KR102086984B1 - 강담돔 웅성 특이적 dna 마커 및 유전적 성별 감식 방법 - Google Patents
강담돔 웅성 특이적 dna 마커 및 유전적 성별 감식 방법 Download PDFInfo
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Abstract
본 발명은 강담돔 웅성 특이적 DNA 마커를 제공하였고, 그 Y 염색체 DNA 단편의 서열은 SEQ ID NO:1이며; X 염색체 DNA 단편의 서열은 SEQ ID NO:2이다. 여기서, Y 염색체 DNA 단편은 X 염색체의 단편보다 12 bp가 더 많고, 이러한 단편이 바로 Y 염색체 고유의 DNA 단편이다. 본 발명은 강담돔 전체 게놈 서열로부터 2가닥의 X 염색체, Y 염색체와 상동인 차별적 DNA 단편을 선별하여, 강담돔 유전적 성별 감식 방법을 추가적으로 구축하였으며, 상기 방법에 의해 강담돔 유전적 성별을 빠르고 정확하게 효과적으로 구별할 수 있다. 상기 방법은 웅성 개체에서 특이적 목적 밴드를 증폭시키는 반면, 자성 개체에서 산물을 증폭시킬 수 없으며, 아가로스 전기 영동에 의해 분별될 수 있어, 강담돔 유전적 성별을 감식하는 시간을 단축시키고, 양식장의 간이한 환경에서의 강담돔 유전적 성별의 감식에 활용되어, 검출 시간 및 원가를 절약하였다. 강담돔 성별 감식, 종자 번식 및 가계 선별적 육종에 중요한 의미와 응용 가치가 있다.
Description
본 발명은 수산 유전 육종에서의 어류 유전적 성별 감식 및 성별 제어 기술 분야에 속하며, 구체적으로, 강담돔 웅성 특이적 DNA 마커 및 유전적 성별 감식 방법에 관한 것이다.
강담돔(Oplegnathus punctatus)은 농어목, 돌돔과, 돌돔속에 속하고, 속칭 얼룩갯돔, 흑금고로 불리운다. 주로 중국 동해와 남해 및 주변의 일본, 북한 해역에 분포하며, 온열대 연안 중하층 어류에 속하며, 주로 암초 및 산호에 서식하고, 이의 이빨은 날카로워 조개류, 랍스터, 성게 등의 딱딱한 껍데기를 씹을 수 있다. 강담돔은 주로 낚시로 얻을 수 있으며, 천연 자원이 매우 희소하다(You Hongzheng et al. 2016). 강담돔은 육질이 부드럽고, 식감이 독특하여 소비자들에게 많은 사랑을 받고 있다. 이의 식용 및 약용 가치는 매우 높으며, 일본 요리에서 "사시미 절품"이라는 찬사를 받았다. 이 물고기는 운송이 편리하고, 운송 생존율이 높다. 강담돔은 자태가 아름답고, 푸른 빛 아래에서 몽환적이므로, "몽환 고기"라고도 하며, 감상 가치가 매우 높다. 2014년, 산동라이저우밍보우아쿠아틱(Shandong Laizhou Mingbo Aquatic) 유한회사는 중국 과학원 해양 연구소와 협력하여 중국 국내에서 처음으로 강담돔 생식 조절 및 종자 생산 기술을 돌파하였으며, 산동 라이저우에서 대량의 강담돔 종자와 성어를 성공적으로 배양하였다. 이는 높은 감상 가치와 경제적 가치로 인해 새로운 어류 양식 품종이 되었다.
강담돔은 22쌍의 상염색체와 한 세트의 복합 성염색체(X1, X2 및 Y)를 가지고 있고, 이의 성별 결정 메커니즘은 (X1X2Y)형이며, 유전적 자성은 동형 성염색체(X1X1X2X2)이고, 유전적 웅성은 이형 염색체(X1X2Y)이다(Xue Rui et al. 2016). 자연 조건 하에서, 자성 강담돔은 X1X2형 난자를 생산하고, 웅성 강담돔은 X1X2, Y 두 가지 정자를 생산하며, 수정 후 정상적인 X1X1X2X2 자성 및 X1X2Y 웅성 후대를 얻는다. 인공 번식 및 선택적 육종 과정에서, 양질의 종자를 얻기 위하여 어미 물고기의 자성 및 웅성을 선별해야 하며, 가계 구축을 위해 강담돔의 성별을 정확하게 감식하여야 한다. 강담돔의 첫번째 성 성숙은 3-4년이 걸리며, 유묘, 어종 및 성어 시기에서 외관 형태에 의해 감당돔의 성별을 감식할 수 없으므로, 강담돔 인공 번식과 우량종의 선택 육종의 연구 진척이 제한되었다. 강담돔 성별 특이적 분자 마커를 개발하고, 강담돔 유전적 성별을 빠르게 감식하기 위한 분자 방법의 구축은 자성 및 웅성 부모 성별 비율 제어, 성염색체 감식, 성별 결정 및 성염색체 진화 메커니즘 연구의 중요한 수단이다.
