JPH07506192A - タンパク質構造決定のための組成物類および方法類 - Google Patents

タンパク質構造決定のための組成物類および方法類

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JPH07506192A JP6518272A JP51827294A JPH07506192A JP H07506192 A JPH07506192 A JP H07506192A JP 6518272 A JP6518272 A JP 6518272A JP 51827294 A JP51827294 A JP 51827294A JP H07506192 A JPH07506192 A JP H07506192A
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 タンパク質構造決定のための組成物類および方法類発明の分野 本発明は、生体高分子類、特にタンパク質類の三次元構造の決定に関する。特に 、NMR分光分析によって、補乳類または昆虫細胞培養物中で発現されたタンパ ク質類の三次元構造決定のための新規組成物順および方法類に関する。
発明の背景 生体高分子、特にタンパク質類の三次元構造の決定には多年にわたり多大な関心 が寄せられてきた。いわゆる゛構造−機能”研究は、ある分子または分子属のど の構造特性が生体活性に重要であるかを決定する目的で、行われてきた。ノーペ ル賞授賞者であるペルッ(Perutz)および共同研究者らのヘモグロビン構 造に関する先駆的研究(Perutz、M、F、ら、ネイチャー(Nature l、 185,416−422.(19601)およびDNA構造に関するワト ソン(Watsor+)およびクリック(Crick )の先駆的研究(Wat son、J、D、、およびCr1ck、 F、11. 、 Nature、 1 71,737.(19531)以降、この分野〉、生物科学で特に重要となって いる。
さらに最近になって、”合理的薬物設計”という概念が生まれてきている。薬物 設計のためのこうした戦略では、タンパク質のようなある特定の生体分子の”活 性部分”の三次元構造の決定を必要とする。たとえば、生体分子は、受容体、酵 素、ホルモンまたはその他の生体活性分子であるかも知れない。活性部位の三次 元構造を知ることで、科学者は、分子の本来の生体活性を阻害し、模倣しまたは 亢進する分子類を設計できるようになる。(アベルト1Appelt、Klら、 J、Med、 Chew、 、 34.1925 f1991))。生体分子類 の三次元横道の決定は、従って、実用的かつ商業的にも極めて重要となっている 。
三次元構造決定のために最初に開発された技術は、X線結晶学である。ヘモグロ ビンおよびDNAの構造が、両者とも、この技術を用いて決定された。X線結晶 学は、調べる物質の1個の結晶をxwAビームで衝撃し、前記結晶中の配列され た分子類の原子類によってX線が屈折されることが必要となる。分散されたX線 は写真乾板に捕獲され、それを標準的手法によって現像する。以上のようにして 、分散X線は前記乾板上の1群のスポットとして描出され、このパターンから、 前記結晶中の分子類のrLaが決められる。より大きな分子類については、相差 によるあいまいさを排除するため、ルテニウムのような重イオンによって物質を 結晶化することも必要である。
さらに最近になって、もうひとつの技術である核磁気共鳴じNMR″)分光分析 が開発され、生体分子および特にタンパク質類の三次元構造か決定されている。
NMR分光分析は1950年代に最初に開発され、分子量1000ダルトン以下 のもののような小化合物類の構造解析の強力な手段に変化していった。簡単に述 べると、この技術では、(通常適切な溶媒中にある)物質を強力な磁場に配置し それを強度の高いラジオシグナルで照射することを必要とする。種々の原子類の 核は、前記の磁場によって自身を配列し、このラジオシグナルによって励起され るようになる。それらは、その後、このエネルギーを吸収し、i)核の種類およ びlL)核の化学的環境(主に結合によって決定される)に依存する周波数にお いてそれを再放射(共鳴)する。さらに、共鳴は、結合によってまたは三次元空 間を介してひとつの核から他の核に伝搬され、従って、特定の核およびその周辺 の核の環境についての情報を付与する。
しかし、全ての核がNMR活性であるとは限らないことを認識することが重要で ある。実際には、同一元素の全ての同位体類が活性であるとは限らない。たとえ ば、”通常の“水素である1HはNMR活性である一方で、重い水素(重水素) 7Hは活性ではない。従って、通常lH重水素含有するいかなる物質も、全ての IH重水素2日と置換することによって、水素NMRスペクトルにおいて”描出 不能”とすることができる。この理由のため、水溶性物質のNMRスペクトルは 、水シグナルを回避するため、H,O中ン容液としてめられる。
これとは逆に、”通常の”炭素であるltCはNMR不活性であるにもかかわら ず、天然の総炭素中に約1%で存在する安定同位体である”Cが活性である。同 様に、天然の総窒素中に同様に約1%で存在する安定同位体であるIsNが活性 であるにもかかわらず、”通常の”窒素である14NはNMR不活性である。小 分子類については、実験を十分量の物質類で十分な時間実行されれば、これらの 低レベルの天然の含量で必要な実験情報が十分にもたらされることが、見いださ れた。
ハードウェアおよびソフトウェアが進歩するに伴い、これらの技術によって解析 できる分子の大きさが小タンパク質の大きさである約10゜000グル1−ンに まで拡大された。したがって、NMR分光分析のタンパク質構造決定への適用は 、数年前に始まったばかりである。この大きさの限定は、タンパク質類中におい て、NMR不活性同位体類14Nおよび12CをNMR活性同位体類ISNおよ び13cで置換することによって、突破できることがすぐにわかった。この置換 を達成する方法は、これらの同位体類で標識された増殖培地中においてタンパク 質類産生可能な微生物類を増殖させることであった。
過去2年乃至3年にわたり、タンパク質類のl fi N lj識化および”c m識化によって、それぞれ、15kdおよび25kdにまで分析上の太きさの限 界が解消された。この同位体置換は、遺伝子工学によって形質転換され選択され たタンパク質を産生する細菌または酵母をItCおよび/または15N標識基質 類を含有する増殖培地中で増殖させることによって、達成された。実際には、こ れらの培地は、通常、”cPIA識グルコースおよび/または’ N 標識アン モニウム塩類からなる。(ケイ(Kay、 L、 lら、サイエンス1scie ncel、249,41]11990) )およびそれに記載の参考文献類。) 最近、標識タンパク質加水分解物類を含有する細菌および酵は栄養培地カ柚己載 されている。国際特許出願、公報番号WO90/15525.1990年12月 27日公表参考。
”Cおよび19 N F、脆化によって、こうした技術でこれまで可能であった ものに比べて実質的に大きいタンパク質類のNMR構造決定が可能とな−〕たが 、約25 k dよりも大きいタンパク質類では、あいまいな結果しか得られて いない。この大きさでは、各原子からの共鳴の多(があまり広くなりすぎ、分解 できない。最近の刊行物では、より大きな分子においで、三重標識化、すなわち 、重水素2Hならびに130およびIsNの部分的取り込みによって、そうでな ければ広くなる(スペクトル)線を有意に狭くできることが報告されている。( パックス1Baxl 、 J、 Am、 Chem。
Sac、 、+15:436911993)) 。三重標識培地は、したがって 、約25kdよりも大きいタンパク質類のNMR構造決定用標識形態を調製する のに好適である。細菌性タンパク質類については、H2Oおよび2H20の混合 物存在下において細菌を培養することによって、部分的2H標識化が達成できる 。この手法は、しかし、適切に標識された哨乳類タンパク質印の産生のためには 不十分である。
これまで、NMR構造決定のための組成物類および方法類は、重要な限界に直面 していた。構造機能研究で問題となるほとんどのタンパク質類は、由来が師乳類 である。さらに、合理的ヒト用薬物設計において問題となる実質的に全てのクン バク質類は、由来が哨乳類すなわちヒトである。しかし、X線結晶学またはNM R分光分析のいずれも、晴乳類細胞で産生されたタンパク質類の研究において広 い用途をこれまで有していなかった。X線結晶学は当然結晶物質を必要とするが 、′@乳類細胞タンパク質類は、その結晶化が恐ろしく難しい。今日までに抗体 類および哨乳類由来レセプター類で結晶学に適した形態で結晶化されたものは。
わずかしかない。結晶化されたものは、通常、ある分子の選択された断片であっ た。分子断片に由来する情報は、主要分子それ自体の部分の構造が全体の分子中 における前記分子のその部分の構造と同一であるかどうかが全(わからないので 、注意深く検討しなければならない。さらに、X線結晶学は、結晶物質が得られ ない多くの場合において、適用できない。
NMR横這研究は、これまで、標識タンパク質類を細菌または酵母中で発現させ る必要性によって限定されてきた。しかし、はとんどの哨乳類タンパク質類は、 細菌および酵母系では起こり得ない顕著な転写後改変を含んでいる。すなわち、 それらは、適切に折り畳まれジスルフィド橋によって架橋されており、オリゴヌ クレオチド側鎖結合物を有しているかも知れないしおよびタンパク質分解によっ て切断され活性形となっているかも知れない。細菌または酵母産生クンバク質類 は、哨乳類細胞産生タンパク質類の生体活性を有していないことが多い。実際に 、いくつかの例では、哨乳類タンパク質類は、細菌では全(産生できない。これ らの理由のため、1980年代半ばにおいて、バイオテクノロジー業界は、組織 プラスミノーゲン活性化因子、第■因子:C、エリスロボイエチン等のような治 療用組換えタンパク質類の産生のため細菌発現系から補乳類系へと移ってきた。
数種の晴乳類細胞タンパク質類の一部は、間四の分子の断片の遺伝子を細菌中に クローニングし、前記細菌を同位体標識培地中で増殖させることによって前記断 片を同位体標識形で発現させることによって、NMRによって研究されてきた。
また、問題の分子の細菌中で発現可能な部分のみがこれらの系における研究が可 能である(例 ドウリスコル(Driscoll、P、C,l ら、Natur e、353.Oct、24.1991参照)。細菌発現において固有の転写後改 変がないために、グリコジル化のような転写後改変がないままで前記の調べた分 子部分が産生され、得られた構造の価値に関して再度疑いが生じることになった 。X線結晶学についてと同様に、タンパク質断片から得られた構造情報の価値に ついて、その後、疑念が生じることになった。
哺乳類細胞および昆虫細胞の両者を用いた宿主−ベクター系が、開発された。チ ャイニーズ(Chinesel ハムスター卵巣(CHO)細胞類のような哺乳 類細胞株類、CO8細胞類および5podoptera frugiperda 細胞株5F9j;よび5F21(ラッコーfLuckow、 V、 A。
)およびサマーズfsummers、 IJ、 D暑、バイオテクノロジー(B iotechnologyl、 6.47−5511988))のような昆虫細 胞株類が、天然のタンパク質のそれらに類似の転写後改変を有する組換え哺乳類 タンパク質類を産生ずることが見いだされた。
哺乳類および昆虫細胞産生タンパク質類に関するNMR研究は、”Cまたは”3 Cおよび15Nの両者のような安定同位体類を細菌のそれと同様の方法で普遍的 に取り入れる手段が得られていないので、限られた価値しか有していない。細菌 はグルコースおよび塩類の単純な混合物で増殖できる一方、哺乳類および昆虫細 胞は、グルコースに加えて、増殖に必須のアミノ酸類全てを要求する。たとえば 、ILcおよび/またはISNで普遍的に標識されたタンパク質類を哺乳類細胞 からうまく産生するためには、これらのアミノ酸類全てが存在していなければな らず、かつ、全てが、13Cおよび/またはISNで普遍的に標識されていなけ ればならないであろう。
同位体標識培地を産生するためのひとつの理論的方法として、同位体標識タンパ ク質の単純な加水分解物を使用することが挙げられる。残念なことに、タンパク 質類の成分アミノvi類への加水分解によって、哺乳類細胞に有毒な副産物が同 時に形成されることにもなる。未精製加水分解物を使用すると、細胞が急激に死 滅することがわかった。さらに、従来の加水分解操作では、ある必須アミノ酸類 が破壊され、こうした破壊を防止するために使用可能な手段によって、有害な影 響が生じる。一方、個々のアミノ酸類の単離および精製のための技術が公知であ る。たとえば、レマスター(LeMasterlおよび共同研究者らは、′Hお よび”Nアミノ酸類の精製を記載した論文を公表している(Anal、Bioc hew+、、122,238+198211゜カラムクロマトグラフィ段階5段 階以上が必要であり、そtでもなお、これらの研究者らは、完全に標識されたシ スティンおよびグルタミンな単離できず、一方、トリプトファンの収率は、”誤 り”であった。これらのアミノ酸類の3種全てが、組換えタンパク質類の産生の ために宿主細胞として使用されるほとんどの哺乳類細胞および昆虫細胞の増殖に 必須である。さらに、本操作では、調製クロマトグラフィカラムからのアミノ酸 類の重要な溶出液としてピペリジンを利用していた。ピペリジンは、極めて有毒 な、管理対象物質であると報告されているこのように、個々のアミノ酸類の精製 のための操作は、複雑で、時間を要しかつ低収率であり、従って、経済的に見合 っていない。その結果、一部の13cおよび/またはlSNアミノ酸類は、少量 でその都度しか得られないことを除けば、商業的に入手可能であるとはいうもの の、はとんどは可能となっていない。
