KR20180089329A - L-트립토판을 생산하는 재조합 코리네형 미생물 및 이를 이용한 l-트립토판을 생산하는 방법 - Google Patents
L-트립토판을 생산하는 재조합 코리네형 미생물 및 이를 이용한 l-트립토판을 생산하는 방법 Download PDFInfo
- Publication number
- KR20180089329A KR20180089329A KR1020180022057A KR20180022057A KR20180089329A KR 20180089329 A KR20180089329 A KR 20180089329A KR 1020180022057 A KR1020180022057 A KR 1020180022057A KR 20180022057 A KR20180022057 A KR 20180022057A KR 20180089329 A KR20180089329 A KR 20180089329A
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- ala
- leu
- gly
- val
- glu
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/67—General methods for enhancing the expression
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/74—Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora
- C12N15/77—Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora for Corynebacterium; for Brevibacterium
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1022—Transferases (2.) transferring aldehyde or ketonic groups (2.2)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/88—Lyases (4.)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
- C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
- C12P13/22—Tryptophan; Tyrosine; Phenylalanine; 3,4-Dihydroxyphenylalanine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
- C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
- C12P13/22—Tryptophan; Tyrosine; Phenylalanine; 3,4-Dihydroxyphenylalanine
- C12P13/227—Tryptophan
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y202/00—Transferases transferring aldehyde or ketonic groups (2.2)
- C12Y202/01—Transketolases and transaldolases (2.2.1)
- C12Y202/01001—Transketolase (2.2.1.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y401/00—Carbon-carbon lyases (4.1)
- C12Y401/03—Oxo-acid-lyases (4.1.3)
- C12Y401/03027—Anthranilate synthase (4.1.3.27)
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
본 출원은 유전자 조작기법을 이용한 재조합 L-트립토판을 생산하는 코리네박테리움속 미생물, 및 상기 미생물을 이용하여 L-트립토판을 생산하는 방법에 관한 것이다.
Description
본 출원은 유전자 조작기법을 이용한 재조합 L-트립토판을 생산하는 코리네박테리움속 미생물, 및 상기 미생물을 이용하여 L-트립토판을 생산하는 방법에 관한 것이다.
L-트립토판은 필수 아미노산의 하나로 사료 첨가제, 또는 수액제 등의 의약품 원료 및 건강식품소재 등으로 널리 사용되어 왔다. 현재에는 미생물을 이용한 직접 발효법이 L-트립토판 생산에 주로 이용되고 있다.
L-트립토판 생산에 사용되는 미생물들은 초기에 화학적 또는 물리적 돌연변이를 통한 유사체 내성 선별 균주들이 주로 사용되어 왔으나, 1990년대 유전자 재조합 기술의 급격한 발전과 분자수준의 조절 기작들이 규명됨에 따라 유전자 조작 기법을 이용한 재조합 균주들이 주로 사용되고 있다.
한편, 대장균을 이용한 L-트립토판 생산 연구는 당유입, pentose phosphate pathway, 세린 생합성, aromatic/tryptophan 생합성에 걸쳐 다양한 연구가 진행되었고 현재 산업적 생산까지 이어지고 있다. GRAS(Generally Recognized as Safe) 균주인 코리네박테리움속 미생물은 Endotoxin-free와 같은 장점이 있어 글루탐산, 라이신, 발린 생산에 적용되고 있음에도 불구하고, 트립토판 경우 유전자 regulation에 대한 연구가 대장균에 비해 진행이 미비하여 산업적 생산까지는 적용되지 않은 실정이다.
이러한 배경하에서, 본 출원에서는 대사공학적 관점에서 코리네박테리움속 미생물에 유전자 조작을 통하여 트립토판 생합성 경로를 강화시킴과 동시에 트립토판 생합성의 첫 기질인 에리스로즈 4-포스페이트가 증가되도록 함으로써, 트립토판 생산능이 획기적으로 향상됨을 확인하여 본 출원을 완성하였다.
본 출원의 하나의 목적은, L-트립토판을 과생산할 수 있도록 유전자 재조합된, L-트립토판을 생산하는 코리네박테리움속 미생물을 제공하는 것이다.
본 출원의 또 다른 하나의 목적은, 상기 미생물을 배지에서 배양하는 단계; 및 상기 배양된 미생물 또는 배지로부터 L-트립토판을 회수하는 단계를 포함하는, L-트립토판 생산 방법을 제공하는 것이다.
이를 구체적으로 설명하면 다음과 같다. 한편, 본 출원에서 개시된 각각의 설명 및 실시형태는 각각의 다른 설명 및 실시 형태에도 적용될 수 있다. 즉, 본 출원에서 개시된 다양한 요소들의 모든 조합이 본 출원의 범주에 속한다. 또한, 하기 기술된 구체적인 서술에 의하여 본 출원의 범주가 제한된다고 볼 수 없다.
상기 목적을 달성하기 위한 본 출원의 하나의 양태는, N-말단이 서열번호 32의 아미노산 서열로 구성되고 피드백 저해가 해제된 안스라닐산 합성효소를 코딩하는 유전자와 이를 포함하는 트립토판 오페론 및 트랜스케토라제를 코딩하는 유전자의 발현이 강화된, L-트립토판을 생산하는 코리네박테리움속 미생물에 대한 것이다.
또 하나의 일 실시 양태로, 상기 미생물에 추가적으로 N-말단이 서열번호 33의 아미노산 서열로 구성된 피드백 해제된 안스라닐산 합성효소를 코딩하는 유전자와 이를 포함하는 대장균 유래 트립토판 오페론이 발현되도록 변형된, L-트립토판을 생산하는 코리네박테리움속 미생물을 제공한다.
본 출원에서 용어, " L-트립토판(L-tryptophan)"은 α-아미노산의 하나로, 체내에서 합성되지 않는 필수 아미노산이며 화학식이 C11H12N2O2인 방향족 아미노산을 말한다.
본 출원에서 용어, “트립토판 오페론(tryptophan operon; Trp operon)”은 코리스민산(chorismic acid; chorismate)로부터 트립토판을 합성하는데 관여하는 효소를 암호화 하고 있는 유전자군을 의미한다. 구체적으로, 트립토판 오페론은 코리네박테리움 속 미생물 유래의 트립토판 오페론, 또는 에스케리키아 속 미생물 유래의 트립토판 오페론일 수 있다. 코리네박테리움 속 미생물에서는 trpE, trpG, trpD, trpC, trpB, trpA 유전자로, 에스케리키아속 미생물에서는 trpE, trpD, trpC, trpB, trpA 유전자가 촉진자와 작동인자 하부에 이 순서로 배열하여 오페론을 구성한다. 구체적으로 상기 코리네박테리움속 미생물은 코리네박테리움 글루타미쿰일 수 있고, 에스케리키아속 미생물은 대장균일 수 있다. 상기 트립토판 오페론은 공지된 뉴클레오티드 서열을 가질 수 있으며, 당업자는 NCBI 또는 Kegg 등의 데이터베이스를 통해 트립토판 오페론의 뉴클레오티드 서열을 용이하게 수득할 수 있다. 통상의 트립토판 오페론은 세포가 요구하는 충분한 양의 트립토판을 생산할 수 있도록 활발히 전사하지만, 세포내 트립토판이 충분히 존재하는 경우에 억제인자(repressor)가 트립토판과 결합하여 트립토판 오페론이 불활성화되므로 전사가 억제된다. 이에 트립토판을 미생물에서 과량으로 생산하기 위해서는 트립토판 오페론의 억제인자가 작동하지 않도록 해야 하며, 트립토판에 의해 피드백 억제를 받지 않도록 유전자 조작이 필요하다.
상기 트립토판 오페론에 의해 코딩되는 단백질은 안스라닐산 합성효소(anthranilate synthase), 안스라닐산 포스포리보실 전이효소(anthranilate phosphoribosyltransferase), 포스포리보실 안트라닐산 이성화효소(phosphoribosylanthranilate isomerase), 인돌-3-글리세롤 인산합성 효소(indole-3-glycerol phosphate synthase) 및 트립토판 합성효소(tryptophan synthase)로 공지되어 있다. 구체적으로, 먼저 안스라닐산 합성효소가 코리스믹산에 작용하여 안스라닐산(anthranilic acid)을 합성한다. 이어서 안스라닐산 포스포리보실 전이효소가 작용하여 포스포리보실 안트라닐산 (N -(5'-phosphoribosyl)-anthranilate)을 합성한다. 이어서 포스포리보실 안트라닐산 이성화효소 와 인돌-3-글리세롤 인산합성 효소가 작용하여 인돌-3-글리세롤 인산 (indole-3-glycerol-phosphate)을 합성하고, 여기에 트립토판 합성효소가 작용하여 L-트립토판 합성을 완성한다(Bonggaerts et al., Metab Eng, 3, 289-300, 2001, Iris Brune et al., J.Bacteriol., 189(7):2720-33, 2007).
본 출원에서 상기 "안스라닐산 합성효소 (anthranilate synthase)"는 코리스믹산으로 부터 안스라닐산을 합성하는 효소를 의미한다. 본 출원의 상기 안스라닐산 합성효소는 코리네박테리움 속 미생물 유래의 안스라닐산 합성효소, 또는 에스케리키아 속 미생물 유래의 안스라닐산 합성효소일 수 있다. 코리네글루타미쿰의 경우 트립토판 오페론 내의 trpE와 trpG 유전자가 생성하는 단백질이, 대장균의 경우 trpE와 trpD 유전자가 생성하는 단백질이 중합체를 이뤄 안트라닐산 합성효소를 형성한다.
본 출원의 안스라닐산 합성효소는 이의 활성을 갖는 야생형 또는 천연형 단백질과 달리, 최종 산물인 트립토판, 이의 유도체 또는 유사체에 의한 피드백 저해가 해제되거나 탈감작된 특징을 가진다. 본 출원에서 용어, “피드백 저해 (feedback inhibition)”는 효소계의 종산물이 그 효소계의 초기 단계에 있는 반응을 저해하거나 억제하는 것을 의미한다. 따라서, 안스라닐산 합성효소의 피드백 저해를 해제하거나 탈감작하는 경우, 그렇지 않은 경우에 비하여 트립토판의 생산성을 높일 수 있다.
상기 피드백 저해가 해제된 안스라닐산 합성효소는 트립토판에 의한 피드백 저해가 해제되거나 탈감작되기만 하면 본 출원에 포함되는 것은 자명하다. 구체적으로, 상기 피드백 저해가 해제된 안스라닐산 합성효소는 N-말단이 서열번호 32의 아미노산 서열로 구성된 것이거나, N-말단이 서열번호 33의 아미노산 서열로 구성된 것일 수 있다. 상기 서열번호 32의 아미노산 서열은 38번 위치의 세린이 알지닌으로 치환된 서열이며, 상기 서열번호 33의 아미노산 서열은 21번 위치의 프롤린이 세린으로 치환된 서열이다. 상기 서열번호 32의 아미노산 서열 또는 서열번호 33의 아미노산 서열로 구성되는 폴리펩티드는 서열번호 32 또는 서열번호 33의 아미노산 서열을 가지는 폴리펩티드, 서열번호 32 또는 33의 아미노산으로 이루어진 폴리펩티드, 또는 서열번호 32 또는 33의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드와 혼용되어 사용될 수 있다.
상기 안스라닐산 합성효소는 코리네박테리움속 미생물 유래의 공지된 아미노산 서열이나 에스케리키아속 미생물 유래의 아미노산 서열을 가질 수 있으며, 당업자는 NCBI 또는 Kegg 등의 데이터베이스를 통해 안스라닐산 합성효소의 아미노산 서열을 용이하게 수득할 수 있다. 다만, 피드백 저해 (feedback inhibition) 해소를 위해 코리네박테리움 속 미생물 유래의 경우 전체 아미노산 서열에서 N-말단이 서열번호 32의 아미노산을 포함하기만 하면, 그 이후는 공지된 아미노산 서열이거나 다른 피드백 저해 해제 변이를 포함한 아미노산 서열일 수 있다. 에스케리키아속 미생물 유래의 경우 피드백 저해 해소를 위해 전체 아미노산 서열로부터 N-말단이 서열번호 33의 아미노산을 포함하기만 하면, 그 이후는 공지된 아미노산 서열이거나 다른 피드백 저해 해제 변이를 포함한 아미노산 서열일 수 있다.
본 출원에서의 안스라닐산 합성효소는 비록 N-말단이 서열번호 32 또는 서열번호 33의 아미노산을 포함하는 폴리펩티드라고 정의하였지만, 38번 위치가 알지닌인 것을 제외한 서열번호 32, 또는 21번 아미노산이 세린인 것을 제외한 서열번호 33의 아미노산 서열 내에 자연적으로 발생할 수 있는 돌연변이, 혹은 이의 잠재성 돌연변이 (silent mutation)를 제외하는 것이 아니며, 서열번호 32 또는 서열번호 33의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드와 서로 동일 또는 상응하는 활성을 가지는 경우라면 본원의 안스라닐산 합성효소에 해당됨은 당업자에게 자명하다. 구체적인 예를 들어, 본원의 코리네박테리움속 미생물 유래의 안스라닐산 합성효소는 38번 위치가 알지닌인 것을 포함하고, 서열번호 32의 아미노산 서열 또는 이와 70%, 80%, 90%, 95%, 또는 97% 이상의 상동성을 갖는 아미노산 서열로 구성되는 폴리펩티드일 수 있다. 또한, 본원의 에스케리키아속 미생물 유래의 안스라닐산 합성효소는 21번 위치가 세린인 것을 포함하고, 서열번호 33의 아미노산 서열 또는 이와 70%, 80%, 90%, 95%, 또는 97% 이상의 상동성을 갖는 아미노산 서열로 구성되는 폴리펩티드일 수 있다. 이러한 상동성을 가지며 상기 폴리펩티드에 상응하는 효능을 나타내는 아미노산 서열이라면, 일부 서열이 결실, 변형, 치환 또는 부가된 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드도 본 출원의 범위 내에 포함됨은 자명하다.
상기 "상동성"은 두 개의 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩타이드 모이어티(moiety) 사이의 동일성의 퍼센트를 말한다. 주어진 아미노산 서열 또는 염기 서열과 일치하는 정도를 의미하며 백분율로 표시될 수 있다. 본 명세서에서, 주어진 아미노산 서열 또는 염기 서열과 동일하거나 유사한 활성을 가지는 그의 상동성 서열이 "% 상동성"으로 표시된다. 하나의 모이어티로부터 다른 하나의 모이어티까지의 서열 간 상동성은 알려진 당해 기술에 의해 결정될 수 있다. 예를 들면, 점수(score), 동일성(identity) 및 유사도(similarity) 등의 매개 변수(parameter)들을 계산하는 표준 소프트웨어, 구체적으로 BLAST 2.0을 이용하거나, 정의된 엄격한 조건하에서 써던 혼성화 실험에 의해 서열을 비교함으로써 확인할 수 있으며, 정의되는 적절한 혼성화 조건은 해당 기술 범위 내이고, 당업자에게 잘 알려진 방법(예컨대, J. Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2nd Edition, Cold Spring Harbor Laboratory press, Cold Spring Harbor, New York, 1989; F.M. Ausubel et al., CurrentProtocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, Inc., New York)으로 결정될 수 있다.
상기 안스라닐산 합성효소를 코딩하는 폴리뉴클레오티드는 상기 안스라닐산 합성효소를 코딩할 수 있는 서열이라면 제한 없이 포함될 수 있다.
또한, 상기 안스라닐산 합성효소를 코딩하는 폴리뉴클레오티드는 코돈의 축퇴성(degeneracy)으로 인하여 또는 상기 폴리펩티드를 발현시키고자 하는 생물에서 선호되는 코돈을 고려하여, 폴리펩티드의 아미노산 서열을 변화시키지 않는 범위 내에서 코딩 영역에 다양한 변형이 이루어질 수 있다. 한편, 상기 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드는 이와 70%, 80%, 90%, 95%, 또는 97% 이상의 상동성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드일 수 있다. 또한, 이러한 상동성을 가지며 실질적으로 상기 폴리펩티드와 동일하거나 상응하는 효능을 나타내는 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열이라면, 일부 서열이 결실, 변형, 치환 또는 부가된 폴리뉴클레오티드 서열도 본 출원의 범위 내에 포함됨은 자명하다. 또한 공지의 유전자 서열로부터 조제될 수 있는 프로브, 예를 들면, 상기 폴리뉴클레오티드 서열의 전체 또는 일부에 대한 상보 서열과 엄격한 조건 하에 하이드리드화하여, N-말단이 서열번호 32 또는 서열번호 33의 아미노산 서열로 이루어진 폴리펩티드와 동등 또는 유사한 활성을 가지는 폴리펩티드를 암호화하는 서열이라면 제한없이 포함될 수 있다. 상기 “엄격한 조건”이란 폴리뉴클레오티드 간의 특이적 혼성화를 가능하게 하는 조건을 의미한다. 이러한 조건은 문헌 (예컨대, J. Sambrook et al., 상동)에 구체적으로 기재되어 있다. 예를 들어, 상동성이 높은 유전자끼리, 70% 이상, 80% 이상, 구체적으로는 90% 이상, 보다 구체적으로는 95% 이상, 더욱 구체적으로는 97% 이상, 특히 구체적으로는 99% 이상의 상동성을 갖는 유전자끼리 하이브리드화하고, 그보다 상동성이 낮은 유전자끼리 하이브리드화하지 않는 조건, 또는 통상의 써던 하이브리드화의 세척 조건인 60℃, 1×SSC, 0.1% SDS, 구체적으로는 60℃, 0.1×SSC, 0.1% SDS, 보다 구체적으로는 68℃, 0.1×SSC, 0.1% SDS에 상당하는 염 농도 및 온도에서, 1회, 구체적으로는 2회 내지 3회 세정하는 조건을 열거할 수 있다. 혼성화는 비록 혼성화의 엄격도에 따라 염기 간의 미스매치(mismatch)가 가능할지라도, 두 개의 핵산이 상보적 서열을 가질 것을 요구한다. 용어, “상보적”은 서로 혼성화가 가능한 뉴클레오티드의 염기 간의 관계를 기술하는데 사용된다. 예를 들면, DNA에 관하여, 아데노신은 티민에 상보적이며 시토신은 구아닌에 상보적이다. 따라서, 본 출원은 또한 실질적으로 유사한 뉴클레오티드 서열뿐만 아니라 전체 서열에 상보적인 단리된 뉴클레오티드 단편을 포함할 수 있다. 구체적으로, 상동성을 가지는 폴리뉴클레오티드는 55 ℃의 Tm 값에서 혼성화 단계를 포함하는 혼성화 조건을 사용하고 상술한 조건을 사용하여 탐지할 수 있다. 또한, 상기 Tm 값은 60 ℃, 63 ℃ 또는 65 ℃일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니고 그 목적에 따라 당업자에 의해 적절히 조절될 수 있다. 폴리뉴클레오티드를 혼성화하는 적절한 엄격도는 폴리뉴클레오티드의 길이 및 상보성 정도에 의존하고 변수는 해당기술분야에 잘 알려져 있다(Sambrook et al., supra,9.50-9.51, 11.7-11.8 참조).
