JPWO2013094359A1 - セルロース/キチン系高分子発光材料 - Google Patents
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Abstract
斯かる課題を解決する発明として、次が提供される。発光ドメインとセルロース及び/又はキチン結合ドメインを含むキメラ蛋白質であって、前記発光ドメインがルシフェラーゼ及び蛍光発光蛋白質からなる群から選ばれる少なくとも1種の発光蛋白質を含む、キメラ蛋白質。
Description
本出願は、2011年12月19日に出願された日本国出願第2011-277363号明細書および2012年1月27日に出願された日本国出願第2012-014817号明細書(それらの開示全体が参照により本明細書中に援用される)に基づく優先権を主張する。
項1:発光ドメインとセルロース及び/又はキチン結合ドメインを含むキメラ蛋白質であって、前記発光ドメインがルシフェラーゼ及び蛍光発光蛋白質からなる群から選ばれる少なくとも1種の発光蛋白質を含む、キメラ蛋白質。
項2:発光ドメインとセルロース及び/又はキチン結合ドメインが直接又は第1リンカーを介して結合されてなる、項1に記載のキメラ蛋白質。
項3:前記発光ドメインがルシフェラーゼ及び蛍光発光蛋白質を含み、ルシフェラーゼから蛍光発光蛋白質へのエネルギー移動(BRET)が生じ得るものである、項1又は2に記載のキメラ蛋白質。
項4:ルシフェラーゼと蛍光発光蛋白質が第2リンカーを介して結合されてなる、項3に記載のキメラ蛋白質。
項5:蛍光発光蛋白質が、GFP、YFP、BFP、CFP、OFP、DsREDまたはRFPである項1〜4のいずれか1項に記載のキメラ蛋白質。
項6:蛍光発光蛋白質がYFPまたはRFPである、項5に記載のキメラ蛋白質。
項7:第1リンカー及び/又は第2リンカーがプロテアーゼ切断配列を含む、項1〜6のいずれか1項に記載のキメラ蛋白質。
項8:項1〜7のいずれかに記載のキメラ蛋白質をコードするDNAまたはその相補鎖。
項9:項1〜7のいずれかに記載のキメラ蛋白質をセルロース又はキチンを含む粒子、ビーズ、シート又はフィルムに結合させてなる、発光材料。
セルロース/キチン結合ドメインは、セルロースに結合できるドメイン(セルロース結合ドメイン)、キチンに結合できるドメイン(キチン結合ドメイン)、セルロール及びキチンの両方に結合できるドメインのいずれであってもよい。
発光ドメインは、各種ルシフェラーゼ、蛍光発光蛋白質、あるいはこれらの融合蛋白質(例えばBAF)が挙げられる。ルシフェラーゼとしては、ホタル、イリオモテボタル、ウミボタル、鉄道虫、ヒカリコメツキムシ、渦鞭毛藻、ウミシイタケなどに由来する各種ルシフェラーゼが挙げられ、蛍光発光蛋白質としては、GFP、YFP、BFP、CFP、OFP、DsRED、RFPなどが挙げられる。
本発明のキメラ蛋白質は、セルロース/キチン結合ドメインをコードするDNAと発光ドメインをコードするDNAを直接又は第1リンカーに対応するDNA配列を介して連結したキメラ蛋白質をコードするDNAを含む遺伝子構築物またはベクターを宿主細胞(例えば大腸菌)に導入して形質転換体とし、この形質転換体を培養することにより得ることができる。
第1リンカーは、アミノ酸からなり、セルロース/キチン結合ドメインと発光ドメインの各々の機能を損なわない限り特に限定されない。第1リンカーのアミノ酸の数は、1個以上であればよく、2〜100個、例えば4〜80個、好ましくは5〜60個、より好ましくは6〜40個程度、さらに好ましくは7〜30個、特に8〜16個程度が挙げられる。
