KR100536848B1 - 구제역 바이러스의 2c 및 3b 비구조단백질에 대한펩타이드를 포함하는 구제역 진단용 키트 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 구제역 바이러스의 비구조단백질에 대한 펩타이드를 항원으로 포함하는 구제역 진단용 키트 및 이를 이용하여 구제역을 진단하는 방법에 관한 것으로서, 보다 상세하게는 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 구제역 바이러스의 비구조단백질 2C 및 3B에 대한 펩타이드를 항원으로 포함하는 구제역 진단용 키트 및 이를 이용하여 발굽이 둘로 갈라진 모든 유제류에 대하여 구제역을 진단하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 키트에 포함되는 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 펩타이드는 종래의 구제역 진단키트에서 사용되는 재조합 단백질보다 백신 접종축과 감염축에 대한 민감도와 특이도가 뛰어나므로, 구제역감염축 및 백신접종축에 대한 감별 진단에 보다 효과적으로 사용될 수 있다.
Description
본 발명은 구제역 바이러스(Foot-and-mouth virus; FMDV)의 비구조단백질에 대한 펩타이드를 항원으로 포함하는 구제역 진단용 키트 및 이를 이용하여 구제역을 진단하는 방법에 관한 것으로서, 보다 상세하게는 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 구제역 바이러스의 비구조단백질 2C 및 3B에 대한 펩타이드를 항원으로 포함하는 구제역 진단용 키트 및 이를 이용하여 발굽이 둘로 갈라진 모든 유제류에 대하여 구제역을 진단하는 방법에 관한 것이다.
구제역(foot-and-mouth disease)은 가축에게 있어서 매우 치명적인 질병으로 국제수역사무국(Office International des Epizooties)에 A급으로 기록되어 있는 질병이며, 우리나라에서도 제1종 가축전염병으로 지정되어 있다. 소, 돼지, 양, 염소, 사슴 등과 같이 발굽이 둘로 갈라진 모든 동물(유제류)이 감염될 수 있으며, 전염성이 매우 강하고, 감염초기에는 입술, 혀, 잇몸, 코, 발굽 사이 등에 수포가 생기고 체온이 급격히 상승되며 식욕이 저하되는 등의 증상이 나타나다가 급성 폐사에 이르게 된다. 따라서, 구제역 발생국이 되면 축산물의 자유무역 증대로 인해 무역규제 대상국가가 되는 등 경제적으로 큰 피해를 입게 된다.
구제역의 원인이 되는 병원체는 피코나비리대 과(Picornaviridae family)의 아프소바이러스(aphthovirus)에 속하는 바이러스이며, 상기 바이러스의 게놈은 약 8,000개의 핵산 염기로 이루어진 단일 RNA 포지티브 가닥(single RNA positive strand)으로 구성되어 있다. 상기 RNA는 초기에 단일폴리펩타이드로 번역된 후 감염된 세포 내에서 바이러스에 의해 암호화된 프로테아제(viral protease)에 의해 연속적으로 절단되어 4개의 캡시드 단백질(VP1∼VP4) 및 비구조 폴리펩타이드(2C, 3A, 3B, 3C 및 3D)를 생성한다. 이러한 구제역 바이러스의 혈청형은 7가지 타입(A, O, C, Asia 1, SAT 1, SAT 2, SAT 3)이 존재하고 80여 가지의 아형(subtype)이 있다고 알려져 있다(Fredric W. Scott, Hagan and Bruner's Microbiology and infectious Diseases of Domestic Animals, Eight Editon, p647-667,1988). 한 종류의 구제역 바이러스의 혈청형은 나머지 6개의 혈청형과는 항원적으로 구별되는데, 혈청형 A 바이러스가 제일 가변적이며 30개 이상의 아형을 갖는다. 또한, 각각의 혈청형은 항원이 다른 다수의 아형으로 세분화될 수 있다.
구제역 바이러스의 혈청형들은 본래 동물들에서의 교차-면역 실험(cross-immunity experiment)에 의해 확인되는데, 동물이 하나의 혈청형으로부터 감염에서 회복되었을지라도 또 다른 혈청형에 의해서 재감염될 수 있다. 이런 구제역바이러스의 여러 혈청형은 각기 다른 지질학적 분포를 가지며, 아시아에서는 혈청형 A, O 및 Asia가 가장 일반적이고, 유렵 및 남아프리카에서는 혈청형 A, O 및 C가 발견되며, 아프리카에서는 혈청형 A, O 및 SAT가 우세하다. 아프리카, 아시아 및 남아프리카의 몇몇 국가들은 풍토병적 발생지역이다.
한편, 현재 사용중인 구제역 예방백신은 생산과정 중에 바이러스 입자만을 정제하여 사용하고 있기 때문에 백신 내에는 구조단백질만이 포함되어 있으며, 비구조단백질은 포함되어 있지 않기 때문에 백신을 접종한 동물에서는 비구조단백질 (일부단백질 제외, 3D 등)에 대한 항체가 생기지 않는 것으로 알려져 있다(Richard F. Meyer et al., Baculovirus expressed 2C of foot-and-mouth disease virus has the potential for differentiating convalescent from vaccinated animals, Journal of Virological Methods 65 (1997) 33-43). 이러한 비구조단백질은 구조단백질에 비해 훨씬 변이가 적어 여러 혈청형에서 동일한 항원결정기를 가지고 있기 때문에, 구제역 바이러스 비구조단백질을 이용하여 여러 혈청형의 야외감염축 항체 확인은 물론 백신 접종축 항체와의 감별에 대한 연구가 전세계적으로 활발히 진행되고 있다. 이와 관련하여, 대다수의 나라에서는 구제역 예방을 위해 예방백신을 비축하고 있으며 구제역 발생시 조기근절을 위해 많은 검사방법을 연구하고 있다. 그 결과, 비구조단백질을 이용한 효소면역검사법(ELISA) 또는 보체결합반응 방법 등이 개발되었으나, 현재까지는 그 정확성과 민감도 등이 불완전하다. 따라서, 백신축과 감염축을 보다 정확하게 감별하기 위한 연구가 지속적으로 요구되고 있는 실정이다.
이에, 본 발명자들은 보다 정확한 구제역 감별진단을 위해 구제역 항혈청과 특이적으로 반응하는 아미노산 염기서열을 분석하고 이를 토대로 합성 펩타이드를 제작하였으며, 상기 합성 펩타이드를 이용한 진단 방법이 구제역 바이러스의 재조합 단백질을 이용하여 진단하는 종래의 진단방법에 비해 진단 특이도가 높고, 기존의 합성 펩타이드를 이용한 진단 방법보다 펩타이드 길이를 줄여 제조 비용을 절감할 수 있어 구제역의 진단에 유용하게 사용될 수 있음을 밝힘으로써 본 발명을 완성하였다.
본 발명은 상기와 같은 종래 구제역 진단 방법의 문제점을 해결하기 위하여 안출된 것으로서, 구제역 바이러스의 비구조단백질 단일 부위만을 진단 항원으로 사용할 경우 두 부위를 사용하는 것보다 진단 효율이 떨어진다는 것에 착안하여 구제역 바이러스 혈청형과 관계없이 변이가 적고 구제역 예방백신의 생산과정에서 백신내에 포함되지 않는 2C 및 3B 비구조단백질중 일부인 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 펩타이드를 항원으로 포함하는 구제역 진단용 키트 및 이를 이용하여 유제류 동물에서의 구제역을 진단하는 방법을 제공하는 것을 그 목적으로 한다.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 구제역 바이러스의 비구조단백질 2C 및 3B에 대한 펩타이드를 항원으로 포함하는 구제역 진단용 키트를 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 비구조단백질 2C 및 3B에 대한 펩타이드를 이용하여 유제류 동물에서의 구제역을 진단하는 방법을 제공한다.
이하, 본 발명을 상세히 설명한다.
본 발명은 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 구제역 바이러스의 비구조단백질 2C 및 3B에 대한 펩타이드를 항원으로 포함하는 구제역 진단용 키트를 제공한다.
본 발명의 구제역 진단용 키트에 포함되는 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 항원 펩타이드는 화학적으로 합성할 수도 있고 유전자 재조합 방법을 이용하여 미생물 또는 진핵세포에서 제조될 수도 있으나, 그의 제조방법이 반드시 여기에 한정되는 것은 아니다. 상기 유전자 재조합 방법을 이용하기 위한 벡터로는 인간 및 동물에는 감염성이 없으면서 재조합 단백질을 발현시킬 수 있는 전이벡터를 사용하는 것이 바람직하다. 상기 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 펩타이드는 구제역 바이러스 2000년도 분리주인 "O/SKR/2000"와 2002년도 분리주인 "O/SKR/2002"의 전체 유전자를 기본으로 하여 아미노산 및 염기서열을 분석하고, 이를 토대로 비구조단백질 부위에 항원성이 인정되는 부위에 대한 스크리닝을 실시한 결과 선발되었다(도 2 및 표 1 참조).
본 발명의 구제역 진단용 키트는 상기 항원 단백질에 대한 항체를 정량분석 또는 정성분석함으로써 동물에서의 구제역을 진단할 수 있으며, 상기 항체의 분석을 위해 ELISA 방법을 이용할 수 있다. 예를 들어, 상기 재조합 항원 단백질을 표면에 코팅시킨 96-웰 마이크로타이터 플레이트 등을 이용하여 ELISA를 수행하도록 상기 진단키트를 제공할 수 있다. 이와 같은 진단키트는 항원 단백질, 적당한 완충용액, 표준 항체, 발색 효소 또는 형광 물질로 표지된 2차 항체, 발색 기질 등을 포함할 수 있다.
