JPWO2009084616A1 - 改変型グルコース脱水素酵素遺伝子 - Google Patents
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Abstract
Description
[態様2]
野生型GLDと比較してキシロース作用性/グルコース作用性が0.85倍以下に低下した、態様1記載の改変型GLD。
[態様3]
アミノ酸置換が、D72A、G73D、G73A、G73S、G73C、G73Q、G73W、G73Y、G73E、G73H、R102H、Y228H、V356A、及びP527L、並びに、S37V、S37G、T69I、L76F、F78L、R102V、N217S、P240I、P240L、Q407A、Q407S、Y424S、A437I及びT530Aからなる群から選択される、態様1又は2記載の改変型GLD。
[態様4]
配列番号1で示される野生型のFAD結合型グルコース脱水素酵素(GLD)アミノ酸配列において、N64D+R102H+L250Q、G73D、Y228H+A589T、K374Q+P527L、V356A、D72A+G210S、G73A、P527L、D72A、Y228H、G73C、G73H、R102H、D72A+G73D、G73S、G73Q、G73W、G73Y、及びG73E、並びに、S37V、S37G、T69I、L76F、F78L、R102V、N217S、P240I、P240L、Q407A、Q407S、Y424S、A437I及びT530Aからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する改変型GLD。
[態様5]
態様1ないし4のいずれか一項に記載の改変型GLDをコードするポリヌクレオチド。
[態様6]
配列番号1で示される野生型のFAD結合型グルコース脱水素酵素(GLD)アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドが配列番号2に示される塩基配列を有する、態様5記載のポリヌクレオチド。
[態様7]態様5又は6記載のポリヌクレオチドを保有する組換えベクター。
[態様8]態様7記載の組換えベクターを用いることによって作製された形質転換細胞。
[態様9]大腸菌又はアスペルギルス・オリゼである、態様8記載の形質転換細胞。
[態様10]態様8又は9の形質転換細胞を培養し、得られた培養物から改変型GLDを採取することを特徴とする、改変型GLDの製造方法。
[態様11]態様1ないし4のいずれか一項に記載の改変型GLD又は請求項10記載の製造方法で得られた改変型GLDを使用することを特徴とする、グルコースの測定方法。
[態様12]態様1ないし4のいずれか一項に記載の改変型GLD又は請求項10記載の製造方法で得られた改変型GLDを含有することを特徴とする、グルコース測定試薬組成物。
[態様13]態様1ないし4のいずれか一項に記載の変型GLD又は請求項10記載の製造方法で得られた改変型GLDを使用することを特徴とする、グルコース測定用のバイオセンサ。
0.1M リン酸カリウム緩衝液(pH7.0)1.0mL、1.0M D−グルコース1.0mL、3mM 2,6−ジクロロフェノールインドフェノール(以下DCIPという)0.14mL、3mM 1−メトキシ−5−メチルフェナジウムメチルサルフェイト0.2mL、水0.61mLを3mL石英セル(光路長1cm)に添加し、恒温セルホルダー付き分光光度計にセットして37℃で10分間インキュベート後、酵素溶液0.05mLを添加後、DCIPの600nmにおける吸光度変化(ΔABS/min)を測定する。DCIPのpH7.0におけるモル吸光係数を16.3×103cm-1M-1とし、1分間に1μmolのDCIPが還元される酵素活性が実質的に該酵素活性1unitと等価であることから、吸光度変化より該酵素活性を次式に従って求めた。
また、グルコースを酸化する酵素活性(U)を100%とした場合のキシロースを酸化する酵素活性(相対活性)を「キシロース作用性/グルコース作用性」(%)と定義する。
同じく、グルコースを酸化する酵素活性(U)を100%とした場合のマルトース又はガラクトースを酸化する酵素活性(相対活性)を「マルトース作用性/グルコース作用性」(%)及び「ガラクトース作用性/グルコース作用性」(%)と定義する。
なお、活性測定はプレートリーダーを用いて行うこともできる。その場合には、上記と同一組成の反応試薬と適宜希釈した酵素を用いて600nmにおける吸光度変化を測定し、上記石英セルを用いた活性測定手順により酵素活性が既知となっている酵素溶液の吸光度変化との間で比例換算を行うことにより、酵素溶液の酵素活性を算出することができる。
