JPH0686A - Ｃ型肝炎ウイルス由来の遺伝子またはｄｎａ断片、それがコードするポリペプチド及びその産生方法 - Google Patents

Ｃ型肝炎ウイルス由来の遺伝子またはｄｎａ断片、それがコードするポリペプチド及びその産生方法

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JPH0686A
JPH0686A JP4293734A JP29373492A JPH0686A JP H0686 A JPH0686 A JP H0686A JP 4293734 A JP4293734 A JP 4293734A JP 29373492 A JP29373492 A JP 29373492A JP H0686 A JPH0686 A JP H0686A
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Makoto Seki
誠 関
Yoshikazu Honda
喜員 本多
Kazunobu Takahashi
和展 高橋
Tomoko Murakami
智子 村上
Yutaka Teranishi
豊 寺西
Norio Hayashi
紀夫 林
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Original Assignee
Mitsubishi Kasei Corp
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Abstract

(57)【要約】 【構成】 Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）由来の新規な遺
伝子またはＤＮＡ断片、該ＤＮＡ断片によってコードさ
れるポリペプチド及び該ポリペプチドを発現させるベク
ターにより形質転換された宿主細胞を培養してＨＣＶ抗
原性ペプチドを産出する方法。 【効果】 上記ＨＣＶ抗原性ペプチドはＨＣＶ抗体を高
率で検出できる診断法の開発または新規なワクチンの開
発に有用である。

Description

【発明の詳細な説明】
【０００１】
【産業上の利用分野】本発明は新規なＣ型肝炎ウイルス
（以下「ＨＣＶ」という。）由来の遺伝子またはＤＮＡ
断片とそれに対応する新規なポリペプチドに関し、さら
には、該ポリペプチドをコードするＤＮＡ断片と該ポリ
ペプチドの利用法に関する。
【０００２】
【従来の技術】ヒトの肝炎ウイルスは、現在までにＡ
型、Ｂ型、及びＤ型が発見されており、血清学的診断法
もそれぞれ確立されているが、依然として原因不明の肝
炎が存在し問題となっていた（ダイジェスティブ ディ
ジ−ゼズ アンド サイエンスイズ、３１，１２２Ｓ−
１３２Ｓ，１９８６、セミナ−ズ イン リバ−ディジ
−ズ，６，５６−６６，１９８６）。一方、１９７０年
半ばに、Ａ型肝炎ウイルス（ＨＡＶ）とＢ型肝炎ウイル
ス（ＨＢＶ）を検出する特異的な診断技術が開発され、
実用に供されるようになった。その結果、輸血に伴うほ
とんどの肝炎は、肝細胞で増殖するＨＡＶ、ＨＢＶやそ
の他のウイルスとは違った、病原体によって起こされる
ことが次第に明かとなり、これらの肝炎は非Ａ非Ｂ型肝
炎と名付けられた。米国では現在輸血例の１〜１０％の
頻度で輸血後肝炎が起こっており、その９０％以上を非
Ａ非Ｂ型肝炎が占めている（実験医学、８、（３）、１
５−１８、１９９０）。また日本でも、輸血例の１０〜
２０％で輸血後肝炎が発症しており（年間約２０万
