KR100536848B1 - 구제역 바이러스의 2c 및 3b 비구조단백질에 대한펩타이드를 포함하는 구제역 진단용 키트 - Google Patents

구제역 바이러스의 2c 및 3b 비구조단백질에 대한펩타이드를 포함하는 구제역 진단용 키트 Download PDF

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Abstract

본 발명은 구제역 바이러스의 비구조단백질에 대한 펩타이드를 항원으로 포함하는 구제역 진단용 키트 및 이를 이용하여 구제역을 진단하는 방법에 관한 것으로서, 보다 상세하게는 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 구제역 바이러스의 비구조단백질 2C 및 3B에 대한 펩타이드를 항원으로 포함하는 구제역 진단용 키트 및 이를 이용하여 발굽이 둘로 갈라진 모든 유제류에 대하여 구제역을 진단하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 키트에 포함되는 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 펩타이드는 종래의 구제역 진단키트에서 사용되는 재조합 단백질보다 백신 접종축과 감염축에 대한 민감도와 특이도가 뛰어나므로, 구제역감염축 및 백신접종축에 대한 감별 진단에 보다 효과적으로 사용될 수 있다.

Description

구제역 바이러스의 2C 및 3B 비구조단백질에 대한 펩타이드를 포함하는 구제역 진단용 키트{Kit for Diagnosis of Foot-and-Mouth Disease Containing Peptide of 2C and 3B Nonstructural Protein of Foot-and-Mouth Disease Virus}
본 발명은 구제역 바이러스(Foot-and-mouth virus; FMDV)의 비구조단백질에 대한 펩타이드를 항원으로 포함하는 구제역 진단용 키트 및 이를 이용하여 구제역을 진단하는 방법에 관한 것으로서, 보다 상세하게는 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 구제역 바이러스의 비구조단백질 2C 및 3B에 대한 펩타이드를 항원으로 포함하는 구제역 진단용 키트 및 이를 이용하여 발굽이 둘로 갈라진 모든 유제류에 대하여 구제역을 진단하는 방법에 관한 것이다.
구제역(foot-and-mouth disease)은 가축에게 있어서 매우 치명적인 질병으로 국제수역사무국(Office International des Epizooties)에 A급으로 기록되어 있는 질병이며, 우리나라에서도 제1종 가축전염병으로 지정되어 있다. 소, 돼지, 양, 염소, 사슴 등과 같이 발굽이 둘로 갈라진 모든 동물(유제류)이 감염될 수 있으며, 전염성이 매우 강하고, 감염초기에는 입술, 혀, 잇몸, 코, 발굽 사이 등에 수포가 생기고 체온이 급격히 상승되며 식욕이 저하되는 등의 증상이 나타나다가 급성 폐사에 이르게 된다. 따라서, 구제역 발생국이 되면 축산물의 자유무역 증대로 인해 무역규제 대상국가가 되는 등 경제적으로 큰 피해를 입게 된다.
구제역의 원인이 되는 병원체는 피코나비리대 과(Picornaviridae family)의 아프소바이러스(aphthovirus)에 속하는 바이러스이며, 상기 바이러스의 게놈은 약 8,000개의 핵산 염기로 이루어진 단일 RNA 포지티브 가닥(single RNA positive strand)으로 구성되어 있다. 상기 RNA는 초기에 단일폴리펩타이드로 번역된 후 감염된 세포 내에서 바이러스에 의해 암호화된 프로테아제(viral protease)에 의해 연속적으로 절단되어 4개의 캡시드 단백질(VP1∼VP4) 및 비구조 폴리펩타이드(2C, 3A, 3B, 3C 및 3D)를 생성한다. 이러한 구제역 바이러스의 혈청형은 7가지 타입(A, O, C, Asia 1, SAT 1, SAT 2, SAT 3)이 존재하고 80여 가지의 아형(subtype)이 있다고 알려져 있다(Fredric W. Scott, Hagan and Bruner's Microbiology and infectious Diseases of Domestic Animals, Eight Editon, p647-667,1988). 한 종류의 구제역 바이러스의 혈청형은 나머지 6개의 혈청형과는 항원적으로 구별되는데, 혈청형 A 바이러스가 제일 가변적이며 30개 이상의 아형을 갖는다. 또한, 각각의 혈청형은 항원이 다른 다수의 아형으로 세분화될 수 있다.
구제역 바이러스의 혈청형들은 본래 동물들에서의 교차-면역 실험(cross-immunity experiment)에 의해 확인되는데, 동물이 하나의 혈청형으로부터 감염에서 회복되었을지라도 또 다른 혈청형에 의해서 재감염될 수 있다. 이런 구제역바이러스의 여러 혈청형은 각기 다른 지질학적 분포를 가지며, 아시아에서는 혈청형 A, O 및 Asia가 가장 일반적이고, 유렵 및 남아프리카에서는 혈청형 A, O 및 C가 발견되며, 아프리카에서는 혈청형 A, O 및 SAT가 우세하다. 아프리카, 아시아 및 남아프리카의 몇몇 국가들은 풍토병적 발생지역이다.
