JPWO2020219934A5 - - Google Patents

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JPWO2020219934A5
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本開示の好ましい実施形態が本明細書に示され、説明されているが、そのような実施形態が例としてのみ提供されることは、当業者には明らかであろう。本開示から逸脱することなく、多数の変形、変化、及び置換が当業者に想起されるであろう。本明細書に記載される本開示の実施形態に対する様々な代替物が、本開示の実施において用いられ得ることが理解されるべきである。以下の特許請求の範囲は、本開示の範囲を定義し、これらの特許請求の範囲及びそれらの等価物の範囲内の方法及び構造がそれによって包含されることが意図される。
発明の態様
[態様1]標的ペプチド配列をコードし、かつ非効率的な翻訳領域を含むプレmRNAを有する細胞による前記標的ペプチド配列の発現を調節する方法であって、前記細胞を、前記標的ペプチド配列をコードする前記プレmRNAの標的化された領域に結合する治療剤と接触させることを含み、それによって、前記標的ペプチド配列をコードする前記プレmRNAからの前記非効率的な翻訳領域のスプライシングが調節され、それによって、前記非効率的な翻訳領域を含まず、かつ前記標的ペプチド配列を含む第1のタンパク質をコードする第1の処理されたmRNAのレベルを調節し、それによって前記細胞において前記標的ペプチド配列の前記発現を調節し、前記第1の処理されたmRNAが、前記標的ペプチド配列を含む第2のタンパク質を産生するための第2の処理されたmRNAの翻訳効率と比較して、前記細胞において前記標的ペプチド配列を含む前記第1のタンパク質を産生するためのより高い翻訳効率を有し、前記第2の処理されたmRNAが、前記非効率的な翻訳領域を含む、前記方法。
[態様2]疾患または状態を治療することを必要とする対象において、前記対象の細胞における標的ペプチド配列の発現を調節することにより、それを治療する方法であって、前記細胞が、前記標的ペプチド配列をコードし、かつ非効率的な翻訳領域を含むプレmRNAを有し、前記方法が、前記対象の前記細胞を、前記標的ペプチド配列をコードする前記プレmRNAからの前記非効率的な翻訳領域のスプライシングを調節する治療剤と接触させることを含み、前記治療剤が、前記プレmRNAの標的化された領域に結合し、それによって、前記プレmRNAからの前記非効率的な翻訳領域のスプライシングが調節され、それによって、前記非効率的な翻訳領域を含まず、かつ前記標的ペプチド配列を含む第1のタンパク質をコードする第1の処理されたmRNAのレベルを調節し、それによって前記対象の前記細胞において前記標的ペプチド配列の発現を調節し、前記第1の処理されたmRNAが、前記標的ペプチド配列を含む第2のタンパク質を産生するための第2の処理されたmRNAの翻訳効率と比較して、前記細胞において前記標的ペプチド配列を含む前記第1のタンパク質を産生するためのより高い翻訳効率を有し、前記第2の処理されたmRNAが、前記非効率的な翻訳領域を含む、前記方法。
[態様3]前記第2の処理されたmRNAが、前記非効率的な翻訳領域を含むこと以外は、前記第1の処理されたmRNAと同一である、態様1または2に記載の方法。
[態様4]前記標的ペプチド配列をコードする前記プレmRNAが、第1の開始コドン、第2の開始コドン、ならびに前記第1の開始コドンの下流及び前記第2の開始コドンの上流に位置する早期終結コドン(PTC)を含み、前記非効率的な翻訳領域が、前記早期終結コドン(PTC)及び前記第2の開始コドンを含む、態様1~3のいずれかに記載の方法。
[態様5]前記非効率的な翻訳領域が、プロリンリッチペプチド配列をコードする領域を含む、態様1~3のいずれかに記載の方法。
[態様6]標的ペプチド配列をコードし、かつ第1の開始コドン、第2の開始コドン、ならびに前記第1の開始コドンの下流及び前記第2の開始コドンの上流に位置する早期終結コドン(PTC)を含むプレmRNAを有する細胞による前記標的ペプチド配列の発現を調節する方法であって、前記細胞を、前記標的ペプチド配列をコードする前記プレmRNAの標的化された部分に結合する治療剤と接触させることを含み、それによって、前記プレmRNAからの前記PTC及び前記第2の開始コドンのスプライシングが調節され、それによって、前記PTC及び前記第2の開始コドンを含まず、かつ前記標的ペプチド配列を含む第1のタンパク質をコードする第1の処理されたmRNAのレベルを調節し、それによって前記細胞において前記標的ペプチド配列の前記発現を調節する、前記方法。
[態様7]疾患または状態を治療することを必要とする対象において、前記対象の細胞における標的ペプチド配列の発現を調節することにより、それを治療する方法であって、前記細胞が、前記標的ペプチド配列をコードし、かつ第1の開始コドン、第2の開始コドン、ならびに前記第1の開始コドンの下流及び前記第2の開始コドンの上流に位置する早期終結コドン(PTC)を含むプレmRNAを有し、前記方法が、前記対象の前記細胞を、前記標的ペプチド配列をコードする前記プレmRNAからの前記PTC及び前記第2の開始コドンのスプライシングを調節する治療剤と接触させることを含み、前記治療剤が、前記プレmRNAの標的化された領域に結合し、それによって、前記プレmRNAからの前記PTC及び前記第2の開始コドンのスプライシングが調節され、それによって、前記PTC及び前記第2の開始コドンを含まず、かつ前記標的ペプチド配列を含む第1のタンパク質をコードする第1の処理されたmRNAのレベルを調節し、それによって前記対象の前記細胞において前記標的ペプチド配列の前記発現を調節する、前記方法。
[態様8]前記標的ペプチド配列が、少なくとも10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、200、300、400、500、750、または1000個のアミノ酸を有する、態様1~7のいずれかに記載の方法。
[態様9]前記治療剤が、小分子である、態様1~8のいずれかに記載の方法。
[態様10]前記治療剤が、前記プレmRNAの前記標的化された領域と相補的であるアンチセンスオリゴマー(ASO)である、態様1~8のいずれかに記載の方法。
[態様11]前記治療剤が、前記標的ペプチド配列をコードする前記プレmRNAの前記標的化された領域と少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%相補的であるASOである、態様1~10のいずれかに記載の方法。
[態様12]前記プレmRNAの前記標的化された領域の少なくとも一部が、前記非効率的な翻訳領域または前記PTC及び前記第2の開始コドンを含むエクソンの上流にある、態様1~11のいずれかに記載の方法。
[態様13]前記プレmRNAの前記標的化された領域の少なくとも一部が、前記非効率的な翻訳領域または前記PTC及び前記第2の開始コドンを含むエクソンの下流にある、態様1~11のいずれかに記載の方法。
[態様14]前記プレmRNAの前記標的化された領域の少なくとも一部が、前記非効率的な翻訳領域または前記PTC及び前記第2の開始コドンを含むエクソン内にある、態様1~11のいずれかに記載の方法。
[態様15]前記細胞が、前記第1の処理されたmRNA、前記PTC、及び前記第2の開始コドンの配列を含み、かつ前記標的ペプチド配列を含む第2のタンパク質をコードする第2の処理されたmRNAを有する、態様6~14のいずれかに記載の方法。
[態様16]前記第1の処理されたmRNA及び前記第2の処理されたmRNAが両方とも、前記細胞における前記プレmRNAのスプライシング産物である、態様1~5、または8~15のいずれかに記載の方法。
[態様17]前記第2の処理されたmRNAが、前記第1の処理されたmRNA、前記PTC、及び前記第2の開始コドンの配列を含む、態様4または8~16のいずれかに記載の方法。
[態様18]前記PTC及び前記第2の開始コドンが、前記プレmRNA上に少なくとも2ntの距離を有する、態様4または6~17のいずれかに記載の方法。
[態様19]前記PTC及び前記第2の開始コドンが、前記プレmRNA上に最大で75ntの距離を有する、態様4または6~17のいずれかに記載の方法。
[態様20]前記PTC及び前記第2の開始コドンが、前記プレmRNA上に2nt~75nt、5nt~70nt、10nt~65nt、15nt~60nt、20nt~55nt、25nt~50nt、30nt~45nt、40nt~50nt、45nt~55nt、50nt~60nt、55nt~70nt、または60nt~75ntの距離を有する、態様4または6~17のいずれかに記載の方法。
