KR20140087201A - Gogat의 불활성화에 의한 아미노산 고생산능 변이 균주 - Google Patents

Gogat의 불활성화에 의한 아미노산 고생산능 변이 균주 Download PDF

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Abstract

본 발명은 불활성화 GOGAT(glutamate synthase)를 포함하는 글루타민 또는 알기닌 고생산능 변이 균주 및 이의 제조방법에 관한 것이다. 본 발명에 따르면 GOGAT(glutamate synthase)를 불활성화 시킴으로써 야생형 또는 활성화 GOGAT를 포함하는 글루타민 또는 알기닌 생산능 균주보다 생육이 저하되지 않으면서 글루타민(Glutamine) 및 알기닌(Arginine) 생산능이 향상된 변이 균주를 제조하여 고농도 글루타민 및 고농도 알기닌을 생산할 수 있는 효과가 있다.

Description

GOGAT의 불활성화에 의한 아미노산 고생산능 변이 균주{Mutant Strain with improved Amino acid production by inactivating GOGAT}
본 발명은 GOGAT(glutamate synthase)를 불활성화 시킴으로써 글루타민(Glutamine) 및 알기닌(Arginine) 생산능이 향상된 변이 균주에 관한 것이다.
L-글루타민은 L-글루타민산 계열 아미노산의 일종으로, 최근 들어 세포재생 능력에 효과가 있는 것으로 확인되면서 화장품 원료로 수요가 늘고 있으며 노화방지에 대한 연구도 계속되고 있다. 그밖에도 L-글루타민은 영양제, 소화기 궤양 치료제, 알콜중독 치료제 및 뇌기능 향상제 등 의약용으로 꾸준히 이용되어 오고 있다. 한편, L-글루타민은 원래 필수아미노산이 아닌 것으로 분류되어 왔으나, 근래에 들어 필수아미노산의 기능성을 갖게 되는 컨디셔날 필수아미노산(Conditional Essential Amino acid)으로 확인되어 그 중요성이 한층 강조되고 있는 실정이다.
L-아르기닌은 의약품, 식품, 기타 동물 사료 등에 널리 이용되는 천연 아미노산의 일종으로 의약용으로는 간기능 촉진제, 뇌기능 촉진제, 남성 불임 치료제, 종합 아미노산 제제 등에 사용되고 있으며, 식품 용도로는 생선묵 첨가제, 건강음료 첨가용, 고혈압 환자의 식염 대체용으로 최근 각광을 받고 있는 물질이다.
아미노산 생산 균주를 개발하기 위한 방법은 종래 기술로부터 여러 가지가 있었다. 가장 일반적인 아미노산 생산 균주 개발법으로는 돌연변이법을 이용한 중간대사산물 또는 최종산물에 대한 내성주 선별법, 염색체 변이를 통한 목적 산물 생산 조절 유전자의 활성, 결실 또는 강화 등이 있다. 즉, 돌연변이법 이용으로는 아미노산의 유사 구조체에 대한 내성을 가지는 변이주를 선별하는 방법이 적용될 수 있다. 또한 목적산물 이외의 분지점에 해당하는 생합성 경로의 활성을 감소시키거나 차단하는 방법, 또는 목적산물로의 생합성 경로를 강화하는 방법 등 생합성 경로를 조절하는 효소를 활성, 결실 또는 강화하는 방법이 있다. 하지만 이러한 경우 원치 않는 돌연변이가 생겨 생육 저하 및 피드백 억제(feedback inhibition)로 목적 산물 생산이 저하되는 문제가 발생할 수 있다.
본 발명에서 결실을 시킨 gltB 유전자는 GOGAT(glutamate synthase)를 코딩하는 유전자인 gltBD 중 라지 서브유닛(large subunit)에 해당하는 유전자로 글루탐산을 합성하는 효소를 코딩한다. 글루탐산은 글루타민 생산에 있어 주요 부산물 중 하나이다. 따라서 글루탐산을 합성하는 효소를 불활성화 시킴으로써 글루타민 생산성을 증대시키고자 하였다.
또한 글루타민으로부터 생성되는 카바모일인산(Carbamoyl phosphate)은 알기닌 합성에 사용되므로, GOGAT 불활성화 균주를 이용하여 알기닌 생산성을 증대시키고자 하였다(도 1a 및 도 1b 참조).
본 명세서 전체에 걸쳐 다수의 논문 및 특허문헌이 참조되고 그 인용이 표시되어 있다. 인용된 논문 및 특허 문헌의 개시 내용은 그 전체로서 본 명세서에 참조로 삽입되어 본 발명이 속하는 기술 분야의 수준 및 본 발명의 내용이 보다 명확하게 설명된다.
본 발명자들은 글루타민 및 알기닌의 생산성을 높이기 위한 방법을 개발하고자 예의 연구 노력하였다. 그 결과, 유전자 재조합 기술을 이용하여 GOGAT(glutamate synthase)를 불활성화 시키는 경우 글루타민 생산에 있어 주요 부산물 중 하나인 글루탐산의 합성을 감소시켜 글루타민의 생산성을 증가시킬 뿐만 아니라, 글루타민으로부터 생성되는 카바모일인산(Carbamoyl phosphate)은 알기닌 합성에 사용되므로 알기닌의 생산성 또한 향상시킬 수 있음을 확인함으로써 본 발명을 완성하였다.
따라서 본 발명의 목적은 불활성화 GOGAT를 포함하는 글루타민 또는 알기닌 고생산능 변이 균주를 제공하는 데 있다.
본 발명의 다른 목적은 GOGAT를 불활성화 시키는 단계를 포함하는 글루타민 또는 알기닌 고생산능 변이 균주의 제조방법을 제공하는 데 있다.
본 발명의 또 다른 목적은 본 발명의 변이 균주를 배양하는 단계를 포함하는 고농도 글루타민 또는 고농도 알기닌을 생산하는 방법을 제공하는 데 있다.
