KR20160113700A - 천식 폐에서의 il-13 활성화의 말초 바이오마커로서의 디펩티딜 펩티다제-4(dpp4/cd26) - Google Patents

천식 폐에서의 il-13 활성화의 말초 바이오마커로서의 디펩티딜 펩티다제-4(dpp4/cd26) Download PDF

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이홍 야오
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인나 바인슈테인
에드워드 피퍼
리차드 메이
라스 노덴마크
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Abstract

본 개시내용은, IL-13 매개 질환 또는 장애, 예를 들면, 천식, IPF, COPD 또는 아토피성 피부염에 대한 바이오마커로서의 DPP4, 단백질 또는 유전자 발현 수준의 용도에 관한 것이다. 소정의 DPP4 역치 수준 초과 또는 미만의 DPP4 바이오마커의 수준은 (i) IL-13 길항제를 사용한 치료에 대한 환자의 적격성을 확인하거나, (ii) 특정 IL-13 길항제를 사용한 IL-13 매개 질환 또는 장애의 치료가 시작되어야 하는지, 중단되어야 하는지 아니면 변경되어야 하는지를 결정하거나, (ii) IL-13 매개 질환 또는 장애가 특정 IL-13 길항제로 치료될 수 있는지 아니면 치료될 수 없는지를 진단하거나, (iv) IL-13 매개 질환 또는 장애를 특정 IL-13 길항제로 치료한 결과를 예후하는 데에 사용될 수 있다. 본 개시내용은 DPP4의 검출을 위한 분석 키트뿐만 아니라 컴퓨터 구현 진단 방법도 제공한다.

Description

천식 폐에서의 IL-13 활성화의 말초 바이오마커로서의 디펩티딜 펩티다제-4(DPP4/CD26){DIPEPTIDYL PEPTIDASE-4 (DPP4/CD26) AS A PERIPHERAL BIOMARKER OF IL-13 ACTIVATION IN ASTHMATIC LUNG}
전자적으로 제출된 서열목록의 언급
본원과 함께 출원된, ASCII 텍스트 파일(명칭: IL13-400WO_Sequence_Listing_ascii.txt; 크기: 174,694 바이트; 및 생성일: 2015년 1월 15일) 형식의 전자적으로 제출된 서열목록의 내용은 전체적으로 본원에 참고로 도입된다.
기관지 천식은 기도 과민성, 점액 과다생성, 섬유증 및 상승된 혈청 IgE 수준을 특징으로 하는 폐의 흔한 지속성 염증 질환이다. 기도 과민성(AHR)은 비특이적 자극, 예컨대, 차가운 공기에 대한 기도의 과도한 수축이다. AHR 및 점액 과다생성 둘 다가 천식 발작의 호흡곤란 특징(악화)을 유발하고 이 질환과 관련된 사망의 원인인 가변 기도 폐쇄의 원인인 것으로 생각된다.
현재 영국 흉부 협회(BTS) 및 세계 천식 기구(GINA) 지침은 천식의 치료에의 단계적 접근을 제안한다(Society, B. T., Thorax, 2003. 58 Suppl 1:1-94; GINA, Global Strategy for Asthma Management and Prevention. 2002, National Institute of Health). 경증 내지 중증도 천식은 통상적으로 베타-효현제(agonists) 또는 류코트리엔(leukotriene) 억제제와 함께 흡입 코르티코스테로이드(corticosteroid)의 사용에 의해 조절될 수 있다. 그러나, 코르티코스테로이드의 보고된 부작용으로 인해 환자는 치료법에 순응하지 않는 경향을 나타내고, 이것은 치료의 효과를 감소시킨다(Milgrom, H. et al. Ann Allergy Asthma Immunol, 2002. 88:429-31; Fish, L. and C. L. Lung, Ann Allergy Asthma Immunol, 2001. 86:24-30; Bender, B. G. J. Allergy Clin. Immunol, 2002. 109:S554-9). 천식은 다양한 치료들에 반응하여 상당한 불균질성을 제시함으로써, 이 질환에 대한 보다 효과적인 요법을 개발하거나 특정 요법에 대한 반응을 예측하는 바이오마커를 확인할 필요성을 강조한다.
아토피성 피부염은 다른 아토피성 장애, 예컨대, 알레르기성 비염 및 천식과 종종 관련되어 있는 흔한 만성 염증성 피부 질환이다(Bieber, New England Journal of Medicine, 2008, 358: 1483-1494). IL-13 mRNA의 상향조절은 아토피성 피부염의 아급성 병변 및 만성 병변에서 관찰되어 왔다(Tazawa et al., Arch. Dermatol. Res., 2004, 295:459-464; Purwar et al,, J. Invest. Derm., 2006, 126, 1043-1051; Oh et al., J Immunol., 2011, 186:7232-42).
만성 폐쇄성 폐 질환(COPD)은 다양한 정도의 만성 기관지염, 소기도 질환 및 폐기종을 가진 환자 집단을 포함하고 현재 천식 기반 요법에 잘 반응하지 않는 진행성 비가역적 폐 기능 감퇴를 특징으로 한다. COPD의 근본적인 원인은 잘 이해되어 있지 않은 상태로 남아있다. 문헌(Zheng et al., J Clin Invest, 106: 1081-93, 2000)의 저자들은 마우스 폐에서의 IL-13의 과다발현이 인간 COPD의 양태들을 반영하는 폐기종, 상승된 점액 생성 및 염증을 야기하였다는 것을 입증하였다. 뿐만 아니라, 알레르기성 염증의 뮤린 모델에서 IL-13 의존적 반응인 AHR은 흡연자들에서 폐 기능 감퇴의 전조가 되는 것으로 밝혀졌다(Tashkin et al., Am J Respir Crit Care Med, 153(6 Pt 1): 1802-11, 1996). IL-13 프로모터 다형성과 COPD를 발생시킬 민감성 사이에도 연관성이 확립되어 있다(Van Der Pouw Kraan et al., Genes Immun. 3: 436-9, 2002). 따라서, 징후들은 IL-4/IL-13 경로, 특히 IL-13이 COPD의 발병기전에서 중요한 역할을 수행한다는 것이다. 예를 들면, 문헌(Chen et al. PLoS One 8:e68222, 2013); 문헌(Dente et al., Respiration 84:98-100, 2012); 문헌(Grubek-Jaworska et al., Respiration 84:101-107, 2012); 및 문헌(Walsh, Curr. Opin. Investig. Drugs 11:1305-12, 2010)(이들 모두가 전체적으로 본원에 참고로 도입됨)을 참조한다.
인터류킨(IL-13)은 대략 12 kDa의 비변경된 분자 질량을 가진 114 아미노산 사이토카인이다(McKenzie, A. N., et al. J Immunol, 1993. 150:5436-44; Minty, A., et al. Nature, 1993. 362:248-50). IL-13 수준은 천식 환자들 및 알레르기성 염증의 설치류 모델에서 질환 중증도와 상관관계를 갖는 것으로 밝혀졌다(2012년 3월 1일자로 공개되었고 전체적으로 본원에 참고로 도입되는 미국 특허출원 공보 제2012-0052060호 참조). IL-13은 염증성 장 질환의 발병기전에서 일정할 역할을 할 수도 있고 섬유증성 질환, 예컨대, 특발성 폐 섬유증(IPF)과 관련되어 있다. 항-IL-13 항체는 중등도 내지 중증 천식을 가진 환자의 치료를 위한 요법으로서 현재 개발되어 있다. 그러나, 천식 환자들의 서브세트만이 IL-13에 의해 유발된 질환을 갖는 듯하다. 따라서, 단순한 바이오마커 또는 바이오마커들의 조합물을 사용하여 이러한 환자를 확인하고 IL-13 길항제, 예컨대, 항-IL-13 항체를 사용한 치료의 결과를 예측할 필요성이 존재한다.
본 개시내용은, 인터류킨-13(IL-13) 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법으로서, 상기 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4(디펩티딜 펩티다제-4)의 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우, IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는 방법을 제공한다. (a) 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4의 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하고, (b) 환자가 (i) 높은 페리오스틴(periostin)(≥ 중간 혈청 페리오스틴 또는 약 23 ng/㎖), (ii) 높은 호산구 세포 카운트(혈액 호산구 카운트 ≥ 300개 세포/㎕), (iii) 높은 Th2(IgE > 100 IU/㎖ 및 혈액 호산구 ≥ 0.14 X 109/ℓ로서 정의된 높은 Th2), (iv) 단기 작용 β2 효현제에 대한 FEV1 가역성(reversibility) ≥ 12%, (v) 폐의 CT 스캔을 통해 측정된 약 68% 초과의 세분절(subsegmental) 기도의 벽 면적 %(WA%) 또는 (vi) 이들의 조합을 나타내는 경우, IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 인터류킨-13(IL-13) 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법도 제공된다.
추가로, 본 개시내용은 (a) 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4의 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하고, (b) 환자가 높은 페리오스틴(≥ 중간 혈청 페리오스틴 또는 약 23 ng/㎖)을 나타내는 경우, IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 인터류킨-13(IL-13) 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법을 제공한다. (a) 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4의 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하고, (b) 환자가 높은 호산구 세포 카운트(혈액 호산구 카운트 ≥ 300개 세포/㎕)를 나타내는 경우, IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 인터류킨-13(IL-13) 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법도 제공된다. (a) 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4의 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하고, (b) 환자가 높은 Th2(IgE > 100 IU/㎖ 및 혈액 호산구 ≥ 0.14 X 109/ℓ로서 정의된 높은 Th2)를 나타내는 경우, IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 인터류킨-13(IL-13) 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법도 제공된다. (a) 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4의 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하고, (b) 환자가 단기 작용 β2 효현제에 대한 FEV1 가역성 ≥ 12%를 나타내는 경우, IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 인터류킨-13(IL-13) 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법도 제공된다. (a) 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4의 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하고, (b) 환자가 (i) 높은 페리오스틴(≥ 중간 혈청 페리오스틴 또는 약 23 ng/㎖), (ii) 높은 호산구 세포 카운트(혈액 호산구 카운트 ≥ 300개 세포/㎕), (iii) 높은 Th2(IgE > 100 IU/㎖ 및 혈액 호산구 ≥ 0.14 X 109/ℓ로서 정의된 높은 Th2), (iv) 단기 작용 β2 효현제에 대한 FEV1 가역성 ≥ 12%, 및 (v) 폐의 CT 스캔을 통해 측정된 약 68% 초과의 세분절 기도의 벽 면적 %(WA%) 중 하나 이상을 나타내는 경우, IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 인터류킨-13(IL-13) 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법도 제공된다.
추가로, 본 개시내용은 (a) 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4의 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하고, (b) 환자가 소정의 바이오마커 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 바이오마커 수준을 초과하는 하나 이상의 추가 바이오마커의 수준을 상기 환자로부터 채취된 샘플에서 나타내는 경우, IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 인터류킨-13(IL-13) 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법으로서, 상기 추가 바이오마커가 POSTN(서열번호 8), CSTl(서열번호 9), CCL26(서열번호 10), CLCA1(서열번호 11), CST2(서열번호 12), PRR4(서열번호 13), SERPINB2(서열번호 14), CEACAM5(서열번호 15), iNOS(서열번호 16), SERPINB4(서열번호 17), CST4(서열번호 18), PRB4(서열번호 19), TPSD1(서열번호 20), TPSG1(서열번호 21), MFSD2(서열번호 22), CPA3(서열번호 23), GPR105(서열번호 24), CDH26(서열번호 25), GSN(서열번호 26), C2ORF32(서열번호 27), TRACH2000196(TMEM71)(서열번호 28), DNAJC12(서열번호 29), RGS13(서열번호 30), SLC18A2(서열번호 31), SERPINB10(서열번호 32), SH3RF2(서열번호 33), FCER1B(서열번호 34), RUNX2(서열번호 35), PTGS1(서열번호 36), ALOX15(서열번호 37), 및 이들의 조합으로 구성된 군으로부터 선택되는 것인 방법을 제공한다.
본원에 개시된 방법들의 일부 양태들에서, 샘플은 환자로부터 수득되고 샘플 중의 DPP4의 수준의 측정을 위해 제출된다. 다른 양태들에서, 환자의 DPP4 수준은 면역분석으로 측정된다. 일부 양태들에서, 면역분석은 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 사용한다.
(a) 샘플 중의 DPP4 수준의 측정을 위해 환자로부터 채취된 샘플을 제출하는 단계로서, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석에서 상기 환자의 DPP4 수준을 측정하는 것인 단계; 및 (b) 상기 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법도 제공된다. (a) IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자로부터 얻은 샘플 중의 DPP4 수준을 측정하는 단계로서, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석에서 상기 샘플 중의 환자의 DPP4 수준을 측정하는 단계; (b) 상기 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는지를 확인하는 단계; 및 (c) 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하도록 건강관리 제공자에게 조언하는 단계를 포함하는, IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법도 제공된다.
상기 개시된 방법들의 일부 양태들에서, IL-13 매개 질환 또는 장애는 폐 질환 또는 장애, 염증성 장 질환 또는 장애, 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애이다. 다른 양태들에서, 폐 질환 또는 장애는 천식 또는 알레르기성 비염이다. 일부 양태들에서, 만성 염증성 피부 질환 또는 장애는 아토피성 피부염이다. 일부 양태들에서, 폐 질환 또는 장애는 COPD이다. 일부 양태들에서, COPD는 안정한 COPD 또는 COPD의 급성 악화(AECOPD)이다.
본 개시내용은 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 폐 질환 또는 장애로 진단받은 환자를 치료하는 방법도 제공한다. 일부 양태들에서, 환자의 DPP4 수준은 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석으로 측정된다.
(a) 샘플 중의 DPP4 수준의 측정을 위해 환자로부터 채취된 샘플을 제출하는 단계로서, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석에서 상기 환자의 DPP4 수준을 측정하는 것인 단계; 및 (b) 상기 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 폐 질환 또는 장애, 염증성 장 질환 또는 장애, 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애로 진단받은 환자를 치료하는 방법도 제공된다.
(a) 폐 질환 또는 장애, 염증성 장 질환 또는 장애, 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애로 진단받은 환자로부터 얻은 샘플 중의 DPP4 수준을 측정하거나 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계로서, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석에서 상기 환자의 DPP4 수준을 측정하는 것인 단계; 및 (b) 상기 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제 치료법으로 상기 환자를 치료하거나 치료하도록 건강관리 제공자에게 지시하는 단계를 포함하는, 폐 질환 또는 장애, 염증성 장 질환 또는 장애, 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애로 진단받은 환자를 IL-13 길항제 치료법으로 치료할지를 결정하는 방법도 제공된다.
(a) 폐 질환 또는 장애, 염증성 장 질환 또는 장애, 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애로 진단받은 환자로부터 얻은 샘플 중의 DPP4 수준을 측정하거나 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계로서, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석에서 상기 환자의 DPP4 수준을 측정하는 것인 단계; 및 (b) 상기 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제 치료법으로 상기 환자를 치료하거나 치료하도록 건강관리 제공자에게 지시하는 단계를 포함하는, IL-13 길항제 치료법을 사용한 치료를 위한 후보로서 폐 질환 또는 장애, 염증성 장 질환 또는 장애, 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애로 진단받은 환자를 선택하는 방법도 제공된다. 일부 양태들에서, 폐 질환 또는 장애는 천식, IPF, COPD(안정한 COPD 또는 AECOPD), 만성 비부비동염 또는 알레르기성 비염이다. 일부 양태들에서, 천식은 알레르기성 천식, 아토피성 천식, 코르티코스테로이드 무경험(naive) 천식, 만성 천식, 코르티코스테로이드 내성 천식, 코르티코스테로이드 불응성 천식, 흡연으로 인한 천식, 또는 코르티코스테로이드로 조절되지 않는 천식이다. 일부 양태들에서, 만성 염증성 피부 질환 또는 장애는 아토피성 피부염이다.
상기 개시된 방법들의 일부 양태들에서, IL-13 길항제는 항-IL-13 항체 또는 이의 항원 결합 단편, IL-13 뮤테인(mutein), IL-4 뮤테인, 항-IL-13Rα1 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 항-IL-4Rα 항체 또는 이의 항원 결합 단편 중 하나 이상을 포함한다. 일부 양태들에서, 환자는 IL-13 길항제의 투여 전에, 동안에 또는 후에 하나 이상의 추가 약물로 치료받았다. 일부 양태들에서, 하나 이상의 추가 약물은 스테로이드를 포함한다. 다른 양태들에서, 하나 이상의 추가 약물은 기관지확장제를 추가로 포함한다. 일부 양태들에서, 스테로이드는 플루티카손(fluticasone) 또는 부데소나이드(budesonide)이다. 일부 양태들에서, 기관지확장제는 살부타몰(salbutamol) 또는 살메테롤(salmeterol)이다. 다른 양태들에서, 하나 이상의 추가 약물은 흡입, 경구 투여, 주사 또는 이들의 조합에 의해 투여된다. 일부 양태들에서, 흡입 투여는 정량 흡입기(MDI) 또는 건조 분말 흡입기(DPI)를 이용함으로써 수행된다. 일부 양태들에서, 스테로이드는 고용량으로 투여된다.
본원에 개시된 방법들의 일부 양태들에서, IL-13 길항제는 항-IL-13 항체 또는 이의 항원 결합 단편이다. 일부 양태들에서, 상기 항체 또는 이의 단편은 트랄로키누맙(tralokinumab)과 동일한 IL-13 에피토프에 결합하거나, 트랄로키누맙과 IL-13의 결합을 경쟁적으로 억제하거나, 이 성질들 둘 다를 가진다. 다른 양태들에서, 상기 항체 또는 이의 단편은 트랄로키누맙 또는 이의 항원 결합 단편을 포함한다. 일부 양태들에서, 상기 항체 또는 이의 단편은 트랄로키누맙 또는 이의 항원 결합 단편으로 구성된다. 일부 양태들에서, 상기 항체 또는 이의 단편은 레브리키주맙(lebrikizumab)과 동일한 IL-13 에피토프에 결합하거나, 레브리키주맙과 IL-13의 결합을 경쟁적으로 억제하거나, 이 성질들 둘 다를 가진다. 일부 양태들에서, 상기 항체 또는 이의 단편은 레브리키주맙 또는 이의 항원 결합 단편을 포함한다. 다른 양태들에서, 상기 항체 또는 이의 단편은 레브리키주맙 또는 이의 항원 결합 단편으로 구성된다.
본원에 개시된 방법들의 일부 양태들에서, 환자로부터 채취된 샘플은 전혈, 혈청, 혈장, 피부, 침, 객담, 기관지폐포 세척액, 폐 상피 세포, 소변 또는 비용종(polyps) 중 하나 이상을 포함한다. 일부 양태들에서, 환자로부터 채취된 샘플은 혈액 혈청이다. 일부 양태들에서, 본원에 개시된 방법은 (i) 환자의 IgE 수준, (ii) 환자의 호산구 카운트, (iii) 환자의 배출된 산화질소의 분획(FENO), (iv) 환자의 호산구/림프구 및 호산구/호중구(ELEN) 지수, (v) 환자의 EOS 지수, (vi) 폐의 CT 스캔을 통해 측정된 약 68% 초과의 세분절 기도의 벽 면적 %(WA%), 또는 (vii) 이들 중 둘 이상의 조합을 측정하거나, 측정을 위해 환자로부터 채취된 샘플을 제출하거나, 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계를 더 포함한다. 일부 양태들에서, 본원에 개시된 방법은 인간 페리오스틴의 동형체(isoforms) 1, 2, 3 또는 4의 발현 수준 또는 활성, 환자의 혈액 호산구 세포 카운트, 환자의 IgE 수준, 기관지확장제 전 또는 후 FEV1 가역성, 또는 이들의 조합을 측정하거나, 측정을 위해 환자로부터 채취된 샘플을 제출하거나, 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계를 더 포함한다.
일부 양태들에서, 본원에 개시된 방법은 sCTLA-3(가용성 CTLA-3; 세포독성 T-림프구 관련 세린 에스터라제 3, 그랜자임 A 또는 그랜자임 1로서도 공지되어 있음; 유니프롯(Uniprot): P12544), sCD28(가용성 CD28; 분화 28 또는 Tp44의 클러스터로서도 공지되어 있음; 유니프롯: P10747), CCL5(케모카인 C-C 모티프 리간드 5; RANTES로서도 공지되어 있음; 유니프롯: P13501), CCL11(C-C 모티프 케모카인 11; 호산구 화학주성 단백질 또는 에오탁신-1로서도 공지되어 있음; 유니프롯: P51671), CCL22(C-C 모티프 케모카인 22; 유니프롯: O00626), 또는 이들의 조합의 발현 수준 또는 활성을 측정하거나, 측정을 위해 환자로부터 채취된 샘플을 제출하거나, 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계를 더 포함한다.
일부 양태들에서, 본원에 개시된 방법은 POSTN(서열번호 8), CST1(서열번호 9), CCL26(서열번호 10), CLCA1(서열번호 11), CST2(서열번호 12), PRR4(서열번호 13), SERPINB2(서열번호 14), CEACAM5(서열번호 15), iNOS(서열번호 16), SERPINB4(서열번호 17), CST4(서열번호 18), PRB4(서열번호 19), TPSD1(서열번호 20), TPSG1(서열번호 21), MFSD2(서열번호 22), CPA3(서열번호 23), GPR105(서열번호 24), CDH26(서열번호 25), GSN(서열번호 26), C2ORF32(서열번호 27), TRACH2000196(TMEM71)(서열번호 28), DNAJC12(서열번호 29), RGS13(서열번호 30), SLC18A2(서열번호 31), SERPINB10(서열번호 32), SH3RF2(서열번호 33), FCER1B(서열번호 34), RUNX2(서열번호 35), PTGS1(서열번호 36), ALOX15(서열번호 37), 및 이들의 조합의 발현 수준 또는 활성을 측정하거나, 측정을 위해 환자로부터 채취된 샘플을 제출하거나, 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계를 더 포함한다.
일부 양태들에서, IL-13 길항제는 고정 용량으로 투여된다. 특정 양태에서, 트랄로키누맙은 약 300 mg/용량의 고정 용량으로 투여된다. 일부 양태들에서, IL-13 길항제는 2회 이상의 용량으로 투여된다. 다른 양태들에서, IL-13 길항제는 주마다, 2주마다 또는 월마다 투여된다. 일부 양태들에서, IL-13 길항제는 2주마다 투여된다.
일부 양태들에서, IL-13 길항제는 정맥내로, 근육내로, 피하로 또는 이들의 조합에 의해 투여된다. 다른 양태들에서, ELISA를 이용하여 혈청에서 측정하였을 때, 소정의 DPP4 역치 수준은 적어도 약 250 ng/㎖, 적어도 약 275 ng/㎖, 적어도 약 300 ng/㎖, 적어도 약 325 ng/㎖, 적어도 약 350 ng/㎖, 적어도 약 375 ng/㎖, 적어도 약 400 ng/㎖, 적어도 약 425 ng/㎖, 적어도 약 450 ng/㎖, 적어도 약 475 ng/㎖, 적어도 약 500 ng/㎖, 적어도 약 525 ng/㎖, 적어도 약 550 ng/㎖, 적어도 약 575 ng/㎖, 또는 적어도 약 600 ng/㎖이다. 일부 양태들에서, ELISA는 콴티카인(QUANTIKINE)® 분석이다. 일부 양태들에서, 소정의 DPP4 역치 수준은 약 365 ng/㎖이다.
일부 양태들에서, 하나 이상의 대조군 샘플은 정상적인 건강한 개체; 천식의 비-IL-13 매개 서브세트를 가진 환자; 코르티코스테로이드 치료에 대한 경험이 없는 천식 환자; 코르티코스테로이드로 치료받은 천식 환자; 소정의 표준량의 단리된 DPP4; 또는 이들의 조합으로부터 수득된다. 일부 양태들에서, 하나 이상의 대조군 샘플은 전혈, 혈청, 혈장, 침, 객담, 기관지폐포 세척액, 폐 상피 세포, 소변 또는 이들의 조합 중 하나 이상을 포함한다.
본원에 개시된 방법들의 일부 양태들에서, IL-13 길항제의 투여는 (a) AER(급성 악화율) 감소; (b) FEV1(1초간 강제 호기량) 증가; (c) 개선된 ACQ-6(천식 조절 설문지, 6-항목 버전) 결과; (d) 개선된 AQLQ(천식 삶의 질 설문지) 결과; 또는 (e) 이들의 조합을 유발한다. 일부 양태들에서, AER 감소는 플라세보로 치료받은 환자의 집단에서 관찰된 AER에 비해 적어도 5%, 적어도 10%, 적어도 15%, 적어도 20%, 적어도 25%, 적어도 30%, 적어도 35%, 적어도 40% 또는 적어도 45%이다. 다른 양태들에서, 평균 AER 감소는 플라세보로 치료받은 환자의 집단에서 관찰된 평균 AER에 비해 약 28%이다. 일부 양태들에서, FEV1 증가는 플라세보로 치료받은 환자의 집단에서 관찰된 FEV1에 비해 적어도 3%, 적어도 5%, 적어도 7%, 적어도 9%, 적어도 11%, 적어도 13%, 적어도 15%, 적어도 17% 또는 적어도 19%이다. 다른 양태들에서, 평균 FEV1 증가는 플라세보로 치료받은 환자의 집단에서 관찰된 평균 FEV1에 비해 약 10%이다.
도 1은 폐에서 IL-13에 의해 조절되는 유전자를 확인하기 위해 이용된 계획을 제시한다. 스크린에서 확인된 후보 유전자의 정상 혈청 및 천식 혈청 중의 단백질 수준을 측정하였다. 정상 인간 기관지 상피 세포 또는 에피에어웨이(EPIAIRWAY)™ 모델로부터의 인간 기관지 상피 세포를 24시간 동안 IL-13으로 자극하고 수거하고 용해시켰고, 야기된 전사 변경을 전체 게놈 어레이(WGA) 및 택만(TAQMAN)® PCR로 분석하였다.
도 2는 에피에어웨이™ 모델로부터의 정상 인간 기관지 상피 세포의 IL-13 자극에 의해 상향조절된 유전자를 보여준다. IL-13 자극 후 각각의 유전자에 대한 log2 변화 배수(fc) 값이 표시되어 있다. CCL26/에오탁신-3, 디펩티딜 펩티다제-4(DPP4), 페투인(fetuin) B(FETUB) 및 페리오스틴(POSTN)을 비롯한 다수의 유전자들이 IL-13 치료에 의해 상향조절되는 것으로 발견되었다. 자극받지 않았거나 24시간 동안 100 ng/㎖ IL-13으로 자극받은 다중층 고도 분화된 기체-액체 계면 모델(에피에어웨이Y™, 매테크 코포레이션(Mattek Corp.))에서 생장된 정상 기관지 상피 세포로부터 총 RNA를 준비하였다. RNA를 cDNA로 역전사하고 전체 게놈 마이크로어레이로 분석하였다.
도 3은 정상 인간 기관지 상피 세포의 IL-13 자극에 의해 상향조절된 유전자를 보여준다. IL-13 자극 후 각각의 유전자에 대한 log2 변화 배수(fc) 값이 표시되어 있다. CCL26/에오탁신-3, 디펩티딜 펩티다제-4(DPP4), 페투인 B(FETUB) 및 페리오스틴(POSTN)을 비롯한 다수의 유전자들이 IL-13 치료에 의해 상향조절되는 것으로 발견되었다. 자극받지 않았거나 24시간 동안 100 ng/㎖ IL-13으로 자극받은 단일층으로 생장된 정상 기관지 상피 세포로부터 총 RNA를 준비하였다. RNA를 cDNA로 역전사하고 전체 게놈 마이크로어레이로 분석하였다.
도 4는 도 2 및 도 3에 제시된 IL-13 자극 후 마이크로어레이 데이터의 ㅌ태택만® qPCR 확인을 보여준다. 자극받지 않은 세포/조직에서의 유전자 발현을 IL-13 자극 후 유전자 발현과 비교하는 평균 ± SD 선형 변화 배수 값이 표시되어 있다. IL-13 자극에 의해 상승되는 것으로 확인된 4종의 유전자들(DPP4, POSTN, CCL26 및 FETUB)을 택만® qPCR(플루이다임(Fluidigm))로 분석하였다. 디펩티딜 펩티다제-4(DPP4), 페리오스틴(POSTN), CCL26/에오탁신-3(CCL26) 및 페투인 B(FETUB)뿐만 아니라 자극받지 않은(Unstim) 샘플에도 상응하는 결과들이 표시되어 있다. 자극받지 않았거나 24시간 동안 IL-13으로 자극받은 후 기관지 상피(각각의 샘플에 대해 2명의 기증자들; 좌측 컬럼), 정상 에피에어웨이™ 조직(각각의 샘플에 대해 3명의 기증자들; 중간 컬럼), 또는 천식 에피에어웨이™ 조직(각각의 샘플에 대해 4명의 기증자들; 우측 컬럼)으로부터 총 RNA를 단리하였다. 샘플을 cDNA로 역전사하고 미리 증폭하였다.
도 5는 DPP4 단백질 수준이 중증 천식 환자로부터의 혈청에서 상승되었다는 것을 보여준다. 건강한 자원자(n = 38) 및 중등도(n = 13) 또는 중증(n = 12)으로서 확인된 천식 환자로부터의 혈청을 상업적 공급원으로부터 수득하였다. R&D 시스템스(R&D Systems)로부터의 콴티카인® ELISA를 이용하여 DPP4 수준(ng/㎖)을 측정하였다. 각각의 집단에서의 중간 DPP4 값은 흑색 막대로 표시되어 있다. 중증 질환을 가진 천식 환자에서 DPP4 발현의 통계적으로 유의한 증가(* p 값 <0.05)와 함께 증가된 DPP4에 대한 경향이 중등도 질환을 가진 천식 환자에서 관찰되었다.
도 6은 DPP4 단백질 수준이 경구 및 흡입 스테로이드를 복용하는 천식 환자로부터의 혈청에서 더 낮았다는 것을 보여준다. 다양한 약물들을 복용하는 것으로서 확인된 천식 환자들(약물 부재, n = 8; 어드바이어(ADVAIR)® 단독, n = 18; 알부테롤 및 흡입 스테로이드, n = 27; 또는 경구 및 흡입 스테로이드, n = 40)로부터의 혈청을 상업적 공급원으로부터 입수하였다. R&D 시스템스로부터의 콴티카인® ELISA를 이용하여 DPP4 수준(ng/㎖)을 측정하였다. 각각의 집단에서의 중간 DPP4 값은 흑색 막대로 표시되어 있다. 평가된 환자들 중에서 중간 DPP4 수준은 경구 및 흡입 스테로이드를 복용하는 환자들에서 더 낮았다.
도 7은 트랄로키누맙 2b상 연구(CD-RI-CAT-354-1049)의 디자인 및 핵심 질문의 요약, 투약 빈도, 참여 기준, 및 핵심 일차 및 이차 종점(EP)을 보여준다. Q2W=2주마다; Q4W=4주마다; Wk=주; SC=피하 투여.
도 8은 기관지확장제 전 FEV1에서의 기준(베이스라인; baseline)으로부터의 변화를 시간의 경과에 따라 보여준다(ITT 집단). FEV1의 상대적 증가가 연구의 처음 17주 동안에 플라세보에 비해 치료군들 둘 다에서 관찰되었다. 이 증가는 트랄로키누맙 300 mg Q2W 군에서 53주째 날까지 유지되었으나, 트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 군에서는 상실되었다. FEV1=1초간 강제 호기량; ITT=치료 의도; MMRM=혼합된-효과 모델 반복된 측정치; SEM=평균의 표준 오차; CAT-354=트랄로키누맙.
도 9는 연간 급성 악화율 감소(AERR) 및 53주째의 기관지확장제 전에서의 기준으로부터의 변화를 FEV1 가역성 및 혈청 페리오스틴 수준별로 보여주는 포레스트 플롯(forest plot)을 제공한다. 도 9a는 연간 % AERR의 백분율 감소를 플라세보(PBO)와 비교된 CAT-354 Q2W 또는 CAT-354 Q4W 코호트(cohorts)에 대한 FEV1 가역성 및 혈청 페리오스틴 수준별로 보여주는 포레스트 플롯이다. 도 9b는 기관지확장제 전 FEV1에서의 기준으로부터의 변화에서 플라세보와 비교된 차이를 CAT-354 Q2W 또는 CAT-354 Q4W 코호트에 대한 FEV1 가역성 및 혈청 페리오스틴 수준별로 보여주는 포레스트 플롯이다. CAT-354=트랄로키누맙; FEV1=1초간 강제 호기량; Q2W=2주마다; Q2/4W=2종의 주사, 즉 12주 동안 Q2W 주사에 이은 38주 동안 Q4W 주사.
도 10은 53주째 날에서 ACQ 및 AQLQ(S)를 FEV1 가역성 및 혈청 페리오스틴 수준별로 보여주는 포레스트 플롯을 제공한다. 도 10a는 ACQ에 대해 플라세보와 비교된 차이를 CAT-354 Q2W 또는 CAT-354 Q4W 코호트에 대한 FEV1 가역성 및 페리오스틴 수준별로 보여주는 포레스트 플롯이다. 도 10b는 AQLQ(S)에 대해 플라세보와 비교된 차이를 CAT-354 Q2W 또는 CAT-354 Q4W 군에 대한 FEV1 가역성 및 페리오스틴 수준별로 보여주는 포레스트 플롯이다. ACQ-6=천식 조절 설문지 6; AQLQ(S)=천식 삶의 질 설문지-표준화된 버전; CI=신뢰구간; FEV1=1초간 강제 호기량; ITT=치료 의도; Q2W=2주마다; Q2/4W=2종의 주사, 즉 12주 동안 Q2W 주사에 이은 38주 동안 Q4W 주사.
도 11은 연간 급성 악화율(AER)에 대한 하위군 분석의 효과를 보여주는 포레스트 플롯이다. ITT 집단에서, 일차 종점인 연간 AER의 감소는 플라세보에 비해 트랄로키누맙 치료 코호트에서 관찰되지 않았으나; 트랄로키누맙을 제공받는 환자들에서 AER의 감소에 대한 경향은 기준에서 SABA에 대한 12% 이상의 FEV1 가역성의 존재, 높은 페리오스틴, 높은 호산구, 및 높은 Th2 하위군을 포함하는 다수의 미리 특정된 하위군들에서 관찰되었다. AER의 감소는 트랄로키누맙 치료 코호트에서 장기적 OCS를 제공받는 하위군에서 관찰되지 않았다. AERR=천식 악화율 감소; CAT-354=트랄로키누맙; Eos=호산구; FEV1=1초간 강제 호기량; ITT=치료 의도; OCS=경구 코르티코스테로이드; PBO=플라세보; Q2W=2주마다; Q2/4W=2종의 주사, 즉 12주 동안 Q2W 주사에 이은 38주 동안 Q4W 주사; Th2=T 헬퍼 2.
도 12는 기관지확장제 전(pre-BD) FEV1에 대한 하위군 분석의 효과를 보여주는 포레스트 플롯이다. ITT 집단에서, 플라세보와 비교되었을 때 53주째 날에서 기관지확장제 전 FEV1에서의 기준으로부터의 통계적으로 유의한 증가는 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트에서 관찰되었다. 53주째 날에서 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트 내에서, 플라세보에 비해 기관지확장제 전 FEV1의 증가는 높은 페리오스틴 하위군 및 낮은 페리오스틴 하위군 둘 다에서 밀접하게 일치하였고 상응하는 낮은 하위군들보다 높은 가역성 하위군, 높은 호산구 하위군 및 높은 Th2 하위군에서 수치적으로 더 높았다. 기관지확장제 전 FEV1의 증가는 트랄로키누맙 치료 코호트에서 장기적 OCS를 제공받은 하위군에서 관찰되지 않았다. CAT-354=트랄로키누맙; Eos=호산구; FEV1=1초간 강제 호기량; ITT=치료 의도; OCS=경구 코르티코스테로이드; PBO=플라세보; Q2W=2주마다; Q2/4W=2종의 주사, 즉 12주 동안 Q2W 주사에 이은 38주 동안 Q4W 주사; Th2=T 헬퍼 2.
도 13은 53주째 날 환자에 대한 천식 악화율 감소 및 기관지확장제 전 FEV1에서의 기준으로부터의 평균 퍼센트 변화를 기준 혈청 페리오스틴 수준별로 보여준다(트랄로키누맙 Q2W 대 플라세보). 도 13a는 분석에서 사용된 중간 페리오스틴 값을 보여주는 혈청 페리오스틴 수준에 따른 AER 감소(95% CI) 및 53주째 날 AER 감소에 대한 중간 페리오스틴 값(기준 페리오스틴 컷포인트) 변화의 효과를 연속적으로 표시한다. 도 13b는 분석에서 사용된 중간 페리오스틴 값을 보여주는 혈청 페리오스틴 수준에 따른 기관지확장제 전 FEV1에서의 기준으로부터의 퍼센트 변화(95% CI) 및 53주째 날 기관지확장제 전 FEV1에서의 기준으로부터의 퍼센트 변화에 대한 중간 페리오스틴 값(기준 페리오스틴 컷포인트) 변화의 효과를 연속적으로 표시한다. Q2W=2주마다; AER=천식 악화율; FEV1=1초간 강제 호기량; CI=신뢰구간.
도 14a는 페리오스틴이 중간치(ITT 집단) 이상일 때 기관지확장제 전 FEV1에서의 기준으로부터의 퍼센트 변화를 시간의 경과에 따라 보여준다. FEV1에서의 상대적 증가는 53주째 날까지 300 mg Q2W 군에서 관찰되었다. FEV1=1초간 강제 호기량; ITT=치료 의도; Q2W=2주마다; Q2/4W=2종의 주사, 즉 12주 동안 Q2W 주사에 이은 38주 동안 Q4W 주사; CAT-354=트랄로키누맙.
도 14b는 페리오스틴이 중간치(ITT 집단) 미만일 때 기관지확장제 전 FEV1에서의 기준으로부터의 퍼센트 변화를 시간의 경과에 따라 보여준다. FEV1의 유의한 증가가 53주째 날까지 300 mg Q2W 군 또는 Q2/4W에서 관찰되지 않았다. FEV1=1초간 강제 호기량; ITT=치료 의도; Q2W=2주마다; Q2/4W=2종의 주사, 즉 12주 동안 Q2W 주사에 이은 38주 동안 Q4W 주사; CAT-354=트랄로키누맙.
도 15는 DPP4(DPP4-높음 분류자; 즉, DPP4 >= 중간치)가 급성 악화율 감소, FEV1에서의 기준으로부터의 백분율 변화, 기준으로부터의 ACQ-6 변화 및 기준으로부터의 AQLQ 변화를 비롯한 다양한 종점들에서 플라세보에 비해 치료 의도(ITT) 집단인 300 mg 트랄로키누맙 Q2W 군에서 페리오스틴(페리오스틴-높음 분류자; 즉, 페이오스틴 수준 >= 중간치)을 능가한다는 것을 보여주는 데이터를 제공한다. FEV1=1초간 강제 호기량; ACQ-6=천식 조절 설문지 6; AQLQ(S)=천식 삶의 질 설문지-표준화된 버전; CI=신뢰구간; Q2W=2주마다.
도 16은 4개의 분류자들에 따라 등급화된, 치료 의도(ITT) 집단인 300 mg 트랄로키누맙 Q2W 군에서 급성 악화율 감소, FEV1에서의 기준으로부터의 백분율 변화, 기준으로부터의 ACQ-6 변화 및 기준으로부터의 AQLQ 변화를 비교한다: 페리오스틴-높음(페리오스틴 수준 >= 중간치), 페리오스틴-낮음(페리오스틴 수준 < 중간치), DPP4-높음(DPP4 수준 >= 중간치), 및 DPP4-낮음(DPP4 수준 < 중간치). FEV1=1초간 강제 호기량; ACQ-6=천식 조절 설문지 6; AQLQ=천식 삶의 질 설문지; CI=신뢰구간; Q2W=2주마다.
도 17a 내지 17i는 53주째 날까지 트랄로키누맙 300 mg Q2W 군 또는 Q2/4W 군에서 DPP4 분류자 사용자(즉, DPP4 수준 >= 중간치 또는 DPP4 수준 < 중간치)에 따라 상이한 종점들에 대한 기준으로부터의 퍼센트 변화를 보여준다. Q2W=2주마다; Q2/4W=2종의 주사, 즉 12주 동안 Q2W 주사에 이은 38주 동안 Q4W 주사; CAT-354=트랄로키누맙; BSL=기준; WX=X주; FEV1=1초간 강제 호기량; ACQ-6=천식 조절 설문지 6; AQLQ(S)=천식 삶의 질 설문지-표준화된 버전. 도 17a(시간의 경과에 따른 기관지확장제 전 FEV1에서의 기준으로부터의 퍼센트 변화 및 DPP4 >= 중간치), 도 17b(시간의 경과에 따른 기관지확장제 전 FEV1에서의 기준으로부터의 퍼센트 변화 및 DPP4 < 중간치), 도 17c(시간의 경과에 따른 평균 ACQ-6에서의 기준으로부터의 변화 및 DPP4 >= 중간치), 도 17d(시간의 경과에 따른 평균 ACQ-6에서의 기준으로부터의 변화 및 DPP4 < 중간치), 도 17e(시간의 경과에 따른 평균 AQLQ(S)에서의 기준으로부터의 변화 및 DPP4 >= 중간치), 도 17f(시간의 경과에 따른 평균 AQLQ(S)에서의 기준으로부터의 변화 및 DPP4 < 중간치), 도 17g(시간의 경과에 따른 기관지확장제 전 FEV1에서의 기준으로부터의 퍼센트 변화, 기준 FEV1 가역성 >= 12% 및 DPP4 >= 중간치), 도 17h(시간의 경과에 따른 평균 ACQ-6에서의 기준으로부터의 변화, 기준 FEV1 가역성 >= 12% 및 DPP4 >= 중간치), 및 도 17i(시간의 경과에 따른 평균 AQLQ(S)에서의 기준으로부터의 변화, 기준 FEV1 가역성 >= 12% 및 DPP4 >= 중간치). 53주째 날에서 플라세보에 비해 기관지확장제 전 FEV1에서의 기준으로부터의 퍼센트 변화의 증가(17a), 평균 ACQ-6에서의 기준으로부터의 변화의 감소(17c) 및 평균 AQLQ(S)에서의 기준으로부터의 변화의 증가(17e)는 DPP4 >= 중간치에 대한 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트에서 관찰되었다(각각 도 17a, 17c 및 17e). 이 변화들은 DPP 수준 < 중간치 군에서 상실되었다(각각 도 17b, 17d 및 17f). 유사하게, 53주째 날에서 플라세보에 비해 기관지확장제 전 FEV1에서의 기준으로부터의 퍼센트 변화의 증가(17g), 평균 ACQ-6에서의 기준으로부터의 변화의 감소(17h) 및 평균 AQLQ(S)에서의 기준으로부터의 변화의 증가(17i)는 단기 작용 β2 효현제에 대한 기준 FEV1 가역성 >= 12% + DPP4 >= 중간치 군에 대한 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코흐트에서 관찰되었다.
도 18은 플라세보와 비교될 때 CAT-354 Q2W로 치료받은, 기준 DPP4 >= 컷-포인트를 가진 대상체에 대한 천식 악화율 감소(95% CI)를 보여주는, DPP4 수준별 천식 악화율 감소의 연속적 표시이다. 분석에서 사용된 중간 DPP4 값 및 천식 악화율 감소에 대한 중간 DPP4 값(기준 DPP4 컷-포인트) 변화의 효과가 표시되어 있다. Q2W=2주마다; CAT-354=트랄로키누맙; CI=신뢰구간.
도 19는 플라세보와 비교될 때 CAT-354 Q2W로 치료받은, 기준 DPP4 >= 컷-포인트를 가진 대상체에 대한 53주째 날 기관지확장제 전(pre-BD) FEV1에서의 기준으로부터의 평균 퍼센트 변화를 연속적으로 표시한다. 분석에서 사용된 중간 DPP4 값 및 pre-BD FEV1에서의 기준으로부터의 평균 퍼센트 변화에 대한 중간 DPP4 값(기준 DPP4 컷-포인트) 변화의 효과가 표시되어 있다. Q2W=2주마다; CAT-354=트랄로키누맙; CI=신뢰구간; pre-BD=기관지확장제 전; FEV1= 1초간 강제 호기량.
