JPH11511002A - Capl特異的オリゴヌクレオチドおよび転移性癌を抑制する方法 - Google Patents

Capl特異的オリゴヌクレオチドおよび転移性癌を抑制する方法

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JPH11511002A JP8525157A JP52515796A JPH11511002A JP H11511002 A JPH11511002 A JP H11511002A JP 8525157 A JP8525157 A JP 8525157A JP 52515796 A JP52515796 A JP 52515796A JP H11511002 A JPH11511002 A JP H11511002A
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Abstract

(57)【要約】 CAPL核酸に相補的なヌクレオチド配列を有する合成オリゴヌクレオチド(リボザイムを含む)を開示する。CAPL特異的オリゴヌクレオチドを用いたCAPL遺伝子の発現を抑制する方法および転移性癌を抑制する方法もまた開示する。

Description

【発明の詳細な説明】 CAPL特異的オリゴヌクレオチドおよび転移性癌を抑制する方法 発明の技術分野 本発明は癌治療に関する。特に、本発明は転移性癌を制御および治療するため の合成オリゴヌクレオチドの使用に関する。発明の背景 腫瘍の進行は腫瘍細胞集団内で選択的な増殖特性を有する変異細胞が発生する 場合に起こると考えられている(フォウルズ(Foulds)(1975)Neoplast ic Dev.、第2巻、アカデミック・プレス(Academic Press)、ロンドン)。 腫瘍の進行の最終段階の1つは転移性の表現型の出現である(ニコルソン(Nic olson(1984))Cancer Metast.Rev.3:24−42)。転移の間に、 該腫瘍細胞は血管に侵入し、循環する宿主の免疫防御に対して生き残り、ついで 血管外遊出(extravasate)し、着床し、ついで第1次腫瘍の位置から遠く離れ た部位で増殖する(ニコルソン(Nicolson)(1982)Biochim.Biophys. Acta 695:113−176;およびニコルソン(1987)Cancer Res. 47:1473−1487)。腫瘍細胞の近隣組織への侵入および他の器官に着 床するこの能力は癌関連死の主要な原因である。 転移という語には癌死へと最も頻繁に導く臨床的な問題となる多数の表現型の 特徴を含む。該細胞はその接着性を喪失し、組織化された組織内の限られた位置 にとどまり、近隣部位へと移動し、血管からの侵入および遊出(egress)の両方 の能力を増大させ、本来のではない位置または環境で増殖することができる。増 殖パターンにおけるこれらの変化は転移性のプロセスを促進する能力を有する生 化学的変化の蓄積を伴う。 転移性癌は体の多数の異なる領域に(骨が最も頻繁におこる部位の1つである )侵入する。例えば、癌腫および時には肉腫からでさえの転移は骨格に広がるこ と が知られている。骨格の転移は無症状であるかまたは第1次腫瘍と同様のメカニ ズムによる症状、すなわち、痛み、腫張、変形、骨髄中の造血幹細胞組織への侵 入、脊髄または神経根の圧縮および病理学上の骨折などを生み出す。さらに、急 速に溶解する骨格転移は過カルシウム血症となることができる。転移の痛みが多 く、しばしばこのような衰弱させる効果のため一層よい治療および改良された方 法が至急に必要である。 これまでのところ、転移のカスケードに関する本質的なメカニズムは殆ど知ら れていない。いくつかの場合においてある腫瘍細胞の増大した転移能は癌遺伝子 の増大した発現のためであり、癌遺伝子は通常は細胞の多様な機能(分化、増殖 、細胞運動およびコミュニケーションを含む)のコントロールを担う(カーンズ (Cairns)(1981)Nature 289:353−57;バーガー(Berger) ら(1988)Cancer Res.48:1238−1243;およびクライン(K lein)ら(1985)Nature 315:190−195)。 近年、このプロセスに関連するとされるいくつかの遺伝子が同定された。例え ば、Ca2+結合タンパク質のS100ファミリーのいくつかのメンバーは悪質新 生物の進行、腫瘍発生および転移能の異なる側面と関連する(エブラリズ(Ebr alidze)ら(1989)Genes & Dev.3:1086−1092;リー(Lee )ら(1992)Proc.Natl.Acad.Sci.89:2504−2508)) 。このファミリーは組織特異的および細胞特異的なやり方で発現する13のヒト のメンバーからなる。これらのタンパク質は事実上すべての第1次および転移性 の黒色腫などの多様なヒトの腫瘍において見られ、腫瘍の組織病理発生の同定の ためのマーカーとして使用される(例えば、リーら(1992)Proc.Natl. Acad.Sci.(USA)89:2504−2508)。S100タンパク質の 正常な細胞の機能は必須のシグナルトランスダクション経路への関連、細胞の発 生および分化の制御および細胞骨格構成への関与などを含む幾つかは示唆されて いるものの明らかにされていない(クリグマン(Kligman)ら(1988)Tre nds.Biol.Sci.13:437−443)。 ある特定のヒトS100タンパク質を染色体1(Iq21−22)に局在化さ れたCAPL遺伝子と少なくとも5つの他の構造的に関連した遺伝子によってコ ードされると見出された(エングルカンプ(Englekamp)ら(1992)Bioch em.31:10258−10264;エンゲルカンプ(Engelkamp)ら(199 3)Proc.Natl.Acad.Sci.(USA)90:6547−6551)。そ のマウスの対応物mts1は転移性のマウス乳癌に発現する(エブラリズら(19 89)Genes Dev.3:1086−1093)。これらの遺伝子、すなわちS 100ファミリーの小(10kD)Ca2+結合タンパク質をコードする遺伝子は 特に、Ca2+結合ドメインをコードする領域において高程度のホモロジーを共有 する(モンクリフ(Moncrief)(1990)J.Mol.Evol.30:522− 562)。 どの癌が転移性となるかのメカニズムならびにS100関連遺伝子の機能およ び転移性癌の進行におけるタンパク質の機能は未だ解明されていない。これらの 基礎にあるプロセスの一層の理解は該疾患の進行に関与する遺伝子の発現を抑制 する方法を含み、確かに必要とされている転移性癌の一層効果的な治療および制 御方法を提供する。発明の概要 本発明は転移性癌を治療および制御する方法および組成物を提供する。これら の組成物および方法はCAPLがたいていの骨肉腫組織および確立された骨肉腫 細胞株において他の腫瘍の型において観察されるレベルに比較して高いレベルで 発現するという現在の発見に基づいて開発された。CAPL転写物に特異的なリ ボザイムは、トランスフェクションされるヒト転移性癌細胞株におけるCAPL 発現を減少させ、増殖の速度を減少させ、ついでその形態を変えることもまた見 出された。さらに、このリボザイムは該リボザイムでトランスフェクションした ヒト骨肉腫細胞で注入した哺乳動物モデルにおいて骨転移の進行を効果的に減少 させる。 これらの発見を用いて本発明がなされ、本発明は第一の態様においてCAPL 核酸に相補的であるヌクレオチド配列を有する合成オリゴヌクレオチドを含む。 本発明の目的のため、「合成オリゴヌクレオチド」とは6またはそれ以上のヌ クレオチドまたはヌクレオチド類似体が少なくとも1つの5'→3'のインターヌ クレオチド結合を介して互いに結合している化学的に合成されたポリマーを含む 意味である。この結合はアンチセンス技術において公知である任意の結合を含ん でよい。このような分子は3'末端および5'末端を有する。 「核酸に相補的なヌクレオチド配列を有するオリゴヌクレオチド」なる語は、 生理学的条件下で例えばワトソン−クリックの塩基対形成(オリゴヌクレオチド と一本鎖核酸間の相互作用)またはフーグスティーンの塩基対形成(オリゴヌク レオチドと二本鎖核酸間の相互作用)またはオリゴヌクレオチドがRNAに結合 し、偽の結合(pseudoknott)を形成する場合を含む他の任意の手段によって核 酸に結合する6〜50ヌクレオチドのオリゴヌクレオチド配列を含むよう意図さ れている。