한편, 현재 사용중인 구제역 예방백신은 생산과정 중에 바이러스 입자만을 정제하여 사용하고 있기 때문에 백신 내에는 구조단백질만이 포함되어 있으며, 비구조단백질은 포함되어 있지 않기 때문에 백신을 접종한 동물에서는 비구조단백질 (일부단백질 제외, 3D 등)에 대한 항체가 생기지 않는 것으로 알려져 있다(Richard F. Meyer et al., Baculovirus expressed 2C of foot-and-mouth disease virus has the potential for differentiating convalescent from vaccinated animals, Journal of Virological Methods 65 (1997) 33-43). 이러한 비구조단백질은 구조단백질에 비해 훨씬 변이가 적어 여러 혈청형에서 동일한 항원결정기를 가지고 있기 때문에, 구제역 바이러스 비구조단백질을 이용하여 여러 혈청형의 야외감염축 항체 확인은 물론 백신 접종축 항체와의 감별에 대한 연구가 전세계적으로 활발히 진행되고 있다. 이와 관련하여, 대다수의 나라에서는 구제역 예방을 위해 예방백신을 비축하고 있으며 구제역 발생시 조기근절을 위해 많은 검사방법을 연구하고 있다. 그 결과, 비구조단백질을 이용한 효소면역검사법(ELISA) 또는 보체결합반응 방법 등이 개발되었으나, 현재까지는 그 정확성과 민감도 등이 불완전하다. 따라서, 백신축과 감염축을 보다 정확하게 감별하기 위한 연구가 지속적으로 요구되고 있는 실정이다.
이에, 본 발명자들은 보다 정확한 구제역 감별진단을 위해 구제역 항혈청과 특이적으로 반응하는 아미노산 염기서열을 분석하고 이를 토대로 합성 펩타이드를 제작하였으며, 상기 합성 펩타이드를 이용한 진단 방법이 구제역 바이러스의 재조합 단백질을 이용하여 진단하는 종래의 진단방법에 비해 진단 특이도가 높고, 기존의 합성 펩타이드를 이용한 진단 방법보다 펩타이드 길이를 줄여 제조 비용을 절감할 수 있어 구제역의 진단에 유용하게 사용될 수 있음을 밝힘으로써 본 발명을 완성하였다.
본 발명은 상기와 같은 종래 구제역 진단 방법의 문제점을 해결하기 위하여 안출된 것으로서, 구제역 바이러스의 비구조단백질 단일 부위만을 진단 항원으로 사용할 경우 두 부위를 사용하는 것보다 진단 효율이 떨어진다는 것에 착안하여 구제역 바이러스 혈청형과 관계없이 변이가 적고 구제역 예방백신의 생산과정에서 백신내에 포함되지 않는 2C 및 3B 비구조단백질중 일부인 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 펩타이드를 항원으로 포함하는 구제역 진단용 키트 및 이를 이용하여 유제류 동물에서의 구제역을 진단하는 방법을 제공하는 것을 그 목적으로 한다.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 구제역 바이러스의 비구조단백질 2C 및 3B에 대한 펩타이드를 항원으로 포함하는 구제역 진단용 키트를 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 비구조단백질 2C 및 3B에 대한 펩타이드를 이용하여 유제류 동물에서의 구제역을 진단하는 방법을 제공한다.
이하, 본 발명을 상세히 설명한다.
본 발명은 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 구제역 바이러스의 비구조단백질 2C 및 3B에 대한 펩타이드를 항원으로 포함하는 구제역 진단용 키트를 제공한다.
본 발명의 구제역 진단용 키트에 포함되는 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 항원 펩타이드는 화학적으로 합성할 수도 있고 유전자 재조합 방법을 이용하여 미생물 또는 진핵세포에서 제조될 수도 있으나, 그의 제조방법이 반드시 여기에 한정되는 것은 아니다. 상기 유전자 재조합 방법을 이용하기 위한 벡터로는 인간 및 동물에는 감염성이 없으면서 재조합 단백질을 발현시킬 수 있는 전이벡터를 사용하는 것이 바람직하다. 상기 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 펩타이드는 구제역 바이러스 2000년도 분리주인 "O/SKR/2000"와 2002년도 분리주인 "O/SKR/2002"의 전체 유전자를 기본으로 하여 아미노산 및 염기서열을 분석하고, 이를 토대로 비구조단백질 부위에 항원성이 인정되는 부위에 대한 스크리닝을 실시한 결과 선발되었다(도 2 및 표 1 참조).
본 발명의 구제역 진단용 키트는 상기 항원 단백질에 대한 항체를 정량분석 또는 정성분석함으로써 동물에서의 구제역을 진단할 수 있으며, 상기 항체의 분석을 위해 ELISA 방법을 이용할 수 있다. 예를 들어, 상기 재조합 항원 단백질을 표면에 코팅시킨 96-웰 마이크로타이터 플레이트 등을 이용하여 ELISA를 수행하도록 상기 진단키트를 제공할 수 있다. 이와 같은 진단키트는 항원 단백질, 적당한 완충용액, 표준 항체, 발색 효소 또는 형광 물질로 표지된 2차 항체, 발색 기질 등을 포함할 수 있다.
