CN114025848A - 用于调节剪接和翻译的方法和组合物 - Google Patents

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CN114025848A CN202080045541.XA CN202080045541A CN114025848A CN 114025848 A CN114025848 A CN 114025848A CN 202080045541 A CN202080045541 A CN 202080045541A CN 114025848 A CN114025848 A CN 114025848A
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伊莎贝尔·阿兹纳雷兹
乔根·沙尔内尔
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Abstract

基因中的选择性剪接事件可产生非生产性或较低生产性的mRNA转录物,并且可靶向基因中的所述选择性剪接事件的治疗剂可调节患者中的功能性蛋白质的表达水平和/或抑制异常的蛋白质表达。本文提供了通过调节mRNA前体的剪接来调节靶肽序列的表达水平的组合物和方法。本文还提供了通过调节mRNA前体的剪接来治疗由于功能性靶蛋白的量或活性不足所引起的疾病或疾患的组合物和方法。

Description

用于调节剪接和翻译的方法和组合物
交叉引用
本申请要求2019年4月24日提交的美国临时申请第62/838,010号的权益,所述申请通过引用整体并入本文。
序列表的引用
本申请含有序列表,所述序列表已以ASCII格式以电子方式提交并通过引用整体并入本文。2020年4月22日创建的所述ASCII副本命名为47991-725_601_SL.txt并且大小为4,882,023个字节。
背景技术
基因中的选择性剪接事件可产生非生产性或较低生产性的mRNA转录物。可靶向基因中的所述选择性剪接事件的治疗剂可调节患者中的功能性蛋白质的表达水平和/或抑制异常的蛋白质表达。此类治疗剂可用于治疗因蛋白质缺乏所引起的疾患或疾病。
发明内容
在一些方面,本文公开了一种调节具有mRNA前体的细胞对靶肽序列的表达的方法,所述mRNA前体编码所述靶肽序列并包含低效翻译区,所述方法包括使所述细胞与治疗剂接触,所述治疗剂与编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的靶向区结合,由此调节所述低效翻译区从编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的剪接,进而调节不含所述低效翻译区并编码包含所述靶肽序列的第一蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并且进而调节所述靶肽序列在所述细胞中的表达,其中在所述细胞中产生包含所述靶肽序列的所述第一蛋白质的所述第一经加工mRNA的翻译效率高于产生包含所述靶肽序列的第二蛋白质的第二经加工mRNA的翻译效率,并且其中所述第二经加工mRNA包含所述低效翻译区。
在一些方面,本文公开了一种通过调节靶肽序列在有需要的受试者的细胞中的表达来治疗所述受试者的疾病或疾患的方法,所述细胞具有mRNA前体,所述mRNA前体编码所述靶肽序列并包含低效翻译区,所述方法包括使所述受试者的所述细胞与治疗剂接触,所述治疗剂调节所述低效翻译区从编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的剪接,其中所述治疗剂与所述mRNA前体的靶向区结合,由此调节所述低效翻译区从所述mRNA前体的剪接,进而调节不含所述低效翻译区并编码包含所述靶肽序列的第一蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并且进而调节所述靶肽序列在所述受试者的所述细胞中的表达,其中在所述细胞中产生包含所述靶肽序列的所述第一蛋白质的所述第一经加工mRNA的翻译效率高于产生包含所述靶肽序列的第二蛋白质的第二经加工mRNA的翻译效率,并且其中所述第二经加工mRNA包含所述低效翻译区。
在一些情况下,所述第二经加工mRNA除了包含所述低效翻译区以外在其他方面与所述第一经加工mRNA相同。在一些情况下,编码所述靶肽序列的所述mRNA前体包含第一起始密码子、第二起始密码子以及位于所述第一起始密码子下游并位于所述第二起始密码子上游的提前终止密码子(PTC),并且其中所述低效翻译区包含所述提前终止密码子(PTC)和所述第二起始密码子。在一些情况下,所述低效翻译区包含编码富含脯氨酸的肽序列的区域。
在一些方面,本文公开了一种调节具有mRNA前体的细胞对靶肽序列的表达的方法,所述mRNA前体编码所述靶肽序列并包含第一起始密码子、第二起始密码子以及位于所述第一起始密码子下游并位于所述第二起始密码子上游的提前终止密码子(PTC),所述方法包括使所述细胞与治疗剂接触,所述治疗剂与编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的靶向部分结合,由此调节所述PTC和所述第二起始密码子从所述mRNA前体的剪接,进而调节不含所述PTC和所述第二起始密码子并编码包含所述靶肽序列的第一蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并且进而调节所述靶肽序列在所述细胞中的表达。
在一些方面,本文公开了一种通过调节靶肽序列在有需要的受试者的细胞中的表达来治疗所述受试者的疾病或疾患的方法,所述细胞具有mRNA前体,所述mRNA前体编码所述靶肽序列并包含第一起始密码子、第二起始密码子以及位于所述第一起始密码子下游并位于所述第二起始密码子上游的提前终止密码子(PTC),所述方法包括使所述受试者的所述细胞与治疗剂接触,所述治疗剂调节所述PTC和所述第二起始密码子从编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的剪接,其中所述治疗剂与所述mRNA前体的靶向区结合,由此调节所述PTC和所述第二起始密码子从所述mRNA前体的剪接,进而调节不含所述PTC和所述第二起始密码子并编码包含所述靶肽序列的第一蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并且进而调节所述靶肽序列在所述受试者的所述细胞中的表达。
在一些情况下,所述靶肽序列具有至少10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、200、300、400、500、750或1000个氨基酸。在一些情况下,所述治疗剂是小分子。在一些情况下,所述治疗剂是与所述mRNA前体的所述靶向区互补的反义寡聚体(ASO)。在一些情况下,所述治疗剂是与编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的所述靶向区至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%互补的ASO。在一些情况下,所述mRNA前体的所述靶向区的至少一部分在所述低效翻译区或包含所述PTC和所述第二起始密码子的外显子上游。在一些情况下,所述mRNA前体的所述靶向区的至少一部分在所述低效翻译区或包含所述PTC和所述第二起始密码子的外显子下游。在一些情况下,所述mRNA前体的所述靶向区的至少一部分在所述低效翻译区或包含所述PTC和所述第二起始密码子的外显子内。在一些情况下,所述细胞具有第二经加工mRNA,所述第二经加工mRNA包含所述第一经加工mRNA、所述PTC和所述第二起始密码子的序列并编码包含所述靶肽序列的第二蛋白质。在一些情况下,所述第一经加工mRNA和所述第二经加工mRNA两者都是所述细胞中的所述mRNA前体的剪接产物。在一些情况下,所述第二经加工mRNA包含所述第一经加工mRNA、所述PTC和所述第二起始密码子的序列。在一些情况下,所述PTC和所述第二起始密码子在所述mRNA前体上具有至少2nt的距离。在一些情况下,所述PTC和所述第二起始密码子在所述mRNA前体上具有至多75nt的距离。在一些情况下,所述PTC和所述第二起始密码子在所述mRNA前体上具有2nt至75nt、5nt至70nt、10nt至65nt、15nt至60nt、20nt至55nt、25nt至50nt、30nt至45nt、40nt至50nt、45nt至55nt、50nt至60nt、55nt至70nt或60nt至75nt的距离。在一些情况下,所述PTC和所述第二起始密码子在所述mRNA前体上具有2nt至75nt的距离。
在一些情况下,包含所述靶肽序列的所述第一蛋白质从所述第一经加工mRNA上的所述第一起始密码子开始翻译,并且所述第二蛋白质从所述第二经加工mRNA上的所述第二起始密码子开始翻译。在一些情况下,产生所述第一蛋白质的所述第一经加工mRNA的翻译效率高于产生所述第二蛋白质的所述第二经加工mRNA的翻译效率。
在一些情况下,所述低效翻译区从编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的去除或者所述PTC和所述第二起始密码子从编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的去除增加。在一些情况下,所述治疗剂增加所述细胞中编码所述靶肽序列的所述第一经加工mRNA的水平。在一些情况下,所述治疗剂增加所述细胞中所述靶肽序列的水平。
在一些情况下,所述靶肽序列是全长蛋白质的一部分。在一些情况下,所产生的所述靶肽序列是完全功能性蛋白质。在一些情况下,所述靶肽序列是全长蛋白质的N末端部分。在一些情况下,所述靶肽序列由所述mRNA前体中所述低效翻译区上游的一部分编码。在一些情况下,所述低效翻译区位于所述第二经加工mRNA的3′非翻译区(3′UTR)中。
在一些情况下,所述靶肽序列是全长蛋白质的C末端部分。在一些情况下,所述靶肽序列由所述mRNA前体中所述低效翻译区或所述PTC下游的一部分编码。
在一些情况下,所述靶肽序列是MeCP2蛋白质同功型的一部分。在一些情况下,所述靶肽序列由选自由SEQ ID NO:32-34组成的组的序列翻译。在一些情况下,所述治疗剂减少所述细胞中MeCP2 mRNA的e2同功型的水平并增加MeCP2 mRNA的e1同功型的水平。在一些情况下,所述治疗剂减少所述细胞中MeCP2蛋白质的e2同功型的水平并增加MeCP2蛋白质的e1同功型的水平。在一些情况下,所述mRNA前体包含与选自由SEQ ID NO:2-27组成的组的任一者具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列。在一些情况下,所述治疗剂与MeCP2 mRNA前体的靶向区结合,其中所述靶向区位于选自由SEQ ID NO:28-31组成的组的序列内。在一些情况下,所述治疗剂与MeCP2 mRNA前体的靶向区结合,其中所述靶向区位于序列SEQ ID NO:28内。在一些情况下,所述治疗剂是与同选自由SEQ ID NO:28-31组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,所述治疗剂是与同选自由SEQ ID NO:28-31组成的组的序列具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,所述治疗剂是与同SEQ ID NO:28具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,所述治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:35-129组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,所述治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:35-129组成的组的序列具有100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,所述疾病或所述疾患是雷特综合征(Rett syndrome)。
在一些情况下,所述靶肽序列是选自由以下组成的组的蛋白质的一部分:ACIN1、ACTN1、ACTN2、ADH4、AKR1C3、ALDH1A2、ALG8、AMPD2、AMT、ANKRD11、ANKS3、APOL4、APPL1、ARCN1、ARMC8、ARNTL、BOC、BRCA1、C8B、CALM1、CALM3、CASP5、CAST、CEP19、CEP57、CHEK1、CIB2、COX4I1、DCLRE1C、DECR1、DHFR、DKK2、DLG2、DOK2、DPF3、DTNA、DYRK1A、FOLH1、FUZ、GANAB、GEMIN4、GGA3、GOSR2、GPM6A、GRB10、GSN、HDAC8、HIVEP1、HK1、IFNGR1、IKBKB、ISCU、KARS、KIAA0319、KIAA0586、KIZ、KLK6、LMNA、LMNTD1、LRRC7、LRTOMT、LZTFL1、MAGI2、MECP2、MERTK、MFSD2A、MLF1、MOB1B、MSRB3、NR1I3、NT5C3A、NUTM1、OTOF、PDCD4、PDPK1、PHKB、PIGA、PLOD2、POLR2F、PPP6C、PRKN、PRUNE1、PSMA6、PSMC3IP、PTPN1、RAB11B、RBPJ、RNPS1、RPL5、RPS20、SECISBP2、SELENBP1、SEPT11、SIRT2、SLC25A26、SMARCE1、SMC1A、SMG1、SPACA7、SPRED1、SRP54、SRPK2、STK36、STRADA、SUMO1、TBL1XR1、TLR8、TXNRD2、UBE3A、UFM1、WAC、WDR81、YME1L1和ZMYND10。在一些情况下,所述治疗剂增加对具有选自由SEQ ID NO:8096-8297组成的组的序列的所述第一蛋白质进行编码的所述第一经加工mRNA的水平,并减少对具有选自由SEQ ID NO:332-533组成的组的序列的所述第二蛋白质进行编码的所述第二经加工mRNA的水平。
在一些情况下,所述mRNA前体的所述靶向区是选自由SEQ ID NO:130-331组成的组的序列上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,所述mRNA前体的所述靶向区是选自由SEQ ID NO:130-331组成的组的序列上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。
在一些情况下,所述mRNA前体的所述靶向区是选自由以下组成的组的基因组位点上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸:GRCh38/hg38:chr14 23071186、GRCh38/hg38:chr14 68925672、GRCh38/hg38:chr1 236735635、GRCh38/hg38:chr499143305、GRCh38/hg38:chr4 99143305、GRCh38/hg38:chr6 32182698、GRCh38/hg38:chr10 5077900、GRCh38/hg38:chr15 58058108、GRCh38/hg38:chr11 78138767、GRCh38/hg38:chr1 109620914、GRCh38/hg38:chr3 49422257、GRCh38/hg38:chr3 49422257、GRCh38/hg38:chr3 49422257、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr1689317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr1689317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 4726780、GRCh38/hg38:chr22 36201796、GRCh38/hg38:chr3 57230714、GRCh38/hg38:chr11 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在一些情况下,所述mRNA前体的所述靶向区是选自由以下组成的组的基因组位点上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸:GRCh38/hg38:chr14 23071186、GRCh38/hg38:chr14 68925672、GRCh38/hg38:chr1 236735635、GRCh38/hg38:chr499143305、GRCh38/hg38:chr4 99143305、GRCh38/hg38:chr6 32182698、GRCh38/hg38:chr10 5077900、GRCh38/hg38:chr15 58058108、GRCh38/hg38:chr11 78138767、GRCh38/hg38:chr1 109620914、GRCh38/hg38:chr3 49422257、GRCh38/hg38:chr3 49422257、GRCh38/hg38:chr3 49422257、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr1689317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr1689317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 4726780、GRCh38/hg38:chr22 36201796、GRCh38/hg38:chr3 57230714、GRCh38/hg38:chr11 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在一些情况下,所述mRNA前体的所述靶向区是选自由以下组成的组的基因组位点下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸:GRCh38/hg38:chr14 23071125、GRCh38/hg38:chr14 68925558、GRCh38/hg38:chr1 236735720、GRCh38/hg38:chr499143166、GRCh38/hg38:chr4 99143166、GRCh38/hg38:chr6 32182568、GRCh38/hg38:chr10 5077977、GRCh38/hg38:chr15 58058012、GRCh38/hg38:chr11 78138710、GRCh38/hg38:chr1 109621266、GRCh38/hg38:chr3 49422104、GRCh38/hg38:chr3 49422104、GRCh38/hg38:chr3 49422104、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr1689316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr1689316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 4726659、GRCh38/hg38:chr22 36201700、GRCh38/hg38:chr3 57230767、GRCh38/hg38:chr11 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在一些情况下,所述mRNA前体的所述靶向区是选自由以下组成的组的基因组位点下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸:GRCh38/hg38:chr14 23071125、GRCh38/hg38:chr14 68925558、GRCh38/hg38:chr1 236735720、GRCh38/hg38:chr499143166、GRCh38/hg38:chr4 99143166、GRCh38/hg38:chr6 32182568、GRCh38/hg38:chr10 5077977、GRCh38/hg38:chr15 58058012、GRCh38/hg38:chr11 78138710、GRCh38/hg38:chr1 109621266、GRCh38/hg38:chr3 49422104、GRCh38/hg38:chr3 49422104、GRCh38/hg38:chr3 49422104、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr1689316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr1689316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 4726659、GRCh38/hg38:chr22 36201700、GRCh38/hg38:chr3 57230767、GRCh38/hg38:chr11 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在一些情况下,所述mRNA前体的所述靶向区位于选自由SEQ ID NO:130-331组成的组的序列内。在一些情况下,所述mRNA前体的所述靶向区位于选自由以下组成的组的一对基因组位点之间的序列内:GRCh38/hg38:chr14 23071186和GRCh38/hg38:chr1423071125;GRCh38/hg38:chr14 68925672和GRCh38/hg38:chr14 68925558;GRCh38/hg38:chr1 236735635和GRCh38/hg38:chr1 236735720;GRCh38/hg38:chr4 99143305和GRCh38/hg38:chr4 99143166;GRCh38/hg38:chr4 99143305和GRCh38/hg38:chr4 99143166;GRCh38/hg38:chr6 32182698和GRCh38/hg38:chr6 32182568;GRCh38/hg38:chr105077900和GRCh38/hg38:chr10 5077977;GRCh38/hg38:chr15 58058108和GRCh38/hg38:chr15 58058012;GRCh38/hg38:chr11 78138767和GRCh38/hg38:chr11 78138710;GRCh38/hg38:chr1 109620914和GRCh38/hg38:chr1 109621266;GRCh38/hg38:chr3 49422257和GRCh38/hg38:chr3 49422104;GRCh38/hg38:chr3 49422257和GRCh38/hg38:chr349422104;GRCh38/hg38:chr3 49422257和GRCh38/hg38:chr3 49422104;GRCh38/hg38:chr16 89317078和GRCh38/hg38:chr16 89316933;GRCh38/hg38:chr16 89317078和GRCh38/hg38:chr16 89316933;GRCh38/hg38:chr16 89317078和GRCh38/hg38:chr1689316933;GRCh38/hg38:chr16 89317075和GRCh38/hg38:chr16 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在一些情况下,所述治疗剂是与同选自由SEQ ID NO:130-331组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,所述治疗剂是与同选自由SEQ ID NO:130-331组成的组的序列具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,所述治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:534-8095组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,所述治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:534-8095组成的组的序列具有100%序列同一性的序列的反义寡聚体。
在一些情况下,所述疾病或所述疾患选自由以下组成的组:智力障碍;结肠直肠癌;血小板型出血障碍15型;常染色体显性巨血小板减少症;肥厚性心肌病;扩张性心肌病1AA型;伴有或不伴有心室致密化不全的家族肥大性心肌病23型;家族扩张性心肌病;恰克-马里-杜斯氏病(Charcot-Marie-Tooth Disease);心脏传导障碍;扩张性心肌病;酒精使用障碍;酒精滥用;慢性酒精中毒;酒精使用障碍;酒精滥用;慢性酒精中毒;精神分裂症;躁郁症;慢性酒精中毒;先天性糖基化障碍;癫痫性脑病;抑郁症;先天性糖基化障碍1H型;脑桥小脑发育不全9型;癫痫性脑病;遗传性共济失调;常染色体隐性痉挛性截瘫63型;小脑发育不全;遗传性痉挛性截瘫;非酮症性高甘氨酸血症;暂时性新生儿高甘氨酸血症;甘氨酸脑病;KBG综合征;16q24.3微缺失综合征;内脏逆位;乳房恶性赘瘤;青年人中的成年发病型糖尿病;青年人中的成年发病型糖尿病14型;小头畸形;多指(趾)症;纤毛病;精神抑郁症;季节性情感障碍;躁郁症;情绪障碍;抑郁症;乳房恶性赘瘤;细胞减少症;胃肠道赘瘤;抑郁症;家族性前列腺癌;原发性腹膜癌;家族性易感性卵巢癌1型;家族性男性乳腺癌;恶性赘瘤;胰腺赘瘤;家族性乳腺癌;具有不明确或未知的乳房行为的赘瘤;卵巢癌;前列腺腺癌;具有不明确或未知的卵巢行为的赘瘤;胰腺恶性赘瘤;胰腺癌;卵巢恶性赘瘤;先天性贫血;血液系统赘瘤;乳腺腺癌;家族性易感性乳房-卵巢癌1型;家族性胰腺癌;胰腺良性肿瘤;乳腺癌;家族性易感性乳腺癌1型;卵巢赘瘤;遗传性乳房和卵巢癌综合征;精神抑郁症;上皮卵巢癌;乳房恶性赘瘤;偶发性乳腺癌;家族性乳房-卵巢癌1型;易感性胰腺癌4型;C8缺乏症II型;儿茶酚胺敏感性多形性室性心动过速4型;儿茶酚胺敏感性多形性室性心动过速1型;长QT综合征;罗马诺-沃德综合征(Romano-Ward Syndrome);长Qt综合征14型;皮肤剥落综合征;伴有白甲病、肢端点状角化症、唇炎和指节垫的皮肤剥落;红斑角化症;掌跖角化症;病态肥胖症和精子生成障碍;warburton anyane yeboa综合征;马赛克杂色非整倍体综合征;家族性乳腺癌;卵巢恶性赘瘤;线粒体疾病;伴有对电离辐射敏感的严重联合免疫缺陷;部分性严重联合免疫缺陷;伴有嗜曙红细胞增多的家族性网状内皮增生症;欧门氏综合征(Omenn Syndrome);Athabaskan严重联合免疫缺陷;严重联合免疫缺陷Athabaskan型;可卡因滥用;先天性贫血;细胞减少症;由大脑叶酸转运不足引起的神经变性;由二氢叶酸还原酶缺乏引起的巨幼细胞性贫血;慢性酒精中毒;躁郁症;单相抑郁症;严重抑郁症;精神分裂症和相关病症;左心室致密化不全心肌病;左心室致密化不全;家族性美尼尔氏病(Familial Meniere′s disease);恰克-马里-杜斯氏病;常染色体显性家族性孤立性左心室心肌致密化不全1型;原发性小头畸形;小头畸形;癫痫性脑病;常染色体显性智力迟钝7型;结肠直肠癌;抑郁症;精神抑郁症;尾部退化综合征;阿诺德基亚里畸形(Arnold ChiariMalformation);尾部发育不良综合征;基亚里畸形II型;骶骨发育不全综合征;骶骨发育不全;Currarino三联征;颈椎显性脊柱裂;神经管缺陷;常染色体显性多囊肾;常染色体显性多囊性肾病3型;慢性酒精中毒;乳房恶性赘瘤;遗传性共济失调;进行性肌痉挛癫痫症6型;癫痫性脑病;格子状角膜营养不良II型;梅雷托亚综合征(Meretoja syndrome);乳房恶性赘瘤;周期性发热综合征;家族性淀粉样多神经病IV型;Gsn相关的大脑淀粉样血管病;角膜异常;芬兰型淀粉样变性;原发性小头畸形;狄兰吉氏(cornelia de lange)综合征5型;桡侧球棒手;狄兰吉氏综合征;威尔逊-特纳(wilson-turner)X连锁智力迟钝综合征;先天性贫血;色素性视网膜炎79型;恰克-马里-杜斯氏病;细胞减少症;由己糖激酶缺乏引起的非球形红细胞性溶血性贫血;russe型遗传性运动和感觉神经病;干扰素γ受体1缺陷;免疫缺陷27a型;免疫缺陷27b型;易感性幽门螺旋杆菌(H.pylori)感染;预防性肺结核感染;免疫缺陷27A型分枝杆菌病AR型;免疫缺陷27B型分枝杆菌病AD型;易感性乙型肝炎病毒感染;易感性肺结核;乳房恶性赘瘤;非霍奇金淋巴瘤(Lymphoma,Non-Hodgkin);免疫缺陷15型;先天性肌病;关节弯曲;横纹肌溶解症;伴有运动不耐受的瑞典型肌病;伴有乳酸中毒的遗传性肌病;隐性中间型恰克-马里-杜斯氏病B型;恰克-马里-杜斯氏病;常染色体隐性耳聋89型;常染色体隐性耳聋89型;易感性阅读障碍2型;朱伯特(Joubert)综合征23型;多指(趾)症;家族性小脑蚓部发育不全;伴有热纳(Jeune)窒息性胸廓发育不良的朱伯特综合征;脑积水;纤毛病;伴有多指(趾)症的短肋胸廓发育不良14型;色素性视网膜炎;色素性视网膜炎69型;肢带型肌肉萎缩1B型;肥厚性心肌病;左心室致密化不全;成骨不全;恰克-马里-杜斯氏病;家族性特发性心肌病;家族性部分性脂肪营养不良1型;左心室致密化不全心肌病;下颌骨发育不良;Lmna相关的先天性肌肉萎缩;先天性肌病;关节弯曲;心律失常性右心室发育不良;肢带型肌肉萎缩;马卢夫(Malouf)综合征;纳贾尔(Najjar)综合征;恰克-马里-杜斯氏病2B1型;艾梅氏(Emery-Dreifuss)肌肉萎缩3型;致死性限制性皮肤挛缩综合征;家族性部分性脂肪营养不良2型;心脏传导障碍;扩张性心肌病;儿童发病型早老综合征;非典型沃纳(Werner)综合征;先天性肌肉萎缩;常染色体隐性艾梅氏肌肉萎缩;心-手综合征Slovenian型;早老症;常染色体显性艾梅氏肌肉萎缩;扩张性心肌病1A型;下颌骨发育不良;肢带型肌肉萎缩1B型;艾梅氏肌肉萎缩2型AD型;马卢夫综合征;致死性限制性皮肤病;艾梅氏肌肉萎缩3型AR型;心-手综合征Slovenian型;恰克-马里-杜斯氏病2B1型;Hutchinson-Gilford早老症;家族性部分性脂肪营养不良2型;先天性肌肉萎缩;乳房恶性赘瘤;常染色体隐性耳聋63型;Bardet-Biedl综合征;多指(趾)症;纤毛病;Bardet-Biedl综合征17型;重度情感障碍2型;躁郁症;癫痫性脑病;保留语言功能型雷特综合征;Lubs X连锁智力迟钝综合征;由Mecp2突变引起的新生儿重度脑病;伴有精神病、锥体束征和大睾丸的智力迟钝;伴有痉挛的X连锁智力迟钝;Xq28染色体三体症;X连锁智力迟钝16型;癫痫性脑病;X连锁综合型智力迟钝13型;X连锁智力迟钝1型;非典型雷特综合征;X连锁智力迟钝79型;小头畸形;Ppm-X综合征;Zappella型雷特综合征;雷特综合征;X连锁自闭症易感3型;肾上腺良性赘瘤;色素性视网膜炎;普通型(透明细胞)肾细胞癌;头颈部鳞状细胞癌;主动脉体和其他嗜铬体的恶性赘瘤;色素性视网膜炎38型;恶性肾上腺髓质赘瘤;主动脉体和其他嗜铬体的良性赘瘤;原发性小头畸形;常染色体隐性原发性小头畸形15型;常染色体隐性原发性小头畸形;小头畸形;急性骨髓白血病;常染色体隐性耳聋74型;细胞减少症;引起溶血性贫血的尿苷5-Prime单磷酸水解酶缺乏;先天性贫血;NUT中线癌;乳房恶性赘瘤;常染色体隐性耳聋;常染色体隐性耳聋9型;非综合型隐性听觉神经病;常染色体隐性听觉神经病1型;乳房恶性赘瘤;乳腺癌;具有不明确或未知的乳房行为的赘瘤;乳腺腺癌;酮症性低血糖;横纹肌溶解症;糖原贮积病IXB;常染色体隐性肝脏和肌肉磷酸化酶激酶缺乏;先天性贫血;先天性糖基化障碍;细胞减少症;癫痫性脑病;阵发性睡眠性血红蛋白尿症;阵发性睡眠性血红蛋白尿症1型;韦斯特(West)综合征;多发性先天性异常-张力减退-痉挛综合征2型;先天性贫血;先天性糖基化障碍;细胞减少症;癫痫性脑病;阵发性睡眠性血红蛋白尿症;阵发性睡眠性血红蛋白尿症1型;韦斯特综合征;多发性先天性异常-张力减退-痉挛综合征2型;布鲁克(Btuck)综合征2型;成骨不全;布鲁克综合征1型;关节弯曲;布鲁克综合征;皮肤黑色素瘤;黑色素瘤;常染色体隐性青少年型帕金森病(Parkinson Disease)2型;青年发病型帕金森病;老年发病型帕金森病;易感性麻疯病;体细胞性卵巢腺癌;体细胞性肺腺癌;原发性小头畸形;伴有小头畸形、张力减退和多样脑部异常的神经发育障碍;易感性心肌梗死;46-XX单纯性腺发育不全;卵巢发育不全3型;易感性胰岛素抵抗;脑白质营养不良;癫痫性脑病;亚当斯-奥利弗(Adams-Oliver)综合征3型;亚当斯奥利弗综合征;情绪障碍;先天性贫血;血液系统赘瘤;Diamond-Blackfan贫血;细胞减少症;Aase Smith综合征2型;桡侧球棒手;T细胞前体淋巴母细胞白血病-淋巴瘤;Diamond-Blackfan贫血6型;遗传性非息肉性结肠直肠癌综合征;家族性结肠直肠癌X型;遗传性非息肉性结肠直肠癌;遗传性非息肉性结肠直肠赘瘤;异常甲状腺激素代谢;甲状腺激素抵抗综合征;躁郁症;情绪紊乱;联合氧化磷酸化缺乏28型;科芬-西里斯(Coffin-Siris)综合征5型;科芬-西里斯综合征;脑膜瘤;多发性脑膜瘤;家族性易感性脑膜瘤;原发性小头畸形;先天性贫血;成骨不全;细胞减少症;癫痫性脑病;桡侧球棒手;狄兰吉氏综合征;伴有脸部畸形的发育缺陷和智力迟钝;先天性肌肥大-大脑综合征;狄兰吉氏综合征2型;浸润性女性乳房导管癌;结肠直肠癌;神经纤维瘤1型;类神经纤维瘤1型综合征;Legius综合征;舒瓦克曼(Shwachman)综合征;多形性胶质母细胞瘤;卵巢浆液性腺癌;波利尼西亚(Polynesian)支气管扩张;卡塔格内(Kartagener)综合征;羊水过多、巨脑和症状性癫痫;脑积水;癫痫性脑病;少牙畸形;牙发育不全;唇腭裂10型;膀胱恶性赘瘤;急性前髓细胞性白血病;大肠腺癌;膀胱赘瘤;癫痫性脑病;具有不明确或未知的膀胱行为的赘瘤;常染色体显性智力迟钝41型;膀胱良性赘瘤;非霍奇金淋巴瘤;膀胱原位癌;中枢神经系统淋巴瘤;膀胱癌;足底脂肪过多、特殊面容和发育迟缓;皮尔庞(Pierpont)综合征;X连锁肾上腺发育不全;抑郁症状;家族性扩张性心肌病;家族性糖皮质激素缺乏1型;心脏传导障碍;扩张性心肌病;安格曼(Angelman)综合征;癫痫性脑病;小头畸形;15q11-q13重复综合征;髓鞘形成不良性脑白质营养不良6型;染色体10p12-p11缺失综合征;结肠直肠癌;Desanto-Shinawi综合征;遗传性共济失调;小脑共济失调、智力迟钝和平衡失调综合征2型;脑积水;小脑发育不全;平衡失调综合征;视神经萎缩11型;波利尼西亚支气管扩张;原发性纤毛运动障碍22型;卡塔格内综合征;和纤毛病。
在一些情况下,所述疾病或所述疾患是由功能性靶蛋白的量或活性不足所引起,并且其中包含所述靶肽序列的所述第一蛋白质至少在功能上部分地等效于所述功能性靶蛋白。在一些情况下,所述疾病或所述疾患是由所述靶肽序列的量或活性不足所引起。在一些情况下,所述治疗剂增加所述细胞中所述第一经加工mRNA的水平。在一些情况下,与所述治疗剂接触的所述细胞中所述第一经加工mRNA的水平与对照细胞中所述第一经加工mRNA的水平相比增加约1.1至约10倍、约1.5至约10倍、约2至约10倍、约3至约10倍、约4至约10倍、约1.1至约5倍、约1.1至约6倍、约1.1至约7倍、约1.1至约8倍、约1.1至约9倍、约2至约5倍、约2至约6倍、约2至约7倍、约2至约8倍、约2至约9倍、约3至约6倍、约3至约7倍、约3至约8倍、约3至约9倍、约4至约7倍、约4至约8倍、约4至约9倍、至少约1.1倍、至少约1.5倍、至少约2倍、至少约2.5倍、至少约3倍、至少约3.5倍、至少约4倍、至少约5倍、或至少约10倍。
在一些情况下,所述治疗剂增加所述细胞中所述靶肽序列的表达。在一些情况下,与所述治疗剂接触的所述细胞中所述靶肽序列的水平与对照细胞中所述靶肽序列的水平相比增加约1.1至约10倍、约1.5至约10倍、约2至约10倍、约3至约10倍、约4至约10倍、约1.1至约5倍、约1.1至约6倍、约1.1至约7倍、约1.1至约8倍、约1.1至约9倍、约2至约5倍、约2至约6倍、约2至约7倍、约2至约8倍、约2至约9倍、约3至约6倍、约3至约7倍、约3至约8倍、约3至约9倍、约4至约7倍、约4至约8倍、约4至约9倍、至少约1.1倍、至少约1.5倍、至少约2倍、至少约2.5倍、至少约3倍、至少约3.5倍、至少约4倍、至少约5倍、或至少约10倍。
在一些情况下,所述治疗剂是反义寡核苷酸,并且其中所述治疗剂包含包括硫代磷酸酯键或二氨基磷酸酯键的主链修饰。在一些情况下,所述治疗剂是反义寡核苷酸,并且其中所述治疗剂包含二氨基磷酸酯吗啉基、锁核酸、肽核酸、2′-O-甲基、2′-氟或2′-O-甲氧基乙基部分。在一些情况下,所述治疗剂是反义寡核苷酸,并且其中所述治疗剂包含至少一个经修饰的糖部分。在一些情况下,每个糖部分是经修饰的糖部分。在一些情况下,所述治疗剂是反义寡核苷酸,并且其中所述治疗剂由8至50个核碱基、8至40个核碱基、8至35个核碱基、8至30个核碱基、8至25个核碱基、8至20个核碱基、8至15个核碱基、9至50个核碱基、9至40个核碱基、9至35个核碱基、9至30个核碱基、9至25个核碱基、9至20个核碱基、9至15个核碱基、10至50个核碱基、10至40个核碱基、10至35个核碱基、10至30个核碱基、10至25个核碱基、10至20个核碱基、10至15个核碱基、11至50个核碱基、11至40个核碱基、11至35个核碱基、11至30个核碱基、11至25个核碱基、11至20个核碱基、11至15个核碱基、12至50个核碱基、12至40个核碱基、12至35个核碱基、12至30个核碱基、12至25个核碱基、12至20个核碱基、或12至15个核碱基组成。
在一些情况下,所述方法还包括评估编码所述靶肽序列的mRNA水平或所述靶肽序列的表达水平。
在一些情况下,所述受试者是人类。在一些情况下,所述受试者是非人类动物。在一些情况下,所述受试者是胎儿、胚胎或儿童。在一些情况下,所述一个或多个细胞是离体细胞,或位于离体组织或器官中。
在一些情况下,所述治疗剂是通过脑室内注射、腹膜内注射、肌肉内注射、鞘内注射、皮下注射、口服施用、滑膜注射、玻璃体内施用、视网膜下注射、局部应用、植入或静脉内注射向所述受试者施用。
在一些方面,本文公开了一种适用于本文所公开的方法的治疗剂。
在一些方面,本文公开了一种包含本文所描述的治疗剂和药学上可接受的赋形剂的药物组合物。
在一些方面,本文公开了一种治疗有需要的受试者的方法,所述方法包括通过脑室内注射、腹膜内注射、肌肉内注射、鞘内注射、皮下注射、经口施用、滑膜注射、玻璃体内施用、视网膜下注射、局部应用、植入或静脉内注射向所述受试者施用本文所描述的药物组合物。
通过引用并入
本说明书中所提及的所有出版物、专利和专利申请均通过引用并入本文,其引用的程度如同每个单独的出版物、专利或专利申请被特定地和单独地指示通过引用并入一般。
附图说明
本公开的新颖特征具体阐述于所附权利要求中。通过参考阐述利用本公开原理的说明性实施方案和其附图的以下详细描述,将获得对本公开的特征和优点的更好理解,在所述附图中:
图1A-1B描绘MECP2 mRNA前体剪接同功型(图1A)和蛋白结构域(图1B)的示意性图示。
图2是描绘用于调节MECP2 mRNA前体的选择性剪接的靶向策略的示意图。
图3A-3B展示用于确定MECP2 mRNA加工期间的外显子2纳入事件的RT-PCR分析。
图4描绘MECP2外显子2区的ASO walk。
图5展示用于评价MECP2外显子2区的ASO walk的RT-PCR分析。
图6A-6B展示所选ASO对MECP2外显子2纳入(图6A)和MECP2蛋白质表达(图6B)的效应。
图7展示总MECP2 mRNA(e1+e2)的定量。
图8展示在小鼠胚胎纤维母细胞(MEF)细胞中所选ASO对Mecp2外显子2纳入的剂量依赖性效应。
图9展示用于评价ASO 31-33和37-38区中的ASO microwalk的RT-PCR分析。
具体实施方式
特定基因中的选择性剪接可产生非生产性或较低生产性的mRNA转录物,其继而可下调蛋白质表达。可靶向这些基因中的选择性剪接事件的治疗剂可调节蛋白质表达水平。此类治疗剂可用于治疗由蛋白质缺乏所引起的疾患。
可产生非生产性或较低生产性的mRNA转录物的选择性剪接事件中的一者可为纳入含有低效翻译区的外显子,其可导致mRNA转录物的低效翻译。在一些情况下,具有低效翻译区的mRNA转录物与在其他方面相同但不具有低效区的对应mRNA转录物相比,翻译效率显著降低。
在一个方面,本公开提供了用于调节基因的选择性剪接以增加经高效翻译并编码靶肽序列的mRNA的产生,并由此增加经翻译靶肽序列的产生的组合物和方法,所述基因可具有mRNA前体,所述mRNA前体具有包含低效翻译区的外显子。所述组合物和方法包括可导致外显子跳跃并促进可高效翻译的mRNA的产生的反义寡聚体(ASO)。在各个实施例中,可使用本公开的方法来增加靶肽序列,以治疗由靶肽序列或相关蛋白质的缺乏所引起的疾患。
在一些实施方案中,本文描述了一种调节具有mRNA前体的细胞对靶肽序列的表达的方法,所述mRNA前体编码所述靶肽序列并包含低效翻译区,所述方法包括使所述细胞与结合至编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的靶向区的治疗剂接触,由此调节编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的所述低效翻译区的剪接,进而调节不具有所述低效翻译区并编码所述靶肽序列的第一经加工mRNA的水平,并且进而调节所述靶肽序列在所述细胞中的表达,其中在所述细胞中产生所述靶肽序列的所述经加工mRNA与包含所述低效翻译区的第二经加工mRNA相比具有更高翻译效率。在一些情况下,所述第二经加工mRNA除了包含所述低效翻译区以外在其他方面与所述第一经加工mRNA相同。在一些情况下,所述第一经加工mRNA和所述第二经加工mRNA两者都是同一mRNA前体的剪接产物。在一些情况下,本发明治疗剂调节所述mRNA前体的剪接,进而调节细胞中所述第一经加工mRNA与所述第二经加工mRNA之间的平衡。
在一些实施方案中,可产生非生产性或较低生产性的mRNA转录物的选择性剪接事件中的一者是纳入含有后接有替代性起始密码子的提前终止密码子(PTC)的外显子。在这些情况下,mRNA前体具有第一起始密码子、第二起始密码子(替代性起始密码子)和位于所述第一起始密码子下游并位于所述第二起始密码子上游的PTC。不希望受特定理论束缚,含有PTC和替代性起始密码子的基序或外显子可造成mRNA转录物的低生产性。在一些实施方案中,含有PTC和替代性起始密码子的基序或外显子导致下游外显子序列的低效翻译。在一些实施方案中,含有PTC和替代性起始密码子的基序或外显子引起由下游外显子序列表达的较不稳定蛋白质产物,或引起有缺陷的翻译后修饰或分子或细胞水平上的可导致缺陷蛋白质表达或功能的一些其他过程。不希望受特定理论束缚,替代性起始密码子的存在可导致缺少mRNA转录物的无义介导衰变(nonsense-mediated decay;NMD),这是由于翻译核糖体可在遇到PTC之后而非在触发NMD机制的募集之后立即在替代性起始密码子处重新起始翻译,这种情形最终可引起mRNA转录物的降解。
在一个方面,本公开提供了用于调节基因的选择性剪接以增加编码靶肽序列的成熟mRNA的产生,并由此增加经翻译靶肽序列的产生的组合物和方法,所述基因可具有mRNA前体,所述mRNA前体具有含有后接有替代性起始密码子的PTC的外显子。在一些情况下,所述组合物包括可导致外显子跳跃并促进可高效翻译的mRNA的产生的ASO。在各个实施例中,可使用本公开的方法来增加靶肽序列,以治疗由靶肽序列或相关蛋白质的缺乏所引起的疾患。
在一些实施方案中,本文描述了一种调节具有mRNA前体的细胞对靶肽序列的表达的方法,所述mRNA前体编码所述靶肽序列并包含第一起始密码子、第二起始密码子以及位于所述第一起始密码子下游并位于所述第二起始密码子上游的提前终止密码子(PTC),所述方法包括使所述细胞与结合至编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的靶向部分的治疗剂接触,由此调节所述mRNA前体的所述PTC和所述第二起始密码子的剪接,进而调节不具有所述PTC和所述第二起始密码子并编码所述靶肽序列的第一经加工mRNA的水平,并且进而调节所述细胞中所述靶肽序列的表达。
RNA剪接
介入序列或内含子由被称为剪接体的较大且高度动态的RNA-蛋白质复合物移除,所述RNA-蛋白质复合物协调初级转录物、小核RNA(snRNA)与多种蛋白质之间的复杂相互作用。剪接体按有序方式针对每个内含子专门组装,从通过U1 snRNA识别5′剪接位点(5′ss)或通过U2途径识别3′剪接位点(3′ss)开始,所述U2途径涉及将U2辅助因子(U2AF)结合至3′ss区以促进U2结合至分支点序列(branch point sequence;BPS)。U2AF是由以下构成的稳定杂二聚体:经U2AF2编码的65-kD亚基(U2AF65),其结合多嘧啶串(polypyrimidinetract;PPT);和经U2AF1编码的35-kD亚基(U2AF35),其与3′ss处高度保守的AG二核苷酸相互作用并使U2AF65结合稳定。除BPS/PPT单元和3′ss/5′ss以外,精确剪接还需要激活或抑制剪接位点识别的辅助序列或结构,其被称为内含子或外显子剪接增强子或沉默子。这些元件允许在高等真核生物的基因组中的大量多余隐蔽位点或假位点中识别出真正的剪接位点,所述隐蔽位点或假位点具有相同序列但在数目上比真实位点多出一个数量级。尽管所述隐蔽位点或假位点通常具有调节功能,但其激活或抑制的确切机制还不清楚。
是否进行剪接的决策可通常被模型化为随机过程而非确定性过程,使得甚至在最大程度上定义的剪接信号有时也可不正确地剪接。然而,在正常条件下,mRNA前体剪接可以出人意料的高保真度进行。这可部分归因于邻近的顺式作用辅助外显子和内含子剪接调节元件(ESR或ISR)的活性。通常,这些功能元件分别基于其刺激或抑制剪接的能力而分类为外显子或内含子剪接增强子(ESE或ISE)或沉默子(ESS或ISS)。尽管目前有证据表明一些辅助顺式作用元件可通过影响剪接体组装的动力学,例如通过影响U1 snRNP与5′ss之间的复合物的布置而起作用,但似乎很有可能多种元件与反式作用RNA结合蛋白(RNA-bindingprotein;RBP)共同作用。例如,富含丝氨酸和精氨酸的RBP(SR蛋白)家族是在定义外显子方面具有关键作用的保守蛋白质家族。SR蛋白通过将剪接体前体的组分募集至邻近剪接位点或通过拮抗附近ESS的作用而促进外显子识别。ESS的抑制作用可通过核内不均一核糖核蛋白(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein;hnRNP)家族的成员介导,并且可改变核心剪接因子至邻近剪接位点的募集。沉默子元件除了在剪接调节方面具有作用以外,也表明在假外显子(具有外显子的典型间距但不具有功能性开放阅读框的诱饵内含子剪接位点集合)的抑制方面具有作用。与其同源反式作用RBP协作的ESE和ESS表示剪接控制件集合中的重要组分,所述剪接控制件集合指定由mRNA的前体组装mRNA的方式、位置和时间。
标记外显子-内含子边界的序列是具有变化强度的简并信号,其可在人类基因内高频率地出现。在多外显子基因中,不同对的剪接位点可按许多不同组合连接在一起,从而从单一基因产生一系列不同的转录物。这通常被称为选择性mRNA前体剪接。尽管由选择性剪接产生的大部分mRNA同功型可从细胞核输出并翻译成功能性多肽,但来自单一基因的不同mRNA同功型的翻译效率可变化极大。在外显子连接复合物上游具有至少50bp的提前终止密码子(PTC)的那些mRNA同功型可能由无义介导的mRNA衰变(NMD)途径靶向而降解。然而,在一些实施方案中,PTC之后的替代性起始密码子可阻止NMD事件的诱导,如在MECP2 e2mRNA同功型(下文所论述)的情况下所示例。传统剪接基序(BPS/PPT/3′ss/5′ss)和辅助剪接基序的突变可导致异常剪接,例如外显子跳跃或隐蔽(或假)外显子纳入或剪接位点活化,并且显著提高人类发病率和死亡率。异常剪接模式和选择性剪接模式两者均可受外显子和内含子的天然DNA变体影响。
在一些实施方案中,所述组合物和方法利用隐蔽剪接位点来调节选择性剪接以产生所需的剪接同功型,以便调节靶肽序列的表达水平。隐蔽(或假)剪接位点可具有与真正剪接位点相同的剪接识别序列但不用于剪接反应。所述隐蔽(或假)剪接位点在数目上比人类基因组中的真正剪接位点多出一个数量级,并且通常由迄今尚不清楚的分子机制抑制。隐蔽5′剪接位点具有共有序列NNN/GUNNNN或NNN/GCNNNN,其中N是任何核苷酸,并且/是外显子-内含子边界。隐蔽3′剪接位点具有共有序列NAG/N。所述隐蔽剪接位点的活化受周围核苷酸正面影响,所述周围核苷酸使得所述隐蔽剪接位点分别更类似于真实剪接位点的最佳共有序列,即MAG/GURAGU和YAG/G,其中M是C或A,R是G或A,并且Y是C或U。
剪接位点和其调节序列可易于由本领域技术人员使用公开可用的适合算法加以鉴定,所述算法例如列于Kralovicova,J.和Vorechovsky,I.(2007)Global control ofaberrant splice site activation by auxiliary splicing sequences:evidence fora gradient in exon and intron definition.Nucleic Acids Res.,35,6399-6413(可在www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2095810/pdf/gkm680.pdf获得)中。
隐蔽剪接位点或剪接调节序列可竞争RNA结合蛋白,例如U2AF。在一些实施方案中,药剂可结合至隐蔽剪接位点或剪接调节序列以防止RNA结合蛋白的结合,并且由此促进RNA结合蛋白至所需剪接位点的结合。
MECP2 mRNA剪接
在一些实施方案中,本公开的方法利用从MECP2基因转录的mRNA前体的选择性剪接。MECP2 mRNA前体可具有4个外显子并且经选择性剪接(图1)。示例性MECP2 mRNA前体序列包括SEQ ID NO:2-27。在一些实施方案中,MECP2 mRNA前体可剪接成两种同功型,其可分别产生MeCP2α或e1蛋白质同功型和MeCP2β或e2同功型。外显子2的跳跃可产生主要MeCP2α或e1同功型,而外显子2的纳入可产生MeCP2β或e2同功型。MeCP2-e1和MeCP2-e2同功型可分别具有21aa和9aa的独特N末端序列。这些同功型的相对表达水平可在组织之间变化,其中MeCP2-e1在成人大脑中更占主导地位。MeCP2-e2在胎盘、肝脏和骨胳肌肉中更大量地表达。此外,在一些情况下,MeCP2-e2由于外显子2遭到破坏而引起的缺失并未在小鼠中产生RTT相关表型。外显子2是框架外外显子。其具有PTC以及替代性起始密码子两者。从下游起始密码子的翻译可能极低效。突变诱发研究已表明,全长(e2)转录物中两个起始密码子的存在极大地降低下游开放阅读框的翻译效率。当外显子1中的上游ATG被消除时,MeCP2-e2的翻译可显著增加。在一些实施方案中,从全长(e2)MECP2转录物跳跃(剪接掉)外显子2可减少非生产性转录物池,从而使MeCP2-e1蛋白质的翻译增加。在成人大脑中,大约50%转录物可含有外显子2,如通过RNA-seq(Lister PMID 23828890)所测定。在一些情况下,含有外显子2的同功型可为成人大脑中非必需的,因此,由治疗剂(例如ASO)诱导的外显子2跳跃可为用于增加患有MeCP2蛋白质缺乏的患者(例如,雷特综合征患者)的MeCP2表达的可行治疗策略。
在一些实施方案中,治疗剂靶向低效翻译区(例如,MECP2 mRNA前体的外显子2区)的5′端上游(或5′)约4至约300个核苷酸的序列。在一些实施方案中,治疗剂靶向低效翻译区的5′端上游(或5′)约1至约20个核苷酸、约20至约50个核苷酸、约50至约100个核苷酸、约100至约150个核苷酸、约150至约200个核苷酸、约200至约250个核苷酸或约250至约300个核苷酸的序列。在一些实施方案中,治疗剂可靶向低效翻译区的5′端上游超过300个核苷酸的序列。在一些实施方案中,治疗剂靶向低效翻译区的3′端下游(或3′)约4至约300个核苷酸的序列。在一些实施方案中,治疗剂靶向低效翻译区的3′端下游约1至约20个核苷酸、约20至约50个核苷酸、约50至约100个核苷酸、约100至约150个核苷酸、约150至约200个核苷酸、约200至约250个核苷酸或约250至约300个核苷酸的序列。在一些实施方案中,治疗剂靶向低效翻译区的3′端下游超过300个核苷酸的序列。
在一些实施方案中,治疗剂靶向含有PTC和第二起始密码子(替代性起始密码子)的外显子(例如,MECP2 mRNA前体的外显子2区)的5′端上游(或5′)约4至约300个核苷酸的序列。在一些实施方案中,治疗剂靶向含有PTC和替代性起始密码子的外显子的5′端上游(或5′)约1至约20个核苷酸、约20至约50个核苷酸、约50至约100个核苷酸、约100至约150个核苷酸、约150至约200个核苷酸、约200至约250个核苷酸或约250至约300个核苷酸的序列。在一些实施方案中,治疗剂可靶向含有PTC和替代性起始密码子的外显子的5′端上游超过300个核苷酸的序列。在一些实施方案中,治疗剂靶向含有PTC和替代性起始密码子的外显子的3′端下游(或3′)约4至约300个核苷酸的序列。在一些实施方案中,治疗剂靶向含有PTC和替代性起始密码子的外显子的3′端下游约1至约20个核苷酸、约20至约50个核苷酸、约50至约100个核苷酸、约100至约150个核苷酸、约150至约200个核苷酸、约200至约250个核苷酸或约250至约300个核苷酸的序列。在一些实施方案中,治疗剂靶向含有PTC和替代性起始密码子的外显子的3′端下游超过300个核苷酸的序列。
在一些实施方案中,本文所提供的方法或组合物可靶向的mRNA前体转录物由与SEQ ID NO:1具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的基因序列编码。在一些实施方案中,本文所提供的方法或组合物可靶向的mRNA前体转录物包含与SEQ ID NO:2-27中的任一者具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列。
在一些实施方案中,治疗剂靶向MECP2 mRNA前体的内含子1、外显子2或内含子2。在一些实施方案中,治疗剂靶向与选自由SEQ ID NO:28-31组成的组的任一者具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的外显子序列。在一些实施方案中,治疗剂靶向MECP2 mRNA前体的外显子2。在一些实施方案中,治疗剂靶向与SEQID NO:28具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的外显子序列。
在一些实施方案中,治疗剂靶向MECP2 mRNA前体的外显子2的5′端上游(或5′)约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸的序列。在一些实施方案中,治疗剂靶向MECP2mRNA前体的外显子2的5′端上游(或5′)至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸的序列。
在一些实施方案中,治疗剂靶向MECP2 mRNA前体的外显子2的3′端下游(或3′)约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸的序列。在一些实施方案中,治疗剂靶向MECP2mRNA前体的外显子2的3′端下游(或3′)至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸的序列。
在一些实施方案中,治疗剂是ASO,并且所述ASO具有与根据SEQ ID NO:2-27的mRNA前体的靶向部分互补的序列。在一些实施方案中,ASO具有与同选自由SEQ ID NO:28-31组成的组的任一者具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的序列。在一些实施方案中,ASO具有与同选自由SEQ ID NO:28-31组成的组的任一者具有100%序列同一性的序列互补的序列。在一些实施方案中,ASO具有与同SEQ ID NO:28具有100%序列同一性的序列互补的序列。
在一些实施方案中,ASO靶向含有外显子-内含子边界(或连接区)的序列。
在一些实施方案中,本公开的方法和组合物用于通过诱导MECP2 mRNA前体的外显子2的外显子跳跃来增加MeCP2的表达。
在一些情况下,靶肽序列是MECP2蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8204的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:440的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:238上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:238上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 154092307上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 154092307上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:238下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:238下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 154092184下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 154092184下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:238内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chrX 154092307与GRCh38/hg38:chrX 154092184之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:238具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:238具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8205的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:441的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:239上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:239上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 154092307上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX154092307上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:239下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:239下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX154092184下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 154092184下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:239内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chrX 154092307与GRCh38/hg38:chrX 154092184之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:239具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:239具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:4548-4611组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:4548-4611组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是MECP2蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;保留语言功能型雷特综合征;Lubs X连锁智力迟钝综合征;由MeCP2突变引起的新生儿重度脑病;伴有精神病、锥体束征和大睾丸的智力迟钝;伴有痉挛的X连锁智力迟钝;Xq28染色体三体症;X连锁智力迟钝16型;癫痫性脑病;X连锁综合型智力迟钝13型;X连锁智力迟钝1型;非典型雷特综合征;X连锁智力迟钝79型;小头畸形;Ppm-X综合征;Zappella型雷特综合征;雷特综合征;或X连锁自闭症易感3型。
蛋白质表达
在一些实施方案中,本文所描述的方法用于增加例如具有靶肽序列的功能性蛋白质(例如MeCP2蛋白质)的产生。如本文所使用,术语“功能性”是指消除所治疗疾患或疾病(例如雷特综合征)的任何一个或多个症状所需的蛋白质的活性或功能的量。在一些实施方案中,所述方法用于增加部分功能性MeCP2蛋白质的产生。如本文所使用,术语“部分功能性”是指比消除或预防疾病或疾患(例如雷特综合征)的任何一个或多个症状所需的活性或功能的量更少的蛋白质的活性或功能的任何量。在一些实施方案中,部分功能性蛋白质的活性将比完全功能性蛋白质小至少10%、至少20%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%或至少95%。
在一些实施方案中,所述方法是一种增加受试者的细胞对靶肽序列的表达的方法,所述细胞具有编码所述靶肽序列的mRNA前体,其中所述受试者患有由至少在功能上等效于所述靶肽序列的功能性靶蛋白的活性量不足所引起的疾病或疾患。在这种实施方案中,所述受试者具有编码未产生的功能性靶蛋白的第一对偶基因。在另一个这种实施方案中,所述受试者具有编码功能性靶蛋白的第一对偶基因和编码非功能性靶蛋白的第二对偶基因。在另一个这种实施方案中,所述受试者具有编码功能性靶蛋白的第一对偶基因和编码部分功能性靶蛋白的第二对偶基因。在这些实施方案中的一些中,反义寡聚体结合至从第二对偶基因转录的mRNA前体的靶向部分,所述mRNA前体编码靶肽序列并包含含有低效翻译区的外显子,由此诱导所述mRNA前体的所述低效翻译区的跳跃,并且从而使得编码所述靶肽序列的成熟mRNA的水平增加,并且使得所述受试者的所述细胞中所述靶肽序列的表达增加。在这些实施方案中的一些中,反义寡聚体结合至从第二对偶基因转录的mRNA前体的靶向部分,所述mRNA前体编码靶肽序列并包含含有后接有替代性起始密码子的PTC的外显子,由此诱导所述mRNA前体的所述PTC和所述起始密码子的跳跃,并从而使得编码所述靶肽序列的成熟mRNA的水平增加,并且使得所述受试者的所述细胞中所述靶肽序列的表达增加。
在一些实施方案中,如本文所描述的靶肽序列可为完全功能性蛋白质。在一些实施方案中,靶肽序列是全长蛋白质的一部分,例如全长蛋白质的N末端部分或全长蛋白质的C末端部分。在MeCP2的情况下,靶肽序列可为MeCP2的C末端部分。在一些实施方案中,靶肽序列翻译自选自由SEQ ID NO:32-34组成的组的序列。在一些实施方案中,靶肽序列翻译自具有SEQ ID NO:32或SEQ ID NO:33和SEQ ID NO:34的序列。在一些实施方案中,靶肽序列由低效翻译区或替代性起始密码子下游的mRNA前体的一部分编码。在一些实施方案中,靶肽序列由低效翻译区或替代性起始密码子上游的mRNA前体的一部分编码。靶肽序列可包含至少约10个氨基酸(aa)、20aa、30aa、40aa、50aa、60aa、70aa、80aa、90aa、100aa、120aa、150aa、200aa、300aa、400aa、500aa、600aa、700aa、800aa、100aa、1500aa或2000aa。靶肽序列可包含约10个氨基酸(aa)、20aa、30aa、40aa、50aa、60aa、70aa、80aa、90aa、100aa、120aa、150aa、200aa、300aa、400aa、500aa、600aa、700aa、800aa、100aa、1500aa或2000aa。
在一些实施方案中,所述方法是一种增加受试者的细胞对具有靶肽序列的功能性靶蛋白(例如由MECP2基因的外显子1、3和4编码的MeCP2-e1同功型)的表达的方法,所述细胞具有编码所述靶肽序列的mRNA前体,其中所述受试者患有由MeCP2蛋白质的活性量不足所引起的疾病或疾患。在这种实施方案中,所述受试者具有编码部分功能性MeCP2的对偶基因,例如次型态对偶基因。在此类实施方案中,所述受试者具有编码功能性MeCP2蛋白质的第一对偶基因和编码部分功能性MeCP2蛋白质的第二对偶基因。在这些实施方案中的一些中,反义寡聚体结合至从第二对偶基因转录的mRNA前体的靶向部分,所述mRNA前体编码MeCP2并包含MECP2的外显子2,由此诱导所述mRNA前体的MECP2外显子2的至少部分的跳跃,并且从而使得编码MeCP2-e1同功型的成熟mRNA的水平增加,并且使得所述受试者的所述细胞中MeCP2-e1同功型的表达增加。不希望受特定理论束缚,归因于X染色体失活,在具有包含WT对偶基因和编码部分功能性MeCP2的突变型对偶基因(例如次型态对偶基因)的细胞的受试者中,可存在具有表达WT对偶基因而非突变型对偶基因的突变型对偶基因的约50%细胞以及具有表达突变型对偶基因而非WT对偶基因的突变型对偶基因的另外约50%细胞。在一些情况下,本文所提供的方法和组合物可增加来自细胞中的所述突变型次型态对偶基因的具有靶肽序列的功能性靶蛋白(例如由MECP2基因的外显子1、3和4编码的MeCP2-e1同功型)的表达,所述细胞具有来自所述次型态对偶基因的mRNA前体转录物。在一些情况下,本文所提供的方法和组合物可增加受试者中具有次等位因素突变型对偶基因的约50%细胞中MeCP2-e1同功型的表达。在一些情况下,所述方法和组合物恢复受试者中具有次等位因素突变型对偶基因的约50%细胞中MeCP2的功能性,例如相当于具有正常量的WT MeCP2蛋白质的功能性水平。
在一些实施方案中,所述方法是一种增加受试者的细胞对靶蛋白的表达的方法,所述细胞具有编码所述靶蛋白并包含含有低效翻译区或后接有替代性起始密码子的PTC的外显子的mRNA前体,其中所述受试者患有由常染色体隐性遗传导致的靶蛋白量或活性不足所引起的疾病或疾患。在一些实施方案中,所述方法是一种增加受试者的细胞对靶蛋白的表达的方法,所述细胞具有编码所述靶蛋白并包含含有低效翻译区或后接有替代性起始密码子的PTC的外显子的mRNA前体,其中所述受试者患有由常染色体显性遗传导致的靶蛋白量或活性不足所引起的疾病或疾患。在一些实施方案中,所述疾病或疾患由编码靶蛋白的靶基因的单倍剂量不足引起或与之相关联。在一些实施方案中,所述方法是一种增加受试者的细胞对靶蛋白的表达的方法,所述细胞具有编码所述靶蛋白并包含含有低效翻译区或后接有替代性起始密码子的PTC的外显子的mRNA前体,其中所述受试者患有由X连锁显性突变导致的靶蛋白量或活性不足所引起的疾病或疾患。例如,所述方法可为一种增加受试者的细胞(例如脑细胞,例如神经元或胶质细胞)对MeCP2-e1同功型的表达的方法,所述细胞具有编码MeCP2并包含外显子2的mRNA前体,其中所述受试者患有由X连锁显性突变导致的MeCP2量或活性不足所引起的雷特综合征。
在一些实施方案中,本文所描述的ASO靶向编码导致所述疾病或疾患的蛋白质的mRNA前体转录物。在一些实施方案中,ASO靶向编码不导致所述疾病的蛋白质的mRNA前体转录物。例如,由特定途径中第一蛋白质的突变或缺乏所引起的疾病可通过靶向编码第二蛋白质(例如含有靶肽序列)的mRNA前体,由此增加所述第二蛋白质的产生而改善。在一些实施方案中,第二蛋白质的功能能够补偿第一蛋白质的突变或缺乏(所述突变或缺乏导致所述疾病或疾患)。
在一些实施方案中,所述方法和组合物适用于治疗具有以下的受试者:
(a)第一突变型对偶基因,从所述第一突变型对偶基因
(i)靶蛋白以相比于来自野生型对偶基因的产量降低的水平产生,
(ii)靶蛋白以相比于等量野生型蛋白质功能减弱的形式产生,或
(iii)未产生靶蛋白;以及
(b)第二突变型对偶基因,从所述第二突变型对偶基因
(i)靶蛋白以相比于来自野生型对偶基因的产量降低的水平产生,
(ii)靶蛋白以相比于等量野生型蛋白质功能减弱的形式产生,或
(iii)未产生靶蛋白。
在一些实施方案中,与本文提供的治疗剂接触的细胞中编码包含靶肽序列的第一蛋白质的第一经加工mRNA的水平相比于在其他方面相同但未与治疗剂接触的对照细胞中所述第一经加工mRNA的水平有所增加。在一些实施方案中,与本文提供的治疗剂接触的细胞中编码包含靶肽序列的第一蛋白质的第一经加工mRNA的水平与对照细胞中第一经加工mRNA的水平相比增加约1.1至约10倍、约1.5至约10倍、约2至约10倍、约3至约10倍、约4至约10倍、约1.1至约5倍、约1.1至约6倍、约1.1至约7倍、约1.1至约8倍、约1.1至约9倍、约2至约5倍、约2至约6倍、约2至约7倍、约2至约8倍、约2至约9倍、约3至约6倍、约3至约7倍、约3至约8倍、约3至约9倍、约4至约7倍、约4至约8倍、约4至约9倍、至少约1.1倍、至少约1.5倍、至少约2倍、至少约2.5倍、至少约3倍、至少约3.5倍、至少约4倍、至少约5倍或至少约10倍。在一些实施方案中,与本文提供的治疗剂接触的细胞中包含低效翻译区并编码包含靶肽序列的第二蛋白质的第二经加工mRNA的水平相比于在其他方面相同但未与治疗剂接触的对照细胞中所述第二经加工mRNA的水平有所减少。在一些实施方案中,与本文提供的治疗剂接触的细胞中包含低效翻译区并编码包含靶肽序列的第二蛋白质的第二经加工mRNA的水平与对照细胞中第二经加工mRNA的水平相比减少约1.1至约10倍、约1.5至约10倍、约2至约10倍、约3至约10倍、约4至约10倍、约1.1至约5倍、约1.1至约6倍、约1.1至约7倍、约1.1至约8倍、约1.1至约9倍、约2至约5倍、约2至约6倍、约2至约7倍、约2至约8倍、约2至约9倍、约3至约6倍、约3至约7倍、约3至约8倍、约3至约9倍、约4至约7倍、约4至约8倍、约4至约9倍、至少约1.1倍、至少约1.5倍、至少约2倍、至少约2.5倍、至少约3倍、至少约3.5倍、至少约4倍、至少约5倍或至少约10倍。
在一些实施方案中,本文提供的治疗剂增加细胞中靶肽序列的表达。在一些实施方案中,与治疗剂接触的细胞中靶肽序列的水平相比于在其他方面相同但未与治疗剂接触的对照细胞中靶肽序列的水平有所增加。在一些实施方案中,与治疗剂接触的细胞中靶肽序列的水平与对照细胞中靶肽序列的水平相比增加约1.1至约10倍、约1.5至约10倍、约2至约10倍、约3至约10倍、约4至约10倍、约1.1至约5倍、约1.1至约6倍、约1.1至约7倍、约1.1至约8倍、约1.1至约9倍、约2至约5倍、约2至约6倍、约2至约7倍、约2至约8倍、约2至约9倍、约3至约6倍、约3至约7倍、约3至约8倍、约3至约9倍、约4至约7倍、约4至约8倍、约4至约9倍、至少约1.1倍、至少约1.5倍、至少约2倍、至少约2.5倍、至少约3倍、至少约3.5倍、至少约4倍、至少约5倍或至少约10倍。
低效翻译区
如本文所描述,低效翻译区可指mRNA转录物中导致由mRNA转录物编码的靶肽序列的低效翻译的任何区,其方式为产生所述靶肽序列的不具有低效翻译区的对应mRNA转录物相比于具有低效翻译区的mRNA转录物将具有更高翻译效率。低效翻译区可在翻译起始阶段、延伸阶段、终止阶段或其任何组合处降低mRNA转录物对靶肽序列的翻译效率。在一些实施方案中,具有低效翻译区的mRNA转录物的翻译效率比不具有低效翻译区的对应mRNA转录物低约10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或100%。在一些实施方案中,具有低效翻译区的mRNA转录物的翻译效率比不具有低效翻译区的对应mRNA转录物低约1.2、1.5、1.8、2、2.5、3、3.5、4、4.5、5、5.5、6、6.5、7、7.5、8、9、10、11、12、15、18、20、22、25、28、30、35、40、50、60、70、80、90、100、120、150、200、300、400、500、600、700、800、900、1000、2000、5000、104、105或甚至更多倍。在一些实施方案中,具有低效翻译区的mRNA转录物的翻译效率比不具有低效翻译区的对应mRNA转录物低至少约10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或100%。在一些实施方案中,具有低效翻译区的mRNA转录物的翻译效率比不具有低效翻译区的对应mRNA转录物低至少约1.2、1.5、1.8、2、2.5、3、3.5、4、4.5、5、5.5、6、6.5、7、7.5、8、9、10、11、12、15、18、20、22、25、28、30、35、40、50、60、70、80、90、100、120、150、200、300、400、500、600、700、800、900、1000、2000、5000、104或105倍。
在一些实施方案中,低效翻译区包含后接有替代性起始密码子的PTC。不希望受特定理论束缚,含有PTC和替代性起始密码子的基序或外显子可导致下游序列的低效翻译,这是由于虽然PTC诱导mRNA中的上游开放阅读框的翻译提前终止,但替代性起始密码子与PTC的紧密接近可阻止无义介导衰变的诱导,确切而言重新起始下游开放阅读框的翻译。就此而言,下游开放阅读框的翻译起始的效率与从典型起始密码子(例如,下游开放阅读框上游的起始密码子)开始的典型开放阅读框相比可相对低得多。如在MECP2 mRNA加工的情况下所示例,去除含有PTC和替代性起始密码子的外显子2可使得MeCP2-e1同功型的产生增加,然而,相对成熟mRNA水平可保持稳定,这表明不具有含有PTC和替代性起始密码子的外显子2的MECP2 e1 mRNA同功型与具有外显子2的MECP2 e2 mRNA同功型相比翻译效率更高。在一些实施方案中,低效翻译区中PTC与下游起始密码子之间的距离较短,例如至多75个核苷酸(nt)、70nt、60nt、55nt、50nt、45nt、40nt、35nt、30nt、27nt、24nt、21nt、18nt、15nt、12nt、10nt、9nt、6nt、3nt或2nt。在一些实施方案中,低效翻译区中PTC与下游起始密码子之间的距离为约3nt、6nt、9nt、10nt、12nt、15nt、18nt、21nt、24nt、27nt、30nt、35nt、40nt、45nt、50nt、55nt、60nt、70nt或75nt。在一些情况下,低效翻译区中PTC与下游起始密码子之间的距离为至少2nt、3nt、6nt、9nt、10nt、12nt、15nt、18nt、21nt、24nt、27nt、30nt、35nt、40nt、45nt、50nt或55nt。在一些情况下,低效翻译区中PTC与下游起始密码子之间的距离为2nt至75nt、5nt至70nt、10nt至65nt、15nt至60nt、20nt至55nt、25nt至50nt、30nt至45nt、40nt至50nt、45nt至55nt、50nt至60nt、55nt至70nt、或60nt至75nt。
在一些实施方案中,低效翻译区包含编码富含脯氨酸的肽序列的区域。不希望受特定理论束缚,编码富含脯氨酸的肽序列的mRNA序列可导致含有所述mRNA序列的mRNA转录物的低效翻译,例如低效翻译延伸。在一些实施方案中,低效翻译区编码具有至少约5、8、10、12、15、16、18、20、22、24、26、28、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、95或100个脯氨酸的肽序列。在一些实施方案中,低效翻译区编码具有由至少约5、8、10、12、15、16、18、20、22、24、26、28、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、95或100个脯氨酸组成的连续肽序列的肽序列。在一些实施方案中,低效翻译区编码具有至少约5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或100%脯氨酸的肽序列。
低效翻译区可具有任何长度。在一些实施方案中,低效翻译区可为5个核苷酸至10个核苷酸长、10个核苷酸至15个核苷酸长、15个核苷酸至20个核苷酸长、20个核苷酸至25个核苷酸长、25个核苷酸至30个核苷酸长、30个核苷酸至35个核苷酸长、35个核苷酸至40个核苷酸长、40个核苷酸至45个核苷酸长、45个核苷酸至50个核苷酸长、50个核苷酸至55个核苷酸长、55个核苷酸至60个核苷酸长、60个核苷酸至65个核苷酸长、65个核苷酸至70个核苷酸长、70个核苷酸至75个核苷酸长、75个核苷酸至80个核苷酸长、80个核苷酸至85个核苷酸长、85个核苷酸至90个核苷酸长、90个核苷酸至95个核苷酸长或95个核苷酸至100个核苷酸长。在一些实施方案中,低效翻译区可为至少10个核苷酸、至少20个核苷酸、至少30个核苷酸、至少40个核苷酸、至少50个核苷酸、至少60个核苷酸、至少70个核苷酸、至少80个核苷酸长、至少90个核苷酸或至少100个核苷酸长。在一些实施方案中,低效翻译区可为100至200个核苷酸长、200至300个核苷酸长、300至400个核苷酸长、400至500个核苷酸长、500至600个核苷酸长、600至700个核苷酸长、700至800个核苷酸长、800至900个核苷酸长、900至1,000个核苷酸长。在一些实施方案中,低效翻译区的长度可比1,000个核苷酸更长。
各种靶标的翻译的调节
在各方面,所述方法、组合物和试剂盒适用于调节例如靶肽序列的各种靶标的翻译,所述靶肽序列的翻译通过编码所述靶肽序列的经加工mRNA转录物中所存在的低效翻译区调节。在一些情况下,低效翻译区包含包括后接有替代性起始密码子的PTC的外显子的至少一部分。下方表1列出可加工成具有包含后接有替代性起始密码子的PTC的外显子的mRNA转录物的示例性靶基因和其对应的mRNA前体转录物。外显子的序列(和SEQ ID NO)和其对应的基因组坐标列于所述表中。在一些情况下,本发明方法、组合物和试剂盒适用于调节由表1中所列的靶基因编码的靶肽序列的翻译。
表1.示例性基因和含有PTC和替代性起始密码子的外显子
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ACIN1
在一些情况下,靶肽序列是ACIN1(凋亡染色质凝聚诱导因子1)蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8096的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:332的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:130上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:130上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 23071186上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 23071186上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:130下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:130下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 23071125下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 23071125下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:130内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr14 23071186与GRCh38/hg38:chr14 23071125之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:130具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:130具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:534-584组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:534-584组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是ACIN1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;或结肠直肠癌。
ACTN1
在一些情况下,靶肽序列是ACTN1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8097的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:333的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:131上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:131上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 68925672上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 68925672上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:131下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:131下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 68925558下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 68925558下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:131内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr14 68925672与GRCh38/hg38:chr14 68925558之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:131具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:131具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:585-646组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:585-646组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是ACTN1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:血小板型出血障碍15型;或常染色体显性巨血小板减少症。
