KR20070041765A - Ｈｉｖ-감염의 예방 및 치료를 위한 백신 - Google Patents
Ｈｉｖ-감염의 예방 및 치료를 위한 백신 Download PDFInfo
- Publication number
- KR20070041765A KR20070041765A KR1020077005049A KR20077005049A KR20070041765A KR 20070041765 A KR20070041765 A KR 20070041765A KR 1020077005049 A KR1020077005049 A KR 1020077005049A KR 20077005049 A KR20077005049 A KR 20077005049A KR 20070041765 A KR20070041765 A KR 20070041765A
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- leu
- glu
- lys
- nef
- gly
- Prior art date
Links
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 title abstract description 27
- 208000031886 HIV Infections Diseases 0.000 title description 3
- 208000037357 HIV infectious disease Diseases 0.000 title description 3
- 208000033519 human immunodeficiency virus infectious disease Diseases 0.000 title description 3
- 230000002265 prevention Effects 0.000 title description 3
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 76
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 76
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims abstract description 73
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims abstract description 71
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 claims abstract description 63
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 claims abstract description 63
- 239000000427 antigen Substances 0.000 claims abstract description 62
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims abstract description 60
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 claims abstract description 49
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims abstract description 41
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims abstract description 41
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims abstract description 41
- 230000004927 fusion Effects 0.000 claims abstract description 38
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 claims abstract description 6
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 126
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 102
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 59
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 claims description 43
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 43
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 claims description 35
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 claims description 33
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 claims description 33
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 claims description 27
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 25
- 239000000872 buffer Substances 0.000 claims description 24
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 claims description 17
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 claims description 17
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 15
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims description 15
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 claims description 14
- 101800003471 Helicase Proteins 0.000 claims description 12
- 238000011210 chromatographic step Methods 0.000 claims description 12
- 101710203526 Integrase Proteins 0.000 claims description 10
- 101800000007 p51 RT Proteins 0.000 claims description 9
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims description 7
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 claims description 4
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 claims description 3
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 2
- 230000036039 immunity Effects 0.000 claims 1
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 96
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 58
- 102100027881 Tumor protein 63 Human genes 0.000 description 57
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 56
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 52
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 48
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 46
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 43
- 101710147327 Calcineurin B homologous protein 1 Proteins 0.000 description 39
- 101710205625 Capsid protein p24 Proteins 0.000 description 39
- 101710177166 Phosphoprotein Proteins 0.000 description 39
- 101710149279 Small delta antigen Proteins 0.000 description 39
- 102100022563 Tubulin polymerization-promoting protein Human genes 0.000 description 39
- 102100029905 DNA polymerase epsilon subunit 3 Human genes 0.000 description 38
- 101710104359 F protein Proteins 0.000 description 38
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 36
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 35
- 241000725303 Human immunodeficiency virus Species 0.000 description 35
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 29
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 28
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 27
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 24
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 24
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 24
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 23
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 23
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 21
- 239000000047 product Substances 0.000 description 21
- 230000004044 response Effects 0.000 description 21
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 20
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 20
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 18
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 18
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 18
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 18
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 18
- IBMVEYRWAWIOTN-UHFFFAOYSA-N L-Leucyl-L-Arginyl-L-Proline Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CCCN=C(N)N)C(=O)N1CCCC1C(O)=O IBMVEYRWAWIOTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 17
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 17
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 17
- KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N alpha-L-glutamyl-L-glutamic acid Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 17
- 108010055341 glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 17
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 17
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 15
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 15
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 15
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 14
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 13
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 13
- 241000713772 Human immunodeficiency virus 1 Species 0.000 description 12
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 description 12
- HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N cholesterol Chemical compound C1C=C2C[C@@H](O)CC[C@]2(C)[C@@H]2[C@@H]1[C@@H]1CC[C@H]([C@H](C)CCCC(C)C)[C@@]1(C)CC2 HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N 0.000 description 12
- 108010054813 diprotin B Proteins 0.000 description 12
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 12
- 108010009298 lysylglutamic acid Proteins 0.000 description 12
- NKBQZKVMKJJDLX-SRVKXCTJSA-N Arg-Glu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NKBQZKVMKJJDLX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 11
- 239000000287 crude extract Substances 0.000 description 11
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 11
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 11
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 11
- YKBUCXNNBYZYAY-MNXVOIDGSA-N Glu-Lys-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O YKBUCXNNBYZYAY-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 10
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 10
- 108010044940 alanylglutamine Proteins 0.000 description 10
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 10
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 10
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 10
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 9
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 9
- PHIXPNQDGGILMP-YVNDNENWSA-N Ile-Glu-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N PHIXPNQDGGILMP-YVNDNENWSA-N 0.000 description 9
- WBSCNDJQPKSPII-KKUMJFAQSA-N Lys-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O WBSCNDJQPKSPII-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 9
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 9
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 description 9
- 108010078144 glutaminyl-glycine Proteins 0.000 description 9
- 108010085325 histidylproline Proteins 0.000 description 9
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 9
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 9
- 108010053725 prolylvaline Proteins 0.000 description 9
- 229930182490 saponin Natural products 0.000 description 9
- 150000007949 saponins Chemical class 0.000 description 9
- 235000017709 saponins Nutrition 0.000 description 9
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 9
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 9
- JBVSSSZFNTXJDX-YTLHQDLWSA-N Ala-Ala-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)N JBVSSSZFNTXJDX-YTLHQDLWSA-N 0.000 description 8
- BTYTYHBSJKQBQA-GCJQMDKQSA-N Ala-Asp-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](C)N)O BTYTYHBSJKQBQA-GCJQMDKQSA-N 0.000 description 8
- HYIDEIQUCBKIPL-CQDKDKBSSA-N Ala-Phe-His Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N HYIDEIQUCBKIPL-CQDKDKBSSA-N 0.000 description 8
- VKKYFICVTYKFIO-CIUDSAMLSA-N Arg-Ala-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N VKKYFICVTYKFIO-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 8
- SRUUBQBAVNQZGJ-LAEOZQHASA-N Asn-Gln-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N SRUUBQBAVNQZGJ-LAEOZQHASA-N 0.000 description 8
- 108700010070 Codon Usage Proteins 0.000 description 8
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- LPCKHUXOGVNZRS-YUMQZZPRSA-N Gly-His-Ser Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O LPCKHUXOGVNZRS-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 8
- UHPAZODVFFYEEL-QWRGUYRKSA-N Gly-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CN UHPAZODVFFYEEL-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 8
- IWXMHXYOACDSIA-PYJNHQTQSA-N His-Ile-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O IWXMHXYOACDSIA-PYJNHQTQSA-N 0.000 description 8
- 101000716102 Homo sapiens T-cell surface glycoprotein CD4 Proteins 0.000 description 8
- PMGDADKJMCOXHX-UHFFFAOYSA-N L-Arginyl-L-glutamin-acetat Natural products NC(=N)NCCCC(N)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(O)=O PMGDADKJMCOXHX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- LZDNBBYBDGBADK-UHFFFAOYSA-N L-valyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)C(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 LZDNBBYBDGBADK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- IUYCGMNKIZDRQI-BQBZGAKWSA-N Met-Gly-Ala Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O IUYCGMNKIZDRQI-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 8
- 101710164425 Movement protein TGB1 Proteins 0.000 description 8
- 108010066427 N-valyltryptophan Proteins 0.000 description 8
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 8
- CDVFZMOFNJPUDD-ACZMJKKPSA-N Ser-Gln-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O CDVFZMOFNJPUDD-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 8
- 239000012505 Superdex™ Substances 0.000 description 8
- 102100036011 T-cell surface glycoprotein CD4 Human genes 0.000 description 8
- SCSVNSNWUTYSFO-WDCWCFNPSA-N Thr-Lys-Glu Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SCSVNSNWUTYSFO-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 8
- FMXFHNSFABRVFZ-BZSNNMDCSA-N Tyr-Lys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O FMXFHNSFABRVFZ-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 8
- 102100040827 Zinc finger protein 398 Human genes 0.000 description 8
- 108010077245 asparaginyl-proline Proteins 0.000 description 8
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 8
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 8
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 8
- RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N glutathione Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(O)=O RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N 0.000 description 8
- VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N glycyl-DL-alpha-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 108010036413 histidylglycine Proteins 0.000 description 8
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 8
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 8
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 8
- 108010015796 prolylisoleucine Proteins 0.000 description 8
- 108010031491 threonyl-lysyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 8
- 108010015666 tryptophyl-leucyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 8
- 108010073969 valyllysine Proteins 0.000 description 8
- 210000002845 virion Anatomy 0.000 description 8
- VNTGPISAOMAXRK-CIUDSAMLSA-N Gln-Pro-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VNTGPISAOMAXRK-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 7
- ALCAUWPAMLVUDB-FXQIFTODSA-N Glu-Gln-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O ALCAUWPAMLVUDB-FXQIFTODSA-N 0.000 description 7
- KFQDSSNYWKZFOO-LSJOCFKGSA-N His-Val-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O KFQDSSNYWKZFOO-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 7
- LKACSKJPTFSBHR-MNXVOIDGSA-N Ile-Gln-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N LKACSKJPTFSBHR-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 7
- SITWEMZOJNKJCH-UHFFFAOYSA-N L-alanine-L-arginine Natural products CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCNC(N)=N SITWEMZOJNKJCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- MYGQXVYRZMKRDB-SRVKXCTJSA-N Leu-Asp-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN MYGQXVYRZMKRDB-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 7
- LJADEBULDNKJNK-IHRRRGAJSA-N Lys-Leu-Val Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O LJADEBULDNKJNK-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 7
- XOQMURBBIXRRCR-SRVKXCTJSA-N Lys-Lys-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN XOQMURBBIXRRCR-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 7
- ZUGVARDEGWMMLK-SRVKXCTJSA-N Lys-Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN ZUGVARDEGWMMLK-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 7
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 7
- SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-valine Natural products CC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)CN)C(O)=O)=CNC2=C1 AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- VTFXTWDFPTWNJY-RHYQMDGZSA-N Pro-Leu-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O VTFXTWDFPTWNJY-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 7
- AVYVKJMBNLPWRX-WFBYXXMGSA-N Trp-Ala-Ser Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O)=CNC2=C1 AVYVKJMBNLPWRX-WFBYXXMGSA-N 0.000 description 7
- 108010013835 arginine glutamate Proteins 0.000 description 7
- 108010001271 arginyl-glutamyl-arginine Proteins 0.000 description 7
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 7
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 7
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 7
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 7
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 7
- 230000003308 immunostimulating effect Effects 0.000 description 7
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 7
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 7
- 108010003700 lysyl aspartic acid Proteins 0.000 description 7
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 description 7
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 7
- 108010014614 prolyl-glycyl-proline Proteins 0.000 description 7
- 108010070643 prolylglutamic acid Proteins 0.000 description 7
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 6
- GIVATXIGCXFQQA-FXQIFTODSA-N Arg-Ala-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N GIVATXIGCXFQQA-FXQIFTODSA-N 0.000 description 6
- LVMUGODRNHFGRA-AVGNSLFASA-N Arg-Leu-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O LVMUGODRNHFGRA-AVGNSLFASA-N 0.000 description 6
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 6
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 6
- LPYPANUXJGFMGV-FXQIFTODSA-N Gln-Gln-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N LPYPANUXJGFMGV-FXQIFTODSA-N 0.000 description 6
- VSRCAOIHMGCIJK-SRVKXCTJSA-N Glu-Leu-Arg Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O VSRCAOIHMGCIJK-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 6
- MXJYXYDREQWUMS-XKBZYTNZSA-N Glu-Thr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MXJYXYDREQWUMS-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 6
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 6
- PYTZFYUXZZHOAD-WHFBIAKZSA-N Gly-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN PYTZFYUXZZHOAD-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 6
- OUUCIIJSBIBCHB-ZPFDUUQYSA-N Ile-Leu-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O OUUCIIJSBIBCHB-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 6
- WRLPVDVHNWSSCL-MELADBBJSA-N Leu-His-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O)N WRLPVDVHNWSSCL-MELADBBJSA-N 0.000 description 6
- HVHRPWQEQHIQJF-AVGNSLFASA-N Leu-Lys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HVHRPWQEQHIQJF-AVGNSLFASA-N 0.000 description 6
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 6
- KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-proline Natural products NCC(=O)N1CCCC1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108010079364 N-glycylalanine Proteins 0.000 description 6
- LRBSWBVUCLLRLU-BZSNNMDCSA-N Phe-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)Cc1ccccc1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O LRBSWBVUCLLRLU-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 6
- XKHCJJPNXFBADI-DCAQKATOSA-N Pro-Asp-Lys Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O XKHCJJPNXFBADI-DCAQKATOSA-N 0.000 description 6
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 6
- IJVNLNRVDUTWDD-MEYUZBJRSA-N Thr-Leu-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O IJVNLNRVDUTWDD-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 6
- OGOYMQWIWHGTGH-KZVJFYERSA-N Thr-Val-Ala Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O OGOYMQWIWHGTGH-KZVJFYERSA-N 0.000 description 6
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108010069205 aspartyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 6
- 230000036755 cellular response Effects 0.000 description 6
- 235000012000 cholesterol Nutrition 0.000 description 6
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 6
- 108010044374 isoleucyl-tyrosine Proteins 0.000 description 6
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 6
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 6
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 6
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 6
- 108010017391 lysylvaline Proteins 0.000 description 6
- 229940035032 monophosphoryl lipid a Drugs 0.000 description 6
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 6
- 230000037452 priming Effects 0.000 description 6
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 6
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 6
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 6
- 108010051110 tyrosyl-lysine Proteins 0.000 description 6
- BRPMXFSTKXXNHF-IUCAKERBSA-N (2s)-1-[2-[[(2s)-pyrrolidine-2-carbonyl]amino]acetyl]pyrrolidine-2-carboxylic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@H]1NCCC1 BRPMXFSTKXXNHF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 5
- MNZHHDPWDWQJCQ-YUMQZZPRSA-N Ala-Leu-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O MNZHHDPWDWQJCQ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 5
- VJVQKGYHIZPSNS-FXQIFTODSA-N Ala-Ser-Arg Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N VJVQKGYHIZPSNS-FXQIFTODSA-N 0.000 description 5
- XPBVBZPVNFIHOA-UVBJJODRSA-N Ala-Trp-Val Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)N)=CNC2=C1 XPBVBZPVNFIHOA-UVBJJODRSA-N 0.000 description 5
- BVLPIIBTWIYOML-ZKWXMUAHSA-N Ala-Val-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O BVLPIIBTWIYOML-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 5
- QAODJPUKWNNNRP-DCAQKATOSA-N Arg-Glu-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O QAODJPUKWNNNRP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 5
- QCTOLCVIGRLMQS-HRCADAONSA-N Arg-Tyr-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)O QCTOLCVIGRLMQS-HRCADAONSA-N 0.000 description 5
- YRTOMUMWSTUQAX-FXQIFTODSA-N Asn-Pro-Asp Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O YRTOMUMWSTUQAX-FXQIFTODSA-N 0.000 description 5
- WUQXMTITJLFXAU-JIOCBJNQSA-N Asn-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)O WUQXMTITJLFXAU-JIOCBJNQSA-N 0.000 description 5
- AMGQTNHANMRPOE-LKXGYXEUSA-N Asn-Thr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O AMGQTNHANMRPOE-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 5
- UOEYKPDDHSFMLI-DCAQKATOSA-N Cys-Val-His Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N UOEYKPDDHSFMLI-DCAQKATOSA-N 0.000 description 5
- CGYDXNKRIMJMLV-GUBZILKMSA-N Glu-Arg-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O CGYDXNKRIMJMLV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 5
- CGOHAEBMDSEKFB-FXQIFTODSA-N Glu-Glu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O CGOHAEBMDSEKFB-FXQIFTODSA-N 0.000 description 5
- BUZMZDDKFCSKOT-CIUDSAMLSA-N Glu-Glu-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BUZMZDDKFCSKOT-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 5
- LGYZYFFDELZWRS-DCAQKATOSA-N Glu-Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O LGYZYFFDELZWRS-DCAQKATOSA-N 0.000 description 5
- LYCDZGLXQBPNQU-WDSKDSINSA-N Glu-Gly-Cys Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O LYCDZGLXQBPNQU-WDSKDSINSA-N 0.000 description 5
- IRXNJYPKBVERCW-DCAQKATOSA-N Glu-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IRXNJYPKBVERCW-DCAQKATOSA-N 0.000 description 5
- NWOUBJNMZDDGDT-AVGNSLFASA-N Glu-Leu-His Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 NWOUBJNMZDDGDT-AVGNSLFASA-N 0.000 description 5
- HQTDNEZTGZUWSY-XVKPBYJWSA-N Glu-Val-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O HQTDNEZTGZUWSY-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 5
- SSFWXSNOKDZNHY-QXEWZRGKSA-N Gly-Pro-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CN SSFWXSNOKDZNHY-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 5
- GAAHQHNCMIAYEX-UWVGGRQHSA-N Gly-Pro-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CN GAAHQHNCMIAYEX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 5
- JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N H-Gly-Phe-OH Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- RVKIPWVMZANZLI-UHFFFAOYSA-N H-Lys-Trp-OH Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 RVKIPWVMZANZLI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 102000000588 Interleukin-2 Human genes 0.000 description 5
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 5
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 5
- IBMVEYRWAWIOTN-RWMBFGLXSA-N Leu-Arg-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(O)=O IBMVEYRWAWIOTN-RWMBFGLXSA-N 0.000 description 5
- CIVKXGPFXDIQBV-WDCWCFNPSA-N Leu-Gln-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O CIVKXGPFXDIQBV-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 5
- NEEOBPIXKWSBRF-IUCAKERBSA-N Leu-Glu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O NEEOBPIXKWSBRF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 5
- LFSQWRSVPNKJGP-WDCWCFNPSA-N Leu-Thr-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O LFSQWRSVPNKJGP-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 5
- ODRREERHVHMIPT-OEAJRASXSA-N Leu-Thr-Phe Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 ODRREERHVHMIPT-OEAJRASXSA-N 0.000 description 5
- NRQRKMYZONPCTM-CIUDSAMLSA-N Lys-Asp-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O NRQRKMYZONPCTM-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 5
- RBEATVHTWHTHTJ-KKUMJFAQSA-N Lys-Leu-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O RBEATVHTWHTHTJ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 5
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 5
- DZZCICYRSZASNF-FXQIFTODSA-N Pro-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 DZZCICYRSZASNF-FXQIFTODSA-N 0.000 description 5
- HAAQQNHQZBOWFO-LURJTMIESA-N Pro-Gly-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1 HAAQQNHQZBOWFO-LURJTMIESA-N 0.000 description 5
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 5
- LKJCABTUFGTPPY-HJGDQZAQSA-N Thr-Pro-Gln Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O LKJCABTUFGTPPY-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 5
- WNZRNOGHEONFMS-PXDAIIFMSA-N Trp-Ile-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O WNZRNOGHEONFMS-PXDAIIFMSA-N 0.000 description 5
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- JAGGEZACYAAMIL-CQDKDKBSSA-N Tyr-Lys-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N JAGGEZACYAAMIL-CQDKDKBSSA-N 0.000 description 5
- BTWMICVCQLKKNR-DCAQKATOSA-N Val-Leu-Ser Chemical compound CC(C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O BTWMICVCQLKKNR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 5
- NHXZRXLFOBFMDM-AVGNSLFASA-N Val-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)C(C)C NHXZRXLFOBFMDM-AVGNSLFASA-N 0.000 description 5
- 229940037003 alum Drugs 0.000 description 5
- BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N ammonium sulfate Chemical compound N.N.OS(O)(=O)=O BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 229910052921 ammonium sulfate Inorganic materials 0.000 description 5
- 238000012870 ammonium sulfate precipitation Methods 0.000 description 5
- 235000011130 ammonium sulphate Nutrition 0.000 description 5
- 108010008355 arginyl-glutamine Proteins 0.000 description 5
- 108010062796 arginyllysine Proteins 0.000 description 5
- 108010092854 aspartyllysine Proteins 0.000 description 5
- FSXRLASFHBWESK-UHFFFAOYSA-N dipeptide phenylalanyl-tyrosine Natural products C=1C=C(O)C=CC=1CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FSXRLASFHBWESK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 5
- XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N glycyl-L-tyrosine hemihydrate Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 5
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 5
- 108010083708 leucyl-aspartyl-valine Proteins 0.000 description 5
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 5
- 108010063431 methionyl-aspartyl-glycine Proteins 0.000 description 5
- 108010024607 phenylalanylalanine Proteins 0.000 description 5
- 108010020755 prolyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 5
- 108010029020 prolylglycine Proteins 0.000 description 5
- 108010026333 seryl-proline Proteins 0.000 description 5
- 238000007921 solubility assay Methods 0.000 description 5
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- GUPXYSSGJWIURR-UHFFFAOYSA-N 3-octoxypropane-1,2-diol Chemical compound CCCCCCCCOCC(O)CO GUPXYSSGJWIURR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 7H-purine Chemical compound N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- XSLGWYYNOSUMRM-ZKWXMUAHSA-N Ala-Val-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O XSLGWYYNOSUMRM-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 4
- JCAISGGAOQXEHJ-ZPFDUUQYSA-N Arg-Gln-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N JCAISGGAOQXEHJ-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 4
- AGVNTAUPLWIQEN-ZPFDUUQYSA-N Arg-Ile-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N AGVNTAUPLWIQEN-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 4
- OMKZPCPZEFMBIT-SRVKXCTJSA-N Arg-Met-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O OMKZPCPZEFMBIT-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 4
- CZUHPNLXLWMYMG-UBHSHLNASA-N Arg-Phe-Ala Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 CZUHPNLXLWMYMG-UBHSHLNASA-N 0.000 description 4
- JJIBHAOBNIFUEL-SRVKXCTJSA-N Arg-Pro-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N JJIBHAOBNIFUEL-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 4
- BDMIFVIWCNLDCT-CIUDSAMLSA-N Asn-Arg-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BDMIFVIWCNLDCT-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 4
- HTOZUYZQPICRAP-BPUTZDHNSA-N Asp-Arg-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N HTOZUYZQPICRAP-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 4
- LKIYSIYBKYLKPU-BIIVOSGPSA-N Asp-Asp-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)C(=O)O LKIYSIYBKYLKPU-BIIVOSGPSA-N 0.000 description 4
- WSGVTKZFVJSJOG-RCOVLWMOSA-N Asp-Gly-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O WSGVTKZFVJSJOG-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 4
- DWOGMPWRQQWPPF-GUBZILKMSA-N Asp-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O DWOGMPWRQQWPPF-GUBZILKMSA-N 0.000 description 4
- 102100037904 CD9 antigen Human genes 0.000 description 4
- MWLYSLMKFXWZPW-ZPFDUUQYSA-N Gln-Arg-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O MWLYSLMKFXWZPW-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 4
- JKGHMESJHRTHIC-SIUGBPQLSA-N Gln-Ile-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N JKGHMESJHRTHIC-SIUGBPQLSA-N 0.000 description 4
- LTUVYLVIZHJCOQ-KKUMJFAQSA-N Glu-Arg-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O LTUVYLVIZHJCOQ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 4
- XTZDZAXYPDISRR-MNXVOIDGSA-N Glu-Ile-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N XTZDZAXYPDISRR-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 4
- OCJRHJZKGGSPRW-IUCAKERBSA-N Glu-Lys-Gly Chemical compound NCCCC[C@@H](C(=O)NCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O OCJRHJZKGGSPRW-IUCAKERBSA-N 0.000 description 4
- LPHGXOWFAXFCPX-KKUMJFAQSA-N Glu-Pro-Phe Chemical compound C1C[C@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=CC=C2)C(=O)O LPHGXOWFAXFCPX-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 4
- QVXWAFZDWRLXTI-NWLDYVSISA-N Glu-Thr-Trp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O QVXWAFZDWRLXTI-NWLDYVSISA-N 0.000 description 4
- FGGKGJHCVMYGCD-UKJIMTQDSA-N Glu-Val-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O FGGKGJHCVMYGCD-UKJIMTQDSA-N 0.000 description 4
- 108010024636 Glutathione Proteins 0.000 description 4
- YYPFZVIXAVDHIK-IUCAKERBSA-N Gly-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)CN YYPFZVIXAVDHIK-IUCAKERBSA-N 0.000 description 4
- GDOZQTNZPCUARW-YFKPBYRVSA-N Gly-Gly-Glu Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O GDOZQTNZPCUARW-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 4
- QITBQGJOXQYMOA-ZETCQYMHSA-N Gly-Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CN QITBQGJOXQYMOA-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 4
- OJNZVYSGVYLQIN-BQBZGAKWSA-N Gly-Met-Asp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O OJNZVYSGVYLQIN-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- FGPLUIQCSKGLTI-WDSKDSINSA-N Gly-Ser-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O FGPLUIQCSKGLTI-WDSKDSINSA-N 0.000 description 4
- RZEDHGORCKRINR-STQMWFEESA-N Gly-Trp-Cys Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)CN RZEDHGORCKRINR-STQMWFEESA-N 0.000 description 4
- RYAOJUMWLWUGNW-QMMMGPOBSA-N Gly-Val-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O RYAOJUMWLWUGNW-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 4
- QAMFAYSMNZBNCA-UWVGGRQHSA-N His-Gly-Met Chemical compound CSCC[C@H](NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1cnc[nH]1)C(O)=O QAMFAYSMNZBNCA-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 4
- RMNMUUCYTMLWNA-ZPFDUUQYSA-N Ile-Lys-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N RMNMUUCYTMLWNA-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 4
- DLEBSGAVWRPTIX-PEDHHIEDSA-N Ile-Val-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)[C@@H](C)CC DLEBSGAVWRPTIX-PEDHHIEDSA-N 0.000 description 4
- UCOCBWDBHCUPQP-DCAQKATOSA-N Leu-Arg-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UCOCBWDBHCUPQP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 4
- YKNBJXOJTURHCU-DCAQKATOSA-N Leu-Asp-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N YKNBJXOJTURHCU-DCAQKATOSA-N 0.000 description 4
- CQGSYZCULZMEDE-UHFFFAOYSA-N Leu-Gln-Pro Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(=O)N1CCCC1C(O)=O CQGSYZCULZMEDE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- FIYMBBHGYNQFOP-IUCAKERBSA-N Leu-Gly-Gln Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N FIYMBBHGYNQFOP-IUCAKERBSA-N 0.000 description 4
- ADJWHHZETYAAAX-SRVKXCTJSA-N Leu-Ser-His Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N ADJWHHZETYAAAX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 4
- KCXUCYYZNZFGLL-SRVKXCTJSA-N Lys-Ala-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KCXUCYYZNZFGLL-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 4
- PAMDBWYMLWOELY-SDDRHHMPSA-N Lys-Glu-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)C(=O)O PAMDBWYMLWOELY-SDDRHHMPSA-N 0.000 description 4
- BXPHMHQHYHILBB-BZSNNMDCSA-N Lys-Lys-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O BXPHMHQHYHILBB-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 4
- RMKGXGPQIPLTFC-KKUMJFAQSA-N Phe-Lys-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O RMKGXGPQIPLTFC-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 4
- LGMBKOAPPTYKLC-JYJNAYRXSA-N Pro-Phe-Arg Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCNC(=N)N)C(O)=O)NC(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CC=CC=C1 LGMBKOAPPTYKLC-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 4
- UOLGINIHBRIECN-FXQIFTODSA-N Ser-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UOLGINIHBRIECN-FXQIFTODSA-N 0.000 description 4
- JWOBLHJRDADHLN-KKUMJFAQSA-N Ser-Leu-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O JWOBLHJRDADHLN-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 4
- STKZKWFOKOCSLW-UMPQAUOISA-N Trp-Thr-Val Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O)[C@@H](C)O)=CNC2=C1 STKZKWFOKOCSLW-UMPQAUOISA-N 0.000 description 4
- IDKGBVZGNTYYCC-QXEWZRGKSA-N Val-Asn-Pro Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O IDKGBVZGNTYYCC-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 4
- VHIZXDZMTDVFGX-DCAQKATOSA-N Val-Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](C(C)C)N VHIZXDZMTDVFGX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 4
- 108010005233 alanylglutamic acid Proteins 0.000 description 4
- WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K aluminium hydroxide Chemical compound [OH-].[OH-].[OH-].[Al+3] WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 4
- 230000005875 antibody response Effects 0.000 description 4
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 4
- 108010069495 cysteinyltyrosine Proteins 0.000 description 4
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 4
- 229960003180 glutathione Drugs 0.000 description 4
- 108010079413 glycyl-prolyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 4
- 108010084389 glycyltryptophan Proteins 0.000 description 4
- 239000003022 immunostimulating agent Substances 0.000 description 4
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 4
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 4
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 4
- 108010077158 leucinyl-arginyl-tryptophan Proteins 0.000 description 4
- 108010090333 leucyl-lysyl-proline Proteins 0.000 description 4
- 125000003588 lysine group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 4
- 108010045397 lysyl-tyrosyl-lysine Proteins 0.000 description 4
- 108010064235 lysylglycine Proteins 0.000 description 4
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 4
- 108010005942 methionylglycine Proteins 0.000 description 4
- 108700004028 nef Genes Proteins 0.000 description 4
- 239000007764 o/w emulsion Substances 0.000 description 4
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 4
- YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N phenylmethanesulfonyl fluoride Chemical compound FS(=O)(=O)CC1=CC=CC=C1 YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 4
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 4
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 4
- 108010069117 seryl-lysyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 4
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 4
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 4
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 4
- 208000030507 AIDS Diseases 0.000 description 3
- UWQJHXKARZWDIJ-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ala-Cys Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O UWQJHXKARZWDIJ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 3
- YLTKNGYYPIWKHZ-ACZMJKKPSA-N Ala-Ala-Glu Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O YLTKNGYYPIWKHZ-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 3
- KIUYPHAMDKDICO-WHFBIAKZSA-N Ala-Asp-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O KIUYPHAMDKDICO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- FRFDXQWNDZMREB-ACZMJKKPSA-N Ala-Cys-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O FRFDXQWNDZMREB-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 3
- OBVSBEYOMDWLRJ-BFHQHQDPSA-N Ala-Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)N OBVSBEYOMDWLRJ-BFHQHQDPSA-N 0.000 description 3
- PVQLRJRPUTXFFX-CIUDSAMLSA-N Ala-Met-Gln Chemical compound CSCC[C@H](NC(=O)[C@H](C)N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O PVQLRJRPUTXFFX-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- OMDNCNKNEGFOMM-BQBZGAKWSA-N Ala-Met-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)NCC(O)=O OMDNCNKNEGFOMM-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- YXXPVUOMPSZURS-ZLIFDBKOSA-N Ala-Trp-Leu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)N)=CNC2=C1 YXXPVUOMPSZURS-ZLIFDBKOSA-N 0.000 description 3
- MUXONAMCEUBVGA-DCAQKATOSA-N Arg-Arg-Gln Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O MUXONAMCEUBVGA-DCAQKATOSA-N 0.000 description 3
- FKQITMVNILRUCQ-IHRRRGAJSA-N Arg-Phe-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FKQITMVNILRUCQ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 3
- YNDLOUMBVDVALC-ZLUOBGJFSA-N Asn-Ala-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N YNDLOUMBVDVALC-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 3
- BZMWJLLUAKSIMH-FXQIFTODSA-N Asn-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BZMWJLLUAKSIMH-FXQIFTODSA-N 0.000 description 3
- GFFRWIJAFFMQGM-NUMRIWBASA-N Asn-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GFFRWIJAFFMQGM-NUMRIWBASA-N 0.000 description 3
- NYGILGUOUOXGMJ-YUMQZZPRSA-N Asn-Lys-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(O)=O NYGILGUOUOXGMJ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- VCJCPARXDBEGNE-GUBZILKMSA-N Asn-Pro-Pro Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 VCJCPARXDBEGNE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 3
- SUIJFTJDTJKSRK-IHRRRGAJSA-N Asn-Pro-Tyr Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 SUIJFTJDTJKSRK-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 3
- BCADFFUQHIMQAA-KKHAAJSZSA-N Asn-Thr-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O BCADFFUQHIMQAA-KKHAAJSZSA-N 0.000 description 3
- IPPFAOCLQSGHJV-WFBYXXMGSA-N Asn-Trp-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O IPPFAOCLQSGHJV-WFBYXXMGSA-N 0.000 description 3
- XEGZSHSPQNDNRH-JRQIVUDYSA-N Asn-Tyr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O XEGZSHSPQNDNRH-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 3
- MRQQMVZUHXUPEV-IHRRRGAJSA-N Asp-Arg-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O MRQQMVZUHXUPEV-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 3
- SBHUBSDEZQFJHJ-CIUDSAMLSA-N Asp-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O SBHUBSDEZQFJHJ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- XAJRHVUUVUPFQL-ACZMJKKPSA-N Asp-Glu-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O XAJRHVUUVUPFQL-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 3
- CLUMZOKVGUWUFD-CIUDSAMLSA-N Asp-Leu-Asn Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O CLUMZOKVGUWUFD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- LIJXJYGRSRWLCJ-IHRRRGAJSA-N Asp-Phe-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O LIJXJYGRSRWLCJ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 3
- KOWYNSKRPUWSFG-IHPCNDPISA-N Asp-Phe-Trp Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N KOWYNSKRPUWSFG-IHPCNDPISA-N 0.000 description 3
- LLRJPYJQNBMOOO-QEJZJMRPSA-N Asp-Trp-Gln Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N LLRJPYJQNBMOOO-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 3
- BYLPQJAWXJWUCJ-YDHLFZDLSA-N Asp-Tyr-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O BYLPQJAWXJWUCJ-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 3
- QLCPDGRAEJSYQM-LPEHRKFASA-N Cys-Arg-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CS)N)C(=O)O QLCPDGRAEJSYQM-LPEHRKFASA-N 0.000 description 3
- MXZYQNJCBVJHSR-KATARQTJSA-N Cys-Lys-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CS)N)O MXZYQNJCBVJHSR-KATARQTJSA-N 0.000 description 3
- JLZCAZJGWNRXCI-XKBZYTNZSA-N Cys-Thr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O JLZCAZJGWNRXCI-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 3
- 230000006820 DNA synthesis Effects 0.000 description 3
- 101710177291 Gag polyprotein Proteins 0.000 description 3
- SHERTACNJPYHAR-ACZMJKKPSA-N Gln-Ala-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O SHERTACNJPYHAR-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 3
- KWUSGAIFNHQCBY-DCAQKATOSA-N Gln-Arg-Arg Chemical compound NC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O KWUSGAIFNHQCBY-DCAQKATOSA-N 0.000 description 3
- INFBPLSHYFALDE-ACZMJKKPSA-N Gln-Asn-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O INFBPLSHYFALDE-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 3
- MGJMFSBEMSNYJL-AVGNSLFASA-N Gln-Asn-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O MGJMFSBEMSNYJL-AVGNSLFASA-N 0.000 description 3
- CRRFJBGUGNNOCS-PEFMBERDSA-N Gln-Asp-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O CRRFJBGUGNNOCS-PEFMBERDSA-N 0.000 description 3
- ZQPOVSJFBBETHQ-CIUDSAMLSA-N Gln-Glu-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O ZQPOVSJFBBETHQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- SNLOOPZHAQDMJG-CIUDSAMLSA-N Gln-Glu-Glu Chemical compound NC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SNLOOPZHAQDMJG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- XJKAKYXMFHUIHT-AUTRQRHGSA-N Gln-Glu-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N XJKAKYXMFHUIHT-AUTRQRHGSA-N 0.000 description 3
- CLPQUWHBWXFJOX-BQBZGAKWSA-N Gln-Gly-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O CLPQUWHBWXFJOX-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- FTIJVMLAGRAYMJ-MNXVOIDGSA-N Gln-Ile-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O FTIJVMLAGRAYMJ-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 3
- RWCBJYUPAUTWJD-NHCYSSNCSA-N Gln-Met-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O RWCBJYUPAUTWJD-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 3
- ININBLZFFVOQIO-JHEQGTHGSA-N Gln-Thr-Gly Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N)O ININBLZFFVOQIO-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 3
- UGEZSPWLJABDAR-KKUMJFAQSA-N Gln-Tyr-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N UGEZSPWLJABDAR-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 3
- VYOILACOFPPNQH-UMNHJUIQSA-N Gln-Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N VYOILACOFPPNQH-UMNHJUIQSA-N 0.000 description 3
- SZXSSXUNOALWCH-ACZMJKKPSA-N Glu-Ala-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O SZXSSXUNOALWCH-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 3
- OGMQXTXGLDNBSS-FXQIFTODSA-N Glu-Ala-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O OGMQXTXGLDNBSS-FXQIFTODSA-N 0.000 description 3
- KRRFFAHEAOCBCQ-SIUGBPQLSA-N Glu-Ile-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O KRRFFAHEAOCBCQ-SIUGBPQLSA-N 0.000 description 3
- UDEPRBFQTWGLCW-CIUDSAMLSA-N Glu-Pro-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O UDEPRBFQTWGLCW-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- DCBSZJJHOTXMHY-DCAQKATOSA-N Glu-Pro-Pro Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 DCBSZJJHOTXMHY-DCAQKATOSA-N 0.000 description 3
- RGJKYNUINKGPJN-RWRJDSDZSA-N Glu-Thr-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N RGJKYNUINKGPJN-RWRJDSDZSA-N 0.000 description 3
- DLISPGXMKZTWQG-IFFSRLJSSA-N Glu-Thr-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O DLISPGXMKZTWQG-IFFSRLJSSA-N 0.000 description 3
- YQPFCZVKMUVZIN-AUTRQRHGSA-N Glu-Val-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O YQPFCZVKMUVZIN-AUTRQRHGSA-N 0.000 description 3
- YMUFWNJHVPQNQD-ZKWXMUAHSA-N Gly-Ala-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN YMUFWNJHVPQNQD-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 3
- YZACQYVWLCQWBT-BQBZGAKWSA-N Gly-Cys-Arg Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O YZACQYVWLCQWBT-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- VOCMRCVMAPSSAL-IUCAKERBSA-N Gly-Gln-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)CN VOCMRCVMAPSSAL-IUCAKERBSA-N 0.000 description 3
- LXXANCRPFBSSKS-IUCAKERBSA-N Gly-Gln-Leu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O LXXANCRPFBSSKS-IUCAKERBSA-N 0.000 description 3
- PDAWDNVHMUKWJR-ZETCQYMHSA-N Gly-Gly-His Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 PDAWDNVHMUKWJR-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 3
- ITZOBNKQDZEOCE-NHCYSSNCSA-N Gly-Ile-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)CN ITZOBNKQDZEOCE-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 3
- IUZGUFAJDBHQQV-YUMQZZPRSA-N Gly-Leu-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O IUZGUFAJDBHQQV-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- MHXKHKWHPNETGG-QWRGUYRKSA-N Gly-Lys-Leu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O MHXKHKWHPNETGG-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 3
- YKJUITHASJAGHO-HOTGVXAUSA-N Gly-Lys-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)CN YKJUITHASJAGHO-HOTGVXAUSA-N 0.000 description 3
- GJHWILMUOANXTG-WPRPVWTQSA-N Gly-Val-Arg Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O GJHWILMUOANXTG-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 3
- UPGJWSUYENXOPV-HGNGGELXSA-N His-Gln-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N UPGJWSUYENXOPV-HGNGGELXSA-N 0.000 description 3
- NWGXCPUKPVISSJ-AVGNSLFASA-N His-Gln-Lys Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N NWGXCPUKPVISSJ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 3
- YADRBUZBKHHDAO-XPUUQOCRSA-N His-Gly-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O YADRBUZBKHHDAO-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 3
- PYNPBMCLAKTHJL-SRVKXCTJSA-N His-Pro-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O PYNPBMCLAKTHJL-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- PFOUFRJYHWZJKW-NKIYYHGXSA-N His-Thr-Gln Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N)O PFOUFRJYHWZJKW-NKIYYHGXSA-N 0.000 description 3
- JRHFQUPIZOYKQP-KBIXCLLPSA-N Ile-Ala-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O JRHFQUPIZOYKQP-KBIXCLLPSA-N 0.000 description 3
- ASCFJMSGKUIRDU-ZPFDUUQYSA-N Ile-Arg-Gln Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O ASCFJMSGKUIRDU-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 3
- CYHJCEKUMCNDFG-LAEOZQHASA-N Ile-Gln-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)NCC(=O)O)N CYHJCEKUMCNDFG-LAEOZQHASA-N 0.000 description 3
- RWYCOSAAAJBJQL-KCTSRDHCSA-N Ile-Gly-Trp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)N RWYCOSAAAJBJQL-KCTSRDHCSA-N 0.000 description 3
- KEKTTYCXKGBAAL-VGDYDELISA-N Ile-His-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N KEKTTYCXKGBAAL-VGDYDELISA-N 0.000 description 3
- TWPSALMCEHCIOY-YTFOTSKYSA-N Ile-Ile-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)N TWPSALMCEHCIOY-YTFOTSKYSA-N 0.000 description 3
- TVYWVSJGSHQWMT-AJNGGQMLSA-N Ile-Leu-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N TVYWVSJGSHQWMT-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 3
- MLSUZXHSNRBDCI-CYDGBPFRSA-N Ile-Pro-Val Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)N MLSUZXHSNRBDCI-CYDGBPFRSA-N 0.000 description 3
- WCNWGAUZWWSYDG-SVSWQMSJSA-N Ile-Thr-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N WCNWGAUZWWSYDG-SVSWQMSJSA-N 0.000 description 3
- 102100034353 Integrase Human genes 0.000 description 3
- FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N L-Phenylalanyl-L-lysin Natural products NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- UGTHTQWIQKEDEH-BQBZGAKWSA-N L-alanyl-L-prolylglycine zwitterion Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O UGTHTQWIQKEDEH-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N L-leucyl-L-arginine Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- DLCOFDAHNMMQPP-SRVKXCTJSA-N Leu-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O DLCOFDAHNMMQPP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- WIDZHJTYKYBLSR-DCAQKATOSA-N Leu-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O WIDZHJTYKYBLSR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 3
- HQUXQAMSWFIRET-AVGNSLFASA-N Leu-Glu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN HQUXQAMSWFIRET-AVGNSLFASA-N 0.000 description 3
- FEHQLKKBVJHSEC-SZMVWBNQSA-N Leu-Glu-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 FEHQLKKBVJHSEC-SZMVWBNQSA-N 0.000 description 3
- JFSGIJSCJFQGSZ-MXAVVETBSA-N Leu-Ile-His Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N JFSGIJSCJFQGSZ-MXAVVETBSA-N 0.000 description 3
- DSFYPIUSAMSERP-IHRRRGAJSA-N Leu-Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N DSFYPIUSAMSERP-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 3
- VULJUQZPSOASBZ-SRVKXCTJSA-N Leu-Pro-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VULJUQZPSOASBZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- RGUXWMDNCPMQFB-YUMQZZPRSA-N Leu-Ser-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O RGUXWMDNCPMQFB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- AIMGJYMCTAABEN-GVXVVHGQSA-N Leu-Val-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AIMGJYMCTAABEN-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 3
- YQFZRHYZLARWDY-IHRRRGAJSA-N Leu-Val-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN YQFZRHYZLARWDY-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 3
- FDBTVENULFNTAL-XQQFMLRXSA-N Leu-Val-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N FDBTVENULFNTAL-XQQFMLRXSA-N 0.000 description 3
- RVOMPSJXSRPFJT-DCAQKATOSA-N Lys-Ala-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O RVOMPSJXSRPFJT-DCAQKATOSA-N 0.000 description 3
- NLOZZWJNIKKYSC-WDSOQIARSA-N Lys-Arg-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 NLOZZWJNIKKYSC-WDSOQIARSA-N 0.000 description 3
- JBRWKVANRYPCAF-XIRDDKMYSA-N Lys-Asn-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCCCN)N JBRWKVANRYPCAF-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 3
- QFGVDCBPDGLVTA-SZMVWBNQSA-N Lys-Gln-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 QFGVDCBPDGLVTA-SZMVWBNQSA-N 0.000 description 3
- LCMWVZLBCUVDAZ-IUCAKERBSA-N Lys-Gly-Glu Chemical compound [NH3+]CCCC[C@H]([NH3+])C(=O)NCC(=O)N[C@H](C([O-])=O)CCC([O-])=O LCMWVZLBCUVDAZ-IUCAKERBSA-N 0.000 description 3
- ISHNZELVUVPCHY-ZETCQYMHSA-N Lys-Gly-Gly Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O ISHNZELVUVPCHY-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 3
- QBEPTBMRQALPEV-MNXVOIDGSA-N Lys-Ile-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN QBEPTBMRQALPEV-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 3
- ZXFRGTAIIZHNHG-AJNGGQMLSA-N Lys-Ile-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N ZXFRGTAIIZHNHG-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 3
- NCZIQZYZPUPMKY-PPCPHDFISA-N Lys-Ile-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O NCZIQZYZPUPMKY-PPCPHDFISA-N 0.000 description 3
- WAIHHELKYSFIQN-XUXIUFHCSA-N Lys-Ile-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O WAIHHELKYSFIQN-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 3
- YPLVCBKEPJPBDQ-MELADBBJSA-N Lys-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N YPLVCBKEPJPBDQ-MELADBBJSA-N 0.000 description 3
- RYOLKFYZBHMYFW-WDSOQIARSA-N Lys-Trp-Arg Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O)=CNC2=C1 RYOLKFYZBHMYFW-WDSOQIARSA-N 0.000 description 3
- UGCIQUYEJIEHKX-GVXVVHGQSA-N Lys-Val-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UGCIQUYEJIEHKX-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 3
- IKXQOBUBZSOWDY-AVGNSLFASA-N Lys-Val-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N IKXQOBUBZSOWDY-AVGNSLFASA-N 0.000 description 3
- 201000005505 Measles Diseases 0.000 description 3
- JQEBITVYKUCBMC-SRVKXCTJSA-N Met-Arg-Arg Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O JQEBITVYKUCBMC-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- CTVJSFRHUOSCQQ-DCAQKATOSA-N Met-Arg-Glu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O CTVJSFRHUOSCQQ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 3
- TUSOIZOVPJCMFC-FXQIFTODSA-N Met-Asp-Asp Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O TUSOIZOVPJCMFC-FXQIFTODSA-N 0.000 description 3
- VZBXCMCHIHEPBL-SRVKXCTJSA-N Met-Glu-Lys Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN VZBXCMCHIHEPBL-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- BCRQJDMZQUHQSV-STQMWFEESA-N Met-Gly-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O BCRQJDMZQUHQSV-STQMWFEESA-N 0.000 description 3
- KMSMNUFBNCHMII-IHRRRGAJSA-N Met-Leu-Lys Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN KMSMNUFBNCHMII-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 3
- ILKCLLLOGPDNIP-RCWTZXSCSA-N Met-Met-Thr Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O ILKCLLLOGPDNIP-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 3
- RIIFMEBFDDXGCV-VEVYYDQMSA-N Met-Thr-Asn Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O RIIFMEBFDDXGCV-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 3
- FXBKQTOGURNXSL-HJGDQZAQSA-N Met-Thr-Glu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O FXBKQTOGURNXSL-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 3