도 20은 플라세보와 비교될 때 CAT-354 Q2W로 치료받은, 기준 DPP4 >= 컷-포인트를 가진 대상체에 대한 53주째 날 평균 ACQ-6 점수에서의 기준으로부터의 평균 변화를 연속적으로 표시한다. 분석에서 사용된 중간 DPP4 값 및 ACQ-6에서의 기준으로부터의 평균 변화에 대한 중간 DPP4 값(기준 DPP4 컷-포인트) 변화의 효과가 표시되어 있다. Q2W=2주마다; CAT-354=트랄로키누맙; CI=신뢰구간; ACQ-6=천식 조절 설문지 6.
도 21은 치료군과 관계없이 DPP4-높음(혈청 DPP4 ≥ 중간치); DPP-낮음(중간치 미만의 혈청 DPP4); 페리오스틴-높음(혈청 페리오스틴 ≥ 중간치); 및 페리오스틴-낮음(중간치 미만의 혈청 페리오스틴)으로서 분류된 대상체들의 상대적 분포를 보여준다. 각각의 사분면에서, 상한 수치는 대상체의 수에 상응하는 반면, 하한 수치는 총 대상체의 %(예를 들면, DPP4-높음, 페리오스틴-높음 = 125명의 환자들 또는 연구 대상체들의 27.84%)에 상응한다. DPP4-높음 군과 페리오스틴-높음 군 사이에 부분적 중첩이 있다.
도 22는 치료군과 관계없이 DPP4-높음(혈청 DPP4 ≥ 중간치); DPP-낮음(중간치 미만의 혈청 DPP4); Th2-높음(IgE > 100 IU/㎖ 및 혈청 호산구 ≥ 0.14 X 109/ℓ); 및 Th2-낮음(Th2-높음으로서 분류되지 않은 대상체들)으로서 분류된 대상체들의 상대적 분포를 보여준다. 각각의 사분면에서, 상한 수치는 대상체의 수에 상응하는 반면, 하한 수치는 총 대상체의 %(예를 들면, DPP4-높음, Th2-높음 = 114명의 환자들 또는 연구 대상체들의 27.67%)에 상응한다. DPP4-높음 군과 Th2-높음 군 사이에 부분적 중첩이 있다.
도 23은 치료군과 관계없이 DPP4-높음(혈청 DPP4 ≥ 중간치); DPP-낮음(중간치 미만의 혈청 DPP4); Eos-높음(혈액 호산구 카운트 ≥ 300개 세포/㎕); 및 Eos-낮음(혈액 호산구 카운트 < 300개 세포/㎕)으로서 분류된 대상체들의 상대적 분포를 보여준다. 각각의 사분면에서, 상한 수치는 대상체의 수에 상응하는 반면, 하한 수치는 총 대상체의 %(예를 들면, DPP4-높음, Eos-높음 = 84명의 환자들 또는 연구 대상체들의 19.86%)에 상응한다. DPP4-높음 군과 Eos-높음 군 사이에 부분적 중첩이 있다.
도 24는 장기적으로 OCS를 사용하였거나(양성) 또는 사용하지 않은(음성) 대상체들에 대한 평균 및 중간 혈청 DPP4 수준을 보여준다. 평균 및 중간 혈청 DPP4 수준은 장기적으로 OCS로 치료받은 환자들에서 감소된다. OCS=경구 코르티코스테로이드; N=대상체의 수.
도 25는 단기 작용 β2 효현제에 대한 기준 FEV1 가역성(≥ 12% 또는 < 12%) 및 높은(≥ 중간치) 또는 낮은(< 중간치) 혈청 DPP4를 가진, 장기적으로 OCS로 치료받지 않은 대상체에서 플라세보에 비해 CAT-354에 대한 AERR, 악화율, 기준 FEV1로부터의 평균 퍼센트 변화, ACQ-6에 대한 기준으로부터의 평균 변화 및 AQLQ에 대한 기준으로부터의 평균 변화를 보여준다. OCS=경구 코르티코스테로이드; CAT-354=트랄로키누맙; BL=기준; FEV1=1초간 강제 호기량; ACQ-6=천식 조절 설문지 6; AQLQ=천식 삶의 질 설문지; pbo=플라세보; N=대상체의 수; CI=신뢰구간.
도 26은 단기 작용 β2 효현제에 대한 기준 FEV1 가역성(≥ 12% 또는 < 12%) 및 높은(≥ 중간치) 또는 낮은(< 중간치) 혈청 페리오스틴을 가진, 장기적으로 OCS로 치료받지 않은 대상체에서 플라세보에 비해 CAT-354에 대한 AERR, 악화율, 기준 FEV1로부터의 평균 퍼센트 변화, ACQ-6에 대한 기준으로부터의 평균 변화 및 AQLQ에 대한 기준으로부터의 평균 변화를 보여준다. OCS=경구 코르티코스테로이드; CAT-354=트랄로키누맙; BL=기준; FEV1=1초간 강제 호기량; ACQ-6=천식 조절 설문지 6; AQLQ=천식 삶의 질 설문지; pbo=플라세보; N=대상체의 수; CI=신뢰구간.
도 27은 전체 게놈 마이크로어레이(아피메트릭스(Affymetrix))를 이용하여 2개의 프로브들, 즉 각각 프로브 1555778(패널 A) 및 프로브 210809(패널 B)를 사용함으로써 측정된, 정상 피부 및 아토피성 피부염(AD) 피부에서의 페리오스틴(POSTN) mRNA 발현 강도 수준을 보여준다. 정상 피부(31명의 기증자들) 또는 아토피성 피부염으로 진단받은 대상체로부터의 피부(4명의 기증자들)로부터 총 RNA를 단리하였다. 총 RNA로부터 바이오틴-표지된 증폭된 cRNA를 생성하고 아피메트릭스 인간 게놈 U133 플러스 2.0 진칩(GeneChip)® 어레이 상에서의 혼성화를 위해 단편화하였다. 각각의 집단에서의 중간 발현 강도 수준은 흑색 막대로 표시되어 있다. POSTN mRNA 발현은 정상 피부에 비해 AD 피부 샘플에서 상승되어 있다.
도 28은 전체 게놈 마이크로어레이(아피메트릭스)를 이용하여 2개의 프로브들, 즉 각각 프로브 203717(패널 A) 및 프로브 203716(패널 B)을 사용함으로써 측정된, 정상 피부 및 아토피성 피부염(AD) 피부에서의 DPP4 mRNA 발현 강도 수준을 보여준다. 정상 피부(31명의 기증자들) 또는 아토피성 피부염으로 진단받은 대상체들로부터의 피부(4명의 기증자들)로부터 총 RNA를 단리하였다. 총 RNA로부터 바이오틴-표지된 증폭된 cRNA를 생성하고 아피메트릭스 인간 게놈 U133 플러스 2.0 진칩® 어레이 상에서의 혼성화를 위해 단편화하였다. 각각의 집단에서 중간 발현 강도 수준은 흑색 막대로 표시되어 있다. DPP4 mRNA 발현은 정상 피부에 비해 AD 피부 샘플에서 상승되어 있다.
도 29는 다양한 기관지 기도들을 보여주는, 4회째 방문(visit)(패널 A) 및 30회째 방문(패널 B)에서 환자 폐의 대표적인 컴퓨터 단층촬영(CT) 영상을 보여준다.
도 30은 폐의 3D 컴퓨터 단층촬영 영상화 스캔의 비다 아폴로(VIDA APOLLO)® 소프트웨어를 사용하여 측정하였을 때 플라세보 또는 트랄로키누맙으로 치료받은 환자에서 기준(4회째 방문) 및 30회째 방문으로부터의 루멘(lumen) 면적(LA)의 상대적 변화를 보여준다. RB1 기관지 기도(패널 A), 분절 기도(패널 B) 및 세분절 기도(패널 C)에 상응하는 LA의 상대적 변화가 제시되어 있다. 세분절 기도의 루멘 면적의 유의한 증가가 플라세보에 비해 트랄로키누맙으로 치료받은 환자에서 관찰되었다(p 값=0.021). Tralo=트랄로키누맙; p=p 값.
도 31은 폐의 3D 컴퓨터 단층촬영 영상화 스캔의 비다 아폴로® 소프트웨어를 사용하여 측정하였을 때 플라세보 또는 트랄로키누맙(Tralo)으로 치료받은 환자에서 기준(4회째 방문) 및 30회째 방문으로부터의 기관지 벽 면적 백분율(WA%)의 상대적 변화를 보여준다. RB1 기관지 기도(패널 A), 분절 기도(패널 B) 및 세분절 기도(패널 C)에 상응하는 WA%의 상대적 변화가 제시되어 있다. 세분절 기도의 벽 면적 백분율(WA%)의 유의한 감소는 플라세보에 비해 트랄로키누맙으로 치료받은 환자에서 관찰되었다(p 값=0.0049). Tralo=트랄로키누맙; p=p 값.
도 32는 폐의 3D 컴퓨터 단층촬영 영상화 스캔의 비다 아폴로® 소프트웨어를 사용하여 측정하였을 때 플라세보 또는 트랄로키누맙(Tralo)으로 치료받은 환자에서 기준(4회째 방문) 및 30회째 방문으로부터의 기도 저항성의 상대적 변화를 보여준다. 보다 상세한 내용에 대해서는 실시예 6을 참조한다. RB1 기관지 기도(패널 A), 분절 기도(패널 B) 및 세분절 기도(패널 C)에 상응하는 기도 저항성의 상대적 변화가 제시되어 있다. 쇄선 직사각형은 기준 WA% 역치 값(중간 WA%)에 따라 도 33a에서 재분석된 기도 저항성 데이터 세트를 표시한다. 세분절 기도의 기도 저항성의 유의한 감소가 플라세보에 비해 트랄로키누맙으로 치료받은 환자에서 관찰되었다(p 값=0.0081). Tralo=트랄로키누맙; p=p 값.
도 33은 트랄로키누맙으로 치료받은 환자에서 세분절 기도의 기도 저항성(패널 A) 및 기관지확장제 전 FEV1(패널 B)에서의 기준(4회째 방문) 및 30회째 방문으로부터의 상대적 변화를 보여준다. 기준에서 68%보다 더 높은 세분절 기도의 벽 백분율(WA%)을 가진 환자는 기준에서 68% 미만의 벽 백분율(WA%)을 가진 환자에 비해 기도 저항성의 유의한 감소(p 값=0.0037) 및 FEV1 반응의 유의한 개선(p 값=0.045)을 가졌다. Tralo=트랄로키누맙; p=p 값.
도 34는 기체-액체 계면(에피에어웨이™ 모델)에서 생장된 고도로 분화된 기관지 상피 세포로부터의 CCL-26(패널 A), DPP4(패널 B), 페리오스틴 POSTN-745(패널 C) 및 페리오스틴 POST-815(패널 D) 전사체의 IL-13 특이적 상향조절을 보여준다. 샘플들은 각각 정상-25, 정상-21 및 정상-30으로서 표기된 3명의 정상 기증자들(각각의 세트의 막대 1 내지 3, 좌측에서 우측으로), 및 각각 COPD-15, COPD-12 및 COPD-18로서 표기된 3명의 COPD 기증자들(각각의 세트의 막대 4 내지 6, 좌측에서 우측으로)에 상응하였다.
도 35는 중등도(Mod) 또는 중증(Sev) 아토피성 피부염을 앓고 있는 아토피성 피부염 환자들에서의 페리오스틴(패널 A) 및 DPP4(패널 B) 발현 수준을 보여준다. 데이터는 95%의 신뢰구간과 함께 기하 평균(중앙 점 옆의 수치)으로서 표현된다(양성 막대 및 음성 막대). 각각의 개별 환자 관찰은 별개의 점으로서 표시되어 있다. 수평선 및 관련된 수치는 중등도 환자 포인트 추정치 주변의 상한 신뢰구간 및 하한 신뢰구간을 나타낸다.
도 36은 면역분석에 의해 측정된, 건강한 대조군(n=20명의 대상체들), 안정한 COPD(n=101명의 대상체들) 및 COPD의 급성 악화(AECOPD; n=61명의 대상체들)에서의 페리오스틴의 혈청 수준을 보여준다. 혈청 페리오스틴 수준은 건강한 대조군에 비해 COPD(안정한 COPD 및 COPD의 급성 악화 둘 다)를 앓고 있는 환자에서 유의하게 상승되어 있다. P=p 값; NS=유의한 차이 없음.
도 37은 면역분석에 의해 측정된, 건강한 대조군(n=20명의 대상체들), 안정한 COPD(n=104명의 대상체들) 및 COPD의 급성 악화(AECOPD; n=72명의 대상체들)에서의 DPP4의 혈청 수준을 보여준다. 혈청 DPP4 수준은 건강한 대조군에 비해 COPD(안정한 COPD 및 COPD의 급성 악화 둘 다)를 앓고 있는 환자에서 유의하게 상승되어 있다. P=p 값; NS=유의한 차이 없음.
본 개시내용은 IL-13 매개 질환 또는 장애, 예를 들면, 천식, IPF, COPD(예를 들면, 안정한 COPD 또는 COPD의 급성 악화), 또는 아토피성 피부염을 위한 바이오마커로서 DPP4(서열번호 5, 막 결합된 형태 단백질 서열; 서열번호 6, 가용성 형태 단백질 서열; 서열번호 7, DPP4 유전자 cDNA 서열)의 용도에 관한 것이다. 따라서, 본 개시내용은 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 상기 DPP4 수준이 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준에 비해 상승되어 있는 경우 IL-13 길항제, 예를 들면, 항-IL-13 항체를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 것으로서 대상체를 진단하고 치료하는 방법을 제공한다. 구체적으로, 소정의 DPP4 역치 수준 초과 또는 미만의 DPP4 바이오마커의 수준의 존재는 예를 들면, (i) IL-13 매개 질환 또는 장애를 앓고 있는 환자가 IL-13 길항제(예를 들면, 항체, 예컨대, 트랄로키누맙)을 사용한 특정 치료에 적합한지 아니면 적합하지 않은지를 결정하거나, (ii) IL-13 길항제를 사용한 IL-13 매개 질환 또는 장애의 특정 치료가 시작되어야 하는지, 중단되어야 하는지, 아니면 변경되어야 하는지를 결정하거나, (iii) IL-13 매개 질환 또는 장애가 특정 IL-13 길항제로 치료될 수 있는지 아니면 치료될 수 없는지를 진단하거나, (iv) 특정 IL-13 길항제를 사용한 IL-13 매개 질환 또는 장애의 치료 결과를 예측하는 데에 사용될 수 있다.
일부 양태들에서, IL-13 매개 폐 질환 또는 장애(예를 들면, 천식, IPF 또는 COPD) 또는 IL-13 매개 만성 염증성 피부 질환 또는 장애(예를 들면, 아토피성 피부염)를 앓고 있는 환자로부터 얻은 샘플(예를 들면, 혈액 혈청 또는 피부) 중의 소정의 DPP4 역치 수준 초과 또는 미만의 DPP4 수준의 존재는 예를 들면, (i) 환자가 특정 치료제를 사용한 치료에 적합한지 아니면 적합하지 않은지를 결정하거나, (ii) 특정 치료가 시작되어야 하는지, 중단되어야 하는지, 아니면 변경되어야 하는지를 결정하거나, (iii) 상기 질환 또는 장애가 특정 치료제로 치료될 수 있는지 아니면 치료될 수 없는지를 진단하거나, (iv) 특정 치료제를 사용한 상기 질환 또는 장애(예를 들면, 천식, IPF, COPD 또는 아토피성 피부염)의 치료 결과를 예측하는 데에 사용될 수 있다.
일부 양태들에서, (i) 높은 페리오스틴(≥ 중간 혈청 페리오스틴 또는 약 23 ng/㎖), (ii) 높은 호산구 세포 카운트(혈액 호산구 카운트 ≥ 300개 세포/㎕), (iii) 높은 Th2(IgE > 100 IU/㎖ 및 혈액 호산구 ≥ 0.14 X 109/ℓ로서 정의된 높은 Th2), (iv) 단기 작용 β2 효현제에 대한 FEV1 가역성 ≥ 12%, (v) 폐의 CT 스캔을 통해 측정된 약 68% 초과의 세분절 기도의 벽 면적 %(WA%), 또는 (vi) 이들의 조합 중 하나 이상과 함께, IL-13 매개 질환 또는 장애(예를 들면, 천식, IPF 또는 COPD) 또는 IL-13 매개 만성 염증성 피부 질환 또는 장애(예를 들면, 아토피성 피부염)를 앓고 있는 환자로부터 얻은 샘플(예를 들면, 혈액 혈청 또는 피부) 중의 소정의 DPP4 역치 수준 초과 또는 미만의 DPP4 수준의 존재는 예를 들면, (i) IL-13 매개 질환 또는 장애를 앓고 있는 환자가 IL-13 길항제(예를 들면, 항체, 예컨대, 트랄로키누맙 또는 레브리키주맙)를 사용한 특정 치료에 적합한지 아니면 적합하지 않은지를 결정하거나, (ii) 특정 치료가 시작되어야 하는지, 중단되어야 하는지, 아니면 변경되어야 하는지를 결정하거나, (iii) 상기 질환 또는 장애가 특정 치료제로 치료될 수 있는지 아니면 치료될 수 없는지를 진단하거나, (iv) 특정 치료제를 사용한 상기 질환 또는 장애(예를 들면, 천식, IPF, COPD 또는 아토피성 피부염)의 치료 결과를 예측하는 데에 사용될 수 있다.
본 개시내용이 보다 더 용이하게 이해될 수 있게 하기 위해, 일부 용어들이 먼저 정의된다. 추가 정의는 상세한 설명 전체에 걸쳐 기재되어 있다.
I. 정의
본 명세서 및 첨부된 청구범위에서, 문맥이 달리 명시하지 않은 한, 단수 형태 "하나", "한" 및 "상기"는 복수 지시대상을 포함한다. 용어 "하나"(또는 "한")뿐만 아니라 용어 "하나 이상" 및 "적어도 하나"는 본원에서 상호교환적으로 사용될 수 있다.
나아가, 본원에서 사용될 경우 "및/또는"은 2개의 특정된 특징들 또는 성분들 각각이 다른 특징 또는 성분과 함께 또는 다른 특징 또는 성분 없이 구체적으로 개시된 것으로서 간주되어야 한다. 따라서, 본원에서 어구, 예컨대, "A 및/또는 B"에서 사용된 용어 "및/또는"은 "A 및 B", "A 또는 B", "A"(단독) 및 "B"(단독)를 포함하기 위한 것이다. 마찬가지로, 어구, 예컨대, "A, B 및/또는 C"에서 사용된 용어 "및/또는"은 하기 양태들 각각을 포괄하기 위한 것이다: A, B 및 C; A, B 또는 C; A 또는 C; A 또는 B; B 또는 C; A 및 C; A 및 B; B 및 C; A(단독); B(단독); 및 C(단독).
양태들이 용어 "포함하는"으로 본원에 기재되어 있는 경우 언제나, 용어 "구성된" 및/또는 "본질적으로 구성된"으로 기재된 다른 유사한 양태들도 제공된다.
명세서 및 청구범위 전체에 걸쳐 수치 값과 함께 사용된 용어 "약"은 당업자에게 친숙하고 허용가능한 정확성의 간격을 표시한다. 일반적으로, 이러한 정확성의 간격은 ± 15%이다.
달리 정의되어 있지 않은 한, 본원에서 사용된 모든 기술 및 과학 용어들은 본 개시내용과 관련된 분야에서 통상의 기술을 가진 자에 의해 통상적으로 이해되는 의미와 동일한 의미를 가진다. 예를 들면, 문헌(the Concise Dictionary of Biomedicine and Molecular Biology, Juo, Pei-Show, 2nd ed., 2002, CRC Press); 문헌(The Dictionary of Cell and Molecular Biology, 3rd ed., 1999, Academic Press); 및 문헌(the Oxford Dictionary Of Biochemistry And Molecular Biology, Revised, 2000, Oxford University Press)은 본 개시내용에서 사용된 용어들 중 많은 용어들의 일반적인 사전을 당업자에게 제공한다.
유닛, 접두사 및 부호는 그들의 국제단위체계(SI) 허용된 형태로 표시되어 있다. 수치 범위는 그 범위를 한정하는 수치를 포함한다. 달리 표시되어 있지 않은 한, 아미노산 서열은 아미노에서 카복시 방향으로 좌측에서 우측으로 기재되어 있다. 본원에서 제공된 표제는 전체적으로 본 명세서를 참고함으로써 가질 수 있는 다양한 양태들 또는 본 개시내용의 양태들의 한정이 아니다. 따라서, 바로 아래에 정의된 용어들은 전체적으로 본 명세서를 참고함으로써 보다 완전하게 정의된다.
본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "항체"(또는 이의 단편, 변이체 또는 유도체)는 항원에 결합할 수 있는 항체의 적어도 최소 부분, 예를 들면, B 세포에 의해 생성된 전형적인 항체의 환경에서 적어도 중쇄의 가변 도메인(VH) 및 경쇄의 가변 도메인(VL)을 지칭한다. 척추동물 시스템에서 기본 항체 구조는 상대적으로 잘 이해되어 있다. 예를 들면, 문헌(Harlow et al., Antibodies: A Laboratory Manual, (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2nd ed. 1988))을 참조한다.
항체 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체 또는 유도체는 다중클론, 단일클론, 인간, 인간화된 또는 키메라 항체, 단일 쇄 항체, 에피토프 결합 단편, 예를 들면, Fab, Fab' 및 F(ab')2, Fd, Fvs, 단일 쇄 Fvs(scFv), 단일 쇄 항체, 다이설파이드-연결된 Fvs(sdFv), VL 또는 VH 도메인을 포함하는 단편, Fab 발현 라이브러리에 의해 생성된 단편을 포함하나 이들로 한정되지 않는다. ScFv 분자는 당분야에서 공지되어 있고, 예를 들면, 미국 특허 제5,892,019호에 기재되어 있다. 이 개시내용에 의해 포괄되는 면역글로불린 또는 항체 분자는 임의의 유형(예를 들면, IgG, IgE, IgM, IgD, IgA 및 IgY), 클래스(예를 들면, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 및 IgA2) 또는 서브클래스의 면역글로불린 분자일 수 있다.
"특이적으로 결합한다"는 일반적으로 항체 또는 이의 단편, 변이체 또는 유도체가 그의 항원 결합 도메인을 통해 에피토프에 결합하고 결합이 항원 결합 도메인과 에피토프 사이의 일부 상보성을 필요로 한다는 것을 의미한다. 이 정의에 따르면, 항체는 관련없는 무작위 에피토프에 결합할 때보다 더 용이하게 그의 항원 결합 도메인을 통해 에피토프에 결합할 때 그 에피토프에 "특이적으로 결합한다"고 알려져 있다.
항체 또는 이의 단편, 변이체 또는 유도체는 기준 항체 또는 항원 결합 단편과 에피토프의 결합을 어느 정도까지 차단할 정도로 그 에피토프에 우선적으로 결합하는 경우 기준 항체 또는 항원 결합 단편과 주어진 에피토프의 결합을 경쟁적으로 억제한다고 알려져 있다. 경쟁적 억제는 당분야에서 공지된 임의의 방법, 예를 들면, 경쟁 ELISA 분석에 의해 측정될 수 있다. 결합 분자는 기준 항체 또는 항원 결합 단편과 주어진 에피토프의 결합을 적어도 90%, 적어도 80%, 적어도 70%, 적어도 60% 또는 적어도 50%까지 경쟁적으로 억제한다고 주장될 수 있다.
본원에 개시된 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체 또는 유도체는 이것이 인식하거나 특이적으로 결합하는 항원, 예를 들면, 표적 폴리사카라이드의 에피토프(들) 또는 부분(들)의 관점에서 기재될 수 있거나 특정될 수 있다. 예를 들면, 항-DPP4 항체의 항원 결합 도메인과 특이적으로 상호작용하는 인간 DPP4의 부분은 "에피토프"이다.
본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "IL-13 매개 질환 또는 장애"는 상기 장애를 가진 대상체에서 IL-13의 비정상적인 수준에 의해 (단독으로 또는 다른 매개제와 함께) 야기되었거나 악화된, 이러한 비정상적인 수준과 관련된, 또는 이러한 비정상적인 수준에 의해 연장된 임의의 병리학적 상태를 지칭한다. IL-13 매개 질환 또는 장애의 비한정적인 예는 천식, 특발성 폐 섬유증(IPF), 만성 폐쇄성 폐 질환(COPD), 궤양성 결장염(UC), 알레르기성 비염, 만성 비부비동염 및 아토피성 피부염을 포함한다.
본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "폐 질환 또는 장애"는 폐 또는 호흡 시스템에 적어도 부분적으로 영향을 미치는 임의의 병리학적 상태를 지칭한다. 비한정적인 예는 천식, IPF, COPD, 알레르기성 비염 또는 만성 비부비동염을 포함한다. 일부 양태들에서, 폐 질환 또는 장애는 IL-13에 의해 매개된다.
본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "만성 염증성 피부 질환 또는 장애"는 피부에 적어도 부분적으로 영향을 미치는 임의의 병리학적 상태를 지칭한다. 비한정적인 예는 아토피성 피부염, 피부 섬유증, 알레르기성 접촉 피부염, 습진 또는 건선을 포함한다. 일부 양태들에서, 만성 염증성 피부 질환 또는 장애는 IL-13에 의해 매개된다.
용어 "천식"은 기저 염증과 관련될 수 있거나 관련될 수 없는 가역적 기류 폐쇄 및/또는 기관지 과민성으로서 존재하는 질환을 지칭한다. 천식의 예는 알레르기성 천식, 아토피성 천식, 코르티코스테로이드 무경험 천식, 만성 천식, 코르티코스테로이드 내성 천식, 코르티코스테로이드 불응성 천식, 흡연으로 인한 천식, 코르티코스테로이드로 조절되지 않는 천식 및, 예를 들면, 전체적으로 본원에 참고로 도입되는 문헌(the Expert Panel Report 3: Guidelines for the Diagnosis and Management of Asthma, National Asthma Education and Prevention Program (2007) ("NAEPP Guidelines"))에서 언급된 다른 천식을 포함한다.
본원에서 사용된 용어 "COPD"는 만성 폐쇄성 폐 질환을 지칭한다. 용어 "COPD"는 2종의 주요 질환인 폐기종 및 만성 폐쇄성 기관지염을 포함한다. 따라서, 가장 넓은 의미에서, 본원에서 사용된 용어 COPD는 COPD 그 자체 및 그의 하위질환인 만성 기관지염 및 폐기종을 지칭한다. 세계 만성 폐쇄성 폐 질환 기구(GOLD)는 COPD의 4개 상이한 병기들을 분류하였다. COPD 단계 0에 대한 GOLD 분류: COPD에 대한 위험. 만성 감기 및 객담 생성의 증상이 존재할 수 있으나, 환자들은 정상적인 폐활량측정 판독치를 가진다. 병기 I: 경증 COPD. FEV1 >= 80%, FEV1/FVC < 70%를 특징으로 한다. 환자들은 만성 감기 및 증가된 객담 생성을 가질 수 있거나 갖지 않을 수 있다. 병기 II: 중등도 COPD. 기류의 악화(30% >= FEV1 > 80%)를 특징으로 한다. 병기 II 질환을 가진 환자들은 종종 증상을 나타내고 치료를 찾고 호흡곤란을 가진다. 병기 II는 2개의 서브카테고리들을 가진다: IIA 및 IIB. IIA 환자들은 50% 내지 80%의 FEV1을 갖고; 병기 IIB 환자들은 30% 내지 50%의 FEV1을 가진다. 50% 미만의 FEV1을 가진 환자들은 특히 질환의 급성 악화를 겪기 쉽다. 병기 III: 중증 COPD. 30% 미만의 FEV1을 특징으로 한다. 환자들은 호흡 부전 또는 우측 심장 부전을 가진 경우에도 병기 III에 포함된다. 삶의 질은 이 환자들에서 심각하게 영향을 받는다. 이 환자 집단에서의 급성 악화는 종종 입원을 요구하고 종종 생명을 위협한다.
본원에서 사용된 바와 같이, "초기 병기" COPD는 GOLD 병기 0 또는 이의 전구체 상태를 의미하기 위한 것이다.
일부 양태들에서, COPD는 안정한 COPD이다. 다른 양태들에서, COPD는 COPD 악화를 지칭한다. 본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "악화"는 환자의 기준 상태에 비해 COPD 증상의 악화를 지칭한다. 일부 실시양태들에서, COPD 악화는 환자의 기준 폐 기능, 호흡곤란, 기침 및/또는 객담의 변화가 정상적인 일일 변화를 초과하는 것을 특징으로 하는, 질환의 천연 과정에서의 사건이 발병에서 급성적인 경우로서 정의될 수 있고 기저 COPD를 가진 환자에서 약물의 변화를 정당화할 수 있다. 일부 실시양태들에서, COPD의 악화는 호흡곤란 및/또는 천명의 증상의 갑작스런 증가, 및/또는 화농성 객담의 생성의 증가일 수 있다.
용어 "특발성 폐 섬유증"(IPF)은 폐의 진행성 흉터형성 또는 섬유증을 특징으로 하는 질환을 지칭한다. 이것은 폐포가 섬유증성 조직에 의해 점진적으로 대체되게 되는 간질성 폐 질환의 한 특정 유형이다. IPF의 경우, 진행성 흉터형성은 정상적으로 얇고 유연한 조직이 두꺼워지고 경직되게 함으로써, 폐가 팽창하는 것을 더 어렵게 만들어, 산소가 혈류 내로 용이하게 들어오는 것을 방해한다. 예를 들면, 문헌(Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2000. 161:646-664)을 참조한다.
본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "아토피성 피부염"은 종종 다른 아토피성 장애, 예컨대, 알레르기성 비염 및 천식과 관련되어 있는 만성 염증 재발 비전염성 및 소양성 피부 장애를 지칭한다(Bieber, New England Journal of Medicine, 2008, 358: 1483-1494). 용어 "아토피성 피부염"은 "신경피부염", "아토피성 습진" 또는 "내인성 습진"과 동등하다. 발생하는 장소, 외관, 또는 유발하는 스트레스 인자로부터 그의 명칭을 얻은 아토피성 피부염의 특정 형태들도 본 개시내용에 따라 용어 "아토피성 피부염"에 포함된다. 이들은 굴측성 습진, 유연성 습진, 사마귀 습진, 종두상 습진, 디스코이드성 습진(eczema dyskoides), 발한이상 습진, 미생물 습진, 동전 습진, 지루성 습진 및 다른 형태의 습진; 입주위 피부염 및 안와 피부염을 포함하나 이들로 한정되지 않는다. 본원에서 사용된 바와 같이, 용어 아토피성 피부염은 빈번하게 발생하는 세균성 이차 감염, 예컨대, 스타필로코커스 아우레우스(Staphylococcus aureus) 감염으로 인한 이차 감염, 화농피부증, 예컨대, 접촉전염성 농가진 및 이의 유도체뿐만 아니라 턱스염모낭염 또는 바이러스성 이차 감염도 포함한다. IL-13은 질환의 발병기전에 관여하고 중요한 생체내 유도체이다. 예를 들면, 문헌(Oh et al., J. Immunol. 186:7232-42 (2011)); 문헌(Tazawa et al., Arch. Dermatol. Res. 295:459-464 (2004)); 및 문헌(Metwally et al. Egypt J. Immunol. 11:171-7 (2004))을 참조한다.
본원에서 사용된 바와 같이, (예를 들면, 어구 "IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는"에서) 용어 "치료한다", "치료" 또는 "의 치료"는 바람직하게는 대상체가 IL-13 매개 질환 또는 장애로 인한 불편함 및/또는 변경된 기능을 더 이상 겪지 않을 정도(예를 들면, 치료받지 않은 환자와 비교될 때 천식 악화의 상대적 감소)까지 IL-13 매개 질환 또는 장애에 대한 잠재력을 감소시키고/시키거나, IL-13 매개 질환 또는 장애의 발생을 감소시키고/시키거나, IL-13 매개 질환 또는 장애의 중증도를 감소시키는 것을 지칭한다. 예를 들면, 치료는 대상체에게 투여되었을 때 IL-13 매개 질환 또는 장애가 발생하는 것을 방지하고/하거나 IL-13 매개 질환 증상, 징후 또는 원인을 치유하거나 완화시키는 요법의 능력을 지칭할 수 있다. 치료는 하나 이상의 임상적 증상의 경감 또는 감소, 질환의 진행의 억제 또는 지연, 및/또는 질환 또는 질병의 발병의 예방 또는 지연도 지칭한다. 따라서, 용어 "치료한다", "치료하는" 또는 "의 치료"(또는 문법적으로 동등한 용어)는 예방적 치료법 및 치유적 치료법 둘 다를 지칭한다.
본 개시내용은 IL-13 매개 질환 또는 장애의 치료에서 치료적 이점을 제공하는 방법 및 시스템을 제공한다. 치료적 이점은 반드시 특정 IL-13 매개 질환 또는 장애에 대한 치유일 필요는 없고, 오히려 가장 전형적으로 IL-13 매개 질환 또는 장애의 완화 또는 증가된 생존, IL-13 매개 질환 또는 장애의 제거, IL-13 매개 질환 또는 장애와 관련된 증상의 감소, 일차 IL-13 매개 질환 또는 장애의 발생으로부터 비롯된 이차 질환, 장애 또는 질병의 예방 또는 완화, 및/또는 IL-13 매개 질환 또는 장애의 예방을 포함하는 결과를 포괄한다.
본원에서 사용된 용어 "대상체" 또는 "환자"는 IL-13 매개 질환 또는 장애의 진단, 예후 또는 치료가 요구되는 임의의 대상체, 특히 포유동물 대상체를 지칭한다. 본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "대상체" 또는 "환자"는 임의의 인간 또는 비인간 동물을 포함한다. 용어 "비인간 동물"은 모든 척추동물들, 예를 들면, 포유동물 및 비포유동물, 예컨대, 비인간 영장류, 양, 개, 고양이, 말, 소, 곰, 닭, 양서류, 파충류 등을 포함한다. 본원에서 사용된 바와 같이, 어구, 예컨대, "IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자"는 그 IL-13 매개 질환 또는 장애의 요법, 영상화 또는 다른 진단 절차, 및/또는 예방적 치료의 투여로부터 이익을 얻을 대상체, 예컨대, 포유동물 대상체를 포함한다. 본 개시내용의 일부 양태들에서, 대상체는 무경험 대상체이다. 무경험 대상체는 요법, 예를 들면, 치료제를 투여받지 않은 대상체이다. 일부 양태들에서, 무경험 대상체는 IL-13 매개 질환 또는 장애, 예를 들면, 천식, IFP, COPD, UC 또는 아토피성 피부염을 가진 것으로서 진단받기 전에 치료제로 치료받지 않았다. 또 다른 양태에서, 대상체는 IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 것으로서 진단받기 전에 요법 및/또는 1회 이상의 용량의 치료제(예를 들면, IL-13 매개 질환 또는 장애, 폐 질환 또는 장애, 염증성 장 질환 또는 장애, 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애와 관련된 염증 반응을 조절할 수 있는 치료제)를 제공받았다. 한 양태에서, 치료제는 소분자 약물이다. 특정 양태에서, 치료제는 코르티코스테로이드이다. 또 다른 양태에서, 치료제는 류코트리엔 변경제, 예컨대, 몬테루카스트(montelukast), 자피르루카스트(zafirlukast) 또는 질레우톤(zileuton)일 수 있다. 추가 양태에서, 치료제는 메틸잔틴(예를 들면, 테오필린(theophylline)) 또는 크로몬(cromone)(예를 들면, 나트륨 크로몰린(cromolyn) 및 네도크로밀(nedocromil))일 수 있다. 또 다른 양태에서, 치료제는 장기 작용 베타-2 효현제, 예컨대, 살메테롤(salmeterol), 포모테롤(fomoterol) 또는 인다카테롤(indacaterol)일 수 있다. 추가 양태에서, 치료제는 메토트렉세이트 또는 사이클로스포린일 수 있다.
일부 양태들에서, 치료제는 천식 또는 COPD의 예방, 치료, 관리 또는 완화를 위해 사용되는 물질일 수 있다. 천식 또는 COPD를 위한 요법의 비한정적인 예는 항-콜린작용제(예를 들면, 이프라트로퓸 브로마이드 및 옥시트로퓸 브로마이드), 베타-2 길항제(예를 들면, 알부테롤(프로벤틸(PROVENTIL)® 또는 벤톨린(VENTOLIN)®), 비톨테롤(토말레이트(TOMALATE)®), 페노테롤, 포르모테롤, 이소에타린, 메타프로테레놀, 피부테롤(막사이어(MAXAIR)®), 살부타몰, 살부타몰 테르부탈린, 및 살메테롤, 테르부틀라인(브레타이어(BRETHAIRE)®)), 코르티코스테로이드(예를 들면, 프레드니손, 베클로메타손 디프로피오네이트(반서릴(VANCERIL)® 또는 베클로벤트(BECLOVENT)®), 트리암시놀론 아세토나이드(아즈마코프(AZMACORF)®), 플루니솔라이드(애로비드(AEROBID)®), 및 플루티카손 프로피오네이트(플로벤트(FLOVENT)®)), 류코트리엔 길항제(예를 들면, 몬테루카스트, 자피르루카스트 및 질레우톤), 테오필린(테오-두르(THEO-DUR)®, 유니두르(UNIDUR)® 정제 및 슬로-비드(SLO-BID)® 기로캡스(Gyrocaps)), 및 살메테롤(서레벤트(SEREVENT)®), 크로몰린, 및 네도르크로밀(인탈(INTAL)® 및 틸레이드(TILADE)®)), IgE 길항제, IL-4 길항제(항체를 포함함), IL-5 길항제(항체를 포함함), PDE4 억제제, NF-카파-B 억제제, IL-13 길항제(항체를 포함함), CpG, CD23 길항제, 셀렉틴(selectin) 길항제(예를 들면, TBC 1269), 비만 세포 프로테아제 억제제(예를 들면, 트립타제 키나제 억제제(예를 들면, GW-45, GW-58 및 제니스테인(genisteine)), 포스파티딜이노시타이드-3'(PI3)-키나제 억제제(예를 들면, 칼포스틴 C), 및 다른 키나제 억제제(예를 들면, 스타우로스포린), C2a 수용체 길항제(항체를 포함함), 및 지지 호흡 요법, 예컨대, 보충적 및 기계적 호흡을 포함한다.
일부 양태들에서, 대상체는 1회 이상의 치료 유효 용량의 경구 또는 흡입 코르티코스테로이드를 제공받았다. 일부 양태들에서, 대상체는 다회 치료 유효 용량의 경구 또는 흡입 코르티코스테로이드를 제공받았다. 일부 양태들에서, 대상체는 장기적 경구 코르티코스테로이드(OCS) 사용자이다.
일부 양태들에서, 대상체는 장기 작용 베타2-아드레날린성 효현제, 예를 들면, 살메테롤 지나포에이트를 제공받았다. 일부 양태들에서, 대상체는 합성 글루코코르티코이드, 예를 들면, 플루티카손 프로피오네이트를 제공받았다. 일부 양태들에서, 대상체는 살메테롤 지나포에이트와 플루티카손 프로피오네이트의 조합물 (어드바이어(ADVAIR)®)을 제공받았다. 일부 양태들에서, 대상체는 베타2-아드레날린성 기관지확장제, 예를 들면, 알부테롤 설페이트를 제공받았다.
한 양태에서, 본원에 개시된 방법에 따라 사용되는 치료제는 항체, 예를 들면, 항-IL-13 항체 또는 이의 항원 결합 단편이다. 따라서, 일부 양태들에서, 대상체는 IL-13 매개 병리학적 상태를 중화시킬 수 있는 1회 이상의 치료 유효 용량의 항체(예를 들면, 항-IL-13 항체 또는 이의 항원 결합 단편)를 제공받았거나 제공받을 후보이다. 일부 양태들에서, 항-IL-13 항체는 트랄로키누맙(서열번호 3 및 4) 또는 이의 항원 결합 단편이다. 전체적으로 본원에 참고로 도입되는 미국 특허 제7,829,090호를 참조한다. 사용될 수 있는 다른 항-IL-13 단일클론 항체는 2012년 3월 1일자로 공개된 미국 특허출원 공보 제2012-0052060호에 기재된 항체들을 포함한다. 다른 IL-13 길항제는 하기 물질들을 포함하나 이들로 한정되지 않는다: (a) 항-인간-IL-13 항체, 예를 들면, 레브리키주맙(MILR1444A/RG3637, 로슈(Roche)/제넨테크(Genentech))(서열번호 1 및 2) 또는 이의 항원 결합 단편, ABT-308(애보트(Abbott)), GSK679586(글락소스미쓰클라인(GlaxoSmithKline)) 또는 QAX576(노바티스(Novartis)); (b) 항-인간-IL-13Rα1 항체, 예를 들면, 머크(Merck) MK6105; (c) IL-13-독소 접합체, 예컨대, IL-13-PE38QQR(네오팜 인코포레이티드(NeoPharm, Inc.)); (d) IL-4 뮤테인 AEROVANT™(애로반스 인코포레이티드(Aerovance, Inc.)); (e) 항-IL-4Rα 항체, 예컨대, 두필루맙(dupilumab)/REGN668(리제네론(Regeneron)); (f) IL-4Rα에 대해 유도된 이중 가닥 올리고뉴클레오티드, 예컨대, AIR645(아이시스(Isis)); 또는 (g) IL-4/IL-13 이중특이적 항체, 예컨대, GSK2434735(글락소스미쓰클라인). 일부 양태들에서, 대상체의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하는 경우 또는 상기 DPP4 수준이 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준에 비해 상승되어 있는 경우, 상기 대상체는 1회 이상의 치료 유효 용량의 본원에 개시된 항-IL-13 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 투여받을 수 있다. 다른 양태들에서, 대상체의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하는 경우 또는 상기 DPP4 수준이 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준에 비해 상승되어 있는 경우, 상기 대상체는 1회 이상의 치료 유효 용량의 본원에 개시된 항-IL-13 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 제공받기에 적합한 것으로 간주될 수 있다.
본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "IL-13 길항제"는 시험관내 또는 생체내 IL-13의 발현, 활성 또는 반감기, 또는 IL-13 매개 질환 또는 장애, 예를 들면, 천식을 가진 대상체에서 IL-13에 의해 야기되었거나 악화된 증상, 병리학적 상태 또는 후유증에 영향을 미칠 수 있는 임의의 물질을 지칭한다. IL-13 길항제는 직접적으로 또는 간접적으로 IL-13 활성을 억제할 수 있거나, 줄일 수 있거나 중화시킬 수 있거나, IL-13 발현을 억제할 수 있거나 감소시킬 수 있거나, IL-13 반감기를 감소시킬 수 있거나, IL-13으로 인한 증상의 악화를 예방할 수 있는, 본원에서 정의된 임의의 "치료제"일 수 있다. 일부 양태들에서, IL-13 길항제는 항-IL-13 단일클론 항체, 예를 들면, 트랄로키누맙, 또는 예를 들면, 2012년 3월 1일자로 공개된 미국 특허출원 공보 제2012-0052060호에 기재된 다른 항-IL-13 단일클론 항체이다.
본원에서 사용된 용어 "요법"은 예를 들면, 치료제, 기구, 지지 조치, 및 수술 또는 재활 절차를 비롯한, IL-13 매개 질환 또는 장애를 치유하거나, 경감시키거나 예방하기 위한 임의의 수단을 포함한다. 이와 관련하여, 용어 요법은 IL-13 매개 질환 또는 장애의 예방, 관리, 치료 및/또는 완화에 사용될 수 있는 임의의 프로토콜, 방법 및/또는 치료제 또는 진단제를 포괄한다.
본원에서 사용된 용어 "치료제"는 원하는 효과, 통상적으로 유리한 효과를 생성하기 위해 IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 대상체에게 투여되는 임의의 치료 활성 물질을 지칭한다. 용어 치료제는 예를 들면, 항체 또는 이의 활성 단편, 펩티드, 지질, 단백질 약물, 단백질 접합체 약물, 효소, 올리고뉴클레오티드, 리보자임, 유전 물질, 프리온, 바이러스, 세균 및 진핵 세포를 포함하나 이들로 한정되지 않는, 통상적으로 소분자 약물 및 생물제제로서 지칭되는 고전적인 저분자량 치료제를 포함한다. 치료제는 대상체에게 투여되었을 때 원하는 치료 활성 물질로 대사되는 프로드러그일 수도 있다. 일부 양태들에서, 치료제는 예방제이다. 추가로, 치료제는 약학적으로 제제화될 수 있다. 치료제는 일부 다른 형태의 에너지, 예컨대, 광 또는 초음파 에너지, 또는 전신 투여될 수 있는 다른 순환 분자에 의해 활성화되는 방사성 동위원소 또는 물질일 수도 있다.