ACTN2
在一些情况下,靶肽序列是ACTN2蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8098的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:334的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:132上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:132上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 236735635上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 236735635上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:132下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:132下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 236735720下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 236735720下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:132内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr1 236735635与GRCh38/hg38:chr1 236735720之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:132具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:132具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:647-702组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:647-702组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是ACTN2蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:肥厚性心肌病;扩张性心肌病1AA型;伴有或不伴有心室致密化不全的家族肥大性心肌病23型;家族扩张性心肌病;恰克-马里-杜斯氏病;心脏传导障碍;或扩张性心肌病。
ADH4
在一些情况下,靶肽序列是ADH4蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8099的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:335的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:133上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:133上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 99143305上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 99143305上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:133下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:133下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 99143166下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 99143166下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:133内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr499143305与GRCh38/hg38:chr4 99143166之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:133具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:133具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8100的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:336的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:134上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:134上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 99143305上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 99143305上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:134下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:134下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 99143166下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 99143166下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:134内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr4 99143305与GRCh38/hg38:chr4 99143166之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:134具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:134具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:703-769组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:703-769组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是ADH4蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:酒精使用障碍;酒精滥用;或慢性酒精中毒。
AGER
在一些情况下,靶肽序列是AGER蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8101的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:337的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:135上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:135上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr6 32182698上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr6 32182698上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:135下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:135下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr6 32182568下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr6 32182568下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:135内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr632182698与GRCh38/hg38:chr6 32182568之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:135具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:135具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:8031-8095组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:8031-8095组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是AGER蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:精神分裂症。
AKR1C3
在一些情况下,靶肽序列是AKR1C3蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8102的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:338的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:136上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:136上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 5077900上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 5077900上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:136下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:136下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 5077977下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 5077977下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:136内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr105077900与GRCh38/hg38:chr10 5077977之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:136具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:136具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:770-824组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:770-824组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是AKR1C3蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:躁郁症;或慢性酒精中毒。
ALDH1A2
在一些情况下,靶肽序列是ALDH1A2蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8103的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:339的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:137上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:137上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 58058108上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 58058108上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:137下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:137下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 58058012下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 58058012下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:137内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr15 58058108与GRCh38/hg38:chr15 58058012之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:137具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:137具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:825-882组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:825-882组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是ALDH1A2蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:精神分裂症。
ALG8
在一些情况下,靶肽序列是ALG8蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8104的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:340的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:138上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:138上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 78138767上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 78138767上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:138下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:138下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 78138710下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 78138710下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:138内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 78138767与GRCh38/hg38:chr11 78138710之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:138具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:138具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:883-933组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:883-933组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是ALG8蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;先天性糖基化障碍;癫痫性脑病;抑郁症;或先天性糖基化障碍1H型。
AMPD2
在一些情况下,靶肽序列是AMPD2蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8105的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:341的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:139上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:139上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 109620914上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 109620914上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:139下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:139下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 109621266下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 109621266下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:139内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr1 109620914与GRCh38/hg38:chr1 109621266之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:139具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:139具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:934-1043组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:934-1043组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是AMPD2蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;脑桥小脑发育不全9型;癫痫性脑病;遗传性共济失调;常染色体隐性痉挛性截瘫63型;小脑发育不全;或遗传性痉挛性截瘫。
AMT
在一些情况下,靶肽序列是AMT蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8106的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:342的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:140上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:140上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 49422257上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 49422257上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:140下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:140下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 49422104下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 49422104下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:140内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr349422257与GRCh38/hg38:chr3 49422104之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:140具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:140具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8107的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:343的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:141上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:141上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 49422257上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 49422257上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:141下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:141下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 49422104下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 49422104下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:141内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr3 49422257与GRCh38/hg38:chr3 49422104之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:141具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:141具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8108的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:344的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:142上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:142上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 49422257上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 49422257上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:142下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:142下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 49422104下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 49422104下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:142内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr3 49422257与GRCh38/hg38:chr3 49422104之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:142具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:142具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:1044-1113组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:1044-1113组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是AMT蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:非酮症性高甘氨酸血症;暂时性新生儿高甘氨酸血症;或甘氨酸脑病。
ANKRD11
在一些情况下,靶肽序列是ANKRD11蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8109的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:345的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:143上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:143上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:143下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:143下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:143内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078与GRCh38/hg38:chr16 89316933之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:143具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:143具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8110的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:346的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:144上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:144上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1689317078上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:144下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:144下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1689316933下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:144内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078与GRCh38/hg38:chr16 89316933之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:144具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:144具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8111的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:347的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:145上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:145上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:145下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:145下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:145内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078与GRCh38/hg38:chr1689316933之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:145具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:145具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8112的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:348的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:146上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:146上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317075上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317075上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:146下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:146下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:146内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317075与GRCh38/hg38:chr16 89316933之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:146具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:146具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8113的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:349的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:147上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:147上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:147下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:147下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:147内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078与GRCh38/hg38:chr16 89316933之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:147具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:147具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8114的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:350的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:148上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:148上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1689317078上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:148下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:148下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1689316933下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:148内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078与GRCh38/hg38:chr16 89316933之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:148具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:148具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8115的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:351的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:149上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:149上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317075上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317075上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:149下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:149下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:149内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317075与GRCh38/hg38:chr1689316933之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:149具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:149具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8116的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:352的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:150上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:150上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:150下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:150下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:150内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078与GRCh38/hg38:chr16 89316933之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:150具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:150具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8117的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:353的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:151上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:151上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:151下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:151下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:151内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078与GRCh38/hg38:chr16 89316933之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:151具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:151具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8118的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:354的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:152上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:152上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317075上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1689317075上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:152下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:152下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1689316933下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:152内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317075与GRCh38/hg38:chr16 89316933之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:152具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:152具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8119的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:355的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:153上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:153上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:153下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:153下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:153内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078与GRCh38/hg38:chr1689316933之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:153具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:153具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8120的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:356的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:154上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:154上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317075上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317075上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:154下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:154下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:154内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317075与GRCh38/hg38:chr16 89316933之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:154具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:154具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8121的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:357的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:155上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:155上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:155下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:155下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:155内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078与GRCh38/hg38:chr16 89316933之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:155具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:155具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8122的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:358的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:156上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:156上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1689317078上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:156下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:156下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1689316933下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89316933下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:156内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 89317078与GRCh38/hg38:chr16 89316933之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:156具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:156具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:1114-1181组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:1114-1181组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是ANKRD11蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;KBG综合征;或16q24.3微缺失综合征。
ANKS3
在一些情况下,靶肽序列是ANKS3蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8123的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:359的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:157上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:157上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 4726780上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 4726780上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:157下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:157下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 4726659下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 4726659下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:157内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr164726780与GRCh38/hg38:chr16 4726659之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:157具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:157具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:1182-1244组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:1182-1244组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是ANKS3蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:内脏逆位。
APOL4
在一些情况下,靶肽序列是APOL4蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8124的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:360的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:158上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:158上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr22 36201796上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr22 36201796上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:158下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:158下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr22 36201700下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr22 36201700下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:158内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr22 36201796与GRCh38/hg38:chr22 36201700之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:158具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:158具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:1245-1302组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:1245-1302组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是APOL4蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:精神分裂症。
APPL1
在一些情况下,靶肽序列是APPL1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8125的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:361的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:159上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:159上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 57230714上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 57230714上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:159下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:159下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 57230767下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 57230767下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:159内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr357230714与GRCh38/hg38:chr3 57230767之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:159具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:159具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:1303-1352组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:1303-1352组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是APPL1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:乳房恶性赘瘤;青年人中的成年发病型糖尿病;或青年人中的成年发病型糖尿病14型。
ARCN1
在一些情况下,靶肽序列是ARCN1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8126的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:362的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:160上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:160上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 118573620上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 118573620上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:160下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:160下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 118573783下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 118573783下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:160内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 118573620与GRCh38/hg38:chr11 118573783之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:160具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:160具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ IDNO:1353-1424组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:1353-1424组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是ARCN1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;或小头畸形。
ARMC8
在一些情况下,靶肽序列是ARMC8蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8127的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:363的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:161上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:161上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 138188455上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 138188455上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:161下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:161下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 138188530下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 138188530下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:161内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr3 138188455与GRCh38/hg38:chr3 138188530之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:161具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:161具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8128的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:364的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:162上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:162上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 138188455上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3138188455上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:162下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:162下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3138188530下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 138188530下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:162内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr3 138188455与GRCh38/hg38:chr3 138188530之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:162具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:162具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:1425-1478组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:1425-1478组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是ARMC8蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:多指(趾)症;或纤毛病。
ARNTL
在一些情况下,靶肽序列是ARNTL蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8129的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:365的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:163上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:163上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 13355226上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 13355226上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:163下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:163下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 13355296下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 13355296下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:163内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 13355226与GRCh38/hg38:chr11 13355296之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:163具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:163具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8130的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:366的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:164上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:164上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 13355226上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1113355226上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:164下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:164下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1113355296下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 13355296下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:164内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 13355226与GRCh38/hg38:chr11 13355296之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:164具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:164具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:1479-1531组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:1479-1531组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是ARNTL蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:精神抑郁症;季节性情感障碍;躁郁症;情绪障碍;或抑郁症。在一些情况下,所述方法治疗与ARNTL蛋白质相关的癌症。
BOC
在一些情况下,靶肽序列是BOC蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8131的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:367的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:165上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:165上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 113249722上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 113249722上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:165下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:165下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 113249899下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 113249899下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:165内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr3 113249722与GRCh38/hg38:chr3 113249899之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:165具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:165具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8132的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:368的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:166上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:166上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 113249722上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3113249722上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:166下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:166下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3113249899下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 113249899下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:166内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr3 113249722与GRCh38/hg38:chr3 113249899之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:166具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:166具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8133的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:369的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:167上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:167上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 113249722上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 113249722上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:167下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:167下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 113249899下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 113249899下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:167内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr3 113249722与GRCh38/hg38:chr3113249899之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:167具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:167具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8134的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:370的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:168上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:168上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 113249722上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 113249722上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:168下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:168下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 113249899下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 113249899下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:168内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr3 113249722与GRCh38/hg38:chr3 113249899之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:168具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:168具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:1532-1606组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:1532-1606组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是BOC蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:乳房恶性赘瘤。
BRCA1
在一些情况下,靶肽序列是BRCA1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8135的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:371的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:169上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:169上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 43106533上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 43106533上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:169下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:169下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 43106456下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 43106456下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:169内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr17 43106533与GRCh38/hg38:chr17 43106456之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:169具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:169具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8136的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:372的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:170上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:170上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 43106533上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1743106533上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:170下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:170下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1743106456下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 43106456下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:170内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr17 43106533与GRCh38/hg38:chr17 43106456之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:170具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:170具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:1607-1661组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:1607-1661组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是BRCA1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:细胞减少症;胃肠道赘瘤;抑郁症;家族性前列腺癌;原发性腹膜癌;家族性易感性卵巢癌1型;家族性男性乳腺癌;恶性赘瘤;胰腺赘瘤;家族性乳腺癌;具有不明确或未知的乳房行为的赘瘤;卵巢癌;前列腺腺癌;具有不明确或未知的卵巢行为的赘瘤;胰腺恶性赘瘤;胰腺癌;卵巢恶性赘瘤;先天性贫血;血液系统赘瘤;乳腺腺癌;家族性易感性乳房-卵巢癌1型;家族性胰腺癌;胰腺良性肿瘤;乳腺癌;卵巢赘瘤;遗传性乳房和卵巢癌综合征;精神抑郁症;上皮卵巢癌;乳房恶性赘瘤;偶发性乳腺癌;精神分裂症;家族性乳房-卵巢癌1型;或易感性胰腺癌4型。
C8B
