JPH11276172A - Abcトランスポーター遺伝子 - Google Patents

Abcトランスポーター遺伝子

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JPH11276172A
JPH11276172A JP10080597A JP8059798A JPH11276172A JP H11276172 A JPH11276172 A JP H11276172A JP 10080597 A JP10080597 A JP 10080597A JP 8059798 A JP8059798 A JP 8059798A JP H11276172 A JPH11276172 A JP H11276172A
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leu
ala
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gly
amino acid
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JP10080597A
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English (en)
Inventor
Takeji Shibatani
武爾 柴谷
Kenji Omori
謙司 大森
Hiroyuki Akatsuka
浩之 赤塚
Eri Kawai
衣里 河合
Akiko Idei
晶子 出井
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Tanabe Seiyaku Co Ltd
Original Assignee
Tanabe Seiyaku Co Ltd
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Abstract

(57)【要約】 【課題】 シュードモナス属微生物の新規なATP結合
カセットトランスポーター遺伝子を提供する。また、前
記遺伝子を利用してリパーゼなどの有用蛋白質を効率的
に製造する方法を提供する。 【解決手段】 シュードモナス・フルオレッセンスのA
TP結合カセットトランスポーター遺伝子。配列番号
2、3、4、6、7もしくは8で示されるアミノ酸配列
を有するポリペプチドをコードする微生物のATP結合
カセットトランスポーター遺伝子。前記遺伝子を挿入し
た組換えプラスミドを含む形質転換微生物を培養するこ
とによる有用蛋白質の製造方法。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【発明の属する技術分野】本発明は、シュードモナス属
微生物の新規なATP結合カセットトランスポーターの
遺伝子に関する。
【0002】
【従来の技術】細菌の多くは酵素や毒素など種々の蛋白
質を細胞外に分泌する。グラム陰性菌(シュードモナス
属、エルウィニア属、エシェリシア属、セラチア属微生
物など)においては、少なくとも二つの異なる蛋白質分
泌経路が存在することが知られている。その一つは、N
末端にシグナル配列を有するタイプの蛋白質を分泌する
経路であり、細胞膜の内膜と外膜の間に位置するペリプ
ラズム領域に一旦滞留される2段階のシステムからな
る。もう一つの分泌経路としては、ATP結合カセット
トランスポーター(ATP-binding cassette transporte
r)(もしくはATP結合カセットエキスポーター)と
称される分泌装置を介して蛋白質を一段階で直接細胞膜
の外に分泌するシステムが知られており、このシステム
はN末端にシグナル配列を有しないタイプの蛋白質の分
泌に関与する(文献:Higgins、AnnualReview of Cell
Biology、第8巻、第67−113頁、1992年;赤塚ら、化学
と生物、第35巻、第2号、第132−137頁、1997年)。
【0003】微生物のATP結合カセットトランスポー
ター(以下、ABCトランスポーター)は、ATP結合
カセット(ATP Binding Cassette:ABC)蛋白質、膜
融合蛋白質(Membrane Fusion Protein:MFP)及び
外膜蛋白質(Outer MembraneProtein:OMP)と呼ば
れる3種のコンポーネント蛋白質からなり、これらコン
ポーネントで細胞膜の内外に通じる一つの分泌装置を構
成する。また、ABCトランスポーターには、同じファ
ミリーに属する複数の分子種が存在し、分泌蛋白質とこ
れを輸送するABCトランスポーターとの間には特異性
が存在することが知られている(文献:Akatsukaら、Jo
urnal of Bacteriology 第179巻、第4754−4760頁、19
97年;Binetら、EMBO Journal、第14巻、第2298−2306
頁、1995年)。
【0004】微生物のABCトランスポーターを介して
細胞外へ分泌される蛋白質としては、例えば、エステラ
ーゼ(リパーゼなど)、プロテアーゼ、バクテリア毒素
(ヘモリシンなど)、ヘム結合蛋白質などが知られてお
り、これらの中には、例えば化合物の不斉加水分解など
に利用されるリパーゼなど、工業的に有用な蛋白質(酵
素等)も多い。
【0005】微生物を用いたこれら有用蛋白質の生産に
おいては、蛋白質が菌体外に分泌されることは回収操作
が容易である点で有利であるが、例えば、遺伝子増幅や
変異導入等の手段で有用蛋白質(酵素等)の生産性を向
上させようとする場合に、菌体外への分泌能が十分でな
ければ、菌体内への蓄積が生じて回収操作が煩雑となっ
たり、生産性自体十分に向上しない等の問題が生じる。
ABCトランスポーターは、前記の通り、蛋白質を菌体
外に分泌させる機能を有しており、これを利用すれば、
効率よく工業的に有用な蛋白質を生産させることが可能
となる。
【0006】例えば、セラチア属微生物においては、A
BCトランスポーターの遺伝子として、ヘム結合蛋白質
(HasA)の分泌に関与するhasDE及びhasF
遺伝子、及び、リパーゼ(LipA)の分泌に関与する
lipBCD遺伝子が知られている。また、アカツカら
は、このlipBCD遺伝子を増幅することにより、エ
ステラーゼを産生する大腸菌及びセラチア属微生物のエ
ステラーゼ分泌能が顕著に増大することを報告している
(Journal of Bacteriology、第177巻、6381−6389頁、
1995年;特開平8−256775(EP73370
7))。
【0007】一方、シュードモナス属微生物において
は、ABCトランスポーターの遺伝子として、シュード
モナス・アエルギノーザ(Pseudomonas aeruginosa)の
アルカリプロテアーゼ(AprA)の分泌に関与するa
prDEF遺伝子が知られている。ドゥオングらは、こ
のシュードモナス・アエルギノーザ由来のABCトラン
スポーター(AprDEF)によって、シュードモナス
・フルオレッセンス(Pseudomonas fluorescens)由来
のリパーゼが細胞外へ分泌されたことを報告している
(Molecular Microbiology、第11巻、1117−1126頁、19
94年)。
【0008】しかしながら、シュードモナス属微生物由
来のABCトランスポーターの遺伝子としては、前記の
aprDEF以外のものは知られていない。また、工業
的に有用なリパーゼなどを生産するシュードモナス・フ
ルオレッセンスについてはABCトランスポーターの遺
伝子は知られていなかった。さらに、種々の有用な蛋白
質の分泌を可能にするために、シュードモナス属微生物
においても種々の特異性を有するABCトランスポータ
ーの遺伝子を見出すことが望まれていた。
【0009】
【発明が解決しようとする課題】本発明の目的は、シュ
ードモナス属微生物の新規なABCトランスポーターの
遺伝子を提供することにある。また、この新規なABC
トランスポーターの遺伝子を利用してリパーゼなどの有
用蛋白質を効率的に製造する方法を提供することにあ
る。
【0010】
【課題を解決するための手段】本発明者らは、鋭意研究
の結果、シュードモナス属微生物から当該微生物リパー
ゼの分泌機構に関与するABCトランスポーターの遺伝
子を取得することに成功するとともに、この遺伝子を増
幅することにより、微生物由来の分泌蛋白質(リパー
ゼ)を分泌する能力を増大させることができることを見
出し、本発明を完成するに至った。
【0011】すなわち、本発明は、シュードモナス・フ
ルオレッセンスのATP結合カセットトランスポーター
(以下、ABCトランスポーターと称する)を構成する
ポリペプチドをコードする遺伝子である。
【0012】また、本発明は、微生物のATP結合カセ
ットトランスポーターを構成するポリペプチドをコード
する遺伝子であって、該ポリペプチドが、(1)配列番
号2記載のアミノ酸配列を有するポリペプチド、(2)
配列番号3記載のアミノ酸配列を有するポリペプチド、
(3)配列番号4記載のアミノ酸配列を有するポリペプ
チド、(4)配列番号2記載のアミノ酸配列において1
もしくは数個のアミノ酸残基が付加、欠失又は置換され
たアミノ酸配列を有するポリペプチド、(5)配列番号
3記載のアミノ酸配列において1もしくは数個のアミノ
酸残基が付加、欠失又は置換されたアミノ酸配列を有す
るポリペプチド、及び(6)配列番号4記載のアミノ酸
配列において1もしくは数個のアミノ酸残基が付加、欠
失又は置換されたアミノ酸配列を有するポリペプチドか
ら選択される遺伝子である。
【0013】また、本発明は、微生物のATP結合カセ
ットトランスポーターを構成するポリペプチドをコード
する遺伝子であって、該ポリペプチドが、(1)配列番
号6記載のアミノ酸配列を有するポリペプチド、(2)
配列番号7記載のアミノ酸配列を有するポリペプチド、
(3)配列番号8記載のアミノ酸配列を有するポリペプ
チド、(4)配列番号6記載のアミノ酸配列において1
もしくは数個のアミノ酸残基が付加、欠失又は置換され
たアミノ酸配列を有するポリペプチド、(5)配列番号
7記載のアミノ酸配列において1もしくは数個のアミノ
酸残基が付加、欠失又は置換されたアミノ酸配列を有す
るポリペプチド、及び(6)配列番号8記載のアミノ酸
配列において1もしくは数個のアミノ酸残基が付加、欠
失又は置換されたアミノ酸配列を有するポリペプチドか
ら選択される遺伝子である。
【0014】さらに、本発明は、上記のABCトランス
ポーターを構成するポリペプチドをコードする遺伝子を
ベクタープラスミドに挿入した組換えプラスミド、該組
換えプラスミドを含む形質転換微生物、及び、該形質転
換微生物を培養することを特徴とする蛋白質の製造方法
である。
【0015】本発明におけるABCトランスポーター
は、蛋白質(より詳細には、N末端にシグナル配列を有
しない分泌蛋白質)を微生物の細胞外に分泌させる能力
を有する。また、ABCトランスポーターは、ATP結
合カセット(ATP Binding Cassette:ABC)蛋白質、
膜融合蛋白質(Membrane Fusion Protein:MFP)及
び外膜蛋白質(Outer Membrane Protein:OMP)の3
種のコンポーネント蛋白質から構成される。従って、A
BCトランスポーターを構成するポリペプチドとは、A
TP結合カセット蛋白質、膜融合蛋白質又は外膜蛋白質
を意味する。また、ABCトランスポーターの遺伝子と
は、ABCトランスポーターを構成するポリペプチドの
うちの少なくとも1つをコードする遺伝子を意味する。
【0016】後記配列表の配列番号1及び5は、シュー
ドモナス・フルオレッセンス由来のABCトランスポー
ターを構成するポリペプチドをコードする遺伝子(以
下、ABCトランスポーター遺伝子と称する)を含むD
NAの全塩基配列を示す。両配列中には、各々3つのオ
ープン・リーディング・フレーム(open reading fram
e: ORF)が存在する。
【0017】配列番号2、3及び4は、配列番号1で示
されるDNAの翻訳領域にコードされた3つのポリペプ
チドのアミノ酸配列を示す。配列番号2のアミノ酸配列
は配列番号1記載の塩基配列の第778番目から252
6番目に、配列番号3のアミノ酸配列は配列番号1記載
の塩基配列の第2526番目から3857番目に、ま
た、配列番号4のアミノ酸配列は配列番号1記載の塩基
配列の第3863番目から5194番目にそれぞれコー
ドされている。
【0018】配列番号6、7及び8は、配列番号5で示
されるDNAの翻訳領域にコードされた3つのポリペプ
チドのアミノ酸配列を示す。配列番号6のアミノ酸配列
は配列番号5記載の塩基配列の第278番目から201
7番目に、配列番号7のアミノ酸配列は配列番号5記載
の塩基配列の第2017番目から3345番目に、ま
た、配列番号8のアミノ酸配列は配列番号5記載の塩基
配列の第3354番目から4670番目にそれぞれコー
ドされている。
【0019】前記配列番号1から8で示される塩基配列
もしくはアミノ酸配列について、既知DNAデータベー
ス(GenBankおよびEMBL)及びプロテインデ
ータベース(NBRF及びSWISS−PROT)に含
まれる全ての配列に対してホモロジー検索を行った結
果、一致するものはなく、これらの配列は新規なもので
あると考えられる。
【0020】
【発明の実施の形態】本発明のABCトランスポーター
遺伝子は、遺伝子源となる微生物から、公知の遺伝子組
換え技術を用いる方法により単離することができる。
【0021】遺伝子源となる微生物は、特に限定されな
いが、シュードモナス属微生物が好ましく、とりわけシ
ュードモナス・フルオレッセンスが好適である。かかる
微生物としては、具体的には、例えばシュードモナス・
フルオレッセンスATCC13525、シュードモナス
・フルオレッセンスIFO3459、シュードモナス・
フルオレッセンスIFO3081、シュードモナス・フ
ルオレッセンスIAM1176、シュードモナス・フル
オレッセンスIAM1199などの他、本発明の実施例
で遺伝子の単離に用いたシュードモナス・フルオレッセ
ンスNo.33株が挙げられる。
【0022】ABCトランスポーター遺伝子の単離は、
例えば以下のようにして実施できる。すなわち、前記の
ような遺伝子源となる微生物から常法により染色体DN
Aを調製し、これを適当な制限酵素で処理した後、ベク
タープラスミドに組込む。得られた組換えプラスミドを
宿主微生物(エシェリシア・コリ(Escherichia coli:
大腸菌)K−12 DH5など)に導入し、得られる形
質転換体からABCトランスポーター遺伝子を含むクロ
ーンを選択することにより得られる。
【0023】目的クローンの選択は、例えば、プローブ
として、既知のABCトランスポーター遺伝子間で相同
性の高い領域や、その配列をもとに設計した合成オリゴ
ヌクレオチド、それをプライマーとして用いて微生物の
染色体DNAからポリメラーゼ連鎖反応(PCR:Poly
merase Chain Reaction)によって増幅したDNA断片
などを用いたコロニーハイブリダイゼーションなどによ
り実施できる。プローブとして用いる領域は、特に限定
されないが、ATP結合カセット蛋白質をコードする領
域が好ましい。また、トランスポーター遺伝子を、ファ
ージベクター(例えばpBluscriptSK+な
ど)に導入した場合は、プラークハイブリダイゼーショ
ンによって陽性クローンを選択できる。得られた候補ク
ローンについて、その塩基配列を決定し、ABCトラン
スポーターに特徴的な構造の類似性を調べることによ
り、目的遺伝子であることを決定することができる。
【0024】あるいはまた、ABCトランスポーター遺
伝子の塩基配列が分かっている場合には、その配列情報
をもとに設計して合成したプライマーを用い、微生物の
染色体DNAを鋳型として通常のPCRを実施すること
などにより遺伝子をクローニングすることができる。
【0025】本発明のABCトランスポーター遺伝子を
用いて、ABCトランスポーターを宿主微生物内で発現
させることができる。ABCトランスポーター遺伝子
を、必要に応じて適当なプロモーター(λpLプロモー
ター、trpプロモーター、lacプロモーター、ta
cプロモーター、tetプロモーターなど)の下流に接
続し、宿主微生物中で機能するベクターに挿入して発現
プラスミドを構築する。あるいは、適当なプロモーター
を含む発現用ベクターにABCトランスポーター遺伝子
を連結してもよい。ベクタープラスミドとしては、例え
ばpLG339(Gene、第18巻、332頁、1982年)、p
BR322(Gene、第2巻、95頁、1977年)、pUC1
8(Gene、第33巻、103頁、1985年)、pUC19(Gen
e、第33巻、103頁、1985年)、pHSG298(Gene、
第61巻、63頁、1987年)、pHSG299(Gene、第61
巻、63頁、1987年)、pACYC184(Changら、Jou
rnal of Bacteriology、第134巻、1141−1156頁、1978
年)などが挙げられる。
【0026】組換えプラスミドを導入する宿主微生物
は、形質転換可能で、組換えプラスミド中のABCトラ
ンスポーター遺伝子が発現しうるものであればよい。か
かる宿主微生物としては、グラム陰性菌を用いることが
好ましく、例えばシュードモナス属微生物(シュードモ
ナス・フルオレッセンス、シュードモナス・アエルギノ
ーザなど)、セラチア属微生物(セラチア・マルセッセ
ンス(Serratia marcescens)など)又はエシェリシア
属微生物(エシェリシア・コリなど)があげられる。シ
ュードモナス属微生物としては、シュードモナス・フル
オレッセンスATCC13525、シュードモナス・フ
ルオレッセンスIFO3459、シュードモナス・フル
オレッセンスIFO3081、シュードモナス・フルオ
レッセンスIAM1176、シュードモナス・フルオレ
ッセンスIAM1199などが挙げられる。セラチア属
微生物としては、セラチア・マルセッセンスSr41及
びそれから誘導される種々の変異株、例えば、セラチア
・マルセッセンスM−1(FERM BP−4068
(特開平5−344891(EP544250)))、
同TT392株(Takagiら、Journal of Bacteriolog