[態様21]前記PTC及び前記第2の開始コドンが、前記プレmRNA上に2nt~75ntの距離を有する、態様4または6~17のいずれかに記載の方法。
[態様22]前記標的ペプチド配列を含む前記第1のタンパク質が、前記第1の処理されたmRNA上の前記第1の開始コドンから開始して翻訳され、前記第2のタンパク質が、前記第2の処理されたmRNA上の前記第2の開始コドンから開始して翻訳される、態様15~21のいずれかに記載の方法。
[態様23]前記第1の処理されたmRNAが、前記第2のタンパク質を産生するための前記第2の処理されたmRNAの翻訳効率と比較して、前記第1のタンパク質を産生するためのより高い翻訳効率を有する、態様15~22のいずれかに記載の方法。
[態様24]前記標的ペプチド配列をコードする前記プレmRNAからの前記非効率的な翻訳領域の除外、または前記PTC及び前記第2の開始コドンの除外が増加される、態様1~23のいずれかに記載の方法。
[態様25]前記治療剤が、前記細胞における前記標的ペプチド配列をコードする前記第1の処理されたmRNAの前記レベルを増加させる、態様1~24のいずれかに記載の方法。
[態様26]前記治療剤が、前記細胞における前記標的ペプチド配列のレベルを増加させる、態様1~25のいずれかに記載の方法。
[態様27]前記標的ペプチド配列が、完全長タンパク質の一部である、態様1~26のいずれかに記載の方法。
[態様28]産生される前記標的ペプチド配列が、完全機能性タンパク質である、態様1~26のいずれかに記載の方法。
[態様29]前記標的ペプチド配列が、完全長タンパク質のN末端部分である、態様1~27のいずれかに記載の方法。
[態様30]前記標的ペプチド配列が、前記非効率的な翻訳領域の上流の前記プレmRNAの一部によってコードされる、態様29に記載の方法。
[態様31]前記非効率的な翻訳領域が、前記第2の処理されたmRNAの3’非翻訳領域(3’UTR)にある、態様1~30のいずれかに記載の方法。
[態様32]前記標的ペプチド配列が、完全長タンパク質のC末端部分である、態様1~27のいずれかに記載の方法。
[態様33]前記標的ペプチド配列が、前記非効率的な翻訳領域または前記PTCの下流の前記プレmRNAの一部によってコードされる、態様32に記載の方法。
[態様34]前記標的ペプチド配列が、MeCP2タンパク質アイソフォームの一部である、態様1~27のいずれかに記載の方法。
[態様35]前記標的ペプチド配列が、配列番号32~34からなる群から選択される配列から翻訳される、態様1~27のいずれかに記載の方法。
[態様36]前記治療剤が、前記細胞においてMeCP2 mRNAのe2アイソフォームのレベルを減少させ、MeCP2 mRNAのe1アイソフォームのレベルを増加させる、態様34に記載の方法。
[態様37]前記治療剤が、前記細胞においてMeCP2タンパク質のe2アイソフォームのレベルを減少させ、MeCP2タンパク質のe1アイソフォームのレベルを増加させる、態様34に記載の方法。
[態様38]前記プレmRNAが、配列番号2~27からなる群から選択されるいずれか1つと少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する配列を含む、態様34に記載の方法。
[態様39]前記治療剤が、MeCP2プレmRNAの標的化された領域に結合し、前記標的化された領域が、配列番号28~31からなる群から選択される配列内にある、態様34に記載の方法。
[態様40]前記治療剤が、MeCP2プレmRNAの標的化された領域に結合し、前記標的化された領域が、配列番号28の配列内にある、態様34に記載の方法。
[態様41]前記治療剤が、配列番号28~31からなる群から選択される配列と少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する配列と相補的であるアンチセンスオリゴマーである、態様34に記載の方法。
[態様42]前記治療剤が、配列番号28~31からなる群から選択される配列と100%の配列同一性を有する配列と相補的であるアンチセンスオリゴマーである、態様34に記載の方法。
[態様43]前記治療剤が、配列番号28と100%の配列同一性を有する配列と相補的であるアンチセンスオリゴマーである、態様34に記載の方法。
[態様44]前記治療剤が、配列番号35~129からなる群から選択される配列と少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する配列を有するアンチセンスオリゴマーである、態様34に記載の方法。
[態様45]前記治療剤が、配列番号35~129からなる群から選択される配列と100%の配列同一性を有する配列を有するアンチセンスオリゴマーである、態様34に記載の方法。
[態様46]前記疾患または前記状態が、レット症候群である、態様2~5または7~45のいずれかに記載の方法。
[態様47]前記標的ペプチド配列が、ACIN1、ACTN1、ACTN2、ADH4、AKR1C3、ALDH1A2、ALG8、AMPD2、AMT、ANKRD11、ANKS3、APOL4、APPL1、ARCN1、ARMC8、ARNTL、BOC、BRCA1、C8B、CALM1、CALM3、CASP5、CAST、CEP19、CEP57、CHEK1、CIB2、COX4I1、DCLRE1C、DECR1、DHFR、DKK2、DLG2、DOK2、DPF3、DTNA、DYRK1A、FOLH1、FUZ、GANAB、GEMIN4、GGA3、GOSR2、GPM6A、GRB10、GSN、HDAC8、HIVEP1、HK1、IFNGR1、IKBKB、ISCU、KARS、KIAA0319、KIAA0586、KIZ、KLK6、LMNA、LMNTD1、LRRC7、LRTOMT、LZTFL1、MAGI2、MECP2、MERTK、MFSD2A、MLF1、MOB1B、MSRB3、NR1I3、NT5C3A、NUTM1、OTOF、PDCD4、PDPK1、PHKB、PIGA、PLOD2、POLR2F、PPP6C、PRKN、PRUNE1、PSMA6、PSMC3IP、PTPN1、RAB11B、RBPJ、RNPS1、RPL5、RPS20、SECISBP2、SELENBP1、SEPT11、SIRT2、SLC25A26、SMARCE1、SMC1A、SMG1、SPACA7、SPRED1、SRP54、SRPK2、STK36、STRADA、SUMO1、TBL1XR1、TLR8、TXNRD2、UBE3A、UFM1、WAC、WDR81、YME1L1、及びZMYND10からなる群から選択されるタンパク質の一部である、態様1~27のいずれかに記載の方法。
[態様48]前記治療剤が、配列番号8096~8297からなる群から選択される配列を有する前記第1のタンパク質をコードする前記第1の処理されたmRNAのレベルを増加させ、配列番号332~533からなる群から選択される配列を有する前記第2のタンパク質をコードする前記第2の処理されたmRNAのレベルを減少させる、態様47に記載の方法。
[態様49]前記プレmRNAの前記標的化された領域が、配列番号130~331からなる群から選択される配列の最大で約1500ヌクレオチド、約1000ヌクレオチド、約800ヌクレオチド、約700ヌクレオチド、約600ヌクレオチド、約500ヌクレオチド、約400ヌクレオチド、約300ヌクレオチド、約200ヌクレオチド、約100ヌクレオチド、約80ヌクレオチド、約70ヌクレオチド、約60ヌクレオチド、約50ヌクレオチド上流である、態様47に記載の方法。
[態様50]前記プレmRNAの前記標的化された領域が、配列番号130~331からなる群から選択される配列の少なくとも約1500ヌクレオチド、約1000ヌクレオチド、約800ヌクレオチド、約700ヌクレオチド、約600ヌクレオチド、約500ヌクレオチド、約400ヌクレオチド、約300ヌクレオチド、約200ヌクレオチド、約100ヌクレオチド、約80ヌクレオチド、約70ヌクレオチド、約60ヌクレオチド、約50ヌクレオチド上流である、態様47に記載の方法。