현재 강담돔 성별 특이적 분자 마커의 선별 및 유전적 성별 감식에 관한 연구는 중국 국내외에서 보도되지 않았다. 따라서, 강담돔 성별 특이적 분자 마커의 발굴 및 아가로스 겔 전기 영동 방법으로 정확하게 분별할 수 있고 양식장 현장에서 적용되는 강담돔 유전적 성별을 신속하게 감식할 수 있는 분자 기술의 구축은 강담돔 양식 산업에서 시급히 극복해야 할 중요한 과제이다.
본 발명에 따르면, 강담돔 자성, 웅성 물고기 전체 게놈 시퀀싱 및 비교 분석에 의해 강담돔 웅성 특이적 DNA 마커, 즉 일정한 웅성 Y 염색체에 특이적인 DNA 단편을 발견하였으며, 이 단편을 강담돔 유전적 성별 감식에 적용하였다.
본 발명은 먼저 3세대의 게놈 시퀀싱 기술에 의해 강담돔 자성 물고기 및 웅성 물고기의 전체 게놈 시퀀싱을 완성하였고, 이후 생물 정보학 방법을 통해 자성 물고기와 웅성 물고기의 게놈 서열을 비교 분석한 결과, 2가닥의 강담돔 X(X1 또는 X2) 염색체, Y 염색체와 상동인 차별적 DNA 단편을 발견하였으며, 여기서 Y 염색체의 DNA 단편 길이는 573 bp이고, SEQchrY로 명명하며, 이의 서열은 SEQ ID NO:1이고;
X 염색체의 DNA 단편 길이는 561 bp이며, SEQchrX로 명명하며, 이의 서열은 SEQ ID NO:2이고;
여기서, Y 염색체 DNA 단편은 X 염색체의 단편보다 12 bp가 더 많으며, 이러한 단편이 바로 웅성 Y 염색체 고유의 DNA 마커이다.
본 발명은 Y 염색체 및 X 염색체의 상기 차별적 단편에 의해 성별을 결정하는, 강담돔 유전적 성별을 감식하는 방법을 더 제공하고;
그 구체적인 검출 방법으로서 상기 서열이 SEQ ID NO:1인 뉴클레오티드 단편이 검출될 강담돔에 존재하는지 여부를 결정하고; PCR 프라이머에 의해 감별한다.
본 발명은 또한 강담돔 2가닥의 X, Y 성염색체 서열의 비교 분석에 기반하여, Y 염색체 특이적 단편을 이용하여, 3개의 프라이머를 설계하였다. 1.5 %의 아가로스 겔 전기 영동으로 PCR 산물을 검출하여, 자성 및 웅성 개체를 판단하고, 강담돔 유전적 성별을 정확하게 감식하며, 업스트림, 다운스트림 프라이머 서열은 각각 하기와 같다:
SEQ XY:1: 5'- TATCTCTCTGCTCTGCCTGGGTA -3'(SEQ ID NO:3);
SEQ XY:2: 5'- ACGGCAACAAACACACACATCAT -3'(SEQ ID NO:4);
SEQ Y:3: 5'- GCTAGGAGGAGAATAACAAC -3'(SEQ ID NO:5);
상기 프라이머를 사용하여 강담돔 유전적 성별을 감식하며,
주로 강담돔 게놈 DNA의 추출, 웅성 특이적 마커 DNA 단편 PCR 증폭, PCR 산물 아가로스 전기 영동 검출 단계를 포함하고; 여기서, 유전적 자성(X1X1X2X2) 개체에서 561 bp의 단일 DNA 단편을 증폭시키며; 유전적 웅성 개체(X1X2Y)에서 561 bp, 573 bp 및 222 bp의 3개의 DNA 단편을 증폭시키나, 561 bp 및 573 bp 단편 차이가 너무 작기 때문에, 전기 영동도에서 하나의 밴드로 융합되어 보인다.
