KR20200116084A - 발효 공정 - Google Patents

Abstract

일부 실시양태는 유전자 활성이 미생물 숙주에게 이점을 부여하는 제1 핵산 서열을 포함하며, 임의로 여기서 상기 제1 핵산 분자의 유전자 활성이 제어되는 것인 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 사용하여 미생물 숙주와 함께 관심 생산물을 생산하는 방법에 관한 것이다.

Description

발효 공정

본원의 실시양태는 유전자 활성이 미생물 숙주에게 이점을 부여하는 제1 핵산 서열을 포함하며, 임의로 여기서 상기 제1 핵산 분자의 유전자 활성이 제어되는 것인 자가-복제성(auto-replicative) 염색체외(extra-chromosomal) 핵산 분자를 사용하여 미생물 숙주와 함께 관심 생산물을 생산하는 방법에 관한 것이다.

항생제는 미생물 세포에서 관심 생산물의 생산을 위한 선택제로서 널리 사용된다. 그러나, 환경에서의 항생제의 대규모 확산과 같은 항생제의 사용과 연관된 몇 가지 단점이 있다. 게다가, DNA 구축물에서 항생제의 내성을 코딩하는 서열은 세포에 대한 에너지 부담을 나타내며, 따라서 생산물의 수율에 부정적인 영향을 미친다. 이 에너지 부담은 내성-부여 유전자가 큰 유전자인 경우, 그것이 높은 수준으로 발현되는 경우 및/또는 그것이 구성적으로 발현되는 경우 특히 관련이 있다.

따라서, 기존 방법의 모든 단점을 갖지 않는 대안적이고 심지어 개선된 방법이 여전히 필요하다.

a) 제1 핵산 서열을 포함하며, 임의로 여기서 상기 제1 핵산 서열의 유전자 활성이 제어되는 것인 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 포함하는 미생물 숙주를 제공하는 단계;

b) 임의로, 상기 자가-복제성 염색체외 핵산 분자는 상기 관심 생산물의 생산에 관여하는 제2 핵산 서열을 포함하고, 여기서 상기 제2 핵산 서열의 유전자 활성은 제1 서열과 독립적으로 제어되고;

c) 상기 미생물 숙주가 제1 핵산 서열을 주어진 수준으로 발현시켜 자가-복제성 염색체외 분자를 성장하는 미생물 집단 내로 유지할 수 있게 하며 동시에 상기 관심 생산물에 대한 제2 서열 코딩을 유전자적으로 제어하는 조건 하에 상기 미생물 숙주를 배양하는 단계

를 포함하는, 미생물 숙주와 함께 관심 생산물을 생산하는 방법이 제공된다.

단계 a)

단계 a)는 유전자 활성이 미생물 숙주에게 이점을 부여하는 제1 핵산 서열을 포함하며, 임의로 여기서 상기 제1 핵산 서열 유전자 활성이 제어되는 것인 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 포함하는 미생물 숙주를 제공하는 것을 포함한다. 자가-복제성 염색체외 핵산 분자는 미생물 숙주 (예를 들어, 본원에 기재된 바와 같은 미생물 세포)에 제공될 수 있다. 예를 들어, 숙주 또는 숙주의 전임자는 자가-복제성 염색체외 핵산 분자로 이전에 형질전환되었을 수 있다. 이와 같이, 일부 실시양태에서, 단계 a)는 유전자 활성이 미생물 숙주에게 이점을 부여하는 제1 핵산 서열을 포함하며, 임의로 여기서 상기 제1 핵산 서열 유전자 활성이 제어되는 것인 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 포함하는 미생물 숙주를 제공하는 것을 포함한다.

임의적 형질전환 단계

일부 실시양태에서, 미생물 숙주는 상기 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 받은 숙주 만이 생존할 수 있게 하는 조건 하에 자가-복제성 염색체외 핵산 분자로 형질전환되어, 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 포함하는 미생물 숙주를 제공한다. 이와 같이, 일부 실시양태에서, 방법은 단계 a) 이전에 또는 동안에 미생물 숙주를 상기 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 받은 숙주 만이 생존할 수 있게 하는 조건 하에 자가-복제성 염색체외 핵산 분자로 형질전환시켜, 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 포함하는 미생물 숙주를 제공하는 단계를 추가로 포함한다.

미생물 숙주로 형질전환된 자가-복제성 염색체외 핵산 분자는 임의로 단계 b)의 제2 핵산 서열을 포함한다. 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 포함하는 미생물 숙주는 후속적으로 단계 c)에 따라 배양될 수 있다.

본원의 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산의 맥락 내에서, 제1 핵산 서열을 포함하는 자가-복제성 염색체외 핵산 분자가 제공된다. 자가-복제성 염색체외 핵산 분자는 게놈 없이 존재할 수 있으며, 플라스미드, 또는 에피솜, 미니염색체, 또는 이와 유사한 것으로부터 유래되거나 이를 포함하거나, 본질적으로 이로 이루어지거나, 이로 이루어질 수 있다. 이러한 특징은 이러한 핵산 분자의 카피의 더 많은 수 (사용된 플라스미드에 따라 1 내지 수백 카피 또는 10 내지 50 카피)가 미생물 세포 숙주 내로 도입되고 유지될 수 있다는 점에서 매력적이다. 게다가, 임의의 숙주가 본원의 실시양태의 방법에서 사용될 수 있다. 일부 실시양태에서, 숙주의 게놈을 변형시킬 필요가 없다. 본원의 실시양태의 방법을 수행하는데 필요한 유전자적 요소는 자가-복제성 염색체외 핵산 분자에 존재한다. 이러한 자가-복제성 염색체외 핵산 분자는 대개 복제 기점, 관심 있는 제1 핵산 서열 및 조절 영역을 포함한다. 일부 실시양태에서, 이론에 의해 제한되지 않으면서, 면역 조정제를 코딩하는 제1 핵산 서열은 숙주 세포에서 자가-복제성 염색체외 핵산의 존재 및 기능을 유지하기 위해 선택 가능한 마커로서 작용한다. 일부 실시양태에서, 면역 조정제를 코딩하는 제1 핵산 서열은 생산물이 생산될 수 있도록 자가-복제성 염색체외 핵산의 존재를 유지한다. 생산물은, 예를 들어 환경에서 물질을 발효시켜 하나 이상의 새로운 물질을 생산함으로써 숙주가 존재하는 환경을 변경할 수 있다. 일부 실시양태에서, 돌연변이를 획득하고 기능성 면역 조정제를 생산하지 않고, 감소된 기능을 가진 면역 조정제를 생산하고/하거나, 돌연변이(들)를 획득하지 않은 자가-복제성 염색체외 핵산보다 더 낮은 수준의 면역 조정제를 생산한 자가-복제성 염색체외 핵산에 대헤 선택적 압력을 제공함으로써 유전적 부동이 최소화된다.

본원의 실시양태의 방법, 용도 조성물, 숙주, 및 핵산의 맥락 내에서, 제1 핵산 서열로 표시되는 제1 핵산 분자는 유전자 활성을 나타낼 수 있으며, 상기 유전자 활성은 그것이 존재하고 여기서 유전자 활성이 발현되는 미생물 숙주 세포에게 선택적 이점을 부여한다. 이 유전자 활성은 제1 핵산 분자에 의해 코딩된 생산물에 의해 제공된다. 더욱이, 이 유전자 활성은 제어될 수 있거나 낮은 수준에서 구성적으로 발현되거나 조정 가능하거나 약한 구성적 프로모터의 제어 하에 있다. 상기 활성의 제어는 숙주에 대한 에너지 부담을 제한하는 이점을 제공하는 것으로 여겨진다. 유사하게, 숙주의 에너지 부담을 제한하는 이점은 유전자 활성이 낮은 수준으로 구성적으로 발현되거나 조정 가능하거나 약한 구성적 프로모터의 제어 하에 있는 경우 수득될 수 있다. 본 출원 본문 전반에 걸쳐, "이점을 부여하는" 개념은 "박테리오신(bacteriocin)에 대한 면역을 부여하는" 또는 "박테리오신에 대한 내성을 부여하는"에 의해 대체될 수 있다. 일부 실시양태에서, 제1 핵산 서열은 본원에 기재된 바와 같은 면역 조정제를 코딩하여, 숙주에게 이점을 부여한다.

제2 핵산 서열은 관심 생산물을 직접 또는 간접적으로 코딩한다. 동일한 설명은 본원에 기재된 제2 핵산 분자의 유전자 활성에 대해 유지된다. 일부 실시양태에서, 관심 생산물은 산업 공정, 예를 들어 발효 공정에서 유용한 효소를 포함한다. 발효 공정은 배양 배지에서 적어도 1종의 화합물을 발효시킬 수 있다. 일부 실시양태에서, 관심 생산물은 산업상 유용한 분자, 예를 들어, 탄수화물, 지질, 유기 분자, 영양소, 비료, 바이오연료, 화장품 (또는 그의 전구체), 의약품 또는 바이오의약품 (또는 그의 전구체), 또는 열거된 항목 중 어느 하나의 2종 이상을 포함한다.

본원의 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산의 맥락 내에서, 유전자 활성은 미생물 숙주에서의 제1 핵산 분자의 존재에 의해 유발되거나 이와 관련된 임의의 활성을 의미할 수 있다. 상기 활성의 이점은 주어진 조건 (pH, 온도, 박테리오신과 같은 주어진 분자의 존재 또는 본원에 기재된 바와 같은 2종 이상의 박테리오신의 조합,...) 하에 생존 또는 생존하고 성장하는 능력일 수 있다. 따라서, 상기 활성의 이점은 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 포함하는 미생물 세포/숙주의 수를 결정함으로써 평가될 수 있다. 평가는 임의적 형질전환 단계의 말기에 및/또는 동안에 (그러나 배양 단계 c) 이전에, 또는 단계 a) 및 배양 단계 c) 이전에) 및/또는 배양 단계 c) 이전에 수행될 수 있다. 한 실시양태에서, 존재하는 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 포함하는 미생물 숙주 세포의 수는, 상기 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 받은 미생물 숙주가 생존할 수 있게 하는 조건 하에 (예를 들어, 본원에 기재된 바와 같고, 주어진 조건에 존재하는 1종 이상의 박테리오신에 대한 면역을 보유함으로써) 세포가 배양 중인 경우 초기 미생물 세포/숙주의 수와 비교하여 감소되지 않았으며, 적어도 5%, 적어도 10%, 적어도 15%, 적어도 20%, 적어도 25%, 적어도 30%, 적어도 35%, 적어도 40%, 적어도 45%, 적어도 50%, 적어도 55%, 적어도 60%, 적어도 65%, 적어도 70%, 적어도 75%, 적어도 80%, 적어도 85%, 적어도 90%, 적어도 95% 또는 그 초과로 증가될 수 있다. 이 평가 단계는 열거된 값 중 임의의 둘 사이의 범위를 포함하여, 적어도 6시간, 12시간, 24시간, 36시간, 48시간, 60시간, 72시간, 84시간, 96시간, 108시간, 120시간 또는 그 초과의 지속기간을 가질 수 있다.

본원의 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산의 맥락 내에서, 유전자 활성의 제어는 핵산 분자 (즉, 제1 및/또는 제2 핵산 분자)의 활성의 증가 또는 감소를 의미할 수 있다. 따라서, 유전자 활성의 제어는 제어될 수 있거나 낮은 수준에서 구성적으로 발현되거나 조정 가능하거나 약한 구성적 프로모터의 제어 하에 있다. 일부 실시양태에서, 유전자 활성이 조절/제어되는 코딩 생산물은 면역 조정제를 포함하거나, 본질적으로 이로 이루어지거나, 이로 이루어지거나, 관심 생산물의 생산에 관여한다. 일부 실시양태에서, 유전자 활성은 유전자 발현 수준에서 조절/제어된다. 일부 실시양태에서, 유전자 활성은 전사 수준에서, 예를 들어 프로모터를 활성화 또는 억제함으로써 조절된다. 일부 실시양태에서, 이러한 맥락에서 프로모터는 유도성 프로모터이다. 일부 실시양태에서, 이러한 맥락에서 프로모터는 약한 프로모터이다. 이론에 의해 제한되지 않으면서, 일부 실시양태의 약한 프로모터는 전사 수준을 상향- 또는 하향- 조절하여 수정될 수 있어서 숙주에게 부여된 이점 (예를 들어 면역 조정제 활성)은 프로모터의 제어 하에 유전자 생산물(들)의 수준 및/또는 활성의 변화에 민감하다. 일부 실시양태에서, 프로모터는 서열번호 707로 표시되는 P24 프로모터 및/또는 서열번호 708로 표시되는 ProC 프로모터 및/또는 P24 LacO 혼성 프로모터를 포함하거나, 이로 이루어지거나, 본질적으로 이로 이루어진다. P24LacO 혼성 프로모터는 조정 가능/제어된 프로모터이다. 일부 실시양태에서, 유전자 활성은 전사 후 수준, 예를 들어 RNA 안정성의 조절을 통해 조절/제어된다. 일부 실시양태에서, 유전자 활성은 번역 수준에서, 예를 들어 번역 개시의 조절을 통해 조절/제어된다. 일부 실시양태에서, 유전자 활성은 번역 후 수준에서, 예를 들어 폴리펩티드 안정성의 조절, 폴리펩티드의 번역 후 변형, 또는 폴리펩티드에 대한 억제제의 결합을 통해 조절/제어된다.

일부 실시양태에서, 유전자 활성이 증가된다. 일부 실시양태에서, 면역 조정제 및/또는 제2 핵산 분자의 코딩 생산물 중 적어도 하나의 활성은 관심 생산물의 생산이 증가되는 것에 관여한다. 개념적으로, 유전자 활성은 유전자 활성을 직접 활성화시키거나, 유전자 활성의 억제제의 활성을 감소시킴으로써 증가될 수 있다. 일부 실시양태에서, 유전자 활성은 프로모터 활성 유도, 전사 리프레서 억제, RNA 안정성 증가, 전사 후 억제제 억제 (예를 들어, 리보자임 또는 안티센스 올리고뉴클레오티드 억제), 번역 유도 (예를 들어, 조절 가능한 tRNA를 통해), 원하는 번역 후 변형을 수행하거나, 번역 후 억제제 (예를 들어, 유전자에 의해 코딩된 폴리펩티드에 대한 프로테아제)를 억제하는 것 중 적어도 하나에 의해 활성화된다. 일부 실시양태에서, 원하는 환경에 존재하는 화합물은 프로모터를 유도한다. 예를 들어, 배양 배지에서 철의 존재는 본원에 기재된 바와 같이 철-민감성 프로모터에 의한 전사를 유도할 수 있다. 일부 실시양태에서, 원하는 배양 배지에 존재하는 화합물은 전사 리프레서를 억제한다. 예를 들어, 환경에서 테트라시클린의 존재는 tet 리프레서를 억제하여, tetO 프로모터로부터의 활성을 허용할 수 있다. 일부 실시양태에서, 원하는 배양 배지 외부에서만 발견되는 화합물은 전사를 유도한다.

일부 실시양태에서, 유전자 활성이 감소된다. 개념적으로, 유전자 활성은 유전자 활성을 직접 억제하거나 유전자 활성의 활성화제의 활성을 감소시킴으로써 감소될 수 있다. 일부 실시양태에서, 유전자 활성은 감소되나, 일부 수준의 활성은 남아 있다. 일부 실시양태에서, 유전자 활성은 완전히 억제된다. 일부 실시양태에서, 유전자 활성은 프로모터 활성 억제, 전사 리프레서 활성화, RNA 안정성 감소, 전사 후 억제제 활성화 (예를 들어, 리보자임 또는 안티센스 올리고뉴클레오티드 발현), 번역 억제 (예를 들어, 조절 가능한 tRNA를 통해), 필요한 번역 후 변형을 수행하지 못하거나, 폴리펩티드를 불활성화시키거나 (예를 들어, 억제제를 결합시키거나 폴리펩티드-특이적 프로테아제를 통해), 폴리펩티드를 적절히 국소화하지 못하는 것에 의해 감소된다. 일부 실시양태에서, 원하는 위치로부터 유전자를 제거함으로써, 예를 들어 FLP-FRT 또는 cre-lox 카세트, 상동 재조합 또는 CRIPR-CAS9 활성을 사용하거나 플라스미드의 손실 또는 분해를 통해 유전자를 절제함으로써 유전자 활성이 감소된다. 일부 실시양태에서, 유전자 생산물 (예를 들어, 폴리펩티드) 또는 유전자 생산물에 의해 생산된 생산물 (예를 들어, 효소 반응의 생산물)은 추가의 유전자 활성 (예를 들어, 음성 피드백 루프)을 억제한다.

일부 실시양태에서, 제1 핵산 분자의 유전자 활성에 의해 미생물 숙주에게 부여되는 이점은 박테리오신 (또는 박테리오신의 혼합물)을 포함하는 배지에서 생존 또는 생존하고 성장하는 능력이다. 본원에 사용된 바와 같이, "박테리오신"은 이러한 폴리펩티드의 무세포 또는 화학적으로 합성된 버전을 포함한다. "박테리오신", 및 이 루트 용어의 변형은, 또한 숙주 세포에 의해 분비된 폴리펩티드를 지칭할 수 있다. 따라서 박테리오신은 박테리아에 의해 생산된 단백질성 독소를 포함하여 유사하거나 밀접하게 관련된 박테리아 균주 (들)의 성장을 억제한다. 이들은 효모 및 파라메시움(paramecium) 사멸 요인과 유사하며 구조적으로, 기능적으로, 그리고 생태적으로 다양하다. 박테리오신은 또한 숙주 세포에 의해 분비된 박테리오신의 합성 변이체를 포함한다. 박테리오신의 합성 변이체는 합성 변이체가 여전히 숙주 세포에 의해 분비된 상응하는 박테리오신의 활성의 적어도 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%를 나타내는 한, 임의의 방식으로 숙주 세포에 의해 분비된 박테리오신으로부터 유래될 수 있다.

항생제의 상세한 설명은 본 명세서의 말미에 일반 설명에 전념하는 부분에서 제공된다.

"박테리오신"은 숙주 세포 및 다른 미생물 세포와 클론적으로 관련된 세포를 포함하여, 폴리펩티드가 제조되는 개별 숙주 세포 외에 적어도 하나 이상의 세포를 중화시킬 수 있다.

특정한 "면역 조정제"(본원에서 보다 상세히 논의됨)를 발현하는 세포는 특정한 박테리오신 또는 박테리오신 군의 중화 효과에 면역이 있다. 이와 같이, 박테리오신은 이들 세포가 적절한 면역 조정제를 생산하지 않는 한, 박테리오신 및/또는 다른 미생물 세포를 생산하는 세포를 중화시킬 수 있다. 이와 같이, 박테리오신은 복수개의 다른 미생물 유기체에 세포독성 또는 성장-억제 효과를 발휘할 수 있다. 한 실시양태에서, 박테리오신은 미생물 세포의 번역 기구(translational machinery) (예를 들어, 리보솜 등)에 의해 생산된다. 다른 실시양태에서, 박테리오신은 화학적으로 합성된다. 일부 박테리오신은 폴리펩티드 전구체로부터 유래될 수 있다. 폴리펩티드 전구체는 박테리오신 자체의 폴리펩티드를 산출하기 위해 절단 (예를 들어 프로테아제에 의한 처리)을 겪을 수 있다. 이와 같이, 일부 실시양태에서, 박테리오신은 전구체 폴리펩티드로부터 생산된다. 일부 실시양태에서, 박테리오신은 번역 후 변형, 예를 들어 절단, 또는 하나 이상의 관능기의 첨가를 겪은 폴리펩티드를 포함하거나, 본질적으로 이로 이루어지거나 또는 이로 이루어진다.

박테리오신의 중화 활성은 미생물 번식의 정지, 또는 세포독성을 포함할 수 있다. 일부 박테리오신은 세포독성 활성 (예를 들어, "살균제" 효과)을 가지므로, 미생물 유기체, 예를 들어 박테리아, 효모, 조류(algae), 합성 미생물 등을 사멸시킬 수 있다. 일부 박테리오신은, 예를 들어 세포 주기를 정지시킴으로써, 미생물 유기체 (예를 들어, "정균" 효과), 예를 들어 박테리아, 효모, 조류, 합성 미생물 등의 번식을 억제할 수 있다.

다수의 박테리오신이 확인되고 특성화되었다 (표 1.1 및 표 1.2 참조). 임의의 특정한 이론에 의해 제한되지 않으면서, 예시적인 박테리오신은, 전형적으로 번역 후 변형을 겪는 "클래스 I" 박테리오신, 및 전형적으로 비변형 "클래스 II" 박테리오신으로서 분류될 수 있다. 게다가, 표 1.1에 요약된 바와 같이, 각각의 클래스에서의 예시적인 박테리오신은 다양한 하위 군으로 분류될 수 있으며, 이는 문헌 [Cotter, P.D. et al. "Bacteriocins- a viable alternative to antibiotics" Nature Reviews Microbiology 1 1 : 95-105]로부터 적합화되며, 이는 그 전문이 본원에 참조로 포함된다.

임의의 특정한 이론에 의해 제한되지 않으면서, 박테리오신은 여러 가지의 방식으로 표적 미생물 세포의 중화에 영향을 줄 수 있다. 예를 들어, 박테리오신은 세포벽을 투과하여, 세포벽을 탈분극시키고 호흡을 방해할 수 있다.

[표 1.1] 예시적인 박테리오신의 분류

다수의 박테리오신이 본원의 실시양태에 따라 사용될 수 있다. 예시적인 박테리오신을 표 1.2에 나타냈다. 일부 실시양태에서, 표 1.2의 폴리펩티드 서열을 포함하거나, 본질적으로 이로 이루어지거나, 이로 이루어진 적어도 1종의 박테리오신이 제공된다. 표 1.2에 나타낸 바와 같이, 일부 박테리오신은 분자의 쌍으로서 기능한다. 이와 같이, 달리 명시적으로 언급되지 않는 한, 기능적 "박테리오신" 또는 "박테리오신을 제공하는" 등이 본원에서 논의되는 경우, 기능적 박테리오신 쌍은 개별적으로 기능하는 박테리오신과 함께 포함되는 것으로 이해될 것이다. 표 1.2를 참조하면, 괄호 안에 열거된 "기원의 유기체"는 명시된 박테리오신을 생산하는 것으로 공지된 유기체에 대한 대안적 명칭 및/또는 균주 정보를 나타낸다.

본원의 실시양태는 또한 표 1.2에 기재된 박테리오신과 동일성을 가진 펩티드 및 단백질을 포함한다. 용어 "동일성"은 핵산 또는 단백질 서열 상동성 또는 3차원 상동성을 포함하는 것으로 의도된다. 폴리펩티드에 대한 핵산 또는 폴리펩티드 서열 상동성 및/또는 3차원 상동성을 결정하기 위한 몇몇 기술이 존재한다. 이들 방법은 하나의 서열, 도메인, 또는 모델이 표적 서열, 도메인, 또는 모델에 대해 갖는 동일성의 정도를 발견하기 위해 일상적으로 이용된다. 방대한 범위의 기능적 박테리오신은 본원에 개시된 박테리오신의 특징을 포함할 수 있으며, 따라서 표 1.2에서의 박테리오신와 방대한 정도의 동일성을 제공한다. 일부 실시양태에서, 박테리오신은 표 1.2의 폴리펩티드 중 어느 하나와 적어도 50% 동일성, 예를 들어, 적어도 50%, 51%, 52%, 53%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일성을 갖는다. 퍼센트 동일성을 디폴트 파라미터와 함께 블라스트(BLAST) 소프트웨어를 사용하여 결정할 수 있다 (blast.ncbi.nlm.nih.gov에서 월드 와이드 웹 상에서 접근 가능한, 문헌 [Altschul, S.F., et al. (1990) "Basic local alignment search tool." J. Mol. Biol. 215:403-410]).

표 1.2에서의 박테리오신은 자연적으로 발생하지만, 통상의 기술자는 표 1.2에서의 박테리오신의 변이체, 표 1.2에서의 박테리오신 외에 자연적으로 발생하는 박테리오신 또는 그의 변이체, 또는 합성 박테리오신이 본원의 일부 실시양태에 따라 사용될 수 있음을 이해할 것이다. 일부 실시양태에서, 이러한 변이체는 야생형 단백질에 비해 동일하거나 상이한 미생물 또는 미생물 종에 대해 향상되거나 감소된 수준의 세포독성 또는 성장 억제 활성을 갖는다. 몇몇 모티프는 박테리오신의 특징으로서 인식되어 왔다. 예를 들어, X가 임의의 아미노산 잔기인 모티프 YGXGV (서열번호 2)는 클래스 Ila 박테리오신의 N-말단 공통 서열 서열이다. 따라서, 일부 실시양태에서, 합성 박테리오신은 서열번호 2에 대해 적어도 50% 동일성, 예를 들어 서열번호 2에 대해 적어도 50%, 51%, 52%, 53%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일성을 가진 N-말단 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, 합성 박테리오신은 서열번호 2를 포함하는 N-말단 서열을 포함한다. 게다가, 일부 클래스 lib 박테리오신은 GxxxG 모티프 (x는 임의의 아미노산을 의미한다)를 포함한다. 임의의 특정한 이론에 의해 제한되지 않으면서, GxxxG 모티프는, 예를 들어 세포막 상호작용을 통해 박테리오신-매개 중화를 촉진하기 위해 세포막에서 나선형 단백질 사이의 연관성을 매개할 수 있는 것으로 여겨진다. 이와 같이, 일부 실시양태에서, 박테리오신은 세포막과의 상호작용을 촉진하는 모티프를 포함한다. 일부 실시양태에서, 박테리오신은 GxxxG 모티프를 포함한다. 임의로, GxxxG 모티프를 포함하는 박테리오신은 나선형 구조를 포함할 수 있다. 본원에 기재된 구조 이외에, 본원에 사용된 바와 같은 "박테리오신"은 본원에 명시적으로 제공된 박테리오신 중 임의의 것과 미생물 세포에 실질적으로 동일한 효과를 갖는 구조를 포함한다.

2종 이상의 박테리오신 또는 그의 일부를 포함하거나, 본질적으로 이로 이루어지거나, 이로 이루어진 융합 폴리펩티드는 어느 한쪽의 개별 박테리오신보다 더 넓은 범위의 미생물 유기체에 대해 중화 활성을 가질 수 있는 것으로 나타났다. 예를 들어, 혼성 박테리오신, Ent35-MccV (GKYYGNGVSCNKKGCSVDWGRAIGIIGNNSAANLATGGAAGWKSGGGASGRDIAMAIGTLSGQFVAGGIGAAAGGVAGGAIYDYASTHKPNPAMSPSGLGGTIKQKPEGIPSE AWNYAAGRLCNWSPNNLSDVCL, 서열번호 3)는, 병원성 그람-양성 및 그람-음성 박테리아에 대한 항균 활성을 나타내는 것으로 밝혀졌다 (Acuna et al. (2012), FEBS Open Bio, 2: 12-19). Ent35-MccV 융합 박테리오신은 N-말단에서 C-말단까지, N-말단 글리신, 엔테로신 CRL35, 3개의 글리신을 포함하는 링커, 및 C-말단 마이크로신(Microcin) V를 포함한다는 점에 주목한다. 박테리오신은 박테리오신 활성을 갖는 2종 이상의 폴리펩티드의 융합체를 포함할 수 있는 것으로 본원에서 고려된다. 일부 실시양태에서, 2종 이상의 박테리오신의 융합 폴리펩티드가 제공된다. 일부 실시양태에서, 2종 이상의 박테리오신은 표 1.2로부터의 폴리펩티드, 또는 그의 변형을 포함하거나, 본질적으로 이로 이루어지거나, 이로 이루어진다. 일부 실시양태에서, 2종 이상의 박테리오신을 포함하는 융합 폴리펩티드는 어느 한쪽의 개별 박테리오신보다 더 넓은 범위의 활성을 갖고, 예를 들어 더 많은 미생물 유기체에 대해 중화 활성, 더 넓은 범위의 환경 조건 하에 중화 활성, 및/또는 더 높은 효율의 중화 활성을 갖는다. 일부 실시양태에서, 2종 이상의 박테리오신의 융합, 예를 들어 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10종의 박테리오신이 제공된다. 일부 실시양태에서, 2종 이상의 박테리오신 폴리펩티드는 공유 결합, 예를 들어 펩티드 연결을 통해 서로 융합된다. 일부 실시양태에서, 링커는 2종의 박테리오신 폴리펩티드 사이에 위치된다. 일부 실시양태에서, 링커는 1종 이상의 글리신, 예를 들어 약 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 또는 20종의 글리신을 포함하거나, 본질적으로 이로 이루어지거나, 이로 이루어진다. 일부 실시양태에서, 링커는 세포 내에서 절단되어 융합 단백질에 포함된 개별 박테리오신을 생산한다. 일부 실시양태에서, 본원에 제공된 바와 같은 박테리오신은 비변형 박테리오신에 대해 원하는 활성 스펙트럼을 제공하도록 변형된다. 예를 들어, 변형 박테리오신은 비변형 박테리오신과 동일한 유기체에 대해 향상되거나 감소된 활성을 가질 수 있다. 대안적으로, 변형 박테리오신은 유기체에 대해 향상된 활성을 가질 수 있고 이에 대해 비변형 박테리오신은 보다 덜한 활성을 갖거나 활성을 갖지 않는다.

[표 1.2] 예시적인 박테리오신

예를 들어, 일부 실시양태에서, 항진균 활성 (예컨대, 항효모 활성)이 바람직하다. 항진균 활성을 갖는 다수의 박테리오신이 밝혀졌다. 예를 들어, 바실러스로부터의 박테리오신은 효모 균주에 대해 중화 활성을 갖는 것으로 나타났으며 {문헌 [Adetunji and Olaoye (2013) Malaysian Journal of Microbiology 9: 130-13] 참조, 그 전문이 본원에 참조로 포함됨), 엔테로코커스 패칼리스 펩티드 엔테로코커스 패칼리스 펩티드 (WLPPAGLLGRCGRWFRPWLLWLQ SGAQY KWLGNLFGLGPK, 서열번호 1)는 칸디다 종에 대해 중화 활성을 갖는 것으로 나타났으며 {문헌 [Shekh and Roy (2012) BMC Microbiology 12: 132] 참조, 그 전문이 본원에 참조로 포함됨), 슈도모나스로부터의 박테리오신은 진균 예컨대 커르불라리아 루나타(Curvularia lunata), 푸사리움(Fusarium) 종, 헬민토스포리움(Helminthosporium) 종, 및 바이오폴라리스(Biopolaris) 종에 대해 중화 활성을 갖는 것으로 나타났다 (Shalani and Srivastava (2008) The Internet Journal of Microbiology. Volume 5 Number 2. DOI: 10.5580/27dd - 전 세계 웹 상에서 아카이브, ispub.com/journal/the-internet-journal-of-micro bio logy/volume-5-number-2/screening- for-antifungal-activity-of-pseudomonas-fluorescens-against-phytopathogenic- fungi.html#sthash.d0Ys03UO. lDKuTlUS.dpuf에 접근 가능하며, 이는 그 전문이 본원에 참조로 포함됨). 예로써, 보트리시딘(botrycidin) AJ1316 {문헌 [Zuber, P et al. (1993) Peptide Antibiotics. In Bacillus subtilis and Other Gram-Positive Bacteria: Biochemistry, Physiology, and Molecular Genetics ed Sonenshein et al., pp. 897-916, American Society for Microbiology] 참조, 그 전문이 본원에 참조로 포함됨) 및 알리린 Bl {문헌 [Shenin et al. (1995) Antibiot Khimioter 50: 3-7] 참조, 그 전문이 본원에 참조로 포함됨) (5. 서브틸리스로부터)이 항진균 활성을 갖는 것으로 나타났다. 이와 같이, 일부 실시양태에서, 예를 들어 진균 미생물 유기체의 중화가 바람직한 실시양태에서, 박테리오신은 보트리시딘 AJ1316 또는 알리린 B 1 중 적어도 1종을 포함한다.

예를 들어, 일부 실시양태에서, 시아노박테리아(Cyanobacteria)의 배양물에서 박테리오신 활성이 바람직하다. 일부 실시양태에서, 시아노박테리아를 중화시키기 위해 박테리오신이 제공된다. 일부 실시양태에서, 박테리오신은 시아노박테리아 배양 환경에서 전형적으로 발견되는 침입 미생물 유기체를 중화시키기 위해 제공된다. 보존된 박테리오신 폴리펩티드의 클러스터는 다종다양한 시아노박테리아 종에서 확인되었다. 예를 들어, 그 전문이 본원에 참조로 포함된, 문헌 [Wang et al. (2011), Genome Mining Demonstrates the Widespread Occurrence of Gene Clusters Encoding Bacteriocins in Cyanobacteria. PLoS ONE 6(7): e22384]에 보고된 바와 같이, 적어도 145종의 추정 박테리오신 유전자 클러스터가 적어도 43종의 시아노박테리아 종에서 확인되었다. 예시적인 시아노박테리아 박테리오신은 서열식별번호 420, 422, 424, 426, 428, 30, 432, 434, 436, 438, 440, 442, 444, 446, 448, 및 450으로서 표 1.2에 나타냈다.

본원의 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산의 맥락 내에서, 본원에 설명된 바와 같이, 박테리오신은 미생물 세포상에서 상이한 메커니즘을 통해 작용할 수 있긴 하지만, 미생물 숙주가 박테리오신을 포함하는 배지와 함께 배양 중인 경우 초기 미생물 숙주의 수와 비교하여 미생물 숙주의 수가 적어도 5%, 적어도 10%, 적어도 15%, 적어도 20%, 적어도 25%, 적어도 30%, 적어도 35%, 적어도 40%, 적어도 45%, 적어도 50%, 적어도 55%, 적어도 60%, 적어도 65%, 적어도 70%, 적어도 75%, 적어도 80%, 적어도 85%, 적어도 90%, 적어도 95%, 또는 그 초과로 감소된 경우 박테리오신이 활성이라고 말할 수 있다. 이 배양 단계는 존재하는 미생물 숙주의 수를 계수하여 박테리오신의 활성을 평가하기 전에 적어도 12시간, 24시간, 36시간, 48시간, 60시간, 72시간 또는 그 초과의 지속기간을 가질 수 있다. 활성은 현미경 하에 세포를 계수하거나 임의의 공지된 미생물 기술에 의해 평가될 수 있다. 일부 실시양태에서, 미생물 숙주가 박테리오신을 포함하는 배지와 함께 배양 중인 경우 미생물 숙주의 초기 집단과 비교하여 미생물 숙주의 적어도 특정된 수 또는 백분율, 예를 들어 정지된 미생물 숙주의 예를 들어 적어도 5%, 적어도 10%, 적어도 15%, 적어도 20%, 적어도 25%, 적어도 30%, 적어도 35%, 적어도 40%, 적어도 45%, 적어도 50%, 적어도 55%, 적어도 60%, 적어도 65%, 적어도 70%, 적어도 75%, 적어도 80%, 적어도 85%, 적어도 90%, 또는 적어도 95%로 성장이 정지된 경우 박테리오신이 활성이다.

본원의 일부 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산의 맥락 내에서, 박테리오신은 각각 서열번호 198 또는 200을 포함하거나 이로 이루어진 아미노산 서열로 표시되는 B17 또는 C7이다. B17 및 C7은 본원의 일부 실시양태에 따라 배양 배지에서 생산하기 간단하고, 사용하기 쉽고, 안정한 선택 작용제인 것으로 실험적으로 확인되었다 (실시예 1 참조). 본원의 실시양태의 일부 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산은 또한 서열번호 198 또는 200과 적어도 50% 동일성, 예를 들어 서열번호 198 또는 200과 적어도 50%, 51%, 52%, 53%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일성을 갖는 박테리오신의 사용을 포함한다. B17 또는 C7의 이러한 변이체는 이들이 B17 또는 C7의 적어도 실질적인 활성을 나타내는 한, 본원의 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산에서 사용될 수 있다. 이러한 맥락에서, "실질적인"은, 예를 들어, 서열번호 198 또는 200을 갖는 B17 또는 C7의 활성의 적어도 50%, 적어도 60%, 적어도 705, 적어도 80%, 적어도 90%, 또는 적어도 100%를 의미한다. 박테리오신의 활성은 본원에서 앞서 기재되어 있다.

본원의 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산의 맥락 내에서, 그리고 표적화된 미생물 숙주 및 사용된 박테리오신에 따라, 통상의 기술자는 어느 농도의 박테리오신이 배지 또는 한천 페트리 플레이트에서 사용될 지를 알 것이다. 박테리오신 B17 또는 C7을 사용하여 발명자들은 상기 박테리오신을 포함하는 배양 배지를 본원의 실시양태의 방법 및 용도를 수행할 수 있게 하는, 즉 상기 유전자 활성의 발현의 이점을 관찰 또는 가시화할 수 있는 농도로 제조할 수 있었다. 상기 활성의 이점이 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 포함하는 숙주의 성장을 허용하는 것이라면, 상기 배지 또는 한천 플레이트에서의 박테리오신의 양은 상기 자가-복제성 염색체외를 포함하지 않는 숙주의 수가, 상기 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 받은 미생물 숙주가 생존하고 성장하게 할 수 있는 조건 하에 세포가 배양 중인 경우 초기 미생물 세포/숙주의 수와 비교하여 적어도 5%, 적어도 10%, 적어도 15%, 적어도 20%, 적어도 25%, 적어도 30%, 적어도 35%, 적어도 40%, 적어도 45%, 적어도 50%, 적어도 55%, 적어도 60%, 적어도 65%, 적어도 70%, 적어도 75%, 적어도 80%, 적어도 85%, 적어도 90%, 적어도 95% 또는 그 초과로 감소된 정도이다. 이 평가 단계는 적어도 6시간, 12시간, 24시간, 36시간, 48시간, 60시간, 72시간, 84시간, 96시간, 108시간, 120시간 또는 그 초과의 지속기간을 가질 수 있다. 상기 배양 배지는 실질적인 박테리오신 활성을 잃지 않으면서 멸균될 수 있다. 이러한 맥락에서, "실질적인"은, 예를 들어, 멸균 전에 배양 배지에 존재하는 박테리오신 활성의 50% 초과, 60% 초과, 70% 초과, 80% 초과, 90% 초과를 의미한다.

본원의 일부 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산에 적합하고, 박테리오신에 대한 면역을 제공하는 제1 핵산 서열이 표 2에 제시되어 있다.

[표 2] 박테리오신에 면역을 제공하는 예시적인 핵산 서열

표 2의 박테리오신에 면역을 제공하는 서열은 자연적으로 발생하지만, 통상의 기술자는 이러한 분자의 변이체, 표 2의 것들 외에 자연적으로 발생하는 분자, 또는 합성 분자가 본원의 일부 실시양태에 따라 사용될 수 있음을 이해할 것이다. 일부 실시양태에서, 특정한 박테리오신, 박테리오신의 특정한 부류 또는 카테고리, 또는 박테리오신의 특정 조합에 면역을 부여하는 특정한 분자 또는 면역을 부여하는 분자의 특정한 조합. 분자가 면역을 부여할 수 있는 예시적인 박테리오신이 표 2에 특정되어 있다. 표 2는 면역을 부여하는 분자에 대한 "기원의 유기체"를 특정하지만, 면역을 부여하는 이들 분자는 본원에서 일부 실시양태에 따라 원하는 박테리오신 면역 활성을 제공하기 위해 다른 자연적으로 발생하는, 유전자 변형된, 또는 합성 미생물에서 용이하게 발현될 수 있다. 이와 같이, 본원에 사용된 바와 같이 "면역 조정제" 또는 "박테리오신에 면역을 부여하는 또는 제공하는 분자"는 본원에 분명히 제공된 구조뿐만 아니라, 완전 합성 면역 조정제, 및 본원에 개시된 박테리오신과 기능적으로 동등한 박테리오신에 면역을 제공하는 면역 조정제를 포함하여, 본원에 기재된 "면역 조정제" 구조와 실질적으로 동일한 효과를 갖는 구조를 포함한다.

표 2의 폴리펩티드를 코딩하는 예시적인 폴리뉴클레오티드 서열은 표 2에 나타냈다. 통상의 기술자는 유전자 코드가 변성되고, 더욱이, 코돈 사용이 유전자 생산물이 발현되는 특정한 유기체에 기초하여 변할 수 있고, 이와 같이, 특정한 폴리펩티드가 하나 초과의 폴리뉴클레오티드에 의해 코딩될 수 있음을 용이하게 이해할 것이다. 일부 실시양태에서, 박테리오신 면역 조정제를 코딩하는 폴리뉴클레오티드는 박테리오신 면역 조정제를 발현하는 유기체의 코돈 사용에 기초하여 선택된다. 일부 실시양태에서, 박테리오신 면역 조정제를 코딩하는 폴리뉴클레오티드는 박테리오신 면역 조정제를 발현하는 특정 유기체에 기초하여 코돈 최적화된다. 방대한 범위의 기능적 면역 조정제는 본원에 개시된 면역 조성제의 특징을 포함할 수 있으며, 따라서 표 2에서의 면역 조정제와 방대한 정도의 동일성을 제공한다. 일부 실시양태에서, 면역 조정제는 표 2의 폴리펩티드 중 어느 하나와, 적어도 약 50% 동일성, 예를 들어, 적어도 50%, 51%, 52%, 53%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일성을 갖는다.

본원의 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산의 맥락 내에서, 박테리오신에 대한 내성 또는 면역은 세포가 박테리오신을 포함하는 배지와 함께 배양 중인 경우 초기 미생물 세포의 수와 비교하여 박테리오신과의 배양 단계의 말기에 미생물 세포의 수가 감소되지 않았으며, 일부 실시양태에서는 적어도 5%, 적어도 10%, 적어도 15%, 적어도 20%, 적어도 25%, 적어도 30%, 적어도 35%, 적어도 40%, 적어도 45%, 적어도 50%, 적어도 55%, 적어도 60%, 적어도 65%, 적어도 70%, 적어도 75%, 적어도 80%, 적어도 85%, 적어도 90%, 적어도 95% 또는 그 초과로 증가되었음을 의미할 수 있다. 이 배양 단계는 존재하는 미생물 세포의 수를 계수하여 박테리오신의 활성을 평가하기 전에 적어도 12시간, 24시간, 36시간, 48시간, 60시간, 72시간, 84시간, 96시간, 108시간, 120시간 또는 그 초과의 지속기간을 가질 수 있다.

본원의 일부 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산에 적합하고 코딩 생산물이 면역을 부여하는 핵산 분자는 McbG (박테리오신 B17에 대한 면역)이며, 이는 서열번호 699로 표시된다. McbG는 본원의 일부 실시양태에 따라 구성적으로 또는 유도적으로 선택 가능한 마커로서 유용한 것으로 실험적으로 확인되었다 (실시예 3 참조). 또 다른 적합한 핵산은 서열번호 700으로 표시되는 MccE (박테리오신 C7에 대한 면역) 또는 서열번호 701로 표시되는 그의 C-말단 부분이다. MccE는 마이크로신/박테리오신에 민감한 균주에서 벡터 선택 마커로서 사용되었다 (실시예 2 참조). 일부 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산은 또한 코딩 생산물이 박테리오신 B17 및/또는 C7에 면역을 부여하고 서열번호 699, 700, 또는 701과 적어도 50%의 동일성, 예를 들어 서열번호 699, 700, 또는 701과적어도 50%, 51%, 52%, 53%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일성을 갖는 핵산 분자의 사용을 포함한다. McbG 및/또는 MccE의 이러한 변이체는 이들이 McbG (각각 MccE)의 적어도 실질적인 활성을 나타내는 한, 본원의 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산에서 사용될 수 있다. 이러한 맥락에서, "실질적인"은, 예를 들어, 서열번호 699, 700, 또는 701을 갖는 McbG (각각 MccE)의의 활성의 적어도 50%, 적어도 60%, 적어도 70%, 적어도 80%, 적어도 90%, 또는 적어도 100% 또는 그 초과를 의미한다. McbG (각각 MccE)의 코딩 생산물에 의해 부여된 면역은 본원에서 앞서 기재되어 있다.

놀랍게도, 서열번호 701로 표시되는 MccE의 C-말단 부분은 박테리오신 C7에 대한 내성을 부여하기에 충분한 것으로 밝혀졌다. 이러한 맥락에서, 부분은 예를 들어, 원래 핵산 분자의 적어도 50%, 적어도 60%, 적어도 70%, 적어도 80%, 적어도 90% 또는 그 초과를 의미한다. 이는 이러한 짧은 핵산 분자가 박테리오신에 내성을 부여할 수 있다는 점에서 매우 매력적이고 놀랍다. 이러한 짧은 핵산 분자를 포함하는 자가-복제성 염색체외 핵산 분자가 미생물 세포에 대한 어떠한 부담도 형성하지 않을 것으로 예상된다.

본원의 일부 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산에 적합하고, 생산물이 박테리오신에 면역을 제공하는 추가의 적합한 핵산 분자는 그의 단일 생산물이 적어도 2종의 별개의 박테리오신에 면역을 제공하는 단일 핵산 분자이다. 일부 실시양태에서, 이러한 핵산 분자의 이러한 생산물은 B17 및 C7에 또는 ColV 및 C7에 또는 ColV 및 B17에 또는 B17, C7 및 ColV에 면역을 제공한다. ColV를 코딩하는 핵산은 서열번호 65로 확인되고 상응하는 코딩 아미노산 서열은 서열번호 64로 확인된다.

일부 실시양태에서, 생산물이 B17 및 C7에 면역을 제공하는 핵산 분자는 서열번호 715 또는 716과 적어도 50% 동일성 예를 들어 서열번호 715 또는 716과 적어도 50%, 51%, 52%, 53%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일성을 갖는 서열로 표시된다. 서열번호 715는 MccE에 융합된 McbG의 핵산 분자이다. 서열번호 716은 본원에서 앞서 기재된 바와 같이 MccE의 C-말단 부분에 융합된 McbG의 핵산 분자이다.

일부 실시양태에서, 생산물이 ColV 및 C7에 면역을 제공하는 핵산 분자는 서열번호 717 또는 718과 적어도 50% 동일성 예를 들어 서열번호 717 또는 718과 적어도 50%, 51%, 52%, 53%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일성을 갖는 서열로 표시된다. 서열번호 717은 MccE에 융합된 Cvi의 핵산 분자이다. 서열번호 718은 본원에서 앞서 기재된 바와 같이 MccE의 C-말단 부분에 융합된 Cvi의 핵산 분자이다.

코어 서열의 이러한 동일성 변이체는 본원에서 앞서 기재된 바와 같이 이들이 유래된 분자의 적어도 실질적인 활성을 나타내는 한, 본원의 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산에서 사용될 수 있다.

본원의 일부 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산에서, 생산물이 단일 또는 1종 초과 또는 적어도 2종의 박테리오신에 면역을 부여하는 본원에 기재된 이들 핵산 분자 각각은 본원에 기재된 바와 같이 프로모터에 작동 가능하게 연결될 수 있다. 일부 실시양태에서, 프로모터는 약한 프로모터이다. 일부 실시양태에서, 약한 프로모터는 실험적으로 확인된, 서열번호 708로 표시되는 proC 프로모터 또는 서열번호 707로 표시되는 P24 프로모터이다 (예를 들어, 실시예 3 참조).

본원의 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산에서 유용한 적합한 구축물은 생산물이 박테리오신에 면역을 부여하는 제1 핵산 분자를 포함할 수 있으며, 이들 구축물은 서열식별번호　: 702, 703, 710, 711, 704, 705, 712, 713 또는 714를 포함하거나, 본질적으로 이로 이루어지거나, 이로 이루어질 수 있다. 이들 구축물 각각은 적용의 실험 부분에서 광범위하게 기재되었으며, 이 실험 부분은 이들구축물 각각이 실제로 구축되었으며 본원에 일부 실시양태에 따라 적합한 것으로 확인되었음을 언급한다 (예를 들어, 실시예 1 및 2 및 3 참조).

일부 실시양태의 방법에서, 배양 배지에 첨가된 박테리오신은 본원에서 확인된 바와 같은 B17 및/또는 C7 및/또는 ColV이다

본 방법은 임의의 관심 생산물의 생산을 가능할 수 있다. 일부 실시양태의 방법에서, 관심 생산물은 미생물 바이오매스, 자가-복제성 염색체외 핵산 분자, 상기 제2 핵산 서열의 전사체, 상기 제2 서열에 의해 코딩된 폴리펩티드 또는 상기 폴리펩티드에 의해 직접 또는 간접적으로 생산된 대사산물이다.

일부 실시양태의 방법에서, 관심 생산물은 배양 단계 c)의 말기에 정제된다. 이는 통상의 기술자에게 공지된 기술을 사용하여 수행될 수 있다.

자가-복제성 염색체외 핵산 분자의 존재와 연관된 에너지 부담이 최소화되었으므로, 관심 생산물의 수율이 최적일 것으로 예상된다.

방법은 임의의 적합한 미생물 세포, 예를 들어 숙주로서 사용할 수 있다. 적합한 미생물 세포는 일반 설명이라는 제목의 명세서 부분에 열거되어 있다. 적합한 미생물 세포 그 자체 및 본원의 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 및 숙주에서 사용하기 위한 적합한 미생물 세포는, 박테리아 (예를 들어, 그람 음성 박테리아, 예를 들어 이. 콜라이 종), 효모, 사상균 또는 조류를 포함하나, 이에 제한되지는 않는다. 일부 실시양태에서, 미생물 세포는 합성 미생물 세포이다.

방법에서, 자가-복제성 염색체외 핵산 분자 상에 존재하는 제1 핵산 서열은 프로모터에 작동 가능하게 연결될 수 있다. 일부 실시양태에서, 상기 프로모터는 약한 프로모터이다. 일부 실시양태에서, 상기 프로모터는 구성적 프로모터이다. 일부 실시양태에서, 상기 프로모터는 유도성이다. 일부 실시양태에서, 상기 프로모터는 약한 구성적 프로모터이다. 일부 실시양태에서, 상기 프로모터는 약한 유도성 프로모터이다. 상기 프로모터의 유도성은 제1 핵산 서열의 유전자 활성의 존재를 제어하는 방법이다. 프로모터는 관련 기술분야에 널리 공지되어 있다. 상세한 설명은 일반 설명에 대한 명세서의 부분에서 제공된다. 프로모터는 하나 이상의 코딩 서열의 전사를 유도하는데 사용될 수 있다. 임의로, 상기 자가-복제성 염색체외 핵산 분자는 관심 생산물의 생산에 관여하는 제2 핵산 서열을 포함하고, 여기서 상기 제2 핵산 서열의 유전자 활성은 제1 서열 중 하나와 독립적으로 제어된다.

한 실시양태에서, 상기 제2 핵산 서열의 유전자 활성의 제어는 제1 서열의 유전자 활성의 제어와 독립적이지 않다.

일부 실시양태에서, 제2 프로모터는 본원에 기재된 바와 같이 관심 생산물의 생산에 관여하는 상기 제2 핵산 서열의 발현을 구동시킨다. 한 실시양태에서, 제1 프로모터는 본원에 기재된 바와 같은 면역 조정제 폴리뉴클레오티드의 발현을 구동시킨다.

본원에서 사용될 수 있는 프로모터는 그것이 작동 가능하게 연결된 핵산 분자에 고유한 것이 아닐 수 있으며, 즉 그것이 작동 가능하게 연결된 핵산 분자 (코딩 서열)와 이종기원(heterologous)인 프로모터이다. 일부 실시양태의 프로모터가 그것이 작동 가능하게 연결된 코딩 서열과 이종기원이긴 하지만, 일부 실시양태에서, 프로모터는 상동성, 예를 들어 미생물 세포에 대해 내인성이다. 일부 실시양태에서, (뉴클레오티드 서열에 대한) 이종기원 프로모터는 코딩 서열에 고유한 프로모터보다 코딩 서열을 포함하는 더 높은 정상 상태 수준의 전사체를 생산할 수 있다 (또는 단위 시간당, 보다 많은 전사체 분자, 즉 mRNA 분자를 생산할 수 있다). 일부 프로모터는 항상 전사를 구동시킬 수 있다 ("구성적 프로모터"). 일부 프로모터는, 예를 들어 환경 조건, 화합물, 유전자 생산물, 세포 주기의 단계 등의 존재 또는 부재에 따라, 선택된 상황 ("조건적 프로모터" 또는 "유도성 프로모터") 하에 전사를 구동시킬 수 있다.

통상의 기술자는 원하는 발현 활성에 따라, 적절한 프로모터가 선택될 수 있고, 발현될 서열과 시스로 배치될 수 있음 (즉, 작동 가능하게 연결됨)을 인식할 것이다. 예시적인 활성을 가진 예시적인 프로모터가 본원의 표 3.1 내지 3.11에 제공된다. 통상의 기술자는 일부 프로모터가 특정한 전사 기구(transcriptional machinery) (예를 들어, RNA 폴리머라제, 일반적인 전사 인자 등)와 적합성임을 인식할 것이다. 이와 같이, 본원에 기재된 일부 프로모터에 대해 적합성(compatible) "종"이 확인되지만, 본원의 일부 실시양태에 따르면, 이들 프로모터는 확인된 종 외에 미생물, 예를 들어, 적합성 내인성 전사 기구를 가진 종, 적합성 전사 기구를 포함하는 유전자 변형된 종, 또는 적합성 전사 기구를 포함하는 완전 합성 미생물 유기체에서 용이하게 기능할 수 있는 것으로 고려된다.

본원의 표 3.1 내지 표 3.11의 프로모터는 바이오브릭스 재단(Biobricks foundation)으로부터 공개적으로 입수 가능하다. 바이오브릭스 재단은 바이오브릭™ 공개 계약(Biobricks™ Public Agreement) (BPA)에 따라 이들 프로모터의 사용을 권장한다.

본원에 기재된 "코딩" 폴리뉴클레오티드 중 임의의 것 (예를 들어, 관심 생산물의 생산에 관여하는 제1 핵산 서열 및/또는 제2 핵산 서열)은 원하는 프로모터의 제어 하에 발현 중인 것으로 일반적으로 수정될 수 있음을 이해하여야 한다. 한 실시양태에서, 제1 핵산 서열은 제1 프로모터의 제어 하에 있다. 한 실시양태에서, 관심 생산물의 생산에 관여하는 제2 핵산 서열은 제2 프로모터의 제어 하에 있다.

일반적으로, 특정한 전사체에 대한 번역 개시는 전사체의 코딩 서열의 5' 말단에서 특정한 서열에 의해 조절된다. 예를 들어, 코딩 서열은 개시제 tRNA와 쌍을 형성하도록 구성된 시작 코돈으로 시작할 수 있다. 자연적으로 발생하는 번역 시스템은 전형적으로 Met (AUG)를 시작 코돈으로서 사용하지만, 개시제 tRNA는 임의의 원하는 트리플렛 또는 트리플렛에 결합하도록 조작될 수 있으며, 따라서 AUG 외에 트리플렛이 특정 실시양태에서 시작 코돈으로서 또한 기능할 수 있음을 용이하게 이해할 것이다. 게다가, 시작 코돈 근처의 서열은 리보솜 어셈블리, 예를 들어 코작(Kozak) 서열 ((gcc)gccNccAUGG, 서열번호 542, 여기서 N은 "A" 또는 "G"를 나타낸다) 또는 전형적인 진핵생물 번역 시스템에서의 내부 리보솜 진입 부위(Internal Ribosome Entry Site) (IRES), 또는 전형적인 원핵생물 번역 시스템에서의 또는 샤인-달가노(Shine-Dalgarno) 서열 (GGAGGU, 서열번호 543)를 촉진할 수 있다. 이와 같이 일부 실시양태에서, "코딩" 폴리뉴클레오티드 서열, 예를 들어 발효 생산물의 생산에 관여하는 제1 핵산 서열, 또는 제2 핵산 서열을 포함하는 전사체는 적절한 시작 코돈 및 번역 개시 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, 예를 들어 2개 이상의 "코딩" 폴리뉴클레오티드 서열이 전사체 상에 시스에 위치되는 경우, 각각의 폴리뉴클레오티드 서열은 적절한 시작 코돈 및 번역 개시 서열 (들)을 포함한다.

일부 실시양태에서, 예를 들어 2개 이상의 "코딩" 폴리뉴클레오티드 서열이 전사체 상의 시스에 위치되는 경우, 2개의 서열은 단일 번역 개시 서열의 제어 하에 있고, 시스로 코딩된 2개의 폴리펩티드와 함께 기능할 수 있는 단일 폴리펩티드를 제공하거나, 시스로 코딩된 2개의 폴리펩티드, 예를 들어 2A 서열 등을 분리하기 위한 수단을 제공한다. 일부 실시양태에서, 번역 개시제 tRNA는 면역 조정제 또는 산업 상 유용한 분자의 번역 개시를 조절하기 위해 조절 가능하다.

[표 3.1] 예시적인 금속-민감성 프로모터

[표 3.2] 예시적인 세포-신호전달-반응성 프로모터

[표 3.3] 예시적인 구성적 이. 콜라이 σ ⁷⁰ 프로모터

[표 3.4] 예시적인 구성적 이. 콜라이 σ ⁸ 프로모터

[표 3.5] 예시적인 구성적 이. 콜라이 σ ³² 프로모터

[표 3.6] 예시적인 구성적 비. 서브틸리스( B. subtilis ) σ ^A 프로모터

[표 3.7] 예시적인 구성적 비. 서브틸리스 σ ^B 프로모터

[표 3.8] 잡다한 원핵생물로부터 예시적인 구성적 프로모터

[표 3.9] 박테리오파지 T7로부터 예시적인 구성적 프로모터

[표 3.10] 효모로부터 예시적인 구성적 프로모터

[표 3.11] 잡다한 진핵생물로부터 예시적인 구성적 프로모터

상기-언급된 프로모터는 단지 비제한적인 예로서 제공된다. 프로모터는 합성 프로모터일 수 있다. 본원의 일부 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산에 적합한 프로모터는 본원에서 앞서 기재되어 있고, 예를 들어 본원의 일부 실시양태에 따라 실험적으로 확인된 서열번호 708로 표시되는 proC (실시예 2 참조) 및 본원의 일부 실시양태에 따라 실험적으로 확인된 서열번호 707로 표시되는 P24 (실시예 3 참조)이다. 일부 실시양태에서, 적합한 유도성 프로모터는 P24 LacO 혼성 프로모터이며, 이는 LacI의 존재 하에 억제되고 IPTG의 존재 하에 활성이다. 이 프로모터는 본원의 일부 실시양태에 따라 실험적으로 확인되었다 (실시예 3 참조).