본 출원에서 용어, “트랜스케토라제(transketolase)”는 프럭토스-6-포스페이트 및 글리세르알데하이드-3-포스페이트의 자일룰로즈-5-포스페이트 및 에리스로즈 4-포스페이트(E4P, erythorse-4-phosphate)로의 전환을 촉진시키는 효소를 의미한다 (Kochetov, G. A. 1982, Transketolase from yeast, rat liver, and pig liver, Methods Enzymol., 90:209-23). 트립토판 생산은 방향족 아미노산 대사회로로부터 기인하며, 이 대사회로는 포스포엔올피루베이트 (Phosphoenolpyruvate)와 에리스로즈 4-포스페이트 (Erythrose 4-phosphate)의 축합 반응으로 시작된다. 따라서 두 가지 전구체의 원활한 공급은 트립토판 생산성 향상에 필수적이며 본 출원에서는 상대적으로 부족하다고 알려진 트립토판의 전구체로서 에리스로즈 4-포스페이트의 원활한 공급을 위해 tkt 유전자의 발현을 강화시키고자 한다.
본 출원의 트랜스케토라제는 상기 활성을 가지고 있으면 미생물의 유래에 관계없이 당업자가 이의 활성을 가지는 아미노산 서열을 자명하게 이용할 수 있다. 구체적으로, 코리네박테리움속 미생물 유래의 공지된 아미노산 서열이나 에스케리키아속 미생물 유래의 아미노산 서열을 가질 수 있으며, 당업자는 NCBI 또는 Kegg 등의 데이터베이스를 통해 트랜스케토라제의 아미노산 서열을 용이하게 수득할 수 있다. 더욱 구체적으로, 트랜스케토라제는 코리네박테리움속 미생물 유래일 수 있으며, 더욱 더 구체적으로 코리네박테리움 글루타미쿰 유래일 수 있다.
본 출원에서 용어, 유전자의 “발현이 강화된/되도록”은 목적 유전자가 기능을 가진 단백질로의 합성이 내재적 또는 변형 전에 비하여 증가된 상태를 의미한다. 상기에서 “내재적”은 자연적, 또는 인위적 요인에 의한 유전적 변이로 미생물의 형질이 변화하는 경우, 형질 변화 전 모균주가 본래 가지고 있던 상태를 의미한다.
구체적으로, 본 출원의 발현 강화는 목적 단백질을 코딩하는 유전자의 세포 내 카피수 증가, 상기 단백질을 암호화하는 염색체상 유전자의 발현 조절 서열에 변이를 도입하는 방법, 상기 단백질을 암호화하는 염색체상의 유전자 발현 조절 서열을 활성이 강력한 서열로 교체하는 방법, 상기 단백질 활성이 증가되도록 돌연변이된 유전자로 염색체상의 상기 단백질을 암호화하는 유전자를 대체하는 방법 및 상기 단백질의 활성이 강화되도록 상기 단백질을 암호화하는 염색체상의 유전자에 변이를 도입시키는 방법으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 방법으로 이루어질 수 있다. 더욱 구체적으로, 본 출원의 발현 강화는 목적 유전자의 프로모터를 강력한 프로모터로 치환한 것일 수 있다.
상기에서 유전자의 카피수 증가는, 특별히 이에 제한되지 않으나, 벡터에 작동 가능하게 연결된 형태로 수행되거나, 숙주세포 내의 염색체 내로 삽입됨으로써 수행될 수 있다. 구체적으로, 본 출원의 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드가 작동 가능하게 연결된, 숙주와 무관하게 복제되고 기능할 수 있는 벡터가 숙주세포 내에 도입되는 것일 수 있다. 또는, 상기 폴리뉴클레오티드가 작동 가능하게 연결된, 숙주세포 내의 염색체 내로 상기 폴리뉴클레오티드를 삽입시킬 수 있는 벡터가 숙주세포의 염색체 내에 도입되는 것일 수 있다. 상기 폴리뉴클레오티드의 염색체 내로의 삽입은 당업계에 알려진 임의의 방법, 예를 들면, 상동재조합에 의하여 이루어질 수 있다.
다음으로, 폴리뉴클레오티드의 발현이 증가하도록 발현 조절서열을 변형하는 것은, 특별히 이에 제한되지 않으나, 상기 발현 조절서열의 활성을 더욱 강화하도록 핵산 서열을 결실, 삽입, 비보전적 또는 보전적 치환 또는 이들의 조합으로 서열상의 변이를 유도하여 수행하거나, 더욱 강한 활성을 갖는 핵산 서열로 교체함에 의하여 수행될 수 있다. 상기 발현 조절서열은, 특별히 이에 제한되지 않으나, 프로모터, 오퍼레이터 서열, 리보좀 결합부위를 코딩하는 서열, 전사 및 해독의 종결을 조절하는 서열 등을 포함할 수 있다.
상기 폴리뉴클레오티드 발현 단위의 상부에는 본래의 프로모터 대신 강력한 프로모터가 연결될 수 있으며 이에 한정되는 것은 아니다. 공지된 강력한 프로모터의 예에는 cj1 내지 cj7 프로모터(대한민국 등록특허 제10-0620092호), lac 프로모터, trp 프로모터, trc 프로모터, tac 프로모터, 람다 파아지 PR 프로모터, PL 프로모터, tet 프로모터, gapA 프로모터, SPL7 프로모터, SPL13(sm3) 프로모터 (대한민국 등록특허 제10-1783170호), O2 프로모터(대한민국 등록특허 제10-1632642), tkt 프로모터 및 yccA 프로모터 등이 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.
아울러, 염색체상의 폴리뉴클레오티드 서열의 변형은, 특별히 이에 제한되지 않으나, 상기 폴리뉴클레오티드 서열의 활성을 더욱 강화하도록 핵산 서열을 결실, 삽입, 비보전적 또는 보전적 치환 또는 이들의 조합으로 발현 조절서열상의 변이를 유도하여 수행하거나, 더욱 강한 활성을 갖도록 개량된 폴리뉴클레오티드 서열로 교체함에 의하여 수행될 수 있다.
본 출원에서 용어, 유전자의 “도입”은, 미생물이 본래 가지고 있지 않았던 유전자가 그 미생물내에서 발현됨에 따라 특정 단백질의 활성을 나타나게 되는 것 또는 해당 단백질의 내재적 활성 또는 변형 전 활성에 비하여 향상된 활성을 나타나게 되는 것을 의미한다. 예를 들어, 특정 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드가 미생물 내 염색체로 도입되거나, 특정 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 벡터가 미생물 내로 도입되어 이의 활성이 나타나는 것일 수 있다.
이와 같은 단백질 활성의 도입 및 강화는, 상응하는 단백질의 활성 또는 농도가 야생형이나 비변형 미생물 균주에서의 단백질의 활성 또는 농도를 기준으로 하여 일반적으로 최소 1%, 10%, 25%, 50%, 75%, 100%, 150%, 200%, 300%, 400% 또는 500%, 최대 1000% 또는 2000%까지 증가되는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 출원에서 용어, “L-트립토판을 생산하는 미생물”은 배지 중의 탄소원으로부터 L-트립토판을 야생형이나 비변형 미생물과 비교하여 과량으로 생산할 수 있는 미생물을 의미한다. 또한, 상기 L-트립토판을 생산하는 미생물은 재조합 미생물일 수 있다. 구체적으로 L-트립토판을 생산할 수 있다면 그 종류가 특별히 제한되지 않으나, 엔테로박터(Enterbacter) 속, 에스케리키아(Escherichia) 속, 어위니아(Erwinia) 속, 세라티아(Serratia) 속, 프로비덴시아(Providencia) 속, 코리네박테리움(Corynebacterium) 속 및 브레비박테리움(Brevibacterium) 속에 속하는 미생물 일 수 있다. 보다 구체적으로는 에스케리키아(Escherichia) 속 또는 코리네박테리움(Corynebacterium) 속에 속하는 미생물일 수 있다.
보다 더욱 구체적으로는 코리네박테리움(Corynebacterium) 속 미생물은 코리네박테리움 글루타미쿰 (corynebacterium glutamicum)일 수 있으나, 트립토판 오페론 및 트랜스케토라제를 코딩하는 유전자의 발현이 강화되어 L-트립토판 생산량이 증가될 수 있는 코리네박테리움 속에 속하는 미생물은 제한 없이 포함될 수 있다.
상기 목적을 달성하기 위한 본 출원의 또 다른 하나의 양태는, N-말단이 서열번호 32의 아미노산 서열로 구성되고 피드백 저해가 해제된 안스라닐산 합성효소를 코딩하는 유전자와 이를 포함하는 트립토판 오페론 및 트랜스케토라제를 코딩하는 유전자의 발현이 강화된, L-트립토판을 생산하는 코리네박테리움속 미생물을 배지에서 배양하는 단계; 및 상기 배양된 미생물 또는 배지로부터 L-트립토판을 회수하는 단계를 포함하는, L-트립토판 생산 방법에 대한 것이다.
상기 N-말단이 서열번호 32 또는 서열번호 33의 아미노산 서열로 구성되고 피드백 저해가 해제된 안스라닐산 합성효소, 트립토판 오페론, 트랜스케톨라제, L-트립토판, 및 미생물에 대해서는 상기에서 설명한 바와 같다.
본 출원에서 용어, "배양"은 상기 미생물을 적당히 조절된 환경 조건에서 생육시키는 것을 의미한다. 본 출원의 배양과정은 당업계에 알려진 적당한 배지와 배양조건에 따라 이루어질 수 있다. 이러한 배양 과정은 선택되는 균주에 따라 당업자가 용이하게 조정하여 사용할 수 있다. 구체적으로 상기 배양은 회분식, 연속식 및 유가식일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 출원에서 용어, “배지”는 상기 미생물을 배양하기 위해 필요로 하는 영양물질을 주성분으로 혼합한 물질을 의미하며, 생존 및 발육에 불가결한 물을 비롯하여 영양물질 및 발육인자 등을 공급한다. 구체적으로, 본 출원의 미생물의 배양에 사용되는 배지 및 기타 배양 조건은 통상의 미생물의 배양에 사용되는 배지라면 특별한 제한 없이 어느 것이나 사용할 수 있으나, 본 출원의 미생물을 적당한 탄소원, 질소원, 인원, 무기화합물, 아미노산 및/또는 비타민 등을 함유한 통상의 배지 내에서 호기성 조건 하에서 온도, pH 등을 조절하면서 배양할 수 있다.
본 출원에서 상기 탄소원으로는 글루코오스, 프룩토오스, 수크로오스, 말토오스, 만니톨, 소르비톨 등과 같은 탄수화물; 당 알코올, 글리세롤, 피루브산, 락트산, 시트르산 등과 같은 알코올; 유기산, 글루탐산, 메티오닌, 리신 등과 같은 아미노산 등이 포함될 수 있다. 또한, 전분 가수분해물, 당밀, 블랙스트랩 당밀, 쌀겨울, 카사버, 사탕수수 찌꺼기 및 옥수수 침지액 같은 천연의 유기 영양원을 사용할 수 있으며, 구체적으로는 글루코오스 및 살균된 전처리 당밀(즉, 환원당으로 전환된 당밀) 등과 같은 탄수화물이 사용될 수 있으며, 그 외의 적정량의 탄소원을 제한 없이 다양하게 이용할 수 있다. 이들 탄소원은 단독으로 사용되거나 2 종 이상이 조합되어 사용될 수 있으며, 이에 한정되는 것은 아니다.
상기 질소원으로는 암모니아, 황산암모늄, 염화암모늄, 초산암모늄, 인산암모늄, 탄산안모늄, 질산암모늄 등과 같은 무기질소원; 글루탐산, 메티오닌, 글루타민 등과 같은 아미노산, 펩톤, NZ-아민, 육류 추출물, 효모 추출물, 맥아 추출물, 옥수수 침지액, 카세인 가수분해물, 어류 또는 그의 분해생성물, 탈지 대두 케이크 또는 그의 분해 생성물 등과 같은 유기 질소원이 사용될 수 있다. 이들 질소원은 단독으로 사용되거나 2 종 이상이 조합되어 사용될 수 있으며, 이에 한정되는 것은 아니다.
상기 인원으로는 인산 제1칼륨, 인산 제2칼륨, 또는 이에 대응되는 소디움-함유 염 등이 포함될 수 있다. 무기화합물로는 염화나트륨, 염화칼슘, 염화철, 황산마그네슘, 황산철, 황산망간, 탄산칼슘 등이 사용될 수 있으며, 그 외에 아미노산, 비타민 및/또는 적절한 전구체 등이 포함될 수 있다. 이들 구성성분 또는 전구체는 배지에 회분식 또는 연속식으로 첨가될 수 있다. 그러나, 이에 한정되는 것은 아니다.
본 출원에서, 미생물의 배양 중에 수산화암모늄, 수산화칼륨, 암모니아, 인산, 황산 등과 같은 화합물을 배지에 적절한 방식으로 첨가하여, 배지의 pH를 조정할 수 있다. 또한, 배양 중에는 지방산 폴리글리콜 에스테르와 같은 소포제를 사용하여 기포 생성을 억제할 수 있다. 또한, 배지의 호기 상태를 유지하기 위하여, 배지 내로 산소 또는 산소 함유 기체를 주입하거나 혐기 및 미호기 상태를 유지하기 위해 기체의 주입 없이 혹은 질소, 수소 또는 이산화탄소 가스를 주입할 수 있으며, 이에 한정되는 것은 아니다.
배지의 온도는 20℃ 내지 50℃, 구체적으로는 30℃ 내지 37℃일 수 있으나 이에 제한되지 않는다. 배양 기간은 유용 물질의 원하는 생성량이 수득될 때까지 계속될 수 있으며, 구체적으로는 10 시간 내지 100 시간일 수 있으나 이에 제한되지 않는다.
상기 트립토판을 회수하는 단계는 본 출원의 미생물의 배양 방법, 예를 들어 회분식, 연속식 또는 유가식 배양 방법 등에 따라 당해 기술 분야에 공지된 적합한 방법을 이용하여 배지로부터 목적하는 L-트립토판을 회수할 수 있다. 예컨대 원심분리, 여과, 결정화 단백질 침전제에 의한 처리(염석법), 추출, 초음파 파쇄, 한외여과, 투석법, 분자체 크로마토그래피(겔여과), 흡착크로마토그래피, 이온교환 크로마토그래피, 친화도 크로마토그래피 등의 각종 크로마토그래피, HPLC 및 이들의 방법을 조합하여 사용될 수 있으나, 이들 예에 한정되는 것은 아니다.
상기 회수 단계는 추가적인 정제 공정을 포함할 수 있다. 상기 정제공정은 당해 기술분야에 공지된 적합한 방법을 이용하여, 회수된 L-트립토판을 정제할 수 있다.
본 출원에서 제공되는 L-트립토판 생산 미생물은 피드백 해제된 트립토판 오페론과 트랜스케토라제를 코딩하는 유전자의 발현을 강화함으로써 발효 안정성이 뛰어난 코리네박테리움속 미생물에서 L-트립토판의 생산량을 향상시킬 수 있다. 추가로, 상기 코리네박테리움 속 미생물에 대장균 유래의 피드백 해제된 트립토판 오페론의 발현이 조합되면 L-트립토판의 생산량을 획기적으로 향상시킬 수 있다. 이에, 산업적으로 유용하게 사용할 수 있고, 발효 안정성이 강화되어 L-트립토판을 효과적으로 생산하는 코리네박테리움속 미생물을 제공할 수 있다.
이하, 실시예를 통하여 본 발명의 구성 및 효과를 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 예시하기 위한 것일 뿐, 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 한정되는 것은 아니다.
이하 본 출원을 실시예를 통하여 보다 상세하게 설명한다. 그러나 이들 실시예는 본 출원을 예시적으로 설명하기 위한 것으로 본 출원의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.
실시예 1 : Trp 오페론 발현강화 및 피드백 저항성(Feedback-resistant) trpE 변이 적용
야생형의 코리네박테리움 글루타미쿰은 L-트립토판을 생산하지 못하거나 생산하더라도 극미량으로 생산할 뿐이므로, 생산에 필수적인 생합성 경로를 야생형 코리네박테리움 글루타미쿰에서 강화하고자 하였다.
코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13869에서, L-트립토판 생합성 유전자의 오페론(operon)을 프로모터 강화를 통해 발현을 향상시켰다. 또한 추가적으로 L-트립토판 생산 향상에 따른 TrpE 폴리펩티드의 피드백 제한 (feedback inhibition) 해소를 위해 TrpE의 N-말단으로부터 38번 아미노산인 세린 (Serine)을 알지닌 (Arginine)으로 치환하였다 (서열번호 32) (JOURNAL OF BACTERIOLOGY, Nov. 1987, p. 5330-5332).
이러한 유전자 조작을 위해 우선 염색체상 상동재조합 (Homologous recombination)이 발생하는 trpE 프로모터 업스트림 (Upstream) 과 trpE 38번 변이 다운스트림 (Downsteam) 지역을 수득하였다. 구체적으로 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13869 염색체 DNA를 주형으로 하여 서열번호 1과 서열번호 2의 프라이머를 이용하여 trpE 프로모터 업스트림 (Upstream) 지역을, 서열번호 3와 서열번호 4의 프라이머를 이용하여 trpE 38번 변이 다운스트림 (Downsteam) 지역의 유전자 단편을 PCR을 수행을 통해 수득하였다.
중합효소는 SolgTM Pfu-X DNA 폴리머라제를 사용하였으며, PCR 증폭 조건은 95 ℃에서 5분간 변성 후, 95℃ 30초 변성, 60℃ 30초 어닐링, 72℃ 60초 중합을 30회 반복한 후, 72℃에서 5분간 중합반응을 수행하였다.
합성 제작한 프로모터 SPL7(서열번호 5, 대한민국 등록특허 제 10-1783170호)을 주형으로 서열번호 6과 서열번호 7 의 프라이머를 이용하여 PCR을 수행하였다.
서열번호 5 (SPL7 promoter seq.)
GGCGCTTCATGTCAACAATCTTTAACGTTTTCAAGTTCACAAGTCGTGTTCAAATGGTGACAAGATTGGACACTGTGCTGAATTGGCACCAAGCCCTCATAAATGATAGATCTAAATCGAATATCAATATATGGTCTGTTTATTGGAACGCGTCCCAGTGGCTGAGACGCATCCGCTAAAGCCCCAGGAACCCTGTGCAGAAAGAACAAATAATCGTGAATTTTGGCAGCAACAGCAATTCCTGCTACAATTGAAAACGTGCAAAAGCATAGATTATTGGAGGAGATCAAAACA
중합효소는 SolgTM Pfu-X DNA 폴리머라제 (SolGent co.)를 사용하였으며, PCR증폭 조건은 95 ℃에서 5분간 변성 후, 95℃ 30초 변성, 62℃ 30초 어닐링, 72℃ 30초 중합을 30회 반복한 후, 72℃에서 5분간 중합반응을 수행하였다.
코리네박테리움 글루타미쿰 유래의 trpE 38번 변이 앞 부분 단편을 확보하기 위하여, 코리네박테리움 글루타미쿰 게놈 DNA를 주형으로 하여 서열번호 8과 서열번호 9의 프라이머를 이용하여 PCR을 수행하였다.
중합효소는 SolgTM Pfu-X DNA 폴리머라제를 사용하였으며, PCR증폭 조건은 95 ℃에서 5분간 변성 후, 95℃ 30초 변성, 62℃ 30초 어닐링, 72℃ 30초 중합을 30회 반복한 후, 72℃에서 5분간 중합반응을 수행하였다.
