JPWO2009072593A1 - 乳酸脱水素酵素発現カセット、形質転換酵母および乳酸の製造方法 - Google Patents
乳酸脱水素酵素発現カセット、形質転換酵母および乳酸の製造方法 Download PDFInfo
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Abstract
Description
(a)配列番号1〜3いずれかに示す塩基配列からなるプロモーター
(b)配列番号1〜3いずれかに示す塩基配列もしくはその一部を含む塩基配列とストリンジェントな条件でハイブリダイズする塩基配列からなるプロモーター
(c)配列番号1〜3いずれかに記載の塩基配列において、1あるいは複数個の塩基が欠失、置換および/または付加された塩基配列からなるプロモーター
(a)
(1)配列番号1〜3いずれかに示す塩基配列からなるプロモーター
(2)配列番号1〜3いずれかに示す塩基配列もしくはその一部を含む塩基配列とストリンジェントな条件でハイブリダイズする塩基配列からなるプロモーター
(3)配列番号1〜3いずれかに記載の塩基配列において、1あるいは複数個の塩基が欠失、置換および/または付加された塩基配列からなるプロモーター
(b)
(1)配列番号4〜6いずれかに示す塩基配列からなる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子
(2)配列番号4〜6いずれかに示す塩基配列もしくはその一部を含む塩基配列とストリンジェントな条件でハイブリダイズする塩基配列からなる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子
(3)配列番号4〜6いずれかに記載の塩基配列において、1あるいは複数個の塩基が欠失、置換および/または付加された塩基配列からなる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子
2 分離膜エレメント2
3 水頭差制御装置
4 第2のタグ配列
5 攪拌機
6 レベルセンサ
7 培地供給ポンプ
8 pH調整溶液供給ポンプ
9 pHセンサ・制御装置
10 温度調節器
11 発酵培養液循環ポンプ
12 膜分離槽
13 支持板
14 流路材
15 分離膜
16 凹部
17 集水パイプ
18 分離膜束
19 上部樹脂封止層
20 下部樹脂封止層
21 支持フレーム
22 集水パイプ
本発明の乳酸脱水素酵素発現カセットは、プロモーターの下流に乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子(ldh遺伝子)が連結された乳酸脱水素酵素(LDH:lactate dehydrogenase、以下、「LDH」という)発現カセットであって、乳酸生産能力を有する酵母を分離膜で濾過しながら行う連続培養において、前記プロモーターは、培養開始後50時間以降における遺伝子発現量が全遺伝子の平均相対発現量の5倍以上である遺伝子のプロモーターである、乳酸脱水素酵素発現カセットである。
(b)下記配列番号1〜3いずれかに示す塩基配列もしくはその一部を含む塩基配列とストリンジェントな条件でハイブリダイズする塩基配列からなるプロモーター
(c)下記配列番号1〜3いずれかに記載の塩基配列において、1あるいは複数個の塩基が欠失、置換および/または付加された塩基配列からなるプロモーター
配列番号1:(SED1遺伝子:Saccharomyces cerevisiae(サッカロマイセス・セレビシエ)由来)
aggattttaa tctgttggag ttaaggtgaa tacgtttttc catattgggg tatgcagctc
gaacctaaag tggtatgtac acatcccctc aagcacaccc attaccctta taggattaat
gtaagcaaca gcttacacgg aattggaaat actattcaac gatccatgca tctgccagat
tcggacatgc atattcccca attggatata gaaaattaac gtaaggcagt atcttttcac
aatgtacttg caacgcggcg acttaaagtt gaagtacaac ctgcagcagc ggctttttgt
acggtacgcc aaactgtcaa tggataatat tgcgtagacc gaaaaaggta atcctcaaca
ctacccgtgg tggatgacct aaagcagtaa tattggttgg aattatctcc cagacggcac
cgtctccccg agaaagctta gccccgaggt ctaccttcca tacaccactg attgctccac
gtcatgcggc cttctttcga ggacaaaaag gcatatatcg ctaaaattag ccatcagaac