生理学的条件下のこのような結合(ワトソン−クリックの塩基対形成 による)は核酸配列の機能との干渉を観察することによって実際の物質として測 定される。 いくつかの態様において、本発明のオリゴヌクレオチドはトリヌクレオチドG UC(配列番号:2)を含む。他の態様において、特許請求されているオリゴヌ クレオチドはエクソン2または転写開始部位、翻訳開始部位、翻訳終結部位また はスプライシング部位を含むCAPL転写物に相補的なヌクレオチド配列を有す る。好ましい態様において、このヌクレオチド配列はヌクレオチド132を含む エクソン2の少なくとも一部を含むCAPL転写物に相補的である。特定の態様 において、本発明は配列番号:9または10を有する合成オリゴヌクレオチドを 含み、CAPL特異的リボザイムが結合する(および「GUX」配列を含んでよ い)CAPL核酸領域、配列番号:3または4を有するオリゴヌクレオチド(3 'スプライシング部位に相補的である)、配列番号:5または6を有するオリゴ ヌクレオチド(5'スプイライシング部位に相補的である)または配列番号:7 または8を有するオリゴヌクレオチド(翻訳開始部位に相補的である)に相補的 である。 修飾されたオリゴヌクレオチドはまた、少なくとも1つの「非ホスホジエステ ル−インターヌクレオチド結合、すなわち1つのヌクレオチドの5'末端と5'リ ン酸ヌクレオチド任意の数の化学基で置換されているが他のヌクレオチドの3' 末端の間のホスホジエステル結合の他の結合によって結合されているものをも含 む。好ましい合成結合には、アルキルホスホネート、ホスホロチオエート、ホス ホロジチオエート、アルキルホスホノチオエート、ホスホルアミデート、ホスホ ルアミダイト、リン酸エステル、カルバメート、カーボネート、リン酸トリエス テル、アセトアミデートおよびカルボキシメチルエステルが含まれる。これらの 結合のうちの任意のものがまた、多様な化学基、例えばアミノアルキルホスフェ ートなどで置換されていてもよい。本発明の1つの好ましい態様において、該オ リゴヌクレオチドの全てのヌクレオチドはオスホロチオエートおよび/またはホ スホロジチオエート結合を介して結合する。 本発明のいくつかの態様において、該オリゴヌクレオチドは修飾される。本明 細書で使用する「修飾されたオリゴヌクレオチド」とは修飾された核酸、塩基お よび/または天然にみられない糖を含む。例えば、3',5'−置換オリゴヌクレ オチドは、3'位および5'位の両方の位置にて、ヒドロキシル基以外の化学基( 3'位)およびリン酸基以外の化学基(5'位)に結合した糖を有するオリゴヌク レオチドである。 本発明の目的のため、「2'−置換されたオリゴヌクレオチド」なる語はその 2'位でヒドロキシル基以外の化学基に接着した糖を有するオリゴヌクレオチド をいう。リボース分子の2'−OHは1−6炭素原子、2−6炭素原子(例えば 、2'−O−アリル、2'−O−アリール、2'−O−アルキル(2'−O−メチル など)、2'−ハロまたは2'−アミノであるが2'−Hは含まない)アリールま たは置換されたアリールまたはアリルを含む−O−低級アルキルで置換されるこ とができる。ここでアリル、アリールまたはアルキル基は置換されていなくても よいし、例えばハロ、ヒドロキシ、トリフルオロメチル、シアノ、ニトロ、アシ ル、アシロキシ、アルコキシ、カルボキシル、カルバルコキシルまたはアミノ基 で置換されていてもよい。 修飾されたオリゴヌクレオチドはまた、ジアミン、コレステリルまたは他の脂 質親和基またはキャッピング化された種などの付加置換されたものであってもよ い。さらに、酸化されていないかまたは、該分子中のヌクレオチド当たり1つの 非架橋酸素原子における置換を有する部分的に酸化されたオリゴヌクレオチドも または修飾されたオリゴヌクレオチドとみなされる。また、3'および/または 5'末端でのヌクレアーゼ耐性を付与するかさばった置換体および/または修飾 されたオリゴヌクレオチドはヒトの介在なしにはイン・ビボでは見られない他の 構造上の多様な修飾もまた本明細書中では修飾されたとみなされている。 本発明の他の態様において該CAPL特異的合成オリゴヌクレオチドは少なく とも1つのリボヌクレオチド、少なくとも1つのデオキシリボヌクレオチドまた はリボヌクレオチドおよびデオキシリボヌクレオチドの両方を含む。最も好まし い態様において、本発明のオリゴヌクレオチドは約15から30ヌクレオチドの 長さを有する。 本発明の他の態様においてCAPL遺伝子の発現を抑制する方法を提供する。 この方法において、CAPL核酸はCAPL核酸に相補的な合成オリゴヌクレオ チドと結合する。 本発明のさらに別の態様において、骨肉腫などの転移性癌を治療するまたは抑 制する方法を提供する。この方法において、CAPL核酸に相補的である合成オ リゴヌクレオチドの治療上の量を癌を罹患している被験体に投与する。1つの態 様において、少なくとも2つの異なる合成オリゴヌクレオチドを同時に投与する 。そのそれぞれはCAPL核酸に相補的なヌクレオチド配列を有するが、該オリ ゴヌクレオチドの核酸配列は異なっているものである。 本発明の方法はまた、コントロール動物および転移性癌を罹患している動物に おいてのCAPL遺伝子の機能を試験する。現在、遺伝子機能はマウスなどの「 ノックアウト」動物を作製する困難な仕事によってしか試験できない。この仕事 は困難で、時間を消費するものであり、「ノックアウト」が致死表現型を生み出 すので動物の発生に不可欠な遺伝子では行うことができない。本発明はこのモデ ルの欠点を克服するものである。 本発明の少なくとも1つのCAPL特異的合成オリゴヌクレオチドおよび製薬 学的および生理学的に許容し得る担体を含む治療製剤をも提供する。図面の簡単な説明 本発明の前記および他の目的、本発明の種々の特徴ならびに本発明自体は下記 の説明を添付の図面とともに読めばより完全に理解されるであるろう。 図1Aは、ヒトCAPL遺伝子のゲノム配列の模式図であり、下段の文字はm RAN中においてスプライシングされる遺伝子の領域を示し、「n」は決定され ていない塩基を表わす。 図1Bは、本発明の有用なオリゴヌクレオチドが標的化される領域を含むスプ ライシングされていないCAPL RNAの図を表している。 図2Aは、保存されたハンマーヘッド配列および認識配列およびGUC開裂部 位を有する相補的なCAPL mRNA(nt.98−118)および対応する 遺伝子を有するCAPLイリボザイムの構造を模式的に表わす。 図2Bは、CAPL特異的リボザイムをクローニングする方法およびリボザイ ム特異的RNAおよび標的特異的RNAを合成する方法の図である。 図3は、イン・ビトロのCAPL抑制リボザイム活性を示す変性ポリアクリル アミドゲルのオートラジオグラムであり、レーン1は32P−CTP標識したCA PL特異的RNA、レーン2は未標識のリボザイムと混合した32P−CTP標識 したCAPL特異的RNA、レーン3は未標識のリボザイムと混合した32P−C TP標識したCAPL特異的RNA(MgCl2は無添加)およびレーン4は32P −CTP標識したリボザイム特異的RNAである。 図4は、CAPL特異的リボザイムをOHSへトランスファーしたクローンI I−11a、II−11b、III−2およびIII−14をトランスフェクシ ョンしていない親のOHS細胞および「ベクターのみ」トランスフェクションし た細胞であるpHβ−1の両方に比較して特徴付けした図である。すべての細胞 クローンの形態学的写真、ノーザンンブロット分析(ハイブリダイゼーションに はCAPL cDNA、CAPLリボザイムおよび18S rRNAとともに)、 サザンブロット分析(CAPLリボザイムを使用し、pIIβAPr−1−ネオ ベクターまたはハイブリダイゼーションのためのRT−PCR分析による挿入の 検出)およびウェスタンブロット分析(CAPLに対するモノクローナル抗体で 染 色する)を示す。 図5は、本発明のCAPL特異的なオリゴヌクレオチドで処理したヒト骨肉腫 細胞中のCAPL mRNAの発現の抑制を示すグラフである。 図6Aは、コントロールオリゴヌクレオチドまたはCAPL特異的オリゴヌク レオチド(配列番号:9)で処理した後のイン・ビトロでのヒト黒色腫細胞中で のCAPL発現の抑制を示すSDS−ポリアクリルアミドゲルのオートラジオグ ラフを示す。 図6Bは、コントロールオリゴヌクレオチドまたはCAPL特異的オリゴヌク レオチド(配列番号:9)で処理した後のイン・ビトロでのヒト肉腫細胞中での CAPL発現の抑制を示すSDS−ポリアクリルアミドゲルのオートラジオグラ フを示す。