증폭된 trpE 프로모터 업스트림과 trpE 38번 변이 다운스트림 지역, SPL7 프로모터와 trpE 38번 앞 부분 단편, 그리고 SmaI 제한효소로 절단된 염색체 형질전환용 벡터 pDZ(특허등록 제10-0924065호) 는 깁슨 어셈블리 (DG Gibson et al., NATURE METHODS, VOL.6 NO.5, MAY 2009, NEBuilder HiFi DNA Assembly Master Mix) 방법을 이용하여 클로닝함으로써 재조합 플라스미드를 획득하였으며, pDZ-PSPL7-trpE (S38R)로 명명하였다. 클로닝은 깁슨 어셈블리 시약과 각 유전자 단편들을 계산된 몰수로 혼합 후 50℃에 1시간 보존함으로써 수행하였다.
제작된 pDZ-PSPL7-trpE (S38R) 벡터를 야생형 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13869 균주에 전기천공법으로 형질 전환 후, 2차 교차 과정을 거쳐 염색체 상에서 trp 오페론의 프로모터를 보다 강한 프로모터인 SPL7 프로모터로 교체하고, TrpE의 38번 아미노산이 세린에서 알지닌으로 교체(서열번호 32)된 균주를 얻었다. 유전자가 삽입된 상동재조합 업스트림 지역과 다운스트림 지역의 외부 부위를 각각 증폭할 수 있는 서열번호 10과 서열번호 11를 이용한 PCR 법과 게놈 시퀀싱을 통해 해당 유전적 조작을 확인하였으며, 이를 CA04-8325 로 명명하였다.
추가적으로 trpE S38R 변이만을 도입하기 위해, 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13869 염색체 DNA를 주형으로 하여 서열번호 1과 서열번호 9의 프라이머를 이용하여 trpE(S38R) 업스트림 (Upstream) 지역을, 서열번호 3와 서열번호 4의 프라이머를 이용하여 trpE 38번 변이 다운스트림 (Downsteam) 지역의 유전자 단편을 PCR을 수행을 통해 수득하였다.
중합효소는 SolgTM Pfu-X DNA 폴리머라제를 사용하였으며, PCR 증폭 조건은 95 ℃에서 5분간 변성 후, 95℃ 30초 변성, 60℃ 30초 어닐링, 72℃ 60초 중합을 30회 반복한 후, 72℃에서 5분간 중합반응을 수행하였다.
상기의 방법으로 증폭된 trpE(S38R) 업스트림과 trpE(S38R) 다운스트림 단편, 그리고 SmaI 제한효소로 절단된 염색체 형질전환용 벡터 pDZ를 깁슨 어셈블리 방법을 이용하여 클로닝함으로써 재조합 플라스미드를 획득하였으며, pDZ-trpE (S38R)로 명명하였다. 클로닝은 깁슨 어셈블리 시약과 각 유전자 단편들을 계산된 몰수로 혼합 후 50℃에 1시간 보존함으로써 수행하였다.
상기의 과정으로 제작된 pDZ-trpE (S38R) 벡터를 야생형 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13869 균주에 전기천공법으로 형질 전환 후, 2차 교차 과정을 거쳐 염색체 상에서 TrpE의 38번 아미노산이 세린에서 알지닌으로 교체된 균주를 얻었다. 유전자가 삽입된 상동재조합 업스트림 지역과 다운스트림 지역의 외부 부위를 각각 증폭할 수 있는 서열번호 10과 서열번호 11를 이용한 PCR 법과 게놈 시퀀싱을 통해 해당 유전적 조작을 확인하였으며, 이를 CA04-8312 로 명명하였다.
그리고 trp 오페론의 프로모터를 보다 강한 프로모터인 SPL7 프로모터로 교체하기 위하여 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13869 염색체 DNA를 주형으로 하여 서열번호 1와 서열번호 2의 프라이머를 이용하여 trpE 프로모터 업스트림 (Upstream) 지역을, 서열번호 8과 서열번호 4의 프라이머를 이용하여 trpE 프로모터 다운스트림 (Downsteam) 지역의 유전자 단편을 PCR을 수행을 통해 수득하였다.
합성 제작한 프로모터 SPL7을 주형으로 서열번호 6과 서열번호 7 의 프라이머를 이용하여 PCR을 수행하였다.
중합효소는 SolgTM Pfu-X DNA 폴리머라제를 사용하였으며, PCR 증폭 조건은 95 ℃에서 5분간 변성 후, 95℃ 30초 변성, 60℃ 30초 어닐링, 72℃ 60초 중합을 30회 반복한 후, 72℃에서 5분간 중합반응을 수행하였다.
상기의 방법으로 증폭된 trpE 프로모터 업스트림, trpE 프로모터 다운스트림과 SPL7 프로모터 단편, 그리고 SmaI 제한효소로 절단된 염색체 형질전환용 벡터 pDZ를 깁슨 어셈블리 방법을 이용하여 클로닝함으로써 재조합 플라스미드를 획득하였으며, pDZ-SPL7_trpE 명명하였다. 클로닝은 깁슨 어셈블리 시약과 각 유전자 단편들을 계산된 몰수로 혼합 후 50℃에 1시간 보존함으로써 수행하였다.
상기의 과정으로 제작된 pDZ-SPL7_trpE 벡터를 야생형 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13869 균주에 전기천공법으로 형질 전환 후, 2차 교차 과정을 거쳐 염색체 상에서 trp 오페론이 강한 프로모터인 SPL7 프로모터로 교체된 균주를 얻었다. 유전자가 삽입된 상동재조합 업스트림 지역과 다운스트림 지역의 외부 부위를 각각 증폭할 수 있는 서열번호 10과 서열번호 11를 이용한 PCR 법과 게놈 시퀀싱을 통해 해당 유전적 조작을 확인하였으며, 이를 CA04-8315 로 명명하였다.
본 실시예서 사용한 프라이머의 서열은 다음과 같다.
서열번호 1 (Pspl7-trpE(S38R)_L-1) | TCGAGCTCGGTACCCAAACAACTGCGACGTGTGTC |
서열번호 2 (Pspl7-trpE(S38R)_L-2) | CATGAAGCGCCGGTACCTTAATCATTTTTGGGTTC |
서열번호 3 (Pspl7-trpE(S38R)_R-1) | GCCCTGTTGGAACGCGCTGATATCACCACCAAGAA |
서열번호 4 (Pspl7-trpE(S38R)_R-2) | CTCTAGAGGATCCCCAGATGTCACCGTTGTAAATG |
서열번호 6 (Pspl7 - 1) | CCCAAAAATGATTAAGGTACCGGCGCTTCATGTCA |
서열번호 7 (Pspl7 - 2) | GGGATTCGTGCTCATGATATCTGTTTTGATCTCCTCC |
서열번호 8 (trpE (S38R) - 1) | ATCAAAACAGATATCATGAGCACGAATCCCCATGT |
서열번호 9 (trpE (S38R) - 2) |
GTGGTGATATCAGCGCGTTCCAACAGGGCTGCATC |
서열번호 10 (Confirm_Pspl7-trpE(S38R) - 1) |
GAAGAAGAGGCTGCAGATG |
서열번호 11 (Confirm_Pspl7-trpE(S38R) - 2) | GATCAGCGCCATCATGTT |
실시예 2 : tkt 유전자 발현 강화 (트랜스케토라제 발현 강화)
트립토판의 전구체로서 에리스로즈 4-포스페이트의 원활한 공급을 위해 tkt 유전자의 과발현을 진행하고자 하였다.
이러한 유전자 조작을 위해 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13869 염색체 DNA를 주형으로 하여 프라이머 서열번호 12와 서열번호 13를 이용하여 tkt 유전자를 추가 삽입할 업스트림 (Upstream) 지역을, 서열번호 14와 서열번호 15를 이용하여 tkt 유전자를 추가 삽입할 다운스트림 (Downsteam) 지역의 유전자 단편을 PCR을 수행을 통해 수득하였다.
중합효소는 SolgTM Pfu-X DNA 폴리머라제를 사용하였으며, PCR 증폭 조건은 95 ℃에서 2분간 변성 후, 95℃ 20초 변성, 62℃ 40초 어닐링, 72℃ 30초 중합을 27회 반복한 후, 72℃에서 5분간 중합반응을 수행하였다.
또한, tkt 유전자와 프로모터를 확보하기 위하여, 야생종의 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13869 염색체 DNA를 주형으로 하여 서열번호 16와 서열번호 17를 이용하여 tkt 프로모터를 포함하는 tkt 유전자 단편을 PCR을 수행을 통해 수득하였다.
중합효소는 SolgTM Pfu-X DNA 폴리머라제를 사용하였으며, PCR증폭 조건은 95 ℃에서 2분간 변성 후, 95℃ 20초 변성, 62℃ 40초 어닐링, 72℃ 1분 20초 중합을 27회 반복한 후, 72℃에서 5분간 중합반응을 수행하였다.
증폭된 tkt 유전자를 추가 삽입할 업스트림과 tkt 유전자를 추가 삽입할 다운스트림 지역, tkt 프로모터를 포함하는 tkt 유전자, 그리고 SmaI 제한효소로 절단된 염색체 형질전환용 벡터 pDZ는 깁슨 어셈블리 방법을 이용하여 클로닝함으로써 재조합 플라스미드를 획득하였으며, pDZ-Pn-tkt 로 명명하였다. 클로닝은 깁슨 어셈블리 시약과 각 유전자 단편들을 계산된 몰수로 혼합 후 50℃에 1시간 보존함으로써 수행하였다.
제작된 pDZ-Pn-tkt 벡터를 각각 ATCC13869와 CJ04-8325 균주에 전기천공법으로 형질 전환 후, 2차 교차 과정을 거쳐 염색체 상에 tkt 프로모터를 포함하는 tkt 유전자가 삽입된 균주를 얻었다. 해당 유전자가 삽입된 상동재조합 업스트림 지역과 다운스트림 지역의 외부 부위를 각각 증폭할 수 있는 서열번호 18과 서열번호 19 프라이머를 이용한 PCR 법과 게놈 시퀀싱을 통해 해당 유전적 조작을 확인하였으며, 이를 각각 CA04-8321과 CA04-8352 로 명명하였다.
본 실시예서 사용한 프라이머의 서열은 다음과 같다.
서열번호 12 (Pn-tkt_L - 1 ) |
TCGAGCTCGGTACCCAAACTTTGAGTGGGTGCGTG |
서열번호 13 (Pn-tkt_L - 2 ) |
TCGAGCTACGAGGGCGGTTCCCAGCCCTTCATTAG |
서열번호 14(Pn-tkt_R - 1) | ATTAACGGTTAATTGATTCTGGACGTCATGACTAC |
서열번호 15(Pn-tkt_R - 2) | CTCTAGAGGATCCCCGCCTCGATGATGCAGTCGTC |
서열번호 16(Pn-tkt - 1) | GAAGGGCTGGGAACCGCCCTCGTAGCTCGAGAGTT |
서열번호 17(Pn-tkt - 2) | CATGACGTCCAGAATCAATTAACCGTTAATGGAGTCC |
서열번호 18(Confirm_Pn-tkt - 1) | ACCCAGAACCCCAAATTTTC |
서열번호 19 (Confirm_Pn-tkt - 2) |
TTGAGTTCGACAACTTTGG |
실시예 3: 코리네박테리움속 미생물의 트립토판 생산
상기 실시예 1 및 2에서 제작된 균주들의 트립토판 생산량을 확인하고자 아래와 같은 방법으로 배양하였다. 종 배지 25 ㎖을 함유하는 250 ㎖ 코너-바플 플라스크에 각 균주들을 접종하고, 30 ℃에서 20 시간 동안, 200 rpm으로 진탕 배양하였다. 그런 다음, 생산 배지 25 ㎖을 함유하는 250 ㎖ 코너-바플 플라스크에 1 ㎖의 종 배양액을 접종하고 30 ℃에서 24시간 동안, 200 rpm에서 진탕 배양하였다. 배양 종료 후 HPLC에 의해 L-트립토판의 생산량을 측정하였다.
종배지 (pH 7.0)
포도당 20g, 펩톤 10 g, 효모추출물 5 g, 요소 1.5 g, KH2PO4 4 g, K2HPO4 8 g, MgSO4 7H2O 0.5 g, 바이오틴 100 ㎍, 티아민 HCl 1000 ㎍, 칼슘-판토텐산 2000 ㎍, 니코틴아미드 2000 ㎍ (증류수 1 리터 기준)
생산배지 (pH 7.0)
포도당 30g, (NH4)2SO4 15 g, MgSO4 7H2O 1.2 g, KH2PO4 1 g, 효모추출물 5 g, 바이오틴 900 ㎍, 티아민 염산염 4500 ㎍, 칼슘-판토텐산 4500 ㎍, CaCO3 30 g (증류수 1리터 기준).
형질 | 사용한 포도당(g/L) |
트립토판
생산량 (g/L) |
트립토판 수율
(*100 g/g, %) |
|
ATCC13869 | 30 | 0.00 | 0.00 | |
CA04-8312 | trpE::trpE(S38R) | 30 | 0.00 | 0.00 |
CA04-8315 | Pn::SPL7_trpE | 30 | 0.00 | 0.00 |
CA04-8321 | ::Pn_tkt | 30 | 0.00 | 0.00 |
CA04-8325 | Pn::SPL7_trpE(S38R) | 30 | 0.05 | 0.16 |
CA04-8352 | SPL7_trpE(S38R) , ::Pn_tkt |
30 | 0.27 | 0.90 |
야생형 코리네박테리움, CA04-8312, CA04-8315, CA04-8321, CA04-8325, CA04-8352에 대한 배양물 중의 L-트립토판 생산에 대한 결과는 상기 표 3과 같다.
야생형 코리네박테리움의 trpE에 피드백이 해제된 변이가 도입된 CA04-8312와 트립토판 오페론(operon)이 발현 강화된 CA04-8315, 그리고 tkt가 강화된 CA04-8321 균주는 트립토판 생산이 확인되지 않았다. 하지만 이들 개별 형질들이 조합된 CA04-8352 균주의 경우, CA04-8325에 비해 약 5배나 향상된 트립토판을 생산하였다. 이는 트립토판에 대한 피드백이 해제된 트립토판 오페론 강화와 tkt 발현 강화가 조합되어야 트립토판 생산을 향상시킴을 의미한다. 야생형의 코리네박테리움속 미생물은 트립토판을 생산하지 않거나 생산하더라도 극미량의 트립토판만 생산할 뿐이므로 이러한 생산량 증가는 매우 의미 있는 효과로 해석된다.
실시예 4 : 대장균 유래 트립토판 오페론 발현 강화
트립토판의 생산을 더 향상시키기 위하여, 추가적인 대장균 유래 트립토판 오페론을 도입 및 발현 강화시키고자 하였다. 대장균 유래 트립토판 오페론을 강화시키기 위해서 강한 프로모터로 알려진 SPL7 프로모터와 대장균 TrpE 단백질의 피드백 제한이 해소된 trpE의 21번 아미노산인 프롤린(Proline)이 세린(Serine)으로 치환된 trpE (서열번호 33) 및 대장균 trpDCBA 형태로 강화를 진행하였다(J. Biochem. Mol. Biol. 32, 20-24 (1999)).
이러한 유전자 조작을 위해 우선 염색체상 상동재조합 (Homologous recombination)이 발생하는 프로모터 업스트림 (Upstream)과 trpDCBA 다운스트림 (Downsteam) 지역을 수득하였다. 구체적으로 코리네박테리움 글루타미쿰 염색체 DNA를 주형으로 하여 서열번호 20와 서열번호 21의 프라이머를 이용하여 프로모터 업스트림 (Upstream) 지역을, 서열번호 22와 서열번호 23의 프라이머를 이용하여 다운스트림 (Downsteam) 지역의 유전자 단편을 PCR을 수행을 통해 수득하였다.
중합효소는 SolgTM Pfu-X DNA 폴리머라제를 사용하였으며, PCR 증폭 조건은 95 ℃에서 5분간 변성 후, 95℃ 30초 변성, 58℃ 30초 어닐링, 72℃ 60초 중합을 30회 반복한 후, 72℃에서 5분간 중합반응을 수행하였다.
합성 제작한 프로모터 SPL7을 주형으로 서열번호 24과 서열번호 25 의 프라이머를 이용하여 PCR을 수행하였다.
중합효소는 SolgTM Pfu-X DNA 폴리머라제 (SolGent co.)를 사용하였으며, PCR증폭 조건은 95 ℃에서 5분간 변성 후, 95℃ 30초 변성, 58℃ 30초 어닐링, 72℃ 60초 중합을 30회 반복한 후, 72℃에서 5분간 중합반응을 수행하였다.
대장균 trpE 유전자의 아미노산 1부터 변이형 21번까지를 코딩하는 뉴클레오타이드를 확보하기 위하여, 대장균 W3110 게놈 DNA를 주형으로 하여 서열번호 26과 서열번호 27을 이용하여 PCR을 수행하였다.
중합효소는 SolgTM Pfu-X DNA 폴리머라제를 사용하였으며, PCR증폭 조건은 95 ℃에서 5분간 변성 후, 95℃ 30초 변성, 58℃ 30초 어닐링, 72℃ 30초 중합을 30회 반복한 후, 72℃에서 5분간 중합반응을 수행하였다.
대장균 trpE 유전자의 변이형 아미노산 21번부터 말단을 포함한 trpE 및 trpDCBA 까지를 코딩하는 뉴클레오타이드를 확보하기 위하여, 대장균 W3110 게놈 DNA를 주형으로 하여 서열번호 28과 서열번호 29를 이용하여 PCR을 수행하였다.
중합효소는 SolgTM Pfu-X DNA 폴리머라제를 사용하였으며, PCR증폭 조건은 95 ℃에서 5분간 변성 후, 95℃ 30초 변성, 58℃ 30초 어닐링, 72℃ 7분 중합을 30회 반복한 후, 72℃에서 10분간 중합반응을 수행하였다.
염색체상 상동재조합이 발생하기 위해서 증폭된 업스트림 지역과 다운스트림 지역, SPL7 프로모터, 대장균 trpE P21S 앞 단편, 대장균 trpE P21S 을 포함한 말단 및 trpDCBA 유전자, 그리고 SmaI 제한효소로 절단된 염색체 형질전환용 벡터 pDZ는 깁슨 어셈블리 방법을 이용하여 클로닝함으로써 재조합 플라스미드를 획득하였으며, pDZ-PSPL7-trpE(P21S)DCBA.eco 로 명명하였다. 클로닝은 깁슨 어셈블리 시약과 각 유전자 단편들을 계산된 몰수로 혼합 후 50℃에 1시간 보존함으로써 수행하였다.
제작된 pDZ-PSPL7-trpE(P21S)DCBA.eco 벡터를 각각 야생형 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13869, CJ04-8321과 CJ04-8352 균주에 전기천공법으로 형질 전환 후, 2차 교차 과정을 거쳐 염색체 상에 강한 프로모터인 SPL7 형태로 대장균 trpE(P21S)DCBA 오페론이 삽입된 균주를 얻었다. 해당 유전자가 삽입된 상동재조합 업스트림 지역과 다운스트림 지역의 외부 부위를 각각 증폭할 수 있는 서열번호 30과 서열번호 31 프라이머를 이용한 PCR 법과 게놈 시퀀싱을 통해 해당 유전적 조작을 확인하였으며, 이를 각각 CA04-8316, CA04-8330와 CA04-8357 로 명명하였다.
본 실시예서 사용한 프라이머의 서열은 다음과 같다.