最近、フェンツク(Fesiklおよび共同研究者らは、NMR構造研究用補、 ?L類細胞からの同位体標識タンパク質類の産生のための方法を記載している。
(バイオケミス1−リー(Biochemistryl 、 31.第51巻、  12713. +1992))。これらの共同研究者らは、トリプタミンおよ びイミダゾール存在下において、同位体P!識1類および細菌タンパク質類をメ タンスルホン酸で加水分解した。後者の試薬類の目的は、アミノ酸類トリプトフ ァンおよびヒスデシンの破壊を減するための°゛自殺基地”として作用させるこ とにあった。その後、加水分解物をレマスターおよび共同研究者らが記載の操作 で精製した;すなわち、前記加水分解物をl]十形の陽イオン交換カラムにのせ 、1群として前記アミノ酸類をカラムからピペリジンによって溶出することによ って、精製した。前記アミノ酸含有分画をまとめ、蒸発乾燥させ、水に再ン容解 させ、水酸化ナトリウムでpHを115に調整し、生成した?8液をpHが一定 になり、”これ以上アンモニアまたはピペリジンが除去されないことが示唆され るようになるまで”、薄発させた。前記アミノ酸類をその後、分子量500のカ ッ1−オフ膜でろ過し、不純物をさらに除去し、凍結乾燥させた。著者らは、生 成したアミノ@類を直接使用したのか(すなわち、高pHで)または溶液のpH を中和しもしそうであればどの酸によって中和したのかを示唆していない。フェ ンツクらの研究は技術的進歩を示しているが、にもかかわらず、明確なN M  Relll成造のために有用な哺乳類細胞発現タンパク質類を普遍的にPA識す るための手段を提供していない。まず第1に、用いた加水分解条件で、アスパラ ギン、グルタミンおよびシスティン残基類が分解され、単に”+a量の”トリプ トファンを残したに過ぎない(12715頁、第1表)。第2に、本操作では、 上記にも述べたように有害で管理対象物質であるピペリジンを溶出液として使用 している。第3に、レマスターは、−自殺基地類の”ひとつであるイミダゾール が、アミノ酸ロイシンと同時に溶出されることを彼の原著で述べている。レマス ターは、ロイシンの結晶化によって前記イミダゾールを除去できた。フェンツク らはこのような結晶化段階を記載しておらず、このような段階は、実際には、個 々のアミノ酸類が分解されていないフェンツクらの操作では不可能であろう。
フェンツクらは、溶液のpHを11.5まで上げ、pHが一定になるまで前記4 液を加熱蒸発させることによるピペリジン溶出液の除去を記載している。このp Hにおいては、特にピペリジン(沸点106″C)除去に必要な高温において、 ピペリジンおよび/または水酸化ナトリウム(π合物によるアミノ酸類のラセミ 化および/または核的攻撃のリスクが生ずる。このような反応は、前記混合物中 における活性の(v i ab+e)アミノ酸類の量を減少させ、増殖培地とし てのその有効性を低下させることになるであろう。さらに、著者らが自身で認め ているように、執蒸発段階は、安定ig液pHが”これ以上アンモニアまたはピ ペリジンは除去されない”ことを示唆すると、停止される。したがって、得られ たアミノ@混合物が極めて毒性の高い物質であるピペリジンを微量、含有する可 能性がある。
しかし、アミノ酸類アスパラギン、グルタミンおよびシスティンが存在しないこ と、および”微量”しかトリプトファンが存在しないことは、極めて重要である (12715頁、第1表)。アスパラギン残基類が不足していることはフェンツ クらの研究した系では重要ではないことがわかっているが、グルタミンは、細胞 増殖に必須であることが見いだされた(12716頁、第2図)。著者らは、添 加物としてのグルタミン酸からグルタミンを酵素合成する方法を示している。し かし、この重要な反応のためには、適切に標識されたグルタミン酸源が入手可能 でなければならない。著者らが記載しているように、13C1IIN標識グルタ ミン酸は市販されている。しかし、たとえば、三重標識グルタミン酸は市阪され ていない。
対照的に、フェシックは、標識システィン調製の方法を示していない。安定同位 体でIff識されたシスティンは、!SN標識形でのみ市販されている。二重標 識”C115Nシステインまたは三重標識2H1IIc、IIINシスティンは これまで市販されていない。その結果、フエシックおよび共同研究者らが採用し た手法では、システィンおよびトリプトファン残基が適切に標識されないので、 単純なIIN標識化の場合を除いて、いがなる場合においても普遍的に標識され た産物を生成することはないであろう。さらに、細胞代謝によって、不所望の同 位体の同位体漏洩が正確に標識されていないシスティン残基からその他のアミノ 酸残基中−一起こることもあり得る。
原則的に、三重標識システィンを含む[識システィン産生の最も簡便な方法は、 適切な標識培地中でシスティン含量が高い生体を培養し、その生体のタンパク質 から前記システィンを単離することである。このような主体類は、当業者には公 知であり、Rhodopseudomonas 5peroidesおよびca psulataのような紫硫黄細菌類、Lepjothrix discoph oraおよび5chizophy l ] um communeのようなその 他のシスティン含量豊富な生体類、およびヒトインシ1リンA鎖を発現するよう に工学的に産′tされた大腸菌(E、coli)であるATCC31448のよ うなシスティン高含量のタンパク質を産生するように工学的に製造された細菌類 が挙げられる。
システィンは、次に、加水分解によってタンパク質から単離されるであろう。し かし、システィンを同時分解せずにタンパク質類を加水分解する唯一の公知の方 法は、1)アルカリ性条件下で加水分解すること(オクタl0kuda) 、  Pr、Acad、 Tokyo、 2.2779%、)およびil)酵素加水分 解である。残念ながら、これらの操作の両者ともに、標識された、および特に三 重標識されたシスティンの産主には不適切である。アルカリ性条件下における加 水分解は、必要なし一システィンのラセミ化を起こし、また、その他のいくつか の重要な同位体PAArミノ酸類の分解を起こし得る。酵素加水分解は、特にも し長期の加水分解が通常通り必要である場合、酵素分解産物による同位体夾雑物 のリスクを有している。
システィンの場合と同様に、フエシックらが用いた混合物中に存在する”装置の ”トリプトファンは、追加しないでは、細胞増殖に不十分であった(12715 頁、第1表、12716頁、第1図および第2図)。”N標識トリプトファンは 市販されているが 13C、+ 81tJまたは三重標識トリプトファンはいず れも入手可能でない。したがって、単純な1″N(り黒化の場合以外の全てのP A識実験のための添加物として導入された1−リブトファンは、適切な標識シス ティン残基がないことによる同一問題、すなわち、不完全な同位体標識に関連し た同一問題を生じることになるであろう。
したがって、フエシックおよび共同研究者らが示した方法は、IIIN標識タン パク質類の場合にのみタンパク質類の普遍的同位体標識化を生じるであろう。前 記方法は、確かにひとつの進歩ではあるが、先にも述べたように、1N標識アミ ノ酸類は既に市販されている。IsC,116N標識実験の場合、システィンお よびトリプトファン残基類は、普遍的には標識されないであろうが、一方、 2 H標識実験および三重標識実験の場合、システィン、l−リブl−ファンおよび グルタミン残基類が、不正確に標識されるであろう。
さらに、哨乳類細胞のための培養培地調製のためにタンパク質加水分解操作を用 いることのひとつの不利な点として、加水分解条件下では、出発タンパク質中に 存在するアミノ酸類、グルタミンおよびアスパラギンが、それぞれ、グルタミン 酸およびアスパラギン酸に変換されるがもじれないことが挙げられる。はとんど の補乳類細胞培地は、少量のグルタミン酸および実質量のグルタミンを含有して いる。これらの培地は、細胞生存性と産生の観点から、晴乳類細胞株の最適挙動 をもたらすために開発された。実際に、NMR分析上問題となるタンパク質類を 産生するほとんど全ての晴乳類細胞株が、低レベルのグルタミン酸および高レベ ルのグルタミンを含有する培地中で条件付けられた。
最大限可能な範囲の細胞株での使用に適用可能であるためには、したがって、晴 乳類細胞タンパク質類の同位体標識用培地は、低比率のグルクミン酸と高比率の グルタミンを含有しているのが有益である。同様に、培地は、好適には、はとん どまたは全くアスパラギン酸を含有しておらず、および高比率のアスパラギンを 含有している。
したがって、存在するその使のアミノ酸類の割合を変化させることなく、アミノ 酸類混合物からグルタミン酸および/またはアスパラギン酸を特異的に除去し、 このようにして単離されたグルタミン酸および/またはアスパラギン酸を適当に 標識されたグルタミンおよび/またはアスパラギンに変換し、前記アミノ酸混合 物にこのようにして得られたグルタミンおよび/またはアスパラギンを添加する 方法が必要とされているアミノ酸混合物からグルタミン酸を特異的に除去するた めの操作は全く当技術で記載されていない。グルタミン酸のグルタミンへの変換 のための酵素技術は、公表されている(フエシックら、Biochemistr y、 31(51+、+2713f19921 )。残念なことに、この反応は 遅< (3−4日)、付随する酵素の分解によって天然に高含量のアミノ酸類が 夾雑することになるのを除外できない。さらに、アミノ酸類の三重標識混合物類 の場合、すなわち、 ′Hで部分的に標識されかつ13cおよび18Nで普遍的 に標識されたものの場合、 ′H原子類の存在が、 2Hの同位体効果により、 2Hで標識されたグルタミン酸のグルタミンへの酵素変換をさらに遅速させる。
最後になるが、アスパラギン酸のアスパラギンへの変換のための酵素操作は、こ れまで当技術で記載されていない。
また、最近、ヒュft(sulおよびアーミタージ(Armitagelは、免 疫抑制剤サイクロスポリンがそのレセプターであるシクロフィリンに結合した構 造をNMRによって決定することに関して、論文を公表している(Bioche mist、ry、 31f511,12778f19921) 、これらの研究 者らは、細菌中で発現されたシクロフィリンをNMR不活性の同位体2Hで標識 した。彼らは、したがって、シクロフィリンからの信号に妨害されることな(サ イクロスポリンA/シクロフィリン複合体の構造を調べることができた。したが って、哨乳類リガンド/レセプター相互作用の重要性を考慮すtば、同様に、晴 乳類細胞タンパク質類、特にレセプター類が慴で普遍的に標識される必要が生じ る。これまで、この目的を達成するために標識された晴乳類栄養培地は得られて いない。
したがって、一般的な構造−機能の両者の研究および特に合理的な薬物設計のた め、哨乳類細胞タンパク質類、およびタンパク質複合体類の三次元構造を決定す るための普遍的に標識された組成物類および方法類が必要とされている。その結 果、ある範囲の安定同位体類で標識された普遍的に標識された形態の晴乳類細胞 タンパク質類を産生する必要が生じる。
発明の要約 本発明によれば、タンパク質の三次元構造情報を決定する方法は、(a)タンパ ク質産生条件下において、問題のタンパク質を産生可能な嗜乳顎または昆虫細胞 培養物をmi記細胞の増殖に必須である全てのアミン酸類を含有しかつ炭水化物 、必須無機物類および増殖因子類の吸収源を含有する栄養培地中で増殖させ、上 記栄養培地中の前記アミノ酸類およびタンパク質合成のために細胞が使用するそ の他全ての基質がNMR活性同位体によって実質的に同位体標識されていること を特徴とし、(b)前記標識タンパク質な実質的に標識された形態で栄養培地か ら単離すること、および(C)前記タンパク質をNMR分光分析に供し、その三 次元構造についての情報をめることが必要となる。
本発明のもうひとつの面では、タンパク質の三次元構造情報を決定する方法は、 (a)タンパク質産生条件下において、問題のタンパク質を産生可能な晴乳類ま たは昆虫細胞培養物を前記細胞株の増殖に必須である全てのアミノ酸類を含有し かつ炭水化物、必須無機物類および増殖因子類の吸収源を含有する栄養培地中で 増殖させ、上記栄養培地中の前記アミノ酸類および炭水化物源中の実質的に全て の炭素原子類がIIcであることを特徴とし、 (b)前記標識クンバク質を実 質的に標識された形態で栄養培地から単離すること、および(C)前記タンパク 質をNMR分光分析に供し、その三次元構造についての情報をめることを必要と する。