好ましい態様の詳細な説明 本明細書中に言及する特許および科学的文献は当業者に利用できる知見を確立 するものである。本明細書中に引用する発行された米国特許および許された出願 は参照のため引用する。 本発明は、転移性癌の治療に有用な、CAPL核酸に特異的な合成アンチセン スオリゴヌクレオチドを提供する。 アンチセンスオリゴヌクレオチド法は、CAPL発現の抑制に対する、それゆ え転移性癌の治療または予防に対する新たなアプローチを提供する(一般にアグ ラワル(Agrawal)(1992)Trends in Biotech.10:152;ワグナー (Wagner)(1994)Nature372:333〜335;およびスタイン(S tein)ら(1993)Science261:1004〜1012を参照)。アンチセ ンスオリゴヌクレオチドは相補的な核酸配列(センス鎖)に結合することにより RNAのスプライシングおよび翻訳を抑制することができる。このようにしてア ンチセンスオリゴヌクレオチドはタンパク質の発現を抑制することができる。ア ンチセンスオリゴヌクレオチドはまたゲノムDNAに結合して三本鎖を形成し、 転写を抑制することも示されている。さらに17マーの塩基配列は統計的にヒト ゲノム中に1度しか現れず、それゆえ、かかるアンチセンスオリゴヌクレオチド を用いて特異的配列の極めて正確なターゲティングが可能である。 本発明のオリゴヌクレオチドは、CAPL遺伝子発現を抑制し、ヒトCAPL 核酸配列の一部に向けられたものであればいかなるものも包含する。ヒトCAP L核酸配列は知られており(エンゲルカンプ(Engelkamp)ら(1993)Pro c.Natl.Acad.Sci.(USA)90:6547〜6551 ジーンバンク(Gen Bank)、AC.No.218950)、図1Aに模式的に示してあり、配列番号: 1に示してある。これら標的領域としては、公知のエクソンのいずれかの部分、 ならびにスプライシング部位(エクソン−イントロン境界)、リボソーム結合部 位、転写開始部位、翻訳開始部位、または翻訳停止部位が挙げられるが、これら に限られるものではない。 ヒトCAPLに特異的な幾つかの代表的だが限定されないオリゴヌクレオチド のヌクレオチド配列を下記表1に列挙する。 本明細書の開示に従い、当業者であればCAPL発現を抑制する他のアンチセ ンス核酸配列を最小限の実験により同定することができるであろう。たとえば、 CAPLに対して特異的にターゲティングした他の配列は、RNアーゼH開裂ア ッセイ(フランク(Frank)ら(1993)Proc.Int.Conf.Nucleic Acid Med.Applns.1:4.14(アブストラクト))やヒトCAPLcDNAを転写 しアッセイに用いたランダム(たとえば、20マー)ライブラリーを用いて選択 することができる。このRNアーゼH分析法は、CAPL mRNA内のアンチ センス結合を最も受けやすい領域を示す。 本発明の合成オリゴヌクレオチドは、リボヌクレオチド、デオキシリボヌクレ オチド、またはそれらの組み合わせからなり、一つのヌクレオチドの5'末端と 他のヌクレオチドの3'末端とが共有結合により連結されている。これらオリゴ ヌクレオチドは長さが少なくとも6ヌクレオチドであるが、好ましくは12〜5 0ヌクレオチドの長さであり、15〜30ヌクレオチドが最も一般的である。 これらRNA−、DNA−、およびRNA/DNA−含有オリゴヌクレオチド は、ホスホルアミデートまたはH−ホスホネート化学などの当該技術分野で認め られた方法(手動または自動合成機により行うことができる)(たとえば、ウー ルマン(Uhlmann)ら(Chem.Rev.(1990)90:534〜583を参照 )により調製することができる。 本発明のオリゴヌクレオチドはまた、CAPL核酸へハイブリダイズする能力 を損なうことなく多くの方法で修飾してよい。たとえば、オリゴヌクレオチドは 、一つのヌクレオチドの5'末端と他のヌクレオチドの3'末端との間にホスホジ エステル以外のインターヌクレオチド結合を含んでいてよく、その際、5'ヌク レオチドリン酸は幾つかの化学基で置換されている。そのような化学基の例とし ては、アルキルホスホネート、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ア ルキルホスホノチオエート、ホスホルアミデート、リン酸エステル、カルバメー ト、アセトアミデート、カルボキシメチルエステル、カーボネート、およびリン 酸トリエステルが挙げられる。これら結合を有するオリゴヌクレオチドは、公知 の方法(Protocols for Oligonucleotides and Analogs、Meth.Mol.Biol. 、 Vol.20(アグラワル編)ヒューマナ・プレス、トトワ、ニュージャージー( 1993)およびウールマンら(1990)Chem.Rev.90:543〜583 に概説されている)に従って調製できる。 他の修飾としてはオリゴヌクレオチド分子の内部または末端に存在するものが 挙げられ、インターヌクレオシドリン酸結合への分子、たとえばコレステリルや ジアミン化合物(アミノ基と末端リボース、デオキシリボースとの間に種々の炭 素数の残基を有する)の付加、および開裂もしくは反対鎖や付随する酵素へ架橋 するリン酸修飾を含む。そのような修飾オリゴヌクレオチドの例としては、2' −O−アルキル化リボース、リボースの代わりのアラビノースなどの修飾された 塩基および/または糖を有するオリゴヌクレオチド、またはその3'位および5' 位の両方にてヒドロキシル基以外の化学基(その3'位にて)およびリン酸基以 外の化学基(その5'位にて)に結合した糖を有する3',5'−置換オリゴヌクレ オチドが挙げられる。他の修飾したオリゴヌクレオチドは、その3'および/ま たは5'末端にてヌクレアーゼ耐性を付与する嵩ばった置換基でキャッピングさ れているか、またはヌクレオチド当たり一つの非架橋性酸素原子に置換を有する 。そのような修飾はインターヌクレオシド結合の幾つかまたはすべてにおいてな されてよく、オリゴヌクレオチドのいずれかまたは両方の末端で、および/また は該分子の内部でなされてよい。 これら修飾されたオリゴヌクレオチドの調製は当該技術分野でよく知られてい る(アグラワルら(1992)Trends Biotechnol.10:152〜158に概 説されている)。たとえば、ホスホルアミデート、H−ホスホネート化学、また はメチルホスホルアミデート化学(たとえば、ウールマンら(1990)Chem. Rev.90:543〜584;アグラワルら(1987)Tetrahedron Lett.2 8:(31):3539〜3542;カルサーズ(Caruthers)ら(1987) Meth.Enzymol.154:287〜313;米国特許第5,149,798号を参 照)などの技術分野で認められた方法を用いてヌクレオチドを共有結合により連 結することができる。オリゴマー性のホスホロチオエートアナログは、メトキシ ホスホルアミダイト(たとえば、アグラワルら(1988)Proc.Natl.Acad. Sci.(USA)85:7079〜7083を参照)やH−ホスホネート(たと えば、フレーラー(Froehler)(1986)Tetrahedron Lett.27:557 5〜5578を参照)化学などの当該技術分野でよく知られた方法を用いて調製 することができる。バーゴット(Bergot)らによって記載された方法(J.Chr omatog.(1992)559:35〜42)を用いることもできる。 ハンマーヘッドリボザイムと呼ばれる特別の形態の合成オリゴヌクレオチドを 用いてCAPL遺伝子の発現を抑制することもできる。リボザイムは、基質にハ イブリダイズするアンチセンスオリゴヌクレオチドとしての機能、およびそれが ハイブリダイズしたRNA分子、たとえばmRNA、RNA含有基質、およびリ ボザイムそれ自体の特定のホスホジエステル結合において開裂する能力を有する 触媒分子としての機能の両機能を有するRNA分子である。 リボザイムはホスホルアミデートまたはH−ホスホネート化学などの技術分野 で認められた方法により調製することができ、該方法は米国特許第5,149,7 89号に記載された標準H−ホスホネート化学を用い、または標準ホスホルアミ ダイト化学(たとえば、ボーケージ(Beaucage)(Meth.Mol.Biol.