在一些情况下,靶肽序列是C8B蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8137的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:373的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:171上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:171上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 56959657上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 56959657上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:171下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:171下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 56959529下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 56959529下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:171内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr156959657与GRCh38/hg38:chr1 56959529之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:171具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:171具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8138的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:374的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:172上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:172上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 56959657上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 56959657上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:172下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:172下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 56959529下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 56959529下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:172内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr1 56959657与GRCh38/hg38:chr1 56959529之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:172具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:172具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:1662-1726组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:1662-1726组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是C8B蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:C8缺乏症II型。
CALM1
在一些情况下,靶肽序列是CALM1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8139的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:375的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:173上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:173上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 90398991上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 90398991上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:173下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:173下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 90399087下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 90399087下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:173内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr14 90398991与GRCh38/hg38:chr14 90399087之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:173具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:173具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:1727-1784组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:1727-1784组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是CALM1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:儿茶酚胺敏感性多形性室性心动过速4型;儿茶酚胺敏感性多形性室性心动过速1型;长QT综合征;罗马诺-沃德综合征;长QT综合征14型;或精神分裂症。
CALM3
在一些情况下,靶肽序列是CALM3蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8140的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:376的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:174上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:174上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 46608205上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 46608205上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:174下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:174下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 46608340下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 46608340下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:174内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr19 46608205与GRCh38/hg38:chr19 46608340之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:174具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:174具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:1785-1850组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:1785-1850组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是CALM3蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:儿茶酚胺敏感性多形性室性心动过速1型;或长QT综合征。
CASP5
在一些情况下,靶肽序列是CASP5蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8141的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:377的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:175上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:175上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 105009053上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 105009053上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:175下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:175下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 105008807下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 105008807下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:175内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 105009053与GRCh38/hg38:chr11 105008807之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:175具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:175具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ IDNO:1851-1938组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:1851-1938组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是CASP5蛋白质的一部分,并且所述方法治疗与CASP5蛋白质相关的癌症。
CAST
在一些情况下,靶肽序列是CAST蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8142的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:378的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:176上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:176上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr5 96726754上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr5 96726754上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:176下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:176下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr5 96726859下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr5 96726859下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:176内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr596726754与GRCh38/hg38:chr5 96726859之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:176具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:176具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:1939-1998组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:1939-1998组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是CAST蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:皮肤剥落综合征;伴有白甲病、肢端点状角化症、唇炎和指节垫的皮肤剥落;红斑角化症;或掌跖角化症。
CEP19
在一些情况下,靶肽序列是CEP19蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8143的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:379的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:177上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:177上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 196708727上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 196708727上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:177下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:177下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 196708528下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 196708528下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:177内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr3 196708727与GRCh38/hg38:chr3 196708528之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:177具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:177具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:1999-2077组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:1999-2077组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是CEP19蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:病态肥胖症和精子生成障碍。
CEP57
在一些情况下,靶肽序列是CEP57蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8144的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:380的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:178上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:178上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 95795516上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 95795516上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:178下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:178下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 95795559下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 95795559下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:178内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 95795516与GRCh38/hg38:chr11 95795559之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:178具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:178具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:2078-2125组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:2078-2125组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是CEP57蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;Warburton Anyane Yeboa综合征;或马赛克杂色非整倍体综合征。
CHEK1
在一些情况下,靶肽序列是CHEK1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8145的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:381的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:179上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:179上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 125627607上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 125627607上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:179下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:179下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 125627830下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 125627830下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:179内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 125627607与GRCh38/hg38:chr11 125627830之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:179具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:179具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ IDNO:2126-2209组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:2126-2209组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是CHEK1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:家族性乳腺癌;卵巢恶性赘瘤;或精神分裂症。
CIB2
在一些情况下,靶肽序列是CIB2蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8146的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:382的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:180上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:180上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 78111276上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 78111276上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:180下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:180下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 78111165下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 78111165下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:180内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr15 78111276与GRCh38/hg38:chr15 78111165之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:180具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:180具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8147的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:383的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:181上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:181上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 78111276上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1578111276上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:181下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:181下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1578111165下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 78111165下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:181内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr15 78111276与GRCh38/hg38:chr15 78111165之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:181具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:181具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:2210-2270组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:2210-2270组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是CIB2蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:I型尤塞氏综合征;智力障碍;常染色体隐性耳聋48型;或IJ型尤塞氏综合征。
COX4I1
在一些情况下,靶肽序列是COX4I1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8148的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:384的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:182上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:182上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 85804941上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 85804941上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:182下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:182下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 85805104下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 85805104下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:182内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 85804941与GRCh38/hg38:chr16 85805104之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:182具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:182具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:2271-2342组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:2271-2342组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是COX4I1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:线粒体疾病。
DCLRE1C
在一些情况下,靶肽序列是DCLRE1C蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8149的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:385的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:183上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:183上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 14939869上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 14939869上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:183下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:183下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 14939810下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 14939810下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:183内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr10 14939869与GRCh38/hg38:chr10 14939810之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:183具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:183具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:2343-2393组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:2343-2393组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是DCLRE1C蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:伴有对电离辐射敏感的严重联合免疫缺陷;部分性严重联合免疫缺陷;伴有嗜曙红细胞增多的家族性网状内皮增生症;欧门氏综合征;Athabaskan严重联合免疫缺陷;或严重联合免疫缺陷Athabaskan型。
DECR1
在一些情况下,靶肽序列是DECR1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8150的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:386的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:184上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:184上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 90005292上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 90005292上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:184下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:184下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 90005369下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 90005369下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:184内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr890005292与GRCh38/hg38:chr8 90005369之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:184具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:184具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8151的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:387的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:185上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:185上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 90015541上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 90015541上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:185下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:185下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 90015666下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 90015666下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:185内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr8 90015541与GRCh38/hg38:chr8 90015666之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:185具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:185具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:2394-2457组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:2394-2457组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是DECR1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;或可卡因滥用。
DHFR
在一些情况下,靶肽序列是DHFR蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8152的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:388的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:186上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:186上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr5 80649494上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr5 80649494上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:186下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:186下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr5 80649389下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr5 80649389下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:186内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr580649494与GRCh38/hg38:chr5 80649389之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:186具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:186具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:2458-2517组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:2458-2517组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是DHFR蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;先天性贫血;细胞减少症;由大脑叶酸转运不足引起的神经变性;或由二氢叶酸还原酶缺乏引起的巨幼细胞性贫血。
DKK2
在一些情况下,靶肽序列是DKK2蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8153的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:389的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:187上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:187上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 106925949上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 106925949上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:187下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:187下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 106925799下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 106925799下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:187内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr4 106925949与GRCh38/hg38:chr4 106925799之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:187具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:187具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:2518-2586组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:2518-2586组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是DKK2蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:慢性酒精中毒。
DLG2
在一些情况下,靶肽序列是DLG2蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8154的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:390的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:188上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:188上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 83651930上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 83651930上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:188下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:188下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 83651839下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 83651839下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:188内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 83651930与GRCh38/hg38:chr11 83651839之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:188具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:188具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:2587-2643组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:2587-2643组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是DLG2蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;躁郁症;单相抑郁症;严重抑郁症;精神分裂症相关病症;或精神分裂症。
DOK2
在一些情况下,靶肽序列是DOK2蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8155的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:391的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:189上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:189上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 21910857上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 21910857上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:189下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:189下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 21910673下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 21910673下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:189内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr821910857与GRCh38/hg38:chr8 21910673之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:189具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:189具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:2644-2719组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:2644-2719组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是DOK2蛋白质的一部分,并且所述方法治疗与DOK2蛋白质相关的癌症。
DPF3
在一些情况下,靶肽序列是DPF3蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8156的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:392的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:190上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:190上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 72879947上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 72879947上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:190下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:190下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 72879804下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 72879804下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:190内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr14 72879947与GRCh38/hg38:chr14 72879804之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:190具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:190具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8157的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:393的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:191上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:191上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 72879947上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1472879947上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:191下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:191下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1472879804下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 72879804下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:191内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr14 72879947与GRCh38/hg38:chr14 72879804之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:191具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:191具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:2720-2787组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:2720-2787组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是DPF3蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍。
DTNA
在一些情况下,靶肽序列是DTNA蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8158的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:394的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:192上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:192上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr18 34757158上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr18 34757158上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:192下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:192下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr18 34757288下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr18 34757288下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:192内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr18 34757158与GRCh38/hg38:chr18 34757288之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:192具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:192具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8159的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:395的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:193上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:193上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr18 34757158上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1834757158上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:193下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:193下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1834757288下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr18 34757288下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:193内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr18 34757158与GRCh38/hg38:chr18 34757288之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:193具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:193具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:2788-2852组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:2788-2852组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是DTNA蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:左心室致密化不全心肌病;左心室致密化不全;家族性美尼尔氏病;恰克-马里-杜斯氏病;或常染色体显性家族性孤立性左心室心肌致密化不全1型。
DYRK1A
在一些情况下,靶肽序列是DYRK1A蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8160的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:396的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:194上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:194上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr21 37456130上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr21 37456130上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:194下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:194下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr21 37456308下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr21 37456308下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:194内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr21 37456130与GRCh38/hg38:chr21 37456308之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:194具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:194具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:2853-2927组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:2853-2927组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是DYRK1A蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;原发性小头畸形;小头畸形;癫痫性脑病;或常染色体显性智力迟钝7型。
FOLH1
在一些情况下,靶肽序列是FOLH1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8161的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:397的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:195上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:195上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 49206874上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 49206874上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:195下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:195下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 49206778下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 49206778下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:195内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 49206874与GRCh38/hg38:chr11 49206778之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:195具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:195具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:2928-2985组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:2928-2985组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是FOLH1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:结肠直肠癌;抑郁症;精神抑郁症;或精神分裂症。
FUZ
在一些情况下,靶肽序列是FUZ蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8162的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:398的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:196上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:196上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 49812335上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 49812335上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:196下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:196下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 49812251下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 49812251下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:196内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr19 49812335与GRCh38/hg38:chr19 49812251之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:196具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:196具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:2986-3041组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:2986-3041组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是FUZ蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:尾部退化综合征;阿诺德-基亚里畸形;尾部发育不良综合征;基亚里畸形II型;骶骨发育不全综合征;骶骨发育不全;Currarino三联征;颈椎显性脊柱裂;或神经管缺陷。
GANAB
在一些情况下,靶肽序列是GANAB蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8163的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:399的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:197上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:197上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 62639110上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 62639110上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:197下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:197下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 62638983下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 62638983下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:197内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 62639110与GRCh38/hg38:chr11 62638983之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:197具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:197具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:3042-3106组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:3042-3106组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是GANAB蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:常染色体显性多囊肾;或常染色体显性多囊性肾病3型。在一些情况下,所述方法治疗与GANAB蛋白质相关的癌症。
GEMIN4
在一些情况下,靶肽序列是GEMIN4蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8164的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:400的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:198上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:198上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 749909上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 749909上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:198下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:198下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 749814下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 749814下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:198内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr17749909与GRCh38/hg38:chr17 749814之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ IDNO:198具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:198具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:3107-3164组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:3107-3164组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是GEMIN4蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;慢性酒精中毒;或精神分裂症。
GGA3
在一些情况下,靶肽序列是GGA3蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8165的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:401的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:199上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:199上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 75243570上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 75243570上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:199下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:199下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 75243447下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 75243447下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:199内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr17 75243570与GRCh38/hg38:chr17 75243447之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:199具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:199具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:3165-3228组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:3165-3228组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是GGA3蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:乳房恶性赘瘤。
GOSR2
在一些情况下,靶肽序列是GOSR2蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8166的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:402的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:200上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:200上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 46924261上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 46924261上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:200下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:200下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 46924468下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 46924468下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:200内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr17 46924261与GRCh38/hg38:chr17 46924468之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:200具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:200具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:3229-3309组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:3229-3309组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是GOSR2蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:遗传性共济失调;智力障碍;进行性肌痉挛癫痫症6型;或癫痫性脑病。
GPM6A
在一些情况下,靶肽序列是GPM6A蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8167的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:403的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:201上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:201上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 175812249上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 175812249上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:201下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:201下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 175812191下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 175812191下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:201内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr4 175812249与GRCh38/hg38:chr4 175812191之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:201具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:201具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:3310-3360组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:3310-3360组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是GPM6A蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:精神分裂症。
GRB10
在一些情况下,靶肽序列是GRB10蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8168的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:404的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:202上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:202上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr7 50710990上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr7 50710990上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:202下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:202下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr7 50710875下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr7 50710875下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:202内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr750710990与GRCh38/hg38:chr7 50710875之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:202具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:202具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:3361-3422组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:3361-3422组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是GRB10蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:精神分裂症。
GSN
在一些情况下,靶肽序列是GSN蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8169的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:405的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:203上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:203上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr9 121300056上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr9 121300056上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:203下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:203下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr9 121300126下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr9 121300126下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:203内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr9 121300056与GRCh38/hg38:chr9 121300126之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:203具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:203具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:3423-3475组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:3423-3475组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是GSN蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:格子状角膜营养不良II型;梅雷托亚综合征;乳房恶性赘瘤;周期性发热综合征;家族性淀粉样多神经病IV型;Gsn相关的大脑淀粉样血管病;角膜异常;精神分裂症;或芬兰型淀粉样变性。在一些情况下,所述方法治疗与GSN蛋白质相关的癌症。
HDAC8