[態様51]前記プレmRNAの前記標的化された領域が、GRCh38/hg38:chr14 23071186、GRCh38/hg38:chr14 68925672、GRCh38/hg38:chr1 236735635、GRCh38/hg38:chr4 99143305、GRCh38/hg38:chr4 99143305、GRCh38/hg38:chr6 32182698、GRCh38/hg38:chr10 5077900、GRCh38/hg38:chr15 58058108、GRCh38/hg38:chr11 78138767、GRCh38/hg38:chr1 109620914、GRCh38/hg38:chr3 49422257、GRCh38/hg38:chr3 49422257、GRCh38/hg38:chr3 49422257、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 4726780、GRCh38/hg38:chr22 36201796、GRCh38/hg38:chr3 57230714、GRCh38/hg38:chr11 118573620、GRCh38/hg38:chr3 138188455、GRCh38/hg38:chr3 138188455、GRCh38/hg38:chr11 13355226、GRCh38/hg38:chr11 13355226、GRCh38/hg38:chr3 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[態様52]前記プレmRNAの前記標的化された領域が、GRCh38/hg38:chr14 23071186、GRCh38/hg38:chr14 68925672、GRCh38/hg38:chr1 236735635、GRCh38/hg38:chr4 99143305、GRCh38/hg38:chr4 99143305、GRCh38/hg38:chr6 32182698、GRCh38/hg38:chr10 5077900、GRCh38/hg38:chr15 58058108、GRCh38/hg38:chr11 78138767、GRCh38/hg38:chr1 109620914、GRCh38/hg38:chr3 49422257、GRCh38/hg38:chr3 49422257、GRCh38/hg38:chr3 49422257、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 4726780、GRCh38/hg38:chr22 36201796、GRCh38/hg38:chr3 57230714、GRCh38/hg38:chr11 118573620、GRCh38/hg38:chr3 138188455、GRCh38/hg38:chr3 138188455、GRCh38/hg38:chr11 13355226、GRCh38/hg38:chr11 13355226、GRCh38/hg38:chr3 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[態様53]前記プレmRNAの前記標的化された領域が、配列番号130~331からなる群から選択される配列の最大で約1500ヌクレオチド、約1000ヌクレオチド、約800ヌクレオチド、約700ヌクレオチド、約600ヌクレオチド、約500ヌクレオチド、約400ヌクレオチド、約300ヌクレオチド、約200ヌクレオチド、約100ヌクレオチド、約80ヌクレオチド、約70ヌクレオチド、約60ヌクレオチド、約50ヌクレオチド下流である、態様47に記載の方法。
[態様54]前記プレmRNAの前記標的化された領域が、配列番号130~331からなる群から選択される配列の少なくとも約1500ヌクレオチド、約1000ヌクレオチド、約800ヌクレオチド、約700ヌクレオチド、約600ヌクレオチド、約500ヌクレオチド、約400ヌクレオチド、約300ヌクレオチド、約200ヌクレオチド、約100ヌクレオチド、約80ヌクレオチド、約70ヌクレオチド、約60ヌクレオチド、約50ヌクレオチド下流である、態様47に記載の方法。
[態様55]前記プレmRNAの前記標的化された領域が、GRCh38/hg38:chr14 23071125、GRCh38/hg38:chr14 68925558、GRCh38/hg38:chr1 236735720、GRCh38/hg38:chr4 99143166、GRCh38/hg38:chr4 99143166、GRCh38/hg38:chr6 32182568、GRCh38/hg38:chr10 5077977、GRCh38/hg38:chr15 58058012、GRCh38/hg38:chr11 78138710、GRCh38/hg38:chr1 109621266、GRCh38/hg38:chr3 49422104、GRCh38/hg38:chr3 49422104、GRCh38/hg38:chr3 49422104、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 4726659、GRCh38/hg38:chr22 36201700、GRCh38/hg38:chr3 57230767、GRCh38/hg38:chr11 118573783、GRCh38/hg38:chr3 138188530、GRCh38/hg38:chr3 138188530、GRCh38/hg38:chr11 13355296、GRCh38/hg38:chr11 13355296、GRCh38/hg38:chr3 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[態様56]前記プレmRNAの前記標的化された領域が、GRCh38/hg38:chr14 23071125、GRCh38/hg38:chr14 68925558、GRCh38/hg38:chr1 236735720、GRCh38/hg38:chr4 99143166、GRCh38/hg38:chr4 99143166、GRCh38/hg38:chr6 32182568、GRCh38/hg38:chr10 5077977、GRCh38/hg38:chr15 58058012、GRCh38/hg38:chr11 78138710、GRCh38/hg38:chr1 109621266、GRCh38/hg38:chr3 49422104、GRCh38/hg38:chr3 49422104、GRCh38/hg38:chr3 49422104、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 4726659、GRCh38/hg38:chr22 36201700、GRCh38/hg38:chr3 57230767、GRCh38/hg38:chr11 118573783、GRCh38/hg38:chr3 138188530、GRCh38/hg38:chr3 138188530、GRCh38/hg38:chr11 13355296、GRCh38/hg38:chr11 13355296、GRCh38/hg38:chr3 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8:chr3 177064920、GRCh38/hg38:chr3 177064920、GRCh38/hg38:chr3 177064920、GRCh38/hg38:chrX 12910442、GRCh38/hg38:chr22 19880856、GRCh38/hg38:chr15 25408620、GRCh38/hg38:chr15 25408620、GRCh38/hg38:chr13 38350227、GRCh38/hg38:chr10 28535757、GRCh38/hg38:chr17 1728626、GRCh38/hg38:chr10 27153227、及びGRCh38/hg38:chr3 50345124からなる群から選択されるゲノム部位の少なくとも約1500ヌクレオチド、約1000ヌクレオチド、約800ヌクレオチド、約700ヌクレオチド、約600ヌクレオチド、約500ヌクレオチド、約400ヌクレオチド、約300ヌクレオチド、約200ヌクレオチド、約100ヌクレオチド、約80ヌクレオチド、約70ヌクレオチド、約60ヌクレオチド、約50ヌクレオチド下流である、態様47に記載の方法。
[態様57]前記プレmRNAの前記標的化された領域が、配列番号130~331からなる群から選択される配列内にある、態様47に記載の方法。