cgttattgtt attatatttt cattacgaaa gaggagaggg cccagcgcgc cagagcacac
acggtcattg attactttat ttggctaaag atccatccct tctcgatgtc atctctttcc
attcttgtgt atttttgatt gaaaatgatt ttttgtccac taatttctaa aaataagaca
aaaagccttt aagcagtttt tcatccattt tactacggta aaatgaatta gtacggtatg
gctcccagtc gcattatttt tagattggcc gtaggggctg gggtagaact agagtaagga
acattgctct gccctctttt gaactgtcat ataaatacct gacctatttt attctccatt
atcgtattat ctcacctctc tttttctatt ctcttgtaat tattgattta tagtcgtaac
tacaaagaca agcaaaataa aatacgttcg ctctattaag
配列番号2:(CWP2遺伝子:Saccharomyces cerevisiae(サッカロマイセス・セレビシエ)由来)
ctaatagaca aggtgctatg agtgaattgc tagcctcccc tttttatttt gtgcggtcac
cgcaagggac aaagcttttc ttagaaaacc gtctgagaag cataacgtac gccatcccct
agacatatta ataatgctac agatactatg ctgctcgtct ttttttgacg acccttttat
tgcaatgtgc aactaatggc aaacaaccac atagtatcac agtattacat tgcctccacc
gatgcggatg ttagggcgcc aagtctgtca tgaagcatgt tcctgtcata atcttgtatg
caaaataccg cgttctgcgc cactgatatg ctaggcagca gcaacctatg cagaagattg
cttttcccac gcctgtttta cgtctccagg gcacttgaaa caatgcagcg atcgccgcca
caacacgcca aagagaagcg aaagtgggcc tgggcggcct cagtttcggc agaggtaaac
aacacgaact gaactgcctt agctccgaag ggcaattcca caggcactcc gcggggcccg
gccaaggccc aaaaggcgtg gaatatgcgc gttttggggc cataacaccc agtaccacgg
ccggaacggg ccatataata agtttttcac tctcaagaat ggtaaacgta aataggaaca
tcccactacc ctagaaattg cggaaatttc gcgcttatca ttagaaaatc tggaaccgtc
ctttttcctc tttcttgcat ttccctttcc gtattattgc cattctttaa ctgcatttgg
ggaaccgtag accaaaagcc aaacagagaa atgtaacgtt ctaaaaaaaa aacaacgaaa
aaattgaaaa ataagataca ataatcgtat ataaatcagg cttcttgttc atcattttca
attctcttct tgccatccct tttcctatct ttgttctttt cttctcataa tcaagaataa
ataacttcat cacattcgct acacactaac aagaaaaaaa
配列番号3:(ENO1遺伝子:Saccharomyces cerevisiae(サッカロマイセス・セレビシエ)由来)
tagaaagcat actatactat tcgacacttc ctttcaatcc tggaattaac agtcactttt
aaaaaagaca tctaccgtga aggtgccgta gagtatcgcg ttaccatatc gccaaaaact
gatatacgcc gcggaaacca ggcaaacaat tgaaaagaaa aattttgagg aactctctgc
atcgaagccg tctagagtta ccactagtca gatgccgcgg gcacttgagc acctcatgca
cagcaataac acaacacaat ggttagtagc aacctgaatt cggtcattga tgcatgcatg
tgccgtgaag cgggacaacc agaaaagtcg tctataaatg ccggcacgtg cgatcatcgt