在一些情况下,靶肽序列是HDAC8蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8170的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:406的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:204上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:204上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 72572109上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 72572109上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:204下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:204下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 72572057下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 72572057下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:204内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chrX72572109与GRCh38/hg38:chrX 72572057之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:204具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:204具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:3476-3525组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:3476-3525组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是HDAC8蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;原发性小头畸形;狄兰吉氏综合征5型;桡侧球棒手;狄兰吉氏综合征;或威尔逊-特纳X连锁智力迟钝综合征。
HIVEP1
在一些情况下,靶肽序列是HIVEP1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8171的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:407的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:205上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:205上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr6 12020248上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr6 12020248上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:205下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:205下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr6 12020418下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr6 12020418下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:205内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr612020248与GRCh38/hg38:chr6 12020418之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:205具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:205具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:3526-3598组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:3526-3598组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是HIVEP1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗与HIVEP1蛋白质相关的癌症。
HK1
在一些情况下,靶肽序列是HK1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8172的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:408的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:206上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:206上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 69300769上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 69300769上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:206下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:206下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 69300861下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 69300861下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:206内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr10 69300769与GRCh38/hg38:chr10 69300861之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:206具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:206具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8173的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:409的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:207上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:207上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 69300769上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1069300769上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:207下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:207下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1069300861下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 69300861下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:207内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr10 69300769与GRCh38/hg38:chr10 69300861之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:207具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:207具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:3599-3656组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:3599-3656组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是HK1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;先天性贫血;色素性视网膜炎79型;恰克-马里-杜斯氏病;细胞减少症;由己糖激酶缺乏引起的非球形红细胞性溶血性贫血;Russe型遗传性运动和感觉神经病;或精神分裂症。
IFNGR1
在一些情况下,靶肽序列是IFNGR1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8174的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:410的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:208上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:208上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr6 137215377上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr6 137215377上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:208下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:208下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr6 137215267下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr6 137215267下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:208内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr6 137215377与GRCh38/hg38:chr6 137215267之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:208具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:208具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:3657-3717组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:3657-3717组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是IFNGR1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:干扰素γ受体1缺陷;免疫缺陷27A型;免疫缺陷27B型;易感性幽门螺旋杆菌感染;预防性肺结核感染;免疫缺陷27A型分枝杆菌病AR型;免疫缺陷27B型分枝杆菌病AD型;易感性乙型肝炎病毒感染;或易感性肺结核。
IKBKB
在一些情况下,靶肽序列是IKBKB蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8175的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:411的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:209上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:209上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 42272083上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 42272083上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:209下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:209下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 42272205下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 42272205下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:209内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr842272083与GRCh38/hg38:chr8 42272205之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:209具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:209具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8176的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:412的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:210上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:210上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 42272083上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 42272083上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:210下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:210下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 42272205下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 42272205下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:210内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr8 42272083与GRCh38/hg38:chr8 42272205之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:210具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:210具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8177的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:413的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:211上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:211上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 42272083上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 42272083上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:211下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:211下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 42272205下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 42272205下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:211内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr8 42272083与GRCh38/hg38:chr8 42272205之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:211具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:211具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8178的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:414的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:212上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:212上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 42272083上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr842272083上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:212下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:212下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr842272205下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 42272205下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:212内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr8 42272083与GRCh38/hg38:chr8 42272205之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:212具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:212具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:3718-3781组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:3718-3781组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是IKBKB蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:乳房恶性赘瘤;非霍奇金淋巴瘤;或免疫缺陷18型。
ISCU
在一些情况下,靶肽序列是ISCU蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8179的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:415的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:213上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:213上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr12 108564060上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr12 108564060上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:213下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:213下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr12 108564155下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr12 108564155下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:213内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr12 108564060与GRCh38/hg38:chr12 108564155之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:213具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:213具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ IDNO:3782-3839组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:3782-3839组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是ISCU蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:线粒体疾病;先天性肌病(病症);关节弯曲;横纹肌溶解症;伴有运动不耐受的瑞典型肌病;或伴有乳酸中毒的遗传性肌病。
KARS
在一些情况下,靶肽序列是KARS蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8180的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:416的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:214上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:214上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 75644462上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 75644462上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:214下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:214下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 75644283下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 75644283下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:214内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 75644462与GRCh38/hg38:chr16 75644283之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:214具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:214具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8181的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:417的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:215上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:215上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 75644462上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1675644462上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:215下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:215下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1675644283下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 75644283下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:215内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 75644462与GRCh38/hg38:chr16 75644283之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:215具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:215具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:3840-3914组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:3840-3914组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是KARS蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;线粒体疾病;隐性中间型恰克-马里-杜斯氏病B型;恰克-马里-杜斯氏病;或常染色体隐性耳聋89型。
KIAA0319
在一些情况下,靶肽序列是KIAA0319蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8182的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:418的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:216上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:216上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr6 24600709上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr6 24600709上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:216下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:216下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr6 24600619下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr6 24600619下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:216内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr624600709与GRCh38/hg38:chr6 24600619之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:216具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:216具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:3915-3971组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:3915-3971组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是KIAA0319蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:易感性阅读障碍2型。
KIAA0586
在一些情况下,靶肽序列是KIAA0586蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8183的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:419的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:217上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:217上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 58429363上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 58429363上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:217下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:217下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 58429433下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 58429433下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:217内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr14 58429363与GRCh38/hg38:chr14 58429433之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:217具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:217具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8184的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:420的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:218上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:218上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 58429363上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1458429363上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:218下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:218下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1458429433下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 58429433下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:218内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr14 58429363与GRCh38/hg38:chr14 58429433之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:218具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:218具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:3972-4024组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:3972-4024组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是KIAA0586蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;朱伯特综合征23型;多指(趾)症;家族性小脑蚓部发育不全;伴有热纳窒息性胸廓发育不良的朱伯特综合征;脑积水;纤毛病;或伴有多指(趾)症的短肋胸廓发育不良14型。
KIZ
在一些情况下,靶肽序列是KIZ蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8185的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:421的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:219上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:219上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr20 21132097上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr20 21132097上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:219下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:219下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr20 21132159下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr20 21132159下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:219内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr20 21132097与GRCh38/hg38:chr20 21132159之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:219具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:219具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:4025-4076组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:4025-4076组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是KIZ蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:色素性视网膜炎;或色素性视网膜炎69型。
KLK6
在一些情况下,靶肽序列是KLK6蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8186的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:422的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:220上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:220上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 50963549上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 50963549上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:220下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:220下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 50963302下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 50963302下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:220内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr19 50963549与GRCh38/hg38:chr19 50963302之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:220具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:220具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:4077-4165组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:4077-4165组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是KLK6蛋白质的一部分,并且所述方法治疗与KLK6蛋白质相关的癌症。
LMNA
在一些情况下,靶肽序列是LMNA蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8187的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:423的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:221上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:221上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 156126736上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 156126736上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:221下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:221下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 156126915下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 156126915下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:221内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr1 156126736与GRCh38/hg38:chr1 156126915之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:221具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:221具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:4166-4240组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:4166-4240组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是LMNA蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;肢带型肌肉萎缩1B型;肥厚性心肌病;左心室致密化不全;成骨不全;恰克-马里-杜斯氏病;家族性特发性心肌病;家族性部分性脂肪营养不良1型;左心室致密化不全心肌病;下颌骨发育不良;LMNA相关的先天性肌肉萎缩(病症);先天性肌病(病症);关节弯曲;心律失常性右心室发育不良;肢带型肌肉萎缩;马卢夫综合征;纳贾尔综合征;恰克-马里-杜斯氏病2B1型;艾梅氏肌肉萎缩3型;致死性限制性皮肤挛缩综合征(病症);家族性部分性脂肪营养不良2型;心脏传导障碍;扩张性心肌病;儿童发病型早老综合征;非典型沃纳综合征;先天性肌肉萎缩(病症);常染色体隐性艾梅氏肌肉萎缩;心-手综合征Slovenian型;早老症;常染色体显性艾梅氏肌肉萎缩;扩张性心肌病1A型;下颌骨发育不良;肢带型肌肉萎缩1B型;艾梅氏肌肉萎缩2型AD型;马卢夫综合征;致死性限制性皮肤病;艾梅氏肌肉萎缩3型AR型;心-手综合征Slovenian型;恰克-马里-杜斯氏病2B1型;Hutchinson-Gilford早老症;家族性部分性脂肪营养不良2型;或先天性肌肉萎缩。
LMNTD1
在一些情况下,靶肽序列是LMNTD1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8188的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:424的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:222上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:222上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr12 25552989上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr12 25552989上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:222下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:222下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr12 25552871下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr12 25552871下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:222内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr12 25552989与GRCh38/hg38:chr12 25552871之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:222具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:222具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8189的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:425的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:223上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:223上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr12 25552989上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1225552989上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:223下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:223下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1225552871下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr12 25552871下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:223内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr12 25552989与GRCh38/hg38:chr12 25552871之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:223具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:223具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:4241-4303组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:4241-4303组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是LMNTD1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗与LMNTD1蛋白质相关的癌症。
LRRC7
在一些情况下,靶肽序列是LRRC7蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8190的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:426的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:224上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:224上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 69716142上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 69716142上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:224下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:224下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 69716218下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 69716218下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:224内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr169716142与GRCh38/hg38:chr1 69716218之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:224具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:224具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:4304-4357组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:4304-4357组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是LRRC7蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:乳房恶性赘瘤。
LRTOMT
在一些情况下,靶肽序列是LRTOMT蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8191的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:427的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:225上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:225上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:225下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:225下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089165下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089165下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:225内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029与GRCh38/hg38:chr11 72089165之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:225具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:225具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8192的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:428的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:226上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:226上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1172089029上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:226下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:226下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1172089165下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089165下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:226内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029与GRCh38/hg38:chr11 72089165之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:226具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:226具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8193的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:429的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:227上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:227上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:227下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:227下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089165下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089165下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:227内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029与GRCh38/hg38:chr1172089165之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:227具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:227具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8194的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:430的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:228上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:228上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:228下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:228下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089165下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089165下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:228内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029与GRCh38/hg38:chr11 72089165之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:228具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:228具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8195的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:431的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:229上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:229上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:229下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:229下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089165下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089165下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:229内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029与GRCh38/hg38:chr11 72089165之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:229具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:229具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8196的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:432的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:230上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:230上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1172089029上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:230下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:230下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1172089165下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089165下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:230内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029与GRCh38/hg38:chr11 72089165之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:230具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:230具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8197的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:433的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:231上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:231上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:231下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:231下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089165下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089165下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:231内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029与GRCh38/hg38:chr1172089165之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:231具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:231具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8198的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:434的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:232上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:232上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:232下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:232下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089165下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089165下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:232内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029与GRCh38/hg38:chr11 72089165之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:232具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:232具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8199的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:435的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:233上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:233上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:233下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:233下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089165下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089165下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:233内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029与GRCh38/hg38:chr11 72089165之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:233具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:233具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8200的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:436的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:234上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:234上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1172089029上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:234下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:234下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1172089165下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089165下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:234内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029与GRCh38/hg38:chr11 72089165之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:234具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:234具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8201的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:437的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:235上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:235上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:235下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:235下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089165下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089165下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:235内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr11 72089029与GRCh38/hg38:chr1172089165之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:235具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:235具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:4358-4423组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:4358-4423组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是LRTOMT蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:常染色体隐性耳聋71型。
LZTFL1
在一些情况下,靶肽序列是LZTFL1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8202的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:438的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:236上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:236上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 45838051上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 45838051上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:236下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:236下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 45837927下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 45837927下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:236内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr345838051与GRCh38/hg38:chr3 45837927之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:236具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:236具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:4424-4487组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:4424-4487组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是LZTFL1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:Bardet-Biedl综合征;多指(趾)症;纤毛病;或Bardet-Biedl综合征17型。
MAGI2
在一些情况下,靶肽序列是MAGI2蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8203的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:439的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:237上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:237上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr7 78554671上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr7 78554671上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:237下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:237下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr7 78554567下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr7 78554567下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:237内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr778554671与GRCh38/hg38:chr7 78554567之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:237具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:237具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:4488-4547组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:4488-4547组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是MAGI2蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;重度情感障碍2型;躁郁症;癫痫性脑病;或精神分裂症。
MERTK
在一些情况下,靶肽序列是MERTK蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8206的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:442的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:240上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:240上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr2 111944960上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr2 111944960上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:240下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:240下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr2 111945060下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr2 111945060下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:240内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr2 111944960与GRCh38/hg38:chr2 111945060之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:240具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:240具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:4612-4670组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:4612-4670组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是MERTK蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:肾上腺良性赘瘤;色素性视网膜炎;普通型(透明细胞)肾细胞癌;头颈部鳞状细胞癌;主动脉体和其他嗜铬体的恶性赘瘤;色素性视网膜炎38型;恶性肾上腺髓质赘瘤;或主动脉体和其他嗜铬体的良性赘瘤。
MFSD2A
在一些情况下,靶肽序列是MFSD2A蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8207的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:443的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:241上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:241上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 39965211上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 39965211上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:241下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:241下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 39965334下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 39965334下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:241内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr139965211与GRCh38/hg38:chr1 39965334之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:241具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:241具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:4671-4734组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:4671-4734组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是MFSD2A蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;原发性小头畸形;常染色体隐性原发性小头畸形15型;常染色体隐性原发性小头畸形;或小头畸形。在一些情况下,所述方法治疗与MFSD2A蛋白质相关的癌症。
MLF1
