CN102099485A - 诊断新生物的方法-ⅱ - Google Patents

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Abstract

本发明总体上涉及核酸分子，所述核酸分子的DNA或RNA或蛋白质表达谱的改变代表发生新生物、发生新生物的倾向性和/或新生物的进展。更具体地，本发明涉及核酸分子，所述核酸分子的DNA或RNA或蛋白质表达谱的改变代表大肠新生物(例如腺瘤或腺癌)的发生和/或进展。本发明的DNA或表达谱的用途包括但不限于结直肠新生物(例如结直肠腺癌)的诊断和/或监测。因此，本发明的另一方面涉及通过筛查一或多种核酸分子标记物的DNA或RNA或蛋白质表达谱的调变而筛查个体发生新生物、发生新生物的倾向性和/或新生物的进展的方法。

Description

诊断新生物的方法-Ⅱ
发明领域
本发明总体上涉及核酸分子，所述核酸分子的DNA或RNA或蛋白质表达谱的改变代表发生新生物、发生新生物的倾向性和/或新生物的进展。更具体地，本发明涉及核酸分子，所述核酸分子的DNA或RNA或蛋白质表达谱的改变代表大肠新生物(例如腺瘤或腺癌)的发生和/或进展。本发明的DNA或表达谱的用途包括但不限于结直肠新生物(例如结直肠腺癌)的诊断和/或监测。因此，本发明的另一方面涉及通过筛查一或多种核酸分子标记物的DNA或RNA或蛋白质表达谱的调变而筛查个体发生新生物、发生新生物的倾向性和/或新生物的进展的方法。
背景技术
本说明书中按照作者姓名引用的出版物的详细信息以字母顺序汇集在说明书的最后。
本说明书中对任何现有技术出版物(或自其产生的信息)或任何已知事物的引用均不是并且也不应该被认为是承认或以任何形式提示该现有技术出版物(或自其产生的信息)或已知事物构成本说明书所涉及的技术领域的公知常识的一部分。
腺瘤是上皮来源的良性肿瘤或新生物(neoplasms)，它们源自腺体组织或展现出清楚的腺状结构。一些腺瘤显示出可识别的组织特征，例如纤维组织(纤维腺瘤)和上皮结构，而其他一些，例如支气管腺瘤，产生活性化合物可导致出现临床综合征。
腺瘤可以进展变成侵袭性新生物，称为腺癌。因此，腺癌被定义为来源于腺体结构(体内许多数器官的组成部分)的恶性上皮肿瘤。术语腺癌也适用于显示出腺样生长模式的肿瘤。可以根据这些肿瘤所产生的物质(例如粘液分泌型和浆液型腺癌)或它们的细胞在显微镜下排列成的方式(例如乳头状和滤泡状腺癌)而将它们分为亚型。这些癌症可以是实体性的或囊性的(囊腺癌)。各个器官可产生多种组织类型的肿瘤，例如卵巢可产生粘液性和囊腺癌。
不同器官的腺瘤具有不同的行为。一般而言，腺瘤的总体癌变(即，在良性病变内已经出现癌灶)发生率大约为5％。不过，这与腺瘤的大小相关。例如，在大肠(具体为结肠和直肠)内，小于1厘米的腺瘤中极少发生癌变。但在大于4厘米且显示出特定组织病理学改变如绒毛改变或高度发育异常(dysplasia)的腺瘤中，癌变发生率估计为40至50％。发育异常程度越高的腺瘤其癌变发生率也越高。在任何给定的结直肠腺瘤中，该器官中目前存在癌症或未来出现癌症的预测因子包括大小(特别是大于9mm)、从管状转变为绒毛状形态学的改变程度、存在高度发育异常以及称为“锯齿状腺瘤(serrated adenoma)”的形态学改变。在任何给定的个体中，年龄增加、家族中出现结直肠腺瘤或癌、男性或多个腺瘤等额外因素，提示未来该器官癌变的风险增加——这些是所谓的癌症风险因子。除了腺瘤的存在及其大小之外，这些因子均未被客观定义，且除了数量和大小之外的因子均易于受到观察者的错误以及对该因素没有准确定义的混乱情况的影响。由于这些因子难以评估和定义，它们作为当前和未来发生癌症的风险预测因子的价值是不确定的。
一旦出现散发的腺瘤，在26个月内出现新腺瘤的机会大约为30％。
结直肠腺瘤这类腺瘤的发病率逐渐增加，特别是在较富裕的国家。引起腺瘤及其进展为腺癌的原因仍然是热门研究课题。目前认为除了遗传易感性以外，环境因素(例如饮食)在该病的发生中也起作用。大多数研究指出有关的环境因素涉及饮食中的高脂肪、低纤维、低蔬菜摄入、肥胖、体力活动少和大量精制碳水化合物。
结肠腺瘤是局部的发育异常上皮病灶，最初可仅累及一或几个隐窝，可不突出表面，但不断长大，通常是增殖和/或凋亡失衡所致，结肠腺瘤可以是突出的。腺瘤可通过不同方式加以分类。一种方式是根据其大体的外观，主要的描述符包括突出的程度：平坦无蒂(即，突出但无明显的蒂)或有蒂(即，具有蒂)。其他大体描述符包括最大方向上的实际长度以及在结肠/直肠内的实际数量。小腺瘤(例如小于5或10毫米)具有平滑的黄褐色表面，而有蒂且特别是是较大的腺瘤倾向于具有鹅卵石样或分叶状的棕红色表面。较大的无蒂腺瘤可具有更加细致的绒毛表面。另一类描述符包括组织病理学分类：具有临床意义的主要描述符包括发育异常的程度(低度或高度)，是否存在侵润癌灶，从管状腺形成到绒毛腺形成的转变程度(据此分类为管状、绒毛状或管状绒毛状)，存在混合增生改变以及存在所谓的“锯齿状”腺瘤及其亚组。腺瘤可位于结肠和/或直肠的任何部位，但它们在在直肠和远端结肠更加常见。除了数量和大小，所有这些描述符均相对主观，在不同观察者之间可有不同意见。
腺瘤的各种描述性特征的价值不仅在于可确定特定腺瘤的新生状态，也可预测个体将来发生结直肠腺瘤或癌的风险。提示个体将来发生癌或反复出现新腺瘤的风险的腺瘤特征或腺瘤数量包括：最大腺瘤的大小(特别是10mm或以上)，绒毛状改变的程度(特别是至少25％的此类改变，尤其是100％的此类改变)，高度发育异常，数量(3个或以上的任何大小或组织学状态的腺瘤)或存在锯齿状腺瘤特征。除了大小和数量，这些描述符无一是客观的，它们均相对主观，在不同观察者之间可有不同意见。这些关于将来发生新生物形成(neoplasia)的风险的预测因子在实践中至关重要，这是因为它们可用于确定将来是否需要进行结肠镜监测及其频率。因此，更加精确的风险分类或许可降低结肠镜的需要量，提高成本效益率，并降低因不必要的操作所导致的并发症的风险。
腺瘤通常是无症状的，因此在它们可能出现侵袭特性并变成癌之前的阶段难以对其做出诊断和治疗。从技术上讲，无法基于腺瘤的大体外观预测是否存在癌症，不过认为较大的腺瘤较较小的腺瘤更有可能出现恶性改变区域。无蒂腺瘤较同等大小的有蒂腺瘤具有更高的癌变率。一些腺瘤导致失血，可在粪便中观察到或检测到这种失血；尽管有时是肉眼可见的，但当其发生时，通常是显微镜下的或为“潜血”。较大的腺瘤比较小的腺瘤更容易出血。但是，由于便血(无论是明显的还是潜血)也可以由非腺瘤性病变引起，因此在不进行高创伤性方法例如结肠镜加切除(即，息肉切除术)或活检获取组织并随后进行组织病理学分析的情况下很难准确诊断腺瘤。
因此，一直需要阐明腺瘤的原因并开发更具指示性的诊断方案或诊断辅助方法，以便能够对更有可能具有腺瘤的人直接进行结肠镜检查。这些腺瘤可能是高风险的，高度进展的，或既不是高风险的也不是进展的，特别是那些能够实现快速、常规和准确诊断腺瘤的方案。此外，在结肠镜后也难以确定是否所有腺瘤均已切除，对于患有多发腺瘤的人尤其如此。准确的筛查测试可最大程度降低对通过进行早期第二次结肠镜检查以确保结肠的新生物已经被清除的需求。因此，鉴定腺瘤的分子标记物将为理解腺瘤和癌症的成因、改进腺瘤的诊断(包括开发有用的筛查测试法)、阐明腺瘤的组织学阶段、根据腺瘤的分子状态表征患者未来发生结直肠新生物形成的风险和促进腺瘤治疗等提供手段。
迄今为止的研究集中于鉴定那些导致发生结直肠新生物的基因突变。但导致作出本发明的研究则是确定那些同样表达于健康个体的基因的DNA或RNA或蛋白质表达谱的改变，所述改变代表发生大肠新生物(例如腺瘤和腺癌)。已经进一步确定，就大肠新生物而言，可基于一组这样的差异性表达基因中的一或多个基因而作出诊断。在一个有关的方面，已经进一步确定，对于无论是通过采用本发明的方法还是采用其他方法而鉴定的新生组织而言，本发明还进一步提供了将该组织表征为腺瘤或癌症的手段。在另一方面，已经确定，可根据基因在非新生组织中表达而在新生组织中不表达这一点而表征上述那些基因中的一部分，由此有助于建立不需要针对非新生物或正常对照参考水平进行相对分析的定量分析法。因此，本发明人已经鉴定了一组基因，这些基因有助于诊断腺癌和腺瘤的发生和/或有助于监测以发生这些类型的新生物为特征的情况。
发明内容
在本说明书和权利要求书中，除非前后文有不同的要求，否则，“包含”(“comprise”)及其不同变化形式如“包含”(“comprises”和“comprising”)，应理解为意味着纳入所述的事物或步骤或事物的组或步骤的组，但不排除任何其他的事物或步骤或事物的组或步骤的组。
在本文中，术语“源自”应该理解为指的是从所述的种类起源的特定事物或事物的组，但其不一定是从所述来源直接得到的。此外，在本文中，单数形式的“a”、“an”和“the”包括复数个指代物，除非前后文明确指示有其他情况。
除非另有说明，本文中所用的所有技术和科技术语具有与本发明所属技术领域的技术人员所通常理解的含义相同的含义。
本说明书含有使用程序PatentIn Version 3.4制备的氨基酸和核苷酸序列信息，呈现在参考文献目录之后。每一氨基酸和核苷酸序列在序列表中表示为数字指示符<210>后面加序列标识符(例如<210>1，<210>2等等)。各序列的长度、序列类型(氨基酸、DNA等等)和来源生物体分别由数字指示符域<211>m<212>和<213>中提供的信息指明。说明书中涉及的氨基酸和核苷酸序列表示为指示符SEQ ID NO：后面加序列标识符(例如SEQ IDNO：1，SEQ ID NO：2等等)。说明书中涉及的序列标识符对应于序列表中由数字指示符域<400>后面加序列标识符(例如<400>1，<400>2等等)所提供的信息。也就是说，说明书中记载的SEQ ID NO：1对应于序列表中<400>1所表示的序列。
本发明的一个方面涉及筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
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204570_at      212414_s_at    227061_at      221584_s_at
204688_at      212419_at      227235_at      221841_s_at
204697_s_at    212464_s_at    227265_at      221896_s_at
204719_at      212667_at      227404_s_at    223484_at
204745_x_at    212671_s_at    227529_s_at    223597_at
204834_at      212713_at      227561_at      223754_at
204894_s_at    212730_at      227623_at      224342_x_at
204931_at      212764_at      227662_at      224989_at
204938_s_at    212859_x_at    227705_at      224990_at
204939_s_at    212956_at      227727_at      225458_at
204940_at      213068_at      227826_s_at    225728_at
204955_at      213071_at      227827_at      226147_s_at
205097_at      213428_s_at    228202_at      226302_at
205200_at      213509_x_at    228504_at      226594_at
205267_at      213624_at      228507_at      226654_at
205382_s_at    213746_s_at    228640_at      226811_at
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205464_at      214038_at      228750_at      227682_at
205547_s_at    214091_s_at    228766_at      227725_at
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205950_s_at    214505_s_at    228885_at      228133_s_at
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206198_s_at    214768_x_at    230264_s_at    228469_at
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206461_x_at    215176_x_at    231773_at      229831_at
206561_s_at    215193_x_at    234764_x_at    230595_at
206576_s_at    215382_x_at    234987_at      231925_at
206637_at      215388_s_at    236300_at      231975_s_at
206641_at      215657_at      236313_at      233565_s_at
206710_s_at    216207_x_at    242317_at      235146_at
206784_at      216401_x_at    200884_at      235766_x_at
207003_at      216442_x_at    201495_x_at    235849_at
207080_s_at    216474_x_at    202266_at      238143_at
207134_x_at    216576_x_at    202350_s_at    238750_at
207266_x_at    216834_at      202731_at      238751_at
207502_at      216984_x_at    202741_at      239272_at
207961_x_at    217148_x_at    202742_s_at    241994_at
207977_s_at    217179_x_at    202768_at      242447_at
207980_s_at    217235_x_at    202838_at      242601_at
208131_s_at    217258_x_at    203058_s_at    243278_at；
208370_s_at    217378_x_at    203060_s_at
208383_s_at    217480_x_at    203240_at      和/或
(ii) CLCA4     VIM            CA12           AP1S2
     ZG16      SMPDL3A        FKBP5          EMP3
     CA2       P2RY14         HSPB8          MMP28
     CA1       CHGA           TPSB2          UGT2A3
     MS4A12    C15orf48       FGL2           RGS5
     AQP8      COL3A1         C1QB           PTGIS
     SLC4A4    CYR61          ANGPTL1        DUSP5
     CEACAM7   TRPM6          MEP1A          MFAP4
     TAGLN     OSTbeta        GUCY1A3        UGT1A6
GUCA1B     IGLV1-44    UGDH      PRKAR2B
GCG        VSIG2       DUSP1     HHLA2
ADH1B      IGHM        C2orf40   LOC652128
UGT2B17    LRRC19      PLN       C3
ADAMDEC1   CD163       UGT2B15   ATP2B4
MT1M       CEACAM1     PDLIM3    HBA1
AKR1B10    TIMP2       TP53INP2  TCF21
FN1        ENTPD5      ATP8B1    PPID
MGP        DDR2        ANK3      PPAP2B
CXCL12     CHRDL1      CTGF      SPON1
PDK4       SRGN        MUCDHL    PHLDB2
CA4        PDE9A       SDPR      RARRES2
PYY        PMP22       COL14A1   ETHE1
IGHA1      FLNA        DSCR1     MMP2
TPM2       STMN2       CITED2    SRI
C6orf105   MYL9        MT1H      CNTN3
HPGD       SEMA6D      NEXN      RGS2
ADH1C      PADI2       MUC2      COL6A1
CLCA1      SEPP1       NID1      FBN1
FABP1      TGFB1I1     HBB       MXD1
ENAM       SFRP2       GCNT2     PLCE1
CFD        UGT1A3      C20orf118 KCNMB1
GUCA2B     MS4A7       SLC20A1   CALM1
FBLN1      ALDH1A1     CD14      HLA-DPB1
LOC63928   SGK         KCTD12    SMOC2
ABCA8      CFL2        RBMS1     LOC285382
POSTN      C1S         PTRF      CLIC5
DCN        SELENBP1    TSPAN1    APOE
ITLN1      MT1E        UGT1A9    SERPINF1
COL6A2     ADAMTS1     COX7A1    PPP1R12B
FCGBP      ITM2A       MUC12     HSPB6
SLC26A2    POU2AF1     PDCD4     FNBP1
PGM5       FAM55D      CAV1      C4orf34
DMN        C6orf204    FAM46C    SORBS2
GPNMB      AKAP12      LRIG1     GPA33
IGFBP5     TUBB6       HLA-DPA1  GALNAC4S-6ST
CLEC3B     LGALS2      Clorf115  CFHR1
LOC253012  KIAA0828    HBA2      MGC13057
DPT        MGC14376    EDIL3     C10orf56
PCK1       PPP1R14A    DES       SULT1A1
CNN1       MUC4        MT2A      TTRAP
HSD17B2    PKIB        KCNMA1    CCL28
PLAC8           PIGR       GAS1        IDH3A
TMEM47          ASPN       TBC1D9      EDG2
OGN             A2M        C7          UGT1A8
CALD1           LOC25845   P2RY1       RAB27A
ACTG2           LGALS1     NR3C1       ANTXR1
MGC4172         BCHE       STOM        EMP1
MAB21L2         ST6GALNAC1 CKB         CSRP1
RPL24           GJA1       CLU         PLEKHC1
ABCG2           SCNN1B     SLC26A3     LOC572558
CCDC80          FABP4      SDC2        FOXP2
UGT1A1          F13A1      SST         HSPA2
MRC1            CD36       HLA-DRA     ATP1A2
HSD11B2         SPARCL1    TSC22D3     TNXB
ANPEP           ZCWPW2     IL6ST       FUCA1
MATN2           TNC        C1QC        MRGPRF
PRNP            MT1A       MT1X        HIGD1A
ABI3BP          LOC652745  AOC3        MFSD4
HLA-C           MALL       PPAP2A      AXL
NDE1            GNG2       ZSCAN18     AQP1
SRPX            DNASE1L3   IVD         MAP1B
WWTR1           EGR1       SFRP1       PALLD
HMGCS2          CMBL       COL4A2      MPEG1
LOC646627       GCNT3      GPM6B       KLHL5
KRT20           SERPING1   EPB41L3     TCEAL7
KLF4            MEIS1      MAOA        FILIP1L
FHL1            EDN3       DMD         IQGAP2
ARL14           MSN        MSRB3       PRDX6
LUM             MT1G       PLOD2       RAB31
SORBS1          TPSAB1     C9orf19     LOC96610
METTL7A         GPX3       MIER3       FGFR2
FAM129A         CDKN2B     XDH         PAPSS2
SCARA5          FOSB       CLDN23      XLKD1
SI              HSPA1A     SGCE        SMTN
ACTA2           CYBRD1     FOXF2       C8orf4
CD177           PTGER4     AGR3        SDCBP2
C10orf99        MAG1       IGLJ3       CCL11
COL15A1         BEST2      QKI         ELOVL5
NR3C2           HLA-DQA1   LOC399959   FOXF1
DHRS9           PRIMA1     ANKRD25     RELL1
LMOD1           MT1F       CRISPLD2    PNMA1
EFEMP1          MAFB       ANK2        LOC339562
GREM1           FAM107A    LOC283666   PALM2-AKAP2
IL1R2      PRKACB    CRYAB    PAG1
LOC387763  SELM      ACAT1    HCLS1
TIMP3      TYROBP    IGL@     RGS1
MYLK       TNS1      PBLD     FXYD6
CLDN8      MYH11     CCL8     OLFML3
RDX        ITM2C     LIFR     COL6A3
TSPAN7     CES2      HLA-DRB1
TNFRSF17   MS4A4A    UGP2
SYNPO2     PDGFRA    IGKV1D-13
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生性大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
本发明的另一方面提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
220026_at；和/或
(ii)CLCA4
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
本发明的另一方面提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
214142_at；和/或
(ii)ZG16
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生性大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
本发明的另一方面提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
    209301_at 205950_s_at；和/或
(ii)CA2       CA1
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生性大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
本发明的另一方面提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
220834_at；和/或
(ii)MS4A12
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生性大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
本发明的另一方面提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
206784_at；和/或
(ii)AQP8
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生性大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
本发明的另一方面提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
203908_at，206198_s_at，205547_s_at，207003_at，206422_at，209613_s_at，
207245_at；和/或
(ii)SLC4A4，CEACAM7，TAGLN，GUCA1B，GCG，ADH1B，UGT2B17，
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生性大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
本发明的另一方面提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
203908_at，206198_s_at，205547_s_at，207003_at，206422_at，209613_s_at，
207245_at；和/或
(ii)SLC4A4，CEACAM7，TAGLN，GUCA1B，GCG，ADH1B，UGT2B17，
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生性大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
本发明的另一方面提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括筛查来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
225207_at      211548_s_at    205382_s_at
206208_at      206262_at      207502_at
207080_s_at    210107_at      202995_s_at
215118_s_at    205892_s_at    206149_at
204083_s_at    212592_at      204719_at
229070_at；和/或
(ii)PDK4        HPGD          CFD
    CA4         ADH1C         GUCA2B
    PYY         CLCA1         FBLN1
    IGHA1       FABP1         LOC63928
    TPM2        ENAM          ABCA8
    C6orf105
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生性大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
本发明的另一方面提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括筛查来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
210809_s_at    201617_x_at    202133_at
201893_x_at    202274_at      204607_at
223597_at      218756_s_at    238143_at
209156_s_at    210302_s_at    213953_at
203240_at      228885_at      220266_s_at
224963_at      209735_at      210299_s_at
226303_at      228504_at      220468_at
212730_at      225242_s_at    201744_s_at
201141_at      215125_s_at    218087_s_at
211959_at      204438_at      207761_s_at
205200_at      204130_at      217967_s_at
242601_at      202888_s_at    229839_at
213068_at      202350_s_at    206664_at
208383_s_at    201300_s_at    200974_at
203951_at      223395_at      219669_at
204818_at      214768_x_at    227736_at
219014_at      228133_s_at    203477_at
209656_s_at    204955_at      205259_at
222722_at；和/或
(ii)POSTN      OGN            WWTR1
    DCN        CALD1          HMGCS2
    ITLN1      ACTG2          LOC646627
    COL6A2     MGC4172        KRT20
    FCGBP      MAB21L2        KLF4
    SLC26A2    RPL24          FHL1
    PGM5       ABCG2          ARL14
    DMN        CCDC80         LUM
    GPNMB      UGT1A1         SORBS1
    IGFBP5     MRC1           METTL7A
    CLEC3B     HSD11B2        FAM129A
    LOC253012  ANPEP          SCARA5
    DPT        MATN2          SI
    PCK1       PRNP           ACTA2
    CNN1       ABI3BP         CD177
    HSD17B2    HLA-C          C10orf99
    PLAC8      NDE1           COL15A1
    TMEM47     SRPX           NR3C2
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生性大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
本发明的另一方面涉及筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括筛查来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
200600_at      208788_at      215382_x_at
200665_s_at    208789_at      215388_s_at
200799_at      208894_at      216442_x_at
200845_s_at    209047_at      216474_x_at
200859_x_at    209101_at      216834_at
200897_s_at    209138_x_at    217480_x_at
200974_at      209147_s_at    217757_at
200986_at      209156_s_at    217762_s_at
201041_s_at    209191_at      217764_s_at
201061_s_at    209209_s_at    217767_at
201069_at      209210_s_at    217897_at
201105_at      209312_x_at    218162_at
201137_s_at    209335_at      218224_at
201141_at      209436_at      218312_s_at
201150_s_at    209457_at      218353_at
201289_at      209496_at      218418_s_at
201300_s_at    209621_s_at    218468_s_at
201426_s_at    209651_at      218469_at
201438_at      209656_s_at    218559_s_at
201616_s_at    209868_s_at    219087_at
201617_x_at    210084_x_at    219607_s_at
201645_at      210133_at      221541_at
201667_at      210139_s_at    222043_at
201743_at      210495_x_at    222453_at
201744_s_at    210517_s_at    222513_s_at
201842_s_at    210764_s_at    223121_s_at
201852_x_at    210809_s_at    223122_s_at
201858_s_at    210982_s_at    223235_s_at
201859_at      211161_s_at    223343_at
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201893_x_at    211671_s_at    224694_at
201920_at      211719_x_at    224840_at
202007_at      211813_x_at    224964_s_at
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202766_s_at    212136_at      225688_s_at
202953_at      212158_at      225710_at
202957_at      212185_x_at    226001_at
202994_s_at    212195_at      226051_at
202995_s_at    212230_at      226084_at
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203382_s_at    212387_at      226694_at
203477_at      212397_at      226818_at
203645_s_at    212414_s_at    226834_at
203680_at      212419_at      226841_at
203729_at      212464_s_at    227061_at
203748_x_at    212667_at      227099_s_at
204069_at      212671_s_at    227235_at
204122_at      212713_at      227404_s_at
204135_at      212764_at      227529_s_at
204438_at      212956_at      227561_at
204457_s_at    213428_s_at    227623_at
204570_at      213509_x_at    227705_at
204688_at      213746_s_at    227727_at
205412_at      213891_s_at    228507_at
205683_x_at    214038_at      228750_at
205935_at      214677_x_at    228846_at
207134_x_at    214752_x_at    229530_at
207266_x_at    215049_x_at    230264_s_at
208131_s_at    215076_s_at    231579_s_at
208370_s_at    215193_x_at    234987_at；和/或
208747_s_at
(ii)A2M        FBN1           PALLD
    ACAT1      FILIP1L        PALM2-AKAP2
    ACTA2      FKBP5          PDGFRA
    AKAP12     FLNA           PDLIM3
    ANKRD25    FN1            PHLDB2
    ANTXR1     FOXF1          PLEKHC1
    AP1S2      FXYD6          PLOD2
    APOE       GALNAC4S-6ST   PMP22
    AQP1       GAS1           PNMA1
    ASPN       GJA1           POSTN
    ATP2B4     GNG2           PPAP2A
    AXL        GPNMB          PPAP2B
    C10orf56   GREM1          PRDX6
    C1QB       GUCY1A3        PRKAR2B
    C1QC       HCLS1          PRNP
    C1S        HLA-DPA1       PTGIS
    C20orf118  HLA-DPB1       PTRF
    C3         HLA-DQA1       QKI
    C9orf19    HLA-DRA        RAB31
    CALD1      HLA-DRB1       RARRES2
    CALM1      HSPA1A         RBMS1
CCDC80         IDH3A        RDX
CCL11          IGFBP5       RELL1
CCL8           IGL@         RGS1
CD14           IGLJ3        RGS5
CD163          IL6ST        SDC2
CES2           KLHL5        SELM
CFHR1          LGAL         S1SEPT6
CLU            LOC283666    SERPINF1
COL14A1        LOC339562    SERPING1
COL15A1        LOC387763    SFRP2
COL1A2         LOC399959    SGCE
COL3A1         LRIG1S       LC20A1
COL4A2         LUM          SMOC2
COL6A1         MAFB         SORBS1
COL6A2         MAP1B        SPARC
COL6A3         MEIS1        SPON1
COX7A1         MFAP4        SRGN
CRISPLD2       MGP          STOM
CTGF           MMP2         TBC1D9
CYBRD1         MPEG1        TCEAL7
CYR61          MRC1         TGFB1I1
DCN            MRGPRF       TIMP2
DDR2           MS4A4A       TIMP3
DSCR1          MS4A7        TMEM47
DUSP1          MSN          TNC
DUSP5          MT2A         TPSAB1
EFEMP1         MXD1         TPSB2
EGR1           NEXN         TUBB6
ELOVL5         NID1         TYROBP
EMP3           NR3C1        VIM
F13A1          OLFML3       WWTR1
FBLN1          PAG1         ZSCAN18
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表腺瘤细胞或倾向于发生腺瘤状态的细胞。
本发明的另一方面提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括筛查来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因：
200884_at      208596_s_at    220812_s_at
201495_x_at    208920_at      221004_s_at
202266_at      209114_at      221305_s_at
202350_s_at    209374_s_at    221584_s_at
202731_at      209458_x_at    221841_s_at
202741_at      209791_at      221896_s_at
202742_s_at    210107_at      223484_at
202768_at      210524_x_at    223597_at
202838_at      210735_s_at    223754_at
203058_s_at    211372_s_at    224342_x_at
203060_s_at    211538_s_at    224989_at
203240_at      211549_s_at    224990_at
203296_s_at    211637_x_at    225458_at
203343_at      211699_x_at    225728_at
203474_at      211745_x_at    226147_s_at
203638_s_at    212224_at      226302_at
203963_at      212592_at      226594_at
204018_x_at    212741_at      226654_at
204034_at      212814_at      226811_at
204036_at      213317_at      227052_at
204130_at      213451_x_at    227522_at
204388_s_at    213629_x_at    227682_at
204389_at      213921_at      227725_at
204508_s_at    213953_at      227735_s_at
204532_x_at    214164_x_at    227736_at
204607_at      214433_s_at    228133_s_at
204673_at      214598_at      228195_at
204818_at      214916_x_at    228232_s_at
204895_x_at    215125_s_at    228241_at
204897_at      215299_x_at    228469_at
205112_at      215867_x_at    228961_at
205259_at      216336_x_at    229070_at
205403_at      216491_x_at    229254_at
205480_s_at    216510_x_at    229659_s_at
205554_s_at    217022_s_at    229831_at
205593_s_at    217109_at      230595_at
205892_s_at    217110_s_at    231925_at
205929_at      217165_x_at    231975_s_at
206000_at      217232_x_at    233565_s_at
206094_x_at    217414_x_at    235146_at
206262_at      218541_s_at    235766_x_at
206377_at      218546_at      235849_at
206385_s_at    219059_s_at    238143_at
206664_at      219543_at      238750_at
207126_x_at    219796_s_at    238751_at
207245_at      219948_x_at    239272_at
207390_s_at    220075_s_at    241994_at
207392_x_at    220266_s_at    242447_at
207432_at      220468_at      242601_at
207761_s_at    220645_at      243278_at；和/或
(ii)ADH1C          HIGD1A         NR3C2
    AGR3           HMGCS2         P2RY1
    ALDH1A1        HPGD           PADI2
    ANK3           HSD11B2        PAPSS2
    ARL14          HSD17B2        PBLD
    ATP1A2         HSPA2          PDCD4
    ATP8B1         IGHA1          PDE9A
    BEST2          IGHM           PIGR
    C10orf99       IL1R2          PLCE1
    C15orf48       IL8            PPID
    C1orf115       IQGAP2         PRKACB
    C4orf34        ITLN1          PTGER4
    C6orf105       ITM2C          RAB27A
    C8orf4         KCNMA1         SCARA5
    CA12           KIAA0828       SDCBP2
    CCL28          KLF4           SELENBP1
    CKB            KRT20          SI
    CLCA1          LOC253012      SMTN
    CLDN8          LOC25845       SORBS2
    CLIC5          LOC285382      SRI
    CMBL           LOC572558      SST
    CNTN3          LOC646627      ST6GALNAC1
    DNASE1L3       LOC652128      SULT1A1
    EDG2           LOC96610       TNXB
    ENAM           MAOA           TSPAN1
    ENTPD5         MATN2          TTRAP
    ETHE1          MEP1A          UGDH
    FABP1          METTL7A        UGP2
    FAM46C         MFSD4          UGT1A1
    FAM55D         MGC13057       UGT1A3
    FCGBP          MIER3          UGT1A6
    FGFR2          MMP28          UGT1A8
    FOSB           MT1A           UGT1A9
    FOXF2          MT1F           UGT2A3
    FOXP2          MT1M           UGT2B15
FUCA1         MUC12        UGT2B17
GPA33         MUC2         VSIG2
HBA1          MUC4         XDH
HBA2          MUCDHL       XLKD1
HBB           MYH11        ZCWPW2
HHLA2         NDE1
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表癌细胞或倾向于发生癌性状态的细胞。
本发明的另一方面提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括筛查来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
202920_at      222717_at      231120_x_at
203881_s_at    224412_s_at    231773_at
204719_at      225381_at      203296_s_at
204931_at      225575_at      206664_at
204940_at      227529_s_at    211549_s_at
205433_at      227623_at      214598_at
206637_at      227705_at      219948_x_at
207080_s at    227827_at      220812_s_at
207980_s_at    228504_at      221305_s_at
209170_s_at    228706_s_at    229831_at
209209_s_at    228766_at      231925_at
209613_s_at    228854_at      235146_at
220037_s_at    228885_at      238751_at
220376_at      230788_at      243278_at；和/或
(ii)ADH1B      ANGPTL1        HHLA2
    SORBS2     DMD            SORBS2
    PYY        GCNT2          CLDN23
    ABCA8      SDPR           CNTN3
    RPL24      PKIB           PLEKHC1
    SI         CITED2         LRRC19
    CLDN8      TCF21          LIFR
    P2RY14     P2RY1          ATP1A2
    PLN        ANK2           HPGD
    TRPM6      XLKD1          GPM6B
    CD36       LOC399959      UGT1A8
    BCHE       AKAP12         FOXP2
    TCEAL7     UGT2A3
其中基本上不高于背景水平的组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的表达水平代表新生细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
本发明的另一方面提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括筛查来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
209209_s_at，225381_at，227529_s_at，227623_at，227705_at；和/或
(ii)AKAP12，LOC399959，PLEKHC1，TCEAL7，
其中基本上不高于背景水平的组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表腺瘤细胞或倾向于发生腺瘤状态的细胞。
本发明的另一方面提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括筛查来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
203296_s_at    219948_x_at    231925_at
206664_at      220812_s_at    235146_at
211549_s_at    221305_s_at    238751_at
214598_at      229831_at      243278_at；和/或
(ii)ATP1A2     HHLA2          SORBS2
    CLDN8      HPGD           UGT1A8
    CNTN3      P2RY1          UGT2A3
    FOXP2SI
其中基本上不高于背景水平的组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表癌细胞或倾向于发生癌性状态的细胞。
本发明的另一方面提供表征新生细胞或细胞群体的方法，所述细胞或细胞群体来自个体的大肠，所述方法包括评估所述细胞或细胞群体中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
200600_at      204006_s_at    213428_s_at
200665_s_at    204051_s_at    213524_s_at
200832_s_at    204122_at      213869_x_at
200974_at      204320_at      213905_x_at
200986_at      204475_at      214247_s_at
201058_s_at    204620_s_at    215049_x_at
201069_at      205479_s_at    215076_s_at
201105_at      205547_s_at    215646_s_at
201141_at      205828_at      216442_x_at
201147_s_at    207173_x_at    217430_x_at
201150_s_at    207191_s_at    217762_s_at
201162_at      208747_s_at    217763_s_at
201163_s_at    208782_at      217764_s_at
201185_at      208788_at      218468_s_at
201261_x_at    208850_s_at    218469_at
201289_at      208851_s_at    218559_s_at
201426_s_at    209101_at      218638_s_at
201438_at      209156_s_at    219087_at
201616_s_at    209218_at      221011_s_at
201645_at      209395_at      221729_at
201667_at      209396_s_at    221730_at
201744_s_at    209596_at      221731_x_at
201792_at      209875s_at     37892a_t
201842_s_at    209955s_at     223122_s_at
201852_x_at    210095s_at     223235_s_at
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201893_x_at    210511s_at     224694_at
202237_at      210764s_at     224724_at
202238_s_at    210809s_at     225664_at
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202859_x_at    211981_at      227140_at
202878_s_at    212077_at      227566_at
202917_s_at    212344_at      229218_at
202998_s at    212353_at      229802_at
203083_at      212354_at      231579_s_at
203325_s_at    212464_s_at    231766_s_at
203382_s_at    212488_at      231879_at
203477_at      212489_at      232458_at
203570_at      212667_at      233555_s_at
203645_s_at    213125_at      234994_at；和/或
203878_s_at
(ii)COL1A2           LGAL        S1SRGN
    CTHRC1           ELOVL5      LBH
    FN1              MGP         CTGF
    POSTN            MMP2        TNC
    SPP1             LOXL2       G0S2
    MMP1             MYL9        SQLE
    SPARC            DCN         EFEMP1
    LUM              CALD1       APOE
    GREM1            FBN1        MSN
    IL8              MMP3        IGFBP3
    IGFBP5           IGFBP7      SERPINF1
    SFRP2            FSTL1       ISLR
    SULF1            COL4A2      HNT
    ASPN             VCAN        COL5A1
    COL6A3           SMOC2       OLFML2B
    COL8A1           HTRA1       KIAA1913
    COL12A1          CYR61       PALM2-AKAP2
    COL5A2           FAP         SERPING1
    CDH11            VIM         TYROBP
    THBS2            TIMP2       ACTA2
    COL15A1          SCD         COL3A1
    COL11A1          TIMP3       PLOD2
    S100A8           AEBP1       MMP11
    FNDC1            GJA1        CD163
    SFRP4            NNMT        FCGR3B
    INHBA            COL1A1      PLAU
    COL6A2           SULF2       MAFB
    ANTXR1           COL6A1      LOC541471
    GPNMB            SPON2       LOC387763
    BGN              CTSK        CHI3L1
    TAGLN            MXRA5       THY1
    COL4A1           C1S         LOXL1
    RAB31            DKK3        CD93
其中相对于胃肠道癌症的对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因的较低表达水平代表腺瘤细胞或倾向于发生腺瘤状态的细胞。
本发明的另一方面提供表征新生细胞或细胞群体的方法，所述细胞或细胞群体来自个体的大肠，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
200884_at      214234_s_at    226248_s_at
203240_at      214235_at      226302_at
203963_at      214433_s_at    227676_at
204508_s_at    215125_s_at    227719_at
204607_at      215867_x_at    227725_at
204811_s_at    217109_at      228232_s_at
204895_x_at    217110_s_at    229070_at
204897_at      218211_s_at    231832_at
205259_at      219543_at      232176_at
205765_at      219955_at      232481_s_at
205927_s_at    221841_s_at    235976_at
208063_s_at    221874_at      236894_at
208937_s_at    223969_s_at    237521_x_at
210107_at      223970_at      242601_at；和/或
213106_at
(ii)CLCA1      CTSE           ATP8B1
    FCGBP      C6orf105       CACNA2D2
    HMGCS2     CKB            KLF4
    RETNLB     ATP8A1         CYP3A5P2
    L1TD1      MUC4           CAPN9
    SLITRK6    UGT1A1         NR3C2
    VSIG2      SELENBP1       PBLD
    LOC253012  PTGER4         CA12
    ST6GALNAC1 MLPH           WDR51B
    ID1        KIAA1324       FAM3D
    CYP3A5
其中相对于胃肠道腺瘤的对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表癌或倾向于发生癌性状态的细胞。
本发明的另一方面提供表征新生细胞或细胞群体的方法，所述细胞或细胞群体来自个体的大肠，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因：
202404_s_at，212464_s_at，210809_s_at，225681_at；和/或
(ii)COL1A2，FN1，POSTN，CTHRC1
其中相对于胃肠道癌症对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表腺瘤细胞或倾向于发生腺瘤状态的细胞。
本发明的另一方面提供表征新生细胞或细胞群体的方法，所述细胞或细胞群体来自个体的大肠，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因的表达水平，所述一或多种基因选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
    209875_s_at    227140_at    204475_at；和/或
(ii)SPP1           MMP1
其中相对于胃肠道癌症对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表腺瘤细胞或倾向于发生腺瘤状态的细胞。
本发明的另一方面涉及表征细胞或细胞群体的方法，所述细胞或细胞群体来自个体的大肠，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
200665_s_at    226237_at    226930_at
201744_s_at    225664_at    204051_s_at
218468_s_at    221730_at    210511_s_at
202859_x_at    207173_x_at  209156_s_at
211959_at      203083_at    224694_at
223122_s_at    203477_at    201141_at
212353_at      37892_at     213905_x_at
219087_at      202917_s_at  205547_s_at
201438_at；和/或
(ii)SPARC      COL8A1       SFRP4
LUM            COL12A1      INHBA
GREM1          COL5A2       COL6A2
IL8            CDH11        ANTXR1
IGFBP5         THBS2        GPNMB
SFRP2          COL15A1      BGN
SULF1          COL11A1      TAGLN
ASPN           S100A8
COL6A3         FNDC1
其中相对于胃肠道癌症对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表腺瘤或倾向于发生腺瘤状态的细胞。
本发明的另一方面涉及表征细胞或细胞群体的方法，所述细胞或细胞群体来自个体的大肠，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
210107_at和/或
(ii)CLCA1
其中相对于胃肠道腺瘤对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表癌或倾向于发生癌性状态的细胞。
本发明的另一方面涉及表征细胞或细胞群体的方法，所述细胞或细胞群体来自个体的大肠，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
203240_at      219955_at      242601_at
204607_at      232481_s_at    227725_at
223969_s_at    228232_s_at；和/或
(ii)FCGBP      L1TD1          LOC253012
    HMGCS2     SLITRK6        ST6GALNAC 1
    RETNLB    VSIG2
其中相对于胃肠道腺瘤对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表癌或倾向于发生癌性状态的细胞。
本发明的另一方面提供表征新生细胞或细胞群体的方法，所述细胞或细胞群体来自个体的大肠，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因：
235976_at    236894_at    237521；和/或
(ii)SLITRK6  L1TD1
其中基本上不高于背景新生组织水平的组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的表达水平代表癌或倾向于发生癌性状态的细胞。
本发明的另一方面提供分子阵列，所述阵列包含多个：
(i)包含相应于任何一或多种前述新生物标记物基因的核苷酸序列或与之具有至少80％相同性的序列的核酸分子，或所述核酸分子的功能性衍生物、片段、变体或同源物；或
(ii)包含能够在中等严格性条件下与(i)的任何一或多种序列杂交的核苷酸序列的核酸分子，或所述核酸分子的功能性衍生物、片段、变体或同源物；或
(iii)包含能够在中等严格性条件下与(i)的任何一或多种序列杂交的核苷酸序列的核酸探针或寡核苷酸，或所述核酸分子的功能性衍生物、片段、变体或同源物；或
(iv)能够与(i)的核酸分子所编码的任何一或多种蛋白质相结合的探针，或其衍生物、片段或同源物
其中(i)的所述标记物基因的表达水平或(iv)的所述蛋白质的表达水平代表源自大肠的细胞或细胞亚群的新生状态。
附图说明
图1所示为醇脱氢酶IB(I类)，β肽。
图2所示为正常和新生组织和细胞系中MAMDC2和GPM6B的甲基化。图中A显示了通过甲基化特异性PCR测定的MAMDC2基因的甲基化水平，通过扩增CAGE基因来标准化输入DNA水平。每一点代表一个个体组织样品或细胞系。样品包括以下来源的DNA：18个结直肠癌组织、12个结直肠腺瘤、22个匹配的正常结直肠组织、6个其他正常组织和细胞系以及6个结肠癌细胞系。图中B了通过COBRA测定法测定的GPM6B基因的相对甲基化水平。甲基化水平的积分在O(无限制性酶消化)和5(完全限制性酶消化)之间。每一点代表单个组织样品。样品包括14个结直肠癌组织、11个结直肠腺瘤和22个匹配的正常组织。
图3示意性显示了源自hCG_1815491的推定的RNA变体。使用来自人16号染色体上从8579310至8562303的绘制区的cDNA克隆来定位外显子序列。箭头：寡核苷酸引物组，设计为用于通过PCR测量各个RNA变体。覆盖剪接结合部的引物被显示为跨内含子序列，但内含子序列并不包括在实际的寡核苷酸引物序列中。
发明详述
本发明的产生部分基于阐明了如下基因表达谱，所述基因表达谱可表征大肠细胞群体的新生状态，更具体而言，它们是恶性的还是恶性前期的。这一发现现已促成开发出一些常规手段，用于根据筛查这些分子相对于对照表达模式和水平的表达下调而筛查大肠新生物的发生或发生倾向性或表征来自大肠的细胞群体。为此，除了评估被研究基因相对于正常或非新生物水平的表达水平之外，还确定了这些基因的一部分不表达于疾病状态，由此促成开发出仅需要相对于测试背景水平进行评估的简单的定性测试法。
根据本发明，已经确定了上述基因可依据表达该基因的细胞是否为新生细胞而以表达水平发生差异性改变的方式而受到调控。应该理解，基因“表达产物”或″基因表达″指的是转录物(例如初级RNA或mRNA)或翻译产物例如蛋白质。就此而言，可以通过以下方式评估基因表达水平的改变：筛查产生的表达产物(即，RNA或蛋白质)的水平的改变，筛查与该基因相关的染色质蛋白的改变(例如存在在氨基酸位置9或27位的赖氨酸处发生甲基化(阻抑性修饰)的组蛋白H3)，或DNA本身起到下调表达作用的改变(例如DNA甲基化的改变)。这些基因以及它们的基因表达产物，无论它们是RNA转录物、起到下调表达作用的DNA改变、还是所编码的蛋白质，均统称为“新生物标记物”。
因此，本发明的一个方面涉及筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
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200621_at      210139_s_at     227265_at
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200799_at      210299_s_at     227529_s_at
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200974_at      210764_s_at     227705_at
200986_at      210809_s_at     227727_at
201041_s_at    210946_at       227826_s_at
201058_s_at    210982_s_at     227827_at
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201105_at      211596_s_at     228507_at
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201150_s_at    211645_x_at     228707_at
201289_at      21167_1s_at     228750_at
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209167_at      225381_at      227682_at
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209283_at      225626_at      228195_at
209301_at      225688_s_at    228232_s_at
209312_x_at    225710_at      228241_at
209335_at      225720_at      228469_at
209357_at      225721_at      228961_at
209373_at      225782_at      229070_at
209436_at      225894_at      229254_at
209457_at      225895_at      229659_s_at
209496_at      226001_at      229831_at
209498_at      226051_at      230595_at
209612_s_at    226084_at      231925_at
209613_s_at    226103_at      231975_s_at
209621_s_at    226303_at      233565_s_at
209651_at      226304_at      235146_at
209656_s_at    226333_at      235766_x_at
209667_at      226430_at      235849_at
209668_x_at    226492_at      238143_at
209687_at      226682_at      238750_at
209735_at      226694_at      238751_at
209763_at      226818_at      239272_at
209868_s_at    226834_at      241994_at
209948_at      226841_at      242447_at
210084_x_at    227006_at      242601_at
227099_s_at    227061_at      243278_at；和/或
(ii)CLCA4        SGK        MT1X
    ZG16         CFL2       AOC3
    CA2          C1S        PPAP2A
    CA1          SELENBP1   ZSCAN18
    MS4A12       MT1E       IVD
    AQP8         ADAMTS1    SFRP 1
    SLC4A4       ITM2A      COL4A2
    CEACAM7      POU2AF1    GPM6B
    TAGLN        FAM55D     EPB41L3
    GUCA1B       C6orf204   MAOA
    GCG          AKAP12     DMD
    ADH1B        TUBB6      MSRB3
    UGT2B17      LGALS2     PLOD2
    ADAMDEC1     KIAA0828   C9orf19
    MT1M         MGC14376   MIER3
    AKR1B10      PPP1R14A   XDH
    FN1          MUC4       CLDN23
    MGP          PKIB       SGCE
    CXCL12       PIGR       FOXF2
    PDK4         ASPN       AGR3
    CA4          A2M        IGLJ3
    PYY          LOC25845   QKI
    IGHA1        LGALS1     LOC399959
    TPM2         BCHE       ANKRD25
    C6orf105     ST6GALNAC1 CRISPLD2
    HPGD         GJA1       ANK2
    ADH1C        SCNN1B     LOC283666
    CLCA1        FABP4      CRYAB
    FABP1        F13A1      ACAT1
    ENAM         CD36       IGL@
    CFD          SPARCL1    PBLD
    GUCA2B       ZCWPW2     CCL8
    FBLN1        TNC        LIFR
    LOC63928     MT1A       HLA-DRB1
    ABCA8        LOC652745  UGP2
    POSTN        MALL       IGKV1D-13
    DCN          GNG2       AP1S2
    ITLN1        DNASE1L3   EMP3
    COL6A2       EGR1       MMP28
    FCGBP        CMBL       UGT2A3
    SLC26A2      GCNT3      RGS5
PGM5            SERPING1         PTGIS
DMN             MEIS1            DUSP5
GPNMB           EDN3             MFAP4
IGFBP5          MSN              UGT1A6
CLEC3B          MT1G             PRKAR2B
LOC253012       TPSAB1           HHLA2
DPT             GPX3             LOC652128
PCK1            CDKN2B           C3
CNN1            FOSB             ATP2B4
HSD17B2         HSPA1A           HBA1
PLAC8           CYBRD1           TCF21
TMEM47          PTGER4           PPID
OGN             MAG1             PPAP2B
CALD1           BEST2            SPON1
ACTG2           HLA-DQA1         PHLDB2
MGC4172         PRIMA1           RARRES2
MAB21L2         MT1F             ETHE1
RPL24           MAFB             MMP2
ABCG2           FAM107A          SRI
CCDC80          PRKACB           CNTN3
UGT1A1          SELM             RGS2
MRC1            TYROBP           COL6A1
HSD11B2         TNS1             FBN1
ANPEP           MYH11            MXD1
MATN2           ITM2C            PLCE1
PRNP            CES2             KCNMB1
ABI3BP          MS4A4A           CALM1
HLA-C           PDGFRA           HLA-DPB1
NDE1            CA12             SMOC2
SRPX            FKBP5            LOC285382
WWTR1           HSPB8            CLIC5
HMGCS2          TPSB2            APOE
LOC646627       FGL2             SERPINF1
KRT20           C1QB             PPP1R12B
KLF4A           NGPTL1           HSPB6
FHL1            MEP1A            FNBP1
ARL14           GUCY1A3          C4orf34
LUM             UGDH             SORBS2
SORBS1          DUSP1            GPA33
METTL7A         C2orf40          GALNAC4S-6ST
FAM129A         PLN              CFHR1
SCARA5          UGT2B15          MGC13057
SI          PDLIM3         C10orf56
ACTA2       TP53INP2       SULT1A1
CD177       ATP8B1         TTRAP
C10orf99    ANK3           CCL28
COL15A1     CTGF           IDH3A
NR3C2       MUCDHL         EDG2
DHRS9       SDPR           UGT1A8
LMOD1       COL14A1        RAB27A
EFEMP1      DSCR1          ANTXR1
GREM1       CITED2         EMP 1
IL1R2       MT1H           CSRP1
LOC387763   NEXN           PLEKHC 1
TIMP3       MUC2           LOC572558
MYLK        NID1           FOXP2
CLDN8       HBB            HSPA2
RDX         GCNT2          ATP1A2
TSPAN7      C20orf118      TNXB
TNFRSF17    SLC20A1        FUCA1
SYNPO2      CD14           MRGPRF
VIM         KCTD12         HIGD1A
SMPDL3A     RBMS1          MFSD4
P2RY14      PTRF           AXL
CHGA        TSPAN1         AQP1
C15orf48    UGT1A9         MAP1B
COL3A1      COX7A1         PALLD
CYR61       MUC12          MPEG1
TRPM6       PDCD4          KLHL5
OSTbeta     CAV1           TCEAL7
IGLV1-44    FAM46C         FILIP1L
VSIG2       LRIG1          IQGAP2
IGHM        HLA-DPA1       PRDX6
LRRC19      C1orf115       RAB31
CD163       HBA2           LOC96610
CEACAM1     EDIL3          FGFR2
TIMP2       DES            PAPSS2
ENTPD5      MT2A           XLKD1
DDR2        KCNMA1         SMTN
CHRDL1      GAS1           C8orf4
SRGN        TBC1D9         SDCBP2
PDE9A       C7             CCL11
PMP22       P2RY1          ELOVL5
FLNA        NR3C1          FOXF1
S1MN2       S1OM     RELL1
MYL9        CKB      PNMA1
SEMA6D      CLU      LOC339562
PADI2       SLC26A3  PALM2-AKAP2
SEPP1       SDC2     PAG1
TGFB1I1     SST      HCLS1
SFRP2       HLA-DRA  RGS1
UGT1A3      TSC22D3  FXYD6
MS4A7       IL6ST    OLFML3
ALDH1A1     C1QC     COL6A3
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生性大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
在一个实施方式中，通过筛查影响甲基化、特别是超甲基化的DNA改变而评估所述表达。在另一实施方式中，通过DNA与携带阻抑性修饰(例如组蛋白H3的9或27位的赖氨酸甲基化)的染色质蛋白的相关性来评估表达。
提及“大肠”，应该被理解为指的是来自从回肠末端区域开始的大肠的6个解剖学区域之一的细胞，这6个解剖学区域是：
(i)盲肠；
(ii)升结肠；
(iii)横结肠；
(iv)降结肠；
(v)乙状结肠；和
(vi)直肠。
提及“新生物”，应该被理解为指的是包含新生细胞的病变、肿瘤或其他包囊化或非包囊化的团块或其他生长形式。“新生细胞”应该被理解为指的是表现为异常生长的细胞。术语“生长”应该理解为其最为宽泛的含义，包括增殖。就此而言，异常细胞生长的实例是细胞不受控制的增殖。另一个实例是细胞不发生凋亡，因此延长其通常的生命跨度。新生细胞可以是良性细胞或恶性细胞。在优选的实施方式中，新生物是腺瘤或腺癌。无意于将本发明限制于任何一种理论或作用方式，腺瘤通常是上皮来源的良性肿瘤，其来源于上皮组织或表现出清楚的上皮结构。这些结构可以是腺体的样子。其可以包括腺瘤内的恶性细胞群体，例如随着良性腺瘤进展为恶性腺癌而出现。
优选地，所述新生细胞是腺瘤或腺癌，且更优选地是结直肠腺瘤或腺癌。
前面亚段落(i)和(ii)中所逐一列出的各个基因和转录物及其编码的蛋白质均是本领域人员已知的。通过使用Affymetrix HGU133A或HGU133B基因芯片进行差异性表达分析将这些基因和转录物的表达产物鉴定为新生物形成的标记物。为此，每一基因芯片具有大约45,000个探针组，其可检测从基因组转录而来的RNA。平均大约11个探针对检测所述RNA转录物的重叠或连续区域。一般来说，能够被Affymetrix探针组鉴定到在此所述的RNA转录物的基因均是熟知的且被充分表征的基因。不过，对于一些探针组检测到的尚不清楚的RNA转录物，这些转录物被表示为“通过Affymetrix探针x而检测到的基因或转录物”。在一些情况中单个探针组能够检测到多个基因。不过，应该理解，这无意于作为对如何检测到被研究基因或转录物表达水平的限制。首先，应该理解所述被研究基因转录物也可通过可能存在于Affymetrix基因芯片上的其他探针组而检测。提到单个探针组只是将其作为感兴趣的基因转录物的标识符。不过，在实际筛查转录物时，可使用针对转录物任何区域的探针或探针组，而非仅针对Affymetrix探针通常所针对的3-末端600bp的转录物区域。
因此，提到前面逐一列出的每一基因和转录物及其转录和翻译表达产物应该被理解为提到的是所有形式的这些分子及其片段或变体。本领域人员能够理解，已知一些基因在个体之间存在等位基因变异。因此，本发明应该被理解为包括此类变体，就本发明的诊断用途而言，这些变体可达到相同的结果，尽管不同个体的真实核酸序列之间可存在小的遗传变异，或在一个个体内可存在2个或多个该被研究基因的剪接变体。因此，本发明应该被理解为包括通过选择性剪接或任何其他突变、多态性或等位基因变异而产生的所有形式的RNA(如mRNA、初级RNA转录物、miRNA等等)、cDNA和肽异构体。也应该理解其包括可能产生的任何亚单位多肽，例如前体形式，无论其形式是单体、多聚体、融合蛋白或其他复合体。
为此，就本发明所涵盖的基因而言，实施例6描述了用于确定此类变体的存在并对其进行表征的手段。对于参照Affymetrix探针组而描述的本发明的基因，表6提供了每一探针组所针对的核酸序列的详细信息。基于这些信息，本领域人员能够常规鉴定出该序列所形成的是哪一部分，对此实施例6还给出了典型的方案。
应该理解，作为测试对象的“个体”可以是任何人或非人哺乳动物。非人哺乳动物的实例包括灵长类、家畜(例如马、牛、羊、猪、驴)、实验室测试动物(例如小鼠、大鼠、兔、豚鼠)、宠物动物(例如狗、猫)和圈养的野生动物(例如鹿、狐狸)。哺乳动物优选地是人。
本发明的方法基于将生物学样品的新生物标记物水平与这些标记物的对照水平进行比较。“对照水平”可以是这样一种“正常水平”，其是相应的非新生性大肠细胞或细胞群体所表达的标记物水平。
可使用源自作为测试对象的同一个体的组织来确定正常水平(或“非新生物水平”)。不过，应该理解，这样做对于有关个体而言可能相当具有创伤性，因此，更加方便的可能是通过将测试结果与反映来自不同于所研究的患者的个体的单个或汇总结果的标准结果相比较来分析。后一种分析形式实际上是优选的分析方法，因为其能够满足设计出需要收集并分析作为感兴趣的测试样品的单个生物学样品的试剂盒的需要。可通过本领域人员熟知的任何合适的方式计算出用于提供正常水平的标准结果。例如，可就本发明的新生物标记物的水平来评价正常组织群体，由此提供标准值或标准值范围，用于分析以后所有的测试样品。还应该理解，可从特定一组对象中确定正常水平并用于来自该组的测试样品。因此，可以确定多种标准值或范围，它们对应于具有例如不同年龄、性别、种族或健康状况等特征的组。所述“正常水平”可以是不同的水平或水平范围。被研究基因的表达水平相对于正常水平的下降代表该组织是新生组织。
无意于将本发明限制于任何一种理论或作用方式，在将大肠的新生细胞与非新生细胞相比时，尽管每一上述基因或转录物，单独地或是组合地，均存在差异性表达，且因此对大肠新生物的存在具有诊断意义，但发现这些基因中的一部分具有非常显著水平的敏感性、特异性和阳性及阴性预测值。因此，在优选的实施方式中，可以对一或多种这些基因的表达水平进行筛查和评估。为此，且无意于将本发明限制于任何一种理论或作用方式，当采用本发明所示例的方法进行评估时，已经确定以下标记物在新生物组织中表达的水平比非新生物组织中低3-11倍：
  降低倍数   由Affymetrix探针No检测到的基因或转录物：   基因
  11   220026_at   CLCA4
  10   214142_at   ZG16
9   209301_at205950_s_at   CA1CA2
  8   220834_at   MS4A12
  7   206784_at   AQP8
6   203908_at206198_s-at205547_s-at207003_at206422_at209613_s_at207245_at   SLC4A4CEACAM7TAGLNGUCA1BGCGADH1BUGT2B17
5   206134_at217546_at206561_s-at211719_x_at202291_s_at209687_at   ADAMDEC1MT1MAKR1B10FN1MGPCXCL12
4   225207_at206208_at207080_s_at215118_s_at204083_s_at229070_at211548_s_at206262_at210107_at205892_s_at212592_at205382_s_at207502_at202995_s_at206149_at204719_at   PDK4CA4PYYIGHA1TPM2C6orf105HPGDADH1CCLCA1FABP1ENAMCFDGUCA2BFBLN1LOC63928ABCA8
3   210809_s_at201893_x_at223597_at209156_s_at203240_at   POSTNDCNITLN1COL6A2FCGBP
  降低倍数   由Affymetrix探针No检测到的基因或转录物：   基因
  224963_at226303_at212730_at201141_at211959_at205200_at242601_at213068_at208383_s_at203951_at204818_at219014_at209656_s_at222722_at201617_x_at202274_at218756_s_at210302_s_at228885_at209735_at228504_at225242_s_at215125_s_at204438_at204130_at202888_s_at202350_s_at201300_s_at223395_at214768_x_at228133_s_at204955_at202133_at204607_at238143_at213953_at220266_s_at210299_s_at220468_at201744_s_at218087_s_at   SLC26A2PGM5DMNGPNMBIGFBP5CLEC3BLOC253012DPTPCK1CNN1HSD17B2PLAC8TMEM47OGNCALD1ACTG2MGC4172MAB21L2RPL24ABCG2CCDC80UGT1A1MRC1HSD11B2ANPEPMATN2PRNPABI3BPHLA-CNDE1SRPXWWTR1HMGCS2LOC646627KRT20KLF4FHL1ARL14LUMSORBS1METTL7A
  降低倍数   由Affymetrix探针No检测到的基因或转录物：   基因
  207761_s_at217967_s_at229839_at206664_at200974_at219669_at227736_at203477_at205259_at   FAM129ASCARA5SIACTA2CD177C10orf99COL15A1NR3C2
因此本发明更具体地提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
220026_at；和/或
(ii)CLCA4
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
优选地，所述对照水平是非新生物水平。
另一实施方式提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
214142_at；和/或
(ii)ZG16
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生性大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