또한, 상기 키트는 구제역의 진단을 위해 생물학적 마이크로칩을 이용한 자동화된 분석 방법을 이용할 수 있다. 예를 들어, 상기 재조합 항원 단백질을 표면에 코팅시킨 글래스 슬라이드 등의 칩을 이용하여 ELISA를 수행하도록 상기 진단키트를 구성할 수 있다. 이와 같은 진단키트는 항원 단백질이 표면에 고정된 생물학적 마이크로칩, 적당한 완충용액, 표준항체, 2차 항체 등을 포함한다.
또한, 본 발명은 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 구제역 바이러스의 비구조단백질 2C 및 3B에 대한 펩타이드를 이용하여 동물의 구제역을 진단하는 방법을 제공한다.
본 발명의 구제역 진단 방법은
1) 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 펩타이드를 플레이트에 부착시키는 단계;
2) 상기 플레이트에 부착되지 않은 펩타이드를 세척하여 제거하는 단계;
3) 상기 펩타이드가 부착된 플레이트에 검사하고자 하는 동물의 가검 혈청을 반응시키는 단계;
4) 항원 펩타이드에 결합하지 않은 가검 혈청을 세척하여 제거하는 단계;
5) 상기 가검 혈청 중의 구제역 바이러스에 대한 항체에 특이적으로 결합하며, 검출 마커(marker)가 결합된 콘쥬게이트(conjugate)를 반응시키는 단계; 및
6) 상기 결합된 콘쥬게이트의 특이도를 측정하는 단계를 포함한다.
상기에서, 단계 3의 동물은 발굽이 둘로 갈라진 모든 유제류 동물이 될 수 있으며, 그 중에서도 소, 돼지, 양, 염소 및 사슴으로 구성된 군으로부터 선택될 수 있으나, 반드시 여기에 한정되는 것은 아니다.
단계 5에 있어서, 콘쥬게이트로는 항체를 사용하는 것이 바람직하며, 이때에는 "2차항체"라 명명한다. "검출 마커"는 펩타이드에 결합된 구제역 바이러스에 대한 항체의 측정을 용이하게 하기 위하여 콘쥬게이트에 결합된 물질을 의미하는 것으로서, 발색효소, 형광물질 및 방사선물질로 구성된 군으로부터 선택될 수 있으나, 반드시 여기에 한정되는 것은 아니다. 상기에서, 발색효소는 퍼옥시다제(peroxidase), 알칼라인 포스파타제(alkaline phosphatase)가 사용될 수 있고, 형광물질은 FITC, RITC 등이 사용될 수 있으며, 방사성물질로는 32P, 3H, 99m Tc 및 188Re으로 구성된 군으로부터 선택될 수 있으나, 반드시 여기에 한정되는 것은 아니다.
단계 6에 있어서, 콘쥬게이트의 특이도 측정은 효소인 경우에는 효소반응을 통한 기질의 발색반응에 의해 흡광도를 측정하고, 형광물질인 경우에는 형광광도를 측정하고, 방사선 물질인 경우에는 방사선 방출량을 측정함으로써 가검 혈청 중의 구제역 바이러스 항체가를 측정할 수 있다.
상기 방법에서 이용될 수 있는 실험과정, 시약 및 반응조건은 종래 당업계에서 통상적으로 알려져 있는 것들을 이용할 수 있으며, 이는 당업자에게 있어서 자명한 일이다.
본 발명의 구제역 진단 방법의 합성 펩타이드를 이용한 효소면역측정법은 구제역 항체에 특이적으로 반응하는 구제역 항원결정부위만을 사용하였기 때문에 그 민감도 및 정확도가 매우 뛰어나고(도 3 내지 도 10 참조), 또한 구제역 비구조단백질의 한 부위만을 사용하는 종래의 방법보다 두 부위를 동시에 사용함으로써 진단 효율에서 기존의 진단 방법보다 우수하다(표 2 참조). 또한, 본 발명에서 항원으로 사용된 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 펩타이드는 구제역 바이러스의 7가지 혈청형에 관계없이 공통으로 반응하는 비구조단백질 부위이므로 이를 항원으로 이용할 경우 각기 다른 혈청형의 구제역 바이러스의 감염여부에 대해 신속한 진단이 가능하다는 이점이 있다. 또한, 구제역 백신중에는 상기 두 부위에 대한 2C 및 3B 비구조단백질의 항원이 포함되어 있지 않으므로, 비구조단백질 항원에 대한 항체는 구제역에 야외감염된 가축에 한하여 나타나고 백신접총축에서는 나타나지 않기 때문에 백신감염축과 야외감염축을 진단할 수 있는 장점이 있다.
이하, 본 발명을 실시예에 의해 상세히 설명한다.
단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기 실시예에 한정되는 것은 아니다.