在一些情况下,靶肽序列是MLF1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8208的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:444的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:242上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:242上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592434上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592434上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:242下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:242下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592581下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592581下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:242内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592434与GRCh38/hg38:chr3 158592581之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:242具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:242具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8209的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:445的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:243上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:243上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592434上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3158592434上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:243下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:243下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3158592581下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592581下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:243内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592434与GRCh38/hg38:chr3 158592581之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:243具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:243具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8210的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:446的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:244上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:244上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592434上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592434上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:244下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:244下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592581下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592581下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:244内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592434与GRCh38/hg38:chr3158592581之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:244具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:244具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8211的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:447的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:245上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:245上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592434上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592434上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:245下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:245下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592581下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592581下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:245内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592434与GRCh38/hg38:chr3 158592581之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:245具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:245具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8212的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:448的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:246上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:246上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592434上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592434上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:246下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:246下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592581下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592581下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:246内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr3 158592434与GRCh38/hg38:chr3 158592581之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:246具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:246具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:4735-4803组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:4735-4803组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,所述靶肽序列是MLF1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:急性骨髓白血病。
MOB1B
在一些情况下,靶肽序列是MOB1B蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8213的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:449的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:247上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:247上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 70950700上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 70950700上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:247下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:247下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 70950811下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 70950811下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:247内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr470950700与GRCh38/hg38:chr4 70950811之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:247具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:247具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:4804-4864组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:4804-4864组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是MOB1B蛋白质的一部分,并且所述方法治疗与MOB1B蛋白质相关的癌症。
MSRB3
在一些情况下,靶肽序列是MSRB3蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8214的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:450的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:248上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:248上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr12 65308529上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr12 65308529上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:248下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:248下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr12 65308655下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr12 65308655下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:248内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr12 65308529与GRCh38/hg38:chr12 65308655之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:248具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:248具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:4865-4928组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:4865-4928组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是MSRB3蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:常染色体隐性耳聋74型。
NR1I3
在一些情况下,靶肽序列是NR1I3蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8215的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:451的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:249上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:249上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:249下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:249下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:249内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598与GRCh38/hg38:chr1 161236459之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:249具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:249具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8216的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:452的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:250上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:250上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1161236598上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:250下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:250下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1161236459下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:250内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598与GRCh38/hg38:chr1 161236459之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:250具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:250具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8217的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:453的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:251上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:251上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:251下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:251下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:251内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598与GRCh38/hg38:chr1161236459之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:251具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:251具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8218的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:454的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:252上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:252上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:252下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:252下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:252内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598与GRCh38/hg38:chr1 161236459之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:252具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:252具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8219的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:455的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:253上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:253上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:253下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:253下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:253内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598与GRCh38/hg38:chr1 161236459之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:253具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:253具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8220的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:456的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:254上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:254上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1161236598上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:254下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:254下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1161236459下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:254内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598与GRCh38/hg38:chr1 161236459之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:254具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:254具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8221的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:457的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:255上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:255上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:255下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:255下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:255内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598与GRCh38/hg38:chr1161236459之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:255具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:255具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8222的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:458的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:256上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:256上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:256下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:256下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:256内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598与GRCh38/hg38:chr1 161236459之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:256具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:256具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8223的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:459的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:257上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:257上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:257下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:257下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:257内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598与GRCh38/hg38:chr1 161236459之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:257具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:257具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8224的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:460的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:258上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:258上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1161236598上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:258下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:258下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1161236459下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:258内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598与GRCh38/hg38:chr1 161236459之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:258具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:258具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8225的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:461的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:259上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:259上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:259下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:259下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:259内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598与GRCh38/hg38:chr1161236459之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:259具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:259具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8226的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:462的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:260上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:260上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:260下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:260下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:260内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598与GRCh38/hg38:chr1 161236459之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:260具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:260具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8227的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:463的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:261上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:261上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:261下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:261下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236459下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:261内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr1 161236598与GRCh38/hg38:chr1 161236459之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:261具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:261具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:4929-4995组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:4929-4995组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是NR1I3蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍。
NT5C3A
在一些情况下,靶肽序列是NT5C3A蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8228的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:464的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:262上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:262上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr7 33035988上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr7 33035988上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:262下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:262下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr7 33035934下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr7 33035934下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:262内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr733035988与GRCh38/hg38:chr7 33035934之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:262具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:262具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8229的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:465的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:263上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:263上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr7 33035988上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr7 33035988上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:263下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:263下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr7 33035934下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr7 33035934下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:263内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr7 33035988与GRCh38/hg38:chr7 33035934之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:263具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:263具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:4996-5045组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:4996-5045组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是NT5C3A蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;细胞减少症;引起溶血性贫血的尿苷5-Prime单磷酸水解酶缺乏;或先天性贫血。
NUTM1
在一些情况下,靶肽序列是NUTM1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8230的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:466的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:264上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:264上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 34345857上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 34345857上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:264下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:264下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 34346035下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 34346035下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:264内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr15 34345857与GRCh38/hg38:chr15 34346035之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:264具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:264具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:5046-5120组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:5046-5120组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是NUTM1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:NUT中线癌。
OTOF
在一些情况下,靶肽序列是OTOF蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8231的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:467的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:265上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:265上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr2 26477749上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr2 26477749上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:265下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:265下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr2 26477649下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr2 26477649下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:265内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr226477749与GRCh38/hg38:chr2 26477649之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:265具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:265具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8232的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:468的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:266上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:266上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr2 26477749上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr2 26477749上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:266下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:266下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr2 26477649下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr2 26477649下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:266内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr2 26477749与GRCh38/hg38:chr2 26477649之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:266具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:266具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:5121-5179组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:5121-5179组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是OTOF蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:乳房恶性赘瘤;常染色体隐性耳聋;常染色体隐性耳聋9型;非综合型隐性听觉神经病;或常染色体隐性听觉神经病1型。
PDCD4
在一些情况下,靶肽序列是PDCD4蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8233的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:469的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:267上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:267上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 110876670上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 110876670上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:267下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:267下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 110876753下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 110876753下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:267内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr10 110876670与GRCh38/hg38:chr10 110876753之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:267具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:267具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ IDNO:5180-5235组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:5180-5235组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是PDCD4蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:乳房恶性赘瘤。在一些情况下,所述方法治疗与PDCD4蛋白质相关的癌症。
PDPK1
在一些情况下,靶肽序列是PDPK1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8234的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:470的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:268上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:268上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2566356上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2566356上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:268下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:268下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2566453下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2566453下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:268内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr162566356与GRCh38/hg38:chr16 2566453之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:268具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:268具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:5236-5294组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:5236-5294组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是PDPK1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:乳房恶性赘瘤;乳腺癌;具有不明确或未知的乳房行为的赘瘤;或乳腺腺癌。
PHKB
在一些情况下,靶肽序列是PHKB蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8235的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:471的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:269上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:269上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 47463899上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 47463899上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:269下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:269下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 47463993下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 47463993下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:269内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 47463899与GRCh38/hg38:chr16 47463993之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:269具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:269具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8236的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:472的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:270上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:270上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 47463882上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1647463882上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:270下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:270下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1647463993下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 47463993下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:270内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 47463882与GRCh38/hg38:chr16 47463993之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:270具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:270具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:5295-5352组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:5295-5352组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是PHKB蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:乳房恶性赘瘤;酮症性低血糖;横纹肌溶解症;糖原贮积病IXB;或常染色体隐性肝脏和肌肉磷酸化酶激酶缺乏。
PIGA
在一些情况下,靶肽序列是PIGA蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8237的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:473的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:271上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:271上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 15331992上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 15331992上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:271下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:271下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 15331216下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 15331216下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:271内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chrX15331992与GRCh38/hg38:chrX 15331216之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:271具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:271具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8238的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:474的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:272上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:272上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 15331992上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 15331992上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:272下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:272下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 15331216下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 15331216下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:272内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chrX 15331992与GRCh38/hg38:chrX 15331216之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:272具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:272具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:5353-5546组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:5353-5546组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是PIGA蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;先天性贫血;先天性糖基化障碍;细胞减少症;癫痫性脑病;阵发性睡眠性血红蛋白尿症;阵发性睡眠性血红蛋白尿症1型;韦斯特综合征;或多发性先天性异常-张力减退-痉挛综合征2型。
PLOD2
在一些情况下,靶肽序列是PLOD2蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8239的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:475的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:273上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:273上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 146124229上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 146124229上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:273下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:273下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 146124138下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 146124138下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:273内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr3 146124229与GRCh38/hg38:chr3 146124138之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:273具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:273具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:5547-5603组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:5547-5603组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是PLOD2蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;布鲁克综合征2型;成骨不全;布鲁克综合征1型;关节弯曲;或布鲁克综合征。
POLR2F
在一些情况下,靶肽序列是POLR2F蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8240的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:476的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:274上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:274上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr22 37958374上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr22 37958374上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:274下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:274下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr22 37958471下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr22 37958471下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:274内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr22 37958374与GRCh38/hg38:chr22 37958471之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:274具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:274具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:5604-5662组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:5604-5662组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是POLR2F蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:乳房恶性赘瘤。
PPP6C
在一些情况下,靶肽序列是PPP6C蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8241的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:477的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:275上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:275上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr9 125172001上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr9 125172001上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:275下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:275下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr9 125171909下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr9 125171909下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:275内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr9 125172001与GRCh38/hg38:chr9 125171909之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:275具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:275具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:5663-5720组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:5663-5720组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是PPP6C蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:皮肤黑色素瘤;或黑色素瘤。
PRKN
在一些情况下,靶肽序列是PRKN蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8242的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:478的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:276上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:276上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr6 162262765上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr6 162262765上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:276下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:276下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr6 162262525下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr6 162262525下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:276内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr6 162262765与GRCh38/hg38:chr6 162262525之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:276具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:276具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:5721-5807组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:5721-5807组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是PRKN蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:常染色体隐性青少年型帕金森病2型;帕金森病;青年发病型帕金森病;老年发病型帕金森病;易感性麻疯病;体细胞性卵巢腺癌;或体细胞性肺腺癌。
PRUNE1
在一些情况下,靶肽序列是PRUNE1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8243的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:479的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:277上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:277上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 151027233上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 151027233上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:277下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:277下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 151027327下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 151027327下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:277内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr1 151027233与GRCh38/hg38:chr1 151027327之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:277具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:277具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:5808-5865组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:5808-5865组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是PRUNE1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;原发性小头畸形;或伴有小头畸形、张力减退和多样脑部异常的神经发育障碍。
PSMA6
在一些情况下,靶肽序列是PSMA6蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8244的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:480的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:278上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:278上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 35308914上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 35308914上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:278下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:278下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 35308995下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 35308995下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:278内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr14 35308914与GRCh38/hg38:chr14 35308995之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:278具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:278具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:5866-5920组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:5866-5920组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是PSMA6蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:易感性心肌梗死。
PSMC3IP
在一些情况下,靶肽序列是PSMC3IP蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8245的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:481的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:279上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:279上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 42573623上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 42573623上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:279下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:279下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 42573478上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 42573478下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:279内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr17 42573623与GRCh38/hg38:chr17 42573478之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:279具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:279具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:5921-5988组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:5921-5988组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是PSMC3IP蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:46-XX单纯性腺发育不全;或卵巢发育不全3型。
PTPN1
在一些情况下,靶肽序列是PTPN1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8246的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:482的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:280上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:280上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr20 50564969上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr20 50564969上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:280下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:280下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr20 50565069下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr20 50565069下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:280内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr20 50564969与GRCh38/hg38:chr20 50565069之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:280具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:280具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:5989-6047组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:5989-6047组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是PTPN1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:精神分裂症;或易感性胰岛素抵抗。在一些情况下,所述方法治疗与PTPN1蛋白质相关的癌症。
RAB11B
在一些情况下,靶肽序列是RAB11B蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8247的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:483的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:281上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:281上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 8402086上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 8402086上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:281下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:281下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 8402279下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 8402279下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:281内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr198402086与GRCh38/hg38:chr19 8402279之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:281具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:281具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:6048-6125组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:6048-6125组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是RAB11B蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;脑白质营养不良;或癫痫性脑病。
RBPJ