또한, 상기 키트는 구제역의 진단을 위해 생물학적 마이크로칩을 이용한 자동화된 분석 방법을 이용할 수 있다. 예를 들어, 상기 재조합 항원 단백질을 표면에 코팅시킨 글래스 슬라이드 등의 칩을 이용하여 ELISA를 수행하도록 상기 진단키트를 구성할 수 있다. 이와 같은 진단키트는 항원 단백질이 표면에 고정된 생물학적 마이크로칩, 적당한 완충용액, 표준항체, 2차 항체 등을 포함한다.
또한, 본 발명은 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 구제역 바이러스의 비구조단백질 2C 및 3B에 대한 펩타이드를 이용하여 동물의 구제역을 진단하는 방법을 제공한다.
본 발명의 구제역 진단 방법은
1) 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 펩타이드를 플레이트에 부착시키는 단계;
2) 상기 플레이트에 부착되지 않은 펩타이드를 세척하여 제거하는 단계;
3) 상기 펩타이드가 부착된 플레이트에 검사하고자 하는 동물의 가검 혈청을 반응시키는 단계;
4) 항원 펩타이드에 결합하지 않은 가검 혈청을 세척하여 제거하는 단계;
5) 상기 가검 혈청 중의 구제역 바이러스에 대한 항체에 특이적으로 결합하며, 검출 마커(marker)가 결합된 콘쥬게이트(conjugate)를 반응시키는 단계; 및
6) 상기 결합된 콘쥬게이트의 특이도를 측정하는 단계를 포함한다.
상기에서, 단계 3의 동물은 발굽이 둘로 갈라진 모든 유제류 동물이 될 수 있으며, 그 중에서도 소, 돼지, 양, 염소 및 사슴으로 구성된 군으로부터 선택될 수 있으나, 반드시 여기에 한정되는 것은 아니다.
단계 5에 있어서, 콘쥬게이트로는 항체를 사용하는 것이 바람직하며, 이때에는 "2차항체"라 명명한다. "검출 마커"는 펩타이드에 결합된 구제역 바이러스에 대한 항체의 측정을 용이하게 하기 위하여 콘쥬게이트에 결합된 물질을 의미하는 것으로서, 발색효소, 형광물질 및 방사선물질로 구성된 군으로부터 선택될 수 있으나, 반드시 여기에 한정되는 것은 아니다. 상기에서, 발색효소는 퍼옥시다제(peroxidase), 알칼라인 포스파타제(alkaline phosphatase)가 사용될 수 있고, 형광물질은 FITC, RITC 등이 사용될 수 있으며, 방사성물질로는 32P, 3H, 99m
Tc 및 188Re으로 구성된 군으로부터 선택될 수 있으나, 반드시 여기에 한정되는 것은 아니다.
단계 6에 있어서, 콘쥬게이트의 특이도 측정은 효소인 경우에는 효소반응을 통한 기질의 발색반응에 의해 흡광도를 측정하고, 형광물질인 경우에는 형광광도를 측정하고, 방사선 물질인 경우에는 방사선 방출량을 측정함으로써 가검 혈청 중의 구제역 바이러스 항체가를 측정할 수 있다.
상기 방법에서 이용될 수 있는 실험과정, 시약 및 반응조건은 종래 당업계에서 통상적으로 알려져 있는 것들을 이용할 수 있으며, 이는 당업자에게 있어서 자명한 일이다.
본 발명의 구제역 진단 방법의 합성 펩타이드를 이용한 효소면역측정법은 구제역 항체에 특이적으로 반응하는 구제역 항원결정부위만을 사용하였기 때문에 그 민감도 및 정확도가 매우 뛰어나고(도 3 내지 도 10 참조), 또한 구제역 비구조단백질의 한 부위만을 사용하는 종래의 방법보다 두 부위를 동시에 사용함으로써 진단 효율에서 기존의 진단 방법보다 우수하다(표 2 참조). 또한, 본 발명에서 항원으로 사용된 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 펩타이드는 구제역 바이러스의 7가지 혈청형에 관계없이 공통으로 반응하는 비구조단백질 부위이므로 이를 항원으로 이용할 경우 각기 다른 혈청형의 구제역 바이러스의 감염여부에 대해 신속한 진단이 가능하다는 이점이 있다. 또한, 구제역 백신중에는 상기 두 부위에 대한 2C 및 3B 비구조단백질의 항원이 포함되어 있지 않으므로, 비구조단백질 항원에 대한 항체는 구제역에 야외감염된 가축에 한하여 나타나고 백신접총축에서는 나타나지 않기 때문에 백신감염축과 야외감염축을 진단할 수 있는 장점이 있다.
이하, 본 발명을 실시예에 의해 상세히 설명한다.
단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기 실시예에 한정되는 것은 아니다.
<실시예 1> 국내분리 구제역 바이러스의 전체 유전자 염기서열 및 아미노산 서열 결정
본 발명에서 사용된 국내분리 구제역 바이러스는 국내 감염우 및 감염돈의 조직 및 수포에서 추출된 것을 사용하였으며, 각각 "O/SKR/2000" 및 "O/SKR/2002"라 명명하였다. 먼저, 국내 발생한 구제역 감염우 및 감염돈의 조직 및 수포액을 균질화한 다음 구아니디움 티오시아네이트(guanidium thiocynate, GTC)를 함유한 용해 완충액(lysis buffer) 0.9㎖에 0.1㎖의 비율로 혼합하였다. 상온에서 10분간 실리카(silica)로 흡착시킨 다음 원심분리하여 상층액을 버렸으며, GTC를 함유한 세척액과 에탄올, 아세톤의 순서로 펠렛(pellet)을 세척한 후 56℃에서 건조시켰다. 여기에 RNase 억제제를 첨가한 정제수를 넣고 65℃에서 5분간 가열하여 RNA를 용출하였다.
다음으로, 상기 RNA로부터 cDNA를 합성하였다. 이를 위하여, 추출한 상기 RNA를 서열번호 20으로 기재되는 역(reverse) 프라이머와 혼합하여 5분간 끊인 후, 즉시 얼음에 넣고 5분간 냉각시켜 10,000rpm에서 1분간 원심분리하였다. 첫째가닥(first-strand) cDNA는 1㎍의 전체 RNA, 40 유니트(unit)의 RNAsin (Promega), 50mM Tris-HCl pH 8.3, 3mM MgCl2, 75mM KCl, 10mM DTT, 0.4mM dATP, 0.4mM dCTP, 0.4mM dTTP, 0.4mM dGTP 및 상기 역 프라이머를 20㎕의 반응액에 넣고 42℃에서 2분간 반응시킨 다음, 2,000 유니트의 역전사 효소(SUPERSCIPT II RNase H-Reverse Transcriptase, Gibco-BRL)를 첨가하여 42℃에서 50분간 반응시켜 합성하였다. cDNA는 유전자은행(GenBank, http://www.ncbi.nlm.nih.gov)에서 검색한 구제역의 유전자 서열을 참고로 하여 작성된 하기 표 1로 기재되는 서열번호 21 내지 서열번호 42로 기재되는 염기서열을 가지는 합성 프라이머와 Tag 중합효소(polymerase, Takara)를 사용하여 95℃에서 5분간 변성(denature)시킨 후 50∼58℃ 1분, 72℃ 2∼5분, 92∼94℃ 1∼5분씩 30∼35회 순환 반응시킨 다음, 50∼58℃ 1∼5분, 72℃ 2∼5분간 반응시켜 합성하였다(Gene Amp PCR system 9600, Perkin Elmer). PCR을 이용하여 증폭된 DNA 단편은 제한효소 처리없이 바로 pGEM-T Easy 벡터(Promega)에 클로닝하였고, 디데옥시-체인 다이 종결 순환 시퀀싱 키트(dye terminator cycle sequencing kit, PE-Bio-system)를 이용하여 반응시켰다. 반응 후 유전자 자동염기서열분석기(ABI)를 사용하여 국내분리 구제역 바이러스의 염기서열을 분석하였다.
프라이머 염기서열 | 위치 | 종류 | 서열번호 |
TTGAAAGGGGGCGCTAGGGTC | 1 | 정상 프라이머 | 21 |
TGAAAGGCGGGTTTCGGGTG | 368 | 역프라이머 | 22 |
AAGTTTTACCGTCTGTCCCG | 369 | 정상 프라이머 | 23 |
TTGTTACCAAGGAGGAGTT | 658 | 역프라이머 | 24 |
CCTGGTCTTTCCAGGTCTAG | 665 | 정상 프라이머 | 25 |
TCACCAAGCTGTGTGTTCCAT | 1654 | 역프라이머 | 26 |
TCAACAATTACTACATGCAGC | 1749 | 정상프라이머 | 27 |
GTGCCACTGTACTGTGTTGTAGT | 2907 | 역프라이머 | 28 |
GTGCTCGCCCAGTTTGAC | 2810 | 정상프라이머 | 29 |
GCTGCCTACCTCCTTCAAT | 3727 | 정상프라이머 | 30 |
CAGATGCAGGAGGACATGTG | 3998 | 정상프라이머 | 31 |
GAGCTTGTACCAGGGTTTGGC | 4109 | 역프라이머 | 32 |
CCAAGCCTTCATCCAGTCGC | 4482 | 역프라이머 | 33 |
GTGTCGAGCCACCCGATTTTC | 5339 | 정상프라이머 | 34 |
GGTTTCTGACGCTCGAG | 5836 | 역프라이머 | 35 |
CCACTCGAGCGTCAGAAACC | 5833 | 정상 프라이머 | 36 |
CTCGTGGTGTGGTTCGGGGTC | 6649 | 역프라이머 | 37 |
GACAGGACATGCTCTCAGACGC | 6263 | 정상프라이머 | 38 |
GATGCGTTTGTTCTCATAGGCG | 7519 | 역프라이머 | 39 |
GCTGAGTGGATCCTGAAAC | 7481 | 정상프라이머 | 40 |
GGATTATGCGTCACCGCACA | 8068 | 역프라이머 | 41 |
GTTTTCCCAGTCACGAC | 8155 | 역프라이머 | 42 |
그 결과, 본 발명의 국내분리 구제역 바이러스인 O/SKR/2000 및 O/SKR/2002는 각각 서열번호 1 및 서열번호 2로 기재되는 염기서열을 가지며, 각각 서열번호 3 및 서열번호 4로 기재되는 하나의 폴리펩타이드를 코딩하고 있음을 확인하였다. 상기 서열번호 3 및 서열번호 4로 기재되는 아미노산 서열을 비교한 결과를 도 1에 나타내었다. 본 발명자들은 상기 염기서열 및 아미노산 서열을 2003년 7월 2일자로 유전자은행(GenBank)에 각각 AY312589 및 AY312587로 등록하였다.