y、第161巻、1−6頁、1985年)などが挙げられる。エシ
ェリシア属微生物としては、エシェリシア・コリK12
DH5株(Maniatisら、Molecular Cloning、第2編、A
10頁(Cold SpringHarbor Laboratory、米国、1989
年))などが挙げられる。
【0027】また、上記のような微生物に分泌蛋白質
(リパーゼなど)の遺伝子を含む組換えプラスミドを導
入した微生物を宿主微生物として使用することもでき
る。
【0028】本発明のABCトランスポーター遺伝子を
発現させることにより、蛋白質を微生物の細胞外に分泌
させることができる。
【0029】ABCトランスポーターによって微生物の
細胞外に分泌される蛋白質は、N末端にシグナル配列を
有しない分泌蛋白質である。また、一般にC末端側の領
域に、コンセンサスな配列(GGXGXDXXX)の繰
返し(4〜13回)が見られ、また両親媒性のαヘリック
ス構造を有する(文献:Duongら、Molecular Microbiol
ogy、第11巻、1117−1126頁、1994年)。
【0030】かかる分泌蛋白質としては、具体的には、
例えば、エステラーゼ(リパーゼなど)、プロテアー
ゼ、バクテリア毒素(ヘモリシンなど)、ヘム結合性蛋
白質などが挙げられる。これらのうち、エステラーゼ
(リパーゼなど)は、ABCトランスポーターによって
好適に分泌されるとともに、工業的な利用価値が高いも
のである。
【0031】かかるエステラーゼとしては、微生物由来
のリパーゼ、例えば、シュードモナス・フルオレッセン
ス由来のリパーゼ(文献:Tanら、Applied and Environ
mental Microbiology、第58 巻、第1402−1407頁、1992
年;Chungら、Agriculturaland Biological Chemistr
y、第55巻、第2359−2365頁、1991年)、セラチア・マ
ルセッセンス由来のリパーゼ(文献:Akatsukaら、Jour
nal of Bacteriology、第176巻、第1949−1956頁、1994
年;特開平5−344891)、などが挙げられる。前
記のリパーゼは、遺伝子が既にクローニングされて配列
が報告されている。
【0032】また、プロテアーゼとしては、シュードモ
ナス・アエルギノーザ由来のプロテアーゼ(Duongら、G
ene、第121巻、第47−54頁、1992年)、セラチア・マル
セッセンス由来のプロテアーゼ(Nakahamaら、Nucleic
Acids Research、第14巻、第5843−5855頁、1986年)、
エルウィニア・クリサンティーミ(Erwinia chrysanthe
mi)由来のプロテアーゼ(Letoffeら、EMBO Journal、
第9巻、第1375−1382頁、1990年)などが挙げられ、バ
クテリア毒素としては、大腸菌由来のヘモリシン(Felm
eleeら、Journal of Bacteriology、第163巻、第94−10
5頁、年)、パスツレラ・ヘモリティカ(Pasteurella h
aemolytica)由来のロイコトキシン(Loら、Infection
and Immunity、第55巻、第1987−1996頁、1987年)、
ボルデテラ・ペルトゥシス(Bordetella pertussis)由
来のサイクロリシン(Glaserら、EMBO Journal、第7
巻、第3997−4004頁、1988年)などが挙げられる。
【0033】ABCトランスポーター遺伝子を用いて蛋
白質を分泌させる方法は、例えば以下のようにして実施
できる。ABCトランスポーター遺伝子を含む組換えプ
ラスミドを、目的とする分泌蛋白質の産生能を有する宿
主微生物中に導入する。あるいは、分泌蛋白質遺伝子を
含む組換えプラスミド及びABCトランスポーター遺伝
子を含む組換えプラスミドの両者を宿主微生物中に導入
する。分泌蛋白質遺伝子及びABCトランスポーター遺
伝子の両者を含むプラスミドを導入してもよい。このよ
うにして、ABCトランスポーターの発現能(及び分泌
蛋白質生産能)を付与又は増幅した微生物を得る。
【0034】この微生物を培地中で培養することによ
り、培地中に目的蛋白質が分泌され蓄積される。ABC
トランスポーターの機能(すなわち、ABCトランスポ
ーター遺伝子にコードされるポリペプチドが、蛋白質を
細胞外に分泌する能力を有するABCトランスポーター
を構成するかどうか)については細胞外に分泌された蛋
白質の量を指標として検定することができる。
【0035】微生物の細胞外に分泌された蛋白質は、培
養液の培養上清から無機塩類による塩析、有機溶媒によ
る分画沈澱、イオン交換樹脂、及び各種カラムクロマト
グラフィーによる吸脱着法、ゲルろ過法、蛋白沈澱剤を
利用する方法などの公知方法により、又はこれらを適宜
組み合わせることによって分離、採取することができ
る。また、微生物の細胞内に蓄積された蛋白質は、摩擦
型破砕装置ダイノミル(Dyno Mill)など物理的な手法、
あるいは、リゾチーム処理など化学的な手法により細胞
を破砕し、その細胞抽出液から上記と同様な方法で分
離、採取することができる。
【0036】例えば、分泌蛋白質がリパーゼの場合、リ
パーゼ遺伝子を含むプラスミドと、ABCトランスポー
ター遺伝子を含むプラスミドを宿主微生物中に導入して
形質転換し、得られた形質転換体を、リパーゼの基質で
あるトリブチン等を含有する培地中で培養するる。培地
中にリパーゼが分泌された場合、トリブチン等が分解さ
れてコロニー周辺にクリアゾーンが形成されるので、こ
のクリアゾーン形成の大小によりリパーゼの分泌を検出
できる。また、基質として三酪酸ジメルカプロールなど
を用い、培養上清についてリパーゼ活性を測定してもよ
い。検出したリパーゼの分泌量を指標として、ABCト
ランスポーターの発現と機能を確認できる。
【0037】ABCトランスポーターを構成する3種の
コンポーネントは、異なる種又は異なる分子種由来のも
のを組み合わせてもよく、適切な組み合わせを選択する
ことにより、機能するABCトランスポーターを構成さ
せることができる。
【0038】本発明の遺伝子がコードするポリペプチド
としては、配列番号2、3、4、6、7又は8で示され
たアミノ酸配列を有するもののほか、例えばそれらのア
ミノ酸配列において1もしくは数個のアミノ酸が付加、
欠失もしくは置換されたアミノ酸配列を有するものが挙
げられる。アミノ酸の付加、欠失もしくは置換は、蛋白
質を細胞外に分泌する能力が失われない程度であればよ
く、通常1〜約70個、好ましくは1〜約45個、より
好ましくは1〜約20個である。このようなポリペプチ
ドは、配列番号2、3、4、6、7又は8で示されるア
ミノ酸配列と通常85%以上、好ましくは90%以上、
より好ましくは95%以上のアミノ酸配列のホモロジー
を有する。
【0039】また、本発明の遺伝子としては、配列番号
1又は5で示される塩基配列を有するDNAを含むもの
のほか、例えば配列番号1又は5で示される塩基配列を
有するDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダ
イズし得るDNAを含むものが挙げられる。このように
ハイブリダイズし得るDNAは、そのDNAにコードさ
れるポリペプチドが目的の蛋白質を分泌する能力を有す
るものであればよい。このようなDNAは、配列番号1
又は5で示される塩基配列と、通常、80%以上、好ま
しくは90%以上、より好ましくは95%以上の塩基配
列のホモロジーを有する。このようなDNAとしては、
自然界で発見される変異型遺伝子、人為的に改変した変
異型遺伝子、異種生物由来の相同遺伝子等が含まれる。
【0040】本発明において、ストリンジェントな条件
下でのハイブリダイゼーションは、通常、ハイブリダイ
ゼーションを、6xSSC又はこれと同等の塩濃度のハ
イブリダイゼーション溶液中、50−55℃の温度条件
下、約12時間行い、6xSSC又はこれと同等の塩濃
度の溶液等で必要に応じて予備洗浄を行った後、1xS
SC又はこれと同等の塩濃度の溶液中55℃で10分〜
1時間洗浄を行うことにより実施できる。また、より高
いストリンジェンシーを得るためには、洗浄を0.1x
SSC又はこれと同等の塩濃度の溶液中65℃で1時間
洗浄を行うことにより実施できる。
【0041】本発明のABCトランスポーター遺伝子
は、微生物の自然に存在する遺伝子を用いてもよいが、
これに限定されるものではなく、例えば、配列番号2、
3、4、6、7又は8で示されるアミノ酸配列をコード
するDNAであればよい。アミノ酸に対応するコドンは
公知であるので、ネイティブなABCトランスポーター
遺伝子に限定されることなく、アミノ酸配列に対応する
DNAを設計し、ポリペプチドをコードするDNAとし
て用いることができる。ひとつのアミノ酸をコードする
コドンは各々1〜6種類知られており、用いるコドンの
選択は任意でよいが、例えば発現に利用する宿主のコド
ン使用頻度を考慮して、より発現効率の高い配列を設計
することができる。設計した塩基配列を持つDNAは、
化学合成や自然に存在する遺伝子の一部改変などによっ
て取得できる。人為的な塩基配列の一部改変、変異導入
は、所望の改変をコードする合成オリゴヌクレオチドを
プライマーとして利用し、公知の部位特異的変異導入法
(Markら、Proceedings of National Academy of Scien
ces、第81巻、5662−5666頁、1984年)等によって実施
できる。
【0042】以下、実施例を挙げて本発明を更に具体的
に説明する。
【0043】なお、下記実施例において、各操作は特に
明示がない限り、「Molecular Clonin
g」(Sambrook, J.、Fritsch, E.F.及びManiatis, T.
著、Cold Spring Harbor Laboratory Pressより1989年
に発刊)に記載の方法により行うか、又は、市販の試薬
やキットを用いる場合には市販品の指示書にしたがって
使用した。
【0044】また、リパーゼ活性の測定は、実施例にお
いては、基質として三酪酸ジメルカプロールを用いる簡
便法(大日本製薬製リパーゼキットSを用いる方法)を
用いたが、オリーブ油を基質として用いる方法(pH
8.0、37℃で20分間酵素反応させ、1分間に1μ
molの脂肪酸を遊離する酵素量を1単位とする活性測
定法)も、必要に応じて採用することができる。
【0045】また、以下の実施例で使用した培地の組成
は、以下に示す通りである(組成における%は、特にこ
とわらない限り、W/V%を表わす)。
【0046】LB培地:バクトトリプトン(ディフコ社
製)1.0%、バクトイーストエキストラクト(ディフ
コ社製)0.5%、塩化ナトリウム0.5%。
【0047】LBG平板培地:バクトトリプトン(ディ
フコ社製)1.0%、バクトイーストエキストラクト
(ディフコ社製)0.5%、塩化ナトリウム0.5%、
ゲランガム(和光純薬製)1.0%。
【0048】トリブチリン含有LBG平板培地:トリブ
チリン0.5v/v%、ポリオキシエチレンセチルアル
コールエーテル0.5%、アンピシリン0.005%を
含むLBG平板培地。
【0049】
【実施例】実施例1 ABCトランスポーター遺伝子の
クローニングと解析(I) (1)クローニング 後記参考例1のように同定したシュードモナス・フルオ
レッセンスNo.33株を、LB培地で培養し、得られ
た菌体から染色体DNAを調製した。この染色体DNA
(約1μg)を鋳型とし、PCR(Polymerase Chain R
eaction)を行った。PCRプライマーは、種々のAB
Cトランスポーター中のATP結合カセット蛋白質のア
ミノ酸配列から相同性の高い部分を選択し、そのDNA
配列を参考にして設計した。用いたセンスプライマーを
配列番号9に、アンチセンスプライマーを配列番号10
に各々示した。PCRで増幅したDNAを、ポリアクリ
ルアミドゲル電気泳動によって分離し、約300bpの
DNA断片を回収してこれをベクタープラスミドに結合
した。
【0050】この挿入DNA断片を32Pで標識してプ
ローブとして用い、以下のようにコロニーハイブリダイ
ゼーションを行った。染色体DNA(約20μg)を制
限酵素BglIIを用いて切断し、プラスミドベクター
pUC19(宝酒造社製)のBamHI切断部位に連結
した。得られた組換えプラスミドを大腸菌DH5株(東
洋紡社製)に導入した。これをアンピシリン含有LB平
板培地上のナイロンフィルター上で培養してコロニーバ
ンクを調製し、コロニーバイブリダイゼーションを行っ
た。ハイブリダイゼーションは、通常のストリンジェン
トな条件を用い以下のように行った。すなわち、プレハ
イブリダイゼーション溶液(6xSSC、5xデンハル
ト溶液、0.1%SDS、100μg/mlのサケ精子
DNA)で約60℃、約2時間振とう後、標識プローブ
を加え、ハイブリダイゼーション溶液(6xSSC、5
xデンハルト溶液、0.1%SDS、100μg/ml
のサケ精子DNA)中で60℃18時間インキュベート
した。洗浄溶液(0.1xSSC、0.1%SDS)を
用い、65℃で1時間フィルターを洗浄した後、オート
ラジオグラフィーを行い、陽性クローンを選択した。得
られたクローンの保持する組換えプラスミドをpAK6
0と名づけた。
【0051】(2)塩基配列の決定と解析 pAK60の挿入断片について、ダイデオキシ法により
以下のように塩基配列を決定した。pAK60から、キ
ロベース・デレーション・キット(宝酒造製)を用い
て、種々欠失プラスミドを作成した。これら欠失プラス
ミドとダイプライム・サイクルシーケンスキット(パー
キンエルマー・アプライドバイオシステムズ社製)を用
いて反応を行い、自動シーケンサー(パーキンエルマー
・アプライドバイオシステムズ社製モデル373A)で
塩基配列を決定した。
【0052】その結果、シュードモナス・フルオレッセ
ンス由来の挿入断片のうち5660bpの塩基配列が決
定され、この配列を後記配列表の配列番号1に示した。
【0053】また、配列番号1の配列中には、ABCト
ランスポーターの3種のコンポーネント蛋白質をコード
していると考えられる3つのオープンリーディングフレ
ームが存在していた。これら3つのオープンリーディン
グフレーム、すなわち第778〜2526番目の塩基、
第2526〜3857番目の塩基、及び第3863〜5
194番目の塩基にコードされているポリペプチドのア
ミノ酸配列を、各々配列番号2、配列番号3及び配列番
号4に示した。
【0054】これら3種のポリペプチドのアミノ酸配列
をセラチア・マルセッセンスのLipBCDのアミノ酸
配列と比較すると、配列番号2はLipBと約60%、
配列番号3はLipCと約44%、配列番号4はLip
Dと約46%の相同性を有していた。
【0055】また、配列番号1の塩基配列をセラチア・
マルセッセンスのlipBCDの塩基配列と比較する
と、配列番号2をコードする領域の塩基配列はlipB
と約63%、配列番号3をコードする領域の塩基配列は
lipCと約56%、また、配列番号4をコードする領
域の塩基配列はlipDと約57%の相同性を有してい
た。
【0056】また、上記の3種のポリペプチドは、以下
のような特徴を有していた。各アミノ酸配列について、
PROSITE Motif Dictionaryデータベースを対象にMot
ifプログラムを用いて検索したところ、配列番号2は
ATP結合蛋白質に特有な配列及びATP/GTP結合
部位(GASGSGKS;Sarasteら、Trends in BiochemicalSc
ience、第15巻、第430−434頁、1990年)を含んでい
た。また、配列番号3はHlyD蛋白質ファミリーに特
有の配列に類似した配列を含んでおり、配列番号4はN
末側に塩基性アミノ酸クラスタと疎水性アミノ酸クラス
タが連続したシグナル様の配列と思われる配列が認めら
れた。
【0057】上記解析結果から、取得した遺伝子(配列
番号1)は、シュードモナス・フルオレッセンスのAB
Cトランスポーター遺伝子(タイプAと称する)であ
り、これにコードされる3つのポリペプチド(配列番号
2、3及び4)は、ABCトランスポーター(タイプ
A)を構成するコンポーネント蛋白質であると判定し
た。
【0058】なお、組換えプラスミドpAK60はベク
タープラスミドpUC19上に、シュードモナス・フル
オレッセンス由来の約5.6kbのBglII断片が挿
入されており、ベクター由来のlacプロモーターの下
流にABCトランスポーター遺伝子(タイプA)が正方
向に連結されている。組換えプラスミドpAK60を導
入した大腸菌DH5株は、工業技術院生命工学工業技術
研究所に平成10年3月16日付でFERM P−16
711(微生物名称:大腸菌AK60(Escherichia co
li AK60))として寄託済である。
【0059】実施例2 ABCトランスポーター遺伝子
のクローニングと解析(II) (1)クローニング 後記参考例1のように同定したシュードモナス・フルオ
レッセンスNo.33株を、LB培地で培養し、得られ
た菌体から染色体DNAを調製した。
【0060】得られた染色体DNA(20μg)を制限
酵素SalIを用いて切断し、切断断片を、プラスミド
ベクターpUC18のSalI切断部位に連結した。得
られた組換えプラスミドを大腸菌DH5株に導入した。
これをアンピシリン含有LB平板培地上のナイロンフィ
ルター上で培養してコロニーバンクを調製し、コロニー
バイブリダイゼーションを行った。プローブとしては、
セラチア・マルセッセンス由来のlipB遺伝子のN末
端側(Journal of Bacteriology、第177巻、第6381‐63
89頁、1995年)を含むDNA断片(制限酵素Pst1断
片、約0.9kb)を32Pで標識して用いた。ハイブ
リダイゼーションは、通常のストリンジェントな条件よ
りも、やや弱い条件下で以下のように行った。すなわ
ち、プレハイブリダイゼーション溶液(6xSSC、5
xデンハルト溶液、0.1%SDS、100μg/ml
のサケ精子DNA)で約60℃、約2時間振とう後、標
識プローブを加え、ハイブリダイゼーション溶液(6x
SSC、5xデンハルト溶液、0.1%SDS、100
μg/mlのサケ精子DNA)中で55℃、18時間イ
ンキュベートした。洗浄溶液として、2xSSC、0.