本明細書において、ルシフェラーゼは、天然のルシフェラーゼを使用してもよく、安定性や発光特性などの性質が改善されたルシフェラーゼを使用してもよい。
また、キチンとして、セミ類の抜け殻を用いることもできる。セミ類の抜け殻は、キチンが内表面に露出しているため、無処理で使用することができる。
プラスミドの作製
(1)pCII-CBD-eBAF-Ym3及びpCII-CBD(TN)-eBAF-Ym3
CBD-eBAF-Y発現ベクターを作製するために、CBD(wt)又はCBD(TN)をコードする遺伝子をPCRにより増幅した。PCRに用いられたプライマーは次の通りである:
chBD2-F-NdeI,5’-GGAATTCCATATGACTACCCCTGTCCCAGTCTC-3’;
chBD2-R-NdeI, 5’-CGATATCCATATGAATTACTTGTCCGTTTATTTCTAG-3’。
PCR断片をNdeIで消化し、pCII-eBAF-Ym3のNdeI部位へ組み込み、pCII-CBD-eBAF-Ym3及びpCII-CBD(TN)-eBAF-Ym3を構築した。
大腸菌での効率的な蛋白質発現のために、大腸菌でのコドン最適化を目的としたCBD遺伝子の人工合成を行った(CBD(TN)のみ)。当該人工合成CBD(TN)遺伝子(以下hCBDと呼称して区別するが、アミノ酸配列はCBD(TN)と同一である)を、上記pCII-CBD(TN)-eBAF-Ym3のCBD(TN)部分と置換したpCII-hCBD-eBAF-Ym3を構築した。またこの時、後々の組換えに備え、人工遺伝子設計に際し、hCBD配列の3’側にAsp718-BamHI-NdeI部位を付加した。その結果、連結部分の塩基配列は、5’-GGTACCGGGGGATCCCATATG-3’となり、G-T-G-G-S-Hのアミノ酸配列でhCBDとeBAF-Ym3をインフレームに連結することになる(NdeI部位のATGはeBAF-Ym3の開始Metに相当)。
pCII-hCBD-eBAF-Ym3のAsp718-BamHI部位に、AspHRV3CsBam-Sens:5’-GTACCGGTGGTTCCGCGGGTCTGGAAGTTCTGTTCCAGGGGCCCTCCGCGGGTtccggtg-3’とAspHRV3CsBam-Anti:GATCCACCGGAACCCGCGGAGGGCCCCTGGAACAGAACTTCCAGACCCGCGGAACCACCGからなる合成2重鎖DNAを挿入し、HRV-3Cプロテアーゼの切断配列を挿入した。Asp718部位からBamHI部位までに対応するアミノ酸配列は、G-T-G-G-S-A-G-L-E-V-L-F-Q-G-P-S-A-G-S-G-G-Sであり、中央のLEVLFQ/GPが当該プロテアーゼの切断配列である(/:切断部位)。
pCII-eBAF-Yで代表される各種BAFの大腸菌発現ベクターにおいて、2008年に開発済の400種類を超える各種BAFは全てNdeI-XbaI部位でクローニングされている。一方でpCII-hCBD-HRV3Cs-eBAF-Ym3は、hCBD部分がNdeI部位で挿入されており、BAFの置換体を作製するためにhCBD部分の5’側のNdeI部位が新たなBAF置換体作製の障害になる。そのため、hCBDdelNdeIoligo-Sens: 5’-TCATCATCATCATCAcATGACCACTCCGGTG-3’、hCBDdelNdeIoligo-Anti: 5’-CACCGGAGTGGTCATgTGATGATGATGATGA-3’を用いて、1塩基の塩基置換変異導入により、NdeI部位を破壊した、pCII-hCBD-HRV3Cs-eBAF-Ym3ΔNdeIを作製した。なお、この一塩基変異導入にはストラタジーン社のQuickExchenge systemを用いた。