优选地，所述对照水平是非新生物水平。
另一实施方式提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
209301_at 205950_s_at；和/或
(ii)CA2    CA1
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生性大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
优选地，所述对照水平是非新生物水平。
另一优选的实施方式提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
220834_at；和/或
(ii)MS4A12
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生性大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
优选地，所述对照水平是非新生物水平。
另一优选的实施方式提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
206784_at；和/或
(ii)AQP8
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生性大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
优选地，所述对照水平是非新生物水平。
另一实施方式提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
203908_at，206198_s_at，205547_s_at，207003_at，206422_at，
209613_s_at，207245_at；和/或
(ii)SLC4A4，CEACAM7，TAGLN，GUCA 1B，GCG，ADH1B，UGT2B17
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生性大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
优选地，所述对照水平是非新生物水平。
另一实施方式提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
206134_at，217546_at，206561_s_at，211719_x_at，202291_s_at，
209687_at；和/或
(ii)ADAMDEC1，MT1M，AKR1B10，FN1，MGP，CXCL12
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生性大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
优选地，所述对照水平是非新生物水平。
另一实施方式提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括筛查来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
225207_at      211548_s_at    205382_s_at
206208_at      206262_at      207502_at
207080_s_at    210107_at      202995_s_at
215118_s_at    205892_s_at    206149_at
204083_s_at    212592_at      204719_at
229070_at；和/或
(ii)PDK4       HPGD           CFD
    CA4        ADH1C          GUCA2B
    PYY        CLCA1          FBLN1
    IGHA1      FABP1          LOC63928
    TPM2       ENAM           ABCA8
    C6orf105
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生性大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
优选地，所述对照水平是非新生物水平。
另一实施方式提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括筛查来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
210809_s at    201617_x_at    202133_at
201893_x_at    202274_at      204607_at
223597_at      218756_s_at    238143_at
209156_s_at    210302_s_at    213953_at
203240_at      228885_at      220266_s_at
224963_at      209735_at      210299_s_at
226303_at      228504_at      220468_at
212730_at      225242_s_at    201744_s_at
201141_at      215125_s_at    218087_s_at
211959_at      204438_at      207761_s_at
205200_at      204130_at      217967_s_at
242601_at      202888_s_at    229839_at
213068_at      202350_s_at    206664_at
208383_s_at    201300_s_at    200974_at
203951_at      223395_at      219669_at
204818_at      214768_x_at    227736_at
219014_at      228133_s_at    203477_at
209656_s_at    204955_at      205259_at
222722_at；和/或
(ii)POSTN      OGN            WWTR1
    DCN        CALD1          HMGCS2
    ITLN1      ACTG2          LOC646627
    COL6A2     MGC4172        KRT20
    FCGBP      MAB21L2        KLF4
    SLC26A2    RPL24          FHL1
    PGM5       ABCG2          ARL14
    DMN        CCDC80         LUM
    GPNMB      UGT1A1         SORBS1
IGFBP5          MRC1      METTL7A
CLEC3B          HSD11B2   FAM129A
LOC253012       ANPEP     SCARA5
DPT             MATN2     SI
PCK1            PRNP      ACTA2
CNN1            ABI3BP    CD177
HSD17B2         HLA-C     C10orf99
PLAC8           NDE1      COL15A1
TMEM47          SRPX      NR3C2
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生性大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
优选地，所述对照水平是非新生物水平。
根据本发明的这些方面，所述大肠组织优选地是结直肠组织。
在一个实施方式中，通过筛查影响甲基化且特别是超甲基化的DNA改变而评估所述表达。在另一实施方式中，通过将DNA与携带阻抑性修饰的染色质蛋白相关联而评估表达，阻抑性修饰例如为组蛋白H3的第9或27位赖氨酸的甲基化。
本发明的检测方法可在任何合适的生物学样品上进行。为此，提到“生物学样品”应该理解为指的是源自动物的任何生物学样品，例如但不限于，细胞材料、生物流体(如血液)、粪便、组织标本(例如活检标本)、手术标本或经引入动物体内随后再移除的流体(例如，灌肠洗液的回收液)。根据本发明的方法进行测试的生物学样品可以直接测试或在测试之前需要某种形式的处理。例如，活检或手术样品在测试之前需要匀浆化或需要切片以便原位检测各个基因的定量表达水平。或者，细胞样品需要在测试之前进行通透化。此外，对于非流体形式的生物学样品(如果需要测试此类形式的话)，需要加入试剂例如缓冲液以便使得样品流动。
对于生物学样品中存在的新生物标记物基因表达产物，可直接测试生物学样品或在测试之前分离生物学样品中的全部或部分核酸物质。在另一个实例中，可在分析之前对样品进行部分纯化或富集。例如，对于包含非常多样性的细胞群体的生物学样品，可以富集特别感兴趣的亚群。本发明包括在测试之前对靶细胞群体或源自其中的分子进行预处理，例如，灭活活的病毒活在凝胶上进行电泳。还应该理解，生物学样品可以是测试之前新鲜收集的或者是储存的(例如通过冷冻)，或在测试之前进行处理的(例如进行培养)。
选择何种类型的样品最适合于根据本发明的方法进行测试将取决于具体的情况。优选地，所述样品是粪便样品、灌肠洗液、手术切除物、组织标本或血液标本。
在一个相关的方面，已经确定某些上述标记物更加代表腺瘤的发生而非癌的发生，或反之亦然。这一发现具有特殊的价值，因为这使得本领域人员能够更加特异性地表征通过本发明的方法检测到的新生物的可能的性质。
因此，本发明的另一方面涉及筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括筛查来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
200600_at      208788_at      215382_x_at
200665_s_at    208789_at      215388_s_at
200799_at      208894_at      216442_x_at
200845_s_at    209047_at      216474_x_at
200859_x_at    209101_at      216834_at
200897_s_at    209138_x_at    217480_x_at
200974_at      209147_s_at    217757_at
200986_at      209156_s_at    217762_s_at
201041_s_at    209191_at      217764_s_at
201061_s_at    209209_s_at    217767_at
201069_at      209210_s_at    217897_at
201105_at      209312_x_at    218162_at
201137_s_at    209335_at      218224_at
201141_at      209436_at      218312_s_at
201150_s_at    209457_at      218353_at
201289_at      209496_at      218418_s_at
201300_s_at    209621_s_at    218468_s_at
201426_s_at    209651_at      218469_at
201438_at      209656_s_at    218559_s_at
201616_s_at    209868_s_at    219087_at
201617_x_at    210084_x_at    219607_s_at
201645_at      210133_at      221541_at
201667_at      210139_s_at    222043_at
201743_at      210495_x_at    222453_at
201744_s_at    210517_s_at    222513_s_at
201842_s_at    210764_s_at    223121_s_at
201852_x_at    210809_s_at    223122_s_at
201858_s_at    210982_s_at    223235_s_at
201859_at      211161_s_at    223343_at
201865_x_at    211596_s_at    224560_at
201893_x_at    211671_s_at    224694_at
201920_at      211719_x_at    224840_at
202007_at      211813_x_at    224964_s_at
202069_s_at    211896_s_at    225242_s_at
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202283_at      211964_at      225353_s_at
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202403_s_at    211990_at      225442_at
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202686_s_at    212077_at      225604_s_at
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202957_at      212185_x_at    226001_at
202994_s_at    212195_at      226051_at
202995_s_at    212230_at      226084_at
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203131_at      212265_at      226430_at
203305_at      212386_at      226682_at
203382_s_at    212387_at      226694_at
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203645_s_at    212414_s_at    226834_at
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203729_at      212464_s_at    227061_at
203748_x_at    212667_at      227099_s_at
204069_at      212671_s_at    227235_at
204122_at      212713_at      227404_s_at
204135_at      212764_at      227529_s_at
204438_at      212956_at      227561_at
204457_s_at    213428_s_at    227623_at
204570_at      213509_x_at    227705_at
204688_at      213746_s_at    227727_at
205412_at      213891_s_at    228507_at
205683_x_at    214038_at      228750_at
205935_at      214677_x_at    228846_at
207134_x_at    214752_x_at    229530_at
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208131_s_at    215076_s_at    231579_s_at
208370_s_at    215193_x_at    234987_at；和/或
208747_s_at
(ii)A2M        FBN1           PALLD
    ACAT1      FILIP1L        PALM2-AKAP2
    ACTA2      FKBP5          PDGFRA
    AKAP12     FLNA           PDLIM3
    ANKRD25    FN1            PHLDB2
    ANTXR1     FOXF1          PLEKHC1
    AP1S2      FXYD6          PLOD2
    APOE       GALNAC4S-6ST   PMP22
    AQP1GAS1   PNMA1
ASPN             GJA1       POSTN
ATP2B4           GNG2       PPAP2A
AXL              GPNMB      PPAP2B
C10orf56         GREM1      PRDX6
C1QB             GUCY1A3    PRKAR2B
C1QC             HCLS1      PRNP
C1S              HLA-DPA1   PTGIS
C20orf118        HLA-DPB1   PTRF
C3               HLA-DQA1   QKI
C9orf19          HLA-DRA    RAB31
CALD1            HLA-DRB1   RARRES2
CALM1            HSPA1A     RBMS1
CCDC80           IDH3A      RDX
CCL11            IGFBP5     RELL1
CCL8             IGL@       RGS1
CD14             IGLJ3      RGS5
CD163            IL6ST      SDC2
CES2             KLHL5      SELM
CFHR1            LGALS1     SEPT6
CLU              LOC283666  SERPINF1
COL14A1          LOC339562  SERPING1
COL15A1          LOC387763  SFRP2
COL1A2           LOC399959  SGCE
COL3A1           LRIG1      SLC20A1
COL4A2           LUM        SMOC2
COL6A1           MAFB       SORBS1
COL6A2           MAP1B      SPARC
COL6A3           MEIS1      SPON1
COX7A1           MFAP4      SRGN
CRISPLD2         MGP        STOM
CTGF             MMP2       TBC1D9
CYBRD1        MPEG1       TCEAL7
CYR61         MRC1        TGFB1I1
DCN           MRGPRF      TIMP2
DDR2          MS4A4A      TIMP3
DSCR1         MS4A7       TMEM47
DUSP1         MSN         TNC
DUSP5         MT2A        TPSAB1
EFEMP1        MXD1        TPSB2
EGR1          NEXN        TUBB6
ELOVL5        NID1        TYROBP
EMP3          NR3C1       VIM
F13A1         OLFML3      WWTR1
FBLN1         PAG1        ZSCAN18
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表腺瘤细胞或倾向于发生腺瘤状态的细胞。
本发明这一方面的另一优选实施方式提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括筛查来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因：
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201495_x_at    208920_at      221004_s_at
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207126_x_at    219796_s_at    238751_at
207245_at      219948_x_at    239272_at
207390_s_at    220075_s_at    241994_at
207392_x_at    220266_s_at    242447_at
207432_at      220468_at      242601_at
207761_s_at    220645_at      243278_at；和/或
(ii)ADH1C     HIGD1A        NR3C2
    AGR3      HMGCS2        P2RY1
    ALDH1A1   HPGD          PADI2
    ANK3      HSD11B2       PAPSS2
    ARL14     HSD17B2       PBLD
    ATP1A2    HSPA2         PDCD4
    ATP8B1    IGHA1         PDE9A
    BEST2     IGHM          PIGR
    C10orf99  IL1R2         PLCE1
    C15orf48  IL8           PPID
    C1orf115  IQGAP2        PRKACB
    C4orf34   ITLN1         PTGER4
    C6orf105  ITM2C         RAB27A
    C8orf4    KCNMA1        SCARA5
    CA12      KIAA0828      SDCBP2
    CCL28     KLF4          SELENBP1
    CKB       KRT20         SI
    CLCA1     LOC253012     SMTN
    CLDN8     LOC25845      SORBS2
    CLIC5     LOC285382     SRI
    CMBL      LOC572558     SST
    CNTN3     LOC646627     ST6GALNAC1
    DNASE1L3  LOC652128     SULT1A1
EDG2        LOC96610    TNXB
ENAM        MAOA        TSPAN1
ENTPD5      MATN2       TTRAP
ETHE1       MEP1A       UGDH
FABP1       METTL7A     UGP2
FAM46C      MFSD4       UGT1A1
FAM55D      MGC13057    UGT1A3
FCGBP       MIER3       UGT1A6
FGFR2       MMP28       UGT1A8
FOSB        MT1A        UGT1A9
FOXF2       MT1F        UGT2A3
FOXP2       MT1M        UGT2B15
FUCA1       MUC12       UGT2B17
GPA33       MUC2        VSIG2
HBA1        MUC4        XDH
HBA2        MUCDHL      XLKD1
HBB         MYH11       ZCWPW2
HHLA2       NDE1
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表癌细胞或倾向于发生癌性状态的细胞。
根据这些方面，所述对照水平优选地是非新生物水平，且所述大肠组织是结直肠组织。甚至更优选地，所述生物学样品是粪便样品或血液样品。
在一个实施方式中，通过筛查影响甲基化且特别是超甲基化的DNA改变而评估所述表达。在另一实施方式中，通过将DNA与携带阻抑性修饰的染色质蛋白相关联而评估表达，阻抑性修饰例如为组蛋白H3的第9或27位赖氨酸的甲基化。
在一个相关的方面，已经确定，本发明的标记物的亚组不仅表达水平低于正常水平，它们还具有特征性的表达模式，即在新生物组织中检测不到高于背景对照水平的表达水平。据此可开发出定性筛查系统，这样的系统被设计为用于检测标记物相对于对照背景水平的表达。根据本发明的这一方面，所述“对照水平”因此是“背景水平”。
本发明的这一方面因此提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括筛查来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
202920_at      222717_at    231120_x_at
203881_s_at    224412_s_at  231773_at
204719_at      225381_at    203296_s_at
204931_at      225575_at    206664_at
204940_at      227529_s_at  211549_s_at
205433_at      227623_at    214598_at
206637_at      227705_at    219948_x_at
207080_s_at    227827_at    220812_s_at
207980_s_at    228504_at    221305_s_at
209170_s_at    228706_s_at  229831_at
209209_s_at    228766_at    231925_at
209613_s_at    228854_at    235146_at
220037_s_at    228885_at    238751_at
220376_at      230788_at    243278_at；和/或
(ii)ADH1B     ANGPTL1     HHLA2
    SORBS2    DMD         SORBS2
    PYY       GCNT2       CLDN23
    ABCA8     SDPR        CNTN3
    RPL24     PKIB        PLEKHC1
    SI        CITED2      LRRC19
    CLDN8     TCF21       LIFR
    P2RY14    P2RY1       ATP1A2
    PLN       ANK2        HPGD
    TRPM6     XLKD1       GPM6B
    CD36      LOC399959   UGT1A8
    BCHE      AKAP12      FOXP2
TCEAL7               UGT 2A3
其中基本上不高于背景水平的组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的表达水平代表新生细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
在最优选的实施方式中，所述基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
209613_s_at，227827_at，204719_at，228504_at，228885_at，206664_at，
207080_s_at；和/或
(ii)ADH1B，SORBS2，PYY，ABCA8，RPL24，SI
优选地，所述新生物是腺瘤或腺癌，所述胃肠道组织是结直肠组织。
在另一实施方式中，已经确定，这些标记物的另一亚组对于腺瘤的发生更具特征性，而其他的标记物则对于癌症的发生更具特征性。因此，本发明提供了可定性获取与被研究新生物的特征有关的指示信息的简便手段。
本发明的这一实施方式提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括筛查来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
209209_s_at，225381_at，227529_s_at，227623_at，227705_at；和/或
(ii)AKAP12，LOC399959，PLEKHC1，TCEAL7
其中基本上不高于背景水平的组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表腺瘤细胞或倾向于发生腺瘤状态的细胞。
本发明的另一优选实施方式提供筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括筛查来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
203296_s_at    219948_x_at    231925_at
206664_at      220812_s_at    235146_at
211549_s_at    221305_s_at    238751_at
214598_at      229831_at      243278_at；和/或
(ii)ATP1A2    HHLA2         SORBS2
    CLDN8     HPGD          UGT1A8
CNTN3          P2RY1       UGT2A3
FOXP2          SI
其中基本上不高于背景水平的组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表癌细胞或倾向于发生癌性状态的细胞。
优选地，所述大肠组织是结直肠组织。
更优选地，所述生物学样品是粪便样品或血液样品。
在一个实施方式中，通过筛查影响甲基化且特别是超甲基化的DNA改变而评估所述表达。在另一实施方式中，通过将DNA与携带阻抑性修饰的染色质蛋白相关联而评估表达，阻抑性修饰例如为组蛋白H3的第9或27位赖氨酸的甲基化。
如前所详述，本发明被设计为用于筛查位于大肠内的新生细胞或细胞群体。因此，提到“细胞或细胞群体”，应该理解为指的是单个细胞或细胞的组。所述细胞的组可以是散在的细胞群体、细胞悬液、包囊化的细胞群体或组织形式的细胞群体。
提到“表达”，应该理解为指的是核酸分子的转录和/或翻译。就此而言，通过筛查RNA转录物(如初级RNA或mRNA)形式的新生物标记物表达产物来例证本发明。提到“RNA”，应该理解为指的是任何形式的RNA，例如初级RNA或mRNA。无意于以任何形式限制本发明，导致RNA合成增加或降低的基因转录调变也与某些此类RNA转录物(例如mRNA)翻译产生蛋白质产物相关联。因此，本发明也包括这样的检测方法，其目的在于筛查新生物标记物蛋白质产物被调变的水平或模式，以其作为细胞或细胞群体的新生状态的指示物。尽管一种方法筛查的是mRNA转录物和/或相应的蛋白质产物，但应该理解，本发明并不限于此方面，而是包括筛查任何其他形式的新生物标记物表达产物，例如，初级RNA转录物。
对于筛查标记物表达的下调，本领域人员也熟知，DNA水平发生的可检测改变可代表基因表达活性的改变，且因此也代表表达产物水平的改变。此类改变包括但不限于DNA甲基化的改变。因此，本文中提及″筛查表达水平″并将这种″表达水平″与对照″表达水平″相比较时，应该被理解为指的是评估与转录相关的DNA因子，例如基因/DNA甲基化模式。
本领域人员已知，染色质结构的改变代表基因表达的改变。基因表达的沉默通常与染色质蛋白的修饰相关联，被广泛研究的实例是组蛋白H3的第9和27位赖氨酸之一或两者的甲基化，而活性染色质的特征为组蛋白H3第9位赖氨酸的乙酰化。因此可利用基因序列与携带阻抑性修饰或活性修饰的染色质关联性来评估基因的表达水平。
对于任何给定的情况如何确定最合适的筛查方法是本领域人员已知的。为此，下表详细列出了那些已知编码细胞分泌型或膜结合型表达产物的基因。应该理解，对于设计诊断性筛查产品而言，筛查分泌型或膜结合型新生物标记物可具有特别的优势。
Figure BPA00001162670800571
Figure BPA00001162670800581
Figure BPA00001162670800591
Figure BPA00001162670800601
Figure BPA00001162670800611
Figure BPA00001162670800621
Figure BPA00001162670800631
提到“核酸分子”，应该理解为既指脱氧核糖核酸分子也指核糖核酸分子及其片段。因此本发明既包括直接筛查生物学样品中的mRNA水平也包括筛查已经从感兴趣的mRNA群体逆转录得到的互补cDNA。本领域人员有能力设计用于筛查DNA或RNA的方法。如上所详述，本发明的方法也包括筛查从被研究mRNA或基因组DNA本身翻译得到的蛋白质产物。
在一个优选的实施方式中，通过参照编码蛋白质产物的基因而测定基因表达的水平，更具体地，在蛋白质水平测定所述表达水平。因此，在本发明涉及筛查上表中所详细列出的标记物的情况中，所述筛查优选地针对的是所编码的蛋白质。
在另一个特别优选的实施方式中，通过分析DNA甲基化而评估所述基因表达。在另一实施方式中，通过将DNA与携带阻抑性修饰的染色质蛋白相关联而评估表达，阻抑性修饰例如为组蛋白H3的第9或27位赖氨酸的甲基化。
如前所详述，应该理解，尽管本发明以检测表达的核酸分子(例如mRNA)为例证，但其也包括基于筛查被研究基因的蛋白质产物的检测方法。本发明应该被理解为包括基于鉴定一或多种生物学样品中的蛋白质和/或核酸分子的检测方法。这一点在一些感兴趣的新生物标记物可对应于不编码蛋白质产物的基因或基因片段的情况中可具有特别的意义。因此，对于这种情况将不可能检测蛋白质，而是有可能不得不基于转录表达谱或基因组DNA的改变来评价被研究标记物。
术语“蛋白质”应该被理解为包括肽、多肽和蛋白质(包括蛋白质片段)。蛋白质可以是糖基化的或非糖基化的和/或可含有一些与所述蛋白质相融合的、连接的、结合的或以其他形式相关联的其他的分子，例如氨基酸、脂质、碳水化合物或其他的肽、多肽或蛋白质。本文提到的“蛋白质”包括包含氨基酸序列的蛋白质以及与其他分子例如氨基酸、脂质、碳水化合物或其他的肽、多肽或蛋白质相关联的蛋白质。
本发明的新生物标记物编码的蛋白质可以是多聚体形式，这意味着两个或多个分子结合在一起。如果是同样的蛋白质分子结合在一起，该复合体是同多聚体。同多聚体的实例是同二聚体。如果至少一种标记物蛋白与至少一种非标记物蛋白相结合，则该复合体是异多聚体，例如异二聚体。
提到“片段”，应该理解为指的是被研究核酸分子或蛋白质的一部分。与此特别相关的是筛查粪便样品中的被调变的RNA水平，因为这种被研究RNA很可能在肠道环境内已经被降解或片段化。因此实际上可以检测这种被研究RNA分子的片段，所述片段可通过使用合适的特异性探针来鉴定。
提及新生物(例如腺瘤或腺癌)的“发生”，应该被理解为指的是该个体的一或多个细胞表现出发育异常。就此而言，当出现发育异常的细胞团时，则发生了腺瘤或腺癌。或者，当做出诊断时，如果仅出现了极少数异常细胞分裂时，腺瘤或腺癌可能是处于非常早期的阶段。本发明还包括评估个体出现新生物(例如腺瘤或腺癌)的倾向性。无意于以任何方式限制本发明，新生物标记物改变的水平可代表该个体出现新生物形成的倾向性，例如将来出现腺瘤或腺癌或另一个腺瘤或腺癌的倾向性。
在本发明的另一个有关的方面，已经鉴定了能够用于表征大肠新生物组织是腺瘤还是癌症的标记物。这一进展提供了采用不同于当前所使用的方法的手段来表征组织的简单但精确的手段。
根据本发明的这一方面，提供了表征新生细胞或细胞群体的方法，所述细胞或细胞群体来自个体的大肠，所述方法包括评估所述细胞或细胞群体中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
200600_at      204006_s_at    213428_s_at
200665_s_at    204051_s_at    213524_s_at
200832_s_at    204122_at      213869_x_at
200974_at      204320_at      213905_x_at
200986_at      204475_at      214247_s_at
201058_s_at    204620_s_at    215049_x_at
201069_at      205479_s_at    215076_s_at
201105_at      205547_s_at    215646_s_at
201141_at      205828_at      216442_x_at
201147_s_at    207173_x_at    217430_x_at
201150_s_at    207191_s_at    217762_s_at
201162_at      208747_s_at    217763_s_at
201163_s_at    208782_at      217764_s_at
201185_at      208788_at      218468_s_at
201261_x_at    208850_s_at    218469_at
201289_at      208851_s_at    218559_s_at
201426_s_at    209101_at      218638_s_at
201438_at      209156_s_at    219087_at
201616_s_at    209218_at      221011_s_at
201645_at      209395_at      221729_at
201667_at      209396_s_at    221730_at
201744_s_at    209596_at      221731_x_at
201792_at      209875_s_at    37892a_t
201842_s_at    209955_s_at    223122_s_at
201852_x_at    210095_s_at    223235_s_at
201859_at      210495_x_at    224560_at
201893_x_at    210511_s_at    224694_at
202237_at      210764_s_at    224724_at
202238_s_at    210809_s_at    225664_at
202283_at      211161_s_at    225681_at
202291_s_at    211571_s_at  225710_at
202310_s_at    211719_x_at  225799_at
202311_s_at    211813_x_at  226237_at
202403_s_at    211896_s_at  226311_at
202404_s_at    211959_at    226694_at
202450_s_at    211964_at    226777_at
202620_s_at    211966_at    226930_at
202766_s_at    211980_at    227099_s_at
202859_x_at    211981_at    227140_at
202878_s_at    212077_at    227566_at
202917_s_at    212344_at    229218_at
202998_s_at    212353_at    229802_at
203083_at      212354_at    231579_s_at
203325_s_at    212464_s_at  231766_s_at
203382_s_at    212488_at    231879_at
203477_at      212489_at    232458_at
203570_at      212667_at    233555_s_at
203645_s_at    213125_at    234994_at；和/或
203878_s_at
(ii)COL1A2    LGALS1      SRGN
    CTHRC1    ELOVL5      LBH
    FN1       MGP         CTGF
    POSTN     MMP2        TNC
    SPP1      LOXL2       GOS2
    MMP1      MYL9        SQLE
    SPARC     DCN         EFEMP1
    LUM       CALD1       APOE
    GREM1     FBN1        MSN
    IL8       MMP3        IGFBP3
    IGFBP5    IGFBP7S     ERPINF1
    SFRP2     FSTL1       ISLR
SULF1        COL4A2    HNT
ASPN         VCAN      COL5A1
COL6A3       SMOC2     OLFML2B
COL8A1       HTRA1     KIAA1913
COL12A1      CYR61     PALM2-AKAP2
COL5A2       FAP       SERPING1
CDH11        VIM       TYROBP
THBS2        TIMP2     ACTA2
COL15A1      SCD       COL3A1
COL11A1      TIMP3     PLOD2
S100A8       AEBP1     MMP11
FNDC1        GJA1      CD163
SFRP4        NNMT      FCGR3B
INHBA        COL1A1    PLAU
COL6A2       SULF2     MAFB
ANTXR1       COL6A1    LOC541471
GPNMB        SPON2     LOC387763
BGN          CTSK      CHI3L1
TAGLN        MXRA5     THY1
COL4A1       C1S       LOXL1
RAB31        DKK3      CD93
其中相对于胃肠道癌症的对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因的较低表达水平代表腺瘤细胞或倾向于发生腺瘤状态的细胞。
本发明的另一方面提供表征新生细胞或细胞群体的方法，所述细胞或细胞群体来自个体的大肠，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
200884_at    214234_s_at    226248_s_at
203240_at    214235_at      226302_at
203963_at    214433_s_at    227676_at
204508_s_at    215125_s_at   227719_at
204607_at      215867_x_at   227725_at
204811_s_at    217109_at     228232_s_at
204895_x_at    217110_s_at   229070_at
204897_at      218211_s_at   231832_at
205259_at      219543_at     232176_at
205765_at      219955_at     232481_s_at
205927_s_at    221841_s_at   235976_at
208063_s_at    221874_at     236894_at
208937_s at    223969_s_at   237521_x_at
210107_at      223970_at     242601_at；和/或
213106_at
(ii)CLCA1      CTSE          ATP8B1
    FCGBP      C6orf105      CACNA2D2
    HMGCS2     CKB           KLF4
    RETNLB     ATP8A1        CYP3A5P2
    L1TD1      MUC4          CAPN9
    SLITRK6    UGT1A1        NR3C2
    VSIG2      SELENBP1      PBLD
    LOC253012  PTGER4        CA12
    ST6GALNAC1 MLPH          WDR51B
    ID1         KIAA1324     FAM3D
    CYP3A5
其中相对于胃肠道腺瘤的对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表癌或倾向于发生癌性状态的细胞。
优选地，所述胃肠道组织是结直肠组织。
在一个实施方式中，通过筛查影响甲基化且特别是超甲基化的DNA改变而评估所述表达。在另一实施方式中，通过将DNA与携带阻抑性修饰的染色质蛋白相关联而评估表达，阻抑性修饰例如为组蛋白H3的第9或27位赖氨酸的甲基化。
提及“腺瘤对照水平”或“癌对照水平”，应该被理解为分别指的是在胃肠道腺瘤或癌细胞的群体内该基因表达的水平。正如前面就“正常水平”所讨论的那样，被研究水平可以是不同的水平或水平范围。因此，“腺瘤对照水平”或“癌对照水平”的定义应该被理解为具有与“正常水平”相对应的定义，只不过其中所说的是新生物大肠细胞群体的基因表达。
就本发明的这一方面而言，在新生细胞群体上进行对象分析。可以任何方式获得这些细胞，例如来自通过灌肠洗液而收集的脱落的新生细胞，或来自胃肠道样品，例如粪便样品。或者，可以通过活检或外科手术获得被研究细胞。
无意于以任何方式限制本发明的这一方面，已经确定，本发明这一方面的一些标记物的表达水平显著低于新生细胞的水平。例如，当以本文所示例的方法评估时，观察到以下代表胃肠道腺瘤的标记物的表达水平降低3到9倍。
  降低倍数   由Affymetrix探针No检测到的基因或转录物：   基因
  9   202404_s_at   COL1A2
  8   225681_at   CTHRC1
7   212464_s_at210809_s_at   FN1POSTN
  6   209875_s_at   SPP1
5   221740_at204475_at MMP1
4   200665_s_at201744_s_at218468_s_at202859_x_at211959_at   SPARCLUMGREM1IL8IGFBP5
3   223122_s_at212353_at219087_at201438_at   SFRP2SULF1ASPNCOL6A3
  降低倍数 由Affymetrix探针No检测到的基因或转录物：   基因
226237_at225664_at221730_at207173_x_at203083_at203477_at37892_at202917_s_at226930_at204051_s_at210511_s_at209156_s_at224694_at201141_at213905_x_at205547_s_at   COL8A1COL12A1COL5A2CDH11THBS2COL15A1COL11A1S100A8FNDC1SFRP4INHBACOL6A2ANTXR1GPNMBBGNTAGLN
在另一实例中，当以本文所示例的方法评估时，观察到以下代表胃肠道癌的标记物的表达水平降低3到5倍。
  降低倍数 由Affymetrix探针No检测到的基因或转录物：   基因
  5 210107at   CLCA1
3 203240_at204607_at223969_s_at219955_at232481_s_at228232_s_at242601_at227725_at   FCGBPHMGCS2RETNLBL1TD1SLITRK6VSIG2LOC253012ST6GALNAC1
根据这一实施方式，提供了表征新生细胞或细胞群体的方法，所述细胞或细胞群体来自个体的大肠，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因：
202404_s_at，212464_s_at，210809_s_a，225681_at；和/或
(ii)COL1A2，CTHRC1，FN1，POSTN
其中相对于胃肠道癌症对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表腺瘤细胞或倾向于发生腺瘤状态的细胞。
另一实施方式提供表征新生细胞或细胞群体的方法，所述细胞或细胞群体来自个体的大肠，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因的表达水平，所述一或多种基因选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
209875_s_at    227140_at    204475_at；和/或
(ii)SPP1       MMP1
其中相对于胃肠道癌症对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表腺瘤细胞或倾向于发生腺瘤状态的细胞。
优选地，所述胃肠道组织是结直肠组织。
仍更优选地，所述生物学样品是组织样品。
本发明的另一优选实施方式涉及表征细胞或细胞群体的方法，所述细胞或细胞群体来自个体的大肠，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
200665_s_at     226237_at    226930_at
201744_s_at     225664_at    204051_s_at
218468_s_at     221730_at    210511_s_at
202859_x_at     207173_x_at  209156_s_at
211959_at       203083_at    224694_at
223122_s_at     203477_at    201141_at
212353_at       37892a_t     213905_x_at
219087_at       202917_s_at  205547_s_at
201438_at；和/或
(ii)SPARC    COL8A1     SFRP4
    LUM      COL12A1    INHBA
    GREM1    COL5A2     COL6A2
    IL8      CDH11      ANTXR1
    IGFBP5   THBS2      GPNMB
    SFRP2    COL15A1    BGN
    SULF1    COL11A1    TAGLN
    ASPN     S100A8
    COL6A3   FNDC1
其中相对于胃肠道癌症对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表腺瘤或倾向于发生腺瘤状态的细胞。
本发明的另一优选实施方式涉及表征细胞或细胞群体的方法，所述细胞或细胞群体来自个体的大肠，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
210107_at；和/或
(ii)CLCA1
其中相对于胃肠道腺瘤对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表癌或倾向于发生癌性状态的细胞。
本发明的另一优选实施方式涉及表征细胞或细胞群体的方法，所述细胞或细胞群体来自个体的大肠，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
203240_at，204607_at，223969_s_at，219955_at，232481_s_at，242601_at，
227725_at，228232_s_at；和/或
(ii)FCGBP，HMGCS2，RETNLB，L1TD1，SLITRK6，VSIG2，LOC253012，ST6GALNAC1
其中相对于胃肠道腺瘤对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表癌或倾向于发生癌性状态的细胞。
优选地，所述胃肠道组织是结直肠组织。
甚至更优选地，所述生物学样品是组织样品。
在另一有关的方面中，已经确定，本发明这一方面的一亚组标记物可用作新生物组织的定性标记物，特征在于，如果不能以显著高于新生物组织背景水平的水平检测到这些标记物，则代表是癌组织。
根据这一方面，本发明提供了表征新生细胞或细胞群体的方法，所述细胞或细胞群体来自个体的大肠，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因：
235976_at    236894_at    237521；和/或
(ii)SLITRK6  L1TD1
其中基本上不高于背景新生组织水平的组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的表达水平代表癌或倾向于发生癌性状态的细胞。
优选地，所述胃肠道组织是结直肠组织。
仍更优选地，所述生物学样品是组织样品。
在最优选的实施方式中，本发明的方法优选地筛查由本发明的标记物所编码的蛋白质或基因组DNA的DNA甲基化的改变。在另一实施方式中，通过将DNA与携带阻抑性修饰的染色质蛋白相关联而评估表达，阻抑性修饰例如为组蛋白H3的第9或27位赖氨酸的甲基化。
尽管为了诊断出现新生物形成或其倾向性，优选的方法是检测新生物标记物的表达产物或DNA的改变，但在某些情况下可能需要检测所述标记物水平的反向改变，例如，以便监测针对调变新生物情况(例如腺瘤或腺癌发生)的治疗或预防处理的效果。例如，在被研究标记物的表达降低代表个体已经出现以腺瘤或腺癌发生为特征的情况时，那么例如可采用在开始治疗之后筛查这些标记物水平的升高以表明被研究个体的情况发生逆转或其他形式的改善。
因此，本发明的方法可作为一次式测试(one off test)或作为对那些被认为具有发生新生物形成的风险的个体进行持续监测的方法，或作为目的在于抑制或以其他方式减慢新生物形成发生的治疗性或预防性处理方案之有效性的监测方法。在这些情况中，绘制出任何一或多种类型的生物学样品中的新生物标记物表达水平的调变是个体状态或目前使用的治疗性或预防性方案之有效性的重要指标。因此，本发明的方法应该被理解为包括监测个体的标记物表达水平相对于它们的正常水平(如前面所定义的)、背景对照水平、癌水平、腺瘤水平或相对于从所述个体的生物学样品中测定的一或多种早期标记物表达水平的升高或降低。
用于测试生物学样品中所表达的新生物标记物的手段可通过本领域人员熟知的任何合适的方法而实现。为此，应该理解，在检查同质性细胞群体(例如肿瘤活检物或已经从异质性初始群体中富集得到的细胞群体)或组织切片时，可以利用多种技术，例如原位杂交、微阵列表达谱评估、免疫测定等等(下文详述)，以检测一或多种感兴趣标记物的表达水平的缺失或下调。然而，在筛查异质性细胞群体或其中存在异质性细胞群体的体液如血液样品时，由于样品中存在的非新生细胞固有地表达某种特定的标记物，致使该标记物表达水平的缺失或降低可能无法被检测到。也就是说，可能无法检测到细胞亚群的表达水平的降低。在这种情况下，检测新生物亚群中本发明的一或多种标记物表达水平的降低的更合适的机制是通过间接方式，例如检测表观变化(Epigenetic changes)。
无意于将本发明限制于任何一种理论或作用方式，在发育过程中，一些调控基因表达的过程改变基因在不同细胞系中表达的程度，但不改变基因的序列，并且这些状态可通过细胞分裂得以遗传——这一过程称为表观遗传(Epigenetic inheritance)。表观遗传是由DNA甲基化(胞嘧啶甲基化产生5-甲基胞嘧啶，5meC)的组合和包装DNA的组蛋白染色体蛋白质的修饰而确定的。DNA在CpG位点的甲基化以及一些修饰例如组蛋白H3在赖氨酸9的去乙酰化和在赖氨酸9或27的甲基化与无活性染色质相关联，而相反的状态即缺乏DNA甲基化的组蛋白H3赖氨酸9的乙酰化与开放染色质和活性基因表达相关联。在癌症中，基因表达的表观调控经常被破坏(Esteller&Herman，2000；Jones&Baylin，2002)。一些基因例如肿瘤抑制基因或转移抑制基因通常被DNA甲基化沉默，而其他基因可能发生低甲基化和不适当表达。因此，在癌症中显示出表达降低或缺失的基因中，常常具有该基因的启动子或调控区域甲基化的特征。
可采用多种方法检测特定基因的DNA异常甲基化，甚至在存在大量过量正常DNA时也能做到这一点(Clark 2007)。因此，对于除了免疫组化方法难以在蛋白质或RNA水平检测的基因表达缺失，常常可以通过在肿瘤样品中和癌症患者的体液中存在该基因启动子的超甲基化DNA这一点而检测到。类似地，可利用DNA低甲基化来检测某些在癌症中表达升高的基因。癌症中的表观改变和染色质改变也常表现为修饰的组蛋白与特定基因之间相关性的改变(Esteller，2007)，例如，被抑制的基因通常与赖氨酸9的去乙酰化和发生甲基化的组蛋白H3相关联。使用针对改变的组蛋白的抗体容许分离与特定染色质状态相关的DNA，因此可用于癌症的诊断。
用于测试基因表达水平的其他方法，且特别是被研究的生物学样品未被大量非新生细胞污染时用于测试基因表达水平的其他方法，例如但不限于：
(i)体内检测
可在施用能够揭示肠道组织中标记物的表达发生改变的成像探针或试剂之后进行分子成像。
分子成像(Moore et al.，BBA，1402：239-249，1988；Weissleder et al.，Nature Medicine 6：351-355，2000)是分子表达的体内成像，其与目前使用“经典的”诊断成像技术，例如x-线、计算机体层成像(CT)、MRI、正电子发射体层成像(PET)或内窥镜，所观察的宏观特征相关联。
(ii)通过荧光原位杂交(FISH)检测细胞内RNA表达的下调或通过例如定量性逆转录酶聚合酶链反应(QRTPCR)或流式细胞术定量竞争性RT-PCR产物(Wedemeyer et al.，Clinical Chemistry 48：91398-1405，2002)等方法检测细胞提取物内RNA表达的下调。
(iii)评价RNA表达谱，例如通过阵列技术(Alon et al.，Proc.Natl.Acad.Sci.USA：96,6745-6750，June 1999)。
“微阵列”是在固相支持物表面形成的线性或多维阵列，优选地具有离散的区域(discrete regions)，各区域具有限定的范围。离散区域在微阵列上的密度取决于单个固相支持物表面上待检测的靶多核苷酸的总数。在本文中，DNA微阵列是置于芯片或其他表面上的用于扩增或克隆靶多核苷酸的寡核苷酸探针阵列。由于各特定探针组在阵列中的位置是已知的，因此可基于靶多核苷酸与微阵列中的特定位置的结合而确定其性质。
DNA微阵列技术的新进展使得能够在单个固相支持物上对多个靶核酸分子进行大规模测定。美国专利5,837,832(Chee et al.)和有关专利申请公开了固定化用于杂交并检测样品内的特定核酸序列的寡核苷酸探针阵列。将从感兴趣的组织分离到的感兴趣的靶多核苷酸与DNA芯片杂交，并基于靶多核苷酸与离散的探针位置相杂交的优先性和程度而检测特定序列。阵列的一个重要用途是用于分析差异性基因表达，其中比较不同细胞或组织(通常是感兴趣的组织和对照组织)的基因表达谱并鉴定相应组织之间基因表达的任何差别。此类信息可用于鉴定特定组织类型中表达的基因类型以及基于所述表达谱而诊断疾病。
在一个实例中，对来自感兴趣的样品的RNA进行逆转录以获得标记的cDNA。见美国专利6,410,229(Lockhart et al.)。然后将cDNA与以已知顺序排布在芯片或其他表面上的具有已知序列的寡核苷酸或cDNA杂交。在另一个实例中，RNA分离自生物学样品并与上面锚定了cDNA探针的芯片杂交。标记的cDNA与之相杂交的寡核苷酸的位置提供了cDNA的序列信息，而标记的杂交RNA或cDNA的量提供了相对代表感兴趣的RNA或cDNA的估计值。见Schena，et al.Science 270：467-470(1995)。例如，DeRisi，et al.(Nature Genetics 14：457-460(1996))公开了使用cDNA微阵列来分析人类癌症的基因表达模式。
在优选的实施方式中，制备对应于被研究核酸的核酸探针。附着于生物芯片上的核酸探针被设计为与生物学样品中的核酸基本上互补，以便靶序列与本发明的探针发生特异性杂交。这种互补性不必是完全性的，因为可以有任意数量的可能干扰靶序列与本发明的单链核酸之间的杂交的碱基对错配。预期基因在核苷酸水平的总体同源性可能为大约40％或更高，可能为大约60％或更高，且甚至更可能为大约80％或更高；并且，此外还应该有大约8-12个核苷酸或更长的相应的连续序列。不过，如果突变的数量如此之大以致于即便在杂交的最低严格性条件下仍不发生杂交，则该序列不是互补性靶序列。因此，“基本上互补”在此指的是探针与靶序列的互补性足以使得在正常反应条件下、特别是在高严格性条件下实现杂交。
核酸探针通常是单链的，但也可以是部分单链和部分双链的。探针的链性(strandedness)取决于靶序列的结构、组成和特性。通常而言，寡核苷酸探针的长度为大约6，8，10，12，15，20，30至大约100个碱基，优选地为大约10至大约80个碱基，特别优选地为15至大约40个碱基。也就是说，通常不会将这个基因用作探针。在一些实施方式中，可以使用多达数百个碱基的更长的探针。探针要具有足够的特异性，以便在本领域人员已知的条件下与互补靶序列杂交。在杂交过程中，探针序列与其所杂交的互补模板(靶)序列之间的错配通常不超过15％，通常不超过10％，且优选地不超过5％(经BLAST确定(默认设置))。
寡核苷酸探针可包括核酸中常见的天然存在的杂环碱基(尿嘧啶、胞嘧啶、胸腺嘧啶、腺嘌呤和鸟嘌呤)以及修饰的碱基和碱基类似物。适合探针与靶序列杂交任何修饰的碱基或碱基类似物均可用于本发明。探针的糖或糖苷可包括脱氧核糖、核糖、和/或这些糖的修饰形式，例如，2′-O-烷基核糖。在优选的实施方式中，所述糖部分是2′-脱氧核糖；不过，任何适合于探针与靶序列杂交的糖部分均可使用。
在一个实施方式中，探针的核苷酸单元通过磷酸二酯键连接，这是本领域人员已知的。在另外的实施方式中，核苷酸间的连键可包括本领域人员已知的适合于探针特异性杂交的任何连键，包括但不限于硫代磷酸酯、甲基膦酸酯(methylphosphonate)、氨基磺酸酯(如美国专利5,470,967)和聚酰胺(即，肽核酸)。肽核酸请参见Nielsen et al.(1991)Science 254：1497-1500、美国专利5,714,331、和Nielsen(1999)Curr.Opin.Biotechnol.10：71-75。
在某些实施方式中，探针可以是嵌合分子；即，在同一引物内可包含多于一种类型的碱基或糖亚基、和/或多于一种类型的连键。探针可包含促进其与靶序列杂交的部分，这是本领域人员已知的，例如，嵌入剂和/或小沟结合物。碱基、糖和核苷酸间连键等的变化以及探针上存在的任何吊链(pendant group)均适合于探针以序列特异性方式与其靶序列相结合的能力。在这一范围内可进行大量的结构性修饰。有利地，本发明的探针可具有使其允许进行信号扩增的结构特征，此类结构特征是，例如，分支的DNA探针，例如Urdea et al.(Nucleic Acids Symp.Ser.，24：197-200(1991))或欧洲专利EP-0225,807中所述的那些特征。此外，制备用于形成探针的各种杂环碱基、糖、核苷以及核苷酸的合成方法，以及具有特定的预定序列的寡核苷酸的制备，均是本领域人员熟知的。用于合成寡核苷酸的优选方法包括美国专利5,419,966的教导。
可为特定靶核酸设计多个探针以便将靶核酸的多态性和/或二级结构、数据的冗余性等等均考虑在内。在一些实施方式中，如果对每个序列使用多于一种的探针，可使用重叠探针或者是针对单一靶基因的不同部分的探针。也就是说，可使用两种、三种、四种或者更多种探针以便为特定靶建立冗余性。探针可以是重叠的(即，具有部分相同的序列)，或是对基因的不同序列具有特异性。如果要根据本发明检测多个靶多核苷酸，对应于特定靶多核苷酸的每种探针或探针组可被置于所述微阵列的离散区域。
探针可以是在溶液中，例如位于孔或微阵列的表面，或附着于固相支持物。可使用的固相支持物材料的实例包括塑料、陶瓷、金属、树脂、凝胶和膜。固相支持物的可用类型包括板、珠、磁性材料、微珠、杂交芯片、膜、晶体、陶瓷和自组装单层。一个实例包括二维或三维基质，例如具有多个探针结合位点的凝胶或杂交芯片(Pevzner et al，J.Biomol.Struc.&Dyn.9：399-410，1991；Maskos and Southern，Nuc.Acids Res.20：1679-84，1992)。可使用杂交芯片来构建非常大的探针阵列，然后用于与靶核酸杂交。对芯片的杂交模式进行分析可有助于鉴定靶核苷酸序列。可采用手工或计算机分析模式，但通过杂交进行位置性测序这一方式显然导致使用计算机分析和自动化。在另一个实例中，可组合使用固相结构支持物上的Affymetrix芯片和基于荧光珠的方法。在另一个实例中，可使用cDNA微阵列。就此而言，Lockkart et al(即，在固相原位Affymetrix合成探针)所公开的寡核苷酸是特别优选的，即光刻技术(photolithography)。
本领域人员能够理解，可使用多种方法将核酸附着于或固定化于固相支持物。“固定化”在此指的是核酸探针与固相支持物之间的结合足以在结合、洗涤、分析和移除等条件下保持稳定。结合可以是共价的或非共价的。“非共价结合”及其语法上的等同形式在此指的是一或多种静电、亲水性和疏水性相互作用。非共价结合包括分子，例如抗生蛋白链菌素，共价附着于支持物，而生物素化的探针非共价结合于抗生蛋白链菌素。“共价结合”及其语法上的等同形式在此指的是固相支持物和探针这两个部分经至少一种键相附着，这包括σ键、π键和配位键。共价键可在探针与固相支持物之间直接形成，或可通过交联剂或通过在固相支持物或探针或两者上纳入特异性反应基团而形成。固定化也可包括共价和非共价相互作用的组合。
核酸探针可通过共价结合(例如通过缀合于偶联剂)或通过共价或非共价结合(例如静电相互作用、氢键或抗体-抗原偶联)或通过它们的组合而附着于固相支持物。典型的偶联剂包括生物素/抗生物素蛋白、生物素/抗生蛋白链菌素、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)蛋白A/IgG抗体Fc片段和抗生蛋白链菌素/蛋白A嵌合体(T.Sano and C.R.Cantor，Bio/Technology 9：1378-81(1991))、或它们的衍生物或其组合。核酸可通过光致断裂键(photocleavable bond)、静电键、二硫键、肽键、二酯键或这些类型的键的组合而附着于固相支持物。阵列还可通过选择性释放型键附着于固相支持物，所述选择性释放型键例如为4，4′-二甲氧三苯甲基或其衍生物。可用的衍生物包括3或4[双-(4-甲氧苯基)]-甲基-苯甲酸、N-琥铂酰亚胺基-3或4[双-(4-甲氧苯基)]-甲基-苯甲酸、N-琥铂酰亚胺基-3或4[双-(4-甲氧苯基)]-羟甲基-苯甲酸、N-琥铂酰亚胺基-3或4[双-(4-甲氧苯基)]-氯甲基-苯甲酸、以及这些酸的盐。
通常而言，探针以多种方式附着于生物芯片，这是本领域人员所能够理解的。如本文所述，核酸可以先合成并随后附着于生物芯片，或者可直接在生物芯片上合成。
生物芯片包括合适的固相基材。“基材”或“固相支持物”或其他语法上的等同形式在此指的是任何这样的材料，其可被修饰以便含有适合于核酸探针的附着或结合的离散的各个位点且适合用于至少一种检测方法。本发明的固相支持物可以是适合于支持核苷酸的杂交和合成的任何固体材料。优选地，固相支持物包含至少一种基本上刚性的表面，其上可固定化引物并进行逆转录酶反应。多核苷酸微阵列元件与之稳定结合的基材可由多种材料制造，包括塑料、陶瓷、金属、丙烯酰胺、纤维素、硝酸纤维素、玻璃、聚苯乙烯、聚乙烯乙酸乙烯酯、聚丙烯、聚甲基丙烯酸酯、聚乙烯、聚氧化乙烯、聚硅酸盐、聚碳酸酯、Teflon、碳氟化合物、尼龙、硅橡胶、聚酐、聚乙醇酸、聚乳酸、多正酯类、polypropylfumerate、胶原、葡糖氨基聚糖类、和聚氨基酸。基材可以是二维的或三维的形式，例如凝胶、膜、薄膜、玻璃、板、圆筒、珠、磁珠、光学纤维、织物纤维等等。阵列的优选形式是三维阵列。优选的三维阵列是经标记的珠的集合。各个标记的珠上附着了不同的引物。标记物可通过信号手段(例如颜色)(Luminex，Illumina)和电磁场(Pharmaseq)手段来检测。标记物可通过信号手段来检测，并可远程检测标记的珠上的信号(例如使用光导纤维)。固相支持物的大小可以是用于DNA微阵列技术的任何标准微阵列的大小，且其大小可以裁剪以适合用于进行本发明的反应的具体仪器。通常而言，基材允许进行光学检测且不发出可感知的荧光。
在一个实施方式中，可使用化学官能团对生物芯片的表面和探针进行衍生化以便随后使两者附着。因此，例如，可用于对生物芯片进行衍生化的化学官能团包括，但不限于，氨基、羧基、氧基(oxo groups)和巯基，其中特别优选氨基。使用这些官能团，探针可通过官能团附着于生物芯片。例如，含有氨基的核酸可例如使用本领域已知的连接物附着于包含氨基的表面；例如，同双官能连接物或异双官能理解为是已知的。此外，在一些情况中，可使用其他的连接物，例如烷基(包括取代的和杂烷基)。
在这种实施方式中，按照现有技术已知的方式合成寡核苷酸，然后附着于固相支持物的表面。本领域人员已知，可将5′或3′末端附着于固相支持物，或可通过内部核苷实现附着。在另一个实施方式中，在固相支持物上的固定化可以很强，但却是非共价的。例如，可制备生物素化的寡核苷酸，其与包被的抗生蛋白链菌素的表面共价结合，以产生附着。
可使用任何方便的技术产生阵列，例如制备多核苷酸微阵列元件并将其稳定地结合在表面。或者，可按照本领域已知的方式在表面合成寡核苷酸。多种不同的阵列构造和方法均是本领域人员已知的并可参见WO95/25116和WO 95/35505(光刻技术)、美国专利5,445,934(通过光刻技术原位合成)、美国专利5,384,261(机械方式指导的流体通路原位合成)；和美国专利5,700,637(通过点样、印刷或偶联而合成)；在此通过引用将上述文献的全文并入本申请。另一种将DNA偶联于珠的方法是使用附着于DNA末端的特异性配体，使之连接于附着于珠的配体结合分子。可能的配体结合配偶体对包括生物素-抗生物素蛋白/抗生蛋白链菌素、或各种抗体/抗原对例如地高辛-抗地高辛抗体(Smith et al.，Science 258：1122-1126(1992))。通过使用标准的偶联剂将DNA的5′-磷酸通过氨基磷酸酯连接于包被的微球，可实现将DNA共价化学附着于支持物。将寡核苷酸固定化于固态基材的方法是已知的。参见Pease et al.，Proc.Natl.Acad.Sci.USA91(11)：5022-5026(1994)。将寡核苷酸附着于固态基材的优选的方法见Guoet al.，Nucleic Acids Res.22：5456-5465(1994)。可通过原位DNA合成(Maskos and Southern，见上)或通过化学合成的寡核苷酸的共价附着(Guo etal.，见上)并与机器人阵列技术相组合而实现固定化。
除了以生物芯片为代表的固相技术，还可利用液相阵列来定量基因表达。此类系统之一是动态聚合酶链反应(PCR)。动态PCR运行同时扩增和定量特异性核酸序列。这种特异性源自合成的寡核苷酸引物，所述引物被设计为优先附着于靶位点的侧翼单链核酸序列。这对寡核苷酸引物在各条靶序列链上形成特异性的非共价结合的复合体。这些复合体促进双链DNA在相对的方向上进行体外转录。对反应混合物进行的温度循环产生了连续的引物结合、转录、以及核酸再次解链为单个链的循环。结果是靶dsDNA产物呈对数级增加。可通过使用嵌入型染料或序列特异性探针对产物进行实时定量。
Figure BPA00001162670800811
Green 1是嵌入型染料的一个实例，其优先结合dsDNA，导致荧光信号随之增加。序列特异性探针例如TaqMan技术所用的探针，由共价结合于寡核苷酸的相对末端的荧光染料和淬火分子组成。探针被设计为选择性结合所述两条引物之间的靶DNA序列。如果PCR反应过程中合成了DNA链，则聚合酶的核酸外切酶活性可将荧光染料从探针上裂解下来，产生信号淬灭(signal dequenching)。探针信号方法与嵌入型染料方法相比更具特异性，但在各种情况中，信号强度与产生的dsDNA产物成比例。各类型的定量方法可在多孔液相阵列中使用，每个孔代表对感兴趣的核酸具有特异性的引物和/或探针。如果使用的是来自组织或细胞系的信使RNA制备物，探针/引物反应的阵列可同时定量多种感兴趣的基因产物的表达。见Germer et al.，Genome Res.10：258-266(2000)；Heid et al.，Genome Res.6：986-994(1996)。
(iv)测定细胞提取物中新生物标记物蛋白水平的改变，例如通过免疫测定法。
可采用本领域人员所熟知的多种合适的方法中的任一种来测试生物学样品中的蛋白源性新生物标记物表达产物。合适的方法的实例包括，但不限于，使用抗体对组织切片进行筛查、活检标本或体液样品。
对于使用基于抗体的诊断方法，可采用多种方式确定标记物蛋白的存在，例如通过免疫印迹、ELISA或流式细胞术方法。当然，这些方法包括单位点和双位点或“夹心”测定法(非竞争性类型以及常规竞争性结合测定法)。这些测定法还包括标记的抗体与靶直接结合。
夹心测定法是有用和常用的测定法。夹心测定技术有多种变化形式，均可用于本发明。简言之，在典型的正向测定法中，将未标记的抗体固定化于固相基材并将待测试的样品与结合的分子相接触。经过一段合适的温育阶段之后，该段时间足以允许形成抗体-抗原复合物，然后加入对抗原具有特异性的第二抗体，其标记了能够产生可检测信号的报告分子，并温育，温育时间使得足以形成另一种抗体-抗原-标记的抗体的复合物。将任何未反应的物质洗去，并通过观察报告分子产生的信号而确定抗原的存在。可通过简单观察可视的信号而对结果进行定性，或者可通过与对照样品进行比较而对结果进行定量。正向测定法的变化形式包括同时测定，其中将样品和标记的抗体同时添加给所述的结合的抗体。这些技术是本领域人员熟知的，并包括任何显而易见的小的变化。
在典型的正向夹心测定法中，对标记物或其抗原性部分具有特异性的第一抗体被共价地或被动地结合于固相表面。固相表面典型地是玻璃或聚合物，最常用的聚合物是纤维素、聚丙烯酰胺、尼龙、聚苯乙烯、聚氯乙烯或聚丙烯。固相支持物可以是管、珠、微板的盘、或其他适合于进行免疫测定的表面。结合方法是本领域已知的且通常包括交联、共价结合或物理吸附，在制备测试样品时要洗涤聚合物-抗体复合物。然后将测试量的待测样品加入至固相复合物并温育一段时间，该段时间(例如2-40分钟)足以在合适的条件下(例如25℃)允许存在于抗体内的任何亚基结合。温育阶段之后，洗涤抗体亚单位固相并干燥，并与对抗原的部分具有特异性的第二抗体温育。第二抗体连接于报告分子，后者可用于指示第二抗体与抗原的结合。
一种替代性方法包括将生物学样品中的靶分子固定化，然后将固定化的靶暴露于特异性抗体，该抗体可标记有或未标记报告分子。根据靶的量以及报告分子信号的强度，通过直接标记所述抗体可以来检测所结合的靶。或者，将特异于第一抗体的标记的第二抗体暴露于所述的靶-第一抗体复合物，以形成靶-第一抗体-第二抗体的第三复合物。通过报告分子所发出的信号来检测复合物。
在本说明书中，“报告分子”指的是一种分子，其化学性质使得其提供能够通过分析方法而鉴定的信号，由此允许对结合了抗原的抗体进行检测。检测可以是定性的或定量的。此类测定法中最常用的报告分子是酶、荧光团或含有放射性核素的分子(即，放射性同位素)和化学发光分子。
对于酶免疫测定，酶被缀合于第二抗体，通常是通过戊二醛或过碘酸盐。不过，容易理解的是存在多种多样的缀合技术，且均是本领域人员容易获得的。常用的酶包括辣根过氧化物酶、葡萄糖氧化酶、β-半乳糖苷酶和碱性磷酸酶等等。作为与这些具体的酶一起使用的底物，通常选择那些经相应的酶水解后能够产生可检测的颜色改变的底物。合适的酶包括碱性磷酸酶过氧化物酶。也可使用荧光性底物，而非上述的显色动物，荧光性底物产生的是荧光产物。在所有情况中，均将酶标抗体添加至第一抗体半抗原复合物，允许它们结合，然后洗去多余的试剂。然后将含有合适底物的溶液添加至抗体-抗原-抗体复合物。底物将与连接于第二抗体的酶反应，产生定性的视觉信号，后者可被进一步定量，通常是使用分光光度法，以表明存在于样品中的抗原的量。“报告分子”还包括使用细胞凝集法或凝集抑制法，例如乳胶颗粒上的红细胞等等。
或者，可将荧光化合物，例如荧光素和罗丹明，化学偶联于抗体而不改变其结合能力。当使用特定波长的光进行照射时，荧光染料标记的抗体会吸收光能，在该分子中诱导激发状态，随后释放出能够被光学显微镜检测到的具有特征性颜色的光。在EIA中，使得荧光标记的抗体与第一抗体-半抗原复合物相结合。洗去未结合的试剂之后，将所得第三复合物暴露于具有合适波长的光，观察到的荧光表明感兴趣的半抗原的存在。免疫荧光和EIA技术均是本领域的成熟技术，且对本发明的方法而言是特别优选的。不过，也可使用其他报告分子，例如放射性同位素、化学发光或生物发光分子。
(v)确定细胞表面的蛋白质新生物标记物的表达改变，例如通过免疫组化。
(vi)基于除了上述(iv)和(v)中详述的方法之外的任何合适的功能性测试、酶性测试或免疫学测试来确定蛋白质表达的改变。
作为常规的程序，本领域人员能够确定一种特定的方法是否适合于特定类型的生物学样品。
无意于以任何形式限制本发明，且如上所详述，可通过本领域已知的多种方法测定基因表达水平。例如，可测定基因转录或翻译产物。测定基因转录物，即，RNA，例如，可通过杂交测定法、失控测定法(run-offassays)、Northern印迹、或本领域已知的其他方法。
杂交测定法通常涉及使用与单链RNA转录物杂交的寡核苷酸探针。因此，寡核苷酸探针互补于转录的RNA表达产物。典型地，序列特异性探针可与RNA或cDNA杂交。在本文中，“核酸探针”可以是与互补序列杂交的DNA探针或RNA探针。本领域人员知晓如何设计此类探针以产生序列特异性杂交。本领域人员也知晓如何定量序列特异性杂交的量，由于基因转录产生特异性RNA，因此上述序列特异性杂交的量可作为基因表达量的测定值。
杂交样品被置于足以允许核酸探针与特定基因表达产物发生特异性杂交的条件下。在本文中，“特异性杂交”指的是近乎精确杂交(例如，存在极少的错配，如果有的话)。特异性杂交可在高严格性条件或中等严格性条件下进行。在一个实施方式中，特异性杂交的杂交条件具有高严格性。例如，特定的高严格性条件可用于将精确互补核酸与互补性较低的核酸区别开。核酸杂交的“高严格性条件”、“中等严格性条件”和“低严格性条件”可参见Current Protocols in Molecular Biology，2.10.1-2.10.16页和6.3.1-6.3.6页(Ausubel，F.et al.，“Current Protocols in Molecular Biology”，John Wiley&Sons，(1998)，在此通过引用将其中的全部教导并入本文)。确定杂交严格性的确切条件不仅取决于离子强度(例如，0.2xSSC，0.1xSSC)、温度(例如，室温、42℃、68℃)以及去稳定剂例如甲酰胺或变性剂例如SDS的浓度，还取决于一些因素例如核酸序列的长度、碱基组成、杂交序列之间的错配百分数、以及该序列的亚组在其他非相同序列中出现的频率。因此，通过改变一或多种这些参数同时保持两种核酸分子之间具有相似程度的相同性或相似性，可以确定等同的条件。典型地，所使用的条件使得彼此之间的相同性为至少大约60％、至少大约70％、至少大约80％、至少大约90％或至少大约95％或更高的序列保持相互杂交。通过改变杂交条件，从不出现杂交的严格性水平改变到首次出现杂交的水平，可以确定出允许特定序列与样品中的最为互补的序列发生杂交(例如，选择性地)的条件。
描述确定中等或低严格性条件的洗涤条件的示例性条件可参见Kraus，M.and Aaronson，S.，1991.Methods Enzymol.，200：546-556；和Ausubel et al.，Current Protocols in Molecular Biology，John Wiley&Sons，(1998)。洗涤步骤中的条件通常被设置为用于决定杂交体的最低互补性水平。通常，从仅出现同源性杂交的最低的温度开始，最终洗涤温度每降低1℃(保持SSC浓度恒定)允许相杂交的序列之间的最大错配百分数增加1％。通常，SSC浓度升高一倍导致Tm升高大约17℃。利用这些指导，根据所需的错配水平，可经验性地确定高、中或低严格性的洗涤温度。例如，低严格性洗涤可包括在含有0.2x SSC/0.1％SDS的溶液中在室温洗涤10分钟；中等严格性洗涤可包括在含有0.2xSSC/0.1％SDS的预热的溶液中(42℃)在42℃洗涤15分钟；而高严格性洗涤可包括在含有0.1xSSC/0.1％SDS的预热的溶液中(68℃)在68℃洗涤15分钟。此外，可反复或依次进行洗涤以获得所需的结果，这是本领域人员已知的。可通过改变作为实例所给出的这些参数中一或多种参数，这是本领域人员已知的，同时将靶核酸分子与所使用的引物或探针(例如，待杂交的序列)之间的互补性保持在相似的程度，而确定等同的条件。
本发明的另一方面提供分子阵列，所述阵列包含多个：
(i)包含相应于任何一或多种前述新生物标记物基因的核苷酸序列或与之具有至少80％相同性的序列的核酸分子，或所述核酸分子的功能性衍生物、片段、变体或同源物；或
(ii)包含能够在中等严格性条件下与(i)的任何一或多种序列杂交的核苷酸序列的核酸分子，或所述核酸分子的功能性衍生物、片段、变体或同源物；或
(iii)包含能够在中等严格性条件下与(i)的任何一或多种序列杂交的核苷酸序列的核酸探针或寡核苷酸，或所述核酸分子的功能性衍生物、片段、变体或同源物；或
(iv)能够与(i)的核酸分子所编码的任何一或多种蛋白质相结合的探针，或其衍生物、片段或同源物
其中(i)的所述标记物基因的表达水平或(iv)的所述蛋白质的表达水平代表源自大肠的细胞或细胞亚群的新生状态。
优选地，所述百分比相同性至少为85％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％。
低严格性包括，杂交条件为至少大约1％v/v到至少大约15％v/v的甲酰胺和从至少大约1M到至少大约2M的盐，而洗涤条件为至少大约1M到至少大约2M的盐。需要时可采用替代性严格性条件，例如中等严格性，其包括，杂交条件为从至少大约16％v/v至少大约30％v/v的甲酰胺和从至少大约0.5M到至少大约0.9M的盐，而洗涤条件为至少大约0.5M到至少大约0.9M的盐，或高严格性，其包括，杂交条件为从至少大约31％v/v到至少大约50％v/v的甲酰胺和从至少大约0.01M到至少大约0.15M的盐，而洗涤条件为至少大约0.01M到至少大约0.15M的盐。通常而言，进行洗涤的温度为Tm＝69.3+0.41(G+C)％[19]＝-12℃。不过，双链DNA的Tm每降低1℃，错配碱基对的数量增加1％(Bonner et al(1973)J.Mol.Biol.81：123)。
优选地，被研究探针被设计为以使得非特异性反应发生率降至最低的特异性水平结合核酸或蛋白质。不过，应该理解，可能无法完全消除潜在的交叉反应性或非特异性反应性，这是任何基于探针的系统的固有局限性。
对于用于检测被研究蛋白质的探针而言，它们可以是任何合适的形式，包括抗体和适体。
核酸或蛋白质探针的文库或阵列可提供丰富而重要的信息。此外，此类序列的两个或更多个阵列或表达谱(使用一种阵列获得的信息)是将测试组结果与参照相比较的有用工具，所述参照例如为另一种样品或储存的校准品。使用阵列时，各个探针通常被固定化于不同的位置，并允许其进行结合反应。与组装的标记物试剂盒相关的引物可用于制备序列文库或直接从其他生物学样品中检测标记物。
基因标记物的文库(或阵列，其指的是对应于文库中的至少部分序列的物理性分开的核酸)展现出十分合适的特性。这些特性与特定的条件相关，并可被表征为调节表达谱。术语表达谱在此指的是一组成员，其提供所述标记物最初源自其中的组织的诊断信息。在很多情况中，表达谱包含由沉积的序列制得的阵列上的一系列点。
通常利用阵列来制备特征性的患者表达谱。可将阵列表达谱与一或多个其他阵列表达谱或其他参照表达谱相比较。比较的结果可提供有关所述患者的疾病状态、发育状态、对治疗的接受性以及该患者的其他信息的丰富信息。
本发明的另一方面提供用于测定生物学样品的诊断试剂盒，其包含用于检测一或多种新生物标记物的物质和用于促进通过第一隔室中的物质进行检测的试剂。也可包括其他装置，例如，用于接收生物学样品的装置。所述物质可以是任何合适的检测分子。
通过以下非限制性实施例进一步阐述本发明：
实施例1
方法和材料
Affymetrix基因芯片数据
基因表达谱和相关的临床数据购自GeneLogic Inc(Gaithersburg，MDUSA)。对于所分析的各个组织，采集44,928个探针组(AffymetrixHGU133A&HGU133B，已组合)的寡核苷酸微阵列数据、实验和临床描述符、以及组织学制备物的数字化显微镜图象。进行质量控制分析以剔除不符合生产商所定义的基本质量控制指标。
通过Microarray Suite(MAS)5.0(Affymetrix)和Robust MultichipAverage(RMA)标准化技术(Affymetrix.基因芯片expression data analysisfundamentals.Affymetrix，Santa Clara，CA USA，2001；Hubbell et al.Bioinformatics，18：1585-1592，2002；Irizarry et al.Nucleic Acid Research，31，2003)计算出转录物表达水平。使用MAS标化数据进行标准质量控制程序，并使用RMA将最终数据集标准化，用于后续分析。
单变量差异性表达
在从Bioconductor的R资料库下载的limma文库(G.K.Smyth.Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology，3(1)：Article 3，2004；G K Smyth.Bioinformatics and Computational Biology Solutions using R andBioconductor.Springer，New York，2005)中进行中度t-检验，鉴定到了差异性表达的基因转录物。使用Bonferonni校正法来校正显著性估计值(p-值)以便符合多重假设检验。
组织特异性表达模式
为了给假设被“关闭”的基因表达构建筛选程序，首先在所有454份组织的范围估测了所有44,928个探针组的平均表达水平。为了估测表达开/关阈值，将44,928个平均值，并计算相当于所计算的数据组第30位百分点的表达值。选择这一假定阈值的原因在于，理论上讲，给定标本中的大多数转录物(大概超过30％)应该是转录沉默的。因此这一阈值代表的是估计出的非特异性或背景信号的保守性上限。
基因代号注释
为了将Affymetrix探针组命名与官方基因代号相对应，使用了获自Bioconductor的注释元数据。使用了Hgul33plus2文库版本1.16.0，该文库是采用2007年3月15日下载的Entrez Gene数据集合而成的。
性能特征的估计值
为各标记物表所估测的诊断用途包括：敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值、阳性似然比、阴性似然比。这些估计值是在发现所述标记物时所使用的相同数据中计算的，因此可能潜在性地过高估计了标记物在未来组织样品中的性能特征。为了改善这些估计值的通用性，采用改良的折刀重复取样技术(jackknife resampling technique)计算出每一特征的低偏倚值。
结果
对Affymetrix寡核苷酸微阵列数据进行多种单变量统计学检验以发现能够用于将结直肠新生物组织与非新生物组织区分开的人类基因。进一步鉴定到了一些可用于鉴别结直肠腺瘤与结直肠癌的基因转录物。还鉴定到这些转录物的一个亚组可能特别具有诊断用途，因为它们的蛋白质产物是分泌型的或者是表达在上皮细胞的细胞表面。最后还鉴定到一个亚组的转录物，它们特异性表达于新生物组织，而在非新生物组织中为低于或接近背景水平。
在新生物组织内差异性表达的基因
在总共44,928个探针组的一套基因芯片中，通过使用保守性(Bonferroni)多重检验校正的BioConductor(G.K.Smyth，2004，见上)limma软件包的中等t-检验确定了超过11,000个探针组被差异性表达。进一步筛选这些探针组，仅纳入那些在新生物组织和非新生物组织之间的平均表达发生2倍或以上改变的探针组，这样发现了560个探针组，它们在新生物形成中的表达低于在正常组织中的表达。
使用最近的元数据以及芯片的注释软件包对这560个探针组做出注释。这560个低表达的探针组对应于434个基因代号。
  Δ-表达   探针组ID数相对应的基因代号数
  下调   560434
对结直肠新生物形成具有特异性的假定标记物
尽管差异性基因表达模式有助于诊断，本研究仍尝试鉴定由新生性结直肠上皮脱落至肠腔内的诊断性蛋白质。为了发现候选蛋白质，对这一系列差异性表达的转录物进行筛选，筛选标准的目的在于鉴定到在结直肠新生物形成组织中被特异性关闭的标记物。为了鉴定“关闭的”基因，筛选标准被设计为用于发现具有以下特征的基因：i)新生物的表达水平低于理论的开/关阈值，且ii)正常的信号则至少要高2倍。图1给出了在新生物组织中被“关闭”的示例性转录物的表达谱。
实施例2
在非新生物形成组织中较新生物组织中升高的探针组
进行差异性表达分析以便在测定454份结直肠组织中的RNA浓度的Affymetrix基因芯片数据中鉴定下调的探针组，这些组织包括161份腺癌标本、29份腺瘤标本、42份结肠炎标本以及222份非疾病组织。使用多重假设检验的保守性校正以及2倍的绝对倍数改变截断值，确定有560个探针组在新生物组织中表达水平低于非新生物对照。基于转录物的核苷酸序列将这560个探针组与434个推定的基因代号相对应。
验证/假设检验
在独立获取的临床标本上测定这些候选物的RNA表达水平。使用定制的“Adenoma Gene Chip”将526个探针组与来自68份临床标本的RNA提取物杂交，所述标本包括19个腺瘤、19个腺癌和30个非疾病对照。有三十四(34)个探针组没有进行测试，因为它们没有被纳入定制芯片中。已经确认了526个靶探针组(或与同一基因座靶直接相关的探针组)中的459个在这些独立获取的组织中以类似方式差异性表达(P＜0.05)。表1给出了这459个探针组的差异性表达分析结果。
进一步测试了被认为这560个探针组与之杂交的434个独特基因座中的372个。其余的62个基因代号没有在验证数据中给出。观察到372个基因代号中的328个被至少一个差异性表达探针组反映在验证数据中，许多代号包括针对推定基因座多个区域的多个探针组。表2给出了与靶基因座结合的探针组的完整列表。
结论
表1和2分别给出的候选探针组和代号在新生结直肠组织和非新生物对照中被差异性表达，它们在新生结直肠组织中的表达低于非新生物对照。
实施例3
显示出非新生物形成特异性谱的探针组
在分析发现数据的过程中，观察到在新生物表型与非新生物表型之间存在新的表达谱。推测定量性差异表达的探针组亚组也是定性差异性表达的。此类探针组未显示出在新生物组织中有基因表达活性的证据，即，这些探针组似乎仅在非新生物组织中的表达超过背景水平。这一观测结果以及所得到的假设基于以下两个原则：
1.基因组范围的基因芯片(例如U133)上出现的大多数人类转录物很可能不表达于结直肠粘膜；和
2.此类“关闭的”探针组(与标记的cRNA)的微阵列结合强度可反映技术测定法的背景，即非特异性寡核苷酸结合。
为了产生一系列非新生物形成特异性探针组，将差异性表达的探针组的新生物强度与来自芯片上的所有探针组的假定背景信号阈值相比较。我们注意到，根据设计，从中选择出“打开的”转录物的候选池中的所有探针组，相对于疾病组织而言，它们在非疾病组织中只是有2倍的过表达。这些标准组合起来产生了在非新生物组织中特异性表达的一个亚组的差异性表达转录物。
这一分析证实，对应于大约41个基因座的42个探针组显示出非新生物形成特异性的转录表达谱。
验证/假设检验
定制基因芯片设计不使用与发现过程中所用的原则相同的原则来测试非新生物形成-特异性探针组。具体而言，定制基因芯片(根据设计)不含有大量预期与假定为“关闭的”/“非转录的”基因转录物杂交的探针组。这是因为，定制基因芯片设计对结直肠新生物组织内差异性表达的转录物具有严重的偏倚。
因此对这些候选探针组在非新生物组织中的特异性表达进行常规差异性表达测试(limma)。在定制基因芯片上的(42个)探针组中的37个中，33个探针组(或结合于同一基因座的探针组)在38个新生物组织(腺瘤和癌)与非新生物对照之间被差异性表达。表3显示了这些验证实验的结果。
进一步的目的是测试所有已知与本发明的探针组与之杂交的基因座杂交的探针组。在所述探针组所靶向的41个推定的基因座中，33个出现于验证数据中。这33个基因代号中的所有三十三(33)个(100％)均证实了至少一个在新生物组织中差异性表达的杂交探针组。表4给出了这些实验的结果，包括所有以差异性表达方式与各个靶基因座结合的探针组。
实施例4
实施例2和3的材料与方法
在454份结直肠组织标本(包括新生物、正常和非新生物疾病对照)中测定的基因表达谱数据购自GeneLogic Inc(Gaithersburg，MD USA)。对于各个组织标本，采集总共44,928个探针组(HGU133A&HGU133B，已组合)的Affymetrix(Santa Clara，CA USA)寡核苷酸微阵列数据、实验和临床描述符、以及组织学制备物的数字化显微镜图象。在对这些数据实施发现方法之前，进行深入的质量控制方法，包括统计学研究、回顾临床记录的一致性以及阵列随机样品的组织病理学核查。将不符合可接受的质量标准的微阵列自分析中剔除。
假设检验
使用被设计为与发现过程中所鉴定的候选RNA转录物杂交的25聚体寡核苷酸探针组的定制寡核苷酸微阵列来测试候选转录生物学标记物。使用获取自独立收集的临床样品(包括30份正常结直肠组织、19份结直肠腺瘤组织和19份结直肠腺癌组织)的RNA提取物来检验差异性表达假设。已确认各个RNA提取物符合严格的质量控制标准。
结直肠组织标本
用于假设检验的所有组织均来自澳大利亚Adelaide地区的三级会诊医院(Repatriation General Hospital and Flinders Medical Centre)的组织库。为本研究目的使用组织库已经获得Repatriation General Hospital科研伦理委员会和Flinders Medical Centre伦理委员会的批准。每一被研究的组织均得到了患者的知情同意。
手术切除后，在手术室内将标本置于无菌容器内并收集。从手术切除至手术室收集之间的时间有所不同，但均不超过30分钟。样品体积大约为125mm3(5x5x5mm)，均取自距离病理部位尽可能远处的大体正常的组织，标注结肠区域以及位于病理部位的近端或远端的距离。将组织置于冷冻管，然后立即浸入液氮，保存在-150℃直至处理。
RNA提取
使用
Figure BPA00001162670800921
试剂(Invitrogen，Carlsbad，CA，USA)按照生产商的说明提取RNA。将各样品在300μL Trizol试剂内匀浆，使用改良的Dremel钻头和无菌一次性乳钵。给匀浆物加入额外的200μL Trizol试剂，将样品在室温温育10分钟。然后加入100μL氯仿，振荡样品15秒，然后再次室温温育3分钟。12,000rpm离心15分钟，40℃，获得含有靶RNA的水相。通过将样品与250μL异丙醇室温温育10分钟而沉淀RNA。12,000rpm离心10分钟，40℃，收集纯化的RNA沉淀物，弃上清液。以1mL 75％乙醇洗涤沉淀，随后震荡并7,500g离心8分钟，40℃。将沉淀风干5分钟，重悬于80μL无RNase的水中。为了增加后续的溶解性，将样品在55℃温育10分钟。通过测定A260/280nn的光密度而定量RNA。通过在1.2％琼脂糖甲醛凝胶上进行电泳来评估RNA的质量。
基因芯片的处理
为了检验与结直肠新生物形成生物学标记物候选物相关的假设，使用我们与Affymertix(Santa Clara，CA USA)合作设计的定制基因芯片评估RNA提取物。采用为HU Gene ST 1.0阵列开发的标准的Affymetrix方案(见Affy：WTAssay)处理这些定制基因芯片。
统计学软件和数据处理
绝大多数分析均采用R统计学环境R和BioConductor文库(BioConductor，www.bioconductor.org)(BIOC)。为了将探针组ID与定制基因芯片上的基因代号相对应，使用了hgu133plus2文库版本2.2.0，该文库是采用2008年4月18日12:30:55(BIOC)下载的Entrez Gene数据集合而成的。
差异性表达的生物学标记物的假设检验
使用两个样品之间的等均值的Student′s t检验或limma文库(Smyth)(limma)提供的robust variant来评估不同组织类型之间的差异性表达。为了减少多重假设检验引起的假发现的影响，对发现过程中的P值进行Bonferroni调整(MHT：Bonf)。对于假设检验，使用稍低的Benjamini&Hochberg保守性多重假设检验校正，其目的在于控制方案(MHT：BH)的假发现率。
组织特异性基因表达模式的发现
使用基因表达数据的发现方法通常产生大量的候选物，其中很多不适合商品化的产品，这是因为它们涉及精细的基因表达差异，而后者在实验室工作中可能难以检测。Pepe等注意到“理想的”生物学标记物在肿瘤组织中是可检测到的，而在非肿瘤组织内是(根本)检测不到的(Pepe:biomarker:development)。为了使得发现偏向于那些符合这一标准的候选物，开发了目的在于富集那些其缺失或存在的定性测定结果对于感兴趣的表型具有诊断意义的生物学标记物候选物的分析方法。这一方法试图选择相对于芯片上的背景/噪音表达估计值显示出典型的“打开的”或“关闭的”模式的候选物。理论上认为此类RNA转录物更有可能与具有诊断潜能的下游翻译蛋自相关联或可预测可用于诊断用途的上游基因组改变(例如甲基化状态)。这种对定性结果而非定量结果的注重可简化针对此类生物学标记物的产品开发过程。
这种方法基于这样一种假设，即任何给定组织(例如结直肠粘膜)中所提取的RNA样品池均与基因芯片上用于测定整个基因组的所有探针组中相对较小一个亚组特异性结合。基于这一假设，估计完整人类基因芯片上的绝大多数探针组不会表现出特异性的高强度信号。
采用这一观察结果，通过选择等同于例如分级平均值的最低25％的百分点的值的理论水平来近似整个芯片的背景或“非特异性结合”。可以将这一百分点主观设定为某一水平，低于该水平则可以合理推断该信号不代表超过背景的RNA结合。最后，将这一背景估计值用作阈值，以估计试验中(例如非新生物组织标本)的“关闭的”探针组。
反之，进一步假设以下探针组可能是肿瘤特异性候选生物学标记物，所述探针组1)的表达高于该理论阈值水平，2)以差异性的较高水平表达于肿瘤标本中。注意到在这种情况中，也可简单地采用“倍数改变”阈值这一概念来进一步强调推定为“打开的”探针组中绝对表达增加的概念。