(199 3)20:33〜61);ダマー(Damha)ら(Protocols for Oligonucleot ides and Analogs:Synthesis and Properties(アグラワル編)(1993 )ヒューマナ・プレス、トトワ、ニュージャージー、81〜114頁);または ウールマンら(Chem.Rev.(1990)90:534〜583を参照)を用い て手動または自動合成機により行うことができる。 リボザイムのフランキング領域および他の領域はまた、基質RNAにハイブリ ダイズするリボザイムアナログの能力を損なうことなく、ヌクレアーゼ消化に対 して保護するために幾つかの仕方で修飾できる。これら修飾は本質的に上記合成 オリゴヌクレオチドについて記載したものと同じである。 別のやり方として、代表的なCAPL特異的リボザイムDNAは、それぞれS al IおよびHind III制限部位を含む2つの部分的に重複するオリゴヌクレオチ ドプライマーから合成することができる。これらプライマーを、PCR増幅を行 う前にアニールさせて半二本鎖を形成させる。つぎに、制限部位でフランキン グされた48bpのリボザイムDNAからなるPCR産物をpHβAPr−1n eoなどの発現ベクター中にクローニングし、ついで該ベクターをOHSなどの 哺乳動物細胞中にトランスフェクションし、発現させることができる。 コドン14のGUCトリヌクレオチドの後でCAPL mRNA転写物を特異 的に開裂すべく開発した代表的なハンマーヘッドリボザイムの構造を図2Aに示 す。該リボザイムのイン・ビトロ活性を、イン・ビトロ転写したリボザイムおよ び32P標識CAPLを混合することにより調べた。最適の開裂条件は、基質とリ ボザイムとのモル比が約1:1で、10mM MgCl2とともに37℃で1時間 インキュベートするものであることがわかった。開裂生成物を変性ポリアクリル アミドゲル電気泳動により分析したところ、該リボザイムは132塩基の標的R NAをそれぞれ91塩基および41塩基の生成物に開裂したことが示された(図 3)。 CAPLが転移性癌の発生において役割を果たしていることは、ヒト転移性癌 細胞株を用いたイン・ビトロおよび骨肉腫の2つの哺乳動物モデルを用いたイン ・ビボの両方において示された。 イン・ビトロ系は、哺乳動物発現ベクターpHβAPr−1neoでトランス フェクションした転移性ヒト骨肉腫細胞株OHS(フォスタッド(Fodstad)( 1986)Int.J.Cancer38:33〜40)から調製した。このベクターは 構成的なヒトβ−アクチンプロモーターの制御下にあり(図2B)、CAPL核 酸に特異的なリボザイムをコードするDNAを含んでいる。 リボザイムでトランスフェクションしたOHS細胞におけるCAPL mRN A発現の抑制を調べて、リボザイム構築物の特異性を決定した。該リボザイムを 哺乳動物発現ベクターpHβAPr−1neo(構成的なヒトβ−アクチンプロ モーターの制御下にある;図2B)中にクローニングした。ベクター単独および クローニングしたリボザイム構築物の両者を転移性ヒト骨肉腫細胞株OHS(フ ォスタッドら(1986)Int.J.Cancer38:33〜40)中にトランスフ ェクションした。個々のジェネチシン耐性コロニーを拾い、45のクローンを増 殖させ、CAPLをコードするmRNAおよびリボザイムをコードするmRNA の 両者についてノーザンブロット上で転写レベルでスクリーニングした。リボザイ ムの存在は40のクローンにおいて認められ、RT−PCRおよびサザーンブロ ット分析によっても確認された。リボザイム活性は、親OHS細胞およびベクタ ー単独をトランスフェクションしたOHS細胞のレベルに比べてCAPL mR NAの量が75%かまたはそれ未満である場合にクローン中に存在すると考えら れた。CAPL転写レベルの著しい低下が17の試験クローンにおいて観察され 、そのすべてが中位から高度のリボザイム発現を伴っていた。さらに、抗CAP L抗体を用いて調製したウエスタンブロットから、mRNAレベルおよびタンパ ク質レベルの両者でのCAPLの低減の間の密接な相関関係が明らかとなった( 図4)。 活性なCAPLリボザイムの生物学的作用をスクリーニングするため、CAP LのmRNAレベルおよびタンパク質レベルで有意に低減した3つのクローンを さらに特徴付けるために選択した。親のOHS細胞およびベクターをトランスフ ェクションしたOHS細胞に加えて、CAPLレベルの低減が観察されなかった 一つのリボザイム発現クローン(クローンIII−2)をコントロールとして含め た。形態学的な作用に加えて、インビトロでの増殖特性、およびヌードマウスお よびラットにおけるインビボでの腫瘍形成性および転移能を評価した。 CAPL発現が低減したOHS形質転換体の培養液は、単層で培養したときに 親のOHS細胞と比べて異なる形態を示した。親の細胞が丸い細胞形状を示した のに対して形質転換細胞は一層平べったく、一層速やかに拡張して表面を覆う傾 向があった。形質転換した単層細胞は親の細胞株に比べて、増殖速度も、軟寒天 コロニー形成実験における播種効率も共にそれほど変化しなかった。 細胞の接着特性および凝集体として増殖する能力を測定するため、クローンを 三次元の凝集体(スフェロイド)として培養した。CAPL発現の低減した細胞 からのスフェロイドは、コントロールのスフェロイドと比較したときに一層ゆっ くりと増殖し、互いに接着する傾向が小さく、CAPLタンパク質がある種の細 胞−細胞接着特性に影響を及ぼすことを示唆していた。 さらに、CAPL特異的なリボザイムの有意量を発現し、それと同時にCAP LのRNAおよびタンパク質のレベルが低減しているクローンでは、ラットにお いて転移頻度が劇的に低くなることが観察された。詳しくは、通常レベルのCA PL RNAおよびタンパク質を発現する細胞では90%の転移が観察されたの に対し、CAPL RNAおよびタンパク質の発現レベルが低減した細胞では2 2%の転移が観察された。このことは、CAPL遺伝子の発現が転移性の表現型 を付与するのに預かっており、該遺伝子の発現を特異的に低減させることにより 腫瘍細胞の転移能を低減させ得ることを示している。 ヒト骨肉腫(KPDX)および黒色腫(THX)細胞株でのCAPL mRN Aおよびタンパク質の抑制もまた、5'スプライス部位に向けられたCAPL特 異的オリゴヌクレオチド(配列番号:5)、開始コドンに向けられたCAPL特 異的オリゴヌクレオチド(配列番号:22)、ATGの前のスプライシング部位 の3'末端に向けられたCAPL特異的オリゴヌクレオチド(配列番号:23) 、およびリボザイム部位に向けられたCAPL特異的オリゴヌクレオチド(配列 番号:9)で処理した後に示された。これら結果を図6Aおよび6Bおよび表2 に示す。 ヒト転移性癌モデルがヌードマウスにおいて(例えばニョニクセン(Kjoniks en)ら(1994)Cancer Res.54:1715−1719参照)およびヌー ドラットにおいて(例えばウェーターマン(Weterman)らCancer Res.52 :1291−1296参照)ヒト癌細胞の直接注射によって確立された。これら および類似のモデルを使用して、CAPL遺伝子の発現と転移性癌の進行との間 の相関を決定する。 特に、CAPL特異的リボザイムでトランスフェクションされたヒト骨肉腫細 胞から調製されたクローンをヌードマウスに皮下移植することによって試験した 。重要なことに、親細胞株とリボザイムトランスフォーマントの間に腫瘍取り込 み(tumor intake)時間の遅延または増殖速度における明確な相違は観察されな かった。これらの結果はイン・ビボでの発生の特徴と一致し、そのことは増殖能 力それ自体がリボザイム活性に影響されないことを示唆している。 心内腫瘍細胞注入で処理した免疫欠損ラットの転移性の表現型を抑圧する合成 オリゴヌクレオチドの能力(ニョニクセンら(1994)Cancer Res.54: 1715−1719;ニョニクセンら(1990)J.Nat.Cancer Inst. 82(5)3月)をもまた研究した。このヌードラットモデル系において、親細 胞および減少させたCAPL発現を有するOHSクローンの転移性の可能性を比 較した。親OHS細胞を注入した動物において37ラットのうちの33(89% )が骨転移を発生し、一方、II−11、II−11BおよびIII−14の細胞 クローンを発現するリボザイムを注入した場合はそれぞれ15のうちの2(13 %)、16のうちの4(25%)および15のうちの4(27%)ラットが転移 性の疾患を発生した。ベクターでトランスフェクションしたコントロール細胞 では骨髄の転移が全部で14のうちの11(78%)ラットにおいて発生した。 