통상의 기술자는 상기-언급된 프로모터의 많은 변이체, 및 많은 다른 프로모터 (자연적으로 존재하는 유기체로부터 단리된 프로모터, 그의 변이체, 및 완전 합성 또는 조작된 프로모터를 포함)가 본원의 일부 실시양태에 따라 용이하게 사용될 수 있음을 용이하게 인식할 것이다. 변이체, 완전 합성 또는 합성 또는 조작된 프로모터는 활성 또는 기능적이라고 하며, 따라서 전사체를 코딩하는 핵산 분자와 작동 가능하게 연결된 대조군 또는 참조 플라스미드에서 시험되는 경우, 상기 플라스미드가 세포에 존재하는 경우 검출 가능한 양의 상기 전사체 분자가 존재한다. 변이체, 완전 합성 또는 합성 또는 조작된 프로모터는 그것이 유래하는 프로모터의 활성의 적어도 50%, 적어도 60%, 적어도 70%, 적어도 80%, 적어도 90%, 또는 적어도 100%를 가질 수 있다.

임의로, 방법은 상기 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 받은 숙주가 생존할 수 있게 하는 조건 하에 상기 미생물 숙주를 상기 자가-복제성 염색체외 핵산 분자로 형질전환시키는 것을 포함한다. 일부 실시양태에서, 자가-복제성 염색체외 핵산 분자는 미생물 세포에 제공될 수 있으며 (예를 들어, 미생물 세포 또는 이의 전임자가 자가-복제성 염색체외 핵산 분자로 형질전환된 경우), 이와 같이, 일부 실시양태에서, 형질전환 단계는 방법에서 필요하지 않다는 점에 주목한다. 형질전환 단계는 단계 c)의 배양 전에 수행될 수 있다. 일부 실시양태에서, 형질전환 단계는 단계 a) 이전에 제공되어 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 포함하는 숙주 세포를 제공하도록 한다. 일부 실시양태에서, 형질전환 단계에서 사용된 자가-복제성 염색체외 핵산 분자는 임의적 단계 b)의 제2 핵산을 추가로 포함한다.

미생물 유기체의 유전자 변형 기술은 관련 기술분야에 널리 공지되어 있다 (예를 들어 문헌 [Molecular Cloning Fourth edition, 2012 Cold Spring Harbor Laboratory Press, A laboratory manual, by M.R. Green and J Sambrook] 참조, 상기 문헌은 그 전문이 본원에 참조로 포함됨). 일부 실시양태에서, 미생물은 제1 핵산 서열 및 임의로 관심 생산물의 생산에 관여하는 분자를 포함하는 상기 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 포함하도록 유전자 변형된다. 폴리뉴클레오티드 또는 핵산 분자는 미생물에 전달될 수 있다.

한 실시양태에서, 미생물 세포는 상기 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 받은 세포가 생존할 수 있게 하는 적어도 하나의 주어진 조건에 상응하는 제1 핵산 서열의 유전자 활성에 의해 양성적으로 선택되고 상기 조건은 환경 조건일 수 있다. 환경 조건은 배양 배지일 수 있다

미생물 세포를 유연하게 유전자 변형하여, 예를 들어 원하는 유형 및/또는 스펙트럼의 유전자 활성을 갖도록 미생물 세포를 조작 또는 재조작하는 것이 유용할 수 있다. 일부 실시양태에서, 하나 이상의 원하는 별개의 제1 핵산 서열을 삽입하기 위한 카세트가 제공된다. 예시적인 카세트는 Cre/lox 카세트 또는 FLP/FRT 카세트를 포함하나, 이에 제한되지는 않는다.

한 실시양태에서, 미생물 세포는 본원에 기재된 바와 같은 제1 핵산 서열을 포함하는 1개 초과 (2개 초과, 3개 초과,…)의 상이한 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 포함하며, 이는 상기 세포가 1개 초과 (2개 초과, 3개 초과,…)의 유전자 활성을 나타낼 수 있고, 각각의 유전자 활성이 세포에게 이점을 부여한다는 것을 의미한다. 제1 프로모터가 상이한 자가-복제성 염색체외 핵산 분자 각각에 존재하는 경우, 상기 제1 프로모터 각각은 상이하거나 동일할 수 있다. 따라서, 관심 생산물을 생산하는 방법에서 1, 2, 3, 4개 또는 그 초과의 별개의 박테리오신을 사용하는 것이 본원의 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산의 범위 내에 있으며 여기서 미생물 숙주는 1, 2, 3, 4개 또는 그 초과의 별개의 염색체외 핵산 분자를 포함하고, 각각은 상기 미생물 숙주에게 별개의 유전자 활성을 부여한다. 대안적으로, 생산물이 적어도 별개의 박테리오신에 면역을 제공하는 단일 핵산 분자를 사용하는 것이 본원의 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산의 범위 내에 있다. 이러한 핵산 분자는 본원에 기재되어 있다.

일부 실시양태에서, 플라스미드 접합은 "공여자" 미생물 세포로부터 수용자 미생물 세포로 원하는 플라스미드를 도입하기 위해 사용될 수 있다. (문헌 [Goni-Moreno, et al. (2013) Multicellular Computing Using Conjugation for Wiring. PLoS ONE 8(6): e65986], 그 전문이 본원에 참조로 포함됨). 일부 실시양태에서, 플라스미드 접합은 공여자 미생물 세포로부터 수용자 미생물 세포로 접합 플라스미드를 도입함으로써 수용자 미생물 세포를 유전자 변형시킬 수 있다. 임의의 특정한 이론에 의해 제한되지 않으면서, 동일하거나 기능적으로 동일한 복제 유전자 세트를 포함하는 접합 플라스미드는 전형적으로 동일한 미생물 세포에 공존할 수 없다. 이와 같이, 일부 실시양태에서, 플라스미드 접합은 새로운 접합 플라스미드를 도입하여 수용자 세포에 존재하는 또 다른 접합 플라스미드를 대체함으로써 수용자 미생물 세포를 "리프로그래밍"한다. 일부 실시양태에서, 플라스미드 접합은 (일부 실시양태에서 면역 조정제를 코딩할 수 있는) 제1 핵산 분자의 특정한 조합으로 미생물 세포를 조작 (또는 재조작)하는데 사용된다. 일부 실시양태에 따르면, (일부 실시양태에서 면역 조정제를 코딩할 수 있는) 제1 산 서열의 상이한 조합을 포함하는 여러 가지의 접합 플라스미드가 제공된다. 플라스미드는 본원에 기재된 바와 같은 추가의 유전적 요소, 예를 들어 프로모터, 번역 개시 부위 등을 포함할 수 있다. 일부 실시양태에서, 여러 가지의 접합 플라스미드는 공여자 세포의 집합으로 제공되므로, 원하는 플라스미드를 포함하는 공여자 세포가 플라스미드 접합을 위해 선택될 수 있다. 일부 실시양태에서, 면역 조정제의 특정한 조합이 선택되고, 적절한 공여자 세포가 관심 미생물 세포와 접합되어 그 조합을 포함하는 접합 플라스미드를 수용자 세포 내로 도입한다. 일부 실시양태에서, 수용자 세포는, 예를 들어 배양물에 도입되거나 배양을 개시하기 위해 "새롭게 조작된" 세포이다.

단계 b)

단계 a)에 더하여, 일부 실시양태에서, 방법은 임의적 단계 b)를 추가로 포함하고, 여기서 상기 자가-복제성 염색체외 핵산 분자는 상기 관심 생산물의 생산에 관여하는 제2 핵산 서열을 포함하고, 여기서 상기 제2 핵산 서열의 유전자 활성은 제1 서열 중 하나와 독립적으로 제어된다.

본원의 실시양태의 방법, 용도, 조성물, 숙주, 및 핵산의 맥락 내에서, 표현 "독립적으로 제어되는"은 제1 및 제2 핵산 서열의 유전자 활성을 제어하기 위해 별개의 방법이 사용됨을 의미하는 것을 포함하여, 본 개시내용의 관점에서 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 이해되는 바와 같은 그의 관습적이고 통상적인 의미를 갖는다. 핵산 서열의 유전자 활성을 제어하는 방법은 이미 본원에 상세하게 기재되어 있다.

단계 c)

일부 실시양태에서, 단계 a) (이는 본원에 기재된 바와 같이 형질전환을 임의로 포함한다) 및 임의적 단계 (b)는 단계 (c)로 이어지며, 이는 상기 미생물 숙주가 제1 핵산 서열을 주어진 수준으로 발현시켜 자가-복제성 염색체외 분자를 성장하는 미생물 집단 내로 유지할 수 있게 하는 조건 하에 상기 형질 전환된 미생물 숙주를 배양하는 것을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 관심 생산물에 대한 제2 서열 코딩을 임의로 제어한다.

일부 실시양태의 방법에서, 단계 c) 조건의 적어도 일부는 제1 핵산 서열이 상기 유전자 활성을 나타내지 않는다는 조건이다. "단계 c)의 일부"는, 예를 들어, 단계 c)의 지속기간의 적어도 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80% 또는 90% 또는 최대 100%를 의미한다. 방법의 이러한 실시양태는 단계 c)의 일부가 제1 핵산 서열의 유전자 활성 없이 수행되므로 매우 매력적이다. 상기 유전자 활성의 존재는 미생물 숙주 세포에 에너지 부담을 형성하며, 관심 생산물의 적합한 생산 수준을 유지하기 위해 항상 필요한 것은 아니다. 일부 실시양태에서, 제1 핵산 서열의 유전자 활성이 없는 단계 c)의 일부에 이어서 상기 활성을 가진 일부를 갖는 것으로 예상된다. 이들 2개의 부분은 단계 c) 동안 1 회 이상 반복될 수 있다.

미생물 세포는 임의의 적합한 미생물 배양 환경에서 배양될 수 있다. 미생물 배양 환경은 다종다양한 배양 배지, 예를 들어 공급원료를 포함할 수 있다. 특정 배양 배지의 선택은 원하는 적용에 의존할 수 있다. 배양 배지의 조건은 화학적 조성뿐만 아니라, 온도, 빛의 양, pH, CO₂ 수준 등을 포함한다. 배양 배지는 박테리오신을 포함할 수 있다. 한 실시양태에서, 박테리오신의 활성을 유도하는 화합물은 공급원료 외부에 존재하나, 공급원료에는 존재하지 않는다.

한 실시양태에서, 본원에 기재된 바와 같은 유전자 조작 또는 형질전환 미생물은 하나 이상의 공급원료를 포함하는 배양 배지에 첨가된다. 한 실시양태에서, 배양 배지는 면역 조정제의 활성 또는 발현을 유도하는 화합물을 포함한다.

용어 "공급원료"는 본 개시내용의 관점에서 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 이해되는 바와 같은 그의 관습적이고 통상적인 의미를 가지며, 예를 들어 산업 공정의 맥락에서, 미생물 유기체에 의해 소비, 발효, 정제, 변형 또는 달리 처리될 수 있는 물질을 포함한다. 따라서, 이와 같이, "공급원료"는 음식 또는 식품으로 제한되지 않는다. 본원에 사용된 바와 같이, "공급원료"는 배양 배지의 카테고리이다. 따라서, 본원에 사용된 바와 같이 "배양 배지"는 공급원료를 포함하나, 이에 제한되지는 않는다. 이와 같이, "배양 배지"가 본원에 언급될 때마다, 공급원료도 분명히 고려된다.

형질전환된 미생물 세포를 배양하기 전에, 만약에 있다면, 효과를 결정하거나, 상기 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 받은 숙주가 생존하고 임의로 성장할 수 있게 하는 조건을 최적화하는 것이 유용할 수 있다.

일부 실시양태에서, 유전자 활성이 미생물 숙주에게 이점을 부여하는 제1 핵산 서열을 포함하고 여기서 상기 제1 핵산 서열의 유전자 활성이 제어되고, 임의로 관심 생산물의 생산에 직접 또는 간접적으로 관여하는 제2 핵산 서열을 포함하는, 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 포함하는 미생물 세포 또는 미생물 숙주 또는 미생물 숙주 세포 또는 합성 미생물 숙주 세포가 제공된다.

일부 실시양태에서, 유전자 활성이 미생물 숙주에게 이점을 부여하는 제1 핵산 서열을 포함하고 여기서 상기 제1 핵산 서열의 유전자 활성이 제어되고, 임의로 관심 생산물의 생산에 직접 또는 간접적으로 관여하는 제2 핵산 서열을 포함하는 자가-복제성 염색체외 핵산 분자가 제공된다.

이 미생물 숙주 및 이러한 자가-복제성 염색체외 핵산 분자의 각각의 특징은 본원에 이미 기재되어 있다.

일반 설명

본원에 사용된 용어는 본 개시내용을 고려하여 읽을 때 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 이해되는 바와 같은 관습적이고 일반적인 의미를 가지며, 다음의 일반 설명을 포함할 수 있다

미생물

본원에 사용된 바와 같이, "미생물 유기체", "미생물," "미생물 세포" 또는 "미생물 숙주" 및 이들 근원 용어의 변형 (예를 들어 복수형 등)은, 임의의 자연적으로 발생하는 종 또는 합성 또는 완전 합성 원핵 또는 진핵 단세포 유기체,뿐만 아니라 아르캐(Archae) 종을 포함한, 본 개시내용의 관점에서 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 이해되는 바와 같은 그의 관습적이고 통상적인 의미를 갖는다. 따라서, 이 표현은 박테리아 종, 진균 종 및 조류의 세포를 지칭할 수 있다. 본원의 실시양태에 따라 사용될 수 있는 예시적인 미생물은 박테리아, 효모, 사상균, 및 조류, 예를 들어 광합성 미세조류를 포함하나, 이에 제한되지는 않는다. 더욱이, 완전 합성 미생물 게놈을 합성하고 단일 미생물 세포에 이식하여, 연속 자기-복제가 가능한 합성 미생물을 생산할 수 있다 (문헌 [Gibson et al. (2010), "Creation of a Bacterial Cell Controlled by a Chemically Synthesized Genome," Science 329: 52-56] 참조, 그 전문이 본원에 참조로 포함된). 이와 같이, 일부 실시양태에서, 미생물은 완전 합성이다. 유전자 발현을 조절하는 요소, 및 유전자 생산물을 코딩하는 요소 (예를 들어, 면역 조정제, 독, 해독제, 및 관심 생산물이라고도 칭해지는 산업상 유용한 분자)를 포함한, 유전자적 요소의 원하는 조합은 원하는 섀시(chassis) 상에서 부분 또는 완전 합성 미생물로 어셈블리될 수 있다. 산업적 적용을 위한 유전자 조작된 미생물 유기체에 대한 설명은 또한 문헌 [Wright, et al. (2013) "Building-in biosafety for synthetic biology" Microbiology 159: 1221-1235]에서 찾을 수 있다. 유전자적 요소의 적합한 실시양태는 본원에서 나중에 설명될 것이다.

여러 가지의 박테리아 종 및 균주가 본원의 실시양태에 따라 사용될 수 있고, 유전자 변형된 변이체, 또는 공지된 종의 "섀시"에 기초한 합성 박테리아가 제공될 수 있다. 본원의 실시양태에 따라 사용될 수 있는 산업상 적용 가능한 특성을 갖는 예시적인 박테리아는 바실러스 종 (예를 들어 바실러스 코아굴란스, 바실러스 서브틸리스, 및 바실러스 리체니포르미스), 파에니바실러스 종, 스트렙토마이세스 종, 마이크로코커스 종, 코리네박테리움(Corynebacterium) 종, 아세토박터(Acetobacter) 종, 시아노박테리아 종, 살모넬라 종, 로도코커스(Rhodococcus) 종, 슈도모나스 종, 락토바실러스 종, 엔테로코커스 종, 알칼리게네스(Alcaligenes) 종, 클렙시엘라 종, 파에니바실러스 종, 아르트로박터(Arthrobacter) 종, 코리네박테리움 종, 브레비박테리움 종, 써무스 아쿠아티쿠스(Thermus aquaticus), 슈도모나스 스투체리(Pseudomonas stutzeri), 클로스트리디움 써모셀루스(Clostridium thermocellus), 및 에스케리치아 콜라이를 포함하나, 이에 제한되지는 않는다.

여러 가지의 효모 종 및 균주가 본원의 실시양태에 따라 사용될 수 있고, 유전자 변형된 변이체, 또는 공지된 종의 "섀시"에 기초한 합성 효모가 제공될 수 있다. 본원의 실시양태에 따라 사용될 수 있는 산업상 적용 가능한 특성을 갖는 예시적인 효모는 사카로마이세스 종(Saccharomyces) 종 (예를 들어, 사카로마이세스 세레비지아에(Saccharomyces cerevisiae), 사카로마이세스 바야누스(Saccharomyces bayanus), 사카로마이세스 보울라르디이(Saccharomyces boulardii), 칸디다 종 (예를 들어, 칸디다 유틸리스(Candida utilis), 칸디다 크루세이(Candida krusei)), 스키조사카로마이세스(Schizosaccharomyces) 종 (예를 들어 스키조사카로마이세스 폼베(Schizosaccharomyces pombe), 스키조사카로마이세스 자포니카(Schizosaccharomyces japonicas)), 피치아(Pichia) 또는 한세눌라(Hansenula) 종 (예를 들어, 피치아 파스토리스(Pichia pastoris) 또는 한세눌라 폴리모르프드(Hansenula polymorphd) 종, 및 브레타노마이세스(Brettanomyces) 종 (예를 들어, 브레타노마이세스 클라우센니이(Brettanomyces claussenii))을 포함하나, 이에 제한되지는 않는다.

여러 가지의 조류 및 균주가 본원의 실시양태에 따라 사용될 수 있고, 유전자 변형된 변이체, 또는 공지된 종의 "섀시"에 기초한 합성 조류가 제공될 수 있다. 일부 실시양태에서, 조류는 광합성 미세조류를 포함하거나, 본질적으로 이로 이루어지거나, 이로 이루어진다. 바이오 연료에 유용할 수 있고 본원의 실시양태에 따라 사용될 수 있는 예시적인 조류 종은 보트리오코커스 브라우니이(Botryococcus braunii), 클로렐라(Chlorella) 종, 두날리엘라 테르티오렉타(Dunaliella tertiolecta), 그라실라리아(Gracilaria) 종, 플레우로키리시스 카르테라에(Pleurochrysis carterae), 및 사르가숨(Sargassum) 종을 포함한다. 게다가, 많은 조류가 식품, 비료 제품, 폐기물 중화, 환경 복원, 및 탄수화물 제조 (예를 들어 바이오 연료)에 유용할 수 있다.

여러 가지의 사상균 종 및 균주가 본원의 실시양태에 따라 사용될 수 있고, 유전자 변형된 변이체, 또는 공지된 종의 "섀시"에 기초한 합성 사상균이 제공될 수 있다. 본원에 실시양태에 따라 사용될 수 있는, 산업상 적용 가능한 특성을 갖는 예시적인 사상균은 아크레모늄(Acremonium), 아가리쿠스(Agaricus), 알케르나리아(Alternaria), 아스페르길루스(Aspergillus), 아우레바시디움(Aureobasidium), 보트리오스패리아(Botryospaeria), 세리포리옵시스(Ceriporiopsis), 채토미디움(Chaetomidium), 크리소스포리움(Chrysosporium), 클라비셉스(Claviceps), 코클리오볼루스(Cochliobolus), 코프리놉시스(Coprinopsis), 콥토테르메스(Coptotermes), 코리나스쿠스(Corynascus), 크리포넥트리아(Cryphonectria), 크립토코커스(Cryptococcus), 디플로디아(Diplodia), 엑시디아(Exidia), 필리바시디움(Filibasidium), 푸사리움(Fusarium), 기베렐라(Gibberella), 홀로마스티고토이데스(Holomastigotoides), 후미콜라(Humicola), 를르펙스(lrpex), 렌티눌라(Lentinula), 렙토스패리아(Leptospaeria), 마그나포르테(Magnaporthe), 멜라노카르푸스(Melanocarpus), 메리필루스(Meripilus), 무코르(Mucor), 미셀리오프토라(Myceliophthora), 네오카피매스틱스(Neocaffimastix), 뉴로스포라(Neurospora), 패실로마이세스(Paecilomyces), 페니시피움(Peniciffium), 파네로캐테(Phanerochaete), 피로마이세스(Piromyces), 포이트라시아(Poitrasia), 슈도플렉타니아(Pseudoplectania), 슈도트리코님파(Pseudotrichonympha), 리조무코르(Rhizomucor), 스키조필룸(Schizophyllum), 사이탈리디움(Scytalidium), 탈라로마이세스(Talaromyces), 서모아스쿠스(Thermoascus), 티엘라비아(Thielavia), 톨리포클라디움(Tolypocladium), 트리코더마(Trichoderma), 트리코패아(Trichophaea), 버티실리움(Verticillium), 볼바리엘라(Volvariella), 또는 크실라리아(Xylaria)를 포함하나, 이에 제한되지는 않는다.

종은 아크레모늄 셀룰로리티쿠스(Acremonium cellulolyticus), 아스페르길루스 아쿨레아투스(Aspergillus aculeatus), 아스페르길루스 아와모리(Aspergillus awamori), 아스페르길루스 포에티두스(Aspergillus foetidus), 아스페르길루스 푸미가투스(Aspergillus fumigatus), 아스페르길루스 자포니쿠스(Aspergillus japonicus), 아스페르길루스 니둘란스(Aspergillus nidulans), 아스페르길루스 니거(Aspergillus niger), 아스페르길루스 오리자에(Aspergillus oryzae), 크리소스포리움 이놉스(Chrysosporium inops), 크리소스포리움 케라티노필룸(Chrysosporium keratinophilum), 크리소스포리움 루크노웬스(Chrysosporium lucknowense), 크리소스포리움 메르다리움(Chrysosporium merdarium), 크리소스포리움 파니콜라(Chrysosporium pannicola), 크리소스포리움 퀸스랜디쿰(Chrysosporium queenslandicum), 크리소스포리움 트로피쿰(Chrysosporium tropicum), 크리소스포리움 조나 턴(Chrysosporium zona turn), 푸사리움 박트리디오이데스(Fusarium bactridioides), 푸사리움 세레알리스(Fusarium cerealis), 푸사리움 크룩웨렌스(Fusarium crookwellense), 푸사리움 컬모룸(Fusarium culmorum), 푸사리움 그라미네아룸(Fusarium graminearum), 푸사리움 그라미눔(Fusarium graminum), 푸사리움 헤테로스포룸(Fusarium heterosporum), 푸사리움 네군디(Fusarium negundi), 푸사리움 옥시스포룸(Fusarium oxysporum), 푸사리움 레티쿨라텀(Fusarium reticulatum), 푸사리움 로세움(Fusarium roseum), 푸사리움 삼부시눔(Fusarium sambucinum), 푸사리움 사르코크로움(Fusarium sarcochroum), 푸사리움 스포로트리키오이데스(Fusarium sporotrichioides), 푸사리움 술푸레움(Fusarium sulphureum), 푸사리움 토룰로숨(Fusarium torulosum), 푸사리움 트리코테시오이데스(Fusarium trichothecioides), 푸사리움 베네나텀(Fusarium venenaturn), 후미콜라 그리세아(Humicola grisea), 후미콜라 인솔렌스(Humicola insolens), 후미콜라 라누기노사(Humicola lanuginosa), 이르펙스 락테루스(Irpex lacteus), 무코르 미에헤이(Mucor miehei), 미셀리오프토라 써모필라(Myceliophthora thermophila), 뉴로스포라 크라사(Neurospora crassa), 페니실륨 푸니쿨로숨(Penicillium funiculosum), 페니실륨 푸르푸로게눔(Penicillium purpurogenum), 파네로캐테 크리소스포리움(Phanerochaete chrysosporium), 티엘라비아 아크로마티카(Thielavia achromatica), 티엘라비아 알보마이세스(Thielavia albomyces), 티엘라비아 알보필로사(Thielavia albopilosa), 티엘라비아 오스트랄레인시스(Thielavia australeinsis), 티엘라비아 피메티(Thielavia fimeti), 티엘라비아 마이크로스포라(Thielavia microspora), 티엘라비아 오비스포라(Thielavia ovispora), 티엘라비아 페루비아나(Thielavia peruviana), 티엘라비아 세토사(Thielavia setosa), 티엘라비아 스페데도니움(Thielavia spededonium), 티엘라비아 서브서모필라(Thielavia subthermophila), 티엘라비아 테레스트리스(Thielavia terrestris), 트리코더마 하르지아눔(Trichoderma harzianum), 트리코더마 코닌기이(Trichoderma koningii), 트리코더마 롱기브라키아툼(Trichoderma longibrachiatum), 트리코더마 레세이(Trichoderma reesei), 또는 트리코더마 비리드(Trichoderma viride)를 포함한다.

항생제

"항생제" 및 이 근원 용어의 변형은 하나 이상의 미생물 세포의 대사산물, 또는 성장을 사멸시키거나 정지시킬 수 있는 대사 경로의 중간체를 포함한, 본 개시내용의 관점에서 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 이해되는 바와 같은 그의 관습적이고 통상적인 의미를 갖는다. 일부 항생제는 미생물 세포, 예를 들어 박테리아에 의해 생산될 수 있다. 일부 항생제는 화학적으로 합성될 수 있다. 박테리오신은 항생제와 구별되는 것으로 이해되고, 적어도 박테리오신은 유전자 생산물 (이는, 일부 실시양태에서 추가적인 번역 후 처리를 겪는다) 또는 그의 합성 유사체를 지칭하며, 한편 항생제는 대사 경로의 중간체 또는 그의 합성 유사체를 지칭한다는 점에서 이해된다.

서열 동일성 및 유사성

서열 동일성은 본 개시내용의 관점에서 서열을 비교함으로써 결정되는 바와 같이, 2개 이상의 아미노산 (폴리펩티드 또는 단백질) 서열 또는 2개 이상의 핵산 (폴리뉴클레오티드) 서열 간의 관계를 포함한, 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 이해되는 바와 같은 그의 관습적이고 통상적인 의미를 갖는다. 대개 서열 동일성 또는 유사성은 비교된 서열의 전체 길이에 걸쳐 비교된다. 관련 기술분야에서, "동일성"은, 경우에 따라, 이러한 서열의 문자열(string) 사이의 일치에 의해 결정되는 바와 같이, 아미노산 또는 핵산 서열 사이의 서열 관련성의 정도를 지칭할 수 있다. 2개의 아미노산 서열 사이의 "유사성"은 하나의 폴리펩티드의 아미노산 서열 및 그의 보존된 아미노산 대체물을 제2 폴리펩티드의 서열과 비교함으로써 결정될 수 있다. "동일성"및 "유사성"은 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 공지된 다양한 방법에 의해 용이하게 계산될 수 있다. 일부 실시양태에서, 서열 동일성은 본원에서 확인된 바와 같이 서열의 전체 길이를 비교함으로써 결정된다.

동일성을 결정하는 일부 방법은 시험된 서열 사이에서 가장 큰 일치를 제공하도록 설계된다. 동일성과 유사성을 결정하는 방법은 공개적으로 이용 가능한 컴퓨터 프로그램에 체계화되어 있다. 두 서열 사이의 동일성 및 유사성을 결정하기 위한 컴퓨터 프로그램 방법은 예를 들어 NCBI 및 다른 공급원 (BLAST Manual, Altschul, S., et al., NCBI NLM NIH Bethesda, MD 20894)으로부터 공개적으로 입수할 수 있는, BestFit, BLASTP, BLASTN, 및 FASTA (Altschul, S. F. et al., J. Mol. Biol. 215:403-410 (1990)를 포함한다. 사용된 알고리즘은 EMBOSS일 수 있다 (www.ebi.ac.uk/emboss/align의 월드 와이드 웹 상에서 접근 가능). EMBOSS를 사용한 아미노산 서열 비교를 위한 파라미터는 갭 개방(gap open) 10.0, 갭 연장(gap extend) 0.5, 블로섬(Blosum) 62 매트릭스를 포함할 수 있다. EMBOSS를 사용한 핵산 서열 비교를 위한 파라미터는 갭 개방 10.0, 갭 연장 0.5, DNA 완전 매트릭스 (DNA 동일성 매트릭스)를 포함할 수 있다.

임의로, 아미노산 유사성의 정도를 결정할 때, 통상의 기술자는 통상의 기술자에게 명백한 바와 같이, 소위 "보존적" 아미노산 치환을 또한 고려할 수 있다. 보존적 아미노산 치환은 유사한 측쇄를 갖는 잔기의 상호교환성을 지칭한다. 예를 들어, 지방족 측쇄를 갖는 아미노산의 군은 글리신, 알라닌, 발린, 류신, 및 이소류신이고; 지방족-히드록실 측쇄를 갖는 아미노산의 군은 세린 및 트레오닌이고; 아미드-함유 측쇄를 갖는 아미노산의 군은 아스파라긴 및 글루타민이고; 방향족 측쇄를 갖는 아미노산의 군은 페닐알라닌, 티로신, 및 트립토판이고; 염기성 측쇄를 갖는 아미노산의 군은 리신, 아르기닌, 및 히스티딘이고; 황-함유 측쇄를 갖는 아미노산의 군은 시스테인 및 메티오닌이다. 적합한 보존적 아미노산 치환 군은 발린-류신-이소류신, 페닐알라닌-티로신, 리신-아르기닌, 알라닌-발린, 및 아스파라긴-글루타민을 포함한다. 본원에 개시된 아미노산 서열의 치환 변이체는 개시된 서열 중 하나 이상의 잔기가 제거되고 상이한 잔기가 그의 위치에 삽입된 것들이다. 일부 실시양태에서, 아미노산 변화는 보존적이다. 자연 발생 아미노산 각각에 대한 적합한 보존적 치환은 lys에서 Arg; Asn에서 gln 또는 his; Asp에서 glu; Cys에서 ser 또는 ala; Gln에서 asn; Glu에서 asp; Gly에서 pro; His에서 asn 또는 gln; Ile에서 leu 또는 val; Leu에서 ile 또는 val; Lys에서 arg; gln 또는 glu; Met에서 leu 또는 ile; Phe에서 met, leu 또는 tyr; Ser에서 thr; Thr에서 ser; Trp에서 tyr; Tyr에서 trp 또는 phe; 및, Val에서 ile 또는 leu를 포함한다.

상동성

용어 "상동성"은 주어진 (재조합) 핵산 또는 폴리펩티드 분자와 주어진 숙주 유기체 또는 숙주 세포 사이의 관계를 나타내기 위해 사용되는 경우, 본질적으로 핵산 또는 폴리펩티드 분자는 동일한 종, 임의로 동일한 변종 또는 균주의 숙주 세포 또는 유기체에 의해 생산됨을 의미하는 것으로 이해될 수 있음을 포함하여, 본 개시내용의 관점에서 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 이해되는 바와 같은 그의 관습적이고 통상적인 의미를 갖는다. 숙주 세포에 상동성인 경우, 폴리펩티드를 코딩하는 핵산 서열은 전형적으로 그의 자연 환경에서 보다 또 다른 프로모터 서열에 작동 가능하게 연결될 것이다. 2개의 핵산 서열의 관련성을 나타내는데 사용되는 경우, 용어 "상동성"은 본 개시내용의 관점에서 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 이해되는 바와 같은 그의 관습적이고 통상적인 의미를 가지며, 이는 상보적인 단일-가닥 핵산 서열에 혼성화할 수 있는 단일-가닥 핵산 서열을 지칭할 수 있다. 혼성화의 정도는 앞서 제시된 바와 같이 서열과 혼성화 조건, 예컨대 온도 및 염 농도와 같은 서열 사이의 동일성의 양을 포함한 다수의 인자에 의존할 수 있다. 동일성의 영역은 약 5 bp 초과일 수 있고, 동일성의 영역은 10 bp 초과일 수 있다. 일부 실시양태에서, 2개의 핵산 또는 폴리펩티드 서열은 이들이 80% 초과의 동일성을 가질 때 상동성이라고 한다.

이종기원

용어 "이종기원"은 핵산 (DNA 또는 RNA) 또는 단백질과 관련하여 사용되는 경우, 핵산 (DNA 또는 RNA)과 관련하여 사용되는 경우, 존재하는 유기체, 세포, 게놈 또는 DNA 또는 RNA 서열의 일부로서 자연적으로 발생하지 않거나, 또는 자연에서 발견되는 것과 상이한 게놈 또는 DNA 또는 RNA 서열에서의 세포 또는 위치 또는 위치들에서 발견되는 핵산 또는 단백질 (폴리펩티드 또는 효소라고도 함)을 지칭할 수 있는 것을 포함하여, 본 개시내용의 관점에서 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 이해되는 바와 같은 관습적이고 통상적인 의미를 갖는다. 이종기원 핵산 또는 단백질은 이것이 도입된 세포에 대해 내인성이 아니라, 또 다른 세포로부터 수득되거나 합성적으로 또는 재조합적으로 생산된다. 일반적으로, 반드시 그런 것은 아니지만, 이러한 핵산은 DNA가 전사되거나 발현되는 세포에 의해 정상적으로 생산되지 않는 단백질을 코딩한다. 유사하게 외인성 RNA는 외인성 RNA가 존재하는 세포에서 정상적으로 발현되지 않는 단백질을 코딩한다. 이종기원 핵산 및 단백질은 또한 외래 핵산 또는 단백질로 지칭될 수 있다. 관련 기술분야의 통상의 기술자가 이를 발현하는 세포에 대해 이종기원 또는 외래성(foreign)으로 인식할 수 있는 임의의 핵산 또는 단백질은 본원에서 용어 이종기원 핵산 또는 단백질에 의해 포함된다. 용어 이종기원은 또한 핵산 또는 아미노산 서열의 비천연 조합, 즉 조합된 서열 중 적어도 2개가 서로에 대해 외래성인 조합에 적용된다.

작동 가능하게 연결된

본원에 사용된 용어 "작동 가능하게 연결된"은 본 개시내용의 관점에서 통상의 기술자에 의해 이해되는 관습적이고 통상적인 의미를 가지며, 기능적 관계에서 폴리뉴클레오티드 요소 (또는 코딩 서열 또는 핵산 서열 또는 핵산 분자)의 연결을 지칭할 수 있다. 핵산 서열이 또 다른 핵산 서열과 기능적 관계에 놓여지는 경우 "작동 가능하게 연결"된다. 예를 들어, 프로모터 또는 인핸서는 그것이 코딩 서열의 전사에 영향을 미치는 경우 코딩 서열에 작동 가능하게 연결된다. 작동 가능하게 연결된다는 것은 연결되는 핵산 서열이 전형적으로 인접하며, 필요한 경우 두 개의 단백질 코딩 영역에 연결하기 위해 인접하며 판독 프레임에 있음을 의미한다.

프로모터

본원에 사용된 용어 "프로모터"는 본 개시내용의 관점에서 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 이해되는 바와 같은 관습적이고 통상적인 의미를 가지며, 핵산 분자의 전사 개시 부위의 전사 방향과 관련하여 상류에 위치하여, 하나 이상의 핵산의 전사를 제어하는 기능을 하며, DNA-의존적 RNA 폴리머라제, 전사 개시 부위, 및 전사 인자 결합 부위, 리프레서 및 활성화제 단백질 결합 부위를 포함하나 이에 제한되지 않는 임의의 다른 DNA 서열, 및 프로모터로부터 전사의 양을 조절/제어하기 위해 직접 또는 간접적으로 작용하는 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 공지된 뉴클레오티드의 임의의 다른 서열에 대한 결합 부위의 존재에 의해 구조적으로 확인되는 핵산 단편을 지칭할 수 있다. "구성적" 프로모터는 대부분의 환경 및 발달 조건 하에 활성인 프로모터이다. "유도성" 프로모터는 환경 또는 발달 규제하에 활성인 프로모터이다.

본 문서 및 그의 청구범위에서, 동사 "포함하다" 및 그의 활용형은 비제한적인 의미로 사용되어 단어 뒤의 항목이 포함되나, 특별히 언급되지 않은 항목은 제외되지 않음을 의미한다. 게다가, 동사 "이루어지다"는 "본질적으로 ~로 이루어지다"에 의해 대체될 수 있으며, 이는 본원에 정의된 바와 같은 자가-복제성 염색체외 핵산 분자, 미생물 숙주 (또는 방법)가 구체적으로 확인된 것보다 추가 성분(들) (또는 추가 단계) (상기 추가 성분(들) (또는 추가 단계)은 본 발명의 고유 한 특성을 변경하지 않는다)을 포함할 수 있음을 의미한다. 또한, 부정 관사 "한(a)"또는 "하나(an)"에 의한 요소에 대한 언급은 문맥이 하나 및 하나의 요소 만이 존재하여야 함을 분명히 요구하지 않는 한, 하나 초과의 요소가 존재할 가능성을 배제하지 않는다. 따라서 부정 관사 "한"또는 "하나"는 대개 "적어도 하나"를 의미한다.

본 명세서에 인용된 모든 특허 및 참고 문헌은 그 전문이 본원에 참조로 포함된다. 하기 실시예는 단지 예시의 목적으로 제공되며, 어떠한 방식으로든 본 발명의 범위를 제한하고자 하는 것이 아니다.

서열 목록 (달리 명시되지 않는 한 DNA)

서열번호 1 엔테로코커스 패칼리스 펩티드

서열번호 2 박테리오신의 모티프 특징

서열번호 3 혼성 박테리오신, Ent35-MccV

서열번호 4-698, 720-759: 표 1 내지 표 3의 서열 (표에 명시된 바와 같은 절반 DNA/절반 단백질)

서열번호 699 McbG

서열번호 700 MccE

서열번호 701 MccE의 C 말단부

서열번호 702 pSyn2-McbG

서열번호 703 pSyn2-McbE/F

서열번호 704 pMcbG1.0

서열번호 705 pMcbG.1.1.

서열번호 706 MccE의 C-말단 부분 (아미노산)

서열번호 707 P24 프로모터

서열번호 708 proC 프로모터

서열번호 709 Cvi

서열번호 710 proC-McbG-CterMccE(proc) (Cter가 C-말단에 의해 대체될 수 있을 것이다)

서열번호 711 proC-Cvi-Cter-MccE (proc) (Cter가 C-말단에 의해 대체될 수 있을 것이다)

서열번호 712 pBACT5.0

서열번호 713 pBACT2.0

서열번호 714 pBACT5.0-mcherry

서열번호 715 McbG-MccE

서열번호 716 McbG-Cter 부분 MccE (Cter가 C-말단에 의해 대체될 수 있을 것이다)

서열번호 717 Cvi-MccE

서열번호 718 Cvi-Cter 부분 MccE (Cter가 C-말단에 의해 대체될 수 있을 것이다)

서열번호 719: 벡터 pUC-ColV

도 1: 구축: pSyn2-McbE/F: Ptac 하에 유전자 McbE 및 F 함유.
도 2: 구축: pSyn2-McbG : Ptac 하에 유전자 McbG 함유.
도 3: 구축: pMcbG 1.1: P24 하에 유전자 McbG 함유.
도 4: 구축: pMcbG 1.0: P24 LacO 하에 유전자 McbG 함유.
도 5: pBACT5.0 벡터
도 6: pBACT2.0 벡터
도 7: pBACT5.0-mcherry 벡터
도 8: 프로모터 튜닝(tuning). 유도자(inductor)의 부재 하에 (상부), 리프레서는 작동유전자에 결합하여 선택 유전자의 발현을 방지할 수 있다. 유도자의 존재 하에 (하부), 리프레서는 작동유전자에 결합할 수 없어 선택 유전자가 발현하게 한다.
도 9: 이. 콜라이에서의 단백질 X의 과발현과 KanR (pKan-pLac) 그리고 마이크로신 C7 및 ColV에 대한 2 가지 면역 (pBACT6.0-pLac)의 비교. 5 mg의 총 추출물을 SDS-PAGE에서 분석하였다.
도 10: 이. 콜라이에서의 이오타-카라기나제 단백질의 과발현과 KanR (pKan-T7prom) 그리고 마이크로신 C7 및 ColV에 대한 2 가지 면역 (pBACT5.0-T7prom)의 비교. 5 mg의 총 추출물을 SDS-PAGE에서 분석하였다.
도 11: 이. 콜라이에서의 람다-카라기나제 단백질의 과발현과 KanR (pKan-T7prom) 그리고 마이크로신 C7 및 ColV에 대한 2 가지 면역 (pBACT5.0-T7prom)의 비교. 5 mg의 총 추출물을 SDS-PAGE에서 분석하였다.

실시예

실시예 1: 선택 작용제로서 박테리오신 B17 및 C7의 사용

1. 박테리오신 B17, C7 및 ColV의 생산

사용된 균주: C600: F^-　tonA21 thi-1 thr-1 leuB6 lacY1 glnV44 rfbC1 fhuA1 λ^-

문헌 [Appleyard　Genetics 39 (1954), 440-452]에 기재됨.

Mic B17 생산에 사용된 벡터는 하기 표에 설명되어 있다.

[표 X]

Mic B17 생산에 사용된 벡터

이들 구축물은 문헌 [Rodriguez-Sainz, M. C., C. et al .1990 . Mol. Microbiol.　 4:1921-1932]에 상세하게 기재되어 있다.

Mic C7 생산에 사용된 벡터는 Pp70이다. 이 벡터는 pBR322를 기반으로 하고 mcc 유전자 클러스터와 함께 ~6000 bp DNA 단편을 보유한다 (문헌 [Zukher I et al, Nucleic Acids Research, 2014, Vol. 42, No. 19　11891-11902]에 기재된 바와 같음).

ColV 생산에 사용된 벡터는 pUC-ColV (서열번호 719)이다. 이 벡터는 pUC57에 기초하고 ColV 유전자 클러스터와 함께 ~5000 bp DNA 단편을 보유한다.

이들 재조합 벡터를 보유하는 균주는 37℃에서 LB 배지에서 성장시켰다. 밤새 배양한 후, 발효 배지를 원심분리하고, 상청액을 0.2 미크론 필터 상에서 여과하였다.

상청액에 존재하는 박테리오신 활성은 민감한 균주를 함유하는 플레이트 상에서의 확산 억제 성장의 크기에 의해 추정되었다.

2. 결과

본 발명자들은 배양 배지에 첨가된 Amp, Kan 또는 Chlo와 같은 고전적인 항생제로서 B17, C7 또는 ColV 활성을 나타내는 상청액을 사용할 수 있음을 입증하였다. 이러한 박테리오신 활성을 나타내는 상청액을 -20℃에서 수개월 (적어도 12개월) 동안 보관하였고, 활성의 상당한 감소가 관찰되지 않았다. 이러한 박테리오신 활성을 가진 배지를 함유하는 페트리 플레이트를 +4℃에서 수주 (적어도 4주) 동안 보관하였다. 활성의 감소가 관찰되지 않았다. 따라서 본 발명자들은 배양 배지에 존재하는 바와 같은 이러한 B17, C7 또는 ColV 활성이 안정적임을 입증하였다.

3. 결론

실험실에서 발효에 의해 생산된 박테리오신 B17, C7 및 ColV는 배양 배지에서 생산하기 간단하고, 사용하기 쉽고, 안정한 선택 작용제이다. 이들 특성은 고전적인 선택 작용제로서 사용되는 항생제의 특성과 유사하다.

실시예 2: C7 및 B17에 내성을 부여하기 위해 필요한 최소 유전자적 요소의 확인

1. 필요한 벡터의 구축

문헌은 B17 박테리오신: 서열번호 699로 표시되는, B17의 경우 McbG 및 pumps (서열번호 703으로 표시되는, B17의 경우 McbE 및 McbF)의 경우에도, 자체 박테리오신의 생산에 대해 숙주의 생산에 필요한 요소를 결정하는 것을 가능하게 하였다. 이들 유전자는 필요한 것으로 공지되어 있다 (또는 박테리오신 B17의 작용에 대한 보호에 보다 정확하게 관여한다). B17 유전자자리에 대한 문헌은 어느 것이 내성을 제공하기에 충분한 요소인지를 특정하지 않는다.

본 발명자들은 B17 면역 구조로부터 유전자를 분리하고 이들을 유도성 프로모터 (Ptac) 뒤에 벡터에 복제하였다.

구축: pSyn2-McbG (도 2, 서열번호 702): Ptac하에 유전자 McbG 함유

구축: pSyn2-McbE/F (도 1, 서열번호 703): Ptac하에 유전자 McbE 및 F 함유

본 발명자들은 B17 면역 구조로부터 유전자를 분리하고 그들을 유도성 프로모터 (Ptac) 뒤에 벡터에 복제하였다.

본 발명자들은 낮은 McbG 발현 (Ptac는 유도되지 않음)이 균주에 대한 내성의 표현형을 제공하기에 충분하며 다른 한편으로는 McbE / F의 존재는 독성이 있으며 B17의 존재와 관련하여 제공된 보호에 대한 반응을 제공할 수 있게 하지 않았음을 보여 주었다.

2. 결과

놀랍게도, 서열번호 701로 표시되는 MccE의 C-말단 부분은 박테리오신 C7에 대한 내성을 부여하기에 충분하다는 것이 밝혀졌다.

본 발명자들은 McbG 및 MccE 유전자의 플라스미드 (또는 서열번호 701로 표시되는 말단절단된 MccE)로부터의 발현이 벡터로 복제될 때 각각 B17 및 C7에 내성을 제공할 수 있고 이들 단백질이 이들 마이크로신/박테리오신에 민감한 균주에서 벡터 선택 마커로서 사용될 수 있음을 입증하였다. 사용된 벡터는 pBACT2.0이다 (도 6, 서열번호 713).

서열번호 710은 구축물 proC-McbG-CterMccE를 나타낸다

본 발명자들은 MccE 유전자의 Cvi 및 C-말단 부분의 플라스미드로부터의 발현이 벡터로 복제될 때 각각 ColV 및 C7에 내성을 제공할 수 있고 이들 단백질이 이들 마이크로신/박테리오신에 민감한 균주에서 벡터 선택 마커로서 사용될 수 있음을 입증하였다. 사용된 벡터는 pBACT5.0이다 (도 5, 서열번호 712).

서열번호 711은 구축물 proC- Cvi-CterMccE를 나타낸다

3. 결론

따라서, C7에 대한 선택 마커로서 서열번호 701로 표시되는 작은 크기의 단일 세그먼트를 사용할 수 있다.

실시예 3: McbG로부터의 박테리아로부터 에너지를 거의 또는 전혀 사용하지 않고 선택 가능한 마커를 생산할 수 있을까?

1. 구축된 벡터

이 질문에 답하기 위해, McbG 유전자는 약한 프로모터 P24 (서열번호 707) 하에 복제하였다. P24 프로모터는 문헌 [Braatsch S et al, Biotechniques.　2008 Sep;45(3):335-7]에 기재되어 있다.

본 발명자들은 B17 McbG 면역 구조 유전자를 삽입하고 상기 유정자를 약한 구성적 프로모터 (P24) 뒤에 벡터에 복제하였다. lacI의 존재 하에 억제되고 IPTG의 존재 하에 활성인 유도성 프로모터인 P24 LacO 혼성 프로모터를 사용하여 제2 구축물을 생산하였다.

구축: P24 LacO 하에 유전자 McbG를 함유하는 pMcbG 1.0 (도 4, 서열번호 704).

구축: P24 하에 유전자 McbG를 함유하는 pMcbG 1.1 (도 3, 서열번호 705):

사용된 균주는 다음과 같다:

BL21(DE3):　fhuA2 [lon] ompT gal ( λ DE3) [dcm] Δ hsdS

λ DE3 = λ sBamHIo Δ EcoRI-B int::(lacI::PlacUV5::T7　gene1) i21 Δ nin5

BL21(DE3) 균주는 벡터 pMcbG1.0 또는 pMcbG1.1으로 형질전환되었다 (도 3 또는 도 4 참조). 형질전환 후, 형질전환체를 B17을 함유하는 플레이트 상에서 선택하였다. 단리된 콜로니를 재성장시키고, 이들이 함유한 플라스미드를 관련 제한 효소로 처리한 후 겔 전기영동에 의해 분석하였다.

2. 결과

본 발명자들은 McbG의 약한 전사가 B17에 대한 내성을 제공하기에 충분함을보여 주었다. 게다가, 본 발명자들은 이 선택 마커가 P24 LacO 프로모터를 통해 유도될 수 있고 이 유전자를 함유하는 벡터가 IPTG의 존재 하에만 내성의 표현형을 제공함을 보여 주었다.

3. 결론

구성적으로 또는 유도적으로 선택 가능한 마커로서 McbG 유전자를 사용할 수 있다. 따라서, 공정 동안 필요에 따라 낮은 수준의 구성적 발현 및 유도성 발현은 생산 세포로부터 플라스미드의 손실 없이 생산 세포에 대한 에너지 부담을 감소시킬 수 있음을 보여준다.

실시예 4: m-cherry 단백질의 생산

서열번호 714는 m-cherry 단백질을 생산하기 위해 사용된 구축물을 나타낸다. 이 구축물은 도 7에 도시되어 있다.

m-cherry 단백질은 생산되고 IPTG의 존재 하에 페트리 접시 상에서 박테리아 콜로니가 적색으로 변함에 따라 가시화되었다.

실시예 5: 프로모터 튜닝

본 발명자들은 조정 가능한 면역 선택을 가진 벡터를 제조하였다 (도 8 참조). 프로모터를 튜닝하면 선택을 "온(on)" 또는 "오프(off)"로 전환할 수 있다. 처음으로, 이것은 예를 들어 재조합 플라스미드의 숙주에 의한 손실에 따라, 발효 공정 동안 필요에 따라 선택적 압력을 적합화할 수 있게 한다. 이것은 숙주에 대한 에너지 부담을 제한함으로써 이점을 제공할 것이다. 따라서, 이러한 벡터는 산업상 결과 (재조합 생산물)를 개선시킨다. 더욱이, 이들은 임의의 균주에서 사용하기 쉽고 (숙주 게놈에서의 특수한 기능이 필요하지 않음) 항생제가 필요하지 않다.

실시예 6: 항생제 (카나마이신) 선택과 면역 선택의 비교

본 발명자들은 상이한 재조합 단백질에 면역 선택을 적용하였다.

도 9는 이. 콜라이에서의 단백질 X의 과발현과 KanR (pKan-pLac) 그리고 마이크로신 C7 및 ColV에 대한 2 가지 면역 (pBACT6.0-pLac)의 비교를 나타낸다. 5 mg의 총 추출물을 SDS-PAGE에서 분석하였다.

도 10은 이. 콜라이에서의 이오타-카라기나제 단백질의 과발현과 KanR (pKan-T7prom) 그리고 마이크로신 C7 및 ColV에 대한 2 가지 면역 (pBACT5.0-T7prom)의 비교를 나타낸다. 5 mg의 총 추출물을 SDS-PAGE에서 분석하였다. 사용된 벡터는 pBACT5.0 벡터 (서열번호 712)를 기반으로 한다.

도 11은 이. 콜라이에서의 람다-카라기나제 단백질의 과발현과 KanR (pKan-T7prom) 그리고 마이크로신 C7 및 ColV에 대한 2 가지 면역 (pBACT5.0-T7prom)의 비교를 나타낸다. 5 mg의 총 추출물을 SDS-PAGE에서 분석하였다. 사용된 벡터는 pBACT5.0 벡터 (서열번호 712)를 기반으로 한다.

이 실시예에서 사용된 약한 구성적 proC 프로모터는 숙주에 대한 에너지 부담을 감소시킨다.