<실시예 1> 국내분리 구제역 바이러스의 전체 유전자 염기서열 및 아미노산 서열 결정
본 발명에서 사용된 국내분리 구제역 바이러스는 국내 감염우 및 감염돈의 조직 및 수포에서 추출된 것을 사용하였으며, 각각 "O/SKR/2000" 및 "O/SKR/2002"라 명명하였다. 먼저, 국내 발생한 구제역 감염우 및 감염돈의 조직 및 수포액을 균질화한 다음 구아니디움 티오시아네이트(guanidium thiocynate, GTC)를 함유한 용해 완충액(lysis buffer) 0.9㎖에 0.1㎖의 비율로 혼합하였다. 상온에서 10분간 실리카(silica)로 흡착시킨 다음 원심분리하여 상층액을 버렸으며, GTC를 함유한 세척액과 에탄올, 아세톤의 순서로 펠렛(pellet)을 세척한 후 56℃에서 건조시켰다. 여기에 RNase 억제제를 첨가한 정제수를 넣고 65℃에서 5분간 가열하여 RNA를 용출하였다.
다음으로, 상기 RNA로부터 cDNA를 합성하였다. 이를 위하여, 추출한 상기 RNA를 서열번호 20으로 기재되는 역(reverse) 프라이머와 혼합하여 5분간 끊인 후, 즉시 얼음에 넣고 5분간 냉각시켜 10,000rpm에서 1분간 원심분리하였다. 첫째가닥(first-strand) cDNA는 1㎍의 전체 RNA, 40 유니트(unit)의 RNAsin (Promega), 50mM Tris-HCl pH 8.3, 3mM MgCl2, 75mM KCl, 10mM DTT, 0.4mM dATP, 0.4mM dCTP, 0.4mM dTTP, 0.4mM dGTP 및 상기 역 프라이머를 20㎕의 반응액에 넣고 42℃에서 2분간 반응시킨 다음, 2,000 유니트의 역전사 효소(SUPERSCIPT II RNase H-Reverse Transcriptase, Gibco-BRL)를 첨가하여 42℃에서 50분간 반응시켜 합성하였다. cDNA는 유전자은행(GenBank, http://www.ncbi.nlm.nih.gov)에서 검색한 구제역의 유전자 서열을 참고로 하여 작성된 하기 표 1로 기재되는 서열번호 21 내지 서열번호 42로 기재되는 염기서열을 가지는 합성 프라이머와 Tag 중합효소(polymerase, Takara)를 사용하여 95℃에서 5분간 변성(denature)시킨 후 50∼58℃ 1분, 72℃ 2∼5분, 92∼94℃ 1∼5분씩 30∼35회 순환 반응시킨 다음, 50∼58℃ 1∼5분, 72℃ 2∼5분간 반응시켜 합성하였다(Gene Amp PCR system 9600, Perkin Elmer). PCR을 이용하여 증폭된 DNA 단편은 제한효소 처리없이 바로 pGEM-T Easy 벡터(Promega)에 클로닝하였고, 디데옥시-체인 다이 종결 순환 시퀀싱 키트(dye terminator cycle sequencing kit, PE-Bio-system)를 이용하여 반응시켰다. 반응 후 유전자 자동염기서열분석기(ABI)를 사용하여 국내분리 구제역 바이러스의 염기서열을 분석하였다.
O/SKR/2002 바이러스의 전체 유전자 시퀀싱을 위해 사용된 프라이머
프라이머 염기서열 위치 종류 서열번호
TTGAAAGGGGGCGCTAGGGTC 1 정상 프라이머 21
TGAAAGGCGGGTTTCGGGTG 368 역프라이머 22
AAGTTTTACCGTCTGTCCCG 369 정상 프라이머 23
TTGTTACCAAGGAGGAGTT 658 역프라이머 24
CCTGGTCTTTCCAGGTCTAG 665 정상 프라이머 25
TCACCAAGCTGTGTGTTCCAT 1654 역프라이머 26
TCAACAATTACTACATGCAGC 1749 정상프라이머 27
GTGCCACTGTACTGTGTTGTAGT 2907 역프라이머 28
GTGCTCGCCCAGTTTGAC 2810 정상프라이머 29
GCTGCCTACCTCCTTCAAT 3727 정상프라이머 30
CAGATGCAGGAGGACATGTG 3998 정상프라이머 31
GAGCTTGTACCAGGGTTTGGC 4109 역프라이머 32
CCAAGCCTTCATCCAGTCGC 4482 역프라이머 33
GTGTCGAGCCACCCGATTTTC 5339 정상프라이머 34
GGTTTCTGACGCTCGAG 5836 역프라이머 35
CCACTCGAGCGTCAGAAACC 5833 정상 프라이머 36
CTCGTGGTGTGGTTCGGGGTC 6649 역프라이머 37
GACAGGACATGCTCTCAGACGC 6263 정상프라이머 38
GATGCGTTTGTTCTCATAGGCG 7519 역프라이머 39
GCTGAGTGGATCCTGAAAC 7481 정상프라이머 40
GGATTATGCGTCACCGCACA 8068 역프라이머 41
GTTTTCCCAGTCACGAC 8155 역프라이머 42
그 결과, 본 발명의 국내분리 구제역 바이러스인 O/SKR/2000 및 O/SKR/2002는 각각 서열번호 1 및 서열번호 2로 기재되는 염기서열을 가지며, 각각 서열번호 3 및 서열번호 4로 기재되는 하나의 폴리펩타이드를 코딩하고 있음을 확인하였다. 상기 서열번호 3 및 서열번호 4로 기재되는 아미노산 서열을 비교한 결과를 도 1에 나타내었다. 본 발명자들은 상기 염기서열 및 아미노산 서열을 2003년 7월 2일자로 유전자은행(GenBank)에 각각 AY312589 및 AY312587로 등록하였다.