<실시예 2> 합성 펩타이드의 선발
아미노산 염기 서열 분석을 여러 분석 프로그램을 통해 실시하더라도 실제로 가검 샘플과의 반응성이 있는 펩타이드를 선발하는 것이 더욱 중요하다. 이를 위하여, 본 발명자들은 단백질 분석 프로그램인 Protean(Dnastar)을 이용하여 항원결정기 부위를 포함하는 2C 및 3B 부위를 여러 펩타이드 형태로 제작한 후에 다양한 혈청 판낼(panel)을 이용하여 펩타이드를 스크리닝(screening)함으로써 항원성이 가장 뛰어난 부위를 선발하였다.
그 결과, 하기 표 2에 기재된 바와 같이, 총 15종의 펩타이드가 구제역 항체 검출을 위한 합성 펩타이드로 선발되었다.
서열번호 | 단백질 | 아미노산 서열 | 위치 |
5 | 2C | LKARDINDIFAILKNGEC | 1-18 |
6 | 2C | QRDLNDPSKYKEA | 54-66 |
7 | 2C | VAPAPSKSRPEP | 92-103 |
8 | 2C | GKSGQGKSFLAN | 110-121 |
9 | 2C | STHFTGRTDSVWYC | 128-141 |
10 | 2C | CPDPDHFDGYNQQT | 143-155 |
11 | 2C | CMDDLGQNPDGKDFK | 159-172 |
12 | 2C | CLEDKGKPFNSKVI | 190-202 |
13 | 2C | CVSAKDGYKINNKL | 233-245 |
14 | 2C | CKALEDTHTNPVAM | 249-261 |
15 | 2C | CEMKRMQQDMFKPQ | 275-287 |
16 | 2C | CEVIDRVELHEKVSSHP | 299-314 |
17 | 2C | CELHEKVSSHPIFKQ | 305-318 |
18 | 3B | GPYTGPLERQKPLK | 1-14 |
19 | 3B | PLKVRAKLPQQE | 12-23 |
다음으로, 구제역 양성 혈청 2점(동물실험을 통해 얻어진 28 DPI 와 56 DPI 혈청), 백신혈청 1점(2000년 발생 당시 채취한 소혈청) 및 음성혈청 1점(제주도에서 채취한 음성혈청)을 이용하여 상기에서 선발된 펩타이드의 항체 결합능을 확인하였다. 구체적으로, 제작된 펩타이드를 Maxisorp 플레이트(Nunc)에 1㎍/㎖의 농도로 코팅한 후, 상기 4종류의 혈청을 이용하여 펩타이드와의 반응성을 조사하였으며, 이때 혈청은 1:100과 1:20으로 희석하여 사용하였다. 그 결과, 항체와의 반응성이 가장 좋은 펩타이드로 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 펩타이드를 선발하였다(도 2).
<실시예 3> 선발된 펩타이드 2종에 대한 구제역 감염혈청, 백신혈청 및 음성혈청을 이용한 평가 실험
<3-1> 일자별 구제역 감염혈청을 이용한 민감도 측정
국내에서 분리한 O/SKR/2000 바이러스를 이용하여 소, 돼지, 양, 염소 등 구제역 감수성 동물에서 일자별 병원성 실험을 통해 확보된 구제역 감염혈청을 이용하여 민감도(sensitivity) 측정 실험을 실시하였다. 먼저, 상기 실시예 2에서 선발된 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 2종의 펩타이드를 각각 1㎍/㎖씩 혼합하여 100㎕씩 플레이트(Nunc사)에 분주한 후 4℃에서 최소 10시간 정도 코팅을 실시하였다. 냉장 보관된 플레이트를 계면활성제인 트윈을 함유한 인산완충액(phosphate buffered saline containing Tween 20, PBST)으로 3회 세척하고 흡수지에 깨끗하게 털어준 후, 1% BSA (bovine serum albumin)와 5% 젤라틴(gelatine)이 포함된 PBST에 가검 혈청을 100배 희석하여 시료당 펩타이드가 코팅된 웰에 2 반복, 대조군으로 구제역 바이러스 항체와 반응성이 없는 펩타이드가 코팅된 웰에 2 반복으로하여 각 웰당 100㎕씩 분주하였다. 이때, 양성 대조 혈청과 음성 대조 혈청(국내 분리주 구제역 바이러스에 대한 감염 실험을 통해 확보된 구제역 양성 혈청 28 DPI과 음성혈청 0 DPI를 세계표준 진단법인 중화시험을 통해 역가를 측정하여 사용)을 모든 플레이트에 함께 반응시켜 평가 기준으로 삼았다. 플레이트를 37℃에서 40분간 방치한 후, PBST로 3회 세척하고 흡습지에 깨끗이 털어준 후 퍼옥시다제(peroxidase)가 결합된 콘쥬게이트를 1% BSA와 젤라틴 5%가 함유된 PBST에 2,000배 희석하여 웰당 100㎕씩 분주하였다. 37℃에서 40분간 방치 후 PBST로 3회 세척하였으며, TMB (KPL)를 제조사의 농도대로 100㎕씩 분주하고 실온에서 15분간 가볍게 흔들어 주며 발색시켰다. 15분 후에 1.25M 황산(Sigma) 용액을 첨가하여 반응을 정지시켰다. 발색이 정지된 플레이트 내 반응을 ELISA 판독기(reader)를 이용하여 450nm에서 흡광도를 측정함으로써 펩타이드의 민감도 여부를 판정하였다.
그 결과, 도 3 내지 도 6에서 알 수 있는 바와 같이, 본 발명의 펩타이드를 사용하였을 때 평균 7-10 DPI에서 구제역 특이 항체를 검출할 수 있었으며, 이는 본 발명의 펩타이드를 사용함으로써 종래의 진단 방법에 비해 3-5DPI 정도 일찍 구제역 항체를 검출할 수 있음을 의미한다.
<3-2> 구제역 백신 혈청을 이용한 특이도 측정
국내에서 2000년 구제역 발생당시 긴급 백신을 접종했던 소에서 채취한 구제역 백신 혈청 327점과 돼지 혈청 96점을 사용하여 백신혈청에 대한 특이도 실험을 상기 실시예 <3-1>의 방법에 따라 실시하였다.
그 결과, 도 7 및 도 8에서 알 수 있는 바와 같이, 거의 모든 백신 혈청에서 흡광도 수치가 0.2 이하로 나타났다. 이는 구제역 백신축에 대해 높은 특이도를 나타내는 것으로 구제역 감염축과 백신축에 대해 본 방법을 적용시 감별 가능함을 의미한다.
<3-3> 구제역 음성 혈청을 이용한 특이도 측정
국내에서 구제역 비 발생 지역으로부터 확보된 소 및 돼지 음성 혈청 각각 96개를 사용하여 구제역 음성 혈청에 대한 특이도 실험을 상기 실시예 <3-1>의 방법에 따라 실시하였다.
그 결과, 도 9 및 도 10에서 알 수 있는 바와 같이, 거의 모든 음성 혈청에서 흡광도 수치가 0.2 이하로 나타났다. 이는 구제역 음성축에 대해 높은 특이도를 나타내는 것으로 구제역 감염축과 음성축에 대해 본 방법을 적용시 감별 가능함을 의미한다.
<비교예> 2C 및 3B 펩타이드를 이용한 효소결합면역측정법 비교
2000년도 구제역 발생 당시 발생농장에서 확보한 구제역 가검 혈청 98개와 백신접종축으로부터 얻은 백신 혈청 100개를 사용하여 이태리 ELISA 키트(Brecia,ltaly), 영국산 ELISA 키트(Pirbright laboratory, UK), 국내산 3D ELISA 키트(NVRQS, Korea) 및 본 발명의 펩타이드를 이용한 ELISA에 대한 민감도 및 특이도(specificity) 비교 실험을 상기 실시예 <3-1>의 방법에 따라 실시하였다.
그 결과, 구제역 발생 농장으로부터 확보된 96개 가검 혈청에 대한 본 발명의 진단 키트의 양성율이 22%로 나타나 종래의 진단 키트보다 높은 진단 효율을 나타내었으며, 백신 접종축으로부터 얻은 혈청에 대한 특이도 실험에서도 이태리 ELISA와는 동등하게 100%의 특이도를 나타내었고 국내 3D ELISA보다는 월등히 높은 특이도를 나타내었다(표 3).