さらに本発明のもうひとつの面では、タンパク質の三次元構造情報を決定する方 法は、(a)タンパク質産生条件下において、問題のタンパク質を産生可能な補 乳類または昆虫細胞培養物を前記細胞株の増殖に必須である全てのアミノ酸類を 含有しかつ炭水化物、必須無機物類および増殖因子類の吸収源を含有する栄養培 地中で増殖させ、上記栄養培地中における前記アミノ酸類および炭水化物源中の 実質的に全ての炭素原子類が13cでありかつ上記栄養培地中のアミノ酸類の窒 素原子類の実質的に全てがIsNであることを特徴とし、(b)前記標識タンパ ク質を実質的にlj識された形態で栄II培地から単離すること、および(C) 前記クンバク質をNMR分光分析に供し、その三次元構造についての情報をめる ことを必要とする。
さらに別の面では、本発明は、第2分子と複合体となっている第1分子の三次元 構造情報を決定することに関し、前記分子類の少なくともひとつがタンパク質で あることを特徴とする。前記操作は、第1分子を安定NMR活性同位体で実質的 にfi識することおよび第2分子を重水素で実質的に標識すること、前記第1分 子と第2分子の間で複合体を形成すること、および、前記複合体をNMR分光分 析に供し、第1分子の三次元構造についての情報をめることを必要とする。
本発明のもうひとつの面は、晴乳類または昆虫細胞培養物の増殖を支持可能な新 規栄養培地に関連し、前記培地は、前記細胞の増殖に必須である全てのアミノ酸 類を含有しかつ炭水化物吸収源、必須無機物類および増殖因子類を含有し、上記 栄養培地中における前記アミノ酸類およびタンパク質合成のために細胞が使用す るその他全ての基質が、”Cによって、または、”CおよびlI+Nの両者によ って実質的に標識されていることを特徴とする。
さらにもうひとつの態様では、本発明は、実質的に完全に同位体標識された形態 のアミノ酸類混合物を産生ずる方法に関し、前記方法は、(a)タンパク質生合 成において基質として利用される実質的に全ての炭素が130である栄養培地中 において、微生物培養物を増殖させること:(b)前記微生物培養物からタンパ ク質分画を回収すること; (C)前記タンパク質を酸性、非酸化条件下でスル フヒドリル還元剤の存在下で加水分解し、アミノ酸粗混合物を産生すること;  (d)前記アミノ酸粗混合物を陽イオン交換クロマトグラフィに供し、部分的に 精製されたアミノ酸混合物を得ること; (e)前記部分的に精製されたアミノ 酸混合物を陰イオン交換クロマトグラフィに供し、精製されたアミノ酸混合物を 得ること:および(f)前記精製されたアミノ酸混合物に、晴乳類または昆虫細 胞によるタンパク質産生を支持するために十分な量の”cm識システィンを添加 することからなる。先の方法は、また、”C1l S N二重標識アミノ酸類ま たは2H,+3(:、”N三重標識アミノ酸類を産生ずるため、または、 ′1 ]標識アミノ酸類の混合物を産生ずるために、用いることができる。
本発明は、さらに、それぞれ、グルタミン酸およびアスパラギン酸をグルタミン およびアスパラギンに変換する方法を提供し、低レベルのグルタミン酸を含有し かつグルタミンを添加された同位体標識晴乳類細胞培地および適宜低レベルのア スパラギン酸を含有するかまたは全(含有せずかつアスパラギンを添加された培 養培地を提供する。特に、本発明は、本文に記載の方法によって産生されたアミ ノ酸類混合物から特異的にグルタミン酸を除去すること、および、前記グルタミ ン酸をグルタミンに変換する方法を提供する。アスパラギンは、同一操作を用い て、アスパラギン酸から化学的に合成できる。本操作の有効性は、 ′Hを含む 同位体標識形類の存在によって影響されない。
本発明は、さらに、標識されたポリペプチド類及びアミノ酸混合物類から同位体 標識されたシスティンを単離する方法を示している。この方法は、 ′H1l  3 C、l S Nのいかなる組み合わせで標識されたシスティンを産生するた めにも使用できる。上記標識システィンを添加されたアミノ酸混合物類も、また 、記載されている。
発明の説明 本発明は、補乳類または昆虫細胞産生タンパク質類についての三次元構造情報を 決定する手段を提供する。組換えDNAのための宿主として使用される晴乳類ま たは昆虫細胞は、天然の三次元構造に類似のまたは等価の形態の複合クンバク質 類を産生可能であるので、本発明は、生体活性タンパク質類の構造−機能関係の 研究のために貴重な技術を提供する。本操作では、アミノ酸類の全てが1個以上 のNMR活性同位体類で実質的に完全に標識されている栄養培地中におけるD南 乳類細胞株の増殖を含んでいる。本発明によって、IscまたはIsNまたは両 者によるタンパク質類の普遍的標識化および2H1IIcおよびll′Nによる 三重標識化が可能となる。本発明は、さらに、タンパク質類をNMRで描出でき ないようにするために、 ”H単独によるタンパク質類の普遍的標識化を提供す る。後者の技術は、特に、たとえば、ホルモンーレセプター複合体類のような複 合体中における分子についての構造情報を得るために有用である。結合対のひと つなNMR描出不可とすることによって、その他の結合対の構造は1個以上のN MR活性同位体類で標識され、研究可能となる。
本発明の晴乳類細胞株栄養培地は、微生物由来の同位体標識アミノ酸類を含有し ている。晴乳類および昆虫細胞のための合成栄養培地は周知である。これらの細 胞の増殖要件は十分にわかっており、炭水化物、必須無機物類および増殖因子の 吸収源を含有する合成培地は市販されている。これらの培地のいくつかは、さら に、微量のピルビン酸を含有している。この種の培地を所望である際には、適当 に標識された形態でピルビン酸を添加することが有効である。ピルビン酸の同位 体標識形は市販されている。血清を全く含まない合成培地は、市販されている。
血清を全く含まない培地は、NMR分析のために実質的に純粋な標識クンバク質 の回収を促進するために1本発明の実施において好適である。血清を含まない晴 乳類または昆虫細胞培地からの前記標識タンパク質の精製は、さまざまな公知の 技術のいかなるものによっても、達成できる。(ドイツチャー (Deut、5 cher、 M、 P、 l、Guide to Protein Purif ication Methods in Enzymology 、第182巻 (1990)参照。)タンパク質類の普遍的標識化は、必須アミノ酸類および標 識された形態のタンパク質合成のために細胞が使用するその信金ての基質を添加 することによって、達成される。本文で使用したように、タンパク質合成には、 糖タンパク質類の場合炭水化物側鎖の生合成も含まれる。
本発明は、アミノ酸類混合物を産生ずる簡便な手段を提供する。大量の[2培地 がNMR解析のためにタンパク質を十分量産生するため必要となることを考膚す れば、それは実施が容易で、使用者に有害でなく、しかも容易にスケール調整が 可能であり、このことは重要である。
標識アミノ酸混合物産生の方法は、化合物の1属としてのアミノ#!類が陽電荷 および陰電荷の両者を帯びることができるという事実に依存している。それらは 、従って、酸性および塩基性イオン交換樹脂への吸収およびそれからの溶出によ って、中性化合物類から、および、陽電荷のみまたは陰電荷のみを有する化合物 類から、111):として分離できる。
本文で使用したように、タンパク質が”実質的に標識されている”またはある分 子中の特定元素の”実質的に全ての”原子が一定の同位体形態であるということ は、前記分子の所望の同位体含量が十分に高くなっており、有意義なNMRスペ クトル情報が得ることができることを意味している。′3C1および+5Nのよ うなNMR活性活性同位体温合、添加の程度は、三次元構造がNMRスペクトル から推定できるような程度となるであろう。一般に、一定元素の原子の約95% 以上が所望の同位体形状となっているであろうし、好適には、約98%を越えて いる。
2日単独による添加の場合、添加の程度は、標識分子が、それに複合体となった NMR活性種の解析を妨害する程のNMR信号を産生じない程度となろう。この 場合、添加の程度は、約70%よりも高く、約95%を越えることが特に好適で ある。
これとは別に、2F1添加の程度は、 ’H,”Cおよび”NのNMR活性核種 からの信号が増強されるがまたはその分解が向上するような程度である。通常、 このレベルの添加は、約20%から約100%の範囲であろう。
アミノ酸混合物出発物質は、選択した安定同位体類で標識されたタンパク質加水 分解物である。本発明によれば、出発タンパク質はt ”cによって、13cお よび18Nの両者によって、12 c、 l II Nによっておよび少なくと も部分的に2Hによって、または2H単独によって実質的に標識されている。多 くの技術がこうしたクンバク質類の産生のために公表されており、標識炭水化物 および塩類の存在下における細菌の増殖(ケイら、同上)、藻類溶解物中におけ る細菌の増殖(チャフfchubb、 R,T−1ら、 Biochemist ry、30,7718f19911) 、 a類溶解物中における酵母の増殖( バワーズfPowers、 R,l ら、 Biochemistry、 31 ,4334(19921) 、標識メタノール中における細菌および酵母の増殖 (モート(Moat、A、G、lおよびフォスターfFoster、J、W、l  、 Microbial Physiology 、第2版、John Ni 1ey&5ons、 New York(19881,218頁)および同位体 !識11co□および/または15N塩類の存在下における藻類の光栄養性培養 (コックスfcox、、J、lら、 5table l5otopes in  Pediatric Nutritional and Metabolic  Re5earch 、チャツプマンfchapman、 T、 Ejら編著、イ ンターセプト・リミテッド(Intercept Ltd、l、 Andove r House、 Engla而(1950+ 、 165頁)が含まれる。同 様に、タンパク質類の加水分解についての多(の操作が公表されており、塩酸に よる加水分解、メタンスルホン酸による加水分解(レマスターら、同上)および 酵素加水分解が挙げられる。もし酵素加水分解をその際用いると、加水分解物の 酸性化に好都合である。これは、酵素を変性させかっ?、を澱させるという利点 を有し、その後、遠心分離によって、加水分解物から除去できる。
本方法においては、酸加水分解が好適である。酸加水分解は、塩酸、鎖酸または 硫酸のような強鉱酸またはp−1−ルエンスルホン酸またはメタンスルホン酸の ようなスルホン酸を用いて実施するのが有益であり、後者が好適である。酸濃度 は、タンパク質基質の性質に応じて変化するが、通常、完全な加水分解を実施す るのに十分である。典型的には、酸濃度は、約INから約6Nまでの範囲にあり 、好適には、約2Nから約4Nまでの範囲にある。酸加水分解は、非酸化条件下 で実施される。これらの条件は、反応をインバキュオで実施するかまたは窒素、 アルゴン等のような不活性ガスでパージすることによって、達成できる。
加水分解されるタンパク質は、約0.5g/10m1および5g/10m1の間 の濃度で、好適には約1g/10m1から2.3g/10m1の濃度で加水分解 培地に添加できる。
加水分解は、ラセミ化または不安定なアミノ酸類の損失を最小としつつ、実質的 に完全な加水分解を実施するために十分な温度および時間で実施される。加水分 解温度は、通常、約90’Cから140″′Cの範囲であるが、しかし、アミノ 酸類のラセミ化を最小とするため、好適には100乃至115°Cの範囲にある のが好適であり、特に100″Cを好適とする。加水分解時間は、加水分解され るタンパク質に応じて、24乃至72時間の範囲である。約48時間の加水分解 時間が、好適に用いられる。
酸化による分解を受けるアミノ酸類は、さらに、還元剤の存在によって保護され る。好適には、チオグリコール酸のような強スルフヒドリル含有還元剤が用いら れる(ファスマンiFasman、G、D、1編著、 PracticalHa nrlbook of Biochemistry and Mo1ecula r Biology、CRC,New York(19W9 1、106頁)。還元剤の目的は、攻撃され易いトリプトファンおよびヒスチジ ン残基類を保護することだけにあるのではない。もしチオグリコール酸が用いら れると、本発明の操作に従って、それは容易にその後除去できる。
還元剤は、加水分解混合物中でトリプトファンおよびヒスチジンの実質的分解を 防止するために十分な濃度で用いられる。チオグリコール酸の場合、上記濃度は 通常、約1乃至約7%v / vの範囲であり、好適には約3乃至約5%v /  vの範囲である。
加水分解物は、陽イオン交換樹脂のカラムに添加される。陽イオン交換樹脂は、 好適には酸形態である。原則として、樹脂のいかなる酸形態も用いられるが、樹 脂がト1+のような単純な酸、ピリジニウム、メチルアンモニウム等の形態であ るのが好都合である。この方法で使用される陽イオン交換樹脂は、ミシガン州、 ミツドランドf14idlandl ダウ・ケミカルlDow Chemica l1社から布板されているDowex 50X8−400が挙げられる。加水分 解物を前記樹脂に添加した後、中性および酸性夾雑物を、樹脂を酸性溶液で洗浄 することによって除去する。原則として、いかなる酸も使用でき、塩酸、硫酸等 のような単純な鉱酸が好都合に用いられる。酸性溶液は、はとんどの酸性アミノ 酸類のpKa以下のpHを有しているが、実質的ラセミ化を起こす程低くはない 。通常、前記pHは、約1乃至約2の範囲にあり、好適には約2である。酸性溶 液の容量は、実質的に全ての材料及び酸性夾雑物類を除去するために十分な量で ある。約2−6ベツドボリユームによる溶出で、通常、十分である。