서열번호 20 (TY384) | ttcgagctcggtacccGATCGAGGCTAACAAGGCA |
서열번호 21 (HR-sp R) | GGTACCACTAAACCGGAAGGGCCCTCCTGCTGTACTTTCGACA |
서열번호 22(trpA-HR F) | AGTTAAACTAAACAGGAAGAGCCAGTTAAGGGAC |
서열번호 23(HR-vector R) | gactctagaggatccccATCATGGGAATCCGGCCAT |
서열번호 24(HR-sp F) | GGCCCTTCCGGTTTAGTGGTACCGGCGCTTCATGTCAACAATC |
서열번호 25(spl7-trpE R) | TTTGCATGATATCTGTTTTGATCTCCTCCAATA |
서열번호 26(spl7-trpE F) | CAAAACAGATATCATGCAAACACAAAAACCGAC |
서열번호 27(trpE P21S R) | GAAAAAGCGCGGTGGAATTGTCGCGATAAGCGC |
서열번호 28 (trpE P21S F) | CAAAACAGATATCATGCAAACACAAAAACCGAC |
서열번호 29(trpA-HR R) | TCTTCCTGTTTAGTTTAACTGCGCGTCGCCGCTT |
서열번호 30(Nested 1F) | CGTTGACCCAAACATGCTG |
서열번호 31(Nested 1R) | CTTCTTCATTTCGGCTATCG |
실시예 5 : 대장균 트립토판 오페론이 강화된 균주 평가
상기 실시예 4에서 제작된 CA04-8316, CA04-8330 및 CA04-8357 균주들과 실시예 2에서 제작된 CA04-8352 균주의 트립토판 생산량을 확인하고자 아래와 같은 방법으로 배양하였다. 종 배지 25 ㎖을 함유하는 250 ㎖ 코너-바플 플라스크에 각 균주들을 접종하고, 30 ℃에서 20 시간 동안, 200 rpm으로 진탕 배양하였다. 그런 다음, 생산 배지 25 ㎖을 함유하는 250 ㎖ 코너-바플 플라스크에 1 ㎖의 종 배양액을 접종하고 30 ℃에서 24시간 동안, 200 rpm에서 진탕 배양하였다. 배양 종료 후 HPLC에 의해 L-트립토판의 생산량을 측정하였다.
종배지 (pH 7.0)
포도당 20g, 펩톤 10 g, 효모추출물 5 g, 요소 1.5 g, KH2PO4 4 g, K2HPO4 8 g, MgSO4 7H2O 0.5 g, 바이오틴 100 ㎍, 티아민 HCl 1000 ㎍, 칼슘-판토텐산 2000 ㎍, 니코틴아미드 2000 ㎍ (증류수 1 리터 기준)
생산배지 (pH 7.0)
포도당 30g, (NH4)2SO4 15 g, MgSO4 7H2O 1.2 g, KH2PO4 1 g, 효모추출물 5 g, 바이오틴 900 ㎍, 티아민 염산염 4500 ㎍, 칼슘-판토텐산 4500 ㎍, CaCO3 30 g (증류수 1리터 기준).
형질 | 사용한 포도당(g/L) |
트립토판
생산량 (g/L) |
트립토판 수율
(*100 g/g, %) |
|
ATCC13869 | 30 | 0.00 | 0.00 | |
CA04-8316 | ::SPL7_trpE(P21S)DCBA.eco | 30 | 0.03 | 0.10 |
CA04-8330 | ::Pn_tkt, ::SPL7_trpE(P21S)DCBA.eco |
30 | 0.32 | 1.06 |
CA04-8352 | SPL7_trpE(S38R) , ::Pn_tkt |
30 | 0.27 | 0.90 |
CA04-8357 | SPL7_trpE(S38R) , ::Pn_tkt, ::SPL7_trpE(P21S)DCBA.eco |
30 | 2.72 | 9.06 |
야생형 코리네박테리움, CA04-8316, CA04-8330, CA04-8352, CA04-8357에 대한 배양물 중의 L-트립토판 생산에 대한 결과는 상기 표 5와 같다.
야생형 코리네박테리움에 대장균 유래의 피드백이 해제된 trpE를 포함하는 트립토판 오페론(operon)이 발현 강화된 CA04-8316 균주는 0.03 g/L로 L-트립토판을 생산하였고, tkt만 강화된 CA04-8321 균주에 상기의 대장균 유래의 피드백이 해제된 트립토판 오페론이 강화된 CA04-8330 균주의 트립토판 생산량은 0.32 g/L로 향상되었다. 모든 유전자 조작을 종합한 CA04-8357 균주의 경우, 약 0.3~0.6 g/L 정도의 트립토판 생산량이 예상되었으나, CA04-8352 에 비해 약 10배나 향상된 2.72 g/L를 생산하였다.
상기 결과로부터 대장균 유래 피드백 해제된 트립토판 오페론과 모균주인 코리네박테리움형의 TKT (트랜스케토라제) 및 피드백 해제된 트립토판 오페론 강화가 조합되는 경우 예상치 못한 수준으로 생산량이 대폭 증가됨을 확인하였다. 즉, 대장균 유래의 피드백 해제된 트립토판 오페론과 코리네박테리움 유래의 피드백 해제된 트립토판 오페론과 전구체 향상이 함께 할 때 트립토판 생산에 시너지 효과가 크다는 것을 알 수 있다.
상기 균주, CA04-8352는 2018년 2월 2일자로 부다페스트 조약하의 국제기탁기관인 한국미생물보존센터(KCCM)에 국제기탁하여 KCCM12218P로 기탁번호를 부여 받았다.
이상의 설명으로부터, 본 출원이 속하는 기술분야의 당업자는 본 출원이 그 기술적 사상이나 필수적 특징을 변경하지 않고서 다른 구체적인 형태로 실시될 수 있다는 것을 이해할 수 있을 것이다. 이와 관련하여, 이상에서 기술한 실시예들은 모든 면에서 예시적인 것이며 한정적인 것이 아닌 것으로 이해해야만 한다. 본 출원의 범위는 상기 상세한 설명보다는 후술하는 특허 청구범위의 의미 및 범위 그리고 그 등가 개념으로부터 도출되는 모든 변경 또는 변형된 형태가 본 출원의 범위에 포함되는 것으로 해석되어야 한다.
<110> CJ CheilJedang Corporation
<120> Tryptophan operon-enhanced microorganism and method for producing
L-tryptophan using the same
<130> KPA180110-KR
<160> 48
<170> KoPatentIn 3.0
<210> 1
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Pspl7-trpE(S38R)_L-1
<400> 1
tcgagctcgg tacccaaaca actgcgacgt gtgtc 35
<210> 2
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Pspl7-trpE(S38R)_L-2
<400> 2
catgaagcgc cggtacctta atcatttttg ggttc 35
<210> 3
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Pspl7-trpE(S38R)_R-1
<400> 3
gccctgttgg aacgcgctga tatcaccacc aagaa 35
<210> 4
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Pspl7-trpE(S38R)_R-2
<400> 4
ctctagagga tccccagatg tcaccgttgt aaatg 35
<210> 5
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> spl7 promoter seq.
<400> 5
ggcgcttcat gtcaacaatc tttaacgttt tcaagttcac aagtcgtgtt caaatggtga 60
caagattgga cactgtgctg aattggcacc aagccctcat aaatgataga tctaaatcga 120
atatcaatat atggtctgtt tattggaacg cgtcccagtg gctgagacgc atccgctaaa 180
gccccaggaa ccctgtgcag aaagaacaaa taatcgtgaa ttttggcagc aacagcaatt 240
cctgctacaa ttgaaaacgt gcaaaagcat agattattgg aggagatcaa aaca 294
<210> 6
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Pspl7 - 1
<400> 6
cccaaaaatg attaaggtac cggcgcttca tgtca 35
<210> 7
<211> 37
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Pspl7 - 2
<400> 7
gggattcgtg ctcatgatat ctgttttgat ctcctcc 37
<210> 8
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> trpE (S38R) - 1
<400> 8
atcaaaacag atatcatgag cacgaatccc catgt 35
<210> 9
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> trpE (S38R) - 2
<400> 9
gtggtgatat cagcgcgttc caacagggct gcatc 35
<210> 10
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Confirm_Pspl7-trpE(S38R) - 1
<400> 10
gaagaagagg ctgcagatg 19
<210> 11
<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Confirm_Pspl7-trpE(S38R) - 2
<400> 11
gatcagcgcc atcatgtt 18
<210> 12
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Pn-tkt_L - 1
<400> 12
tcgagctcgg tacccaaact ttgagtgggt gcgtg 35
<210> 13
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Pn-tkt_L - 2
<400> 13
tcgagctacg agggcggttc ccagcccttc attag 35
<210> 14
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Pn-tkt_R - 1
<400> 14
attaacggtt aattgattct ggacgtcatg actac 35
<210> 15
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Pn-tkt_R - 2
<400> 15
ctctagagga tccccgcctc gatgatgcag tcgtc 35
<210> 16
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Pn-tkt - 1
<400> 16
gaagggctgg gaaccgccct cgtagctcga gagtt 35
<210> 17
<211> 37
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Pn-tkt - 2
<400> 17
catgacgtcc agaatcaatt aaccgttaat ggagtcc 37
<210> 18
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Confirm_Pn-tkt - 1
<400> 18
acccagaacc ccaaattttc 20
<210> 19
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Confirm_Pn-tkt - 2
<400> 19
ttgagttcga caactttgg 19
<210> 20
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TY384
<400> 20
ttcgagctcg gtacccgatc gaggctaaca aggca 35
<210> 21
<211> 43
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HR-sp R
<400> 21
ggtaccacta aaccggaagg gccctcctgc tgtactttcg aca 43
<210> 22
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> trpA-HR F
<400> 22
caaaacagat atcatgcaaa cacaaaaacc gac 33
<210> 23
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HR-vector R
<400> 23
gactctagag gatccccatc atgggaatcc ggccat 36
<210> 24
<211> 43
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HR-sp F
<400> 24
ggcccttccg gtttagtggt accggcgctt catgtcaaca atc 43
<210> 25
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> spl7-trpE R
<400> 25
tttgcatgat atctgttttg atctcctcca ata 33
<210> 26
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> spl7-trpE F
<400> 26
caaaacagat atcatgcaaa cacaaaaacc gac 33
<210> 27
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> trpE P21S R
<400> 27
gaaaaagcgc ggtggaattg tcgcgataag cgc 33
<210> 28
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> trpE P21S F
<400> 28
caaaacagat atcatgcaaa cacaaaaacc gac 33
<210> 29
<211> 34
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> trpA-HR R
<400> 29
tcttcctgtt tagtttaact gcgcgtcgcc gctt 34
<210> 30
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nested 1F
<400> 30
cgttgaccca aacatgctg 19
<210> 31
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nested 1R
<400> 31
cttcttcatt tcggctatcg 20
<210> 32
<211> 40
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> cgl trpE S38R
<400> 32
Met Ser Thr Asn Pro His Val Phe Ser Leu Asp Val Arg Tyr His Glu
1 5 10 15
Asp Ala Ser Ala Leu Phe Ala His Leu Gly Gly Thr Thr Ala Asp Asp
20 25 30
Ala Ala Leu Leu Glu Arg Ala Asp
35 40
<210> 33
<211> 40
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> eco trpE P21S
<400> 33
Met Gln Thr Gln Lys Pro Thr Leu Glu Leu Leu Thr Cys Glu Gly Ala
1 5 10 15
Tyr Arg Asp Asn Ser Thr Ala Leu Phe His Gln Leu Cys Gly Asp Arg
20 25 30
Pro Ala Thr Leu Leu Leu Glu Ser
35 40
<210> 34
<211> 6770
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DNA sequence of tryptophan operon - Corynebacterium glutamicum
<400> 34
atgagcacga atccccatgt tttctcccta gatgtccgct atcacgagga tgcttctgcg 60
ttgtttgccc acttgggtgg cacaaccgca gatgatgcag ccctgttgga acgcgctgat 120
atcaccacca agaatggtat ttcttccctc gcggtgttga agagttcggt gcgcattacg 180
tgcacgggca acacggtggt aacgcagccg ctgacggact cgggtagggc agtggttgcg 240
cgcctaacac agcagcttgg ccagtacaac accgcagaga acacctttag cttccccgcc 300
tccgatgcgg ttgatgagcg cgagcgcctc accgcaccaa gcaccatcga agtgctgcgc 360
aagttgcagt tcgagtccgg ctacagcgac gcgtccctgc cactgctcat gggcggtttc 420
gcctttgatt tcttagaaac ctttgaaacg ctccccgcag tcgaggaaag cgtcaacact 480
taccccgatt accagttcgt cctcgcggaa atcgtcctgg acatcaatca ccaggaccag 540
accgccaaac tcaccggcgt ctccaacgcc ccaggcgagc tcgaggccga gctcaacaag 600
ctttcattgc ttatcgacgc cgccctcccc gcaaccgaac acgcctacca aaccacccct 660
cacgacggcg acactcttcg cgttgtggct gatattcccg atgctcagtt ccgcactcag 720
atcaatgagc tgaaagaaaa catttacaac ggtgacatct accaagttgt cccggcgcgc 780
actttcaccg caccatgtcc tgatgcattc gctgcttatc tgcagctgcg tgccaccaac 840
ccgtcgccgt acatgttcta tatccgtgga ctcaacgaag gtcgctccta tgaacttttt 900
ggcgcatccc ctgagtccaa cctcaagttc accgctgcta accgtgagct gcagctgtac 960
ccaatcgcag gtacccgccc ccgtggactc aacccagatg gctccatcaa cgatgagcta 1020
gatatccgca atgagttgga tatgcgcact gatgccaaag agatcgcgga gcacaccatg 1080
cttgtcgatc tcgcccgcaa cgacctcgcc cgcgtctcgg tcccagcgtc gcgccgggtt 1140
gcggatcttt tgcaggtgga tcgctattcc cgcgtgatgc acttggtgtc ccgtgtgacg 1200
gcgacgttgg acccagagct tgatgctttg gacgcctatc gggcgtgcat gaatatgggc 1260
acgttgaccg gcgctccgaa gttgcgcgct atggagctgt tgcgcggcgt cgaaaagcgc 1320
aggcgtggtt cttatggtgg ggcagtgggg tacctgcgcg gcaatggcga tatggataat 1380
tgcattgtta ttcgttcggc gtttgtccag gatggtgtgg ctgctgtgca ggctggtgct 1440
ggtgtggtcc gcgattctaa tcctcaatct gaagccgatg agacgttgca caaggcgtat 1500
gccgtgttga atgccattgc gcttgctgct ggttccactt tggaggtcat ccgatgacac 1560
acgttgttct cattgataat cacgattctt ttgtctacaa cctggtggat gcgttcgccg 1620
tggccggtta taagtgcacg gtgttccgca atacggtgcc agttgaaacc attttggcag 1680
ccaacccgga cctgatctgc ctttcacctg gacctggtta ccctgccgat gcgggcaaca 1740
tgatggcgct gatcgagcgc acactcggcc agattccttt actgggtatt tgcctcggct 1800
accaggcact catcgaatac cacggcggca aggttgagcc ttgtggccct gtgcacggca 1860
ccaccgacaa catgatcctt actgatgcag gtgtgcagag ccctgttttt gcaggtcttg 1920
ccactgatgt tgagcctgat catccagaag tcccaggccg caaggttcca attggccgtt 1980
atcactcact gggctgcgtg gttgccccag acggtattga atcattgggc acctgttcct 2040
ctgagattgg tgatgtcatc atggcggcac gcaccaccga tggaaaggcc attggcctgc 2100
agtttcaccc tgagtcagtg ctgagcccaa cgggtcctat cattttgtcc cgctgtgtcg 2160
aacaacttct cgcgaactaa taaaaaggat ttgattcatg acttctccag caacactgaa 2220
agttctcaac gcctacttgg ataaccccac tccaaccctg gaggaggcaa ttgaggtgtt 2280
caccccgctg accgtgggtg aatacgatga cgtgcacatc gcagcgctgc ttgcgaccat 2340
ccgtactcgc ggtgagcagt tcgctgatat tgccggcgct gccaaggcat tcctcgcggc 2400
ggctcgtccg ttcccgatta ctggcgcagg tttgctagat tccgctggca ctggtggcga 2460
cggtgccaac accatcaaca tcaccaccgg cgcatccctg atcgcagcat ccggtggagt 2520
gaagctggtt aagcacggca accgttcggt gagctccaag tccggctccg ccgatgtgct 2580
ggaagcgctg aatattcctt tgggccttga tgtggatcgt gctgtgaagt ggttcgaagc 2640
gtccaacttc accttcctgt tcgcacctgc gtacaaccct gaaattgcgc atgtgcagcc 2700
ggttcgccag gcgctgaaat tccccaccat cttcaacacg cttggaccat tgctgtcccc 2760
ggcgcgcccg gagcgtcaga tcatgggcgt ggccaatgcc aatcatggac agctcatcgc 2820
cgaggtcttc cgcgagttgg gccgtacacg cgcgcttgtt gtgcatggcg caggcaccga 2880
tgagatcgca gtccacggca ccaccttggt gtgggagctt aaagaagacg gcaccatcga 2940
gcattacacc atcgagcctg aggaccttgg ccttggccgc tacacccttg aggatctcgt 3000
gggtggcctc ggcactgaga acgccgaagc tatgcgcgct actttcgcgg gcaccggccc 3060
tgatgcacac cgtgatgcgt tggctgcgtc cgcaggtgcg atgttctatc tcaacggcga 3120
tgtcgactcc ttgaaggatg gtgcacaaaa ggcgctttcc ttgcttgccg acggcaccac 3180
ccaggcatgg ttggccaagc acgaagagat cgattactca gaaaaggagt cttccaatga 3240
ctagtaataa tctgcccacg gtgttggaaa gcatcgtgga gggtcgtcgc ggacacctgg 3300
aggaaattcg cgctcgcatc gctcacgtgg atgtggatgc gcttccaaaa tccacccgct 3360
ctctgttcga ttccctcaac cagggtaggg gaggggcgcg tttcatcatg gagtgcaagt 3420
ccgcatcgcc ttctttggga atgattcgtg agcactacca gccgggtgaa atcgctcgcg 3480
tgtactctcg ctacgccagc ggcatttccg tgctgtgcga gccggatcgt tttggtggcg 3540