人）、そのうち９５％が非Ａ非Ｂ型肝炎である。さら
に、年間約３０万人発症している散発性肝炎のうちの４
０〜５０％も非Ａ非Ｂ型肝炎であり、一地方のみで流行
している非Ａ非Ｂ型肝炎も含めてこれらの多くのもの
は、輸血という明白な感染系路はないものの、なんらか
の別の感染ル−トで感染したものと考えられている（実
験医学、８、（３）、１３−１４、１９９０）。
【０００３】この輸血後肝炎の主原因である非Ａ非Ｂ型
肝炎の原因ウイルスは、１９８８年５月カイロン社が、
従来の伝統的なウイルス探索法とは全く異なる方法によ
り、その遺伝子断片を得ることに成功し、Ｃ型肝炎ウイ
ルスと命名された。その後、カイロン社の他、国立ガン
センタ−の下遠野ら（プロシ−ディングスオブ ナショ
ナル アカデミ− オブ サイエンス ユ−・エス・エ
−（Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳ
Ａ），８７，９５２４−９５２８，１９９０）、大阪大
・微研の高見沢ら（ジャ−ナル オブ ビロロジ−（Ｊ
ｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，６５，３，１
１０５−１１１３，１９９１））によって、Ｃ型肝炎ウ
イルスの構造蛋白質と非構造蛋白質の全遺伝子の配列が
発表されている。また、同遺伝子に関しては、多数の特
許出願がこれまでになされている（欧州特許公開３１８
２１６号、同３８８２３２号、同３９８７４８号、国際
特許出願公開ＷＯ９１／０１３７６号、欧州特許公開４
１９１８２号、英国特許２２３９２４５号、欧州特許公
開４５０９３１号、国際特許出願公開ＷＯ９１／１５５
１６号、欧州特許公開４６４２８７号、同４６３８４８
号、同４６８６５７号）。
【０００４】カイロン社は、Ｃ型肝炎ウイルスの非構造
蛋白質の一部であるＮＳ３からＮＳ４にかけての領域
（３６３残基）のポリペプチドをＣ末端に持つ融合タン
パク質（Ｎ末端側は、ヒト・スーパーオキシドジスムタ
ーゼ）を酵母で発現させ（特表平２−５００８８０号公
報、欧州特許公開３１８２１６号）、この組換え抗原を
用いて、オルソ社と共同でエライザ（エンザイムーリン
クト イムノソルベントアッセイ〔ｅｎｚｙｍｅ−ｌｉ
ｎｋｅｄ ｉｍｍｕｎｏｓｏｒｂｅｎｔ ａｓｓａ
ｙ〕）を開発した。日本の厚生省は世界に先駆けて、こ
の抗体検出キットを輸血用血液のスクリーニングやＣ型
肝炎の診断の補助に用いることを認可し、この検査キッ
トの輸入が承認された（１９８９年１２月２６日）翌日
より、日本赤十字社では全国的に献血者血液についてＨ
ＣＶ抗体のスクリーニングを開始した。日本において１
年間で輸血を受ける患者は約１７０万人いるが、この検
査薬導入前のＣ型肝炎発生率は１２．３％、導入後は、
約３％になると推定され、年に１７万３０００人あった
輸血によるＣ型肝炎患者が約４分の１になったことにな
る（朝日新聞 朝刊 １９９１年５月２日）。
【０００５】ところで、カイロン社の用いた組換え抗原
であるＣ１００−３クローンは、塩基配列、アミノ酸配
列においてのホモロジーが日本でクローニングされたも
のと２０％近く異なっている場合もあり、それが原因で
ＨＣＶ抗体が検出できないことも否めない。さらに、他
の領域においては（たとえば、カイロン社のいうところ
のＮＳ１，ＮＳ２，ＮＳ３，ＮＳ５各領域の１部、ある
いは大半）７０％以下のホモロジーしかないところがあ
ることも種々報告されており、前述のキットでは検出で
きない検体があることが容易に推定される。つまり、こ
