CN105934254A - 作为哮喘肺中il-13活化的外周生物标志的二肽基肽酶-4（dpp4/cd26） - Google Patents

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Abstract

本披露涉及DPP4，蛋白或基因表达水平，作为针对IL‑13介导的疾病或障碍的生物标志物的用途，这些IL‑13介导的疾病或障碍是例如哮喘、IPF、COPD或特应性皮炎。可以将高于或低于预定的DPP4阈值水平的DPP4生物标志物的水平用于(i)确定患者对用IL‑13拮抗剂进行某项治疗的合格性，(ii)确定使用特异性IL‑13拮抗剂对IL‑13介导的病症或障碍的某项治疗是否应该开始、暂停或修改，(iii)诊断IL‑13介导的病症或障碍是否可以用特异性IL‑13拮抗剂进行治疗，(iv)预测用特异性IL‑13拮抗剂治疗IL‑13介导的病症或障碍的结果。本披露进一步提供了用于检测DPP4的测定试剂盒，以及计算机实现的诊断方法。

Description

作为哮喘肺中IL-13活化的外周生物标志的二肽基肽酶-4 (DPP4/CD26)
对以电子方式提交的序列表的引用
将与本申请一起以电子方式提交的处于ASCII文本文件形式的序列表的内容(名称：IL13-400WO_序列表_ascii.txt；大小：174,694字节；以及创建日期2015年1月15日)通过引用以其全文结合在此。
背景
支气管哮喘是以呼吸道高反应性、粘液产生过度、纤维化和增加的血清IgE水平为特征的常见的持续性肺部炎性疾病。气道高反应性(AHR)是气道对非特异性刺激(如冷空气)的过度收缩。AHR与粘液产生过多都被认为造成了变异性气道阻塞，该变异性气道阻塞造成哮喘发作(恶化)的呼吸短促特征并且导致与该疾病相关联的死亡率。
当前英国胸科协会(BTS)和全球哮喘防治创议(GINA)指南提出一种逐步治疗哮喘的方法(瑟赛尔提(Society)，B.T.，胸(Thorax)，2003.58增刊1:1-94；GINA，全球哮喘管理和预防战略(Global Strategy for Asthma Management and Prevention)，2002，国立卫生研究院(National Institute of Health))。轻度至中度哮喘通常可以通过使用吸入性皮质类固醇，结合以β-激动剂或白三烯抑制剂来控制。然而，由于记录的皮质类固醇的副作用，患者往往不依从治疗方案，这降低了治疗的有效性(米尔格龙(Milgrom)，H.等人，过敏、哮喘和免疫学年鉴(Ann Allergy Asthma Immunol)，2002，88:429-31；菲什(Fish)，L.和C.L.伦格(Lung)，过敏、哮喘和免疫学年鉴，2001，86:24-30；本德(Bender)，B.G.变态反应学与临床免疫学杂志(J Allergy Clin Immunol)，2002，109:S554-9)。哮喘响应于不同治疗呈现出显著的异质性，从而突出了对于开发针对该疾病的更有效的疗法或鉴别对特异性疗法响应进行预测的生物标志的需要。
特应性皮炎是一种常见的慢性炎性皮肤病，其通常与其他特应性障碍(如过敏性鼻炎和哮喘)相关联(比伯(Bieber)，新英格兰医学杂志(New England JournalofMedicine)，2008,358:1483-1494)。已经在特应性皮炎的亚急性和慢性损伤中观察到IL-13mRNA的上调(田泽(Tazawa)等人，皮肤病学研究档案(Arch.Dermatol.Res.)，2004，295:459-464；普瓦尔(Purwar)等人，皮肤病学研究杂志(J.Invest.Derm.)，2006，126，1043-1051；Oh等人，免疫学杂志(J Immunol.)，2011，186:7232-42)。
慢性阻塞性肺病(COPD)包括患有不同程度的慢性支气管炎、小气道疾病以及肺气肿的患者群体，并且特征在于进行性不可逆性肺功能下降，该下降对当前基于哮喘的疗法应答不良。COPD的潜在病因仍未充分了解。郑(Zheng)等人(临床研究杂志(J ClinInvest)，106:1081-93,2000)已经证实小鼠肺中过量表达IL-13引起肺气肿、升高的粘液产生和炎症，反映人COPD的多个方面。此外，AHR-在过敏性发炎的鼠类模型中的一种IL-13依赖性应答-已经被示出可预测吸烟者中的肺功能下降(Tashkin等人，美国呼吸与危重症医学(Am J Respir Crit Care Med)，153(6Pt l):1802-l 1,1996)。也已经在IL-13启动子多态性与发展COPD的易感性之间确立了一种联系(Van Der Pouw Kraan等人，基因与免疫(Genes Immun.)3:436-9,2002)。因此，迹象是IL-4/IL-13途径，并且特别是IL-13在COPD的发病机制中起重要作用。参见，例如，陈(Chen)等人，公共科学图书馆·综合(PLoS One)8:e68222,2013；登特(Dente)等人，呼吸(Respiration)84:98-100,2012；Grubek-Jaworska等人，呼吸(Respiration)84:101-107,2012；沃尔什(Walsh)，试验药物的当前观点(Curr.Opin.Investig.Drugs)11:1305-12,2010，所有文献以其全文通过引用结合在此。
白介素(IL)-13是114个氨基酸的细胞因子，具有约12kDa的未修饰的分子量(麦肯齐(McKenzie)，A.N.，等人，免疫学杂志(J Immunol)，1993，150:5436-44；明蒂(Minty)，A.，等人，自然(Nature)，1993，362:248-50)。在过敏性炎症的哮喘和啮齿类动物模型中，已经显示出IL-13水平与疾病严重程度相关(参见，美国专利申请公开号2012-0052060，公开于2012年3月1日，并且将该文件通过引用以其全文结合在此)。IL-13还可能在炎性肠病的发病机制中起作用，并且与纤维化病症，如特发性肺纤维化(IPF)相关。抗IL-13抗体目前被研发为用于治疗患有中度到重度哮喘的患者的疗法。然而，仅有一个亚群的哮喘患者似乎患有IL-13引起的疾病。因此，存在鉴别此类患者以及使用简单的生物标志或生物标志的组合来预测用IL-13拮抗剂(如抗IL-13抗体)进行治疗的结果的需要。
简要概述
本披露提供了一种对患有白介素-13(IL-13)介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括如果取自该患者的样品中的DPP4(二肽基肽酶-4)水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。还提供了一种对患有白介素-13(IL-13)介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括如果(a)取自该患者的样品中的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，并且(b)该患者呈现出(i)高骨膜蛋白(≥血清骨膜蛋白中值或约23ng/mL)、(ii)高嗜酸性粒细胞直接计数(血液嗜酸性粒细胞计数≥300个细胞/μL)、(iii)高Th2(高Th2定义为IgE>100IU/mL并且血液嗜酸性粒细胞≥0.14×109/L)、(iv)对短效β2激动剂的FEV1可逆性≥12％、(v)经肺CT扫描所测量的次级气道的壁面积％(WA％)高于约68％、或(vi)及其组合，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。
此外，本披露提供了一种对患有白介素-13(IL-13)介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括如果(a)取自该患者的样品中的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，并且(b)该患者呈现出高骨膜蛋白(≥血清骨膜蛋白中值或约23ng/mL)，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。还提供了一种对患有白介素-13(IL-13)介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括如果(a)取自该患者的样品中的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，并且(b)该患者呈现出高嗜酸性粒细胞直接计数(血液嗜酸性粒细胞计数≥300个细胞/μL)，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。还提供了一种对患有白介素-13(IL-13)介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括如果(a)取自该患者的样品中的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，并且(b)该患者呈现出高Th2(高Th2定义为IgE>100IU/mL并且血液嗜酸性粒细胞≥0.14×109/L)，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。还提供了一种对患有白介素-13(IL-13)介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括如果(a)取自该患者的样品中的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，并且(b)该患者呈现出对短效β2激动剂的FEV1可逆性≥12％，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。还提供了一种对患有白介素-13(IL-13)介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括如果(a)取自该患者的样品中的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，并且(b)该患者呈现出以下各项中的一者或多者：i)高骨膜蛋白(≥血清骨膜蛋白中值或约23ng/mL)、(ii)高嗜酸性粒细胞直接计数(血液嗜酸性粒细胞计数≥300个细胞/μL)、(iii)高Th2(高Th2定义为IgE>100IU/mL并且血液嗜酸性粒细胞≥0.14×109/L)、(iv)对短效β2激动剂的FEV1可逆性≥12％以及(v)经肺CT扫描所测量的次级气道的壁面积％(WA％)高于约68％，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。
此外，本披露提供了一种对患有白介素-13(IL-13)介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括如果(a)取自该患者的样品中的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，并且(b)该患者呈现出取自该患者的样品中的至少一种另外的生物标志的水平高于预定生物标志阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的生物标志水平，那么向该患者给予IL-13拮抗剂，其中所述另外的生物标志选自下组，该组由以下各项组成：POSTN(SEQ ID NO:8)、CSTl(SEQ ID NO:9)、CCL26(SEQ ID NO:10)、CLCAl(SEQ ID NO:11)、CST2(SEQ ID NO:12)、PRR4(SEQ ID NO:13)、SERPINB2(SEQ IDNO:14)、CEACAM5(SEQ ID NO:15)、iNOS(SEQ ID NO:16)、SERPINB4(SEQ ID NO:17)、CST4(SEQ ID NO:18)、PRB4(SEQ ID NO:19)、TPSDl(SEQ ID NO:20)、TPSGl(SEQ ID NO:21)、MFSD2(SEQ ID NO:22)、CPA3(SEQ ID NO:23)、GPR105(SEQ ID NO:24)、CDH26(SEQ ID NO:25)、GSN(SEQ ID NO:26)、C2ORF32(SEQ ID NO:27)、TRACH2000196(TMEM71)(SEQ ID NO:28)、DNAJC12(SEQ ID NO:29)、RGS13(SEQ ID NO:30)、SLC18A2(SEQ ID NO:31)、SERPINBl0(SEQ ID NO:32)、SH3RF2(SEQ ID NO:33)、FCERlB(SEQ ID NO:34)、RUNX2(SEQ ID NO:35)、PTGSl(SEQ ID NO:36)、ALOX15(SEQ ID NO:37)、及其组合。
在此处所披露的方法中的一些方面，样品获得自该患者并且提交用于测量该样品中的DPP4水平。在其他方面，该患者的DPP4水平是在免疫测定中测量的。在一些方面，该免疫测定采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4。
还提供了一种对患有IL-13介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括：(a)提交取自该患者的样品，以用于测量该样品中的DPP4水平，其中该患者的DPP4水平是在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；以及(b)如果在该样品中该患者的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。还提供了一种对患有IL-13介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括：(a)测量获得自患者的样品中的DPP4水平，该患者患有IL-13介导的疾病或障碍，其中在该样品中该患者的DPP4水平是在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；(b)确定在该样品中该患者的DPP4水平是否高于预定的DPP4阈值水平，或是否高于一种或多种对照样品中的DPP4水平；并且(c)如果该患者的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么建议医疗提供者向该患者给予IL-13拮抗剂。
在以上披露的方法中的一些方面，该IL-13介导的疾病或障碍是肺部疾病或障碍、炎性肠病或障碍、或慢性炎性皮肤病或障碍。在其他方面，该肺部疾病或障碍是哮喘或过敏性鼻炎。在一些方面，该慢性炎性皮肤病或障碍是特应性皮炎。在一些方面，该肺部疾病或障碍是COPD。在一些方面，COPD是稳定COPD或急性COPD恶化(AECOPD)。
本披露还提供了对被诊断为患有肺部疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括如果取自患者的样品中的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。在一些方面，该患者的DPP4水平在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4。
还提供了一种对诊断为患有肺部疾病或障碍、炎性肠病或障碍、或慢性炎性皮肤病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括：(a)提交取自该患者的样品，以用于测量该样品中的DPP4水平，其中该患者的DPP4水平是在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；以及(b)如果在该样品中该患者的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。
还提供了一种确定是否用IL-13拮抗剂治疗方案治疗被诊断为患有肺部疾病或障碍、炎性肠病或障碍、或慢性炎性皮肤病或障碍的患者的方法，该方法包括：(a)测量、或指导临床实验室测量样品中的DPP4水平，该样品获得自被诊断为患有肺部疾病或障碍、炎性肠病或障碍、或慢性炎性皮肤病或障碍的患者，其中该患者的DPP4水平是在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；并且(b)如果在该样品中该患者的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么用IL-13拮抗剂治疗方案对该患者进行治疗或指导医疗提供者用IL-13拮抗剂治疗方案对该患者进行治疗。
还提供了一种选择被诊断为患有肺部疾病或障碍、炎性肠病或障碍、或慢性炎性皮肤病或障碍的患者作为用IL-13拮抗剂治疗方案进行治疗的候选者的方法，该方法包括：(a)测量、或指导临床实验室测量样品中的DPP4水平，该样品获得自被诊断为患有肺部疾病或障碍、炎性肠病或障碍、或慢性炎性皮肤病或障碍的患者，其中该患者的DPP4水平是在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；并且(b)如果在该样品中该患者的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么用IL-13拮抗剂治疗方案对该患者进行治疗或指导医疗提供者用IL-13拮抗剂治疗方案对该患者进行治疗。在一些方面，该肺部疾病或障碍是哮喘、IPF、COPD(稳定COPD或AECOPD)、慢性鼻窦炎、或过敏性鼻炎。在一些方面，该哮喘是过敏性哮喘、特应性哮喘、皮质类固醇未用性哮喘(corticosteroid naiveasthma)、慢性哮喘、皮质类固醇抗性哮喘、皮质类固醇难治性哮喘、由于吸烟造成的哮喘、或皮质类固醇失控性哮喘。在一些方面，该慢性炎性皮肤病或障碍是特应性皮炎。
在以上披露的方法中的一些方面，该IL-13拮抗剂包括以下项中的一种或多种：抗IL-13抗体或其抗原结合片段、IL-13突变蛋白、IL-4突变蛋白、抗IL-13Rα1抗体或其抗原结合片段、或者抗IL-4Rα抗体或其抗原结合片段。在一些方面，在给予IL-13拮抗剂之前、过程中、或之后，该患者已经用一种或多种另外的药物进行了治疗。在一些方面，该一种或多种另外的药物包括类固醇。在其他方面，该一种或多种另外的药物进一步包括支气管扩张剂。在一些方面，该类固醇是氟替卡松或布地奈德。在一些方面，该支气管扩张剂是沙丁胺醇或沙美特罗。在其他方面，该一种或多种另外的药物是通过吸入、通过口服给药、通过注射、或通过其组合进行给予的。在一些方面，使用定量雾化吸入剂(MDI)或干粉吸入剂(DPI)来进行吸入给药。在一些方面，类固醇是以高剂量给予的。
在此处所披露的方法中的一些方面，该IL-13拮抗剂是抗-IL-13抗体、或其抗原结合片段。在一些方面，该抗体或其片段结合至与曲洛克木单抗(tralokinumab)所结合表位相同的IL-13表位，或竞争性地抑制曲洛克木单抗与IL-13的结合，或二者。在其他方面，该抗体或其片段包括曲洛克木单抗或其抗原结合片段。在一些方面，该抗体或其片段由曲洛克木单抗或其抗原结合片段组成。在一些方面，该抗体或其片段合结至与来金珠单抗(lebrikizumab)所结合表位相同的IL-13表位，或竞争性地抑制来金珠单抗与IL-13的结合，或二者。在一些方面，该抗体或其片段包括来金珠单抗或其抗原结合片段。在其他方面，该抗体或其片段由来金珠单抗或其抗原结合片段组成。
在此处所披露的方法中的一些方面，取自该患者的样品包括全血、血清、血浆、皮肤、唾液、痰、支气管肺泡灌洗液、肺上皮细胞、尿或鼻息肉中的一种或多种。在一些方面，取自该患者的样品是血清。在一些方面，此处所披露的方法进一步包括确定、提交取自该患者的样品用于确定、或指导临床实验室以确定(i)该患者的IgE水平的水平，(ii)该患者的嗜酸性粒细胞计数，(iii)该患者的氧化氮呼出率(FENO)，(iv)该患者的嗜酸性粒细胞/淋巴细胞和嗜酸性粒细胞/嗜中性粒细胞(ELEN)指数，(v)该患者的EOS指数，(vi)经肺CT扫描所测量的次级气道的壁面积％(WA％)高于约68％，或(vii)其两种或更多种的组合。在一些方面，此处所披露的方法进一步包括确定、提交取自该患者的样品用于确定、或指导临床实验室以确定人类骨膜蛋白的亚型1、2、3、或4的表达水平或活性、患者的血嗜酸性粒细胞计数、该患者的IgE水平的水平、支气管扩张剂前或后的FEV1可逆性、或其组合。
在一些方面，此处所披露的方法进一步包括确定、提交取自该患者的样品用于确定、或指导临床实验室以确定sCTLA-3(可溶性CTLA-3；又称为细胞毒性T淋巴细胞相关丝氨酸酯酶3、粒酶A、或粒酶1；Uniprot：P12544)、sCD28(可溶性CD28；又称为分化抗原簇28或Tp44；Uniprot：P10747)、CCL5(趋化因子C-C基序配体5；又称为RANTES；Uniprot：P13501)、CCL11(C-C基序趋化因子11；又称为嗜酸性粒细胞趋化性蛋白或嗜酸性粒细胞趋化因子-1；Uniprot：P51671)、CCL22(C-C基序趋化因子22；Uniprot：O00626)、或其组合的表达水平或活性。
在一些方面，此处所披露的方法进一步包括确定、提交取自该患者的样品用于确定、或指导临床实验室以确定POSTN(SEQ ID NO:8)、CSTl(SEQ ID NO:9)、CCL26(SEQ IDNO:10)、CLCAl(SEQ ID NO:11)、CST2(SEQ ID NO:12)、PRR4(SEQ ID NO:13)、SERPINB2(SEQID NO:14)、CEACAM5(SEQ ID NO:15)、iNOS(SEQ ID NO:16)、SERPINB4(SEQ ID NO:17)、CST4(SEQ ID NO:18)、PRB4(SEQ ID NO:19)、TPSDl(SEQ ID NO:20)、TPSGl(SEQ ID NO:21)、MFSD2(SEQ ID NO:22)、CPA3(SEQ ID NO:23)、GPR105(SEQ ID NO:24)、CDH26(SEQ IDNO:25)、GSN(SEQ ID NO:26)、C2ORF32(SEQ ID NO:27)、TRACH2000196(TMEM71)(SEQ IDNO:28)、DNAJC12(SEQ ID NO:29)、RGS13(SEQ ID NO:30)、SLC18A2(SEQ ID NO:31)、SERPINBl0(SEQ ID NO:32)、SH3RF2(SEQ ID NO:33)、FCERlB(SEQ ID NO:34)、RUNX2(SEQID NO:35)、PTGSl(SEQ ID NO:36)、ALOX15(SEQ ID NO:37)、及其组合的表达水平或活性。
在一些方面，该IL-13拮抗剂是以固定剂量给予的。在具体方面，曲洛克木单抗是以约300mg/剂量的固定剂量给予的。在一些方面，该IL-13拮抗剂是以两个或更多个剂量给予的。在其他方面，该IL-13拮抗剂是按周、每两周或每月给予的。在某些方面，该IL-13拮抗剂是按每两周给予的。
在一些方面，该IL-13拮抗剂经静脉内地、肌内地、皮下地、或它们的组合给予。在其他方面，如在血清中使用ELISA所测量的预定的DPP4阈值水平是至少约250ng/ml、至少约275ng/ml、至少约300ng/ml、至少约325ng/ml、至少约350ng/mL、至少约375ng/mL、至少约400ng/mL、至少约425ng/mL、至少约450ng/mL、至少约475ng/mL、至少约500ng/mL、至少约525ng/mL、至少550ng/mL、至少约575ng/mL、或至少约600ng/mL。在一些方面，该ELISA是测定。在一些方面，该预定的DPP4阈值水平是约365ng/mL。
在一些方面，该一种或多种对照样品获得自正常的健康个体；患有非IL-13介导的哮喘子集的患者；未用皮质类固醇治疗的哮喘患者；使用皮质类固醇进行了治疗的哮喘患者；预定标准量的分离的DPP4；或其组合。在一些方面，该一种或多种对照样品包括全血、血清、血浆、唾液、痰、支气管肺泡灌洗液、肺上皮细胞、尿、或其组合中的一种或多种。
在此处所披露的方法中的一些方面，给予IL-13拮抗剂导致(a)AER(急性恶化速率)降低；(b)FEV1(第一秒用力呼气容积)增加；(c)改善的ACQ-6(哮喘控制调查表，6项版)结果；(d)改善的AQLQ(哮喘生活质量调查表)结果；或(e)其组合。在一些方面，与在用安慰剂治疗的患者群体中所观察到的AER相比，AER降低至少5％、至少10％、至少15％、至少20％、至少25％、至少30％、至少35％、至少40％、或至少45％。在其他方面，与在用安慰剂治疗的患者群体中所观察到的平均AER相比，平均AER降低约28％。在一些方面，与在用安慰剂治疗的患者群体中所观察到的FEV1相比，FEV1增加至少3％、至少5％、至少7％、至少9％、至少11％、至少13％、至少15％、至少17％、或至少19％。在其他方面，与在用安慰剂治疗的患者群体中所观察到的平均FEV1相比，平均FEV1增加约10％。
附图/图简要说明
图1呈现用于鉴别肺中受IL-13调节的基因的方案。确定了筛查中鉴定的后选基因的正常和哮喘血清中的蛋白水平。正常人类支气管上皮细胞或来自EpiAirwayTM模型的人类支气管上皮细胞用IL-13刺激持续24小时，收获并裂解，并且通过全基因组阵列(WGA)和PCR对所得转录变化进行分析。
图2示出了由来自EpiAirwayTM模型的正常人类支气管上皮细胞的IL-13刺激上调的基因。所示出的是IL-13刺激之后每种基因的log2倍数变化(fc)值。发现经IL-13处理上调的多种基因，包括CCL26/嗜酸性粒细胞趋化因子-3、二肽基肽酶-4(DPP4)、胎球蛋白B(FETUB)以及骨膜蛋白(POSTN)。总RNA制备自在多层、高度分化、气液界面模型(EpiAirwayTM，玛迪克公司(Mattek Corp.))中生长的正常支气管上皮细胞，该模型不受刺激或用100ng/mL IL-13刺激持续24小时。RNA被逆转录成cDNA并且通过全基因组微阵列进行测定。
图3示出了由正常人类支气管上皮细胞的IL-13刺激上调的基因。所示出的是IL-13刺激之后每种基因的log2倍数变化(fc)值。发现经IL-13处理上调的多种基因，包括CCL26/嗜酸性粒细胞趋化因子-3、二肽基肽酶-4(DPP4)、胎球蛋白B(FETUB)以及骨膜蛋白(POSTN)。总RNA制备自在单细胞层中生长的正常支气管上皮细胞，其不受刺激或用100ng/mL IL-13刺激持续24小时。RNA被逆转录成cDNA并且通过全基因组微阵列进行测定。
图4示出了在图2和图3所呈现的IL-13刺激之后微阵列数据的qPCR构象。所示出的是平均±Sd线性倍数变化值，这些值将未受刺激的细胞/组织中的基因表达与IL-13刺激之后的基因表达相比较。通过qPCR(富鲁达(Fluidigm))分析，4种基因示出了经IL-13刺激是升高的(DPP4、POSTN、CCL26以及FETUB)。示出了与未受刺激(Unstim)的样品连同二肽基肽酶-4(DPP4)、骨膜蛋白(POSTN)、CCL26/嗜酸性粒细胞趋化因子-3、以及胎球蛋白B(FETUB)对应的结果。不受刺激或用IL-13刺激持续24小时之后，将总RNA从支气管上皮(2个供体；每个样品左侧)、正常EPIAIRWAYTM组织(3个供体；每个样品中柱)、或哮喘EPIAIRWAYTM组织(4个供体；每个样品右侧)中分离。将样品逆转录成cDNA并且预扩增。
图5显示，来自重度哮喘患者的血清中的DPP4蛋白水平是升高的。来自健康志愿者(n＝38)和被鉴定为中度(n＝13)或重度(n＝12)的哮喘患者的血清获得自商业来源。使用来自R&D系统的ELISA测量DPP4水平(ng/mL)。每个群体的中位数DPP4值用黑条形指示。在患有中度疾病的哮喘患者中观察到DPP4增加的趋势，在患有重度疾病的哮喘患者中的DPP4表达有统计学上显著的增加(*p值<0.05)。
图6显示，DPP4蛋白水平低于来自服用口服和吸入类固醇的哮喘患者的血清中的水平。来自被鉴定为服用不同药物(无药物，n＝8；仅n＝18；沙丁胺醇和吸入类固醇，n＝27；或口服和吸入类固醇，n＝40)的哮喘患者的血清获得自商业来源。使用来自R&D系统的ELISA测量DPP4水平(ng/mL)。每个群体的中位数DPP4值用黑条形指示。在所评价的患者中，中位数DPP4水平低于服用口服和吸入类固醇的患者中的水平。
图7显示曲洛克木单抗2b期研究(CD-RI-CAT-354-1049)的设计和关键问题、给药频率、进入标准以及关键主要终点及次要终点(EP)的概述。Q2W＝每2周；Q4W＝每4周；Wk＝周；SC＝皮下给药。
图8显示从基线处的支气管扩张剂前FEV1随着时间的变化(ITT群体)。与安慰剂相比在前17周的研究过程中治疗组都观察到了FEV1的相对增加。这些增加在曲洛克木单抗300mg Q2W组中直至保持至53周，但在曲洛克木单抗300mg Q2/4W组中丢失。FEV1＝第一秒用力呼气流量；ITT＝意向治疗；MMRM＝混合效应模型重复测量；SEM＝平均标准误差；CAT-354＝曲洛克木单抗。
图9呈现了森林图，其显示每年急性恶化速率降低(AERR)和53周处通过FEV1可逆性和血清骨膜蛋白水平从基线处的支气管扩张剂前的变化。图9A是森林图，其显示与安慰剂(PBO)相比对于CAT-354Q2W或CAT-354Q4W组群通过FEV1可逆性和血清骨膜蛋白水平的年％AERR中的减小百分数。图9B是森林图，其显示对于CAT-354Q2W或CAT-354Q4W组群通过FEV1可逆性和血清骨膜蛋白水平从基线处的支气管扩张剂前FEV1的变化中相比于安慰剂的差异。CAT-354＝曲洛克木单抗；FEV1＝第一秒用力呼气容积；Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周。
图10呈现了森林图，其显示53周处通过FEV1可逆性和血清骨膜蛋白水平的ACQ和AQLQ(S)。图10A是森林图，其显示对于CAT-354Q2W或CAT-354Q4W组群通过FEV1可逆性和骨膜蛋白相比于对于ACQ的安慰剂的差异。图10B是森林图，其显示对于CAT-354Q2W或CAT-354Q4W组通过FEV1可逆性和骨膜蛋白相比于对于AQLQ(S)的安慰剂的差异。ACQ-6＝哮喘控制调查表6；AQLQ(S)＝哮喘生活质量调查表-标准版；CI＝置信区间；FEV1＝第一秒用力呼气容积；ITT＝意向治疗；Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周。
图11是森林图，其显示亚组分析对于每年急性恶化速率(AER)的效果。在ITT群体中，与安慰剂相比，在曲洛克木单抗治疗组群中均未观察到主要终点、年AER的降低；然而，在接受曲洛克木单抗的患者中AER降低的趋势在多个预指定的亚组中观察到，这些亚组包括：在基线处存在FEV1可逆性对SABA≥12％、高骨膜蛋白、高嗜酸性粒细胞、以及高Th2亚组。在曲洛克木单抗治疗组群中的接受慢性OCS的亚组中均未观察到AER的降低。AERR＝哮喘恶化速率降低；CAT-354＝曲洛克木单抗；Eos＝嗜酸性粒细胞；FEV1＝第一秒用力呼气容积；ITT＝意向治疗；OCS＝口服型皮质类固醇；PBO＝安慰剂；Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周；Th2＝T辅助细胞2。
图12是森林图，其显示亚组分析对于支气管扩张剂前(pre-BD)FEV1的效果。在ITT群体中，与安慰剂相比，在曲洛克木单抗300mg Q2W组群中观察到在第53周处与基线处的支气管扩张剂前FEV1相比统计学上显著的增加。在第53周处曲洛克木单抗300mg Q2W组群中，与安慰剂相比支气管扩张剂前FEV1的增加与高和低骨膜蛋白亚组均密切匹配并且在高可逆、高嗜酸性粒细胞以及高Th2亚组中在数值上高于对应的低亚组。在曲洛克木单抗治疗组群中的接受慢性OCS的亚组中均未观察到支气管扩张剂前FEV1的增加。CAT-354＝曲洛克木单抗；Eos＝嗜酸性粒细胞；FEV1＝第一秒用力呼气容积；ITT＝意向治疗；OCS＝口服型皮质类固醇；PBO＝安慰剂；Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周；Th2＝T辅助细胞2。
图13示出了按基线血清骨膜蛋白水平计，在患者第53周哮喘恶化速率的降低以及与基线相比的支气管扩张剂前FEV1的平均百分比变化(曲洛克木单抗Q2W对比安慰剂)。图13A是按血清骨膜蛋白水平计，AER减少(95％CI)的连续表示，该图显示出该分析中使用的骨膜蛋白中位值和改变骨膜蛋白中位值(基线骨膜蛋白割点)对在第53周降低AER的作用。图13B是按血清骨膜蛋白水平计，与基线相比支气管扩张剂前FEV1的百分比变化(95％CI)的连续表示，该图显示出该分析中使用的骨膜蛋白中位值和改变骨膜蛋白中位值(基线骨膜蛋白割点)对在第53周与基线相比的支气管扩张剂前FEV1的百分比变化的作用。Q2W＝每2周；AER＝哮喘恶化速率；FEV1＝第一秒用力呼气容积；CI＝置信区间。
图14A显示与基线相比的支气管扩张剂前FEV1随着时间的百分比变化，当骨膜蛋白>＝中位值时(ITT群体)。在300mg Q2W组中观察直到第53周，观察到了FEV1的相对增加。FEV1＝第一秒用力呼气流量；ITT＝意向治疗；Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周；CAT-354＝曲洛克木单抗。
图14B显示与基线相比的支气管扩张剂前FEV1随着时间的百分比变化，当骨膜蛋白<中位值时(ITT群体)。在300mg Q2W组或Q2/4W中观察直到第53周，观察到FEV1没有显著增加。FEV1＝第一秒用力呼气流量；ITT＝意向治疗；Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周；CAT-354＝曲洛克木单抗。
图15呈现了数据，其显示在意向治疗(ITT)群体中、与安慰剂相比300mg曲洛克木单抗Q2W组在各种终点中(包括急性恶化速率降低、与基线相比FEV1的百分比变化、与基线相比ACQ-6变化、以及与基线相比AQLQ变化)DPP4(DPP4-高分类；即DPP4>＝中位值)超越了骨膜蛋白(骨膜蛋白-高分类；即骨膜蛋白水平>＝中位值)。FEV1＝第一秒用力呼气流量；ACQ-6＝哮喘控制调查表6；AQLQ(S)＝哮喘生活质量调查表-标准版；CI＝置信区间；Q2W＝每2周。
图16比较了意向治疗(ITT)群体、300mg曲洛克木单抗Q2W组中急性恶化速率降低、与基线相比FEV1的百分比变化、与基线相比ACQ-6变化、以及与基线相比AQLQ变化，根据4种类别将其分层：骨膜蛋白-高(骨膜蛋白水平>＝中位值)、骨膜蛋白-低(骨膜蛋白水平<中位值)、DPP4-高(DPP4水平>＝中位值)、以及DPP4-低(DPP4水平<中位值)。FEV1＝第一秒用力呼气流量；ACQ-6＝哮喘控制调查表6；AQLQ＝哮喘生活质量调查表；CI＝置信区间；Q2W＝每2周。