본 발명의 다른 목적 및 이점은 하기의 발명의 상세한 설명, 청구범위 및 도면에 의해 보다 명확하게 된다.
본 발명의 일 양태에 따르면, 본 발명은 불활성화 GOGAT(glutamate synthase)를 포함하는 글루타민 또는 알기닌 고생산능 변이 균주를 제공한다.
본 발명자들은 글루타민 및 알기닌의 생산성을 높이기 위한 방법을 개발하고자 예의 연구 노력하였다. 그 결과, GOGAT(glutamate synthase)를 불활성화 시킨 변이 균주의 글루타민 및 알기닌의 생산성이 향상된 사실을 확인하였다.
본 발명자들은 유전자 재조합 기술을 이용하여 GOGAT(glutamate synthase)를 불활성화 시키는 경우 글루타민 생산에 있어 주요 부산물 중 하나인 글루탐산의 합성을 감소시켜 글루타민의 생산성을 증가시킬 뿐만 아니라, 글루타민으로부터 생성되는 카바모일인산(Carbamoyl phosphate)은 알기닌 합성에 사용되므로 알기닌의 생산성 또한 향상시킬 수 있음을 확인하였다.
본 발명에서 글루타민 또는 알기닌 고생산능 변이 균주를 표현하면서 사용하는 용어 "불활성화"는 유전자를 코딩하는 뉴클레오타이드를 치환, 삽입, 결실 또는 이들의 조합에 의하여 단백질의 발현을 억제시키는 것을 의미한다.
본 발명의 일 구현예에 따르면, 본 발명의 글루타민 또는 알기닌 고생산능 변이 균주는 gltB 유전자를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열의 치환, 삽입, 결실 또는 이들의 조합에 의하여 GOGAT가 불활성화된 변이 균주를 의미한다. 본 발명의 다른 구현예에 따르면, 본 발명의 글루타민 또는 알기닌 고생산능 변이 균주는 gltB 유전자를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열의 완전 또는 부분 결실에 의하여 GOGAT가 불활성화된 변이 균주를 의미한다. 본 발명의 특정 구현예에 따르면, 본 발명의 글루타민 또는 알기닌 고생산능 변이 균주는 gltB 유전자를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열의 부분 결실에 의하여 GOGAT가 불활성화된 변이 균주를 의미한다.
본 발명은 야생형(wild type) 또는 활성화 GOGAT를 포함하는 글루타민 또는 알기닌 생산능 균주를 모균주로 하여 GOGAT를 불활성화 시킨 균주이며, GOGAT를 발현하거나 GOGAT의 효소 활성을 포함하고 있는 균주라면 모균주로 제한 없이 이용이 가능하다.
본 발명의 일 구현예에 따르면, 본 발명의 글루타민 고생산능 변이 균주는 코리네박테리움(Corynebacterium) 속, 브레비박테리움(Brevibacterium) 속, 마이크로코커스(Micrococcus) 속, 마이크로박테리움(Microbacterium) 속, 바실러스 속, 스트렙토마이세스 속, 페닐실리움 속, 슈도모나스(Pseudomonas) 속, 아쓰로박터(Arthrobacter) 속, 세라티아(Serratia) 속, 캔디다(Candida) 속, 에어로박터 에어로겐스(Aerobacter aerogenes), 클렙시엘라(Klebsiella) 속, 에르위니아(Erwinia) 속 및 판토에아(Pantoea) 속으로 이루어진 군으로부터 선택된 균주이다. 본 발명의 다른 구현예에 따르면, 본 발명의 글루타민 고생산능 변이 균주는 코리네박테리움 속, 브레비박테리움 속 또는 마이크로박테리움 속이다. 본 발명의 특정 구현예에 따르면, 본 발명의 글루타민 고생산능 변이 균주는 코리네박테리움 아세토액시도필럼(Corynebacterium acetoacidophilum), 코리네박테리움 아세토글루타미쿰(Corynebacterium acetoglutamicum), 코리네박테리움 알카노리티쿰(Corynebacterium alkanolyticum), 코리네박테리움 칼루내(Corynebacterium callunae), 코리네박테리움 글루타미쿰(Corynebacterium glutamicum), 코리네박테리움 릴리움(Corynebacterium lilium), 코리네박테리움 멜라쎄콜라(Corynebacterium melassecola), 코리네박테리움 써모아미노게네스(Corynebacterium thermoaminogenes), 코리네박테리움 에피시엔스(Corynebacterium efficiens), 코리네박테리움 헤르쿨리스(Corynebacterium herculis), 브레비박테리움 디바리카툼(Brevibacterium divaricatum), 브레비박테리움 플라붐(Brevibacterium flavum), 브레비박테리움 임마리오필럼(Brevibacterium immariophilum), 브레비박테리움 락토퍼멘툼(Brevibacterium lactofermentum), 브레비박테리움 로세움(Brevibacterium roseum), 브레비박테리움 사카로리티쿰(Brevibacterium saccharolyticum), 브레비박테리움 티오게니탈리스(Brevibacterium thiogenitalis), 브레비박테리움 암모니아게네스(Brevibacterium ammoniagenes), 브레비박테리움 알붐(Brevibacterium album), 브레비박테리움 세리눔(Brevibacterium cerinum), 마이크로박테리움 암모니아필럼(Microbacterium ammoniaphilum)이다. 본 발명의 어떠한 구현예에 따르면, 본 발명의 글루타민 고생산능 변이 균주는 코리네박테리움 아세토액시도필럼, 코리네박테리움 아세토글루타미쿰, 코리네박테리움 알카노리티쿰, 코리네박테리움 칼루내, 코리네박테리움 글루타미쿰, 코리네박테리움 릴리움, 코리네박테리움 멜라쎄콜라, 코리네박테리움 써모아미노게네스, 코리네박테리움 에피시엔스, 코리네박테리움 헤르쿨리스이다. 본 발명의 또 다른 구현예에 따르면, 본 발명의 글루타민 고생산능 변이 균주는 코리네박테리움 글루타미쿰(Corynebacterium glutamicum)이다.