酸溶液は、その後、前記樹脂から、樹脂カラムを水で洗浄することによって、除 去される。夾雑物の除去を確実とするため、使用した水の容量は、好適には、2 −6ベツドボリユームの範囲にある。
酸を水洗浄で除去した後、陽イオン交換樹脂に付着したアミノ酸類および塩基性 物質類は、塩基性?8液によって溶出する。原則として、いかなる塩基性溶液も 使用できるが、水酸化ナトリウム、水酸化カリウムまたは一般式NRIR2R3 (式中、R1、R2およびR3は、それぞれ、独立して、水素、またはCl−C 4アルキルまたはアルケニル群である)の窒素性塩基のような単純な塩基が使用 できる。このような窒素性塩基類の例として、アンモニア水、メチルアミン水溶 液、トリエチルアミン水溶液等が挙げられる。前記塩基性媒体は、結合したアミ ノ酸類および塩基性化合物類を同時に溶出することによって、酸性陽イオン交換 樹脂を中和する。塩基性媒体のpHは、アミノ[iのアミノ基類が中性で一方ア ミノ酸類のカルボキシル官能基が陰電荷を帯びているようなものである。塩基性 媒体のpHは、好適には、約lOよりも大きい。余り強い塩基性条件下における 前記アミノ酸類のラセミ化を防止するため、前記pl(は、約13未満であるの が有益であり、好適には約10−11の範囲である。塩基性媒体は、結合したア ミノ酸類および塩基性化合物類を同時溶出することによ−〕で、前記酸性陽イオ ン交換樹脂を中和する前記アミノ酸混合物は、さらに、陰イオン交換クロマトグ ラフィによって精製できる。前記陽イオン交換カラムからの溶離液を塩基性形態 の陰イオン交換樹脂カラムに添加する。原則として、前記樹脂のいかなる塩基性 形態も使用でき、好適には、水酸化物のような単純な塩基形態が使用される。適 切な陰イオン交換樹脂として、ミシガン州、ミ・ンドランドのダウ・ケミカル社 から市販されているDowex 1X8−100が挙げられる。前記アミノ酸類 を前記塩基性イオン交換樹脂に吸収させるが、その理由として、それらのアミン 基類がここで全く陽電荷を有しでいない一方で、それらのカルボキシル官能基が ここで陰電荷を帯びていることが挙げられる。
前記塩基性および中性夾雑物類を、樹脂を塩基性溶液で洗浄することによって除 去する。この段階で使用される塩基性溶液は、陽イオン交換カラムからのアミノ 酸類の溶出について記載された塩基性溶液のいかなるものであってもよい。
前記塩基性媒体は、水による溶出によって、陰イオン交換カラムから除去される 。樹脂に結合したアミノ酸類と接触したまま塩基性媒体を全く残さないのが好適 であり、従って、約2−8ベツドボリユーム、好適には少なくとも約4ベツドボ リユームの水を用いてカラムを洗浄する。
前記アミノr!1類は、酸によって前記塩基性陰イオン交換樹脂から溶出される 。原則として、いかなる酸溶液も使用できるが、好適には、その後の蒸発によっ て除去できる弱い揮発性の酸の溶液が使用される。したがって、ギ酸または酢酸 のいずれかが好適である。使用した酸の濃度は、酸性?8浦のpHが約2−6の 範囲、好適には約3−5の範囲にある。
精製されたアミノ酸類は、従って、前記カラムからオフホワイトの溶液どして溶 出される。さらに本発明の利点として、アスパラギン酸が他のアミノ酸類全ての 後に溶出されることが挙げられる。たとえば、アスパラギン酸を除(全てのアミ ノ酸類が、前記カラムから0.25%V / V酢酸水溶液によって溶出できる 。その後、アスパラギン酸をカラムから、2,5%v / v酢酸水?8 il Mによって溶出する。したがって、さらに本発明の面として、アミノ酸であるア スパラギン酸の簡便な精製法が挙げられる。下記にも述べるように、標識された 形態となっているこのアスパラギン酸を標識されたアスパラギンに変換し、次に 、それを用いて、標識アミノ酸類の混合物にさらに添加する。当業者であれば、 上記溶出操作がいわゆる”段階−勾配”溶出であることがわかるであろう。さら に、溶出酸の濃度の直線勾配またはこれとは別に対数勾配も使用できることがわ かるであろう。このような勾配類は、使用した勾配に応じて、アミノ酸類の混合 物としてまたは単独のアミノ酸類としてのいずれかで、アミノ酸類を順次溶出す ることになるであろう。本発明のさらに別の面は、従って、単独でまたは混合物 としてのいずれかでアミノ酸類を精製するのための簡便な操作となる。本発明の もうひとつの面は、このように単離されたアミノU類を用いてアミノ酸混合物全 体のアミノ酸プロフィールを変化させることができることにある。さらに本発明 の別の面は、アミノ酸混合物全体をこのように一定の細胞株の要件に合うよう調 整することにある。
単離されたアミノ酸類を次に減圧下における蒸発および凍結乾燥のよりなt↑準 的手法によって、分離できる。さらに本発明の別の面は、使用した酸が極めて揮 発性であるので、前記アミノ酸類が実質的に純粋な形態でl1ilされるであろ うということである。
さらに本発明の1声、として、1種のアミノ酸であるアルギニンが他の全てより もはるかに塩基性であるという事実に関連している。したがって、それは、他の アミノ酸類の後および全ての夾雑物類の後、陽イオン交換カラムから最後に溶出 されるであろう。10−12の範囲のpHにおける溶出に際して、アルギニンは 全く正味の電荷を有していないであろう。このことは、10−12の範囲のpH で陽電荷を有しておりかつカルボキシル官能基の陰電荷を中和する極めて塩基性 のグアニジニウム側鎖の存在によるのであろう。したがって、アルギニンは、他 の全てのアミノ酸類と異なり、全ての夾雑物の後陽イオン交換樹脂を通過し、そ の後単離され、かつ、たとえば標準的手法によって塩酸塩として結晶化される( コックスICox、G、J、)、 j、Biol、chem、、78,475( 19281)、さらに本発明の別の面は、従って、アミノ酸アルギニンの簡便な 精製法である当業者であれば、本発明は、特にもしスルフヒドリル含有還元剤を 加水分解段階に使用すれば、出発加水分解物中におけるのと同一比率で各アミノ 酸収率をほとんどまたは全(変動させることなく、純粋なアミノ酸類の混合物を 生ずるであろう。本発明のもうひとつの面は、出発クンバク質中におけるのと同 一割合で純粋なアミノ酸類の混合物を調製する簡便な手段である。アミノ酸類の 割合は、従って、適切な出発タンパク質またはクンバク1X類混合物を選択する ことによって、制御できる。これとは別に、本発明に従って調製したアミノ酸類 混合物は、商業的に入手可能であるかまたは合成可能であるアミノ酸またはアミ ノ酸類を添加することによって、補充できる。
たとえば、システィンは晴乳類細胞培地中において重要なアミノ酸であるが、し かし、はとんどの細菌、酵母または藻類タンパク質中においては、晴れ類または 昆虫細胞における晴乳類タンパク質生合成を支持するほど十分に高い1度では存 在していない。
システィン合成の酵素的操作は、公知である。たとえば、本文で参考として引用 したミャハラ(Miyaharalらの米国特許第4,733,011号は、硫 化水素との酵素反応によってL−セリンからL−システィンを調製する方法を開 示している。本文で参考として引用したイシワタ(Ishiwatalらの米国 特許第4.782,021号は、セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼ存 在下におけるリシンとホルムアルデヒドの反応によるL−セリンの産生を記載し ている。13cmシスティンおよび13C1IIIN−システィンを含む同位体 標識システィンは、市販の基質類を使用しそれらの操作によって調製できる。
上記に記載の同位体標識システィンの酵素的調製方法は、適切にm識された三重 標識出発物質類が入手できないために、三重F識2H1+10、IN−システィ ンの産主には不利である。もしこのような基質類が入手できたにしても、酵素変 換動態が重水素によって悪影響を受けるであろう。したがって、さらに本発明の 態様は、三重[iシスティンを含む同位体標識システィン、および、このような 同位体標識システィンを含有するアミノ酸混合物を調製する新規方法に関連して いる。
この方法において、三重標識システィンを含む同位体標識システィンは、適切に 標識されたシスティン含有タンパク質の酸加水分解によって産生される。システ ィンは、酸加水分解条件下において、不安定であることが公知であるので 従っ て、前記方法は、i)タンパク質加水分解時においてシスティンを保護し。
ii)前記保護されたシスティンを分離し、および、1ii)標識されたシステ ィンを脱保護しかつ単離するための手段を含んでいる。
チオール基のS−ペンチルエーテル類としての化学的保護は、以前から公知であ る。(総説については、グリーン(Green、T、lおよびワッッ(Watz 、 P、 G、 ) 、 Protective Group Chemist ry、第二版、John Wiley & 5onsB New York(199115照。)実際に、システィン残基類は、通常、ペ プチド類の化学的合成時においてS−ペンチル基によって保護される。しかし、 このような保護された化合物類は、それほど酸に安定ではなく、また、タンパク 質加水分解に使用した条件によって分解される。
前記チオール基は、式 (式中、R1は、単独またはタンパク質分子の一部としてのシスティン残基であ り、および、R2−R6の少なくともひとつは、カルボキシ。
C1−C4カルボキシアルキルまたはC1−C4カルボキシアルコキシ)中にお ける荷電した酸または塩基性基の存在が酸性培地中におけるべのような酸性基で あるかまたはC2−C4ジアルキルアミノ、C3−C6ジアルキルアミノアルキ ルまたはC3−C6ジアルキルアミノアルコキシのような塩基性基であり、およ び残りのR2−R6基は、単独または共に、水素、ハロゲン、C1−C6アルキ ルまたはC1−C6アルコキシである)の荷電ペンチルチオエーテルとして保護 された際にタンパク質類の加水分解が可能な強、高温酸性培地中において安定で あることが見いだされた。好適には、R6は、カルボキシ、カルボキシメチルま たはカルボキシメトキシのような酸性基、またはジメチルアミノ、ジメチルアミ ノメチル、またはジメチルアミノメトキシのような塩基性基であり、残りの基類 R2−R5は、単独または共に、水素、ハロゲン、C1−C6アルキルまたはC l −C6アルコキシのいずれかである。
化合物(1)は、システィンチオール(II)をへロベンチル化合物(jll  )によって処理し、高収率で調製できる。
(式中、Xは、好適にはクロロまたはブロモであるハロゲンであり、およびR2 −R6は、塩基性媒体中において上記で定義したとおりであり、希アンモニアま たは水酸化ナトリウム水溶液である。)出発物質チオールが高温酸性条件下にお いて保護されるように、(Iできる。同位体標識システィンの調製のため、希ア ンモニア水または水ンチルチオールの安定性を増強し、また、溶解度差、イオン 交換クロマトグラフィ等の手段によって他の分子種から保護された分子を分離す る基盤を提供する。
前記チオール誘導体(I)は、たとえば、液体アンモニアまたはエタノール中の ナトリウムのようなアルカリ金属による処理のような公知の技術によって、出発 物質チオールに再変換できる。
本発明の好適な面において、システィン(11)は、酸性p−カルボキシペンチ ルチオエーテル(IV)として保護される。
(式中、RおよびRoは、反応の出発物質が遊離のシスティンである時それぞれ 水素であるか、または、RおよびRoは、出発物質がポリペプチドである時前記 ポリペプチド中における隣接するアミノ酸残基類を示している。) 化合物(IV)は、遊離アミノ酸としてまたはポリペプチド中のペプチド残基と してのいずれかとしてのシスティン(II)を希アンモニア水または水酸化ナト リウム水溶液のような中等度の塩基性媒体中においてp−クロロメチル安恩香酸 によって処理することによって、高収率で調製酸化ナトリウム水溶液の存在下で 、チオールエーテル形成条汗↑で(111)によって適切に同位体標識されたタ ンパク質を処理する。適切なタンパク質類は当業者に周知であるが、Rhodo pseudomonassperoidesおよびcapsulataのような 紫硫黄細菌類、Leptothrix discophoraおよびSch i  zophy l l um communeのようなその他のシスティン含量 豊富な主体類、およびヒトインシュリンA鎖を発現するように工学的に産生され た大腸菌(E、coli)であるATCC3144Bのようなシスティン高含型 のタンパク質を産生するように工学的に製造された細菌類由来のものが好適であ る。前記生体類は、適切に標識された培地中において増殖されている。