特許文献2に全塩基配列が公開されている野生型GLD遺伝子(配列番号2)を含むプラスミドpCGLDをEschelichia coli JM109/pCGLD(FERM BP-10243)から単離した。これは、特許文献1に公開されているアスペルギルス・テレウス(Aspergillus terreus)FERM BP-08578株由来のGLD遺伝子を通常の方法により単離し、シグナル配列(配列番号1における1〜19番目のアミノ酸配列)をコードする部位を除いた形で、タカラバイオより市販されているプラスミドベクターpColdIIIのマルチクローニングサイトにあるKpnI-PstI部位に挿入することでも取得できる。
GLD遺伝子にランダム変異を導入するために、下記のようなオリゴヌクレオチドをデザインし、合成した。なお、プライマーDNA(F)は制限酵素KpnI切断部位を有し、プライマーDNA(R)は制限酵素PstI切断部位を有する。
プライマーDNA(F):5’ cgtcatggtacctccaactccacgtccgccaa 3’ (配列番号3)
プライマーDNA(R):5’ agtgtactgcagctaacgacgaccagcatcgg 3’ (配列番号4)
トリプトン(BD社製)1.2%(w/v)、Yeast extract(BD社製)2.4%(w/v)、グリセリン(ナカライテスク社製)5%(w/v)及び水からなる溶液Aを121℃、15分オートクレーブ処理して調製し、リン酸二水素カリウム(ナカライテスク社製)2.3%、リン酸水素二カリウム(ナカライテスク社製)12.5%及び水からなる溶液Bを0.45μmフィルター(アドバンテック社製)を用いてろ過調製した。上記の溶液Aと溶液BをA:B=9:1となるように無菌環境下混合し、TB培地を調製した。
96マイクロウェルプレート(Nunc社製)の各ウェルに150μLのTB培地を分注し、実施例2で取得した形質転換体を1コロニーずつ植菌した。
37℃、1,000rpmで5時間振とう培養後、培養温度を15℃とし、1,000rpmで30分振とう後、終濃度が0.1mMとなるようにイソプロピル−β−D−1−チオガラクトピラノシド(シグマアルドリッチジャパン社製)水溶液を25μL加えて、再度、15℃、1,000rpmで13時間振とう培養した。
培養後の形質転換体を遠心により集菌し、蒸留水で洗浄した後、再度遠心分離を行って得た菌体に1ウェルあたり50μLのCelLytic B Cellysis Reagent(SIGMA社製)を加えてから、25℃で30分間静置した後、遠心して上清を回収し、無細胞抽出液とした。
前述の酵素活性測定法に従い、無細胞抽出液のGLD酵素活性を確認した。D-グルコースを基質とした場合の培養液1mLあたりのGLD酵素活性(U/mL-b)が野生株と比べて10分の1以下に低下しておらず、かつキシロース作用性/グルコース作用性(Xyl/Glc)が野生株と比べて優位に低下していた変異株を選別し、遺伝子解析を実施した結果、表3の通りだった。
GLD遺伝子に部位特異的な置換変異を導入するために、下記のようなオリゴヌクレオチドをデザインし、合成した。
プライマーDNA(G73A):5’ gtcacaaacgtggatgcctacgggcttgctttt 3’ (配列番号5)
プライマーDNA(P527L):5’ gttctaacttccatctcgtcggcacggctgc 3’ (配列番号6)
プライマーDNA(D72A):5’ atgtcacaaacgtggctggctacgggcttgc 3’ (配列番号7)
プライマーDNA(Y228H):5’ cgtgaatcttgaggagcatgtgcgcgaagacgc 3’ (配列番号8)
プライマーDNA(G73C):5’ tcccaatgtcacaaacgtggattgctacgggcttg 3’ (配列番号9)
プライマーDNA(G73H):5’ caatgtcacaaacgtggatcactacgggcttgcttttggg 3’ (配列番号10)
プライマーDNA(R102H):5’ tagtcaagtgcttcatgccggcaaggccc 3’ (配列番号11)
プライマーDNA(D72A+G73D):5’ ccaatgtcacaaacgtggctgactacgggcttgcttttgg 3’ (配列番号12)
プライマーDNA(G73S):5’ tcccaatgtcacaaacgtggatagctacgggcttg 3’ (配列番号13)