1%SDSを用い45℃で10分間フィルターを洗浄し
た後、オートラジオグラフィーを行った。陽性クローン
を数個選択し、これらのプラスミド挿入断片について制
限酵素地図を作成した。予め染色体DNAについてセラ
チア・マルセッセンスlipBを含むDNA断片をプロ
ーブとして実施したサザンハイブリダイゼーションの結
果と照合し、同様の制限酵素切断断片を有すると考えら
れたクローンを選択した。
【0061】得られたクローンの挿入断片について、部
分的に塩基配列を決定したところ、セラチア・マルセッ
センスのlipBに相当すると思われる遺伝子の一部分
が末端領域に存在することがわかった。そこでこの領域
を含むBglII−SalI断片をプローブとし、再度
コロニーハイブリダイゼーションを行った。コロニーバ
ンクは、制限酵素EcoRIで切断した染色体DNAと
ベクタープラスミドpUC19とで調製したものを用
い、また、ハイブリダイゼーションは実施例1と同様通
常のストリンジェントな条件にて行った。得られた陽性
クローンの挿入断片について、セラチア・マルセッセン
スのlipBに相当すると思われる領域の下流の塩基配
列を決定したところ、続いてlipCに相当すると思わ
れる領域が存在することがわかった。そこで、このli
pBのC末端領域及びlipCのN末端領域を含むSa
lI−EcoRI断片をプローブとし、再度コロニーハ
イブリダイゼーションを行った。コロニーバンクは制限
酵素BglII−EcoRVで切断した染色体DNAと
ベクタープラスミドpACYC184(ニッポンジーン
社製)で調製したものを用い、ハイブリダイゼーション
は、前記と同様通常のストリンジェントな条件にて行っ
た。かくして、ABCトランスポータの3つのコンポー
ネントの遺伝子全長を含むと考えられる目的クローンを
得た。得られたクローンの挿入断片の中から、ABCト
ランスポータの3つのコンポーネントの遺伝子全長を含
む最小領域と予想されたBglII−StuI断片(約
6.4kb)をベクタープラスミドpBluscrip
tSK+(東洋紡社製)のBamHI−EcoRV部位
にサブクローニングし、この組換えプラスミドをpOI
70と名づけた。
【0062】(2)塩基配列の決定と解析 pOI70の挿入断片について、前記実施例1(2)と
同様にして塩基配列を決定した。その結果、シュードモ
ナス・フルオレッセンス由来の挿入断片のうち6400
bpの塩基配列が決定され、この配列を後記配列表の配
列番号5に示した。
【0063】配列番号5の配列中に、ABCトランスポ
ーターの3種のコンポーネント蛋白質をコードしている
と考えられる3つのオープンリーディングフレームが存
在していた。これら3つのオープンリーディングフレー
ム、すなわち第278〜2017番目の塩基、第201
7〜3345番目の塩基、及び第3354〜4670番
目の塩基にコードされているポリペプチドのアミノ酸配
列を、各々配列番号6、配列番号7及び配列番号8に示
した。
【0064】これら3種のポリペプチドのアミノ酸配列
をセラチア・マルセッセンスのLipBCD(Journal
of Bacteriology、第177巻、第6381‐6389頁、1995年)
のアミノ酸配列と比較すると、配列番号6はLipBと
約60%、配列番号7はLipCと約50%、配列番号
8はLipDと約54%の相同性を有していた。
【0065】また、配列番号5の塩基配列をセラチア・
マルセッセンスのlipBCD(Journal of Bacteriol
ogy、第177巻、第6381‐6389頁、1995年)の塩基配列と
比較すると、配列番号6をコードする領域の塩基配列は
lipBと約63%、配列番号7をコードする領域の塩
基配列はlipCと約56%、また、配列番号8をコー
ドする領域の塩基配列はlipDと約59%の相同性を
有していた。
【0066】また、実施例1で得られたタイプAの配列
と比較すると、以下のようであった。配列番号6は配列
番号2と約61%、配列番号7は配列番号3と約50
%、配列番号8は配列番号4と約57%の相同性をそれ
ぞれ有し、また、配列番号6をコードする塩基配列は配
列番号2をコードする塩基配列と約67%、配列番号7
をコードする塩基配列は配列番号3をコードする塩基配
列と約60%、配列番号8をコードする塩基配列は配列
番号4をコードする塩基配列と約66%の相同性をそれ
ぞれ有していた。
【0067】また、配列番号6、7及び8のポリペプチ
ドは、配列番号2、3及び4のポリペプチドと同様の特
徴を有していた。すなわち、配列番号6はATP結合蛋
白質に特有な配列及びATP/GTP結合部位(GASGSG
KS;Sarasteら、Trends in Biochemical Science、第15
巻、第430−434頁、1990年)を含んでいた。また、配列
番号7はHlyD蛋白質ファミリーに特有の配列に類似
した配列を含んでおり、配列番号8はN末側に塩基性ア
ミノ酸クラスタと疎水性アミノ酸クラスタが連続したシ
グナル様の配列と思われる配列が認められた。
【0068】上記解析結果から、取得した遺伝子(配列
番号5)は、シュードモナス・フルオレッセンスのAB
Cトランスポーター遺伝子(タイプBと称する)であ
り、これにコードされる3つのポリペプチド(配列番号
6、7及び8)は、ABCトランスポーター(タイプ
B)を構成するコンポーネント蛋白質であると判定し
た。
【0069】なお、組換えプラスミドpOI70はベク
タープラスミドpBluscriptSK+(東洋紡社
製)上に、シュードモナス・フルオレッセンス由来の約
6.4kbのBglII−StuI断片が挿入されてお
り、ベクター由来のlacプロモーター下流にABCト
ランスポーター遺伝子(タイプB)が正方向に連結され
ている。組換えプラスミドpOI70を導入した大腸菌
DH5株は、工業技術院生命工学工業技術研究所に平成
10年3月16日付でFERM P−16710(微生
物名称:大腸菌OI70(Escherichia coli OI70))
として寄託済である。
【0070】実施例3 蛋白質分泌活性の測定 (1)シュードモナス・フルオレッセンス由来のリパー
ゼの分泌 前記実施例2で取得したシュードモナス・フルオレッセ
ンス由来ABCトランスポーター遺伝子(タイプB)を
含む組換えプラスミド(pOI70)、及び後記参考例
2に記載した方法で取得したシュードモナス・フルオレ
ッセンス由来リパーゼ遺伝子を含む組換えプラスミドp
PFlipC13を用いて、大腸菌DH5株を供形質転
換(co-transformation)した。必要に応じて薬剤(ア
ンピシリン及びクロラムフェニコール)を添加したLB
培地で両プラスミドを含む形質転換体を選択した。
【0071】得られた形質転換体を、トリブチリン含有
LBG平板培地で培養した。その結果、両組換えプラス
ミドが導入された供形質転換体では、コロニー周辺に円
形のクリアゾーンが形成され、菌体からのリパーゼ分泌
が検出された。一方、コントロールとして用いた菌株、
すなわち、pBluscriptSK+(ベクタープラ
スミド)とpPFlipC13で供形質転換した大腸菌
DH5株では、クリアゾーン形成はほとんど認められな
かった。
【0072】また、形質転換体を、必要に応じて薬剤を
添加したLB培地で培養した後、遠心分離により培養上
清を得た。この培養上清について、簡便法によりリパー
ゼ活性を測定したところ、8500単位/mlの活性が
得られた。一方、コントロールとして用いた菌株、すな
わち、pBluscriptSK+とpPFlipC1
3を供形質転換した大腸菌DH5株では、培養上清中の
リパーゼ活性は、5単位/ml以下であった。
【0073】これらの結果から、前記実施例2で取得し
たシュードモナス・フルオレッセンス由来ABCトラン
スポーター遺伝子(タイプB)によって発現されたAB
Cトランスポーターは、シュードモナス・フルオレッセ
ンスのリパーゼを細胞外に分泌する機能を有することが
判明した。
【0074】(2)セラチア・マルセッセンス由来のリ
パーゼの分泌 セラチア・マルセッセンス由来のリパーゼ遺伝子(Akat
sukaら、Journal of Bacteriology、第176巻、第1949−
1956頁、1994年;特開平5−344891)を含む組換
えプラスミド(pLIPE111)から、リパーゼ遺伝
子を含む断片をベクタープラスミドpACYC184に
サブクローニングし、組換えプラスミドpYE111を
得た。
【0075】実施例2で取得したシュードモナス・フル
オレッセンス由来ABCトランスポーター遺伝子(タイ
プB)を含む組換えプラスミド(pOI70)、及び前
記で得られたセラチア・マルセッセンス由来リパーゼ遺
伝子を含む組換えプラスミド(pYE111)を用い
て、大腸菌DH5株を供形質転換した。必要に応じて薬
剤(アンピシリン及びクロラムフェニコール)を添加し
たLB培地で両プラスミドを含む形質転換体を選択し
た。
【0076】得られた形質転換体を、トリブチリン含有
LBG平板培地で培養した。その結果、両組換えプラス
ミドが導入された供形質転換体では、コロニー周辺に円
形のクリアゾーンが形成され、菌体からのリパーゼ分泌
が検出された。一方、コントロールとして用いた菌株、
すなわち、pBluscriptSK+とpYE111
を供形質転換した大腸菌DH5株では、クリアゾーン形
成はほとんど認められなかった。
【0077】また、形質転換体を、必要に応じて薬剤を
添加したLB培地で培養した後、遠心分離により培養上
清を得た。この培養上清について、簡便法によりリパー
ゼ活性を測定したところ、3300単位/mlの活性が
得られた。一方、コントロールとして用いた菌株、すな
わち、pBluscriptSK+とpYE111を供
形質転換した大腸菌DH5株では、培養上清中のリパー
ゼ活性は、5単位/ml以下であった。
【0078】これらの結果から、前記実施例2で取得し
たシュードモナス・フルオレッセンス由来ABCトラン
スポーター遺伝子(タイプB)によって発現されたAB
Cトランスポーターは、セラチア・マルセッセンスのリ
パーゼを細胞外に分泌する機能を有することが判明し
た。
【0079】参考例1 シュードモナス・フルオレッセ
ンスNo.33株の同定及び生化学的性状検査 (1)マルチテストシステム(キット)による同定 試験菌株(No.33株)を、市販のキット、バイオテ
スト2号(栄研化学製)及びapi20NE(日本ビオ
メリュー・バイテック製)を用いて同定し、シュードモ
ナス・フルオレッセンスであることが確認された。
【0080】(2)生化学的性状検査 試験菌株の生化学的性状検査は、医学細菌の同定の手引
き(近代出版)、病原細菌の生化学的検査法(医学書
院)、新細菌培地学講座(近代出版)などの方法に従
い、培養基は栄研製品及び自家調製品を使用した。ま
た、試験菌株は37℃で発育しないため、検査は通常3
0℃で24〜48時間培養して判定を行った。
【0081】嫌気的条件下での発育試験は、嫌気ボック
ス内で48時間培養した。
【0082】温度による発育試験は、5、30、37及
び40℃で48時間培養した。
【0083】生育pHの試験は、ハートインフュジョン
ブイヨン培地(栄研化学製)を用いてpH3、4、5、
6、7、8、9及び10になるように1NHCl又は1
NNaOHで調整後、48時間培養した。
【0084】MacConkey寒天培地上での発育
は、MacConkey寒天培地(栄研化学製)を用い
た。カタラーゼ試験は、3%過酸化水素水を用いた。オ
キシダーゼ試験は、チトクローム・オキシダーゼ試験用
ろ紙(ニッスイ製)を用いた。硝酸塩の還元は、硝酸塩
ブイヨンで3日間培養した。クエン酸塩利用能確認試験
は、シモンズ・クエン酸ナトリウム培地(栄研)及びク
リステンゼン・クエン酸塩培地(栄研化学製)を用い
た。ウレアーゼ確認試験は、UREA AGERBAS
E(OXOID)を用いた。ゼラチナーゼ確認試験は、
普通ゼラチン培地を用いて3日間培養した。
【0085】OF試験及び炭水化物からの酸産生試験は
OF培地(栄研化学製)、硫化水素の産生試験はクリグ
ラー確認培地(栄研化学製)、グルコン酸酸化試験はグ
ルコン酸塩ブイヨン、マロン酸塩利用能確認試験はマロ
ン酸塩培地(栄研化学製)を用いた。アルギニン加水分
解試験、リジン脱炭酸試験、オルニチン脱炭酸試験はメ
ラーの方法により、アルギニン培地、リジン培地、オル
ニチン培地及び対照培地(栄研化学製:ポアメディア)
を用いた。DNase産生試験はDNA培地(栄研化学
製)、硫化水素産生、インドール産生、IPA産生及び
運動性の試験はSIM培地(栄研化学製)、VP反応は
VP半流動培地(栄研化学製)、蛍光色素産生はKin
gB寒天培地(栄研化学製)を用いた。ブドウ糖からの
ガス産生試験は寒天を除いたOF培地(栄研化学製)1
0mlにダーラム管を入れ、48時間培養後のガス発生
の有無を確認した。なお、特に記述しなかったものは常
法により行い、その他の試験はハートインフュジョン寒
天培地(栄研化学製)を用いて実施した。
【0086】検査結果を表1及び表2に示す。
【0087】
【表1】
【0088】
【表2】
【0089】参考例2 シュードモナス・フルオレッセ
ンス リパーゼ遺伝子のクローニング 前記参考例1で同定したシュードモナス・フルオレッセ
ンスNo.33株を、LB培地で培養し、得られた菌体
から染色体DNAを調製した。この染色体DNAを制限
酵素EcoRIで切断し、断片をベクタープラスミドp
HSG299(宝酒造社製)のEcoRI部位に連結し
た。得られた組換えプラスミドを大腸菌DH5株に導入
した。カナマイシンを含有したトリブチリンLBG平板
培地上で培養し、コロニー周辺にクリアゾーンを形成し
たクローンを選択した。得られたクローンの組換えプラ
スミドは挿入断片についてサブクローニングを行った結
果、SphI−EcoRI断片(約2.8kb)上にリ
パーゼ遺伝子が存在すると考えられた。このSphI−
EcoRI(約2.8kb)を含むDNA断片を、ベク
タープラスミドpACYC184のSpHI部位に連結
した。かくして、ベクタープラスミド上のテトラサイク
リン(tet)プロモーターの下流にシュードモナス・
フルオレッセンス由来リパーゼ遺伝子が正方向に連結さ
れた組換えプラスミドpPFlipC13を取得した。
【0090】リパーゼ遺伝子を含む挿入断片について塩
基配列を決定した。この塩基配列及びその中にコードさ
れるリパーゼのアミノ酸配列を、後記配列表の配列番号
11に示した。文献に報告されたシュードモナス・フル
オレッセンスB52株及びSIKW1株由来のリパーゼ
遺伝子(Tanら、Applied and Environmental Microbiol
ogy、第58巻、第1402-1407頁、1992年;Chungら、Agricult
ural and BiologicalChemistry、第55巻、第2359−2365
頁、1991年)の配列と比較すると、前記で得られたN
o.33株由来リパーゼ遺伝子は、塩基配列で約84
%、アミノ酸配列で約90%のホモロジーを有してい
た。
【0091】
【発明の効果】本発明のABCトランスポーター遺伝子
を用いることにより、微生物の蛋白質を分泌する能力を
付与或いは増大させることができる。このように蛋白質
分泌能を付与或いは増大させた微生物を利用すれば、有
用蛋白質(リパーゼ等の酵素等)の生産を効率よく行う
ことができる。
【0092】
【配列表】
配列番号:1 配列の長さ:5660 配列の型:核酸 鎖の数:2本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:Genomic DNA 起源 生物名:シュードモナス・フルオレッセンス(Pseudomo