图17A-17I显示在曲洛克木单抗300mg Q2W或Q2/4W组中直到第53周对于根据DPP4分级使用者(即DPP4水平>＝中位值或DPP4水平<中位值)的不同终点与基线相比的百分比变化。Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周；CAT-354＝曲洛克木单抗；BSL＝基线；WX＝周X；FEV1＝第一秒用力呼气流量；ACQ-6＝哮喘控制调查表6；AQLQ(S)＝哮喘生活质量调查表-标准版。图17A(与基线相比的支气管扩张剂前FEV1随着时间的百分比变化并且DPP4>＝中位值)，图17B(与基线相比的支气管扩张剂前FEV1随着时间的百分比变化并且DPP4<中位值)，图17C(与基线相比的平均ACQ-6随着时间的变化并且DPP4>＝中位值)，图17D(与基线相比的平均ACQ-6随着时间的变化并且DPP4<中位值)，图17E(与基线相比的平均AQLQ(S)随着时间的变化并且DPP4>＝中位值)，图17F(与基线相比的平均AQLQ(S)随着时间的变化并且DPP4<中位值)，图17G(与基线相比的支气管扩张剂前FEV1随着时间的百分比变化，基线FEV1可逆性>＝12％并且DPP4>＝中位值)，图17H(与基线相比的平均ACQ-6随着时间的变化，基线FEV1可逆性>＝12％并且DPP4>＝中位值)，以及图17I(与基线相比的平均AQLQ(S)随着时间的变化，基线FEV1可逆性>＝12％并且DPP4>＝中位值)。与安慰剂相比，在对于DPP4>＝中位值的曲洛克木单抗300mg Q2W组群中观察到在第53周处与基线相比支气管扩张剂前FEV1的百分比变化的增加(17A)，与基线相比平均ACQ-6的变化的减少(17C)，以及与基线相比平均AQLQ(S)的变化的增加(17E)。(分别为图17A、17C、17E)。这些变化在DPP4水平<中位值组中丢失(分别为图17B、17D、17F)。类似地，与安慰剂相比，在对于对短效β2激动剂的基线FEV1可逆性>＝12％+DPP4>＝中位值组的曲洛克木单抗300mgQ2W组群中观察到在第53周处与基线相比支气管扩张剂前FEV1的百分比变化的增加(17G)，与基线相比平均ACQ-6的变化的减少(17H)，以及与基线相比平均AQLQ(S)的变化的增加(17I)。
图18是按DPP4水平计，哮喘恶化速率降低减少的连续表示，该图显示出对于与安慰剂相比用CAT-354Q2W治疗的具有基线DPP4>＝割点的受试者的哮喘恶化速率降低减少(95％CI)。显示出了该分析中使用的DPP4中位值和改变DPP4中位值(基线DPP4割点)对哮喘恶化速率降低减少的作用。Q2W＝每2周；CAT-354＝曲洛克木单抗；CI＝置信区间。
图19是对于与安慰剂相比用CAT-354Q2W治疗的具有基线DPP4>＝割点的受试者的第53周与基线相比的pre-BD FEV1的平均百分比变化(95％CI)的连续表示。显示出了该分析中使用的DPP4中位值和改变DPP4中位值(基线DPP4割点)对与基线相比的pre-BD FEV1的平均百分比变化的作用。Q2W＝每2周；CAT-354＝曲洛克木单抗；CI＝置信区间；pre-BD＝支气管扩张剂前；FEV1＝FEV1＝第一秒用力呼气流量。
图20是对于与安慰剂相比用CAT-354Q2W治疗的具有基线DPP4>＝割点的受试者的第53周与基线相比的平均ACQ-6得分的平均变化(95％CI)的连续表示。显示出了该分析中使用的DPP4中位值和改变DPP4中位值(基线DPP4割点)对与基线相比ACQ-6的平均变化的作用。Q2W＝每2周；CAT-354＝曲洛克木单抗；CI＝置信区间；ACQ-6＝哮喘控制调查表6。
图21示出了被分类为DPP4-高(血清DPP4≥中位值)；DPP4-低(血清DPP4低于中位值)；骨膜蛋白-高(血清骨膜蛋白≥中位值)；以及骨膜蛋白-低(血清骨膜蛋白低于中位值)的受试者的相对分布(不论治疗组)。在每个象限中，上面的数字对应于受试者数而下面的数字对应于总受试者的％(例如，DPP4-高、骨膜蛋白-高＝125名患者或研究受试者的27.84％)。DPP4-高和骨膜蛋白-高组之间存在部分重叠。
图22示出了被分类为DPP4-高(血清DPP4≥中位值)；DPP4-低(血清DPP4低于中位值)；Th2-高(IgE>100IU/mL并且血液嗜酸性粒细胞≥0.14×109/L)；以及Th2-低(未被分类为Th-2高的受试者)的受试者的相对分布(不论治疗组)。在每个象限中，上面的数字对应于受试者数而下面的数字对应于总受试者的％(例如，DPP4-高、Th2-高＝114名患者或研究受试者的27.67％)。DPP4-高和Th2-高组之间存在部分重叠。
图23示出了被分类为DPP4-高(血清DPP4≥中位值)；DPP4-低(血清DPP4低于中位值)；EOS-高(血液嗜酸性粒细胞计数≥300个细胞/μL)；以及EOS-低(血液嗜酸性粒细胞计数<300个细胞/μL)的受试者的相对分布(不论治疗组)。在每个象限中，上面的数字对应于受试者数而下面的数字对应于总受试者的％(例如，DPP4-高、Eos-高＝84名患者或研究受试者的19.86％)。DPP4-高和Eos-高组之间存在部分重叠。
图24显示了对于有(阳性)或没有(阴性)慢性OCS使用的受试者的平均和中值血清DPP4水平。在长期用OCS治疗的患者中平均和中值血清DPP4水平降低。OCS＝口服型皮质类固醇；N＝受试者数。
图25显示了在未长期用OCS进行治疗、具有对短效β2激动剂的基线FEV1可逆性(≥12％或<12％)和高(≥中位值)或低(<中位值)血清DPP4的受试者中与安慰剂相比，对于CAT-354的AERR、恶化速率、与基线FEV1相比的平均百分比变化、与基线相比ACQ-6的平均变化以及与基线相比AQLQ的平均变化。OCS＝口服型皮质类固醇；CAT-354＝曲洛克木单抗；BL＝基线；FEV1＝第一秒用力呼气流量；ACQ-6＝哮喘控制调查表6；AQLQ＝哮喘生活质量调查表；pbo＝安慰剂；N＝受试者数；CI＝置信区间。
图26显示了在未长期用OCS进行治疗、具有对短效β2激动剂的基线FEV1可逆性(≥12％或<12％)和高(≥中位值)或低(<中位值)血清骨膜蛋白的受试者中与安慰剂相比，对于CAT-354的AERR、恶化速率、与基线FEV1相比的平均百分比变化、与基线相比ACQ-6的平均变化以及与基线相比AQLQ的平均变化。OCS＝口服型皮质类固醇；CAT-354＝曲洛克木单抗；BL＝基线；FEV1＝第一秒用力呼气流量；ACQ-6＝哮喘控制调查表6；AQLQ＝哮喘生活质量调查表；pbo＝安慰剂；N＝受试者数；CI＝置信区间。
图27显示了分别使用两种探针，探针1555778(图A)和探针210809(图B)，使用全基因组微阵列(昂飞(Affymetrix))测量的正常皮肤和特应性皮炎(AD)皮肤中骨膜蛋白(POSTN)mRNA表达强度水平。将总RNA从正常皮肤(31个供体)或来自被诊断患有特应性皮炎的受试者(4个供体)的皮肤中分离。由总RNA产生生物素标记的扩增的cRNA，并且将其片段化用于在昂飞(Affymetrix)人类基因组U133Plus 2.0基因芯片阵列上杂交。每个群体的中值表达强度水平用黑条形指示。相比于正常皮肤，在AD皮肤样品中POSTNmRNA表达是提高的。
图28显示了分别使用两种探针，探针203717(图A)和探针203716(图B)，使用全基因组微阵列(昂飞(Affymetrix))测量的正常皮肤和特应性皮炎(AD)皮肤中DPP4mRNA表达强度水平。将总RNA从正常皮肤(31个供体)或来自被诊断患有特应性皮炎的受试者(4个供体)的皮肤中分离。由总RNA产生生物素标记的扩增的cRNA，并且将其片段化用于在昂飞(Affymetrix)人类基因组U133Plus 2.0基因芯片阵列上杂交。每个群体的中值表达强度水平用黑条形指示。相比于正常皮肤，在AD皮肤样品中DPP4mRNA表达是提高的。
图29显示了来自患者在就诊4(图A)和就诊30时(图B)的肺的代表性计算机断层摄影(CT)图像，其显示了不同的支气管的气道。
图30显示了用安慰剂或曲洛克木单抗治疗的患者中管腔面积(LA)与基线(就诊4)和就诊30相比的相对变化，如使用肺的3D计算机断层摄影成像扫描的VIDA软件所测量的。呈现了对应于RB1支气管的气道(图A)、肺段气道(图B)、以及次级气道(图C)的LA的相对变化。与安慰剂相比，在用曲洛克木单抗治疗的患者中观察到了次级气道的管腔面积的显著增加(p值＝0.021)。Tralo＝曲洛克木单抗；p＝p值。
图31显示了用安慰剂或曲洛克木单抗(Tralo)治疗的患者中支气管壁面积百分数(WA％)与基线(就诊4)和就诊30相比的相对变化，如使用肺的3D计算机断层摄影成像扫描的VIDA软件所测量的。呈现了对应于RB1支气管的气道(图A)、肺段气道(图B)、以及次级气道(图C)的WA％的相对变化。与安慰剂相比，在用曲洛克木单抗治疗的患者中观察到了次级气道的壁面积百分数(WA％)的显著减少(p值＝0.0049)。Tralo＝曲洛克木单抗；p＝p值。
图32显示了用安慰剂或曲洛克木单抗(Tralo)治疗的患者中气道阻力与基线(就诊4)和就诊30相比的相对变化，如使用肺的3D计算机断层摄影成像扫描的VIDA软件所测量的。更多细节，参见实例6。呈现了对应于RB1支气管的气道(图A)、肺段气道(图B)、以及次级气道(图C)的气道阻力的相对变化。虚线矩形指示在图33A中根据基线WA％阈值(中值WA％)重新分析的气道阻力数据集。与安慰剂相比，在用曲洛克木单抗治疗的患者中观察到了次级气道的气道阻力的显著减少(p值＝0.0081)。Tralo＝曲洛克木单抗；p＝p值。
图33显示了在用曲洛克木单抗治疗的患者中次级气道的气道阻力(图A)以及支气管扩张剂前FEV1(图B)与基线(就诊4)和就诊30相比的相对变化。与在基线处具有低于68％面积百分数(WA％)的患者相比，在基线处具有高于68％的次级气道面积百分数(WA％)的患者在气道阻力(p值＝0.0037)方面有显著下降并且在FEV1反应(p值＝0.045)方面有显著改善。Tralo＝曲洛克木单抗；p＝p值。
图34显示了来自在气液界面生长的高度分化支气管上皮细胞(EpiAirwayTM模型)的CCL-26(图A)、DPP4(图B)、骨膜蛋白POSTN-745(图C)、以及骨膜蛋白POST-815(图D)转录物的IL-13特异性上调。对应于3个正常供体的样品分别指定为正常-25、正常-21以及正常-30(每组从左往右条1-3)，并且对应于3个COPD供体的样品分别指定为COPD-15、COPD-12以及COPD-18(每组从左往右条4-6)。
图35显示了患有中度(Mod)或重度(Sev)特应性皮炎的特应性皮炎患者中的骨膜蛋白(图A)和DPP4(图B)表达水平。数据被表示为几何平均值(紧挨着中央点的数字)，95％置信区间(正负条)。每个个体患者观察显示为单独的点。水平线和相伴数代表围绕中度患者点估计的置信区间的上限和下限。
图36显示了在健康对照(n＝20名受试者)、稳定COPD(n＝101名受试者)以及急性COPD恶化(AECOPD；n＝61名受试者)中通过免疫测定所测量的骨膜蛋白的血清水平。相比于健康对照，患有COPD(稳定以及急性COPD恶化)的患者的血清骨膜蛋白水平显著升高。P＝p值；NS＝无显著差异。
图37显示了在健康对照(n＝20名受试者)、稳定COPD(n＝104名受试者)以及急性COPD恶化(AECOPD；n＝72名受试者)中通过免疫测定所测量的DPP4的血清水平。相比于健康对照，患有COPD(稳定以及急性COPD恶化)的患者的血清DPP4水平显著升高。P＝p值；NS＝无显著差异。
详细说明
本披露涉及DPP4(SEQ ID:5，膜结合形式蛋白质序列；SEQ ID NO:6，可溶性形式蛋白质序列；SEQ ID NO:7，DPP4基因cDNA序列)作为针对IL-13介导的疾病或障碍(例如，哮喘、IPF、COPD(例如，稳定COPD或急性COPD恶化)、或特应性皮炎)的生物标志物的用途。因此，本披露提供了用于诊断和治疗患有IL-13介导的疾病或障碍的受试者的方法，这些方法包括如果取自患者的样品中的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或如果DPP4水平相对于一种或多种对照样品中的DPP4水平是提高的，那么向该患者给予IL-13拮抗剂(例如，抗-IL-13抗体)。具体而言，可以将DPP4生物标志物的水平高于或低于预定的DPP4阈值水平的存在用于，例如，(i)确定患有IL-13介导的疾病或障碍的患者是否适宜于用IL-13拮抗剂(例如，如曲洛克木单抗的抗体)进行特异性治疗，(ii)确定使用IL-13拮抗剂对IL-13介导的疾病或障碍的特异性治疗是否应该开始、暂停或修改，(iii)诊断IL-13介导的疾病或障碍是否可以用特异的IL-13拮抗剂进行治疗，(iv)预测用特异的IL-13拮抗剂治疗IL-13介导的疾病或障碍的结果等。
在一些方面，可以将获得自患有IL-13介导的肺部疾病或障碍(例如，哮喘、IPF或COPD)或IL-13介导的慢性炎性皮肤病或障碍(例如，特应性皮炎)的患者的样品(例如，血清或皮肤)中的DPP4水平高于或低于预定的DPP4阈值水平的存在用于，例如，(i)确定该患者是否适宜于用特异的治疗剂进行治疗，(ii)确定特异性治疗是否应该开始、暂停或修改，(iii)诊断疾病或障碍是否可以用特异的治疗剂进行治疗，(iv)预测用特异的治疗剂治疗疾病或障碍(例如，哮喘、IPF、COPD或特应性皮炎)的结果等。
在一些方面，可以将获得自患有IL-13介导的疾病或障碍(例如，哮喘、IPF或COPD)或IL-13介导的慢性炎性皮肤病或障碍(例如，特应性皮炎)的患者的样品(例如，血清或皮肤)中的DPP4水平高于或低于预定的DPP4阈值水平的存在与(i)高骨膜蛋白(≥血清骨膜蛋白中值或约23ng/mL)、(ii)高嗜酸性粒细胞直接计数(血液嗜酸性粒细胞计数≥300个细胞/μL)、(iii)高Th2(高Th2定义为IgE>100IU/mL并且血液嗜酸性粒细胞≥0.14×109/L)、(iv)对短效β2激动剂的FEV1可逆性≥12％、(v)经肺CT扫描所测量的次级气道的壁面积％(WA％)高于约68％、或(vi)及其组合中的一种或多种组合用于，例如，(i)确定患有IL-13介导的疾病或障碍的患者是否适宜于用IL-13拮抗剂(例如，如曲洛克木单抗或来金珠单抗的抗体)进行特异性治疗，(ii)确定特异性治疗是否应该开始、暂停或修改，(iii)诊断疾病或障碍是否可以用特异的治疗剂进行治疗，(iv)预测用特异的治疗剂治疗疾病或障碍(例如，哮喘、IPF、COPD或特应性皮炎)的结果等。
为了使本披露可更容易理解，首先定义某些术语。另外的定义贯穿详细说明而阐述。
I.定义
在本说明书和随附权利要求书中，除非上下文另外明确说明，否则单数形式“一个/种”和“该”包括复数参考对象。术语“一个”(或“一种”)，以及术语“一个或多个/一种或多种”和“至少一个”在此可以互换地使用。
此外，在本文中使用“和/或”应当理解为在有或没有另一者的情况下，两个指定的特征或组分中的每一者的特定披露。因此，如在此在措词如“A和/或B”中所使用的术语“和/或”旨在包括“A和B”、“A或B”、“A”(单独)、以及“B”(单独)。同样，如在词组如“A、B和/或C”中使用的术语“和/或”旨在包括以下方面：A、B以及C；A、B或C；A或C；A或B；B或C；A和C；A和B；B和C；A(单独)；B(单独)；以及C(单独)。
当用语言“包含”来说明方面时，还提供了关于“由……组成”和/或“主要由……组成”描述的其他类似方面。
在说明书和随附权利要求书通篇中与数值结合使用的术语“约”表示本领域技术人员熟知并可接受的精确度的区间。一般，这种精确度的区间是±15％。
除非另外定义，在此所使用的所有技术和科学术语具有与本披露涉及的领域所属的技术人员通常所理解的相同的意义。例如，生物医学与分子生物学简明词典(theConcise Dictionary of Biomedicine and Molecular Biology)，乔培秀(Juo，Pei-Show)，第二版，2002，CRC出版社；细胞与分子生物学词典(The Dictionary of Cell andMolecular Biology)，第三版，1999，学术出版社(Academic Press)；以及生物化学与分子生物学牛津词典(the Oxford Dictionary Of Biochemistry And Molecular Biology)，修订版，2000，牛津大学出版社(Oxford University Press)为技术人员提供在本披露中使用的许多术语的常用词典。
单位、前缀和符号均以它们的国际单位系统(SI)接受形式表示。数值范围包括定义该范围的数字。除非另外指明，否则氨基酸序列以氨基到羧基的方向从左到右书写。在此提供的小标题不是本披露的不同方面或方面的限制，可以通过作为一个整体参考本说明书来获得这些方面。因此，通过以其全文参考说明书，更完全地定义了就在以下定义的术语。
如在此使用的术语“抗体”(或其片段、变体、或衍生物)是指能够结合至抗原的抗体的至少最小部分，例如，在由B细胞产生的典型抗体的情况下，至少重链(VH)的可变结构域和轻链(VL)的可变结构域。脊椎动物系统中的基础抗体结构相对较好理解。参见，例如，哈洛(Harlow)等人，抗体：实验室手册(Antibodies:A Laboratory Manual)(冷泉港实验室出版社(Cold Spring Harbor Laboratory Press)，第2版，1988)。
抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物，包括但不限于多克隆抗体、单克隆抗体、人类抗体、人源化抗体或嵌合抗体、单链抗体、表位结合片段，例如Fab、Fab'和F(ab')2、Fd、Fvs、单链Fvs(scFv)、单链抗体、二硫化物连接的Fvs(sdFv)、包括VL或VH域的片段、由Fab表达文库产生的片段。ScFv分子在本领域中是已知的并且描述于例如美国专利5,892,019之中。本披露涵盖的免疫球蛋白或抗体分子可以是免疫球蛋白分子的任何类型(例如IgG、IgE、IgM、IgD、IgA、以及IgY)、类别(例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、以及IgA2)或子类。
“特异性结合”一般是指抗体或其片段、变体或衍生物经由其抗原结合结构域来结合至表位，并且这种结合需要抗原结合结构域与表位之间有某种互补性。根据此定义，当与抗体将结合至随机、不相关的表位相比，该抗体更容易经由其抗原结合结构域来结合至表位时，该抗体被认为是“特异性地结合”至该表位。
抗体或其片段、变体或衍生物被认为竞争性地抑制参考抗体或抗原结合片段与给定表位的结合，如果它优先结合至所述表位至它在某种程度上阻断参考抗体或抗原结合片段与该表位的结合的程度的话。竞争性地抑制可以通过在本领域中已知的任何方法、例如竞争ELISA测定来确定。结合分子可被认为是竞争性地抑制参考抗体或抗原结合片段与给定表位的结合达至少90％、至少80％、至少70％、至少60％、或至少50％。
在此披露的抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物可以在抗原的一个或多个表位或一个或多个部分(例如它们识别或特异性结合的靶标多糖)方面来描述或规定。例如，与抗-DPP4抗体的抗原结合结构域特异性相互作用的人类DPP4的部分是“表位”。
如在此使用的术语“IL-13介导的疾病或障碍”是指由患有障碍的受试者中异常的IL-13水平引起的(单独或与其他介导物相关联的)、恶化的、相关的、或延长的任何病变。IL-13介导的疾病或障碍的非限制性实例包括哮喘、特发性肺纤维化(IPF)、慢性阻塞性肺病(COPD)、溃疡性结肠炎(UC)、过敏性鼻炎、慢性鼻窦炎、以及特应性皮炎。
如在此使用的术语“肺部疾病或障碍”是指至少部分影响肺或呼吸系统的任何病变。非限制性实例包括哮喘、IPF、COPD、过敏性鼻炎、或慢性鼻窦炎。在某些方面，该肺部疾病或障碍是IL-13介导的。
如在此使用的术语“慢性炎性皮肤病或障碍”是指至少部分影响皮肤的任何病变。非限制性实例包括特应性皮炎、皮肤纤维化、过敏性接触性皮炎、湿疹、或银屑病。在某些方面，慢性炎性皮肤病或障碍是IL-13介导的。
术语“哮喘”是指表现为可逆的气流阻塞和/或支气管高反应性的疾病，其可能与潜在的炎症相关或不相关。哮喘的实例包括过敏性哮喘、特应性哮喘、皮质类固醇未用性哮喘、慢性哮喘、皮质类固醇抗性哮喘、皮质类固醇难治性哮喘、由于吸烟造成的哮喘、皮质类固醇失控性哮喘以及其他提到的哮喘，例如，在国家哮喘教育和预防项目专家组报告3：用于诊断和管理哮喘的指南(Expert Panel Report 3:Guidelines for the Diagnosis andManagement of Asthma,National Asthma Education and Prevention Program)(2007)(“NAEPP指南”)，该文件通过引用以其全文结合在此。
如在此使用的术语“COPD”是指慢性阻塞性肺病。术语“COPD”包括两种主要病症：气肿病和慢性阻塞性支气管炎。因此，在最广泛意义上，如在此使用的术语COPD是指COPD本身并且还有其子病症慢性支气管炎和肺气肿。慢性阻塞性肺疾病全球倡议(GOLD)已分类出4个不同阶段的COPD。GOLD分类COPD阶段0：处于COPD的风险中。可存在慢性咳嗽和痰液产生的症状，但患者具有正常的肺呼吸量测定法读数。阶段I：轻度COPD。表征为FEV1>＝80％，FEV1/FVC<70％。患者可具有或可不具有慢性咳嗽和增加的痰液产生。阶段II：中度COPD。表征为气流恶化(30％>＝FEV1>80％)。患有阶段II疾病的患者通常是有症状的，寻求医疗看护，并且患有活动性呼吸短促。阶段II具有2个亚类：IIA和IIB。IIA患者具有50％和80％之间的FEV1；阶段IIB患者具有30％和50％之间的FEV1。具有对于50％的FEV1的患者尤其易于疾病的急性加重。阶段III：严重COPD。表征为FEV1低于30％。如果患者患有呼吸衰竭和右心衰竭，那么他们同样被包括在阶段III中。这些患者的生命质量受到了严重影响。该患者群体的急性加重通常需要住院治疗并且时常是危及生命的。
如在此使用的，短语“早期阶段”COPD旨在指GOLD阶段0或其前体病症。
在一些方面，COPD是稳定的COPD。在其他方面，COPD是指COPD恶化。如在此使用的术语“恶化”是指COPD的症状相对于患者的基础状况恶化。在某些实施例中，COPD恶化可以被定义为疾病自然进程中的事件，其特征在于患者的基线肺功能、呼吸困难、咳嗽、和/或痰发生变化，该变化其超过正常的每日变化，这在发作时是急性的并且可保证在患有潜在COPD的患者中变化药物。在某些实施例中，COPD恶化可以是呼吸短促和/或喘息症状的突然增加，和/或脓性痰产生的增加。
术语“特发性肺纤维化”(IPF)是指一种以肺部的渐进性瘢痕形成或纤维化为表征的疾病。它是间质性肺病的一种特定类型，其中肺泡逐渐被纤维组织代替。在IPF的情况下，渐进性瘢痕形成引起正常薄的以及可弯曲的组织增厚并变硬，使得肺部更难扩展，阻止氧轻易进入血流。参见，例如，美国呼吸和重症监护医学杂志(Am.J.Respir.Crit.CareMed.)，2000.161:646-664。
如在此使用的术语“特应性皮炎”是指慢性炎性、复发、非传染性并且痒的皮肤病，其通常与其他特应性障碍(如过敏性鼻炎和哮喘)相关联(比伯(Bieber)，新英格兰医学杂志(New England Journal of Medicine)，2008,358:1483-1494)。术语“特应性皮炎”相当于“神经性皮炎”、“异位性湿疹”或“内源性湿疹”。根据本披露的特应性皮炎的具体形式(由它们发生的位置或它们的外观或引起它们的应激因素而得名)也被术语“特应性皮炎”所包括。这些包括但不限于屈侧性湿疹(eczema flexurarum)、马鲁斯图姆湿疹(eczemamulluscatum)、维茹斯图姆湿疹(eczema verrucatum)、痘性湿疹(eczema vaccinatum)、迪斯卡德斯湿疹(eczema dyskoides)、迪赛多提克湿疹(dyshydrotic eczema)、微生物性湿疹(microbial eczema)、钱币状湿疹(nummular eczema)、脂溢性湿疹(seborrhobiceczema)及其他形式的湿疹；口周皮炎以及眶周皮炎。如在此使用的术语“特应性皮炎”还包括经常发生的细菌继发性感染(如由于例如金黄色葡萄球菌感染引起的那些)、化脓性皮肤病(如接触传染性脓疱病及其衍生物连同毛囊须疮)或病毒性继发性感染。IL-13涉及到疾病的发病机理中并且是重要的体内诱导物。参见，例如，Oh等人，免疫学杂志(J Immunol.)186:7232-42(2011)；田泽(Tazawa)等人，皮肤病学研究档案(Arch.Dermatol.Res.)，295:459-464(2004)；迈特沃利(Metwally)等人，埃及免疫学杂志(Egypt J.Immunol.)11:171-7(2004)。
如在此使用的术语“治疗(treat、treatment、或treatment of)”，(例如，在短语“对患有IL-13介导的疾病或障碍的患者进行治疗”中)是指减少IL-13介导的疾病或障碍的可能性、减少IL-13介导的疾病或障碍的发生、和/或减轻IL-13介导的疾病或障碍的严重性，优选地，至受试者不再受到由其造成的不适和/或改变的功能的程度(例如，当与未治疗的患者相比时，哮喘恶化的相对减少)。例如，治疗可以是指，当向受试者给予时，疗法防止IL-13介导的疾病或障碍发生和/或治疗或减轻IL-13介导的疾病症状、体征、或病因的能力。治疗还指缓和或减少至少一种临床症状和/或抑制或延迟病症的进展和/或预防或延迟疾病或疾患的发作。因此，术语“治疗(treat、treatment、或treatment of)”(或语法上等同的术语)是指预防以及治疗性处理方案。
本披露提供了方法和系统，这些方法和系统在IL-13介导的疾病或障碍的治疗中提供了治疗益处。治疗益处不一定是针对具体IL-13介导的疾病或障碍的痊愈，而是涵盖了最典型包括以下项的结果：缓解IL-13介导的疾病或障碍或增加的存活，消除IL-13介导的疾病或障碍，减少与IL-13介导的疾病或障碍相关的症状，预防或缓解继发性疾病、障碍或病症(其是由原发性IL-13介导的疾病或障碍的发生造成的)，和/或预防IL-13介导的疾病或障碍。
如在此使用的术语“受试者”或“患者”是指针对希望诊断、预测、或治疗IL-13介导的疾病或障碍的任何受试者，具体的是哺乳动物受试者。如在此使用的术语“受试者”或“患者”包括任何人类或非人类动物。术语“非人类动物”包括所有脊椎动物，例如哺乳动物及非哺乳动物，例如非人灵长类动物、绵羊、犬、猫、马、牛、熊、鸡、两栖动物、爬行动物等等。如在此使用的短语如“患有IL-13介导的疾病或障碍的患者”包括受试者，如哺乳动物受试者，这些受试者会从给予治疗、成像或其他诊断程序中受益，和/或预防性治疗IL-13介导的疾病或障碍。在本披露的一些方面，受试者是一名初试受试者。初试受试者是还没有给予治疗例如治疗剂的受试者。在一些方面，初试受试者在诊断为患有IL-13介导的疾病或障碍(例如，哮喘、IFP、COPD、UC、或特应性皮炎)之前，没有用治疗剂进行治疗。在其他方面，受试者在诊断为患有IL-13介导的疾病或障碍之前，已经接受了治疗和/或一个或多个剂量的治疗剂(例如，能够调节与以下相关的炎性反应的治疗剂：IL-13介导的疾病或障碍、肺部疾病或障碍、炎性肠道疾病或障碍、或慢性炎性皮肤病或障碍)。在一方面，治疗剂是一种小分子药物。在一个特定方面，该药剂是皮质类固醇。在另一方面，该药剂可以是白三烯调节剂如孟鲁司特、扎鲁司特或齐留通。在另一方面，该治疗剂可以是甲基黄嘌呤(例如，茶碱)或克米罗(例如，色甘酸钠(sodium cromolyn)和奈多罗米)。在另一方面，该治疗剂可以是长效β-2激动剂如沙美特罗、福莫特罗、或茚达特罗。在又一方面，该药剂可以是氨甲蝶呤或环孢素。
在某些方面，该治疗剂可以是用于预防、治疗、管理、或缓解哮喘或COPD的药剂。针对哮喘或COPD的疗法的非限制性实例包括抗胆碱能药物(例如，异丙托溴铵和氧托溴铵)，β-2拮抗剂(例如，沙丁胺醇(或)，比托特罗非诺特罗、福莫特罗、异他林、间羟异丙肾上腺素、吡布特罗(pibuterol)沙丁胺醇、沙丁胺醇特布他林、以及沙美特罗、特布他林(terbutlaine))，皮质类固醇(例如，泼尼松、倍氯米松二丙酸酯(或)、曲安奈德氟尼缩松和丙酸氟替卡松)，白三烯拮抗剂(例如，孟鲁司特、扎鲁司特、和齐留通)，茶碱( 片剂、以及Gyrocaps)，以及沙美特罗色甘酸，以及奈多罗米(和))，IgE拮抗剂，IL-4拮抗剂(包括抗体)，IL-5拮抗剂(包括抗体)，PDE4抑制剂，NF-κ-B抑制剂，IL-13拮抗剂(包括抗体)，CpG，CD23拮抗剂，选择拮抗剂(例如，TBC 1269)，肥大细胞蛋白酶抑制剂(例如，类胰蛋白酶激酶抑制剂(例如，GW-45，GW-58，和染料木碱)，磷脂酰肌醇-3’(PI3)-激酶抑制剂(例如，卡弗他丁C)，以及其他激酶抑制剂(例如，星孢素)，C2a受体拮抗剂(包括抗体)，以及支持性呼吸疗法，如补充和机械通风。
在一些方面，受试者已经接受了至少一种治疗有效剂量的口服或吸入的皮质类固醇。在一些方面，受试者已经接受了多个治疗有效剂量的口服或吸入的皮质类固醇。在一些方面，受试者是长期口服型皮质类固醇(OCS)使用者。
在某些方面，该受试者已经接受了长效β2-肾上腺素能激动剂，例如，沙美特罗昔萘酸酯。在一些方面，该受试者已经接受了合成的糖皮质激素，例如，丙酸氟替卡松。在某些方面，该受试者已经接受了沙美特罗昔萘酸酯和丙酸氟替卡松在某些方面，该受试者已经接受了β2-肾上腺素能支气管扩张剂，例如，硫酸沙丁胺醇。
在一方面，根据在此披露的方法使用的治疗剂是一种抗体，例如，抗IL-13抗体或其抗原结合片段。因此，在一些方面，受试者已经接受了或是有待接受至少一种治疗有效剂量的抗体(例如，抗IL-13抗体或其抗原结合片段)的候选者，该抗体能够中和IL-13介导的病变。在一些方面，该抗IL-13抗体是曲洛克木单抗(SEQ ID NO:3和4)或其抗原结合片段。参见美国专利7,829,090，通过引用以其全文结合在此。其他可以使用的抗IL-13单克隆抗体包括于2012年3月1日公开的美国专利申请公开号2012-0052060中所描述的那些。其他IL-13拮抗剂包括但不限于：(a)抗人类IL-13抗体，例如，来金珠单抗(MILR1444A/RG3637，罗氏(Roche)/基因泰克公司(Genentech))(SEQ ID NOS:1以及2)或其抗原结合片段、ABT-308(阿伯特公司(Abbott))、GSK679586(葛兰素史克公司(GlaxoSmithkline))、或QAX576(诺华公司(Novartis))；(b)抗人类IL-13Rαl抗体，例如，默克公司(Merck)MK6105；(c)IL-13毒素轭合物如IL-13-PE38QQR(NeoPharm公司)；(d)IL-4突变蛋白AerovantTM(Aerovance公司)；(e)抗IL-4Rα抗体如dupilumab/REGN668(瑞泽恩公司)；(f)针对IL-4Rα如AIR645(Isis)的双链寡核苷酸；或(g)IL-4/IL-13双特异性抗体如GSK2434735(葛兰素史克(GlaxoSmithKline))。在一些方面，如果受试者的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或如果DPP4水平相对于一种或多种对照样品中的DPP4水平是提高的，那么可以给予该受试者此处所披露的至少一种治疗有效剂量的抗IL-13抗体或其抗原结合片段。在其他方面，如果受试者的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或如果DPP4水平相对于一种或多种对照样品中的DPP4水平是提高的，那么可以将该受试者视为适宜接受此处所披露的至少一种治疗有效剂量的抗IL-13抗体或其抗原结合片段。
如在此使用的术语“IL-13拮抗剂”是指任何药剂，该药剂可以在患有IL-13介导的疾病或障碍的受试者中影响体外或体内IL-13的表达、活性、或半衰期，或者由IL-13引起的或恶化的症状、病变、或后遗症，例如哮喘。IL-13拮抗剂可以是任何如在此所定义的“治疗剂”，该治疗剂可以直接或间接地抑制、减少、或中和IL-13活性，抑制或减少IL-13表达，减少IL-13半衰期，或者可以预防由于IL-13造成的症状的恶化。在某些方面，IL-13拮抗剂是抗IL-13单克隆抗体，例如，曲洛克木单抗，或例如在2012年3月1日公开的美国专利申请公开号2012-0052060中所描述的其他抗IL-13单克隆抗体。
如在此使用的术语“疗法”包括用于治愈、缓和、或预防IL-13介导的疾病或障碍的任何手段，这些手段包括例如治疗剂、仪器装备、支持措施、以及外科手术或康复过程。在此方面，术语疗法涵盖了任何可以用来预防、管理、治疗、和/或缓解IL-13介导的疾病或障碍的方案、方法和/或治疗或诊断。
如在此使用的术语“治疗剂”是指任何治疗活性物质，将该治疗活性物质给予至患有IL-13介导的疾病或障碍的受试者以产生所希望的、通常有益的作用。术语治疗剂包括例如通常称为小分子药物和生物制剂的典型低分子量治疗剂，其包括但不限于：抗体或其活性片段、肽、脂质、蛋白质药物、蛋白轭合物药物、酶、寡核苷酸、核酶、遗传物质、朊病毒、病毒、细菌、以及真核细胞。一种治疗剂还可以是前药，当给予受试者时，该前药代谢成所希望的治疗活性物质。在一些方面，该治疗剂是一种预防剂。此外，可以按药学方式配制治疗剂。治疗剂还可以是放射性同位素或药剂，其通过一些其他形式的能量(如光或超声能量)、或通过其他全身给予的循环分子来活化。
如在此使用的“治疗有效”量是治疗剂的量，该量向患有IL-13介导的疾病或障碍(例如，IL-13介导的肺部疾病或障碍(如哮喘、IPF或COPD)；或慢性炎性皮肤病或障碍(如特应性皮炎))提供了一些改进或益处。因此，“治疗有效”量是提供IL-13介导的疾病或障碍(例如，IL-13介导的肺部疾病或障碍(如哮喘、IPF或COPD)；或慢性炎性皮肤病或障碍(如特应性皮炎))的至少一种临床症状的一些缓解、缓和、和/或减少的量。与IL-13介导的疾病或障碍(例如，IL-13介导的肺部疾病或障碍(如哮喘、IPF或COPD)；或慢性炎性皮肤病或障碍(如特应性皮炎))相关的临床症状，可以通过本披露的方法和系统进行治疗，这些临床症状对本领域技术人员是熟知的。此外，本领技术人员将理解治疗效果不需要是完全的或治愈的，只要向受试者提供一些益处。在一些方面，该术语“治疗有效”是指治疗剂的能够在对其有需要的患者中降低IL-13活性的量。
如在此使用的“足够的量”或“量足以”在患有IL-13介导的疾病或障碍的患者中实现具体结果，是指治疗剂(例如，抗体(如曲洛克木单抗))的有效产生所希望的作用的量，该所希望的作用可任选地是治疗有效的(即，通过给予治疗有效量)。在一些方面，这种具体结果在有需要的患者中是IL-13活性的降低。
如在此使用的术语“样品”包括任何生物学流体或组织，如从受试者获得的全血、血清、肌肉、唾液、或皮肤。样品包括任何生物学流体或组织，如全血、血清、肌肉、唾液、尿、滑液、骨髓、脑脊液、鼻腔分泌物、痰、羊水、支气管肺泡灌洗液、肺组织、外周血单核细胞、白细胞总数、淋巴结细胞、脾细胞、扁桃体细胞、或皮肤。在一些具体方面，该样品是血液或其部分、肌肉、皮肤、或其组合。可以通过任何本领域已知的手段来获得样品。在一些方面，样品是患者器官或组织(包括但不限于肺)的计算机体层摄影(CT)扫描。在一些方面，可以通过从多个受试者中取出生物样品并且将它们聚池或将每个受试者的生物样品的整分试样聚池而获得样品。可以将聚池的样品作为来自单个受试者的样品进行处理。术语样品还包括所有前述的实验分离的部分。例如，可以将血样分级成血清或包含具体类型的细胞的级分。在一些方面，样品可以是来自个体的样品的组合，如组织和体液样品的组合。
为了应用本披露的方法和系统，可以在给予疗法来治疗IL-13介导的疾病或障碍之前或之后获得来自患者的样品。在一些情况下，在疗法开始后或在疗法停止后，从患者获得连续样品。例如，样品可由医疗提供者(例如，医生)或医疗福利提供者所请求的，通过相同的或不同的医疗提供者(例如，护士、医院)或临床实验室获得和/或处理，并且在处理后，结果可以转发到最初的医疗提供者或又另一个医疗提供者、医疗福利提供者或患者。类似地，测量/确定一个或多个得分，在分数之间比较，评估得分以及治疗决策可以由一个或多个医疗提供者、医疗福利提供者、和/或临床实验室进行。