<실시예 2> 합성 펩타이드의 선발
아미노산 염기 서열 분석을 여러 분석 프로그램을 통해 실시하더라도 실제로 가검 샘플과의 반응성이 있는 펩타이드를 선발하는 것이 더욱 중요하다. 이를 위하여, 본 발명자들은 단백질 분석 프로그램인 Protean(Dnastar)을 이용하여 항원결정기 부위를 포함하는 2C 및 3B 부위를 여러 펩타이드 형태로 제작한 후에 다양한 혈청 판낼(panel)을 이용하여 펩타이드를 스크리닝(screening)함으로써 항원성이 가장 뛰어난 부위를 선발하였다.
그 결과, 하기 표 2에 기재된 바와 같이, 총 15종의 펩타이드가 구제역 항체 검출을 위한 합성 펩타이드로 선발되었다.
서열번호 단백질 아미노산 서열 위치
5 2C LKARDINDIFAILKNGEC 1-18
6 2C QRDLNDPSKYKEA 54-66
7 2C VAPAPSKSRPEP 92-103
8 2C GKSGQGKSFLAN 110-121
9 2C STHFTGRTDSVWYC 128-141
10 2C CPDPDHFDGYNQQT 143-155
11 2C CMDDLGQNPDGKDFK 159-172
12 2C CLEDKGKPFNSKVI 190-202
13 2C CVSAKDGYKINNKL 233-245
14 2C CKALEDTHTNPVAM 249-261
15 2C CEMKRMQQDMFKPQ 275-287
16 2C CEVIDRVELHEKVSSHP 299-314
17 2C CELHEKVSSHPIFKQ 305-318
18 3B GPYTGPLERQKPLK 1-14
19 3B PLKVRAKLPQQE 12-23
다음으로, 구제역 양성 혈청 2점(동물실험을 통해 얻어진 28 DPI 와 56 DPI 혈청), 백신혈청 1점(2000년 발생 당시 채취한 소혈청) 및 음성혈청 1점(제주도에서 채취한 음성혈청)을 이용하여 상기에서 선발된 펩타이드의 항체 결합능을 확인하였다. 구체적으로, 제작된 펩타이드를 Maxisorp 플레이트(Nunc)에 1㎍/㎖의 농도로 코팅한 후, 상기 4종류의 혈청을 이용하여 펩타이드와의 반응성을 조사하였으며, 이때 혈청은 1:100과 1:20으로 희석하여 사용하였다. 그 결과, 항체와의 반응성이 가장 좋은 펩타이드로 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 펩타이드를 선발하였다(도 2).
<실시예 3> 선발된 펩타이드 2종에 대한 구제역 감염혈청, 백신혈청 및 음성혈청을 이용한 평가 실험
<3-1> 일자별 구제역 감염혈청을 이용한 민감도 측정
국내에서 분리한 O/SKR/2000 바이러스를 이용하여 소, 돼지, 양, 염소 등 구제역 감수성 동물에서 일자별 병원성 실험을 통해 확보된 구제역 감염혈청을 이용하여 민감도(sensitivity) 측정 실험을 실시하였다. 먼저, 상기 실시예 2에서 선발된 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 2종의 펩타이드를 각각 1㎍/㎖씩 혼합하여 100㎕씩 플레이트(Nunc사)에 분주한 후 4℃에서 최소 10시간 정도 코팅을 실시하였다. 냉장 보관된 플레이트를 계면활성제인 트윈을 함유한 인산완충액(phosphate buffered saline containing Tween 20, PBST)으로 3회 세척하고 흡수지에 깨끗하게 털어준 후, 1% BSA (bovine serum albumin)와 5% 젤라틴(gelatine)이 포함된 PBST에 가검 혈청을 100배 희석하여 시료당 펩타이드가 코팅된 웰에 2 반복, 대조군으로 구제역 바이러스 항체와 반응성이 없는 펩타이드가 코팅된 웰에 2 반복으로하여 각 웰당 100㎕씩 분주하였다. 이때, 양성 대조 혈청과 음성 대조 혈청(국내 분리주 구제역 바이러스에 대한 감염 실험을 통해 확보된 구제역 양성 혈청 28 DPI과 음성혈청 0 DPI를 세계표준 진단법인 중화시험을 통해 역가를 측정하여 사용)을 모든 플레이트에 함께 반응시켜 평가 기준으로 삼았다. 플레이트를 37℃에서 40분간 방치한 후, PBST로 3회 세척하고 흡습지에 깨끗이 털어준 후 퍼옥시다제(peroxidase)가 결합된 콘쥬게이트를 1% BSA와 젤라틴 5%가 함유된 PBST에 2,000배 희석하여 웰당 100㎕씩 분주하였다. 37℃에서 40분간 방치 후 PBST로 3회 세척하였으며, TMB (KPL)를 제조사의 농도대로 100㎕씩 분주하고 실온에서 15분간 가볍게 흔들어 주며 발색시켰다. 15분 후에 1.25M 황산(Sigma) 용액을 첨가하여 반응을 정지시켰다. 발색이 정지된 플레이트 내 반응을 ELISA 판독기(reader)를 이용하여 450nm에서 흡광도를 측정함으로써 펩타이드의 민감도 여부를 판정하였다.