nas fluorescens) 株名:No.33 配列 AGATCTTCGA CTTCACCTCG GGTTCGGACA AGATCGACCT CACCGGCATC ACCAAAGGTG 60 CAGGCCTGAC CTTCGTCAAT GCCTTCACCG GTCACGCTGG CGATGCGGTG CTGTCCTACG 120 CCTCGGGTAC TAACCTGGGC ACCTTGGCCG TGGACTTCTC CGGGCACGGA GTGGCGGATT 180 TCCTCGTCAC CACCGTCGGC CAGGCAGCGG TCAGCGACAT CGTGGCCTGA TATACGGGTA 240 AAGGAGGGCG GCGCGCACGC GCTGCCCTCT GCCCTTGCGT CCACCCCTTG AACGGGCGAT 300 GGTGATGACG TTATTTCGCA CTACAGTGGC CTGGTGTTTC CAGGCAATGC TTATGTCGGC 360 AGGAGCCTCA GCAATGGCAA GCAGTCTGGT TTTACCTACG TCGGCGCAAC TGGCCGGGCA 420 TTGGGCGCTG CACCAGCAGG AACAGGTGTG CGCGCTGGAC TTGATCGAAC AAGCCAACGC 480 GCTCGGCGGG GATGTAGCGT GCGCCGGACA ATGGCTGGGG GAAGCGCCCG TTAGTTGGAC 540 GCCGACTCCC GACGGTATTT GGTTGATGAA TGCCGAAGGC ACGGGCATTA CACATTTAAA 600 TCGCCAGAAA GAAGGCGAAT ATGAAGGGCG CTCCAAATCT GGCGCGGTGT TGTTATTACA 660 ACGCGCACCT TAATAGTTCG TTATAACGAT ATAACCCGAT TTTAATGTTT GCCCGCCCTT 720 TAATGAGGCG CCGGGCAAAC TATTGCGCGT CATTCGGCTC AGGGAAGATC AGGCAACATG 780 GCGAAGACCA CTCCCGTTGC ACCACTGTTT AAAGCACTCG GTGATTACAA AAGTATTCTG 840 ATCAGTATTG GCTGCTTCAC CGCATTGATT AACGTATTGA TGCTGGTGCC GTCGATTTAT 900 ATGTTGCAAG TCTACGACCG CGTGCTGTCG TCCCAGAACG AAACCACCCT GGTGATGTTG 960 ACGCTGATGG TGGTGGGGTT CTTCGCGTTT ATCGGCGTGC TGGAGGTGAT CCGCAGCTTT 1020 ATCGTGATTC GCATCGGTAG CCAGTTGGAG CGGCGTTTCA ACCTGCGGGT GTACAAGGCC 1080 GCCTTCGAGC GCAACCTGCA ACGGGGCGAG GGCCACGGCG GCCAATCCCT GGGGGATTTG 1140 ACCCACATCC GCCAGTTCAT CACCGGGCCT GCACTGTTCG CGTTTTTCGA TGCGCCGTGG 1200 TTTCCGATTT ATCTGTTTGT GATCTTCCTG TTCAACGTGT GGCTAGGGGT GTTGGCCAGC 1260 GCCGGGGCCG TGCTGCTGAT CGGGCTGGCG TGCCTCAACG AGTACCTGAC CAAAAAGCCC 1320 CTGGGCGAAG CCAGCGGGTA TTCCCAGCAA TCCACCCAAT TGGCTACCAG CCACCTGCAC 1380 AACGCCGAAA CCATCCAGGC CATGGGCATG CTGGGGGCGT TGCGCAAGCG CTGGTTCAAG 1440 GTGCATTCGC AGTTTCTGGG CTTGCAAAAC AAGGCCAGCG ACACCGGCTC GATCATCAGT 1500 TCCCTGAGTA AATCCCTGCG CCTGTGCCTG CAATCACTGG TGCTGGGCCT GGGTGCATTG 1560 CTGGTGATCA AGGGCGACAT GACCGCCGGG ATGATGATCG CCGGTTCGAT CCTGATGGGT 1620 CGGGTATTGA GCCCCATCGA CCAGTTGATT GCCGTGTGGA AGCAATGGAG CTCGGCCAAG 1680 CTGGCCTACC AGCGCCTCGA CAACCTGATG CGCGAGTTCC CGCCCCAGGG CGAACAGATG 1740 GCCTTGCCGG CGCCCAAGGG CAATGTGAGT TTCGAGCAGG TCAGCGCCGG CCCGCCCGGG 1800 CGGCGTGTGC CGACCTTGCA TCAGGTCAGC TTCAACCTGG CGGCCGGTGA AGTGCTCGGC 1860 GTGCTGGGCG CGTCGGGCTC CGGCAAGTCG ACCCTGGCCC GTGTGCTGGT GGGCGTGTGG 1920 CCCACCCTGG CGGGCACCGT GCGCCTGGAC GGTGCTGACA TCCATCGCTG GGACCGTGAC 1980 GACCTCGGCC CGCATATCGG CTACCTGCCC CAGGACATCG AACTGTTCAG CGGCAGCATC 2040 GCCGACAACA TCGCACGCTT TCGTGACGCC GACCCGCAGT TAGTGGTGCA GGCCGCCCAG 2100 CAAGCCGGCG TGCACGAACT GATCCTGCGT TTGCCCCACG GCTACGACAC CGTGCTCGGC 2160 GACGAAGGCA GCGGCCTGTC CGGTGGCCAG AAACAGCGGG TCGCCCTGGC TCGCGCGTTG 2220 TATGGCGGCC CGCGGCTGAT CGTACTGGAT GAGCCCAACT CCAACCTCGA CACCGTGGGC 2280 GAAGCCGCCC TGGCCAGCGC GATCATGCAG ATGAAGGCCC AGGGCAGCAC GGTGGTGCTG 2340 GTGACGCACC GCTCCTCGGC GTTGGCCCAG GCCGACAAGC TGCTGGTGCT CAACGAAGGC 2400 CGCTTGCAGG CCTTCGGACC CAGCCAGGAC GTGCTGCGGG CACTGTCCGG CCAGCAGGAA 2460 GCACCGCGAG AAAAGGCCGG GGTCAGCCTC AGCCGTCAGT ATCAAGCCGG AAGGAATCCA 2520 GGCGCATGAG CAGCGACAGC AGCATTCAAA TCAACCGCGA TTACGAACAG ACTCACCCCG 2580 AACATGGCGC ACGTTTCTTT GCCCGCATGG GCTGGCTGCT GACGGTGGTC GGCGCCGGTG 2640 GTTTCTTCCT GTGGGCCAGC CTGGCGCCGC TGGACCAGGG CATTCCGGTG CAGGGCACCG 2700 TGGTGGTCTC GGGCAAGCGC AAGGCCGTGC AAACCCTGAG CCCCGGAGTG GTCAGCCGGA 2760 TCCTGGTGCG GGAAGGCGAG GCAGTGAAGC AGGGCCAGCC GCTGTTCCGC CTCGACCAGA 2820 CGCAAAACCA GGCTGACGTG CACTCCCTGC AAGCCCAGTA CCGCATGGCC TGGGCCAGCG 2880 TGGCGCGGTG GCAGAGCGAG CGTGATAACC AGTCGACGAT CACCTTTCCG GCGGAGCTGA 2940 GCGGTAACCC GGATCAAGCC CTGGCCTTGG TTCTGGAAGG CCAGCGCCAA CTGTTCAGCA 3000 GCCGCCGCGA AGCCTTTGCC CGGGAACAGG CCGGGATTCG CGCGAACATC GAGGGCGCCA 3060 CCGCCCAACT CAACGGCATG CGCCGCGCCC GCAGTGACCT GACTGCCCAG GCCCAATCCC 3120 TGCGCGACCA GTTGAACAAC CTGCAACCCT TGGCCGACAA CGGCTACATA CCGCGCAACC 3180 GGCTGATGGA GTACCAGCGG CAGCTGTCCC AGGTGCAACA GGACCTGGCG CAGAACACCG 3240 GCGAAAGCGG GCGGGTGGAG CAGGGCATTC TTGAATCGCG GCTCAAGCTG CAACAGCACA 3300 GCGAGGAGTA TCAGAAGGAG GTCCGCAGCC AACTCGCCGA CGCGCAACTG CGCAGCCTGA 3360 CCCTGGAGCA GCAACTGACC TCCGCGGGGT TCGACCTGCA GCACAGCGAA ATCAACGCCC 3420 CGGCCGATGG CATCGCGGTC AACCTGAGCG TGCACACCGA AGGTGCCGTG GTGCGTGCCG 3480 GTGAAACCCT GCTGGAAATC GTGCCCCAGG ACACTCGCCT GGAAGTGGAA GGGCGCTTGC 3540 CGGTGCACCT GGTGGACAAG GTCGGCACCC ATTTGCCAGT GGACATCCTG TTCACCGCCT 3600 TCAACCAGAG CCGCACGCCC CGGGTGCCGG GGGAGGTGAG CCTGATTTCT GCCGACCAGA 3660 TGCTCGACGA AAAAACCGGC ATGCCGTACT ACGTGCTGCG CACCACCGTC AGCAGCAGCG 3720 CCCTGGAGAA ACTCCATGGC CTGGTGATCA AGCCGGGGAT GCCCGCCGAG ATGTTTATCC 3780 GCACCGGCGA GCGCTCCTTG CTCAACTACC TGTTCAAGCC GCTGCTGGAC CGCGCCGGCT 3840 CGGCGTTGAC CGAGGAATGA ACATGAAACC GATGTTCATC GCCTTGCTAC TCGCCTGCAG 3900 CAGCGCCCAG GCCGCCATGG GCCCGTTTGA TGTCTACGAA CAGGCCCTGC GCAACGACCC 3960 GGTGTTCCTC GGCGCCATCA AGGAACGTGA CGCCGGCCTG GAAAACCGCA CCATTGGCCG 4020 CGCCGGCCTG CTGCCCAAGC TGTCGTACAA CTACAACAAG GGGCGCAACA ACTCCCAGGC 4080 CACCTTGCCC GACGGGCGCG GCGGTAATTA TCACGACGAC CGCAACTACA ACAGCTACGG 4140 CTCCACCTTC ACCCTGCAAC AGCCGCTGTT CGACTACGAA GCCTATGCCA ACTACCGCAA 4200 GGGTGTGGCC CAGGCGCTGT TTGCCGACGA GAGTTTTCGC GACAAGAGCC AGGCGTTGCT 4260 GGTGCGGGTG CTGACCTATT ACACCCAGGC CTTGTTTGCC CAGGACCAGA TCGACATTGC 4320 CCGCGCCAAA AAGAAGGCGT ACGAGCAGCA GTTCCAGCAG AACCAGCATT TGTTCCAACA 4380 AGGCGAAGGC ACCCGTACCG ATATCCTCGA AGCCGAATCC CGTTATGAGC TGGCCACCGC 4440 CGAAGAAATC CAGGCGCTGG ATGAGCAGGA CGCCTCGCTG CGGGAGCTGG GTGCGCTGAT 4500 CGGCGTGCAG AGCGTCAACA TCAACGACCT GGCGCCACTG AACCCGGGGT TTGCCGCCTT 4560 CACCCTGACG CCGGCCAACT ACGACACCTG GCACGAACTC GCCCTGACCA ACAACCCGAC 4620 CCTGGCCTCG CAACGCCAAT CCCTGGAAGT GGCGCGCTAT GAAGTGGAGC GCAACCGTGC 4680 CGGGCATATG CCACGGGTGA CGGCCTATGC CAGTTCGCGG CAGCAGGAAT CCGACAGCGG 4740 CAACACCTAC AACCAGCGCT ACGACACCAA CACCATTGGC GTGGAAATCA GCATGCCGCT 4800 GTATGCCGGT GGCGGGGTCT CGGCCTCCAC CCGCCAGGCC AGCCGCGCCA TGGAACAGGC 4860 CGAGTACGAG CTGGAAGGCA AGACCCGCGA AACCCTGATC GAACTGCGTC GCCAGTTCAG 4920 TGCGTGCCTG TCGGGCGTCA GCAAGCTGCG CGCCTACCAG AAGGCCCTGA CCTCGGCCGA 4980 AGCGCTGGTG GTGTCGACCA AGCAAAGCAT CCTCGGCGGC GAGCGGGTCA ACCTCGATGC 5040 GCTGAACGCC GAACAGCAGC TGTACAGCAC CCGTCGCGAC CTGGCCCAGG CGCGCTACGA 5100 CTACCTGATG GCCTGGACCA AATTGCATTA CTACGCAGGC AACTTGCGCG ACACCGACCT 5160 GGCCAAGGTG GATGAGGCGT TTGGCCCCGA ACATTGAGCA CACCCATAAA AACAACAAGG 5220 GACGGTTTAG ATGATCACCG ATTCACCTCG CTTCAAACCC TTCACCGCAG GCTCCTTGCT 5280 GCTGCTGTCC GTGGCGGCCC ACGGGCAGTA CCTCGAAGCC GGCAAACCGG GCGATCCCGC 5340 CAGTTGGCGT TCGACCGAGT TCCAGAGCGA CTGGGGCCTG GACCGCATGA AAGCCAACGA 5400 GGCCTACGCG GCCGGCATCA CCGGCAGTGG CGTCAAGATC GGCGCGCTGG ACTCGGGTTT 5460 TGACCCCAAC CATCCCGAAG CCTCAAAAGA CCGTTATCAC GCGGTCACCG CCAGCGGTAC 5520 CTACGTCGAT GGCAGCCCGT TCAACACCAC CGGCGCCCTC AACCCCAACA ACGACTCCCA 5580 CGGCACCCAT GTGACCGGCA CCATGGGCGC GGCCCGTGAT GGCGTGGGCA TGCACGGCGT 5640 GGCGTACAAC GCGCAGATCT 5660 。
【0093】配列番号:2 配列の長さ:583 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド 配列 Met Ala Lys Thr Thr Pro Val Ala Pro Leu Phe Lys Ala Leu Gly 1 5 10 15 Asp Tyr Lys Ser Ile Leu Ile Ser Ile Gly Cys Phe Thr Ala Leu 20 25 30 Ile Asn Val Leu Met Leu Val Pro Ser Ile Tyr Met Leu Gln Val 35 40 45 Tyr Asp Arg Val Leu Ser Ser Gln Asn Glu Thr Thr Leu Val Met 50 55 60 Leu Thr Leu Met Val Val Gly Phe Phe Ala Phe Ile Gly Val Leu 65 70 75 Glu Val Ile Arg Ser Phe Ile Val Ile Arg Ile Gly Ser Gln Leu 80 85 90 Glu Arg Arg Phe Asn Leu Arg Val Tyr Lys Ala Ala Phe Glu Arg 95 100 105 Asn Leu Gln Arg Gly Glu Gly His Gly Gly Gln Ser Leu Gly Asp 110 115 120 Leu Thr His Ile Arg Gln Phe Ile Thr Gly Pro Ala Leu Phe Ala 125 130 135 Phe Phe Asp Ala Pro Trp Phe Pro Ile Tyr Leu Phe Val Ile Phe 140 145 150 Leu Phe Asn Val Trp Leu Gly Val Leu Ala Ser Ala Gly Ala Val 155 160 165 Leu Leu Ile Gly Leu Ala Cys Leu Asn Glu Tyr Leu Thr Lys Lys 170 175 180 Pro Leu Gly Glu Ala Ser Gly Tyr Ser Gln Gln Ser Thr Gln Leu 185 190 195 Ala Thr Ser His Leu His Asn Ala Glu Thr Ile Gln Ala Met Gly 200 205 210 Met Leu Gly Ala Leu Arg Lys Arg Trp Phe Lys Val His Ser Gln 215 220 225 Phe Leu Gly Leu Gln Asn Lys Ala Ser Asp Thr Gly Ser Ile Ile 230 235 240 Ser Ser Leu Ser Lys Ser Leu Arg Leu Cys Leu Gln Ser Leu Val 245 250 255 Leu Gly Leu Gly Ala Leu Leu Val Ile Lys Gly Asp Met Thr Ala 260 265 270 Gly Met Met Ile Ala Gly Ser Ile Leu Met Gly Arg Val Leu Ser 275 280 285 Pro Ile Asp Gln Leu Ile Ala Val Trp Lys Gln Trp Ser Ser Ala 290 295 300 Lys Leu Ala Tyr Gln Arg Leu Asp Asn Leu Met Arg Glu Phe Pro 305 310 315 Pro Gln Gly Glu Gln