[態様58]前記プレmRNAの前記標的化された領域が、GRCh38/hg38:chr14 23071186、及びGRCh38/hg38:chr14 23071125;GRCh38/hg38:chr14 68925672、及びGRCh38/hg38:chr14 68925558;GRCh38/hg38:chr1 236735635、及びGRCh38/hg38:chr1 236735720;GRCh38/hg38:chr4 99143305、及びGRCh38/hg38:chr4 99143166;GRCh38/hg38:chr4 99143305、及びGRCh38/hg38:chr4 99143166;GRCh38/hg38:chr6 32182698、及びGRCh38/hg38:chr6 32182568;GRCh38/hg38:chr10 5077900、及びGRCh38/hg38:chr10 5077977;GRCh38/hg38:chr15 58058108、及びGRCh38/hg38:chr15 58058012;GRCh38/hg38:chr11 78138767、及びGRCh38/hg38:chr11 78138710;GRCh38/hg38:chr1 109620914、及びGRCh38/hg38:chr1 109621266;GRCh38/hg38:chr3 49422257、及びGRCh38/hg38:chr3 49422104;GRCh38/hg38:chr3 49422257、及びGRCh38/hg38:chr3 49422104;GRCh38/hg38:chr3 49422257、及びGRCh38/hg38:chr3 49422104;GRCh38/hg38:chr16 89317078、及びGRCh38/hg38:chr16 89316933;GRCh38/hg38:chr16 89317078、及びGRCh38/hg38:chr16 89316933;GRCh38/hg38:chr16 89317078、及びGRCh38/hg38:chr16 89316933;GRCh38/hg38:chr16 89317075、及びGRCh38/hg38:chr16 89316933;GRCh38/hg38:chr16 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h38/hg38:chr17 63714108、及びGRCh38/hg38:chr17 63714006;GRCh38/hg38:chr17 63714108、及びGRCh38/hg38:chr17 63714006;GRCh38/hg38:chr17 63714108、及びGRCh38/hg38:chr17 63714006;GRCh38/hg38:chr17 63714108、及びGRCh38/hg38:chr17 63714006;GRCh38/hg38:chr2 202214429、及びGRCh38/hg38:chr2 202214357;GRCh38/hg38:chr3 177065022、及びGRCh38/hg38:chr3 177064920;GRCh38/hg38:chr3 177065022、及びGRCh38/hg38:chr3 177064920;GRCh38/hg38:chr3 177065022、及びGRCh38/hg38:chr3 177064920;GRCh38/hg38:chr3 177065022、及びGRCh38/hg38:chr3 177064920;GRCh38/hg38:chrX 12910306、及びGRCh38/hg38:chrX 12910442;GRCh38/hg38:chr22 19880945、及びGRCh38/hg38:chr22 19880856;GRCh38/hg38:chr15 25408684、及びGRCh38/hg38:chr15 25408620;GRCh38/hg38:chr15 25408684、及びGRCh38/hg38:chr15 25408620;GRCh38/hg38:chr13 38349999、及びGRCh38/hg38:chr13 38350227;GRCh38/hg38:chr10 28535562、及びGRCh38/hg38:chr10 28535757;GRCh38/hg38:chr17 1727990、及びGRCh38/hg38:chr17 1728626;GRCh38/hg38:chr10 27153281、及びGRCh38/hg38:chr10 27153227;GRCh38/hg38:chr3 50345232、及びGRCh38/hg38:chr3 50345124からなる群から選択されるゲノム部位の対の間の配列内にある、態様47に記載の方法。
[態様59]前記治療剤が、配列番号130~331からなる群から選択される配列と少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する配列と相補的であるアンチセンスオリゴマーである、態様47に記載の方法。
[態様60]前記治療剤が、配列番号130~331からなる群から選択される配列と100%の配列同一性を有する配列と相補的であるアンチセンスオリゴマーである、態様47に記載の方法。
[態様61]前記治療剤が、配列番号534~8095からなる群から選択される配列と少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する配列を有するアンチセンスオリゴマーである、態様47に記載の方法。
[態様62]前記治療剤が、配列番号534~8095からなる群から選択される配列と100%の配列同一性を有する配列を有するアンチセンスオリゴマーである、態様47に記載の方法。
[態様63]前記疾患または前記状態が、知的障害;大腸癌;出血障害、血小板型、15;常染色体優性巨大血小板性血小板減少症;肥大型心筋症;心筋症、拡張型、1AA;心筋症、家族性肥大型、23、心筋緻密化障害を伴うまたは伴わない;家族性拡張型心筋症;シャルコー・マリー・トゥース病;心臓の伝導障害;心筋症、拡張型;アルコール使用障害;アルコール乱用;アルコール中毒、慢性;アルコール使用障害;アルコール乱用;アルコール中毒、慢性;統合失調症;双極性障害;アルコール中毒、慢性;先天性グリコシル化異常症;てんかん性脳症;うつ病性障害;先天性グリコシル化異常症1H型;橋小脳低形成9型;てんかん性脳症;運動失調症、遺伝性;痙性対麻痺63、常染色体劣性;小脳低形成症;痙性対麻痺、遺伝性;非ケトン性高グリシン血症;新生児一過性高グリシン血症;グリシン脳症;KBG症候群;16q24.3微細欠失症候群;内臓逆位症;乳房の悪性新生物;若年発症成人型糖尿病;若年発症成人型糖尿病14型;小頭症;多指症;繊毛病;精神的うつ病;季節性情動障害;双極性障害;気分障害;うつ病性障害;乳房の悪性新生物;血球減少症;胃腸新生物;うつ病性障害;前立腺癌、家族性;原発性腹膜癌;卵巣癌(ovarian cancer)、家族性、感受性、1;乳癌、家族性男性;悪性新生物;膵臓新生物;乳癌、家族性;乳房の不確かまたは未知の性状の新生物;卵巣癌(Ovarian Carcinoma);前立腺腺癌;卵巣の不確かまたは未知の性状の新生物;膵臓の悪性新生物;膵臓癌;卵巣の悪性新生物;先天性貧血;血液腫瘍;乳腺癌;乳癌卵巣癌、家族性、感受性、1;脾臓癌、家族性;膵臓の良性腫瘍;乳癌(Breast Carcinoma);乳癌(breast cancer)、家族性、感受性、1;卵巣新生物;遺伝性乳癌卵巣癌症候群;精神的うつ病;卵巣上皮癌;乳房の悪性新生物;散発性乳癌;乳癌卵巣癌、家族性、1;脾臓癌、感受性、4;C8欠損症II型;心室頻拍、カテコラミン誘発多形性、4;心室頻拍、カテコラミン誘発多形性、1;QT延長症候群;ロマノ・ワード症候群;Qt延長症候群14;皮膚剥離症候群;爪甲白斑、末端点状角化症、口唇炎、及びナックルパッドを伴う皮膚剥離;紅斑角皮症;掌蹠角化症;病的肥満及び精子形成不全;ワーブルトン・エニヤン・イエボア症候群;多彩異数性モザイク症候群;乳癌、家族性;卵巣の悪性新生物;ミトコンドリア病;電離放射線への感受性を伴う重症複合免疫不全症;重症複合免疫不全症、部分的;細網内皮症、家族性、好酸球増多症を伴う;オーメン症候群;アサバスカン型重症複合免疫不全症;重症複合免疫不全症、アサバスカ人型;コカイン乱用;先天性貧血;血球減少症;脳葉酸輸送不全に起因する神経変性;ジヒドロ葉酸還元酵素欠損症に起因する巨赤芽球性貧血;アルコール中毒、慢性;双極性障害;単極性うつ病;大うつ病性障害;統合失調症及び関連障害;左室心筋緻密化障害;左室緻密化障害;家族性メニエール病;シャルコー・マリー・トゥース病;左室心筋緻密化障害、家族性孤立性、常染色体優性1;原発性小頭症;小頭症;てんかん性脳症;精神遅滞、常染色体優性7;大腸癌;うつ病性障害;精神的うつ病;尾部退行症候群;アーノルド・キアリ奇形;尾部異形成症候群;キアリ奇形II型;仙骨形成不全症候群;仙骨形成不全;クラリーノ三徴;頸椎の顕在性二分脊椎;神経管欠損症;多発性嚢胞腎、常染色体優性;多発性嚢胞腎3、常染色体優性;アルコール中毒、慢性;乳房の悪性新生物;運動失調症、遺伝性;てんかん、進行性ミオクローヌス、6;てんかん性脳症;格子状角膜変性症II型;メレトジャ症候群;乳房の悪性新生物;周期性発熱症候群;家族性アミロイドポリニューロパチーIV型;脳アミロイドアンギオパチー、Gsn関連;角膜の異常;アミロイドーシス、フィンランド型;原発性小頭症;コルネリア・デ・ランゲ症候群5;内反手;コルネリア・デ・ランゲ症候群;ウィルソン・ターナーX連鎖性精神遅滞症候群;先天性貧血;網膜色素変性症79;シャルコー・マリー・トゥース病;血球減少症;ヘキソキナーゼ欠損症に起因する非球状赤血球性 