SEQUENCE LISTING <110> SYNGULON S.A. UNIVERSITE LIBRE DE BRUXELLES <120> FERMENTATION PROCESS <130> IPA200755-NL <150> EP 17208600.1 <151> 2017-12-19 <160> 759 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 40 <212> PRT <213> Enterococcus faecalis <400> 1 Trp Leu Pro Pro Ala Gly Leu Leu Gly Arg Cys Gly Arg Trp Phe Arg 1 5 10 15 Pro Trp Leu Leu Trp Leu Gln Ser Gly Ala Gln Tyr Lys Trp Leu Gly 20 25 30 Asn Leu Phe Gly Leu Gly Pro Lys 35 40 <210> 2 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> N-terminal motif of class terminal IIa <220> <221> VARIANT <222> (3)..(3) <223> Xaa = any amino acid <400> 2 Tyr Gly Xaa Gly Val 1 5 <210> 3 <211> 135 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Hybrid bacteriocin Ent35-MccV <400> 3 Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys Asn Lys Lys Gly Cys Ser 1 5 10 15 Val Asp Trp Gly Arg Ala Ile Gly Ile Ile Gly Asn Asn Ser Ala Ala 20 25 30 Asn Leu Ala Thr Gly Gly Ala Ala Gly Trp Lys Ser Gly Gly Gly Ala 35 40 45 Ser Gly Arg Asp Ile Ala Met Ala Ile Gly Thr Leu Ser Gly Gln Phe 50 55 60 Val Ala Gly Gly Ile Gly Ala Ala Ala Gly Gly Val Ala Gly Gly Ala 65 70 75 80 Ile Tyr Asp Tyr Ala Ser Thr His Lys Pro Asn Pro Ala Met Ser Pro 85 90 95 Ser Gly Leu Gly Gly Thr Ile Lys Gln Lys Pro Glu Gly Ile Pro Ser 100 105 110 Glu Ala Trp Asn Tyr Ala Ala Gly Arg Leu Cys Asn Trp Ser Pro Asn 115 120 125 Asn Leu Ser Asp Val Cys Leu 130 135 <210> 4 <211> 46 <212> PRT <213> Lactobacillus acidophilus <400> 4 Met Ile Ser Ser His Gln Lys Thr Leu Thr Asp Lys Glu Leu Ala Leu 1 5 10 15 Ile Ser Gly Gly Lys Thr His Tyr Pro Thr Asn Ala Trp Lys Ser Leu 20 25 30 Trp Lys Gly Phe Trp Glu Ser Leu Arg Tyr Thr Asp Gly Phe 35 40 45 <210> 5 <211> 141 <212> DNA <213> Lactobacillus acidophilus <400> 5 atgatttcat ctcatcaaaa aacgttaact gataaagaat tagcattaat ttctgggggg 60 aaaacgcact acccgactaa tgcatggaaa agtctttgga aaggtttctg ggaaagcctt 120 cgttatactg acggttttta g 141 <210> 6 <211> 81 <212> PRT <213> Lactobacillus acidophilus <400> 6 Met Ile Ser Met Ile Ser Ser His Gln Lys Thr Leu Thr Asp Lys Glu 1 5 10 15 Leu Ala Leu Ile Ser Gly Gly Lys Thr Tyr Tyr Gly Thr Asn Gly Val 20 25 30 His Cys Thr Lys Lys Ser Leu Trp Gly Lys Val Arg Leu Lys Asn Val 35 40 45 Ile Pro Gly Thr Leu Cys Arg Lys Gln Ser Leu Pro Ile Lys Gln Asp 50 55 60 Leu Lys Ile Leu Leu Gly Trp Ala Thr Gly Ala Phe Gly Lys Thr Phe 65 70 75 80 His <210> 7 <211> 246 <212> DNA <213> Lactobacillus acidophilus <400> 7 atgatttcaa tgatttcatc tcatcaaaaa acgttaactg ataaagaatt agcattaatt 60 tctgggggga aaacgtacta tggtactaat ggtgtgcatt gtactaaaaa gagtctttgg 120 ggtaaagtac gcttaaaaaa cgtgattcct ggaactcttt gtcgtaagca atcgttgccg 180 atcaaacagg atttaaaaat tttactgggc tgggctacag gtgcttttgg caagacattt 240 cattaa 246 <210> 8 <211> 60 <212> PRT <213> Lactobacillus acidophilus <400> 8 Met Asp Lys Lys Thr Lys Ile Leu Phe Glu Val Leu Tyr Ile Ile Cys 1 5 10 15 Ile Ile Gly Pro Gln Phe Ile Leu Phe Val Thr Ala Lys Asn Asn Met 20 25 30 Tyr Gln Leu Val Gly Ser Phe Val Gly Ile Val Trp Phe Ser Tyr Ile 35 40 45 Phe Trp Tyr Ile Phe Phe Lys Gln His Lys Lys Met 50 55 60 <210> 9 <211> 183 <212> DNA <213> Lactobacillus acidophilus <400> 9 atggataaga aaacaaaaat attatttgaa gtattataca tcatctgtat aataggccct 60 caatttatat tatttgtgac tgcaaaaaac aatatgtatc agttggtggg ttcgtttgtt 120 ggaatagtat ggttttcgta tattttttgg tatatttttt tcaaacaaca taaaaaaatg 180 tag 183 <210> 10 <211> 65 <212> PRT <213> Lactobacillus gasseri <400> 10 Met Ala Leu Lys Thr Leu Glu Lys His Glu Leu Arg Asn Val Met Gly 1 5 10 15 Gly Asn Lys Trp Gly Asn Ala Val Ile Gly Ala Ala Thr Gly Ala Thr 20 25 30 Arg Gly Val Ser Trp Cys Arg Gly Phe Gly Pro Trp Gly Met Thr Ala 35 40 45 Cys Ala Leu Gly Gly Ala Ala Ile Gly Gly Tyr Leu Gly Tyr Lys Ser 50 55 60 Asn 65 <210> 11 <211> 198 <212> DNA <213> Lactobacillus gasseri <400> 11 atggctttaa aaacattaga aaaacatgaa ttaagaaatg taatgggtgg aaacaagtgg 60 gggaatgctg taataggagc tgctacggga gctactcgcg gagtaagttg gtgcagagga 120 ttcggaccat ggggaatgac tgcctgtgcg ttaggaggtg ctgcaattgg aggatatctg 180 ggatataaga gtaattaa 198 <210> 12 <211> 51 <212> PRT <213> Staphylococcus aureus <400> 12 Met Ser Trp Leu Asn Phe Leu Lys Tyr Ile Ala Lys Tyr Gly Lys Lys 1 5 10 15 Ala Val Ser Ala Ala Trp Lys Tyr Lys Gly Lys Val Leu Glu Trp Leu 20 25 30 Asn Val Gly Pro Thr Leu Glu Trp Val Trp Gln Lys Leu Lys Lys Ile 35 40 45 Ala Gly Leu 50 <210> 13 <211> 156 <212> DNA <213> Staphylococcus aureus <400> 13 atgagttggt taaatttttt aaaatacatc gctaaatatg gcaaaaaagc ggtatctgct 60 gcttggaagt acaaaggtaa agtattagaa tggcttaatg ttggtcctac tcttgaatgg 120 gtatggcaaa aattaaagaa aattgctgga ttataa 156 <210> 14 <211> 61 <212> PRT <213> Enterococcus avium <400> 14 Met Thr Arg Ser Lys Lys Leu Asn Leu Arg Glu Met Lys Asn Val Val 1 5 10 15 Gly Gly Thr Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys Asn Lys Lys Gly Cys 20 25 30 Ser Val Asp Trp Gly Lys Ala Ile Ser Ile Ile Gly Asn Asn Ser Ala 35 40 45 Ala Asn Leu Ala Thr Gly Gly Ala Ala Gly Trp Lys Ser 50 55 60 <210> 15 <211> 186 <212> DNA <213> Enterococcus avium <400> 15 atgacaagat caaaaaaatt aaatttacgc gaaatgaaga atgttgttgg tggtacctac 60 tatggaaatg gtgtatcttg taacaagaaa ggctgttcag ttgactgggg caaagccatc 120 agtattatag gaaataattc cgcagcaaac ttagcaactg gtggtgctgc tggttggaag 180 tcataa 186 <210> 16 <211> 67 <212> PRT <213> Enterococcus faecalis <400> 16 Met Lys Lys Lys Leu Val Ile Cys Gly Ile Ile Gly Ile Gly Phe Thr 1 5 10 15 Ala Leu Gly Thr Asn Val Glu Ala Ala Thr Tyr Tyr Gly Asn Gly Leu 20 25 30 Tyr Cys Asn Lys Gln Lys Cys Trp Val Asp Trp Asn Lys Ala Ser Arg 35 40 45 Glu Ile Gly Lys Ile Ile Val Asn Gly Trp Val Gln His Gly Pro Trp 50 55 60 Ala Pro Arg 65 <210> 17 <211> 204 <212> DNA <213> Enterococcus faecalis <400> 17 atgaaaaaga aattagttat ttgtggcatt attgggattg gttttacagc attaggaaca 60 aatgtagaag ctgctacgta ttacggaaat ggtttatatt gtaataagca aaaatgttgg 120 gtagactgga ataaagcttc aagggaaatt ggaaaaatta ttgttaatgg ttgggtacaa 180 catggccctt gggctcctag atag 204 <210> 18 <211> 51 <212> PRT <213> Lactococcus lactis <400> 18 Met Lys Glu Gln Asn Ser Phe Asn Leu Leu Gln Glu Val Thr Glu Ser 1 5 10 15 Glu Leu Asp Leu Ile Leu Gly Ala Lys Gly Gly Ser Gly Val Ile His 20 25 30 Thr Ile Ser His Glu Val Ile Tyr Asn Ser Trp Asn Phe Val Phe Thr 35 40 45 Cys Cys Ser 50 <210> 19 <211> 156 <212> DNA <213> Lactococcus lactis <400> 19 atgaaagaac aaaactcttt taatcttctt caagaagtga cagaaagtga attggacctt 60 attttaggtg caaaaggcgg cagtggagtt attcatacaa tttctcatga agtaatatat 120 aatagctgga actttgtatt tacttgctgc tcttaa 156 <210> 20 <211> 74 <212> PRT <213> Enterococcus faecium <400> 20 Met Lys Lys Lys Val Leu Lys His Cys Val Ile Leu Gly Ile Leu Gly 1 5 10 15 Thr Cys Leu Ala Gly Ile Gly Thr Gly Ile Lys Val Asp Ala Ala Thr 20 25 30 Tyr Tyr Gly Asn Gly Leu Tyr Cys Asn Lys Glu Lys Cys Trp Val Asp 35 40 45 Trp Asn Gln Ala Lys Gly Glu Ile Gly Lys Ile Ile Val Asn Gly Trp 50 55 60 Val Asn His Gly Pro Trp Ala Pro Arg Arg 65 70 <210> 21 <211> 225 <212> DNA <213> Enterococcus faecium <400> 21 atgaaaaaga aagtattaaa acattgtgtt attctaggaa tattaggaac ttgtctagct 60 ggcatcggta caggaataaa agttgatgca gctacttact atggaaatgg tctttattgt 120 aacaaagaaa aatgttgggt agattggaat caagctaaag gagaaattgg aaaaattatt 180 gttaatggtt gggttaatca tggtccatgg gcacctagaa ggtag 225 <210> 22 <211> 50 <212> PRT <213> Clostridium botulinum <400> 22 Met Gln Lys Pro Glu Ile Ile Ser Ala Asp Leu Gly Leu Cys Ala Val 1 5 10 15 Asn Glu Phe Val Ala Leu Ala Ala Ile Pro Gly Gly Ala Ala Thr Phe 20 25 30 Ala Val Cys Gln Met Pro Asn Leu Asp Glu Ile Val Ser Asn Ala Ala 35 40 45 Tyr Val 50 <210> 23 <211> 153 <212> DNA <213> Clostridium botulinum <400> 23 atgcaaaaac cagaaattat tagtgctgat ttagggcttt gtgcagttaa tgaatttgta 60 gctcttgctg ccattcctgg tggtgctgct acatttgcag tatgccaaat gccaaacttg 120 gatgagattg ttagtaatgc agcatatgtt taa 153 <210> 24 <211> 58 <212> PRT <213> Streptococcus equinus <400> 24 Met Met Asn Ala Thr Glu Asn Gln Ile Phe Val Glu Thr Val Ser Asp 1 5 10 15 Gln Glu Leu Glu Met Leu Ile Gly Gly Ala Asp Arg Gly Trp Ile Lys 20 25 30 Thr Leu Thr Lys Asp Cys Pro Asn Val Ile Ser Ser Ile Cys Ala Gly 35 40 45 Thr Ile Ile Thr Ala Cys Lys Asn Cys Ala 50 55 <210> 25 <211> 177 <212> DNA <213> Streptococcus equinus <400> 25 atgatgaatg ctactgaaaa ccaaattttt gttgagactg tgagtgacca agaattagaa 60 atgttaattg gtggtgcaga tcgtggatgg attaagactt taacaaaaga ttgtccaaat 120 gtaatttctt caatttgtgc aggtacaatt attacagctt gtaaaaattg tgcttaa 177 <210> 26 <211> 77 <212> PRT <213> Brochothrix campestris <400> 26 Met His Lys Val Lys Lys Leu Asn Asn Gln Glu Leu Gln Gln Ile Val 1 5 10 15 Gly Gly Tyr Ser Ser Lys Asp Cys Leu Lys Asp Ile Gly Lys Gly Ile 20 25 30 Gly Ala Gly Thr Val Ala Gly Ala Ala Gly Gly Gly Leu Ala Ala Gly 35 40 45 Leu Gly Ala Ile Pro Gly Ala Phe Val Gly Ala His Phe Gly Val Ile 50 55 60 Gly Gly Ser Ala Ala Cys Ile Gly Gly Leu Leu Gly Asn 65 70 75 <210> 27 <211> 234 <212> DNA <213> Brochothrix campestris <400> 27 atgcacaagg taaaaaaatt aaacaatcaa gagttacaac agatcgtggg aggttacagt 60 tcaaaagatt gtctaaaaga tattggtaaa ggaattggtg ctggtacagt agctggggca 120 gccggcggtg gcctagctgc aggattaggt gctatcccag gagcattcgt tggagcacat 180 tttggagtaa tcggcggatc tgccgcatgc attggtggat tattaggtaa ctag 234 <210> 28 <211> 80 <212> PRT <213> Butyrivibrio fibrisolvens <400> 28 Met Ser Lys Lys Gln Ile Met Ser Asn Cys Ile Ser Ile Ala Leu Leu 1 5 10 15 Ile Ala Leu Ile Pro Asn Ile Tyr Phe Ile Ala Asp Lys Met Gly Ile 20 25 30 Gln Leu Ala Pro Ala Trp Tyr Gln Asp Ile Val Asn Trp Val Ser Ala 35 40 45 Gly Gly Thr Leu Thr Thr Gly Phe Ala Ile Ile Val Gly Val Thr Val 50 55 60 Pro Ala Trp Ile Ala Glu Ala Ala Ala Ala Phe Gly Ile Ala Ser Ala 65 70 75 80 <210> 29 <211> 243 <212> DNA <213> Butyrivibrio fibrisolvens <400> 29 atgagtaaaa aacaaattat gagtaactgt atatcaattg cattattaat agcactaatt 60 cctaatatct attttattgc agataaaatg ggaattcagt tagcacctgc ttggtatcaa 120 gatattgtga attgggtatc tgctggtgga acacttacta ctggttttgc gattattgta 180 ggagttacag taccggcatg gatagcagaa gcagctgcag cttttggtat agcttcagca 240 tga 243 <210> 30 <211> 48 <212> PRT <213> Butyrivibrio fibrisolvens <400> 30 Met Asn Lys Glu Leu Asn Ala Leu Thr Asn Pro Ile Asp Glu Lys Glu 1 5 10 15 Leu Glu Gln Ile Leu Gly Gly Gly Asn Gly Val Ile Lys Thr Ile Ser 20 25 30 His Glu Cys His Met Asn Thr Trp Gln Phe Ile Phe Thr Cys Cys Ser 35 40 45 <210> 31 <211> 147 <212> DNA <213> Butyrivibrio fibrisolvens <400> 31 atgaacaaag aacttaatgc acttacaaat cctattgacg agaaggagct tgagcagatc 60 ctcggtggtg gcaatggtgt catcaagaca atcagccacg agtgccacat gaacacatgg 120 cagttcattt tcacatgttg ctcttaa 147 <210> 32 <211> 66 <212> PRT <213> Carnobacterium maltaromaticum <400> 32 Met Asn Ser Val Lys Glu Leu Asn Val Lys Glu Met Lys Gln Leu His 1 5 10 15 Gly Gly Val Asn Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys Ser Lys Thr Lys Cys 20 25 30 Ser Val Asn Trp Gly Gln Ala Phe Gln Glu Arg Tyr Thr Ala Gly Ile 35 40 45 Asn Ser Phe Val Ser Gly Val Ala Ser Gly Ala Gly Ser Ile Gly Arg 50 55 60 Arg Pro 65 <210> 33 <211> 201 <212> DNA <213> Carnobacterium maltaromaticum <400> 33 atgaatagcg taaaagaatt aaacgtgaaa gaaatgaaac aattacacgg tggagtaaat 60 tatggtaatg gtgtttcttg cagtaaaaca aaatgttcag ttaactgggg acaagccttt 120 caagaaagat acacagctgg aattaactca tttgtaagtg gagtcgcttc tggggcagga 180 tccattggta ggagaccgta a 201 <210> 34 <211> 61 <212> PRT <213> Carnobacterium maltaromaticum <400> 34 Met Lys Ser Val Lys Glu Leu Asn Lys Lys Glu Met Gln Gln Ile Asn 1 5 10 15 Gly Gly Ala Ile Ser Tyr Gly Asn Gly Val Tyr Cys Asn Lys Glu Lys 20 25 30 Cys Trp Val Asn Lys Ala Glu Asn Lys Gln Ala Ile Thr Gly Ile Val 35 40 45 Ile Gly Gly Trp Ala Ser Ser Leu Ala Gly Met Gly His 50 55 60 <210> 35 <211> 186 <212> DNA <213> Carnobacterium maltaromaticum <400> 35 atgaaaagcg ttaaagaact aaataaaaaa gaaatgcaac aaattaatgg tggagctatc 60 tcttatggca atggtgttta ttgtaacaaa gagaaatgtt gggtaaacaa ggcagaaaac 120 aaacaagcta ttactggaat agttatcggt ggatgggctt ctagtttagc aggaatggga 180 cattaa 186 <210> 36 <211> 71 <212> PRT <213> Carnobacterium maltaromaticum <400> 36 Met Asn Asn Val Lys Glu Leu Ser Ile Lys Glu Met Gln Gln Val Thr 1 5 10 15 Gly Gly Asp Gln Met Ser Asp Gly Val Asn Tyr Gly Lys Gly Ser Ser 20 25 30 Leu Ser Lys Gly Gly Ala Lys Cys Gly Leu Gly Ile Val Gly Gly Leu 35 40 45 Ala Thr Ile Pro Ser Gly Pro Leu Gly Trp Leu Ala Gly Ala Ala Gly 50 55 60 Val Ile Asn Ser Cys Met Lys 65 70 <210> 37 <211> 216 <212> DNA <213> Carnobacterium maltaromaticum <400> 37 atgaataatg taaaagagtt aagtattaaa gaaatgcaac aagttactgg tggagaccaa 60 atgtcagatg gtgtaaatta tggaaaaggc tctagcttat caaaaggtgg tgccaaatgt 120 ggtttaggga tcgtcggcgg attagctact atcccttcag gtcctttagg ctggttagcc 180 ggagcagcag gtgtaattaa tagctgtatg aaataa 216 <210> 38 <211> 64 <212> PRT <213> Carnobacterium maltaromaticum <400> 38 Met Leu Tyr Glu Leu Val Ala Tyr Gly Ile Ala Gln Gly Thr Ala Glu 1 5 10 15 Lys Val Val Ser Leu Ile Asn Ala Gly Leu Thr Val Gly Ser Ile Ile 20 25 30 Ser Ile Leu Gly Gly Val Thr Val Gly Leu Ser Gly Val Phe Thr Ala 35 40 45 Val Lys Ala Ala Ile Ala Lys Gln Gly Ile Lys Lys Ala Ile Gln Leu 50 55 60 <210> 39 <211> 195 <212> DNA <213> Carnobacterium maltaromaticum <400> 39 atgttatatg aattagttgc atatggtatc gcacaaggta cagctgaaaa ggttgtaagt 60 ctaattaacg caggtttaac agtagggtct attatttcaa ttttgggtgg ggtcacagtc 120 ggtttatcag gtgtcttcac agcagttaaa gcagcaattg ctaaacaagg aataaaaaaa 180 gcaattcaat tataa 195 <210> 40 <211> 836 <212> PRT <213> Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum <400> 40 Met Ile Lys Tyr Arg Leu Tyr Ala Pro Asn Asp Gly Asp Thr Met Thr 1 5 10 15 Val Ser Gly Gly Gly Gly Trp Val Ser Asn Asp Asp Arg Lys Gly Gly 20 25 30 Asn Asp Arg Asp Asn Gly Lys Gly Gly Ser Ala Val Asp Phe Ser Lys 35 40 45 Asn Pro Glu Lys Gln Ala Ile Val Asn Pro Tyr Leu Ala Ile Ala Ile 50 55 60 Pro Met Pro Val Tyr Pro Leu Tyr Gly Lys Leu Gly Phe Thr Ile Asn 65 70 75 80 Thr Thr Ala Ile Glu Thr Glu Leu Ala Asn Val Arg Ala Ala Ile Asn 85 90 95 Thr Lys Leu Ala Thr Leu Ser Ala Val Ile Gly Arg Ser Leu Pro Val 100 105 110 Val Gly Arg Val Phe Gly Val Thr Ala Ala Gly Met Trp Pro Ser Ser 115 120 125 Thr Ala Pro Ser Ser Leu Asp Ser Ile Tyr Asn Gln Ala His Gln Gln 130 135 140 Ala Leu Ala Gln Leu Ala Ala Gln Gln Gly Val Leu Asn Lys Gly Tyr 145 150 155 160 Asn Val Thr Ala Met Pro Ala Gly Phe Val Ser Ser Leu Pro Val Ser 165 170 175 Glu Ile Lys Ser Leu Pro Thr Ala Pro Ala Ser Leu Leu Ala Gln Ser 180 185 190 Val Ile Asn Thr Glu Leu Ser Gln Arg Gln Leu Ala Leu Thr Gln Pro 195 200 205 Thr Thr Asn Ala Pro Val Ala Asn Ile Pro Val Val Lys Ala Glu Lys 210 215 220 Thr Ala Met Pro Gly Val Tyr Ser Ala Lys Ile Ile Ala Gly Glu Pro 225 230 235 240 Ala Phe Gln Ile Lys Val Asp Asn Thr Lys Pro Ala Leu Ala Gln Asn 245 250 255 Pro Pro Lys Val Lys Asp Asp Ile Gln Val Ser Ser Phe Leu Ser Ser 260 265 270 Pro Val Ala Asp Thr His His Ala Phe Ile Asp Phe Gly Ser Asp His 275 280 285 Glu Pro Val Tyr Val Ser Leu Ser Lys Ile Val Thr Ala Glu Glu Glu 290 295 300 Lys Lys Gln Val Glu Glu Ala Lys Arg Arg Glu Gln Glu Trp Leu Leu 305 310 315 320 Arg His Pro Ile Thr Ala Ala Glu Arg Lys Leu Thr Glu Ile Arg Gln 325 330 335 Val Ile Ser Phe Ala Gln Gln Leu Lys Glu Ser Ser Val Ala Thr Ile 340 345 350 Ser Glu Lys Thr Lys Thr Val Ala Val Tyr Gln Glu Gln Val Asn Thr 355 360 365 Ala Ala Lys Asn Arg Asp Asn Phe Tyr Asn Gln Asn Arg Gly Leu Leu 370 375 380 Ser Ala Gly Ile Thr Gly Gly Pro Gly Tyr Pro Ile Tyr Leu Ala Leu 385 390 395 400 Trp Gln Thr Met Asn Asn Phe His Gln Ala Tyr Phe Arg Ala Asn Asn 405 410 415 Ala Leu Glu Gln Glu Ser His Val Leu Asn Leu Ala Arg Ser Asp Leu 420 425 430 Ala Lys Ala Glu Gln Leu Leu Ala Glu Asn Asn Arg Leu Gln Val Glu 435 440 445 Thr Glu Arg Thr Leu Ala Glu Glu Lys Glu Ile Lys Arg Asn Arg Val 450 455 460 Asn Val Ser Thr Phe Gly Thr Val Gln Thr Gln Leu Ser Lys Leu Leu 465 470 475 480 Ser Asp Phe Tyr Ala Val Thr Ser Leu Ser Gln Ser Val Pro Ser Gly 485 490 495 Ala Leu Ala Ser Phe Ser Tyr Asn Pro Gln Gly Met Ile Gly Ser Gly 500 505 510 Lys Ile Val Gly Lys Asp Val Asp Val Leu Phe Ser Ile Pro Val Lys 515 520 525 Asp Ile Pro Gly Tyr Lys Ser Pro Ile Asn Leu Asp Asp Leu Ala Lys 530 535 540 Lys Asn Gly Ser Leu Asp Leu Pro Ile Arg Leu Ala Phe Ser Asp Glu 545 550 555 560 Asn Gly Glu Arg Val Leu Arg Ala Phe Lys Ala Asp Ser Leu Arg Ile 565 570 575 Pro Ser Ser Val Arg Gly Val Ala Gly Ser Tyr Asp Lys Asn Thr Gly 580 585 590 Ile Phe Ser Ala Glu Ile Asp Gly Val Ser Ser Arg Leu Val Leu Glu 595 600 605 Asn Pro Ala Phe Pro Pro Thr Gly Asn Val Gly Asn Thr Gly Asn Thr 610 615 620 Ala Pro Asp Tyr Lys Ala Leu Leu Asn Thr Gly Val Asp Val Lys Pro 625 630 635 640 Val Asp Lys Ile Thr Val Thr Val Thr Pro Val Ala Asp Pro Val Asp 645 650 655 Ile Asp Asp Tyr Ile Ile Trp Leu Pro Thr Ala Ser Gly Ser Gly Val 660 665 670 Glu Pro Ile Tyr Val Val Phe Asn Ser Asn Pro Tyr Gly Gly Thr Glu 675 680 685 Lys Gly Lys Tyr Ser Lys Arg Tyr Tyr Asn Pro Asp Lys Ala Gly Gly 690 695 700 Pro Ile Leu Glu Leu Asp Trp Lys Asn Val Lys Ile Asp His Ala Gly 705 710 715 720 Val Asp Asn Val Lys Leu His Thr Gly Arg Phe Lys Ala Ser Val Glu 725 730 735 Asn Lys Val Met Ile Glu Arg Leu Glu Asn Ile Leu Asn Gly Gln Ile 740 745 750 Thr Ala Thr Asp Thr Asp Lys Arg Phe Tyr Thr His Glu Leu Arg Glu 755 760 765 Leu Asn Arg Tyr Arg Asn Leu Gly Ile Lys Asp Gly Glu Val Pro Ser 770 775 780 Ser Ile Gln Glu Glu Ser Ala Val Trp Asn Asp Thr His Thr Ala Thr 785 790 795 800 Leu Glu Asp Tyr Lys Ile Asn Glu Lys Glu Gln Pro Leu Tyr Thr Asp 805 810 815 Ala Ala Leu Gln Ala Ala Tyr Glu Gln Glu Leu Lys Asp Ala Leu Gly 820 825 830 Gly Lys His Gly 835 <210> 41 <211> 2511 <212> DNA <213> Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum <400> 41 atgattaaat accgtttata tgctccaaat gatggagaca ccatgacagt gagtggtggt 60 ggtggttggg tttcaaacga tgatcgcaaa ggtggtaatg acagggacaa tggcaaaggt 120 ggttctgccg ttgattttag taaaaatcca gaaaagcagg ctatcgttaa tccctatttg 180 gcaatcgcga taccgatgcc ggtctaccct ctttatggaa agctagggtt cacaataaat 240 acgacggcaa ttgagactga actcgcaaat gtcagagcag caattaacac taaacttgca 300 acactcagtg cagtgattgg cagatcactt ccggtcgttg ggcgggtatt tggtgttact 360 gccgccggaa tgtggccttc tagtaccgct cccagtagtc tcgattctat atacaatcaa 420 gcacatcagc aggctttagc ccagttagct gctcaacagg gagtattaaa taaagggtat 480 aacgttacag caatgcctgc aggtttcgtc agcagtttgc ctgttagtga aatcaaatca 540 ttgccaacag ctcccgccag tttactggca caaagtgtga ttaataccga actttcccag 600 cgtcaactgg ctcttactca gcccacgacg aatgcaccag tcgcgaatat tcccgtagtt 660 aaagcagaga aaacagcaat gccaggtgtg tattcagcga aaattattgc tggtgagcct 720 gcattccaaa tcaaggtcga taataccaaa cctgctttgg cacagaatcc gccgaaagta 780 aaagatgata ttcaggtatc ttctttcctt tcctcgccag tagctgatac gcaccatgca 840 tttattgatt ttggcagcga tcatgaaccg gtatacgtgt ctctttcaaa gatcgtgaca 900 gccgaggagg agaaaaaaca ggttgaagag gccaagcgcc gtgagcagga gtggttgttg 960 cgtcatccaa ttacagctgc ggagcgaaaa ttaactgaaa tccgccaagt gatctctttt 1020 gctcaacagc taaaagaaag ctctgtcgca accatttcag aaaaaactaa aactgttgcg 1080 gtttaccaag aacaggtgaa taccgctgca aaaaatcgcg acaattttta taatcaaaat 1140 agaggtctgt taagtgcggg tataactggg ggaccgggat atcctattta tcttgcttta 1200 tggcaaacga tgaataactt tcatcaggct tatttcagag caaataatgc attggaacaa 1260 gagagtcatg ttctgaacct ggctcgttct gatctggcta aggctgagca attgcttgct 1320 gagaataatc gacttcaggt tgaaacggag cgaacgcttg ccgaagaaaa agagataaaa 1380 cgcaacaggg ttaatgtatc aacatttggc acagtgcaaa ctcaacttag taaattgctg 1440 tcagattttt atgctgttac atcactttcc caaagtgttc cttcgggggc attagcctct 1500 ttttcatata atccacaagg gatgattggc agcggtaaga ttgttgggaa ggatgtcgat 1560 gttttatttt ccatcccagt aaaagatatt ccgggatata aatctcctat taacttggac 1620 gatttagcca agaaaaatgg aagtctggat cttcccattc gtctggcatt ttctgatgag 1680 aatggagaaa gggttcttcg ggcattcaaa gcggatagtc tgcgaatccc ttcgagtgtc 1740 agaggtgtag cgggcagtta tgacaaaaat acgggtattt ttagtgcaga aattgatggt 1800 gtttcatctc gccttgtact ggaaaaccca gcgtttcctc cgaccggaaa tgtcggtaat 1860 acgggtaata ctgcacctga ctataaagca ttactgaata ctggtgttga tgttaaacct 1920 gttgataaaa tcacagttac ggtaacacca gttgctgatc cagtggatat tgatgactat 1980 ataatctggt tgccaactgc gtctggttct ggcgtggaac ccatttatgt cgtgtttaac 2040 agtaatccgt atggtgggac ggaaaaagga aaatatagca aacgttatta taatccagat 2100 aaggcaggcg gtccgatctt ggagctggat tggaaaaacg ttaagattga ccatgcaggt 2160 gtggacaatg ttaaattaca cacagggcgt ttcaaagcgt cggttgaaaa caaagtgatg 2220 attgaacgtt tggaaaacat actgaatggt caaatcacgg ccacggatac tgacaagcga 2280 ttctatacgc atgaattaag agagttaaac cgctacagaa atttaggcat caaagacggt 2340 gaagtgccta gtagcattca agaagaaagc gctgtttgga acgacacaca cacagcgacg 2400 cttgaagact acaaaattaa tgagaaagag caaccgttgt acactgatgc tgctttgcag 2460 gcagcctacg aacaggaact caaagacgca ttaggaggga aacatggcta a 2511 <210> 42 <211> 74 <212> PRT <213> Bacillus cereus <400> 42 Met Glu Asn Leu Gln Met Leu Thr Glu Glu Glu Leu Met Glu Ile Glu 1 5 10 15 Gly Gly Gly Trp Trp Asn Ser Trp Gly Lys Cys Val Ala Gly Thr Ile 20 25 30 Gly Gly Ala Gly Thr Gly Gly Leu Gly Gly Ala Ala Ala Gly Ser Ala 35 40 45 Val Pro Val Ile Gly Thr Gly Ile Gly Gly Ala Ile Gly Gly Val Ser 50 55 60 Gly Gly Leu Thr Gly Ala Ala Thr Phe Cys 65 70 <210> 43 <211> 225 <212> DNA <213> Bacillus cereus <400> 43 atggaaaact tacaaatgtt aactgaagaa gaattaatgg aaattgaagg tggaggctgg 60 tggaatagct ggggtaaatg tgttgctgga actatcggtg gagctggaac tggtggttta 120 ggtggagctg ctgcaggttc agctgttccg gttattggta ctggtattgg tggcgctatt 180 ggtggagtta gcggtggcct tacaggtgca gctacttttt gctaa 225 <210> 44 <211> 78 <212> PRT <213> Streptoverticillium griseoverticillatum <400> 44 Met Thr Ala Ser Ile Leu Gln Gln Ser Val Val Asp Ala Asp Phe Arg 1 5 10 15 Ala Ala Leu Leu Glu Asn Pro Ala Ala Phe Gly Ala Ser Ala Ala Ala 20 25 30 Leu Pro Thr Pro Val Glu Ala Gln Asp Gln Ala Ser Leu Asp Phe Trp 35 40 45 Thr Lys Asp Ile Ala Ala Thr Glu Ala Phe Ala Cys Arg Gln Ser Cys 50 55 60 Ser Phe Gly Pro Phe Thr Phe Val Cys Asp Gly Asn Thr Lys 65 70 75 <210> 45 <211> 237 <212> DNA <213> Streptoverticillium griseoverticillatum <400> 45 atgaccgctt ccattcttca gcagtccgtc gtggacgccg acttccgcgc ggcgctgctt 60 gagaaccccg ccgccttcgg cgcttccgcc gcggccctgc ccacgcccgt cgaggcccag 120 gaccaggcgt cccttgactt ctggaccaag gacatcgccg ccacggaagc cttcgcctgc 180 cgccagagct gcagcttcgg cccgttcacc ttcgtgtgcg acggcaacac caagtaa 237 <210> 46 <211> 76 <212> PRT <213> Geobacillus kaustophilus <400> 46 Met Ser Leu Leu Ala Leu Val Ala Gly Thr Leu Gly Val Ser Gln Ser 1 5 10 15 Ile Ala Thr Thr Val Val Ser Ile Val Leu Thr Gly Ser Thr Leu Ile 20 25 30 Ser Ile Ile Leu Gly Ile Thr Ala Ile Leu Ser Gly Gly Val Asp Ala 35 40 45 Ile Leu Glu Ile Gly Trp Ser Ala Phe Val Ala Thr Val Lys Lys Ile 50 55 60 Val Ala Glu Arg Gly Lys Ala Ala Ala Ile Ala Trp 65 70 75 <210> 47 <211> 231 <212> DNA <213> Geobacillus kaustophilus <400> 47 atgagtttgc tggcgcttgt tgccgggacg ctcggcgtgt cacagtcaat cgcgacgacg 60 gttgtttcga ttgtgttgac cggctccact ctcatttcta ttattcttgg gatcaccgct 120 attttgtcag gtggagtcga cgccattttg gaaattgggt ggtcagcttt tgtcgcgacg 180 gtgaaaaaaa tagtggcgga acgaggaaaa gcggcagcga ttgcatggta a 231 <210> 48 <211> 309 <212> PRT <213> Clostridium tyrobutyricum <400> 48 Met Arg Lys Val Phe Leu Arg Ser Ile Ile Ser Thr Leu Val Met Cys 1 5 10 15 Ala Phe Val Ser Ser Ser Phe Ser Val Asn Ala Asp Glu Ser Lys Pro 20 25 30 Asn Asp Glu Lys Ile Ile Asn Asn Ile Glu Asn Val Thr Thr Thr Lys 35 40 45 Asp Ile Val Lys Ser Asn Lys Asn Asn Ile Val Tyr Leu Asp Glu Gly 50 55 60 Val Met Ser Ile Pro Leu Ser Gly Arg Lys Pro Ile Ala Ile Lys Asp 65 70 75 80 Asp Asn Asn Lys Glu Asp Leu Thr Val Thr Leu Pro Ile Lys Asn Thr 85 90 95 Gly Asp Ile Ser Lys Ile Ser Ser Asn Gly Thr Ile Leu Tyr Lys Asn 100 105 110 Asn Ser Ser Asn Ser Ser Asn Ile Ala Leu Gln Pro Lys Asn Asp Gly 115 120 125 Phe Lys Ala Leu Ile Asn Ile Asn Asp Lys Leu Ala Asn Lys Glu Tyr 130 135 140 Glu Phe Thr Phe Asn Leu Pro Lys Asn Ser Lys Leu Ile Ser Ala Ala 145 150 155 160 Thr Tyr Leu Gly Lys Glu Tyr Asp Thr Lys Glu Val Phe Val Val Asp 165 170 175 Lys Asn Asn Ile Ile Thr Ser Ile Ile Ser Pro Ala Trp Ala Lys Asp 180 185 190 Ala Asn Gly His Asn Val Ser Thr Tyr Tyr Lys Ile Val Ser Asn Asn 195 200 205 Lys Leu Val Gln Val Val Glu Phe Thr Glu Asn Thr Ala Phe Pro Val 210 215 220 Val Ala Asp Pro Asn Trp Thr Lys Ile Gly Lys Cys Ala Gly Ser Ile 225 230 235 240 Ala Trp Ala Ile Gly Ser Gly Leu Phe Gly Gly Ala Lys Leu Ile Lys 245 250 255 Ile Lys Lys Tyr Ile Ala Glu Leu Gly Gly Leu Gln Lys Ala Ala Lys 260 265 270 Leu Leu Val Gly Ala Thr Thr Trp Glu Glu Lys Leu His Ala Gly Gly 275 280 285 Tyr Ala Leu Ile Asn Leu Ala Ala Glu Leu Thr Gly Val Ala Gly Ile 290 295 300 Gln 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gctgaggcta aagctgaact ggcgaaggcc 660 gaaagcgatg tacagagtaa gcaagcgatt gtttccagag ttgcagggga gcttgaaaac 720 gctcaaaaaa gtgttgatgt gaaggttacc ggatttcctg gatggcgtga tgttcagaaa 780 aaactggaga gacaattgca ggataagaag aatgaatatt cgtcagtgac gaatgctctt 840 aattctgctg ttagcattag agatgctaaa aaaacagaag ttcagaatgc tgagataaaa 900 ttaaaagaag ctaaggatgc tcttgagaag agtcaggtaa aagactctgt tgatactatg 960 gttgggtttt atcaatatat aaccgaacaa tatggggaaa aatattccag aatagctcag 1020 gatttagctg aaaaggcgaa gggtagtaaa tttaatagtg ttgatgaagc acttgctgca 1080 tttgaaaagt ataaaaatgt actggataag aaattcagta aggttgatag ggatgatatt 1140 tttaatgctt tagagtctat tacttatgat gagtgggcca agcatctaga aaagatctct 1200 agggctctta aggttactgg atatttgtct ttcgggtatg atgtatggga tggtacccta 1260 aagggattaa aaacaggaga ctggaagcct ttatttgtca ctctggagaa gagcgcggta 1320 gatttcggcg tggcaaaaat tgtggcatta atgtttagtt ttattgttgg tgcgcctctt 1380 ggcttctggg gaattgcaat tatcacaggt attgtttctt cttacatagg ggatgatgag 1440 ttgaacaagc ttaatgaatt actaggtatt taa 1473 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aaaaatacaa ggatgtttta 1200 aataagaaat tcagcaaagc cgatcgtgat gctattttta atgcgttggc atcggtgaag 1260 tatgatgact gggctaaaca tttagatcag tttgccaagt acttgaagat tacggggcat 1320 gtttcttttg gatatgatgt ggtatctgat atcctaaaaa ttaaggatac aggtgactgg 1380 aagccactat ttcttacatt agagaagaaa gctgcagatg caggggtgag ttatgttgtt 1440 gctttacttt ttagcttgct tgctggaact acattaggta tttggggtat tgctattgtt 1500 acaggaattc tatgctccta tattgataag aataaactta atactataaa tgaggtgtta 1560 gggatttaa 1569 <210> 56 <211> 626 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 56 Met Ser Asp Pro Val Arg Ile Thr Asn Pro Gly Ala Glu Ser Leu Gly 1 5 10 15 Tyr Asp Ser Asp Gly His Glu Ile Met Ala Val Asp Ile Tyr Val Asn 20 25 30 Pro Pro Arg Val Asp Val Phe His Gly Thr Pro Pro Ala Trp Ser Ser 35 40 45 Phe Gly Asn Lys Thr Ile Trp Gly Gly Asn Glu Trp Val Asp Asp Ser 50 55 60 Pro Thr Arg Ser Asp Ile Glu Lys Arg Asp Lys Glu Ile Thr Ala Tyr 65 70 75 80 Lys Asn Thr Leu Ser Ala Gln Gln Lys Glu Asn Glu Asn Lys Arg Thr 85 90 95 Glu Ala Gly Lys Arg Leu Ser 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Ala Ile Lys Leu Thr Ser Asp Phe Tyr Arg Thr Ile Tyr 450 455 460 Asp Glu Phe Gly Lys Gln Ala Ser Glu Leu Ala Lys Glu Leu Ala Ser 465 470 475 480 Val Ser Gln Gly Lys Gln Ile Lys Ser Val Asp Asp Ala Leu Asn Ala 485 490 495 Phe Asp Lys Phe Arg Asn Asn Leu Asn Lys Lys Tyr Asn Ile Gln Asp 500 505 510 Arg Met Ala Ile Ser Lys Ala Leu Glu Ala Ile Asn Gln Val His Met 515 520 525 Ala Glu Asn Phe Lys Leu Phe Ser Lys Ala Phe Gly Phe Thr Gly Lys 530 535 540 Val Ile Glu Arg Tyr Asp Val Ala Val Glu Leu Gln Lys Ala Val Lys 545 550 555 560 Thr Asp Asn Trp Arg Pro Phe Phe Val Lys Leu Glu Ser Leu Ala Ala 565 570 575 Gly Arg Ala Ala Ser Ala Val Thr Ala Trp Ala Phe Ser Val Met Leu 580 585 590 Gly Thr Pro Val Gly Ile Leu Gly Phe Ala Ile Ile Met Ala Ala Val 595 600 605 Ser Ala Leu Val Asn Asp Lys Phe Ile Glu Gln Val Asn Lys Leu Ile 610 615 620 Gly Ile 625 <210> 59 <211> 1881 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 59 atgtctgacc ctgtacgtat tacaaatccc ggtgcagaat cgctgggata tgattcagat 60 ggccatgaaa ttatggccgt tgatatttat gtaaaccctc cacgtgtcga tgtctttcat 120 ggtaccccgc ctgcatggag ttccttcggg aacaaaacca tctggggtgg aaacgagtgg 180 gtcgatgatt ccccaacccg aagtgatatc gaaaaaaggg acaaggaaat cacagcgtac 240 aaaaacacgc tcagcgcgca gcagaaagag aatgagaata agcgtactga agctggaaaa 300 cgcctttctg cggcaattgc tgcaagggaa aaagatgaaa acacactgaa aacactccgt 360 gccggaaacg cagatgccgc tgatattaca cgacaggagt tcagactcct gcaggcagag 420 ctgagagaat acggattccg tactgaaatc gccggatatg atgccctccg gctgcataca 480 gagagccgga tgctgtttgc tgatgctgat tctcttcgta tatctccccg cgaggccagg 540 tcgttaatcg aacaggctga aaaacggcag aaggatgcgc agaacgcaga caagaaggcc 600 gctgatatgc ttgctgaata cgagcgcaga aaaggtattc tggacacgcg gttgtcagag 660 ctggaaaaaa atggcggggc agcccttgcc gttcttgatg cacaacaggc ccgtctgctc 720 gggcagcaga cacggaatga cagggccatt tcagaggccc ggaataaact cagttcggtg 780 acggaatcgc ttaagacggc ccgtaatgca ttaaccagag ctgaacaaca gctgacgcaa 840 cagaaaaaca cgcctgacgg caaaacgata gtttcccctg aaaaattccc ggggcgttca 900 tcaacaaatc attctattgt tgtgagtggt gatccgaggt ttgccggtac gataaaaatc 960 acaaccagcg cggtcatcga taaccgtgca aacctgaatt atcttctgac ccattccggt 1020 ctggactata aacgcaatat tctgaatgac cggaatccgg tggtgacaga ggatgtggaa 1080 ggtgacaaga aaatttataa tgctgaagtt gctgaatggg ataagttacg gcaacgattg 1140 cttgatgcca gaaataaaat cacctctgct gaatctgcga taaattcggc gagaaataac 1200 gtcagtgcca gaacaaatga acaaaagcat gcaaatgacg ctcttaatgc cctgttgaag 1260 gaaaaagaga atatccgtag ccagcttgct gacatcaatc agaaaatagc tgaagagaaa 1320 agaaaaaggg atgaaataaa tatggtaaag gatgccataa aactcacctc tgatttctac 1380 agaacgatat atgatgagtt cggtaaacaa gcatccgaac ttgctaagga gctggcttct 1440 gtatctcaag ggaaacagat taagagtgtg gatgatgcac tgaacgcttt tgataaattc 1500 cgtaataatc tgaacaagaa atataacata caagatcgca tggccatttc taaagccctg 1560 gaagctatta atcaggtcca tatggcggag aattttaagc tgttcagtaa ggcatttggt 1620 tttaccggaa aagttattga acgttatgat gttgctgtgg agttacaaaa ggctgtaaaa 1680 acggacaact ggcgtccatt ttttgtaaaa cttgaatcac tggcagcagg aagagctgct 1740 tcagcagtta cagcatgggc gttttccgtc atgctgggaa cccctgtagg tattctgggt 1800 tttgcaatta ttatggcggc tgtgagtgcg cttgttaatg ataagtttat tgagcaggtc 1860 aataaactta ttggtatctg a 1881 <210> 60 <211> 271 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 60 Met Glu Thr Leu Thr Val His Ala Pro Ser Pro Ser Thr Asn Leu Pro 1 5 10 15 Ser Tyr Gly Asn Gly Ala Phe Ser Leu Ser Ala Pro His Val Pro Gly 20 25 30 Ala Gly Pro Leu Leu Val Gln Val Val Tyr Ser Phe Phe Gln Ser Pro 35 40 45 Asn Met Cys Leu Gln Ala Leu Thr Gln Leu Glu Asp Tyr Ile Lys Lys 50 55 60 His Gly Ala Ser Asn Pro Leu Thr Leu Gln Ile Ile Ser Thr Asn Ile 65 70 75 80 Gly Tyr Phe Cys Asn Ala Asp Arg Asn Leu Val Leu His Pro Gly Ile 85 90 95 Ser Val Tyr Asp Ala Tyr His Phe Ala Lys Pro Ala Pro Ser Gln Tyr 100 105 110 Asp Tyr Arg Ser Met Asn Met Lys Gln Met Ser Gly Asn Val Thr Thr 115 120 125 Pro Ile Val Ala Leu Ala His Tyr Leu Trp Gly Asn Gly Ala Glu Arg 130 135 140 Ser Val Asn Ile Ala Asn Ile Gly Leu Lys Ile Ser Pro Met Lys Ile 145 150 155 160 Asn Gln Ile Lys Asp Ile Ile Lys Ser Gly Val Val Gly 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gtggcgcttg ctcactattt atggggtaat 420 ggcgctgaaa ggagcgttaa tatcgccaac attggtctta aaatttcccc tatgaaaatt 480 aatcagataa aagacattat aaaatctggt gtagtaggca cattccctgt ttctacaaag 540 ttcacacatg ccactggtga ttataatgtt attaccggtg catatcttgg taatatcaca 600 ctgaaaacag aaggtacttt aactatctct gccaatggct cctggactta caatggcgtt 660 gttcgttcat atgatgataa atacgatttt aacgccagca ctcaccgtgg cattatcgga 720 gagtcgctca caaggctcgg ggcgatgttt tctggtaaag agtaccagat actgcttcct 780 ggtgaaattc acattaaaga aagtggtaag cgataa 816 <210> 62 <211> 387 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 62 Met Gly Ser Asn Gly Ala Asp Asn Ala His Asn Asn Ala Phe Gly Gly 1 5 10 15 Gly Lys Asn Pro Gly Ile Gly Asn Thr Ser Gly Ala Gly Ser Asn Gly 20 25 30 Ser Ala Ser Ser Asn Arg Gly Asn Ser Asn Gly Trp Ser Trp Ser Asn 35 40 45 Lys Pro His Lys Asn Asp Gly Phe His Ser Asp Gly Ser Tyr His Ile 50 55 60 Thr Phe His Gly Asp Asn Asn Ser Lys Pro Lys Pro Gly Gly Asn Ser 65 70 75 80 Gly Asn Arg Gly Asn Asn Gly Asp Gly Ala Ser Ala Lys Val Gly Glu 85 90 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Ser Ile Glu Gly Tyr Asn Thr Gly Asn Trp Gly Pro Leu Leu Leu Glu 305 310 315 320 Val Glu Ser Trp Ile Ile Gly Gly Val Val Ala Gly Val Ala Ile Ser 325 330 335 Leu Phe Gly Ala Val Leu Ser Phe Leu Pro Ile Ser Gly Leu Ala Val 340 345 350 Thr Ala Leu Gly Val Ile Gly Ile Met Thr Ile Ser Tyr Leu Ser Ser 355 360 365 Phe Ile Asp Ala Asn Arg Val Ser Asn Ile Asn Asn Ile Ile Ser Ser 370 375 380 Val Ile Arg 385 <210> 63 <211> 1171 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 63 atgggtagta atggcgcaga taatgcacat aacaatgctt ttggtggagg gaaaaatccg 60 ggcattggta ataccagtgg cgcaggaagt aatggtagtg catcaagtaa ccgaggaaat 120 tccaatggat ggtcatggag taataagcct cataaaaatg atggcttcca cagtgatggt 180 tcttaccata ttacatttca tggggacaat aattcaaagc ctaaacctgg agggaatagt 240 ggaaatcgag gtaataacgg tgatggagcg agtgctaagg ttggagagat aacaatcaca 300 cctgacaact cgaaaccagg tcgttatatt tcgtcaaatc ctgaatattc attgttggca 360 aaattaattg atgcggaatc aattaaaggt acagaggtat atacttttca caccagaaaa 420 ggtcagtatg ttaaggttac tgttccagat agtaatattg ataaaatgag agttgattat 480 gtgaactgga agggaccgaa atataacaat aaacttgtga agaggtttgt gagccagttt 540 ttattattta ggaaggaaga aaaagaaaaa aatgaaaaag aagccttgct aaaggctagt 600 gaacttgtgt ctggtatggg ggataagctt ggcgagtatc ttggagtaaa atataaaaat 660 gtagctaagg aagttgccaa tgatattaaa aacttccatg gtcgtaatat tcgtagctat 720 aatgaagcaa tggcttcact taataaagtg ttagcaaatc caaagatgaa agtaaacaaa 780 tctgataagg atgccattgt gaatgcctgg aaacaggtta atgctaagga catggctaat 840 aagattggta atcttggcaa ggcatttaag gttgctgatt tagctataaa ggttgagaaa 900 attagggaaa aaagcattga gggatacaat actggcaact ggggacctct cctgttggag 960 gttgaatcat ggatcattgg tggcgttgtt gctggagttg ctattagttt attcggggct 1020 gtgttgagtt ttctcccaat ctctggactt gcagttactg cgttgggggt aataggaata 1080 atgacgatta gttacttgtc atctttcata gatgcaaatc gagtttcgaa tataaataac 1140 attatatcta gtgttattcg agcaaatcga g 1171 <210> 64 <211> 103 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 64 Met Arg Thr Leu Thr Leu Asn Glu Leu Asp Ser Val Ser Gly Gly Ala 1 5 10 15 Ser Gly Arg Asp Ile Ala Met Ala Ile Gly Thr Leu Ser Gly Gln Phe 20 25 30 Val Ala Gly Gly Ile Gly Ala Ala Ala Gly Gly Val Ala Gly Gly Ala 35 40 45 Ile Tyr Asp Tyr Ala Ser Thr His Lys Pro Asn Pro Ala Met Ser Pro 50 55 60 Ser Gly Leu Gly Gly Thr Ile Lys Gln Lys Pro Glu Gly Ile Pro Ser 65 70 75 80 Glu Ala Trp Asn Tyr Ala Ala Gly Arg Leu Cys Asn Trp Ser Pro Asn 85 90 95 Asn Leu Ser Asp Val Cys Leu 100 <210> 65 <211> 312 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 65 atgagaactc tgactctaaa tgaattagat tctgtttctg gtggtgcttc agggcgtgat 60 attgcgatgg ctataggaac actatccgga caatttgttg caggaggaat tggagcagct 120 gctgggggtg tggctggagg tgcaatatat gactatgcat ccactcacaa acctaatcct 180 gcaatgtctc catccggttt aggaggaaca attaagcaaa aacccgaagg gataccttca 240 gaagcatgga actatgctgc gggaagattg tgtaattgga gtccaaataa tcttagtgat 300 gtttgtttat aa 312 <210> 66 <211> 58 <212> PRT <213> Enterococcus columbae <400> 66 Met Met Asn Ala Thr Glu Asn Gln Ile Phe Val Glu Thr Val Ser Asp 1 5 10 15 Gln Glu Leu Glu Met Leu Ile Gly Gly Ala Gly Arg Gly Trp Ile Lys 20 25 30 Thr Leu Thr Lys Asp Cys Pro Asn Val Ile Ser Ser Ile Cys Ala Gly 35 40 45 Thr Ile Ile Thr Ala Cys Lys Asn Cys Ala 50 55 <210> 67 <211> 177 <212> DNA <213> Enterococcus columbae <400> 67 atgatgaatg ctactgaaaa ccaaattttt gttgagactg tgagtgacca agaattagaa 60 atgttaattg gtggtgcagg tcgtggatgg attaagactt taacaaaaga ttgtccaaat 120 gtgatttctt caatttgtgc aggtacaatt attacagctt gtaaaaattg tgcttaa 177 <210> 68 <211> 59 <212> PRT <213> Lactobacillus curvatus <400> 68 Met Asn Asn Val Lys Glu Leu Ser Met Thr Glu Leu Gln Thr Ile Thr 1 5 10 15 Gly Gly Ala Arg Ser Tyr Gly Asn Gly Val Tyr Cys Asn Asn Lys Lys 20 25 30 Cys Trp Val Asn Arg Gly Glu Ala Thr Gln Ser Ile Ile Gly Gly Met 35 40 45 Ile Ser Gly Trp Ala Ser Gly Leu Ala Gly Met 50 55 <210> 69 <211> 180 <212> DNA <213> Lactobacillus curvatus <400> 69 atgaataatg taaaagaatt aagtatgaca gaattacaaa caattaccgg cggtgctaga 60 tcatatggca acggtgttta ctgtaataat aaaaaatgtt gggtaaatcg gggtgaagca 120 acgcaaagta ttattggtgg tatgattagc ggctgggcta gtggtttagc tggaatgtaa 180 <210> 70 <211> 64 <212> PRT <213> Streptomyces sp. <400> 70 Met Arg Ser Glu Met Thr Leu Thr Ser Thr Asn Ser Ala Glu Ala Leu 1 5 10 15 Ala Ala Gln Asp Phe Ala Asn Thr Val Leu Ser Ala Ala Ala Pro Gly 20 25 30 Phe His Ala Asp Cys Glu Thr Pro Ala Met Ala Thr Pro Ala Thr Pro 35 40 45 Thr Val Ala Gln Phe Val Ile Gln Gly Ser Thr Ile Cys Leu Val Cys 50 55 60 <210> 71 <211> 195 <212> DNA <213> Streptomyces sp. <400> 71 gtgcgatctg agatgactct tacgagcacg aattccgctg aggctctggc ggcgcaggac 60 tttgcgaaca ccgttctcag cgcggcggcc ccgggcttcc acgcggactg cgagacgccg 120 gccatggcca ccccggccac gccgaccgtc gcccagttcg tgatccaggg cagcacgatc 180 tgcctggtct gctga 195 <210> 72 <211> 65 <212> PRT <213> Bacillus halodurans <400> 72 Met Val Asn Ser Lys Asp Leu Arg Asn Pro Glu Phe Arg Lys Ala Gln 1 5 10 15 Gly Leu Gln Phe Val Asp Glu Val Asn Glu Lys Glu Leu Ser Ser Leu 20 25 30 Ala Gly Ser Gly Asp Val His Ala Gln Thr Thr Trp Pro Cys Ala Thr 35 40 45 Val Gly Val Ser Val Ala Leu Cys Pro Thr Thr Lys Cys Thr Ser Gln 50 55 60 Cys 65 <210> 73 <211> 198 <212> DNA <213> Bacillus halodurans <400> 73 atggtaaatt caaaagattt gcgtaatcct gaattccgca aagcccaagg tctacaattc 60 gttgacgagg tgaacgagaa ggaactttcg tctctagctg gttcaggaga tgtgcatgca 120 caaacaactt ggccttgcgc tacagttggt gtctccgtag ccttgtgccc aactacaaag 180 tgtacaagcc agtgctaa 198 <210> 74 <211> 66 <212> PRT <213> Carnobacterium divergens <400> 74 Met Lys Asn Leu Lys Glu Gly Ser Tyr Thr Ala Val Asn Thr Asp Glu 1 5 10 15 Leu Lys Ser Ile Asn Gly Gly Thr Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Tyr 20 25 30 Cys Asn Ser Lys Lys Cys Trp Val Asp Trp Gly Gln Ala Ser Gly Cys 35 40 45 Ile Gly Gln Thr Val Val Gly Gly Trp Leu Gly Gly Ala Ile Pro Gly 50 55 60 Lys Cys 65 <210> 75 <211> 201 <212> DNA <213> Carnobacterium divergens <400> 75 atgaaaaact taaaagaagg ttcatacact gctgttaata ctgatgaatt aaaaagtatc 60 aatggtggaa caaaatatta tgggaatggc gtttattgca attctaaaaa atgttgggta 120 gattggggac aagcttcagg ttgtatcggt caaactgttg ttggcggatg gctaggcgga 180 gctataccag gtaaatgcta a 201 <210> 76 <211> 63 <212> PRT <213> Carnobacterium divergens <400> 76 Met Ile Lys Arg Glu Lys Asn Arg Thr Ile Ser Ser Leu Gly Tyr Glu 1 5 10 15 Glu Ile Ser Asn His Lys Leu Gln Glu Ile Gln Gly Gly Lys Gly Ile 20 25 30 Leu Gly Lys Leu Gly Val Val Gln Ala Gly Val Asp Phe Val Ser Gly 35 40 45 Val Trp Ala Gly Ile Lys Gln Ser Ala Lys Asp His Pro Asn Ala 50 55 60 <210> 77 <211> 192 <212> DNA <213> Carnobacterium divergens <400> 77 atgattaaaa gagaaaagaa cagaacaatt tcttcccttg gttatgaaga aatttctaat 60 cataaattgc aagaaataca aggtggaaaa ggaattcttg gtaaactagg agtagtacag 120 gcaggagtgg attttgtatc aggagtgtgg gctggaataa aacagtctgc caaagatcat 180 cctaatgcgt aa 192 <210> 78 <211> 75 <212> PRT <213> Carnobacterium divergens <400> 78 Met Lys Lys Gln Ile Leu Lys Gly Leu Val Ile Val Val Cys Leu Ser 1 5 10 15 Gly Ala Thr Phe Phe Ser Thr Pro Gln Gln Ala Ser Ala Ala Ala Pro 20 25 30 Lys Ile Thr Gln Lys Gln Lys Asn Cys Val Asn Gly Gln Leu Gly Gly 35 40 45 Met Leu Ala Gly Ala Leu Gly Gly Pro Gly Gly Val Val Leu Gly Gly 50 55 60 Ile Gly Gly Ala Ile Ala Gly Gly Cys Phe Asn 65 70 75 <210> 79 <211> 228 <212> DNA <213> Carnobacterium divergens <400> 79 atgaaaaaac aaattttaaa agggttggtt atagttgttt gtttatctgg ggcaacattt 60 ttctcaacac cacaacaagc ttctgctgct gcaccgaaaa ttactcaaaa acaaaaaaat 120 tgtgttaatg gacaattagg tggaatgctt gctggagctt tgggtggacc tggcggagtt 180 gtgttaggtg gtataggtgg tgcaatagca ggaggttgtt ttaattaa 228 <210> 80 <211> 72 <212> PRT <213> Enterococcus durans <400> 80 Met Gln Thr Ile Lys Glu Leu Asn Thr Met Glu Leu Gln Glu Ile Ile 1 5 10 15 Gly Gly Glu Asn Asp His Arg Met Pro Tyr Glu Leu Asn Arg Pro Asn 20 25 30 Asn Leu Ser Lys Gly Gly Ala Lys Cys Ala Ala Gly Ile Leu Gly Ala 35 40 45 Gly Leu Gly Ala Val Gly Gly Gly Pro Gly Gly Phe Ile Ser Ala Gly 50 55 60 Ile Ser Ala Val Leu Gly Cys Met 65 70 <210> 81 <211> 219 <212> DNA <213> Enterococcus durans <400> 81 atgcaaacga tcaaagaatt gaacacgatg gaattacaag aaataattgg aggtgaaaat 60 gaccatcgga tgccttacga attgaaccgt ccaaataatt tatccaaagg tggggctaag 120 tgtgctgctg gaatacttgg cgctggacta ggcgcagtag gcggtggacc tggcggattt 180 attagtgccg gaatcagtgc tgttcttggt tgtatgtaa 219 <210> 82 <211> 72 <212> PRT <213> Enterococcus durans <400> 82 Met Gln Thr Ile Lys Glu Leu Asn Thr Met Glu Leu Gln Lys Ile Ile 1 5 10 15 Gly Gly Glu Asn Asp His Arg Met Pro Tyr Glu Leu Asn Arg Pro Asn 20 25 30 Asn Leu Ser Lys Gly Gly Ala Lys Cys Ala Ala Gly Ile Leu Gly Ala 35 40 45 Gly Leu Gly Ala Val Gly Gly Gly Pro Gly Gly Phe Ile Ser Ala Gly 50 55 60 Ile Ser Ala Val Leu Gly Cys Met 65 70 <210> 83 <211> 219 <212> DNA <213> Enterococcus durans <400> 83 atgcaaacga tcaaagaatt gaacacgatg gaattacaaa aaataattgg aggtgaaaat 60 gaccatcgga tgccttacga attgaaccgt ccaaataatt tatccaaagg tggagctaag 120 tgcgctgccg gaatacttgg tgctggatta ggcgcagtag gcggtggacc tggcggattt 180 attagtgccg gaatcagtgc tgttcttggt tgtatgtaa 219 <210> 84 <211> 220 <212> PRT <213> Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis <400> 84 Met Lys Lys Leu Lys Arg Leu Val Ile Ser Leu Val Thr Ser Leu Leu 1 5 10 15 Val Ile Ser Ser Thr Val Pro Ala Leu Val Tyr Ala Asn Glu Thr Asn 20 25 30 Asn Phe Ala Glu Thr Gln Lys Glu Ile Thr Thr Asn Ser Glu Ala Thr 35 40 45 Leu Thr Asn Glu Asp Tyr Thr Lys Leu Thr Ser Glu Val Lys Thr Ile 50 55 60 Tyr Thr Asn Leu Ile Gln Tyr Asp Gln Thr Lys Asn Lys Phe Tyr Val 65 70 75 80 Asp Glu Asp Lys Thr Glu Gln Tyr Tyr Asn Tyr Asp Asp Glu Ser Ile 85 90 95 Lys Gly Val Tyr Leu Met Lys Asp Ser Leu Asn Asp Glu Leu Asn Asn 100 105 110 Asn Asn Ser Ser Asn Tyr Ser Glu Ile Ile Asn Gln Lys Ile Ser Glu 115 120 125 Ile Asp Tyr Val Leu Gln Gly Asn Asp Ile Asn Asn Leu Ile Pro Ser 130 135 140 Asn Thr Arg Val Lys Arg Ser Ala Asp Phe Ser Trp Ile Gln Arg Cys 145 150 155 160 Leu Glu Glu Ala Trp Gly Tyr Ala Ile Ser Leu Val Thr Leu Lys Gly 165 170 175 Ile Ile Asn Leu Phe Lys Ala Gly Lys Phe Glu Ala Ala Ala Ala Lys 180 185 190 Leu Ala Ser Ala Thr Ala Gly Arg Ile Ala Gly Met Ala Ala Leu Phe 195 200 205 Ala Phe Val Ala Thr Cys Gly Ala Thr Thr Val Ser 210 215 220 <210> 85 <211> 663 <212> DNA <213> Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis <400> 85 atgaaaaaat taaaacgtct tgttatctct cttgttactt cattactagt aatttcaagt 60 acagttccag cacttgttta cgctaatgaa acaaataact ttgcagaaac tcaaaaagaa 120 attacaacaa attcagaagc aacattaacc aatgaagact acactaaatt aacttccgaa 180 gtaaaaacaa tttatacaaa tctgattcaa tacgaccaaa caaaaaacaa attttacgtc 240 gatgaagaca aaactgaaca atattataac tacgatgatg aaagtataaa aggggtttat 300 ctcatgaaag atagtttgaa cgatgagtta aacaataata actcttcaaa ctattctgaa 360 ataattaatc aaaaaatctc tgaaattgac tatgtccttc aaggaaacga tataaataat 420 ttaattccta gcaataccag agtaaaaaga tcagcagatt tttcttggat tcaaagatgt 480 ctagaagaag catggggata tgctattagt ctagttactc taaaaggaat aatcaatcta 540 tttaaagcag gaaaatttga agctgctgct gctaaattag cttctgctac agcaggtaga 600 atcgctggaa tggctgcctt atttgctttc gtagcaactt gcggtgcgac aactgtatca 660 taa 663 <210> 86 <211> 57 <212> PRT <213> Enterococcus faecalis <400> 86 Met Lys Gln Tyr Lys Val Leu Asn Glu Lys Glu Met Lys Lys Pro Ile 1 5 10 15 Gly Gly Glu Ser Val Phe Ser Lys Ile Gly Asn Ala Val Gly Pro Ala 20 25 30 Ala Tyr Trp Ile Leu Lys Gly Leu Gly Asn Met Ser Asp Val Asn Gln 35 40 45 Ala Asp Arg Ile Asn Arg Lys Lys His 50 55 <210> 87 <211> 174 <212> DNA <213> Enterococcus faecalis <400> 87 atgaagcaat ataaagtatt gaatgaaaaa gaaatgaaaa aacctattgg gggagagtcg 60 gtttttagta aaataggtaa tgctgtaggt ccagctgctt attggatttt aaaaggatta 120 ggtaatatga gtgatgtaaa ccaagctgat agaattaata gaaagaaaca ttaa 174 <210> 88 <211> 44 <212> PRT <213> Enterococcus faecalis <400> 88 Met Gly Ala Ile Ala Lys Leu Val Ala Lys Phe Gly Trp Pro Ile Val 1 5 10 15 Lys Lys Tyr Tyr Lys Gln Ile Met Gln Phe Ile Gly Glu Gly Trp Ala 20 25 30 Ile Asn Lys Ile Ile Asp Trp Ile Lys Lys His Ile 35 40 <210> 89 <211> 135 <212> DNA <213> Enterococcus faecalis <400> 89 atgggagcaa tcgcaaaatt agtagcaaag tttggatggc caattgttaa aaagtattac 60 aaacaaatta tgcaatttat tggagaagga tgggcaatta acaaaattat tgattggatc 120 aaaaaacata tttaa 135 <210> 90 <211> 43 <212> PRT <213> Enterococcus faecalis <400> 90 Met Gly Ala Ile Ala Lys Leu Val Ala Lys Phe Gly Trp Pro Phe Ile 1 5 10 15 Lys Lys Phe Tyr Lys Gln Ile Met Gln Phe Ile Gly Gln Gly Trp Thr 20 25 30 Ile Asp Gln Ile Glu Lys Trp Leu Lys Arg His 35 40 <210> 91 <211> 132 <212> DNA <213> Enterococcus faecalis <400> 91 atgggagcaa tcgcaaaatt agtagcaaag tttggatggc catttattaa aaaattctac 60 aaacaaatta tgcagtttat cggacaagga tggacaatag atcaaattga aaaatggtta 120 aaaagacatt ga 132 <210> 92 <211> 74 <212> PRT <213> Enterococcus faecalis <400> 92 Met Leu Asn Lys Lys Leu Leu Glu Asn Gly Val Val Asn Ala Val Thr 1 5 10 15 Ile Asp Glu Leu Asp Ala Gln Phe Gly Gly Met Ser Lys Arg Asp Cys 20 25 30 Asn Leu Met Lys Ala Cys Cys Ala Gly Gln Ala Val Thr Tyr Ala Ile 35 40 45 His Ser Leu Leu Asn Arg Leu Gly Gly Asp Ser Ser Asp Pro Ala Gly 50 55 60 Cys Asn Asp Ile Val Arg Lys Tyr Cys Lys 65 70 <210> 93 <211> 225 <212> DNA <213> Enterococcus faecalis <400> 93 atgttaaata aaaaattatt agaaaatggt gtagtaaatg ctgtaacaat tgatgaactt 60 gatgctcaat ttggtggaat gagcaaacgt gattgtaact tgatgaaggc gtgttgtgct 120 ggacaagcag taacatatgc tattcatagt cttttaaatc gattaggtgg agactctagt 180 gatccagctg gttgtaatga tattgtaaga aaatattgta aataa 225 <210> 94 <211> 65 <212> PRT <213> Enterococcus faecium <400> 94 Met Lys His Leu Lys Ile Leu Ser Ile Lys Glu Thr Gln Leu Ile Tyr 1 5 10 15 Gly Gly Thr Thr His Ser Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Tyr Cys 20 25 30 Thr Lys Asn Lys Cys Thr Val Asp Trp Ala Lys Ala Thr Thr Cys Ile 35 40 45 Ala Gly Met Ser Ile Gly Gly Phe Leu Gly Gly Ala Ile Pro Gly Lys 50 55 60 Cys 65 <210> 95 <211> 195 <212> DNA <213> Enterococcus faecium <400> 95 atgaaacatt taaaaatttt gtctattaaa gagacacaac ttatctatgg gggtaccact 60 catagtggaa aatattatgg aaatggagtg tattgcacta aaaataaatg tacggtcgat 120 tgggccaagg caactacttg tattgcagga atgtctatag gtggtttttt aggtggagca 180 attccaggga agtgc 195 <210> 96 <211> 105 <212> PRT <213> Enterococcus faecalis <400> 96 Met Val Lys Glu Asn Lys Phe Ser Lys Ile Phe Ile Leu Met Ala Leu 1 5 10 15 Ser Phe Leu Gly Leu Ala Leu Phe Ser Ala Ser Leu Gln Phe Leu Pro 20 25 30 Ile Ala His Met Ala Lys Glu Phe Gly Ile Pro Ala Ala Val Ala Gly 35 40 45 Thr Val Leu Asn Val Val Glu Ala Gly Gly Trp Val Thr Thr Ile Val 50 55 60 Ser Ile Leu Thr Ala Val Gly Ser Gly Gly Leu Ser Leu Leu Ala Ala 65 70 75 80 Ala Gly Arg Glu Ser Ile Lys Ala Tyr Leu Lys Lys Glu Ile Lys Lys 85 90 95 Lys Gly Lys Arg Ala Val Ile Ala Trp 100 105 <210> 97 <211> 318 <212> DNA <213> Enterococcus faecalis <400> 97 atggttaaag aaaataaatt ttctaagatt tttattttaa tggctttgag ttttttgggg 60 ttagccttgt ttagtgcaag tcttcagttt ttgcccattg cacatatggc taaagagttc 120 ggtataccag cagcagttgc aggaactgtg cttaatgtag ttgaagctgg tggatgggtc 180 actactattg tatcaattct tactgctgta ggtagcggag gtctttcttt actcgctgca 240 gcaggaagag agtcaattaa agcatacctt aagaaagaaa ttaagaaaaa aggaaaaaga 300 gcagttattg cttggtaa 318 <210> 98 <211> 71 <212> PRT <213> Enterococcus faecium <400> 98 Met Gln Asn Val Lys Glu Leu Ser Thr Lys Glu Met Lys Gln Ile Ile 1 5 10 15 Gly Gly Glu Asn Asp His Arg Met Pro Asn Glu Leu Asn Arg Pro Asn 20 25 30 Asn Leu Ser Lys Gly Gly Ala Lys Cys Gly Ala Ala Ile Ala Gly Gly 35 40 45 Leu Phe Gly Ile Pro Lys Gly Pro Leu Ala Trp Ala Ala Gly Leu Ala 50 55 60 Asn Val Tyr Ser Lys Cys Asn 65 70 <210> 99 <211> 216 <212> DNA <213> Enterococcus faecium <400> 99 atgcaaaatg taaaagaatt aagtacgaaa gagatgaaac aaattatcgg tggagaaaat 60 gatcacagaa tgcctaatga gttaaataga cctaacaact tatctaaagg tggagcaaaa 120 tgtggtgctg caattgctgg gggattattt ggaatcccaa aaggaccact agcatgggct 180 gctgggttag caaatgtata ctctaaatgc aactaa 216 <210> 100 <211> 58 <212> PRT <213> Enterococcus mundtii <400> 100 Met Lys Lys Leu Thr Ser Lys Glu Met Ala Gln Val Val Gly Gly Lys 1 5 10 15 Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys Asn Lys Lys Gly Cys Ser Val Asp 20 25 30 Trp Gly Lys Ala Ile Gly Ile Ile Gly Asn Asn Ser Ala Ala Asn Leu 35 40 45 Ala Thr Gly Gly Ala Ala Gly Trp Lys Ser 50 55 <210> 101 <211> 177 <212> DNA <213> Enterococcus mundtii <400> 101 ttgaagaaat taacatcaaa agaaatggca caagtagtag gtggaaaata ctacggtaat 60 ggagtctcat gtaataaaaa agggtgcagt gttgattggg gaaaagctat tggcattatt 120 ggaaataatt ctgctgcgaa tttagctact ggtggagcag ctggttggaa aagttaa 177 <210> 102 <211> 44 <212> PRT <213> Enterococcus faecalis <400> 102 Met Leu Ala Lys Ile Lys Ala Met Ile Lys Lys Phe Pro Asn Pro Tyr 1 5 10 15 Thr Leu Ala Ala Lys Leu Thr Thr Tyr Glu Ile Asn Trp Tyr Lys Gln 20 25 30 Gln Tyr Gly Arg Tyr Pro Trp Glu Arg Pro Val Ala 35 40 <210> 103 <211> 135 <212> DNA <213> Enterococcus faecalis <400> 103 atgttagcaa aaattaaagc gatgattaag aagtttccga acccttatac tttagcagct 60 aagctaacga cttacgaaat taattggtat aaacaacaat acggtcgtta tccttgggag 120 cgccctgtag cataa 135 <210> 104 <211> 71 <212> PRT <213> Enterococcus faecium <400> 104 Met Arg Lys Lys Leu Phe Ser Leu Ala Leu Ile Gly Ile Phe Gly Leu 1 5 10 15 Val Val Thr Asn Phe Gly Thr Lys Val