ggcggggttt taagagtgca tatcacaaat tgtcgcatta ccgcggaacc gccagatatt
cattacttga cgcaaaagcg tttgaaataa tgacgaaaaa gaaggaagaa aaaaaaagaa
aaataccgct tctaggcggg ttatctactg atccgagctt ccactaggat agcacccaaa
cacctgcata tttggacgac ctttacttac accaccaaaa accactttcg cctctcccgc
ccctgataac gtccactaat tgagcgatta cctgagcggt cctcttttgt ttgcagcatg
agacttgcat actgcaaatc gtaagtagca acgtctcaag gtcaaaactg tatggaaacc
ttgtcacctc acttaattct agctagccta ccctgcaagt caagaggtct ccgtgattcc
tagccacctc aaggtatgcc tctccccgga aactgtggcc ttttctggca cacatgatct
ccacgatttc aacatataaa tagcttttga taatggcaat attaatcaaa tttattttac
ttctttcttg taacatctct cttgtaatcc cttattcctt ctagctattt ttcataaaaa
accaagcaac tgcttatcaa cacacaaaca ctaaatcaaa
(a)
(1)上記配列番号1〜3いずれかに示す塩基配列からなるプロモーター
(2)上記配列番号1〜3いずれかに示す塩基配列もしくはその一部を含む塩基配列とストリンジェントな条件でハイブリダイズする塩基配列からなるプロモーター
(3)上記配列番号1〜3いずれかに記載の塩基配列において、1あるいは複数個の塩基が欠失、置換および/または付加された塩基配列からなるプロモーター
(b)
(1)下記配列番号4〜6いずれかに示す塩基配列からなる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子
(2)下記配列番号4〜6いずれかに示す塩基配列もしくはその一部を含む塩基配列とストリンジェントな条件でハイブリダイズする塩基配列からなる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子
(3)下記配列番号4〜6いずれかに記載の塩基配列において、1あるいは複数個の塩基が欠失、置換および/または付加された塩基配列からなる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子
atggcaactg tgaaggataa actcatccac aatgtggtca aggaggagtc gctcccccag
aacaaggtca ccattgtggg tgtgggggcc gtgggcatgg cctgtgccat cagtgtcctg
cagaaggatt tggcagatga gcttgcactt gttgatgtga tagaagacaa actgaagggg
gaaatgatgg atctccagca tggcagtctg ttccttcgta cccccaagat tgtctcaggg
aaagattaca gcgtcactgc aaactccaag ctggtagttg tgacggccgg ggcccgtcag
caggagggag agagtcgcct gaatctggtt cagcgcaatg tcaacatctt caaattcatc
attcccaaca ttgtcaagta cagccccaac tgcaccctgc tcatcgtctc caacccagtg
gacattctga catatgtggc ctggaagatc agtggattcc ccaaaaaccg tgtcattggc
agcggctgca atttggactc tgcccgtttc cgttacctca tggggcagaa gtttgggatc
cacacccaga gctgccacgg ttgggtcatt ggggaacacg gagactcgag tgtgccagtg
tggagtgggg tgaatgtggc tggcgtgtcc ctgaaaaccc tgcaccccga tattgggagt
gacgcagaca aggagaactg gaaggaggtg cacaagcagg ttgtggacag cgcctatgaa
gtgatcaagc tgaagggcta cacctcctgg gctattggcc tgtccgtagc tgacctgtct
gagagtatcc tgaagaacct ccgccgagtc catcccattt ccacaatggt caagggcatg