본 발명의 일 구현예에 따르면, 본 발명의 알기닌 고생산능 변이 균주는 코리네박테리움(Corynebacterium) 속 또는 브레비박테리움(Brevibacterium) 속이다. 본 발명의 다른 구현예에 따르면, 본 발명의 알기닌 고생산능 변이 균주는 코리네박테리움 글루타미쿰(Corynebacterium glutamicum), 코리네박테리움 아세토글루타미쿰(Corynebacterium acetoglutamicum), 코리네박테리움 아세토아시도필럼(Corynebacterium acetoacidophilum), 코리네박테리움 써모아미노제네스(Corynebacterium thermoaminogenaes), 브레비박테리움 플라붐(Brevibacterium flavum), 브레비박테리움 락토퍼멘툼(Brevibacterium lactofermentum), 브레비박테리움 디바리카툼(Brevibacterium divaricatum)이다.
본 발명의 특정 구현예에 따르면, 본 발명의 알기닌 고생산능 변이 균주는 코리네박테리움 글루타미쿰이다. 본 발명의 또 다른 구현예에 따르면, 상기 코리네박테리움 글루타미쿰은 코리네박테리움 글루타미쿰(Corynebacterium glutamicum) ATCC13032이다.
본 발명의 특정 구현예에 따르면, 본 발명의 알기닌 고생산능 변이 균주는 코리네박테리움 아세토글루타미쿰 ATCC15806, 코리네박테리움 아세토아시도필럼 ATCC13870, 코리네박테리움 써모아미노제네스FERM BP-1539, 브레비박테리움 플라붐 ATCC14067, 브레비박테리움 락토퍼멘툼 ATCC13869, 브레비박테리움 디바리카툼 ATCC14020이다.
본 명세서의 용어 "고생산능"은 야생형 또는 활성화 GOGAT를 포함하는 글루타민 또는 알기닌 생산능 균주로부터 생산되는 글루타민 또는 알기닌의 생산량보다 증가된 양의 글루타민 또는 알기닌을 생산할 수 있는 능력을 의미한다.
본 발명의 일 구현예에 따르면, 본 발명의 글루타민 고생산능 변이 균주는 야생형 또는 활성화 GOGAT를 포함하는 글루타민 생산능 균주와 비교하여 글루타민의 생산능이 10-70%, 10-65%, 10-60% 또는 10-55% 증가된 균주이다. 본 발명의 다른 구현예에 따르면, 본 발명의 글루타민 고생산능 변이 균주는 야생형 또는 활성화 GOGAT를 포함하는 글루타민 생산능 균주와 비교하여 글루타민의 생산능이 15-70%, 20-70%, 23-70%, 23-65%, 23-60% 또는 23-55% 증가된 균주이다. 본 발명의 특정 구현예에 따르면, 본 발명의 글루타민 고생산능 변이 균주는 야생형 또는 활성화 GOGAT를 포함하는 글루타민 생산능 균주와 비교하여 글루타민의 생산능이 15-65%, 20-65%, 20-60% 또는 20-55% 증가된 균주이다.
본 발명의 일 구현예에 따르면, 본 발명의 알기닌 고생산능 변이 균주는 야생형 또는 활성화 GOGAT를 포함하는 알기닌 생산능 균주와 비교하여 알기닌의 생산능이 1-15%, 1-10%, 1-8% 또는 1-7% 증가된 균주이다. 본 발명의 다른 구현예에 따르면, 본 발명의 알기닌 고생산능 변이 균주는 야생형 또는 활성화 GOGAT를 포함하는 알기닌 생산능 균주와 비교하여 알기닌의 생산능이 1.5-15%, 2-15%, 2.5-15%, 2.5-10%, 2.5-8% 또는 2.5-7% 증가된 균주이다. 본 발명의 특정 구현예에 따르면, 본 발명의 글루타민 고생산능 변이 균주는 야생형 또는 활성화 GOGAT를 포함하는 글루타민 생산능 균주와 비교하여 글루타민의 생산능이 1.5-10%, 1.5-8%, 2-8% 또는 2-7% 증가된 균주이다.
본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 GOGAT를 불활성화 시키는 단계를 포함하는 글루타민 또는 알기닌 고생산능 변이 균주의 제조방법을 제공한다.
본 발명은 야생형 또는 활성화 GOGAT를 포함하는 글루타민 또는 알기닌 생산능 균주를 공지된 유전자 재조합 방법에 의하여 GOGAT를 불활성화 시키는 것이 가능하다.
본 발명의 일 구현예에 따르면, 본 발명의 불활성화는 gltB 유전자를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열의 치환, 삽입, 결실 또는 이들의 조합에 의하여 GOGAT를 억제시키는 것을 의미한다. 본 발명의 다른 구현예에 따르면, 본 발명의 불활성화는 gltB 유전자를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열의 완전 또는 부분 결실에 의하여 GOGAT를 억제시키는 것을 의미한다. 본 발명의 특정 구현예에 따르면, 본 발명의 글루타민 또는 알기닌 고생산능 변이 균주는 gltB 유전자를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열의 부분 결실에 의하여 GOGAT를 억제시키는 것을 의미한다.
글루타민 또는 알기닌 생합성에 관련된 GOGAT를 암호화 하는 유전자 gltB를 염색체상에서 결실시키기 위하여 재조합 플라스미드 pK19mobsacB::ΔgltB를 이용한다(도 2a 및 도 2b).
본 발명에서 야생형 또는 활성화 GOGAT를 포함하는 글루타민 또는 알기닌 생산능 균주에 형질전환 시키는 단계는 공지된 방법을 통하여 실시될 수 있다. 예컨대, 전기 천공 방법(van der Rest et al., Appl. Microbiol. Biotechnol., 52, 541-545, 1999) 등에 의해 실시될 수 있다.