Asp Ala Ala Thr Arg Ser Tyr 20 25 30 Gly Asn Gly Val Tyr Cys Asn Asn Ser Lys Cys Trp Val Asn Trp Gly 35 40 45 Glu Ala Lys Glu Asn Ile Ala Gly Ile Val Ile Ser Gly Trp Ala Ser 50 55 60 Gly Leu Ala Gly Met Gly His 65 70 <210> 105 <211> 216 <212> DNA <213> Enterococcus faecium <400> 105 atgagaaaaa aattatttag tttagctctt attggaatat ttgggttagt tgtgacaaat 60 tttggtacaa aagttgatgc agctacgcgt tcatatggta atggtgttta ttgtaataat 120 agtaaatgct gggttaactg gggagaagct aaagagaata ttgcaggaat cgttattagt 180 ggctgggctt ctggtttggc aggtatggga cattaa 216 <210> 106 <211> 34 <212> PRT <213> Enterococcus faecium <400> 106 Met Asn Phe Leu Lys Asn Gly Ile Ala Lys Trp Met Thr Gly Ala Glu 1 5 10 15 Leu Gln Ala Tyr Lys Lys Lys Tyr Gly Cys Leu Pro Trp Glu Lys Ile 20 25 30 Ser Cys <210> 107 <211> 105 <212> DNA <213> Enterococcus faecium <400> 107 atgaattttc ttaaaaatgg tatcgcaaaa tggatgaccg gtgctgaatt gcaagcgtat 60 aaaaagaaat atggatgctt gccatgggaa aaaatttctt gttaa 105 <210> 108 <211> 76 <212> PRT <213> Enterococcus faecalis <400> 108 Met Lys Lys Lys Leu Val Lys Gly Leu Val Ile Cys Gly Met Ile Gly 1 5 10 15 Ile Gly Phe Thr Ala Leu Gly Thr Asn Val Glu Ala Ala Thr Tyr Tyr 20 25 30 Gly Asn Gly Val Tyr Cys Asn Lys Gln Lys Cys Trp Val Asp Trp Ser 35 40 45 Arg Ala Arg Ser Glu Ile Ile Asp Arg Gly Val Lys Ala Tyr Val Asn 50 55 60 Gly Phe Thr Lys Val Leu Gly Gly Ile Gly Gly Arg 65 70 75 <210> 109 <211> 231 <212> DNA <213> Enterococcus faecalis <400> 109 atgaaaaaga aattagttaa aggcttagtt atttgtggca tgattgggat tggttttaca 60 gcattaggaa caaatgtaga agccgccacg tattacggaa atggtgtcta ttgcaataag 120 caaaaatgtt gggtagattg gagtagagca cgttctgaaa ttatagacag aggcgtaaaa 180 gcatacgtca atggatttac gaaagtgtta ggtggtatag gtggaagata a 231 <210> 110 <211> 60 <212> PRT <213> Enterococcus faecalis <400> 110 Met Lys Lys Glu Glu Leu Val Gly Met Ala Lys Glu Asp Phe Leu Asn 1 5 10 15 Val Ile Cys Glu Asn Asp Asn Lys Leu Glu Asn Ser Gly Ala Lys Cys 20 25 30 Pro Trp Trp Asn Leu Ser Cys His Leu Gly Asn Asp Gly Lys Ile Cys 35 40 45 Thr Tyr Ser His Glu Cys Thr Ala Gly Cys Asn Ala 50 55 60 <210> 111 <211> 183 <212> DNA <213> Enterococcus faecalis <400> 111 atgaaaaaag aagaattagt aggaatggct aaggaagact ttttaaatgt tatttgtgaa 60 aatgacaaca aactagaaaa tagtggagca aaatgtcctt ggtggaatct ttcttgtcat 120 ttaggcaatg atggtaaaat ttgcacttat tcacatgaat gtaccgcagg ttgtaatgca 180 taa 183 <210> 112 <211> 61 <212> PRT <213> Enterococcus faecalis <400> 112 Met Thr Glu Leu Asn Lys Arg Leu Gln Leu Lys Arg Asp Val Ser Thr 1 5 10 15 Glu Asn Ser Leu Lys Lys Ile Ser Asn Thr Asp Glu Thr His Gly Gly 20 25 30 Val Thr Thr Ser Ile Pro Cys Thr Val Met Val Ser Ala Ala Val Cys 35 40 45 Pro Thr Leu Val Cys Ser Asn Lys Cys Gly Gly Arg Gly 50 55 60 <210> 113 <211> 186 <212> DNA <213> Enterococcus faecalis <400> 113 atgactgaac ttaacaaaag attacaatta aaaagagatg tttcaacaga aaatagtttg 60 aaaaaaattt ctaatactga tgaaacacat gggggagtta ctacatcaat tccatgtaca 120 gtaatggtta gtgcggcagt atgtcctacc cttgtttgct cgaataaatg tggcggtaga 180 ggctag 186 <210> 114 <211> 58 <212> PRT <213> Enterococcus faecium <400> 114 Met Gln Asn Val Lys Glu Val Ser Val Lys Glu Met Lys Gln Ile Ile 1 5 10 15 Gly Gly Ser Asn Asp Ser Leu Trp Tyr Gly Val Gly Gln Phe Met Gly 20 25 30 Lys Gln Ala Asn Cys Ile Thr Asn His Pro Val Lys His Met Ile Ile 35 40 45 Pro Gly Tyr Cys Leu Ser Lys Ile Leu Gly 50 55 <210> 115 <211> 177 <212> DNA <213> Enterococcus faecium <400> 115 atgcaaaatg taaaagaagt ttctgtaaaa gagatgaaac aaattatcgg tggttctaat 60 gatagtcttt ggtatggtgt aggacaattt atgggtaaac aagcaaactg tataacaaac 120 catcctgtta aacacatgat aattcctgga tattgtttat cgaaaatttt agggtaa 177 <210> 116 <211> 55 <212> PRT <213> Enterococcus faecium <400> 116 Met Lys Lys Tyr Asn Glu Leu Ser Lys Lys Glu Leu Leu Gln Ile Gln 1 5 10 15 Gly Gly Ile Ala Pro Ile Ile Val Ala Gly Leu Gly Tyr Leu Val Lys 20 25 30 Asp Ala Trp Asp His Ser Asp Gln Ile Ile Ser Gly Phe Lys Lys Gly 35 40 45 Trp Asn Gly Gly Arg Arg Lys 50 55 <210> 117 <211> 168 <212> DNA <213> Enterococcus faecium <400> 117 atgaaaaaat ataatgagtt atctaaaaaa gaacttctac agattcaagg aggaatagca 60 cctattatag ttgctggcct tggctattta gtaaaagatg catgggatca ctcagatcaa 120 ataatctcag gatttaaaaa aggttggaat ggtggacgta gaaaataa 168 <210> 118 <211> 343 <212> PRT <213> Enterococcus faecalis <400> 118 Met Lys Asn Ile Leu Leu Ser Ile Leu Gly Val Leu Ser Ile Val Val 1 5 10 15 Ser Leu Ala Phe Ser Ser Tyr Ser Val Asn Ala Ala Ser Asn Glu Trp 20 25 30 Ser Trp Pro Leu Gly Lys Pro Tyr Ala Gly Arg Tyr Glu Glu Gly Gln 35 40 45 Gln Phe Gly Asn Thr Ala Phe Asn Arg Gly Gly Thr Tyr Phe His Asp 50 55 60 Gly Phe Asp Phe Gly Ser Ala Ile Tyr Gly Asn Gly Ser Val Tyr Ala 65 70 75 80 Val His Asp Gly Lys Ile Leu Tyr Ala Gly Trp Asp Pro Val Gly Gly 85 90 95 Gly Ser Leu Gly Ala Phe Ile Val Leu Gln Ala Gly Asn Thr Asn Val 100 105 110 Ile Tyr Gln Glu Phe Ser Arg Asn Val Gly Asp Ile Lys Val Ser Thr 115 120 125 Gly Gln Thr Val Lys Lys Gly Gln Leu Ile Gly Lys Phe Thr Ser Ser 130 135 140 His Leu His Leu Gly Met Thr Lys Lys Glu Trp Arg Ser Ala His Ser 145 150 155 160 Ser Trp Asn Lys Asp Asp Gly Thr Trp Phe Asn Pro Ile Pro Ile Leu 165 170 175 Gln Gly Gly Ser Thr Pro Thr Pro Pro Asn Pro Gly Pro Lys Asn Phe 180 185 190 Thr Thr Asn Val Arg Tyr Gly Leu Arg Val Leu Gly Gly Ser Trp Leu 195 200 205 Pro Glu Val Thr Asn Phe Asn Asn Thr Asn Asp Gly Phe Ala Gly Tyr 210 215 220 Pro Asn Arg Gln His Asp Met Leu Tyr Ile Lys Val Asp Lys Gly Gln 225 230 235 240 Met Lys Tyr Arg Val His Thr Ala Gln Ser Gly Trp Leu Pro Trp Val 245 250 255 Ser Lys Gly Asp Lys Ser Asp Thr Val Asn Gly Ala Ala Gly Met Pro 260 265 270 Gly Gln Ala Ile Asp Gly Val Gln Leu Asn Tyr Ile Thr Pro Lys Gly 275 280 285 Glu Lys Leu Ser Gln Ala Tyr Tyr Arg Ser Gln Thr Thr Lys Arg Ser 290 295 300 Gly Trp Leu Lys Val Ser Ala Asp Asn Gly Ser Ile Pro Gly Leu Asp 305 310 315 320 Ser Tyr Ala Gly Ile Phe Gly Glu Pro Leu Asp Arg Leu Gln Ile Gly 325 330 335 Ile Ser Gln Ser Asn Pro Phe 340 <210> 119 <211> 1032 <212> DNA <213> Enterococcus faecalis <400> 119 atgaaaaata ttttactttc tattctaggg gtattatcta tcgttgtttc tttggcgttt 60 tcttcttatt ctgtcaacgc agcttctaat gagtggtcgt ggccactggg caaaccatat 120 gcgggaagat atgaagaagg acaacaattc gggaacactg catttaaccg aggaggtact 180 tatttccatg atgggtttga ctttggttct gctatttatg gaaatggcag tgtgtatgct 240 gtgcatgatg gtaaaatttt atatgctggt tgggatcctg taggtggagg ctcattaggt 300 gcatttattg tactacaagc gggaaacaca aatgtgattt atcaagaatt tagccgaaat 360 gttggagata ttaaagttag cactggacaa actgttaaaa aaggacagct gataggaaag 420 tttacttcta gtcatttaca tttaggaatg acaaaaaaag aatggcgttc tgctcattct 480 tcttggaata aagatgatgg cacttggttt aacccaattc ctatacttca aggaggatct 540 acgcctacgc ctccaaatcc aggaccaaaa aatttcacaa caaatgttcg ttacggattg 600 cgggtcctcg gaggttcatg gttaccagaa gtaaccaact ttaacaatac caatgatggt 660 ttcgcaggtt accctaatcg tcaacatgat atgctttata taaaggtaga taaagggcaa 720 atgaaatatc gtgttcacac ggctcaaagt ggatggttgc cttgggtaag taaaggggat 780 aagagcgata cagtaaatgg agcggcaggt atgcctggac aagcaattga tggtgttcag 840 ctaaactata taactcctaa gggagaaaaa ttatcacagg cttactatcg ttcacaaact 900 acgaaacgat caggctggtt aaaagtaagt gcagataatg gttctattcc tggactagac 960 agttatgcag gaatctttgg agaaccgttg gatcgcttgc aaataggtat ttcacagtca 1020 aatccatttt aa 1032 <210> 120 <211> 56 <212> PRT <213> Staphylococcus epidermidis <400> 120 Met Glu Asn Lys Lys Asp Leu Phe Asp Leu Glu Ile Lys Lys Asp Asn 1 5 10 15 Met Glu Asn Asn Asn Glu Leu Glu Ala Gln Ser Leu Gly Pro Ala Ile 20 25 30 Lys Ala Thr Arg Gln Val Cys Pro Lys Ala Thr Arg Phe Val Thr Val 35 40 45 Ser Cys Lys Lys Ser Asp Cys Gln 50 55 <210> 121 <211> 171 <212> DNA <213> Staphylococcus epidermidis <400> 121 atggaaaaca aaaaagattt atttgattta gaaatcaaaa aagataatat ggaaaataat 60 aatgaattag aagctcaatc tcttggtcct gcaattaagg caactagaca ggtatgtcct 120 aaagcaacac gttttgttac agtttcttgt aaaaaaagtg attgtcaata g 171 <210> 122 <211> 51 <212> PRT <213> Staphylococcus epidermidis <400> 122 Met Ala Ala Phe Met Lys Leu Ile Gln Phe Leu Ala Thr Lys Gly Gln 1 5 10 15 Lys Tyr Val Ser Leu Ala Trp Lys His Lys Gly Thr Ile Leu Lys Trp 20 25 30 Ile Asn Ala Gly Gln Ser Phe Glu Trp Ile Tyr Lys Gln Ile Lys Lys 35 40 45 Leu Trp Ala 50 <210> 123 <211> 156 <212> DNA <213> Staphylococcus epidermidis <400> 123 atggcagcat ttatgaagtt aattcagttc ttagcaacta aaggtcaaaa gtatgtttca 60 cttgcatgga aacataaagg tactatttta aaatggatta acgccggtca aagttttgaa 120 tggatttata aacaaatcaa aaaattatgg gcataa 156 <210> 124 <211> 52 <212> PRT <213> Staphylococcus epidermidis <400> 124 Met Glu Ala Val Lys Glu Lys Asn Asp Leu Phe Asn Leu Asp Val Lys 1 5 10 15 Val Asn Ala Lys Glu Ser Asn Asp Ser Gly Ala Glu Pro Arg Ile Ala 20 25 30 Ser Lys Phe Ile Cys Thr Pro Gly Cys Ala Lys Thr Gly Ser Phe Asn 35 40 45 Ser Tyr Cys Cys 50 <210> 125 <211> 159 <212> DNA <213> Staphylococcus epidermidis <400> 125 atggaagcag taaaagaaaa aaatgatctt tttaatcttg atgttaaagt taatgcaaaa 60 gaatctaacg attcaggagc tgaaccaaga attgctagta aatttatatg tactcctgga 120 tgtgcaaaaa caggtagttt taacagttat tgttgttaa 159 <210> 126 <211> 55 <212> PRT <213> Staphylococcus epidermidis <400> 126 Met Asn Asn Ser Leu Phe Asp Leu Asn Leu Asn Lys Gly Val Glu Thr 1 5 10 15 Gln Lys Ser Asp Leu Ser Pro Gln Ser Ala Ser Val Leu Lys Thr Ser 20 25 30 Ile Lys Val Ser Lys Lys Tyr Cys Lys Gly Val Thr Leu Thr Cys Gly 35 40 45 Cys Asn Ile Thr Gly Gly Lys 50 55 <210> 127 <211> 168 <212> DNA <213> Staphylococcus epidermidis <400> 127 atgaataact cattattcga tttaaaccta aacaaaggtg tagaaactca aaagagtgat 60 ttaagtccgc aatctgctag tgtcttgaag acttctatta aagtatctaa aaaatattgt 120 aaaggtgtta ctttaacatg cggttgcaat attactggtg gtaaataa 168 <210> 128 <211> 52 <212> PRT <213> Staphylococcus gallinarum <400> 128 Met Glu Ala Val Lys Glu Lys Asn Glu Leu Phe Asp Leu Asp Val Lys 1 5 10 15 Val Asn Ala Lys Glu Ser Asn Asp Ser Gly Ala Glu Pro Arg Ile Ala 20 25 30 Ser Lys Phe Leu Cys Thr Pro Gly Cys Ala Lys Thr Gly Ser Phe Asn 35 40 45 Ser Tyr Cys Cys 50 <210> 129 <211> 159 <212> DNA <213> Staphylococcus gallinarum <400> 129 atggaagcag taaaagagaa aaatgaactt tttgatcttg acgttaaagt aaatgcaaaa 60 gagtctaatg attcaggcgc agaaccacga attgctagta aatttttatg tactcctgga 120 tgtgccaaaa caggtagctt caatagctac tgttgttaa 159 <210> 130 <211> 63 <212> PRT <213> Lactococcus garvieae <400> 130 Met Glu Asn Asn Asn Tyr Thr Val Leu Ser Asp Glu Glu Leu Gln Lys 1 5 10 15 Ile Asp Gly Gly Ile Gly Gly Ala Leu Gly Asn Ala Leu Asn Gly Leu 20 25 30 Gly Thr Trp Ala Asn Met Met Asn Gly Gly Gly Phe Val Asn Gln Trp 35 40 45 Gln Val Tyr Ala Asn Lys Gly Lys Ile Asn Gln Tyr Arg Pro Tyr 50 55 60 <210> 131 <211> 192 <212> DNA <213> Lactococcus garvieae <400> 131 atggaaaaca acaattacac agtactttca gatgaagaac tacaaaaaat tgatggtgga 60 atcggcgggg ctcttggtaa tgctctcaac ggattaggta cctgggcaaa catgatgaac 120 ggtggaggat ttgttaatca gtggcaagtt tatgctaata aaggaaaaat aaatcaatac 180 cgtccgtatt aa 192 <210> 132 <211> 63 <212> PRT <213> Lactococcus garvieae <400> 132 Met Phe Asp Leu Val Ala Thr Gly Met Ala Ala Gly Val Ala Lys Thr 1 5 10 15 Ile Val Asn Ala Val Ser Ala Gly Met Asp Ile Ala Thr Ala Leu Ser 20 25 30 Leu Phe Ser Gly Ala Phe Thr Ala Ala Gly Gly Ile Met Ala Leu Ile 35 40 45 Lys Lys Tyr Ala Gln Lys Lys Leu Trp Lys Gln Leu Ile Ala Ala 50 55 60 <210> 133 <211> 192 <212> DNA <213> Lactococcus garvieae <400> 133 atgtttgatt tagtcgcgac tggaatggct gcaggtgtag caaaaactat tgttaatgcc 60 gttagtgctg gtatggatat tgccactgct ttatcattgt tctcaggagc ttttactgca 120 gctgggggaa ttatggcact cattaaaaaa tatgctcaaa agaaattatg gaaacagctt 180 attgctgcat aa 192 <210> 134 <211> 91 <212> PRT <213> Lactobacillus gasseri <400> 134 Met Val Thr Lys Tyr Gly Arg Asn Leu Gly Leu Asn Lys Val Glu Leu 1 5 10 15 Phe Ala Ile Trp Ala Val Leu Val Val Ala Leu Leu Leu Thr Thr Ala 20 25 30 Asn Ile Tyr Trp Ile Ala Asp Gln Phe Gly Ile His Leu Ala Thr Gly 35 40 45 Thr Ala Arg Lys Leu Leu Asp Ala Met Ala Ser Gly Ala Ser Leu Gly 50 55 60 Thr Ala Phe Ala Ala Ile Leu Gly Val Thr Leu Pro Ala Trp Ala Leu 65 70 75 80 Ala Ala Ala Gly Ala Leu Gly Ala Thr Ala Ala 85 90 <210> 135 <211> 276 <212> DNA <213> Lactobacillus gasseri <400> 135 atggttacta agtacggacg taatttaggt ttgaacaagg tagagttgtt tgcaatttgg 60 gcggttttag tagttgctct tttattgacc acagcgaaca tttattggat tgctgatcaa 120 ttcgggattc atttagcgac tggaacagcc cgtaagttat tagatgcaat ggcttctggt 180 gcctcattgg gaactgcctt tgctgctatt ttgggcgtga cattacctgc atgggctttg 240 gcagctgcag gagcattggg agcgactgca gcctag 276 <210> 136 <211> 75 <212> PRT <213> Lactobacillus gasseri <400> 136 Met Lys Asn Phe Asn Thr Leu Ser Phe Glu Thr Leu Ala Asn Ile Val 1 5 10 15 Gly Gly Arg Asn Asn Trp Ala Ala Asn Ile Gly Gly Val Gly Gly Ala 20 25 30 Thr Val Ala Gly Trp Ala Leu Gly Asn Ala Val Cys Gly Pro Ala Cys 35 40 45 Gly Phe Val Gly Ala His Tyr Val Pro Ile Ala Trp Ala Gly Val Thr 50 55 60 Ala Ala Thr Gly Gly Phe Gly Lys Ile Arg Lys 65 70 75 <210> 137 <211> 228 <212> DNA <213> Lactobacillus gasseri <400> 137 atgaaaaatt ttaatacatt atcatttgaa acattggcta acatagttgg tgggagaaat 60 aattgggctg ctaatatagg tggagtaggt ggagcgacag tcgctggatg ggctcttgga 120 aatgcagttt gcggtcctgc ttgtggcttt gttggagcac actatgttcc aatagcatgg 180 gctggcgtaa cggcagctac tggtggattc ggaaagataa gaaagtag 228 <210> 138 <211> 64 <212> PRT <213> Lactobacillus plantarum <400> 138 Met Ser Lys Leu Val Lys Thr Leu Thr Ile Ser Glu Ile Ser Lys Ala 1 5 10 15 Gln Asn Asn Gly Gly Lys Pro Ala Trp Cys Trp Tyr Thr Leu Ala Met 20 25 30 Cys Gly Ala Gly Tyr Asp Ser Gly Thr Cys Asp Tyr Met Tyr Ser His 35 40 45 Cys Phe Gly Ile Lys His His Ser Ser Gly Ser Ser Ser Tyr His Cys 50 55 60 <210> 139 <211> 195 <212> DNA <213> Lactobacillus plantarum <400> 139 atgagtaaat tggttaagac acttactata agtgaaattt ctaaggctca aaacaacggt 60 ggaaaacctg catggtgttg gtatacttta gcaatgtgtg gtgctggtta tgattcggga 120 acctgtgatt atatgtattc gcattgtttt ggtataaagc atcatagtag tggtagtagc 180 agttatcatt gttag 195 <210> 140 <211> 359 <212> PRT <213> Haloferax mediterranei <400> 140 Met Ser Lys Asp Arg Asp Gly Arg Arg Thr Ser Arg Arg Gly Thr Leu 1 5 10 15 Lys Lys Ile Gly Gly Phe Ser Leu Gly Ala Leu Ser Phe Gly Ala Val 20 25 30 Gly Arg Thr Gln Ala Ala Thr Gly Ser Ser Val Thr Thr Ala Asp Ile 35 40 45 Ala Pro Pro Gly Pro Asn Gly Asp Pro Lys Ser Val Gln Ile Asp Asp 50 55 60 Lys Tyr Thr Gly Ala Glu Met Tyr Gly Glu Gly Asp Phe Arg Val Gly 65 70 75 80 Leu Gly Thr Asp Leu Thr Met Tyr Pro Pro Val Tyr Arg Glu Ser Leu 85 90 95 Gly Asn Gly Ser Gly Gly Trp Glu Phe Asp Phe Thr Val Cys Gly Ser 100 105 110 Thr Ala Cys Arg Phe Val Asp Ser Asn Gly Asp Val Lys Glu Asp Asp 115 120 125 Lys Ala Lys Glu Met Trp Trp Gln Glu Ile Asn Phe Asn Asp Ile Asn 130 135 140 Gln Asp Leu Tyr Ser Arg Asn Asp Ser Asp Trp Val Gly Ser Thr Pro 145 150 155 160 Ala Asp Thr Gln Pro Glu Phe Asp Tyr Thr Glu Phe Ala Leu Ala Arg 165 170 175 Asp Gly Val Thr Leu Ala Leu Thr Ala Leu Asn Pro Ala Met Gly Ser 180 185 190 Leu Ala Leu Gly Ala Thr Tyr Phe Leu Ser Asp Met Val Asn Trp Ile 195 200 205 Ala Ser Gln His Glu Asp Asp Ser Ser Leu Lys Arg Lys Trp Asp Tyr 210 215 220 Asp Gly Leu Ser Gly Pro Leu Tyr Ala Asp Ser Ser Thr Tyr Leu Leu 225 230 235 240 Ala Arg Asp Glu Met Thr Ser Asn Ser Tyr Glu Ser Phe Thr Ile Asp 245 250 255 Asn Ile Ala Val Ala Phe Pro Glu Phe Pro Val Arg Thr Lys Tyr Tyr 260 265 270 Val Thr Phe Thr Ala Pro Asp Asp Pro Ser Thr Gln Ser Ile Ser Thr 275 280 285 Leu Glu Glu Glu Gly Ile Tyr Arg Val Pro Ala Thr Glu Val Ala Ala 290 295 300 Ala Arg Pro Pro Gly Ser Arg Arg Ser Lys Ser Ala Ala Asp Glu Met 305 310 315 320 Val Tyr Val Ala Asp Pro Lys Lys Phe Ile Glu Val Glu Pro Val Lys 325 330 335 Asn Pro Ser Ile Pro Asp Arg Ile Tyr Glu Glu Ile Glu Gln Lys Lys 340 345 350 Lys Gln Arg Ser Arg Lys Gln 355 <210> 141 <211> 1080 <212> DNA <213> Haloferax mediterranei <400> 141 atgtcgaaag acagagatgg gagaaggaca agtcggcgag gcacgttaaa gaaaatcggc 60 ggtttcagtc tcggagcgct tagtttcggg gcagtcggac gaactcaagc ggcgaccggc 120 tcatcggtta cgaccgctga tatcgcacct cccggaccga acggagaccc gaagagtgtt 180 cagatagatg ataaatacac cggagccgag atgtacggcg agggtgactt cagagtcggt 240 ctcggaactg acctgacgat gtatccgccc gtgtaccgtg agagtcttgg aaatggaagc 300 gggggttggg aattcgactt caccgtttgt gggtccactg cctgtcgatt tgtggacagt 360 aacggtgacg tcaaagagga cgacaaggcg aaagaaatgt ggtggcagga aattaacttc 420 aacgacataa atcaggattt atacagtcgg aacgattccg actgggtcgg gtcgacccct 480 gccgataccc aaccggagtt cgattacacc gactttgcgc tcgctcggga cggagtgacg 540 ctcgctctca cggcactcaa ccccgcaatg gggagtcttg cactcggtgc cacgtacttc 600 ctcagcgaca tggtgaactg gattgcgagc cagcacgaag acgacagttc gctcaagaga 660 aaatgggatt acgacgggct aagtgggccg ttgtacgccg attcgtcgac gtacctactg 720 gcacgcgacg agatgacttc gaactcgtac gaatcattca cgatcgataa catcgccgtt 780 gccttcccag agttccccgt ccggaccaag tactacgtca cattcactgc gccggatgac 840 ccgtcaacgc agtcgatatc tacgctcgaa gaggagggaa tctaccgagt gcccgctacg 900 gaagtggctg cggccagacc accggggtcc cgacgttcca aatcggcagc cgacgagatg 960 gtgtacgttg ccgatccgaa gaagttcata gaggtcgagc cggtgaagaa cccaagtatc 1020 ccggaccgaa tctacgagga gatagagcaa aaaaagaaac aacggagtag gaaacagtag 1080 <210> 142 <211> 311 <212> PRT <213> Haloarchaeon S8a <400> 142 Met Ser Asp Lys Asp Ser Ile Asn Arg Arg Asn Val Leu Arg Lys Ile 1 5 10 15 Gly Gly Ile Gly Val Ala Ser Ala Val Gly Phe Ser Gly Leu Ala Ser 20 25 30 Gly Glu Ser Leu Ser Asp Asp Glu Lys Gln Asp Val Ile Asp Thr Ile 35 40 45 Tyr Lys Ser Gln Arg Val Glu Gln Ile Lys Lys Lys Phe Gly Gly Val 50 55 60 Asn Ile Glu Pro Lys Lys Val Gln Ser Val Thr Thr Asn Gln Ser Gly 65 70 75 80 Asp Leu Val Thr Ala Lys Leu Ser Val Ser Asp Gly Asp Leu Val Tyr 85 90 95 Ser Ser Val Lys Asp Thr Thr Val Ile Val Gln Phe Asp Arg Ser Ala 100 105 110 Ser Glu Ile Gly Glu Ser Trp Pro Lys Asn Thr Glu Ala Phe Ile Lys 115 120 125 Ser Thr Ser Ser Gly Val Asp Leu Leu Arg Thr Ala Thr Asp Glu Glu 130 135 140 Ile Lys Asp Val Thr Glu Gly Val Asn Thr Ser Glu Ile Glu Ser Ala 145 150 155 160 Asp Ala Val Asn Ile Phe Ile Asp Pro Glu Ser Gln Thr Tyr Tyr Met 165 170 175 Glu Lys Tyr Asp Phe Asn Asn Lys Val Leu Glu Met Phe Glu Leu Ala 180 185 190 Thr Gly Gly Thr Ser Ser Gly Lys Ile Ser Pro Thr Arg Glu Asp Gln 195 200 205 Asn His Glu Tyr Asn Val Arg Glu His Lys Val Phe Asn Ser Glu Lys 210 215 220 Gln Asn Ile Gln Leu Gln Ser Asp Cys Asn Ile Asn Ser Asn Thr Ala 225 230 235 240 Ala Asp Val Ile Leu Cys Phe Asn Gln Val Gly Ser Cys Ala Leu Cys 245 250 255 Ser Pro Thr Leu Val Gly Gly Pro Val Pro Thr Val Ala Cys Leu Leu 260 265 270 Val Val Cys Phe Gly Thr Pro Asn Ala Val Ser Ala Ile Leu Glu Glu 275 280 285 Val Asp Asn Ser Cys Phe Asn Leu Ile Lys Asp Val Ile Ser Cys Trp 290 295 300 Asp Glu Trp Thr Ser Phe Trp 305 310 <210> 143 <211> 936 <212> DNA <213> Haloarchaeon S8a <400> 143 atgtcggata aagacagcat taacagaaga aatgtattaa gaaaaattgg cggtatcggt 60 gtggcttcag ctgtcggatt ttctggtttg gcaagcgggg aaagtcttag cgatgatgag 120 aaacaagatg ttattgacac aatttacaaa tcacaaagag ttgaacagat aaagaaaaag 180 ttcggaggag tgaatattga gccgaaaaag gttcaatctg taacgaccaa tcagagcgga 240 gatcttgtta cggcgaagct gtcggttagt gatggggatt tggtatattc gagtgtcaaa 300 gatacaactg taatagttca gttcgataga tcggcttctg aaattggtga aagttggccc 360 aagaatactg aggcattcat caaatcgacg tcctctgggg tcgatcttct acgtacagca 420 actgatgaag aaataaagga cgttactgag ggagtcaaca catctgaaat tgaatctgcg 480 gatgctgtta acatatttat tgatcctgaa tcacagacat actatatgga gaaatatgac 540 tttaataata aggtacttga gatgtttgaa ttagcgacag gtgggacaag tagtggtaaa 600 atctccccca cacgtgaaga ccagaatcac gaatataatg ttagggaaca taaagtattt 660 aactcagaaa aacagaatat acaacttcag agtgactgta atataaacag taacaccgct 720 gctgatgtta ttctatgctt caaccaggtt ggttcttgtg cactctgctc cccgacttta 780 gtcggaggtc cagtccctac agttgcatgt ctcttagtcg tctgtttcgg cactccaaat 840 gctgtgtccg cgatacttga agaagtcgat aattcttgct ttaacttgat caaggatgta 900 atttcgtgtt gggatgaatg gactagcttc tggtga 936 <210> 144 <211> 333 <212> PRT <213> Lactobacillus helveticus <400> 144 Met Lys His Leu Asn Glu Thr Thr Asn Val Arg Ile Leu Ser Gln Phe 1 5 10 15 Asp Met Asp Thr Gly Tyr Gln Ala Val Val Gln Lys Gly Asn Val Gly 20 25 30 Ser Lys Tyr Val Tyr Gly Leu Gln Leu Arg Lys Gly Ala Thr Thr Ile 35 40 45 Leu Arg Gly Tyr Arg Gly Ser Lys Ile Asn Asn Pro Ile Leu Glu Leu 50 55 60 Ser Gly Gln Ala Gly Gly His Thr Gln Thr Trp Glu Phe Ala Gly Asp 65 70 75 80 Arg Lys Asp Ile Asn Gly Glu Glu Arg Ala Gly Gln Trp Phe Ile Gly 85 90 95 Val Lys Pro Ser Lys Ile Glu Gly Ser Lys Ile Ile Trp Ala Lys Gln 100 105 110 Ile Ala Arg Val Asp Leu Arg Asn Gln Met Gly Pro His Tyr Ser Asn 115 120 125 Thr Asp Phe Pro Arg Leu Ser Tyr Leu Asn Arg Ala Gly Ser Asn Pro 130 135 140 Phe Ala Gly Asn Lys Met Thr His Ala Glu Ala Ala Val Ser Pro Asp 145 150 155 160 Tyr Thr Lys Phe Leu Ile Ala Thr Val Glu Asn Asn Cys Ile Gly His 165 170 175 Phe Thr Ile Tyr Asn Leu Asp Thr Ile Asn Glu Lys Leu Asp Glu Lys 180 185 190 Gly Asn Ser Glu Asp Val Asn Leu Glu Thr Val Lys Tyr Glu Asp Ser 195 200 205 Phe Ile Ile Asp Asn Leu Tyr Gly Asp Asp Asn Asn Ser Ile Val Asn 210 215 220 Ser Ile Gln Gly Tyr Asp Leu Asp Asn Asp Gly Asn Ile Tyr Ile Ser 225 230 235 240 Ser Gln Lys Ala Pro Asp Phe Asp Gly Ser Tyr Tyr Ala His His Lys 245 250 255 Gln Ile Val Lys Ile Pro Tyr Tyr Ala Arg Ser Lys Glu Ser Glu Asp 260 265 270 Gln Trp Arg Ala Val Asn Leu Ser Glu Phe Gly Gly Leu Asp Ile Pro 275 280 285 Gly Lys His Ser Glu Val Glu Ser Ile Gln Ile Ile Gly Glu Asn His 290 295 300 Cys Tyr Leu Thr Val Ala Tyr His Ser Lys Asn Lys Ala Gly Glu Asn 305 310 315 320 Lys Thr Thr Leu Asn Glu Ile Tyr Glu Leu Ser Trp Asn 325 330 <210> 145 <211> 1002 <212> DNA <213> Lactobacillus helveticus <400> 145 atgaagcatt taaatgaaac aactaatgtt agaattttaa gtcaatttga tatggatact 60 ggctatcaag cagtagttca aaaaggcaat gtaggttcaa aatatgtata tggattacaa 120 cttcgcaaag gtgctactac tatcttgcgt ggttaccgtg gaagtaaaat taataaccct 180 attcttgaat tatctggtca agcaggtggt cacacacaga catgggaatt tgctggtgat 240 cgtaaagaca ttaatggtga agaaagagca ggtcaatggt ttataggtgt taaaccatcg 300 aaaattgaag gaagcaaaat tatttgggca aagcaaattg caagagttga tcttagaaat 360 caaatgggac ctcattattc aaatactgac tttcctcgat tatcctactt gaatcgcgcc 420 ggttctaatc catttgctgg taataagatg acgcatgccg aagccgcagt atcacctgat 480 tatactaagt ttttaattgc tactgttgaa aataactgta ttggtcattt tactatatac 540 aatttagata caattaatga aaaacttgat gaaaagggaa atagtgaaga tgttaatctc 600 gaaactgtta aatacgaaga tagttttatc attgataatt tatatggtga tgataataat 660 tctattgtaa attcaattca agggtatgat ttggataatg atggaaatat ttatatttcc 720 agtcaaaaag cgccagattt tgatggctct tattatgcac atcataagca gattgttaag 780 attccatatt atgctcggtc taaagaaagc gaagaccaat ggagagctgt aaatttaagc 840 gaattcggtg gcttggatat tccaggtaaa catagtgaag ttgaaagcat ccaaattatt 900 ggtgagaatc attgttactt aactgttgca tatcattcta aaaataaagc gggtgaaaat 960 aaaactactt tgaatgagat ttatgaatta tcttggaatt ag 1002 <210> 146 <211> 74 <212> PRT <213> Enterococcus hirae <400> 146 Met Lys Lys Lys Val Leu Lys His Cys Val Ile Leu Gly Ile Leu Gly 1 5 10 15 Thr Cys Leu Ala Gly Ile Gly Thr Gly Ile Lys Val Asp Ala Ala Thr 20 25 30 Tyr Tyr Gly Asn Gly Leu Tyr Cys Asn Lys Glu Lys Cys Trp Val Asp 35 40 45 Trp Asn Gln Ala Lys Gly Glu Ile Gly Lys Ile Ile Val Asn Gly Trp 50 55 60 Val Asn His Gly Pro Trp Ala Pro Arg Arg 65 70 <210> 147 <211> 225 <212> DNA <213> Enterococcus hirae <400> 147 atgaaaaaga aagtattaaa acattgtgtt attctaggaa tattaggaac ttgtctagct 60 ggcatcggta caggaataaa agttgatgca gctacttact atggaaatgg tctttattgt 120 aacaaagaaa aatgttgggt agattggaat caagctaaag gagaaattgg aaaaattatt 180 gttaatggtt gggttaatca tggtccatgg gcacctagaa ggtag 225 <210> 148 <211> 75 <212> PRT <213> Lactobacillus johnsonii <400> 148 Met Lys Gln Phe Asn Tyr Leu Ser His Lys Asp Leu Ala Val Val Val 1 5 10 15 Gly Gly Arg Asn Asn Trp Gln Thr Asn Val Gly Gly Ala Val Gly Ser 20 25 30 Ala Met Ile Gly Ala Thr Val Gly Gly Thr Ile Cys Gly Pro Ala Cys 35 40 45 Ala Val Ala Gly Ala His Tyr Leu Pro Ile Leu Trp Thr Ala Val Thr 50 55 60 Ala Ala Thr Gly Gly Phe Gly Lys Ile Arg Lys 65 70 75 <210> 149 <211> 228 <212> DNA <213> Lactobacillus johnsonii <400> 149 atgaaacaat ttaattattt atcacataaa gatttagcag tcgttgttgg tggaagaaat 60 aattggcaaa caaatgtggg aggagcagtg ggatcagcta tgattggggc tacagttggt 120 ggtacaattt gtggacctgc atgtgctgta gctggtgccc attatcttcc tattttatgg 180 acagcggtta cagctgcaac aggtggtttt ggcaagataa gaaagtag 228 <210> 150 <211> 62 <212> PRT <213> Lactobacillus johnsonii <400> 150 Met Lys Leu Asn Asp Lys Glu Leu Ser Lys Ile Val Gly Gly Asn Arg 1 5 10 15 Trp Gly Asp Thr Val Leu Ser Ala Ala Ser Gly Ala Gly Thr Gly Ile 20 25 30 Lys Ala Cys Lys Ser Phe Gly Pro Trp Gly Met Ala Ile Cys Gly Val 35 40 45 Gly Gly Ala Ala Ile Gly Gly Tyr Phe Gly Tyr Thr His Asn 50 55 60 <210> 151 <211> 189 <212> DNA <213> Lactobacillus johnsonii <400> 151 atgaaattaa atgacaaaga attatcaaag attgttggtg gaaatcgatg gggagatact 60 gttttatcag ctgctagtgg cgcaggaact ggtattaaag catgtaaaag ttttggccca 120 tggggaatgg caatttgtgg tgtaggaggt gcagcaatag gaggttattt tggctatact 180 cataattaa 189 <210> 152 <211> 59 <212> PRT <213> Lactococcus lactis subsp. lactis <400> 152 Met Asn Lys Asn Glu Ile Glu Thr Gln Pro Val Thr Trp Leu Glu Glu 1 5 10 15 Val Ser Asp Gln Asn Phe Asp Glu Asp Val Phe Gly Ala Cys Ser Thr 20 25 30 Asn Thr Phe Ser Leu Ser Asp Tyr Trp Gly Asn Asn Gly Ala Trp Cys 35 40 45 Thr Leu Thr His Glu Cys Met Ala Trp Cys Lys 50 55 <210> 153 <211> 180 <212> DNA <213> Lactococcus lactis subsp. lactis <400> 153 atgaacaaaa atgaaattga aacacaacca gttacatggt tggaagaagt atctgatcaa 60 aattttgatg aagatgtatt tggtgcgtgt agtactaaca cattctcgct cagtgattac 120 tggggaaata acggggcttg gtgtacactc actcatgaat gtatggcttg gtgtaaataa 180 <210> 154 <211> 65 <212> PRT <213> Lactococcus lactis subsp. lactis <400> 154 Met Lys Glu Lys Asn Met Lys Lys Asn Asp Thr Ile Glu Leu Gln Leu 1 5 10 15 Gly Lys Tyr Leu Glu Asp Asp Met Ile Glu Leu Ala Glu Gly Asp Glu 20 25 30 Ser His Gly Gly Thr Thr Pro Ala Thr Pro Ala Ile Ser Ile Leu Ser 35 40 45 Ala Tyr Ile Ser Thr Asn Thr Cys Pro Thr Thr Lys Cys Thr Arg Ala 50 55 60 Cys 65 <210> 155 <211> 198 <212> DNA <213> Lactococcus lactis subsp. lactis <400> 155 atgaaagaaa aaaatatgaa aaagaatgac actattgaat tacaattggg aaaatacctt 60 gaagatgata tgattgaatt agctgaaggg gatgagtctc atggaggaac aacaccagca 120 actcctgcaa tctctattct cagtgcatat attagtacca atacttgtcc aacaacaaaa 180 tgtacacgtg cttgttaa 198 <210> 156 <211> 51 <212> PRT <213> Lactococcus lactis subsp. lactis <400> 156 Met Lys Glu Gln Asn Ser Phe Asn Leu Leu Gln Glu Val Thr Glu Ser 1 5 10 15 Glu Leu Asp Leu Ile Leu Gly Ala Lys Gly Gly Ser Gly Val Ile His 20 25 30 Thr Ile Ser His Glu Cys Asn Met Asn Ser Trp Gln Phe Val Phe Thr 35 40 45 Cys Cys Ser 50 <210> 157 <211> 156 <212> DNA <213> Lactococcus lactis subsp. lactis <400> 157 atgaaagaac aaaactcttt taatcttctt caagaagtga cagaaagtga attggacctt 60 attttaggtg caaaaggcgg cagtggagtt attcatacaa tttctcatga atgtaatatg 120 aatagctggc aatttgtatt tacttgctgc tcttaa 156 <210> 158 <211> 53 <212> PRT <213> Lactococcus lactis <400> 158 Met Ala Gly Phe Leu Lys Val Val Gln Leu Leu Ala Lys Tyr Gly Ser 1 5 10 15 Lys Ala Val Gln Trp Ala Trp Ala Asn Lys Gly Lys Ile Leu Asp Trp 20 25 30 Leu Asn Ala Gly Gln Ala Ile Asp Trp Val Val Ser Lys Ile Lys Gln 35 40 45 Ile Leu Gly Ile Lys 50 <210> 159 <211> 162 <212> DNA <213> Lactococcus lactis <400> 159 atggcagggt ttttaaaagt agttcaatta ctagctaaat atggttctaa agctgtacaa 60 tgggcttggg caaacaaggg taagatttta gattggctta atgcaggtca ggctattgat 120 tgggtagttt cgaaaattaa gcaaatttta ggtattaagt aa 162 <210> 160 <211> 53 <212> PRT <213> Lactococcus lactis <400> 160 Met Ala Gly Phe Leu Lys Val Val Gln Ile Leu Ala Lys Tyr Gly Ser 1 5 10 15 Lys Ala Val Gln Trp Ala Trp Ala Asn Lys Gly Lys Ile Leu Asp Trp 20 25 30 Ile Asn Ala Gly Gln Ala Ile Asp Trp Val Val Glu Lys Ile Lys Gln 35 40 45 Ile Leu Gly Ile Lys 50 <210> 161 <211> 162 <212> DNA <213> Lactococcus lactis <400> 161 atggcagggt ttttaaaagt agtccaaatt ttggctaagt atggttctaa agccgtacaa 60 tgggcatggg caaataaagg aaaaatctta gattggatta atgcaggtca agctattgac 120 tgggtagttg aaaagattaa gcaaattttg ggtattaaat aa 162 <210> 162 <211> 65 <212> PRT <213> Lactobacillus amylovorus <400> 162 Met Lys Gln Leu Asn Ser Glu Gln Leu Gln Asn Ile Ile Gly Gly Asn 1 5 10 15 Arg Trp Thr Asn Ala Tyr Ser Ala Ala Leu Gly Cys Ala Val Pro Gly 20 25 30 Val Lys Tyr Gly Lys Lys Leu Gly Gly Val Trp Gly Ala Val Ile Gly 35 40 45 Gly Val Gly Gly Ala Ala Val Cys Gly Leu Ala Gly Tyr Val Arg Lys 50 55 60 Gly 65 <210> 163 <211> 198 <212> DNA <213> Lactobacillus amylovorus <400> 163 atgaaacaat tgaattcaga acaattacaa aatattatcg gtggaaatag atggactaat 60 gcatacagcg cagctttggg atgcgctgtc cctggagtta aatatggaaa aaaacttggt 120 ggcgtatggg gtgctgtaat tggtggcgta ggcggtgcag cagtctgtgg cttggcgggt 180 tatgttcgta aaggctaa 198 <210> 164 <211> 68 <212> PRT <213> Lactobacillus sakei L45 <400> 164 Met Lys Thr Glu Lys Lys Val Leu Asp Glu Leu Ser Leu His Ala Ser 1 5 10 15 Ala Lys Met Gly Ala Arg Asp Val Glu Ser Ser Met Asn Ala Asp Ser 20 25 30 Thr Pro Val Leu Ala Ser Val Ala Val Ser Met Glu Leu Leu Pro Thr 35 40 45 Ala Ser Val Leu Tyr Ser Asp Val Ala Gly Cys Phe Lys Tyr Ser Ala 50 55 60 Lys His His Cys 65 <210> 165 <211> 207 <212> DNA <213> Lactobacillus sakei L45 <400> 165 atgaaaacag aaaaaaaggt tttagatgaa ctgagcttac acgcttctgc aaaaatggga 60 gcacgtgatg ttgaatccag catgaatgca gactcaacac cagttttagc atcagtcgct 120 gtatccatgg aattattgcc aactgcgtct gttctttatt cggatgttgc aggttgcttc 180 aaatattctg caaaacatca ttgttag 207 <210> 166 <211> 91 <212> PRT <213> Lactococcus lactis subsp. lactis <400> 166 Met Lys Thr Lys Ser Leu Val Leu Ala Leu Ser Ala Val Thr Leu Phe 1 5 10 15 Ser Ala Gly Gly Ile Val Ala Gln Ala Glu Gly Thr Trp Gln His Gly 20 25 30 Tyr Gly Val Ser Ser Ala Tyr Ser Asn Tyr His His Gly Ser Lys Thr 35 40 45 His Ser Ala Thr Val Val Asn Asn Asn Thr Gly Arg Gln Gly Lys Asp 50 55 60 Thr Gln Arg Ala Gly Val Trp Ala Lys Ala Thr Val Gly Arg Asn Leu 65 70 75 80 Thr Glu Lys Ala Ser Phe Tyr Tyr Asn Phe Trp 85 90 <210> 167 <211> 276 <212> DNA <213> Lactococcus lactis subsp. lactis <400> 167 atgaaaacca agtctctcgt attggcatta tctgcggtta cgttattctc tgccggagga 60 attgtagctc aagctgaagg aacatggcaa catggatatg gtgttagttc ggcatattca 120 aattatcatc atggtagcaa aactcattca gccacagttg taaataataa tactggccga 180 caaggtaagg atacacaacg tgccggtgtt tgggcaaaag ctactgttgg acgtaactta 240 actgaaaaag cttcatttta ttataacttt tggtaa 276 <210> 168 <211> 75 <212> PRT <213> Lactococcus lactis subsp. cremoris <400> 168 Met Lys Asn Gln Leu Asn Phe Asn Ile Val Ser Asp Glu Glu Leu Ser 1 5 10 15 Glu Ala Asn Gly Gly Lys Leu Thr Phe Ile Gln Ser Thr Ala Ala Gly 20 25 30 Asp Leu Tyr Tyr Asn Thr Asn Thr His Lys Tyr Val Tyr Gln Gln Thr 35 40 45 Gln Asn Ala Phe Gly Ala Ala Ala Asn Thr Ile Val Asn Gly Trp Met 50 55 60 Gly Gly Ala Ala Gly Gly Phe Gly Leu His His 65 70 75 <210> 169 <211> 228 <212> DNA <213> Lactococcus lactis subsp. cremoris <400> 169 atgaaaaatc aattaaattt taatattgtt tcagatgaag aactttcaga agctaacgga 60 ggaaaattaa catttattca atcgacagcg gctggagatt tatattacaa tactaataca 120 cacaaatatg tttaccaaca aactcaaaac gcttttgggg ctgctgctaa taccattgtt 180 aatggatgga tgggtggcgc tgctggaggt ttcgggttgc accattga 228 <210> 170 <211> 68 <212> PRT <213> Lactococcus lactis subsp. cremoris <400> 170 Met Lys Asn Gln Leu Asn Phe Asn Ile Val Ser Asp Glu Glu Leu Ala 1 5 10 15 Glu Val Asn Gly Gly Ser Leu Gln Tyr Val Met Ser Ala Gly Pro Tyr 20 25 30 Thr Trp Tyr Lys Asp Thr Arg Thr Gly Lys Thr Ile Cys Lys Gln Thr 35 40 45 Ile Asp Thr Ala Ser Tyr Thr Phe Gly Val Met Ala Glu Gly Trp Gly 50 55 60 Lys Thr Phe His 65 <210> 171 <211> 207 <212> DNA <213> Lactococcus lactis subsp. cremoris <400> 171 atgaaaaatc aattaaattt taatattgtt tctgatgaag aacttgcaga agttaatgga 60 ggaagcttgc agtatgttat gagtgctgga ccatatactt ggtataaaga tactagaaca 120 ggaaaaacaa tatgtaaaca gacaattgac acagcaagtt atacatttgg tgtaatggca 180 gaaggatggg gaaaaacatt ccactaa 207 <210> 172 <211> 63 <212> PRT <213> Lactococcus sp. QU 12 <400> 172 Met Lys Leu Ile Asp His Leu Gly Ala Pro Arg Trp Ala Val Asp Thr 1 5 10 15 Ile Leu Gly Ala Ile Ala Val Gly Asn Leu Ala Ser Trp Val Leu Ala 20 25 30 Leu Val Pro Gly Pro Gly Trp Ala Val Lys Ala Gly Leu Ala Thr Ala 35 40 45 Ala Ala Ile Val Lys His Gln Gly Lys Ala Ala Ala Ala Ala Trp 50 55 60 <210> 173 <211> 192 <212> DNA <213> Lactococcus sp. QU 12 <400> 173 atgaaattaa ttgatcattt aggtgctcca agatgggccg ttgatactat tttaggtgca 60 atcgcagttg ggaacttagc aagttgggtt ctagcgcttg tccctggtcc agggtgggca 120 gtaaaagctg gtttagcaac tgctgctgcc atcgttaaac atcaaggtaa agctgccgct 180 gctgcttggt aa 192 <210> 174 <211> 50 <212> PRT <213> Brevibacillus sp. GI-9 <400> 174 Met Ala Cys Gln Cys Pro Asp Ala Ile Ser Gly Trp Thr His Thr Asp 1 5 10 15 Tyr Gln Cys His Gly Leu Glu Asn Lys Met Tyr Arg His Val Tyr Ala 20 25 30 Ile Cys Met Asn Gly Thr Gln Val Tyr Cys Arg Thr Glu Trp Gly Ser 35 40 45 Ser Cys 50 <210> 175 <211> 153 <212> DNA <213> Brevibacillus sp. GI-9 <400> 175 atggcttgcc aatgtccaga tgcgatctca ggttggacgc atacagatta ccagtgtcac 60 ggtttggaga ataaaatgta tagacatgtt tatgcaattt gcatgaacgg tactcaagta 120 tattgcagaa cagagtgggg tagcagctgc tag 153 <210> 176 <211> 57 <212> PRT <213> Leuconostoc pseudomesenteroides <400> 176 Met Asn Lys Glu Tyr Asn Ser Ile Ser Asn Phe Lys Lys Ile Thr Asn 1 5 10 15 Lys Asp Leu Gln Asn Ile Asn Gly Gly Phe Ile Gly Arg Ala Ile Gly 20 25 30 Asp Phe Val Tyr Phe Gly Ala Lys Gly Leu Arg Glu Ser Gly Lys Leu 35 40 45 Leu Asn Tyr Tyr Tyr Lys His Lys His 50 55 <210> 177 <211> 174 <212> DNA <213> Leuconostoc pseudomesenteroides <400> 177 atgaataaag aatataatag cattagcaat tttaaaaaaa ttactaataa agacttgcaa 60 aacataaatg gtggatttat tggtagggca ataggtgact ttgtgtactt tggagcgaag 120 ggactaagag aatctggtaa actacttaat tattactata agcataagca ttga 174 <210> 178 <211> 53 <212> PRT <213> Leuconostoc pseudomesenteroides <400> 178 Met Lys Asn Gln Leu Met Ser Phe Glu Val Ile Ser Glu Lys Glu Leu 1 5 10 15 Ser Thr Val Gln Gly Gly Lys Gly Leu Gly Lys Leu Ile Gly Ile Asp 20 25 30 Trp Leu Leu Gly Gln Ala Lys Asp Ala Val Lys Gln Tyr Lys Lys Asp 35 40 45 Tyr Lys Arg Trp His 50 <210> 179 <211> 162 <212> DNA <213> Leuconostoc pseudomesenteroides <400> 179 atgaaaaatc agttaatgtc tttcgaagtg atatcagaaa aagaattgtc cacggtacaa 60 ggtggcaaag gcttaggtaa actcatagga attgattggc ttttgggtca agctaaggac 120 gctgttaaac agtacaagaa ggattacaaa cgttggcact aa 162 <210> 180 <211> 61 <212> PRT <213> Leuconostoc gelidum <400> 180 Met Met Asn Met Lys Pro Thr Glu Ser Tyr Glu Gln Leu Asp Asn Ser 1 5 10 15 Ala Leu Glu Gln Val Val Gly Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val His 20 25 30 Cys Thr Lys Ser Gly Cys Ser Val Asn Trp Gly Glu Ala Phe Ser Ala 35 40 45 Gly Val His Arg Leu Ala Asn Gly Gly Asn Gly Phe Trp 50 55 60 <210> 181 <211> 186 <212> DNA <213> Leuconostoc gelidum <400> 181 atgatgaaca tgaaacctac ggaaagctat gagcaattgg ataatagtgc tctcgaacaa 60 gtcgtaggag gtaagtatta tggtaacgga gttcattgca caaaaagtgg ttgttctgta 120 aactggggag aagccttttc agctggagta catcgtttag caaatggtgg aaatggtttc 180 tggtaa 186 <210> 182 <211> 61 <212> PRT <213> Leuconostoc carnosum <400> 182 Met Asn Asn Met Lys Ser Ala Asp Asn Tyr Gln Gln Leu Asp Asn Asn 1 5 10 15 Ala Leu Glu Gln Val Val Gly Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val His 20 25 30 Cys Thr Lys Ser Gly Cys Ser Val Asn Trp Gly Glu Ala Phe Ser Ala 35 40 45 Gly Val His Arg Leu Ala Asn Gly Gly Asn Gly Phe Trp 50 55 60 <210> 183 <211> 186 <212> DNA <213> Leuconostoc carnosum <400> 183 atgaataaca tgaaatctgc ggataattat cagcaattgg ataataatgc tctcgaacaa 60 gtcgtaggag gtaagtatta tggtaacgga gttcattgca caaaaagtgg ttgttctgta 120 aactggggag aagccttttc agctggagta catcgtttag caaatggtgg aaatggtttc 180 tggtaa 186 <210> 184 <211> 63 <212> PRT <213> Leuconostoc mesenteroides <400> 184 Met Phe Leu Val Asn Gln Leu Gly Ile Ser Lys Ser Leu Ala Asn Thr 1 5 10 15 Ile Leu Gly Ala Ile Ala Val Gly Asn Leu Ala Ser Trp Leu Leu Ala 20 25 30 Leu Val Pro Gly Pro Gly Trp Ala Thr Lys Ala Ala Leu Ala Thr Ala 35 40 45 Glu Thr Ile Val Lys His Glu Gly Lys Ala Ala Ala Ile Ala Trp 50 55 60 <210> 185 <211> 192 <212> DNA <213> Leuconostoc mesenteroides <400> 185 atgttcttgg taaatcagtt agggatttca aaatcgttag ctaatactat tcttggtgca 60 attgctgttg gtaatttggc cagttggtta ttagctttgg ttcctggtcc gggttgggca 120 acaaaagcag cacttgcgac agctgaaaca attgtgaagc atgaaggaaa agcagctgct 180 attgcgtggt aa 192 <210> 186 <211> 74 <212> PRT <213> Bacillus licheniformis <400> 186 Met Ser Lys Lys Glu Met Ile Leu Ser Trp Lys Asn Pro Met Tyr Arg 1 5 10 15 Thr Glu Ser Ser Tyr His Pro Ala Gly Asn Ile Leu Lys Glu Leu Gln 20 25 30 Glu Glu Glu Gln His Ser Ile Ala Gly Gly Thr Ile Thr Leu Ser Thr 35 40 45 Cys Ala Ile Leu Ser Lys Pro Leu Gly Asn Asn Gly Tyr Leu Cys Thr 50 55 60 Val Thr Lys Glu Cys Met Pro Ser Cys Asn 65 70 <210> 187 <211> 225 <212> DNA <213> Bacillus licheniformis <400> 187 atgtcaaaaa aggaaatgat tctttcatgg aaaaatccta tgtatcgcac tgaatcttct 60 tatcatccag cagggaacat ccttaaagaa ctccaggaag aggaacagca cagcatcgcc 120 ggaggcacaa tcacgctcag cacttgtgcc atcttgagca agccgttagg aaataacgga 180 tacctgtgta cagtgacaaa agaatgcatg ccaagctgta actaa 225 <210> 188 <211> 266 <212> PRT <213> Brevibacterium linens <400> 188 Met Asn Asn Leu Tyr Arg Glu Leu Ala Pro Ile Pro Gly Pro Ala Trp 1 5 10 15 Ala Glu Ile Glu Glu Glu Ala Arg Arg Thr Phe Lys Arg Asn Ile Ala 20 25 30 Gly Arg Arg Ile Val Asp Val Ala Gly Pro Thr Gly Phe Glu Thr Ser 35 40 45 Ala Val Thr Thr Gly His Ile Arg Asp Val Gln Ser Glu Thr Ser Gly 50 55 60 Leu Gln Val Lys Gln Arg Ile Val Gln Glu Tyr Ile Glu Leu Arg Thr 65 70 75 80 Pro Phe Thr Val Thr Arg Gln Ala Ile Asp Asp Val Ala Arg Gly Ser 85 90 95 Gly Asp Ser Asp Trp Gln Pro Val Lys Asp Ala Ala Thr Thr Ile Ala 100 105 110 Met Ala Glu Asp Arg Ala Ile Leu His Gly Leu Asp Ala Ala Gly Ile 115 120 125 Gly Gly Ile Val Pro Gly Ser Ser Asn Ala Ala Val Ala Ile Pro Asp 130 135 140 Ala Val Glu Asp Phe Ala Asp Ala Val Ala Gln Ala Leu Ser Val Leu 145 150 155 160 Arg Thr Val Gly Val Asp Gly Pro Tyr Ser Leu Leu Leu Ser Ser Ala 165 170 175 Glu Tyr Thr Lys Val Ser Glu Ser Thr Asp His Gly Tyr Pro Ile Arg 180 185 190 Glu His Leu Ser Arg Gln Leu Gly Ala Gly Glu Ile Ile Trp Ala Pro 195 200 205 Ala Leu Glu Gly Ala Leu Leu Val Ser Thr Arg Gly Gly Asp Tyr Glu 210 215 220 Leu His Leu Gly Gln Asp Leu Ser Ile Gly Tyr Tyr Ser His Asp Ser 225 230 235 240 Glu Thr Val Glu Leu Tyr Leu Gln Glu Thr Phe Gly Phe Leu Ala Leu 245 250 255 Thr Asp Glu Ser Ser Val Pro Leu Ser Leu 260 265 <210> 189 <211> 801 <212> DNA <213> Brevibacterium linens <400> 189 gtgaataacc tctatcgcga gcttgccccc atccccggcc cggcctgggc ggagatcgag 60 gaggaggctc gacggacatt caaacgcaat atcgccggcc gccggatcgt cgatgtcgca 120 gggcccacgg gcttcgagac ctccgcggtg accactggcc acatccgaga cgtccagtcg 180 gagacgagcg gactgcaggt taagcagcgc atcgtgcagg aatacatcga gctgcggacc 240 ccattcaccg tgactcggca ggccatcgat gacgtggccc gcgggtccgg tgactcggac 300 tggcagcccg tcaaggatgc ggccacgacg atcgcgatgg ctgaagatcg ggccattctc 360 cacgggctcg atgcggccgg gatcggcgga atcgttcccg gcagctcgaa tgccgcagtg 420 gccatccccg acgccgtcga ggacttcgcg gacgccgtcg cccaggcgct gagtgtgctg 480 cgcacggtgg gagtcgacgg gccctacagc ctgttgctct cctccgcgga gtacaccaag 540 gtctccgagt ccaccgacca cggctacccg atccgcgagc acctctcccg gcagctcggc 600 gccggagaga tcatctgggc gcccgcgctc gaaggggcgc tgctcgtctc cacgcgcggg 660 ggtgactacg agctccacct cggccaggac ctgtcgatcg gttactacag ccacgacagc 720 gagaccgtcg aactctatct gcaggagacc ttcggattcc tcgcgctgac cgacgaatcc 780 agtgtgcctt tgagcctctg a 801 <210> 190 <211> 71 <212> PRT <213> Listeria innocua <400> 190 Met Lys Lys Ala Ala Leu Lys Phe Ile Ile Val Ile Ala Ile Leu Gly 1 5 10 15 Phe Ser Phe Ser Phe Phe Ser Ile Gln Ser Glu Ala Lys Ser Tyr Gly 20 25 30 Asn Gly Val Gln Cys Asn Lys Lys Lys Cys Trp Val Asp Trp Gly Ser 35 40 45 Ala Ile Ser Thr Ile Gly Asn Asn Ser Ala Ala Asn Trp Ala Thr Gly 50 55 60 Gly Ala Ala Gly Trp Lys Ser 65 70 <210> 191 <211> 216 <212> DNA <213> Listeria innocua <400> 191 ttgaagaagg cagcgttaaa atttattatt gttattgcta ttctaggttt cagtttttct 60 ttctttagca tacaatctga agctaaatct tatggaaatg gagttcagtg taataagaaa 120 aaatgttggg tagattgggg tagtgctata agtactattg gaaataattc tgcagcgaat 180 tgggctacag gtggagcagc tggttggaaa agctga 216 <210> 192 <211> 68 <212> PRT <213> Bacillus sp. <400> 192 Met Ser Gln Glu Ala Ile Ile Arg Ser Trp Lys Asp Pro Phe Ser Arg 1 5 10 15 Glu Asn Ser Thr Gln Asn Pro Ala Gly Asn Pro Phe Ser Glu Leu Lys 20 25 30 Glu Ala Gln Met Asp Lys Leu Val Gly Ala Gly Asp Met Glu Ala Ala 35 40 45 Cys Thr Phe Thr Leu Pro Gly Gly Gly Gly Val Cys Thr Leu Thr Ser 50 55 60 Glu Cys Ile Cys 65 <210> 193 <211> 207 <212> DNA <213> Bacillus sp. <400> 193 atgagtcaag aagctatcat tcgttcatgg aaagatcctt tttcccgtga aaattctaca 60 caaaatccag ctggtaaccc attcagtgag ctgaaagaag cacaaatgga taagttagta 120 ggtgcgggag acatggaagc agcatgtact tttacattgc ctggtggcgg cggtgtttgt 180 actctaactt ctgaatgtat ttgttaa 207 <210> 194 <211> 61 <212> PRT <213> Leuconostoc mesenteroides <400> 194 Met Thr Asn Met Lys Ser Val Glu Ala Tyr Gln Gln Leu Asp Asn Gln 1 5 10 15 Asn Leu Lys Lys Val Val Gly Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val His 20 25 30 Cys Thr Lys Ser Gly Cys Ser Val Asn Trp Gly Glu Ala Ala Ser Ala 35 40 45 Gly Ile His Arg Leu Ala Asn Gly Gly Asn Gly Phe Trp 50 55 60 <210> 195 <211> 186 <212> DNA <213> Leuconostoc mesenteroides <400> 195 atgacgaata tgaagtctgt ggaagcatat cagcaattag ataaccagaa tctcaagaaa 60 gttgttggtg gaaagtatta tgggaatggt gttcactgta caaaaagtgg atgctctgtt 120 aactggggag aagctgcctc agctggcata catcgtttgg ccaatggtgg aaatggattt 180 tggtaa 186 <210> 196 <211> 68 <212> PRT <213> Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis <400> 196 Met Asn Asp Ile Leu Glu Thr Glu Thr Pro Val Met Val Ser Pro Arg 1 5 10 15 Trp Asp Met Leu Leu Asp Ala Gly Glu Asp Thr Ser Pro Ser Val Gln 20 25 30 Thr Gln Ile Asp Ala Glu Phe Arg Arg Val Val Ser Pro Tyr Met Ser 35 40 45 Ser Ser Gly Trp Leu Cys Thr Leu Thr Ile Glu Cys Gly Thr Ile Ile 50 55 60 Cys Ala Cys Arg 65 <210> 197 <211> 207 <212> DNA <213> Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis <400> 197 atgaacgaca tcctcgagac ggagaccccc gtcatggtca gcccccggtg ggacatgctg 60 ctcgacgcgg gcgaggacac cagcccgtcc gtccagaccc agatcgacgc ggagttccgt 120 cgcgtcgtga gcccgtacat gtccagcagc ggctggctct gcacgctcac catcgaatgt 180 ggcaccatca tctgcgcgtg tcgctga 207 <210> 198 <211> 69 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 198 Met Glu Leu Lys Ala Ser Glu Phe Gly Val Val Leu Ser Val Asp Ala 1 5 10 15 Leu Lys Leu Ser Arg Gln Ser Pro Leu Gly Val Gly Ile Gly Gly Gly 20 25 30 Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Ser Cys Gly Gly Gln Gly Gly Gly Cys 35 40 45 Gly Gly Cys Ser Asn Gly Cys Ser Gly Gly Asn Gly Gly Ser Gly Gly 50 55 60 Ser Gly Ser His Ile 65 <210> 199 <211> 207 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 199 atggaattaa aagcgagtga atttggtgta gttttgtccg ttgatgctct taaattatca 60 cgccagtctc cattaggtgt tggcattggt ggtggtggcg gcggcggcgg cggcggtagc 120 tgcggtggtc aaggtggcgg ttgtggtggt tgcagcaacg gttgtagtgg tggaaacggt 180 ggcagcggcg gaagtggttc acatatc 207 <210> 200 <211> 7 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 200 Met Arg Thr Gly Asn Ala Asn 1 5 <210> 201 <211> 24 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 201 atgcgtactg gtaatgcaaa ctaa 24 <210> 202 <211> 99 <212> PRT <213> Klebsiella pneumoniae <400> 202 Met Arg Glu Ile Ser Gln Lys Asp Leu Asn Leu Ala Phe Gly Ala Gly 1 5 10 15 Glu Thr Asp Pro Asn Thr Gln Leu Leu Asn Asp Leu Gly Asn Asn Met 20 25 30 Ala Trp Gly Ala Ala Leu Gly Ala Pro Gly Gly Leu Gly Ser Ala Ala 35 40 45 Leu Gly Ala Ala Gly Gly Ala Leu Gln Thr Val Gly Gln Gly Leu Ile 50 55 60 Asp His Gly Pro Val Asn Val Pro Ile Pro Val Leu Ile Gly Pro Ser 65 70 75 80 Trp Asn Gly Ser Gly Ser Gly Tyr Asn Ser Ala Thr Ser Ser Ser Gly 85 90 95 Ser Gly Ser <210> 203 <211> 300 <212> DNA <213> Klebsiella pneumoniae <400> 203 atgagagaaa ttagtcaaaa ggacttaaat cttgcttttg gtgcaggaga gaccgatcca 60 aatactcaac ttctaaacga ccttggaaat aatatggcat ggggtgctgc tcttggcgct 120 cctggcggat taggatcagc agctttgggg gccgcgggag gtgcattaca aactgtaggg 180 caaggattaa ttgaccatgg tcctgtaaat gtccccatcc ctgtactcat cgggccaagc 240 tggaatggta gcggtagtgg ttataacagc gcaacatcca gttccggtag tggtagttaa 300 <210> 204 <211> 75 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 204 Met Arg Glu Ile Thr Glu Ser Gln Leu Arg Tyr Ile Ser Gly Ala Gly 1 5 10 15 Gly Ala Pro Ala Thr Ser Ala Asn Ala Ala Gly Ala Ala Ala Ile Val 20 25 30 Gly Ala Leu Ala Gly Ile Pro Gly Gly Pro Leu Gly Val Val Val Gly 35 40 45 Ala Val Ser Ala Gly Leu Thr Thr Ala Ile Gly Ser Thr Val Gly Ser 50 55 60 Gly Ser Ala Ser Ser Ser Ala Gly Gly Gly Ser 65 70 75 <210> 205 <211> 228 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 205 atgcgagaaa taacagaatc acagttaaga tatatttccg gggcgggagg tgcgccagcg 60 acttcagcta atgccgcagg tgctgcagct attgttggag ctctcgccgg aatacctggt 120 ggtccacttg gggttgtagt tggagccgta tctgccggtt tgacaacagc aattggctcg 180 accgtgggaa gtggtagtgc cagttcttct gctggtggcg gtagctaa 228 <210> 206 <211> 58 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 206 Met Ile Lys His Phe His Phe Asn Lys Leu Ser Ser Gly Lys Lys Asn 1 5 10 15 Asn Val Pro Ser Pro Ala Lys Gly Val Ile Gln Ile Lys Lys Ser Ala 20 25 30 Ser Gln Leu Thr Lys Gly Gly Ala Gly His Val Pro Glu Tyr Phe Val 35 40 45 Gly Ile Gly Thr Pro Ile Ser Phe Tyr Gly 50 55 <210> 207 <211> 177 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 207 atgattaagc attttcattt taataaactg tcttctggta aaaaaaataa tgttccatct 60 cctgcaaagg gggttataca aataaaaaaa tcagcatcgc aactcacaaa aggtggtgca 120 ggacatgtgc ctgagtattt tgtggggatt ggtacaccta tatctttcta tggctga 177 <210> 208 <211> 90 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 208 Met Tyr Met Arg Glu Leu Asp Arg Glu Glu Leu Asn Cys Val Gly Gly 1 5 10 15 Ala Gly Asp Pro Leu Ala Asp Pro Asn Ser Gln Ile Val Arg Gln Ile 20 25 30 Met Ser Asn Ala Ala Trp Gly Pro Pro Leu Val Pro Glu Arg Phe Arg 35 40 45 Gly Met Ala Val Gly Ala Ala Gly Gly Val Thr Gln Thr Val Leu Gln 50 55 60 Gly Ala Ala Ala His Met Pro Val Asn Val Pro Ile Pro Lys Val Pro 65 70 75 80 Met Gly Pro Ser Trp Asn Gly Ser Lys Gly 85 90 <210> 209 <211> 273 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 209 atgtatatga gagagttaga tagagaggaa ttaaattgcg ttggtggggc tggagatccg 60 cttgcagatc ctaattccca aattgtaaga cagataatgt ctaatgcggc atggggcccg 120 cctttggtgc cagagcggtt taggggaatg gctgttggag ccgcaggtgg ggttacgcag 180 acagttcttc aaggagcagc agctcatatg ccggttaatg tccctatacc taaagttccg 240 atgggaccct catggaacgg aagtaaagga taa 273 <210> 210 <211> 50 <212> PRT <213> Enterococcus mundtii <400> 210 Met Ser Gln Val Val Gly Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys 1 5 10 15 Asn Lys Lys Gly Cys Ser Val Asp Trp Gly Lys Ala Ile Gly Ile Ile 20 25 30 Gly Asn Asn Ser Ala Ala Asn Leu Ala Thr Gly Gly Ala Ala Gly Trp 35 40 45 Lys Ser 50 <210> 211 <211> 153 <212> DNA <213> Enterococcus mundtii <400> 211 atgtcacagg tagtaggtgg aaaatactac ggtaatggag tctcatgtaa taaaaaaggg 60 tgcagtgttg attggggaaa agcgattggc attattggaa ataattctgc tgcgaattta 120 gctactggtg gagcagctgg ttggaaaagt taa 153 <210> 212 <211> 58 <212> PRT <213> Enterococcus mundtii <400> 212 Met Lys Lys Leu Thr Ser Lys Glu Met Ala Gln Val Val Gly Gly Lys 1 5 10 15 Tyr Tyr Gly Asn Gly Leu Ser Cys Asn Lys Lys Gly Cys Ser Val Asp 20 25 30 Trp Gly Lys Ala Ile Gly Ile Ile Gly Asn Asn Ser Ala Ala Asn Leu 35 40 45 Ala Thr Gly Gly Ala Ala Gly Trp Lys Ser 50 55 <210> 213 <211> 177 <212> DNA <213> Enterococcus mundtii <400> 213 ttgaagaaat taacatcaaa agaaatggca caagtagtag gtgggaaata ctacggtaat 60 ggattatcat gtaataaaaa agggtgcagt gttgattggg gaaaagctat tggcattatt 120 ggaaataatt ctgctgcgaa tttagctact ggtggagcag ctggttggaa aagttaa 177 <210> 214 <211> 63 <212> PRT <213> Streptococcus mutans <400> 214 Met Ser Asn Thr Gln Leu Leu Glu Val Leu Gly Thr Glu Thr Phe Asp 1 5 10 15 Val Gln Glu Asp Leu Phe Ala Phe Asp Thr Thr Asp Thr Thr Ile Val 20 25 30 Ala Ser Asn Asp Asp Pro Asp Thr Arg Phe Lys Ser Trp Ser Leu Cys 35 40 45 Thr Pro Gly Cys Ala Arg Thr Gly Ser Phe Asn Ser Tyr Cys Cys 50 55 60 <210> 215 <211> 192 <212> DNA <213> Streptococcus mutans <400> 215 atgtcaaaca cacaattatt agaagtcctt ggtactgaaa cttttgatgt tcaagaagat 60 ctctttgctt ttgatacaac agatactact attgtggcaa gcaacgacga tccagatact 120 cgtttcaaaa gttggagcct ttgtacgcct ggttgtgcaa ggacaggtag tttcaatagt 180 tactgttgct ga 192 <210> 216 <211> 53 <212> PRT <213> Streptococcus mutans <400> 216 Met Asn Lys Leu Asn Ser Asn Ala Val Val Ser Leu Asn Glu Val Ser 1 5 10 15 Asp Ser Glu Leu Asp Thr Ile Leu Gly Gly Asn Arg Trp Trp Gln Gly 20 25 30 Val Val Pro Thr Val Ser Tyr Glu Cys Arg Met Asn Ser Trp Gln His 35 40 45 Val Phe Thr Cys Cys 50 <210> 217 <211> 162 <212> DNA <213> Streptococcus mutans <400> 217 atgaacaagt taaacagtaa cgcagtagtt tctttgaatg aagtttcaga ttctgaattg 60 gatactattt tgggtggtaa tcgttggtgg caaggtgttg tgccaacggt ctcatatgag 120 tgtcgcatga attcatggca acatgttttc acttgctgtt aa 162 <210> 218 <211> 57 <212> PRT <213> Lactococcus lactis subsp. lactis <400> 218 Met Ser Thr Lys Asp Phe Asn Leu Asp Leu Val Ser Val Ser Lys Lys 1 5 10 15 Asp Ser Gly Ala Ser Pro Arg Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro 20 25 30 Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu Met Gly Cys Asn Met Lys Thr Ala Thr 35 40 45 Cys His Cys Ser Ile His Val Ser Lys 50 55 <210> 219 <211> 174 <212> DNA <213> Lactococcus lactis subsp. lactis <400> 219 atgagtacaa aagattttaa cttggatttg gtatctgttt cgaagaaaga ttcaggtgca 60 tcaccacgca ttacaagtat ttcgctatgt acacccggtt gtaaaacagg agctctgatg 120 ggttgtaaca tgaaaacagc aacttgtcat tgtagtattc acgtaagcaa ataa 174 <210> 220 <211> 57 <212> PRT <213> Lactococcus lactis <400> 220 Met Ser Thr Lys Asp Phe Asn Leu Asp Leu Val Ser Val Ser Lys Lys 1 5 10 15 Asp Ser Gly Ala Ser Pro Arg Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro 20 25 30 Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu Met Gly Cys Asn Met Lys Thr Ala Thr 35 40 45 Cys Asn Cys Ser Val His Val Ser Lys 50 55 <210> 221 <211> 171 <212> DNA <213> Lactococcus lactis <400> 221 atgagtacaa aagatttcaa cttggatttg gtatctgttt cgaagaaaga ttcaggtgca 60 tcaccacgca ttacaagtat ttcgctatgt acacccggtt gtaaaacagg agctctgatg 120 ggttgtaaca tgaaaacagc aacttgtaat tgtagcgttc acgtaagcaa a 171 <210> 222 <211> 57 <212> PRT <213> Lactococcus lactis <400> 222 Met Ser Thr Lys Asp Phe Asn Leu Asp Leu Val Ser Val Ser Lys Thr 1 5 10 15 Asp Ser Gly Ala Ser Thr Arg Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro 20 25 30 Gly Cys Lys Thr Gly Val Leu Met Gly Cys Asn Leu Lys Thr Ala Thr 35 40 45 Cys Asn Cys Ser Val His Val Ser Lys 50 55 <210> 223 <211> 174 <212> DNA <213> Lactococcus lactis <400> 223 atgagtacaa aagatttcaa cttagatttg gtatctgttt caaaaacaga ttctggcgct 60 tcaacacgta ttaccagcat ttcgctttgt acaccaggtt gtaaaacagg tgttctgatg 120 ggatgtaacc tgaaaacagc aacttgtaat tgtagcgttc acgtaagcaa ataa 174 <210> 224 <211> 55 <212> PRT <213> Streptococcus uberis <400> 224 Met Asn Asn Glu Asp Phe Asn Leu Asp Leu Ile Lys Ile Ser Lys Glu 1 5 10 15 Asn Asn Ser Gly Ala Ser Pro Arg Ile Thr Ser Lys Ser Leu Cys Thr 20 25 30 Pro Gly Cys Lys Thr Gly Ile Leu Met Thr Cys Pro Leu Lys Thr Ala 35 40 45 Thr Cys Gly Cys His Phe Gly 50 55 <210> 225 <211> 168 <212> DNA <213> Streptococcus uberis <400> 225 atgaacaatg aagattttaa tttggatctc atcaaaatct caaaggaaaa caactcagga 60 gcttcacctc gaataactag taaatcatta tgtactcctg gatgtaagac gggtattttg 120 atgacttgtc cactaaaaac tgcaacctgt ggttgtcatt ttggataa 168 <210> 226 <211> 57 <212> PRT <213> Lactococcus lactis subsp. lactis <400> 226 Met Ser Thr Lys Asp Phe Asn Leu Asp Leu Val Ser Val Ser Lys Lys 1 5 10 15 Asp Ser Gly Ala Ser Pro Arg Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro 20 25 30 Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu Met Gly Cys Asn Met Lys Thr Ala Thr 35 40 45 Cys Asn Cys Ser Ile His Val Ser Lys 50 55 <210> 227 <211> 174 <212> DNA <213> Lactococcus lactis subsp. lactis <400> 227 atgagtacaa aagattttaa cttggatttg gtatctgttt cgaagaaaga ttcaggtgca 60 tcaccacgca ttacaagtat ttcgctatgt acacccggtt gtaaaacagg agctctgatg 120 ggttgtaaca tgaaaacagc aacttgtaat tgtagtattc acgtaagcaa ataa 174 <210> 228 <211> 57 <212> PRT <213> Staphylococcus warneri <400> 228 Met Glu Asn Ser Lys Val Met Lys Asp Ile Glu Val Ala Asn Leu Leu 1 5 10 15 Glu Glu Val Gln Glu Asp Glu Leu Asn Glu Val Leu Gly Ala Lys Lys 20 25 30 Lys Ser Gly Val Ile Pro Thr Val Ser His Asp Cys His Met Asn Ser 35 40 45 Phe Gln Phe Val Phe Thr Cys Cys Ser 50 55 <210> 229 <211> 174 <212> DNA <213> Staphylococcus warneri <400> 229 atggaaaatt ctaaagttat gaaggacatt gaagtagcaa atttattaga agaggttcaa 60 gaagatgaat tgaatgaagt cttaggagct aagaaaaagt caggagtaat cccaactgtg 120 tcacacgatt gccatatgaa ttctttccaa tttgtattta cttgttgttc ataa 174 <210> 230 <211> 58 <212> PRT <213> Paenibacillus polymyxa <400> 230 Met Ala Glu Asn Leu Phe Asp Leu Asp Ile Gln Val Asn Lys Ser Gln 1 5 10 15 Gly Ser Val Glu Pro Gln Val Leu Ser Ile Val Ala Cys Ser Ser Gly 20 25 30 Cys Gly Ser Gly Lys Thr Ala Ala Ser Cys Val Glu Thr Cys Gly Asn 35 40 45 Arg Cys Phe Thr Asn Val Gly Ser Leu Cys 50 55 <210> 231 <211> 177 <212> DNA <213> Paenibacillus polymyxa <400> 231 atggctgaaa acttatttga tctggacatt caagtaaaca aatctcaagg ttctgtagag 60 cctcaggttc tgagcattgt tgcatgttct agcggatgtg gtagcggtaa aacagctgcc 120 agttgtgttg aaacttgtgg caaccggtgc tttactaacg ttggttcact ctgctaa 177 <210> 232 <211> 62 <212> PRT <213> Pediococcus acidilactici <400> 232 Met Lys Lys Ile Glu Lys Leu Thr Glu Lys Glu Met Ala Asn Ile Ile 1 5 10 15 Gly Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Thr Cys Gly Lys His Ser Cys 20 25 30 Ser Val Asp Trp Gly Lys Ala Thr Thr Cys Ile Ile Asn Asn Gly Ala 35 40 45 Met Ala Trp Ala Thr Gly Gly His Gln Gly Asn His Lys Cys 50 55 60 <210> 233 <211> 189 <212> DNA <213> Pediococcus acidilactici <400> 233 atgaaaaaaa ttgaaaaatt aactgaaaaa gaaatggcca atatcattgg tggtaaatac 60 tacggtaatg gggttacttg tggcaaacat tcctgctctg ttgactgggg taaggctacc 120 acttgcataa tcaataatgg agctatggca tgggctactg gtggacatca aggtaatcat 180 aaatgctag 189 <210> 234 <211> 60 <212> PRT <213> Pediococcus pentosaceus <400> 234 Met Thr Glu Ile Lys Val Leu Asn Asp Lys Glu Leu Lys Asn Val Val 1 5 10 15 Gly Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val His Cys Gly Lys Lys Thr Cys 20 25 30 Tyr Val Asp Trp Gly Gln Ala Thr Ala Ser Ile Gly Lys Ile Ile Val 35 40 45 Asn Gly Trp Thr Gln His Gly Pro Trp Ala His Arg 50 55 60 <210> 235 <211> 183 <212> DNA <213> Pediococcus pentosaceus <400> 235 atgactgaaa ttaaagtact aaacgataag gaactaaaaa atgtcgtagg aggaaagtat 60 tacggtaacg gagtgcattg tggtaaaaag acttgctatg tggactgggg acaagctaca 120 gctagcattg gaaaaattat agtgaacgga tggacacaac acgggccttg ggcacataga 180 taa 183 <210> 236 <211> 60 <212> PRT <213> Staphylococcus epidermidis <400> 236 Met Lys Asn Asn Lys Asn Leu Phe Asp Leu Glu Ile Lys Lys Glu Thr 1 5 10 15 Ser Gln Asn Thr Asp Glu Leu Glu Pro Gln Thr Ala Gly Pro Ala Ile 20 25 30 Arg Ala Ser Val Lys Gln Cys Gln Lys Thr Leu Lys Ala Thr Arg Leu 35 40 45 Phe Thr Val Ser Cys Lys Gly Lys Asn Gly Cys Lys 50 55 60 <210> 237 <211> 183 <212> DNA <213> Staphylococcus epidermidis <400> 237 atgaaaaata acaaaaattt atttgattta gaaattaaaa aagaaacaag tcaaaacact 60 gatgaacttg aacctcaaac tgctggacca gcgattagag cttctgtgaa acaatgtcag 120 aaaactttga aagctacgcg tttatttaca gtgtcttgca aaggaaaaaa cggatgtaaa 180 tag 183 <210> 238 <211> 62 <212> PRT <213> Carnobacterium maltaromaticum <400> 238 Met Lys Thr Val Lys Glu Leu Ser Val Lys Glu Met Gln Leu Thr Thr 1 5 10 15 Gly Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys Asn Lys Asn Gly Cys 20 25 30 Thr Val Asp Trp Ser Lys Ala Ile Gly Ile Ile Gly Asn Asn Ala Ala 35 40 45 Ala Asn Leu Thr Thr Gly Gly Ala Ala Gly Trp Asn Lys Gly 50 55 60 <210> 239 <211> 189 <212> DNA <213> Carnobacterium maltaromaticum <400> 239 atgaaaactg ttaaagaact tagcgttaaa gaaatgcaac taactacagg aggtaagtat 60 tacggaaatg gcgtttcctg taataaaaat ggttgtactg tagattggag caaagctatt 120 gggattatag gaaacaatgc agcagcaaat ttgactacag gtggagccgc tggttggaac 180 aaaggataa 189 <210> 240 <211> 69 <212> PRT <213> Lactobacillus plantarum <220> <221> VARIANT <222> (40)..