tacggcgtga ataatgatgt tttcctcagt gtcccctgtg tgttgggcaa cttgggcatc
acagacgtgg ttaacatgac gctgaaggca gatgaagagg atcgcttacg caagagcgca
gacaccctgt gggccatcca gaaggagctg cagttctag
配列番号5:ホモ・サピエンス(Homo sapiens)由来
atggcaactc taaaggatca gctgatttat aatcttctaa aggaagaaca gaccccccag
aataagatta cagttgttgg ggttggtgct gttggcatgg cctgtgccat cagtatctta
atgaaggact tggcagatga acttgctctt gttgatgtca tcgaagacaa attgaaggga
gagatgatgg atctccaaca tggcagcctt ttccttagaa caccaaagat tgtctctggc
aaagactata atgtaactgc aaactccaag ctggtcatta tcacggctgg ggcacgtcag
caagagggag aaagccgtct taatttggtc cagcgtaacg tgaacatatt taaattcatc
attcctaatg ttgtaaaata cagcccgaac tgcaagttgc ttattgtttc aaatccagtg
gatatcttga cctacgtggc ttggaagata agtggttttc ccaaaaaccg tgttattgga
agtggttgca atctggattc agcccgattc cgttacctga tgggggaaag gctgggagtt
cacccattaa gctgtcatgg gtgggtcctt ggggaacatg gagattccag tgtgcctgta
tggagtggaa tgaatgttgc tggtgtctct ctgaagactc tgcacccaga tttagggact
gataaagata aggaacagtg gaaagaggtt cacaagcagg tggttgagag tgcttatgag
gtgatcaaac tcaaaggcta cacatcctgg gctattggac tctctgtagc agatttggca
gagagtataa tgaagaatct taggcgggtg cacccagttt ccaccatgat taagggtctt
tacggaataa aggatgatgt cttccttagt gttccttgca ttttgggaca gaatggaatc
tcagaccttg tgaaggtgac tctgacttct gaggaagagg cccgtttgaa gaagagtgca
gatacacttt gggggatcca aaaggagctg caattttaa
配列番号6:ロイコノストック・メセンテロイデス(Leuconostoc mesenteroides)由来
atgaagattt ttgcttacgg cattcgtgat gatgaaaagc catcacttga agaatggaaa
gcggctaacc cagagattga agtggactac acacaagaat tattgacacc tgaaacagct
aagttggctg agggatcaga ttcagctgtt gtttatcaac aattggacta tacacgtgaa
acattgacag ctttagctaa cgttggtgtt actaacttgt cattgcgtaa cgttggtaca
gataacattg attttgatgc agcacgtgaa tttaacttta acatttcaaa tgttcctgtt
tattcaccaa atgctattgc agaacactca atgcttcaat tatctcgttt gctacgtcgc
acgaaagcat tggatgccaa aattgctaag cgagacttgc gttgggcacc aacaactgga
cgtgaaatgc gtatgcaaac agttggtgtt attggtacag gtcatattgg ccgtgttgct
attaacattt tgaaaggctt tggggccaag gttattgctt atgacaagta cccaaatgct
gaattacaag cagaaggttt gtacgttgac acattagacg aattatatgc acaagctgat
gcaatttcat tgtatgttcc tggtgtacct gaaaaccatc atctaatcaa tgcagatgct
attgctaaga tgaaggatgg tgtggttatc atgaacgctg cgcgtggtaa tttgatggac