attacgatca cctcgctacc gttgccgcta cctctcatct tccggtgctg tgcaaagact 3600
tcatcattga tcctgtccag gtacacgcgg cgcgttactt tggtgctgat gccatcctgc 3660
tcatgctctc tgtgcttgat gatgaagagt acgcagcact cgctgccgag gctgcgcgtt 3720
ttgatctgga tatcctcacc gaggttattg atgaggagga agtcgcccgc gccatcaagc 3780
tgggtgcgaa gatctttggc gtcaaccacc gcaacctgca tgatctgtcc attgatttgg 3840
atcgttcacg tcgcctgtcc aagctcattc cagcagatgc cgtgctcgtg tctgagtctg 3900
gcgtgcgcga taccgaaacc gtccgccagc taggtgggca ctccaatgca ttcctcgttg 3960
gctcccagct gaccagccag gaaaacgtcg atctggcagc ccgcgaattg gtctacggcc 4020
ccaacaaagt ctgcggactc acctcaccaa gtgcagcaca aaccgctcgc gcagcgggtg 4080
cggtctacgg cgggctcatc ttcgaagagg catcgccacg taatgtttca cgtgaaacat 4140
cgcaaaaaat catcgccgca gagcccaacc tgcgctacgt cgcggtcagc cgtcgcacct 4200
ccgggtacaa ggatttgctt gtcgacggca tcttcgccgt acaaatccac gccccactgc 4260
agggcagcgt cgaagcagaa aaggcattga tcgccgccgt tcgtgaagag gttggaccgc 4320
aggtccaggt ctggcgcgcg atctcgatgt ccagcccctt gggggctgaa gtggcagctg 4380
cggtggaggg tgacgtcgat aagctaattc ttgatgccca tgaaggtggc agcggggaag 4440
tattcgactg ggctacggtg ccggccgctg tgaaggcaaa gtctttgctc gcgggaggca 4500
tctctccgga caacgctgcg caggcactcg ctgtgggctg cgcaggttta gacatcaact 4560
ctggcgtgga ataccccgcc ggtgcaggca cgtgggctgg ggcgaaagat gccggcgcgc 4620
tgctgaaaat tttcgcgacc atctccacat tccattacta aaggtttaaa taggatcatg 4680
actgaaaaag aaaacttggg cggctccacg ctgctacctg catacttcgg tgaattcggc 4740
ggccagttcg tcgcggaatc cctcctgcct gctctcgacc agctggagaa ggccttcgtt 4800
gacgcgacca acagcccaga gttccgcgaa gaactcggcg gctacctccg cgattatctc 4860
ggccgcccaa ccccgctgac cgaatgctcc aacctgccac tcgcaggcga aggcaaaggc 4920
tttgcgcgga tcttcctcaa gcgcgaagac ctcgtccacg gcggtgcaca caaaactaac 4980
caggtgatcg gccaggtgct gcttgccaag cgcatgggca aaacccgcat catcgcagag 5040
accggcgcag gccagcacgg caccgccacc gctctcgcat gtgcgctcat gggcctcgag 5100
tgcgttgtct acatgggcgc caaggacgtt gcccgccagc agcccaacgt ctaccgcatg 5160
cagctgcacg gcgcgaaggt catccccgtg gaatctggtt ccggcaccct gaaggacgcc 5220
gtgaatgaag cgctgcgcga ttggaccgca accttccacg agtcccacta ccttctcggc 5280
accgccgccg gcccgcaccc attcccaacc atcgtgcgtg aattccacaa ggtgatctct 5340
gaggaagcca aggcacagat gctagagcgc accggcaagc ttcccgacgt tgtggtcgcc 5400
tgtgtcggtg gtggctccaa cgccatcggc atgttcgcag acttcattga cgatgaaggc 5460
gtagagctcg tcggcgctga gccagccggt gaaggcctcg actccggcaa gcacggcgca 5520
accatcacca acggtcagat cggcatcctg cacggcaccc gttcctacct gatgcgcaac 5580
tccgacggcc aagtggaaga gtcctactcc atctccgccg gacttgatta cccaggcgtc 5640
ggcccacagc acgcacacct gcacgccacc ggccgcgcca cctacgttgg tatcaccgac 5700
gccgaagccc tccaagcatt ccagtacctc gcccgctacg aaggcatcat ccccgcactg 5760
gaatcctcac acgcgttcgc ctacgcactc aagcgcgcca agaccgccga agaggaaggc 5820
cagaacttaa ccatcctcgt ctccctatcc ggccgtggcg acaaggacgt tgaccacgtg 5880
cgccgcaccc tcgaagaaaa tccagaactg atcctgaagg acaaccgatg agccgttacg 5940
acgatctttt tgcacgcctc gacacggcag gggagggcgc ctttgttccc ttcatcatgc 6000
tgagcgaccc ttcaccagag gaggctttcc agatcatctc cacagcaatc gaagctggcg 6060
cagatgcact ggaacttggc gtacctttct ccgacccagt tgccgatggc cccaccgtcg 6120
cggaatccca cctccgcgca ctcgacggcg gcgccaccgt agacagcgca ctcgagcaga 6180
tcaagcgcgt gcgcgcagcc tacccagagg ttcccatcgg aatgctcatc tacggcaacg 6240
ttcctttcac ccgtggcttg gatcgcttct accaagagtt cgctgaagct ggcgcagact 6300
ccatcctcct gccagacgtc ccagtccgcg aaggcgcacc gttttctgca gcagctgcag 6360
cagccggaat tgatcccatt tacatcgctc cggccaacgc cagcgagaaa accctcgagg 6420
gtgtctccgc cgcatcaaag ggctacatct acgccatctc ccgcgacggc gtcaccggca 6480
ccgaacgtga atcatccacc gacggcctgt ccgcagtggt ggacaacatc aagaaatttg 6540
atggcgcacc catcctcttg ggcttcggca tctcatcccc tcagcacgtg gcagacgcga 6600
ttgcagcggg tgcttccggt gcgatcacgg gttccgcgat caccaagatc attgcttccc 6660
actgcgaagg tgagcacccg aacccgtcca ccattcgaga tatggacggt ttgaagaagg 6720
atctcactga gttcatctct gcgatgaagg cagcgaccaa gaaggtttag 6770
<210> 35
<211> 518
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TrpE-cgl
<400> 35
Met Ser Thr Asn Pro His Val Phe Ser Leu Asp Val Arg Tyr His Glu
1 5 10 15
Asp Ala Ser Ala Leu Phe Ala His Leu Gly Gly Thr Thr Ala Asp Asp
20 25 30
Ala Ala Leu Leu Glu Arg Ala Asp Ile Thr Thr Lys Asn Gly Ile Ser
35 40 45
Ser Leu Ala Val Leu Lys Ser Ser Val Arg Ile Thr Cys Thr Gly Asn
50 55 60
Thr Val Val Thr Gln Pro Leu Thr Asp Ser Gly Arg Ala Val Val Ala
65 70 75 80
Arg Leu Thr Gln Gln Leu Gly Gln Tyr Asn Thr Ala Glu Asn Thr Phe
85 90 95
Ser Phe Pro Ala Ser Asp Ala Val Asp Glu Arg Glu Arg Leu Thr Ala
100 105 110
Pro Ser Thr Ile Glu Val Leu Arg Lys Leu Gln Phe Glu Ser Gly Tyr
115 120 125
Ser Asp Ala Ser Leu Pro Leu Leu Met Gly Gly Phe Ala Phe Asp Phe
130 135 140
Leu Glu Thr Phe Glu Thr Leu Pro Ala Val Glu Glu Ser Val Asn Thr
145 150 155 160
Tyr Pro Asp Tyr Gln Phe Val Leu Ala Glu Ile Val Leu Asp Ile Asn
165 170 175
His Gln Asp Gln Thr Ala Lys Leu Thr Gly Val Ser Asn Ala Pro Gly
180 185 190
Glu Leu Glu Ala Glu Leu Asn Lys Leu Ser Leu Leu Ile Asp Ala Ala
195 200 205
Leu Pro Ala Thr Glu His Ala Tyr Gln Thr Thr Pro His Asp Gly Asp
210 215 220
Thr Leu Arg Val Val Ala Asp Ile Pro Asp Ala Gln Phe Arg Thr Gln
225 230 235 240
Ile Asn Glu Leu Lys Glu Asn Ile Tyr Asn Gly Asp Ile Tyr Gln Val
245 250 255
Val Pro Ala Arg Thr Phe Thr Ala Pro Cys Pro Asp Ala Phe Ala Ala
260 265 270
Tyr Leu Gln Leu Arg Ala Thr Asn Pro Ser Pro Tyr Met Phe Tyr Ile
275 280 285
Arg Gly Leu Asn Glu Gly Arg Ser Tyr Glu Leu Phe Gly Ala Ser Pro
290 295 300
Glu Ser Asn Leu Lys Phe Thr Ala Ala Asn Arg Glu Leu Gln Leu Tyr
305 310 315 320
Pro Ile Ala Gly Thr Arg Pro Arg Gly Leu Asn Pro Asp Gly Ser Ile
325 330 335
Asn Asp Glu Leu Asp Ile Arg Asn Glu Leu Asp Met Arg Thr Asp Ala
340 345 350
Lys Glu Ile Ala Glu His Thr Met Leu Val Asp Leu Ala Arg Asn Asp
355 360 365
Leu Ala Arg Val Ser Val Pro Ala Ser Arg Arg Val Ala Asp Leu Leu
370 375 380
Gln Val Asp Arg Tyr Ser Arg Val Met His Leu Val Ser Arg Val Thr
385 390 395 400
Ala Thr Leu Asp Pro Glu Leu Asp Ala Leu Asp Ala Tyr Arg Ala Cys
405 410 415
Met Asn Met Gly Thr Leu Thr Gly Ala Pro Lys Leu Arg Ala Met Glu
420 425 430
Leu Leu Arg Gly Val Glu Lys Arg Arg Arg Gly Ser Tyr Gly Gly Ala
435 440 445
Val Gly Tyr Leu Arg Gly Asn Gly Asp Met Asp Asn Cys Ile Val Ile
450 455 460
Arg Ser Ala Phe Val Gln Asp Gly Val Ala Ala Val Gln Ala Gly Ala
465 470 475 480
Gly Val Val Arg Asp Ser Asn Pro Gln Ser Glu Ala Asp Glu Thr Leu
485 490 495
His Lys Ala Tyr Ala Val Leu Asn Ala Ile Ala Leu Ala Ala Gly Ser
500 505 510
Thr Leu Glu Val Ile Arg
515
<210> 36
<211> 208
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TrpG-cgl
<400> 36
Met Thr His Val Val Leu Ile Asp Asn His Asp Ser Phe Val Tyr Asn
1 5 10 15
Leu Val Asp Ala Phe Ala Val Ala Gly Tyr Lys Cys Thr Val Phe Arg
20 25 30
Asn Thr Val Pro Val Glu Thr Ile Leu Ala Ala Asn Pro Asp Leu Ile
35 40 45
Cys Leu Ser Pro Gly Pro Gly Tyr Pro Ala Asp Ala Gly Asn Met Met
50 55 60
Ala Leu Ile Glu Arg Thr Leu Gly Gln Ile Pro Leu Leu Gly Ile Cys
65 70 75 80
Leu Gly Tyr Gln Ala Leu Ile Glu Tyr His Gly Gly Lys Val Glu Pro
85 90 95
Cys Gly Pro Val His Gly Thr Thr Asp Asn Met Ile Leu Thr Asp Ala
100 105 110
Gly Val Gln Ser Pro Val Phe Ala Gly Leu Ala Thr Asp Val Glu Pro
115 120 125
Asp His Pro Glu Val Pro Gly Arg Lys Val Pro Ile Gly Arg Tyr His
130 135 140
Ser Leu Gly Cys Val Val Ala Pro Asp Gly Ile Glu Ser Leu Gly Thr
145 150 155 160
Cys Ser Ser Glu Ile Gly Asp Val Ile Met Ala Ala Arg Thr Thr Asp
165 170 175
Gly Lys Ala Ile Gly Leu Gln Phe His Pro Glu Ser Val Leu Ser Pro
180 185 190
Thr Gly Pro Ile Ile Leu Ser Arg Cys Val Glu Gln Leu Leu Ala Asn
195 200 205
<210> 37
<211> 348
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TrpD-cgl
<400> 37
Met Thr Ser Pro Ala Thr Leu Lys Val Leu Asn Ala Tyr Leu Asp Asn
1 5 10 15
Pro Thr Pro Thr Leu Glu Glu Ala Ile Glu Val Phe Thr Pro Leu Thr
20 25 30
Val Gly Glu Tyr Asp Asp Val His Ile Ala Ala Leu Leu Ala Thr Ile
35 40 45
Arg Thr Arg Gly Glu Gln Phe Ala Asp Ile Ala Gly Ala Ala Lys Ala
50 55 60
Phe Leu Ala Ala Ala Arg Pro Phe Pro Ile Thr Gly Ala Gly Leu Leu
65 70 75 80
Asp Ser Ala Gly Thr Gly Gly Asp Gly Ala Asn Thr Ile Asn Ile Thr
85 90 95
Thr Gly Ala Ser Leu Ile Ala Ala Ser Gly Gly Val Lys Leu Val Lys
100 105 110
His Gly Asn Arg Ser Val Ser Ser Lys Ser Gly Ser Ala Asp Val Leu
115 120 125
Glu Ala Leu Asn Ile Pro Leu Gly Leu Asp Val Asp Arg Ala Val Lys
130 135 140
Trp Phe Glu Ala Ser Asn Phe Thr Phe Leu Phe Ala Pro Ala Tyr Asn
145 150 155 160
Pro Glu Ile Ala His Val Gln Pro Val Arg Gln Ala Leu Lys Phe Pro
165 170 175
Thr Ile Phe Asn Thr Leu Gly Pro Leu Leu Ser Pro Ala Arg Pro Glu
180 185 190
Arg Gln Ile Met Gly Val Ala Asn Ala Asn His Gly Gln Leu Ile Ala
195 200 205
Glu Val Phe Arg Glu Leu Gly Arg Thr Arg Ala Leu Val Val His Gly
210 215 220
Ala Gly Thr Asp Glu Ile Ala Val His Gly Thr Thr Leu Val Trp Glu
225 230 235 240
Leu Lys Glu Asp Gly Thr Ile Glu His Tyr Thr Ile Glu Pro Glu Asp
245 250 255
Leu Gly Leu Gly Arg Tyr Thr Leu Glu Asp Leu Val Gly Gly Leu Gly
260 265 270
Thr Glu Asn Ala Glu Ala Met Arg Ala Thr Phe Ala Gly Thr Gly Pro
275 280 285
Asp Ala His Arg Asp Ala Leu Ala Ala Ser Ala Gly Ala Met Phe Tyr
290 295 300
Leu Asn Gly Asp Val Asp Ser Leu Lys Asp Gly Ala Gln Lys Ala Leu
305 310 315 320
Ser Leu Leu Ala Asp Gly Thr Thr Gln Ala Trp Leu Ala Lys His Glu
325 330 335
Glu Ile Asp Tyr Ser Glu Lys Glu Ser Ser Asn Asp
340 345
<210> 38
<211> 474
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> trpC-cgl
<400> 38
Met Thr Ser Asn Asn Leu Pro Thr Val Leu Glu Ser Ile Val Glu Gly
1 5 10 15
Arg Arg Gly His Leu Glu Glu Ile Arg Ala Arg Ile Ala His Val Asp
20 25 30
Val Asp Ala Leu Pro Lys Ser Thr Arg Ser Leu Phe Asp Ser Leu Asn
35 40 45
Gln Gly Arg Gly Gly Ala Arg Phe Ile Met Glu Cys Lys Ser Ala Ser
50 55 60
Pro Ser Leu Gly Met Ile Arg Glu His Tyr Gln Pro Gly Glu Ile Ala
65 70 75 80
Arg Val Tyr Ser Arg Tyr Ala Ser Gly Ile Ser Val Leu Cys Glu Pro
85 90 95
Asp Arg Phe Gly Gly Asp Tyr Asp His Leu Ala Thr Val Ala Ala Thr
100 105 110
Ser His Leu Pro Val Leu Cys Lys Asp Phe Ile Ile Asp Pro Val Gln
115 120 125
Val His Ala Ala Arg Tyr Phe Gly Ala Asp Ala Ile Leu Leu Met Leu
130 135 140
Ser Val Leu Asp Asp Glu Glu Tyr Ala Ala Leu Ala Ala Glu Ala Ala
145 150 155 160
Arg Phe Asp Leu Asp Ile Leu Thr Glu Val Ile Asp Glu Glu Glu Val
165 170 175
Ala Arg Ala Ile Lys Leu Gly Ala Lys Ile Phe Gly Val Asn His Arg
180 185 190
Asn Leu His Asp Leu Ser Ile Asp Leu Asp Arg Ser Arg Arg Leu Ser
195 200 205
Lys Leu Ile Pro Ala Asp Ala Val Leu Val Ser Glu Ser Gly Val Arg
210 215 220
Asp Thr Glu Thr Val Arg Gln Leu Gly Gly His Ser Asn Ala Phe Leu
225 230 235 240
Val Gly Ser Gln Leu Thr Ser Gln Glu Asn Val Asp Leu Ala Ala Arg
245 250 255
Glu Leu Val Tyr Gly Pro Asn Lys Val Cys Gly Leu Thr Ser Pro Ser
260 265 270
Ala Ala Gln Thr Ala Arg Ala Ala Gly Ala Val Tyr Gly Gly Leu Ile
275 280 285
Phe Glu Glu Ala Ser Pro Arg Asn Val Ser Arg Glu Thr Ser Gln Lys
290 295 300
Ile Ile Ala Ala Glu Pro Asn Leu Arg Tyr Val Ala Val Ser Arg Arg
305 310 315 320
Thr Ser Gly Tyr Lys Asp Leu Leu Val Asp Gly Ile Phe Ala Val Gln
325 330 335
Ile His Ala Pro Leu Gln Gly Ser Val Glu Ala Glu Lys Ala Leu Ile
340 345 350
Ala Ala Val Arg Glu Glu Val Gly Pro Gln Val Gln Val Trp Arg Ala
355 360 365
Ile Ser Met Ser Ser Pro Leu Gly Ala Glu Val Ala Ala Ala Val Glu
370 375 380
Gly Asp Val Asp Lys Leu Ile Leu Asp Ala His Glu Gly Gly Ser Gly
385 390 395 400
Glu Val Phe Asp Trp Ala Thr Val Pro Ala Ala Val Lys Ala Lys Ser
405 410 415
Leu Leu Ala Gly Gly Ile Ser Pro Asp Asn Ala Ala Gln Ala Leu Ala
420 425 430
Val Gly Cys Ala Gly Leu Asp Ile Asn Ser Gly Val Glu Tyr Pro Ala
435 440 445
Gly Ala Gly Thr Trp Ala Gly Ala Lys Asp Ala Gly Ala Leu Leu Lys
450 455 460
Ile Phe Ala Thr Ile Ser Thr Phe His Tyr
465 470
<210> 39
<211> 417
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TrpB-cgl
<400> 39
Met Thr Glu Lys Glu Asn Leu Gly Gly Ser Thr Leu Leu Pro Ala Tyr
1 5 10 15
Phe Gly Glu Phe Gly Gly Gln Phe Val Ala Glu Ser Leu Leu Pro Ala
20 25 30
Leu Asp Gln Leu Glu Lys Ala Phe Val Asp Ala Thr Asn Ser Pro Glu
35 40 45
Phe Arg Glu Glu Leu Gly Gly Tyr Leu Arg Asp Tyr Leu Gly Arg Pro
50 55 60
Thr Pro Leu Thr Glu Cys Ser Asn Leu Pro Leu Ala Gly Glu Gly Lys
65 70 75 80
Gly Phe Ala Arg Ile Phe Leu Lys Arg Glu Asp Leu Val His Gly Gly