- PNHRPOWKRRJATF-IHRRRGAJSA-N Met-Tyr-Ser Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 PNHRPOWKRRJATF-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 3
- KPVLLNDCBYXKNV-CYDGBPFRSA-N Met-Val-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O KPVLLNDCBYXKNV-CYDGBPFRSA-N 0.000 description 3
- BQVUABVGYYSDCJ-UHFFFAOYSA-N Nalpha-L-Leucyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 BQVUABVGYYSDCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 3
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 3
- YYRCPTVAPLQRNC-ULQDDVLXSA-N Phe-Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 YYRCPTVAPLQRNC-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 3
- OJUMUUXGSXUZJZ-SRVKXCTJSA-N Phe-Asp-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O OJUMUUXGSXUZJZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- AAERWTUHZKLDLC-IHRRRGAJSA-N Phe-Pro-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O AAERWTUHZKLDLC-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 3
- ZLAKUZDMKVKFAI-JYJNAYRXSA-N Phe-Pro-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O ZLAKUZDMKVKFAI-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 3
- QSWKNJAPHQDAAS-MELADBBJSA-N Phe-Ser-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)N)C(=O)O QSWKNJAPHQDAAS-MELADBBJSA-N 0.000 description 3
- BNBBNGZZKQUWCD-IUCAKERBSA-N Pro-Arg-Gly Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(=O)NCC(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 BNBBNGZZKQUWCD-IUCAKERBSA-N 0.000 description 3
- ZPPVJIJMIKTERM-YUMQZZPRSA-N Pro-Gln-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 ZPPVJIJMIKTERM-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- UAYHMOIGIQZLFR-NHCYSSNCSA-N Pro-Gln-Val Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O UAYHMOIGIQZLFR-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 3
- QGOZJLYCGRYYRW-KKUMJFAQSA-N Pro-Glu-Tyr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O QGOZJLYCGRYYRW-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 3
- WSRWHZRUOCACLJ-UWVGGRQHSA-N Pro-Gly-His Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CN=CN1 WSRWHZRUOCACLJ-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 3
- YXHYJEPDKSYPSQ-AVGNSLFASA-N Pro-Leu-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 YXHYJEPDKSYPSQ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 3
- APIAILHCTSBGLU-JYJNAYRXSA-N Pro-Met-Phe Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@@H]2CCCN2 APIAILHCTSBGLU-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 3
- QGLFRQCECIWXFA-RCWTZXSCSA-N Pro-Met-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@@H]1CCCN1)O QGLFRQCECIWXFA-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 3
- SWRNSCMUXRLHCR-ULQDDVLXSA-N Pro-Phe-Lys Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)NC(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CC=CC=C1 SWRNSCMUXRLHCR-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 3
- RMJZWERKFFNNNS-XGEHTFHBSA-N Pro-Thr-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RMJZWERKFFNNNS-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 3
- CXGLFEOYCJFKPR-RCWTZXSCSA-N Pro-Thr-Val Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O CXGLFEOYCJFKPR-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 3
- DGDCSVGVWWAJRS-AVGNSLFASA-N Pro-Val-His Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@@H]2CCCN2 DGDCSVGVWWAJRS-AVGNSLFASA-N 0.000 description 3
- YDTUEBLEAVANFH-RCWTZXSCSA-N Pro-Val-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 YDTUEBLEAVANFH-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 3
- 101710192141 Protein Nef Proteins 0.000 description 3
- 101710149136 Protein Vpr Proteins 0.000 description 3
- HRNQLKCLPVKZNE-CIUDSAMLSA-N Ser-Ala-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O HRNQLKCLPVKZNE-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- QEDMOZUJTGEIBF-FXQIFTODSA-N Ser-Arg-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O QEDMOZUJTGEIBF-FXQIFTODSA-N 0.000 description 3
- WDXYVIIVDIDOSX-DCAQKATOSA-N Ser-Arg-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CO)CCCN=C(N)N WDXYVIIVDIDOSX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 3
- UGJRQLURDVGULT-LKXGYXEUSA-N Ser-Asn-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O UGJRQLURDVGULT-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 3
- QPFJSHSJFIYDJZ-GHCJXIJMSA-N Ser-Asp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO QPFJSHSJFIYDJZ-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 3
- YRBGKVIWMNEVCZ-WDSKDSINSA-N Ser-Glu-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O YRBGKVIWMNEVCZ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 3
- MOQDPPUMFSMYOM-KKUMJFAQSA-N Ser-His-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)NC(=O)[C@H](CO)N MOQDPPUMFSMYOM-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 3
- LQESNKGTTNHZPZ-GHCJXIJMSA-N Ser-Ile-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O LQESNKGTTNHZPZ-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 3
- IUXGJEIKJBYKOO-SRVKXCTJSA-N Ser-Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N IUXGJEIKJBYKOO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- NUEHQDHDLDXCRU-GUBZILKMSA-N Ser-Pro-Arg Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O NUEHQDHDLDXCRU-GUBZILKMSA-N 0.000 description 3
- WLJPJRGQRNCIQS-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ser-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O WLJPJRGQRNCIQS-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 3
- VGQVAVQWKJLIRM-FXQIFTODSA-N Ser-Ser-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O VGQVAVQWKJLIRM-FXQIFTODSA-N 0.000 description 3
- LGIMRDKGABDMBN-DCAQKATOSA-N Ser-Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N LGIMRDKGABDMBN-DCAQKATOSA-N 0.000 description 3
- HSWXBJCBYSWBPT-GUBZILKMSA-N Ser-Val-Val Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CO)C(C)C)C(O)=O HSWXBJCBYSWBPT-GUBZILKMSA-N 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 108700005078 Synthetic Genes Proteins 0.000 description 3
- 101150006914 TRP1 gene Proteins 0.000 description 3
- UHBPFYOQQPFKQR-JHEQGTHGSA-N Thr-Gln-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O UHBPFYOQQPFKQR-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 3
- ONNSECRQFSTMCC-XKBZYTNZSA-N Thr-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ONNSECRQFSTMCC-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 3
- IMDMLDSVUSMAEJ-HJGDQZAQSA-N Thr-Leu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O IMDMLDSVUSMAEJ-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 3
- MEJHFIOYJHTWMK-VOAKCMCISA-N Thr-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O MEJHFIOYJHTWMK-VOAKCMCISA-N 0.000 description 3
- XNTVWRJTUIOGQO-RHYQMDGZSA-N Thr-Met-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O XNTVWRJTUIOGQO-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 3
- RVMNUBQWPVOUKH-HEIBUPTGSA-N Thr-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O RVMNUBQWPVOUKH-HEIBUPTGSA-N 0.000 description 3
- GJOBRAHDRIDAPT-NGTWOADLSA-N Thr-Trp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)N GJOBRAHDRIDAPT-NGTWOADLSA-N 0.000 description 3
- GKUROEIXVURAAO-BPUTZDHNSA-N Trp-Asp-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O GKUROEIXVURAAO-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 3
- HXMJXDNSFVNSEH-IHPCNDPISA-N Trp-Cys-Tyr Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC3=CC=C(C=C3)O)C(=O)O)N HXMJXDNSFVNSEH-IHPCNDPISA-N 0.000 description 3
- CZSMNLQMRWPGQF-XEGUGMAKSA-N Trp-Gln-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O CZSMNLQMRWPGQF-XEGUGMAKSA-N 0.000 description 3
- VPRHDRKAPYZMHL-SZMVWBNQSA-N Trp-Leu-Glu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 VPRHDRKAPYZMHL-SZMVWBNQSA-N 0.000 description 3
- YTYHAYZPOARHAP-HOCLYGCPSA-N Trp-Lys-Gly Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(=O)O)N YTYHAYZPOARHAP-HOCLYGCPSA-N 0.000 description 3
- LVTKHGUGBGNBPL-UHFFFAOYSA-N Trp-P-1 Chemical compound N1C2=CC=CC=C2C2=C1C(C)=C(N)N=C2C LVTKHGUGBGNBPL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- IKUMWSDCGQVGHC-UMPQAUOISA-N Trp-Pro-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)N)O IKUMWSDCGQVGHC-UMPQAUOISA-N 0.000 description 3
- WSMVEHPVOYXPAQ-XIRDDKMYSA-N Trp-Ser-Lys Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N WSMVEHPVOYXPAQ-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 3
- IYHNBRUWVBIVJR-IHRRRGAJSA-N Tyr-Gln-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 IYHNBRUWVBIVJR-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 3
- BSCBBPKDVOZICB-KKUMJFAQSA-N Tyr-Leu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O BSCBBPKDVOZICB-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 3
- SINRIKQYQJRGDQ-MEYUZBJRSA-N Tyr-Lys-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 SINRIKQYQJRGDQ-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 3
- PSALWJCUIAQKFW-ACRUOGEOSA-N Tyr-Phe-Lys Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N PSALWJCUIAQKFW-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 3
- WURLIFOWSMBUAR-SLFFLAALSA-N Tyr-Phe-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)NC(=O)[C@H](CC3=CC=C(C=C3)O)N)C(=O)O WURLIFOWSMBUAR-SLFFLAALSA-N 0.000 description 3
- JIODCDXKCJRMEH-NHCYSSNCSA-N Val-Arg-Gln Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N JIODCDXKCJRMEH-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 3
- TZVUSFMQWPWHON-NHCYSSNCSA-N Val-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N TZVUSFMQWPWHON-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 3
- OUUBKKIJQIAPRI-LAEOZQHASA-N Val-Gln-Asn Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O OUUBKKIJQIAPRI-LAEOZQHASA-N 0.000 description 3
- SZTTYWIUCGSURQ-AUTRQRHGSA-N Val-Glu-Glu Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SZTTYWIUCGSURQ-AUTRQRHGSA-N 0.000 description 3
- WDIGUPHXPBMODF-UMNHJUIQSA-N Val-Glu-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N WDIGUPHXPBMODF-UMNHJUIQSA-N 0.000 description 3
- CELJCNRXKZPTCX-XPUUQOCRSA-N Val-Gly-Ala Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O CELJCNRXKZPTCX-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 3
- JVYIGCARISMLMV-HOCLYGCPSA-N Val-Gly-Trp Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)N JVYIGCARISMLMV-HOCLYGCPSA-N 0.000 description 3
- FEFZWCSXEMVSPO-LSJOCFKGSA-N Val-His-Ala Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](Cc1cnc[nH]1)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O FEFZWCSXEMVSPO-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 3
- SDSCOOZQQGUQFC-GVXVVHGQSA-N Val-His-Gln Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N SDSCOOZQQGUQFC-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 3
- YTUABZMPYKCWCQ-XQQFMLRXSA-N Val-His-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O)N YTUABZMPYKCWCQ-XQQFMLRXSA-N 0.000 description 3
- LYERIXUFCYVFFX-GVXVVHGQSA-N Val-Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N LYERIXUFCYVFFX-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 3
- XTDDIVQWDXMRJL-IHRRRGAJSA-N Val-Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N XTDDIVQWDXMRJL-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 3
- QSPOLEBZTMESFY-SRVKXCTJSA-N Val-Pro-Val Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O QSPOLEBZTMESFY-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- 108010069020 alanyl-prolyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- 239000003513 alkali Substances 0.000 description 3
- 108010050025 alpha-glutamyltryptophan Proteins 0.000 description 3
- AZDRQVAHHNSJOQ-UHFFFAOYSA-N alumane Chemical class [AlH3] AZDRQVAHHNSJOQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 3
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 3
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 3
- 210000000234 capsid Anatomy 0.000 description 3
- 230000034303 cell budding Effects 0.000 description 3
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 3
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 3
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 3
- 108010009297 diglycyl-histidine Proteins 0.000 description 3
- 108010078428 env Gene Products Proteins 0.000 description 3
- 239000006167 equilibration buffer Substances 0.000 description 3
- 108700004026 gag Genes Proteins 0.000 description 3
- 238000001641 gel filtration chromatography Methods 0.000 description 3
- 108010079547 glutamylmethionine Proteins 0.000 description 3
- 108010008671 glycyl-tryptophyl-methionine Proteins 0.000 description 3
- 108010010147 glycylglutamine Proteins 0.000 description 3
- 108010081551 glycylphenylalanine Proteins 0.000 description 3
- 108010018006 histidylserine Proteins 0.000 description 3
- 230000028996 humoral immune response Effects 0.000 description 3
- 230000008348 humoral response Effects 0.000 description 3
- 230000004957 immunoregulator effect Effects 0.000 description 3
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 3
- PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N iodoacetamide Chemical compound NC(=O)CI PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010000761 leucylarginine Proteins 0.000 description 3
- 108010057821 leucylproline Proteins 0.000 description 3
- 230000021633 leukocyte mediated immunity Effects 0.000 description 3
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 3
- 108010057952 lysyl-phenylalanyl-lysine Proteins 0.000 description 3
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 3
- 108700004029 pol Genes Proteins 0.000 description 3
- 108010077112 prolyl-proline Proteins 0.000 description 3
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 3
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 3
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 3
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 3
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 3
- 238000010257 thawing Methods 0.000 description 3
- 108010084932 tryptophyl-proline Proteins 0.000 description 3
- YYGNTYWPHWGJRM-UHFFFAOYSA-N (6E,10E,14E,18E)-2,6,10,15,19,23-hexamethyltetracosa-2,6,10,14,18,22-hexaene Chemical compound CC(C)=CCCC(C)=CCCC(C)=CCCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)C YYGNTYWPHWGJRM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CBNVOPQSNMPGDO-UHFFFAOYSA-N 2-[[2-[[1-[2-amino-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]acetyl]amino]-3-methylpentanoic acid Chemical compound CCC(C)C(C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)C1CCCN1C(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 CBNVOPQSNMPGDO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XQGIRPGAVLFKBJ-CIUDSAMLSA-N Ala-Asn-Lys Chemical compound N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O XQGIRPGAVLFKBJ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- DECCMEWNXSNSDO-ZLUOBGJFSA-N Ala-Cys-Ala Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O DECCMEWNXSNSDO-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- ZODMADSIQZZBSQ-FXQIFTODSA-N Ala-Gln-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ZODMADSIQZZBSQ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- CZPAHAKGPDUIPJ-CIUDSAMLSA-N Ala-Gln-Pro Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O CZPAHAKGPDUIPJ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- NJPMYXWVWQWCSR-ACZMJKKPSA-N Ala-Glu-Asn Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O NJPMYXWVWQWCSR-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- VBRDBGCROKWTPV-XHNCKOQMSA-N Ala-Glu-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N VBRDBGCROKWTPV-XHNCKOQMSA-N 0.000 description 2
- PCIFXPRIFWKWLK-YUMQZZPRSA-N Ala-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)N PCIFXPRIFWKWLK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- LXAARTARZJJCMB-CIQUZCHMSA-N Ala-Ile-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LXAARTARZJJCMB-CIQUZCHMSA-N 0.000 description 2
- MEFILNJXAVSUTO-JXUBOQSCSA-N Ala-Leu-Thr Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O MEFILNJXAVSUTO-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 2
- ARHJJAAWNWOACN-FXQIFTODSA-N Ala-Ser-Val Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O ARHJJAAWNWOACN-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- JNJHNBXBGNJESC-KKXDTOCCSA-N Ala-Tyr-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O JNJHNBXBGNJESC-KKXDTOCCSA-N 0.000 description 2
- 241000710929 Alphavirus Species 0.000 description 2
- OTCJMMRQBVDQRK-DCAQKATOSA-N Arg-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O OTCJMMRQBVDQRK-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- PTVGLOCPAVYPFG-CIUDSAMLSA-N Arg-Gln-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O PTVGLOCPAVYPFG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- OBFTYSPXDRROQO-SRVKXCTJSA-N Arg-Gln-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N OBFTYSPXDRROQO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- AQPVUEJJARLJHB-BQBZGAKWSA-N Arg-Gly-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N AQPVUEJJARLJHB-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- KRQSPVKUISQQFS-FJXKBIBVSA-N Arg-Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N KRQSPVKUISQQFS-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 2
- RIIVUOJDDQXHRV-SRVKXCTJSA-N Arg-Lys-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O RIIVUOJDDQXHRV-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- QBQVKUNBCAFXSV-ULQDDVLXSA-N Arg-Lys-Tyr Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 QBQVKUNBCAFXSV-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 2
- DDBMKOCQWNFDBH-RHYQMDGZSA-N Arg-Thr-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)O DDBMKOCQWNFDBH-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 2
- CTAPSNCVKPOOSM-KKUMJFAQSA-N Arg-Tyr-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O CTAPSNCVKPOOSM-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- GXMSVVBIAMWMKO-BQBZGAKWSA-N Asn-Arg-Gly Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)NCC(O)=O)CCCN=C(N)N GXMSVVBIAMWMKO-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- ZWASIOHRQWRWAS-UGYAYLCHSA-N Asn-Asp-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O ZWASIOHRQWRWAS-UGYAYLCHSA-N 0.000 description 2
- WQSCVMQDZYTFQU-FXQIFTODSA-N Asn-Cys-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O WQSCVMQDZYTFQU-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- YVXRYLVELQYAEQ-SRVKXCTJSA-N Asn-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N YVXRYLVELQYAEQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- WLVLIYYBPPONRJ-GCJQMDKQSA-N Asn-Thr-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O WLVLIYYBPPONRJ-GCJQMDKQSA-N 0.000 description 2
- DXQOQMCLWWADMU-ACZMJKKPSA-N Asp-Gln-Ser Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DXQOQMCLWWADMU-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- QNFRBNZGVVKBNJ-PEFMBERDSA-N Asp-Ile-Gln Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N QNFRBNZGVVKBNJ-PEFMBERDSA-N 0.000 description 2
- HOBNTSHITVVNBN-ZPFDUUQYSA-N Asp-Ile-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N HOBNTSHITVVNBN-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 2
- RQHLMGCXCZUOGT-ZPFDUUQYSA-N Asp-Leu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O RQHLMGCXCZUOGT-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 2
- WNGZKSVJFDZICU-XIRDDKMYSA-N Asp-Leu-Trp Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N WNGZKSVJFDZICU-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 2
- NVFSJIXJZCDICF-SRVKXCTJSA-N Asp-Lys-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N NVFSJIXJZCDICF-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- ZXRQJQCXPSMNMR-XIRDDKMYSA-N Asp-Lys-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N ZXRQJQCXPSMNMR-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 2
- MYLZFUMPZCPJCJ-NHCYSSNCSA-N Asp-Lys-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O MYLZFUMPZCPJCJ-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 2
- AHWRSSLYSGLBGD-CIUDSAMLSA-N Asp-Pro-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AHWRSSLYSGLBGD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- FAUPLTGRUBTXNU-FXQIFTODSA-N Asp-Pro-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FAUPLTGRUBTXNU-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- ZBYLEBZCVKLPCY-FXQIFTODSA-N Asp-Ser-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O ZBYLEBZCVKLPCY-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- ZVGRHIRJLWBWGJ-ACZMJKKPSA-N Asp-Ser-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O ZVGRHIRJLWBWGJ-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- GGBQDSHTXKQSLP-NHCYSSNCSA-N Asp-Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N GGBQDSHTXKQSLP-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 2
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 2
- 238000011537 Coomassie blue staining Methods 0.000 description 2
- OJQJUQUBJGTCRY-WFBYXXMGSA-N Cys-Ala-Trp Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N OJQJUQUBJGTCRY-WFBYXXMGSA-N 0.000 description 2
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 2
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 2
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 2
- 102100038132 Endogenous retrovirus group K member 6 Pro protein Human genes 0.000 description 2
- 241000701832 Enterobacteria phage T3 Species 0.000 description 2
- YJIUYQKQBBQYHZ-ACZMJKKPSA-N Gln-Ala-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O YJIUYQKQBBQYHZ-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- YXQCLIVLWCKCRS-RYUDHWBXSA-N Gln-Gly-Tyr Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N)O YXQCLIVLWCKCRS-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 2
- IWUFOVSLWADEJC-AVGNSLFASA-N Gln-His-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IWUFOVSLWADEJC-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- HHQCBFGKQDMWSP-GUBZILKMSA-N Gln-Leu-Cys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N HHQCBFGKQDMWSP-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- QKCZZAZNMMVICF-DCAQKATOSA-N Gln-Leu-Glu Chemical compound NC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O QKCZZAZNMMVICF-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- PSERKXGRRADTKA-MNXVOIDGSA-N Gln-Leu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O PSERKXGRRADTKA-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 2
- MLSKFHLRFVGNLL-WDCWCFNPSA-N Gln-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O MLSKFHLRFVGNLL-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 2
- HPCOBEHVEHWREJ-DCAQKATOSA-N Gln-Lys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HPCOBEHVEHWREJ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- FKXCBKCOSVIGCT-AVGNSLFASA-N Gln-Lys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O FKXCBKCOSVIGCT-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- OREPWMPAUWIIAM-ZPFDUUQYSA-N Gln-Pro-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CCC(=O)N)N OREPWMPAUWIIAM-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 2
- CTJRFALAOYAJBX-NWLDYVSISA-N Gln-Trp-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N)O CTJRFALAOYAJBX-NWLDYVSISA-N 0.000 description 2
- NCWOMXABNYEPLY-NRPADANISA-N Glu-Ala-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O NCWOMXABNYEPLY-NRPADANISA-N 0.000 description 2
- HTTSBEBKVNEDFE-AUTRQRHGSA-N Glu-Gln-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N HTTSBEBKVNEDFE-AUTRQRHGSA-N 0.000 description 2
- KRGZZKWSBGPLKL-IUCAKERBSA-N Glu-Gly-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N KRGZZKWSBGPLKL-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- ITBHUUMCJJQUSC-LAEOZQHASA-N Glu-Ile-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(O)=O ITBHUUMCJJQUSC-LAEOZQHASA-N 0.000 description 2
- QXDXIXFSFHUYAX-MNXVOIDGSA-N Glu-Ile-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O QXDXIXFSFHUYAX-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 2
- VMKCPNBBPGGQBJ-GUBZILKMSA-N Glu-Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N VMKCPNBBPGGQBJ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- YGLCLCMAYUYZSG-AVGNSLFASA-N Glu-Lys-His Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 YGLCLCMAYUYZSG-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- KXTAGESXNQEZKB-DZKIICNBSA-N Glu-Phe-Val Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 KXTAGESXNQEZKB-DZKIICNBSA-N 0.000 description 2
- GMVCSRBOSIUTFC-FXQIFTODSA-N Glu-Ser-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O GMVCSRBOSIUTFC-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- CQGBSALYGOXQPE-HTUGSXCWSA-N Glu-Thr-Phe Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O CQGBSALYGOXQPE-HTUGSXCWSA-N 0.000 description 2
- JDAYMLXPUJRSDJ-XIRDDKMYSA-N Glu-Trp-Arg Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O)=CNC2=C1 JDAYMLXPUJRSDJ-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 2
- BPCLDCNZBUYGOD-BPUTZDHNSA-N Glu-Trp-Glu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 BPCLDCNZBUYGOD-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 2
- PMSDOVISAARGAV-FHWLQOOXSA-N Glu-Tyr-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 PMSDOVISAARGAV-FHWLQOOXSA-N 0.000 description 2
- QLNKFGTZOBVMCS-JBACZVJFSA-N Glu-Tyr-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O QLNKFGTZOBVMCS-JBACZVJFSA-N 0.000 description 2
- UZWUBBRJWFTHTD-LAEOZQHASA-N Glu-Val-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O UZWUBBRJWFTHTD-LAEOZQHASA-N 0.000 description 2
- VIPDPMHGICREIS-GVXVVHGQSA-N Glu-Val-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O VIPDPMHGICREIS-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 2
- FKJQNJCQTKUBCD-XPUUQOCRSA-N Gly-Ala-His Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)O FKJQNJCQTKUBCD-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 2
- KQDMENMTYNBWMR-WHFBIAKZSA-N Gly-Asp-Ala Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O KQDMENMTYNBWMR-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- BYYNJRSNDARRBX-YFKPBYRVSA-N Gly-Gln-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O BYYNJRSNDARRBX-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- LJXWZPHEMJSNRC-KBPBESRZSA-N Gly-Gln-Trp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O LJXWZPHEMJSNRC-KBPBESRZSA-N 0.000 description 2
- HDNXXTBKOJKWNN-WDSKDSINSA-N Gly-Glu-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O HDNXXTBKOJKWNN-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- KMSGYZQRXPUKGI-BYPYZUCNSA-N Gly-Gly-Asn Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O KMSGYZQRXPUKGI-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- SXJHOPPTOJACOA-QXEWZRGKSA-N Gly-Ile-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N SXJHOPPTOJACOA-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 2
- BHPQOIPBLYJNAW-NGZCFLSTSA-N Gly-Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)CN BHPQOIPBLYJNAW-NGZCFLSTSA-N 0.000 description 2
- ULZCYBYDTUMHNF-IUCAKERBSA-N Gly-Leu-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ULZCYBYDTUMHNF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- LRQXRHGQEVWGPV-NHCYSSNCSA-N Gly-Leu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CN LRQXRHGQEVWGPV-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 2
- PTIIBFKSLCYQBO-NHCYSSNCSA-N Gly-Lys-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)CN PTIIBFKSLCYQBO-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 2
- FXGRXIATVXUAHO-WEDXCCLWSA-N Gly-Lys-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CCCCN FXGRXIATVXUAHO-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 2
- CVFOYJJOZYYEPE-KBPBESRZSA-N Gly-Lys-Tyr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O CVFOYJJOZYYEPE-KBPBESRZSA-N 0.000 description 2
- IEGFSKKANYKBDU-QWHCGFSZSA-N Gly-Phe-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)NC(=O)CN)C(=O)O IEGFSKKANYKBDU-QWHCGFSZSA-N 0.000 description 2
- OHUKZZYSJBKFRR-WHFBIAKZSA-N Gly-Ser-Asp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O OHUKZZYSJBKFRR-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- XHVONGZZVUUORG-WEDXCCLWSA-N Gly-Thr-Lys Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN XHVONGZZVUUORG-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 2
- PASHZZBXZYEXFE-LSDHHAIUSA-N Gly-Trp-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)NC(=O)CN)C(=O)O PASHZZBXZYEXFE-LSDHHAIUSA-N 0.000 description 2
- OCRQUYDOYKCOQG-IRXDYDNUSA-N Gly-Tyr-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)CN)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 OCRQUYDOYKCOQG-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 2
- IZVICCORZOSGPT-JSGCOSHPSA-N Gly-Val-Tyr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O IZVICCORZOSGPT-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 2
- 108060003393 Granulin Proteins 0.000 description 2
- 108010086377 HLA-A3 Antigen Proteins 0.000 description 2
- SOFSRBYHDINIRG-QTKMDUPCSA-N His-Arg-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N)O SOFSRBYHDINIRG-QTKMDUPCSA-N 0.000 description 2
- YAALVYQFVJNXIV-KKUMJFAQSA-N His-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 YAALVYQFVJNXIV-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- ZVKDCQVQTGYBQT-LSJOCFKGSA-N His-Pro-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZVKDCQVQTGYBQT-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 2
- FLXCRBXJRJSDHX-AVGNSLFASA-N His-Pro-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O FLXCRBXJRJSDHX-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- PLCAEMGSYOYIPP-GUBZILKMSA-N His-Ser-Gln Chemical compound NC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 PLCAEMGSYOYIPP-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- FBVHRDXSCYELMI-PBCZWWQYSA-N His-Thr-Asn Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N)O FBVHRDXSCYELMI-PBCZWWQYSA-N 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- 108700020134 Human immunodeficiency virus 1 nef Proteins 0.000 description 2
- YOTNPRLPIPHQSB-XUXIUFHCSA-N Ile-Arg-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N YOTNPRLPIPHQSB-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 2
- GQKSJYINYYWPMR-NGZCFLSTSA-N Ile-Gly-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N GQKSJYINYYWPMR-NGZCFLSTSA-N 0.000 description 2
- RIVKTKFVWXRNSJ-GRLWGSQLSA-N Ile-Ile-Gln Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N RIVKTKFVWXRNSJ-GRLWGSQLSA-N 0.000 description 2
- SJLVSMMIFYTSGY-GRLWGSQLSA-N Ile-Ile-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N SJLVSMMIFYTSGY-GRLWGSQLSA-N 0.000 description 2
- UIEZQYNXCYHMQS-BJDJZHNGSA-N Ile-Lys-Ala Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)N UIEZQYNXCYHMQS-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 2
- GVNNAHIRSDRIII-AJNGGQMLSA-N Ile-Lys-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N GVNNAHIRSDRIII-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 2
- VOCZPDONPURUHV-QEWYBTABSA-N Ile-Phe-Gln Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N VOCZPDONPURUHV-QEWYBTABSA-N 0.000 description 2
- CAHCWMVNBZJVAW-NAKRPEOUSA-N Ile-Pro-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N CAHCWMVNBZJVAW-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 2
- VGSPNSSCMOHRRR-BJDJZHNGSA-N Ile-Ser-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N VGSPNSSCMOHRRR-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 2
- JNLSTRPWUXOORL-MMWGEVLESA-N Ile-Ser-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N JNLSTRPWUXOORL-MMWGEVLESA-N 0.000 description 2
- GNXGAVNTVNOCLL-SIUGBPQLSA-N Ile-Tyr-Gln Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N GNXGAVNTVNOCLL-SIUGBPQLSA-N 0.000 description 2
- GVEODXUBBFDBPW-MGHWNKPDSA-N Ile-Tyr-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 GVEODXUBBFDBPW-MGHWNKPDSA-N 0.000 description 2
- KXUKTDGKLAOCQK-LSJOCFKGSA-N Ile-Val-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O KXUKTDGKLAOCQK-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 2
- UYODHPPSCXBNCS-XUXIUFHCSA-N Ile-Val-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C UYODHPPSCXBNCS-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 2
- APQYGMBHIVXFML-OSUNSFLBSA-N Ile-Val-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)N APQYGMBHIVXFML-OSUNSFLBSA-N 0.000 description 2
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 2
- 108010061833 Integrases Proteins 0.000 description 2
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical class [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LHSGPCFBGJHPCY-UHFFFAOYSA-N L-leucine-L-tyrosine Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 LHSGPCFBGJHPCY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CQQGCWPXDHTTNF-GUBZILKMSA-N Leu-Ala-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O CQQGCWPXDHTTNF-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- GRZSCTXVCDUIPO-SRVKXCTJSA-N Leu-Arg-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O GRZSCTXVCDUIPO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- XYUBOFCTGPZFSA-WDSOQIARSA-N Leu-Arg-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 XYUBOFCTGPZFSA-WDSOQIARSA-N 0.000 description 2
- POJPZSMTTMLSTG-SRVKXCTJSA-N Leu-Asn-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N POJPZSMTTMLSTG-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- QCSFMCFHVGTLFF-NHCYSSNCSA-N Leu-Asp-Val Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O QCSFMCFHVGTLFF-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 2
- NHHKSOGJYNQENP-SRVKXCTJSA-N Leu-Cys-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N NHHKSOGJYNQENP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- VQPPIMUZCZCOIL-GUBZILKMSA-N Leu-Gln-Ala Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O VQPPIMUZCZCOIL-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- ZYLJULGXQDNXDK-GUBZILKMSA-N Leu-Gln-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O ZYLJULGXQDNXDK-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- DZQMXBALGUHGJT-GUBZILKMSA-N Leu-Glu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O DZQMXBALGUHGJT-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- HPBCTWSUJOGJSH-MNXVOIDGSA-N Leu-Glu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O HPBCTWSUJOGJSH-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 2
- QVFGXCVIXXBFHO-AVGNSLFASA-N Leu-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O QVFGXCVIXXBFHO-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- CCQLQKZTXZBXTN-NHCYSSNCSA-N Leu-Gly-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O CCQLQKZTXZBXTN-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 2
- KYIIALJHAOIAHF-KKUMJFAQSA-N Leu-Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 KYIIALJHAOIAHF-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- KPYAOIVPJKPIOU-KKUMJFAQSA-N Leu-Lys-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O KPYAOIVPJKPIOU-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- VVQJGYPTIYOFBR-IHRRRGAJSA-N Leu-Lys-Met Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)N VVQJGYPTIYOFBR-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- RTIRBWJPYJYTLO-MELADBBJSA-N Leu-Lys-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N RTIRBWJPYJYTLO-MELADBBJSA-N 0.000 description 2
- OVZLLFONXILPDZ-VOAKCMCISA-N Leu-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O OVZLLFONXILPDZ-VOAKCMCISA-N 0.000 description 2
- GZRABTMNWJXFMH-UVOCVTCTSA-N Leu-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GZRABTMNWJXFMH-UVOCVTCTSA-N 0.000 description 2
- LXGSOEPHQJONMG-PMVMPFDFSA-N Leu-Trp-Tyr Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)N[C@@H](CC3=CC=C(C=C3)O)C(=O)O)N LXGSOEPHQJONMG-PMVMPFDFSA-N 0.000 description 2
- WUHBLPVELFTPQK-KKUMJFAQSA-N Leu-Tyr-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O WUHBLPVELFTPQK-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- SXOFUVGLPHCPRQ-KKUMJFAQSA-N Leu-Tyr-Cys Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O SXOFUVGLPHCPRQ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- AAKRWBIIGKPOKQ-ONGXEEELSA-N Leu-Val-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O AAKRWBIIGKPOKQ-ONGXEEELSA-N 0.000 description 2
- 102000004083 Lymphotoxin-alpha Human genes 0.000 description 2
- 108090000542 Lymphotoxin-alpha Proteins 0.000 description 2
- XFIHDSBIPWEYJJ-YUMQZZPRSA-N Lys-Ala-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN XFIHDSBIPWEYJJ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- SWWCDAGDQHTKIE-RHYQMDGZSA-N Lys-Arg-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SWWCDAGDQHTKIE-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 2
- WLCYCADOWRMSAJ-CIUDSAMLSA-N Lys-Asn-Cys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O WLCYCADOWRMSAJ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- YFGWNAROEYWGNL-GUBZILKMSA-N Lys-Gln-Asn Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O YFGWNAROEYWGNL-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- DTUZCYRNEJDKSR-NHCYSSNCSA-N Lys-Gly-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCCN DTUZCYRNEJDKSR-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 2
- VLMNBMFYRMGEMB-QWRGUYRKSA-N Lys-His-Gly Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)NCC(O)=O)CC1=CNC=N1 VLMNBMFYRMGEMB-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- AIRZWUMAHCDDHR-KKUMJFAQSA-N Lys-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O AIRZWUMAHCDDHR-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- UQRZFMQQXXJTTF-AVGNSLFASA-N Lys-Lys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UQRZFMQQXXJTTF-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- YDDDRTIPNTWGIG-SRVKXCTJSA-N Lys-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YDDDRTIPNTWGIG-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- AZOFEHCPMBRNFD-BZSNNMDCSA-N Lys-Phe-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 AZOFEHCPMBRNFD-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- PDIDTSZKKFEDMB-UWVGGRQHSA-N Lys-Pro-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O PDIDTSZKKFEDMB-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- DIBZLYZXTSVGLN-CIUDSAMLSA-N Lys-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DIBZLYZXTSVGLN-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- QVTDVTONTRSQMF-WDCWCFNPSA-N Lys-Thr-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@H](O)C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN QVTDVTONTRSQMF-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 2
- GVKINWYYLOLEFQ-XIRDDKMYSA-N Lys-Trp-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GVKINWYYLOLEFQ-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 2
- OHXUUQDOBQKSNB-AVGNSLFASA-N Lys-Val-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O OHXUUQDOBQKSNB-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- NYTDJEZBAAFLLG-IHRRRGAJSA-N Lys-Val-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O NYTDJEZBAAFLLG-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- HMZPYMSEAALNAE-ULQDDVLXSA-N Lys-Val-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O HMZPYMSEAALNAE-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 2
- 101710125418 Major capsid protein Proteins 0.000 description 2
- FJVJLMZUIGMFFU-BQBZGAKWSA-N Met-Asp-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O FJVJLMZUIGMFFU-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- UZWMJZSOXGOVIN-LURJTMIESA-N Met-Gly-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O UZWMJZSOXGOVIN-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- MVBZBRKNZVJEKK-DTWKUNHWSA-N Met-Gly-Pro Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)NCC(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N MVBZBRKNZVJEKK-DTWKUNHWSA-N 0.000 description 2
- IHRFZLQEQVHXFA-RHYQMDGZSA-N Met-Thr-Lys Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN IHRFZLQEQVHXFA-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 2
- NSMXRFMGZYTFEX-KJEVXHAQSA-N Met-Thr-Tyr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCSC)N)O NSMXRFMGZYTFEX-KJEVXHAQSA-N 0.000 description 2
- WUGMRIBZSVSJNP-UHFFFAOYSA-N N-L-alanyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)C)C(O)=O)=CNC2=C1 WUGMRIBZSVSJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N N-alpha-L-glutamyl-L-phenylalanine Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010087066 N2-tryptophyllysine Proteins 0.000 description 2
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 2
- 108091081548 Palindromic sequence Proteins 0.000 description 2
- DFEVBOYEUQJGER-JURCDPSOSA-N Phe-Ala-Ile Chemical compound N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)O DFEVBOYEUQJGER-JURCDPSOSA-N 0.000 description 2
- MPGJIHFJCXTVEX-KKUMJFAQSA-N Phe-Arg-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O MPGJIHFJCXTVEX-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- OPEVYHFJXLCCRT-AVGNSLFASA-N Phe-Gln-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O OPEVYHFJXLCCRT-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- MVIJMIZJPHQGEN-IHRRRGAJSA-N Phe-Ser-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H]([NH3+])CC1=CC=CC=C1 MVIJMIZJPHQGEN-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- FGWUALWGCZJQDJ-URLPEUOOSA-N Phe-Thr-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O FGWUALWGCZJQDJ-URLPEUOOSA-N 0.000 description 2
- GOUWCZRDTWTODO-YDHLFZDLSA-N Phe-Val-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O GOUWCZRDTWTODO-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 2
- FCCBQBZXIAZNIG-LSJOCFKGSA-N Pro-Ala-His Chemical compound C[C@H](NC(=O)[C@@H]1CCCN1)C(=O)N[C@@H](Cc1cnc[nH]1)C(O)=O FCCBQBZXIAZNIG-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 2
- FZHBZMDRDASUHN-NAKRPEOUSA-N Pro-Ala-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1)C(O)=O FZHBZMDRDASUHN-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 2
- GDXZRWYXJSGWIV-GMOBBJLQSA-N Pro-Asp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 GDXZRWYXJSGWIV-GMOBBJLQSA-N 0.000 description 2
- ZYBUKTMPPFQSHL-JYJNAYRXSA-N Pro-Asp-Trp Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O ZYBUKTMPPFQSHL-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 2
- KIPIKSXPPLABPN-CIUDSAMLSA-N Pro-Glu-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 KIPIKSXPPLABPN-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- ZTVCLZLGHZXLOT-ULQDDVLXSA-N Pro-Glu-Trp Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)C(=O)O ZTVCLZLGHZXLOT-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 2
- FEPSEIDIPBMIOS-QXEWZRGKSA-N Pro-Gly-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1 FEPSEIDIPBMIOS-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 2
- HAEGAELAYWSUNC-WPRPVWTQSA-N Pro-Gly-Val Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O HAEGAELAYWSUNC-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 2
- YTWNSIDWAFSEEI-RWMBFGLXSA-N Pro-His-Pro Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)N3CCC[C@@H]3C(=O)O YTWNSIDWAFSEEI-RWMBFGLXSA-N 0.000 description 2
- KWMUAKQOVYCQJQ-ZPFDUUQYSA-N Pro-Ile-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 KWMUAKQOVYCQJQ-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 2
- CGSOWZUPLOKYOR-AVGNSLFASA-N Pro-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 CGSOWZUPLOKYOR-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- IMNVAOPEMFDAQD-NHCYSSNCSA-N Pro-Val-Glu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IMNVAOPEMFDAQD-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 2
- 238000011152 Q-Sepharose FF chromatography Methods 0.000 description 2
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 2
- BTKUIVBNGBFTTP-WHFBIAKZSA-N Ser-Ala-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O BTKUIVBNGBFTTP-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- BGOWRLSWJCVYAQ-CIUDSAMLSA-N Ser-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O BGOWRLSWJCVYAQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- RNMRYWZYFHHOEV-CIUDSAMLSA-N Ser-Gln-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O RNMRYWZYFHHOEV-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- YPUSXTWURJANKF-KBIXCLLPSA-N Ser-Gln-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O YPUSXTWURJANKF-KBIXCLLPSA-N 0.000 description 2
- GZFAWAQTEYDKII-YUMQZZPRSA-N Ser-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CO GZFAWAQTEYDKII-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- VMLONWHIORGALA-SRVKXCTJSA-N Ser-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H]([NH3+])CO VMLONWHIORGALA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- PPNPDKGQRFSCAC-CIUDSAMLSA-N Ser-Lys-Asp Chemical compound NCCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O PPNPDKGQRFSCAC-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- LRWBCWGEUCKDTN-BJDJZHNGSA-N Ser-Lys-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O LRWBCWGEUCKDTN-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 2
- FPCGZYMRFFIYIH-CIUDSAMLSA-N Ser-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FPCGZYMRFFIYIH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- ADJDNJCSPNFFPI-FXQIFTODSA-N Ser-Pro-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CO ADJDNJCSPNFFPI-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- AABIBDJHSKIMJK-FXQIFTODSA-N Ser-Ser-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O AABIBDJHSKIMJK-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- PCJLFYBAQZQOFE-KATARQTJSA-N Ser-Thr-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)O PCJLFYBAQZQOFE-KATARQTJSA-N 0.000 description 2
- SIEBDTCABMZCLF-XGEHTFHBSA-N Ser-Val-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SIEBDTCABMZCLF-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 2
- 101710172711 Structural protein Proteins 0.000 description 2
- 101710137500 T7 RNA polymerase Proteins 0.000 description 2
- BHEOSNUKNHRBNM-UHFFFAOYSA-N Tetramethylsqualene Natural products CC(=C)C(C)CCC(=C)C(C)CCC(C)=CCCC=C(C)CCC(C)C(=C)CCC(C)C(C)=C BHEOSNUKNHRBNM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KEGBFULVYKYJRD-LFSVMHDDSA-N Thr-Ala-Phe Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 KEGBFULVYKYJRD-LFSVMHDDSA-N 0.000 description 2
- SWIKDOUVROTZCW-GCJQMDKQSA-N Thr-Asn-Ala Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)N)O SWIKDOUVROTZCW-GCJQMDKQSA-N 0.000 description 2
- YLXAMFZYJTZXFH-OLHMAJIHSA-N Thr-Asn-Asp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N)O YLXAMFZYJTZXFH-OLHMAJIHSA-N 0.000 description 2
- JHBHMCMKSPXRHV-NUMRIWBASA-N Thr-Asn-Gln Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N)O JHBHMCMKSPXRHV-NUMRIWBASA-N 0.000 description 2
- XDARBNMYXKUFOJ-GSSVUCPTSA-N Thr-Asp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O XDARBNMYXKUFOJ-GSSVUCPTSA-N 0.000 description 2
- WLDUCKSCDRIVLJ-NUMRIWBASA-N Thr-Gln-Asp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N)O WLDUCKSCDRIVLJ-NUMRIWBASA-N 0.000 description 2
- UDQBCBUXAQIZAK-GLLZPBPUSA-N Thr-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UDQBCBUXAQIZAK-GLLZPBPUSA-N 0.000 description 2
- BNGDYRRHRGOPHX-IFFSRLJSSA-N Thr-Glu-Val Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O)C(O)=O BNGDYRRHRGOPHX-IFFSRLJSSA-N 0.000 description 2
- MPUMPERGHHJGRP-WEDXCCLWSA-N Thr-Gly-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O MPUMPERGHHJGRP-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 2
- SPVHQURZJCUDQC-VOAKCMCISA-N Thr-Lys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O SPVHQURZJCUDQC-VOAKCMCISA-N 0.000 description 2
- BIBYEFRASCNLAA-CDMKHQONSA-N Thr-Phe-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)NCC(O)=O)CC1=CC=CC=C1 BIBYEFRASCNLAA-CDMKHQONSA-N 0.000 description 2
- MXDOAJQRJBMGMO-FJXKBIBVSA-N Thr-Pro-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O MXDOAJQRJBMGMO-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 2
- GFRIEEKFXOVPIR-RHYQMDGZSA-N Thr-Pro-Lys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O GFRIEEKFXOVPIR-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 2
- XHWCDRUPDNSDAZ-XKBZYTNZSA-N Thr-Ser-Glu Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N)O XHWCDRUPDNSDAZ-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 2
- WPSKTVVMQCXPRO-BWBBJGPYSA-N Thr-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WPSKTVVMQCXPRO-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 2
- ZESGVALRVJIVLZ-VFCFLDTKSA-N Thr-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O ZESGVALRVJIVLZ-VFCFLDTKSA-N 0.000 description 2
- XGUAUKUYQHBUNY-SWRJLBSHSA-N Thr-Trp-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O XGUAUKUYQHBUNY-SWRJLBSHSA-N 0.000 description 2
- BGHVVGPELPHRCI-HZTRNQAASA-N Thr-Trp-Trp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)N[C@@H](CC3=CNC4=CC=CC=C43)C(=O)O)N)O BGHVVGPELPHRCI-HZTRNQAASA-N 0.000 description 2
- KAJRRNHOVMZYBL-IRIUXVKKSA-N Thr-Tyr-Gln Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O KAJRRNHOVMZYBL-IRIUXVKKSA-N 0.000 description 2
- XGFYGMKZKFRGAI-RCWTZXSCSA-N Thr-Val-Arg Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N XGFYGMKZKFRGAI-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 2
- BKIOKSLLAAZYTC-KKHAAJSZSA-N Thr-Val-Asn Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O BKIOKSLLAAZYTC-KKHAAJSZSA-N 0.000 description 2
- QGVBFDIREUUSHX-IFFSRLJSSA-N Thr-Val-Gln Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O QGVBFDIREUUSHX-IFFSRLJSSA-N 0.000 description 2
- 101800001690 Transmembrane protein gp41 Proteins 0.000 description 2
- AOAMKFFPFOPMLX-BVSLBCMMSA-N Trp-Arg-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)N)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 AOAMKFFPFOPMLX-BVSLBCMMSA-N 0.000 description 2
- SSNGFWKILJLTQM-QEJZJMRPSA-N Trp-Gln-Asn Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N SSNGFWKILJLTQM-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 2
- RPVDDQYNBOVWLR-HOCLYGCPSA-N Trp-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O RPVDDQYNBOVWLR-HOCLYGCPSA-N 0.000 description 2
- WLBZWXXGSOLJBA-HOCLYGCPSA-N Trp-Gly-Lys Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 WLBZWXXGSOLJBA-HOCLYGCPSA-N 0.000 description 2
- DTPWXZXGFAHEKL-NWLDYVSISA-N Trp-Thr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O DTPWXZXGFAHEKL-NWLDYVSISA-N 0.000 description 2
- JRXKIVGWMMIIOF-YDHLFZDLSA-N Tyr-Asn-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N JRXKIVGWMMIIOF-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 2
- NRFTYDWKWGJLAR-MELADBBJSA-N Tyr-Asp-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N)C(=O)O NRFTYDWKWGJLAR-MELADBBJSA-N 0.000 description 2
- FJKXUIJOMUWCDD-FHWLQOOXSA-N Tyr-Gln-Tyr Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=C(C=C2)O)C(=O)O)N)O FJKXUIJOMUWCDD-FHWLQOOXSA-N 0.000 description 2
- CVXURBLRELTJKO-BWAGICSOSA-N Tyr-His-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N)O CVXURBLRELTJKO-BWAGICSOSA-N 0.000 description 2
- BIWVVOHTKDLRMP-ULQDDVLXSA-N Tyr-Pro-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O BIWVVOHTKDLRMP-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 2
- XUIOBCQESNDTDE-FQPOAREZSA-N Tyr-Thr-Ala Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N)O XUIOBCQESNDTDE-FQPOAREZSA-N 0.000 description 2
- AOIZTZRWMSPPAY-KAOXEZKKSA-N Tyr-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N)O AOIZTZRWMSPPAY-KAOXEZKKSA-N 0.000 description 2
- SQUMHUZLJDUROQ-YDHLFZDLSA-N Tyr-Val-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O SQUMHUZLJDUROQ-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 2
- NWEGIYMHTZXVBP-JSGCOSHPSA-N Tyr-Val-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O NWEGIYMHTZXVBP-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 2
- ABSXSJZNRAQDDI-KJEVXHAQSA-N Tyr-Val-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O ABSXSJZNRAQDDI-KJEVXHAQSA-N 0.000 description 2
- GXAZTLJYINLMJL-LAEOZQHASA-N Val-Asn-Gln Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N GXAZTLJYINLMJL-LAEOZQHASA-N 0.000 description 2
- ZEVNVXYRZRIRCH-GVXVVHGQSA-N Val-Gln-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N ZEVNVXYRZRIRCH-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 2
- DJEVQCWNMQOABE-RCOVLWMOSA-N Val-Gly-Asp Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N DJEVQCWNMQOABE-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 2
- JZWZACGUZVCQPS-RNJOBUHISA-N Val-Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N JZWZACGUZVCQPS-RNJOBUHISA-N 0.000 description 2
- MYLNLEIZWHVENT-VKOGCVSHSA-N Val-Ile-Trp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N MYLNLEIZWHVENT-VKOGCVSHSA-N 0.000 description 2
- AGXGCFSECFQMKB-NHCYSSNCSA-N Val-Leu-Asp Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N AGXGCFSECFQMKB-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 2
- ZHQWPWQNVRCXAX-XQQFMLRXSA-N Val-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N ZHQWPWQNVRCXAX-XQQFMLRXSA-N 0.000 description 2
- WBAJDGWKRIHOAC-GVXVVHGQSA-N Val-Lys-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O WBAJDGWKRIHOAC-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 2
- ZRSZTKTVPNSUNA-IHRRRGAJSA-N Val-Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)C(C)C)C(O)=O ZRSZTKTVPNSUNA-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- LJSZPMSUYKKKCP-UBHSHLNASA-N Val-Phe-Ala Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 LJSZPMSUYKKKCP-UBHSHLNASA-N 0.000 description 2
- LCHZBEUVGAVMKS-RHYQMDGZSA-N Val-Thr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C(C)C)[C@@H](C)O)C(O)=O LCHZBEUVGAVMKS-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 2
- DVLWZWNAQUBZBC-ZNSHCXBVSA-N Val-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O DVLWZWNAQUBZBC-ZNSHCXBVSA-N 0.000 description 2
- HTONZBWRYUKUKC-RCWTZXSCSA-N Val-Thr-Val Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O HTONZBWRYUKUKC-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 2
- OWFGFHQMSBTKLX-UFYCRDLUSA-N Val-Tyr-Tyr Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=C(C=C2)O)C(=O)O)N OWFGFHQMSBTKLX-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 2
- AEFJNECXZCODJM-UWVGGRQHSA-N Val-Val-Gly Chemical compound CC(C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC([O-])=O AEFJNECXZCODJM-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- 241000710959 Venezuelan equine encephalitis virus Species 0.000 description 2
- 108020005202 Viral DNA Proteins 0.000 description 2
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 description 2
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 description 2
- 108010047495 alanylglycine Proteins 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 108010068380 arginylarginine Proteins 0.000 description 2
- 108010060035 arginylproline Proteins 0.000 description 2
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 2
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 2
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 2
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 2
- 239000013599 cloning vector Substances 0.000 description 2
- 238000000354 decomposition reaction Methods 0.000 description 2
- 239000007857 degradation product Substances 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 2
- 238000011026 diafiltration Methods 0.000 description 2
- PRAKJMSDJKAYCZ-UHFFFAOYSA-N dodecahydrosqualene Natural products CC(C)CCCC(C)CCCC(C)CCCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C PRAKJMSDJKAYCZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000009977 dual effect Effects 0.000 description 2