鉴于所测定的探针组的相当大的部分是低背景结合这一假设，这一方法仅用于大的GeneLogic数据和发现。为了在GeneLogic发现数据中构建假定为“打开的”生物学标记物的筛选方法，估计了所有44,928个探针组在整个454份组织的范围内的平均表达水平。然后将这44,928个平均值分级，并计算相当于所计算的数据组第25位百分点的表达值。选择这一假定阈值的原因在于，给定标本中的大多数转录物(大概超过25％)应该表现出是有效转录沉默的低浓度。因此这一阈值代表的是估计出的非特异性或背景表达的保守性上限。
实施例5
DNA甲基化数据
为检测表5中的8个下调基因的启动子区域的甲基化建立分析法。亚硫酸氢盐处理DNA的方法和确定DNA甲基化水平的方法，包括MSP和COBRA，可参见Clark et al..(2006)。
5个MSP分析使用了表7所示的引物对。使用CAGE基因无偏倚扩增对照PCR来确定输入DNA的量，以便提供定量各基因甲基化水平的参照物。对于PCR，Biorad iQ SyBr Green Super Mix中的25μL反应物含有5ng亚硫酸氢盐处理的DNA(细胞系测定为1ng，临床标本为6ng)和200nM前向和反向引物。PCR循环条件为：
95.0℃，2分钟
继以50个循环的：
95.0℃/15sec
Temp℃/30sec
72.0℃/30sec
其中“Temp”是为各基因优化的退火温度，如表yy所示。
对于DF基因，进行如下3个预循环：95.0℃解链温度，继以50个循环，使用较低的84.0℃解链温度(以减少非特异性扩增)。
使用以M.SssI甲基化酶甲基化的DNA(100％甲基化)和已经使用Phi29DNA聚合酶体外扩增的DNA(0％甲基化)产生标准曲线。
为表8所示的3个基因建立COBRA分析法。如上设置PCR，循环条件为：
95.0℃，2分钟
继以50个循环的：
95.0℃/15sec
Temp℃/30sec
72.0℃/30sec
PCR后，以合适的酶消化10μLPCR产物(表8)，通过凝胶电泳分析消化的产物，半定量方法确定甲基化水平。
测定了4种结直肠癌细胞系Caco2，HCT116，HT29和SW480以及正常血液DNA和正常肺成纤维细胞系MRC5中这8个基因的甲基化状态。表5概括了甲基化水平。在4种所测试的结直肠癌细胞系中的2或3种中，所有8个基因的启动子区域显示出强甲基化。除了DF在MRC5中甲基化之外，在来自正常血液DNA和成纤维细胞系MRC5的DNA中，它们均显示出缺乏甲基化或低水平甲基化。
对这些基因中的MAMDC2和GPM6B这两个基因，进一步在12个腺瘤、18个癌症和22个匹配的正常组织样品中进行了分析(图2，A和B)。
对于MAMDC2，定量分析证实，与正常组织样品中所观察到的最高水平相比，12个腺瘤样品有2个，18个癌样品中有6个均显示出升高的甲基化。通过半定量COBRA测定法确定了GPM6B基因的甲基化水平，基于限制性酶消化观察给出0至5的积分。从正常到腺瘤到癌的进展中显然存在启动子甲基化逐渐增加的明显趋势(图2，B)。
这些数据以大量下调基因的实例证实，结直肠癌细胞系和原代新生物形成组织内的这种下调与DNA甲基化相关联，且分析DNA甲基化可用于鉴别癌和正常组织。
实施例6
确定Affymetrix探针组所定义的感兴趣核酸序列的基因身份
使用在线Basic Local Alignment Search Tools[BLAST]对感兴趣的序列进行BLAST分析。例如NCBI/BLAST
(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)
(a)在网页http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi上的BLASTASSEMBLED GENOMES中选择″Human″
(b)采用默认设置，即：
数据库：Genome(所有汇编)
程序：megaBLAST：比较高度相关的核苷酸序列
任选参数：Expect：0.01，Filter：默认，Descriptions：100，Alignments：100
(c)复制/粘贴序列至″BLAST″视窗
(d)点击″Begin Search″
(e)点击″View Report″
评估Open BLAST搜索结果
当″blasting″序列时可鉴定多个重要序列比对。
鉴定所鉴定的序列匹配物的基因命名
(a)点击一个鉴定的命中项的链接
(b)新网页会以图表形式显示命中项在染色体中的位置。可以很清楚地看出哪一个基因被命中。
(c)点击链接寻回″hit″序列
(d)在所提供的″search″视窗内搜索该基因，提供该基因的基因核苷酸等同物。
确定序列的杂乱性
(a)打开NCBI/BLAST工具(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)
(b)点击″basic BLAST″下的″nucleotide Blast″
(c)复制/粘贴感兴趣的序列至″Query Sequence″视窗
(d)点击″Blast″。
评估序列的nBLAST搜索结果
(a)以该序列运行nBLAST可得到多个Blast命中项，在″Description″中会列出其中的一些目录号
(b)应该查看这些命中项
确定序列在基因中的位置
Ensembl数据库是在线数据库，其产生并维护自动注释选定的真核基因组(www.ensembl.orq/index.html)
鉴定序列在基因中的位置
(a)将″Search″设置为Homo Sapiens，在所提供的Search FieldEnsemble.org/index.html)中键入″the gene name″
(b)点击″Go″
(c)点击″vega protein_coding Gene：OTTHUMG000000144184″链接以得到注释报告
(d)点击″Gene DAS Report″以寻回有关替代性剪接位点数据库的信息：在搜索框内键入″the gene name″
点击″the gene entry″
向下移动至″evidences″
查看替代性剪接位点
点击″Confirmed intron/exons″以得到外显子和内含子的一系列等同物。
替代性剪接和/或转录
AceView数据库提供所有公开的mRNA序列的精确且非冗余的序列代表。可从NCBI：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/IEB/Research/Acembly/获得该数据库
进一步研究该基因mRNA转录物
(a)在所提供的″search″框中键入″the gene name″
(b)点击″Go″
(c)可从AceView的所得目录中得到以下信息：
从中构建出(即从涉及分离mRNA的实验工作中产生)该基因的cDNA克隆的数目
推定由该基因产生的mRNA
存在非重叠性替代性外显子和经验证的替代性聚腺苷酰化位点
存在截短体
受控交替表达的可能性
被记录为参与基因替代性剪接的内含子
(d)经典剪接位点基序
将方法应用于LOC643911/hCG 1815491
材料和方法
提取RNA
使用
Figure BPA00001162670800991
试剂(Invitrogen，Carlsbad，CA，USA)按照生产商的说明提取RNA。将各样品在300μL Trizol试剂内匀浆，使用改良的Dremel钻头和无菌一次性乳钵。给匀浆物加入额外的200μL Trizol试剂，将样品在室温温育10分钟。然后加入100μL氯仿，振荡样品15秒，然后再次室温温育3分钟。12,000rpm离心15分钟，40℃，获得含有靶RNA的水相。通过将样品与250μL异丙醇室温温育10分钟而沉淀RNA。12,000rpm离心10分钟，40℃，收集纯化的RNA沉淀物，弃上清液。以1mL 75％乙醇洗涤沉淀，随后震荡并7,500g离心8分钟，40℃。最后将沉淀风干5分钟，重悬于80μL无RNase的水中。为了增加后续的溶解性，将样品在55℃温育10分钟。通过测定A260/280nm的光密度而定量RNA。通过在1.2％琼脂糖甲醛凝胶上进行电泳来评估RNA的质量。
基因芯片的处理
使用Affymetrix WT靶标记和对照试剂盒(part#900652)按照所述方案(Affymetrix 2007P/N 701880Rev.4)准备在Human Exon 1.0ST基因芯片上分析的RNA样品。简言之：使用以T7启动子序列和SuperScript II(Invitrogen，Carlsbad CA)标记的随机六聚体引物自100ng核糖体还原型RNA合成第一循环cDNA，随后使用DNA聚合酶I合成第二链cDNA。然后使用T7聚合酶合成反义cRNA。然后使用SuperScript II、dNTP+dUTP和随机六聚体合成第二循环有义cDNA，以产生掺入尿嘧啶的有义第二链cDNA。然后组合使用尿嘧啶DNA糖基化酶(UDG)和无瞟呤/无嘧啶(apurinic/apyrimidinic)内切酶1(APE 1)将该含有尿嘧啶的单链cDNA片段化。最后使用末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)和Affymetrix专用DNA标记试剂给DNA标记生物素。在45℃与阵列杂交16-18小时。
使用Affymetrix Fluidics Station 450洗涤和染色杂交的基因芯片，并使用Affymetrix Scanner 3000按照推荐的方案扫描。
基于SYBR green的定量实时-PCR
在分离自临床样品的RNA上进行定量实时聚合酶链反应以扩增并监测各种hCG_1815491转录物。
首先使用Applied Biosystems高性能反转录试剂盒(P/N 4368814)从2ug总RNA合成cDNA。合成后将反应物以水1∶2稀释，终体积为40ul，取1ul这种稀释cDNA用于随后的PCR反应。
PCR在25ul体积内进行，使用12.5ul Promega 2x PCR master mix(P/NM7502)，1.5ul 5uM正向引物，1.5ul 5uM反向引物，7.875ul水，0.625ul 1∶3000稀释的10,000x SYBR green 1纯染料储存液(Invitrogen P/N S7567)，和1ulcDNA。
扩增循环推荐为：95℃2分钟x1个循环，95℃15秒和60℃1分钟x40个循环。在Corbett Research Rotor-Gene RG3000或RocheLightCycler480实时PCR仪中进行扩增反应。使用Roche LightCycler480实时PCR仪扩增时反应物体积降至10ul，并在384孔板中进行，但所有组分之间的相对比例保持不变。使用ΔΔCt方法计算最终的结果，其中相对于内源性管家基因HPRT的表达水平计算各种hCG_1815491转录物的表达水平。
终点PCR
在分离自临床样品的RNA上对各种hCG 1815491转录物进行终点PCR。条件与SYBR green测定法中所述条件相同，不同之处在于SYBRgreen染料被水替代。扩增反应在MJ Research PTC-200热循环仪中进行。在2％琼脂糖E-凝胶(Invitrogen)上分析2.5μl的扩增产物，使用100碱基对DNA Ladder分子量标准。
结果
基于自基因芯片分析中鉴定到的Affymetrix探针组238021_s_at和238022_at的诊断用途，对与hCG_1815491有关的转录物的核苷酸结构和表达水平进行分析。
基因hCG_1815491目前在NCBI中以单一RefSeq序列XM_93911表示。hCG_1815491的RefSeq序列基于89个GenBank登记号，来自83个cDNA克隆。在2006年3月之前，预测这些克隆代表两个重叠的基因，LOC388279和LOC650242(后者也称为LOC643911)。2006年3月，针对克隆重排对人类基因组数据库进行筛选，与基因组共排列并以最小非冗余方式成簇。结果是LOC388272与LOC650242合并称为一个基因，称为hCG_1815491(hCG_1815491的早期名称有：LOC388279，LOC643911，LOC650242，XM_944116，AF275804，XM_373688)。
已经确定，由人16号染色体上的基因组等同物8579310至8562303(由NCBI重叠群NT_010498.15|Hs16_10655(NCBI 36March 2006基因组)限定)限定的Ref序列包括hCG_1815491。已经将来自该基因的10个推定的RNA变体与位于绘制区8579310至8562303内的基因组核苷酸序列进行比对。比对分析发现存在至少6个外显子，其中的几个具有替代性剪接。所鉴定的外显子不同于在NCBI hCG_1815491 RefSeq XM_93911中表征的仅4个外显子。通过检查Affymetrix基因芯片HuGene Exon1.0中的针对Ref序列中所含的靶核苷酸序列的探针组，在Ref序列中还鉴定到了2个额外的推定的外显子。已经利用所鉴定的并扩充的hCG_1815491的外显子-内含子结构设计出特异性寡核苷酸引物，这使得能够通过基于PCR的方法对由Ref序列产生的RNA变体的表达进行测定(图4)。
附表
探针组命名包括HG-133plus2探针组ID和Human Gene 1.0ST阵列探针ID。可使用Affymetrix提供的Human Gene 1.0ST探针标记文件(http://www.affymetrix.com/Auth/analysis/downloads/na22/wtgene/HuGene-10-st-vl.probe.tab.zip)方便地将后者与Transcript Cluster ID相对应。使用公共软件例如NetAffx(Affymetrix提供)，可将Transcript Cluster ID进一步与基因代号、染色体定位等相对应。
表1
被证明在非新生物组织中的表达高于新生物对照的探针组。TargetPS：Affymetrix HG-U133plus2探针组ID；代号：与靶探针组ID相对应的推定的基因代号-多重代号命名表示探针组可能与多个靶基因杂交；SigniF.FDR：提取自新生物形成和非新生物组织的RNA之间的平均差异检验的调整的p值。采用用于多重假设检验的Benjamini&Hochberg校正(Benjamini andHochberg，1995)进行调整；D.value50：诊断有效性参数估计值，对应于受试者操作特征ROC的面积。该参数提供了具有诊断用途的方便的估计值(见Saunders，2006)；FC：非新生物形成与新生物形成相比的平均表达水平的改变倍数；Sens-Spec：诊断性能的估计值，对应于显示出相等的敏感性和特异性的ROC曲线点；CI(95)：敏感性和特异性估计值的95％置信区间。
表2
相应于本发明的基因代号的多重探针组的证据，它们显示了非新生物组织与新生物对照之间的RNA浓度差异。代号：基因代号；ValidPS_DOWN：显示出相对于新生物对照而言在非新生物RNA提取物中具有统计学意义的显著过表达的Affymetrix探针组ID。Signif.FDR：提取自新生物形成和非新生物组织的RNA之间的平均差异检验的调整的p值。采用用于多重假设检验的Benjamini&Hochberg校正(Benjamini andHochberg，1995)进行调整；D.value50：诊断有效性参数估计值，对应于受试者操作特征ROC的面积。该参数提供了具有诊断用途的方便的估计值(见Saunders，2006)；FC：非新生物形成与新生物形成相比的平均表达水平的改变倍数；Sens-Spec：诊断性能的估计值，对应于显示出相等的敏感性和特异性的ROC曲线点；CI(95)：敏感性和特异性估计值的95％置信区间。
表3
显示出相对于新生物对照而言非新生物组织中的定性(除了定量之外)升高谱的探针组。TargetPS：Affymetrix HG-U133plus2探针组ID；代号：与靶探针组ID相对应的推定的基因代号-多重代号命名表示探针组可能与多个靶基因杂交；Signif.FDR：提取自新生物形成和非新生物组织的RNA之间的平均差异检验的调整的p值。采用用于多重假设检验的Benjamini&Hochberg校正(Benjamini and Hochberg，1995)进行调整；D.value50：诊断有效性参数估计值，对应于受试者操作特征ROC的面积。该参数提供了具有诊断用途的方便的估计值(见Saunders，2006)；FC：非新生物形成与新生物形成相比的平均表达水平的改变倍数；Sens-Spec：诊断性能的估计值，对应于显示出相等的敏感性和特异性的ROC曲线点；CI(95)：敏感性和特异性估计值的95％置信区间。
表4
相应于本发明的基因代号的多重探针组的证据，它们显示了非新生物组织与新生物对照相比其中RNA浓度的定性改变。代号：基因代号；ValidPS DOWN：显示出相对于非新生物对照而言在新生物RNA提取物中具有统计学意义的显著过表达的Affymetrix探针组ID。Signif.FDR：提取自新生物形成和非新生物组织的RNA之间的平均差异检验的调整的p值。采用用于多重假设检验的Benjamini&Hochberg校正(Benjamini andHochberg，1995)进行调整；D.value50：诊断有效性参数估计值，对应于受试者操作特征ROC的面积。该参数提供了具有诊断用途的方便的估计值(见Saunders，2006)；FC：非新生物形成与新生物形成相比的平均表达水平的改变倍数；Sens-Spec：诊断性能的估计值，对应于显示出相等的敏感性和特异性的ROC曲线点；CI(95)：敏感性和特异性估计值的95％置信区间。
本领域人员可以理解，除了具体描述的内容之外，在此公开的本发明容许有其他的变化和修改。应该理解，本发明包括所有此类的变化和修改。本发明还包括本说明书中个别地或共同地提及的或指出的所有的步骤、特征、组合物和化合物，以及任何两个或更多个所述步骤或特征的所有组合。
表1
  TargetPS   代号   Signif.FDR   D.va15   FC   Sens-Spec   CI(95)
  230788_at   SPTLC3：GCNT2   2.16E-27   3.9512   13.36   97.6   94.2-99.2
  207502_at   GUCA2B   7.04E-25   3.6279   51.78   96.5   92.3-98.6
  207003_at   GUCA1B   7.32E-25   3.565   10.7   96.3   92-98.5
  206208_at   CA4   1.73E-24   3.6263   10.41   96.5   92.4-98.6
  206209_s_at   CA4   1.73E-24   3.6265   10.41   96.5   92.3-98.6
  203908_at   LOC727995：SLC4A4：LOC730895   2.23E-23   3.6298   3.58   96.5   92.4-98.6
  206784_at   AQP8   2.98E-22   3.3284   10.82   95.2   90.3-97.9
  205950_s_at   CA1   3.15E-22   3.368   38.27   95.4   90.6-98
  209735_at   ABCG2   1.09E-21   3.2584   31.53   94.8   89.7-97.7
  230830_at   OSTbeta   6.23E-21   3.1861   7.15   94.4   89.2-97.5
  223754_at   MGC13057   6.94E-21   3.2036   3.18   94.5   89.3-97.5
  228195_at   MGC13057   6.94E-21   3.2023   3.18   94.5   89.4-97.5
  228706_s_at   CLDN23   4.27E-20   3.0757   3.47   93.8   88.2-97.1
  228707_at   CLDN23   4.27E-20   3.072   3.47   93.8   88.3-97.1
  223551_at   PKIB   5.94E-20   3.1219   3.28   94.1   88.6-97.3
  231120_x_at   PKIB   5.94E-20   3.1226   3.28   94.1   88.6-97.3
  226492_at   SEMA6D   6.07E-20   3.0898   4.27   93.9   88.4-97.2
  220026_at   CLCA4   1.25E-19   3.1909   16.3   94.5   89.2-97.5
  224836_at   TP53INP2   1.45E-19   3.0248   3.78   93.5   87.9-96.9
  220834_at   MS4A12   2.13E-19   3.29   7.15   95   90-97.8
  224412_s_at   TRM6   2.25E-19   3.01   7.5   93.4   87.7-96.8
  220037_s_at   XLKD1   3.60E-19   2.9412   7.44   92.9   87.1-96.6
  219059_s_at   XLKD1   3.60E-19   2.942   7.44   92.9   87-96.6
  209612_s_at   ADH1B：ADH1A   4.70E-19   3.0183   4.67   93.4   87.7-96.9
  209613_s_at   ADH1B：ADH1A   4.70E-19   3.0147   4.67   93.4   87.7-96.9
  200845_s_at   LOC389249：PRDX6   5.56E-19   2.8412   2.76   92.2   86.1-96.1
  209301_at   CA2   5.87E-19   2.9662   9.22   93.1   87.3-96.7
  208399_s_at   EDN3   6.42E-19   2.9342   11.21   92.9   87-96.5
  228961_at   MIER3   9.14E-19   2.9183   3.91   92.8   86.9-96.5
  231975_s_at   MIER3   9.14E-19   2.9172   3.91   92.8   86.8-96.4
  204719_at   ABCA8   1.26E-18   2.9172   6.82   92.8   86.8-96.5
  207761_s_at   METTL7A   1.35E-18   3.1247   1.93   94.1   88.6-97.3
  207977_s_at   DPT   1.53E-18   2.8967   9.07   92.6   86.6-96.4
  213068_at   DPT   1.53E-18   2.8973   9.07   92.6   86.7-96.4
  213071_at   DPT   1.53E-18   2.8962   9.07   92.6   86.7-96.4
  218756_s_at   MRM1：MGC4172   1.74E-18   2.9041   3.74   92.7   86.6-96.4
  212288_at   FNBP1：Clorf85：CCT3   1.76E-18   3.0475   2.04   93.6   88-97
  204036_at   EDG2   2.44E-18   2.8853   3.19   92.5   86.4-96.3
  202037_s_at   SFRP1   2.77E-18   2.8647   15.53   92.4   86.3-96.2
  206143_at   SLC26A3   4.18E-18   2.9202   21.4   92.8   86.9-96.5
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  201645_at   TNC   0.9905   0.3687   1.09   57.3   47.7-66.6
  214414_x_at   HBA1：HBA2，HBA1：HBA2   0.9979   0.4707   1.21   59.3   49.7-68.3
  204018_x_at   HBA1：HBA2，HBA1：HBA2   0.9979   0.4711   1.21   59.3   49.7-68.3
  209458_x_at   HBA1：HBA2，HBA1：HBA2   0.9979   0.4727   1.21   59.3   49.7-68.4
  211699_x_at   HBA1：HBA2，HBA1：HBA2   0.9979   0.4697   1.21   59.3   49.7-68.3
  211745_x_at   HBA1：HBA2.HBA1：HBA2   0.9979   0.4708   1.21   59.3   49.8-68.3
  217414_x_at   HBA1：HBA2，HBA1：HBA2   0.9979   0.469   1.21   59.3   49.7-68.4
表2
  基因代号   ValidPS_DOWN   Signif.FDR   D.val5   FC   Sens-Spec   CI(95)
  GCNT2   935239-HuGene_st：225205-HuGene_st：1026280-HuGene_st：668101-HuGene_st：1099985-HuGene_st：698568-HuGene_st：134540-HuGene_st：697147-HuGene_st：250092-HuGene_st：611927-HuGene_st：972833-HuGene_st：168891-HuGene_st：990860-HuGene_st：109287-HuGene st：322116-HuGene_st：231019-HuGene_st：211020_at：959570-HuGene_st：858764-HuGene_st：215593_at：820195-HuGene_st：239606_at：41059-HuGene_st：669940-HuGene_st：215595_x_at：230788_at   2.16E-27   3.9513   13.36   97.6   94.2-99.2
  GUCA2B   276512-HuGene_st：1006871-HuGene_st：948364-HuGene_st：46575-HuGene_st：207502_at：436788-HuGene_st：485636-HuGene_st：60132-HuGene_st：608718-HuGene_st：779511-HuGene_st：132431-HuGene_st：974232-HuGene_st：425596-HuGene_st：308287-HuGene_st：800088-HuGene_st：827119-HuGene_st：233789-HuGene_st：623623-HuGene_st   7.04E-25   3.6268   51.78   96.5   92.4-98.6
  GUCA1B   207003at   7.32E-25   3.5625   10.7   96.3   91.9-98.5
  CA4   636392-HuGene_st：206209_s_at：365396-HuGene_st：978203-HuGene_st：987169-HuGene_st：638557-HuGene_st：206208_at：1033858-HuGene_st：597808-HuGene_st：756864-HuGene_st：326439-HuGene_st：356096-HuGene_st：478435-HuGene_st：31642-HuGene_st：682778-HuGene st：1006162-HuGene_st：673533-HuGene_st：491473-HuGene_st：822299-HuGene_st：871453-HuGene_st：209666-HuGene_st：465368-HuGene_st：354896-HuGene_st   1.73E-24   3.6291   10.41   96.5   92.4-98.7
  SLC4A4   810103-HuGene_st：634869-HuGene_st：210739_x_at：211494_s_at：268096-HuGene_st：70822-HuGene_st：940785-HuGene_st：484105-HuGene_st：210738_s_at：203908_at：99375-HuGene_st：238833-HuGene_st：149464-HuGene_st：874564-HuGene_st：161948-HuGene_st：501640-HuGene_st：65687-HuGene_st：886057-HuGene_st：495376-HuGene_st：247215-HuGene_st：847550-HuGene_st：190252-HuGene_st：244077-HuGene_st：477911-HuGene_st：904959-HuGene_st：218417-HuGene_st：1554027_a_at   2.23E-23   3.6301   3.58   96.5   92.4-98.6
  AQP8   486167-HuGene_st：126752-HuGene_st：93102-HuGene_st：1090469-HuGene_st：980308-HuGene_st：107169-HuGene_st：829020-HuGene_st：1053234-HuGene_st：954102-HuGene_st：40331-HuGene_st：206784at：990703-HuGene_st：459706-HuGene_st：863327-HuGene_st：965233-HuGene_st：459009-HuGene_st：180228-HuGene_st：944315-HuGene_st：814773-HuGene_st：810460-HuGene_st：228837-HuGene_st   2.98E-22   3.3311   10.82   95.2   90.3-97.9
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  LUM   NA   0.3157   0.5442   1.54   60.7   51.1-69.7
  C1QB   NA   0.3668   0.5005   1.24   59.9   50.4-69
  TGFB1I1   NA   0.4093   0.4951   1.35   59.8   50.1-68.8
  ALDH1A1   NA   0.4232   0.354   1.4   57   47.4-66.2
  LRIG1   NA   0.4614   0.5998   1.26   61.8   52.2-70.7
  C8orf4   NA   0.475   0.483   1.44   59.5   49.9-68.5
  EGR1   NA   0.4851   0.5374   1.38   60.6   51-69.6
  LOC652745   NA   0.4864   0.1722   1.09   53.4   43.8-62.8
  IGKV1D-13   NA   0.5177   0.1597   1.1   53.2   43.7-62.5
  COL15A1   NA   0.6601   0.54   1.22   60.6   51-69.6
  IGFBP5   NA   0.7663   0.3504   1.25   57   47.4-66.3
  LGALS1   NA   0.8555   0.4626   1.16   59.1   49.5-68.3
  COL6A3   NA   0.8739   0.4412   1.2   58.7   49.1-67.9
  HLA-DQA1   NA   0.9084   0.5417   1.28   60.7   51.1-69.6
  HLA-DRA   NA   0.9084   0.5391   1.28   60.6   51-69.6
  ST6GALNAC1   NA   0.9452   0.2594   1.15   55.2   45.6-64.5
  HLA-DPA1   NA   0.9664   0.4166   1.39   58.3   48.7-67.4
  IGLV1-44   NA   0.9777   0.2865   1.07   55.7   46.1-64.9
  TNC   NA   0.9905   0.3682   1.09   57.3   47.7-66.5
  HBA1   NA   0.9979   0.47   1.21   59.3   49.6-68.4
  HBA2   NA   0.9979   0.4705   1.21   59.3   49.6-68.3
表3
  TargetPS   代号   Signif.FDR   D.va15   FC   Sens-Spec   CI(95)
  230788_at   SPTLC3：GCNT2   2.1587E-27   3.9562   13.36   97.6   94.2-99.2
  228706_s_at   CLDN23   4.2694E-20   3.0727   3.47   93.8   88.3-97.1
  231120_x_at   PKIB   5.9397E-20   3.1191   3.28   94.1   88.6_97.3
  224412_s_at   TRPM6   2.2514E-19   3.0115   7.5   93.4   87.7-96.8
  220037_s_at   XLKD1   3.5991E-19   2.9405   7.44   92.9   87-96.5
  209613_s_at   ADH1B：ADH1A   4.6957E-19   3.0158   4.67   93.4   87.7-96.9
  204719_at   ABCA8   1.2559E-18   2.9171   6.82   92.8   86.8-96.5
  231773_at   ANGPTL1   1.4172E-17   2.7946   4.64   91.9   85.6-95.9
  225575_at   LIFR   2.4532E-17   2.7797   6.36   91.8   85.5-95.8
  220812_s_at   HHLA2   3.4739E-17   2.6718   10.02   90.9   84.4-95.2
  211549_s_at   HPGD   3.6502E-17   2.8451   3.21   92.3   86.1-96.1
  202920_at   ANK2   2.5934E-16   2.6488   6.76   90.7   84.2-95.1
  231925_at   P2RY1   1.4091E-15   2.5329   3.6   89.7   82.8-94.4
  207080_s_at   PYY   3.5022E-15   2.4783   11.71   89.2   82.2-94
  228885_at   RPL24：LOC731365   1.2312E-14   2.5575   1.63   90   83.1-94.6
  228766_at   CD36   6.2677E-14   2.4687   1.65   89.1   82.1-94
  204931_at   TCF21   2.5147E-13   2.3036   2.34   87.5   80.1-92.8
  205433_at   BCHE   3.1756E-13   2.2538   6.21   87   79.5-92.5
  207980_s_at   CITED2   5.2905E-13   2.2709   1.64   87.2   79.7-92.6
  209170_s_at   GPM6B   4.0429E-12   2.1588   3.59   86   78.1-91.6
  220376_at   LRRC19   6.7548E-12   2.0763   4.51   85   77.1-90.9
  228504_at   无代号   9.1926E-12   2.152   1.61   85.9   78.2-91.6
  228854_at   无代号   9.1926E-12   2.1538   1.61   85.9   78.2-91.6
  235146_at   无代号   9.1926E-12   2.1537   1.61   85.9   78.2-91.6
  221305_s_at   UGT1A10：UGT1A7：UGT1A8：UGT1A1：UGT1A9：UGT1A6：UGT1A5：UGT1A3：UGT1A4   1.0319E-11   2.0677   4.56   84.9   77.1-90.9
  203881_s_at   DMD   5.0063E-11   2.0137   4.74   84.3   76.3-90.4
  206637_at   P2RY14   1.3104E-10   1.9836   2   83.9   75.8-90.1
  214598_at   CLDN8   2.9225E-10   1.8624   12.96   82.4   74.1-88.9
 227529_s_at  AKAP12   7.4077E-09   1.7434   2.83   80.8   72.3-87.5
 219948_x_at  LOC642329：UGT2A3   8.638E-09   1.741   4.89   80.8   72.3-87.6
 222717_at  SDPR   9.6207E-08   1.5993   2.21   78.8   70.1-85.9
 229831_at  CNTN3   1.1953E-07   1.6145   3.93   79   70.3-86.1
 204940_at  PLN   4.1416E-07   1.5439   2.01   78   69.2-85.2
 227827_at  SORBS2   4.2323E-05   1.3016   2.1   74.2   65.1-81.9
 238751_at  SORBS2   4.2323E-05   1.3015   2.1   74.2   65.1-82
 209209_s_at  PLEKHC1   0.0007   1.0304   1.82   69.7   60.3-78
 206664_at  SI   0.0054   0.9301   2.79   67.9   58.4-76.3
表4
  基因代号   ValidPS_DOWN   Signif.FDR   D.val5   FC   Sens-Spec   CI(95)
  ANK2   314086-HuGene_st：282874-HuGene_st：382431-HuGene_st：229308-HuGene_st：779600-HuGene_st：297624-HuGene_st：385943-HuGene_st：730140-HuGene_st：442277-HuGene_st：699309-HuGene_st：182816-HuGene_st：202921_s_at：799860-HuGene_st：868462-HuGene_st：634421-HuGene_st：571536-HuGene_st：1050903-HuGene_st：649509-HuGene_st：239935-HuGene_st：202920_at   2.59E-16   2.6515   6.76   90.8   84.1-95.1
  DMD   945600-HuGene_st：12596-HuGene_st：434657-HuGene_st：676962-HuGene_st：1020969-HuGene_st：170680-HuGene_st：855670-HuGene_st：909848-HuGene_st：134644-HuGene_st：887814-HuGene_st：649184-HuGene_st：110990-HuGene_st：914217-HuGene_st：961622-HuGene_st：514011-HuGene_st：842792-HuGene_st：445483-HuGene_st：208086_s_at：987362-HuGene_st：997308-HuGene_st   5.01E-11   2.0162   4.74   84.3   76.3-90.4
  ABCA8   57305-HuGene_st：111752-HuGene_st：61357-HuGene_st：123451-HuGene_st：740746-HuGene_st：512280-HuGene_st：389185-HuGene_st：427721-HuGene_st：346028-HuGene_st：224566-HuGene_st：149653-HuGene_st：680699-HuGene_st：76772-HuGene_st：742091-HuGene_st：423333-HuGene_st：559944-HuGene_st：341399-HuGene_st：1565780_at：863400-HuGene_st：921748-HuGene_st：623719-HuGene_st：204719_at：123143-HuGene_st：1077391-HuGene_st   1.26E-18   2.9182   6.82   92.8   86.8-96.5
  TCF21   804657-HuGene_st：106365-HuGene_st：710514-HuGene_st：299556-HuGene_st：608149-HuGene_st：242233-HuGene_st：655881-HuGene_st：356773-HuGene_st：788445-HuGene_st：709897-HuGene_st：605488-HuGene_st：652466-HuGene_st：204931_at：830709-HuGene_st：273418-HuGene_st：1004754-HuGene_st：990861-HuGene_st：238739-HuGene_st：836241-HuGene_st：110045-HuGene_st：229529_at：1001969-HuGene_st   2.51E-13   2.3037   2.34   87.5   80.1-92.9
  PLN   204938s_at：418214-HuGene_st：769837-HuGene_st：603329-HuGene_st：1048096-HuGene_st：944510-HuGene_st：430402-HuGene_st：86633-HuGene_st：795093-HuGene_st：377757-HuGene_st：770145-HuGene_st：920628-HuGene_st：594048-HuGene_st：800583-HuGene_st：204939_s_at：556723-HuGene_st：818339-HuGene_st：175524-HuGene_st：498924-HuGene_st：204940_at   4.14E-07   1.5399   2.01   77.9   69.2-85.2
  BCHE   228090-HuGene_st：752051-HuGene_st：800167-HuGene_st：221362-HuGene_st：155900-HuGene_st：717363-HuGene_st：536584-HuGene_st：146780-HuGene_st：302487-HuGene_st：508472-HuGene_st：516293-HuGene_st：968992-HuGene_st：666625-HuGene_st：923158-HuGene_st   3.18E-13   2.2544   6.21   87   79.4-92.5
  P2RY14   528057-HuGene_st：780310-HuGene_st：235178-HuGene_st：352954-HuGene_st：699489-HuGene_st：38001-HuGene_st：637791-HuGene_st：25606-HuGene_st：40647-HuGene_st：896487-HuGene_st：672149-HuGene_st：863820-HuGene_st：352427-HuGene_st：632821-HuGene_st：116148-HuGene_st：561792-HuGene_st：840910-HuGene_st：296420-HuGene_st：974643-HuGene_st：206637_at   1.31E-10   1.9805   2   83.9   75.9-90
  PYY   656845-HuGene_st：816022-HuGene_st：633572-HuGene_st：20355-HuGene_st：240779-HuGene_st：638358-HuGene_st：879780-HuGene_st：207080_s_at：211253_x_at：368591-HuGene_st   3.50E-15   2.4828   11.71   89.3   82.2-94
  CITED2   125201-HuGene_st：410723-HuGene_st：463405-HuGene_st：401168-HuGene_st：1012057-HuGene_st：235057-HuGene_st：361772-HuGene_st：207980_s_at：1091907-HuGene_st：985355-HuGene_st：175990-HuGene_st：227287_at：48433-HuGene_st：209357_at：477746-HuGene_st：243264-HuGene_st：904401-HuGene_st：328536-HuGene_st：1095110-HuGene_st：89784-HuGene_st：206734-HuGene_st：927615-HuGene_st   5.29E-13   2.269   1.64   87.2   79.7-92.6
  GPM6B   599862-HuGene_st：754598-HuGene_st：503642-HuGene_st：224935-HuGene_st：754449-HuGene_st：577489-HuGene_st：1073242-HuGene_st：560873-HuGene_st：1003662-HuGene_st：430217-HuGene_st：903323-HuGene_st：231962-HuGene_st：244945-HuGene_st：562460-HuGene_st：583561-HuGene_st：209168_at   4.04E-12   2.1547   3.59   85.9   78.2-91.7
  PLEKHC1   831786-HuGene_st：88016-HuGene_st：1087035-HuGene_st：530331-HuGene_st：209209_s_at：184398-HuGene_st：904923-HuGene_st：193550-HuGene_st：468805-HuGene_st：104495-HuGene_st：604317-HuGene_st：501652-HuGene_st：118096-HuGene_st：321532-HuGene_st：675257-HuGene_st：79496-HuGene_st：590867-HuGene_st：147248-HuGene_st：627402-HuGene_st：377514-HuGene_st   7.00E-04   1.0307   1.82   69.7   60.4-78
  ADH1B   1078343-HuGene_st：512808-HuGene_st：614446-HuGene_st：910188-HuGene_st：422504-HuGene_st：731361-HuGene_st：209612_s_at：258079-HuGene_st：568239-HuGene_st：879930-HuGene_st：420417-HuGene_st：1025048-HuGene_st：908335-HuGene_st：654633-HuGene_st：947292-HuGene_st：1087125-HuGene_st：1004870-HuGene_st：209613_s_at：579636-HuGene_st：681018-HuGene_st：822774-HuGene_st   4.70E-19   3.0174   4.67   93.4   87.7-96.9
  XLKD1   520080-HuGene_ st：1091117-HuGene_st：943125-HuGene_st：444068-HuGene_st：648558-HuGene_st：346991-HuGene_st：1006205-HuGene_st：373107-HuGene_st：682535-HuGene_st：1083245-HuGene_st：863143-HuGene_st：820120-HuGene_st：1044561-HuGene_st：220037_s_at：541228-HuGene_st：220256-HuGene_st：289122-HuGene_st：219059_s_at：246683-HuGene_st：775976-HuGene_st：207399-HuGene_st：1052557-HuGene_st：92121-HuGene_st   3.60E-19   2.9461   7.44   93   87.1-96.6
  LRRC19   177641-HuGene_st：1070020-HuGene_st：1055140-HuGene_st：525999-HuGene_st：937256-HuGene_st：620791-HuGene_st：891251-HuGene_st：707559-HuGene_st：892056-HuGene_st：764919-HuGene_st：382143-HuGene_st：52584-HuGene_st：920414-HuGene_st：1028155-HuGene_st：755055-HuGene_st：678651-HuGene_st：1080156-HuGene_st：530282-HuGene_st：523877-HuGene_st：335198-HuGene_st：787709-HuGene_st：153175-HuGene_st：220376_at   6.75E-12   2.0779   4.51   85.1   77.1-91
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表5
  基因   正常血   MRC5   CaCo2   HCT116   HT29   SW480
  CXCL12   非甲基化   低甲基化   非甲基化   甲基化   甲基化   非甲基化
  DF   低甲基化   甲基化   甲基化   甲基化   非甲基化   甲基化
  MAMDC2   非甲基化   非甲基化   甲基化   非甲基化   非甲基化   甲基化
  CA4   非甲基化   非甲基化   甲基化   甲基化   甲基化   非甲基化
  MT1M   低甲基化   低甲基化   低甲基化   甲基化   低甲基化   甲基化
  P2RY14   非甲基化   低甲基化   甲基化   甲基化   非甲基化   甲基化
  GPM6B   低甲基化   低甲基化   低甲基化   甲基化   甲基化   甲基化
  ADAMDEC1   低甲基化   非甲基化   甲基化   甲基化   非甲基化   甲基化
表6
  探针组ID   靶序列
1 200600at   tagtcttggggcaggatgattttggcctcattactttaccacccccacacctggaaagcatatactatattacaaaatgacattttgccaaaattattaatataagaagctttcagtattagtgatgtcatctgtcactataggtcatacaatccattcttaaagtacttgttatttgtttttattattactgtttgtcttctccccagggttcagtccctcaaggggccatcctgtcccaccatgcagtgccccctagcttagagcctccctcaattccccctggccaccaccccccactctgtgcctgaccttgaggagtcttgtgtgcattgctgtgaattagctcacttggtgatatgtcctatattggctaaattgaaacctggaattgtggggcaatctattaatagctgccttaaagtcagtaacttacccttagggaggctgggggaaaaggttagattttgtattcaggggttttttgtgtactttttgggtttttaaaaaattgtttttggaggggtttatgctcaatccatgt
2 200621at   gatagcctcccactaggactgggaggagaataacccaggtcttaaggaccccaaagtcaggatgttgtttgatcttctcaaacatctagttccctgcttgatgggaggatcctaatgaaatacctgaaacatatattggcatttatcaatggctcaaatcttcatttatctctggccttaaccctggctcctgaggctgcggccagcagagcccaggccagggctctgttcttgccacacctgcttgatcctcagatgtggagggaggtaggcactgcctcagtcttcatccaaacacctttccctttgccctgagacctcagaatcttccctttaacccaagaccctgcctcttccactccacccttctccagggacccttagatcacatcactccacccctgccaggccccaggttaggaatagtggtgggaggaaggggaaagggctgggcctcaccgctcccagcaactgaaaggacaacactatctggagccacccactgaaagggctgcaggcatgggctgtac
3 200665sat   gttggttcaaacttttgggagcacggactgtcagttctctgggaagtggtcagcgcatcctgcagggcttctcctcctctgtcttttggagaaccagggctcttctcaggggctctagggactgccaggctgtttcagccaggaaggccaaaatcaagagtgagatgtagaaagttgtaaaatagaaaaagtggagttggtgaatcggttgttctttcctcacatttggatgattgtcataaggtttttagcatgttcctccttttcttcaccctcccctttgttcttctattaatcaagagaaacttcaaagttaatgggatggtcggatctcacaggctgagaactcgttcacctccaagcatttcatgaaaaagctgcttcttattaatcatacaaactctcaccatgatgtg
4 200795at   aacactgcataacccgtttctttgaggagtgtgaccccaacaaggataagcacatcaccctgaaggagtggggccactgctttggaattaaagaagaggacatagatgaaaatctcttgttttgaacgaagattttaaagaactcaactttccagcatcctcctctgttctaaccacttcagaaatatatgcagctgtgatacttgtagatttatatttagcaaaatgttagcatgtatgacaagacaatgagagtaattgcttgacaacaacctatgcaccaggtatttaacattaactttggaaacaaaaatgtacaattaagtaaagtcaacatatgcaaaatactgtacattgtgaacagaagtttaattcatagtaatttcactctctgcattgacttatgagataattaatgattaaactattaatgataaaaataatgcatttgtattgttcataatatcatgtgcacttcaagaaaatggaatgctactcttttgtggtttac
  5   200799at   ggccgacaagaagaaggtgctggacaagtgtcaagaggtcatctcgtggctggacgccaacaccttggccgagaaggacgagtttgagcacaagaggaaggagctggagcaggtgtgtaaccccatcatcagcggactgtaccagggtgccggtggtcccgggcctgggggcttcggggctc
 agggtcccaagggagggtctgggtcaggccccaccattgaggaggtagattaggggcctttccaagattgctgtttttgttttggagcttcaagactttgcatttcctagtatttctgtttgtcagttctcaatttcctgtgtttgcaatgttgaaattttttggtgaagtactgaacttgctttttttccggtttctacatgcagagatgaatttatactgccatcttacgactatttcttctttttaatacacttaactcaggccatttttt
6 200845_s_at  tcctgtcacccattttgaagagtggcagaacttgaagttcaacttcctctgtaaatatccaagtataaagcccaggaacttctagaataacccagatgcgctttaattttttttaatatgttttgatcacagaacttctagaataacccagatgctctttcatattcttttaatacatcttgatcacagctgggggaaaaaaagctttttaattctgtaccttcctagtagataagtgaagagcagggaaagagacctttaaatattttgctataaaaaaatttgtgataagtttctatcaaaatggggagattgcagaaaaggcttcccttggctcccaaggaggtgtagcaggtgtgagcaatattagtgccatgtgcctttcacacagggtttgcatttatcagtctgttttccgatgatgtgtacatgaaagagtacaccatgtgaagagaagagagaatgattgaaaatgttttagtatagaactcttcttgcagtgggttgctattttctagatttta
7 200859_x_at  gtttgtagactctctgaccaaggccacctgtgccccccagcatggggccccgggtcctgggcctgctgacgccagcaaggtggtggccaagggcctggggctgagcaaggcctacgtaggccagaagagcagcttcacagtagactgcagcaaagcaggcaacaacatgctgctggtgggggttcatggcccaaggaccccctgcgaggagatcctggtgaagcacgtgggcagccggctctacagcgtgtcctacctgctcaaggacaagggggagtacacactggtggtcaaatgggggcacgagcacatcccaggcagcccctaccgcgttgtggtgccctgagtctggggcccgtgccagccggcagcccccaagcctgccccgctacccaagcagccccgccctcttcccctcaaccccggcccaggccgccctggccgcccgcctgtcactgcagctgcccctgccctgtgccgtgctgcgctcacctgcctccccagccagccgctgacctctcggctttcacttgggcagagggagccatttggtggcgctgct
8 200884_at  cctcacccagattgaaactctcttcaagtctaaggactatgagttcatgtggaaccctcacctgggctacatcctcacctgcccatccaacctgggcaccgggctgcgggcaggtgtcgatatcaagctgcccaacctgggcaagcatgagaagttctcggaggtgcttaagcggctgcgacttcagaagcgaggcacaggcggtgtggacacggctgcggtgggcggggtcttcgacgtctccaacgctgaccgcctgggcttctcagaggtggagctggtgcagatggtggtggacggagtgaagctgctcatcgagatggaacagcggctggagcagggccaggccatcgacgacctcatgcctgcccagaaatgaagcccggcccacacccgacaccagccctgctgcttcctaacttattgcctgcagtgcccaccatgcacccctcgatgttgccgtctggcgagcccttagccttgctgtaaggaaggcttccgtcacccttggtagagtttat
9 200897_s_at  ctctcttagctcagttactcaattcatacgtagtattttttaaaataattttatatctgtgtaccaccccatatatttcatattactgtttcacatgtacagctttctacttctttgtaagaacaccaaccaaccaaggtttaagtgattaataggcttgagcaccgggtggcagatgttctatgcagtgtggttcaagtttctttgaccgcacttatatgcattgctaatatggaatttaagataccatacacagtctctcatggacctatctctattgtagaattatgacttatgtcttacttggcaaatttttctgaatgtgacctttttttggctgatttgctgggtttgggattaactagcattattttgccacctt
10 200974_at  aagagttacgagttgcctgatgggcaagtgatcaccatcggaaatgaacgtttccgctgcccagagaccctgttccagccatccttcatcgggatggagtctgctggcatccatgaaaccacctacaacagcatcatgaagtgtgatattgacatcaggaaggacctctatgctaacaatgtcctatcagggggcaccactatgtaccctggcattgccgaccgaatgcagaaggagatcacggccctagcacccagcaccatgaagatcaagatcattgcccctccggagcgcaaatactctgtctggatcggtggctccatcctggcctctctgtccaccttccagcagatgtggatcagcaaacaggaatacgatgaagccgggccttccattgtccaccgcaaatgcttctaaaacactttcctgctcctctctgtctctagcacacaactgtgaatgtcctgtggaattatgccttcagttcttttccaaatcattcctagccaaagctctgactcggt
11 200986_at  gacgaccagccaggatatgctctcaatcatggagaaattggaattcttcgatttttcttatgaccttaacctgtgtgggctgacagaggacccagatcttcaggtttctgcgatgcagcaccagacagtgctggaactgacagagactggggtggaggcggctgcagcctccgccatctctgtggcccgcaccctgctggtctttgaagtgcagcagcccttcctcttcggtgctctgggaccagcagcacaagttccctgtcttcatggggcgagtatatgaccccagggcctgagacctgcaggatcaggttagggcgagcgctacctctccagcctcagctctcagttgcagccctgctgctgcctgcctggacttgcccctgccacctcctgcctcaggtgtccgctatccaccaaaagggctcctgagggtctgggcaagggacctgcttctattagcccttctccatggccctgccatgctctccaaaccactttttgcagctttctc
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13 201058_s_at  gcatcctcaaacatggcgccaaggataaacacgactaggccatccccagccccctgacacccagcccccgccagtcacccctccccgcacacacccgtccataccagctccctgcccatgaccctcggctcagggatccccctttgagggttagggtcccagttcccagtggaagaaacaggccaggagagtgcgtgccgagctgaggcagatgttcccacagtgaccccagagccctgggctatagtctctgacccctccaaggaaagaccaccttctggggacatgggctggagggcaggacctagaggcaccaagggaacccgcattccggggctgttccccgaggaggaagggaagcctccgtgtgccccccaggaggaagaggccctgagtcctgggatcagacaccccttcacgtgtatcccacacaaatgcaagctcaccaaggtccc
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  636   223970_at   ggagctcagagatctaagctgctttccatcttttctcccagccccaggacactgactctgtacaggatggggccgtcctcttgcctccttctcatcctaatcccccttctccagctgatcaacccggggagtactcagtgttccttagactccgttatggataagaagatcaaggatgttctcaacagtctagagtacagtccctctcctataagcaagaagctctcgtgtgctagtgtcaaaagccaaggcagaccgtcctcctgccctgctgggatggctgtcactggctgtgcttgtggctatggctgtggttcgtgggatgttcagctggaaaccacctgccactgccagtgcagtgtggtggactggaccactgcccgctgctgccacctgacctgacagggaggaggctgagaactcagttttgtgaccatgacagtaatgaaaccagggtcccaaccaagaaatctaactcaaa
 cgtcccact
  637   224724_at  gcctgagaaagcaagcacgcactctcagtcaacatgacagattctggaggataaccagcaggagcagagataacttcaggaagtccatttttgcccctgcttttgctttggattatacctcaccagctgcacaaaatgcattttttcgtatcaaaaagtcaccactaaccctcccccagaagctcacaaaggaaaacggagagagcgagcgagagagatttccttggaaatttctcccaagggcgaaagtcattggaatttttaaatcataggggaaaagcagtcctgttctaaatcctcttattcttttggtttgtcacaaagaaggaactaagaagcaggacagaggcaacgtggagaggctgaaaacagtgcagagacgtttgacaatgagtcagtagcacaaaagagatgacatttacctagcactataaaccctggttgcctctgaagaaactgccttcattgtatatatgtgactatttacatgtaatcaacatgggaacttttaggggaacctaataagaaatcccaattttcaggagtggtggtgtcaataaacgctctgtggccagtg
  638   225664_at  ggaacccagagctgctgtgtatttcgagcgggcagtttatcttttgctatacttattttcaattcaattacaccacgattcaaataattcccctcctaaaaccaaaaaggagggaaacgtcaactccattgcaattacttatcttcctcttctatctctgttatacgccggggcatagaatgctcgtatacatctctttaacaaccacaaaccttaagccatgtagatgaagttagtgcatcaacgggatacagttccatattgccttaaacctccttgttttagacacactaacatttataccaaattgcagattattctgcagagagggaattgcatgtttgtgttgta
  639   225681_at  aattaatattcatcgcacttcttctgtggaaggactttgtgaaggaattggtgctggattagtggatgttgctatctgggttggcacttgttcagattacccaaaaggagatgcttctactggatggaattcagtttctcgcatcattattgaagaactaccaaaataaatgctttaattttcatttgctacctctttttttattatgccttggaatggttcacttaaatgacattttaaataagtttatgtatacatctgaatgaaaagcaaagctaaatatgtttacagaccaaagtgtgatttcacactgtttttaaatctagcattattcattttgcttcaatcaaaagtggtttcaatattttttttagttggttagaatactttcttcatagtcacattctctcaacctataatttggaatattgttgtggtcttttgttttttctcttagtatagcatttttaaaaaaatataaaagctaccaatctttgtacaatttg
  640   225799_at  aaatgactggatggtcgctgctttttaagtttcaaattgacattccagacaagcggtgcctgagcccgtgcctgtcttcagatcttcacagcacagttcctgggaaggtggagccaccagcctctccntgaataactgggagatgaaacaggaagctctatgacacacttgatcgaatatgacagacacngaaaatcacgactcanccccctccagcacctctacctgttgcccgccgatcacagccggaatgcagctgaaagattccctggggcctggttccaaccgcccactgtggactctgaggcctctgcatttgcgggtggtctgcctgtgatattttggtcatgggctggtctg
  641   226237_at  gaagaggagcaacatctatgccaaatactgtgcattctacaatggtgctaatctcagacctaaatgatactccatttaatttaaaaaagagttttaaataattatctatgtgcctgtatttcccttttgagtgctgcacaacatgttaacatattagtgtaaaagcagatgaaacaaccacgtgttctaaagtctagggattgtgctataatccctatttagttcaaaattaaccagaattcttccatgtgaaatggaccaaactcatattattgttatgtaaatacagagttttaatgcagtatgacatcccacaggggaaaagaatgtctgtagtgggtgactgttatcaaatattttatagaatacaatgaacggtgaacagactggtaacttgtttgagttcccatgacagatttgagacttg
  642   226248_s_at  tgaaagtgggcatctctgcaggcacctgtactgccatcctgctcaccgtcttgacctgctacttttggaaaaagaatcaaaanctagagtacangtactccangctggtgatgaatgctactctcaaggactgnnnnntnncngnngctgacagctgcgccatcatggnanncnnnnangnanngnnnnnnnncancnnnnnncanntgcgccatcatggaaggcgaggatgtagaggacgacctcatctttaccagcaagaagtcactctttgggaagatcaaatcatttacctccaagaggactcctgatggatttgactcagtgccgctgaagacatcctcaggaggcccagacatggacctgtgagaggcactgcctgcctcacctgcctcctcaccttgcatagcacctttgcaagcctgcggcgatttgggtgccagcatcctgcaacacccactgctggaaatctcttcattgtggccttatcagatgtttgaatttcagatctttttttatagagtacccaaaccctcctttctgcttgcctcaaacctgccaaatatacccacac
  643   226311_at  aaacgacgcaaatctctgagctggggaccacttggagaaccggcttagtaacagtcctgatcttcgcaagccagcttcttctgcatctgaggggctcctggcgcccagaggaggcagacagatgtcttctagctgagtttctaaccgcatgatgagactcagaccttccgctgcactagaaaatctgcaacagtgtccctgagtcacttctccttagtgggcagactcgtgttagatttgtggaacccagctctctgatttactccttttggaaaacccatggaatttcatgtataaggctttcatttgtattttaaggtttttctgtttgttttgagtatatacatggtgctcaatagcaacatcttagcagatgaagcagtttatgattccactccctcctgtatgacaggtagccactatactgaatcaaggtgctgaactcaaatcacaaaattctggcttaccggatacaacaaccaatac
  644   226777_at  tataaggtaactctttagtcctccatttagcacattttaaatcctccaaagaataagtatcatgtgattattttagctttacaaaaaaaaagttgaatggcgttttattttcatggcctataagcaggtaccttagtagggcagatataggaaaaacaaattagagcaaaacaaatcctctacaaatccaaggcaggaaaagtggtggcagagtgactcattctcctgtccctcccatcaggtcaaatcaggaggctgcagtgaatgcctgttctttgaatgtgtagcagttgttncctgtaactctttaaaacttggctataggctgtttagcacagtacagattaaagatacagttacgtaaacagcaaagtaattttatagtgcttcatccatttatcatgctttggtttgctaattttttcacatacctttttctatcacagtctgttgcttttgtacacatttctcatattggggttcgaca
  645   226930_at  ggtgccaggaaggtcacagatggacactggccattctggtcatctcagtctggaactcagtcccacttcttggcctggacaatgaacaggattcagttttgctgttaactttgcttctctacttttttttgtttgtttgtaatagcacatcccagagacatcagaaaccagcaactgattcagtgtgatttccagactttttaggcatgaaattcggacacttcagtatttccaggaatagcatatgcacgctgttcttgcttcatggaatgctacatgctttctgtttttctcattttggatttctccaaaactaactgaatttaagcttcaggtccctttgtatgcagtagaaaggaattattaaaaacaccaccaaagaaaataaatatatcctacttgaaatttactctatggacttacccactgctagaataaatgtatcaaatcttatttgtaaattctcaattttgatatatatatgtatatatgcatatacatatccacacttgtctgcaag
  646   227140_at  ttaccctctatttaaatgctttgaaaaacagtgcattgacaatgggttgatatttttctttaaaagaaaaatataattatgaaagccaagataatctgaagcctgttttattttaaaactttttatgttctgtggttgatgttgtttgtttgtttgtttctattttgttggttttttactttgttttttgttttgttttgttttgttttgcatactacatgcagttctttaaccaatgtctgtttggctaatgtaattaaagttgttaatttatatgagtgcatttcaactatgtcaatggtttcttaatatttattgtgtagaagtactggtaatttttttatttacaatatgtttaaagagataacagtttgatatgttttcatgtgtttatagcagaagttatttatttctatggcattccagcggatattttggtgtttgcgaggcatgcagtcaatattttgtacagttagtggacagtattcagcaacgcctgatagcttctttggcctt
  647   227566_at  ccacacaccaggcactaatcacctggtgaggatttggcatatccaccaaaaaatgcatccgatttaaccaacatctccaccagcgctacggactcctcccaattctgacatctcttgcagacaatactatgctctctacacactgtttagaaatggaaaggtgatctgcactgtatcttgggtttgttggctatgcttcctttgatgacatatattatacagtatatatatacatatattttttttgttagagttctagccattttatttctccgcagggtcctttctcagacattactgcatgctgtatatggcgttagctgcgcgttgatcttctaaaagatgatagagtttactggtaattgtgtaatcagctcctgcctttttatt
  648   227676_at  caggaaactcttctccgacttggggagttcctacgcganacaactgggcttccgggacagctgggtcttcataggagccaaagacctcaggggtaaaagcccctttgagcagttcttaaagaacagcccagacacaaacaaatacgagggatggccagagctgctggagatggagggctgcatgcccccgaagccattttagggtggctgcggctcttcctcagccaggggcctgaagaagctcctgcctgacttaggagtcagagcccggcaggggctgaggaggaggagcagggggtgctgcgtggaaggtgctgcaggtccttgcacgctgtgtcgcgcctctcctcctcggaaacagaaccctccca
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  649   227719_at cacttgatagactgtaagcacctgcttaactttgtgtcccaaatatttagtgtgtatatatatatatatatanncncacacacacacatatatattcaacaaataaagcaaaatataacatgcatttcacattttgtctttccctgttacgattttaatagcagaactgtatgacaagtttaggtgatcctagcatatgttaaattcaaattaatgtaaaacagattaacaacaacaaagaaactgtctatttgagtgaagtcatgctttctattataataacttggcttcggttatccatcaaatgcacacttatactgttatctgattg
  650   229218_at gccaaaaggcctggcttctgataggaaactggtaagaaactcttcatgaaaacacatcactaatattcgctattactctcctggtctgaagtcagcttttctgaaccattaaggtatttcatcacaagttatattttataatatcagtttaagaggcttttattcatgtgaacaccagnnccctttcaggggcatggtctttttgaaaaaaaaaaaanaaaaaaannaacagttttagccacatatcagatatttctatatctaattatcctttatggctaacattctgcctccattgttaaggtataattgttcctgaatttaaaggtggtttggcctctaatttaattctgattcagactctcctgtcaggactcaagaaaatttaattaattaccaaggattaagtcttctggttaaggtttctgggaaaaaaaaatagcaaagatgttgatttcttggaatccttttacaggttcataacagaaaaatcttcattccctgtaggcatttaattaaacctagttgagaagtgtgtgggattcctcaattatgaacaaaacacgtatattggctttcttt
  651   229802_at gacatgattgtctataatctcgctagccttgtactgtgtgtgcatagcaattacagggaagtaatctagctcctgactattatgttgaactatgtcgctgctttttacaaacttgtcttgatccaaagcagtcacaatgataaccctgcatatctgggaatcataagtcaactatgtatctctgtgtgtgtatatatatgtatgtatgtatctattttcaaactgtgatttaatatttaaatattcctactgccatttttgtgactgaaaaactacacatgaggaaacgtcttagaattttccaatagaggaaaaataacacttgggcaatctgtcatgtttcacaacagttctcatttttctcatgatttgtgtagcgtggaatgtgtttgctcaatgtgaagggttttcattgctcaatttctctgtgtaa
  652   231766_s_at ggttccggctaacacattttctaagtcgccagtgctgcttacagtttgaatacatgaaaatcctgtttctnagatgtttgcgcacgtgcttattaggaaatgagtctgtatggaaatctcaccacagataatggttaacgaaccgggtcgacatcacaaaggagggtggagactctttttactaacttgaatgagacaaaagcagtggtgtcagtttataatcctgatgcatttcagtaataatgtagaaaaacattattttaaaaaagttccaacacacagccatgaggagccnnnnnnnnnntcagttttgaaagaggtgcataataaaactactaaccagaggagtctatgccatttt
  653   231832_at gagtttcaactttaaatgttcactatgtcatttagtgtccanctttacggataggttgactatctaaataggcatttttagtcattaaaaaaaantctagtcaccaggaggatccctataactcaaaataacttgtttgtaaaagaaaatttgtttacttacccattagtaagttcctgcatattcattataagatggcaaatcaaacttttctaggatgaagacagcttatttttaagttgtatagtcttagttggtttagggtctcaattttaattaataaaatacttggtttttatttgcttgtccttttgaattcctgttttaataattttaaaatgagcacaaagaangttgaagttcagattaatctcttctgaatgatgtttttttcctctgtgatgagttgtttctg
  654   231879_at tgctgtagtcactggtgttcctcacccaccagctgtaactcagtttgtgtgaggtacagccacagaagatgtcatgtactgtatattacctggtgatagttgcttttcaccccccgagttcagtttctaggagccaatgaaacttcccctcacctcctcatctttccaagttgttctttgaattgaggagtttgaaggcataaacagttacttggggatttgcgaaaatcctacttagttactgcgtttacagttctttggcccagtctctgacccttcccnagtatttgtgcnatgattgtgtttactgctggatttttgaaggttttttttttnnaagaaagtgccatttcattatttgatt
  655   232176_at gggatcactgggagaagccatggcattatcttcaggcaatttagtctgtcccaaataaaataaatccttgcatgtaaatcattcaagggttatagtaatatttcatatactgaaaagtgtctcataggagtcctcttgcacatctaaaaaggctgaacatttaagtatcccgaattttcttgaattgctttccctatagattaattacaattggatttcatcatttaaaaaccatacttgtatatgtagttataatatgtaaggaatacattgtttataaccagtatgtacttcaaaaatgtgtattgtcaaacatacctaactttcttgcaataaatgcaaaagaaactggaacttgacaattataaatagtaatagtgaagaaaaaatagaaaggttgcaattatataggccatgggtggctcaaaactttgaa
  656   232458_at gattcctggattgatgtcttatctacaggcttctttttaaaaatnnnnnnngattggctgtgagtttaccaggattatagttgaggctaaaggacagctcctcaggaaagcccctgttctacatctacggtcacatgctggaccttgagttgtcactcagagaaaagagtgccatctaccgaaactccacagtttccattgtgaatggcttctttggtgcagagttccaaaaattatgtagcccagctctttaattttgtaacatctaatgatatcaccgccttgaagtgattaaagtagattgcttaaagaattaaagctttaaagatgaaagatgttattgcttttgctggacatgaggaacagttgtaaagtttccaggtctacaataactttctgganccctctcagtgaactgtttcttgta
  657   232481_s_at gaagtccatcctttggtccaaagcatctggaagaggaagaagagaggaatgagaaagaaggaagtgatgcaaaacatctccaaagaagtcttttggaacaggaaaatcattcaccactcacagggtcaaatatgaaatacaaaaccacgaaccaatcaacagaatttttatccttccaagatgccagctcattgtacagaaacattttagaaaaagaaagggaacttcagcaactgggaatcacagaatacctaaggaaaaacattgctcagctccagcctgatatggaggcacattatcctggagcccacgaagagctgaagttaatggaaacattaatgtactcacgtccaaggaaggtattagtggaacagacaaaaaatgagtattttgaacttaaagctaatttacatgctgaacctgactatttagaagtcctggagcagcaaacatagatggagagtttgagggctttcgcagaaatgctgtgattctgttttaagtccataccttgtaaataagtgccttacgtgagtgtgtcatcaatcagaacctaagc
  658   233555_s_at gctgctcaagcgcctgcagaacaacgacacgtgcagcatgccaggcctcacgtgcttcacccacgacaaccagcactggcagacggcgcctttctggacactggggcctttctgtgcctgcaccagcgccaacaataacacgtactggtgcatgaggaccatcaatgagactcacaatttcctcttctgtgaatttgcaactggcttcctagagtactttgatctcaacacagacccctaccagctgatgaatgcagtgaacacactggacagggatgtcctcaaccagctacacgtacagctcatggagctgaggagctgcaagggttacaagcagtgtaacccccggactcgaaacatggacctgg
  659   234994_at acaatcggctaaccttgacatttctttttaccttcatatgccactatctcggtagttcaaaaaaatttagttcttgataaattgccttgaagtttaccttgtgctggagagccttatgataactccaaagactttcttacggtataatacatgttgtttaggattgtgtttcttagtcactgaagataataaatattaaaatggatgttttcatcagaaaattttcatgttttcctttaaggtaacataattgtaagaattgtttaataaaatactcaggaaattctaaaggtttctccnaatacctaaacatttctgaacatcagtattgcagttgtggaagagcagaaggaggatacatttgtttgtgttgctccccaaaattccaccttgcatttgcatcacaaacttccctcaattgaggcagttttctttg
  660   235976_at cagtgctgctgtgaactaaagtatgtcatttatgctcaaagtttaattcttcttcttgggatattttaaaaatgctactgagattctgctgtaaatatgactagagaatatattgggtttgctttatttcataggcttaattctttgtaaatctgaatgaccataatagaaatacatttcttgtggcaagtaattcacagttgtaaagtaaataggaaaaattattttatttttattgatgtacattgatagatgccataaatcagtagcaaaaggcacttctaaaggtaagtggtttaagttgcctcaanagagggacaatgtagctttattttacaagaaggcatagttagatttctatgaaatatttattctgtacagttttatatanttttggttcacaaaagtaattattcttgggtgcctttcaa
  661   236894_at aaagtatattgtgctagcttgtctaagaataaacttnnatactgttgggggagggctgcacctgtcaagataacctgtcaatgtagtaggaaaacaggaggggacagtaacagaaaagcacgggaaaagatggcaaggttagttaaaatagaaaagtgctcagttcctcatacctgtaatcccagca
gtttagggggccaaggaaggtgggtcacttgagcccaagagttcaaggccatcctgggcaatgtggcgaaagtgtctacaaaaaaatacaaaaagaggaagaaatgatatttcacaagtttgtatcatttgtcat
  662   237521_x_at cagtccaaaatccatagacacagacagtagaaaggtggttatncaagggnctggtaggagagggagttagtatttagtggtatagagttttagtgtttnccgggtaaaaatgttnctagagatctgttgcaaccatgtgaatatacttaacactaccgtactgtacactgaaaaaatggttaagaggataaatttaaatggttaagaggaaaaatggttaagaggataatgttgttttgttaccacagtagtaacttttaaaaaccctcatgtatgttcttt
  663   37892_at caacccattttgtgccacatgcaagttttgaataaggatggtatagaaaacaacgctgcatatacaggtaccatttaggnannancngatgcctttntgggggcagaatcacatggcaaaagctttgaaaatcataaagatataagttggtgtggctaagatggaaacagggctgattcttgattcccaattctcaactctccttttcctatttgaatttctttggtgctgtagaaaacaaaaaaagaaaaatatatattcataaaaaatatggtgctcattctcatccatccaggatgtactaaaacagtgtgtttaataaattgtaattattttgtgtacagttctatactgttatctgtgtccatttccaaaacttgcacgtgtccctgaattcc
表7：MSP引物和PCR条件
  基因   探针组  基因名称   正向引物5’-3’   反向引物5’-3’   退火温度
  CA4   206208_at  碳酸酐酶IV   TCGTTTTTCGCGTTTAGTTGTC(SEQ IDNO：664)   GCGCACCGAAAAAACCG(SEQ ID NO：665)   61.0℃
  CXCL12   209687_at  趋化因子，CXC基序，配体12   CGGTTACGGTTAGTATTCGGTTTC(SEQ IDNO：666)   AAAATACGACGATAAAAAACGCG(SEQID NO：667)   64.0℃
  DF   205382_s_at  补体因子D   CGAGGGTTTTTTAGCGATTTGTC(SEQ IDNO：668)   AAACGAACCGCTCCCCG(SEQ ID NO：669)   64.0℃
  MAMDC2   228885_at  含MAM结构域蛋白2前体   TTCGGCGTTTTCGTTTTTTAC(SEQ IDNO：670)   CCCCTTAACAACATAATCGCG(SEQ IDNO：671)   60.0℃
  MT1M   217546_at  金属硫蛋白-1M   GATGGTGCGTTCGGTATTTATGT(SEQ IDNO：672)   GCTTACACCCGCCCGACTA(SEQ IDNO：673)   62.0℃
  CAGE  对照无偏扩增测定   GTTTTGTGATTGGTTAGGTTATTAAAGT(SEQ ID NO：674)   CCRTCACCTTCTACACCAAAAAATA(SEQID NO：675)   61.0℃
表8：COBRA引物和PCR条件
  基因   探针组  基因名称   正向引物5’-3’   反向引物5’-3’   退火温度，酶
  ADAMDECI   206134_at  ADAM-样，decysin 1   TGTGGATTTATTTTTATAAGGATATTGAAT(SEQ ID NO：676)   ATAACTCATTAAAAACTCACATCTAAACACTA(SEQ IDNO：677)   61.0℃BstU I
  GPM6B   209170_s_at  神经元膜糖蛋白M6-b   TTAAGAAAGAGAGTAAGGAGGAAGAGTT(SEQ ID NO：678)   AAAATCCCAATTAAAAAACAACCA(SEQID NO：679)   60.0℃Hinf I
  P2RY14   206637_at  嘌呤能受体P2Y，G蛋白偶联，14   CAAAATAATAAATCCCTCTACTACTATTATCAA(SEQ IDNO：680)   GGAGGAAAGGAATTAGTTTAGAAGTTAGTT(SEQ IDNO：681)   60.0℃Acl I
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tagtcttggg gcaggatgat tttggcctca ttactttacc acccccacac ctggaaagca     60
tatactatat tacaaaatga cattttgcca aaattattaa tataagaagc tttcagtatt    120
agtgatgtca tctgtcacta taggtcatac aatccattct taaagtactt gttatttgtt    180
tttattatta ctgtttgtct tctccccagg gttcagtccc tcaaggggcc atcctgtccc    240
accatgcagt gccccctagc ttagagcctc cctcaattcc ccctggccac caccccccac    300
tctgtgcctg accttgagga gtcttgtgtg cattgctgtg aattagctca cttggtgata    360
tgtcctatat tggctaaatt gaaacctgga attgtggggc aatctattaa tagctgcctt    420
aaagtcagta acttaccctt agggaggctg ggggaaaagg ttagattttg tattcagggg    480
ttttttgtgt actttttggg tttttaaaaa attgtttttg gaggggttta tgctcaatcc    540
atgt                                                                 544
 