如在此使用的术语“医疗提供者”是指直接交互或管理活体受试者(例如，人类患者)的个体或机构。医疗提供者的非限制性实例包括医生、护士、技术员、临床医学家、药剂师、顾问、替代医学执业医生、医疗设施、医生办公室、医院、急诊室、诊所、急诊中心、替代医学诊所/设施、以及任何其他实体，这些任何其他实体提供与所有、或任何部分的患者健康状态相关的通用和/或专门的治疗、评估、维持、疗法、药物、和/或建议，其包括但不限于：全科医疗、专门医疗、外科手术、和/或任何其他类型的治疗、评估、维持、疗法、药物、和/或建议。
如在此使用的，术语“临床实验室”是指用于检验或处理源自活体受试者(例如，人类)的材料的设施。处理的非限制性实例包括对源自人体的材料进行的生物学的、生物化学的、血清学的、化学的、免疫血液学的、血液学的、生物物理学的、细胞学的、病理学的、遗传学的、或其他检查，这些检查是出于提供关于例如诊断、预防、或治疗活体受试者(例如，人类)任何疾病或损伤的信息或者评估活体受试者(例如，人类)的健康的目的。这些检测还可包括收集或以其他方式获得样品、制备、确定、测量的程序，或以其他方式描述在活体受试者(例如，人类)的体内或获得自活体受试者(例如，人类)身体的样品中的各种物质的存在或不存在。
如在此使用的术语“医疗福利提供者”涵盖个体(individual parties)、组织、或集团，其提供、提出、供给、偿还(全部或部分)，或者以其他方式相关地给患者提供一种或多种医疗福利、福利计划、健康保险、和/或医疗报销程序的途径。
在一些方面，医疗提供者可以给予或指导另一个医疗提供者给予疗法来治疗IL-13介导疾病或障碍。医疗提供者可以实现或指导另一个医疗提供者或患者进行以下行为：获得样品，处理样品，提交样品，接收样品，转移样品，分析或测量样品，量化样品，提供分析/测量/量化样品后所获得的结果，接收分析/测量/量化样品后所获得的结果，对分析/测量/量化一种或多种样品后所获得的结果进行比较/评分，提供来自一种或多种样品的比较/评分，获得来自一种或多种样品的比较/评分，给予疗法(例如，一种治疗剂，该治疗剂治疗IL-13介导的疾病或障碍如哮喘、IPF、COPD、溃疡性结肠炎、或特应性皮炎)，开始疗法的给予，停止疗法的给予，继续疗法的给予，暂时中断疗法的给予，增加所给予的治疗剂的量，降低所给予的治疗剂的量，继续给予一定量的治疗剂，增加给予治疗剂的频率，降低给予治疗剂的频率，维持治疗剂的相同给药频率，以至少另一种疗法或治疗剂代替疗法或治疗剂，将疗法或治疗剂与至少另一种疗法或另外的治疗剂组合。
在一些方面，医疗福利提供者可以授权或否定，例如，收集样品，处理样品，提交样品，接收样品，转移样品，分析或测量样品，量化样品，提供分析/测量/量化样品后所获得的结果，转移分析/测量/量化样品后所获得的结果，对分析/测量/量化一种或多种样品后所获得的结果进行比较/评分，转移来自一种或多种样品的比较/评分，给予疗法或治疗剂，开始给予疗法或治疗剂，停止给予疗法或治疗剂，继续给予疗法或治疗剂，暂时中断给予疗法或治疗剂，增加所给予的治疗剂的量，降低所给予的治疗剂的量，继续给予一定量的治疗剂，增加治疗剂给予的频率，减少治疗剂给予的频率，维持治疗剂相同的给药频率，以至少另一种疗法或治疗剂代替疗法或治疗剂，或将疗法或治疗剂与至少另一种疗法或另外的治疗剂组合。
此外，医疗福利提供者可以例如授权或否定疗法的处方，授权或否定疗法的覆盖性，授权或否定疗法费用的报销，确定或否定疗法的合格性。
在一些方面，临床实验室可以例如收集或获得样品，处理样品，提交样品，接收样品，转移样品，分析或测量样品，量化样品，提供分析/测量/量化样品后所获得的结果，接收分析/测量/量化样品后所获得的结果，对分析/测量/量化一种或多种样品后所获得的结果进行比较/评分，提供来自一种或多种样品的比较/评分，获得来自一种或多种样品的比较/评分，或其他相关活性。
如在此使用的术语“计算机体层摄影”或“CT”是指使用扫描的器官、组织或对象的特定区域的体层摄影术图像(虚拟‘切片’)的成像方法。将数字几何处理用于将一系列围绕单个转动轴拍摄的二维(2D)放射摄影影像生成对象该器官的内部的三维(3D)图像。
如在此使用的术语“计算机体层摄影扫描”或“CT扫描”是指使用任何适合的方法获得体层摄影术图像的生成，这些方法包括但不限于X射线、多层计算机体层摄影(MDCT)、高分辨率计算机体层摄影(HRCT)、正电子发射断层摄影(PET)、正电子发射断层摄影计算机体层摄影(PET-CT)、单光子发射计算机体层摄影(SPECT)、磁共振成象(MRI)、计算机轴向断层摄影(CAT扫描)、计算机辅助断层摄影术、氙通气计算机体层摄影、以及超极化气体肺MRI通气显像。
II.DPP4作为生物标志物
如在此使用的术语“DPP4”是指由DPP4基因编码的二肽基肽酶IV蛋白(EC3.4.14.5；Uniprot：P27487)。DPP4又称为DPP-IV、腺苷脱氨酶复合蛋白2、或CD26(分化抗原簇26)。DPP4与吸引素(attractin)、FAP、DPP8以及DPP9有关。DPP4是高度保守的多功能类型II跨膜糖蛋白，其存在于循环(血浆)中以及若干细胞类型(包括上皮、内皮及淋巴样细胞)的表面上。DPP4是在T细胞共刺激、趋化因子生物学、II型糖尿病、以及肿瘤生物学中涉及的丝氨酸蛋白酶家族的一部分(钟(Zhong)等人，动脉硬化(Atherosclerosis)2013；226:305-314)。DPP4的内源底物包括种类繁多的含脯氨酸的肽，如生长因子、趋化因子、神经肽以及血管活性肽(戈雷尔(Gorrell),M.,临床科学(Clin.Sci.)108,277-292,2005；麦金托什(McIntosh),C.H.S.,等人，国际生物化学与细胞生物学杂志(Int.J.Biochem.Cell Biol.)38,860-872,2006)。DPP4在炎性呼吸道疾病样哮喘中的作用由吉奥瓦尼尼-沙米(Giovannini-Chami)(吉奥瓦尼尼-沙米等人，欧洲呼吸杂志(European RespiratoryJournal.)2012年5月；39(5):1197-205)提出，其发现在患有尘螨过敏性鼻炎的儿童的鼻腔上皮中升高的DPP4转录物(及其他Th2签名基因)与不受控哮喘相关联。术语DPP4还包括其片段、变体(例如，本领域中已知的K1R、V7I、S437I、T557I、D663E变体)、以及衍生物(例如，DPP4蛋白的糖基化或未糖基化蛋白形式、或以其他方式蛋白的化学修饰形式)。在一些方面，术语DPP4是指DPP4基因，其包括基因组DNA、cDNA、mRNA以及其片段。在一些方面，术语DPP4还指能够在严格条件下与DPP4基因特异性杂交的寡核苷酸。在一些方面，寡核苷酸包括不同于A、T、C、G、或U的核碱基，例如通用碱基。
例如，如在“DPP4水平”中的术语“水平”是指使用任何用于检测DPP4(蛋白质表达或基因表达)在生物样品中存在或表达的分析方法所做出的并且指示该生物样品中对应于DPP4的、对于DPP4的、或DPP4的存在、缺失、绝对量或浓度、相对量或浓度、滴定度、表达水平、测量水平的比率或诸如此类的测量。“值”或“水平”的确切性质取决于用于检测DPP4的特定分析方法的具体设计和组分(例如，免疫测定、质谱法、体内分子成像、基因表达谱、基于适体的测定等)。参见，例如，U.S.2010/00221752。
参考DPP4，在此使用的术语“升高的DPP4”、“高DPP4”、“升高的DPP4水平”、或“高DPP4水平”是指生物样品(例如，血清)中的水平高于正常水平或范围。根据标准规程来限定对于DPP4的正常水平或范围。因此，在特定生物样品中测量的水平可以与相似正常样本中确定的水平或水平的范围相比较。在此背景下，正常样本是获得自没有可检出的IL-13介导的疾病症状的个体的样品。其中DPP4在测试样品中以高于正常样本中的水平或范围存在，则DPP4的水平被称为升高的。
可以使用任何可包含可溶性DPP4的样品、以及包含DPP4的膜结合形式、其细胞内、跨膜、或细胞外部分、或其任何肽部分的样品进行此处所披露的方法。便利的样品包含例如血、血细胞、血清、血浆、尿等。在一些方面，必要时可以将该样品通过在适当的缓冲溶液中稀释进行预处理或浓缩。可以在生理学pH下使用多种标准水性缓冲溶液和/或蛋白酶抑制剂中的任一种，采用多种缓冲剂(如磷酸盐、Tris或诸如此类)中的任一种。
可以通过本领域普通技术人员熟知的多种方法中的任一种检测和定量DPP4水平(表达的蛋白水平或核酸水平，如mRNA水平)。这些方法包括生物化学分析方法，如电泳、毛细管电泳、高效液相层析(HPLC)、薄层层析(TLC)、超扩散色谱、质谱以及类似物，或各种免疫学方法，如流体或凝胶沉淀素反应、免疫扩散(单或双)、免疫组织化学、亲和色谱法、免疫电泳、放射免疫测定(RIA)、酶联免疫吸附测定(ELISA)、免疫荧光测定、蛋白质印迹法以及类似物。
在一方面，可以在电泳多肽分离(例如，单向或双向电泳)中检测和/或定量DPP4。使用电泳技术检测多肽的手段对于本领域技术人员而言是众所周知的。(总体上参见，R.斯科普斯(Scopes)(1982)多肽纯化(Polypeptide Purification)，柏林斯普林格出版社(Springer-Verlag)，纽约(N.Y.)；多伊彻(Deutscher)，(1990)酶学方法(Methods inEnzymology)第182卷：多肽纯化指南(Guide to Polypeptide Purification)，学术出版社有限公司(Academic Press,Inc.)，纽约)。该方面的变化形式使用蛋白质印迹法(免疫印迹)分析以检测和定量样品中DPP4的存在。该技术通常包括通过凝胶电泳基于分子量分离样品多肽，将分离的多肽转移至适合的固体支持物(如硝化纤维素滤器、尼龙过滤器、或衍生化尼龙过滤器)，以及将该样品与特异性结合分析物的抗体一起孵育。可以将特异性结合至分析物的抗体直接标记，或可替代地可以使用特异性结合至第一抗体的结构域的经标记的抗体(例如，标记的绵羊抗小鼠抗体)随后对其检测。
在一些方面，将样品和/或DPP4在检测和/或定量测定过程中以一定的方式转化。例如，可以将样品分级，以使得将DPP4从至少一种其他样品组分中分离。可以在液体级分中回收DPP4或可以在其包埋在分离介质(如凝胶)中的同时对其检测。对于质谱，使DPP4挥发用于检测。
在具体方面中，在生物样品中使用免疫测定检测和/或定量DPP4。对于免疫测定的一般概述，还可参见细胞生物学方法(Methods in Cell Biology)，第37卷：细胞生物学抗体(Antibodies in Cell Biology)，浅井(Asai)编辑，学术出版社有限公司(AcademicPress,Inc.)纽约(New York)(1993)；基础临床免疫学(Basic and Clinical Immunology)第7版，斯蒂茨(Stites)&Terr编辑(1991)。在一些方面，该免疫测定可以采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4。
在某些方面，该免疫测定包括夹心免疫测定，例如，酶联免疫吸附测定(ELISA)或夹心电化学发光(ECL)测定，其中第一抗-DPP4“捕获”抗体或其抗原结合片段附接至固体支持体，使得来自样品或标准品的抗原结合至该捕获抗体，并且然后添加第二抗-DPP4“检测”抗体或其抗原结合片段，并且通过酶促反应、ECL反应、放射性、或其他检测方法来检测。
在某些方面，该免疫测定包括以下步骤：首先，允许捕获抗体或其片段结合至固体支持体，例如，本领域技术人员已知的多孔板或或他其测定设备。允许捕获抗体附接一段时间，例如，过夜，并且然后去除未结合的抗体。然后可以洗涤该板，以去除任何未结合的捕获抗体。然后可以用封闭液处理该板，以允许非特异性蛋白结合至固体支持体的任何未结合的区域。
典型的封闭液包括无关的蛋白，例如，脱脂奶粉或血清白蛋白。然后可以再次洗涤该板，以去除任何未结合的封闭液。接下来，将疑似包含DPP4的样品添加至该板。样品通常是连续稀释并一式两份或一式三份进行铺板。还包括对照，这些对照包括标准量的DPP4或其适合的片段以及各种阴性对照。允许抗原结合至捕获抗体一段时间，例如，在室温下一小时。孵育后，然后可以洗涤该板，以去除任何未结合的抗原。
接下来，添加检测抗体。检测抗体典型地是抗-DPP4抗体，该抗-DPP4抗体结合至不同的DPP4表位而不是捕获抗体。该检测抗体可以是标记的或未标记的。如本领域技术人员熟知的，在检测抗体是未标记的情况下，将需要标记的第二抗体的添加步骤。可以用酶，例如，辣根过氧化物酶或碱性磷酸酯酶，来直接标记该检测抗体，或者可以用允许酶结合的标记进行标记。例如，该检测抗体可以轭合至生物素，并且在后续步骤中通过允许酶轭合的链霉亲和素结合至生物素标记来附接酶。
可替代地，可以将该检测抗体轭合至化学发光、荧光、或ECL标记。后者的实例是钌螯合物。孵育后，然后可以洗涤该板，以去除任何未结合的检测抗体。
可以通过如下方法完成检测抗体的检测，这些方法根据所使用的检测抗体的类型而变化。如果将检测抗体用生物素进行标记，那么添加酶轭合的链霉亲和素，洗掉未结合的链霉亲和素，并且添加底物，这提供了可以例如在分光光度计上读取的比色反应。如果将检测抗体轭合至钌螯合物，那么该板将经受电流，并且测量光发射。
在某些方面，该方法直接地测量了患者样品中的DPP4水平，其中绝对水平是通过在使用例如纯化的全长或DPP4片段的标准曲线上绘制免疫测定结果来计算的。然后可以基于包括在板上的各种标准品和对照，对来自检测抗体的检测信号进行定量。通过在标准曲线上绘制结果，可以计算在测试样品中的DPP4的绝对水平，例如，以ng DPP4/mL或ng DPP4/mg蛋白计。
基于与已知对照试样的对比，可以确定“DPP4阈值水平”，并且落在该DPP4阈值水平(例如，DPP4蛋白质表达和/或基因表达阈值水平)之上的样品可以指示出该取样患者可以从用IL-13拮抗剂(例如，抗IL-13抗体(如曲洛克木单抗))的治疗中获益。DPP4阈值水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)必须被预先确定，并且必须关于样品类型(例如，血清、肺部组织、皮肤)、疾病类型(例如，哮喘、IPF、COPD、UC、或特应性皮炎)、以及在一些情况下所使用的测定相匹配。在一些方面，血清样品中的预定的DPP4阈值水平可以是图5-6，18-20或24中描绘的DPP4中位值或DPP4平均水平。在一些方面，血清样品中的预定的DPP4阈值水平可以是至少约100ng DPP4/mL血清至约1000ng DPP4/mL血清，例如，至少约100ngDPP4/mL血清、至少约150ng DPP4/mL血清、至少约200ng DPP4/mL血清、至少约250ng DPP4/mL血清、约300ng DPP4/mL血清、至少约350ng DPP4/mL血清、至少约400ng DPP4/mL血清、至少约450ng DPP4/mL血清、至少约500ng DPP4/mL血清、至少约550ng DPP4/mL血清、至少约600ng DPP4/mL血清、至少约650ng DPP4/mL血清、至少约700ng DPP4/mL血清、至少约750ngDPP4/mL血清、至少约800ng DPP4/mL血清、至少约850ng DPP4/mL血清、或至少约900ngDPP4/mL血清。在一些方面，预定的DPP4阈值水平是至少约300ng DPP4/mL、至少约310ngDPP4/mL、至少约320ng DPP4/mL、至少约330ng DPP4/mL、至少约340ng DPP4/mL、至少约350ng DPP4/mL、至少约360ng DPP4/mL、至少约370ng DPP4/mL、至少约380ng DPP4/mL、至少约390ng DPP4/mL、至少400ng DPP4/mL、至少约410ng DPP4/mL、至少约420ng DPP4/mL、至少约430ng DPP4/mL、至少约440ng DPP4/mL、至少约450ng DPP4/mL、至少约460ng DPP4/mL、至少约470ng DPP4/mL、至少约480ng DPP4/mL、至少约490ng DPP4/mL、至少500ngDPP4/mL、至少约510ng DPP4/mL、至少约520ng DPP4/mL、至少约530ng DPP4/mL、至少约540ng DPP4/mL、至少约550ng DPP4/mL、至少约560ng DPP4/mL、至少约570ng DPP4/mL、至少约580ng DPP4/mL、至少约590ng DPP4/mL、或至少600ng DPP4/mL。
在一些方面，血清样品中的预定的DPP4阈值水平可以是至少约200ng DPP4/mL血清至约500ng DPP4/mL血清。在一些方面，血清样品中的预定的DPP4阈值水平可以是至少约300ng DPP4/mL血清至约400ng DPP4/mL血清。在一些方面，血清样品中的预定的DPP4阈值水平可以是至少约315ng DPP4/mL血清至约380ng DPP4/mL血清。在一些方面，使用ELISA测量血清中的DPP4水平。在一些具体方面，该ELISA是测定。
使用DPP4测定(实例2)以及来自长期口服型皮质类固醇使用者群体的血清样品获得定量的DPP4水平指示，中值为371ng/mL，最小值为134ng/mL，并且最大值为905ng/mL。参见图24。相应地，在一些方面，预定的DPP4阈值是这种中值，即约371ng DPP4/mL的血清。
使用DPP4测定(实例2)以及来自非使用者或长期口服型皮质类固醇(OCS)使用者群体的血清样品获得定量的DPP4水平指示，中值为321ng/mL，最小值为169ng/mL，并且最大值为540ng/mL。参见图24。相应地，在一些方面，预定的DPP4阈值是这种中值，即约321ng DPP4/mL的血清。
使用DPP4测定(实例2)以及来自437名参与临床研究的受试者(见实例3)的血清样品获得定量的DPP4水平指示，中值为364ng/mL，最小值为134ng/mL，并且最大值为905ng/mL。相应地，在一些方面，预定的DPP4阈值是这种中值，即约364ng DPP4/mL的血清。在安慰剂组中，中值为343ng DPP4/mL的血清。参见表5。因此，在一些方面，预定的DPP4阈值是约343ng DPP4/mL的血清。在每两周(Q2W)用曲洛克木单抗治疗的组中，中值为372ngDPP4/mL的血清。参见表5。相应地，在一些方面，预定的DPP4阈值是约372ng DPP4/mL的血清。在每4周(Q4W)用曲洛克木单抗治疗的组中，中值为375DPP4ng/mL的血清。参见表5。因此，在一些方面，预定的DPP4阈值是约375DPP4ng/mL的血清。
如DPP4测定制造商手册中所指示，使用人类DPP4免疫测定在血清、EDTA血浆、或肝素血浆中的正常DPP4水平分别是197-615ng/mL、187-604ng/mL、以及159-588ng/mL。对于尿，正常DPP4水平是2.26-13.3ng/mL。对于唾液，测量的正常DPP4水平是13.0-69.9ng/mL。
该DPP4阈值水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)可以基于测定的性质而变化，例如，所使用的捕获抗体和检测抗体、DPP4标准品的来源、纯度、以及组成等等。在一方面，代替使用任意的阈值水平来确定患者是否从用IL-13拮抗剂(例如，抗IL-13抗体(如曲洛克木单抗))的治疗中受益，可以将患者的DPP4水平与一种或多种对照DPP4水平相比较。根据这一方面，将测试样品(例如，来自患有IL-13介导的疾病或障碍的样品)与一种或多种对照样品进行比较(例如，取自正常健康个体的样品，取自相同患者的早期样品，取自患有患者疾病(例如，哮喘、COPD、IPF、UC、或特应性皮炎)的非IL-13-介导的子集的患者的样品，或者预定的标准量的分离的DPP4，或其组合)。
这些结果可以表达为与对照样品的比率，以确定与对照DPP4水平相比患者的DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)的百分比增加或百分比减少。根据这一方面，可以将对照样品与患者样品配对，该患者样品例如是以下中的一种或多种：全血(如果该患者样品是全血)、血清(如果该患者样品是血清)、血浆(如果该患者样品是血浆)、唾液(如果该患者样品是唾液)、尿液(如果该患者样品是尿液)、痰(如果该患者样品是痰)、支气管肺泡灌洗液(如果该患者样品是支气管肺泡灌洗液)、肺部组织(如果该患者样品是肺部组织)、或皮肤(如果该患者样品是皮肤)。
如果DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)高于对照DPP4水平至少约10％、至少20％、至少约30％、至少约40％、至少约50％、至少约60％、至少约70％、至少约80％、至少约90％、或至少约100％，则认为其是增加的。如果DPP4低于对照DPP4水平至少约10％、至少20％、至少约30％、至少约40％、至少约50％、至少约60％、至少约70％、至少约80％、至少约90％、或至少约100％，则认为其是降低的。
用于检测DPP4的免疫测定可以是竞争性或非竞争性的。非竞争性的免疫测定是对其中所捕获的分析物的量直接测量的测定。在竞争性的测定中，样品中分析物的量通过测量被样品存在的分析物从捕获剂中取代的(或竞争离开)添加的(外源性)标记的分析物的量来直接测量。在竞争性的测定中，在此情形下，将已知量的经标记的DPP4添加到样品中，并且然后将样品与捕获剂接触。结合至抗体的经标记的DPP4的量与样品中存在的DPP4的浓度成反比。
可以根据本领域的普通技术人员熟知的标准方法对DPP4检测测定评分(作为阳性或阴性或分析物的量)。具体的评分方法将取决于测定形式和标签的选择。例如，可以通过将由酶标签产生的有色产物可视化对蛋白印迹测定进行评分。将在正确分子量处清晰可见的有色条带或点评分为阳性结果，而将缺失清晰可见的点或条带评分为阴性。条带或点的强度可以提供分析物浓度的定量测量。
一旦确定，可以将DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)记录在患者医疗记录中。在一些方面，此处所披露的方法包括至少部分地基于DPP4水平作出诊断，通常是鉴别诊断。
如在此使用的术语“鉴别诊断”是指基于临床数据的分析，确定具有类似症状的两种或更多种疾病中哪一种可能负责受试者的一种或多种症状。该术语还可以指确定患者是否易受IL-13拮抗剂治疗影响，这取决于来自患者样品的样品中所测量的DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)是否高于预定的DPP4阈值水平，或相对于一种或多种对照样品中的DPP4水平是提高的。
在特定方面，此处所披露的方法包括至少部分地基于DPP4水平通知该受试者DPP4测定和/或诊断的结果。可以口头地、书面地、和/或以电子方式通知患者。
还可以将诊断记录在患者医疗记录中。例如，在不同方面中，将可以用特异的Il-13拮抗剂进行治疗的Il-13介导的疾病或障碍的诊断结论记录在医疗记录中。术语“医疗记录”或“患者医疗记录”是指关于患者的检查和/或治疗的报告，其典型地包括以下各项中的一种或多种：患者的病史和医疗投诉、医师的体检发现、诊断测试和流程的结果、以及患者药物和治疗过程。医疗记录典型地由一名或多名医师和/或医师助理完成，并且它是书面、抄录或以其他方式记录的记录和/或需要医疗护理、和/或接种、和/或过敏、和/或治疗、和/或预后、和/或有关父母、兄弟姐妹的经常健康信息、和/或职业的各种疾病或损伤的历史记录。医师在诊断病症时可回顾该记录。
医疗记录可以处于纸质形式和/或可以保存在计算机可读介质中。医疗记录可以由实验室、医师办公室、医院、医疗保健维护机构、保险公司和/或个人医疗记录网站保存。在一些方面，将至少部分地基于DPP4水平的诊断进行记录在医用警示物品之上或其中，如卡片、佩戴的物品、和/或射频识别(RFID)标签。如在此使用的术语“佩戴的物品”是指可以佩戴在受试者身体上的任何物品，包括但不限于标签、手镯、项链、臂章或头带。
此处所披露的方法还包括对例如IL-13介导的疾病或障碍(例如，哮喘、IPF、COPD或特应性皮炎)开处方、开始和/或改变预防和/或治疗。在某些方面，这些方法可以使得需要排序和/或进行一个或多个另外的测定。例如，如果确定DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)处于正常范围(即没有升高)之内，可以重复DPP4测定以排除假阴性结果，和/或可以进行一个或多个另外的DPP4测定以监测受试者的状态。如果确定DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)是升高的，可能希望的是重复DPP4测定以排除假阳性结果。在某些方面，将令人希望的是测定例如IL-13介导的疾病(例如，哮喘、IPF、COPD或特应性皮炎)的另一种指示物以确认诊断。
本领域的技术人员将会理解，DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)可以根据在此披露的方法用于，包括但不限于治疗、诊断、以及监测方法，用作(i)阳性选择物，即如果取自患者的样品中的DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)高于预定的DPP4阈值水平，或相对于一种或多种对照样品中的DPP4水平是提高的，那么将采取特定行动(例如，用IL-13拮抗剂治疗患有IL-13介导的疾病或障碍的患者)；或(ii)阴性选择物，即如果取自患者的样品中的DPP4水平低于预定的DPP4阈值水平，或相对于一种或多种对照样品中的DPP4水平更低，那么将采取特定行动(例如，用IL-13拮抗剂治疗患有IL-13介导的疾病或障碍的患者)；或(iii)既为阳性选择物又为阴性选择物，例如，如果取自患者的样品中的DPP4水平高于/低于预定的DPP4阈值水平，或相对于一种或多种对照样品中的DPP4水平更高/更低，那么可停止特异性治疗(例如，口服皮质类固醇治疗)并且可开始不同的治疗(例如，用抗IL-13抗体治疗)。
III.诊断和治疗的方法
本披露提供了一种对患有IL-13介导的疾病或障碍的患者、或患有病因不明的可能是IL-13介导的肺部疾病或障碍、炎性肠病或障碍、或慢性炎性皮肤病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括如果取自患者的样品中的DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)高于预定的DPP4阈值水平，或相对于一种或多种对照样品中的DPP4水平是提高的，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。在一方面，该患者的DPP4水平在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4、或其抗原结合片段、变体或衍生物。
本披露还提供了用以辅助医疗提供者、医疗福利提供者、或临床实验室确定患者是否会从用IL-13拮抗剂的治疗中受益的方法、测定、和试剂盒，该IL-13拮抗剂例如是抗IL-13抗体或其抗原结合片段，例如曲洛克木单抗、或其片段、变体、或衍生物，结合至与曲洛克木单抗所结合表位相同的IL-13表位的抗体或其片段，或者竞争性地抑制曲洛克木单抗与IL-13结合的抗体或其片段。在此提供的方法、测定、和试剂盒还将辅助医疗提供者、医疗福利提供者、或临床实验室确定患者是否会从用任何其他IL-13拮抗剂(在此所披露的、或本领域技术人员已知的)的治疗中受益。
本披露提供了一种对患有白介素-13(IL-13)介导的疾病或障碍(例如，哮喘、IPF、COPD或特应性皮炎)的患者进行治疗的方法，该方法包括如果取自该患者的样品中的DPP4(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。在一些方面，样品获得自该患者并且提交至例如临床实验室用于测量该样品中的DPP4水平。
还提供了一种对患有IL-13介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括：(a)提交取自该患者的样品，以用于测量该样品中的DPP4水平，其中该患者的DPP4水平例如是在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；以及(b)如果在该样品中该患者的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。
本披露还提供了一种对患有IL-13介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括：(a)测量获得自患者的样品中的DPP4水平，该患者患有IL-13介导的疾病或障碍，其中在该样品中该患者的DPP4水平例如是在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；(b)确定在该样品中该患者的DPP4水平是否高于预定的DPP4阈值水平，或是否高于一种或多种对照样品中的DPP4水平；并且(c)如果该患者的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么建议医疗提供者向该患者给予IL-13拮抗剂。
在一些方面，该患者的DPP4水平在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4。在其他方面，患者DPP4水平(例如，DNA或RNA水平)是在采用一种或多种寡核苷酸探针的测定中测量，所述寡核苷酸探针能够特异性测量DPP4基因的表达。
在某些方面，该DPP4检测测定(例如，免疫测定)是由治疗患者的医疗专业人士在获得自患者的样品上进行，例如使用配制成“护理点”诊断试剂盒的如在此描述的免疫测定。在一些方面，样品获得自患者并且提交至例如临床实验室，以便根据医疗保健专业人士的指导(例如使用如在此描述的免疫测定)来测量样品中的DPP4水平。在某些方面，进行该测定的临床实验室将基于患者的DPP4水平是否高于预定的DPP4阈值或者相对于一种或多种对照样品是否是提高的，建议医疗提供者关于患者是否能从用IL-13拮抗剂的治疗中受益。
在某些方面，本披露提供了一种在一段时间内对患有IL-13介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括：测量取自患者的第一样品中的第一DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)，或提交取自患者的第一样品以用于测量样品中的第一DPP4水平，其中该患者的DPP4水平是例如在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4，并且如果在该第一样品中的患者DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平或相对于一种或多种对照样品中的DPP4水平是提高的，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。该测试可以通过如以上所指出的医疗提供者或临床实验室来进行。
根据这一方面，该方法可以进一步包括：测量取自患者的第二样品中的第二DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)，或者提交取自患者的第二样品以用于测量样品中的第二DPP4水平，其中患者的DPP4水平再次例如在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；比较患者的第一和第二DPP4水平，并且改变剂量，例如，如果该第二样品中患者的DPP4水平高于第一样品中的DPP4水平，那么增加或维持向该患者给予的IL-13拮抗剂的量或频率、或甚至中断IL-13拮抗剂疗法，或者如果该第二样品中患者的DPP4水平低于该第一样品中的DPP4水平或几乎与其相同，那么维持或减少向该患者给予的IL-13拮抗剂的量或频率。
在此提供的治疗方面的所有方法的某些方面中，给予IL-13拮抗剂的“负荷”剂量来实现患者中所希望的治疗水平。如果负荷剂量并没有显著影响患者的DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)或患者的DPP4水平升高，那么可做出停止治疗的决定-例如，使用非IL-13拮抗剂疗法。如果负荷剂量导致患者中稳定的或降低的DPP4水平，那么可做出将剂量大小或频率降低至“维持”剂量的决定。需要重要指出的是，在此提供的方法是医疗提供者给予治疗的指南，而最终治疗决策将基于医疗提供者的合理判断。
在某些方面，可以将在此提供的免疫测定的结果提交至医疗福利提供者，以确定患者的保险是否覆盖用IL-13拮抗剂的治疗。
在某些方面，本披露提供了一种对患有IL-13介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括：例如在临床实验室中测量取自患有IL-13介导的疾病或障碍的患者的第一样品中的DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)，该第一样品是例如由医疗提供者提供的样品，其中在该第一样品中患者的DPP4水平例如是在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；确定在该第一样品中患者的DPP4水平是否高于预定的DPP4阈值水平，或相对于一种或多种对照样品中的DPP4水平是否是提高的；并且如果该患者的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或相对于一种或多种对照样品中的DPP4水平是提高的，那么建议医疗提供者向该患者给予IL-13拮抗剂。
在某些方面，本方法可以进一步包括：测量获得自患者的第二样品中的DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)，该第二样品是例如由医疗提供者提供的样品，其中患者的DPP4水平再次例如在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；确定在该第二样品中该患者的DPP4水平是否高于、几乎相同于、或低于在该第一样品中所测量的DPP4水平；并且视病人病情，建议医疗提供者调节IL-13拮抗剂疗法，例如，如果该第二样品中患者的DPP4水平高于第一样品中的DPP4水平，那么增加或维持向该患者给予的IL-13拮抗剂的量或频率、或中断IL-13拮抗剂疗法，或者如果该第二样品中患者的DPP4水平低于该第一样品中的DPP4水平或几乎与其相同，那么维持或减少向该患者给予的IL-13拮抗剂的量或频率。
在一些方面，样品获得自患者并且提交至例如临床实验室，以便使用免疫测定测量样品中的DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)。在某些方面，进行该测定的临床实验室将基于患者的DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)是否高于预定的DPP4阈值或者相对于一种或多种对照样品是否是提高的，建议医疗提供者关于患者是否能从用IL-13拮抗剂的治疗中受益。