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 2
- 239000002158 endotoxin Substances 0.000 description 2
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 2
- -1 for example Substances 0.000 description 2
- 230000008014 freezing Effects 0.000 description 2
- 238000007710 freezing Methods 0.000 description 2
- 101150098622 gag gene Proteins 0.000 description 2
- 108010008237 glutamyl-valyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 108010049041 glutamylalanine Proteins 0.000 description 2
- 108010067216 glycyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N glycyl-glycyl-glycine Natural products NCC(=O)NCC(=O)NCC(O)=O XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 2
- 108010007811 human immunodeficiency virus p17 gag peptide Proteins 0.000 description 2
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 2
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 2
- 230000002480 immunoprotective effect Effects 0.000 description 2
- 229960001438 immunostimulant agent Drugs 0.000 description 2
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 2
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 2
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 2
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 2
- 231100000518 lethal Toxicity 0.000 description 2
- 230000001665 lethal effect Effects 0.000 description 2
- 108010012058 leucyltyrosine Proteins 0.000 description 2
- 108010038320 lysylphenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 2
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 101150023385 nef gene Proteins 0.000 description 2
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 2
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 2
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 2
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 2
- 230000001590 oxidative effect Effects 0.000 description 2
- 108010051242 phenylalanylserine Proteins 0.000 description 2
- 101150088264 pol gene Proteins 0.000 description 2
- 235000010482 polyoxyethylene sorbitan monooleate Nutrition 0.000 description 2
- 229920000053 polysorbate 80 Polymers 0.000 description 2
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 2
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 2
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 2
- 230000009465 prokaryotic expression Effects 0.000 description 2
- 108010090894 prolylleucine Proteins 0.000 description 2
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 2
- 239000013014 purified material Substances 0.000 description 2
- 239000001397 quillaja saponaria molina bark Substances 0.000 description 2
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 2
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 2
- 238000012552 review Methods 0.000 description 2
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 2
- 239000012723 sample buffer Substances 0.000 description 2
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 2
- 241000894007 species Species 0.000 description 2
- 229940031439 squalene Drugs 0.000 description 2
- TUHBEKDERLKLEC-UHFFFAOYSA-N squalene Natural products CC(=CCCC(=CCCC(=CCCC=C(/C)CCC=C(/C)CC=C(C)C)C)C)C TUHBEKDERLKLEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 2
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 2
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 2
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 2
- 108010038745 tryptophylglycine Proteins 0.000 description 2
- 108010045269 tryptophyltryptophan Proteins 0.000 description 2
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 2
- 239000012646 vaccine adjuvant Substances 0.000 description 2
- 229940124931 vaccine adjuvant Drugs 0.000 description 2
- AXFMEGAFCUULFV-BLFANLJRSA-N (2s)-2-[[(2s)-1-[(2s,3r)-2-amino-3-methylpentanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]pentanedioic acid Chemical compound CC[C@@H](C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AXFMEGAFCUULFV-BLFANLJRSA-N 0.000 description 1
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 1
- AWAFMFHOLVZLFG-UHFFFAOYSA-N 1-iodoaziridine-2,3-dione Chemical compound IN1C(=O)C1=O AWAFMFHOLVZLFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AXAVXPMQTGXXJZ-UHFFFAOYSA-N 2-aminoacetic acid;2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol Chemical compound NCC(O)=O.OCC(N)(CO)CO AXAVXPMQTGXXJZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QRXMUCSWCMTJGU-UHFFFAOYSA-N 5-bromo-4-chloro-3-indolyl phosphate Chemical compound C1=C(Br)C(Cl)=C2C(OP(O)(=O)O)=CNC2=C1 QRXMUCSWCMTJGU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ala-Ser Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- SVBXIUDNTRTKHE-CIUDSAMLSA-N Ala-Arg-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SVBXIUDNTRTKHE-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- LWUWMHIOBPTZBA-DCAQKATOSA-N Ala-Arg-Lys Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](N)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O LWUWMHIOBPTZBA-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- GGNHBHYDMUDXQB-KBIXCLLPSA-N Ala-Glu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C)N GGNHBHYDMUDXQB-KBIXCLLPSA-N 0.000 description 1
- HXNNRBHASOSVPG-GUBZILKMSA-N Ala-Glu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O HXNNRBHASOSVPG-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- NJWJSLCQEDMGNC-MBLNEYKQSA-N Ala-His-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)NC(=O)[C@H](C)N)O NJWJSLCQEDMGNC-MBLNEYKQSA-N 0.000 description 1
- RZZMZYZXNJRPOJ-BJDJZHNGSA-N Ala-Ile-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C)N RZZMZYZXNJRPOJ-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- QCTFKEJEIMPOLW-JURCDPSOSA-N Ala-Ile-Phe Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 QCTFKEJEIMPOLW-JURCDPSOSA-N 0.000 description 1
- CYBJZLQSUJEMAS-LFSVMHDDSA-N Ala-Phe-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)NC(=O)[C@H](C)N)O CYBJZLQSUJEMAS-LFSVMHDDSA-N 0.000 description 1
- YYAVDNKUWLAFCV-ACZMJKKPSA-N Ala-Ser-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O YYAVDNKUWLAFCV-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- XQNRANMFRPCFFW-GCJQMDKQSA-N Ala-Thr-Asn Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C)N)O XQNRANMFRPCFFW-GCJQMDKQSA-N 0.000 description 1
- LTTLSZVJTDSACD-OWLDWWDNSA-N Ala-Thr-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O LTTLSZVJTDSACD-OWLDWWDNSA-N 0.000 description 1
- ZCUFMRIQCPNOHZ-NRPADANISA-N Ala-Val-Gln Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N ZCUFMRIQCPNOHZ-NRPADANISA-N 0.000 description 1
- RYRQZJVFDVWURI-SRVKXCTJSA-N Arg-Gln-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N RYRQZJVFDVWURI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- OHYQKYUTLIPFOX-ZPFDUUQYSA-N Arg-Glu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O OHYQKYUTLIPFOX-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- GOWZVQXTHUCNSQ-NHCYSSNCSA-N Arg-Glu-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O GOWZVQXTHUCNSQ-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- FSNVAJOPUDVQAR-AVGNSLFASA-N Arg-Lys-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O FSNVAJOPUDVQAR-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- CLICCYPMVFGUOF-IHRRRGAJSA-N Arg-Lys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O CLICCYPMVFGUOF-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- HGKHPCFTRQDHCU-IUCAKERBSA-N Arg-Pro-Gly Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O HGKHPCFTRQDHCU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- 108010051330 Arg-Pro-Gly-Pro Proteins 0.000 description 1
- LYJXHXGPWDTLKW-HJGDQZAQSA-N Arg-Thr-Gln Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)O LYJXHXGPWDTLKW-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- UZSQXCMNUPKLCC-FJXKBIBVSA-N Arg-Thr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O UZSQXCMNUPKLCC-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 1
- UGJLILSJKSBVIR-ZFWWWQNUSA-N Arg-Trp-Gly Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)NCC(O)=O)=CNC2=C1 UGJLILSJKSBVIR-ZFWWWQNUSA-N 0.000 description 1
- LJUOLNXOWSWGKF-ACZMJKKPSA-N Asn-Asn-Glu Chemical compound C(CC(=O)O)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N LJUOLNXOWSWGKF-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- IYVSIZAXNLOKFQ-BYULHYEWSA-N Asn-Asp-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O IYVSIZAXNLOKFQ-BYULHYEWSA-N 0.000 description 1
- TWXZVVXRRRRSLT-IMJSIDKUSA-N Asn-Cys Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O TWXZVVXRRRRSLT-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- ALHMNHZJBYBYHS-DCAQKATOSA-N Asn-Lys-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O ALHMNHZJBYBYHS-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- COWITDLVHMZSIW-CIUDSAMLSA-N Asn-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O COWITDLVHMZSIW-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- CBHVAFXKOYAHOY-NHCYSSNCSA-N Asn-Val-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O CBHVAFXKOYAHOY-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- BLQBMRNMBAYREH-UWJYBYFXSA-N Asp-Ala-Tyr Chemical compound N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O BLQBMRNMBAYREH-UWJYBYFXSA-N 0.000 description 1
- POTCZYQVVNXUIG-BQBZGAKWSA-N Asp-Gly-Pro Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O POTCZYQVVNXUIG-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- KYQNAIMCTRZLNP-QSFUFRPTSA-N Asp-Ile-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O KYQNAIMCTRZLNP-QSFUFRPTSA-N 0.000 description 1
- MYOHQBFRJQFIDZ-KKUMJFAQSA-N Asp-Leu-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O MYOHQBFRJQFIDZ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- YIDFBWRHIYOYAA-LKXGYXEUSA-N Asp-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O YIDFBWRHIYOYAA-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 1
- OZBXOELNJBSJOA-UBHSHLNASA-N Asp-Ser-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N OZBXOELNJBSJOA-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- XWKPSMRPIKKDDU-RCOVLWMOSA-N Asp-Val-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O XWKPSMRPIKKDDU-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 1
- 108020000946 Bacterial DNA Proteins 0.000 description 1
- 101710149870 C-C chemokine receptor type 5 Proteins 0.000 description 1
- 102100035875 C-C chemokine receptor type 5 Human genes 0.000 description 1
- 102100031650 C-X-C chemokine receptor type 4 Human genes 0.000 description 1
- 101710082513 C-X-C chemokine receptor type 4 Proteins 0.000 description 1
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical class [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108090000565 Capsid Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102100023321 Ceruloplasmin Human genes 0.000 description 1
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 1
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 1
- 108091029430 CpG site Proteins 0.000 description 1
- 229920000858 Cyclodextrin Polymers 0.000 description 1
- 108010072220 Cyclophilin A Proteins 0.000 description 1
- 229930105110 Cyclosporin A Natural products 0.000 description 1
- PMATZTZNYRCHOR-CGLBZJNRSA-N Cyclosporin A Chemical compound CC[C@@H]1NC(=O)[C@H]([C@H](O)[C@H](C)C\C=C\C)N(C)C(=O)[C@H](C(C)C)N(C)C(=O)[C@H](CC(C)C)N(C)C(=O)[C@H](CC(C)C)N(C)C(=O)[C@@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N(C)C(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N(C)C(=O)CN(C)C1=O PMATZTZNYRCHOR-CGLBZJNRSA-N 0.000 description 1
- 108010036949 Cyclosporine Proteins 0.000 description 1
- IDFVDSBJNMPBSX-SRVKXCTJSA-N Cys-Lys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IDFVDSBJNMPBSX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- LLUXQOVDMQZMPJ-KKUMJFAQSA-N Cys-Tyr-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CS)CC1=CC=C(O)C=C1 LLUXQOVDMQZMPJ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- 235000001815 DL-alpha-tocopherol Nutrition 0.000 description 1
- 239000011627 DL-alpha-tocopherol Substances 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 102000012410 DNA Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108010061982 DNA Ligases Proteins 0.000 description 1
- 108010041986 DNA Vaccines Proteins 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- 238000011238 DNA vaccination Methods 0.000 description 1
- 229940021995 DNA vaccine Drugs 0.000 description 1
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 1
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 1
- 241000725619 Dengue virus Species 0.000 description 1
- 241000702421 Dependoparvovirus Species 0.000 description 1
- 101100364969 Dictyostelium discoideum scai gene Proteins 0.000 description 1
- 102000002322 Egg Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010000912 Egg Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 241000709661 Enterovirus Species 0.000 description 1
- 241000991587 Enterovirus C Species 0.000 description 1
- 101710091045 Envelope protein Proteins 0.000 description 1
- 241000701959 Escherichia virus Lambda Species 0.000 description 1
- 101150111889 F4 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000710831 Flavivirus Species 0.000 description 1
- 208000000666 Fowlpox Diseases 0.000 description 1
- XXLBHPPXDUWYAG-XQXXSGGOSA-N Gln-Ala-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O XXLBHPPXDUWYAG-XQXXSGGOSA-N 0.000 description 1
- CKNUKHBRCSMKMO-XHNCKOQMSA-N Gln-Asn-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N)C(=O)O CKNUKHBRCSMKMO-XHNCKOQMSA-N 0.000 description 1
- VOLVNCMGXWDDQY-LPEHRKFASA-N Gln-Glu-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N)C(=O)O VOLVNCMGXWDDQY-LPEHRKFASA-N 0.000 description 1
- NXPXQIZKDOXIHH-JSGCOSHPSA-N Gln-Gly-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N NXPXQIZKDOXIHH-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- LGIKBBLQVSWUGK-DCAQKATOSA-N Gln-Leu-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O LGIKBBLQVSWUGK-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- CAXXTYYGFYTBPV-IUCAKERBSA-N Gln-Leu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O CAXXTYYGFYTBPV-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- UWKPRVKWEKEMSY-DCAQKATOSA-N Gln-Lys-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O UWKPRVKWEKEMSY-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- JILRMFFFCHUUTJ-ACZMJKKPSA-N Gln-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O JILRMFFFCHUUTJ-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- YJCZUTXLPXBNIO-BHYGNILZSA-N Gln-Trp-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N)C(=O)O YJCZUTXLPXBNIO-BHYGNILZSA-N 0.000 description 1
- WPJDPEOQUIXXOY-AVGNSLFASA-N Gln-Tyr-Asn Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N)O WPJDPEOQUIXXOY-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- LKDIBBOKUAASNP-FXQIFTODSA-N Glu-Ala-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O LKDIBBOKUAASNP-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- KEBACWCLVOXFNC-DCAQKATOSA-N Glu-Arg-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O KEBACWCLVOXFNC-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- FLLRAEJOLZPSMN-CIUDSAMLSA-N Glu-Asn-Arg Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N FLLRAEJOLZPSMN-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- VAZZOGXDUQSVQF-NUMRIWBASA-N Glu-Asn-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O VAZZOGXDUQSVQF-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- PAQUJCSYVIBPLC-AVGNSLFASA-N Glu-Asp-Phe Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PAQUJCSYVIBPLC-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- HNVFSTLPVJWIDV-CIUDSAMLSA-N Glu-Glu-Gln Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O HNVFSTLPVJWIDV-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- MUSGDMDGNGXULI-DCAQKATOSA-N Glu-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O MUSGDMDGNGXULI-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- QJCKNLPMTPXXEM-AUTRQRHGSA-N Glu-Glu-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O QJCKNLPMTPXXEM-AUTRQRHGSA-N 0.000 description 1
- LRPXYSGPOBVBEH-IUCAKERBSA-N Glu-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O LRPXYSGPOBVBEH-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- YVYVMJNUENBOOL-KBIXCLLPSA-N Glu-Ile-Cys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N YVYVMJNUENBOOL-KBIXCLLPSA-N 0.000 description 1
- WVYJNPCWJYBHJG-YVNDNENWSA-N Glu-Ile-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O WVYJNPCWJYBHJG-YVNDNENWSA-N 0.000 description 1
- HVYWQYLBVXMXSV-GUBZILKMSA-N Glu-Leu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O HVYWQYLBVXMXSV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- CUPSDFQZTVVTSK-GUBZILKMSA-N Glu-Lys-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O CUPSDFQZTVVTSK-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- BCYGDJXHAGZNPQ-DCAQKATOSA-N Glu-Lys-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BCYGDJXHAGZNPQ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- JHSRJMUJOGLIHK-GUBZILKMSA-N Glu-Met-Glu Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N JHSRJMUJOGLIHK-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- QJVZSVUYZFYLFQ-CIUDSAMLSA-N Glu-Pro-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O QJVZSVUYZFYLFQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- NNQDRRUXFJYCCJ-NHCYSSNCSA-N Glu-Pro-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O NNQDRRUXFJYCCJ-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- SYAYROHMAIHWFB-KBIXCLLPSA-N Glu-Ser-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O SYAYROHMAIHWFB-KBIXCLLPSA-N 0.000 description 1
- UMZHHILWZBFPGL-LOKLDPHHSA-N Glu-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O UMZHHILWZBFPGL-LOKLDPHHSA-N 0.000 description 1
- XPJBQTCXPJNIFE-ZETCQYMHSA-N Gly-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CN XPJBQTCXPJNIFE-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- BUEFQXUHTUZXHR-LURJTMIESA-N Gly-Gly-Pro zwitterion Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O BUEFQXUHTUZXHR-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- LLZXNUUIBOALNY-QWRGUYRKSA-N Gly-Leu-Lys Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN LLZXNUUIBOALNY-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- JJGBXTYGTKWGAT-YUMQZZPRSA-N Gly-Pro-Glu Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O JJGBXTYGTKWGAT-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- NSVOVKWEKGEOQB-LURJTMIESA-N Gly-Pro-Gly Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O NSVOVKWEKGEOQB-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- OCPPBNKYGYSLOE-IUCAKERBSA-N Gly-Pro-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CN OCPPBNKYGYSLOE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- SOEGEPHNZOISMT-BYPYZUCNSA-N Gly-Ser-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O SOEGEPHNZOISMT-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- ABPRMMYHROQBLY-NKWVEPMBSA-N Gly-Ser-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CO)NC(=O)CN)C(=O)O ABPRMMYHROQBLY-NKWVEPMBSA-N 0.000 description 1
- LKJCZEPXHOIAIW-HOTGVXAUSA-N Gly-Trp-Lys Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)CN LKJCZEPXHOIAIW-HOTGVXAUSA-N 0.000 description 1
- UVTSZKIATYSKIR-RYUDHWBXSA-N Gly-Tyr-Glu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UVTSZKIATYSKIR-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- 108010039334 HIV Envelope Protein gp120 Proteins 0.000 description 1
- 102000006481 HIV Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010083930 HIV Receptors Proteins 0.000 description 1
- 229940033330 HIV vaccine Drugs 0.000 description 1
- NTXIJPDAHXSHNL-ONGXEEELSA-N His-Gly-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O NTXIJPDAHXSHNL-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- SVVULKPWDBIPCO-BZSNNMDCSA-N His-Phe-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O SVVULKPWDBIPCO-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- BZAQOPHNBFOOJS-DCAQKATOSA-N His-Pro-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O BZAQOPHNBFOOJS-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- 102000008949 Histocompatibility Antigens Class I Human genes 0.000 description 1
- 241000598171 Human adenovirus sp. Species 0.000 description 1
- 241000701085 Human alphaherpesvirus 3 Species 0.000 description 1
- 206010020751 Hypersensitivity Diseases 0.000 description 1
- CWJQMCPYXNVMBS-STECZYCISA-N Ile-Arg-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N CWJQMCPYXNVMBS-STECZYCISA-N 0.000 description 1
- QYZYJFXHXYUZMZ-UGYAYLCHSA-N Ile-Asn-Asn Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N QYZYJFXHXYUZMZ-UGYAYLCHSA-N 0.000 description 1
- VQUCKIAECLVLAD-SVSWQMSJSA-N Ile-Cys-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)N VQUCKIAECLVLAD-SVSWQMSJSA-N 0.000 description 1
- HUORUFRRJHELPD-MNXVOIDGSA-N Ile-Leu-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N HUORUFRRJHELPD-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 1
- FZWVCYCYWCLQDH-NHCYSSNCSA-N Ile-Leu-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)O)N FZWVCYCYWCLQDH-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- BJECXJHLUJXPJQ-PYJNHQTQSA-N Ile-Pro-His Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N BJECXJHLUJXPJQ-PYJNHQTQSA-N 0.000 description 1
- NURNJECQNNCRBK-FLBSBUHZSA-N Ile-Thr-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O NURNJECQNNCRBK-FLBSBUHZSA-N 0.000 description 1
- WKSHBPRUIRGWRZ-KCTSRDHCSA-N Ile-Trp-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)NCC(=O)O)N WKSHBPRUIRGWRZ-KCTSRDHCSA-N 0.000 description 1
- JSLIXOUMAOUGBN-JUKXBJQTSA-N Ile-Tyr-His Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N JSLIXOUMAOUGBN-JUKXBJQTSA-N 0.000 description 1
- NSPNUMNLZNOPAQ-SJWGOKEGSA-N Ile-Tyr-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O)N NSPNUMNLZNOPAQ-SJWGOKEGSA-N 0.000 description 1
- 102100034347 Integrase Human genes 0.000 description 1
- 102100034349 Integrase Human genes 0.000 description 1
- 102000008070 Interferon-gamma Human genes 0.000 description 1
- 108010074328 Interferon-gamma Proteins 0.000 description 1
- 102000003814 Interleukin-10 Human genes 0.000 description 1
- 108090000174 Interleukin-10 Proteins 0.000 description 1
- 102000004388 Interleukin-4 Human genes 0.000 description 1
- 108090000978 Interleukin-4 Proteins 0.000 description 1
- 108010002616 Interleukin-5 Proteins 0.000 description 1
- 102000000743 Interleukin-5 Human genes 0.000 description 1
- 108090001005 Interleukin-6 Proteins 0.000 description 1
- 102000004889 Interleukin-6 Human genes 0.000 description 1
- 241000710842 Japanese encephalitis virus Species 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- KSZCCRIGNVSHFH-UWVGGRQHSA-N Leu-Arg-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(O)=O KSZCCRIGNVSHFH-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- USTCFDAQCLDPBD-XIRDDKMYSA-N Leu-Asn-Trp Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)N USTCFDAQCLDPBD-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- ILJREDZFPHTUIE-GUBZILKMSA-N Leu-Asp-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ILJREDZFPHTUIE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- OGUUKPXUTHOIAV-SDDRHHMPSA-N Leu-Glu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N OGUUKPXUTHOIAV-SDDRHHMPSA-N 0.000 description 1
- CFZZDVMBRYFFNU-QWRGUYRKSA-N Leu-His-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)NCC(O)=O CFZZDVMBRYFFNU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- YUTNOGOMBNYPFH-XUXIUFHCSA-N Leu-Pro-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O YUTNOGOMBNYPFH-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- YLMIDMSLKLRNHX-HSCHXYMDSA-N Leu-Trp-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O YLMIDMSLKLRNHX-HSCHXYMDSA-N 0.000 description 1
- VQHUBNVKFFLWRP-ULQDDVLXSA-N Leu-Tyr-Val Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 VQHUBNVKFFLWRP-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- CGHXMODRYJISSK-NHCYSSNCSA-N Leu-Val-Asp Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O CGHXMODRYJISSK-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- 239000000232 Lipid Bilayer Substances 0.000 description 1
- 241000186781 Listeria Species 0.000 description 1
- 238000003231 Lowry assay Methods 0.000 description 1
- 238000009013 Lowry's assay Methods 0.000 description 1
- FZIJIFCXUCZHOL-CIUDSAMLSA-N Lys-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN FZIJIFCXUCZHOL-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- FACUGMGEFUEBTI-SRVKXCTJSA-N Lys-Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN FACUGMGEFUEBTI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- IWWMPCPLFXFBAF-SRVKXCTJSA-N Lys-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IWWMPCPLFXFBAF-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- VSRXPEHZMHSFKU-IUCAKERBSA-N Lys-Gln-Gly Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O VSRXPEHZMHSFKU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- RZHLIPMZXOEJTL-AVGNSLFASA-N Lys-Gln-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCCCN)N RZHLIPMZXOEJTL-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- GCMWRRQAKQXDED-IUCAKERBSA-N Lys-Glu-Gly Chemical compound [NH3+]CCCC[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CCC([O-])=O)C(=O)NCC([O-])=O GCMWRRQAKQXDED-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- IMAKMJCBYCSMHM-AVGNSLFASA-N Lys-Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN IMAKMJCBYCSMHM-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- WGLAORUKDGRINI-WDCWCFNPSA-N Lys-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O WGLAORUKDGRINI-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- FHIAJWBDZVHLAH-YUMQZZPRSA-N Lys-Gly-Ser Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FHIAJWBDZVHLAH-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- GTAXSKOXPIISBW-AVGNSLFASA-N Lys-His-Gln Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N GTAXSKOXPIISBW-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- IVFUVMSKSFSFBT-NHCYSSNCSA-N Lys-Ile-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN IVFUVMSKSFSFBT-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- QOJDBRUCOXQSSK-AJNGGQMLSA-N Lys-Ile-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O QOJDBRUCOXQSSK-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 1
- PRSBSVAVOQOAMI-BJDJZHNGSA-N Lys-Ile-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN PRSBSVAVOQOAMI-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- OVAOHZIOUBEQCJ-IHRRRGAJSA-N Lys-Leu-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O OVAOHZIOUBEQCJ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- NJNRBRKHOWSGMN-SRVKXCTJSA-N Lys-Leu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O NJNRBRKHOWSGMN-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- ALGGDNMLQNFVIZ-SRVKXCTJSA-N Lys-Lys-Asp Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N ALGGDNMLQNFVIZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- JQSIGLHQNSZZRL-KKUMJFAQSA-N Lys-Lys-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCCCN)N JQSIGLHQNSZZRL-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- MEQLGHAMAUPOSJ-DCAQKATOSA-N Lys-Ser-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O MEQLGHAMAUPOSJ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- JHNOXVASMSXSNB-WEDXCCLWSA-N Lys-Thr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O JHNOXVASMSXSNB-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- BDFHWFUAQLIMJO-KXNHARMFSA-N Lys-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)O BDFHWFUAQLIMJO-KXNHARMFSA-N 0.000 description 1
- BIWVMACFGZFIEB-VFAJRCTISA-N Lys-Trp-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)O BIWVMACFGZFIEB-VFAJRCTISA-N 0.000 description 1
- SUZVLFWOCKHWET-CQDKDKBSSA-N Lys-Tyr-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O SUZVLFWOCKHWET-CQDKDKBSSA-N 0.000 description 1
- PPNCMJARTHYNEC-MEYUZBJRSA-N Lys-Tyr-Thr Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 PPNCMJARTHYNEC-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 1
- 108091054437 MHC class I family Proteins 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 241000712079 Measles morbillivirus Species 0.000 description 1
- ZAJNRWKGHWGPDQ-SDDRHHMPSA-N Met-Arg-Pro Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N ZAJNRWKGHWGPDQ-SDDRHHMPSA-N 0.000 description 1
- DBMLDOWSVHMQQN-XGEHTFHBSA-N Met-Ser-Thr Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DBMLDOWSVHMQQN-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- 101710145242 Minor capsid protein P3-RTD Proteins 0.000 description 1
- 241001092142 Molina Species 0.000 description 1
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 1
- 241000714177 Murine leukemia virus Species 0.000 description 1
- 101100364971 Mus musculus Scai gene Proteins 0.000 description 1
- 108091061960 Naked DNA Proteins 0.000 description 1
- 241000588653 Neisseria Species 0.000 description 1
- 101100342977 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) leu-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 108700001237 Nucleic Acid-Based Vaccines Proteins 0.000 description 1
- 108090001074 Nucleocapsid Proteins Proteins 0.000 description 1
- 238000011795 OF1 mouse Methods 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 241000282579 Pan Species 0.000 description 1
- 108010067902 Peptide Library Proteins 0.000 description 1
- 102100034539 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A Human genes 0.000 description 1
- OVJMCXAPGFDGMG-HKUYNNGSSA-N Phe-Gly-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O OVJMCXAPGFDGMG-HKUYNNGSSA-N 0.000 description 1
- YTGGLKWSVIRECD-JBACZVJFSA-N Phe-Trp-Glu Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 YTGGLKWSVIRECD-JBACZVJFSA-N 0.000 description 1
- 102000004160 Phosphoric Monoester Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- 108090000608 Phosphoric Monoester Hydrolases Proteins 0.000 description 1
- 241000709664 Picornaviridae Species 0.000 description 1
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 1
- KIZQGKLMXKGDIV-BQBZGAKWSA-N Pro-Ala-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 KIZQGKLMXKGDIV-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- PULPZRAHVFBVTO-DCAQKATOSA-N Pro-Glu-Arg Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O PULPZRAHVFBVTO-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- VOZIBWWZSBIXQN-SRVKXCTJSA-N Pro-Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1)C(O)=O VOZIBWWZSBIXQN-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- FEVDNIBDCRKMER-IUCAKERBSA-N Pro-Gly-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1 FEVDNIBDCRKMER-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- BWCZJGJKOFUUCN-ZPFDUUQYSA-N Pro-Ile-Gln Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O BWCZJGJKOFUUCN-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- UREQLMJCKFLLHM-NAKRPEOUSA-N Pro-Ile-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UREQLMJCKFLLHM-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- AUQGUYPHJSMAKI-CYDGBPFRSA-N Pro-Ile-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 AUQGUYPHJSMAKI-CYDGBPFRSA-N 0.000 description 1
- CLJLVCYFABNTHP-DCAQKATOSA-N Pro-Leu-Asp Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O CLJLVCYFABNTHP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- SMFQZMGHCODUPQ-ULQDDVLXSA-N Pro-Lys-Phe Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O SMFQZMGHCODUPQ-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- WOIFYRZPIORBRY-AVGNSLFASA-N Pro-Lys-Val Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O WOIFYRZPIORBRY-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- WIPAMEKBSHNFQE-IUCAKERBSA-N Pro-Met-Gly Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 WIPAMEKBSHNFQE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- WHNJMTHJGCEKGA-ULQDDVLXSA-N Pro-Phe-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O WHNJMTHJGCEKGA-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- NAIPAPCKKRCMBL-JYJNAYRXSA-N Pro-Pro-Phe Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CC=CC=C1 NAIPAPCKKRCMBL-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- LNICFEXCAHIJOR-DCAQKATOSA-N Pro-Ser-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O LNICFEXCAHIJOR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- SXJOPONICMGFCR-DCAQKATOSA-N Pro-Ser-Lys Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O SXJOPONICMGFCR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- QHSSUIHLAIWXEE-IHRRRGAJSA-N Pro-Tyr-Asn Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O QHSSUIHLAIWXEE-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- VDHGTOHMHHQSKG-JYJNAYRXSA-N Pro-Val-Phe Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@@H]1CCCN1)C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(O)=O VDHGTOHMHHQSKG-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- FIODMZKLZFLYQP-GUBZILKMSA-N Pro-Val-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FIODMZKLZFLYQP-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- 229940124158 Protease/peptidase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 101710188315 Protein X Proteins 0.000 description 1
- 101000933967 Pseudomonas phage KPP25 Major capsid protein Proteins 0.000 description 1
- CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N Pyrimidine Chemical compound C1=CN=CN=C1 CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012564 Q sepharose fast flow resin Substances 0.000 description 1
- 241001454523 Quillaja saponaria Species 0.000 description 1
- 235000009001 Quillaja saponaria Nutrition 0.000 description 1
- 102000001218 Rec A Recombinases Human genes 0.000 description 1
- 108010055016 Rec A Recombinases Proteins 0.000 description 1
- 241000607142 Salmonella Species 0.000 description 1
- 241000710961 Semliki Forest virus Species 0.000 description 1
- YMTLKLXDFCSCNX-BYPYZUCNSA-N Ser-Gly-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O YMTLKLXDFCSCNX-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- DOSZISJPMCYEHT-NAKRPEOUSA-N Ser-Ile-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O DOSZISJPMCYEHT-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- RXSWQCATLWVDLI-XGEHTFHBSA-N Ser-Met-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O RXSWQCATLWVDLI-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- GZGFSPWOMUKKCV-NAKRPEOUSA-N Ser-Pro-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CO GZGFSPWOMUKKCV-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- NERYDXBVARJIQS-JYBASQMISA-N Ser-Trp-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)NC(=O)[C@H](CO)N)O NERYDXBVARJIQS-JYBASQMISA-N 0.000 description 1
- 241000607768 Shigella Species 0.000 description 1
- 241000710960 Sindbis virus Species 0.000 description 1
- 230000024932 T cell mediated immunity Effects 0.000 description 1
- 241000906446 Theraps Species 0.000 description 1
- IGROJMCBGRFRGI-YTLHQDLWSA-N Thr-Ala-Ala Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O IGROJMCBGRFRGI-YTLHQDLWSA-N 0.000 description 1
- VGYBYGQXZJDZJU-XQXXSGGOSA-N Thr-Glu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O VGYBYGQXZJDZJU-XQXXSGGOSA-N 0.000 description 1
- BIENEHRYNODTLP-HJGDQZAQSA-N Thr-Glu-Met Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)N)O BIENEHRYNODTLP-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- LKEKWDJCJSPXNI-IRIUXVKKSA-N Thr-Glu-Tyr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 LKEKWDJCJSPXNI-IRIUXVKKSA-N 0.000 description 1
- YJCVECXVYHZOBK-KNZXXDILSA-N Thr-Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)N YJCVECXVYHZOBK-KNZXXDILSA-N 0.000 description 1
- KRDSCBLRHORMRK-JXUBOQSCSA-N Thr-Lys-Ala Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O KRDSCBLRHORMRK-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 1
- UUSQVWOVUYMLJA-PPCPHDFISA-N Thr-Lys-Ile Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O UUSQVWOVUYMLJA-PPCPHDFISA-N 0.000 description 1
- NDXSOKGYKCGYKT-VEVYYDQMSA-N Thr-Pro-Asp Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O NDXSOKGYKCGYKT-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 1
- MROIJTGJGIDEEJ-RCWTZXSCSA-N Thr-Pro-Pro Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 MROIJTGJGIDEEJ-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- YGCDFAJJCRVQKU-RCWTZXSCSA-N Thr-Pro-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O YGCDFAJJCRVQKU-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- AHERARIZBPOMNU-KATARQTJSA-N Thr-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O AHERARIZBPOMNU-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- VBMOVTMNHWPZJR-SUSMZKCASA-N Thr-Thr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VBMOVTMNHWPZJR-SUSMZKCASA-N 0.000 description 1
- CJEHCEOXPLASCK-MEYUZBJRSA-N Thr-Tyr-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)[C@H](O)C)CC1=CC=C(O)C=C1 CJEHCEOXPLASCK-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 1
- BKVICMPZWRNWOC-RHYQMDGZSA-N Thr-Val-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O BKVICMPZWRNWOC-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- MNYNCKZAEIAONY-XGEHTFHBSA-N Thr-Val-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MNYNCKZAEIAONY-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- MVHHTXAUJCIOMZ-WDSOQIARSA-N Trp-Arg-Lys Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N MVHHTXAUJCIOMZ-WDSOQIARSA-N 0.000 description 1
- OKAMOYTUQMIFJO-JBACZVJFSA-N Trp-Glu-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)N)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 OKAMOYTUQMIFJO-JBACZVJFSA-N 0.000 description 1
- SNJAPSVIPKUMCK-NWLDYVSISA-N Trp-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SNJAPSVIPKUMCK-NWLDYVSISA-N 0.000 description 1
- DVWAIHZOPSYMSJ-ZVZYQTTQSA-N Trp-Glu-Val Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 DVWAIHZOPSYMSJ-ZVZYQTTQSA-N 0.000 description 1
- RRXPAFGTFQIEMD-IVJVFBROSA-N Trp-Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)N RRXPAFGTFQIEMD-IVJVFBROSA-N 0.000 description 1
- XOLLWQIBBLBAHQ-WDSOQIARSA-N Trp-Pro-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O XOLLWQIBBLBAHQ-WDSOQIARSA-N 0.000 description 1
- WTRQBSSQBKRNKV-MNSWYVGCSA-N Trp-Thr-Tyr Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)[C@H](O)C)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 WTRQBSSQBKRNKV-MNSWYVGCSA-N 0.000 description 1
- GQYPNFIFJRNDPY-ONUFPDRFSA-N Trp-Trp-Thr Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=3C4=CC=CC=C4NC=3)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(O)=O)=CNC2=C1 GQYPNFIFJRNDPY-ONUFPDRFSA-N 0.000 description 1
- NIHNMOSRSAYZIT-BPNCWPANSA-N Tyr-Ala-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 NIHNMOSRSAYZIT-BPNCWPANSA-N 0.000 description 1
- ZNFPUOSTMUMUDR-JRQIVUDYSA-N Tyr-Asn-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O ZNFPUOSTMUMUDR-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 1
- UXUFNBVCPAWACG-SIUGBPQLSA-N Tyr-Gln-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N UXUFNBVCPAWACG-SIUGBPQLSA-N 0.000 description 1
- NZFCWALTLNFHHC-JYJNAYRXSA-N Tyr-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 NZFCWALTLNFHHC-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- YSGAPESOXHFTQY-IHRRRGAJSA-N Tyr-Met-Asp Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N YSGAPESOXHFTQY-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- NVZVJIUDICCMHZ-BZSNNMDCSA-N Tyr-Phe-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O NVZVJIUDICCMHZ-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- OJCISMMNNUNNJA-BZSNNMDCSA-N Tyr-Tyr-Asp Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 OJCISMMNNUNNJA-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- 206010046865 Vaccinia virus infection Diseases 0.000 description 1
- KKHRWGYHBZORMQ-NHCYSSNCSA-N Val-Arg-Glu Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N KKHRWGYHBZORMQ-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- AUMNPAUHKUNHHN-BYULHYEWSA-N Val-Asn-Asp Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N AUMNPAUHKUNHHN-BYULHYEWSA-N 0.000 description 1
- PVPAOIGJYHVWBT-KKHAAJSZSA-N Val-Asn-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O PVPAOIGJYHVWBT-KKHAAJSZSA-N 0.000 description 1
- HHSILIQTHXABKM-YDHLFZDLSA-N Val-Asp-Phe Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(O)=O HHSILIQTHXABKM-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- VFOHXOLPLACADK-GVXVVHGQSA-N Val-Gln-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](C(C)C)N VFOHXOLPLACADK-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- AGKDVLSDNSTLFA-UMNHJUIQSA-N Val-Gln-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N AGKDVLSDNSTLFA-UMNHJUIQSA-N 0.000 description 1
- VCAWFLIWYNMHQP-UKJIMTQDSA-N Val-Glu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N VCAWFLIWYNMHQP-UKJIMTQDSA-N 0.000 description 1
- MDYSKHBSPXUOPV-JSGCOSHPSA-N Val-Gly-Phe Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)N MDYSKHBSPXUOPV-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- LAYSXAOGWHKNED-XPUUQOCRSA-N Val-Gly-Ser Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O LAYSXAOGWHKNED-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- PTFPUAXGIKTVNN-ONGXEEELSA-N Val-His-Gly Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)NCC(=O)O)N PTFPUAXGIKTVNN-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- BZWUSZGQOILYEU-STECZYCISA-N Val-Ile-Tyr Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 BZWUSZGQOILYEU-STECZYCISA-N 0.000 description 1
- NZYNRRGJJVSSTJ-GUBZILKMSA-N Val-Ser-Val Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O NZYNRRGJJVSSTJ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 1
- 108700005077 Viral Genes Proteins 0.000 description 1
- 108010067390 Viral Proteins Proteins 0.000 description 1
- 108020000999 Viral RNA Proteins 0.000 description 1
- 241000710772 Yellow fever virus Species 0.000 description 1
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical class [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UZQJVUCHXGYFLQ-AYDHOLPZSA-N [(2s,3r,4s,5r,6r)-4-[(2s,3r,4s,5r,6r)-4-[(2r,3r,4s,5r,6r)-4-[(2s,3r,4s,5r,6r)-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-4-[(2s,3r,4s,5s,6r)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxan-2-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hy Chemical compound O([C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]([C@@H]1O)O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]([C@@H]1O)O[C@H]1CC[C@]2(C)[C@H]3CC=C4[C@@]([C@@]3(CC[C@H]2[C@@]1(C=O)C)C)(C)CC(O)[C@]1(CCC(CC14)(C)C)C(=O)O[C@H]1[C@@H]([C@@H](O[C@H]2[C@@H]([C@@H](O[C@H]3[C@@H]([C@@H](O[C@H]4[C@@H]([C@@H](O[C@H]5[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O5)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O4)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O3)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O UZQJVUCHXGYFLQ-AYDHOLPZSA-N 0.000 description 1
- FHICGHSMIPIAPL-HDYAAECPSA-N [2-[3-[6-[3-[(5R,6aS,6bR,12aR)-10-[6-[2-[2-[4,5-dihydroxy-3-(3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl)oxyoxan-2-yl]ethoxy]ethyl]-3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl]oxy-5-hydroxy-2,2,6a,6b,9,9,12a-heptamethyl-1,3,4,5,6,6a,7,8,8a,10,11,12,13,14b-tetradecahydropicene-4a-carbonyl]peroxypropyl]-5-[[5-[8-[3,5-dihydroxy-4-(3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl)oxyoxan-2-yl]octoxy]-3,4-dihydroxy-6-methyloxan-2-yl]methoxy]-3,4-dihydroxyoxan-2-yl]propoxymethyl]-5-hydroxy-3-[(6S)-6-hydroxy-2,6-dimethylocta-2,7-dienoyl]oxy-6-methyloxan-4-yl] (2E,6S)-6-hydroxy-2-(hydroxymethyl)-6-methylocta-2,7-dienoate Chemical compound C=C[C@@](C)(O)CCC=C(C)C(=O)OC1C(OC(=O)C(\CO)=C\CC[C@](C)(O)C=C)C(O)C(C)OC1COCCCC1C(O)C(O)C(OCC2C(C(O)C(OCCCCCCCCC3C(C(OC4C(C(O)C(O)CO4)O)C(O)CO3)O)C(C)O2)O)C(CCCOOC(=O)C23C(CC(C)(C)CC2)C=2[C@@]([C@]4(C)CCC5C(C)(C)C(OC6C(C(O)C(O)C(CCOCCC7C(C(O)C(O)CO7)OC7C(C(O)C(O)CO7)O)O6)O)CC[C@]5(C)C4CC=2)(C)C[C@H]3O)O1 FHICGHSMIPIAPL-HDYAAECPSA-N 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 108010070783 alanyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 208000026935 allergic disease Diseases 0.000 description 1
- 230000007815 allergy Effects 0.000 description 1
- 229910052782 aluminium Inorganic materials 0.000 description 1
- XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N aluminium Chemical compound [Al] XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ILRRQNADMUWWFW-UHFFFAOYSA-K aluminium phosphate Chemical compound O1[Al]2OP1(=O)O2 ILRRQNADMUWWFW-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- 238000005571 anion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 150000001450 anions Chemical class 0.000 description 1
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 description 1
- 230000000840 anti-viral effect Effects 0.000 description 1
- 230000008349 antigen-specific humoral response Effects 0.000 description 1
- 108010093581 aspartyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010038633 aspartylglutamate Proteins 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 229960000074 biopharmaceutical Drugs 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 1
- 238000005898 carboxamidation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 1
- 238000005277 cation exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 125000002091 cationic group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001768 cations Chemical class 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 108091092356 cellular DNA Proteins 0.000 description 1
- 239000003638 chemical reducing agent Substances 0.000 description 1
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 1
- 229960001265 ciclosporin Drugs 0.000 description 1
- 238000005352 clarification Methods 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- NKLPQNGYXWVELD-UHFFFAOYSA-M coomassie brilliant blue Chemical compound [Na+].C1=CC(OCC)=CC=C1NC1=CC=C(C(=C2C=CC(C=C2)=[N+](CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C=2C=CC(=CC=2)N(CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C=C1 NKLPQNGYXWVELD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 description 1
- 229940097362 cyclodextrins Drugs 0.000 description 1
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 1
- 230000016396 cytokine production Effects 0.000 description 1
- 230000001461 cytolytic effect Effects 0.000 description 1
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 1
- GVJHHUAWPYXKBD-UHFFFAOYSA-N d-alpha-tocopherol Natural products OC1=C(C)C(C)=C2OC(CCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C)(C)CCC2=C1C GVJHHUAWPYXKBD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000000326 densiometry Methods 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 230000001066 destructive effect Effects 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 230000003828 downregulation Effects 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 241001493065 dsRNA viruses Species 0.000 description 1
- 235000013345 egg yolk Nutrition 0.000 description 1
- 210000002969 egg yolk Anatomy 0.000 description 1
- 238000005538 encapsulation Methods 0.000 description 1
- 238000001125 extrusion Methods 0.000 description 1
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 1
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 1
- 239000013020 final formulation Substances 0.000 description 1
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 1
- 230000037433 frameshift Effects 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 1
- 238000001476 gene delivery Methods 0.000 description 1
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 1
- 108010090037 glycyl-alanyl-isoleucine Proteins 0.000 description 1
- 108010028188 glycyl-histidyl-serine Proteins 0.000 description 1
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 1
- 108010037850 glycylvaline Proteins 0.000 description 1
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 1
- 229940029575 guanosine Drugs 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 210000002443 helper t lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000002949 hemolytic effect Effects 0.000 description 1
- 208000006454 hepatitis Diseases 0.000 description 1
- 231100000283 hepatitis Toxicity 0.000 description 1
- 239000000833 heterodimer Substances 0.000 description 1
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 108010025306 histidylleucine Proteins 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 238000004191 hydrophobic interaction chromatography Methods 0.000 description 1
- 239000013315 hypercross-linked polymer Substances 0.000 description 1
- 230000002519 immonomodulatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000007124 immune defense Effects 0.000 description 1
- 230000008076 immune mechanism Effects 0.000 description 1
- 238000010324 immunological assay Methods 0.000 description 1
- 230000001024 immunotherapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 238000010949 in-process test method Methods 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 239000011261 inert gas Substances 0.000 description 1
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 239000002198 insoluble material Substances 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 1
- 229960003130 interferon gamma Drugs 0.000 description 1
- 239000013067 intermediate product Substances 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000001788 irregular Effects 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 108010027338 isoleucylcysteine Proteins 0.000 description 1
- 108010078274 isoleucylvaline Proteins 0.000 description 1
- GZQKNULLWNGMCW-PWQABINMSA-N lipid A (E. coli) Chemical compound O1[C@H](CO)[C@@H](OP(O)(O)=O)[C@H](OC(=O)C[C@@H](CCCCCCCCCCC)OC(=O)CCCCCCCCCCCCC)[C@@H](NC(=O)C[C@@H](CCCCCCCCCCC)OC(=O)CCCCCCCCCCC)[C@@H]1OC[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](OC(=O)C[C@H](O)CCCCCCCCCCC)[C@@H](NC(=O)C[C@H](O)CCCCCCCCCCC)[C@@H](OP(O)(O)=O)O1 GZQKNULLWNGMCW-PWQABINMSA-N 0.000 description 1
- 229920006008 lipopolysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 1
- 230000003211 malignant effect Effects 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- 150000002741 methionine derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 125000001360 methionine group Chemical group N[C@@H](CCSC)C(=O)* 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 1
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 1
- 230000012223 nuclear import Effects 0.000 description 1
- 125000002347 octyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 1
- 101150080184 p17 gene Proteins 0.000 description 1
- 239000000137 peptide hydrolase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000000144 pharmacologic effect Effects 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- WTJKGGKOPKCXLL-RRHRGVEJSA-N phosphatidylcholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCCCCCCC=CCCCCCCCC WTJKGGKOPKCXLL-RRHRGVEJSA-N 0.000 description 1
- 229920002627 poly(phosphazenes) Polymers 0.000 description 1
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 1
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 1
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 description 1
- 229940068965 polysorbates Drugs 0.000 description 1
- 230000002028 premature Effects 0.000 description 1
- 229940023867 prime-boost vaccine Drugs 0.000 description 1
- 108010031719 prolyl-serine Proteins 0.000 description 1
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 1
- 230000004224 protection Effects 0.000 description 1
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 description 1
- 235000004252 protein component Nutrition 0.000 description 1
- 229940023143 protein vaccine Drugs 0.000 description 1
- 230000002797 proteolythic effect Effects 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- 101150079601 recA gene Proteins 0.000 description 1
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 108010071207 serylmethionine Proteins 0.000 description 1
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 1
- 239000002195 soluble material Substances 0.000 description 1
- 238000000527 sonication Methods 0.000 description 1
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 1
- 210000004989 spleen cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 description 1
- 238000004659 sterilization and disinfection Methods 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 1
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 239000008348 synthetic phosphatidyl choline Substances 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 229960000984 tocofersolan Drugs 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001529453 unidentified herpesvirus Species 0.000 description 1
- 229940125575 vaccine candidate Drugs 0.000 description 1
- 208000007089 vaccinia Diseases 0.000 description 1
- 108010009962 valyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 1
- 230000029812 viral genome replication Effects 0.000 description 1
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 1
- 230000029302 virus maturation Effects 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
- 229940051021 yellow-fever virus Drugs 0.000 description 1
- 229910052725 zinc Chemical class 0.000 description 1
- 239000011701 zinc Chemical class 0.000 description 1
- GVJHHUAWPYXKBD-IEOSBIPESA-N α-tocopherol Chemical compound OC1=C(C)C(C)=C2O[C@@](CCC[C@H](C)CCC[C@H](C)CCCC(C)C)(C)CCC2=C1C GVJHHUAWPYXKBD-IEOSBIPESA-N 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K19/00—Hybrid peptides, i.e. peptides covalently bound to nucleic acids, or non-covalently bound protein-protein complexes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
- A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
- A61P31/18—Antivirals for RNA viruses for HIV
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
- A61P37/04—Immunostimulants
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/64—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the architecture of the carrier-antigen complex, e.g. repetition of carrier-antigen units
- A61K2039/645—Dendrimers; Multiple antigen peptides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2740/00—Reverse transcribing RNA viruses
- C12N2740/00011—Details
- C12N2740/10011—Retroviridae
- C12N2740/16011—Human Immunodeficiency Virus, HIV
- C12N2740/16211—Human Immunodeficiency Virus, HIV concerning HIV gagpol
- C12N2740/16222—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2740/00—Reverse transcribing RNA viruses
- C12N2740/00011—Details
- C12N2740/10011—Retroviridae
- C12N2740/16011—Human Immunodeficiency Virus, HIV
- C12N2740/16311—Human Immunodeficiency Virus, HIV concerning HIV regulatory proteins
- C12N2740/16322—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
Abstract
본 발명은 면역원성 조성물 및 백신에 유용한 Gag, Pol 및 Nef의 신규한 HIV 폴리펩티드 및 폴리누클레오티드 융합체에 관한 것이다. 특히, 본 발명은 Nef 또는 이의 면역원성 단편, 및 p17 Gag 및/또는 p24 Gag 또는 이의 면역원성 단편을 포함하고, p17 및 p24 Gag 둘 모두가 존재하는 경우, 이들 사이에 하나 이상의 HIV 항원 또는 면역원성 단편이 존재하는 폴리펩티드에 관한 것이다. 또한, 폴리펩티드는 Pol 또는 RT 또는 이의 면역원성 단편을 포함할 수 있다.