CAPL発現においてリボザイム誘発減少を有するクローンとコントロール細胞 の間の顕著な違いは、リボザイム発現細胞で注入したラットにおける転移の発生 の遅延によってさらに証明される。従って、平均的な発生した転移の症状が現れ る前までの遅延時間はすべてのリボザイムトランスフェクションしたクローンに 関して50日以上であるのに比較して、OHS細胞でトランスフェクションした 場合2 8日のみで、「ベクターのみ」でトランスフェクションした細胞では29日であ った。重要なことに、全てのリボザイム発現細胞クローンはOHS(図4)に比 較してCAPL mRNAおよびタンパク質レベルにおいて顕著な減少を示す。 対して、CAPL mRNAまたはタンパク質レベルにおいて減少が見られない リボザイムでトランスフェクションしたクローンIII−2は親のOHS細胞の転 移可能性を保持する。これらのデータはCAPL発現および骨肉腫細胞の転移能 力との間の密接な関係の証拠をさらに強力にする。 別の態様において、OHS細胞および多様なクローンを注入したヌードラット の骨髄における腫瘍細胞を抗ヒト抗体でコートされた免疫磁気(immunomagnetic )ビーズによって単離し、ついでRT−PCRによってCAPLおよびリボザイ ムコードmRNAの両方の発現を分析する。リボザイム特異的PCR産物を観察 し(図3)、設計されたリボザイムが実際に活性であり部位特異的であることを 示す。 結論として、CAPL特異的オリゴヌクレオチドによるCAPL遺伝子発現の 調節は、ヒト骨肉腫細胞株OHSの転移性表現型を取り消す。これはただ1つの 遺伝子産物がイン・ビボアッセイによりヒト腫瘍細胞の転移性の動きにおける総 変化を引き起こすことができることの最初の証明である。 治療製剤の形態における本発明の合成アンチセンスオリゴヌクレオチドは骨肉 腫、乳癌などの転移性癌の治療または抑制に有用である。それらは生理学的にお よび/または製薬学的に許容し得る担体と組み合わせた場合に医薬組成物の一部 として使用されてよい。該担体の特徴は投与経路に依存する。そのような組成物 は合成オリゴヌクレオチドおよび担体に加えて希釈剤、充填剤、塩、バッファー 、安定剤、可溶化剤および当該技術分野においてよく知られた他の物質を含んで よい。本発明の医薬組成物はまた、他の活性因子および/またはCAPL発現の 抑制を増強する薬剤を含んでいてよい。例えば、合成オリゴヌクレオチドの組合 せ(その各々はCAPL mRNAの異なる領域にむかう)は本発明の医薬組成 物において使用されてよい。本発明の医薬組成物はさらに他の化学療法剤を含ん でいてよい。そのような別の因子および/または薬剤は本発明の合成オリゴヌク レ オチドと相乗効果を生み出すため、または本発明の合成オリゴヌクレオチドによ って引き起こされる副作用を最少限度にとどめるために医薬組成物に含まれてよ い。逆に、本発明の合成オリゴヌクレオチドは特定の抗CAPLまたは抗転移性 癌因子の製剤および/または抗CAPL因子および/または薬剤の副作用を最少 限度にするための薬剤に含まれていてよい。 本発明の医薬組成物は本発明の合成オリゴヌクレオチドが他の製薬学的に許容 し得る担体に加えてミセルとしての集合形態で存在する脂質、不溶性の単層、液 体結晶または水溶液中にあるラメラ層などの両親媒性薬剤と組み合わされてリポ ソームの形態であってよい。リポソーム製剤に適した脂質は制限ではないが、モ ノグリセリド、ジグリセリド、スルファチド、リソレシチン、リン脂質、サポニ ン、胆汁酸などが含まれる。そのようなリポソーム製剤の調製は当業者のレベル の範囲にあり、例えば米国特許第4,235,871号;米国特許第4,501,7 28号;米国特許第4,837,028号;および米国特許第4,737,323号 に開示されている。本発明の医薬組成物はさらにシクロデキストリンおよび細胞 へのオリゴヌクレオチドの運搬を増強するようなものまたは徐放性ポリマーなど の化合物をも含む。 本明細書で使用する「治療上有効な量」とは、患者の意味ある利益、すなわち 転移性腫瘍における低減を示すのに十分である医薬組成物または方法の各活性成 分の総量である。個々の活性成分について、単独で投与する場合には、該語はそ の活性成分単独をいう。組み合わせて用いる場合には、該語は組み合わせて連続 でまたは同時に投与されるかどうかにかかわらず治療上の効果を生む活性成分の 組み合わせた量をいう。 本発明の治療法および使用方法を実施することにおいて、治療上有効な量の本 発明の1つまたはそれ以上の合成オリゴヌクレオチドを転移性または前転移性( premetastatic)癌を罹患した被験体に投与する。本発明の合成オリゴヌクレオ チドを単独でかまたは転移性癌の他の公知の治療剤と組み合わせて本発明の方法 に従って投与する。1つまたはそれ以上の他の治療剤と共に投与する(co-admin isterd)場合、本発明の合成オリゴヌクレオチドを他の治療剤と同時 かまたは連続して投与してよい。連続して投与する場合、担当医が本発明の合成 オリゴヌクレオチドを他の治療剤と組み合わせて投与する適切な順序を決定する であろう。医薬組成物中で使用される本発明の合成オリゴヌクレオチドの投与ま たは本発明の方法を実施することは眼内、経口摂取、吸入または皮膚、皮下、筋 肉内または静脈内注射などの従来の多様な方法で行うことができる。 本発明の合成オリゴヌクレオチドの治療上有効な量を経口投与する場合、該合 成オリゴヌクレオチドは錠剤、カプセル、粉末、溶液またはエリキシル剤の形態 であろう。錠剤の形態で投与する場合には、本発明の医薬組成物はさらにゼラチ ンまたはアジュバントなどの固相担体を含む。該錠剤、カプセルおよび粉末は約 5%−95%の合成オリゴヌクレオチドを含み、好ましくは約25%−90%の 合成オリゴヌクレオチドを含む。液体状で投与される場合、水、ワセリン、動物 性油脂または落花生油、ミネラルオイル、大豆油、ゴマ油または合成油などの植 物起源の油脂などの液相担体が添加される。該医薬組成物の液体の形態はさらに 生理学的食塩水、デキストロースまたは他のサッカリド溶液またはエチレングリ コール、プロピレングリコールまたはポリエチレングリコールなどのグリコール を含む。液体状で投与される場合、該医薬組成物は該合成オリゴヌクレオチドの 約0.5−90重量%および好ましくは合成オリゴヌクレオチドの約1−50重 量%である。 本発明の合成オリゴヌクレオチドの治療上有効な量を静脈内、皮膚または皮下 注射によって投与する場合、該合成オリゴヌクレオチドは無発熱物質の、非経口 的に許容し得る水溶液の形態であろう。そのような非経口的に許容し得る溶液の 調製は、pH、等浸透圧性、安定性などのために当業者の範囲内にある。静脈内 、皮膚または皮下注射のための好ましい医薬組成物は該合成オリゴヌクレオチド に加えて、塩化ナトリウム溶液、リンガー液、デキストロース液、デキストロー スおよび塩化ナトリウム溶液、乳酸加リンガー液または公知の他のビヒクルなど の等張性ビヒクルを含むべきである。本発明の医薬組成物はまた、安定剤、保存 剤、バッファー、抗酸化剤または他の当業者に公知の添加剤を含んでもよい。 本発明の医薬組成物中の合成オリゴヌクレオチドの量は、治療される性質およ び重篤度および該特許が受ける前の治療の本質に依存するであろう。最終的に、 担当医が個々の患者を治療するための合成オリゴヌクレオチドの量を決定する。 最初に、担当医は低用量の該合成オリゴヌクレオチドを投与し、ついで患者の応 答を観察する。該患者にとって最適な治療効果を得るまで合成オリゴヌクレオチ ドの高用量が投与され、その時点でそれ以上は用量は増加しない。本発明の方法 を実施するのに使用される多様な医薬組成物は体重1kg当たり約1.0ng〜2.5 mgの合成オリゴヌクレオチドを含むべきである。 本発明の医薬組成物を使用した静脈内治療の時間は多様であり、治療される疾 患の重篤度および個々の患者の潜在的な特異体質的応答に依存する。該合成オリ ゴヌクレオチドの各々の適用の時間は持続的な静脈内投与で12時間から24時 間の範囲にわたる。最終的に担当医は本発明の医薬組成物を用いた静脈内治療の 適当な時間を決定するであろう。 以下の実施例は、本発明の好ましい製造および実施態様を示すものであるが、 本発明の範囲を制限しようと意図するものではない。なぜなら他の方法を用いて も、同様の結果を得ることができるからである。 