본원에서 사용된 "치료 유효"량은 IL-13 매개 질환 또는 장애, 예를 들면, IL-13 매개 폐 질환 또는 장애, 예컨대, 천식, IPF 또는 COPD; 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애, 예컨대, 아토피성 피부염을 가진 대상체에게 일부 개선 또는 이점을 제공하는 치료제의 양이다. 따라서, "치료 유효"량은 IL-13 매개 질환 또는 장애, 예를 들면, IL-13 매개 폐 질환 또는 장애, 예컨대, 천식, IPF 또는 COPD; 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애, 예컨대, 아토피성 피부염의 하나 이상의 임상적 증상의 일부 완화, 경감 및/또는 감소를 제공하는 양이다. 본 개시내용의 방법 및 시스템에 의해 치료될 수 있는 IL-13 매개 질환 또는 장애, 예를 들면, IL-13 매개 폐 질환 또는 장애, 예컨대, 천식, IPF 또는 COPD; 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애, 예컨대, 아토피성 피부염과 관련된 임상적 증상은 당업자에게 잘 공지되어 있다. 추가로, 당업자는 일부 이익이 대상체에게 제공되는 한, 치료 효과가 완전하거나 치유적일 필요가 없다는 것을 인식할 것이다. 일부 양태들에서, 용어 "치료 유효"는 IL-13 활성의 감소를 필요로 하는 환자에서 IL-13 활성을 감소시킬 수 있는 치료제의 양을 지칭한다.
본원에서 사용된 바와 같이, IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자에서 특정 결과를 달성하기 위한 "충분 양" 또는 이러한 결과를 달성하기에 "충분한 양"은 (즉, 치료 유효량의 투여로) 임의적으로 치료 효과인 원하는 효과를 생성하기에 효과적인 치료제(예를 들면, 항체, 예컨대, 트랄로키누맙)의 양을 지칭한다. 일부 양태들에서, 이러한 특정 결과는 IL-13 활성의 감소를 필요로 하는 환자에서의 IL-13 활성의 감소이다.
본원에서 사용된 용어 "샘플"은 대상체로부터 수득된 임의의 생물학적 유체 또는 조직, 예컨대, 전혈, 혈청, 근육, 침 또는 피부를 포함한다. 샘플은 임의의 생물학적 유체 또는 조직, 예컨대, 전혈, 혈청, 근육, 침, 소변, 활액, 골수, 뇌척액, 코 분비물, 객담, 양수, 기관지폐포 세척액, 폐 조직, 말초 혈액 단핵 세포, 총 백혈 세포, 림프절 세포, 비장 세포, 편도 세포 또는 피부를 포함한다. 일부 특정 양태들에서, 샘플은 혈액 또는 그의 분획, 근육, 피부, 또는 이들의 조합이다. 샘플은 당분야에서 공지된 임의의 수단에 의해 수득될 수 있다. 일부 양태들에서, 샘플은 폐를 포함하나 이것으로 한정되지 않는 환자의 장기 또는 조직의 컴퓨터 단층촬영(CT) 스캔이다. 일부 양태들에서, 샘플은 다수의 대상체들로부터 생물학적 샘플을 채취하고 이들을 풀링하거나 각각의 대상체의 생물학적 샘플의 분취액을 풀링함으로써 유도될 수 있다. 풀링된 샘플은 단일 대상체로부터의 샘플로서 처리될 수 있다. 용어 샘플은 전술된 것들 모두의 실험적으로 분리된 분획도 포함한다. 예를 들면, 혈액 샘플은 특정 유형의 세포를 함유하는 혈청 또는 분획으로 분획화될 수 있다. 일부 양태들에서, 샘플은 개체로부터의 샘플들의 조합물, 예컨대, 조직과 유체 샘플의 조합물일 수 있다.
본 개시내용의 방법 및 시스템을 적용하기 위해, 환자로부터의 샘플은 IL-13 매개 질환 또는 장애를 치료하기 위한 요법의 투여 전에 또는 후에 수득될 수 있다. 일부 경우들에서, 요법이 시작된 후에 또는 요법이 중단된 후에 일련의 샘플들이 환자로부터 수득될 수 있다. 예를 들면, 샘플은 건강관리 제공자(예를 들면, 의사) 또는 건강관리 이익 제공자에 의해 요구될 수 있고, 동일한 또는 상이한 건강관리 제공자(예를 들면, 간호사, 병원) 또는 임상 실험실에 의해 수득될 수 있고/있거나 프로세싱될 수 있고, 프로세싱 후에, 결과가 원래의 건강관리 제공자 또는 또 다른 건강관리 제공자, 건강관리 이익 제공자 또는 환자에게 전달될 수 있다. 유사하게, 하나 이상의 점수들의 측정/확인, 점수들 사이의 비교, 점수들의 평가 및 치료 결정은 하나 이상의 건강관리 제공자, 건강관리 이익 제공자 및/또는 임상 실험실에 의해 수행될 수 있다.
본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "건강관리 제공자"는 살아있는 대상체들, 예를 들면, 인간 환자들과 직접적으로 상호작용하고 이들을 관리하는 개체 또는 기관을 지칭한다. 건강관리 제공자의 비한정적인 예는 의사, 간호사, 기술자, 요법시술자, 약사, 상담사, 대체 의약 실시자, 의료 시설, 의사의 사무실, 병원, 응급실, 진료실, 응급치료센터, 대체 의약 진료실/시설, 및 일반적인 의학적, 전문화된 의학적, 수술적 및/또는 임의의 다른 유형의 치료, 평가, 유지, 요법, 약물 및/또는 조언을 포함하나 이들로 한정되지 않는, 환자의 건강 상태의 전부 또는 임의의 일부에 관한 일반적인 및/또는 전문화된 치료, 평가, 유지, 요법, 약물 및/또는 조언을 제공하는 임의의 다른 독립체(entity)를 포함한다.
본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "임상 실험실"은 살아있는 대상체, 예를 들면, 인간으로부터 유래된 물질의 검사 또는 프로세싱을 위한 시설을 지칭한다. 프로세싱의 비한정적인 예는 예를 들면, 살아있는 대상체, 예를 들면, 인간의 임의의 질환 또는 손상의 진단, 예방 또는 치료를 위한, 또는 살아있는 대상체, 예를 들면, 인간의 건강의 평가를 위한 정보를 제공하는 것을 목적으로 하는, 인체로부터 유래된 물질의 생물학적, 생화학적, 혈청학적, 화학적, 면역혈액학적, 혈액학적, 생체물리학적, 세포학적, 병리학적, 유전학적 또는 다른 검사를 포함한다. 이 검사들은 샘플을 수집하거나 다른 방식으로 수득하거나, 준비하거나, 살아있는 대상체, 예를 들면, 인간의 체내 또는 살아있는 대상체, 예를 들면, 인간의 신체로부터 얻은 샘플에의 다양한 물질들의 존재 또는 부재를 확인하거나, 측정하거나 다른 방식으로 기술하기 위한 절차도 포함할 수 있다.
본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "건강관리 이익 제공자"는 하나 이상의 건강관리 이익, 유리한 계획, 건강 보험 및/또는 건강관리 소요 경비 프로그램을 제공하거나, 제시하거나, 부여하거나, 전체적으로 또는 부분적으로 지불하거나, 또는 이들에의 환자 접근을 제공하는 것과 다른 방식으로 관련되어 있는 개별 단체, 조직 또는 군을 포괄한다.
일부 양태들에서, 건강관리 제공자는 IL-13 매개 질환 또는 장애를 치료하기 위해 요법을 투여할 수 있거나 요법을 투여하도록 또 다른 건강관리 제공자에게 지시할 수 있다. 건강관리 제공자는 하기 조치들을 수행할 수 있거나 하기 조치들을 수행하도록 또 다른 건강관리 제공자 또는 환자에게 지시할 수 있다: 샘플의 수득, 샘플의 프로세싱, 샘플의 제출, 샘플의 수령, 샘플의 전달, 샘플의 분석 또는 측정, 샘플의 정량, 샘플을 분석/측정/정량한 후에 얻어진 결과의 제공, 샘플을 분석/측정/정량한 후에 얻어진 결과의 수령, 하나 이상의 샘플을 분석/측정/정량한 후에 얻어진 결과의 비교/점수화, 하나 이상의 샘플로부터의 비교/점수의 제공, 하나 이상의 샘플로부터의 비교/점수의 수득, 요법(예를 들면, IL-13 매개 질환 또는 장애, 예컨대, 천식, IPE, COPD, 궤양성 결장염 또는 아토피성 피부염을 치료하는 치료제)의 투여, 요법의 투여의 시작, 요법의 투여의 중단, 요법의 투여의 계속, 요법의 투여의 일시적 중단, 투여되는 치료제의 양의 증가, 투여되는 치료제의 양의 감소, 소정량의 치료제의 투여의 계속, 치료제의 투여 빈도의 증가, 치료제의 투여 빈도의 감소, 치료제에 대한 동일한 투약 빈도의 유지, 적어도 또 다른 요법 또는 치료제에 의한 요법 또는 치료제의 대체, 요법 또는 치료제와 적어도 또 다른 요법 또는 추가 치료제의 조합.
일부 양태들에서, 건강관리 이익 제공자는 예를 들면, 샘플의 채취, 샘플의 프로세싱, 샘플의 제출, 샘플의 수령, 샘플의 전달, 샘플의 분석 또는 측정, 샘플의 정량, 샘플을 분석/측정/정량한 후에 얻어진 결과의 제공, 샘플을 분석/측정/정량한 후에 얻어진 결과의 전달, 하나 이상의 샘플을 분석/측정/정량한 후에 얻어진 결과의 비교/점수화, 하나 이상의 샘플로부터의 비교/점수의 전달, 요법 또는 치료제의 투여, 요법 또는 치료제의 투여의 시작, 요법 또는 치료제의 투여의 중단, 요법 또는 치료제의 투여의 계속, 요법 또는 치료제의 투여의 일시적 중단, 투여되는 치료제의 양의 증가, 투여되는 치료제의 양의 감소, 소정량의 치료제의 투여의 계속, 치료제의 투여 빈도의 증가, 치료제의 투여 빈도의 감소, 치료제에 대한 동일한 투약 빈도의 유지, 적어도 또 다른 요법 또는 치료제에 의한 요법 또는 치료제의 대체, 또는 요법 또는 치료제와 적어도 또 다른 요법 또는 추가 치료제의 조합을 허가할 수 있거나 거부할 수 있다.
추가로, 건강관리 이익 제공자는 예를 들면, 요법의 처방을 허가할 수 있거나 거부할 수 있거나, 요법에 대한 범위를 허가할 수 있거나 거부할 수 있거나, 요법의 비용에 대한 상환을 허가할 수 있거나 거부할 수 있거나, 요법에 대한 적격성을 결정할 수 있거나 거부할 수 있다.
일부 양태들에서, 임상 실험실은 예를 들면, 샘플을 수집할 수 있거나 수득할 수 있거나, 샘플을 프로세싱할 수 있거나, 샘플을 제출할 수 있거나, 샘플을 수령할 수 있거나, 샘플을 전달할 수 있거나, 샘플을 분석할 수 있거나 측정할 수 있거나, 샘플을 정량할 수 있거나, 샘플을 분석/측정/정량한 후에 얻어진 결과를 제공할 수 있거나, 샘플을 분석/측정/정량한 후에 얻어진 결과를 수령할 수 있거나, 하나 이상의 샘플을 분석/측정/정량한 후에 얻어진 결과를 비교/점수화할 수 있거나, 하나 이상의 샘플로부터의 비교/점수를 제공할 수 있거나, 하나 이상의 샘플로부터의 비교/점수를 수득할 수 있거나, 다른 관련된 활동을 할 수 있다.
본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "컴퓨터 단층좔영" 또는 "CT"는 스캐닝된 장기, 조직 또는 물체의 특정 영역의 단층촬영 영상(사실상 '슬라이스')을 사용하는 영상화 방법을 지칭한다. 디지털 기하학 프로세싱을 이용하여 단일 회전축 주변에서 촬영된 일련의 2-차원적(2D) 방사선사진 영상으로부터 물체 또는 장기 내부의 3-차원적(3D) 영상을 생성한다.
본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "컴퓨터 단층촬영 스캔" 또는 "CT 스캔"은 x-선, 다중검출제 컴퓨터 단층촬영(MDCT), 고해상 컴퓨터 단층촬영(HRCT), 양전자 방사 단층촬영(PET), 양전자 방사 단층촬영 컴퓨터 단층촬영(PET-CT), 단일-광자 방사 컴퓨터 단층촬영(SPECT), 자기 공명 영상화(MRI), 컴퓨터 축 단층촬영(CAT 스캔), 컴퓨터-보조 단층촬영, 제논 호흡 컴퓨터 단층촬영, 및 과분극화된 기체 폐 MRI 호흡 영상을 포함하나 이들로 한정되지 않는 임의의 적합한 방법을 이용함으로서 수득된 단층촬영 영상의 생성을 지칭한다.
II. 바이오마커로서의 DPP4
본원에서 사용된 용어 "DPP4"는 DPP4 유전자에 의해 코딩된 디펩티딜 펩티다제 IV 단백질(EC 3.4.14.5; 유니프롯: P27487)을 지칭한다. DPP4는 DPP-IV, 아데노신 데아미나제 복합 단백질 2 또는 CD26(분화 26의 클러스터)을 지칭한다. DPP4는 아트랙틴(attractin), FAP, DPP8 및 DPP9와 관련되어 있다. DPP4는 순환계(혈장), 및 상피 세포, 내피 세포 및 림프 세포를 비롯한 여러 유형의 세포들의 표면 둘 다에 존재하는 고도로 보존된 다기능 II형 막관통 당단백질이다. DPP4는 T-세포 보조자극, 케모카인 생물학, II형 당뇨병 및 종양 생물학에 관여하는 세린 프로테아제 패밀리의 부분이다(Zhong et al., Atherosclerosis 2013;226:305-314). DPP4의 내재성 기질은 매우 다양한 프롤린 함유 펩티드들, 예컨대, 성장 인자, 케모카인, 뉴로펩티드 및 혈관작용 펩티드를 포함한다(Gorrell, M., Clin. Sci. 108, 277-292, 2005; McIntosh, C. H. S., et al. Int. J. Biochem. Cell Biol. 38, 860-872, 2006). 염증 호흡 질환, 예컨대, 천식에서의 DPP4의 역할은 조절되지 않는 천식과 관련된 집먼지 진드기 알레르기성 비염을 가진 소아의 코 상피에서 상승된 DPP4 전사체(및 다른 Th2 시그너처 유전자)를 발견한 지오반니니-카미(Giovannini-Chami)(Giovannini-Chami et al., European Respiratory Journal. 2012 May;39(5):1197-205)에 의해 제안되었다. 용어 DPP4는 단편, 변이체(예를 들면, 당분야에서 공지된 K1R, V7I, S437I, T557I 및 D663E 변이체들), 및 이들의 유도체(예를 들면, DPP4 단백질의 글리코실화된 또는 아글리코실화된 단백질 형태, 또는 상기 단백질의 다른 방식으로 화학적으로 변경된 형태)도 포함한다. 일부 양태들에서, 용어 DPP4는 게놈 DNA, cDNA, mRNA 및 이들의 단편을 포함하는 DPP4 유전자를 지칭한다. 일부 양태들에서, 용어 DPP4는 엄격한 조건 하에서 DPP4 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 올리고뉴클레오티드도 지칭한다. 일부 양태들에서, 올리고뉴클레오티드는 A, T, C, G 또는 U, 예를 들면, 보편적인 염기와 상이한 뉴클레오염기를 포함한다.
예를 들면, "DPP4 수준"에서 용어 "수준"은 생물학적 샘플에서 DPP4의 존재 또는 발현(단백질 발현 또는 유전자 발현)을 검출하기 위해 임의의 분석 방법을 이용함으로써 수득되고 상기 생물학적 샘플에서 DPP4의, DPP4에 대한, 또는 DPP4에 상응하는 존재, 부재, 절대적 양 또는 농도, 상대적 양 또는 농도, 역가, 발현 수준, 측정된 수준의 비 등을 표시하는 측정치를 지칭한다. "값" 또는 "수준"의 정확한 성질은 구체적인 디자인, 및 DPP4를 검출하는 데에 이용되는 구체적인 분석 방법(예를 들면, 면역분석, 질량 분광측정 방법, 생체내 분자 영상화, 유전자 발현 프로파일링, 앱타머-기반 분석 등)의 성분에 의존한다. 예를 들면, 미국 특허출원 공보 제2010/00221752호를 참조한다.
DPP4의 언급 시 본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "상승된 DPP4", "높은 DPP4", "상승된 DPP4 수준" 또는 "높은 DPP4 수준"은 정상 수준 또는 범위보다 더 높은 생물학적 샘플(예를 들면, 혈액 혈청) 중의 수준을 지칭한다. DPP4에 대한 정상 수준 또는 범위는 표준 관행에 따라 정의된다. 따라서, 특정 생물학적 샘플에서 측정된 수준은 유사한 정상 샘플에서 측정된 수준 또는 수준의 범위와 비교될 수 있다. 이와 관련하여, 정상 샘플은 검출가능한 IL-13 매개 질환 증상을 갖지 않은 개체로부터 얻은 샘플일 것이다. DPP4의 수준은 DPP4가 정상 샘플에 존재하는 수준 또는 범위보다 더 높은 수준 또는 범위로 검사 샘플에 존재하는 경우 상승되어 있다고 알려져 있다.
본원에 개시된 방법은 가용성 DPP4를 함유할 수 있는 임의의 샘플뿐만 아니라, 막 결합된 형태의 DPP4, 그의 세포내, 막관통 또는 세포외 모이어티, 또는 이의 임의의 펩티드 분획을 함유하는 샘플을 사용함으로써 수행될 수 있다. 편리한 샘플은 예를 들면, 혈액, 혈액 세포, 혈청, 혈장, 소변 등을 포함한다. 일부 양태들에서, 샘플은 필요에 따라 적절한 완충제 용액에서의 희석에 의해 전처리될 수 있거나 농축될 수 있다. 생리학적 pH에서 다양한 완충제들 중 임의의 완충제, 예컨대, 포스페이트, 트리스(Tris) 등을 사용하는 다수의 표준 수성 완충제 용액들 중 임의의 표준 수성 완충제 용액 및/또는 프로테아제 억제제가 사용될 수 있다.
DPP4 수준(발현된 단백질 수준, 또는 핵산 수준, 예컨대, mRNA 수준)은 당업자에게 잘 공지된 다수의 방법들 중 임의의 방법에 의해 검출될 수 있고 정량될 수 있다. 이 방법들은 분석 생화학적 방법, 예컨대, 전기영동, 모세관 전기영동, 고성능 액체 크로마토그래피(HPLC), 박층 크로마토그래피(TLC), 과확산 크로마토그래피, 질량 분광법 등, 또는 다양한 면역학적 방법들, 예컨대, 유체 또는 겔 침강소 반응, 면역확산(단일 또는 이중), 면역조직화학, 친화성 크로마토그래피, 면역전기영동, 방사성면역분석(RIA), 효소-연결된 면역흡착 분석(ELISA), 면역형광 분석, 웨스턴 블롯팅 등을 포함한다.
한 양태에서, DPP4는 전기영동 폴리펩티드 분리(예를 들면, 1-차원적 또는 2-차원적 전기영동)에서 검출될 수 있고/있거나 정량될 수 있다. 전기영동 기법을 이용한 폴리펩티드의 검출 수단은 당업자에게 잘 공지되어 있다(일반적으로, 문헌(R. Scopes (1982) Polypeptide Purification, Springer-Verlag, N.Y.; Deutscher, (1990) Methods in Enzymology Vol. 182: Guide to Polypeptide Purification, Academic Press, Inc., N.Y.) 참조). 이 양태의 변경은 웨스턴 블롯(면역블롯) 분석을 이용하여 샘플에서 DPP4의 존재를 검출하고 정량한다. 이 기법은 일반적으로 분자량을 기준으로 겔 전기영동으로 샘플 폴리펩티드들을 분리하는 단계, 분리된 폴리펩티드들을 적합한 고체 지지체(예컨대, 니트로셀룰로스 필터, 나일론 필터 또는 유도체화된 나일론 필터)에 옮기는 단계, 및 샘플을 분석물에 특이적으로 결합하는 항체와 함께 항온처리하는 단계를 포함한다. 분석물에 특이적으로 결합하는 항체는 직접적으로 표지될 수 있거나, 대안적으로 추후에 일차 항체의 도메인에 특이적으로 결합하는 표지된 항체(예를 들면, 표지된 양 항-마우스 항체)를 사용함으로써 검출될 수 있다.
일부 양태들에서, 샘플 및/또는 DPP4는 검출 및/또는 정량 분석의 과정에서 일부 방식으로 변환된다. 예를 들면, 샘플은 DPP4가 하나 이상의 다른 샘플 성분으로부터 분리되도록 분획화될 수 있다. DPP4는 액체 분획에서 회수될 수 있거나 분리 매질, 예컨대, 겔에 매립되어 있는 동안 검출될 수 있다. 질량 분광법의 경우, DPP4는 검출을 위해 휘발된다.
특정 양태에서, DPP4는 면역분석을 이용함으로써 생물학적 샘플에서 검출되고/되거나 정량된다. 면역분석의 일반적인 검토를 위해서는 문헌(Methods in Cell Biology Volume 37: Antibodies in Cell Biology, Asai, ed. Academic Press, Inc. New York (1993)); 및 문헌(Basic and Clinical Immunology 7th Edition, Stites & Terr, eds. (1991))도 참조한다. 일부 양태들에서, 면역분석은 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 사용할 수 있다.
일부 양태들에서, 면역분석은 제1 항-DPP4 "포획" 항체 또는 이의 항원 결합 단편이 고체 지지체에 부착되고 샘플 또는 표준물로부터의 항원이 포획 항체에 결합된 후, 제2 항-DPP4 "검출" 항체 또는 이의 항원 결합 단편이 첨가되고 효소 반응, ECL 반응, 방사성 또는 다른 검출 방법에 의해 검출되는 샌드위치 면역분석, 예를 들면, 효소-연결된 면역흡착 분석(ELISA) 또는 샌드위치 전기화학발광(ECL) 분석을 포함한다.
일부 양태들에서, 면역분석은 하기 단계들을 포함한다: 먼저, 포획 항체 또는 이의 단편을 고체 지지체, 예를 들면, 다중웰 플레이트 또는 당분야에서 통상의 기술을 가진 자에게 공지된 다른 분석 디바이스에 결합시킨다. 포획 항체를 일정한 시간, 예를 들면, 하룻밤 동안 부착시킨 후, 결합되지 않은 항체를 제거한다. 그 다음, 상기 플레이트를 세척하여 임의의 결합되지 않은 포획 항체를 제거한다. 그 다음, 상기 플레이트를 차단 용액으로 처리하여 비특이적 단백질이 고체 지지체의 임의의 결합되지 않은 영역에 결합할 수 있게 한다.
전형적인 차단 용액은 무관한 단백질, 예를 들면, 탈지 분유 또는 혈청 알부민을 포함한다. 그 다음, 플레이트를 다시 세척하여 임의의 결합되지 않은 차단 용액을 제거할 수 있다. 다음으로, DPP4를 함유하는 것으로 의심되는 샘플을 상기 플레이트에 첨가한다. 샘플을 전형적으로 연속적으로 희석하고 이중으로 또는 삼중으로 플레이팅한다. 표준량의 DPP4 또는 이의 적합한 단편 및 다양한 음성 대조군들을 포함하는 대조군들도 포함된다. 항원을 일정한 시간, 예를 들면, 실온에서 1시간 동안 포획 항체에 결합시킨다. 항온처리 후, 플레이트를 세척하여 임의의 결합되지 않은 항원을 제거할 수 있다.
그 다음, 검출 항체를 첨가한다. 검출 항체는 전형적으로 포획 항체와 상이한 DPP4 에피토프에 결합하는 항-DPP4 항체이다. 검출 항체는 표지될 수 있거나 표지되지 않을 수 있다. 검출 항체가 표지되지 않은 경우, 당분야에서 통상의 기술을 가진 자에게 잘 공지되어 있는 바와 같이 표지된 이차 항체를 첨가하는 첨가 단계가 요구될 것이다. 검출 항체는 효소, 예를 들면, 호스라디쉬 퍼록시다제 또는 알칼리성 포스파타제로 직접적으로 표지될 수 있거나, 효소가 결합할 수 있게 할 태그로 표지될 수 있다. 예를 들면, 검출 항체는 바이오틴에 접합될 수 있고, 효소는 효소-접합된 스트렙타비딘이 바이오틴 태그에 결합할 수 있게 함으로써 후속 단계에서 부착될 수 있다.
대안적으로, 검출 항체는 화학발광, 형광 또는 ECL 태그에 접합될 수 있다. 후자의 일례는 루테늄 킬레이트이다. 항온처리 후, 플레이트를 세척하여 임의의 결합되지 않은 검출 항체를 제거할 수 있다.
검출 항체의 검출은 사용되는 검출 항체의 유형에 따라 달라지는 방법에 의해 달성될 수 있다. 검출 항체가 바이오틴으로 태깅되어 있는 경우, 효소-접합된 스트렙타비딘이 첨가되고, 결합되지 않은 스트렙타비딘이 세척되고, 예를 들면, 분광광도계 상에서 판독될 수 있는 비색 반응을 제공하는 기질이 첨가된다. 검출 항체가 루테늄 킬레이트에 접합되어 있는 경우, 플레이트는 전류에 노출되고, 광 방사가 측정된다.
일부 양태들에서, 상기 방법은 환자 샘플에서 DPP4 수준을 직접적으로 측정하는데, 이때 절대적 수준은 예를 들면, 정제된 전체 길이 또는 DPP4 단편을 사용하여 표준 곡선 상에서 면역분석 결과를 작도함으로써 계산된다. 그 다음, 검출 항체로부터의 검출된 신호가 플레이트 상에 포함된 다양한 표준물들 및 대조군들을 기준으로 정량될 수 있다. 표준 곡선 상에서 결과를 작도함으로써 검사 샘플 중의 DPP4의 절대적 수준을 예를 들면, ng DPP4/㎖ 또는 ng DPP4/mg 단백질 단위로 계산할 수 있다.
공지된 대조군 샘플과의 비교를 기준으로, "DPP4 역치 수준"을 결정할 수 있고, DPP4 역치 수준(예를 들면, DPP4 단백질 발현 및/또는 유전자 발현 역치 수준)을 초과하는 검사 샘플은 샘플이 채취된 환자가 IL-13 길항제, 예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙을 사용한 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 시사할 수 있다. DPP4 역치 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)은 예정되어야 하고, 샘플의 유형(예를 들면, 혈청, 폐 조직, 피부), 질환의 유형(예를 들면, 천식, IPF, COPD, UC 또는 아토피성 피부염), 및 일부 경우들에서 이용된 분석에 대하여 일치되어야 한다. 일부 양태들에서, 혈청 샘플 중의 소정의 DPP4 역치 수준은 도 5, 6, 18 내지 20 또는 24에 표시된 바와 같은 DPP4 중간 또는 DPP4 평균 수준일 수 있다. 일부 양태들에서, 혈청 샘플 중의 소정의 DPP4 역치 수준은 적어도 약 100 ng DPP4/㎖ 혈청 내지 약 1000 ng DPP4/㎖ 혈청, 예를 들면, 적어도 약 100 ng DPP4/㎖ 혈청, 적어도 약 150 ng DPP4/㎖ 혈청, 적어도 약 200 ng DPP4/㎖ 혈청, 적어도 약 250 ng DPP4/㎖ 혈청, 약 300 ng DPP4/㎖ 혈청, 적어도 약 350 ng DPP4/㎖ 혈청, 적어도 약 400 ng DPP4/㎖ 혈청, 적어도 약 450 ng DPP4/㎖ 혈청, 적어도 약 500 ng DPP4/㎖ 혈청, 적어도 약 550 ng DPP4/㎖ 혈청, 적어도 약 600 ng DPP4/㎖ 혈청, 적어도 약 650 ng DPP4/㎖ 혈청, 적어도 약 700 ng DPP4/㎖ 혈청, 적어도 약 750 ng DPP4/㎖ 혈청, 적어도 약 800 ng DPP4/㎖ 혈청, 적어도 약 850 ng DPP4/㎖ 혈청 또는 적어도 약 900 ng DPP4/㎖ 혈청일 수 있다. 일부 양태들에서, 소정의 DPP4 역치 수준은 적어도 약 300 ng DPP4/㎖, 적어도 약 310 ng DPP4/㎖, 적어도 약 320 ng DPP4/㎖, 적어도 약 330 ng DPP4/㎖, 적어도 약 340 ng DPP4/㎖, 적어도 약 350 ng DPP4/㎖, 적어도 약 360 ng DPP4/㎖, 적어도 약 370 ng DPP4/㎖, 적어도 약 380 ng DPP4/㎖, 적어도 약 390 ng DPP4/㎖, 적어도 400 ng DPP4/㎖, 적어도 약 410 ng DPP4/㎖, 적어도 약 420 ng DPP4/㎖, 적어도 약 430 ng DPP4/㎖, 적어도 약 440 ng DPP4/㎖, 적어도 약 450 ng DPP4/㎖, 적어도 약 460 ng DPP4/㎖, 적어도 약 470 ng DPP4/㎖, 적어도 약 480 ng DPP4/㎖, 적어도 약 490 ng DPP4/㎖, 적어도 500 ng DPP4/㎖, 적어도 약 510 ng DPP4/㎖, 적어도 약 520 ng DPP4/㎖, 적어도 약 530 ng DPP4/㎖, 적어도 약 540 ng DPP4/㎖, 적어도 약 550 ng DPP4/㎖, 적어도 약 560 ng DPP4/㎖, 적어도 약 570 ng DPP4/㎖, 적어도 약 580 ng DPP4/㎖, 적어도 약 590 ng DPP4/㎖, 또는 적어도 600 ng DPP4/㎖이다.
일부 양태들에서, 혈청 샘플 중의 소정의 DPP4 역치 수준은 적어도 약 200 ng DPP4/㎖ 혈청 내지 약 500 ng DPP4/㎖ 혈청일 수 있다. 일부 양태들에서, 혈청 샘플 중의 소정의 DPP4 역치 수준은 적어도 약 300 ng DPP4/㎖ 혈청 내지 약 400 ng DPP4/㎖ 혈청일 수 있다. 일부 양태들에서, 혈청 샘플 중의 소정의 DPP4 역치 수준은 적어도 약 315 ng DPP4/㎖ 혈청 내지 약 380 ng DPP4/㎖ 혈청일 수 있다. 일부 양태들에서, 혈청 중의 DPP4 수준은 ELISA를 이용함으로써 측정된다. 일부 특정 양태들에서, ELISA는 콴티카인® 분석이다.
콴티카인® DPP4 분석(실시예 2) 및 장기적 경구 코르티코스테로이드 사용자들의 집단으로부터의 혈청 샘플들을 이용함으로써 수득된 정량된 DPP4 수준은 134 ng/㎖의 최소 값 및 905 ng/㎖의 최대 값과 함께 중간 값이 371 ng/㎖이었다는 것을 표시하였다. 도 24를 참조한다. 따라서, 일부 양태들에서, 소정의 DPP4 역치는 이러한 중간 값, 즉 약 371 ng DPP4/㎖ 혈청이다.
콴티카인® DPP4 분석(실시예 2) 및 비사용자들 또는 장기적 경구 코르티코스테로이드(OCS) 사용자들의 집단으로부터의 혈청 샘플들을 이용함으로써 수득된 정량된 DPP4 수준은 169 ng/㎖의 최소 값 및 540 ng/㎖의 최대 값과 함께 중간 값이 321 ng/㎖이었다는 것을 표시하였다. 도 24를 참조한다. 따라서, 일부 양태들에서, 소정의 DPP4 역치는 이러한 중간 값, 즉 약 321 ng DPP4/㎖ 혈청이다.
콴티카인® DPP4 분석(실시예 2) 및 임상 연구에 등록된 437명의 대상체들로부터의 혈청 샘플(실시예 3 참조)을 이용함으로써 수득된 정량된 DPP4 수준은 134 ng/㎖의 최소 값 및 905 ng/㎖의 최대 값과 함께 중간 값이 364 ng/㎖이었다는 것을 표시하였다. 따라서, 일부 양태들에서, 소정의 DPP4 역치는 이러한 중간 값, 즉 약 364 ng DPP4/㎖ 혈청이다. 플라세보 군에서, 중간 값은 343 ng DPP4/㎖ 혈청이다. 표 5를 참조한다. 따라서, 일부 양태들에서, 소정의 DPP4 역치는 약 343 ng DPP4/㎖ 혈청이다. 2주마다(Q2W) 트랄로키누맙으로 치료받는 군에서, 중간 값은 372 ng DPP4/㎖ 혈청이었다. 표 5를 참조한다. 따라서, 일부 양태들에서, 소정의 DPP4 역치는 약 372 ng DPP4/㎖ 혈청이다. 4주마다(Q4W) 트랄로키누맙으로 치료받는 군에서, 중간 값은 375 DPP4 ng/㎖ 혈청이다. 표 5를 참조한다. 따라서, 일부 양태들에서, 소정의 DPP4 역치는 약 375 DPP4 ng/㎖ 혈청이다.
콴티카인® DPP4 분석 제조자 매뉴얼에서 표시된 바와 같이, 콴티카인® 인간 DPP4 면역분석을 이용함으로써 측정된 혈청, EDTA 혈장 또는 헤파린 혈장 중의 정상 DPP4 수준은 각각 197 내지 615 ng/㎖, 187 내지 604 ng/㎖ 및 159 내지 588 ng/㎖이다. 소변의 경우, 정상 DPP4 수준은 2.26 내지 13.3 ng/㎖이다. 침의 경우, 정상 DPP4 수준은 13.0 내지 69.9 ng/㎖이다.
DPP4 역치 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)은 분석의 성질, 예를 들면, 사용된 포획 항체 및 검출 항체, 공급원, 순도, 및 DPP4 표준물의 조성 등에 따라 달라질 수 있다. 한 양태에서, 환자가 IL-13 길항제(예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙)를 사용한 치료로부터 이익을 얻을 수 있는지를 확인하기 위해 임의 역치 수준을 사용하는 대신에, 환자의 DPP4 수준을 하나 이상의 대조군 DPP4 수준과 비교할 수 있다. 이 양태에 따라, 검사 샘플(예를 들면, IL-13 매개 질환 또는 장애를 앓고 있는 환자로부터의 샘플)을 하나 이상의 대조군 샘플(예를 들면, 정상의 건강한 개체로부터 채취된 샘플, 동일한 환자로부터 채취된 초기 샘플, 환자의 질환, 예를 들면, 천식, COPD, IPF, UC 또는 아토피성 피부염의 비-IL-13 매개 서브세트를 가진 환자로부터 채취된 샘플, 소정의 표준량의 단리된 DPP4 또는 이들의 조합)과 비교한다.
결과는 대조군 DPP4 수준에 비해 환자의 DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)의 퍼센트 증가 또는 퍼센트 감소를 측정하기 위해 대조군 샘플과의 비로서 표현될 수 있다. 이 양태에 따라, 대조군 샘플은 환자 샘플과 일치된 쌍, 예를 들면, 환자 샘플이 전혈인 경우 전혈, 환자 샘플이 혈청인 경우 혈청, 환자 샘플이 혈장인 경우 혈장, 환자 샘플이 침인 경우 침, 환자 샘플이 소변인 경우 소변, 환자 샘플이 객담인 경우 객담, 환자 샘플이 기관지폐포 세척액인 경우 기관지폐포 세척액, 환자 샘플이 폐 조직인 경우 폐 조직, 또는 환자 샘플이 피부인 경우 피부 중 하나 이상일 수 있다.
DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)은 대조군 DPP4 수준보다 적어도 약 10%, 적어도 20%, 적어도 약 30%, 적어도 약 40%, 적어도 약 50%, 적어도 약 60%, 적어도 약 70%, 적어도 약 80%, 적어도 약 90% 또는 적어도 약 100% 더 높은 경우 증가되어 있는 것으로 간주된다. DPP4는 대조군 DPP4 수준보다 적어도 약 10%, 적어도 20%, 적어도 약 30%, 적어도 약 40%, 적어도 약 50%, 적어도 약 60%, 적어도 약 70%, 적어도 약 80%, 적어도 약 90% 또는 적어도 약 100% 더 낮은 경우 감소되어 있는 것으로 간주된다.
DPP4를 검출하는 면역분석은 경쟁적 또는 비경쟁적 면역분석일 수 있다. 비경쟁적 면역분석은 포획된 분석물의 양이 직접적으로 측정되는 분석이다. 경쟁 분석에서, 샘플 중의 분석물의 양은 샘플에 존재하는 분석물에 의해 포획제로부터 이탈된(또는 경쟁에서 진) 첨가된 (외재성) 표지된 분석물의 양을 측정함으로써 간접적으로 측정된다. 한 경쟁적 분석에서, 이 경우 공지된 양의 표지된 DPP4가 샘플에 첨가된 후, 샘플이 포획제와 접촉된다. 항체에 결합된 표지된 DPP4의 양은 샘플에 존재하는 DPP4의 농도에 반비례한다.
DPP4 검출 분석은 당업자에게 잘 공지된 표준 방법에 따라 (양성 또는 음성, 또는 분석물의 양으로서) 점수화될 수 있다. 구체적인 점수화 방법은 분석 형식 및 표지의 선택에 의존할 것이다. 예를 들면, 웨스턴 블롯 분석은 효소적 표지에 의해 생성된 착색된 생성물을 가시화함으로써 점수화될 수 있다. 정확한 분자량에서 명확히 보이는 착색된 밴드 또는 점은 양성 결과로서 점수화되는 반면, 명확히 보이는 점 또는 밴드의 부재는 음성 결과로서 점수화된다. 상기 밴드 또는 점의 강도는 분석물 농도의 정량적 측정치를 제공할 수 있다.
일단 확인되면, DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)은 환자의 의료 기록에 기록될 수 있다. 일부 양태들에서, 본원에 개시된 방법은 적어도 부분적으로 DPP4 수준을 기준으로 진단, 종종 감별 진단을 수행하는 것을 포함한다.
본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "감별 진단"은 임상적 데이터의 분석을 기초로 유사한 증상을 가진 2종 이상의 질환들 중 어느 질환이 대상체의 증상(들)의 원인일 가능성이 있는지를 확인하는 것을 지칭한다. 상기 용어는 환자 샘플로부터의 샘플에서 측정된 DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준에 비해 상승되어 있는지에 따라 환자가 IL-13 길항제를 사용한 치료에 민감할지를 확인하는 것을 지칭할 수도 있다.
특정 양태에서, 본원에 개시된 방법은 적어도 부분적으로 DPP4 수준을 기초로 DPP4 분석 및/또는 진단의 결과를 대상체에게 통보하는 단계를 포함한다. 환자는 구두로, 서면으로 및/또는 전자적으로 통보받을 수 있다.
이 진단도 환자 의료 기록에 기록될 수 있다. 예를 들면, 다양한 양태들에서, 특정 IL-13 길항제로 치료될 수 있는 IL-13 매개 질환 또는 장애의 진단이 의료 기록에 기록된다. 용어 "의료 기록" 또는 "환자 의료 기록"은 환자의 병력 및 통증, 의사의 물리적 소견, 진단 검사 및 절차의 결과, 및 환자 약물 및 치료 절차 중 하나 이상을 전형적으로 포함하는 환자의 검사 및/또는 치료의 보고서를 지칭한다. 의료 기록은 전형적으로 1명 이상의 의사 및/또는 의사의 보조자에 의해 만들어지고, 의료적 케어를 요구하는 다양한 질병들 또는 손상들, 및/또는 예방접종, 및/또는 알레르기, 및/또는 치료, 및/또는 예후, 및/또는 종종 부모 및 형제자매에 대한 건강 정보, 및/또는 직업의 작성된, 복사된 또는 다른 방식으로 기록된 기록 및/또는 이력이다. 상기 기록은 상태를 진단함에 있어서 의사에 의해 검토될 수 있다.
의료 기록은 종이 형태로 존재할 수 있고/있거나 컴퓨터 판독가능한 매체로 유지될 수 있다. 의료 기록은 실험실, 의사의 진료실, 병원, 건강관리 유지 기구, 보험 회사 및/또는 개인 의료 기록 웹사이트에 의해 유지될 수 있다. 일부 양태들에서, 적어도 부분적으로 DPP4 수준을 기초로 한 진단은 의료 경보 물품, 예컨대, 카드, 착용된 물품, 및/또는 라디오주파수 식별(RFID) 태그 상에 또는 내에 기록된다. 본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "착용된 물품"은 태그, 팔찌, 목걸이, 팔 밴드 또는 머리 밴드를 포함하나 이들로 한정되지 않는, 대상체의 신체 상에 착용될 수 있는 임의의 물품을 지칭한다.
본원에 개시된 방법은 예를 들면, IL-13 매개 질환 또는 장애(예를 들면, 천식, IPF, COPD 또는 아토피성 피부염)에 대한 예방 및/또는 요법의 처방, 시작 및/또는 변경도 포함한다. 일부 양태들에서, 상기 방법은 하나 이상의 추가 분석을 지시하고/하거나 수행하는 것을 필요로 할 수 있다. 예를 들면, DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)이 정상 범위 이내에 있는(즉, 상승되어 있지 않은) 것으로 확인되는 경우, DPP4 분석을 반복하여 거짓 음성 결과를 배제할 수 있고/있거나, 하나 이상의 추가 DPP4 분석을 수행하여 대상체의 상태를 모니터링할 수 있다. DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)이 상승되어 있는 것으로 확인되는 경우, DPP4 분석을 반복하여 거짓 양성 결과를 배제하는 것이 바람직할 수 있다. 일부 양태들에서, 예를 들면, IL-13 매개 질환(예를 들면, 천식, IPF, COPD 또는 아토피성 피부염)의 또 다른 표시제를 분석하여 진단을 확인하는 것이 바람직할 것이다.
당업자는 DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)이 치료 방법, 진단 방법 및 모니터링 방법을 포함하나 이들로 한정되지 않는, 본원에 개시된 방법에 따라 (i) 양성 선택제(즉, 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준에 비해 상승되어 있는 경우 특정 조치(예를 들면, IL-13 길항제를 사용하여 IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 것)가 취해질 것임); (ii) 음성 선택제(즉, 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준 미만이거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준에 비해 더 낮은 경우 특정 조치(예를 들면, IL-13 길항제를 사용하여 IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 것)가 취해질 것임); 또는 (iii) 양성 선택제 및 음성 선택제 둘 다(예를 들면, 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준 초과/미만이거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준에 비해 더 높은/낮은 경우 특정 치료(예를 들면, 경구 코르티코스테로이드 치료)가 중단될 수 있고 상이한 치료(예를 들면, 항-IL-13 항체를 사용한 치료)가 시작될 수 있음)로서 사용될 수 있다는 것을 이해할 것이다.
III. 진단 및 치료 방법
본 개시내용은 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준에 비해 상승되어 있는 경우 IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자, 또는 IL-13에 의해 매개될 비공지된 병인의 폐 질환 또는 장애, 염증성 장 질환 또는 장애, 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법을 제공한다. 한 양태에서, 환자의 DPP4 수준은 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체 또는 유도체를 사용하는 면역분석으로 측정된다.
본 개시내용은 환자가 IL-13 길항제, 예를 들면, 항-IL-13 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 예를 들면, 트랄로키누맙, 또는 이의 단편, 변이체 또는 유도체, 트랄로키누맙과 동일한 IL-13 에피토프에 결합하는 항체 또는 이의 단편, 또는 트랄로키누맙과 IL-13의 결합을 경쟁적으로 억제하는 항체 또는 이의 단편을 사용한 치료로부터 이익을 얻을 것인지에 대한 건강관리 제공자, 건강관리 이익 제공자 또는 임상 실험실에 의한 결정을 용이하게 하는 방법, 분석 및 키트도 제공한다. 본원에서 제공된 상기 방법, 분석 및 키트는 환자가 본원에 개시되어 있거나 당분야에서 통상의 기술을 가진 자에게 공지되어 있는 임의의 다른 IL-13 길항제를 사용한 치료로부터 이익을 얻을지에 대한 건강관리 제공자, 건강관리 이익 제공자 또는 임상 실험실에 의한 결정도 용이하게 할 것이다.
본 개시내용은 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4의 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 인터류킨-13(IL-13) 매개 질환 또는 장애(예를 들면, 천식, IPF, COPD 또는 아토피성 피부염)를 가진 환자를 치료하는 방법을 제공한다. 일부 양태들에서, 샘플은 환자로부터 수득되고 샘플 중의 DPP4의 수준을 측정하기 위해, 예를 들면, 임상 실험실에 제출된다.