こで注目すべきはＨＣＶは高頻度で遺伝子変異が起き、
この変異によってＨＣＶ由来タンパク質のエピトープ部
位も変異し、血清内で提示されるＨＣＶ関連抗原（特
に、ＨＣＶ由来タンパク質）に対する抗体にその影響を
与えると推測されることである。また、オルソ社の開発
した前述の検査キットでも高率に検出できるのは、肝炎
のうちでは慢性肝炎に移行する時期であり（最新医学
４５、１２、２３３１−２３３６、１９９０）、この抗
体の陽性時期は輸血後平均２４．７週と遅い（医学のあ
ゆみ １５１、８９２−８９６）ことなどから、感染後
の他の時期（特に急性期の肝炎等）のＨＣＶ抗体を検出
できる診断法の開発が待たれている。さらに、慢性肝炎
から肝硬変、肝癌と病症が進んでもＨＣＶは肝臓細胞か
ら検出される場合が多く、特に肝癌患者全体の約５割〜
６割近くにＨＣＶ感染が見られ、肝癌の発症とＨＣＶの
関連性に関する研究が盛んに行われ始めているが、未だ
明かになっていない。特に、ＨＣＶのキャリアのうちで
肝炎を発症していない人、急性肝炎患者、慢性肝炎患
者、さらにすすんだ病態を示す患者のそれぞれの血清を
用いても、常に高率で検出できる検査キット、あるい
は、肝炎のどの時期の患者血清かを示唆できる検査キッ
トは、未だ開発されていない。
【０００６】また、ＨＣＶにすでに感染している患者は
世界中に広がっており、例えば、日本では、献血者の１
０００人に約１２人の血清からＨＣＶが検出され、米
国、イタリア、スペインなどにおいても約０．８％、
１．５％、１．２％の感染率であると報告され社会的な
問題になっている（蛋白質 核酸 酵素 ３６、１０、
１６７９−１６９１、１９９１）。これら、ＨＣＶ患者
からＨＣＶを除く、あるいは消滅させる抗ウイルス的薬
剤は、全く開発されていない。
【０００７】
【発明の解決すべき問題点】従来の技術でも述べたよう
にＨＣＶ（Ｃ型肝炎ウイルス）の遺伝子は非常に変異し
やすいと考えられている。この変異によって、ＨＣＶの
サブタイプは大きく分かれウイルスを構成するタンパク
質の表面抗原部位のみならずタンパク質の性格付けを担
う重要な部位を含む様々な箇所が変異している。これら
のウイルス群は人に感染すればいわゆるＣ型肝炎を起こ
すと思われるが、タイプによっては症状が幾らか異なる
可能性もある。つまり、ホモロジーの低いものによって
は違うウイルスとさえも言えないこともない。また、我
々は、一人のＣ型肝炎の患者から配列表に示すようにア
ミノ酸配列や塩基配列の異なる複数のウイルスを単離し
ている。これらの変異のしやすさは、ＨＣＶ遺伝子が１
本鎖のＲＮＡであることに起因していると思われる。
【０００８】
【問題点を解決するための手段】本発明者らは、Ｃ型肝
炎患者の診断とワクチン開発のため、いままで発見され
たウイルスとは異なる新規のウイルスを取得し、いまま
で開発された診断系とは異なる性格の、特にいままで検
出できなかった範囲、あるいは、いままでより高率にＨ
ＣＶ抗体を検出できる診断法の開発と新規なワクチン開
発のため以下の要領で新規なＨＣＶ遺伝子を取得すべく
鋭意検討を重ね、かかる遺伝子ならびにそれのＤＮＡ断
片を取得するに至った。さらに本発明者らは、該ＤＮＡ
断片を利用して、かかる目的に有用な該ウイルスに由来
するタンパク質を組換えＤＮＡ技術によって生産するこ
とも可能とした。また、Ｃ型肝炎ウイルス由来のプロテ
アーゼ遺伝子領域とその周辺領域の２本鎖ｃＤＮＡ断片
から＋鎖のＲＮＡを合成させ、ｉｎ ｖｉｔｒｏでＨＣ
Ｖ由来のプロテアーゼを含むポリペプチドを合成させ、