溶血性貧血;ニューロパチー、遺伝性運動感覚性、russe型;インターフェロンガンマ受容体1欠乏症;免疫不全症27a;免疫不全症27b;H.pylori感染症、感受性;結核感染症、それに対する保護;免疫不全症27A、抗酸菌症、AR;免疫不全症27B、抗酸菌症、AD;B型肝炎ウイルス感染症、感受性;結核、感受性;乳房の悪性新生物;リンパ腫、非ホジキン;免疫不全症15;先天性ミオパチー;関節拘縮症;横紋筋融解症;運動不耐性を伴うミオパチー、スウェーデン型;乳酸アシドーシスを伴うミオパチー、遺伝性;シャルコー・マリー・トゥース病、劣性中間型B;シャルコー・マリー・トゥース病;難聴、常染色体劣性89;難聴、常染色体劣性89;失読症、感受性、2;ジュベール症候群23;多指症;家族性小脳虫部形成不全;ジューン窒息性胸郭異形成症を伴うジュベール症候群;水頭症;繊毛病;多指症を伴う短肋骨胸郭異形成症14;網膜色素変性症;網膜色素変性症69;筋ジストロフィー、肢帯型、1B型;肥大型心筋症;左室緻密化障害;骨形成不全症;シャルコー・マリー・トゥース病;心筋症、家族性特発性;家族性部分型リポジストロフィー1型;左室心筋緻密化障害;下顎顔面異骨症;筋ジストロフィー、先天性、Lmna関連;先天性ミオパチー;関節拘縮症;不整脈原性右室異形成症;筋ジストロフィー、肢帯型;Malouf症候群;ナジャール症候群;シャルコー・マリー・トゥース病2B1型;エメリー・ドレイフス型筋ジストロフィー3;致死性緊張皮膚性拘縮症候群;家族性部分型リポジストロフィー2型;心臓の伝導障害;心筋症、拡張型;プロジェリア症候群、小児期発症;非典型的ウェルナー症候群;先天性筋ジストロフィー;常染色体劣性エメリー・ドレイフス型筋ジストロフィー;心臓-手症候群、スロベニア型;プロジェリア;常染色体優性エメリー・ドレイフス型筋ジストロフィー;心筋症、拡張型、1A;下顎骨肢端形成不全症;筋ジストロフィー、肢帯型、1B型;エメリー・ドレイフス型筋ジストロフィー2、AD;Malouf症候群;致死性拘束性皮膚障害;エメリー・ドレイフス型筋ジストロフィー3、AR;心臓-手症候群、スロベニア型;シャルコー・マリー・トゥース病2B1型;ハッチンソン・ギルフォード・プロジェリア;リポジストロフィー、家族性部分型、2型;筋ジストロフィー、先天性;乳房の悪性新生物;難聴、常染色体劣性63;バルデー・ビードル症候群;多指症;繊毛病;バルデー・ビードル症候群17;大感情障害2;双極性障害;てんかん性脳症;レット症候群、発話保存変異型;Lubs X連鎖性精神遅滞症候群;Mecp2変異に起因する新生児重症脳症;精神病、錐体路徴候、及び巨大睾丸を伴う精神遅滞;精神遅滞、X連鎖性、痙縮を伴う;Xq28トリソミー;精神遅滞、X連鎖性16;てんかん性脳症;精神遅滞、X連鎖性、症候性13;精神遅滞、X連鎖性1;レット症候群、非典型的;精神遅滞、X連鎖性79;小頭症;Ppm-X症候群;レット症候群、Zappella変異型;レット症候群;自閉症感受性、X連鎖性3;副腎の良性新生物;網膜色素変性症;従来型(淡明細胞)腎細胞癌;頭頸部の扁平上皮癌;大動脈体及び他の傍神経節腫の悪性新生物;網膜色素変性症38;悪性副腎髄質新生物;大動脈体及び他の傍神経節腫の良性新生物;原発性小頭症;小頭症15、原発性、常染色体劣性;常染色体劣性原発性小頭症;小頭症;白血病、急性骨髄性;難聴、常染色体劣性74;血球減少症;ウリジン5’一リン酸加水分解酵素欠損症、それに起因する溶血性貧血;先天性貧血;NUT正中線癌;乳房の悪性新生物;難聴、常染色体劣性;難聴、常染色体劣性9;オーディトリーニューロパチー、非症候群性劣性;オーディトリーニューロパチー、常染色体劣性、1;乳房の悪性新生物;乳癌;乳房の不確かまたは未知の性状の新生物;乳腺癌;ケトン性低血糖症;横紋筋融解症;糖原病IXB;肝臓及び筋肉のホスホリラーゼキナーゼ欠損症、常染色体劣性;先天性貧血;先天性グリコシル化異常症;血球減少症;てんかん性脳症;発作性夜間ヘモグロビン尿症;発作性夜間ヘモグロビン尿症1;ウエスト症候群;先天多発奇形-筋緊張低下-けいれん症候群2;先天性貧血;先天性グリコシル化異常症;血球減少症;てんかん性脳症;発作性夜間ヘモグロビン尿症;発作性夜間ヘモグロビン尿症1;ウエスト症候群;先天多発奇形-筋緊張低下-けいれん症候群2;ブルック症候群2;骨形成不全症;ブルック症候群1;関節拘縮症;ブルック症候群;皮膚黒色腫;黒色腫;パーキンソン病2、常染色体劣性若年性;パーキンソン病;若年発症パーキンソン病;パーキンソン病、後期発症;ハンセン病、感受性;腺癌、卵巣、体細胞性;肺腺癌、体細胞性;原発性小頭症;小頭症、筋緊張低下、及び様々な脳奇形を伴う神経発達障害;心筋梗塞、感受性;純粋型性腺形成不全症、46、XX;卵巣形成不全症3;インスリン抵抗性、感受性;白質ジストロフィー;てんかん性脳症;アダムズ-オリバー症候群3;アダムズ-オリバー症候群;気分障害;先天性貧血;血液腫瘍;ダイアモンド・ブラックファン貧血;血球減少症;オーセスミス症候群2;橈側内反手;前駆T細胞性リンパ芽球性白血病リンパ腫;ダイアモンド・ブラックファン貧血6;遺伝性非ポリポーシス大腸癌症候群;家族性大腸癌X型;遺伝性非ポリポーシス大腸癌;遺伝性非ポリポーシス結腸直腸新生物;甲状腺ホルモン代謝異常;甲状腺ホルモン不応症;双極性障害;気分障害;複合酸化的リン酸化欠乏症28;コフィン・シリス症候群5;コフィン・シリス症候群;髄膜腫(Meningioma);髄膜腫(Meningiomas)、多発性;髄膜腫、家族性、感受性;原発性小頭症;先天性貧血;骨形成不全症;血球減少症;てんかん性脳症;橈側内反手;コルネリア・デ・ランゲ症候群;顔面異形症を伴う成長不全及び精神遅滞;先天性筋肥大-脳症候群;コルネリア・デ・ランゲ症候群2;女性の浸潤性乳管癌;大腸癌;神経線維腫症1;神経線維腫症1型様症候群;レジウス症候群;シュワッハマン症候群;多形膠芽腫;卵巣漿液性腺癌;ポリネシアン気管支拡張症;カルタゲナー症候群;羊水過多症、巨大脳症、及び症候性てんかん;水頭症;てんかん性脳症;部分性無歯症;歯数不足症;口腔顔面裂10;膀胱の悪性新生物;急性前骨髄球性白血病;大腸腺癌;膀胱新生物;てんかん性脳症;膀胱の不確かまたは未知の性状の新生物;精神遅滞、常染色体優性41;膀胱の良性新生物;リンパ腫、非ホジキン;膀胱の上皮内癌;中枢神経系リンパ腫;膀胱の癌;足底脂肪腫症、異常顔貌、及び発達遅延;Pierpont症候群;X連鎖性副腎低形成症;うつ症状;家族性拡張型心筋症;家族性グルココルチコイド欠損症1型;心臓の伝導障害;心筋症、拡張型;アンジェルマン症候群;てんかん性脳症;小頭症;15q11-q13重複症候群;白質ジストロフィー、髄鞘形成不全性、6;染色体10p12-p11欠失症候群;大腸癌;デサント・シナウィ症候群;運動失調症、遺伝性;小脳性運動失調症、精神遅滞、及び不均衡症候群2;水頭症;小脳低形成症;不均衡症候群;視神経萎縮症11;ポリネシアン気管支拡張症;線毛運動不全症、原発性、22;カルタゲナー症候群;ならびに繊毛病からなる群から選択される、態様47~62のいずれかに記載の方法。
[態様64]前記疾患または前記状態が、不十分な量または活性の機能性標的タンパク質によって引き起こされ、前記標的ペプチド配列を含む前記第1のタンパク質が、前記機能性標的タンパク質と少なくとも部分的に機能的に同等である、態様2~5または7~63に記載の方法。
[態様65]前記疾患または前記状態が、不十分な量または活性の前記標的ペプチド配列によって引き起こされる、態様2~5または7~63に記載の方法。
[態様66]前記治療剤が、前記細胞における前記第1の処理されたmRNAの前記レベルを増加させる、態様1~65のいずれかに記載の方法。
[態様67]前記治療剤と接触させた前記細胞における前記第1の処理されたmRNAの前記レベルが、対照細胞における前記第1の処理されたmRNAのレベルと比較して、約1.1~約10倍、約1.5~約10倍、約2~約10倍、約3~約10倍、約4~約10倍、約1.1~約5倍、約1.1~約6倍、約1.1~約7倍、約1.1~約8倍、約1.1~約9倍、約2~約5倍、約2~約6倍、約2~約7倍、約2~約8倍、約2~約9倍、約3~約6倍、約3~約7倍、約3~約8倍、約3~約9倍、約4~約7倍、約4~約8倍、約4~約9倍、少なくとも約1.1倍、少なくとも約1.5倍、少なくとも約2倍、少なくとも約2.5倍、少なくとも約3倍、少なくとも約3.5倍、少なくとも約4倍、少なくとも約5倍、または少なくとも約10倍に増加される、態様1~66のいずれかに記載の方法。