Met Ala Leu Pro Ala Pro Lys Gly Asn Val 320 325 330 Ser Phe Glu Gln Val Ser Ala Gly Pro Pro Gly Arg Arg Val Pro 335 340 345 Thr Leu His Gln Val Ser Phe Asn Leu Ala Ala Gly Glu Val Leu 350 355 360 Gly Val Leu Gly Ala Ser Gly Ser Gly Lys Ser Thr Leu Ala Arg 365 370 375 Val Leu Val Gly Val Trp Pro Thr Leu Ala Gly Thr Val Arg Leu 380 385 390 Asp Gly Ala Asp Ile His Arg Trp Asp Arg Asp Asp Leu Gly Pro 395 400 405 His Ile Gly Tyr Leu Pro Gln Asp Ile Glu Leu Phe Ser Gly Ser 410 415 420 Ile Ala Asp Asn Ile Ala Arg Phe Arg Asp Ala Asp Pro Gln Leu 425 430 435 Val Val Gln Ala Ala Gln Gln Ala Gly Val His Glu Leu Ile Leu 440 445 450 Arg Leu Pro His Gly Tyr Asp Thr Val Leu Gly Asp Glu Gly Ser 455 460 465 Gly Leu Ser Gly Gly Gln Lys Gln Arg Val Ala Leu Ala Arg Ala 470 475 480 Leu Tyr Gly Gly Pro Arg Leu Ile Val Leu Asp Glu Pro Asn Ser 485 490 495 Asn Leu Asp Thr Val Gly Glu Ala Ala Leu Ala Ser Ala Ile Met 500 505 510 Gln Met Lys Ala Gln Gly Ser Thr Val Val Leu Val Thr His Arg 515 520 525 Ser Ser Ala Leu Ala Gln Ala Asp Lys Leu Leu Val Leu Asn Glu 530 535 540 Gly Arg Leu Gln Ala Phe Gly Pro Ser Gln Asp Val Leu Arg Ala 545 550 555 Leu Ser Gly Gln Gln Glu Ala Pro Arg Glu Lys Ala Gly Val Ser 560 565 570 Leu Ser Arg Gln Tyr Gln Ala Gly Arg Asn Pro Gly Ala 575 580 583 。
【0094】配列番号:3 配列の長さ:444 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド 配列 Met Ser Ser Asp Ser Ser Ile Gln Ile Asn Arg Asp Tyr Glu Gln 1 5 10 15 Thr His Pro Glu His Gly Ala Arg Phe Phe Ala Arg Met Gly Trp 20 25 30 Leu Leu Thr Val Val Gly Ala Gly Gly Phe Phe Leu Trp Ala Ser 35 40 45 Leu Ala Pro Leu Asp Gln Gly Ile Pro Val Gln Gly Thr Val Val 50 55 60 Val Ser Gly Lys Arg Lys Ala Val Gln Thr Leu Ser Pro Gly Val 65 70 75 Val Ser Arg Ile Leu Val Arg Glu Gly Glu Ala Val Lys Gln Gly 80 85 90 Gln Pro Leu Phe Arg Leu Asp Gln Thr Gln Asn Gln Ala Asp Val 95 100 105 His Ser Leu Gln Ala Gln Tyr Arg Met Ala Trp Ala Ser Val Ala 110 115 120 Arg Trp Gln Ser Glu Arg Asp Asn Gln Ser Thr Ile Thr Phe Pro 125 130 135 Ala Glu Leu Ser Gly Asn Pro Asp Gln Ala Leu Ala Leu Val Leu 140 145 150 Glu Gly Gln Arg Gln Leu Phe Ser Ser Arg Arg Glu Ala Phe Ala 155 160 165 Arg Glu Gln Ala Gly Ile Arg Ala Asn Ile Glu Gly Ala Thr Ala 170 175 180 Gln Leu Asn Gly Met Arg Arg Ala Arg Ser Asp Leu Thr Ala Gln 185 190 195 Ala Gln Ser Leu Arg Asp Gln Leu Asn Asn Leu Gln Pro Leu Ala 200 205 210 Asp Asn Gly Tyr Ile Pro Arg Asn Arg Leu Met Glu Tyr Gln Arg 215 220 225 Gln Leu Ser Gln Val Gln Gln Asp Leu Ala Gln Asn Thr Gly Glu 230 235 240 Ser Gly Arg Val Glu Gln Gly Ile Leu Glu Ser Arg Leu Lys Leu 245 250 255 Gln Gln His Ser Glu Glu Tyr Gln Lys Glu Val Arg Ser Gln Leu 260 265 270 Ala Asp Ala Gln Leu Arg Ser Leu Thr Leu Glu Gln Gln Leu Thr 275 280 285 Ser Ala Gly Phe Asp Leu Gln His Ser Glu Ile Asn Ala Pro Ala 290 295 300 Asp Gly Ile Ala Val Asn Leu Ser Val His Thr Glu Gly Ala Val 305 310 315 Val Arg Ala Gly Glu Thr Leu Leu Glu Ile Val Pro Gln Asp Thr 320 325 330 Arg Leu Glu Val Glu Gly Arg Leu Pro Val His Leu Val Asp Lys 335 340 345 Val Gly Thr His Leu Pro Val Asp Ile Leu Phe Thr Ala Phe Asn 350 355 360 Gln Ser Arg Thr Pro Arg Val Pro Gly Glu Val Ser Leu Ile Ser 365 370 375 Ala Asp Gln Met Leu Asp Glu Lys Thr Gly Met Pro Tyr Tyr Val 380 385 390 Leu Arg Thr Thr Val Ser Ser Ser Ala Leu Glu Lys Leu His Gly 395 400 405 Leu Val Ile Lys Pro Gly Met Pro Ala Glu Met Phe Ile Arg Thr 410 415 420 Gly Glu Arg Ser Leu Leu Asn Tyr Leu Phe Lys Pro Leu Leu Asp 425 430 435 Arg Ala Gly Ser Ala Leu Thr Glu Glu 440 444 。
【0095】配列番号:4 配列の長さ:444 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド 配列 Met Lys Pro Met Phe Ile Ala Leu Leu Leu Ala Cys Ser Ser Ala 1 5 10 15 Gln Ala Ala Met Gly Pro Phe Asp Val Tyr Glu Gln Ala Leu Arg 20 25 30 Asn Asp Pro Val Phe Leu Gly Ala Ile Lys Glu Arg Asp Ala Gly 35 40 45 Leu Glu Asn Arg Thr Ile Gly Arg Ala Gly Leu Leu Pro Lys Leu 50 55 60 Ser Tyr Asn Tyr Asn Lys Gly Arg Asn Asn Ser Gln Ala Thr Leu 65 70 75 Pro Asp Gly Arg Gly Gly Asn Tyr His Asp Asp Arg Asn Tyr Asn 80 85 90 Ser Tyr Gly Ser Thr Phe Thr Leu Gln Gln Pro Leu Phe Asp Tyr 95 100 105 Glu Ala Tyr Ala Asn Tyr Arg Lys Gly Val Ala Gln Ala Leu Phe 110 115 120 Ala Asp Glu Ser Phe Arg Asp Lys Ser Gln Ala Leu Leu Val Arg 125 130 135 Val Leu Thr Tyr Tyr Thr Gln Ala Leu Phe Ala Gln Asp Gln Ile 140 145 150 Asp Ile Ala Arg Ala Lys Lys Lys Ala Tyr Glu Gln Gln Phe Gln 155 160 165 Gln Asn Gln His Leu Phe Gln Gln Gly Glu Gly Thr Arg Thr Asp 170 175 180 Ile Leu Glu Ala Glu Ser Arg Tyr Glu Leu Ala Thr Ala Glu Glu 185 190 195 Ile Gln Ala Leu Asp Glu Gln Asp Ala Ser Leu Arg Glu Leu Gly 200 205 210 Ala Leu Ile Gly Val Gln Ser Val Asn Ile Asn Asp Leu Ala Pro 215 220 225 Leu Asn Pro Gly Phe Ala Ala Phe Thr Leu Thr Pro Ala Asn Tyr 230 235 240 Asp Thr Trp His Glu Leu Ala Leu Thr Asn Asn Pro Thr Leu Ala 245 250 255 Ser Gln Arg Gln Ser Leu Glu Val Ala Arg Tyr Glu Val Glu Arg 260 265 270 Asn Arg Ala Gly His Met Pro Arg Val Thr Ala Tyr Ala Ser Ser 275 280 285 Arg Gln Gln Glu Ser Asp Ser Gly Asn Thr Tyr Asn Gln Arg Tyr 290 295 300 Asp Thr Asn Thr Ile Gly Val Glu Ile Ser Met Pro Leu Tyr Ala 305 310 315 Gly Gly Gly Val Ser Ala Ser Thr Arg Gln Ala Ser Arg Ala Met 320 325 330 Glu Gln Ala Glu Tyr Glu Leu Glu Gly Lys Thr Arg Glu Thr Leu 335 340 345 Ile Glu Leu Arg Arg Gln Phe Ser Ala Cys Leu Ser Gly Val Ser 350 355 360 Lys Leu Arg Ala Tyr Gln Lys Ala Leu Thr Ser Ala Glu Ala Leu 365 370 375 Val Val Ser Thr Lys Gln Ser Ile Leu Gly Gly Glu Arg Val Asn 380 385 390 Leu Asp Ala Leu Asn Ala Glu Gln Gln Leu Tyr Ser Thr Arg Arg 395 400 405 Asp Leu Ala Gln Ala Arg Tyr Asp Tyr Leu Met Ala Trp Thr Lys 410 415 420 Leu His Tyr Tyr Ala Gly Asn Leu Arg Asp Thr Asp Leu Ala Lys 425 430 435 Val Asp Glu Ala Phe Gly Pro Glu His 440 444 。
【0096】配列番号:5 配列の長さ:6400 配列の型:核酸 鎖の数:2本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:Genomic DNA 起源 生物名:シュードモナス・フルオレッセンス(Pseudomo
nas fluorescens) 株名:No.33 配列 AGATCTCGGC CGGCCTGGCA GCACACGCTA CGGCAACCAC CACCGACGTC GCCCTGGTAG 60 GCGTGCAGGA CGTTGCACAG GACTGGGCAC TCGCTGCCTG ACTTTGCTGT GCAATGAAAA 120 AAGCGAATGG AAGATCGCTC TCCCATTCGC TGCGTAAACC CCGTCGTCGC CGTGAGTTTC 180 GAAGGCCAGG GCGACGGCGG TGACAAATTC TGCGGAGCGG CGCGCGGCGT GTCAAACGCG 240 GGCGGCGCTT CCCGATTTCC CCCATGAGAA TCCCTCGATG CGCCATGCCG GCAACGAAAC 300 CCTGGCCGCT CTCACGGCCT ATAAAAGTGG CTTCCTCAAC ATTGGCCTGT TTTCGGCAGT 360 GATCAACCTG TTGATGCTGG CCCCGGCGCT GTACATGTTG CAGGTCTACG ACCGGGTGCT 420 GGCCTCCGGC AACCCGATGA CCCTGTTGAT GCTGACGCTG ATGATCCTTG GCTTGTTCGG 480 CTTGATGGGC GCGCTGGAGT GGGTGCGCAG CCAGGTGGTG ATCCGCCTTG GCACACAGAT 540 GGACATGCGC CTGAACCAGC GGGTGTACGA CGCCGCGTTC GAGGCGCAAC TCAAGGGCGG 600 CACCCAGGCG GCAGGGCAGG CGTTGAGCGA CCTGACGACC TTGCGCCAGT TCGCCACCGG 660 CCAGGCGCTG TTCGCATTTT TTGATGCGCC GTGGTTTCCG GTGTACTTGC TGGTGATCTT 720 CCTGTTCCAC CCCTGGCTCG GCGTCCTGGC GCTGGCCGGT GCGCTGATGC TGATGGCGCT 780 GGCGTGGGCC AACCAGCACA TCTGCCAGGC ACCGTTGACC CAGGCCAATC AGCTGTCGAT 840 CAGCGCCAGC CAGCAGGCCA CGGCCAACCT GCGCAATGCC GAAGCCATCG AAGCCATGGG 900 CATGCTGGCA ACCCTGCGTG CGCGCTGGTT TGCCCAGCAC CAGGCGTTTC TGGCGGCGCA 960 GAACCTGGCC AGTGAAAAGA CCGCCGCCAT CAGTGCCTGG TCCAAGGGCG TGCGCCTGGC 1020 GTTGCAGTCA TTGGTTCTCG GTTTGGGCGC ATTGCTGGCG GTGCAGGGGG CGATTACGCC 1080 GGGCATGATG ATCGCCGGCT CGATCCTGAT GGGGCGGGTA CTGAGCCCTA TCGACCAACT 1140 GATCGGCGTG TGGAAACAGT GGAGTTCGGC GCGCCTGGCC TATGAGCGTT TGACCCTGAT 1200 GCTGGCGGCC AACCCGGCGC GCACCGAGCG CATGAGCTTG CCGGCGCCCA GCGGCCAGTT 1260 GACGGTCGAG CAGGTAAGCG CGTGTGCGCC GGGCAGTCGT CGGCCCGCGT TGGCCAACCT 1320 CGGGTTCAGC CTGCCTGCCG GTGACGTGCT GGGCGTGATC GGTCCTTCCG GTTGCGGCAA 1380 GTCGACCCTG GCGCGGTTGC TGGTGGGGGC CTGGACGCCG ATGGCCGGCA AGGTTCGGCT 1440 GGACGGCGCG GACCTGGCGC AATGGGACAA GCAGCAACTC GGCCCGCACA TTGGGTATCT 1500 GCCCCAGGAC