該プロテアーゼの特異性、活性、種々の機能を調べ、該
プロテアーゼによるＨＣＶ由来前駆体ポリペプチドのプ
ロセッシングを特異的に抑制させる物質のスクリーニン
グ系も作成可能とした。該ｃＤＮＡ断片を用いて大腸菌
や動物細胞などでＨＣＶ由来前駆体ポリペプチドを発現
させることにより、細胞内で該ポリペプチドをプロセッ
シングさせ、そのプロセッシングを特異的に抑制させる
物質のスクリーニング系も作成可能とした。
【０００９】更に、Ｃ型肝炎ウイルス由来のＲＮＡ依存
性ＲＮＡポリメラーゼ遺伝子領域と予想される遺伝子領
域の２本鎖ｃＤＮＡ断片を用いて大腸菌や動物細胞など
でＨＣＶ由来ポリペプチドを発現させることにより、該
ポリペプチドの酵素活性を抑制させる物質のスクリーニ
ング系も作成可能とした。即ち、本発明の要旨は、配列
表の配列番号１〜４３、６４〜７５および１０１〜１０
４に示すアミノ酸配列でコードされる或いは塩基配列で
表される遺伝子またはＤＮＡ断片、それがコードするポ
リペプチドに存する。以下に本発明を説明するに、本発
明の新規なＨＣＶ由来の遺伝子またはＤＮＡ断片及びそ
れがコードするポリペプチドは、配列表の配列番号１〜
４３、６４〜７５および１０１〜１０４に示すものであ
り、該ポリペプチドはＣ型肝炎患者血清と特異的に免疫
化学的に反応する。もとより、本発明においては、かか
るＣ型肝炎患者血清との反応性を損なわない範囲で一部
のアミノ酸または核酸を除去、挿入、修飾あるいは追加
する等の改変を行ったものも本発明の新規なポリペプチ
ドおよびＤＮＡ断片に含まれる。
【００１０】また、配列表の配列番号の１〜１０４に示
すアミノ酸配列の１部で、Ｃ型肝炎患者血清と、異なっ
た特異性で免疫化学的に反応する該ポリペプチド（例え
ば、特許請求の範囲の請求項１１９、１２１、１２３、
１２５、１２７、１２９、１３１〜１３６、１３８、１
４０〜１５４、１５７〜１７９、１８５〜１９９に示
す）も、かかるＣ型肝炎患者血清との反応性を損なわな
い範囲で一部のアミノ酸を除去、挿入、修飾あるいは追
加する等の改変を行ったものも本発明の新規なポリペプ
チドに含まれる。 〔１〕（１）配列表の配列番号１〜１２に示すＣ型肝炎
患者血清由来ｃＤＮＡクローンを得る方法と該クローン
の塩基配列を決定する方法（コア〜エンベロープ領域） 本発明の配列表に示す塩基配列で表される新規なポリペ
プチドをコードする遺伝子またはＤＮＡ断片は、例え
ば、次のような方法によって得られる。
【００１１】このＨＣＶは、血清中に微量しか存在しな
いうえ、遺伝子がＲＮＡであると予想され、従来のｃＤ
ＮＡクローニング法であるＯｋａｙａｍａ−Ｂｅｒｇ法
や、Ｇｕｂｌｅｒ−Ｈｏｆｆｍａｎ法を基本とした方法
でのクローニングには困難が予想されたので、少量の血
清から変異の多い該遺伝子を確実にクローニングするた
めに、以下の方法によった。即ち、後述の実施例１で示
すようにＣ型肝炎患者の血清から核酸を抽出する。該血
清としては、通常、オルソ社の検査キットでの測定値で
ＯＤが３．５以上のものが使用されるが、この値に限ら
れるわけではない。血清にはウイルスＲＮＡのキャリア
としてトランスファーＲＮＡ（ｔＲＮＡ）を混ぜておく
のが好ましい。キャリアは必ずしもｔＲＮＡに限られる
ものではなく、ポリリボヌクレオシドであれば代用でき
る。ただし、ｔＲＮＡを使用すればインタクトな長さを
もったｔＲＮＡが必要量存在するかどうかを電気泳動で
迅速に確認できる利点があり、この確認をすることで少
なくとも、ウイルスＲＮＡのキャリアとしてトランスフ