또한, 본 발명은 형질전환이 되지 않은 야생형 또는 활성화 GOGAT를 포함하는 글루타민 또는 알기닌 생산능 균주로부터 형질 전환된 변이 균주를 분리 및 수득하는 단계를 포함한다.
상기 본 발명에서 형질전환이 되지 않은 글루타민 또는 알기닌 생산능 균주 균주로부터 형질전환된 변이 균주를 분리 및 수득하는 단계를 실시하는데 있어서 선택 표지된 벡터를 이용할 수 있다.
또한, 본 발명에서 이용하는 벡터는 플라스미드 또는 파지(phage)를 포함하나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명에서 이용하는 선택 표지는 당업계에서 통상적으로 이용되는 카나마이신, 클로람페니콜 같은 항생제 내성 유전자와 고초균 유래 SacB 유전자의 산물인 레반슈크라제(levansucrase)를 포함한다.
본 발명의 제조방법은 상술한 글루타민 또는 알기닌 고생산능 변이 균주와 동일한 균주를 제조하는 방법이며, 불활성화의 대상이 되는 단백질(GOGAT) 및 관련 유전자(gltB)를 공통으로 하기 때문에, 이 둘 사이의 공통된 내용은 본 명세서의 과도한 복잡성을 피하기 위하여 그 기재를 생략한다.
본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 본 발명의 변이 균주를 배양하는 단계를 포함하는 고농도 글루타민 또는 고농도 알기닌 생산방법을 제공한다.
본 발명은 글루타민 또는 알기닌 생산능 균주 및 변이 균주의 전배양 또는 종배양 하는데 있어서 공지된 배양 방법을 통해 배양할 수 있다.
본 발명의 일 구현예에 따르면, 본 발명의 배양은 25-35℃에서 실시한다. 본 발명의 다른 구현예에 따르면, 본 발명의 배양은 28-32℃에서 실시한다.
본 발명의 일 구현예에 따르면, 본 발명의 배양은 교반속도 100-600 rpm에서 실시한다. 본 발명의 다른 구현예에 따르면, 본 발명의 배양은 교반속도 100-200 rpm 또는 400-600 rpm에서 실시한다. 본 발명의 특정 구현예에 따르면, 본 발명의 배양은 본 발명의 글루타민 고생산능 변이균주를 배양하는 경우 교반속도 400-600 rpm 또는 알기닌 고생산능 변이균주를 배양하는 경우 교반속도 100-200 rpm에서 실시한다. 본 발명의 어떠한 구현예에 따르면, 본 발명의 배양은 본 발명의 글루타민 고생산능 변이균주를 배양하는 경우 교반속도 450-550 rpm 또는 알기닌 고생산능 변이균주를 배양하는 경우 교반속도 140-180 rpm에서 실시한다.
본 발명에 천연배지 또는 합성배지를 사용할 수 있으며, 배지의 탄소원으로는 예를 들어, 글루코오스, 수크로오스, 덱스트린, 글리세롤, 녹말 등이 사용될 수 있고, 질소원으로는 펩톤, 육류 추출물, 효모 추출물, 건조된 효모, 대두 케이크, 우레아, 티오우레아, 암모늄염, 나이트레이트 및 기타 유기 또는 무기 질소-함유 화합물이 사용될 수 있으나, 이러한 성분에 한정되는 것은 아니다.
배지에 포함되는 무기염으로는 마그네슘, 망간, 포타슘, 칼슘, 철 등의 포스페이트, 나이트레이트, 카보네이트, 클로라이드 등이 사용될 수 있으나, 이들에 한정되는 것은 아니다.
상기 탄소원, 질소원 및 무기염의 성분 이외에 아미노산, 비타민, 핵산 및 그와 관련된 화합물들이 배지에 첨가될 수 있다.
본 명세서의 용어 "생산수율"은 탄소원 및 에너지원으로 사용된 포도당에 대한 글루타민 또는 알기닌의 생산량(중량/중량) 비율을 의미한다. 본 발명의 일 구현예에 따르면, 본 발명의 글루타민은 생산수율이 20-70%, 20-65%, 20-60% 또는 20-55%이다. 본 발명의 다른 구현예에 따르면, 본 발명의 글루타민은 생산수율이 25-70%, 30-70%, 35-70% 또는 40-70%이다. 본 발명의 특정 구현예에 따르면, 본 발명의 글루타민은 생산수율이 25-65%, 30-60%, 35-55% 또는 40-55%이다.
본 발명의 일 구현예에 따르면, 본 발명의 알기닌은 생산수율이 10-30%, 10-25% 또는 10-20%이다. 본 발명의 다른 구현예에 따르면, 본 발명의 글루타민은 생산수율이 15-30%, 15-25% 또는 18-22%이다.
본 발명은 상기 GOGAT 불활성화 글루타민 또는 알기닌 고생산능 변이 균주와 동일한 균주 및 균주제조 방법을 이용하여 고농도 글루타민 또는 고농도 알기닌을 생산하는 방법이므로, 이 둘 사이에 공통된 내용은 본 명세서의 과도한 복잡성을 피하기 위하여, 그 기재를 생략한다.
본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 본 발명의 방법을 이용하여 생산한 글루타민 또는 알기닌을 제공한다.
본 발명의 특징 및 이점을 요약하면 다음과 같다:
(a) 본 발명은 불활성화 GOGAT를 포함하는 글루타민 또는 알기닌 고생산능 변이 균주 및 이의 제조방법을 제공한다.
(b) 본 발명은 본 발명의 변이 균주를 배양하는 단계를 포함하는 고농도 글루타민 또는 고농도 알기닌을 생산하는 방법을 제공한다.
(c) 본 발명은 GOGAT(glutamate synthase)를 불활성화 시킴으로써 야생형 또는 활성화 GOGAT를 포함하는 글루타민 또는 알기닌 생산능 균주보다 생육이 저하되지 않으면서 글루타민 및 알기닌 생산능이 향상된 변이 균주를 제조하여 고농도 글루타민 및 고농도 알기닌을 생산할 수 있는 효과가 있다.