类似地，本披露提供了一种监测IL-13拮抗剂治疗方案在患有IL-13介导的疾病或障碍的患者中的疗效的方法，该方法包括测量、或指导临床实验室测量获得自患者的第一样品中的DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)，该患者患有IL-13介导的疾病或障碍，其中该患者的DPP4水平是例如在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；如果在该第一样品中该患者的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或相对于一种或多种对照样品中的DPP4水平是提高的，那么向该患者给予或建议医疗专业人士向该患者给予IL-13拮抗剂；测量获得自患者的第二样品中的DPP4水平，其中该患者的DPP4水平再次例如在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4，并且确定、或获得指示出第二样品中患者的DPP4水平是否高于、几乎相同于、或低于第一样品中所测量的DPP4水平的结果；其中如果在该第二样品中该患者的DPP4水平低于在该第一样品中的DPP4水平或与其几乎相同，那么该IL-13拮抗剂治疗方案是有效的。
在某些方面，患者被诊断为患有肺部疾病或障碍，并且在诊断过程中可以确定是否用IL-13拮抗剂治疗患者。因此，在某些方面，本披露提供了对被诊断为患有肺部疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括如果取自患者的样品中的DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)高于预定的DPP4阈值水平或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么向该患者给予IL-13拮抗剂；其中该患者的DPP4水平在例如采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4。
在某些方面，本披露提供了一种对被诊断为患有肺部疾病或障碍(例如，哮喘、IPF或COPD)或慢性炎性皮肤病或障碍(例如，或特应性皮炎)的患者进行治疗的方法，该方法包括：
(a)提交取自该患者的样品，以用于测量该样品中的DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)，其中该患者的DPP4水平例如是在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；以及，
(b)如果在该样品中该患者的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。
在某些方面，本披露还提供了一种确定是否用IL-13拮抗剂治疗方案治疗被诊断为患有肺部疾病或障碍(例如，哮喘、IPF或COPD)或慢性炎性皮肤病或障碍(例如，或特应性皮炎)的患者的方法，该方法包括：
(a)测量、或指导临床实验室测量样品中的DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)，该样品获得自被诊断为患有肺部疾病或障碍(例如，哮喘、IPF或COPD)或慢性炎性皮肤病或障碍(例如，或特应性皮炎)的患者，其中该患者的DPP4水平例如是在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；以及，
(b)如果在该样品中该患者的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么用IL-13拮抗剂治疗方案对该患者进行治疗或指导医疗提供者用IL-13拮抗剂治疗方案对该患者进行治疗。
在某些方面，本披露提供了一种对被诊断为患有肺部疾病或障碍(例如，哮喘、IPF或COPD)或慢性炎性皮肤病或障碍(例如，或特应性皮炎)的患者进行治疗的方法，该方法包括：提交取自该患者的第一样品，以用于测量该样品中的第一DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)，其中该患者的DPP4水平例如是在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；如果在该第一样品中该患者的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或相对于一种或多种对照样品中的DPP4水平是提高的，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。可以由医疗专业人士或由临床实验室来测量DPP4水平，该临床实验室从医疗专业人士获得患者样品并且由医疗专业人士指导测量样品中的DPP4。
在某些方面，以上提供的治疗的方法可以进一步包括：提交取自该患者的第二样品，以用于测量该样品中的第二DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)，其中该患者的DPP4水平再次例如是在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；如果该第二样品中患者的DPP4水平高于该第一样品中的DPP4水平，那么增加或维持向该患者给予的IL-13拮抗剂的量或频率、或甚至中断IL-13拮抗剂疗法，或者如果该第二样品中患者的DPP4水平低于该第一样品中的DPP4水平或几乎与其相同，那么维持或减少向该患者给予的IL-13拮抗剂的量或频率。需要重要指出的是，在此提供的方法是医疗提供者给予治疗的指南，而最终治疗决策将基于医疗提供者的合理判断。
在某些方面，本披露提供了一种确定是否用IL-13拮抗剂治疗方案治疗被诊断为患有肺部疾病或障碍(例如，哮喘、IPF或COPD)或慢性炎性皮肤病或障碍(例如，或特应性皮炎)的患者的方法，该方法包括测量、或指导临床实验室测量第一样品中的DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)，该第一样品获得自被诊断为患有肺部疾病或障碍(例如，哮喘、IPF或COPD)或慢性炎性皮肤病或障碍(例如，或特应性皮炎)的患者，其中该患者的DPP4水平例如是在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；并且如果在该第一样品中该患者的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或相对于一种或多种对照样品中的DPP4水平是提高的，那么用IL-13拮抗剂治疗方案对该患者进行治疗或指导医疗提供者用IL-13拮抗剂治疗方案对该患者进行治疗。在某些方面，可以将测量DPP4水平的测定(例如，免疫测定)的结果提交至医疗福利提供者，以确定患者的保险是否覆盖用IL-13拮抗剂的治疗。
在一些方面，可以将此处所披露的方法用于诊断COPD。在其他方面，可以将此处所披露的方法用于预防受试者中的COPD从COPD GOLD分类中的一个阶段发展为随后阶段。在另一个方面中，此处所披露的方法允许监测COPD疾病从GOLD分类中的一个阶段发展为随后阶段。此处所披露的COPD标志物还适合用来区别患有如上文限定的COPD阶段I/II和COPD阶段III/IV的人类。区别这些COPD阶段对于确定适当疗法极为重要。在另一个方面中，此处所披露的方法允许监测CPOD从GOLD分类中的一个阶段发展为随后阶段。在另一个方面中，此处所披露的方法允许监测COPD治疗的进展。在又另一方面中，可以将此处所披露的方法用于预防或改善受试者中的COPD从COPD GOLD分类中的一个阶段发展为随后阶段。在一些方面，可以将此处所披露的方法用于预防、治疗或改善COPD恶化。
在某些方面，在给予IL-13拮抗剂之前、过程中、或之后，该患者已经用一种或多种另外的药物进行了治疗或正在用其治疗。本文其他处描述了用于治疗，例如，哮喘、IPF、COPD、UC和特应性皮炎的各种其他药物。在某些方面，该患者已经、继续、或将要用一种或多种另外的药物(包括，例如类固醇、支气管扩张剂、或其组合)进行治疗。在某些方面，该类固醇是皮质类固醇。在一些方面，该皮质类固醇是口服型皮质类固醇。在一些方面，该类固醇是氟替卡松或布地奈德。在一些方面，该支气管扩张剂是沙丁胺醇或沙美特罗。在某些方面，该另外的药物包括类固醇，其中该类固醇是氟替卡松或布地奈德，以及至少一种支气管扩张剂，其中该支气管扩张剂是沙丁胺醇或沙美特罗。在某些方面，一种或多种另外的药物通过吸入、通过口服给药、通过注射、或其组合进行给予。在一些方面，使用定量雾化吸入剂(MDI)或干粉吸入剂(DPI)来进行吸入给药。
在一些方面，类固醇是以高剂量给予的。术语高剂量当应用于吸入型皮质类固醇(ICS)时可以指例如日总剂量为至少500μg的ICS(例如，氟替卡松)DPI或至少440μg ICSMDI。在一些方面，高的ICS日总剂量为至少约300μg、至少约350μg、至少约400μg、至少约450μg、至少约500μg、至少约550μg、至少约600μg、至少约650μg、至少约700μg、至少约750μg、至少约800μg、至少约850μg、至少约900μg、至少约950μg、或至少1000μg的ICS(例如，氟替卡松)DPI。在一些方面，高的ICS日总剂量为至少约300μg、至少约350μg、至少约400μg、至少约450μg、至少约500μg、至少约550μg、至少约600μg、至少约650μg、至少约700μg、至少约750μg、至少约800μg、至少约850μg、至少约900μg、至少约950μg、或至少1000μg的ICS(例如，氟替卡松)MPI。
术语“高剂量”当应用于吸入型皮质类固醇(ICS)(例如，氟替卡松)在联合治疗(例如，与如沙美特罗的支气管扩张剂联合治疗)时可以指例如约230μg氟替卡松和约21μg沙美特罗作为MDI按每天两次以2次吸入的剂量，或指约500μg氟替卡松和约50μg沙美特罗作为单次剂量DPI。单独以及与其他治疗剂组合时被认为是高剂量的皮质类固醇浓度在本领域中是熟知的。
在某些方面，IL-13拮抗剂包括一种或多种抗IL-13抗体或其抗原结合片段，例如，曲洛克木单抗，IL-13突变蛋白，例如IL-13E13K((Kioi)M，等人，细胞免疫学(CellImmunol.)2004 229:41-51)，IL-4突变蛋白，例如匹曲白滞素(AER-001，BAY-16-9996)(安东尼(Antoniu)SA.，调查药物的目前观点(Curr Opin Investig Drugs)，201011:1286-94)，抗IL-13Rα1抗体或其抗原结合片段，或抗IL-4Rα抗体或其抗原结合片段。在某些方面，该IL-13拮抗剂是抗IL13抗体、或其抗原结合片段。在某些方面，该抗IL-13抗体或其片段结合至与曲洛克木单抗所结合表位相同的IL-13表位，或者竞争性地抑制曲洛克木单抗与IL-13的结合，或二者。在某些方面，该抗体包括曲洛克木单抗或其抗原结合片段。在其他方面，该抗体或其片段由曲洛克木单抗或其抗原结合片段组成。
在一些方面，该抗IL-13抗体或其片段结合至与来金珠单抗所结合表位相同的IL-13表位，或者竞争性地抑制来金珠单抗与IL-13的结合，或二者。在一些方面，该抗IL-13抗体或其片段包括来金珠单抗或其抗原结合片段。在一些方面，该抗IL-13抗体或其片段由来金珠单抗或其抗原结合片段组成。
在一些方面，在此处所披露的方法中使用的样品取自患者并且包括全血、血清、血浆、唾液、痰、支气管肺泡灌洗液、尿、肺上皮细胞、皮肤、或鼻息肉中的一种或多种。在特定方面，取自该患者的样品是血清。
在一些方面，在基线处的气道容积(即在给予IL-13拮抗剂之前)，例如，如使用次级气道(WA％)的肺的CT扫描所确定的壁面积％可以用于预测在用IL-13拮抗剂(例如，抗IL-13抗体(如曲洛克木单抗或来金珠单抗))进行治疗的患者或候选者中的治疗反应(例如，气道阻力和/或FEV1的改善)。如在此使用的术语“壁面积”是指支气管管壁的截面积(例如，上叶中肺段及肺亚段支气管)。壁面积百分数(WA％)计算如下：100*壁面积/(壁面积+管腔面积)。用于测量壁面积和壁面积百分数的工具在本领域中是熟知的。参见，例如，古普塔(Gupta)等人，变态反应学与临床免疫学杂志(J Allergy Clin Immunol.)133(3):729-738(2014)；古普塔(Gupta)等人，胸(Thorax.)65(9):775-81(2010)。在一些方面，由肺的计算机断层摄影(CT)成像数据测量气道容积。可以使用例如可商购的软件，如VIDA Apollo(例如，容量信息显示和分析(the Volumetric Information Display and Analysis)(VIDA)肺的工作站(Pulmonary Workstation)，VIDA诊断学(VIDA Diagnostics)，珊瑚村(Coralville)，爱荷华州(Iowa))，来处理这类成像数据。在一些方面，由肺的CT扫描数据的次级气道的WA％可以用于确定例如是否治疗、改变治疗、或监测对患有IL-13介导的疾病(例如，哮喘、COPD、肺气肿、IPF、UC、或特应性皮炎)的患者的治疗。在一些方面，由CT扫描数据的次级气道的WA％可以单独或与其他生物标志物(例如，骨膜蛋白、DPP4和/或临床特征(如FEV1可逆性)组合用于鉴别响应于抗IL-13治疗剂(例如，曲洛克木单抗或来金珠单抗)的患有IL-13介导的疾病(例如，哮喘、COPD、肺气肿、IPF、UC、或特应性皮炎)的患者群体。相应地，本披露所提供的方法包括评价由患者的肺的CT扫描成像数据所测量的WA％，以及确定次级气道的WA％是否高于或低于预定WA％阈值水平，或其是否高于或低于一种或多种对照CT扫描中的WA％，其中对患有IL-13介导的疾病(例如，哮喘、COPD、肺气肿、IPF、UC、或特应性皮炎)、具有高于预定WA％阈值水平或高于一种或多种对照CT扫描中的WA％的次级气道的WA％值的患者用IL-13拮抗剂(例如，抗IL-13抗体(如曲洛克木单抗或来金珠单抗))进行治疗。WA％可以独立地或与骨膜蛋白水平、DPP4水平和/或临床特征(如FEV1可逆性)相结合用于此处所披露的方法中。
在一些方面，可用于此处所披露的方法中的预定WA％阈值水平是约40％、约45％、约50％、约55％、约60％、约65％、约70％、约75％、约80％、约85％、或约90％。在一些方面，可用于此处所披露的方法中的预定WA％阈值水平在约60％和约80％之间。在其他方面，可用于此处所披露的方法中的预定WA％阈值水平在约65％和约75％之间。在其他方面，可用于此处所披露的方法中的预定WA％阈值水平是约60％。在其他方面，可用于此处所披露的方法中的预定WA％阈值水平是约68％。在具体方面，可用于此处所披露的方法中的预定WA％阈值水平是68％。在一些方面，可用于此处所披露的方法中的预定阈值WA％水平是患者群体的平均WA％值。在其他方面，可用于此处所披露的方法中的预定阈值WA％水平是患者群体的中位WA％值。在一些方面，该患者已经用IL-13拮抗剂(例如，曲洛克木单抗或来金珠单抗)进行了治疗。在一些方面，该患者还未用IL-13拮抗剂进行治疗(例如，他们已经用非IL-13拮抗剂治疗剂进行了治疗，或还未用任何治疗剂进行治疗)。
在一些方面，对肺扫描的CT扫描数据使用3D气道分析来测量WA％，肺扫描使用肺段支气管。在其他方面，对肺扫描的CT扫描数据使用3D气道分析来测量WA％，肺扫描使用肺亚段支气管。在一些方面，肺段或肺亚段支气管来自上叶。在一些方面，肺段或肺亚段支气管来自全肺。在一些方面，这些肺段气道是右肺尖段(RB1)、右前(RB2)、右后(RB3)、左肺后尖段(LB1+2)、LB3(左前)、或其组合。在一些方面，这些次级气道是RB1a、RB1b、RB2a、RB2b、RB3a、RB3b、LB1、LB1a、LB1b、LB2、LB2a、LB2b、LB3a、LB3b、或其组合。参见纳迪许(Naidich)等人，气道成像-功能与放射性相关(Imaging of the Airways-Functional andRadiologic Correlations)，2005。在一些方面，针对各段气道分别计算气道参数，并且然后对每个受试者中的肺段和/或次级气道取平均。
在一些方面，具有高于指定阈值(例如，在肺亚段水平WA％至少60％)的WA％的患者在气道阻力方面展现出统计学上显著的改善。在一些方面，具有高于指定阈值(例如，在肺亚段水平WA％至少60％)的WA％的患者在支气管扩张剂前FEV1方面展现出统计学上显著的改善。在一些方面，WA％可以与其他生物标志物组合，这些生物标志物通过使用CT扫描数据(例如，管腔面积(LA)、壁面积(WA)、壁厚面积(WT)、气道阻力、或其组合)的3D气道分析而获得。
在一些方面，除了确定DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)之外，本披露的方法可以进一步包括确定、提交取自该患者的样品用于确定、或指导临床实验室以确定：
(i)该患者的IgE水平的水平、
(ii)该患者的嗜酸性粒细胞计数、
(iii)该患者的氧化氮呼出率(FENO)、
(iv)该患者的嗜酸性粒细胞/淋巴细胞和嗜酸性粒细胞/嗜中性粒细胞(ELEN)指数(参见WO 2012158954，所述文献通过引用的方式完整结合在此)、
(v)该患者的EOS指数(参见WO 2012158954，所述文献通过引用的方式完整结合在此)、
(vi)由肺的CT扫描数据的次级气道的患者壁面积百分数(WA％)、或
(vii)其两种或更多种的组合。
相应地，在以上描述的某些方面，该患有IL-13介导的疾病或障碍的患者已经被诊断为患有肺部疾病或障碍、炎性肠病或障碍或慢性炎性皮肤病或障碍，其在鉴别诊断的亚类中可以是IL-13介导的。参见，例如，美国专利申请公开2012-0328606，将其通过引用以其全文结合在此。在某些方面，疑似患有IL-13介导的病变的疾病或障碍是哮喘、特发性肺纤维化(IPF)、慢性阻塞性肺病(COPD)、溃疡性结肠炎(UC)、或特应性皮炎。
在一些方面，除了确定DPP4的水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)之外，此处所披露的方法可以包括确定、提交取自该患者的样品用于确定、或指导临床实验室以确定人类骨膜蛋白的亚型1、2、3、或4的表达水平或活性、或其组合。骨膜蛋白作为用于IL-13介导的疾病的生物标志物的用途已经披露于例如希亚(Jia)等人，变态反应学与临床免疫学杂志(J Allergy Clin.Immunol)2012 130:647-654；高山(Takayama)等人，变态反应学与临床免疫学杂志(J Allergy Clin.Immunol)2006 118:98-104；以及PCT公开号WO2012/083132中，各自通过引用以其全文结合在此。
如在此使用的术语“骨膜蛋白”是指由POSTN基因编码的成骨细胞特异性因子蛋白(Uniprot：Q15063)。骨膜蛋白又称为成骨细胞特异性因子2(OSF-2)。骨膜蛋白对α-V/β-3和α-V/β-5整联蛋白起到配体的作用，以支持上皮细胞的黏附和迁移。骨膜蛋白是gla结构域维生素K依存因子。
术语骨膜蛋白还包括其片段、变体(例如，由可变剪接产生的亚型)、以及衍生物(例如，蛋白的糖基化或未糖基化蛋白形式、或以其他方式蛋白的化学修饰形式)。本领域已知由可变剪接产生的7种亚型：亚型1(Uniprot：Q15063-1)，又称为OSF-2OS，其长为836个氨基酸；亚型2(Uniprot：Q15063-2)，又称为OSF-2p1，其长为779个氨基酸；亚型3(Uniprot：Q15063-3)，其长为781个氨基酸；亚型4(Uniprot：Q15063-4)，其长为751个氨基酸；亚型5(Uniprot：Q15063-5)，其长为809个氨基酸；亚型6(Uniprot：Q15063-6)，其长为749个氨基酸；以及亚型7(Uniprot：Q15063-7)，其长为721个氨基酸。已知的骨膜蛋白变体包括具有以下相对于规范亚型-1序列的序列差异中的任一种的那些：I290F、D421V、T339I、或V814M。
在一些方面，术语骨膜蛋白是指骨膜蛋白基因，其包括基因组DNA、cDNA、mRNA以及其片段。在一些方面，术语骨膜蛋白还指能够在严格条件下与骨膜蛋白基因特异性杂交的寡核苷酸。在一些方面，寡核苷酸包括不同于A、T、C、G、或U的核碱基，例如通用碱基。参见竹下(Takeshita)等人，生物化学杂志(Biochem J.)294:271-278(1993)；佐佐木(Sasaki)等人，癌症(Cancer)92:843-848(2001)；布兰查德(Blanchard)等人，粘膜免疫学(MucosalImmunol.)1:289-296(2008)；布兰查德(Blanchard)&罗滕伯格(Rothenberg)，北美变态反应学与临床免疫学(Immunol.Allergy Clin.North.Am.)29:141-148(2009)；西杜(Sidhu)等人，美国国家科学院院刊(Proc.Natl.Acad.Sci.USA)107:14170-14175(2010)；金光(Kanemitsu)等人，变态反应学与临床免疫学杂志(J.Allergy Clin.Immunol.)132:305-12(2013)，将其通过引用以其全文结合在此。
在其他方面，除了确定DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)和/或骨膜蛋白(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)之外，此处所披露的方法可以包括确定、提交取自该患者的样品用于确定、或指导临床实验室以确定患者的血嗜酸性粒细胞计数、该患者的IgE水平的水平、支气管扩张剂前或后的FEV1可逆性、由肺的CT扫描数据的次级气道的壁面积百分数(WA％)、或其组合。
在其他方面，除了确定DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)之外，此处所披露的方法可以包括确定、提交取自该患者的样品用于确定、或指导临床实验室以确定sCTLA-3(可溶性CTLA-3；又称为细胞毒性T淋巴细胞相关丝氨酸酯酶3、粒酶A、或粒酶1；Uniprot：P12544)、sCD28(可溶性CD28；又称为分化抗原簇28或Tp44；Uniprot：P10747)、CCL5(趋化因子C-C基序配体5；又称为RANTES；Uniprot：P13501)、CCL11(C-C基序趋化因子11；又称为嗜酸性粒细胞趋化性蛋白或嗜酸性粒细胞趋化因子-1；Uniprot：P51671)、CCL22(C-C基序趋化因子22；Uniprot：O00626)、或其组合的表达水平或活性。这些生物标志物已经披露于IL-13介导的疾病中，例如，在伦(Lun)等人，临床免疫学杂志(J.Clin.Immunol.)200727:430-437。
在一些方面，除了确定DPP4水平之外，此处所披露的方法可以进一步包括确定、提交取自该患者的样品用于确定、或指导临床实验室以确定CCL26、FZD5、DOK1、CST2、ZNF436、C20orf100、NAGS、CST1、CDH13、HRH1、TMEM132B、NTRK1、SLCO2A1、IgE、FETUB、KRT31IKRT34、C6orf138、ATP5J、TUBAL3、JAM2、NOVA2、NOS2A、HS3ST4、GRM8、IL1R2、CTDSPL、CEP72、LOC199800、LYPD1、DISP1、NKX1-2、C4orf38、LOXL4、PRKD1、PAM124B、GPR44、HIGD1B、CLCA1、SEPT11、CYYR1、CD36、ALOX15、AADAC、ACTA1、ODC1、DKFZp434F142、ACHE、CSF3、LOC100132552、C12orf27、ZNF331、GK5、DUSP1IDUSP4、LRWD1、PGLYRP4、GUSBL2、CLGN、NR1I2、EST、LRRC37B、SAA4、SLC12A3、TMEM45A、FLJ37464、MUC5B、CXCL6、GLRB、DKFp686K01114、FOLR1、TSPAN6、AKR1C1、KIAA0232、PTP4A1、PCYT2、RHOV、PROS1、C11orf63、TCTN1、PIP5K1B、OSBPL6、NSUM7、GJB7、IRS2、或其组合的表达水平或活性。这些基因是如披露于崔(Choi)等人，免疫学杂志(J.Immunol.)186(3):1861-9(2011)和WO 2009124090中的Th-2签名的一部分，两者都通过引用以其全文结合在此。
在一些方面，除了确定DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)之外，此处所披露的方法可以进一步包括确定、提交取自该患者的样品用于确定、或指导临床实验室以确定POSTN(SEQ ID NO:8)、CSTl(SEQ ID NO:9)、CCL26(SEQ ID NO:10)、CLCAl(SEQ IDNO:11)、CST2(SEQ ID NO:12)、PRR4(SEQ ID NO:13)、SERPINB2(SEQ ID NO:14)、CEACAM5(SEQ ID NO:15)、iNOS(SEQ ID NO:16)、SERPINB4(SEQ ID NO:17)、CST4(SEQ ID NO:18)、PRB4(SEQ ID NO:19)、TPSDl(SEQ ID NO:20)、TPSGl(SEQ ID NO:21)、MFSD2(SEQ ID NO:22)、CPA3(SEQ ID NO:23)、GPR105(SEQ ID NO:24)、CDH26(SEQ ID NO:25)、GSN(SEQ IDNO:26)、C2ORF32(SEQ ID NO:27)、TRACH2000196(TMEM71)(SEQ ID NO:28)、DNAJC12(SEQID NO:29)、RGS13(SEQ ID NO:30)、SLC18A2(SEQ ID NO:31)、SERPINBl0(SEQ ID NO:32)、SH3RF2(SEQ ID NO:33)、FCERlB(SEQ ID NO:34)、RUNX2(SEQ ID NO:35)、PTGSl(SEQ IDNO:36)、ALOX15(SEQ ID NO:37)、及其组合的表达水平或活性。
POSTN(骨膜蛋白)的实例包括一种包含SEQ ID NO:8的多肽及其他POSTN自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:38和/或39杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类POSTN及其片段的核酸及它们的互补序列。
CST1(半胱氨酸蛋白酶抑制剂-SN；Uniprot：P01037)的实例包括一种包含SEQ IDNO:9的多肽及其他CSTl自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQID NO:40杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类CST1及其片段的核酸及它们的互补序列。
CCL26(趋化因子(C-C基序)配体26；Uniprot：Q9Y258)的实例包括一种包含SEQ IDNO:10的多肽及其他CCL26自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:41杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类CCL26及其片段的核酸及它们的互补序列。
CLCA1(钙活化氯离子通道调节剂1；Uniprot：A8K7I4)的实例包括一种包含SEQ IDNO:11的多肽及其他CLCAl自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:42杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类CLCA1及其片段的核酸及它们的互补序列。
CST2(半胱氨酸蛋白酶抑制剂-SA；Uniprot：P09228)的实例包括一种包含SEQ IDNO:12的多肽及其他CST自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQID NO:43杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类CST2及其片段的核酸及它们的互补序列。
PRR4(富含脯氨酸的蛋白4；Uniprot：Q16378)的实例包括一种包含SEQ ID NO:13的多肽及其他PRR4自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ IDNO:44杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类PRR4及其片段的核酸及它们的互补序列。
SERPINB2(纤溶酶原激活物抑制剂-2(胎盘PAI)，又称为HsT1201、PAI、PAI-2、PAI2或PLANH2；Uniprot：P05120)的实例包括一种包含SEQ ID NO:14的多肽及其他SERPINB2自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:45杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类SERPINB2及其片段的核酸及它们的互补序列。
CEACAM5(癌胚抗原相关的细胞黏着分子5(CEACAM5)又称为CD66e(分化抗原簇66)；Uniprot：P06731)的实例包括一种包含SEQ ID NO:15的多肽及其他CEACAM5自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:46杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类CEACAM5及其片段的核酸及它们的互补序列。
iNOS(诱导型NOS，称为iNOS或NOS2)的实例包括一种包含SEQ ID NO:16的多肽及其他iNOS自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:47杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类iNOS及其片段的核酸及它们的互补序列。
SERPINB4(丝氨酸蛋白酶抑制剂肽酶抑制剂，进化枝B(卵白蛋白)，成员4，又称为LEUPIN、PI11、SCCA-2、SCCA1、或SCCA2；Uniprot：P48594)的实例包括一种包含SEQ ID NO:17的多肽及其他SERPINB4自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:48和/或49杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类SERPINB4及其片段的核酸及它们的互补序列。
CST4(半胱氨酸蛋白酶抑制剂S；Uniprot：P01036)的实例包括一种包含SEQ IDNO:18的多肽及其他CST4自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQID NO:50杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类CST4及其片段的核酸及它们的互补序列。
PRB4(碱性唾液富含脯氨酸的蛋白4；Uniprot：P10163)的实例包括一种包含SEQID NO:19的多肽及其他PRB4自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:51杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类PRB4及其片段的核酸及它们的互补序列。
TPSD1(类胰蛋白酶δ11，又称为δ-类胰蛋白酶，肥大细胞MMCP-7样蛋白，或HmMCP-3-样类胰蛋白酶III；Uniprot：Q9BZJ3)的实例包括一种包含SEQ ID NO:20的多肽及其他TPSD1自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与选自由SEQ ID NO:52-58组成的组的序列杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类TPSD1及其片段的核酸及它们的互补序列。
TPSG1(类胰蛋白酶γ1，又称为TMT，类胰蛋白酶γI，类胰蛋白酶γII，丝氨酸蛋白酶31，肺类胰蛋白酶，肥大细胞蛋白酶II，肥大细胞类胰蛋白酶，或皮肤类胰蛋白酶；Uniprot：Q9NRR2)的实例包括一种包含SEQ ID NO:21的多肽及其他TPSG1自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与选自由SEQ ID NO:59-62组成的组的序列杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类TPSG1及其片段的核酸及它们的互补序列。
MFSD2(包含2A蛋白的主要协助转运蛋白超家族结构域；Uniprot：Q8NA29)的实例包括一种包含SEQ ID NO:22的多肽及其他MFSD2自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:63杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类MFSD2及其片段的核酸及它们的互补序列。
CPA3(羧肽酶A3，又称为肥大细胞羧肽酶A，组织羧肽酶A，或MC-CPA2；Uniprot：P15088)的实例包括一种包含SEQ ID NO:23的多肽及其他CPA3自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:64杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类CPA3及其片段的核酸及它们的互补序列。
GPR105(G蛋白偶联受体105，又称为尿苷二磷酸葡萄糖的G蛋白偶联受体，P2Y嘌呤受体14，BPR105，尿苷二磷酸葡萄糖受体，嘌呤受体P2Y G-蛋白偶联14，或P2RY14；Uniprot：Q15391)的实例包括一种包含SEQ ID NO:24的多肽及其他GPR105自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:65杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类GPR105及其片段的核酸及它们的互补序列。
CDH26(钙粘素26，又称为VR20；Uniprot：Q8IXH8)的实例包括一种包含SEQ ID NO:25的多肽及其他CDH26自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQID NO:66杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类CDH26及其片段的核酸及它们的互补序列。
GSN(绒毛蛋白，又称为短秆素，ADF，AGEL，或肌动蛋白解聚合因子2；Uniprot：P06396)的实例包括一种包含SEQ ID NO:26的多肽及其他GSN自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:67杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类GSN及其片段的核酸及它们的互补序列。
