 제 8 항에 기재된 디바이스를 사용하여 피험체의 혈액, 혈청, 또는 혈장에 있어서의 표적 핵산의 발현량을 측정하고, 그 측정된 발현량과, 마찬가지로 측정된 건상체의 대조 발현량을 비교하여, 피험체에 있어서의 식도암의 검출을 위한 정보를 제공하는 방법.
  16. 제 11 항에 있어서,
    상기 피험체가 인간인 방법.
  17. 제 1 항 또는 제 2 항에 기재된 키트 또는 제 5 항 또는 제 6 항에 기재된 디바이스를 사용하여, 피험체의 혈액, 혈청, 또는 혈장에 있어서의 표적 핵산의 발현량을 측정하고, 식도암을 갖는 것이 기지인 피험체 유래의 표적 핵산의 발현량과 건상체 유래의 표적 핵산의 발현량을 교사 샘플로 해서 작성하며, 또한 식도암과 건상을 구별적으로 판별하는 것이 가능한 판별식에 대입하여, 그것에 의해, 식도암의 존재 또는 부존재를 평가하는 것을 포함하는, 피험체에 있어서의 식도암을 검출하는 방법.
  18. 제 17 항에 있어서,
    상기 피험체가 인간인 방법.
  19. 표적 유전자로서 miR-1247-3p, miR-6875-5p, miR-6726-5p, miR-3188, miR-8069, miR-4257, miR-1343-3p, miR-7108-5p, miR-6825-5p, miR-7641, miR-3185, miR-4746-3p, miR-6791-5p, miR-6893-5p, miR-4433b-3p, miR-3135b, miR-6781-5p, miR-1908-5p, miR-4792, miR-7845-5p, miR-4417, miR-3184-5p, miR-1225-5p, miR-1231, miR-1225-3p, miR-150-3p, miR-4433-3p, miR-6125, miR-4513, miR-6787-5p, miR-6784-5p, miR-615-5p, miR-6765-3p, miR-5572, miR-6842-5p, miR-8063, miR-6780b-5p, miR-187-5p, miR-128-1-5p, miR-6729-5p, miR-6741-5p, miR-6757-5p, miR-7110-5p, miR-7975, miR-1233-5p, miR-6845-5p, miR-3937, miR-4467, miR-7109-5p, miR-6088, miR-6782-5p, miR-5195-3p, miR-4454, miR-6724-5p, miR-8072, miR-4516, miR-6756-5p, miR-4665-3p, miR-6826-5p, miR-6820-5p, miR-6887-5p, miR-3679-5p, miR-7847-3p, miR-6721-5p, miR-3622a-5p, miR-939-5p, miR-602, miR-7977, miR-6749-5p, miR-1914-3p, miR-4651, miR-4695-5p, miR-6848-5p, miR-1228-3p, miR-642b-3p, miR-6746-5p, miR-3620-5p, miR-3131, miR-6732-5p, miR-7113-3p, miR-23a-3p, miR-3154, miR-4723-5p, miR-3663-3p, miR-4734, miR-6816-5p, miR-4442, miR-4476, miR-423-5p, miR-1249, miR-6515-3p, miR-887-3p, miR-4741, miR-6766-3p, miR-4673, miR-6779-5p, miR-4706, miR-1268b, miR-4632-5p, miR-3197, miR-6798-5p, miR-711, miR-6840-3p, miR-6763-5p, miR-6727-5p, miR-371a-5p, miR-6824-5p, miR-4648, miR-1227-5p, miR-564, miR-3679-3p, miR-2861, miR-6737-5p, miR-4725-3p, miR-6716-5p, miR-4675, miR-1915-3p, miR-671-5p, miR-3656, miR-6722-3p, miR-4707-5p, miR-4449, miR-1202, miR-4649-5p, miR-744-5p, miR-642a-3p, miR-451a, miR-6870-5p, miR-4443, miR-6808-5p, miR-4728-5p, miR-937-5p, miR-135a-3p, miR-663b, miR-1343-5p, miR-6822-5p, miR-6803-5p, miR-6805-3p, miR-128-2-5p, miR-4640-5p, miR-1469, miR-92a-2-5p, miR-3940-5p, miR-4281, miR-1260b, miR-4758-5p, miR-1915-5p, miR-5001-5p, miR-4286, miR-6126, miR-6789-5p, miR-4459, miR-1268a, miR-6752-5p, miR-6131, miR-6800-5p, miR-4532, miR-6872-3p, miR-718, miR-6769a-5p, miR-4707-3p, miR-6765-5p, miR-4739, miR-4525, miR-4270, miR-4534, miR-6785-5p, miR-6850-5p, miR-4697-5p, miR-1260a, miR-4486, miR-6880-5p, miR-6802-5p, miR-6861-5p, miR-92b-5p, miR-1238-5p, miR-6851-5p, miR-7704, miR-149-3p, miR-4689, miR-4688, miR-125a-3p, miR-23b-3p, miR-614, miR-1913, miR-16-5p, miR-6717-5p, miR-3648, miR-3162-5p, miR-1909-3p, miR-8073, miR-6769b-5p, miR-6836-3p, miR-4484, miR-6819-5p 및 miR-6794-5p로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개의 폴리뉴클레오티드를 사용하여, 피험체의 혈액, 혈청, 또는 혈장에 있어서의 상기 표적 유전자의 발현량을 측정하고, 그 측정된 발현량과, 마찬가지로 측정된 건상체의 대조 발현량을 비교하여, 피험체에 있어서의 식도암의 검출을 위한 정보를 제공하는 방법.
  20. 제19항에 있어서,
    표적 유전자로서 miR-575, miR-24-3p, miR-675-5p, miR-486-3p, miR-6777-5p, miR-4497, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-4731-5p, miR-6889-5p, miR-6786-5p, miR-92a-3p, miR-4294, miR-4763-3p, miR-6076, miR-663a, miR-760, miR-4667-5p, miR-6090, miR-4730, miR-7106-5p, miR-3196, miR-5698, miR-6087, miR-4665-5p, miR-8059 및 miR-6879-5p로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개의 폴리뉴클레오티드를 더 사용하는, 방법.
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