実施例 1.CAPLオリゴヌクレオチドの配列決定 CAPL発現のアンチセンス抑制のための最適な配列を決定するために、CA PL mRNAのRNアーゼ H分析をフランク(Frank)ら(Proc.Int.Co nf.Nucleic Acid Med.Applns.(1993)1:4.14(要約))によ り記載されるように行う。簡単には、CAPL mRNAをランダムオリゴヌク レオチドのライブラリーおよびRNアーゼ Hの限られた量とともにインキュベ ートし、ついでRNアーゼ H感受性部位を同定するためにゲル電気泳動による mRNAの分析を行う。少なくとも5つの20マーのホスホロチオエートオリゴ ヌクレオチドを各RNアーゼ H部位を標的として合成する:1つは直接その部 位をスパンし、4つは3塩基の5'および3'の最初のオリゴヌクレオチドによっ て動く。この分析によって見出された代表的なオリゴヌクレオチドは配列番号: 3−10である。 2.オリゴヌクレオチドの調製 修飾していない(PO)および修飾した(PS)オリゴヌクレオチドを自動化 合成機(ミリポア(Millipore)8700、ミリポア・コープ(Millipore Co rp.)、ベッドフォード(Bedford)、マサチューセッツ)でホスホルアミデー ト化学(アグラワルら(1989)Proc.Natl.Acad.Sci.(USA)8 6:7790−7794;マックブライド(McBride)ら(1983)Tetrah edron Lett.24:245参照)を用いて合成する。本合成で使用する酸化剤は リン酸ジエステル結合のためにはヨウ素の標準溶液、ホスホロチオエート結合の 形成のためにはアセトニトリル100ml中の1g溶液として3H−1,2−ベンゾ チオール−3−オン−1,1−ジオキシドである。メチルホスホネートをボーケ ージ(Beaucage)(「オリゴヌクレオチド・シンセシス(Oligonucleotide S ynthesis):ホスホルアミダイト・アプローチ(Phosphoramidite Approach) 」プロトコールズ・フォー・オリゴヌクレオチズ・アンド・アナログズ、メソッ ズ・イン・モレキュラー・バイオロジー(Protocols for Oligonucleotides a nd Analogs,Methods in Molecular Biology)(1994)20:33−6 2中)の方法に従って調製する。オリゴヌクレオチドの濃度を各配列に存在する ヌクレオチドのモル吸光係数を考慮に入れて260nmでの吸光度によって決定す る(オースベル(Ausubel)ら(編)(1987)Current Protocols in Mo lecular Biology(ウィリー(Wiley)、ニューヨーク)。 3.リボザイム、プローブおよび抗体の調製 リボザイム特異的なプローブを提供するため、上記に記載したリボザイムをク ローニングするのに使用するプライマー(配列番号:11および12)をキナー ゼ化(kinased)、アニーリングおよびライゲーションする。続いてそのライゲ ーション混合液を32P−dCTPでメランズモ(Maelandsmo)ら(British J .Cancer(1995)印刷中)に記載されるようにして標識する。ヒト18S リボソームRNAに特異的なオリゴヌクレオチドプローブおよび287から30 5までのヌクレオチドに相補的であるオリゴヌクレオチドプローブをノーザンブ ロッ トのキャリブレーションに使用する。ウェスタンブロットの分析にはヒトCAP Lに対する直接のモノクローナル抗体を含むハイブリドーマ培養物からの上清を 使用する。 CAPL−rib−1およびCAPL−rib−2のオリゴヌクレオチド(そ れぞれ配列番号:11および12を有する)をそのCAPLリボザィム(SatI およびHind IIIのフランキング部位を有する)のクローニングのために構築す る。T7−rib−1およびrib−2のオリゴヌクレオチドプライマー(それ ぞれ配列番号:13および14を有する)をCAPL特異的リボサイム(T7 RNAポリメラーゼプロモーターを有する)の合成のために構築する。T7−C APL−ex−1およびCAPL−ex−2のオリゴヌクレオチドプライマー( それぞれ配列番号:15および16を有する)をCAPL基質(T7 RNAポ リメラーゼプロモーターを有する)の合成のために構築する。pHb−1および pHb−2のPCRプライマー(それぞれ配列番号:17および18を有する) をトランスフェクションした細胞内でのCAPLリボザイム発現を検出するため に構築する。そのリボザイムの保存された触媒的な配列に相補的であるCAPL 特異的なプローブ(配列番号:19を有する)もまた構築する。CAPL−ex −1およびCAPL−ex−2のPCRプライマー(それぞれ配列番号:20お よび21を有する)をCAPL mRNAを検出するために構築する。 これらのプライマーおよびプローブを逆転写酵素を使用した標準的な方法によ り調製する(ウェーターマンら(1992)Cancer Res.52:1291−1 296参照)。 ハンマーヘッドリボザイムをカシャーニ−サベット(Kashani−Sabet)ら( Antisense Res.Dev.(1992)2:3−15)によって記載されたプロト コールに従って構築する。CAPL mRNA中のコドン14のGUCトリヌク レオチドをリボザイム開裂部位として選択する(図2A)。ハンマーヘッドリボ ザイムの触媒コアをコードする2つの部分的に相補的なオリゴヌクレオチドプラ イマー(配列番号:11および12)を混合し、半二本鎖(hemiduplex)を形成 させる。さらに、そのプライマーはCAPL mRNA中の開裂部位の各側の 11または9ヌクレオチドに相補的であり、Sal IおよびHind IIIの制限フラ ンキング部位(プライマー配列番号:7および8)を有する。PCR増幅は哺乳 動物の発現ベクターpHβApr−1ネオ(pHβ)にライゲーションされる5 2bpのリボザイムDNAとなる(ガニング(Gunning)ら(1987)Proc. Natl.Acad.Sci.84:4831−4835)。インサートの配列および方 向をシークエナーゼ・キット(Sequenase kit)、バージョン2.0(U.S.バ イオケミカル・コープ(U.S.Biochemical Corp.)、クリーブランド(Clea veland)、オハイオ)を用いてシークエンシングによって確認する。 4.合成DNA鋳型からのRNAのイン・ビトロ転写 リボザイムおよび標的RNAの両者のイン・ビトロでの転写のための鋳型をP CRによって産生する。そのPCR産物をリボザイムインサートを有するpHβ Apr−1ネオベクターからまたはOHS細胞から単離した総RNAから配列番 号:9および10のプライマーを用いて増幅する。ついで0.5μgのPCR産物 (DNA鋳型)と20u T7−RNAポリメラーゼを混合することによってサ ンブルック(Sambrook)ら(モレキュラー・クローニング、ア・ラボラトリー ・マニュアル(Molecular Cloning,a Laboratory Manual)(第2版)コール ド・スプリング・ハーバー・ラボラトリー・プレス(Cold Spring Harbor L aboratory Press)、(1989)ニューヨーク、5.58頁および17.11− 17.16頁)によって記載されるようにイン・ビトロ転写を行う。 転写物の放射性標識のため60μCi32−CTP(800Ci mmol-1,アマシャ ム(Amersham)、英国)を添加する。その鋳型をDNアーゼ消化した後、その 混合物を1回フェノール抽出し、NENSORB 20カートリッジ(デュ・ポ ン(Du Pont)、NENプロダクツ(NEN Products)、ハートフォードシ アー(Hartfordshire)、英国)上で製造者の手引きに従って精製する。 5.イン・ビトロリボザイム開裂反応 開裂反応をカシャーニ−サベットら(Antisense Res.and Dev.)による記 載のようにイン・ビトロで転写した32P−標識CAPL基質とCAPL特異的リ ボザイムの等モル量の割合での混合によって行う。その開裂反応を10mMのMg Cl2を添加して開始する。37℃で1時間インキュベーションした後、その開裂 反応産物を変性ポリアクリルアミドゲル電気泳動によって分析する。 6.イン・ビトロ研究 A.細胞 OHS細胞株を多数の骨格転移を有する患者から得た骨腫瘍生検から確立し、 ついでフォスタッド(Fodstad)ら(Int.J.Cancer(1986)38:3 3−40)によって記載されるように10%ウシ胎児血清を含むRPMI培地中 で単層培養物として増殖させる。