본 발명은 강담돔 전체 게놈 서열에서 2가닥의 X 염색체, Y 염색체와 상동인 차별적 DNA 단편을 선별하여, 강담돔 유전적 성별 감식 방법을 구축하였고, 상기 방법에 의해 강담돔 유전적 성별을 빠르고 정확하게 효과적으로 구별할 수 있다. 상기 방법은 웅성 개체에서 특이적 목적 밴드(222 bp)를 증폭시키는 반면, 자성 개체에서 상기 222 bp의 DNA 밴드를 증폭시킬 수 없으며, 아가로스 전기 영동에 의해 분별될 수 있어, 강담돔 유전적 성별을 정확하게 감식하는 시간을 단축시키고, 양식장의 간이한 환경에서의 강담돔 유전적 성별의 감식에 활용되어, 검출 시간 및 원가를 절약하였다. 본 발명의 강담돔의 유전적 성별을 검출하는 방법은, 강담돔 어미 물고기 번식, 가계 구축 및 양식 집단의 자성 웅성 성별 비율을 제어하고, 강담돔 양식업의 지속 가능하고 건강한 발전을 촉진하는 데 중요한 의미와 응용 가치가 있다.
도 1은 본 발명의 X 염색체, Y 염색체 DNA 단편 서열 대비도이고, 프라이머 위치는 밑줄로 표시되며; 공란: X 염색체, Y 염색체 DNA 단편의 차별적 서열; *: X 염색체, Y 염색체 DNA 단편의 동일한 서열; -: 결실된 서열이다.
도 2는 본 발명의 유전적 자성, 웅성 강담돔 PCR 산물의 1.5 %의 아가로스 겔 전기 영동 결과도이고, ♀: 생리적 자성 물고기; ♂: 생리적 웅성 물고기; M: DL 2000 DNA 마커; 도면에서 단일 밴드가 나타난 것은 유전적 자성 물고기이고, 이중 밴드가 나타난 것은 웅성 물고기이며, 여기서, 60마리의 생리적 웅성 물고기에서 2마리가 유전적 성별이 자성인 강담돔으로 나타났고, 이 2마리의 강담돔을 해부하여 검사한 결과 생리적 가짜 웅성임을 확인하였다. 이 2마리의 물고기는 유전적으로 자성이고, 생리적으로 웅성인 가짜 웅성 물고기이다.
도 2는 본 발명의 유전적 자성, 웅성 강담돔 PCR 산물의 1.5 %의 아가로스 겔 전기 영동 결과도이고, ♀: 생리적 자성 물고기; ♂: 생리적 웅성 물고기; M: DL 2000 DNA 마커; 도면에서 단일 밴드가 나타난 것은 유전적 자성 물고기이고, 이중 밴드가 나타난 것은 웅성 물고기이며, 여기서, 60마리의 생리적 웅성 물고기에서 2마리가 유전적 성별이 자성인 강담돔으로 나타났고, 이 2마리의 강담돔을 해부하여 검사한 결과 생리적 가짜 웅성임을 확인하였다. 이 2마리의 물고기는 유전적으로 자성이고, 생리적으로 웅성인 가짜 웅성 물고기이다.
아래에서는 도면 및 구체적인 실시예를 결부하여 본 발명을 더 상세하게 설명하고자 한다.