지역 | 계 | 본 발명 ELISA | 영국산 ELISA | 이태리산 ELISA | 국내산 ELISA | ||||
양성 | 음성 | 양성 | 음성 | 양성 | 음성 | 양성 | 음성 | ||
구제역 감염지역 | 96 | 22 | 74 | 56 | 40 | 13 | 83 | 16 | 80 |
구제역 백신지역 | 100 | 0 | 100 | 89 | 11 | 0 | 100 | 24 | 76 |
민감도 | 22.9% | 73.9% | 13.5% | 16.6% | |||||
특이도 | 100 | 100 | 76% | ||||||
정확도 | 62.2% | 57.6% | 46.9% |
상기에서 살펴본 바와 같이, 본 발명의 구제역 진단 키트는 구제역 바이러스에 대한 항체에 특이적으로 결합하는 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 펩타이드를 이용하여 구제역바이러스 비구조단백질에 대한 항체 2종을 동시에 검출함으로써 백신 접종축과 야외 감염축에 대한 감별 진단에 보다 효과적으로 사용될 수 있다.
도 1은 국내 분리 구제역 바이러스인 O/SKR/2000 및 O/SKR/2002의 전체 아미노산 염기서열을 비교한 것이고,
도 2는 합성된 펩타이드를 구제역 감염혈청 2점, 백신혈청 1점, 음성혈청 1점을 이용하여 항체와의 반응성을 스크리닝(screening)한 결과를 보여주는 그래프이고,
양성 혈청 1 ; 구제역 감염 28일째에 채취한 혈청,
양성 혈청 2 ; 구제역 감염 56일째 채취한 혈청,
백신 혈청 ; 2000년도 긴급 구제역 백신접종 후 채취한 혈청,
음성 혈청 ; 구제역의 발생 보고가 없는 지역에서 채취한 혈청
도 3은 일자별 소 구제역(O/SKR/2000) 감염혈청에 대한 2C 및 3B 펩타이드 ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay)에서의 반응성을 보여주는 그래프이고,
도 4는 일자별 돼지 감염혈청(O/SKR/2000)에 대한 2C 및 3B 펩타이드 ELISA에서의 반응성을 보여주는 그래프이고,
도 5는 일자별 양 감염혈청(O/SKR/2000)에 대한 2C 및 3B 펩타이드 ELISA에서의 반응성을 보여주는 그래프이고,
도 6은 일자별 염소 감염혈청(O/SKR/2000)에 대한 2C 및 3B 펩타이드 ELISA에서의 반응성을 보여주는 그래프이고,
도 7은 구제역 소 백신혈청에 대한 2C 및 3B 펩타이드 ELISA의 특이도를 측정한 결과를 보여주는 그래프이고,
도 8은 구제역 소 야외 음성 혈청에 대한 2C 및 3B 펩타이드 ELISA의 특이도를 측정한 결과를 보여주는 그래프이고,
도 9는 구제역 돼지 백신혈청에 대한 2C 및 3B 펩타이드 ELISA의 특이도를 측정한 결과를 보여주는 그래프이고,
도 10은 구제역 돼지 야외 음성 혈청에 대한 2C 및 3B 펩타이드 ELISA의 특이도를 측정한 결과를 보여주는 그래프이다.
상기 도 3 내지 도 6에 있어서, Y축은 일자별 구제역 감염 혈청에 대한 본 진단법을 이용하여 측정한 흡광도 측정치를 나타내고, X축은 구제역바이러스 감염후 날짜를 나타내며, #은 동물의 개체 번호를 나타낸다.
<110> National Veterinary Research and Quarantine Service
<120> Kit for Diagnosis of Foot-and-Mouth Disease Containing Peptide of
2C and 3B Nonstructural Protein of Foot-and-Mouth Disease Virus
<130> aaaaa
<160> 42
<170> KopatentIn 1.71
<210> 1
<211> 7803
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 1
agttttaccg tctgtcccgg cgttaaaggg aggtaaccac aagcttgcga ctgtcttgct 60
cgacgataaa gggctgtgac cgcaagatga caccgccttt cccggcgtta attggatgta 120
accacaagat gaaccttcac ccggaagtaa aacggtaaat tcgcctagtt ttgcccgttt 180
tcacgagaaa tgggacgtct gcgcacgaaa cgcgccgtcg cttgaggagg acttgtacaa 240
acacggtcca ttcaggtccc cacaaccgac acaaatcgtg caacttgaaa ctccgcctgg 300
tctttccagg tctagagggg tgacattttg tactgtgctt gactccacgc tcggtccact 360
ggcgagtgct agtaacagca ctgctgcttc gtagcggagc atggtggccg cgggaattcc 420
tccttggtaa cagggacccg cggggccgaa agccacgtcc tcacggaccc accatgtgtg 480
caaccccagc acggcaactt tactgtgaaa accactttaa ggtgacactg atactggtac 540
tcaatcactg gtgacaggct aaggatgccc ttcaggtacc ctgaggtaac acgcgacact 600
cgggatcttg agaaggggac tggggcttct ttaaaagcgc ctagtttaaa aagcttctac 660
gcctgaatag gtgaccggag gccggcacct ttcttttaaa caactatttt taatgaacac 720
aaccgactgt ctcaccgctt tgttgtacgc cttcagagag atcaaaacac tgttcttatc 780
acgagcacaa ggaaagatgg agttcacact tcacaacggt gagaagaaaa cattctactc 840
caggcccaac aaccacgaca actgctggct gaacgccatc ctccagttgt ttaggtacgt 900
tgatgaacct ttcttcgact gggtctacta ctcacctgag aacctcacgc tcgatgctat 960
caaacaactg gaaggaatta ctggtctcga gctccacgag ggtggaccac ccgctctcgt 1020
tatttggaac attaaacacc tgctcaacac cggaatcggc accgcttcac gacccaacga 1080
agtgtgcatg gtagatggga cggacatgtg tttggctgac ttccacgctg gcatcttcct 1140
gaaaggacag gaacacgctg tgttcgcctg tgtcacctcc aacgggtggt acgcgattga 1200
tgacgaggac ttttacccct ggacgccgga cccgtctgac gttctggtgt tcgtcccgta 1260
cgaccaacaa ccgctcaacg gagaatggaa agcgaaggtt cagaaacgac tcagaggcgc 1320
cgggcaatcc agcccggcga ctgggtcgca gaaccagtca ggtaacactg gaagcattat 1380
caacaattac tacatgcagc agtaccagaa ctccatggac acgcaacttg gtgacaacgc 1440
tattagtgga ggctccaacg aggggtccac ggacaccacc tccacccaca caaccaacac 1500
tcagaataat gactggtttt caaagctggc cagttccgct tttagcggtc ttttcggcgc 1560
tctcctcgcc gacaagaaaa ccgaggagac cactcttctc gaggaccgca tcctcactac 1620
ccgcaacgga cacacgacct cgacaaccca gtcgagcgtt ggagtcactt acgggtacgc 1680
aacagctgag gacttcgtga gcggaccaaa cacatctggg cttgagacca gggttgtgca 1740
ggcagagcgg ttctttaaaa cccacttgtt cgactgggtc accagtgacc cgttcggacg 1800
gtgctacctg ctggaactcc caactgacca caaaggtgtc tacggcagcc tgaccgactc 1860
ttatgcttac atgagaaacg gttgggacgt tgaggtcact gcagtgggaa atcagttcaa 1920
cggaggatgt ttgttggtgg tcatggtgcc agaactttgc tctattgaca agagagggct 1980
ataccagctc acgctctttc cccaccaatt catcaacccc cagacgaaca tgacggcgca 2040
cattactgtg ccctttgttg gcgtcaaccg ctacgaccag tacaaagtac acaaaccttg 2100
gaccctcgtt gtcatggttg tggccccgct gactgtcaac accgaaggtg ccccacagat 2160
caaggtctat gccaacatcg cccctactaa cgtgcacgtt gcgggtgagc tcccttctaa 2220
ggaagggatc ttccccgtgg catgtagcga cggttacggt ggtctggtga ccactgaccc 2280
aaagacggct gaccccgcct acgggaaagt gttcaatcca cctcgcaaca tgttgccggg 2340
gcggttcacc aacttccttg atgtggctga ggcgtgccct acgttcctgc actttgaggg 2400
tgacgtgccg tacgtgacca caaagacgga ctcagacagg gtactcgccc agtttgactt 2460
gtctctggca gcaaagcaca tgtcaaacac cttcctggca ggtctcgccc agtactacac 2520
acagtacagt ggcaccatca acctgcactt catgttcaca ggacccactg acgcgaaagc 2580
gcgttacatg attgcatacg ccccccctgg catggagccg cccaaaacac ccgaggcggc 2640
cgctcactgc attcatgcgg agtgggacac agggttgaat tcaaaattca cattttcaat 2700
cccttacctt tcggcggctg attatgcgta caccgcgtct gacaccgcgg agaccacaaa 2760
tgtgcagggt tgggtttgcc tgtttcaaat tacacacggg aaggctgacg gcgacgcact 2820
ggtcgttcta gctagcgccg gtaaggattt tgagctgcgt ctgccagttg acgctcgcac 2880
gcagaccacc tccacaggtg agtcggctga ccccgtgact gccaccgttg agaactacgg 2940
tggtgagaca caggtccaga gacgccaaca cacggatgtc tcgttcatac tagacagatt 3000
tgtgaaagta acaccaaaag accaaattaa tgtgttggac ctgatgcaaa tccctgcaca 3060
cactttggta ggcgcgctcc tccgtactgc cacctactac ttcgcagatc tggaagtggc 3120
agtgaaacac gaggggaacc tcacctgggt cccgaacggg gcgcccgagg cagcgttgga 3180
caacaccacc aatccaacgg cctatcacaa ggcgccgctc acccggcttg cactgcctta 3240
cacggcacca caccgtgtct tggctactgt ttacaacggg aactgcaagt atggcgagag 3300
ccccgtgacc aatctgagag gtgacctgca agtgttgacc cagaaggcgg caagaacgct 3360
gcctacctcc ttcaattacg gtgccatcaa agccactcgg gtgactgaac tgctttaccg 3420
catgaagagg gccgaaacat actgcccccg gcctcttttg gctattcacc cgagcgaagc 3480
tagacacaaa caaaagattg tggcgcctgt gaaacagctg ttgaactttg acctgctcaa 3540
gttggcagga gacgtcgagc ccaaccctgg gcccttcttc ttctctgacg tcaggtcaaa 3600
tttttccaag ttggttgaaa ccgtcaacca gatgcaggag gacatgtcaa caaaacacgg 3660
acccgacttt aaccggttgg tgtctgcatt tgaggaactg gccactggag tgaaggccat 3720
caggaccggt ctcgacgagg ccaaaccctg gtacaagctc atcaagctct tgagccgcct 3780
gtcatgtatg gccgctgtag cagcacggtc aaaggaccca ctccttgtgg ccatcatgct 3840