<210>2
<211>530
<212>DNA
<213>human
<400>2
gatagcctcc cactaggact gggaggagaa taacccaggt cttaaggacc ccaaagtcag     60
gatgttgttt gatcttctca aacatctagt tccctgcttg atgggaggat cctaatgaaa    120
tacctgaaac atatattggc atttatcaat ggctcaaatc ttcatttatc tctggcctta    180
accctggctc ctgaggctgc ggccagcaga gcccaggcca gggctctgtt cttgccacac    240
ctgcttgatc ctcagatgtg gagggaggta ggcactgcct cagtcttcat ccaaacacct    300
ttccctttgc cctgagacct cagaatcttc cctttaaccc aagaccctgc ctcttccact    360
ccacccttct ccagggaccc ttagatcaca tcactccacc cctgccaggc cccaggttag    420
gaatagtggt gggaggaagg ggaaagggct gggcctcacc gctcccagca actgaaagga    480
caacactatc tggagccacc cactgaaagg gctgcaggca tgggctgtac               530
 
<210>3
<211>416
<212>DNA
<213>human
<400>3
gttggttcaa acttttggga gcacggactg tcagttctct gggaagtggt cagcgcatcc     60
tgcagggctt ctcctcctct gtcttttgga gaaccagggc tcttctcagg ggctctaggg    120
actgccaggc tgtttcagcc aggaaggcca aaatcaagag tgagatgtag aaagttgtaa    180
aatagaaaaa gtggagttgg tgaatcggtt gttctttcct cacatttgga tgattgtcat    240
aaggttttta gcatgttcct ccttttcttc accctcccct ttgttcttct attaatcaag    300
agaaacttca aagttaatgg gatggtcgga tctcacaggc tgagaactcg ttcacctcca    360
agcatttcat gaaaaagctg cttcttatta atcatacaaa ctctcaccat gatgtg        416
 
<210>4
<211>511
<212>DNA
<213>human
<400>4
aacactgcat aacccgtttc tttgaggagt gtgaccccaa caaggataag cacatcaccc     60
tgaaggagtg gggccactgc tttggaatta aagaagagga catagatgaa aatctcttgt    120
tttgaacgaa gattttaaag aactcaactt tccagcatcc tcctctgttc taaccacttc    180
agaaatatat gcagctgtga tacttgtaga tttatattta gcaaaatgtt agcatgtatg    240
acaagacaat gagagtaatt gcttgacaac aacctatgca ccaggtattt aacattaact    300
ttggaaacaa aaatgtacaa ttaagtaaag tcaacatatg caaaatactg tacattgtga    360
acagaagttt aattcatagt aatttcactc tctgcattga cttatgagat aattaatgat    420
taaactatta atgataaaaa taatgcattt gtattgttca taatatcatg tgcacttcaa    480
gaaaatggaa tgctactctt ttgtggttta c                                   511
 
<210>5
<211>456
<212>DNA
<213>human
<400>5
ggccgacaag aagaaggtgc tggacaagtg tcaagaggtc atctcgtggc tggacgccaa     60
caccttggcc gagaaggacg agtttgagca caagaggaag gagctggagc aggtgtgtaa    120
ccccatcatc agcggactgt accagggtgc cggtggtccc gggcctgggg gcttcggggc    180
tcagggtccc aagggagggt ctgggtcagg ccccaccatt gaggaggtag attaggggcc    240
tttccaagat tgctgttttt gttttggagc ttcaagactt tgcatttcct agtatttctg    300
tttgtcagtt ctcaatttcc tgtgtttgca atgttgaaat tttttggtga agtactgaac    360
ttgctttttt tccggtttct acatgcagag atgaatttat actgccatct tacgactatt    420
tcttcttttt aatacactta actcaggcca tttttt                              456
 
<210>6
<211>524
<212>DNA
<213>human
<400>6
tcctgtcacc cattttgaag agtggcagaa cttgaagttc aacttcctct gtaaatatcc     60
aagtataaag cccaggaact tctagaataa cccagatgcg ctttaatttt ttttaatatg    120
ttttgatcac agaacttcta gaataaccca gatgctcttt catattcttt taatacatct    180
tgatcacagc tgggggaaaa aaagcttttt aattctgtac cttcctagta gataagtgaa    240
gagcagggaa agagaccttt aaatattttg ctataaaaaa atttgtgata agtttctatc    300
aaaatgggga gattgcagaa aaggcttccc ttggctccca aggaggtgta gcaggtgtga    360
gcaatattag tgccatgtgc ctttcacaca gggtttgcat ttatcagtct gttttccgat    420
gatgtgtaca tgaaagagta caccatgtga agagaagaga gaatgattga aaatgtttta    480
gtatagaact cttcttgcag tgggttgcta ttttctagat ttta                     524
 
<210>7
<211>562
<212>DNA
<213>human
<400>7
gtttgtagac tctctgacca aggccacctg tgccccccag catggggccc cgggtcctgg     60
gcctgctgac gccagcaagg tggtggccaa gggcctgggg ctgagcaagg cctacgtagg    120
ccagaagagc agcttcacag tagactgcag caaagcaggc aacaacatgc tgctggtggg    180
ggttcatggc ccaaggaccc cctgcgagga gatcctggtg aagcacgtgg gcagccggct    240
ctacagcgtg tcctacctgc tcaaggacaa gggggagtac acactggtgg tcaaatgggg    300
gcacgagcac atcccaggca gcccctaccg cgttgtggtg ccctgagtct ggggcccgtg    360
ccagccggca gcccccaagc ctgccccgct acccaagcag ccccgccctc ttcccctcaa    420
ccccggccca ggccgccctg gccgcccgcc tgtcactgca gctgcccctg ccctgtgccg    480
tgctgcgctc acctgcctcc ccagccagcc gctgacctct cggctttcac ttgggcagag    540
ggagccattt ggtggcgctg ct                                             562
 
<210>8
<211>521
<212>DNA
<213>human
<400>8
cctcacccag attgaaactc tcttcaagtc taaggactat gagttcatgt ggaaccctca     60
cctgggctac atcctcacct gcccatccaa cctgggcacc gggctgcggg caggtgtcga    120
tatcaagctg cccaacctgg gcaagcatga gaagttctcg gaggtgctta agcggctgcg    180
acttcagaag cgaggcacag gcggtgtgga cacggctgcg gtgggcgggg tcttcgacgt    240
ctccaacgct gaccgcctgg gcttctcaga ggtggagctg gtgcagatgg tggtggacgg    300
agtgaagctg ctcatcgaga tggaacagcg gctggagcag ggccaggcca tcgacgacct    360
catgcctgcc cagaaatgaa gcccggccca cacccgacac cagccctgct gcttcctaac    420
ttattgcctg cagtgcccac catgcacccc tcgatgttgc cgtctggcga gcccttagcc    480
ttgctgtaag gaaggcttcc gtcacccttg gtagagttta t                        521
 
<210>9
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<212>DNA
<213>human
<400>9
ctctcttagc tcagttactc aattcatacg tagtattttt taaaataatt ttatatctgt     60
gtaccacccc atatatttca tattactgtt tcacatgtac agctttctac ttctttgtaa    120
gaacaccaac caaccaaggt ttaagtgatt aataggcttg agcaccgggt ggcagatgtt    180
ctatgcagtg tggttcaagt ttctttgacc gcacttatat gcattgctaa tatggaattt    240
aagataccat acacagtctc tcatggacct atctctattg tagaattatg acttatgtct    300
tacttggcaa atttttctga atgtgacctt tttttgctga tttgctgggt ttgggattaa    360
ctagcattat tttgccacct t                                              381
 
<210>10
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<212>DNA
<213>human
<400>10
aagagttacg agttgcctga tgggcaagtg atcaccatcg gaaatgaacg tttccgctgc     60
ccagagaccc tgttccagcc atccttcatc gggatggagt ctgctggcat ccatgaaacc    120
acctacaaca gcatcatgaa gtgtgatatt gacatcagga aggacctcta tgctaacaat    180
gtcctatcag ggggcaccac tatgtaccct ggcattgccg accgaatgca gaaggagatc    240
acggccctag cacccagcac catgaagatc aagatcattg cccctccgga gcgcaaatac    300
tctgtctgga tcggtggctc catcctggcc tctctgtcca ccttccagca gatgtggatc    360
agcaaacagg aatacgatga agccgggcct tccattgtcc accgcaaatg cttctaaaac    420
actttcctgc tcctctctgt ctctagcaca caactgtgaa tgtcctgtgg aattatgcct    480
tcagttcttt tccaaatcat tcctagccaa agctctgact cgt                      523
 
<210>11
<211>513
<212>DNA
<213>human
<400>11
gacgaccagc caggatatgc tctcaatcat ggagaaattg gaattcttcg atttttctta     60
tgaccttaac ctgtgtgggc tgacagagga cccagatctt caggtttctg cgatgcagca    120
ccagacagtg ctggaactga cagagactgg ggtggaggcg gctgcagcct ccgccatctc    180
tgtggcccgc accctgctgg tctttgaagt gcagcagccc ttcctcttcg tgctctggga    240
ccagcagcac aagttccctg tcttcatggg gcgagtatat gaccccaggg cctgagacct    300
gcaggatcag gttagggcga gcgctacctc tccagcctca gctctcagtt gcagccctgc    360
tgctgcctgc ctggacttgc ccctgccacc tcctgcctca ggtgtccgct atccaccaaa    420
agggctcctg agggtctggg caagggacct gcttctatta gcccttctcc atggccctgc    480
catgctctcc aaaccacttt ttgcagcttt ctc                                 513
<210>12
<211>360
<212>DNA
<213>human
<400>12
gcaataactc tgggaggggc tcgagagggc tggtccttat ttatttaact tcacccgagt     60
tcctctgggt ttctaagcag ttatggtgat gacttagcgt caagacattt gctgaactca    120
gcacattcgg gaccaatata tagtgggtac atcaagtcca tctgacaaaa tggggcagaa    180
gagaaaggac tcagtgtgtg atccggtttc tttttgctcg cccctgtttt ttgtagaatc    240
tcttcatgct tgacatacct accagtatta ttcccgacga cacatataca tatgagaata    300
taccttattt atttttgtgt aggtgtctgc cttcacaaat gtcattgtct actcctagaa    360
 
<210>13
<211>453
<212>DNA
<213>human
<400>13
gcatcctcaa acatggcgcc aaggataaac acgactaggc catccccagc cccctgacac     60
ccagcccccg ccagtcaccc ctccccgcac acacccgtcc ataccagctc cctgcccatg    120
accctcgctc agggatcccc ctttgagggt tagggtccca gttcccagtg gaagaaacag    180
gccaggagag tgcgtgccga gctgaggcag atgttcccac agtgacccca gagccctggg    240
ctatagtctc tgacccctcc aaggaaagac caccttctgg ggacatgggc tggagggcag    300
gacctagagg caccaaggga accgcattcc ggggctgttc cccgaggagg aagggaagcc    360
tctgtgtgcc ccccaggagg aagaggccct gagtcctggg atcagacacc ccttcacgtg    420
tatcccacac aaatgcaagc tcaccaaggt ccc                                 453
 
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<212>DNA
<213>human
<400>14
tatagctctc tttagctcaa ccactctgtc catccagcca atggatgtcc ttccctgtac     60
ccaattcaag cttattttag ggaagccttg aaactaccat gtatctggct ctagctgagt    120
tattgaggat tgagccagtg caacgttaaa ctcagtgcac ttacatttga tttaaatgat    180
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tgaaaacctt ttctgagact tagagtaaca gtacttttgg ttccttgagt tctcctgtct    300
ccagatacct aaatgacctt gacttttctg ccttgtgaat tcgtagtcca atcagctgaa    360
attaaatcac ttgggaggga cgcatagaag gagctctagg aacacagtgc cagtgcagaa    420
gtttctccag gtggcc                                                    436
 
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<212>DNA
<213>human
<400>15
ctcagagcca cccctaaaga gatcctttga tattttcaac gcagccctgc tttgggctgc     60
cctggtgctg ccacacttca ggctcttctc ctttcacaac cttctgtggc tcacagaacc    120
cttggagcca atggagactg tctcaagagg gcactggtgg cccgacagcc tggcacaggg    180
cagtgggaca gggcatggcc aggtggccac tccagacccc tggcttttca ctgctggctg    240
ccttagaacc tttcttacat tagcagtttg ctttgtatgc actttgtttt tttctttggg    300
tcttgttttt tttttccact tagaaattgc atttcctgac agaaggactc aggttgtctg    360
aagtcactgc acagtgcatc tcagcccaca tagtgatggt tcccctgttc actctactta    420
gcatgtccct accgagtctc ttctccactg gatggaggaa aaccaagccg tggcttcccg    480
ctcagccctc cctgcccctc ccttcaacca ttccccatgg gaaat                    525
 
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<211>398
<212>DNA
<213>human
<400>16
ctcctggact caatcatggc ttgtggtctg gtcgccagca acctgaatct caaacctgga     60
gagtgccttc gagtgcgagg cgaggtggct cctgacgcta agagcttcgt gctgaacctg    120
ggcaaagaca gcaacaacct gtgcctgcac ttcaaccctc gcttcaacgc ccacggcgac    180
gccaacacca tcgtgtgcaa cagcaaggac ggcggggcct gggggaccga gcagcgggag    240
gctgtctttc ccttccagcc tggaagtgtt gcagaggtgt gcatcacctt cgaccaggcc    300
aacctgaccg tcaagctgcc agatggatac gaattcaagt tccccaaccg cctcaacctg    360
gaggccatca actacatggc agctgacggt gacttcaa                            398
 
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<212>DNA
<213>human
<400>17
ggcagcattc aagtccgatg gttcctgaat ggacaggagg aaacagctgg ggtcgtgtcc     60
accaacctga tccgtaatgg agactggacc atccagatcc tggtgatgct ggaaatgacc    120
ccccagcagg gagacgtcta catctgccaa gtggagcaca ccagcctgga tagttccgtc    180
accgtggagt ggaaggcaca gtctgattct gcccagagta agacattgac gggagctggg    240
ggcttcgtgc tggggctcat catctgtgga gtgggactct tcatgcacag gaggagcaag    300
aaagttcaac gaggatctgc ataaacaggg ttcctgacct caccgaaaag actaatgtgc    360
cttagaacaa gcatttgctg tgttttgtta acacctggtt ccaggacaga ccctcagctt    420
cccaagagga tactgctgcc aagaagttgc tctgaagtca gtttctatcg ttctgctctt    480
tgattcaaa                                                            489
 
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<212>DNA
<213>human
<400>18
agaggcggga tactttcagc tttccatgta actgtatgca taaagccaat gtagtccagt     60
ttctaagatc atgttccaag ctaactgaat cccacttcaa tacacactca tgaactcctg    120
atggaacaat aacaggccca agcctgtggt atgatgtgca cacttgctag actcagaaaa    180
aatactactc tcataaatgg gtgggagtat tttggtgaca acctactttg cttggctgag    240
tgaaggaatg atattcatat attcatttat tccatggaca tttagttagt gctttttata    300
taccaggcat gatgctgagt gacactcttg tgtatatttc caaatttttg tatagtcgct    360
gcacatattt gaaatcatat attaagactt tccaaagatg aggtccctgg tttttcatgg    420
caacttgatc agtaaggatt tcacctctgt ttgtaacta                           459
 
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<213>human
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gactttttgg aatagccctg tctagggcaa actgtggccc ccaggagaca ctacccttcc     60
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atagtttttg ctttgggggt agaggcttct tagattctcc cagcatccgc ctttcccttt    360
agccagtctg ctgtcctgaa acccagaagt gatggagaga aaccaacaag agatctcgaa    420
ccctgtctag aaggaatgta tttgttgcta aatttcgtag cactgtttac agttttcctc    480
catgttattt atg                                                       493
 
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<212>DNA
<213>human
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gccacgattg gagaatactt tgcttcatag tattggagca catgttactg cttcattttg     60
gagcttgtgg agttgatgac tttctgtttt ctgtttgtaa attatttgct aagcatattt    120
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tcctgaaggg ggacactcca tgagtgtctg tgagaggcag ctatctgcac tctaaactgc    300
 
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<211>511
<212>DNA
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<400>21
ttaggtcaag ttcatagttt ctgtaattgg cttttgaatc aaagaatagg gagacaatct     60
aaaaaatatc ttaggttgga gatgacagaa atatgattga tttgaagtgg aaaaagaaat    120
tctgttaatg ttaattaaag taaaattatt ccctgaattg tttgatattg tcacctagca    180
gatatgtatt acttttctgc aatgttatta ttggcttgca ctttgtgagt atctatgtaa    240
aaatatatat gtatataaaa tatatattgc ataggacaga cttaggagtt ttgtttagag    300
cagttaacat ctgaagtgtc taatgcatta acttttgtaa ggtactgaat acttaatatg    360
tgggaaaccc ttttgcgtgg tccttaggct tacaatgtgc actgaatcgt ttcatgtaag   420
aatccaaagt ggacaccatt aacaggtctt tgaaatatgc atgtacttta tattttctat    480
atttgtaact ttgcatgttc ttgttttgtt a                                   511
 
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caccaaatta cctaggctga ggttagagag attggccagc aaaaactgtg ggaagatgaa     60
ctttgtcatt atgatttcat tatcacatga ttatagaagg ctgtcttagt gcaaaaaaca    120
tacttacatt tcagacatat ccaaagggaa tactcacatt ttgttaagaa gttgaactat    180
gactggagta aaccatgtat tcccttatct tttacttttt ttctgtgaca tttatgtctc    240
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<213>human
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accagctcta ggtccaattg ttctgctcta actgatacct caaccttggg gccagcatct     60
cccactgcct ccaaatatta gtaactatga ctgacgtccc cagaagtttc tgggtctacc    120
acactcccca accccccact cctacttcct gaagggccct cccaaggcta catccccacc    180
ccacagttct ccctgagaga gatcaacctc cctgagatca accaaggcag atgtgacagc    240
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tgtggatgtt tccaagcctg acctcacggc tgccctgcgt gacgtacgtc agcaatatga     60
aagtgtggct gccaagaacc tgcaggaggc agaagaatgg tacaaatccn agtttgctga    120
cctctctgag gctgccaacc ggnacnatga cgccctgcgc caggcnaagc aggagtccnc    180
tgagtaccgg agacaggtgc agtccctcac ctgtgaagtg gatgccctta aaggaaccaa    240
tgagtccctg gaacgccaga tgcgtgaaat ggaagagaac tttgccgttg aagctgctaa    300
ctaccaagac actattggcc gcctgcagga tgagattcag aatatgaagg aggaaatggc    360
tcgtcacctt cgtgaatacc aagacctgct caatgttaag atggcccttg acattgagat    420
tgccacct                                                             428
 
<210>25
<211>362
<212>DNA
<213>human
<400>25
gatccagaaa tacttaacac gtgaatattt tgctaaaaaa gcatatataa ctattttaaa     60
tatccattta tcttttgtat atctaagact catcctgatt tttactatca cacatgaata    120
aaggcctttg tatctttctt tctctaatgt tgtatcatac tcttctaaaa cttgagtggc    180
tgtcttaaaa gatataaggg gaaagataat attgtctgtc tctatattgc ttagtaagta    240
tttccatagt caatgatggt ttaataggta aaccaaaccc tataaacctg acctccttta    300
tggttaatac tattaagcaa gaatgcagta cagaattgga tacagtacgg atttgtccaa    360
at                                                                   362
 
<210>26
<211>456
<212>DNA
<213>human
<400>26
ctccagcagt tctctcgaat actttgaatg ttgtgtaaca gttagccact gctggtgttt     60
atgtgaacat tcctatcaat ccaaattccc tctggagttt catgttatgc ctgttgcagg    120
caaatgtaaa gtctagaaaa taatgcaaat gtcacggcta ctctatatac ttttgcttgg    180
ttcatttttt ttccctttta gttaagcatg actttagatg ggaagcctgt gtatcgtgga    240
gaaacaagag accaactttt tcattccctg cccccaattt cccagactag atttcaagct    300
aattttcttt ttctgaagcc tctaacaaat gatctagttc agaaggaagc aaaatccctt    360
aatctatgtg caccgttggg accaatgcct taattaaaga atttaaaaaa gttgtaatag    420
agaatatttt tggcattcct ctcaatgttg tgtgtt                              456
 
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<213>human
<400>27
caagtgcagc gatggggagc gggcccgggc ggagctcaat gacaaagtcc acaagctgca     60
gaatgaagtt gagagcgtca cagggatgct taacgaggcc gaggggaagg ccattaagct    120
ggccaaggac gtggcgtccc tcagttccca gctccaggac acccaggagc tgcttcaaga    180
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cagcctgcaa gaccagctgg acgaggagat ggaggccaag cagaacctgg agcgccacat    300
ctccactctc aacatccagc tctccgactc gaagaagaag ctgcaggact ttgccagcac    360
cgtggaagct ctggaagagg ggaagaagag gttccagaag gagatcgaga acctcaccca    420
g                                                                    421
 
<210>28
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<212>DNA
<213>human
 
<220>
<221>misc_feature
<222>(297)..(298)
<223>n is a，c，g，or t
<400>28
tcaagtccaa gttcaagtcc accatcgcgg cgctggaggc caagattgca cagctggagg     60
agcaggtcga gcaggaggcc agagagaaac aggcggccac caagtcgctg aagcagaaag    120
acaagaagct gaaggaaatc ttgctgcagg tggaggacga gcgcaagatg gccgagcagt    180
acaaggagca ggcagagaaa ggcaatgcca gggtcaagca gctcaagagg cagctggagg    240
aggcagagga ggagtcccag cgcatcaacg ccaaccgcag gaagctgcag cgggagnngg    300
atgaggccac ggagagcaac gaggccatgg gccgcgaggt gaacgcactc aagagcaagc    360
tcagagggcc ccccccacag gaaacttcgc agtgatgcac caggcgagga aacgagacct    420
ctttcgttcc ttctagaagg tctggaggac gtagagttat tgaaaatgca gatggttctg    480
aggaggaaac ggacactcga gacgcagact tcaatggaac caaggccagt gaataagcaa    540
ctttctacag ttttgcacca cgg                                            563
 
<210>29
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<212>DNA
<213>human
<400>29
tgagccagga agaacgctcc agcccaggac ttcgaggctg caatgagcta taattgcatc     60
attgcactcc agcctgggca acagagaccc tgtctcaacc accaccacca ccaccacccc    120
tactacccct gtattcaagg taaaaattga agtttgtatg atgtaagaga tgagaaaaac    180
ccaacaggaa acacagacac atcctccagt tctatcaatg gattgtgcag acactgagtt    240
tttagaaaaa catatccacg gtaaccggtc cctggcaatt ctgtttacat gaaatgggga    300
gaaagtcacc gaaatgggtg ccgccggccc ccactcccaa ttcattccct aacctgcaaa    360
cctttccaac ttctcacgtc aggcctttga gaattctttc cccctctcct ggtttccaca    420
cctcagacac gcacagttca ccaagtgcct tctgtagtca catgaattga aaaggagacg    480
ctgctcccac ggaggggagc aggaatgctg cactgtttac accctgactg tgcttaaaa     539
 
<210>30
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<212>DNA
<213>human
<400>30
tgaagtgcaa caaggccatc acatctggag gaatcactta ccaggatcag ccctggcatg     60
ccgattgctt tgtgtgtgtt acctgctcta agaagctggc tgggcagcgt ttcaccgctg    120
tggaggacca gtattactgc gtggattgct acaagaactt tgtggccaag aagtgtgctg    180
gatgcaagaa ccccatcact gg                                             202
 
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<212>DNA
<213>human
<400>31
cagggctgtc atcaacatgg atatgacatt tcacaacagt gactagttga atcccttgta     60
acgtagtagt tgtctgctct ttgtccatgt gttaatgagg actgcaaagt cccttctgtt    120
gtgattccca ggacttttcc tcaagaggaa atctggattt ccacctaccg cttacctgaa    180
atgcaggatc acctacttac tgtattctac attattatat gacatagtat aatgagacaa    240
tatcaaaagt aaacatgtaa tgacaataca tactaacatt cttgtaggag tggttagaga    300
agctgatgcc tcatttctac attctgtcat tagctattat catctaacgt ttcagtg       357
 
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<212>DNA
<213>human
<400>32
cttgagacca ggagacgtat ccagcaagcg gaacctctgg gaaaagcaat ctgtggataa     60
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gacgagctca gttgtagagg gctaattcgc tctgttttgt atttatgttg atttactaaa    180
ttgggttcat tatcttttat ttttcaatat cccagtaaac ccatgtatat tatcactata    240
tttaataatc acagtctaga gatgttcatg gtaaaagtac tgcctttgca caggagcctg    300
tttctaaaga aacccatgct gtgaaataga gacttttcta ctgatcatca taactctgta    360
tctgagcagt gataccaacc acatctgaag tcaacagaag atccaagttt aaaattgcct    420
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<212>DNA
<213>human
<400>33
tgttgtttct gcactttata ataaagcatg gaagaaatta tcttagtagg caattgtaac     60
actttttgaa agtaacccat ttcagatttg aaatactgca ataatggttg tctttaaaaa    120
aaaaaagaat gtactgttaa ggtattactt tttttcatgc tgatgattca tatctaaatt    180
acattattat gttagctgac agtggtactg attttttagg ttggttgttt tgtggatttc    240
tttagtagtg atagtagcct gaaccacatt ttagataact caattatgta tgtatgtgca    300
tacacatata caaacacact aatggtagaa tgctttttta tgtgctagac tattatattt    360
agtagtatgt cattgtaact agccaatatc acagcttttg aaaaattaaa aaatcatcat    420
cactataata tttcatattt gccaacagaa acatggcaga taggtatcaa tatgttttca    480
atgcctgatg acctat                                                    496
 
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<213>human
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ttttaccaaa gcatcaatac aaccagccca accatcggtc cacacctggg catttggtga     60
gaatcaaagc tgaccatgga tccctggggc caacggcaac agcatgggcc tcacctcctc    120
tgtgatttct ttctttgcac caaagacatc agtctccaac atgtttctgt tttgttgttt    180
gattcagcaa aaatctccca gtgacaacat cgcaatagtt ttttacttct cttaggtggc    240
tctgggatgg gagaggggta ggatgtacag gggtagtttg ttttagaacc agccgtattt    300
tacatgaagc tgtataatta attgtcatta tttttgttag caaagattaa atgtgtcatt    360
ggaagccatc ccttttttta catttcatac aacagaaacc agaaaagcaa tactgtttcc    420
attttaagga tatgattaat attattaata taataatgat gatgatgatg atgaaaacta    480
aggatttttc aagagatctt tctttccaaa acatttctgg acagtacctg attgt         535
 
<210>35
<211>436
<212>DNA
<213>human
<400>35
gagtggacta ttaaatgtgc ctaaatgaat tttgcagtaa ctggtattct tgggttttcc     60
tacttaatac acagtaattc agaacttgta ttctattatg agtttagcag tcttttggag    120
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gtttctccaa atgccttttt taaaactcat cacagaagat tggtgaaaat gctgagtatg    300
acacttttct tcttgcatgc atgtcagcta cataaacagt tttgtacaat gaaaattact    360
aatttgtttg acattccatg ttaaactacg gtcatgttca gcttcattgc atgtaatgta    420
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<210>36
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<212>DNA
<213>human
<400>36
tgctgtgtga accgtcgtgt gagtgtggta tgcctgatca cagatggatt ttgttataag     60
catcaatgtg acacttgcag gacactacaa cgtgggacat tgtttgtttc ttccatattt    120
ggaagataaa tttatgtgta gacttttttg taagatacgg ttaataacta aaatttattg    180
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ttctattttt agaaagggtt tttatggacc aatgccccag ttgtcagtca gagccgttgg    300
tgtttttcat tgtttaaaat gtcacctgta aaatgggcat tatttatgtt tttttttttg    360
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tatatttaaa cttacaggct tatttgtaat gtaaaccacc attttaatgt actgtaatta    480
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<212>DNA
<213>human
<400>37
ccatccagaa tctagcgctg cgcaacacag gaatggagac gcccacaggc gtgtgcgccg     60
cactggcggc ggcaggtgtg cagccccaca gcctagacct cagccacaac tcgctgcgcg    120
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tgtcgttcgc tgggctggaa caggtgccta aaggactgcc agccaagctc agagtgctcg    240
atctcagctg caacagactg aacagggcgc cgcagcctga cgagctgccc gaggtggata    300
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gaaccctggt gctgctccaa ggggcccggg gctttgccta agatccaaga cagaataatg    480
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<210>38
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<212>DNA
<213>human
<400>38
caaatgatgt gcaaaacctt ttactggttg catggaaatc agccaagttt tataatcctt     60
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tctct                                                                305
 
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<212>DNA
<213>human
<400>39
tcagcagtat agggaccttc cgcacaagct ctgtgttaag attgacaata atagtggggc     60
cattttcatt ttagtctttt ctaagagtca accacaggca tttaagtcag ccaaagaata    120
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gtgggaccaa gcaatgatga tcttctgtgg tgcttaagga aacttactag agctccacta    420
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<212>DNA
<213>human
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gtgccaatcc tttgaatgtt ccacggaaac actggtggac agattctagt gctgagaaga     60
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gaaatgtaaa gaaggccctg aagctgatgg ggtcaaatga aggtgaattc aaggctgaag    300
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ggagcaaaac agtctttgaa tatcgaacac gcaaggctgt gagactacct attgtagata    420
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cctggttctg gaatcctcag ttcaaggtta tcctacgcag agagccaggt accaatgggt     60
gcgctgcaat ccagacagta attctgcaaa ctgccttgaa gaaaaaggac caatgttcga    120
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gagaatccag gacttgaatc gtatcttccc actttctgag gactactctg gatcaggctt    240
cggctccggc tccggctctg gatcaggatc tgggagtggc ttcctaacgg aaatggaaca    300
ggattaccaa ctagtagacg aaagtgatgc tttccatgac aaccttaggt ctcttgacag    360
gaatctgccc tcagac                                                          376
 
<210>42
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<212>DNA
<213>human
<400>42
tatgctttaa tgctgttatc tatcttattg ttcttgaaaa tacctgcatt ttttggtatc     60
atgttcaacc aacatcatta tgaaattaat tagattccca tggccataaa atggctttaa    120
agaatatata tatattttta aagtagcttg agaagcaaat tggcaggtaa tatttcatac    180
ctaaattaag actctgactt ggattgtgaa ttataatgat atgccccttt tcttataaaa    240
acaaaaaaaa aataatgaaa cacagtgaat ttgtagagtg ggggtatttg acatatttta    300
cagggtggag tgtactatat actattacct ttgaatgtgt ttgcagagct agtggatgtg    360
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cagttgtgct gtcaatacct catactgctt tacctttttt tcctggatat ctgtgtattt    480
tc                                                                   482
 
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<212>DNA
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gttgagtcgt catcactttt cagtgatggg agagtagatg gtgaaattta ttagttaata     60
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tctcctacat ccgcattgct gataccaata tcaccagcat tcctcaaggt cttcctcctt     60
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tcagagctcc agtttgcatt tggatgtgta aattacagta atcccatttc ccaaacctaa    120
aatctgtttt tctcatcaga ctctgagtaa ctggttgctg tgtcataact tcatagatgc    180
aggaggctca ggtgatctgt ttgaggagag caccctaggc agcctgcagg gaataacata    240
ctggccgttc tgacctgttg ccagcagata cacaggacat ggatgaaatt cccgtttcct    300
ctagtttctt cctgtagtac tcctctttta gatcc                               335
 
<210>49
<211>464
<212>DNA
<213>human
<400>49
cagtcactct aaatggacac cacatgaacc tctgtttaga atacctacgt atgtatgcat     60
tggtttgctt gtttcttgac agtacatttt tagatctggc cttttcttaa caaaatctgt    120
gcaaaagatg caggtggatg tccctaggtc tgttttcaaa gaactttttc caagtgcttg    180
ttttatttat taagtgtcta cctggtaaat gttttttttg taaactctga gtggactgta    240
tcatttgcta ttctaaacca ttttacactt aagttaaaat agtttctctt cagctgtaaa    300
taacaggata cagaattaac aagagaaaat gtctaacttt ttaagaaaaa ccttattttc    360
ttcggttttt gaaaaacata atggaaataa aacaggatat tgacataata gcacaaaatg    420
acactcttct aaaactaaat gggcacaaga gaattttcct ggga                     464
<210>50
<211>499
<212>DNA
<213>human
<400>50
gtcaaaacct aattgcaatt ctgttaaatc taagtaattt ttagacagtg tttcaccgta     60
ttatttagga tgtgaaatgc catttctttc actgattaca ccatatacag gaaacaggta    120
aaacagtgaa aactttattg tgctggttga tgccaacttg gttgaaaagc tctctgcaga    180
agaagtgatc tagactgaca gaagtgttgc taattacaag ttgtgttctc atgacgtaat    240
tagaaagtaa cttctcaaag tacaactttt atgaaaaaaa taagctgtta aaaaaaggaa    300
atcgtaggtt aatttaattg ggaaaatggg caattgacag agaccatttt cctaacacat    360
atatgtgcta gtactttaac tttttaaaat tttacttcta cgttttgtaa tataaaaatt    420
tctattttaa gtttagaatg ttatacgtac cgaaagtatg cagccaaatc gatcagatca    480
aaccatttta cctggagtt                                                 499
 
<210>51
<211>174
<212>DNA
<213>human
<400>51
agctgtgagc cttggctgtt ggcagtgagt gagcctggct cttgtgctgg atggagccca     60
ggcgggagcg gtggccctgt ccctcccacc tctgtgacct gaggcctacg ctttggctct    120
ggagatagcc ccagagcagg gtgttgggat actgcagggc caggactgag cccc          174
 
<210>52
<211>531
<212>DNA
<213>human
<400>52
ctgttagctc ctcactgtgg taaatgccac acacctttaa gtagataagc agacgatagt     60
tatctgttct tttgacttaa tctcatttgg tttgattttc cctctactaa ggctttccta    120
ccttcttcag gctgcctaag acatgtaagc gaaacacttc aataattgtc catgaggaga    180
aaaaaagcat tgtcatgcat gaaggaaact gaacttgagg tggcctcctt gcttgttaca    240
tacctgggta tgtgtaggca gtttagtgca tctttgcctc tcagttgaaa cctgtataac    300
cctgttacaa agctgtgttg ttgcttcttg tgaaggccat gatattttgt tttttcccca    360
attaattgct attgtgttat tttactaact tctctctgta ttttttcttg cattgacatt    420
atagacattg aggacctcat ccaaacaatt taaaaatgag tgtgaagggg gaacaagtca    480
aaatattttt aaaagatctt caaaaataat gcctctgtct agcatgccaac              531
 
<210>53
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<212>DNA
<213>human
<400>53
tgtcagagtt ttcaacggtg cttatagctg ccagctggat tccaaacagg taccccattg     60
tctctgagct aatgtttata tttttccatt caggcaccga aatagttaat atttaaaata    120
agtcttcaaa agaaaacata agagattatt gagttcttgg gactggatcc tttatttcat    180
aagttcagat catcttaaat gaaaatgcca tgattatctg cagttaagta gatgacagct    240
attctacatc agacttgatt tttgtcagct aattacataa ttggtaagct ataattgaaa    300
ccttatggct taaaattcct taactccttt ttgattcatg tttgtagtca tgttgtcaac    360
agaggcaaag ttaagcttga tgatggttaa aatcggtttg atagcaccat gggacatttt    420
tctaacaaaa ataaatgcat gaagagacat agccttttag ttttgct                  467
 
<210>54
<211>445
<212>DNA
<213>human
<400>54
aagagctatg agctgccaga tgggcaggtt atcaccattg gcaatgagcg cttccgctgc     60
cctgagaccc tcttccagcc ttcctttatt ggcatggagt ccgctggaat tcatgagaca    120
acctacaatt ccatcatgaa gtgtgacatt gacatccgta aggacttata tgccaacaat    180
gtcctctctg ggggcaccac catgtaccct ggcattgctg acaggatgca gaaggagatc    240
acagccctgg cccccagcac catgaagatc aagattattg ctcccccaga gcggaagtac    300
tcagtctgga tcgggggctc tatcctggcc tctctctcca ccttccagca gatgtggatc    360
agcaagcctg agtatgatga ggcagggccc tccattgtcc acaggaagtg cttctaaagt    420
cagaacaggt tctccaagga tcccc                                          445
 
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<211>525
<212>DNA
<213>human
<400>55
caactgccct tgaccggaag catgagtatc atcttcttcc tgcccctgaa agtgacccag     60
aatttgacct tgatagagga gagcctcacc tccgagttca ttcatgacat agaccgagaa    120
ctgaagaccg tgcaggcggt cctcactgtc cccaagctga agctgagtta cgaaggcgaa    180
gtcaccaagt ccctgcagga gatgaagctg caatccttgt ttgattcacc agactttagc    240
aagatcacag gcaaacccat caagctgact caggtggaac accgggctgg ctttgagtgg    300
aacgaggatg gggcgggaac cacccccagc ccagggctgc agcctgccca cctcaccttc    360
ccgctggact atcaccttaa ccagcctttc atcttcgtac tgagggacac agacacaggg    420
gcccttctct tcattggcaa gattctggac cccaggggcc cctaatatcc cagtttaata    480
ttccaatacc ctagaagaaa acccgaggga cagcagattc cacag                    525
 
<210>56
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<212>DNA
<213>human
<400>56
ctgacctgca ggacgaaacc atgaagagcc tgatccttct tgccatcctg gccgccttag     60
cggtagtaac tttgtgttat gaatcacatg aaagcatgga atcttatgaa cttaatccct    120
tcattaacag gagaaatgca aataccttca tatcccctca gcagagatgg agagctaaag    180
tccaagagag gatccgagaa cgctctaagc ctgtccacga gctcaatagg gaagcctgtg    240
atgactacag actttgcgaa cgctacgcca tggtttatgg atacaatgct gcctataatc    300
gctacttcag gaagcgccga ggggccaaat gagactgagg gaagaaaaaa aatctctttt    360
tttctggagg ctggcacctg attttgtatc cccctgtagc agcattactg aaatacatag    420
gcttatatac aatgcttctt tcct                                           444
 
<210>57
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<212>DNA
<213>human
<400>57
gaagccctgg aaaatcgcct gagatacaga tgaagattag aaatcgcgac acatttgtag     60
tcattgtatc acggattaca atgaacgcag tgcagagccc caaagctcag gctattgtta    120
aatcaataat gttgtgaagt aaaacaatca gtactgagaa acctggtttg ccacagaaca    180
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tggacacaac ttgcttctgc ctcatcctgc cttagtgtgc aatctcattt gactatacga    360
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actggacttt accttgatat atgt                                           444
 
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<212>DNA
<213>human
<400>58
gctggtatca gaacagcttc cctcactgtg tacagaacgc aagaagggaa taggtggtct     60
gaacgtggtg tctcactctg aaaagcagga atgtaagatg atgaaagaga caatgtaata    120
ctgttggtcc aaaagcattt aaaatcaata gatctgggat tatgtggcct taggtagctg    180
gttgtacatc tttccctaaa tcgatccatg ttaccacata gtagttttag tttaggattc    240
agtaacagtg aagtgtttac tatgtgcaag ggtattgaag ttcttatgac cacagatcat    300
cagtactgtt gtctcatgta atgctaaaac tgaaatggtc cgtgtttgca ttgttaaaaa    360
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caaaaatctg tcttgaaggc agctacactt                                     450
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<212>DNA
<213>human
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tggacatcgg tggtgctgac caggaattct ttgtggacat tggcccagtc tgtt          474
 
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<212>DNA
<213>human
<400>60
gagccattgg aagactgtcc tctatggcaa tgatctcagg gctcagtggc aggaaatcct     60
caacagggtc accaaccagc ccgctcaatg cagaaaaact agaatctgaa gatgtgtccc    120
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gggatgacga tgccaagtac acctgcaagg ctgtcaacag tcttggagaa gccacctgca    420
c                                                                    421
 
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<212>DNA
<213>human
<400>61
ttatcaagtg tcaagatcag caagtgtcct taagtcaaat aggttttttt ttgttggtgg     60
ttgtgcttgc tttccttttt tagaaagttc tagaaaatag gaaaacgaaa aatttcattg    120
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ttctgagtgt ctatgttaac ttccctctat cccgcttata aaaaaattct ccaacaaaaa    360
tacttgttga cttgatgttt tatcacttct ctaagtaagg ttgaaatatc cttattgtag    420
ctactgtttt taatgtaaag gttaaacttg aaaagaaatt cttaatcacg gtgccaaaat    480
tcattttcta acaccatgtg tt                                             502
 
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<212>DNA
<213>human
 
<220>
<221>misc_feature
<222>(163)..(164)
<223>n is a，c，g，or t
<400>62
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ttctaagact caaatgttct aagtttctaa gattctaaag gtccacaggt ctagactatt    300
aggtgcaatt tcaaggttct aaccctatac tgtagtattc tttggggtgc ccctctcctt    360
cttagctatc attgcttcct cctccccaac tgtgggggtg tgcccccttc aagcctgtgc    420
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gttgcccccg tgagccaatc cctcaccttc tgagtacaga gtgtggactc tggtgcctcc    540
a                                                                    541
 
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<212>DNA
<213>human
<400>63
ggctctggag gtgggcagca atctgtcaat caccttgtta aagagattga tatgctgctg     60
aaagaatatt tactctctgg agacatatct gaagctgaac attgccttaa ggaactggaa    120
gtacctcatt ttcaccatga gcttgtatat gaagctatta taatggtttt agagtcaact    180
ggagaaagta catttaagat gattttggat ttattaaagt ccctttggaa gtcttctacc    240
attactgtag accaaatgaa aagaggttat gagagaattt acaatgaaat tccggacatt    300
aatctggatg tcccacattc atactctgtg ctggagcggt ttgtagaaga atgttttcag    360
gctggaataa tttggaaaca actcagagat ctttgtcctt caaggggcag aaagcgtttt    420
gtaagcgaag gagatggagg tcgtcttaaa ccagagagct actgaatata agaactcttg    480
cagtcttaga tgttat                                                    496
 
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<212>DNA
<213>human
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gtaagattcc tcctaacttt cacagtcgat gacaagattg tctttttatc tgatattttg     60
aagggtatat tgctttgaag taagtctcaa taaggcaata tattttaggg catctttctt    120
cttatctctg acagtgttct taaaattatt tgaatatcat aagagccttg gtgtctgtcc    180
taattccttt ctcactcacc gatgctgaat acccagttga atcaaactgt caacctacca    240
aaaacgatat tgtggcttat gggtattgct gtctcattct tggtatattc ttgtgttaac    300
tgcccattgg cctgaaaata ctcattgtaa gcctgaaaaa aaaaatcttt cccactgttt    360
tttctgcttg ttgtaagaat caaatgaaat aatgtatgtg aaagcacctt gtaaactgta    420
acctatcaat gtaaaatgtt aaggtgtgtt gttatttcat taattacttc tttgtttaga    480
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<212>DNA
<213>human
<400>65
tacacttttt tttgccaact gacttaacaa cattgctgtc aggtggaaat ttcaagcact     60
tttgcacatt tagttcagtg tttgttgaga atccatggct taacccactt gttttgctat    120
ttttttcttt gcttttaatt ttccccatct gattttatct ctgcgtttca gtgacctacc    180
ttaaaacaac acacgagaag agttaaactg ggttcatttt aatgatcaat ttacctgcat    240
ataaaattta tttttaatca agctgatctt aatgtatata atcattctat ttgctttatt    300
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ggttatcaag tgtttctgca tggtaatgtc                                     450
 
<210>66
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<213>human
 
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<222>(76)..(76)
<223>n is a，c，g，cr t
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aaactactaa ccactgcaag ctcttgtcaa attttagttt aattggcatt gcttgttttt     60
tgaaactgaa attacntgag tttcattttt tctttgaatt tatagggttt agatttctga    120
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<212>DNA
<213>human
<400>67
gagatactat ttttgctgag caaccagtgt gtttcaggat gatacaaaga aaaatataga     60
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tcctatttat tctcatactt tacattcatg cttagtatac tatagaggat gccagcttta    480
atctttctg                                                            489
 
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<211>543
<212>DNA
<213>human
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caagtactag gttgtccatt tatggtacct atttggtgct agtaaatttt caaactagat    120
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aatacattac atgtaaatta agtgtgtgta tactgtaatc gtgctatttt ttatcattga    300
aacatttata aactagaata ataatgccct taatgtgagg gtttgtaatg gtgcttatta    360
agaccaaaga cttgttaaat gtatacacca agtggtaatg aaatttcgtg actggcccac    420
acgtgcatag aggtctggga ggaccaggaa acagcctcag tggccagagg atcaccagtg    480
catccttcat cacagcatgt gcaatatgcc aagattaccc tcggtcattc ctgtcaacaa    540
ggg                                                                  543
 
<210>69
<211>500
<212>DNA
<213>human
<400>69
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gactgaggga tcgtagattt ttacaatctg tatctttgac aattctgggt gcgagtgtga    360
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<213>human
<400>70
agaaagaggc gctgctcact gttttcctgc ttcagttttt ctcttatagt accatcacta     60
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taatatttgg aaattatcta caatggaatc ttccctctgt tctctgataa cctacttgct    300
tactcaatgc ctttaagcca agtcaccctg ttgcctatgg gaggaggtgg aaggatttgg    360
caagctcaac cacatgctat ttagttagca tcagttgtca ccaacagtct ttctgcaaag    420
ggcaggagag ctttggggga aaggaaaagg cttaccaggc tgctatggtc aactcttcag    480
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<210>71
<211>508
<212>DNA
<213>human
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agccctggag aagacgaaag ccaacatcaa gtgggtgaag gagaacaagg aggtggtgct     60
ccagtggttc acagaaaaca gcaaatagtc cccagccctt gaagtcaccc ggccccgatg    120
caaggtgccc acatgtgtcc atcccagcgg ctggtgcagg gcctccattc ctggagcccg    180
aggcaccagt gtcctcccct caaggacaaa gtctccagcc cacgttctct ctgcctgtga    240
gccagtctag ttcctgatga cccaggctgc ctgagcacct cccagcccct gcccctcatg    300
ccaaccccgc cctaggcctg gcatggcacc tgtcgcccag tgccctgggg ctgatctcag    360
ggaagcccag ctccagggcc agatgagcag aagctctcga tggacaatga acggccttgc    420
tgggggccgc cctgtaccct ctttcacctt tccctaaaga ccctaaatct gaggaatcaa    480
cagggcagca gatctgtata tttttttc                                       508
 
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<213>human
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attatctggt cttttcctgt tgtgcaaaaa tgactcattg ctccgaatgt caaaaacaaa     60
tgcgacaaac aatggcactt catcatttaa agtaatgttg ccaagagaaa aaatttcctg    120
ggagggaggt ttcccacaag ccaaatctcc taagcctcaa atgctagcac tttttggcag    180
ttggatagga aatgagacat tctttggcag ccaaaataag agaggccgat ggtgaaactt    240
tttgagacac cctatggcct tcttgtcaaa accttcactg gagctcaaga aaagcatttc    300
tgttgtgtta tttgcagtgc agatgatgtc tgtgtaacaa cataatggtt attcaccttt    360
ttttgatttt gatttttgct gtgttatcaa aaacttgaat actgtgagaa gaagtgaatt    420
ttcagttgac gaatcagcat cttgttccca tggtgataac                          460
 
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<213>human
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cttcgaccac gtgatcacca acatgaacaa caattatgag ccccgcagtg gcaagttcac     60
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ctacaacacc ttccaggtca ccaccggtgg catggtcctc aagctggagc agggggagaa    240
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atgctcagaa a                                                         551
 
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<213>human
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ctgctccacc ccctccctat tcctgatgca aatgtctaac cagatgagtt tctggacaga    240
cttccctctc ctgcttcatt aagggcttgg ggcagagaca gcatggggaa ggaggtcccc    300
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gggcttccca gtttgtttac ccgggaaagt acgtctagat tgtgtggttt gcctcattgt    480
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ta                                                                   542
 
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<213>human
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gctggaatac ttactcttgt cgggagattg aaccactaaa atgttagagc agaattcatt     60
atgctgtggt cacaggggtg tcttgtctga gaacaaatac aattcagtct tctctttggg    120
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<223>n is a，c，g，or t
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gacagacctg agaccaatct gggtagaagc aaaaagttga accttttaaa gtgctgaaca     60
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aacaaagaat ccaacccttt catcttacag gtgaacaaac tgtgatgatg cacatgtatg    300
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ggtggcagtg aagaagcacc caggccactt gactcccagt ctggtgccct gtctacacca    420
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agtgcttaca aagctgcctt ctcggatact                                     510
 
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<213>human
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<213>human
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ttcagttgct aatgaggctc ctccgctctg gacacaaccc ttttatagat taatttctct     60
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<213>human
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gtccttcaca tcaccatttt gagacctcag cttggcactc aggtgctgaa gggtaatatg     60
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atgaatatat atacatgggt aaaattactc tgtgctagtg tagtcttact agagaatgtt    240
tatggtccca cttgtatatg aaaatgtggt tagaatgtta attggataat gtatatataa    300
gaagttaaag tatgtaaagt ataacttcag ccacattttt agaacactgt ttaacatttt    360
tgcaaaacct tcttgtagga aaagagagct ctctacatga agatgacttg ttttatattt    420
cagattttat tttaaaagcc atgtctgtta aacaagaaaa aacacaaaag aactccagat    480
tcctggttca tcattctgta ttcttactca ctttttcaag tt                       522
 
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<212>DNA
<213>human
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atcctcattc ttatactgct tttcgtggcc actttggaca agtcctggtg gactctccct     60
gggaaagagt ccctgaatct ctggtacgac tgcacgtgga acaacgacac caaaacatgg    120
gcctgcagta atgtcagcga gaatggctgg ctgaaggcgg tgcaggtcct catggtgctc    180
tccctcattc tctgctgtct ctccttcatc ctgttcatgt tccagctcta caccatgcga    240
cgaggaggtc tcttctatgc caccggcctc tgccagcttt gcaccagcgt ggcggtgttt    300
actggcgcct tgatctatgc cattcacgcc gaggagatcc tggagaagca cccgcgaggg    360
ggcagcttcg gatactgctt cgccctggcc tgggtggcct tccccctcgc cctggtcagc    420
ggcatcatct acatccacct acggaagcgg gagtgagcgc cccgc                    465
 
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<212>DNA
<213>human
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caagtatcgg ggctctgcta tcaaggtgca aagtccttcg tggatgcaac ctcaaccata     60
tattctacag caccctggtg ccgtgttaac tccctcaatg gagcacacca tgtcactaca    120
gcccgcatca atgatcagcc ctctggccca gcagatgagt catctgtcac taggcagcac    180
cggaacatac atgcctgcaa cgtcagctat gcaaggagcc tacttgccac agtatgcaca    240
tatgcagacg acagcggttc ctgttgagga ggcaagtggt caacagcagg tggctgtcga    300
gacgtctaat gaccattctc catatacctt tcaacctaat aagtaactgt gagatgtaca    360
gaaaggtgtt cttacatgaa gaagggtgtg aaggctgaac aatcatggat ttttctgatc    420
aattgtgctt taggaaatta ttgacagttt tgcacaggtt cttgaaaacg ttatttataa    480
tgaaatcaac taaaactatt tttgctataa gttctataag gtgcataaaa cccttaaatt    540
catctagtag ctgttccccc                                                560
 
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<212>DNA
<213>human
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caccttgggt ctgtgtcact tgtaggtttc tctgcctcca ggttgcctca acagcaggag     60
gcacagcagt ttcaccatct ttgaggtgag ggtggggtgc cccagctagg aagcaagatc    120
gctgtgctag gtctgaccaa aaccagaggg cagtctagtc ctgggggtaa agccctcaga    180
tcccagggta cactcttctc cattccctcc acccacttgc ctgtcacccc agtcacctaa    240
gcaatcactg ggcccagagg agaggagaca gacacacact ggctcctgga cctaaagggt    300
atgagctgga gctaaggcca gctagagctt ccactgtcag ccctcactgt cagccccact    360
gcacccccct gtgcctgctg ggcactgggc actagctaga tgctttaggt tgcttcagct    420
gatccttcaa ctctgtgagg tg                                             442
 
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<212>DNA
<213>human
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tatgtgacgc tggacctttt ctttacccaa ggatttttaa aactcagatt taaaacaagg     60
ggttacttta catcctacta agaagtttaa gtaagtaagt ttcattctaa aatcagaggt    120
aaatagagtg cataaataat tttgttttaa tctttttgtt tttcttttag acacattagc    180
tctggagtga gtctgtcata atatttgaac aaaaattgag agctttattg ctgcatttta    240
agcataatta atttggacat tatttcgtgt tgtgttcttt ataaccaccg agtattaaac    300
tgtaaatcat aatgtaactg aagcataaac atcacatggc atgttttgtc attgttttca    360
ggtactgagt tcttacttga gtatcataat atattgtgtt ttaacaccaa cactgtaaca    420
tttacgaatt atttttttaa acttcagttt tactgcattt tcacaacata tcagacttca    480
ccaa                                                                 484
 