attgacgcta ttattgatgg tttgaattct ggtaagattt cagacttcgg tatggacgtt
tatgaaaatg aagttgcttg ttcaatgaag attggtctgg taaagaattc cccagatgct
aagattgctg acttgattgc acgcgaaaat gttatgatca ccccacacac ggctttctat
acaactaaag ctgttctaga aatggttcac caatcatttg atgcagcagt tgctttcgcc
aagggtgaga agccagctat tgctgttgaa tattaa
本発明は、上記乳酸脱水素酵素発現カセットを染色体中に少なくとも一つ含む形質転換酵母である。本発明における形質転換酵母は、乳酸脱水素酵素発現カセットからのLDHの発現が起こりうる染色体中の任意の位置に該乳酸脱水素酵素発現カセットを導入することができる。好ましくは、SED1遺伝子、CWP2遺伝子又はENO1遺伝子から選ばれる遺伝子の少なくとも一つが上記乳酸脱水素酵素発現カセットにより置換されている酵母である。
本発明は、上記形質転換酵母を培養することを含む乳酸の製造方法である。培養には、バッチ培養、流加培養(フェドバッチ培養)、ケモスタット培養または連続培養のいずれも採用することができる。好ましくは連続培養である。より好ましくは、培養液を分離膜で濾過し、濾液から乳酸を回収し、さらに未濾過液を培養液に保持または還流し、かつ、培地を培養液に追加する連続培養である。
多孔質基材の表面に、前記の樹脂と溶媒とを含む原液の被膜を形成すると共に、その原液を多孔質基材に含浸させる。その後、被膜を有する多孔質基材の被膜側表面のみを、非溶媒を含む凝固浴と接触させて樹脂を凝固させると共に多孔質基材の表面に多孔質樹脂層を形成する。原液は、樹脂を溶媒に溶解させて調整する。原液に、さらに非溶媒を含ませることもできる。原液の温度は、製膜性の観点から、通常、15〜120℃の範囲内で選定することが好ましい。
中空糸膜は、樹脂と溶媒からなる原液を二重管式口金の外側の管から吐出すると共に、中空部形成用流体を二重管式口金の内側の管から吐出して、冷却浴中で冷却固化して作製することができる。
・装置:原子間力顕微鏡装置(Digital Instruments(株)製Nanoscope IIIa)
・条件:探針 SiNカンチレバー(Digital Instruments(株)製)
:走査モード コンタクトモード(気中測定)
水中タッピングモード(水中測定)
:走査範囲 10μm、25μm 四方(気中測定)
5μm、10μm 四方(水中測定)
:走査解像度 512×512
・試料調製:測定に際し膜サンプルは、常温でエタノールに15分浸漬後、RO水中に24時間浸漬し洗浄した後、風乾し用いた。RO水とは、濾過膜の一種である逆浸透膜(RO膜)を用いて濾過し、イオンや塩類などの不純物を排除した水を指す。RO膜の孔の大きさは、概ね2nm以下である。
膜表面粗さdroughは、上記のAFMにより各ポイントのZ軸方向の高さから、下記の(式2)により算出する。
発酵生産速度(g/L/hr)=抜き取り液中の生産物濃度(g/L)×発酵培養液抜き取り速度(L/hr)÷装置の運転液量(L) ・・・・(式3)
本発明では、乳酸生産能力を有する酵母として、配列番号4に記載の塩基配列を有するゼノプス・レービス由来のldh遺伝子がPDC1プロモーターの下流の導入された酵母を使用した。ゼノプス・レービス由来のldh遺伝子のクローニングはPCR法により行った。PCRには、ゼノプス・レービスの腎臓由来cDNAライブラリー(STRATAGENE社製)より付属のプロトコールに従い調製したファージミドDNAを鋳型とした。
配列番号7:
gtcgacatgg caactgtgaa ggataa
配列番号8:
gcggccgcct agaactgcag ctcctt
配列番号9:
tctcaattat tattttctac tcataacctc acgcaaaata acacagtcaa atcaatcaaa
atggcaactg tgaaggataa actca
配列番号10:
aggcgtatca cgaggccctt
配列番号11:
gaattaattc ttgaagacga aagggcctcg tgatacgcct agattgtact gagagtgcac
配列番号12:
tatttttcgt tacataaaaa tgcttataaa actttaacta ataattagag attaaatcgc
ctgtgcggta tttcacaccg
配列番号13:
caaatatcgt ttgaatattt ttccg
移動相:5mM p−トルエンスルホン酸(流速0.8mL/min)
反応液:5mM p−トルエンスルホン酸、20mM ビストリス、0.1mM EDTA・2Na(流速0.8mL/min)