ァーＲＮＡを混ぜたステップからはウイルスＲＮＡの分
解があるかどうかを確認することができる。
【００１２】かかる核酸からｃＤＮＡをクローニングす
る手段としては、Ｓａｉｋｉらの開発したポリメラーゼ
チェイン リアクション法｛（ＰＣＲ法） ネーチャ
ー（Ｎａｔｕｒｅ）、３２４，１２６，（１９８６）｝
を改良して利用する。まず、ウイルスＲＮＡを鋳型にし
て逆転写酵素を反応させる。この時、プライマーとして
は市販のランダムプライマーでも良いし、下記に示した
ような塩基配列の合成ＤＮＡを用いても良い。 ５′ ３′ Ｓ１；ＣＴＣＣＡＣＣＡＴＡＧＡＴＣＡＣＴＣＣ（配列番号：１０５） Ｓ２；ＡＧＧＴＣＴＡＧＴＡＧＡＣＣＧＴＧＣ（配列番号：１０６） Ｓ３；ＡＧＧＡＡＧＡＣＴＴＣＣＧＡＧＣＧＧ（配列番号：１０７） Ｓ４；ＣＧＴＧＡＡＣＴＡＴＧＣＡＡＣＡＧＧＧ（配列番号：１０８） ＡＳ１；ＡＣＣＧＣＴＣＧＧＡＡＧＴＣＴＴＣＣ（配列番号：１０９） ＡＳ２；ＧＧＧＣＡＡＧＴＴＣＣＣＴＧＴＴＧＣ（配列番号：１１０） ＡＳ３；ＧＣＴＧＧＡＴＴＣＴＣＴＧＡＧＡＣＧ（配列番号：１１１）
【００１３】ＰＣＲ法は、具体的には、実施例２に記述
したような条件で実施される。このようにして得られた
第１鎖相補鎖ＤＮＡ（１ｓｔ ｃＤＮＡ）を鋳型にして
実施例２のようにＰＣＲ法を行い目的の該ＤＮＡ断片を
得ることができる。このとき、ＰＣＲの条件は、プライ
マーの種類、組合せ、増幅する長さ等によって、異なる
ことがあるので適宜状況に応じて条件は変えても良い。
プライマーの組合せとしては、具体的には、例えば、次
のようなものが挙げられる。 Ｓ１−ＡＳ１ Ｓ１−ＡＳ２ Ｓ１−ＡＳ３ Ｓ２−ＡＳ１ Ｓ２−ＡＳ２ Ｓ２−ＡＳ３ Ｓ３−ＡＳ２ Ｓ３−ＡＳ３ Ｓ４−ＡＳ３
【００１４】実施例２［２］の方法に従って該ＤＮＡ断
片をクローニングするために必要な最小血清量は使用し
た血清内にある該ウィルス含量によって異なるが、例え
ば、前期のオルソ社のキットでＯＤが３以上である場合
は５〜７μｌ程度である。第１鎖相補鎖ＤＮＡを合成し
た時にプライマーとして、ランダムプライマーを使用し
た場合（実施例２［２］）と、独自に設計した合成ＤＮ
Ａを使用した場合（実施例２［３］）とでは最終的な塩
基配列が同一であることは、例えば、実施例８のような
方法で確認した。即ち、配列表の配列番号１に記載の領
域（クローンＮ１−１）を上記２通りの方法で取得し
た。同じ患者血清から取得したクローンは、ランダムプ
ライマーを使用した場合、独立に得られた３つのクロー
ンが配列表の配列番号１に示す塩基配列であった。ま
た、前述のＳ１とＡＳ１に示した合成ＤＮＡを使用した
場合、独立に得られた３つのクローンの内の２つが、配
列表の配列番号１に示す塩基配列と同じであり、残りの
１つのクローンが配列表の配列番号１の塩基配列番号で
３４５番目のＡがＣ、３３２番目のＡがＴ、９５番目の
ＡがＣと３カ所で異なっていた。この変異は、一人の患
者に感染している該ウィルスが２種類以上あることを示
している。
【００１５】このようにして得られたＤＮＡ断片は、独
立に３つ以上のクローンの塩基配列を両鎖に関して決定
する。塩基配列の決定にはデュポン社製蛍光シークエン
サージェネシス２０００（ＧＥＮＥＳＩＳ ２０００）
システムを用いて、デュポン社の該システム用のプロト
コールに従って行えば容易に決定できる。塩基配列が決
定しにくい所や、決定しようとするＤＮＡ断片が約１８
０塩基対以上ある場合には、常法に従い、サブクローニ