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<212>DNA
<213>human
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tgtgtaatac gccaaccagt caagttgtgt tttggccaga gatttagata tgtccaattt     60
cctggctcat ttcattgtgc tctatgggta cgtataaaaa gcaagaattc tgtttcctag    120
gcaaacattg caactcaggg ctaaagtcat ccagtgaaac ttttagagcc agaagtaact    180
ttgtcccagt cctacaatgt gaaaagagtg aatagttgcc tctttttagc cattttcatg    240
gctggtacat attcgtacgc attacttttc agaatcaata cgcactttca gatattctta    300
tttttattct cttaagtctt tattaacttt ggagagagaa atgatgcatc tttttatttt    360
aaatgaagta gatcaacatg gtggaacaaa atgataaaga acagaaaaca tttcaatata    420
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aacactcaca tacaagttca tactttaaaa gaggaaagct acttaacaat gacaaatatt     60
tcacaataat aatttttact tatataccat ctttcaactg aacatttcag ttcttccaag    120
agcttcttag agtagtatat tttgggggca gtcaaggaat aaactacagt gtaaacatat    180
cccagatgaa aactgctgta tggaaaaatg acagaaagta actgattgac actgttgatt    240
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ttaccgactc caaaaatctc aggaattaaa cttttaacag ttacagcaat aaagaatagt    360
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<212>DNA
<213>human
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gatttccaaa tcagtcgttt tctcaaaaaa atatcgtata agtgactcat cctgtctgct     60
aactccagac ctcccagctt gaagccaaat ctttccatgt gagattgata tggatttcct    120
agaagtactg gaatgttgtc atatcttgcc ctattttaat tctgctatag aaaacaattg    180
ccttcacttt taaggagtaa tttgaatatt aataactctg gtctagattt tcatataatg    240
tattaaagac aaagtagtga acatcaatga acatctgata gagataaact gtaatcaggc    300
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atcacttatc ttctgtattt ttcctctgtc gtgtaaatag tataaccttt tcatttatgg    420
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acgcacacaa ctactacaat tccgcctagg tccacaaggc cttcactgtt ttccccccaa     60
gggaggctgc tgctgctctt ggctggagcc agccagggcc agccgacccc ctctccctgc    120
atggcatcct ccagcccctg tagaactcaa cctctacagg gttagagttt ggagagagca    180
gactggcggg gggcccattg gggggaaggg gaccctccgc tctgtagtgc tacagggtcc    240
aacatagaac agggtgtccc caacagcgcc caaaggacgc actgagcaac gctattccag    300
ctgtcccccc actccctcac aagtgggtac ccccaggacc agaagctccc ccagcaaagc    360
ccccagagcc caggctcggc ctgcccccac cccattcccg cagtgggagc aaactgcatg    420
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ccaaatttca tttcagccac ttctgcagga tccctactgc caacctggaa tggagacttt     60
tatctacttc tctctctctg aagatgtcaa atcgtggttt agatcaaata tatttcaagc    120
tataaaagca ggaggttatc tgtgcagggg gctggcatca tgtatttagg ggcaagtaat    180
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ggcgcaactc ctccattttc ctcccgcagg tgagaaccct gtggagatga gtcagtgcca    300
tgactgagaa ggaaccgacc cctagttgag agcaccttgc agttccccga gaactttctg    360
attcacagtc tcattttgac agcatgaaat gtcctcttga agcatagctt tttaaatatc    420
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gtgtgatgct tttgtaggta cctggaaact tgtctccagt gaaaactttg atgattatat     60
gaaagaagta ggagtgggct ttgccaccag gaaagtggct ggcatggcca aacctaacat    120
gatcatcagt gtgaatgggg atgtgatcac cattaaatct gaaagtacct ttaaaaatac    180
tgagatttcc ttcatactgg gccaggaatt tgacgaagtc actgcagatg acaggaaagt    240
caagagcacc ataaccttag atgggggtgt cctggtacat gtgcagaaat gggatggaaa    300
atcaaccacc ataaagagaa aacgagagga tgataaactg gtggtggaat gcgtcatgaa    360
aggcgtcact tccacgagag tttatgagag agcataagcc aagggacgtt gacctggact    420
gaagttcgca ttgaactcta caacattctg tgggatatat tgttcaaaaa gatattgttg    480
ttttccctga tttagcaagc a                                              501
 
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<212>DNA
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ggtccccaca gactcagaga gaacccacca tggtgctgtc tcctgccgac aagaccaacg     60
tcaaggccgc ctggggtaag gtcggcgcgc acgctggcga gtatggtgcg gaggccctgg    120
agaggatgtt cctgtccttc cccaccacca agacctactt cccgcacttc gacctgagcc    180
acggctctgc ccaggttaag ggccacggca agaaggtggc cgacgccctg accaacgccg    240
tggcgcacgt ggacgacatg cccaacgcgc tgtccgccct gagcgacctg cacgcgcaca    300
agcttcgggt ggacccggtc aacttcaagc tcctaagcca ctgcctgctg gtgaccctgg    360
ccgcccacct ccccgccgag ttcacccctg cggtgcacgc ctccctggac aagttcctgg    420
cttctgtgag caccgtgctg acctccaaat accgttaagc tg                       462
 
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gcccaggctg acttacacat tgaggatgga gactccatcc gcttcgggcg cttcgcgttg     60
gagaccaggg ccagccctgg ccacacccca ggctgtgtca ccttcgtcct gaatgaccac    120
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caaggctgtg ccaagacctt gtaccactcg gtccatgaaa agatcttcac acttccagga    240
gactgtctga tctaccctgc tcacgattac catgggttca cagtgtccac cgtggaggag    300
gagaggactc tgaaccctcg gctcaccctc agctgtgagg agtttgtcaa aatcatgggc    360
aacctgaact tgcctaaacc tcagcagata gactttgctg ttccagccaa catgcgctgt    420
ggggtgcaga cacccactgc ctgatctcac ttctgtcaga tgctcccatc cactattaat    480
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aattgccaca ttttcttatg gcattaaaaa ttttacaaaa acataatttt aatggctata     60
ttatattcca tttaatggat gcaactcang tttatttaac cattcccatn gttgttaact    120
atttaggttg tttctaattt tcattattat aaagttgcag aaatttggtg tacataaaac    180
tgtctccata taattgatta ttaggatata ttcccatgaa ggattcnttt ttttaaaaaa    240
atgtgaaatn tcatcttgta cttacacctt tcatgnaaag ggatttcctg cttttgtact    300
gcatgggtgg cagttgtgag gaaaagccag tcaaatgacc tttttacaaa agaaatgcag    360
tggtcacttc agttgagagt gactttttaa tacaacaaga tcaactagaa gaattcaact    420
gtctcaagaa tcaaggtacc ccaatatatc tcgcaattcc aaactttgtt tgagggactc    480
gttatccagc tcttggtagc cacacctgca atgta                               515
 
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aagccttaca gttatcctgc aagggacagg aaggtctgat ttgcaggatt tttagagcat     60
taaaataact atcaggcaga agaatctttc ttctcgccta ggatttcagc catgcgcgcg    120
ctctctctct ttctctctct tttcctctct ctccctcttt ctagcctggg gcttgaattt    180
gcatgtctaa ttcatttact caccatattt gaattggcct gaacagatgt aaatcgggaa    240
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acatcaagca tcattgtccc catgcaacaa ccaccacctt atacatcact tcctgtttta    420
agcagctcta aaacatagac tgaagattta tttttaatat gttgacttta tttctgagca    480
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<213>human
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gaaggcggct gatgagagcg agagaggaat gaaggtcatc gaaaaccggg ccatgaagga     60
tgaggagaag atggaactgc aggagatgca gctgaaggag gccaagcaca tcgctgagga    120
ttcagaccgc aaatatgaag aggtggccag gaagctggtg atcctggaag gagagctgga    180
gcgctcggag gagagggctg aggtggccga gagccgagcc agacagctgg aggaggaact    240
tcgaaccatg gaccaggccc tcaagtccct gatggcctca gaggaggagt attccaccaa    300
agaagataaa tatgaagagg agatcaaact gttggaggag aagctgaagg aggctgagac    360
ccgagcagag tttgccgaga ggtctgtggc aaagttggag aaaaccatcg atgac         415
 
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<212>DNA
<213>human
<400>109
catgggggga cttgaaccct gcagcaggct cctgctcctg cctctcctgc tggctgtaag     60
tggtctccgt cctgtccagg cccaggccca gagcgattgc agttgctcta cggtgagccc    120
gggcgtgctg gcagggatcg tgatgggaga cctggtgctg acagtgctca ttgccctggc    180
cgtgtacttc ctgggccggc tggtccctcg ggggcgaggg gctgcggagg cagcgacccg    240
gaaacagcgt atcactgaga ccgagtcgcc ttatcaggag ctccagggtc agaggtcgga    300
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<213>human
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tccccagcag tggctcggtg agccatgtgc acctatggcc cagccactgc agcacaggag     60
gctccgtgag ccttggttcc tccccgaaaa cccccagcat tacgatcccc caagtgtcct    120
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cccggtgagg ccaaggtttc ccagtgagcc tctgcgcctc tccactgttt catgagccca    240
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tcatgcaaga cttcactgca gcctttcaca ggactctgca gatagtgcct ctgcaaacta    360
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tgctgcaatt gagggctaaa tcccaagtgt ctcttgactg gctcaagaat tagggcccca    480
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<212>DNA
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cagaccggca gtcatcatgg cagtttcagc gttcaaacag caatagctca agtgtgataa     60
ctactgagga taataaaatc cacattcact taggaagtcc ttacatgcaa gctgtagcca    120
gcccttcagc accactgcag gataaccgaa ctcaaggctt aattaacggg gcactaaaca    180
aaacaaccaa taaagtcacc agcagtatta ctatcacacc aacagccaca cctcttcctc    240
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catactgata tttttgcaag gaactcaatc cttttttaat catccctcca tatcccccaa    360
gactgactga actcgtactt tgggaaggtt tgtgcatgaa ctatacaaga gtatctgaaa    420
ctaactgttg cctgcatagt catatcgagt gtgcacttac tgtatatctt ttcat         475
 
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acagctgtgc tctcagatgt aaatagagca acctatataa acctggattt tttttttttt    300
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ctgggtacaa gaacctgaat caaaggacgt tccagcggta gaaatcaccc acaccttctg    180
ggaaaggaac ctgccctctg tttctggcct gctgaagatc attggatttt ccacatcagt    240
aactgccctg gggtttgtgc tgtacaaata caagctcctg ccacggtctt gaagttctgt    300
tcttatgctc tctgctcact ggttttcaat accaccaaga ggaaaatatt gacaagttta    360
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<213>human
<400>116
gcactgccat gtatgaaagt ctctttatga tgtttgtttt tttgtcattt ttgttcttta     60
catcaagaaa ttttatgttt aaatatgcgg agaatgtata ttgcctctgc tcctatcagg    120
gttgctaaac cctggtacat cgtatataaa atgtattaaa actggggttt gttaccagtt    180
gctgtacttt gtatatagaa tttttataaa ttgtatgctt cagaaataat ttatttttaa    240
aaagaaatta aaagttttaa actcacatcc atattacacc tttcccccct gaaatgtata    300
gaatccattt gtcatcagga atcaaaaccc acagtccatt gtgaagtgtg ctatatttag    360
aacagtctta aaatgtacag tgtattttat agaattgaag ttaacattct tattttcaag    420
agaatttatg gacgttgtag aaatgtacaa atgcatttcc aaactgcctt aaacgttgta    480
tt                                                                   482
 
<210>117
<211>422
<212>DNA
<213>human
<400>117
gggactgtct gtcaaaagac tctgtatatc ttttgtggat gagttttgtg agagaacaga     60
gagaccattg tacctggcac aagggctctt catgaaaagg gagacttact gggaggtgca    120
agacagtggc atttctcctc tcctcttgct gctcagcaca gccctggatt gcagccccga    180
ggctgagacc agacaaagcc cgggaggcag aaagatgctc caagaaccaa cactatcaat    240
gtctttgcaa atcctcacag gattcctgtg ggtccagctt tggaactggg aaacctttct    300
tcggatccgc actcattcca ctgatgccag ctgcccctga aggatgccag tactgtggtg    360
tgtgagtctc agcagccgcc cacacgctcc taactctgct gcatggcaga tgcctaggtg    420
ga                                                                   422
 
<210>118
<211>357
<212>DNA
<213>human
<400>118
attaatcagc cccagagtgc tttaaaaaat tctcttaaat aaaaataata gactcgctag     60
tcagtaaaga tatttgaata tgtatcgtgc cccctccggt gtctttgatc aggatgacat    120
gtgccatttt tcagaggacg tgcagacagg ctggcattct agattacttt tcttactctg    180
aaacatggcc tgtttgggag tgcgggattc aaaggtggtc ccaccgctgc ccctactgca    240
aatggcagtt ttaatcttat cttttggctt ctgcagatgg ttgcaattga tccttaacca    300
ataatggtca gtcctcatct ctgtcctgct tcataggtgc caccttgtgt gtttaaa       357
 
<210>119
<211>328
<212>DNA
<213>human
<400>119
ctacgcgtgt ccttgggcgg agaagggagg tgactccggc ggaagaggac aaggcagaat     60
gcaggccctt cgggtgtccc aggcgctgat ccgctccttc agctccaccg cccggaaccg    120
ctttcagaac cgagtgcgcg agaaacagaa gctcttccag gaggacaatg acatcccgtt    180
gtacctgaag ggcggcatcg ttgacaacat cctgtaccga gtgacaatga cgctgtgtct    240
gggcggcact gtctacagct tgtactccct tggctgggcc tccttcccca ggaattaaga    300
ccaagaagcc tggggggcct gagagact                                       328
<210>120
<211>417
<212>DNA
<213>human
<400>120
tggtgacaca aacagccttt tcccaggtac ttggtacctg gagcgagtgg acgagcagca     60
tcgccgaaag tatgcccggc gtcccgtcta aaggtgttct gcagatccat ggaaagcttc    120
ctgggaaacg tatgctagca gagcttctcc ccgtgaatca tatttttaag atcccactct    180
tagctggtaa atgaatttga atcgacatag tagccccata agcatcagcc ctgtagagtg    240
aggagccatc tctagcgggc ccttcattcc tctccatgct gcaatcactg tcctgggctt    300
atggtgccta tggactaggg gtcctttgtg aaagagcaag atggagcaat ggagagaaga    360
cctcttcctg aatcactgga ctccagaaat gtgcatgcag atcagctgtt gccttca       417
 
<210>121
<211>533
<212>DNA
<213>human
<400>121
ttgatgccag catttgcatc ccgggctcca tcacattcat gcccaatgga tgctgcaaga     60
cctgcacccc tcgcaatgag accagggtgc cctgctccac cgtccccgtc accacggagg    120
tttcgtacgc cggctgcacc aagaccgtcc tcatgaatca ttgctccggg tcctgcggga    180
catttgtcat gtactcggcc aaggcccagg ccctggacca cagctgctcc tgctgcaaag    240
aggagaaaac cagccagcgt gaggtggtcc tgagctgccc caatggcggc tcgctgacac    300
acacctacac ccacatcgag agctgccagt gccaggacac cgtctgcggg ctccccaccg    360
gcacctcccg ccgggcccgg cgctccccta ggcatctggg gagcgggtga gcggggtggg    420
cacagccccc ttcactgccc tcgacagctt tacctccccc ggaccctctg agcctcctaa    480
gctcggcttc ctctcttcag atatttattg tctgagtctt tgttcagtcc ttg           533
 
<210>122
<211>417
<212>DNA
<213>human
<400>122
cttgcttata tcatgtgctg ccgacgggaa ggcgtggaaa agagaaacat gcaaacacca     60
gacatccaac tggtccatca cagtgctatt cagaaatcta ccaaggagct tcgagacatg    120
tccaagaata gagagatagc atggcccctg tcaacgcttc ctgtgttcca ccctgtgact    180
ggggaaatca tacctccttt acacacagac aactatgata gcacaaacat gccattgatg    240
caaacgcagc agaacttgcc acatcagact cagattcccc aacagcagac tacaggtaaa    300
tggtatccct gaagaaagaa aactgactga agcaatgaat ttataatcag acaatatagc    360
agttacatca catttctttt ctcttccaat aatgcatgag cttttctggc atatgtt       417
 
<210>123
<211>542
<212>DNA
<213>human
<400>123
cctcccggga ggacagcctt gaggcgggcc tgcccctcca ggtccgaggc taccccgagg     60
agaagaaaga ggaggagggc agcgcaaacc gcagaccaga ggaccaggag ctggagagcc    120
tgtcggccat tgaagcagag ctggagaaag tggcccacca gctgcaggca ctacggcggg    180
gctgagacac cggctggcag ggctggcccc agggcaccct gtggccctgg ctctgctgtc    240
cccttggcag gtcctggcca gatggcccgg acgctgcttc cggtagggag gcagcctcca    300
gcctgcccaa gcccaggcca ccctatcgcc ccctacgcgc cttgtctcct actcctgact    360
cctacctgcc ctggaacatc ctttgcaggg cagccccaca actttaaaca ttgacgattc    420
cttctctgaa cacaggcagc tttctagaag tttcccttcc tccatcctat ccactgggca    480
caactgcaat aacttctgac cttttggtga aagctgagaa ctcctgactg taacatattc    540
tg                                                                   542
 
<210>124
<211>537
<212>DNA
<213>human
<400>124
gcaggccata ctggttccat tgttctgtat aatactgaat aaataaattt acttttacat     60
gatcgtataa gtttctagat aagataaaca aattctgttt aaattttttt aataaaaatc    120
ttaaaacact ttttttctaa cctagactga gaaattcatg tttacttttc taggtgtatg    180
atactttgta aagttgatac tttcctaaga atttaacatg tcatattttt gaaatagatt    240
taagtgtgct tcttattgct aaaaatacta aatgtcatgg gtcatagtat ctgatatcaa    300
tatcgttgat aacatatcca caggtaacac catgatgtag gcataaatgg aaaacaaaaa    360
ccctactatt tcaaatatat tgtacttttt tatttctgta agccaactgt gtgccatttt    420
cactggactt ttaaatctag actttagtga tgtctacatt gtaaatgatc ttttgtggat    480
atttgtcact tggtttcaga aagttcacaa atgtagcaac agctcacatg actgagt       537
 
<210>125
<211>312
<212>DNA
<213>human
<400>125
tcccttctcg cttgggaact ctagtctcgc ctcgggttgc aatggacccc aactgctcct     60
gtgccgctgg tgtctcctgc acctgcgcca gctcctgcaa gtgcaaagag tgcaaatgca    120
cctcctgcaa gaagagctgc tgctcctgct gccctgtggg ctgtgccaag tgtgcccaag    180
gctgcatctg caaaggggca tcggagaagt gcagctgctg cgcctgatgt cgggacagcc    240
ctgctcccaa gtacaaatag agtgacccgt aaaatctagg attttttgtt ttttgctaca    300
atcttgaccc ct                                                        312
 
<210>126
<211>393
<212>DNA
<213>human
<400>126
aaaggctggc atcttatggc tcatcaaagg cggctgtgac catgttctca tcagttatga     60
gactggagct ttccaagtgg ggaattaaag ttgcttccat ccaacctgga ggcttcctaa    120
caaatatcgc aggcaccagt gacaagtggg aaaagctgga gaaggacatt ctggaccacc    180
tccccgctga ggtacaggaa gactacggcc aggactacat cttagcacag cggaatttcc    240
tcctattgat caactcgtta gccagcaagg acttctctcc ggtgctgcgg gacatccagc    300
atgctatctt ggcgaagagc ccttttgcct attacacgcc agggaaaggc gcttacttgt    360
ggatctgcct tgctcactat ttgcctattg gca                                 393
 
<210>127
<211>460
<212>DNA
<213>human
<400>127
ggtgtcgaac tatatgcctt gtatgatcag ttttatgtgg ctaatgagtt tctcaaatat     60
cgtttacacg ttggtaacta taatggcaca gctggagatg cattacgttt caacaaacat    120
tacaaccacg atctgaagtt tttcaccact ccagataaag acaatgatcg atatccttct    180
gggaactgtg ggctgtacta cagttcaggc tggtggtttg atgcatgtct ttctgcaaac    240
ttaaatggca aatattatca ccaaaaatac agaggtgtcc gtaatgggat tttctggggt    300
acctggcctg gtgtaagtga ggcacaccct ggtggctaca agtcctcctt caaagaggct    360
aagatgatga tcagacccaa gcactttaag ccataaatca ctctgttcat tcctccaggt    420
attcgttatc taatagggca attaattcct tcagcacttt                          460
 
<210>128
<211>525
<212>DNA
<213>human
<400>128
ccaggagggg ctgtccaatc acattcaggc atgcgaatga gctgggccct gggtgaggtg     60
ggggtctggc ctagtgggga ggggcctggc ctgggtgggg cagggcctgg cctggtccag    120
gcttgggctc cattcccatc actgctgtcc ctcctgaggt ctggattggg gatggggaca    180
aagaaatagc aagagatgag aaacaacaga aacttttttc tctaaaggac tggttaaatc    240
aattctgata cagccttaca atacaatagt atgcagctaa aaaataattg tatgtcttta    300
tatactaata tgtaataatc ttcaggtgaa aaaggcaagc cacagaaatg tgtatagcgc    360
acttcccatt tgtgtttcag aaaggagtag aatataaaca cataattgct tatgtatgcc    420
tattcagaat aaatgggtaa cactgattac ttttgggagg ggaaccagta ggttgaggac    480
aggagaggga agggtcttaa cacttacacc cttttgtaca ttttg                  525
 
<210>129
<211>515
<212>DNA
<213>human
<400>129
aggagcccag gaacgacgtg gtcttccagc ccatttccgg ggaagacgtg cgcgatgtga     60
cagccctgaa cgtgagcacg ctgaaggctt acttcagatg cgatggctac aagggctacg    120
acctggtcta cagcccccag agcggcttca cctgcgtgtc cccgtgcagt aggggctact    180
gtgaccatgg aggccagtgc cagcacctgc ccagtgggcc ccgctgcagc tgtgtgtcct    240
tctccatcta cacggcctgg ggcgagcact gtgagcacct gagcatgaaa ctcgacgcgt    300
tcttcggcat cttctttggg gccctgggcg gcctcttgct gctgggggtc gggacgttcg    360
tggtcctgcg cttctggggt tgctccgggg ccaggttctc ctatttcctg aactcagctg    420
aggccttgcc ttgaaggggc agctgtggcc taggctacct caagactcac ctcatcctta    480
ccgcacattt aaggcgccat tgcttttggg agact                               515
 
<210>130
<211>339
<212>DNA
<213>human
<400>130
agcagcttat tgtttctctg aaagtgtgtg tagttttact ttcctaagga attaccaaga     60
atatccttta aaatttaaaa ggatggcaag ttgcatcaga aagctttatt ttgagatgta    120
aaaagattcc caaacgtggt tacattagcc attcatgtat gtcagaagtg cagaattggg    180
gcacttaatg gtcaccttgt aacagttttg tgtaactccc agtgatgctg tacacatatt    240
tgaagggtct ttctcaaaga aatattaagc atgttttgtt gctcagtgtt tttgtgaatt    300
gcttggttgt aattaaattc tgagcctgat attgatatg                           339
 
<210>131
<211>377
<212>DNA
<213>human
<400>131
gagaacgggt acattcaccc ggtcaacctg acgtggccct ttatggtggc cgggaaaccc     60
gagagtgacc tgaaagaagt ggtgaccgcg agccgcttat gtggaaccac cgcgtcctga    120
ccttggaggt gcgagtctgg gaaaggcgcg ctcccggggg gagcgggccc cgggaaggcg    180
acccctgccc tcagtgctct ctgtctctgc ttccccctcg caatgctcct ctctctgtcc    240
caccccgcga gaacacttta caacgacgag gagattcgtt tccaaaccag aggagatcaa    300
ttgtacttac aaagattccc atctatttaa ctttattaac ttctaccgtg aatgactctg    360
caagccttgc tggtcca                                                   377
 
<210>132
<211>252
<212>DNA
<213>human
<400>132
ttctctcgac cacttaaaac ttcagacttc ctgtcctgct ggtatcatgg agaaagtcca     60
atacctcact cgctcagcta taagaagagc ctcaaccatt gaaatgcctc aacaagcacg    120
tcaaaagcta cagaatctat ttatcaattt ctgtctcatc ttaatatgtc tcttgctgat    180
ctgtatcatc gtgatgcttc tctgaagttc tgctacaacc tctagatctg cagcttgcca    240
catcagctta aa                                                        252
 
<210>133
<211>191
<212>DNA
<213>human
<400>133
tggcccatct attacatcta cagctgaccc ttgaacatgg gggttagggg agctgacaat     60
tcgtgggtcc gcaaaatctt aactacctaa tagcctacta ttgaccataa accttactga    120
taacataaac agtaaattaa cacatatttt gcgtgttata tgtattatac actatattcc    180
tacaataaag t                                                         191
<210>134
<211>371
<212>DNA
<213>human
<400>134
aaatctgttc taagacatat gatcaacaga tgagaactgg tggttaatat gtgacagtga     60
gattagtcat atcactaata tactaacaac agaatctaat cttcatttaa ggcactgtag    120
tgaattatct gagctagagt tacctagctt accatactat atctttggaa tcatgaaacc    180
ttaagacttc agaatgattt tgcaggttgt cttccattcc agcctaacat ccaatgcagg    240
caaggaaaat aaaagatttc cagtgacaga aaaatatatt atctcaagta ttttttaaaa    300
atatatgaat tctctctcca aatattaact aattattaga ttatattttg aaatgaactt    360
gttggcccat c                                                         371
 
<210>135
<211>441
<212>DNA
<213>human
<400>135
ggacaaagag cgctatgtct ccctggtgat gcctgtggcc ctgttcaacc tgattgacac     60
ttttcccttg agaaaagaag agatggtcct acaagccgaa atgagccaga cctgtaacac    120
ctgacatgat ggttcctctc ttggcaattc ctcttcattg tctacatagt gacatgcaca    180
cgggaaagcc ttaaaaatat ccttgatgta cagattttat ttgtaatttt aaaagtctat    240
tttattatga gctttctttg cacttaaaaa ttagcatgct gctttttgta cttggaagtg    300
tttcaaaaaa ttatatgacc atatttactc tttctaacct ttctttactc catcatggct    360
ggttgatttg tagagaaatt agaacccata accatacaca ggctatcaac atgttattca    420
atgtgacacc taactctttt c                                              441
 
<210>136
<211>402
<212>DNA
<213>human
 
<220>
<221>misc_feature
<222>(353)..(353)
<223>n is a，c，g，or t
<400>136
tactcatgcc tttttgttta ggataaatag gtaagcacaa agagctcttc aaaatcagaa     60
aaaacaatag gagtccttcc ttgtcttttc tgtgatctct gtccttgttt ctgagacttt    120
ctctaccatt aagctctatt ttagctttca gttattctag tttgtttccc atggaatctg    180
tcctaaactg gtgtttttgt cagtgacagt cttgccagtc agcaatttct aacagcattt    240
taaatgagtt tgatgtacag taaatattga tgacaatgac agcttttaac tcttcaagtc    300
acctaaagct attatgcagg aggatttaga agtcacattc ataaaaccca agngctatgg    360
gtgtattatt catgatagct ggcccacagg tcatgaattg ag                       402
 
<210>137
<211>174
<212>DNA
<213>human
<400>137
agaagctcac caagtcaact aaacagcccc gaggacttac atcaccttct cagctcttga     60
cctcagaaag tatccaaacc aaggaggaga aacctgtggg tggcttgtcc tccagtgaca    120
caatggatta ccgacagtga ctaagggcag catgtttaac ccaggtgaag atct          174
 
<210>138
<211>371
<212>DNA
<213>human
<400>138
tttctggcct tcacccagac gaagaccttc cacgaggcca gcgaggactg catctcgcgc     60
gggggcaccc tgagcacccc tcagactggc tcggagaacg acgccctgta tgagtacctg    120
cgccagagcg tgggcaacga ggccgagatc tggctgggcc tcaacgacat ggcggccgag    180
ggcacctggg tggacatgac cggcgcccgc atcgcctaca agaactggga gactgagatc    240
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ggcaagtggt tcgacaagcg ctgccgcgat cagctgccct acatctgcca gttcgggatc    360
gtgtagccgg c                                                         371
 
<210>139
<211>406
<212>DNA
<213>human
<400>139
gcagactggg agttgctagc aaacaaatgg cttacttaca aaagcagctt ttagttcaga     60
cttagttttt ataaaatgag aattctgact tacttaacca ggtttgggat ggagatggtc    120
tgcatcagct ttttgtatta acaaagttac tggctctttg tgtgtctcca ggtaactttg    180
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ttgtctgtct gctcttattt ttgtaccata ttgctcttaa aaatcttggt ttggtacagt    300
tcataattca ccaaaaagtt catataattt aaagaaacac taaattagtt taaaatgaag    360
caatttatat ctttatgcaa aaacatatgt ctgtctttgc aaagga                   406
 
<210>140
<211>388
<212>DNA
<213>human
<400>140
gcacccagcc ttttaccatg tgggtttctt tagtgtctta aaagcgtcca taagccacca     60
ttctgtggaa ccaaggcccc ctccacgcaa acaccctccc tcctggggac ctctggagcc    120
tcagccagaa gtaccattag gtttaatttt aatttgtttt gctggagaaa catcaggttt    180
gtaggagact gagttgttag caggtgtgct tagctcttga tagtgaacgt gtaccttggg    240
aactggctca cccacctgct aatagcacca tcgtcactat taagcagaca tttcagttgg    300
tagaatccat gtagaagtca tggacttttc tgggaaatga cttttctggg aaatgacagt    360
ttctttgaca tattttcttt gcccactt                                       388
 
<210>141
<211>317
<212>DNA
<213>human
<400>141
cgccatcacc gagcgcttga tgtgcgcgga gagcaatcgc cgggacagct gcaagggtga     60
ctccgggggc ccgctggtgt gcgggggcgt gctcgagggc gtggtcacct cgggctcgcg    120
cgtttgcggc aaccgcaaga agcccgggat ctacacccgc gtggcgagct atgcggcctg    180
gatcgacagc gtcctggcct agggtgccgg ggcctgaagg tcagggtcac ccaagcaaca    240
aagtcccgag caatgaagtc atccactcct gcatctggtt ggtctttatt gagcacctac    300
tatatgcaga aggggag                                                   317
 
<210>142
<211>317
<212>DNA
<213>human
<400>142
gggccacgcc aggaatattc agaaaataat gagaactaca ttgaagtgcc attgattttt     60
gatcctgtca caagagagga tttgcacatg gattttaaat gtgttgtcca taataccctg    120
agttttcaga cactacgcac cacagtcaag gaagcctcct ccacgttctc ctggggcatt    180
gtgctggccc cactttcact ggccttcttg gttttggggg gaatatggat gcacagacgg    240
tgcaaacaca gaactggaaa agcagatggt ctgactgtgc tatggcctca tcatcaagac    300
tttcaatcct atcccaa                                                   317
 
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<212>DNA
<213>human
<400>143
gctgctctgg ttctcatgac ggcagatgca gcgaagaggc tcaatgttac accactggca    60
agaatagtag catttgctga cgctgctgta gaacctattg attttccaat tgctcctgta    120
tatgctgcat ctatggttct taaagatgtg ggattgaaaa aagaagatat tgcaatgtgg    180
gaagtaaatg aagcctttag tctggttgta ctagcaaaca ttaaaatgtt ggagattgat    240
ccccaaaaag tgaatatcaa tggaggagct gtttctctgg gacatccaat tgggatgtct    300
ggagccagga ttgttggtca tttgactcat gccttgaagc aaggagaata cggtcttgcc    360
agtatttgca atggaggagg aggtgcttct gccatgctaa ttcagaagct gtagacaacc    420
tctgctattt aaggagacaa ccctatgtga ccagaa                              456
 
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<212>DNA
<213>human
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ggaaagcagg attccatcgc tggaacaatt acatgatgga ctggaaaaat caatttaacg     60
attacactag caagaaagaa agttgtgtgg gtctctaatt aatagattta ccctttatag    120
aacatatttt cctttagatc aaggcaaaaa tatcaggagc ttttttacac acctactaaa    180
aaagttatta tgtagctgaa acaaaaatgc cagaaggata atattgattc ctcacatctt    240
taacttagta ttttacctag catttcaaaa cccaaatggc tagaacatgt ttaattaaat    300
ttcacaatat aaagttctac agttaattat gtgcatatta aaacaatggc ctggttcaat    360
ttctttcttt ccttaataaa tttaagtttt ttccccccaa aattatcagt gctctgcttt    420
tagtcacgtg tattttcatt accactcgta aaaaggtatc ttttttaaat gaattaaata    480
ttgaaacact gtacaccata gtttaca                                        507
 
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<212>DNA
<213>human
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gagggtgatg ccatctaacc ctgcccctgt ccaccccggg tgggtgaaac tcactgagca     60
gccaagactg ttgcccgagg actcactgta tggtgccctc tccaaagggt cgggagggta    120
gctctccagg ccagagcttg tgtccttcaa cagagaggcc agcggcaact ggtccgttac    180
tggccaaggg ctctgaagaa tcaacggtgc tggtacagga tacaggaata aattgtatct    240
tcacctggtt cctaccctcg tccctacctg tcctgatcct ggtcctgaag acccctcgga    300
acaccctctc ctggtggcag gccacttccc tcccagtgcc agtctccatc caccccagag    360
aggaacaggc gggtgggcca tgtggttttc tccttcctgg ccttggctgg cctctggggc    420
aggggtggtg gagagatgga agggcatcag gtgtagggac cctgccaagt ggcacctgat    480
ttactctag                                                            489
 
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<212>DNA
<213>human
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ttaatgtgcc aaggagccgt tttctgcctg tcaaaaccac atcagatctc ttgctggtga     60
tgtcaaacct ctatagtctt aatgcaggat ctctgacaat gagtgaaaag cgggaatttc    120
ctacagtgcc cttggttaaa ttaggcagtt cttttacgaa ggttcaagat tatctaagaa    180
gatttgaaag tataccagat atgcttgaat tggatcacct cacagtttca ggagatgtga    240
catttggaaa aaatgtttca ttaaagggaa cggttatcat cattgcaaat catggtgaca    300
gaattgatat cccacctgga gcagtattag agaacaagat agtgtctgga aaccttcgca    360
tcttggacca ctgaaatgaa aaatactgtg gacacttaaa taatgggcta gtttcttaca    420
atgaaatgtt ctctaggatt taggcactaa aaggtacttt actatgttac tgtaccctgc    480
 
<210>147
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<212>DNA
<213>human
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caagaatgat gggcactacc gtggagatcc caactggttt atgaagaaag cgcaggagca     60
taagagggaa ttcacagaga gccagctgca ggagggaaag catgtcattg gccttcagat    120
gggcagcaac agaggggcct cccaggccgg catgacaggc tacggacgac ctcggcagat    180
catcagttag agcggagagg gctagccctg agcccggcgc tcccccagct ccttggctgc    240
agccatcccg cttagcctgc ctcacccaca cccgtgtggt accttcagcc ctggccaagc    300
tttgaggctc tgtcactgag caatggtaac tgcacctggg cagctcctcc ctgtgccccc    360
agcctcagcc caacttctta cccgaaagca tcactgcctt ggcccctccc tcccggcggc    420
ccccatcacc tctactgtct cctccctggg ctaagcaggg gagaagcggg ctgggggtag    480
cctggatgtg ggcgaagtcc actgtcctcc ttggcggcaa aagcccatt                529
 
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tcaaagactt cgtgattatc cccctgcaca ccaccccaga gacatccgtt aaggagatcg     60
atgagttggt tgaggtctac acggacgtga aacaccgctg gaaggcggag aatttcattt    120
tcatgggtga cttcaatgcc ggctgcagct acgtccccaa gaaggcctgg aagaacatcc    180
gcttgaggac tgaccccagg tttgtttggc tgatcgggga ccaagaggac accacggtga    240
agaagagcac caactgtgca tatgacagga ttgtgcttag aggacaagaa atcgtcagtt    300
ctgttgttcc caagtcaaac agtgtttttg acttccagaa agcttacaag ctgactgaag    360
aggaggccct ggatgtcagc gaccactttc cagttgaatt taaactacag tcttcaaggg    420
ccttcaccaa cagcaaaaaa tctgtcactc taaggaagaa aacaaagagc aaacgctcct    480
agacccaagg gtctcatctt attaaccatt tcttgcctct aaata                    525
 
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<213>human
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aacgaggagc acatgaccct gctgaagatg attttgataa aatgctgtga tatctctaac     60
gaggtccgtc caatggaagt cgcagagcct tgggtggact gtttattaga ggaatatttt    120
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aaagtgacca aggccacagc ccagattggg ttcatcaagt ttgtcctgat cccaatgttt    240
gaaacagtga ccaagctctt ccccatggtt gaggagatca tgctgcagcc actttgggaa    300
tcccgagatc gctacgagga gctgaagcgg atagatgacg ccatgaaaga gttacagaag    360
aagactgaca gcttgacgtc tggggccacc gagaagtcca gagagagaag cagagatgtg    420
aaaaacagtg aaggagactg tgcctgagga aagcgggggg cgtggctgca gttctggacg    480
ggctggccga gctgcgcggg atccttgtgc agggaagagc tgccctgggc acctggcacc    540
acaagaccat gttttctaa                                                 559
 
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tgacgcaaaa taccaccttg gcgcctacac gggagacgac gtccgcatcg tccgtgacga     60
catgctgtgt gccgggaaca cccggaggga ctcatgccag ggcgactccg gagggcccct    120
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tgcccagccc aaccggcctg gcatctacac ccgtgtcacc tactacttgg actggatcca    240
ccactatgtc cccaaaaagc cgtgagtcag gcctgggttg gccacctggg tcactggagg    300
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ct                                                                   542
 
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gaagagggag ctctattgcc accatgagtt tctccggcaa gtaccaactg cagagccagg     60
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<213>human
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ccttctctgg tctccttgag atgatcgtag acacagggat gattcccacc caaacccacg     60
tattcattca gtgagttaaa cacgaattga tttaaagtga acacacacaa gggagcttgc    120
ttgcagatgg tctgagttct tgtgtcctgg taattcctct ccaggccaga ataattggca    180
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ccctgcccag cccatttggg ctctggtttt ctggtggggc tgtcctgctg ccctcccaca    300
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gcttaggtct catggaccag tggctggtct cacccaactg cagtttacta ttgctatctt    420
ttctggatga tcagaaaaat aattccataa atctattgtc tacttgcgat tttttaaaaa    480
atgtatattt ttatatatat tgttaaatcc tttgcttcat tcca                     524
 
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<212>DNA
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tctcccaacc tctactgtaa actttctggt ccgagaacga gccgaacaca gcgcgacgca     60
gggactagga cggcccggtg accgcgcgga ttcaggattg cggggacgca gaaaggttaa    120
ggcactttta aaaactatag caaggctcct gtttatttat tctactttct ttccctaata    180
atcaaaacac cgcgtaggct cctccgttta tcagtattaa tggtgtaact ttgttggcaa    240
tatttgccgt gtagaatttt ttttagatat ccattgtaaa tttgaaacaa agaccgatct    300
gtgtaaaaac aaatttccat atgttttata taaatatata tataatatga aggactaccc    360
tccttttttt ttttttgtat tttggctgct agagtgcagc atttgtgaca cgtatttgaa    420
atttgaaatt tccttctgca ctgtataaaa ggaccatttg aggatgtttt gccttttgtg    480
tatttt                                                               486
 
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<212>DNA
<213>human
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gagccccatt cacaaatttt gacccctcta ctctccttcc ttcatccctg gatttctgga     60
cctaccctgg ctctctgact catcctcctc tttatgagag tgtaacttgg atcatctgta    120
aggagagcat cagtgtcagc tcagagcagc tggcacaatt ccgcagcctt ctatcaaatg    180
ttgaaggtga taacgctgtc cccatgcagc acaacaaccg cccaacccaa cctctgaagg    240
gcagaacagt gagagcttca ttttgatgat tctgagaaga aacttgtcct tcctcaagaa    300
cacagccctg cttctgacat aatccagtta aaataataat ttttaagaaa taaatttatt    360
tcaatattag caagacagca tgccttcaaa tcaatctgta aaactaagaa acttaaattt    420
tagttcttac tgcttaattc aaataataat tagtaagcta gcaaatagta atctgtaagc    480
ataagcttat cttaaattca agtttagttt gaggaattct ttaaaattac aactaagtga    540
tttgtatgtc tatttttttc                                                560
 
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<212>DNA
<213>human
<400>155
ggcagctttt ttatcagcct tgctttggat aggacctcca aggactaagc ctccagcccc     60
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aatgtatcta gtgtgtcctg tgacaacact catcacactt cattgtaaat cacttgtttt    180
attgactgtc tttcctatag actgtaagct ccatgagggc aggcacatgt tgttctcatt    240
gaccgtgctg gccccagtgc ctagatgcat ggctggcaca ttgttggcac tcaacaatgg    300
ttgaatgaat aaaacaataa atgaatgaat aactaagata tagaaactct catttatatt    360
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tttcattaga tacagtagtg tcatcactct tttaagatct tgttaaagat ttcaaataaa    480
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<212>DNA
<213>human
<400>156
tatttgaata tgtatcgtgc cccctccgga gtctttgatc aggatgacat gtgccatttt     60
tcagaggacg tgcagacagg ctggcattct agattacttt tcttactctg aaacatggcc    120
tgtttgggag tgcgggattc aaaggtggtc ccacggctgc ccctactgca aatggcagtt    180
ttaatcttat cttttggctt ctgcagatgg ttgcattgat ccttaaccaa taatggtcag    240
tcctcatctc tgtcctgact tcataggt                                       268
 
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<212>DNA
<213>human
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ctttctatat tgttatcagt ccaggaaaca ggtaaacaga tgtaattaga gacattggct     60
ctttgtttag gcctaatctt tctttttact tttttttttc ttttttcttt ttttttaaag    120
atcatgaatt tgtgacttag ttctgccctt tggagaacaa aagaaagcag tcttccatca    180
aatcacctta aaatgcacgg ctaaactatt cagagttaac actccagaat tgttaaatta    240
caagtactat gctttaatgc ttctttcatc ttactagtat ggcctataaa aaaaataata    300
ccacttgatg ggtgaaggct ttggcaatag aaagaagaat agaattcagg ttttatgtta    360
ttcctctgtg ttcacttcgc cttgctcttg aaagtgcagt atttttctac atcatgtcga    420
gaatgattca atgtaaatat ttttcatttt atcatgtata tcctatacac acatctcctt    480
catcatcata tatgaagttt attttgagaa gtctacattg cttacattt                529
 
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<212>DNA
<213>human
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taacaatcca tgatgctgtt ttgcatattt tgatgaagaa agattacagt acttcaaagt     60
ttaatcccag tcaggaaaaa gatggaaaaa ttgattttac cataaataca aatggaggat    120
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gttctagcat ggcatatttt tcacatatct agtatgaaat tatataagta ttctaaattt    360
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<212>DNA
<213>human
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tcatcaggct ccagttattc tccatctccc agctcagctt tttctgtctg taagcctgat     60
tttcaggaag gctctttcct agtgatggag atgaccacca tcagctccag gcttctatcc    120
tgctaaccca gtaacccagt gggaagagat ttacttattc caataattcc aagtggagag    180
tgtcattgac ccgtttgggg tctcatctct acttctaggg gaatgaaaca ctttgagtgg    240
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tggggtgaaa ggtggttgct taaaggaaaa tgaaatacaa ttagcagaat aaggggaaac    360
gagtggtctg ctctgctcgg gcaaaacaag agatgcccat tactgtgagg gacccttgaa    420
gtctggactc ttaaatgggt ttttgctgat ttcctgggtg catgctagg                469
 
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accagcaaca acttcaatcc ggtggagaac aaagatattg tggttttaac ctgtcaacct     60
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atattagtta ccctggtgtg ctgtattctc taaaaccttt aaatgtttgc atgcagccat     60
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ccaatcagtt tatttaaatc aatttattta tattcttctg ttcctggatt cccattttac    480
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ccgtaccgtc ctgacgtttt gaaacaatac agatgccttc ccttgtagca gttttcagcc    240
tcctctaccc tacatgatct ggagcaacag ctaggaaata tcattaattc tgctcttcag    300
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gtgccatgcg taaggcatca acgtgtatct gtgggatctt cgttgccttc agtaatcagg    180
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ttcaaaaagg cagtgctaag cacaagattt caagaaagcc tcttcttgtt gcctagctga    300
gtgggagagt cattttcccc agacactaca tttggataca ggtgccaaag aacattatta    360
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acaacgtttt tacaaggttg ttttctacca ccatatttta aagatatttt tatgaccgtg    480
tatactcaca ctttgctt                                                  498
 
<210>166
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<213>human
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ctgtaaaatt attactgtat tgtgtactgg ctataagatg tagacacctt tcagtaagcc    300
aatcatttgt aaccattcta gcagtgtcat attaggttaa taaggctgct gtgttttaaa    360
gggcattttt atttgggttt tggtgaaatt ctttaatttg ttgattatat tcacataaaa    420
tcagcattca ttgacacata gctctaatga catatgtatg aaaaaccata cactggatga    480
cctagtcga                                                            489
 
<210>167
<211>556
<212>DNA
<213>human
<400>167
ctgatggttc tttctctgat gagatgaaca ccattcttga taatcttgcc gccagggact     60
ttataaactg gttgattcag accaaaatca ctgacaggaa ataactatat cactattcaa    120
gatcatcttc acaacatcac ctgctagcca cgtgggatgt ttgaaatgtt aagtcctgta    180
aatttaagag gtgtattctg aggccacatt gctttgcatg ccaataaata aattttcttt    240
tagtgttgtg tagccaaaaa ttacaaatgg aataaagttt tatcaaaata ttgctaaaat    300
atcagcttta aaatatgaaa gtgctagatt ctgttatttt cttcttattt tggatgaagt    360
accccaacct gtttacattt agcgataaaa ttatttttct atgatataat ttgtaaatgt    420
aaattattcc gatctgacat atctgcatta taataatagg agaatagaag aactggtagc    480
cacagtggtg aaattggaaa gagaactttc ttcctgaaac ctttgtctta aaaatactca    540
gctttcaatg tatcaa                                                    556
 
<210>168
<211>244
<212>DNA
<213>human
<400>168
gccggctcct gcaagtgcaa aaagtgcaaa tgcacctcct gcaagaagag ctgctgctcc     60
tgttgccccc tgggctgtgc caagtgtgcc cagggctgca tctgcaaagg ggcgtcagag    120
aagtgcagct gctgtgcctg atgtcgggac agccctgctg tcagatgaaa acagaatgac    180
acgtaaaatc cgaggttttt tttttctaca actccgactc atttgctaca ttcctttttt    240
tctg                                                                 244
 
<210>169
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<212>DNA
<213>human
<400>169
ttccctgctg gaggatccca agattaagga gattgctgca aagcacaaaa aaaccgcagc     60
ccaggttctg atccgtttcc atatccagag gaatgtgatt gtcatcccca agtctgtgac    120
accagcacgc attgttgaga acattcaggt ctttgacttt aaattgagtg atgaggagat    180
ggcaaccata ctcagcttca acagaaactg gagggcctgt aacgtgttgc aatcctctca    240
tttggaagac tatcccttca atgcagaata ttgaggttga atctcctggt gagattatac    300
aggagattct ctttcttcgc tgaagtgtga ctacctccac tcatgtccca ttttagccaa    360
gcttatttaa gatcacagtg aacttagtcc tgttatagac gagaatcgag gtgctgtttt    420
agacatttat ttctgtatgt tcaactagga tcagaatatc acagaaaagc atggcttgaa    480
taaggaaatg acaatttttt ccacttatct gatcagaaca aatgtttatt aagcatcaga    540
aactctgcca acactga                                                   557
 
<210>170
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<212>DNA
<213>human
<400>170
taagtccagt agtagcaaag ccccaaatca aagccagcaa gaccacagtc acaggagata     60
aggactctgt gaacctgacc tgctccacaa atgacactgg aatctccatc cgttggttct    120
tcaaaaacca gagtctcccg tcctcggaga ggatgaagct gtcccagggc aacaccaccc    180
tcagcataaa ccctgtcaag agggaggatg ctgggacgta ttggtgtgag gtcttcaacc    240
caatcagtaa gaaccaaagc gaccccat                                       268
 
<210>171
<211>459
<212>DNA
<213>human
<400>171
tgagcctggg gttctggtgt tagaatattt ttaagtaggc tttactgaga gaaactaaat     60
attggcatac gttatcagca acttcccctg ttcaatagta tgggaaaaat aagatgactg    120
ggaaaaagac acacccacac cgtagaacat atattaatct actggcgaat gggaaaggag    180
accattttct tagaaagcaa ataaacttga tttttttaaa tctaaaattt acattaatga    240
gtgcaaaata acacataaaa tgaaaattca cacatcacat ttttctggaa aacagacgga    300
ttttacttct ggagacatgg catacggtta ctgacttatg agctaccaaa actaaattct    360
ttctctgcta ttaactggct agaagacatt catctatttt tcaaatgttc tttcaaaaca    420
tttttataag taatgtttgt atctatttca tgctttact                           459
 
<210>172
<211>482
<212>DNA
<213>human
<400>172
atttctttgg cagttttcgt gctaatgttt ttgctaagga agataagctc tgaaccatta     60
aaggacgagt ttaaaaacac aggatcaggt ctcctgggca tggctaacat tgacctggaa    120
aagagcagga ctggtgatga aattattctt ccgagaggcc tcgagtacac ggtggaagaa    180
tgcacctgtg aagactgcat caagagcaaa ccgaaggtcg actctgacca ttgctttcca    240
ctcccagcta tggaggaagg cgcaaccatt cttgtcacca cgaaaacgaa tgactattgc    300
aagagcctgc cagctgcttt gagtgctacg gagatagaga aatcaatttc tgctaggtaa    360
ttaaccattt cgactcgagc agtgccactt taaaaatctt ttgtcagaat agatgatgtg    420
tcagatctct ttaggatgac tgtatttttc agttgccgat acagcttttt gtcctctaac    480
tg                                                                   482
 
<210>173
<211>519
<212>DNA
<213>human
<400>173
gaagacacta ccaacatgat attacgtatt gatctgacca cacacaatgt tactctagaa     60
gaaccaatag aaatcaactg gtcatgaaga tcaccatcaa ttttagttgt caatgggaaa    120
aaacaccagg atttaagttt cacagcactt acaattttcc ctcttcactt ggttcttgta    180
ctctacaaaa tatagctttc ataacatcga aaagttattt tgtagcgtac atcaatgata    240
atgctaattt tattatagta atgtgacttg gattcaattt taaggcatat ttaacaaaat    300
ttgaatagcc ctatttatcc ttgttaagta tcagctacaa ttgtaaacta gttactaaac    360
atgtatgtaa atagctaaga tataatttaa acgtgatttt taaattaaat aaaattttta    420
tgtaattata tatactatat ttttctcaat gtttagcaga tttaagatat gtaacaacaa    480
ttatttgaag atttaattac ttcttagtat gtgcattta                           519
 
<210>174
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<212>DNA
<213>human
<400>174
attgcaattt cttaggtaac cttatattta caataaatga agattaccct caaatgctag     60
aagctgtcta ggtccgtccg gtgtgtcaga tttcctcaga ttagatgtgc caataaccaa    120
gtttattcag taaacaactt gtacttgttt catctggttt attactctca cccataaaca    180
gtaatgactc tctgaccctc tggaaatatg taatgcttcc aatcttg                  227
 
<210>175
<211>478
<212>DNA
<213>human
<400>175
ttttggacct gcggtggtgg ccaaccactg gaacttccac tggatctact ggctgggccc     60
actcctggct ggcctgcttg ttggactgct cattaggtgc ttcattggag atgggaagac    120
ccgcctcatc ctgaaggctc ggtgagcaga gctcgtggga ttcctgctgc tccaggtgtc    180
ctcagctcac ctgtcccaga ctgaggacag gggagttcct gcatttcctg ccagggcaga    240
ggcccagagg agcgaccccc tgcttccact gcttgggcct gctttctcag atagactgac    300
tgctgaggag gctctaggtt cttggaattc ctttgtgctc atcagagacc ccagcctggg    360
gaacacgctg cccgcactgc ccagagagca gtgcaaacac cacaacacga gcgtgtttct    420
tgagaggaat gtccccgagt tggacaagga ggctgtttct gcacatcagc tcatttcc      478
 
<210>176
<211>436
<212>DNA
<213>human
<400>176
gaggggtcac cgtgcaggat ggaaatttct ccttttctct ggagtcagtg aagaagctca     60
aagacctcca ggagccccag gagcccaggg ttgggaaact caggaacttt gcacccatcc    120
ctggtgaacc tgtggttccc atcctctgta gcaacccgaa ctttccagaa gaactcaagc    180
ctctctgcaa ggagcccaat gcccaggaga tacttcagag gctggaggaa atcgctgagg    240
acccgggcac atgtgaaatc tgtgcctacg ctgcctgtac cggatgctag gggggcttgc    300
ccactgcctg cctcccctcc gcagcaggga agctcttttc tcctgcagaa agggccaccc    360
atgatactcc actcccagca gctcaaccta ccctggtcca gtcgggagga gcagcccggg    420
gaggaactgg gtgact                                                    436
 
<210>177
<211>234
<212>DNA
<213>human
<400>177
tcgtctgctt cacaagctat cgctatggtg ttcgtgcgca ggccgtggcc cgccttgacc     60
acagtgcttc tggccctgct cgtctgccta ggggcgctgg tcgacgccta ccccatcaaa    120
cccgaggctc ccggcgaaga cgcctcgccg gaggagctga accgctacta cgcctccctg    180
cgccactacc tcaacctggt cacccggcag cggtatggga aaagagacgg cccg          234
 
<210>178
<211>287
<212>DNA
<213>human
<400>178
tatttgaata tgtatcgtgc cccctccggt gtctttgatc aggatgacat gtgccatttt     60
tcagaggacg tgcagacagg ctggcattct agattacttt tcttactctg aaacatggcc    120
tgtttgggag tgcgggattc aaaggtggtc ccaccgctgc ccctactgca aatggcagtt    180
ttaatcttat cttttggctt ctgcagatgg ttgcaattga tccttaacca ataatggtca    240
gtcctcatct ctgtcctgct tcataggtgc caccttgtgt gtttaaa                  287
 
<210>179
<211>536
<212>DNA
<213>human
<400>179
tgacgcaaaa taccaccttg gcgcctacac gggagacgac gtccgcatcg tccgtgacga     60
catgctgtgt gccgggaaca cccggaggga ctcatgccag ggcgactccg gagggcccct    120
ggtgtgcaag gtgaatggca cctggctgca ggcgggcgtg gtcagctggg gcgagggctg    180
tgcccagccc aaccggcctg gcatctacac ccgtgtcacc tactacttgg actggatcca    240
ccactatgtc cccaaaaagc cgtgagtcag gcctgggttg gccacctggg tcactggagg    300
accaacccct gctgtccaaa acaccactgc ttcctaccca ggtggcgact gccccccaca    360
ccttccctgc cccgtcctga gtgccccttc ctgtcctaag ccccctgctc tcttctgagc    420
cccttcccct gtcctgagga cccttcccca tcctgagccc ccttccctgt cctaagcctg    480
acgcctgcac cgggccctcc ggccctcccc tgcccaggca gctggtggtg ggcgct        536
 
<210>180
<211>472
<212>DNA
<213>human
<400>180
atgatcacaa aatgttgcct gttttgtttc cgaaagcttg ccaaaacagg aaagaagaag     60
aaaagggatt agttatatca aaagcctgaa gtggaatgac caaaagatgg gactcctcct    120
ttattccagc atggagggtt ttaaatggag gatttccttt ttcctgcgac aaaacgtctt    180
ttcacaactt accctgttaa gtcaaaattt attttccagg aatttaatat gtactttagt    240
tggaattatt ctatgtcaat gatttttaag ctatgaaaaa taataatata aaaccttatg    300
ggcttatatt gaaatttatt attctaatcc aaaagttacc ccacacaaaa gttactgagc    360
ttccttatgt ttcacacatt gtatttgaac acaaaacatt aacaactcca ctcatagtat    420
caacattgtt ttgcaaatac tcagaatatt ttggcttcat tttgagcaga at            472
 
<210>181
<211>334
<212>DNA
<213>human
<400>181
caagtatcgg ggctctgcta tcaaggtgca aagtccttcg tggatgcaac ctcaaccata     60
tattctacag caccctggtg ccgtgttaac tccctcaatg gagcacacca tgtcactaca    120
gcccgcatca atgatcagcc ctctggccca gcagatgagt catctgtcac taggcagcac    180
cggaacatac atgcctgcaa cgtcagctat gcaaggagcc tacttgccac agtatgcaca    240
tatgcagacg acagcggttc ctgttgagga ggcaagtggt caacagcagg tggctgtcga    300
gacgtctaat gaccattctc catatacctt tcaa                                334
 
<210>182
<211>475
<212>DNA
<213>human
<400>182
tggactggtg tcgagccaag actcggggcc tacgagcacg tcgacatcca gaacttctcc     60
tccagctgga gtgatgggat ggccttctgt gccctggtgc acaacttctt ccctgaggcc    120
ttcgactatg ggcagcttag ccctcagaac cgacgccaga acttcgaggt ggccttctca    180
tctgcggaga tgctggtgga ctatgtgccc ctggtggagg tggacgacat gatgatcatg    240
ggcaagaagc ctgaccccaa gtgtgtcttc acctatgtgc agtcgctcta caaccacctg    300
cgacgccacg aactggcctc gcgcggcaag aatgtctagc ctgcccgccc gcatggccag    360
ccagtggcaa ctgccgcccc cactctccgg gcaccgtctc ctgcctgtgc gtccgcccac    420
cgctgccctg tctgttgcga caccctcccc cccacataca cacgcagcgt tttga         475
 
<210>183
<211>561
<212>DNA
<213>human
<400>183
ggatgtgata gcattcctgc tggcctgcgt ggcaactgtg atatttatca tcacaaaatt     60
ttgcctgttt tgtttccgaa agcttgccaa aacaggaaag aagaagaaaa gagattagtt    120
atatcaaaag cctgaagtgg aatgactgaa agatgggact cctcctttat ttcagcatgg    180
agggttttaa atggaggatt tcctttttcc tgtgacaaaa catcttttca caacttacct    240
tgttaagaca aaatttattt tccagggatt taatacgtac tttagttgga attattctat    300
gtcaatgatt tttaagctat gaaaaataca atggggggaa ggatagcatt tggagatata    360
cctaatgtta aatgacgagt tactggatgc agcacgcaac atggcacatg tgtatacata    420
tgtagctaac ccttcgttgt gcacatgtac cctaaaactt aaagtataat ttaaaaaaag    480
caaaaaaaaa aaataccaac tctttttttt aaaccaggaa ggaaaatgtg aacatggaaa    540
caacttctag tattggatct g                                              561
<210>184
<211>512
<212>DNA
<213>human
<400>184
gccccggagt gcagctgcgg ggacccgctg ctcgaccccg gcctgccgga gcccgaggcc     60
ccgccccctg cgggtcccga accgcttacc ctcatccctg ggcctgtcga gcccttcagc    120
atcgtgacca tgcccgggcc ccggggtccg gcgccaccct ggctgcccag ccctattggc    180
gaggaggagg agaatctggc ctgagatctt agagcccagc cccctaagga cagggaacca    240
ggtccctgca cggcacccac gcaggtgtcc cggtctgcat aagcctcgta tgcctttgta    300
aagtccacct acacttttga ccagctctcg ctgcccgcat gtgtttggcg ctgtgctagg    360
ggcgggagtt cttccagact cttggaccag cccgccctga ccaccagctc tacttcccaa    420
cccccactgc ctgagaggtc tctatcagtg tcctgcctga attctttcct tcaagtgaag    480
atgtgactga ctacctcctc gagttgtcat ga                                  512
 
<210>185
<211>450
<212>DNA
<213>human
<400>185
gaacccaggg agcgcgatgg gctgcagggc tgcgtcaggg ctcctgccag gagtggccgt     60
ggtcctcctg ctgctgctgc agagcacaca gtcagtctac atccagtacc aaggcttccg    120
ggtccagctg gaatccatga agaagctgag tgacctggag gcacagtggg cacccagccc    180
ccgcctgcag gcccagagcc tcctgcccgc cgtgtgccac caccctgctc tgcctcagga    240
ccttcagcct gtctgcgcct cgcaggaggc ttccagcatc ttcaagaccc tgaggaccat    300
cgctaacgac gactgtgagc tgtgtgtgaa cgttgcgtgt accggctgcc tctgagatag    360
ccctgggtac cctgagccca ccagggacac ctcgcccttc agcccaccac cctggcaggc    420
ttccatcccc gtccatgctc aagatgggtc                                     450
 
<210>186
<211>474
<212>DNA
<213>human
<400>186
ttattcttag cgtcactggt ctggctttca gaattaacat acaaggttgc cacacctagt     60
tctgcccagc tttatgtctt ttattccagt attccaccaa agtttgtttt cctgcattcc    120
agttctcaag tcttaagata aagattgtac ttgacagttt agtatatcca taaaactatt    180
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taggcaatga aaaagtctac taaattagga aaaccttgaa taattaggta tcctaggtaa    300
gagcccctaa acatcaagca atctgtgagt ctgtaaagaa ataaatattt tttggattat    360
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tgtgaaaatc atcacaagtg cctctgaaag cgagtgttag gttggttaga gggt          474
 
<210>187
<211>569
<212>DNA
<213>human
<400>187
gtgacggtgc tgaagaaggc cctggatgaa gagacgcggt cccatgaggc tcaggtccag     60
gagatgaggc agaaacacgc acaggcggtg gaggagctca cagagcagct tgagcagttc    120
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aagctggagg cgcaggtgca gacactgagt ttttagaaaa acatatccac ggtaaccggt    300
ccctggcaat tctgtttaca tgaaatgggg agaaagtcac cgaaatgggt gccgccggcc    360
cccactccca attcattccc taacctgcaa acctttccaa cttctcacgt caggcctttg    420
agaattcttt ccccctctcc tggtttccac acctcagaca cgcacagttc accaagtgcc    480
ttctgtagtc acatgaattg aaaaggagac gctgctccca cggaggggag caggaatgct    540
gcactgttta caccctgact gtgcttaaa                                      569
 
<210>188
<211>422
<212>DNA
<213>human
<400>188
tagtggccgt gaggagcatc ttcagtaaga aggaaggttc tgacagacaa tggaactacg     60
cctgcatgcc cacgccacag agcctcgggg aacccacgga gtgctggtgg gaggagatca    120
acagggctgg catggaatgg taccagacgt gctccaacaa tgggctggtg gcaggattcc    180
agagccgcta cttcgagtca gtgctggatc gggagtggca gttttactgt tgtcgctaca    240
gcaagaggtg cccatattcc tgctggctaa caacagaata tccaggtcac tatggtgagg    300
aaatggacat gatttcctac aattatgatt actatatccg aggagcaaca accactttct    360
ctgcagtgga aagggatcgc cagtggaagt tcataatgtg ccggatgact gaatacgact    420
gt                                                                   422
 
<210>189
<211>183
<212>DNA
<213>human
<400>189
aatgtcatag acactgattt catcgacgag gaagttctta tgtccttggt gatagaaatg     60
ggtttggacc gcatcaagga gctgcccgaa ctctggctgg ggcaaaacga gtttgatttt    120
atgacggact tcgtgtgcaa acagcagccc agcagagtga gctgttgact cgatcgaaac    180
ccc                                                                  183
 
<210>190
<211>434
<212>DNA
<213>human
 
<220>
<221>misc_feature
<222>(158)..(158)
<223>n is a，c，g，or t
<400>190
ccccccaatt gctgccaata gtggataaca tgtatcactc actgccaaaa atagaaagtg     60
accatgaaaa ataaattcgc tggggaaggg ggctccatgc tggtgtggcc aaggctgaga    120
gctctctctt ctctgttaca aaacgagata agcaagtntt agaattgcct taaggccaca    180
ctggcatctc cctgaccttc tccagggaca gaagcaggag taagtttctc atcccatggg    240
cgaccagggc catctcctcc caccagtggc ccccactcac agggagctgg caatgcccta    300
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gccttgctat ttta                                                      434
 
<210>191
<211>463
<212>DNA
<213>human
<400>191
gatgtattaa cctacctgtg aatcatatgt tgtaggaaaa gctgttccca tgtctaacag     60
gacttgaatt caaagcatgt caagtggata gtagatctgt ggcgatatga gagggatgca    120
gtgcctttcc ccattcattc ctgatggaat tgttatacta ggttaacatt tgtaattttt    180
ttctagttgt aatgtgtatg tctggtaaat aggtattata ttttggcctt acaataccgt    240
aacaatgttt gtcattttga aatacttaat gccaagtaac aatgcatgct ttggaaattt    300
ggaagatggt tttattcttt gagaagcaaa tatgtttgca ttaaatgctt tgattgttca    360
tatcaagaaa ttgattgaac gttctcaaac cctgtttacg gtacttggta agagggagcc    420
ggtttgggag agaccattgc atcgctgtcc aagtgtttct tgt                      463
 
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<212>DNA
<213>human
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agggcaagtg ttcccaaatt gacgccacct aataatcatc accacaccgg gagcagatct     60
gaaggcacac tttgattttt ttaaggataa gaaccacaga acactgggta gtagctaatg    120
aaattgagaa gggaaatctt agcatgcctc caaaaattca catccaatgc atactttgtt    180
caaatttaag gttactcagg cattgatctt ttcagtgttt tttcacttag ctatgtggat    240
tagctagaat gcacaccaaa aagatacttg agctgtatat atatatgtgt gtgtgtgtgt    300
gtgtgtgtgt gtgtgtgcat gtatgtgcac atgtgtctgt gtgatatttg gtatgtgtat    360
ttgtatgtac tgttattcaa aatatattta atacctttgg aaaatcttgg gcaagatgac    420
ctactagttt tccttgaaaa aaagttgctt tgttattaat attgtgct                 468
 
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<213>human
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ccgagccgag cttactgtga gtgtggagat gttatcccac catgtaaagt cgcctgcgca     60
ggggagggct gcccatctcc ccaacccagt cacagagaga taggaaacgg catttgagtg    120
ggtgtccagg gccccgtaga gagacattta agatggtgta tgacagagca ttggccttga    180
ccaaatgtta aatcctctgt gtgtatttca taagttatta caggtataaa agtgatgacc    240
tatcatgagg aaatgaaagt ggctgatttg ctggtaggat tttgtacagt ttagagaagc    300
gattatttat tgtgaaactg ttctccactc caactccttt atgtggatct gttcaaagta    360
gtcactgtat atacgtatag agaggtagat aggtaggtag attttaaatt gcattctgaa    420
tacaaactca tactccttag agcttgaatt acatttttaa aatgcatatg tgctgtttgg    480
caccgtggca agatggtatc agagagaaac ccatcaattg ctcaaatact c             531
 
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<212>DNA
<213>human
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ggagctgtca ccatgacggg ggaacttgag gttaagaaca tggacatgaa gccggggtca     60
accctgaaga tcacaggcag catcgccgat ggcactgatg gctttgtaat taatctgggc    120
caggggacag acaagctgaa cctgcatttc aaccctcgct tcagcgaatc caccattgtc    180
tgcaactcat tggacggcag caactggggg caagaacaac gggaagatca cctgtgcttc    240
agcccagggt cagaggtcaa gttcacagtg acctttgaga gtgacaaatt caaggtgaag    300
ctgccagatg ggcacgagct gacttttccc aacaggctgg gtcacagcca cctgagctac    360
ctgagcgtaa ggggcgggtt caacatgtcc tc                                  392
 
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<213>human
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gcgtgttttc ctcttgatcg ggaactcctg cttctccttg cctcgaaatg gaccccaact     60
gctcctgctc gcctgttggc tcctgtgcct gtgccggctc ctgcaaatgc aaagagtgca    120
aatgcacctc ctgcaagaag agctgctgct cctgctgccc tgtcggctgt gccaagtgtg    180
cccagggctg catctgcaaa gggacgtcag acaagtgcag ctgctgtgcc tga           233
 