検出方法:電気伝導度
温度:45℃
カラム:TSK−gel Enantio LI(登録商標:東ソー社製)
移動相:1mM 硫酸銅水溶液
流速:1.0ml/min
検出方法:UV254nm
温度:30℃
光学純度(%)=100×(L−D)/(L+D)
ここで、LはL−乳酸の濃度、DはD−乳酸の濃度を表す。
HPLC分析の結果、L−乳酸が検出され、D−乳酸は検出限界以下であった。以上の検討により、このSU014株がL−乳酸生産能力を持つことを確認した。
本発明では、分離膜として以下の方法で作製した多孔性膜を使用した。
樹脂としてポリフッ化ビニリデン(PVDF)樹脂を、また開孔剤として分子量が約20,000のポリエチレングリコール(PEG)を、溶媒としてN,N−ジメチルアセトアミド(DMAc)を、そして非溶媒として純水をそれぞれ用い、これらを90℃の温度下に十分に攪拌し、次の組成を有する原液を得た。
・PVDF:13.0重量%
・PEG:5.5重量%
・DMAc:78.0重量%
・純水:3.5重量%
本発明では、参考例1で作製したSU014株を用い、図1に示す連続培養装置により濾過連続培養を行った。培地には表1に示す組成の乳酸発酵培地を用いた。この培地は、121℃の温度で15分間、高圧(2気圧)蒸気滅菌処理して用いた。分離膜エレメント部材としては、ステンレス、及びポリサルホン樹脂の成型品を用い、分離膜としては参考例2で作製した多孔性膜を用いた。本実施例における運転条件は、特に断らない限り、以下のとおりである。
発酵反応槽容量:1.5(L)
使用分離膜:PVDF濾過膜(参考例2で作製)
膜分離エレメント有効濾過面積:120平方cm
温度調整:30(℃)
発酵反応槽通気量:空気0.01(L/min)、窒素ガス0.19(L/min)
発酵反応槽攪拌速度:800(rpm)
pH調整:1N NaOHによりpH5に調整
消泡剤:3時間毎に滅菌した消泡剤PE−L(和光純薬社製)を200μl添加
滅菌:分離膜エレメントを含む培養槽、および使用培地は総て121℃、20minの
オートクレーブにより高圧蒸気滅菌
参考例3で行った連続培養中の遺伝子発現量の変化を検討するために、参考例3で行った連続培養開始から70時間および210時間の培養液サンプルを取得し、酵母菌体から全RNAの抽出を行った。全RNAの抽出は、取得した酵母をOD600=0.2になるように10mlの破砕用緩衝液(50mM 酢酸ナトリウム(pH5.3)、10mM EDTA DEPC treated)に懸濁し、50mlチューブに移した。500μlの20% SDSを加え、更に予め65℃に保温しておいた12mlのフェノール(破砕緩衝液飽和)を加え、ボルテックスミキサーで5秒間攪拌した。65℃で4分間保温した後、ドライアイス/エタノール浴で室温まで急冷した。室温で遠心分離(5 min. 12000 G)し、水上清を新しい50mlチューブに移し、等量のPCI(pH5.3)を加え抽出した。その水上清を新しい50mlチューブに移し、等量のクロロホルムを加え抽出した。その水上清を新しい50mlチューブに移し、1/10量の3M 酢酸ナトリウム(pH5.3)を加えエタノール沈殿した。ペレットを80%エタノールで2回洗浄、乾固し、RNAフリー水で溶かしたものを全RNAサンプルとした。
実施例1で得られた結果をもとに、配列番号4に記載のldh遺伝子をSED1遺伝子、CWP2遺伝子およびENO1遺伝子座に導入した。
配列番号14:
tattgattta tagtcgtaac tacaaagaca agcaaaataa aatacgttcg ctctattaag
atggcaactg tgaaggataa actca
配列番号15:
aaaaaataac ataatactga aagaaagcat taagaaggcg gatgtgtcaa acaccaccgt
ctgtgcggta tttcacaccg
配列番号16:
tagattggcc gtaggggctg
配列番号17:
cacgcaacgc gtaagaaaca
配列番号18:
cttctcataa tcaagaataa ataacttcat cacattcgct acacactaac aagaaaaaaa
atggcaactg tgaaggataa actca
配列番号19:
ctagtaaaac cgaaaatttt gaaaaaagcc atatagatat tataaaaaat cagagatttc
ctgtgcggta tttcacaccg
配列番号20:
aaacagagaa atgtaacgtt
配列番号21:
cattcgaaga gaaatcacag
配列番号22:
ctagctattt ttcataaaaa accaagcaac tgcttatcaa cacacaaaca ctaaatcaaa
atggcaactg tgaaggataa actca
配列番号23:
