JPWO2020218489A5 - - Google Patents

Claims (24)

1. マイクロＲＮＡの修飾状態を分析する方法であって、
   （Ａ）前記マイクロＲＮＡを、電極対の間を通過させる工程と、
   （Ｂ）前記マイクロＲＮＡが前記電極対の間を通過したときに生じるトンネル電流を検出する工程と、
   （Ｃ）前記トンネル電流に基づいて前記修飾状態を分析する工程と、
   を含む、方法。
2. 前記マイクロＲＮＡの塩基配列上の修飾位置、化学構造上の修飾位置、修飾率および特定の修飾位置における修飾率の少なくとも１つが同定される、請求項１に記載の方法。
3. 前記修飾がメチル化を含む、請求項１または２に記載の方法。
4. 前記マイクロＲＮＡの塩基配列が少なくとも部分的に同定される、請求項１～３のいずれか一項に記載の方法。
5. 前記マイクロＲＮＡの質量分析計による分析結果を参照して、前記修飾状態と前記トンネル電流のパターンとを関連付ける工程を含む、請求項１～４のいずれか一項に記載の方法。
6. 対象の状態を示すための指標として前記対象由来の試料におけるマイクロＲＮＡの修飾状態を分析する方法であって、前記方法は
   （Ｙ－Ａ）対象由来のマイクロＲＮＡを含むように調製された試料を、電極対の間を通過させる工程と、
   （Ｙ－Ｂ）前記試料が前記電極対の間を通過したときに生じるトンネル電流を検出する工程と、
   （Ｙ－Ｃ）前記トンネル電流に基づいて前記修飾状態を分析する工程と
   を含み、
   ここで、前記修飾状態が前記対象の状態を示す、方法。
7. 蓄積された前記修飾状態と前記トンネル電流のパターンとの組み合わせのデータを参照して、検出された前記トンネル電流のパターンに基づいてマイクロＲＮＡの修飾状態を分析することで、前記マイクロＲＮＡを取得した対象の状態が示される、請求項６に記載の方法。
8. 前記試料をトンネル電流測定に供したときから１５分以内に、前記試料を取得した対象の状態の分析結果が示される、請求項６または７に記載の方法。
9. 前記対象の状態が、がん、炎症性腸疾患、クローン病、糖尿病または精神疾患の状態を含む、請求項６～８のいずれか一項に記載の方法。
10. 前記対象の状態が、がんのステージを含む、請求項６～８のいずれか一項に記載の方法。
11. 前記がんが、膵臓がんである、請求項９または１０に記載の方法。
12. 前記トンネル電流に基づいて前記マイクロＲＮＡの塩基配列を分析するステップをさらに含み、前記修飾状態および前記塩基配列が前記対象の状態を示す、請求項６～１１のいずれか一項に記載の方法。
13. マイクロＲＮＡの質量分析計による分析結果を入力するステップと、前記マイクロＲＮＡのトンネル電流測定で取得されたトンネル電流のパターンを入力するステップと、前記質量分析による分析結果とトンネル電流のパターンとを関連付けて前記マイクロＲＮＡの修飾状態を決定させるステップとを含む、マイクロＲＮＡを分析する方法をコンピュータに実装するように構成された、プログラム。
14. マイクロＲＮＡの修飾状態と、前記マイクロＲＮＡについてトンネル電流測定で取得されたトンネル電流のパターンとの組み合わせの蓄積されたデータを参照して、マイクロＲＮＡのトンネル電流測定で取得されたトンネル電流のパターンに基づいて、前記マイクロＲＮＡを取得した対象のマイクロＲＮＡの修飾状態を示させるステップとを含む、マイクロＲＮＡを分析する方法を、コンピュータに実装するように構成された、プログラム。
15. 対象を分析する方法をコンピュータに実装するように構成されたプログラムであって、該方法は、対象のマイクロＲＮＡのトンネル電流測定によりトンネル電流のパターンを取得するステップと、マイクロＲＮＡの修飾状態と、トンネル電流測定で既に取得されたトンネル電流のパターンとの組み合わせを含むデータベースを参照し、前記取得されたトンネル電流のパターンに基づいて、前記対象のマイクロＲＮＡの修飾状態を分析するステップと、前記修飾状態に基づいて前記対象の状態を分析するステップを包含する、プログラム。
16. 前記対象の状態が、がんのステージを含む、請求項１５に記載のプログラム。
17. 前記がんが、膵臓がんである、請求項１６に記載のプログラム。
18. 前記方法が前記トンネル電流のパターンに基づいて前記マイクロＲＮＡの塩基配列を分析するステップをさらに含み、前記修飾状態に基づいて前記対象の状態を分析するステップが、前記修飾状態および前記塩基配列に基づいて前記対象の状態を分析するステップである、請求項１５～１７のいずれか一項に記載のプログラム。
19. マイクロＲＮＡの修飾状態を、トンネル電流測定で取得されたトンネル電流のパターンと関連付けるためのシステムであって、
    質量分析計と、
    トンネル電流測定器と、
    前記質量分析計および前記トンネル電流測定による目的のマイクロＲＮＡの測定結果を関連付けて、目的のマイクロＲＮＡの修飾状態を分析・判定する分析・判定部と
    を含む、システム。
20. マイクロＲＮＡの修飾状態に基づいて、対象の状態を判定するためのシステムであって、
    トンネル電流測定器と、
    マイクロＲＮＡの修飾状態と、トンネル電流測定で取得されたトンネル電流のパターンとの組み合わせの蓄積されたデータを参照して、マイクロＲＮＡのトンネル電流測定で取得されたトンネル電流のパターンに基づいて、前記マイクロＲＮＡを取得した対象のマイクロＲＮＡの修飾状態を分析・判定する修飾分析・判定部と、
    を含む、システム。
21. 分析・判定された前記修飾状態に基づいて、前記対象の状態を分析・判定する状態分析・判定部を含む、請求項２０に記載のシステム。
22. 前記対象の状態が、がんのステージを含む、請求項２１に記載のシステム。
23. 前記がんが、膵臓がんである、請求項２２に記載のシステム。
24. 前記トンネル電流のパターンに基づいて、前記マイクロＲＮＡの塩基配列を分析・判定する配列分析・判定部をさらに含み、前記状態分析・判定部が、前記修飾状態および前記塩基配列に基づいて前記対象の状態を分析・判定する、請求項２１～２３のいずれか一項に記載のシステム。