システィン誘導体(IV)は、高温1強酸培地中において安定であり、一方、酸 および中性培地中において室温における溶解性が劣る。化合物(1v)は、その 結果、タンパク質加水分解物中におけるその他のアミノ酸印から、たとえば、ろ 過によってまたは冷却加水分解物の遠心分離によって、容易に分離される。対照 的に、システィン誘導体(IV)は、たとえばエタノール性アンモニアのような 塩基性有1m溶媒中において極めて溶解性であり、従って、エタノール性アンモ ニア水のような溶媒類によって塩基性有機抽出によってタンパク質加水分解のそ の他の成分類から分離できる。
これとは別に、システィン誘導体(IV)は、上記に述べたアミノ酸精製プロセ スのバリエーションによってタンパク質加水分解物から単離できる。前記タンパ ク質加水分解物は、H十形態でイオン交換樹脂上に吸収され、夾雑物は、酸によ る溶出によって除去される。システィン誘導体(IVIを含む加水分解物のアミ ノ酸類は、H+レジンから溶出され、アンモニアによる溶出によってOH−レジ ン上に溶出される。水洗浄後、前記アミノ酸類をOH−レジンから希酢酸による 溶出によって溶出させる。しかし、システィン誘導体(IV)は、安息香酸側鎖 の存在により他のアミノu類よりも酸性がより強く、その結果、アスパラギン酸 を含むその地金てのアミノ酸類よりも後で溶出される。システィン誘導体(IV )は、その後、適切な分画な乾燥させるかまたはH+レジン上での濃縮およびそ の後の希アンモニアによる溶出および適切な分画の蒸発によって、単離される。
システィン誘導体(IV)は、液体アンモニアまたはエタノール中のナトリウム のようなアルカリ金属による処理のような標準的技術によって、システィン(I +1に再変換できる。
システィンは、非標識、単独朋に重標識または三重標識形態で上記操作によって 産生できる。システィン含有タンパク質出発物質の所望の同位体組成は、前記ダ ンバク質産主に使用した栄養培地の組成を制御することによって、制御可能であ る。
当業者であれば、晴乳類細胞培地がアミノ酸類およびグルコースに加λて、ビタ ミン類、脂肪酸類、必須無機物類および成長因子類のようなflJの化合物類を 含有していることがわかるであろう。本発明のもうひとつの面は、本発明によっ て産生された純粋な標識されたアミノ酸類混合物類がある細胞株のために調製さ れた成長因子類のいかなる混合物にも添加でき、それによって、全ての補乳類ま たは昆虫細胞株のための同位体は識培地を産生することである。同位体標識アミ ノ酸類に加えて。
タンパク質合成のために細胞が利用するその他の基質類は、F識された形態で提 供できる。たとえば、グルコースのような炭水化物は +10−(翠識形態およ び/または重水素化された形態で提供できる。
さらに、当業者であれば、タンパク質加水分解操作がアミノ酸類アスパラギンお よびグルタミンを分解し、同時に、それぞれ、酸性アミノ酸類であるアスパラギ ン酸およびグルタミン酸を形成することがわかるであろう。はとんどの補乳類細 胞培地は、大量のグルタミンを含有している1本発明によって産生されたアミノ 酸類の混合物へのグルタミンの添加は、予想に反して、ある晴乳類細胞の成長速 度または組換えタンパク質生産性の最適化には必要ではない。しかし、グルタミ ン添加は、い(つかの晴れ類および昆虫細胞株の最適挙動を得る際に重要である ことが見いだされた。本発明のさらにもうひとつの面は、本発明によって産生さ れたアミノ酸類混合物が培地を使用することになる特定細胞株の特性に応じて、 グルタミンを添加しても添加しなくてもよいことである。本文に記載の好適な条 件を用いると、検出可能なラセミ化が全く起こらないことが見いだされた。
グルタミン酸がさらにクロマトグラフィ段階によってアミノ酸混合物から都合よ く分離でき、その後、化学的または酵素的操作によってグルタミンに変換できる ことが見いだされた。このようにして産生されたグルタミンをその後用いて、必 要に応じてアミノ酸混合物に添加できる。
中性pHにおいて、アミノ酸混合物中のグルタミン酸残基類のみが、2個のカル ボキシ基および1個のアミノ官能基の存在により、正味の陰電荷を有しているで あろう。その他のアミノ酸類は全て、全体としての荷電を全く有していないか( 例 グリシン)または中性pHにおいて正味の陽1ii荷を有している(例 リ シン)。
したがって、グルタミン酸は、渚出酸を除去した後、たとえば、凍結乾燥によっ て、1itiac!混合物を弱酸で調製した陰イオン交換樹脂に流すことによっ て、前記アミノ酸混合物から特異的に分離できる。原則として、全ての弱酸が適 しているが、しかし、好適には、陰イオン交換樹脂は酢酸またはギ酸形態である 。
グルタミン酸は、その正味の陰電荷の故に、前記陰イオン交換樹脂に付着するで あろうが、一方、中性または陽性荷電アミノ酸類は通過してしまう。アミノ酸類 を樹脂から溶出し、樹脂を水で洗浄し前記グルタミン酸を適切な酸の溶液によっ てカラムから溶出できる。このように単離されたグルタミン酸を減圧下の蒸発ま たは凍結乾燥のような標準的技術によって回収できる。
その後、グルタミン酸を、フエシックらによって記載された酵素的操作のような 公知の操作によってグルタミンに変換できる。しかし、上記にも示したように、 酵素的操作は、重水素化および三重標識基質類には不利である。これとは別に、 本発明によれば、スキーム1に概略を示した新規化学的操作を使用できる。
スキーム■ (Vl1 (VH) (VIIl) (IXI (X) 前記グルタミン酸は、最初にそのアミン官能基を保護され(IV)を生成する。
多くの適切な保護基が当業者に公知であり、Fmoe、t−BOC等が含まれる 。
前記のN−保護グルタミン酸は、その後、環化され、オキサゾリジノン(■)を 生成する。この変換のための技術は当業者に公知であり、たとえば、イトウfl tohl (CIlen+、Pharm、Bull、17.1679.1969  ) ?照。イトウの参考文献では、1−ルエンスルホン酸のような触媒量の強 酸の存在下でトリオキサンで化合物(Vl)を処理し、公知の技術によって単離 できる(■)を産生する。(VlのiHIのカルボン酸基は、その後ジシクロへ キシルカルボジイミド、ジイソプロピルカルボジイミド、n−ブロモスクシンイ ミド等のような適切な活性化剤によって活性化される。当業者には、さらに、活 性化剤が公知であろう。
前記活性化されたオキサゾリジノンを、その後、アンモニアガスで処理し、環状 アミド誘導体(■)を生成する。”N−$1識グルタミンを調製する時、アンモ ニアも15Nで標識する必要がある。全ての18N物質類と同様に、1N−アン モニアは高価である。さらに、ガスであるので、それは、正確に制御し測定する のが困難である。したがって、好適には、15N−アンモニアガスは、1′N− 塩化アンモニウム、+iN−硫酸アンモニウム等のような1 ′5N塩類の溶液 を別のフラスコ中で塩基で処理し、発生したアンモニアを活性化オキサゾリジノ ンの溶液中に通気することによって、製造される。適切な溶媒として、ジメチル スルホキシドおよびジメチルホルムアミドのような極性、非プロトン性溶媒類が 挙げられるが、一方、適切な塩基類として、テトラメチルグアニジンおよび水酸 化ナトリウムのような強または中等度の強混和性塩基類が挙げられる。
環状アミド誘導体(■)を次に適切な溶媒中の弱い水性塩基によって加水分解し 、N−保護グルタミン誘導体(IX)が生成する。多くのこのような塩基類が入 手可能であるが、使用した塩基は、簡便なため、エタノール水溶液中の水酸化ナ トリウムのような単純なアルカリである。アミド官能基の同時加水分解を最小と するため、塩基の1−5当量のみを最も好適な1−2当量とともに用いるのが好 適である。
生成したN−保護グルタミンは、その後、使用した保護基に応じて公知の操作に よって脱保護される。(グリーンら、同上。)グルタミン(X)を、たとえば、 結晶化または減圧下における蒸発によって単離でき、たとえば、公知のクロマト グラフィ操作によって精製できる。
当業者であれば、上記の操作が、また、アスパラギン酸をアスパラギンに変換す るために使用できることがわかるであろう。本発明のもうひとつの面は、アスパ ラギンの製造方法である。
上記の力[1水分解条件を標識システィングルタミンおよびアスパラギン調製の ための操作と組み合わせて、 ”H,”CおよびIIINのいかなる組み合わせ によっても標識されたアミノ酸混合物の調製が可能となる。本発明のさらにもう ひとつの面は、いかなる同位体置換のアミノ酸類も本発明のプロセスによって精 製できることである。本発明はアミンU類のアミンおよびカルボキシル官能基の みをプロトン化することに依存しているので、いかなる同位体標識のアミノ酸混 合物も、本発明によって精製できる。
いかなる同位体標識化であろうと、精製したアミノ酸混合物は晴乳類または昆虫 細胞類の増殖を支持する。しかし、本発明の別の面は、生成した晴乳類または昆 虫細胞およびそれらの代謝産物が、出発物質としての同一同位体混合物によって 普遍的に標識されることである。
本発明は、下記の実施例によって例示するが、それらは例示のためのみに示され ており、本発明の範囲を全く制限するものではない。
実施例 実施例1 クロレラ(Chlorela) S p培養物由来の藻類バイオマス(500g )を希釈しくH2o)約10%スラリーとし、水中に入れ、ミクロフルイダイザ ーを3回通して細胞を破砕した。生成したスラリーを5°Cで15分間、5.O OOrpmで遠心分離した。上清を採取し、ペレットをHzO中に再懸濁し、同 一条件下で再遠心分離した。このプロセスを2回操り返した。上清をまとめ、ト リクロロ酢酸で処理しく最終濃度5%v/v)、全体を5°Cで一晩保存した。
生成した懸濁液を5°Cで30分間、5.000rpmで遠心分離した。上清を 捨て、ペレットを等量のアセトン中に再懸濁し、全体を5゜Cで15分間、5. OOOrpmで遠心分離した。上清を除去し、ペレッ1−を500m1のエタノ ール/エーテル中に懸濁し、減圧下におけるろ過によって採取した。ペレットを エタノール/エーテルで洗浄し、減圧下で乾燥させた。
上記に述べた可溶性タンパク質分画7gを4%v / vチオグリコール酸含有 3M メタンスルホン酸(70m l )中で10°Cで48時間、インバキュ オで加熱した。冷却後、加水分解物を、水浴中で冷却した水(70ml)上に注 ぎ、生成した混合物を約10分間放置した。生成した冷却溶液を遠心分離した( RC−3B、250m1容量、5.00Orpm、10分)。上清を、FMI  Lab Pump QSYを基部に付属したDowex 50X8イオン交換樹 脂(H十形、500g)のカラムにポンプで入れた(36ml/分)。
加水分解物全てをポンプでカラムに注入した時、希H,So4水溶液(pH2, 0,1,5L)次に水(2L)をカラムにポンプで入れた(36ml/分)。分 画(標識H+、500m1)をカラム下端から採取した。
トI十カラムを次にポンプを介してDowex lX8−100イオン交換樹脂 (O1]−形、500g)に接続した。希アンモニア水(1%V/V、9F、) を14十カラムを介してポンプで注入しく36m1/分)、C容出液を011− カラムに流した。分画(標識OH−1500ml)を0II−カラムの下端から 次に採取した。
T L C分析(Analtech 5ilica GS プレート、n−Bu OH:AcOH:H,0(2: 1 : lv/v)、展開剤・ニンヒドリン( Meoll : G l ac AcOH(97: 3v/v)中1%V/V) )は、分画0H−13−18中にアルギニンの存在を示していた。
アルギニン分画を溶出した後、ポンプを停止させ、OI]−カラムに直接接続し た。ポンプを再始動させ、一方、分画(500ml)を0)1−カラムから連続 して採取した。
希酢酸水溶?a(0,25%v/v、1OL)をその後OH−カラムを介してポ ンプで注入し、一方、500m1分画をカラム下端から連続して採取した。ポン プ注入は、それ以上ニンヒドリン陽性スボッ1−が溶出物中に検出されなくなる まで継続させた。
TLC分析(Analtech 5ilica GS プレート、n−BuOH :AcOH+11.O(2: 1 : lv/v)、展開剤、ニンヒドリン(〜 1eOH:Glac AcOH(97:3v/v)中1%V/v))は、 (分 画OH−25−36中に)混合アミノ酸類の存在を明確に示していた。
前記アルギニン含有分画および混合アミノ酸分画を、それぞれ、乾燥させ、凍結 乾燥によって濃縮した。残渣を水に溶解し、。22ミクロンのフィルターで滅菌 瓶中にろ過し、再凍結乾燥させた。アルギニン分画を、Cox、J、同上に記載 の操作に基本的に従って、塩酸塩として結晶させ、収量は0.31gであった。
混合アミノ酸分画を淡黄色粉末として単離し、収量は4.6gであった。
実施例2 CHO細胞のために最適化した血清を含まない培地であるCHO−3SFM−1 培地(Gibco)を、前記アミノ酸類を除外した状態で業者から購入した。2 種の培地試料を下記のように調製した二アミノ酸を含まないCHO−5SFM− 1アリコツト200m1に対して、 1 混合アミノ酸類 (340mg)+システィン(20mg)十結晶化アルギニン(40mg) 2、混合アミノ酸類 (340mg)+システィン(20mg)十結晶化アルギニン(40mg)+グ ルタミン(1,20mg)を添加した。
前記溶液を1.22ミクロンのフィルターを通過させ滅菌し、アリコツl(2− 3ml)に対してCHO細胞を接種した(当初の濃度lXIO3/ml)。細胞 数および%生存細胞(%)を、対照CHO−5SFM−1培地試料に対して、相 対的に記録した。