プライマーDNA(G73Q):5’ aacaatcccaatgtcacaaacgtggatcagtacgggcttgctttt 3’ (配列番号14)
プライマーDNA(G73W):5’cccaatgtcacaaacgtggattggtacgggcttgct 3’ (配列番号15)
プライマーDNA(G73Y):5’ ggaacaatcccaatgtcacaaacgtggattattacgggcttgcttttg 3’ (配列番号16)
プライマーDNA(G73E):5’ atgtcacaaacgtggatgagtacgggcttgcttttggg 3’ (配列番号17)
上記方法と同様にして、野生型GLD遺伝子を含むプラスミドpCGLDと、実施例4で合成した配列番号6ないし17に記載の各プライマーDNA、及び各プライマーDNAと相補的な合成オリゴヌクレオチドを用いて、各々の置換変異を導入したプラスミドを取得した。形質転換も上記同様に行い、野生型GLDのアミノ酸配列の一部が置換された各々の改変型GLDをコードする改変型GLD遺伝子を持つ形質転換体を取得した。
実施例5により取得した形質転換体について、実施例3に記載の手順と同様にして培養し、無細胞抽出液のGLD酵素活性を測定評価した。D-グルコースを基質とした場合の培養液1mLあたりのGLD酵素活性(U/mL-b)が野生株GLDのそれと比べて10分の1以上保持されており、かつキシロース作用性/グルコース作用性(Xyl/Glc)が野生株と比べて優位に低下していた変異株を選別し、遺伝子解析を実施した結果を表4に示す。
実施例5により取得した形質転換体について、TB培地に代えて、トリプトン(BD社製)4%(w/v)、Yeast extract(BD社製)2%(w/v)、グリセリン(ナカライテスク社製)4%(w/v)及び水からなる培地(pHをNaOHで7.0に調整)を121℃、15分オートクレーブ処理して調製した培地を用いて、実施例3に記載の手順と同様に培養し、無細胞抽出液のGLD酵素活性を測定評価した。D-グルコースを基質とした場合の培養液1mLあたりのGLD酵素活性(U/mL-b)が野生株GLDのそれと比べて10分の1以上保持されており、かつキシロース作用性/グルコース作用性(Xyl/Glc)が野生株と比べて優位に低下していた変異株を選別し、遺伝子解析を実施した結果を表5に示す。
実施例2において取得した形質転換体のうち、野生型GLDのアミノ酸配列の374位のリジンがグルタミンに置換され、かつ527位のプロリンがロイシンに置換された改変型GLDをコードする改変型GLD遺伝子を持つ形質転換体(R30株)を用いて、改変型GLD遺伝子を含むプラスミドを常法により単離した。
同様に、実施例2において取得した形質転換体のうち、野生型GLDのアミノ酸配列の73位のグリシンがアスパラギン酸に置換された改変型GLDをコードする改変型GLD遺伝子を持つ形質転換体(R25株)を用いて、改変型GLD遺伝子を含むプラスミドを常法により単離した。
同様にして、実施例5において取得した形質転換体のうち、野生型GLDのアミノ酸配列の102位のアルギニンがヒスチジンに置換された改変型GLDをコードする改変型GLD遺伝子を持つ形質転換体(S32株)を用いて、改変型GLD遺伝子を含むプラスミドを常法により単離した。
また同様にして、実施例5において取得した形質転換体のうち、野生型GLDのアミノ酸配列の73位のグリシンがセリンに置換された改変型GLDをコードする改変型GLD遺伝子を持つ形質転換体(S16株)を用いて、改変型GLD遺伝子を含むプラスミドを常法により単離した。
5'-atgttgggaaagctctccttcctcagtgccctgtccctggcagtggcggcacctttgtccaactccacgtccgcc-3'(配列番号18)
2. gene1F-2:
5'-(acgcgtcgac)tgaccaattccgcagctcgtcaaaatgttgggaaagctctcc-3'(配列番号19)
3. gene1R:
5'-(gtg)ctaacgacgaccagcatcggccttgatgagatcc-3'(配列番号20)
(Fは5’側、Rは3’側、括弧内:制限酵素切断部位、下線部:enoA 5’-UTR、その他:ORF)
本菌株に対し、公知文献2(Aspergillus属の異種遺伝子発現系、峰時俊貴、化学と生物、38、12、P831-838、2000)に記載してあるアスペルギルス・オリゼ由来のアミラーゼ系の改良プロモーターを使用し、その下流に上記の改変型GLD遺伝子を結合させることで、本遺伝子が発現可能なベクターを調製した。