(40) <223> Xaa = any amino acid <400> 240 Met Tyr Lys Glu Leu Thr Val Asp Glu Leu Ala Leu Ile Asp Gly Gly 1 5 10 15 Lys Lys Lys Lys Lys Lys Val Ala Cys Thr Trp Gly Asn Ala Ala Thr 20 25 30 Ala Ala Ala Ser Gly Ala Val Xaa Gly Ile Leu Gly Gly Pro Thr Gly 35 40 45 Ala Leu Ala Gly Ala Ile Trp Gly Val Ser Gln Cys Ala Ser Asn Asn 50 55 60 Leu His Gly Met His 65 <210> 241 <211> 210 <212> DNA <213> Lactobacillus plantarum <220> <221> misc_feature <222> (119)..(119) <223> n = a, c, t or g <400> 241 atgtataaag aattaacagt tgatgaatta gcattgattg atggaggaaa aaagaagaag 60 aaaaaagtag cttgtacttg gggaaatgca gcaacagccg ctgcttctgg tgcagttang 120 ggtattcttg gtgggcctac tggtgcactg gctggagcta tctggggcgt ttcacaatgc 180 gcgtctaaca acttacacgg catgcactaa 210 <210> 242 <211> 56 <212> PRT <213> Lactobacillus plantarum <400> 242 Met Met Lys Lys Ile Glu Lys Leu Thr Glu Lys Glu Met Ala Asn Ile 1 5 10 15 Ile Gly Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Thr Cys Gly Lys His Ser 20 25 30 Cys Ser Val Asn Trp Gly Gln Ala Phe Ser Cys Ser Val Ser His Leu 35 40 45 Ala Asn Phe Gly His Gly Lys Cys 50 55 <210> 243 <211> 171 <212> DNA <213> Lactobacillus plantarum <400> 243 atgatgaaaa aaattgaaaa attaactgaa aaagaaatgg ccaatatcat tggtggtaaa 60 tactatggta atggggttac ttgtggtaaa cattcctgct ctgttaactg gggccaagca 120 ttttcttgta gtgtgtcaca tttagctaac ttcggtcatg gaaagtgcta a 171 <210> 244 <211> 64 <212> PRT <213> Lactobacillus plantarum <400> 244 Met Ser Lys Leu Val Lys Thr Leu Thr Val Asp Glu Ile Ser Lys Ile 1 5 10 15 Gln Thr Asn Gly Gly Lys Pro Ala Trp Cys Trp Tyr Thr Leu Ala Met 20 25 30 Cys Gly Ala Gly Tyr Asp Ser Gly Thr Cys Asp Tyr Met Tyr Ser His 35 40 45 Cys Phe Gly Val Lys His Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Tyr His Cys 50 55 60 <210> 245 <211> 195 <212> DNA <213> Lactobacillus plantarum <400> 245 atgagtaaac tagttaaaac attaactgtc gatgaaatct ctaagattca aaccaatggt 60 ggaaaacctg catggtgttg gtacacattg gcaatgtgcg gtgctggtta tgattcaggc 120 acttgtgatt atatgtattc acactgcttt ggtgtaaaac actctagcgg tggtggcggt 180 agctaccatt gttag 195 <210> 246 <211> 56 <212> PRT <213> Lactobacillus plantarum <400> 246 Met Leu Gln Phe Glu Lys Leu Gln Tyr Ser Arg Leu Pro Gln Lys Lys 1 5 10 15 Leu Ala Lys Ile Ser Gly Gly Phe Asn Arg Gly Gly Tyr Asn Phe Gly 20 25 30 Lys Ser Val Arg His Val Val Asp Ala Ile Gly Ser Val Ala Gly Ile 35 40 45 Arg Gly Ile Leu Lys Ser Ile Arg 50 55 <210> 247 <211> 171 <212> DNA <213> Lactobacillus plantarum <400> 247 atgctacagt ttgagaaatt acaatattcc aggttgccgc aaaaaaagct tgccaaaata 60 tctggtggtt ttaatcgggg cggttataac tttggtaaaa gtgttcgaca tgttgttgat 120 gcaattggtt cagttgcagg cattcgtggt attttgaaaa gtattcgtta a 171 <210> 248 <211> 52 <212> PRT <213> Lactobacillus plantarum <400> 248 Met Lys Lys Phe Leu Val Leu Arg Asp Arg Glu Leu Asn Ala Ile Ser 1 5 10 15 Gly Gly Val Phe His Ala Tyr Ser Ala Arg Gly Val Arg Asn Asn Tyr 20 25 30 Lys Ser Ala Val Gly Pro Ala Asp Trp Val Ile Ser Ala Val Arg Gly 35 40 45 Phe Ile His Gly 50 <210> 249 <211> 159 <212> DNA <213> Lactobacillus plantarum <400> 249 atgaaaaaat ttctagtttt gcgtgaccgt gaattaaatg ctatttcagg tggcgttttc 60 catgcctata gcgcgcgtgg cgttcggaat aattataaaa gtgctgttgg gcctgccgat 120 tgggtcatta gcgctgtccg aggattcatc cacggatag 159 <210> 250 <211> 55 <212> PRT <213> Lactobacillus plantarum <400> 250 Met Thr Val Asn Lys Met Ile Lys Asp Leu Asp Val Val Asp Ala Phe 1 5 10 15 Ala Pro Ile Ser Asn Asn Lys Leu Asn Gly Val Val Gly Gly Gly Ala 20 25 30 Trp Lys Asn Phe Trp Ser Ser Leu Arg Lys Gly Phe Tyr Asp Gly Glu 35 40 45 Ala Gly Arg Ala Ile Arg Arg 50 55 <210> 251 <211> 168 <212> DNA <213> Lactobacillus plantarum <400> 251 atgactgtga acaaaatgat taaggatttg gatgtagtag atgcatttgc acctatttct 60 aataataagt tgaacggggt tgttggggga ggcgcttgga aaaatttctg gtctagttta 120 agaaaaggat tttatgatgg cgaagctggc agagcaatcc gtcgttaa 168 <210> 252 <211> 57 <212> PRT <213> Lactobacillus plantarum <400> 252 Met Lys Ile Lys Leu Thr Val Leu Asn Glu Phe Glu Glu Leu Thr Ala 1 5 10 15 Asp Ala Glu Lys Asn Ile Ser Gly Gly Arg Arg Ser Arg Lys Asn Gly 20 25 30 Ile Gly Tyr Ala Ile Gly Tyr Ala Phe Gly Ala Val Glu Arg Ala Val 35 40 45 Leu Gly Gly Ser Arg Asp Tyr Asn Lys 50 55 <210> 253 <211> 174 <212> DNA <213> Lactobacillus plantarum <400> 253 atgaaaatta aattaactgt tttaaatgaa tttgaagaat taactgctga cgctgaaaag 60 aatatttctg gtggccgtcg gagtcgtaaa aatggaattg gatacgctat tggttatgcg 120 tttggcgcgg ttgaacgggc cgtgcttggt ggttcaaggg attataataa gtga 174 <210> 254 <211> 47 <212> PRT <213> Lactobacillus plantarum <400> 254 Met Asp Lys Phe Glu Lys Ile Ser Thr Ser Asn Leu Glu Lys Ile Ser 1 5 10 15 Gly Gly Asp Leu Thr Thr 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plantarum <400> 258 Met Asn Asn Ala Leu Ser Phe Glu Gln Gln Phe Thr Asp Phe Ser Thr 1 5 10 15 Leu Ser Asp Ser Glu Leu Glu Ser Val Glu Gly Gly Arg Asn Lys Leu 20 25 30 Ala Tyr Asn Met Gly His Tyr Ala Gly Lys Ala Thr Ile Phe Gly Leu 35 40 45 Ala Ala Trp Ala Leu Leu Ala 50 55 <210> 259 <211> 168 <212> DNA <213> Lactobacillus plantarum <400> 259 atgaataacg cattaagttt tgaacaacaa tttacagact tcagcacctt atcggactct 60 gaattagaat ccgttgaggg tggccgaaat aagcttgcat ataatatggg gcattacgct 120 ggtaaggcaa ccatttttgg acttgcagca tgggcactcc ttgcatga 168 <210> 260 <211> 47 <212> PRT <213> Lactobacillus plantarum <400> 260 Met Asp Lys Ile Ile Lys Phe Gln Gly Ile Ser Asp Asp Gln Leu Asn 1 5 10 15 Ala Val Ile Gly Gly Lys Lys Lys Lys Gln Ser Trp Tyr Ala Ala Ala 20 25 30 Gly Asp Ala Ile Val Ser Phe Gly Glu Gly Phe Leu Asn Ala Trp 35 40 45 <210> 261 <211> 144 <212> DNA <213> Lactobacillus plantarum <400> 261 atggataaga ttattaagtt tcaagggatt tctgatgatc aattaaatgc tgttatcggt 60 gggaaaaaga aaaaacaatc ttggtacgca gcagctggtg atgcaatcgt tagttttggt 120 gaaggatttt taaatgcttg gtaa 144 <210> 262 <211> 59 <212> PRT <213> Lactobacillus plantarum <400> 262 Met Lys Ile Ser Lys Ile Glu Ala Gln Ala Arg Lys Asp Phe Phe Lys 1 5 10 15 Lys Ile Asp Thr Asn Ser Asn Leu Leu Asn Val Asn Gly Ala Lys Cys 20 25 30 Lys Trp Trp Asn Ile Ser Cys Asp Leu Gly Asn Asn Gly His Val Cys 35 40 45 Thr Leu Ser His Glu Cys Gln Val Ser Cys Asn 50 55 <210> 263 <211> 180 <212> DNA <213> Lactobacillus plantarum <400> 263 atgaaaattt ctaagattga agctcaggct cgtaaagatt tttttaaaaa aatcgatact 60 aactcgaact tattaaatgt aaatggtgcc aaatgcaagt ggtggaatat ttcgtgtgat 120 ttaggaaata atggccatgt ttgtaccttg tcacatgaat gccaagtatc ttgtaactaa 180 <210> 264 <211> 67 <212> PRT <213> Lactobacillus plantarum <400> 264 Met Thr Lys Thr Ser Arg Arg Lys Asn Ala Ile Ala Asn Tyr Leu Glu 1 5 10 15 Pro Val Asp Glu Lys Ser Ile Asn Glu Ser Phe Gly Ala Gly Asp Pro 20 25 30 Glu Ala Arg Ser Gly Ile Pro Cys Thr Ile Gly Ala Ala Val Ala Ala 35 40 45 Ser Ile Ala Val Cys Pro 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Propionibacterium jensenii <400> 269 atgaacaaaa cacacaaaat ggcgacgctg gtaattgccg cgatcttggc cgccggaatg 60 accgcaccaa ctgcctatgc agattctcct ggaaacacca gaattacagc cagcgagcaa 120 agcgtcctta cccagatact cggccacaaa cctacacaaa ctgaatataa ccgatacgtt 180 gagacttacg gaagcgtacc gaccgaagca gacatcaacg catatataga agcgtctgaa 240 tctgagggat catcaagtca aacggctgct cacgatgact cgacatcacc cggcacgagt 300 accgaaatct acacgcaggc agcccctgcc aggttctcaa tgtttttcct gtccggaact 360 tggatcacta ggagtggtgt agtatcgctc tccttgaagc caaggaaggg tggtattggc 420 aacgaggggg acgagcgtac ctggaagact gtatacgaca aattccataa cgctgggcaa 480 tggacacgat acaagaacaa cggcgtagac gccagcatga aaaagcagta catgtgccac 540 ttcaagtacg ggatggtgaa gacgccatgg aatctggagc cccacaagaa ggctgcagac 600 gtcagtccag tcaagtgcaa ctag 624 <210> 270 <211> 96 <212> PRT <213> Propionibacterium thoenii <400> 270 Met Lys Lys Thr Leu Leu Arg Ser Gly Thr Ile Ala Leu Ala Thr Ala 1 5 10 15 Ala Ala Phe Gly Ala Ser Leu Ala Ala Ala Pro Ser Ala Met Ala Val 20 25 30 Pro Gly Gly Cys 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tggctaatga tcctgagtta agtaaacagt ttaatcctgg tagtttagct 1680 gtaatgagag atggaggggc tccttatgtc agagagtcag aacaggctgg cgggagaata 1740 aagatcgaaa tccaccacaa ggttcgagta gcagatggag gcggcgttta caatatgggg 1800 aaccttgttg cagtaacgcc aaaacgtcat atagaaatcc acaagggagg gaagtga 1857 <210> 276 <211> 689 <212> PRT <213> Pseudomonas aeruginosa <400> 276 Met Ala Val Asn Asp Tyr Glu Pro Gly Ser Met Val Ile Thr His Val 1 5 10 15 Gln Gly Gly Gly Arg Asp Ile Ile Gln Tyr Ile Pro Ala Arg Ser Ser 20 25 30 Tyr Gly Thr Pro Pro Phe Val Pro Pro Gly Pro Ser Pro Tyr Val Gly 35 40 45 Thr Gly Met Gln Glu Tyr Arg Lys Leu Arg Ser Thr Leu Asp Lys Ser 50 55 60 His Ser Glu Leu Lys Lys Asn Leu Lys Asn Glu Thr Leu Lys Glu Val 65 70 75 80 Asp Glu Leu Lys Ser Glu Ala Gly Leu Pro Gly Lys Ala Val Ser Ala 85 90 95 Asn Asp Ile Arg Asp Glu Lys Ser Ile Val Asp Ala Leu Met Asp Ala 100 105 110 Lys Ala Lys Ser Leu Lys Ala Ile Glu Asp Arg Pro Ala Asn Leu Tyr 115 120 125 Thr Ala Ser Asp Phe Pro Gln Lys Ser Glu Ser Met Tyr Gln Ser Gln 130 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ggggttgcca ggtaaagcgg tcagtgccaa tgacatccgc 300 gatgaaaaga gtatcgttga tgcactcatg gatgccaaag caaaatcgct aaaggccatt 360 gaggatcgcc cggccaatct ttatacggct tcagactttc ctcagaagtc agagtcgatg 420 taccagagtc agttgctggc cagccgaaaa ttctatggag agttcctgga tcgccatatg 480 agtgagctgg ccaaagcgta cagcgccgat atctataagg cgcaaatcgc tatcttgaaa 540 caaacgtctc aagagctgga gaataaagcc cggtcattgg aagcagaagc ccagcgagcc 600 gctgctgagg tggaggcgga ctacaaggcc aggaaggcaa atgtcgagaa aaaagtgcag 660 tccgagcttg accaggctgg gaatgctttg cctcaactga ccaatccaac gccagagcag 720 tggcttgaac gcgctactca actggttacg caggcgatcg ccaataagaa gaaattgcag 780 actgcaaaca atgccttgat tgccaaggca cccaatgcac tggagaaaca aaaggcaacc 840 tacaacgccg atctcctagt ggatgaaatc gccagcctgc aagcacggct ggacaagctg 900 aacgccgaaa cggcaaggcg caaggaaatc gctcgtcaag cggcgatcag ggctgccaat 960 acttatgcca tgccagccaa tggcagcgtt gtcgccaccg ccgcaggccg gggtctgatc 1020 caggtcgcac aaggcgccgc atcccttgct caagcgatct ccgatgcgat tgccgtcctg 1080 ggccgggtcc tggcttcagc accctcggtg atggccgtgg gctttgccag tctgacctac 1140 tcctcccgga ctgccgagca atggcaggac caaacgcccg atagcgttcg ttacgccctg 1200 ggcatggatg ccgctaaatt ggggcttccc ccaagcgtaa acctgaacgc ggttgcaaaa 1260 gccagcggta ccgtcgatct gccgatgcgc ctgaccaacg aggcacgagg caacacgacg 1320 accctttcgg tggtcagcac cgatggtgtg agcgttccga aagccgttcc ggtccggatg 1380 gcggcctaca atgccacgac aggcctgtac gaggttacgg ttccctctac gaccgcagaa 1440 gcgccgccac tgatcctgac ctggacgccg gcgagtcctc caggaaacca gaacccttcg 1500 agtaccactc cggtcgtacc gaagccggtg ccggtatatg agggagcgac ccttacaccg 1560 gtgaaggcta ccccggaaac ctatcctggg gtgattacac taccggaaga cctgatcatc 1620 ggcttcccgg ccgactcggg gatcaagccg atctatgtga tgttcaggga tccgcgggat 1680 gtacctggtg ctgcgactgg caagggacag cccgtcagcg gtaattggct cggcgccgcc 1740 tctcaaggtg agggggctcc aattccaagc cagattgcgg ataaactacg tggtaagaca 1800 ttcaaaaact ggcgggactt tcgggaacaa ttctggatag ctgtggctaa tgatcctgag 1860 ttaagtaaac agtttaatcc tggtagttta gctgtaatga gagatggagg ggctccttat 1920 gtcagagagt cagaacaggc tggcgggaga ataaagatcg aaatccacca caaggttcga 1980 atagcagatg gaggcggcgt ttacaatatg gggaaccttg ttgcagtaac gccaaaacgt 2040 catatagaaa tccacaaggg agggaagtga 2070 <210> 278 <211> 47 <212> PRT <213> Ruminococcus gnavus <400> 278 Met Arg Asn Asp Val Leu Thr Leu Thr Asn Pro Met Glu Glu Lys Glu 1 5 10 15 Leu Glu Gln Ile Leu Gly Gly Gly Asn Gly Val Leu Lys Thr Ile Ser 20 25 30 His Glu Cys Asn Met Asn Thr Trp Gln Phe Leu Phe Thr Cys Cys 35 40 45 <210> 279 <211> 144 <212> DNA <213> Ruminococcus gnavus <400> 279 atgagaaatg acgtattaac attaacaaac ccaatggaag agaacgaact ggagcagatc 60 ttaggtggtg gcaatggtgt gttaaaaacg attagccacg aatgcaatat gaacacatgg 120 cagttcctgt ttacttgttg ctaa 144 <210> 280 <211> 55 <212> PRT <213> Lactobacillus sakei <400> 280 Met Lys Asn Ala Lys Ser Leu Thr Ile Gln Glu Met Lys Ser Ile Thr 1 5 10 15 Gly Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys Asn Ser His Gly Cys 20 25 30 Ser Val Asn Trp Gly Gln Ala Trp Thr Cys Gly Val Asn His Leu Ala 35 40 45 Asn Gly Gly His Gly Val Cys 50 55 <210> 281 <211> 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acggagtggt tcttactctt 120 actcatgaat gtaacctagc aacttggaca aaaaaactaa aatgttgcta a 171 <210> 288 <211> 51 <212> PRT <213> Streptococcus pyogenes serotype M28 <400> 288 Met Ser Phe Met Lys Asn Ser Lys Asp Ile Leu Thr Asn Ala Ile Glu 1 5 10 15 Glu Val Ser Glu Lys Glu Leu Met Glu Val Ala Gly Gly Lys Lys Gly 20 25 30 Ser Gly Trp Phe Ala Thr Ile Thr Asp Asp Cys Pro Asn Ser Val Phe 35 40 45 Val Cys Cys 50 <210> 289 <211> 156 <212> DNA <213> Streptococcus pyogenes serotype M28 <400> 289 atgagtttta tgaaaaattc aaaggatatt ttgactaatg ctatcgaaga agtttctgaa 60 aaagaactta tggaagtagc tggtggtaaa aaaggttccg gttggtttgc aactattact 120 gatgactgtc cgaactcagt attcgtttgt tgttaa 156 <210> 290 <211> 48 <212> PRT <213> Streptococcus salivarius <400> 290 Met Lys Asn Ser Lys Asp Val Leu Asn Asn Ala Ile Glu Glu Val Ser 1 5 10 15 Glu Lys Glu Leu Met Glu Val Ala Gly Gly Lys Lys Gly Pro Gly Trp 20 25 30 Ile Ala Thr Ile Thr Asp Asp Cys Pro Asn Ser Ile Phe Val Cys Cys 35 40 45 <210> 291 <211> 147 <212> DNA <213> 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ggttatattt ctaaccaaac atgtccaaca 180 actgcttgta cacgcgcttg ctag 204 <210> 298 <211> 46 <212> PRT <213> Streptococcus pyogenes <400> 298 Met Asn Asn Thr Ile Lys Asp Phe Asp Leu Asp Leu Lys Thr Asn Lys 1 5 10 15 Lys Asp Thr Ala Thr Pro Tyr Val Gly Ser Arg Tyr Leu Cys Thr Pro 20 25 30 Gly Ser Cys Trp Lys Leu Val Cys Phe Thr Thr Thr Val Lys 35 40 45 <210> 299 <211> 141 <212> DNA <213> Streptococcus pyogenes <400> 299 atgaataaca caattaaaga ctttgatctc gatttgaaaa caaataaaaa agacactgct 60 acaccttatg ttggtagccg ttacctatgt acccctggtt cttgttggaa attagtttgc 120 tttacaacaa ctgttaaata a 141 <210> 300 <211> 51 <212> PRT <213> Streptococcus pyogenes <400> 300 Met Glu Lys Asn Asn Glu Val Ile Asn Ser Ile Gln Glu Val Ser Leu 1 5 10 15 Glu Glu Leu Asp Gln Ile Ile Gly Ala Gly Lys Asn Gly Val Phe Lys 20 25 30 Thr Ile Ser His Glu Cys His Leu Asn Thr Trp Ala Phe Leu Ala Thr 35 40 45 Cys Cys Ser 50 <210> 301 <211> 156 <212> DNA <213> Streptococcus pyogenes <400> 301 atggaaaaaa ataatgaagt aatcaactct attcaagaag 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catgaacttg acttagcaaa tgtaactggc 60 ggtcaaatta attggggatc agttgtagga cactgtatag gtggagctat tatcggaggt 120 gcattttcag gaggtgcagc ggctggagta ggatgccttg ttgggagcgg aaaggcaatc 180 ataaatggat tataa 195 <210> 316 <211> 85 <212> PRT <213> Streptococcus thermophilus <400> 316 Met Asn Thr Ile Thr Ile Cys Lys Phe Asp Val Leu Asp Ala Glu Leu 1 5 10 15 Leu Ser Thr Val Glu Gly Gly Tyr Ser Gly Lys Asp Cys Leu Lys Asp 20 25 30 Met Gly Gly Tyr Ala Leu Ala Gly Ala Gly Ser Gly Ala Leu Trp Gly 35 40 45 Ala Pro Ala Gly Gly Val Gly Ala Leu Pro Gly Ala Phe Val Gly Ala 50 55 60 His Val Gly Ala Ile Ala Gly Gly Phe Ala Cys Met Gly Gly Met Ile 65 70 75 80 Gly Asn Lys Phe Asn 85 <210> 317 <211> 258 <212> DNA <213> Streptococcus thermophilus <400> 317 atgaatacaa taactatttg taaatttgat gttttagatg ctgaacttct ttcgacagtt 60 gagggtggat actctggtaa ggattgttta aaagacatgg gaggatatgc attggcagga 120 gctggaagtg gagctctgtg gggagctcca gcaggaggtg ttggagcact tccaggtgca 180 tttgtcggag ctcatgttgg ggcaattgca ggaggctttg catgtatggg tggaatgatt 240 ggtaataagt ttaactaa 258 <210> 318 <211> 52 <212> PRT <213> Bacillus cereus <400> 318 Met Ser Glu Ile Lys Lys Ala Leu Asn Thr Leu Glu Ile Glu Asp Phe 1 5 10 15 Asp Ala Ile Glu Met Val Asp Val Asp Ala Met Pro Glu Asn Glu Ala 20 25 30 Leu Glu Ile Met Gly Ala Ser Cys Thr Thr Cys Val Cys Thr Cys Ser 35 40 45 Cys Cys Thr Thr 50 <210> 319 <211> 159 <212> DNA <213> Bacillus cereus <400> 319 atgagtgaaa ttaaaaaagc attaaatacg cttgaaattg aagattttga tgcaattgaa 60 atggttgatg ttgatgctat gccagaaaac gaagcgcttg aaattatggg agcgtcatgt 120 acgacatgcg tatgtacatg cagttgttgt acaacttga 159 <210> 320 <211> 47 <212> PRT <213> Bacillus cereus <400> 320 Met Glu Val Met Asn Asn Ala Leu Ile Thr Lys Val Asp Glu Glu Ile 1 5 10 15 Gly Gly Asn Ala Ala Cys Val Ile Gly Cys Ile Gly Ser Cys Val Ile 20 25 30 Ser Glu Gly Ile Gly Ser Leu Val Gly Thr Ala Phe Thr Leu Gly 35 40 45 <210> 321 <211> 144 <212> DNA <213> Bacillus cereus <400> 321 atggaagtta tgaacaatgc tttaattaca aaagtagatg aggagattgg aggaaacgct 60 gcttgtgtaa ttggttgtat tggcagttgc gtaattagtg aaggaattgg ttcacttgta 120 ggaacagcat ttactttagg ttaa 144 <210> 322 <211> 49 <212> PRT <213> Bacillus cereus <400> 322 Met Glu Val Leu Asn Lys Gln Asn Val Asn Ile Ile Pro Glu Ser Glu 1 5 10 15 Glu Val Gly Gly Trp Val Ala Cys Val Gly Ala Cys Gly Thr Val Cys 20 25 30 Leu Ala Ser Gly Gly Val Gly Thr Glu Phe Ala Ala Ala Ser Tyr Phe 35 40 45 Leu <210> 323 <211> 150 <212> DNA <213> Bacillus cereus <400> 323 atggaagttt taaacaaaca aaatgtaaat attattccag aatctgaaga agtaggtgga 60 tgggtagcat gtgttggagc atgtggtaca gtatgtcttg ctagtggtgg tgttggaaca 120 gagtttgcag ctgcatctta tttcctataa 150 <210> 324 <211> 40 <212> PRT <213> Bacillus thuringiensis <400> 324 Met Glu Thr Pro Val Val Gln Pro Arg Asp Trp Thr Cys Trp Ser Cys 1 5 10 15 Leu Val Cys Ala Ala Cys Ser Val Glu Leu Leu Asn Leu Val Thr Ala 20 25 30 Ala Thr Gly Ala Ser Thr Ala Ser 35 40 <210> 325 <211> 123 <212> DNA <213> Bacillus thuringiensis <400> 325 atggaaacac cagtagtaca accaagggat tggacttgtt ggagttgctt agtatgtgca 60 gcatgttctg tggaattatt aaatttagtt actgcggcaa caggggctag tactgcaagc 120 taa 123 <210> 326 <211> 42 <212> PRT <213> Rhizobium leguminosarum bv. trifolii <400> 326 Met Asp Asn Lys Val Ala Lys Asn Val Glu Val Lys Lys Gly Ser Ile 1 5 10 15 Lys Ala Thr Phe Lys Ala Ala Val Leu Lys Ser Lys Thr Lys Val Asp 20 25 30 Ile Gly Gly Ser Arg Gln Gly Cys Val Ala 35 40 <210> 327 <211> 129 <212> DNA <213> Rhizobium leguminosarum bv. trifolii <400> 327 atggataaca aggttgcgaa gaatgtcgaa gtgaagaagg gctccatcaa ggcgaccttc 60 aaggctgctg ttctgaagtc gaagacgaag gtcgacatcg gaggtagccg tcagggctgc 120 gtcgcttaa 129 <210> 328 <211> 70 <212> PRT <213> Streptococcus uberis <400> 328 Met Asn Thr Ile Glu Lys Phe Glu Asn Ile Lys Leu Phe Ser Leu Lys 1 5 10 15 Lys Ile Ile Gly Gly Lys Thr Val Asn Tyr Gly Asn Gly Leu Tyr Cys 20 25 30 Asn Gln Lys Lys Cys Trp Val Asn Trp Ser Glu Thr Ala Thr Thr Ile 35 40 45 Val Asn Asn Ser Ile Met Asn Gly Leu Thr Gly Gly Asn Ala Gly Trp 50 55 60 His Ser Gly Gly Arg Ala 65 70 <210> 329 <211> 213 <212> DNA <213> Streptococcus uberis <400> 329 atgaatacaa ttgaaaaatt tgaaaatatt aaactttttt cactaaagaa aattatcggt 60 ggcaaaactg taaattatgg taatggcctt tattgtaacc aaaaaaaatg ctgggtaaac 120 tggtcagaaa ctgctacaac aatagtaaat aattccatca tgaacgggct cacaggtggt 180 aatgcgggtt ggcactcagg cgggagagca taa 213 <210> 330 <211> 76 <212> PRT <213> Streptococcus uberis <400> 330 Met Asp Ile Leu Leu Glu Leu Ala Gly Tyr Thr Gly Ile Ala Ser Gly 1 5 10 15 Thr Ala Lys Lys Val Val Asp Ala Ile Asp Lys Gly Ala Ala Ala Phe 20 25 30 Val Ile Ile Ser Ile Ile Ser Thr Val Ile Ser Ala Gly Ala Leu Gly 35 40 45 Ala Val Ser Ala Ser Ala Asp Phe Ile Ile Leu Thr Val Lys Asn Tyr 50 55 60 Ile Ser Arg Asn Leu Lys Ala Gln Ala Val Ile Trp 65 70 75 <210> 331 <211> 231 <212> DNA <213> Streptococcus uberis <400> 331 atggacattt tattagaact cgcaggatat actgggatag cctcaggtac tgcaaaaaaa 60 gttgttgatg ccattgataa aggagctgca gcctttgtta ttatttcaat tatctcaaca 120 gtaattagtg cgggagcatt gggagcagtt tcagcctcag ctgattttat tattttaact 180 gtaaaaaatt acattagtag aaatttaaaa gcacaagctg tcatttggta a 231 <210> 332 <211> 64 <212> PRT <213> Clostridium perfringens <400> 332 Met Asp Ser Glu Leu Phe Lys Leu Met Ala Thr Gln Gly Ala Phe Ala 1 5 10 15 Ile Leu Phe Ser Tyr Leu Leu Phe Tyr Val Leu Lys Glu Asn Ser Lys 20 25 30 Arg Glu Asp Lys Tyr Gln Asn Ile Ile Glu Glu Leu Thr Glu Leu Leu 35 40 45 Pro Lys Ile Lys Glu Asp Val Glu Asp Ile Lys Glu Lys Leu Asn Lys 50 55 60 <210> 333 <211> 195 <212> DNA <213> Clostridium perfringens <400> 333 atggatagtg aattatttaa gttaatggca acacaaggag cctttgcaat attattttcg 60 tatttattgt tttatgtttt aaaagagaat agtaaaagag aagataagta tcaaaatata 120 atagaggagc ttacagaatt attgccaaaa ataaaagaag atgtagaaga tataaaagaa 180 aaacttaata aatag 195 <210> 334 <211> 47 <212> PRT <213> Micrococcus varians <400> 334 Met Thr Asn Ala Phe Gln Ala Leu Asp Glu Val Thr Asp Ala Glu Leu 1 5 10 15 Asp Ala Ile Leu Gly Gly Gly Ser Gly Val Ile Pro Thr Ile Ser His 20 25 30 Glu Cys His Met Asn Ser Phe Gln Phe Val Phe Thr Cys Cys Ser 35 40 45 <210> 335 <211> 144 <212> DNA <213> Micrococcus varians <400> 335 atgacgaacg catttcaggc actggacgaa gtcacggacg ccgagctcga cgccatcctt 60 ggcgggggca gtggtgttat tcccacgatc agccacgagt gccacatgaa ctccttccag 120 ttcgtgttca cctgctgctc ctga 144 <210> 336 <211> 285 <212> PRT <213> Streptococcus equi subsp. zooepidemicus <400> 336 Met Lys Arg Ile Phe Phe Ala Phe Leu Ser Leu Cys Leu Phe Ile Phe 1 5 10 15 Gly Thr Gln Thr Val Ser Ala Ala Thr Tyr Thr Arg Pro Leu Asp Thr 20 25 30 Gly Asn Ile Thr Thr Gly Phe Asn Gly Tyr Pro Gly His Val Gly Val 35 40 45 Asp Tyr Ala Val Pro Val Gly Thr Pro Val Arg Ala Val Ala Asn Gly 50 55 60 Thr Val Lys Phe Ala Gly Asn Gly Ala Asn His Pro Trp Met Leu Trp 65 70 75 80 Met Ala Gly Asn Cys Val Leu Ile Gln His Ala Asp Gly Met His Thr 85 90 95 Gly Tyr Ala His Leu Ser Lys Ile Ser Val Ser Thr Asp Ser Thr Val 100 105 110 Lys Gln Gly Gln Ile Ile Gly Tyr Thr Gly Ala Thr Gly Gln Val Thr 115 120 125 Gly Pro His Leu His Phe Glu Met Leu Pro Ala Asn Pro Asn Trp Gln 130 135 140 Asn Gly Phe Ser Gly Arg Ile Asp Pro Thr Gly Tyr Ile Ala Asn Ala 145 150 155 160 Pro Val Phe Asn Gly Thr Thr Pro Thr Glu Pro Thr Thr Pro Thr Thr 165 170 175 Asn Leu Lys Ile Tyr Lys Val Asp Asp Leu Gln Lys Ile Asn Gly Ile 180 185 190 Trp Gln Val Arg Asn Asn Ile Leu Val Pro Thr Asp Phe Thr Trp Val 195 200 205 Asp Asn Gly Ile Ala Ala Asp Asp Val Ile Glu Val Thr Ser Asn Gly 210 215 220 Thr Arg Thr Ser Asp Gln Val Leu Gln Lys Gly Gly Tyr Phe Val Ile 225 230 235 240 Asn Pro Asn Asn Val Lys Ser Val Gly Thr Pro Met Lys Gly Ser Gly 245 250 255 Gly Leu Ser Trp Ala Gln Val Asn Phe Thr Thr Gly Gly Asn Val Trp 260 265 270 Leu Asn Thr Thr Ser Lys Asp Asn Leu Leu Tyr Gly Lys 275 280 285 <210> 337 <211> 858 <212> DNA <213> Streptococcus equi subsp. zooepidemicus <400> 337 atgaaacgta tattttttgc tttcttaagt ttatgcttat ttatattcgg aacacaaacg 60 gtatctgcag ctacttatac tcggccatta gatacgggaa atatcactac agggtttaac 120 ggataccctg gtcatgttgg agtcgattat gcagtacccg ttggaactcc ggttagagca 180 gttgcaaatg gtacagtcaa atttgcaggt aatggggcta atcacccatg gatgctttgg 240 atggctggaa actgtgttct aattcaacat gctgacggga tgcatactgg atatgcacac 300 ttatcaaaaa tttcagttag cacagatagt acagttaaac aaggacaaat cataggttat 360 actggtgcca ccggccaagt taccggtcca catttgcatt ttgaaatgtt gccagcaaat 420 cctaactggc aaaatggttt ttctggaaga atagatccaa ccggatacat cgctaatgcc 480 cctgtattta atggaacaac acctacagaa cctactactc ctacaacaaa tttaaaaatc 540 tataaagttg atgatttaca aaaaattaat ggtatttggc aagtaagaaa taacatactt 600 gtaccaactg atttcacatg ggttgataat ggaattgcag cagatgatgt aattgaagta 660 actagcaatg gaacaagaac ctctgaccaa gttcttcaaa aaggtggtta ttttgtcatc 720 aatcctaata atgttaaaag tgttggaact ccgatgaaag gtagtggtgg tctatcttgg 780 gctcaagtaa actttacaac aggtggaaat gtctggttaa atactactag caaagacaac 840 ttactttacg gaaaataa 858 <210> 338 <211> 45 <212> PRT <213> Myxococcus fulvus <400> 338 Ala Asn Cys Ser Cys Ser Thr Ala Ser Asp Tyr Cys Pro Ile Leu Thr 1 5 10 15 Phe Cys Thr Thr Gly Thr Ala Cys Ser Tyr Thr Pro Thr Gly Cys Gly 20 25 30 Thr Gly Trp Val Tyr Cys Ala Cys Asn Gly Asn Phe Tyr 35 40 45 <210> 339 <211> 135 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 338 <400> 339 gcgaactgca gctgcagcac cgcgagcgat tattgcccga ttctgacctt ttgcaccacc 60 ggcaccgcgt gcagctatac cccgaccggc tgcggcaccg gctgggtgta ttgcgcgtgc 120 aacggcaact tttat 135 <210> 340 <211> 19 <212> PRT <213> Streptomyces griseoluteus <400> 340 Cys Ala Asn Ser Cys Ser Tyr Gly Pro Leu Thr Trp Ser Cys Asp Gly 1 5 10 15 Asn Thr Lys <210> 341 <211> 57 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 340 <400> 341 tgcgcgaaca gctgcagcta tggcccgctg acctggagct gcgatggcaa caccaaa 57 <210> 342 <211> 19 <212> PRT <213> Streptoverticillium griseoverticillatum <400> 342 Cys Lys Gln Ser Cys Ser Phe Gly Pro Phe Thr Phe Val Cys Asp Gly 1 5 10 15 Asn Thr Lys <210> 343 <211> 57 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 342 <400> 343 tgcaaacaga gctgcagctt tggcccgttt acctttgtgt gcgatggcaa caccaaa 57 <210> 344 <211> 7 <212> PRT <213> Carnobacterium sp. <400> 344 Gly Ser Glu Ile Gln Pro Arg 1 5 <210> 345 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 344 <400> 345 ggcagcgaaa ttcagccgcg c 21 <210> 346 <211> 39 <212> PRT <213> Lactococcus lactis subsp. lactis <400> 346 Gly Thr Trp Asp Asp Ile Gly Gln Gly Ile Gly Arg Val Ala Tyr Trp 1 5 10 15 Val Gly Lys Ala Met Gly Asn Met Ser Asp Val Asn Gln Ala Ser Arg 20 25 30 Ile Asn Arg Lys Lys Lys His 35 <210> 347 <211> 117 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 346 <400> 347 ggcacctggg atgatattgg ccagggcatt ggccgcgtgg cgtattgggt gggcaaagcg 60 atgggcaaca tgagcgatgt gaaccaggcg agccgcatta accgcaaaaa aaaacat 117 <210> 348 <211> 35 <212> PRT <213> Lactococcus lactis subsp. lactis <400> 348 Lys Lys Trp Gly Trp Leu Ala Trp Val Asp Pro Ala Tyr Glu Phe Ile 1 5 10 15 Lys Gly Phe Gly Lys Gly Ala Ile Lys Glu Gly Asn Lys Asp Lys Trp 20 25 30 Lys Asn Ile 35 <210> 349 <211> 105 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 348 <400> 349 aaaaaatggg gctggctggc gtgggtggat ccggcgtatg aatttattaa aggctttggc 60 aaaggcgcga ttaaagaagg caacaaagat aaatggaaaa acatt 105 <210> 350 <211> 19 <212> PRT <213> Streptomyces sp. <400> 350 Cys Val Gln Ser Cys Ser Phe Gly Pro Leu Thr Trp Ser Cys Asp Gly 1 5 10 15 Asn Thr Lys <210> 351 <211> 57 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 350 <400> 351 tgcgtgcaga gctgcagctt tggcccgctg acctggagct gcgatggcaa caccaaa 57 <210> 352 <211> 19 <212> PRT <213> Actinoplanes liguriae <400> 352 Ser Ser Gly Trp Val Cys Thr Leu Thr Ile Glu Cys Gly Thr Val Ile 1 5 10 15 Cys Ala Cys <210> 353 <211> 57 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 352 <400> 353 agcagcggct gggtgtgcac cctgaccatt gaatgcggca ccgtgatttg cgcgtgc 57 <210> 354 <211> 38 <212> PRT <213> Lactobacillus curvatus <220> <221> misc_feature <222> (34)..(34) <223> Xaa can be any naturally occurring amino acid <220> <221> VARIANT <222> (37)..(37) <223> Xaa = any amino acid <400> 354 Tyr Thr Ala Lys Gln Cys Leu Gln Ala Ile Gly Ser Cys Gly Ile Ala 1 5 10 15 Gly Thr Gly Ala Gly Ala Ala Gly Gly Pro Ala Gly Ala Phe Val Gly 20 25 30 Ala Xaa Val Val Xaa Ile 35 <210> 355 <211> 114 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 354 <220> <221> misc_feature <222> (100)..(102) <223> nnn = any amino acid-coding triplet <220> <221> misc_feature <222> (109)..(111) <223> nnn = any amino acid-coding triplet <400> 355 tataccgcga aacagtgcct gcaggcgatt ggcagctgcg gcattgcggg caccggcgcg 60 ggcgcggcgg gcggcccggc gggcgcgttt gtgggcgcgn nngtggtgnn natt 114 <210> 356 <211> 42 <212> PRT <213> Lactobacillus sakei <220> <221> VARIANT <222> (32)..(32) <223> Xaa = any amino acid <400> 356 Thr Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Tyr Cys Asn Ser Lys Lys Cys Trp 1 5 10 15 Val Asp Trp Gly Gln Ala Ala Gly Gly Ile Gly Gln Thr Val Val Xaa 20 25 30 Gly Trp Leu Gly Gly Ala Ile Pro Gly Lys 35 40 <210> 357 <211> 126 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 356 <220> <221> misc_feature <222> (94)..(96) <223> nnn = any amino acid-coding triplet <400> 357 accaaatatt atggcaacgg cgtgtattgc aacagcaaaa aatgctgggt ggattggggc 60 caggcggcgg gcggcattgg ccagaccgtg gtgnnnggct ggctgggcgg cgcgattccg 120 ggcaaa 126 <210> 358 <211> 22 <212> PRT <213> Streptococcus mutans <400> 358 Phe Lys Ser Trp Ser Phe Cys Thr Pro Gly Cys Ala Lys Thr Gly Ser 1 5 10 15 Phe Asn Ser Tyr Cys Cys 20 <210> 359 <211> 132 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 358 <400> 359 tttaaaagct ggagcttttg caccccgggc tgcgcgaaaa ccggcagctt taacagctat 60 tgctgcttta aaagctggag cttttgcacc ccgggctgcg cgaaaaccgg cagctttaac 120 agctattgct gc 132 <210> 360 <211> 43 <212> PRT <213> Enterococcus mundtii <400> 360 Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys Asn Lys Lys Gly Cys Ser Val 1 5 10 15 Asp Trp Gly Lys Ala Ile Gly Ile Ile Gly Asn Asn Ser Ala Ala Asn 20 25 30 Leu Ala Thr Gly Gly Ala Ala Gly Trp Ser Lys 35 40 <210> 361 <211> 129 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 360 <400> 361 aaatattatg gcaacggcgt gagctgcaac aaaaaaggct gcagcgtgga ttggggcaaa 60 gcgattggca ttattggcaa caacagcgcg gcgaacctgg cgaccggcgg cgcggcgggc 120 tggagcaaa 129 <210> 362 <211> 41 <212> PRT <213> Lactobacillus sakei <220> <221> VARIANT <222> (9)..(9) <223> Xaa = any amino acid <220> <221> VARIANT <222> (14)..(14) <223> Xaa = any amino acid <220> <221> VARIANT <222> (33)..(33) <223> Xaa = any amino acid <220> <221> VARIANT <222> (37)..(37) <223> Xaa = any amino acid <400> 362 Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val His Xaa Gly Lys His Ser Xaa Thr Val 1 5 10 15 Asp Trp Gly Thr Ala Ile Gly Asn Ile Gly Asn Asn Ala Ala Ala Asn 20 25 30 Xaa Ala Thr Gly Xaa Asn Ala Gly Gly 35 40 <210> 363 <211> 123 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 362 <220> <221> misc_feature <222> (25)..(27) <223> nnn = any amino acid-coding triplet <220> <221> misc_feature <222> (40)..(42) <223> nnn = any amino acid-coding triplet <220> <221> misc_feature <222> (97)..(99) <223> nnn = any amino acid-coding triplet <220> <221> misc_feature <222> (109)..(111) <223> nnn = any amino acid-coding triplet <400> 363 aaatattatg gcaacggcgt gcatnnnggc aaacatagcn nnaccgtgga ttggggcacc 60 gcgattggca acattggcaa caacgcggcg gcgaacnnng cgaccggcnn naacgcgggc 120 ggc 123 <210> 364 <211> 31 <212> PRT <213> Lactobacillus paracasei <400> 364 Gly Met Ser Gly Tyr Ile Gln Gly Ile Pro Asp Phe Leu Lys Gly Tyr 1 5 10 15 Leu His Gly Ile Ser Ala Ala Asn Lys His Lys Lys Gly Arg Leu 20 25 30 <210> 365 <211> 93 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 364 <400> 365 ggcatgagcg gctatattca gggcattccg gattttctga aaggctatct gcatggcatt 60 agcgcggcga acaaacataa aaaaggccgc ctg 93 <210> 366 <211> 31 <212> PRT <213> Leuconostoc mesenteroides <400> 366 Lys Gly Lys Gly Phe Trp Ser Trp Ala Ser Lys Ala Thr Ser Trp Leu 1 5 10 15 Thr Gly Pro Gln Gln Pro Gly Ser Pro Leu Leu Lys Lys His Arg 20 25 30 <210> 367 <211> 93 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 366 <400> 367 aaaggcaaag gcttttggag ctgggcgagc aaagcgacca gctggctgac cggcccgcag 60 cagccgggca gcccgctgct gaaaaaacat cgc 93 <210> 368 <211> 43 <212> PRT <213> Leuconostoc mesenteroides <400> 368 Lys Asn Tyr Gly Asn Gly Val His Cys Thr Lys Lys Gly Cys Ser Val 1 5 10 15 Asp Trp Gly Tyr Ala Trp Thr Asn Ile Ala Asn Asn Ser Val Met Asn 20 25 30 Gly Leu Thr Gly Gly Asn Ala Gly Trp His Asn 35 40 <210> 369 <211> 129 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 368 <400> 369 aaaaactatg gcaacggcgt gcattgcacc aaaaaaggct gcagcgtgga ttggggctat 60 gcgtggacca acattgcgaa caacagcgtg atgaacggcc tgaccggcgg caacgcgggc 120 tggcataac 129 <210> 370 <211> 47 <212> PRT <213> Bacillus subtilis <400> 370 Ala Ile Lys Leu Val Gln Ser Pro Asn Gly Asn Phe Ala Ala Ser Phe 1 5 10 15 Val Leu Asp Gly Thr Lys Trp Ile Phe Lys Ser Lys Tyr Tyr Asp Ser 20 25 30 Ser Lys Gly Tyr Trp Val Gly Ile Tyr Glu Val Trp Asp Arg Lys 35 40 45 <210> 371 <211> 141 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 370 <400> 371 gcgattaaac tggtgcagag cccgaacggc aactttgcgg cgagctttgt gctggatggc 60 accaaatgga tttttaaaag caaatattat gatagcagca aaggctattg ggtgggcatt 120 tatgaagtgt gggatcgcaa a 141 <210> 372 <211> 12 <212> PRT <213> Bacillus licheniformis <220> <221> VARIANT <222> (7)..(7) <223> Xaa = any amino acid <400> 372 Ile Ser Leu Glu Ile Cys Xaa Ile Phe His Asp Asn 1 5 10 <210> 373 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 372 <220> <221> misc_feature <222> (19)..(21) <223> nnn = any amino acid-coding triplet <400> 373 attagcctgg aaatttgcnn natttttcat gataac 36 <210> 374 <211> 37 <212> PRT <213> Lactococcus lactis subsp. lactis <400> 374 Thr Ser Tyr Gly Asn Gly Val His Cys Asn Lys Ser Lys Cys Trp Ile 1 5 10 15 Asp Val Ser Glu Leu Glu Thr Tyr Lys Ala Gly Thr Val Ser Asn Pro 20 25 30 Lys Asp Ile Leu Trp 35 <210> 375 <211> 111 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 374 <400> 375 accagctatg gcaacggcgt gcattgcaac aaaagcaaat gctggattga tgtgagcgaa 60 ctggaaacct ataaagcggg caccgtgagc aacccgaaag atattctgtg g 111 <210> 376 <211> 9 <212> PRT <213> Serratia plymuthica <400> 376 Asp Tyr His His Gly Val Arg Val Leu 1 5 <210> 377 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 376 <400> 377 gattatcatc atggcgtgcg cgtgctg 27 <210> 378 <211> 15 <212> PRT <213> Halobacterium sp. <400> 378 Asp Ile Asp Ile Thr Gly Cys Ser Ala Cys Lys Tyr Ala Ala Gly 1 5 10 15 <210> 379 <211> 45 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 378 <400> 379 gatattgata ttaccggctg cagcgcgtgc aaatatgcgg cgggc 45 <210> 380 <211> 12 <212> PRT <213> Bacillus subtilis <220> <221> VARIANT <222> (1)..(1) <223> Xaa = any amino acid <220> <221> VARIANT <222> (2)..(2) <223> Xaa = any amino acid <220> <221> VARIANT <222> (6)..(6) <223> Xaa = any amino acid <400> 380 Xaa Xaa Lys Glu Ile Xaa His Ile Phe His Asp Asn 1 5 10 <210> 381 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 380 <220> <221> misc_feature <222> (1)..(3) <223> nnn = any amino acid-coding triplet <220> <221> misc_feature <222> (4)..(6) <223> nnn = any amino acid-coding triplet <220> <221> misc_feature <222> (16)..(18) <223> nnn = any amino acid-coding triplet <400> 381 nnnnnnaaag aaattnnnca tatttttcat gataac 36 <210> 382 <211> 12 <212> PRT <213> Lactobacillus curvatus <400> 382 Thr Pro Val Val Asn Pro Pro Phe Leu Gln Gln Thr 1 5 10 <210> 383 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 382 <400> 383 accccggtgg tgaacccgcc gtttctgcag cagacc 36 <210> 384 <211> 10 <212> PRT <213> Lactobacillus curvatus <220> <221> VARIANT <222> (10)..(10) <223> Xaa = any amino acid <400> 384 Val Ala Pro Phe Pro Glu Gln Phe Leu Xaa 1 5 10 <210> 385 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 384 <220> <221> misc_feature <222> (28)..(30) <223> nnn = any amino acid-coding triplet <400> 385 gtggcgccgt ttccggaaca gtttctgnnn 30 <210> 386 <211> 9 <212> PRT <213> Lactobacillus curvatus <400> 386 Asn Ile Pro Gln Leu Thr Pro Thr Pro 1 5 <210> 387 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 386 <400> 387 aacattccgc agctgacccc gaccccg 27 <210> 388 <211> 18 <212> PRT <213> Bacillus thuringiensis subsp. entomocidus <220> <221> VARIANT <222> (4)..(4) <223> Xaa = any amino acid <220> <221> VARIANT <222> (7)..(7) <223> Xaa = any amino acid <220> <221> VARIANT <222> (10)..(10) <223> Xaa = any amino acid <400> 388 Asp Trp Thr Xaa Trp Ser Xaa Leu Val Xaa Ala Ala Cys Ser Val Glu 1 5 10 15 Leu Leu <210> 389 <211> 54 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 388 <220> <221> misc_feature <222> (10)..(12) <223> nnn = any amino acid-coding triplet <220> <221> misc_feature <222> (19)..(21) <223> nnn = any amino acid-coding triplet <220> <221> misc_feature <222> (28)..