ATCCAGCTGT TCGCCGGCAG CATTGCCGAC AACATCGCGC GTTTCGACAC 1560 CGTGGATTCG GACAAGGTGC TCGCTGCCGC GCAAATGGCC GGCGTGCATC AACTGATCCT 1620 GCAGTTGCCC CAAGGCTACG ACACCCAACT GGGGGAGGGC GGTGCCGGGT TGTCCGGCGG 1680 GCAGAAGCAA CGTGTCGCGC TGGCGCGGGC GCTGTACGGC TTGCCTGCGC TGATCGTACT 1740 GGATGAGCCC AATTCCAATC TCGATGAGGC CGGCGAGCAG GCCTTGCTCC ATGCCATCAC 1800 CTTGCTCAAG GCGCAGCGTC GCACGCTGGT GCTGATCACC CACAAGACCC CTGTGCTGGC 1860 GTTGACGGAC CAACTGCTGA TCCTGCGGGA CGGCCAGTTG CAGGCGTTCG GGCCCACGGC 1920 GCGGGTGTTG GAGGCCACGC AGAAACCGGC GGCCGCGCCA CCCAAACCGG TGTCGGCGAT 1980 GAGCATGAGC TACCGCCTCG GTGAAGGAAA AAAAGCATGA GCCGACCTGT GCTTGTCACG 2040 GACAACAGCG TGCCGCCGGT GAACAACGTG CTGGCGCTGG ACGATAAAAA ATACGCCCGC 2100 CTGGGCTGGT TGCTGGTGCT CGGCGGGTTT GCCGGGTTCC TCGGCTGGGC CGCGCTGGCG 2160 CCGCTGGACA AGGGCGTGGC GGTGTCCGGC AAGGTCATGG TGTCGGGGCA CCGCAAGACG 2220 GTGCAGCACC CGTCGGGCGG GATCGTCGAG CGGATCGAGG TGCGCGATGG CGAGGTGGTG 2280 AGCGCCGGCC AGGTATTGAT CCACCTGAAG GAAACTCCGT TGCGCGGCCA GATGCAGTCT 2340 TTGCGCAGCC AGTTCATTGC GTCCCAGGCC AGCGAAGCGC GCTTGAGTGC CGAGAGCGAA 2400 GGCTTGTCGG CCGTCGTTTT CGGCCCCGAA CTGCTGAACG AGCCGGAGGC CGCCGCCACC 2460 TTGAGCCTGC AACGGCAACT GTTCAGCAGT CGCGCCCAGG CCCTGGCCAC AGAGCAGCAA 2520 GGCCTGCGGG AAACCATCGC CGGGGCCGAG GCGCAATTGC GCGGCACCCG GGAATCCCAG 2580 GCCAGCAAAG TGCTGCAACG CACCGCGATG AATGAACAAC TGCAAGGTCT GCGCGAGCTG 2640 GCGCGGGACG GCTACATCCC GCGCAATCGG CTGCTGGAAA ATGAACGGCT GTATGCCCAG 2700 CTCGACGGTG CGATTGCCGA GGATTTCGGC CGCATCGGCC AGCTGCAACG GCAAGTCCTT 2760 GAACTGCGCC TGCGCATCCG CCAGCTCGGC GAAGACTTCC AGAAAGACCT GCGCGGCCAA 2820 CTGGCCGAAA CCCGCACCCG CAGCGACGAC TTGCGCAACC GGTTGGCCTC GGCCGAATTC 2880 GAACTGGCCA ACAGCCTGGC GCGCGCGCCG GCGGCTGGTG TGGTGGTGGG GCTGGACGTG 2940 TACACCGAAG GCGGCGTGAT CAAGCCCGGC CAGGCGCTGA TGGACATCGT GCCCCAGGGT 3000 GAACCACTGC TGGTGGAAGC GCGGGTGCCG GTGCAGATGG TCGACAAGGT GCACCCGGGC 3060 TTGCCGGTGG AGTTGCTGTT CTCGGCGTTC AACCAGAGCA CCACCCCACG CATTGCCGGT 3120 GAAGTGACGC TGGTGTCGGC CGACCGCCAG GTCGACGAGC GCACCGATGA GCCGTATTAC 3180 ACCTTGCGCG CCCAGGTCAG CGCAGCCGGC ATGCGCCAGC TCGACGGCTT GCAGATTCGC 3240 CCGGGCATGC CGGTGGAAGC GTTCGTCAAA ACCGGTGAGC GCTCGATGCT CAACTACCTG 3300 TTCAAACCCT TGCTGGATCG GACTCACATG GCGTTGGTGG AAGAATGAAG GCGCTGTTAT 3360 TCGGTCTGTG TTGTGCCTGC AGTGGATCGG TCCAGGCGCT GGGATTGCTC GATGCTTATG 3420 ACTTGGCCCT GCGCAACGAC CCGACGTTTC AGGCGGCAAT CCAGGAGCGC GAGGCTGGCG 3480 AGGAAAACCG CATCATCGGC CGCGCCGGGC TGTTGCCGAA CCTGTCCTGG AGCTACAACA 3540 ACTCGCGCAA TGAATCCGAA GTCACCCAGT CGACGGCGGT GGGCAACGTC ACCAGCGACC 3600 GCGATTACCG CAGCTATGCC TCGACCCTGA CCCTGCAACA ACCGCTGCTC GATTACGAAG 3660 CCTATGCGCG CTATCGCCAG GGTGCAGCGC AGGCGCTGTT TGCCGATGAA CGCTTTCGCG 3720 GCAAGAGCCA GGAACTGGCC GTGCGGGTGT TGAGCGCCTA CAGCCAGGCG TTGCTGGCCC 3780 AGGAGCGGAT CGAGCTGAGC CGCGCCCAGA AACGCGCGTA CGCCGAGCGC CTGCAACTCA 3840 ATGAACGGCT GCTCAAGGGC GGCGAGGGCA CCCGCACCGA TGTGCTGGAA ACCCAGGCAC 3900 GCCTGAGCCT GGCCCAGGCC GAAGAGATCG AATCCCAGGA CACCCAGGAC GCAGCCTTGC 3960 GCGAGCTGGA AGCGATTGTG GGCCAGCCGT TGCAGATAGA CGAGTTGGCG CCGCTGACGC 4020 GACAGTTCGA GATCCCGCCG CTGGAGCCCA ATCGCTTCGA GACCTGGCGG GAAATGGCGA 4080 TGGCCAACAA CCCGGAGCTC AAATCCCAGC ACCACGCGCT GGACGTCGCC GAATACGAAG 4140 TGGAGCGCAA GCGCGCCGGG CACATGCCCA AGGTCAGCCT GTATGCGAGC AGCCGCCAGA 4200 CCAGCTCGGA TTCGGAAAGC AGCTACAACC AGAAGTACGA CACCAACAGC GTCGGCATCC 4260 AGGTCAGCCT GCCGCTGTTC GCCGGTGGCT CGGTGTCGGC ATCGACGCGC CAGGCCGCCA 4320 ATCAACTGTC CCAGGCCCAG TACGAACTGG ACGCGCAAAC CGCCAGAACG CTGATCGAAC 4380 TGCGCAAACA ATTCAACCTC AACACCAGCG GCGCGGCCAA AGTGCGGGCG TATGAAATGG 4440 CGGTCAGCTC GGCCACGGCC TTGGTGACGG CGACCAAAAA AAGTGTGGCC GGCGGTGAGC 4500 GCGTCAACCT CGACGTGCTG GACGCCGAAC AGCAACTGTT CACGGCCCGC CGTGACCTTG 4560 CGGATGCACG GCATGCGTAC CTGCTGGCGC GGATACAGCT GAAGTATTTC GCCGGGTTGC 4620 TGAACGAGCA GGACCTGCGA GCGTTGGCGG GGTATTTCCA GCCATCGGCA TGATGGCTAT 4680 ATCGGCTAAC ACACCGATCC ACTGTGGGAG CTGTCGAGCC TTGGCGAGGC TGCGATGGCG 4740 GCGGCATGGG CGACATTTTT AGTGTCTGAC CCACCGCCAT CGCGGCCTCG CTGAAGCTCG 4800 ACGGCTCCCA CATGTGGAAC GGCACTTACC GCCGAGTCAG CAACACACCC GATTCCATGT 4860 GGTGCGTCCA CGGGAACTGG TCAAACATCG CGCACTGGGT AATCCGGTGT GTGTCATGCA 4920 GTTGCGCAAT GTTCGCCGCC AACGTCTCCG GGTTGCAGGA GATGTACAGG ATGTTCTCGA 4980 AGCGTCGGGT CAGCTCGCAG GTGTCCGGGT CCATGCCGGC ACGCGGCGGG TCGACGAACA 5040 CGCTGCCGAA CTCGTAGCTC TTGAGGTCGA TGCCGTGCAG GCGTCGGAAC GGCCGCACTT 5100 CGTTCAAGGC TTCGGTCAGT TCCTCGGCAG ACAAACGCAC CAGGGTGACG TTATCCACCG 5160 CGTTTTCATC GAGGTTGCTC AGCGCCGCGT TCACCGAAGT CTTGCTGATC TCGGTGGCCA 5220 GCACTTTGCG TACGCGGGTG GCCAGGGGCA GGGTGAAGTT GCCGTTGCCG CAGTACAGCT 5280 CCAGCAGGTC ATCACTGCGA TCGCCGAGGG CTTCGAATGC CCAGTTGAGC ATCTTCTGGT 5340 TCACCGTGCC GTTGGGCTGG GTGAACGCGC CTTCCGGCTG GCGATAGCTG AAGGTGCGAC 5400 CGCCGACATC GAGTTTCTCG ACCACGTAAT CGCGGCCGAT CACGTCACGC TTGCCCTTGG 5460 AGCGGCCGAT GATGCTCACG TTCAAATCAG CCGCCAGCTT GTTCGCGGCG GTGTGCCAAT 5520 GCTCGTCCAG CGGGCGGTGA TAGCACAGAG TGATCATCGC GTCGCCGGCC AGGGTGGTGA 5580 GGAACTCCAC CTGGAACAGC TTGTGGCTCA GGGCGGCGCT GGCTTGCCAG GCGGCCTTGA 5640 GCTGCGGCAT CAACTGGTTG ATGCGCAGGC TGGCAATCGG GAACTCTTCG ATGAGGATTG 5700 GCGTGCGCTT GTCGTCCTGG GAAAACATCG CGTAGTGACG TTCACCCCCT TCACGCCACA 5760 GGCGGAACTC CGCCCGCAGG CGGAAGTTCT GCAAGGGCGA GTCGAAAACC TGCGGCTCTG 5820 GCGCGTCGAA CGGCGCCAGC AGGTCACGCA AGCGCGTGAC CTTGTCTTGC AGTTGAGCGG 5880 TGTAGCTTGC GGCGTCAAAA GTCATGCGTT GAACCAGCCC AGCTTGATCA CAAACAGAAT 5940 CGACAGGATC ACCAGCGCCG GGTTCAGCTC ACGGTAGCGG CCCGAAAGCA GCTTGATGGC 6000 GGTCCAGGCG ATGAAACCGA AGGCAATGCC GTTGGCGATG GAATAAGTGA ATGGCATCGC 6060 CAGGGCGGTG ATCACCACCG GCGCGGCGAC AGTGATGTCG TCCCAGTCGA TTTCGGCCAG 6120 GCCAGACGTC ATCAATACGG CAACGAACAG CAGCGCCGGC GCGGTGGCGA AGGCCGGCAC 6180 GCTGGCCGCC AGTGGCGAGA AGAACAGCGC CAGCAGGAAC AGGATGGCGA CCACGACGGC 6240 GGTCAAACCG GTACGGCCAC CGGCACTCAC GCCCGCCGCC GATTCGATGT AGCTGGTGGT 6300 GGTCGAGGTG CCCAGCAGGG AGCCGGCCAT GGCCGCAGTA CTGTCGGCGA TCAGCGCACG 6360 GCCCATTTTC GGCATGTGGC CGTCCTTGCC CATCAGGCCT 6400 。
【0097】配列番号:6 配列の長さ:580 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド 配列 Met Arg His Ala Gly Asn Glu Thr Leu Ala Ala Leu Thr Ala Tyr 1 5 10 15 Lys Ser Gly Phe Leu Asn Ile Gly Leu Phe Ser Ala Val Ile Asn 20 25 30 Leu Leu Met Leu Ala Pro Ala Leu Tyr Met Leu Gln Val Tyr Asp 35 40 45 Arg Val Leu Ala Ser Gly Asn Pro Met Thr Leu Leu Met Leu Thr 50 55 60 Leu Met Ile Leu Gly Leu Phe Gly Leu Met Gly Ala Leu Glu Trp 65 70 75 Val Arg Ser Gln Val Val Ile Arg Leu Gly Thr Gln Met Asp Met 80 85 90 Arg Leu Asn Gln Arg Val Tyr Asp Ala Ala Phe Glu Ala Gln Leu 95 100 105 Lys Gly Gly Thr Gln Ala Ala Gly Gln Ala Leu Ser Asp Leu Thr 110 115 120 Thr Leu Arg Gln Phe Ala Thr Gly Gln Ala Leu Phe Ala Phe Phe 125 130 135 Asp Ala Pro Trp Phe Pro Val Tyr Leu Leu Val Ile Phe Leu Phe 140 145 150 His Pro Trp Leu Gly Val Leu Ala Leu Ala Gly Ala Leu Met Leu 155 160 165 Met Ala Leu Ala Trp Ala Asn Gln His Ile Cys Gln Ala Pro Leu 170 175 180 Thr Gln Ala Asn Gln Leu Ser Ile Ser Ala Ser Gln Gln Ala Thr 185 190 195 Ala Asn Leu Arg Asn Ala Glu Ala Ile Glu Ala Met Gly Met Leu 200 205 210 Ala Thr Leu Arg Ala Arg Trp Phe Ala Gln His Gln Ala Phe Leu 215 220 225 Ala Ala Gln Asn Leu Ala Ser Glu Lys Thr Ala Ala Ile Ser Ala 230 235 240 Trp Ser Lys Gly Val Arg Leu Ala Leu Gln Ser Leu Val Leu Gly 245 250 255 Leu Gly Ala Leu Leu Ala Val Gln Gly Ala Ile Thr Pro Gly Met 260 265 270 Met Ile Ala Gly Ser Ile Leu Met Gly Arg Val Leu Ser Pro Ile 275 280 285 Asp Gln Leu Ile Gly Val Trp Lys Gln Trp Ser Ser Ala Arg Leu 290 295 300 Ala Tyr Glu Arg Leu Thr Leu Met Leu Ala Ala Asn Pro Ala Arg 305 310 315 Thr Glu Arg Met Ser Leu Pro Ala Pro Ser Gly Gln Leu Thr Val 320 325 330 Glu Gln Val Ser Ala Cys Ala Pro Gly Ser Arg Arg Pro Ala Leu 335 340 345 Ala Asn Leu Gly Phe Ser Leu Pro Ala Gly Asp Val Leu Gly Val 350 355 360 Ile Gly Pro Ser Gly Cys Gly Lys Ser Thr Leu Ala Arg Leu Leu 365 370 375 Val Gly Ala Trp Thr Pro Met Ala Gly Lys Val Arg Leu Asp Gly 380 385 390 Ala Asp Leu Ala Gln Trp Asp Lys Gln Gln Leu Gly Pro His Ile 395 400 405 Gly Tyr Leu Pro Gln Asp Ile Gln Leu Phe Ala Gly Ser Ile Ala 410 415 420 Asp Asn Ile Ala Arg Phe Asp Thr Val Asp Ser Asp Lys Val Leu 425 430 435 Ala Ala Ala Gln Met Ala Gly Val His Gln Leu Ile Leu Gln Leu 440 445 450 Pro Gln Gly Tyr Asp Thr Gln Leu Gly Glu Gly Gly Ala Gly Leu 455 460 465 Ser Gly Gly Gln Lys Gln Arg Val Ala Leu Ala Arg Ala Leu Tyr 470 475 480 Gly Leu Pro Ala Leu Ile Val Leu Asp Glu Pro Asn Ser Asn Leu 485 490 495 Asp Glu Ala Gly Glu Gln Ala Leu Leu His Ala Ile Thr Leu Leu 500 505 510 Lys Ala Gln Arg Arg Thr Leu Val Leu Ile Thr His Lys Thr Pro 515 520 525 Val Leu Ala Leu Thr Asp Gln Leu Leu Ile Leu Arg Asp Gly Gln 530 535 540 Leu Gln Ala Phe Gly Pro Thr Ala Arg Val Leu Glu Ala Thr Gln 545 550 555 Lys Pro Ala Ala Ala Pro Pro Lys Pro Val Ser Ala Met Ser Met 560 565 570 Ser Tyr Arg Leu Gly Glu Gly Lys Lys Ala 575 580 。