(d) 본 발명은 본 발명의 변이 균주를 이용하여 고농도의 글루타민 또는 알기닌 생산이 가능한바, 글루타민 또는 알기닌이 원료로 사용되는 경우에 있어 원가 절감의 이점이 있다.
도 1a 및 1b는 글루타민(도 1a) 또는 알기닌(도 1b)의 생합성 경로를 나타낸다.
도 2a 및 2b는 gltB 유전자 결실벡터 제조과정(도 2a) 및 gltB 유전자 결실벡터(도 2b)를 나타낸다. 글루타민 생산균주의 경우 GMgltB-F(HindⅢ), GMgltB-R(Fu), GMgltB-F(Fu), GMgltB-R(HindⅢ), GMgltB-cf 및 GMgltB-cr를 프라이머를 사용하였고, 알기닌 생산균주의 경우 ARGgltB-F(HindⅢ), ARGgltB-R(Fu), ARGgltB-F(Fu), ARGgltB-R(HindⅢ), ARGgltB-cf 및 ARGgltB-cr 프라이머를 사용하였다.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로, 본 발명의 요지에 따라 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되지 않는다는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에 있어서 자명할 것이다.
실시예
본 명세서 전체에 걸쳐, 특정 물질의 농도를 나타내기 위하여 사용되는 "%"는 별도의 언급이 없는 경우, 고체/고체는 (중량/중량) %, 고체/액체는 (중량/부피) %, 그리고 액체/액체는 (부피/부피) %이다.
실시예 1: gltB 유전자가 결실된 변이주 제조
gltB 유전자를 상동성 재조합 방법(homologous recombination)으로 결실시켰다. 결실하고자 하는 gltB 유전자의 뉴클레오타이드 서열은 서열번호 1(코리네박테리움 글루타미쿰 365) 및 서열번호 2(코리네박테리움 글루타미쿰 ARP)와 같다.
위자드 지노믹 DNA 정제 키트(Wizard Genomic DNA Purification Kit, 프로메가, 미국)를 이용하여 글루타민 생산 균주인 코리네박테리움 글루타미쿰 365(기탁번호 KFCC-10694) 및 알기닌 생산 균주인 코리네박테리움 글루타미쿰 균주(기탁번호 ATCC 21831)를 변이 처리(예컨대, 자외선 조사 또는 MNNG(N-methyl-N'-nitrosoguanidine)처리)하여 알기닌 하이드록사메이트(L-Arginie hydroxamate hydrochloride, 시그마, 미국)에 내성을 갖는 코리네박테리움 글루타미쿰 ARP의 염색체 DNA(지노믹 DNA)를 분리하였다. 상기 알기닌 생산 균주를 변이 처리하여 알기닌 하이드록사메이트에 내성을 갖는 균주를 분리하는 방법은 본 발명자들의 대한민국 등록특허 제 10-0052645호 및 대한민국 등록특허 제 10-0055145호에 상세하게 기재되어 있으며, 이는 본 명세서에 참조로서 삽입된다.
상기 염색체 DNA를 주형(template)으로 중합효소 연쇄반응(PCR)을 이용하여 결실된 형태의 gltB DNA 절편 1173bp(주형: 코리네박테리움 글루타미쿰 365) 및 999bp(주형: 코리네박테리움 글루타미쿰 ARP)를 증폭하였다.
gltB 결실 균주를 제작하기 위해서 하기 표 1에서의 프라이머 쌍을 이용하여 PCR 반응(총 반응 부피는 50 ㎕, 94℃에서 5분 1 사이클 후, 94℃에서 30초, 55℃에서 30초, 72℃에서 2분 총 30 사이클 및 그 후 72℃에서 5분)을 수행하였다. 1 차 PCR 산물을 획득 후 오버랩 PCR(overlap PCR)을 수행하여 최종 PCR 산물인 1173bp(GMgltB-cf 및 GMgltB-cr 이용) 및 999bp(ARGgltB-cf 및 ARGgltB-cr 이용) 각각을 우선적으로 pGEMT-이지 벡터(T-벡터, 프로메가, 미국)에 클로닝 하였다.
T-벡터에 포함된 형태의 gltB를 제한효소 HindⅢ로 처리하였으며, 최종 벡터 제조를 위하여 pK19mobsacB 벡터 역시 같은 제한효소를 처리하고 난 후 이를 연결(ligation)하였다. 연결 반응은 연결 키트 버전 2.1(Ligation kit Ver 2.1, 다카라, 일본)을 사용하였다.
완성된 벡터는 전기충격요법(electroporation)으로 글루타민 및 알기닌 생산균주에 도입하였다. 최종 후보주는 표 1의 프라이머쌍(글루타민 생산균주의 경우 GMgltB-cf 및 GMgltB-cr, 알기닌 생산균주의 경우 ARGgltB-cf 및 ARGgltB-cr)을 이용하여 gltB 유전자가 결실되었는지 확인하였다.
글루타민 및 알기닌을 분석하기 위하여 배양액을 증류수로 100배 희석하고 0.45 μm 여과막으로 여과한 다음 컬럼(Universal Cation HR 3u, 100 mm, Part No. 23100)과 자외선 검출기(195 nm)가 장착된 고성능 액체크로마토그래피(HPLC)를 이용하였다.