실시예 1. 강담돔 웅성 특이적 DNA 단편의 선별 및 검증
웅성 특이적 DNA 단편의 발견: 본 발명에 사용된 성염색체-연결된 DNA 단편 서열은 중국 수산 과학 연구원 황해 수산 연구소의 수산 생물 기술과 게놈 연구실 첸송린(Chen songlin)의 연구팀에 의해 완성된 강담돔의 전체 게놈 시퀀싱 결과로부터 유래된 것이고(미발표), 생물 정보학적으로 강담돔 게놈 서열을 분석하여 2가닥의 X 염색체, Y 염색체와 상동인 차별적 DNA 단편을 선별하였다. 2가닥의 강담돔 X 염색체(X1 또는 X2), Y 염색체와 상동인 차별적 DNA 단편을 발견하였고, 여기서 Y 염색체의 DNA 단편의 길이는 573 bp이며, SEQchrY로 명명하고, 이의 서열은 SEQ ID NO:1:
TATCTCTCTGCTCTGCCTGGGTAGCTCTGATTGTCAAGAGCATCGTAAAAACCATTAAACTGTTGTAAATAGTTTAGTCTCCTGTTTTATTCCTCAAAAGCCTTTACAGCATTTAGTGAAATTTCCTCCAGCTTTTTTAATCAGTGTTTTATTGTCTGTAAAGCCAGTTTTAGCTCTTAAGTTCTATTAGAATATATAAACAAAGTGCCTCTGCTATTTTCCACAGTATTATACTGTAGACAGATGAGCCGCTCCATATTGGGCAGCTTTCTCAAATTGCTGTATGTTAATTTGTGTAATCAGAAAGTAGCAGGAGGTGCCAATCTGATCACAACCAGTCAGATAATGACAGCTAGGAGGAGAATAACAACTATTATGATTTTTCCCCTCGCGCCTTTGGTTTTCTCTAGGACTGTTAATTCCAATTACTCTCCTTAATTTTTGGAATTTCCTGCTTTTCACGACTGAGTGTGGTGCCCTGATGTTTCAGTTTGGGTTCGGATCGTGTCGGACCAGAATGTGAAGTGAATTCATGATGATGATGATGATGATGATGTGTGTGTTTGTTGCCGT이며;
X 염색체의 DNA 단편의 길이는 561 bp이고, SEQchrX로 명명하며, 이의 서열은 SEQ ID NO:2:
TATCTCTCTGCTCTGCCTGGGTAACTCTGATTGTCAAGAGCATCGTAAAAACCATTAAACTGTTGTAAATAGTTTAGTCTCCTGTTTTATTCCTCAAAAGCCTTTACAGCATTTAGTGAAATTTCCTCCAGCTTTTTTAATCAGTGTTTTATTGTCTGTAAAGCCAGTTTTAGCTCTTAAGTTCTATTAGAATATACAAACAAAGTGCCTCTGCTATTTTCCACAGTATTATACTGTAGACAGATGAGCCGCTCCATATTGGGCAGCTTTCTCAAATTGCTGTATGTTAATTTGTGTAATCAGAAAGTAGCAGGAGGCGCCAATCTGATCACAACCAGTCAGATAATGACAGCTATTATGATTTTTCCCCTCGCGCCTTTGGTTTTCTCTAGGATTGTTAATTCCAATTACTCTCCTTAATTTTTGGAATTTCCTGCTTTTCACGACTGAGTGTGGTGCCCTGATGTTTCAGTTTGGGTTCGGATCGTGTCGGACCAGAATGTGAAGTGAATTCATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGTGTGTGTTTGTTGCCGT이다.
여기서 Y 염색체 DNA 단편은 X 염색체의 단편보다 12 bp가 더 많고, 이러한 여분의 단편이 바로 Y 염색체 고유의 DNA 단편이며, 이의 존재 여부에 의해 강담돔의 자성 및 웅성 유전적 성별을 감별할 수 있다.
웅성 특이적 DNA 단편의 서열 검증: 여러 쌍의 프라이머를 설계하여, 증폭 결과 안정적인 한 쌍의 프라이머를 선별하였다. 생리적 성별을 알고 있는 자성, 웅성 강담돔 DNA를 선택하는 동시에 프라이머 SEQ XY:1, SEQ XY:2, SEQ Y:3을 이용하여 PCR 증폭하되, 반응 조건 및 절차는 하기와 같다: PCR 반응 시스템은 총 50 μL이고, 35.5 μL의 ddH2O; 5.0 μL의 10×완충액; 4.0 μL의 dNTP(2.5 mmol/L); 1.0 μL의 SEQ XY:1(10 μmol/L); 1.0 μL의 SEQ XY:2(10 μmol/L); 2.0 μL의 SEQ Y:3(10 μmol/L); 0.5 μL의 rTaq 효소(5 U/μL); 3.0 μL의 주형 DNA(상청액)를 포함하고, 혼합하여 원심분리하였다. PCR 증폭 절차: 95 ℃에서 5 분; 95 ℃에서 30 초, 60℃에서 30 초, 72 ℃에서 30 초, 30개의 사이클; 72 ℃에서 7분 동안 진행하여, 4 ℃에서 보관하였다. PCR 산물은 1.5 %의 아가로스 겔 전기 영동에 의해 자성, 웅성 개체에 차이가 존재하는 것을 확인할 수 있다. 이러한 자성, 웅성 차별적 단편을 회수하고 pMD18-T 담체에 연결하며, 컴피턴트 세포로 형질전환시키고, 양성 클론을 골라 칭다오화다로 보내 시퀀싱하였다. 시퀀싱 결과는 X 염색체, Y 염색체의 상동인 차별적 DNA 단편의 서열을 검증하였다.