48h 72h 96h 120h 144h 168hControl 2. 4(9915,2f9617.0f911 7.0f911 5.H8314, (164111,6+9913.8f9315.1(97112,0f92+  9.2f8415.0f7212 2.2(9914,0f9515.5F93 1 7.2f95+ 7.2+8217.0(691これらの結果は、i)本実 施例の方法によって得られたアミノ酸混合物が対照のそれと識別できない増殖特 徴をもたらしたこと、および、il)グルタミンの添加が細胞増殖に必要でない ことを示唆している。
実施例3 二重標識アミノU類は、使用した藻類バイオマスが”co、およびK” N O xをそれぞれ唯一の炭素および窒素源として利用し増殖させたクロレラfchl orelal s pの培養物由来であることを除き、実質的に実施例1に記載 の方法によって調製した。13c、1″N−システィンは、実質的に上記に記載 のような酵素的操作によって調製した。
(’、HO−5SFM−1培地(Gibco)は、同様に、前記アミノ酸類、炭 水化物類、中間代謝物類、およびクンバク質加水分解物を除外した状態で、業者 から購入した。
この培地1リツトルに対して、 13C,”N−混合アミノ酸類(13C,”N−グルタミン酸を含む)、3g1 3C,15N−アルギニン−HCl:240mg13C115N−システィン+ 1ロ0mg口C−ピルビン酸す)・リウム(アイソチックflsoteci社) ニア0mg13C−D−グルコース:3.8g を添加した。
生成した溶液を、22ミクロンフィルターを通過させ、滅菌した。この(容42 50m1に対して、ヒト絨毛性ゴナドトロピンを発現し分泌するように工学的に 設計されたC )+ O細胞株を接種し、最終濃度3X106細胞/mlとした 。培養物を15時間攪拌した後、細胞を遠心分離によって単離した。細胞ペレッ トを上記のようにして調製した1sC1IsN−標識培地500m1中に濃度り 、2X10’細胞/mlとなるように再懸濁し、全体を73時間攪拌した。市販 のCHO−SSFM−1を用いた対照培養物を、同一レジタに従って実施した。
13C1IIIN−標識hCGの濃度は、その後、hCGに対して作製した抗体 を用いてRIAによって測定した。対照培養物中における非槽mhCGの対照濃 度が88時間において100100p/mlであったのに比較して、ICおよび lSN標識hCGの濃度は、73時間において90pmol/mlであることが わかった。
実施例4.アンモニウムシスティン−5−4−メチル安息香酸の調製システィン (2,42g、20mmol)および4−クロロメチル安息香酸(3,74g、 20mmol)をHa O(90ml)中に懸濁し、懸濁液を濃アンモニア水で 処理した。生成した溶液を室温で1時間、攪拌した。前記溶媒的50m1をその 後蒸発によって除去すると、沈澱が出現した。濃アンモニア水をその後沈澱が溶 解するまで滴下した。さらに、沈澱が形成され始めるまで、蒸発によって溶媒を 除去した。乾燥蒸留エタノールを次に滴下し、アンモニウムシスティン−5−4 −メチル安息香酸を白色結晶として得た(実験値:C,49,O;H,5,8、 N、9.3;S、11.6 C++H+sNx O,S理論値。C,48゜5: H,5゜9.N、10.3;S、11.8);収量4.9g (90%l 、R f (2: 1 : lv/v/v n−BuOH:Ha O:Ac0H)9. 73゜Delt、a H(Da 0,300Mhz)7.76 (2H、d、J  8Hz)、7.37(2H,d、J 8Hz)、3.78(2H,S)、3. 73 (IH,dd、J2,5)12)、2.90 (21−1、m)、 De lta C(Dz 0.75Mhz)175.30,172.89,141.1 8,135.43,129.34,128.86.53.60,35,178, 3]、、78,28.16゜実施例5・酸加水分解条件に対するアンモニウムシ スティン−3−4−メチル安息香酸の安定性 アンモニウムシスティン−5−4−メチル安息香酸(1g)を5chlenk試 験管中のメタンスルホン酸(3M)およびチオグリコール酸(4%)の凍結水溶 液(10ml)に添加した。空気を真空ポンプで除去し、試験管を封印し、全体 を100°Cで48時間、加熱した。懸濁液を次に冷却し、アンモニウムシステ ィン−3−4−メチル安息香酸な遠・し・分離および水で洗浄しく3X50ml )、定量的収率で単離した。
実施例6 アンモニウムシスティン−5−4−メチル安息香酸からのシスティン の単離 アンモニウムシスティン−5−4−メチル安息香酸(200mg、076mmo l)を、20ナシ型フラスコに添加した。フラスコをドライアイス/アセトレン 谷中で冷却し、アンモニアガスでフラッシュした。
約10m1の液体アンモニアを濃縮した後、ナトリウム金属(約50mg)を永 久的インジゴ色が得られるまで1分間隔で添加した。次に、ドライアイス(約1 00mg)をすぐに添加すると、白色沈澱が形成された。アンモニアを蒸発させ 、残渣をさらにドライアイスで処理した。アンモニアが全て蒸発した後、水を添 加し、濃塩酸を注意して添加しpI−1を約8に調整した。この混合物に空気を 24時間吹き付け、pHをさらに、!塩酸を添加して約pH5に調整し懸濁液を 攪拌した。生成した沈澱をろ】のによって採取し、脱気水(約10m1)に懸濁 し、ジチオスレイトール(114mg)によって処理し、全体を窒素中で50° Cで2時間、攪拌した。生成した懸濁液をWhatman No、1ペーパーで ろ過し、ガム状になるまで蒸発させた。乾燥蒸留エタノールを滴下し、白色坂秋 物として2回に分けてシスティンが収量30mgで得られた。
実施例7:リゾチームからのシスティンの単離リゾチーム白Og)を水(IL) に溶解し、トリクロロ酢酸(50g)で処理し4°Cで一晩、放置した。生成し た沈澱を、遠心分離によ−)で単離し、アセトンで洗浄しく300m1、×3) 、乾燥させた。収量9.95g。
変性リゾチームを窒素雰囲気中の脱気水に懸濁し、ジチオスレイトール(2,1 4g)で処理した。生成した混合物を、室温で一晩、振とうした。
乾燥蒸留エタノール(200ml)を添加し、溶液を5にで10分間、遠心分離 した。ペレットをエタノール(200ml)中に再懸濁し再度遠心分離した。こ の最後の操作を繰り返した。
4−クロロメチル安息香酸(1,54g)を脱気水(42ml)および濃アンモ ニア(7m I J中に溶解した。生成した溶液を上記の単離ベレットに添加し 、全体を室2Mで窒素下で一晩、攪拌した。
乾燥蒸留エタノール(200ml)を添加し、溶液を5にで10分間、遠心分離 した。ペレットをエタノール(200ml)中に再度懸濁し、再遠心分離した。
この最後の操作を繰り返した。このようにして得られたペレットをデシケータ− 中で乾燥し、単離した。
上記で得られたエタノール洗浄液が、タンパク質性物質を含有していることがわ かった。したがって、上記で得られた上清をまとめたものを、5にで10分間、 遠心分離し、ペレットを単離した。脱気水(50ml)およびジチオスレイトー ルを添加し、全体を窒素中で室温で一晩振とうした。アセトン(100ml)を 添加し、全体を5にで一晩、遠心分離した。
ペレットを脱気水(125ml)中に溶解し、水(21ml)に溶解した4−り 四ロメチル安息香u (0,77g)の溶液および濃アンモニア水(4ml)で 処理した。全体を、窒素中で室温で一晩振とうした。
アセトン(100ml)を添加し、全体を4にで10分間、遠心分離した。この ようにして得られたベレットをデシケータ−中で乾燥し、先に得られたベレット と一緒にした。総収量、9.5g (リゾチームアミノ酸配列に基づくと、87 %)。
生成したタンパク質分画(9,5g)を、4%V/Vチオグリコール酸含有3M  メタンスルホン酸(95ml)中で100°Cで48時間、インバキュオで加 熱した。冷却後、加水分解物を水(95ml)と混合し、生成した混合物を、F MI Lab Pump QSYを基部に付属したDowex lX2−400 イオン交換樹脂(H十形、250g)のカラムにポンプで入れた(50m 17 分)。
加水分解物全てなポンプでカラムに注入した時、希Ha So、水溶液(p+4 2.0、IL)次に水(1,25L)をカラムにポンプで入れた(50ml/分 )、、この8十カラムを次にポンプを介してDowex50X8−1 oo−r :tン交換樹脂(01−1−形、500g)に接続した。
希アンモニア水(2%v/v、6L)を、H十カラムを介してポンプで注入しく 50m l 7分)、溶出液をOH−カラムに流した。分画(2L)をOH−カ ラムの下端から次に採取した。
TLC分析(Analtech 5ilica GS プレート、n−BuOH :AcOH:H,O(2: 1 : lv/v)、展開剤:ニンヒドリン(Me OH:Glac Ac0H(97:3v/v)中1%V/V))は1分画2およ び3中にアルギニンの存在を明確に示していた。
アルギニン分画を溶出した後、ポンプを停止させ、OH−カラムに直接接続し、 水(2L)で溶出した。ポンプを再始動させ、一方、分画(2L)を01(−カ ラムから連続して採取した。
希酢酸水溶液(025%v / v、l0L)をその後OH−カラムを介してポ ンプで注入し、一方、500m1分画をカラム下端から連続して採取した。ポン プ注入は、それ以上ニンヒドリン陽性スポットが溶出物中に検出されなくなるま で継続させた。
TLC分析(Analtech 5ilica GS プレート、n−BuOH : AcOH: Hz O(2: 1 : l v/v)−展開剤:ニンヒドリ ン(MeOH:Glac Ac0H(97:3v/v)中1%V/V))は、  (分画11.12および13中に)混合アミノ酸類の存在を明確に示していた。
希酢酸水溶液(2,5%v / v、12L)をその後OH−カラムを介してポ ンプで注入し、一方、IL分画をカラム下端から連続して採取した。ポンプ注入 は、それ以上ニンヒドリン陽性スポットが溶出物中に検出されなくなるまで継続 させた。
TLC分析(Analtech 5ilica GS プレート、n−BuOH :AcOH:Hz O(2: 1 : lv/v) 、展開剤:ニンヒドリン( MeO)(:Glac Ac0H(97:3v/v)中1%V/v))は、(分 画15−18中に)アスパラギン酸の存在を、および。
(分画18−25中に)システィン−5−4−メチル安息香rm)の存在を、明 確に示していた。
前記システィン−5−4−メチル安息香酸含有分画をまとめ、そのpHを希硫酸 で2に調整した。生成した溶液をDowex 1X2−400イオン交換樹脂( H十形、25g)のカラムに2ml/分でポンプで入れた。加水分解物全てをポ ンプでカラムに注入した時、希H,So。
水溶液(pH2,0,500m1)次に水(500ml)をカラムにポンプで入 れた。
希アンモニア水(2%v/v、XXL)を、ポンプで注入した(25ml/分) 。分画(約150m1)をOH−カラムの下端から次に採取した。
TLC分析(Analtech 5ilica GS プレート、n−BuOH :AcOH:H□O(2: 1 : lv/v)、展開剤:ニンヒドリン(Me OH:Glac Ac0H(97:3v/v)中1%V/V))は、分画12中 にアンモニウムシスティン−3−(4−メチル安息香酸)の存在を明確に示して おり、それを蒸発させ、白色粉末として、アンモニウムシスティン−5−(4− メチル安息香酸)を収量0.47g(誘導体化されたりゾチームを基準として、 32%)で得た。
実施例8 アンモニウム(50%2H1l I C、18N−標識システィン) −8−4−メチル安息香酸の単離 グルタミン酸含有50%211.13C1”N−1ff識アミノ酸混合物l。
g(実施例9と同様に調製した)をHz O436,2mlおよび1SN11、 CI (8g)、NaC1(5g)、リン酸緩衝液(pH7,100m1)、T K−M金属塩類(20ml)、塩化カルシウム(濃、4m1)、ビタミン混合物 (1,4m1)、リボフラビン(2ml)、p−アミノ安息香酸(0,2m1) 含有D20 436.2ml中に溶解した。生成した溶液をろ過滅菌し、2個の 容量500m1の振とうフラスコ中に等環ずつ分配した。この溶液に対して、A TCC31448(ヒトインシュリンA鎖を発現するように工学的に製造された 大腸菌(E、 col i))の培養物を接種し、37°Cで24時間、振とう した。
次に、この培養物を、遠心分離し、細胞ベレットを凍結乾燥によって単離し、約 1.1gの乾燥物を得た。
この細胞ベレットを、その後、ジチオスレイトールおよび4−クロロメチル安息 香酸で順次処理し、実施例7に記載の技術によって加水分解した。生成した誘導 体化されたバイオマスを、Dowex 1X2−400イオン交換樹脂(H十形 )およびDowex 50X8−100イオン交換樹脂(OH−形)を使用した こと以外、実施例7の技術に従って精製した。(6出されたアンモニウム(50 %2H1”C,”N−[識−システィン)−5−4−メチル安息香酸含有分画を まとめ、そのp)Iを希硫酸で2に調整した。生成した溶液を、Dowex l X2−400イオン交換樹脂(Hu形、5g)のカラムに10m1/分でポンプ で入れた。加水分解物全てをポンプでカラムに注入した時、希H,So。