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<212>DNA
<213>human
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cccgaccatc gaatcttgcg aacaacacga tacttgttaa gtggctaccc caaaacgatc     60
tgcttggtca cccgatgacc cgtgccttta tcacccatgc tggttcccat ggtgtttatg    120
aaagcatatg caatggcgtt cccatggtga tgatgccctt gtttggtgat cagatggaca    180
atgcaaagcg catggagact aagggagctg gagtgaccct gaatgttctg gaaatgactt    240
ctgaagattt agaaaatgct ctaaaagcag tcatcaatga caaaagttac aaggagaaca    300
tcatgcgcct ctccagcctt cacaaggacc gcccggtgga gccgctggac ctggccgtgt    360
tctgggtgga gtttgtgatg aggcacaagg gcgcgccaca cctgcgcccc gcagcccacg    420
acctcacctg gtaccagtac cattccttgg acgtgattgg tttcctcttg gccgtcgtgc    480
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aaaaagggcg agttaagaaa gcccacaaat ccaagacc                            578
 
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<212>DNA
<213>human
<400>197
tgcagaggcc tatgttttca ctcctaacat gatctgtgct ggaggagaga agggcatgga     60
tagctgtaaa ggggacagtg gtggggcctt tgctgtacag gatcccaatg acaagaccaa    120
attctacgca gctggcctgg tgtcctgggg gccccagtgt gggacctatg ggctctacac    180
acgggtaaag aactatgttg actggataat gaagactatg caggaaaata gcaccccccg    240
tgaggactaa tccagataca tcccaccagc ctctccaagg gtggtgacca atgcattacc    300
ttctgttcct tatgatattc tcattatttc atcatgactg aaagaagaca cgagcgaatg    360
atttaaatag aacttgattg ttgagacgcc ttgctagagg tagagtttga tcatagaatt    420
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gggcctaacc agccttggga gtattgactg gtcccttacc tcttatggct aagtctttga     60
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aaggcaagga ggggggccag cctctgaatg cggccacgga tgccttgctg ctgcaaccct    180
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gaaaacgttt tttgttttgt tttgtaatta ttgtggaaaa ctttcaagtg aacagaagga    360
tggtgtccta ctgtggatga gggatgaaca aggggatggc tttgatccaa tggagcctgg    420
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agatgtgttt agaacctctt gtttaaaaat aatagactgc ttatcataaa atcacatctc     60
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gaagggagtg ttgctcccag tccagaggcc tgattctgtt cggactgggt tctcaagaca     60
cgaccaggtt ctcaagacac gagtcccctt gttcctcccc attaaagggg gtttgtcaga    120
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<213>human
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ggctgcctgc ggatgaagga ccagtgtgac aagtgccggg agatcttgtc tgtggactgt     60
tccaccaaca acccctccca ggctaagctg cggcgggagc tcgacgaatc cctccaggtc    120
gctgagaggt tgaccaggaa atataacgag ctgctaaagt cctaccagtg gaagatgctc    180
aacacctcct ccttgctgga gcagctgaac gagcagttta actgggtgtc ccggctggca    240
aacctcacgc aaggcgaaga ccagtactat ctgcgggtca ccacggtggc ttcccacact    300
tctgactcgg acgttccttc cggtgtcact gaggtggtcg tgaagctctt tgactctgat    360
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agcagctgaa cgagcagttt aactgggtgt cccggctggc aaacctcacg caaggcgaag     60
accagtacta tctgcgggtc accacggtgg cttcccacac ttctgactcg gacgttcctt    120
ccggtgtcac tgaggtggtc gtgaagctct ttgactctga tcccatcact gtgacggtcc    180
ctgtagaagt ctccaggaag aaccctaaat ttatggagac cgtggcggag aaagcgctgc    240
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<213>human
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cgatcaccaa tgtacctcca gaggtaactg tgctcacgaa cagccctgtg gaactgagag    60
agcccaacgt cctcatctgt ttcatagaca agttcacccc a                       101
 
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<213>human
 
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gatataccat gtattcacac tttaaaaaat acacatagca gagtatcgga aagtatgtac     60
caaaacattg atctggctac cactgggagt caggatcatg agttcatctt cttcntnctt    120
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ttttaaaaaa ttttaagctg tacactttca agtaagatct gaattctaat gctggcttgt    240
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gaaggctgga ttctatctac ataagtcctt tcaattccac cagggccaga gcagctccac     60
cactgtgcac ttagccatga tggcaacaga aaccaagaga cacaattacg caggtattta    120
gaagcagagg gacaaccaga aggcccttaa ctatcaccag tgcatcacat ctgcacactc    180
tcttctccat tccctagcag gaacttctag ctcatttaac agataaagaa actgaggccc    240
acggtttcag ctagacaatg atttggccag gcctagtaac caaggccctg tctctggcta    300
ctccctggac cacgaggctg attcctctca tttccagctt ctcagtttct gcctgggcaa    360
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<212>DNA
<213>human
<400>206
agacagctgt ttagggtctt ctcccctcac ccatgctttc atcatcccct ccgcacagcc     60
tccccgtcca ggccttctaa ccacacctac ccagggctgc cgcattcctg cactcagaag    120
tctgcagcgg tgcctcacaa acttgattgt gcataaaaat cactggggat cttgttaata    180
cagattctaa ctcaatagat ctgggagatc ctgcatttct aacaagctcc caggtaaggc    240
ggaggctgct ggtgtgagga ccatgctgtg agcagcaggg cgagagtgcc cagggctgat    300
atatattgga aatatcaccc ctgaagccat cgctggcccc cacctcctgt ggactgatgc    360
cccagggatt cccaccccac ttctgcaacc ccaggtatcc ttcattatcc accccatccc    420
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ccacac                                                               546
 
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<212>DNA
<213>human
<400>207
atcatcagat cgactcttat acgagtaata tgcctgctat ttgaagtgta attgagaagg     60
aaaattttag cgtgctcact gacctgcctg tagccccagt gacagctagg atgtgcattc    120
tccagccatc aagagactga gtcaagttgt tccttaagtc agaacagcag actcagctct    180
gacattctga ttcgaatgac actgttcagg aatcggaatc ctgtcgatta gactggacag    240
cttgtggcaa gtgaatttgc ctgtaacaag ccagattttt taaaatttat attgtaaata    300
ttgtgtgtgt gtgtgtgtgt gtatatatat atatatatgt acagttatct aagttaattt    360
aaagttgttt gtgccttttt atttttgttt ttaatgcttt gatatttcaa tgttagcctc    420
aatttctgaa caccataggt agaatgtaaa gcttgtctga tcgttcaaag catgaaatgg    480
atacttatat ggaaattctg ctcagataga atgacagtcc gtcaaaacag attgtttgca    540
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<212>DNA
<213>human
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tacaccacaa tggctgagca cttcctgacg ttgctggtag tgcctgccat caagaaagat     60
tatggttccc aggaagactt cactcaagtg tggaacacca ccatgaaagg gctcaagtgc    120
tgtggcttca ccaactatac ggattttgag gactcaccct acttcaaaga gaacagtgcc    180
tttcccccat tctgttgcaa tgacaacgtc accaacacag ccaatgaaac ctgcaccaag    240
caaaaggctc acgaccaaaa agtagagggt tgcttcaatc agcttttgta tgacatccga    300
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tactgctgcc acatgggaaa ctgtgaagag gcaccctggg caagcagcag tgattggggg    480
aggggacagg atctaacaat gtcacttggg ccagaatgga cctggccttt ctgctcccag    540
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gcagttatgg gcaaccctaa ggtgaaggct catggcaaga aagtgctcgg tgcctttagt     60
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<212>DNA
<213>human
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gccccgtcaa ggcgggagtg gagaccacca caccctccaa acaaagcaac aacaagtacg    300
cggccagcag ctatctgagc ctgacgcctg agcagtggaa gtcccacaga agctacagct    360
gccaggtcac gcatgaaggg agcaccgtgg agaagacagt ggcccctaca gaatgtt       417
 
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<213>human
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caagccagga tgaagggaga ctgggcaaga ctcttacgcc ccacactgca atttggtctt    300
gttgccgtat ccatttatgt gggcctttct cgagtttctg attataaaca ccactggagc    360
gatgtgttga ctggactcat tcagggagct ctggttgcaa tattagttgc tgtatatgta    420
tcggatttct tcaaagaaag aacttctttt aaagaaagaa aagaggagga ctctcataca    480
actctgcatg aaacaccaac aactgggaat cactatccga gcaatcacca gc            532
 
<210>212
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<213>human
<400>212
gcacgccatc aatgccatcg tgcgcagccc gcgtggcggg gcccggaggc acgcagagct     60
gtccttcgtg ttcctcacgg acggcgtcac gggcaacgac agtctgcacg agtcggcgca    120
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<210>213
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<212>DNA
<213>human
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tgtttcctca tagctagttc tcaagctgca tgtaagattt taacgggaag agaaaatagg     60
cctggacctg aaggtctcaa atatgttgag aagaaagtat gaactataag gaacttgaga    120
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atgaaaaatg tagtttcaca actaagtttt gttaacagag actgcatgct ttgcttatag    300
ttcttaattt tggttttgac attcatttaa ttttttccat gttaaatatg tagtttaatt    360
atttactcaa aataaacatt gttcatgctt ttaggccttt gggggaattg atttttatcc    420
acaggtagaa aatggtcttt gcacacacta cacttatttc aaatatacaa tgtgctcccg    480
aactttcgca ttagtctt                                                  498
 
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<213>human
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gaaatatcac tgacactcca gactaaagca gagtctaggt ttctgcaatt ttgttacagt     60
aatttgtaaa tagctttagt aaactcacct tgcatggtag attaataaga tgacttactg    120
tacatgaatt acacaataat gagatctggt ggctatttcc acattttgaa aaggattcag    180
ttatttactg acagtggtga gcatcctttt taaaataatg ttctgatact taaacattag    240
agagcagtat ctttaaatga attattaaca ctttggaata cttacatttt ctgttatttt    300
tgattgcctg ataaccagtt tcaatgatga aaatgaaaac aagtgctgaa gatgaaatgg    360
aagagaaccg ttttaatctg gattttgttt tgtcacacct ggaaaatact ttgcaaatat    420
gttctaaatt gaaaacaatt tttttatgat cacatggttc actaccaaat gaccctcaaa    480
taagccagat g                                                         491
 
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<213>human
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gatagtcgga atagagccgc cccaactcag atcctacaac acgcaagttc cttcttgaac     60
cctggtgcct cctaccctat ggccctgaat ggtgcactgg tttaattgtg ttggtgtcgg    120
cccctcacaa atgcagccaa gtcatgtaat tagtcatctg gaacaaagac taaaaacagc    180
agagaattgc gggttctacc cagtcagaag atcacaccat ggagactttc tactagagga    240
cttgaaagag aactgagggg ccacaaaata aacttcacct tccattaagt gttcaagcat    300
gtctgcaaat taggagggag ttagaaacag tctttttcat cctttgtgat gaagcctgaa    360
attgtgccgt gttgccttat atgaatatg                                      389
 
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<213>human
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tgtctccccg ctatctaaaa aagtataaga acaagcagat aacagcgaga atcttggagg     60
cccatcagaa tgtagctcag atgagtctaa ttgaagccaa gatgagattt attcaagctt    120
ggcagtcact acctgaattt ggcatcactc acttcattgc aaggttccaa gggggcaaaa    180
aagaagaact tattggaatt gcatacaaca gactgattcg gatggatgcc agcactggag    240
atgcaattaa aacatggcgt ttcagcaaca tgaaacagtg gaatgtcaac tgggaaatca    300
aaatggtcac cgtagagttt gcagatgaag tacgattgtc cttcatttgt actgaagtag    360
attgcaaagt ggttcatgaa ttcattggtg gctacatatt tctctcaaca cgtgcaaaag    420
accaaaacga gagtttagat gaagagatgt tctacaaact taccagtggt tgggtgtgaa    480
tagaaatact gtttaatgaa actccacggc cataa                               515
 
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aaaatgctat tagtccgtcg tgcttnattt gtttttgtcc ttgaataagc atgttatgta     60
tatngtctcg tgtttttatt tttacaccat attgtattac acttttagta ttcaccagca    120
taancactgt ctgcctaaaa tatgcaactc tttgcattac aatatgaagt aaagttctat    180
gaagtatgca ttttgtgtaa ctaatgtaaa aacacaaatt ttataaaatt gtacagtttt    240
ttaaaaacta ctcacaacta gcagatggct taaatgtagc aatctctgcg ttaattaaat    300
gcctttaaga gatataatta acgtgcagtt ttaatatcta ctaaattaag aatgacttca    360
ttatgatcat gatttgccac aatgtcctta actctaatgc ctggactggc catgttctag    420
tctgttgcgc tgttacaatc tgtattggtg ctagtcagaa aattcctagc tcacatagcc    480
caaaagggtg cgagggagag gtggattacc agtattgttc aataatccat ggttca        536
 
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gaccagttct tcggagagca cctgttggag tctgatcttt tcccgacgtc tacttccctg     60
agtcccttct accttcggcc accctccttc ctgcgggcac ccagctggtt tgacactgga    120
ctctcagaga tgcgcctgga gaaggacagg ttctctgtca acctggatgt gaagcacttc    180
tccccagagg aactcaaagt taaggtgttg ggagatgtga ttgaggtgca tggaaaacat    240
gaagagcgcc aggatgaaca tggtttcatc tccagggagt tccacaggaa ataccggatc    300
ccagctgatg tagaccctct caccattact tcatccctgt catctgatgg ggtcctcact    360
gtgaatggac caaggaaaca ggtctctggc cctgagcgca ccattcccat cacccgtgaa    420
aagaagcctg ctgtcaccgc agcccccaag aaaaagatgc cctttcttga attgcatttt    480
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<212>DNA
<213>human
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tgaatcttcg ggtgtttccc tttagctaag cacagatcta ccttggtgat ttggaccctg     60
gttgctttgt gtctagtttt ctagaccctt catctcttac ttgatagact tactaataaa    120
atgtgaagac tagaccaatt gtcatgcttg acacaactgc tgtggctggt tggtgctttg    180
tttatggtag tagtttttct gtaacacaga atataggata agaaataaga ataaagtacc    240
ttgactttgt tcacagcatg tagggtgatg agcactcaca attgttgact aaa           293
 
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<212>DNA
<213>human
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ctgtgtatcc ttcaaagacc cagcccctgc agcaccataa cctcctggtc tgttctgtga     60
gtggtttcta tccaggcagc attgaagtca ggtggttccg gaatggccag gaagagaaga    120
ctggggtggt gtccacaggc ctgatccaca atggagactg gaccttccag accctggtga    180
tgctggaaac agttcctcgg agtggagagg tttacacctg ccaagtggag cacccaagcg    240
tgacaagccc tctcacagtg gaatggagag cacggtctga atctgcacag agcaagatgc    300
tgagtggagt cgggggcttt gtgctgggcc tgctcttcct tggggccggg ctgttcatct    360
acttcaggaa tcagaaagga cactctggac ttcagcca                            398
 
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agtcaaatgc caaacactag ctctgtatta atccccatca ttactggtaa agcctcattt     60
gaatgtgtga attcaataca ggctatgtaa aatttttact aatgtcatta ttttgaaaaa    120
ataaatttaa aaatacattc aaaattanna nnnnanacaa gcttaattgt taatattccc    180
taaacacaat tttatgaagg gagaagacat tggtttgttg acaataacag tacatctttt    240
caagttctca gctatttctt ctacctctcc ctatcttaca tttgagtatg gtaacttatg    300
tcatctatgt tgaatgtaag cttataaagc acaaagcata catttcctga ctggtctaga    360
gaactgatgt ttcaatttac ccctctgcta aataaa                              396
 
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ggcaaactgc ttaatcttgt ggattttgta gatggtttca aatgactgaa ctgcattcag     60
atttacgagt gaaaggaaaa attgcattag ttggttgcat gaactttgaa gggcagatat    120
tactgcacaa actgccatct cgcttcattt ttttaactat gcatttgagt acagactaat    180
ttttaaaata tgctaaactg gaagattaaa cagatgtggc ccaaactgtt ctggatcagg    240
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<212>DNA
<213>human
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ctcctccatg agtctgacat ctcggaaact gagcagctgc cggacgcctg ggtcaggaat     60
ccaagacccc acctcttaag gactggttcc tcagaaagca ccctcaggga aaaaggtgaa    120
aacattacat ccgtggattc tcctgccaca accgcattgg aagaaaaggc tgccgcaaca    180
tctcagcgag gagtgaagga cccatgtccc aggaaccgcg ctgcgccacc tgcactcacc    240
cccctcacat tctcttaagc acccggtggc cctccgaggc ctggcggaat ggtggtgccc    300
acggggttgg gcaagggctc accaggacct caacgggcaa agttgtgcac actaaaatat    360
caaatcaagg tgcttggttt taaagtaaat gtttttctaa agaaagctgt gttcttctgt    420
tgacccagac gaatagggca cagccctgta actgcacgtg ccttctgtca ttgggaatg     479
 
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<212>DNA
<213>human
<400>224
caccatcacg tgcctggtga cgggcttctc tcccgcggac gtcttcgtgc agtggatgca     60
gagggggcag cccttgtccc cggagaagta tgtgaccagc gccccaatgc ctgagcccca    120
ggccccaggc cggtacttcg cccacagcat cctgaccgtg tccgaagagg aatggaacac    180
gggggagacc tacacctgcg tggtggccca tgaggccctg cccaacaggg tcaccgagag    240
gaccgtggac aagtccacc                                                 259
 
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ttctttttta tattgtcctc cacctccatc attttcaata aaagataggg cttttgctcc     60
cttgttcttg gagggaccat tattacatct ctgaactacc tttgtatcca acatgtttta    120
aatccttaaa tgaattgctt tctcccaaaa aaagcacaat ataaagaaac acaagattta    180
attatttttc tacttggggg gaaaaaangt cctcatgtag aagcacccac ttttgcaatg    240
ttgttctaag ctatctatct anctctcagc ccatgataaa gttccttaag ctggtgattc    300
ctaatcaagg acaagccacc ctagtgtctc atgtttgtat                          340
 
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<213>human
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ggaagcacaa tttccacctt attttttgaa ctttggcagt ttcaatgtct gtctctgttg     60
cttcggggca taagctgatc accgtctagt tgggaaagta accctacagg gtttgtaggg    120
acatgatcag catcctgatt tgaaccctga aatgttgtgt agacaccctc ttgggtccaa    180
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cttcactgac cttggacttt ggcatgattc ttagtcatac ttgaacttgt ctcattccac    300
ctcttctcag agcaactctt cctttgggaa aagagttctt cagatcatag accaaaaaag    360
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<212>DNA
<213>human
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agagaaccca ccatggtgct gtctcctgcc gacaagacca acgtcaaggc cgcctggggt     60
aaggtcggcg cgcacgctgg cgagtatggt gcggaggccc tggagaggat gttcctgtcc    120
ttccccacca ccaagaccta cttcccgcac ttcgacctga gccacggctc tgcccaggtt    180
aagggccacg gcaagaaggt ggccgacgcg ctgaccaacg ccgtggcgca cgtggacgac    240
atgcccaacg cgctgtccgc cctgagcgac ctgcacgcgc acaagcttcg ggtggacccg    300
gtcaacttca agctcctaag ccactgcctg ctggtgaccc tggccgccca cctccccgcc    360
gagttcaccc ctgcggtgca cgcctccctg gacaagttcc tggcttctgt gagcaccgtg    420
ctgacctcca aataccgtta agctg                                          445
 
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<212>DNA
<213>human
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tggaggaatt tcacaagcac ccgcccgtgc agtgggcctt ccaggagacc agtgtggaga     60
gcgccgtgga cacgcccttc ccagctggaa tatttgtgag gctggaattt aagctgcagc    120
agacaagctg ccggaagagg gactggaaga aacccgagtg caaagtcagg cccaatggga    180
ggaaacggaa atgcctggcc tgcatcaaac tgggctctga ggacaaagtt ctgggccggt    240
tggtccactg ccccatagag acccaagttc tgcgggaggc tgaggagcac caggagaccc    300
agtgcctcag ggtgcagcgg gctggtgagg acccccacag cttctacttc cctggacagt    360
tcgccttctc caaggccctg ccccgcagct aagccagcac tgagctgcgt ggtgcctcca    420
ggaccgctgc cggtggtaac cagtggaaga ccccagcccc cagggagagg accccgttct    480
atccccagcc atgataata                                                 499
 
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<212>DNA
<213>human
<400>229
tttgtcagga aaccttggcc tctgctaagg tgtatttggt ccttgagaag tgggagcacc     60
ctacagggac actatcactc atgctggtgg cattgtttac agctagaaag ctgcactggt    120
gctaatgccc cttggggaaa tggggctgtg aggaggagga ttataactta ggcctagcct    180
cttttaacag cctctgaaat ttatcttttc ttctatgggg tctataaatg tatcttataa    240
taaaaaggaa ggacaggagg aagacaggca aatgtacttc tcacccagtc ttctacacag    300
atggaatctc tttggggcta agagaaaggt tttattctat attgcttacc tgatctcatg    360
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<212>DNA
<213>human
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actggatgcg ttaataaccc atgttttacc ttttgaaaaa ataaatgaag gatttgacct     60
gcttcactct gggaaaagta tccgtaccgt cctgacgttt tgaggcaata gagatgcctt    120
cccctgtagc agtcttcagc ctcctctacc ctacaagatc tggagcaaca gctaggaaat    180
atcattaatt cagctcttca gagatgttat caataaatta cacatggggg ctttccaaag    240
aaatggaaat tgatgggaaa ttatttttca ggaaaattta aaattcaagt gagaagtaaa    300
taaagtgttg aacatcagct ggggaattga agccaacaaa ccttccttct taaccattct    360
actgtgtcac ctttgccatt gaggaaaaat attcctgtga cttcttgcat ttttggtatc    420
ttcataatct ttagtcatcg aatcccagtg gaggggaccc ttttacttgc cctgaacata    480
cacatgctgg gccattgtga ttgaagtctt ctaactctgt ctcagt                   526
 
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<212>DNA
<213>human
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gcagatttct tgcttcatat gacaaagcct caattactaa ttgtaaaaac tgaactattc     60
ccagaatcat gttcaaaaaa tctgtaattt ttgctgatcg aaagtgcttc attgactaaa    120
cagtattagt ttgtggctat aaatgattat ttagatgatg actgaaaatg tgtataaagt    180
aattaaaagt aatatggtgg ctttaagtgt agagatggga tggcaaatgc tgtgaatgca    240
gaatgtaaaa ttggtaacta agaaatggca caaacacctt aagcaatata ttttcctagt    300
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tttcaatcta gaacttttct attaactacc atgtcttaaa atcaagtcta taatcctagc    420
attagtttaa tattttgaat atgtaaacac ctgtgttaat gctttgttaa tgcttttccc    480
actctcattt gttaatgctt tcccactctc gggaaggatt tgcattttga gctttatctc    540
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ttcctgaagc tcttcggctg acagcccgct cggctcgccc tctcccccgg aggccgcgcc     60
ctcccggaaa agccgggtcc tccagacccc gaggccttgc tctcagagcg ggaggcccca    120
cccactggag agccccgccc ctaaggtact atgagttctc aggggtcaag ttcagaaacg    180
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gcaattccag cgaatcggag gccaggccag gacgtccttg ctccctgcac cctcactgtt    360
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gcagggctag ttattccgat ttcttgcaca attatttagc tttttgtaag ttcaacatgt     60
aaattttaaa gacataaata tagagagact tatgtgtttg aatataaatg atatatatgg    120
attagcatgt acctgtatat tattaaacat gcaatgaact gactggtaag tgacgtctaa    180
ttgtatggct agcaatgtaa tttattcaga ctgtattttt gtacagagca gtgcactcta    240
acctatgcct ctgtgtcctc tttaatgcct aaagctgtgc ctagaaattt catctgtctt    300
aaaagtaaaa tatacttcat gctgtttatg ctattagttt ctgtactgct attctatatt    360
tattattttt aaatatatga catgtttact acttaaacat gaattcatgg tatcctggtt    420
atttttttta agtcatctgg gggaaaacct gtttatcact ccagtgattt tgagtttgca    480
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<213>human
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caggcctttt ccactttgag ggaggtgctt cgaagaatgt tgcccacacc taagtgttag    60
aagcctatgt ccgttcatcc ctgagaggtc tgaa                                94
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tggcggactc catgtttgtg atccctgcac tccaagtagc acattttcag tgttcccggg     60
cccctgtgta cttctacgag ttccagcatc agcccagctg gctcaagaac atcaggccac    120
cgcacatgaa ggcagaccat ggtgatgagc ttccttttgt tttcagaagt ttctttgggg    180
gcaactacat taaattcact gaggaagagg agcagctaag caggaagatg atgaagtact    240
gggccaactt tgcgagaaat gggaacccga atggcgaggg tctgccacac tggccgctgt    300
tcgaccagga ggagcaatac ctgcagctga acctacagcc tgcggtgggc cgggctctga    360
aggcccacag gctccagttc tggaagaagg cgctgcccca aaagatccag gagctcgagg    420
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gagagctcgc tttgagtgac tgggttttgt gattgcctct gaagcctatg tatgccatgg     60
aggcactaac aaactctgag gtttccgaaa tcagaagcga aaaaatcagt gaataaacca    120
tcatcttgcc actaccccct cctgaagcca cagcagggtt tcaggttcca atcagaactg    180
ttggcaaggt gacatttcca tgcataaatg cgatccacag aaggtcctgg tggtatttgt    240
aactttttgc aaggcatttt tttatatata tttttgtgca catttttttt tacgtttctt    300
tagaaaacaa atgtatttca aaatatattt atagtcgaac aattcatata tttgaagtgg    360
agccatatga atgtcagtag tttatacttc tctattatct caaactactg gcaatttgta    420
aagaaatata tatgatatat aaatgtgatt gcagcttttc aatgttagcc acagt         475
 
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<212>DNA
<213>human
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tgtggtttct gtagcaacac ttctcatgac catctgtttt gtgtttatga tgattttttc     60
aggtctgttg gtcaatctca caaccattgc atcttggctg tcatggcttc agtacttcag    120
cattccacga tatggattta cggctttgca gcataatgaa tttttgggac aaaacttctg    180
cccaggactc aatgcaacag gaaacaatcc ttgtaactat gcaacatgta ctggcgaaga    240
atatttggta aagcagggca tcgatctctc accctggggc ttgtggaaga atcacgtggc    300
cttggcttgt atgattgtta ttttcctcac aattgcctac ctgaaattgt tatttcttaa    360
aaaatattct taaatttccc cttaattcag tatgatttat cctcacataa aaaagaagca    420
ctttgattga agtattcaat caagtttttt tgttgttttc tgttcccttg ccatcacact    480
gttgcacagc a                                                         491
 
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<212>DNA
<213>human
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gaacacgcag agagtttccc tagatatact cctgcctcca ggtgctggga cacacctttg     60
caaaatgctg tgggaagcag gagctgggga gctgtgttaa gtcaaagtag aaaccctcca    120
gtgtttggtg ttgtgtagag aataggacat agggtaaaga ggccaagctg cctgtagtta    180
gtagagaaga atggatgtgg ttcttcttgt gtatttattt gtatcataaa cacttggaac    240
aacaaagacc ataagcatca tttagcagtt gtagccattt tctagttaac tcatgtaaac    300
aagtaagagt aacataacag tattaccctt tcactgttct cacaggacat gtacctaatt    360
atggtactta tttatgtagt cactgtattt ctggattttt                          400
 
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<212>DNA
<213>human
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<222>(84)..(85)
<223>n is a，c，g，or t
<220>
<221>misc_feature
<222>(136)..(137)
<223>n is a，c，g，or t
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ctccagcccc agagctgaaa acaccaagtg cctatttgag ggtgtctgtc tggagactta     60
gagtttgtca tgtgtgtgtg tgtnnttggt taatgtgggt ttatgggttt tctttctttt    120
tttttttttt tttttnnagt ctacattagg gggaagtgag cgcctcccat gtgcagacag    180
tgtgtcttta tagatttttc taaggctttc cccaatgatg tcggtaattt ctgatgtttc    240
tgaagttccc aggactcaca cacccgttcc catctcactt gcccacccag tgtgacaacc    300
ctcggtgtgg atataccccc gtggactcat ggctcttccc cacccccact ttctataaat    360
gtaggcctag aatacgcttc tctgttgcaa aactcagcta agttcctgct tccaccttga    420
tgttgaaata tcttatgtaa gagggcaggg gatgtcgtga agatggc                  467
 
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<213>human
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ggaatgacac ttacttacga cccaactaca gctgctatac agaacggatt ttatccttca     60
ccatacagta ttgctacaaa ccgaatgatc actcaaactt ctattacacc ctatattgca    120
tctcctgtat ctgcctacca ggtgcaaagt ccttcgtgga tgcaacctca accatatatt    180
ctacagcacc ctggtgccgt gttaactccc tcaatggagc acaccatgtc actacagccc    240
gcatcaatga tcagccctct ggcccagcag atgagtcatc tgtcactagg cagcaccgga    300
acatacatgc ctgcaacgtc agctatgcaa ggagcctact tgccacagta tg            352
 
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<213>human
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ggaacgaaac cagcgtccta ttccagcgcc tctacgggcc ccaggccctc ctcttctccc     60
tcttctggcc caccttcctg ctgaccggtg gcctcctcat tatcgccatg gtgaagagca    120
accagtacct gtccatcctg gcggcccaga agtagagcca tccatccatg ccataccact    180
tgtcagggca caggggactg gctgggcccc cagggctgct ccccacttgc agcacaatgc    240
cttctccacc tgccctccca ctcttccagt ccaatccacg ctgtcttctg ttgcaggact    300
aacctttgag aaatcctttt gtgaagtcat tgcctgctca agaatgtaca gtggctcccc    360
aatgccttgg agccataagg ccagccagtt ctagctctct attacctgtc cccactcaac    420
tgactcatac ctgtttccgg ctgcatcact atgtgcccca cagagaacga tgatcgtcac    480
ctctgtgcct gagttctccc tgttgtctca aagcggtacc                          520
 
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<212>DNA
<213>human
<400>243
ccggtcagca ggatcatcgt gcacccacag ttctacatca tccagactgg agcggatatc     60
gccctgctgg agctggagga gcccgtgaac atctccagcc gcgtccacac ggtcatgctg    120
ccccctgcct cggagacctt ccccccgggg atgccgtgct gggtcactgg ctggggcgat    180
gtggacaatg atgagcccct cccaccgcca tttcccctga agcaggtgaa ggtccccata    240
atggaaaacc acatttgtga cgcaaaatac caccttggcg cctacacggg agacgacgtc    300
cgcatcatcc gtgacgacat gctgtgtgcc gggaacaccc ggagggactc atgccagggc    360
gactctggag ggcccctggt gtgcaaggtg aatggcacct ggctacaggc gggcgtggtc    420
agctgggacg agggctgtgc ccagcccaac cggcctggca tctacacccg tgtcacctac    480
tacttggact ggatccacca ctatgtcccc aaaaagccgt gagtcaggcc tggggtgt      538
 
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<212>DNA
<213>human
<400>244
ggccaaatca ccgacctgaa ggcggaaatt cacgggggca gtctcattaa tctgacttgg     60
acagctcctg gggatgatta tgaccatgga acagctcaca agtatatcat tcgaataagt    120
acaagtattc ttgatctcag agacaagttc aatgaatctc ttcaagtgaa tactactgct    180
ctcatcccaa aggaagccaa ctctgaggaa gtctttttgt ttaaaccaga aaacattact    240
tttgaaaatg gcacagatct tttcattgct attcaggctg ttgataaggt cgatctgaaa    300
tcagaaatat ccaacattgc acgagtatct ttgtttattc ctccacagac tccgccagag    360
acacctagtc ctgatgaaac gtctgctcct tgtcctaata ttcatatcaa cagcaccatt    420
cctggcattc acattttaaa aattatgtgg aagtggatag gagaactgca gctgtcaata    480
gcctagggc                                                            489
 
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<212>DNA
<213>human
<400>245
accccttcag cgactagaga gctacaggag aatcaccagt ggcaaatgtc cccagaaagc     60
tgtgatcttc aagaccaaac tggccaagga tatctgtgcc gaccccaaga agaagtgggt    120
gcaggattcc atgaagtatc tggaccaaaa atctccaact ccaaagccat aaataatcac    180
catttttgaa accaaaccag agcctgagtg ttgcctaatt tgttttccct tcttacaatg    240
cattctgagg taacctcatt atcagtccaa agggcatggg ttttattata tatatatata    300
tttttttttt aaaaaaaaac gtattgcatt taatttattg aggctttaaa acttatcctc    360
catgaatatc agttattttt aaactgtaaa gctttgtgca gattctttac cccctgggag    420
ccccaattcg atcccctgtc acgtgtgggc aatgttcccc  c                       461
 
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<212>DNA
<213>human
<400>246
tgtgaagctt tacgcgcaca cggacaaaat gcccaaactg gagcccttgc aaaaacacgg     60
cttgtggcat tggcatactt gcccttacag gtggagtatc ttcgtcacac atctaaatga    120
gaaatcagtg acaacaagtc tttgaaatgg tgctatggat ttaccattcc ttattatcac    180
taatcatcta aacaactcac tggaaatcca attaacaatt ttacaacata agatagaatg    240
gagacctgaa taattctgtg taatataaat ggtttataac tgcttttgta cctagctagg    300
ctgctattat tactataatg agtaaatcat aaagccttca tcactcccac atttttctta    360
cggtcggagc atcagaacaa gcgtctagac tccttgggac cgtgagttcc tagagcttgg    420
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<212>DNA
<213>human
<400>247
tctactgcgt gacttgccat gagaccaagt ttgccaagca ttgcgtgaag tgcaacaagg     60
ccatcacatc tggaggaatc acttaccagg atcagccctg gcatgccgat tgctttgtgt    120
gtgttacctg ctctaagaag ctggctgggc agcgtttcac cgctgtggag gaccagtatt    180
actgcgtgga ttgctacaag aactttgtgg ccaagaagtg tgctggatgc aagaacccca    240
tcactgggaa aaggactgtg tcaagagtga gccgcccagt ctctaaagct aggaagcccc    300
cagtgtgcca cgggaaacgc ttgcctctca ccctgtttcc cagcgccaac ctccggggca    360
ggcatccggg tggagagagg acttgtccct cgtgggtggt ggttctttat agaaaaaatc    420
gaagcttagc agctcctcgt ggcccgggtt tggtaaaggc tccagtgtgg tggcctatga    480
aggacaatcc tggcacgact actgcttcca ctgcaaaaaa tgctccgtga atctggccaa    540
caagcgcttt gttttccacc                                                560
 
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<211>445
<212>DNA
<213>human
<400>248
gcataggaga taaaaccccc actgagatgc tctcatgcct cagctggacc caccgtgtag     60
acacacgaca tgcaagagtt gcagcggctg ctccaactca ctgctcaccc tctctgtgag    120
cagaaagaac cctactgaca tgcatggtta acttcctcat cagaactctg cccttccctt    180
ctgttctttt gtgctttcaa ataactaaca cgaacttcca gaaaattaac atttgaactt    240
agctgtaatt ctaaactgac ctttccccgt actaacgttt ggtttccccg tgtggcatgc    300
ttttctgagc cttcctactt taaagcatgg aacatgcagg tgatttggga agtgtagaaa    360
gacctgagaa aacgagcctg tttcagagga acatcgtcac aacgaatact tctggaagct    420
taacaaaact aaccctgctg tcctt                                          445
 
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<212>DNA
<213>human
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atttcgtttt gcttttggtt gcctgaatgt tgtcaccaag tgaaaaaatt atttaactat     60
atgtaaaatt tctcttttaa aaaaaagttt tactgatgtt aaacgttctc agtgccaatg    120
tcagactgtg ctcctccctc tcctgaacct ctaccctcac cctgagctgt cttgttgaaa    180
acagt                                                                185
 
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<212>DNA
<213>human
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agccctttgc tctggaggaa gttctccagc ttcagctcaa ctcacagctt ctccaagcat     60
caccctggga gtttcctgag ggttttctca taaatgaggg ctgcacattg cctgttctgc    120
ttcgaagtat tcaataccgc tcagtatttt aaatgaagtg attctaagat ttggtttggg    180
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tactgtagga acaagcatga tcttgttact gtgatatttt aaatatccac agtactcact    360
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<212>DNA
<213>human
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gtgccatagt gcaggcttgg ggagctttaa gcctcagtta tataacccac gaaaaacaga     60
gcctcctaga tgtaacattc ctgatcaagg tacaattctt taaaattcac taatgattga    120
ggtccatatt tagtggtact ctgaaattgg tcactttcct attacacgga gtgtgctaaa    180
actaaaaagc attttgaaac atacagaatg ttctattgtc attgggaaat ttttctttct    240
aacccagtgg aggttagaaa gaagttatat tctggtagca aattaacttt acatcctttt    300
tcctacttgt tatggttgtt tggaccgata agtgtgctta atcctgaggc aaagtagtga    360
atatgtttta tatgttatga agaaaagaat tgttgtaagt ttttgattct actcttatat    420
gctggactgc attcacacat ggcatgaaat aagtcaggtt ctttacaaat ggtattttga    480
tagatactgg attgtgtttg tgccatattt gtgccatt                            518
 
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<212>DNA
<213>human
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gtcaggactg ttatggccct gttgtgctga gttagttgga acagaattca agctccctgc     60
actagtccac ctgccccact gcttcttcgc ttctctcttg gaaagtccag tctctcctcg    120
gcttgcaatg gaccccaact gctcctgcgc cgctggtgtc tcctgcacct gcgctggttc    180
ctgcaagtgc aaagagtgca aatgcacctc ctgcaagaag agctgctgct cctgctgccc    240
cgtgggctgt agcaagtgtg cccagggctg tgtttgcaaa ggggcgtcag agaagtgcag    300
ctgctgcgac tgatgccagg acaacctttc tcccagatgt aaacagagag acatgtacaa    360
acctggattt tttttttata ccaccttgac ccatttgcta cattcctttt cctgtgaaa    419
 
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<212>DNA
<213>human
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caggaaggac cttgctttgg accctacaca cttcggctct ctggacactt gcgacacctc     60
aaggtgttct ctgtagctca atctgcaaac atgccaggcc tcagggatcc tctgctgggt    120
gcctccttgc cttgggacca tggccacccc agagccatcc gatcgatgga tgggatgcac    180
tctcagacca agcagcagga attcaaagct gcttgctgta actgtgtgag attgtgaagt    240
ggtctgaatt ctggaatcac aaaccaagcc atgctggtgg gccattaatg gttggaaaac    300
actttcatcc ggggctttgc cagagcgtgc tttcaagtgt cctggaaagt ctgctgcttc    360
tccaagcttt cagacaagaa tgtgcactct ctgcttaggt tttgcttggg aaactcaact    420
tctttcctct ggagacgggg catctccctc tgatttcctt ctgctatgac aaaaccttta    480
atctgcacct tacaactcgg ggacaa                                         506
 
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<212>DNA
<213>human
<400>254
ttaccaatga caaccctgag tgccgccttg tgaaagaaac ccggatttgt gaggtgcggc     60
cttgtggaca gccagtgtac agcagcctga aaaagggcaa gaaatgcagc aagaccaaga    120
aatcccccga accagtcagg tttacttacg ctggatgttt gagtgtgaag aaataccggc    180
ccaagtactg cggttcctgc gtggacggcc gatgctgcac gccccagctg accaggacat    240
gtgaagatgc ggttccgctg cgaagatggg gagacatttt ccaagaacgt catgatgatc    300
cagtcctcaa atgcaactac aactgcccgc atgccaatga agcagcgttt cccttctaca    360
ggctgttcaa tgacattcac aaatttaggg actaaatgct acctgggttt ccagggcaca    420
cctagacaaa caagggagaa gagtgtcaga atcagaatca tggagaaaat gggcgggggt    480
ggtgtgggtg atgggactca ttgtagaaag gaagccttgc tcattcttga ggagcattaa    540
ggtatttcga aactgccaag ggtgc                                          565
 
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<212>DNA
<213>human
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aaattgtgga gttagcctcc tgtggagtta gcctcctgtg gtaaaggaat tgaagaaaat     60
ataacacctt acaccctttt tcatcttgac attaaaagtt ctggctaact ttggaatcca    120
ttagagaaaa atccttgtca ccagattcat tacaattcaa atcgaagagt tgtgaactgt    180
tatcccattg aaaagaccga gccttgtatg tatgttatgg atacataaaa tgcacgcaag    240
ccattatctc tccatgggaa gctaagttat aaaaataggt gcttggtgta caaaactttt    300
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<212>DNA
<213>human
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aaggcaagag gatgcatctt tcttcctggt gtacaagcct ttaaagactt ctgctgctga     60
tatgcctctt ggatgcacac tttgtgtgta catagttacc tttaactcag tggttatcta    120
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tacattttta ttaaaaaaat gtaatgctta tgtataaaca tgtatgtaat atgctttcta    240
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<213>human
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gaaggagacg gtctggcggc ttgaagaatt tggacgattt gccagctttg aggctcaagg     60
tgcattggcc aacatagctg tggacaaagc caacttggaa atcatgacaa agcgctccaa    120
ctatactccg atcaccaatg acaagttcac cccaccagtg gtcaatgtca cgtggcttcg    180
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cacccataat                                                           370
 
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atctcatacc cgcaaatttt aaccttgtca acctctgggg tattagtatg ccctgacctg     60
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<213>human
<400>261
gctttttttg ttgtcagcta tcttaagaat cattaaatac acctgctttg ggtaaaactc     60
tttgcaagca gtaattaaca ctagtaacag tgaaagcaca agatttccaa atcagtcgtt    120
ttctcaaaaa aatatcgtat aagtgactca tcctgtctgc taactccaga cctcccagct    180
tgaagccaaa tctttccatg tgagattgat atggatttcc tagaagtact ggaatgttgt    240
catatcttgc cctattttaa ttctgctata gaaaacaatt gccttcactt ttaaggagta    300
atttgaatat taataactct ggtctagatt ttcatataat gtattaaaga caaagtagtg    360
aacatcaatg aacatctgat agagataaac tgtaatcagg cataagcttg tttgtatgtt    420
ctggcagtga ctaatcagta aatgatgtcg gtttgcccag tatcacttat cttctg    476
 
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<212>DNA
<213>human
<400>262
cgtgaacggc aaagtggcgc tggtgaccgg cgcggctcag ggcataggca gagcctttgc     60
agaggcgctg ctgcttaagg gcgccaaggt agcgctggtg gattggaatc ttgaagcagg    120
tgtacagtgt aaagctgccc tggatgagca atttgaacct cagaagactc tgttcatcca    180
gtgcgatgtg gctgaccagc aacaactgag agacactttt agaaaagttg tagaccactt    240
tggaagactg gacattttgg tcaataatgc tggagtgaat aatgagaaaa actgggaaaa    300
aactctgcaa attaatttgg tttctgttat cagtggaacc tatcttggtt tggattacat    360
gagtaagcaa aatggaggtg aaggcggcat cattatcaat atgtcatctt tagcagccca    420
ccattgattg ccaatggatt gataacactc attgaagatg atgctttaaa tggtgctatt    480
atgaagatca caacttctaa gggaattcat tttcaagact atgatacaac tccatttcaa    540
g                                                                    541
 
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<212>DNA
<213>human
<400>263
gagtattaca ttggccttgg gggacagaaa ggaggaagtt ctgacttttc agggctacct     60
tatttctact aaggacccag agcaggcctg tccatgccat tccttcgcac agatgaaact    120
gagctgggac tggaaaggac agcccttgac ctgggttctg ggtataattt gcacttttga    180
gactggtagc taaccatctt atgagtgcca atgtgtcatt tagtaaaact taaatagaaa    240
caaggtcctt caaatgttcc tttggccaaa agctgaaggg agttactgag aaaatagtta    300
acaattactg tcaggtgtca tcactgttca aaaggtaagc acatttagaa ttttgttctt    360
gacagttaac tgactaatct tacttccaca aaatatgtga atttgctgct tctgagaggc    420
a                                                                    421
 
<210>264
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<212>DNA
<213>human
<400>264
ggactggtga agccttcgga gaccctgtcc ctcacctgca gtgtctctgg tggctccatc     60
agtagttact actggagctg gatccggcag cccccaggga agggactgga gtggattggg    120
tatatcaatt acagtgggag caccaactat aacccctccc tcaagagtcg agtcaccata    180
tcagtagaca cgtccaagaa ccagttctcc ctgaagctga gctctgtgac cgctgcggac    240
acggccgtgt attactgtgc gagaacgatt tcggggggtc g                        281
 
<210>265
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<212>DNA
<213>human
<400>265
aatagtgatg acgcagcttc cagccaccct gtctgtgtct ccaggggaaa gagccaccct     60
ctcctgcagg gccagtcaga gtgttcgcag caacttagcc tggtaccagc aaaaacctgg    120
ccaggctccc aggctcctca tctacggtgc atccaccagg gccaatggta tcccagccag    180
gttcagtggc agtgggtctg ggacagagtt cactctcacc atcagcggcc tgcagtctga    240
cgattttgca gtttattact gtcaacacta taataactgg cctccgtgga cgt           293
 
<210>266
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<212>DNA
<213>human
<400>266
aattgtgttg acgcagtctc caggcaccct gtctttgtct ccaggggaaa gagccaccct     60
ctcctgcagg gccagtcaga gtattagcag cagtttctta gcctggtacc agcagaaagt    120
tggccaggct cccaggctcc tcatctatgg tgcatccagc agggccactg gcatcccaga    180
caggttcagt ggcagtgggt ctgggacaga cttcactctc accatcagca gactggagcc    240
tgaagatttt gcagtgtatt actgtcagca atatggtagc tcgc                     284
 
<210>267
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<212>DNA
<213>human
<400>267
tcctccctgt ctgcatctgt aggagacaga gtcaccatca cttgccgggc aagtcagggc     60
attagaaatg atttagcctg gtatcagcag aaaccaggga aagcccctaa gcgcctgatc    120
tatgctgcat ccagtttgca aagtggggtc ccatcaaggt tcagcggcag tggatctggg    180
acagaattca ctctcacaat cagcagcctg cagcctgaag attttgcaac ttattactgt    240
ctacagcata atagttaccc ttg                                            263
 
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<212>DNA
<213>human
<400>268
gcagttgagt cgtcatcact tttcagtgat gggagagtag atggtgaaat ttattagtta     60
atatatccca gaaattagaa accttaatat gtggacgtaa tctccacagt caaagaagga    120
tggcacctaa accaccagtg cccaaagtct gtgtgatgaa ctttctcttc atactttttt    180
tcacagttgg ctggatgaaa ttttctagac tttctgttgg tgtatccccc ccctgtatag    240
ttaggatagc atttttgatt tatgcatgga aacctgaaaa aaagtttaca agtgtatatc    300
agaaaaggga agttgtgcct tttatagcta ttactgtctg gttttaacaa tttcctttat    360
atttagtgaa ctacgcttgc tcattttttc ttacataatt ttttattcaa gttattgtac    420
agctgtttaa gatgggcagc tagttcgtag ctttccca                            458
 
<210>269
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<212>DNA
<213>human
<400>269
tgaggagaag tctgccgtta ctgccctgtg gggcaaggtg aacgtggatg aagttggtgg     60
tgaggccctg ggcaggctgc tggtggtcta cccttggacc cagaggttct ttgagtcctt    120
tggggatctg tccactcctg atgctgttat gggcaaccct aaggtgaagg ctcatggcaa    180
gaaagtgctc ggtgccttta gtgatggcct ggctcacctg gacaacctca agggcacctt    240
tgccacactg agtgagctgc actgtgacaa gctgcacgtg gatcctgaga acttcaggct    300
cctgggcaac gtgctggtct gtgtgccggc ccatcacttt ggcaaagaat tcacccaacc    360
agtgcaggct gcctatcaga aagtggtggc tggtgtggct aatgccctgg cccacaagta    420
tcactaagct cgctttcttg ctgtccaatt tctattaaag gttcctttgt tccctaagtc    480
caactactaa actg                                                      494
 
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<212>DNA
<213>human
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agagaaccca ccatggtgct gtctcctgac gacaagacca acgtcaaggc cgcctggggt     60
aaggtcggcg cgcacgctgg cgagtatggt gcggaggccc tggagaggat gttcctgtcc    120
ttccccacca ccaagaccta cttcccgcac ttcgacctga gccacggctc tgcccaggtt    180
aagggccacg gcaagaaggt ggccgacgcg ctgaccaacg ccgtggcgca cgtggacgac    240
atgcccaacg cgctgtccgc cctgagcgac ctgcacgcgc acaagcttcg ggtggacccg    300
gtcaacttca agctcctaag ccactgcctg ctggtgaccc tggccgccca cctccccgcc    360
gagttcaccc ctgcggtgca cgcctccctg gacaagttcc tggcttctgt gagcaccgtg    420
ctgacctcca aataccgtta agctg                                          445
 
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<212>DNA
<213>human
<400>271
gggagtttcc tgagggtttt ctcataaatg agggctgcac attgcctgtt ctgcttcgaa     60
gtattcaata ccgctcagta ttttaaatga agtgattcta agatttggtt tgggatcaat    120
aggaaagcat atgcagccaa ccaagatgca aatgttttga aatgatatga ccaaaatttt    180
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aggaacaagc atgatcttgt tactgtgata ttttaaatat ccacagtact cactttttcc    300
aaatgatcct agtaattgcc tagaaatatc tttctcttac ctgttattta tcaatttttc    360
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ctgtg                                                                485
 
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<212>DNA
<213>human
<400>272
tcctgccgac aagaccaacg tcaaggccgc ctggggtaag gtcggcgcgc acgctggcga     60
gtatggtgcg gaggccctgg agaggatgtt cctgtccttc cccaccacca agacctactt    120
cccgcacttc gacctgagcc acggctctgc ccaggttaag ggccacggca agaaggtggc    180
cgacgcgctg accaacgccg tggcgcacgt ggacgacatg cccaacgcgc tgtccgccct    240
gagcgacctg cacgcgcaca agcttcgggt ggacccggtc aacttcaagc tcctaagcca    300
ctgcctgctg gtgaccctgg ccgcccacct ccccgccgag ttcacccctg cggtgcacgc    360
ctccctggac aagttcctgg cttctgtgag caccgtgctg acctccaaat accgttaagc    420
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<210>273
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<212>DNA
<213>human
<400>273
tacgcagact ccgtgaaggg ccgattcacc atctccagag acaattccaa gaacacgctg     60
tatcttcaaa tgaacagcct gagagccgag gacacggccg tattactgtg caagagagac    120
ttgtgtgatt ggggccaagg taccctggtc accgtgtcga gaggtggcgg tggctcgggc    180
ggtggtgggt cgggtggcgg cggatcttct gagctgactc aggaccctgc tgtgtctgtg    240
gccttgggac agacagtcag gatcacatgc caaggagaca gcctcagaag ctattatgca    300
agctggtacc agcagaagcc aggacaggcc cctgtacttg tcatctatgg taaaaacaac    360
cggccctcag ggatcccaga ccgattctct ggctccagct caggaaacac agcttccttg    420
accatcactg gggctcaggc ggaagatgag gctgactatt actgtaactc ccgggacagc    480
agtggtaacc atgtggtatt cggcggaggg accaagctga ccgtcctagg tgcggccgca    540
gaacaaaaac tcatctcaga agaggatctg aatggggccg cat                      583
 
<210>274
<211>484
<212>DNA
<213>human
<400>274
ttgcacaagt ttcctgggct ggaccgtttc aacagagagg cttatttgac tttatgctag     60
aagatgaggc ttctgggata ggcccagaag ttcctgatga ccgcgacttc gagccctccc    120
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acta                                                                 484
 
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<212>DNA
<213>human
<400>275
tgtccataca gagtgtgcat tccctggcag gggctcctgc tcacagcctc gcttttaacc     60
ttctggaacc tgccaaacag tgcccagacc aatattgatg gtgtgccgtt caatgtcgca    120
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<212>DNA
<213>human
<400>276
tgcacagtac tcctggctta tcaatggaac attccagcaa agcacacaag agctctttat     60
ccctaacatc actgtgaata atagtggatc ctatacctgc cacgccaata actcagtcac    120
tggctgcaac aggaccacag tcaagacgat catagtcact gagagacaga atctcaccat    180
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tggcattgtg attggagtag tggccctggt tgctctgata gcagtagccc tggcatgttt    360
tctgcatttc gggaagaccg gcagggcaag cgaccagcgt gatctcacag agcacaaacc    420
ctcagtgtcc aaccacactc aggaccactc caatgaccca cctaacaaga tgaatgaagt    480
tacttattct accctgaact ttgaagccca                                     510
 
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<213>human
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tcctccttcc cttacggaat tacatcttga tggcaacaaa atcagcagag ttgatgcagc     60
tagcctgaaa ggactgaata atttggctaa gttgggattg agtttcaaca gcatctctgc    120
tgttgacaat ggctctctgg ccaacacgcc tcatctgagg gagcttcact tggacaacaa    180
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tcat                                                                 244
 
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<212>DNA
<213>human
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tcacaccgta gcccacatgg atagcacagt tgtcagacaa gattccttca gattccgagt     60
tgcctaccgg ttgttttcgt tgttgttgtt gttgtttttc tttttctttt tttttttgaa    120
gacagcaata accacagtac atattactgt agttctctat agttttacat acattcatac    180
cataactctg ttctctcc                                                  198
 
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<213>human
 
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cactttccaa tgccacagac aactcacatt gttcaactcc cnttctcggg gtgggacaga     60
cgagacaaca gcacacaggc agccagccgt ggnnccagag gctcganggg gctcaggggc    120
ntcanggcac ccgtccccac acgnagggcc ccgtngggtg ggncctnggc cctngctttc    180
tacngccnaa tgnttatgnc cagctccatg ttctcccaaa taccgttgat gtgaattatt    240
ttaaaggcaa aacngtgctc tttattttan aaaacactga taatcacact gcggtaggtc    300
attcttttgc cacatcccta tagaccactg ggtttggcaa aactcaggca gaagtggaga    360
nccnttctag acatcantgt cagccttgct acttgaaggt acaccccata gggtcggagg    420
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<212>DNA
<213>human
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gaggcaaatg gatctcgata tttcagatgg gcttttgatg cactgttgcc aaggaaggct     60
ttttctgatt ttttgacaaa tgaatttttg cacactttca ttggtgtctt tcggcaactt    120
acacacattg aaaat                                                     135
 
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<212>DNA
<213>human
 
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gaggacttag gagagatctg aactccagct gccctacaaa ctccntcnca gcttttcttc     60
tcacttcatg tgaaaactac tccagtggct gactgaattg ctgacccttc aagctctgtc    120
cttatccatt acctcaaagc agtcattcct tagtaaagtt tccaacaaat agaaattaat    180
gacactttgg tagcactaat atggagatta tcctttcatt gagcctttta tcctctgttc    240
tcctttgaag aacccctcac                                                260
 
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gcactgggag gcccaagagc caatccagat gcctgagaca acggagactg tgctctgtgc     60
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gtttgaatta aggcctatgg taaggtaaca ttgctttgtt gtacttttga acaagagctc    180
ctcctgatca ctattacata tttttctaga aaatctaaag ttcagaagag aatgtatcac    240
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<213>human
 
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tcacagcggg caggacggac cccgcccacg acgtgcgggt ggcggtggtg cagtacagcg     60
gcacgggcca gcagcgccca gagcgggcgt cgctgcagtt cctgcagaac tacacggccc    120
tggccagtgc cgtcgatgcc atggacttta tcaacgacgc caccgacgtc aacgatgccc    180
tgggctatgt gacccgcttc taccgcgagg cctcgtccgg cgctgccaag aagaggctgc    240
tgctcttctc agatggcaac tcgcagggcg ccacgcccgc tgccatcgag aaggccgtgc    300
aggnagncca gcgggcaggc atcgagatct tcgtggtggt cgtgggccgc caggtgaatg    360
agccccacat ccgcgtcctg gtcaccggca agacggccga gtacgacgtg gcctacggcg    420
agagccacct gttccgtgtc cccagctacc aggccctgct ccgcggtgtc ttccaccaga    480
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gaatttcacc tgtaaacctg agtcgtacag aaagctgcct ggtatatcca aaangctttt     60
tattcctcct gctcatattg tgattctgcc ntttggggna cttttncttn aaaccttcag    120
ttatgatttt tttttncata cacttattgg naactctgct tgatttttgc ctcttccagt    180
cttcctgaca ctttaattac caacctgtta cctactttga ctttttgcat ttaaaacaga    240
cactggcatg gatatagttt tacttttaaa ctgtgtacat aactgaaaat gtgctatact    300
gcatactttt taaatgtaaa gatattttta tctttatatg aagaaaatca cttaggaaat    360
ggctttgtga ttcaatctgt aaactgtgta ttccaagaca tgtctgttct acatagatgc    420
ttagtccctc atgcaaatca attactggtc caaaagattg ctgaaatttt atatgcttac    480
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a                                                                    541
 
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tcttcccctt gagcttcaga gaggagagtt ggcatggtta aatctgaatg gttacctcac     60
tgctgaaaac ccagaggggc gtggcacact cgcttgtgtg gaaaagcctc taaatgcatc    120
ccttcctttc tttcctgctt cctttgcctt acaattgaag cagcccgtgg taccatcaca    180
gtatgcagag acttcctcac ctttcatatc tagggaccac ccccgatgca ttggtgaggg    240
tgggcactta taaatgcctg ctattgttaa gccattccag cctcttcctc tgaatagacc    300
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ctgctgttcc ctttgctctt gattaggaga gatggaagga gatgagctcc cataactgaa    420
ttggcctttg gttcatgttt tctccccata tgtatatatg ccatatgtga atatgccata    480
tatatgtgcc aacaaatcta tctacgttgt tcttttcaaa ttagcacgca gataggaatt    540
ttgagtttct tcttctt                                                   557
 
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<213>human
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tatgtaaact ttaacttcca ctttgtataa atttttaagt gtcagactat ccattttaca     60
cttgctttat ttttcattac ctgtagcttt gggcagattt gcaacagcaa attaatgtgt    120
aaaattggat tattactaca aaaccgttta gtcatatcta tctaatcaga tcttcttttg    180
ggaggatttg atgtaagtta ctgacaagcc tcagcaaacc caaagatgtt aacagtattt    240
taagaagttg ctgcagattc ctttggccac tgtatttgtt aatttcttgc aatttgaagg    300
tacgagtaga ggtttaaaga aaaatcagtt tttgttctta aaaatgcatt taagttgtaa    360
acgtcttttt aagcctttga agtgcctctg attctatgta acttgttgca gactggtg      418
 
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<213>human
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cgccggctcc tgcaaatgca aagagtgcaa atgcacctcc tgcaagaaaa gctgctgctc     60
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<213>human
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caactgtttt tgcgacttta taggcaggta aattttgcta ttactattga atacaaatga     60
caattcattt atgaccactc aaacagcgtt agtaaccatt tagtgacaaa ggattaaaac    120
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gatatttcaa aggtagatat ttgaaaattc tctagtctca atatgtatgt gtattgaata    240
tactctaaaa ataaatgtgc aatttgctag taggacaatg cagtgactga ctagcattag    300
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gggtagatgg gagtgtcgct tgtatgttat cgtacagctg acatgtattt ttgtctattc     60
tttattatct tagtttcatg ctatgtatgt accataacca acctattgcc tatgagaaac    120
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ctacttgcag tacatcaaag gaatggatgg tggaccctac tattcatgtt ttgagacata    120
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cacatggttc tagcctggac ctggctgggc tccatgagaa tgagttgcct ccaccctgtc     60
ccaacagctg acagccagga gccactctcc cagctgcagg cctttgtggt ccatcttgtc    120
ctgcttcctc actgtggacc cctgtctggg ccaccctagt gtgctaagct gagcagtgca    180
gtgtgaacag ggcccatggt gtattctagg ccacagccca gcactcctct gggctgctct    240
caaaccatgt cccatcttca gcatccctcc caccaactta ctcccctgtg gtgagtaccg    300
tggaacccca gcccacctca ctatcatact cagcttcccc tgatggccca tcccagcccc    360
tgaagctnta tgccaagaac acagctaccg cacaccaccc tgaaacagcc acagccaagg    420
taggcatgca tatgaggtct tccccatacc ctctgggtgt tgagaggttt agccacatga    480
gggagcagag gacaatctct gcagggctgg gagtgggtag ggactgaagg tctcaat       537
 
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tcagtgtctg ggctcatgac ttgtaaatgg aagctgatgt gaacaggtaa ttaatattat     60
gacccacttc tatttacttt gggaaatatc ttggatctta attatcatct gcaagtttca    120
agaagtattc tgccaaaagt atttacaagt atggactcat gagctattgt tggttgctaa    180
atgtgaatca cgcgggagtg agtgtgccct tcacactgtg acattgtgac attgtgacaa    240
gctccatgtc ctttaaaatc agtcactctg cacacaagag aaatcaactt cgtggttgga    300
tggggccgga acacaaccag tctttttgta tttattgtta ctgagacaaa acagtactca    360
ctgagtgttt ttcagtttcc tactggtggt tttgatattg tttgtttaag atgtatattt    420
agaatgacat catctaagaa gctgattttg ctaaactcct gttccc                   466
 
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gaactcatgt gatttaccct tttcaacttt ttggaaaacg atttaattta ttctaattag     60
attaacccta ttaatctatg gattgggtat caaaatgaat gccagtccag atgtgcctag    120
acacgaaatt ggagctgagg actctcacga tatgcaagtt catccaacgt gaagatacca    180
taagcttttt ctctgaacca gagaaatgaa agtcagttta agaggctgat agatcttggc    240
cctgttaagg catccacttc acagttctga aggctgagtc agccccactc cacagttagg    300
ccaagaatta gattttaaaa cttcatctgt ctgtcccagt taactgttaa ataaggcctc    360
atcctccact gaagagtatg gattgaagga ttgtgaacta tgtttagtgt gattgtgaac    420
ttggtgccta atgttccatg tctgaagttt gccccagtgc tacacgttgg agta          474
 
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gatgcaattg gttctcctgc attgagattt gatttaacag tgttatgtta acatttatac     60
ttgccttgga ctgtagaaca gaacttaaat gggaatgtat tagttttaca actacaatca    120
agtcatttta cctttaccca gtttttaata taaaacttaa attttgaaat tcactgtgtg    180
actaatagca tgatgctctg cagttttatt aagaaatnag cctaaccata caactctcat    240
ttccttagta agccaaatta ggattaactt ctataaacag tgttgggaac aatgtttaac    300
attttgtgcc aatttgttcc tgtattcatg tatgtaagtt acagatctga ctcttcattt    360
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cctatcctac ttgcccatat gagcacggct ccccatggcc acatactcct gcaaagcttt     60
tatgctgctt cgcttttctc taaacagatc tgatattgct gctcctgtgg ttttctcaaa    120
attaactttg ccgtggtttt taaaaaggaa tcaaaatgca ttgttgcatt aagctttttc    180
aataaaggaa aattacggaa ggaaaatagg caacaccagc aaattatatg tggacaggtt    240
ctaaactcta tatatacata tatatatata tatctatata tctatatacg taatcatcta    300
gttctgtcat cttactgaaa ggaataacac ttctaaagat caccatttct gagaagttct    360
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caccgcgcag agctcagggg gtggtgcgcc cggcccttct gcggcgcaca gcccagccca     60
ggaacgcggg cggtgcggac tcagcgggcc gggtgcaggc gcggagctgg gcctctgcgc    120
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ggaccccaac tgctcttgcg ccactggntg gctcctgcac gtgcgccggc tcctgcaagt    300
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tactgatgct tctgatactg gatgtttagc ttcttactgc aaaaacataa gtaaaacagt     60
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tatttcctga atggatgtgg aaatgaaagc tagcgcacct gcactttgaa ttcttgcttc    300
ttttttatta ctgttatgat tttgcttttt acagatgttg gacgattttt tcttctgatt    360
gttgaattca taatcatggt ctcatttcct ttgcttcttt ggaatatttc tttcaacaca    420
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gacaggaggg tgtccacata tgttaacatc agttggatct cctatagaag tttctgctgc     60
tctctttcct tctccctgag ctggtaactg caatgccaac ttcctgggcc tttctgacta    120
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gctccacatg agccatgcat gcttagcaat ccaagtgcag agctctttgc tccaggagtg     60
aggagactgg gaggtgaaat ggggaaatgg aagggtttgg aggcagagct gaaaacaggg    120
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naggggccan ggggaacccg tgaggatcac tctcaaatga gattaaaaac aaggaagcag    240
agaatggtca gagaatggga ttcagattgg gaacttgtgg ggatgagagt gaccaggttg    300
aactgggaag tggaaaaagg agtttgagtc actggcacct agaagcctgc ccacgattcc    360
taggaaggct ggcagacacc ctggaaccct ggggagctac tggcaaactc tcctggattg    420
gncctnatnn ttttggtggg aaaggctgcc ctggggatca actttccttc tgtgtgtggc    480
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gtttgaattt gtcttacttt cctggccacc tcgttgtcct attttataag ctggggagtt    300
aactagctta acaaaagatg cttagctttt gtaaaagaac aagtgtttca ttttacaaag    360
acactccaaa tgatagttac ttgattttct cgagaccttt aactatggtg atgaataaca    420
ggacttgctt tcaagcctta ataaatgtaa aatgcctttt aatgaagata cagctgagtg    480
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<213>human
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gaaaccaagg tcaggaggcc gttgcagaca taaatctcgg cgactcggcc ccgtctcctg     60
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tccttcctca gaatagtgat gtgttcgacg ttttatcaaa ggcccccttt ctatgttcat    360
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gcccacacac acccactaag gagaaagaag ttgattcctt cattcacttc gccattcatt    300
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tataaaatac tacaattact tctttgtgag ttatgacagc agtgtaacat gtgataagac    180
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cctcaaacag ctttatataa agcacaatta ctagtatttc acagtttttg ctaatagaaa    300
atgctgattc tgattctgag atcaatttgt gggaatttta cataaatctt tgttaattac    360
tgagtgggca agtagacttc ctgtctttgc tttctttttt tttttctttt tgatgcctta    420
atgtagatat ctttatcatt ctgaattgta ttatatattt aaantgctca ttaatagaat    480
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gaaactgtat gggtagcttt tttgtttgtt ttttgttttg tttttgtttt tgtttttgtt     60
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atgcctacag gtatgcgtga ttgtgtgtgt gtgcatgggt gnacagccac ntgtctacct     60
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gcctctggca atgccattca ggccaggtct tcctcctatn gtgnaganna tnnnnntggn     60
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aaaacaacaa aaaactctgt atctgtttct agcatgtgct gcattgactc tattaatcac    180
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gcataaatta atcagcccca gagtgcttta annnnttctc ttaaataccg gtgtctttga     60
tcaggatgac atgtgccatt tttcagagga cgtgcagaca ggctggcatt ctagattact    120
tttcttactc tgaaacatgg cctgtttggg agtgcgggat tcaaaggtgg tcccaccgct    180
gcccctactg caaatggcag ttntaatctt atcttttggc ttctgcagat ggttgcaatn    240
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tctgcatctg taggagacag agtcaccatc acttgccggg caagtcagag cattagcagc    120
tatttaaatt ggtatcagca gaaaccaggn aaagccccta ngctcctgat ctatgctgca    180
tccantttgc aaagtggggt cccatcaagg ttcagtggca gtggatctgg gacagatttc    240
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gccgagtact ggaacagcca gaaggacntc ctggaagacn agcgggccnn ggtggacacc     60
tactgcagac acaactacgg ggttgnngag agcttcacng tgcagcggcg agtccatcct    120
naggtgactg tgtatcctnc aaagacccag cccctgcagc accacaanct cctggtctgn    180
tctgtgagtg gtttctatcc aggcagcatt gnaagtcagg tggttncgga anggcnagga    240
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ccctggtgat gctngaaaca gttcctcgga gtggagaggt ttacacctgc caagtggagc    360
acccaagcnt nacgagccct ctcacagtgg aatggagngc acggtctgaa tctgcacaga    420
gcaagatgct gagtggagtc gggggctt                                       448
 