프라이머 염기서열 (5'→ 3')
GMgltB-F(HindⅢ) CCC AAG CTT GGG TGG CGT AGA TAA CTG
GMgltB-R(Fu) CCA CAA GTC CAG AAT CAG GCG ATT CCT GTT GCG TAC
GMgltB-F(Fu) GTA CGC AAC AGG AAT CGC CTG ATT CTG GAC TTG TGG
GMgltB-R(HindⅢ) CCC AAG CTT CAG GAT TGC CAG CTC ATG
GMgltB-cf GGC TGG CAC ATT CAA AGG
GMgltB-cr CTG ATT CCA CCA CCA ACG
ARGgltB-F(HindⅢ) CCC AAG CTT GGG TGG CGT AGA TGA TTG
ARGgltB-R(Fu) CGC GAA TCC ACT CAC CAT GCA ATA CCA GTG GCA TAC
ARGgltB-F(Fu) GTA TGC CAC TGG TAT TGC ATG GTG AGT GGA TTC GCG
ARGgltB-R(HindⅢ) CCC AAG CTT CAG CAG CAC CAA AGG AAT
ARGgltB-cf TCC CGG AAC ATT GAG GGG
ARGgltB-cr CCC TGG TGG TGG AAT CTG
실시예 2: 글루타민 생산균주 365와 gltB 유전자 결실균주의 글루타민 생산량 평가(플라스크)
상기 실시예 1에서 얻어진 gltB 유전자 결실 균주의 글루타민 생산량을 확인하기 위하여 모균주인 글루타민 생산균주 365와 gltB 유전자가 결실된 균주인 365 Δg l tB의 글루타민 생산량을 비교하였다. 상기 두 균주를 표 2의 조성으로 구성된 배지에서 플라스크 역가 실험으로 글루타민 생산량을 비교하였다.
성분 플라스크 배지 농도
글루코오스 10%
HVP 1%
비프 추출물 0.05%
요소 0.15%
NH4Cl 3.5%
비오틴 1.5 μg/L
티아민-HCl 2000 μg/L
시스테인-HCl 200 mg/L
M-100 200 mg/L
CaCl2 0.25%
MgSO4 0.05%
FeSO4 10 ppm
MnSO4 10 ppm
ZnSO4 20 ppm
KH2PO4 0.05%
K2HPO4 0.05%
상기 배지 조건으로 플라스크 역가 실험을 수행하였고, 물리적인 배양 조건은 온도 30℃, 교반속도 140 rpm으로 배양하였다. 하기 표 3은 모균주 및 gltB 결실 균주의 글루타민 생성량 비교(플라스크 역가 실험)에 관한 것이다.
균주명 글루타민(%) 수율(Yp/s)
365 ΔgltB #3 3.38 46.6
365 ΔgltB #4 3.42 49.2
365 ΔgltB #6 3.21 46.8
365 ΔgltB #9 3.45 46.9
365 2.25 38.5
표 3의 결과와 같이 365 ΔgltB #4 균주는 모균주에 비해 글루타민 생산이 증가하여 수율이 높아진 것으로 나타났다. 365와 365 ΔgltB #4 배양 결과의 글루타민 생산량을 비교하면 모균주 대비 365 ΔgltB #4의 생산량이 2.25%에서 3.42%로, 글루타민 생산량 2.25% 기준 시 본 발명에 의해 글루타민 생산량이 53.3% 증가한 것을 확인할 수 있었다.
실시예 3: 글루타민 생산균주 365와 gltB 유전자 결실균주의 글루타민 생산량 평가(발효조)
상기 두 균주를 표 4의 배지 조성으로 구성된 50L 발효조에서 글루타민 생산량을 비교하였다.
성분 사입 배지 농도
글루코오스 18%
HVP 2.5%
CSP 0.208%
NH4Cl 0.738%
비오틴 1 μg/L
티아민-HCl 2000 μg/L
시스테인-HCl 700 mg/L
M-100 360 mg/L
CaCl2 0.1%
MgSO4 0.088%
FeSO4 20 ppm
MnSO4 24 ppm
ZnSO4 60 ppm
KH2PO4 0.162%
K2HPO4 0.107%
상기 배지 조건으로 사입 액량 1.8 L로 수행하였고, 물리적인 배양 조건은 온도 30℃, 교반속도 500 rpm 및 통기량 1.0 vvm의 조건으로 배양하였다. 본 발명에서 얻어진 365 ΔgltB는 모균주와 같은 조건으로 배양하였다. 하기 표 5는 모균주 및 gltB 결실 균주의 글루타민 생성량 비교(50L J/F)에 관한 것이다.
균주명 배양시간(hr) O.D 글루타민(%) 수율(Yp/s)
365 ΔgltB #4-41 84 58.9 11.23 50.9
365 ΔgltB #4-46 84 55.3 10.83 51.6
365 84 58.2 8.61 38.3
표 5의 결과와 같이 365 ΔgltB #4-41 균주는 모균주에 비해 생육이 저하되지 않으면서 글루타민 생산이 증가하여 수율이 높아진 것으로 나타났다. 모균주와 동일한 시간(84 hr)으로 365 ΔgltB #4-41를 배양한 결과, 58.9의 O.D 값을 보여 모균주와 유사한 생육 정도를 나타냈다. 또한, 365 ΔgltB #4-41의 글루타민 생산량은 11.23%로, 본 발명에 의해 모균주의 글루타민 생산량 8.61%을 기준으로 하여 365 ΔgltB #4-41의 글루타민 생산량이 30.4% 증가한 것을 확인 할 수 있었다.
실시예 4: 알기닌 생산균주 ARP와 gltB 유전자 결실균주의 알기닌 생산량 평가
상기 실시예 1에서 얻어진 gltB 유전자 결실 균주의 알기닌 생산량을 확인하기 위하여 모균주인 알기닌 생산균주 ARP와 gltB 유전자가 결실된 균주인 ARP ΔgltB의 알기닌 생산량을 비교하였다. 상기 두 균주를 표 6의 조성으로 구성된 배지에서 플라스크 역가 실험으로 알기닌 생산량을 비교하였다.
성분 플라스크 배지 농도
글루코오스 10 %
효모 펩톤 1 %
요소 0.2 %
(NH4)2SO4 4.5 %
비오틴 100 ug/L
티아민-HCl 100 ug/L
MgSO4 0.1 %
FeSO4 20 ppm
MnSO4 20 ppm
KH2PO4 0.2 %
알기닌 2 %
상기 배지 조건으로 플라스크 역가 실험을 수행하였고, 물리적인 배양 조건은 온도 30℃, 교반속도 160 rpm으로 배양하였다. 하기 표 7은 모균주 및 gltB 결실 균주의 알기닌 생성량 비교(플라스크 역가 실험)에 관한 것이다.