ggctgacacc ggccttgaga tcctggacag tacctttgtc gtgaagaaga tctccgactc 3900
gctctccagt ctctttcacg tgccggcccc cgtcttcagt tccggagccc cgattttgtt 3960
ggccgggttg gtcaaagtcg cctcgagttt cttccggtcc acacccgaag accttgagag 4020
agcggagaaa cagctcaaag cacgtgacat caatgacata ttcgccattc ttaagaacgg 4080
cgagtggccg gtcaagctga ttcttgccat ccgcgactgg atcaaggcat ggatcgcctc 4140
agaagaaaag tttgtcacca tgacagacct ggtgcctggc atccttgaaa agcagcggga 4200
tctcaacgac ccaagcaagt acaaggaggc caaggagtgg ctcgacaacg cgcgccaagc 4260
gtgtctgaag agcgggaaca tccacatcgc aaacctttgc aaagtggttg ccccagcgcc 4320
cagcaggtcg aggcccgaac ccgtggtcgt ttgcctccgt ggcaagtcag gccagggcaa 4380
gagtttcctt gcgaacgtgc ttgcacaagc aatttcaacc cacttcactg gcagaaccga 4440
ttcagtttgg tactgcccac ctgaccctga ccacttcgac ggttacaacc agcagaccgt 4500
tgtagtaatg gatgatttgg gccacaaccc cgacgggaag gacttcaagt acttcgccca 4560
aatggtttca actacggggt ttatcccgcc catggcttca ctagaggata aaggcaaacc 4620
tttcaacagc aaggtcatca tcgccaccac caacctgtac tcgggcttca ccccgagaac 4680
tatggtgtgc cctgatgcac tgaaccgaag gttccacttt gacattgacg tgagcgccaa 4740
ggacgggtac aaaattaaca acaaattgga catcatcaaa gctcttgaag acacccaccc 4800
caacccagtg gcaatgtttc aatacgactg tgcccttctc aacggcatgg ccgttgaaat 4860
gaagagaatg caacaagata tgttcaagcc tcaaccgccc ctccagaacg tctaccagct 4920
tgttcaggag gtgattgacc gggtcgagct ccacgagaag gtgtcgagtc acccgatctt 4980
caagcagatc tcaattcctt cccaaaaggc tgtgctgtac tttctcattg agaaaggcca 5040
gcacgaagca gcaattgaat tctttgaggg gatggtgtgt gactccatca aggaggagct 5100
ccggcctctc atccaacaga cctcatttgt gaagcgcgct tttaagcgcc tgaaggaaaa 5160
ctttgagata gttgccctgt gtttgactct aatggcaaac atagtgatca tgatccgcga 5220
gactcgcaag agacagcaga tggtggatga tgcagtgaac gagtacactg agaaggtaaa 5280
catcaccacg gatgacaaga ctcttgacga ggcggaaaag aaccctctgg aaaccagcgg 5340
tgccaccact gttggtttca gagagaaaac tctcccgggg cacaagacgg gtgatgacgt 5400
gagctccgag cccaccaaac ccgtggaagg acaaccacaa gctgaaggac cctacaccgg 5460
cccactcgag cgtcaaaaac ctctgaaagt gagagccaag ctcccgcagc aggaggggcc 5520
ttatgctggt cccatggaga gacagaaacc actgaaagtg aaagcgaaag ccccggtcgt 5580
taaggaagga ccttacgaag gaccggtgaa gaaacctgtc gctttgaaag tgaaagcaaa 5640
gaacttgatt gtcactgaga gtggtgctcc cccgactgac ttgcaaaaga tggtcatggg 5700
taacaccaag cctgttgagc tcgtcctcga tgggaagacg gtggccatct gctgcgccac 5760
cggagtgttt ggtactgcct accttgttcc tcgtcatctt ttcgcagaga agtatgacaa 5820
gatcatgttg gacggcagag ccatgacaga cagtgactac agagtgtttg agtttgagat 5880
taaagtgaaa ggacaggaca tgctctcaga cgccgcgctc atggtgcttc accgtgggaa 5940
tcgagtgcgg gacatcacga agcacttccg tgatgtggca agaatgaaga aaggcacccc 6000
cgtcgtcggc gtgatcaaca acgctgatgt tgggaggctg atcttctctg gtgaggccct 6060
tacctacaag gacattgtag tgcgcatgga cggagacacc atgcccggtc tcttcgccta 6120
caaagccgcc accaaggcgg gctactgtgg aggatccgtt cttgcaaagg acggagccga 6180
tactttcatc gtcggcactc actccgcagg cggcaatgga gttggatact gctcatgcgt 6240
ttccaggtct atgctgctta aaatgaaggc acacatcgac cccgaaccac accacgaggg 6300
attgatagtt gacaccagag atgttgagga gcgcgtacat gtcatgcgca aaaccaagct 6360
cgcacccacc gtggcacacg gtgtgtttaa ccccgaattt gggcctgccg ccttgtccaa 6420
caagggcccg cgcctgaatg agggggttgt cctcgatgaa gccatcttct ccaaacacaa 6480
aggaaacaca aagatgtctg aggaggacaa agcgctgttc cgccgctgtg ctgctgatta 6540
cgcgtcgcgt ctgcacagtg tgctgggtac ggcaaatgcc ccactgagca tttacgaggc 6600
aatcaagggc gtcgacggac ttgacgccat ggaaccagac accgcgcctg gtctcccttg 6660
ggctctccag gggaaacgcc ggggtgcgct cattgacttc gaaaacggca ctgtcggacc 6720
cgaggttgaa gctgccttga agctcatgga gaaaagagag tacaagtttg tgtgccagac 6780
cttcttgaag gacgagattc gcccgatgga gaaggtacgt gccggtaaga ctcgcattgt 6840
cgacgtcctg cctgttgaac acattcttta caccaggatg atgattggca gattttgtgc 6900
tcaaatgcac tcaaacaacg gaccgcaaat tggctcggcg gttggttgta atcctgatgt 6960
tgattggcaa agatttggca cgcactttgc tcagtacaga aacgtgtggg atgtagacta 7020
ttcggccttc gacgccaacc actgcagtga cgcaatgaac atcatgcttg aggaggtgtt 7080
caacacggat ttcggtttcc acccaaacgc tgagtggatc ctgaaaaccc tcgtgaacac 7140
tgaacacgcc tatgagaaca aacgcatcac tgttgaaggc gggatgccgt ctggttgttc 7200
cgcgacaagc atcatcaaca caattttgaa caacatctac gtgctctacg ccttgcgtag 7260
acactacgag ggagtcgagc tggactctta caccatgatc tcctacggag acgacatcgt 7320
ggttgcaagt gatcacgatc tggactttga ggccctcaag cctcacttca aatcccttgg 7380
tcaaaccatc actccagctg acaaaagcga caaaggtttt gttcttggtc actccattac 7440
cgatgtcact ttcctcaaaa gacacttcca catggactat ggaactgggt tttacaaacc 7500
tgtgatggct tcgaagaccc tcgaagctat cctctccttt gcacgtcgtg ggaccataca 7560
ggagaagttg atctccgtgg caggacttgc cgtccactct ggacctgacg agtaccggcg 7620
tctctttgag cctttccagg gtctctttga gattccaagc tacagatcac tttacctgcg 7680
ttgggtgaac cccgtgtgcg gtgacgcata atccctcaga tgtcacaatt ggcagaaaga 7740
cgctgaggcg agcgacgccg taggagtgga aagtccgaaa gggtttttcc cgcttcctat 7800
ttc 7803
<210> 2
<211> 7799
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 2
agttttaccg tcgttcccgg cgttaaaggg aggtaaccac aagcttgcaa ctgtcttgct 60
cgacgataaa gggctgtgac cgcaagatga taccgccttc ccggcgttaa ttggatgcaa 120
ccacaagatg aaccttcacc cggaagtaaa acggcacatt cgcctagttt tacccgtttt 180
caggagaaat gggacgtccg cgcacgaaac gcgccgtcgc ttgaggagga cttgtacaaa 240
cacgatatat tcaggttccc acaaccgaca caaaccgtgc aacctgaaac tccgcctggt 300
ctttccaggt ctagaggggt gacattttgt actgtgcttg actccacgct cggtccactg 360
gcgagtgcta gtaacagcac tgttgcttcg tagcggagca tggtggccgc gggaactcct 420
ccttggtaac agggacccgc ggggccgaaa gccacgtcct cacggaccca ccatgtgtgc 480
aaccccagca cggcaacttt actgtggaaa ccactttaag gtgacactga tactggtact 540
caaccactgg tgacaggcta aggatgccct tcaggtaccc tgaggtaaca cgcgacactc 600
gggatctgag aaggggactg gggcttcttt aaaagcgcct agtttaaaaa gcttctacgc 660
ctgaataggt gaccggaggc cggcaccttt cttttaaaca actactttta atgagcacaa 720
ctgactgttt catcgctttg ttgtacgctt tcagagagat taaaacactg ttcttatcac 780
gagcacaagg aaagatggag ttcacacttc acaacggtga gaagaaaaca ttctactcca 840
ggcccaacaa ccacgacaac tgctggctga acaccatcct ccagttgttt aggtacgttg 900
atgaaccttt cttcgactgg gtctactact cacctgagaa cctcacgctt gatgctatca 960
aacaattgga agaaattact ggtctcgaac tccaggaggg tggaccaccc gctctcgtta 1020
tttggaacat taaacacctg ctcaacaccg gaatcggcac cgcttcacga cccaacgaag 1080
tgtgcatggt agacgggacg gacatgtgtt tggctgactt ccacgctggc atcttcctga 1140
aaggacagga acacgctgtg ttcgcctgcg tcacctccaa cgggtggtac gcgattgacg 1200
ataaggactt ttacccctgg acgccggacc cgtccgacgt tctggtgttt gtcccgtacg 1260
atcaagaacc gctcaacgga gaatggaaag caagggttca gaaacgactc agaggcgccg 1320
ggcaatccag cccggcgact gggtcacaga accagtcagg caacactgga agcatcatca 1380
acaattacta catgcagcag taccagaact ccatggacac gcaacttggt gacgacgcta 1440