실시예 2: 강담돔 유전적 성별 감식 기술의 구축과 적용
1. 실험실 조건 하에서의 강담돔 유전적 성별 감식
DNA 추출: 해양 생물 DNA 추출 키트(Tiangen)를 사용하여 강담돔 지느러미줄 DNA를 추출하고, 1 %의 아가로스 겔 전기 영동에 의해 이의 완전성을 감식하였으며, UV 분광 광도계로 이의 OD값을 측정하고, DNA 농도를 50 ng/μL로 조정하여, -20 ℃의 온도 하에서 냉동 보관하여 사용하였다.
PCR 감식: 강담돔 성별 특이적인 DNA 단편 프라이머 SEQ XY:1, SEQ XY:2, SEQ Y:3을 사용하여 PCR 방법에 의해 강담돔 유전적 성별을 검출하였다. PCR 반응 시스템은 15 μL이고, 여기서 10×완충액은 1.5 μL이며, dNTP는 0.8 μL이고, 업스트림 프라이머는 각각 0.3 μL이며, 다운스트림 프라이머는 0.6μL이고, 주형 DNA는 1 μL(50ng/μL), ddH2O은 11.0 μL이고, rTaq 효소는 0.1μL이다. PCR 증폭 절차: 95 ℃에서 5 분; 95 ℃에서 30 초, 60℃에서 30 초, 72 ℃에서 30 초, 30개의 사이클; 72 ℃ 에서 7 분 동안 진행하여, 4 ℃에서 보관하였다. 2.0 μL의 10×로딩 완충액을 넣고, 1.5 %의 아가로스 겔 전기 영동에 의해, 150 V에서 20분 동안 진행하여, 겔 이미징으로 유전적 성별을 분별할 수 있다. X1X1X2X2의 유전적 자성 개체는 561 bp의 단일 DNA 단편만을 증폭시킬 수 있고, X1X2Y 유전적 웅성 개체는 561-573 bp 및 222 bp의 2가닥의 DNA 밴드를 증폭시켰으며, 도 2에 도시된 바와 같다.
2. 양식장 조건 하에서의 강담돔 유전적 성별의 감식
DNA 추출: 강담돔 등 지느러미 또는 꼬리 지느러미에서 소량의 지느러미줄을 잘라내고, 지느러미줄이 담긴 각각의 원심분리 튜브에 500 μL의 용해물과 20 μL의 프로테이나제 K를 넣어, 55 ℃의 워터 배스(water bath)에서 1시간 동안 분해하며, 이 기간 동안 여러번 흔들어 분해를 가속화하였다. 분해된 원심분리 튜브를 취출하고, 500μL의 페놀: 클로로포름: 아소아밀알콜을 넣으며, 10분 동안 뒤집어 흔들어주고, 12000 rpm에서 10분 동안 원심분리하며, 450 μL의 상청액을 취하여 앞서 준비된 500 μL의 무알콜이 담긴 원심분리 튜브에 넣고, 30번 흔들어주며, 12000 rpm에서 5분 동안 원심분리하면, 백색 DNA가 원심분리 튜브 밑바닥에 침전되는 것을 볼 수 있다. 원심분리 튜브의 액체를 버리고, DNA 침전을 건조시키며, 100 μL의 ddH2O을 넣어, 2번 볼텍싱하여 DNA를 충분히 용해시킨다.
PCR 감식: 상기 3가닥의 프라이머를 사용하여 PCR 실험을 하고, PCR 반응 시스템은 15 μL이며, 여기서 10×완충액은 1.5 μL이고, dNTP는 0.8 μL이며, 업스트림 프라이머는 각각 0.3 μL이고, 다운스트림 프라이머는 0.6μL이며, 주형 DNA는 1 μL(50ng/μL)이고, ddH2O은 11.0 μL이며, rTaq 효소는 0.1μL이다. PCR 증폭 절차: 95 ℃에서 5 분; 95 ℃에서 30 초, 60℃에서 30 초, 72 ℃에서 30 초, 30개의 사이클; 72 ℃에서 7분 동안 진행하여, 4 ℃에서 보관하였다. 2.0 μL의 10×Loading 완충액을 넣고, 1 %의 아가로스 겔 전기 영동에 의해, 120 V의 하에서 20분 동안 진행하여, 겔 이미징으로 유전적 성별을 분별할 수 있다. 유전적 자성 물고기 DNA에서 561 bp의 단일 밴드만이 증폭되었고, 유전적 웅성 물고기 DNA에서 561-573 bp 및 222 bp 2가닥의 밴드가 증폭되었으며, 도 2에 도시된 바와 같다.