【0098】配列番号:7 配列の長さ:443 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド 配列 Met Ser Arg Pro Val Leu Val Thr Asp Asn Ser Val Pro Pro Val 1 5 10 15 Asn Asn Val Leu Ala Leu Asp Asp Lys Lys Tyr Ala Arg Leu Gly 20 25 30 Trp Leu Leu Val Leu Gly Gly Phe Ala Gly Phe Leu Gly Trp Ala 35 40 45 Ala Leu Ala Pro Leu Asp Lys Gly Val Ala Val Ser Gly Lys Val 50 55 60 Met Val Ser Gly His Arg Lys Thr Val Gln His Pro Ser Gly Gly 65 70 75 Ile Val Glu Arg Ile Glu Val Arg Asp Gly Glu Val Val Ser Ala 80 85 90 Gly Gln Val Leu Ile His Leu Lys Glu Thr Pro Leu Arg Gly Gln 95 100 105 Met Gln Ser Leu Arg Ser Gln Phe Ile Ala Ser Gln Ala Ser Glu 110 115 120 Ala Arg Leu Ser Ala Glu Ser Glu Gly Leu Ser Ala Val Val Phe 125 130 135 Gly Pro Glu Leu Leu Asn Glu Pro Glu Ala Ala Ala Thr Leu Ser 140 145 150 Leu Gln Arg Gln Leu Phe Ser Ser Arg Ala Gln Ala Leu Ala Thr 155 160 165 Glu Gln Gln Gly Leu Arg Glu Thr Ile Ala Gly Ala Glu Ala Gln 170 175 180 Leu Arg Gly Thr Arg Glu Ser Gln Ala Ser Lys Val Leu Gln Arg 185 190 195 Thr Ala Met Asn Glu Gln Leu Gln Gly Leu Arg Glu Leu Ala Arg 200 205 210 Asp Gly Tyr Ile Pro Arg Asn Arg Leu Leu Glu Asn Glu Arg Leu 215 220 225 Tyr Ala Gln Leu Asp Gly Ala Ile Ala Glu Asp Phe Gly Arg Ile 230 235 240 Gly Gln Leu Gln Arg Gln Val Leu Glu Leu Arg Leu Arg Ile Arg 245 250 255 Gln Leu Gly Glu Asp Phe Gln Lys Asp Leu Arg Gly Gln Leu Ala 260 265 270 Glu Thr Arg Thr Arg Ser Asp Asp Leu Arg Asn Arg Leu Ala Ser 275 280 285 Ala Glu Phe Glu Leu Ala Asn Ser Leu Ala Arg Ala Pro Ala Ala 290 295 300 Gly Val Val Val Gly Leu Asp Val Tyr Thr Glu Gly Gly Val Ile 305 310 315 Lys Pro Gly Gln Ala Leu Met Asp Ile Val Pro Gln Gly Glu Pro 320 325 330 Leu Leu Val Glu Ala Arg Val Pro Val Gln Met Val Asp Lys Val 335 340 345 His Pro Gly Leu Pro Val Glu Leu Leu Phe Ser Ala Phe Asn Gln 350 355 360 Ser Thr Thr Pro Arg Ile Ala Gly Glu Val Thr Leu Val Ser Ala 365 370 375 Asp Arg Gln Val Asp Glu Arg Thr Asp Glu Pro Tyr Tyr Thr Leu 380 385 390 Arg Ala Gln Val Ser Ala Ala Gly Met Arg Gln Leu Asp Gly Leu 395 400 405 Gln Ile Arg Pro Gly Met Pro Val Glu Ala Phe Val Lys Thr Gly 410 415 420 Glu Arg Ser Met Leu Asn Tyr Leu Phe Lys Pro Leu Leu Asp Arg 425 430 435 Thr His Met Ala Leu Val Glu Glu 440 443 。
【0099】配列番号:8 配列の長さ:439 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド 配列 Leu Leu Phe Gly Leu Cys Cys Ala Cys Ser Gly Ser Val Gln Ala 1 5 10 15 Leu Gly Leu Leu Asp Ala Tyr Asp Leu Ala Leu Arg Asn Asp Pro 20 25 30 Thr Phe Gln Ala Ala Ile Gln Glu Arg Glu Ala Gly Glu Glu Asn 35 40 45 Arg Ile Ile Gly Arg Ala Gly Leu Leu Pro Asn Leu Ser Trp Ser 50 55 60 Tyr Asn Asn Ser Arg Asn Glu Ser Glu Val Thr Gln Ser Thr Ala 65 70 75 Val Gly Asn Val Thr Ser Asp Arg Asp Tyr Arg Ser Tyr Ala Ser 80 85 90 Thr Leu Thr Leu Gln Gln Pro Leu Leu Asp Tyr Glu Ala Tyr Ala 95 100 105 Arg Tyr Arg Gln Gly Ala Ala Gln Ala Leu Phe Ala Asp Glu Arg 110 115 120 Phe Arg Gly Lys Ser Gln Glu Leu Ala Val Arg Val Leu Ser Ala 125 130 135 Tyr Ser Gln Ala Leu Leu Ala Gln Glu Arg Ile Glu Leu Ser Arg 140 145 150 Ala Gln Lys Arg Ala Tyr Ala Glu Arg Leu Gln Leu Asn Glu Arg 155 160 165 Leu Leu Lys Gly Gly Glu Gly Thr Arg Thr Asp Val Leu Glu Thr 170 175 180 Gln Ala Arg Leu Ser Leu Ala Gln Ala Glu Glu Ile Glu Ser Gln 185 190 195 Asp Thr Gln Asp Ala Ala Leu Arg Glu Leu Glu Ala Ile Val Gly 200 205 210 Gln Pro Leu Gln Ile Asp Glu Leu Ala Pro Leu Thr Arg Gln Phe 215 220 225 Glu Ile Pro Pro Leu Glu Pro Asn Arg Phe Glu Thr Trp Arg Glu 230 235 240 Met Ala Met Ala Asn Asn Pro Glu Leu Lys Ser Gln His His Ala 245 250 255 Leu Asp Val Ala Glu Tyr Glu Val Glu Arg Lys Arg Ala Gly His 260 265 270 Met Pro Lys Val Ser Leu Tyr Ala Ser Ser Arg Gln Thr Ser Ser 275 280 285 Asp Ser Glu Ser Ser Tyr Asn Gln Lys Tyr Asp Thr Asn Ser Val 290 295 300 Gly Ile Gln Val Ser Leu Pro Leu Phe Ala Gly Gly Ser Val Ser 305 310 315 Ala Ser Thr Arg Gln Ala Ala Asn Gln Leu Ser Gln Ala Gln Tyr 320 325 330 Glu Leu Asp Ala Gln Thr Ala Arg Thr Leu Ile Glu Leu Arg Lys 335 340 345 Gln Phe Asn Leu Asn Thr Ser Gly Ala Ala Lys Val Arg Ala Tyr 350 355 360 Glu Met Ala Val Ser Ser Ala Thr Ala Leu Val Thr Ala Thr Lys 365 370 375 Lys Ser Val Ala Gly Gly Glu Arg Val Asn Leu Asp Val Leu Asp 380 385 390 Ala Glu Gln Gln Leu Phe Thr Ala Arg Arg Asp Leu Ala Asp Ala 395 400 405 Arg His Ala Tyr Leu Leu Ala Arg Ile Gln Leu Lys Tyr Phe Ala 410 415 420 Gly Leu Leu Asn Glu Gln Asp Leu Arg Ala Leu Ala Gly Tyr Phe 425 430 435 Gln Pro Ser Ala 439 。
【0100】配列番号:9 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(合成DNA) 配列 ATGYTGCARG TSTAYGAYCG 20 。
【0101】配列番号:10 配列の長さ:18 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(合成DNA) 配列 CRTCRAARAA SGCRAACA 18 。
【0102】配列番号:11 配列の長さ:2773 配列の型:核酸 鎖の数:2本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:Genomic DNA 起源 生物名:シュードモナス・フルオレッセンス(Pseudomo
nas fluorescens) 株名:No.33 配列 GCATGCTGGC GGGTGTGGAC GGCGCGCTGG ACGAAGACAC CCGTTTGGGC CTGGTGGCGG 60 GCTACAGCGA CACGTCGCTG AATATGGGCA GTGACACCCA CTCCCGCGCA TCGGTCGACA 120 GCTATCACCT GGGTGCCTAT GCCGGGCACG AGATCGGCGC CTTGCGTTTG AGCGGTGGCG 180 CAACCTACAG CTGGCACCGC GCCGATGTGA AGCGCGAGCT GCAATACGGT GAAGTCGCCG 240 GCAAGCAAAA AGCCAAGGTC GATGCCCGCA GTACCCAGGT GTTTACCGAA GCGGCGTATC 300 GCCTGAACTT GCAACCCCTT GCCCTGGAAC CGTTCGCCAA CCTGGCGTAT GTGCACCTGG 360 ATGCCGACGG GTTTACCGAG AAGGGCGATG CGGCGGCGTT GAAGGGCGGG GATGACAGCC 420 GCGACCTGGT GTTGAGCACC CTGGGCGTAA GGGCGCTGAA AACCTTGAAC GTGAGCGATC 480 ACCAGCAACT GGAGCTTTCC GGCACGCTGG GCTGGCAGCA CAACCTGAGC AGCATCGACT 540 CCGAGCGCCA CCTGGCGTTT GCGTCGGGCA GCCCGTCGTT CTCCGTGGAA AGTTCGCCGA 600 TGGTGCGTGA TGCGGCCCTG GTAGGCGCGC GGGTCAGCCT GGCGTTGAGC AAGGACGCGA 660 AGGTGAATCT TGATTACAAC GGCCTGCTGG CCAGCAAGGA GAAAGTCCAT GGCGTCGGCT 720 TGAGCCTCGA CTGGGCGTTC TGAAATACCG TTGTTTGGCT TTCTCGACAA TTCCAACAAA 780 AGAGAGGCAA TACC 794 ATG GGT GTC TTT GAC TAT AAA AAC CTC GGG ACC GAG GGC TCC AAA 839 Met Gly Val Phe Asp Tyr Lys Asn Leu Gly Thr Glu Gly Ser Lys 1 5 10 15 GCG TTG TTC GCC GAT GCC ATG GCG ATC ACG TTG TAC TCC TAC CAC 884 Ala Leu Phe Ala Asp Ala Met Ala Ile Thr Leu Tyr Ser Tyr His 20 25 30 AAC CTG GAT AAC GGC TTT GCA GTG GGC TAC CAG CAC AAC GGT TTT 929 Asn Leu Asp Asn Gly Phe Ala Val Gly Tyr Gln His Asn Gly Phe 35 40 45 GGC CTG GGC CTG CCC GCA ACC CTG GTG GGC GCG TTG CTG GGC AGT 974 Gly Leu Gly Leu Pro Ala Thr Leu Val Gly Ala Leu Leu Gly Ser 50 55 60 ACT GAT TCC CAA GGG GTG ATT CCG GGG ATT CCC TGG AAC CCC GAT 1019 Thr Asp Ser Gln Gly Val Ile Pro Gly Ile Pro Trp Asn Pro Asp 65 70 75 TCG GAA AAG GCC GCC CTC GAT GCG GTG CAC AAG GCC GGC TGG ACG 1064 Ser Glu Lys Ala Ala Leu Asp Ala Val His Lys Ala Gly Trp Thr 80 85 90 CCC ATC AGC GCC AGC ACC CTG GGC TAC GGT GGC AAG GTC GAC GCC 1109 Pro Ile Ser Ala Ser Thr Leu