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aagatcctgg agtttgtggg gcgctccctn ccagaggaga cngtggacnt catggttnag     60
cacacgtcgt tcaaggagat gaagaagaac cctatgacca actacaccac cgtccnccng    120
gagttcatgg accacagcat ctcccccttc atgaggaaag gcatggctgg ggacnngngn    180
ngnccacntt caccgtggcg cagaatgagc gcttcgatgc ggacntatgc ggagaagatg    240
gcaggncngc agcctcangc ttccgctntg agcngtgaga ggggnnncnt ggagtcacng    300
cagagggagt gtgcgaatca aacctgacca agcggntcaa gaataaaata tgaattgagg    360
gccngggacg gtaggtcatg tctgtaatcc cagcaatttg gaggctgagg tgggaggatc    420
atttgagccc aggagttcga gaccaacctg ggcaacatag tgagattctg ttaaaaaaat    480
aaaataaaat aaaaccaatt tttaaaaaga gaataaaata tgattgtggg ccaggcagag    540
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ccggtcagca ggatcatcgt gcacccacag ttctacatca tccagactgg agcggatatc     60
gccctgctgg agctggagga gcccgtgaac atctccagcc gcgtccacac ggtcatgctg    120
ccccctgcct cggagacctt ccccccgggn ntgccgtgct gggtcactgg ctggggcgat    180
gtggacaatg atgagcccct cccaccgcca tttcccctga agcaggtgaa ggtccccata    240
atggaaaacc acatttgtga cgcaaaatac caccttggcg cctacacggg agacgacgtc    300
cgcatcatcc gtgacgacat gctgtgtgcc gggaacaccc ggagngnntc atgccagggc    360
gactcnggag ggcccctggt gtgcaaggtg aatggcacct ggctncaggc gggcgtggtc    420
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tacttggact ggatcc                                                    496
 
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gaaccacctc aatgcaaaga ttctacggga aaatgtgggc cccctccacc tattgacaat     60
ggggacatta cttcattccc gttgtcagta tatgctccag cttcatcagt tgagtaccaa    120
tgccagaact tgtatcaact tgagggtaac aagcgaataa catgtagaaa tggacaatgg    180
tcagaaccac caaaatgctt acatccgtgt gtaatatccc gagaaattat ggaaaattat    240
aacatagcat taaggtggac agccaaacag aagctttatt tgagaacagg tgaatcagct    300
gaatttgtgt gtaaacgggg atatcngtct ttcatcacgt tctcacacat tgcgaacaac    360
atgttgggat gggnnnctgg agtatccaac ttgtgcannn ngatagaatc aatcataaaa    420
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tcttccaatt tattatctgc accaattatt ttgggcactt ctcctgtgta tgtaaacttt     60
ggagtttagg tctacgtcat ttatataaga gcctgtagac ctgagtggat ggacactgcc    120
tcttagaact agaacttaga actttatctt gaaaatgtac nncnnnngcn gaannnccnc    180
acagagtatg tgtcaggtag gaaccaaatt tatgattgtt atattcaaac tggttttctg    240
ttccttgaaa atggtntttt ttctgatcaa agcctattta ggagttatta tgttcttgag    300
tttattccat gtgtgtgaat attttgaatg aatccactaa taagatatgc atgtatgtct    360
ggannnnnnn cnnnnnagaa taaatattta agtagacttt aacaagtaaa tggttgtagg    420
catcattaag tcttaaatag ccttttcaaa gatattagtg ttctngtttt aattattcag    480
ataattcctt taattctcca ctcaaatctg acttta                              516
 
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gattcctgtg ggtccagctt tggaactggg aaacctttct tcggatccgc actcattcca     60
ctgatgccag ctgcccctga aggatgccag tactgtggtg tgtgagtctc agcagccgcc    120
cacacgctcc taactctgct gcatggcaga tgcctaggtg gaaatagcaa aaacaaggcc    180
cgggctgggg ccagggccag aggggaaggc cctggattct cactcatgtg agatcttgaa    240
tctctttctt tgttctgttt gtttagttag tatcatctgg taaaatagtt aaaaaacaac    300
aaaaaactct gtatctgttt ctagcatgtg ctgcattgac tctattaatc acatttcaaa    360
ttcaccctac attcctctcc tcttcactag cctctctgaa ggtgtcctgg ccagccctgg    420
agaagcactg gtgtctgcag cacccctcag ttcctgtgcc tcagcccaca ggccactgtg    480
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ctctggctcc caggtgccag atgtgccatc cagttgaccc agtctccatc ctccctgtct     60
gcatctgtag gagacagagt caccatcact tgccgggcaa gtcagggcat tagcagtgct    120
ttagcctgnt atcagcagaa accagggaaa gctcctaagc tcctgatcta tgatgcctcc    180
agtttgnaaa ntggggtccc atcaaggttc agcggcagtg gatctgggac agatttcact    240
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<213>human
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aatggacccc aactgctcct gtgccactgg tggctcctgc atgtgcgccg gctcctgcaa    120
gtgcaaagag tgcaaatgca cctcctgcaa gaagagctgc tgctcctgct gccccgtggg    180
ctgtgccaag tgtgcccagg gctgcatctg caaaggggcg ttggagaagt gcaactgcta    240
tgcctgacgt ggggacagct ctgctcccag atgtaaatag agtaacctgc acaaacctgg    300
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tcctccctgt ctgcatctgt aggagacaga gtcaccatca cttgccgggt gagtcagggc     60
attagcagtt atttaaattg gtatcggcag aaaccaggga aagttcctaa gctcctgatc    120
tatagtgcat ccaatttgca atctggagtc ccatctcggt tcagtggcag tggatctggg    180
acagatttca ctctcactat cagcagcctg cagcctgaag atgttgcaac ttattacggt    240
caacggactt acaatgccc                                                 259
 
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<213>human
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gcatatgcag ccaaccaaga tgcaaatgtt ttgaaatgat atgaccaaaa ttttaagtag    240
gaaagtcacc caaacacttc tgctttcact taagtgtctg gcccgcaata ctgtaggaac    300
aagcatgatc ttgttactgt gatattttaa atatccacag tactcacttt ttccaaatga    360
tcctagtaat tgcctagaaa tatctttctc ttacctgtta tttatcaatt tttcccagta    420
tttttatacg gaaaaaattg tattgaaaac acttagtatg cagttgataa gaggaatttg    480
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tgagagccga ggacacggcc gtatattact gtgcgaaatc cc                       162
 
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tcctccctgt ctgcatctgt aggagacaga gtcaccatca cttgccaggc gagtcaggac     60
attagtaatt ttttaacttg gtatcagaag aagccaggga aagcccctaa agtcctgatc    120
tacgatgcat ccaatttgga aacaggggtc ccatcaaggt tcagtggaag tggttctggg    180
acagatttta ctttcaccat cgccagcctg cagcctgacg attttgcaac atattactgt    240
caacaatata atgatcaccc cctcactttc ggccctggga ccaaagtg                 288
 
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atgaaactga ttacaacagg ctgtaagaat caaagtcaac tgacatctat gctacatatt     60
attatatagt ttgtactgag ctattgaagt cccattaact taaagtatat gttttcaaat    120
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aagttaaatc attggtgcta ataataaatg tggattttgt attaaaatat atagaagcaa    300
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catctcctgc actggaacca gcagtgacgt tggtgcttat aactatgtct cctggtacca     60
acagcaccca ggcaaagccc ccaaactcat gatttatgag gtcagtaatc ggccctcagg    120
ggtttctaat cgcttctctg gctccaagtc tggcaacacg gcctccctga ccatctctgg    180
gctccaggct gacgacgagg gtgattacta ctgcatctca tatacaagta gcaaccctct    240
cgtggtt                                                              247
 
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tcaagtggga agagcgctgt tcaaggacca cctgagcgtg acctctgtgg ctgctacagc     60
gtgttccagt gtcctgccgg gctgtgccga gccatggaac catggggaga ccttcacttg    120
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ctgcaggggt cacaggagct gccccgcgag aagtacctga cttgggcatc ccggcaggag    360
cccagccagg gcaccaccac cttcgctgtg accagcatac tgcgcgtggc agccgaggac    420
tggaagaagg gggacacctt ctcctgcatg gtgggccacg aggccctgcc gctggccttc    480
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gctgtcagga ttcttcaagg agaatgaata ctgggaatca agacaggact ataccttatc     60
cataggcgca ggtgcacagg gggaggccat aaagatcaaa catgcatgga tgggtcctca    120
cgcagacaca cccacagaag gacactagcc tggcgcgcgt gcacacacac acacacacac    180
acgagttcat aatgtggtga tggccctaag ttaagcaaaa tgcttctgca cacaaaactc    240
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gcacctgagc atgaaactcg acgcgttctt cggcatcttc tttggggccc tgggcggcct     60
cttgctgctg ggggtcggga cgttcgtggt cctgcgcttc tggggttgct ccggggccag    120
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catctcctgc actggaacca gcagtgacgt tgntggttat aacnatgtct cctggtacca     60
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gcgctggttc ctgcaagtgc aaagagtgca aatgcacctc ctgcaagaag agctgctgct     60
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aggacagagg gtcaccatct cttgctctgg aagcagctcc aacattggga agaattatgt     60
atcctggtac cagcaactcc caggaacagc ccccaaactc ctcatctata aaaataataa    120
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tgaggagaag tctgccgtta ctgccctgtg gggcaaggtg aacgtggatg aagttggtgg     60
tgaggccctg ggcaggctgc tggtggtcta cccttggacc cagaggttct ttgagtcctt    120
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tcctgcactg ggagcagctc ctacatcggg gcaggttatg atgtacactg gtaccggcaa     60
cttcccggca cagcccccaa actcctcatc tatggtaaca ccgatcggcc ctcaggggtc    120
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ggtccccaca gactcagaga gaacccacca tggtgctgtc tcctgccgac aagaccaacg     60
tcaaggccgc ctggggtaag gtcggcgcgc acgctggcga gtatggtgcg gaggccctgg    120
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gctgccaggt gccagatgtg acatccagat gacccagtct ccatcctccc tgtctgcatc     60
tgtaggagac agagtcacca tcacttgccg ggcgagtcag ggcattagca ataatttaaa    120
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<213>human
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agtcgctcca tttatcgctt gagatctcca gccttaccgc ggctcgaaat ggaccccaac     60
tgctcctgca ccactggtgt ctcctgcgcc tgcaccggct cctgcaagtg caaagagtgc    120
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aggagtgcag actctgcctc aaacttgtga tgaacccaaa gcccacacca gcttccaaat    120
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ngctaacctt tattgacaat ctatatngca aaagtcagga aagaggttgt gagctgattg    240
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tgctcaagtg gaaattttgt cagctgttta gccttttcgt acttggcgtg atgtcaactt    240
cacttctaat ctgcaaaagc agaagctgtt tcctagttta cctcgcgtgt gtttacctat    300
atggagtagc tcgcagagat cacagaaatg cttgcagcct aaggcagggt tttcagaccg    360
tgggtcccag cccatttagt aaaatgggaa atcaattagc aagtggtcac cagcattaca    420
cagca                                                                425
 
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<211>551
<212>DNA
<213>human
<400>383
tatacagttt aataagcctc ttgcaagtta cttgttctct cacctgaggt atttttttcc     60
tccccacctt gcccctgttc ctcccttcct cttctccctt tgcaagagga aatatttaac    120
atatttgggt ccaacttcaa taatgtaata attaatacat taaaagcatt taacttcctt    180
tctagaaaaa tgcacaggct aaggcataga caaaacaaag agaaatgctg agaaatttgc    240
cactggagac aagcaatctg aataaatatt tgccaaaagt tctttttatg tcatatagtg    300
tcaggatttg aaggagctat tttttttaat gttgcaacta gcaactcatc ttcggaagac    360
acagccagga gaatgaagta gaagtgaaag gtttataaat ccatttgtaa gcatttatcc    420
catatatttt aaattcaaga aaaattgtgt ttatctttag aattttgtat tcaatacttt    480
atgtactatg tgactcatgc ttctggataa ataaagcacc aaatatgtat ctgtaaccac    540
aatcacacat a                                                         551
 
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<212>DNA
<213>human
<400>384
ggcttgatgt agactggctt gctttgattt ttagtgaagg gaatgtacgt aaaacaaaat     60
agggcttggc tggtcaaagg agacaagcag gatggatgga tggatggatg aatagataga    120
tggtgtttgc atgtaaattg cagagaaaac aaaaccaaag ctgattggaa acaattaatt    180
gtgggtgtct gagggggaag gtcgcagctt tgggcagctt tgagaagcgg tacaagagct    240
ctgtgcctgt gtgtccagcc ctggagccag ccagtgcatt tattttaagc tcttagaagc    300
aactccttgg cccaggaatg cgtgacccct gagatgggtc cacgcatctc tctacacgtc    360
cttctctccg tgggatactg gactcgtgcc tctgcgccca ttctcttctc acgcatatcc    420
atgagcttta atttcacttt ctgatcacgg tacgtccata aagccagt                 468
 
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<212>DNA
<213>human
<400>385
ggagatgact taagttggca gcagtaatct tcttttagga gcttgtacca cagtcttgca     60
cataagtgca gatttgcccc aagtaaagag aatttcctca acactaactt cacggggata    120
atcaccacgt aactaccctt aaagcatatc actagccaaa gaggggaata tctgttcttc    180
ttactgtgcc tatattaaga ctagtacaaa tgtggtgtgt cttccaactt tcattgaaaa    240
tgccatatct ataccatatt ttattcgagt cactgatgat gtaatgatat attttttcat    300
tattatagta gaatattttt atggcaagag atttgtggtc ttgatcatac ctatt         355
 
<210>386
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<212>DNA
<213>human
<400>386
gaagctgaca caccgtatgt tgttagagtc ttttatctgg tcaggggaaa caaaatcttg     60
acccagctga acatgtcttc ctgagtcagt gcctgaatct ttatttttta aattgaatgt    120
tccttaaagg ttaacatttc taaagcaata ttaagaaaga ctttaaatgt tattttggaa    180
gacttacgat gcatgtatac aaacgaatag cagataatga tgactagttc acacataaag    240
tccttttaag gagaaaatct aaaatgaaaa gtggataaac agaacattta taagtgatca    300
gttaatgcct aagagtgaaa gtagttctat tgacattcct caagatattt aatatcaact    360
gcattatgta ttatgtctgc ttaaatcatt taaaaacggc aaagaattat atagactatg    420
aggtaccttg ctgtgtagga ggatgaaagg ggagttgata gtctcataaa actaatttgg    480
cttcaagttt catgaatctg taactagaat ttaattttca ccccaataat gttctatata    540
gcctttgcta a                                                         551
 
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<212>DNA
<213>human
<400>387
gttcaaaata tttccaagcc tgagtattgt ctattggtat agatttttag aaatcaataa     60
ttgattattt atttgcactt attacaatgc ctgaaaaagt gcaccacatg gatgttaagt    120
agaaattcaa gaaagtaaga tgtcttcagc aactcagtaa aaccttacgc caccttttgg    180
tttgtaagag gttttttata catttcaaac aggttgcaca aaagttaaaa taatggggtc    240
ttttataaat ccaaagtact gtgaaaacat tttacatatt ttttaaatct tctgactaat    300
gctaaaacgt aatctaatta aatttcatac agttactgca gtaagcatta ggaagtgaat    360
atgatataca aaatagttta taaagactct atagtttcta taatttattt tactggcaaa    420
tgtcatgcaa caa                                                       433
 
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<212>DNA
<213>human
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ggcagcccac aagtttctcg tggggagatg gaggcagagc ccagggtagg ggacagagct     60
gctggggcct ttccttgcct gggaatctgt cccaggaaga gcttccccac tcccatcccc    120
caaattggaa aaaccgtaca ttcaagcctg tttggccctg aaattcttaa gaatctggtt    180
aagaattaac tcactaatgt caaaagtcaa aacctcctag gggttgtcct gggagtcagg    240
ttcacgggta cagaagatga atctcagatg tcactcaacc tgagccgtca ttctctgtgg    300
cagggctgcc ctgggtttct cttactcaat ccctggagtg taagcatttg gattgtgtca    360
cagattacct ttttaccttt tctttctttt tttttctttt tttcaatatc agtgcccaca    420
ccttactgag tattgagttt tagagctttc gcttgatgtg cttgaccaag agacttcttt    480
tgtatccttt tct                                                       493
 
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<212>DNA
<213>human
<400>389
tcaagtgcgt tctttagacc aatgcattgc gtttctttcc ctgcttttga gatagtagga     60
agagttcttg gtggtgtccc cccccttcaa ttcttcagtt gtatagtagt tatagggaag    120
atatgggtgt ttttctttat tattactttt ttttttctgc aggtcagtaa aaggatttaa    180
gttgcactga caaaaatacc aaaataaaag tgtattttta agttcccatt tgaaattgct    240
ggcgctgctg gccggatgca tttttgagtt tgtattagtt gataaattaa cagtaataac    300
aagattgtat gaaccgcatg gtgcttgcag ttttaaatat tgtggatatt tgtcctgcat    360
cagaaacgag ctttggtttt tacagattca actgtgttga aatcaaacct gccgcaacag    420
aaattgtttt tatttcatgt aaaataaggg atcaatttca aaccctgctt atg    473
 
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<212>DNA
<213>human
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cctcctgcct ctggatttta ggtgttgatt tctggatcac gggataccac ttcctgtcca     60
caccccgacc aggggctaga aaatttgttt gagattttta tatcatcttg tcaaattgct    120
tcagttgtaa atgtgaaaaa tgggctgggg aaaggaggtg gtgtccctaa ttgttttact    180
tgttaacttg ttcttgtgcc cctgggcact tggcctttgt ctgctctcag tgtcttccct    240
ttgacatggg aaaggagttg tggccaaaat ccccatcttc ttgcacctca acgtctgtgg    300
ctcagggctg gggtggcaga gggaggcctt caccttatat ctgtgttgtt atccagggct    360
ccagacttcc tcctctgcct gccccactgc accctctccc ccttatctat ctccttctcg    420
gctccccagc ccagtcttgg cttcttgtcc cctcctgggg tcatccctcc actctgactc    480
tgactatggc agcag                                                     495
 
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<213>human
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ggcatgtgtg actgtttcag cgactgcgga gtctgtctct gtggcacatt ttgtttcccg     60
tgccttgggt gtcaagttgc agctgatatg aatgaatgct gtctgtgtgg aacaagcgtc    120
gcaatgagga ctctctacag gacccgatat ggcatccctg gatctatttg tgatgactat    180
atggcaactc tttgctgtcc tcattgtact ctttgccaaa tcaagagaga tatcaacaga    240
aggagagcca tgcgtacttt ctaaaaactg atggtgaaaa gctcttaccg aagcaacaaa    300
attcagcaga cacctcttca gcttgagttc ttcaccatct tttgcaactg aaatatgatg    360
gatatgctta agtacaactg atggcatgaa aaaaatcaaa tttttgattt attataaatg    420
aatgttgtcc ctgaacttag ctaaatggtg caacttagtt tctccttgct ttcatattat    480
cg                                                                   482
 
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<212>DNA
<213>human
 
<220>
<221>misc_feature
<222>(124)..(124)
<223>n is a，c，g，or t
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agagaatgcc cttctcctta ttgtaaccct gtctggatcc tatcctccta cctccaaagc     60
ttcccacggc ctttctagcc tggctatgtc ctaataatat cccactggga gaaaggagtt    120
ttgncaaagt gcaaggacct aaaacatctc atcagtatcc agtggtaaaa aggcctcctg    180
gctgtctgag gctaggtggg ttgaaagcca aggagtcact gagaccaagg ctttctctac    240
tgattccgca gctcagaccc tttcttcagc tctgaaagag aaacacgtat cccacctgac    300
atgtccttct gagcccggta agagcaaaag aatggcagaa aagtttagcc cctgaaagcc    360
atggagattc tcataacttg agacctaatc tctgtaaagc taaaataaag aaatagaaca    420
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ggtctctacc actgctgata ttttct                                         566
 
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<212>DNA
<213>human
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attaccttat catgtcttag agcccgtctt tatgtttaaa actaatttct taaaataaag     60
ccttcagtaa atgttcatta ccaacttgat aaatgctact cataagagct ggtttggggc    120
tatagcatat gctttttttt ttttaattat tacctgattt aaaaatctct gtaaaaacgt    180
gtagtgtttc ataaaatctg taactcgcat tttaatgatc cgctattata agcttttaat    240
agcatgaaaa ttgttaggct atataacatt gccacttcaa ctctaaggaa tatttttgag    300
atatcccttt ggaagacctt gcttggaaga gcctggacac taacaattct acaccaaatt    360
gtctcttcaa atacgtatgg actggataac tctgagaaac acatctagta taactgaata    420
agcagagcat caaattaaac agacagaaac cgaaagctct atataaatgc tcagagttct    480
ttatgtatt                                                            489
 
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<213>human
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atggggctgg ggacttgaat tggatgcttc aaaaccatca cctgttggcc aacaagtttg     60
acccaaaggt agatgataat gctcttcagt gcttagaaga atacctacgt tataaggcca    120
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ggagctgccg ttcctaataa ttccag                                         506
 
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<212>DNA
<213>human
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ggaattcttc tcttacttca ataaaatggg ttttaacata actttaaatt cagttaaata     60
tacaatattg aatacctata gttgactttg ggatggggac tttttcaagt cattaagagt    120
gtttgtttaa ggtgatctca ttgatggtag ttctcagccg tctcaaaaac tgcaagctaa    180
tcagtcagac attctttaat gaccccaatt ttttcacttt aattgttacc atgttttcta    240
tttttactga tttttgctaa agcatgtaag agtgaattta ttatagcagt aatcttgtgt    300
ttctcctgat gtgca                                                     315
 
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<212>DNA
<213>human
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atcaacacat ttagcttggc gttttattca ttccatcacc cttactgtaa ctactatggc     60
aactcaaata attgtcatgg gactatgtcc atcttaatgg gtctggatgg catggtgctc    120
ctcttaagtg tgctggaatt ctgcattgct gtgtccctct ctgcctttgg atgtaaagtg    180
ctctgttgta cccctggtgg ggttgtgtta attctgccat cacattctca catggcagaa    240
acagcatctc ccacaccact taatgaggtt tgaggccacc caaagatcaa cagacaaatg    300
ctccagaaat ctatgctgac tgtgacacaa g                                   331
 
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<212>DNA
<213>human
<400>397
catctctcag gaggtgggct gtccaccaaa atgagcattc agggctgcgt ggcccaacct     60
tccagcttct tgttgaacca caccagacaa atcgggatct tctctgcgcg tgagaagcgt    120
gatgtgcagc ctcctgcctc tcagcatgag ggaggtgggg ctgagggcct ggagtctctc    180
acttgggggg tggggctggc actggcccca gcgctgtggt ggggagtggt ttgcccttcc    240
tgctaactct attaccccca cgattcttca ccgctgctga ccacccacactcaacctccc     300
tctgacctca taacctaatg gccttggaca ccagattctt tcccattctg tccatgaatc    360
atcttcccca cacacaatca ttcatatcta ctcacctaac agcaacactg gggagagcct    420
ggagcatccg gacttgccct atgggagag                                      449
 
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<212>DNA
<213>human
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tccttgtcca caagcactat ggcccccggc tcaagtgctg ctctggcaaa gctccggagc     60
cccagcccca aggctttgac aaccaggcgt tcctccctga ccacaaggcc aactgggcgc    120
ccgtccccag ccccacgcac gaccccaagc ccgcggaggc accgatgccc gcagagcccg    180
caccccccgg ccctgcctcc ccaggcggtg cccctgagcc ccccgcagcg gcccgagctg    240
gcggaagccc cacggcggtg aggtccatcc tgaccaagga gcggcggcca gagggcgggt    300
acaaggctgt ctggtttggc gaggacatcg ggacggaggc agacgtggtc gttctcaacg    360
cgcccaccct ggacgtggat ggcgccagtg actccggcag cggcgatgag ggcgagggcg    420
cggggagggg tgggggtccc tacgatgcgc ccggtggtga tgactcctac atctaagtgg    480
ccc                                                                  483
 
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<212>DNA
<213>human
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accatcgctg gtggtatccc agggtccctg ctcaagtttt ctttgaaaag gagggctgga     60
atggtacatc acataggcaa gtcctgccct gtatttaggc tttgcctgct tggtgtgatg    120
taagggaaat tgaaagactt gcccattcaa aatgatcttt accgtggcct gccccatgct    180
tatggtcccc agcatttaca gtaacttgtg aatgttaagt atcatctctt atctaaatat    240
t                                                                    241
 
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<212>DNA
<213>human
<400>400
gaatactcat aattcttatc tctataatca aaagtataat ttactgtaga aaaataaaga     60
gatgcttgtt ctgaaagtaa gatcagtgaa ctgcttttca gtctcaatct ttgagaattg    120
taaattcatc aaataattgc ttacatagta aaaatttaag gtattagaaa acctgcataa    180
caaatagtat tatatattaa atattttgat atgtaaagct ctacacaaag ctaaatatag    240
tgtaataatg tttacactaa taagcaaata tgttaatctt ctcatttttt tactgtcata    300
taatcttagt gatatgccta ttaatagttt taaataaata aattggctca tctggctttt    360
tgaaaatttt gaaattctta cagatgttga ttaggtatat ctacaaatta atttcaattt    420
taaaatgatg atataaaaat aaatataagt atttttcttg tgtatgtata               470
 
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<213>human
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gaaatgat                                                             488
 
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<213>human
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ttccacttct attccacgga gaaaaaaatt gatttgtgtc acagaagttt ttatggaaac     60
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aaacaagaat cagcagaagg aaatgatcga aaccaaagta gtaaaggagg agaaggccaa    300
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ctcaactcgg ccatcacata tcgaattacc aaccactcac acttccggat ggagggagag     60
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gagcattttc caggtcggac c                                              321
 
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<213>human
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aaaacccatt ctttcagtta catctactaa gagctcgtag ttcaataaca ttccaaagaa     60
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acttctgtgt atgttgtgta tggtatagta tgctatttct gtgtatgttc aaattgttta    480
tgtatataat aaagttttaa aaatttgtat gtacttgaca attccttaga a             531
 
<210>406
<211>533
<212>DNA
<213>human
<400>406
agaggagaca ctttggcgtt cttcaagcag aactgaggct gcgaaaaatc caagtctcta     60
cagagacact gatgaagttg aaagggtaat tgtttttcca tgccaaatga ggaaatcaaa    120
ttaatgagtt gacaaacttt tcctgagatg ttatttcatc tacatttagt taaacaactt    180
agaatgatat ctagaaaata tttattttca gccaggaact ttagcaaact gtggcaatga    240
tcactgggaa tgaaaacgta taatgttcta caatttttgt tatcacattg gatgactttg    300
aatatagtag tgacacttgg gaccaaataa attattttat atgactacta gaacaaagtt    360
ttagtaagct gtctgctaat agagtcagaa ttcttccaga ttgtttccag ctgtaacagg    420
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ttatggagtg gaagaagcgt aatgttaata tcttgtaaat tcgtattccc tat           533
 
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cattttccag gatctcagtg tgagtatcat tgatgcctgg gatataacaa ttgcatatgg     60
cacaaataat gtacacccac ctcaacatgt agtcggaaat cagattaata tattattaaa    120
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gagaatctac attatggctg atccataagc caccaattca gctaaatgag atgtttctaa    300
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tccagatggc ctaaagtaac tgaagatcca caaaagaagt aaaaatagcc ttaactgatg    240
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agcccaccag caggagcttg gagtttgggg agtggggatg agtccgtcaa gcacaactgt     60
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gtgaggctca gtcagaacct ccaccctccc ccacaccaaa gacaggggca gcgtagtatt     60
caaaccagta ttgtggtggg gaataattgt atacatgtaa attatcaagc cctatgagtg    120
gaagaatttt ttcaaattat ttttgtctct ctatatattg atttatatta tgtataacta    180
tctctttata taaactatat ataattatat atatataact atataattat atatatataa    240
ctatatatat aactatatat atgtatcccc tagtattgga tcatgaagag ctcttcatgc    300
attctttgca aaggaggtta taaagttacg ccctcagaac atttataact ataagaatgt    360
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cat                                                                  423
 
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tttaatgatg gtttccaact ggcctaatac attaagtaag actggctgat aacatgacca    360
gacagacata aagaccctgt tgggaatgac attgaactct caaagtcaag atttcttaca    420
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agggactttg actgtcttgt tcattgctat atgataatgc ctggcccaac agcaggcatt    300
ctgtagtgtc tgttgaacaa acatctaaaa tctggcaaag tgaacaatgg ttcctgagga    360
taagtattta aataacaaaa ttaactttca ctacaaaagc tgccaactta cctttatctt    420
ctggtgctat cccctgagct ttcttaagat ca                                  452
 
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gaatgcatga tctcaagcct taactactat aatctttttc tgcccctcag aaattgaata     60
acctaaccaa gatgccttta ggggatgccc taagtaaatg taatttcaga tttcagggnt    120
tttttttttt tcctctctaa gtgttccttc cctttcttct cctgctctcc atcatgttat    180
ggagaccagt gaggaaccag tgttaacttg gtgacaatgt gacagctggt gctttatcta    240
agctccgttt tctatttctt gggaatgctt tattgtggaa actgcttcag atacttaaat    300
tgaatcataa cttgcttctg taaattgcgt aaagacaaca aactgatttt agtttgaaaa    360
gtttatcttt tacttgtaaa ccttgtttgc cagttacct                           399
 
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agccccaggt gtatttctga gtgtcaacag tgttaatttc aagcatgcta ataaaatgtn     60
nnnncggnnn atannnnnnn nnnaannann cnttnaaant nnnggtttcc nntgntaaaa    120
ncanccncnt ttgcttttgt tagctgtaat attttttgtc atttagataa gacctggttt    180
ggctctcaat aaaagatgaa gacagtagct ctgtacaggg atatatctat attagtcttc    240
atctgatgaa tgaagaaatt ttctcatatt atgttcaaga aagtatttac ttcctaaaaa    300
tagaattccc gattctgtct attttggttg aataccagaa caaatctttc cgttgcaatc    360
ccagtaaaac gaaagaaaag gaatatctta cagactgttc atattagatg tatgtagact    420
gttaatttgc antttcccca tatttcctgc ctatcttacc cagataactt tctttgaagg    480
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aatcttgtga gttgtgacct aggtgaaggt ntaatgataa catctggagg aagcatcatt     60
tgttcagcta cctagggttt actttcagac ttttcctaca gtttaaagca cttgcgttca    120
gtgtggtacg atctgtttgt aatgttaatc attgactatt gttctgctac ttggatgttg    180
atagtgaagc agagaacaat ttatcatcgt ttattatgag tcactatgca cgcaactatg    240
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aaagggtggc atttgcgtca cgtggaccag ggacagtgct gaaatcagca gtgctcagaa     60
acaatttaac atgttgaaac gacaatattc taaaatactg atgaatcttg catcaatata    120
attattgggt tttttttctt tttcctgctg tataactcct tgccatgcaa actctcaaga    180
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agagccatgc aaatgccagc agcttaatgg atttcatgga atgaaatacc gtgattaact     60
catagctaca tatcattgca taaatgggat ttatcttttt tctcacttat ttttgcggtg    120
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gacccagagt cacctaagag aactcttcca acttaaatga ctagggtgtg taatcagttg    60
cttcttattc tgtgtctcag atttcctagt ccatgacatt taatagtgag tatagagtag    120
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atgcacgtac aaatttctta acctgttatc aatgtctgag ctacataatt atctttctag     60
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ctttccgcat ctgccttcgt ttcgtgtaga ttgacgcgtt tctttgtaat ttcagtgttt    120
ctgacaagat ttaaaaaaaa aaaaaaggaa aaaaaaagaa aaaatgaatt tactgctgca    180
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aataggtctt gcaggtttcc ttttgaattt taagtatcat aaatattttt taagtaaata     60
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gtttatgtat acatacccag caacttttat aaatgtgtta aacaatttta ctgattttta    420
taataaatat tttggtaaga ttttgaataa tatgaattca ggcagatata ctaaactgct    480
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gaaggatgct gaggacctag atgagaagtt acctgcaaaa ggcaaaaggg ttacttagtg     60
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tactgaagtt gtctgtctac ttgggataat agcaaattaa ttgaagacaa tgggaaagta    300
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ggaaagagaa acgtggctca agtgctggct caccttctag ctgtgtggcc ctgggcaggt     60
tactgaggct cttccaanct cacttttcac atgtaaaatg gcatttctaa aagtacctac    120
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taaatgacag cacctgagaa gaggaaccgt tttacactgg atgtttctca tgtagaacaa    120
gaaatctttc tggaattgat gtttacatgt ctgttgttgg tcatctctcc tgtgtcttaa    180
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aaaagaaaag atgcagccac cagaaaaaga aactccagaa gtcctgcatt tggatgaggc    120
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tactagttgt tttacactct cttttcttat tcttagggct tttgtgtatg tctnactnnt     60
ntttnaanna nntncncnnn nanncagacc ttaantttta tattttttta aagtngctaa    120
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ctttaaatat atatctaagc atatatttta aaaggagcna aaataaaacc aaagtgttag    240
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aggtccagag caccccctgc ggtgctgaca ccctctttcc ctgctctgcc ccgtttaact    480
gcccagtaag tgggagtcac aggtctccag gcaatgccga cagctgcctt gt            532
 
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<213>human
 
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<222>(37)..(37)
<223>n is a，c，g，or t
<400>553
tttgtccata gaggcttcaa gatagatagg taagagncca gtagtgttca taagaagcca     60
atagagagca ggagccactt tatcaggtgg caggtgtcct gggcctccct gctggctagt    120
cccaagcggt ggtgttgcca ggatgtcttg gaggtgataa tgggacacac agaggcactg    180
agtctccata ggttaaaatg ccaccaaaac tggcctttgc ctaatatccc tcattgacta    240
tttagcattt aatttattta ttttcctgac atttctgcaa gctttgtatt tatatttcca    300
ctttatagat gaggaaattt gaggctctta gaggtaaaat gacttgccca ggtcacacag    360
gaagtggcag agacaagctt tttaaataag aaaaaattaa taaaatataa tatgagagta    420
acttaaaata ttaataaacc acaattttaa attaattaac cgtgataacc aacattaata    480
aaagttaaga taccaaaaca ctggtgtcta attctttcaa c                        521
 
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gttctgttgt ttatccatga agcctatata tttctagtgc aaaangccca gtgggtctca     60
aaacattctt ggaggggttt gacacactgc tattagtagt gactcataat tccacgattc    120
cctgggatac agagaaggca ggggggtagt actgtttgaa caaaaatctt cccaagaccc    180
tggcaaagag atcttcctta ggaatcagtg gcatatgcgt ttatgttctt taacagggaa    240
agtaaaagtg agcgcacttt tttgaagctc ataaatactc atgtgactgt aaatttagaa    300
atgttaatta attgggccta atgtttgatc tggaaaagta cttagcagtc accaggaatt    360
tgccttgaac tgactcgaac cacaaatcag aaccgtattt ccacaattta               410
 
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gcactgttaa aatccggcta ggccaagatt tcccaatgtc ttgaagccaa tggctaggaa     60
aacagctgag cctgggactg gactttgtca gtaacctctc ttccctaggg cacgggagga    120
gtngggtgaa taggacctct tggcttgagg accatgattg tgaatacaga catttaattc    180
agaatgacac ctacattgat gaattttcat tgtacaagtg tttttccaga tcaaacacaa    240
aacccatgta attccttgat aaattttcaa tgcagggcag ataaactgtt gctaac        296
 
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<212>DNA
<213>human
 
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gtgatcttgg actgtcaatt cccctncctg tgatccattt tactgcaaac ataagggttg     60
cagtaaaggg ttgtctcacg tcttctgctt taaaagccta taaatatatg acctgaaaac    120
tccagttaca taaaggatct gcagctatct aaggcttggt tttcttactg tcatatgata    180
cctgggtcta atgaactctg ctgagatcac ctcaagtttc tgcggttggt aaagagaaca    240
agggaagaac aaacatccct tttattgctc caaatggtga tttaatccct acatggtgct    300
gggtggacaa tgtgtcactg tcacatgcct tnactgtata aatccaacct tctgccagag    360
agaatctgtg gttctggcca tggagggagg atagtggaaa tgatatagtt ggactggtgc    420
ttgatgtcac ta                                                        432
 
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<213>human
 
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atgtgattat acttctcttt gacttgtcag cttagcttta gnngatacac tctggtgccc     60
aactattatt gtatcagtga acttnccact ttncttttnc cttttnctct caatttttgt    120
tgtatcattc ctaccttgtg aggacatata atatttacat tctgttgtca tcctcacatt    180
tcttagttcc acagtttaaa tgtatttgaa actcaaaaca ttcccattaa tctcttggtc    240
agctgaaatt aatgatttaa tagtttcctt aaaaaagact catggaacaa tttccctaaa    300
tttttgccat gtcaaatatg tttatctgta gcctttacac agtaaaaaca atttggctag    360
ataatacaat tctcagttca tat                                            383
 
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<212>DNA
<213>human
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agggcacttc tcaacattaa ttttggaatt attcaccatt taaaaattgt cactgctctt     60
tttcattact gtagataact gagagttagc tgttctagga aaaggccatg tttcagttag    120
tgctatgact tcttttttcg attaaggttg aagcagtgtt ctcttagtag cctgaacact    180
tctcaaagcg acttatcact agcggcttta atattgagct tctatatcgt tgtgtccacc    240
tcacttttta aggctgttca tacctggcaa tattcactta ctctgctatt tttaaaaact    300
attttaaagt tttaagcaca atgttgactc ttctgtaatt tcctaaaatt atattgtttt    360
cctacagaca gctcaacttt ccttgatatg t                                   391
 
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<212>DNA
<213>human
<400>559
ctcattattc ctttacatgc agaatagagg catttatgca aattgaactg cagtttttca     60
gcatatacac aatgtcttgt gcaacagaaa aacatgttgg ggaaatattc ctcagtggag    120
agtcgttctc atgctgacgg ggagaacgaa agtgacaggg gtttcctcat aagttttgta    180
tgaaatatct ctacaaacct caattagttc tactctacac tttcactatc atcaacactg    240
agactatcct gtctcaccta caaatgtgga aactttacat tgttcgattt ttcagcagac    300
t                                                                    301
 
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<212>DNA
<213>human
 
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<223>n is a，c，g，or t
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ataaatgacc agactttttc taagaaaaat gttgctttaa tgcatttcat gaatttttac     60
tcttatatca ttgcttgcta gtaatagcaa atctgctttt ctgcatctgc tttgcgtagc    120
tattgtaagg ctttgaacta atgtatgtat ttattgcttg aacttctgtg cataccttat    180
aaagcataat gtctgacaat ttaaatggct catgtattct tgcttntatc ataagctgat    240
tatggggact atgatctttt gtatacagca aattttaaac tgtagcacaa acatctgttt    300
atgtattggt ggaatatacc tgttttattt atcttttttg aggtaaacta atttttgata    360
cttttcatta ctgtgtacta tgttcatact ttgaattctc tgacgttaga agtcatggtt    420
gagaattgta acagctgtta ttcgttctgt attcatggct ttc                      463
 
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<212>DNA
<213>human
<400>561
aaaagcgagg tggccatgtt atgctggtgg ttgccagggc ctccaaccac tgtgccactg     60
acttgctgtg tgaccctggg caagtcactt aactataagg tgcctcagtt ttccttctgt    120
taaaatgggg ataataatac tgacctacct caaagggcag ttttgaggca tgactaatgc    180
tttttagaaa gcattttggg atccttcagc acaggaattc tcaagacctg agtatttttt    240
ataataggaa tgtccaccat gaacttgata cgtccgtgtg tcccagatgc tgtcattagt    300
ctatatggtt ctccaagaaa ctgaatgaat ccattggaga agcggtggat aactagccag    360
acaaaatttg agaatacata aacaacgcat tgccacggaa acatacagag gatgcctttt    420
ctgtgattgg gtgggatttt ttcccttttt atgtgggata tagtagttac ttgtgacaag    480
aataattttg gaataatttc tattaatatc aactctgaag ctaattgtac taatctgaga    540
t                                                                    541
 
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<212>DNA
<213>human
<400>562
gagtcggaga tgatgcagca cacacacaat tccccagccc agtgatgctt gtgttgacca     60
gatgttcctg agtctggagc aagcacccag gccagaataa cagagctttc ttagttggtg    120
aagacttaaa catctgcctg aggtcaggag gcaatttgcc tgccttgtac aaaagctcag    180
gtgaaagact gagatgaatg tctttcctct ccctgcctcc caccagactt cctcctggaa    240
aacgctttgg tagatttggc caggagcttt cttttatgta aattggataa atacacacac    300
catacactat ccacagatat agccaagtag atttgggtag aggatactat ttccagaata    360
gtgtttagct cacctagggg gatatgtttg tatacacatt tgcatatacc cacatgggg     419
 
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<212>DNA
<213>human
<400>563
ggaatgtcac tggtgcccag gtgtacttga gctgtgaggt catcggaatc ccgacacctg     60
tcctcatctg gaacaaggta aaaaggggtc actatggagt tcaaaggaca gaactcctgc    120
ctggtgaccg ggacaacctg gccattcaga cccggggtgg cccagaaaag catgaagtaa    180
ctggctgggt gctggtatct cctctaagta aggaagatgc tggagaatat gagtgccatg    240
catccaattc ccaaggacag gcttcagcat cagcaaaaat tacagtggtt gatgccttac    300
atg                                                                  303
 
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<212>DNA
<213>human
<400>564
aggtgaaggt gccgagctat aaacctccag aatattatta gtctgcatgg ttaaaagtag     60
tcatggataa ctacattacc tgttcttgcc taataagttt cttttaatcc aatccactaa    120
cactttagtt atattcactg gttttacaca gagaaataca aaataaagat cacacatcaa    180
gactatctac aa                                                        192
 
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<212>DNA
<213>human
<400>565
ctcaaagact ctcccgtgga tgacggatga ggactctggg ctgctggaat aggacactca     60
agacttttga ctgccatttt gtttgttcag tggagactcc ctggccaaca gaatccttct    120
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tctgtatcct atgtatgcag tgtgcttttt cttgccagct tgggccattc ttgcttagac    240
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ttttctccaa gtcagcaccc aaaggtcaat gcacagagac cccgggtggg tgagcgctgg    420
cttctcaaac ggccgaagtt gcctctttt                                      449
 
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<212>DNA
<213>human
<400>566
tctctctttc tgtgtgtgtg tgtgtgtgtg tgtgtgtgtg tgtgtgtgtc ttgtgcttcc     60
tcagaccttt ctcgcttctg agcttggtgg cctgttccct ccatctctcc gaacctggct    120
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gtctgtccgg cctgcaccca gcccctgccc acaaaacccc agggacagcg gtctccccag    240
cctgccctgc tcaggccttg cccccaaacc tgtactgtcc cggaggaggt tgggaggtgg    300
aggcccagca tcccgcgcag atgacaccat caaccgccag agtcccagac accggttttc    360
ctagaagccc ctcaccccca ctggcccact ggtggctagg tctcccctta tccttctggt    420
ccagcgcaag gaggggctgc ttctgaggtc ggtggctgtc tttccattaa agaaacacc     479
 
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<211>537
<212>DNA
<213>human
<400>567
ccaccgctgg ctgggaggag tcggagactg agacctacac agaggtggtg acagagtttg     60
ggaccgaggt ggagcccgag tttgggacca aggtggagcc cgagtttgag acccagttgg    120
agcctgagtt cgagacccag ctggaacccg agtttgagga agaggaggag gaggagaaag    180
aggaggagat agccactggc caggcattcc ccttcacaac agtagagacc tacacagtga    240
actttgggga cttctgagat cagcgtccta ccaagacccc agcccaactc aagctacagc    300
agcagcactt cccaagcctg ctgaccacag tcacatcacc catcagcaca tggaaggccc    360
ctggtatgga cactgaaagg aagggctggt cctgcccctt tgagggggtg caaacatgac    420
tgggacctaa gagccagagg ctgtgtagag gctcctgctc cacctgccag tctcgtaaga    480
gatggggttg ctgcagtgtt ggagtagggg cagagggagg gagccaaggt cactcca       537
 
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<212>DNA
<213>human
<400>568
ctactacatg attggtgagc agaagttctc cagcctcccc ctgggccggg aggcagtaga     60
ggctgctgtg aaagaggctg gctacacaat cgaatggttt gaggtgatct cgcaaagtta    120
ttcttccacc atggccaaca acgaaggact tttctccctg gtggcgagga agctgagcag    180
 
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<212>DNA
<213>human
<400>569
tcgtcactga ctactcagac cagaacctgc aggagctgga gaagtggctg aagaaagagc     60
cagaggcctt tgactggtcc ccagtggtga cctatgtgtg tgatcttgaa gggaacagag    120
tcaagggtcc agagaaggag gagaagttga gacaggcggt caagcaggtg ctgaagtgtg    180
atgtgactca gagccagcca ctgggggccg tccccttacc cccggctgac tgcgtgctca    240
gcacactgtg tctggatgcc gcctgcccag acctccccac ctactgcagg gcgctcagga    300
acctcggcag cctactgaag ccagggggct tcctggtgat catggatgcg ctcaagagca    360
gctactac                                                             368
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<212>DNA
<213>human
<400>570
tggcctacat ggaccagcag actggcaacc tcaagaaggc cctgctcctc cagggctcca     60
acgagatcga gatccgcgcc gagggcaaca gccgcttcac ctacagcgtc actgtcgatg    120
gctgcacgag tcacaccgga gcctggggca agacagtgat tgaatacaaa accaccaaga    180
cctcccgcct gcccatcatc gatgtggccc ccttggacgt tggtgcccca gaccaggaat    240
tcggcttcga cgttggccct gtctgcttcc tgtaaactcc ctccatccca acctggctcc    300
ctcccaccca accaactttc cccccaaccc ggaaacagac aagcaaccca aactgaaccc    360
cctcaaaagc caaaaaatgg gagacaattt cacatggact ttggaaaata tttttttcct    420
ttgcattcat ctctcaaact tagtttttat ctttgaccaa ccgaacatga cca           473
 
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<212>DNA
<213>human
 
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<220>
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<222>(153)..(153)
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<220>
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<222>(428)..(428)
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<400>571
gctccccatt tttataccaa aggtgctaca tctatgtgat gggtggggtg gggagggaat     60
cactggtgct atagaaattg agatgccccc ccaggccagc aaatgttcct ttttgttcaa    120
agtctatttt tattccttga tattttttnt ttnttttttt ttttttttgt ggatggggac    180
ttgtgaattt ttctaaaggt gctatttaac atgggaggag agcgtgtgcg gctccagccc    240
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<210>572
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<213>human
<400>572
actttcccat gagtgtgatc cacattgtta ggtgctgacc tagacagaga tgaactgagg     60
tccttgtttt gttttgttca taatacaaag gtgctaatta atagtatttc agatacttga    120
agaatgttga tggtgctaga agaatttgag aagaaatact cctgtattga gttgtatcgt    180
gtggtgtatt ttttaaaaaa tttgatttag cattcatatt ttccatctta ttcccaatta    240
aaagtatgca gattatttgc ccaaagttgt cctcttcttc agattcagca tttgttcttt    300
gccagtctca ttttcatctt cttccatggt tccacagaag ctttgtttct tgggca        356
 
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<213>human
<400>573
gaacaacgcc tgtggcattg ccaacctggc cagcttcccc aagatgtgac tccagccagc     60
caaatccatc ctgctcttcc atttcttcca cgatggtgca gtgtaacgat gcactttgga    120
agggagttgg tgtgctattt ttgaagcaga tgtggtgata ctgagattgt ctgttcagtt    180
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ttttcactgt ggccatcagg actttccctg acagctgtgt actcttaggc taagagatgt    300
gactacagcc tgcccctgac tgtgttgtcc cagggctgat gctgtacagg tacaggctgg    360
agattttcac ataggttaga ttctcattca cgggactagt tagctttaag caccctagag    420
gactagggta atctgacttc tcacttccta agttcccttc tatatcctca aggtagaaat    480
gtctatgttt tctactccaa ttc                                            503
 
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gtacccagtt aaattttcat ttcagataaa caacaaataa ttttttagta taagtacatt     60
attgtttatc tgaaagtttt aattgaacta acaatcctag tttgatactc ccagtcttgt    120
cattgccagc tgtgttggta gtgctgtgtt gaattacgga ataatgagtt agaactatta    180
aaacagccaa aactccacag tcaatattag taatttcttg ctggttgaaa cttgtttatt    240
atgtacaaat agattcttat aatattattt aaatgactgc atttttaaat acaaggcttt    300
atatttttaa ctttaagatg tttttatgtg ctctccaaat tttttttact gtttctgatt    360
gtat                                                                 364
 
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atccgaattc tccatatatt cactaatcaa agacactatt ttcatactag attcctgaga     60
caaatactca ctgaagggct tgtttaaaaa taaattgtgt tttggtctgt tcttgtagat    120
aatgcccttc tattttaggt agaagctctg gaatcccttt attgtgctgt tgctcttatc    180
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ggcatcatgt tgaccgagct ggagaaagcc ttgaactcta tcatcgacgt ctaccacaag     60
tactccctga taaaggggaa tttccatgcc gtctacaggg atgacctgaa gaaattgcta    120
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<213>human
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gccagtcttg accgggatga ggcccacaga caggttgtca tcagcttgtc ccattcaagc     60
caccgagctc accacagaca cagtggagcc gcgctcttct ccagtgacac gtggacaaat    120
gcgggctcat cagccccccc agagagggtc aggccgaacc ccatttctcc tcctcttagg    180
tcattttcag caaacttgaa tatctagacc tctcttccaa tgaaaccctc cagtctatta    240
tagtcacata gataatggtg ccacgtgttt tctgatttgg tgagctcaga cttggtgctt    300
ccctctccac aacccccacc ccttgttttt caagatacta ttattatatt ttcacagact    360
tttgaagcac aaatttattg gcatttaata ttggacatct gggcccttgg aagtacaaat    420
ctaaggaaaa accaacccac tgtgtaagtg actcatcttc ctgttgttcc aattctgtgg    480
gtttttgatt caacggtgct ataaccaggg tcctgggtga cagggcgctc actgagcacc    540
atgtgtcatc acagaca                                                   557
 
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<212>DNA
<213>human
<400>578
caggaaatag tcactcatcc cactccacat aaggggttta gtaagagaag tctgtctgtc     60
tgatgatgga tagggggcaa atctttttcc cctttctgtt aatagtcatc acatttctat    120
gccaaacagg aacgatccat aactttagtc ttaatgtaca cattgcattt tgataaaatt    180
aattttgttg tttcctttga ggttgatcgt tgtgttgttt tgctgcactt tttacttttt    240
tgcgtgtgga gctgtattcc cgagacaacg aagcgttggg atacttcatt aaatgtagcg    300
actgtcaaca gcgtgcaggt tttctgtttc tgtgttgtgg ggtcaaccgt acaatggtgt    360
gggaatgacg atgatgtgaa tatttagaat gtaccatatt ttttgtaaat tatttatgtt    420
tttctaaaca aatttatcgt ataggttgat gaaacgtcat gtgttttgcc aaagactgta    480
aatatttatt tatgtgttca catggtcaaa atttcaccac tgaaaccctg cacttagcta    540
gaacct                                                               546
 
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<212>DNA
<213>human
 
<220>
<221>misc_feature
<222>(75)..(75)
<223>n is a，c，g，or t
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cccacctgga gctgaatcac atgacctagc tgcaccccag cgcctgggcc cgccccacgc     60
tctgtccaca cccangcgcc ccgggagcgg ggccatgcct ccagcccccc agctcgcccg    120
acccatcctg ttcgtgaata ggtctcaggg gttgggggag ggactgccag atttggacac    180
tatatttttt tctaaattca acttgaagat gtgtatttcc cctgaccttc aaaaaatgtt    240
ccaaggtaag cctcgtaaag gtcatcccac catcaccaaa gcctccgttt ttaacaacct    300
ccaacacgat ccatttagag gccaaatgtc attctgcagg tgccttcccg atggattaaa    360
g                                                                    361
 
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<213>human
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ctggaggaca gcacctgtga cttcggcaac ctcaagcgct atgcatgcac ctctcatacc     60
cagggcctga gcccaggctg ctatgacacc tacaatgcgg acatcgactg ccagtggatc    120
gacataaccg acgtgcagcc tgggaactac atcctcaagg tgcacgtgaa cccaaagtat    180
attgttttgg agtctgactt caccaacaac gtggtgagat gcaacattca ctacacaggt    240
cgctacgttt ctgcaacaaa ctgcaaaatt gtccaatcct gatctccggg agggacagat    300
ggccaatctc tccccttcca aagcaggccc tgctccccgg gcagcctccc gccgaggggc    360
ccagccccca acccacaggc agggaggggc atccctccct gccggcctca gggagcgaac    420
gtggatgaaa accacaggga ttccggatgc cagaccccat tttatacttc acttttctct    480
acagtgttgt tttgttgttg ttggttttta ttttttatac tttggccata ccacagagct    540
agattgccc                                                            549
 
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tgccagcgac tgtctcagac tgggcaggga ggctttggca tgacttaaga ggaagggcag     60
tcttgggacc cgctatgcag gtcctggcaa acctggctgc cctgtctcat ccctgtccct    120
cagggtagca ccatggcagg actgggggaa ctggagtgtc cttgctgtat ccctgttgtg    180
aggttccttc caggggctgg cactgaagca agggtgctgg ggccccatgg ccttcagccc    240
tggctgagca actgggctgt agggcagggc cacttcctga ggtcaggtct tggtaggtgc    300
ctgcatctgt ctgccttctg gctgacaatc ctggaaatct gttctccaga atccaggcca    360
aaaagttcac agtcaaatgg ggaggggtat tcttcatgca ggagacccca ggccctggag    420
gctgcaacat acctcaatcc tgtcccaggc cggatcctcc tgaagccctt ttcgcagcac    480
tgctatcctc caaagccatt gtaaatgtgt gtacagtgtg tataaacctt cttcttctt    539
 
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<213>human
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gagtacaggt gccagacaaa cctctccacc ctcagtgacc cggtgcagct agaagtccat     60
atcggctggc tgttgctcca ggcccctcgg tgggtgttca aggaggaaga ccctattcac    120
ctgaggtgtc acagctggaa gaacactgct ctgcataagg tcacatattt acagaatggc    180
aaagacagga agtattttca tcataattct gacttccaca ttccaaaagc cacactcaaa    240
gatagcggct cctacttctg cagggggctt gttgggagta aaaatgtgtc ttcagagact    300
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gggtaccaag tctctttctg cttggtgatg gtactccttt ttgcagtgga cacaggacta    420
tatttctctg tgaagacaaa catttgaagc tcaacaagag actggaagga ccataaactt    480
aaatggagaa aggaccctca agacaaatga cc                                  512
 
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<213>human
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aaccagccag tcccaagaag aacattaaaa ctaggagtgc ccagaagaga acaaacccga     60
aaagagtgtg agctaactag tttccaaagc ggagacttcc gacttcctta caggatgagg    120
ctgggcattg cctgggacag cctatgtaag gccatgtgcc ccttgcccta acaactcact    180
gcagtgctct tcatagacac atcttgcagc atttttctta aggctatgct tcagtttttc    240
tttgtaagcc atcacaagcc atagtggtag gtttgccctt tggtacagaa g             291
 
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<213>human
<400>584
gaaaatgtac cttggtgcca ccaacccatt ttgtgccaca tgcaagtttt gaataaggat     60
gtatggaaaa caacgctgca tatacaggta ccatttagga aataccgatg cctttgtggg    120
ggcagaatca cagacaaaag ctttgaaaat cataaagata taagttggtg tggctaagat    180
ggaaacaggg ctgattcttg attcccaatt ctcaactctc cttttcctat ttgaatttct    240
ttggtgctgt agaaaacaaa aaaagaaaaa tatatattca taaaaaatat ggtgctcatt    300
ctcatccatc caggatgtac taaaacagtg tgtttaataa attgtaatta ttttgtgtac    360
agttctatac tgttatctgt gtccatttcc aaaacttgca cgtgtccctg aattccgctg    420
actctaattt atgaggatgc cgaactctga tggcaataat atatgtatta tgaaaatgaa    480
gttatgattt ccgatgaccc taagtcc                                        507
 
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<213>human
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gaagaactgt ctattttctc agtcattttt aacctctaga gtcactgata cacagaatat     60
aatcttattt atacctcagt ttgcatattt ttttactatt tagaatgtag ccctttttgt    120
actgatataa tttagttcca caaatggtgg gtacaaaaag tcaagtttgt ggcttatgga    180
ttcatatagg ccagagttgc aaagatcttt tccagagtat gcaactctga cgttgatccc    240
agagagcagc ttcagtgaca aacatatcct ttcaagacag aaagagacag gagacatgag    300
tctttgccgg aggaaaagca gctcaagaac acatgtgcag tcactggtgt caccctggat    360
aggcaaggga taactcttct aacaca                                         386
 
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<212>DNA
<213>human
<400>586
tgccgtgctc ccaaaacatt ttaaatgaaa gtattggcat tcaaaaagac agcagacaaa    60
atgaaagaaa atgagagcag aaagtaagca tttccagcct atctaatttc tttagttttc    120
tatttgcctc cagtgcagtc catttcctaa tgtataccag cctactgtac tatttaaaat    180
gctcaatttc agcaccgatg gccatgtaaa taagatgatt taatgttgat tttaatcctg    240
tatataaaat aaaaagtcac aatgagtttg ggcatattta atgatgatta tggagcctta    300
gaggtcttta atcattggtt cggctgcttt tatgtagttt aggctggaaa tggtttcact    360
tgctctttga ctgtcagcaa gactgaagat ggcttttcct ggacagctag aaaacacaaa    420
atcttgtagg tcattgcacc tatctcagcc ataggtgcag tttgcttcta catgatgcta    480
aaggctgcga atgggatcct gatggaacta aggactccaa tgtcgaactc ttctttgctg    540
c                                                                    541
 
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<212>DNA
<213>human
<400>587
ggggaactga gggcaagggg atatagtgat ggggctcaga tggactggga ggagggggag     60
ggtgatgcat taattaatgg cttcgttaat taatgtcatg ttgcttgtcg ctttctcagt    120
gtgtgtgtgt ggtccatgcc cactgctggt gccagggtgg gtgtccatgt gcacccggcc    180
tggatgccag ctgtgtcctt cgggggcgtg cgtgtaactg tagtgtagtc aggtgctcaa    240
tggagaatat aaacatatac agaaaaatat atattttaag tttaaaaaac agaaaaacag    300
acaaaacaat ccccatcagg tagctgtcta acccccagct gggtctaatc cttctcatta    360
cccacccgac ctggctgccc ctcaccttgg gctgggggac tggggggcca tttccttttc    420
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<212>DNA
<213>human
<400>588
cccgaccggt gggcatttgt gaggcccatg gttgagaaat gaataatttc ccaattagga     60
agtgtaagca gctgaggtct cttgagggag cttagccaat gtgggagcag cggtttgggg    120
agcagagaca ctaacgactt cagggcaggg ctctgatatt ccatgaatgt atcaggaaat    180
atatatgtgt gtgtatgttt gcacacttgt tgtgtgggct gtgagtgtaa gtgtgagtaa    240
gagctggtgt ctgattgtta agtctaaata tttccttaaa ctgtgtggac tgtgatgcca    300
cacagagtgg tctttctgga gaggttatag gtcactcctg gggcctcttg ggtcccccac    360
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atccaatcct cactgggtgg gg                                             502
 
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caccacctac ctatgatgcc gtggtacaga tggagtacct tgacatggtg gtgaatgaaa     60
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gcatgaggtt tgctctcatg aacatgaaac ttgctctaat cagagtcctt cagaacttct    360
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gaaaatcgat gcagccattt ctgataagga aaagaacaaa acatatttct ttgtagagga      60
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tccacacacg gccaggcctg tttatctaca ctgctgccca ctcctctctc cagctccaca     60
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tttctaacat ccttaaatat acaatcggaa ttcaagcatc tcccattgtc ccacaaatgt    180
ttggctgttt ttgtagttgg attgtttgta ttaggattca agcaaggccc atatattgca    240
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<212>DNA
<213>human
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gaacatccaa gtctttcttc ttttttaagt tgtcaaagaa gcttccacaa aattagaaag     60
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tgcttctact ttcatcttaa actaatacgt gccagatata actgtcttgt ttcagtgaga    300
gacgccctat ttctatgtca tttttaatgt atctatttgt acaattttaa agttcttatt    360
ttagtataca tataaatatc agtattctga catgtaagaa aatgttacgg catcacactt    420
atatttta                                                             428
 
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<213>human
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aatctcttct agagcacctg ctatccccaa cttctagacc tgctccaaac tagtgactag     60
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t                                                                    541
 
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<213>human
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ct                                                                   542
 
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cgggaccaga aacctgggag agacttggat gaggagtggt tgggctgtgc ctgggcctag    420
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aaagcagcgc tagtggaggg ttggagaagg aggtaaggat gagggttcat catccctccc     60
tgcctaagga agctaaaagc atggccctgc tgcccctccc tgcctccacc cacagtggag    120
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cccaagtttc taagggaggc acttcctccc ctcgcccatc agtgccagcc cctgctggct    300
ggtgcctgag cccctcagac agccccctgc cccgcaggcc tgccttctca gggacttctg    360
cggggcctga ggcaagccat ggagtgagac ccaggagccg gacacttctc aggaaatggc    420
ttttcccaac ccccagcccc cacccggtgg ttcttcctgt tctgtgactg tgtatag       477
 
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ttcagccagt cgccaagaat catgaaagtc gccagtggca gcaccgccac cgccgccgcg     60
ggccccacgt gcgcgctgaa ggccggcaag acagcgagcg gtgcgggcga ggtggtgcgc    120
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cgcctcaagg agctggtgcc caccctgccc cagaaccgca aggtgagcaa ggtggagatt    300
ctccagcacg tcatcgacta catcagggac cttcagttgg agctgaactc ggaatccgaa    360
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gagatcagcg cc                                                        432
 
<210>599
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gattccctgc atcaactaag aaaagcctgt tttctttatt tcaaacttgg tggcgaatgt     60
gttgcgggtc ctgttgggct gctttctgta ttgtctccta accctctagt tttaattgga    120
cacttctttg ctgttgcaat ctatgccgtg tatttttgct ttaagtcaga accttggatt    180
acaaaacctc gagcccttct cagtagtggt gctgtattgt acaaagcgtg ttctgtaata    240
tttcctctaa tttactcaga aatgaagtat atggttcatt aagcttaaag gggaaccatt    300
tgtgaatgaa tatttggaac ttaccaagtc ctaagagact tttggaagag gatatatata    360
gcatagtacc ataccactta ta                                             382
 
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<213>human
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gctgtgggga tagtgaggca tcgcaatgta agactcggga ttagtacaca cttgttgatg     60
attaatggaa atgtttacag atccccaagc ctggcaaggg aatttcttca actccctgcc    120
ccctagccct ccttatcaaa ggacaccatt ttggcaagct ctatcaccaa ggagccaaac    180
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tcaccaatgc catcaaggat gcactcgctg caacgtagcc ctctgttctg cacacagcac     60
gggggccaag gatgccccgt ccccctctgg ctccagctgg ccgggagcct gatcacctgc    120
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agtgaggcat cgcaatgtaa gactcgggat tagtacacac ttgttgatga ttaatggaaa    300
tgtttacaga tccccaagcc tggcaaggga atttcttcaa ctccctgccc cctagccctc    360
cttatcaaag gacaccattt tggcaagctc tatcaccaag gagccaaaca tcctacaaga    420
cacagtgacc atactaatta taccccctgc aaagccagct tgaaaccttc act           473
 
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tccaacctcc ttcaaattca gtcaccactg ttatattacc ttctccagga accctccagt     60
ggggaaggct gcgatattag atttccttgt atgcaaagtt tttgttgaaa gctgtgctca    120
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gaatggtgca tacaaggcca tccccgttgc ccaggacctg aacgcgcctt ctgattggga     60
cagccgtggg aaggacagtt atgaaacgag tcagctggat gaccagagtg ctgaaaccca    120
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tcacagccat gaagatatgc tggttgtaga ccccaaaagt aaggaagaag ataaacacct    300
gaaatttcgt atttctcatg aattagatag tgcatcttct gaggtcaatt aaaaggagaa    360
aaaatacaat ttctcacttt gcatttagtc aaaagaaaaa atgctttata gcaaaatgaa    420
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acagctttcc aaggtgacaa actcctctat gcagtgtatc gaaagctggg tgtttatgaa     60
gttgaagacc agattacagc tgtcagaaaa ttcatagaaa tgggtttcat tgatgaaaaa    120
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tataagaatt caactgtgat ggcaagagca gaatatttca gaaatgtaga ctatcttctc    360
atccacggaa cagcagatga taatgtgcac tttcagaact cagcacagat tgctaaagct    420
ctggttaatg cacaagtgga tttccaggca atgtggtact ctgaccagaa ccacggctta    480
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<213>human
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tcttttgtcc tccttagcac aatgtaaaaa agaatagtaa tatcagaaca ggaaggagga     60
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<223>n is a，c，g，or t
<400>620
cacaaaaccc cagggacagc ggtctcccca gcctgccctg ctcangcctt gcccccaaac     60
ctgtactgtc ccggaggagg ttgggaggtg gaggcccagc atcccgcgca gatgacaccg    120
gttttcctag aagcccctca cccccactgg cccactggtg gctaggtctc cccttatcct    180
tctggtccag cgcaaggagg ggctgcttct gaggtcggtg gctgtctttc cattaaagaa    240
acaccgtg                                                             248
 