gaaaatgaaa taaatgacaa aaaaacgtgt tttttggact agaaggctta atcaaaagct
ctgtgcggta tttcacaccg
配列番号24:
aaggtatgcc tctccccgga
配列番号25:
cggatacacg cgtcaccaca
3−1 ヒト由来およびロイコノストック・メセンテロイデス由来ldh遺伝子のクローニング
次に、配列番号5、6に記載のヒト由来およびロイコノストック・メセンテロイデス由来ldh遺伝子のクローニングを行った。まず、ヒト由来のldh遺伝子のクローニング方法を下記に示す。
ロイコノストック・メセンテロイデス由来ldh遺伝子は、Res.Microbiol,146,291−302(1995)に記されている配列(配列番号6)を参考にして、PCR法を応用した遺伝子全合成によりクローニングした。全合成時に5末端側にはXhoI認識配列、3末端側にはNotI認識配列を付加するように行い、PCR断片をpTA2ベクターにTAクローニングした。ライゲーションは、DNA ligation kit Ver.2(宝酒造株式会社製)を用いて行った。ライゲーションプラスミド産物で大腸菌DH5αを形質転換し、プラスミドDNAを回収することによりロイコノストック・メセンテロイデス由来ldh遺伝子(配列番号6)がサブクローニングされたプラスミドを得た。得られたldh遺伝子が挿入されたpTA2プラスミドを制限酵素XhoIおよびNotIで消化し、得られた各DNA断片を酵母発現用ベクターpTRS11のXhoI/NotI切断部位に挿入した。このようにしてロイコノストック・メセンテロイデス由来ldh遺伝子発現プラスミドpTRS152を得た。
次に、配列番号5および6に記載のldh遺伝子をPDC1遺伝子、SED1遺伝子、CWP2遺伝子およびENO1遺伝子座に導入した。
実施例2で用いた配列番号14のプライマーの代わりにヒト由来ldh遺伝子では配列番号30、ロイコノストック・メセンテロイデス由来ldh遺伝子では配列番号33のプライマーに変更して行い、得られたPCR断片を用いてSU019,024株をそれぞれヒスチジン非要求に形質転換した。得られた形質転換株をそれぞれSU020株(ヒト由来ldh遺伝子導入株),SU025株(ロイコノストック・メセンテロイデス由来ldh遺伝子導入株)とする。
実施例2で用いた配列番号18のプライマーの代わりにヒト由来ldh遺伝子では配列番号31、ロイコノストック・メセンテロイデス由来ldh遺伝子では配列番号34のプライマーに変更して行い、得られたPCR断片を用いてSU019,024株をそれぞれヒスチジン非要求に形質転換した。得られた形質転換株をそれぞれSU021株(ヒト由来ldh遺伝子導入株),SU026株(ロイコノストック・メセンテロイデス由来ldh遺伝子導入株)とする。
実施例2で用いた配列番号22のプライマーの代わりにヒト由来ldh遺伝子では配列番号32、ロイコノストック・メセンテロイデス由来ldh遺伝子では配列番号35のプライマーに変更して行い、得られたPCR断片を用いてSU019,024株をそれぞれウラシル非要求に形質転換した。得られた形質転換株をそれぞれSU022株(ヒト由来ldh遺伝子導入株),SU027株(ロイコノストック・メセンテロイデス由来ldh遺伝子導入株)とする。さらに、SU020,025株を同様にウラシル非要求性に形質転換し、それぞれSU023株(ヒト由来ldh遺伝子導入株),SU028株(ロイコノストック・メセンテロイデス由来ldh遺伝子導入株)を得た。
参考例1(SU014)および実施例2、3で得られたSU015〜SU028株を用いてバッチ培養により乳酸発酵試験を行った。表1に示した乳酸発酵培地を10mL試験管に取り、そこにそれぞれ少量のSU014〜SU028株を植菌し、30℃で一晩培養した(前々培養)。次に、新鮮な表1に示した乳酸発酵培地100mLを500ml容三角フラスコにいれ、各前々培養液をそれぞれ全量植菌し、30℃で24時間振とう培養した(前培養)。続いて、表1に示した乳酸発酵培地を1L投入したミニジャーファメンター(丸菱バイオエンジ社製、容量5L)に、前培養開始から24時間後の前培養液をそれぞれ全量植菌し、攪拌速度(120rpm)、通気量(0.1L/min)、温度(30℃)、pH(pH5)を一定にして培養を行った(本培養)。なお、中和は1N NaOHで行い、重量変化を天秤で測定することで投入量を計測した。本培養開始後40時間の培養液を遠心分離し、得られた上清を膜濾過した後、参考例1に示した方法で、乳酸蓄積濃度を算出した。グルコース濃度の測定には、“グルコーステストワコーC”(登録商標)(和光純薬社製)を用いた。