(30) <223> nnn = any amino acid-coding triplet <400> 389 gattggaccn nntggagcnn nctggtgnnn gcggcgtgca gcgtggaact gctg 54 <210> 390 <211> 30 <212> PRT <213> Lactobacillus curvatus <400> 390 Ala Tyr Pro Gly Asn Gly Val His Cys Gly Lys Tyr Ser Cys Thr Val 1 5 10 15 Asp Lys Gln Thr Ala Ile Gly Asn Ile Gly Asn Asn Ala Ala 20 25 30 <210> 391 <211> 90 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 390 <400> 391 gcgtatccgg gcaacggcgt gcattgcggc aaatatagct gcaccgtgga taaacagacc 60 gcgattggca acattggcaa caacgcggcg 90 <210> 392 <211> 43 <212> PRT <213> Carnobacterium divergens <400> 392 Thr Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Tyr Cys Asn Ser Lys Lys Cys Trp 1 5 10 15 Val Asp Trp Gly Thr Ala Gln Gly Cys Ile Asp Val Val Ile Gly Gln 20 25 30 Leu Gly Gly Gly Ile Pro Gly Lys Gly Lys Cys 35 40 <210> 393 <211> 129 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 392 <400> 393 accaaatatt atggcaacgg cgtgtattgc aacagcaaaa aatgctgggt ggattggggc 60 accgcgcagg gctgcattga tgtggtgatt ggccagctgg gcggcggcat tccgggcaaa 120 ggcaaatgc 129 <210> 394 <211> 62 <212> PRT <213> Enterococcus sp. <400> 394 Asn Arg Trp Tyr Cys Asn Ser Ala Ala Gly Gly Val Gly Gly Ala Ala 1 5 10 15 Val Cys Gly Leu Ala Gly Tyr Val Gly Glu Ala Lys Glu Asn Ile Ala 20 25 30 Gly Glu Val Arg Lys Gly Trp Gly Met Ala Gly Gly Phe Thr His Asn 35 40 45 Lys Ala Cys Lys Ser Phe Pro Gly Ser Gly Trp Ala Ser Gly 50 55 60 <210> 395 <211> 186 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 394 <400> 395 aaccgctggt attgcaacag cgcggcgggc ggcgtgggcg gcgcggcggt gtgcggcctg 60 gcgggctatg tgggcgaagc gaaagaaaac attgcgggcg aagtgcgcaa aggctggggc 120 atggcgggcg gctttaccca taacaaagcg tgcaaaagct ttccgggcag cggctgggcg 180 agcggc 186 <210> 396 <211> 39 <212> PRT <213> Enterococcus faecium <400> 396 Thr Thr Lys Asn Tyr Gly Asn Gly Val Cys Asn Ser Val Asn Trp Cys 1 5 10 15 Gln Cys Gly Asn Val Trp Ala Ser Cys Asn Leu Ala Thr Gly Cys Ala 20 25 30 Ala Trp Leu Cys Lys Leu Ala 35 <210> 397 <211> 117 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 396 <400> 397 accaccaaaa actatggcaa cggcgtgtgc aacagcgtga actggtgcca gtgcggcaac 60 gtgtgggcga gctgcaacct ggcgaccggc tgcgcggcgt ggctgtgcaa actggcg 117 <210> 398 <211> 30 <212> PRT <213> Paenibacillus polymyxa <400> 398 Ala Ser Ile Ile Lys Thr Thr Ile Lys Val Ser Lys Ala Val Cys Lys 1 5 10 15 Thr Leu Thr Cys Ile Cys Thr Gly Ser Cys Ser Asn Cys Lys 20 25 30 <210> 399 <211> 90 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 398 <400> 399 gcgagcatta ttaaaaccac cattaaagtg agcaaagcgg tgtgcaaaac cctgacctgc 60 atttgcaccg gcagctgcag caactgcaaa 90 <210> 400 <211> 31 <212> PRT <213> Staphylococcus epidermidis <400> 400 Ser Ala Ser Ile Val Lys Thr Thr Ile Lys Ala Ser Lys Lys Leu Cys 1 5 10 15 Arg Gly Phe Thr Leu Thr Cys Gly Cys His Phe Thr Gly Lys Lys 20 25 30 <210> 401 <211> 93 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 400 <400> 401 agcgcgagca ttgtgaaaac caccattaaa gcgagcaaaa aactgtgccg cggctttacc 60 ctgacctgcg gctgccattt taccggcaaa aaa 93 <210> 402 <211> 43 <212> PRT <213> Enterococcus faecium <400> 402 Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys Asn Lys Lys Gly Cys Ser Val 1 5 10 15 Asp Trp Gly Lys Ala Ile Gly Ile Ile Gly Asn Asn Ala Ala Ala Asn 20 25 30 Leu Thr Thr Gly Gly Lys Ala Ala Trp Ala Cys 35 40 <210> 403 <211> 129 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 402 <400> 403 aaatattatg gcaacggcgt gagctgcaac aaaaaaggct gcagcgtgga ttggggcaaa 60 gcgattggca ttattggcaa caacgcggcg gcgaacctga ccaccggcgg caaagcggcg 120 tgggcgtgc 129 <210> 404 <211> 39 <212> PRT <213> Paenibacillus polymyxa <400> 404 Ala Thr Tyr Tyr Gly Asn Gly Leu Tyr Cys Asn Lys Gln Lys His Tyr 1 5 10 15 Thr Trp Val Asp Trp Asn Lys Ala Ser Arg Glu Ile Gly Lys Ile Thr 20 25 30 Val Asn Gly Trp Val Gln His 35 <210> 405 <211> 117 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 404 <400> 405 gcgacctatt atggcaacgg cctgtattgc aacaaacaga aacattatac ctgggtggat 60 tggaacaaag cgagccgcga aattggcaaa attaccgtga acggctgggt gcagcat 117 <210> 406 <211> 35 <212> PRT <213> Bacillus circulans <400> 406 Val Asn Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys Ser Lys Thr Lys Cys Ser Val 1 5 10 15 Asn Trp Gly Ile Ile Thr His Gln Ala Phe Arg Val Thr Ser Gly Val 20 25 30 Ala Ser Gly 35 <210> 407 <211> 105 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 406 <400> 407 gtgaactatg gcaacggcgt gagctgcagc aaaaccaaat gcagcgtgaa ctggggcatt 60 attacccatc aggcgtttcg cgtgaccagc ggcgtggcga gcggc 105 <210> 408 <211> 30 <212> PRT <213> Paenibacillus polymyxa <400> 408 Phe Val Tyr Gly Asn Gly Val Thr Ser Ile Leu Val Gln Ala Gln Phe 1 5 10 15 Leu Val Asn Gly Gln Arg Arg Phe Phe Tyr Thr Pro Asp Lys 20 25 30 <210> 409 <211> 90 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 408 <400> 409 tttgtgtatg gcaacggcgt gaccagcatt ctggtgcagg cgcagtttct ggtgaacggc 60 cagcgccgct ttttttatac cccggataaa 90 <210> 410 <211> 13 <212> PRT <213> Lactobacillus rhamnosus <400> 410 Ala Val Pro Ala Val Arg Lys Thr Asn Glu Thr Leu Asp 1 5 10 <210> 411 <211> 39 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 410 <400> 411 gcggtgccgg cggtgcgcaa aaccaacgaa accctggat 39 <210> 412 <211> 69 <212> PRT <213> Bacillus licheniformis <400> 412 Met Lys Asn Ser Ala Ala Arg Glu Ala Phe Lys Gly Ala Asn His Pro 1 5 10 15 Ala Gly Met Val Ser Glu Glu Glu Leu Lys Ala Leu Val Gly Gly Asn 20 25 30 Asp Val Asn Pro Glu Thr Thr Pro Ala Thr Thr Ser Ser Trp Thr Cys 35 40 45 Ile Thr Ala Gly Val Thr Val Ser Ala Ser Leu Cys Pro Thr Thr Lys 50 55 60 Cys Thr Ser Arg Cys 65 <210> 413 <211> 207 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 412 <400> 413 atgaaaaaca gcgcggcgcg cgaagcgttt aaaggcgcga accatccggc gggcatggtg 60 agcgaagaag aactgaaagc gctggtgggc ggcaacgatg tgaacccgga aaccaccccg 120 gcgaccacca gcagctggac ctgcattacc gcgggcgtga ccgtgagcgc gagcctgtgc 180 ccgaccacca aatgcaccag ccgctgc 207 <210> 414 <211> 36 <212> PRT <213> Lactobacillus plantarum <400> 414 Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Leu Ser Cys Ser Lys Lys Gly Cys Thr Val 1 5 10 15 Asn Trp Gly Gln Ala Phe Ser Cys Gly Val Asn Arg Val Ala Thr Ala 20 25 30 Gly His Gly Lys 35 <210> 415 <211> 108 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 414 <400> 415 aaatattatg gcaacggcct gagctgcagc aaaaaaggct gcaccgtgaa ctggggccag 60 gcgtttagct gcggcgtgaa ccgcgtggcg accgcgggcc atggcaaa 108 <210> 416 <211> 24 <212> PRT <213> Lactobacillus acidophilus <400> 416 Gly Asn Pro Lys Val Ala His Cys Ala Ser Gln Ile Gly Arg Ser Thr 1 5 10 15 Ala Trp Gly Ala Val Ser Gly Ala 20 <210> 417 <211> 72 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 416 <400> 417 ggcaacccga aagtggcgca ttgcgcgagc cagattggcc gcagcaccgc gtggggcgcg 60 gtgagcggcg cg 72 <210> 418 <211> 40 <212> PRT <213> Enterococcus faecalis <400> 418 Trp Leu Pro Pro Ala Gly Leu Leu Gly Arg Cys Gly Arg Trp Phe Arg 1 5 10 15 Pro Trp Leu Leu Trp Leu Gln Ser Gly Ala Gln Tyr Lys Trp Leu Gly 20 25 30 Asn Leu Phe Gly Leu Gly Pro Lys 35 40 <210> 419 <211> 120 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 418 <400> 419 tggctgccgc cggcgggcct gctgggccgc tgcggccgct ggtttcgccc gtggctgctg 60 tggctgcaga gcggcgcgca gtataaatgg ctgggcaacc tgtttggcct gggcccgaaa 120 <210> 420 <211> 40 <212> PRT <213> Anabaena variabilis <400> 420 Asn Leu Asp Gln Trp Leu Thr Glu Gln Val His Glu Phe Gln Asp Met 1 5 10 15 Tyr Leu Glu Pro Gln Ala Ile Ser Asn Gln Asp Ile Thr Phe Lys Leu 20 25 30 Ser Asp Leu Asp Phe Ile His Asn 35 40 <210> 421 <211> 124 <212> DNA <213> Anabaena variabilis <400> 421 taatttagat cagtggttaa cagaacaagt tcatgagttt caagatatgt acttggaacc 60 acaagcaata tccaatcaag acattacctt caaactatct gacctagatt ttattcataa 120 ttga 124 <210> 422 <211> 40 <212> PRT <213> Nostoc sp <400> 422 Asn Leu Asp Gln Trp Leu Thr Glu Gln Val His Glu Phe Gln Asp Met 1 5 10 15 Tyr Leu Glu Pro Gln Ala Ile Ser Asn Gln Asp Ile Thr Phe Lys Leu 20 25 30 Ser Asp Leu Asp Phe Ile His Asn 35 40 <210> 423 <211> 123 <212> DNA <213> Nostoc sp <400> 423 aatttagatc aatggttaac agaacaagtt catgagtttc aagatatgta cttggaacca 60 caagcaatat ccaatcaaga cattaccttc aaactgtcag acctagattt tattcataat 120 tga 123 <210> 424 <211> 7 <212> PRT <213> Nostoc azollae <400> 424 His Arg Glu Lys Lys Ser Ala 1 5 <210> 425 <211> 24 <212> DNA <213> Nostoc azollae <400> 425 cacagagaga aaaaatcagc atag 24 <210> 426 <211> 23 <212> PRT <213> Acaryochloris marina <400> 426 Thr Ser Asn Asn Trp Leu Ala Lys Asn Tyr Leu Ser Met Trp Asn Lys 1 5 10 15 Lys Ser Ser Asn Pro Asn Leu 20 <210> 427 <211> 72 <212> DNA <213> Acaryochloris marina <400> 427 acaagcaata actggctagc caaaaactat ctttctatgt ggaataaaaa gagcagtaat 60 ccaaaccttt ag 72 <210> 428 <211> 6 <212> PRT <213> Cyanothece <400> 428 Phe Arg Tyr Phe Trp Trp 1 5 <210> 429 <211> 21 <212> DNA <213> Cyanothece <400> 429 tttagatatt tttggtggta a 21 <210> 430 <211> 6 <212> PRT <213> Cyanothece <400> 430 Phe Arg Tyr Phe Trp Trp 1 5 <210> 431 <211> 21 <212> DNA <213> Cyanothece <400> 431 tttagatatt tttggtggta a 21 <210> 432 <211> 9 <212> PRT <213> Cyanothece <400> 432 Cys Gly Glu Lys Trp Arg Ile Phe Ser 1 5 <210> 433 <211> 27 <212> DNA <213> Cyanothece <400> 433 tgtggagaaa aatggagaat ttttagc 27 <210> 434 <211> 8 <212> PRT <213> Cyanothece <400> 434 Phe Arg Leu Gln Leu Trp Gln Phe 1 5 <210> 435 <211> 24 <212> DNA <213> Cyanothece <400> 435 tttcgcttac aactgtggca attt 24 <210> 436 <211> 16 <212> PRT <213> Cyanothece <400> 436 Leu Gly Cys Asn Gln Ser Ser Ile Trp Ser Ile Phe Phe Trp Asn His 1 5 10 15 <210> 437 <211> 51 <212> DNA <213> Cyanothece <400> 437 ctaggatgta accagagcag tatctggtca atttttttct ggaatcatta a 51 <210> 438 <211> 40 <212> PRT <213> Microcoleus chthonoplastes <400> 438 Tyr Asn Leu Gln Gly Leu Pro Ala Ile Glu Ser Glu Asp Cys Ile Pro 1 5 10 15 Asp Ser Val Ala Pro Ser Asp Asp Trp Phe Ser Gly Val Ser Ser Leu 20 25 30 Phe Asn Arg Leu Thr Gly Leu Gly 35 40 <210> 439 <211> 123 <212> DNA <213> Microcoleus chthonoplastes <400> 439 tataacctac aggggttgcc agcaattgag tcagaagact gtatcccaga ttctgtagcg 60 ccttcggatg attggttttc aggcgtatcg tctctgttta accgcttgac tgggttgggt 120 tag 123 <210> 440 <211> 37 <212> PRT <213> Nostoc sp <400> 440 Trp Met Ala Ile Arg Arg Ile Leu Arg Cys His Pro Phe His Pro Gly 1 5 10 15 Gly Tyr Asp Pro Val Pro Glu Leu Gly Glu His Cys Cys His His Asp 20 25 30 Ser Gly Asn Lys Gly 35 <210> 441 <211> 114 <212> DNA <213> Nostoc sp <400> 441 tggatggcga ttcgccgcat tttgcgttgt catccattcc acccaggggg ttatgatcct 60 gtaccagagt tgggtgagca ttgttgtcat catgatagcg ggaataaggg gtga 114 <210> 442 <211> 35 <212> PRT <213> Anabaena variabilis <400> 442 Trp Met Gly Ile Arg Arg Ile Leu Arg Cys His Pro Phe His Pro Gly 1 5 10 15 Gly Tyr Asp Pro Val Pro Glu Val Gly Glu His Cys Cys His His Asp 20 25 30 Ser Gly Lys 35 <210> 443 <211> 108 <212> DNA <213> Anabaena variabilis <400> 443 tggatgggga ttcgccgcat tttgcgttgt catccattcc acccaggcgg ttatgatcct 60 gtaccagagg tgggtgagca ttgttgtcat catgatagcg ggaagtag 108 <210> 444 <211> 48 <212> PRT <213> Nodularia spumigena <400> 444 Trp Met Ala Thr Arg Arg Ile Leu Arg Cys His Pro Phe His Pro Gly 1 5 10 15 Gly Tyr Asp Pro Val Pro Glu Val Lys His Asn Cys Cys Asp Gln His 20 25 30 Leu Ser Asp Ser Gly Lys Gln Thr Thr Glu Asp His His Lys Gly Ser 35 40 45 <210> 445 <211> 147 <212> DNA <213> Nodularia spumigena <400> 445 tggatggcga ctcggcggat tttgcgttgt catcccttcc atcctggtgg atatgatcca 60 gttccagagg taaaacacaa ttgctgcgat cagcatctgt ccgattctgg gaaacagacc 120 acagaagacc atcacaaagg ctcgtag 147 <210> 446 <211> 34 <212> PRT <213> Nostoc azollae <400> 446 Trp Met Ala Thr Leu Arg Ile Leu Arg Cys His Pro Phe His Pro Gly 1 5 10 15 Gly Tyr Asp Pro Val Pro Gly Leu Ala Glu Lys Ser Cys Cys Asp His 20 25 30 His Asp <210> 447 <211> 105 <212> DNA <213> Nostoc azollae <400> 447 tggatggcaa ctttgcggat tttacgctgt catcctttcc atcctggtgg ttatgatcct 60 gtaccaggac tagcggaaaa atcctgttgt gaccatcatg attga 105 <210> 448 <211> 28 <212> PRT <213> Synechococcus <400> 448 Trp Leu Thr Ala Lys Arg Phe Cys Arg Cys His Pro Leu His Pro Gly 1 5 10 15 Gly Tyr Asp Pro Val Pro Glu Lys Lys Ser Val Leu 20 25 <210> 449 <211> 87 <212> DNA <213> Synechococcus <400> 449 tggctaacag ccaagcgctt ttgtcgctgt catccgcttc atcctggcgg gtatgatccg 60 gtaccggaga agaaatcggt actctaa 87 <210> 450 <211> 23 <212> PRT <213> Prochlorococcus marinus <400> 450 Trp Leu Thr Leu Arg Arg Leu Ser Arg Cys His Pro Phe Thr Pro Cys 1 5 10 15 Gly Cys Asp Pro Val Pro Asp 20 <210> 451 <211> 72 <212> DNA <213> Prochlorococcus marinus <400> 451 tggctcaccc tgcggcgcct gtctcgttgc catcctttta ccccctgtgg ttgcgacccg 60 gtgcctgatt aa 72 <210> 452 <211> 69 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 452 Met Ser Tyr Lys Lys Leu Tyr Gln Leu Thr Ala Ile Phe Ser Leu Pro 1 5 10 15 Leu Thr Ile Leu Leu Val Ser Leu Ser Ser Leu Arg Ile Val Gly Glu 20 25 30 Gly Asn Ser Tyr Val Asp Val Phe Leu Ser Phe Ile Ile Phe Leu Gly 35 40 45 Phe Ile Glu Leu Ile His Gly Ile Arg Lys Ile Leu Val Trp Ser Gly 50 55 60 Trp Lys Asn Gly Ser 65 <210> 453 <211> 210 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 453 atgagttata aaaaactgta ccaattgacg gctatattta gtttacctct tactatctta 60 ttggtttcac tttcatccct tcggattgtt ggcgaaggga attcttatgt tgacgttttt 120 ctaagcttta taatatttct tggttttatt gagctgattc atgggattcg aaagattttg 180 gtctggtcag gctggaaaaa cggaagttaa 210 <210> 454 <211> 85 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 454 Met Gly Leu Lys Leu Asp Leu Thr Trp Phe Asp Lys Ser Thr Glu Asp 1 5 10 15 Phe Lys Gly Glu Glu Tyr Ser Lys Asp Phe Gly Asp Asp Gly Ser Val 20 25 30 Met Glu Ser Leu Gly Val Pro Phe Lys Asp Asn Val Asn Asn Gly Cys 35 40 45 Phe Asp Val Ile Ala Glu Trp Val Pro Leu Leu Gln Pro Tyr Phe Asn 50 55 60 His Gln Ile Asp Ile Ser Asp Asn Glu Tyr Phe Val Ser Phe Asp Tyr 65 70 75 80 Arg Asp Gly Asp Trp 85 <210> 455 <211> 258 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 455 atgggactta aattggattt aacttggttt gataaaagta cagaagattt taagggtgag 60 gagtattcaa aagattttgg agatgacggt tcagttatgg aaagtctagg tgtgcctttt 120 aaggataatg ttaataacgg ttgctttgat gttatagctg aatgggtacc tttgctacaa 180 ccatacttta atcatcaaat tgatatttcc gataatgagt attttgtttc gtttgattat 240 cgtgatggtg attggtga 258 <210> 456 <211> 113 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 456 Met Ser Leu Arg Tyr Tyr Ile Lys Asn Ile Leu Phe Gly Leu Tyr Cys 1 5 10 15 Thr Leu Ile Tyr Ile Tyr Leu Ile Thr Lys Asn Ser Glu Gly Tyr Tyr 20 25 30 Phe Leu Val Ser Asp Lys Met Leu Tyr Ala Ile Val Ile Ser Thr Ile 35 40 45 Leu Cys Pro Tyr Ser Lys Tyr Ala Ile Glu Tyr Ile Ala Phe Asn Phe 50 55 60 Ile Lys Lys Asp Phe Phe Glu Arg Arg Lys Asn Leu Asn Asn Ala Pro 65 70 75 80 Val Ala Lys Leu Asn Leu Phe Met Leu Tyr Asn Leu Leu Cys Leu Val 85 90 95 Leu Ala Ile Pro Phe Gly Leu Leu Gly Leu Phe Ile Ser Ile Lys Asn 100 105 110 Asn <210> 457 <211> 342 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 457 atgagcttaa gatactacat aaaaaatatt ttatttggcc tgtactgcac acttatatat 60 atatacctta taacaaaaaa cagcgaaggg tattatttcc ttgtgtcaga taagatgcta 120 tatgcaatag tgataagcac tattctatgt ccatattcaa aatatgctat tgaatacata 180 gcttttaact tcataaagaa agattttttc gaaagaagaa aaaacctaaa taacgccccc 240 gtagcaaaat taaacctatt tatgctatat aatctacttt gtttggtcct agcaatccca 300 tttggattgc taggactttt tatatcaata aagaataatt aa 342 <210> 458 <211> 85 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 458 Met Gly Leu Lys Leu His Ile His Trp Phe Asp Lys Lys Thr Glu Glu 1 5 10 15 Phe Lys Gly Gly Glu Tyr Ser Lys Asp Phe Gly Asp Asp Gly Ser Val 20 25 30 Ile Glu Ser Leu Gly Met Pro Leu Lys Asp Asn Ile Asn Asn Gly Trp 35 40 45 Phe Asp Val Glu Lys Pro Trp Val Ser Ile Leu Gln Pro His Phe Lys 50 55 60 Asn Val Ile Asp Ile Ser Lys Phe Asp Tyr Phe Val Ser Phe Val Tyr 65 70 75 80 Arg Asp Gly Asn Trp 85 <210> 459 <211> 258 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 459 atggggctta aattacatat tcattggttt gataagaaaa ccgaagagtt taaaggcggt 60 gaatactcaa aagacttcgg tgatgatggt tctgtcattg aaagtctggg gatgccttta 120 aaggataata ttaataatgg ttggtttgat gttgaaaaac catgggtttc gatattacag 180 ccacacttta aaaatgtaat cgatattagt aaatttgatt actttgtatc ctttgtttac 240 cgggatggta actggtaa 258 <210> 460 <211> 86 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 460 Met Glu Leu Lys His Ser Ile Ser Asp Tyr Thr Glu Ala Glu Phe Leu 1 5 10 15 Glu Phe Val Lys Lys Ile Cys Arg Ala Glu Gly Ala Thr Glu Glu Asp 20 25 30 Asp Asn Lys Leu Val Arg Glu Phe Glu Arg Leu Thr Glu His Pro Asp 35 40 45 Gly Ser Asp Leu Ile Tyr Tyr Pro Arg Asp Asp Arg Glu Asp Ser Pro 50 55 60 Glu Gly Ile Val Lys Glu Ile Lys Glu Trp Arg Ala Ala Asn Gly Lys 65 70 75 80 Ser Gly Phe Lys Gln Gly 85 <210> 461 <211> 261 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 461 atggaactga aacatagtat tagtgattat accgaggctg aatttctgga gtttgtaaaa 60 aaaatatgta gagctgaagg tgctactgaa gaggatgaca ataaattagt gagagagttt 120 gagcgattaa ctgagcaccc agatggttca gatctgattt attatcctcg cgatgacagg 180 gaagatagtc ctgaagggat tgtcaaggaa attaaagaat ggcgagctgc taacggtaag 240 tcaggattta aacagggctg a 261 <210> 462 <211> 178 <212> PRT <213> Citrobacter freundii <400> 462 Met Met Asn Glu His Ser Ile Asp Thr Asp Asn Arg Lys Ala Asn Asn 1 5 10 15 Ala Leu Tyr Leu Phe Ile Ile Ile Gly Leu Ile Pro Leu Leu Cys Ile 20 25 30 Phe Val Val Tyr Tyr Lys Thr Pro Asp Ala Leu Leu Leu Arg Lys Ile 35 40 45 Ala Thr Ser Thr Glu Asn Leu Pro Ser Ile Thr Ser Ser Tyr Asn Pro 50 55 60 Leu Met Thr Lys Val Met Asp Ile Tyr Cys Lys Thr Ala Pro Phe Leu 65 70 75 80 Ala Leu Ile Leu Tyr Ile Leu Thr Phe Lys Ile Arg Lys Leu Ile Asn 85 90 95 Asn Thr Asp Arg Asn Thr Val Leu Arg Ser Cys Leu Leu Ser Pro Leu 100 105 110 Val Tyr Ala Ala Ile Val Tyr Leu Phe Cys Phe Arg Asn Phe Glu Leu 115 120 125 Thr Thr Ala Gly Arg Pro Val Arg Leu Met Ala Thr Asn Asp Ala Thr 130 135 140 Leu Leu Leu Phe Tyr Ile Gly Leu Tyr Ser Ile Ile Phe Phe Thr Thr 145 150 155 160 Tyr Ile Thr Leu Phe Thr Pro Val Thr Ala Phe Lys Leu Leu Lys Lys 165 170 175 Arg Gln <210> 463 <211> 537 <212> DNA <213> Citrobacter freundii <400> 463 atgatgaatg aacactcaat agatacggac aacagaaagg ccaataacgc attgtattta 60 tttataataa tcggattaat accattattg tgcatttttg ttgtttacta caaaacgcca 120 gacgctttac ttttacgtaa aattgctaca agcactgaga atctcccgtc aataacatcc 180 tcctacaacc cattaatgac aaaggttatg gatatttatt gtaaaacagc gcctttcctt 240 gccttaatac tatacatcct aacctttaaa atcagaaaat taatcaacaa caccgacagg 300 aacactgtac ttagatcttg tttattaagt ccattggtct atgcagcaat tgtttatcta 360 ttctgcttcc gaaattttga gttaacaaca gccggaaggc ctgtcagatt aatggccacc 420 aatgacgcaa cactattgtt attttatatt ggtctgtact caataatttt ctttacaacc 480 tatatcacgc tattcacacc agtcactgca tttaaattat taaaaaaaag gcagtaa 537 <210> 464 <211> 111 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 464 Met Asn Arg Lys Tyr Tyr Phe Asn Asn Met Trp Trp Gly Trp Val Thr 1 5 10 15 Gly Gly Tyr Met Leu Tyr Met Ser Trp Asp Tyr Glu Phe Lys Tyr Arg 20 25 30 Leu Leu Phe Trp Cys Ile Ser Leu Cys Gly Met Val Leu Tyr Pro Val 35 40 45 Ala Lys Trp Tyr Ile Glu Asp Thr Ala Leu Lys Phe Thr Arg Pro Asp 50 55 60 Phe Trp Asn Ser Gly Phe Phe Ala Asp Thr Pro Gly Lys Met Gly Leu 65 70 75 80 Leu Ala Val Tyr Thr Gly Thr Val Phe Ile Leu Ser Leu Pro Leu Ser 85 90 95 Met Ile Tyr Ile Leu Ser Val Ile Ile Lys Arg Leu Ser Val Arg 100 105 110 <210> 465 <211> 336 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 465 atgaacagaa aatattattt taataatatg tggtggggat gggtgacggg gggatatatg 60 ctgtatatgt catgggatta tgagtttaaa tacagattac tgttctggtg tatttctctc 120 tgcggaatgg ttttgtatcc ggttgcaaaa tggtatattg aagatacagc tctaaaattt 180 acccggcctg atttctggaa cagcggtttt tttgctgata cacctggaaa aatggggttg 240 cttgcggttt atacgggtac tgttttcata ttatctcttc cgttaagtat gatatatatt 300 ctttctgtta ttataaaaag gctgtctgta agatag 336 <210> 466 <211> 115 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 466 Met Lys Leu Asp Ile Ser Val Lys Tyr Leu Leu Lys Ser Leu Ile Pro 1 5 10 15 Ile Leu Ile Ile Leu Thr Val Phe Tyr Leu Gly Trp Lys Asp Asn Gln 20 25 30 Glu Asn Ala Arg Met Phe Tyr Ala Phe Ile Gly Cys Ile Ile Ser Ala 35 40 45 Ile Thr Phe Pro Phe Ser Met Arg Ile Ile Gln Lys Met Val 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35 40 45 His Lys Glu Leu Glu Leu Lys Pro Lys Ser Ser Pro Leu Arg Ala Leu 50 55 60 Lys Ile Leu Thr Pro Phe Thr Ile Leu Tyr Ile Ser Met Ile Tyr Cys 65 70 75 80 Phe Leu Leu Thr Asp Thr Glu Leu Thr Leu Ser Ser Lys Thr Phe Val 85 90 95 Leu Ile Val Lys Lys Arg Ser Val Phe Val Phe Phe Leu Tyr Asn Thr 100 105 110 Ile Tyr Trp Asp Ile Tyr Ile His Ile Phe Val Leu Leu Val Pro Tyr 115 120 125 Arg Asn Ile 130 <210> 469 <211> 396 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 469 atgcacaata cactcctcga aaaaatcatc gcatacctat ccctaccagg atttcattca 60 ttaaacaacc cgcccctaag cgaagcattc aatctctatg ttcatacagc ccctttagct 120 gcaaccagct tattcatatt cacacacaaa gaattagagt taaaaccaaa gtcgtcacct 180 ctgcgggcac taaagatatt aactcctttc actattcttt atatatccat gatatactgt 240 ttcttgctaa ctgacacaga actaaccttg tcatcaaaaa catttgtatt aatagtcaaa 300 aaacgatctg tttttgtctt ttttctatat aacactatat attgggatat atatattcac 360 atatttgtac ttttggttcc ttataggaac atataa 396 <210> 470 <211> 85 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 470 Met Glu Leu Lys Asn Ser Ile Ser Asp Tyr Thr Glu Thr Glu Phe Lys 1 5 10 15 Lys Ile Ile Glu Asp Ile Ile Asn Cys Glu Gly Asp Glu Lys Lys Gln 20 25 30 Asp Asp Asn Leu Glu His Phe Ile Ser Val Thr Glu His Pro Ser Gly 35 40 45 Ser Asp Leu Ile Tyr Tyr Pro Glu Gly Asn Asn Asp Gly Ser Pro Glu 50 55 60 Ala Val Ile Lys Glu Ile Lys Glu Trp Arg Ala Ala Asn Gly Lys Ser 65 70 75 80 Gly Phe Lys Gln Gly 85 <210> 471 <211> 258 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 471 atggaactga aaaacagcat tagtgattac actgaaactg aattcaaaaa aattattgaa 60 gacatcatca attgtgaagg tgatgaaaaa aaacaggatg ataacctcga gcattttata 120 agtgttactg agcatcctag tggttctgat ctgatttatt acccagaagg taataatgat 180 ggtagccctg aagctgttat taaagagatt aaagaatggc gagctgctaa cggtaagtca 240 ggatttaaac agggctga 258 <210> 472 <211> 98 <212> PRT <213> Lactococcus lactis subsp. lactis <400> 472 Met Lys Lys Lys Gln Ile Glu Phe Glu Asn Glu Leu Arg Ser Met Leu 1 5 10 15 Ala Thr Ala Leu Glu Lys Asp Ile Ser Gln Glu Glu Arg Asn Ala Leu 20 25 30 Asn Ile Ala Glu Lys Ala Leu Asp Asn Ser Glu Tyr Leu Pro Lys Ile 35 40 45 Ile Leu Asn Leu Arg Lys Ala Leu Thr Pro Leu Ala Ile Asn Arg Thr 50 55 60 Leu Asn His Asp Leu Ser Glu Leu Tyr Lys Phe Ile Thr Ser Ser Lys 65 70 75 80 Ala Ser Asn Lys Asn Leu Gly Gly Gly Leu Ile Met Ser Trp Gly Arg 85 90 95 Leu Phe <210> 473 <211> 297 <212> DNA <213> Lactococcus lactis subsp. lactis <400> 473 atgaaaaaaa aacaaataga atttgaaaac gagctaagaa gtatgttggc taccgccctt 60 gaaaaagaca ttagtcaaga ggaaagaaat gctctgaata ttgcagaaaa ggcgcttgac 120 aattctgaat atttaccaaa aattatttta aacctcagaa aagccctaac tccattagct 180 ataaatcgaa cacttaacca tgatttatct gaactgtata aattcattac aagttccaaa 240 gcatcaaaca aaaatttagg tggtggttta attatgtcgt ggggacgact attctaa 297 <210> 474 <211> 98 <212> PRT <213> Lactococcus lactis subsp. cremoris <400> 474 Met Lys Lys Lys Gln Ile Glu Phe Glu Asn Glu Leu Arg Ser Met Leu 1 5 10 15 Ala Thr Ala Leu Glu Lys Asp Ile Ser Gln Glu Glu Arg Asn Ala Leu 20 25 30 Asn Ile Ala Glu Lys Ala Leu Asp Asn Ser Glu Tyr Leu Pro Lys Ile 35 40 45 Ile Leu Asn Leu Arg Lys Ala Leu Thr Pro Leu Ala Ile Asn Arg Thr 50 55 60 Leu Asn His Asp Leu Ser Glu Leu Tyr Lys Phe Ile Thr Ser Ser Lys 65 70 75 80 Ala Ser Asn Lys Asn Leu Gly Gly Gly Leu Ile Met Ser Trp Gly Arg 85 90 95 Leu Phe <210> 475 <211> 297 <212> DNA <213> Lactococcus lactis subsp. cremoris <400> 475 atgaaaaaaa aacaaataga atttgaaaac gagctaagaa gtatgttggc taccgccctt 60 gaaaaagaca ttagtcaaga ggaaagaaat gctctgaata ttgcagaaaa ggcgcttgac 120 aattctgaat atttaccaaa aattatttta aacctcagaa aagccctaac tccattagct 180 ataaatcgaa cacttaacca tgatttatct gaactgtata aattcattac aagttccaaa 240 gcatcaaaca aaaatttagg tggtggttta attatgtcgt ggggacgact attctaa 297 <210> 476 <211> 87 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 476 Met Asn Lys Met Ala Met Ile Asp Leu Ala Lys Leu Phe Leu Ala Ser 1 5 10 15 Lys Ile Thr Ala Ile Glu Phe Ser Glu Arg Ile Cys Val Glu Arg Arg 20 25 30 Arg Leu Tyr Gly Val Lys Asp Leu Ser Pro Asn Ile Leu Asn Cys Gly 35 40 45 Glu Glu Leu Phe Met Ala Ala Glu Arg Phe Glu Pro Asp Ala Asp Arg 50 55 60 Ala Asn Tyr Glu Ile Asp Asp Asn Gly Leu Lys Val Glu Val Arg Ser 65 70 75 80 Ile Leu Glu Lys Phe Lys Leu 85 <210> 477 <211> 249 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 477 atgatcgatt tggcgaaatt atttttagct tcgaaaatta cagtgattga gttttcagag 60 cgaatttgtg ttgaacggag aagattgtat ggtgttaagg atttgtctcc gaatatatta 120 aattgtgggg aagagttgtc tatggctgct gagcgatttg agcctgatgc agatagggct 180 aattatgaaa ttgatgataa tggacttaag gtcgaggtcc gatctatctt ggaaaaactt 240 aaatcataa 249 <210> 478 <211> 83 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 478 Met Lys Leu Ser Pro Lys Ala Ala Ile Glu Val Cys Asn Glu Ala Ala 1 5 10 15 Lys Lys Gly Leu Trp Ile Leu Gly Ile Asp Gly Gly His Trp Leu Asn 20 25 30 Pro Gly Phe Arg Ile Asp Ser Ser Ala Ser Trp Thr Tyr Asp Met Pro 35 40 45 Glu Glu Tyr Lys Ser Lys Ile Pro Glu Asn Asn Arg Leu Ala Ile Glu 50 55 60 Asn Ile Lys Asp Asp Ile Glu Asn Gly Tyr Thr Ala Phe Ile Ile Thr 65 70 75 80 Leu Lys Met <210> 479 <211> 243 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 479 atgaagttat caccaaaagc tgcaatagaa gtttgtaatg aagcagcgaa aaaaggctta 60 tggattttgg gcattgatgg tgggcattgg ctgaatcctg gattcaggat agatagttca 120 gcatcatgga catatgatat gccggagaat acaaatcaaa aatccctgaa aataatagat 180 tggctattga aaatattaaa gatgatattg agaatggata cactgctttc attatcacgt 240 taa 243 <210> 480 <211> 85 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 480 Met Gly Leu Lys Leu His Ile Asn Trp Phe Asp Lys Arg Thr Glu Glu 1 5 10 15 Phe Lys Gly Gly Glu Tyr Ser Lys Asp Phe Gly Asp Asp Gly Ser Val 20 25 30 Ile Glu Arg Leu Gly Met Pro Phe Lys Asp Asn Ile Asn Asn Gly Trp 35 40 45 Phe Asp Val Ile Ala Glu Trp Val Pro Leu Leu Gln Pro Tyr Phe Asn 50 55 60 His Gln Ile Asp Ile Ser Asp Asn Glu Tyr Phe Val Ser Phe Asp Tyr 65 70 75 80 Arg Asp Gly Asp Trp 85 <210> 481 <211> 258 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 481 atggggctta aattacatat taattggttt gataagacga ccgaggaatt taaaggtggt 60 gagtattcaa aagattttgg agatgatggc tcggtcattg aacgtcttgg aatgccttta 120 aaagataata tcaataatgg ttggtttgat gttatagctg aatgggtacc tttgctacaa 180 ccatacttta atcatcaaat tgatatttcc gataatgagt attttgtttc gtttgattat 240 cgtgatggtg attggtga 258 <210> 482 <211> 85 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 482 Met Glu Leu Lys Lys Ser Ile Gly Asp Tyr Thr Glu Thr Glu Phe Lys 1 5 10 15 Lys Ile Ile Glu Asn Ile Ile Asn Cys Glu Gly Asp Glu Lys Lys Gln 20 25 30 Asp Asp Asn Leu Glu His Phe Ile Ser Val Thr Glu His Pro Ser Gly 35 40 45 Ser Asp Leu Ile Tyr Tyr Pro Glu Gly Asn Asn Asp Gly Ser Pro Glu 50 55 60 Ala Val Ile Lys Glu Ile Lys Glu Trp Arg Ala Ala Asn Gly Lys Ser 65 70 75 80 Gly Phe Lys Gln Gly 85 <210> 483 <211> 258 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 483 gtggagctaa agaaaagtat tggtgattac actgaaaccg aattcaaaaa aattattgaa 60 aacatcatca attgtgaagg tgatgaaaaa aaacaggatg ataacctcga gcattttata 120 agtgttactg agcatcctag tggttctgat ctgatttatt acccagaagg taataatgat 180 ggtagccctg aagctgttat taaagagatt aaagaatggc gagctgctaa cggtaagtca 240 ggatttaaac agggctga 258 <210> 484 <211> 86 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 484 Met Glu Leu Lys His Ser Ile Ser Asp Tyr Thr Glu Ala Glu Phe Leu 1 5 10 15 Gln Leu Val Thr Thr Ile Cys Asn Ala Asp Thr Ser Ser Glu Glu Glu 20 25 30 Leu Val Lys Leu Val Thr His Phe Glu Glu Met Thr Glu His Pro Ser 35 40 45 Gly Ser Asp Leu Ile Tyr Tyr Pro Lys Glu Gly Asp Asp Asp Ser Pro 50 55 60 Ser Gly Ile Val Asn Thr Val Lys Gln Trp Arg Ala Ala Asn Gly Lys 65 70 75 80 Ser Gly Phe Lys Gln Gly 85 <210> 485 <211> 261 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 485 atggaactga agcatagcat tagtgattat acagaagctg aatttttaca acttgtaaca 60 acaatttgta atgcgaacac ttccagtgaa gaagaactgg ttaaattggt tacacacttt 120 gaggaaatga ctgagcaccc tagtggtagt gatttaatat attacccaaa agaaggtgat 180 gatgactcac cttcaggtat tgtaaacaca gtaaaacaat ggcgagccgc taacggtaag 240 tcaggattta aacagggcta a 261 <210> 486 <211> 141 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 486 Met Leu Thr Leu Tyr Gly Tyr Ile Arg Asn Val Phe Leu Tyr Arg Met 1 5 10 15 Asn Asp Arg Ser Cys Gly Asp Phe Met Lys Val Ile Ser Met Lys Phe 20 25 30 Ile Phe Ile Leu Thr Ile Ile Ala Leu Ala Ala Val Phe Phe Trp Ser 35 40 45 Glu Asp Lys Gly Pro Ala Cys Tyr Gln Val Ser Asp Glu Gln Ala Arg 50 55 60 Thr Phe Val Lys Asn Asp Tyr Leu Gln Arg Met Lys Arg Trp Asp Asn 65 70 75 80 Asp Val Gln Leu Leu Gly Thr Glu Ile Pro Lys Ile Thr Trp Glu Lys 85 90 95 Ile Glu Arg Ser Leu Thr Asp Val Glu Asp Glu Lys Thr Leu Leu Val 100 105 110 Pro Phe Lys Ala Glu Gly Pro Asp Gly Lys Arg Met Tyr Tyr Gly Met 115 120 125 Tyr His Cys Glu Glu Gly Tyr Val Glu Tyr Ala Asn Asp 130 135 140 <210> 487 <211> 354 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 487 atgaaagtaa ttagcatgaa atttattttt attttaacga ttattgctct tgctgctgtt 60 tttttctggt ctgaagataa aggtccggca tgctatcagg tcagcgatga acaggccaga 120 acgtttgtaa aaaatgatta cctgcaaaga atgaaacgct gggacaacga tgtacaactt 180 cttggtacag aaatcccgaa aattacatgg gaaaagattg agagaagttt aacagatgtt 240 gaagatgaaa aaacacttct tgtcccattt aaagctgaag gcccggacgg taagagaatg 300 tattatggca tgtaccattg tgaggaggga tatgttgaat atgcgaatga ctaa 354 <210> 488 <211> 175 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 488 Met Thr Ser Asn Lys Asp Lys Asn Lys Lys Ala Asn Glu Ile Leu Tyr 1 5 10 15 Ala Phe Ser Ile Ile Gly Ile Ile Pro Leu Met Ala Ile Leu Ile Leu 20 25 30 Arg Ile Asn Asp Pro Tyr Ser Gln Val Leu Tyr Tyr Leu Tyr Asn Lys 35 40 45 Val Ala Phe Leu Pro Ser Ile Thr Ser Leu His Asp Pro Val Met Thr 50 55 60 Thr Leu Met Ser Asn Tyr Asn Lys Thr Ala Pro Val Met Gly Ile Leu 65 70 75 80 Val Phe Leu Cys Thr Tyr Lys Thr Arg Glu Ile Ile Lys Pro Val Thr 85 90 95 Arg Lys Leu Val Val Gln Ser Cys Phe Trp Gly Pro Val Phe Tyr Ala 100 105 110 Ile Leu Ile Tyr Ile Thr Leu Phe Tyr Asn Leu Glu Leu Thr Thr Ala 115 120 125 Gly Gly Phe Phe Lys Leu Leu Ser His Asn Val Ile Thr Leu Phe Ile 130 135 140 Leu Tyr Cys Ser Ile Tyr Phe Thr Val Leu Thr Met Thr Tyr Ala Ile 145 150 155 160 Leu Leu Met Pro Leu Leu Val Ile Lys Tyr Phe Lys Gly Arg Gln 165 170 175 <210> 489 <211> 528 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 489 atgaccagca ataaagataa gaacaagaaa gcaaacgaaa tattatatgc attttccata 60 atcgggatta ttccattaat ggctatatta atacttcgaa taaatgatcc atattctcaa 120 gtgctgtact acttatataa taaggtggca tttctccctt ctattacatc attgcatgat 180 cccgtcatga caacacttat gtcaaactac aacaagacag cgccagttat gggtattctc 240 gtttttcttt gcacatataa gacaagagaa atcataaagc cagtaacaag aaaacttgtt 300 gtgcaatcct gtttctgggg gcccgttttt tatgccattc tgatttatat cacactgttc 360 tataatctgg aactaacaac agcaggtggt ttttttaaat tattatctca taatgtcatc 420 actctgttta ttttatattg ctccatttac tttactgttt taaccatgac atatgcgatt 480 ttactgatgc cattacttgt cattaaatat tttaaaggga ggcagtaa 528 <210> 490 <211> 78 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 490 Met Asp Arg Lys Arg Thr Lys Leu Glu Leu Leu Phe Ala Phe Ile Ile 1 5 10 15 Asn Ala Thr Ala Ile Tyr Ile Ala Leu Ala Ile Tyr Asp Cys Val Phe 20 25 30 Arg Gly Lys Asp Phe Leu Ser Met His Thr Phe Cys Phe Ser Ala Leu 35 40 45 Met Ser Ala Ile Cys Tyr Phe Val Gly Asp Asn Tyr Tyr Ser Ile Ser 50 55 60 Asp Lys Ile Lys Arg Arg Ser Tyr Glu Asn Ser Asp Ser Lys 65 70 75 <210> 491 <211> 237 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 491 atggatagaa aaagaacaaa attagagttg ttatttgcat ttataataaa tgccaccgca 60 atatatattg cattagctat atatgattgt gtttttagag gaaaggactt tttatccatg 120 catacatttt gcttctctgc attaatgtct gcaatatgtt actttgttgg tgataattat 180 tattcaatat ccgataagat aaaaaggaga tcatatgaga actctgactc taaatga 237 <210> 492 <211> 113 <212> PRT <213> Shigella sonnei <400> 492 Met Ser Leu Arg Tyr Tyr Ile Lys Asn Ile Leu Phe Gly Leu Tyr Cys 1 5 10 15 Ala Leu Ile Tyr Ile Tyr Leu Ile Thr Lys Asn Asn Glu Gly Tyr Tyr 20 25 30 Phe Leu Ala Ser Asp Lys Met Leu Tyr Ala Ile Val Ile Ser Thr Ile 35 40 45 Leu Cys Pro Tyr Ser Lys Tyr Ala Ile Glu His Ile Phe Phe Lys Phe 50 55 60 Ile Lys Lys Asp Phe Phe Arg Lys Arg Lys Asn Leu Asn Lys Cys Pro 65 70 75 80 Arg Gly Lys Ile Lys Pro Tyr Leu Cys Val Tyr Asn Leu Leu Cys Leu 85 90 95 Val Leu Ala Ile Pro Phe Gly Leu Leu Gly Leu Val Tyr Ile Asn Lys 100 105 110 Glu <210> 493 <211> 342 <212> DNA <213> Shigella sonnei <400> 493 atgagtttaa gatactacat aaaaaatatt ttgtttggcc tatactgcgc acttatatat 60 atatacctta taacaaaaaa caacgaaggg tattatttcc tagcgtcaga taagatgcta 120 tacgcaatag tgataagcac tattctatgc ccatattcaa aatatgctat tgaacacata 180 ttttttaagt tcataaagaa agattttttc agaaaaagaa aaaacctaaa taaatgcccc 240 cgtggcaaaa ttaaaccgta tttatgcgta tacaatctac tttgtttggt cctagcaatc 300 ccatttggat tgctaggact tgtttatatc aataaagaat aa 342 <210> 494 <211> 113 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 494 Met Ser Leu Arg Tyr Tyr Ile Lys Asn Ile Leu Phe Gly Leu Tyr Cys 1 5 10 15 Thr Leu Ile Tyr Ile Tyr Leu Ile Thr Lys Asn Ser Glu Glu Tyr Tyr 20 25 30 Phe Leu Val Thr Asp Lys Met Leu Tyr Ala Ile Val Ile Ser Thr Ile 35 40 45 Leu Cys Pro Tyr Ser Lys Tyr Ala Ile Glu His Ile Ala Phe Asn Phe 50 55 60 Ile Lys Lys His Phe Phe Glu Arg Arg Lys Asn Leu Asn Asn Ala Pro 65 70 75 80 Val Ala Lys Leu Asn Leu Phe Met Leu Tyr Asn Leu Leu Cys Leu Val 85 90 95 Leu Ala Ile Pro Phe Gly Leu Leu Gly Leu Phe Ile Ser Ile Lys Asn 100 105 110 Asn <210> 495 <211> 342 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 495 atgagcttaa gatactacat aaaaaatatt ttatttggcc tgtactgcac acttatatat 60 atatacctta taacaaaaaa cagcgaagag tattatttcc ttgtgacaga taagatgcta 120 tatgcaatag tgataagcac tattctatgt ccatattcaa aatatgctat tgaacacata 180 gcttttaact tcataaagaa acattttttc gaaagaagaa aaaacctaaa taacgccccc 240 gtagcaaaat taaacctatt tatgctatat aatctacttt gtttggtcct agcaatccca 300 tttggattgc taggactttt tatatcaata aagaataatt aa 342 <210> 496 <211> 113 <212> PRT <213> Leuconostoc gelidum <400> 496 Met Arg Lys Asn Asn Ile Leu Leu Asp Asp Ala Lys Ile Tyr Thr Asn 1 5 10 15 Lys Leu Tyr Leu Leu Leu Ile Asp Arg Lys Asp Asp Ala Gly Tyr Gly 20 25 30 Asp Ile Cys Asp Val Leu Phe Gln Val Ser Lys Lys Leu Asp Ser Thr 35 40 45 Lys Asn Val Glu Ala Leu Ile Asn Arg Leu Val Asn Tyr Ile Arg Ile 50 55 60 Thr Ala Ser Thr Asn Arg Ile Lys Phe Ser Lys Asp Glu Glu Ala Val 65 70 75 80 Ile Ile Glu Leu Gly Val Ile Gly Gln Lys Ala Gly Leu Asn Gly Gln 85 90 95 Tyr Met Ala Asp Phe Ser Asp Lys Ser Gln Phe Tyr Ser Ile Phe Glu 100 105 110 Arg <210> 497 <211> 342 <212> DNA <213> Leuconostoc gelidum <400> 497 ttgagaaaaa ataacatttt attggacgat gctaaaatat acacgaacaa actctatttg 60 ctattaatcg atagaaaaga tgacgctggg tatggagata tttgtgatgt tttgtttcag 120 gtatccaaaa aattagatag cacaaaaaat gtagaagcat tgattaaccg attggtcaat 180 tatatacgaa ttaccgcttc aacaaacaga attaagtttt caaaagatga agaggctgta 240 attatagaac ttggtgtaat tggtcagaag gctggattaa acggccaata catggctgat 300 ttttctgaca aatctcagtt ttatagtatc tttgaaagat aa 342 <210> 498 <211> 91 <212> PRT <213> Lactococcus lactis subsp. cremoris <400> 498 Met Lys Lys Lys Val Asp Thr Glu Lys Gln Ile Thr Ser Trp Ala Ser 1 5 10 15 Asp Leu Ala Ser Lys Asn Glu Thr Lys Val Gln Glu Lys Leu Ile Leu 20 25 30 Ser Ser Tyr Ile Gln Asp Ile Glu Asn His Val Tyr Phe Pro Lys Ala 35 40 45 Met Ile Ser Leu Glu Lys Lys Leu Arg Asp Gln Asn Asn Ile Cys Ala 50 55 60 Leu Ser Lys Glu Val Asn Gln Phe Tyr Phe Lys Val Val Glu Val Asn 65 70 75 80 Gln Arg Lys Ser Trp Met Val Gly Leu Ile Val 85 90 <210> 499 <211> 276 <212> DNA <213> Lactococcus lactis subsp. cremoris <400> 499 atgaaaaaaa aagttgatac agaaaaacaa attacttctt gggcatctga cttagcttcc 60 aaaaatgaaa caaaggttca agaaaaatta atactgtctt cttatattca ggacatcgaa 120 aaccatgttt actttccaaa agcaatgatt tctttagaaa aaaaattacg agaccaaaat 180 aatatttgcg ctttatcaaa agaagtcaat cagttttatt ttaaagttgt tgaagtaaat 240 caaagaaaat cctggatggt aggtttgata gtttaa 276 <210> 500 <211> 112 <212> PRT <213> Pediococcus acidilactici <400> 500 Met Asn Lys Thr Lys Ser Glu His Ile Lys Gln Gln Ala Leu Asp Leu 1 5 10 15 Phe Thr Arg Leu Gln Phe Leu Leu Gln Lys His Asp Thr Ile Glu Pro 20 25 30 Tyr Gln Tyr Val Leu Asp Ile Leu Glu Thr Gly Ile Ser Lys Thr Lys 35 40 45 His Asn Gln Gln Thr Pro Glu Arg Gln Ala Arg Val Val Tyr Asn Lys 50 55 60 Ile Ala Ser Gln Ala Leu Val Asp Lys Leu His Phe Thr Ala Glu Glu 65 70 75 80 Asn Lys Val Leu Ala Ala Ile Asn Glu Leu Ala His Ser Gln Lys Gly 85 90 95 Trp Gly Glu Phe Asn Met Leu Asp Thr Thr Asn Thr Trp Pro Ser Gln 100 105 110 <210> 501 <211> 339 <212> DNA <213> Pediococcus acidilactici <400> 501 atgaataaga ctaagtcgga acatattaaa caacaagctt tggacttatt tactaggcta 60 cagtttttac tacagaagca cgatactatc gaaccttacc agtacgtttt agatattctg 120 gagactggta tcagtaaaac taaacataac cagcaaacgc ctgaacgaca agctcgtgta 180 gtctacaaca agattgccag ccaagcgtta gtagataagt tacattttac tgccgaagaa 240 aacaaagttc tagcagccat caatgaattg gcgcattctc aaaaagggtg gggcgagttt 300 aacatgctag atactaccaa tacgtggcct agccaatag 339 <210> 502 <211> 88 <212> PRT <213> Carnobacterium maltaromaticum <400> 502 Met Ile Lys Asp Glu Lys Ile Asn Lys Ile Tyr Ala Leu Val Lys Ser 1 5 10 15 Ala Leu Asp Asn Thr Asp Val Lys Asn Asp Lys Lys Leu Ser Leu Leu 20 25 30 Leu Met Arg Ile Gln Glu Thr Ser Ile Asn Gly Glu Leu Phe Tyr Asp 35 40 45 Tyr Lys Lys Glu Leu Gln Pro Ala Ile Ser Met Tyr Ser Ile Gln His 50 55 60 Asn Phe Arg Val Pro Asp Asp Leu Val Lys Leu Leu Ala Leu Val Gln 65 70 75 80 Thr Pro Lys Ala Trp Ser Gly Phe 85 <210> 503 <211> 267 <212> DNA <213> Carnobacterium maltaromaticum <400> 503 atgataaaag atgaaaaaat aaataaaatc tatgctttag ttaagagcgc acttgataat 60 acggatgtta agaatgataa aaaactttct ttacttctta tgagaataca agaaacatca 120 attaatggag aactatttta cgattataaa aaagaattac agccagctat tagtatgtac 180 tctattcaac ataactttcg ggttcctgac gatctagtaa aactgttagc attagttcaa 240 acacctaaag cttggtcagg gttttaa 267 <210> 504 <211> 111 <212> PRT <213> Carnobacterium maltaromaticum <400> 504 Met Asp Ile Lys Ser Gln Thr Leu Tyr Leu Asn Leu Ser Glu Ala Tyr 1 5 10 15 Lys Asp Pro Glu Val Lys Ala Asn Glu Phe Leu Ser Lys Leu Val Val 20 25 30 Gln Cys Ala Gly Lys Leu Thr Ala Ser Asn Ser Glu Asn Ser Tyr Ile 35 40 45 Glu Val Ile Ser Leu Leu Ser Arg Gly Ile Ser Ser Tyr Tyr Leu Ser 50 55 60 His Lys Arg Ile Ile Pro Ser Ser Met Leu Thr Ile Tyr Thr Gln Ile 65 70 75 80 Gln Lys Asp Ile Lys Asn Gly Asn Ile Asp Thr Glu Lys Leu Arg Lys 85 90 95 Tyr Glu Ile Ala Lys Gly Leu Met Ser Val Pro Tyr Ile Tyr Phe 100 105 110 <210> 505 <211> 336 <212> DNA <213> Carnobacterium maltaromaticum <400> 505 atggatataa agtctcaaac attatatttg aatctaagcg aggcatataa agaccctgaa 60 gtaaaagcta atgaattctt atcaaaatta gttgtacaat gtgctgggaa attaacagct 120 tcaaacagtg agaacagtta tattgaagta atatcattgc tatctagggg tatttctagt 180 tattatttat cccataaacg tataattcct tcaagtatgt taactatata tactcaaata 240 caaaaggata taaaaaacgg gaatattgac accgaaaaat taaggaaata tgagatagca 300 aaaggattaa tgtccgttcc ttatatatat ttctaa 336 <210> 506 <211> 245 <212> PRT <213> Lactococcus lactis subsp. lactis <400> 506 Met Arg Arg Tyr Leu Ile Leu Ile Val Ala Leu Ile Gly Ile Thr Gly 1 5 10 15 Leu Ser Gly Cys Tyr Gln Thr Ser His Lys Lys Val Arg Phe Asp Glu 20 25 30 Gly Ser Tyr Thr Asn Phe Ile Tyr Asp Asn Lys Ser Tyr Phe Val Thr 35 40 45 Asp Lys Glu Ile Pro Gln Glu Asn Val Asn Asn Ser Lys Val Lys Phe 50 55 60 Tyr Lys Leu Leu Ile Val Asp Met Lys Ser Glu Lys Leu Leu Ser Ser 65 70 75 80 Ser Asn Lys Asn Ser Val Thr Leu Val Leu Asn Asn Ile Tyr Glu Ala 85 90 95 Ser Asp Lys Ser Leu Cys Met Gly Ile Asn Asp Arg Tyr Tyr Lys Ile 100 105 110 Leu Pro Glu Ser Asp Lys Gly Ala Val Lys Ala Leu Arg Leu Gln Asn 115 120 125 Phe Asp Val Thr Ser Asp Ile Ser Asp Asp Asn Phe Val Ile Asp Lys 130 135 140 Asn Asp Ser Arg Lys Ile Asp Tyr Met Gly Asn Ile Tyr Ser Ile Ser 145 150 155 160 Asp Thr Thr Val Ser Asp Glu Glu Leu Gly Glu Tyr Gln Asp Val Leu 165 170 175 Ala Glu Val Arg Val Phe Asp Ser Val Ser Gly Lys Ser Ile Pro Arg 180 185 190 Ser Glu Trp Gly Arg Ile Asp Lys Asp Gly Ser Asn Ser Lys Gln Ser 195 200 205 Arg Thr Glu Trp Asp Tyr Gly Glu Ile His Ser Ile Arg Gly Lys Ser 210 215 220 Leu Thr Glu Ala Phe Ala Val Glu Ile Asn Asp Asp Phe Lys Leu Ala 225 230 235 240 Thr Lys Val Gly Asn 245 <210> 507 <211> 738 <212> DNA <213> Lactococcus lactis subsp. lactis <400> 507 atgagaagat atttaatact tattgtggcc ttaataggga taacaggttt atcagggtgt 60 tatcaaacaa gtcataaaaa ggtgaggttt gacgaaggaa gttatactaa ttttatttat 120 gataataaat cgtatttcgt aactgataag gagattcctc aggagaacgt taacaattcc 180 aaagtaaaat tttataagct gttgattgtt gacatgaaaa gtgagaaact tttatcaagt 240 agcaacaaaa atagtgtgac tttggtctta aataatattt atgaggcttc tgacaagtcg 300 ctatgtatgg gtattaacga cagatactat aagatacttc cagaaagtga taagggggcg 360 gtcaaagctt tgagattaca aaactttgat gtgacaagcg atatttctga tgataatttt 420 gttattgata aaaatgattc acgaaaaatt gactatatgg gaaatattta cagtatatcg 480 gacaccaccg tatctgatga agaattggga gaatatcagg atgttttagc tgaagtacgt 540 gtgtttgatt cagttagtgg caaaagtatc ccgaggtctg aatgggggag aattgataag 600 gatggttcaa attccaaaca gagtaggacg gaatgggatt atggcgaaat ccattctatt 660 agaggaaaat ctcttactga agcatttgcc gttgagataa atgatgattt taagcttgca 720 acgaaggtag gaaactag 738 <210> 508 <211> 261 <212> PRT <213> Rhizobium leguminosarum bv. trifolii <400> 508 Met Asn Asp Glu Ile Cys Leu Thr Gly Gly Gly Arg Thr Thr Val Thr 1 5 10 15 Arg Arg Gly Gly Val Val Tyr Arg Glu Gly Gly Pro Trp Ser Ser Thr 20 25 30 Val Ile Ser Leu Leu Arg His Leu Glu Ala Ser Gly Phe Ala Glu Ala 35 40 45 Pro Ser Val Val Gly Thr Gly Phe Asp Glu Arg Gly Arg Glu Thr Leu 50 55 60 Ser Phe Ile Glu Gly Glu Phe Val His Pro Gly Pro Trp Ser Glu Glu 65 70 75 80 Ala Phe Pro Gln Phe Gly Met Met Leu Arg Arg Leu His Asp Ala Thr 85 90 95 Ala Ser Phe Lys Pro Pro Glu Asn Ser Met Trp Arg Asp Trp Phe Gly 100 105 110 Arg Asn Leu Gly Glu Gly Gln His Val Ile Gly His Cys Asp Thr Gly 115 120 125 Pro Trp Asn Ile Val Cys Arg Ser Gly Leu Pro Val Gly Leu Ile Asp 130 135 140 Trp Glu Val Ala Gly Pro Val Arg Ala Asp Ile Glu Leu Ala Gln Ala 145 150 155 160 Cys Trp Leu Asn Ala Gln Leu Tyr Asp Asp Asp Ile Ala Glu Arg Val 165 170 175 Gly Leu Gly Ser Val Thr Met Arg Ala His Gln Val Arg Leu Leu Leu 180 185 190 Asp Gly Tyr Gly Leu Ser Arg Lys Gln Arg Gly Gly Phe Val Asp Lys 195 200 205 Leu Ile Thr Phe Ala Val His Asp Ala Ala Glu Gln Ala Lys Glu Ala 210 215 220 Ala Val Thr Pro Glu Ser Asn Asp Ala Glu Pro Leu Trp Ala Ile Ala 225 230 235 240 Trp Arg Thr Arg Ser Ala Ser Trp Met Leu His His Arg Gln Thr Leu 245 250 255 Glu Ala Ala Leu Ala 260 <210> 509 <211> 786 <212> DNA <213> Rhizobium leguminosarum bv. trifolii <400> 509 atgaatgatg agatttgcct gacaggtggc ggacgaacga ctgtcacgcg gcgcggcgga 60 gtcgtgtatc gcgaaggcgg cccgtggtca tcaaccgtca tttcgctcct gcggcatctg 120 gaagcctctg gcttcgctga agctccttcc gttgtcggca ccggtttcga tgagcgcggc 180 cgggagacat tatcgtttat cgagggtgag tttgttcacc caggcccttg gtcggaggag 240 gcttttccgc aatttggaat gatgttgcgg cgactgcacg atgccaccgc ctcgttcaaa 300 cctcccgaaa actcgatgtg gcgcgattgg ttcgggcgta acctcggtga gggtcaacac 360 gtaataggac actgcgacac aggcccatgg aacattgttt gccggtcagg attgcctgtc 420 gggttgatag attgggaggt ggctgggcct gtcagggcgg atatcgaatt ggcccaggct 480 tgttggctga atgcccagct ctacgatgac gacattgcgg agagggtcgg attaggctct 540 gtgaccatga gagcgcatca agttcgcctg ctgcttgacg gctatggtct gtctcggaag 600 caacgcggcg gcttcgtcga caagctaatc acgttcgcag ttcacgatgc ggccgagcag 660 gcgaaagagg cggctgtcac gccagagtcg aacgatgcgg aaccgctatg ggcaattgcc 720 tggcgcacta gaagtgcctc ctggatgctc catcatcggc aaacactgga agcagcgctg 780 gcatag 786 <210> 510 <211> 436 <212> PRT <213> Bacillus subtilis <400> 510 Met Asn Asn Ile Ile Pro Ile Met Ser Leu Leu Phe Lys Gln Leu Tyr 1 5 10 15 Ser Arg Gln Gly Lys 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aatgcaatta gtaaagtata caatgaagca 60 actatagatg actatcctga cttaaaagaa aagctctttc tttattctaa agaaatcagt 120 gagggaaaaa gtgttggtga agttagtatg aaattaagta gttttcttgg aagatatatt 180 ttaaaacata aatttggatt acctaaatct ttaatagaat tacaagaaat tgttagtaag 240 gaatctcaag tatatagagg atgggcttct attggtattt ggagttaa 288 <210> 524 <211> 113 <212> PRT <213> Leuconostoc mesenteroides <400> 524 Met Lys Lys Lys Tyr Arg Tyr Leu Glu Asp Ser Lys Asn Tyr Thr Ser 1 5 10 15 Thr Leu Tyr Ser Leu Leu Val Asp Asn Val Asp Lys Pro Gly Tyr Ser 20 25 30 Asp Ile Cys Asp Val Leu Leu Gln Val Ser Lys Lys Leu Asp Asn Thr 35 40 45 Gln Ser Val Glu Ala Leu Ile Asn Arg Leu Val Asn Tyr Ile Arg Ile 50 55 60 Thr Ala Ser Thr Tyr Lys Ile Ile Phe Ser Lys Lys Glu Glu Glu Leu 65 70 75 80 Ile Ile Lys Leu Gly Val Ile Gly Gln Lys Ala Gly Leu Asn Gly Gln 85 90 95 Tyr Met Ala Asp Phe Ser Asp Lys Ser Gln Phe Tyr Ser Val Phe Asp 100 105 110 Gln <210> 525 <211> 342 <212> DNA <213> Leuconostoc mesenteroides <400> 525 ttgaaaaaaa agtatcggta 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atatctagat atatcaaaga aaatacaaag 180 ttaaaaaaag aaccctggta cttatgcaag ttatctgcat tgttttattt attaatggca 240 atcccagtag gattgccaag tttcatatat tacactctaa agagaaatta a 291 <210> 530 <211> 344 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 530 Met Met Ile Gln Ser His Pro Leu Leu Ala Ala Pro Leu Ala Val Gly 1 5 10 15 Asp Thr Ile Gly Phe Phe Ser Ser Ser Ala Pro Ala Thr Val Thr Ala 20 25 30 Lys Asn Arg Phe Phe Arg Gly Val Glu Phe Leu Gln Arg Lys Gly Phe 35 40 45 Lys Leu Val Ser Gly Lys Leu Thr Gly Lys Thr Asp Phe Tyr Arg Ser 50 55 60 Gly Thr Ile Lys Glu Arg Ala Gln Glu Phe Asn Glu Leu Val Tyr Asn 65 70 75 80 Pro Asp Ile Thr Cys Ile Met Ser Thr Ile Gly Gly Asp Asn Ser Asn 85 90 95 Ser Leu Leu Pro Phe Leu Asp Tyr Asp Ala Ile Ile Ala Asn Pro Lys 100 105 110 Ile Ile Ile Gly Tyr Ser Asp Thr Thr Ala Leu Leu Ala Gly Ile Tyr 115 120 125 Ala Lys Thr Gly Leu Ile Thr Phe Tyr Gly Pro Ala Leu Ile Pro Ser 130 135 140 Phe Gly Glu His Pro Pro Leu Val Asp Ile Thr Tyr Glu Ser Phe Ile 145 150 155 160 Lys Ile Leu Thr Arg 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tggatggatt tgattgttca catacacatc caatgctaac tcttccactt 960 ggtgtaaaat tagctattga ctttgacaac aaaaatatat 1000 <210> 532 <211> 90 <212> PRT <213> Lactobacillus sakei <400> 532 Met Lys Ala Asp Tyr Lys Lys Ile Asn Ser Ile Leu Thr Tyr Thr Ser 1 5 10 15 Thr Ala Leu Lys Asn Pro Lys Ile Ile Lys Asp Lys Asp Leu Val Val 20 25 30 Leu Leu Thr Ile Ile Gln Glu Glu Ala Lys Gln Asn Arg Ile Phe Tyr 35 40 45 Asp Tyr Lys Arg Lys Phe Arg Pro Ala Val Thr Arg Phe Thr Ile Asp 50 55 60 Asn Asn Phe Glu Ile Pro Asp Cys Leu Val Lys Leu Leu Ser Ala Val 65 70 75 80 Glu Thr Pro Lys Ala Trp Ser Gly Phe Ser 85 90 <210> 533 <211> 268 <212> DNA <213> Lactobacillus sakei <400> 533 ggcagattat aaaaaaataa attcaatact aacttacaca tctactgctt taaaaaaccc 60 taaaattata aaagataaag atttagtagt ccttctaact attattcaag aagaagccaa 120 acaaaataga atcttttatg attataaaag aaaatttcgt ccagcggtta ctcgctttac 180 aattgataat aattttgaga ttcctgattg tttggttaaa ctactgtcag ctgttgaaac 240 acctaaggcg tggtctggat ttagttag 268 <210> 534 <211> 83 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 534 Met Lys Leu Ser Pro Lys Ala Ala Ile Glu Val Cys Asn Glu Ala Ala 1 5 10 15 Lys Lys Gly Leu Trp Ile Leu Gly Ile Asp Gly Gly His Trp Leu Asn 20 25 30 Pro Gly Phe Arg Ile Asp Ser Ser Ala Ser Trp Thr Tyr Asp Met Pro 35 40 45 Glu Glu Tyr Lys Ser Lys Thr Pro Glu Asn Asn Arg Leu Ala Ile Glu 50 55 60 Asn Ile Lys Asp Asp Ile Glu Asn Gly Tyr Thr Ala Phe Ile Ile Thr 65 70 75 80 Leu Lys Met <210> 535 <211> 251 <212> DNA <213> Escherichia coli <400> 535 tgaagttatc accaaaagct gcaatagaag tttgtaatga agcagcgaaa aaaggcttat 60 ggattttggg cattgatggt gggcattggc tgaatcctgg attcaggata gatagttcag 120 catcatggac atatgatatg ccggaggaat acaaatcaaa aacccctgaa aataatagat 180 tggctattga aaatattaaa gatgatattg agaatggata cactgctttc attatcacgt 240 taaagatgta a 251 <210> 536 <211> 436 <212> PRT <213> Bacillus subtilis <400> 536 Met Asn Asn Ile Phe Pro Ile Met Ser Leu Leu Phe Lys Gln Leu Tyr 1 5 10 15 Ser Arg Gln Gly Lys Lys Asp Ala Ile Arg Ile Ala Ala Gly Leu Val 20 25 30 Ile Leu Ala Val Phe Glu Ile Gly Leu Ile Arg Gln Ala Gly Ile Asp 35 40 45 Glu Ser Val Leu Gly Lys Thr Tyr Ile Ile Leu Ala Leu Leu Leu Met 50 55 60 Asn Thr Tyr Met Val Phe Leu Ser Val Thr Ser Gln Trp Lys Glu Ser 65 70 75 80 Tyr Met Lys Leu Ser Cys Leu Leu Pro Ile Ser Ser Arg Ser Phe Trp 85 90 95 Leu Ala Gln Ser Val Val Leu Phe Val Asp Thr Cys Leu Arg Arg Thr 100 105 110 Leu Phe Phe Phe Ile Leu Pro Leu Phe Leu Phe Gly Asn Gly Thr Leu 115 120 125 Ser Gly Ala Gln Thr Leu Phe Trp Leu Gly Arg Phe Ser Phe Phe Thr 130 135 140 Val Tyr Ser Ile Leu Phe Gly Val Met Leu Ser Asn His Phe Val Lys 145 150 155 160 Lys Lys Asn Ser Met Phe Leu Leu His Ala Ala Val Phe Ala Phe Val 165 170 175 Cys Leu Ser Ala Ala Phe Met Pro Ala Val Thr Ile Pro Leu Cys Ala 180 185 190 Val His Met Leu Trp Ala Val Ile Ile Asp Phe Pro Val Phe Leu Gln 195 200 205 Ala Pro Pro His Gln Ser Lys Met His Phe Phe Met Arg Arg Ser Glu 210 215 220 Phe Ser Phe Tyr Lys Arg Glu Trp Asn Arg Phe Ile Ser Ser Lys Ala 225 230 235 240 Met Leu Leu Asn Tyr Val Val Met Ala Ala Phe Ser Gly Phe Phe Ser 245 250 255 Phe Gln Met Met Asn Thr Gly Ile Phe Asn Gln Gln Val Ile Tyr Ile 260 265 270 Val Ile Ser Ala Leu Leu Leu Ile Cys Ser Pro Ile Ala Leu Leu Tyr 275 280 285 Ser Ile Glu Lys Asn Asp Arg Met Leu Leu Ile Thr Leu Pro Ile Lys 290 295 300 Arg Arg Thr Met Phe Trp Ala Lys Tyr Arg Phe Tyr Ser Gly Leu Leu 305 310 315 320 Ala Gly Gly Phe Leu Leu Val Ala Ile Ile Val Gly Phe Ile Ser Gly 325 330 335 Arg Pro Ile Ser Ala Leu Thr Phe Val Gln Cys Met Glu Leu Leu Leu 340 345 350 Ala Gly Ala Phe Ile Arg Leu Thr Ala Asp Glu Lys Arg Pro Ser Phe 355 360 365 Gly Trp Gln Thr Glu Gln Gln Leu Trp Ser Gly Phe Ser Lys Tyr Arg 370 375 380 Ser Tyr Leu Phe Cys Leu Pro Leu Phe Leu Ala Thr Leu Ala Gly Thr 385 390 395 400 Ala Val Ser Leu Ala Val Ile Pro Ile Ala Ala Leu Ile Ile Val Tyr 405 410 415 Tyr Leu Gln Lys Gln Asp Gly Gly Phe Phe Asp Thr Ser Lys Arg Glu 420 425 430 Arg Ile Gly Ser 435 <210> 537 <211> 1000 <212> DNA <213> Bacillus subtilis <400> 537 ttggggagga gaccgatctg cggcgggaat tttttgaggt tatcggccat gaataacata 60 ttccccatca tgtcgttgct gttcaaacag ctgtacagcc ggcaagggaa aaaggacgct 120 atccgcattg ctgcagggct tgtgattctc gccgtgtttg aaatcgggct gatccgacaa 180 gccggcattg acgaatcggt gttgggaaaa acgtatatca tattggcgct tctcttaatg 240 aacacgtata tggtgtttct ttccgtgaca tcacaatgga aggaatctta tatgaagctg 300 agctgtctgc tgccgatttc atcacggagc ttttggctcg cccagagtgt cgttctgttt 360 gtcgatacct gtttgagaag aacgttattc ttttttattt taccgctgtt cttatttgga 420 aacggaacgc tgtcaggggc gcaaacattg ttttggcttg gcagattttc gttttttacc 480 gtttactcga ttctattcgg agttatgcta agcaaccatt tcgtcaaaaa gaagaactcg 540 atgtttctgc tgcatgcggc ggtattcgcc tttgtatgcc tcagtgccgc ttttatgccg 600 gccgtcacga tcccgctatg cgcggttcac atgctatggg cggtgatcat tgactttccg 660 gtctttctgc aggcgcctcc gcatcagagc aagatgcatt tttttatgcg gcgatctgaa 720 ttttcgtttt acaaaagaga atggaaccga tttatttctt ctaaagcgat gctgttaaat 780 tacgtggtga tggcggcgtt cagcggattc ttttcgttcc agatgatgaa cactggcatc 840 ttcaatcagc aagtgattta tattgtgatt tccgctctat tgctgatttg ctcgccgatc 900 gcccttttgt actctattga aaaaaacgat cgcatgctgc tcatcacgct tccaattaaa 960 agaagaacga tgttttgggc gaaatatcgc ttttattcag 1000 <210> 538 <211> 580 <212> PRT <213> Escherichia coli <400> 538 Met Glu Arg Lys Gln Lys Asn Ser Leu Phe Asn Tyr Ile Tyr Ser Leu 1 5 10 15 Met Asp Val Arg Gly Lys Phe Leu Phe Phe Ser Met Leu Phe Ile Thr 20 25 30 Ser Leu Ser Ser Ile Ile Ile Ser Ile Ser Pro Leu Ile Leu Ala Lys 35 40 45 Ile Thr Asp Leu Leu Ser Gly Ser Leu Ser Asn Phe Ser Tyr Glu Tyr 50 55 60 Leu Val Leu Leu Ala Cys Leu Tyr Met Phe Cys Val Ile Ser Asn Lys 65 70 75 80 Ala Ser Val Phe Leu Phe Met Ile Leu Gln Ser Ser Leu Arg Ile Asn 85 90 95 Met Gln Lys Lys Met Ser Leu Lys Tyr Leu Arg Glu Leu Tyr Asn Glu 100 105 110 Asn Ile Thr Asn Leu Ser Lys Asn Asn Ala Gly Tyr Thr Thr Gln Ser 115 120 125 Leu Asn Gln Ala Ser Asn Asp Ile Tyr Ile Leu Val Arg Asn Val Ser 130 135 140 Gln Asn Ile Leu Ser Pro Val Ile Gln Leu Ile Ser Thr Ile Val Val 145 150 155 160 Val Leu Ser Thr Lys Asp Trp Phe Ser Ala 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Ser Gly Ser Gly Lys 370 375 380 Ser Thr Leu Val Lys Ile Ile Ser Gly Tyr Tyr Lys Asn Tyr Phe Gly 385 390 395 400 Asp Ile Tyr Leu Asn Asp Ile Ser Leu Arg Asn Ile Ser Asp Glu Asp 405 410 415 Leu Asn Asp Ala Ile Tyr Tyr Leu Thr Gln Asp Asp Tyr Ile Phe Met 420 425 430 Asp Thr Leu Arg Phe Asn Leu Arg Leu Ala Asn Tyr Asp Ala Ser Glu 435 440 445 Asn Glu Ile Phe Lys Val Leu Lys Leu Ala Asn Leu Ser Val Val Asn 450 455 460 Asn Glu Pro Val Ser Leu Asp Thr His Leu Ile Asn Arg Gly Asn Asn 465 470 475 480 Tyr Ser Gly Gly Gln Lys Gln Arg Ile Ser Leu Ala Arg Leu Phe Leu 485 490 495 Arg Lys Pro Ala Ile Ile Ile Ile Asp Glu Ala Thr Ser Ala Leu Asp 500 505 510 Tyr Ile Asn Glu Ser Glu Ile Leu Ser Ser Ile Arg Thr His Phe Pro 515 520 525 Asp Ala Leu Ile Ile Asn Ile Ser His Arg Ile Asn Leu Leu Glu Cys 530 535 540 Ser Asp Cys Val Tyr Val Leu Asn Glu Gly Asn Ile Val Ala Ser Gly 545 550 555 560 His Phe Arg Asp Leu Met Val Ser Asn Glu Tyr Ile Ser Gly Leu Ala 565 570 575 Ser Val Thr Glu 580 <210> 539 <211> 1000 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taggtgtgct gaatggtgta 840 gttagtatcg gccacttcat tatgattaca tcatatatca ttcttctttc aacgccagtg 900 gaaaatatag gggcattgct aagtgagatc aggcagtcaa tgtctagcct ggcaggtttt 960 attcaacgtc atgccgagaa taaagccaca tctccttcaa 1000 <210> 540 <211> 95 <212> PRT <213> Klebsiella pneumoniae <400> 540 Met Thr Leu Leu Ser Phe Gly Phe Ser Pro Val Phe Phe Ser Val Met 1 5 10 15 Ala Phe Cys Ile Ile Ser Arg Ser Lys Phe Tyr Pro Gln Arg Thr Arg 20 25 30 Asn Lys Val Ile Val Leu Ile Leu Leu Thr Phe Phe Ile Cys Phe Leu 35 40 45 Tyr Pro Leu Thr Lys Val Tyr Leu Val Gly Ser Tyr Gly Ile Phe Asp 50 55 60 Lys Phe Tyr Leu Phe Cys Phe Ile Ser Thr Leu Ile Ala Ile Ala Ile 65 70 75 80 Asn Val Val Ile Leu Thr Ile Asn Gly Ala Lys Asn Glu Arg Asn 85 90 95 <210> 541 <211> 288 <212> DNA <213> Klebsiella pneumoniae <400> 541 atgacattac tttcatttgg attttctcct gttttctttt cagtcatggc gttctgtatc 60 atttcacgta gtaaattcta tccgcagaga acgcgaaaca aagttattgt tctgatttta 120 ctaacttttt ttatttgttt tttatatcca ttaacaaaag tgtatctggt gggaagttac 180 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ctgaaagcgc ataccgctat ggagggggtt 30 <210> 549 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PrFe (PI + PII rus operon) <400> 549 tagatatgcc tgaaagcgca taccgctatg 30 <210> 550 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Lux cassette right promoter <400> 550 tgttatagtc gaatacctct ggcggtgata 30 <210> 551 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> P(Las) TetO <400> 551 ttttggtaca ctccctatca gtgatagaga 30 <210> 552 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> P(Las) CIO <400> 552 ctttttggta cactacctct ggcggtgata 30 <210> 553 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> P(Rhl) <400> 553 tacgcaagaa aatggtttgt tatagtcgaa 30 <210> 554 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Double Promoter (LuxR/HSL, positive / cI, negative) <400> 554 cgtgcgtgtt gataacaccg tgcgtgttga 30 <210> 555 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> P2 promoter in agr operon from S. aureus <400> 555 agattgtact aaatcgtata atgacagtga 30 <210> 556 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> plux-cI hybrid promoter <400> 556 gtgttgatgc ttttatcacc gccagtggta 30 <210> 557 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> plux-lac hybrid promoter <400> 557 agtgtgtgga attgtgagcg gataacaatt 30 <210> 558 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CinR, CinL and glucose controlled promotor <400> 558 acatcttaaa agttttagta tcatattcgt 30 <210> 559 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RhIR promoter repressible by CI <400> 559 tacgcaagaa aatggtttgt tatagtcgaa 30 <210> 560 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Reverse Lux Promoter <400> 560 tcttgcgtaa acctgtacga tcctacaggt 30 <210> 561 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> rhlI promoter <400> 561 atcctccttt agtcttcccc ctcatgtgtg 30 <210> 562 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> lasI promoter <400> 562 taaaattatg aaatttgcat aaattcttca 30 <210> 563 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> LuxR+3OC6HSL independent R0065 <400> 563 gtgttgacta ttttacctct ggcggtgata 30 <210> 564 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> LasR/LasI Inducible & RHLR/RHLI repressible Promoter <400> 564 gaaatctggc agtttttggt acacgaaagc 30 <210> 565 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pLux/cI Hybrid Promoter <400> 565 acaccgtgcg tgttgatata gtcgaataaa 30 <210> 566 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pLas promoter <400> 566 aaaattatga aatttgtata aattcttcag 30 <210> 567 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pLas/cI Hybrid Promoter <400> 567 ggttcttttt ggtacctctg gcggtgataa 30 <210> 568 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pLas/Lux Hybrid Promoter <400> 568 tgtaggatcg tacaggtata aattcttcag 30 <210> 569 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pLux <400> 569 caagaaaatg gtttgttata gtcgaataaa 30 <210> 570 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pLux/Las Hybrid Promoter <400> 570 ctatctcatt tgctagtata gtcgaataaa 30 <210> 571 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Hybrid promoter: HSL-LuxR activated, P22 C2 repressed <400> 571 tagtttataa tttaagtgtt ctttaatttc 30 <210> 572 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PAI+LasR -> LuxI (AI) <400> 572 caccttcggg tgggcctttc tgcgtttata 30 <210> 573 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PAI+LasR -> LasI & AI+LuxR --| LasI <400> 573 aataactctg atagtgctag tgtagatctc 30 <210> 574 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PAI+LasR -> LasI+GFP & AI+LuxR --| LasI+GFP <400> 574 caccttcggg tgggcctttc tgcgtttata 30 <210> 575 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Complex QS -> LuxI & LasI circuit <400> 575 caccttcggg tgggcctttc tgcgtttata 30 <210> 576 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> position 3 mutated promoter lux pR-3 (luxR & HSL regulated) <400> 576 caagaaaatg gtttgttata gtcgaataaa 30 <210> 577 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> position 5 mutated promoter lux pR-5 (luxR & HSL regulated) <400> 577 caagaaaatg gtttgttata gtcgaataaa 30 <210> 578 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> position 3&5 mutated promoter lux pR-3/5 (luxR & HSL regulated) <400> 578 caagaaaatg gtttgttata gtcgaataaa 30 <210> 579 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Promoter (HSL-mediated luxR repressor) <400> 579 ttgacacctg taggatcgta caggtataat 30 <210> 580 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Promoter (luxR & HSL regulated -- lux pR) <400> 580 caagaaaatg gtttgttata gtcgaataaa 30 <210> 581 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Promoter (luxR & HSL regulated -- lux pL) <400> 581 cacgcaaaac ttgcgacaaa caataggtaa 30 <210> 582 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Promoter (RhlR & C4-HSL regulated) <400> 582 gttagctttc gaattggcta aaaagtgttc 30 <210> 583 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Promoter (cinR and HSL regulated) <400> 583 ccattctgct ttccacgaac ttgaaaacgc 30 <210> 584 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Promoter (LasR & PAI regulated) <400> 584 ggccgcgggt tctttttggt acacgaaagc 30 <210> 585 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Promoter, Standard (luxR and HSL regulated -- lux pR) <400> 585 aagaaaatgg tttgttgata ctcgaataaa 30 <210> 586 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> P(Bla) <400> 586 gtttatacat aggcgagtac tctgttatgg 30 <210> 587 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> P(Cat) <400> 587 agaggttcca actttcacca taatgaaaca 30 <210> 588 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> P(Kat) <400> 588 taaacaacta acggacaatt ctacctaaca 30 <210> 589 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Template for Building Primer Family Member <400> 589 acatcaagcc aaattaaaca ggattaacac 30 <210> 590 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Reverse lambda cI-regulated promoter <400> 590 gaggtaaaat agtcaacacg cacggtgtta 30 <210> 591 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Key Promoter absorbs 3 <400> 591 caggccggaa taactcccta taatgcgcca 30 <210> 592 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter family member <400> 592 ggctagctca gtcctaggta cagtgctagc 30 <210> 593 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter family member <400> 593 agctagctca gtcctaggta ttatgctagc 30 <210> 594 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter family member <400> 594 agctagctca gtcctaggta ctgtgctagc 30 <210> 595 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter family member <400> 595 agctagctca gtcctaggga ttatgctagc 30 <210> 596 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter family member <400> 596 agctagctca gtcctaggta ttgtgctagc 30 <210> 597 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter family member <400> 597 ggctagctca gtcctaggta ctatgctagc 30 <210> 598 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter family member <400> 598 ggctagctca gtcctaggta tagtgctagc 30 <210> 599 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter family member <400> 599 ggctagctca gccctaggta ttatgctagc 30 <210> 600 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter family member <400> 600 agctagctca gtcctaggta taatgctagc 30 <210> 601 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter family member <400> 601 agctagctca gtcctaggga ctgtgctagc 30 <210> 602 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter family member <400> 602 ggctagctca gtcctaggta caatgctagc 30 <210> 603 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter family member <400> 603 ggctagctca gtcctaggta tagtgctagc 30 <210> 604 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter family member <400> 604 agctagctca gtcctaggga ttatgctagc 30 <210> 605 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter family member <400> 605 ggctagctca gtcctaggga ttatgctagc 30 <210> 606 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter family member <400> 606 ggctagctca gtcctaggta caatgctagc 30 <210> 607 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter family member <400> 607 agctagctca gcccttggta caatgctagc 30 <210> 608 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter family member <400> 608 agctagctca gtcctaggga ctatgctagc 30 <210> 609 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter family member <400> 609 agctagctca gtcctaggga ttgtgctagc 30 <210> 610 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter family member <400> 610 ggctagctca gtcctaggta ttgtgctagc 30 <210> 611 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter family member <400> 611 agctagctca gtcctaggta taatgctagc 30 <210> 612 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 1bp mutant from J23107 <400> 612 ggctagctca gtcctaggta ttatgctagc 30 <210> 613 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 1bp mutant from J23114 <400> 613 ggctagctca gtcctaggta caatgctagc 30 <210> 614 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pBAD reverse <400> 614 aaagtgtgac gccgtgcaaa taatcaatgt 30 <210> 615 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NikR promoter, a protein of the ribbon helix-helix family of trancription factors that repress expre <400> 615 gacgaatact taaaatcgtc atacttattt 30 <210> 616 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> lacq_Promoter <400> 616 aaacctttcg cggtatggca tgatagcgcc 30 <210> 617 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> lacIQ - promoter sequence <400> 617 tgatagcgcc cggaagagag tcaattcagg 30 <210> 618 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> E. Coli CreABCD phosphate sensing operon promoter <400> 618 ttatttaccg tgacgaacta attgctcgtg 30 <210> 619 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> GlnRS promoter <400> 619 catacgccgt tatacgttgt ttacgctttg 30 <210> 620 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Constitutive weak promoter of lacZ <400> 620 ttatgcttcc ggctcgtatg ttgtgtggac 30 <210> 621 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Mutated LacZ promoter <400> 621 ttatgcttcc ggctcgtatg gtgtgtggac 30 <210> 622 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter with (TA)10 between -10 and -35 elements <400> 622 atatatatat atatataatg gaagcgtttt 30 <210> 623 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter with (TA)9 between -10 and -35 elements <400> 623 atatatatat atatataatg gaagcgtttt 30 <210> 624 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter with (C)10 between -10 and -35 elements <400> 624 ccccgaaagc ttaagaatat aattgtaagc 30 <210> 625 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constitutive promoter with (C)12 between -10 and -35 elements <400> 625 ccccgaaagc ttaagaatat aattgtaagc 30 <210> 626 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> optimized (TA) repeat constitutive promoter with 13 bp between -10 and -35 elements <400> 626 tgacaatata tatatatata taatgctagc 30 <210> 627 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> optimized (TA) repeat constitutive promoter with 15 bp between -10 and -35 elements <400> 627 acaatatata tatatatata taatgctagc 30 <210> 628 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> optimized (TA) repeat constitutive promoter with 17 bp between -10 and -35 elements <400> 628 aatatatata tatatatata taatgctagc 30 <210> 629 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> optimized (TA) repeat constitutive promoter with 19 bp between -10 and -35 elements <400> 629 tatatatata tatatatata taatgctagc 30 <210> 630 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> optimized (TA) repeat constitutive promoter with 21 bp between -10 and -35 elements <400> 630 tatatatata tatatatata taatgctagc 30 <210> 631 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> optimized (A) repeat constitutive promoter with 17 bp between -10 and -35 elements <400> 631 aaaaaaaaaa aaaaaaaata taatgctagc 30 <210> 632 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> optimized (A) repeat constitutive promoter with 18 bp between -10 and -35 elements <400> 632 aaaaaaaaaa aaaaaaaata taatgctagc 30 <210> 633 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> J23101:GFP <400> 633 caccttcggg tgggcctttc tgcgtttata 30 <210> 634 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> J23119:IFP <400> 634 caccttcggg tgggcctttc tgcgtttata 30 <210> 635 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> J23119:HO1 <400> 635 caccttcggg tgggcctttc tgcgtttata 30 <210> 636 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Infrared signal reporter (J23119:IFP:J23119:HO1) <400> 636 caccttcggg tgggcctttc tgcgtttata 30 <210> 637 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Double terminator + constitutive promoter <400> 637 ggctagctca gtcctaggta cagtgctagc 30 <210> 638 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Double terminator + Constitutive promoter + Strong RBS <400> 638 tgctagctac tagagattaa agaggagaaa 30 <210> 639 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> IPTG inducible Lac promoter cassette <400> 639 ttgtgagcgg ataacaagat actgagcaca 30 <210> 640 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> IPTG inducible Lac promoter cassette <400> 640 ttgtgagcgg ataacaagat actgagcaca 30 <210> 641 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> IPTG inducible Lac promoter cassette <400> 641 ttgtgagcgg ataacaagat actgagcaca 30 <210> 642 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> M13K07 gene I promoter <400> 642 cctgttttta tgttattctc tctgtaaagg 30 <210> 643 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> M13K07 gene II promoter <400> 643 aaatatttgc ttatacaatc ttcctgtttt 30 <210> 644 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> M13K07 gene III promoter <400> 644 gctgataaac cgatacaatt aaaggctcct 30 <210> 645 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> M13K07 gene IV promoter <400> 645 ctcttctcag cgtcttaatc taagctatcg 30 <210> 646 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> M13K07 gene V promoter <400> 646 atgagccagt tcttaaaatc gcataaggta 30 <210> 647 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> M13K07 gene VI promoter <400> 647 ctattgattg tgacaaaata aacttattcc 30 <210> 648 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> M13K07 gene VIII promoter <400> 648 gtttcgcgct tggtataatc gctgggggtc 30 <210> 649 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> M13110 <400> 649 ctttgcttct gactataata gtcagggtaa 30 <210> 650 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Modified promoter sequence of g3. <400> 650 aaaccgatac aattaaaggc tcctgctagc 30 <210> 651 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Constitutive Promoter I <400> 651 caccacactg atagtgctag tgtagatcac 30 <210> 652 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Constitutive Promoter II <400> 652 gccggaataa ctccctataa tgcgccacca 30 <210> 653 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> --Specify Parts List-- <400> 653 ttgacaagct tttcctcagc tccgtaaact 30 <210> 654 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Full-length stationary phase osmY promoter <400> 654 ggtttcaaaa ttgtgatcta tatttaacaa 30 <210> 655 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Minimal stationary phase osmY promoter <400> 655 ggtttcaaaa ttgtgatcta tatttaacaa 30 <210> 656 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> htpG Heat Shock Promoter <400> 656 tctattccaa taaagaaatc ttcctgcgtg 30 <210> 657 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Promoter veg a constitutive promoter for B. subtilis <400> 657 aaaaatgggc tcgtgttgta caataaatgt 30 <210> 658 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Promoter 43 a constitutive promoter for B. subtilis <400> 658 aaaaaaagcg cgcgattatg taaaatataa 30 <210> 659 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Strong constitutive promoter for Bacillus subtilis <400> 659 aattgcagta ggcatgacaa aatggactca 30 <210> 660 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PliaG <400> 660 caagcttttc ctttataata gaatgaatga 30 <210> 661 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PlepA <400> 661 tctaagctag tgtattttgc gtttaatagt 30 <210> 662 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Pveg <400> 662 aatgggctcg tgttgtacaa taaatgtagt 30 <210> 663 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Promoter ctc for B. subtilis <400> 663 atccttatcg ttatgggtat tgtttgtaat 30 <210> 664 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Promoter gsiB for B. subtilis <400> 664 taaaagaatt gtgagcggga atacaacaac 30 <210> 665 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Promoter 43 a constitutive promoter for B. subtilis <400> 665 aaaaaaagcg cgcgattatg taaaatataa 30 <210> 666 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Pspv2 from Salmonella <400> 666 tacaaaataa ttcccctgca aacattatca 30 <210> 667 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Pspv from Salmonella <400> 667 tacaaaataa ttcccctgca aacattatcg 30 <210> 668 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> T7 promoter (strong promoter from T7 bacteriophage) <400> 668 agggaataca agctacttgt tctttttgca 30 <210> 669 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> T7 Promoter <400> 669 taatacgact cactataggg aga 23 <210> 670 <211> 28 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> T7 Promoter <400> 670 gaatttaata cgactcacta tagggaga 28 <210> 671 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> T7 consensus -10 and rest <400> 671 taatacgact cactatagg 19 <210> 672 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> overlapping T7 promoter <400> 672 gagtcgtatt aatacgactc actatagggg 30 <210> 673 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> more overlapping T7 promoter <400> 673 agtgagtcgt actacgactc actatagggg 30 <210> 674 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> weaken overlapping T7 promoter <400> 674 gagtcgtatt aatacgactc tctatagggg 30 <210> 675 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> T7 Consensus Promoter Sequence <400> 675 taatacgact cactataggg aga 23 <210> 676 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> T7 RNAP promoter <400> 676 ttatacgact cactataggg aga 23 <210> 677 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> T7 RNAP promoter <400> 677 gaatacgact cactataggg aga 23 <210> 678 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> T7 RNAP promoter <400> 678 taatacgtct cactataggg aga 23 <210> 679 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> T7 RNAP promoter <400> 679 tcatacgact cactataggg aga 23 <210> 680 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> T7 strong promoter <400> 680 taatacgact cactataggg agaccacaac 30 <210> 681 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> T7 weak binding and processivity <400> 681 taattgaact cactaaaggg agaccacagc 30 <210> 682 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> T7 weak binding promoter <400> 682 cgaagtaata cgactcacta ttagggaaga 30 <210> 683 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pCyc (Medium) Promoter <400> 683 acaaacacaa atacacacac taaattaata 30 <210> 684 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pAdh (Strong) Promoter <400> 684 ccaagcatac aatcaactat ctcatataca 30 <210> 685 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pSte5 (Weak) Promoter <400> 685 gatacaggat acagcggaaa caacttttaa 30 <210> 686 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> yeast ADH1 promoter <400> 686 tttcaagcta taccaagcat acaatcaact 30 <210> 687 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> cyc100 minimal promoter <400> 687 cctttgcagc ataaattact atacttctat 30 <210> 688 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> cyc70 minimal promoter <400> 688 cctttgcagc ataaattact atacttctat 30 <210> 689 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> cyc43 minimal promoter <400> 689 cctttgcagc ataaattact atacttctat 30 <210> 690 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> cyc28 minimal promoter <400> 690 cctttgcagc ataaattact atacttctat 30 <210> 691 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> cyc16 minimal promoter <400> 691 cctttgcagc ataaattact atacttctat 30 <210> 692 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pPGK1 <400> 692 ttatctactt tttacaacaa atataaaaca 30 <210> 693 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pCYC Yeast Promoter <400> 693 acaaacacaa atacacacac taaattaata 30 <210> 694 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Yeast GPD (TDH3) Promoter <400> 694 gtttcgaata aacacacata aacaaacaaa 30 <210> 695 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> yeast mid-length ADH1 promoter <400> 695 ccaagcatac aatcaactat ctcatataca 30 <210> 696 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Yeast CLB1 promoter region, G2/M cell cycle specific <400> 696 accatcaaag gaagctttaa tcttctcata 30 <210> 697 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CMV promoter <400> 697 agaacccact gcttactggc ttatcgaaat 30 <210> 698 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Ubc Promoter <400> 698 ggccgttttt ggcttttttg ttagacgaag 30 <210> 699 <211> 564 <212> DNA <213> Escherichia coli <220> <223> McbG gene <400> 699 atggatataa tagaaaaaag aatcacaaaa cgacacctca gtgaaagtga attatcaggt 60 gtaaattatt acaattgtat atttgaacga atacagcttg acaactttaa ctttcgcgat 120 tgtgagttcg aaaaatgtcg cttcgtaaac tgctcaataa agaatttaaa acttaatttt 180 tttaaactta ttgactgtga attcaaagat tgtttattac aaggagtaaa tgcagcagac 240 attatgtttc cctgtacttt ttctcttgta aattgtgatt tgagatttgt tgattttatt 300 agtttacggt tacagaaatc tattttttta tcctgtcgct tccgtgattg tttatttgag 360 gaaacagacc ttcgtaaatc tgattttact ggttcggagt ttaataatac agagttcaga 420 cattctgatt tgtctcactg tgatttttca atgacagaag gtctcgatat aaatcctgag 480 ataaacagga tcttatctat aaagatacca caggaagcag gtttaaaaat acttaaacga 540 atgggagtgg ttgtaggggg atga 564 <210> 700 <211> 1770 <212> DNA <213> Escherichia coli <220> <223> MccE gene <400> 700 atggcgcaaa aaataacacc atctaaaatt gttaaacatg cccgggagtt aattattaag 60 gggattgaat cgggcgataa ctcatttgtc atttttgatg tagatggagc tctggagcgt 120 ctggaacatt acaggtgtca acttaagagt tttttcccca acagcagtat cgcatattca 180 tataagtcaa ataatctggc acaatggtgc cagattatct caggtaaagg tttgtatgca 240 gaggtgtgct ctgttgatga aatgaacctc gctaaaagag acggttttaa ccggattgtt 300 tttgatggcc ctttaaaaaa aacgagtgaa ctattaaagg caatagagat tggggcatta 360 attgaagttg acaatattga tgaatgtaaa agacttaatg aactatgtaa attgcataag 420 ttgacatgta gaattcattt gagattatcg cattactatg atgataattt atcaagattt 480 ggcttatctg aaagtgaggc tattaattta ctggagatgt tgatcagtaa gtcagagtat 540 ctcattttag acgggttcca tttacatgtt ggctctaatc tacccaatgc ggaaaaaata 600 tgtaaagctg ttatacagta tcatgagttg attcttaggt atatgccaga tgatggcact 660 cttaatcttg gtagtgggat acctgcagat tctttctcag catccagtga taacccaact 720 ccatgtccgg aggtattttt ctcatcgata tatgatacaa taaaaaattg cttcggtact 780 gtatgtgata aatggaacta tatttttgaa cctgggagac atctggtcga agactttggc 840 tactttatag ggaaagttat tagtactaaa aacaggtatg gtgttaaagt tgctcaaact 900 aacattggta taaactggat accttcgatc agaaattggg accattcatt tacattgttt 960 cataatcata accatatttc agatgataaa tctgatgagt atattattgc tggattcaat 1020 tgctttgaat gtgattgctt gtttccttca gttattcttc ccagtaactt atctgattat 1080 ttattttctg ttcgagggtg tggtgcttat gatatgcaaa caggaaacca gtggacgcgt 1140 aatctttatg ctgtatatac cataacaaat gatgttgtta atatatcaag gattcacaga 1200 agagaacttg atttccggaa gtatgatgta tctcttacgc catcaggaat aaaagtaaat 1260 gatgagatta cattattgta tccagcgtta aaatacgctg aagagttata tttgctcatt 1320 aatcaaaaca aaataaattt cattaaaagc atggcatggc cagcgtttgt taataacatt 1380 tctgattctg tttctttcat tgagcaatca atgattgata accagaatga aaaagcatta 1440 atcctcttta ttaaatacaa aactaagata gctggcgttg tatcttttaa tattattgac 1500 catgccaata aaacagcata tattggctat tggttaggcg ctaactttca gggaaagggg 1560 attgtaacca atgctataaa taaactgata caggagtatg gggattcggg cgttataaaa 1620 agatttgtta taaaatgtat tgttgataat aaaaaaagta atgccacggc attgaggtgt 1680 ggcttcacct tagagggtgt tctgcaaaaa gcagaaatac tcaacggtgt atcatacgat 1740 caaaatattt attcgaaagt aattggttaa 1770 <210> 701 <211> 561 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> C-terminal part of MccE gene <400> 701 atgttccgga agtatgatgt atctcttacg ccatcaggaa taaaagtaaa tgatgagatt 60 acattattgt atccagcgtt aaaatacgct gaagagttat atttgctcat taatcaaaac 120 aaaataaatt tcattaaaag catggcatgg ccagcgtttg ttaataacat ttctgattct 180 gtttctttca ttgagcaatc aatgattgat aaccagaatg aaaaagcatt aatcctcttt 240 attaaataca aaactaagat agctggcgtt gtatctttta atattattga ccatgccaat 300 aaaacagcat atattggcta ttggttaggc gctaactttc agggaaaggg gattgtaacc 360 aatgctataa ataaactgat acaggagtat ggggattcgg gcgttataaa aagatttgtt 420 ataaaatgta ttgttgataa taaaaaaagt aatgccacgg cattgaggtg tggcttcacc 480 ttagagggtg ttctgcaaaa agcagaaata ctcaacggtg tatcatacga tcaaaatatt 540 tattcgaaag taattggtta a 561 <210> 702 <211> 6904 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pSyn2-McbG <400> 702 atggatataa tagaaaaaag aatcacaaaa cgacacctca gtgaaagtga attatcaggt 60 gtaaattatt acaattgtat atttgaacga atacagcttg acaactttaa ctttcgcgat 120 tgtgagttcg aaaaatgtcg cttcgtaaac tgctcaataa agaatttaaa acttaatttt 180 tttaaactta ttgactgtga attcaaagat tgtttattac aaggagtaaa tgcagcagac 240 attatgtttc cctgtacttt ttctcttgta aattgtgatt tgagatttgt tgattttatt 300 agtttacggt tacagaaatc tattttttta tcctgtcgct tccgtgattg tttatttgag 360 gaaacagacc ttcgtaaatc tgattttact ggttcggagt ttaataatac agagttcaga 420 cattctgatt tgtctcactg tgatttttca atgacagaag gtctcgatat aaatcctgag 480 ataaacagga tcttatctat aaagatacca caggaagcag gtttaaaaat acttaaacga 540 atgggagtgg ttgtaggggg atgacttctg ttttggcgga tgagagaaga ttttcagcct 600 gatacagatt aaatcagaac gcagaagcgg tctgataaaa cagaatttgc ctggcggcag 660 tagcgcggtg gtcccacctg accccatgcc gaactcagaa gtgaaacgcc gtagcgccga 720 tggtagtgtg gggtctcccc atgcgagagt agggaactgc caggcatcaa ataaaacgaa 780 aggctcagtc gaaagactgg gcctttcgtt ttatctgttg tttgtcggtg aacgctctcc 840 tgagtaggac aaatccgccg ggagcggatt tgaacgttgc gaagcaacgg cccggagggt 900 ggcgggcagg acgcccgcca taaactgcca ggcatcaaat taagcagaag gccatcctga 960 cggatggcct ttttgcgttt ctacaaactc ttttgtttat ttttctaaat acattcaaat 1020 atgtatccgc tcatgagaca ataaccctga taaatgcttc aataatattg aaaaaggaag 1080 agtatgagta ttcaacattt ccgtgtcgcc cttattccct tttttgcggc attttgcctt 1140 cctgtttttg ctcacccaga aacgctggtg aaagtaaaag atgctgaaga tcagttgggt 1200 gcacgagtgg gttacatcga actggatctc aacagcggta agatccttga gagttttcgc 1260 cccgaagaac gttttccaat gatgagcact tttaaagttc tgctatgtgg cgcggtatta 1320 tcccgtgttg acgccgggca agagcaactc ggtcgccgca tacactattc tcagaatgac 1380 ttggttgagt actcaccagt cacagaaaag catcttacgg atggcatgac agtaagagaa 1440 ttatgcagtg ctgccataac catgagtgat aacactgcgg ccaacttact tctgacaacg 1500 atcggaggac cgaaggagct aaccgctttt ttgcacaaca tgggggatca tgtaactcgc 1560 cttgatcgtt gggaaccgga gctgaatgaa gccataccaa acgacgagcg tgacaccacg 1620 atgcctgtag caatggcaac aacgttgcgc aaactattaa ctggcgaact acttactcta 1680 gcttcccggc aacaattaat agactggatg gaggcggata aagttgcagg accacttctg 1740 cgctcggccc ttccggctgg ctggtttatt gctgataaat ctggagccgg tgagcgtggg 1800 tctcgcggta tcattgcagc actggggcca gatggtaagc cctcccgtat cgtagttatc 1860 tacacgacgg ggagtcaggc aactatggat gaacgaaata gacagatcgc tgagataggt 1920 gcctcactga ttaagcattg gtaactgtca gaccaagttt actcatatat actttagatt 1980 gatttaaaac ttcattttta atttaaaagg atctaggtga agatcctttt tgataatctc 2040 atgaccaaaa tcccttaacg tgagttttcg ttccactgag cgtcagaccc cgtagaaaag 2100 atcaaaggat cttcttgaga tccttttttt ctgcgcgtaa tctgctgctt gcaaacaaaa 2160 aaaccaccgc taccagcggt ggtttgtttg ccggatcaag agctaccaac tctttttccg 2220 aaggtaactg gcttcagcag agcgcagata ccaaatactg tccttctagt gtagccgtag 2280 ttaggccacc acttcaagaa ctctgtagca ccgcctacat acctcgctct gctaatcctg 2340 ttaccagtgg ctgctgccag tggcgataag tcgtgtctta ccgggttgga ctcaagacga 2400 tagttaccgg ataaggcgca gcggtcgggc tgaacggggg gttcgtgcac acagcccagc 2460 ttggagcgaa cgacctacac cgaactgaga tacctacagc gtgagctatg agaaagcgcc 2520 acgcttcccg aagggagaaa ggcggacagg tatccggtaa gcggcagggt cggaacagga 2580 gagcgcacga gggagcttcc agggggaaac gcctggtatc tttatagtcc tgtcgggttt 2640 cgccacctct gacttgagcg tcgatttttg tgatgctcgt caggggggcg gagcctatgg 2700 aaaaacgcca gcaacgcggc ctttttacgg ttcctggcct tttgctggcc ttttgctcac 2760 atgttctttc ctgcgttatc ccctgattct gtggataacc gtattaccgc ctttgagtga 2820 gctgataccg ctcgccgcag ccgaacgacc gagcgcagcg agtcagtgag cgaggaagcg 2880 gaagagcgcc tgatgcggta ttttctcctt acgcatctgt gcggtatttc acaccgatta 2940 ccgacctttg agtgagcatc gatggcagct cgcgttgcat tttcggaagc gctcgttttc 3000 ggaaacgctt tgaagttcct attccgaagt tcctattctc tagctagaaa gtataggaac 3060 ttcagagcgc ttttgaaaac caaaagcgct ctgaagacgc actttcaaaa aaccaaaaac 3120 gcaccggact gtaacgagct actaaaatat tgcgaatacc gcttccacaa acattgctca 3180 aaagtatctc tttgctatat atctctgtgc tatatcccta tataacctac ccatccacct 3240 ttcgctcctt gaacttgcat ctaaactcga cctctacatt ttttatgttt atctctagta 3300 ttactcttta gacaaaaaaa ttgtagtaag aactattcat agagtgaatc gaaaacaata 3360 cgaaaatgta aacatttcct atacgtagta tatagagaca aaatagaaga aaccgttcat 3420 aattttctga ccaatgaaga atcatcaacg ctatcacttt ctgttcacaa agtatgcatc 3480 gatgctgata ccgctcgccg cagccgaacg accgagcgca gcgagtcagt gagcgaggaa 3540 gcggaagagc gcccaatacg caaaccgcct ctccccgcgc gttggccgat tcattaatgc 3600 agcagatctg gcttttcaat tcatcatttt ttttttattc ttttttttga tttcggtttc 3660 tttgaaattt ttttgattcg gtaatctccg aacagaagga agaacgaagg aaggagcaca 3720 gacttagatt ggtatatata cgcatatgta gtgttgaaga aacatgaaat tgcccagtat 3780 tcttaaccca actgcacaga acaaaaaccg gaaacgaaga taaatcatgt cgaaagctac 3840 atataaggaa cgtgctgcta ctcatcctag tcctgttgct gccaagctat ttaatatcat 3900 gcacgaaaag caaacaaact tgtgtgcttc attggatgtt cgtaccacca aggaattact 3960 ggagttagtt gaagcattag gtcccaaaat ttgtttacta aaaacacatg tggatatctt 4020 gactgatttt tccatggagg gcacagttaa gccgctaaag gcattatccg ccaagtacaa 4080 ttttttactc ttcgaagaca gaaaatttgc tgacattggt aatacagtca aattgcagta 4140 ctctgcgggt gtatacagaa tagcagaatg ggcagacatt acgaatgcac acggtgtggt 4200 gggcccaggt attgttagcg gtttgaagca ggcggcagaa gaagtaacaa aggaacctag 4260 aggccttttg atgttagcag aattgtcatg caagggctcc ctatctactg gagaatatac 4320 taagggtact gttgacattg cgaagagcga caaagatttt gttatcggct ttattgctca 4380 aagagacatg ggtggaagag atgaaggtta cgattggttg attatgacac ccggtgtggg 4440 tttagatgac aagggagacg cattgggtca acagtataga accgtggatg atgtggtctc 4500 tacaggatct gacattatta ttgttggaag aggactattt gcaaagggaa gggatgctaa 4560 ggtagagggt gaacgttaca gaaaagcagg ctgggaagca tatttgagaa gatgcggcca 4620 gcaaaactaa aaaactgtat tataagtaaa tgcatgtata ctaaactcac aaaaaaaaaa 4680 aattggaaag aaaaagctca gatctgctgg cacgacaggt ttcccgtggt gcactctcag 4740 tacaatctgc tctgatgccg catagttaag ccagtataca ctccgctatc gctacgtgac 4800 tgggtcatgg ctgcgccccg acacccgcca acacccgctg acgcgccctg acgggcttgt 4860 ctgctcccgg catccgctta cagacaagct gtgaccgtct ccgggagctg catgtgtcag 4920 aggttttcac cgtcatcacc gaaacgcgcg aggcagctgc ggtaaagctc atcagcgtgg 4980 tcgtgaagcg attcacagat gtctgcctgt tcatccgcgt ccagctcgtt gagtttctcc 5040 agaagcgtta atgtctggct tctgataaag cgggccatgt taagggcggt tttttcctgt 5100 ttggtcactt gatgcctccg tgtaaggggg aatttctgtt catgggggta atgataccga 5160 tgaaacgaga gaggatgctc acgatacggg ttactgatga tgaacatgcc cggttactgg 5220 aacgttgtga gggtaaacaa ctggcggtat ggatgcggcg ggaccagaga aaaatcactc 5280 agggtcaatg ccagcgcttc gttaatacag atgtaggtgt tccacagggt agccagcagc 5340 atcctgcgat gcagatccgg aacataatgg tgcagggcgc tgacttccgc gtttccagac 5400 tttacgaaac acggaaaccg aagaccattc atgttgttgc tcaggtcgca gacgttttgc 5460 agcagcagtc gcttcacgtt cgctcgcgta tcggtgattc attctgctaa ccagtaaggc 5520 aaccccgcca gcctagccgg gtcctcaacg acaggagcac gatcatgcgc acccgtggcc 5580 aggacccaac gctgcccgag atgcgccgcg tgcggctgct ggagatggcg gacgcgatgg 5640 atatgttctg ccaagggttg gtttgcgcat tcacagttct ccgcaagaat tgattggctc 5700 caattcttgg agtggtgaat ccgttagcga ggtgccgccg gcttccattc aggtcgaggt 5760 ggcccggctc catgcaccgc gacgcaacgc ggggaggcag acaaggtata gggcggcgcc 5820 tacaatccat gccaacccgt tccatgtgct cgccgaggcg gcataaatcg ccgtgacgat 5880 cagcggtcca gtgatcgaag ttaggctggt aagagccgcg agcgatcctt gaagctgtcc 5940 ctgatggtcg tcatctacct gcctggacag catggcctgc aacgcgggca tcccgatgcc 6000 gccggaagcg agaagaatca taatggggaa ggccatccag cctcgcgtcg cgaacgccag 6060 caagacgtag cccagcgcgt cggccgccat gccggcgata atggcctgct tctcgccgaa 6120 acgtttggtg gcgggaccag tgacgaaggc ttgagcgagg gcgtgcaaga ttccgaatac 6180 cgcaagcgac aggccgatca tcgtcgcgct ccagcgaaag cggtcctcgc cgaaaatgac 6240 ccagagcgct gccggcacct gtcctacgag ttgcatgata aagaagacag tcataagtgc 6300 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tatcatggtt tgtaggctac 180 atttcttttt ctgttgttct gtttaattac tgtctgtatc tggtcggaag aagagaaagt 240 ggttttattg ctaccttcgt gcataatatg gatggtcgac tattatttat tcgttctcaa 300 ttaatagcct cacttatcat gtctattttg tatgtgtttt ttttcatttt agtcgtacta 360 acaggattcc aggcaagtcc agattatcaa atagtaatga ttattttaaa atcgatatac 420 ataaatgcat ttatgatggt ttcactcact ttcatggcat cgttcagagt cacattccaa 480 acagccagca ctatctattc tgtattaata actgtctgta tggtatcagg aattgtatca 540 ttaaaatata atgaggggat cgtttactgg ataaatcagg ttaatcctat cgccatctat 600 tctacaatac tccagtcaga ccaggagttg tctctgatga cgatattttt ctatagtata 660 atgttaatca taagtattat ttcagcacta accttcaaaa ctgagccagt ctggagttct 720 caatgaccat acctctttta gaaatcaact ctctgagctt ttcatataaa gtaaatttac 780 cccctgtttt caataatctg tcgcttaaga ttgagcaggg agagttgata ggtctgcttg 840 gagaaaatgg agccgggaag accactcttt ttaaccttat caggggcgga gtcagtaatt 900 atgaagggac cctcaagcga aatttctctg gtggagaatt agtaagtcta cctcaagtca 960 taaatctttc aggtacacta aggaatgagg aggttcttga tttgatttgc 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catcaaactt tcttccctcc 5820 ctaatctcat tggttacctt gggctatcga aacttaatta accagtcaag tcagctactt 5880 ggcgagatcg acttgtctgg gtttcgacta cgctcagaat tgcgtcagtc aagttcgatc 5940 tggtccttgc tattgcaccc gttctccgat tacgagtttc atttaaatca tgtgagcaaa 6000 aggccagcaa aaggccagga accgtaaaaa ggccgcgttg ctggcgtttt tccataggct 6060 ccgcccccct gacgagcatc acaaaaatcg acgctcaagt cagaggtggc gaaacccgac 6120 aggactataa agataccagg cgtttccccc tggaagctcc ctcgtgcgct ctcctgttcc 6180 gaccctgccg cttaccggat acctgtccgc ctttctccct tcgggaagcg tggcgctttc 6240 tcatagctca cgctgtaggt atctcagttc ggtgtaggtc gttcgctcca agctgggctg 6300 tgtgcacgaa ccccccgttc agcccgaccg ctgcgcctta tccggtaact atcgtcttga 6360 gtccaacccg gtaagacacg acttatcgcc actggcagca gccactggta acaggattag 6420 cagagcgagg tatgtaggcg gtgctacaga gttcttgaag tggtggccta actacggcta 6480 cactagaaga acagtatttg gtatctgcgc tctgctgaag ccagttacct tcggaaaaag 6540 agttggtagc tcttgatccg gcaaacaaac caccgctggt agcggtggtt tttttgtttg 6600 caagcagcag attacgcgca gaaaaaaagg atctcaagaa 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ccaaatacat ttgtaccacg 7500 ggcgatttgc ctgtcccctg ggcgacgctt gtaagcacgc tctcgtatgg tgtccagtgc 7560 ttcgcgaaat atccatcgca cattaaggac tttttcaagt cggccatgcc agaaggttac 7620 acacaagaac gaaccatctc ctttgagggg gacggagtgt ataagacacg cgcgatggta 7680 acgtacgagc gcgggtccat ctacaacagg gtaactctta ctggggagaa ctttaagaag 7740 gacgggcata tcttgcggaa aaacgtggca tttcaatgtc cgccctcgat tctgtatatt 7800 ctcccggaca cggtgaataa tgggatcaga gtggagttca accaggcata cgatattgag 7860 ggtgtgactg aaaagctcgt caccaaatgc agccagatga atcgccccct tgcgggatca 7920 gcagccgtcc atatcccccg gtatcaccat attacctacc acacaaaact ctcaaaagac 7980 agagatgaga gaagggacca tatgtgcctg gtcgaagtag tgaaggcggt ggatcttgat 8040 acataccagt aggctagcca ttggcgcaga aaaaaatgcc tgatgcgacg ctgcgcgtct 8100 tatactccca catatgccag attcagcaac ggatacggct tccccaactt gcccacttcc 8160 atacgtgtcc tccttaccag aaatttatcc ttaagggcgc gcctggtgta ccgagaacga 8220 tcctctcagt gcgagtctcg acgatccata tcgttgcttg gcagtcagcc agtcggaatc 8280 cagcttggga cccaggaagt ccaatcgtca gatattgtac tcaagcctgg tcacggcagc 8340 gtaccgatct gtttaaacct agatattgat agtctgatcg gtcaacgtat aatcgagtcc 8400 tagcttttgc aaacatctat caagagacag gatcagcagg aggctttcgc atgattgaac 8460 aagatggatt gcacgcaggt tctccggcgg cttgggtgga gaggctattc ggctatgact 8520 gggcacaaca gacaatcggc tgctctgatg ccgccgtgtt ccggctgtca gcgcaggggc 8580 gtccggttct ttttgtcaag accgacctgt ccggtgccct gaatgaactg caagacgagg 8640 cagcgcggct atcgtggctg gcgacgacgg gcgttccttg cgcggctgtg ctcgacgttg 8700 tcactgaagc gggaagggac tggctgctat tgggcgaagt gccggggcag gatctcctgt 8760 catctcacct tgctcctgcc gagaaagtat ccatcatggc tgatgcaatg cggcggctgc 8820 atacgcttga tccggctacc tgcccattcg accaccaagc gaaacatcgc atcgagcgag 8880 cacgtactcg gatggaagcc ggtcttgtcg atcaggatga tctggacgaa gagcatcagg 8940 ggctcgcgcc agccgaactg ttcgccaggc tcaaggcgtc tatgcccgac ggcgaggatc 9000 tcgtcgtgac ccacggcgat gcctgcttgc cgaatatcat ggtggaaaat ggccgctttt 9060 ctggattcat cgactgtggc cgtctgggtg tggcggaccg ctatcaggac atagcgttgg 9120 ctacccgtga tattgctgaa gagcttggcg gcgaatgggc tgaccgcttc cttgtgcttt 9180 acggtatcgc cgcgcccgat tcgcagcgca tcgccttcta tcgccttctt gacgagttct 9240 tctgaccgat tctaggtgca ttggcgcaga aaaaaatgcc tgatgcgacg ctgcgcgtct 9300 tatactccca catatgccag attcagcaac ggatacggct tccccaactt gcccacttcc 9360 atacgtgtcc tccttaccag aaatttatcc ttaaggtcgt ttaaactcga ctctggctct 9420 atcgaatctc cgtcgtttcg agcttacgcg aacagccgtg gcgctcattt gctcgtcggg 9480 catcgaatct cgtcagctat cgtcagctta cctttttggc a 9521 <210> 720 <211> 9 <212> PRT <213> Lactobacillus curvatus <400> 720 Asn Ile Pro Gln Leu Thr Pro Thr Pro 1 5 <210> 721 <211> 27 <212> DNA <213> Lactobacillus curvatus <400> 721 aacattccgc agctgacccc gaccccg 27 <210> 722 <211> 18 <212> PRT <213> Bacillus thuringiensis <220> <221> VARIANT <222> (4)..(4) <223> Xaa = any amino acid <220> <221> VARIANT <222> (7)..(7) <223> Xaa = any amino acid <220> <221> VARIANT <222> (10)..(10) <223> Xaa = any amino acid <400> 722 Asp Trp Thr Xaa Trp Ser Xaa Leu Val Xaa Ala Ala Cys Ser Val Glu 1 5 10 15 Leu Leu <210> 723 <211> 54 <212> DNA <213> Bacillus thuringiensis <220> <221> misc_feature <222> (10)..(12) <223> n = A,T,C or G <220> <221> misc_feature <222> (19)..(21) <223> n = A,T,C or G <220> <221> misc_feature <222> (28)..(30) <223> n = A,T,C or G <400> 723 gattggaccn nntggagcnn nctggtgnnn gcggcgtgca gcgtggaact gctg 54 <210> 724 <211> 30 <212> PRT <213> Lactobacillus curvatus L442 <400> 724 Ala Tyr Pro Gly Asn Gly Val His Cys Gly Lys Tyr Ser Cys Thr Val 1 5 10 15 Asp Lys Gln Thr Ala Ile Gly Asn Ile Gly Asn Asn Ala Ala 20 25 30 <210> 725 <211> 90 <212> DNA <213> Lactobacillus curvatus L442 <400> 725 gcgtatccgg gcaacggcgt gcattgcggc aaatatagct gcaccgtgga taaacagacc 60 gcgattggca acattggcaa caacgcggcg 90 <210> 726 <211> 43 <212> PRT <213> Carnobacterium divergens <400> 726 Thr Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Tyr Cys Asn Ser Lys Lys Cys Trp 1 5 10 15 Val Asp Trp Gly Thr Ala Gln Gly Cys Ile Asp Val Val Ile Gly Gln 20 25 30 Leu Gly Gly Gly Ile Pro Gly Lys Gly Lys Cys 35 40 <210> 727 <211> 129 <212> DNA <213> Carnobacterium divergens <400> 727 accaaatatt atggcaacgg cgtgtattgc aacagcaaaa aatgctgggt ggattggggc 60 accgcgcagg gctgcattga tgtggtgatt ggccagctgg gcggcggcat tccgggcaaa 120 ggcaaatgc 129 <210> 728 <211> 24 <212> PRT <213> Microbispora sp. (strain 107891 <400> 728 Val Thr Ser Trp Ser Leu Cys Thr Pro Gly Cys Thr Ser Pro Gly Gly 1 5 10 15 Gly Ser Asn Cys Ser Phe Cys Cys 20 <210> 729 <211> 72 <212> DNA <213> Microbispora sp. (strain 107891 <400> 729 gtgaccagct ggagcctgtg caccccgggc tgcaccagcc cgggcggcgg cagcaactgc 60 agcttttgct gc 72 <210> 730 <211> 62 <212> PRT <213> Enterococcus sp. <400> 730 Asn Arg Trp Tyr Cys Asn Ser Ala Ala Gly Gly Val Gly Gly Ala Ala 1 5 10 15 Val Cys Gly Leu Ala Gly Tyr Val Gly Glu Ala Lys Glu Asn Ile Ala 20 25 30 Gly Glu Val Arg Lys Gly Trp Gly Met Ala Gly Gly Phe Thr His Asn 35 40 45 Lys Ala Cys Lys Ser Phe Pro Gly Ser Gly Trp Ala Ser Gly 50 55 60 <210> 731 <211> 186 <212> DNA <213> Enterococcus sp. <400> 731 aaccgctggt attgcaacag cgcggcgggc ggcgtgggcg gcgcggcggt gtgcggcctg 60 gcgggctatg tgggcgaagc gaaagaaaac attgcgggcg aagtgcgcaa aggctggggc 120 atggcgggcg gctttaccca taacaaagcg tgcaaaagct ttccgggcag cggctgggcg 180 agcggc 186 <210> 732 <211> 39 <212> PRT <213> Enterococcus faecium <400> 732 Thr Thr Lys Asn Tyr Gly Asn Gly Val Cys Asn Ser Val Asn Trp Cys 1 5 10 15 Gln Cys Gly Asn Val Trp Ala Ser Cys Asn Leu Ala Thr Gly Cys Ala 20 25 30 Ala Trp Leu Cys Lys Leu Ala 35 <210> 733 <211> 117 <212> DNA <213> Enterococcus faecium <400> 733 accaccaaaa actatggcaa cggcgtgtgc aacagcgtga actggtgcca gtgcggcaac 60 gtgtgggcga gctgcaacct ggcgaccggc tgcgcggcgt ggctgtgcaa actggcg 117 <210> 734 <211> 30 <212> PRT <213> Paenibacillus polymyxa <400> 734 Ala Ser Ile Ile Lys Thr Thr Ile Lys Val Ser Lys Ala Val Cys Lys 1 5 10 15 Thr Leu Thr Cys Ile Cys Thr Gly Ser Cys Ser Asn Cys Lys 20 25 30 <210> 735 <211> 90 <212> DNA <213> Paenibacillus polymyxa <400> 735 gcgagcatta ttaaaaccac cattaaagtg agcaaagcgg tgtgcaaaac cctgacctgc 60 atttgcaccg gcagctgcag caactgcaaa 90 <210> 736 <211> 31 <212> PRT <213> Staphylococcus epidermidis <400> 736 Ser Ala Ser Ile Val Lys Thr Thr Ile Lys Ala Ser Lys Lys Leu Cys 1 5 10 15 Arg Gly Phe Thr Leu Thr Cys Gly Cys His Phe Thr Gly Lys Lys 20 25 30 <210> 737 <211> 93 <212> DNA <213> Staphylococcus epidermidis <400> 737 agcgcgagca ttgtgaaaac caccattaaa gcgagcaaaa aactgtgccg cggctttacc 60 ctgacctgcg gctgccattt taccggcaaa aaa 93 <210> 738 <211> 58 <212> PRT <213> Enterococcus faecium <400> 738 Met Glu Lys Leu Thr Val Lys Glu Met Ser Gln Val Val Gly Gly Lys 1 5 10 15 Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys Asn Lys Lys Gly Cys Ser Val Asp 20 25 30 Trp Gly Lys Ala Ile Gly Ile Ile Gly Asn Asn Ala Ala Ala Asn Leu 35 40 45 Thr Thr Gly Gly Lys Ala Gly Trp Lys Gly 50 55 <210> 739 <211> 178 <212> DNA <213> Enterococcus faecium <400> 739 atggaaaaat taactgtgaa agaaatgtcg caagtagttg gcggaaagta ctatggtaac 60 ggagtatcat gtaataaaaa gggatgtagt gttgattggg gaaaagctat tggtattatt 120 ggaaataatg ctgctgctaa tttaactact ggcggaaaag cagggtggaa aggttaac 178 <210> 740 <211> 39 <212> PRT <213> Paenibacillus polymyxa <400> 740 Ala Thr Tyr Tyr Gly Asn Gly Leu Tyr Cys Asn Lys Gln Lys His Tyr 1 5 10 15 Thr Trp Val Asp Trp Asn Lys Ala Ser Arg Glu Ile Gly Lys Ile Thr 20 25 30 Val Asn Gly Trp Val Gln His 35 <210> 741 <211> 93 <212> DNA <213> Paenibacillus polymyxa <400> 741 agcgcgagca ttgtgaaaac caccattaaa gcgagcaaaa aactgtgccg cggctttacc 60 ctgacctgcg gctgccattt taccggcaaa aaa 93 <210> 742 <211> 35 <212> PRT <213> Bacillus circulans <400> 742 Val Asn Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys Ser Lys Thr Lys Cys Ser Val 1 5 10 15 Asn Trp Gly Ile Ile Thr His Gln Ala Phe Arg Val Thr Ser Gly Val 20 25 30 Ala Ser Gly 35 <210> 743 <211> 105 <212> DNA <213> Bacillus circulans <400> 743 gtgaactatg gcaacggcgt gagctgcagc aaaaccaaat gcagcgtgaa ctggggcatt 60 attacccatc aggcgtttcg cgtgaccagc ggcgtggcga gcggc 105 <210> 744 <211> 30 <212> PRT <213> Paenibacillus polymyxa <400> 744 Phe Val Tyr Gly Asn Gly Val Thr Ser Ile Leu Val Gln Ala Gln Phe 1 5 10 15 Leu Val Asn Gly Gln Arg Arg Phe Phe Tyr Thr Pro Asp Lys 20 25 30 <210> 745 <211> 90 <212> DNA <213> Paenibacillus polymyxa <400> 745 tttgtgtatg gcaacggcgt gaccagcatt ctggtgcagg cgcagtttct ggtgaacggc 60 cagcgccgct ttttttatac cccggataaa 90 <210> 746 <211> 13 <212> PRT <213> Lactobacillus rhamnosus <400> 746 Ala Val Pro Ala Val Arg Lys Thr Asn Glu Thr Leu Asp 1 5 10 <210> 747 <211> 39 <212> DNA <213> Lactobacillus rhamnosus <400> 747 gcggtgccgg cggtgcgcaa aaccaacgaa accctggat 39 <210> 748 <211> 60 <212> PRT <213> Bacillus licheniformis <400> 748 Met Lys Asn Ser Ala Ala Arg Glu Ala Phe Lys Gly Ala Asn His Pro 1 5 10 15 Ala Gly Met Val Ser Glu Glu Glu Leu Lys Ala Leu Val Gly Gly Asn 20 25 30 Asp Val Asn Pro Glu Thr Thr Pro Ala Thr Thr Ser Ser Trp Thr Cys 35 40 45 Ile Thr Ala Gly Val Thr Val Ser Ala Ser Leu Cys 50 55 60 <210> 749 <211> 180 <212> DNA <213> Bacillus licheniformis <400> 749 atgaaaaaca gcgcggcgcg cgaagcgttt aaaggcgcga accatccggc gggcatggtg 60 agcgaagaag aactgaaagc gctggtgggc ggcaacgatg tgaacccgga aaccaccccg 120 gcgaccacca gcagctggac ctgcattacc gcgggcgtga ccgtgagcgc gagcctgtgc 180 <210> 750 <211> 689 <212> PRT <213> Pseudomonas aeruginosa <400> 750 Met Ala Val Asn Asp Tyr Glu Pro Gly Ser Met Val Ile Thr His Val 1 5 10 15 Gln Gly Gly Gly Arg Asp Ile Ile Gln Tyr Ile Pro Ala Arg Ser Ser 20 25 30 Tyr Gly Thr Pro Pro Phe Val Pro Pro Gly Pro Ser Pro Tyr Val Gly 35 40 45 Thr Gly Met Gln Glu Tyr Arg Lys Leu Arg Ser Thr Leu Asp Lys Ser 50 55 60 His Ser Glu Leu Lys Lys Asn Leu Lys Asn Glu Thr Leu Lys Glu Val 65 70 75 80 Asp Glu Leu Lys Ser Glu Ala Gly Leu Pro Gly Lys Ala Val Ser Ala 85 90 95 Asn Asp Ile Arg Asp Glu Lys Ser Ile Val Asp Ala Leu Met Asp Ala 100 105 110 Lys Ala Lys Ser Leu Lys Ala Ile Glu Asp Arg Pro Ala Asn Leu Tyr 115 120 125 Thr Ala Ser Asp Phe Pro Gln Lys Ser Glu Ser Met Tyr Gln Ser Gln 130 135 140 Leu Leu Ala Ser Arg Lys Phe Tyr Gly Glu Phe Leu Asp Arg His Met 145 150 155 160 Ser Glu Leu Ala Lys Ala Tyr Ser Ala Asp Ile Tyr Lys Ala Gln Ile 165 170 175 Ala Ile Leu Lys Gln Thr Ser Gln Glu Leu Glu Asn Lys Ala Arg Ser 180 185 190 Leu Glu Ala Glu Ala Gln Arg Ala Ala Ala Glu Val Glu Ala Asp Tyr 195 200 205 Lys Ala Arg Lys Ala Asn Val Glu Lys Lys Val Gln Ser Glu Leu Asp 210 215 220 Gln Ala Gly Asn Ala Leu Pro Gln Leu Thr Asn Pro Thr Pro Glu Gln 225 230 235 240 Trp Leu Glu Arg Ala Thr Gln Leu Val Thr Gln Ala Ile Ala Asn Lys 245 250 255 Lys Lys Leu Gln Thr Ala Asn Asn Ala Leu Ile Ala Lys Ala Pro Asn 260 265 270 Ala Leu Glu Lys Gln Lys Ala Thr Tyr Asn Ala Asp Leu Leu Val Asp 275 280 285 Glu Ile Ala Ser Leu Gln Ala Arg Leu Asp Lys Leu Asn Ala Glu Thr 290 295 300 Ala Arg Arg Lys Glu Ile Ala Arg Gln Ala Ala Ile Arg Ala Ala Asn 305 310 315 320 Thr Tyr Ala Met Pro Ala Asn Gly Ser Val Val Ala Thr Ala Ala Gly 325 330 335 Arg Gly Leu Ile Gln Val Ala Gln Gly Ala Ala Ser Leu Ala Gln Ala 340 345 350 Ile Ser Asp Ala Ile Ala Val Leu Gly Arg Val Leu Ala Ser Ala Pro 355 360 365 Ser Val Met Ala Val Gly Phe Ala Ser Leu Thr Tyr Ser Ser Arg Thr 370 375 380 Ala Glu Gln Trp Gln Asp Gln Thr Pro Asp Ser Val Arg Tyr Ala Leu 385 390 395 400 Gly Met Asp Ala Ala Lys Leu Gly Leu Pro Pro Ser Val Asn Leu Asn 405 410 415 Ala Val Ala Lys Ala Ser Gly Thr Val Asp Leu Pro Met Arg Leu Thr 420 425 430 Asn Glu Ala Arg Gly Asn Thr Thr Thr Leu Ser Val Val Ser Thr Asp 435 440 445 Gly Val Ser Val Pro Lys Ala Val Pro Val Arg Met Ala Ala Tyr Asn 450 455 460 Ala Thr Thr Gly Leu Tyr Glu Val Thr Val Pro Ser Thr Thr Ala Glu 465 470 475 480 Ala Pro Pro Leu Ile Leu Thr Trp Thr Pro Ala Ser Pro Pro Gly Asn 485 490 495 Gln Asn Pro Ser Ser Thr Thr Pro Val Val Pro Lys Pro Val Pro Val 500 505 510 Tyr Glu Gly Ala Thr Leu Thr Pro Val Lys Ala Thr Pro Glu Thr Tyr 515 520 525 Pro Gly Val Ile Thr Leu Pro Glu Asp Leu Ile Ile Gly Phe Pro Ala 530 535 540 Asp Ser Gly Ile Lys Pro Ile Tyr Val Met Phe Arg Asp Pro Arg Asp 545 550 555 560 Val Pro Gly Ala Ala Thr Gly Lys Gly Gln Pro Val Ser Gly Asn Trp 565 570 575 Leu Gly Ala Ala Ser Gln Gly Glu Gly Ala Pro Ile Pro Ser Gln Ile 580 585 590 Ala Asp Lys Leu Arg Gly Lys Thr Phe Lys Asn Trp Arg Asp Phe Arg 595 600 605 Glu Gln Phe Trp Ile Ala Val Ala Asn Asp Pro Glu Leu Ser Lys Gln 610 615 620 Phe Asn Pro Gly Ser Leu Ala Val Met Arg Asp Gly Gly Ala Pro Tyr 625 630 635 640 Val Arg Glu Ser Glu Gln Ala Gly Gly Arg Ile Lys Ile Glu Ile His 645 650 655 His Lys Val Arg Ile Ala Asp Gly Gly Gly Val Tyr Asn Met Gly Asn 660 665 670 Leu Val Ala Val Thr Pro Lys Arg His Ile Glu Ile His Lys Gly Gly 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actgcaaaca atgccttgat tgccaaggca cccaatgcac tggagaaaca aaaggcaacc 840 tacaacgccg atctcctagt ggatgaaatc gccagcctgc aagcacggct ggacaagctg 900 aacgccgaaa cggcaaggcg caaggaaatc gctcgtcaag cggcgatcag ggctgccaat 960 acttatgcca tgccagccaa tggcagcgtt gtcgccaccg ccgcaggccg gggtctgatc 1020 caggtcgcac aaggcgccgc atcccttgct caagcgatct ccgatgcgat tgccgtcctg 1080 ggccgggtcc tggcttcagc accctcggtg atggccgtgg gctttgccag tctgacctac 1140 tcctcccgga ctgccgagca atggcaggac caaacgcccg atagcgttcg ttacgccctg 1200 ggcatggatg ccgctaaatt ggggcttccc ccaagcgtaa acctgaacgc ggttgcaaaa 1260 gccagcggta ccgtcgatct gccgatgcgc ctgaccaacg aggcacgagg caacacgacg 1320 accctttcgg tggtcagcac cgatggtgtg agcgttccga aagccgttcc ggtccggatg 1380 gcggcctaca atgccacgac aggcctgtac gaggttacgg ttccctctac gaccgcagaa 1440 gcgccgccac tgatcctgac ctggacgccg gcgagtcctc caggaaacca gaacccttcg 1500 agtaccactc cggtcgtacc gaagccggtg ccggtatatg agggagcgac ccttacaccg 1560 gtgaaggcta ccccggaaac ctatcctggg gtgattacac taccggaaga cctgatcatc 1620 ggcttcccgg ccgactcggg gatcaagccg atctatgtga tgttcaggga tccgcgggat 1680 gtacctggtg ctgcgactgg caagggacag cccgtcagcg gtaattggct cggcgccgcc 1740 tctcaaggtg agggggctcc aattccaagc cagattgcgg ataaactacg tggtaagaca 1800 ttcaaaaact ggcgggactt tcgggaacaa ttctggatag ctgtggctaa tgatcctgag 1860 ttaagtaaac agtttaatcc tggtagttta gctgtaatga gagatggagg ggctccttat 1920 gtcagagagt cagaacaggc tggcgggaga ataaagatcg aaatccacca caaggttcga 1980 atagcagatg gaggcggcgt ttacaatatg gggaaccttg ttgcagtaac gccaaaacgt 2040 catatagaaa tccacaaggg agggaagtga 2070 <210> 752 <211> 36 <212> PRT <213> Lactobacillus plantarum <400> 752 Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Leu Ser Cys Ser Lys Lys Gly Cys Thr Val 1 5 10 15 Asn Trp Gly Gln Ala Phe Ser Cys Gly Val Asn Arg Val Ala Thr Ala 20 25 30 Gly His Gly Lys 35 <210> 753 <211> 108 <212> DNA <213> Lactobacillus plantarum <400> 753 aaatattatg gcaacggcct gagctgcagc aaaaaaggct gcaccgtgaa ctggggccag 60 gcgtttagct gcggcgtgaa ccgcgtggcg accgcgggcc atggcaaa 108 <210> 754 <211> 30 <212> PRT <213> Lactococcus lactis <400> 754 Met Lys Thr Ile Leu Arg Phe Val Ala Gly Tyr Asp Ile Ala Ser His 1 5 10 15 Lys Lys Lys Thr Gly Gly Tyr Pro Trp Glu Arg Gly Lys Ala 20 25 30 <210> 755 <211> 93 <212> DNA <213> Lactococcus lactis <400> 755 atgaaaacaa tcctacgttt tgttgctggc tacgatattg ctagtcataa aaagaaaact 60 ggcggctatc catgggaacg tggaaaagct taa 93 <210> 756 <211> 24 <212> PRT <213> Lactobacillus acidophilus <400> 756 Gly Asn Pro Lys Val Ala His Cys Ala Ser Gln Ile Gly Arg Ser Thr 1 5 10 15 Ala Trp Gly Ala Val Ser Gly Ala 20 <210> 757 <211> 72 <212> DNA <213> Lactobacillus acidophilus <400> 757 ggcaacccga aagtggcgca ttgcgcgagc cagattggcc gcagcaccgc gtggggcgcg 60 gtgagcggcg cg 72 <210> 758 <211> 53 <212> PRT <213> Lactobacillus salivarius cp400 <400> 758 Met Phe Phe Asn Phe Met Lys Lys Val Asp Val Lys Lys Asn Phe Gly 1 5 10 15 Tyr Lys Glu Val Ser Arg Lys Asp Leu Ala Lys Val Asn Gly Gly Lys 20 25 30 Arg Lys Lys His Arg Cys Arg Val Tyr Asn Asn Gly Met Pro Thr Gly 35 40 45 Met Tyr Arg Trp Cys 50 <210> 759 <211> 162 <212> DNA <213> Lactobacillus salivarius cp400 <400> 759 atgtttttta attttatgaa aaaagtagat gtgaagaaga attttggata taaagaagtt 60 tctagaaaag atctagctaa agtaaatggt ggaaagagaa agaaacatcg ttgcagagtt 120 tataataatg gaatgcctac aggaatgtat cgttggtgct aa 162