在一些情况下,靶肽序列是RBPJ蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8248的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:484的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:282上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:282上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 26320700上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 26320700上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:282下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:282下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 26320815下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 26320815下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:282内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr426320700与GRCh38/hg38:chr4 26320815之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:282具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:282具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8249的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:485的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:283上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:283上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 26320700上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 26320700上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:283下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:283下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 26320815下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 26320815下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:283内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr4 26320700与GRCh38/hg38:chr4 26320815之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:283具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:283具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:6126-6187组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:6126-6187组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是RBPJ蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;亚当斯-奥利弗综合征3型;或亚当斯奥利弗综合征。
RNPS1
在一些情况下,靶肽序列是RNPS1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8250的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:486的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:284上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:284上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2264760上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2264760上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:284下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:284下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2264573下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2264573下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:284内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr162264760与GRCh38/hg38:chr16 2264573之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:284具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:284具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8251的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:487的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:285上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:285上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2264760上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2264760上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:285下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:285下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2264573下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2264573下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:285内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2264760与GRCh38/hg38:chr16 2264573之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:285具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:285具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8252的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:488的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:286上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:286上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2264760上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2264760上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:286下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:286下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2264573下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2264573下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:286内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2264760与GRCh38/hg38:chr16 2264573之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:286具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:286具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8253的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:489的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:287上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:287上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2264760上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr162264760上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:287下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:287下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr162264573下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2264573下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:287内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 2264760与GRCh38/hg38:chr16 2264573之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:287具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:287具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:6188-6264组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:6188-6264组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是RNPS1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:情绪障碍。
RPL5
在一些情况下,靶肽序列是RPL5蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8254的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:490的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:288上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:288上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 92833545上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 92833545上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:288下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:288下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 92833660下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 92833660下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:288内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr192833545与GRCh38/hg38:chr1 92833660之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:288具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:288具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:6265-6326组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:6265-6326组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是RPL5蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:先天性贫血;血液系统赘瘤;Diamond-Blackfan贫血;细胞减少症;Aase Smith综合征2型;桡侧球棒手;T细胞前体淋巴母细胞白血病-淋巴瘤;或Diamond-Blackfan贫血6型。在一些情况下,所述方法治疗与RPL5蛋白质相关的癌症。
RPS20
在一些情况下,靶肽序列是RPS20蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8255的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:491的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:289上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:289上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 56073768上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 56073768上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:289下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:289下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 56073695下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr8 56073695下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:289内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr856073768与GRCh38/hg38:chr8 56073695之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:289具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:289具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:6327-6380组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:6327-6380组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是RPS20蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:遗传性非息肉性结肠直肠癌综合征;家族性结肠直肠癌X型;遗传性非息肉性结肠直肠癌;或遗传性非息肉性结肠直肠赘瘤。
SECISBP2
在一些情况下,靶肽序列是SECISBP2蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8256的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:492的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:290上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:290上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr9 89325427上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr9 89325427上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:290下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:290下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr9 89325676下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr9 89325676下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:290内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr989325427与GRCh38/hg38:chr9 89325676之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:290具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:290具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:6381-6469组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:6381-6469组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是SECISBP2蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:异常甲状腺激素代谢;或甲状腺激素抵抗综合征。
SELENBP1
在一些情况下,靶肽序列是SELENBP1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8257的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:493的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:291上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:291上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 151369978上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 151369978上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:291下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:291下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 151369713下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 151369713下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:291内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr1 151369978与GRCh38/hg38:chr1 151369713之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:291具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:291具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8258的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:494的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:292上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:292上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 151369978上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1151369978上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:292下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:292下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1151369713下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1 151369713下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:292内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr1 151369978与GRCh38/hg38:chr1 151369713之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:292具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:292具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:6470-6561组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:6470-6561组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是SELENBP1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗与SELENBP1蛋白质相关的癌症。
SEPT11
在一些情况下,靶肽序列是SEPT11蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8259的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:495的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:293上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:293上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 76995781上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 76995781上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:293下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:293下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 76995938下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr4 76995938下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:293内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr476995781与GRCh38/hg38:chr4 76995938之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:293具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:293具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:6562-6632组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:6562-6632组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是SEPT11蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:躁郁症;或精神分裂症。
SIRT2
在一些情况下,靶肽序列是SIRT2蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8260的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:496的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:294上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:294上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893867上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893867上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:294下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:294下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893819下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893819下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:294内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893867与GRCh38/hg38:chr19 38893819之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:294具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:294具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8261的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:497的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:295上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:295上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893867上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1938893867上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:295下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:295下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1938893819下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893819下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:295内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893867与GRCh38/hg38:chr19 38893819之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:295具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:295具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8262的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:498的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:296上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:296上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893867上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893867上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:296下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:296下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893819下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893819下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:296内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893867与GRCh38/hg38:chr1938893819之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:296具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:296具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8263的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:499的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:297上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:297上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893867上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893867上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:297下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:297下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893819下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893819下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:297内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893867与GRCh38/hg38:chr19 38893819之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:297具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:297具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8264的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:500的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:298上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:298上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893867上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893867上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:298下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:298下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893819下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893819下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:298内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr19 38893867与GRCh38/hg38:chr19 38893819之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:298具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:298具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:6633-6681组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:6633-6681组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是SIRT2蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:情绪紊乱;或情绪障碍。在一些情况下,所述方法治疗与SIRT2蛋白质相关的癌症。
SLC25A26
在一些情况下,靶肽序列是SLC25A26蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8265的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:501的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:299上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:299上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 66243203上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 66243203上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:299下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:299下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 66243312下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 66243312下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:299内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr366243203与GRCh38/hg38:chr3 66243312之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:299具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:299具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8266的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:502的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:300上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:300上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 66243203上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 66243203上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:300下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:300下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 66243312下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 66243312下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:300内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr3 66243203与GRCh38/hg38:chr3 66243312之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:300具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:300具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:6682-6742组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:6682-6742组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是SLC25A26蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;联合氧化磷酸化缺乏28型;或线粒体疾病。
SMARCE1
在一些情况下,靶肽序列是SMARCE1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8267的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:503的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:301上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:301上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 40644459上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 40644459上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:301下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:301下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 40644385下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 40644385下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:301内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr17 40644459与GRCh38/hg38:chr17 40644385之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:301具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:301具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:6743-6796组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:6743-6796组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是SMARCE1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;科芬-西里斯综合征5型;科芬-西里斯综合征;脑膜瘤;多发性脑膜瘤;或家族性易感性脑膜瘤。
SMC1A
在一些情况下,靶肽序列是SMC1A蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8268的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:504的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:302上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:302上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 53422040上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 53422040上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:302下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:302下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 53421895下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 53421895下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:302内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chrX53422040与GRCh38/hg38:chrX 53421895之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:302具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:302具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:6797-6864组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:6797-6864组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是SMC1A蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;原发性小头畸形;先天性贫血;成骨不全;细胞减少症;癫痫性脑病;桡侧球棒手;狄兰吉氏综合征;伴有脸部畸形的发育缺陷和智力迟钝;先天性肌肥大-大脑综合征;或狄兰吉氏综合征2型。
SMG1
在一些情况下,靶肽序列是SMG1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8269的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:505的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:303上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:303上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 18900044上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 18900044上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:303下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:303下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 18899987下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr16 18899987下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:303内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr16 18900044与GRCh38/hg38:chr16 18899987之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:303具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:303具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:6865-6915组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:6865-6915组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是SMG1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:浸润性女性乳房导管癌。
SPACA7
在一些情况下,靶肽序列是SPACA7蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8270的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:506的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:304上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:304上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr13 112382278上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr13 112382278上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:304下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:304下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr13 112382507下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr13 112382507下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:304内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr13 112382278与GRCh38/hg38:chr13 112382507之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:304具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:304具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ IDNO:6916-7000组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:6916-7000组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是SPACA7蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:结肠直肠癌。
SPRED1
在一些情况下,靶肽序列是SPRED1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8271的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:507的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:305上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:305上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 38299373上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 38299373上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:305下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:305下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 38299547下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 38299547下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:305内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr15 38299373与GRCh38/hg38:chr15 38299547之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:305具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:305具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:7001-7074组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:7001-7074组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是SPRED1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;神经纤维瘤1型;类神经纤维瘤1型综合征;或Legius综合征。
SRP54
在一些情况下,靶肽序列是SRP54蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8272的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:508的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:306上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:306上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 35000936上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 35000936上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:306下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:306下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 35001020下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr14 35001020下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:306内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr14 35000936与GRCh38/hg38:chr14 35001020之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:306具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:306具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:7075-7130组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:7075-7130组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是SRP54蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:舒瓦克曼综合征。
SRPK2
在一些情况下,靶肽序列是SRPK2蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8273的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:509的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:307上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:307上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr7 105268869上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr7 105268869上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:307下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:307下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr7 105268806下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr7 105268806下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:307内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr7 105268869与GRCh38/hg38:chr7 105268806之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:307具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:307具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:7131-7182组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:7131-7182组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是SRPK2蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:多形性胶质母细胞瘤。
STK36
在一些情况下,靶肽序列是STK36蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8274的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:510的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:308上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:308上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr2 218673665上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr2 218673665上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:308下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:308下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr2 218673765下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr2 218673765下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:308内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr2 218673665与GRCh38/hg38:chr2 218673765之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:308具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:308具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:7183-7241组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:7183-7241组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是STK36蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:卵巢浆液性腺癌;波利尼西亚支气管扩张;或卡塔格内综合征。
STRADA
在一些情况下,靶肽序列是STRADA蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8275的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:511的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:309上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:309上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:309下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:309下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714006下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714006下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:309内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108与GRCh38/hg38:chr17 63714006之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:309具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:309具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8276的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:512的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:310上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:310上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1763714108上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:310下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:310下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1763714006下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714006下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:310内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108与GRCh38/hg38:chr17 63714006之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:310具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:310具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8277的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:513的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:311上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:311上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:311下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:311下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714006下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714006下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:311内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108与GRCh38/hg38:chr1763714006之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:311具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:311具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8278的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:514的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:312上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:312上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:312下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:312下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714006下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714006下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:312内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108与GRCh38/hg38:chr17 63714006之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:312具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:312具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8279的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:515的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:313上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:313上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:313下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:313下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714006下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714006下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:313内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108与GRCh38/hg38:chr17 63714006之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:313具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:313具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8280的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:516的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:314上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:314上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1763714108上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:314下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:314下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1763714006下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714006下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:314内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108与GRCh38/hg38:chr17 63714006之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:314具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:314具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8281的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:517的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:315上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:315上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:315下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:315下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714006下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714006下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:315内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108与GRCh38/hg38:chr1763714006之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:315具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:315具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8282的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:518的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:316上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:316上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:316下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:316下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714006下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714006下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:316内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108与GRCh38/hg38:chr17 63714006之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:316具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:316具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8283的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:519的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:317上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:317上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:317下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:317下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714006下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714006下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:317内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr17 63714108与GRCh38/hg38:chr17 63714006之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:317具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:317具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:7242-7301组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:7242-7301组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是STRADA蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:羊水过多、巨脑和症状性癫痫;脑积水;智力障碍;或癫痫性脑病。在一些情况下,所述方法治疗与STRADA蛋白质相关的癌症。
SUMO1
在一些情况下,靶肽序列是SUMO1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8284的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:520的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:318上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:318上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr2 202214429上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr2 202214429上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:318下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:318下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr2 202214357下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr2 202214357下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:318内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr2 202214429与GRCh38/hg38:chr2 202214357之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:318具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:318具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:7302-7355组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:7302-7355组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是SUMO1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:少牙畸形;牙发育不全;或唇腭裂10型。
TBL1XR1