水?82f (p H2、0,200m1)次に水(100ml)をカラムにポ ンプで入れた。
希アンモニア水(2%v / v、IL)を、ポンプで注入した(10m1/分 )。分画(約15m1)をOH−カラムの下端から次に採取した、TLC分析( Analtech 5ilica GS プレートn−BuOH:AcOH:H −0(2: 1 : lv/v)、展開剤:ニンヒドリン(MeOH: G1  ac AcOH(97: 3v/v)中1%V/V))は、実施例1で調製した アンモニウムシスティン−8−(4−メチル安息香酸)と同一のRfの成分の存 在を明確に示していた。適切な分画を蒸発させ、白色粉末として、アンモニウム (50%2H1IJc、IsN l!4識システィン)−5−(4−メチル安息 香酸)を収量30mgで得た。
実施例9 クロレラfchlorelal s pの培養物を、それぞれ、単一の炭素およ び窒素源として〉98%13CO□および〉98%KISNow存在下において 、1:1v/vH□O/D、Oの溶液中で増殖させた。生成した藻類バイオマス (約500g)を約10%スラリーとなるように希釈(H2O)し、水中にいれ 、細胞をホモジナイザーを3回通して、破砕した、生成したスラリーを5,00 0!・pmで5’Cで25分間、遠心分離した。上清を採取し、ベレットをI− 1,0中に同一条件下で再懸濁した。
このプロセスを2回繰り返した。上清をまとめて、トリクロロ酢酸で処理しく最 終濃度5%v/v)、全体を5’ Cで一晩放置した。
生成した懸濁液を5°Cで30分間、5,000rpmで遠心分離した。上清を 捨て、ベレットを等量のアセトン中に再懸濁し、全体を5゜000rpmで5° Cで15分間、遠心分離した。ベレットをエタノール/エーテル500m1中に 懸濁し、減圧下で乾燥させた。
生成した50%2日、13c、16N−標識タンパク質52gを、4%V/Vチ オグリコール酸含有3M メタンスルホン酸(520ml)中で100°Cで4 8時間、インバキュオで加熱した。冷却後、加水分解物を、水浴中で冷却した水 (520m l )に注ぎ、生成した混合物を、約10分間放置した。生成した 冷却溶液を、遠心分離した(RC−38゜250m1容量、5に、10分間)。
上清をFMI Lab PumpModel QDを基部に付属したDowex  lX2−400イオン交換樹脂(H十形、2.5kg)のカラムにポンプで入 れた(200ml/分)。
加水分解物全てをポンプでカラムに注入した時、希Ht So、水溶液(p)1 2.O17,5L)次に水(IIL)をカラムにポンプで入れた(200ml/ 分)。 その後、このH十カラムをポンプを介してり。
wex 50X8−100イオン交換樹脂(OH−形、2.5kg)に接続した 。希アンモニア水(2%V / V、50L)を、H十カラムを介してポンプで 注入しく200m1/分)、溶出液をそのままOH−カラムに導いた。分画(2 L)をOH−カラム下端から次に採取した。
TLC分析(Analtech 5ilica GS プレート、n−BuOI −1:AcOH:H,0(2+ 1 + lv/v)、展開剤:ニンヒドリン( MeOH:Glac AcOH(97:3v/v)中1%V/V))は、分画1 1−24中に50%2日、1ffc、15N−標識アルギニンの存在を明確に示 していた。
アルギニン分画の溶出後、ポンプを停止させ、OH−カラムに直接接続した。ポ ンプを再始動させ、水(14L)をこのOH−カラムにポンプで入れた。分画( 2L)を連続して採取した。
希酢酸水溶液(0,25%v / v )をその後OH−カラムを介してポンプ で注入し、一方、2L分画をカラム下端から連続して採取した。ポンプ注入は、 それ以上ニンヒドリン陽性スポットが溶出物中に検出されなくなるまで継続させ た。
TLC分析(Analtecl+ 5ilica GS プレート、n−BuO H:Ac0F(:Ha O(2: 1 : lv/v)、展開剤:ニンヒドリン (MeOH:Glac Ac0H(97:3v/v)中1%V/v))は、分画 46−58中に50%”Hl”Ct ”N−標識混合アミノ酸類(50%2日、 ”C,”N−[識グルタミン酸を含む)の存在を明確に示していた。この50% 2H1l * C、l II N−標識混合アミノ酸類を淡黄色粉末として凍結 乾燥によって単離した。
上記の単離された50%”H,”C,”N−標識混合アミノ酸類を水(8L)に 溶解し、Dowex 50X8−1ooイオン交換樹脂(酢酸形、500g)の カラムにポンプで流した。分画(2L)を採取した。全混合アミノun溶液をカ ラムに添加した後、前記アミノ酸類が全て溶出されるまでカラムにポンプで注入 した。
TLC分析(Analtec 5ilica GS プレートn−BuOH:A cOH+)L O(2: 1 : lv/v)、展開剤:ニンヒドリン(MeO H:Glac Ac0H(97:3v/v)中1%v / v))は、分画1− 6中に(50%2日、+3.(、,1″N−標識グルタミン酸を除く)50%” H,”C,1″N−標識混合アミノ酸類の存在を明確に示しており、これは、淡 黄色粉末として凍結乾燥によって単離した。収量、20.63g。
このカラムを次に希酢酸(3%、6L)で洗浄し、50%2H1+3(16N  PA識グルタミン酸を単一のアミノ酸成分として分画7−8中に溶出し、凍結乾 燥によって白色粉末として単離した。収量、2.9g。
De l tab (D20,300MHz)4.19.3.97.3.72. 348.3.11.2.68.2.26.2.07および1.83における13 C1I SNおよび” l−1カツプリングにより、広い多重度。DelLa  C(D20.75MHz) 177.30 (d)、173.92 (ql 、 54.20 (ri)、53.49 (d)、51.58−50゜37 (m) 、35.50−34.28 (m)、30.36 (d)、2964 (d)、 and 25.92−24.99 (m)。
この50%21]、l IC,l S N−標識アミノU混合物を、HPLC( アミノ酸類は、オルトフラールアルデヒド誘導体類として、誘導体化した、5u pelco 5upelcosil LC−18,15X4.6mmカラム、1 00%テトラヒドロフラン(10%):KH,PO4(0,1M):KOAc  (0,25M)から100%メタノール(80%) 酢1!!(0,IN、20 %)へ55分間に及ぶ非直線勾配)によって、50%”H,”C,”N−標識グ ルタミン酸の除去前後において、例示した。この[(PLCクロマトグラムは、 グルタミン酸に対応するピークが酢酸レジン通過後に完全に除去されていること を除き、実質的に同等であった。
実施例10 9−フルオレニルメチルクロロホルメート(3,88g、l 5mm。
1)およびN−ヒドロキシスクシンイミド(1,73g、15mmo 1)をジ オキサン(20ml)中に溶解し、トリエチルアミン(2,09m1.15mm ol)で処理した。生成した懸濁液を15分間、攪拌した。
50%”H,”C1IjJ−標識グルタミン酸(1,88g、12mmo1)お よび無水炭酸ナトリウム(2,54g、20mmol)を水に溶解し、生成した 溶液を上記で調製した9−フルオレニルメチル−N−ヒドロキシスクシニルホル メートの懸濁液に添加した。生成した懸濁液を室温で一晩攪拌した。
この溶液を蒸発乾燥させ、クロロホルム(約200m1)および水(約200m 1)で分配した。水相を約pH2まで濃塩酸で酸性とし、酢酸エチルで抽出した 。有機相を乾燥させ(無水硫酸マグネシウム)、および、減圧下で蒸発させ、推 定N−フルオレニルメチル−50%2日、”C,IN−m識グルタミン酸誘導体 を粉末として得た。
トリオキサン(2,70g、30mmol)およびp−t−ルエンスルホン酸( 微量)を、上記で得た粉末に添加し、全体をトルエン中に懸濁し一晩還流した。
次に溶液を冷却させ、減圧下で蒸発させ、ガム状にした。残渣を酢酸エチル(約 200m1)および水(約200m1)で分配し、水相を乾燥させ(無水硫酸マ グネシウム)、減圧下で蒸発乾燥させ、粉末としてオキサゾリジノンを得た。
このようにして得た粉末を無水テトラヒドロフラン(50m l )中にr8解 し、ジイソプロピルカルボジイミドol)で処理し、室温で30分間攪拌後、ド ライアイス/アセトン洛中で冷却した。
これとは別に、ISN−塩化アンモニウム(2.86g、52.5mmol)を 5chlenk試験管に入れ、ジメチルスルホキシド(25ml)に溶解した。
試験管蓋を閉め、溶液をドライアイス/アセトン浴中に漫積し凍結させた。蓋を 再度開け、水素化ナトリウム(2,1g、60%才イル中分散剤、52,5mm ol、ヘキサンで前洗浄し窒素中で乾燥させである)をこの試験管に添加した。
蓋をすぐに閉め、通気管に接続した側腕をオキサゾリジノン誘導体を含有する冷 却フラスコ中に入れた。
Sch l enk試験管中のジメチルスルホキシド溶液を融解させると、IN −アンモニアが発生し、オキサゾリジノン溶液中に凝縮された。
1jN−アンモニアの全てが蒸発した後、クランプを通気管におき、それによっ て管を閉とした。オキサゾリジノン溶液を室温まで一晩温めた。
水(約2m1)を生成した溶液に添加し、全体を30分間、攪拌した。生成した 溶液をその後、減圧下で蒸発乾燥させた。
残渣をエタノール(50ml)および水(lomりに溶解した。溶液を水素化ナ トリウム(IM、10.5m1)で処理し、2.5時間還流し、N−保護グルタ ミン誘導体を得た。冷却してすぐ、溶液をピペリジン(1,04m1.10.5 mmol)で処理し、全体を室温で一晩攪拌した。
生成した溶液を減圧下で蒸発乾燥させ、クロロホルム(約100m1)ど水(約 100m1)に分配した。水相をジエチルエーテル(約1゜0m1)で抽出し、 このpHを氷酢酸で約7に調整した。生成した溶液を、Dowex 1X2−4 00イオン交換樹脂(NH十形、20g)のカラムに流し、蒸発乾燥させた。残 渣を水(約100m1)に溶解し、Dowex 50X8−100イオン交換樹 脂(酢酸形、log)のカラムに流し、生成した?8液を減圧下で蒸発乾燥させ た。このようにして産生された50%2H113C、I ! N=標識グルタミ ンは結晶化しなかった。
したがって、前記物質の一部を最小5 : 1.5 : 5v/v/vイソプロ ピルアルコール:水:氷酢酸に溶解し、EM 5eparation1ichr oprep Diol カラム(50X2.5cm)に添加し、5:1v/v/ vイソプロピルアルコール;氷酢酸で溶出した。
適切な分画をまとめて、減圧下で蒸発させ、50%”l(,13c、” N − 標識グルタミンをガム状として得た。
フロントページの続き (51) Int、 C1,6識別記号 庁内整理番号GOIN 33/60  Z 7055−2J(81)指定国 EP(AT、BE、CH,DE。
DK、ES、FR,GB、GR,IE、IT、LU、MC,NL、 PT、 S E)、0A(BF、BJ、CF、CG、 C1,CM、 GA、 GN、 ML 、 MR,NE、SN。
TD、 TG)、 AT、 AU、 BB、 BG、 BR,BY。
CA、CH,CN、CZ、DE、DK、ES、FI、GB、HU、JP、KP、 KR,KZ、LK、LU、MG、MN、MW、NL、No、 NZ、 PL、  PT、 RO。
RU、SD、SE、SK、UA、US、VNI