Description
본 발명은 신규한 HIV 폴리펩티드 작제물, 이의 의약에서의 용도, 이를 포함하는 약제 조성물 및 이들의 제조 방법에 관한 것이다. 또한, 본 발명은 폴리펩티드를 엔코딩하는 폴리누클레오티드에 관한 것이다. 특히, 본 발명은 HIV-1 Nef 및 HIV-1 Gag 또는 이들의 단편을 포함하는 융합 단백질, 및 이를 엔코딩하는 폴리누클레오티드에 관한 것이다. 보다 특히, 본 발명은 HIV-1 Nef, HIV-1 Pol 및 HIV-1 Gag 단백질 또는 이들의 단편을 포함하는 융합 단백질 및 이를 엔코딩하는 폴리누클레오티드에 관한 것이다.
HIV-1은 전세계적으로 주요 건강 관련 문제 중 하나로서 간주되는 후천성 면역결핍증(AIDS)의 주원인이다. HIV 감염의 예방 및/또는 치료를 위한 백신이 필요하다.
HIV-1은 레트로비리디아에(Retroviridiae) 류의 RNA 바이러스이다. HIV 게놈은 하기 세 부류로 나뉘는 9개 이상의 단백질을 엔코딩한다: 주 구조적 단백질인 Gag, Pol 및 Env, 조절성 단백질인 Tat 및 Rev, 및 보조 단백질인 Vpu, Vpr, Vif 및 Nef. HIV 게놈은 모든 레트로바이러스의 5'LTR-gag-pol-env-LTR3' 조직화 를 나타낸다.
HIV 엔벨로프(envelope) 글리코단백질(glycoprotein) gp 120은 숙주 세포에 부착하기 위해 사용되는 바이러스 단백질이다. 이러한 부착은 CD4 및 두개의 케모킨 수용체 CCR-5 또는 CXCR-4 중 어느 하나로서 공지된 헬퍼 T 세포 및 마크로파아지의 두개의 표면 분자에 결합하므로써 매개된다. gp120 단백질은 먼저 보다 큰 전구 분자(gp160)로서 발현되고, 이후, 후번역에 의해 분해되어 gp120 및 gp41을 생성한다. gp120 단백질은 gp41 분자로의 연결에 의해 비리온의 표면 상에 보유되고, 이것이 바이러스 멤브레인에 삽입된다.
gp120 단백질은 항체를 중화시키는 것을 주 목적으로 하지만, 불행하게도 단백질의 최고 면역원성 영역(V3 루프)은 또한 단백질의 최고 가변성 부분이다. 그러므로, 항체의 중화를 유도하기 위한 백신 항원으로서 gp120(또는 이의 전구 gp160)의 사용은 광범위한 보호 백신에 대해서는 사용이 제한된 것으로 여겨진다. 또한, gp120 단백질은 세포독성 T 림프구(CTL)에 의해 인지되는 에피토프를 함유한다. 이러한 이펙터(effector) 세포는 바이러스 감염된 세포를 제거할 수 있으며, 이에 따라 제 2의 주 항바이러스 면역 메카니즘을 구성한다. 항체를 중화시키는 표적 영역과 대조적으로, 일부 CTL 에피토프는 상이한 HIV 스트레인(strain) 중에서 상대적으로 보존되는 것으로 보인다. 이러한 이유로 gp120 및 gp160은 세포 매개된 면역 반응(특히 CTL)을 유도하는 것을 목표로 하는 백신에서 유용한 항원 성분이 될 수 있다.
HIV-1의 비엔벨로프(non-envelope) 단백질은 예를 들어 gag 및 pol 유전자의 생성물과 같은 내부 구조적 단백질 및 Rev, Nef, Vif 및 Tat와 같은 그 밖의 비구조적 단백질을 포함한다[참조: Green et al., New England J. Med, 324, 5, 308 et seq (1991) and Bryant et al. (Ed. Pizzo), Pediatr. Infect. Dis. J., 11, 5, 390 et seq (1992)].
HIV NeF는 초기 단백질이다. 즉, 감염시에 초기에, 그리고 구조적 단백질의 부재시에 발현된다.
Nef 유전자는 몇몇 활성을 지니는 것으로 나타난 초기 보조 HIV 단백질을 엔코딩한다. 예를 들어, Nef 단백질은 그 기능의 생물학적 중요성이 검토되고 있지만, 세포 표면으로부터 CD4, HIV 수용체 및 MHC 클래스 I 분자의 하향 조절을 유발하는 것으로 알려져 있다. 또한, Nef는 T 세포의 시그널 경로와 상호작용하여 활성 상태를 유도하고, 이에 따라 보다 효과적인 유전자 발현을 조장할 수 있다. 몇몇 HIV 분리물은 이러한 영역에서 변이가 있는데, 이러한 변이는 기능성 단백질을 엔코딩하지 못하도록 하여 생체내 복제 및 발병에 있어서 심각하게 불리하게 된다.
Gag 유전자는 전구 폴리단백질로서 번역되고 이것이 프로테아제로 분해되어 매트릭스 단백질(p17), 캡시드(p24), 누클레오캡시드(p9), p6 및 두개의 스페이스 펩티드인, p2 및 p1을 포함하는 생성물을 형성한다.
Gag 유전자는 비스플라이싱된(unspliced) 바이러스 mRNA로부터 발현되는 p55로 불리우는 55kD Gag 전구 단백질을 야기시킨다. 번역 동안에, p55의 N 말단은 미리스토일화되어(myristolyated), 세포 멤브레인의 세포질과의 결합을 유발시킨다. 멤브레인 결합된 Gag 폴리단백질은 감염된 세포의 표면으로부터 바이러스 입 자의 버딩(budding)을 유발시키는 그 밖의 바이러스 및 세포 단백질과 함께 바이러스 게놈 RNA의 두개의 복사체를 보충한다. 버딩후, p55는 바이러스 성숙의 과정 동안에 바이러스 엔코딩된 프로테아제(pol 유전자의 생성물)에 의해 MA(매트릭스 [p17]), CA(캡시드 [p24]), NC(누클레오티드캡시드[p9]) 및 p6으로 명명되는 4개의 보다 작은 단백질로 분해된다.
3개의 주요 Gag 단백질 이외에, 모든 Gag 전구체는 몇몇 그 밖의 영역을 함유하며, 이들은 분해되어 다양한 크기의 펩티드로서 비리온으로 잔류한다. 이러한 단백질은 상이한 역할을 하는데, 예를 들어, p2 단백질은 프로테아제의 활성을 조절하는 데 있어서 의도한 역할을 하고, 단백질 분해 과정의 올바른 타이밍에 기여한다.
p17(MA) 폴리펩티드는 p55의 N 말단의 미리스토일화된 말단으로부터 유래된다. 대부분의 MA 분자는 비리온 지질 이층의 내부 표면에 부착되어 잔류하여 입자를 안정화시킨다. MA의 서브셋은 비리온의 보다 심층 내측에서 보충되며, 여기에서 착물의 일부가 되어 바이러스 DNA를 핵까지 호위한다. 이러한 MA 분자는, MA에 대한 핵친화성 시그널이 세포 핵 수입기(cellular nuclear import machinery)에 의해 인지되기 때문에 바이러스 게놈의 핵 전달을 용이하게 한다. 이러한 현상은 HIV가 레트로바이러스에 대해 특이적인 특성인 비분할 세포를 감염되게 한다.
p24(CA) 단백질은 바이러스 입자의 원추형 코어를 형성한다. 시클로필린 A는 HIV 입자로의 혼입을 유도하는 p55의 p24 영역과 상호작용하는 것으로 입증되었다. Gag와 시클로필린 A간의 상호작용은 필수적인데, 그 이유는 시클로스포린 A에 의한 이러한 상호작용의 방해가 바이러스 복제를 억제하기 때문이다.
Gag의 NC 영역은 소위 HIV 패키징 시그널을 특이적으로 인식하는 것을 담당한다. 패키징 시그널은 바이러스 RNA의 5'말단 근처에 위치한 4개의 스템 루프(stem loop) 구조로 이루어지며, 이종 RNA의 HIV-1 비리온으로의 혼입을 매개하기에 충분하다. NC는 두개의 징크-핑거 모티프(zinc-finger motif)에 의해 매개되는 상호작용을 통해 패키징 시그널에 결합한다. 또한, NC는 역전사를 용이하게 한다.
p6 폴리펩티드 영역은 p55 Gag과 보조 단백질 Vpr 간의 상호작용을 매개하여 Vpr의 어셈블링 비리온으로의 혼입을 유도한다. 또한, p6 영역은 감염된 세포로부터 버딩 비리온의 효과적인 방출을 위해 요구되는 소위 레이트 도메인(late domain)을 함유한다.
Pol 유전자는 바이러스 DNA의 세포 DNA로의 인테그레이션(integration)에 요구되는 RT 및 인테그라제 단백질인, 초기 감염시에 바이러스에 의해 요구되는 두개의 활성을 함유하는 두개의 단백질을 엔코딩한다. Pol의 일차 생성물은 비리온 프로테아제에 의해 분해되어 DNA 합성에 필요한 활성(RNA 및 DNA 의존성 DNA 폴리머라제 활성 뿐만 아니라 RN아제 H 기능)을 포함하는 아미노 말단 RT 펩티드 및 카르복시 말단 인테그라제 단백질을 생성한다. HIV RT는 카르복시 말단 RN아제 H 도메인이 결여된 분해 생성물(p51) 및 전장 RT(p66)의 헤테로이량체이다.
RT는 레트로바이러스 게놈에 의해 엔코딩된 가장 잘 보존된 단백질 중 하나이다. RT의 두가지 주요 활성은 DNA Pol 및 리보누클레아제 H이다. RT의 DNA Pol 활성은 템플레이트로서 상호교체가능하게 RNA 및 DNA를 사용하고, 유사한 모든 공 지된 DNA 폴리머라제는 다시 DNA 합성을 개시할 수 없지만 프라이머(RAN)로서 작용하는 예비 존재 분자를 필요로 한다.
모든 RT 단백질내 고유의 RN아제 H 활성은 DNA 합성이 진행함에 따라 RNA 게놈 분리를 복제함에 있어서 초기에 중요한 역할을 한다. 모든 RNA-DNA 하이브리드 분자로부터 RNA가 선택적으로 열화된다. 구조적으로, 폴리머라제 및 리보 H는 상기 Pol의 아미노산 2/3을 커버하는 Pol을 지닌 분리된 비중첩 도메인을 점유한다.
p66 촉매적 서브유닛은 5개의 별개의 서브유닛으로 폴딩된다(folded). 이러한 아미노산 말단 23은 RT 활성을 갖는 부분을 지닌다. 이에 대한 카르복시 말단이 RN아제 H 도메인이다.
WO 03/025003은 HIV-1 p17/24 Gag, Nef 및 RT를 엔코딩하는 DNA 작제물을 기술하고 있으며, 여기에서 DNA 서열은 고도로 발현된 사람 유전자를 닮도록 코돈 최적화될 수 있다. 이러한 작제물은 DNA 백신에 유용하다.
다중 HIV 항원을 함유하는 융합 단백질, 예컨대 WO 99/16884에 기술된 바와 같은 Nef-Tat 융합체는 HIV에 대한 백신 후보물질로서 제안되었다. 그러나, 융합 단백질은 직접적으로 생성되는 것이 아니며, 따라서 원시 단백질에 상응하지 않기 때문에 이들을 발현시키는 데 어려움이 있을 수 있다. 전사 수준, 또는 추가의 다운스트림(downstream)에서도 어려움이 있을 수 있다. 또한, 약제학적으로 허용되는 조성물로 직접 포뮬레이션(formulation)하지 못할 수 있다. 특히, 함께 융합된 다중 항원을 포함하는 HIV 백신에 대한 주 접근방법은 폴리펩티드 융합 단백질보다는 DNA 또는 생벡터(live vector)이다.
본 발명은 HIV 감염 및 AIDS의 예방 및 치료를 위한 백신에 사용하기 위한 신규한 작제물을 제공한다.
일면에서, 본 발명은 Nef 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체 및 p17 Gag 및/또는 p24 Gag 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체를 포함하며, p17 및 p24 Gag가 존재하는 경우, 이들 사이에 하나 이상의 HIV 항원 및 면역원성 단편이 존재하는 폴리펩티드를 제공한다.
본원에서 기술된 바와 같은 작제물 및 조성물에 있어서, Nef는 바람직하게는 전장(full-length) Nef이다.
본 발명에 따른 작제물에 있어서, p17 Gag 및 p24 Gag는 바람직하게는 각각 전장 p17 및 p24이다.
일 구체예에서, 폴리펩티드는 p17 및 p24 Gag 둘 모두 또는 이들의 면역원성 단편을 포함한다. 이러한 작제물에 있어서, p24 Gag 성분 및 p17 Gag 성분은 Nef 및/또는 RT 또는 이들의 면역원성 단편 또는 유도체와 같은 하나 이상의 추가의 HIV 항원 또는 면역원성 단편에 의해 분리된다.
다르게는, p17 또는 p24 Gag가 독립적으로 제공될 수 있다. 따라서, 본 발명은 또한 (i) Nef 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체 및 p17 Gag 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체를 포함하는 폴리펩티드 및 (ii) p24 Gag 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체를 포함하거나, (i) Nef 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체 및 p24 Gag 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체를 포함하는 폴리펩티드, 및 (ii) p17 Gag 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체를 포함하는 조성물을 제공한다.
또 다른 구체예에서, 본 발명에 따른 폴리펩티드 작제물은 Pol 또는 Pol의 유도체, 예컨대 RT 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체를 추가로 포함한다. 본 발명에 사용하기에 적합한 RT의 특정 단편은 RT가 C 말단에서 절두된 단편, 바람직하게는 카르복시 말단 RN아제 H 도메인이 결여되어 있는 말단이다. 카르복시 말단 RN아제 H 도메인이 결여되어 있는 이러한 단편 중 하나는 본원에 기술된 p51 단편이다.
바람직하게는, 본원에 기술된 융합 단백질에서 RT 또는 면역원성 단편은 p66RT 또는 p51 RT이다.
본 발명에 따른 융합 단백질 또는 조성물의 RT 성분은 592 위치에서의 변이, 또는 HXB2 이외의 스트레인에서의 동등한 변이를 포함하거나 포함하지 않아, 메티오닌이 또 다른 잔기, 예컨대 리신으로 변이되므로써 제거된다. 이러한 변이의 목적은 원핵 발현 시스템에서 내부 개시 자리로서 작용하는 자리를 제거하는 것이다.
RT 성분 또한, 또는 다르게는, 효소 활성(역전사효소)을 제거하기 위한 변이를 포함한다. 따라서, K231이 W 대신에 존재할 수 있다.
p24 및 RT를 포함하는 본 발명에 따른 융합 단백질에 있어서, p24가 작제물에서 RT에 선행하는 것이 바람직할 수 있는 데, 그 이유는 항원이 E.coli 에서 단독으로 발현되는 경우에, RT에 비해 p24의 발현이 보다 양호하게 관찰되기 때문이다.
본 발명에 따른 바람직한 작제물은 하기를 포함한다:
1. P24-RT-Nef-pl7
2. p24-RT*-Nef-pl7
3. p24-p51RT-Nef-pl7
4. p24-p51RT*-Nef-pl7
5. pl7-p51RT-Nef
6. pl7-p51RT*-Nef
7. Nef-pl7
8. 링커를 지닌 Nef-pl7
9. pl7-Nef
10. 링커를 지닌 pl7-Nef
*는 리신으로의 RT 메티오닌592 변이를 나타낸다.
상기 기재된 작제물에 포함되는 링커는 함께 연결되는 두개의 융합 파트너 간의 잠재적 상호작용을 감소시키기 위한 임의의 짧은 아미노산 서열일 수 있다. 링커는 예를 들어 4 내지 10개의 아미노산 길이일 수 있다. 예를 들어, 본원의 실시예에서 기술된 GSGGGP 서열과 같은 6개의 아미노산 서열일 수 있다.
또다른 일면에서, 본 발명은 4개 이상의 HIV 항원 또는 면역원성 단편을 포함하는 HIV 항원의 융합 단백질로서, 4개의 항원 또는 단편이 Nef, Pol 및 Gag이거나, 이로부터 유래되는 융합 단백질을 제공한다. 바람직하게는, Gag는 융합체중 하나 이상의 다른 항원에 의해 분리되는 두개의 별개 성분으로서 존재한다. 바람직하게는, Nef는 전장 Nef이다. 바람직하게는, Pol은 p66 또는 p51RT이다. 바람직하게는, Gag는 p17 및 p24 Gag이다. 본 발명의 일면에서 융합체의 항원 성분의 또 다른 바람직한 특징 및 특성은 본원에서 기술되는 바와 같다.
본 발명의 일면의 바람직한 구체예는 상기 이미 기재된 바와 같은 4성분 융합체이다:
1. P24 - RT - Nef-pl7
2. P24 - RT* - Nef- pl7
3. p24 - p51RT - Nef- pl7
4. p24 - p51RT* - Nef- pl7
본 발명에 포함되는 HIV 항원과 관련하여 용어 "~로부터 유래된" 또는 "유도체"는 항원이 이들 본래의 상대에 대해 제한된 방식으로 변형될 수 있다는 것을 의미한다. 이는 예를 들어 원핵 시스템에서 발현을 증진시키거나 바람직하지 않은 효소 활성을 포함하는 바람직하지 않은 활성을 제거하므로써 단백질의 특성을 변화시킬 수 있는 점 변이를 포함한다. RT에 대해 본원에서 기술된 점 변이는 이러한 것들을 달성하도록 설계된다. 그러나, 항원은 백신에서 바람직할 수 있는 항원성 특성을 보유하고, 이에 따라 원시 항원에 대한 면역 반응을 일으킬 수 있도록 원시 항원과 충분히 유사하게 잔류해야 한다. 특정 유도체가 이러한 면역 반응을 일으키거나 일으키지 않건 간에, 면역반응은 ELISA(항체 반응에 대해)과 같은 적합한 면역학적 검정 또는 세포 마커 및 사이토킨에 대해 적합한 염색을 사용하는 유세포 분석법(세포 반응에 대해)에 의해 측정될 수 있다.
본 발명에 따른 HIV 항원의 폴리펩티드 작제물은 E. coli와 같은 원핵 시스템을 포함하는 시험관내 시스템에서 발현될 수 있다. 유리하게는, 이들 작제물은 통상적인 정제 방법에 의해 정제될 수 있다.
본원에서 기술된 융합체는 바람직하게는 선택된 발현 시스템에서 발현되는 경우에 용해될 수 있다. 즉, 이들 융합체는 발현 시스템으로부터 미정제 추출물의 상청액 중에 상당량으로 존재한다. 미정제 추출물 중의 융합 단백질의 존재는 SDS 겔 상에서 수행되는 것, 쿠마시에 염색법 및 농도계측적 측정에 의해 적합한 밴드를 체크하는 것과 같은 통상적인 수단에 의해 측정될 수 있다. 본 발명에 따른 융합 단백질은 바람직하게는 본원의 실시예에 기술된 기법에 의해 측정되어 50% 이상 가용성, 보다 바람직하게는 70% 이상 가용성, 보다 바람직하게는 90% 가용성 이상이다. 재조합에 의해 발현되는 단백질의 용해도를 증진시키기 위한 기술이 공지되어 있으며, 예를 들어 유전자 발현이 유도되는 온도를 낮추므로써 원핵 발현 시스템에서의 용해도가 증진된다.
본원에 기술된 융합 단백질은 정제될 수 있다. 특히, 융합 단백질은 정제될 수 있으나 가용성 또는 상당히 가용성인 채로 잔류할 수 있다.
본원에 기술된 바와 같은 면역원성 단편은 항원중 하나 이상의 에피토프를 함유할 것이며, HIV 항원성을 나타내고, 적합한 작제물에 제공되는 경우에, 예컨대 다른 HIV 항원에 융합되거나 담체 상에 제공되는 경우에 면역 반응을 일으킬 수 있으며, 이러한 면역 반응은 원시 항원에 대해 유도된다. 전형적으로, 면역원성 단편은 HIV 항원으로부터 20개 이상, 바람직하게는 50개 이상, 보다 바람직하게는 100개 이상의 연속 아미노산을 함유한다.
본 발명은 추가의 일면에서 본 발명에 따른 폴리펩티드를 엔코딩하는 폴리누클레오티드를 제공한다.
본 발명에 따른 폴리누클레오티드는 폴리누클레오티드 백신으로서 사용될 수 있다. 폴리누클레오티드는 플라즈미드 DNA, 박테리아 및 바이러스 발현 시스템과 같은 핵산 발현 시스템을 포함하여 당업자들에게 공지된 다양한 임의의 전달 시스템내에 존재할 수 있다. 수많은 유전자 전달 기술, 예컨대 문헌(Rolland, Crit. Rev. Therap. Drug Carrier Systems 15:143-198, 1998) 및 본원에서 인용되는 문헌에 기술된 기술이 당해 널리 공지되어 있다. 적합한 핵산 발현 시스템은 환자에게서 발현을 위해 필요한 DNA 서열(예컨대 적합한 프로모터 및 터미네이팅 시스널)을 함유한다. 발현 시스템은 바이러스 또는 박테리아와 같은 재조합 생미생물인 경우, 대상 유전자가 생재조합 바이러스 또는 박테리아의 게놈에 삽입될 수 있다. 이러한 생벡터와의 접종 및 생체내 감염은 항원의 생체내 발현 및 면역 반응 유도를 이끌어낼 것이다. 이러한 목적으로 사용되는 바이러스 및 박테리아는 예를 들면, 폭스바이러스(예를 들어, 백시니아(vaccinia), 포울폭스(fowlpox), 카나리폭스(canarypox), 변형된 폭스바이러스(예를 들어, 변형된 바이러스 안카라(Modified Virus Ankara:(MVA)), 알파바이러스(alphaviruses) (신드비스 바이러스(Sindbis virus), 셈리키 포레스트 바이러스(Semliki Forest Virus), 베네주엘리안 에퀸 뇌염 바이러스(Venezuelian Equine Encephalitis Virus), 플라비바이러스(flaviviruses) (황색열 바이러스(yellow fever virus), 뎅기 바이러스(Dengue virus), 일본 뇌염 바이러스(Japanese encephalitis virus)), 아데노바이러스(adenoviruses), 아데노 관련 바이러스(adeno-associated virus), 피코르나바이러스(picornaviruses) (폴리오바이러스(poliovirus), 리노바이러스(rhinovirus)), 헤르페스바이러스(herpesviruses) (바리셀라 조스터 바이러스(varicella zoster virus) 등), 모르빌리바이러스(예컨대, 홍역), 리스테리아(Listeria), 살모넬라(Salmonella) , 시겔라(Shigella), 네이세리아(Neisseria), BCG가 있다. 이들 바이러스 및 박테리아는 악성일 수 있으며, 즉 생 백신을 얻기 위해서는 다양한 방식으로 약화될 수 있다. 또한, 이러한 생 백신은 본 발명의 일부를 형성한다.
본 발명에 따른 생벡터로서 사용하기 위한 바람직한 홍역 벡터는 슈워츠 스트레인(Schwartz strain) 또는 이로부터 유래된 스트레인이다.
생벡터로서 사용하기 위한 바람직한 아데노바이러스는 저혈청우세(low sero-prevalent) 사람 아데노바이러스, 예컨대 Ad5 또는 Ad35 또는 비사람 기원 아데노바이러스, 예컨대 비사람 영장류 아데노바이러스, 예컨대 원숭이 아데노바이러스이다. 이러한 저혈청우세 사람 또는 유사 아데노바이러스는 모집단에서 60% 미만, 전형적으로는 50% 미만의 혈청우세일 것이다. 바람직하게는, 이러한 벡터는 복제 결여성이다. 일반적으로, 이러한 바이러스는 E1 결손을 함유하고, E1 유전자로 형질변환된 세포주 상에서 성장될 수 있다. 바람직한 원숭이 아데노바이러스는 침팬지로부터 분리된 바이러스이다. 특히, C68(또한, Pan9로서 공지됨)(미국 특허 6083 716 참조) 및 Pan 5, 6 및 Pan 7(WO 03/046124)가 본 발명에 사용하기에 바람직하다. 이러한 벡터가 조작되어 본 발명에 따른 이종 폴리누클레오티드에 삽입되므로써 본 발명에 따른 폴리펩티드가 발현될 것이다. 이러한 재조합 아데노바이러스의 용도, 포뮬레이션 및 제조는 WO 03/046142에 자세히 기술되어 있다.
따라서, 본 발명에 따른 바람직한 백신의 Nef, p17 및 p24, 및 RT는 바람직한 폴리펩티드를 엔코딩하는 폴리누클레오티드의 형태로 제공될 수 있다.
본 발명에 따른 폴리누클레오티드는 선택된 발현 시스템에서 엔코딩된 폴리펩티드를 발현시키는 데 사용될 수 있다. HIV 항원 중 하나 이상이, 예를 들어 RT가 폴리누클레오티드에서 코돈 최적화된 서열에 의해, 즉 E.coli와 같은 선택된 재조합 발현 시스템에서 발현을 위해 최적화된 서열에 의해 엔코딩될 수 있다.
또 다른 일면에서, 본 발명은 p51 RT 폴리펩티드 또는 이의 유도체 또는 이를 엔코딩하는, 바람직하게는 적합한 발현 시스템, 특히 E.coli와 같은 원핵 시스템에서 발현을 위해 코돈 최적화된 폴리누클레오티드를 제공한다.
p51 RT 폴리펩티드 또는 폴리누클레오티드는 단독으로 사용되거나, 본 발명에 따른 폴리펩티드 또는 폴리누클레오티드 작제물과 조합하여 사용될 수 있다. 따라서, 추가의 일면에서, 본 발명은 (i) Nef 또는 Nef 에피토프를 함유하는 단편 및 p17 Gag 및/또는 p24 Gag를 포함하고, p17 및 p24 Gag 둘 모두가 존재하는 경우 이들 사이에 하나 이상의 HIV 항원 또는 면역원성 단편이 존재하는 폴리펩티드 및 (ii) p51 RT 폴리펩티드를 포함하는 조성물을 제공한다. 본 발명은 추가로 이들을 엔코딩하는 폴리누클레오티드를 제공한다.
이러한 구체예에 따르면, (i)은, 예를 들어
1. Nef-pl7
2. 링커를 지닌 Nef- p17
3. p17 - Nef
4. 링커를 지닌 p17 - Nef로부터 선택될 수 있다.
바람직하게는, Nef는 전장 Nef이다. 바람직하게는, pl7는 전장 pl7이다.
본 발명에 따른 폴리펩티드 및 폴리누클레오티드는 다른 항원 또는 다른 항원을 엔코딩하는 폴리누클레오티드와 결합될 수 있다. 특히, 이는 HIV env 단백질 또는 이의 단편 또는 유도체를 포함할 수 있다. env의 바람직한 형태는 gp120, gp140 및 gp160이다. env는 예를 들어 R2로서 공지된 HIV-1 클레드 B 엔벨로프 클론으로부터의 WO 00/07631에 기술된 엔벨로프 단백질, 또는 이의 단편 또는 유도체일 수 있다. 따라서, 본 발명은 추가로 HIV env 단백질 또는 이의 단편 또는 유도체와 함께 본 발명에 따른 임의의 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 조성을 포함하는 조성물을 제공한다. 유사하게, 본 발명은 본 발명에 따른 폴리펩티드(들)을 엔코딩하는 폴리누클레오티드(들) 및 HIV env 단백질 또는 이의 단편 또는 유도체를 엔코딩하는 폴리누클레오티드를 포함하는 조성물을 제공한다.
본 발명은 추가로 본원에 기술된 폴리펩티드를 제조하는 방법으로서, 적합한 발현 시스템, 특히 E.coli와 같은 원핵 시스템에서 폴리펩티드를 엔코딩하는 폴리누클레오티드를 발현시키고, 발현된 폴리펩티드를 회수하는 것을 포함하는 방법을 제공한다. 바람직하게는, 발현은 저온, 즉 37℃ 미만의 온도에서 유도되어 폴리펩티드의 용해도를 촉진시킨다.
본 발명은 추가로 본원에서 기술된 바와 같은 폴리펩티드를 정제하는 방법으로서,
i). 비정제된 폴리펩티드를 포함하는 조성물을 제공하고,
ii). 조성물을 2개 이상의 크로마토그래피 단계로 처리하고,
iii) 임의적으로 폴리펩티드를 카르복시아미드화시키고,
iv) 완충액 교체 단계를 수행하여 약제 포뮬레이션을 위한 적합한 완충액 중에 단백질을 제공하는 것을 포함하는 방법을 제공한다.
상기 카르복시아미드화는 두개의 크로마토그래피 단계 사이에서 수행될 수 있다. 카르복시아미드화 단계는 요오도아세트이미드를 사용하여 수행될 수 있다.
일 실시예에서, 본 발명에 따른 방법은 두개 이하의 크로마그래피 단계를 사용한다.
본 발명은 추가로 약제학적으로 허용되는 애주번트 또는 담체와 함께 본 발명에 따른 폴리펩티드 및 폴리누클레오티드를 포함하는 약제 조성물 및 면역원성 조성물 및 백신을 제공한다.
본 발명에 따른 백신은 HIV에 대한 예방적 또는 치료적 면역화에 사용될 수 있다.
본 발명은 추가로 HIV에 대한 예방적 또는 치료적 면역화를 위한 백신의 제조시에 본원에서 기술된 바와 같은 폴리펩티드 및 폴리펩티드 조성물 및 폴리누클레오티드 및 폴리누클레오티드 조성물의 용도를 제공한다.
본 발명의 백신은 폴리펩티드 및/또는 폴리누클레오티드 항원의 면역보호적 또는 면역치료적 양을 함유할 것이며, 통상적인 기술에 의해 제조될 수 있다.
백신 제조는 일반적으로 문헌(New Trends and Developments in Vaccines, edited by Voller et al., University Park Press, Baltimore, Maryland, U.S.A. 1978)에 기술되어 있다. 리포좀내 캡슐화는 예를 들어, 풀러톤(Fullerton)의 미국 특허 제 4,235,877호에 기술되어 있다. 단백질의 마크로분자로의 컨쥬게이션은 예를 들어 리크하이트(Likhite)의 미국 특허 제 4,372,945호 및 아르모르(Armor) 등의 미국 특허 제 4,474,757호에 기술되어 있다.
백신 용량에 있어서 단백질의 양은 일반적인 백신에 명백한 부작용 없이 면역보호 반응을 유도하는 양으로서 선택된다. 이러한 양은 어떠한 특이적 면역원이 사용되는 지와 선택된 백신화 섭생법에 따라 달라질 것이다. 일반적으로, 각각의 용량은 1 내지 1000㎍의 각각의 단백질, 바람직하게는 2 내지 200㎍, 매우 바람직하게는 4 내지 40㎍의 폴리펩티드 융합체를 포함할 것으로 예상된다. 특정 백신에 대한 최적의 양은 항체 역가 및 피검체의 다른 면역 반응의 관찰을 포함하여 표준 연구에 의해 확인될 수 있다. 초기 백신화 이후, 피검체는 약 4주후에 부스트(boost)를 수용하고 이후 2차 부스터 면역화될 수 있다.
본 발명의 단백질은 바람직하게는 본 발명의 백신 포뮬레이션에서 애주번트첨가된다. 애주번트는 일반적으로 문헌(Vaccine Design - Subunit and Adjuvant Approach, edited by Powell and Newman, Plenum Press, New York, 1995)에 기술되어 있다.
적합한 애주번트로는 수산화알루미늄 또는 인산알루미늄과 같은 알루미늄이 포함되나 또한 칼슘, 철 또는 아연의 염이거나, 아크릴화된 티로신, 또는 아크릴화된 당, 양이온 또는 음이온 유도체화된 폴리사카라이드 또는 폴리포스파젠의 불용성 현탁액일 수 있다.
본 발명의 포뮬레이션에 있어서, 애주번트 조성물은 우선적 Th1 반응을 유도하는 것이 바람직하다. 그러나, 그 밖의 체액 반응을 포함하는 그 밖의 반응도 배제되지 않는 것으로 이해해야 할 것이다.
면역 반응은 항원과 면역 시스템의 세포와의 상호작용을 통해 항원에 대해 생성된다. 형성된 면역 반응은 광범위하게는 두개의 극명한 카테고리로서 체액 또는 세포 매개된 면역 반응(전통적으로 각각 항체 및 세포 이펙터 보호 메카니즘에 의해 특징됨)으로 구분될 수 있다. 이러한 반응 카테고리는 Th1 타입 반응(세포 매개된 반응) 및 Th2 타입 면역 반응(체액 반응)으로 명명되어 있다.
극명한 Th1 타입 면역 반응은 항원 특이적인 할로타입 제한된 세포독성 T 림프구의 생성 및 천연 치사 세포 반응에 의해 특징될 수 있다. 마우스에서 Th1 타입 반응은 IgG2a 서브타입의 항체의 생성에 의해 특징되지만, 이는 사람에서는 IgG1 타입 항체에 상응한다. Th2 타입 면역 반응은 마우스에서 IgG1, IgA 및 IgM을 포함하는 광범위한 범위의 면역글로불린 이소타입의 생성에 의해 특징된다.
이러한 두가지 타입의 면역 반응의 진행 배후의 구동력은 면역 시스템의 세포를 도와주고, 궁극적으로 면역 반응을 Th1 또는 Th2 반응 중 어느 하나에 대해 조정하는 역할을 하는 다수의 확인된 단백질 메신저인 시토킨인 것으로 간주될 수 있다. 따라서, Th1 타입 시토킨의 높은 수준은 설정된 항원에 대한 세포 매개된 면역 반응의 유도를 유리하게 하는 경향이 있지만, Th2 타입 시토킨의 높은 수준은 항원에 대한 체액 면역 반응의 유도를 유리하게 하는 경향이 있다.
Th1 및 Th2 타입 면역 반응의 구별이 절대적인 것은 아님을 기억하는 것이 중요하다. 사실상, 개체는 Th1이 우세한 것으로, 또는 Th2가 우세한 것으로 기술된 면역 반응을 지지할 것이다. 그러나, 모스만(Mosmann) 및 코프만(Coffman)에 의한 뮤린 CD4+ve T 세포 클론에서 기술된 것에 비추어 시토킨의 패밀리를 고려하는 것이 종종 편리하다[참조: Mosmann, T.R. and Coffman, R.L. (1989) THl and TH2 cells: different patterns of lymphokine secretion lead to different functional properties. Annual Review of Immunology, 7, p 145-173]. 전통적으로, Th1 타입 반응은 T 림프구에 의한 IL-2 시토킨 및 INF-γ의 생성과 관련된다. Th1 타입 면역 반응의 유도와 흔히 직접적으로 관련된 다른 시토킨은 IL-12와 같은 T 세포에 의해서는 생성되지 않는다. 대조적으로, Th2 타입 반응은 IL-4, IL-5, IL-6, IL-10 및 종양 괴사 인자-β(TNF-β)의 분비와 관련된다.
특정 백신 애주번트는 Th1 또는 Th2 타입 시토킨 반응의 자극에 특히 적합한 것으로 공지되어 있다. 전통적으로, 백신화 또는 감염 후 면역 반응의 Th1:Th2 조화에 대한 최상의 인디케이터(indicator)로는, 항원에 의한 재자극 후 시험관내 T 림프구에 의한 Th1 또는 Th2 시토킨 생성의 직접적인 측정, 및/또는 항원 특이적 항체 반응의 IgG1:IgG2 비의 측정이 포함된다.
따라서, Th1 타입 애주번트는 분리된 T 세포 집단을 자극하여 시험관내 항원으로 재자극되는 경우 Th1 타입 시토킨의 높은 수준을 생성하고, Th1 타입 이소타입과 관련된 항원 특이적 면역글로불린 반응을 유도한다.
포뮬레이션되어 본 발명에 사용하기 적합한 애주번트를 생성할 수 있는 바람직한 Th1 타입 면역자극물질은 하기를 포함하나, 이로 제한되는 것은 아니다. 모노포스포릴 지질 A, 특히, 3-데-아실화된 모노포스포릴 지질 A(3D-MPL)이 본 발명에 사용하기에 바람직한 Th1 타입 면역자극물질이다. 3D-MPL은 리비 이뮤노켐(Ribi Immunochem, Montana)사에 의해 제조된 널리 공지된 애주번트이다. 화학적으로는, 흔히 4,5 또는 6 아실화된 사슬과의 3-데-O-아실화된 모노포스포릴 지질 A의 혼합물로서 공급된다. GB 2122204B에 교시된 방법에 의해 정제되고 제조될 수 있으며, 또한 이 문헌은 디포스포릴 지질 A, 및 이의 3-O-탈아실화된 변이형을 개시하고 있다. 그 밖의 정제된 합성 리포폴리사카라이드가 개시되어 있다[참조: US 6,005,099 및 EP 0 729 473 Bl ; Hilgers et al, 1986, Int. Arch. Allergy.Immunol., 79(4):392-6; Hilgers et al, 1987, Immunology, 60(l):141-6; and EP 0 549 074 Bl]. 3D-MPL의 바람직한 형태는 직경이 0.2㎛ 미만의 작은 입자 크기를 갖는 미립 포뮬레이션의 형태로 존재하며, 이의 제조 방법은 EP 0 689 454에 기술되어 있다.
또한, 사포닌은 본 발명에 따른 바람직한 Th1 면역자극물질이다. 사포닌은 널리 공지된 애주번트이며 문헌(Lacaille-Dubois, M and Wagner H. (1996. A review of the biological and pharmacological activities of saponins. Phytomedicine vol 2 pp 363-386)에 교시되어 있다. 예를 들어, 쿠일(Quil) A (남아메리카목 퀼라자 사포나리아 몰리나(Quillaja Saponaria Molina)의 목피로부터 유래됨), 및 이의 분획은 US 5,057,540 및 문헌("Saponins as vaccine adjuvants", Kensil, C. R., Crit Rev Ther Drug Carrier Syst, 1996, 12 (1-2): 1-55); 및 EP 0 362 279 Bl에 개시되어 있다. 용혈성 사포닌 QS21 및 QS17(쿠일 A의 HPLC 정제된 단편)이 효능있는 전신 애주번트로서 개시되어 있으며, 이들의 제조 방법은 US 미국 제 5,057,540호 및 EP 0 362 279 Bl에 개시되어 있다. 또한, 전신 백신을 위한 효능있는 애주번트로서 작용하는 QS7(쿠일-A의 비용혈성 단편)의 용도가 상기 문헌에 개시되어 있다. QS21의 용도는 추가로 문헌(Kensil et al. (1991. J. Immunology vol 146, 431-437))에 개시되어 있다. QS21와 폴리소르베이트 또는 시클로덱스트린의 조합은 또한 공지되어 있다(WO 99/10008). QS21 및 QS7와 같은 쿠일 A의 분획을 포함하는 미립 애주번트 시스템이 WO 96/33739 및 WO 96/11711에 개시되어 있다. 이러한 시스템은 이스콘(Iscorn)으로서 공지되어 있으며, 하나 이상의 사포닌을 함유할 수 있다.
또 다른 바람직한 면역자극물질은 비메틸화된 CpG 디누클레오티드("CpG")를 함유하는 면역자극성 올리고누클레오티드이다. CpG는 DNA에 존재하는 시토신-구아노신 디누클레오티드 모티프의 약어이다. CpG는 전신 경로 및 점막 경로 둘 모두에 의해 투여되는 경우에 애주번트인 것으로 당해 공지되어 있다[참조: WO 96/02555, EP 468520, Davis et al, J.Immunol, 1998, 160(2):870-876; McCluskie and Davis, J.Immunol., 1998, 161(9):4463-6]. 전통적으로, BCG의 DNA 분획은 항종양 효과를 발휘할 수 있는 것으로 관찰되었다. 추가의 연구에서, BCG 유전자 서열로부터 유래된 합성 올리고누클레오티드는 면역자극 효과를 유발시킬 수 있는 것으로 나타났다(시험관내 및 생체내 둘 모두에서). 이러한 연구의 연구자들은 중심 CG 모티프를 포함하는 특정 회문식 서열이 이러한 활성을 지니는 것으로 결론내렸다. 면역자극화에서 CG 모티브의 중심적인 역할은 문헌(Krieg, Nature 374, p546 1995)에 의해 후에 규명되었다. 자세한 분석에서, CG 모티프가 특정 서열 컨택스트(context)로 존재하고, 이러한 서열은 박테리아 DNA에서 통상적이나 척추동물 DNA에서는 드문 것으로 나타났다. 면역자극성 서열은 흔히 푸린, 푸린, C, G, 피리미딘이며, 여기에서 CG 모티프는 메틸화되지 않으나, 그 밖의 메틸화되지 않은 CpG 서열이 면역자극성인 것으로 공지되어 있으며, 본 발명에 사용될 수 있다.
6개의 누클레오티드의 특정 조합에서, 회문식 서열이 존재한다. 이러한 모티프중 몇몇은 하나의 모티프의 반복이거나 상이한 모티프의 조합으로서 동일한 올리고누클레오티드에 존재할 수 있다. 하나 이상의 이러한 면역조절 서열을 함유하는 올리고누클레오티드의 존재는 천연 치사 세포(인터페론 γ를 생성하고 세포분해 활성을 지니는)를 포함하는 다양한 면역 서스셋 및 마크로파지(Wooldrige et al Vol 89(no. 8), 1977)를 활성화시킨다. 그 밖의 이러한 컨센서스 서열을 지니지 않는 그 밖의 비메틸화 CpG 함유 서열이 또한 면역조절성인 것으로 나타났다.
백신으로 포뮬레이션되는 경우 CpG는 일반적으로 유리 항원과 함께 유리 용액으로 투여되거나(WO 96/02555; 상기 McCluskie and Davis), 항원에 공유적으로 컨쥬게이트되거나(WO 98/16247), 수산화알루미늄(간염 표면 항원)과 같은 담체와 함께 포뮬레이션된다[참조: 상기 Davis et al.; Brazolot-Millan et al, Proc.Natl.Acad.Sci., USA, 1998, 95(26), 15553-8].
상기 기술된 바와 같은 이러한 면역자극물질은 예를 들어, 리포좀 수중유 에멀젼 및/또는 알루미늄 염(예컨대 수산화알루미늄)을 포함하는 금속 염과 같은 담체와 함께 포뮬레이션될 수 있다. 예를 들어, 3D-MPL은 수산화알루미늄(EP 0 689 454) 또는 수중유 에멀젼 (WO 95/17210)과 함께 포뮬레이션될 수 있으며; QS21 는 유리하게는 콜레스테롤 함유 리포좀(WO 96/33739), 수중유 에멀젼(WO 95/17210) 또는 알룸(alum) (WO 98/15287)과 함께 포뮬레이션될 수 있으며; CpG는 알룸(상기 Davis 등; 상기 Brazolot-Millan)과 함께 또는 그 밖의 양이온성 담체와 함께 포뮬레이션될 수 있다.