在一些情况下,靶肽序列是TBL1XR1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8285的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:521的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:319上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:319上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 177065022上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 177065022上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:319下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:319下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 177064920下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 177064920下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:319内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr3 177065022与GRCh38/hg38:chr3 177064920之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:319具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:319具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8286的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:522的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:320上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:320上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 177065022上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3177065022上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:320下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:320下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3177064920下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 177064920下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:320内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr3 177065022与GRCh38/hg38:chr3 177064920之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:320具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:320具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8287的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:523的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:321上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:321上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 177065022上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 177065022上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:321下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:321下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 177064920下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 177064920下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:321内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr3 177065022与GRCh38/hg38:chr3177064920之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:321具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:321具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8288的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:524的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:322上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:322上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 177065022上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 177065022上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:322下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:322下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 177064920下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 177064920下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:322内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr3 177065022与GRCh38/hg38:chr3 177064920之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:322具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:322具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:7356-7415组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:7356-7415组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是TBL1XR1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:膀胱恶性赘瘤;智力障碍;急性前髓细胞性白血病;大肠腺癌;膀胱赘瘤;癫痫性脑病;具有不明确或未知的膀胱行为的赘瘤;常染色体显性智力迟钝41型;膀胱良性赘瘤;非霍奇金淋巴瘤;膀胱原位癌;中枢神经系统淋巴瘤;膀胱癌;足底脂肪过多、特殊面容和发育迟缓;或皮尔庞综合征。
TLR8
在一些情况下,靶肽序列是TLR8蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8289的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:525的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:323上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:323上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 12910306上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 12910306上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:323下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:323下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 12910442下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chrX 12910442下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:323内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chrX12910306与GRCh38/hg38:chrX 12910442之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:323具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:323具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:7416-7481组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:7416-7481组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是TLR8蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;或家族性美尼尔氏病。
TXNRD2
在一些情况下,靶肽序列是TXNRD2蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8290的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:526的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:324上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:324上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr22 19880945上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr22 19880945上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:324下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:324下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr22 19880856下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr22 19880856下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:324内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr22 19880945与GRCh38/hg38:chr22 19880856之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:324具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:324具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:7482-7538组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:7482-7538组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是TXNRD2蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:X连锁肾上腺发育不全;抑郁症状;家族性扩张性心肌病;家族性糖皮质激素缺乏1型;心脏传导障碍;或扩张性心肌病。
UBE3A
在一些情况下,靶肽序列是UBE3A蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8291的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:527的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:325上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:325上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 25408684上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 25408684上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:325下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:325下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 25408620下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 25408620下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:325内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr15 25408684与GRCh38/hg38:chr15 25408620之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:325具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:325具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ IDNO:8292的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:528的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:326上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:326上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 25408684上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1525408684上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:326下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:326下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr1525408620下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr15 25408620下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:326内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr15 25408684与GRCh38/hg38:chr15 25408620之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:326具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:326具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:7539-7590组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:7539-7590组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是UBE3A蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;安格曼综合征;癫痫性脑病;小头畸形;或15q11-q13重复综合征。
UFM1
在一些情况下,靶肽序列是UFM1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8293的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:529的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:327上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:327上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr13 38349999上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr13 38349999上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:327下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:327下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr13 38350227下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr13 38350227下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:327内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr13 38349999与GRCh38/hg38:chr13 38350227之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:327具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:327具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:7591-7675组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:7591-7675组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是UFM1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:髓鞘形成不良性脑白质营养不良6型。
WAC
在一些情况下,靶肽序列是WAC蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8294的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ IDNO:530的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:328上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:328上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 28535562上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 28535562上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:328下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:328下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 28535757下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 28535757下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:328内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr10 28535562与GRCh38/hg38:chr10 28535757之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:328具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:328具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:7676-7753组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:7676-7753组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是WAC蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;染色体10p12-p11缺失综合征;结肠直肠癌;或Desanto-Shinawi综合征。
WDR81
在一些情况下,靶肽序列是WDR81蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8295的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:531的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:329上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:329上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 1727990上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 1727990上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:329下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:329下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 1728626下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr17 1728626下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ IDNO:329内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr171727990与GRCh38/hg38:chr17 1728626之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:329具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:329具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:7754-7919组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:7754-7919组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是WDR81蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:智力障碍;遗传性共济失调;小脑共济失调、智力迟钝和平衡失调综合征2型;脑积水;小脑发育不全;或平衡失调综合征。
YME1L1
在一些情况下,靶肽序列是YME1L1蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8296的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQID NO:532的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ IDNO:330上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:330上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 27153281上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 27153281上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:330下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:330下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 27153227下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr10 27153227下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:330内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr10 27153281与GRCh38/hg38:chr10 27153227之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:330具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:330具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:7920-7969组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:7920-7969组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是YME1L1蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:视神经萎缩11型。
ZMYND10
在一些情况下,靶肽序列是ZMYND10蛋白质的一部分。在一些情况下,治疗剂增加编码具有序列SEQ ID NO:8297的蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并减少编码具有序列SEQ ID NO:533的蛋白质的第二经加工mRNA的水平。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:331上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:331上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 50345232上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 50345232上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:331下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是SEQ ID NO:331下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 50345124下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区是基因组位点GRCh38/hg38:chr3 50345124下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在序列SEQ ID NO:331内。在一些情况下,mRNA前体的靶向区在一对基因组位点GRCh38/hg38:chr350345232与GRCh38/hg38:chr3 50345124之间的序列内。在一些情况下,治疗剂是与同SEQID NO:331具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是与同SEQ ID NO:331具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:7970-8030组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。在一些情况下,治疗剂是具有选自由SEQ ID NO:7970-8030组成的组的序列的反义寡聚体。在一些情况下,靶肽序列是ZMYND10蛋白质的一部分,并且所述方法治疗包括以下的疾病或疾患:波利尼西亚支气管扩张;原发性纤毛运动障碍22型;卡塔格内综合征;或纤毛病。在一些情况下,所述方法治疗与ZMYND10蛋白质相关的癌症。
治疗剂
在本公开的各种实施方案中,提供用以调节蛋白质表达水平的包含治疗剂的组合物和方法。在一些实施方案中,本文提供了用以调节编码靶肽序列的mRNA前体的选择性剪接的组合物和方法。在一些实施方案中,本文提供了用以在编码靶肽序列的mRNA前体的剪接中诱导外显子跳跃的组合物和方法。在其他实施方案中,治疗剂可用于诱导外显子的纳入以降低蛋白质表达水平。
在一些情况下,治疗剂包含聚核酸聚合物。在一些情况下,治疗剂包含表达聚核酸聚合物的病毒载体,所述病毒载体结合至编码靶肽序列的mRNA前体的靶向区。在一些情况下,病毒载体包含腺病毒载体、腺相关病毒(AAV)载体、豆状病毒载体、单纯疱疹病毒(HSV)病毒载体、反转录病毒载体或任何可应用的病毒载体。在一些情况下,治疗剂包含基因编辑工具,所述基因编辑工具经配置以修饰编码靶肽序列的基因,使得编码低效翻译区的基因区缺失。在一些情况下,基因编辑工具包含用于基于CRISPR-Cas9、TALEN、锌指(ZincFinger)或其他可应用技术来进行基因编辑的载体,例如病毒载体。
根据本公开的一个方面,本文提供了一种通过调节靶肽序列在有需要的受试者的细胞中的表达来治疗所述受试者的疾病或疾患的方法,所述细胞具有mRNA前体,所述mRNA前体编码所述靶肽序列并包含低效翻译区,所述方法包括:使所述受试者的所述细胞与治疗剂接触,所述治疗剂调节编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的所述低效翻译区的剪接,其中所述治疗剂结合至所述mRNA前体的靶向区,由此调节所述mRNA前体的所述低效翻译区的剪接,进而调节不含所述低效翻译区并编码所述靶肽序列的第一经加工mRNA的水平,并且进而调节所述靶肽序列在所述受试者的所述细胞中的表达,其中在所述细胞中产生所述靶肽序列的所述第一经加工mRNA与包含所述低效翻译区的第二经加工mRNA相比具有更高翻译效率。在一些情况下,所述第二经加工mRNA除了包含所述低效翻译区以外在其他方面与所述第一经加工mRNA相同。
在一些其他方面,本文提供了一种通过调节靶肽序列在有需要的受试者的细胞中的表达来治疗所述受试者的疾病或疾患的方法,所述细胞具有mRNA前体,所述mRNA前体编码所述靶肽序列并包含第一起始密码子、第二起始密码子以及位于所述第一起始密码子下游并位于所述第二起始密码子上游的提前终止密码子(PTC),所述方法包括:使所述受试者的所述细胞与治疗剂接触,所述治疗剂调节编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的所述PTC和所述第二起始密码子的剪接,其中所述治疗剂结合至所述mRNA前体的靶向区,由此调节所述mRNA前体的所述PTC和所述第二起始密码子的剪接,进而调节不含所述PTC和所述第二起始密码子并编码所述靶肽序列的第一经加工mRNA的水平,并且进而调节所述靶肽序列在所述受试者的所述细胞中的表达。
在提及减少成熟mRNA中低效翻译区或后接有替代区的PTC的纳入时,减少可为完全减少(例如100%)或可为部分减少。减少可为临床上显著的。减少/校正可相对于未经治疗的受试者中低效翻译区或后接有替代区的PTC的纳入水平而言,或相对于类似受试者群体中低效翻译区或后接有替代区的PTC的纳入量而言。减少/校正可为比普通受试者或治疗前的受试者少至少10%纳入。减少可为比普通受试者或治疗前的受试者少至少20%纳入。减少可为比普通受试者或治疗前的受试者少至少40%纳入。减少可为比普通受试者或治疗前的受试者少至少50%纳入。减少可为比普通受试者或治疗前的受试者少至少60%纳入。减少可为比普通受试者或治疗前的受试者少至少80%纳入。减少可为比普通受试者或治疗前的受试者少至少90%纳入。
在提及增加MeCP2-e1蛋白质水平时,增加可为临床上显著的。增加可相对于未经治疗的受试者中MeCP2-e1蛋白质的水平而言,或相对于类似受试者群体中活性MeCP2-e1蛋白质的量而言。增加可为比普通受试者或治疗前的受试者多至少10%活性MeCP2-e1蛋白质。增加可为比普通受试者或治疗前的受试者多至少20%活性MeCP2-e1蛋白质。增加可为比普通受试者或治疗前的受试者多至少40%活性MeCP2-e1蛋白质。增加可为比普通受试者或治疗前的受试者多至少50%活性MeCP2-e1蛋白质。增加可为比普通受试者或治疗前的受试者多至少80%活性MeCP2-e1蛋白质。增加可为比普通受试者或治疗前的受试者多至少100%活性MeCP2-e1蛋白质。增加可为比普通受试者或治疗前的受试者多至少200%活性MeCP2-e1蛋白质。增加可为比普通受试者或治疗前的受试者多至少500%活性MeCP2-e1蛋白质。
在其中药剂包含聚核酸聚合物的实施方案中,聚核酸聚合物可为约50个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约45个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约40个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约35个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约30个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约24个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约25个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约20个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约19个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约18个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约17个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约16个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约15个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约14个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约13个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约12个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约11个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约10个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约10至约50个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约10至约45个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约10至约40个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约10至约35个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约10至约30个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约10至约25个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约10至约20个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约15至约25个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约15至约30个核苷酸长。聚核酸聚合物可为约12至约30个核苷酸长。
聚核酸聚合物的序列可与mRNA转录物(例如,部分经加工mRNA转录物)的靶序列至少50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或99.5%互补。聚核酸聚合物的序列可与mRNA前体转录物的靶序列100%互补。
聚核酸聚合物的序列可与mRNA前体转录物的靶序列具有4个或更少错配。聚核酸聚合物的序列可与mRNA前体转录物的靶序列具有3个或更少错配。聚核酸聚合物的序列可与mRNA前体转录物的靶序列具有2个或更少错配。聚核酸聚合物的序列可与mRNA前体转录物的靶序列具有1个或更少错配。聚核酸聚合物的序列可与mRNA前体转录物的靶序列不具有错配。
聚核酸聚合物可与mRNA前体转录物的靶序列特异性杂交。例如,聚核酸聚合物可与mRNA前体转录物的靶序列具有91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99.5%或100%序列互补性。杂交可在严格杂交条件下进行。
聚核酸聚合物包含与选自由SEQ ID NO:35-129或SEQ ID NO:534-8095组成的组的序列具有至少50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或99.5%序列同一性的序列。聚核酸聚合物可包含与选自由SEQ ID NO:35-129或534-8095组成的组的序列具有100%序列同一性的序列。下表2列出聚核酸聚合物可包含的示例性序列。
表2.用于翻译调节的聚核酸聚合物的示例性序列
Figure BDA0003423795060004271
Figure BDA0003423795060004281
Figure BDA0003423795060004291
Figure BDA0003423795060004301
当提及聚核酸聚合物序列时,本领域技术人员应理解,所述序列中可容许一个或多个取代,任选地可容许两个取代,使得所述序列维持与靶序列杂交的能力;或者当取代位于靶序列中时,维持被识别为靶序列的能力。可使用标准/默认参数,通过BLAST序列比对来确定序列同一性的参考。例如,序列可具有99%同一性并且仍根据本公开起作用。在其他实施方案中,序列可具有98%同一性并且仍根据本公开起作用。在另一实施方案中,序列可具有95%同一性并且仍根据本公开起作用。在另一实施方案中,序列可具有90%同一性并且仍根据本公开起作用。
反义寡聚体
本文提供了包含反义寡聚体的组合物,所述反义寡聚体通过结合至mRNA前体的靶向部分而诱导外显子跳跃,所述mRNA前体包含含有低效翻译区或后接有替代性起始密码子的PTC的外显子。如本文所使用,术语“ASO”与“反义寡聚体”可互换使用并且是指例如多核苷酸的寡聚体,其包含通过沃森-克里克(Watson-Crick)碱基配对或摆动碱基配对(G-U)与靶核酸(例如MECP2 mRNA前体)序列杂交的核碱基。ASO可具有与靶序列互补的准确序列或具有接近互补性(例如,足以结合靶序列并增强剪接位点处的剪接的互补性)。ASO被设计成使得其结合(杂交)至靶核酸(例如,mRNA前体转录物的靶向部分)并且在生理条件下保持杂交。通常,如果ASO杂交至除预期(靶向)核酸序列以外的位点,则所述ASO杂交至并非靶核酸的有限数目个序列(杂交至除靶核酸以外的若干位点)。ASO的设计可考虑mRNA前体转录物的靶向部分的核酸序列的存在或者基因组或细胞mRNA前体或转录组中的其他位置中充分相似核酸序列的存在,使得ASO将结合其他位点并导致“脱靶”效应的可能性受到限制。本领域中,例如PCT申请第PCT/US2014/054151号(公布为WO 2015/035091,标题为“ReducingNonsense-Mediated mRNA Decay”,通过引用并入本文)中已知的任何反义寡聚体可用于实践本文所描述的方法。
在一些实施方案中,ASO与mRNA前体的靶核酸或靶向部分“特异性杂交”或对其“具有特异性”。通常,这种杂交在基本上大于37℃、优选至少50℃、并且通常在60℃至大约90℃之间的Tm下发生。这种杂交优选对应于严格杂交条件。在给定离子强度和pH下,Tm为50%靶序列与互补寡核苷酸杂交的温度。
当两个单链多核苷酸之间以反向平行构型发生杂交时,寡聚体(例如寡核苷酸)彼此“互补”。如果第一多核苷酸的链中的一者与第二多核苷酸的链中的一者之间可发生杂交,则双链多核苷酸可与另一多核苷酸“互补”。互补性(一个多核苷酸与另一多核苷酸互补的程度)可依据相对链中根据普遍接受的碱基配对规则预期彼此形成氢键的碱基的比例(例如,百分比)加以定量。反义寡聚体(ASO)的序列不一定与同其杂交的靶核酸的序列100%互补。在某些实施方案中,ASO可与其所靶向的靶核酸序列内的靶标区具有至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列互补性。例如,寡聚化合物的20个核碱基中的18个与靶标区互补并将因此特异性杂交的ASO将代表90%互补性。在此实施例中,其余非互补核碱基可集中在一起或穿插有互补核碱基,并且不一定彼此邻接或与互补核碱基邻接。可使用本领域已知的BLAST程序(基础局部比对搜寻工具)或PowerBLAST程序来确定ASO与靶核酸区域的互补百分比(Altschul等人,J.Mol.Biol.,1990,215,403-410;Zhang和Madden,Genome Res.,1997,7,649-656)。
ASO不一定与靶序列中的所有核碱基杂交,并且不与ASO杂交的核碱基可为连续或非连续的。ASO可在mRNA前体转录物的一个或多个区段上杂交,使得间插或相邻区段不参与杂交事件(例如,可形成环结构或发夹结构)。在某些实施方案中,ASO与靶标mRNA前体转录物中的非连续核碱基杂交。例如,ASO可与mRNA前体转录物中通过不与所述ASO杂交的一个或多个核碱基间隔开的核碱基杂交。
本文所描述的ASO包含与mRNA前体的靶部分中存在的核碱基互补的核碱基。术语ASO体现寡核苷酸和包含能够与靶标mRNA上的互补核碱基杂交的核碱基但不包含糖部分的任何其他寡聚分子,例如肽核酸(PNA)。ASO可包含天然存在的核苷酸、核苷酸类似物、经修饰的核苷酸或前述两者或三者的任何组合。术语“天然存在的核苷酸”包括脱氧核糖核苷酸和核糖核苷酸。术语“经修饰的核苷酸”包括具有经修饰或经取代的糖基团和/或具有经修饰主链的核苷酸。在一些实施方案中,ASO的所有核苷酸都是经修饰的核苷酸。与本文所描述的方法和组合物相容的ASO或ASO的组分的化学修饰将是本领域技术人员显而易见的,并且可见于例如以下文献中:美国专利第8,258,109 B2号;美国专利第5,656,612号;美国专利公开第2012/0190728号;以及Dias和Stein,Mol.Cancer Ther.2002,347-355,所述文献通过引用整体并入本文。
ASO的一个或多个核碱基可为任何天然存在的未经修饰的核碱基,例如腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶和尿嘧啶,或者是任何合成或经修饰的核碱基,其与未经修饰的核碱基充分相似使得其能够与靶标mRNA前体上存在的核碱基氢键结。经修饰的核碱基的实例包括但不限于次黄嘌呤、黄嘌呤、7-甲基鸟嘌呤、5,6-二氢尿嘧啶、5-甲基胞嘧啶和5-羟甲基胞嘧啶。
本文所描述的ASO还包含连接寡聚体的组分的主链结构。术语“主链结构”与“寡聚体键”可互换使用,并且是指ASO的单体之间的连接。在天然存在的寡核苷酸中,主链包含连接寡聚体的糖部分的3′-5′磷酸二酯键。本文所描述的ASO的主链结构或寡聚体键可包括但不限于硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯、硒代磷酸酯、二硒代磷酸酯、苯胺硫代磷酸酯、苯胺磷酸酯、氨基磷酸酯等。参见例如LaPlanche等人,Nucleic Acids Res.14:9081(1986);Stec等人,J.Am.Chem.Soc.106:6077(1984);Stein等人,Nucleic Acids Res.16:3209(1988);Zon等人,Anti-Cancer Drug Design 6:539(1991);Zon等人,Oligonucleotides andAnalogues:A Practical Approach,第87-108页(F.Eckstein编,Oxford UniversityPress,Oxford England(1991));Stec等人,美国专利第5,151,510号;Uhlmann和Peyman,Chemical Reviews 90:543(1990)。在一些实施方案中,ASO的主链结构不含磷,而是含有肽键(例如在肽核酸(PNA)中),或含有包括氨基甲酸酯、酰胺以及直链和环状烃基团的连接基团。在一些实施方案中,主链修饰是硫代磷酸酯键。在一些实施方案中,主链修饰是氨基磷酸酯键。
在一些实施方案中,ASO主链的磷核苷酸间键中的每一者处的立体化学是随机的。在一些实施方案中,ASO主链的磷核苷酸间键中的每一者处的立体化学是受控而非随机的。例如,通过引用并入本文的美国专利申请公开第2014/0194610号“Methods for theSynthesis of Functionalized Nucleic Acids”描述用于独立地选择核酸寡聚体中的每个磷原子处的手性倾向的方法。在一些实施方案中,本公开方法中使用的ASO(包括但不限于本文表5和表6中所阐述的ASO中的任一者)包含磷核苷酸间键并非随机的ASO。在一些实施方案中,本公开方法中使用的组合物包含纯非对映异构ASO。在一些实施方案中,本公开方法中使用的组合物包含具有以下非对映异构体纯度的ASO:至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%、至少约99%、约100%、约90%至约100%、约91%至约100%、约92%至约100%、约93%至约100%、约94%至约100%、约95%至约100%、约96%至约100%、约97%至约100%、约98%至约100%、或约99%至约100%。
在一些实施方案中,ASO在其磷核苷酸间键处具有Rp和Sp构型的非随机混合物。例如,已提出,反义寡核苷酸中需要Rp和Sp的混合物以在良好活性与核酸酶稳定性之间获得平衡(Wan等人,2014,“Synthesis,biophysical properties and biological activityof second generation antisense oligonucleotides containing chiralphosphorothioate linkages”,Nucleic Acids Research 42(22):13456-13468,通过引用并入本文)。在一些实施方案中,本公开方法中使用的ASO(包括但不限于本文SEQ ID NO:35-129或534-8095中所阐述的ASO中的任一者)包含约5-100%Rp、至少约5%Rp、至少约10%Rp、至少约15%Rp、至少约20%Rp、至少约25%Rp、至少约30%Rp、至少约35%Rp、至少约40%Rp、至少约45%Rp、至少约50%Rp、至少约55%Rp、至少约60%Rp、至少约65%Rp、至少约70%Rp、至少约75%Rp、至少约80%Rp、至少约85%Rp、至少约90%Rp或至少约95%Rp,其余是Sp;或包含约100%Rp。在一些实施方案中,本公开方法中使用的ASO(包括但不限于本文所阐述的包含与包含SEQ ID NO:35-129或534-8095中的任一者的至少8个连续核酸的区域具有至少约80%、85%、90%、95%、97%或100%序列同一性的序列的ASO中的任一者)包含约10%至约100%Rp、约15%至约100%Rp、约20%至约100%Rp、约25%至约100%Rp、约30%至约100%Rp、约35%至约100%Rp、约40%至约100%Rp、约45%至约100%Rp、约50%至约100%Rp、约55%至约100%Rp、约60%至约100%Rp、约65%至约100%Rp、约70%至约100%Rp、约75%至约100%Rp、约80%至约100%Rp、约85%至约100%Rp、约90%至约100%Rp、或约95%至约100%Rp、约20%至约80%Rp、约25%至约75%Rp、约30%至约70%Rp、约40%至约60%Rp、或约45%至约55%Rp,其余是Sp。
在一些实施方案中,本公开方法中使用的ASO(包括但不限于本文所阐述的包含与包含SEQ ID NO:35-129或534-8095中的任一者的至少8个连续核酸的区域具有至少约80%、85%、90%、95%、97%或100%序列同一性的序列的ASO中的任一者)包含约5-100%Sp、至少约5%Sp、至少约10%Sp、至少约15%Sp、至少约20%Sp、至少约25%Sp、至少约30%Sp、至少约35%Sp、至少约40%Sp、至少约45%Sp、至少约50%Sp、至少约55%Sp、至少约60%Sp、至少约65%Sp、至少约70%Sp、至少约75%Sp、至少约80%Sp、至少约85%Sp、至少约90%Sp或至少约95%Sp,其余是Rp;或包含约100%Sp。在实施方案中,本公开方法中使用的ASO(包括但不限于本文所阐述的包含与包含SEQ ID NO:35-129或534-8095中的任一者的至少8个连续核酸的区域具有至少约80%、85%、90%、95%、97%或100%序列同一性的序列的ASO中的任一者)包含约10%至约100%Sp、约15%至约100%Sp、约20%至约100%Sp、约25%至约100%Sp、约30%至约100%Sp、约35%至约100%Sp、约40%至约100%Sp、约45%至约100%Sp、约50%至约100%Sp、约55%至约100%Sp、约60%至约100%Sp、约65%至约100%Sp、约70%至约100%Sp、约75%至约100%Sp、约80%至约100%Sp、约85%至约100%Sp、约90%至约100%Sp、或约95%至约100%Sp、约20%至约80%Sp、约25%至约75%Sp、约30%至约70%Sp、约40%至约60%Sp、或约45%至约55%Sp,其余是Rp。
本文所描述的ASO中的任一者可含有包含核糖或脱氧核糖的糖部分(如存在于天然存在的核苷酸中),或含有经修饰的糖部分或糖类似物(包括吗啉环)。经修饰糖部分的非限制性实例包括2′取代,例如2′-O-甲基(2′-O-Me)、2′-O-甲氧基乙基(2′MOE)、2′-O-氨基乙基、2′F;N3′->P5′氨基磷酸酯、2′二甲氨基氧基乙氧基、2′二甲氨基乙氧基乙氧基、2′-胍鎓、2′-O-乙基胍鎓、氨基甲酸酯修饰糖和双环修饰糖。在一些实施方案中,糖部分修饰选自2′-O-Me、2′F和2′MOE。在一些实施方案中,糖部分修饰是额外桥键,例如在锁核酸(LNA)中。在一些实施方案中,糖类似物含有吗啉环,例如二氨基磷酸酯吗啉基(PMO)。在一些实施方案中,糖部分包含呋喃核糖基或2′脱氧呋喃核糖基修饰。在一些实施方案中,糖部分包含2′4′受约束的2′O-甲基氧基乙基(eMOE)修饰。在一些实施方案中,糖部分包含cEt 2′,4′受约束的2′-O乙基BNA修饰。在一些实施方案中,糖部分包含三环DNA(teDNA)修饰。在一些实施方案中,糖部分包含亚乙基核酸(ENA)修饰。在一些实施方案中,糖部分包含MCE修饰。修饰是本领域已知的,并且描述于例如如下文献中:Jarver等人,2014,“A Chemical View ofOligonucleotides for Exon Skipping and Related Drug Applications”,NucleicAcid Therapeutics 24(1):37-47,出于此目的通过引用并入本文。
在一些实施方案中,ASO的每个单体以相同方式经修饰,例如ASO的主链的每个键包含硫代磷酸酯键或每个核糖部分包含2′O-甲基修饰。存在于ASO的单体组分中的每一者上的此类修饰被称为“均一修饰”。在一些实施例中,可能需要不同修饰的组合,例如ASO可包含二氨基磷酸酯键与包含吗啉环(吗啉基)的糖部分的组合。针对ASO的不同修饰的组合被称为“混合修饰”或“混合化学性质”。
在一些实施方案中,ASO包含一个或多个主链修饰。在一些实施方案中,ASO包含一个或多个糖部分修饰。在一些实施方案中,ASO包含一个或多个主链修饰和一个或多个糖部分修饰。在一些实施方案中,ASO包含2′MOE修饰和硫代磷酸酯主链。在一些实施方案中,ASO包含二氨基磷酸酯吗啉基(PMO)。在一些实施方案中,ASO包含肽核酸(PNA)。本文所描述的ASO或ASO的任何组分(例如,核碱基、糖部分、主链)中的任一者可被修饰以获得ASO的所需性质或活性或降低ASO的非所需性质或活性。例如,ASO或任何ASO的一个或多个组分可被修饰以:增强与mRNA前体转录物上的靶序列的结合亲和力;减少与任何非靶标序列的结合;减少被细胞核酸酶(即,RNase H)的降解;改进ASO至细胞中和/或至细胞的细胞核中的摄取;改变ASO的药物动力学或药效学;和/或调节ASO的半衰期。
在一些实施方案中,ASO由经2′-O-(2-甲氧基乙基)(MOE)硫代磷酸酯修饰的核苷酸构成。由此类核苷酸构成的ASO尤其适合于本文中所公开的方法;具有此类修饰的寡聚体已展现具有显著增强的抗核酸酶降解性和增加的生物可用性,使得其在本文所描述的一些实施方案中例如适合于口服递送。参见例如Geary等人,J Pharmacol Exp Ther.2001;296(3):890-7;Geary等人,J Pharmacol Exp Ther.2001;296(3):898-904。
合成ASO的方法将是本领域技术人员已知的。替代地或另外,ASO可获自市售来源。
除非另外规定,否则单链核酸(例如mRNA前体转录物、寡核苷酸、ASO等)序列的左侧端是5′端,并且单链或双链核酸序列的左侧方向被称为5′方向。类似地,核酸序列(单链或双链)的右侧端或方向是3′端或方向。一般来说,核酸中在参考点5′的区域或序列被称为“上游”,并且核酸中在参考点3′的区域或序列被称为“下游”。一般来说,mRNA的5′方向或端是起始密码子(initiation codon/start codon)所处位置,而3′端或方向是终止密码子所处位置。在一些方面,核酸中参考点上游的核苷酸可由负数表示,而参考点下游的核苷酸可由正数表示。例如,参考点(例如,mRNA中的外显子-外显子连接点)可表示为“零”位点,并且与所述参考点直接相邻并在其上游的核苷酸表示为“减一”,例如“-1”,而与所述参考点直接相邻并在其下游的核苷酸表示为“加一”,例如“+1”。
在一些实施方案中,ASO与mRNA前体的靶向部分互补(并结合),所述mRNA前体包含含有低效翻译区或后接有替代性起始密码子的PTC的外显子,并且所述靶向部分在外显子的5′剪接位点下游(在3′方向上)。在一些实施方案中,靶标部分在相对于外显子的5′剪接位点(或3′端)的约+1至约+500的区域内。在一些实施方案中,靶向部分在相对于外显子的5′剪接位点(或3′端)的+6至+40,000核苷酸的区域内。在一些方面,ASO与在相对于外显子的5′剪接位点(或3′端)的约+1至约+40,000、约+1至约+30,000、约+1至约+20,000、约+1至约+15,000、约+1至约+10,000、约+1至约+5,000、约+1至约+4,000、约+1至约+3,000、约+1至约+2,000、约+1至约+1,000、约+1至约+500、约+1至约+490、约+1至约+480、约+1至约+470、约+1至约+460、约+1至约+450、约+1至约+440、约+1至约+430、约+1至约+420、约+1至约+410、约+1至约+400、约+1至约+390、约+1至约+380、约+1至约+370、约+1至约+360、约+1至约+350、约+1至约+340、约+1至约+330、约+1至约+320、约+1至约+310、约+1至约+300、约+1至约+290、约+1至约+280、约+1至约+270、约+1至约+260、约+1至约+250、约+1至约+240、约+1至约+230、约+1至约+220、约+1至约+210、约+1至约+200、约+1至约+190、约+1至约+180、约+1至约+170、约+1至约+160、约+1至约+150、约+1至约+140、约+1至约+130、约+1至约+120、约+1至约+110、约+1至约+100、约+1至约+90、约+1至约+80、约+1至约+70、约+1至约+60、约+1至约+50、约+1至约+40、约+1至约+30、或约+1至约+20的区域内的靶向部分互补。在一些方面,ASO与在相对于外显子的5′剪接位点(或3′端)的约+1至约+100、约+100至约+200、约+200至约+300、约+300至约+400、或约+400至约+500的区域内的靶向部分互补。
在一些实施方案中,ASO与mRNA前体的靶向部分互补(并结合),所述mRNA前体包含含有低效翻译区或后接有替代性起始密码子的PTC的外显子,并且所述靶向部分在外显子的5′剪接位点(或3′端)上游(在5′方向上)。在一些实施方案中,靶向部分在相对于外显子的5′剪接位点(或3′端)的约-4至约-270的区域内。在一些实施方案中,靶向部分在相对于外显子的5′剪接位点(或3′端)的-1至-40,000核苷酸的区域内。在一些方面,ASO与在相对于外显子的5′剪接位点(或3′端)的约-1至约-40,000、约-1至约-30,000、约-1至约-20,000、约-1至约-15,000、约-1至约-10,000、约-1至约-5,000、约-1至约-4,000、约-1至约-3,000、约-1至约-2,000、约-1至约-1,000、约-1至约-500、约-1至约-490、约-1至约-480、约-1至约-470、约-1至约-460、约-1至约-450、约-1至约-440、约-1至约-430、约-1至约-420、约-1至约-410、约-1至约-400、约-1至约-390、约-1至约-380、约-1至约-370、约-1至约-360、约-1至约-350、约-1至约-340、约-1至约-330、约-1至约-320、约-1至约-310、约-1至约-300、约-1至约-290、约-1至约-280、约-1至约-270、约-1至约-260、约-1至约-250、约-1至约-240、约-1至约-230、约-1至约-220、约-1至约-210、约-1至约-200、约-1至约-190、约-1至约-180、约-1至约-170、约-1至约-160、约-1至约-150、约-1至约-140、约-1至约-130、约-1至约-120、约-1至约-110、约-1至约-100、约-1至约-90、约-1至约-80、约-1至约-70、约-1至约-60、约-1至约-50、约-1至约-40、约-1至约-30、或约-1至约-20的区域内的靶向部分互补。
在一些实施方案中,ASO与mRNA前体的靶向部分互补(并结合),所述mRNA前体包含含有低效翻译区或后接有替代性起始密码子的PTC的外显子,并且所述靶向部分在外显子的3′剪接位点(或5′端)上游(在5′方向上)。在一些实施方案中,靶向部分在相对于外显子的3′剪接位点(或5′端)的约-1至约-500的区域内。在一些实施方案中,ASO与在相对于所包括外显子的3′剪接位点的-1至-40,000的区域内的靶向部分互补。在一些方面,ASO与在相对于所包括外显子的3′剪接位点的约-1至约-40,000、约-1至约-30,000、-1至约-20,000、约-1至约-15,000、约-1至约-10,000、约-1至约-5,000、约-1至约-4,000、约-1至约-3,000、约-1至约-2,000、约-1至约-1,000、约-1至约-500、约-1至约-490、约-1至约-480、约-1至约-470、约-1至约-460、约-1至约-450、约-1至约-440、约-1至约-430、约-1至约-420、约-1至约-410、约-1至约-400、约-1至约-390、约-1至约-380、约-1至约-370、约-1至约-360、约-1至约-350、约-1至约-340、约-1至约-330、约-1至约-320、约-1至约-310、约-1至约-300、约-1至约-290、约-1至约-280、约-1至约-270、约-1至约-260、约-1至约-250、约-1至约-240、约-1至约-230、约-1至约-220、约-1至约-210、约-1至约-200、约-1至约-190、约-1至约-180、约-1至约-170、约-1至约-160、约-1至约-150、约-1至约-140、约-1至约-130、约-1至约-120、约-1至约-110、约-1至约-100、约-1至约-90、约-1至约-80、约-1至约-70、约-1至约-60、约-1至约-50、约-1至约-40、约-1至约-30、或约-1至约-20的区域内的靶向部分互补。在一些方面,ASO与在相对于所包括外显子的3′剪接位点的约-1至约-100、约-100至约-200、约-200至约-300、约-300至约-400、或约-400至约-500的区域内的靶向部分互补。
在一些实施方案中,ASO与mRNA前体的靶向部分互补(并结合),所述mRNA前体包含含有低效翻译区或后接有替代性起始密码子的PTC的外显子,并且所述靶向部分在外显子的3′剪接位点(5′端)下游(在3′方向上)。在一些实施方案中,ASO与在相对于外显子的3′剪接位点的约+1至约+40,000的区域内的靶向部分互补。在一些方面,ASO与在相对于外显子的3′剪接位点的约+1至约+40,000、约+1至约+30,000、约+1至约+20,000、约+1至约+15,000、约+1至约+10,000、约+1至约+5,000、约+1至约+4,000、约+1至约+3,000、约+1至约+2,000、约+1至约+1,000、约+1至约+500、约+1至约+490、约+1至约+480、约+1至约+470、约+1至约+460、约+1至约+450、约+1至约+440、约+1至约+430、约+1至约+420、约+1至约+410、约+1至约+400、约+1至约+390、约+1至约+380、约+1至约+370、约+1至约+360、约+1至约+350、约+1至约+340、约+1至约+330、约+1至约+320、约+1至约+310、约+1至约+300、约+1至约+290、约+1至约+280、约+1至约+270、约+1至约+260、约+1至约+250、约+1至约+240、约+1至约+230、约+1至约+220、约+1至约+210、约+1至约+200、约+1至约+190、约+1至约+180、约+1至约+170、约+1至约+160、约+1至约+150、约+1至约+140、约+1至约+130、约+1至约+120、约+1至约+110、约+1至约+100、约+1至约+90、约+1至约+80、约+1至约+70、约+1至约+60、约+1至约+50、约+1至约+40、约+1至约+30、或约+1至约+20、或约+1至约+10的区域内的靶向部分互补。
在一些实施方案中,靶向部分在相对于外显子的5′剪接位点(3′端)的+100至相对于外显子的3′剪接位点(5′端)的-100的区域内。在一些实施方案中,靶向部分在含有低效翻译区或后接有替代性起始密码子的PTC的外显子内。在一些实施方案中,靶向部分包含外显子-内含子边界。
ASO可具有适合于特异性结合并有效增强剪接的任何长度。在一些实施方案中,ASO由8至50个核碱基组成。例如,ASO可为8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、40、45或50个核碱基长。在一些实施方案中,ASO由超过50个核碱基组成。在一些实施方案中,ASO是8至50个核碱基、8至40个核碱基、8至35个核碱基、8至30个核碱基、8至25个核碱基、8至20个核碱基、8至15个核碱基、9至50个核碱基、9至40个核碱基、9至35个核碱基、9至30个核碱基、9至25个核碱基、9至20个核碱基、9至15个核碱基、10至50个核碱基、10至40个核碱基、10至35个核碱基、10至30个核碱基、10至25个核碱基、10至20个核碱基、10至15个核碱基、11至50个核碱基、11至40个核碱基、11至35个核碱基、11至30个核碱基、11至25个核碱基、11至20个核碱基、11至15个核碱基、12至50个核碱基、12至40个核碱基、12至35个核碱基、12至30个核碱基、12至25个核碱基、12至20个核碱基、12至15个核碱基、13至50个核碱基、13至40个核碱基、13至35个核碱基、13至30个核碱基、13至25个核碱基、13至20个核碱基、14至50个核碱基、14至40个核碱基、14至35个核碱基、14至30个核碱基、14至25个核碱基、14至20个核碱基、15至50个核碱基、15至40个核碱基、15至35个核碱基、15至30个核碱基、15至25个核碱基、15至20个核碱基、20至50个核碱基、20至40个核碱基、20至35个核碱基、20至30个核碱基、20至25个核碱基、25至50个核碱基、25至40个核碱基、25至35个核碱基、或25至30个核碱基长。在一些实施方案中,ASO是18个核苷酸长。在一些实施方案中,ASO是15个核苷酸长。在一些实施方案中,ASO是25个核苷酸长。
在一些实施方案中,使用具有不同化学结构但与mRNA前体的同一靶向部分互补的两种或更多种ASO。在一些实施方案中,使用与mRNA前体的不同靶向部分互补的两种或更多种ASO。
在一些实施方案中,本公开的反义寡核苷酸与一个或多个部分或缀合物化学连接,例如与靶向部分或增强寡核苷酸的活性或细胞摄取的另一缀合物化学连接。此类部分包括但不限于脂质部分,例如作为胆固醇部分、胆固醇基部分、脂族链(例如十二烷二醇或十一烷基残基)、聚胺或聚乙二醇链或金刚烷乙酸。包含亲脂性部分的寡核苷酸和制备方法已描述于所公布文献中。在实施方案中,反义寡核苷酸与以下部分缀合,所述部分包括但不限于:无碱基核苷酸、聚醚、聚胺、聚酰胺、肽、碳水化合物(例如N-乙酰基半乳胺糖(GalNAc)、N-Ac-葡糖胺(GluNAc)或甘露糖(例如甘露糖-6-磷酸))、脂质或多烃化合物。如本领域中所理解以及文献中所描述,缀合物可例如使用连接基团在糖、碱基或磷酸基团上的若干位置中的任一者处与包含反义寡核苷酸的任何核苷酸中的一者或多者连接。连接基团可包括二价或三价支链连接基团。在实施方案中,缀合物连接至反义寡核苷酸的3′端。制备寡核苷酸缀合物的方法例如描述于通过引用并入本文的美国专利第8,450,467号“Carbohydrate conjugates as delivery agents for oligonucleotides”中。
在一些实施方案中,有待由ASO靶向的核酸是表达于细胞(例如真核细胞)中的mRNA前体。在一些实施方案中,术语“细胞”可指细胞群。在一些实施方案中,细胞在受试者内。在一些实施方案中,细胞与受试者分离。在一些实施方案中,细胞是离体的。在一些实施方案中,细胞是疾患或疾病相关的细胞或细胞系。在一些实施方案中,细胞是体外细胞(例如在细胞培养物中)。
药物组合物
包含所描述组合物的药剂(例如反义寡核苷酸)并且适用于所描述方法中的任一者的药物组合物或制剂可根据医药行业中熟知并且所公布文献中描述的常规技术来制备。在实施方案中,用于治疗受试者的药物组合物或制剂包含有效量的如本文所描述的任何反义寡聚体或其药学上可接受的盐、溶剂合物、水合物或酯。包含反义寡聚体的药物制剂还可包含药学上可接受的赋形剂、稀释剂或载体。
药学上可接受的盐适用于与人类和低等动物的组织接触而无过度毒性、刺激、过敏反应等,并且与合理的益处/风险比相称。参见例如S.M.Berge等人,J.PharmaceuticalSciences,66:1-19(1977),其出于此目的通过引用并入本文。所述盐可在化合物的最终分离和纯化期间原位制备,或通过使游离碱形式与合适的有机酸反应而单独制备。药学上可接受的无毒性酸加成盐的实例是用无机酸(例如盐酸、氢溴酸、磷酸、硫酸和过氯酸)或用有机酸(例如乙酸、草酸、马来酸、酒石酸、柠檬酸、丁二酸或丙二酸)或通过使用其他所记载方法(例如离子交换)形成的氨基的盐。其他药学上可接受的盐包括己二酸盐、海藻酸盐、抗坏血酸盐、天冬氨酸盐、苯磺酸盐、苯甲酸盐、硫酸氢盐、硼酸盐、丁酸盐、樟脑酸盐、樟脑磺酸盐、柠檬酸盐、环戊烷丙酸盐、二葡糖酸盐、十二烷基硫酸盐、乙烷磺酸盐、甲酸盐、富马酸盐、葡庚糖酸盐、甘油磷酸盐、葡糖酸盐、半硫酸盐、庚酸盐、己酸盐、氢碘酸盐、2-羟基-乙烷磺酸盐、乳糖酸盐、乳酸盐、月桂酸盐、月桂基硫酸盐、苹果酸盐、马来酸盐、丙二酸盐、甲磺酸盐、2-萘磺酸盐、烟碱酸盐、硝酸盐、油酸盐、草酸盐、棕榈酸盐、双羟萘酸盐、果胶酸盐、过硫酸盐、3-苯基丙酸盐、磷酸盐、苦味酸盐、特戊酸盐、丙酸盐、硬脂酸盐、丁二酸盐、硫酸盐、酒石酸盐、硫氰酸盐、对甲苯磺酸盐、十一烷酸盐、戊酸盐等。代表性碱金属或碱土金属盐包括钠盐、锂盐、钾盐、钙盐、镁盐等。在适当时,其他药学上可接受的盐包括无毒铵、季铵和使用例如卤离子、氢氧根、羧酸根、硫酸根、磷酸根、硝酸根、低级烷基磺酸根和芳基磺酸根的平衡离子形成的胺阳离子。
在一些实施方案中,组合物被配制成许多可能剂型中的任一者,例如(但不限于)片剂、胶囊、凝胶胶囊、液体糖浆、软凝胶、栓剂和灌肠剂。在实施方案中,组合物在水性、非水性或混合介质中配制成悬浮液。水性悬浮液还可含有提高悬浮液粘度的物质,包括(例如)羧甲基纤维素钠、山梨糖醇和/或聚葡萄糖。悬浮液还可含有稳定剂。在实施方案中,本公开的药物制剂或组合物包括但不限于溶液、乳液、微乳液、泡沫或含有脂质体的制剂(例如,阳离子性或非阳离子性脂质体)。
在适当时并且如本领域技术人员熟知或如所公布文献中所描述,本文所描述的药物组合物或制剂可包含一种或多种穿透增强剂、载体、赋形剂或其他活性或非活性成分。在实施方案中,脂质体还包括空间稳定型脂质体,例如包含一种或多种特化脂质的脂质体。这些特化脂质产生循环寿命增加的脂质体。在实施方案中,空间稳定型脂质体包含一种或多种糖脂,或通过一种或多种亲水性聚合物(例如聚乙二醇(PEG)部分)衍生。在一些实施方案中,药物制剂或组合物中包括表面活性剂。表面活性剂在药品、制剂和乳液中的用途是本领域中熟知的。在实施方案中,本公开使用穿透增强剂来实现反义寡核苷酸的有效递送,例如辅助跨细胞膜的扩散和/或增强亲脂性药物的渗透性。在一些实施方案中,穿透增强剂是表面活性剂、脂肪酸、胆汁盐、螯合剂或非螯合性非表面活性剂。
在一些实施方案中,药物制剂包含多种反义寡核苷酸。在实施方案中,反义寡核苷酸与另一药物或治疗剂组合施用。
组合疗法
在一些实施方案中,本公开中所公开的ASO可与一种或多种额外治疗剂组合使用。在一些实施方案中,一种或多种额外治疗剂可包含小分子。例如,一种或多种额外治疗剂可包含WO2016128343A1、WO2017053982A1、WO2016196386A1、WO201428459A1、WO201524876A2、WO2013119916A2和WO2014209841A2中所描述的小分子,所述文献通过引用整体并入本文。在一些实施方案中,一种或多种额外治疗剂包含可用于校正内含子保留的ASO。
受试者的治疗
本文提供的组合物中的任一者可向个体施用。“个体”可与“受试者”或“患者”互换使用。个体可为哺乳动物,例如人类或动物,例如非人类灵长类动物、啮齿动物、兔、大鼠、小鼠、马、驴、山羊、猫、狗、母牛、猪或绵羊。在实施方案中,个体是人类。在实施方案中,个体是胎儿、胚胎或儿童。在其他实施方案中,个体可为另一真核生物体,例如植物。在一些实施方案中,本文所提供的组合物被施用于离体细胞。
在一些实施方案中,作为治疗疾病或病症的方法,向个体施用本文所提供的组合物。在一些实施方案中,个体患有遗传疾病,例如本文所描述的疾病中的任一者。在一些实施方案中,个体有风险患上疾病,例如本文所描述的疾病中的任一者。在一些实施方案中,个体患上由蛋白质的量不足或蛋白质的活性不足引起的疾病或病症的风险增加。如果个体患上由蛋白质的量不足或蛋白质的活性不足引起的疾病或病症的“风险增加”,则所述方法涉及预防性或防治性治疗。例如,个体可由于家族病史而患上这种疾病或病症的风险增加。通常,患上这种疾病或病症的风险增加的个体受益于防治性治疗(例如通过阻止或延迟疾病或病症的发作或进展)。在实施方案中,例如通过直接或间接地(例如经由母亲)向胎儿施用ASO组合物而在子宫内治疗胎儿。
用于施用本公开的ASO的合适途径可根据需要递送ASO的细胞类型而变化。本公开的ASO可以肠胃外方式,例如通过鞘内注射、脑室内注射、腹膜内注射、肌肉内注射、皮下注射或静脉内注射向患者施用。
在实施方案中,反义寡核苷酸通过本领域中已知的任何方法与一种或多种能够促进本发明反义寡核苷酸跨血脑屏障的穿透的药剂一起施用。例如,通过向肌肉组织中的运动神经元施用腺病毒载体进行的药剂的递送描述于通过引用并入本文的美国专利第6,632,427号“Adenoviral-vector-mediated gene transfer into medullary motorneurons”中。载体至大脑(例如纹状体、丘脑、海马区或黑质)的直接递送描述于例如通过引用并入本文的美国专利第6,756,523号“Adenovirus vectors for the transfer offoreign genes into cells of the central nervous system particularly in brain”中。
在一些实施方案中,反义寡核苷酸与提供所需药学或药效学性质的药剂连接或缀合。在实施方案中,反义寡核苷酸与本领域中已知用于促进跨血脑屏障的穿透或转运的物质(例如,针对转铁蛋白受体的抗体)偶联。在实施方案中,反义寡核苷酸与病毒载体连接,例如以使反义化合物更有效或增加跨血脑屏障的转运。在实施方案中,通过输注糖或氨基酸来辅助渗透性血脑屏障破坏,所述糖例如内消旋赤藻糖醇、木糖醇、D(+)半乳糖、D(+)乳糖、D(+)木糖、卫矛醇、肌醇、L(-)果糖、D(-)甘露糖醇、D(+)葡萄糖、D(+)阿拉伯糖、D(-)阿拉伯糖、纤维二糖、D(+)麦芽糖、D(+)棉子糖、L(+)鼠李糖、D(+)蜜二糖、D(-)核糖、福寿草醇、D(+)阿拉伯糖醇、L(-)阿拉伯糖醇、D(+)岩藻糖、L(-)岩藻糖、D(-)来苏糖、L(+)来苏糖和L(-)来苏糖;所述氨基酸例如谷氨酰胺、赖氨酸、精氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、甘氨酸、组氨酸、亮氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、缬氨酸和牛磺酸。用于增强血脑屏障穿透的方法和材料描述于例如以下文献中:美国专利第9,193,969号,“Compositions and methods for selective delivery ofoligonucleotide molecules to specific neuron types”;美国专利第4,866,042号,“Method for the delivery of genetic material across the blood brain barrier”;美国专利第6,294,520号,“Material for passage through the blood-brain barrier”;和美国专利第6,936,589号,“Parenteral delivery systems”,每个文献通过引用并入本文。
在一些实施方案中,本公开的ASO使用例如通过引用并入本文的美国专利第9,193,969号中所描述的方法与以下各者偶联:多巴胺再摄取抑制剂(DRI)、选择性血清素再摄取抑制剂(SSRI)、去甲肾上腺素再摄取抑制剂(NRI)、去甲肾上腺素-多巴胺再摄取抑制剂(NDRI)和血清素-去甲肾上腺素-多巴胺再摄取抑制剂(SNDRI)。
在一些实施方案中,使用本领域中已知并描述的任何方法来评价使用所述方法和组合物治疗的受试者的疾患改善。
实施例
将通过以下实施例更确切地说明本公开。然而,应理解,本公开不以任何方式受这些实施例限制。
实施例1:确认MECP2 mRNA加工中的外显子2纳入事件。
在外显子中使用来自经DMSO处理或经嘌呤霉素(Puro)或环己酰亚胺(CHX)处理的RenCellsVM(神经祖细胞)的细胞质RNA进行RT-PCR分析可确认与在mRNA加工期间经历选择性剪接的外显子对应的条带的存在。引物被设计成靶向MECP2基因的外显子1和外显子3。图3A展示分别对应于e2 mRNA同功型(具有外显子1、2和3)和e1 mRNA同功型(具有外显子1和3)的条带。对条带进行光密度分析以计算总转录物的外显子纳入百分比。用环己酰亚胺或嘌呤霉素处理细胞并未引起e2 mRNA同功型的显著改变,如图3B中所展示。
实施例2:MECP2的外显子2区的ASO Walk。
使用18聚体2′-MOEASO(PS主链),用靶向紧接3′剪接位点上游、跨3′剪接位点、外显子2、跨5′剪接位点和5′剪接位点下游的序列的各种ASO对MCEP2 mRNA前体的外显子2区进行ASO walk。 ASO被设计成通过一次位移5个核苷酸而覆盖这些区域。
实施例3:通过RT-PCR评价ASO Walk。
例如通过RT-PCR来评价ASO walk序列。使用来自用80nM ASO转染24小时的HEK293细胞的RNA进行的RT-PCR描绘于图4中。用于RT-PCR分析的引物位于外显子1和3中。RT-PCR产物的定量经绘制为e2同功型的百分比(e2/(e2+e1)*100),如图5(N=2)中所展示。
实施例4:示例性ASO诱导MECP2外显子2跳跃并增加MeCP2蛋白质表达。
使用来自用80nM ASO(ASO1、52或33)转染24小时或未经转染(模拟物)的HEK293细胞的RNA进行RT-PCR。图6A显示,用针对MECP2的ASO处理的HEK293细胞诱导外显子2纳入(ASO52)或外显子2跳跃(ASO33)。ASO1靶向MECP2但不影响外显子2剪接。条形图表示平均值±SE。n=3。通过检查用ASO 1、52和33处理的细胞的全细胞溶解物的蛋白质印迹法(westernblot),图6B显示,与转染后72小时的模拟物相比,用外显子跳跃型ASO33处理的细胞展现同功型切换和增加的总MeCP2蛋白质。抗MeCP2抗体检测同功型e1(顶部条带)和e2(底部条带)。对应于MeCP2的条带的定量相对于TBP(TATA结合蛋白)内参照归一化并绘制为相比于对照物(模拟物)的倍数变化。
实施例5:总MECP2 mRNA(e1+e2)的定量。
来自图6A的RT-PCR产物经定量并绘制为e1+e2的总和(图7)。ASO处理未增加总mRNA水平。
实施例6.在鼠类细胞中测试示例性ASO
与在人类细胞系中筛选ASO并行地在鼠类细胞中筛选ASO。MECP2外显子2的外显子序列以及侧接内含子序列在人类与小鼠之间几乎完全保守。靶向人类转录物的保守区的前导候选物在鼠类细胞(小鼠胚胎纤维母细胞,MEF)中可保留其效能。使用来自用10、30或80nM ASO(NT、ASO1、52或33)转染24小时或未经转染(模拟物)的MEF细胞的RNA进行RT-PCR。图8显示,用针对MECP2的ASO处理的MEF细胞诱导外显子2纳入(ASO52)或外显子2跳跃(ASO33)(左图)。ASO1靶向MECP2但不影响外显子2剪接。图8还展示绘制RT-PCR测定的定量并表示平均值±SD(n=2)(右图)的条形图。效应是剂量反应性的。
例如通过RT-PCR评价ASO microwalk序列。使用来自用80nM ASO核转染24小时的ReNcell VM的RNA进行RT-PCR,所述ASO以1nt步长跨越ASO 31和33以及37和38周围的区域(图9)。用于RT-PCR分析的引物位于外显子1和3中。RT-PCR产物的定量绘制为e2同功型的百分比(e2/(e2+e1)*100),如图9A(N=2)中所示。
实施例7.在雷特综合征的动物模型中测试示例性ASO
在若干小鼠模型中测试所选择的靶向MECP2的ASO,以测试以下效应:(a)野生型小鼠中MeCP2表达的增加;(b)异型接合性基因剔除小鼠中MeCP2表达的增加;以及(c)携带部分功能性MECP2 p.A140V变体的小鼠中MeCP2表达的增加。
通过脑室内(icv)推注将ASO递送至新生的野生型小鼠中。2-14天后评估ASO对Mecp2外显子2跳跃和蛋白质表达的效应。一旦确定效应的持续时间和幅度,即在使用雷特综合征的小鼠模型的功能性研究中测试前导ASO。由于可使用TANGO-ASO诱导MECP2重复综合征,因此使用一连串神经和行为评估来在野生型动物和异型接合性基因剔除动物(JAXB6.129P2(C)-Mecp2tm1.1Bird/J)中比较治疗性ASO的效应。使用异型接合性基因剔除动物的研究也可确定神经元亚群中MeCP2的增加是否有益并且可缓解所述表型。无Mecp2表达的小鼠可再现雷特氏患者的若干疾病表型,包括肌无力和神经学表型(PsychoGenics Inc.)。相比于野生型同窝小鼠,8至12周龄异型接合性Mecp2剔除雌性小鼠的握力以及其从旋杆落下的等待时间可显著减少。相比于携带两个Mecp2拷贝的小鼠,16周龄异型接合性雌性小鼠可具有呼吸异常(呼吸变化和呼吸暂停持续时间)并展现减少的脑衍生神经营养因子(BNDF)表达。
也在表达MECP2 p.A140V的小鼠模型(JAX B6N.129-Mecp2tm1.1Vnar/J)中测试ASO介导的MeCP2表达增加的效应。与野生型对照动物相比,雌性Mecp2A140/y动物中的海马神经元可明显较小。此外,mTOR信号传导可失调,如通过mTORC2亚基RICTOR的表达减少以及mTOR和4E-BP1的磷酸化减少所示。针对这些小鼠的大脑中海马神经元的形态以及mTOR信号传导来测试增加MeCP2表达的ASO的效应。
表3.示例性ASO的序列.