(a) 샘플 중의 DPP4 수준을 측정하기 위해 환자로부터 채취된 샘플을 제출하는 단계로서, 예를 들면, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석에서 환자의 DPP4 수준을 측정하는 단계; 및 (b) 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법도 제공된다.
본 개시내용은 (a) IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자로부터 얻은 샘플 중의 DPP4 수준을 측정하는 단계로서, 예를 들면, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석에서 샘플 중의 환자의 DPP4 수준을 측정하는 단계; (b) 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 단계; 및 (c) 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하도록 건강관리 제공자에게 조언하는 단계를 포함하는, IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법도 제공한다.
일부 양태들에서, 환자의 DPP4 수준은 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석으로 측정된다. 다른 양태에서, 환자의 DPP4 수준(예를 들면, DNA 또는 RNA 수준)은 DPP4 유전자의 발현을 특이적으로 측정할 수 있는 하나 이상의 올리고뉴클레오티드 프로브를 사용하는 분석으로 측정된다.
일부 양태들에서, DPP4 검출 분석(예를 들면, 면역분석)은 (예를 들면, "케어의 포인트(point of care)" 진단 키트로서 제제화된, 본원에 기재된 면역분석을 이용하여) 환자를 치료하는 건강관리 전문가에 의해 환자로부터 얻은 샘플에 대해 수행된다. 일부 양태들에서, 샘플은 환자로부터 수득되고, 예를 들면, 건강관리 전문가의 지시에 따라 (예를 들면, 본원에 기재된 면역분석을 이용함으로써) 샘플 중의 DPP4 수준을 측정하기 위해, 예를 들면, 임상 실험실에 제출된다. 일부 양태들에서, 상기 분석을 수행하는 임상 실험실은 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 값을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플에 비해 상승되어 있는지를 기초로 환자가 IL-13 길항제를 사용한 치료로부터 이익을 얻을 수 있는지에 대해 건강관리 제공자에게 조언할 것이다.
일부 양태들에서, 본 개시내용은 환자로부터 채취된 제1 샘플 중의 제1 DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)을 측정하거나 샘플 중의 제1 DPP4 수준을 측정하기 위해 환자로부터 채취된 제1 샘플을 제출하는 단계로서, 예를 들면, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석에서 환자의 DPP4 수준을 측정하는 것인 단계; 및 제1 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준에 비해 상승되어 있는 경우 IL-13 길항제를 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 일정한 기간에 걸쳐 IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법을 제공한다. 검사는 상기 언급된 바와 같이 건강관리 제공자 또는 임상 실험실에 의해 수행될 수 있다.
이 양태에 따르면, 상기 방법은 환자로부터 채취된 제2 샘플 중의 제2 DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)을 측정하거나 샘플 중의 제2 DPP4 수준을 측정하기 위해 환자로부터 채취된 제2 샘플을 제출하는 단계로서, 예를 들면, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석에서 환자의 DPP4 수준을 다시 측정하는 것인 단계; 환자에서 제1 DPP4 수준과 제2 DPP4 수준을 비교하는 단계; 및 용량을 변경하는, 예를 들면, 환자에게 투여되는 IL-13 길항제의 양 또는 빈도를 증가시키거나 유지하거나, 심지어 제2 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 제1 샘플 중의 DPP4 수준보다 더 높은 경우 IL-13 길항제 요법을 중단하거나, 제2 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 제1 샘플 중의 DPP4 수준보다 더 낮거나 제1 샘플 중의 DPP4 수준과 거의 동일한 경우 환자에게 투여되는 IL-13 길항제의 양 또는 빈도를 유지하거나 감소시키는 단계를 더 포함할 수 있다.
본원에서 제공된 모든 치료 방법 양태들의 일부 양태들에서, IL-13 길항제의 "로딩" 용량을 투여하여 환자에서 원하는 치료 수준을 달성한다. 로딩 용량이 환자의 DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)에 유의하게 영향을 미치지 않거나 환자의 DPP4 수준이 상승하는 경우, 예를 들면, 비-IL-13 길항제 요법을 사용하기 위해 치료를 중단하는 결정을 내릴 수 있다. 로딩 용량이 환자에서 정상 상태 또는 감소된 DPP4 수준을 초래하는 경우, 용량 크기 또는 빈도를 "유지" 용량까지 감소시키는 결정을 내릴 수 있다. 본원에서 제공된 방법은 건강관리 제공자가 치료를 관리하기 위한 지침이고 궁극적인 치료 결정은 건강관리 제공자의 타당한 판단에 기초할 것임을 인지하는 것이 중요하다.
일부 양태들에서, 본원에서 제공된 면역분석의 결과는 환자의 보험이 IL-13 길항제를 사용한 치료를 커버할 것인지에 대한 결정을 위해 건강관리 이익 제공자에게 제출될 수 있다.
일부 양태들에서, 본 개시내용은 IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자로부터 수득된 제1 샘플, 예를 들면, 건강관리 제공자에 의해 제공된 샘플 중의 DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)을 예를 들면, 임상 실험실에서 측정하는 단계로서, 예를 들면, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석에서 제1 샘플 중의 환자의 DPP4 수준을 측정하는 단계; 제1 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준에 비해 상승되어 있는지를 확인하는 단계; 및 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준에 비해 상승되어 있는 경우 IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하도록 건강관리 제공자에게 조언하는 단계를 포함하는, IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법을 제공한다.
일부 양태들에서, 이 방법은 환자로부터 수득된 제2 샘플, 예를 들면, 건강관리 제공자에 의해 제공된 샘플 중의 DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)을 측정하는 단계로서, 예를 들면, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석에서 환자의 DPP4 수준을 다시 측정하는 단계; 제2 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 제1 샘플에서 측정된 DPP4 수준보다 더 높은지, 제1 샘플에서 측정된 DPP4 수준과 거의 동일한지 아니면 제1 샘플에서 측정된 DPP4 수준보다 더 낮은지를 확인하는 단계; 및 예를 들면, 환자에게 투여되는 IL-13 길항제의 양 또는 빈도를 증가시키거나 유지하기 위해 표시된 경우 IL-13 길항제 요법을 조절하거나, 제2 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 제1 샘플 중의 DPP4 수준보다 더 높은 경우 IL-13 길항제 요법을 중단하거나, 제2 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 제1 샘플 중의 DPP4 수준보다 더 낮거나 제1 샘플 중의 DPP4 수준과 거의 동일한 경우 환자에게 투여되는 IL-13 길항제의 양 또는 빈도를 유지하거나 감소시키도록 건강관리 제공자에게 조언하는 단계를 더 포함할 수 있다.
일부 양태들에서, 샘플은 환자로부터 수득되고, 예를 들면, 면역분석을 이용하여 상기 샘플 중의 DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)을 측정하기 위해 예를 들면, 임상 실험실에게 제출된다. 일부 양태들에서, 분석을 수행하는 임상 실험실은 환자의 DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)이 소정의 DPP4 역치 값을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플에 비해 상승되어 있는지를 기초로 환자가 IL-13 길항제를 사용한 치료로부터 이익을 얻을 수 있는지에 대해 건강관리 제공자에게 조언할 것이다.
유사하게, 본 개시내용은 IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자로부터 수득된 제1 샘플 중의 DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)을 측정하거나 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계로서, 예를 들면, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석에서 환자의 DPP4 수준을 측정하는 것인 단계; 제1 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준에 비해 상승되어 있는 경우 IL-13 길항제를 환자에게 투여하거나 투여하도록 건강관리 전문가에게 조언하는 단계; 환자로부터 수득된 제2 샘플 중의 DPP4 수준을 측정하는 단계로서, 예를 들면, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석에서 환자의 DPP4 수준을 다시 측정하는 단계; 및 제2 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 제1 샘플에서 측정된 DPP4 수준보다 더 높은지, 제1 샘플에서 측정된 DPP4 수준과 거의 동일한지, 아니면 제1 샘플에서 측정된 DPP4 수준보다 더 낮은지를 확인하거나 표시하는 결과를 수득하는 단계를 포함하는, IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자에서 IL-13 길항제 치료법의 치료 효능을 모니터링하는 방법으로서, 제2 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 제1 샘플 중의 DPP4 수준보다 더 낮거나 제1 샘플 중의 DPP4 수준과 거의 동일한 경우 IL-13 길항제 치료법이 효과적인 것인 방법을 제공한다.
일부 양태들에서, 환자는 폐 질환 또는 장애로 진단받고, 진단 과정에서 환자를 IL-13 길항제로 치료할지에 대한 결정이 내려질 수 있다. 따라서, 일부 양태들에서, 본 개시내용은 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제를 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 폐 질환 또는 장애로 진단받은 환자를 치료하는 방법으로서, 예를 들면, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석에서 환자의 DPP4 수준을 측정하는 것인 방법을 제공한다.
일부 양태들에서, 본 개시내용은 하기 단계들을 포함하는, 폐 질환 또는 장애(예를 들면, 천식, IPF 또는 COPD) 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애(예를 들면, 아토피성 피부염)로 진단받은 환자를 치료하는 방법을 제공한다:
(a) 샘플 중의 DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)을 측정하기 위해 환자로부터 채취된 샘플을 제출하는 단계로서, 예를 들면, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석에서 환자의 DPP4 수준을 측정하는 것인 단계; 및
(b) 상기 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제를 환자에게 투여하는 단계.
일부 양태들에서, 본 개시내용은 하기 단계들을 포함하는, 폐 질환 또는 장애(예를 들면, 천식, IPF 또는 COPD) 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애(예를 들면, 아토피성 피부염)로 진단받은 환자를 IL-13 길항제 치료법으로 치료할지를 결정하는 방법도 제공한다:
(a) 폐 질환 또는 장애(예를 들면, 천식, IPF 또는 COPD) 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애(예를 들면, 아토피성 피부염)로 진단받은 환자로부터 얻은 샘플 중의 DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)을 측정하거나 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계로서, 예를 들면, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석에서 환자의 DPP4 수준을 측정하는 것인 단계; 및
(b) 상기 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 환자를 IL-13 길항제 치료법으로 치료하거나 치료하도록 건강관리 제공자에게 지시하는 단계.
일부 양태들에서, 본 개시내용은 샘플 중의 제1 DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)을 측정하기 위해 환자로부터 채취된 제1 샘플을 제출하는 단계로서, 예를 들면, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석에서 환자의 DPP4 수준을 측정하는 것인 단계; 및 제1 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준에 비해 상승되어 있는 경우 IL-13 길항제를 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 폐 질환 또는 장애(예를 들면, 천식, IPF 또는 COPD) 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애(예를 들면, 아토피성 피부염)로 진단받은 환자를 치료하는 방법을 제공한다. DPP4 수준은 건강관리 전문가에 의해, 또는 건강관리 전문가로부터 환자 샘플을 수득하고 건강관리 전문가에 의해 샘플 중의 DPP4를 측정하도록 지시받은 임상 실험실에 의해 측정될 수 있다.
일부 양태들에서, 상기 제공된 치료 방법은 샘플 중의 제2 DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)을 측정하기 위해 환자로부터 채취된 제2 샘플을 제출하는 단계로서, 예를 들면, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석에서 환자의 DPP4 수준을 다시 측정하는 것인 단계; 환자에게 투여되는 IL-13 길항제의 양 또는 빈도를 증가시키거나 유지하거나, 심지어 제2 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 제1 샘플 중의 DPP4 수준보다 더 높은 경우 IL-13 길항제 요법을 중단하거나, 제2 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 제1 샘플 중의 DPP4 수준보다 더 낮거나 제1 샘플 중의 DPP4 수준과 거의 동일한 경우 환자에게 투여되는 IL-13 길항제의 양 또는 빈도를 유지하거나 감소시키는 단계를 더 포함할 수 있다. 본원에서 제공된 방법은 건강관리 제공자가 치료를 관리하기 위한 지침이고 궁극적인 치료 결정은 건강관리 제공자의 타당한 판단에 기초할 것임을 인지하는 것이 중요하다.
일부 양태들에서, 본 개시내용은 폐 질환 또는 장애(예를 들면, 천식, IPF 또는 COPD), 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애(예를 들면, 아토피성 피부염)로 진단받은 환자로부터 수득된 제1 샘플 중의 DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)을 측정하거나 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계로서, 예를 들면, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석에서 환자의 DPP4 수준을 측정하는 것인 단계; 및 제1 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준에 비해 상승되어 있는 경우 환자를 IL-13 길항제 치료법으로 치료하거나 치료하도록 건강관리 제공자에게 지시하는 단계를 포함하는, 폐 질환 또는 장애(예를 들면, 천식, IPF 또는 COPD), 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애(예를 들면, 아토피성 피부염)로 진단받은 환자를 IL-13 길항제 치료법으로 치료할지를 결정하는 방법을 제공한다. 일부 양태들에서, 환자의 보험이 IL-13 길항제를 사용한 치료를 커버할지를 확인하기 위해 DPP4 수준 측정 분석(예를 들면, 면역분석)의 결과를 건강관리 이익 제공자에게 제출할 수 있다.
일부 양태들에서, 본원에 개시된 방법은 COPD를 진단하는 데에 이용될 수 있다. 다른 양태들에서, 본원에 개시된 방법은 대상체의 COPD가 COPD GOLD 분류에서 한 병기부터 후속 병기까지 진행되는 것을 예방하는 데에 이용될 수 있다. 또 다른 양태에서, 본원에 개시된 방법은 COPD 질환이 GOLD 분류에서 한 병기부터 후속 병기까지 진행되는 것을 모니터링할 수 있게 한다. 본원에 개시된 COPD 마커는 상기 정의된 바와 같은 COPD 병기 I/II 및 COPD 병기 III/IV를 앓고 있는 인간을 식별하는 데에도 적합하다. 이 COPD 병기들 사이의 식별은 적절한 요법을 결정하는 데에 중요하다. 또 다른 양태에서, 본원에 개시된 방법은 COPD가 GOLD 분류에서 한 병기부터 후속 병기까지 진행되는 것을 모니터링할 수 있게 한다. 또 다른 양태에서, 본원에 개시된 방법은 COPD 요법의 진행을 모니터링할 수 있게 한다. 또 다른 양태에서, 본원에 개시된 방법은 대상체의 COPD가 COPD GOLD 분류에서 한 병기부터 후속 병기까지 진행되는 것을 예방하거나 완화시키는 데에 이용될 수 있다. 일부 양태들에서, 본원에 개시된 방법은 COPD 악화를 예방하거나, 치료하거나 완화시키는 데에 이용될 수 있다.
일부 양태들에서, 환자는 IL-13 길항제의 투여 전에, 동안에 또는 후에 하나 이상의 추가 약물로 치료받았거나 치료받고 있다. 예를 들면, 천식, IPF, COPD, UC 및 아토피성 피부염을 치료하는 데에 유용한 다양한 다른 약물들은 본원의 다른 부분에 기재되어 있다. 일부 양태들에서, 환자는 예를 들면, 스테로이드, 기관지확장제 또는 이들의 조합을 포함하는 하나 이상의 추가 약물로 치료받았거나, 계속 치료받고 있거나 치료받을 것이다. 일부 양태들에서, 스테로이드는 코르티코스테로이드이다. 일부 양태들에서, 코르티코스테로이드는 경구 코르티코스테로이드이다. 일부 양태들에서, 스테로이드는 플루티카손 또는 부데소나이드이다. 일부 양태들에서, 기관지확장제는 살부타몰 또는 살메테롤이다. 일부 양태들에서, 추가 약물은 하나 이상의 스테로이드 및 하나 이상의 기관지확장제를 포함하고, 이때 상기 스테로이드는 플루티카손 또는 부데소나이드이고, 상기 기관지확장제는 살부타몰 또는 살메테롤이다. 일부 양태들에서, 하나 이상의 추가 약물은 흡입, 경구 투여, 주사, 또는 이들의 조합에 의해 투여된다. 일부 양태들에서, 흡입 투여는 정량 흡입기(MDI) 또는 건조 분말 흡입기(DPI)를 이용함으로써 수행된다.
일부 양태들에서, 스테로이드는 고용량으로 투여된다. 흡입 코르티코스테로이드(ICS)에 적용될 때 용어 고용량은 예를 들면, 적어도 500 ㎍의 ICS(예를 들면, 플루티카손) DPI 또는 적어도 440 ㎍ ICS MDI의 총 1일 용량을 지칭할 수 있다. 일부 양태들에서, 높은 ICS 총 1일 용량은 적어도 약 300 ㎍, 적어도 약 350 ㎍, 적어도 약 400 ㎍, 적어도 약 450 ㎍, 적어도 약 500 ㎍, 적어도 약 550 ㎍, 적어도 약 600 ㎍, 적어도 약 650 ㎍, 적어도 약 700 ㎍, 적어도 약 750 ㎍, 적어도 약 800 ㎍, 적어도 약 850 ㎍, 적어도 약 900 ㎍, 적어도 약 950 ㎍ 또는 적어도 1000 ㎍의 ICS(예를 들면, 플루티카손) DPI이다. 일부 양태들에서, 높은 ICS 총 1일 용량은 적어도 약 300 ㎍, 적어도 약 350 ㎍, 적어도 약 400 ㎍, 적어도 약 450 ㎍, 적어도 약 500 ㎍, 적어도 약 550 ㎍, 적어도 약 600 ㎍, 적어도 약 650 ㎍, 적어도 약 700 ㎍, 적어도 약 750 ㎍, 적어도 약 800 ㎍, 적어도 약 850 ㎍, 적어도 약 900 ㎍, 적어도 약 950 ㎍ 또는 적어도 1000 ㎍의 ICS(예를 들면, 플루티카손) MPI이다.
(예를 들면, 기관지확장제, 예컨대, 살메테롤을 사용한) 조합 치료에서 흡입 코르티코스테로이드(ICS)(예를 들면, 플루티카손)에 적용될 때 용어 "고용량"은 예를 들면, 일당 2회 2 흡입의 용량으로 MDI로서 약 230 ㎍ 플루티카손 및 약 21 ㎍ 살메테롤을 지칭할 수 있거나, 단일 용량 DPI로서 약 500 ㎍ 플루티카손 및 약 50 ㎍ 살메테롤을 지칭할 수 있다. 단독으로 사용될 때뿐만 아니라 다른 치료제와 조합될 때에도 고용량인 것으로 간주되는 코르티코스테로이드의 농도는 당분야에서 잘 공지되어 있다.
일부 양태들에서, IL-13 길항제는 항-IL-13 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 예를 들면, 트랄로키누맙, IL-13 뮤테인, 예를 들면, IL-13E13K(Kioi M, et al., Cell Immunol. 2004 229:41-51), IL-4 뮤테인, 예를 들면, 피트라킨라(Pitrakinra)(AER-001, BAY-16-9996)(Antoniu SA., Curr Opin Investig Drugs. 2010 11:1286-94), 항-IL-13Rα1 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 항-IL-4Rα 항체 또는 이의 항원 결합 단편 중 하나 이상을 포함한다. 일부 양태들에서, IL-13 길항제는 항-IL-13 항체 또는 이의 항원 결합 단편이다. 일부 양태들에서, 항-IL-13 항체 또는 이의 단편은 트랄로키누맙과 동일한 IL-13 에피토프에 결합하거나, 트랄로키누맙과 IL-13의 결합을 경쟁적으로 억제하거나, 이 성질들 둘 다를 가진다. 일부 양태들에서, 항체는 트랄로키누맙 또는 이의 항원 결합 단편을 포함한다. 다른 양태들에서, 항체 또는 이의 단편은 트랄로키누맙 또는 이의 항원 결합 단편으로 구성된다.
일부 양태들에서, 항-IL-13 항체 또는 이의 단편은 레브리키주맙과 동일한 IL-13 에피토프에 결합하거나, 레브리키주맙과 IL-13의 결합을 경쟁적으로 억제하거나, 이 성질들 둘 다를 가진다. 일부 양태들에서, 항-IL-13 항체 또는 이의 단편은 레브리키주맙 또는 이의 항원 결합 단편을 포함한다. 일부 양태들에서, 항-IL-13 항체 또는 이의 단편은 레브리키주맙 또는 이의 항원 결합 단편으로 구성된다.
일부 양태들에서, 본원에 개시된 방법에서 사용된 샘플은 환자로부터 채취되고 전혈, 혈청, 혈장, 침, 객담, 기관지폐포 세척액, 소변, 폐 상피 세포, 피부 또는 비용종 중 하나 이상을 포함한다. 특정 양태에서, 환자로부터 채취된 샘플은 혈액 혈청이다.
일부 양태들에서, 기준(즉, IL-13 길항제의 투여 전)에서의 기도 치수, 예를 들면, 세분절 기도의 폐의 CT 스캔을 이용함으로써 측정된 벽 면적 %(WA%)는 IL-13 길항제(예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙 또는 레브리키주맙)로 치료받은 환자 또는 치료받을 후보에서 치료 반응(예를 들면, 기도 저항성 및/또는 FEV1의 개선)을 예측하는 데에 사용될 수 있다. 본원에서 사용된 용어 "벽 면적"은 기관지 튜브 벽(예를 들면, 상엽 내의 분절 및 세분절 기관지)의 횡단면적을 지칭한다. 벽 면적 백분율(WA%)은 다음과 같이 계산된다: 100*벽 면적/(벽 면적 + 루멘 면적). 벽 면적 및 벽 면적 백분율을 측정하기 위한 수단은 당분야에서 잘 공지되어 있다. 예를 들면, 문헌(Gupta et al., J Allergy Clin Immunol. 133(3): 729-738 (2014)); 및 문헌(Gupta et al., Thorax. 65(9):775-81 (2010))을 참조한다. 일부 양태들에서, 기도 치수는 폐의 컴퓨터 단층촬영(CT) 영상화 데이터로부터 측정된다. 이러한 영상화 데이터는 예를 들면, 상업적으로 입수가능한 소프트웨어, 예컨대, VIDA 아폴로(Apollo)(예를 들면, 부피측정 정보 디스플레이 및 분석(VIDA) 폐 워크스테이션, VIDA 디아그노스틱스(Diagnostics), 미국 아이오와주 코랄빌 소재)를 이용함으로써 프로세싱될 수 있다. 일부 양태들에서, 폐의 CT 스캔 데이터로부터의 세분절 기도의 WA%는 예를 들면, IL-13 매개 질환, 예를 들면, 천식, COPD, 폐기종, IPF, UC 또는 아토피성 피부염을 앓고 있는 환자를 치료할지, 이러한 환자의 치료를 변경할지 아니면 이러한 환자의 치료를 모니터링할지를 결정하는 데에 사용될 수 있다. 일부 양태들에서, CT 스캔 데이터로부터의 세분절 기도의 WA%는 항-IL-13 치료제(예를 들면, 트랄로키누맙 또는 레브리키주맙)에 반응하는, IL-13 매개 질환, 예를 들면, 천식, COPD, 폐기종, IPF, UC 또는 아토피성 피부염을 앓고 있는 환자 집단을 확인하는 데에 단독으로 또는 다른 바이오마커(예를 들면, 페리오스틴, DPP4 및/또는 임상적 특징, 예컨대, FEV1 가역성)과 함께 사용될 수 있다. 따라서, 본 개시내용에서 제공된 방법은 환자의 폐의 CT 스캔 영상화 데이터로부터 측정된 WA%를 평가하는 단계, 및 세분절 기도의 WA%가 소정의 WA% 역치 수준 초과 또는 미만이거나 하나 이상의 대조군 CT 스캔에서의 WA% 초과 또는 미만인지를 확인하는 단계를 포함하고, 이때 소정의 WA% 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 CT 스캔에서의 WA%를 초과하는 세분절 기도의 WA% 값을 가진 IL-13 매개 질환(예를 들면, 천식, COPD, 폐기종, IPF, UC 또는 아토피성 피부염)을 앓고 있는 환자는 IL-13 길항제(예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙 또는 레브리키주맙)로 치료받는다. WA%는 본원에 개시된 방법에서 독립적으로, 또는 페리오스틴 수준, DPP4 수준 및/또는 임상적 특징, 예컨대, FEV1 가역성과 함께 사용될 수 있다.
일부 양태들에서, 본원에 개시된 방법에서 유용한 소정의 WA% 역치 수준은 약 40%, 약 45%, 약 50%, 약 55%, 약 65%, 약 70%, 약 75%, 약 80%, 약 85% 또는 90%이다. 일부 양태들에서, 본원에 개시된 방법에서 유용한 소정의 WA% 역치 수준은 약 60% 내지 약 80%이다. 다른 양태들에서, 본원에 개시된 방법에서 유용한 소정의 WA% 역치 수준은 약 65% 내지 약 75%이다. 다른 양태들에서, 본원에 개시된 방법에서 유용한 소정의 WA% 역치 수준은 약 60%이다. 다른 양태들에서, 본원에 개시된 방법에서 유용한 소정의 WA% 역치 수준은 약 68%이다. 특정 양태에서, 본원에 개시된 방법에서 유용한 소정의 WA% 역치 수준은 68%이다. 일부 양태들에서, 본원에 개시된 방법에서 유용한 소정의 WA% 역치 수준은 환자 집단의 평균 WA% 값이다. 다른 양태들에서, 본원에 개시된 방법에서 유용한 소정의 WA% 역치 수준은 환자 집단의 중간 WA% 값이다. 일부 양태들에서, 환자들은 IL-13 길항제(예를 들면, 트랄로키누맙 또는 레브리키주맙)로 치료받았다. 일부 양태들에서, 환자들은 IL-13 길항제로 치료받지 않았다(예를 들면, 이들은 비-IL-13 길항제 치료제로 치료받았거나 임의의 치료제로 치료받지 않았다).
일부 양태들에서, WA%는 분절 기관지를 사용한 폐 스캔의 CT 스캔 데이터의 3D 기도 분석을 이용함으로써 측정된다. 다른 양태들에서, WA%는 세분절 기관지를 사용한 폐 스캔의 CT 스캔 데이터의 3D 기도 분석을 이용함으로써 측정된다. 일부 양태들에서, 분절 또는 세분절 기관지는 상엽으로부터 유래된다. 일부 양태들에서, 분절 또는 세분절 기관지는 전체 폐로부터 유래된다. 일부 양태들에서, 분절된 기도는 우측 정점(RB1), 우측 전방(RB2), 우측 후방(RB3), 좌측 정점후방(apicoposterior)(LB1+2), LB3(좌측 전방) 또는 이들의 조합이다. 일부 양태들에서, 세분절 기도는 RB1a, RB1b, RB2a, RB2b, RB3a, RB3b, LB1, LB1a, LB1b, LB2, LB2a, LB2b, LB3a, LB3b 또는 이들의 조합이다. 문헌(Naidich, et al., Imaging of the Airways - Functional and Radiologic Correlations, 2005)을 참조한다. 일부 양태들에서, 기도 파라미터는 개별적으로 각각의 기도 분절에 대해 계산된 후, 각각의 대상체에서 분절 및/또는 세분절 기도에 대해 평균으로서 산출된다.
일부 양태들에서, 특정된 역치 초과의 WA%(예를 들면, 세분절 수준에서 적어도 60%의 WA%)를 가진 환자는 기도 저항성의 통계적으로 유의한 개선을 표시한다. 일부 양태들에서, 특정된 역치 초과의 WA%(예를 들면, 세분절 수준에서 적어도 60%의 WA%)를 가진 환자는 기관지확장제 전 FEV1의 통계적으로 유의한 개선을 표시한다. 일부 양태들에서, WA%는 CT 스캔 데이터, 예를 들면, 루멘 면적(LA), 벽 면적(WA), 벽 두께 면적(WT), 기도 저항성 또는 이들의 조합의 3D 기도 분석을 이용함으로써 수득된 다른 바이오마커와 조합될 수 있다.
일부 양태들에서, 본 개시내용의 방법은 DPP4의 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)을 측정하는 단계 이외에
(i) 환자의 IgE 수준,
(ii) 환자의 호산구 카운트,
(iii) 환자의 배출된 산화질소의 분획(FENO),
(iv) 환자의 호산구/림프구 및 호산구/호중구(ELEN) 지수(전체적으로 본원에 참고로 도입되는 국제 특허출원 공보 제WO2012158954호 참조),
(v) 환자의 EOS 지수(전체적으로 본원에 참고로 도입되는 국제 특허출원 공보 제WO2012158954호 참조),
(vi) 폐의 CT 스캔 데이터로부터 환자의 세분절 기도의 벽 면적 백분율(WA%), 또는
(vii) 이들 중 둘 이상의 조합
을 측정하거나, 측정을 위해 환자로부터 채취된 샘플을 제출하거나, 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계를 더 포함할 수 있다.
따라서, 전술된 일부 양태들에서, IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자는 감별 진단의 서브세트에서 IL-3에 의해 매개될 수 있는 폐 질환 또는 장애, 염증성 장 질환 또는 장애, 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애로 진단받았다. 예를 들면, 전체적으로 본원에 참고로 도입되는 미국 특허출원 공보 제2012-0328606호를 참조한다. 일부 양태들에서, IL-13 매개 병리학적 상태를 가진 것으로 의심되는 질환 또는 장애는 천식, 특발성 폐 섬유증(IPF), 만성 폐쇄성 폐 질환(COPD), 궤양성 결장염(UC) 또는 아토피성 피부염이다.
일부 양태들에서, 본원에 개시된 방법은 DPP4의 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)을 측정하는 단계 이외에 인간 페리오스틴의 동형체 1, 2, 3 또는 4, 또는 이들의 조합의 발현 수준 또는 활성을 측정하거나, 측정하기 위해 환자로부터 채취된 샘플을 제출하거나, 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계를 포함할 수 있다. IL-13 매개 질환에 대한 바이오마커로서의 페리오스틴의 용도는 예를 들면, 전체적으로 본원에 각각 참고로 도입되는 문헌(Jia, et al., J Allergy Clin. Immunol 2012 130:647-654); 문헌(Takayama, et al., J Allergy Clin Immunol 2006 118:98-104); 및 PCT 국제 공보 제WO2012/083132호에 개시되어 있다.
본원에서 사용된 용어 "페리오스틴"은 POSTN 유전자에 의해 코딩된 조골세포 특이적 인자 단백질(유니프롯: Q15063)을 지칭한다. 페리오스틴은 조골세포 특이적 인자 2(OSF-2)로서도 공지되어 있다. 페리오스틴은 상피 세포의 부착 및 이동을 뒷받침하기 위한 알파-V/베타-3 및 알파-V/베타-5 인테그린에 대한 리간드로서 기능한다. 페리오스틴은 gla 도메인 비타민 K 의존적 인자이다.
용어 페리오스틴은 이의 단편, 변이체(예를 들면, 대안적 스플라이싱에 의해 생성된 동형체) 및 유도체(예를 들면, 상기 단백질의 글리코실화된 또는 아글리코실화된 단백질 형태, 또는 상기 단백질의 다른 방식으로 화학적으로 변경된 형태)도 포함한다. 대안적 스플라이싱에 의해 생성된 7종의 동형체들이 당분야에서 공지되어 있다: 836개 아미노산 길이를 가진, OSF-2OS로서도 공지되어 있는 동형체 1(유니프롯: Q15063-1); 779개 아미노산 길이를 가진, OSF-2p1로서도 공지되어 있는 동형체 2(유니프롯: Q15063-2); 781개 아미노산 길이를 가진 동형체 3(유니프롯: Q15063-3); 751개 아미노산 길이를 가진 동형체 4(유니프롯: Q15063-4); 809개 아미노산 길이를 가진 동형체 5(유니프롯: Q15063-5); 749개 아미노산 길이를 가진 동형체 6(유니프롯: Q15063-6); 및 721개 아미노산 길이를 가진 동형체 7(유니프롯: Q15063-7). 공지된 페리오스틴 변이체는 기준 동형체-1 서열에 대하여 하기 서열 차이들 중 임의의 서열 차이를 가진 페리오스틴 변이체를 포함한다: I290F, D421V, T339I 또는 V814M.
일부 양태들에서, 용어 페리오스틴은 게놈 DNA, cDNA, mRNA 및 이들의 단편을 포함하는 페리오스틴 유전자를 지칭한다. 일부 양태들에서, 용어 페리오스틴은 엄격한 조건 하에서 페리오스틴 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 올리고뉴클레오티드도 지칭한다. 일부 양태들에서, 올리고뉴클레오티드는 A, T, C, G 또는 U, 예를 들면, 보편적인 염기와 상이한 뉴클레오염기를 포함한다. 전체적으로 본원에 참고로 도입되는 문헌(Takeshita et al. Biochem J. 294:271-278 (1993)); 문헌(Sasaki et al. Cancer 92:843-848 (2001)); 문헌(Blanchard et al. Mucosal Immunol. 1:289-296 (2008)); 문헌(Blanchard & Rothenberg, Immunol. Allergy Clin. North. Am. 29:141-148 (2009)); 문헌(Sidhu et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 107:14170-14175 (2010)); 및 문헌(Kanemitsu et al., J. Allergy Clin. Immunol. 132:305-12 (2013))을 참조한다.
다른 양태들에서, 본원에 개시된 방법은 DPP4의 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준) 및/또는 페리오스틴의 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)을 측정하는 단계 이외에 환자의 혈액 호산구 세포 카운트, 환자의 IgE 수준, 기관지확장제 전 또는 후 FEV1 가역성, 폐의 CT 스캔 데이터로부터의 세분절 기도의 벽 면적 백분율(WA%) 또는 이들의 조합을 측정하거나, 측정을 위해 환자로부터 채취된 샘플을 제출하거나, 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계를 포함할 수 있다.
다른 양태들에서, 본원에 개시된 방법은 DPP4의 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)을 측정하는 단계 이외에 sCTLA-3(가용성 CTLA-3; 세포독성 T-림프구 관련 세린 에스터라제 3, 그랜자임 A 또는 그랜자임 1로서도 공지되어 있음; 유니프롯: P12544), sCD28(가용성 CD28; 분화 28의 클러스터 또는 Tp44로서도 공지되어 있음; 유니프롯: P10747), CCL5(케모카인 C-C 모티프 리간드 5: RANTES로서도 공지되어 있음; 유니프롯: P13501), CCL11(C-C 모티프 케모카인 11; 호산구 화학주성 단백질 또는 에오탁신-1로서도 공지되어 있음; 유니프롯: P51671), CCL22(C-C 모티프 케모카인 22; 유니프롯: O00626), 또는 이들의 조합의 발현 수준 또는 활성을 측정하거나, 측정을 위해 환자로부터 채취된 샘플을 제출하거나, 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계를 포함할 수 있다. 이 바이오마커들은 IL-13 매개 질환, 예를 들면, 문헌(Lun et al., J. Clin. Immunol. 2007 27:430-437)에 개시되어 있다.
일부 양태들에서, 본원에 개시된 방법은 DPP4의 수준을 측정하는 단계 이외에 CCL26, FZD5, DOK1, CST2, ZNF436, C20orf100, NAGS, CST1, CDH13, HRH1, TMEM132B, NTRK1, SLCO2A1, IgE, FETUB, KRT31IKRT34, C6orf138, ATP5J, TUBAL3, JAM2, NOVA2, NOS2A, HS3ST4, GRM8, IL1R2, CTDSPL, CEP72, LOC199800, LYPD1, DISP1, NKX1-2, C4orf38, LOXL4, PRKD1, PAM124B, GPR44, HIGD1B, CLCA1, SEPT11, CYYR1, CD36, ALOX15, AADAC, ACTA1, ODC1, DKFZp434F142, ACHE, CSF3, LOC100132552, C12orf27, ZNF331, GK5, DUSP1IDUSP4, LRWD1, PGLYRP4, GUSBL2, CLGN, NR1I2, EST, LRRC37B, SAA4, SLC12A3, TMEM45A, FLJ37464, MUC5B, CXCL6, GLRB, DKFp686K01114, FOLR1, TSPAN6, AKR1C1, KIAA0232, PTP4A1, PCYT2, RHOV, PROS1, C11orf63, TCTN1, PIP5K1B, OSBPL6, NSUM7, GJB7, IRS2 또는 이들의 조합의 발현 수준 또는 활성을 측정하거나, 측정을 위해 환자로부터 채취된 샘플을 제출하거나, 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계를 더 포함할 수 있다. 이 유전자들은 문헌(Choi et al,, J. Immunol. 186(3):1861-9 (2011)) 및 국제 특허출원 공보 제WO2009124090호(이들 둘 다가 전체적으로 본원에 참고로 도입됨)에 개시된 바와 같이 Th-2 시그너처의 일부이다.
일부 양태들에서, 본원에 개시된 방법은 DPP4의 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)을 측정하는 단계 이외에 POSTN(서열번호 8), CST1(서열번호 9), CCL26(서열번호 10), CLCA1(서열번호 11), CST2(서열번호 12), PRR4(서열번호 13), SERPINB2(서열번호 14), CEACAM5(서열번호 15), iNOS(서열번호 16), SERPINB4(서열번호 17), CST4(서열번호 18), PRB4(서열번호 19), TPSD1(서열번호 20), TPSG1(서열번호 21), MFSD2(서열번호 22), CPA3(서열번호 23), GPR105(서열번호 24), CDH26(서열번호 25), GSN(서열번호 26), C2ORF32(서열번호 27), TRACH2000196(TMEM71)(서열번호 28), DNAJC12(서열번호 29), RGS13(서열번호 30), SLC18A2(서열번호 31), SERPINB10(서열번호 32), SH3RF2(서열번호 33), FCER1B(서열번호 34), RUNX2(서열번호 35), PTGS1(서열번호 36), ALOX15(서열번호 37), 및 이들의 조합의 발현 수준 또는 활성을 측정하거나, 측정을 위해 환자로부터 채취된 샘플을 제출하거나, 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계를 더 포함할 수 있다.
POSTN(페리오스틴)의 예는 서열번호 8을 포함하는 폴리펩티드 및 다른 POSTN 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 38 및/또는 39에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 POSTN 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
CST1(시스타틴-SN; 유니프롯: P01037)의 예는 서열번호 9를 포함하는 폴리펩티드 및 다른 CST1 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 40에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 CST1 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
CCL26(케모카인 (C-C 모티프) 리간드 26; 유니프롯: Q9Y258)의 예는 서열번호 10을 포함하는 폴리펩티드 및 다른 CCL26 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 41에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 CCL26 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
CLCA1(칼슘-활성화된 클로라이드 채널 조절제 1; 유니프롯: A8K7I4)의 예는 서열번호 11을 포함하는 폴리펩티드 및 다른 CLCA1 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 42에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 CLCA1 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
CST2(시스타틴-SA; 유니프롯: P09228)의 예는 서열번호 12를 포함하는 폴리펩티드 및 다른 CST 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 43에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 CST2 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
PRR4(프롤린 풍부 단백질 4; 유니프롯: Q16378)의 예는 서열번호 13을 포함하는 폴리펩티드 및 다른 PRR4 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 44에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 PRR4 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
SERPINB2(HsT1201, PAI, PAI-2, PAI2 또는 PLANH2로서도 공지되어 있는 플라스미노겐 활성화제 억제제-2(태아 PAI); 유니프롯: P05120)의 예는 서열번호 14를 포함하는 폴리펩티드 및 다른 SERPINB2 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 45에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 SERPINB2 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
CEACAM5(CD66e(분화 66의 클러스터)로서도 공지되어 있는 암배아 항원 관련 세포 부착 분자 5(CEACAM5); 유니프롯: P06731)의 예는 서열번호 15를 포함하는 폴리펩티드 및 다른 CEACAM5 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 46에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 CEACAM5 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
iNOS(iNOS 또는 NOS2로서도 공지되어 있는 유도성 NOS)의 예는 서열번호 16을 포함하는 폴리펩티드 및 다른 iNOS 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 47에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 iNOS 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
SERPINB4(LEUPIN, PI11, SCCA-2, SCCA1 또는 SCCA2로서도 공지되어 있는 서핀(serpin) 펩티다제 억제제, 클레이드(clade) B(오브알부민), 구성원 4; 유니프롯: P48594)의 예는 서열번호 17을 포함하는 폴리펩티드 및 다른 SERPINB4 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 48 및/또는 49에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 SERPINB4 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
CST4(시스타틴 S; 유니프롯: P01036)의 예는 서열번호 18을 포함하는 폴리펩티드 및 다른 CST4 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 50에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 CST4 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
PRB4(염기성 침 프롤린 풍부 단백질 4; 유니프롯: P10163)의 예는 서열번호 19를 포함하는 폴리펩티드 및 다른 PRB4 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 51에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 PRB4 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
TPSD1(델타-트립타제, 비만 세포 MMCP-7 유사 단백질 또는 HmMCP-3 유사 트립타제 III으로서도 공지되어 있는 트립타제 델타 11; 유니프롯: Q9BZJ3)의 예는 서열번호 20을 포함하는 폴리펩티드 및 다른 TPSD1 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 52 내지 58로 구성된 군으로서 선택된 서열에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 TPSD1 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
TPSG1(TMT, 트립타제 감마 I, 트립타제 감마 II, 세린 프로테아제 31, 폐 트립타제, 비만 세포 프로테아제 II, 비만 세포 트립타제, 또는 피부 트립타제로서도 공지되어 있는 트립타제 감마 1; 유니프롯: Q9NRR2)의 예는 서열번호 21을 포함하는 폴리펩티드 및 다른 TPSG1 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 59 내지 62로 구성된 군으로부터 선택된 서열에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 TPSG1 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
MFSD2(주요 촉진자 수퍼패밀리 도메인 함유 2A 단백질; 유니프롯: Q8NA29)의 예는 서열번호 22를 포함하는 폴리펩티드 및 다른 MFSD2 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 63에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 MFSD2 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
CPA3(비만 세포 카복시펩티다제 A, 조직 카복시펩티다제 A 또는 MC-CPA2로서도 공지되어 있는 카복시펩티다제 A3; 유니프롯: P15088)의 예는 서열번호 23을 포함하는 폴리펩티드 및 다른 CPA3 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 64에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 CPA3 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
GPR105(UDP-글루코스에 대한 G 단백질 커플링된 수용체, P2Y 푸리노셉터(purinoceptor) 14, BPR105, UDP-글루코스 수용체, 푸린성 수용체 P2Y G-단백질 커플링된 14 또는 P2RY14로서도 공지되어 있는 G-단백질 커플링된 수용체 105; 유니프롯: Q15391)의 예는 서열번호 24를 포함하는 폴리펩티드 및 다른 GPR105 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 65에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 GPR105 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
CDH26(VR20으로서도 공지되어 있는 캐드헤린 26; 유니프롯: Q8IXH8)의 예는 서열번호 25를 포함하는 폴리펩티드 및 다른 CDH26 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 66에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 CDH26 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
GSN(브레빈(brevin), ADF, AGEL 또는 액틴-탈중합 인자 2로서도 공지되어 있는 겔솔린(gelsolin); 유니프롯: P06396)의 예는 서열번호 26을 포함하는 폴리펩티드 및 다른 GSN 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 67에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 GSN 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
C2ORF32(CRIP-1로서도 공지되어 있는 칸나비노이드(cannabinoid) 수용체 상호작용 단백질 11; 유니프롯: Q96F85)의 예는 서열번호 27을 포함하는 폴리펩티드 및 다른 C2ORF32 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 68에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 C2ORF32 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
TRACH2000196(막관통 단백질 711 또는 TMEM71; 유니프롯: Q6P5X7)의 예는 서열번호 28을 포함하는 폴리펩티드 및 다른 TRACH2000196(TMEM71) 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 69에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 TRACH2000196 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
DNAJC12(JDP1 또는 J 도메인 단백질 1로서도 공지되어 있는 DnaJ (Hsp40) 상동체, 서브패밀리 C, 구성원 121; 유니프롯: Q9UKB3)의 예는 서열번호 29를 포함하는 폴리펩티드 및 다른 DNAJC12 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 70에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 DNAJC12 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
RGS 13(G-단백질 신호전달 13의 조절제; 유니프롯: O14921)의 예는 서열번호 30을 포함하는 폴리펩티드 및 다른 RGS 13 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 71에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 RGS 13 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
SLC18A2(용질 담체 패밀리 18 구성원 2(SLC18A2)로서도 공지되어 있는 소포 모노아민 수송제 2(VMAT2); 유니프롯: Q05940)의 예는 서열번호 31을 포함하는 폴리펩티드 및 다른 SLC18A2 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 72에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 SLC18A2 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
SERPINB10(서핀 펩티다제 억제제, 클레이드 B(오브알부민), 구성원 10; 유니프롯: P48595)의 예는 서열번호 32를 포함하는 폴리펩티드 및 다른 SERPINB10 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 73에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 SERPINB10 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
SH3RF2(SH3 고리 핑거(finger) 2 단백질)의 예는 서열번호 33을 포함하는 폴리펩티드 및 다른 SH3RF2 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 74에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 SH3RF2 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
FCER1B(고친화성 면역글로불린 엡실론 수용체 서브유닛 베타 또는 MS4A2; 유니프롯: Q01362)의 예는 서열번호 34를 포함하는 폴리펩티드 및 다른 FCER1B 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 75에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 FCER1B 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
RUNX2(코어 결합 인자 서브유닛 알파-1 또는 CBF-알파-1로서도 공지되어 있는 런트(runt) 관련 전사 인자 2; 유니프롯: Q13950)의 예는 서열번호 35를 포함하는 폴리펩티드 및 다른 RUNX2 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 76에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 RUNX2 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
PTGS1(프로스타글란딘 G/H 합성효소 1, 프로스타글란딘-엔도퍼록사이드 합성효소 1 또는 프로스타글란딘 H2 합성효소 1로서도 공지되어 있는 사이클로옥시게나제-1, COX-1; 유니프롯: P23219)의 예는 서열번호 36을 포함하는 폴리펩티드 및 다른 PTGS1 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 77에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 PTGS1 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
ALOX15(아라키도네이트 15-리폭시게나제; 유니프롯: P16050)의 예는 서열번호 37을 포함하는 폴리펩티드 및 다른 ALOX15 천연 서열 폴리펩티드, 예컨대, 엄격한 조건 하에서 서열번호 78에 혼성화할 수 있는 핵산 서열에 의해 코딩된 천연 생성 변이체 및 천연 서열 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 ALOX15 및 이의 단편을 코딩하는 핵산, 및 이의 상보적 서열도 포함된다.