Gly Tyr Gly Gly Lys Val Asp Ala 95 100 105 CGG GGC ACG TTC TTC GGT GAA AAA GCC GGC TAT ACC ACC GCT CAG 1154 Arg Gly Thr Phe Phe Gly Glu Lys Ala Gly Tyr Thr Thr Ala Gln 110 115 120 GTG GAA GTG CTG GGC AAG TAC GAT GGT GAC GGC AAG TTG CTG GAA 1199 Val Glu Val Leu Gly Lys Tyr Asp Gly Asp Gly Lys Leu Leu Glu 125 130 135 ATC GGC ATC GGT TTT CGC GGC ACC TCC GGC CCC CGG GAA ACC CTG 1244 Ile Gly Ile Gly Phe Arg Gly Thr Ser Gly Pro Arg Glu Thr Leu 140 145 150 ATC AGC GAT TCC ATC GGC GAT TTG GTC AGT GAC CTG CTG GCC GCG 1289 Ile Ser Asp Ser Ile Gly Asp Leu Val Ser Asp Leu Leu Ala Ala 155 160 165 CTG GGG CCG AAG GAT TAC GCG AAA AAC TAC GCG GGC GAA GCC TTT 1334 Leu Gly Pro Lys Asp Tyr Ala Lys Asn Tyr Ala Gly Glu Ala Phe 170 175 180 GGC ACC TTG CTC AAG GAT GTC GCG GCG TAT GCC GGC AGC CAT GGG 1379 Gly Thr Leu Leu Lys Asp Val Ala Ala Tyr Ala Gly Ser His Gly 185 190 195 TTG ACG GGC AAG GAC GTG GTG GTC AGC GGC CAT AGC CTG GGT GGC 1424 Leu Thr Gly Lys Asp Val Val Val Ser Gly His Ser Leu Gly Gly 200 205 210 CTG GCG GTC AAC AGC ATG GCC GAC TTG AGC GGC AAT AAA TGG TCG 1469 Leu Ala Val Asn Ser Met Ala Asp Leu Ser Gly Asn Lys Trp Ser 215 220 225 GGA TTC TAC AAG GAT TCC AAC TAC GTG GCC TAC GCC TCG CCG ACC 1514 Gly Phe Tyr Lys Asp Ser Asn Tyr Val Ala Tyr Ala Ser Pro Thr 230 235 240 CAG AGT GCC GGC GAC AAG GTG CTG AAC ATC GGG TAT GAA AAT GAC 1559 Gln Ser Ala Gly Asp Lys Val Leu Asn Ile Gly Tyr Glu Asn Asp 245 250 255 CCG GTA TTT CGT GCC CTG GAC GGT TCG TCG TTC AAT TTC TCG TCC 1604 Pro Val Phe Arg Ala Leu Asp Gly Ser Ser Phe Asn Phe Ser Ser 260 265 270 CTG GGC GTG CAC GAC AAG CCC CAT GAG TCG ACC ACC GAC AAT ATC 1649 Leu Gly Val His Asp Lys Pro His Glu Ser Thr Thr Asp Asn Ile 275 280 285 GTC AGC TTC AAC GAT CAC TAT GCG TCG ACG CTG TGG AAT GTC CTG 1694 Val Ser Phe Asn Asp His Tyr Ala Ser Thr Leu Trp Asn Val Leu 290 295 300 CCG TTT TCC ATC GTC AAT GTG CCG ACC TGG ATC TCC CAT TTG CCC 1739 Pro Phe Ser Ile Val Asn Val Pro Thr Trp Ile Ser His Leu Pro 305 310 315 ACG GCG TAT GGG GAT GGC TTG ACG CGG GTG CTG GAC TCG CAG TTC 1784 Thr Ala Tyr Gly Asp Gly Leu Thr Arg Val Leu Asp Ser Gln Phe 320 325 330 TAC GAC CTG ACC AGC CGG GAC TCG ACG ATT ATC GTG GCC AAC CTG 1829 Tyr Asp Leu Thr Ser Arg Asp Ser Thr Ile Ile Val Ala Asn Leu 335 340 345 TCG GAC CCG GCC CGC GCC AAT ACC TGG GTG CAG GAC CTT AAC CGC 1874 Ser Asp Pro Ala Arg Ala Asn Thr Trp Val Gln Asp Leu Asn Arg 350 355 360 AAC GCC GAG CCC CAC AAG GGC AAC ACG TTC ATC ATC GGC AGT GAC 1919 Asn Ala Glu Pro His Lys Gly Asn Thr Phe Ile Ile Gly Ser Asp 365 370 375 GGT AAT GAC CTG ATT CAG GGC GGC AAG GGC GTG GAC TTC ATC GAG 1964 Gly Asn Asp Leu Ile Gln Gly Gly Lys Gly Val Asp Phe Ile Glu 380 385 390 GGT GGC AAG GGC AAT GAC ACG ATC CGC GAC AAC AGT GGG CAT AAC 2009 Gly Gly Lys Gly Asn Asp Thr Ile Arg Asp Asn Ser Gly His Asn 395 400 405 ACC TTT CTG TTC GGA GGG CAG TTT GGG CAG GAC CGG GTG ATC GGC 2054 Thr Phe Leu Phe Gly Gly Gln Phe Gly Gln Asp Arg Val Ile Gly 410 415 420 TAC CAG CCC ACC GAC AAG CTG GTG TTC CGG GAT GTG GAG GGC AGT 2099 Tyr Gln Pro Thr Asp Lys Leu Val Phe Arg Asp Val Glu Gly Ser 425 430 435 GCT GAC TGG CGC GAT CAC GCC AAG GTG GTG GGT AGC GAT ACG GTG 2144 Ala Asp Trp Arg Asp His Ala Lys Val Val Gly Ser Asp Thr Val 440 445 450 CTG AGT TTT GGC GCG GAC TCG GTA ACG CTG GTG GGG GTT GGA CTG 2189 Leu Ser Phe Gly Ala Asp Ser Val Thr Leu Val Gly Val Gly Leu 455 460 465 GCC GGG GTG TGG GGC GAT GGA ATT TCC ATC AGC 2222 Ala Gly Val Trp Gly Asp Gly Ile Ser Ile Ser 470 475 476 TAAATAGCGC TGCTGTTGTG GCGAGGGAGC AAGCTCCCTC GCCACAGGGT TAGTCAGCGT 2282 CTGGGGAGGG GTTATCTCCA GTAGTGGCCG TGGTTCCAGT ACGGGCGATG GGGTTGGCCG 2342 TAGCCGTAGC CGTAGTAATG ACCGCTTGGC CAGTAGCCTC GCGGGCCGTA GCCATAACCC 2402 CAGTGGCCGT AGTAGCCGGG AGGAGGCGGT TGCACGATTA CCACGCGCGC TGGCGCCTGG 2462 CGGATGATGA GGGTGTCGGC AAACACCGGC GTACTCGCCA GCGCAGCCCA CATCACGGGA 2522 ATGAGTAGCA GAGCGCGCAC CGCTCGGGAC ATGAATGCCA TGGCCATGGT TCTCCGTCGT 2582 ACCGCTTTCG AAGATGAAGG CGGTTGATCG GTTAAACGCG GGGGCGGTGG AAATCTTCGG 2642 TAAAATTTTG TTTATTTTGC CCATGCCAAA AAAAACGCGC ATTTGCGCGG TTTTTTTTAT 2702 TTCTCCTTGA TCACGGTCGC GACGTCCGCG GCCTTGACCC GTATGTGCTT GCCGGCGATG 2762 TCGGTGAATT C 2773 。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 FI (C12N 15/09 ZNA C12R 1:43) (C12N 1/21 C12R 1:19) (C12N 9/20 C12R 1:19) (72)発明者 出井 晶子 大阪府大阪市都島区都島北通2丁目4番18 −505号

Claims (21)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 シュードモナス・フルオレッセンスのA
    TP結合カセットトランスポーターを構成するポリペプ
    チドをコードする遺伝子。
  2. 【請求項2】 微生物のATP結合カセットトランスポ
    ーターを構成するポリペプチドをコードする遺伝子であ
    って、該ポリペプチドが、(1)配列番号2記載のアミ
    ノ酸配列を有するポリペプチド、(2)配列番号3記載
    のアミノ酸配列を有するポリペプチド、(3)配列番号
    4記載のアミノ酸配列を有するポリペプチド、(4)配
    列番号2記載のアミノ酸配列において1もしくは数個の
    アミノ酸残基が付加、欠失又は置換されたアミノ酸配列
    を有するポリペプチド、(5)配列番号3記載のアミノ
    酸配列において1もしくは数個のアミノ酸残基が付加、
    欠失又は置換されたアミノ酸配列を有するポリペプチ
    ド、及び(6)配列番号4記載のアミノ酸配列において
    1もしくは数個のアミノ酸残基が付加、欠失又は置換さ
    れたアミノ酸配列を有するポリペプチドから選択される
    遺伝子。
  3. 【請求項3】 微生物のATP結合カセットトランスポ
    ーターを構成するポリペプチドが、(1)配列番号2記
    載のアミノ酸配列を有するポリペプチド、(2)配列番
    号3記載のアミノ酸配列を有するポリペプチド、及び
    (3)配列番号4記載のアミノ酸配列を有するポリペプ
    チドから選択される請求項2記載の遺伝子。
  4. 【請求項4】 配列番号1記載の塩基配列を有するDN
    A、又は配列番号1記載の塩基配列を有するDNAとス
    トリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNA、
    からなる請求項2記載の遺伝子。
  5. 【請求項5】 (1)配列番号1記載の塩基配列の第7
    78番目から2526番目までに相当する塩基配列を有
    するDNA、(2)配列番号1記載の塩基配列の第25
    26番目から3857番目までに相当する塩基配列を有
    するDNA、及び(3)配列番号1記載の塩基配列の第
    3863番目から5194番目までに相当する塩基配列
    を有するDNAから選択されるDNAからなる請求項2
    記載の遺伝子。
  6. 【請求項6】 微生物がシュードモナス属微生物である
    請求項2記載の遺伝子。
  7. 【請求項7】 微生物がシュードモナス・フルオレッセ
    ンスである請求項6記載の遺伝子。
  8. 【請求項8】 微生物のATP結合カセットトランスポ
    ーターを構成するポリペプチドをコードする遺伝子であ
    って、該ポリペプチドが、(1)配列番号6記載のアミ
    ノ酸配列を有するポリペプチド、(2)配列番号7記載
    のアミノ酸配列を有するポリペプチド、(3)配列番号
    8記載のアミノ酸配列を有するポリペプチド、(4)配
    列番号6記載のアミノ酸配列において1もしくは数個の
    アミノ酸残基が付加、欠失又は置換されたアミノ酸配列
    を有するポリペプチド、(5)配列番号7記載のアミノ
    酸配列において1もしくは数個のアミノ酸残基が付加、
    欠失又は置換されたアミノ酸配列を有するポリペプチ
    ド、及び(6)配列番号8記載のアミノ酸配列において
    1もしくは数個のアミノ酸残基が付加、欠失又は置換さ
    れたアミノ酸配列を有するポリペプチドから選択される
    遺伝子。
  9. 【請求項9】 微生物のATP結合カセットトランスポ
    ーターを構成するポリペプチドが、(1)配列番号6記
    載のアミノ酸配列を有するポリペプチド、(2)配列番
    号7記載のアミノ酸配列を有するポリペプチド、及び
    (3)配列番号8記載のアミノ酸配列を有するポリペプ
    チドから選択される請求項8記載の遺伝子。
  10. 【請求項10】 配列番号5記載の塩基配列を有するD
    NA、又は配列番号5記載の塩基配列を有するDNAと
    ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDN
    A、からなる請求項8記載の遺伝子。
  11. 【請求項11】 (1)配列番号5記載の塩基配列の第
    278番目から2017番目までに相当する塩基配列を
    有するDNA、(2)配列番号5記載の塩基配列の第2
    017番目から3345番目までに相当する塩基配列を
    有するDNA、及び(3)配列番号5記載の塩基配列の
    第3354番目から4670番目までに相当する塩基配
    列を有するDNAから選択されるDNAからなる請求項
    8記載の遺伝子。
  12. 【請求項12】 微生物がシュードモナス属微生物であ
    る請求項8記載の遺伝子。
  13. 【請求項13】 微生物がシュードモナス・フルオレッ
    センスである請求項12記載の遺伝子。
  14. 【請求項14】 ATP結合カセットトランスポーター
    が微生物のリパーゼを細胞外へ分泌する能力を有する請
    求項1から13のいずれか1項記載の遺伝子。
  15. 【請求項15】 ATP結合カセットトランスポーター
    を構成するポリペプチドをコードする請求項1から14
    記載の遺伝子をベクタープラスミドに組込んでなる組換
    えプラスミド。
  16. 【請求項16】 請求項15記載の組換えプラスミドを
    含む形質転換微生物。
  17. 【請求項17】 セラチア属又はシュードモナス属微生
    物のATP結合カセットトランスポーターによって分泌
    される蛋白質をコードする遺伝子をベクタープラスミド
    に組込んでなる組換えプラスミドを含む請求項16記載
    の形質転換微生物。
  18. 【請求項18】 ATP結合カセットトランスポーター
    によって分泌される蛋白質がリパーゼである請求項17
    記載の形質転換微生物。
  19. 【請求項19】 宿主微生物がシュードモナス属、セラ
    チア属又はエシェリシア属微生物である請求項16又は
    17記載の形質転換微生物。
  20. 【請求項20】 請求項16又は17記載の形質転換微
    生物を培地で培養し、培地中に蓄積した蛋白質を分離・
    採取することを特徴とする蛋白質の製法。
  21. 【請求項21】 蛋白質がリパーゼである請求項20記
    載の製法。
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Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2001007621A3 (de) * 1999-07-23 2001-10-11 Inst Genomic Res Tigr Dna-sequenzen, die abc-transporter kodieren
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CN114214350A (zh) * 2021-12-16 2022-03-22 南开大学 AltL蛋白或altL基因的应用及转运烷烃的重组表达载体和菌株

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