또한, 면역자극물질의 조합이 바람직한데, 특히 모노포스포릴 지질 A와 사포닌 유도체의 조합(WO 94/00153; WO 95/17210; WO 96/33739; WO 98/56414; WO 99/12565; WO 99/11241), 보다 특히 WO 94/00153에 개시된 바와 같은 QS21와 3D-MPL의 조합이 바람직하다. 다르게는, CpG와 QS21과 같은 사포닌의 조합은 또한 본 발명에 사용하기 위한 효능있는 애주번트를 형성한다. 다르게는, 사포닌은 리포좀으로 또는 이스콘(Iscorn)으로 포뮬레이션될 수 있으며, 면역조절성 올리고누클레오티드와 조합될 수 있다.
따라서, 적합한 애주번트 시스템은 예를 들어, 모노포스포릴 지질 A, 바람직하게는 3D-MPL과 알루미늄 염과의 조합을 포함한다. 개선된 시스템은 모노포스포릴 지질 A와 사포닌 유도체의 조합, 특히 WO 94/00153에 기술된 바와 같이 QS21과 3D-MPL의 조합을 포함하거나, QS21이 WO 96/33739에서 기술된 바와 같이 콜레스테롤 함유 리포좀(DQ)에 켄칭되는 덜 반응생성적인 조성물을 포함한다. 이러한 조합은 추가로 면역조절성 올리고누클레오티드를 포함할 수 있다.
수중유 에멀젼에 QS21, 3D-MPL과 토코페놀을 포함하는 특히 효능있는 애주번트 포뮬레이션이 WO 95/17210에 개시되어 있으며, 이것은 본 발명에 사용하기에 바람직한 또 다른 포뮬레이션이다.
또 다른 바람직한 포뮬레이션은 CpG 올리고누클레오티드를 단독으로, 또는 알루미늄 염과 함께 포함한다.
본 발명의 추가의 일면에서, 본원에서 기술된 바와 같은 백신의 제조 방법으로서, 본 발명에 따른 폴리펩티드를 적합한 애주번트와 혼합하는 것을 포함하는 방법이 제공된다.
본 발명에 따른 포뮬레이션에 사용하기 위한 특히 바람직한 애주번트 조합은 하기와 같다:
i) 3D-MPL + 리포좀 중의 QS21
ii) 알룸 + 3D-MPL
iii) 알룸 + 리포좀 중의 QS21 + 3D-MPL
iv) 알룸 + CpG
v) 3D-MPL + QS21 + 수중유 에멀젼
vi) CpG
약제 조성물의 투여는 하나의 개별적인 용량보다는 하나 이상의 형태, 예를 들어 동일한 폴리펩티드 함유 조성물의 반복 용량을 취하거나 이종 "프라임-부스트(prime-boost)" 백신 섭생법으로 이루어질 수 있다. 이종 프라임 -부스트 섭생법은 각각이 그 자체로 두개 이상의 투여법을 포함할 수 있는 프라임 및 부스트로 상이한 형태의 백신을 투여하는 것을 사용한다. 동일한 형태의 항원이 필수적인 것은 아니지만, 프라이밍 조성물 및 부스팅 조성물은 보통 하나 이상의 항원을 가질 것이며, 동일한 항원의 상이한 형태로 존재할 수 있다.
본 발명에 따른 프라임 부스트 면역화는 단백질과 DNA 기재 포뮬레이션의 조합물에 의해 수행될 수 있다. 이러한 전략은 광범위한 면역 반응을 유발시키는 데 효과적인 것으로 간주된다. 애주번트 첨가된 단백질 백신은 주로 항체 및 T 헬퍼 면역 반응을 유발하는 반면, 플라즈미드 또는 생벡터로서 DNA의 전달은 강한 세포독성 T 림프구(CTL) 반응을 유발한다. 따라서, 단백질과 DNA 백신화의 조합은 광범위하게 다양한 면역 반응에 대비할 것이다. 이는 특히 HIV의 컨텍스트와 관련되는 데, 그 이유는 항체 및 CTL 둘 모두를 중화하는 것이 HIV에 대해 면역 방어에 대해 중요한 것으로 간주되기 때문이다.
본 발명에 따르면, 백신화에 대한 스케쥴은 폴리펩티드 항원 및 폴리펩티드를 엔코딩하는 DNA의 연속적인 ("프라임-부스트") 또는 동시 투여를 포함할 수 있다. 상기 DNA는 플라즈미드 DNA와 같은 네이키드(naked) DNA로서, 또는 예컨대 폭스바이러스 벡터, 아데노바이러스 벡터, 홍역 바이러스 벡터 또는 임의의 다른 적합한 생 벡터와 같은 재조합 생 벡터의 형태로 전달될 수 있다. 단백질 항원이 1회 또는 수회 주입된 후에, 1회 이상의 DNA 투여가 수행되거나, DNA가 먼저 1회 이상의 투여로 사용된 후 1회 이상의 단백질 면역화가 수행될 수 있다.
본 발명에 따른 프라임-부스트 면역화의 특정예는 변형된 폭스바이러스 벡터, 예를 들어, 변형된 바이러스 앙카라(MVA) 또는 알파바이러스, 예를 들어 베네주엘리안 에퀸 뇌염 바이러스, 또는 아데노바이러스 벡터, 또는 홍역 바이러스 벡터와 같은 재조합 생 벡터의 형태로 DNA로 프라이밍시키고, 단백질, 바람직하게는 애주번트 첨가된 단백질로 부스팅시키는 것을 포함한다.
따라서, 본 발명은
a) Nef 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체 및 p17 및/또는 p24 Gag 또는 이의 면역원성 단편 또는 이의 유도체를 포함하고, p17 및 p24 Gag 둘 모두가 존재하는 경우, 이들 사이에 하나 이상의 HIV 항원 또는 면역원성 단편 또는 유도체가 존재하는 폴리펩티드를 약제학적으로 허용되는 부형제와 함께 포함하는 조성물; 및
b) 하나 이상의 Nef 및 Gag, 또는 a)의 폴리펩티드에 존재하는 Nef 또는 Gag 에피토프를 함유하는 Nef 또는 Gag의 면역원성 단편 또는 유도체를 엔코딩하는 폴리누클레오티드를 약제학적으로 허용되는 부형제와 함께 포함하는 조성물을 포함하는 약제학적 키트를 제공한다.
바람직하게는, a)의 폴리펩티드는 RT 또는 p51RT와 같은 이의 면역원성 단편 또는 유도체를 포함한다.
다른 구체예에서, 약제학적 키트는
a) Nef 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체 및 p17 및/또는 p24 Gag 또는 이의 면역원성 단편 또는 이의 유도체를 포함하고, p17 및 p24 Gag 둘 모두가 존재하는 경우, 이들 사이에 하나 이상의 HIV 항원 또는 면역원성 단편 또는 유도체가 존재하는 폴리펩티드를 엔코딩하는 폴리누클레오티드를 약제학적으로 허용되는 부형제와 함께 포함하는 조성물; 및
b) 하나 이상의 Nef 및 Gag, 또는 a)의 폴리펩티드에 존재하는 Nef 또는 Gag 에피토프를 함유하는 Nef 또는 Gag의 면역원성 단편 또는 유도체를 포함하는 폴리펩티드를 약제학적으로 허용되는 부형제와 함께 포함하는 조성물을 포함하는 약제학적 키트를 제공한다.
바람직하게는, a)의 폴리누클레오티드는, 추가로 RT 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체, 예컨대 p51RT를 포함하는 폴리펩티드를 엔코딩한다.
본 발명에 따른 프라임/부스트 키트에 사용하기에 바람직한 폴리펩티드 및 폴리누클레오티드는 본원에 기술된 바와 같은 폴리펩티드 및 폴리누클레오티드이다. 따라서, 단백질/DNA 타입 프라임 부스트 방법의 단백질 성분은 본원에 기술된 임의의 바람직한 융합 단백질일 수 있다. 유사하게, DNA 성분은 임의의 바람직한 단백질을 엔코딩하는 폴리누클레오티드일 수 있다.
따라서, 예를 들어, 본원에서 기술된 바와 같은 p24 - RT - Nef- p17, p24 - RT* - Nef- p17, p24 - p51RT - Nef - p17, p24 - p51RT* - Nef- p17, p17 - p51RT - Nef 또는 p17 - p51RT* - Nef 융합체 또는 임의의 p17-Nef 융합체가 프라임 부스트 키트에 제공될 수 있으며, 여기에서, 프라이밍 조성물은 융합 단백질을 포함하고, 부스팅 조성물은 융합 단백질을 엔코딩하는 폴리누클레오티드를 포함하거나, 프라이밍 조성물은 폴리누클레오티드를 포함하고, 부스팅 조성물은 융합 단백질을 포함한다.
프라이밍 조성물 및 부스팅 조성물 둘 모두는 하나 이상의 용량으로 전달될 수 있다. 추가로, 초기 프라이밍 및 부스팅 용량은 추가의 용량이 후속될 수 있으며, 후속 용량은 예를 들어 DNA 플라즈미드 프라임/단백질 부스트/추가의 DNA 플라즈미드 용량/추가의 단백질 용량을 초래하도록 교대로 사용될 수 있다.
코돈 최적화는, 폴리누클레오티드 서열이 예를 들어 E.coli와 같은 원핵 시스템과 같은 목적하는 발현 시스템에서 유전자의 코돈 사용과 유사하도록 최적화되는 것을 의미한다. 특히, 서열에서 코돈 사용은 고도로 발현된 E.coli 유전자의 것과 유사하게 최적화된다.
본 발명에 따른 재조합 시스템에서 발현을 위한 코돈 최적화의 목적은 두가지로, 재조합 생성물의 발현 수준을 개선시키는 것과 보다 균질한 발현 생성물이 부여하는 것이다(보다 동종의 발현을 얻음). 개선된 균질성은 절두체(truncate)와 같은 불규칙 발현 생성물이 보다 적게 존재함을 의미한다. E.coli 발현에 적합한 코돈 사용은 또한 추정되는 "프레임-시프트(frame-shift)" 서열 뿐만 아니라 조기 말단화 및/또는 내부 개시 자리를 제거할 수 있다.
DNA 코드는 4개의 문자(A, T, C 및 G)를 가지며, 세개 문자의 "코돈"이 되도록 사용하여 유기체의 유전자에서 엔코딩된 단백질의 아미노산을 나타낸다. DNA 분자를 따른 코돈의 선형 서열은 그러한 유전자에 의해 엔코딩되는 단백질(들)은 아미노산의 선형 서열로 번역된다. 코드는 고도로 변질되어, 61개의 코돈이 20개의 천연 아미노산에 대해 코딩하고, 3개의 코돈이 "정지" 시그널을 나타낸다. 따라서, 대부분의 아미노산은 하나 초과의 코돈에 의해 코딩되는 데, 실제로 몇몇은 4개 이상의 상이한 코돈에 의해 코딩된다.
하나 초과의 코돈이 소정의 아미노산을 코딩하는데 이용될 수 있는 경우, 유기체의 코돈 사용 패턴은 매우 비랜덤인 것으로 관찰되었다. 상이한 종은 그들의 코돈 선택에 있어서 상이한 성향을 나타내며, 추가로, 코돈의 이용성은, 높고, 낮은 수준으로 발현되는 유전자들 간의 단일 종에 있어서 현저하게 상이할 수 있다. 이러한 성향은 바이러스, 식물, 박테리아 및 포유동물 세포에서 상이하며, 일부 종은 다른 것보다 랜덤 코돈 선택으로부터 차별되는 강한 성향을 보여준다. 예를 들어, 사람 및 그 밖의 포유동물은 특정 박테리아 또는 바이러스 보다 덜 강한 성향을 갖는다. 이러한 이유로, E.coli에서 발현된 포유동물 바이러스로부터의 바이러스 유전자, 또는 포유 동물 세포에서 발현된 외래 또는 재조합 유전자가 효율적인 발현을 위해 코돈의 부적합한 분포를 가질 가능성이 크다. 발현이 일어나야 하는 숙주에서 드물게 관찰되는 풍부한 코돈 또는 코돈 클러스터의 이종 DNA 서열에서의 존재는 이러한 숙주에서 낮은 이종 발현 수준의 징표인 것으로 여겨진다.
따라서, 본 발명의 폴리누클레오티드에 있어서, 코돈 사용 패턴은 전형적인 사람 면역결핍 바이러스로부터 변경되어 예컨대 E.coli와 같은 표적 유기체의 코돈 성향을 보다 근접하게 나타낼 수 있다.
코돈 최적화에 유용한 공개적으로 이용할 수 있는 다양한 프로그램, 예컨대 "CalcGene"(Hale and Thompson, Protein Expression and Purification 12: 185- 189 (1998)이 존재한다.
실시예
실시예 1: HIV-1 p24 - RT - Nef- pl7 융합 F4 및 코돈 최적화된 F4 (co)의 작제 및 발현
1. 비-코돈 최적화된 F4
HIV-1 gag p24(캡시드 단백질) 및 p17(매트릭스 단백질), 역전사 효소 및 Nef 단백질을 박테리오파지 T7 프로모터(pET 발현 시스템)의 제어하에 E.coli B834 스트레인(B834(DE3)는 BL21(DE3)의 메티오닌 옥소트로프 패런트(methionine auxotroph parent)이다)에서 발현시켰다.
상기 단백질을 4개의 단백질의 완전 서열을 함유하는 단일 융합 단백질로서 발현시켰다. 성숙한 p24 코딩 서열을 HIV-1 BH10 분자 클론으로부터 유도하고, 성숙한 p17 서열 및 RT 유전자를 HXB2로부터 유도하고, Nef 유전자를 BRU 분리물로부터 유도하였다.
유도 후, 재조합 세포를 전체 단백질의 10%에 이르는 p24-RT-Nef-p17 융합체의 상당한 수준으로 발현시켰다.
세포가 22℃에서 성장하고, 유도되면, p24-RT-Nef 융합 단백질을 주로 박테리아 융해물의 가용성 분획으로 제한시켰다(냉동/해동 이후에도). 30℃에서 성장되면, 약 30%의 재조합 단백질이 불용성 분획과 결합하였다.
융합 단백질 p24-RT-Nef-p17을 분자량이 약 129kDa인 1136개의 아미노산으로 구성하였다. 전장 단백질을 SDS 겔 상에서 약 130kDa로 이동시켰다. 이 단백질은 2D 겔 전기영도에 의해 확인된 바와 같이, 그 아미노산 서열에 기초하여 이론적 등전점(pI)가 7.96이었다.
재조합 플라즈미드에 대한 상세한 내용:
명칭: pRIT15436 (또는 랩명(lab name) pET28b/p24-RT-Nef-pl7)
숙주 벡터: pET28b
레플리콘: colEl
선택: 카나마이신
프로모터: T7
삽입: p24-RT-Nef-pl7 융합 유전자.
재조합 단백질에 대한 상세한 내용:
p24-RT-Nef-pl7 융합 단백질: 1136개의 아미노산.
N-말단- p24: 232a.a. -힌지(hinge):2a.a. - RT: 562a.a. -힌지:2a.a. -Nef: 206a.a. - - P17: 132a.a. -C-말단
누클레오티드 및 아미노산 서열:
누클레오티드 서열
p24 서열은 진하게 표시됨.
Nef 서열은 밑줄쳐 짐.
박스: 유전적 구성에 의해 도입된 누클레오티드
아미노산 서열
P24 서열: 아미노산 1-232(진하게)
RT 서열: 아미노산 235-795
Nef 서열: 아미노산 798-1002
P17 서열: 아미노산 1005-1136
박스: 유전적 구성에 의해 도입된 아미노산
K (리신): 트립토판(w) 대신. 효소 활성을 제거하기 위해 도입된 변이.
재조합 단백질의 발현:
pET 플라즈미드에서, 표적 유전자(p24-RT-Nef-p17)를 강력한 박테리오파아지 T7 프로모터의 조절하에 두었다. 이 프로모터는 E.coli RNA 폴리머라제에 의해 인지되지 않으며, 숙주 세포에서 T7 RNA 폴리머라제의 공급원에 의존한다. B834(DE3) 숙주 세포는 lacUV5 조절 하에 T7 RNA 폴리머라제 유전자의 염색체 복사체(copy)를 함유하며, 발현은 IPTG를 박테리아 배양물에 첨가하므로써 유지된다.
예비 배양물을 진탕 플라스크 중에서 37℃에서 미드-로그 페이스(mid-log phase)(A620:0.6)까지 배양한 후, 4℃에서 밤새 저장하였다(고정상 배양물을 피하기 위해). 배양물을 1% 글루코스 및 50㎍/ml 카나마이신이 보충된 LBT 배지에서 배양시켰다. 글루코스의 성장 배지로의 첨가는 기저 재조합 단백질 발현을 감소시키는 데 유리하다(lacUV5 프로모터의 cAMP 매개된 억제해제를 피함).
4℃에서 밤새 저장된 10ml의 배양물을, 카나마이신을 함유하는 LBT 배지(글루코스 비함유) 200ml를 접종하는 데 사용하였다. 배양물을 30℃ 및 22℃에서 배양하고, O.D.620이 0.6에 도달하면, IPTG를 첨가하였다(최종 1mM). 배양물을 추가로 3, 5 및 18시간(밤새) 동안 접종하였다. 샘플을 유도 전 및 유도 후 3, 5 및 18시간에 수거하였다.
추출물 제조는 하기와 같았다:
세포 펠릿을 파괴 완충액(이론상 10의 O.D.)에 현탁시키고, 프렌치 프레스에서 4개의 경로에 의해 분쇄하였다(20,000psi 또는 1250bar에서). 미정제 추출물(T)을 30분 동안 20,000g에서 원심분리하여 가용성(S) 및 불용성(P) 분획을 분리시켰다.
* 파괴 완충액: 5OmM 트리스-HCL pH 8.0, ImM EDTA, ImM DTT + 프로테아제 억제제 칵테일 (완전/뵈링거)
SDS-PAGE 및 웨스턴 블롯 분석:
불용성 펠릿(P), 상청액(S) 및 미정제 추출물(T)에 상응하는 분획을 10% 환원성 SDS-PAGE에서 분석하였다. p24-RT-Nef-p17재조합체를 쿠마시에 블루 염색 및 웨스턴 블롯(WB)에 의해 검출하였다.
쿠마시에 염색: p24-RT-Nef-p17 단백질은 하기와 같이 나타났다:
±130kDa에서 하나의 밴드(계산된 MW로 맞춤)
MW 이론치: 128,970 달톤
MW 겉보기 수치: 130 kDa
웨스턴 블롯 분석:
시약 = - RT에 대한 모노클로날 항체 (p66/p51)
ABI(어드밴스드 바이오테크놀로지스(Advanced Biotechnologies)로부터 구입
희석비: 1/5000
- 알칼리 포스파타제-컨쥬게이트 항마우스 항체
희석비: 1/7500
발현 수준: 22℃에서 20시간 후 매우 강한 p24-RT-Nef-p17 특이적 밴드, 이는 10% 이하의 전체 단백질을 나타냄(표 1A 참조)
재조합 단백질의 "용해도":
"새로운" 세포 추출물(T,S,P 분획): 22℃/20시간의 배양으로, 거의 모든 p24-RT-Nef-p17 융합 단백질이 세포 추출물의 가용성 분획으로 회수되었다(도 1A 참조). 30℃/20시간의 성장/유도로, 약 30%의 p24-RT-Nef-p17 단백질이 불용성 분획과 결합하였다(도 1A).
"동결/해동"(S2, P2 분획):
가용성(S1) 분획(22℃에서 20시간 유도)을 -20℃에서 보존하였다. 해동하고 20,000g/30분에서 원심분리하였다: S2 및 P2(1/10부피로 재현탁시킴).
DTT 함유 파괴 완충액: 거의 모든 p24-RT-Nef-p17 융합 단백질이 여전히 가용성임(1 내지 5%만 침전됨)(도 1B 참조).
DTT 비함유 파괴 완충액: 85 내지 90%의 p24-RT-Nef-p17가 여전히 가용성임(도 1B).
도면:
도 1A - 쿠마시에 염색 및 웨스턴 블롯.
도 1B - p24-RT-Nef-p17 용해도 검정
F4 단백질을 실시예 7에서 정제 방법 I를 사용하여 정제하였다.
하기 실시예에 대한 세포 성장 및 유도 조건 및 세포 추출물 제조는 다른 조건이 명시되지 않는 한(예를 들어, 온도, 파괴 완충액의 조성), 실시예 1에서 기술된 바와 같다.
2. 코돈 최적화된 F4
하기 폴리누클레오티드 서열은 코돈 최적화되므로써 이러한 코돈 사용은 E.coli에서 고도로 발현된 유전자에서의 코돈 사용과 유사하게 된다. 아미노산 서열은 비-코돈 최적화된 F4에 대해 상기 기재된 것과 동일하다.
F4co에 대한 누클레오티드 서열:
p24 서열은 진하게 표시됨.
Nef은 밑줄쳐 짐.
박스: 유전적 구성에 의해 도입된 누클레오티드
비-코돈 최적화된 F4와 관련하여 사용된 절차가 코돈 최적화된 서열에 대해 적용되었다.
재조합 플라즈미드에 대한 상세한 내용:
명칭: pRIT15513 (랩명: pET28b/p24-RT-Nef-pl7)
숙주 벡터: pET28b
레플리콘: colEl
선택: 카나마이신
프로모터: T7
삽입: p24-RT-Nef-pl7 융합 유전자, 코돈 최적화됨.
코돈 최적화된 F4 유전자를 B834(DE3) 스트레인의 recA- 유도체인 E.coli BLR(DE3)에서 발현시켰다. RecA 변이는 추정되는 람다 파지의 생성을 억제한다.
예비 배양물을 진탕 플라스크 내에서 37℃에서 미드-로그 페이스(A620:0.6)까지 배양한 후, 4℃에서 밤새 저장하였다(고정상 배양물을 피하기 위해).
배양물을 1% 글루코스 및 50㎍/ml 카나마이신이 보충된 LBT 배지에서 배양시켰다. 글루코스의 성장 배지로의 첨가는 기저 재조합 단백질 발현을 감소시키는 데 유리하다(lacUV5 프로모터의 cAMP 매개된 억제해제를 피함).
4℃에서 밤새 저장된 10ml의 배양물을, 카나마이신을 함유하는 LBT 배지(글루코스 비함유) 200ml를 접종하는 데 사용하였다. 배양물을 37℃에서 배양하고, O.D.620이 0.6에 도달하면, IPTG를 첨가하였다(최종 1mM). 배양물을 22℃에서 추가 19시간(밤새) 동안 접종하였다. 샘플을 유도 전 및 19시간 유도시에 수거하였다.
추출물 제조는 하기와 같았다:
세포 펠릿을 샘플 완충액(이론상 10의 O.D.)에 재현탁시키고, 비등시키고, 직접 SDS-PAGE에 로딩하였다.
SDS-PAGE 및 웨스턴 블롯 분석:
미정제 추출물 샘플을 10% 환원성 SDS-PAGE에서 수행하였다.
p24-RT-Nef-p17재조합 단백질을 쿠마시에 블루 염색(도 2) 및 웨스턴 블롯(WB)에 의해 검출하였다.
쿠마시에 염색: p24-RT-Nef-p17 단백질은 하기와 같이 나타났다:
±130kDa에서 하나의 밴드(계산된 MW로 맞춤)
MW 이론치: 128,967 달톤
MW 겉보기 수치: 130 kDa
웨스턴 블롯 분석:
시약 = - 래빗 폴리클로날 항 RT(래빗 PO3L16)
희석비: 1/10,000
- 래빗 폴리클로날 항 Nef-Tat(래빗 388)
희석비 1/10,000
- 알칼리 포스파타제-컨쥬게이트 항 래빗 항체
희석비: 1/7500
22℃에서 19시간 유도 후, 재조합 BLR(DE3) 세포는 10 내지 15%의 전체 단백질로부터 매우 높은 수준에 걸쳐 F4 융합체를 발현시켰다.
원시 유전자로부터 F4를 비교하면, 코돈 최적화 유전자로부터의 F4 재조합 생성물 프로파일은 상당히 단순화되었다. 60kDa에서의 F4 관련 주밴드 뿐만 아니라 그 아래에서 부밴드가 사라졌다(도 2 참조). F4를 발현하는 B834(DE3) 재조합 스트레인과 비교하면, F4co를 생성하는 BLR(DE3) 스트레인은 하기의 이점을 갖는다: 재조합 생성물의 덜 복잡한 밴드 패턴의 F4 전장 단백질의 높은 생성율.
실시예 2: P51RT(절두된, 코돈 최적화된 RT)의 작제 및 발현
아미노산 428-448 사이의 RT/p66 영역은 E.coli 프로테아제에 대해 민감하다. P51 작제물은 Leu 427에서 종료되어, RN아제H 도메인의 제거를 초래한다(도 3의 RT 서열 배열 참조).
RT 원시 유전자 서열에서 확인된 추정되는 E.coli "프레임쉬프트(frameshifte)" 서열이 또한 제거되었다(p51 유전자의 코돈 최적화에 의해).
p51 합성 유전자 설계/작제:
합성 p51 유전자의 서열을 E.coli 코돈 사용에 따라 설계하였다. 이에 따라, 코돈 사용이 E.coli에서 고도로 발현된 유전자에서의 코돈 사용과 유사하도록 코돈 최적화하였다. 합성 유전자는 하기와 같이 작제하였다: 32개의 올리고누클레오티드를 단일 단계 PCR로 어셈블링하였다. 2차 PCR에서, 전장 어셈블리를 말단 프라이머를 사용하여 증폭시키고, 형성된 PCR 생성물을 pGEM-T 중간 플라즈미드로 클로닝하였다. 유전자 합성 동안에 도입된 포인트 에러를 수정한 후, p51 합성 유전자를 pET29a 발현 플라즈미드로 클로닝하였다. 이러한 재조합 플라즈미드를 B834(DE3) 세포로 형질변환하는 데 사용하였다.
재조합 단백질 특징:
p51 RT 누클레오티드 서열
박스: 유전적 구성에 의해 도입된 아미노산
아미노산 서열:
박스: 유전적 구성에 의해 도입된 아미노산
K (리신): 트립토판(w) 대신. 효소 활성을 제거하기 위해 도입된 변이.
길이, 분자량, 등전점(IP):
433 AA, MW : 50.3 kDa,, IP: 9.08
B834(DE3) 세포에서의 p51 발현:
P51 발현 수준 및 재조합 단백질 용해도를 RT/p66 생성 스트레인과 유사하게 평가하였다.
p51 발현 수준:
유도 조건
: 37℃에서 5시간 동안 세포 배양/유도(+1mM IPTG).
파괴 완충액
: 50 mM 트리스/HCl, pH:7.5, ImM EDTA, +/- ImM DTT.
웨스턴 블롯 분석:
시약 : - 래빗 클로날 항 RT(래빗 PO3L16)(희석비:1/10,000)
- 알칼리 포스페이트-컨쥬게이트 항 래빗 항체(희석비: 1/7500)
미정제 추출물(T), 불용성 펠릿(P) 및 상청액(S)에 상응하는 세포 분획을 10% 환원성 SDS-PAGE에서 분석하였다.
쿠마시에 염색된 겔 및 웨스턴 블롯(도 4)으로 도시된 바와 같이, P51의 매우 높은 발현(전체 단백질의 15 내지 20%)이 관찰되었으며, P66에 대해 관찰된 발현보다 높았다.
p51 및 p66 단백질(37℃에서 5시간 유도 후) 둘 모두에 대해, 80%의 재조합 생성물이 세포 추출물의 가용성 분획(S1)으로 회수되었다(도 4 참조). 30℃에서 발현된 경우, 99%의 재조합 단백질이 가용성 분획과 결합하였다(미도시됨).
p51 웨스턴 블롯 패턴은 다중밴드이나, P66에 대해 관찰된 것보다 덜 복잡하였다.
용해도 검정
용해도 검정: 환원(DTT 함유 파괴 완충액) 및 비환원 조건 하에서 동결/해동의 가용성(S1) 분획(37℃에서, 5시간 유도)을 제조하였다. 해동 후, S1 샘플을 20,000g/30분에서 원심분리하여 S2 및 P2를 생성하였다(p2는 1/10 부피로 재현탁되었다).
환원 조건 뿐만 아니라 비환원 조건 하에서 제조된 가용성 분획(S1)의 동결/해동 후, 99%의 p51 및 p66은 여전히 가용성 (S2) 분획으로 수거되었다. 단지 1%가 침전물(P2)에서 발견되었다. 이는 도 5에 도시된다.
실시예 3: 링커 함유 또는 비함유의 p17-Nef 및 Nef-p17의 작제 및 발현
이중 융합 단백질을 링커 함유 및 비함유로 작제하였다. 두개의 융합 파트너 간에 유효 상호작용을 감소시키는 것을 목적으로 하는 링커는 다음과 같다:
재조합 플라즈미드 작제:
● pET29a/Nef-p17 발현 벡터:
Nef-p17 융합 유전자를 F4 재조합 플라즈미드로부터 PCR에 의해 증폭시켰다. PCR 생성물을 중간 pGEM-T 클로닝 벡터로 클로닝하고 이어서 pET29a 발현 벡터로 클로닝하였다.
● pET28b/p17-Nef 발현 벡터:
Nef 유전자를 F4 재조합 플라즈미드로부터 PCR에 의해 증폭시켰다. 이 PCR 생성물을 중간 pGEM-T 클로닝 벡터로 클로닝하고, 이어서 p17 유전자를 지닌 프레임 융합체의 C 말단으로서 pET28b/p17 발현 벡터로 클로닝하였다.
● pET29a/Nef-링커-p17 및 pET28b/p17-링커-Nef 발현 벡터:
헥사펩티드 링커를 코딩하는 18 bp DNA 단편(GSGGGP)을 부위 특이적 변이 유발법("Gene Tailor Site-Directed Mutagenesis System", Invitrogen)에 의해 Nef와 p17 융합 파트너 사이에 삽입시켰다.
재조합 단백질 특징:
● 길이, 분자량, 등전점(IP)
Nef-pl7 (NP로 명명됨): 340 AA, MW: 38.5 kDa, IP:7.48
Nef-
-P17 (NLP로 명명됨): 346 AA, MW:38.9 kDa, IP: 7.48
pl7-Nef (PN으로 명명됨): 342 AA, MW: 38.7 kDa, IP: 7.19
p17-
-Nef(PLN으로 명명됨): 348 AA, MW: 39.IkDa, IP: 7.19
● 아미노산 서열 및 폴리누클레오티드 서열:
Nef-p17 누클레오티드 서열
박스: 유전적 구성에 의해 도입된 아미노산
Nef 서열은 진하게 표시됨.
p17-Nef 누클레오티드 서열:
박스: 유전적 구성에 의해 도입된 아미노산
p17 서열은 진하게 표시됨.
Nef-링커-p17 누클레오티드 서열:
Nef-링커-p17(NLP)
헥사펩티드 링커
박스: 유전적 구성에 의해 도입된 아미노산
p17-링커-Nef 누클레오티드 서열:
P17-링커-Nef (PLN)
헥사펩티드 링커
박스: 유전적 구성에 의해 도입된 아미노산
링커 존재 또는 부재에서의 Nef-p17, p17-Nef 융합체의 발현 비교
네개의 재조합 스트레인을 F4 및 Nef 생성 스트레인과 유사하게 3시간 동안 30℃에서 유도하였다. 미정제 추출물을 제조하고, 쿠마시에 염색된 겔 및 웨스턴 블롯팅에 의해 분석하였다.
웨스턴 블롯 분석:
시약 : - 래빗 클로날 항 RT(래빗 PO3L16)(희석비:1/10,000)
- 알칼리 포스페이트-컨쥬게이트 항 래빗 항체(희석비: 1/7500)
도 6에 도시된 바와 같이, 링커 존재 또는 부재 하에서 Nef-p17 및 p17-Nef 융합체는 높은 수준으로 발현되었다(10% 전체 단백질).
웨스턴 블롯에서, 4개의 이중 융합 작제물을 다중 밴드 패턴을 나타내지만, F4에 대해 관찰된 것보다 덜 복잡하였다. 단독으로 발현되는 경우, Nef 및 p17 단백질은 단일 밴드 패턴을 나타내었다.
링커 펩티드의 부재하에 Nef-p17(NP) 및 p17-Nef(PN) 융합체를 발현시키는 스트레인을 추가로 분석하였다(용해도 검정, 하기 참조).
Nef-p17 및 p17-Nef 용해도 검정:
Nef-p17 및 p17-Nef 단백질을 F4 및 Nef 생성 스트레인과 유사하게 유도하였다.
유도 조건
: 30℃에서 3시간 동안 세포 배양/유도(+1mM IPTG).
파괴 완충액
: 50 mM 트리스/HCl, pH:8, 50mM NaCl, 1mM DTT.
새로운 세포 추출물:
세포 추출물을 (비환원 조건 하에서) 준비하고, 미정제 추출물(T), 불용성 펠릿(P), 및 상청액(S1)에 상응하는 분획을 쿠마시에 염색된 겔 및 웨스턴 블롯으로 분석하였다.
쿠마시에 염색된 겔 및 웨스턴 블롯에 대해 도 7에 도시된 바와 같이, 거의 모든 Nef-p17, p17-Nef 뿐만 아니라 Nef 단백질이 세포 추출물의 가용성 분획(S)으로 회수되었다. F4 작제물에 대해 5 내지 10%의 재조합 단백질이 이미 펠릿 분획에서 회수되었다.
결론:
시험된 모든 이중 작제물은 고도로 발현되었다(전체 단백질의 10% 초과). P17-Nef 및 Nef-p17 융합 단백질은 F4 보다 가용성이었다. 둘 모두 덜 복잡한 WB 패턴을 제공하였다.
실시예 4: p24-RT*-Nef-p17(F4*)의 작제물 및 발현
F4*는, 592 위치에서 메티오닌이 리신으로 치환된 F4(p24-RT/p66-Nef-p17)의 변이형이다. 이러한 메티오닌은 F4 정제 실험의 Q 세파로스 용리물 샘플에 대해 수행되는 N 말단 시퀀싱에 의해 지지되는 바와 같이 추정되는 내부 전사 "개시" 자리이다. 사실상, Q 용리물 샘플에 존재하는 62kDa에서의 주가되는 F4 관련된 작은 밴드는 메티오닌 592에서 시작된다.
메티오닌은 리신에 의해 치환된다: RMR → RKR. RKR 모티프는 본래 클레이드 A RT 서열에 존재한다.
CD4-CD8 에피토프에 대한 이러한 변이에 대한 영향을 평가하였다:
- 하나의 HLA-A3 CTL 에피토프(A* 3002)가 소실되었으나, 9개의 다른 HLA-A3 에피토프가 RT 서열에 존재한다.
- 헬퍼 에피토프가 이러한 영역에서 전혀 확인되지 않았다.
재조합 단백질 특징:
● 길이, 분자량, 등전점(IP):
1136 AA, 129 kDa, IP: 8.07
● 누클레오티드 서열:
p24 서열은 진하게 표시됨.
Nef 서열은 밑줄쳐짐.
박스: 유전적 구성에 의해 도입된 누클레오티드
● 아미노산 서열
P24 서열: 아미노산 1-232 (진하게)
RT 서열: 아미노산 235-795
Nef 서열: 아민노산 798-1002
P17 서열: 아미노산 1005-1136
박스: 유전적 구성에 의해 도입된 아미노산
K(리신): 메티오닌 대신(내부 "개시" 코돈)
K(리신)K: 트립토판(w) 대신. 효소 활성을 제거하기 위해 도입된 변이.
B834(DE3) 세포에서의 F4* 발현:
F4* 재조합 스트레인을 F4 비변이된 작제물과 유사하게 18시간 동안 22℃에서 유도하였다. 미정제 추출물을 제조하고, 쿠마시에 염색된 겔 및 웨스턴 블롯팅에 의해 분석하였다.
도 8에 도시된 바와 같이, F4*를 높은 수준(10% 전체 단백질)으로 발현되었고, 이는 F4와 비교하여 약간 더 높으며, 작은 62kDa 밴드는 사라졌다.
웨스턴 블롯 분석:
시약 : - 푸울 3 Mabs 항 p24 (JCl 3.1, JCl 6.1, IG8.1.1) (희석비 1/5000)
- 래빗 폴리클로날 항 RT (래빗 PO3L 16) (희석비: 1/10000)
- 래빗 폴리클로날 항 Nef-Tat (래빗 388) (희석비 1/10000)
- 알칼리 포스파타아제-컨쥬게이트 항 래빗 항체(희석비: 1/7500)
- 알칼리 포스파타아제-컨쥬게이트 항 마우스 항체(희석비: 1/7500)
실시예 5: F3 및 F3*(변이 F3)의 작제 및 발현
F3 (pl7-p51-Nef) 및 추정되는 내부 메티오닌 개시 자리가 리신으로 대체된 F3* (pl7-p51*-Nef).
F3 및 F3* 융합체는 p24와 함께 사용될 수 있다.
재조합 플라즈미드 작제:
F3: p51을 엔코딩하는 서열을 pET29a/p51 발현 플라즈미드로부터 절삭하고(ScaI 및 StuI DNA 단편으로서), p17 및 Nef 서열을 지닌 프레임 융합체에서와 같이 StuI 자리(p17과 Nef 유전자 사이에 위치함)에서, pET28b/p17-Nef 플라즈미드와 결찰시켰다. 형성된 융합 작제물 p17-p51-Nef를 F3로 명명하였다.
F3*: 추정되는 내부 메티오닌 개시화 자리의 변이를, 시스템("Gene Tailor Site-Directed Mutagenesis system"(Invitrogen))을 사용하여 달성하므로써 F3* 작제물을 생성하였다.
F3 및 F3* 플라즈미드를 B834(DE3) 세포를 형질변환하는데 사용하였다.
재조합 단백질 특징:
● 길이, 분자량, 등전점 (IP)
770 AA, 88.5 kDa, IP:8.58
● 누클레오티드 서열(F3*에 대해)
P17: 진한 서열
P51: 대문자 서열
Nef: 소문자 서열
박스: 유전적 구성에 의해 도입된 누클레오티드
● 아미노산 서열(F3에 대해)
P17 서열: 아미노산 1-134(진하게 표시됨)
P51 서열: 아미노산 137-562
Nef 서열: 아미노산 565-770
박스: 유전적 구성에 의해 도입된 아미노산
메티오닌 494가 F3* 작제물에서 리신(K)에 의해 대체
K(리신)K: 트립토판(W) 대신. 효소 활성을 제거하기 위해 도입된 변이.
B834(DE3) 세포에서의 F3 발현:
F3 발현 수준 및 재조합 단백질 용해도를 F4(p24-p66-Nef-p17) 및 p17-Nef(F2) 생성 스트레인과 유사하게 평가하였다.
유도 조건
: 3시간 동안, 37℃에서 세포배양, 30℃에서 유도(+1mM IPTG).
파괴 완충액
: F4: 50 mM 트리스/HCl, pH:8.0, 50mM NaCl, 1mM EDTA, +/- 1mM DTT
F2: 50 mM 트리스/HCl, pH:8.0, 50mM NaCl, 1mM EDTA, DTT 비함유
F3: 50 mM 트리스/HCl, pH:7.5, 50mM NaCl, 1mM EDTA, +/- 1mM DTT
웨스턴 블롯 분석:
시약 : - 래빗 폴리클로날 항 RT(래빗 PO3L16)(희석비:1/10,000)
- 래빗 폴리클로날 항 Nef-Tat(래빗 388)(희석비:1/10,000)
- 알칼리 포스파타제-컨쥬게이트 항 래빗 항체(희석비: 1/7500)
"새로운" 세포 추출물
미정제 추출물(T), 불용성 펠릿(P) 및 상청액(S)에 상응하는 세포 분획을 10% 환원성 SDS-PAGE에서 분석하였다. 도 9에 도시된 바와 같이, F3 융합 단백질이 높은 수준으로 발현되었다(10% 전체 단백질). 5 내지 10%의 F4 생성물이 펠릿 분획과 이미 결합되어 있지만, 거의 모든 F3가 세포 추출물의 가용성 분획(S)으로 회수되었다. WB 패턴은 F4와 비교하여 단순화되었다.
B834(DE3) 세포에서의 F3* 발현:
F3* 재조합 스트레인을 F3 비변이 작제물과 유사하게 3시간 동안 37℃에서 유도하였다. 미정제 세포 추출물을 제조하고, 쿠마시에 염색된 겔 및 웨스턴 블롯팅에 의해 검색하였다. 도 10에 도시된 바와 같이, F3* 융합 단백질이 매우 높은 수준으로 발현되었다(10 내지 20% 전체 단백질). F3와 비교하여 WB 패턴이 단순하였으며, +/- 32kDa에서 매우 희미한 밴드(WB에서만 검출됨)가 사라졌다.
실시예 6: F4(p51) 및 F4(p51)*의 작제 및 발현
RT/p51을 F4 융합 작제물(RT/p66 대신에)에 사용하였다.
F4(p51) = p24-p51-Nef-pl7
F4(p51)* = p24-p51*-Nef-pl7 - 변이 F4(p51): 추정되는 내부 메티오닌 개시 자리(RT 부분에 존재함)를 리신으로 치환시켜 항원 패턴을 더욱 단순화시켰다.
재조합 플라즈미드 작제:
F4(p51) : p51을 엔코딩하는 서열을 pET29a/p51 발현 플라즈미드로부터 PCR에 의해 증폭시켰다. 제한 자리를 PCR 프라이머로 혼입하였다(코딩 서열의 5'말단에 NdeI 및 StuI, 3' 말단에 AvrII). PCR 생성물을 pGEM-T 중간 플라즈미드로 클로닝하고, 시퀀싱하였다. pGem-T/p51 중간 플라즈미드를 NdeI 및 AvrII에 의해 제한시키고, p51 단편을 NdeI 및 NheI에 의해 제한된 pET28b/p24-RT/p66-Nef-p17 발현 플라즈미드로 결찰시켰다(RT/p66 서열을 절삭시킴). 결찰은 T4 DNA 리가아제의 존재 하에서 적합한 농도로 분해 반응을 결합하므로써 수행하였다. 결찰 생성물을 사용하여 DH5αE.coli 세포를 형질변환시켰다. 올바른 번역 판독 프레임으로의 p51의 삽입에 대한 검증(F4 융합체에서 RT/p66 대신에)을 DNA 시퀀싱에 의해 확인하였다. 형성된 융합 작제물 p24-RT/p51-Nef-p17이 F4(p51)이다.
F4(p51)*: 추정되는 내부 메티오닌 개시 자리(RT/p51에 존재함)의 변이를 시스템("Gene Tailor Site-Directed Mutagenesis system"(Invitrogen))을 사용하여 달성하므로써 F4(p51)*을 생성하였다.
F4(p51) 및 F4(p51)* 발현 플라즈미드를 사용하여 B834(DE3) 세포를 형질변환시켰다.
재조합 단백질 특징:
● 길이, 분자량, 등전점(IP)
1005 AA, 114.5 kDa, IP: 8.47
● 누클레오티드 서열(F4(p51)*에 대해)
P24: 진하게 표시된 서열
P51: 대문자 서열
Nef: 소문자 서열
P17: 밑줄쳐 진 서열
박스: 유전적 구성에 의해 도입된 누클레오티드
● 아미노산 서열(F4(p51)*에 대해)
P24: 아미노산 1-232
P51: 아미노산 237-662
Nef: 아미노산 666-871
P17: 아미노산 874-1005
K(리신): 메티오닌 대신(내부 "개시" 코돈)
K(리신)K: 트립토판(w) 대신. 효소 활성을 제거하기 위해 도입된 변이.
834(DE3) 세포에서의 F4(p51) 발현:
F4(p51) 발현 수준 및 재조합 단백질 용해도를 F4 발현 스트레인과 유사하게 평가하였다.
유도 조건
: 19시간 동안, 37℃에서 세포배양, 22℃에서 유도(+1mM IPTG).
파괴 완충액
: 50 mM 트리스/HCl, pH:7.5, 1mM EDTA, 1mM DTT
웨스턴 블롯 분석:
시약 : - 래빗 폴리클로날 항 RT(래빗 PO3L16)(희석비:1/10,000)
- 래빗 폴리클로날 항 Nef-Tat(래빗 388)(희석비:1/10,000)
- 알칼리 포스파타제-컨쥬게이트 항 래빗 항체(희석비: 1/7500)
미정제 추출물(T), 불용성 펠릿(P) 및 상청액(S)에 상응하는 세포 분획을 10% 환원형 SDS-PAGE에서 분석하였다.
도 11에 도시된 바와 같이, F4(p51)은 F4와 유사하게 높은 수준(10%의 전체 단백질)으로 발현되었다. 거의 모든 F5(p51)가 세포 추출물의 불용성 분획(S)으로 회수되었다. 항-Nef-tat 시약으로 검출하여, F4(p51)의 WB 패턴은 단순화된 것으로 나타났다(+/- 60kDa 미만으로 절두된 생성물의 감소).
834(DE3) 세포에서의 F4(p51)* 발현:
F4(p51)* 재조합 스트레인을 F4(p51) 비돌연변히 작제물인, F4 및 F4*와 유사하게 18시간 동안 22℃에서 유도하였다. 미정제 세포 추출물을 제조하고, 쿠마시에 염색된 겔 및 웨스턴 블롯에 의해 분석하였다. 도 12에 도시된 바와 같이, F4(p51) 및 F4(p51)* 융합체의 높은 발현이 관찰되었고, 10% 이상의 전체 단백질을 나타내었다. WB 패턴: +/- 60kDa 미만의 절두된 생성물의 감소. 또한, F4(p51)* 작제물에 대해, 47kDa 밴드(내부 개시 자리로 인해)가 사라졌다.
실시예 7: F4, F4(p51)* 및 F4*의 정제 - 정제 방법 I
4개의 HIV 항원 p24-RT-Nef-p17을 포함하는 F4 융합 단백질을 하기 기본 단계를 포함하는 정제 방법 I에 따라 E.coli 균질화물(homogenate)로부터 정제하였다.
ㆍ F4의 황산암모늄 침전
ㆍSO3 프락토겔 양이온 교환 크로마토그래피(포지티브 모드)
ㆍ옥틸 세파로스 소수성 상호작용 크로마토그래피(포지티브 모드)
ㆍQ 세파로스 FF 음이온-교환 크로마토그래피(포지티브 모드)
ㆍ SDS의 존재 하에서의 슈퍼덱스 200 겔여과 크로마토그래피
ㆍ투석 및 농축
추가로, F4(p51)* 융합 단백질(추가의 변이 Met592Lys를 지닌 코돈 최적화된 p51에 의해 치환된 RT) 및 F4* 단백질(추가의 Met592Lys 변이를 지닌 F4)을 동일한 정제 방법 I을 사용하여 정제하였다.
단백질 정량화
ㆍ 전체 단백질을 로우리(Lowry) 검정을 사용하여 측정하였다. 단백질 농도를 측정하기 전에, 모든 샘플을 PBS, 0.1% SDS에 대해 밤새 투석하여 방해 물질(우레아, DTT)를 제거하였다. BSA(Pierce)를 표준물질로서 사용하였다.
SDS-PAGE 및 웨스턴 블롯
ㆍ 샘플을 환원성 또는 비환원성 SDS-PAGE 샘플 완충액(+/- β-메르캅토에탄올) 중에서 제조하고, 95℃에서 5분 동안 가열하였다.