85 90 95
Ala His Lys Thr Asn Gln Val Ile Gly Gln Val Leu Leu Ala Lys Arg
100 105 110
Met Gly Lys Thr Arg Ile Ile Ala Glu Thr Gly Ala Gly Gln His Gly
115 120 125
Thr Ala Thr Ala Leu Ala Cys Ala Leu Met Gly Leu Glu Cys Val Val
130 135 140
Tyr Met Gly Ala Lys Asp Val Ala Arg Gln Gln Pro Asn Val Tyr Arg
145 150 155 160
Met Gln Leu His Gly Ala Lys Val Ile Pro Val Glu Ser Gly Ser Gly
165 170 175
Thr Leu Lys Asp Ala Val Asn Glu Ala Leu Arg Asp Trp Thr Ala Thr
180 185 190
Phe His Glu Ser His Tyr Leu Leu Gly Thr Ala Ala Gly Pro His Pro
195 200 205
Phe Pro Thr Ile Val Arg Glu Phe His Lys Val Ile Ser Glu Glu Ala
210 215 220
Lys Ala Gln Met Leu Glu Arg Thr Gly Lys Leu Pro Asp Val Val Val
225 230 235 240
Ala Cys Val Gly Gly Gly Ser Asn Ala Ile Gly Met Phe Ala Asp Phe
245 250 255
Ile Asp Asp Glu Gly Val Glu Leu Val Gly Ala Glu Pro Ala Gly Glu
260 265 270
Gly Leu Asp Ser Gly Lys His Gly Ala Thr Ile Thr Asn Gly Gln Ile
275 280 285
Gly Ile Leu His Gly Thr Arg Ser Tyr Leu Met Arg Asn Ser Asp Gly
290 295 300
Gln Val Glu Glu Ser Tyr Ser Ile Ser Ala Gly Leu Asp Tyr Pro Gly
305 310 315 320
Val Gly Pro Gln His Ala His Leu His Ala Thr Gly Arg Ala Thr Tyr
325 330 335
Val Gly Ile Thr Asp Ala Glu Ala Leu Gln Ala Phe Gln Tyr Leu Ala
340 345 350
Arg Tyr Glu Gly Ile Ile Pro Ala Leu Glu Ser Ser His Ala Phe Ala
355 360 365
Tyr Ala Leu Lys Arg Ala Lys Thr Ala Glu Glu Glu Gly Gln Asn Leu
370 375 380
Thr Ile Leu Val Ser Leu Ser Gly Arg Gly Asp Lys Asp Val Asp His
385 390 395 400
Val Arg Arg Thr Leu Glu Glu Asn Pro Glu Leu Ile Leu Lys Asp Asn
405 410 415
Arg
<210> 40
<211> 280
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TrpA-cgl
<400> 40
Met Ser Arg Tyr Asp Asp Leu Phe Ala Arg Leu Asp Thr Ala Gly Glu
1 5 10 15
Gly Ala Phe Val Pro Phe Ile Met Leu Ser Asp Pro Ser Pro Glu Glu
20 25 30
Ala Phe Gln Ile Ile Ser Thr Ala Ile Glu Ala Gly Ala Asp Ala Leu
35 40 45
Glu Leu Gly Val Pro Phe Ser Asp Pro Val Ala Asp Gly Pro Thr Val
50 55 60
Ala Glu Ser His Leu Arg Ala Leu Asp Gly Gly Ala Thr Val Asp Ser
65 70 75 80
Ala Leu Glu Gln Ile Lys Arg Val Arg Ala Ala Tyr Pro Glu Val Pro
85 90 95
Ile Gly Met Leu Ile Tyr Gly Asn Val Pro Phe Thr Arg Gly Leu Asp
100 105 110
Arg Phe Tyr Gln Glu Phe Ala Glu Ala Gly Ala Asp Ser Ile Leu Leu
115 120 125
Pro Asp Val Pro Val Arg Glu Gly Ala Pro Phe Ser Ala Ala Ala Ala
130 135 140
Ala Ala Gly Ile Asp Pro Ile Tyr Ile Ala Pro Ala Asn Ala Ser Glu
145 150 155 160
Lys Thr Leu Glu Gly Val Ser Ala Ala Ser Lys Gly Tyr Ile Tyr Ala
165 170 175
Ile Ser Arg Asp Gly Val Thr Gly Thr Glu Arg Glu Ser Ser Thr Asp
180 185 190
Gly Leu Ser Ala Val Val Asp Asn Ile Lys Lys Phe Asp Gly Ala Pro
195 200 205
Ile Leu Leu Gly Phe Gly Ile Ser Ser Pro Gln His Val Ala Asp Ala
210 215 220
Ile Ala Ala Gly Ala Ser Gly Ala Ile Thr Gly Ser Ala Ile Thr Lys
225 230 235 240
Ile Ile Ala Ser His Cys Glu Gly Glu His Pro Asn Pro Ser Thr Ile
245 250 255
Arg Asp Met Asp Gly Leu Lys Lys Asp Leu Thr Glu Phe Ile Ser Ala
260 265 270
Met Lys Ala Ala Thr Lys Lys Val
275 280
<210> 41
<211> 2103
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Corynebacterium glutamicum tkt (polynucleotide)
<400> 41
ttgaccacct tgacgctgtc acctgaactt caggcgctca ctgtacgcaa ttacccctct 60
gattggtccg atgtggacac caaggctgta gacactgttc gtgtcctcgc tgcagacgct 120
gtagaaaact gtggctccgg ccacccaggc accgcaatga gcctggctcc ccttgcatac 180
accttgtacc agcgggttat gaacgtagat ccacaggaca ccgactgggc aggccgtgac 240
cgcttcgttc tttcttgtgg ccactcctct ttgacccagt acatccagct ttacttgggt 300
ggattcggcc ttgagatgga tgacctgaag gctctgcgca cctgggattc cttgacccca 360
ggacaccctg agtaccgcca caccaagggc gtagagatca ccactggccc tcttggccag 420
ggtcttgcat ctgcagttgg tatggccatg gctgctcgtc gtgagcgtgg cctattcgac 480
ccaaccgctg ctgagggcga atccccattc gaccaccaca tctacgtcat tgcttctgat 540
ggtgacctgc aggaaggtgt cacctctgag gcatcctcca tcgctggcac ccagcagctg 600
ggcaacctca tcgtgttctg ggatgacaac cgcatctcca tcgaagacaa cactgagatc 660
gctttcaacg aggacgttgt tgctcgttac aaggcttacg gctggcagac cattgaggtt 720
gaggctggcg aggacgttgc agcaatcgaa gctgcagtgg ctgaggctaa gaaggacacc 780
aagcgaccta ccttcatccg cgttcgcacc atcatcggct tcccagctcc aaccatgatg 840
aacaccggtg ctgtgcacgg tgctgctctt ggcgcagctg aggttgcagc aaccaagact 900
gagcttggat tcgatcctga ggctcacttc gcgatcgacg atgaggttat cgctcacacc 960
cgctccctcg cagagcgcgc tgcacagaag aaggctgcat ggcaggtcaa gttcgatgag 1020
tgggcagctg ccaaccctga gaacaaggct ctgttcgatc gcctgaactc ccgtgagctt 1080
ccagcgggct acgctgacga gctcccaaca tgggatgcag atgagaaggg cgtcgcaact 1140
cgtaaggctt ccgaggctgc acttcaggca ctgggcaaga cccttcctga gctgtggggc 1200
ggttccgctg acctcgcagg ttccaacaac accgtgatca agggctcccc ttccttcggc 1260
cctgagtcca tctccaccga gacctggtct gctgagcctt acggccgtaa cctgcacttc 1320
ggtatccgtg agcacgctat gggatccatc ctcaacggca tttccctcca cggtggcacc 1380
cgcccatacg gcggaacctt cctcatcttc tccgactaca tgcgtcctgc agttcgtctt 1440
gcagctctca tggagaccga cgcttactac gtctggaccc acgactccat cggtctgggc 1500
gaagatggcc caacccacca gcctgttgaa accttggctg cactgcgcgc catcccaggt 1560
ctgtccgtcc tgcgtcctgc agatgcgaac gagaccgccc aggcttgggc tgcagcactt 1620
gagtacaagg aaggccctaa gggtcttgca ctaacccgcc agaacattcc tgttctggaa 1680
ggcaccaagg agaaggctgc tgaaggcgtt cgccgcggtg gctacgtcct ggttgagggt 1740
tccaaggaaa ccccagatgt gatcctcatg ggctccggct ccgaggttca gcttgcagtt 1800
aacgctgcga aggctctgga agctgagggc gttgcagctc gcgttgtttc cgttccttgc 1860
atggattggt tccaggagca ggacgcagag tacatcgagt ccgttctgcc tgcagctgtg 1920
accgctcgtg tgtctgttga agctggcatc gcaatgcctt ggtaccgctt cttgggcacc 1980
cagggccgtg ctgtctccct tgagcacttc ggtgcttctg cggattacca gaccctgttt 2040
gagaagttcg gcatcaccac cgatgcagtc gtggcagcgg ccaaggactc cattaacggt 2100
taa 2103
<210> 42
<211> 700
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Corynebacterium glutamicum tkt (polypeptide)
<400> 42
Leu Thr Thr Leu Thr Leu Ser Pro Glu Leu Gln Ala Leu Thr Val Arg
1 5 10 15
Asn Tyr Pro Ser Asp Trp Ser Asp Val Asp Thr Lys Ala Val Asp Thr
20 25 30
Val Arg Val Leu Ala Ala Asp Ala Val Glu Asn Cys Gly Ser Gly His
35 40 45
Pro Gly Thr Ala Met Ser Leu Ala Pro Leu Ala Tyr Thr Leu Tyr Gln
50 55 60
Arg Val Met Asn Val Asp Pro Gln Asp Thr Asp Trp Ala Gly Arg Asp
65 70 75 80
Arg Phe Val Leu Ser Cys Gly His Ser Ser Leu Thr Gln Tyr Ile Gln
85 90 95
Leu Tyr Leu Gly Gly Phe Gly Leu Glu Met Asp Asp Leu Lys Ala Leu
100 105 110
Arg Thr Trp Asp Ser Leu Thr Pro Gly His Pro Glu Tyr Arg His Thr
115 120 125
Lys Gly Val Glu Ile Thr Thr Gly Pro Leu Gly Gln Gly Leu Ala Ser
130 135 140
Ala Val Gly Met Ala Met Ala Ala Arg Arg Glu Arg Gly Leu Phe Asp
145 150 155 160
Pro Thr Ala Ala Glu Gly Glu Ser Pro Phe Asp His His Ile Tyr Val
165 170 175
Ile Ala Ser Asp Gly Asp Leu Gln Glu Gly Val Thr Ser Glu Ala Ser
180 185 190
Ser Ile Ala Gly Thr Gln Gln Leu Gly Asn Leu Ile Val Phe Trp Asp
195 200 205
Asp Asn Arg Ile Ser Ile Glu Asp Asn Thr Glu Ile Ala Phe Asn Glu
210 215 220
Asp Val Val Ala Arg Tyr Lys Ala Tyr Gly Trp Gln Thr Ile Glu Val
225 230 235 240
Glu Ala Gly Glu Asp Val Ala Ala Ile Glu Ala Ala Val Ala Glu Ala
245 250 255
Lys Lys Asp Thr Lys Arg Pro Thr Phe Ile Arg Val Arg Thr Ile Ile
260 265 270
Gly Phe Pro Ala Pro Thr Met Met Asn Thr Gly Ala Val His Gly Ala
275 280 285
Ala Leu Gly Ala Ala Glu Val Ala Ala Thr Lys Thr Glu Leu Gly Phe
290 295 300
Asp Pro Glu Ala His Phe Ala Ile Asp Asp Glu Val Ile Ala His Thr
305 310 315 320
Arg Ser Leu Ala Glu Arg Ala Ala Gln Lys Lys Ala Ala Trp Gln Val
325 330 335
Lys Phe Asp Glu Trp Ala Ala Ala Asn Pro Glu Asn Lys Ala Leu Phe
340 345 350
Asp Arg Leu Asn Ser Arg Glu Leu Pro Ala Gly Tyr Ala Asp Glu Leu
355 360 365
Pro Thr Trp Asp Ala Asp Glu Lys Gly Val Ala Thr Arg Lys Ala Ser
370 375 380
Glu Ala Ala Leu Gln Ala Leu Gly Lys Thr Leu Pro Glu Leu Trp Gly
385 390 395 400
Gly Ser Ala Asp Leu Ala Gly Ser Asn Asn Thr Val Ile Lys Gly Ser
405 410 415
Pro Ser Phe Gly Pro Glu Ser Ile Ser Thr Glu Thr Trp Ser Ala Glu
420 425 430
Pro Tyr Gly Arg Asn Leu His Phe Gly Ile Arg Glu His Ala Met Gly
435 440 445
Ser Ile Leu Asn Gly Ile Ser Leu His Gly Gly Thr Arg Pro Tyr Gly
450 455 460
Gly Thr Phe Leu Ile Phe Ser Asp Tyr Met Arg Pro Ala Val Arg Leu
465 470 475 480
Ala Ala Leu Met Glu Thr Asp Ala Tyr Tyr Val Trp Thr His Asp Ser
485 490 495
Ile Gly Leu Gly Glu Asp Gly Pro Thr His Gln Pro Val Glu Thr Leu
500 505 510
Ala Ala Leu Arg Ala Ile Pro Gly Leu Ser Val Leu Arg Pro Ala Asp
515 520 525
Ala Asn Glu Thr Ala Gln Ala Trp Ala Ala Ala Leu Glu Tyr Lys Glu
530 535 540
Gly Pro Lys Gly Leu Ala Leu Thr Arg Gln Asn Ile Pro Val Leu Glu
545 550 555 560
Gly Thr Lys Glu Lys Ala Ala Glu Gly Val Arg Arg Gly Gly Tyr Val
565 570 575
Leu Val Glu Gly Ser Lys Glu Thr Pro Asp Val Ile Leu Met Gly Ser
580 585 590
Gly Ser Glu Val Gln Leu Ala Val Asn Ala Ala Lys Ala Leu Glu Ala
595 600 605
Glu Gly Val Ala Ala Arg Val Val Ser Val Pro Cys Met Asp Trp Phe
610 615 620
Gln Glu Gln Asp Ala Glu Tyr Ile Glu Ser Val Leu Pro Ala Ala Val
625 630 635 640
Thr Ala Arg Val Ser Val Glu Ala Gly Ile Ala Met Pro Trp Tyr Arg
645 650 655
Phe Leu Gly Thr Gln Gly Arg Ala Val Ser Leu Glu His Phe Gly Ala
660 665 670
Ser Ala Asp Tyr Gln Thr Leu Phe Glu Lys Phe Gly Ile Thr Thr Asp
675 680 685
Ala Val Val Ala Ala Ala Lys Asp Ser Ile Asn Gly
690 695 700
<210> 43
<211> 6531
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DNA sequence of tryptophan operon - Escherichia coli
<400> 43
atgcaaacac aaaaaccgac tctcgaactg ctaacctgcg aaggcgctta tcgcgacaat 60
tccaccgcgc tttttcacca gttgtgtggg gatcgtccgg caacgctgct gctggaatcc 120
gcagatatcg acagcaaaga tgatttaaaa agcctgctgc tggtagacag tgcgctgcgc 180
attacagctt taggtgacac tgtcacaatc caggcacttt ccggcaacgg cgaagccctc 240
ctggcactac tggataacgc cctgcctgcg ggtgtggaaa gtgaacaatc accaaactgc 300
cgtgtgctgc gcttcccccc tgtcagtcca ctgctggatg aagacgcccg cttatgctcc 360
ctttcggttt ttgacgcttt ccgtttattg cagaatctgt tgaatgtacc gaaggaagaa 420
cgagaagcca tgttcttcgg cggcctgttc tcttatgacc ttgtggcggg atttgaagat 480
ttaccgcaac tgtcagcgga aaataactgc cctgatttct gtttttatct cgctgaaacg 540
ctgatggtga ttgaccatca gaaaaaaagc acccgtattc aggccagcct gtttgctccg 600
aatgaagaag aaaaacaacg tctcactgct cgcctgaacg aactacgtca gcaactgacc 660
gaagccgcgc cgccgctgcc agtggtttcc gtgccgcata tgcgttgtga atgtaatcag 720
agcgatgaag agttcggtgg cgtagtgcgt ttgttgcaaa aagcgattcg cgctggagaa 780
attttccagg tggtgccatc tcgccgtttc tctctgccct gcccgtcacc gctggcggcc 840
tattacgtgc tgaaaaagag taatcccagc ccgtacatgt tttttatgca ggataatgat 900
ttcaccctat ttggcgcgtc gccggaaagc tcgctcaagt atgatgccac cagccgccag 960
attgagatct acccgattgc cggaacacgc ccacgcggtc gtcgcgccga tggttcactg 1020
gacagagatc tcgacagccg tattgaactg gaaatgcgta ccgatcataa agagctgtct 1080
gaacatctga tgctggttga tctcgcccgt aatgatctgg cacgcatttg cacccccggc 1140
agccgctacg tcgccgatct caccaaagtt gaccgttatt cctatgtgat gcacctcgtc 1200
tctcgcgtag tcggcgaact gcgtcacgat cttgacgccc tgcacgctta tcgcgcctgt 1260
atgaatatgg ggacgttaag cggtgcgccg aaagtacgcg ctatgcagtt aattgccgag 1320
gcggaaggtc gtcgccgcgg cagctacggc ggcgcggtag gttatttcac cgcgcatggc 1380
gatctcgaca cctgcattgt gatccgctcg gcgctggtgg aaaacggtat cgccaccgtg 1440
caagcgggtg ctggtgtagt ccttgattct gttccgcagt cggaagccga cgaaacccgt 1500
aacaaagccc gcgctgtact gcgcgctatt gccaccgcgc atcatgcaca ggagactttc 1560
tgatggctga cattctgctg ctcgataata tcgactcttt tacgtacaac ctggcagatc 1620
agttgcgcag caatgggcat aacgtggtga tttaccgcaa ccatattccg gcgcaaacct 1680
taattgaacg cctggcgacc atgagcaatc cggtgctgat gctttctcct ggccccggtg 1740
tgccgagcga agccggttgt atgccggaac tcctcacccg cttgcgtggc aagctgccca 1800
ttattggcat ttgcctcgga catcaggcga ttgtcgaagc ttacgggggc tatgtcggtc 1860
aggcgggcga aattctccac ggtaaagcct ccagcattga acatgacggt caggcgatgt 1920
ttgccggatt aacaaacccg ctgccggtgg cgcgttatca ctcgctggtt ggcagtaaca 1980
ttccggccgg tttaaccatc aacgcccatt ttaatggcat ggtgatggca gtacgtcacg 2040
atgcggatcg cgtttgtgga ttccagttcc atccggaatc cattctcacc acccagggcg 2100
ctcgcctgct ggaacaaacg ctggcctggg cgcagcagaa actagagcca gccaacacgc 2160
tgcaaccgat tctggaaaaa ctgtatcagg cgcagacgct tagccaacaa gaaagccacc 2220
agctgttttc agcggtggtg cgtggcgagc tgaagccgga acaactggcg gcggcgctgg 2280
tgagcatgaa aattcgcggt gagcacccga acgagatcgc cggggcagca accgcgctac 2340
tggaaaacgc agcgccgttc ccgcgcccgg attatctgtt tgctgatatc gtcggtactg 2400