균주명 알기닌 (%) 수율 (Yp/s)
ARP ΔgltB #1 1.52 19.5
ARP ΔgltB #6 1.49 19.6
ARP ΔgltB #8 1.54 19.8
ARP 1.45 18.2
표 7의 결과와 같이 ARP ΔgltB #8 균주는 모균주에 비해 알기닌 생산이 증가하여 수율이 높아진 것으로 나타났다. ARP와 ARP ΔgltB #8 배양 결과의 알기닌 생산량을 비교하면 모균주 대비 ARP ΔgltB #8 의 생산량이 1.45%에서 1.54%로, 본 발명에 의해 알기닌 생산량 1.45% 기준 시 알기닌 생산량이 6.2% 증가한 것을 확인 할 수 있었다.
이상으로 본 발명의 특정한 부분을 상세히 기술하였는바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 이러한 구체적인 기술은 단지 바람직한 구현 예일 뿐이며, 이에 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백하다. 따라서 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항과 그의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.
<110> DAESANG CORPORATION <120> Mutant Strain with improved Amino acid production by inactivating GOGAT <130> PN120573 <160> 2 <170> KopatentIn 2.0 <210> 1 <211> 4533 <212> DNA <213> Corynebacterium glutamicum 365 gltB <400> 1 atgaataaac aagggcttta taacccagtg catgaacacg atgcctgtgg cgtggcattc 60 atcgcggata tccacggacg tcctagccga agcattgtgg accgtgccct agaagcactg 120 cgcaatattg atcaccgtgg tgcagcaggt gcagaaaaga acaccggcga tggtgcgggc 180 attctcatgc agatccctga cagtttttat cgtgaagtgt caggcattga acttcctgaa 240 gcaggggagt acgcaacagg aatcgccttc ctgccacgag cacggatggc catgttggat 300 gcacaaaaag aaatcgaacg catcgccatc caagaaggtg cagaggttct tggttggcgc 360 atggttcctt ttgattcccg cgagttgggt tccatggctg ttgaatccat gccaagtttt 420 gcgcagatct tccttcacgt acctggaaaa acaggcgagg atctagaccg cgttatgttt 480 tttatccgca agcgctgtga acgtgagctg ggtactacag gtggccggga taccgtgtac 540 tttccatcgc tgtcttctcg cacggtgatt tacaaaggca tgctcaccac cctgcagctt 600 gagggatttt tcgatgatct gggtgatccc cgcatggaga ctgcaatcgc gattgtgcac 660 tcacgctttt ccaccaatac tttccccagc tggcctttgg cacacccata tcgtttcgtc 720 gcccacaatg gtgaaatcaa taccgtgcgc ggcaatgaga attggatgcg ggcgcgcgaa 780 gcgctcatta agagcaataa gctgggagat ctcggcagcg tgctgcctat ctgcaccccg 840 gagggctccg acaccgcgcg tttcgacgag gctttggagc ttttgcacct gggcggatac 900 tccctgcccc atgctgttgc catgatgatt ccgcaggcct gggaacacaa taaaacactg 960 agtccgaagc ttcgtgattt ctacgaatat cactcctgcc tcatggaacc atgggatggt 1020 ccggctgcgc tggcctttac tgatagtcgt tttgtgggtg ctgttctaga ccgtaatggc 1080 ctgcgaccag gacgtatttc cattactgat tctggacttg tggtgatggc ttctgaatcg 1140 ggtgtactgg acttgaggga ggaaagcgtc gtaaagcgaa ctcgcgtcca gcctggacgc 1200 atgttccttg ttgacacggc cgagggccgc attgttgaag acgaagaaat caagcagaaa 1260 ttgagcgaag cgaagcctta tggtgagtgg attcgcgata attttgtgca tcttgatcgc 1320 ttgccgcaga ctcggtacag ctacatggca cactcgcgcg cggtgctgcg ccagcgcgtt 1380 tttggcatta ctgaagaaga cgtggatctg ctcatcctgc cgatggcacg ccagggtgct 1440 gaggctatcg gttccatggg ctcagatacg ccgatcgctg ctctctccca acgtccgcgt 1500 atgctttatg 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aagaaaatgc acaccgtgaa ttggatttgg gcggtgaata caagtggcgc 2400 cgcgaaggtg aataccacct gttcaactcg gaaaccatct tcaagctgca gcatgccact 2460 cgctcgggaa gttacaagat ttttaaggat tacacccgca aggtggatga tcaatccact 2520 cgtctgggta ccattcgtgg gctttttgaa ttcagtgcgg atcgcacccc catccccgta 2580 tcagaggtgg agccggtcag tgagattgtc aagcgatttt ccaccggtgc gatgtcctat 2640 ggctcgatct ctgcggaagc acatgaggta ttggccattg ccatgaatcg tctgggcagc 2700 atgtccaatt ccggcgaagg tggcgaggac gcccgccgct tcgatgtgga acccaatggc 2760 gattggaagc gctctgctat caaacaggtt gcctcaggcc gtttcggcgt gaccagccac 2820 tatctcaaca actgcaccga tattcagatc aagatggctc aaggtgcaaa gccaggtgaa 2880 ggtggccagc tgccaccaaa taaggtctac ccatggatcg cggaagtgcg catcaccacc 2940 ccaggtgttg gtctgatttc tcctccgcca caccacgata tttactccat tgaggatcta 3000 gcccagctga tccacgacct gaaaaatgct aacccccgcg cccgcattca