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.タンパク質の三次元構造情報を決定する方法で、(a)タンパク質産生条件 下において、問題のタンパク質を産生可能な哺乳類または昆虫細胞培養物を前記 細胞の増殖に必須である全てのアミノ酸類を含有しかつ炭水化物、必須無機物類 および増殖因子類の吸収源を含有する栄養培地中で増殖させ、上記栄養培地中の 前記アミノ酸類およびタンパク質合成のために細胞が使用するその他全ての基質 が実質的に同位体標識されていることを特徴とし、(b)前記標識タンパク質を 実質的に標識された形態で栄養培地から単離すること、および (c)前記タンパク質をNMR分光分析に供し、その三次元構造についての情報 を求めること、 からなることを特徴とする方法。 2.上記栄養培地中のアミノ酸類中の実質的に全ての炭素原子が13Cであるこ とを特徴とする請求の範囲第1項記載の方法。 3.上記栄養培地中のアミノ酸類中の実質的に全ての炭素原子が13Cであるこ と、および上記栄養培地中のアミノ酸類中の実質的に全ての窒素原子が15Nで あることを特徴とする請求の範囲第1項記載の方法。 4.非重水素化形態の前記標識タンパク質のNMR分光分析で産生されたそれら に比べてNMR分光分析で産生されたシグナルの分解を増強するため、上記栄養 培地中のアミノ酸類中の十分な割合の水素原子が2Hであることを特徴とする請 求の範囲第2項または第3頃記載の方法。 5.上記栄養培地中のアミノ酸類中の水素原子の約20%乃至約100%が2H であることを特徴とする請求の範囲第2項または第3項記載の方法。 6.上記炭水化物源中の実質的に全ての炭素原子が13Cであること,および前 記炭水化物源中の水素原子の約20%乃至約100%が2Hであることを特徴と する請求の範囲第2項または第3項記載の方法。 7.第1分子が第2分子に複合体化されており、この第1分子の三次元構造情報 を決定する方法で、前記分子類の少なくともひとつがタンパク質であることを特 徴とし、 (a)前記第1分子を安定NMR活性同位体で実質的に標識された形態で製造す ること、 (b)前記第1分子と第2分子の間で複合体を形成すること、および(c)前記 複合体をNMR分光分析に供し、前記第1分子の三次元構造についての情報を求 めること、 からなることを特徴とする方法。 8.さらに、段階(b)の前に、前記第2分子を実質的に重水素で標識された形 態で製造することからなることを特徴とする請求の範囲第7項記載の方法。 9.前記第1分子がタンパク質であること、および、前記第1分子が、(a)タ ンパク質産生条件下において、問題のタンパク質を産生可能な哺乳類または昆虫 細胞培養物を前記細胞の増殖に必須である全てのアミノ酸類を含有しかつ炭水化 物、必須無機物類および増殖因子類の吸収源を含有する栄養培地中で増殖させ、 前記アミノ酸類がNMR活性同位体によって実質的に標識されていることを特徴 とし、および(b)前記標識タンパク質を実質的に標識された形態で栄養培地か ら単離すること、 からなる方法によって製造されることを特徴とする請求の範囲第7項記載の方法 。 10.前記第2分子がタンパク質であること、および、前記第2分子が(a)タ ンパク質産生条件下において、問題のタンパク質を産生可能な哺乳類または昆虫 細胞培養物を前記細胞の増殖に必須である全てのアミノ酸類を含有しかつ炭水化 物、必須無機物類および増殖因子類の吸収源を含有する栄養培地中で増殖させ、 前記アミノ酸類が2Hによって実質的に標識されていることを特徴とし、および (b)前記標識タンパク質を実質的に標識された形態で栄養培地から単離するこ と、 からなる方法によって製造されることを特徴とする請求の範囲第9項記載の方法 。 11.前記第1分子がタンパク質であること、および、前記第1分子が(a)タ ンパク質産生条件下において、問題のタンパク質を産生可能な哺乳類または昆虫 細胞培養物を前記細胞の増殖に必須である全てのアミノ酸類を含有しかつ炭水化 物、必須無機物類および増殖因子類の吸収源を含有する栄養培地中で増殖させ、 前記アミノ酸類がNMR活性同位体によって実質的に標識されていることを特徴 とし、および(b)前記標識タンパク質を実質的に標識された形態で栄養培地か ら単離すること、 からなることを特徴とする方法によって製造されることを特徴とする請求の範囲 第10項記載の方法。 12.前記NMR活性同位体が13Cであることを特徴とする請求の範囲第7項 、8項、9項、10項または11項記載の方法。 13.前記第1分子が13Cおよび15Nによって二重標識されていることを特 徴とする請求の範囲第7項、8項、9項、10項または11項記載の方法。 14.前記NMR活性同位体が13Cまたは13Cおよび13Nの両者であるこ と、および、非重水素化形態の前記標識タンパク質のNMR分光分析で産生され たそれらに比べて、NMR分光分析で産生されたシグナルの分解を増強するため 、前記第1分子調製のために使用した栄養培地中のアミノ酸類中の十分な割合の 水素原子が2Hであることを特徴とする請求の範囲第11項記載の方法。 15.前記第1分子調製のために使用した栄養培地中のアミノ酸類中の水素原子 の約20%乃至約100%が2Hであることを特徴とする請求の範囲第14項記 載の方法。 16.哺乳類または昆虫細胞培養物の増殖を支持可能な栄養培地で、前記細胞の 増殖に必須である全てのアミノ酸類、炭水化物吸収源、および必須無機物類およ び増殖因子類を含有し、前記アミノ酸類およびタンバク質合成のために細胞が使 用したその他全ての基質が、2Hによって、13Cによって、または13Cおよ びIsNの両者によって実質的に標識されていることを特徴とする前記栄養培地 。 17.前記アミノ酸類が実質的に13Cによって標識されていることを特徴とす る請求の範囲第16項記載の栄養培地。 18.前記炭水化物源が実質的に13Cによって標識されていることを特徴とす る請求の範囲第17項記載の栄養培地。 19.前記アミノ酸類が実質的に13Cおよび15Nによって二重標識されてい ることを特徴とする請求の範囲第16項記載の栄養培地。 20.前記炭水化物源が実質的に13Cによって標識されていることを特徴とす る請求の範囲第19項記載の栄養培地。 21.前記栄養培地中のアミノ酸類中の水素原子の約20%乃至約100%が2 Hであることを特徴とする請求の範囲第17項、18項、19項または20項記 載の栄養培地。 22.実質的に13Cおよび15Nによって標識されておりおよびその中の水素 原子の約20%乃至約100%が2Hであるシステインを添加されていることを 特徴とする請求の範囲第21項記載の栄養培地。 23.実質的に13Cおよび15Nによって標識されておりおよびその中の水素 原子の約20%乃至約100%が2Hであるグルタミンを添加されてし、ること を特徴とする請求の範囲第21項記載の栄養培地。 24.実質的に13Cおよび15Nによって標識されておりおよびその中の水素 原子の約20%乃至約100%が2Hであるアスパラギンを添加されていること を特徴とする請求の範囲第21項記載の栄養培地。 25.前記アミノ酸類が実質的に2Hによって標識されていることを特徴とする 請求の範囲第16項記載の栄養培地。 26.前記炭水化物源が実質的に2Hによって標識されていることを特徴とする 請求の範囲第16項記載の栄養培地。 27.実質的に同位体標識された形態のアミノ酸類混合物を産生する方法で、 (a)タンパク質生合成のために微生物によって使用されるいかなる基質中の炭 素も実質的に全てが13Cであるかまたはタンパク質生合成のために微生物によ って使用されるいかなる基質中の窒素も実質的に全てが15Nであるかまたはタ ンパク質生合成のために微生物によって使用されるいかなる基質中の水素も実質 的に全てが2Hである栄養培地中におし、て、前記微生物の培養物を増殖させる こと;(b)前記培養物からタンパク質含有分画を回収すること;(c)前記タ ンパク質を酸性、非酸化条件下でスルフィドリル還元剤の存在下で加水分解し、 アミノ酸粗混合物を産生すること;(d)前記アミノ酸粗混合物を陽イオン交換 クロマトグラフィに供し、部分的に精製されたアミノ酸混合物を得ること;(e )前記部分的に精製されたアミノ酸混合物を陰イオン交換クロマトグラフィに供 し、精製されたアミノ酸混合物を得ること;および(f)前記精製されたアミノ 酸混合物に、前記栄養培地と同一同位体または同位体混合物によって標識された システインを添加することからなり、前記システインは、上記哺乳類または昆虫 細胞によるタンパク質産生を支持するために十分な量で添加されることを特徴と する前記方法。 28.前記栄養培地および前記システインが12Cによって標識されていること を特徴とする請求の範囲第27項記載の方法。 29.前記栄養培地および前記システインが15Nによって標識されていること を特徴とする請求の範囲第27項記載の方法。 30.前記栄養培地および前記システインが2Hによって標識されてし、ること を特徴とする訴求の範囲第27項記載の方法。 31.前記栄養培地および前記システインが13Cおよび15Nによって二重標 識されていることを特徴とする請求の範囲第27項記載の方法。 32.前記栄養培地および前記システインがさらに2Hによって標識されており 、前記精製されたアミノ酸混合物および前記システイン中の水素原子の約20% 乃至約100%が2Hであることを特徴とする請求の範囲第31項記載の方法。 33.前記精製されたアミノ酸混合物に、実質的に13Cおよび15Nによって 標識されかつその中の水素原子の約20%乃至約100%が2Hであるグルタミ ンを添加することからなることを特徴とする請求の範囲第32項記載の方法。 34.前記精製されたアミノ酸混合物に、実質的に13Cおよび15Nによって 標識されかつその中の水素原子の約20%乃至約100%が2Hであるアスパラ ギンを添加することからなることを特徴とする請求の範囲第32項記載の方法。 35.前記微生物が微生物藻類であること、および、前記栄養培地が、炭素源と して、13C標識二酸化炭素を含有してし、ることを特徴とする請求の範囲第2 7項記載の方法。 36.前記微生物が微生物藻類であること、および、前記栄養培地が、16N標 識無機窒素源を含有していることを特徴とする請求の範囲第27項記載の方法。 37,前記微生物が微生物藻類であること、および、前記栄養培地が、炭素源と しての13C標識二酸化炭素および15N標識無機窒素源を含有していることを 特徴とする請求の範囲第27項記載の方法。 38.前記微生物が微生物藻類であること、および、前記栄養培地中の実質的に 全ての水が2H20であることを特徴とする請求の範囲第27項記載の方法。 39.前記陽イオン交換樹脂がH+形で使用されることを特徴とする請求の範囲 第27項記載の方法。 40.前記陰イオン交換樹脂がOH−形で使用されることを特徴とする請求の範 囲第27項記載の方法。 41.段階(d)において、タンパク質加水分解物の酸性および中性夾雑物が、 前記陽イオン交換カラムを酸性溶液で溶出することによって除去されること、お よび前記アミノ酸類が前記陽イオン交換カラムから塩基性溶液によって溶出され ることを特徴とする請求の範囲第39項記載の方法。 42.前記陰イオン交換樹脂がOH−形で使用されること、および、段階(e) において、タンパク質加水分解物の塩基性および中性夾雑物が前記陰イオン交換 カラムを塩基性溶液で溶出することによって除去されること、および前記アミノ 酸類が前記陰イオン交換カラムから酸性溶液によって溶出されることを特徴とす る請求の範囲第41項記載の方法。 43.同位体標識システインの調製方法で、(a)アミノ酸混合物中に存在する 遊離のアミノ酸としてまたはポリペプチド中におけるシステイン残基としてのい ずれかとしての同位体標識システインを、式 ▲数式、化学式、表等があります▼ のハロペンチル化合物と反応させ、式 ▲数式、化学式、表等があります▼ (式中、Xは、ハロゲンである;RおよびR■は、それぞれ、反応の出発物質が 遊離のシステインである時水素であるか)、または、RおよびRは、出発物質が ポリペプチドである時前記ポリペプチド中における隣接するアミノ酸残基類を示 しており、少なくともR2−R6のひとつはカルボキシ、C1−C4カルボキシ アルキルまたはC1−C4カルボキシアルコキシから選択された酸性基であるか またはC2−C4ジアルキルアミノ、C3−C6ジアルキルアミノアルキルまた はC3−C6ジアルキルアミノアルコキシから選択された塩基性基であり、およ び.残りのR2−R6基は、単独または共に、水素、ハロゲン、C1−C6アル キルまたはC1−C6アルコキシである)の保護されたチオエーテルを形成させ ること、(b)前記保護されたチオエーテルを単離すること;および(c)前記 保護されたチオエーテルを脱保護し、同位体標識システインを製造すること、 からなることを特徴とする方法。 44.前記同位体標識システインがシステイン残基としてポリペプチド中に存在 すること、および段階(b)が(i)前記ポリペプチドを加水分解して、保護チ オエーテルを合有するアミノ酸混合物を形成されること、および(ii)前記保 護チオエーテルをイオン交換クロマトグラフィによって前記アミノ酸混合物から 単離することからなることを特徴とする請求の範囲第43項記載の方法。 45.前記ハロペンチル化合物が4−クロロメチル安息香酸であることを特徴と する請求の範囲第44項記載の方法。 46.前記炭素原子の実質的に全てが13Cによって標識され、前記室素原子の 実質的に全てが15Nによって標識され、および前記水素原子の約20%乃至約 100%が2Hであることを特徴とする同位体標識システイン調製物。 47.同位体標識グルタミンまたはアスパラギンの調製方法で、(a)同位体標 識グルタミン酸またはアスパラギン酸をN−保護基と反応させ、式 ▲数式、化学式、表等があります▼ のN−保護アミノ酸を形成させ (b)前記N−保護アミノ酸を環化し、式▲数式、化学式、表等があります▼ のオキサゾリジノンを形成させ、 (c)前記オキサゾリジノンをアミド形成条件下でアンモニアと反応させ、式 ▲数式、化学式、表等があります▼ の環状アミド誘導体を形成させ、 (d)前記環状アミド誘導体を加水分解し、式▲数式、化学式、表等があります ▼ のN−保護アミノ酸を形成させ、 (e)前記N−保護アミノ酸を脱保護し、同位体標識グルタミンまたはアスパラ ギンを形成させること、 (式中、nは1または2であり、および、Xは、アミン保護基である)からなる ことを特徴とする前記方法。 48.前記炭素原子の実質的に全てが13Cによって標識され、前記窒素原子の 実質的に全てが15Nによって標識され、および前記水素原子の約20%乃至約 100%が2Hであることを特徴とするグルタミン調製物。 49.前記炭素原子の実質的に全てが13Cによって標識され、前記窒素原子の 実質的に全てが15Nによって標識され、および前記水素原子の約20%乃至約 100%が2Hであることを特徴とするアスパラギン調製物。 50.前記水素原子の約20%乃至約100%が2Hであることを特徴とする請 求の範囲第49項記載の調製物。
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