pCII-hCBD-HRV3Cs-eBAF-Ym3ΔNdeIを用いて発現させたキメラ蛋白質濾紙に吸着/結合させて乾燥した後の発光活性の試験結果を図3に示す。
pCII-hCBD-HRV3Cs-eBAF-Ym3ΔNdeIをNdeI及びXbaIを用いて消化し、、eBAF-Ym3部分を除去して、その代わりにBAF-R3又はBAF-R4を挿入した。かくして、pCII-hCBD-HRV3Cs-eBAF-R3及びpCII-hCBD-HRV3Cs-eBAF-R4を作製した。なお、BAF-R3及びBAF-R4は、それぞれ赤色蛍光発光蛋白質として、TurboRFP及びmCherryを含んでいる。BAF-R3及びBAF-R4は、特許文献1に記載の方法に準じて作製した。
上記(5)と同様にして、pCII-hCBD-HRV3Cs-eBAF-Ym3ΔNdeIからeBAF-Ym3部分を除去して、その代わりにRLuc(ウミシイタケルシフェラーゼ)を挿入した。得られたpCII-hCBD-HRV3Cs-RLucを用いて発現させたキメラ蛋白質濾紙に吸着/結合させて乾燥させ、室温保存した後の発光活性の試験結果を図10に示す。
各キメラ蛋白質について、リコンビナント蛋白質をHisタグ融合蛋白質として、大腸菌BL21株において低温ショック誘導性プロモーターシステム(TAKARA)により発現させた。リコンビナント蛋白質は、Ni-NTAアフィニティーカラムを用いて精製した。
穴あけパンチで作製した直径6mmの丸形濾紙(ADVANTEC)片をパラフィルム上に置き、当該濾紙片にHisタグ精製した各種キメラ蛋白質の高濃度水溶液を数μlずつ滴下、次いで乾燥の工程を繰り返した。十分量のキメラ蛋白質を結合後、大量の精製水にて、当該濾紙片を洗浄し、未結合のCBD-BAFを除去した。洗浄後の濾紙片をパラフィルム上で風乾することで、各種キメラ蛋白質結合濾紙を作製した。図1に、方法の概要を模式的に示す。キメラ蛋白質としては、CBD-eBAF-Ym3、hCBD-HRV3Cs-eBAF-Ym3ΔNdeI(以下、「hCBD-eBAF-Ym3」と記載する場合がある。)、hCBD-HRV3Cs-eBAF-R3(以下、「hCBD-eBAF-R3」と記載する場合がある。)、hCBD-HRV3Cs-eBAF-R4(以下、「hCBD-eBAF-R4」と記載する場合がある。)及びhCBD-HRV3Cs-RLuc(以下、「hCBD-RLuc」と記載する場合がある。)を用いた。
リンゴ型パンチで切り抜き、中央部にCBD-eBAF-Ym3を結合させた。その後、洗浄した濾紙片に対し、ルシフェリン溶液を添加して、黄緑色発光を視認観察した。塗布部からの拡散が見られないことを確認後、LAS-4000にて、High Resolution mode(感度最低)で4秒間露光により、発光画像を取得した。結果を、図2Aに示す。
なお、本実施例のみ、セルロース/キチン結合ドメインとしてCBD(chBD2(TN)型で、変異導入部分以外は天然型の超好熱性細菌由来の遺伝子(塩基)配列)を有する、CBD-eBAF-Ym3を使用した。本実施例以外は、全てchBD2(TN)のアミノ酸配列をコードするが、大腸菌でのコドン使用に最適化した人工合成遺伝子を使用した(「hCBD」と呼ぶ場合がある。)。
CBD-eBAF-Ym3蛋白質結合濾紙をプラスチックペトリディッシュに入れ、フタをした後、室温(26℃〜27℃)暗所にて保存した。測定直前に、当該乾燥濾紙片をルミノメータ用測定チューブ(Nunc)に入れ、発光反応バッファー(60 mM NaCl, 50 mM Tris-HCl, pH8.0)200 μlを加えて、十分湿潤させた。当該チューブに、1 μMルシフェリン溶液200 μlを添加し、発光測定を行った。発光量はLuminescencer-PSN (アトー)を用いて、10秒間の積算により測定した。結果を図2Bに示す。