gcggtgacgg cagcaacagt atcaatattt ctaccgccag tgcgtttgtc gccgcggcct 2460
gtgggctgaa agtggcgaaa cacggcaacc gtagcgtctc cagtaaatct ggttcgtccg 2520
atctgctggc ggcgttcggt attaatcttg atatgaacgc cgataaatcg cgccaggcgc 2580
tggatgagtt aggtgtatgt ttcctctttg cgccgaagta tcacaccgga ttccgccacg 2640
cgatgccggt tcgccagcaa ctgaaaaccc gcaccctgtt caatgtgctg gggccattga 2700
ttaacccggc gcatccgccg ctggcgttaa ttggtgttta tagtccggaa ctggtgctgc 2760
cgattgccga aaccttgcgc gtgctggggt atcaacgcgc ggcggtggtg cacagcggcg 2820
ggatggatga agtttcatta cacgcgccga caatcgttgc cgaactgcat gacggcgaaa 2880
ttaaaagcta tcagctcacc gcagaagact ttggcctgac accctaccac caggagcaac 2940
tggcaggcgg aacaccggaa gaaaaccgtg acattttaac acgtttgtta caaggtaaag 3000
gcgacgccgc ccatgaagca gccgtcgctg cgaacgtcgc catgttaatg cgcctgcatg 3060
gccatgaaga tctgcaagcc aatgcgcaaa ccgttcttga ggtactgcgc agtggttccg 3120
cttacgacag agtcaccgca ctggcggcac gagggtaaat gatgcaaacc gttttagcga 3180
aaatcgtcgc agacaaggcg atttgggtag aagcccgcaa acagcagcaa ccgctggcca 3240
gttttcagaa tgaggttcag ccgagcacgc gacattttta tgatgcgcta cagggtgcgc 3300
gcacggcgtt tattctggag tgcaagaaag cgtcgccgtc aaaaggcgtg atccgtgatg 3360
atttcgatcc agcacgcatt gccgccattt ataaacatta cgcttcggca atttcggtgc 3420
tgactgatga gaaatatttt caggggagct ttaatttcct ccccatcgtc agccaaatcg 3480
ccccgcagcc gattttatgt aaagacttca ttatcgaccc ttaccagatc tatctggcgc 3540
gctattacca ggccgatgcc tgcttattaa tgctttcagt actggacgac gaccaatatc 3600
gccagcttgc cgccgtcgct cacagtctgg agatgggggt gctgaccgaa gtcagtaatg 3660
aagaggaaca ggagcgcgcc attgcattgg gagcaaaggt cgttggcatc aacaaccgcg 3720
atctgcgtga tttgtcgatt gatctcaacc gtacccgcga gcttgcgccg aaactggggc 3780
acaacgtgac ggtaatcagc gaatccggca tcaatactta cgctcaggtg cgcgagttaa 3840
gccacttcgc taacggtttt ctgattggtt cggcgttgat ggcccatgac gatttgcacg 3900
ccgccgtgcg ccgggtgttg ctgggtgaga ataaagtatg tggcctgacg cgtgggcaag 3960
atgctaaagc agcttatgac gcgggcgcga tttacggtgg gttgattttt gttgcgacat 4020
caccgcgttg cgtcaacgtt gaacaggcgc aggaagtgat ggctgcggca ccgttgcagt 4080
atgttggcgt gttccgcaat cacgatattg ccgatgtggt ggacaaagct aaggtgttat 4140
cgctggcggc agtgcaactg catggtaatg aagaacagct gtatatcgat acgctgcgtg 4200
aagctctgcc agcacatgtt gccatctgga aagcattaag cgtcggtgaa accctgcccg 4260
cccgcgagtt tcagcacgtt gataaatatg ttttagacaa cggccagggt ggaagcgggc 4320
aacgttttga ctggtcacta ttaaatggtc aatcgcttgg caacgttctg ctggcggggg 4380
gcttaggcgc agataactgc gtggaagcgg cacaaaccgg ctgcgccgga cttgatttta 4440
attctgctgt agagtcgcaa ccgggcatca aagacgcacg tcttttggcc tcggttttcc 4500
agacgctgcg cgcatattaa ggaaaggaac aatgacaaca ttacttaacc cctattttgg 4560
tgagtttggc ggcatgtacg tgccacaaat cctgatgcct gctctgcgcc agctggaaga 4620
agcttttgtc agtgcgcaaa aagatcctga atttcaggct cagttcaacg acctgctgaa 4680
aaactatgcc gggcgtccaa ccgcgctgac caaatgccag aacattacag ccgggacgaa 4740
caccacgctg tatctcaagc gtgaagattt gctgcacggc ggcgcgcata aaactaacca 4800
ggtgctgggg caggcgttgc tggcgaagcg gatgggtaaa accgaaatca tcgccgaaac 4860
cggtgccggt cagcatggcg tggcgtcggc ccttgccagc gccctgctcg gcctgaaatg 4920
ccgtatttat atgggtgcca aagacgttga acgccagtcg cctaacgttt ttcgtatgcg 4980
cttaatgggt gcggaagtga tcccggtgca tagcggttcc gcgacgctga aagatgcctg 5040
taacgaggcg ctgcgcgact ggtccggtag ttacgaaacc gcgcactata tgctgggcac 5100
cgcagctggc ccgcatcctt atccgaccat tgtgcgtgag tttcagcgga tgattggcga 5160
agaaaccaaa gcgcagattc tggaaagaga aggtcgcctg ccggatgccg ttatcgcctg 5220
tgttggcggc ggttcgaatg ccatcggcat gtttgctgat ttcatcaatg aaaccaacgt 5280
cggcctgatt ggtgtggagc caggtggtca cggtatcgaa actggcgagc acggcgcacc 5340
gctaaaacat ggtcgcgtgg gtatctattt cggtatgaaa gcgccgatga tgcaaaccga 5400
agacgggcag attgaagaat cttactccat ctccgccgga ctggatttcc cgtctgtcgg 5460
cccacaacac gcgtatctta acagcactgg acgcgctgat tacgtgtcta ttaccgatga 5520
tgaagccctt gaagccttca aaacgctgtg cctgcacgaa gggatcatcc cggcgctgga 5580
atcctcccac gccctggccc atgcgttgaa aatgatgcgc gaaaacccgg ataaagagca 5640
gctactggtg gttaaccttt ccggtcgcgg cgataaagac atcttcaccg ttcacgatat 5700
tttgaaagca cgaggggaaa tctgatggaa cgctacgaat ctctgtttgc ccagttgaag 5760
gagcgcaaag aaggcgcatt cgttcctttc gtcacgctcg gtgatccggg cattgagcag 5820
tcattgaaaa ttatcgatac gctaattgaa gccggtgctg acgcgctgga gttaggtatc 5880
cccttctccg acccactggc ggatggcccg acgattcaaa acgccactct gcgcgccttt 5940
gcggcaggtg tgactccggc acaatgtttt gaaatgctgg cactgattcg ccagaaacac 6000
ccgaccattc ccattggcct gttgatgtat gccaatctgg tgtttaacaa aggcattgat 6060
gagttttatg cccagtgcga aaaagtcggc gtcgattcgg tgctggttgc cgatgtgcca 6120
gttgaagagt ccgcgccctt ccgccaggcc gcgttgcgtc ataatgtcgc acctatcttc 6180
atctgcccgc caaatgccga tgacgacctg ctgcgccaga tagcctctta cggtcgtggt 6240
tacacctatt tgctgtcacg agcaggcgtg accggcgcag aaaaccgcgc cgcgttaccc 6300
ctcaatcatc tggttgcgaa gctgaaagag tacaacgctg cacctccatt gcagggattt 6360
ggtatttccg ccccggatca ggtaaaagca gcgattgatg caggagctgc gggcgcgatt 6420
tctggttcgg ccattgttaa aatcatcgag caacatatta atgagccaga gaaaatgctg 6480
gcggcactga aagtttttgt acaaccgatg aaagcggcga cgcgcagtta a 6531
<210> 44
<211> 520
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TrpE-eco
<400> 44
Met Gln Thr Gln Lys Pro Thr Leu Glu Leu Leu Thr Cys Glu Gly Ala
1 5 10 15
Tyr Arg Asp Asn Ser Thr Ala Leu Phe His Gln Leu Cys Gly Asp Arg
20 25 30
Pro Ala Thr Leu Leu Leu Glu Ser Ala Asp Ile Asp Ser Lys Asp Asp
35 40 45
Leu Lys Ser Leu Leu Leu Val Asp Ser Ala Leu Arg Ile Thr Ala Leu
50 55 60
Gly Asp Thr Val Thr Ile Gln Ala Leu Ser Gly Asn Gly Glu Ala Leu
65 70 75 80
Leu Ala Leu Leu Asp Asn Ala Leu Pro Ala Gly Val Glu Ser Glu Gln
85 90 95
Ser Pro Asn Cys Arg Val Leu Arg Phe Pro Pro Val Ser Pro Leu Leu
100 105 110
Asp Glu Asp Ala Arg Leu Cys Ser Leu Ser Val Phe Asp Ala Phe Arg
115 120 125
Leu Leu Gln Asn Leu Leu Asn Val Pro Lys Glu Glu Arg Glu Ala Met
130 135 140
Phe Phe Gly Gly Leu Phe Ser Tyr Asp Leu Val Ala Gly Phe Glu Asp
145 150 155 160
Leu Pro Gln Leu Ser Ala Glu Asn Asn Cys Pro Asp Phe Cys Phe Tyr
165 170 175
Leu Ala Glu Thr Leu Met Val Ile Asp His Gln Lys Lys Ser Thr Arg
180 185 190
Ile Gln Ala Ser Leu Phe Ala Pro Asn Glu Glu Glu Lys Gln Arg Leu
195 200 205
Thr Ala Arg Leu Asn Glu Leu Arg Gln Gln Leu Thr Glu Ala Ala Pro
210 215 220
Pro Leu Pro Val Val Ser Val Pro His Met Arg Cys Glu Cys Asn Gln
225 230 235 240
Ser Asp Glu Glu Phe Gly Gly Val Val Arg Leu Leu Gln Lys Ala Ile
245 250 255
Arg Ala Gly Glu Ile Phe Gln Val Val Pro Ser Arg Arg Phe Ser Leu
260 265 270
Pro Cys Pro Ser Pro Leu Ala Ala Tyr Tyr Val Leu Lys Lys Ser Asn
275 280 285
Pro Ser Pro Tyr Met Phe Phe Met Gln Asp Asn Asp Phe Thr Leu Phe
290 295 300
Gly Ala Ser Pro Glu Ser Ser Leu Lys Tyr Asp Ala Thr Ser Arg Gln
305 310 315 320
Ile Glu Ile Tyr Pro Ile Ala Gly Thr Arg Pro Arg Gly Arg Arg Ala
325 330 335
Asp Gly Ser Leu Asp Arg Asp Leu Asp Ser Arg Ile Glu Leu Glu Met
340 345 350
Arg Thr Asp His Lys Glu Leu Ser Glu His Leu Met Leu Val Asp Leu
355 360 365
Ala Arg Asn Asp Leu Ala Arg Ile Cys Thr Pro Gly Ser Arg Tyr Val
370 375 380
Ala Asp Leu Thr Lys Val Asp Arg Tyr Ser Tyr Val Met His Leu Val
385 390 395 400
Ser Arg Val Val Gly Glu Leu Arg His Asp Leu Asp Ala Leu His Ala
405 410 415
Tyr Arg Ala Cys Met Asn Met Gly Thr Leu Ser Gly Ala Pro Lys Val
420 425 430
Arg Ala Met Gln Leu Ile Ala Glu Ala Glu Gly Arg Arg Arg Gly Ser
435 440 445
Tyr Gly Gly Ala Val Gly Tyr Phe Thr Ala His Gly Asp Leu Asp Thr
450 455 460
Cys Ile Val Ile Arg Ser Ala Leu Val Glu Asn Gly Ile Ala Thr Val
465 470 475 480
Gln Ala Gly Ala Gly Val Val Leu Asp Ser Val Pro Gln Ser Glu Ala
485 490 495
Asp Glu Thr Arg Asn Lys Ala Arg Ala Val Leu Arg Ala Ile Ala Thr
500 505 510
Ala His His Ala Gln Glu Thr Phe
515 520
<210> 45
<211> 531
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TrpD-eco
<400> 45
Met Ala Asp Ile Leu Leu Leu Asp Asn Ile Asp Ser Phe Thr Tyr Asn
1 5 10 15
Leu Ala Asp Gln Leu Arg Ser Asn Gly His Asn Val Val Ile Tyr Arg
20 25 30
Asn His Ile Pro Ala Gln Thr Leu Ile Glu Arg Leu Ala Thr Met Ser
35 40 45
Asn Pro Val Leu Met Leu Ser Pro Gly Pro Gly Val Pro Ser Glu Ala
50 55 60
Gly Cys Met Pro Glu Leu Leu Thr Arg Leu Arg Gly Lys Leu Pro Ile
65 70 75 80
Ile Gly Ile Cys Leu Gly His Gln Ala Ile Val Glu Ala Tyr Gly Gly
85 90 95
Tyr Val Gly Gln Ala Gly Glu Ile Leu His Gly Lys Ala Ser Ser Ile
100 105 110
Glu His Asp Gly Gln Ala Met Phe Ala Gly Leu Thr Asn Pro Leu Pro
115 120 125
Val Ala Arg Tyr His Ser Leu Val Gly Ser Asn Ile Pro Ala Gly Leu
130 135 140
Thr Ile Asn Ala His Phe Asn Gly Met Val Met Ala Val Arg His Asp
145 150 155 160
Ala Asp Arg Val Cys Gly Phe Gln Phe His Pro Glu Ser Ile Leu Thr
165 170 175
Thr Gln Gly Ala Arg Leu Leu Glu Gln Thr Leu Ala Trp Ala Gln Gln
180 185 190
Lys Leu Glu Pro Ala Asn Thr Leu Gln Pro Ile Leu Glu Lys Leu Tyr
195 200 205
Gln Ala Gln Thr Leu Ser Gln Gln Glu Ser His Gln Leu Phe Ser Ala
210 215 220
Val Val Arg Gly Glu Leu Lys Pro Glu Gln Leu Ala Ala Ala Leu Val
225 230 235 240
Ser Met Lys Ile Arg Gly Glu His Pro Asn Glu Ile Ala Gly Ala Ala
245 250 255
Thr Ala Leu Leu Glu Asn Ala Ala Pro Phe Pro Arg Pro Asp Tyr Leu
260 265 270
Phe Ala Asp Ile Val Gly Thr Gly Gly Asp Gly Ser Asn Ser Ile Asn
275 280 285
Ile Ser Thr Ala Ser Ala Phe Val Ala Ala Ala Cys Gly Leu Lys Val
290 295 300
Ala Lys His Gly Asn Arg Ser Val Ser Ser Lys Ser Gly Ser Ser Asp
305 310 315 320
Leu Leu Ala Ala Phe Gly Ile Asn Leu Asp Met Asn Ala Asp Lys Ser
325 330 335
Arg Gln Ala Leu Asp Glu Leu Gly Val Cys Phe Leu Phe Ala Pro Lys
340 345 350
Tyr His Thr Gly Phe Arg His Ala Met Pro Val Arg Gln Gln Leu Lys
355 360 365
Thr Arg Thr Leu Phe Asn Val Leu Gly Pro Leu Ile Asn Pro Ala His
370 375 380
Pro Pro Leu Ala Leu Ile Gly Val Tyr Ser Pro Glu Leu Val Leu Pro
385 390 395 400
Ile Ala Glu Thr Leu Arg Val Leu Gly Tyr Gln Arg Ala Ala Val Val
405 410 415
His Ser Gly Gly Met Asp Glu Val Ser Leu His Ala Pro Thr Ile Val
420 425 430
Ala Glu Leu His Asp Gly Glu Ile Lys Ser Tyr Gln Leu Thr Ala Glu
435 440 445
Asp Phe Gly Leu Thr Pro Tyr His Gln Glu Gln Leu Ala Gly Gly Thr
450 455 460
Pro Glu Glu Asn Arg Asp Ile Leu Thr Arg Leu Leu Gln Gly Lys Gly
465 470 475 480
Asp Ala Ala His Glu Ala Ala Val Ala Ala Asn Val Ala Met Leu Met
485 490 495
Arg Leu His Gly His Glu Asp Leu Gln Ala Asn Ala Gln Thr Val Leu
500 505 510
Glu Val Leu Arg Ser Gly Ser Ala Tyr Asp Arg Val Thr Ala Leu Ala
515 520 525
Ala Arg Gly
530
<210> 46
<211> 452
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TrpC-eco
<400> 46
Met Gln Thr Val Leu Ala Lys Ile Val Ala Asp Lys Ala Ile Trp Val
1 5 10 15
Glu Ala Arg Lys Gln Gln Gln Pro Leu Ala Ser Phe Gln Asn Glu Val
20 25 30
Gln Pro Ser Thr Arg His Phe Tyr Asp Ala Leu Gln Gly Ala Arg Thr
35 40 45
Ala Phe Ile Leu Glu Cys Lys Lys Ala Ser Pro Ser Lys Gly Val Ile
50 55 60
Arg Asp Asp Phe Asp Pro Ala Arg Ile Ala Ala Ile Tyr Lys His Tyr
65 70 75 80
Ala Ser Ala Ile Ser Val Leu Thr Asp Glu Lys Tyr Phe Gln Gly Ser
85 90 95
Phe Asn Phe Leu Pro Ile Val Ser Gln Ile Ala Pro Gln Pro Ile Leu
100 105 110
Cys Lys Asp Phe Ile Ile Asp Pro Tyr Gln Ile Tyr Leu Ala Arg Tyr
115 120 125
Tyr Gln Ala Asp Ala Cys Leu Leu Met Leu Ser Val Leu Asp Asp Asp
130 135 140
Gln Tyr Arg Gln Leu Ala Ala Val Ala His Ser Leu Glu Met Gly Val
145 150 155 160
Leu Thr Glu Val Ser Asn Glu Glu Glu Gln Glu Arg Ala Ile Ala Leu
165 170 175
Gly Ala Lys Val Val Gly Ile Asn Asn Arg Asp Leu Arg Asp Leu Ser
180 185 190
Ile Asp Leu Asn Arg Thr Arg Glu Leu Ala Pro Lys Leu Gly His Asn
195 200 205
Val Thr Val Ile Ser Glu Ser Gly Ile Asn Thr Tyr Ala Gln Val Arg
210 215 220
Glu Leu Ser His Phe Ala Asn Gly Phe Leu Ile Gly Ser Ala Leu Met
225 230 235 240
Ala His Asp Asp Leu His Ala Ala Val Arg Arg Val Leu Leu Gly Glu
245 250 255
Asn Lys Val Cys Gly Leu Thr Arg Gly Gln Asp Ala Lys Ala Ala Tyr
260 265 270
Asp Ala Gly Ala Ile Tyr Gly Gly Leu Ile Phe Val Ala Thr Ser Pro
275 280 285
Arg Cys Val Asn Val Glu Gln Ala Gln Glu Val Met Ala Ala Ala Pro
290 295 300
Leu Gln Tyr Val Gly Val Phe Arg Asn His Asp Ile Ala Asp Val Val
305 310 315 320
Asp Lys Ala Lys Val Leu Ser Leu Ala Ala Val Gln Leu His Gly Asn
325 330 335
Glu Glu Gln Leu Tyr Ile Asp Thr Leu Arg Glu Ala Leu Pro Ala His
340 345 350
Val Ala Ile Trp Lys Ala Leu Ser Val Gly Glu Thr Leu Pro Ala Arg
355 360 365
Glu Phe Gln His Val Asp Lys Tyr Val Leu Asp Asn Gly Gln Gly Gly
370 375 380
Ser Gly Gln Arg Phe Asp Trp Ser Leu Leu Asn Gly Gln Ser Leu Gly