그 결과, 도 3 내지 도 6에서 알 수 있는 바와 같이, 본 발명의 펩타이드를 사용하였을 때 평균 7-10 DPI에서 구제역 특이 항체를 검출할 수 있었으며, 이는 본 발명의 펩타이드를 사용함으로써 종래의 진단 방법에 비해 3-5DPI 정도 일찍 구제역 항체를 검출할 수 있음을 의미한다.
<3-2> 구제역 백신 혈청을 이용한 특이도 측정
국내에서 2000년 구제역 발생당시 긴급 백신을 접종했던 소에서 채취한 구제역 백신 혈청 327점과 돼지 혈청 96점을 사용하여 백신혈청에 대한 특이도 실험을 상기 실시예 <3-1>의 방법에 따라 실시하였다.
그 결과, 도 7 및 도 8에서 알 수 있는 바와 같이, 거의 모든 백신 혈청에서 흡광도 수치가 0.2 이하로 나타났다. 이는 구제역 백신축에 대해 높은 특이도를 나타내는 것으로 구제역 감염축과 백신축에 대해 본 방법을 적용시 감별 가능함을 의미한다.
<3-3> 구제역 음성 혈청을 이용한 특이도 측정
국내에서 구제역 비 발생 지역으로부터 확보된 소 및 돼지 음성 혈청 각각 96개를 사용하여 구제역 음성 혈청에 대한 특이도 실험을 상기 실시예 <3-1>의 방법에 따라 실시하였다.
그 결과, 도 9 및 도 10에서 알 수 있는 바와 같이, 거의 모든 음성 혈청에서 흡광도 수치가 0.2 이하로 나타났다. 이는 구제역 음성축에 대해 높은 특이도를 나타내는 것으로 구제역 감염축과 음성축에 대해 본 방법을 적용시 감별 가능함을 의미한다.
<비교예> 2C 및 3B 펩타이드를 이용한 효소결합면역측정법 비교
2000년도 구제역 발생 당시 발생농장에서 확보한 구제역 가검 혈청 98개와 백신접종축으로부터 얻은 백신 혈청 100개를 사용하여 이태리 ELISA 키트(Brecia,ltaly), 영국산 ELISA 키트(Pirbright laboratory, UK), 국내산 3D ELISA 키트(NVRQS, Korea) 및 본 발명의 펩타이드를 이용한 ELISA에 대한 민감도 및 특이도(specificity) 비교 실험을 상기 실시예 <3-1>의 방법에 따라 실시하였다.
그 결과, 구제역 발생 농장으로부터 확보된 96개 가검 혈청에 대한 본 발명의 진단 키트의 양성율이 22%로 나타나 종래의 진단 키트보다 높은 진단 효율을 나타내었으며, 백신 접종축으로부터 얻은 혈청에 대한 특이도 실험에서도 이태리 ELISA와는 동등하게 100%의 특이도를 나타내었고 국내 3D ELISA보다는 월등히 높은 특이도를 나타내었다(표 3).
2C 및 3B 펩타이드를 이용한 효소결합면역측정법 비교
지역 본 발명 ELISA 영국산 ELISA 이태리산 ELISA 국내산 ELISA
양성 음성 양성 음성 양성 음성 양성 음성
구제역 감염지역 96 22 74 56 40 13 83 16 80
구제역 백신지역 100 0 100 89 11 0 100 24 76
민감도 22.9% 73.9% 13.5% 16.6%
특이도 100 100 76%
정확도 62.2% 57.6% 46.9%
상기에서 살펴본 바와 같이, 본 발명의 구제역 진단 키트는 구제역 바이러스에 대한 항체에 특이적으로 결합하는 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 펩타이드를 이용하여 구제역바이러스 비구조단백질에 대한 항체 2종을 동시에 검출함으로써 백신 접종축과 야외 감염축에 대한 감별 진단에 보다 효과적으로 사용될 수 있다.