ㆍ 단백질을, 1mm 두께의 프리-캐스트 노벡스 트리스-글리신 겔(pre-case Novex Tris-glycine gel) 또는 크리테리온 겔(Criterion gel)(Bio-Rad)을 사용하여 75분 동안 200V에서 4 내지 20% SDS-폴리아크릴아미드 겔 상에서 분리하였다.
ㆍ 단백질을 쿠마시에-블루 R250으로 가시화시켰다.
ㆍ 웨스턴 블롯(WB)을 위해, 단백질을 1.5시간 동안 100V에서 또는 밤새 30V에서 1.5시간 동안 4℃에서 SDS 겔에서 니트로셀룰로오스 멤브레인(Bio-Rad)으로 이동시켰다.
ㆍ F4를 상이한 항원에 대한 모노클로날 항체, 항 p24, 항 Nef-Tat, 항 RT(때로는 항 p24와 항 Nef-Tat의 혼합물이 최대 단백질 밴드 수를 검출하기 위해 사용되었다)를 사용하여 검출하였다.
ㆍ 알칼리 포스파타제 컨쥬게이트된 항 마우스 또는 항 래빗 항체를 일차 항체에 결합시키고, 단백질 밴드를 기질로서 BCIP 및 NBT를 사용하여 가시화하였다.
항 E.coli 웨스턴 블롯
ㆍ 5㎍ 단백질(Lowry)을 SDS-PAGE에 의해 분리시키고, 상기와 같이 니트로셀룰로오스 멤브레인으로 이동시켰다.
ㆍ 잔류하는 숙주 세포 단백질을 폴리클로날 항 E.coli 항체를 사용하여 검출하였다. 단백질 밴드를 상기와 같이 알칼리-포스파타제로 가시화하였다.
정제 방법 I
방법 I은 황산암모늄에 의한 침전 및 4개의 크로마토그래피 단계를 포함한다:
ㆍ E.coli를 10mM DTT, 1mM PMSF, 1mM EDTA의 존재 하에 OD50(~360mL)에서 pH 8.0에서 50mM 트리스 완충액 중에 균질화시켰다. 2개의 라니 경로(Rannie passage)를 1000bar에서 적용하였다.
ㆍ 세포 파편 및 불용성 물질을 20분 동안 14400 x g에서 원심분리하여 제거하였다.
ㆍ 황산암모늄(AS)을 3.8M 원액으로부터 최종 농도가 2.1M이 되도록 맑은 상청액에 첨가하였다. 단백질은 실온에서 약 2시간 동안 침전시킨 후, 원심 분리하여 펠릿화시켰다(14400 x g에서 10분). 펠릿을 pH 7.0에서 10mm 포스페이트 완충액에서 8M 우레아, 10mM DTT에서 재현탁시켰다.
ㆍ 항원을 8M 우레아 및 10mM DTT의 존재 하에서 pH 7.0에서 포스페이트 완충액 중에서 SO3 프락토겔 칼럼(Merck) 상에서 포획하였다. 칼럼을 세척하여 비결합 단백질을 용리시키고 이어서 170mM NaClf의 예비 용리 단계로 결합된 숙주 세포 단백질(HCP)를 제거하였다. 이후, F4를 포스페이트 완충액 중에서 pH 7.0에서 460mM NaCl, 8M 우레아, 10mM DTT로 용리시켰다.
ㆍ SO3 용리물을 pH 7에서 10mM 포스페이트 완충액으로 2회 희석하고 4M 우레아, 1mM DTT, 230mM NaCl의 존재 하에 pH 7.0에서 포스페이트 완충액 중에서 옥틸 세파로스 칼럼에 로딩시켰다. 세척 단계(평형화 완충액) 이후에, 결합된 F4를 25mM 트리스 완충액 중에서 pH 8.0에서 8M 우레아, 1mM DTT로 용리시켰다.
ㆍ 옥틸 용리물을 희석하고, pH 9.0으로 조절한 후, pH 9.0(25mM 트리스)에서 8M 우레아의 존재 하에 Q 세파로스 칼럼(Amersham Bioscience)에 결합시켰다. 비결합 단백질을 세척해내고(pH 9.0에서 8M 우레아, 25mM 트리스), 예비 용리 단계(8M 우레아 중의 90mM NaCl, 25mM 트리스, pH 9.0)에 의해 HCP 및 F4 분해 생성물을 제거하였다. F4를 pH 9.0에서 트리스 완충액 중에서 200mM NaCl, 8M 우레아를 사용하여 칼럼으로부터 탈착시켰다.
ㆍ Q 용리물의 분취액에 1% SDS를 첨가하고, 0.1% SDS 및 1mM DTT를 함유하는 PBS 완충액에 대해 투석하여 겔여과 칼럼(분석 등급 수퍼덱스 200, 일련의 두개의 16 x 60cm 칼럼)에 샘플을 주입하기 전에 우레아를 제거하였다. 관련 분획을 공정중 SDS-PAGE 분석 후에 푸울링시켰다.
ㆍ 샘플을 1ℓ의 0.5M 아르기닌, 10mM 트리스, 5mM 글루타티온, pH 8.5에 대해 밤새 투석 멤브레인(12-14 kDa 컷-오프)에서 실온에서 2회 투석하였다.
연속되는 정제 단계가 하기 플로우챠트로 표시된다.
정제 플로우시트
360ml 균질화물 OD50(라니)
50mM 트리스 pH 8.0, 1 mM PMSF, 1OmM DTT, 2 mM EDTA
↓
정화
14400 x g에서 20분 원심분리
↓
황산암모늄 침전
실온에서 2시간 1.2M AS, 14400 x g에서 원심분리 10분
↓
8M 우레아, 10mM PO4, 1OmM DTT, pH 7.0에서 펠릿 재현탁됨
↓
(+) SO3 프락토겔 EMD 650 (M) 크로마토그래피
pH 7.0, 8M 우레아, 1OmM DTT, 170mM NaCl에서 예비 용리, 460 mM NaCl에서 용리
↓
pH 7.0으로 2배 희석, 4M 우레아, 5mM DTT, 230mM NaCl
↓
(+) 옥틸 세파로스 크로마토그래피
pH 7.0, 4M 우레아, 230 mM NaCl; 8M 우레아, 20mM 트리스, pH 8.0에서 용리
↓
약 2배 희석, pH 9.0으로 조절 (NaOH)
↓
(+) Q 세파로스 FF 크로마토그래피
트리스 pH 9.0, 8 M 우레아; 90 mM NaCl 예비 용리, 20OmM NaCl 용리
↓
1% SDS 첨가
↓
투석
→ TBS, 0.1% SDS, pH 8.5
↓
슈퍼덱스 200 겔여과 크로마토그래피 16 x 120 cm
TBS, 0.1% SDS, pH 8.5
↓
IPA SDS-PAGE
↓
푸울/농축/투석
→ 포뮬레이션 적합성 완충액
IPA -공정중 분석
모든 완충액은 다르게 명시하지 않는 한 1mM DTT를 함유한다.
F4의 정제 결과
정제 단계 이후의 SDS-PAGE/웨스턴 블롯
도 13은 F4의 정제 동안에 수거된 F4 함유 분획의 SDS 겔 및 항-p24-Nef-Tat 웨스턴 블롯을 나타낸다.
E.coli 균질화물이 도13의 레인 2에 도시되어 있으며, F4는 약 10%의 전체 단백질을 나타내는 것으로 추정된다(쿠마시에 블루 염색된 SDS-겔의 밀도 스캔). 원심분리 후, F4의 가용성 분획을 정화된 상청액(레인 3)으로 회수하였다. 황산암모늄 침전 단계는 많는 불순물(레인 4)을 제거하였고, 후속되는 크로마토그래피 단계를 위해 단백 전하(proteic charge)를 감소시켰다. 추가로, 침전물을 재현탁시키는 데 사용된 8M 우레아는 F4와 HCP의 착물을 해리시켜 F4의 완전한 포획과 SO3 수지로부터의 정량적 용리를 허용하였다. 레인 5에 도시된 SO3 용리물은 F4가 상당히 풍부하나, 불균질 패턴은 기본적으로 변하지 않고 잔류하였다. 소수성 옥틸 세파로스 칼럼은 주로 저분자량(LMW) HCP 및 F4 분해 생성물(레인 6)을 제거하였으며, 이에 따라 F4 패턴을 단순화시켰다. Q 세파로스 크로마토그래피는 추가로 F4 패턴을 단순화시켰으며, 많은 불순물(레인 7)을 제거하였다. E.coli 불순물에 있어서 최종 순도는 이 단계 후에 얻어졌다. 사실상, 숙주 세포 단백질이도 항 -E.coli 웨스턴 블롯 분석에 의해 Q 용리물 중에서 전혀 검출되지 않았다. 따라서, 생성된 정제된 F4는 F4Q로서 언급된다. 슈퍼덱스 200 칼럼은 전장 F4로부터 LMW F4 분해 생성물을 분리시켜 슈퍼덱스 200 용리물(레인 8) 중에서 F4 균질성을 향상시켰다. 용어 F4S는 방법 I의 전체 계획에 따라 정제된 F4를 나타내는 데 사용될 수 있다.
항 E. coli 웨스턴 블롯은 F4의 정제 동안에 수거된 동일한 분획에 대해 수행하였다. 항 E.coli 웨스턴 블롯에 대한 가시적인 밴드의 부재는 HCP 오염도가 Q 용리물 및 슈퍼덱스 용리물중에서 1% 미만임을 나타낸다.
F4 및 단백질 회수
정제 공정의 각 단계에서 F4 회수율을 SDS-PAGE 및 웨스턴 블롯 분석에 의해 추정하였다. SDS-겔로부터 F4 회수율을 추정하기 위해 샘플 부피를 정제 동안에 수거된 상이한 분획의 부피에 상응하는 SDS-겔에 로딩하였다.
하기 표 1은 F4 오염 분획 중 단백질 회수율을 보여준다.
표 1: 정제 공정 동안에 수거된 F4 포지티브 분획(360ml 균질화물) 중에서의 단백질 회수율. 단백질 농도는 로우리 검정으로 측정되었다.
상기 표는 정화 단계 이후에 상청액에서 회수된 F4를 포함하는 균질화물 및 가용성 물질중 단백질의 양을 보여주는 것이다. AS 침전 단계에서는 HCP의 상당량을 제거하여, SDS 겔에 대해 F4가 단지 소량 손실된 것으로 관찰되었다. SO3 크로마토그래피는 추가로 많은 불순물을 제거하였으며, SDS-겔은 F4의 높은 회수율을 나타낸다. 대조적으로, 옥틸 세파로스 및 Q 세파로스 칼럼 둘 모두에 의한 측정된 약 50%의 단백질 회수율은 또한 F4의 손실이 동반되었다. 겔여과 크로마토그래피 후의 단백질 회수율은 약 50% 였다. SDS-겔은 많은 LMW 단백질 밴드(F4 분해 밴드)가 제거되고, 동시에 F4 회수율이 감소되었음을 보여준다.
F4 수율
상기 표 1은 약 36mg의 정제된 F4가 OD50에서 360ml 균질화물로부터 수득될 수 있음을 보여준다. 그러므로, OD50에서 1ℓ균질화물은 약 100mg의 정제된 F4를 수득해야 할 것이다. 70 내지 90의 OD가 발효 공정 동안에 달성되기 때문에, 발효기 리터당 수율은 이에 따라 140 내지 180mg 범위의 F4가 될 것이다.
F4(p51)*의 정제 결과
F4(p51)* 융합 작제물을 변경없이 상기 기술된 정제 방법 I을 사용하여 정제하였다.
정제 공정 이후의 SDS-PAGE/웨스턴 블롯
F14는 F4(p51)*의 정제 동안에 수거된 F4(p51)* 함유 분획의 SDS 겔 및 항 p24/항 Nef-Tat 웨스턴 블롯을 도시한 것이다.
SDS-겔 및 웨스턴 블롯은 F4(p51)* 융합 단백질이 전체적으로 황산암모늄 침전 단계 뿐만 아니라 크로마토그래피 단계 동안에 F4와 유사하게 거동함을 보여준다. 정제된 F4(p51)*는 정제된 F4와 유사한 불균질성 패턴을 가졌다.
항 E.coli 웨스턴 블롯은 HCP 오염율이 Q 용리물 및 슈퍼덱스 용리물 둘 모두에서 1% 미만임을 나타냈다.
수율
약 25%의 F4(p51)*이 균질화물의 불용성 분획에서 손실되었다. 추가로, 상기 정제 방법은 이러한 단백질에는 적합하지 않기 때문에, 크로마토그래피 단계에서 손실이 관찰된 것이다. 그러므로, F4(p51)*의 전체 회수율은 균질화물 리터당 약 25mg(OD50)으로 감소되었다. OD 177에서 1리터 배양물로 외삽하였으며, 이에 따라 85mg F4(p51)*의 범위로 수율이 얻어졌다.
F4*의 정제 결과
F4* 융합 작제물을 변경 없이 상기 기술된 정제 방법을 사용하여 정제하였다.
정제 공정 이후의 SDS-PAGE/웨스턴 블롯
도 15는 F4*의 정제 동안에 회수된 F4* 함유 분획의 SDS 겔 및 항 p24-Nef-Tat 웨스턴 블롯을 도시한 것이다.
F4(p51)*에 있어서, F4*는 전체적으로 정제 절차 동안에 F4와 상당히 유사하게 거동함을 알 수 있다. 이 단백질은 SDS-겔 및 웨스턴 블롯에 의해 도시된 바와 같이 예상된 분획으로 회수되었다. 또한, 항 E.coli 웨스턴 블롯은 또한 Q 세파로스 칼럼 이후 이미 대부분의 HCP가 제거되었음을 보여준다.
수율
전체적인 회수량은 465ml 균질화물 OD50로부터 수득된 약 17mg의 정제된 F4*이다. OD 140에서 1ℓ 배양물로 외삽하면, 이에 따른 수율은 100mg F4*의 범위에 있을 것이다.
요약하면, 3개의 융합 단백질 F4, F4(p51)* 및 F4*는 정제 방법 I을 사용하여 정제하였다. 도 16에서 SDS 겔은 Q 세파로스 단계 이후 및 슈퍼덱스 200 칼럼에 의한 LWM 밴드의 제거 이후 작제물의 불균질성이 상이한 수준을 나타내는 3개의 정제된 단백질을 비교한 것이다.
실시예 8: F4 및 F4co(코돈 최적화됨)의 정제 - 정제 방법 II
정제 방법 II
상기 방법 I과 비교하여 단순화된 정제 절차인 방법 II가 개발되었다. 방법 II는 단지 2개의 크로마토그래피 단계 및 완충액 교체를 위한 최종 투석/투석여과로 구성된다. 특히, CM 하이퍼Z(CM hyperZ) 크로마토그래피 칼럼(BioSepra)이 방법 I의 정화 단계, 황산암모늄 침전 및 SO3 크로마토그래피(실시예 7)를 대체하기 위해 도입된다. 방법 II는 F4 및 전체 코돈 최적화된 F4("Fco") 둘 모두를 정제하는 데 사용되었다. F4co에 있어서, 두개의 상이한 형태의 방법 II가 수행되었는 데, 한 방법은 카르복시아미드화를 포함하고, 다른 한 방법은 포함하지 않는다. 카르복시아미드화 단계의 목적은 단백질의 산화적 응집을 억제하는 것이다. 이러한 카르복시아미드화는 제 1 크로마토그래피 단계(CM 하이퍼Z) 이후에 수행된다.
ㆍ E. coli (F4 또는 F4co)를 발현하는 OD90에서 10mM DTT의 존재 하에서 pH 8.0에서 50mM 트리스 완충액에서 균질화하였다. 2개의 라니 경로를 1000bar에 적용하였다.
ㆍ8M 우레아를 균질화물에 첨가한 후에 pH 7에서 포스페이트 완충액 중에서 8M 우레아로 평형화된 CM 하이퍼Z 수지(BioSepra)에 가하였다. 배치식으로 항원을 포획하였다. 이후, 수지를 칼럼에 패킹하고, 비결합 단백질을 평형 완충액으로 세척해내고, 결합된 숙주 세포 단백질(HCP)을 120mM NaCl로 예비 용리 단계에 의해 제거하였다. 이후, F4co를 pH 7.0에서 포스페이트 완충액에서 360mM NaCl, 8M 우레아, 10mM DTT로 용리하였다.
ㆍ 상기 융합 단백질의 산화적 응집을 조절하기 위해, F4co의 시스테인기가 요오도아세트아미드에 의해 카르복시아미드화될 수 있다. 그러므로, 임의로 50mM 요오도아세트아미드를 CM 하이퍼Z 용리물에 첨가하고, 암실에서 30분 동안 실온에서 카르복시아미드화를 수행하였다.
ㆍ 이후, CM 하이퍼Z 용리물을 충분히 희석하고(약 5 내지 8배), pH 9.0으로 조절하였다. 이후, F4co 또는 F4coca를 pH 9.0에서 트리스 완충액 중에서 8M 우레아의 존재 하에 Q 세파로스 칼럼(Amersham Bioscience)에 결합시켰다. 비결합 단백질을 평형 완충액으로 세척해내고, 동일 완충액 중의 90mM NaCl에 의한 예비 용리 단계(단지 비카르복시아미드화된 단백질을 지닌)로 결합된 HCP를 제거하였다. F4co를 pH 9.0에서 트리스 완충액 중에서 200mM NaCl, 8M 우레아에 의해 칼럼으로부터 탈착시켰다.
ㆍ 샘플을 1ℓ의 0.5M 아르기닌, 10mM 트리스 완충액, 10mM 글루타티온(단지 비카르복시아미드화된 단백질에 첨가됨)에 대해 밤새 투석 멤브레인(12-14kDa 컷-오프(cut-off))으로 RT에서 2회 투석하였다. 다르게는, 완충액 교체는 30 또는 50kDa 컷-오프를 지닌 접선흐름방식(tangential-flow) 멤브레인을 사용하여 동일한 완충액의 10배 샘플 부피에 대해 투석여과에 의해 달성하였다.
ㆍ 끝으로, 투석된 생성물을 0.22㎛ 멤브레인을 통해 무균 여과하였다.
연속되는 정제 단계를 하기 플루오챠트로 표시하였다.
정제 플로우시트
균질화물 OD90(라니)
50mM 트리스 pH 8.0, 10mM DTT
↓
8M 우레아 첨가, pH 7.0으로 조절
↓
(+) CM 하이퍼Z 크로마토그래피
pH 7.0, 8M 우레아, 10mM DTT; 120mM NaCl에서 예비 용리, 360mM NaCl에서 용리
↓
선택적 카르복시아미드화: 50mM 요오도아세트아미드의 첨가, 실온에서 30분
↓
희석 및 pH 9.0으로 조절, 8M 우레아
↓
(+) Q 세파로스 FF 크로마토그래피
트리스 pH 9.0, 8M 우레아, 예비 용리, NaCl*로 용리
↓
투석/투석여과
→ 포스페이트 완충액, 0.5M 아르기닌, pH 8.5(10mM 글루타티온)
↓
살균 여과
F4co가 카르복시아미드화되지 않고, 글루타티온이 정제된 벌크에 존재한 경우, 모든 완충액은 DTT를 함유하였다. 환원제는 단백질이 카르복시아미드화되면 생략하였다. F4co에 대해 *NaCl은 200mM NaCl이고, F4coca에 대해, 용리는 NaCl의 구배에 의하여 이루어졌다. 이 단계는 60mM NaCl로 예비용리하고, 100mM NaCl로 용리하므로써 F4coca에 대해 추가로 최적화될 수 있고, F4co에 대해 100mM NaCl(예비 용리 단계가 요구되지 않음)에 의해 추가로 최적화될 수 있다.
결과: F4co의 정제
도 17은 F4co의 정제 및 카르복시아미드화된 F4co("F4coca")의 정제 동안에 수거된 F4 함유 분획의 SDS 겔을 도시한 것이다.
CM 하이퍼Z 수지는 8M 우레아의 존재 하에서 미정제 균질화물(레인 1)로부터 F4co를 완전히 포획하였으며, 360mM NaCl로 정량적 용리를 달성하였다. 도 2에 도시된 CM 하이퍼Z 용리물은 F4co에 상당히 풍부하였다. 샘플의 적합한 용리 및 pH로의 조절 후, F4co 또는 F4coca가 Q 세파로스 칼럼에 결합하였다. 이후, F4co 또는 F4coca를 레인 3에 도시된 바와 같이 200mM NaCl로 특이적으로 용리하였다. 이 크로마토그래피는 잔류하는 숙주 세포 단백질 뿐만 아니라 DNA 및 엔도톡신을 제거하였다. 포뮬레이션 적합성 완충액 중에서 정제된 물질을 얻기 위해, Q 세파로스 용리물을 10mM 트리스 완충액, 0.5M 아르기닌, 10mM 글루타디온에 대해 pH 8.5에서 12-14 kDa 컷-오프를 가진 투석 멤브리레인에서 투석하였다. 글루타디온은 카르복시아미드화된 단백질과 함께 생략되었다.
F4co 및 F4coca 둘 모두의 정제로 배양액 OD 130의 리터당 약 500mg의 정제된 물질을 수득하였다. 이는 비-코돈 최적화된 F4가 함께하기 이전에 관찰된 범위와 유사하였다.
상기 기술된 바와 같이, 두개의 상이한 정제 방법(I 및 II)은 상이한 F4 작제물을 정제하기 위해 개발되었다. 도 18은 수득된 상이한 정제된 벌크를 비교한 것이다.
도 18에서 SDS 겔은, 두개의 상이한 단백질, 즉, F4 및 F4co의 차별되는 패턴을 분명하게 도시하고 있다. F4는 몇몇 강한 저분자량(LMW) 밴드를 제공한 반면, 코돈 최적화된 F4co에서는 희미한 밴드만 볼 수 있다. 방법 I 및 방법 II는 매우 유사한 F4co 패턴을 제공한다. 항-E.coli 웨스턴 블롯 분석에서는, 정제된 단백질의 순도가 숙주 단백질 오염율이 모든 제제에서 1% 미만인 것으로 나타났음을 확인시켜 주었다.
실시예 9: 마우스에서의 F4의 면역원성
포뮬레이션:
애주번트 포뮬레이션(1B):
애주번트 포뮬레이션(1B)을 제조하기 위해 유기 용매 중의 지질(예컨대, 난황으로부터 또는 합성의 포스파티딜콜린)과 콜레스테롤 및 3D-MPL의 혼합물을 진공 하에(또는 다르게는, 불활성 기체의 스트림 하에) 건조시켰다. 이후, 수용액(예컨대 포스페이트 완충 염수)을 첨가하고, 모든 지질이 현탁액 상태가 될 때까지 용기를 교반하였다. 이후, 이 현탁액을 리포좀 크기가 약 100nm로 감소될 때까지 마이크로유체화시킨 후, 0.2㎛ 필터를 통해 살균 여과하였다. 압출 또는 초음파 처리가 이 단계를 대신할 수 있다.
일반적으로, 콜레스테롤: 포스파티딜콜린의 비는 1:4(w/w)이며, 수용액이 첨가되어 최종 콜레스테롤 농도가 5 내지 50mg/ml가 된다.
리포좀은 100nm의 정해진 크기를 가지며, SUV(small unilamelar vesicles)로서 언급된다. 이러한 용액이 반복적으로 동결 및 해동되면, SUV는 융합하여 크기가 500nm 내지 15㎛ 범위인 MLV(large multilamellar structures)를 형성한다. 리포좀은 그 자체로 시간의 경과에도 안정하며, 용해 능력을 전혀 갖지 않는다. 수용액 중의 QS21를 상기 리포좀에 첨가하여 최종 3D-MPL 및 QS21의 농도가 100㎍/ml에 이르도록 하였다.
포뮬레이션 2A: 수중유 에멀젼 중의 3 De 아실화된 모노포스포릴 지질 A 및 QS21;
수중유 에멀젼을 WO 95/17210에 언급된 바와 같은 프로토콜에 따라 제조하였다. 구체적으로, 상기 에멀젼은 5% 스쿠알렌, 5% 토코페놀, 2.0% 트윈 80을 함유하고, 입자 크기는 180nm이다.
수중유 에멀젼의 제조(2배 농축)
트윈 80을 포스페이트 완충 염수(PBS)에 용해시켜 PBS 중의 2% 용액을 형성하였다. 100ml의 2배 농축 에멀젼을 제공하기 위해, 5g의 DL 알파 토코페롤 및 5ml의 스쿠알렌을 와동시켜 철저히 혼합하였다. 90ml의 PBS/트윈 용액을 첨가하고, 철저히 혼합하였다. 이후, 형성된 에멀젼을 주사기를 통과시키고, 끝으로 M110S 마이크로유체화기를 사용하여 마이크로유체화시켰다. 형성된 오일 방울은 크기가 대략 180nm였다.
살균된 벌크 에멀젼을 PBS에 첨가하여 최종 농도가 500㎕/ml의 에멀젼(v/v)에 도달되도록 하였다. 이후, 3D-MPL을 첨가하여 최종 농도가 100㎍에 이르도록 하였다. 이후, QS21을 첨가하여 최종 농도가 100㎍/ml에 이르도록 하였다. 성분의 각각 첨가하는 사이에, 중간 생성물을 5분 동안 교반하였다.
정제 방법 I에 따라 정제된 코돈 최적화되지 않은 F4Q를 포스페이트/아르기닌 완충액 pH 6.8로 희석하였다. 희석물을 두개의 상이한 농축 애주번트(애주번트 2A 및 1B)와 혼합하여 290mM(애주번트 2A에 대해) - 300(애주번트 1B에 대해)mM 아르기닌, 50㎍ MPL 및 50㎍ QS21의 존재 하에 500㎕의 F4의 40㎍/용량의 최종 포뮬레이션을 얻었다. 100㎕의 각각의 포뮬레이션을 마우스에 주입하였다.
F4(p24, p17, RT 및 Nef)내에서 발견된 4개의 항원에 대한 세포 및 체액 면역 반응을 평가하기 위해 마우스 면역원성 연구를 수행하였다.
F4 항원의 복잡성으로 인해, 각각의 유전적 배경이 상이한 8개의 마우스 스트레인을 상기 기술된 바와 같이 제조된 8㎍의 애주번트 F4 단백질, 100㎕ 부피에서 0일째 및 21일째에 2회 면역화하였다. 혈청 및 비장 샘플을 F4의 네성분(p24, p17, RT 및 Nef) 및 F4 각각의 체액 및 세포 반응을 분석하기 위해 마지막 면역화(35일) 이후 14일째에 수거하였다.
전체 항체 반응을 p24, p17, RT, Nef 및 F4에 대해 특이적인 ELISA로 특징화하였다. 하기 표, 표2는 항원 특이적 체액 반응이 각 스트레인에서 관찰된 것을 요약한 것이다. 이 결과는 애주번트 단독으로 면역화된 동물을 제어하는 지에 대해 비교한 항체의 존재 또는 비존재를 나타낸다. 제시된 결과는 두개의 독립된, 그러나 동일한 실험으로부터 수집된 결과이다. 표에서, 2A는 수중유 에멀젼에서 3D-MPL 및 QS21로 포뮬레이션된 항원을 나타내고, 1B는 3D-MPL, QS21 및 콜레스테롤 함유 리포좀으로 포뮬레이션된 항원을 나타낸다.
표 2
OF1 마우스는 모든 4개의 F4 성분에 대해 항체 반응을 개시하였다. 관찰된 반응이 도 19에 도시된다. +/-는 관찰된 반응이 약하거나 두개의 애주번트 중 하나에서만 관찰되었음을 나타낸다. 예컨대, B6D2F1 마우스 p17반응: +2A 및 -1B와 함께 전체적으로 +/-라는 것은 2A(약하지 않음)과 반응이 있었고, 1B와는 반응이 없었음을 의미한다. Balb/c 마우스 p17 반응: +/- 2A 및 -1B와 함께 전체적으로 -라는 것에서, +/-는 애주번트 2A와의 반응이 약하다는 것을 의미한다.
세포 반응은 CD4 및 CD8, IFNγ 및 IL-2 발현을 위한 유세포 분석 염색(IFNγ 및 IL-2 발현을 위한 세포내 시토킨 염색) 및 이후의 11량체 중첩을 지닌 15량체의 펩티드 라이브러리 푸울을 사용하는, p24, p17, RT 또는 Nef 특이적 펩티드를 지닌 비장 세포의 재자극에 의해 특징화된다. CD 반응이 관찰된 우세한 세포 반응이다. 하기 표 3은 항원 특이적 CD4+IL-2+반응이 각각의 마우스 스트레인에 대해 관찰된 경우를 요약한 것이다. 다시 말하면, 이는 반응의 존재 또는 부재를 나타낸다.
표 3
DBA 마우스는 모든 4개의 F4 성분에 대해 CD4 반응을 일으켰다. 마우스에 대해 관찰된 CD4+IL-2+ 및 CD4+IFNγ+ 반응이 도 20에 도시된다.
요약하면, 두개의 애주번트 포뮬레이션중 어느 하나로 포뮬레이션된 F4는 p24, p27, RT 및 Nef에 대한 체액 및 세포 반응을 촉진시킬 수 있다. 이는 F4의 각 영역이 생체내 위치에서 면역원성임을 나타내는 것이다.
SEQUENCE LISTING
<110> GlaxoSmithKline Biologicals SA
Abrecht, Helge
Delchambre, Martine
Marchand, Martine
Mathy, Nathalie, Louise
Permanne, Philippe, Jean, Gervais, Ghislain
Voss, Gerald, Hermann
<120> Vaccine
<130> VB60990
<140> PCT/EP2005/008434
<141> 2005-08-03
<160> 19
<170> FastSEQ for Windows Version 4.0
<210> 1
<211> 3411
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> p24-RT-Nef-p17 fusion
<400> 1
atggttatcg tgcagaacat ccaggggcaa atggtacatc aggccatatc acctagaact 60
ttaaatgcat gggtaaaagt agtagaagag aaggctttca gcccagaagt aatacccatg 120
ttttcagcat tatcagaagg agccacccca caagatttaa acaccatgct aaacacagtg 180
gggggacatc aagcagccat gcaaatgtta aaagagacca tcaatgagga agctgcagaa 240
tgggatagag tacatccagt gcatgcaggg cctattgcac caggccagat gagagaacca 300
aggggaagtg acatagcagg aactactagt acccttcagg aacaaatagg atggatgaca 360
aataatccac ctatcccagt aggagaaatt tataaaagat ggataatcct gggattaaat 420
aaaatagtaa gaatgtatag ccctaccagc attctggaca taagacaagg accaaaagaa 480
ccttttagag actatgtaga ccggttctat aaaactctaa gagccgagca agcttcacag 540
gaggtaaaaa attggatgac agaaaccttg ttggtccaaa atgcgaaccc agattgtaag 600
actattttaa aagcattggg accagcggct acactagaag aaatgatgac agcatgtcag 660
ggagtaggag gacccggcca taaggcaaga gttttgcata tgggccccat tagccctatt 720
gagactgtgt cagtaaaatt aaagccagga atggatggcc caaaagttaa acaatggcca 780
ttgacagaag aaaaaataaa agcattagta gaaatttgta cagagatgga aaaggaaggg 840
aaaatttcaa aaattgggcc tgaaaatcca tacaatactc cagtatttgc cataaagaaa 900
aaagacagta ctaaatggag aaaattagta gatttcagag aacttaataa gagaactcaa 960
gacttctggg aagttcaatt aggaatacca catcccgcag ggttaaaaaa gaaaaaatca 1020
gtaacagtac tggatgtggg tgatgcatat ttttcagttc ccttagatga agacttcagg 1080
aaatatactg catttaccat acctagtata aacaatgaga caccagggat tagatatcag 1140
tacaatgtgc ttccacaggg atggaaagga tcaccagcaa tattccaaag tagcatgaca 1200
aaaatcttag agccttttag aaaacaaaat ccagacatag ttatctatca atacatggat 1260
gatttgtatg taggatctga cttagaaata gggcagcata gaacaaaaat agaggagctg 1320
agacaacatc tgttgaggtg gggacttacc acaccagaca aaaaacatca gaaagaacct 1380
ccattcctta aaatgggtta tgaactccat cctgataaat ggacagtaca gcctatagtg 1440
ctgccagaaa aagacagctg gactgtcaat gacatacaga agttagtggg gaaattgaat 1500
tgggcaagtc agatttaccc agggattaaa gtaaggcaat tatgtaaact ccttagagga 1560
accaaagcac taacagaagt aataccacta acagaagaag cagagctaga actggcagaa 1620
aacagagaga ttctaaaaga accagtacat ggagtgtatt atgacccatc aaaagactta 1680
atagcagaaa tacagaagca ggggcaaggc caatggacat atcaaattta tcaagagcca 1740
tttaaaaatc tgaaaacagg aaaatatgca agaatgaggg gtgcccacac taatgatgta 1800
aaacaattaa cagaggcagt gcaaaaaata accacagaaa gcatagtaat atggggaaag 1860
actcctaaat ttaaactgcc catacaaaag gaaacatggg aaacatggtg gacagagtat 1920
tggcaagcca cctggattcc tgagtgggag tttgttaata cccctccttt agtgaaatta 1980
tggtaccagt tagagaaaga acccatagta ggagcagaaa ccttctatgt agatggggca 2040
gctaacaggg agactaaatt aggaaaagca ggatatgtta ctaatagagg aagacaaaaa 2100
gttgtcaccc taactgacac aacaaatcag aagactgagt tacaagcaat ttatctagct 2160
ttgcaggatt cgggattaga agtaaacata gtaacagact cacaatatgc attaggaatc 2220
attcaagcac aaccagatca aagtgaatca gagttagtca atcaaataat agagcagtta 2280
ataaaaaagg aaaaggtcta tctggcatgg gtaccagcac acaaaggaat tggaggaaat 2340
gaacaagtag ataaattagt cagtgctgga atcaggaaag tgctagctat gggtggcaag 2400
tggtcaaaaa gtagtgtggt tggatggcct actgtaaggg aaagaatgag acgagctgag 2460
ccagcagcag atggggtggg agcagcatct cgagacctgg aaaaacatgg agcaatcaca 2520
agtagcaata cagcagctac caatgctgct tgtgcctggc tagaagcaca agaggaggag 2580
gaggtgggtt ttccagtcac acctcaggta cctttaagac caatgactta caaggcagct 2640
gtagatctta gccacttttt aaaagaaaag gggggactgg aagggctaat tcactcccaa 2700
cgaagacaag atatccttga tctgtggatc taccacacac aaggctactt ccctgattgg 2760
cagaactaca caccagggcc aggggtcaga tatccactga cctttggatg gtgctacaag 2820
ctagtaccag ttgagccaga taaggtagaa gaggccaata aaggagagaa caccagcttg 2880
ttacaccctg tgagcctgca tggaatggat gaccctgaga gagaagtgtt agagtggagg 2940
tttgacagcc gcctagcatt tcatcacgtg gcccgagagc tgcatccgga gtacttcaag 3000
aactgcaggc ctatgggtgc gagagcgtca gtattaagcg ggggagaatt agatcgatgg 3060
gaaaaaattc ggttaaggcc agggggaaag aaaaaatata aattaaaaca tatagtatgg 3120
gcaagcaggg agctagaacg attcgcagtt aatcctggcc tgttagaaac atcagaaggc 3180
tgtagacaaa tactgggaca gctacaacca tcccttcaga caggatcaga agaacttaga 3240
tcattatata atacagtagc aaccctctat tgtgtgcatc aaaggataga gataaaagac 3300
accaaggaag ctttagacaa gatagaggaa gagcaaaaca aaagtaagaa aaaagcacag 3360
caagcagcag ctgacacagg acacagcaat caggtcagcc aaaattacta a 3411
<210> 2
<211> 1136
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> p24-RT-Nef-p17 fusion
<400> 2
Met Val Ile Val Gln Asn Ile Gln Gly Gln Met Val His Gln Ala Ile
1 5 10 15
Ser Pro Arg Thr Leu Asn Ala Trp Val Lys Val Val Glu Glu Lys Ala
20 25 30
Phe Ser Pro Glu Val Ile Pro Met Phe Ser Ala Leu Ser Glu Gly Ala
35 40 45
Thr Pro Gln Asp Leu Asn Thr Met Leu Asn Thr Val Gly Gly His Gln
50 55 60
Ala Ala Met Gln Met Leu Lys Glu Thr Ile Asn Glu Glu Ala Ala Glu
65 70 75 80
Trp Asp Arg Val His Pro Val His Ala Gly Pro Ile Ala Pro Gly Gln
85 90 95
Met Arg Glu Pro Arg Gly Ser Asp Ile Ala Gly Thr Thr Ser Thr Leu
100 105 110
Gln Glu Gln Ile Gly Trp Met Thr Asn Asn Pro Pro Ile Pro Val Gly
115 120 125
Glu Ile Tyr Lys Arg Trp Ile Ile Leu Gly Leu Asn Lys Ile Val Arg
130 135 140
Met Tyr Ser Pro Thr Ser Ile Leu Asp Ile Arg Gln Gly Pro Lys Glu
145 150 155 160
Pro Phe Arg Asp Tyr Val Asp Arg Phe Tyr Lys Thr Leu Arg Ala Glu
165 170 175
Gln Ala Ser Gln Glu Val Lys Asn Trp Met Thr Glu Thr Leu Leu Val
180 185 190
Gln Asn Ala Asn Pro Asp Cys Lys Thr Ile Leu Lys Ala Leu Gly Pro
195 200 205
Ala Ala Thr Leu Glu Glu Met Met Thr Ala Cys Gln Gly Val Gly Gly
210 215 220
Pro Gly His Lys Ala Arg Val Leu His Met Gly Pro Ile Ser Pro Ile
225 230 235 240
Glu Thr Val Ser Val Lys Leu Lys Pro Gly Met Asp Gly Pro Lys Val
245 250 255
Lys Gln Trp Pro Leu Thr Glu Glu Lys Ile Lys Ala Leu Val Glu Ile
260 265 270
Cys Thr Glu Met Glu Lys Glu Gly Lys Ile Ser Lys Ile Gly Pro Glu
275 280 285
Asn Pro Tyr Asn Thr Pro Val Phe Ala Ile Lys Lys Lys Asp Ser Thr
290 295 300
Lys Trp Arg Lys Leu Val Asp Phe Arg Glu Leu Asn Lys Arg Thr Gln
305 310 315 320
Asp Phe Trp Glu Val Gln Leu Gly Ile Pro His Pro Ala Gly Leu Lys
325 330 335
Lys Lys Lys Ser Val Thr Val Leu Asp Val Gly Asp Ala Tyr Phe Ser
340 345 350
Val Pro Leu Asp Glu Asp Phe Arg Lys Tyr Thr Ala Phe Thr Ile Pro
355 360 365
Ser Ile Asn Asn Glu Thr Pro Gly Ile Arg Tyr Gln Tyr Asn Val Leu
370 375 380
Pro Gln Gly Trp Lys Gly Ser Pro Ala Ile Phe Gln Ser Ser Met Thr
385 390 395 400
Lys Ile Leu Glu Pro Phe Arg Lys Gln Asn Pro Asp Ile Val Ile Tyr
405 410 415
Gln Tyr Met Asp Asp Leu Tyr Val Gly Ser Asp Leu Glu Ile Gly Gln
420 425 430
His Arg Thr Lys Ile Glu Glu Leu Arg Gln His Leu Leu Arg Trp Gly
435 440 445
Leu Thr Thr Pro Asp Lys Lys His Gln Lys Glu Pro Pro Phe Leu Lys
450 455 460
Met Gly Tyr Glu Leu His Pro Asp Lys Trp Thr Val Gln Pro Ile Val
465 470 475 480
Leu Pro Glu Lys Asp Ser Trp Thr Val Asn Asp Ile Gln Lys Leu Val
485 490 495
Gly Lys Leu Asn Trp Ala Ser Gln Ile Tyr Pro Gly Ile Lys Val Arg
500 505 510
Gln Leu Cys Lys Leu Leu Arg Gly Thr Lys Ala Leu Thr Glu Val Ile
515 520 525
Pro Leu Thr Glu Glu Ala Glu Leu Glu Leu Ala Glu Asn Arg Glu Ile
530 535 540
Leu Lys Glu Pro Val His Gly Val Tyr Tyr Asp Pro Ser Lys Asp Leu
545 550 555 560
Ile Ala Glu Ile Gln Lys Gln Gly Gln Gly Gln Trp Thr Tyr Gln Ile
565 570 575
Tyr Gln Glu Pro Phe Lys Asn Leu Lys Thr Gly Lys Tyr Ala Arg Met
580 585 590
Arg Gly Ala His Thr Asn Asp Val Lys Gln Leu Thr Glu Ala Val Gln
595 600 605
Lys Ile Thr Thr Glu Ser Ile Val Ile Trp Gly Lys Thr Pro Lys Phe
610 615 620
Lys Leu Pro Ile Gln Lys Glu Thr Trp Glu Thr Trp Trp Thr Glu Tyr
625 630 635 640
Trp Gln Ala Thr Trp Ile Pro Glu Trp Glu Phe Val Asn Thr Pro Pro
645 650 655
Leu Val Lys Leu Trp Tyr Gln Leu Glu Lys Glu Pro Ile Val Gly Ala
660 665 670
Glu Thr Phe Tyr Val Asp Gly Ala Ala Asn Arg Glu Thr Lys Leu Gly
675 680 685
Lys Ala Gly Tyr Val Thr Asn Arg Gly Arg Gln Lys Val Val Thr Leu
690 695 700
Thr Asp Thr Thr Asn Gln Lys Thr Glu Leu Gln Ala Ile Tyr Leu Ala
705 710 715 720
Leu Gln Asp Ser Gly Leu Glu Val Asn Ile Val Thr Asp Ser Gln Tyr
725 730 735
Ala Leu Gly Ile Ile Gln Ala Gln Pro Asp Gln Ser Glu Ser Glu Leu
740 745 750
Val Asn Gln Ile Ile Glu Gln Leu Ile Lys Lys Glu Lys Val Tyr Leu
755 760 765
Ala Trp Val Pro Ala His Lys Gly Ile Gly Gly Asn Glu Gln Val Asp
770 775 780
Lys Leu Val Ser Ala Gly Ile Arg Lys Val Leu Ala Met Gly Gly Lys
785 790 795 800
Trp Ser Lys Ser Ser Val Val Gly Trp Pro Thr Val Arg Glu Arg Met
805 810 815
Arg Arg Ala Glu Pro Ala Ala Asp Gly Val Gly Ala Ala Ser Arg Asp
820 825 830
Leu Glu Lys His Gly Ala Ile Thr Ser Ser Asn Thr Ala Ala Thr Asn
835 840 845
Ala Ala Cys Ala Trp Leu Glu Ala Gln Glu Glu Glu Glu Val Gly Phe
850 855 860
Pro Val Thr Pro Gln Val Pro Leu Arg Pro Met Thr Tyr Lys Ala Ala
865 870 875 880
Val Asp Leu Ser His Phe Leu Lys Glu Lys Gly Gly Leu Glu Gly Leu
885 890 895
Ile His Ser Gln Arg Arg Gln Asp Ile Leu Asp Leu Trp Ile Tyr His
900 905 910
Thr Gln Gly Tyr Phe Pro Asp Trp Gln Asn Tyr Thr Pro Gly Pro Gly
915 920 925
Val Arg Tyr Pro Leu Thr Phe Gly Trp Cys Tyr Lys Leu Val Pro Val
930 935 940
Glu Pro Asp Lys Val Glu Glu Ala Asn Lys Gly Glu Asn Thr Ser Leu
945 950 955 960
Leu His Pro Val Ser Leu His Gly Met Asp Asp Pro Glu Arg Glu Val
965 970 975
Leu Glu Trp Arg Phe Asp Ser Arg Leu Ala Phe His His Val Ala Arg
980 985 990
Glu Leu His Pro Glu Tyr Phe Lys Asn Cys Arg Pro Met Gly Ala Arg
995 1000 1005
Ala Ser Val Leu Ser Gly Gly Glu Leu Asp Arg Trp Glu Lys Ile Arg
1010 1015 1020
Leu Arg Pro Gly Gly Lys Lys Lys Tyr Lys Leu Lys His Ile Val Trp
1025 1030 1035 1040
Ala Ser Arg Glu Leu Glu Arg Phe Ala Val Asn Pro Gly Leu Leu Glu
1045 1050 1055
Thr Ser Glu Gly Cys Arg Gln Ile Leu Gly Gln Leu Gln Pro Ser Leu
1060 1065 1070
Gln Thr Gly Ser Glu Glu Leu Arg Ser Leu Tyr Asn Thr Val Ala Thr
1075 1080 1085
Leu Tyr Cys Val His Gln Arg Ile Glu Ile Lys Asp Thr Lys Glu Ala
1090 1095 1100
Leu Asp Lys Ile Glu Glu Glu Gln Asn Lys Ser Lys Lys Lys Ala Gln
1105 1110 1115 1120
Gln Ala Ala Ala Asp Thr Gly His Ser Asn Gln Val Ser Gln Asn Tyr
1125 1130 1135
<210> 3
<211> 3411
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> F4co
<400> 3
atggtcattg ttcagaacat acagggccaa atggtccacc aggcaattag tccgcgaact 60
cttaatgcat gggtgaaggt cgtggaggaa aaggcattct ccccggaggt cattccgatg 120
ttttctgcgc tatctgaggg cgcaacgccg caagacctta ataccatgct taacacggta 180
ggcgggcacc aagccgctat gcaaatgcta aaagagacta taaacgaaga ggccgccgaa 240
tgggatcgag tgcacccggt gcacgccggc ccaattgcac caggccagat gcgcgagccg 300
cgcgggtctg atattgcagg aactacgtct acccttcagg agcagattgg gtggatgact 360
aacaatccac caatcccggt cggagagatc tataagaggt ggatcatact gggactaaac 420
aagatagtcc gcatgtattc tccgacttct atactggata tacgccaagg cccaaaggag 480
ccgttcaggg actatgtcga ccgattctat aagacccttc gcgcagagca ggcatcccag 540
gaggtcaaaa attggatgac agaaactctt ttggtgcaga atgcgaatcc ggattgtaaa 600
acaattttaa aggctctagg accggccgca acgctagaag agatgatgac ggcttgtcag 660
ggagtcggtg gaccggggca taaagcccgc gtcttacaca tgggcccgat atctccgata 720
gaaacagttt cggtcaagct taaaccaggg atggatggtc caaaggtcaa gcagtggccg 780
ctaacggaag agaagattaa ggcgctcgta gagatttgta ctgaaatgga gaaggaaggc 840
aagataagca agatcgggcc agagaacccg tacaatacac cggtatttgc aataaagaaa 900
aaggattcaa caaaatggcg aaagcttgta gattttaggg aactaaacaa gcgaacccaa 960
gacttttggg aagtccaact agggatccca catccagccg gtctaaagaa gaagaaatcg 1020
gtcacagtcc tggatgtagg agacgcatat tttagtgtac cgcttgatga ggacttccga 1080
aagtatactg cgtttactat accgagcata aacaatgaaa cgccaggcat tcgctatcag 1140
tacaacgtgc tcccgcaggg ctggaagggg tctccggcga tatttcagag ctgtatgaca 1200
aaaatacttg aaccattccg aaagcagaat ccggatattg taatttacca atacatggac 1260
gatctctatg tgggctcgga tctagaaatt gggcagcatc gcactaagat tgaggaactg 1320
aggcaacatc tgcttcgatg gggcctcact actcccgaca agaagcacca gaaggagccg 1380
ccgttcctaa agatgggcta cgagcttcat ccggacaagt ggacagtaca gccgatagtg 1440
ctgcccgaaa aggattcttg gaccgtaaat gatattcaga aactagtcgg caagcttaac 1500
tgggcctctc agatttaccc aggcattaag gtccgacagc tttgcaagct actgagggga 1560
actaaggctc taacagaggt catcccatta acggaggaag cagagcttga gctggcagag 1620
aatcgcgaaa ttcttaagga gccggtgcac ggggtatact acgacccctc caaggacctt 1680
atagccgaga tccagaagca ggggcagggc caatggacgt accagatata tcaagaaccg 1740
tttaagaatc tgaagactgg gaagtacgcg cgcatgcgag gggctcatac taatgatgta 1800
aagcaactta cggaagcagt acaaaagatt actactgagt ctattgtgat atggggcaag 1860
accccaaagt tcaagctgcc catacagaag gaaacatggg aaacatggtg gactgaatat 1920
tggcaagcta cctggattcc agaatgggaa tttgtcaaca cgccgccact tgttaagctt 1980
tggtaccagc ttgaaaagga gccgatagta ggggcagaga ccttctatgt cgatggcgcc 2040
gcgaatcgcg aaacgaagct aggcaaggcg ggatacgtga ctaatagggg ccgccaaaag 2100
gtcgtaaccc ttacggatac caccaatcag aagactgaac tacaagcgat ttaccttgca 2160
cttcaggata gtggcctaga ggtcaacata gtcacggact ctcaatatgc gcttggcatt 2220
attcaagcgc agccagatca aagcgaaagc gagcttgtaa accaaataat agaacagctt 2280
ataaagaaag agaaggtata tctggcctgg gtccccgctc acaagggaat tggcggcaat 2340
gagcaagtgg acaagctagt cagcgctggg attcgcaagg ttcttgcgat ggggggtaag 2400
tggtctaagt ctagcgtagt cggctggccg acagtccgcg agcgcatgcg acgcgccgaa 2460
ccagccgcag atggcgtggg ggcagcgtct agggatctgg agaagcacgg ggctataact 2520
tccagtaaca cggcggcgac gaacgccgca tgcgcatggt tagaagccca agaagaggaa 2580
gaagtagggt ttccggtaac tccccaggtg ccgttaaggc cgatgaccta taaggcagcg 2640
gtggatcttt ctcacttcct taaggagaaa ggggggctgg agggcttaat tcacagccag 2700
aggcgacagg atattcttga tctgtggatt taccataccc aggggtactt tccggactgg 2760
cagaattaca ccccggggcc aggcgtgcgc tatcccctga ctttcgggtg gtgctacaaa 2820
ctagtcccag tggaacccga caaggtcgaa gaggctaata agggcgagaa cacttctctt 2880
cttcacccgg taagcctgca cgggatggat gacccagaac gagaggttct agaatggagg 2940
ttcgactctc gacttgcgtt ccatcacgta gcacgcgagc tgcatccaga atatttcaag 3000
aactgccgcc caatgggcgc cagggccagt gtacttagtg gcggagaact agatcgatgg 3060
gaaaagatac gcctacgccc ggggggcaag aagaagtaca agcttaagca cattgtgtgg 3120
gcctctcgcg aacttgagcg attcgcagtg aatccaggcc tgcttgagac gagtgaaggc 3180
tgtaggcaaa ttctggggca gctacagccg agcctacaga ctggcagcga ggagcttcgt 3240
agtctttata ataccgtcgc gactctctac tgcgttcatc aacgaattga aataaaggat 3300
actaaagagg cccttgataa aattgaggag gaacagaata agtcgaaaaa gaaggcccag 3360
caggccgccg ccgacaccgg gcacagcaac caggtgtccc aaaactacta a 3411
<210> 4
<211> 1302
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> p51 RT
<400> 4
atgagtactg gtccgatctc tccgatagaa acagtttcgg tcaagcttaa accagggatg 60
gatggtccaa aggtcaagca gtggccgcta acggaagaga agattaaggc gctcgtagag 120
atttgtactg aaatggagaa ggaaggcaag ataagcaaga tcgggccaga gaacccgtac 180
aatacaccgg tatttgcaat aaagaagaag gattcaacaa aatggcgaaa gcttgtagat 240
tttagggaac taaacaagcg aacccaagac ttttgggaag tccaactagg tatcccacat 300
ccagccggtc taaagaagaa gaaatcggtc acagtcctgg atgtaggaga cgcatatttt 360
agtgtaccgc ttgatgagga cttccgaaag tatactgcgt ttactatacc gagcataaac 420
aatgaaacgc caggcattcg ctatcagtac aacgtgctcc cgcagggctg gaaggggtct 480
ccggcgatat ttcagagctc tatgacaaaa atacttgaac cattccgaaa gcagaatccg 540
gatattgtaa tttaccaata catggacgat ctctatgtgg gctcggatct agaaattggg 600
cagcatcgca ctaagattga ggaactgagg caacatctgc ttcgatgggg cctcactact 660
cccgacaaga agcaccagaa ggagccgccg ttcctaaaga tgggctacga gcttcatccg 720
gacaagtgga cagtacagcc gatagtgctg cccgaaaagg attcttggac cgtaaatgat 780
attcagaaac tagtcggcaa gcttaactgg gcctctcaga tttacccagg cattaaggtc 840
cgacagcttt gcaagctact gaggggaact aaggctctaa cagaggtcat cccattaacg 900
gaggaagcag agcttgagct ggcagagaat cgcgaaattc ttaaggagcc ggtgcacggg 960
gtatactacg acccctccaa ggaccttata gccgagatcc agaagcaggg gcagggccaa 1020
tggacgtacc agatatatca agaaccgttt aagaatctga agactgggaa gtacgcgcgc 1080
atgcgagggg ctcatactaa tgatgtaaag caacttacgg aagcagtaca aaagattact 1140
actgagtcta ttgtgatatg gggcaagacc ccaaagttca agctgcccat acagaaggaa 1200
acatgggaaa catggtggac tgaatattgg caagctacct ggattccaga atgggaattt 1260
gtcaacacgc cgccgctggt aaaactgagg cctgctagct aa 1302
<210> 5
<211> 433
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> p51 RT
<400> 5
Met Ser Thr Gly Pro Ile Ser Pro Ile Glu Thr Val Ser Val Lys Leu
1 5 10 15
Lys Pro Gly Met Asp Gly Pro Lys Val Lys Gln Trp Pro Leu Thr Glu
20 25 30
Glu Lys Ile Lys Ala Leu Val Glu Ile Cys Thr Glu Met Glu Lys Glu
35 40 45
Gly Lys Ile Ser Lys Ile Gly Pro Glu Asn Pro Tyr Asn Thr Pro Val
50 55 60
Phe Ala Ile Lys Lys Lys Asp Ser Thr Lys Trp Arg Lys Leu Val Asp
65 70 75 80
Phe Arg Glu Leu Asn Lys Arg Thr Gln Asp Phe Trp Glu Val Gln Leu
85 90 95
Gly Ile Pro His Pro Ala Gly Leu Lys Lys Lys Lys Ser Val Thr Val
100 105 110
Leu Asp Val Gly Asp Ala Tyr Phe Ser Val Pro Leu Asp Glu Asp Phe
115 120 125
Arg Lys Tyr Thr Ala Phe Thr Ile Pro Ser Ile Asn Asn Glu Thr Pro
130 135 140
Gly Ile Arg Tyr Gln Tyr Asn Val Leu Pro Gln Gly Trp Lys Gly Ser
145 150 155 160
Pro Ala Ile Phe Gln Ser Ser Met Thr Lys Ile Leu Glu Pro Phe Arg
165 170 175
Lys Gln Asn Pro Asp Ile Val Ile Tyr Gln Tyr Met Asp Asp Leu Tyr
180 185 190
Val Gly Ser Asp Leu Glu Ile Gly Gln His Arg Thr Lys Ile Glu Glu
195 200 205
Leu Arg Gln His Leu Leu Arg Trp Gly Leu Thr Thr Pro Asp Lys Lys
210 215 220
His Gln Lys Glu Pro Pro Phe Leu Lys Met Gly Tyr Glu Leu His Pro
225 230 235 240
Asp Lys Trp Thr Val Gln Pro Ile Val Leu Pro Glu Lys Asp Ser Trp