腫瘍細胞の成長曲線を構築しついでその細胞が 2倍になる時間を曲線の指数部位から測定した。軟寒天中の培養を行い(トバイ ト(Tveit)(1981)Int.J.Cancer(1986)28:3229−3 34)、ついで播種効率(PE)を播種した細胞の生存数びパーセンテージ中の 形成されたコロニーの数として定義する。回転楕円体(spheroid)の形成および 発生をフォスタッドら(1986)上記、によって得る。その回転楕円体の直径 を光学マイクロメーターにより弱く3回計測し、ついで相対的な容積を算出する (ワイブ(Wibe)(1984)Int.J.Cancer34:21−26)。 そのKPDX細胞株を第一次骨肉腫を有する患者から確立し、ついで10%ウ シ胎児血清を含むRPMI増殖培地中で単層培養物として増殖させる。そのKP DX細胞株はCAPL mRNAおよびタンパク質の高発現を示し、それぞれノ ーザンブロットおよびイムノブロット技術を用いて分析する。 そのTHX細胞株をメラニン欠乏性の黒色腫細胞の転移性沈着物(deposit) を有するリンパ節を有する患者から単離する。その細胞株を10%ウシ胎児血清 を補ったRPMI中で単層として維持する。その細胞株をSDS−PAGEタン パク質電気泳動、ブロッティングおよび免疫染色を用いて可視化してCAPLタ ンパク質の低から中程度の発現を示す。 B.オリゴヌクレオチドの活性 配列番号:3、5、7および9を有する0.5、2、5および10μM合成オ リゴヌクレオチドをOHS細胞中でのアンチセンス活性を評価するために使用す る。特に2×105細胞を小培養フラスコ(25cm2)中に播種しついで指示され た量のオリゴヌクレオチドを翌日加える。これを2.5または5μg/mlのリポフ ェクチン(ギブコ(Gibco)/BRL/ライフテクノロジーズ(LifeTechnolo gies)、デンマーク)の存在下および不在下で行う。リポフェクチンを使用する 時、その細胞を無血清培地中で4時間処理し、後に培地を10%にするように十 分な血清を加える。20時間後、その細胞の培地を変えてさらに新鮮なオリゴヌ クレオチドを加える。ついでその細胞をリポフェクチンを受けない細胞同様の様 式で処理する。播種3日後にその細胞を培地を変えてさらに新鮮なオリゴヌクレ オチドを加える。その細胞をコントロール(非アンチセンス)に関連したmRN Aレベルについて播種後6日目で標準的手法により分析する(例えば、サンブル ックら(1989)モレキュラー・クローニング・ア・ラボラトリー・マニュア ル、コールド・スプリング・ハーバー・ラボラトリー・プレス、ニューヨーク参 照)。幾つかの代表的な結果を図5に示し、それはCAPL特異的オリゴヌクレ オチドの単独または組み合わせてのCAPL mRNAの転写を抑制する能力を 証明するものである。そのCAPLタンパク質を標準的な手法に従ってCAPL モノクローナル抗体を用いたウェスタンブロットにより類似した培養物中で決定 する。 オリゴヌクレオチド(配列番号:5)(スプライシング部位)、配列番号:2 2(開始コドンを含む)、配列番号:23(ATGの前のスプライシング部位の 3'端)および配列番号:9(リボザイム部位))の活性を12日間のインキュ ベーション期間、1μMおよび5μMの濃度を用いてKPDXおよびTHX細胞 株中で試験する。これらの実験ではその濃度でリポフェクチンまたはDOTAP トランスフェクション剤(ベーリンガー・マンハイム(Boehringer Mannheim )GmBh、ドイツ)を製造者の推薦する手続きによって使用する。細胞を個々の 3cmの直径の細胞培養皿中で総用量3mlの10%ウシ胎児血清を補ったRPMI において低い密度(2×103細胞/皿)で播種する。翌日そのオリゴヌクレオ チドを含む懸濁液を5分間沸騰させ、ウシ胎児血清を含まないRPMIで希釈し 、ついでDOTAPトランスフェクション剤を含むRPMIの等用量で混合した 。ついでその混合物を室温で10分間インキュベートして後に皿の培養培地(1 0%ウシ胎児血清を含むRPMI)を加える。その培養培地を4日および8日後 に 新しくし、ついで新しいアンチセンスオリゴヌクレオチドを上記のように加える 。ついでその細胞を回収しSDS−PAGEタンパク質電気泳動、イモビロンメ ンブレン(Immobilon membrane)(ミリポアAB/エネバックベイエン(Eneb akkveien)、ノールウェー)にブロッティングしついで標準的な免疫染色プロト コールにてクリアジェブスカ(Kriajevska)ら(J.Biolog.Chem.(19 94)269:19679−19682)のプロトコールの変形に従って産生す る)CAPL特異的モノクローナル抗体を用いてCAPL発現を分析する。処理 した細胞中のCAPLタンパク質発現をコントロールオリゴヌクレオチド(配列 番号:9を無秩序にしたもの)で処理した細胞と比較する。その結果を図6Aお よび6Bに示す。 C.リボザイムの活性 4×105OHS細胞を5mlのダルベッコ改変イーグル培地(Dulbecco's mod ified Eagle's medium)に再懸濁し、ついで25cm2培養フラスコ中で撒く。そ の細胞を一夜増殖させ、チェン(Chen)ら(Mol.Cell.Biol.(1987 )7:2745−2752)によって記載されたリン酸カルシウム沈澱法に従っ て、そのプラスミドを含む5μgまたは10μgのリボザイムでトランスフェクシ ョンさせた。そのプラスミドpHβApr−1ネオを有しリボザイム配列を有さ ないトランスフェクションをネガティブコントロールとして機能させる。組み込 んだプラスミドを有するトランスフェクションさせた細胞を、6−8週間400 μg/mlのゼラチン(G418ジスルフェート、ギブコ)を含むRPMI増殖培 地中で選択する。個々のG418耐性コロニーを拾い、増殖させ、ついで以下に 記載するようにPCRおよびノーザンブロット分析によってCAPLおよびリボ ザイムの両方の発現をスクリーニングする。数週間か後、細胞にG418を加え てネオマイシン遺伝子の存在を試験する。 7.イン・ビボアッセイ 先天性胸腺欠損Balb/C rnu/rnuマウスおよびRowett Han:rnu/rnuラッ トをこの研究で使用する。単一のOHS細胞懸濁液をサブコンフルエント(subc onfluent)単層培養物から得る。1×106細胞をニョニクセン (Kjonniksen)(J.Natl.Cancer Inst.)(1990)82:408− 412)により記載されたようにヌードマウスの脇腹に皮下注射(s.c.)す るかまたは免疫欠損ラットの左心室(l.v.)に心臓内注射する。腫瘍を増殖させ るs.c.の容量を式0.5*長さ*幅2(フォスタッド(1980)Br.J.Can cer、41(補遺、IV):146−149)に従って計算する。l.v.注射の 後、動物を毎日検査して脊髄中の転移疾患を表わす麻痺または歩行障害の最初の 兆候が見られた時点で殺害する。 8.ノーザンブロット分析 総細胞RNAを、サンブルックらモレキュラー・クローニング・ア・ラボラト リー・マニュアル(第二版)コールド・スプリング・ハーバー・ラボラトリー・ プレス(1989)ニューヨーク、7.5、7.19−7.22頁)に記載される 塩化チオシアネート−セシウムグアニジン法に従って調製する。5μgの総RN Aのサンプルを1%アガロース−ホルムアルデヒドゲル電気泳動によって分離し 、ついでハイボンドN+メンブレン(Hybond-N+ membrane)(アマシャム( Amersham)、アーリントン・ハイツ(Arlington Heights)、イリノイ)に製 造者の手引き書に従ってブロットする。2時間焼いた後、続いて紫外線架橋を行 い、そのフィルターを32P−標識したCAPLまたはCAPL特異的リボザイム をコードするDNAプローブでメランズモ(British J.Cancer(1995) 印刷中)の記載のようにハイブリダイズさせる。 多数回のハイブリダイゼーションのため、結合したプローブをフィルターを9 5−100℃で0.1×SSCおよび0.1%SDSで5分間インキュベートする ことにより除去する。各レーンにローデイングするRNAの不均衡な量を正すた め、そのフィルターをヒト18S rRNAに特異的なキナーゼ標識したオリゴ ヌクレオチドプローブ(19マー)で再度ハイブリダイゼーションする。特異的 なmRNAのレベルをコンピュートデンシトメーター(モレキュラー・ダイナミ クス(Molecular Dynamics)、サニーベル(Sunneyvale)、カリフォルニア )注のオートラジオグラムのスキャン後に18S rRNAの量に相対的に調整 する。 