일부 양태들에서, IL-13 길항제는 고정 용량으로 투여된다. 일부 특정 양태들에서, IL-13 길항제는 트랄로키누맙이고 고정 용량은 약 300 mg/용량이다. 일부 양태들에서, IL-13 길항제, 예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙은 2회 이상의 용량으로 투여된다. 일부 양태들에서, IL-13 길항제, 예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙은 주마다, 2주마다 또는 월마다 투여된다. 일부 양태들에서, IL-13 길항제, 예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙은 2주마다 투여된다. 일부 양태들에서, IL-13 길항제, 예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙은 정맥내로, 근육내로, 피하로 또는 이들의 조합에 의해 투여된다.
일부 양태들에서, 하나 이상의 대조군 샘플은 정상의 건강한 개체; 천식의 비-IL-13 매개 서브세트를 가진 환자; 코르티코스테로이드 치료에 대한 경험이 없는 천식 환자; 코르티코스테로이드로 치료받은 천식 환자; 소정의 표준량의 단리된 DPP4(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준); 또는 이들의 조합으로부터 수득된다.
일부 양태들에서, 환자에게의 IL-13 길항제, 예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙의 투여는 (a) AER(급성 악화율) 감소; (b) FEV1(1초간 강제 호기량) 증가; (c) 개선된 ACQ-6(천식 조절 설문지, 6-항목 버전) 결과; (d) 개선된 AQLQ(천식 삶의 질 설문지) 결과; 또는 (e) 이들의 조합을 유발한다.
일부 양태들에서, IL-13 길항제의 투여(예를 들면, 300 mg/용량의 고정 용량의 트랄로키누맙의 2주마다 투여) 후 AER 감소는 플라세보로 치료받은 환자의 집단에서 관찰된 AER에 비해 적어도 약 5%, 적어도 약 10%, 적어도 약 15%, 적어도 약 20%, 적어도 약 25%, 적어도 약 30%, 적어도 약 35%, 적어도 약 40%, 적어도 약 45%, 적어도 약 50%, 적어도 약 55% 또는 적어도 약 60%이다. 일부 특정 양태들에서, IL-13 길항제의 투여(예를 들면, 300 mg/용량의 고정 용량의 트랄로키누맙의 2주마다 투여) 후 AER 감소는 플라세보로 치료받은 환자의 집단에서 관찰된 평균 AER에 비해 약 28%이다.
일부 양태들에서, IL-13 길항제의 투여(예를 들면, 300 mg/용량의 고정 용량의 트랄로키누맙의 2주마다 투여) 후 FEV1 증가는 플라세보로 치료받은 환자의 집단에서 관찰된 FEV1에 비해 적어도 약 3%, 적어도 약 5%, 적어도 약 7%, 적어도 약 9%, 적어도 약 11%, 적어도 약 13%, 적어도 약 15%, 적어도 약 17% 또는 적어도 약 19%이다. 일부 양태들에서, IL-13 길항제의 투여(예를 들면, 300 mg/용량의 고정 용량의 트랄로키누맙의 2주마다 투여) 후 FEV1 증가는 플라세보로 치료받은 환자의 집단에서 관찰된 평균 FEV1에 비해 약 10%이다.
일부 양태들에서, IL-13 길항제의 투여(예를 들면, 300 mg/용량의 고정 용량의 트랄로키누맙의 2주마다 투여) 후 ACQ-6 변화는 플라세보로 치료받은 환자의 집단에서 관찰된 평균 ACQ-6에 비해 약 -0.5이다. 일부 양태들에서, IL-13 길항제의 투여(예를 들면, 300 mg/용량의 고정 용량의 트랄로키누맙의 2주마다 투여) 후 AQLQ 변화는 플라세보로 치료받은 환자의 집단에서 관찰된 평균 AQLQ에 비해 약 -0.5이다.
일부 양태들에서, 본 개시내용은 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4(디펩티딜 펩티다제-4)의 수준을 측정하는 단계를 포함하는, IL-13 길항제(예를 들면, 트랄로키누맙 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 레브리키주맙 또는 이의 항원 결합 단편을 비롯한 항-IL-13 항체)를 사용한 치료를 위한 후보로서 환자를 확인하는 방법으로서, 소정의 DPP4 역치 수준 초과 또는 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준 초과의 DPP4 수준이, IL-13 길항제를 사용한 치료를 위한 후보로서 환자를 확인하는 것인 방법을 제공한다.
일부 양태들에서, IL-13 길항제(예를 들면, 트랄로키누맙 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 레브리키주맙 또는 이의 항원 결합 단편을 비롯한 항-IL-13 항체)를 사용한 치료를 위한 후보로서 환자를 확인하는 방법은 페리오스틴, 호산구 세포 카운트, IgE 및 FEV1 가역성 중 하나 이상을 측정하는 단계를 추가로 포함하고, 이때 소정의 DPP4 역치 수준 초과 또는 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준 초과의 DPP4 수준 및 하기 (i) 내지 (v) 중 하나 이상은 IL-13 길항제를 사용한 치료를 위한 후보로서 환자를 확인시켜준다: (i) 높은 페리오스틴(≥ 중간 혈청 페리오스틴 또는 약 23 ng/㎖), (ii) 높은 호산구 세포 카운트(혈액 호산구 카운트 ≥ 300개 세포/㎕), (iii) 높은 Th2(IgE > 100 IU/㎖ 및 혈액 호산구 ≥ 0.14 X 109/ℓ로서 정의된 높은 Th2), (iv) 단기 작용 β2 효현제에 대한 FEV1 가역성 ≥ 12%, 또는 (v) 폐의 CT 스캔으로부터 환자의 세분절 기도의 약 68% 초과의 벽 면적 백분율(WA%).
일부 양태들에서, IL-13 길항제(예를 들면, 트랄로키누맙 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 레브리키주맙 또는 이의 항원 결합 단편을 비롯한 항-IL-13 항체)를 사용한 치료를 위한 후보로서 확인된 환자는 천식, IPF, COPD, 만성 비부비동염, 알레르기성 비염 또는 아토피성 피부염을 가진다. 일부 양태들에서, IL-13 길항제를 사용한 치료를 위한 후보로서 확인된 환자는 알레르기성 천식, 아토피성 천식, 코르티코스테로이드 무경험 천식, 만성 천식, 코르티코스테로이드 내성 천식, 코르티코스테로이드 불응성 천식, 흡연으로 인한 천식, 또는 코르티코스테로이드로 조절되지 않는 천식을 가진다.
일부 양태들에서, IL-13 길항제(예를 들면, 트랄로키누맙 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 레브리키주맙 또는 이의 항원 결합 단편을 비롯한 항-IL-13 항체)를 사용한 치료를 위한 후보로서 환자를 확인하는 데에 사용되는 혈청 샘플 중의 소정의 DPP4 역치 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)은 ELISA(예를 들면, 콴티카인® 분석)을 이용함으로써 혈청에서 측정되었을 때 적어도 약 250 ng/㎖, 적어도 약 350 ng/㎖, 적어도 약 365 ng/㎖, 적어도 약 375 ng/㎖, 적어도 약 400 ng/㎖, 적어도 약 450 ng/㎖, 적어도 약 500 ng/㎖, 적어도 550 ng/㎖, 또는 적어도 약 600 ng/㎖이다.
일부 양태들에서, IL-13 길항제를 사용한 치료를 위한 후보로서 환자를 확인하는 데에 사용된 하나 이상의 대조군 샘플은 정상의 건강한 개체; 천식의 비-IL-13 매개 서브세트를 가진 환자; 코르티코스테로이드 치료에 대한 경험이 없는 천식 환자; 코르티코스테로이드로 치료받은 천식 환자; 소정의 표준량의 단리된 DPP4; 또는 이들의 조합으로부터 수득되고; 전혈, 혈청, 혈장, 침, 객담, 기관지폐포 세척액, 폐 상피 세포, 소변 또는 이들의 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
일부 양태들에서, 본 개시내용은 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4(디펩티딜 펩티다제-4)의 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 환자에서 IL-13 매개 질환 또는 장애를 진단하는 방법으로서, DPP4의 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 환자가 IL-13 매개 질환 또는 장애로 진단받는 것인 방법을 제공한다.
추가로, 본 개시내용은 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4(디펩티딜 펩티다제-4)의 수준, 및 페리오스틴, 호산구 세포 카운트, IgE, FEV1 가역성 또는 폐의 CT 스캔으로부터 세분절 기도의 벽 면적 백분율(WA%) 중 하나 이상을 측정하는 단계를 포함하는, 환자에서 IL-13 매개 질환 또는 장애를 진단하는 방법으로서, DPP4의 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하고 환자가 하기 (i) 내지 (v) 중 하나 이상을 가진 경우 환자가 IL-13 매개 질환 또는 장애로 진단받는 것인 방법도 제공한다: (i) 높은 페리오스틴(≥ 중간 혈청 페리오스틴 또는 약 23 ng/㎖), (ii) 높은 호산구 세포 카운트(혈액 호산구 카운트 ≥ 300개 세포/㎕), (iii) 높은 Th2(IgE > 100 IU/㎖ 및 혈액 호산구 ≥ 0.14 X 109/ℓ로서 정의된 높은 Th2), (iv) 단기 작용 β2 효현제에 대한 FEV1 가역성 ≥ 12%, 또는 (v) 폐의 CT 스캔으로부터 환자의 세분절 기도의 약 68% 초과의 벽 면적 백분율(WA%).
일부 양태들에서, 본원에 개시된 방법을 이용함으로써 진단된 IL-13 매개 질환 또는 장애는 천식, IPF, COPD, 만성 비부비동염, 알레르기성 비염, 알레르기성 천식, 아토피성 천식, 코르티코스테로이드 무경험 천식, 만성 천식, 코르티코스테로이드 내성 천식, 코르티코스테로이드 불응성 천식, 흡연으로 인한 천식, 코르티코스테로이드로 조절되지 않는 천식 또는 아토피성 피부염이다.
일부 양태들에서, IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 진단하는 데에 사용된 샘플 중의 소정의 DPP4 역치 수준은 ELISA(예를 들면, 콴티카인® 분석)을 이용함으로써 혈청에서 측정되었을 때 적어도 약 250 ng/㎖, 적어도 약 350 ng/㎖, 적어도 약 365 ng/㎖, 적어도 약 375 ng/㎖, 적어도 약 400 ng/㎖, 적어도 약 450 ng/㎖, 적어도 약 500 ng/㎖, 적어도 550 ng/㎖, 또는 적어도 약 600 ng/㎖이다.
일부 양태들에서, IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 것으로서 환자를 진단하는 데에 사용된 하나 이상의 대조군 샘플은 정상의 건강한 개체; 천식의 비-IL-13 매개 서브세트를 가진 환자; 코르티코스테로이드 치료에 대한 경험이 없는 천식 환자; 코르티코스테로이드로 치료받은 천식 환자; 소정의 표준량의 단리된 DPP4; 또는 이들의 조합으로부터 수득되고; 전혈, 혈청, 혈장, 침, 객담, 기관지폐포 세척액, 폐 상피 세포, 소변, 피부 또는 이들의 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
IV. DPP4 검출 분석 및 키트
본 개시내용은 예를 들면, 면역분석 방법을 통해 DPP4(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)를 검출하는 키트도 제공한다. 이러한 키트는 예를 들면, 하나 이상의 항-DPP4 항체를 포함하는, 상기 방법에서 사용되는 다양한 시약들(예를 들면, 농축된 형태) 중 하나 이상을 각각 가진 용기들을 포함할 수 있다. 고체 지지체에 이미 부착된 하나 이상의 항-DPP4 항체, 예를 들면, 포획 항체가 제공될 수 있다. 검출가능한 표지, 예를 들면, 바이오틴 또는 루테늄 킬레이트에 이미 접합된 하나 이상의 항체, 예를 들면, 검출 항체가 제공될 수 있다. 키트는 검출가능한 표지를 항체(및 표지 그 자체)에 커플링시키기 위한 시약, 완충제, 및/또는 본원에서 제공된 분석의 실시를 뒷받침하기 위한 시약 및 기구를 제공할 수도 있다. 일부 양태들에서, 검출 항체에 결합하는 표지된 이차 항체가 제공될 수 있다. 본 개시내용에 따라 제공된 키트는 적합한 용기, 플레이트, 및 본원에서 제공된 분석을 실시하는 데에 필요한 임의의 다른 시약 또는 물질을 추가로 포함할 수 있다.
일부 양태들에서, 키트는 높은 엄격성 조건 하에서 DPP4 유전자 서열(서열번호 7)의 하위서열에 혼성화할 수 있는 하나 이상의 핵산 프로브(예를 들면, 천연 생성 뉴클레오티드 유닛 및/또는 화학적으로 변경된 뉴클레오티드 유닛을 포함하는 올리고뉴클레오티드)를 포함한다. 일부 양태들에서, 높은 엄격성 조건 하에서 DPP4 유전자 서열(서열번호 7)의 하위서열에 혼성화할 수 있는 하나 이상의 핵산 프로브(예를 들면, 천연 생성 뉴클레오티드 유닛 및/또는 화학적으로 변경된 뉴클레오티드 유닛을 포함하는 올리고뉴클레오티드)는 마이크로어레이 칩에 부착된다.
이 개시내용에 따라 제공된 키트는 과정을 기술하는 브로셔 또는 설명서도 포함할 수 있다. DPP4 검출 면역분석, 특히 샌드위치 면역분석, 예를 들면, ELISA 분석 또는 ECL 분석의 경우, 샌드위치 면역분석 과정은 고체 지지체에 부착된 제1 항-DPP4 "포획" 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 및 제2 항-DPP4 "검출" 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함한다. 면역분석은 본원에서 제공된 방법, 또는 당분야에서 통상의 기술을 가진 자에 의해 잘 공지되어 있고 이해되는 방법에 의해 수행될 수 있다. 한 양태에서, 면역분석은 포획 항체 또는 이의 단편을 고체 지지체에 부착시키는 단계; 검사 샘플 또는 대조군 샘플을 적용하는 단계; 샘플에 존재하는 경우 DPP4가 포획 항체 또는 이의 단편에 결합할 수 있게 하는 단계; 포획 항체 또는 이의 단편에 이미 결합된 DPP4에 결합할 수 있는 검출 항체 또는 이의 단편을 적용하는 단계; 및 DPP4에 결합된 검출 항체 또는 이의 단편의 양을 측정하는 단계를 포함한다. 일부 양태들에서, 분석은 세척 단계, 차단 단계 및 항온처리 단계를 추가로 포함할 수 있다.
검사 키트는 하나 이상의 DPP4 검출 분석, 예를 들면, 면역분석 또는 핵산 검출 분석을 수행하기 위한 설명서를 포함할 수 있다. 키트에 포함된 설명서는 포장재에 고정될 수 있거나 포장 삽입물로서 포함될 수 있다. 설명서는 전형적으로 작성된 또는 인쇄된 물질이지만, 이러한 것으로 한정되지 않는다. 이러한 설명서를 저장할 수 있고 상기 설명서를 최종 사용자에게 전달할 수 있는 임의의 매체가 고려된다. 이러한 매체는 전자 저장 매체(예를 들면, 자기 디스크, 테이프, 카트리지, 칩), 광학 매체(예를 들면, CD ROM) 등을 포함하나 이들로 한정되지 않는다. 본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "설명서"는 설명서를 제공하는 인터넷 장소의 주소를 포함할 수 있다.
V. 컴퓨터 방법 및 소프트웨어
본원에 개시된 방법은 생물학적 샘플을 수집하거나 다른 방식으로 수득하는 단계 및 단독으로 또는 다른 바이오마커(예를 들면, 유전자 시그너처, 예컨대, Th-2 시그너처를 유도하는 데에 사용되는 유전자 패널)와 함께 DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준)을 검출하고 측정하기 위해 분석 방법을 수행하는 단계를 포함할 수 있다. DPP4와 조합될 수 있는 바이오마커는 인간 페리오스틴의 동형체 1, 2, 3 또는 4, sCTLA-3, sCD28, CCL5, CCL11, CCL22, CCL26, FZD5, DOK1, CST2, ZNF436, C20orf100, NAGS, CST1, CDH13, HRH1, TMEM132B, NTRK1, SLCO2A1, IgE, FETUB, KRT31IKRT34, C6orf138, ATP5J, TUBAL3, JAM2, NOVA2, NOS2A, HS3ST4, GRM8, IL1R2, CTDSPL, CEP72, LOC199800, LYPD1, DISP1, NKX1-2, C4orf38, LOXL4, PRKD1, PAM124B, GPR44, HIGD1B, CLCA1, SEPT11, CYYR1, CD36, ALOX15, AADAC, ACTA1, ODC1, DKFZp434F142, ACHE, CSF3, LOC100132552, C12orf27, ZNF331, GK5, DUSP1IDUSP4, LRWD1, PGLYRP4, GUSBL2, CLGN, NR1I2, EST, LRRC37B, SAA4, SLC12A3, TMEM45A, FLJ37464, MUC5B, CXCL6, GLRB, DKFp686K01114, FOLR1, TSPAN6, AKR1C1, KIAA0232, PTP4A1, PCYT2, RHOV, PROS1, C11orf63, TCTN1, PIP5K1B, OSBPL6, NSUM7, GJB7, IRS2, 또는 이들의 조합을 포함한다. 전체적으로 본원에 참고로 도입되는 문헌(Lun et al., J. Clin. Immunol. 27:430-437 (2007)), 문헌(Choi et al,, J. Immunol. 186(3):1861-9 (2011)) 및 국제 특허출원 공보 제WO2009124090A1호를 참조한다. 본원 전체에서 사용된 식별자에 의해 표시된 단백질들 및 유전자들의 표준 명칭, 가명 등(예를 들면, PIP5K1B)은 예를 들면, 진카드(Genecards)(www.genecards.org) 또는 유니프롯(www.uniprot.org)을 통해 확인될 수 있다.
DPP4와 조합될 수 있는 바이오마커는 POSTN(서열번호 8), CST1(서열번호 9), CCL26(서열번호 10), CLCA1(서열번호 11), CST2(서열번호 12), PRR4(서열번호 13), SERPINB2(서열번호 14), CEACAM5(서열번호 15), iNOS(서열번호 16), SERPINB4(서열번호 17), CST4(서열번호 18), PRB4(서열번호 19), TPSD1(서열번호 20), TPSG1(서열번호 21), MFSD2(서열번호 22), CPA3(서열번호 23), GPR105(서열번호 24), CDH26(서열번호 25), GSN(서열번호 26), C2ORF32(서열번호 27), TRACH2000196(TMEM71)(서열번호 28), DNAJC12(서열번호 29), RGS13(서열번호 30), SLC18A2(서열번호 31), SERPINB10(서열번호 32), SH3RF2(서열번호 33), FCER1B(서열번호 34), RUNX2(서열번호 35), PTGS1(서열번호 36), ALOX15(서열번호 37), 및 이들의 조합을 포함한다.
DPP4 수준(예를 들면, 단백질 발현 수준 또는 유전자 발현 수준), 또는 측정된 DPP4 수준으로부터 유도된 표준화된 점수는 (예를 들면, 치료, 진단, 예후 또는 모니터링 목적을 위해) 단독으로 또는 다른 바이오마커(예를 들면, 유전자 시그너처, 예컨대, Th-2 시그너처를 유도하는 데에 사용되는 유전자 패널)로부터 유도된 수준 또는 표준화된 점수와 함께 사용될 수 있다. 이 점수들은 예를 들면, (i) 환자의 IgE 수준, (ii) 환자의 호산구 카운트, (iii) 환자의 배출된 산화질소의 분획(FENO), (iv) 환자의 호산구/림프구 및 호산구/호중구(ELEN) 지수, (v) 환자의 EOS 지수, (vi) 환자의 IgE 수준, (vii) 기관지확장제 전 또는 후 FEV1, FVC 측정치 또는 가역성, (viii) 폐의 CT 스캔으로부터 세분절 기도의 벽 면적 백분율(WA%), 또는 (ix) 이들 중 둘 이상의 조합에 상응하는 점수와 조합되어, 진단 점수를 생성할 수도 있다. 이 방식에서, 진단 점수는 질환의 존재 또는 부재의 표시인 소정의 DPP4 역치 값과 비교되는 모든 마커 계산값들의 합계로부터 결정된 단일 수치일 수 있다. 또는, 진단 점수는 바이오마커 값을 각각 나타내는 일련의 막대들일 수 있고, 반응의 패턴은 질환의 존재 또는 부재의 확인을 위해 소정의 패턴과 비교될 수 있다.
본원에 기재된 방법들의 적어도 일부 양태들에서, 관련된 계산의 복잡성으로 인해, 컴퓨터를 이용하여 바이오마커로서의 DPP4의 사용을 포함하는 방법을 실시할 수 있다. 일부 양태들에서, 컴퓨터 시스템은 프로세서, 입력 디바이스, 출력 디바이스, 저장 디바이스, 컴퓨터 판독가능한 저장 매체 판독기, 통신 시스템, 프로세싱 가속화(예를 들면, DSP 또는 특수 목적 프로세서) 및 메모리를 포함하는, 버스(bus)를 통해 전자적으로 커플링되어 있는 하드웨어 요소들을 포함한다. 컴퓨터 판독가능한 저장 매체 판독기는 컴퓨터 판독가능한 정보를 일시적으로 및/또는 보다 더 영구적으로 함유하기 위해 저장 디바이스, 메모리 및/또는 임의의 다른 이러한 접근가능한 시스템 리소스를 포함할 수 있는, 원거리, 근거리, 고정된 및/또는 제거가능한 저장 디바이스 플러스 저장 매체, 메모리 등을 포괄적으로 대표하는 조합물인 컴퓨터 판독가능한 저장 매체에 커플링될 수도 있다.
단일 구성이 현재 바람직한 프로토콜, 프로토콜 변경, 확장 등에 따라 배열될 수도 있는 하나 이상의 서버를 실행하는 데에 이용될 것이다. 그러나, 실시양태들이 보다 더 구체적인 적용 요건에 따라 잘 이용될 수 있다는 것은 당업자에게 자명할 것이다. 주문제작된 하드웨어도 이용될 것이고/것이거나, 특정 요소가 하드웨어, 소프트웨어 또는 이들 둘 다에서 실행될 것이다. 추가로, 다른 컴퓨팅 디바이스, 예컨대, 네트워크 입력/출력 디바이스(표시되어 있지 않음)와의 연결이 이용될 수 있지만, 다른 컴퓨팅 디바이스와의 유선, 무선, 모뎀 및/또는 다른 연결 또는 연결들도 이용될 수 있다는 것을 이해해야 한다.
한 양태에서, 시스템은 입력 데이터를 하나 이상의 프로세서에게 제공하기 위한 하나 이상의 디바이스도 포함한다. 시스템은 순위가 매겨진 데이터 요소들의 데이터 세트를 저장하기 위한 메모리도 포함한다. 또 다른 양태에서, 입력 데이터를 제공하기 위한 디바이스는 데이터 요소의 특징을 검출하기 위한 검출기, 예를 들면, 형광 플레이트 판독기, 질량 분광계 또는 유전자 칩 판독기를 포함한다.
시스템은 데이터베이스 관리 시스템을 추가로 포함할 수 있다. 사용자 요청 또는 질의는 질의를 프로세싱하여 트레이닝(training) 세트의 데이터베이스로부터 관련 정보를 추출하는 데이터베이스 관리 시스템에 의해 이해되는 적절한 언어로 포맷팅될 수 있다. 시스템은 네트워크 서버 및 1명 이상의 고객과 연결되어 있는 네트워크에 연결될 수 있다. 네트워크는 당분야에서 공지되어 있는 바와 같은 지역 네트워크(LAN) 또는 광역 네트워크(WAN)일 수 있다. 바람직하게는, 서버는 사용자 요청을 프로세싱하기 위해 컴퓨터 프로그램 제품(예를 들면, 소프트웨어)을 실행하여 데이터베이스 데이터에 접근하는 데에 필요한 하드웨어를 포함한다. 시스템은 데이터 요소에 관한 데이터(예를 들면, 발현 값)를 시스템에게 제공하기 위한 입력 디바이스와 소통할 수 있다. 한 양태에서, 입력 디바이스는 예를 들면, 질량 분광계, 유전자 칩 또는 어레이 판독기 등을 비롯한 유전자 발현 프로파일링 시스템을 포함할 수 있다.
본원에 기재된 일부 양태들은 컴퓨터 프로그램 제품을 포함하도록 실시될 수 있다. 컴퓨터 프로그램 제품은 응용 프로그램이 데이터베이스로 컴퓨터 상에서 실행되게 하도록 매체에 구현된 컴퓨터 판독가능한 프로그램 코드를 가진 컴퓨터 판독가능한 매체를 포함할 수 있다. 본원에서 사용된 바와 같이, "컴퓨터 프로그램 제품"은 임의의 성질(예를 들면, 작성된, 전자, 자기, 광학 또는 다른 방식)의 물리적 매체 상에 함유되어 있고 컴퓨터 또는 다른 자동화된 데이터 프로세싱 시스템과 함께 사용될 수 있는 천연 또는 프로그래밍 언어 서술문 형태의 조직화된 지시 세트를 지칭한다. 컴퓨터 또는 데이터 프로세싱 시스템에 의해 실행될 때, 이러한 프로그래밍 언어 서술문은 컴퓨터 또는 데이터 프로세싱 시스템이 상기 서술문의 특정 내용에 따라 작용하게 한다.
컴퓨터 프로그램 제품은 컴퓨터 판독가능한 매체에 내장된 소스 및 목적 코드 및/또는 검사 또는 데이터 라이브러리 형태의 프로그램들을 포함하나 이들로 한정되지 않는다. 나아가, 컴퓨터 시스템 또는 데이터 프로세싱 장치 디바이스가 미리 선택된 방식으로 작용할 수 있게 하는 컴퓨터 프로그램 제품은 원래의 소스 코드, 조립 코드, 목적 코드, 기계 언어, 이들의 암호화된 또는 압축된 버전 및 임의의 모든 등가물들을 포함하나 이들로 한정되지 않는 다수의 형태들로 제공될 수 있다.
한 양태에서, 컴퓨터 프로그램 제품은 본원에 개시된 치료, 진단, 예후 또는 모니터링 방법을 실시하기 위해, 예를 들면, 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4의 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제(예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙)를 이를 필요로 하는 환자에게 투여할지를 결정하기 위해 제공된다.
컴퓨터 프로그램 제품은 컴퓨팅 디바이스 또는 시스템의 프로세서에 의해 실행될 수 있는 프로그램 코드로서, 하기 코드들을 포함하는 프로그램 코드를 구현하는 컴퓨터 판독가능한 매체를 포함한다:
(a) 대상체로부터의 생물학적 샘플에 기인하는 데이터로서, 단독으로 또는 생물학적 샘플 중의 다른 바이오마커(예를 들면, 유전자 시그너처, 예컨대, Th-2 시그너처 또는 페리오스틴을 유도하는 데에 사용된 유전자 패널)에 상응하는 값과 함께 DPP4 수준 값(또는 이 수준 값으로부터 다른 방식으로 유도된 데이터)을 포함하는 데이터를 검색하는 코드(이 값들은 예를 들면, (i) 환자의 IgE 수준, (ii) 환자의 호산구 카운트, (iii) 환자의 배출된 산화질소의 분획(FENO), (iv) 환자의 호산구/림프구 및 호산구/호중구(ELEN) 지수, (v) 환자의 EOS 지수, (vi) 폐의 CT 스캔으로부터 세분절 기도의 벽 면적 백분율(WA%), (vii) 환자의 IgE 수준, (viii) 기관지확장제 전 또는 후 FEV1, FVC 측정치 또는 가역성, 또는 (ix) 이들 중 둘 이상의 조합에 상응하는 값과 조합될 수도 있다); 및
(b) 예를 들면, IL-13 길항제를 이를 필요로 하는 환자에게 투여할지를 표시하는 분류 방법을 실행하는 코드.
다양한 양태들이 방법 또는 장치로서 기재되어 있지만, 양태들이 컴퓨터와 커플링된 코드, 예를 들면, 컴퓨터 상에 존재하거나 컴퓨터에 의해 접근가능한 코드를 통해 실시될 수 있다는 것을 이해해야 한다. 예를 들면, 소프트웨어 및 데이터베이스는 상기 논의된 방법들 중 대다수의 방법들을 실시하는 데에 이용될 수 있다. 따라서, 양태들이 하드웨어에 의해 달성될 수 있다는 것 이외에, 이 양태들은 이 설명에 개시된 기능들을 가능하게 하는, 내부에 구현된 컴퓨터 판독가능한 프로그램 코드를 가진 컴퓨터 사용가능한 매체로 구성된 제품의 사용을 통해 달성될 수 있다는 것도 인지한다. 따라서, 양태들은 그들의 프로그램 코드 수단 면에서도 본 특허에 의해 보호되는 것으로 간주될 것이 요구된다.
나아가, 일부 양태들은 RAM, ROM, 자기 매체, 광학 매체 또는 자기-광학 매체를 포함하나 이들로 한정되지 않는 사실상 임의의 종류의 컴퓨터 판독가능한 메모리에 저장된 코드일 수 있다. 훨씬 더 일반적으로, 일부 양태들은 일반 목적의 프로세서, 마이크로코드, PLAs 또는 ASICs 상에서 실행되는 소프트웨어를 포함하나 이것으로 한정되지 않는 소프트웨어, 하드웨어 또는 이들의 임의의 조합에서 실시될 수 있다.
일부 양태들은 반송파로 구현된 컴퓨터 신호뿐만 아니라 전파 매체를 통해 전파된 신호(예를 들면, 전기 및 광학)로서도 달성될 수 있다는 것도 예상된다. 따라서, 상기 논의된 다양한 유형의 정보들이 구조, 예컨대, 데이터 구조로 포맷팅될 수 있고, 전파 매체를 통해 전기 신호로서 전파될 수 있거나 컴퓨터 판독가능한 매체 상에 저장될 수 있다.
V. 실시양태
실시양태는 "En" 체계에 따라 표시되어 있고, 이때 E는 "실시양태"를 의미하고 n은 실시양태 서수이다.
E1. 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4(디펩티딜 펩티다제-4)의 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제를 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 인터류킨-13(IL-13) 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법.
E2. (a) 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4의 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하고, (b) 환자가 (i) 높은 페리오스틴(≥ 중간 혈청 페리오스틴 또는 약 23 ng/㎖), (ii) 높은 호산구 세포 카운트(혈액 호산구 카운트 ≥ 300개 세포/㎕), (iii) 높은 Th2(IgE > 100 IU/㎖ 및 혈액 호산구 ≥ 0.14 X 109/ℓ로서 정의된 높은 Th2), (iv) 단기 작용 β2 효현제에 대한 FEV1 가역성 ≥ 12%, (v) 폐의 CT 스캔으로부터 세분절 기도의 벽 면적 %(WA%) ≥ 68%, 또는 (vi) 이들의 조합을 나타내는 경우, IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 인터류킨-13(IL-13) 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법.
E3. (a) 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4의 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하고, (b) 환자가 소정의 바이오마커 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 바이오마커 수준을 초과하는 하나 이상의 추가 바이오마커의 수준을 상기 환자로부터 채취된 샘플에서 나타내는 경우, IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 인터류킨-13(IL-13) 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법으로서, 상기 추가 바이오마커가 POSTN(서열번호 8), CST1(서열번호 9), CCL26(서열번호 10), CLCA1(서열번호 11), CST2(서열번호 12), PRR4(서열번호 13), SERPINB2(서열번호 14), CEACAM5(서열번호 15), iNOS(서열번호 16), SERPINB4(서열번호 17), CST4(서열번호 18), PRB4(서열번호 19), TPSD1(서열번호 20), TPSG1(서열번호 21), MFSD2(서열번호 22), CPA3(서열번호 23), GPR105(서열번호 24), CDH26(서열번호 25), GSN(서열번호 26), C2ORF32(서열번호 27), TRACH2000196(TMEM71)(서열번호 28), DNAJC12(서열번호 29), RGS13(서열번호 30), SLC18A2(서열번호 31), SERPINB10(서열번호 32), SH3RF2(서열번호 33), FCER1B(서열번호 34), RUNX2(서열번호 35), PTGS1(서열번호 36), ALOX15(서열번호 37), 및 이들의 조합으로 구성된 군으로부터 선택되는 것인 방법.
E4. 실시양태 E1 내지 E3에 있어서, 샘플을 환자로부터 수득하고 샘플 중의 DPP4 수준의 측정을 위해 제출하는 것인 방법.
E5. 실시양태 E1 내지 E4에 있어서, 환자의 DPP4 수준을 면역분석으로 측정하는 것인 방법.
E6. 실시양태 E5에 있어서, 면역분석이 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 사용하는 것인 방법.
E7. (a) 샘플 중의 DPP4 수준의 측정을 위해 환자로부터 채취된 샘플을 제출하는 단계로서, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로 상기 환자의 DPP4 수준을 측정하는 것인 단계; 및 (b) 상기 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법.
E8. (a) IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자로부터 얻은 샘플 중의 DPP4 수준을 측정하는 단계로서, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로 상기 샘플 중의 환자의 DPP4 수준을 측정하는 단계; (b) 상기 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는지를 확인하는 단계; 및 (c) 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하도록 건강관리 제공자에게 조언하는 단계를 포함하는, IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법.
E9. 실시양태 E1 내지 E8 중 어느 한 실시양태에 있어서, IL-13 매개 질환 또는 장애가 폐 질환 또는 장애, 염증성 장 질환 또는 장애, 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애인 방법.
E10. 실시양태 E9에 있어서, 폐 질환 또는 장애가 천식 또는 알레르기성 비염인 방법.
E11. 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제를 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 폐 질환 또는 장애, 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애로 진단받은 환자를 치료하는 방법.
E12. 실시양태 E11에 있어서, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 면역분석에서 환자의 DPP4 수준을 측정하는 것인 방법.
E13. (a) 샘플 중의 DPP4 수준의 측정을 위해 환자로부터 채취된 샘플을 제출하는 단계로서, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로 환자의 DPP4 수준을 측정하는 것인 단계; 및 (b) 상기 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제를 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 폐 질환 또는 장애, 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애로 진단받은 환자를 치료하는 방법.
E14. (a) 폐 질환 또는 장애, 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애로 진단받은 환자로부터 얻은 샘플 중의 DPP4 수준을 측정하거나 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계로서, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로 환자의 DPP4 수준을 측정하는 것인 단계; 및 (b) 상기 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제 치료법으로 환자를 치료하거나 치료하도록 건강관리 제공자에게 지시하는 단계를 포함하는, 폐 질환 또는 장애, 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애로 진단받은 환자를 IL-13 길항제 치료법으로 치료할지를 결정하는 방법.
E15. (a) 폐 질환 또는 장애, 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애로 진단받은 환자로부터 얻은 샘플 중의 DPP4 수준을 측정하거나 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계로서, 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로 상기 환자의 DPP4 수준을 측정하는 것인 단계; 및 (b) 상기 샘플 중의 환자의 DPP4 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 상기 환자를 IL-13 길항제 치료법으로 치료하거나 치료하도록 건강관리 제공자에게 지시하는 단계를 포함하는, IL-13 길항제 치료법을 사용한 치료를 위한 후보로서 폐 질환 또는 장애, 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애로 진단받은 환자를 선택하는 방법.
E16. 실시양태 E12 내지 E15 중 어느 한 실시양태에 있어서, 폐 질환 또는 장애가 천식, IPF, COPD, 만성 비부비동염 또는 알레르기성 비염이고, 만성 염증성 피부 질환 또는 장애가 아토피성 피부염, 알레르기성 접촉 피부염, 습진 또는 건선인 방법.
E17. 실시양태 E16에 있어서, 천식이 알레르기성 천식, 아토피성 천식, 코르티코스테로이드 무경험 천식, 만성 천식, 코르티코스테로이드 내성 천식, 코르티코스테로이드 불응성 천식, 흡연으로 인한 천식, 또는 코르티코스테로이드로 조절되지 않는 천식인 방법.
E18. 실시양태 E1 내지 E17 중 어느 한 실시양태에 있어서, IL-13 길항제가 항-IL-13 항체 또는 이의 항원 결합 단편, IL-13 뮤테인 및 IL-4 뮤테인, 항-IL-13Rα1 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 항-IL-4Rα 항체 또는 이의 항원 결합 단편 중 하나 이상을 포함하는 것인 방법.
E19. 실시양태 E1 내지 E18 중 어느 한 실시양태에 있어서, 환자가 IL-13 길항제의 투여 전에, 동안에 또는 후에 하나 이상의 추가 약물로 치료받은 것인 방법.
E20. 실시양태 E19에 있어서, 하나 이상의 추가 약물이 스테로이드를 포함하는 것인 방법.
E21. 실시양태 E19 또는 실시양태 E20에 있어서, 하나 이상의 추가 약물이 기관지확장제를 더 포함하는 것인 방법.
E22. 실시양태 E20 또는 실시양태 E21에 있어서, 스테로이드가 플루티카손 또는 부데소나이드인 방법.
E23. 실시양태 E21 또는 실시양태 E22에 있어서, 기관지확장제가 살부타몰 또는 살메테롤인 방법.
E24. 실시양태 E19 내지 E23 중 어느 한 실시양태에 있어서, 하나 이상의 추가 약물을 흡입, 경구 투여, 주사, 또는 이들의 조합으로 투여하는 것인 방법.
E25. 실시양태 E24에 있어서, 흡입 투여를 정량 흡입기(MDI) 또는 건조 분말 흡입기(DPI)를 이용하여 수행하는 것인 방법.
E26. 실시양태 E20 내지 E25에 있어서, 스테로이드를 고용량으로 투여하는 것인 방법.
E27. 실시양태 E1 내지 E26 중 어느 한 실시양태에 있어서, IL-13 길항제가 항-IL-13 항체 또는 이의 항원 결합 단편인 방법.
E28. 실시양태 E27에 있어서, 항체 또는 이의 단편이 트랄로키누맙과 동일한 IL-13 에피토프에 결합하거나, 트랄로키누맙과 IL-13의 결합을 경쟁적으로 억제하거나, 이 성질들 둘 다를 가진 것인 방법.
E29. 실시양태 E27 또는 실시양태 E28에 있어서, 항체 또는 이의 단편이 트랄로키누맙 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 것인 방법.
E30. 실시양태 E27 내지 E29 중 어느 한 실시양태에 있어서, 항체 또는 이의 단편이 트랄로키누맙 또는 이의 항원 결합 단편으로 구성되는 것인 방법.
E31. 실시양태 E27에 있어서, 항체 또는 이의 단편이 레브리키주맙과 동일한 IL-13 에피토프에 결합하거나, 레브리키주맙과 IL-13의 결합을 경쟁적으로 억제하거나, 이 성질들 둘 다를 가진 것인 방법.
E32. 실시양태 E27 또는 실시양태 E31에 있어서, 항체 또는 이의 단편이 레브리키주맙 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 것인 방법.
E33. 실시양태 E27, 실시양태 E31 또는 실시양태 E32에 있어서, 항체 또는 이의 단편이 레브리키주맙 또는 이의 항원 결합 단편으로 구성되는 것인 방법.
E34. 실시양태 E1 내지 E33 중 어느 한 실시양태에 있어서, 환자로부터 채취된 샘플이 전혈, 혈청, 혈장, 침, 객담, 기관지폐포 세척액, 폐 상피 세포, 소변, 피부 또는 비용종 중 하나 이상을 포함하는 것인 방법.
E35. 실시양태 E34에 있어서, 환자로부터 채취된 샘플이 혈액 혈청인 방법.
E36. 실시양태 E1 내지 E35 중 어느 한 실시양태에 있어서, (i) 환자의 IgE 수준, (ii) 환자의 호산구 카운트, (iii) 환자의 배출된 산화질소의 분획(FENO), (iv) 환자의 호산구/림프구 및 호산구/호중구(ELEN) 지수, (v) 환자의 EOS 지수, (vi) 폐의 CT 스캔으로부터 환자의 세분절 기도의 벽 면적 백분율(WA%), 또는 (vii) 이들 중 둘 이상의 조합을 측정하거나, 측정을 위해 환자로부터 채취된 샘플을 제출하거나, 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계를 더 포함하는 방법.
E37. 실시양태 E1 내지 E36 중 어느 한 실시양태에 있어서, 인간 페리오스틴의 동형체 1, 2, 3 또는 4의 발현 수준 또는 활성, 환자의 혈액 호산구 세포 카운트, 환자의 IgE 수준, 기관지확장제 전 또는 후 FEV1 가역성, 폐의 CT 스캔으로부터의 세분절 기도의 벽 면적 백분율(WA%) 또는 이들의 조합을 측정하거나, 측정을 위해 환자로부터 채취된 샘플을 제출하거나, 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계를 더 포함하는 방법.
E38. 실시양태 E1 내지 E37 중 어느 한 실시양태에 있어서, sCTLA-3, sCD28, CCL5, CCL11, CCL22 또는 이의 조합물의 발현 수준 또는 활성을 측정하거나, 측정을 위해 환자로부터 채취된 샘플을 제출하거나, 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계를 더 포함하는 방법.
E39. 실시양태 E1 내지 E38 중 어느 한 실시양태에 있어서, POSTN(서열번호 8), CST1(서열번호 9), CCL26(서열번호 10), CLCA1(서열번호 11), CST2(서열번호 12), PRR4(서열번호 13), SERPINB2(서열번호 14), CEACAM5(서열번호 15), iNOS(서열번호 16), SERPINB4(서열번호 17), CST4(서열번호 18), PRB4(서열번호 19), TPSD1(서열번호 20), TPSG1(서열번호 21), MFSD2(서열번호 22), CPA3(서열번호 23), GPR105(서열번호 24), CDH26(서열번호 25), GSN(서열번호 26), C2ORF32(서열번호 27), TRACH2000196(TMEM71)(서열번호 28), DNAJC12(서열번호 29), RGS13(서열번호 30), SLC18A2(서열번호 31), SERPINB10(서열번호 32), SH3RF2(서열번호 33), FCER1B(서열번호 34), RUNX2(서열번호 35), PTGS1(서열번호 36), ALOX15(서열번호 37) 및 이들의 조합의 발현 수준 또는 활성을 측정하거나, 측정을 위해 환자로부터 채취된 샘플을 제출하거나, 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계를 더 포함하는 방법.
E40. 실시양태 E1 내지 E39 중 어느 한 실시양태에 있어서, IL-13 길항제를 고정 용량으로 투여하는 것인 방법.
E41. 트랄로키누맙을 약 300 mg/용량의 고정 용량으로 투여하는 것인 방법.
E42. 실시양태 E1 내지 E41 중 어느 한 실시양태에 있어서, IL-13 길항제를 2회 이상의 용량으로 투여하는 것인 방법.
E43. 실시양태 E1 내지 E42 중 어느 한 실시양태에 있어서, IL-13 길항제를 주마다, 2주마다 또는 월마다 투여하는 것인 방법.
E44. 실시양태 E1 내지 E43 중 어느 한 실시양태에 있어서, IL-13 길항제를 2주마다 투여하는 것인 방법.
E45. 실시양태 E1 내지 E44 중 어느 한 실시양태에 있어서, IL-13 길항제를 정맥내로, 근육내로, 피하로 또는 이들의 조합으로 투여하는 것인 방법.