<210>621
<211>261
<212>DNA
<213>human
<400>621
gaatgaagaa aagtcgcctc aacgacaaac aaaagcaccg actagatttc cttcagctga     60
tgattgactc ccagaattcg aaagaaactg agtcccacaa agctctgtct gatctggagc    120
tcgcagccca gtcaataatc ttcatttttg ctggctatga aaccaccagc agtgttcttt    180
ccttcacttt atatgaactg gccactcacc ctgatgtcca gcagaaactg caaaaggaga    240
ttgatgcagt tttgcccaat a                                              261
 
<210>622
<211>245
<212>DNA
<213>human
<400>622
ggtgagggga tgacccctgg agatgaaggg aagaggtgaa gccttagcaa aaatgcctcc     60
tcaccactcc ccaggagaat ttttataaaa agcataatca ctgattcctt cactgacata    120
atgtaggaag cctctgagga gaaaaacaaa gggagaaaca tagagaacgg ttgctactgg    180
cagaagcata agatctttgt acaatattgc tggccctggt tcacctgttt actgttatca    240
caata                                                                245
 
<210>623
<211>273
<212>DNA
<213>human
<400>623
acttaggtaa ttgtagggcg aggattataa atgaaatttg caaaatcact tagcagcaac     60
tgaagacaat tatcaaccac gtggagaaaa tcaaaccgag cagggctgtg tgaaacatgg    120
ttgtaatatg cgactgcgaa cactgaactc tacgccactc cacaaatgat gttttcaggt    180
gtcatggact gttgccacca tgtattcatc cagagttctt aaagtttaaa gttgcacatg    240
attgtataag catgctttct ttgagtttta aat                                 273
 
<210>624
<211>212
<212>DNA
<213>human
 
<220>
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<220>
<221>misc_feature
<222>(121)..(121)
<223>n is a，c，g，or t
<400>624
tctcacctat acgtgcaaga aaggaacagt tgcttgcggc cancccctgt tgtagaaaat     60
gccaagacct ttggaaagat gaaacctcgt tatgaaatca actccctgat tagataccac    120
ntgcaaagat ggtttcattc aacgtcacct tccaactatc cggtgcttag gaaatggaag    180
atgggctata cctaaaatta cctgcatgaa cc                                  212
 
<210>625
<211>157
<212>DNA
<213>human
<400>625
agggcctaag ggtgacagag gtgatgctgg tcccaaaggt gctgatggct ctcctggcaa     60
agatggcgtc cgtggtctga ccggccccat tggtcctcct ggccctgctg gtgcccctgg    120
tgacaagggg gaccccattc ccgaggagct ttatgag                             157
 
<210>626
<211>481
<212>DNA
<213>human
<400>626
aacattgtaa tggccatcgc tggaaacaag tgcgacctct cagatattag ggaggttccc     60
ctgaaggatg ctaaggaata cgctgaatcc ataggtgcca tcgtggttga gacaagtgca    120
aaaaatgcta ttaatatcga agagctcttt caaggaatca gccgccagat cccacccttg    180
gacccccatg aaaatggaaa caatggaaca atcaaagttg agaagccaac catgcaagcc    240
agccgccggt gctgttgacc caagggcgtg gtccacggta cttgaagaag ccagagccca    300
catcctgtgc actgctgaag gaccctacgc tcggtggcct ggcacctcac tttgagaaga    360
gtgagcacac tggctttgca tcctggaagg cctgcagggg gcggggcagg aaatgtacct    420
gaaaaggatt ttagaaaacc ctgggaaacc caccacacca ccacaaaatg gcctttagtg    480
t                                                                    481
 
<210>627
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<212>DNA
<213>human
<400>627
gccacacctt cgcgaaacct gtggtggccc accagtccta acgggacagg acagagagac     60
agagcagccc tgcactgttt tccctccacc acagccatcc tgtccctcat tggctctgtg    120
ctttccacta tacacagtca ccgtcccaat gagaaacaag aaggagcacc ctccacatgg    180
actcccacct gcaagtggac agcgacattc agtcctgcac tgctcacctg ggtttactga    240
tgactcctgg ctgccccacc atcctctctg atctgtgaga aacagctaag ctgctgtgac    300
ttccctttag gacaatgttg tgtaaatctt tgaaggacac accgaagacc tttatactgt    360
gatcttttac ccctttcact cttggctttc ttatgttgc                           399
 
<210>628
<211>548
<212>DNA
<213>human
<400>628
ctgccccgag ctcgaagaag aggctgagtg cgtccctgat aactgcgtct aagaccagag     60
ccccgcagcc cctggggccc ccggagccat ggggtgtcgg gggctcctgt gcaggctcat    120
gctgcaggcg gccgaggcac agggggtttc gcgctgctcc tgaccgcggt gaggccgcgc    180
cgaccatctc tgcactgaag ggccctctgg tggccggcac gggcattggg aaacagcctc    240
ctcctttccc aaccttgctt cttaggggcc cccgtgtccc gtctgctctc agcctcctcc    300
tcctgcagga taaagtcatc cccaaggctc cagctactct aaattatggt ctccttataa    360
gttattgctg ctccaggaga ttgtccttca tcgtccaggg gcctggctcc cacgtggttg    420
cagatacctc agacctggtg ctctaggctg tgctgagccc actctcccga gggcgcatcc    480
aagcgggggc cacttgagaa gtgaataaat ggggcggttt cggaagcgtc agtgtttcca    540
tgttatgg                                                             548
 
<210>629
<211>524
<212>DNA
<213>human
<400>629
gaagttgcaa cattcgtttg ataggaattc cagaaaagga gagttatgag aatagggcag     60
aggacataat taaagaaata attgatgaaa actttgcaga actaaagaaa ggttcaagtc    120
ttgagattgt cagtgcttgt cgagtaccta gtaaaattga tgaaaagaga ctgactccta    180
gacacatctt ggtgaaattt tggaattcta gtgataaaga gaaaataata agggcttcta    240
gagagagaag agaaattacc taccaaggaa caagaatcag gttgacagca gacttatcac    300
tggacacact ggatgctaga agtaaatgga gcaatgtctt caaagttctg ctggaaaaag    360
gctttaatcc tagaatccta tatccagcca aaatggcatt tgattttagg ggcaaaacaa    420
aggtatttct tagtattgaa gaatttagag attatgtttt gcatatgccc accttgagag    480
aattactggg gaataatata ccttagcacg ccagggtgac taca                     524
 
<210>630
<211>488
<212>DNA
<213>human
<400>630
gagtggttca tccatactct cattccctcg cctccccttg tggacggggg tcttgccttt     60
tcaattcctg tgttttggtg tcttccctta tctgctaccc tgaatcacct gtcctggtct    120
tgctgtgtga tgggaacatg cttgtaaact gcgtaacaaa tctactttgt gtatgtgtct    180
gtttatgggg gtggtttatt atttttgctg gtccctagac cactttgtat gaccgtttgc    240
agtctgagca ggccaggggc tgacagctaa tgtcaggacc ctcagcggtg gagcctgctg    300
gggggaccca gctgctcttg gacaagtggc tgagctccta tctggcctcc tctttttttt    360
ttttttcaag taatttgtgt gtatttctaa ctgattgtat tgaaaaaatt cctagtattt    420
cagtaaaaat gcctgttgtg agatgaacct cctgtaactt ctatctgttc ttttttgagg    480
ctcaggga                                                             488
 
<210>631
<211>460
<212>DNA
<213>human
<400>631
tggaattaga ccatttggcc tttgaacttt cataggaaaa atgacccaac atttcttagc     60
atgagctacc tcatctctag aagctgggat ggacttacta ttcttgttta tattttagat    120
actgaaaggt gctatgcttc tgttattatt ccaagactgg agataggcag ggctaaaaag    180
gtattattat ttttccttta atgatggtgc taaaattctt cctataaaat tccttaaaaa    240
taaagatggt ttaatcacta ccattgtgaa aacataactg ttagacttcc cgtttctgaa    300
agaaagagca tcgttccaat gcttgttcac tgttcctctg tcatactgta tctggaatgc    360
tttgtaatac ttgcatgctt cttagaccag aacatgtagg tccccttgtg tctcaatact    420
ttttttttct taattgcatt tgttggctct attttaattt                          460
 
<210>632
<211>446
<212>DNA
<213>human
<400>632
tagattccgg tatatcgttc ttcaagacac ttgctctaag cggaatggaa atgtgggcaa     60
gactgtcttt gaatatagaa cacagaatgt ggcacgcttg cccatcatag atcttgctcc    120
tgtggatgtt ggcggcacag accaggaatt cggcgttgaa attgggccag tttgttttgt    180
gtaaagtaag ccaagacaca tcgacaatga gcaccaccat caatgaccac cgccattcac    240
aagaactttg actgtttgaa gttgatcctg agactcttga agtaatggct gatcctgcat    300
cagcattgta tatatggtct taagtgcctg gcctccttat ccttcagaat atttatttta    360
cttacaatcc tcaagtttta attgatttta aatatttttc aatacaacag tttaggttta    420
agatgaccaa tgacaatgac cacctt                                         446
 
<210>633
<211>552
<212>DNA
<213>human
 
<220>
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<400>633
tttcagcacc gatggccatg taaataagat gatttaatgt tgattttaat cctgtatata     60
aantaaaaag tncncaatga gtttngggca tatttaatga tgattatgga gccttagagg    120
tctttaatca ttggttcngg ctgcttttat gtagtttagg ctggaaatgg tttcacttgc    180
tctttgactg tcagcaagac tgaagatggc ttttcctgga cagctagaaa acacaaaatc    240
ttgtaggtca ttgcacctat ctcagccata ggtgcagttt gcttctacat gatgctaaag    300
gctgcgaatg ggatcctgat ggaactaagg actccaatgt cgaactcttc tttgctgcat    360
tcctttttct tcacttacaa gaaaggcctg aatggaggac ttttctgtaa ccaggaacat    420
tttttagggg tcaaagtgct aataattaac tcaaccaggt ctacttttta atggctttca    480
taacactaac tcataaggtt accgatcaat gcatttcata cggatataga cctagggctc    540
tggagggtgg gg                                                        552
 
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<212>DNA
<213>human
 
<220>
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<400>634
ctggcctacg tgttcaattt tctatgaaca aaggctttag tccttgaccc agggctaaag     60
tggtctgtcc aagctgttgt tggtagaggg agtatgataa aatgtttaaa tctcatttgg    120
ttaccttgag tcctggaaca cgcagtaact gtcatgctat agtcntcatc tgtatttggc    180
tgggaataca aatgaagatt gtggtgtatt caagcagtag ggtttttgct tttgtttttg    240
ttttagtgcc aacaaaactt ttttttgtct gactacatta aagataagac tgactatatt    300
tatacaacag aaactttgta atagattttt tcagctttgt gaaatcgaat tttttttcat    360
cagggctggt tggatttcct ttttaccctg taatccaagc gttaatagtt tgttagaaga    420
tgggttattg catgtcactt                                                440
 
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<212>DNA
<213>human
<400>635
gaagatcaag gatgttctca acagtctaga gtacagtccc tctcctataa gcaagaagct     60
ctcgtgtgct agtgtcaaaa gccaaggcag accgtcctcc tgccctgctg ggatggctgt    120
cactggctgt gcttgtggct atggctgtgg ttcgtgggat gttcagctgg aaaccacctg    180
ccactgccag tgcagtgtgg tggactggac cactgcccgc tgctgccacc tgacctgaca    240
gggaggaggc tgagaactca gttttgtgac catgacagta atgaaaccag ggtcccaacc    300
aagaaatcta actcaaacgt cccacttcat ttgttccatt cctgattctt gggtaataaa    360
 
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<212>DNA
<213>human
<400>636
ggagctcaga gatctaagct gctttccatc ttttctccca gccccaggac actgactctg     60
tacaggatgg ggccgtcctc ttgcctcctt ctcatcctaa tcccccttct ccagctgatc    120
aacccgggga gtactcagtg ttccttagac tccgttatgg ataagaagat caaggatgtt    180
ctcaacagtc tagagtacag tccctctcct ataagcaaga agctctcgtg tgctagtgtc    240
aaaagccaag gcagaccgtc ctcctgccct gctgggatgg ctgtcactgg ctgtgcttgt    300
ggctatggct gtggttcgtg ggatgttcag ctggaaacca cctgccactg ccagtgcagt    360
gtggtggact ggaccactgc ccgctgctgc cacctgacct gacagggagg aggctgagaa    420
ctcagttttg tgaccatgac agtaatgaaa ccagggtccc aaccaagaaa tctaactcaa    480
acgtcccact                                                           490
 
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<212>DNA
<213>human
<400>637
gcctgagaaa gcaagcacgc actctcagtc aacatgacag attctggagg ataaccagca     60
ggagcagaga taacttcagg aagtccattt ttgcccctgc ttttgctttg gattatacct    120
caccagctgc acaaaatgca ttttttcgta tcaaaaagtc accactaacc ctcccccaga    180
agctcacaaa ggaaaacgga gagagcgagc gagagagatt tccttggaaa tttctcccaa    240
gggcgaaagt cattggaatt tttaaatcat aggggaaaag cagtcctgtt ctaaatcctc    300
ttattctttt ggtttgtcac aaagaaggaa ctaagaagca ggacagaggc aacgtggaga    360
ggctgaaaac agtgcagaga cgtttgacaa tgagtcagta gcacaaaaga gatgacattt    420
acctagcact ataaaccctg gttgcctctg aagaaactgc cttcattgta tatatgtgac    480
tatttacatg taatcaacat gggaactttt aggggaacct aataagaaat cccaattttc    540
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<212>DNA
<213>human
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ggaacccaga gctgctgtgt atttcgagcg ggcagtttat cttttgctat acttattttc     60
aattcaatta caccacgatt caaataattc ccctcctaaa accaaaaagg agggaaacgt    120
caactccatt gcaattactt atcttcctct tctatctctg ttatacgccg gggcatagaa    180
tgctcgtata catctcttta acaaccacaa accttaagcc atgtagatga agttagtgca    240
tcaacgggat acagttccat attgccttaa acctccttgt tttagacaca ctaacattta    300
taccaaattg cagattattc tgcagagagg gaattgcatg tttgtgttgt a             351
 
<210>639
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<212>DNA
<213>human
<400>639
aattaatatt catcgcactt cttctgtgga aggactttgt gaaggaattg gtgctggatt     60
agtggatgtt gctatctggg ttggcacttg ttcagattac ccaaaaggag atgcttctac    120
tggatggaat tcagtttctc gcatcattat tgaagaacta ccaaaataaa tgctttaatt    180
ttcatttgct acctcttttt ttattatgcc ttggaatggt tcacttaaat gacattttaa    240
ataagtttat gtatacatct gaatgaaaag caaagctaaa tatgtttaca gaccaaagtg    300
tgatttcaca ctgtttttaa atctagcatt attcattttg cttcaatcaa aagtggtttc    360
aatatttttt ttagttggtt agaatacttt cttcatagtc acattctctc aacctataat    420
ttggaatatt gttgtggtct tttgtttttt ctcttagtat agcattttta aaaaaatata    480
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<212>DNA
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tgagcccgtg cctgtcttca gatcttcaca gcacagttcc tgggaaggtg gagccaccag    120
cctctccntg aataactggg agatgaaaca ggaagctcta tgacacactt gatcgaatat    180
gacagacacn gaaaatcacg actcancccc ctccagcacc tctacctgtt gcccgccgat    240
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taaatgatac tccatttaat ttaaaaaaga gttttaaata attatctatg tgcctgtatt    120
tcccttttga gtgctgcaca acatgttaac atattagtgt aaaagcagat gaaacaacca    180
cgtgttctaa agtctaggga ttgtgctata atccctattt agttcaaaat taaccagaat    240
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agtatgacat cccacagggg aaaagaatgt ctgtagtggg tgactgttat caaatatttt    360
atagaataca atgaacggtg aacagactgg taacttgttt gagttcccat gacagatttg    420
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<220>
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<222>(206)..(207)
<223>n is a，c，g，or t
<400>642
tgaaagtggg catctctgca ggcacctgta ctgccatcct gctcaccgtc ttgacctgct     60
acttttggaa aaagaatcaa aanctagagt acangtactc cangctggtg atgaatgcta    120
ctctcaagga ctgnnnnntn ncngnngctg acagctgcgc catcatggna nncnnnnang    180
nanngnnnnn nnncancnnn nnncanntgc gccatcatgg aaggcgagga tgtagaggac    240
gacctcatct ttaccagcaa gaagtcactc tttgggaaga tcaaatcatt tacctccaag    300
aggactcctg atggatttga ctcagtgccg ctgaagacat cctcaggagg cccagacatg    360
gacctgtgag aggcactgcc tgcctcacct gcctcctcac cttgcatagc acctttgcaa    420
gcctgcggcg atttgggtgc cagcatcctg caacacccac tgctggaaat ctcttcattg    480
tggccttatc agatgtttga atttcagatc tttttttata gagtacccaa accctccttt    540
ctgcttgcct caaacctgcc aaatataccc acac                                574
 
<210>643
<211>485
<212>DNA
<213>human
<400>643
aaacgacgca aatctctgag ctggggacca cttggagaac cggcttagta acagtcctga     60
tcttcgcaag ccagcttctt ctgcatctga ggggctcctg gcgcccagag gaggcagaca    120
gatgtcttct agctgagttt ctaaccgcat gatgagactc agaccttccg ctgcactaga    180
aaatctgcaa cagtgtccct gagtcacttc tccttagtgg gcagactcgt gttagatttg    240
tggaacccag ctctctgatt tactcctttt ggaaaaccca tggaatttca tgtataaggc    300
tttcatttgt attttaaggt ttttctgttt gttttgagta tatacatggt gctcaatagc    360
aacatcttag cagatgaagc agtttatgat tccactccct cctgtatgac aggtagccac    420
tatactgaat caaggtgctg aactcaaatc acaaaattct ggcttaccga tacaacaacc    480
aatac                                                                485
<210>644
<211>487
<212>DNA
<213>human
 
<220>
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<222>(296)..(296)
<223>n is a，c，g，or t
<400>644
tataaggtaa ctctttagtc ctccatttag cacattttaa atcctccaaa gaataagtat     60
catgtgatta ttttagcttt acaaaaaaaa agttgaatgg cgttttattt tcatggccta    120
taagcaggta ccttagtagg gcagatatag gaaaaacaaa ttagagcaaa acaaatcctc    180
tacaaatcca aggcaggaaa agtggtggca gagtgactca ttctcctgtc cctcccatca    240
ggtcaaatca ggaggctgca gtgaatgcct gttctttgaa tgtgtagcag ttgttncctg    300
taactcttta aaacttggct ataggctgtt tagcacagta cagattaaag atacagttac    360
gtaaacagca aagtaatttt atagtgcttc atccatttat catgctttgg tttgctaatt    420
ttttcacata cctttttcta tcacagtctg ttgcttttgt acacatttct catattgggg    480
ttcgaca                                                              487
 
<210>645
<211>520
<212>DNA
<213>human
<400>645
ggtgccagga aggtcacaga tggacactgg ccattctggt catctcagtc tggaactcag     60
tcccacttct tggcctggac aatgaacagg attcagtttt gctgttaact ttgcttctct    120
actttttttt gtttgtttgt aatagcacat cccagagaca tcagaaacca gcaactgatt    180
cagtgtgatt tccagacttt ttaggcatga aattcggaca cttcagtatt tccaggaata    240
gcatatgcac gctgttcttg cttcatggaa tgctacatgc tttctgtttt tctcattttg    300
gatttctcca aaactaactg aatttaagct tcaggtccct ttgtatgcag tagaaaggaa    360
ttattaaaaa caccaccaaa gaaaataaat atatcctact tgaaatttac tctatggact    420
tacccactgc tagaataaat gtatcaaatc ttatttgtaa attctcaatt ttgatatata    480
tatgtatata tgcatataca tatccacact tgtctgcaag                          520
 
<210>646
<211>516
<212>DNA
<213>human
<400>646
ttaccctcta tttaaatgct ttgaaaaaca gtgcattgac aatgggttga tatttttctt     60
taaaagaaaa atataattat gaaagccaag ataatctgaa gcctgtttta ttttaaaact    120
ttttatgttc tgtggttgat gttgtttgtt tgtttgtttc tattttgttg gttttttact    180
ttgttttttg ttttgttttg ttttgttttg catactacat gcagttcttt aaccaatgtc    240
tgtttggcta atgtaattaa agttgttaat ttatatgagt gcatttcaac tatgtcaatg    300
gtttcttaat atttattgtg tagaagtact ggtaattttt ttatttacaa tatgtttaaa    360
gagataacag tttgatatgt tttcatgtgt ttatagcaga agttatttat ttctatggca    420
ttccagcgga tattttggtg tttgcgaggc atgcagtcaa tattttgtac agttagtgga    480
cagtattcag caacgcctga tagcttcttt ggcctt                              516
 
<210>647
<211>390
<212>DNA
<213>human
<400>647
ccacacacca ggcactaatc acctggtgag gatttggcat atccaccaaa aaatgcatcc     60
gatttaacca acatctccac cagcgctacg gactcctccc aattctgaca tctcttgcag    120
acaatactat gctctctaca cactgtttag aaatggaaag gtgatctgca ctgtatcttg    180
ggtttgttgg ctatgcttcc tttgatgaca tatattatac agtatatata tacatatatt    240
ttttttgtta gagttctagc cattttattt ctccgcaggg tcctttctca gacattactg    300
catgctgtat atggcgttag ctgtgtgttg atcttctaaa agatgataga gtttactggt    360
aattgtgtaa tcagctcctg cctttttatt                                    390
 
<210>648
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<212>DNA
<213>human
 
<220>
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<400>648
caggaaactc ttctctgact tggggagttc ctacgcgana caactgggct tccgggacag     60
ctgggtcttc ataggagcca aagacctcag gggtaaaagc ccctttgagc agttcttaaa    120
gaacagccca gacacaaaca aatacgaggg atggccagag ctgctggaga tggagggctg    180
catgcccccg aagccatttt agggtggctg tggctcttcc tcagccaggg gcctgaagaa    240
gctcctgcct gacttaggag tcagagcccg gcaggggctg aggaggagga gcagggggtg    300
ctgcgtggaa ggtgctgcag gtccttgcac gctgtgtcgc gcctctcctc ctcggaaaca    360
gaaccctccc acagcacatc ctacccggaa gaccagcctc agagggtcct tctggaacca    420
gctgtctgtg gagagaatgg ggtgctttcg tcagggactg ctgacggctg gtcctgagga    480
aggacaaact gcccagactt gagcc                                          505
 
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<212>DNA
<213>human
 
<220>
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<220>
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<400>649
cacttgatag actgtaagca cctgcttaac tttgtgtccc aaatatttag tgtgtatata     60
tatatatata tanncncaca cacacacata tatattcaac aaataaagca aaatataaca    120
tgcatttcac attttgtctt tccctgttac gattttaata gcagaactgt atgacaagtt    180
taggtgatcc tagcatatgt taaattcaaa ttaatgtaaa acagattaac aacaacaaag    240
aaactgtcta tttgagtgaa gtcatgcttt ctattataat aacttggctt cggttatcca    300
tcaaatgcac acttatactg ttatctgatt g                                   331
 
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<212>DNA
<213>human
 
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<400>650
gccaaaaggc ctggcttctg ataggaaact ggtaagaaac tcttcatgaa aacacatcac    60
taatattcgc tattactctc ctggtctgaa gtcagctttt ctgaaccatt aaggtatttc    120
atcacaagtt atattttata atatcagttt aagaggcttt tattcatgtg aacaccagnn    180
ccctttcagg ggcatggtct ttttgaaaaa aaaaaaanaa aaaaannaac agttttagcc    240
acatatcaga tatttctata tctaattatc ctttatggct aacattctgc ctccattgtt    300
aaggtataat tgttcctgaa tttaaaggtg gtttggcctc taatttaatt ctgattcaga    360
ctctcctgtc aggactcaag aaaatttaat taattaccaa ggattaagtc ttctggttaa    420
ggtttctggg aaaaaaaaat agcaaagatg ttgatttctt ggaatccttt tacaggttca    480
taacagaaaa atcttcattc cctgtaggca tttaattaaa cctagttgag aagtgtgtgg    540
gattcctcaa ttatgaacaa aacacgtata ttggctttct tt                       582
 
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<212>DNA
<213>human
<400>651
gacatgattg tctataatct cgctagcctt gtactgtgtg tgcatagcaa ttacagggaa     60
gtaatctagc tcctgactat tatgttgaac tatgtcgctg ctttttacaa acttgtcttg    120
atccaaagca gtcacaatga taaccctgca tatctgggaa tcataagtca actatgtatc    180
tctgtgtgtg tatatatatg tatgtatgta tctattttca aactgtgatt taatatttaa    240
atattcctac tgccattttt gtgactgaaa aactacacat gaggaaacgt cttagaattt    300
tccaatagag gaaaaataac acttgggcaa tctgtcatgt ttcacaacag ttctcatttt    360
tctcatgatt tgtgtagcgt ggaatgtgtt tgctcaatgt gaagggtttt cattgctcaa    420
tttctctgtg taa                                                       433
 
<210>652
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<212>DNA
<213>human
 
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<400>652
ggttccggct aacacatttt ctaagtcgcc agtgctgctt acagtttgaa tacatgaaaa     60
tcctgtttct nagatgtttg cgcacgtgct tattaggaaa tgagtctgta tggaaatctc    120
accacagata atggttaacg aaccgggtcg acatcacaaa ggagggtgga gactcttttt    180
actaacttga atgagacaaa agcagtggtg tcagtttata atcctgatgc atttcagtaa    240
taatgtagaa aaacattatt ttaaaaaagt tccaacacac agccatgagg agccnnnnnn    300
nnnntcagtt ttgaaagagg tgcataataa aactactaac cagaggagtc tatgccattt    360
t                                                                    361
 
<210>653
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<212>DNA
<213>human
 
<220>
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<222>(353)..(353)
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<400>653
gagtttcaac tttaaatgtt cactatgtca tttagtgtcc anctttacgg ataggttgac     60
tatctaaata ggcattttta gtcattaaaa aaaantctag tcaccaggag gatccctata    120
actcaaaata acttgtttgt aaaagaaaat ttgtttactt acccattagt aagttcctgc    180
atattcatta taagatggca aatcaaactt ttctaggatg aagacagctt atttttaagt    240
tgtatagtct tagttggttt agggtctcaa ttttaattaa taaaatactt ggtttttatt    300
tgcttgtcct tttgaattcc tgttttaata attttaaaat gagcacaaag aangttgaag    360
ttcagattaa tctcttctga atgatgtttt tttcctctgt gatgagttgt ttctg         415
 
<210>654
<211>364
<212>DNA
<213>human
 
<220>
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<222>(294)..(294)
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<220>
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<222>(336)..(337)
<223>n is a，c，g，or t
<400>654
tgctgtagtc actggtgttc ctcacccacc agctgtaact cagtttgtgt gaggtacagc     60
cacagaagat gtcatgtact gtatattacc tggtgatagt tgcttttcac cccccgagtt    120
cagtttctag gagccaatga aacttcccct cacctcctca tctttccaag ttgttctttg    180
aattgaggag tttgaaggca taaacagtta cttggggatt tgcgaaaatc ctacttagtt    240
actgcgttta cagttctttg gcccagtctc tgacccttcc cnagtatttg tgcnatgatt    300
gtgtttactg ctggattttt gaaggttttt tttttnnaag aaagtgccat ttcattattt    360
gatt                                                                 364
 
<210>655
<211>436
<212>DNA
<213>human
<400>655
gggatcactg ggagaagcca tggcattatc ttcaggcaat ttagtctgtc ccaaataaaa     60
taaatccttg catgtaaatc attcaagggt tatagtaata tttcatatac tgaaaagtgt    120
ctcataggag tcctcttgca catctaaaaa ggctgaacat ttaagtatcc cgaattttct    180
tgaattgctt tccctataga ttaattacaa ttggatttca tcatttaaaa accatacttg    240
tatatgtagt tataatatgt aaggaataca ttgtttataa ccagtatgta cttcaaaaat    300
gtgtattgtc aaacatacct aactttcttg caataaatgc aaaagaaact ggaacttgac    360
aattataaat agtaatagtg aagaaaaaat agaaaggttg caattatata ggccatgggt    420
ggctcaaaac tttgaa                                                    436
 
<210>656
<211>427
<212>DNA
<213>human
 
<220>
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<222>(45)..(51)
<223>n is a，c，g，or t
<220>
<221>misc_feature
<222>(402)..(402)
<223>n is a，c，g，or t
<400>656
gattcctgga ttgatgtctt atctacaggc ttctttttaa aaatnnnnnn ngattggctg     60
tgagtttacc aggattatag ttgaggctaa aggacagctc ctcaggaaag cccctgttct    120
acatctacgg tcacatgctg gaccttgagt tgtcactcag agaaaagagt gccatctacc    180
gaaactccac agtttccatt gtgaatggct tctttggtgc agagttccaa aaattatgta    240
gcccagctct ttaattttgt aacatctaat gatatcaccg ccttgaagtg attaaagtag    300
attgcttaaa gaattaaagc tttaaagatg aaagatgtta ttgcttttgc tggacatgag    360
gaacagttgt aaagtttcca ggtctacaat aactttctgg anccctctca gtgaactgtt    420
tcttgta                                                              427
 
<210>657
<211>559
<212>DNA
<213>human
<400>657
gaagtccatc ctttggtcca aagcatctgg aagaggaaga agagaggaat gagaaagaag     60
gaagtgatgc aaaacatctc caaagaagtc ttttggaaca ggaaaatcat tcaccactca    120
cagggtcaaa tatgaaatac aaaaccacga accaatcaac agaattttta tccttccaag    180
atgccagctc attgtacaga aacattttag aaaaagaaag ggaacttcag caactgggaa    240
tcacagaata cctaaggaaa aacattgctc agctccagcc tgatatggag gcacattatc    300
ctggagccca cgaagagctg aagttaatgg aaacattaat gtactcacgt ccaaggaagg    360
tattagtgga acagacaaaa aatgagtatt ttgaacttaa agctaattta catgctgaac    420
ctgactattt agaagtcctg gagcagcaaa catagatgga gagtttgagg gctttcgcag    480
aaatgctgtg attctgtttt aagtccatac cttgtaaata agtgccttac gtgagtgtgt    540
catcaatcag aacctaagc                                                 559
 
<210>658
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<212>DNA
<213>human
<400>658
gctgctcaag cgcctgcaga acaacgacac gtgcagcatg ccaggcctca cgtgcttcac     60
ccacgacaac cagcactggc agacggcgcc tttctggaca ctggggcctt tctgtgcctg    120
caccagcgcc aacaataaca cgtactggtg catgaggacc atcaatgaga ctcacaattt    180
cctcttctgt gaatttgcaa ctggcttcct agagtacttt gatctcaaca cagaccccta    240
ccagctgatg aatgcagtga acacactgga cagggatgtc ctcaaccagc tacacgtaca    300
gctcatggag ctgaggagct gcaagggtta caagcagtgt aacccccgga ctcgaaacat    360
ggacctgg                                                             368
 
<210>659
<211>436
<212>DNA
<213>human
 
<220>
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<222>(300)..(300)
<223>n is a，c，g，or t
<400>659
acaatcggct aaccttgaca tttcttttta ccttcatatg ccactatctc ggtagttcaa     60
aaaaatttag ttcttgataa attgccttga agtttacctt gtgctggaga gccttatgat    120
aactccaaag actttcttac ggtataatac atgttgttta ggattgtgtt tcttagtcac    180
tgaagataat aaatattaaa atggatgttt tcatcagaaa attttcatgt tttcctttaa    240
ggtaacataa ttgtaagaat tgtttaataa aatactcagg aaattctaaa ggtttctccn    300
aatacctaaa catttctgaa catcagtatt gcagttgtgg aagagcagaa ggaggataca    360
tttgtttgtg ttgctcccca aaattccacc ttgcatttgc atcacaaact tccctcaatt    420
gaggcagttt tctttg                                                    436
 
<210>660
<211>431
<212>DNA
<213>human
 
<220>
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cagtgctgct gtgaactaaa gtatgtcatt tatgctcaaa gtttaattct tcttcttggg     60
atattttaaa aatgctactg agattctgct gtaaatatga ctagagaata tattgggttt    120
gctttatttc ataggcttaa ttctttgtaa atctgaatga ccataataga aatacatttc    180
ttgtggcaag taattcacag ttgtaaagta aataggaaaa attattttat ttttattgat    240
gtacattgat agatgccata aatcagtagc aaaaggcact tctaaaggta agtggtttaa    300
gttgcctcaa nagagggaca atgtagcttt attttacaag aaggcatagt tagatttcta    360
tgaaatattt attctgtaca gttttatata nttttggttc acaaaagtaa ttattcttgg    420
gtgcctttca a                                                         431
 
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<211>322
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<213>human
 
<220>
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<222>(37)..(38)
<223>n is a，c，g，or t
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aaagtatatt gtgctagctt gtctaagaat aaacttnnat actgttgggg gagggctgca     60
cctgtcaaga taacctgtca atgtagtagg aaaacaggag gggacagtaa cagaaaagca    120
cgggaaaaga tggcaaggtt agttaaaata gaaaagtgct cagttcctca tacctgtaat    180
cccagcagtt tagggggcca aggaaggtgg gtcacttgag cccaagagtt caaggccatc    240
ctgggcaatg tggcgaaagt gtctacaaaa aaatacaaaa agaggaagaa atgatatttc    300
acaagtttgt atcatttgtc at                                             322
 
<210>662
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<212>DNA
<213>human
 
<220>
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<222>(43)..(43)
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<222>(99)..(99)
<223>n is a，c，g，or t
<220>
<221>misc_feature
<222>(115)..(115)
<223>n is a，c，g，or t
<400>662
cagtccaaaa tccatagaca cagacagtag aaaggtggtt atncaagggn ctggtaggag     60
agggagttag tatttagtgg tatagagttt tagtgtttnc cgggtaaaaa tgttnctaga    120
gatctgttgc aaccatgtga atatacttaa cactaccgta ctgtacactg aaaaaatggt    180
taagaggata aatttaaatg gttaagagga aaaatggtta agaggataat gttgttttgt    240
taccacagta gtaactttta aaaaccctca tgtatgttct tt                       282
 
<210>663
<211>398
<212>DNA
<213>human
 
<220>
<221>misc_feature
<222>(80)..(80)
<223>n is a，c，g，or t
<220>
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<222>(82)..(83)
<223>n is a，c，g，or t
<220>
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<222>(85)..(85)
<223>n is a，c，g，or t
<220>
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<222>(87)..(87)
<223>n is a，c，g，or t
<220>
<221>misc_feature
<222>(97)..(97)
<223>n is a，c，g，or t
<400>663
caacccattt tgtgccacat gcaagttttg aataaggatg gtatagaaaa caacgctgca     60
tatacaggta ccatttaggn annancngat gcctttntgg gggcagaatc acatggcaaa    120
agctttgaaa atcataaaga tataagttgg tgtggctaag atggaaacag ggctgattct    180
tgattcccaa ttctcaactc tccttttcct atttgaattt ctttggtgct gtagaaaaca    240
aaaaaagaaa aatatatatt cataaaaaat atggtgctca ttctcatcca tccaggatgt    300
actaaaacag tgtgtttaat aaattgtaat tattttgtgt acagttctat actgttatct    360
gtgtccattt ccaaaacttg cacgtgtccc tgaattcc                            398
 
<210>664
<211>22
<212>DNA
<213>synthetic
<400>664
tcgtttttcg cgtttagttg tc                                            22
 
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<212>DNA
<213>synthetic
<400>665
gcgcaccgaa aaaaccg                                                  17
 
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<212>DNA
<213>synthetic
<400>666
cggttacggt tagtattcgg tttc                                          24
 
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<212>DNA
<213>synthetic
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aaaatacgac gataaaaaac gcg                                            23
 
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<213>synthetic
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cgagggtttt ttagcgattt gtc  z                                         23
 
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<213>synthetic
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aaacgaaccg ctccccg                                                   17
 
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<213>synthetic
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ttcggcgttt tcgtttttta c                                              21
 
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<211>21
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<213>synthetic
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ccccttaaca acataatcgc g                                              21
 
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<213>synthetic
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<213>synthetic
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gcttacaccc gcccg acta                                                19
 
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<212>DNA
<213>synthetic
<400>674
gttttgtgat tggttaggtt attaaagt                                       28
 
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<211>25
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<213>synthetic
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ccrtcacctt ctacaccaaa aaata                                          25
 
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<212>DNA
<213>synthetic
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tgtggattta tttttataag gatattgaat                            30
 
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<212>DNA
<213>synthetic
<400>677
ataactcatt aaaaactcac atctaaacac ta                         32
 
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<211>28
<212>DNA
<213>synthetic
<400>678
ttaagaaaga gagtaaggag gaagagtt                              28
 
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caaaataata aatccctcta ctactattat caa                        33
 
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<213>synthetic
<400>681
ggaggaaagg aattagttta gaagttagtt                            30

Claims (35)

1.筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性或监测新生物的进展的方法，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
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209687_at      226682_at    238750_at
209735_at      226694_at    238751_at
209763_at      226818_at    239272_at
209868_s_at    226834_at    241994_at
209948_at      226841_at    242447_at
210084_x_at    227006_at    242601_at
227099_s_at    227061_at    243278_at；和/或
(ii)CLCA4    SGK          MT1X
ZG16         CFL2         AOC3
CA2          C1S          PPAP2A
CA1          SELENBP1     ZSCAN18
MS4A12       MT1E         IVD
AQP8         ADAMTS1      SFRP1
SLC4A4       ITM2A        COL4A2
CEACAM7      POU2AF1      GPM6B
TAGLN        FAM55D       EPB41L3
GUCA1B       C6orf204     MAOA
GCG          AKAP12       DMD
ADH1B        TUBB6        MSRB3
UGT2B17    LGALS2        PLOD2
ADAMDEC1   KIAA0828      C9orf19
MT1M       MGC14376      MIER3
AKR1B10    PPP1R14A      XDH
FN1        MUC4          CLDN23
MGP        PKIB          SGCE
CXCL12     PIGR          FOXF2
PDK4       ASPN          AGR3
CA4        A2M           IGLJ3
PYY        LOC25845      QKI
IGHA1      LGALS1        LOC399959
TPM2       BCHE          ANKRD25
C6orf105   ST6GALNAC1    CRISPLD2
HPGD       GJA1          ANK2
ADH1C      SCNN1B        LOC283666
CLCA1      FABP4         CRYAB
FABP1      F13A1         ACAT1
ENAM       CD36          IGL@
CFD        SPARCL1       PBLD
GUCA2B     ZCWPW2        CCL8
FBLN1      TNC           LIFR
LOC63928   MT1A          HLA-DRB1
ABCA8      LOC652745     UGP2
POSTN      MALL          IGKV1D-13
DCN        GNG2          AP1S2
ITLN1      DNASE1L3      EMP3
COL6A2     EGR1          MMP28
FCGBP      CMBL          UGT2A3
SLC26A2    GCNT3         RGS5
PGM5       SERPING1      PTGIS
DMN        MEIS1         DUSP5
GPNMB      EDN3          MFAP4
IGFBP5     MSN           UGT1A6
CLEC3B     MT1G          PRKAR2B
LOC253012    TPSAB1      HHLA2
DPT          GPX3        LOC652128
PCK1         CDKN2B      C3
CNN1         FOSB        ATP2B4
HSD17B2      HSPA1A      HBA1
PLAC8        CYBRD1      TCF21
TMEM47       PTGER4      PPID
OGN          MAG1        PPAP2B
CALD1        BEST2       SPON1
ACTG2        HLA-DQA1    PHLDB2
MGC4172      PRIMA1      RARRES2
MAB21L2      MT1F        ETHE1
RPL24        MAFB        MMP2
ABCG2        FAM107A     SRI
CCDC80       PRKACB      CNTN3
UGT1A1       SELM        RGS2
MRC1         TYROBP      COL6A1
HSD11B2      TNS1        FBN1
ANPEP        MYH11       MXD1
MATN2        ITM2C       PLCE1
PRNP         CES2        KCNMB1
ABI3BP       MS4A4A      CALM1
HLA-C        PDGFRA      HLA-DPB1
NDE1         CA12        SMOC2
SRPX         FKBP5       LOC285382
WWTR1        HSPB8       CLIC5
HMGCS2       TPSB2       APOE
LOC646627    FGL2        SERPINF1
KRT20        C1QB        PPP1R12B
KLF4         ANGPTL1     HSPB6
FHL1         MEP1A       FNBP1
ARL14        GUCY1A3     C4orf34
LUM          UGDH        SORBS2
SORBS1       DUSP1       GPA33
METTL7A    C2orf40    GALNAC4S-6ST
FAM129A    PLN        CFHR1
SCARA5     UGT2B15    MGC13057
SI         PDLIM3     C10orf56
ACTA2      TP53INP2   SULT1A1
CD177      ATP8B1     TTRAP
C10orf99   ANK3       CCL28
COL15A1    CTGF       IDH3A
NR3C2      MUCDHL     EDG2
DHRS9      SDPR       UGT1A8
LMOD1      COL14A1    RAB27A
EFEMP1     DSCR1      ANTXR1
GREM1      CITED2     EMP1
IL1R2      MT1H       CSRP1
LOC387763  NEXN       PLEKHC1
TIMP3      MUC2       LOC572558
MYLK       NID1       FOXP2
CLDN8      HBB        HSPA2
RDX        GCNT2      ATP1A2
TSPAN7     C20orf118  TNXB
TNFRSF17   SLC20A1    FUCA1
SYNPO2     CD14       MRGPRF
VIM        KCTD12     HIGD1A
SMPDL3A    RBMS1      MFSD4
P2RY14     PTRF       AXL
CHGA       TSPAN1     AQP1
C15orf48   UGT1A9     MAP1B
COL3A1     COX7A1     PALLD
CYR61      MUC12      MPEG1
TRPM6      PDCD4      KLHL5
OSTbeta    CAV1       TCEAL7
IGLV1-44   FAM46C     FILIP1L
VSIG2      LRIG1      IQGAP2
IGHM       HLA-DPA1   PRDX6
LRRC19    C1orf115    RAB31
CD163     HBA2        LOC96610
CEACAM1   EDIL3       FGFR2
TIMP2     DES         PAPSS2
ENTPD5    MT2A        XLKD1
DDR2      KCNMA1      SMTN
CHRDL1    GAS1        C8orf4
SRGN      TBC1D9      SDCBP2
PDE9A     C7          CCL11
PMP22     P2RY1       ELOVL5
FLNA      NR3C1       FOXF1
STMN2     STOM        RELL1
MYL9      CKB         PNMA1
SEMA6D    CLU         LOC339562
PADI2     SLC26A3     PALM2-AKAP2
SEPP1     SDC2        PAG1
TGFB1I1   SST         HCLS1
SFRP2     HLA-DRA     RGS1
UGT1A3    TSC22D3     FXYD6
MS4A7     IL6ST       OLFML3
ALDH1A1   C1QC        COL6A3
其中相对于对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表新生性大肠细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
2.权利要求1的方法，其中所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
220026_at；和/或
(ii)CLCA4。
3.权利要求1的方法，其中所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
214142_at；和/或
(ii)ZG16。
4.权利要求1的方法，其中所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
209301_at    205950_s_at；和/或
(ii)CA2      CA1。
5.权利要求1的方法，其中所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
220834_at；和/或
(ii)MS4A12。
6.权利要求1的方法，其中所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
206784_at；和/或
(ii)AQP8。
7.权利要求1的方法，其中所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
203908_at，206198_s_at，205547_s_at，207003_at，206422_at，
209613_s_at，207245_at；和/或
(ii)SLC4A4，CEACAM7，TAGLN，GUCA1B，GCG，ADH1B，
UGT2B17。
8.权利要求1的方法，其中所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
206134_at，217546_at，206561_s_at，211719_x_at，202291_s_at
209687_at；和/或
(ii)ADAMDEC1，MT1M，AKR1B10，FN1，MGP，CXCL12。
9.权利要求1的方法，其中所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
225207_at      211548_s_at    205382_s_at
206208_at      206262_at      207502_at
207080_s_at    210107_at      202995_s_at
215118_s_at    205892_s_at    206149_at
204083_s_at    212592_at      204719_at
229070_at；和/或
(ii)PDK4    HPGD     CFD
CA4         ADH1C    GUCA2B
PYY        CLCA1        FBLN1
IGHA1      FABP1        LOC63928
TPM2       ENAM         ABCA8
C6orf105。
10.权利要求1的方法，其中所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
210809_s_at    201617_x_at    202133_at
201893_x_at    202274_at      204607_at
223597_at      218756_s_at    238143_at
209156_s_at    210302_s_at    213953_at
203240_at      228885_at      220266_s_at
224963_at      209735_at      210299_s_at
226303_at      228504_at      220468_at
212730_at      225242_s_at    201744_s_at
201141_at      215125_s_at    218087_s_at
211959_at      204438_at      207761_s_at
205200_at      204130_at      217967_s_at
242601_at      202888_s_at    229839_at
213068_at      202350_s_at    206664_at
208383_s_at    201300_s_at    200974_at
203951_at      223395_at      219669_at
204818_at      214768_x_at    227736_at
219014_at      228133_s_at    203477_at
209656_s_at    204955_at      205259_at
222722_at；和/或
(ii)POSTN    OGN          WWTR1
DCN          CALD1        HMGCS2
ITLN1        ACTG2        LOC646627
COL6A2       MGC4172      KRT20
FCGBP        MAB21L2      KLF4
SLC26A2      RPL24        FHL1
PGM5      ABCG2     ARL14
DMN       CCDC80    LUM
GPNMB     UGT1A1    SORBS1
IGFBP5    MRC1      METTL7A
CLEC3B    HSD11B2   FAM129A
LOC253012 ANPEP     SCARA5
DPT       MATN2     SI
PCK1      PRNP      ACTA2
CNN1      ABI3BP    CD177
HSD17B2   HLA-C     C10orf99
PLAC8     NDE1      COL15A1
TMEM47    SRPX      NR3C2。
11.权利要求1-10中任一项的方法，其中所述新生细胞是腺瘤或腺癌。
12.权利要求1的方法，其中所述新生物是腺瘤，且所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
200600_at      208788_at      215382_x_at
200665_s_at    208789_at      215388_s_at
200799_at      208894_at      216442_x_at
200845_s_at    209047_at      216474_x_at
200859_x_at    209101_at      216834_at
200897_s_at    209138_x_at    217480_x_at
200974_at      209147_s_at    217757_at
200986_at      209156_s_at    217762_s_at
201041_s_at    209191_at      217764_s_at
201061_s_at    209209_s_at    217767_at
201069_at      209210_s_at    217897_at
201105_at      209312_x_at    218162_at
201137_s_at    209335_at      218224_at
201141_at      209436_at      218312_s_at
201150_s_at    209457_at      218353_at
201289_at      209496_at      218418_s_at
201300_s_at    209621_s_at    218468_s_at
201426_s_at    209651_at      218469_at
201438_at      209656_s_at    218559_s_at
201616_s_at    209868_s_at    219087_at
201617_x_at    210084_x_at    219607_s_at
201645_at      210133_at      221541_at
201667_at      210139_s_at    222043_at
201743_at      210495_x_at    222453_at
201744_s_at    210517_s_at    222513_s_at
201842_s_at    210764_s_at    223121_s_at
201852_x_at    210809_s_at    223122_s_at
201858_s_at    210982_s_at    223235_s_at
201859_at      211161_s_at    223343_at
201865_x_at    211596_s_at    224560_at
201893_x_at    211671_s_at    224694_at
201920_at      211719_x_at    224840_at
202007_at      211813_x_at    224964_s_at
202069_s_at    211896_s_at    225242_s_at
202133_at      211959_at      225269_s_at
202283_at      211964_at      225353_s_at
202291_s_at    211985_s_at    225381_at
202403_s_at    211990_at      225442_at
202620_s_at    211991_s_at    225602_at
202686_s_at    212077_at      225604_s_at
202760_s_at    212091_s_at    225626_at
202766_s_at    212136_at      225688_s_at
202953_at      212158_at      225710_at
202957_at      212185_x_at    226001_at
202994_s_at    212195_at      226051_at
202995_s_at    212230_at      226084_at
203066_at      212233_at      226103_at
203131_at      212265_at      226430_at
203305_at      212386_at      226682_at
203382_s_at    212387_at      226694_at
203477_at      212397_at      226818_at
203645_s_at    212414_s_at    226834_at
203680_at      212419_at      226841_at
203729_at      212464_s_at    227061_at
203748_x_at    212667_at      227099_s_at
204069_at      212671_s_at    227235_at
204122_at      212713_at      227404_s_at
204135_at      212764_at      227529_s_at
204438_at      212956_at      227561_at
204457_s_at    213428_s_at    227623_at
204570_at      213509_x_at    227705_at
204688_at      213746_s_at    227727_at
205412_at      213891_s_at    228507_at
205683_x_at    214038_at      228750_at
205935_at      214677_x_at    228846_at
207134_x_at    214752_x_at    229530_at
207266_x_at    215049_x_at    230264_s_at
208131_s_at    215076_s_at    231579_s_at
208370_s_at    215193_x_at    234987_at；和/或
208747_s_at
(ii)A2M    FBN1       PALLD
ACAT1      FILIP1L    PALM2-AKAP2
ACTA2      FKBP5      PDGFRA
AKAP12     FLNA       PDLIM3
ANKRD25    FN1        PHLDB2
ANTXR1     FOXF1      PLEKHC1
AP1S2        FXYD6             PLOD2
APOE         GALNAC4S-6ST      PMP22
AQP1         GAS1              PNMA1
ASPN         GJA1              POSTN
ATP2B4       GNG2              PPAP2A
AXL          GPNMB             PPAP2B
C10orf56     GREM1             PRDX6
C1QB         GUCY1A3           PRKAR2B
C1QC         HCLS1             PRNP
C1S          HLA-DPA1          PTGIS
C20orf118    HLA-DPB1          PTRF
C3           HLA-DQA1          QKI
C9orf19      HLA-DRA           RAB31
CALD1        HLA-DRB1          RARRES2
CALM1        HSPA1A            RBMS1
CCDC80       IDH3A             RDX
CCL11        IGFBP5            RELL1
CCL8         IGL@              RGS1
CD14         IGLJ3             RGS5
CD163        IL6ST             SDC2
CES2         KLHL5             SELM
CFHR1        LGALS1            SEPT6
CLU          LOC283666         SERPINF1
COL14A1      LOC339562         SERPING1
COL15A1      LOC387763         SFRP2
COL 1A2      LOC399959         SGCE
COL3A1       LRIG1             SLC20A1
COL4A2       LUM               SMOC2
COL6A1       MAFB              SORBS1
COL6A2       MAP1B             SPARC
COL6A3       MEIS1             SPON1
COX7A1    MFAP4    SRGN
CRISPLD2  MGP      STOM
CTGF      MMP2     TBC1D9
CYBRD1    MPEG1    TCEAL7
CYR61     MRC1     TGFB1I1
DCN       MRGPRF   TIMP2
DDR2      MS4A4A   TIMP3
DSCR1     MS4A7    TMEM47
DUSP1     MSN      TNC
DUSP5     MT2A     TPSAB1
EFEMP1    MXD1     TPSB2
EGR1      NEXN     TUBB6
ELOVL5    NID1     TyROBP
EMP3      NR3C1    VIM
F13A1     OLFML3   WWTR1
FBLN1     PAG1     ZSCAN18。
13.权利要求1或11的方法，其中所述新生物是癌，且所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因：
200884_at      208596_s_at    220812_s_at
201495_x_at    208920_at      221004_s_at
202266_at      209114_at      221305_s_at
202350_s_at    209374_s_at    221584_s_at
202731_at      209458_x_at    221841_s_at
202741_at      209791_at      221896_s_at
202742_s_at    210107_at      223484_at
202768_at      210524_x_at    223597_at
202838_at      210735_s_at    223754_at
203058_s_at    211372_s_at    224342_x_at
203060_s_at    211538_s_at    224989_at
203240_at      211549_s_at    224990_at
203296_s_at    211637_x_at    225458_at
203343_at      211699_x_at    225728_at
203474_at      211745_x_at    226147_s_at
203638_s_at    212224_at      226302_at
203963_at      212592_at      226594_at
204018_x_at    212741_at      226654_at
204034_at      212814_at      226811_at
204036_at      213317_at      227052_at
204130_at      213451_x_at    227522_at
204388_s_at    213629_x_at    227682_at
204389_at      213921_at      227725_at
204508_s_at    213953_at      227735_s_at
204532_x_at    214164_x_at    227736_at
204607_at      214433_s_at    228133_s_at
204673_at      214598_at      228195_at
204818_at      214916_x_at    228232_s_at
204895_x_at    215125_s_at    228241_at
204897_at      215299_x_at    228469_at
205112_at      215867_x_at    228961_at
205259_at      216336_x_at    229070_at
205403_at      216491_x_at    229254_at
205480_s_at    216510_x_at    229659_s_at
205554_s_at    217022_s_at    229831_at
205593_s_at    217109_at      230595a_t
205892_s_at    217110_s_at    231925_at
205929_at      217165_x_at    231975_s_at
206000_at      217232_x_at    233565_s_at
206094_x_at    217414_x_at    235146_at
206262_at      218541_s_at    235766_x_at
206377_at      218546_at      235849_at
206385_s_at    219059_s_at    238143_at
206664_at      219543_at      238750_at
207126_x_at    219796_s_at    238751_at
207245_at      219948_x_at    239272_at
207390_s_at    220075_s_at    241994_at
207392_x_at    220266_s_at    242447_at
207432_at      220468_at      242601_at
207761_s_at    220645_at      243278_at；和/或
(ii)ADH1C    HIGD1A        NR3C2
AGR3         HMGCS2        P2RY1
ALDH1A1      HPGD          PADI2
ANK3         HSD11B2       PAPSS2
ARL14        HSD17B2       PBLD
ATP1A2       HSPA2         PDCD4
ATP8B1       IGHA1         PDE9A
BEST2        IGHM          PIGR
C10orf99     IL1R2         PLCE1
C15orf48     IL8           PPID
C1orf115     IQGAP2        PRKACB
C4orf34      ITLN1         PTGER4
C6orf105     ITM2C         RAB27A
C8orf4       KCNMA1        SCARA5
CA12         KIAA0828      SDCBP2
CCL28        KLF4          SELENBP1
CKB          KRT20         SI
CLCA1        LOC253012     SMTN
CLDN8        LOC25845      SORBS2
CLIC5        LOC285382     SRI
CMBL         LOC572558     SST
CNTN3        LOC646627     ST6GALNAC1
DNASE1L3     LOC652128     SUTLT1A1
EDG2         LOC96610      TNXB
ENAM    MAOA       TSPAN1
ENTPD5  MATN2      TTRAP
ETHE1   MEP1A      UGDH
FABP1   METTL7A    UGP2
FAM46C  MFSD4      UGT1A1
FAM55D  MGC13057   UGT1A3
FCGBP   MIER3      UGT1A6
FGFR2   MMP28      UGT1A8
FOSB    MT1A       UGT1A9
FOXF2   MT1F       UGT2A3
FOXP2   MT1M       UGT2B15
FUCA1   MUC12      UGT2B17
GPA33   MUC2       VSIG2
HBA1    MUC4       XDH
HBA2    MUCDHL     XLKD1
HBB     MYH11      ZCWPW2
HHLA2   NDE1。
14.权利要求1-13中任一项的方法，其中所述对照水平是非新生物水平。
15.筛查个体发生大肠新生物或发生大肠新生物的倾向性的方法，所述方法包括筛查来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
202920_at    222717_at    231120_x_at
203881_s_at  224412_s_at  231773_at
204719_at    225381_at    203296_s_at
204931_at    225575_at    206664_at
204940_at    227529_s_at  211549_s_at
205433_at    227623_at    214598_at
206637_at    227705_at    219948_x_at
207080_s_at  227827_at    220812_s_at
207980_s_at    228504_at    221305_s_at
209170_s_at    228706_s_at  229831_at
209209_s at    228766_at    231925_at
209613_s at    228854_at    235146_at
220037_s_at    228885_at    238751_at
220376_at      230788_at    243278_at；和/或
(ii)ADH1B    ANGPTL1    HHLA2
SORBS2       DMD        SORBS2
PYY          GCNT2      CLDN23
ABCA8        SDPR       CNTN3
RPL24        PKIB       PLEKHC1
SI           CITED2     LRRC19
CLDN8        TCF21      LIFR
P2RY14       P2RY1      ATP1A2
PLN          ANK2       HPGD
TRPM6        XLKD1      GPM6B
CD36         LOC399959  UGT1A8
BCHE         AKAP12     FOXP2
TCEAL7       UGT2A3
其中基本上不高于背景水平的组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的表达水平代表新生细胞或倾向于发生新生状态的细胞。
16.权利要求15的方法，其中所述新生细胞是腺瘤或腺癌。
17.权利要求15或16的方法，其中所述新生物是腺瘤，且所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
209209_s_at，225381_at，227529_s_at，227623_at，227705_at；
和/或
(ii)AKAP12，LOC399959，PLEKHC1，TCEAL7。
18.权利要求15或16的方法，其中所述新生物是癌，且所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
203296_s_at    219948_x_at    231925_at
206664_at      220812_s_at    235146_at
211549_s_at    221305_s_at    238751_at
214598_at      229831_at      243278_at；和/或
(ii)ATP1A2    HHLA2    SORBS2
CLDN8         HPGD     UGT1A8
CNTN3         P2RY1    UGT2A3
FOXP2         SI。
19.表征新生细胞或细胞群体的方法，所述细胞或细胞群体来自个体的大肠，所述方法包括评估所述细胞或细胞群体中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
200600_at      204006_s_at    213428_s_at
200665_s_at    204051_s_at    213524_s_at
200832_s_at    204122_at      213869_x_at
200974_at      204320_at      213905_x_at
200986_at      204475_at      214247_s_at
201058_s_at    204620_s_at    215049_x_at
201069_at      205479_s_at    215076_s_at
201105_at      205547_s_at    215646_s_at
201141_at      205828_at      216442_x_at
201147_s_at    207173_x_at    217430_x_at
201150_s_at    207191_s_at    217762_s_at
201162_at      208747_s_at    217763_s_at
201163_s_at    208782_at      217764_s_at
201185_at      208788_at      218468_s_at
201261_x_at    208850_s_at    218469_at
201289_at      208851_s_at    218559_s_at
201426_s_at    209101_at      218638_s_at
201438_at      209156_s_at    219087_at
201616_s_at    209218_at      221011_s_at
201645_at      209395_at      221729_at
201667_at      209396_s_at    221730_at
201744_s_at    209596_at      221731_x_at
201792_at      209875_s_at    37892a_t
201842_s_at    209955_s_at    223122_s_at
201852_x_at    210095_s_at    223235_s_at
201859_at      210495_x_at    224560_at
201893_x_at    210511_s_at    224694_at
202237_at      210764_s_at    224724_at
202238_s_at    210809_s_at    225664_at
202283_at      211161_s_at    225681_at
202291_s_at    211571_s_at    225710_at
202310_s_at    211719_x_at    225799_at
202311_s_at    211813_x_at    226237_at
202403_s_at    211896_s_at    226311_at
202404_s_at    211959_at      226694_at
202450_s_at    211964_at      226777_at
202620_s_at    211966_at      226930_at
202766_s_at    211980_at      227099_s_at
202859_x_at    211981_at      227140_at
202878_s_at    212077_at      227566_at
202917_s_at    212344_at      229218_at
202998_s_at    212353_at      229802_at
203083_at      212354_at      231579_s_at
203325_s_at    212464_s_at    231766_s_at
203382_s_at    212488_at      231879_at
203477_at      212489_at      232458_at
203570_at      212667_at      233555_s_at
203645_s_at    213125_at      234994_at；和/或
203878_s_at
(ii)COL1A2     LGALS1     SRGN
CTHRC1    ELOVL5    LBH
FN1       MGP       CTGF
POSTN     MMP2      TNC
SPP1      LOXL2     G0S2
MMP1      MYL9      SQLE
SPARC     DCN       EFEMP1
LUM       CALD1     APOE
GREM1     FBN1      MSN
IL8       MMP3      IGFBP3
IGFBP5    IGFBP7    SERPINF1
SFRP2     FSTL1     ISLR
SULF1     COL4A2    HNT
ASPN      VCAN      COL5A1
COL6A3    SMOC2     OLFML2B
COL8A1    HTRA1     KIAA1913
COL12A1   CYR61     PALM2-AKAP2
COL5A2    FAP       SERPING1
CDH11     VIM       TYROBP
THBS2     TIMP2     ACTA2
COL15A1   SCD       COL3A1
COL11A1   TIMP3     PLOD2
S100A8    AEBP1     MMP11
FNDC1     GJA1      CD163
SFRP4     NNMT      FCGR3B
INHBA     COL1A1    PLAU
COL6A2    SULF2     MAFB
ANTXR1    COL6A1    LOC541471
GPNMB     SPON2     LOC387763
BGN       CTSK      CHI3L1
TAGLN     MXRA5     THY1
COL4A1    C1S       LOXL1
RAB31    DKK3    CD93
其中相对于胃肠道癌症的对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因的较低表达水平代表腺瘤细胞或倾向于发生腺瘤状态的细胞。
20.表征新生细胞或细胞群体的方法，所述细胞或细胞群体来自个体的大肠，所述方法包括评估来自所述个体的生物学样品中的一或多种基因或转录物的表达水平，所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
200884_at      214234_s_at    226248_s_at
203240_at      214235_at      226302_at
203963_at      214433_s_at    227676_at
204508_s_at    215125_s_at    227719_at
204607_at      215867_x_at    227725_at
204811_s_at    217109_at      228232_s_at
204895_x_at    217110_s_at    229070_at
204897_at      218211_s_at    231832_at
205259_at      219543_at      232176_at
205765_at      219955_at      232481_s_at
205927_s_at    221841_s_at    235976_at
208063__s_at   221874_at      236894_at
208937_s_at    223969_s_at    237521_x_at
210107_at      223970_at      242601_at
213106_at；和/或
(ii)CLCA1    CTSE        ATP8B1
FCGBP        C6orf105    CACNA2D2
HMGCS2       CKB         KLF4
RETNLB       ATP8A1      CYP3A5P2
L1TD1        MUC4        CAPN9
SLITRK6      UGT1A1      NR3C2
VSIG2        SELENBP1    PBLD
LOC253012    PTGER4      CA12
ST6GALNAC1   MLPH        WDR51B
ID1        KIAA1324    FAM3D
CYP3A5
其中相对于胃肠道腺瘤的对照水平而言组(i)和/或组(ii)的基因或转录物的较低表达水平代表癌或倾向于发生癌性状态的细胞。
21.权利要求19的方法，其中所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因：
202404_s_at，212464_s_at，210809_s_at，225681_at；和/或
(ii)COL1A2，CTHRC1，FN1，POSTN。
22.权利要求19的方法，其中所述一或多种基因选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
209875_s_at    227140_at    204475_at；和/或
(ii)SPP1    MMP1。
23.权利要求19的方法，其中所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
200665_s_at    226237_at      226930_at
201744_s_at    225664_at      204051_s_at
218468_s_at    221730_at      210511_s_at
202859_x_at    207173_x_at    209156_s_at
211959_at      203083_at      224694_at
223122_s_at    203477_at      201141_at
212353_at      37892_at       213905_x_at
219087_at      202917_s_at    205547_s_at
201438_at；和/或
(ii)SPARC    COL8A1     SFRP4
LUM          COL12A1    INHBA
GREM1        COL5A2     COL6A2
IL8          CDH11      ANTXR1
IGFBP5       THBS2      GPNMB
SFRP2        COL15A1    BGN
SULF1        COL11A1    TAGLN
ASPN         S100A8
COL6A3    FNDC1。
24.权利要求20的方法，其中所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
210107_at；和/或
(ii)CLCA1。
25.权利要求20的方法，其中所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因或转录物：
203240_at      219955_at      242601_at
204607_at      232481_s_at    227725_at
223969_s_at    228232_s_at；和/或
(ii)FCGBP     L1TD1      LOC253012
HMGCS2        SLITRK6    ST6GALNAC1
RETNLB        VSIG2。
26.权利要求20的方法，其中所述一或多种基因或转录物选自：
(i)由以下Affymetrix探针组ID检测到的基因：
235976_at      236894_at    237521；和/或
(ii)SLITRK6    L1TD1。
27.权利要求1-26中任一项的方法，其中所述细胞是结直肠细胞。
28.权利要求1-27中任一项的方法，其中所述生物学样品是粪便样品、灌肠液、手术切除样品、组织活检样品或血液样品。
29.权利要求1-28中任一项的方法，其中所述表达水平是mRNA表达或蛋白质表达。
30.权利要求1-28中任一项的方法，其中通过筛查基因组DNA的改变而评估所述表达水平。
31.权利要求30的方法，其中所述基因组DNA的改变是DNA甲基化的改变。
32.权利要求1-28中任一项的方法，其中通过筛查与所述基因相关联的染色质蛋白的改变而评估所述表达水平。
33.权利要求1-32中任一项的方法，其中所述个体是人。
34.分子阵列，所述阵列包含多个：
(i)包含相应于权利要求1-26中任一项中所列的任何一或多种新生物标记物基因的核苷酸序列或与之具有至少80％相同性的序列的核酸分子，或所述核酸分子的功能性衍生物、片段、变体或同源物；或
(ii)包含能够在中等严格性条件下与(i)的任何一或多种序列杂交的核苷酸序列的核酸分子，或所述核酸分子的功能性衍生物、片段、变体或同源物；或
(iii)包含能够在中等严格性条件下与(i)的任何一或多种序列杂交的核苷酸序列的核酸探针或寡核苷酸，或所述核酸分子的功能性衍生物、片段、变体或同源物；或
(iv)能够与(i)的核酸分子所编码的任何一或多种蛋白质相结合的探针，或其衍生物、片段或同源物，
其中(i)的所述标记物基因的表达水平或(iv)的所述蛋白质的表达水平代表源自大肠的细胞或细胞亚群的新生状态。
35.用于分析生物学样品的诊断试剂盒，所述试剂盒包含用于检测权利要求1-26中所列的一或多种新生物标记物的物质以及有助于通过所述物质进行检测的试剂。
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