hCBD-HRV3Cs-eBAF-Ym3ΔNdeI、hCBD-eBAF-R3、hCBD-HRV3Cs-eBAF-R4及びhCBD-HRV3Cs-RLucについても、同様に保存後の発光量を測定した。結果を、図3〜5及び図10にそれぞれ示す。
系の概要を、図6及び図7Aに模式的に示す。
カニ甲羅を塩酸処理(脱カルシウム)、NaOH処理(除タンパク)、次いでアルコール処理(除脂質)を順次施し、キチン素材(カニ甲羅キチン素材)を得た。得られたキチン素材に、3種のhCBD-BAF蛋白質(hCBD-HRV3Cs-eBAF-Ym3、hCBD-HRV3Cs-eBAF-R3及びhCBD-HRV3Cs-eBAF-R4)を、領域を分けて塗布(図9A)して、これを乾燥した。室温にて3日間保存した後、505nmの緑色LEDイルミネータを照射し、オレンジ色フィルターを透過する光をデジカメで撮影した。図9Bの(b-1)は蛍光灯下での明視野像、(b-2)は蛍光像をそれぞれ示す。図9Bの(b-1)及び(b-2)は、同一アングルから撮影した写真である。陰性対照と未塗布部分が緑色なのは、照射緑色光が反射しているためである。さらに、同一試料を室温にて10か月乾燥保存した後の蛍光像を、図9Bの(b-3)に示す。
hCBD-BAFに用いた各種BAFのスペクトル測定
3種のhCBD-BAF蛋白質(hCBD-HRV3Cs-eBAF-Ym3、hCBD-HRV3Cs-eBAF-R3及びhCBD-HRV3Cs-eBAF-R4)に用いた各種BAF蛋白質単体(eBAF-Ym3、eBAF-R3及びeBAF-R4)について、特許文献2に記載の方法に準じてスペクトル測定を行なった。結果を、図11〜13に示す。
セミ抜け殻へのCBD-BAF蛋白質の結合及び発光観察
キチン素材として、セミ抜け殻を用いた。セミ抜け殻に直接hCBD-HRV3Cs-eBAF-Ym3を塗布した。当該ハイブリッド材料を前述の反応バッファーに浸し、ルシフェリン溶液を添加した後、発光の様子をデジタルカメラで記録した。結果を図14に示す。
Claims (9)
- 発光ドメインとセルロース及び/又はキチン結合ドメインを含むキメラ蛋白質であって、前記発光ドメインがルシフェラーゼ及び蛍光発光蛋白質からなる群から選ばれる少なくとも1種の発光蛋白質を含む、キメラ蛋白質。
- 発光ドメインとセルロース及び/又はキチン結合ドメインが直接又は第1リンカーを介して結合されてなる、請求項1に記載のキメラ蛋白質。
- 前記発光ドメインがルシフェラーゼ及び蛍光発光蛋白質を含み、ルシフェラーゼから蛍光発光蛋白質へのエネルギー移動(BRET)が生じ得るものである、請求項1又は2に記載のキメラ蛋白質。
- ルシフェラーゼと蛍光発光蛋白質が第2リンカーを介して結合されてなる、請求項3に記載のキメラ蛋白質。
- 蛍光発光蛋白質が、GFP、YFP、BFP、CFP、OFP、DsREDまたはRFPである請求項1〜4のいずれか1項に記載のキメラ蛋白質。
- 蛍光発光蛋白質がYFPまたはRFPである、請求項5に記載のキメラ蛋白質。
- 第1リンカー及び/又は第2リンカーがプロテアーゼ切断配列を含む、請求項1〜6のいずれか1項に記載のキメラ蛋白質。
- 請求項1〜7のいずれかに記載のキメラ蛋白質をコードするDNAまたはその相補鎖。
- 請求項1〜7のいずれかに記載のキメラ蛋白質をセルロース又はキチンを含む粒子、ビーズ、シート又はフィルムに結合させてなる、発光材料。
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