E46. 실시양태 E1 내지 E45 중 어느 한 실시양태에 있어서, 소정의 DPP4 역치 수준이 ELISA를 이용함으로써 혈청에서 측정될 때 적어도 약 250 ng/㎖, 적어도 약 350 ng/㎖, 적어도 약 375 ng/㎖, 적어도 약 400 ng/㎖, 적어도 약 450 ng/㎖, 적어도 약 500 ng/㎖, 적어도 약 550 ng/㎖, 또는 적어도 약 600 ng/㎖인 방법.
E47. 실시양태 E46에 있어서, ELISA가 콴티카인® 분석인 방법.
E48. 실시양태 E46 또는 E47에 있어서, 소정의 DPP4 역치 수준이 약 365 ng/㎖인 방법.
E49. 실시양태 E1 내지 E48 중 어느 한 실시양태에 있어서, 하나 이상의 대조군 샘플을 정상의 건강한 개체; 천식의 비-IL-13 매개 서브세트를 가진 환자; 코르티코스테로이드 치료에 대한 경험이 없는 천식 환자; 코르티코스테로이드로 치료받은 천식 환자; 소정의 표준량의 단리된 DPP4; 또는 이들의 조합으로부터 수득하는 것인 방법.
E50. 실시양태 E49에 있어서, 하나 이상의 대조군 샘플이 전혈, 혈청, 혈장, 침, 객담, 기관지폐포 세척액, 폐 상피 세포, 소변, 피부 또는 이들의 조합 중 하나 이상을 포함하는 것인 방법.
E51. 실시양태 E1 내지 E50 중 어느 한 실시양태에 있어서, IL-13 길항제의 투여가 (a) AER(급성 악화율) 감소; (b) FEV1(1초간 강제 호기량) 증가; (c) 개선된 ACQ-6(천식 조절 설문지, 6-항목 버전) 결과; (d) 개선된 AQLQ(천식 삶의 질 설문지) 결과; 또는 (e) 이들의 조합을 유발하는 것인 방법.
E52. 실시양태 E51에 있어서, AER 감소가 플라세보로 치료받은 환자의 집단에서 관찰된 AER에 비해 적어도 5%, 적어도 10%, 적어도 15%, 적어도 20%, 적어도 25%, 적어도 30%, 적어도 35%, 적어도 40% 또는 적어도 45%인 방법.
E53. 실시양태 E51 또는 실시양태 E52에 있어서, 평균 AER 감소가 플라세보로 치료받은 환자의 집단에서 관찰된 평균 AER에 비해 약 28%인 방법.
E54. 실시양태 E51에 있어서, FEV1 증가가 플라세보로 치료받은 환자의 집단에서 관찰된 FEV1에 비해 적어도 3%, 적어도 5%, 적어도 7%, 적어도 9%, 적어도 11%, 적어도 13%, 적어도 15%, 적어도 17% 또는 적어도 19%인 방법.
E55. 실시양태 E51 또는 실시양태 E54에 있어서, 평균 FEV1이 플라세보로 치료받은 환자의 집단에서 관찰된 평균 FEV1에 비해 약 10%인 방법.
E56. 실시양태 E3 내지 E55 중 어느 한 실시양태에 있어서, (a) 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4의 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하고, (b) 환자가 (i) 높은 페리오스틴(≥ 중간 혈청 페리오스틴 또는 약 23 ng/㎖), (ii) 높은 호산구 세포 카운트(혈액 호산구 카운트 ≥ 300개 세포/㎕), (iii) 높은 Th2(IgE > 100 IU/㎖ 및 혈액 호산구 ≥ 0.14 X 109/ℓ로서 정의된 높은 Th2), (iv) 단기 작용 β2 효현제에 대한 FEV1 가역성 ≥ 12%, (v) 폐의 CT 스캔으로부터의 세분절 기도의 벽 면적 백분율(WA%) ≥ 68%, 또는 (vi) 이들의 조합을 나타내는 경우, IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는 방법.
E57. 실시양태 E7 내지 E56 중 어느 한 실시양태에 있어서, DPP4를 면역분석으로 측정하는 것인 방법.
E58. 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4(디펩티딜 펩티다제-4)의 수준을 측정하는 단계를 포함하는, IL-13 길항제를 사용한 치료를 위한 후보로서 환자를 확인하는 방법으로서, 소정의 DPP4 역치 수준 초과 또는 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준 초과의 DPP4 수준이, IL-13 길항제를 사용한 치료를 위한 후보로서 환자를 확인하는 것인 방법.
E59. 실시양태 E58에 있어서, 페리오스틴, 호산구 세포 카운트, IgE 및 FEV1 가역성 중 하나 이상을 측정하는 단계를 더 포함하는 방법으로서, 소정의 DPP4 역치 수준 초과 또는 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준 초과의 DPP4 수준 및 하기 (i) 내지 (v) 중 하나 이상이 IL-13 길항제를 사용한 치료를 위한 후보로서 환자를 확인시켜주는 것인 방법: (i) 높은 페리오스틴(≥ 중간 혈청 페리오스틴 또는 약 23 ng/㎖), (ii) 높은 호산구 세포 카운트(혈액 호산구 카운트 ≥ 300개 세포/㎕), (iii) 높은 Th2(IgE > 100 IU/㎖ 및 혈액 호산구 ≥ 0.14 X 109/ℓ로서 정의된 높은 Th2), (iv) 폐의 CT 스캔으로부터 세분절 기도의 벽 면적 백분율(WA%) ≥ 68%, 또는 (v) 단기 작용 β2 효현제에 대한 FEV1 가역성 ≥ 12%.
E60. 실시양태 E58 또는 E59에 있어서, 환자가 천식, IPF, COPD, 만성 비부비동염, 알레르기성 비염 또는 아토피성 피부염을 가진 것인 방법.
E61. 실시양태 E60에 있어서, 천식이 알레르기성 천식, 아토피성 천식, 코르티코스테로이드 무경험 천식, 만성 천식, 코르티코스테로이드 내성 천식, 코르티코스테로이드 불응성 천식, 흡연으로 인한 천식, 또는 코르티코스테로이드로 조절되지 않는 천식인 방법.
E62. 실시양태 E58 내지 E61 중 어느 한 실시양태에 있어서, IL-13 길항제가 항-IL-13 항체 또는 이의 항원 결합 단편인 방법.
E63. 실시양태 E62에 있어서, 항-IL-13 항체 또는 이의 항원 결합 단편이 트랄로키누맙 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 레브리키주맙 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 것인 방법.
E64. 실시양태 E58 내지 E63 중 어느 한 실시양태에 있어서, 소정의 DPP4 역치 수준이 ELISA를 이용함으로써 혈청에서 측정될때 적어도 약 250 ng/㎖, 적어도 약 350 ng/㎖, 적어도 약 375 ng/㎖, 적어도 약 400 ng/㎖, 적어도 약 450 ng/㎖, 적어도 약 500 ng/㎖, 적어도 약 550 ng/㎖, 또는 적어도 약 600 ng/㎖인 방법.
E65. 실시양태 E64에 있어서, ELISA가 콴티카인® 분석인 방법.
E66. 실시양태 E64 또는 실시양태 E65에 있어서, 소정의 DPP4 역치 수준이 약 365 ng/㎖인 방법.
E67. 실시양태 E58 내지 E66 중 어느 한 실시양태에 있어서, 하나 이상의 대조군 샘플을 정상의 건강한 개체; 천식의 비-IL-13 매개 서브세트를 가진 환자; 코르티코스테로이드 치료에 대한 경험이 없는 천식 환자; 코르티코스테로이드로 치료받은 천식 환자; 치료받지 않은 아토피성 피부염 환자; 치료받은 아토피성 피부염 환자; 소정의 표준량의 단리된 DPP4; 또는 이들의 조합으로부터 수득하는 것인 방법.
E68. 실시양태 E67에 있어서, 하나 이상의 대조군 샘플이 전혈, 혈청, 혈장, 침, 객담, 기관지폐포 세척액, 폐 상피 세포, 소변, 피부 또는 이들의 조합 중 하나 이상을 포함하는 것인 방법.
E69. 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4(디펩티딜 펩티다제-4)의 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 환자에서 IL-13 매개 질환 또는 장애를 진단하는 방법으로서, DPP4의 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우 환자를 IL-13 매개 질환 또는 장애로 진단하는 것인 방법.
E70. 실시양태 E69에 있어서, 페리오스틴, 호산구 세포 카운트, IgE 및 FEV1 가역성 중 하나 이상을 측정하는 단계를 더 포함하는 방법으로서, DPP4의 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하고 환자가 하기 (i) 내지 (v) 중 하나 이상을 가진 경우 환자를 IL-13 매개 질환 또는 장애로 진단하는 것인 방법: (i) 높은 페리오스틴(≥ 중간 혈청 페리오스틴 또는 약 23 ng/㎖), (ii) 높은 호산구 세포 카운트(혈액 호산구 카운트 ≥ 300개 세포/㎕), (iii) 높은 Th2(IgE > 100 IU/㎖ 및 혈액 호산구 ≥ 0.14 X 109/ℓ로서 정의된 높은 Th2), (iv) 폐의 CT 스캔으로부터 세분절 기도의 벽 면적 백분율(WA%) ≥ 68%, 또는 (v) 단기 작용 β2 효현제에 대한 FEV1 가역성 ≥ 12%.
E71. 실시양태 E69 또는 E70에 있어서, IL-13 매개 질환 또는 장애가 천식, IPF, COPD, 만성 비부비동염, 알레르기성 비염 또는 아토피성 피부염인 방법.
E72. 실시양태 E71에 있어서, 천식이 알레르기성 천식, 아토피성 천식, 코르티코스테로이드 무경험 천식, 만성 천식, 코르티코스테로이드 내성 천식, 코르티코스테로이드 불응성 천식, 흡연으로 인한 천식, 또는 코르티코스테로이드로 조절되지 않는 천식인 방법.
E73. 실시양태 E69 내지 E72 중 어느 한 실시양태에 있어서, 소정의 DPP4 역치 수준이 ELISA를 이용함으로써 혈청에서 측정될 때 적어도 약 250 ng/㎖, 적어도 약 350 ng/㎖, 적어도 약 375 ng/㎖, 적어도 약 400 ng/㎖, 적어도 약 450 ng/㎖, 적어도 약 500 ng/㎖, 적어도 약 550 ng/㎖, 또는 적어도 약 600 ng/㎖인 방법.
E74. 실시양태 E73에 있어서, ELISA가 콴티카인® 분석인 방법.
E75. 실시양태 E73 또는 실시양태 E74에 있어서, 소정의 DPP4 역치 수준이 약 365 ng/㎖인 방법.
E76. 실시양태 E69 내지 E75 중 어느 한 실시양태에 있어서, 하나 이상의 대조군 샘플을 정상의 건강한 개체; 천식의 비-IL-13 매개 서브세트를 가진 환자; 코르티코스테로이드 치료에 대한 경험이 없는 천식 환자; 코르티코스테로이드로 치료받은 천식 환자; 소정의 표준량의 단리된 DPP4; 또는 이들의 조합으로부터 수득하는 것인 방법.
E77. 실시양태 E76에 있어서, 하나 이상의 대조군 샘플이 전혈, 혈청, 혈장, 침, 객담, 기관지폐포 세척액, 폐 상피 세포, 소변, 피부 또는 이들의 조합을 포함하는 것인 방법.
E78. 실시양태 E1 내지 E77 중 어느 한 실시양태에 있어서, (a) 환자의 폐로부터 촬영된 컴퓨터 단층촬영(CT) 스캔으로부터 벽 면적 백분율(WA%)을 측정하는 단계; (b) 상기 CT 스캔으로부터 WA%를 측정하기 위해 환자의 폐로부터 촬영된 CT 스캔을 제출하는 단계; 또는 (c) 상기 CT 스캔으로부터 WA%를 측정하도록 임상 실험실에게 지시하는 단계를 더 포함하는 방법.
E79. 환자의 폐의 CT 스캔으로부터 측정된 벽 면적 백분율(WA%)이 소정의 WA% 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 CT 스캔으로부터 계산된 WA% 역치 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제를 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 인터류킨-13(IL-13) 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법.
E80. (a) CT 스캔으로부터 벽 면적 백분율(WA%)을 측정하기 위해 환자의 폐의 CT 스캔을 제출하는 단계; 및 (b) 상기 CT 스캔으로부터의 환자의 WA%가 소정의 WA% 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 CT 스캔으로부터 계산된 WA% 역치 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제를 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법.
E81. (a) IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자의 폐로부터 수득된 CT 스캔으로부터 벽 면적 백분율(WA%)을 측정하는 단계; (b) 환자의 WA%가 소정의 WA% 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 CT 스캔으로부터 계산된 WA% 역치 수준을 초과하는지를 확인하는 단계; 및 (c) 환자의 WA%가 소정의 WA% 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 CT 스캔으로부터 계산된 WA% 역치 수준을 초과하는 경우 IL-13 길항제를 환자에게 투여하도록 건강관리 제공자에게 조언하는 단계를 포함하는, IL-13 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법.
E82. 실시양태 E79 내지 E81 중 어느 한 실시양태에 있어서, IL-13 매개 질환 또는 장애가 폐 질환 또는 장애, 염증성 장 질환 또는 장애, 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애인 방법.
E83. 실시양태 E82에 있어서, 폐 질환 또는 장애가 천식, IPF, COPD, 폐기종, 만성 비부비동염 또는 알레르기성 비염이고; 만성 염증성 피부 질환 또는 장애가 아토피성 피부염, 알레르기성 접촉 피부염, 습진 또는 건선인 방법.
E84. 실시양태 E83에 있어서, 천식이 알레르기성 천식, 아토피성 천식, 코르티코스테로이드 무경험 천식, 만성 천식, 코르티코스테로이드 내성 천식, 코르티코스테로이드 불응성 천식, 흡연으로 인한 천식, 또는 코르티코스테로이드로 조절되지 않는 천식인 방법.
E85. 실시양태 E79 내지 E84 중 어느 한 실시양태에 있어서, IL-13 길항제가 항-IL-13 항체 또는 이의 항원 결합 단편인 방법.
E86. 실시양태 E85에 있어서, 항체 또는 이의 단편이 트랄로키누맙 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 레브리키주맙 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 것인 방법.
E87. 실시양태 E79 내지 E86 중 어느 한 실시양태에 있어서, 소정의 벽 면적 백분율(WA%) 역치 수준이 상엽 내의 세분절 기관지의 CT 스캔의 3D 분석을 이용함으로써 측정될 때 적어도 약 50%, 적어도 약 55%, 적어도 약 60%, 적어도 약 65%, 적어도 약 70%, 적어도 약 75% 또는 적어도 약 80%인 방법.
E88. 실시양태 E79 내지 E86 중 어느 한 실시양태에 있어서, 소정의 벽 면적 백분율(WA%) 역치 수준이 상엽 내의 세분절 기관지의 CT 스캔의 3D 분석을 이용함으로써 측정될 때 약 68%인 방법.
본원에서 언급된 모든 특허들 및 공개문헌들은 명확히 전체적으로 참고로 도입된다.
본 개시내용의 양태들은 본 개시내용의 일부 항체들의 제조 및 본 개시내용의 항체를 사용하는 방법을 상세히 기술하는 하기 비한정적인 실시예를 참고함으로써 더 정의될 수 있다. 본 개시내용의 범위를 벗어나지 않으면서 물질 및 방법 둘 다에 대한 많은 변경들을 실시할 수 있다는 것은 당업자에게 자명할 것이다.
실시예
실시예 1
폐 내에서의 IL-13 활성화의 말초 마커의 확인
폐에서 IL-13에 의해 조절되는 유전자를 확인하기 위해, 인간 폐 상피 세포 및 정상 인간 기관지 상피 세포의 기체-액체 계면 모델을 IL-13으로 자극하였고, 야기된 전사 변경을 전체 게놈 어레이(WGA) 및 택만® PCR로 분석하였다(도 1 참조). 이 자극들로부터의 결과는 IL-13 경로 활성화를 위한 다수의 잠재적 마커들을 보여주었다. 에피에어웨이 모델 및 정상 인간 기관지 상피 세포에 대한 WGA 결과는 각각 도 2 및 도 3에 표시되어 있다. 도 4에 표시된 바와 같이 택만® qPCR을 이용하여 WGA를 통해 얻어진 결과를 확인하였다. 예상된 바와 같이, 페리오스틴은 IL-13에 반응하여 상당히 상향조절된 것으로 발견되었다. 페리오스틴 상향조절 이외에, IL-13에 의해 변경된 다른 유전자들, 즉 DPP4, CCL26, FETUB 및 CST1을 확인하였다. 따라서, 바이오마커로서 이 유전자들(또는 이들 각각의 발현된 단백질들) 중 하나 이상의 선택은 IL-13 길항제 요법, 예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙을 사용한 치료에 반응할 가능성이 있는 환자의 선택에 유용할 수 있다.
한 이러한 상향조절된 유전자는 발아된(shed) 또는 분비된 형태로서도 존재하는 고도로 보존된 II형 막관통 당단백질인 디펩티딜 펩티다제-4(DPP4)/CD26이었다. DPP4는 여러 질환 환경들에서 순환계 내에서 발견되었고 DPP4 억제제는 II형 당뇨병의 치료에 현재 사용되고 있다. 추가로, DPP4는 폐에서 다수의 유형의 세포들 상에서 발현되고 흡입 코르티코스테로이드 치료와 무관하게 알레르기성 천식 환자로부터의 혈장에서 상향조절되는 것으로 이미 밝혀져 있다(Lun et al. Increased expression of plasma and CD4+ T lymphocyte co-stimulatory molecule CD26 in adult patients with allergic asthma. J Clin Immunol 2007; 27:430-437).
상업적으로 입수가능한 검사(R&D 시스템스 콴티카인® 인간 DPPIV ELISA)를 이용하여 천식 환자로부터의 혈청 샘플에서 DPP4의 수준을 측정하였다. 정상 기증자에 비해 중증 천식 환자에서의 DPP4 수준의 통계적으로 유의한 증가(p < 0.05)가 발견되었고, 이때 중등도 질환을 가진 천식 환자에서 DPP4 수준이 증가하는 경향이 나타났다(도 5). 대조적으로, DPP4 단백질 수준은 약물을 복용하지 않거나, 어드바이어®만을 복용하거나, 알부테롤 및 흡입 스테로이드를 복용하는 환자에 비해 경구 스테로이드 및 흡입 스테로이드를 복용하는 천식 환자로부터의 혈청에서 더 낮았다(도 6). IL-13이 DPP4를 조절한다는 발견, 혈청 DPP4가 중등도 또는 중증 질환을 가진 천식 환자에서 증가된다는 발견, 및 경구 스테로이드 및 흡입 스테로이드가 혈청 DPP4 수준을 낮춘다는 발견은 DPP4가 (1) 천식 폐에서 IL-13 경로 활성화의 말초 마커로서 사용될 수 있고; (2) 천식 환자에 대한 잠재적 요법의 선택에 있어서 정보를 제공할 수 있고; (3) IL-13 길항제, 예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙을 사용한 요법에 반응하는 환자의 선택에 유용할 수 있다는 것을 암시하였다.
실시예 2
인간 혈청에서 DPP4를 정량하는 방법
변경된 인간 DPP4/CD26 콴티카인® ELISA 키트(R&D 시스템스; 카탈로그 번호 DC260)를 사용하여 인간 혈청 샘플로부터 DPP4를 측정하였다. 콴티카인® 면역분석은 세포 배양 상청액, 혈청, 혈장, 침 및 소변에서 인간 DPP4 농도를 정량적으로 측정하는 데에 사용될 수 있다. 면역분석은 NS0-발현된 재조합 인간 DPP4, 및 재조합 인자에 대해 유도된 항체를 함유한다. 상기 분석은 정량적 샌드위치 효소 면역분석 기법을 이용하였다. DPP4에 대해 특이적인 단일클론 항체를 마이크로플레이트 상에 미리 코팅하였다. 표준물 및 샘플을 웰 내로 피펫팅하였고, 존재하는 임의의 DPP4는 고정된 항체에 의해 결합되었다. 임의의 결합되지 않은 물질을 세척하여 제거한 후, DPP4에 대해 특이적인 효소-연결된 다중클론 항체를 웰에 첨가하였다. 임의의 결합되지 않은 항체-효소 시약을 제거하기 위해 세척한 후, 기질 용액을 웰에 첨가하였고, 초기 단계에서 결합된 DPP4의 양에 비례하여 발색되었다. 발색을 중단시켰고, 색채의 강도를 측정한다.
DPPIV 시약:
(1) DPPIV 마이크로플레이트, R&D 파트 892951: DPP4에 대한 래트 단일클론 항체로 코팅된 96웰 폴리스테렌 마이크로플레이트(8개 웰의 12열).
(2) DPPIV 접합체, R&D 파트 892952: 보존제와 함께 호스라디쉬 퍼록시다제에 접합된 DPP4에 대한 21 ㎖의 다중클론 항체.
(3) DPPIV 표준물, R&D 파트 892953: 보존제를 가진 완충제 중의 200 ng의 재조합 인간 DPP4, 동결건조됨.
(4) 분석 희석제 RD1-57, R&D 파트 895207: 청색 염료 및 보존제를 가진 11 ㎖의 완충된 단백질 베이스.
(5) 보정제 희석제 RD5-33, R&D 파트 895813: 혈청/혈장 샘플의 경우 보존제를 가진 3개 바이알(21 ㎖/바이알)의 완충된 단백질 베이스(및 세포 배양 상청액, 침 및 소변 샘플의 경우 보존제와 함께 21 ㎖의 동물 혈청으로 구성된 대안적 보정제 희석제 RD5K(R&D 파트 895119)가 사용될 수 있다).
(6) 발색 시약 A, R&D 파트 895000: 12.5 ㎖의 안정화된 과산화수소.
(7) 발색 시약 B, R&D 파트 895001: 12.5 ㎖의 안정화된 크로모겐(테트라메틸벤지딘).
(8) 중단 용액, R&D 파트 895032: 6 ㎖의 2 N 황산.
(9) 플레이트 커버: 4개 접착 스트립.
샘플 수집 및 저장: 샘플을 하기 방법으로 수집하고 저장하였다.
(1) 세포 배양 상청액: 미립자를 원심분리로 제거하고 즉시 분석하였거나, 샘플을 분취하고 -20℃ 이하의 온도에서 저장하였다. 반복된 동결-해동 주기를 피하였다.
(2) 혈청: 혈청 분리기 튜브(SST)를 이용하였다. 샘플을 1000xg에서 15분 동안 원심분리하기 전에 30분 동안 응고시켰다. 혈청을 제거하고 즉시 분석하였거나, 샘플을 분취하고 -20℃ 이하의 온도에서 저장하였다. 반복된 동결-해동 주기를 피하였다.
(3) 혈장: 항응고제로서 헤파린 또는 EDTA를 사용하여 혈장을 수집하였다. 혈장을 30분의 수집 시간 이내에 1000xg에서 15분 동안 원심분리하였다. 혈장 샘플을 즉시 분석하였거나, 분취하고 -20℃ 이하의 온도에서 저장하였다. 반복된 동결-해동 주기를 피하였다.
(4) 침: 수집 디바이스, 예컨대, 살리벳(SALIVETTE)® 또는 등가물을 이용하여 침을 수집하였다. 침 샘플을 즉시 분석하였거나, 분취하고 -20℃ 이하의 온도에서 저장하였다. 반복된 동결-해동 주기를 피하였다.
(5) 소변: 당일 첫 소변(중간-스트림)을 멸균 용기 내에 무균적으로 수집하고 직접 배설하였다. 샘플을 원심분리하여 미립자 물질을 제거하고 즉시 분석하였거나, 분취하고 -20℃ 이하의 온도에서 저장하였다. 반복된 동결-해동 주기를 피하였다.
DPP4 분석 절차: 모든 시약들 및 샘플들을 사용 전에 실온까지 가온하였다. 모든 샘플들, 표준물들 및 대조군들을 이중으로 분석하였다.
(1) 모든 시약들, 표준 희석물들 및 샘플들을 표준 콴티카인® 제조자의 프로토콜에 표시된 바와 같이 제조하였다.
(2) 샘플을 1:50 MRD(최소 요구된 희석)에서 검사하였다. 모든 샘플들을 2% 혈청 매트릭스에서 검사하였다. 샘플을 실온에서 해동하였고 보정제 희석제 RD5-33으로 희석하였다.
Figure pct00001
Figure pct00002
(3) 100 ㎕의 분석 희석제 RD1-57을 각각의 웰에 첨가하였다.
(4) 50 ㎕의 표준물, 대조군 또는 샘플을 각각의 웰에 첨가하였다. 샘플을 플레이트 밀봉제로 덮고 2시간 동안 실온에서 항온처리하였다.
(5) 총 4회 세척을 위해 과정을 3회 반복하면서 각각의 웰을 흡입하고 세척하였다.
(6) 200 ㎕의 DPP4 접합체를 각각의 웰에 첨가하였다. 샘플을 신규 플레이트 밀봉제로 덮고 2시간 동안 실온에서 항온처리하였다.
(7) 웰 내용물을 흡입하고 웰을 4회 세척하였다.
(8) 200 ㎕의 기질 용액을 각각의 웰에 첨가하였다. 샘플을 30분 동안 실온에서 항온처리하고 광으로부터 보호하였다.
(9) 50 ㎕의 중단 용액을 각각의 웰에 첨가하였다. 30분 이내에 450 nm에서 각각의 웰에 대한 광학 밀도를 측정하였다.
실시예 3
조절되지 않는 중증 천식을 가진 성인에서 SC 트랄로키누맙의 효능 및 안전성을 평가하기 위한 2b상 무작위배정 이중 맹검 연구
Figure pct00003
I. 연구 목적 및 디자인
연구 CD-RI-CAT-354-1049는 추가 조절제 약물과 함께 또는 추가 조절제 약물 없이 고용량 ICS 및 LABA를 요구하는 조절되지 않는 중증 천식을 가진 성인에서 트랄로키누맙의 2종 SC 치료법들의 효능 및 안전성을 평가하기 위한 2b상 무작위배정 이중 맹검 플라세보-대비된 병렬-아암 다중심 연구이었다(총 1일 용량으로서 정의된 고용량 ICS > 500 ㎍ 플루티카손 DPI 또는 > 440 ㎍ 정량 흡입기(MDI); Global Strategy for Asthma Management and Prevention, Global Initiative for Asthma (GINA) 2012. Available from www.ginasthma.org; National Heart, Lung, and Blood Institute National Asthma Education and Prevention Program Expert Panel Report 3: Guidelines for the Diagnosis and Management of Asthma Full Report 2007). 무작위배정 전에 5주 스크리닝/런인(run-in) 기간(-5주째 날부터 -1주째 날[-1일째 날]까지)이 있었다. -4주째 날(-28일째 날)에서 시작하여, 환자들은 일당 2회 2 흡입의 용량에서 MDI(230 ㎍/21 ㎍)로서, 또는 일당 2회 1 흡입의 용량에서 DPI(500 ㎍/50 ㎍)로서 플루티카손/살메테롤의 고정 용량 조합 생성물을 제공받았다. 환자가 추가 천식 조절제 약물(류코트리엔 변경제, 테오필린, 크로몬, 이차 ICS 또는 경구 프레드니솔론 ≤ 20 mg/일 또는 등가 OCS를 포함함)도 복용하고 있는 경우, 이 약물을 스크리닝/런인 및 치료 기간 동안 안정한 용량으로 계속 복용해야 했다.
핵심 포함 기준:
(i) 스크리닝/런인 기간 전 적어도 12개월 동안 문서화된 의사-진단된 천식 및 하기 (a) 내지 (c) 중 어느 하나:
(a) 1회째 방문 전 36개월 이내에 문서화된, SABA에 대한 FEV1 ≥ 12% 및 ≥ 200 ㎖의 기관지확장제 후 가역성의 증거;
(b) 1회째 방문 전 36개월 이내에 문서화된, 메타콜린(20%가 FEV1[PC20] ≤ 8 mg/㎖에 속함), 히스타민 또는 만니톨 챌린지에 대한 양성 반응의 증거; 또는
(c) 1회째 또는 2회째 방문에서 FEV1 ≥ 12% 및 ≥ 200 ㎖의 기관지확장제 후 증가(가역성 평가를 위해 투여된 최대 400 ㎍의 살부타몰).
(ii) 스크리닝/런인 기간 전 12개월 중 적어도 6개월 동안 GINA 지침(GINA, 2009)의 단계 4 및 5에 기재된 천식 조절제 복용법과 일치하고 스크리닝/런인 기간 전 적어도 30일 동안 LABA와 함께 의사 처방 고용량 ICS를 사용해야 하는 천식 조절제 복용법.
(iii) 스크리닝/런인 기간 전 12개월 이내에 2종 이상 내지 6종 이하의 문서화된 천식 악화 사건들의 병력.
(iv) 스크리닝 방문 및 무작위배정 방문 둘 다에서 예측된 40% 내지 80%의 아침 기관지확장제 전 FEV1 값 또는 지난 한 주 동안 ≥ 1.5의 ACQ-6 점수 중 적어도 하나.
18세 내지 75세의 연령을 가진 적어도 390명의 환자들은 2종의 코호트들 중 하나(코호트 1 또는 코호트 2)에 1:1 비로 무작위배정되도록 계획되었다. 각각의 코호트 내에서, 환자들은 다음과 같이 트랄로키누맙(300 mg) 또는 플라세보를 제공받도록 2:1 비로 무작위배정되었다:
코호트 1: 총 26회 용량으로, 50주 동안 Q2W의 2종의 SC 주사로서 트랄로키누맙 300 mg(n = 130) 또는 플라세보(n = 65).
코호트 2: 총 16회 용량으로, 12주 동안 Q2W에 이은 38주 동안 Q4W의 2종의 SC 주사로서 트랄로키누맙 300 mg(n = 130) 또는 플라세보(n = 65).
스크리닝 시 환자들을 지난 12개월 이내의 천식 악화의 횟수(2 대 > 2, 그러나, ≤ 6 악화) 및 장기적 OCS 사용(존재 대 부재)으로 등급화하였다.
이 연구의 일차 목적은 52주에 걸쳐 AER에 대한 트랄로키누맙의 2종의 SC 치료법(300 mg Q2W 및 300 mg Q2/4W)의 효과를 평가하는 것이었다. 이차 목적은 트랄로키누맙의 안전성 및 내약성, 폐 기능에 대한 트랄로키누맙의 효과, 및 환자에 의해 보고된 결과(ACQ-6 점수 및 AQLQ[S]를 사용한 HRQoL, 및 천식 일지를 이용한 천식 증상을 포함함)를 평가하는 것이었다. 시험의 디자인, 및 핵심 일차 및 이차 종점은 도 7에 요약되어 있다.
천식 악화는 레스큐(rescue) 약물 치료의 시작 후 해소되지 않고 환자에 대한 고질적인 문제로 남아있어 하기 결과를 초래하는 천식 증상(기침, 천명, 흉부 조임 및/또는 호흡곤란)의 점진적인 증가로서 정의되었다:
1. 적어도 연속 3일의 지속기간 동안 전신 코르티코스테로이드(정제, 현탁액 또는 주사액)의 사용 또는 안정한 전신 유지 용량의 증가, 또는
2. 적어도 연속 3일의 지속기간 동안 전신 코르티코스테로이드의 환자 시작.
플라세보 군에서의 연간 악화율이 80%의 파워 및 0.15의 유의 수준으로 1.2라고 가정하면서, 코호트 1과 2로부터의 조합된 플라세보에 비해 각각의 트랄로키누맙 치료군에 대한 연간 AER의 40% 감소를 검출하기 위해 시험을 추진하였다. 샘플 크기는 트랄로키누맙에 대한 임상적 반응과 천식 폐에서의 IL-13 상향조절과 관련된 말초 혈액 바이오마커(혈청 페리오스틴, 말초 호산구 카운트 및 Th2 상태(IgE > 100 IU/㎖ 및 혈액 호산구 ≥ 0.14 X 109/ℓ로서 정의된 높은 Th2; Woodruff et al., Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2009; 180:388-395)를 포함함)의 존재 사이의 관계를 조사하기 위한 미리 특정된 하위분석에 적절하였다.
15개 국가들(아르헨티나, 캐나다, 칠레, 체코 공화국, 프랑스, 독일, 일본, 멕시코, 필리핀, 폴란드, 러시아, 대한민국, 스페인, 영국 및 미국)로부터 총 452명의 환자들을 무작위배정하였다. 53주째 날까지 수집된 모든 효능 및 안전성 데이터를 분석하였다.
II. 질환 평가 및 방법
가역성 계산을 포함하는 기관지확장제 전 및 후 FEV1 및 FVC 측정
폐활량측정을 평가할 때마다 기관지확장제 전 및 후 FEV1 및 FVC를 수행하였다. 가역성 평가를 다음과 같이 수행하였다:
(1) 폐활량측정을 이용하여 기관지확장제 전 FEV1 측정을 평가하였다. 미국 흉부 협회(ATS)/유럽 호흡기 협회(ERS) 지침(Miller et al., Eur. Respir. J. 2005 26:153-61)에 따라 중앙 판매사에 의해 공급된 장치 상에서 폐활량측정을 수행하였다. 하기 값들을 수득하였다: 기관지확장제 전 및 후 FEV1, FEV6, FVC 및 IC. 폐활량측정 검사를 오전 6:00시와 오전 11:00시 사이에 수행하였다. 치료 당일에, 시험용 제품의 투여 전에 폐활량측정 검사를 수행하였다. 모든 아침 폐활량측정 검사를 오전 6:00시와 오전 11:00시 사이에 완료하였고 그 시간의 ± 1시간 이내에 스크리닝 폐활량측정을 완료하였다. 예를 들면, 스크리닝 폐활량측정이 오전 8:00시에 수행된 경우, 후속 방문에서의 모든 폐활량측정 검사는 오전 7:00시와 오전 9:00시 사이에 완료되어야 했다. 폐활량측정 검사 전 30분 동안 과격한 운동을 피할 것을 대상체들에게 요청하였다.
(2) 약하고 불완전한 날숨 후, 1회 용량의 100 ㎍ 살부타몰(또는 등가의 단기 작용 기관지확장제)을 스페이서 디바이스로부터 총 폐용량까지 한 호흡에 흡입하였다.
(3) 대상체가 숨을 내쉬기 전 5초 내지 10초 동안 호흡을 유지하였다. 4회 분리된 용량의 100 ㎍ 살부타몰을 30초 간격으로 전달하였다.
(4) 대상체는 15분 내지 30분 동안 대기하였다(단기 작용 항콜린성 물질이 사용된 경우 30분)
(5) 기관지확장제 후 FEV1 측정을 평가하였고 ATS/ERS 허용성 및 재현가능성 기준을 충족시킨 2회 최상의 시도를 기록하였다. 상기 2회 최상의 시도의 최대 FEV1을 분석을 위해 사용하였다. 각각의 대상체는 연구 전체에 걸쳐 동일한 용량 및 유형의 단기 작용 기관지확장제를 사용하였다. 400 ㎍ 미만의 총 용량의 살부타몰 또는 등가물이 가역성 평가를 위해 사용되었다.
가역성을 다음과 같이 계산하였다:
% 가역성 = (기관지확장제 후 FEV1 - 기관지확장제 전 FEV1) X 100/기관지확장제 전 FEV1
ACQ-6: 천식 조절 설문지
ACQ는 천식 증상(야간 각성, 각성 시 증상, 활동 제한, 호흡곤란, 천명) 및 매일 레스큐 기관지확장제 사용 및 FEV1을 평가하는 환자-보고된 설문지이다(Juniper et al., Eur. Respir. J. 1999 14:902-7). ACQ-6은 원래의 ACQ 점수로부터의 FEV1 측정이 누락된, 천식 증상(야간 시간 각성, 각성 시 증상, 활동 제한, 호흡곤란, 천명 및 단기 작용 β2 효현제 사용)을 평가하는 ACQ의 단축된 버전이다. ACQ-6을 1회째 방문(-5주째 날) 동안 완료하였다. 대상체는 2회째 방문 시 ePRO 디바이스를 제공받았고 2회째 방문과 4회째 방문 사이에 주마다, 및 그 후 33회째 방문(75주째 날)까지 4주마다 집에서 ACQ-6을 완료하였다. 대상체는 1개의 기관지확장제 사용 질문 및 5개의 증상 질문들에 응답함으로써 지난 한 주 동안 그들의 천식이 어떠하였는지를 기억하도록 요청받았다. 질문은 동등하게 가중되었고 0(완전히 조절됨)부터 6(심각하게 조절되지 않음)까지 점수화되었다. 평균 ACQ 점수는 응답의 평균이었다. 0.75 이하의 평균 점수는 잘 조절된 천식을 표시하였고, 0.75와 1.5 이하 사이의 점수는 부분적으로 조절된 천식을 표시하였고, 1.5 초과의 점수는 조절되지 않은 천식을 표시하였다(Juniper et al., Respir. Med. 2006 100:616-21). 적어도 0.5의 개별 변화는 임상적으로 유의한 것으로서 간주되었다(Juniper et al., Respir. Med. 2005 99:553-8).
AQLQ: 천식 삶의 질 설문지(표준화된 버전)
AQLQ(S)는 천식 환자에 의해 경험된 HRQoL를 측정하는 32-항목 설문지이고(Juniper et al., Chest. 1999 May; 115(5):1265-70) 1주째 방문에서 완료된 후, ePRO 디바이스를 이용하는 75주째 방문까지 집에서 4주마다 완료되었다. 상기 설문지는 4개의 분리된 도메인들(증상, 활동 제한, 감정 기능 및 환경 자극)을 포함하였다. 대상체는 지난 2주 동안의 그들의 경험을 기억하고 7(손상 없음)부터 1(심각한 손상)까지 7점 크기로 32개 질문들 각각을 점수화하도록 요청받았다. 총 점수는 모든 질문들에 대한 평균 응답으로서 계산되었다. 4개의 개별 도메인 점수들(증상, 활동 제한, 감정 기능 및 환경 자극)은 각각의 도메인 내의 질문에의 응답의 평균이었다. 총 점수 및 개별 도메인 점수 둘 다에서 0.5의 개별 개선은 최소한으로 중요한 변화로서 확인되었고, 이때 1.5 초과의 점수 변화는 큰 유의한 변화로서 확인되었다(Juniper et al., J. Clin. Epidemiol. 1994; 47: 81-7).
천식 악화
이 연구의 목적을 위해, 1회째 방문 후 발생하는 천식 악화는 레스큐 약물의 시작 후 해소되지 않고 대상체에 대한 고질적인 문제로 남아있어, 하기 (1) 또는 (2)의 결과를 초래하는 천식 증상(기침, 천명, 흉부 조임 및/또는 호흡곤란)의 점진적인 증가로서 정의되었다: (1) 적어도 연속 3일의 지속기간 동안 전신 코르티코스테로이드(정제, 현탁액 또는 주사액)의 사용 또는 안정한 전신 유지 용량의 증가; 또는 (2) 적어도 연속 3일의 지속기간 동안 전신 코르티코스테로이드의 시작.
천식 악화 사건은 마지막 용량의 OCS가 투여된 지 10일 후(주사 가능한 코르티코스테로이드가 투여된 지 10일 후)에 해소된 것으로 간주되었다. 이 기간 후 시작된 코르티코스테로이드의 과정은 별개의 신규 천식 악화로서 간주되었다.
천식 악화 중증도는 다음과 같이 분류되었다:
(a) 중등도: 적어도 연속 3일 동안 전신 코르티코스테로이드를 요구하는 악화되는 증상; 및
(b) 중증: 전신 코르티코스테로이드를 요구하고 응급치료 평가 및/또는 입원을 요구하는 악화되는 증상.
III. 종점
폐 기능에 대한 트랄로키누맙의 효과
폐 기능에 대한 트랄로키누맙의 효과를 임상 방문 시(아침) 기관지확장제 전 및 후 FEV1, FEV6, FVC 및 IC로 측정하였고; PEF 및 FEV1을 집에서 측정하였다. 기술통계학을 이용하여 평균 값에서의 기준으로부터의 변화 및 다양한 시점에서의 기준으로부터의 퍼센트 변화를 요약하였다. 2-샘플 t-검정을 이용하여 개별 트랄로키누맙 치료군과 조합된 플라세보 사이에 대상체의 폐 기능에서의 기준으로부터의 변화 및 기준으로부터의 퍼센트 변화를 비교하였다.
환자 보고 결과에 대한 트랄로키누맙의 효과
평균 ACQ-6 점수에서의 기준으로부터의 변화를 분석하였다. 피셔의 정확성 검정을 이용하여 연구 동안 ACQ-6 ≤ 0.75, ACQ-6 ≤ 1.5, 및 0.5 이상의 평균 ACQ-6 점수에서의 기준으로부터의 감소를 달성하는 대상체의 비율을 개별 트랄로키누맙 치료군과 조합된 플라세보 사이에 비교하였다. 등급화된 로그-순위(log-rank) 검정을 수행하여 첫 천식 조절까지의 시간(평균 ACQ-6 점수에서 기준으로부터 0.5 이상의 감소가 처음 관찰된 때로서 정의됨)을 비교하였다. AQLQ(S) 및 EQ-5D를 이용하여 건강 관련 삶의 질을 평가하였다. 기술통계학을 이용하여 AQLQ(S) 응답으로부터의 총 점수 및 4개 도메인 점수를 기준으로부터의 이들 각각의 변화와 함께 요약하였다. 추가로, AQLQ(S) 응답자의 비율을 보고하였다: 방문할 때마다 AQLQ(S) 점수에서 기준으로부터 0.5 초과의 개선을 보인 대상체 및 1.5 초과의 개선을 보인 대상체를 별도로 보고하였다.
EQ-5D 설문지는 5개 차원들을 평가하였다: 운동성, 자가-관리, 일상 활동, 통증/불편함 및 불안증/우울증을 평가하였다. 각각의 차원은 증가하는 수준의 어려움을 반영하는 3개의 응답 선택항목들(문제점 없음, 일부 또는 약간의 문제점, 및 불가능한 또는 극도의 문제점)을 가졌다. 상기 설문지는 시각적인 아날로그 크기도 포함하였는데, 이때 환자는 0 내지 100의 크기로 그들의 현재 건강을 평가하도록 요청받았는데, 이때 0은 상상할 수 있는 최악의 건강 상태이다. 각각의 차원으로부터의 응답 및 시각적인 아날로그 크기를 치료군 및 방문별로 요약하였다. 각각의 차원에 대한 이동(shift) 표를 제공하였다. 시각적인 아날로그 크기에서 기술통계학으로 기준으로부터의 변화를 방문별로 요약하였다.
IV. 결과
효능
일차 효능 분석은 치료 의도(ITT) 집단(n = 452)에 기초하였다. ITT 집단은 연구에 무작위배정된 모든 환자들을 포함하였다. 환자들은 임의의 시험용 제품을 제공받았는지 아니면 이들이 무작위배정된 시험용 제품과 상이한 시험용 제품을 제공받았는지와 관계없이 치료 아암을 초기 무작위배정에 따라 배정하였다.
인구통계학 및 배경 질환 특징
기준 인구통계학적 특징은 플라세보 군과 트랄로키누맙 군 사이에 일반적으로 유사하였다(표 4). 환자 집단의 평균 연령은 50.3세(18세 내지 75세)이었다. 환자들의 대다수는 히스패닉 또는 라틴계가 아니었고, 환자들의 대략 절반은 백인종이었고, 3분의 1은 아시아계이었다. 상기 집단의 대략 3분의 2가 여성이었다.
Figure pct00004
혈청 페리오스틴 수준, 혈청 호산구 카운트 및 Th2 상태를 포함하는 기준 질환 특징은 플라세보 군과 트랄로키누맙 군 사이에 일반적으로 유사하였다(표 5). 16% 내지 18%의 환자들이 장기적 OCS를 제공받았다고 보고되었다. DPP4를 실시예 2에 기재된 바와 같이 측정하였다.
평균 FEV1 % 가역성은 10.0% 내지 12.7%이었고, 이때 환자들의 대략 3분의 1이 기준에서 12% 이상의 FEV1 가역성을 보였다. 평균 ACQ-6 점수 및 % 예측된 기관지확장제 전 FEV1은 기준에서 잘 조절되지 않는 천식을 가진 환자 집단을 반영한다.
Figure pct00005
환자들의 대략 3분의 1이 성인 발병 천식 35세 내지 37세의 중간 연령과 함께 소아 천식을 가졌다(표 6). 알레르기는 환자들의 절반 이상에 대한 천식 유발제로서 보고되었다. 환자들의 3분의 1 이상은 지난해 3회 내지 6회의 천식 악화를 보고하였고(연구 참여 시 지난해 2회 내지 6회 악화를 가진 환자들이 요구되었음) 대략 17% 내지 21%의 환자들이 천식 관련 입원을 보고하였다.