385 390 395 400
Asn Val Leu Leu Ala Gly Gly Leu Gly Ala Asp Asn Cys Val Glu Ala
405 410 415
Ala Gln Thr Gly Cys Ala Gly Leu Asp Phe Asn Ser Ala Val Glu Ser
420 425 430
Gln Pro Gly Ile Lys Asp Ala Arg Leu Leu Ala Ser Val Phe Gln Thr
435 440 445
Leu Arg Ala Tyr
450
<210> 47
<211> 397
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> trpB-eco
<400> 47
Met Thr Thr Leu Leu Asn Pro Tyr Phe Gly Glu Phe Gly Gly Met Tyr
1 5 10 15
Val Pro Gln Ile Leu Met Pro Ala Leu Arg Gln Leu Glu Glu Ala Phe
20 25 30
Val Ser Ala Gln Lys Asp Pro Glu Phe Gln Ala Gln Phe Asn Asp Leu
35 40 45
Leu Lys Asn Tyr Ala Gly Arg Pro Thr Ala Leu Thr Lys Cys Gln Asn
50 55 60
Ile Thr Ala Gly Thr Asn Thr Thr Leu Tyr Leu Lys Arg Glu Asp Leu
65 70 75 80
Leu His Gly Gly Ala His Lys Thr Asn Gln Val Leu Gly Gln Ala Leu
85 90 95
Leu Ala Lys Arg Met Gly Lys Thr Glu Ile Ile Ala Glu Thr Gly Ala
100 105 110
Gly Gln His Gly Val Ala Ser Ala Leu Ala Ser Ala Leu Leu Gly Leu
115 120 125
Lys Cys Arg Ile Tyr Met Gly Ala Lys Asp Val Glu Arg Gln Ser Pro
130 135 140
Asn Val Phe Arg Met Arg Leu Met Gly Ala Glu Val Ile Pro Val His
145 150 155 160
Ser Gly Ser Ala Thr Leu Lys Asp Ala Cys Asn Glu Ala Leu Arg Asp
165 170 175
Trp Ser Gly Ser Tyr Glu Thr Ala His Tyr Met Leu Gly Thr Ala Ala
180 185 190
Gly Pro His Pro Tyr Pro Thr Ile Val Arg Glu Phe Gln Arg Met Ile
195 200 205
Gly Glu Glu Thr Lys Ala Gln Ile Leu Glu Arg Glu Gly Arg Leu Pro
210 215 220
Asp Ala Val Ile Ala Cys Val Gly Gly Gly Ser Asn Ala Ile Gly Met
225 230 235 240
Phe Ala Asp Phe Ile Asn Glu Thr Asn Val Gly Leu Ile Gly Val Glu
245 250 255
Pro Gly Gly His Gly Ile Glu Thr Gly Glu His Gly Ala Pro Leu Lys
260 265 270
His Gly Arg Val Gly Ile Tyr Phe Gly Met Lys Ala Pro Met Met Gln
275 280 285
Thr Glu Asp Gly Gln Ile Glu Glu Ser Tyr Ser Ile Ser Ala Gly Leu
290 295 300
Asp Phe Pro Ser Val Gly Pro Gln His Ala Tyr Leu Asn Ser Thr Gly
305 310 315 320
Arg Ala Asp Tyr Val Ser Ile Thr Asp Asp Glu Ala Leu Glu Ala Phe
325 330 335
Lys Thr Leu Cys Leu His Glu Gly Ile Ile Pro Ala Leu Glu Ser Ser
340 345 350
His Ala Leu Ala His Ala Leu Lys Met Met Arg Glu Asn Pro Asp Lys
355 360 365
Glu Gln Leu Leu Val Val Asn Leu Ser Gly Arg Gly Asp Lys Asp Ile
370 375 380
Phe Thr Val His Asp Ile Leu Lys Ala Arg Gly Glu Ile
385 390 395
<210> 48
<211> 268
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TrpA-eco
<400> 48
Met Glu Arg Tyr Glu Ser Leu Phe Ala Gln Leu Lys Glu Arg Lys Glu
1 5 10 15
Gly Ala Phe Val Pro Phe Val Thr Leu Gly Asp Pro Gly Ile Glu Gln
20 25 30
Ser Leu Lys Ile Ile Asp Thr Leu Ile Glu Ala Gly Ala Asp Ala Leu
35 40 45
Glu Leu Gly Ile Pro Phe Ser Asp Pro Leu Ala Asp Gly Pro Thr Ile
50 55 60
Gln Asn Ala Thr Leu Arg Ala Phe Ala Ala Gly Val Thr Pro Ala Gln
65 70 75 80
Cys Phe Glu Met Leu Ala Leu Ile Arg Gln Lys His Pro Thr Ile Pro
85 90 95
Ile Gly Leu Leu Met Tyr Ala Asn Leu Val Phe Asn Lys Gly Ile Asp
100 105 110
Glu Phe Tyr Ala Gln Cys Glu Lys Val Gly Val Asp Ser Val Leu Val
115 120 125
Ala Asp Val Pro Val Glu Glu Ser Ala Pro Phe Arg Gln Ala Ala Leu
130 135 140
Arg His Asn Val Ala Pro Ile Phe Ile Cys Pro Pro Asn Ala Asp Asp
145 150 155 160
Asp Leu Leu Arg Gln Ile Ala Ser Tyr Gly Arg Gly Tyr Thr Tyr Leu
165 170 175
Leu Ser Arg Ala Gly Val Thr Gly Ala Glu Asn Arg Ala Ala Leu Pro
180 185 190
Leu Asn His Leu Val Ala Lys Leu Lys Glu Tyr Asn Ala Ala Pro Pro
195 200 205
Leu Gln Gly Phe Gly Ile Ser Ala Pro Asp Gln Val Lys Ala Ala Ile
210 215 220
Asp Ala Gly Ala Ala Gly Ala Ile Ser Gly Ser Ala Ile Val Lys Ile
225 230 235 240
Ile Glu Gln His Ile Asn Glu Pro Glu Lys Met Leu Ala Ala Leu Lys
245 250 255
Val Phe Val Gln Pro Met Lys Ala Ala Thr Arg Ser
260 265
Claims (8)
- N-말단이 서열번호 32의 아미노산 서열로 구성되고 피드백 저해가 해제된 안스라닐산 합성효소를 코딩하는 유전자와 이를 포함하는 트립토판 오페론 및 트랜스케토라제를 코딩하는 유전자의 발현이 강화된, L-트립토판을 생산하는 코리네박테리움속 미생물.
- 제1항에 있어서, 상기 트립토판 오페론 발현의 강화는 트립토판 오페론의 프로모터가 강한 프로모터로 치환된, L-트립토판을 생산하는 코리네박테리움속 미생물.
- 제1항에 있어서, 상기 미생물은 추가적으로 N-말단이 서열번호 33의 아미노산 서열로 구성된 피드백 해제된 안스라닐산 합성효소를 코딩하는 유전자와 이를 포함하는 대장균 유래 트립토판 오페론이 도입되고 발현이 강화된, L-트립토판을 생산하는 코리네박테리움속 미생물.
- 제3항에 있어서, 상기 대장균 유래 트립토판 오페론은 트립토판 오페론의 프로모터가 강한 프로모터로 치환된, L-트립토판을 생산하는 코리네박테리움속 미생물.
- 제1항에 있어서, 상기 미생물은 코리네박테리움 글루타미쿰인, L-트립토판을 생산하는 코리네박테리움속 미생물.
- N-말단이 서열번호 32의 아미노산 서열로 구성되고 피드백 저해가 해제된 안스라닐산 합성효소를 코딩하는 유전자와 이를 포함하는 트립토판 오페론 및 트랜스케토라제를 코딩하는 유전자의 발현이 강화된 L-트립토판을 생산하는 코리네박테리움속 미생물을 배지에서 배양하는 단계; 및 상기 배양된 미생물 또는 배지로부터 L-트립토판을 회수하는 단계를 포함하는, L-트립토판 생산 방법.
- 제6항에 있어서, 상기 미생물은 추가적으로 N-말단이 서열번호 33의 아미노산 서열로 구성된 피드백 해제된 안스라닐산 합성효소를 코딩하는 유전자와 이를 포함하는 대장균 유래 트립토판 오페론이 발현되도록 변형된, L-트립토판 생산 방법.
- 제6항에 있어서, 상기 미생물은 코리네박테리움 글루타미쿰인, L-트립토판 생산 방법.
Priority Applications (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020180022057A KR102035844B1 (ko) | 2018-02-23 | 2018-02-23 | L-트립토판을 생산하는 재조합 코리네형 미생물 및 이를 이용한 l-트립토판을 생산하는 방법 |
PCT/KR2019/002236 WO2019164346A1 (ko) | 2018-02-23 | 2019-02-22 | L-트립토판을 생산하는 재조합 코리네형 미생물 및 이를 이용한 l-트립토판을 생산하는 방법 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020180022057A KR102035844B1 (ko) | 2018-02-23 | 2018-02-23 | L-트립토판을 생산하는 재조합 코리네형 미생물 및 이를 이용한 l-트립토판을 생산하는 방법 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
KR20180089329A true KR20180089329A (ko) | 2018-08-08 |
KR102035844B1 KR102035844B1 (ko) | 2019-10-23 |
Family
ID=63230232
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
KR1020180022057A KR102035844B1 (ko) | 2018-02-23 | 2018-02-23 | L-트립토판을 생산하는 재조합 코리네형 미생물 및 이를 이용한 l-트립토판을 생산하는 방법 |
Country Status (2)
Country | Link |
---|---|
KR (1) | KR102035844B1 (ko) |
WO (1) | WO2019164346A1 (ko) |
Cited By (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2019164346A1 (ko) * | 2018-02-23 | 2019-08-29 | 씨제이제일제당 (주) | L-트립토판을 생산하는 재조합 코리네형 미생물 및 이를 이용한 l-트립토판을 생산하는 방법 |
WO2020204427A1 (ko) * | 2019-04-05 | 2020-10-08 | 씨제이제일제당 (주) | 신규 l-트립토판 배출 단백질 변이체 및 이를 이용한 l-트립토판을 생산하는 방법 |
WO2020226341A1 (ko) | 2019-05-09 | 2020-11-12 | 씨제이제일제당 (주) | L-아미노산을 생산하는 미생물 및 이를 이용한 l-아미노산을 생산하는 방법 |
KR102284726B1 (ko) * | 2021-01-25 | 2021-08-02 | 씨제이제일제당 주식회사 | 신규한 타우토머레이즈 pptA 변이체 및 이를 이용한 L-트립토판 생산 방법 |
WO2021187781A1 (ko) * | 2020-03-17 | 2021-09-23 | 씨제이제일제당 (주) | 프리페네이트 디하이드라타아제 활성 강화를 통한 l-트립토판을 생산하는 방법 |
RU2795161C1 (ru) * | 2019-05-09 | 2023-04-28 | СиДжей ЧеилДжеданг Корпорейшн | Микроорганизм, продуцирующий l-аминокислоту, и способ получения l-аминокислоты с его использованием |
Families Citing this family (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR102649245B1 (ko) | 2021-03-08 | 2024-03-21 | 씨제이제일제당 주식회사 | L-아미노산을 생산하는 코리네박테리움 속 미생물 및 이를 이용한 l-아미노산의 생산방법 |
WO2023133484A1 (en) * | 2022-01-07 | 2023-07-13 | Ginkgo Bioworks, Inc. | Skin commensal bacteria engineered to produce anthranilate or derivatives thereof |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPS60176593A (ja) | 1984-02-22 | 1985-09-10 | Kyowa Hakko Kogyo Co Ltd | L−トリプトフアンの製造法 |
US20100028956A1 (en) * | 2006-12-29 | 2010-02-04 | Cj Cheiljedang Corporation | Genetically engineered recombinant escherichia coli producing l-tryptophan having originally l-phenylalanine productivity, and method for producing l-tryptophan using the microorganism |
US20100159523A1 (en) * | 2001-08-06 | 2010-06-24 | Evonik Degussa Gmbh | Coryneform Bacteria Which Produce Chemical Compounds I |
KR101783170B1 (ko) * | 2016-08-31 | 2017-09-29 | 씨제이제일제당 (주) | 신규 프로모터 및 이의 용도 |
Family Cites Families (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
HUE057864T2 (hu) * | 2012-01-10 | 2022-06-28 | Cj Cheiljedang Corp | Fokozott L-triptofán termeléssel rendelkezõ Escherichia coli mikroorganizmusok és eljárás L-triptofán elõállítására azok alkalmazásával |
KR102035844B1 (ko) * | 2018-02-23 | 2019-10-23 | 씨제이제일제당 주식회사 | L-트립토판을 생산하는 재조합 코리네형 미생물 및 이를 이용한 l-트립토판을 생산하는 방법 |
-
2018
- 2018-02-23 KR KR1020180022057A patent/KR102035844B1/ko active IP Right Grant
-
2019
- 2019-02-22 WO PCT/KR2019/002236 patent/WO2019164346A1/ko active Application Filing
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPS60176593A (ja) | 1984-02-22 | 1985-09-10 | Kyowa Hakko Kogyo Co Ltd | L−トリプトフアンの製造法 |
US20100159523A1 (en) * | 2001-08-06 | 2010-06-24 | Evonik Degussa Gmbh | Coryneform Bacteria Which Produce Chemical Compounds I |
US20100028956A1 (en) * | 2006-12-29 | 2010-02-04 | Cj Cheiljedang Corporation | Genetically engineered recombinant escherichia coli producing l-tryptophan having originally l-phenylalanine productivity, and method for producing l-tryptophan using the microorganism |
KR101783170B1 (ko) * | 2016-08-31 | 2017-09-29 | 씨제이제일제당 (주) | 신규 프로모터 및 이의 용도 |
Cited By (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2019164346A1 (ko) * | 2018-02-23 | 2019-08-29 | 씨제이제일제당 (주) | L-트립토판을 생산하는 재조합 코리네형 미생물 및 이를 이용한 l-트립토판을 생산하는 방법 |
WO2020204427A1 (ko) * | 2019-04-05 | 2020-10-08 | 씨제이제일제당 (주) | 신규 l-트립토판 배출 단백질 변이체 및 이를 이용한 l-트립토판을 생산하는 방법 |
KR20200118334A (ko) * | 2019-04-05 | 2020-10-15 | 씨제이제일제당 (주) | 신규 l-트립토판 배출 단백질 변이체 및 이를 이용한 l-트립토판을 생산하는 방법 |
CN112823165A (zh) * | 2019-04-05 | 2021-05-18 | Cj第一制糖株式会社 | 新型l-色氨酸输出蛋白变体及使用其生产l-色氨酸的方法 |
US11524981B2 (en) | 2019-04-05 | 2022-12-13 | Cj Cheiljedang Corporation | L-tryptophan-exporting protein variant and method for producing L-tryptophan using the same |
CN112823165B (zh) * | 2019-04-05 | 2024-03-26 | Cj第一制糖株式会社 | 新型l-色氨酸输出蛋白变体及使用其生产l-色氨酸的方法 |
WO2020226341A1 (ko) | 2019-05-09 | 2020-11-12 | 씨제이제일제당 (주) | L-아미노산을 생산하는 미생물 및 이를 이용한 l-아미노산을 생산하는 방법 |
RU2795161C1 (ru) * | 2019-05-09 | 2023-04-28 | СиДжей ЧеилДжеданг Корпорейшн | Микроорганизм, продуцирующий l-аминокислоту, и способ получения l-аминокислоты с его использованием |
WO2021187781A1 (ko) * | 2020-03-17 | 2021-09-23 | 씨제이제일제당 (주) | 프리페네이트 디하이드라타아제 활성 강화를 통한 l-트립토판을 생산하는 방법 |
KR102284726B1 (ko) * | 2021-01-25 | 2021-08-02 | 씨제이제일제당 주식회사 | 신규한 타우토머레이즈 pptA 변이체 및 이를 이용한 L-트립토판 생산 방법 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO2019164346A1 (ko) | 2019-08-29 |
KR102035844B1 (ko) | 2019-10-23 |
WO2019164346A8 (ko) | 2020-09-24 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
KR102035844B1 (ko) | L-트립토판을 생산하는 재조합 코리네형 미생물 및 이를 이용한 l-트립토판을 생산하는 방법 | |
CN111315876B (zh) | Atp磷酸核糖基转移酶突变体以及使用该突变体生产l-组氨酸的方法 | |
US11667936B2 (en) | Modified polypeptide with attenuated activity of citrate synthase and method for producing L-amino acid using the same | |
EP1482055B1 (en) | Method for producing cadaverine dicarboxylate and its use for the production of nylon | |
KR101592140B1 (ko) | 자일로즈 이용능이 부여된 코리네박테리움 속 미생물 및 이를 이용한 l-라이신의 생산방법 | |
KR102205717B1 (ko) | 신규 l-트립토판 배출 단백질 변이체 및 이를 이용한 l-트립토판을 생산하는 방법 | |
KR101968317B1 (ko) | 신규 l-트립토판 배출 단백질 및 이를 이용한 l-트립토판을 생산하는 방법 | |
AU2019243241A1 (en) | A Novel Promoter And A Method For Producing L-Amino Acid Using The Same | |
KR102126951B1 (ko) | 디하이드로디피콜린산 리덕타제 변이형 폴리펩티드 및 이를 이용한 l-쓰레오닌 생산방법 | |
KR101937569B1 (ko) | 신규 폴리펩타이드 및 이를 이용한 오르니틴계 산물 생산방법 | |
AU2020268059B2 (en) | Microorganism Producing L-Amino Acid And Method Of Producing L-Amino Acid Using The Same | |
KR20190065984A (ko) | L-히스티딘 생산능이 강화된 미생물 및 이를 이용한 히스티딘 생산방법 | |
JP2024112996A (ja) | 新規l-チロシン排出タンパク質変異体及びそれを用いてl-チロシンを生産する方法 | |
KR101941775B1 (ko) | 신규 폴리펩타이드 및 이를 이용한 오르니틴계 산물 생산방법 | |
JP7371119B2 (ja) | グルタミンシンテターゼ変異型ポリペプチド及びそれを用いたl-グルタミン生産方法 | |
CN116917473A (zh) | 预苯酸脱水酶变体以及使用其生产支链氨基酸的方法 | |
JP4495788B2 (ja) | 温度感受性dtsR遺伝子 | |
KR20070116187A (ko) | 메틸로필루스 메틸로트로푸스로부터 유도된 신규한 효소 및이를 암호화하는 유전자 | |
CN115052976B (zh) | 新型乙酰羟酸合酶变体和包括其的微生物 | |
KR102285951B1 (ko) | 시트레이트 신타아제의 활성이 약화된 신규한 변이형 폴리펩티드 및 이를 이용한 l-아미노산 생산 방법 | |
CN111944781A (zh) | 一种突变的高丝氨酸激酶及其应用 | |
RU2805253C1 (ru) | Новый модифицированный полипептид с ослабленной активностью цитратсинтазы и способ получения L-аминокислоты с его использованием | |
CN118632927A (zh) | 新型乙酰羟酸合成酶突变体和使用其的l-异亮氨酸产生方法 | |
CN118647712A (zh) | 新型乙酰羟酸合成酶变体和使用其产生l-异亮氨酸的方法 | |
KR20220107795A (ko) | aroG 알돌라아제 (Phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase) 변이체 및 이를 이용한 분지쇄 아미노산 생산 방법 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
G15R | Request for early opening | ||
E902 | Notification of reason for refusal | ||
E701 | Decision to grant or registration of patent right | ||
GRNT | Written decision to grant |