[態様68]前記治療剤が、前記細胞における前記標的ペプチド配列の前記発現を増加させる、態様1~67のいずれかに記載の方法。
[態様69]前記治療剤と接触させた前記細胞における前記標的ペプチド配列の前記レベルが、対照細胞における前記標的ペプチド配列のレベルと比較して、約1.1~約10倍、約1.5~約10倍、約2~約10倍、約3~約10倍、約4~約10倍、約1.1~約5倍、約1.1~約6倍、約1.1~約7倍、約1.1~約8倍、約1.1~約9倍、約2~約5倍、約2~約6倍、約2~約7倍、約2~約8倍、約2~約9倍、約3~約6倍、約3~約7倍、約3~約8倍、約3~約9倍、約4~約7倍、約4~約8倍、約4~約9倍、少なくとも約1.1倍、少なくとも約1.5倍、少なくとも約2倍、少なくとも約2.5倍、少なくとも約3倍、少なくとも約3.5倍、少なくとも約4倍、少なくとも約5倍、または少なくとも約10倍に増加される、態様1~68のいずれかに記載の方法。
[態様70]前記治療剤が、アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、前記治療剤が、ホスホロチオエート結合またはホスホロジアミデート結合を含む骨格修飾を含む、態様1~69のいずれかに記載の方法。
[態様71]前記治療剤が、アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、前記治療剤が、ホスホロジアミデートモルホリノ、ロック核酸、ペプチド核酸、2’-O-メチル、2’-フルオロ、または2’-O-メトキシエチル部分を含む、態様1~70のいずれかに記載の方法。
[態様72]前記治療剤が、アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、前記治療剤が、少なくとも1つの修飾糖部分を含む、態様1~71のいずれかに記載の方法。
[態様73]各糖部分が、修飾糖部分である、態様72に記載の方法。
[態様74]前記治療剤が、アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、前記治療剤が、8~50核酸塩基、8~40核酸塩基、8~35核酸塩基、8~30核酸塩基、8~25核酸塩基、8~20核酸塩基、8~15核酸塩基、9~50核酸塩基、9~40核酸塩基、9~35核酸塩基、9~30核酸塩基、9~25核酸塩基、9~20核酸塩基、9~15核酸塩基、10~50核酸塩基、10~40核酸塩基、10~35核酸塩基、10~30核酸塩基、10~25核酸塩基、10~20核酸塩基、10~15核酸塩基、11~50核酸塩基、11~40核酸塩基、11~35核酸塩基、11~30核酸塩基、11~25核酸塩基、11~20核酸塩基、11~15核酸塩基、12~50核酸塩基、12~40核酸塩基、12~35核酸塩基、12個~30核酸塩基、12~25核酸塩基、12~20核酸塩基、または12~15核酸塩基からなる、態様1~73のいずれかに記載の方法。
[態様75]前記方法が、前記標的ペプチド配列をコードするmRNAレベルまたは前記標的ペプチド配列の発現レベルを評価することをさらに含む、態様1~74のいずれかに記載の方法。
[態様76]前記対象が、ヒトである、態様2~5または7~75のいずれかに記載の方法。
[態様77]前記対象が、非ヒト動物である、態様2~5または7~75のいずれかに記載の方法。
[態様78]前記対象が、胎児、胚、または子供である、態様2~5または7~76のいずれかに記載の方法。
[態様79]前記細胞(複数可)が、エクスビボ、または組織中、またはエクスビボでの器官である、態様1~75のいずれかに記載の方法。
[態様80]前記治療剤が、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、髄腔内注射、皮下注射、経口投与、滑液注射、硝子体内投与、網膜下注射、局所適用、移植、または静脈内注射によって前記対象に投与される、態様2~5または7~77のいずれかに記載の方法。
[態様81]態様1~80のいずれかに記載の方法で使用するための治療剤。
[態様82]態様81に記載の治療剤と、薬学的に許容される賦形剤とを含む、薬学的組成物。
[態様83]治療を必要とする対象において治療する方法であって、態様82に記載の薬学的組成物を、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、髄腔内注射、皮下注射、経口投与、滑液注射、硝子体内投与、網膜下注射、局所適用、移植、または静脈内注射によって前記対象に投与することを含む、前記方法。

Claims (41)

  1. 治療剤または該治療剤をコードするベクターと、薬学的に許容される賦形剤とを含む薬学的組成物であって、
    前記治療剤は、細胞においてプレmRNAの標的化された部分に結合するように構成されており、前記プレmRNAは、標的ペプチド配列をコードし、かつ非効率的な翻訳領域を含み、それによって、前記標的ペプチド配列をコードする前記プレmRNAからの前記非効率的な翻訳領域のスプライシングが調節され、それによって、前記非効率的な翻訳領域を含まず、かつ前記標的ペプチド配列を含む第1のタンパク質をコードする第1の処理されたmRNAのレベルを調節し、それによって前記細胞において前記標的ペプチド配列の前記発現を調節し、前記第1の処理されたmRNAが、前記標的ペプチド配列を含む第2のタンパク質を産生するための第2の処理されたmRNAの翻訳効率と比較して、前記細胞において前記標的ペプチド配列を含む前記第1のタンパク質を産生するためのより高い翻訳効率を有し、前記第2の処理されたmRNAが、前記非効率的な翻訳領域を含む、薬学的組成物
  2. 前記標的ペプチド配列をコードする前記プレmRNAが、第1の開始コドン、第2の開始コドン、ならびに前記第1の開始コドンの下流及び前記第2の開始コドンの上流に位置する早期終結コドン(PTC)を含み、前記非効率的な翻訳領域が、前記早期終結コドン(PTC)及び前記第2の開始コドンを含む、請求項1に記載の薬学的組成物
  3. 前記非効率的な翻訳領域が、プロリンリッチペプチド配列をコードする領域を含む、請求項1または2に記載の薬学的組成物
  4. 前記標的ペプチド配列が、少なくとも10個のアミノ酸を有する、請求項1~のいずれか1項に記載の薬学的組成物
  5. 前記プレmRNAの前記標的化された領域の少なくとも一部が、前記非効率的な翻訳領域の上流または下流にある、請求項1~のいずれかに記載の薬学的組成物
  6. 前記プレmRNAの前記標的化された領域の少なくとも一部が、前記非効率的な翻訳領域内にある、請求項1~のいずれかに記載の薬学的組成物
  7. 前記第1の処理されたmRNA及び前記第2の処理されたmRNAが両方とも、前記細胞における前記プレmRNAのスプライシング産物である、請求項1~のいずれか1項に記載の薬学的組成物
  8. 前記第2の処理されたmRNAが、前記第1の処理されたmRNA、前記PTC、及び前記第2の開始コドンの配列を含む、請求項2~7のいずれか1項に記載の薬学的組成物
  9. 前記標的ペプチド配列を含む前記第1のタンパク質が、前記第1の処理されたmRNA上の前記第1の開始コドンから開始して翻訳され、前記第2のタンパク質が、前記第2の処理されたmRNA上の前記第2の開始コドンから開始して翻訳される、請求項2~8のいずれか1項に記載の薬学的組成物
  10. 前記標的ペプチド配列をコードする前記プレmRNAからの前記非効率的な翻訳領域の除外が増加される、請求項1~のいずれか1項に記載の薬学的組成物
  11. 前記治療剤が、前記細胞における前記標的ペプチド配列をコードする前記第1の処理されたmRNAの前記レベルを増加させる、請求項1~10のいずれか1項に記載の薬学的組成物
  12. 前記治療剤が、前記細胞における前記標的ペプチド配列のレベルを増加させる、請求項1~11のいずれか1項に記載の薬学的組成物
  13. 前記標的ペプチド配列が、完全長タンパク質の一部である、請求項1~12のいずれか1項に記載の薬学的組成物
  14. 産生される前記標的ペプチド配列が、完全機能性タンパク質である、請求項1~13のいずれか1項に記載の薬学的組成物
  15. 前記標的ペプチド配列が、完全長タンパク質のN末端部分またはC末端部分である、請求項1~14のいずれか1項に記載の薬学的組成物
  16. 前記標的ペプチド配列が、前記非効率的な翻訳領域の上流または前記非効率的な翻訳領域の下流の前記プレmRNAの一部によってコードされる、請求項1~15のいずれか1項に記載の薬学的組成物