ングを行えばよい。以上のようにして決定された、後述
の実施例で得られたＤＮＡ断片の塩基配列は、配列表の
配列番号１から１２に表される通りである。本発明にお
いては、これらＤＮＡ断片の塩基配列の一部が変異して
いてもよい。具体的には、例えば、配列表の配列番号１
の塩基配列番号で３４５番目のＡがＣ、３３２番目のＡ
がＴ、９５番目のＡがＣに夫々変異していてもよい。 （２）クローンにコードされるポリペプチドの発現 次に、配列表の配列番号１から１２の塩基配列で示され
るＤＮＡ断片を発現させてＨＣＶ由来の組換えＣ型肝炎
特異抗原タンパク質を得る。
【００１６】本発明の発現ベクターは、上記のようにし
て得られたＨＣＶ由来の組換えＣ型肝炎特異抗原タンパ
ク質をコードするＤＮＡを転写できる位置にプロモータ
ーを含有している。例えば、大腸菌、枯草菌等、微生物
を宿主とするときは、発現ベクターは、プロモーター、
リボゾーム結合（ＳＤ）配列、ＨＣＶ由来の組換えＣ型
肝炎特異抗原タンパク質遺伝子、転写終結因子、及びプ
ロモーターを制御する遺伝子より成ることが望ましい。
プロモーターとしては、大腸菌、ファージ等由来のも
の、例えば、トリプトファン合成酵素（ｔｒｐ）、ラク
トースオペロン（ｌａｃ）、ラムダファージＰL、
ＰR 、Ｔ5 初期遺伝子Ｐ25、Ｐ26プロモーター等が挙げ
られる。また、これらは独自に設計された配列でも良
い。リボゾーム結合配列としては、大腸菌、ファージ等
由来のものでも良いが、独自に設計された配列を合成に
より作成した１６ＳリボゾームＲＮＡの３′末端領域に
相補的な配列を連続した４塩基以上のコンセンサス配列
を持ったものでも良い。転写終結因子は必ずしも必要で
はないが、ρ非依存性のもの、例えばリポプロテインタ
ーミネーター、ｔｒｐオペロンターミネーター、等を有
している方が望ましい。
【００１７】さらに、これらの発現に必要な因子の発現
プラスミド上での配列順序は、５′上流から、プロモー
ター、ＳＤ配列、ＨＣＶ由来の組換えＣ型肝炎特異抗原
タンパク質遺伝子、転写終結因子の順に並ぶことが望ま
しい。発現ベクターとしては、市販のｐＫＫ２３３−２
（ファルマシア社製）等が使用できる。また、融合蛋白
を発現させるには、発現ベクターｐＧＥＸシリーズ（フ
ァルマシア社製）等が使用される。宿主の形質転換法と
しては、実施例３に示すようにＴＯＹＯＢＯ社のプロト
コールに従うか、常法に従って行うことができる。形質
転換体の培養は、モレキュラー クローニング（Ｍｏｌ
ｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ、１９８２）に記述の方
法を参考に行えばよい。培養温度は２８℃から４２℃程
度である。また、真核生物、例えば、昆虫細胞、動物
（ほ乳類）細胞等における発現ベクターを構成する基本
的な単位は、前述の微生物のものと変わらないが、次の
ようなものが好ましい。
【００１８】昆虫細胞としては、例えば、インビトロジ
ェン社のバキュロウイルス発現マニュアルであるマック
スバック（ＭＡＸＢＡＣTM、ＢＡＣＵＬＯＶＩＲＵＳ
ＥＸＰＲＥＳＳＩＯＮ ＳＹＳＴＥＭ ＭＡＮＵＡＬ
ＶＥＲＳＩＯＮ １．４）に従い、このキットを利用す
る。この時、発現量をあげるためポリヘドリンのプロモ
ーターから開始コドンまでの距離を変えることが望まし
い。動物細胞でのプロモーターとしては、ＳＶ４０初期
プロモーター、ＳＶ４０後期プロモーター、アポリポプ
ロテインＥ遺伝子プロモーター等が使用される。基本的
には、発現ベクターｐＫＣＲ（プロシーディングス オ