도 1은 국내 분리 구제역 바이러스인 O/SKR/2000 및 O/SKR/2002의 전체 아미노산 염기서열을 비교한 것이고,
도 2는 합성된 펩타이드를 구제역 감염혈청 2점, 백신혈청 1점, 음성혈청 1점을 이용하여 항체와의 반응성을 스크리닝(screening)한 결과를 보여주는 그래프이고,
양성 혈청 1 ; 구제역 감염 28일째에 채취한 혈청,
양성 혈청 2 ; 구제역 감염 56일째 채취한 혈청,
백신 혈청 ; 2000년도 긴급 구제역 백신접종 후 채취한 혈청,
음성 혈청 ; 구제역의 발생 보고가 없는 지역에서 채취한 혈청
도 3은 일자별 소 구제역(O/SKR/2000) 감염혈청에 대한 2C 및 3B 펩타이드 ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay)에서의 반응성을 보여주는 그래프이고,
도 4는 일자별 돼지 감염혈청(O/SKR/2000)에 대한 2C 및 3B 펩타이드 ELISA에서의 반응성을 보여주는 그래프이고,
도 5는 일자별 양 감염혈청(O/SKR/2000)에 대한 2C 및 3B 펩타이드 ELISA에서의 반응성을 보여주는 그래프이고,
도 6은 일자별 염소 감염혈청(O/SKR/2000)에 대한 2C 및 3B 펩타이드 ELISA에서의 반응성을 보여주는 그래프이고,
도 7은 구제역 소 백신혈청에 대한 2C 및 3B 펩타이드 ELISA의 특이도를 측정한 결과를 보여주는 그래프이고,
도 8은 구제역 소 야외 음성 혈청에 대한 2C 및 3B 펩타이드 ELISA의 특이도를 측정한 결과를 보여주는 그래프이고,
도 9는 구제역 돼지 백신혈청에 대한 2C 및 3B 펩타이드 ELISA의 특이도를 측정한 결과를 보여주는 그래프이고,
도 10은 구제역 돼지 야외 음성 혈청에 대한 2C 및 3B 펩타이드 ELISA의 특이도를 측정한 결과를 보여주는 그래프이다.
상기 도 3 내지 도 6에 있어서, Y축은 일자별 구제역 감염 혈청에 대한 본 진단법을 이용하여 측정한 흡광도 측정치를 나타내고, X축은 구제역바이러스 감염후 날짜를 나타내며, #은 동물의 개체 번호를 나타낸다.
<110> National Veterinary Research and Quarantine Service <120> Kit for Diagnosis of Foot-and-Mouth Disease Containing Peptide of 2C and 3B Nonstructural Protein of Foot-and-Mouth Disease Virus <130> aaaaa <160> 42 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 7803 <212> DNA <213> Foot-and-mouth disease virus <400> 1 agttttaccg tctgtcccgg cgttaaaggg aggtaaccac aagcttgcga ctgtcttgct 60 cgacgataaa gggctgtgac cgcaagatga caccgccttt cccggcgtta attggatgta 120 accacaagat gaaccttcac ccggaagtaa aacggtaaat tcgcctagtt ttgcccgttt 180 tcacgagaaa tgggacgtct gcgcacgaaa cgcgccgtcg cttgaggagg acttgtacaa 240 acacggtcca ttcaggtccc cacaaccgac acaaatcgtg caacttgaaa ctccgcctgg 300 tctttccagg tctagagggg tgacattttg tactgtgctt gactccacgc tcggtccact 360 ggcgagtgct agtaacagca ctgctgcttc gtagcggagc atggtggccg cgggaattcc 420 tccttggtaa cagggacccg cggggccgaa agccacgtcc tcacggaccc accatgtgtg 480 caaccccagc acggcaactt tactgtgaaa accactttaa ggtgacactg atactggtac 540 tcaatcactg gtgacaggct aaggatgccc ttcaggtacc ctgaggtaac 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1440 tattagtgga ggctccaacg aggggtccac ggacaccacc tccacccaca caaccaacac 1500 tcagaataat gactggtttt caaagctggc cagttccgct tttagcggtc ttttcggcgc 1560 tctcctcgcc gacaagaaaa ccgaggagac cactcttctc gaggaccgca tcctcactac 1620 ccgcaacgga cacacgacct cgacaaccca gtcgagcgtt ggagtcactt acgggtacgc 1680 aacagctgag gacttcgtga gcggaccaaa cacatctggg cttgagacca gggttgtgca 1740 ggcagagcgg ttctttaaaa cccacttgtt cgactgggtc accagtgacc cgttcggacg 1800 gtgctacctg ctggaactcc caactgacca caaaggtgtc tacggcagcc tgaccgactc 1860 ttatgcttac atgagaaacg gttgggacgt tgaggtcact gcagtgggaa atcagttcaa 1920 cggaggatgt ttgttggtgg tcatggtgcc agaactttgc tctattgaca agagagggct 1980 ataccagctc acgctctttc cccaccaatt catcaacccc cagacgaaca tgacggcgca 2040 cattactgtg ccctttgttg gcgtcaaccg ctacgaccag tacaaagtac acaaaccttg 2100 gaccctcgtt gtcatggttg tggccccgct gactgtcaac accgaaggtg ccccacagat 2160 caaggtctat gccaacatcg cccctactaa cgtgcacgtt gcgggtgagc tcccttctaa 2220 ggaagggatc ttccccgtgg catgtagcga cggttacggt ggtctggtga ccactgaccc 2280 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DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> rever primer for synthesis of virus cDNA <400> 20 gttttcccag tcacgac 17 <210> 21 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward primer starting at 1 position of the virus genome <400> 21 ttgaaagggg gcgctagggt c 21 <210> 22 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse primer starting at 368 position of the virus genome <400> 22 tgaaaggcgg gtttcgggtg 20 <210> 23 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward primer starting at 369 position of the virus genome <400> 23 aagttttacc gtctgtcccg 20 <210> 24 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse primer starting at 658 position of the virus genome <400> 24 