  17. 前記非効率的な翻訳領域が、前記第2の処理されたmRNAの3’非翻訳領域(3’UTR)にある、請求項1~16のいずれか1項に記載の薬学的組成物
  18. 前記プレmRNAが、MeCP2プレmRNAである、請求項1~17のいずれか1項に記載の薬学的組成物
  19. 前記プレmRNAが、配列番号2~27からなる群から選択されるいずれか1つの配列と少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する配列を含む、請求項18に記載の薬学的組成物
  20. 前記標的ペプチド配列が、配列番号32~34からなる群から選択される配列から翻訳される、請求項18または19に記載の薬学的組成物。
  21. 前記治療剤が、MeCP2プレmRNAの標的化された領域に結合し、前記標的化された領域が、配列番号28~31からなる群から選択される配列内にある、請求項18に記載の薬学的組成物
  22. 前記第1の処理されたmRNAが、配列番号8204または8205と少なくとも80%の配列同一性を有するタンパク質をコードする、請求項18~21のいずれか1項に記載の薬学的組成物。
  23. 前記治療剤が、配列番号440または441と少なくとも80%の配列同一性を有するタンパク質をコードする第2の処理されたmRNAのレベルを減少させる、請求項18~22のいずれか1項に記載の薬学的組成物。
  24. 前記治療剤が、MeCP2タンパク質のe2アイソフォームのレベルを減少させ、前記細胞におけるMeCP2タンパクのe1アイソフォームのレベルを増加させる、請求項18~23のいずれか1項に記載の薬学的組成物。
  25. プレmRNAの標的化された領域が、
    (a)配列番号238または239の少なくとも10個の連続する核酸塩基を含む、
    (b)GRCh38/hg38:chrX 154092307およびGRCh38/hg38:chrX 154092184からなる群から選択されるゲノム部位の対の間の配列内にある、
    (c)ゲノム部位GRCh38/hg38:chrX 154092184の少なくとも50ヌクレオチド下流である、
    (d)ゲノム部位GRCh38/hg38:chrX 154092184の最大で1500ヌクレオチド下流である、
    (e)ゲノム部位GRCh38/hg38:chrX 154092307の少なくとも50ヌクレオチド上流である、または
    (f)ゲノム部位GRCh38/hg38:chrX 154092307の最大で1500ヌクレオチド上流である、
    請求項18~24のいずれか1項に記載の薬学的組成物。
  26. 前記治療剤が、配列番号35~129および4548~4611からなる群から選択される配列と少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する配列を有するアンチセンスオリゴマーである、請求項18~25のいずれか1項に記載の薬学的組成物。
  27. 前記治療剤が、プレmRNAの標的化された領域と相補的であるアンチセンスオリゴマー(ASO)である、請求項1~17のいずれか1項に記載の薬学的組成物。
  28. 前記治療剤が、前記標的ペプチド配列をコードする前記プレmRNAの前記標的化された領域と少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%相補的であるASOである、請求項1~17のいずれか1項に記載の薬学的組成物。
  29. 前記治療剤が、小分子である、請求項1~17のいずれか1項に記載の薬学的組成物。
  30. 前記治療剤をコードするベクターを含む、請求項1~17のいずれか1項に記載の薬学的組成物。
  31. 前記ベクターがウイルスベクターである、請求項30に記載の薬学的組成物。
  32. 前記治療剤が、アンチセンスオリゴマーであり、かつ前記治療剤が、ホスホロチオエート結合またはホスホロジアミデート結合を含む骨格修飾を含む、請求項1~17のいずれか1項に記載の薬学的組成物。
  33. 前記治療剤が、アンチセンスオリゴマーであり、かつ前記治療剤が、ホスホロジアミデートモルホリノ、ロック核酸、ペプチド核酸、2’-O-メチル、2’-フルオロ、または2’-O-メトキシエチル部分を含む、請求項1~17または32のいずれか1項に記載の薬学的組成物。
  34. 前記治療剤が、アンチセンスオリゴマーであり、かつ前記治療剤が、少なくとも1つの修飾糖部分を含む、請求項1~17、32、または33のいずれか1項に記載の薬学的組成物。
  35. 各糖部分が、修飾糖部分である、請求項34に記載の薬学的組成物。
  36. 前記治療剤が、アンチセンスオリゴマーであり、かつ前記治療剤が、8~50核酸塩基、8~40核酸塩基、8~35核酸塩基、8~30核酸塩基、8~25核酸塩基、8~20核酸塩基、8~15核酸塩基、9~50核酸塩基、9~40核酸塩基、9~35核酸塩基、9~30核酸塩基、9~25核酸塩基、9~20核酸塩基、9~15核酸塩基、10~50核酸塩基、10~40核酸塩基、10~35核酸塩基、10~30核酸塩基、10~25核酸塩基、10~20核酸塩基、10~15核酸塩基、11~50核酸塩基、11~40核酸塩基、11~35核酸塩基、11~30核酸塩基、11~25核酸塩基、11~20核酸塩基、11~15核酸塩基、12~50核酸塩基、12~40核酸塩基、12~35核酸塩基、12個~30核酸塩基、12~25核酸塩基、12~20核酸塩基、または12~15核酸塩基からなる、請求項1~17または32~35のいずれか1項に記載の薬学的組成物。
  37. 前記標的ペプチド配列が、MECP2、ACIN1、ACTN1、ACTN2、ADH4、AKR1C3、ALDH1A2、ALG8、AMPD2、AMT、ANKRD11、ANKS3、APOL4、APPL1、ARCN1、ARMC8、ARNTL、BOC、BRCA1、C8B、CALM1、CALM3、CASP5、CAST、CEP19、CEP57、CHEK1、CIB2、COX4I1、DCLRE1C、DECR1、DHFR、DKK2、DLG2、DOK2、DPF3、DTNA、DYRK1A、FOLH1、FUZ、GANAB、GEMIN4、GGA3、GOSR2、GPM6A、GRB10、GSN、HDAC8、HIVEP1、HK1、IFNGR1、IKBKB、ISCU、KARS、KIAA0319、KIAA0586、KIZ、KLK6、LMNA、LMNTD1、LRRC7、LRTOMT、LZTFL1、MAGI2、MERTK、MFSD2A、MLF1、MOB1B、MSRB3、NR1I3、NT5C3A、NUTM1、OTOF、PDCD4、PDPK1、PHKB、PIGA、PLOD2、POLR2F、PPP6C、PRKN、PRUNE1、PSMA6、PSMC3IP、PTPN1、RAB11B、RBPJ、RNPS1、RPL5、RPS20、SECISBP2、SELENBP1、SEPT11、SIRT2、SLC25A26、SMARCE1、SMC1A、SMG1、SPACA7、SPRED1、SRP54、SRPK2、STK36、STRADA、SUMO1、TBL1XR1、TLR8、TXNRD2、UBE3A、UFM1、WAC、WDR81、YME1L1、及びZMYND10からなる群から選択されるタンパク質の一部である、請求項1~17または27~36のいずれか1項に記載の薬学的組成物
  38. 請求項1に記載の薬学的組成を含む、治療を必要とする対象における疾患または状態の治療における使用のための薬学的組成。