ブ ナショナル アカデミー オブ サイエンス ユー
・エス・エー、７８、１５２８、（１９８１））あるい
はその基本的機能を最低限損わない程度に改良したｐＢ
ＰＶ ＭＴ１（プロシーディングス オブ ナショナル
アカデミー オブ サイエンス ユー・エス・エー、
８０、３９８、（１９８３））等が使用できる。発現ベ
クターで形質転換される動物細胞としては、ＣＨＯ細
胞、ＣＯＳ細胞、等があげられる。大腸菌などの微生
物、昆虫細胞、及び動物細胞で発現させた該組換えポリ
ペプチドをＨＣＶ由来抗原として同定するには、ＨＣＶ
患者血清との免疫学的反応性を利用する。即ち、ウエス
タンブロッティング法により同定する。
【００１９】この方法によって測定した結果、本発明の
配列表の配列番号１から１２に記載のアミノ酸配列を持
つポリペプチドがＣ型肝炎関連抗原であり、Ｃ型肝炎患
者血清のみに由来するｃＤＮＡから発現されたポリペプ
チドであることがわかった。これらのポリペプチドの
内、配列表の配列番号５、６及び８のアミノ酸配列で１
番目から１９１番目までの１９１個のアミノ酸から成る
ポリペプチドは、昆虫細胞内の発現においてプロセッシ
ングを受け切断された後、得られたポリペプチドである
と推測される。則ち、配列番号５、６及び８に記載のア
ミノ酸配列で１７４番目から１８８番目まで（領域Ａ）
に疎水性で分子量の大きい側鎖を持つアミノ酸が主に続
き、１８９番目と１９１番目に分子量の小さい側鎖をも
つアラニンがつづいている。この配列パターンは、動物
（昆虫も含む）細胞内でシグナルペプチダーゼが認識す
るシグナル領域の性質を保持している。また、これらの
配列の前後の配列は、今までクローニングされた公知の
他のＣ型肝炎ウイルス遺伝子の塩基配列と比べ、塩基配
列の置換あるいは、それに対応するアミノ酸配列の変異
が大きい。しかし、領域ＡとＢは変異が非常に少なくな
っている。よって、１９１番目のアラニンのＣ末側がシ
グナルペプチターゼによって切断されるものと推測され
る。
【００２０】また、この配列表の配列番号５、６及び８
に記載のアミノ酸配列で１番目から１９１番目のポリペ
プチドは、今まで報告された日本脳炎ウィルスや黄熱病
ウィルスのコア及びマトリックス領域のポリペプチドの
アミノ酸配列との相同性から、コア蛋白質またはコア蛋
白質及びマトリックス蛋白質であると思われる。本発明
においては、かかる１９１個のアミノ酸から成るポリペ
プチドを「コアタンパク質」または「コア領域」と称す
る。配列表の配列番号１、９、１０、１１及び１２のア
ミノ酸配列で１番目から１８番目までの１８個のアミノ
酸から成るポリペプチド、配列番号３のアミノ酸配列で
４０番目から７３番目までの３４個のアミノ酸からなる
ポリペプチド、及び、同８１番目から１１５番目までの
３５個のアミノ酸から成るポリペプチドは、今までクロ
ーニングされた公知の他のＣ型肝炎ウイルス遺伝子（前
述した、カイロン社、下遠野ら及び高見沢らがクローニ
ングしたＨＣＶ遺伝子）から予想されるアミノ酸配列と
比較して、ホモロジーが高く、親水性度が比較的高いた
め、診断用の抗原ペプチドとして、あるいは、ワクチン
として有用である。
【００２１】また、配列表の配列番号４のアミノ酸配列
で４０番目から５７番目までの１８個のアミノ酸から成
るポリペプチド、及び、同２４０番目から２５１番目ま
での１２個のアミノ酸から成るポリペプチドは、今まで
クローニングされた公知の他のＣ型肝炎ウイルス遺伝子
から予想されるアミノ酸配列と比較して、極めてホモロ
ジーが低く、親水性度が比較的高いため、診断用の抗原