C2ORF32(大麻素受体相互作用蛋白11，又称为CRIP-1；Uniprot：Q96F85)的实例包括一种包含SEQ ID NO:27的多肽及其他C2ORF32自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:68杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类C2ORF32及其片段的核酸及它们的互补序列。
TRACH2000196(跨膜蛋白711或TMEM71；Uniprot：Q6P5X7)的实例包括一种包含SEQID NO:28的多肽及其他TRACH2000196(TMEM71)自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:69杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类TRACH2000196及其片段的核酸及它们的互补序列。
DNAJC12(DnaJ(Hsp40)同系物，亚家族C，成员121，又称为JDP1或J域蛋白1；Uniprot：Q9UKB3)的实例包括一种包含SEQ ID NO:29的多肽及其他DNAJC12自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:70杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类DNAJC12及其片段的核酸及它们的互补序列。
RGS 13(G蛋白信号调节因子13；Uniprot：O14921)的实例包括一种包含SEQ IDNO:30的多肽及其他RGS 13自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:71杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类RGS 13及其片段的核酸及它们的互补序列。
SLC18A2(囊泡单胺转运蛋白2(VMAT2)又称为溶质运载蛋白家族18成员2(SLC18A2)；Uniprot：Q05940)的实例包括一种包含SEQ ID NO:31的多肽及其他SLC18A2自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:72杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类SLC18A2及其片段的核酸及它们的互补序列。
SERPINB10(丝氨酸蛋白酶抑制剂肽酶抑制剂，进化枝B(卵白蛋白)，成员10；Uniprot：P48595)的实例包括一种包含SEQ ID NO:32的多肽及其他SERPINB10自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:73杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类SERPINB10及其片段的核酸及它们的互补序列。
SH3RF2(SH3环指2蛋白)的实例包括一种包含SEQ ID NO:33的多肽及其他SH3RF2自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:74杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类SH3RF2及其片段的核酸及它们的互补序列。
FCER1B(高亲和性免疫球蛋白ε受体亚单元β或MS4A2；Uniprot：Q01362)的实例包括一种包含SEQ ID NO:34的多肽及其他FCER1B自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:75杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类FCER1B及其片段的核酸及它们的互补序列。
RUNX2(人类runt相关转录因子2；又称为核心结合因子亚单元α-1或CBF-α-1；Uniprot：Q13950)的实例包括一种包含SEQ ID NO:35的多肽及其他RUNX2自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:76杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类RUNX2及其片段的核酸及它们的互补序列。
PTGSl(环氧合酶-1，COX-1，又称为前列腺素G/H合酶1，前列腺素内过氧化物合酶1或前列腺素H2合酶1；Uniprot：P23219)的实例包括一种包含SEQ ID NO:36的多肽及其他PTGSl自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:77杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类PTGS1及其片段的核酸及它们的互补序列。
ALOX15(花生四烯酸15-脂氧合酶；Uniprot：P16050)的实例包括一种包含SEQ IDNO:37的多肽及其他ALOX15自然序列多肽，如天然存在的变体以及由在严格条件下可以与SEQ ID NO:78杂交的核酸序列编码的自然序列多肽。还包括编码此类ALOX15及其片段的核酸及它们的互补序列。
在一些方面，该IL-13拮抗剂是以固定剂量给予的。在一些具体方面，该IL-拮抗剂是曲洛克木单抗并且该固定剂量是约300mg/剂量。在一些方面，该IL-13拮抗剂(例如，抗IL-13抗体(如曲洛克木单抗))是以两个或更多个剂量给予的。在一些方面，该IL-13拮抗剂(例如，抗IL-13抗体(如曲洛克木单抗))是按每周、每两周或每月给予的。在一些方面，该IL-13拮抗剂(例如，抗IL-13抗体(如曲洛克木单抗))是按每两周给予的。在一些方面，该IL-13拮抗剂(例如，抗IL-13抗体(如曲洛克木单抗))经静脉内地、肌内地、皮下地、或它们的组合给予。
在一些方面，该一种或多种对照样品获得自正常的健康个体；患有非IL-13介导的哮喘子集的患者；未用皮质类固醇治疗的哮喘患者；使用皮质类固醇进行了治疗的哮喘患者；预定标准量的分离的DPP4(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)；或其组合。
在一些方面，向患者给予该IL-13拮抗剂(例如，抗IL-13抗体(如曲洛克木单抗))导致：
(a)AER(急性恶化速率)降低；
(b)FEV1(第一秒用力呼气容积)增加；
(c)改善的ACQ-6(哮喘控制调查表，6项版)结果；
(d)改善的AQLQ(哮喘生活质量调查表)结果；或
(e)其组合。
在一些方面，与在用安慰剂治疗的患者群体中所观察到的AER相比，在给予IL-13拮抗剂(例如，双周给予固定剂量为300mg/剂量的曲洛克木单抗)之后AER降低至少约5％、至少约10％、至少约15％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、或至少60％。在一些具体方面，与在用安慰剂治疗的患者群体中所观察到的平均AER相比，在给予IL-13拮抗剂(例如，双周给予固定剂量为300mg/剂量的曲洛克木单抗)之后AER降低约28％。
在一些方面，与在用安慰剂治疗的患者群体中所观察到的FEV1相比，在给予IL-13拮抗剂(例如，双周给予固定剂量为300mg/剂量的曲洛克木单抗)之后FEV1增加至少约3％、至少约5％、至少约7％、至少约9％、至少约11％、至少约13％、至少约15％、至少约17％、或至少约19％。在一些方面，与在用安慰剂治疗的患者群体中所观察到的平均FEV1相比，在给予IL-13拮抗剂(例如，双周给予固定剂量为300mg/剂量的曲洛克木单抗)之后FEV1增加约10％。
在一些方面，与在用安慰剂治疗的患者群体中所观察到的平均ACQ-6相比，在给予IL-13拮抗剂(例如，双周给予固定剂量为300mg/剂量的曲洛克木单抗)之后ACQ-6变化约-0.5。在一些方面，与在用安慰剂治疗的患者群体中所观察到的平均AQLQ相比，在给予IL-13拮抗剂(例如，双周给予固定剂量为300mg/剂量的曲洛克木单抗)之后AQLQ变化约-0.5。
在某些方面，本披露提供了鉴定患者为用IL-13拮抗剂(例如，抗IL13抗体，包括曲洛克木单抗或其抗原结合片段、或来金珠单抗或其抗原结合片段)进行治疗的候选者的方法，该方法包括：测量取自该患者的样品中的DPP4(二肽基肽酶-4)水平，其中DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平鉴定该患者为用IL-13拮抗剂进行治疗的候选者。
在一些方面，该鉴定患者为用IL-13拮抗剂(例如，抗IL13抗体，包括曲洛克木单抗或其抗原结合片段、或来金珠单抗或其抗原结合片段)进行治疗的候选者的方法进一步包括：测量骨膜蛋白、嗜酸性粒细胞计数、IgE以及FEV1可逆性中的一种或多种，其中DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，以及以下各项中的一种或多种：(i)高骨膜蛋白(≥血清骨膜蛋白中值或约23ng/mL)、(ii)高嗜酸性粒细胞直接计数(血液嗜酸性粒细胞计数≥300个细胞/μL)、(iii)高Th2(高Th2定义为IgE>100IU/mL并且血液嗜酸性粒细胞≥0.14×109/L)、(iv)对短效β2激动剂的FEV1可逆性≥12％、或(v)肺CT扫描的次级气道的患者的壁面积百分数(WA％)高于约68％，鉴定该患者为用IL-13拮抗剂进行治疗的候选者。
在某些方面，该鉴定为用IL-13拮抗剂(例如，抗IL13抗体，包括曲洛克木单抗或其抗原结合片段、或来金珠单抗或其抗原结合片段)进行治疗的候选者的患者患有哮喘、IPF、COPD、慢性鼻窦炎、过敏性鼻炎、或特应性皮炎。在某些方面，该鉴定为用IL-13拮抗剂进行治疗的候选者的患者患有过敏性哮喘、特应性哮喘、皮质类固醇未用性哮喘、慢性哮喘、皮质类固醇抗性哮喘、皮质类固醇难治性哮喘、由于吸烟造成的哮喘、或皮质类固醇失控性哮喘。
在一些方面，用于鉴定患者为用IL-13拮抗剂(例如，抗IL13抗体，包括曲洛克木单抗或其抗原结合片段、或来金珠单抗或其抗原结合片段)进行治疗的候选者的血清样品中的预定的DPP4阈值水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)为至少约250ng/ml、至少约350ng/mL、至少约365ng/mL、至少约375ng/mL、至少约400ng/mL、至少约450ng/mL、至少约500ng/mL、至少550ng/mL、或至少约600ng/mL，如在血清中使用ELISA(例如，测定)所测量的。
在某些方面，该用于鉴定患者为用IL-13拮抗剂进行治疗的候选者的一种或多种对照样品获得自正常健康的个体；患有非IL-13介导的哮喘子集的患者；未用皮质类固醇治疗的哮喘患者；使用皮质类固醇进行了治疗的哮喘患者；预定标准量的分离的DPP4；或其组合；并且可以包括全血、血清、血浆、唾液、痰、支气管肺泡灌洗液、肺上皮细胞、尿、或其组合中的一种或多种。
在某些方面，本披露提供了诊断患者中IL-13介导的疾病或障碍的方法，该方法包括：测量取自该患者的样品中的DPP4(二肽基肽酶-4)水平，其中如果DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么该患者被诊断为患有IL-13介导的疾病或障碍。
此外，本披露进一步提供了诊断患者中IL-13介导的疾病或障碍的方法，该方法包括：测量取自该患者的样品中的DPP4(二肽基肽酶-4)水平，以及骨膜蛋白、嗜酸性粒细胞计数、IgE、FEV1可逆性或肺CT扫描的次级气道的壁面积百分数(WA％)中的一种或多种，其中如果DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，并且该患者具有以下各项中的一种或多种：(i)高骨膜蛋白(≥血清骨膜蛋白中值或约23ng/mL)、(ii)高嗜酸性粒细胞直接计数(血液嗜酸性粒细胞计数≥300个细胞/μL)、(iii)高Th2(高Th2定义为IgE>100IU/mL并且血液嗜酸性粒细胞≥0.14×109/L)、(iv)对短效β2激动剂的FEV1可逆性≥12％、或(v)肺CT扫描的次级气道的患者的壁面积百分数(WA％)高于约68％，那么该患者被诊断为患有IL-13介导的疾病或障碍。
在某些方面，使用此处所披露的方法诊断的IL-13介导的疾病或障碍是哮喘、IPF、COPD、慢性鼻窦炎、过敏性鼻炎、过敏性哮喘、特应性哮喘、皮质类固醇未用性哮喘、慢性哮喘、皮质类固醇抗性哮喘、皮质类固醇难治性哮喘、由于吸烟造成的哮喘、皮质类固醇失控性哮喘、或特应性皮炎。
在一些方面，用于诊断患者为患有IL-13介导的疾病或障碍的患者的样品中的预定的DPP4阈值水平为至少约250ng/ml、至少约350ng/mL、至少约365ng/mL、至少约375ng/mL、至少约400ng/mL、至少约450ng/mL、至少约500ng/mL、至少550ng/mL、或至少约600ng/mL，如在血清中使用ELISA(例如，测定)所测量的。
在某些方面，该用于诊断患者患有IL-13介导的疾病或障碍的一种或多种对照样品获得自正常健康的个体；患有非IL-13介导的哮喘子集的患者；未用皮质类固醇治疗的哮喘患者；使用皮质类固醇进行了治疗的哮喘患者；预定标准量的分离的DPP4；或其组合；并且可以包括全血、血清、血浆、唾液、痰、支气管肺泡灌洗液、肺上皮细胞、尿、皮肤、或其组合中的一种或多种。
IV.DPP4检测测定和试剂盒
本披露还提供了用于检测DPP4(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)的试剂盒，例如经由免疫测定方法。这类试剂盒可以包括多个容器，每个容器具有该方法中利用的不同试剂(例如，以浓缩的形式)中的一种或多种，包括例如，一种或多种抗DPP4抗体。可以提供一种或多种抗DPP4抗体(例如，捕获抗体)已经附接至固体支持体。可以提供一种或多种抗体(例如，检测抗体)已经轭合至可检测标记(例如，生物素或钌螯合物)。试剂盒还可以提供用于将可检测的标签偶联至抗体(连同标签自身)的试剂、缓冲液、和/或用以支持在此提供的测定实践的试剂以及仪器。在某些方面，可以提供结合至检测抗体的经标记的第二抗体。根据本披露提供的试剂盒可以进一步包括适合的容器、板和任何其他用以实践在此提供的测定所必需的试剂或材料。
在一些方面，试剂盒包括一种或多种核酸探针(例如，包括天然存在和/或化学修饰的核苷酸单元的寡核苷酸)，该一种或多种核酸探针能够在高严格度条件下杂交DPP4基因序列(SEQ ID NO:7)的子序列。在一些方面，一种或多种核酸探针(例如，包括天然存在和/或化学修饰的核苷酸单元的寡核苷酸)附接至微阵列芯片上，该一种或多种核酸探针能够在高严格度条件下杂交DPP4基因序列(SEQ ID NO:7)的子序列。
根据本披露提供的试剂盒还可以包括描述该程序的手册或说明书。对于DPP4检测免疫测定，并且特别是夹心免疫测定，例如，ELISA测定或ECL测定，该夹心免疫测定程序包括附接至固体支持体的第一抗DPP4“捕获”抗体或其抗原结合片段，以及第二抗DPP4“检测”抗体或其抗原结合片段。可以通过在此提供的方法或本领域技术人员熟知的和理解的方法进行免疫测定。在一方面，该免疫测定包括将捕获抗体或其片段附接至固体支持体；施加该测试样品或对照样品，允许DPP4(若在样品中存在的话)结合至捕获抗体或其片段；施加该检测抗体或其片段，该该检测抗体或其片段可以结合至已经结合至捕获抗体或其片段的DPP4；并且测量与DPP4结合的检测抗体或其片段的量。在某些方面，该测定可以进一步包括洗涤步骤、封闭步骤和孵育步骤。
检测试剂盒可以包括用于执行一种或多种DPP4检测测定(例如，免疫测定或核酸检测测定)的说明书。试剂盒中包括的说明书可以附着于包装材料或可以作为包装插入物包括在内。尽管说明书通常是书面材料或印刷制品，但并不限于此。考虑了任何能够存储此类说明书并将其传达给终端用户的介质。这类介质包括但不限于电子存储介质(例如，磁盘、磁带、暗盒、芯片)、光学媒体(例如，CD ROM)、以及类似物。如在此使用的术语“说明书”可以包括提供说明书的互联网网站的地址。
V.计算机方法和软件
此处所披露的方法可以包括收集或以其他方式获得生物样品并且进行分析方法以检测和测量DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)，单独或与其他生物标志物(例如，用于衍生基因签名的一组基因，如Th-2签名)组合。可以与DPP4组合的生物标志物包括人类骨膜蛋白的亚型1、2、3、或4、sCTLA-3、sCD28、CCL5、CCL11、CCL22、CCL26、FZD5、DOK1、CST2、ZNF436、C20orf100、NAGS、CST1、CDH13、HRH1、TMEM132B、NTRK1、SLCO2A1、IgE、FETUB、KRT31IKRT34、C6orf138、ATP5J、TUBAL3、JAM2、NOVA2、NOS2A、HS3ST4、GRM8、IL1R2、CTDSPL、CEP72、LOC199800、LYPD1、DISP1、NKX1-2、C4orf38、LOXL4、PRKD1、PAM124B、GPR44、HIGD1B、CLCA1、SEPT11、CYYR1、CD36、ALOX15、AADAC、ACTA1、ODC1、DKFZp434F142、ACHE、CSF3、LOC100132552、C12orf27、ZNF331、GK5、DUSP1IDUSP4、LRWD1、PGLYRP4、GUSBL2、CLGN、NR1I2、EST、LRRC37B、SAA4、SLC12A3、TMEM45A、FLJ37464、MUC5B、CXCL6、GLRB、DKFp686K01114、FOLR1、TSPAN6、AKR1C1、KIAA0232、PTP4A1、PCYT2、RHOV、PROS1、C11orf63、TCTN1、PIP5K1B、OSBPL6、NSUM7、GJB7、IRS2、或其组合。参见，伦(Lun)等人，临床免疫学杂志(J.Clin.Immunol.)，27:430-437(2007)，崔(Choi)等人，免疫学杂志(J.Immunol.)186(3):1861-9(2011)和WO 2009124090A1，将其通过引用以其全文结合在此。可以通过例如Genecards(www.genecards.org)或Uniprot(www.uniprot.org)鉴定由贯穿本申请所使用的标识符所指定的蛋白以及基因的标准名称、别名等(例如，PIP5K1B)。
可以与DPP4组合的生物标志物包括POSTN(SEQ ID NO:8)、CSTl(SEQ ID NO:9)、CCL26(SEQ ID NO:10)、CLCAl(SEQ ID NO:11)、CST2(SEQ ID NO:12)、PRR4(SEQ ID NO:13)、SERPINB2(SEQ ID NO:14)、CEACAM5(SEQ ID NO:15)、iNOS(SEQ ID NO:16)、SERPINB4(SEQ ID NO:17)、CST4(SEQ ID NO:18)、PRB4(SEQ ID NO:19)、TPSDl(SEQ ID NO:20)、TPSGl(SEQ ID NO:21)、MFSD2(SEQ ID NO:22)、CPA3(SEQ ID NO:23)、GPR105(SEQ ID NO:24)、CDH26(SEQ ID NO:25)、GSN(SEQ ID NO:26)、C2ORF32(SEQ ID NO:27)、TRACH2000196(TMEM71)(SEQ ID NO:28)、DNAJC12(SEQ ID NO:29)、RGS13(SEQ ID NO:30)、SLC18A2(SEQID NO:31)、SERPINBl0(SEQ ID NO:32)、SH3RF2(SEQ ID NO:33)、FCERlB(SEQ ID NO:34)、RUNX2(SEQ ID NO:35)、PTGSl(SEQ ID NO:36)、ALOX15(SEQ ID NO:37)、及其组合。
DPP4水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)或源自所测量的DPP4水平的归一化得分可以单独(例如，用于治疗、诊断、预后、或监测目的)或与源自其他生物标志物(例如，用于衍生基因签名的一组基因，如Th-2签名)的水平或归一化得分组合使用。这些得分还可以与对应于例如以下各项的得分组合：(i)该患者的IgE水平的水平、(ii)该患者的嗜酸性粒细胞计数、(iii)该患者的氧化氮呼出率(FENO)、(iv)该患者的嗜酸性粒细胞/淋巴细胞和嗜酸性粒细胞/嗜中性粒细胞(ELEN)指数、(v)该患者的EOS指数、(vi)该患者的IgE水平、(vii)支气管扩张剂前或后的FEV1、FVC测量或可逆性、(viii)肺CT扫描的次级气道的壁面积百分数(WA％)、或(ix)其两种或更多种的组合，以给出诊断性得分。在该方法中，诊断性得分可以是由所有标志物计算的总和确定的单个数字，该单个数字与预设DPP4阈值相比较，该预设DPP4阈值指示疾病存在或不存在。或者诊断性得分可以是一系列条，每个条代表生物标志物值，并且响应的模式可以与用于确定疾病存在或不存在的预设模式相比较。
在此描述的方法的至少一些方面，由于所涉及的计算的复杂度，可以通过使用计算机来实施包括将DPP4用作生物标志物的方法。在一些方面，该计算机系统包括经由总线电气耦合的硬件元件，包括处理器、输入装置、输出装置、存储装置、计算机可读存储媒体输入机、通信系统、处理加速(例如，DSP或专用处理器)、以及存储器。该计算机可读存储媒体输入机可以进一步连接到计算机可读存储媒体上，该组合包括地代表远程、本地、固定和/或移动式存储设备加上存储媒体、存储器等用于临时和/或更永久性地包含计算机可读信息，其可以包括存储设备、存储器和/或任何其他这类可访问的系统资源。
单个构造可以用于实施一个或多个服务器，该一个或多个服务器可以进一步根据当前期望的方案、方案变化、延伸等进行配置。然而，对于本领域技术人员来说将会清楚的是，根据更具体的使用要求可以更好地利用实施例。也可利用定制的硬件和/或具体的元件可以在硬件、软件或二者中实现。此外，尽管可以采用连接至其他计算装置(如网络输入/输出装置)(未示出)，应当理解的是，还可以采用有线、无线、调制解调器、和/或连接或连接至其他计算装置。
在一个方面，该系统进一步包括一个或多个装置，该一个或多个装置用于向该一个或多个处理器提供输入数据。该系统进一步包括存储器，该存储器用于存储分级数据元素的数据集。在另一个方面，该用于提供输入数据的装置包括检测器，该检测器用于检测该数据元素的特征，例如，如荧光读板机、质谱仪、或基因芯片读取机。
该系统可另外包括数据库管理系统。用户请求或查询可以该数据库管理系统所理解的适当语言格式化，该数据库管理系统对该查询进行处理以提取来自训练集的数据库的相关信息。该系统可连接至网络，网络服务器和一个或多个客户端连接至该网络。该网络可以是局域网(LAN)或广域网(WAN)，如本领域已知的。优选地，该服务器包括硬件，该硬件是运行计算机程序产品(例如，软件)以访问数据库数据用以处理用户请求所必需的。该系统可以与输入装置连通，该输入装置用于提供关于数据元素至该系统(例如，表达值)的数据。在一个方面，该输入装置可以包括基因表达谱系统，该基因表达谱系统包括例如质谱仪、基因芯片或阵列读取器以及类似物。
可以实施在此描述的一些方面以包括计算机程序产品。计算机程序产品可以包括计算机可读介质，该计算机可读介质具有计算机可读程序代码，该计算机可读程序代码体现在该介质中用于使得应用程序在具有数据库的计算机上执行。如在此使用，“计算机程序产品”是指以自然或编程语言语句形式的组织有序的指令集，其包含在任何性质的物理介质上(例如，书面、电子、磁性、光学或以其他方式)并且可以和计算机或其他自动化数据处理系统一起使用。这类编程语言语句，当由计算机或数据处理系统执行时，使得该计算机或数据处理系统根据该语句的具体内容运作。
计算机程序产品包括但不限于：源代码和目标代码中的程序和/或体现在计算机可读介质中的测试或数据文库。此外，使得计算机系统或数据处理设备装置以预选方式运作的计算机程序产品可以多种形式提供，包括但不限于初始源代码、汇编代码、目标代码、机器语言、以上的加密版本或压缩版本以及任意及所有等效物。
在一个方面，提供了计算机程序产品以实施此处所披露的治疗、诊断、预后、或监测方法，例如，以确定是否向对其有需要的患者给予IL-13拮抗剂(例如，如曲洛克木单抗的抗IL-13抗体)，如果取自该患者的样品中的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平。
该计算机程序产品包括计算机可读介质，该计算机可读介质体现可由计算装置或系统的处理器执行的程序代码，该程序代码包括：
(a)检索归因于来自受试者的生物样品的数据的代码，其中该数据包括DPP4水平值(或以其他方式衍生自这些水平值的数据)，单独或与对应于该生物样品中其他生物标志物的值(例如，用于衍生基因签名的一组基因，如Th-2签名或骨膜蛋白)组合。这些值还可以与对应于例如以下各项的值组合：(i)该患者的IgE水平的水平、(ii)该患者的嗜酸性粒细胞计数、(iii)该患者的氧化氮呼出率(FENO)、(iv)该患者的嗜酸性粒细胞/淋巴细胞和嗜酸性粒细胞/嗜中性粒细胞(ELEN)指数、(v)该患者的EOS指数、(vi)由肺的CT扫描数据的次级气道的壁面积百分数(WA％)、(vii)该患者的IgE水平、(viii)支气管扩张剂前或后的FEV1、FVC测量或可逆性、或(ix)其两种或更多种的组合；以及，
(b)执行分类方法的代码，该分类方法指示例如，是否向对其有需要的患者给予IL-13拮抗剂。
尽管已将不同方面描述为方法或装置，应当理解，可以经由与计算机连接的代码实施这些方面，例如，驻留在计算机上的代码或可由计算机访问的代码。例如，软件和数据库可以用于实施以上所讨论的方法中的很多种。因此，除了由硬件实现的方面之外，还应当指出的是，这些方面可以通过使用制造的物品来实现，该制造的物品由具有在其中体现的计算机可读程序代码的计算机可用介质组成，这使得本说明书中所披露的功能得以实现。因此，所希望的是，也被认为是受本专利保护的方面同样在它们的程序代码工具中。
此外，一些方面可以被编码存储在几乎任何类型的计算机可读存储器中，包括，但不限于，RAM、ROM、磁性媒体、光学媒体、或磁光介质。甚至更一般地说，一些方面可以在软件中、或在硬件中、或其任何组合中实施，包括，但不限于，在通用处理器上运行的软件、微代码、PLA、或ASIC。
还可以设想的是，一些方面可以如载波中体现的计算机信号、以及经传输介质传播的信号(例如，电子以及光学的)实现。因此，以上所讨论的各种类型的信息可以如数据结构的结构格式化，并且如电信号经传输介质进行传输或存储在计算机可读介质中。
V.实施例
根据“En”模式命名实施例，其中E意指“实施例”而n是实施例序数。
E1.一种对患有白介素-13(IL-13)介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括如果取自该患者的样品中的DPP4(二肽基肽酶-4)水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。
E2.一种对患有白介素-13(IL-13)介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括如果(a)取自该患者的样品中的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，并且(b)该患者呈现出(i)高骨膜蛋白(≥血清骨膜蛋白中值或约23ng/mL)、(ii)高嗜酸性粒细胞直接计数(血液嗜酸性粒细胞计数≥300个细胞/μL)、(iii)高Th2(高Th2定义为IgE>100IU/mL并且血液嗜酸性粒细胞≥0.14×109/L)、(iv)对短效β2激动剂的FEV1可逆性≥12％、(v)肺CT扫描的次级气道的壁面积百分数(WA％)≥68％、或(vi)及其组合，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。
E3.一种对患有白介素-13(IL-13)介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括如果(a)取自该患者的样品中的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，并且(b)该患者呈现出取自该患者的样品中的至少一种另外的生物标志的水平高于预定生物标志阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的生物标志水平，那么向该患者给予IL-13拮抗剂，其中所述另外的生物标志选自下组，该组由以下各项组成：POSTN(SEQ ID NO:8)、CSTl(SEQ ID NO:9)、CCL26(SEQ ID NO:10)、CLCAl(SEQID NO:11)、CST2(SEQ ID NO:12)、PRR4(SEQ ID NO:13)、SERPINB2(SEQ ID NO:14)、CEACAM5(SEQ ID NO:15)、iNOS(SEQ ID NO:16)、SERPINB4(SEQ ID NO:17)、CST4(SEQ IDNO:18)、PRB4(SEQ ID NO:19)、TPSDl(SEQ ID NO:20)、TPSGl(SEQ ID NO:21)、MFSD2(SEQID NO:22)、CPA3(SEQ ID NO:23)、GPR105(SEQ ID NO:24)、CDH26(SEQ ID NO:25)、GSN(SEQID NO:26)、C2ORF32(SEQ ID NO:27)、TRACH2000196(TMEM71)(SEQ ID NO:28)、DNAJC12(SEQ ID NO:29)、RGS13(SEQ ID NO:30)、SLC18A2(SEQ ID NO:31)、SERPINBl0(SEQ ID NO:32)、SH3RF2(SEQ ID NO:33)、FCERlB(SEQ ID NO:34)、RUNX2(SEQ ID NO:35)、PTGSl(SEQID NO:36)、ALOX15(SEQ ID NO:37)、及其组合。
E4.根据实施例E1至E3所述的方法，其中样品获得自该患者并且被提交用于测量该样品中的DPP4水平。
E5.根据实施例E1至E4所述的方法，其中该患者的DPP4水平是在免疫测定中测量。
E6.根据实施例E5所述的方法，其中该免疫测定采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4。
E7.一种对患有IL-13介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括：(a)提交取自该患者的样品，以用于测量该样品中的DPP4水平，其中该患者的DPP4水平是采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段进行测量的，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；以及(b)如果在该样品中该患者的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。
E8.一种对患有IL-13介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括：(a)测量获得自患者的样品中的DPP4水平，该患者患有IL-13介导的疾病或障碍，其中在该样品中该患者的DPP4水平是采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段进行测量的，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；(b)确定在该样品中该患者的DPP4水平是否高于预定的DPP4阈值水平，或是否高于一种或多种对照样品中的DPP4水平；并且(c)如果该患者的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么建议医疗提供者向该患者给予IL-13拮抗剂。
E9.根据实施例E1至E8中任一项所述的方法，其中该IL-13介导的疾病或障碍是肺部疾病或障碍、炎性肠病或障碍、或慢性炎性皮肤病或障碍。
E10.根据实施例E9所述的方法，其中该肺部疾病或障碍是哮喘或过敏性鼻炎。
E11.一种对诊断为患有肺部疾病或障碍或慢性炎性皮肤病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括如果取自该患者的样品中的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。
E12.根据实施例E11所述的方法，其中该患者的DPP4水平在采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段的免疫测定中测量，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4。
E13.一种对诊断为患有肺部疾病或障碍或慢性炎性皮肤病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括：(a)提交取自该患者的样品，以用于测量该样品中的DPP4水平，其中该患者的DPP4水平是采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段进行测量的，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；以及(b)如果在该样品中该患者的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。
E14.一种确定是否用IL-13拮抗剂治疗方案治疗被诊断为患有肺部疾病或障碍或慢性炎性皮肤病或障碍的患者的方法，该方法包括：(a)测量、或指导临床实验室测量样品中的DPP4水平，该样品获得自被诊断为患有肺部疾病或障碍或慢性炎性皮肤病或障碍的患者，其中该患者的DPP4水平是用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段测量的，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；并且(b)如果在该样品中该患者的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么用IL-13拮抗剂治疗方案对该患者进行治疗或指导医疗提供者用IL-13拮抗剂治疗方案对该患者进行治疗。
E15.一种选择被诊断为患有肺部疾病或障碍或慢性炎性皮肤病或障碍的患者作为用IL-13拮抗剂治疗方案进行治疗的候选者的方法，该方法包括：(a)测量、或指导临床实验室测量样品中的DPP4水平，该样品获得自被诊断为患有肺部疾病或障碍或慢性炎性皮肤病或障碍的患者，其中该患者的DPP4水平是用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段测量的，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4；并且(b)如果在该样品中该患者的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么用IL-13拮抗剂治疗方案对该患者进行治疗或指导医疗提供者用IL-13拮抗剂治疗方案对该患者进行治疗。