ttagcggagg ctccaacgag gggtccacgg acaccacttc cactcacaca accaacactc 1500
agaacaatga ctggttctca aagctggcca gttccgcttt tagcggtctt ttcggcgctc 1560
ttctcgccga taagaaaacc gaggagacca ctcttctcga ggaccgcatc ctcactaccc 1620
gcaacgggca cacgacctcg acaacccagt cgagcgttgg agtcacttac gggtacgcaa 1680
cagccgagga ctttgtgagc ggaccaaaca catctgggct cgagaccagg gttgtgcagg 1740
cagagcggtt cttcaaaacc cacttgttcg actgggtcac cagtgacccg ttcggacggt 1800
gctacctgct ggaactccca actgaccaca aaggtgtcta cggcagcctg actgactctt 1860
atgcttacat gagaaacggt tgggttgttg aggtcactgc agtgggaaat cagttcaacg 1920
gaggatgtcc gttggtggcc atggtgccag aacattgctc tattgacaag agagagctgt 1980
accagctcac gctctttccc caccagttca tcaacccccg gacgaacatg acggcgcaca 2040
tcactgtgcc ctttgttggt gtcaatcgct acgaccagta caaggtacac aaaccttgga 2100
ccctcgtggt tatggttgtg gccccgctga ctgtcaacac cgaaggtgcc ccacagacca 2160
aggtctacgc caacatcgcc cctaccaacg tgtacgttgc gggtgagttc ccttccaagg 2220
aagggatctt ccccgtggca tgtagcgacg gttacggtgg tctggtgacc actgacccaa 2280
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gtgagacaca ggtccagaga cgccaacaca cggatgtctc gttcatatta gacagatttg 3000
tgaaagtaac accaaaagac caaattaatg tgttggacct gatgcaaacc cctgcacaca 3060
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tgaaacacga ggggaacctt acctgggtcc cgaacggggc gcccgagaca gcgttggaca 3180
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tggcaggaga cgtcgagtcc aaccctgggc ctttcttctt ctctgacgtc aggtcaaatt 3600
tttccaagtt ggttgaaacc atcaaccaga tgcaggagga catgtcaaca aaacacggac 3660
ccgactttaa ccggttggtg tctgcatttg aggaactggc cactggagtg aaggctatca 3720
ggaccggtct cgatgaggcc aaaccctggt acaagctcat caagctcttg agccgcctgt 3780
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ctgacaccgg ccttgagatt ctggacagta cctttgtcgt gaagaagatc tccgactcgc 3900
tctccagtct ctttcacgtg ccggcccccg tcttcagttt cggagccccg attttgttgg 3960
ccgggttggt caaagtcgcc tcgactttct tccggtccac acccgaggac cttgagagag 4020
cggagaaaca gctcaaagca cgtgacatca atgacatatt cgccattctc aagaacggcg 4080
agtggttggt caagctgatt cttgccatcc gcgactggat caaggcatgg atcgcctcag 4140
aagaaaaatt tgtcaccatg acagacctgg tacctggcat ccttgaaaag cagcgggatc 4200
ttaacgaccc aagcaagtac aaggaggcca aggagtggct cgacaacgcg cgccaagcgt 4260
gtttgaagag cgggaacatc cacattgcaa acctttgtaa agtagttgcc ccagcaccca 4320
gcaggtcgag gcctgaaccc gtggtcgttt gcctccgtgg caaatcgggc cagggcaaga 4380
gtttccttgc gaacgtgctt gcacaagcaa tttcaaccca cttcactggc agaaccgatt 4440
cagtttggta ctgcccacct gaccctgacc acttcgacgg ttacaaccag cagaccgttg 4500
tagtaatgga tgatttgggc cagaaccccg acgggaagga cttcaaatac ttcgcccaaa 4560
tggtttcaac tacggggttt atcccgccca tggcttcact cgaggacaaa ggcaaacctt 4620
tcaacagcaa ggtcatcatc gccaccacca acctgtactc gggcttcacc ccgagaacta 4680
tggtgtgccc tgatgcactg aaccgaaggt tccactttga cattgacgtg agcgccaagg 4740
acgggtacaa aattaacaac aaattggaca tcaccaaagc tcttgaagat acccacacca 4800
acccagtggc aatgtttcaa tacgactgtg cccttctcaa cggcatggcc gttgagatga 4860
agagaatgca acaagatatg ttcaagcctc aaccgcccct ccagaacgtc taccagcttg 4920
ttcaggaggt gattgaccgg gtcgagctcc acgagaaggt gtcgagtcac ccgatcttca 4980
agcagatctc aataccttcc caaaaggctg tgctgtactt tctcattgag aagggccagc 5040
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ccaccactgt tggttttaga gagaaaactc tcccgggaca caaggcgagt gacgacgtga 5400
actccgagcc cgccaaaccc gcggaagaac aaccacaagc tgaaggaccc tacaccggtc 5460
cactcgagcg tcaaaaacct ctgaaagtga gagccaagct cccacagcag gaggggccct 5520
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aggaaggacc ttacgaagga ccggtgaaga aacctgtcgc tttgaaagtg aaagcaaaga 5640
acttgattgt cactgagagt ggtgctcccc cgactgactt gcaaaagatg gtcatgggta 5700
acaccaagcc tgttgagctc atcctcgacg ggaagacggt ggccatctgt tgcgccaccg 5760
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tcatgttgga cggcagagcc atgacagaca gtgactacag agtgtttgag tttgagatta 5880
aagtgaaagg acaggacatg ctctcagacg ccgcgctcat ggtgcttcac cgtgggaatc 5940
gcgtgcggga catcacgaag cacttccgtg atgtggcaag aatgaagaaa ggcacccccg 6000
tcgtcggcgt ggtcaacaac gctgatgttg ggagactgat cttctctggt gaggccctta 6060
cctacaagga cattgtagtg tgcatggacg gagacaccat gcccggtctc ttcgcctaca 6120
aagccgccac caaggcgggt tactgtggag gagccgttct tgcaaaggac ggagccgaga 6180
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ccaggtctat gctgcttaaa atgaaggcac acatcgatcc cgaaccacac cacgagggat 6300
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caacaagcat catcaacaca attttgaaca acatctacgt gctctacgcc ttgcgtaggc 7260
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ttgcaagtga ttacgatctg gactttgagg ccctcaagcc tcacttcaaa tcccttggtc 7380
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ctgaggcgag cggcgccgta ggagtgaaaa gtccgaaagg gtttttcccg cttcctttc 7799
<210> 3
<211> 2332
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 3
Met Asn Thr Thr Asp Cys Leu Thr Ala Leu Leu Tyr Ala Phe Arg Glu
1 5 10 15
Ile Lys Thr Leu Phe Leu Ser Arg Ala Gln Gly Lys Met Glu Phe Thr
20 25 30
Leu His Asn Gly Glu Lys Lys Thr Phe Tyr Ser Arg Pro Asn Asn His
35 40 45
Asp Asn Cys Trp Leu Asn Ala Ile Leu Gln Leu Phe Arg Tyr Val Asp
50 55 60
Glu Pro Phe Phe Asp Trp Val Tyr Tyr Ser Pro Glu Asn Leu Thr Leu
65 70 75 80
Asp Ala Ile Lys Gln Leu Glu Gly Ile Thr Gly Leu Glu Leu His Glu
85 90 95
Gly Gly Pro Pro Ala Leu Val Ile Trp Asn Ile Lys His Leu Leu Asn
100 105 110
Thr Gly Ile Gly Thr Ala Ser Arg Pro Asn Glu Val Cys Met Val Asp
115 120 125
Gly Thr Asp Met Cys Leu Ala Asp Phe His Ala Gly Ile Phe Leu Lys
130 135 140
Gly Gln Glu His Ala Val Phe Ala Cys Val Thr Ser Asn Gly Trp Tyr
145 150 155 160
Ala Ile Asp Asp Glu Asp Phe Tyr Pro Trp Thr Pro Asp Pro Ser Asp
165 170 175
Val Leu Val Phe Val Pro Tyr Asp Gln Gln Pro Leu Asn Gly Glu Trp
180 185 190
Lys Ala Lys Val Gln Lys Arg Leu Arg Gly Ala Gly Gln Ser Ser Pro
195 200 205
Ala Thr Gly Ser Gln Asn Gln Ser Gly Asn Thr Gly Ser Ile Ile Asn
210 215 220
Asn Tyr Tyr Met Gln Gln Tyr Gln Asn Ser Met Asp Thr Gln Leu Gly
225 230 235 240
Asp Asn Ala Ile Ser Gly Gly Ser Asn Glu Gly Ser Thr Asp Thr Thr
245 250 255
Ser Thr His Thr Thr Asn Thr Gln Asn Asn Asp Trp Phe Ser Lys Leu
260 265 270
Ala Ser Ser Ala Phe Ser Gly Leu Phe Gly Ala Leu Leu Ala Asp Lys
275 280 285
Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu Asp Arg Ile Leu Thr Thr Arg
290 295 300
Asn Gly His Thr Thr Ser Thr Thr Gln Ser Ser Val Gly Val Thr Tyr
305 310 315 320
Gly Tyr Ala Thr Ala Glu Asp Phe Val Ser Gly Pro Asn Thr Ser Gly
325 330 335
Leu Glu Thr Arg Val Val Gln Ala Glu Arg Phe Phe Lys Thr His Leu
340 345 350