形質転換は、基本的には公知文献2及び公知文献3(清酒用麹菌の遺伝子操作技術、五味勝也、醸協、P494-502,2000)に記載の方法に準じて実施することで形質転換体を取得した。
実施例1で取得したプラスミドpCGLDを用い、実施例8に記載の方法と同様の手順により、野生型GLD遺伝子(配列番号1)を持つベクターを調製し、アスペルギルス・オリゼ NS4株を形質転換することで、形質転換体を取得した。
実施例9及び比較例において取得した形質転換体について、グルコース(和光純薬工業社製)1%(w/v)、脱脂大豆(日本食販社製)2%(w/v)、コーンスティープリカー(サンエイ糖化社製)0.5%(w/v)、硫酸マグネシウム(ナカライテスク社製)0.1%(w/v)、及び水を含むpH6.0の培養液20mLを用いて、30℃、3日間振盪培養し、培養終了後、遠心して培養上清を回収した。
これを10μmメンブレンフィルター(アドバンテック社製)を用いてろ過し、SDSポリアクリルアミドゲル電気泳動において約81kDaのバンドを示す酵素溶液を得た。
前述の酵素活性測定法に従い、実施例10で取得した酵素溶液のGLD酵素活性(U/mL-b)及び「キシロース作用性/グルコース作用性」(Xyl/Glc)を確認したところ、下記の表6の通りとなった。この結果から、野生型GLDに比べてキシロース作用性が低下した改変型GLDを生産する形質転換体が得られたことが分かる。
以上の結果から、野生型GLDに比べてキシロース作用性が低下した改変型GLDを生産する形質転換体を培養することにより、改変型GLDが得られたことが分かる。
前述の酵素活性測定法に従い、この精製された改変型GLD酵素の「キシロース作用性/グルコース作用性」を確認したところ、野生型GLDは8.6%であるのに対して、73位のグリシンがアスパラギン酸に置換した改変型GLDは4.8%だった。
以上の結果から、野生型GLDに比べて、マルトース作用性及びガラクトース作用性に加えて、更にキシロース作用性が低下した改変型GLDを生産する形質転換体を培養することにより、マルトース及びガラクトースに作用せず、更にキシロース作用性の低い改変型GLDを得ることができることが確認された。
実施例12で得られた、73位のグリシンがアスパラギン酸に置換した改変型GLDを生産する形質転換体の精製酵素溶液(比活性631U/mg)の酵素溶液を使用し、吸光度変化を測定することによるD-グルコースの測定を行った。プレートリーダーを用いた反応測定系において、終濃度が0.3、1.0、5.0、10、33mMになるようD-グルコースを添加し、600nmにおけるDCIPの吸光度変化(ΔAbs/min)を測定した。この吸光度変化を既知のグルコース濃度(0.3、1.0、5.0、10、33mM)に対してプロットしたところ、表7に示す結果が得られ、それに基づき検量線が作成できた(図1)。これより本発明の改変型GLDを用いてグルコースの定量が可能であることが示された。
実施例4に加えて、GLD遺伝子に部位特異的な置換変異を導入するために、下記のようなオリゴヌクレオチドをデザインし、合成した。
プライマーDNA(S37V):5’ attggaggcggtactgtgggtttggccgtcgca 3’ (配列番号21)
プライマーDNA(S37G):5’ attggaggcggtactggcggtttggccgtcgca 3’ (配列番号22)
プライマーDNA(T69I):5’ aacaatcccaatgtcatcaacgtggatggctac 3’ (配列番号23)
プライマーDNA(L76F):5’ tggatggctacgggttcgcttttgggtctga 3’ (配列番号24)
プライマーDNA(F78L):5’ gctacgggcttgctttggggtctgacattga 3’ (配列番号25)
プライマーDNA(R102V):5’ cttagtcaagtgcttgtcgccggcaaggccctt 3’ (配列番号26)
プライマーDNA(N217S):5’ aagatgcgcggcttttccttatacccctccacc 3’ (配列番号27)
プライマーDNA(P240I):5’ cgtgcatactactggatctacaagtcccgtccc 3’ (配列番号28)プライマーDNA(P240L):5’ cgtgcatactactggttgtacaagtcccgtccc 3’ (配列番号29)
プライマーDNA(Q407L):5’ cgtctcttcgaggtcctgtatgaccttattttc 3’ (配列番号30)
プライマーDNA(Q407S):5’ cgtctcttcgaggtctgctatgaccttattttc 3’ (配列番号31)