E16.根据实施例E12至E15中任一项所述的方法，其中该肺部疾病或障碍是哮喘、IPF、COPD、慢性鼻窦炎、或过敏性鼻炎或其中该慢性炎性皮肤病或障碍是特应性皮炎、过敏性接触性皮炎、湿疹、或银屑病。
E17.根据实施例E16所述的方法，其中该哮喘是过敏性哮喘、特应性哮喘、皮质类固醇未用性哮喘、慢性哮喘、皮质类固醇抗性哮喘、皮质类固醇难治性哮喘、由于吸烟造成的哮喘、或皮质类固醇失控性哮喘。
E18.根据实施例E1至E17中任一项所述的方法，其中该IL-13拮抗剂包括以下项中的一种或多种：抗IL-13抗体或其抗原结合片段、IL-13突变蛋白、IL-4突变蛋白、抗IL-13Rα1抗体或其抗原结合片段、或者抗IL-4Rα抗体或其抗原结合片段。
E19.根据实施例E1至E18中任一项所述的方法，其中在给予IL-13拮抗剂之前、过程中、或之后，该患者已经用一种或多种另外的药物进行了治疗。
E20.根据实施例E19所述的方法，其中该一种或多种另外的药物包括类固醇。
E21.根据实施例E19或实施例E20所述的方法，其中该一种或多种另外的药物进一步包括支气管扩张剂。
E22.根据实施例E20或实施例E21所述的方法，其中该类固醇是氟替卡松或布地奈德。
E23.根据实施例E21或实施例E22所述的方法，其中该支气管扩张剂是沙丁胺醇或沙美特罗。
E24.根据实施例E19至E23中任一项所述的方法，其中该一种或多种另外的药物是通过吸入、通过口服给药、通过注射、或者通过其组合给予的。
E25.根据实施例E24所述的方法，其中使用定量雾化吸入剂(MDI)或干粉吸入剂(DPI)来进行吸入给药。
E26.根据实施例E20至E25所述的方法，其中该类固醇是以高剂量给予的。
E27.根据实施例E1至E26中任一项所述的方法，其中该IL-13拮抗剂是抗IL13抗体、或其抗原结合片段。
E28.根据实施例E27所述的方法，其中该抗体或其片段结合至与曲洛克木单抗所结合表位相同的IL-13表位上，或竞争性地抑制曲洛克木单抗与IL-13的结合，或二者。
E29.根据实施例E27或实施例E28所述的方法，其中该抗体或其片段包括曲洛克木单抗或其抗原结合片段。
E30.根据实施例E27至E29中任一项所述的方法，其中该抗体或其片段由曲洛克木单抗或其抗原结合片段组成。
E31.根据实施例E27所述的方法，其中该抗体或其片段结合至与来金珠单抗所结合表位相同的IL-13表位上，或竞争性地抑制来金珠单抗与IL-13的结合，或二者。
E32.根据实施例E27或实施例E31所述的方法，其中该抗体或其片段包括来金珠单抗或其抗原结合片段。
E33.根据实施例E27、实施例E31、或实施例E32所述的方法，其中该抗体或其片段由来金珠单抗或其抗原结合片段组成。
E34.根据实施例E1至E33中任一项所述的方法，其中该取自患者的样品包括全血、血清、血浆、唾液、痰、支气管肺泡灌洗液、肺上皮细胞、尿、皮肤、或鼻息肉中的一种或多种。
E35.根据实施例E34所述的方法，其中该取自患者的样品是血清。
E36.根据实施例E1至E35中任一项所述的方法，该方法进一步包括确定、提交取自该患者的样品用于确定、或指导临床实验室以确定(i)该患者的IgE水平的水平，(ii)该患者的嗜酸性粒细胞计数，(iii)该患者的氧化氮呼出率(FENO)，(iv)该患者的嗜酸性粒细胞/淋巴细胞和嗜酸性粒细胞/嗜中性粒细胞(ELEN)指数，(v)该患者的EOS指数，(vi)肺CT扫描的次级气道的患者壁面积百分数(WA％)，或(vii)其两种或更多种的组合。
E37.根据实施例E1至E36中任一项所述的方法，该方法进一步包括确定、提交取自该患者的样品用于确定、或指导临床实验室以确定人类骨膜蛋白的亚型1、2、3、或4的表达水平或活性、患者的血嗜酸性粒细胞计数、该患者的IgE水平的水平、支气管扩张剂前或后的FEV1可逆性、肺CT扫描的次级气道的壁面积百分数(WA％)、或其组合。
E38.根据实施例E1至E37中任一项所述的方法，该方法进一步包括确定、提交取自该患者的样品用于确定、或指导临床实验室以确定sCTLA-3、sCD28、CCL5、CCL11、CCL22、或其组合的表达水平或活性。
E39.根据实施例E1至E38中任一项所述的方法，该方法进一步包括确定、提交取自该患者的样品用于确定、或指导临床实验室以确定POSTN(SEQ ID NO:8)、CSTl(SEQ ID NO:9)、CCL26(SEQ ID NO:10)、CLCAl(SEQ ID NO:11)、CST2(SEQ ID NO:12)、PRR4(SEQ ID NO:13)、SERPINB2(SEQ ID NO:14)、CEACAM5(SEQ ID NO:15)、iNOS(SEQ ID NO:16)、SERPINB4(SEQ ID NO:17)、CST4(SEQ ID NO:18)、PRB4(SEQ ID NO:19)、TPSDl(SEQ ID NO:20)、TPSGl(SEQ ID NO:21)、MFSD2(SEQ ID NO:22)、CPA3(SEQ ID NO:23)、GPR105(SEQ ID NO:24)、CDH26(SEQ ID NO:25)、GSN(SEQ ID NO:26)、C2ORF32(SEQ ID NO:27)、TRACH2000196(TMEM71)(SEQ ID NO:28)、DNAJC12(SEQ ID NO:29)、RGS13(SEQ ID NO:30)、SLC18A2(SEQID NO:31)、SERPINBl0(SEQ ID NO:32)、SH3RF2(SEQ ID NO:33)、FCERlB(SEQ ID NO:34)、RUNX2(SEQ ID NO:35)、PTGSl(SEQ ID NO:36)、ALOX15(SEQ ID NO:37)、及其组合的表达水平或活性。
E40.根据实施例E1至E39中任一项所述的方法，其中该IL-13拮抗剂是以固定剂量给予的。
E41.根据实施例E30所述的方法，其中曲洛克木单抗是以约300mg/剂量的固定剂量给予的。
E42.根据实施例E1至E41中任一项所述的方法，其中该IL-13拮抗剂是以两个或更多个剂量给予的。
E43.根据实施例E1至E42中任一项所述的方法，其中该IL-13拮抗剂是按周、每两周或每月给予的。
E44.根据实施例E1至E43中任一项所述的方法，其中该IL-13拮抗剂是按每两周给予的。
E45.根据实施例E1至E44中任一项所述的方法，其中该IL-13拮抗剂经静脉内地、肌内地、皮下地、或它们的组合给予。
E46.根据实施例E1至E45中任一项所述的方法，其中如在血清中使用ELISA所测量的预定的DPP4阈值水平是至少约250ng/ml、至少约350ng/mL、至少约375ng/mL、至少约400ng/mL、至少约450ng/mL、至少约500ng/mL、至少550ng/mL、或至少约600ng/mL。
E47.根据实施例E46所述的方法，其中该ELISA是测定。
E48.根据实施例E46或实施例E47所述的方法，其中该预定的DPP4阈值水平是约365ng/mL。
E49.根据实施例E1至E48中任一项所述的方法，其中该一种或多种对照样品是获得自正常的健康个体；患有非IL-13介导的哮喘子集的患者；未用皮质类固醇治疗的哮喘患者；使用皮质类固醇进行了治疗的哮喘患者；预定标准量的分离的DPP4；或其组合。
E50.根据实施例E49所述的方法，其中该一种或多种对照样品包括全血、血清、血浆、唾液、痰、支气管肺泡灌洗液、肺上皮细胞、尿、皮肤、或其组合中的一种或多种。
E51.根据实施例E1至E50中任一项所述的方法，其中给予IL-13拮抗剂导致
(a)AER(急性恶化速率)降低；
(b)FEV1(第一秒用力呼气容积)增加；
(c)改善的ACQ-6(哮喘控制调查表，6项版)结果；
(d)改善的AQLQ(哮喘生活质量调查表)结果；或
(e)其组合。
E52.根据实施例E51所述的方法，其中与在用安慰剂治疗的患者群体中所观察到的AER相比，AER降低至少5％、至少10％、至少15％、至少20％、至少25％、至少30％、至少35％、至少40％、或至少45％。
E53.根据实施例E51或实施例E52所述的方法，其中与在用安慰剂治疗的患者群体中所观察到的平均AER相比，平均AER降低约28％。
E54.根据实施例E51所述的方法，其中与在用安慰剂治疗的患者群体中所观察到的FEV1相比，FEV1增加至少3％、至少5％、至少7％、至少9％、至少11％、至少13％、至少15％、至少17％、或至少19％。
E55.根据实施例E51或实施例E54所述的方法，其中与在用安慰剂治疗的患者群体中所观察到的平均FEV1相比，平均FEV1增加约10％。
E56.根据实施例E3至E55中任一项所述的方法，该方法包括如果(a)取自该患者的样品中的DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，并且(b)该患者呈现出(i)高骨膜蛋白(≥血清骨膜蛋白中值或约23ng/mL)、(ii)高嗜酸性粒细胞直接计数(血液嗜酸性粒细胞计数≥300个细胞/μL)、(iii)高Th2(高Th2定义为IgE>100IU/mL并且血液嗜酸性粒细胞≥0.14×109/L)、(iv)对短效β2激动剂的FEV1可逆性≥12％、(v)肺CT扫描的次级气道的壁面积百分数(WA％)≥68％、或(vi)及其组合，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。
E57.根据实施例E7至E56中任一项所述的方法，其中DPP4是在免疫测定中测量。
E58.一种鉴定患者为用IL-13拮抗剂进行治疗的候选者的方法，该方法包括：测量取自该患者的样品中的DPP4(二肽基肽酶-4)水平，其中DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平鉴定该患者为用IL-13拮抗剂进行治疗的候选者。
E59.根据实施例E58所述的方法，该方法进一步包括测量骨膜蛋白、嗜酸性粒细胞计数、IgE以及FEV1可逆性中的一种或多种，其中DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，以及以下各项中的一种或多种：(i)高骨膜蛋白(≥血清骨膜蛋白中值或约23ng/mL)、(ii)高嗜酸性粒细胞直接计数(血液嗜酸性粒细胞计数≥300个细胞/μL)、(iii)高Th2(高Th2定义为IgE>100IU/mL并且血液嗜酸性粒细胞≥0.14×109/L)、(iv)肺CT扫描的次级气道的壁面积百分数(WA％)≥68％、或(v)对短效β2激动剂的FEV1可逆性≥12％，鉴定该患者为用IL-13拮抗剂进行治疗的候选者。
E60.根据实施例E58或E59中任一项所述的方法，其中该患者患有哮喘、IPF、COPD、慢性鼻窦炎、过敏性鼻炎、或特应性皮炎。
E61.根据实施例E60所述的方法，其中该哮喘是过敏性哮喘、特应性哮喘、皮质类固醇未用性哮喘、慢性哮喘、皮质类固醇抗性哮喘、皮质类固醇难治性哮喘、由于吸烟造成的哮喘、或皮质类固醇失控性哮喘。
E62.根据实施例E58至E61中任一项所述的方法，其中该IL-13拮抗剂是抗IL13抗体、或其抗原结合片段。
E63.根据实施例E62所述的方法，其中该抗IL13抗体或其抗原结合片段包括曲洛克木单抗或其抗原结合片段、或来金珠单抗或其抗原结合片段。
E64.根据实施例E58至E63中任一项所述的方法，其中如在血清中使用ELISA所测量的预定的DPP4阈值水平是至少约250ng/ml、至少约350ng/mL、至少约375ng/mL、至少约400ng/mL、至少约450ng/mL、至少约500ng/mL、至少550ng/mL、或至少约600ng/mL。
E65.根据实施例E64所述的方法，其中该ELISA是测定。
E66.根据实施例E64或实施例E65所述的方法，其中该预定的DPP4阈值水平是约365ng/mL。
E67.根据实施例E58至E66中任一项所述的方法，其中该一种或多种对照样品是获得自正常的健康个体；患有非IL-13介导的哮喘子集的患者；未用皮质类固醇治疗的哮喘患者；使用皮质类固醇进行了治疗的哮喘患者；未治疗的特应性皮炎患者；已治疗的特应性皮炎患者；预定标准量的分离的DPP4；或其组合。
E68.根据实施例E67所述的方法，其中该一种或多种对照样品包括全血、血清、血浆、唾液、痰、支气管肺泡灌洗液、肺上皮细胞、尿、皮肤、或其组合中的一种或多种。
E69.诊断患者中IL-13介导的疾病或障碍的方法，该方法包括：测量取自该患者的样品中的DPP4(二肽基肽酶-4)水平，其中如果DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么该患者被诊断为患有IL-13介导的疾病或障碍。
E70.根据实施例E69所述的方法，该方法进一步包括测量骨膜蛋白、嗜酸性粒细胞计数、IgE以及FEV1可逆性中的一种或多种，其中如果DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，并且该患者具有以下各项中的一种或多种：(i)高骨膜蛋白(≥血清骨膜蛋白中值或约23ng/mL)、(ii)高嗜酸性粒细胞直接计数(血液嗜酸性粒细胞计数≥300个细胞/μL)、(iii)高Th2(高Th2定义为IgE>100IU/mL并且血液嗜酸性粒细胞≥0.14×109/L)、(iv)肺CT扫描的次级气道的壁面积百分数(WA％)≥68％、或(v)对短效β2激动剂的FEV1可逆性≥12％，那么该患者被诊断为患有IL-13介导的疾病或障碍。
E71.根据实施例E69或E70中任一项所述的方法，其中该IL-13介导的疾病或障碍是是哮喘、IPF、COPD、慢性鼻窦炎、过敏性鼻炎、或特应性皮炎。
E72.根据实施例E71所述的方法，其中该哮喘是过敏性哮喘、特应性哮喘、皮质类固醇未用性哮喘、慢性哮喘、皮质类固醇抗性哮喘、皮质类固醇难治性哮喘、由于吸烟造成的哮喘、或皮质类固醇失控性哮喘。
E73.根据实施例E69至E72中任一项所述的方法，其中如在血清中使用ELISA所测量的预定的DPP4阈值水平是至少约250ng/ml、至少约350ng/mL、至少约375ng/mL、至少约400ng/mL、至少约450ng/mL、至少约500ng/mL、至少550ng/mL、或至少约600ng/mL。
E74.根据实施例E73所述的方法，其中该ELISA是测定。
E75.根据实施例E73或实施例E74所述的方法，其中该预定的DPP4阈值水平是约365ng/mL。
E76.根据实施例E69至E75中任一项所述的方法，其中该一种或多种对照样品是获得自正常的健康个体；患有非IL-13介导的哮喘子集的患者；未用皮质类固醇治疗的哮喘患者；使用皮质类固醇进行了治疗的哮喘患者；预定标准量的分离的DPP4；或其组合。
E77.根据实施例E76所述的方法，其中该一种或多种对照样品包括全血、血清、血浆、唾液、痰、支气管肺泡灌洗液、肺上皮细胞、尿、皮肤、或其组合中的一种或多种。
E78.根据实施例E1至E77中任一项所述的方法，其中该方法进一步包括(a)由取自患者的肺的计算机体层摄影(CT)扫描确定壁面积百分数(WA％)；(b)提交取自该患者的肺的CT扫描用于由该CT扫描确定WA％；或(c)指导临床实验室以由该CT扫描确定WA％。
E79.一种对患有白介素-13(IL-13)介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括如果由该患者的肺的CT扫描所测量的壁面积百分数(WA％)高于预定WA％阈值水平，或高于由一种或多种对照CT扫描计算出的WA％阈值水平，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。
E80.一种对患有IL-13介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括：(a)提交该患者的肺的CT扫描用于由该CT扫描测量壁面积百分数(WA％)；以及(b)如果由CT扫描该患者的WA％高于预定WA％阈值水平，或高于由一种或多种对照CT扫描计算出的WA％阈值水平，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。
E81.一种对患有IL-13介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括：(a)由获得自患有IL-13介导的疾病或障碍的患者的肺的CT扫描来测量壁面积百分数(WA％)；(b)确定该患者的WA％是否高于预定WA％阈值水平，或高于由一种或多种对照CT扫描计算出的WA％阈值水平；并且(c)如果该患者的WA％高于预定WA％阈值水平，或高于由一种或多种对照CT扫描计算出的WA％阈值水平，那么建议医疗提供者向该患者给予IL-13拮抗剂。
E82.根据实施例E79至E81中任一项所述的方法，其中该IL-13介导的疾病或障碍是肺部疾病或障碍、或炎性肠病或障碍、或慢性炎性皮肤病或障碍。
E83.根据实施例E82所述的方法，其中该肺部疾病或障碍是哮喘、IPF、COPD、肺气肿、慢性鼻窦炎、或过敏性鼻炎；或其中该慢性炎性皮肤病或障碍是特应性皮炎、过敏性接触性皮炎、湿疹、或银屑病。
E84.根据实施例E83所述的方法，其中该哮喘是过敏性哮喘、特应性哮喘、皮质类固醇未用性哮喘、慢性哮喘、皮质类固醇抗性哮喘、皮质类固醇难治性哮喘、由于吸烟造成的哮喘、或皮质类固醇失控性哮喘。
E85.根据实施例E79至E84中任一项所述的方法，其中该IL-13拮抗剂是抗IL13抗体、或其抗原结合片段。
E86.根据实施例E85所述的方法，其中该抗体或其片段包括曲洛克木单抗或其抗原结合片段、或来金珠单抗或其抗原结合片段。
E87.根据实施例E79至E86中任一项所述的方法，其中该预定壁面积百分数(WA％)阈值水平是至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、至少约75％、或至少约80％，如使用上叶中肺亚段支气管的CT扫描的3D分析所测量的。
E88.根据实施例E79至E86中任一项所述的方法，其中该预定壁面积百分数(WA％)阈值水平是约68％，如使用上叶中肺亚段支气管的CT扫描的3D分析所测量的。
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本文提到的所有专利和公开都通过引用以其全部内容明确结合在此。
本披露的多方面可以进一步通过参考以下非限制性实例进行定义，这些非限制性实例详细描述了本披露的某些抗体的制备以及使用本披露抗体的方法。对于本领域技术人员来说将会清楚的是，在不背离本披露的范围的情况下，可以对材料和方法二者做出许多修改。
实例
实例1
肺中IL-13活化的外周标志物的鉴别
为了鉴别肺中受IL-13调节的基因，将人类肺上皮细胞、以及正常人类支气管上皮细胞的气液界面模型用IL-13刺激并且通过全基因组阵列(WGA)和PCR对所得转录变化进行分析(参见图1)。来自这些刺激的结果揭示了多个用于IL-13途径活化的潜在标志物。对于EpiAirway模型和正常人类支气管上皮细胞的WGA结果分别显示于图2和图3中。使用如图4中所示的qPCR来证实经由WGA所获得的结果。如所预期的，骨膜蛋白响应于IL-13显著上调。除了骨膜蛋白上调之外，鉴定出了由IL-13改变的其他基因，即DPP4、CCL26、FETUB、以及CST1。相应地，选择这些基因(或它们各自表达的蛋白)中的一种或多种作为生物标志物可以用于选择有可能对IL-13拮抗剂疗法(例如，用如曲洛克木单抗的抗IL-13抗体进行治疗)有响应的患者。
一种这样上调的基因是二肽基肽酶-4(DPP4)/CD26，即还以流出或分泌形式存在的高度保守的类型II跨膜糖蛋白。在若干疾病情况中的循环中已经发现DPP4，并且DPP4抑制剂目前用于II型糖尿病的治疗中。另外，DPP4在肺中的多种细胞类型中表达并且先前在来自过敏性哮喘患者的血浆中已经显示出上调，不取决于吸入型皮质类固醇治疗(伦(Lun)等人，在患有过敏性哮喘的成人患者中血浆和CD4+T淋巴细胞共刺激分子CD26的增加表达(Increased expression of plasma and CD4+T lymphocyte co-stimulatory moleculeCD26in adult patients with allergic asthma.)，临床免疫学杂志(J Clin Immunol)2007；27:430-437)。
使用可商购的测试(R&D系统人类DPPIV ELISA)确定来自哮喘患者的血清样品中的DPP4的水平。与正常供体相比，在重度哮喘患者中发现DPP4水平有统计学上显著的增加(p<0.05)，在患有中度疾病的哮喘患者中有DPP4水平增加的趋势。图5。相反地，与未服用药物、仅服用或服用沙丁胺醇和吸入类固醇的患者相比，来自服用口服和吸入类固醇的哮喘患者的血清中的DPP4蛋白水平较低(图6)。IL-13调节DPP4，在患有中度或重度疾病的哮喘患者中血清DPP4增加，以及口服和吸入类固醇降低血清DPP4水平，这些发现表明DPP4：(1)可以用作哮喘肺中IL-13途径活化的外周标志物；(2)可以在为哮喘患者选择可能的疗法方面是有益的，以及(3)可以用于选择对使用IL-13拮抗剂(例如，抗IL-13抗体(如曲洛克木单抗)的疗法有响应的患者。
实例2
用于人血清中DPP4定量的方法
使用改良的人DPP4/CD26ELISA试剂盒(R&D系统；目录号DC260)确定来自人血清样品的DPP4。免疫测定可以用于定量测定细胞培养物上清液、血清、血浆、唾液、以及尿中的人类DPP4浓度。该免疫测定包含表达NS0的重组人类DPP4，以及针对重组因子而产生的抗体。该测定采用定量夹心酶联免疫分析技术。将对DPP4特异的单克隆抗体预涂覆至微量培养板上。将标准物和样品用移液管吸取进孔中，并且将任何存在的DPP4与固定抗体结合。在将任何非结合的物质洗掉之后，将对DPP4特异的酶联多克隆抗体添加至孔中。在清洗以去除任何非结合的抗体-酶试剂之后，将基质溶液添加至孔中并且彩色与初始步骤中结合的DPP4的量成比例显影。将显色终止并且测量颜色的强度。
DPPIV试剂：
(1)DPPIV微量培养板，R&D Part 892951：96孔聚甾烯微量培养板(12条，每条8孔)，涂覆有针对DPP4的大鼠单克隆抗体。
(2)DPPIV偶联物，R&D Part 892952：21mL的针对DPP4的多克隆抗体，共轭至具有防腐剂的辣根过氧化物酶。
(3)DPPIV标准品，R&D Part 892953：200ng的重组人类DPP4在具有防腐剂的缓冲剂中，冻干的。
(4)测定稀释剂RD1-57，R&D Part 895207：11mL具有蓝色染料和防腐剂的缓冲的蛋白质基。
(5)校准稀释剂RD5-33，R&D Part 895813：3个小瓶(21mL/瓶)的具有防腐剂的缓冲的蛋白质基，对于血清/血浆样品(以及替代的校准稀释剂RD5K，R&D Part 895119，由21mL具有防腐剂的动物血清组成，可以用于细胞培养物上清液、唾液、以及尿液样本)。
(6)显色试剂A，R&D Part 895000：12.5mL的稳定性过氧化氢。
(7)显色试剂B，R&D Part 895001：12.5mL的稳定性色原(四甲基联苯胺)。
(8)终止液，R&D Part 895032：6mL的2N硫酸。
(9)板罩：4条黏合带。
样品收集和贮藏：收集样品并且通过以下方法贮藏。
(1)细胞培养物上清液：通过离心去除微粒并且立即检测，或者将样品等分并在-20℃或更低的温度下贮藏。重复的冻融循环得以避免。
(2)血清：使用血清分离管(SST)。在1000x g下离心15分钟之前，允许样品持续凝块30分钟。去除血清并且立即检测，或者将样品等分并在-20℃或更低的温度下贮藏。重复的冻融循环得以避免。
(3)血浆：使用肝素或EDTA作为抗凝血药收集血浆。在收集30分钟之内，将血浆在1000xg下离心15分钟。将血浆样品立即检测或者等分并在-20℃或更低的温度下贮藏。重复的冻融循环得以避免。
(4)唾液：使用收集装置(如或等效物)收集唾液。将唾液样品立即检测或者等分并在-20℃或更低的温度下贮藏。重复的冻融循环得以避免。
(5)尿：无菌收集当天的第一次尿(中流)并且直接排泄进入无菌容器中。将样品离心以去除颗粒物质并立即检测或者等分，并在-20℃或更低的温度下贮藏。重复的冻融循环得以避免。
DPP4测定步骤：在使用之前将所有试剂和样品带至室温。将所有样品、标准品、以及对照物以一式两份进行测定。
(1)如标准制造商操作方案中所指示来制备所有试剂、标准品稀释液和样品。
(2)在1:50MRD(所需最小稀释)下测试样品。将所有样品在2％血清基质下测试所有样品。将样品在室温下解冻并且用校准稀释剂RD5-33稀释。
表1.标准稀释方案
表2.QC稀释方案
(3)将100μL的测定稀释剂RD1-57添加至每个孔。
(4)将50μL的标准品、对照物、或样品添加至每个孔。用板盖覆盖样品，并且在室温下孵育2小时。
(5)将每个孔吸出并且洗涤，重复该过程3次，总共洗涤4次。
(6)将200μL的DPP4偶联物添加至每个孔。用新板盖覆盖样品，并且在室温下孵育2小时。
(7)将孔内含物吸出，并且将孔洗涤4次。
(8)将200μL的基质溶液添加至每个孔。将样品在室温下孵育30分钟，使其避光。
(9)将50μL的终止液添加至每个孔。在30分钟之内，在450nm处测量每个孔的光密度。
实例3
2b期、随机化、双盲研究，来评估SC曲洛克木单抗在患有不受控、严重哮喘的成人中的疗效与安全性
表3.缩写列表
I.研究目的和设计
研究CD-RI-CAT-354-1049是2b期、随机化的、双盲、安慰剂对照的、平行组、多中心研究，来评估曲洛克木单抗的两种SC治疗方案在患有不受控、严重的哮喘的成人中的疗效和安全性，这些成人需要高剂量的ICS和LABA(具有或不具有另外的控制药物)(高剂量的ICS定义为日总剂量>500μg氟替卡松DPI或>440μg定量雾化吸入剂(MDI；全球哮喘管理和防治策略，全球哮喘防治创议(GINA)2012)，可从www.ginasthma.org获得；国家心脏，肺和血液研究所，全国哮喘教育和预防项目专家小组报告3：诊断与管理哮喘的完整报告指南2007)。在随机化之前，将有一个5周的筛选/导入期(第-5周至第-1周[第-1天])。从第-4周(第-28天)开始，患者接受氟替卡松/沙美特罗的一个固定剂量的组合产品，该组合产品作为MDI(230μg/21μg)，按2次吸入的剂量每日两次；或作为DPI(500μg/50μg)，按1次吸入的剂量每日两次。如果患者还服用另外的哮喘控制药剂(包括白三烯修饰因子、茶碱、克米罗、第二ICS、或口服泼尼松龙≤20mg/天或当量的OCS)，那么在筛选/导入和治疗期期间，这些药剂将按稳定剂量继续。
主要入选标准：
(i)在筛选/导入期之前，记录医生诊断的哮喘持续至少12个月，并且：
(a)在第1次访问前，在36个月内记录的FEV1≥12％和≥200mL至SABA的支气管扩张剂后的可逆性的证据；或者
(b)在第1次访问前，在36个月内记录的对乙酰甲基胆碱(FEV1[PC20]≤8mg/mL的20％下降)、组胺、或甘露醇激发的阳性应答的证据；或者
(c)在第1次或2次访问时，支气管扩张剂后FEV1≥12％和≥200mL的增加。(针对可逆性评估给予最大400μg沙丁胺醇。)
(ii)针对在筛选/导入期前12个月中的至少6个月，哮喘控制剂方案与在GINA指南(GINA，2009)的步骤4或5处所描述的一致，并且必须使用医生规定的高剂量ICS，结合以LABA，在筛选/导入期前持续至少30天
(iii)在筛选/导入期前12个月内至少2次但不超过6次记录的哮喘恶化事件的历史
(iv)下列中的至少一种：在筛选和随机化访问时，所预测的在40％和80％之间的上午支气管扩张剂前的FEV1值或前一周的ACQ-6分数≥1.5。
计划将至少390名年龄在18至75岁之间的患者按1:1的比率对2个组群中的1个进行随机化(组群1或组群2)。在各组群之中，将患者按2:1的比率随机化，以接受曲洛克木单抗(300mg)或安慰剂如下：
组群1：曲洛克木单抗300mg(n＝130)或安慰剂(n＝65)，以Q2W，2次SC注射，持续50周，总计有26个剂量。
组群2：曲洛克木单抗300mg(n＝130)或安慰剂(n＝65)，以Q2W，2次SC注射，持续12周，随后Q4W，持续38周，总计有16个剂量。
患者在筛选时由在过去的12个月中哮喘恶化的次数(2次对比>2次但≤6次恶化)和慢性OCS的使用(存在对比不存在)来进行分层。
本研究的主要目的是评估曲洛克木单抗的两种SC治疗方案(300mg Q2W和300mgQ2/4W)在52周中对AER的作用。次要目的是评估曲洛克木单抗的安全性和耐受性，曲洛克木单抗对肺功能的作用，患者报告的结果(包括ACQ-6分数和使用AQLQ[S]的HRQoL，以及使用哮喘日记的哮喘症状)。试验和关键主要终点及次要终点的设计总结于图7中。
哮喘恶化定义为哮喘症状(咳嗽、喘息、胸部紧迫感、和/或气促)的递增，这些哮喘症状在开始使用急救药物后并不能解决并对患者仍有麻烦，导致：
1.使用全身皮质类固醇(片剂、悬浮剂、或注射剂)或增加稳定的全身维持剂量持续至少3个连续日的持续时间或者
2.患者开始使用全身皮质类固醇持续至少3个连续日的持续时间。
针对曲洛克木单抗治疗组，与结合的安慰剂相比，从组群1和2中，该试验能检测年AER的40％降低，假设在安慰剂组中年恶化率为1.2，具有80％强度以及0.15的显著水平。样本量足够用于预先设定的亚组分析，来研究在哮喘肺部(包括血清骨膜蛋白、外周嗜酸性粒细胞计数、以及Th2状态)中，对曲洛克木单抗的临床应答和与IL-13的上调有关的外周血液生物标志的存在之间的关系(Th2高定义为IgE>100IU/mL并且血液嗜酸性粒细胞≥0.14×109/L；伍德拉夫(Woodruff)，等人，美国呼吸和重症监护医学杂志(Am.J.Respir.Crit.Care Med.)2009；180:388-395)。
共452位患者随机来自15个国家(阿根廷、加拿大、智利、捷克共和国、法国、德国、日本、墨西哥、菲律宾、波兰、俄罗斯、韩国、西班牙、英国和美国)。已经对在53周中收集的所有有效性和安全性数据进行了分析。
II.疾病评估和方法
支气管扩张剂前和后的FEV1以及FVC测量，包括可逆性计算
每次肺呼吸量测定法评估时进行支气管扩张剂前和后的FEV1以及FVC。可逆性评估如下进行：
(1)使用肺呼吸量测定法评估支气管扩张剂前FEV1测量。在根据美国胸腔学会(American Thoracic Society)(ATS)/欧洲呼吸学协会(ERS)指南(米勒(Miller)等人，欧洲呼吸杂志(Eur Respir J)，2005 26:153-61)由中心供应商所提供的设备上进行肺呼吸量测定。捕获以下值：支气管扩张剂前和后的FEV1、FEV6、FVC、以及IC。在6:00AM与11:00AM之间的早上进行肺呼吸量测定法测试。在治疗的那些天，在给予调研产品之前，进行肺活量测定进行测试。所有的早间肺活量测定测试在6:00AM和11:00AM之间完成，并且在筛选肺活量测定的±1小时内完成。举例来说，如果筛选肺呼吸量测定是在8:00Am，那么后续就诊的所有的肺呼吸量测定测试必须在7:00AM和9:00AM之间完成。在肺呼吸量测定法测试之前，受试者被要求避免大强度运动30分钟。
(2)在轻轻并且不完全呼气之后，从间隔物装置中将剂量为100μg的沙丁胺醇(或等效的短效支气管扩张剂)一气地吸入至肺总量。
(3)然后在受试者呼气之前，屏气5-10秒。以30秒的间隔递送4个单独剂量为100μg的沙丁胺醇。
(4)受试者等待15-30分钟(如果使用短效抗胆碱能药，则30分钟)。
(5)评估支气管扩张剂后的FEV1测量，并且记录符合ATS或ERS可接受性和重复性标准的至少2次最佳尝试。将2次最佳尝试的最大FEV1用于分析。在整个研究中，每个受试者使用相同剂量和类型的短效支气管扩张剂。针对可逆性评估，使用了总剂量为小于400μg的沙丁胺醇或等效物。
可逆性计算如下：
％可逆性＝(支气管扩张剂后FEV1-支气管扩张剂前FEV1)×100/支气管扩张剂前FEV1
ACQ-6：哮喘控制调查表
该ACQ是评估哮喘症状的患者报告(夜间醒来，醒来时的症状，活动受限，气促，喘息)和日常救援支气管扩张药的使用以及FEV1的问卷(朱尼珀(Juniper)等人，欧洲呼吸杂志(Eur.Respir.J.)，1999 14:902-7)。该ACQ-6是评估哮喘症状(夜间醒来，醒来时的症状，活动受限，气促，喘息，和短效β2激动剂使用)的ACQ的简化版本，其从原ACQ分数省略了FEV1测量。在第1次就诊期间完成ACQ-6(第-5周)。受试者第2次就诊时配备ePRO装置并且在第2次和第4次就诊之间在家每周完成ACQ-6，并且之后每四周一次直到第33次就诊(第75周)。受试者被要求通过回答一个支气管扩张药使用的问题和5个症状问题，回忆起在前一周他们的哮喘状况如何。问题是等加权的，并且从0(被完全控制)至6(严重失控)进行评分。平均ACQ分数是响应的均值。≤0.75的平均得分表示控制良好的哮喘；在0.75和≤1.5之间的得分表示部分控制的哮喘；并且>1.5的得分表示未控制的哮喘(朱尼珀(Juniper)等人，呼吸道医学(Respir.Med.)2006 100:616-21)。至少0.5的个体变化被认为是具有临床意义的(朱尼珀(Juniper)等人，呼吸道医学(Respir.Med.)2005 99:553-8)。
AQLQ：哮喘生活质量调查表(标准版)
该AQLQ(S)是32项的问卷，测量哮喘患者经历的HRQoL(朱尼珀(Juniper)等人，胸科杂志(Chest.)1999年5月；115(5):1265-70)并且是在第1周的访问完成，并且然后使用ePRO装置每4周一次在家完成，一直到第75周的访问。该问卷包括4个独立的部分(症状、活动受限、情感功能、和环境刺激)。受试者被要求回忆其在前2周内的经历，并且基于范围从7(无损害)至1(重度损害)的7分尺度，对32个问题中的每个进行评分。将整体得分计算为所有问题的平均应答。这4个单个部分的分数(症状、活动受限、情感功能、和环境刺激)是每个部分中对问题的平均应答。0.5的整体得分和单个部分分数的个体改善被确定为最小重要变化，其中将>1.5的得分变化确定为大有意义的变化(朱尼珀(Juniper)等人，临床流行病学期刊(J.Clin.Epidemiol.)1994；47:81-7)。
哮喘恶化
出于本研究的目的，将第1次就诊之后发生的哮喘恶化定义为哮喘症状(咳嗽、喘息、胸部紧迫感、和/或气促)的逐步增加，这些哮喘症状在开始用抢救药物后并没有解决并且对受试者来说仍然很麻烦，导致了(1)使用全身用皮质类固醇(片剂、混悬剂或注射液)或增加稳定全身的维持剂量，持续至少连续3天的时间；或(2)开始用全身用皮质类固醇持续至少连续3天的时间。
在给予最后剂量的OCS后7天(在给予注射用皮质类固醇的10天后)，哮喘恶化事件被视为已解决。在这段时间之后开始的皮质类固醇疗程被认为是独立的新的哮喘恶化。
哮喘恶化严重性分类如下：
(a)中等的：恶化的症状需要全身用皮质类固醇持续至少连续3天的时间；以及，
(b)严重的：恶化的症状需要全身用皮质类固醇和紧急护理评估和/或住院。
III.终点
曲洛克木单抗对肺机能的效果
通过支气管扩张剂前和后的FEV1、FEV6、FVC、以及在临床受访时(早晨)的IC；以及在家测量的PEF和FEV1测量曲洛克木单抗对肺机能的效果。使用描述统计，总结在各时间点与基线相比平均值的变化以及与基线相比的百分比变化。使用双样品t检验来比较单独的曲洛克木单抗治疗组和结合的安慰剂之间受试者的肺机能与基线相比的变化以及与基线相比的百分比变化。
曲洛克木单抗对患者报道式结果的效果