  39. 前記疾患または前記状態が、知的障害;大腸癌;出血障害、血小板型、15;常染色体優性巨大血小板性血小板減少症;肥大型心筋症;心筋症、拡張型、1AA;心筋症、家族性肥大型、23、心筋緻密化障害を伴うまたは伴わない;家族性拡張型心筋症;シャルコー・マリー・トゥース病;心臓の伝導障害;アルコール使用障害;アルコール乱用;アルコール中毒、慢性;統合失調症;双極性障害;先天性グリコシル化異常症;てんかん性脳症;うつ病性障害;先天性グリコシル化異常症1H型;橋小脳低形成9型;運動失調症、遺伝性;痙性対麻痺63、常染色体劣性;小脳低形成症;痙性対麻痺、遺伝性;非ケトン性高グリシン血症;新生児一過性高グリシン血症;グリシン脳症;KBG症候群;16q24.3微細欠失症候群;内臓逆位症;乳房の悪性新生物;若年発症成人型糖尿病;若年発症成人型糖尿病14型;小頭症;多指症;繊毛病;精神的うつ病;季節性情動障害;気分障害;血球減少症;胃腸新生物;前立腺癌、家族性;原発性腹膜癌;卵巣癌(ovarian cancer)、家族性、感受性、1;乳癌、家族性男性;悪性新生物;膵臓新生物;乳癌、家族性;乳房の不確かまたは未知の性状の新生物;卵巣癌(Ovarian Carcinoma);前立腺腺癌;卵巣の不確かまたは未知の性状の新生物;膵臓の悪性新生物;膵臓癌;卵巣の悪性新生物;先天性貧血;血液腫瘍;乳腺癌;乳癌卵巣癌、家族性、感受性、1;脾臓癌、家族性;膵臓の良性腫瘍;乳癌(Breast Carcinoma);乳癌(breast cancer)、家族性、感受性、1;卵巣新生物;遺伝性乳癌卵巣癌症候群;卵巣上皮癌;散発性乳癌;乳癌卵巣癌、家族性、1;脾臓癌、感受性、4;C8欠損症II型;心室頻拍、カテコラミン誘発多形性、4;心室頻拍、カテコラミン誘発多形性、1;QT延長症候群;ロマノ・ワード症候群;Qt延長症候群14;皮膚剥離症候群;爪甲白斑、末端点状角化症、口唇炎、及びナックルパッドを伴う皮膚剥離;紅斑角皮症;掌蹠角化症;病的肥満及び精子形成不全;ワーブルトン・エニヤン・イエボア症候群;多彩異数性モザイク症候群;ミトコンドリア病;電離放射線への感受性を伴う重症複合免疫不全症;重症複合免疫不全症、部分的;細網内皮症、家族性、好酸球増多症を伴う;オーメン症候群;アサバスカン型重症複合免疫不全症;重症複合免疫不全症、アサバスカ人型;コカイン乱用;脳葉酸輸送不全に起因する神経変性;ジヒドロ葉酸還元酵素欠損症に起因する巨赤芽球性貧血;単極性うつ病;大うつ病性障害;統合失調症及び関連障害;左室心筋緻密化障害;左室緻密化障害;家族性メニエール病;シャルコー・マリー・トゥース病;左室心筋緻密化障害、家族性孤立性、常染色体優性1;精神遅滞、常染色体優性7;尾部退行症候群;アーノルド・キアリ奇形;尾部異形成症候群;キアリ奇形II型;仙骨形成不全症候群;仙骨形成不全;クラリーノ三徴;頸椎の顕在性二分脊椎;神経管欠損症;多発性嚢胞腎、常染色体優性;多発性嚢胞腎3、常染色体優性;てんかん、進行性ミオクローヌス、6;格子状角膜変性症II型;メレトジャ症候群;周期性発熱症候群;家族性アミロイドポリニューロパチーIV型;脳アミロイドアンギオパチー、Gsn関連;角膜の異常;アミロイドーシス、フィンランド型;コルネリア・デ・ランゲ症候群5;内反手;コルネリア・デ・ランゲ症候群;ウィルソン・ターナーX連鎖性精神遅滞症候群;網膜色素変性症79;シャルコー・マリー・トゥース病;ヘキソキナーゼ欠損症に起因する非球状赤血球性 溶血性貧血;ニューロパチー、遺伝性運動感覚性、russe型;インターフェロンガンマ受容体1欠乏症;免疫不全症27a;免疫不全症27b;H.pylori感染症、感受性;結核感染症、それに対する保護;免疫不全症27A、抗酸菌症、AR;免疫不全症27B、抗酸菌症、AD;B型肝炎ウイルス感染症、感受性;結核、感受性;リンパ腫、非ホジキン;免疫不全症15;先天性ミオパチー;関節拘縮症;横紋筋融解症;運動不耐性を伴うミオパチー、スウェーデン型;乳酸アシドーシスを伴うミオパチー、遺伝性;シャルコー・マリー・トゥース病、劣性中間型B;難聴、常染色体劣性89;失読症、感受性、2;ジュベール症候群23;家族性小脳虫部形成不全;ジューン窒息性胸郭異形成症を伴うジュベール症候群;水頭症;繊毛病;多指症を伴う短肋骨胸郭異形成症14;網膜色素変性症;網膜色素変性症69;筋ジストロフィー、肢帯型、1B型;肥大型心筋症;骨形成不全症;心筋症、家族性特発性;家族性部分型リポジストロフィー1型;下顎顔面異骨症;筋ジストロフィー、先天性、LMNA関連;先天性ミオパチー;不整脈原性右室異形成症;筋ジストロフィー、肢帯型;Malouf症候群;ナジャール症候群;シャルコー・マリー・トゥース病2B1型;エメリー・ドレイフス型筋ジストロフィー3;致死性緊張皮膚性拘縮症候群;家族性部分型リポジストロフィー2型;プロジェリア症候群、小児期発症;非典型的ウェルナー症候群;先天性筋ジストロフィー;常染色体劣性エメリー・ドレイフス型筋ジストロフィー;心臓-手症候群、スロベニア型;プロジェリア;常染色体優性エメリー・ドレイフス型筋ジストロフィー;心筋症、拡張型、1A;下顎骨肢端形成不全症;エメリー・ドレイフス型筋ジストロフィー2、AD;致死性拘束性皮膚障害;エメリー・ドレイフス型筋ジストロフィー3、AR;ハッチンソン・ギルフォード・プロジェリア;リポジストロフィー、家族性部分型、2型;筋ジストロフィー、先天性;難聴、常染色体劣性63;バルデー・ビードル症候群;繊毛病;バルデー・ビードル症候群17;大感情障害2;レット症候群、発話保存変異型;Lubs X連鎖性精神遅滞症候群;Mecp2変異に起因する新生児重症脳症;精神病、錐体路徴候、及び巨大睾丸を伴う精神遅滞;精神遅滞、X連鎖性、痙縮を伴う;Xq28トリソミー;精神遅滞、X連鎖性16;精神遅滞、X連鎖性、症候性13;精神遅滞、X連鎖性1;レット症候群、非典型的;精神遅滞、X連鎖性79;Ppm-X症候群;レット症候群、Zappella変異型;レット症候群;自閉症感受性、X連鎖性3;副腎の良性新生物;従来型(淡明細胞)腎細胞癌;頭頸部の扁平上皮癌;大動脈体及び他の傍神経節腫の悪性新生物;網膜色素変性症38;悪性副腎髄質新生物;大動脈体及び他の傍神経節腫の良性新生物;小頭症15、原発性、常染色体劣性;常染色体劣性原発性小頭症;白血病、急性骨髄性;難聴、常染色体劣性74;ウリジン5’一リン酸加水分解酵素欠損症に起因する溶血性貧血;NUT正中線癌;難聴、常染色体劣性;難聴、常染色体劣性9;オーディトリーニューロパチー、非症候群性劣性;オーディトリーニューロパチー、常染色体劣性、1;乳;ケトン性低血糖症;糖原病IXB;肝臓及び筋肉のホスホリラーゼキナーゼ欠損症、常染色体劣性;発作性夜間ヘモグロビン尿症;発作性夜間ヘモグロビン尿症1;ウエスト症候群;先天多発奇形-筋緊張低下-けいれん症候群2;夜間ヘモグロビン尿症;ブルック症候群2;ブルック症候群1;ブルック症候群;皮膚黒色腫;黒色腫;パーキンソン病2、常染色体劣性若年性;パーキンソン病;若年発症パーキンソン病;パーキンソン病、後期発症;ハンセン病、感受性;腺癌、卵巣、体細胞性;肺腺癌、体細胞性;小頭症、筋緊張低下、及び様々な脳奇形を伴う神経発達障害;心筋梗塞、感受性;純粋型性腺形成不全症、46、XX;卵巣形成不全症3;インスリン抵抗性、感受性;白質ジストロフィー;アダムズ-オリバー症候群3;アダムズ-オリバー症候群;ダイアモンド・ブラックファン貧血;オーセスミス症候群2;前駆T細胞性リンパ芽球性白血病リンパ腫;ダイアモンド・ブラックファン貧血6;遺伝性非ポリポーシス大腸癌症候群;家族性大腸癌X型;遺伝性非ポリポーシス大腸癌;遺伝性非ポリポーシス結腸直腸新生物;甲状腺ホルモン代謝異常;甲状腺ホルモン不応症;気分障害;複合酸化的リン酸化欠乏症28;コフィン・シリス症候群5;コフィン・シリス症候群;髄膜腫(Meningioma);髄膜腫(Meningiomas)、多発性;髄膜腫、家族性、感受性;顔面異形症を伴う成長不全及び精神遅滞;先天性筋肥大-脳症候群;コルネリア・デ・ランゲ症候群2;女性の浸潤性乳管癌;神経線維腫症1;神経線維腫症1型様症候群;レジウス症候群;シュワッハマン症候群;多形膠芽腫;卵巣漿液性腺癌;ポリネシアン気管支拡張症;カルタゲナー症候群;羊水過多症、巨大脳症、及び症候性てんかん;部分性無歯症;歯数不足症;口腔顔面裂10;膀胱の悪性新生物;急性前骨髄球性白血病;大腸腺癌;膀胱新生物;膀胱の不確かまたは未知の性状の新生物;精神遅滞、常染色体優性41;膀胱の良性新生物;膀胱の上皮内癌;中枢神経系リンパ腫;膀胱の癌;足底脂肪腫症、異常顔貌、及び発達遅延;Pierpont症候群;X連鎖性副腎低形成症;うつ症状;家族性グルココルチコイド欠損症1型;アンジェルマン症候群;15q11-q13重複症候群;白質ジストロフィー、髄鞘形成不全性、6;染色体10p12-p11欠失症候群;デサント・シナウィ症候群;小脳性運動失調症、精神遅滞、及び不均衡症候群2;不均衡症候群;視神経萎縮症11;線毛運動不全症、原発性、22;ならびに繊毛病からなる群から選択される、請求項38に記載の使用のための薬学的組成
  40. 前記疾患または前記状態が、不十分な量または活性の機能性標的タンパク質によって引き起こされ、前記標的ペプチド配列を含む前記第1のタンパク質が、前記機能性標的タンパク質と少なくとも部分的に機能的に同等である、請求項38または39に記載の使用のための薬学的組成物
  41. 前記薬学的組成物が、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、髄腔内注射、皮下注射、経口投与、滑液注射、硝子体内投与、網膜下注射、局所適用、移植、または静脈内注射によって前記対象に投与される、請求項38~40のいずれか1項に記載の使用のための薬学的組成物
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