245 250 255
Thr Val Asn Asp Ile Gln Lys Leu Val Gly Lys Leu Asn Trp Ala Ser
260 265 270
Gln Ile Tyr Pro Gly Ile Lys Val Arg Gln Leu Cys Lys Leu Leu Arg
275 280 285
Gly Thr Lys Ala Leu Thr Glu Val Ile Pro Leu Thr Glu Glu Ala Glu
290 295 300
Leu Glu Leu Ala Glu Asn Arg Glu Ile Leu Lys Glu Pro Val His Gly
305 310 315 320
Val Tyr Tyr Asp Pro Ser Lys Asp Leu Ile Ala Glu Ile Gln Lys Gln
325 330 335
Gly Gln Gly Gln Trp Thr Tyr Gln Ile Tyr Gln Glu Pro Phe Lys Asn
340 345 350
Leu Lys Thr Gly Lys Tyr Ala Arg Met Arg Gly Ala His Thr Asn Asp
355 360 365
Val Lys Gln Leu Thr Glu Ala Val Gln Lys Ile Thr Thr Glu Ser Ile
370 375 380
Val Ile Trp Gly Lys Thr Pro Lys Phe Lys Leu Pro Ile Gln Lys Glu
385 390 395 400
Thr Trp Glu Thr Trp Trp Thr Glu Tyr Trp Gln Ala Thr Trp Ile Pro
405 410 415
Glu Trp Glu Phe Val Asn Thr Pro Pro Leu Val Lys Leu Arg Pro Ala
420 425 430
Ser
<210> 6
<211> 1023
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nef p17
<400> 6
atgggtggca agtggtcaaa aagtagtgtg gttggatggc ctactgtaag ggaaagaatg 60
agacgagctg agccagcagc agatggggtg ggagcagcat ctcgagacct ggaaaaacat 120
ggagcaatca caagtagcaa tacagcagct accaatgctg cttgtgcctg gctagaagca 180
caagaggagg aggaggtggg ttttccagtc acacctcagg tacctttaag accaatgact 240
tacaaggcag ctgtagatct tagccacttt ttaaaagaaa aggggggact ggaagggcta 300
attcactccc aacgaagaca agatatcctt gatctgtgga tctaccacac acaaggctac 360
ttccctgatt ggcagaacta cacaccaggg ccaggggtca gatatccact gacctttgga 420
tggtgctaca agctagtacc agttgagcca gataaggtag aagaggccaa taaaggagag 480
aacaccagct tgttacaccc tgtgagcctg catggaatgg atgaccctga gagagaagtg 540
ttagagtgga ggtttgacag ccgcctagca tttcatcacg tggcccgaga gctgcatccg 600
gagtacttca agaactgcag gcctatgggt gcgagagcgt cagtattaag cgggggagaa 660
ttagatcgat gggaaaaaat tcggttaagg ccagggggaa agaaaaaata taaattaaaa 720
catatagtat gggcaagcag ggagctagaa cgattcgcag ttaatcctgg cctgttagaa 780
acatcagaag gctgtagaca aatactggga cagctacaac catcccttca gacaggatca 840
gaagaactta gatcattata taatacagta gcaaccctct attgtgtgca tcaaaggata 900
gagataaaag acaccaagga agctttagac aagatagagg aagagcaaaa caaaagtaag 960
aaaaaagcac agcaagcagc agctgacaca ggacacagca atcaggtcag ccaaaattac 1020
taa 1023
<210> 7
<211> 340
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nef p17 (NP)
<400> 7
Met Gly Gly Lys Trp Ser Lys Ser Ser Val Val Gly Trp Pro Thr Val
1 5 10 15
Arg Glu Arg Met Arg Arg Ala Glu Pro Ala Ala Asp Gly Val Gly Ala
20 25 30
Ala Ser Arg Asp Leu Glu Lys His Gly Ala Ile Thr Ser Ser Asn Thr
35 40 45
Ala Ala Thr Asn Ala Ala Cys Ala Trp Leu Glu Ala Gln Glu Glu Glu
50 55 60
Glu Val Gly Phe Pro Val Thr Pro Gln Val Pro Leu Arg Pro Met Thr
65 70 75 80
Tyr Lys Ala Ala Val Asp Leu Ser His Phe Leu Lys Glu Lys Gly Gly
85 90 95
Leu Glu Gly Leu Ile His Ser Gln Arg Arg Gln Asp Ile Leu Asp Leu
100 105 110
Trp Ile Tyr His Thr Gln Gly Tyr Phe Pro Asp Trp Gln Asn Tyr Thr
115 120 125
Pro Gly Pro Gly Val Arg Tyr Pro Leu Thr Phe Gly Trp Cys Tyr Lys
130 135 140
Leu Val Pro Val Glu Pro Asp Lys Val Glu Glu Ala Asn Lys Gly Glu
145 150 155 160
Asn Thr Ser Leu Leu His Pro Val Ser Leu His Gly Met Asp Asp Pro
165 170 175
Glu Arg Glu Val Leu Glu Trp Arg Phe Asp Ser Arg Leu Ala Phe His
180 185 190
His Val Ala Arg Glu Leu His Pro Glu Tyr Phe Lys Asn Cys Arg Pro
195 200 205
Met Gly Ala Arg Ala Ser Val Leu Ser Gly Gly Glu Leu Asp Arg Trp
210 215 220
Glu Lys Ile Arg Leu Arg Pro Gly Gly Lys Lys Lys Tyr Lys Leu Lys
225 230 235 240
His Ile Val Trp Ala Ser Arg Glu Leu Glu Arg Phe Ala Val Asn Pro
245 250 255
Gly Leu Leu Glu Thr Ser Glu Gly Cys Arg Gln Ile Leu Gly Gln Leu
260 265 270
Gln Pro Ser Leu Gln Thr Gly Ser Glu Glu Leu Arg Ser Leu Tyr Asn
275 280 285
Thr Val Ala Thr Leu Tyr Cys Val His Gln Arg Ile Glu Ile Lys Asp
290 295 300
Thr Lys Glu Ala Leu Asp Lys Ile Glu Glu Glu Gln Asn Lys Ser Lys
305 310 315 320
Lys Lys Ala Gln Gln Ala Ala Ala Asp Thr Gly His Ser Asn Gln Val
325 330 335
Ser Gln Asn Tyr
340
<210> 8
<211> 1029
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> p17 Nef
<400> 8
atgggtgcga gagcgtcagt attaagcggg ggagaattag atcgatggga aaaaattcgg 60
ttaaggccag ggggaaagaa aaaatataaa ttaaaacata tagtatgggc aagcagggag 120
ctagaacgat tcgcagttaa tcctggcctg ttagaaacat cagaaggctg tagacaaata 180
ctgggacagc tacaaccatc ccttcagaca ggatcagaag aacttagatc attatataat 240
acagtagcaa ccctctattg tgtgcatcaa aggatagaga taaaagacac caaggaagct 300
ttagacaaga tagaggaaga gcaaaacaaa agtaagaaaa aagcacagca agcagcagct 360
gacacaggac acagcaatca ggtcagccaa aattacctcg acaggcctat gggtggcaag 420
tggtcaaaaa gtagtgtggt tggatggcct actgtaaggg aaagaatgag acgagctgag 480
ccagcagcag atggggtggg agcagcatct cgagacctgg aaaaacatgg agcaatcaca 540
agtagcaata cagcagctac caatgctgct tgtgcctggc tagaagcaca agaggaggag 600
gaggtgggtt ttccagtcac acctcaggta cctttaagac caatgactta caaggcagct 660
gtagatctta gccacttttt aaaagaaaag gggggactgg aagggctaat tcactcccaa 720
cgaagacaag atatccttga tctgtggatc taccacacac aaggctactt ccctgattgg 780
cagaactaca caccagggcc aggggtcaga tatccactga cctttggatg gtgctacaag 840
ctagtaccag ttgagccaga taaggtagaa gaggccaata aaggagagaa caccagcttg 900
ttacaccctg tgagcctgca tggaatggat gaccctgaga gagaagtgtt agagtggagg 960
tttgacagcc gcctagcatt tcatcacgtg gcccgagagc tgcatccgga gtacttcaag 1020
aactgctaa 1029
<210> 9
<211> 342
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> p17 Nef (PN)
<400> 9
Met Gly Ala Arg Ala Ser Val Leu Ser Gly Gly Glu Leu Asp Arg Trp
1 5 10 15
Glu Lys Ile Arg Leu Arg Pro Gly Gly Lys Lys Lys Tyr Lys Leu Lys
20 25 30
His Ile Val Trp Ala Ser Arg Glu Leu Glu Arg Phe Ala Val Asn Pro
35 40 45
Gly Leu Leu Glu Thr Ser Glu Gly Cys Arg Gln Ile Leu Gly Gln Leu
50 55 60
Gln Pro Ser Leu Gln Thr Gly Ser Glu Glu Leu Arg Ser Leu Tyr Asn
65 70 75 80
Thr Val Ala Thr Leu Tyr Cys Val His Gln Arg Ile Glu Ile Lys Asp
85 90 95
Thr Lys Glu Ala Leu Asp Lys Ile Glu Glu Glu Gln Asn Lys Ser Lys
100 105 110
Lys Lys Ala Gln Gln Ala Ala Ala Asp Thr Gly His Ser Asn Gln Val
115 120 125
Ser Gln Asn Tyr Leu Asp Arg Pro Met Gly Gly Lys Trp Ser Lys Ser
130 135 140
Ser Val Val Gly Trp Pro Thr Val Arg Glu Arg Met Arg Arg Ala Glu
145 150 155 160
Pro Ala Ala Asp Gly Val Gly Ala Ala Ser Arg Asp Leu Glu Lys His
165 170 175
Gly Ala Ile Thr Ser Ser Asn Thr Ala Ala Thr Asn Ala Ala Cys Ala
180 185 190
Trp Leu Glu Ala Gln Glu Glu Glu Glu Val Gly Phe Pro Val Thr Pro
195 200 205
Gln Val Pro Leu Arg Pro Met Thr Tyr Lys Ala Ala Val Asp Leu Ser
210 215 220
His Phe Leu Lys Glu Lys Gly Gly Leu Glu Gly Leu Ile His Ser Gln
225 230 235 240
Arg Arg Gln Asp Ile Leu Asp Leu Trp Ile Tyr His Thr Gln Gly Tyr
245 250 255
Phe Pro Asp Trp Gln Asn Tyr Thr Pro Gly Pro Gly Val Arg Tyr Pro
260 265 270
Leu Thr Phe Gly Trp Cys Tyr Lys Leu Val Pro Val Glu Pro Asp Lys
275 280 285
Val Glu Glu Ala Asn Lys Gly Glu Asn Thr Ser Leu Leu His Pro Val
290 295 300
Ser Leu His Gly Met Asp Asp Pro Glu Arg Glu Val Leu Glu Trp Arg
305 310 315 320
Phe Asp Ser Arg Leu Ala Phe His His Val Ala Arg Glu Leu His Pro
325 330 335
Glu Tyr Phe Lys Asn Cys
340
<210> 10
<211> 1041
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nef-linker-p17
<400> 10
atgggtggca agtggtcaaa aagtagtgtg gttggatggc ctactgtaag ggaaagaatg 60
agacgagctg agccagcagc agatggggtg ggagcagcat ctcgagacct ggaaaaacat 120
ggagcaatca caagtagcaa tacagcagct accaatgctg cttgtgcctg gctagaagca 180
caagaggagg aggaggtggg ttttccagtc acacctcagg tacctttaag accaatgact 240
tacaaggcag ctgtagatct tagccacttt ttaaaagaaa aggggggact ggaagggcta 300
attcactccc aacgaagaca agatatcctt gatctgtgga tctaccacac acaaggctac 360
ttccctgatt ggcagaacta cacaccaggg ccaggggtca gatatccact gacctttgga 420
tggtgctaca agctagtacc agttgagcca gataaggtag aagaggccaa taaaggagag 480
aacaccagct tgttacaccc tgtgagcctg catggaatgg atgaccctga gagagaagtg 540
ttagagtgga ggtttgacag ccgcctagca tttcatcacg tggcccgaga gctgcatccg 600
gagtacttca agaactgcag gcctggatcc ggtggcggcc ctatgggtgc gagagcgtca 660
gtattaagcg ggggagaatt agatcgatgg gaaaaaattc ggttaaggcc agggggaaag 720
aaaaaatata aattaaaaca tatagtatgg gcaagcaggg agctagaacg attcgcagtt 780
aatcctggcc tgttagaaac atcagaaggc tgtagacaaa tactgggaca gctacaacca 840
tcccttcaga caggatcaga agaacttaga tcattatata atacagtagc aaccctctat 900
tgtgtgcatc aaaggataga gataaaagac accaaggaag ctttagacaa gatagaggaa 960
gagcaaaaca aaagtaagaa aaaagcacag caagcagcag ctgacacagg acacagcaat 1020
caggtcagcc aaaattacta a 1041
<210> 11
<211> 346
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nef-linker-p17 (NLP)
<400> 11
Met Gly Gly Lys Trp Ser Lys Ser Ser Val Val Gly Trp Pro Thr Val
1 5 10 15
Arg Glu Arg Met Arg Arg Ala Glu Pro Ala Ala Asp Gly Val Gly Ala
20 25 30
Ala Ser Arg Asp Leu Glu Lys His Gly Ala Ile Thr Ser Ser Asn Thr
35 40 45
Ala Ala Thr Asn Ala Ala Cys Ala Trp Leu Glu Ala Gln Glu Glu Glu
50 55 60
Glu Val Gly Phe Pro Val Thr Pro Gln Val Pro Leu Arg Pro Met Thr
65 70 75 80
Tyr Lys Ala Ala Val Asp Leu Ser His Phe Leu Lys Glu Lys Gly Gly
85 90 95
Leu Glu Gly Leu Ile His Ser Gln Arg Arg Gln Asp Ile Leu Asp Leu
100 105 110
Trp Ile Tyr His Thr Gln Gly Tyr Phe Pro Asp Trp Gln Asn Tyr Thr
115 120 125
Pro Gly Pro Gly Val Arg Tyr Pro Leu Thr Phe Gly Trp Cys Tyr Lys
130 135 140
Leu Val Pro Val Glu Pro Asp Lys Val Glu Glu Ala Asn Lys Gly Glu
145 150 155 160
Asn Thr Ser Leu Leu His Pro Val Ser Leu His Gly Met Asp Asp Pro
165 170 175
Glu Arg Glu Val Leu Glu Trp Arg Phe Asp Ser Arg Leu Ala Phe His
180 185 190
His Val Ala Arg Glu Leu His Pro Glu Tyr Phe Lys Asn Cys Arg Pro
195 200 205
Gly Ser Gly Gly Gly Pro Met Gly Ala Arg Ala Ser Val Leu Ser Gly
210 215 220
Gly Glu Leu Asp Arg Trp Glu Lys Ile Arg Leu Arg Pro Gly Gly Lys
225 230 235 240
Lys Lys Tyr Lys Leu Lys His Ile Val Trp Ala Ser Arg Glu Leu Glu
245 250 255
Arg Phe Ala Val Asn Pro Gly Leu Leu Glu Thr Ser Glu Gly Cys Arg
260 265 270
Gln Ile Leu Gly Gln Leu Gln Pro Ser Leu Gln Thr Gly Ser Glu Glu
275 280 285
Leu Arg Ser Leu Tyr Asn Thr Val Ala Thr Leu Tyr Cys Val His Gln
290 295 300
Arg Ile Glu Ile Lys Asp Thr Lys Glu Ala Leu Asp Lys Ile Glu Glu
305 310 315 320
Glu Gln Asn Lys Ser Lys Lys Lys Ala Gln Gln Ala Ala Ala Asp Thr
325 330 335
Gly His Ser Asn Gln Val Ser Gln Asn Tyr
340 345
<210> 12
<211> 1047
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> p17-linker-Nef
<400> 12
atgggtgcga gagcgtcagt attaagcggg ggagaattag atcgatggga aaaaattcgg 60
ttaaggccag ggggaaagaa aaaatataaa ttaaaacata tagtatgggc aagcagggag 120
ctagaacgat tcgcagttaa tcctggcctg ttagaaacat cagaaggctg tagacaaata 180
ctgggacagc tacaaccatc ccttcagaca ggatcagaag aacttagatc attatataat 240
acagtagcaa ccctctattg tgtgcatcaa aggatagaga taaaagacac caaggaagct 300
ttagacaaga tagaggaaga gcaaaacaaa agtaagaaaa aagcacagca agcagcagct 360
gacacaggac acagcaatca ggtcagccaa aattacctcg acaggcctgg atccggtggc 420
ggtcctatgg gtggcaagtg gtcaaaaagt agtgtggttg gatggcctac tgtaagggaa 480
agaatgagac gagctgagcc agcagcagat ggggtgggag cagcatctcg agacctggaa 540
aaacatggag caatcacaag tagcaataca gcagctacca atgctgcttg tgcctggcta 600
gaagcacaag aggaggagga ggtgggtttt ccagtcacac ctcaggtacc tttaagacca 660
atgacttaca aggcagctgt agatcttagc cactttttaa aagaaaaggg gggactggaa 720
gggctaattc actcccaacg aagacaagat atccttgatc tgtggatcta ccacacacaa 780
ggctacttcc ctgattggca gaactacaca ccagggccag gggtcagata tccactgacc 840
tttggatggt gctacaagct agtaccagtt gagccagata aggtagaaga ggccaataaa 900
ggagagaaca ccagcttgtt acaccctgtg agcctgcatg gaatggatga ccctgagaga 960
gaagtgttag agtggaggtt tgacagccgc ctagcatttc atcacgtggc ccgagagctg 1020
catccggagt acttcaagaa ctgctaa 1047
<210> 13
<211> 348
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> p17-linker-Nef (PLN)
<400> 13
Met Gly Ala Arg Ala Ser Val Leu Ser Gly Gly Glu Leu Asp Arg Trp
1 5 10 15
Glu Lys Ile Arg Leu Arg Pro Gly Gly Lys Lys Lys Tyr Lys Leu Lys
20 25 30
His Ile Val Trp Ala Ser Arg Glu Leu Glu Arg Phe Ala Val Asn Pro
35 40 45
Gly Leu Leu Glu Thr Ser Glu Gly Cys Arg Gln Ile Leu Gly Gln Leu
50 55 60
Gln Pro Ser Leu Gln Thr Gly Ser Glu Glu Leu Arg Ser Leu Tyr Asn
65 70 75 80
Thr Val Ala Thr Leu Tyr Cys Val His Gln Arg Ile Glu Ile Lys Asp
85 90 95
Thr Lys Glu Ala Leu Asp Lys Ile Glu Glu Glu Gln Asn Lys Ser Lys
100 105 110
Lys Lys Ala Gln Gln Ala Ala Ala Asp Thr Gly His Ser Asn Gln Val
115 120 125
Ser Gln Asn Tyr Leu Asp Arg Pro Gly Ser Gly Gly Gly Pro Met Gly
130 135 140
Gly Lys Trp Ser Lys Ser Ser Val Val Gly Trp Pro Thr Val Arg Glu
145 150 155 160
Arg Met Arg Arg Ala Glu Pro Ala Ala Asp Gly Val Gly Ala Ala Ser
165 170 175
Arg Asp Leu Glu Lys His Gly Ala Ile Thr Ser Ser Asn Thr Ala Ala
180 185 190
Thr Asn Ala Ala Cys Ala Trp Leu Glu Ala Gln Glu Glu Glu Glu Val
195 200 205
Gly Phe Pro Val Thr Pro Gln Val Pro Leu Arg Pro Met Thr Tyr Lys
210 215 220
Ala Ala Val Asp Leu Ser His Phe Leu Lys Glu Lys Gly Gly Leu Glu
225 230 235 240
Gly Leu Ile His Ser Gln Arg Arg Gln Asp Ile Leu Asp Leu Trp Ile
245 250 255
Tyr His Thr Gln Gly Tyr Phe Pro Asp Trp Gln Asn Tyr Thr Pro Gly
260 265 270
Pro Gly Val Arg Tyr Pro Leu Thr Phe Gly Trp Cys Tyr Lys Leu Val
275 280 285
Pro Val Glu Pro Asp Lys Val Glu Glu Ala Asn Lys Gly Glu Asn Thr
290 295 300
Ser Leu Leu His Pro Val Ser Leu His Gly Met Asp Asp Pro Glu Arg
305 310 315 320
Glu Val Leu Glu Trp Arg Phe Asp Ser Arg Leu Ala Phe His His Val
325 330 335
Ala Arg Glu Leu His Pro Glu Tyr Phe Lys Asn Cys
340 345
<210> 14
<211> 3411
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> p24-RT*-Nef-p17 (F4*)
<400> 14
atggttatcg tgcagaacat ccaggggcaa atggtacatc aggccatatc acctagaact 60
ttaaatgcat gggtaaaagt agtagaagag aaggctttca gcccagaagt aatacccatg 120
ttttcagcat tatcagaagg agccacccca caagatttaa acaccatgct aaacacagtg 180
gggggacatc aagcagccat gcaaatgtta aaagagacca tcaatgagga agctgcagaa 240
tgggatagag tacatccagt gcatgcaggg cctattgcac caggccagat gagagaacca 300
aggggaagtg acatagcagg aactactagt acccttcagg aacaaatagg atggatgaca 360
aataatccac ctatcccagt aggagaaatt tataaaagat ggataatcct gggattaaat 420
aaaatagtaa gaatgtatag ccctaccagc attctggaca taagacaagg accaaaagaa 480
ccttttagag actatgtaga ccggttctat aaaactctaa gagccgagca agcttcacag 540
gaggtaaaaa attggatgac agaaaccttg ttggtccaaa atgcgaaccc agattgtaag 600
actattttaa aagcattggg accagcggct acactagaag aaatgatgac agcatgtcag 660
ggagtaggag gacccggcca taaggcaaga gttttgcata tgggccccat tagccctatt 720
gagactgtgt cagtaaaatt aaagccagga atggatggcc caaaagttaa acaatggcca 780
ttgacagaag aaaaaataaa agcattagta gaaatttgta cagagatgga aaaggaaggg 840
aaaatttcaa aaattgggcc tgaaaatcca tacaatactc cagtatttgc cataaagaaa 900
aaagacagta ctaaatggag aaaattagta gatttcagag aacttaataa gagaactcaa 960
gacttctggg aagttcaatt aggaatacca catcccgcag ggttaaaaaa gaaaaaatca 1020
gtaacagtac tggatgtggg tgatgcatat ttttcagttc ccttagatga agacttcagg 1080
aaatatactg catttaccat acctagtata aacaatgaga caccagggat tagatatcag 1140
tacaatgtgc ttccacaggg atggaaagga tcaccagcaa tattccaaag tagcatgaca 1200
aaaatcttag agccttttag aaaacaaaat ccagacatag ttatctatca atacatggat 1260
gatttgtatg taggatctga cttagaaata gggcagcata gaacaaaaat agaggagctg 1320
agacaacatc tgttgaggtg gggacttacc acaccagaca aaaaacatca gaaagaacct 1380
ccattcctta aaatgggtta tgaactccat cctgataaat ggacagtaca gcctatagtg 1440
ctgccagaaa aagacagctg gactgtcaat gacatacaga agttagtggg gaaattgaat 1500
tgggcaagtc agatttaccc agggattaaa gtaaggcaat tatgtaaact ccttagagga 1560
accaaagcac taacagaagt aataccacta acagaagaag cagagctaga actggcagaa 1620
aacagagaga ttctaaaaga accagtacat ggagtgtatt atgacccatc aaaagactta 1680
atagcagaaa tacagaagca ggggcaaggc caatggacat atcaaattta tcaagagcca 1740
tttaaaaatc tgaaaacagg aaaatatgca cgtaaacgcg gtgcccacac taatgatgta 1800
aaacaattaa cagaggcagt gcaaaaaata accacagaaa gcatagtaat atggggaaag 1860
actcctaaat ttaaactgcc catacaaaag gaaacatggg aaacatggtg gacagagtat 1920
tggcaagcca cctggattcc tgagtgggag tttgttaata cccctccttt agtgaaatta 1980
tggtaccagt tagagaaaga acccatagta ggagcagaaa ccttctatgt agatggggca 2040
gctaacaggg agactaaatt aggaaaagca ggatatgtta ctaatagagg aagacaaaaa 2100
gttgtcaccc taactgacac aacaaatcag aagactgagt tacaagcaat ttatctagct 2160
ttgcaggatt cgggattaga agtaaacata gtaacagact cacaatatgc attaggaatc 2220
attcaagcac aaccagatca aagtgaatca gagttagtca atcaaataat agagcagtta 2280
ataaaaaagg aaaaggtcta tctggcatgg gtaccagcac acaaaggaat tggaggaaat 2340
gaacaagtag ataaattagt cagtgctgga atcaggaaag tgctagctat gggtggcaag 2400
tggtcaaaaa gtagtgtggt tggatggcct actgtaaggg aaagaatgag acgagctgag 2460
ccagcagcag atggggtggg agcagcatct cgagacctgg aaaaacatgg agcaatcaca 2520
agtagcaata cagcagctac caatgctgct tgtgcctggc tagaagcaca agaggaggag 2580
gaggtgggtt ttccagtcac acctcaggta cctttaagac caatgactta caaggcagct 2640
gtagatctta gccacttttt aaaagaaaag gggggactgg aagggctaat tcactcccaa 2700
cgaagacaag atatccttga tctgtggatc taccacacac aaggctactt ccctgattgg 2760
cagaactaca caccagggcc aggggtcaga tatccactga cctttggatg gtgctacaag 2820
ctagtaccag ttgagccaga taaggtagaa gaggccaata aaggagagaa caccagcttg 2880
ttacaccctg tgagcctgca tggaatggat gaccctgaga gagaagtgtt agagtggagg 2940
tttgacagcc gcctagcatt tcatcacgtg gcccgagagc tgcatccgga gtacttcaag 3000
aactgcaggc ctatgggtgc gagagcgtca gtattaagcg ggggagaatt agatcgatgg 3060
gaaaaaattc ggttaaggcc agggggaaag aaaaaatata aattaaaaca tatagtatgg 3120
gcaagcaggg agctagaacg attcgcagtt aatcctggcc tgttagaaac atcagaaggc 3180
tgtagacaaa tactgggaca gctacaacca tcccttcaga caggatcaga agaacttaga 3240
tcattatata atacagtagc aaccctctat tgtgtgcatc aaaggataga gataaaagac 3300
accaaggaag ctttagacaa gatagaggaa gagcaaaaca aaagtaagaa aaaagcacag 3360
caagcagcag ctgacacagg acacagcaat caggtcagcc aaaattacta a 3411
<210> 15
<211> 1136
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> p24-RT*-Nef-p17 (F4*)
<400> 15
Met Val Ile Val Gln Asn Ile Gln Gly Gln Met Val His Gln Ala Ile
1 5 10 15
Ser Pro Arg Thr Leu Asn Ala Trp Val Lys Val Val Glu Glu Lys Ala
20 25 30
Phe Ser Pro Glu Val Ile Pro Met Phe Ser Ala Leu Ser Glu Gly Ala
35 40 45
Thr Pro Gln Asp Leu Asn Thr Met Leu Asn Thr Val Gly Gly His Gln
50 55 60
Ala Ala Met Gln Met Leu Lys Glu Thr Ile Asn Glu Glu Ala Ala Glu
65 70 75 80
Trp Asp Arg Val His Pro Val His Ala Gly Pro Ile Ala Pro Gly Gln
85 90 95
Met Arg Glu Pro Arg Gly Ser Asp Ile Ala Gly Thr Thr Ser Thr Leu
100 105 110
Gln Glu Gln Ile Gly Trp Met Thr Asn Asn Pro Pro Ile Pro Val Gly
115 120 125
Glu Ile Tyr Lys Arg Trp Ile Ile Leu Gly Leu Asn Lys Ile Val Arg
130 135 140
Met Tyr Ser Pro Thr Ser Ile Leu Asp Ile Arg Gln Gly Pro Lys Glu
145 150 155 160
Pro Phe Arg Asp Tyr Val Asp Arg Phe Tyr Lys Thr Leu Arg Ala Glu
165 170 175
Gln Ala Ser Gln Glu Val Lys Asn Trp Met Thr Glu Thr Leu Leu Val
180 185 190
Gln Asn Ala Asn Pro Asp Cys Lys Thr Ile Leu Lys Ala Leu Gly Pro
195 200 205
Ala Ala Thr Leu Glu Glu Met Met Thr Ala Cys Gln Gly Val Gly Gly
210 215 220
Pro Gly His Lys Ala Arg Val Leu His Met Gly Pro Ile Ser Pro Ile
225 230 235 240
Glu Thr Val Ser Val Lys Leu Lys Pro Gly Met Asp Gly Pro Lys Val
245 250 255
Lys Gln Trp Pro Leu Thr Glu Glu Lys Ile Lys Ala Leu Val Glu Ile
260 265 270
Cys Thr Glu Met Glu Lys Glu Gly Lys Ile Ser Lys Ile Gly Pro Glu
275 280 285
Asn Pro Tyr Asn Thr Pro Val Phe Ala Ile Lys Lys Lys Asp Ser Thr
290 295 300
Lys Trp Arg Lys Leu Val Asp Phe Arg Glu Leu Asn Lys Arg Thr Gln
305 310 315 320
Asp Phe Trp Glu Val Gln Leu Gly Ile Pro His Pro Ala Gly Leu Lys
325 330 335
Lys Lys Lys Ser Val Thr Val Leu Asp Val Gly Asp Ala Tyr Phe Ser
340 345 350
Val Pro Leu Asp Glu Asp Phe Arg Lys Tyr Thr Ala Phe Thr Ile Pro
355 360 365
Ser Ile Asn Asn Glu Thr Pro Gly Ile Arg Tyr Gln Tyr Asn Val Leu
370 375 380
Pro Gln Gly Trp Lys Gly Ser Pro Ala Ile Phe Gln Ser Ser Met Thr
385 390 395 400
Lys Ile Leu Glu Pro Phe Arg Lys Gln Asn Pro Asp Ile Val Ile Tyr
405 410 415
Gln Tyr Met Asp Asp Leu Tyr Val Gly Ser Asp Leu Glu Ile Gly Gln
420 425 430
His Arg Thr Lys Ile Glu Glu Leu Arg Gln His Leu Leu Arg Trp Gly
435 440 445
Leu Thr Thr Pro Asp Lys Lys His Gln Lys Glu Pro Pro Phe Leu Lys
450 455 460
Met Gly Tyr Glu Leu His Pro Asp Lys Trp Thr Val Gln Pro Ile Val
465 470 475 480
Leu Pro Glu Lys Asp Ser Trp Thr Val Asn Asp Ile Gln Lys Leu Val
485 490 495
Gly Lys Leu Asn Trp Ala Ser Gln Ile Tyr Pro Gly Ile Lys Val Arg
500 505 510
Gln Leu Cys Lys Leu Leu Arg Gly Thr Lys Ala Leu Thr Glu Val Ile
515 520 525
Pro Leu Thr Glu Glu Ala Glu Leu Glu Leu Ala Glu Asn Arg Glu Ile
530 535 540
Leu Lys Glu Pro Val His Gly Val Tyr Tyr Asp Pro Ser Lys Asp Leu
545 550 555 560
Ile Ala Glu Ile Gln Lys Gln Gly Gln Gly Gln Trp Thr Tyr Gln Ile
565 570 575
Tyr Gln Glu Pro Phe Lys Asn Leu Lys Thr Gly Lys Tyr Ala Arg Lys
580 585 590
Arg Gly Ala His Thr Asn Asp Val Lys Gln Leu Thr Glu Ala Val Gln
595 600 605
Lys Ile Thr Thr Glu Ser Ile Val Ile Trp Gly Lys Thr Pro Lys Phe
610 615 620
Lys Leu Pro Ile Gln Lys Glu Thr Trp Glu Thr Trp Trp Thr Glu Tyr
625 630 635 640
Trp Gln Ala Thr Trp Ile Pro Glu Trp Glu Phe Val Asn Thr Pro Pro
645 650 655
Leu Val Lys Leu Trp Tyr Gln Leu Glu Lys Glu Pro Ile Val Gly Ala
660 665 670
Glu Thr Phe Tyr Val Asp Gly Ala Ala Asn Arg Glu Thr Lys Leu Gly
675 680 685
Lys Ala Gly Tyr Val Thr Asn Arg Gly Arg Gln Lys Val Val Thr Leu
690 695 700
Thr Asp Thr Thr Asn Gln Lys Thr Glu Leu Gln Ala Ile Tyr Leu Ala
705 710 715 720
Leu Gln Asp Ser Gly Leu Glu Val Asn Ile Val Thr Asp Ser Gln Tyr
725 730 735
Ala Leu Gly Ile Ile Gln Ala Gln Pro Asp Gln Ser Glu Ser Glu Leu
740 745 750
Val Asn Gln Ile Ile Glu Gln Leu Ile Lys Lys Glu Lys Val Tyr Leu
755 760 765
Ala Trp Val Pro Ala His Lys Gly Ile Gly Gly Asn Glu Gln Val Asp
770 775 780
Lys Leu Val Ser Ala Gly Ile Arg Lys Val Leu Ala Met Gly Gly Lys
785 790 795 800
Trp Ser Lys Ser Ser Val Val Gly Trp Pro Thr Val Arg Glu Arg Met
805 810 815
Arg Arg Ala Glu Pro Ala Ala Asp Gly Val Gly Ala Ala Ser Arg Asp
820 825 830
Leu Glu Lys His Gly Ala Ile Thr Ser Ser Asn Thr Ala Ala Thr Asn
835 840 845
Ala Ala Cys Ala Trp Leu Glu Ala Gln Glu Glu Glu Glu Val Gly Phe
850 855 860
Pro Val Thr Pro Gln Val Pro Leu Arg Pro Met Thr Tyr Lys Ala Ala
865 870 875 880
Val Asp Leu Ser His Phe Leu Lys Glu Lys Gly Gly Leu Glu Gly Leu
885 890 895
Ile His Ser Gln Arg Arg Gln Asp Ile Leu Asp Leu Trp Ile Tyr His
900 905 910
Thr Gln Gly Tyr Phe Pro Asp Trp Gln Asn Tyr Thr Pro Gly Pro Gly
915 920 925
Val Arg Tyr Pro Leu Thr Phe Gly Trp Cys Tyr Lys Leu Val Pro Val
930 935 940
Glu Pro Asp Lys Val Glu Glu Ala Asn Lys Gly Glu Asn Thr Ser Leu
945 950 955 960
Leu His Pro Val Ser Leu His Gly Met Asp Asp Pro Glu Arg Glu Val
965 970 975
Leu Glu Trp Arg Phe Asp Ser Arg Leu Ala Phe His His Val Ala Arg
980 985 990
Glu Leu His Pro Glu Tyr Phe Lys Asn Cys Arg Pro Met Gly Ala Arg
995 1000 1005
Ala Ser Val Leu Ser Gly Gly Glu Leu Asp Arg Trp Glu Lys Ile Arg
1010 1015 1020
Leu Arg Pro Gly Gly Lys Lys Lys Tyr Lys Leu Lys His Ile Val Trp
1025 1030 1035 1040
Ala Ser Arg Glu Leu Glu Arg Phe Ala Val Asn Pro Gly Leu Leu Glu
1045 1050 1055
Thr Ser Glu Gly Cys Arg Gln Ile Leu Gly Gln Leu Gln Pro Ser Leu
1060 1065 1070
Gln Thr Gly Ser Glu Glu Leu Arg Ser Leu Tyr Asn Thr Val Ala Thr
1075 1080 1085
Leu Tyr Cys Val His Gln Arg Ile Glu Ile Lys Asp Thr Lys Glu Ala
1090 1095 1100
Leu Asp Lys Ile Glu Glu Glu Gln Asn Lys Ser Lys Lys Lys Ala Gln
1105 1110 1115 1120
Gln Ala Ala Ala Asp Thr Gly His Ser Asn Gln Val Ser Gln Asn Tyr
1125 1130 1135
<210> 16
<211> 2313
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> p17-p51*-Nef (F3*)
<400> 16
atgggtgcga gagcgtcagt attaagcggg ggagaattag atcgatggga aaaaattcgg 60
ttaaggccag ggggaaagaa aaaatataaa ttaaaacata tagtatgggc aagcagggag 120
ctagaacgat tcgcagttaa tcctggcctg ttagaaacat cagaaggctg tagacaaata 180
ctgggacagc tacaaccatc ccttcagaca ggatcagaag aacttagatc attatataat 240
acagtagcaa ccctctattg tgtgcatcaa aggatagaga taaaagacac caaggaagct 300
ttagacaaga tagaggaaga gcaaaacaaa agtaagaaaa aagcacagca agcagcagct 360
gacacaggac acagcaatca ggtcagccaa aattacctcg acaggactgg tccgatctct 420
ccgatagaaa cagtttcggt caagcttaaa ccagggatgg atggtccaaa ggtcaagcag 480
tggccgctaa cggaagagaa gattaaggcg ctcgtagaga tttgtactga aatggagaag 540
gaaggcaaga taagcaagat cgggccagag aacccgtaca atacaccggt atttgcaata 600
aagaagaagg attcaacaaa atggcgaaag cttgtagatt ttagggaact aaacaagcga 660
acccaagact tttgggaagt ccaactaggt atcccacatc cagccggtct aaagaagaag 720
aaatcggtca cagtcctgga tgtaggagac gcatatttta gtgtaccgct tgatgaggac 780
ttccgaaagt atactgcgtt tactataccg agcataaaca atgaaacgcc aggcattcgc 840
tatcagtaca acgtgctccc gcagggctgg aaggggtctc cggcgatatt tcagagctct 900
atgacaaaaa tacttgaacc attccgaaag cagaatccgg atattgtaat ttaccaatac 960
atggacgatc tctatgtggg ctcggatcta gaaattgggc agcatcgcac taagattgag 1020
gaactgaggc aacatctgct tcgatggggc ctcactactc ccgacaagaa gcaccagaag 1080
gagccgccgt tcctaaagat gggctacgag cttcatccgg acaagtggac agtacagccg 1140
atagtgctgc ccgaaaagga ttcttggacc gtaaatgata ttcagaaact agtcggcaag 1200
cttaactggg cctctcagat ttacccaggc attaaggtcc gacagctttg caagctactg 1260
aggggaacta aggctctaac agaggtcatc ccattaacgg aggaagcaga gcttgagctg 1320
gcagagaatc gcgaaattct taaggagccg gtgcacaggg tatactacga cccctccaag 1380
gaccttatag ccgagatcca gaagcagggg cagggccaat ggacgtacca gatatatcaa 1440
gaaccgttta agaatctgaa gactgggaag tacgcgcgca aacgaggggc tcatactaat 1500
gatgtaaagc aacttacgga agcagtacaa aagattacta ctgagtctat tgtgatatgg 1560
ggcaagaccc caaagttcaa gctgcccata cagaaggaaa catgggaaac atggtggact 1620
gaatattggc aagctacctg gattccagaa tgggaatttg tcaacacgcc gccgctggta 1680
aaactgaggc ctatgggtgg caagtggtca aaaagtagtg tggttggatg gcctactgta 1740
agggaaagaa tgagacgagc tgagccagca gcagatgggg tgggagcagc atctcgagac 1800
ctggaaaaac atggagcaat cacaagtagc aatacagcag ctaccaatgc tgcttgtgcc 1860
tggctagaag cacaagagga ggaggaggtg ggttttccag tcacacctca ggtaccttta 1920
agaccaatga cttacaaggc agctgtagat cttagccact ttttaaaaga aaagggggga 1980
ctggaagggc taattcactc ccaacgaaga caagatatcc ttgatctgtg gatctaccac 2040
acacaaggct acttccctga ttggcagaac tacacaccag ggccaggggt cagatatcca 2100
ctgacctttg gatggtgcta caagctagta ccagttgagc cagataaggt agaagaggcc 2160
aataaaggag agaacaccag cttgttacac cctgtgagcc tgcatggaat ggatgaccct 2220
gagagagaag tgttagagtg gaggtttgac agccgcctag catttcatca cgtggcccga 2280
gagctgcatc cggagtactt caagaactgc taa 2313
<210> 17
<211> 770
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> p17-p51-Nef (F3)
<400> 17
Met Gly Ala Arg Ala Ser Val Leu Ser Gly Gly Glu Leu Asp Arg Trp
1 5 10 15
Glu Lys Ile Arg Leu Arg Pro Gly Gly Lys Lys Lys Tyr Lys Leu Lys
20 25 30
His Ile Val Trp Ala Ser Arg Glu Leu Glu Arg Phe Ala Val Asn Pro
35 40 45
Gly Leu Leu Glu Thr Ser Glu Gly Cys Arg Gln Ile Leu Gly Gln Leu
50 55 60
Gln Pro Ser Leu Gln Thr Gly Ser Glu Glu Leu Arg Ser Leu Tyr Asn
65 70 75 80
Thr Val Ala Thr Leu Tyr Cys Val His Gln Arg Ile Glu Ile Lys Asp
85 90 95
Thr Lys Glu Ala Leu Asp Lys Ile Glu Glu Glu Gln Asn Lys Ser Lys
100 105 110
Lys Lys Ala Gln Gln Ala Ala Ala Asp Thr Gly His Ser Asn Gln Val
115 120 125
Ser Gln Asn Tyr Leu Asp Arg Thr Gly Pro Ile Ser Pro Ile Glu Thr
130 135 140
Val Ser Val Lys Leu Lys Pro Gly Met Asp Gly Pro Lys Val Lys Gln
145 150 155 160
Trp Pro Leu Thr Glu Glu Lys Ile Lys Ala Leu Val Glu Ile Cys Thr
165 170 175
Glu Met Glu Lys Glu Gly Lys Ile Ser Lys Ile Gly Pro Glu Asn Pro
180 185 190
Tyr Asn Thr Pro Val Phe Ala Ile Lys Lys Lys Asp Ser Thr Lys Trp
195 200 205
Arg Lys Leu Val Asp Phe Arg Glu Leu Asn Lys Arg Thr Gln Asp Phe
210 215 220
Trp Glu Val Gln Leu Gly Ile Pro His Pro Ala Gly Leu Lys Lys Lys
225 230 235 240
Lys Ser Val Thr Val Leu Asp Val Gly Asp Ala Tyr Phe Ser Val Pro
245 250 255
Leu Asp Glu Asp Phe Arg Lys Tyr Thr Ala Phe Thr Ile Pro Ser Ile
260 265 270
Asn Asn Glu Thr Pro Gly Ile Arg Tyr Gln Tyr Asn Val Leu Pro Gln
275 280 285
Gly Trp Lys Gly Ser Pro Ala Ile Phe Gln Ser Ser Met Thr Lys Ile
290 295 300
Leu Glu Pro Phe Arg Lys Gln Asn Pro Asp Ile Val Ile Tyr Gln Tyr
305 310 315 320
Met Asp Asp Leu Tyr Val Gly Ser Asp Leu Glu Ile Gly Gln His Arg
325 330 335
Thr Lys Ile Glu Glu Leu Arg Gln His Leu Leu Arg Trp Gly Leu Thr
340 345 350
Thr Pro Asp Lys Lys His Gln Lys Glu Pro Pro Phe Leu Lys Met Gly
355 360 365
Tyr Glu Leu His Pro Asp Lys Trp Thr Val Gln Pro Ile Val Leu Pro
370 375 380
Glu Lys Asp Ser Trp Thr Val Asn Asp Ile Gln Lys Leu Val Gly Lys
385 390 395 400
Leu Asn Trp Ala Ser Gln Ile Tyr Pro Gly Ile Lys Val Arg Gln Leu
405 410 415
Cys Lys Leu Leu Arg Gly Thr Lys Ala Leu Thr Glu Val Ile Pro Leu
420 425 430
Thr Glu Glu Ala Glu Leu Glu Leu Ala Glu Asn Arg Glu Ile Leu Lys
435 440 445
Glu Pro Val His Gly Val Tyr Tyr Asp Pro Ser Lys Asp Leu Ile Ala
450 455 460
Glu Ile Gln Lys Gln Gly Gln Gly Gln Trp Thr Tyr Gln Ile Tyr Gln
465 470 475 480
Glu Pro Phe Lys Asn Leu Lys Thr Gly Lys Tyr Ala Arg Met Arg Gly
485 490 495
Ala His Thr Asn Asp Val Lys Gln Leu Thr Glu Ala Val Gln Lys Ile
500 505 510
Thr Thr Glu Ser Ile Val Ile Trp Gly Lys Thr Pro Lys Phe Lys Leu
515 520 525
Pro Ile Gln Lys Glu Thr Trp Glu Thr Trp Trp Thr Glu Tyr Trp Gln
530 535 540
Ala Thr Trp Ile Pro Glu Trp Glu Phe Val Asn Thr Pro Pro Leu Val
545 550 555 560
Lys Leu Arg Pro Met Gly Gly Lys Trp Ser Lys Ser Ser Val Val Gly
565 570 575
Trp Pro Thr Val Arg Glu Arg Met Arg Arg Ala Glu Pro Ala Ala Asp
580 585 590
Gly Val Gly Ala Ala Ser Arg Asp Leu Glu Lys His Gly Ala Ile Thr
595 600 605
Ser Ser Asn Thr Ala Ala Thr Asn Ala Ala Cys Ala Trp Leu Glu Ala
610 615 620
Gln Glu Glu Glu Glu Val Gly Phe Pro Val Thr Pro Gln Val Pro Leu
625 630 635 640
Arg Pro Met Thr Tyr Lys Ala Ala Val Asp Leu Ser His Phe Leu Lys
645 650 655
Glu Lys Gly Gly Leu Glu Gly Leu Ile His Ser Gln Arg Arg Gln Asp
660 665 670
Ile Leu Asp Leu Trp Ile Tyr His Thr Gln Gly Tyr Phe Pro Asp Trp
675 680 685
Gln Asn Tyr Thr Pro Gly Pro Gly Val Arg Tyr Pro Leu Thr Phe Gly
690 695 700