Claims (18)

1. a) 유전자 활성이 미생물 숙주에게 이점을 부여하는 제1 핵산 서열을 포함하고, 여기서 상기 제1 핵산 서열의 유전자 활성이 제어되는 것인 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 포함하는 미생물 숙주를 제공하는 단계;
   b) 임의로, 상기 자가-복제성 염색체외 핵산 분자는 상기 관심 생산물의 생산에 관여하는 제2 핵산 서열을 포함하고, 여기서 상기 제2 핵산 서열의 유전자 활성은 제1 서열의 활성과 독립적으로 제어되고;
   c) 상기 형질전환된 미생물 숙주가 제1 핵산 서열을 주어진 수준으로 발현시켜 자가-복제성 염색체외 분자를 성장하는 미생물 집단 내로 유지할 수 있게 하며 동시에 상기 관심 생산물에 대한 제2 서열 코딩을 유전자적으로 제어하는 조건 하에 상기 형질전환된 미생물 숙주를 배양하는 단계
   를 포함하는, 미생물 숙주와 함께 관심 생산물을 생산하는 방법.
2. 제1항에 있어서, 단계 a) 이전에 또는 동안에 미생물 숙주를 상기 자가-복제성 염색체외 핵산 분자로 형질전환시키는 단계를 추가로 포함하고, 여기서 상기 자가-복제성 염색체외 핵산 분자는 단계 b)의 제2 핵산 서열을 임의로 포함하여, 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 포함하는 미생물 숙주를 제공하는 것인 방법.
3. 제1항 또는 제2항에 있어서, 단계 c) 조건의 적어도 일부가 제1 핵산 서열이 상기 유전자 활성을 나타내지 않도록 하는 것인 방법.
4. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 관심 생산물이 배양 단계 c)의 말기에 정제되는 것인 방법.
5. 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, 관심 생산물이 미생물 바이오매스, 자가-복제성 염색체외 핵산 분자, 상기 제2 핵산 서열의 전사체, 상기 제2 서열에 의해 코딩된 폴리펩티드 또는 상기 폴리펩티드에 의해 직접 또는 간접적으로 생산된 대사산물인 방법.
6. 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 미생물 숙주가 박테리아, 효모, 사상균 또는 조류(algae)인 방법.
7. 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 있어서, 제1 핵산 서열이 유도성 프로모터에 작동 가능하게 연결된 것인 방법.
8. 제1항 내지 제7항 중 어느 한 항에 있어서, 제1 핵산 서열이 발현이 그의 숙주에게 배지에서 특정 박테리오신(bacteriocin)의 존재에 대한 내성을 부여하는 면역 유전자를 코딩하는 서열을 포함하는 것인 방법.
9. 제8항에 있어서, 제1 핵산 서열에 의해 코딩된 서열이 그의 숙주에게 배지에서 적어도 2종의 별개의 박테리오신의 존재에 대한 내성을 부여하는 것인 방법.
10. 제9항에 있어서, 박테리오신이 B17, C7 또는 ColV이고 B17에 대한 내성을 부여하는 면역은 McbG이고, C7에 대한 내성을 부여하는 면역은 MccE 또는 C-말단 MccE이고 ColV에 대한 내성을 부여하는 면역은 Cvi인 방법.
11. 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 자가-복제성 염색체외 핵산 분자가 플라스미드인 방법.
12. 유전자 활성이 미생물 숙주에게 이점을 부여하는 제1 핵산 서열을 포함하고 여기서 상기 제1 핵산 서열의 유전자 활성이 제어되고,
    임의로 관심 생산물의 생산에 직접 또는 간접적으로 관여하는 제2 핵산 서열을 포함하는
    자가-복제성 염색체외 핵산 분자.
13. 제12항에 있어서, 상기 제1 핵산 서열이 유도성 프로모터에 작동 가능하게 연결된 것인 자가-복제성 염색체외 핵산 분자.
14. 제12항 또는 제13항에 있어서, 플라스미드인 자가-복제성 염색체외 핵산 분자.
15. 제12항 내지 제14항 중 어느 한 항에 있어서, 제1 핵산 서열이 발현이 그의 숙주에게 배지에서 특정 박테리오신의 존재에 대한 내성을 부여하는 면역 유전자를 코딩하는 서열을 포함하는 것인 자가-복제성 염색체외 핵산 분자.
16. 제15항에 있어서, 제1 핵산 서열에 의해 코딩된 서열이 그의 숙주에게 배지에서 적어도 2종의 별개의 박테리오신의 존재에 대한 내성을 부여하는 자가-복제성 염색체외 핵산 분자.
17. 제16항에 있어서, 박테리오신이 B17, C7 또는 ColV이고 B17에 대한 내성을 부여하는 면역은 McbG이고, C7에 대한 내성을 부여하는 면역은 MccE 또는 C-말단 MccE이고 ColV에 대한 내성을 부여하는 면역은 Cvi인 방법.
18. 제11항 내지 제16항 중 어느 한 항의 자가-복제성 염색체외 핵산 분자를 포함하는 미생물 숙주로서, 임의로 여기서 미생물 세포가 박테리아, 효모, 사상균 또는 조류인 미생물 숙주.
    

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