Phe Asp Trp Val Thr Ser Asp Pro Phe Gly Arg Cys Tyr Leu Leu Glu
355 360 365
Leu Pro Thr Asp His Lys Gly Val Tyr Gly Ser Leu Thr Asp Ser Tyr
370 375 380
Ala Tyr Met Arg Asn Gly Trp Asp Val Glu Val Thr Ala Val Gly Asn
385 390 395 400
Gln Phe Asn Gly Gly Cys Leu Leu Val Val Met Val Pro Glu Leu Cys
405 410 415
Ser Ile Asp Lys Arg Gly Leu Tyr Gln Leu Thr Leu Phe Pro His Gln
420 425 430
Phe Ile Asn Pro Gln Thr Asn Met Thr Ala His Ile Thr Val Pro Phe
435 440 445
Val Gly Val Asn Arg Tyr Asp Gln Tyr Lys Val His Lys Pro Trp Thr
450 455 460
Leu Val Val Met Val Val Ala Pro Leu Thr Val Asn Thr Glu Gly Ala
465 470 475 480
Pro Gln Ile Lys Val Tyr Ala Asn Ile Ala Pro Thr Asn Val His Val
485 490 495
Ala Gly Glu Leu Pro Ser Lys Glu Gly Ile Phe Pro Val Ala Cys Ser
500 505 510
Asp Gly Tyr Gly Gly Leu Val Thr Thr Asp Pro Lys Thr Ala Asp Pro
515 520 525
Ala Tyr Gly Lys Val Phe Asn Pro Pro Arg Asn Met Leu Pro Gly Arg
530 535 540
Phe Thr Asn Phe Leu Asp Val Ala Glu Ala Cys Pro Thr Phe Leu His
545 550 555 560
Phe Glu Gly Asp Val Pro Tyr Val Thr Thr Lys Thr Asp Ser Asp Arg
565 570 575
Val Leu Ala Gln Phe Asp Leu Ser Leu Ala Ala Lys His Met Ser Asn
580 585 590
Thr Phe Leu Ala Gly Leu Ala Gln Tyr Tyr Thr Gln Tyr Ser Gly Thr
595 600 605
Ile Asn Leu His Phe Met Phe Thr Gly Pro Thr Asp Ala Lys Ala Arg
610 615 620
Tyr Met Ile Ala Tyr Ala Pro Pro Gly Met Glu Pro Pro Lys Thr Pro
625 630 635 640
Glu Ala Ala Ala His Cys Ile His Ala Glu Trp Asp Thr Gly Leu Asn
645 650 655
Ser Lys Phe Thr Phe Ser Ile Pro Tyr Leu Ser Ala Ala Asp Tyr Ala
660 665 670
Tyr Thr Ala Ser Asp Thr Ala Glu Thr Thr Asn Val Gln Gly Trp Val
675 680 685
Cys Leu Phe Gln Ile Thr His Gly Lys Ala Asp Gly Asp Ala Leu Val
690 695 700
Val Leu Ala Ser Ala Gly Lys Asp Phe Glu Leu Arg Leu Pro Val Asp
705 710 715 720
Ala Arg Thr Gln Thr Thr Ser Thr Gly Glu Ser Ala Asp Pro Val Thr
725 730 735
Ala Thr Val Glu Asn Tyr Gly Gly Glu Thr Gln Val Gln Arg Arg Gln
740 745 750
His Thr Asp Val Ser Phe Ile Leu Asp Arg Phe Val Lys Val Thr Pro
755 760 765
Lys Asp Gln Ile Asn Val Leu Asp Leu Met Gln Ile Pro Ala His Thr
770 775 780
Leu Val Gly Ala Leu Leu Arg Thr Ala Thr Tyr Tyr Phe Ala Asp Leu
785 790 795 800
Glu Val Ala Val Lys His Glu Gly Asn Leu Thr Trp Val Pro Asn Gly
805 810 815
Ala Pro Glu Ala Ala Leu Asp Asn Thr Thr Asn Pro Thr Ala Tyr His
820 825 830
Lys Ala Pro Leu Thr Arg Leu Ala Leu Pro Tyr Thr Ala Pro His Arg
835 840 845
Val Leu Ala Thr Val Tyr Asn Gly Asn Cys Lys Tyr Gly Glu Ser Pro
850 855 860
Val Thr Asn Leu Arg Gly Asp Leu Gln Val Leu Thr Gln Lys Ala Ala
865 870 875 880
Arg Thr Leu Pro Thr Ser Phe Asn Tyr Gly Ala Ile Lys Ala Thr Arg
885 890 895
Val Thr Glu Leu Leu Tyr Arg Met Lys Arg Ala Glu Thr Tyr Cys Pro
900 905 910
Arg Pro Leu Leu Ala Ile His Pro Ser Glu Ala Arg His Lys Gln Lys
915 920 925
Ile Val Ala Pro Val Lys Gln Leu Leu Asn Phe Asp Leu Leu Lys Leu
930 935 940
Ala Gly Asp Val Glu Pro Asn Pro Gly Pro Phe Phe Phe Ser Asp Val
945 950 955 960
Arg Ser Asn Phe Ser Lys Leu Val Glu Thr Val Asn Gln Met Gln Glu
965 970 975
Asp Met Ser Thr Lys His Gly Pro Asp Phe Asn Arg Leu Val Ser Ala
980 985 990
Phe Glu Glu Leu Ala Thr Gly Val Lys Ala Ile Arg Thr Gly Leu Asp
995 1000 1005
Glu Ala Lys Pro Trp Tyr Lys Leu Ile Lys Leu Leu Ser Arg Leu Ser
1010 1015 1020
Cys Met Ala Ala Val Ala Ala Arg Ser Lys Asp Pro Leu Leu Val Ala
1025 1030 1035 1040
Ile Met Leu Ala Asp Thr Gly Leu Glu Ile Leu Asp Ser Thr Phe Val
1045 1050 1055
Val Lys Lys Ile Ser Asp Ser Leu Ser Ser Leu Phe His Val Pro Ala
1060 1065 1070
Pro Val Phe Ser Ser Gly Ala Pro Ile Leu Leu Ala Gly Leu Val Lys
1075 1080 1085
Val Ala Ser Ser Phe Phe Arg Ser Thr Pro Glu Asp Leu Glu Arg Ala
1090 1095 1100
Glu Lys Gln Leu Lys Ala Arg Asp Ile Asn Asp Ile Phe Ala Ile Leu
1105 1110 1115 1120
Lys Asn Gly Glu Trp Pro Val Lys Leu Ile Leu Ala Ile Arg Asp Trp
1125 1130 1135
Ile Lys Ala Trp Ile Ala Ser Glu Glu Lys Phe Val Thr Met Thr Asp
1140 1145 1150
Leu Val Pro Gly Ile Leu Glu Lys Gln Arg Asp Leu Asn Asp Pro Ser
1155 1160 1165
Lys Tyr Lys Glu Ala Lys Glu Trp Leu Asp Asn Ala Arg Gln Ala Cys
1170 1175 1180
Leu Lys Ser Gly Asn Ile His Ile Ala Asn Leu Cys Lys Val Val Ala
1185 1190 1195 1200
Pro Ala Pro Ser Arg Ser Arg Pro Glu Pro Val Val Val Cys Leu Arg
1205 1210 1215
Gly Lys Ser Gly Gln Gly Lys Ser Phe Leu Ala Asn Val Leu Ala Gln
1220 1225 1230
Ala Ile Ser Thr His Phe Thr Gly Arg Thr Asp Ser Val Trp Tyr Cys
1235 1240 1245
Pro Pro Asp Pro Asp His Phe Asp Gly Tyr Asn Gln Gln Thr Val Val
1250 1255 1260
Val Met Asp Asp Leu Gly His Asn Pro Asp Gly Lys Asp Phe Lys Tyr
1265 1270 1275 1280
Phe Ala Gln Met Val Ser Thr Thr Gly Phe Ile Pro Pro Met Ala Ser
1285 1290 1295
Leu Glu Asp Lys Gly Lys Pro Phe Asn Ser Lys Val Ile Ile Ala Thr
1300 1305 1310
Thr Asn Leu Tyr Ser Gly Phe Thr Pro Arg Thr Met Val Cys Pro Asp
1315 1320 1325
Ala Leu Asn Arg Arg Phe His Phe Asp Ile Asp Val Ser Ala Lys Asp
1330 1335 1340
Gly Tyr Lys Ile Asn Asn Lys Leu Asp Ile Ile Lys Ala Leu Glu Asp
1345 1350 1355 1360
Thr His Pro Asn Pro Val Ala Met Phe Gln Tyr Asp Cys Ala Leu Leu
1365 1370 1375
Asn Gly Met Ala Val Glu Met Lys Arg Met Gln Gln Asp Met Phe Lys
1380 1385 1390
Pro Gln Pro Pro Leu Gln Asn Val Tyr Gln Leu Val Gln Glu Val Ile
1395 1400 1405
Asp Arg Val Glu Leu His Glu Lys Val Ser Ser His Pro Ile Phe Lys
1410 1415 1420
Gln Ile Ser Ile Pro Ser Gln Lys Ala Val Leu Tyr Phe Leu Ile Glu
1425 1430 1435 1440
Lys Gly Gln His Glu Ala Ala Ile Glu Phe Phe Glu Gly Met Val Cys
1445 1450 1455
Asp Ser Ile Lys Glu Glu Leu Arg Pro Leu Ile Gln Gln Thr Ser Phe
1460 1465 1470
Val Lys Arg Ala Phe Lys Arg Leu Lys Glu Asn Phe Glu Ile Val Ala
1475 1480 1485
Leu Cys Leu Thr Leu Met Ala Asn Ile Val Ile Met Ile Arg Glu Thr
1490 1495 1500
Arg Lys Arg Gln Gln Met Val Asp Asp Ala Val Asn Glu Tyr Thr Glu
1505 1510 1515 1520
Lys Val Asn Ile Thr Thr Asp Asp Lys Thr Leu Asp Glu Ala Glu Lys
1525 1530 1535
Asn Pro Leu Glu Thr Ser Gly Ala Thr Thr Val Gly Phe Arg Glu Lys
1540 1545 1550
Thr Leu Pro Gly His Lys Thr Gly Asp Asp Val Ser Ser Glu Pro Thr
1555 1560 1565
Lys Pro Val Glu Gly Gln Pro Gln Ala Glu Gly Pro Tyr Thr Gly Pro
1570 1575 1580
Leu Glu Arg Gln Lys Pro Leu Lys Val Arg Ala Lys Leu Pro Gln Gln
1585 1590 1595 1600
Glu Gly Pro Tyr Ala Gly Pro Met Glu Arg Gln Lys Pro Leu Lys Val
1605 1610 1615
Lys Ala Lys Ala Pro Val Val Lys Glu Gly Pro Tyr Glu Gly Pro Val
1620 1625 1630
Lys Lys Pro Val Ala Leu Lys Val Lys Ala Lys Asn Leu Ile Val Thr
1635 1640 1645
Glu Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn
1650 1655 1660