Figure pct00006
일차 및 핵심 이차 효능 종점들의 분석: ITT 집단
53주째 날에서의 연간 천식 악화율의 요약
ITT 집단에서, 53주째 날에서의 연간 AER은 플라세보 군과 트랄로키누맙 군 사이에 유사하였다(표 7).
Figure pct00007
핵심 이차 효능 종점: FEV1에 대한 트랄로키누맙의 효과
이 연구의 핵심 이차 효능 종점은 폐활량측정 변수, 특히 기관지확장제 전 및 후 FEV1에서의 기준으로부터의 변화에 의해 평가된 폐 기능에 대한 트랄로키누맙의 효과를 평가하는 것이었다. 플라세보에 비해 트랄로키누맙 300 mg Q2W 군의 경우 53주째 날에서 기관지확장제 전 및 후 FEV1 둘 다에 대한 기준으로부터의 통계적으로 유의한 평균 증가가 관찰되었다(p < 0.004; 표 8). 플라세보에 비해 트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 군의 경우 53주째 날에서 기관지확장제 전 또는 후 FEV1에 대한 기준으로부터의 통계적으로 유의한 평균 변화가 관찰되지 않았다.
Figure pct00008
연구의 처음 17주 동안 플라세보에 비해 치료군들 둘 다에서 FEV1의 상대적 증가가 관찰되었다(도 8). 이 증가는 트랄로키누맙 300 mg Q2W 군에서 53주째 날까지 유지되었으나 트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 군에서는 상실되었는데, 이것은 Q4W 유지 복용이 기류 폐쇄의 개선을 유지하는 데에 부적절하다는 것을 암시한다.
핵심 이차 효능 종점: 환자 보고 결과 ACQ -6 및 AQLQ(S)에 대한 트랄로키누맙의 효과
ACQ-6은 원래의 ACQ 점수로부터의 FEV1 측정이 누락된, 천식 증상(야간 각성, 각성 시 증상, 활동 제한, 호흡곤란, 천명 및 SABA 사용)을 평가하는 ACQ의 단축된 버전이다. 질문은 동등하게 가중되었고 0(완전히 조절됨)부터 6(심각하게 조절되지 않음)까지 점수화되었다. 평균 ACQ 점수는 응답의 평균이다. 1.5 이상의 ACQ 점수는 환자가 부적절하게 조절된 천식을 가진다는 것을 표시하는 0.88의 양성 예측 값을 가진다(Juniper et al, 2006). 0.75 이하의 평균 점수는 잘 조절된 천식을 표시하고, 0.75 내지 1.5 미만의 점수는 부분적으로 조절된 천식을 표시하고, 1.5 이상의 점수는 조절되지 않은 천식을 표시한다(Juniper et al., Respir Med. 2006 100:616-21). 0.5 이상의 개별 변화는 임상적으로 유의한 것으로서 간주된다(Juniper et al., Respir. Med. 2005 99:553-8).
이 연구에서, 치료 기간 동안 ePRO 디바이스 Q4W를 이용하여 집에서 ACQ-6을 완료하였다. 기준부터 53주째 날까지의 변화를 평가하였다. 53주째 날에서 플라세보 군과 트랄로키누맙 군을 비교하였을 때 ACQ-6 점수의 통계적으로 유의한 차이가 발견되지 않았다(표 9).
AQLQ(S)는 천식 환자에 의해 경험된 HRQoL을 측정하는 32-항목 설문지이다(Juniper et al., Chest. 1999 May; 115(5):1265-70). 상기 설문지는 4개의 분리된 도메인들(증상, 활동 제한, 감정 기능 및 환경 자극)을 포함하였다. 환자들은 지난 2주 동안 그들의 경험을 기억하고 7(손상 없음)부터 1(중증 손상)까지 7점 크기로 32개 질문들 각각을 점수화하도록 요청받았다. 전체 점수는 모든 질문들에 대한 평균 응답으로서 계산되었다. 전체 점수에서 0.5의 개별 개선은 최소한으로 중요한 변화로서 확인되었는데, 이때 1.5 초과의 점수 변화는 큰 유의한 변화로서 확인되었다(Juniper et al., J. Clin. Epidemiol. 1994 47:81-7).
이 연구에서, 치료 기간 동안 ePRO 디바이스 Q4W를 이용하여 집에서 AQLQ(S)를 완료하였다. 기준부터 53주째 날까지 변화를 평가하였다. 53주째 날에서 플라세보 군과 트랄로키누맙 군을 비교하였을 때 AQLQ(S) 점수의 통계적으로 유의한 차이가 발견되지 않았다(표 9).
Figure pct00009
핵심 이차 효능 종점: 천식 일지에 대한 트랄로키누맙의 효과
천식 일지는 13개-항목 설문지이다. ePRO 디바이스를 이용하여 2회째(-4주째 날) 방문부터 75주째 날 방문까지 매일 아침 천식 일지를 평가하였다. 환자들은 주간 및 야간 증상 빈도 및 중증도, 활동 회피 및 제한, 천식 관련 불안증, 및 피로뿐만 아니라 레스큐 약물 사용도 기억하도록 요청받았다. 전체 증상 점수는 주간 중증도 점수, 주간 빈도 점수 및 야간 중증도 점수의 평균으로서 계산되었고, 0(증상 없음) 내지 4(최악의 가능한 증상)이다.
기준부터 53주째 날까지 변화를 평가하였다. 53주째 날에서 플라세보 군과 트랄로키누맙 군을 비교하였을 때 천식 일지 전체 천식 증상 점수의 통계적으로 유의한 차이가 발견되지 않았다(표 10).
Figure pct00010
핵심 일차 및 이차 효능 종점의 하위군 분석
트랄로키누맙에 대한 임상 반응과 기초 임상 기준 사이의 관계를 조사하기 위해 다수의 미리 특정된 하위군 분석들을 정의하였다. 기준 FEV1 % 가역성(≥ 12% 대 < 12%) 및 OCS 사용(존재 대 부재)에 의해 정의된 하위군이 제공된다. 추가로, 기준에서 지난 12개월 이내의 선행 악화(2 대 > 2 ≤ 6)에 의한 하위군 분석을 수행하였고, 트랄로키누맙에 대한 반응과의 관계가 관찰되지 않았다. 트랄로키누맙에 대한 임상 반응과 IL-13의 상향조절과 관련된 말초 혈액 바이오마커 사이의 관계를 조사하기 위해, 기준 혈청 페리오스틴(≥ 평균 대 < 중간치), 말초 호산구 카운트(≥ 300개 세포/㎕ 대 < 300개 세포/㎕) 및 Th2 상태(정의된 높은 Th2 대 낮은 Th2)에 의해 정의된 하위군이 제공된다.
하위군 분석: 기준 FEV1 가역성
무작위배정 방문에서 기관지확장제의 투여 후 SABA에 대한 FEV1 가역성의 정도를 기초로 하위군 분석을 착수하였다. 높은 가역성 하위군(SABA 후 FEV1에서의 기준으로부터의 ≥ 12% 변화) 및 낮은 가역성 하위군(< 12% 변화)을 정의하였다.
53주째 날에서의 분석은 높은 가역성 군에서 플라세보에 비해 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트에서 연간 AER의 감소(34% [95% CI: -32, 67%])를 보여주었다. 낮은 가역성 군에서는 연간 AER의 감소가 관찰되지 않았다(표 11).
트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 코호트 내에서, 높은 가역성 하위군에서의 연간 AER의 감소(24% [95% CI: -54, 63%])는 낮은 가역성 군에서의 연간 AER의 감소보다 수치적으로도 더 컸다(2% [95% CI: -60, 40%]).
Figure pct00011
53주째 날의 분석은 높은 가역성(11.07% [95% CI: 0.99, 21.14]) 하위군 및 낮은 가역성(7.48% [2.55, 12.40]) 하위군 둘 다에서 플라세보에 비해 트랄로키누맙 300 mg Q2W에서 FEV1에서의 기준으로부터의 증가를 보여주었고; 이 증가는 높은 가역성 하위군에서 수치적으로 더 높았다. 높은 또는 낮은 가역성 하위군 내의 트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 코호트에서 FEV1의 임상적으로 유의한 변화가 관찰되지 않았다(표 12).
Figure pct00012
Figure pct00013
트랄로키누맙 300 mg Q2W를 제공받은 환자들에서, 플라세보에 비해 ACQ-6 점수의 평균 변화는 높은 가역성 하위군(-0.44 [95% CI: -0.89, 0.01])에서 수치적으로 더 컸고, 낮은 가역성 하위군(0.06 [95% CI: -0.37, 0.24])에 비해 최소한의 임상적으로 중요한 변화(MCID; -0.5)에 근접하였다. 트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 코호트 내의 하위군들 사이에 동일한 관계가 관찰되었으나, MCID는 높은 가역성 하위군에서 도달되지 않았다(표 12).
트랄로키누맙 300 mg Q2W를 제공받은 환자들에서, 플라세보에 비해 AQLQ(S) 전체 점수의 평균 변화의 개선이 높은 가역성 하위군(0.59 [95% CI: 0.10, 1.09])에서 관찰되었고 0.5의 MCID에 도달되었다. 낮은 가역성 하위군에서는 AQLQ(S)의 개선이 관찰되지 않았다. 트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 코호트 내의 하위군들 사이에 동일한 관계가 관찰되었으나, MCID는 높은 가역성 하위군에서 도달되지 않았다(표 12).
트랄로키누맙 300 mg Q2W를 제공받은 환자들에서, 53주째 날에 플라세보에 비해 전체 천식 일지 증상 점수에서의 기준으로부터의 수치적으로 더 큰 감소가 낮은 가역성 하위군(-0.02 [95% CI: -0.22, 0.19])에 비해 높은 가역성 하위군(-0.23 [95% CI: -0.51, -0.04])에서 관찰되었다. 트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 코호트 내의 하위군들 사이에 동일한 관계가 관찰되었다(표 12).
하위군 분석: OCS 사용
53주째 날 분석은 장기적으로 OCS를 사용하지 않은 환자들에서 플라세보에 비해 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트(21% [95% CI: -17, 47%]) 및 Q2/4W 코호트(13% [95% CI: -34, 43%]) 둘 다에서 연간 AER의 감소가 존재하였다는 것을 보여주었다. 장기적으로 OCS를 사용한 환자들에서 플라세보에 비해 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트 및 Q2/4W 코호트에 대한 연간 AER의 감소는 관찰되지 않았다(표 13).
Figure pct00014
53주째 날 분석은 장기적으로 OCS를 사용한 환자들(0.87% [95% CI: -14.70, 16.44])에 비해 장기적으로 OCS를 사용하지 않은 환자들(7.33% [95% CI: 2.52, 12.14])에서 플라세보에 비해 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트에서 기관지확장제 전 FEV1에서의 기준으로부터의 수치적으로 더 큰 증가를 보여주었다(표 14). 장기적으로 OCS를 사용한 하위군 또는 장기적으로 OCS를 사용하지 않은 하위군 내의 트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 코호트에서 FEV1의 임상적으로 유의한 변화는 관찰되지 않았다.
트랄로키누맙 코호트의 경우 장기적으로 OCS를 사용한 하위군 또는 장기적으로 OCS를 사용하지 않은 하위군에서 ACQ-6, AQLQ(S) 및 천식 일지 증상 점수에 대한 플라세보로부터의 임상적으로 중요한 변화는 관찰되지 않았다.
Figure pct00015
Figure pct00016
하위군 분석: 기준 혈청 페리오스틴 수준
기준에서의 혈청 페리오스틴 수준에 의한 53주째 날 하위군 분석은 높은 페리오스틴 군(≥ 기준에서 중간 혈청 페리오스틴 수준; 25% [95% CI: -19, 53%])에서 플라세보에 비해 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트에서 연간 AER의 감소가 관찰되었다는 것을 보여주었다. 낮은 페리오스틴 군(< 기준에서 중간 혈청 페리오스틴 수준)에서는 AER의 감소가 관찰되지 않았다(표 15).
Figure pct00017
높은 페리오스틴 하위군(6.75% [95% CI-0.31, 13.82]) 및 낮은 페리오스틴 하위군(7.06% [95% CI: 0.51, 13.60]) 둘 다에서 플라세보에 비해 FEV1에서의 기준으로부터의 개선이 관찰되었다(표 16).
어느 페리오스틴 하위군에서도 트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 코호트에서 FEV1의 임상적으로 유의한 변화는 관찰되지 않았다. 어느 트랄로키누맙 코호트의 경우에도 높은 또는 낮은 페리오스틴 하위군에서 ACQ-6, AQLQ(S) 및 천식 일지 증상 점수에 대한 플라세보로부터의 임상적으로 중요한 변화는 관찰되지 않았다.
Figure pct00018
Figure pct00019
하위군 분석: 기준 말초 혈액 호산구 카운트
기준에서의 혈액 호산구 카운트에 의한 53주째 날 하위군 분석은 높은 호산군 군(기준에서 혈액 호산구 카운트 ≥ 300개 세포/㎕; 22% [95% CI: -31, 54%])에서 플라세보에 비해 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트에서 AER의 감소를 보여주었다. 낮은 호산구 군(혈액 호산구 카운트 < 300개 세포/㎕)의 경우 300 mg Q2W 코호트에서 연간 AER의 감소가 관찰되지 않았다. 표 17을 참조한다.
대조적으로, 트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 코호트의 경우 높은 호산구 하위군에서 연간 AER의 감소는 관찰되지 않은 반면, 낮은 호산구 하위군에서 연간 AER의 감소(23%)가 있었다.
Figure pct00020
플라세보에 비해 FEV1에서의 기준으로부터의 백분율 증가는 낮은 호산구 하위군(4.38% [95% CI: -1.51, 10.273])에 비해 높은 호산구 하위군에서 트랄로키누맙 300 mg Q2W를 제공받은 환자(13.49% [95% CI: 4.99, 22.00])에서 수치적으로 더 높았다(표 18). 높은 호산구 하위군 내의 트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 코호트에서 FEV1의 임상적으로 유의한 변화는 관찰되지 않았다.
플라세보에 비해 ACQ-6 점수의 평균 변화는 낮은 호산구 하위군(-0.02 [95% CI: -0.34, 0.290])에 비해 높은 호산구 하위군에서 트랄로키누맙 300 mg Q2W를 제공받은 환자들(-0.49 [95% CI: -0.88, -0.09)에서 더 컸고 -0.50의 MCID에 근접하였다. 하위군들 사이의 이 차이가 트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 코호트에서는 명확하지 않았다.
높은 호산구 하위군 내의 어느 트랄로키누맙 치료 코호트의 경우에도 AQLQ(S) 점수에 대한 플라세보로부터의 임상적으로 중요한 변화는 관찰되지 않았다.
낮은 호산구 하위군(0.03 [95% CI: -0.17, 0.23] 및 -0.12[95% CI: -0.32, 0.07])에 비해 높은 호산구 하위군(각각 -0.21 [95% CI: -0.47, 0.04] 및 -0.19 [95% CI: -0.45, 0.07])에서 300 mg 트랄로키누맙 Q2W 코호트 및 Q2/4W 코호트 둘 다의 경우 플라세보에 비해 수치적으로 더 큰 천식 일지 증상 점수의 감소가 관찰되었다.
Figure pct00021
Figure pct00022
하위군 분석: 기준 Th2 상태
기준에서의 Th2 상태에 의한 53주째 날 하위군 분석은 기준에서 높은 Th2 군에서 플라세보에 비해 트랄로키누맙 300 Q2W 코호트에서 연간 AER의 감소를 보여주었다(23% [95% CI: -25, 52%). 낮은 Th2 군에서는 연간 AER의 감소가 관찰되지 않았다(표 19).
트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 코호트에서는 높은 또는 낮은 Th2 하위군에서 연간 AER에 대한 치료 효과의 증가가 관찰되지 않았다.
Figure pct00023
높은 Th2 하위군(8.64% [95% CI: 1.57, 15.716]) 및 낮은 Th2 하위군(3.42% [95% CI: -2.61, 9.44]) 둘 다에서 트랄로키누맙 300 mg Q2W를 제공받은 환자들에서 플라세보에 비해 FEV1에서의 기준으로부터의 백분율 증가의 개선이 관찰되었다. 높은 또는 낮은 Th2 하위군 내의 트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 코호트에서는 FEV1의 임상적으로 유의한 변화가 관찰되지 않았다(표 20).
어느 트랄로키누맙 치료 코호트의 경우에도 높은 또는 낮은 Th2 하위군에서 ACQ-6, AQLQ(S) 및 천식 일지 증상 점수에 대한 플라세보로부터의 임상적으로 중요한 변화가 관찰되지 않았다(표 20).
Figure pct00024
Figure pct00025
사후 하위군 분석
트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트에서, 단기 작용 기관지확장제에 대한 FEV1 가역성의 존재는 연간 AER, FEV1, ACQ-6, AQLQ(S) 및 천식 일지 증상 점수에 대한 임상적으로 중요한 이익에 대한 잠재력을 표시하는 중요한 환자 특징으로서 확인되었다. 추가로, 조절되지 않은 IL-13(높은 페리오스틴, 높은 호산구, 높은 Th2)과 관련된 것으로 추정되는 하위군들에서, 연간 AER의 감소는 상응하는 '낮은' 하위군에서의 감소보다 수치적으로 더 컸다.
트랄로키누맙에 대한 임상 반응을 더 조사하고 트랄로키누맙에 대한 최적 반응을 가진 환자들의 군을 확인하기 위해, 추가 하위군 분석은 12% 컷-포인트 및 말초 혈액 바이오마커를 기초로 높은 대 낮은 FEV1 가역성의 조합을 조사하였다.
사후 하위군 분석: 기준 FEV1 가역성 및 혈청 페리오스틴 수준
높은 가역성 군 내에서, 기준에서의 혈청 페리오스틴 수준에 의한 분석은 낮은 페리오스틴 군(4% [95% CI: -140, 61%])에 비해 높은 페리오스틴 군(54% [95% CI: -65, 87%)에서 플라세보에 비해 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트에서 수치적으로 더 컸다(표 21).
Figure pct00026
추가로, 높은 페리오스틴 하위군에서 플라세보에 비해 FEV1에서의 기준으로부터의 백분율 증가는 낮은 페리오스틴 하위군(7.62% [95% CI: -7.60, 22.84])에 비해 수치적으로 더 높았다(13.85% [95% CI: -0.18, 27.87])(표 22).
Figure pct00027
기준에서 12% 이상의 FEV1 가역성을 가진 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트 내의 환자들에서 AER 및 기관지확장제 전 FEV1의 개선이 관찰되었고; 이 치료 효과는 중간치 초과의 페리오스틴도 가진 환자들에서 향상되었다. 트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 코호트 내에서 이 종점들에 대한 효과 크기는 일반적으로 보다 더 낮았고 기준에서 중간치 초과의 페리오스틴의 효과는 관찰되지 않았다(표 22 및 도 9).
트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트 및 Q2/4W 코호트 둘 다에 대한 ACQ-6, AQLQ(S) 및 천식 일지라는 종점에 대해, 기준에서 12% 이상의 FEV1 가역성을 가진 환자들에서 관찰된 치료 효과는 중간치 초과의 페리오스틴도 가진 환자들에서 더 향상되지 않았다(표 23 및 도 10).
트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트의 경우 ACQ-6 및 AQLQ(S)의 변화는 기준에서 12% 이상의 FEV1 가역성을 가진 환자들의 경우 MCID에 도달하였거나 근접하였는데(표 23); Q2/4W 코호트의 경우에는 이것이 관찰되지 않았다.
Figure pct00028
Figure pct00029
효능의 요약
ITT 집단에서, 일차 종점인 연간 AER의 감소는 플라세보에 비해 어느 트랄로키누맙 치료 코호트에서도 관찰되지 않았으나; 트랄로키누맙을 제공받은 환자들에서 AER의 감소에 대한 경향은 다수의 미리 특정된 하위군들에서 관찰되었다(도 11). 특히, 기준에서 12% 이상의 SABA에 대한 FEV1 가역성의 존재는 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트 내의 높은 가역성 하위군에서 관찰된 연간 AER의 34%(95% CI: 32, 67%) 감소 및 Q2/4W 코호트에서의 24%[95% CI: -54, 63%] 감소와 함께 중요한 임상적 특징으로서 확인되었고; 어느 코호트에서도 낮은 가역성 하위군에서 AER의 감소는 관찰되지 않았다.
높은 페리오스틴, 높은 호산구 및 높은 Th2 하위군에서, 각각 25%(95% CI: -19, 53%), 22%(95% CI: -31, 54%) 및 23%(95% CI: -25, 52%)의 연간 AER의 감소가 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트에서 관찰된 반면, 이러한 감소가 상응하는 낮은 하위군에서는 관찰되지 않았다. 높은 또는 낮은 바이오마커 하위군 내의 Q2/4W 코호트에서는 연간 AER의 감소가 관찰되지 않았다.
어느 트랄로키누맙 치료 코호트에서도 장기적으로 OCS를 제공받은 하위군에서 AER의 감소가 관찰되지 않았다.
ITT 집단에서, 플라세보 7.10%(95% CI: 2.35, 11.84%)에 비해 53주째 날 기관지확장제 전 FEV1에서의 기준으로부터의 통계적으로 유의한 증가가 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트에서 관찰되었다. 트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 코호트에서의 효과 크기는 1.57%(95% CI: -3.22, 6.35%) 더 낮았는데, 이것은 용량-반응 관계를 시사하고; 이 관계는 Q2/4W 코호트에 비해 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트에서 일관되게 더 높은 53주째 날 기관지확장제 전 FEV1의 증가를 가진 미리 특정된 하위군들에 전체에서도 관찰되었다(도 12). 53주째 날 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트 내에서, 플라세보에 비해 기관지확장제 전 FEV1의 증가는 높은 페리오스틴 하위군 및 낮은 페리오스틴 하위군 둘 다에서 매우 일치하였고 상응하는 낮은 하위군들보다 높은 가역성 하위군, 높은 호산구 하위군 및 높은 Th2 하위군에서 수치적으로 더 높았다.
기관지확장제 전 FEV1의 증가는 어느 트랄로키누맙 치료 코호트에서도 장기적으로 OCS를 제공받은 하위군에서 관찰되지 않았다.
ITT 집단에서, 플라세보에 비해 어느 트랄로키누맙 치료 코호트에서도 ACQ-6, AQLQ(S) 및 천식 일지 증상 점수의 임상적으로 중요한 변화는 관찰되지 않았다. 높은 가역성 하위군에서, 플라세보에 비해 ACQ-6 및 AQLQ 점수의 평균 변화는 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트에서 MCID에 근접하였고 Q2/4W 코호트에서의 평균 변화보다 수치적으로 더 높았고; 이 개선들은 어느 복용법에서도 낮은 가역성 하위군에서 관찰되지 않았다. 천식 일지 증상 점수의 가장 큰 감소도 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트 내의 높은 가역성 하위군에서 관찰되었다. 높은 페리오스틴, 높은 호산구 및 높은 Th2 하위군에서, ACQ-6, AQLQ(S) 및 ASMA 증상 점수의 임상적으로 중요한 변화는 어느 트랄로키누맙 코호트에서도 일관되게 관찰되지 않았다.
하기 3개 주요 결론들이 미리 특정된 ITT 및 하위군 분석으로부터 도달되었다:
(i) ITT 집단 및 시험된 대다수의 하위군들에서, 기관지확장제 전 FEV1의 증가는 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트에서 관찰되었다. Q2/4W 코호트에서 보다 더 작거나 존재하지 않는 이 종점에 대한 효과에 의해 용량 반응은 명확해졌다.
(ii) 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트 내에서의 하위군 분석은 연간 AER의 감소가 관찰된 잠재적 반응자 집단을 확인시켜주었다. 확인된 핵심 하위군들은 다음과 같다:
(a) 기준 감소에서 12% 이상의 SABA에 대한 FEV1 가역성을 가진 환자. 이 하위군에서, 핵심 이차 종점의 일관된 개선(FEV1의 11.07% 증가(95% CI: 0.99, 21.14), 평균 ACQ-6의 -0.44 감소(95% CI: -0.89, 0.01) 및 AQLQ(S)의 0.59 증가(95% CI: 0.10, 1.09))가 관찰되었다.
(b) 상향조절된 기도 IL-13(높은 페리오스틴, 높은 호산구, 높은 Th2)의 존재와 관련된 것으로 추정된 하위군들 내의 환자들은 IL-13의 상향조절과 관련된 혈액 바이오마커가 가장 많은 이익을 유도할 환자를 확인하는 데에 중요할 수 있다는 것을 암시한다.
(iii) AER의 감소는 트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 코호트 내의 동일한 핵심 하위군들에서 명확히 반복되지 않았다.
사후 분석은 기준에서 12% 이상의 FEV1 가역성 및 중간치 이상의 혈청 페리오스틴을 가진 환자들이 트랄로키누맙 300 mg Q2W에 대한 향상된 치료 반응을 가진다는 가설을 조사하였다. 환자들의 이 서브세트에서 AER의 감소는 54%(95% CI: -65, 87%)이었고 플라세보에 비해 기관지확장제 전 FEV1에서의 기준으로부터의 백분율 증가 13.85%(95% CI: -0.18, 27.87)는 12% 이상의 FEV1 가역성 및 중간치 미만의 혈청 페리오스틴(AER의 4% 감소[95% CI: -140, 61%] 및 FEV1의 7.62% 증가[95% CI: -7.60, 22.84])을 가진 대상체에서의 백분율 증가보다 수치적으로 더 컸다.
요약하면, 트랄로키누맙을 고용량 ICS 및 다른 천식 조절제 요법에 300 mg Q2W의 용량으로 추가함으로써, ITT 집단에서 기관지확장제 전 FEV1이 증가되고 생물학적으로 관련된 하위군에서 AER이 감소된다. 이 종점들의 임상적으로 중요한 개선은 기준에서 기관지확장제에 반응하는 환자들에서 관찰되었고, 이 개선은 기준에서 중간치 이상의 혈청 페리오스틴도 가진 환자들에서 더 향상되었다. 트랄로키누맙 300 mg Q4W의 유지 복용법은 이 연구에서 부적절한 것으로 밝혀졌다.
안전성의 요약
연구로부터 입수가능한 전체 안전성 데이터의 평가는 300 mg Q2W 또는 300 mg Q2/4W 복용법에서 트랄로키누맙과 관련된 의학적으로 중요한 위험을 확인시켜주지 않았다. TEAE들의 빈도는 플라세보(84.8%)와 트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 코호트(84.8%) 사이에 동일하였고 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트에서 약간 더 높았다(89.3%). 대다수의 환자들은 중증도 면에서 경증 또는 중등도이고 시험용 제품과 관련되지 않은 TEAE들을 가졌다. 주사 부위 TEAE들의 비율은 플라세보 Q2W를 제공받은 환자들(9.2%)에 비해 Q2W 트랄로키누맙 코호트 내의 대상체들(23.3%)에서 더 높았으나, 트랄로키누맙 Q2/4W(20.5%) 또는 플라세보 Q2/4W(18.7%)를 제공받은 환자들과 동일하였고, 대다수의 사건들은 중증도 면에서 경증 내지 중등도이었고, 결과적으로 시험용 제품을 중단한 환자들은 거의 없었다. TESAE들의 빈도는 플라세보(13.9%)와 트랄로키누맙 300 mg Q2W 코호트(12.0%) 사이에 유사하였고 트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 코호트(16.6%)에서 약간 더 높았고, 이때 시험용 제품과 관련된 TESAE들을 가진 환자들은 거의 없었다. 중증 천식을 가진 환자들의 집단에서 이 지속기간의 연구에서 예상된 바와 같이, TESAE들로서 보고된 다수의 천식 악화 사건들이 있었으나, 이 사건들의 빈도는 플라세보(4.0%), 트랄로키누맙 300 mg Q2W(6.0%) 및 트랄로키누맙 300 mg Q2/4W 코호트(6.6%) 사이에 균형 잡혀 있었는데, 이때 Q2/4W 코호트에서 2개의 사건들만이 상기 제품과 관련된 것으로 간주되었다.
페리오스틴
2b상 연구에서 무작위배정된 환자들로부터 수집된 기준 혈청 샘플, 즉 트랄로키누맙 치료 전의 혈청 샘플에서 페리오스틴 수준을 측정하였다. 중간치 이상의 기준 혈청 페리오스틴 수준을 가진 환자들이 중간치 미만의 기준 혈청 페리오스틴 수준을 가진 환자들에 비해 트릴로키누맙으로부터 더 큰 이익을 유도하는지를 확인하기 위해 AER 감소, FEV1, 및 ACQ-6을 포함하는 핵심 연구 종점들을 중간 혈청 페리오스틴 수준으로 등급화하였다. 트랄로키누맙 300 mg Q2W에 의한 FEV1의 증가(중간치 이상의 기준 혈청 페리오스틴을 가진 환자들에 대한 6.75% 대 혈청 페리오스틴 수준과 관계없는 환자들에 대한 8.65%) 및 보다 더 큰 AER 감소(중간치 이상의 혈청 페리오스틴을 가진 환자들에 대한 25% 대 혈청 페리오스틴 수준과 관계없는 환자들에 대한 7%)가 53주째 날에 관찰되었다(도 14a 및 도 14b). 높은 페리오스틴을 정의하기 위해 본 연구에서 사용된 중간 페리오스틴 수준은 애보트 디아그노스틱스(Abbott Diagnostics)로부터의 ARCHITECT 플랫폼에 의해 측정되었을 때 23 ng/㎖ 이상의 기준 혈청 페리오스틴(즉, 높은 페리오스틴)이었다. 페리오스틴 수준에 의한 AER 감소 및 혈청 페리오스틴 수준에 의한 기관지확장제 전 FEV1에서의 기준으로부터의 퍼센트 변화의 연속적인 표시에 대해서는 도 13을 참조한다.
사후 분석에서, 중간치 이상의 기준 혈청 페리오스틴 수준을 가진 가역적 환자들(FEV1의 기관지확장제 전 가역성 ≥ 12%)은 FEV1의 보다 더 큰 증가(중간치 이상의 혈청 페리오스틴을 가진 가역적 환자들에 대한 13.85% 대 혈청 페리오스틴 수준과 관계없는 가역적 환자들에 대한 11.07%) 및 보다 더 큰 AER 감소(중간치 이상의 혈청 페리오스틴을 가진 가역적 환자들에 대한 54% 대 혈청 페리오스틴 수준과 관계없는 가역적 환자들에 대한 34%)를 가졌다는 것이 관찰되었다(표 21 및 22).
혈청 페리오스틴 수준은 제1 용량 직후에 트랄로키누맙에 의해 실질적으로 감소되었고 연구의 지속기간 동안 낮은 상태로 유지되었다. 기준에서의 혈청 페리오스틴 수준이 중간치 미만인 환자들에 비해 중간치를 초과하는 환자들에서 혈청 페리오스틴 수준의 보다 더 큰 감소가 관찰되었다. 이 결과들은 혈청 페리오스틴이 IL-13 경로에 대한 대용 마커라는 가설에 대한 추가 뒷받침을 제공하였다.
실시예 4
말초 천식 바이오마커로서의 DPP4
천식 환자에서 페리오스틴을 능가하는 IL-13의 다른 잠재적 신규 말초 바이오마커를 확인하기 위해, 정상 인간 대상체로부터의 기관지 세포의 IL-13 자극된 배양물에서 상향조절된 유전자들의 패널을 확인하기 위한 실험을 수행하였다(도 1 내지 4). 그 다음, 이 IL-13에 의해 유도된 패널 내에서, 천식 환자의 혈청에서 상이한 수준을 갖고 타당한 천식 생물학을 가진 단백질을 확인하기 위해 정상 혈청 샘플 및 천식 혈청 샘플을 조사하였다(도 4 및 5). 디펩티딜 펩티다제 4(DPP4 [CD 26])의 상승된 수준이 정상 혈청에 비해 천식 혈청 샘플에서 관찰되었는데, 이 결과는 다른 Th2 사이토카인과 상호관련된 대조군 혈청에 비해 천식 환자로부터의 혈장에서 DPP4 상승을 보여준 룬(Lun)(Lun et al., J Clin Immunol. 2007; 430-37)의 발견과 유사하였다. 추가로, 이들은 천식 CD4+ T 세포 상에서의 증가된 막 DPP4 발현을 발견하였다.
추가로, 경구 스테로이드 및 흡입 스테로이드를 복용하는 대상체들(도 6) 및 장기적으로 경구 코르티코스테로이드로 치료받은 대상체들(도 24 참조)에서 혈청 DPP4 수준이 감소되었다는 것이 관찰되었다.
예비 사후 분석으로서, 본 발명자들은 중간치 이상의 기준 혈청 DPP4 수준을 가진 환자들이 중간치 미만의 기준 혈청 DPP4 수준을 가진 환자들에 비해 트랄로키누맙으로부터 더 큰 이익을 유도하는지를 확인하기 위해 중간 혈청 DPP4 수준에 의해 등급화된 AER 감소, FEV1 및 ACQ-6(도 18, 19 및 20)을 포함하는, 트랄로키누맙 2b상 연구(실시예 3 참조)로부터의 일차 종점 및 이차 종점을 평가하였다. 혈청 DPP4는 실시예 2에 기재된 바와 같이 측정되었다.
트랄로키누맙(300 mg Q2W)으로 치료받은, 중간치 이상의 혈청 DPP4를 가진 환자들에서 기관지확장제 전 FEV1에서의 기준으로부터의 퍼센트 변화(도 17a 및 도 17b 참조), 평균 ACQ-6에서의 기준으로부터의 변화(도 17c 및 도 17d 참조), 및 평균 AQLQ(S)에서의 기준으로부터의 변화(도 17e 및 도 17f 참조)의 통계적으로 유의한 증가가 53주째 날에 관찰되었다(표 24). 추가로, 페리오스틴과 달리, ACQ-6 및 AQLQ의 통계적으로 유의한 변화도 중간치 이상의 혈청 DPP4를 가진 환자들에서 관찰되었다(표 24). ACQ-6, FEV1 및 AER 감소(도 18 내지 20)에 대한 다양한 DPP4 컷-포인트들의 평가는 분석을 위한 상기 중간 값의 용도를 뒷받침하였고 중간치로부터의 변경이 이 종점들에 대한 상당히 더 큰 효능을 야기하지 않을 것임을 보여주었다.
사후 분석에서, 중간치 이상의 기준 혈청 DPP4 수준을 가진 가역적 환자들(단기 작용 베타 효현제에 대한 FEV1의 기관지확장제 후 가역성 ≥ 12%)은 FEV1의 증가(도 17g 참조) 및 보다 더 큰 AER 감소를 보였다. 도 17h, 도 17i 및 도 25 또한 참조한다.
DPP4는 급성 악화율 감소, 기관지확장제 전 FEV1에서의 기준으로부터의 퍼센트 변화, 평균 ACQ-6에서의 기준으로부터의 변화 및 평균 AQLQ(S)에서의 기준으로부터의 변화를 포함하는 다양한 종점들에서 페리오스틴을 능가하였다(도 15 및 16). 이 발견은 IL-13 길항제(예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙 또는 레브리키주맙)을 사용한 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 더 높은 환자를 확인하는 데에 있어서 혈청 DPP4(예를 들면, 중간치 이상의 기준 혈청 DPP4 수준)의 유용성을 강력히 뒷받침한다. 이 결과들은 천식 환자들에서 악화, 악화율, FEV1 반응 및 천식 증상(예를 들면, 야간 각성, 각성 시 증상, 활동 제한, 호흡곤란, 천명 및 SABA 사용)을 예측하는 데에 있어서 혈청 DPP4(예를 들면, 중간치 이상의 기준 혈청 DPP4 수준)의 유용성도 강력히 뒷받침한다.
바이오마커 및 임상적 특징 둘 다에 의해 정의된 하위군에서의 보다 더 큰 AER 감소의 관찰은 OCS를 제공받지 않은 기준에서 가역적인 대상체 집단의 조사로 이어졌다(n=33). 이 군에서, 플라세보에 비해 AER의 감소 및 FEV1, ACQ-6 및 AQLQ(S)의 상당한 개선이 관찰되었다(표 25). 기준에서 상승된 페리오스틴 또는 DPP4를 가진 대상체들에서 효능의 추가 개선의 증거가 관찰되었다(표 25). 기준 혈청 DPP4 또는 중간치 이상의 페리오스틴 수준을 갖고 장기적 경구 코르티코이드 스테로이드 치료를 받지 않은 가역적 환자들(단기 작용 베타 효현제에 대한 FEV1의 기관지확장제 후 가역성 ≥ 12%)에서 DPP4와 페리오스틴을 비교하기 위해 도 25 및 도 26 또한 참조한다.
IL-13 길항제(예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙 또는 레브리키주맙)를 사용한 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 더 큰 환자를 확인하기 위해 DPP4를 다른 마커/분류자(예를 들면, 높은 페리오스틴(페리오스틴-높음), 즉 ≥ 중간 혈청 페리오스틴 또는 약 23 ng/㎖; 높은 호산구 세포 카운트(Eos-높음), 즉 혈액 호산구 카운트 ≥ 300개 세포/㎕; 또는 높은 Th2(th2-높음), 즉 IgE > 100 IU/㎖ 및 혈액 호산구 ≥ 0.14 X 109/ℓ를 포함함)와 조합할 수 있다. DPP4-높음(DPP4 수준 ≥ 중간치) 군과 다른 군들, 즉 페리오스틴-높음(페리오스틴 수준 ≥ 중간치)(도 21), Th2-높음(도 22) 및 EOS-높음(호산구 카운트 ≥ 300) 사이의 부분적 중첩(도 23)은 DPP4가 IL-13 길항제(예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙 또는 레브리키주맙)를 사용한 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 더 큰 환자를 확인하기 위해 이 바이오마커들(예를 들면, Th2, 페리오스틴 및/또는 Eos) 중 하나 이상과 조합될 수 있다는 개념을 뒷받침한다.
Figure pct00030
Figure pct00031
결론적으로, 이 이중 맹검 2b상 연구는 중증 천식, 3년 이내에/스크리닝 시 12% 이상 및 200 ㎖ 이상의 기관지확장제 후 1초간 강제 호기량(FEV1) 가역성, 및 지난해 2회 이상의 천식 악화를 가진 성인을 등록시켰다. 대상체들은 플루티카손/살메테롤 500 ㎍/50 ㎍ bid(1일 2회)(또는 등가물)를 제공받았고 연구 전 조절제 약물을 계속 복용하였다. 5주 런인 기간 후, 예측된 40% 내지 80%의 FEV1 또는 1.5 이상의 천식 조절 설문지 6(ACQ-6) 점수를 가진 대상체들을 2주마다(Q2W) 트랄로키누맙 300 mg/플라세보(2:1)를 제공받는 군 또는 12주 동안 Q2W에 이어서 4주마다(Q4W) 트랄로키누맙 300 mg/플라세보(2:1)를 제공받는 군에 무작위배정하였다. 일차 종점은 52주에 걸친 천식 악화율(AER)이었다. 이차 종점은 FEV1, ACQ-6, 천식 삶의 질 설문지(AQLQ) 및 안전성을 포함하였다. 조합된 플라세보 군들에 비해 각각의 트랄로키누맙 군(Q2W 또는 Q4W)에 대한 AER의 40% 감소를 80%의 파워 및 0.15의 유의 수준으로 검출하기 위해 시험을 추진하였다. 12% 이상의 기준 FEV1 가역성을 가진 대상체들은 "가역적" 하위군으로서 정의되었다. 혈청 DPP4 및 페리오스틴(그의 유전자 발현은 IL-13에 의해 고도로 유도됨)의 기준 수준을 중간 수준에 의해 정의된 하위군으로 잠재적 대용 바이오마커로서 평가하였다.
분석은 치료 의도 집단(ITT, N=452)에 기초하였다. 기준 특징, 평균(SD): 연령: 50.2세(12.3세); ACQ-6: 2.55(0.97); 예측된 FEV1 %: 68.6(18.1). 53주째 날 AER은 플라세보에 비해 트랄로키누맙 군들 둘 다에서 유사하였다. Q2W에서 AER 감소에 대한 경향이 가역성 하위군, 페리오스틴-높음 하위군 및 DPP4-높음 하위군에서 관찰되었다(표 24). 가역성 하위군 및 페리오스틴-높음 하위군에서 AER 감소는 54%(-65, 87%)이었고, 경구 코르티코스테로이드를 제공받는 대상체를 제외하였을 때 67%(2, 89%)이었다. 53주째 날, Q2W에 대한 기관지확장제 전 FEV1의 통계적으로 유의한 증가가 관찰되었고 증가는 모든 하위군들에서 명확하였다(표 24). ACQ-6 및 AQLQ는 Q2W에 대한 가역성 하위군 및 DPP-높음 하위군에서 플라세보와 유의하게 상이하였다(표 24). Q4W 군 또는 하위군에서 플라세보에 비해 이차 종점의 유의한 차이는 관찰되지 않았다. 응급 치료를 요구하는 심각한 부작용/부작용의 빈도는 안전성 집단 내에서 유사하였다(트랄로키누맙 Q2W: 12.0/89.3%; Q4W: 16.6/84.8%; 플라세보: 13.9/84.8%).
실시예 5
아토피성 피부염에서의 IL-13 활성화의 말초 마커의 확인
페리오스틴 및/또는 DPP4가 아토피성 피부염을 앓고 있는 환자의 인간 피부에서도 상향조절되는지를 조사하기 위해, 전체 게놈 마이크로어레이를 이용하여 4개의 아토피성 피부염 피부 샘플들 및 31개의 정상 피부 샘플들에서 전사 변경을 분석하였다. 요약하건대, cDNA 합성 및 IVT 표지부착 키트를 사용하여 총 RNA로부터 바이오틴-표지된 증폭된 cRNA를 생성하였고 아피메트릭스 인간 게놈 U133 플러스 2.0 진칩® 어레이 상에서의 혼성화를 위해 단편화하였다. 진칩 작동 소프트웨어 수단으로 데이터 포착 및 품질 평가를 수행하였다. R 통계학적 분석 수단을 이용하여 어레이 CEL 파일로부터 프로브-수준 요약(frma)을 계산하였다. 전체 게놈 어레이 분석으로부터의 발현 강도 데이터(선형)는 페리오스틴(도 27) 및 DPP4(도 28)의 mRNA 발현이 정상 피부에 비해 아토피성 피부염 피부에서 상승되었다는 것을 보여주었다.
DPP4 및 페리오스틴 발현 수준이 아토피성 피부염 환자의 피부에서 증가되어 있다는 발견은 DPP4 및/또는 페리오스틴 유전자 발현 수준이 (1) 아토피성 피부염 환자에서 IL-13 경로 활성화의 말초 마커로서 사용될 수 있고; (2) 아토피성 피부염 환자를 위한 잠재적 요법을 선택하는 데에 있어서 정보를 제공할 수 있고; (3) IL-13 길항제, 예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙 또는 레브리키주맙을 사용한 요법에 반응하는 환자를 선택하는 데에 유용할 수 있다는 것을 시사한다.
아토피성 피부염 환자로부터의 피부 샘플을 사용하여 수득한 결과는 혈청 중의 DPP4 및/또는 페리오스틴의 발현 수준(예를 들면, 유전자 발현 및/또는 단백질 발현)이 아토피성 피부염에서 바이오마커로서 사용될 수도 있다는 것을 암시한다. DPP4 및 페리오스틴의 단백질 수준은 아토피성 피부염 환자의 혈청에서도 상승되었다(실시예 8 참조). 따라서, 혈청 및 피부 DPP4 및/또는 페리오스틴 단백질 수준이 아토피성 피부염에서 증가되어 있다는 이 발견은 DPP4 및/또는 페리오스틴 수준이 (1) 아토피성 피부염 환자에서 IL-13 경로 활성화의 말초 마커로서 사용될 수 있고; (2) 아토피성 피부염 환자를 위한 잠재적 요법을 선택하는 데에 있어서 정보를 제공할 수 있고; (3) IL-13 길항제, 예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙 또는 레브리키주맙을 사용한 요법에 반응하는 환자를 선택하는 데에 유용할 수 있다는 것을 암시한다.