別法として、RT−PCRをトランスフェクションした細胞注のCAPLまた はリボザイム特異的RNAをスクリーニングするために使用する。異なる細胞ク ローンから単離した総RNA(200ng)を5u MMLV−逆転写酵素(スーパ ースクリプト(Superscript)II、ギブコ/BRL/ライフテクノロジーズ、デ ンマーク)によって逆転写し、ついで配列番号:13および14を有するプライ マーおよび配列番号:16および17を有するプライマーを用いてPCRを行う 。増幅およびPAGE上での分離の後、そのリボザイム特異的なPCR産物をハ イボンドN+メンブレン(アマシャム、アーリントン・ハイツ、イリノイ)にブ ロッティングし、ついでハンマーヘッド配列をコードするキナーゼ標識したオリ ゴヌクレオチドプローブでハイブリダイゼーションする(サンブルックら(19 89)モレキュラー・クローニング・ア・ラボラトリー・マニュアル(第二版) コールド・スプリング・ハーバー・ラボラトリー・プレス、ニューヨーク、5. 68−5.72頁)。 9.サザンブロット分析 ゲノムDNAを標準的な方法により単離する(例えば、サンブルックら(19 89)モレキュラー・クローニング・ア・ラボラトリー・マニュアル(第二版) コールド・スプリング・ハーバー・ラボラトリー・プレス、ニューヨーク、63 頁)。DNAのアリコート(8μg)をHind IIIで消化し、0.8%アガロスゲ ル上で分離し、ハイボンドN+メンブレン(アマシャム、アーリントン・ハイツ 、イリノイ)に製造者の手引書に従ってアルカリブロッテイングによりトランス ファーする。そのメンブレンを調製し、前記のようにハイブリダイゼーションし ついで洗浄する。多数回のハイブリダイゼーションのため、結合したプローブを フィルターを室温で100mM水酸化ナトリウムおよび1mM EDTA中で15 分間インキュベートすることにより除去する。 10.ウェスタンブロット その細胞からのタンパク質リゼイトを標準的な方法に従って(例えば、サンブ ルックら(1989)モレキュラー・クローニング・ア・ラボラトリー・マニュ アル(第二版)コールド・スプリング・ハーバー・ラボラトリー・プレス、ニュ ーヨーク18.62−18.63頁参照)作製し、ついで15%SDS−ポリアク リルアミドゲル電気泳動(例えば、サンブルックら(1989)モレキュラー・ クローニング・ア・ラボラトリー・マニュアル(第二版)コールド・スプリング ・ハーバー・ラボラトリー・プレス、ニューヨーク18.47−18.48頁参照 )によって分離する。イモビロン−P(Immobilon-P)メンブレン(ミリポア ・コーポレーション、ベッドフォード、マサチューセッツ)に製造者の手引書に 従ってトランスファーした後、そのメンブレンを5%乾燥ミルクおよび5%ウシ 胎児血清を含むPBSによってブロッキングする。続いて、そのメンブレンをC APLに対して直接のモノクローナル抗体を含むハイブリドーマ培養培地上清で インキュベートし、ついで洗浄し、ついで1:2000希釈の西洋ワサビペルオ キシダーゼコンジュゲートウサギ抗マウス抗体(ダコ(Dako)、グロストラッ プ(Glostrup)、デンマーク)を含むブロッキング溶液でインキュベートする 。免疫応答タンパク質をECLウェスタンブロット検出系(アマシャム、英国) を用いて可視化する。 均等物 当業者は上記の特定の物質および方法に均等な多くのものについて認識するか 、または常套手段、実験を用いるだけで確認することができるであろう。このよ うな均等物も本発明の範囲に包含され、以下の特許請求の範囲でカバーされると みなされる。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FR,GB,GR,IE,IT,LU,M C,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF,CG ,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE,SN, TD,TG),AP(KE,LS,MW,SD,SZ,U G),UA(AZ,BY,KG,KZ,MD,RU,TJ ,TM),AL,AM,AT,AU,AZ,BB,BG ,BR,BY,CA,CH,CN,CZ,DE,DK, EE,FI,GB,GE,HU,IS,JP,KE,K G,KP,KR,KZ,LK,LR,LS,LT,LU ,LV,MD,MG,MK,MN,MW,MX,NO, NZ,PL,PT,RO,RU,SD,SE,SG,S I,SK,TJ,TM,TR,TT,UA,UG,UZ ,VN (72)発明者 ホーヴィグ,エイヴィンド ノールウェー、エン−0851オスロ、ソーグ ンスヴェイエン31番 (72)発明者 エンイェブラーテン,オラフ ノールウェー、エン−1470ローレンスコ グ、ハネボリィヴェイエン43アー番 (72)発明者 マエランスモ,グンヒルド ノールウェー、エン−0475オスロ、ヨハ ン・セルメルス・ガーテ8番 (72)発明者 アグラワル,サドヒル アメリカ合衆国01545マサチューセッツ州 シュルーズベリー、ランプライター・ド ライブ61番 (72)発明者 ヴォン・ホフ,エリック アメリカ合衆国02181マサチューセッツ州 ウェルズリー、レッドウィング・ロード 33番

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.CAPL遺伝子発現を抑制することができ、CAPL核酸に相補的である ヌクレオチド配列を有する合成オリゴヌクレオチド。 2.配列番号:2(GUC)を有するトリヌクレオチドを含むCAPL核酸に 相補的なヌクレオチド配列を有する請求項1に記載のオリゴヌクレオチド。 3.エクソン2の少なくとも一部を含むCAPL転写物に相補的であるヌクレ オチド配列を有する請求項1に記載のオリゴヌクレオチド。 4.CAPL核酸のリボザイム結合部位に相補的であるヌクレオチド配列を有 する請求項1に記載のオリゴヌクレオチド。 5.配列番号:9を有する請求項1に記載のオリゴヌクレオチド。 6.配列番号:10を有する請求項1に記載のオリゴヌクレオチド。 7.CAPL核酸の3'スプライシング部位に相補的なヌクレオチド配列を有 する請求項1に記載のオリゴヌクレオチド。 8.配列番号:3、4または23を有する請求項7に記載のオリゴヌクレオチ ド。 9.CAPL核酸の5'スプライシング部位に相補的なヌクレオチド配列を有 する請求項1に記載のオリゴヌクレオチド。 10.配列番号:5または6を有する請求項9に記載のオリゴヌクレオチド。 11.CAPL核酸の翻訳開始部位に相補的であるヌクレオチド配列を有する 請求項1に記載のオリゴヌクレオチド。 12.配列番号:7、8または22を有する請求項11に記載のオリゴヌクレ オチド。 13.CAPL核酸の翻訳終結部位に相補的であるヌクレオチド配列を有する 請求項1に記載のオリゴヌクレオチド。 14.CAPL核酸の転写開始部位に相補的であるヌクレオチド配列を有する 請求項1に記載のオリゴヌクレオチド。 15.修飾されている請求項1に記載のオリゴヌクレオチド。 16.少なくとも1つのリボヌクレオチドを含む請求項1に記載のオリゴヌク レオチド。 17.少なくとも1つのデオキシリボヌクレオチドを含む請求項1に記載のオ リゴヌクレオチド。 18.少なくとも1つのデオキシリボヌクレオチドをさらに含む請求項16に 記載のオリゴヌクレオチド。 19.約12−50ヌクレオチドの長さを有する請求項1に記載のオリゴヌク レオチド。 20.CAPL核酸をCAPL核酸に相補的な合成オリゴヌクレオチドと接触 させる工程を含む、CAPL遺伝子の発現を抑制する方法。 21.癌を罹患している被験体にCAPL核酸に相補的な合成オリゴヌクレオ チドの治療上有効な量を投与する工程を含む、転移性癌を抑制する方法。 22.該被験体が骨肉腫を罹患している請求項21に記載の方法。 23.CAPL核酸に相補的であるヌクレオチド配列を有する第2の合成オリ ゴヌクレオチドを同時に投与することをさらに含み、該第2のオリゴヌクレオチ ドの核酸配列は該第1のオリゴヌクレオチドの核酸配列と異なっている請求項2 1に記載の方法。 24.請求項1に記載のオリゴヌクレオチドおよび製薬学的および生理学的に 許容し得る担体を含む治療製剤。
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