Thr Lys Pro Val Glu Leu Val Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys
1665 1670 1675 1680
Cys Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu
1685 1690 1695
Phe Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr
1700 1705 1710
Asp Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln
1715 1720 1725
Asp Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg
1730 1735 1740
Val Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys
1745 1750 1755 1760
Gly Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu
1765 1770 1775
Ile Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Arg Met
1780 1785 1790
Asp Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys
1795 1800 1805
Ala Gly Tyr Cys Gly Gly Ser Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr
1810 1815 1820
Phe Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys
1825 1830 1835 1840
Ser Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp
1845 1850 1855
Pro Glu Pro His His Glu Gly Leu Ile Val Asp Thr Arg Asp Val Glu
1860 1865 1870
Glu Arg Val His Val Met Arg Lys Thr Lys Leu Ala Pro Thr Val Ala
1875 1880 1885
His Gly Val Phe Asn Pro Glu Phe Gly Pro Ala Ala Leu Ser Asn Lys
1890 1895 1900
Gly Pro Arg Leu Asn Glu Gly Val Val Leu Asp Glu Ala Ile Phe Ser
1905 1910 1915 1920
Lys His Lys Gly Asn Thr Lys Met Ser Glu Glu Asp Lys Ala Leu Phe
1925 1930 1935
Arg Arg Cys Ala Ala Asp Tyr Ala Ser Arg Leu His Ser Val Leu Gly
1940 1945 1950
Thr Ala Asn Ala Pro Leu Ser Ile Tyr Glu Ala Ile Lys Gly Val Asp
1955 1960 1965
Gly Leu Asp Ala Met Glu Pro Asp Thr Ala Pro Gly Leu Pro Trp Ala
1970 1975 1980
Leu Gln Gly Lys Arg Arg Gly Ala Leu Ile Asp Phe Glu Asn Gly Thr
1985 1990 1995 2000
Val Gly Pro Glu Val Glu Ala Ala Leu Lys Leu Met Glu Lys Arg Glu
2005 2010 2015
Tyr Lys Phe Val Cys Gln Thr Phe Leu Lys Asp Glu Ile Arg Pro Met
2020 2025 2030
Glu Lys Val Arg Ala Gly Lys Thr Arg Ile Val Asp Val Leu Pro Val
2035 2040 2045
Glu His Ile Leu Tyr Thr Arg Met Met Ile Gly Arg Phe Cys Ala Gln
2050 2055 2060
Met His Ser Asn Asn Gly Pro Gln Ile Gly Ser Ala Val Gly Cys Asn
2065 2070 2075 2080
Pro Asp Val Asp Trp Gln Arg Phe Gly Thr His Phe Ala Gln Tyr Arg
2085 2090 2095
Asn Val Trp Asp Val Asp Tyr Ser Ala Phe Asp Ala Asn His Cys Ser
2100 2105 2110
Asp Ala Met Asn Ile Met Leu Glu Glu Val Phe Asn Thr Asp Phe Gly
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2180 2185 2190
Tyr Thr Met Ile Ser Tyr Gly Asp Asp Ile Val Val Ala Ser Asp His
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Asp Leu Asp Phe Glu Ala Leu Lys Pro His Phe Lys Ser Leu Gly Gln
2210 2215 2220
Thr Ile Thr Pro Ala Asp Lys Ser Asp Lys Gly Phe Val Leu Gly His
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Ser Ile Thr Asp Val Thr Phe Leu Lys Arg His Phe His Met Asp Tyr
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Gly Thr Gly Phe Tyr Lys Pro Val Met Ala Ser Lys Thr Leu Glu Ala
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<211> 2332
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 4
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100 105 110
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260 265 270
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275 280 285
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530 535 540
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<220>
<223> reverse primer starting at 4109 position of the virus genome
<400> 32
gagcttgtac cagggtttgg c 21
<210> 33
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> reverse primer starting at 4482 position of the virus genome
<400> 33
ccaagccttc atccagtcgc 20
<210> 34
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> forward primer starting at 5339 position of the virus genome
<400> 34
gtgtcgagcc acccgatttt c 21
<210> 35
<211> 17
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> reverse primer starting at 5836 position of the virus genome
<400> 35
ggtttctgac gctcgag 17
<210> 36
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> forward primer starting at 5833 position of the virus genome
<400> 36
ccactcgagc gtcagaaacc 20
<210> 37
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> reverse primer starting at 6649 position of the virus genome
<400> 37
ctcgtggtgt ggttcggggt c 21
<210> 38
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> forward primer starting at 6263 position of the virus genome
<400> 38
gacaggacat gctctcagac gc 22
<210> 39
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> reverse primer starting at 7519 position of the virus genome
<400> 39
gatgcgtttg ttctcatagg cg 22
<210> 40
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> forward primer starting at 7481 position of the virus genome
<400> 40
gctgagtgga tcctgaaac 19
<210> 41
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> reverse primer starting at 8068 position of the virus genome
<400> 41
ggattatgcg tcaccgcaca 20
<210> 42
<211> 17
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> reverse primer starting at 8155 position of the virus genome
<400> 42
gttttcccag tcacgac 17
Claims (7)
- 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 구제역 바이러스의 비구조단백질 2C 및 3B에 대한 펩타이드를 항원으로 포함하는 구제역 진단용 키트.
- 제 1항에 있어서, 상기에 더하여 마이크로타이터 플레이트, 분석용 완충용액, 표준항체, 2차 항체 및 발색기질을 추가로 포함하는 것을 특징으로 하는 구제역 진단용 키트.
- 제 2항에 있어서, 2차 항체는 발색효소 또는 형광물질이 결합되는 것을 특징으로 하는 구제역 진단용 키트.
- 1) 서열번호 17 및 서열번호 18로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 펩타이드를 플레이트에 부착시키는 단계;2) 상기 플레이트에 부착되지 않은 펩타이드를 세척하여 제거하는 단계;3) 상기 펩타이드가 부착된 플레이트에 검사하고자 하는 동물의 가검 혈청을 반응시키는 단계;4) 항원 펩타이드에 결합하지 않은 가검 혈청을 세척하여 제거하는 단계;5) 상기 가검 혈청 중의 구제역 바이러스에 대한 항체에 특이적으로 결합하며, 검출 마커가 결합된 콘쥬게이트를 반응시키는 단계; 및6) 상기 결합된 콘쥬게이트의 특이도를 측정하는 단계를 포함하는 동물의 구제역을 진단하는 방법.
- 제 4항에 있어서, 상기 동물은 소, 돼지, 양, 염소 및 사슴으로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 방법.
- 제 4항에 있어서, 상기 콘쥬게이트는 항체인 것을 특징으로 하는 방법.
- 제 4항에 있어서, 상기 검출 마커는 발색효소, 형광물질 및 방사선물질로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 방법.
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Applications Claiming Priority (1)
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KR10-2004-0010973A KR100536848B1 (ko) | 2004-02-19 | 2004-02-19 | 구제역 바이러스의 2c 및 3b 비구조단백질에 대한펩타이드를 포함하는 구제역 진단용 키트 |
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KR20050082512A KR20050082512A (ko) | 2005-08-24 |
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KR101535555B1 (ko) * | 2012-12-24 | 2015-07-10 | 대한민국 | 구제역 바이러스 O Manisa를 이용한 재조합 구제역 백신 바이러스 |
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