Trp Cys Tyr Lys Leu Val Pro Val Glu Pro Asp Lys Val Glu Glu Ala
705 710 715 720
Asn Lys Gly Glu Asn Thr Ser Leu Leu His Pro Val Ser Leu His Gly
725 730 735
Met Asp Asp Pro Glu Arg Glu Val Leu Glu Trp Arg Phe Asp Ser Arg
740 745 750
Leu Ala Phe His His Val Ala Arg Glu Leu His Pro Glu Tyr Phe Lys
755 760 765
Asn Cys
770
<210> 18
<211> 3000
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> F4(p51)*
<400> 18
atggttatcg tgcagaacat ccaggggcaa atggtacatc aggccatatc acctagaact 60
ttaaatgcat gggtaaaagt agtagaagag aaggctttca gcccagaagt aatacccatg 120
ttttcagcat tatcagaagg agccacccca caagatttaa acaccatgct aaacacagtg 180
gggggacatc aagcagccat gcaaatgtta aaagagacca tcaatgagga agctgcagaa 240
tgggatagag tacatccagt gcatgcaggg cctattgcac caggccagat gagagaacca 300
aggggaagtg acatagcagg aactactagt acccttcagg aacaaatagg atggatgaca 360
aataatccac ctatcccagt aggagaaatt tataaaagat ggataatcct gggattaaat 420
aaaatagtaa gaatgtatag ccctaccagc attctggaca taagacaagg accaaaagaa 480
ccttttagag actatgtaga ccggttctat aaaactctaa gagccgagca agcttcacag 540
gaggtaaaaa attggatgac agaaaccttg ttggtccaaa atgcgaaccc agattgtaag 600
actattttaa aagcattggg accagcggct acactagaag aaatgatgac agcatgtcag 660
ggagtaggag gacccggcca taaggcaaga gttttgcata tgaggcctgg tccgatctct 720
ccgatagaaa cagtttcggt caagcttaaa ccagggatgg atggtccaaa ggtcaagcag 780
tggccgctaa cggaagagaa gattaaggcg ctcgtagaga tttgtactga aatggagaag 840
gaaggcaaga taagcaagat cgggccagag aacccgtaca atacaccggt atttgcaata 900
aagaagaagg attcaacaaa atggcgaaag cttgtagatt ttagggaact aaacaagcga 960
acccaagact tttgggaagt ccaactaggt atcccacatc cagccggtct aaagaagaag 1020
aaatcggtca cagtcctgga tgtaggagac gcatatttta gtgtaccgct tgatgaggac 1080
ttccgaaagt atactgcgtt tactataccg agcataaaca atgaaacgcc aggcattcgc 1140
tatcagtaca acgtgctccc gcagggctgg aaggggtctc cggcgatatt tcagagctct 1200
atgacaaaaa tacttgaacc attccgaaag cagaatccgg atattgtaat ttaccaatac 1260
atggacgatc tctatgtggg ctcggatcta gaaattgggc agcatcgcac taagattgag 1320
gaactgaggc aacatctgct tcgatggggc ctcactactc ccgacaagaa gcaccagaag 1380
gagccgccgt tcctaaagat gggctacgag cttcatccgg acaagtggac agtacagccg 1440
atagtgctgc ccgaaaagga ttcttggacc gtaaatgata ttcagaaact agtcggcaag 1500
cttaactggg cctctcagat ttacccaggc attaaggtcc gacagctttg caagctactg 1560
aggggaacta aggctctaac agaggtcatc ccattaacgg aggaagcaga gcttgagctg 1620
gcagagaatc gcgaaattct taaggagccg gtgcacaggg tatactacga cccctccaag 1680
gaccttatag ccgagatcca gaagcagggg cagggccaat ggacgtacca gatatatcaa 1740
gaaccgttta agaatctgaa gactgggaag tacgcgcgca aacgaggggc tcatactaat 1800
gatgtaaagc aacttacgga agcagtacaa aagattacta ctgagtctat tgtgatatgg 1860
ggcaagaccc caaagttcaa gctgcccata cagaaggaaa catgggaaac atggtggact 1920
gaatattggc aagctacctg gattccagaa tgggaatttg tcaacacgcc gccgctggta 1980
aaactggccc tagctatggg tggcaagtgg tcaaaaagta gtgtggttgg atggcctact 2040
gtaagggaaa gaatgagacg agctgagcca gcagcagatg gggtgggagc agcatctcga 2100
gacctggaaa aacatggagc aatcacaagt agcaatacag cagctaccaa tgctgcttgt 2160
gcctggctag aagcacaaga ggaggaggag gtgggttttc cagtcacacc tcaggtacct 2220
ttaagaccaa tgacttacaa ggcagctgta gatcttagcc actttttaaa agaaaagggg 2280
ggactggaag ggctaattca ctcccaacga agacaagata tccttgatct gtggatctac 2340
cacacacaag gctacttccc tgattggcag aactacacac cagggccagg ggtcagatat 2400
ccactgacct ttggatggtg ctacaagcta gtaccagttg agccagataa ggtagaagag 2460
gccaataaag gagagaacac cagcttgtta caccctgtga gcctgcatgg aatggatgac 2520
cctgagagag aagtgttaga gtggaggttt gacagccgcc tagcatttca tcacgtggcc 2580
cgagagctgc atccggagta cttcaagaac tgcaggccta tgggtgcgag agcgtcagta 2640
ttaagcgggg gagaattaga tcgatgggaa aaaattcggt taaggccagg gggaaagaaa 2700
aaatataaat taaaacatat agtatgggca agcagggagc tagaacgatt cgcagttaat 2760
cctggcctgt tagaaacatc agaaggctgt agacaaatac tgggacagct acaaccatcc 2820
cttcagacag gatcagaaga acttagatca ttatataata cagtagcaac cctctattgt 2880
gtgcatcaaa ggatagagat aaaagacacc aaggaagctt tagacaagat agaggaagag 2940
caaaacaaaa gtaagaaaaa agcacagcaa gcagcagctg acacaggaca cagcaatcag 3000
<210> 19
<211> 1005
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> F4(p51)*
<400> 19
Met Val Ile Val Gln Asn Ile Gln Gly Gln Met Val His Gln Ala Ile
1 5 10 15
Ser Pro Arg Thr Leu Asn Ala Trp Val Lys Val Val Glu Glu Lys Ala
20 25 30
Phe Ser Pro Glu Val Ile Pro Met Phe Ser Ala Leu Ser Glu Gly Ala
35 40 45
Thr Pro Gln Asp Leu Asn Thr Met Leu Asn Thr Val Gly Gly His Gln
50 55 60
Ala Ala Met Gln Met Leu Lys Glu Thr Ile Asn Glu Glu Ala Ala Glu
65 70 75 80
Trp Asp Arg Val His Pro Val His Ala Gly Pro Ile Ala Pro Gly Gln
85 90 95
Met Arg Glu Pro Arg Gly Ser Asp Ile Ala Gly Thr Thr Ser Thr Leu
100 105 110
Gln Glu Gln Ile Gly Trp Met Thr Asn Asn Pro Pro Ile Pro Val Gly
115 120 125
Glu Ile Tyr Lys Arg Trp Ile Ile Leu Gly Leu Asn Lys Ile Val Arg
130 135 140
Met Tyr Ser Pro Thr Ser Ile Leu Asp Ile Arg Gln Gly Pro Lys Glu
145 150 155 160
Pro Phe Arg Asp Tyr Val Asp Arg Phe Tyr Lys Thr Leu Arg Ala Glu
165 170 175
Gln Ala Ser Gln Glu Val Lys Asn Trp Met Thr Glu Thr Leu Leu Val
180 185 190
Gln Asn Ala Asn Pro Asp Cys Lys Thr Ile Leu Lys Ala Leu Gly Pro
195 200 205
Ala Ala Thr Leu Glu Glu Met Met Thr Ala Cys Gln Gly Val Gly Gly
210 215 220
Pro Gly His Lys Ala Arg Val Leu His Met Arg Pro Gly Pro Ile Ser
225 230 235 240
Pro Ile Glu Thr Val Ser Val Lys Leu Lys Pro Gly Met Asp Gly Pro
245 250 255
Lys Val Lys Gln Trp Pro Leu Thr Glu Glu Lys Ile Lys Ala Leu Val
260 265 270
Glu Ile Cys Thr Glu Met Glu Lys Glu Gly Lys Ile Ser Lys Ile Gly
275 280 285
Pro Glu Asn Pro Tyr Asn Thr Pro Val Phe Ala Ile Lys Lys Lys Asp
290 295 300
Ser Thr Lys Trp Arg Lys Leu Val Asp Phe Arg Glu Leu Asn Lys Arg
305 310 315 320
Thr Gln Asp Phe Trp Glu Val Gln Leu Gly Ile Pro His Pro Ala Gly
325 330 335
Leu Lys Lys Lys Lys Ser Val Thr Val Leu Asp Val Gly Asp Ala Tyr
340 345 350
Phe Ser Val Pro Leu Asp Glu Asp Phe Arg Lys Tyr Thr Ala Phe Thr
355 360 365
Ile Pro Ser Ile Asn Asn Glu Thr Pro Gly Ile Arg Tyr Gln Tyr Asn
370 375 380
Val Leu Pro Gln Gly Trp Lys Gly Ser Pro Ala Ile Phe Gln Ser Ser
385 390 395 400
Met Thr Lys Ile Leu Glu Pro Phe Arg Lys Gln Asn Pro Asp Ile Val
405 410 415
Ile Tyr Gln Tyr Met Asp Asp Leu Tyr Val Gly Ser Asp Leu Glu Ile
420 425 430
Gly Gln His Arg Thr Lys Ile Glu Glu Leu Arg Gln His Leu Leu Arg
435 440 445
Trp Gly Leu Thr Thr Pro Asp Lys Lys His Gln Lys Glu Pro Pro Phe
450 455 460
Leu Lys Met Gly Tyr Glu Leu His Pro Asp Lys Trp Thr Val Gln Pro
465 470 475 480
Ile Val Leu Pro Glu Lys Asp Ser Trp Thr Val Asn Asp Ile Gln Lys
485 490 495
Leu Val Gly Lys Leu Asn Trp Ala Ser Gln Ile Tyr Pro Gly Ile Lys
500 505 510
Val Arg Gln Leu Cys Lys Leu Leu Arg Gly Thr Lys Ala Leu Thr Glu
515 520 525
Val Ile Pro Leu Thr Glu Glu Ala Glu Leu Glu Leu Ala Glu Asn Arg
530 535 540
Glu Ile Leu Lys Glu Pro Val His Gly Val Tyr Tyr Asp Pro Ser Lys
545 550 555 560
Asp Leu Ile Ala Glu Ile Gln Lys Gln Gly Gln Gly Gln Trp Thr Tyr
565 570 575
Gln Ile Tyr Gln Glu Pro Phe Lys Asn Leu Lys Thr Gly Lys Tyr Ala
580 585 590
Arg Lys Arg Gly Ala His Thr Asn Asp Val Lys Gln Leu Thr Glu Ala
595 600 605
Val Gln Lys Ile Thr Thr Glu Ser Ile Val Ile Trp Gly Lys Thr Pro
610 615 620
Lys Phe Lys Leu Pro Ile Gln Lys Glu Thr Trp Glu Thr Trp Trp Thr
625 630 635 640
Glu Tyr Trp Gln Ala Thr Trp Ile Pro Glu Trp Glu Phe Val Asn Thr
645 650 655
Pro Pro Leu Val Lys Leu Ala Leu Ala Met Gly Gly Lys Trp Ser Lys
660 665 670
Ser Ser Val Val Gly Trp Pro Thr Val Arg Glu Arg Met Arg Arg Ala
675 680 685
Glu Pro Ala Ala Asp Gly Val Gly Ala Ala Ser Arg Asp Leu Glu Lys
690 695 700
His Gly Ala Ile Thr Ser Ser Asn Thr Ala Ala Thr Asn Ala Ala Cys
705 710 715 720
Ala Trp Leu Glu Ala Gln Glu Glu Glu Glu Val Gly Phe Pro Val Thr
725 730 735
Pro Gln Val Pro Leu Arg Pro Met Thr Tyr Lys Ala Ala Val Asp Leu
740 745 750
Ser His Phe Leu Lys Glu Lys Gly Gly Leu Glu Gly Leu Ile His Ser
755 760 765
Gln Arg Arg Gln Asp Ile Leu Asp Leu Trp Ile Tyr His Thr Gln Gly
770 775 780
Tyr Phe Pro Asp Trp Gln Asn Tyr Thr Pro Gly Pro Gly Val Arg Tyr
785 790 795 800
Pro Leu Thr Phe Gly Trp Cys Tyr Lys Leu Val Pro Val Glu Pro Asp
805 810 815
Lys Val Glu Glu Ala Asn Lys Gly Glu Asn Thr Ser Leu Leu His Pro
820 825 830
Val Ser Leu His Gly Met Asp Asp Pro Glu Arg Glu Val Leu Glu Trp
835 840 845
Arg Phe Asp Ser Arg Leu Ala Phe His His Val Ala Arg Glu Leu His
850 855 860
Pro Glu Tyr Phe Lys Asn Cys Arg Pro Met Gly Ala Arg Ala Ser Val
865 870 875 880
Leu Ser Gly Gly Glu Leu Asp Arg Trp Glu Lys Ile Arg Leu Arg Pro
885 890 895
Gly Gly Lys Lys Lys Tyr Lys Leu Lys His Ile Val Trp Ala Ser Arg
900 905 910
Glu Leu Glu Arg Phe Ala Val Asn Pro Gly Leu Leu Glu Thr Ser Glu
915 920 925
Gly Cys Arg Gln Ile Leu Gly Gln Leu Gln Pro Ser Leu Gln Thr Gly
930 935 940
Ser Glu Glu Leu Arg Ser Leu Tyr Asn Thr Val Ala Thr Leu Tyr Cys
945 950 955 960
Val His Gln Arg Ile Glu Ile Lys Asp Thr Lys Glu Ala Leu Asp Lys
965 970 975
Ile Glu Glu Glu Gln Asn Lys Ser Lys Lys Lys Ala Gln Gln Ala Ala
980 985 990
Ala Asp Thr Gly His Ser Asn Gln Val Ser Gln Asn Tyr
995 1000 1005
Claims (28)
- Nef 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체, 및 p17 Gag 및/또는 p24 Gag 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체를 포함하고, p17 및 p24 Gag 둘 모두가 존재하는 경우에, 이들 사이에 하나 이상의 HIV 항원 또는 면역원성 단편이 존재하는 폴리펩티드.
- 제 1항에 있어서, Pol 또는 RT 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체를 추가로 포함하는 폴리펩티드.
- 제 1항 또는 제 2항에 있어서, RT 또는 면역원성 단편이 RT가 C 말단에서 절두되어 카르복시 말단 RN아제 H 도메인이 결여된 단편인 폴리펩티드.
- 제 3항에 있어서, RT 단편이 p51 단편인 폴리펩티드.
- 제 2항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, RT가 메티오닌이 또 다른 잔기, 예를 들어 리신에 의해 치환되는 592 위치에서의 변이를 포함하는 폴리펩티드.
- 제 1항 내지 제 4항 중 어느 한 항에 있어서, Nef가 전장 Nef인 폴리펩티드.
- 하기 중 어느 하나로부터 선택되는 폴리펩티드:1. p24-RT-Nef-p172. p24-RT*-Nef-p173. p24-p51RT-Nef-p174. p24-p51RT*-Nef-p175. p17-p51RT-Nef6. p17-p51RT*-Nef7. Nef-p178. 링커를 지닌 Nef-p179. p17-Nef10. 링커를 지닌 p17-Nef(상기에서, *는 RT 메티오닌592의 리신으로의 변이를 나타낸다).
- 제 1항 내지 제 7항 중 어느 한 항에 따른 폴리펩티드를 정제하는 방법으로서,i). 정제되지 않은 폴리펩티드를 포함하는 조성물을 제공하고;ii). 조성물을 2개 이상의 크로마토그래피 단계로 처리하고;iii). 임의로 폴리펩티드를 카르복시아미드화시키고;iv). 완충액 교체 단계를 수행하여 약제 포뮬레이션을 위한 적합한 완충액 중에 단백질을 제공하는 것을 포함하는 방법.
- 제 8항에 있어서, 두개 이하의 크로마토그래피 단계가 존재하는 방법.
- 제 8항 또는 제 9항에 있어서, 카르복시아미드화가 두개의 크로마토그래피 단계 사이에 수행되는 방법.
- (i) Nef 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체 및 p17 Gag 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체, 및 (ii) p24 Gag 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체를 포함하는 폴리펩티드, 또는 (i) Nef 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체 및 p24 Gag 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체, 및 (ii) p17 Gag 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체를 포함하는 폴리펩티드를 포함하는 조성물.
- 제 11항에 있어서, RT 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체를 추가로 포함하는 조성물.
- (i) Nef 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체 및 p17 Gag 및/또는 p24 Gag 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체를 포함하고, p17 및 p24 Gag 둘 모두가 존재하는 경우, 이들 사이에 하나 이상의 HIV 항원 또는 면역원성 단편이 존재하는 폴리펩티드 및 (ii) p51 RT 폴리펩티드를 포함하는 조성물.
- 제 11항 내지 제 13항 중 어느 한 항에 있어서, (i)이1. Nef-p172. 링커를 지닌 Nef-p173. p17-Nef4. 링커를 지닌 p17-Nef로부터 선택되는 조성물.
- 제 12항 내지 제14항 중 어느 한 항에 있어서, RT 또는 이의 면역원성 단편이 RT가 C 말단에서 절두되어 카르복시 말단 RN아제 H 도메인이 결여된 단편인 조성물.
- 제 15항에 있어서, RT 단편이 p51 단편인 조성물.
- 제 11항 내지 제16항 중 어느 한 항에 있어서, RT가 메티오닌이 또 다른 잔기, 예를 들어 리신에 의해 치환되는 592 위치에서의 변이를 포함하는 조성물.
- 제 11항 내지 제 17항중 어느 한 항에 있어서, Nef가 전장 Nef인 조성물.
- 4개 이상의 HIV 항원 또는 이의 면역원성 단편 또는 유도체를 포함하는 HIV 항원의 융합체인 폴리펩티드로서, 4개의 항원 또는 단편이 Nef, Pol 및 Gag이거나, 이로부터 유래되는 폴리펩티드.
- 제 19항에 있어서, Gag가 융합체내 하나 이상의 다른 항원에 의해 분리되는 두개의 분리된 성분으로서 존재하는 폴리펩티드.
- 제 19항 또는 제 20항에 있어서, Nef가 전장 Nef인 폴리펩티드.
- 제 19항 내지 제 21항 중 어느 한 항에 있어서, Pol이 p66 또는 p51RT인 폴리펩티드.
- 제 19항 내지 제 22항 중 어느 한 항에 있어서, Gag가 p17 및 p24 Gag인 폴리펩티드.
- 제 1항 내지 제 23항 중 어느 한 항에 따른 폴리펩티드 또는 폴리펩티드의 조성물 또는 융합 단백질을 엔코딩하는 폴리누클레오티드(들).
- p51 RT 폴리펩티드 또는 이의 유도체 또는 이를 엔코딩하는, 바람직하게는 E.coli에서의 발현을 위해 코돈 최적화되는 폴리누클레오티드.
- 제 25항에 따른 폴리누클레오티드에 의해 엔코딩된 폴리펩티드.
- 제1항 내지 제 26항 중 어느 한 항에 따른 폴리펩티드 또는 폴리누클레오티드, 또는 폴리펩티드 또는 폴리누클레오티드의 조성물, 또는 제1항 내지 제26항 중 어느 한 항에 따른 정제된 폴리펩티드를 약제학적으로 허용되는 담체 또는 애주번트와 함께 포함하는 약제 조성물.
- 제 27항에 있어서, 애주번트가 QS21 또는 3D-MPL과 같은 Th1 유도 애주번트 또는 QS21과 3D-MPL의 조합물인 약제 조성물.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| GBGB0417494.2A GB0417494D0 (en) | 2004-08-05 | 2004-08-05 | Vaccine |
| GB0417494.2 | 2004-08-05 | ||
| PCT/EP2005/008434 WO2006013106A2 (en) | 2004-08-05 | 2005-08-03 | Vaccine for prevention and treatment of hiv-infection |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| KR20070041765A true KR20070041765A (ko) | 2007-04-19 |
| KR101501495B1 KR101501495B1 (ko) | 2015-03-11 |
Family
ID=32982606
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| KR1020077005049A KR101501495B1 (ko) | 2004-08-05 | 2005-08-03 | Ｈｉｖ-감염의 예방 및 치료를 위한 백신 |
Country Status (32)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US7612173B2 (ko) |
| EP (3) | EP2130921B1 (ko) |
| JP (3) | JP2008507987A (ko) |
| KR (1) | KR101501495B1 (ko) |
| CN (2) | CN102633866B (ko) |
| AR (2) | AR050102A1 (ko) |
| AT (1) | ATE443769T1 (ko) |
| AU (1) | AU2005268856B2 (ko) |
| BR (1) | BRPI0514108A (ko) |
| CA (1) | CA2575898C (ko) |
| CY (1) | CY1109667T1 (ko) |
| DE (1) | DE602005016810D1 (ko) |
| DK (1) | DK1773999T3 (ko) |
| ES (3) | ES2486669T3 (ko) |
| GB (1) | GB0417494D0 (ko) |
| HK (1) | HK1108168A1 (ko) |
| HR (1) | HRP20090678T1 (ko) |
| IL (2) | IL180947A0 (ko) |
| MA (1) | MA28983B1 (ko) |
| MX (1) | MX2007001515A (ko) |
| MY (1) | MY145614A (ko) |
| NO (1) | NO20070988L (ko) |
| NZ (1) | NZ552976A (ko) |
| PE (1) | PE20060577A1 (ko) |
| PL (1) | PL1773999T3 (ko) |
| PT (1) | PT1773999E (ko) |
| RU (1) | RU2441878C2 (ko) |
| SG (1) | SG155206A1 (ko) |
| SI (1) | SI1773999T1 (ko) |
| TW (1) | TWI365191B (ko) |
| WO (1) | WO2006013106A2 (ko) |
| ZA (1) | ZA200700771B (ko) |
Families Citing this family (40)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20020048596A1 (en) * | 1994-12-30 | 2002-04-25 | Gregor Cevc | Preparation for the transport of an active substance across barriers |
| CA2309633C (en) * | 1998-10-23 | 2010-12-14 | Idea Innovative Dermale Applikationen Gmbh | Method for developing, testing and using associates of macromolecules and complex aggregates for improved payload and controllable de/association rates |
| SI1031346T1 (en) | 1999-01-27 | 2002-08-31 | Idea Ag | Noninvasive vaccination through the skin |
| SI1031347T1 (en) | 1999-01-27 | 2002-10-31 | Idea Ag | Transnasal transport/immunisation with highly adaptable carriers |
| AU5409699A (en) * | 1999-07-05 | 2001-01-22 | Idea Ag | A method for the improvement of transport across adaptable semi-permeable barriers |
| US20040105881A1 (en) * | 2002-10-11 | 2004-06-03 | Gregor Cevc | Aggregates with increased deformability, comprising at least three amphipats, for improved transport through semi-permeable barriers and for the non-invasive drug application in vivo, especially through the skin |
| TW200510425A (en) * | 2003-08-13 | 2005-03-16 | Japan Tobacco Inc | Nitrogen-containing fused ring compound and use thereof as HIV integrase inhibitor |
| CA2584475A1 (en) * | 2004-11-12 | 2006-05-18 | Idea Ag | Extended surface aggregates in the treatment of skin conditions |
| AU2006245920A1 (en) * | 2005-05-12 | 2006-11-16 | Glaxo Group Limited | Vaccine composition |
| AU2006252406B2 (en) | 2005-06-01 | 2012-05-17 | California Institute Of Technology | Method of targeted gene delivery using viral vectors |
| CA2651764A1 (en) * | 2006-05-09 | 2007-11-22 | Gerald V. Quinnan | Hiv-1 immunogenic compositions |
| PT2048955E (pt) * | 2006-07-21 | 2013-09-20 | California Inst Of Techn | Administração de gene alvo para vacinação de células dendríticas |
| US9717788B2 (en) | 2007-03-02 | 2017-08-01 | Glaxosmithkline Biologicals Sa | Method of inducing an immune response against HIV employing HIV immunogens, adenoviral vectors encoding said immunogens, and adjuvant |
| EA021391B1 (ru) * | 2007-03-02 | 2015-06-30 | Глаксосмитклайн Байолоджикалс С.А. | Способ индукции иммунного ответа, вакцинная композиция, ее применение и набор |
| US20110244496A1 (en) * | 2007-03-06 | 2011-10-06 | Rutgers, The State University | Hiv reverse transcriptase compositions and methods |
| CA2682045A1 (en) * | 2007-03-26 | 2008-10-02 | International Aids Vaccine Initiative | Method of eliciting immune response with a modified mva viral hiv-1 vector |
| WO2008142133A1 (en) | 2007-05-24 | 2008-11-27 | Glaxosmithkline Biologicals S.A | Lyophilised antigen composition |
| JP2011506565A (ja) * | 2007-12-21 | 2011-03-03 | グラクソスミスクライン バイオロジカルズ ソシエテ アノニム | ワクチン |
| AU2009270771B2 (en) * | 2008-07-16 | 2012-08-23 | Baylor Research Institute | HIV vaccine based on targeting maximized Gag and Nef to dendritic cells |
| GB0815872D0 (en) * | 2008-09-01 | 2008-10-08 | Pasteur Institut | Novel method and compositions |
| US8431153B2 (en) | 2008-09-09 | 2013-04-30 | Celebrity Biogens, Llc | Bioactive composition for the treatment of the HIV/AIDS, method for manufacturing and using the same |
| SI2770061T1 (sl) | 2009-07-24 | 2019-02-28 | Immune Design Corp. | Neintegrirani lentiviralni vektorji |
| AU2011231574A1 (en) * | 2010-03-26 | 2012-10-11 | Glaxosmithkline Biologicals S.A. | HIV vaccine |
| US8623376B2 (en) | 2010-05-14 | 2014-01-07 | Baxter International Inc. | Chimeric OspA genes, proteins, and methods of use thereof |
| MX2013003497A (es) * | 2010-09-27 | 2013-12-02 | Glaxosmithkline Biolog Sa | Vacuna contra el virus de la inmunodeficiencia humana. |
| JP2012120506A (ja) * | 2010-12-10 | 2012-06-28 | Tosoh Corp | Ａｍｖ逆転写酵素遺伝子、該遺伝子によりコードされるａｍｖ逆転写酵素及び該遺伝子を用いるａｍｖ逆転写酵素の製造方法 |
| GB201022007D0 (en) | 2010-12-24 | 2011-02-02 | Imp Innovations Ltd | DNA-sensor |
| JP2013146235A (ja) * | 2012-01-20 | 2013-08-01 | Tosoh Corp | トリ骨髄芽細胞腫ウイルス逆転写酵素の製造方法 |
| EP2620446A1 (en) | 2012-01-27 | 2013-07-31 | Laboratorios Del Dr. Esteve, S.A. | Immunogens for HIV vaccination |
| US8323662B1 (en) | 2012-03-30 | 2012-12-04 | Immune Design Corp. | Methods useful for generating highly mannosylated pseudotyped lentiviral vector particles comprising a Vpx protein |
| DK2831095T3 (en) | 2012-03-30 | 2019-02-18 | Immune Design Corp | LENTIVIRAL VECTOR PARTICLES WITH IMPROVED TRANSDUCTION EFFICIENCY FOR CELL EXPRESSING DC SIGN |
| US9713635B2 (en) | 2012-03-30 | 2017-07-25 | Immune Design Corp. | Materials and methods for producing improved lentiviral vector particles |
| TWI728239B (zh) | 2013-03-26 | 2021-05-21 | 美商環球免疫公司 | 治療或預防人類免疫缺乏病毒感染之組合物及方法 |
| AU2015287773B2 (en) | 2014-07-11 | 2018-03-29 | Gilead Sciences, Inc. | Modulators of toll-like receptors for the treatment of HIV |
| KR102014518B1 (ko) | 2017-01-05 | 2019-08-26 | 서울대학교산학협력단 | HIV 1의 p24 단백질을 발현하는 벡터가 도입된 재조합 마이코박테리움 스메그마티스 균주 및 이를 포함하는 백신 |
| GB201812647D0 (en) | 2018-08-03 | 2018-09-19 | Chancellor Masters And Scholars Of The Univ Of Oxford | Viral vectors and methods for the prevention or treatment of cancer |
| CN114761041A (zh) | 2019-07-16 | 2022-07-15 | 吉利德科学公司 | Hiv疫苗及其制备和使用方法 |
| CA3161633A1 (en) | 2019-11-14 | 2021-05-20 | Aelix Therapeutics, S.L. | Dosage regimens for vaccines |
| US20230330211A1 (en) | 2020-03-27 | 2023-10-19 | Svenska Vaccinfabriken Produktion Ab | Compositions and methods for treating and preventing coronaviruses |
| US20230295244A1 (en) | 2021-09-29 | 2023-09-21 | Svenska Vaccinfabriken Produktion Ab | Compositions and methods for treating and preventing coronaviruses |
Family Cites Families (46)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4235877A (en) | 1979-06-27 | 1980-11-25 | Merck & Co., Inc. | Liposome particle containing viral or bacterial antigenic subunit |
| US4372945A (en) | 1979-11-13 | 1983-02-08 | Likhite Vilas V | Antigen compounds |
| IL61904A (en) | 1981-01-13 | 1985-07-31 | Yeda Res & Dev | Synthetic vaccine against influenza virus infections comprising a synthetic peptide and process for producing same |
| US4436727A (en) | 1982-05-26 | 1984-03-13 | Ribi Immunochem Research, Inc. | Refined detoxified endotoxin product |
| DE3300234A1 (de) | 1983-01-05 | 1984-07-05 | Display-Design GmbH für moderne Verkaufsförderungsmittel und Raumaussstattung, 6233 Kelkheim | Etagenturm zur warenausstellung |
| CA1331443C (en) | 1987-05-29 | 1994-08-16 | Charlotte A. Kensil | Saponin adjuvant |
| US5057540A (en) | 1987-05-29 | 1991-10-15 | Cambridge Biotech Corporation | Saponin adjuvant |
| DK643188A (da) * | 1987-11-24 | 1989-05-25 | Smithkline Biolog | Ekspression af hiv-proteiner i e.coli og s.cerevisiae |
| US5221610A (en) * | 1988-05-26 | 1993-06-22 | Institut Pasteur | Diagnostic method and composition for early detection of HIV infection |
| EP0468520A3 (en) | 1990-07-27 | 1992-07-01 | Mitsui Toatsu Chemicals, Inc. | Immunostimulatory remedies containing palindromic dna sequences |
| JP3723231B2 (ja) | 1991-12-23 | 2005-12-07 | ディミナコ アクチェンゲゼルシャフト | アジュバント |
| KR0172970B1 (ko) | 1992-06-17 | 1999-02-01 | 김영길 | Aids백신에 유용한 키메릭 단백 및 그의 제조방법 |
| SG49909A1 (en) | 1992-06-25 | 1998-06-15 | Smithkline Beecham Biolog | Vaccine composition containing adjuvants |
| CN1087176C (zh) | 1993-03-23 | 2002-07-10 | 史密斯克莱·比奇曼生物公司 | 含有3－o脱酰基单磷酰脂a的疫苗制剂 |
| CA2163212C (en) * | 1993-05-18 | 2004-07-13 | Ahmed Abdullah Azad | Therapeutic compounds |
| HU219810B (hu) | 1993-11-17 | 2001-08-28 | Deutsche Om Arzneimittel Gmbh. | Glükózamin-diszacharidok, eljárás előállításukra és a vegyületeket tartalmazó gyógyszerkészítmények, valamint alkalmazásuk |
| GB9326253D0 (en) | 1993-12-23 | 1994-02-23 | Smithkline Beecham Biolog | Vaccines |
| PT772619E (pt) | 1994-07-15 | 2006-10-31 | Univ Iowa Res Found | Oligonucleotidos imunomoduladores |
| AUPM873294A0 (en) | 1994-10-12 | 1994-11-03 | Csl Limited | Saponin preparations and use thereof in iscoms |
| GB9620795D0 (en) | 1996-10-05 | 1996-11-20 | Smithkline Beecham Plc | Vaccines |
| UA56132C2 (uk) | 1995-04-25 | 2003-05-15 | Смітклайн Бічем Байолоджікалс С.А. | Композиція вакцини (варіанти), спосіб стабілізації qs21 відносно гідролізу (варіанти), спосіб приготування композиції вакцини |
| US6083716A (en) | 1996-09-06 | 2000-07-04 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Chimpanzee adenovirus vectors |
| CA2268825C (en) | 1996-10-11 | 2006-04-18 | The Regents Of The University Of California | Immunostimulatory polynucleotide/immunomodulatory molecule conjugates |
| GB9711990D0 (en) | 1997-06-11 | 1997-08-06 | Smithkline Beecham Biolog | Vaccine |
| ATE435661T1 (de) | 1997-08-29 | 2009-07-15 | Antigenics Inc | Adjuvant qs-21 enthaltende zusammensetzungen mit polysorbate oder cyclodextrin als hilfsmittel |
| EP1279401B1 (en) | 1997-09-05 | 2008-01-09 | GlaxoSmithKline Biologicals S.A. | Oil in water emulsions containing saponins |
| GB9718901D0 (en) | 1997-09-05 | 1997-11-12 | Smithkline Beecham Biolog | Vaccine |
| GB9720585D0 (en) | 1997-09-26 | 1997-11-26 | Smithkline Beecham Biolog | Vaccine |
| JP4637356B2 (ja) | 1998-08-04 | 2011-02-23 | ザ ヘンリー エム． ジャクソン ファウンデーション フォー ザ アドヴァンスメント オブ ミリタリー メディシン インコーポレイテッド | 広い反応性の中和抗体応答を伴うｈｉｖ−１エンベロープタンパク質の発現およびキャクタライゼーション |
| WO2001043693A2 (en) | 1999-12-17 | 2001-06-21 | Merck & Co., Inc. | Polynucleotide vaccines expressing codon optimized hiv-1 nef and modified hiv-1 nef |
| ATE457996T1 (de) * | 1999-12-23 | 2010-03-15 | Medical Res Council | Verbesserungen in oder in bezug auf immunantworten gegen hiv |
| US20020155127A1 (en) * | 2000-06-02 | 2002-10-24 | Danher Wang | Genetic vaccine against human immunodeficiency virus |
| AU9456201A (en) | 2000-09-15 | 2002-03-26 | Merck & Co Inc | Enhanced first generation adenovirus vaccines expressing codon optimized hiv1-gag, pol, nef and modifications |
| CU23235A1 (es) | 2001-02-28 | 2007-09-26 | Ct Ingenieria Genetica Biotech | POXVIRUS RECOMBINANTES PARA PROTEINAS QUIMéRICAS DEL VIRUS DE LA INMUNODEFICIENCIA HUMANA Y SU APLICACION EN LA TERAPéUTICA Y LA PREVENCION DEL SIDA |
| WO2003046124A2 (en) | 2001-11-21 | 2003-06-05 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Simian adenovirus nucleic acid and amino acid sequences, vectors containing same, and methods of use |
| EP1434859A2 (en) * | 2001-07-25 | 2004-07-07 | New York University | Use of glycosylceramides as adjuvants for vaccines against infections and cancer |
| EP2322626A1 (en) * | 2001-09-20 | 2011-05-18 | Glaxo Group Limited | HIV-GAG codon-optimised DNA vaccines |
| AU2002360429A1 (en) | 2001-11-26 | 2003-06-10 | Avigen, Inc. | Methods for producing stocks of recombinant aav virions |
| CA2484044A1 (en) * | 2002-03-19 | 2003-10-02 | Powdermed Limited | Imidazoquinolineamines as adjuvants in hiv dna vaccination |
| US20030190308A1 (en) * | 2002-03-19 | 2003-10-09 | Braun Ralph P. | Adjuvant |
| JP2006512047A (ja) * | 2002-06-11 | 2006-04-13 | グラクソスミスクライン バイオロジカルズ ソシエテ アノニム | 免疫原性組成物 |
| GB0225788D0 (en) * | 2002-11-05 | 2002-12-11 | Glaxo Group Ltd | Vaccine |
| GB0225786D0 (en) * | 2002-11-05 | 2002-12-11 | Glaxo Group Ltd | Vaccine |
| US7501503B2 (en) * | 2002-12-31 | 2009-03-10 | Mcgill University | Compositions and methods for inhibiting RNase H activity of retroid reverse transcriptase |
| US20050175627A1 (en) * | 2003-09-24 | 2005-08-11 | Oxxon Therapeutics Ltd. | HIV pharmaccines |
| EP1682666B1 (en) | 2003-09-24 | 2008-12-31 | Oxxon Therapeutics Limited | HIV Pharmaceutical vaccines |
-
2004
- 2004-08-05 GB GBGB0417494.2A patent/GB0417494D0/en not_active Ceased
-
2005
- 2005-08-02 PE PE2005000896A patent/PE20060577A1/es not_active Application Discontinuation
- 2005-08-03 MX MX2007001515A patent/MX2007001515A/es active IP Right Grant
- 2005-08-03 DE DE602005016810T patent/DE602005016810D1/de active Active
- 2005-08-03 SG SG200905319-0A patent/SG155206A1/en unknown
- 2005-08-03 AU AU2005268856A patent/AU2005268856B2/en not_active Ceased
- 2005-08-03 WO PCT/EP2005/008434 patent/WO2006013106A2/en active Application Filing
- 2005-08-03 MY MYPI20053623A patent/MY145614A/en unknown
- 2005-08-03 ES ES10178939.4T patent/ES2486669T3/es active Active
- 2005-08-03 EP EP09171029.3A patent/EP2130921B1/en active Active
- 2005-08-03 NZ NZ552976A patent/NZ552976A/en not_active IP Right Cessation
- 2005-08-03 PT PT05769948T patent/PT1773999E/pt unknown
- 2005-08-03 DK DK05769948.0T patent/DK1773999T3/da active
- 2005-08-03 TW TW094126452A patent/TWI365191B/zh not_active IP Right Cessation
- 2005-08-03 EP EP10178939.4A patent/EP2280073B1/en active Active
- 2005-08-03 CA CA2575898A patent/CA2575898C/en active Active
- 2005-08-03 CN CN201110406267.7A patent/CN102633866B/zh not_active Expired - Fee Related
- 2005-08-03 PL PL05769948T patent/PL1773999T3/pl unknown
- 2005-08-03 ES ES05769948T patent/ES2334044T3/es active Active
- 2005-08-03 AT AT05769948T patent/ATE443769T1/de active
- 2005-08-03 KR KR1020077005049A patent/KR101501495B1/ko not_active IP Right Cessation
- 2005-08-03 BR BRPI0514108-7A patent/BRPI0514108A/pt not_active IP Right Cessation
- 2005-08-03 CN CN2005800340055A patent/CN101035897B/zh not_active Expired - Fee Related
- 2005-08-03 JP JP2007524281A patent/JP2008507987A/ja active Pending
- 2005-08-03 RU RU2007104088/10A patent/RU2441878C2/ru not_active IP Right Cessation
- 2005-08-03 SI SI200530868T patent/SI1773999T1/sl unknown
- 2005-08-03 ES ES09171029.3T patent/ES2445453T3/es active Active
- 2005-08-03 US US11/573,128 patent/US7612173B2/en active Active
- 2005-08-03 EP EP05769948A patent/EP1773999B1/en active Active
- 2005-08-04 AR ARP050103260A patent/AR050102A1/es active IP Right Grant
-
2007
- 2007-01-25 IL IL180947A patent/IL180947A0/en not_active IP Right Cessation
- 2007-01-26 ZA ZA200700771A patent/ZA200700771B/xx unknown
- 2007-02-21 NO NO20070988A patent/NO20070988L/no not_active Application Discontinuation
- 2007-02-22 MA MA29713A patent/MA28983B1/fr unknown
- 2007-10-17 HK HK07111226.6A patent/HK1108168A1/xx not_active IP Right Cessation
-
2009
- 2009-10-14 US US12/578,969 patent/US20100184836A1/en not_active Abandoned
- 2009-12-16 CY CY20091101311T patent/CY1109667T1/el unknown
- 2009-12-17 HR HR20090678T patent/HRP20090678T1/hr unknown
-
2010
- 2010-08-12 IL IL207575A patent/IL207575A0/en unknown
-
2011
- 2011-02-18 AR ARP110100503A patent/AR080216A2/es not_active Application Discontinuation
- 2011-06-13 JP JP2011131445A patent/JP5629647B2/ja not_active Expired - Fee Related
-
2014
- 2014-07-25 JP JP2014151365A patent/JP6007212B2/ja not_active Expired - Fee Related
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| KR101501495B1 (ko) | Ｈｉｖ-감염의 예방 및 치료를 위한 백신 | |
| AU783005B2 (en) | Novel use | |
| KR20100109555A (ko) | 백신 | |
| SG184188A1 (en) | Hiv vaccine | |
| WO2003011334A1 (en) | Vaccine comprising gp120 and nef and/or tat for the immunisation against hiv | |
| US5876724A (en) | Induction of neutralizing antibody against viral infection by synergy between virus envelope glycoprotein and peptides corresponding to neutralization epitopes of the glycoprotein | |
| ZA200205968B (en) | Vaccine for the prophylactic or therapeutic immunization against HIV. | |
| TW200940094A (en) | Vaccine |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A201 | Request for examination | ||
| E902 | Notification of reason for refusal | ||
| E902 | Notification of reason for refusal | ||
| E701 | Decision to grant or registration of patent right | ||
| GRNT | Written decision to grant | ||
| LAPS | Lapse due to unpaid annual fee |