对与基线相比平均ACQ-6得分的变化进行分析。使用费希尔精确检验分析来比较单独的曲洛克木单抗治疗组和结合的安慰剂之间，在研究过程中，达到ACQ-6≤0.75、ACQ-6≤1.5、以及与基线相比平均ACQ-6得分的降低≥0.5的受试者比例。进行分层的时序检验，以将时间与第一次哮喘对照进行比较，定义为第一次观察到与基线相比平均ACQ-6得分的降低≥0.5。使用AQLQ(S)和EQ-5D，对健康相关的生活质量进行评价。使用描述统计，总结来自AQLQ(S)响应的总体和4个部分的分数与它们各自与基线相比的变化。另外，对AQLQ(S)反应者的比例进行报告；在每次随访时，分别对具有与基线相比AQLQ(S)得分的改善>0.5的受试者以及具有改善>1.5的受试者进行报告。
EQ-5D调查表评估5个方面：移动性、自理、日常活动、疼痛/不适、以及焦虑/抑郁。每个方面具有3个反应选项(没有问题、一些或中等问题、以及无能为力或极端问题)，这些选项反映增加的难度。该调查表还包括直观类比标度，其中患者被要求对他们的健康现况以0-100的标度进行评级，0为所想象的最差的健康状况。按治疗组和访问，总结来自每个方面的响应以及直观类比标度。针对每个方面提供移动表。按访问，用描述统计总结与基线相比直观类比标度的变化。
IV.结果
功效
主要功效分析是基于意向治疗(ITT)群体(n＝452)。ITT群体包括被随机化到研究之中的所有患者。根据初始随机化指定治疗组，无论患者是否接受任何研究产品或接受与他们被随机化到其中不同的研究产品。
人口统计与基础疾病特征
安慰剂与曲洛克木单抗组之间的基线人口统计学特征是大体相似的(表4)。患者群体的平均年龄为50.3岁(范围在18-75岁)。大多数患者不是西班牙裔或拉丁美洲裔，大约一半患者是白人，并且三分之一是亚裔。群体中大约三分之二是女性。
表4：基线人口统计学特征的概述(ITT群体)
BMI＝身体质量指数；ITT＝意向治疗；Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周；SD＝标准偏差
安慰剂与曲洛克木单抗组之间的基线疾病特征是大体相似的(表5)，包括血清骨膜蛋白水平、血嗜酸性粒细胞计数以及Th2状态。据报道16％至18％的患者接受慢性OCS。如在实例2中所述，测量DPP4。
平均FEV1％可逆性范围在10.0％和12.7％之间，大约三分之一的患者显示出基线处FEV1可逆性≥12％。平均ACQ-6得分以及预测的支气管扩张剂前FEV1(％)反映出在基线处没有良好控制的患有哮喘的患者群体。
表5：基线疾病特征的概述(ITT群体)
ACQ-6＝哮喘控制调查表6；AQLQ(S)＝哮喘生活质量调查表-标准版；FEV1＝第一秒用力呼气容积；ITT＝意向治疗；OCS＝口服型皮质类固醇；Pre-BD＝支气管扩张剂前；Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周；SD＝标准偏差；Th2＝T辅助细胞类型2
a平均ACQ-6得分：≤0.75＝控制良好；得分>0.75以及<1.5＝部分控制；得分≥1.5＝不受控
b Th2高：IgE>100IU/mL并且血液嗜酸性粒细胞≥0.14x 109/L(伍德拉夫(Woodruff)，等人，美国呼吸和重症监护医学杂志(Am J Respir Crit Care Med.)180:388-395(2009))。
大约三分之一的患者患有儿童哮喘，成人哮喘发病的中位年龄为35-37岁(表6)。超过一半的患者报告过敏是哮喘触发物。超过三分之一的患者报告在之前的一年里有3-6次哮喘恶化(在进入研究之前的一年里患者被要求有2-6次恶化)并且大约17％至21％的患者报告与哮喘有关的入院。
表6：哮喘史总结(ITT群体)
主要和关键次要疗效终点的分析：ITT群体
在第53周哮喘年恶化率的概述
在ITT群体中，安慰剂与曲洛克木单抗组第53周的年AER是类似的(表7)。
表7：在第53周哮喘年恶化率的概述(ITT群体)
AER＝哮喘恶化速率；CI＝置信区间；ITT＝意向治疗；Q2W＝每2周；
Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周；RR＝速率比
a速率＝每组中哮喘恶化的总数/每组中总人年随访；并且95％CI比率基于确切95％泊松CI
b速率比以及针对该速率比的95％CI估算自泊松回归(皮尔森校正(Pearsoncorrection))，以治疗组、年龄、性别、在过去的一年中恶化的次数(2对比>2但≤6)、特应性哮喘状态(特应性/非特应性)、慢性OCS的使用(存在对比不存在)以及地理区作为协变量。
c来自泊松回归的P-值基于与安慰剂的成对比较
关键次要疗效终点：曲洛克木单抗对FEV1的效果
研究的关键次要疗效终点是评估曲洛克木单抗对肺机能的效果，如通过肺呼吸量测定法变量自基线的变化，特别是支气管扩张剂前和后的FEV1进行评价。在第53周，与安慰剂相比，对于曲洛克木单抗300mg Q2W组，针对支气管扩张剂前和后的FEV1二者都观察到了与基线相比在统计学上显著的平均增加(p<0.004；表8)。在第53周，与安慰剂相比，对于曲洛克木单抗300mg Q2/4W组，针对支气管扩张剂前或后的FEV1二者都没有观察到与基线相比在统计学上显著的平均变化。
表8：在第53周与基线相比FEV1的变化的概述(ITT群体)
CI＝置信区间；FEV1＝第一秒用力呼气容积；ITT＝意向治疗；BD后＝支气管扩张剂后；BD前＝支气管扩张剂前；Q2W＝每2周；
Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周
与基线相比的变化＝当前就诊值-基线值
与基线相比的百分比变化＝(当前就诊值-基线值)/基线值×100
P值来自混合效应重复测量模型，该模型比较第53周每个组群内曲洛克木单抗与安慰剂之间的治疗效果
与安慰剂相比在前17周的研究过程中治疗组都观察到了FEV1的相对增加(图8)。这些增加在曲洛克木单抗300mg Q2W组中直至保持至53周，但在曲洛克木单抗300mg Q2/4W组中丢失，这意味着Q4W维持剂量不足以维持气流阻塞的改善。
关键次要疗效终点：曲洛克木单抗对患者报道式结果ACQ-6和AQLQ(S)的效果
该ACQ-6是评估哮喘症状(夜间醒来，醒来时的症状，活动受限，气促，喘息，和SABA使用)的ACQ的简化版本，其从原ACQ得分省略了FEV1测量。问题是等加权的，并且从0(被完全控制)至6(严重失控)进行评分。平均ACQ得分是响应的均值。≥1.5的ACQ得分具有0.88的阳性预测值，该患者患有控制不足的哮喘(朱尼珀(Juniper)等人，2006)。≤0.75的平均得分表示控制良好的哮喘；在0.75和<1.5之间的得分表示部分控制的哮喘；并且≥1.5的得分表示未控制的哮喘(朱尼珀(Juniper)等人，呼吸道医学(Respir.Med.)2006 100:616-21)。至少0.5的个体变化被认为是具有临床意义的(朱尼珀(Juniper)等人，呼吸道医学(Respir.Med.)2005 99:553-8)。
在这项研究中，在治疗期间，按Q4W使用ePRO装置在家中完成ACQ-6。直到第53周，评价与基线相比的变化。在第53周，当比较安慰剂与曲洛克木单抗组时，没有发现ACQ-6得分存在统计学显著性差异(表9)。
该AQLQ(S)是32项的问卷，测量哮喘患者经历的HRQoL(朱尼珀(Juniper)等人，胸科杂志(Chest.)1999 115:1265-70)。该问卷包括4个独立的部分(症状、活动受限、情感功能、和环境刺激)。患者被要求回忆其在前2周内的经历，并且基于范围从7(无损害)至1(重度损害)的7分尺度，对32个问题中的每个进行评分。将整体得分计算为所有问题的平均应答。0.5的整体得分的个体改善已经被确定为最小重要变化，其中将>1.5的得分变化确定为大有意义的变化(朱尼珀(Juniper)等人，临床流行病学期刊(J.Clin.Epidemiol.)199447:81-7)。
在这项研究中，在治疗期间，按Q4W使用ePRO装置在家中完成AQLQ(S)。直到第53周，评价与基线相比的变化。在第53周，当比较安慰剂与曲洛克木单抗组时，没有发现AQLQ(S)得分存在统计学显著性差异(表9)。
表9：在第53周与基线相比平均ACQ-6和AQLQ(S)的变化的概述(ITT群体)
ACQ-6＝哮喘控制调查表6；AQLQ(S)＝哮喘生活质量调查表-标
准版；CI＝置信区间；ITT＝意向治疗；Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周
P值来自混合效应重复测量模型，该模型比较第53周每个组群内曲洛克木单抗与安慰剂之间的治疗效果
关键次要疗效终点：曲洛克木单抗对哮喘日记的效果
该哮喘日记是13项的问卷。从第2次就诊(第-4周)直到第75周的就诊，明天早晨使用ePRO装置评估该哮喘日记。要求患者回忆起他们的经历：日间和夜间症状频率和严重性、活动回避和活动受限、哮喘相关的焦虑和疲劳连同救援药物的使用。该总体症状得分计算为日间严重性得分、日间频率得分、以及夜间严重性得分的平均数，并且范围从0(无症状)至4(最差可能的症状)。
直到第53周，评价与基线相比的变化。在第53周，当比较安慰剂与曲洛克木单抗组时，没有发现每日哮喘日记总体哮喘症状得分存在统计学显著性差异(表10)。
表10：在第53周与基线相比哮喘日记的变化的概述(ITT群体)
CI＝置信区间；ITT-意向治疗；Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周
P值来自混合效应重复测量模型，该模型比较第53周每个组群内曲洛克木单抗与安慰剂之间的治疗效果
关键主要和次要疗效终点的亚组分析
多个预指定的亚组分析被定义为研究对曲洛克木单抗的临床应答和基线临床标准之间的关系。呈现了由基线FEV1％可逆性(≥12％对比<12％)和OCS的使用(存在对比不存在)定义的亚组。此外，按基线处在过去的12个月中之前的恶化计(2对比>2≤6)进行亚组分析，没有观察到对曲洛克木单抗响应的关系。为了研究对曲洛克木单抗的临床应答和与IL-13的上调有关的外周血液生物标志之间的关系，呈现了由基线血清骨膜蛋白定义的亚组(≥中值对比<中值)、外周嗜酸性粒细胞计数(≥300个细胞/μL对比<300个细胞/μL)、以及Th2状态(定义的Th2高对比Th2低)。
亚组分析：基线FEV1可逆性
基于在随机化访问时给予支气管扩张剂后FEV1可逆性对SABA的程度进行亚组分析。定义了高可逆亚组(SABA之后与基线相比FEV1的变化≥12％)和低可逆亚组(变化<12％)。
在第53周，分析显示出，在高可逆亚组中，与安慰剂相比，在曲洛克木单抗300mgQ2W组群中的年AER降低(34％[95％CI:-32,67％])。在低可逆组中没有观察到年AER的降低(表11)。
在曲洛克木单抗300mg Q2/4W组群中，在高可逆亚组中的年AER降低(24％[95％CI:-54,63％])也在数值上大于低可逆组中的(2％[95％CI:-60,40％])。
表11：按基线处FEV1可逆性计，在第53周哮喘年恶化率的概述(ITT群体)
CI＝置信区间；FEV1＝第一秒用力呼气容积；ITT＝意向治疗；Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周；RR＝速率比
速率＝每组中哮喘恶化的总数/每组中总人年随访；并且95％CI比率基于确切95％泊松CI
速率比以及针对该速率比的95％CI估算自泊松回归(皮尔森校正(Pearsoncorrection))，以治疗组、年龄、性别、在过去的一年中恶化的次数(2对比>2但≤6)、特应性哮喘状态(特应性/非特应性)、慢性OCS的使用(存在对比不存在)以及地理区作为协变量。
来自泊松回归的P-值基于与安慰剂的成对比较
第53周的分析显示出，与安慰剂相比，在曲洛克木单抗300mg Q2W中，在高(11.07％[95％CI:0.99,21.14)和低可逆(7.48％[2.55,12.40])亚组中与基线相比FEV1都有增加；该高可逆亚组中的增加在数值上较高。在曲洛克木单抗300mg Q2/4W组群中，在高或低可逆亚组中均没有观察到FEV1的临床上相关的变化(表12)。
表12：按基线处FEV1可逆性状态计，第53周关键次要疗效终点自基线的变化的概述(ITT群体)
ACQ-6＝哮喘控制调查表6；AQLQ(S)＝哮喘生活质量调查表-标准版；CI＝置信区间；FEV1＝第一秒用力呼气容积；ITT＝意向治疗；Q2W＝每2周；
Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周
P值来自混合效应重复测量模型，该模型比较第53周每个组群内曲洛克木单抗与安慰剂之间的治疗效果
在接受曲洛克木单抗300mg Q2W的患者中，与安慰剂相比，ACQ-6得分的平均变化在高可逆亚组中(-0.44[95％CI:-0.89,0.01])在数值上较大，并且与低可逆亚组(0.06[95％CI:-0.37,0.24])相比，接近最小临床重要改变(MCID；-0.5)。在曲洛克木单抗300mgQ2/4W组群中的亚组中观察到了相同的关系，但没有达到高可逆亚组中的MCID(表12)。
在接受曲洛克木单抗300mg Q2W的患者中，与安慰剂相比，在高可逆亚组(0.59[95％CI:0.10,1.09])中观察到AQLQ(S)总体得分的平均变化的改善并且达到0.5的MCID。在低可逆亚组中没有观察到AQLQ(S)的改善。在曲洛克木单抗300mg Q2/4W组群中的亚组中观察到了相同的关系，但没有达到高可逆亚组中的MCID(表12)。
在第53周，在接受曲洛克木单抗300mg Q2W的患者中，与安慰剂相比，在高可逆亚组(-0.23[95％CI:-0.51,-0.04])中观察到与低可逆亚组(-0.02[95％CI:-0.22,0.19])相比与基线相比每日哮喘日记总体症状得分在数值上较大的降低。在曲洛克木单抗300mgQ2/4W组群中的亚组中观察到了相同的关系(表12)。
亚组分析：OCS的使用
在第53周，分析显示出，在无慢性OCS的使用的患者中，与安慰剂相比，在曲洛克木单抗300mg Q2W(21％[95％CI:-17,47％])和Q2/4W组群(13％[95％CI:-34,43％]))中，年AER有所降低。在有慢性OCS的使用的患者中，与安慰剂相比，对于曲洛克木单抗300mg Q2W和Q2/4W组群，没有观察到年AER的降低(表13)。
表13：按长期口服型皮质类固醇的使用计，在第53周哮喘年恶化率的概述(ITT群体)
CI＝置信区间；ITT＝意向治疗；OCS＝口服型皮质类固醇的使用；Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周；RR＝速率比
速率＝每组中哮喘恶化的总数/每组中总人年随访；并且95％CI比率基于确切95％泊松CI
速率比以及针对该速率比的95％CI估算自泊松回归(皮尔森校正(Pearsoncorrection))，以治疗组、年龄、性别、在过去的一年中恶化的次数(2对比>2但≤6)、特应性哮喘状态(特应性/非特应性)、慢性OCS的使用(存在对比不存在)以及地理区作为协变量。
来自泊松回归的P-值基于与安慰剂的成对比较
第53周的分析显示出，与安慰剂相比，在无慢性OCS的使用的患者中(7.33％[95％CI:2.52,12.14])，与有慢性OCS的使用的患者(0.87％[95％CI:-14.70,16.44]；表14)相比，在曲洛克木单抗300mg Q2W组群中与基线相比的支气管扩张剂前FEV1在数值上有较大的增加。在曲洛克木单抗300mg Q2/4W组群中，在有或无慢性OCS的使用的亚组中均没有观察到FEV1的临床上相关的变化。
对于任一曲洛克木单抗组群，在有或无慢性OCS的使用的亚组中均没有观察到对于ACQ-6、AQLQ(S)、以及每日哮喘日记症状得分与安慰剂相比的临床上的重要变化。
表14：按长期口服型皮质类固醇的使用计，第53周关键次要疗效终点自基线的变化的概述(ITT群体)
ACQ-6＝哮喘控制调查表6；AQLQ(S)＝哮喘生活质量调查表-标准版；CI＝置信区间；FEV1＝第一秒用力呼气容积；OCS＝口服型皮质类固醇；ITT＝意向治疗；Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周
P值来自混合效应重复测量模型，该模型比较第53周每个组群内曲洛克木单抗与安慰剂之间的治疗效果
亚组分析：基线血清骨膜蛋白水平
在第53周由在基线处的血清骨膜蛋白水平的亚组分析显示出，在高骨膜蛋白组(≥在基线处的血清骨膜蛋白中值水平；25％[95％CI:-19,53％])中，与安慰剂相比，在曲洛克木单抗300mg Q2W组群中观察到了年AER的降低。在低骨膜蛋白组(<在基线处的血清骨膜蛋白中值水平；表15)中，没有观察到AER的降低。
表15：按基线处血清骨膜蛋白水平计，直至第53周哮喘恶化速率的概述(ITT群体)
CI＝置信区间；FEV1＝第一秒用力呼气容积；ITT＝意向治疗；Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周；RR＝速率比
速率＝每组中哮喘恶化的总数/每组中总人年随访；并且95％CI比率基于确切95％泊松CI
速率比以及针对该速率比的95％CI估算自泊松回归(皮尔森校正(Pearsoncorrection))，以治疗组、年龄、性别、在过去的一年中恶化的次数(2对比>2但≤6)、特应性哮喘状态(特应性/非特应性)、慢性OCS的使用(存在对比不存在)以及地理区作为协变量。
来自泊松回归的P-值基于与安慰剂的成对比较
与安慰剂相比，在高骨膜蛋白(6.75％[95％CI-0.31,13.82])以及低骨膜蛋白亚组(7.06％[95％CI:0.51,13.60]；表16)中均观察到与基线相比FEV1的改善。
在曲洛克木单抗300mg Q2/4W组群中，在骨膜蛋白亚组中均没有观察到FEV1的临床上相关的变化。对于任一曲洛克木单抗组群，在高或低骨膜蛋白的亚组中均没有观察到对于ACQ-6、AQLQ(S)、以及每日哮喘日记症状得分与安慰剂相比的临床上的重要变化。
表16：按基线处血清骨膜蛋白水平计，第53周关键次要疗效终点自基线的变化的概述(ITT群体)
亚组分析：基线外周血液嗜酸性粒细胞计数
在第53周由在基线处的血液嗜酸性粒细胞计数的亚组分析显示出，在高嗜酸性粒细胞组(血液嗜酸性粒细胞计数≥在基线处的300个细胞/μL；22％[95％CI:-31,54％])中，与安慰剂相比，在曲洛克木单抗300mg Q2W组群中AER的降低。对于低嗜酸性粒细胞组(血液嗜酸性粒细胞计数<300个细胞/μL)，在300mg Q2W组群中未观察到年AER的降低。参见表17。
相反地，对于曲洛克木单抗300mg Q2/4W组群，在高嗜酸性粒细胞亚组中未观察到年AER的降低；而在低嗜酸性粒细胞亚组中存在年AER的降低(23％)。
表17：按基线处外周血嗜酸性粒细胞计数计，直至第53周哮喘恶化速率的概述(ITT群体)
CI＝置信区间；FEV1＝第一秒用力呼气容积；ITT＝意向治疗；Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周；RR＝速率比
速率＝每组中哮喘恶化的总数/每组中总人年随访；并且95％CI比率基于确切95％泊松CI
速率比以及针对该速率比的95％CI估算自泊松回归(皮尔森校正(Pearsoncorrection))，以治疗组、年龄、性别、在过去的一年中恶化的次数(2对比>2但≤6)、特应性哮喘状态(特应性/非特应性)、慢性OCS的使用(存在对比不存在)以及地理区作为协变量。
来自泊松回归的P-值基于与安慰剂的成对比较
与安慰剂相比，在高嗜酸性粒细胞亚组(13.49％[95％CI:4.99,22.00])中与基线相比FEV1的百分比增加在数值上高于低嗜酸性粒细胞亚组(4.38％[95％CI:-1.51,10.273])；表18)中接受曲洛克木单抗300mg Q2W的患者的。在曲洛克木单抗300mg Q2/4W组群中，在高嗜酸性粒细胞亚组中没有观察到FEV1的临床上相关的变化。
在接受曲洛克木单抗300mg Q2W的患者中，与安慰剂相比，ACQ-6得分的平均变化在高嗜酸性粒细胞亚组中(-0.49[95％CI:-0.88,-0.09])与低嗜酸性粒细胞亚组(-0.02[95％CI:-0.34,0.290])相比较大，并且接近-0.50的MCID。这些亚组之间的该差异在曲洛克木单抗300mg Q2/4W组群中并不明显。
对于任一曲洛克木单抗治疗组群，在高嗜酸性粒细胞亚组中没有观察到对于AQLQ(S)得分与安慰剂相比的临床上的重要变化。
与安慰剂相比，对于300mg曲洛克木单抗Q2W和Q2/4W组群，在高嗜酸性粒细胞亚组(分别为-0.21[95％CI:-0.47,0.04]何-0.19[95％CI:-0.45,0.07])中均观察到与低嗜酸性粒细胞亚组(0.03[95％CI:-0.17,0.23]和-0.12[95％CI:-0.32,0.07])相比每日哮喘日记症状得分在数值上较大的降低。
表18：按外周血液嗜酸性粒细胞计数计，第53周关键疗效终点自基线的变化的概述(ITT群体)
ACQ-6＝哮喘控制调查表6；AQLQ(S)＝哮喘生活质量调查表-标准版；CI＝置信区间；FEV1＝第一秒用力呼气容积；ITT＝意向治疗；Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周
P值来自混合效应重复测量模型，该模型比较第53周每个组群内曲洛克木单抗与安
慰剂之间的治疗效果
亚组分析：基线Th2状态
在第53周由在基线处的Th2状态的亚组分析显示出，在基线处高Th2组(23％[95％CI:-25,52％)中，与安慰剂相比，在曲洛克木单抗300mgQ2W组群中年AER的降低。在低Th2组中没有观察到年AER的降低(表19)。
在曲洛克木单抗300mg Q2/4W组群中，在高或低Th2亚组中没有观察到对于年AER的治疗效果的增加。
表19：按基线处Th2状态计，在第53周哮喘年恶化率的概述(ITT群体)
CI＝置信区间；FEV1＝第一秒用力呼气容积；ITT＝意向治疗；Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周；RR＝速率比
a速率＝每组中哮喘恶化的总数/每组中总人年随访；并且95％CI比率基于确切95％泊松CI
b速率比以及针对该速率比的95％CI估算自泊松回归(皮尔森校正(Pearsoncorrection))，以治疗组、年龄、性别、在过去的一年中恶化的次数
(2对比>2但≤6)、特应性哮喘状态(特应性/非特应性)、慢性OCS的使用(存在对比不存在)以及地理区作为协变量。
c来自泊松回归的P-值基于与安慰剂的成对比较
在接受曲洛克木单抗300mg Q2W的患者中，与安慰剂相比，在高Th2亚组(8.64％[95％CI:1.57,15.716])以及低Th2亚组(3.42％[95％CI:-2.61,9.44])中均观察到与基线相比FEV1的百分比增加的改善。在曲洛克木单抗300mg Q2/4W组群中，在高或低Th2亚组中均没有观察到FEV1的临床上相关的变化(表20)。
对于任一曲洛克木单抗治疗组群，在高或低Th2的亚组中均没有观察到对于ACQ-6、AQLQ(S)、以及每日哮喘日记症状得分与安慰剂相比的临床上的重要变化(表20)。
表20：按基线处Th2状态计，第53周关键次要疗效终点自基线的变化的概述(ITT群体)
ACQ-6＝哮喘控制调查表6；AQLQ(S)＝哮喘生活质量调查表-标准版；CI＝置信区间；FEV1＝第一秒用力呼气容积；ITT＝意向治疗；Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周
P值来自混合效应重复测量模型，该模型比较第53周每个组群内曲洛克木单抗与安慰剂之间的治疗效果
事后亚组分析
在曲洛克木单抗300mg Q2W组群中，FEV1对短效支气管扩张剂的可逆性的存在被确定为重要的患者特征，表明对于年AER、FEV1、ACQ-6、AQLQ(S)、以及每日哮喘日记症状得分，临床上重要的益处的可能性。此外，在假设与上调的IL-13(高骨膜蛋白、高嗜酸性粒细胞、高Th2)相关的的亚组中，年AER的降低在数值上大于对应的“低”亚组中的。
为了进一步研究对曲洛克木单抗的临床应答以及鉴别对曲洛克木单抗具有最佳反应的患者组，进一步亚组分析研究了基于12％割点和外周血液生物标志物的高对比低FEV1可逆性的组合。
事后亚组分析：基线FEV1可逆性与血清骨膜蛋白水平
在高可逆组中，由在基线处的血清骨膜蛋白水平的分析显示出，在高骨膜蛋白组(54％[95％CI:-65,87％)中，与安慰剂相比，在曲洛克木单抗300mg Q2W组群中与低骨膜蛋白组(4％[95％CI:-140,61％]；表21)相比，年AER在数值上有较大的降低。
表21：按FEV1可逆性和血清骨膜蛋白水平计，在第53周哮喘年恶化率的概述(ITT群体)
CI＝置信区间；FEV1＝第一秒用力呼气容积；ITT＝意向治疗；Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周RR＝速率比
a速率＝每组中哮喘恶化的总数/每组中总人年随访；并且95％CI比率基于确切95％泊松CI
b速率比以及针对该速率比的95％CI估算自泊松回归(皮尔森校正(Pearsoncorrection))，以治疗组、年龄、性别、在过去的一年中恶化的次数(2对比>2但≤6)、特应性哮喘状态(特应性/非特应性)、慢性OCS的使用(存在对比不存在)以及地理区作为协变量。
c来自泊松回归的P-值基于与安慰剂的成对比较
此外，与安慰剂相比，在高骨膜蛋白亚组(13.85％[95％CI:-0.18,27.87])中与基线相比FEV1的百分比增加在数值上高于低骨膜蛋白亚组(7.62％[95％CI:-7.60,22.84]；表22)中的。
表22：亚组分析：按FEV1可逆性和血清骨膜蛋白水平计，在第53周与基线相比支气管扩张剂前的变化(ITT群体)
CI＝置信区间；FEV1＝第一秒用力呼气容积；ITT＝意向治疗；Q2W＝每2周；Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周
P值来自混合效应重复测量模型，该模型比较第53周每个组群内曲洛克木单抗与安慰剂之间的治疗效果
在曲洛克木单抗300mg Q2W组群中、具有基线处FEV1可逆性≥12％的患者中，观察到AER和支气管扩张剂前FEV1的改善；在那些还具有骨膜蛋白>中位值的患者中，该治疗效果有所提高。在曲洛克木单抗300mg Q2/4W组群中，对这些终点的作用大小通常较低并且没有观察到在基线处骨膜蛋白>中位值的效果(表22和图9)。
对于曲洛克木单抗300mg Q2W和Q2/4W组群二者，在基线处具有FEV1可逆性≥12％的那些患者中观察到的对ACQ-6、AQLQ(S)、以及哮喘日记的终点的治疗效果在那些还具有骨膜蛋白>中位值的患者中没有进一步提高(表23和图10)。
应当注意的是，对于曲洛克木单抗300mg Q2W组群，ACQ-6和AQLQ(S)的变化达到或接近对于在基线处具有FEV1可逆性≥12％的患者的MCID(表23)。而在Q2/4W组群中没有观察到。
表23：亚组分析：按FEV1可逆性和血清骨膜蛋白水平计，在第53周与基线相比患者报道式结果的变化(ITT群体)
ACQ-6＝哮喘控制调查表6；AQLQ(S)＝哮喘生活质量调查表-标准版；CI＝置信区间；FEV1＝第一秒用力呼气容积；ITT＝意向治疗；Q2W＝每2周；
Q2/4W＝2次注射，Q2W，持续12周，随后Q4W，持续38周
P值来自混合效应重复测量模型，该模型比较第53周每个组群内曲洛克木单抗与安慰剂之间的治疗效果
疗效概述
在ITT群体中，与安慰剂相比，在曲洛克木单抗治疗组群中均未观察到主要终点、年AER的降低；然而，在多个预先设定的亚组中观察到在接受曲洛克木单抗的患者中AER降低的趋势(图11)。具体地说，在基线处FEV1对SABA的可逆性≥12％的存在被确定为重要的临床特征，在曲洛克木单抗300mg Q2W组群中的高可逆亚组中观察到年AER降低34％(95％CI:-32,67％)，并且在Q2/4W组群中降低24％[95％CI:-54,63％]；在低可逆亚组中的任一组群中均未观察到AER的降低。
在高骨膜蛋白、高嗜酸性粒细胞、以及高Th2亚组中，在曲洛克木单抗300mg Q2W组群中观察到年AER的降低分别为25％(95％CI:-19,53％)、22％(95％CI:-31,54％)、以及23％(95％CI:-25,52％)，对应的低组群中没有观察到降低。在Q2/4W组群中，在高或低生物标志物亚组中没有观察到年AER的降低。
在曲洛克木单抗治疗组群中的接受慢性OCS的亚组中均未观察到AER的降低。
在ITT群体中，与安慰剂7.10％(95％CI:2.35,11.84％)相比，在曲洛克木单抗300mg Q2W组群中观察到在第53周处与基线处的支气管扩张剂前FEV1相比统计学上显著的增加。曲洛克木单抗300mg Q2/4W组群中的作用大小是较低的1.57％(95％CI:-3.22,6.35％)，其指示剂量反应关系；在各预先设定的亚组中也观察到此关系，与Q2/4W组群相比，在曲洛克木单抗300mg Q2W组群中在第53周支气管扩张剂前FEV1的增加一致更高(图12)。在第53周处曲洛克木单抗300mg Q2W组群中，与安慰剂相比支气管扩张剂前FEV1的增加与高和低骨膜蛋白亚组均密切匹配并且在高可逆、高嗜酸性粒细胞以及高Th2亚组中在数值上高于对应的低亚组。
在曲洛克木单抗治疗组群中的接受慢性OCS的亚组中均未观察到支气管扩张剂前FEV1的增加。
在ITT群体中，与安慰剂相比，在任一曲洛克木单抗治疗组群中均没有观察到ACQ-6、AQLQ(S)、以及每日哮喘日记症状得分的临床上的重要变化。在高可逆亚组中，与安慰剂相比，对于ACQ-6和AQLQ得分的平均变化在曲洛克木单抗300mg Q2W组群中接近MCID并且在数值上高于Q2/4W组群中的；在低可逆亚组中的任一给药方案中均未发现这些改善。在曲洛克木单抗300mg Q2W组群中的高可逆亚组中还观察到每日哮喘日记症状得分最大的降低。在高骨膜蛋白、高嗜酸性粒细胞以及高Th2亚组中，在任一曲洛克木单抗组群中均没有一致地观察到ACQ-6、AQLQ(S)、以及ASMA症状得分的临床上的重要变化。
从预指定的ITT和亚组分析中得到3个主要结论：
(i)在ITT群体中并且在大多数所测试的亚组中，在曲洛克木单抗300mg Q2W组群中观察到支气管扩张剂前FEV1的增加。在Q2/4W组群中，剂量反应明显，对该终点的效果较小或不存在。
(ii)在曲洛克木单抗300mg Q2W组群中的亚组分析鉴定出可能的反应者群体，其中观察到年AER的降低。所鉴定的关键亚组为：
(a)具有在基线处FEV1对SABA的可逆性≥12％的患者的降低。在该亚组中，观察到了关键次要终点的一致性改进(FEV1的增加11.07％(95％CI:0.99,21.14)、平均ACQ-6的降低-0.44(95％CI:-0.89,0.01)、以及AQLQ(S)的增加0.59(95％CI:0.10,1.09))。
(b)在假设与上调的气道IL-13(高骨膜蛋白、高嗜酸性粒细胞、高Th2)的存在相关的的那些亚组中的患者(这表明血液生物标志物与IL-13的上调相关)在鉴别将获得最大益处的患者可以是重要的。
(iii)在曲洛克木单抗300mg Q2/4W组群中相同的关键亚组中没有明确重复AER的降低。
事后分析研究了以下假设：在基线处具有FEV1可逆性≥12％以及血清骨膜蛋白≥中值的患者对曲洛克木单抗300mg Q2W具有增强的治疗反应。在患者的子集中，AER的降低54％(95％CI:-65,87％)，并且与安慰剂13.85％(95％CI:-0.18,27.87)相比从基线处的支气管扩张剂前FEV1的百分比增加在数值上大于那些具有FEV1可逆性≥12％和血清骨膜蛋白<中值的受试者中的百分比增加(AER 4％的降低[95％CI:-140,61％]和FEV17.62％的增加[95％CI:-7.60,22.84])。
总之，将曲洛克木单抗添加至高剂量ICS及以300mg Q2W剂量的其他哮喘控制剂疗法导致在ITT群体中支气管扩张剂前FEV1增加以及在生物上相关的亚组中AER降低。在对基线处支气管扩张剂有响应的患者中观察到这些终点的临床上重要的改善，并且这些改善在那些还具有基线处血清骨膜蛋白≥中位值的患者中有进一步提高。在这项研究中，曲洛克木单抗300mg Q4W的剂量方案保持显示出不足。
安全性概述
对可从该研究获得的总体安全性数据的评价在与曲洛克木单抗相关的300mg Q2W或300mg Q2/4W方案中均未鉴定为医学上重要的危险。TEAE的频率在安慰剂(84.8％)和曲洛克木单抗300mg Q2/4W组群(84.8％)之间是相同的并且在曲洛克木单抗300mg Q2W组群(89.3％)中略高。大多数患者具有TEAE，其严重性为轻度或中度并且与研究产品无关。在Q2W曲洛克木单抗组群(23.3％)中的受试者的注射位点TEAE的比率相比于接受安慰剂Q2W(9.2％)的患者较高，但与接受曲洛克木单抗Q2/4W(20.5％)或安慰剂Q2/4W(18.7％)的患者相似，并且大多数事件的严重性为轻度至中度，且其结果是少数患者停止使用研究产品。TEAE的频率在安慰剂(13.9％)和曲洛克木单抗300mg Q2W组群(12.0％)之间是相似的并且在曲洛克木单抗300mg Q2/4W组群(16.6％)中略高，少数患者具有与研究产品相关的TESAE。正如对患有重度哮喘的患者群的研究过程所料，有多次报告为TESAE的哮喘恶化，但这些事件的频率在安慰剂(4.0％)、曲洛克木单抗300mg Q2W(6.0％)和曲洛克木单抗300mgQ2/4W组群(6.6％)之间是平衡的，该Q2/4W组群中仅有2个事件被认为是与该产品相关的。
骨膜蛋白
在基线血清样品中测量骨膜蛋白水平，即，在曲洛克木单抗治疗前，在2b期研究中随机的患者中收集血清样品。包括AER降低、FEV1、和ACQ-6的关键研究终点通过该中值血清骨膜蛋白水平分层，以确定与那些低于中值的相比，具有处于或高于中值的基线血清骨膜蛋白水平的患者是否能从曲洛克木单抗中获得更大益处。在第53周观察到在曲洛克木单抗300mg Q2W的情况下，FEV1的增加(具有处于或高于中值的基线血清骨膜蛋白的患者6.75％，对比无论具有何种血清骨膜蛋白水平的患者8.65％)和更大的AER降低(具有处于或高于中值的血清骨膜蛋白的患者为25％，对比无论具有何种血清骨膜蛋白水平的患者为7％)。图14A和图14B。在研究中用来定义高骨膜蛋白的中值骨膜蛋白水平是≥23ng/mL的基线血清骨膜蛋白(即，高骨膜蛋白)，如通过来自雅培诊断(Abbott Diagnostics)的ARCHITECT平台所测量的。对于以骨膜蛋白水平计的AER降低和以血清骨膜蛋白水平计的从基线处的支气管扩张剂前FEV1的百分比变化的连续表示，参见图13。
在事后分析中，具有基线血清骨膜蛋白水平≥中值的可逆患者(支气管扩张剂后FEV1的可逆性≥12％)具有较大的FEV1的增加(具有处于或高于中值的血清骨膜蛋白的可逆患者为13.85％，对比无论具有何种血清骨膜蛋白水平的可逆患者为11.07％)并且观察到较大的AER的降低(具有处于或高于中值的血清骨膜蛋白的可逆患者54％，对比无论具有何种血清骨膜蛋白水平的可逆患者为34％；表21和22)。
在第一剂量后不久，血清骨膜蛋白水平基本上由曲洛克木单抗减少了，并且在研究期间维持在低水平。与低于中值的那些相比，在那些处于基线的血清骨膜蛋白水平高于中值的患者中，观察到了血清骨膜蛋白水平的较大减少。所提供的这些结果进一步支持血清骨膜蛋白是IL-13途径的替代标记的假设。
实例4
DPP4作为外周哮喘生物标志物
为了鉴别气喘患者中除骨膜蛋白外其他潜在新颖IL-13的外周生物标志物，进行实验以鉴别在来自人类受试者的支气管细胞的IL-13刺激的培养物中上调的一组基因。图1-4。在该IL-13诱导的组内，然后测定正常和哮喘血清样品以鉴别气喘患者的血清中具有不同水平以及具有可信哮喘生物学的蛋白。图4-5。与正常血清相比，在哮喘血清样品中观察到二肽基肽酶4(DPP4[CD 26])水平升高，类似于伦(Lun)的发现(伦等人，临床免疫学杂志(J Clin Immunol.)2007；430-37)，其显示与对照血清相比，来自哮喘患者的血浆中DPP4升高与其他Th2细胞因子相关。此外，他们发现哮喘CD4+T细胞中增加的膜DPP4表达。