실시예 6
CAT-354-1049 컴퓨터 단층촬영(CT) 영상 데이터 분석: 3D 기도 분석
본원에서 논의된 바와 같이, IL-13 길항제를 사용한 치료적 중재로부터 이익을 얻을 환자를 확인하고 IL-13 길항제, 예컨대, 항-IL-13 항체를 사용한 치료의 결과를 예측할 필요성이 있다. 이것은 실시예 3 내지 5에서 전술된 바와 같이 생화학적 바이오마커, 예컨대, DPP4, 페리오스틴 및/또는 임상적 특징, 예컨대, FEV1 가역성을 사용하거나 이들을 조합함으로써 달성된다. 또 다른 방법은 고성능 CT 스캐너가 대다수의 병원들에서 이용가능하고 표준화된 영상 분석이 서비스로서 수득될 수 있기 때문에 컴퓨터 단층촬영(CT) 영상화 데이터를 이용하는 것이다. 기도 치수, 특히 세분절 기도 치수로부터 추정될 수 있는 기도 저항성의 변화는 폐 기능의 개선과 관련되어 있을 것이고, 표준 폐 기능 검사, 예컨대, FEV1보다 더 객관적인 척도일 것이다.
다른 연구진들은 치료 효과의 표시제들 중 하나로서 큰 기도에 대한 치수의 변화(RB1)를 연구하였다(예를 들면, 문헌(Haldar, et al., 2009) 참조). 여기서, 보다 더 많은 말초 기도들이 RB1을 비롯한 보다 더 큰 기도들만큼 강하지 않기 때문에 이 말초 기도들, 예컨대, 세분절 기관지들의 치수의 정량이 효능을 반영할 보다 더 큰 잠재력을 가질 것이므로, 본 발명자들은 기준으로부터의 세분절 기도 치수의 변화에 의해 측정된 트랄로키누맙 투여 후 치료 효과를 조사하였다.
당분야에서 잘 공지된 방법을 이용하여 비다 아폴로® 소프트웨어(버전 1.2.001_Investigator; VIDA 디아그노스틱스 인코포레이티드(Diagnostics, Inc.), 미국 아이오와주 코랄빌 소재)를 사용하여 CAT-354-1049 임상시험(실시예 3에 기재됨)에 등록된 환자들로부터 수득된 폐 스캔의 컴퓨터 단층촬영(CT) 영상화 데이터를 분석하였다. 예를 들면, 문헌(Gupta et al., J Allergy Clin Immunol. 133(3):729-738 (2014))을 참조한다. 임상시험에서, CT 스캐닝을 이용하여 기도 벽 구조적 변화에 대한 트랄로키누맙 투여의 효과를 확인하였다. 나선/나선형 MSCT(멀티슬라이스 컴퓨터 단층촬영) 영상화를 이용하여 영상 데이터를 수득하였다. 지이 헬쓰케어(GE Healthcare), 필립스(Philips) 및 지멘스(Siemens)로부터의 CT 스캐너를 다중심 시험에서 이용하였다. 영상화 및 재구성 파라미터들을 각각 튜브 전압 120 kVp, 슬라이스 두께 <= 1.0 mm, 레콘 커넬(recon kernel) 표준물(지이), B(필립스) 및 B30f(지멘스)로 표준화하였다. 모든 영상들을 전체 영감(full inspiration)(TLC)에서 획득하였다. 이 연구에서, 폐의 상부 부분만을 영상화함으로써, 상엽에서 분절 및 세분절 기도의 분석을 가능하게 하였다. 비다 아폴로® 소프트웨어는 기도 치수, 특히 기관지 튜브와 관련된 파라미터의 3D 분석을 가능하게 하였다. 본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "기관지 튜브"는 기관지 및 세기관지를 포함하는 기관지 또는 이의 분지들 중 임의의 분지를 의미한다. 각각의 기관지 튜브(또는 분절)에 대해 측정된 파라미터는 평균 횡단 루멘 면적(LA), 벽 면적(WA), 벽 면적 백분율(WA%) 및 벽 두께(WT)이었다. 용어 "루멘"은 기관지 튜브의 내부 개방된 공간 또는 캐비티(cavity)를 지칭한다. 용어 "벽 면적"은 기관지 튜브 벽의 횡단면적을 지칭한다. 벽 면적 백분율을 다음과 같이 계산하였다: 100*벽 면적/(벽 면적 + 루멘 면적). 상엽 내의 모든 영상화된 분절 및 세분절 기관지들에서 측정을 수행하였다. 분절 기도(각각의 대상체에서 최대 5개)는 우측 정점(RB1), 우측 전방(RB2), 우측 후방(RB3); 좌측 정점후방(LB1+2), 및 좌측 전방(LB3)이었다. 세분절 기도(각각의 대상체에서 최대 14개)는 RB1a & b, RB2a & b, RB3a & b, LB1, LB1a* & b*, LB2, LB2a* & b*, 및 LB3a & b이었고, 이때 별표시로 표지된 영역은 하위-세분절 기도이다. LB1 및 LB2는 대안적으로 각각 LB1+2a 및 LB1+2b로서 명명될 수 있었다. 상응하는 하위-세분절 기도들(상기 별표시로 표지됨)은 대안적으로 각각 LB1+2ai, LB1+2aii, LB1+2bi 및 LB1+2bi로서 명명될 수 있었다. 예를 들면, 문헌(Naidich, et al, Imaging of the Airways - Functional and Radiologic Correlations, 2005)을 참조한다.
본원에 개시된 기준 측정치는 문헌(Gupta et al., J Allergy Clin Immunol. 133(3): 729-738 (2014))을 포함하는, 다른 천식 CT 연구에서 관찰된 기준 측정치와 일치하였다.
각각의 기도 분절에 대한 전술된 기도 파라미터들의 변화를 별도로 계산한 후, 각각의 대상체에서 분절 기도 및 세분절 기도에 대해 평균을 산출하였다. 기도 저항성 및 횡단 기도의 평균의 계산을 매트랩(Matlab)(Matlab R2010a (MathWorks, Natick, MA))에서 수행하였다. 기준(4회째 방문)(도 29, 패널 A 참조)과 추적검사(30회째 방문)(도 29, 패널 B 참조) 사이의 상대적 변화만을 계산하였다. 총 트랄로키누맙(즉, 300 mg Q2 + 300 mg Q2/4W 코호트)과 총 플라세보 사이의 군 차이만을 계산하였다.
분석 데이터세트는 기준, 즉 4회째 방문 및 추적검사, 즉 30회째 방문 둘 다에서 CT 스캔을 가진 모든 대상체들을 사용하였다. 가장 심각한 CT 프로토콜 편차(즉, 4회째 방문과 30회째 방문 사이의 영상 슬라이스 두께 또는 재구성 커넬의 변화)는 배제되었다.
그들의 직경보다 실질적으로 더 긴 층류성 기류 및 기도 분절을 가정하여 기도 저항성을 계산하였다. 따라서, 기도 저항성을 이론적으로 다음과 같이 계산하였다:
Figure pct00032
상기 식에서, r은 기도의 반경이다(μ=점도, l=길이, V=유속). 면적이 대략 r2이기 때문에, 저항성의 상대적 변화는 결과적으로 다음과 같이 추정될 수 있다:
Figure pct00033
여러 기관지들에 걸쳐 평균을 산출하기 전에 각각의 기도 분절에 대한 기도 저항성의 상대적 변화를 계산하였다.
기준부터 30회째 방문까지 루멘 영역(LA)의 상대적 변화는 표 26 및 도 30에 제시되어 있다.
Figure pct00034
LA의 상대적 변화는 기준에서의 신체 표면적(BSA)을 사용한 표준화, 즉 하기 식에 의해 영향을 받지 않아야 한다:
Figure pct00035
기준부터 30회째 방문까지 벽 면적(WA)의 상대적 변화는 표 27에 제시되어 있다.
Figure pct00036
WA의 상대적 변화는 기준에서의 신체 표면적(BSA)을 사용한 표준화, 즉 하기 식에 의해 영향을 받지 않아야 한다:
Figure pct00037
기준부터 30회째 방문까지 벽 면적 백분율(WA%)의 상대적 변화는 표 28 및 도 31에 제시되어 있다.
Figure pct00038
기준부터 30회째 방문까지 벽 두께(WT)의 상대적 변화는 표 29에 제시되어 있다.
Figure pct00039
기준부터 30회째 방문까지 기도 저항성의 상대적 변화는 표 30 및 도 32에 제시되어 있다. 세분절 기도 저항성 및 FEV1%의 상대적 개선의 후속 분석을 위해 트랄로키누맙에 대한 데이터세트(도 32에서 쇄선 상자)를 기준에서의 WA%에 따라 2개의 하위군들로 분할하였다. WA%를 기준으로 한 중간 컷-오프를 사용하여, 68%의 컷-오프 수준을 생성하였다(도 33 참조).
Figure pct00040
결론:
하기 (i) 내지 (vii)을 포함하는 다수의 결론들을 이 연구들로부터 도출할 수 있다:
(i) WA%의 3D 측정치는 2D 측정치보다 더 적은 가변성을 가지면서 공개된 데이터와 더 잘 일치하였고;
(ii) 우측 정점 분절 기관지(RB1)에서의 2D 및 3D 측정치는 루멘 면적의 경우 상대적으로 일관되었으나, 벽 측정치의 경우에는 더 가변적이었고;
(iii) 3D 분석에서 다수의 기도들에 대한 각각의 파라미터의 상대적 변화의 평균산출은 가변성을 감소시켰고;
(iv) 트랄로키누맙은 분절 기관지보다 더 작은 (세분절) 기도에서 LA 및 WA%에 대한 보다 더 큰 효과를 가졌고;
(v) 세분절 기관지에서의 루멘 면적, 벽 면적 백분율 및 기도 저항성은 플라세보에 비해 트랄로키누맙에 의해 유의하게 개선되었고(각각 p=0.021, p<0.005 및 p<0.01);
(vi) 벽 면적 및 벽 두께에서 유의한 치료 효과는 관찰되지 않았고;
(vii) 기도 저항성에 대한 트랄로키누맙 치료의 효과는 가장 낮은 벽 면적 백분율(68% 중간 컷-오프보다 더 낮은 세분절 기도의 WA%)을 가진 트랄로키누맙 군의 절반에 비해 기준에서 가장 높은 벽 면적 백분율(68% 중간 컷-오프보다 더 높은 세분절 기도의 WA%)을 가진 트랄로키누맙 군의 절반에서 유의하게 더 높았다(p=0.037). 도 33을 참조한다. 사실상, 특정된 역치(예를 들면, 세분절 수준에서 적어도 68%의 WA%) 초과의 WA%를 가진 환자들은 기도 저항성의 통계적으로 유의한 개선을 나타내고 기관지확장제 전 FEV1의 통계적으로 유의한 개선을 나타낸다. 도 33을 참조한다.
더불어, 이 연구들은 세분절 기도의 폐의 CT 스캔을 이용하여 측정한 벽 면적 %(WA%)를 사용하여 IL-13 길항제(예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙 또는 레브리키주맙)로 치료받은 환자 또는 치료받을 후보에서 치료 반응(예를 들면, 기도 저항성 및/또는 FEV1의 개선)을 예측할 수 있다는 것을 암시한다. 뿐만 아니라, 이 연구는 치료 전에 소정의 WA% 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플에서의 WA%(예를 들면, 세분절 기도의 약 68%, 약 60% 초과 또는 60% 내지 80%의 WA% 역치 수준)를 초과하는 WA% 값을 가진, IL-13 매개 질환(예를 들면, 천식, COPD, IPF, UC 또는 아토피성 피부염)을 앓고 있는 환자들이 IL-13 길항제(예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙 또는 레브리키주맙)를 사용한 치료를 위한 우수한 후보라는 것을 암시한다. 추가로, 벽 면적 백분율(WA%)을, CT 스캔 데이터의 3D 기도 분석을 이용함으로써 수득된 다른 측정치, 예를 들면, 루멘 면적(LA), 벽 면적(WA), 벽 두께 면적(WT), 기도 저항성 또는 이들의 조합과 조합하여, IL-13 길항제(예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙 또는 레브리키주맙)를 사용한 치료를 받을 수 있는 환자의 집단을 확인할 수 있다.
기준에서의 벽 면적 백분율(WA%)은 기도가 어떻게 수축되고/두꺼워지는지 및 결과적으로 IL-13 길항제, 예컨대, 트랄로키누맙 또는 레브리키주맙을 사용한 치료로 달성될 수 있는 잠재적 개선을 기술한다. WA%는 비로서 산출되기 때문에, 이것을 개별 환자에 대한 기도 치수로 자동으로 표준화함으로써, 이 파라미터가 기준 특징규명을 위한 필연적인 선택물이 되게 한다.
중증 천식에서의 사용 이외에, 이 방법은 COPD, 폐기종 및 IPF를 포함하나 이들로 한정되지 않는 다른 폐 질환들에서 적용될 것이다.
실시예 7
COPD 대상체로부터의 기도 상피에서 페리오스틴 및 DPP4 발현의 유도
COPD 내에서의 기도 염증은 불균질하고 IL-17, IL-33 및 IL-13을 포함하는 다양한 염증 매개자들에 의해 조절된다. (에피에어웨이™ 조직) 기체-액체 계면에서 분화된 정상 및 COPD 기관지 상피 세포를 MATTEK(MA,TTEK 코포레이션(Corporation), 미국 매사추세츠주 소재)로부터 입수하고 37℃의 5% CO2 풍부 항온처리기 내에서 24시간 동안 배양하였다. 그 다음, 조직을 PBS로 2회 세정하고 추가 24시간 동안 혈청 또는 스테로이드가 결여된 배지에서 배양하였다. 이 기간 후, 세포를 추가 24시간 동안 25 ng/㎖의 IL-13, IL-17A, IL-17F, IL-17E, IL-13, TSLP 또는 IL-33(펩프로텍(PeproTech), 미국 뉴저지주 소재)으로 자극하였다. 그 다음, 미르바나(mirVana) 단리 프로토콜(라이프 테크놀로지스(Life Technologies), 미국 메릴랜드주 소재)을 이용하여 총 RNA를 추출하고 수퍼스크립트(SuperScript)® III 제1 가닥 합성 시스템(라이프 테크놀로지스, 미국 메릴랜드주 소재)으로 역전사하고 택만® 유전자 발현 PCR 분석(라이프 테크놀로지스, 미국 메릴랜드주 소재)으로 정량하였다.
CCL-26, DPP4, 페리오스틴 POSTN-745 및 페리오스틴 POST-815의 IL-13 특이적 상향조절이 정상 대상체 및 COPD 대상체로부터의 고도로 분화된 기관지 상피 세포로부터 수득된 전사체에서 관찰되었다. 기관지 상피 세포를 기체-액체 계면(에피에어웨이™ 모델)에서 생장시켰다. 도 34를 참조한다. 도 34에서 제공된 데이터는 상기 표시된 바와 같이 24시간 동안 25 ng/㎖의 IL-17A, IL-17F, IL-17E, IL-13, TSLP 또는 IL-33으로 자극한 후 기준/비처리된 기준 조건에 비해 CCL-26, DPP4, 페리오스틴 POSTN-745 및 페리오스틴 POST-815 유전자 전사체의 log2 변화 배수(fc)를 나타낸다. 이 발견은 페리오스틴 및 DPP4가 IL-13 매개 COPD에 대한 특이적 마커라는 것을 시사한다. 분화된 기도 상피 세포에 상응하는 이 실험 데이터는 IL-13 매개 염증이 CCL-26, DPP4 및 페리오스틴의 특이적 발현에 의해 다른 표현형으로부터 구별될 수 있다는 것을 보여준다. 데이터는 IL-13(그러나, IL-17A/F/E, TSLP 또는 IL-33은 아님)이 COPD 대상체로부터의 기도 상피에서 페리오스틴 및 DPP4 발현을 유의하게 유도한다는 것도 보여준다. 정상 상피 및 병든 상피에 걸쳐 이 결과의 보존은 유도된 페리오스틴 및 DPP4가 IL-13 매개 기도 염증에 의해 영향을 받은 COPD 환자를 확인하기 위한 바이오마커로서 사용될 수 있다는 것을 시사한다.
실시예 8
아토피성 피부염 환자에서의 페리오스틴 및 DPP4의 발현
대상체 선택: 아토피성 피부염 환자들은 사전동의와 함께 혈청 샘플 및 임상적 특징을 제공하였다. 중등도 아토피성 피부염을 가진 100명의 환자들 및 중증 아토피성 피부염을 가진 100명의 환자들에 상응하는 샘플들을 익명으로 접근하고 선택하였다. 중등도 비교군과 중증 비교군 사이의 균형을 이루기 위해, 이용가능한 환자 샘플들을 성별 및 연령에 대하여 일치시켰다.
DPP4 정량: 인간 DPPIV/CD26 콴티카인(Quantikine) ELISA 키트를 사용하여 DPP4를 정량하였다. 기준 표준물 원액(RS)은 상기 키트로부터의 인간 DPPIV 표준물이었다. OC 샘플 원액(QCS)은 상기 키트로부터의 인간 DPPIV 표준물이었다. 분석 시작 전날에 품질 조절(QC)을 준비하였다. 키트 내에 제공된 적어도 2개의 기준 표준물(DPPIV 표준물, 파트 892953)(RS) 바이알들을 재구성하였다. 각각의 RS를 제품 삽입물에 따라 1000 ㎕의 diH2O로 재구성하였다. 재구성된 농도는 200 ng/㎖의 원액을 생성하였다. 검사 샘플을 1:70 MRD로 제조하였다. 샘플을 실온에서 해동하고 보정제 희석제 RD5-33으로 희석하였다. 기준 표준물 원액(RS)을 제조하기 위해, RS를 1000 ㎕의 diH2O로 재구성하였다. 재구성된 농도는 200 ng/㎖의 원액을 생성하였다. 기준 표준물 원액(RS)으로 출발하여 기준 표준물을 제조하였다. 동결된 QC 원액(QCS)으로 출발하여 품질 조절(QC) 샘플을 제조하였다. 50 ㎕의 제조된 기준 표준물, QC 및 희석된 검사 샘플을 적절한 웰 내로 피펫팅하였다. 플레이트(들)를 밀봉하고 궤도 플레이트 진탕기 상에서 대략 450 rpm에서 진탕하면서 실온에서 2시간 ± 15분 동안 항온처리하였다. 플레이트 세척제를 이용하여 플레이드(들)를 4회 세척하였다. 세척 후, 임의의 잔존 세척 완충제를 깨끗한 종이 타월에 대해 블롯팅함으로써 제거하였다. 200 ㎕의 DPPIV 접합체를 각각의 웰에 첨가하였다. 플레이트(들)를 밀봉하고 궤도 플레이트 진탕기 상에서 대략 450 rpm에서 진탕하면서 실온에서 2시간 ± 15분 동안 항온처리하였다. 플레이트 세척제를 이용하여 플레이드(들)를 다시 4회 세척하였다. 기질 시약을 웰에 첨가하기 전에 동등한 부피의 기질 A 및 B를 첨가함으로써 기질 시약을 제조하였다. 200 ㎕의 기질 시약을 각각의 웰에 첨가하였다. 플레이트(들)를 밀봉하고 궤도 플레이트 진탕기 상에서 대략 450 rpm에서 진탕하면서 실온에서 30분 ± 5분 동안 항온처리하였다. 샘플을 광으로부터 보호하였다. 50 ㎕의 중단 용액을 첨가하고 분광광도계 마이크로플레이트 판독기를 이용하여 450 nm에서 각각의 웰 내의 흡광도를 측정하였다. 중단 용액을 첨가한지 30분 이내에 웰을 판독하였다. 4-PL 비선형 피트(SoftMax ProGxP v5.2)를 이용하여 데이터를 분석하였다. 농도로 다시 계산할 때 표준물 곡선 값으로부터 블랭크 값을 차감하지 않았다. 분석의 허용성을 위해, 분석 플레이트 상의 표준 곡선 및 품질 조절 복제물은 100 ± 30% 회수 및 ≤ 25% CV라는 허용성 기준을 통과해야 했다. 분석 플레이트 상의 검사 샘플 복제물은 ≤ 25% CV라는 허용성 기준을 통과해야 했다.
페리오스틴 정량: MSD 분석 플레이트(MSD L15XA)(MSD, 미국 메릴랜드주 게이더스버그 소재)를 항-인간 페리오스틴 항체(메디뮨(MedImmune), 클론# 4B4.B11, 본원에 참고로 도입되는 미국 가특허출원 제61/936,967호에 개시되어 있고 2013년 4월 17일 자로 수탁번호 PTA-120210 하에서 어메리칸 타입 컬쳐 콜렉션(미국 버지니아주 마나사스 소재)(ATCC)에 기탁됨)로 코팅하였다. 포획 항체를 1X PBS(론자(Lonza), 카탈로그 # 17-516Q 또는 등가물)로 2 ㎍/㎖의 최종 농도까지 희석하였다. 50 ㎕/웰의 2 ㎍/㎖ 포획 항체를 각각의 웰에 첨가하고, 플레이트를 접착제 마이크로플레이트 밀봉제로 덮었다. 플레이트를 2℃ 내지 8℃에서 밤새 항온처리한 후 ELISA 세척 완충제로 세척하였다.
코팅된 분석 플레이트를 1X ELISA 세척 완충제(0.05% 트윈-20, 1X PBS)로 3회 세척하고 (60분 이상, 그러나 4시간 이하 동안) 약하게 진탕하면서 실온(RT)에서 최소 1시간 동안 150 ㎕/웰 I-차단 완충제(IBB)(I-차단 완충제: 0.5% 트윈-20, 1X PBS, 0.2% I-차단 완충제)(트로픽스(Tropix) I-BlockTM, 어플라이드 바이오시스템스(Applied Biosystems), 카탈로그 # T2015)로 차단하였다.
재조합 인간 페리오스틴(R&D 시스템스, 카탈로그 # 3548-F2)을 표준물로서 사용하였다. 기준 표준물(RS), 품질 조절(QC) 및 음성 대조군(NC)을 IBB에서 제조하고, IBB에서 1:10의 최소 요구된 희석비까지 희석된 혈청 검사 샘플을 플레이트에 첨가하고 약하게 진탕하면서 플레이트 진탕기 상에서 실온에서 대략 1시간 동안 항온처리하였다. 플레이트를 ELISA 세척 완충제로 세척함으로써 결합되지 않은 분석물을 제거하였다. 결합된 분석물을 검출하기 위해, 루테닐화된 항-인간 페리오스틴(Ru-7B5, 접합체 항체 클론# 7B5.C4, 메디뮨, 본원에 참고로 도입되는 미국 가특허출원 제61/936,967호에 개시되어 있고 2013년 4월 17일 자로 수탁번호 PTA-120211 하에서 어메리칸 타입 컬쳐 콜렉션(미국 버지니아주 마나사스 소재)(ATCC)에 기탁됨)을 2 ㎍/㎖의 최종 농도로 제조하고, 200 ㎕/웰의 1X ELISA 세척 완충제로 각각의 웰을 세척한 후, 30 ㎕/웰의 검출 항체를 각각의 웰에 첨가하고 플레이트를 (광 노출로부터 보호된) RT에서 약하게 진탕하면서 플레이트 진탕기 상에서 대략 1시간(60분 ± 10분) 동안 항온처리하였다. 플레이트를 ELISA 세척 완충제로 세척함으로써 결합되지 않은 검출 항체를 제거하였다.
증류수를 사용하여 "4X 판독 완충제 T"(4X, MSD, 카탈로그 # R92TC-1) 원액을 "1X"까지 희석함으로써 판독 완충제(MSD)를 제조하였다. 판독 완충제를 플레이트에 첨가하고 플레이트를 MSD 플레이트 판독기 상에서 판독하였다. 추가 분석을 위해 전기화학발광 유닛(ECLU)의 원데이터를 소프트맥스 프로(SoftMax Pro) 소프트웨어(SoftMax® Pro v5.2 GxP) 및 엑셀 스프레드시트(Excel spreadsheet)에게 전달하였다. 4-파라미터 로지스틱 가중된(1/y^2) 곡선 피트 방법을 이용하여 각각의 분석에 대한 기준 표준물 곡선을 작도하였다. 피팅된 곡선으로부터 각각의 QC 수준, NC 및 혈청 검사 샘플에 대해 페리오스틴 농도를 내삽하였다.
결과 및 결론: 페리오스틴은 중등도 아토피성 피부염 환자들과 비교될 때 중증 아토피성 피부염 환자들의 혈청에서 보다 더 높은 수준으로 발현되었다. 도 35의 패널 A를 참조한다. DPP4 발현은 아토피성 피부염 환자의 혈청에서도 상승되었으나, 발현 수준은 질환 중증도와 관련되어 있지 않았다. 도 35의 패널 B를 참조한다. DPP4 및 페리오스틴 발현 수준이 중증 아토피성 피부염 환자 및 중등도 아토피성 피부염 환자의 혈청에서 증가된다는 발견은 DPP4가 (1) 아토피성 피부염 환자들에서 IL-13 경로 활성화의 말초 바이오마커로서 사용될 수 있고; (2) 아토피성 피부염 환자를 위한 잠재적인 요법을 선택하는 데에 있어서 정보를 제공할 수 있고; (3) IL-13 길항제, 예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙 또는 레브리키주맙을 사용한 요법에 반응하는 환자를 선택하는 데에 유용할 수 있다는 것을 시사한다.
실시예 9
안정한 COPD 및 COPD의 급성 악화에서 페리오스틴 및 혈청 DPP4
안정한 COPD에서 관찰된 발현 수준에 비해 COPD의 급성 악화(AECOPD)에서 페리오스틴 및/또는 DPP4의 발현 수준의 차이가 존재하는지를 확인하기 위해, 페리오스틴(도 36) 및 혈청 DPP4(도 37)의 수준을 건강한 대조군, 안정한 COPD 환자 및 COPD의 급성 악화를 경험하는 환자에서 측정하였다. 20명의 비흡연 대상체들(10명의 여성들 및 10명의 남성들, 연령 17세 내지 59세)로부터의 건강한 대조군 혈청을 바이오레클라메이션(Bioreclamation)(미국 메릴랜드주 발티모어 소재)으로부터 입수하였다. COPD 및 AECOPD 혈청을 메디뮨에 의해 후원받은 MI-CP221 임상 바이오마커 연구로부터 입수하였다. 페리오스틴 및 DPP4 수준을 전술된 바와 같이 면역분석으로 측정하였다. 데이터는 페리오스틴 및 혈청 DPP4가 건강한 대조군에 비해 안정한 COPD뿐만 아니라 AECOPD에서도 증가되었다는 것을 보여주었다. 이것은 DPP4 및/또는 페리오스틴이 안정한 COPD 및 AECOPD 둘 다에 대한 바이오마커로서 사용될 수 있고 IL-13 길항제, 예를 들면, 항-IL-13 항체, 예컨대, 트랄로키누맙 또는 레브리키주맙을 사용한 요법에 반응하는 COPD 환자를 선택하는 데에 유용할 수 있다는 것을 시사하였다.
발명의 내용 및 요약서 단락이 아니라 상세한 설명 단락이 청구범위를 해석하는 데에 사용되어야 한다는 것을 인식해야 한다. 발명의 내용 및 요약서 단락은 본 발명자(들)에 의해 고려되는 본 발명의 하나 이상의 예시적인 실시양태를 기술할 수 있으나 모든 예시적인 실시양태들을 기술할 수는 없으므로, 본 발명 및 첨부된 청구범위를 어떠한 방식으로든 한정하기 위한 것이 아니다.
본 발명은 특정된 기능들 및 이들의 관계의 실시를 예시하는 기능성 구축 블록들의 도움으로 전술되어 있다. 이 기능성 구축 블록들의 경계는 설명의 편의를 위해 본원에서 임의로 정의되어 있다. 특정된 기능들 및 이들의 관계가 적절하게 수행되는 한, 대안적 경계가 정의될 수 있다.
특정 실시양태들의 상기 설명은 다른 사람들이 당분야의 기술 내에 있는 지식을 적용함으로써 본 발명의 일반적인 개념을 벗어나지 않으면서 과도한 실험 없이 이러한 특정 실시양태들을 다양한 적용을 위해 용이하게 변경할 수 있고/있거나 채택할 수 있을 정도로 완전하게 본 발명의 일반적인 성질을 보여줄 것이다. 따라서, 이러한 채택 및 변경은 본원에서 제공된 교시 및 지침을 기초로 할 때 개시된 실시양태들의 등가물의 의미 및 범위 내에 있다. 본원에서 어구 또는 용어는 설명을 위한 것이고 한정하기 위한 것이 아니므로, 본 명세서의 용어 또는 어구는 상기 교시 및 지침에 비추어 볼 때 당업자에 의해 해석되어야 한다는 것을 이해해야 한다.
본 발명의 폭 및 범위는 전술된 예시적인 실시양태들 중 임의의 예시적인 실시양태에 의해 한정되어서는 안 되지만, 하기 청구범위 및 이들의 등가물에 따라서만 정의되어야 한다.
본원에서 인용된 모든 공개문헌들, 특허들, 특허출원들 및/또는 다른 문서들은 각각의 개별 공개문헌, 특허, 특허출원 및/또는 다른 문헌이 모든 목적을 위해 참고로 도입되는 것으로 개별적으로 표시되어 있는 것처럼 동일한 정도로 모든 목적들을 위해 전체적으로 참고로 도입된다.
SEQUENCE LISTING <110> MEDIMMUNE LLC <120> DIPEPTIDYL PEPTIDASE-4 (DPP4/CD26) AS A PERIPHERAL BIOMARKER OF IL-13 ACTIVATION IN ASTHMATIC LUNG <130> IL13-400WO <140> To Be Assigned <141> 2015-01-27 <150> US61931878 <151> 2014-01-27 <150> US61990932 <151> 2014-05-09 <160> 78 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 445 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (1)..(445) <223> Lebrikizumab Heavy chain <400> 1 Gln Val Thr Leu Arg Glu Ser Gly Pro Ala Leu Val Lys Pro Thr Gln 1 5 10 15 Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Phe Ser Leu Ser Ala Tyr 20 25 30 Ser Val Asn Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Ala Leu Glu Trp Leu 35 40 45 Ala Met Ile Trp Gly Asp Gly Lys Ile Val Tyr Asn Ser Ala Leu Lys 50 55 60 Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val Val Leu 65 70 75 80 Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys Ala 85 90 95 Gly Asp Gly Tyr Tyr Pro Tyr Ala Met Asp Asn Trp Gly Gln Gly Ser 100 105 110 Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser 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ggagacatgg catacggtta ctgacttatg agctaccaaa actaaattct 360 ttctctgcta ttaactggct agaagacatt catctatttt tcaaatgttc tttcaaaaca 420 tttttataag taatgtttgt atctatttca tgctttact 459 <210> 67 <211> 430 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> modified_base <222> (343)..(345) <223> a, c, g, t, unknown or other <220> <221> modified_base <222> (347)..(347) <223> a, c, g, t, unknown or other <220> <221> modified_base <222> (349)..(352) <223> a, c, g, t, unknown or other <400> 67 gggaatcact attcagggat ttttcccctt tgctcttctt ttccctcctt aaaagaaaaa 60 ttaccttcta gtcctaggat gaggacacac tattagtttg aattaaatgc tttgatattc 120 tcagatcagc catcttgaac caaagcaaaa ccacaagtta cactttctta aaatttgatt 180 tgtcatattt tctagagaaa cttgaattta attgtgttat tcttagcttc cactggcagc 240 ctagctttga gggtaaatga aaatataacc catagattac ccagccactt gggaacagca 300 ggtaatactg aagaaaaata aaaatagatt ttgaaaacgt tannnanann nntatgatta 360 tgattctgtt ccatttaagg gaaaacttag gtaaatagag aaattttttc tataacattg 420 tgtagtcagt 430 <210> 68 <211> 358 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tccgctcttt cagggaagga 300 tggtaacaaa ctagaaggac aaatatgtac gtatttataa cgtattaaaa ctcttttaag 360 tagcttaagg tattgtgcaa tggcctagcc tagtagaaat gggggaaaag cattgctgtg 420 gaccattgtt aaagtgacag gagttgtagg gttacccctt tgacaagctt ccatagtctt 480 cagacacgca cattgatggc atccct 506 <210> 70 <211> 496 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> modified_base <222> (60)..(60) <223> a, c, g, t, unknown or other <220> <221> modified_base <222> (75)..(75) <223> a, c, g, t, unknown or other <220> <221> modified_base <222> (114)..(114) <223> a, c, g, t, unknown or other <220> <221> modified_base <222> (131)..(131) <223> a, c, g, t, unknown or other <220> <221> modified_base <222> (138)..(138) <223> a, c, g, t, unknown or other <220> <221> modified_base <222> (141)..(141) <223> a, c, g, t, unknown or other <220> <221> modified_base <222> (159)..(159) <223> a, c, g, t, unknown or other <220> <221> modified_base <222> (175)..(175) <223> a, c, g, t, unknown or other <220> <221> modified_base <222> (203)..(203) 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tgcagtcttt gtttatgtct taaaaatgtc atgtttatgt 240 catgtctgtg aattgctgag tactaattga ttcctccatc cttgaatcag ttctcataat 300 gctttttaaa taagaaaaat tcagaagatg aatttcttcc aatatttgaa taaattaaag 360 ctcttagata cagagtagat tgtattatat gctttttcct attaatacta cttatagaaa 420 tccattaaaa agcaatctct gtacagtgta tttaaatatt tcattgacat actgtgatct 480 ctattagtga tggatgtaca aaaaatgttt tcttaccctt gacttacaat gaaatgtgaa 540 attacttgtc tgaaccccgt 560 <210> 72 <211> 512 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> modified_base <222> (443)..(443) <223> a, c, g, t, unknown or other <400> 72 acagcaagcc tatgtagttc aattaatata taaggaaaag gaaggtcttt cttcatgata 60 caagcattat aaagttttta ctgtagtagt caattaatgg atatttcctt gttaataaaa 120 ttttgtgtca taatttacaa attagttctt taaaaattgt tgttatatga attgtgtttc 180 tagcatgaat gttctataga gtactctaaa taacttgaat ttatagacaa atgctactca 240 cagtacaatc aattgtatta taccatgaga aaatcaaaaa ggtgttcttc agagacattt 300 tatctataaa attttcctac tattatgttc attaacaaac ttctttatca catgtatctt 360 ctacgtgtaa 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unknown or other <400> 73 ctgctacttt ggaagatggc tctggaggaa actctcatat ggctaaaaag gcaggctagt 60 ttcttacttc tacaggggta gagccttaaa aaagaacgtg ctacaaattg gttntcttnn 120 agggttncng gttctccctg cccccaatnc cnatatactt tantgcnntt ttatttttgc 180 ctttacggnc tctgtgtctt tctgcaagaa ggcctggcaa aggtatgcct gctgttggtc 240 ccntcgggat aagataaaat ataaataaaa ccttcagaac tgttttggag caaaagatag 300 cttgtacttg gggaaaaaaa ttctaagttc ttttatatga ctaatattct tggttagcaa 360 gactggaaag aggtgttttt ttaaaatgta cataccagaa caaagaacat acagctctct 420 gaacatttat tttttgaaca gaggtggttt ttatgtttgg acctggtaat acagatacaa 480 aaactttaat gaggtagcaa tgaatattca actgtttgac tgctaagtgt atctgtccat 540 attttagcaa g 551 <210> 74 <211> 474 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> modified_base <222> (365)..(365) <223> a, c, g, t, unknown or other <220> <221> modified_base <222> (429)..(429) <223> a, c, g, t, unknown or other <400> 74 tactacaaaa gccgtgacct cagcctgctt atactactgc cagaagacat taatgggctg 60 gaacagctgg aaaaggccat cacctatgag 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Claims (28)

  1. 인터류킨-13(IL-13) 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법으로서, 상기 환자로부터 채취된 하나 이상의 샘플 중의 DPP4(디펩티딜 펩티다제-4)의 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우, IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는 방법.
  2. 인터류킨-13(IL-13) 매개 질환 또는 장애를 가진 환자를 치료하는 방법으로서, (a) 환자로부터 채취된 하나 이상의 샘플 중의 DPP4(디펩티딜 펩티다제-4)의 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우, 및 임의적으로 (b) 환자가 (i) 높은 페리오스틴(periostin)(≥ 중간 혈청 페리오스틴 또는 약 23 ng/㎖), (ii) 높은 호산구 세포 카운트(혈액 호산구 카운트 ≥ 300개 세포/㎕), (iii) 높은 Th2(IgE > 100 IU/㎖ 및 혈액 호산구 ≥ 0.14 X 109/ℓ로서 정의된 높은 Th2), (iv) 단기 작용 β2 효현제에 대한 FEV1 가역성 ≥ 12%, (v) 폐의 CT 스캔으로부터 세분절(subsegmental) 기도의 벽 면적 백분율(WA%) ≥ 68%, 또는 (vi) 이들의 조합을 나타내는 경우, IL-13 길항제를 상기 환자에게 투여하는 단계를 포함하는 방법.
  3. 제1항에 있어서, 환자의 DPP4 수준을 면역분석(immunoassay)으로 측정하는 것인 방법.
  4. 제3항에 있어서, 면역분석이 인간 DPP4를 인식하는 하나 이상의 항-DPP4 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용하는 것인 방법.
  5. 제1항에 있어서, IL-13 길항제가 항-IL-13 항체 또는 이의 항원 결합 단편, IL-13 뮤테인(mutein) 및 IL-4 뮤테인, 항-IL-13Rα1 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 항-IL-4Rα 항체 또는 이의 항원 결합 단편 중 하나 이상을 포함하는 것인 방법.
  6. 제1항에 있어서, 환자가 IL-13 길항제의 투여 전에, 동안에 또는 후에 하나 이상의 추가 약물로 치료받은 것인 방법.
  7. 제6항에 있어서, 하나 이상의 추가 약물이 스테로이드(steroid)를 포함하고, 임의적으로 기관지확장제를 포함하는 것인 방법.
  8. 제7항에 있어서, 스테로이드가 플루티카손(fluticasone) 또는 부데소나이드(budesonide)이고, 기관지확장제가 살부타몰(salbutamol) 또는 살메테롤(salmeterol)인 방법.
  9. 제6항에 있어서, 하나 이상의 추가 약물을 흡입, 경구 투여, 주사, 또는 이들의 조합으로 투여하는 것인 방법.
  10. 제9항에 있어서, 흡입 투여를 정량 흡입기(MDI) 또는 건조 분말 흡입기(DPI)를 사용하여 수행하는 것인 방법.
  11. 제7항에 있어서, 스테로이드를 고용량으로 투여하는 것인 방법.
  12. 제1항에 있어서, IL-13 길항제가 항-IL-13 항체 또는 이의 항원 결합 단편이고, 이때
    (i) 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편이 트랄로키누맙(tralokinumab)(VH: 서열번호 3; VL: 서열번호 4)과 동일한 IL-13 에피토프에 결합하거나, 트랄로키누맙과 IL-13의 결합을 경쟁적으로 억제하거나, 이 성질들 둘 다를 갖거나;
    (ii) 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편이 트랄로키누맙(VH: 서열번호 3; VL: 서열번호 4) 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하거나;
    (iii) 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편이 트랄로키누맙(VH: 서열번호 3; VL: 서열번호 4) 또는 이의 항원 결합 단편으로 구성되거나;
    (iv) 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편이 레브리키주맙(lebrikizumab)(VH: 서열번호 1; VL: 서열번호 2)과 동일한 IL-13 에피토프에 결합하거나, 레브리키주맙과 IL-13의 결합을 경쟁적으로 억제하거나, 이 성질들 둘 다를 갖거나;
    (v) 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편이 레브리키주맙(VH: 서열번호 1; VL: 서열번호 2) 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하거나;
    (vi) 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편이 레브리키주맙(VH: 서열번호 1; VL: 서열번호 2) 또는 이의 항원 결합 단편으로 구성되거나;
    (vii) 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편이 서열번호 3, 서열번호 4 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 것인 방법.
  13. 제1항에 있어서, 환자로부터 채취된 하나 이상의 샘플 및/또는 하나 이상의 대조군 샘플이 전혈, 혈청, 혈장, 침, 객담, 기관지폐포 세척액, 폐 상피 세포, 소변, 피부, 비용종 또는 이들의 조합 중 하나 이상을 포함하는 것인 방법.
  14. 제1항에 있어서, IL-13 길항제를 고정 용량으로 투여하는 것인 방법.
  15. 제12항에 있어서, 항-IL-13 항체가 트랄로키누맙이고, 트랄로키누맙을 약 300 mg/용량의 고정 용량으로 투여하는 것인 방법.
  16. 제1항에 있어서, IL-13 길항제를 2회 이상의 용량으로 투여하는 것인 방법.
  17. 제1항에 있어서, IL-13 길항제를 주마다, 2주마다 또는 월마다 투여하는 것인 방법.
  18. 제1항에 있어서, IL-13 길항제를 정맥내로, 근육내로, 피하로 또는 이들의 조합으로 투여하는 것인 방법.
  19. 제1항에 있어서, 소정의 DPP4 역치 수준이 ELISA 콴티카인(QUANTIKINE)® 분석을 이용하여 혈청에서 측정될 때 적어도 약 250 ng/㎖, 적어도 약 350 ng/㎖, 적어도 약 375 ng/㎖, 적어도 약 400 ng/㎖, 적어도 약 450 ng/㎖, 적어도 약 500 ng/㎖, 적어도 550 ng/㎖, 또는 적어도 약 600 ng/㎖인 방법.
  20. 제1항에 있어서, 소정의 DPP4 역치 수준이 약 365 ng/㎖인 방법.
  21. 제1항에 있어서, 하나 이상의 대조군 샘플이 (i) 정상의 건강한 개체로부터 얻은 샘플 또는 샘플들; (ii) 천식의 비-IL-13 매개 서브세트를 가진 환자로부터 얻은 샘플 또는 샘플들; (iii) 코르티코스테로이드(corticosteroid) 치료 경험이 없는 천식 환자로부터 얻은 샘플 또는 샘플들; (iv) 코르티코스테로이드로 치료받은 천식 환자로부터 얻은 샘플 또는 샘플들; (v) 치료받지 않은 아토피성 피부염 환자로부터 얻은 샘플 또는 샘플들; (vi) 치료받은 아토피성 피부염 환자로부터 얻은 샘플 또는 샘플들; (vii) 소정의 표준량의 단리된 DPP4; 또는 (viii) 이들의 조합인 방법.
  22. 제1항에 있어서, IL-13 길항제의 투여가
    (a) 플라세보로 치료받은 환자들의 집단에서 관찰된 AER(급성 악화율)에 비해 적어도 5%, 적어도 10%, 적어도 15%, 적어도 20%, 적어도 25%, 적어도 30%, 적어도 35%, 적어도 40% 또는 적어도 45%인 AER 감소;
    (b) 플라세보로 치료받은 환자들의 집단에서 관찰된 FEV1(1초간 강제 호기량)에 비해 적어도 3%, 적어도 5%, 적어도 7%, 적어도 9%, 적어도 11%, 적어도 13%, 적어도 15%, 적어도 17% 또는 적어도 19%인 FEV1 증가;
    (c) 개선된 ACQ-6(천식 조절 설문지, 6-항목 버전) 결과;
    (d) 개선된 AQLQ(천식 삶의 질 설문지) 결과; 또는
    (e) 이들의 조합
    을 유도하는 것인 방법.
  23. 제1항에 있어서, IL-13 매개 질환 또는 장애가 폐 질환 또는 장애, 염증성 장 질환 또는 장애, 또는 만성 염증성 피부 질환 또는 장애인 방법.
  24. 제23항에 있어서, 폐 질환 또는 장애가 천식, IPF, COPD, 만성 비부비동염 또는 알레르기성 비염인 방법.
  25. 제23항에 있어서, 만성 염증성 피부 질환 또는 장애가 아토피성 피부염, 알레르기성 접촉 피부염, 습진 또는 건선인 방법.
  26. 제24항에 있어서, 천식이 알레르기성 천식, 아토피성 천식, 코르티코스테로이드 무경험(naive) 천식, 만성 천식, 코르티코스테로이드 내성 천식, 코르티코스테로이드 불응성 천식, 흡연으로 인한 천식, 또는 코르티코스테로이드로 조절되지 않는 천식인 방법.
  27. 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4(디펩티딜 펩티다제-4)의 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 환자에서 IL-13 매개 질환 또는 장애를 진단하는 방법으로서, DPP4의 수준이 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 경우, 환자를 IL-13 매개 질환 또는 장애로 진단하는 것인 방법.
  28. 환자로부터 채취된 샘플 중의 DPP4(디펩티딜 펩티다제-4)의 수준을 측정하는 단계를 포함하는, IL-13 길항제를 사용한 치료를 위한 후보로서 환자를 확인하는 방법으로서, 소정의 DPP4 역치 수준을 초과하거나 하나 이상의 대조군 샘플 중의 DPP4 수준을 초과하는 DPP4의 수준이, IL-13 길항제를 사용한 치료를 위한 후보로서 환자를 확인하는 것인 방법.
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