ttgttaccaa ggaggagtt 19 <210> 25 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward primer starting at 665 position of the virus genome <400> 25 cctggtcttt ccaggtctag 20 <210> 26 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse primer starting at 1654 position of the virus genome <400> 26 tcaccaagct gtgtgttcca t 21 <210> 27 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward primer starting at 1749 position of the virus genome <400> 27 tcaacaatta ctacatgcag c 21 <210> 28 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse primer starting at 2907 position of the virus genome <400> 28 gtgccactgt actgtgttgt agt 23 <210> 29 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward primer starting at 2810 position of the virus genome <400> 29 gtgctcgccc agtttgac 18 <210> 30 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward primer starting at 3727 position of the virus genome <400> 30 gctgcctacc tccttcaat 19 <210> 31 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward primer starting at 3998 position of the virus genome <400> 31 cagatgcagg aggacatgtg 20 <210> 32 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse primer starting at 4109 position of the virus genome <400> 32 gagcttgtac cagggtttgg c 21 <210> 33 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse primer starting at 4482 position of the virus genome <400> 33 ccaagccttc atccagtcgc 20 <210> 34 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward primer starting at 5339 position of the virus genome <400> 34 gtgtcgagcc acccgatttt c 21 <210> 35 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse primer starting at 5836 position of the virus genome <400> 35 ggtttctgac gctcgag 17 <210> 36 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward primer starting at 5833 position of the virus genome <400> 36 ccactcgagc gtcagaaacc 20 <210> 37 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse primer starting at 6649 position of the virus genome <400> 37 ctcgtggtgt ggttcggggt c 21 <210> 38 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward primer starting at 6263 position of the virus genome <400> 38 gacaggacat gctctcagac gc 22 <210> 39 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse primer starting at 7519 position of the virus genome <400> 39 gatgcgtttg ttctcatagg cg 22 <210> 40 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward primer starting at 7481 position of the virus genome <400> 40 gctgagtgga tcctgaaac 19 <210> 41 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse primer starting at 8068 position of the virus genome <400> 41 ggattatgcg tcaccgcaca 20 <210> 42 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse primer starting at 8155 position of the virus genome <400> 42 gttttcccag tcacgac 17

Claims (7)

  1. 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 구제역 바이러스의 비구조단백질 2C 및 3B에 대한 펩타이드를 항원으로 포함하는 구제역 진단용 키트.
  2. 제 1항에 있어서, 상기에 더하여 마이크로타이터 플레이트, 분석용 완충용액, 표준항체, 2차 항체 및 발색기질을 추가로 포함하는 것을 특징으로 하는 구제역 진단용 키트.
  3. 제 2항에 있어서, 2차 항체는 발색효소 또는 형광물질이 결합되는 것을 특징으로 하는 구제역 진단용 키트.
  4. 1) 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 펩타이드를 플레이트에 부착시키는 단계;
    2) 상기 플레이트에 부착되지 않은 펩타이드를 세척하여 제거하는 단계;
    3) 상기 펩타이드가 부착된 플레이트에 검사하고자 하는 동물의 가검 혈청을 반응시키는 단계;
    4) 항원 펩타이드에 결합하지 않은 가검 혈청을 세척하여 제거하는 단계;
    5) 상기 가검 혈청 중의 구제역 바이러스에 대한 항체에 특이적으로 결합하며, 검출 마커가 결합된 콘쥬게이트를 반응시키는 단계; 및
    6) 상기 결합된 콘쥬게이트의 특이도를 측정하는 단계를 포함하는 동물의 구제역을 진단하는 방법.
  5. 제 4항에 있어서, 상기 동물은 소, 돼지, 양, 염소 및 사슴으로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 방법.
  6. 제 4항에 있어서, 상기 콘쥬게이트는 항체인 것을 특징으로 하는 방법.
  7. 제 4항에 있어서, 상기 검출 마커는 발색효소, 형광물질 및 방사선물질로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 방법.
KR10-2004-0010973A 2004-02-19 2004-02-19 구제역 바이러스의 2c 및 3b 비구조단백질에 대한펩타이드를 포함하는 구제역 진단용 키트 KR100536848B1 (ko)

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