此外，在服用口服和吸入类固醇的受试者(图6)和在长期用口服型皮质类固醇进行治疗的受试者(参见图24)中观察到血清DPP4水平降低。
作为初步的事后分析，我们评估了来自曲洛克木单抗2b期研究(参见实例3)的包括AER降低、FEV1、和ACQ-6的主要终点及次要终点通过该中值血清DPP4水平分层(图18、19、以及20)，以确定与那些低于中值的相比，具有处于或高于中值的基线血清DPP4水平的患者是否能从曲洛克木单抗中获得更大益处。如在实例2中所述，测量血清DPP4。
在第53周，在具有处于或高于中值的血清DPP4、用曲洛克木单抗(300mg Q2W)治疗的患者中观察到与基线相比的支气管扩张剂前FEV1的百分比变化(参见图17A和图17B)、与基线相比的平均ACQ-6的变化(参见图17C和图17D)、以及与基线相比平均AQLQ(S)的变化(参见图17E和图17F)在统计学上显著增加(表24)。另外，不像骨膜蛋白，对于具有处于或高于中值的血清DPP4的患者，还观察到了ACQ-6和AQLQ在统计学上显著的变化(表24)。对于ACQ-6、FEV1以及AER降低(图18-20)的不同DPP4割点的评价支持将中值用于分析并且显示对于这些终点，从该中值变化将不会导致更为显著的疗效。
在事后分析中，具有基线血清DPP4水平>＝中值的可逆患者(支气管扩张剂后-FEV1对短效β激动剂的可逆性≥12％)的FEV1增加(参见图17G)并且AER降低更多。还参见图17H、图17I、以及图25。
DPP4在多种终点中优于骨膜蛋白，包括急性恶化速率降低、与基线相比的支气管扩张剂前FEV1的百分比变化、与基线相比的平均ACQ-6的变化、以及与基线相比平均AQLQ(S)的变化。图15-16。这些发现有力支持了，将血清DPP4(例如，基线血清DPP4水平>＝中值)用于鉴别更有可能从用IL-13拮抗剂(例如，抗IL13抗体(如曲洛克木单抗或来金珠单抗))的治疗中受益的患者。这些结果还有力支持了，将血清DPP4(例如，基线血清DPP4水平>＝中值)用于预测哮喘患者的恶化、恶化速率、FEV1反应以及哮喘症状(例如，夜间醒来，醒来时的症状，活动受限，气促，喘息，和SABA使用)。
对由生物标志物和临床特征二者定义的亚组中AER的较大减少的观察引起对没有接受OCS的在基线处可逆的受试者群(n＝33)的探究。在该组中，观察到AER的降低以及FEV1、ACQ-6、和AQLQ(S)对比安慰剂的显著改善(表25)。在具有基线处提高的骨膜蛋白或DPP4的那些受试者中观察到疗效进一步改善的证据(表25)。还参见图25和图26以比较具有基线血清DPP4水平或骨膜蛋白水平>＝中值并且没有进行长期口服型肾上腺皮质激素类固醇治疗的可逆患者(支气管扩张剂后FEV1对短效β激动剂的可逆性≥12％)中的DPP4和骨膜蛋白。
DPP4可以与其他标志物/分类物组合，以鉴别更有可能从用IL-13拮抗剂(例如，抗IL13抗体(如曲洛克木单抗或来金珠单抗))的治疗中受益的患者，包括，例如，高骨膜蛋白(骨膜蛋白-高)，即≥血清骨膜蛋白中值或约23ng/mL、高嗜酸性粒细胞直接计数(Eos-高)，即血液嗜酸性粒细胞计数≥300个细胞/μL；或高Th2(th2-高)，即IgE>100IU/mL并且血液嗜酸性粒细胞≥0.14×109/L。DPP4-高(DPP4水平>＝中值)组和其他组，即骨膜蛋白-高(骨膜蛋白水平>＝中值)组(图21)、Th2-高(图22)、以及Eos-高组(嗜酸性粒细胞计数>＝300)(图23)之间的部分重叠支持这样的概念，即DPP4可以与这些生物标志物(例如，Th2、骨膜蛋白、和/或Eos)中的一种或多种组合，用于鉴别更有可能从用IL-13拮抗剂(例如，抗IL13抗体(如曲洛克木单抗或来金珠单抗))的治疗中受益的患者。
表24：针对曲洛克木单抗300mg Q2W ITT和亚组的主要和次要疗效终点的概述(FEV1可逆性、骨膜蛋白以及DPP4)
表25：对于曲洛克木单抗Q2W，对比安慰剂，在基线处可逆并且没有接受慢性OCS的受试者中的AER降低、FEV1、ACQ-6、和AQLQ(S)(事后探索性分析)
结论，患有重度哮喘、支气管扩张剂后第一秒用力呼气容积(FEV1)可逆性≥12％并且≥200mL在3年内/在筛选时并且在先前一年中≥2次哮喘恶化的患者参与了该双盲2b期研究。受试者接受氟替卡松/沙美特罗500μg/50μg bid(或等效物)并且继续研究前的控制药剂。在5周的导入之后，具有预测为FEV140％-80％或哮喘控制调查表6(ACQ-6)得分≥1.5的受试者被随机化至曲洛克木单抗300mg/安慰剂(2:1)，每2周(Q2W)或曲洛克木单抗300mg/安慰剂(2:1)Q2W持续12周，随后每4周(Q4W)。主要终点是经52周的哮喘恶化率(AER)。次要终点包括FEV1、ACQ-6、哮喘生活质量调查表(AQLQ)、以及安全性。针对各个曲洛克木单抗组(Q2W或Q4W)，与结合的、具有80％强度以及0.15的显著水平的安慰剂组相比，该试验能检测AER的40％降低。具有基线FEV1可逆性≥12％的受试者定义了“可逆的”亚组。如潜在替代生物标志物评估血清DPP4和骨膜蛋白的基线水平、表达受IL-13高度诱导的基因，亚组由中位水平所定义。
分析基于意向治疗群体(ITT，N＝452)。基线特征，平均(SD)：年龄：50.2(12.3)；ACQ-6:2.55(0.97)；预测的FEV1％：68.6(18.1)。第53周AER在曲洛克木单抗组对比安慰剂中相似。在可逆的、骨膜蛋白-高并且DPP4-高亚组中观察到在Q2W中AER降低的趋势(表24)。可逆的并且骨膜蛋白-高亚组的AER降低54％(-65,87％)，并且当排除接受口服型皮质类固醇的受试者时，67％(2,89％)。在第53周，对于Q2W，观察到支气管扩张剂前FEV1有统计学上显著的增加，并且在所有亚组中增加都是明显的(表24)。对于Q2W，可逆的并且DPP4-高亚组中的ACQ-6和AQLQ显著区别于安慰剂(表24)。对于Q4W组或亚组中的次要终点，没有观察到相比于安慰剂的显著差异。治疗突发严重不良事件/不良事件的频率在安全性群体中是相似的(曲洛克木单抗Q2W：12.0/89.3％；Q4W：16.6/84.8％；安慰剂：13.9/84.8％)。
实例5
特应性皮炎中IL-13活化的外周标志物的鉴别
为了检验在患有特应性皮炎的患者的人体皮肤中骨膜蛋白和/或DPP4是否也是上调的，使用全基因组微阵列对4个特应性皮炎皮肤样品和31个正常皮肤样品中的转录变化进行分析。简言之，使用cDNA合成和IVT标记试剂盒由总RNA产生生物素标记的扩增的cRNA，并且将其片段化用于在昂飞(Affymetrix)人类基因组U133Plus 2.0基因芯片阵列上杂交。用基因芯片操作软件(GeneChip Operating Software)工具进行数据捕获和质量评价。将R统计分析工具用于计算来自数组CEL文件的探针层面概括(frma)。来自全基因组阵列分析的表达强度数据(线性)显示，相比于正常皮肤，在特应性皮炎皮肤中骨膜蛋白(图27)和DPP4(图28)的mRNA表达是提高的。
关于特应性皮炎患者的皮肤中DPP4和骨膜蛋白表达水平升高的发现表明DPP4和/或骨膜蛋白基因表达水平：(1)可以用作特应性皮炎患者中IL-13途径活化的外周标志物；(2)可以在为特应性皮炎患者选择可能的疗法方面是有益的，以及(3)可以用于选择对使用IL-13拮抗剂(例如，抗IL-13抗体(如曲洛克木单抗或来金珠单抗))的疗法有响应的患者。
使用来自特应性皮炎患者的皮肤样品所获得的结果表明，血清中DPP4和/或骨膜蛋白(例如，基因表达和/或蛋白质表达)的表达水平也可以用作特应性皮炎中的生物标志物。DPP4和骨膜蛋白的蛋白水平在特应性皮炎患者的血清中也是升高的(参见实例8)。相应地，这些关于特应性皮炎中血清和皮肤DPP4和/或骨膜蛋白蛋白水平升高的发现表明DPP4和/或骨膜蛋白水平：(1)可以用作特应性皮炎患者中IL-13途径活化的外周标志物；(2)可以在为特应性皮炎患者选择可能的疗法方面是有益的，以及(3)可以用于选择对使用IL-13拮抗剂(例如，抗IL-13抗体(如曲洛克木单抗或来金珠单抗))的疗法有响应的患者。
实例6
CAT-354-1049计算机断层摄影(CT)图象数据分析：3D气道分析
如在此所论述，存在鉴别从用IL-13拮抗剂的治疗性干预中受益的患者以及预测用IL-13拮抗剂(如抗IL-13抗体)进行治疗的结果的需要。这通过使用如上述实例3-5中所描述的生物标志物(如DPP4、骨膜蛋白)和/或临床特征(如FEV1可逆性)或其组合来实现。另一种方法是使用计算机断层摄影(CT)成像数据，因为大多数医院都配备高效CT扫描机，并且标准化图象分析可以作为一项服务而获得。气道容积的变化，并且特别是可以由次级气道容积估计的气道阻力应与肺功能的改善关，并且是比标准肺功能测试(如FEV1)更加客观的量度。
其他组已经研究大气道容积的变化(RB1)作为治疗效果指示物之一(参见，例如，哈达尔(Haldar)等人，2009)。在此，我们研究了给予曲洛克木单抗之后的治疗效果，如通过次级气道容积与基线相比的变化所测量，通过量化多条外周气道(如肺亚段支气管)的容积，应具有较大反映疗效的潜力，因为这些气道不像较大气道(包括RB1)一样刚硬。
将获得自参与CAT-354-1049临床试验(描述于实例3中)的患者的肺扫描的计算机断层摄影(CT)成像数据使用VIDA软件(版本1.2.001_检测器；VIDA诊断学公司(VIDA Diagnostics,Inc.)，珊瑚村(Coralville)，爱荷华州(Iowa))使用本领域熟知的方法进行分析。参见，例如，古普塔(Gupta)等人，变态反应学与临床免疫学杂志(J AllergyClin Immunol.)133(3):729-738(2014)。在临床试验中，将CT扫描用于确定给予曲洛克木单抗对气道壁结构改变的作用。使用螺旋/螺旋状MSCT(多层计算机断层摄影)成像获得图象数据。在多中心试验中使用来自GE医疗集团(GE Healthcare)、飞利浦(Philips)和西门子(Siemens)的CT扫瞄仪。分别用管电压120kVp，层面厚度<＝1.0mm，重组子核标准品(GE)、B(飞利浦)以及B30f(西门子)将成像和重建参数标准化。在完全吸气时获取所有图像(TLC)。在这项研究中，仅对肺的上部部分成像，允许分析上叶中的肺段气道和次级气道。该VIDA软件允许对与气道容积相关的参数进行3D分析，特别是支气管。如在此使用的术语“支气管”意指支气管或它的任何分支，包括小支气管和细支气管。针对每个支气管(或部分)所测量的参数是平均管腔截面积(LA)、壁面积(WA)、壁面积百分数(WA％)、以及壁厚(WT)。术语“管腔”是指支气管的内部开放空间或孔腔。术语“壁面积”是指支气管管壁的截面积。壁面积百分数计算如下：100*壁面积/(壁面积+管腔面积)。在上叶中所有成像的肺段及肺亚段支气管中进行测量。肺段气道(每个受试者中高达5条)是右肺尖段(RB1)、右前(RB2)、右后(RB3)；左肺后尖段(LB1+2)、以及左前(LB3)。次级气道(每个受试者中高达14条)是RB1a&b、RB2a&b、RB3a&b、LB1、LB1a*&b*、LB2、LB2a*&b*、LB3a&b，用星号标记的区域为亚次级气道。LB1和LB2可交替地分别命名为LB1+2a和LB1+2b。对应的亚次级气道(以上用星号标记)可交替地分别命名为LB1+2ai、LB1+2aii、LB1+2bi、LB1+2bi。参见，例如，纳迪许(Naidich)等人，气道成像-功能与放射性相关(Imaging ofthe Airways-Functional andRadiologic Correlations)，2005。
此处所披露的基线测量与在其他哮喘CT研究中观察到的基线测量一致，包括古普塔(Gupta)等人，变态反应学与临床免疫学杂志(J Allergy Clin Immunol.)133(3):729-738(2014)。
针对各段气道分别计算以上描述的气道参数的变化，并且然后对每个受试者中的肺段和次级气道取平均。气道阻力和截面气道的平均值的计算在Matlab(Matlab R2010a(迈斯沃克(MathWorks)，纳蒂克(Natick)，马萨诸塞州(MA)))中进行。仅计算基线(就诊4)(见图29，图A)与后续(就诊30)(见图29，图B)之间的相对变化。仅计算总曲洛克木单抗(即300mg Q2+300mgQ2/4W组群)和总安慰剂之间的组间差异。
分析数据集使用所有在基线(即就诊4)与后续(即就诊30)处均有CT扫描的受试者。排除最严重的CT方案偏离(即就诊4和就诊30之间在图象层面厚度或重构核方面的变化)。
假设层状气流和气道部分实质上长于它们的直径，计算气道阻力。因此，理论上气道阻力计算如下：
R = 8 &mu; l V &pi;r 4
其中r是气道的半径(μ＝粘度，l＝长度，V＝流速)。由于面积是大约r2，因此阻力的相对变化可估计如下：
R 2 - R 1 R 1 = 1 / LA 2 2 - 1 / LA 1 2 1 / LA 1 2
在对若干支气管进行平均之前，针对各段气道计算气道阻力的相对变化。
管腔面积(LA)从基线至就诊30的相对变化示于表26和图30中。
表26：管腔面积(LA)从基线至就诊30的相对变化
LA的相对变化不应被用基线处的体表面积(BSA)进行归一化所影响，即
LA 2 / B S A - LA 1 / B S A LA 1 / B S A = LA 2 - LA 1 LA 1
壁面积(WA)从基线至就诊30的相对变化示于表27中。
表27：壁面积(WA)从基线至就诊30的相对变化
WA的相对变化不应被用基线处的体表面积(BSA)进行归一化所影响，即
WA 2 / B S A - WA 1 / B S A WA 1 / B S A = WA 2 - WA 1 WA 1
壁面积百分数(WA％)从基线至就诊30的相对变化示于表28和图31中。
表28：(壁面积百分数)WA％从基线至就诊30的相对变化
壁厚(WT)从基线至就诊30的相对变化示于表29中。
表29：壁厚(WT)从基线至就诊30的相对变化
气道阻力从基线至就诊30的相对变化示于表30和图32中。根据基线处的WA％，将针对曲洛克木单抗(图32中虚线框)的数据集分为两个亚组，用于随后对次级气道阻力和FEV1％的相对改善的分析。使用基于WA％的中位值界限，从而导致68％的界限水平(见图33)。
表30：气道阻力从基线至就诊30的相对变化
结论：
可以从这些研究中做出多个结论，包括：
(i)WA％的3D测量与公开的数据更为一致，并且较2D测量具有较低变化性；
(ii)右肺尖段支气管(RB1)的2D和3D测量对于管腔面积相对一致，但对于壁测量是更加可变的；
(iii)将3D分析中多个气道的每个参数的相对变化进行平均降低了变化性；
(iv)曲洛克木单抗在较小(次级)气道中较在肺段支气管中对LA和WA％具有更强的作用；
(v)与安慰剂相比，用曲洛克木单抗显著改善了肺亚段支气管的管腔面积、壁面积百分数、气道阻力(分别为p＝0.021、p<0.005以及p<0.01)；
(vi)在壁面积和壁厚方面没有看到显著的治疗效果；
(vii)与具有最低壁面积百分数(次级气道的WA％低于68％中位值界限)的一半相比，曲洛克木单抗对气道阻力的治疗效果在曲洛克木单抗组中具有基线处最高壁面积百分数(次级气道的WA％高于68％中位值界限)的一半中显著更高(p＝0.037)。参见图33。确实，具有高于指定阈值(例如，在肺亚段水平WA％至少68％)的WA％的患者在气道阻力方面展现出统计学上显著的改善并且在支气管扩张剂前FEV1方面展现出统计学上显著的改善。参见图33。
一起考虑，这些研究表明，如使用次级气道(WA％)的肺的CT扫描所确定的壁面积％可以用于预测在用IL-13拮抗剂(例如，抗IL-13抗体(如曲洛克木单抗或来金珠单抗))进行治疗的患者或候选者中的治疗反应(例如，气道阻力和/或FEV1的改善)。另外，这些研究表明，在治疗前患有IL-13介导的疾病(例如，哮喘、COPD、IPF、UC、或特应性皮炎)、具有高于预定WA％阈值水平或高于一种或多种对照样品中的WA％(例如，次级气道的约68％、高于约60％或60％-80％之间的WA％阈值水平)的WA％值的患者是用IL-13拮抗剂(例如，抗IL-13抗体(如曲洛克木单抗或来金珠单抗))进行治疗的好的候选者。另外，壁面积百分数(WA％)可以与其他量度组合，这些生物标志物通过使用CT扫描数据(例如，管腔面积(LA)、壁面积(WA)、壁厚面积(WT)、气道阻力、或其组合)的3D气道分析而获得，以鉴别可以对IL-13拮抗剂(例如，抗IL-13抗体(如曲洛克木单抗或来金珠单抗))的治疗响应的患者群体。
基线处的壁面积百分数(WA％)描述了缢缩/增厚的气道是怎样的以及因此可以通过IL-13拮抗剂(如曲洛克木单抗或来金珠单抗)的治疗实现的潜在改善。由于WA％被计算为比率，用针对个体患者的气道容积进行自动归一化，从而使得该参数成为用于基线表征的逻辑选择。
除了在重度哮喘中的用途之外，该方法可应用至其他肺部疾病，包括但不限于COPD、肺气肿、以及IPF。
实例7
来自COPD受试者的气道上皮中骨膜蛋白和DPP4表达的诱导
COPD中的气道炎症是异质的并且由多种炎症介质(包括IL-17、IL-33以及IL-13)调节。在(EpiAirwayTM组织)气液界面处分化的正常和COPD-支气管上皮细胞采购自MATTEK(MA,TTEK Corporation(玛迪克公司)，MA)并且在37℃下在5％富含CO2培养箱中培养24个小时。然后将组织用PBS冲洗两次并且在缺乏血清或类固醇的培养基中培养另外的24小时。这个时期之后，将细胞用25ng/mL的IL-13、IL-17A、IL-17F、IL-17E、IL-13、TSLP或IL-33(派普泰克(PeproTech)，NJ)刺激另外的24h。然后使用mirVana分离方案(生命技术公司(LifeTechnologies)，MD)萃取总RNA，通过TheIII第一链合成系统(生命技术公司(Life Technologies)，MD)进行逆转录并且通过基因表达PCR测定(生命技术公司(Life Technologies)，MD)进行定量。
在获得自正常受试者和COPD受试者的高度分化支气管上皮细胞的转录物中观察到CCL-26、DPP4、骨膜蛋白POSTN-745、以及骨膜蛋白POST-815的IL-13特异性上调。支气管上皮细胞生长在气液界面(EpiAirwayTM模型)。参见图34。图34中呈现的数据代表CCL-26、DPP4、骨膜蛋白POSTN-745、以及骨膜蛋白POST-815基因转录物的log2倍数变化(fc)，相对于如上所指出在用25ng/mL的IL-17A、IL-17F、IL-17E、IL-13、TSLP或IL-33刺激24小时之后基础/未治疗的基础状态。这些发现指示，骨膜蛋白和DPP4是针对IL-13介导的COPD的特异性标志物。该实验数据，对应于分化的气道上皮细胞，显示，IL-13介导的炎症可以通过CCL-26、DPP4以及骨膜蛋白的特异性表达与其他表型区分开。该数据还显示，IL-13(但非IL-17A/F/E、TSLP、或IL-33)显著地诱导骨膜蛋白和DPP4在来自COPD受试者的气道上皮中表达。对正常以及患病上皮的这些结果的保留表明，诱导的骨膜蛋白和DPP4可以用作用于鉴别受IL-13介导的气道炎症影响的COPD患者的生物标志物。
实例8
骨膜蛋白和DPP4在特应性皮炎患者中的表达
受试者选择：征得同意后，特应性皮炎患者提供了血清样品以及临床特征。获得样品并且不具名地选取对应于100名患有中度特应性皮炎的患者和100名患有重度特应性皮炎的患者的样品。为了平衡中度和重度比较组，将可获得的患者样品相对于性别和年龄进行匹配。
DPP4定量：使用人类DPPIV/CD26ELISA试剂盒对DPP4进行定量。参比标准原液(RS)是来自该试剂盒的人类DPPIV标准品。QC样品原液(QCS)是来自该试剂盒的人类DPPIV标准品。在测定开始之前的那天制备质量控制(QC)。将试剂盒中提供的至少2个参比标准(DPPIV标准品，Part 892953)(RS)小瓶复水。根据产品插入物用1000μL的diH2O将每个RS复水。复水的浓度产生200ng/mL的原液。在1:70MRD下制备测试样品。将样品在室温下解冻并且用校准稀释剂RD5-33稀释。为了制备参比标准原液(RS)，用1000μL的diH2O将RS复水。复水的浓度产生200ng/mL的原液。以参比标准料(RS)开始制备参比标准。以冷冻的QC料(QCS)开始制备质量控制(QC)样品。将50μL的精制参比标准、QC以及稀释的测试样品用移液管吸取到合适的孔中。将一个或多个板密封并且在室温下孵育2小时±15分钟，伴随着在眶板摇床上以大约450rpm进行振荡。使用洗板机将一个或多个板洗涤4次。在洗涤之后，通过对干净的纸巾进行印迹将任何剩余的洗涤缓冲液去除。将200μL的DPPIV偶联物添加至每个孔。将一个或多个板密封并且在室温下孵育2小时±15分钟，伴随着在眶板摇床上以大约450rpm进行振荡。再次使用洗板机将一个或多个板洗涤4次。通过在将其添加至孔中之前添加等体积的底物A和B来制备底物试剂。将200μL的底物试剂添加至每个孔。将一个或多个板密封并且在室温下孵育30分钟±5min，伴随着在眶板摇床上以大约450rpm进行振荡。使样品避光。添加50μL的终止液，并且使用分光光度计酶标仪在450nm处测量每个孔中的吸光度。在添加终止液30分钟内，读取各孔。使用4-PL非线性拟合(SoftMax ProGxP v5.2)对数据进行分析。当倒退测算浓度时，未将空白值从标准曲线值中减去。对于测定的验收，测定板上的标准曲线和质量控制复制必须通过100±30％回收和≤25％CV的验收标准。测定板上的测试样品复制必须通过≤25％CV的验收标准。
骨膜蛋白定量：将MSD测定板(MSD L15XA)(MSD，盖瑟斯堡(Gaithersburg)，马里兰州(MD))用抗人类骨膜蛋白抗体包衣(医学免疫公司(MedImmune)，克隆#4B4.B11，如披露于美国临时专利申请号61/936,967，通过引用结合在此，并且保藏在美国种质保存中心(American Type Culture Collection)，马纳萨斯(Manassas)，VA(the ATCC)，保藏号为PTA-120210，于2013年4月17日)。1X PBS(龙沙公司(Lonza)，目录号#17-516Q或等效物)中的捕获抗体至2μg/ml的终浓度。将50μl/孔的2μg/ml捕获抗体添加至每个孔中，并且用粘合剂微量培养板盖覆盖板。将板在2℃至8℃下孵育过夜并且随后用ELISA洗涤缓冲液进行洗涤。
将包被的测定板用1X ELISA洗涤缓冲液(0.05％Tween-20，1X PBS)洗涤3次并且用150μl/孔I-封闭缓冲液(IBB)(I-封闭缓冲液：0.5％Tween-20，1X PBS，0.2％I-封闭缓冲液)(Tropix I-BlockTM，应用生物系统公司(Applied Biosystems)，Cat#T2015)在室温下(RT)封闭最低一小时，伴随轻轻振摇(持续≥60分钟但不超过4小时)。
将重组人类骨膜蛋白(R&D系统，目录号#3548-F2)用作标准品。将在IBB中制备的参比标准(RS)、质量控制(QC)以及阴性对照(NC)、以及在IBB中稀释至所需最小稀释为1:10的血清测试样品添加至该板并且在RT下孵育大约1小时，伴随着在平板摇床上轻轻振摇。通过用ELISA洗涤缓冲液洗涤板来去除未结合的分析物。为了检测结合的分析物，将Ruthenylated-抗人类骨膜蛋白(Ru-7B5，共轭物抗体克隆#7B5.C4，医学免疫公司(MedImmune)，如披露于美国临时专利申请号61/936,967，通过引用结合在此，并且保藏在美国种质保存中心(American Type Culture Collection)，马纳萨斯(Manassas)，VA(theATCC)，保藏号为PTA-120211，于2013年4月17日)制备成终浓度为2μg/ml，并且在用200μl/孔的1X ELISA洗涤缓冲液洗涤各个孔之后，将30μl/孔的检测抗体添加至各个孔中并且将板在RT下孵育大约1小时(60分钟±10分钟)，伴随着在平板摇床上轻轻振摇(避免光照)。通过用ELISA洗涤缓冲液洗涤板来去除未结合的检测抗体。
通过使用蒸馏水将“4X读出缓冲剂T”(4X，MSD，目录号#R92TC-1)原料稀释至“1X”来制备读出缓冲剂(MSD)。将读出缓冲剂添加至板并且在MSD读板机上读出该板。将在电化学发光单位(ECLU)中的原始数据转移至SoftMax Pro软件(Pro v5.2GxP)以及Excel电子表格用于进一步分析。使用4-参数逻辑加权(1/y^2)曲线拟合方法绘制针对每个测定的参比标准曲线。针对每个QC水平、NC并且针对来自拟合曲线的血清测试样品插入骨膜蛋白浓度。
结果和结论：当与中度特应性皮炎的患者相比时，骨膜蛋白在重度特应性皮炎的患者的血清中以较高水平表达。见图35，图A。DPP4表达也在特应性皮炎患者的血清中升高，但表达水平与疾病严重度无关。见图35，图B。关于重度和中度特应性皮炎患者的血清中DPP4和骨膜蛋白表达水平升高的发现表明DPP4：(1)可以用作特应性皮炎患者中IL-13途径活化的外周生物标志物；(2)可以在为特应性皮炎患者选择可能的疗法方面是有益的，以及(3)可以用于选择对使用IL-13拮抗剂(例如，抗IL-13抗体(如曲洛克木单抗或来金珠单抗))的疗法有响应的患者。
实例9
稳定的COPD中以及急性COPD恶化中的骨膜蛋白和血清DPP4
为了确定相对于在稳定COPD中观察到的表达水平，急性COPD恶化(AECOPD)中骨膜蛋白和/或DPP4的表达水平是否存在差异，在健康对照、稳定COPD患者、以及经历急性COPD恶化的患者中测量骨膜蛋白(图36)和血清DPP4(图37)的水平。健康对照血清获得自生物再生(Bioreclamation)(巴尔的摩(Baltimore)MD，美国)，来自20名不吸烟的受试者(10名女性和10名男性，年龄17至59)。COPD和AECOPD血清来自MI-CP221临床生物标志物研究，由医学免疫公司(MedImmune)赞助。通过免疫测定测量骨膜蛋白和DPP4水平，如以上所描述的。数据显示，骨膜蛋白和血清DPP4在稳定COPD中是增加的并且相对于健康对照在AECOPD中也是增加的。这显示，DPP4和/或骨膜蛋白可以用作稳定COPD和AECOPD二者的生物标志物并且可以用于选择对使用IL-13拮抗剂(例如，抗IL-13抗体(如曲洛克木单抗或来金珠单抗))的疗法有响应的COPD患者。
***
应当理解的是，详细说明部分，而不是概述和摘要部分，旨在用于解释权利要求书。概述和摘要部分可提出一个或多个但并非如诸位发明人所预期的本发明的全部示例性实施例，并且因此不意图以任何方式限制本发明和所附权利要求书。
上文已经借助于功能模块对本发明进行了描述，这些功能模块说明了规定功能的实施以及其关系。为了便于描述，已经对这些功能模块的边界在此任意地限定。只要规定功能以及其关系得以适当地进行，可以限定可替代的边界。
具体实施例的以上描述将充分地揭示本发明的总体性质，使得在不脱离本披露的一般概念的情况下，其他人可以无需过多的实验通过应用本领域的技术内的知识，容易地针对此类具体实施例的各种应用进行修改和/或改编。因此，基于在此提出的传授和指导，此类改编和修改旨在处于所披露的实施例的含义和等效范围内。应当理解在此的短语或术语是出于描述而非限制的目的，这样使得本说明书的术语或短语可根据这些传授和指导被技术人员理解。
本发明的宽度和范围应当不限于以上描述的示例性实施例中的任一个，而应当仅根据以下权利要求书和它们的等效物来限定。
在本申请中引用的所有出版物、专利、专利申请、和/或其他参考文献出于所有目的通过引用以其全部内容而结合，在程度上就像每个单独的出版物、专利、专利申请、和/其他文件被单独地指出以出于所有目的通过引用而结合相同。

Claims (28)

1.一种对患有白介素-13(IL-13)介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括如果取自该患者的一种或多种样品中的DPP4(二肽基肽酶-4)水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。
2.一种对患有白介素-13(IL-13)介导的疾病或障碍的患者进行治疗的方法，该方法包括如果(a)取自该患者的一种或多种样品中的DPP4(二肽基肽酶-4)水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，并且任选地如果(b)该患者呈现出(i)高骨膜蛋白(≥血清骨膜蛋白中值或约23ng/mL)、(ii)高嗜酸性粒细胞直接计数(血液嗜酸性粒细胞计数≥300个细胞/μL)、(iii)高Th2(高Th2定义为IgE>100IU/mL并且血液嗜酸性粒细胞≥0.14×109/L)、(iv)对短效β2激动剂的FEV1可逆性≥12％、(v)肺CT扫描的次级气道的壁面积百分数(WA％)≥68％、或(vi)及其组合，那么向该患者给予IL-13拮抗剂。
3.根据权利要求1所述的方法，其中该患者的DPP4水平是在免疫测定中测量。
4.根据权利要求3所述的方法，其中该免疫测定采用一种或多种抗-DPP4抗体或其抗原结合片段，所述抗体或其抗原结合片段识别人类DPP4。
5.根据权利要求1所述的方法，其中该IL-13拮抗剂包括以下项中的一种或多种：抗IL-13抗体或其抗原结合片段、IL-13突变蛋白、IL-4突变蛋白、抗IL-13Rα1抗体或其抗原结合片段、或者抗IL-4Rα抗体或其抗原结合片段。
6.根据权利要求1所述的方法，其中在给予IL-13拮抗剂之前、过程中、或之后，已经用一种或多种另外的药物治疗该患者。
7.根据权利要求6所述的方法，其中该一种或多种另外的药物包括类固醇，并且任选地包括支气管扩张剂。
8.根据权利要求7所述的方法，其中该类固醇是氟替卡松或布地奈德，并且该支气管扩张剂是沙丁胺醇或沙美特罗。
9.根据权利要求6所述的方法，其中该一种或多种另外的药物是通过吸入、通过口服给药、通过注射、或者通过其组合而给予。
10.根据权利要求9所述的方法，其中使用定量雾化吸入剂(MDI)或干粉吸入剂(DPI)来进行吸入给药。
11.根据权利要求7所述的方法，其中该类固醇是以高剂量给予。
12.根据权利要求1所述的方法，其中该IL-13拮抗剂是抗IL13抗体、或其抗原结合片段，其中：
(i)该抗体或其抗原结合片段结合至与曲洛克木单抗(VH:SEQ ID NO:3；VL:SEQ IDNO:4)所结合表位相同的IL-13表位，或竞争性地抑制曲洛克木单抗与IL-13的结合，或二者；
(ii)该抗体或其抗原结合片段包括曲洛克木单抗(VH:SEQ ID NO:3；VL:SEQ ID NO:4)或曲洛克木单抗的抗原结合片段；
(iii)该抗体或其抗原结合片段由曲洛克木单抗(VH:SEQ ID NO:3；VL:SEQ ID NO:4)或曲洛克木单抗的抗原结合片段组成；
(iv)该抗体或其抗原结合片段结合至与来金珠单抗(VH:SEQ ID NO:1；VL:SEQ ID:2)所结合表位相同的IL-13表位，或竞争性地抑制来金珠单抗与IL-13的结合，或二者；
(v)该抗体或其抗原结合片段包括来金珠单抗(VH:SEQ ID NO:1；VL:SEQ ID:2)或来金珠单抗的抗原结合片段；
(vi)该抗体或其抗原结合片段由来金珠单抗(VH:SEQ ID NO:1；VL:SEQ ID:2)或来金珠单抗的抗原结合片段组成；或
(vii)该抗体或其抗原结合片段包括SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4或SEQ ID NO:3、SEQID NO:4的抗原结合片段。
13.根据权利要求1所述的方法，其中取自该患者的一种或多种样品和/或该一种或多种对照样品包括全血、血清、血浆、唾液、痰、支气管肺泡灌洗液、肺上皮细胞、尿、皮肤、鼻息肉、或其组合中的一种或多种。
14.根据权利要求1所述的方法，其中该IL-13拮抗剂是以固定剂量给予。
15.根据权利要求12所述的方法，其中该抗IL-13抗体是曲洛克木单抗，并且其中曲洛克木单抗是以约300mg/剂量的固定剂量给予。
16.根据权利要求1所述的方法，其中该IL-13拮抗剂是以两个或更多个剂量给予。
17.根据权利要求1所述的方法，其中该IL-13拮抗剂是按周、每两周或每月给予。
18.根据权利要求1所述的方法，其中该IL-13拮抗剂是经静脉内地、肌内地、皮下地、或其组合给予。
19.根据权利要求1所述的方法，其中根据在血清中使用ELISA测定所测量的预定的DPP4阈值水平是至少约250ng/ml、至少约350ng/mL、至少约375ng/mL、至少约400ng/mL、至少约450ng/mL、至少约500ng/mL、至少550ng/mL、或至少约600ng/mL。
20.根据权利要求1所述的方法，其中该预定的DPP4阈值水平是约365ng/mL。
21.根据权利要求1所述的方法，其中该一种或多种对照样品是(i)一种或多种获得自正常的健康个体的样品；(ii)一种或多种获得自患有非IL-13介导的哮喘子集的患者的样品；(iii)一种或多种获得自未用皮质类固醇治疗的哮喘患者的样品；(iv)一种或多种获得自使用皮质类固醇进行了治疗的哮喘患者的样品；(v)一种或多种获得自未治疗的特应性皮炎患者的样品；(vi)一种或多种获得自已治疗的特应性皮炎患者的样品；(vii)预定的标准量的分离的DPP4；或(viii)其组合。
22.根据权利要求1所述的方法，其中给予该IL-13拮抗剂导致：
(a)AER(急性恶化速率)降低，其中与在用安慰剂治疗的患者群体中所观察到的AER相比，该AER降低至少5％、至少10％、至少15％、至少20％、至少25％、至少30％、至少35％、至少40％、或至少45％；
(b)FEV1(第一秒用力呼气容积)增加，其中与在用安慰剂治疗的患者群体中所观察到的FEV1相比，该FEV1增加至少3％、至少5％、至少7％、至少9％、至少11％、至少13％、至少15％、至少17％、或至少19％；
(c)改善的ACQ-6(哮喘控制调查表，6项版)结果；
(d)改善的AQLQ(哮喘生活质量调查表)结果；或，
(e)其组合。
23.根据权利要求1所述的方法，其中该IL-13介导的疾病或障碍是肺部疾病或障碍、炎性肠病或障碍、或慢性炎性皮肤病或障碍。
24.根据权利要求23所述的方法，其中该肺部疾病或障碍是哮喘、IPF、COPD、慢性鼻窦炎、或过敏性鼻炎。
25.根据权利要求23所述的方法，其中该慢性炎性皮肤病或障碍是特应性皮炎、过敏性接触性皮炎、湿疹、或银屑病。
26.根据权利要求24所述的方法，其中该哮喘是过敏性哮喘、特应性哮喘、皮质类固醇未用性哮喘、慢性哮喘、皮质类固醇抗性哮喘、皮质类固醇难治性哮喘、由于吸烟造成的哮喘、或皮质类固醇失控性哮喘。
27.一种诊断患者中IL-13介导的疾病或障碍的方法，该方法包括测量取自该患者的样品中的DPP4(二肽基肽酶-4)水平，其中如果DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平，或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平，那么该患者被诊断为患有IL-13介导的疾病或障碍。
28.一种鉴定患者为用IL-13拮抗剂进行治疗的候选者的方法，该方法包括测量取自该患者的样品中的DPP4(二肽基肽酶-4)水平，其中以下DPP4水平鉴定该患者为用IL-13拮抗剂进行治疗的候选者：该DPP4水平高于预定的DPP4阈值水平或高于一种或多种对照样品中的DPP4水平。
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