SEQUENCE LISTING
<110> YELLOW SEA FISHERIES RESEARCH INSTITUTE, CHINESE ACADEMY OF FISHERY SCIENCES
<120> Screening of a sex-specific marker in spotted knifejaw (Oplegnathus punctatus) and its application
<160> 5
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 573
<212> DNA
<213> Oplegnathus punctatus
<400> 1
tatctctctg ctctgcctgg gtagctctga ttgtcaagag catcgtaaaa accattaaac 60
tgttgtaaat agtttagtct cctgttttat tcctcaaaag cctttacagc atttagtgaa 120
atttcctcca gcttttttaa tcagtgtttt attgtctgta aagccagttt tagctcttaa 180
gttctattag aatatataaa caaagtgcct ctgctatttt ccacagtatt atactgtaga 240
cagatgagcc gctccatatt gggcagcttt ctcaaattgc tgtatgttaa tttgtgtaat 300
cagaaagtag caggaggtgc caatctgatc acaaccagtc agataatgac agctaggagg 360
agaataacaa ctattatgat ttttcccctc gcgcctttgg ttttctctag gactgttaat 420
tccaattact ctccttaatt tttggaattt cctgcttttc acgactgagt gtggtgccct 480
gatgtttcag tttgggttcg gatcgtgtcg gaccagaatg tgaagtgaat tcatgatgat 540
gatgatgatg atgatgtgtg tgtttgttgc cgt 573
<210> 2
<211> 561
<212> DNA
<213> Oplegnathus punctatus
<400> 2
tatctctctg ctctgcctgg gtaactctga ttgtcaagag catcgtaaaa accattaaac 60
tgttgtaaat agtttagtct cctgttttat tcctcaaaag cctttacagc atttagtgaa 120
atttcctcca gcttttttaa tcagtgtttt attgtctgta aagccagttt tagctcttaa 180
gttctattag aatatacaaa caaagtgcct ctgctatttt ccacagtatt atactgtaga 240
cagatgagcc gctccatatt gggcagcttt ctcaaattgc tgtatgttaa tttgtgtaat 300
cagaaagtag caggaggcgc caatctgatc acaaccagtc agataatgac agctattatg 360
atttttcccc tcgcgccttt ggttttctct aggattgtta attccaatta ctctccttaa 420
tttttggaat ttcctgcttt tcacgactga gtgtggtgcc ctgatgtttc agtttgggtt 480
cggatcgtgt cggaccagaa tgtgaagtga attcatgatg atgatgatga tgatgatgat 540
gatgtgtgtg tttgttgccg t 561
<210> 3
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
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<210> 4
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
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<210> 5
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 5
gctaggagga gaataacaac 20
Claims (3)
- 강담돔 X 염색체 및 Y 염색체와 상동인 차별적 DNA 단편이고, 여기서 Y 염색체의 DNA 단편의 서열은 SEQ ID NO:1이며; X 염색체의 DNA 단편의 서열은 SEQ ID NO:2이고; Y 염색체의 DNA 단편은 X 염색체의 DNA 단편보다 12 bp가 더 많은 것을 특징으로 하는 강담돔의 유전적 성별을 감식하기 위한 분자 마커.
- 제1항에 따른 차별적 DNA 단편의 검출에 의해 유전적 성별을 결정하고; Y 염색체의 여분의 12 bp의 단편을 이용하여 하나의 Y 염색체에 특이적인 프라이머 SEQ ID NO:5를 설계하며, 다른 2개의 프라이머 SEQ ID NO:3 및 SEQ ID NO:4와 조합하여 사용될 경우, 561 bp의 단일 DNA 단편만을 증폭시키는 개체는 유전적 자성 개체이고, 561 bp, 573 bp 및 222 bp의 3가닥의 DNA 밴드를 증폭시키는 개체는 유전적 웅성 개체인 것을 특징으로 하는 강담돔 유전적 성별을 감식하기 위한 방법.
- 업스트림 프라이머의 서열은 SEQ ID NO:3 및 SEQ ID NO:5이고, 다운스트림 프라이머의 서열은 SEQ ID NO:4인 것을 특징으로 하는 제1항에 따른 분자 마커를 검출하기 위한 PCR 프라이머 세트.
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