cgtgaaattg 3060 gtagcagaac aaggtgttgg aactgttgct gctggtgtgt ccaaagcaca cgcagatatg 3120 gtgctcattt cgggacacga tgggggaacc ggtgcatcgc ctttgacgtc cctcaagcat 3180 gccggtgggc catgggagct tggattagct gaaactcagc aaaccttgct gctcaacggc 3240 ctgcgcgatc gcattcgtgt gcagtgtgat ggccagctaa aaaccggccg cgatgtagtg 3300 atcgcagcgc tacttggtgc agaagaattt ggctttgcca ccgcaccact ggtggtggaa 3360 ggctgcatca tgatgcgtgt ctgccacctg gatacctgcc cggtgggcat tgctacgcaa 3420 aacccagatc tgcgttccaa gttcaccggc aaagcagaac atgtggttaa tttcttcacc 3480 ttcatcgctg aagaagtccg cgagtatttg gcgcagcttg gtttccgctc cattgatgaa 3540 gccgtgggac aagcgcaggt gctgcgtaag cgttccggaa ttccagctga ttcccgtgca 3600 gcacacctgg atttgagccc tatcttccac cgcccagaaa ccccacactt cccaactcag 3660 gacgtgaggt gcaccaaaac ccaggaacat agcctggaaa aagccctgga caacgcattt 3720 attgataagg cttcggacac gattacccgt gccgccgcag gtgtggacac cagcattgtg 3780 atcgaaagcc agatcagcaa tgttaaccgt tcagtaggca ccatgctggg ttccgcagtc 3840 agccgcgtag ctggtgcgaa cggttttcct gatggcacca tcaccttgaa tctggagggc 3900 tgcgccggta actccttcgg tgcattcatt cccaagggca tcaccatcaa cctcaccggc 3960 gatgccaatg actttgtggg caagggactt tcaggcggac gcattgtcat ccgaccatca 4020 ttaaaggccc cgaagcagtt gaaaaacaat ccaaatatca ttgccggaaa cgtgcttggc 4080 tatggtgcca ccagcggtga attgttcatc cacggccagg tcggcgaacg tttctgcgtc 4140 cgtaactctg gcgccaccgc agtggtggaa ggtatcggaa accatggctg tgaatacatg 4200 actggtggcc gcgtgctcgt gcttggccca gtgggtgaaa actttggtgc cggcatgtcc 4260 ggtggcatcg cttacctgcc tagctctgcg gacctgaccc agaagatcaa tggcgaattg 4320 gtggatgttg ttccactgaa cgctgacgat ctgacctggg cagatgagct cattgcccgc 4380 cactgcaaac taaccggatc cgacaccaag ctgcgtgcac aagatttggt gaaagtcatg 4440 ccccgcgact accaaaaagt actcaacatc atcgaaatgg cccaggcaga gggccaagat 4500 ccagcaatca agatcatgga ggcagtgagc taa 4533 <210> 2 <211> 4534 <212> DNA <213> Corynebacterium glutamicum ARP gltB <400> 2 atgaaaccac aaggactcta caaccctgcg catgaacatg acgcctgcgg tgtggcgttt 60 attgcggata tccacggtcg acccagccgc agcattgttg atcgtgcact tgaggcgctt 120 cgcaatattg atcaccgagg tgccgccggt gcagagaaga acactggcga tggtgcgggc 180 atcctcatgc agattccgga tagtttctac cgtgaagtat ctggcattga gcttcctgag 240 gcaggggagt atgccactgg tattgcgttc ttgcctcgcg 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agggccaaga 4500 cccagcaatc aagatcatgg aggcagtgag ctaa 4534

Claims (9)

  1. 불활성화 GOGAT(glutamate synthase)를 포함하는 글루타민 또는 알기닌 고생산능 변이 균주.
  2. 제 1 항에 있어서, 상기 불활성화는 gltB 유전자를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열의 치환, 삽입, 결실 또는 이들의 조합에 의한 불활성화인 것을 특징으로 하는 변이 균주.
  3. 제 1 항에 있어서, 상기 글루타민 고생산능 변이 균주는 코리네박테리움(Corynebacterium) 속, 브레비박테리움(Brevibacterium) 속, 마이크로코커스(Micrococcus) 속, 마이크로박테리움(Microbacterium) 속, 바실러스 속, 스트렙토마이세스 속, 페닐실리움 속, 슈도모나스(Pseudomonas) 속, 아쓰로박터(Arthrobacter) 속, 세라티아(Serratia) 속, 캔디다(Candida) 속, 에어로박터 에어로겐스(Aerobacter aerogenes), 클렙시엘라(Klebsiella) 속, 에르위니아(Erwinia) 속 및 판토에아(Pantoea) 속으로 이루어진 군으로부터 선택된 균주인 것을 특징으로 하는 변이 균주.

  4. 제 1 항에 있어서, 상기 알기닌 고생산능 변이 균주는 코리네박테리움(Corynebacterium) 속 또는 브레비박테리움(Brevibacterium) 속인 것을 특징으로 하는 변이 균주.
  5. 제 1 항에 있어서, 상기 글루타민 고생산능 변이 균주는 야생형 또는 활성화 GOGAT를 포함하는 글루타민 생산능 균주와 비교하여 글루타민의 생산능이 10-70% 증가된 균주 것을 특징으로 하는 변이 균주.
  6. 제 1 항에 있어서, 상기 알기닌 고생산능 변이 균주는 야생형 또는 활성화 GOGAT를 포함하는 알기닌 생산능 균주와 비교하여 알기닌의 생산능이 1-15% 증가된 균주 것을 특징으로 하는 변이 균주.
  7. GOGAT(glutamate synthase)를 불활성화 시키는 단계를 포함하는 글루타민 또는 알기닌 고생산능 변이 균주의 제조방법.
  8. 제 1 항 내지 제 6 항 중 어느 하나의 변이 균주를 배양하는 단계를 포함하는 고농도 글루타민 또는 고농도 알기닌 생산방법.
  9. 제 8 항에 있어서, 상기 배양은 25-35℃에서 실시하는 것을 특징으로 하는 방법.
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