Figure BDA0003423795060004501
Figure BDA0003423795060004511
Figure BDA0003423795060004521
Figure BDA0003423795060004531
表4.microwalk中示例性ASO的序列
Figure BDA0003423795060004541
虽然已在本文中展示并描述了本公开的优选实施方案,但对于本领域技术人员应显而易见的是,这些实施方案仅作为示例提供。本领域技术人员现将在不脱离本公开的情况下想到许多变化、改变和取代。应理解,本文所描述的本公开的实施方案的各种替代方案可用于实践本公开。以下权利要求旨在限定本公开的范围,并且由此涵盖在这些权利要求及其等同物范围内的方法和结构。

Claims (83)

1.一种通过具有编码靶肽序列并包含低效翻译区的mRNA前体的细胞来调节靶肽序列的表达的方法,所述方法包括使所述细胞与治疗剂接触,所述治疗剂与编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的靶向区结合,由此调节所述低效翻译区从编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的剪接,进而调节不含所述低效翻译区并编码包含所述靶肽序列的第一蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并且进而调节所述靶肽序列在所述细胞中的表达,其中在所述细胞中产生包含所述靶肽序列的所述第一蛋白质的所述第一经加工mRNA的翻译效率高于产生包含所述靶肽序列的第二蛋白质的第二经加工mRNA的翻译效率,并且其中所述第二经加工mRNA包含所述低效翻译区。
2.一种通过调节靶肽序列在有需要的受试者的细胞中的表达来治疗所述受试者的疾病或疾患的方法,所述细胞具有编码所述靶肽序列并包含低效翻译区的mRNA前体,所述方法包括:使所述受试者的所述细胞与治疗剂接触,所述治疗剂调节所述低效翻译区从编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的剪接,其中所述治疗剂与所述mRNA前体的靶向区结合,由此调节所述低效翻译区从所述mRNA前体的剪接,进而调节不含所述低效翻译区并编码包含所述靶肽序列的第一蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并且进而调节所述靶肽序列在所述受试者的所述细胞中的表达,其中在所述细胞中产生包含所述靶肽序列的所述第一蛋白质的所述第一经加工mRNA的翻译效率高于产生包含所述靶肽序列的第二蛋白质的第二经加工mRNA的翻译效率,并且其中所述第二经加工mRNA包含所述低效翻译区。
3.如权利要求1或2所述的方法,其中所述第二经加工mRNA除了包含所述低效翻译区以外在其他方面与所述第一经加工mRNA相同。
4.如权利要求1-3中任一项所述的方法,其中编码所述靶肽序列的所述mRNA前体包含第一起始密码子、第二起始密码子以及位于所述第一起始密码子下游并位于所述第二起始密码子上游的提前终止密码子(PTC),并且其中所述低效翻译区包含所述提前终止密码子(PTC)和所述第二起始密码子。
5.如权利要求1-3中任一项所述的方法,其中所述低效翻译区包含编码富含脯氨酸的肽序列的区域。
6.一种通过具有编码靶肽序列并包含第一起始密码子、第二起始密码子以及位于所述第一起始密码子下游并位于所述第二起始密码子上游的提前终止密码子(PTC)的mRNA前体的细胞来调节靶肽序列的表达的方法,所述方法包括使所述细胞与治疗剂接触,所述治疗剂与编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的靶向部分结合,由此调节所述PTC和所述第二起始密码子从所述mRNA前体的剪接,进而调节不含所述PTC和所述第二起始密码子并编码包含所述靶肽序列的第一蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并且进而调节所述靶肽序列在所述细胞中的表达。
7.一种通过调节靶肽序列在有需要的受试者的细胞中的表达来治疗所述受试者的疾病或疾患的方法,所述细胞具有编码所述靶肽序列并包含第一起始密码子、第二起始密码子以及位于所述第一起始密码子下游并位于所述第二起始密码子上游的提前终止密码子(PTC)的mRNA前体,所述方法包括:使所述受试者的所述细胞与治疗剂接触,所述治疗剂调节所述PTC和所述第二起始密码子从编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的剪接,其中所述治疗剂与所述mRNA前体的靶向区结合,由此调节所述PTC和所述第二起始密码子从所述mRNA前体的剪接,进而调节不含所述PTC和所述第二起始密码子并编码包含所述靶肽序列的第一蛋白质的第一经加工mRNA的水平,并且进而调节所述靶肽序列在所述受试者的所述细胞中的表达。
8.如权利要求1-7中任一项所述的方法,其中所述靶肽序列具有至少10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、200、300、400、500、750或1000个氨基酸。
9.如权利要求1-8中任一项所述的方法,其中所述治疗剂是小分子。
10.如权利要求1-8中任一项所述的方法,其中所述治疗剂是与所述mRNA前体的所述靶向区互补的反义寡聚体(ASO)。
11.如权利要求1-10中任一项所述的方法,其中所述治疗剂是与编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的所述靶向区至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%互补的ASO。
12.如权利要求1-11中任一项所述的方法,其中所述mRNA前体的所述靶向区的至少一部分在所述低效翻译区或包含所述PTC和所述第二起始密码子的外显子上游。
13.如权利要求1-11中任一项所述的方法,其中所述mRNA前体的所述靶向区的至少一部分在所述低效翻译区或包含所述PTC和所述第二起始密码子的外显子下游。
14.如权利要求1-11中任一项所述的方法,其中所述mRNA前体的所述靶向区的至少一部分在所述低效翻译区或包含所述PTC和所述第二起始密码子的外显子内。
15.如权利要求6-14中任一项所述的方法,其中所述细胞具有第二经加工mRNA,所述第二经加工mRNA包含所述第一经加工mRNA、所述PTC和所述第二起始密码子的序列并编码包含所述靶肽序列的第二蛋白质。
16.如权利要求1-5或8-15中任一项所述的方法,其中所述第一经加工mRNA和所述第二经加工mRNA两者都是所述细胞中的所述mRNA前体的剪接产物。
17.如权利要求4或8-16中任一项所述的方法,其中所述第二经加工mRNA包含所述第一经加工mRNA、所述PTC和所述第二起始密码子的序列。
18.如权利要求4或6-17中任一项所述的方法,其中所述PTC和所述第二起始密码子在所述mRNA前体上具有至少2nt的距离。
19.如权利要求4或6-17中任一项所述的方法,其中所述PTC和所述第二起始密码子在所述mRNA前体上具有至多75nt的距离。
20.如权利要求4或6-17中任一项所述的方法,其中所述PTC和所述第二起始密码子在所述mRNA前体上具有2nt至75nt、5nt至70nt、10nt至65nt、15nt至60nt、20nt至55nt、25nt至50nt、30nt至45nt、40nt至50nt、45nt至55nt、50nt至60nt、55nt至70nt或60nt至75nt的距离。
21.如权利要求4或6-17中任一项所述的方法,其中所述PTC和所述第二起始密码子在所述mRNA前体上具有2nt至75nt的距离。
22.如权利要求15-21中任一项所述的方法,其中包含所述靶肽序列的所述第一蛋白质从所述第一经加工mRNA上的所述第一起始密码子开始翻译,并且所述第二蛋白质从所述第二经加工mRNA上的所述第二起始密码子开始翻译。
23.如权利要求15-22中任一项所述的方法,其中产生所述第一蛋白质的所述第一经加工mRNA的翻译效率高于产生所述第二蛋白质的所述第二经加工mRNA的翻译效率。
24.如权利要求1-23中任一项所述的方法,其中所述低效翻译区从编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的去除或者所述PTC和所述第二起始密码子从编码所述靶肽序列的所述mRNA前体的去除增加。
25.如权利要求1-24中任一项所述的方法,其中所述治疗剂增加所述细胞中编码所述靶肽序列的所述第一经加工mRNA的水平。
26.如权利要求1-25中任一项所述的方法,其中所述治疗剂增加所述细胞中所述靶肽序列的水平。
27.如权利要求1-26中任一项所述的方法,其中所述靶肽序列是全长蛋白质的一部分。
28.如权利要求1-26中任一项所述的方法,其中所产生的靶肽序列是完全功能性蛋白质。
29.如权利要求1-27中任一项所述的方法,其中所述靶肽序列是全长蛋白质的N末端部分。
30.如权利要求29所述的方法,其中所述靶肽序列是由所述mRNA前体中所述低效翻译区上游的一部分编码。
31.如权利要求1-30中任一项所述的方法,其中所述低效翻译区位于所述第二经加工mRNA的3'非翻译区(3'UTR)中。
32.如权利要求1-27中任一项所述的方法,其中所述靶肽序列是全长蛋白质的C末端部分。
33.如权利要求32所述的方法,其中所述靶肽序列是由所述mRNA前体中所述低效翻译区或所述PTC下游的一部分编码。
34.如权利要求1-27中任一项所述的方法,其中所述靶肽序列是MeCP2蛋白质同功型的一部分。
35.如权利要求1-27中任一项所述的方法,其中所述靶肽序列是由选自由SEQ ID NO:32-34组成的组的序列翻译。
36.如权利要求34所述的方法,其中所述治疗剂减少所述细胞中MeCP2 mRNA的e2同功型的水平并增加MeCP2 mRNA的e1同功型的水平。
37.如权利要求34所述的方法,其中所述治疗剂减少所述细胞中MeCP2蛋白质的e2同功型的水平并增加MeCP2蛋白质的e1同功型的水平。
38.如权利要求34所述的方法,其中所述mRNA前体包含与选自由SEQ ID NO:2-27组成的组的任一者具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列。
39.如权利要求34所述的方法,其中所述治疗剂与MeCP2 mRNA前体的靶向区结合,其中所述靶向区位于选自由SEQ ID NO:28-31组成的组的序列内。
40.如权利要求34所述的方法,其中所述治疗剂与MeCP2 mRNA前体的靶向区结合,其中所述靶向区位于序列SEQ ID NO:28内。
41.如权利要求34所述的方法,其中所述治疗剂是与同选自由SEQ ID NO:28-31组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。
42.如权利要求34所述的方法,其中所述治疗剂是与同选自由SEQ ID NO:28-31组成的组的序列具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。
43.如权利要求34所述的方法,其中所述治疗剂是与同SEQ ID NO:28具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。
44.如权利要求34所述的方法,其中所述治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:35-129组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。
45.如权利要求34所述的方法,其中所述治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:35-129组成的组的序列具有100%序列同一性的序列的反义寡聚体。
46.如权利要求2-5或7-45中任一项所述的方法,其中所述疾病或所述疾患是雷特综合征。
47.如权利要求1-27中任一项所述的方法,其中所述靶肽序列是选自由以下组成的组的蛋白质的一部分:ACIN1、ACTN1、ACTN2、ADH4、AKR1C3、ALDH1A2、ALG8、AMPD2、AMT、ANKRD11、ANKS3、APOL4、APPL1、ARCN1、ARMC8、ARNTL、BOC、BRCA1、C8B、CALM1、CALM3、CASP5、CAST、CEP19、CEP57、CHEK1、CIB2、COX4I1、DCLRE1C、DECR1、DHFR、DKK2、DLG2、DOK2、DPF3、DTNA、DYRK1A、FOLH1、FUZ、GANAB、GEMIN4、GGA3、GOSR2、GPM6A、GRB10、GSN、HDAC8、HIVEP1、HK1、IFNGR1、IKBKB、ISCU、KARS、KIAA0319、KIAA0586、KIZ、KLK6、LMNA、LMNTD1、LRRC7、LRTOMT、LZTFL1、MAGI2、MECP2、MERTK、MFSD2A、MLF1、MOB1B、MSRB3、NR1I3、NT5C3A、NUTM1、OTOF、PDCD4、PDPK1、PHKB、PIGA、PLOD2、POLR2F、PPP6C、PRKN、PRUNE1、PSMA6、PSMC3IP、PTPN1、RAB11B、RBPJ、RNPS1、RPL5、RPS20、SECISBP2、SELENBP1、SEPT11、SIRT2、SLC25A26、SMARCE1、SMC1A、SMG1、SPACA7、SPRED1、SRP54、SRPK2、STK36、STRADA、SUMO1、TBL1XR1、TLR8、TXNRD2、UBE3A、UFM1、WAC、WDR81、YME1L1和ZMYND10。
48.如权利要求47所述的方法,其中所述治疗剂增加对具有选自由SEQ ID NO:8096-8297组成的组的序列的所述第一蛋白质进行编码的所述第一经加工mRNA的水平,并减少对具有选自由SEQ ID NO:332-533组成的组的序列的所述第二蛋白质进行编码的所述第二经加工mRNA的水平。
49.如权利要求47所述的方法,其中所述mRNA前体的所述靶向区是选自由SEQ ID NO:130-331组成的组的序列上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。
50.如权利要求47所述的方法,其中所述mRNA前体的所述靶向区是选自由SEQ ID NO:130-331组成的组的序列上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。
51.如权利要求47所述的方法,其中所述mRNA前体的所述靶向区是选自由以下组成的组的基因组位点上游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸:GRCh38/hg38:chr14 23071186、GRCh38/hg38:chr14 68925672、GRCh38/hg38:chr1 236735635、GRCh38/hg38:chr4 99143305、GRCh38/hg38:chr4 99143305、GRCh38/hg38:chr6 32182698、GRCh38/hg38:chr10 5077900、GRCh38/hg38:chr15 58058108、GRCh38/hg38:chr1178138767、GRCh38/hg38:chr1 109620914、GRCh38/hg38:chr3 49422257、GRCh38/hg38:chr3 49422257、GRCh38/hg38:chr3 49422257、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr1689317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 4726780、GRCh38/hg38:chr22 36201796、GRCh38/hg38:chr3 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52.如权利要求47所述的方法,其中所述mRNA前体的所述靶向区是选自由以下组成的组的基因组位点上游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸:GRCh38/hg38:chr14 23071186、GRCh38/hg38:chr14 68925672、GRCh38/hg38:chr1 236735635、GRCh38/hg38:chr4 99143305、GRCh38/hg38:chr4 99143305、GRCh38/hg38:chr6 32182698、GRCh38/hg38:chr10 5077900、GRCh38/hg38:chr15 58058108、GRCh38/hg38:chr1178138767、GRCh38/hg38:chr1 109620914、GRCh38/hg38:chr3 49422257、GRCh38/hg38:chr3 49422257、GRCh38/hg38:chr3 49422257、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr1689317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317075、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 89317078、GRCh38/hg38:chr16 4726780、GRCh38/hg38:chr22 36201796、GRCh38/hg38:chr3 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53.如权利要求47所述的方法,其中所述mRNA前体的所述靶向区是选自由SEQ ID NO:130-331组成的组的序列下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。
54.如权利要求47所述的方法,其中所述mRNA前体的所述靶向区是选自由SEQ ID NO:130-331组成的组的序列下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸。
55.如权利要求47所述的方法,其中所述mRNA前体的所述靶向区是选自由以下组成的组的基因组位点下游至多约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸:GRCh38/hg38:chr14 23071125、GRCh38/hg38:chr14 68925558、GRCh38/hg38:chr1 236735720、GRCh38/hg38:chr4 99143166、GRCh38/hg38:chr4 99143166、GRCh38/hg38:chr6 32182568、GRCh38/hg38:chr10 5077977、GRCh38/hg38:chr15 58058012、GRCh38/hg38:chr1178138710、GRCh38/hg38:chr1 109621266、GRCh38/hg38:chr3 49422104、GRCh38/hg38:chr3 49422104、GRCh38/hg38:chr3 49422104、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr1689316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 4726659、GRCh38/hg38:chr22 36201700、GRCh38/hg38:chr3 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56.如权利要求47所述的方法,其中所述mRNA前体的所述靶向区是选自由以下组成的组的基因组位点下游至少约1500个核苷酸、约1000个核苷酸、约800个核苷酸、约700个核苷酸、约600个核苷酸、约500个核苷酸、约400个核苷酸、约300个核苷酸、约200个核苷酸、约100个核苷酸、约80个核苷酸、约70个核苷酸、约60个核苷酸、约50个核苷酸:GRCh38/hg38:chr14 23071125、GRCh38/hg38:chr14 68925558、GRCh38/hg38:chr1 236735720、GRCh38/hg38:chr4 99143166、GRCh38/hg38:chr4 99143166、GRCh38/hg38:chr6 32182568、GRCh38/hg38:chr10 5077977、GRCh38/hg38:chr15 58058012、GRCh38/hg38:chr1178138710、GRCh38/hg38:chr1 109621266、GRCh38/hg38:chr3 49422104、GRCh38/hg38:chr3 49422104、GRCh38/hg38:chr3 49422104、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr1689316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 89316933、GRCh38/hg38:chr16 4726659、GRCh38/hg38:chr22 36201700、GRCh38/hg38:chr3 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57.如权利要求47所述的方法,其中所述mRNA前体的所述靶向区位于选自由SEQ IDNO:130-331组成的组的序列内。
58.如权利要求47所述的方法,其中所述mRNA前体的所述靶向区位于选自由以下组成的组的一对基因组位点之间的序列内:GRCh38/hg38:chr14 23071186和GRCh38/hg38:chr14 23071125;GRCh38/hg38:chr14 68925672和GRCh38/hg38:chr14 68925558;GRCh38/hg38:chr1 236735635和GRCh38/hg38:chr1 236735720;GRCh38/hg38:chr4 99143305和GRCh38/hg38:chr4 99143166;GRCh38/hg38:chr4 99143305和GRCh38/hg38:chr499143166;GRCh38/hg38:chr6 32182698和GRCh38/hg38:chr6 32182568;GRCh38/hg38:chr10 5077900和GRCh38/hg38:chr10 5077977;GRCh38/hg38:chr15 58058108和GRCh38/hg38:chr15 58058012;GRCh38/hg38:chr11 78138767和GRCh38/hg38:chr11 78138710;GRCh38/hg38:chr1 109620914和GRCh38/hg38:chr1 109621266;GRCh38/hg38:chr349422257和GRCh38/hg38:chr3 49422104;GRCh38/hg38:chr3 49422257和GRCh38/hg38:chr3 49422104;GRCh38/hg38:chr3 49422257和GRCh38/hg38:chr3 49422104;GRCh38/hg38:chr16 89317078和GRCh38/hg38:chr16 89316933;GRCh38/hg38:chr16 89317078和GRCh38/hg38:chr16 89316933;GRCh38/hg38:chr16 89317078和GRCh38/hg38:chr1689316933;GRCh38/hg38:chr16 89317075和GRCh38/hg38:chr16 89316933;GRCh38/hg38:chr16 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59.如权利要求47所述的方法,其中所述治疗剂是与同选自由SEQ ID NO:130-331组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。
60.如权利要求47所述的方法,其中所述治疗剂是与同选自由SEQ ID NO:130-331组成的组的序列具有100%序列同一性的序列互补的反义寡聚体。
61.如权利要求47所述的方法,其中所述治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:534-8095组成的组的序列具有至少约80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列的反义寡聚体。
62.如权利要求47所述的方法,其中所述治疗剂是具有与选自由SEQ ID NO:534-8095组成的组的序列具有100%序列同一性的序列的反义寡聚体。
63.如权利要求47-62中任一项所述的方法,其中所述疾病或所述疾患是选自由以下组成的组:智力障碍;结肠直肠癌;血小板型出血障碍15型;常染色体显性巨血小板减少症;肥厚性心肌病;扩张性心肌病1AA型;伴有或不伴有心室致密化不全的家族肥大性心肌病23型;家族扩张性心肌病;恰克-马里-杜斯氏病;心脏传导障碍;扩张性心肌病;酒精使用障碍;酒精滥用;慢性酒精中毒;酒精使用障碍;酒精滥用;慢性酒精中毒;精神分裂症;躁郁症;慢性酒精中毒;先天性糖基化障碍;癫痫性脑病;抑郁症;先天性糖基化障碍1H型;脑桥小脑发育不全9型;癫痫性脑病;遗传性共济失调;常染色体隐性痉挛性截瘫63型;小脑发育不全;遗传性痉挛性截瘫;非酮症性高甘氨酸血症;暂时性新生儿高甘氨酸血症;甘氨酸脑病;KBG综合征;16q24.3微缺失综合征;内脏逆位;乳房恶性赘瘤;青年人中的成年发病型糖尿病;青年人中的成年发病型糖尿病14型;小头畸形;多指(趾)症;纤毛病;精神抑郁症;季节性情感障碍;躁郁症;情绪障碍;抑郁症;乳房恶性赘瘤;细胞减少症;胃肠道赘瘤;抑郁症;家族性前列腺癌;原发性腹膜癌;家族性易感性卵巢癌1型;家族性男性乳腺癌;恶性赘瘤;胰腺赘瘤;家族性乳腺癌;具有不明确或未知的乳房行为的赘瘤;卵巢癌;前列腺腺癌;具有不明确或未知的卵巢行为的赘瘤;胰腺恶性赘瘤;胰腺癌;卵巢恶性赘瘤;先天性贫血;血液系统赘瘤;乳腺腺癌;家族性易感性乳房-卵巢癌1型;家族性胰腺癌;胰腺良性肿瘤;乳腺癌;家族性易感性乳腺癌1型;卵巢赘瘤;遗传性乳房和卵巢癌综合征;精神抑郁症;上皮卵巢癌;乳房恶性赘瘤;偶发性乳腺癌;家族性乳房-卵巢癌1型;易感性胰腺癌4型;C8缺乏症II型;儿茶酚胺敏感性多形性室性心动过速4型;儿茶酚胺敏感性多形性室性心动过速1型;长QT综合征;罗马诺-沃德综合征;长Qt综合征14型;皮肤剥落综合征;伴有白甲病、肢端点状角化症、唇炎和指节垫的皮肤剥落;红斑角化症;掌跖角化症;病态肥胖症和精子生成障碍;warburton anyane yeboa综合征;马赛克杂色非整倍体综合征;家族性乳腺癌;卵巢恶性赘瘤;线粒体疾病;伴有对电离辐射敏感的严重联合免疫缺陷;部分性严重联合免疫缺陷;伴有嗜曙红细胞增多的家族性网状内皮增生症;欧门氏综合征;Athabaskan严重联合免疫缺陷;严重联合免疫缺陷Athabaskan型;可卡因滥用;先天性贫血;细胞减少症;由大脑叶酸转运不足引起的神经变性;由二氢叶酸还原酶缺乏引起的巨幼细胞性贫血;慢性酒精中毒;躁郁症;单相抑郁症;严重抑郁症;精神分裂症和相关病症;左心室致密化不全心肌病;左心室致密化不全;家族性美尼尔氏病;恰克-马里-杜斯氏病;常染色体显性家族性孤立性左心室心肌致密化不全1型;原发性小头畸形;小头畸形;癫痫性脑病;常染色体显性智力迟钝7型;结肠直肠癌;抑郁症;精神抑郁症;尾部退化综合征;阿诺德基亚里畸形;尾部发育不良综合征;基亚里畸形II型;骶骨发育不全综合征;骶骨发育不全;Currarino三联征;颈椎显性脊柱裂;神经管缺陷;常染色体显性多囊肾;常染色体显性多囊性肾病3型;慢性酒精中毒;乳房恶性赘瘤;遗传性共济失调;进行性肌痉挛癫痫症6型;癫痫性脑病;格子状角膜营养不良II型;梅雷托亚综合征;乳房恶性赘瘤;周期性发热综合征;家族性淀粉样多神经病IV型;Gsn相关的大脑淀粉样血管病;角膜异常;芬兰型淀粉样变性;原发性小头畸形;狄兰吉氏综合征5型;桡侧球棒手;狄兰吉氏综合征;威尔逊-特纳x连锁智力迟钝综合征;先天性贫血;色素性视网膜炎79型;恰克-马里-杜斯氏病;细胞减少症;由己糖激酶缺乏引起的非球形红细胞性溶血性贫血;russe型遗传性运动和感觉神经病;干扰素γ受体1缺陷;免疫缺陷27a型;免疫缺陷27b型;易感性幽门螺旋杆菌(H.pylori)感染;预防性肺结核感染;免疫缺陷27A型分枝杆菌病AR型;免疫缺陷27B型分枝杆菌病AD型;易感性乙型肝炎病毒感染;易感性肺结核;乳房恶性赘瘤;非霍奇金淋巴瘤;免疫缺陷15型;先天性肌病;关节弯曲;横纹肌溶解症;伴有运动不耐受的瑞典型肌病;伴有乳酸中毒的遗传性肌病;隐性中间型恰克-马里-杜斯氏病B型;恰克-马里-杜斯氏病;常染色体隐性耳聋89型;常染色体隐性耳聋89型;易感性阅读障碍2型;朱伯特综合征23型;多指(趾)症;家族性小脑蚓部发育不全;伴有热纳窒息性胸廓发育不良的朱伯特综合征;脑积水;纤毛病;伴有多指(趾)症的短肋胸廓发育不良14型;色素性视网膜炎;色素性视网膜炎69型;肢带型肌肉萎缩1B型;肥厚性心肌病;左心室致密化不全;成骨不全;恰克-马里-杜斯氏病;家族性特发性心肌病;家族性部分性脂肪营养不良1型;左心室致密化不全心肌病;下颌骨发育不良;Lmna相关的先天性肌肉萎缩;先天性肌病;关节弯曲;心律失常性右心室发育不良;肢带型肌肉萎缩;马卢夫综合征;纳贾尔综合征;恰克-马里-杜斯氏病2B1型;艾梅氏肌肉萎缩3型;致死性限制性皮肤挛缩综合征;家族性部分性脂肪营养不良2型;心脏传导障碍;扩张性心肌病;儿童发病型早老综合征;非典型沃纳综合征;先天性肌肉萎缩;常染色体隐性艾梅氏肌肉萎缩;心-手综合征Slovenian型;早老症;常染色体显性艾梅氏肌肉萎缩;扩张性心肌病1A型;下颌骨发育不良;肢带型肌肉萎缩1B型;艾梅氏肌肉萎缩2型AD型;马卢夫综合征;致死性限制性皮肤病;艾梅氏肌肉萎缩3型AR型;心-手综合征Slovenian型;恰克-马里-杜斯氏病2B1型;Hutchinson-Gilford早老症;家族性部分性脂肪营养不良2型;先天性肌肉萎缩;乳房恶性赘瘤;常染色体隐性耳聋63型;Bardet-Biedl综合征;多指(趾)症;纤毛病;Bardet-Biedl综合征17型;重度情感障碍2型;躁郁症;癫痫性脑病;保留语言功能型雷特综合征;Lubs X连锁智力迟钝综合征;由Mecp2突变引起的新生儿重度脑病;伴有精神病、锥体束征和大睾丸的智力迟钝;伴有痉挛的X连锁智力迟钝;Xq28染色体三体症;X连锁智力迟钝16型;癫痫性脑病;X连锁综合型智力迟钝13型;X连锁智力迟钝1型;非典型雷特综合征;X连锁智力迟钝79型;小头畸形;Ppm-X综合征;Zappella型雷特综合征;雷特综合征;X连锁自闭症易感3型;肾上腺良性赘瘤;色素性视网膜炎;普通型(透明细胞)肾细胞癌;头颈部鳞状细胞癌;主动脉体和其他嗜铬体的恶性赘瘤;色素性视网膜炎38型;恶性肾上腺髓质赘瘤;主动脉体和其他嗜铬体的良性赘瘤;原发性小头畸形;常染色体隐性原发性小头畸形15型;常染色体隐性原发性小头畸形;小头畸形;急性骨髓白血病;常染色体隐性耳聋74型;细胞减少症;引起溶血性贫血的尿苷5-Prime单磷酸水解酶缺乏;先天性贫血;NUT中线癌;乳房恶性赘瘤;常染色体隐性耳聋;常染色体隐性耳聋9型;非综合型隐性听觉神经病;常染色体隐性听觉神经病1型;乳房恶性赘瘤;乳腺癌;具有不明确或未知的乳房行为的赘瘤;乳腺腺癌;酮症性低血糖;横纹肌溶解症;糖原贮积病IXB;常染色体隐性肝脏和肌肉磷酸化酶激酶缺乏;先天性贫血;先天性糖基化障碍;细胞减少症;癫痫性脑病;阵发性睡眠性血红蛋白尿症;阵发性睡眠性血红蛋白尿症1型;韦斯特综合征;多发性先天性异常-张力减退-痉挛综合征2型;先天性贫血;先天性糖基化障碍;细胞减少症;癫痫性脑病;阵发性睡眠性血红蛋白尿症;阵发性睡眠性血红蛋白尿症1型;韦斯特综合征;多发性先天性异常-张力减退-痉挛综合征2型;布鲁克综合征2型;成骨不全;布鲁克综合征1型;关节弯曲;布鲁克综合征;皮肤黑色素瘤;黑色素瘤;常染色体隐性青少年型帕金森病2型;青年发病型帕金森病;老年发病型帕金森病;易感性麻疯病;体细胞性卵巢腺癌;体细胞性肺腺癌;原发性小头畸形;伴有小头畸形、张力减退和多样脑部异常的神经发育障碍;易感性心肌梗死;46-XX单纯性腺发育不全;卵巢发育不全3型;易感性胰岛素抵抗;脑白质营养不良;癫痫性脑病;亚当斯-奥利弗综合征3型;亚当斯奥利弗综合征;情绪障碍;先天性贫血;血液系统赘瘤;Diamond-Blackfan贫血;细胞减少症;Aase Smith综合征2型;桡侧球棒手;T细胞前体淋巴母细胞白血病-淋巴瘤;Diamond-Blackfan贫血6型;遗传性非息肉性结肠直肠癌综合征;家族性结肠直肠癌X型;遗传性非息肉性结肠直肠癌;遗传性非息肉性结肠直肠赘瘤;异常甲状腺激素代谢;甲状腺激素抵抗综合征;躁郁症;情绪紊乱;联合氧化磷酸化缺乏28型;科芬-西里斯综合征5型;科芬-西里斯综合征;脑膜瘤;多发性脑膜瘤;家族性易感性脑膜瘤;原发性小头畸形;先天性贫血;成骨不全;细胞减少症;癫痫性脑病;桡侧球棒手;狄兰吉氏综合征;伴有脸部畸形的发育缺陷和智力迟钝;先天性肌肥大-大脑综合征;狄兰吉氏综合征2型;浸润性女性乳房导管癌;结肠直肠癌;神经纤维瘤1型;类神经纤维瘤1型综合征;Legius综合征;舒瓦克曼综合征;多形性胶质母细胞瘤;卵巢浆液性腺癌;波利尼西亚支气管扩张;卡塔格内综合征;羊水过多、巨脑和症状性癫痫;脑积水;癫痫性脑病;少牙畸形;牙发育不全;唇腭裂10型;膀胱恶性赘瘤;急性前髓细胞性白血病;大肠腺癌;膀胱赘瘤;癫痫性脑病;具有不明确或未知的膀胱行为的赘瘤;常染色体显性智力迟钝41型;膀胱良性赘瘤;非霍奇金淋巴瘤;膀胱原位癌;中枢神经系统淋巴瘤;膀胱癌;足底脂肪过多、特殊面容和发育迟缓;皮尔庞综合征;X连锁肾上腺发育不全;抑郁症状;家族性扩张性心肌病;家族性糖皮质激素缺乏1型;心脏传导障碍;扩张性心肌病;安格曼综合征;癫痫性脑病;小头畸形;15q11-q13重复综合征;髓鞘形成不良性脑白质营养不良6型;染色体10p12-p11缺失综合征;结肠直肠癌;Desanto-Shinawi综合征;遗传性共济失调;小脑共济失调、智力迟钝和平衡失调综合征2型;脑积水;小脑发育不全;平衡失调综合征;视神经萎缩11型;波利尼西亚支气管扩张;原发性纤毛运动障碍22型;卡塔格内综合征;和纤毛病。
64.如权利要求2-5或7-63所述的方法,其中所述疾病或所述疾患是由功能性靶蛋白的量或活性不足所引起,并且其中包含所述靶肽序列的所述第一蛋白质至少在功能上部分地等效于所述功能性靶蛋白。
65.如权利要求2-5或7-63所述的方法,其中所述疾病或所述疾患是由所述靶肽序列的量或活性不足所引起。
66.如权利要求1-65中任一项所述的方法,其中所述治疗剂增加所述细胞中所述第一经加工mRNA的水平。
67.如权利要求1-66中任一项所述的方法,其中与所述治疗剂接触的所述细胞中所述第一经加工mRNA的水平与对照细胞中所述第一经加工mRNA的水平相比增加约1.1至约10倍、约1.5至约10倍、约2至约10倍、约3至约10倍、约4至约10倍、约1.1至约5倍、约1.1至约6倍、约1.1至约7倍、约1.1至约8倍、约1.1至约9倍、约2至约5倍、约2至约6倍、约2至约7倍、约2至约8倍、约2至约9倍、约3至约6倍、约3至约7倍、约3至约8倍、约3至约9倍、约4至约7倍、约4至约8倍、约4至约9倍、至少约1.1倍、至少约1.5倍、至少约2倍、至少约2.5倍、至少约3倍、至少约3.5倍、至少约4倍、至少约5倍、或至少约10倍。
68.如权利要求1-67中任一项所述的方法,其中所述治疗剂增加所述细胞中所述靶肽序列的表达。
69.如权利要求1-68中任一项所述的方法,其中与所述治疗剂接触的所述细胞中所述靶肽序列的水平与对照细胞中所述靶肽序列的水平相比增加约1.1至约10倍、约1.5至约10倍、约2至约10倍、约3至约10倍、约4至约10倍、约1.1至约5倍、约1.1至约6倍、约1.1至约7倍、约1.1至约8倍、约1.1至约9倍、约2至约5倍、约2至约6倍、约2至约7倍、约2至约8倍、约2至约9倍、约3至约6倍、约3至约7倍、约3至约8倍、约3至约9倍、约4至约7倍、约4至约8倍、约4至约9倍、至少约1.1倍、至少约1.5倍、至少约2倍、至少约2.5倍、至少约3倍、至少约3.5倍、至少约4倍、至少约5倍、或至少约10倍。
70.如权利要求1-69中任一项所述的方法,其中所述治疗剂是反义寡核苷酸,并且其中所述治疗剂包含包括硫代磷酸酯键或二氨基磷酸酯键的主链修饰。
71.如权利要求1-70中任一项所述的方法,其中所述治疗剂是反义寡核苷酸,并且其中所述治疗剂包含二氨基磷酸酯吗啉基、锁核酸、肽核酸、2'-O-甲基、2'-氟或2'-O-甲氧基乙基部分。
72.如权利要求1-71中任一项所述的方法,其中所述治疗剂是反义寡核苷酸,并且其中所述治疗剂包含至少一个经修饰的糖部分。
73.如权利要求72所述的方法,其中每个糖部分是经修饰的糖部分。
74.如权利要求1-73中任一项所述的方法,其中所述治疗剂是反义寡核苷酸,并且其中所述治疗剂由8至50个核碱基、8至40个核碱基、8至35个核碱基、8至30个核碱基、8至25个核碱基、8至20个核碱基、8至15个核碱基、9至50个核碱基、9至40个核碱基、9至35个核碱基、9至30个核碱基、9至25个核碱基、9至20个核碱基、9至15个核碱基、10至50个核碱基、10至40个核碱基、10至35个核碱基、10至30个核碱基、10至25个核碱基、10至20个核碱基、10至15个核碱基、11至50个核碱基、11至40个核碱基、11至35个核碱基、11至30个核碱基、11至25个核碱基、11至20个核碱基、11至15个核碱基、12至50个核碱基、12至40个核碱基、12至35个核碱基、12至30个核碱基、12至25个核碱基、12至20个核碱基、或12至15个核碱基组成。
75.如权利要求1-74中任一项所述的方法,其中所述方法还包括评估编码所述靶肽序列的mRNA水平或所述靶肽序列的表达水平。
76.如权利要求2-5或7-75中任一项所述的方法,其中所述受试者是人类。
77.如权利要求2-5或7-75中任一项所述的方法,其中所述受试者是非人类动物。
78.如权利要求2-5或7-76中任一项所述的方法,其中所述受试者是胎儿、胚胎或儿童。
79.如权利要求1-75中任一项所述的方法,其中所述一个或多个细胞是离体细胞,或位于离体组织或器官中。
80.如权利要求2-5或7-77中任一项所述的方法,其中所述治疗剂是通过脑室内注射、腹膜内注射、肌肉内注射、鞘内注射、皮下注射、口服施用、滑膜注射、玻璃体内施用、视网膜下注射、局部应用、植入或静脉内注射向所述受试者施用。
81.一种治疗剂,所述治疗剂适用于权利要求1-80中任一项所述的方法。
82.一种药物组合物,所述药物组合物包含权利要求81所述的治疗剂和药学上可接受的赋形剂。
83.一种治疗有需要的受试者的方法,所述方法包括通过脑室内注射、腹膜内注射、肌肉内注射、鞘内注射、皮下注射、口服施用、滑膜注射、玻璃体内施用、视网膜下注射、局部应用、植入或静脉内注射向所述受试者施用权利要求82所述的药物组合物。
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