プライマーDNA(Y424S):5’ cgctgaagtcctgaactcgccgggcagcgcgacgt 3’ (配列番号32)
プライマーDNA(A437I):5’ tttgcagaattctggatcctccttcccttcgct 3’ (配列番号33)
プライマーDNA(T530A):5’ ttccatcccgtcggcgcggctgccatgatgcct 3’ (配列番号34)
実施例15により取得した形質転換体について、TB培地に代えて、トリプトン(BD社製)4%(w/v)、Yeast extract(BD社製)2%(w/v)、グリセリン(ナカライテスク社製)4%(w/v)及び水からなる培地(pHをNaOHで7.0に調整)を121℃、15分オートクレーブ処理して調製した培地を用いて、実施例3に記載の手順と同様に培養し、無細胞抽出液のGLD酵素活性を測定評価した。D-グルコースを基質とした場合の培養液1mLあたりのGLD酵素活性(U/mL-b)が野生株GLDのそれと比べて10分の1以上保持されており、かつキシロース作用性/グルコース作用性(Xyl/Glc)が野生株と比べて優位に低下していた変異株を選別し、遺伝子解析を実施した結果を表8に示す。
Claims (13)
- 配列番号1で示される野生型のFAD結合型グルコース脱水素酵素(GLD)アミノ酸配列において、37, 69, 72, 73, 76, 78, 102, 217, 228, 240, 356, 407, 424, 437, 527及び530位のアミノ酸からなる群から選択される少なくとも1つのアミノ酸残基における置換を含み、且つ、野生型GLDと比較してキシロース作用性/グルコース作用性が低下した改変型GLD。
- 野生型GLDと比較してキシロース作用性/グルコース作用性が0.85倍以下に低下した、請求項1記載の改変型GLD。
- アミノ酸置換が、D72A、G73D、G73A、G73S、G73C、G73Q、G73W、G73Y、G73E、G73H、R102H、Y228H、V356A、及びP527L、並びに、 S37V、S37G、T69I、L76F、F78L、R102V、N217S、P240I、P240L、Q407A、Q407S、Y424S、A437I及びT530Aからなる群から選択される、請求項1又は2記載の改変型GLD。
- 配列番号1で示される野生型のFAD結合型グルコース脱水素酵素(GLD)アミノ酸配列において、N64D+R102H+L250Q、G73D、Y228H+A589T、K374Q+P527L、V356A、D72A+G210S、G73A、P527L、D72A、Y228H、G73C、G73H、R102H、D72A+G73D、G73S、G73Q、G73W、G73Y、及びG73E、並びに、S37V、S37G、T69I、L76F、F78L、R102V、N217S、P240I、P240L、Q407A、Q407S、Y424S、A437I及びT530Aからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する改変型GLD。
- 請求項1ないし4のいずれか一項に記載の改変型GLDをコードするポリヌクレオチド。
- 配列番号1で示される野生型のFAD結合型グルコース脱水素酵素(GLD)アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドが配列番号2に示される塩基配列を有する、請求項5記載のポリヌクレオチド。
- 請求項5又は6記載のポリヌクレオチドを保有する組換えベクター。
- 請求項7記載の組換えベクターを用いることによって作製された形質転換細胞。
- 大腸菌又はアスペルギルス・オリゼである、請求項8記載の形質転換細胞。
- 請求項8又は9の形質転換細胞を培養し、得られた培養物から改変型GLDを採取することを特徴とする、改変型GLDの製造方法。
- 請求項1ないし4のいずれか一項に記載の改変型GLD又は請求項10記載の製造方法で得られた改変型GLDを使用することを特徴とする、グルコースの測定方法。
- 請求項1ないし4のいずれか一項に記載の改変型GLD又は請求項10記載の製造方法で得られた改変型GLDを含有することを特徴とする、グルコース測定試薬組成物。
- 請求項1ないし4のいずれか一項に記載の改変型GLD又は請求項10記載の製造方法で得られた改変型GLDを使用することを特徴とする、グルコース測定用のバイオセンサ。
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