実施例2、3で得られた形質転換酵母SU015〜028を用いて、図1に示す連続培養装置により濾過連続培養を行った。培地には表1に示す組成の乳酸発酵培地のグルコース濃度を70g/Lに変更した培地を用いた。この培地は、121℃の温度で15分間、高圧(2気圧)蒸気滅菌処理して用いた。分離膜エレメント部材としては、ステンレス、及びポリサルホン樹脂の成型品を用いた。分離膜としては参考例2で作製した多孔性膜を用いた。本実施例における運転条件は、特に断らない限り、以下のとおりである。
発酵反応槽容量:1.5(L)
使用分離膜:PVDF濾過膜(参考例2で作製)
膜分離エレメント有効濾過面積:120平方cm
温度調整:30(℃)
発酵反応槽通気量:空気0.01(L/min)、窒素ガス0.19(L/min)
発酵反応槽攪拌速度:800(rpm)
pH調整:5N 水酸化カルシウムによりpH5に調整
消泡剤:3時間毎に滅菌した消泡剤PE−L(和光純薬社製)を200μl添加
滅菌:分離膜エレメントを含む培養槽、および使用培地は総て121℃、20minの
オートクレーブにより高圧蒸気滅菌
Claims (10)
- プロモーターの下流に乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子が連結された乳酸脱水素酵素発現カセットであって、
前記プロモーターは、
乳酸生産能力を有する酵母を分離膜で濾過しながら行う連続培養において、培養開始後50時間以降における遺伝子発現量が全遺伝子の平均相対発現量の5倍以上である遺伝子のプロモーターである、乳酸脱水素酵素発現カセット。 - 前記プロモーターは、サプレッション・オブ・エクスポネンシャル・ディフェクト1遺伝子(SED1遺伝子)、細胞壁関連タンパク質2遺伝子(CWP2遺伝子)又はエノラーゼ1遺伝子(ENO1遺伝子)のプロモーターである、請求項1に記載の乳酸脱水素酵素発現カセット。
- 前記プロモーターが、以下の(a)〜(c)より選択される塩基配列からなるプロモーターである、請求項1に記載の乳酸脱水素酵素発現カセット。
(a)配列番号1〜3いずれかに示す塩基配列からなるプロモーター
(b)配列番号1〜3いずれかに示す塩基配列もしくはその一部を含む塩基配列とストリンジェントな条件でハイブリダイズする塩基配列からなるプロモーター
(c)配列番号1〜3いずれかに記載の塩基配列において、1あるいは複数個の塩基が欠失、置換および/または付加された塩基配列からなるプロモーター - 以下の(a)群から選ばれるプロモーターおよび以下の(b)群から選ばれる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子を含む、乳酸脱水素酵素発現カセット。
(a)
(1)配列番号1〜3いずれかに示す塩基配列からなるプロモーター
(2)配列番号1〜3いずれかに示す塩基配列もしくはその一部を含む塩基配列とストリンジェントな条件でハイブリダイズする塩基配列からなるプロモーター
(3)配列番号1〜3いずれかに記載の塩基配列において、1あるいは複数個の塩基が欠失、置換および/または付加された塩基配列からなるプロモーター
(b)
(1)配列番号4〜6いずれかに示す塩基配列からなる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子
(2)配列番号4〜6いずれかに示す塩基配列もしくはその一部を含む塩基配列とストリンジェントな条件でハイブリダイズする塩基配列からなる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子
(3)配列番号4〜6いずれかに記載の塩基配列において、1あるいは複数個の塩基が欠失、置換および/または付加された塩基配列からなる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子 - 請求項1〜4いずれかに記載の乳酸脱水素酵素発現カセットを少なくとも一つ染色体中に有する、形質転換酵母。
- 前記形質転換酵母は、そのサプレッション・オブ・エクスポネンシャル・ディフェクト1遺伝子(SED1遺伝子)、細胞壁関連タンパク質2遺伝子(CWP2遺伝子)およびエノラーゼ1遺伝子(ENO1遺伝子)から選ばれる遺伝子の少なくとも一つが、請求項1〜4いずれかに記載の乳酸脱水素酵素発現カセットで置換されている、請求項5に記載の形質転換酵母。
- 前記形質転換酵母は、サッカロミセス属(Genus Saccharomyces)に属する、請求項5または6に記載の形質転換酵母。
- 前記形質転換酵母は、サッカロミセス・セレビセ(Saccharomyces cerevisiae)である、請求項5または6に記載の形質転換酵母。
- 請求項5〜8いずれかに記載の形質転換酵母を培養する培養工程を含む、乳酸の製造方法。
- 前記培養工程は、培養液を分離膜で濾過し、濾液から乳酸を回収し、さらに未濾過液を培養液に保持または還流し、かつ、培地を培養液に追加する連続発酵である、請求項9に記載の乳酸の製造方法。
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