ペプチドとして有用である。なお、これらのポリペプチ
ドは、遺伝子組換え技術により生産させても、合成法で
生産してもよい。更にまた、配列表の配列番号３のアミ
ノ酸配列でコア蛋白質のエピトープ領域である１番目か
ら１１５番目までの１１５個のアミノ酸から成るポリペ
プチド、及び、同１番目から１９１番目までのコア蛋白
質の全領域を表わす１９１個のアミノ酸から成るポリペ
プチドは遺伝子組換え技術による大量生産が可能であ
り、診断用あるいは、ワクチンとして有用である。一
方、これらのポリペプチドの内、配列表の配列番号４の
アミノ酸配列で３１番目から２２２番目までの１９２個
のアミノ酸から成るポリペプチドは、昆虫細胞内の発現
においてプロセッシングを受け切断された後、得られた
ポリペプチドであると推測される。則ち、配列表の配列
番号４に記載のアミノ酸配列で１３番目から２９番目ま
で（領域Ａ）に疎水性で分子量の大きい側鎖を持つアミ
ノ酸が主に続き、３０番目に分子量の小さい側鎖をもつ
アラニンがつづいている。また、２１０番目から２２１
番目まで（領域Ｂ）も同様に疎水性で分子量の大きい側
鎖を持つアミノ酸が主に続き、２２２番目に分子量の小
さい側鎖をもつグリシンが続いている。この配列パター
ンは、動物（昆虫も含む）細胞内でシグナルペプチダー
ゼが認識するシグナル領域の性質を保持している。
【００２２】また、これらの配列の前後の配列は、今ま
でクローニングされた公知の他のＣ型肝炎ウイルス遺伝
子の塩基配列と比べ、塩基配列の置換あるいは、それに
対応するアミノ酸配列の変異が大きい。しかし、領域Ａ
とＢは変異が非常に少なくなっている。よって、３０番
目のアラニンのＣ末側と２２２番目のＣ末側がシグナル
ペプチターゼによって切断されるものと推測される。少
なくともこのポリペプチドは、今までクローニングされ
た公知の他のＣ型肝炎ウイルス遺伝子の塩基配列のこの
領域に相当する塩基配列とのホモロジーの低さから、Ｈ
ＣＶのエンベローブタンパク質そのもの、あるいは、そ
の１部であると思われる。本発明においては、かかる１
９２個のアミノ酸から成るポリペプチドを「Ｍ−ｇｐ３
５」、「Ｍ−ｇｐ３５蛋白質」または「Ｍ−ｇｐ３５領
域」と称する。配列表の配列番号４のアミノ酸配列で１
３４番目から１５２番目までの１９個のアミノ酸から成
るポリペプチド、同２２３番目から２３９番目までの１
７個のアミノ酸から成るポリペプチド、及び、同９２番
目から１０９番目までの１８個のアミノ酸から成るポリ
ペプチドは、今までクローニングされた公知の他のＣ型
肝炎ウイルス遺伝子から予想されるアミノ酸配列と比較
して、ホモロジーが高く、親水性度が比較的高いため、
診断用の抗原ペプチドとして、あるいは、ワクチンとし
て有用である。
【００２３】また、配列表の配列番号４のアミノ酸配列
で４０番目から５７番目までの１８個のアミノ酸から成
るポリペプチド、及び、同２４０番目から２５１番目ま
での１２個のアミノ酸から成るポリペプチドは、今まで
クローニングされた公知の他のＣ型肝炎ウイルス遺伝子
から予想されるアミノ酸配列と比較して、極めてホモロ
ジーが低く、親水性度が比較的高いため、診断用の抗原
ペプチドとして有用である。これらのポリペプチドは、
組換えＤＮＡの技術によることなく、合成法で生産して
もよい。更にまた、配列表の配列番号４のアミノ酸配列
で３１番目から１０６番目までの７６個のアミノ酸から
成るポリペプチド、及び、同１３４番目から１６９番目
までの３６個のアミノ酸から成るポリペプチドはＭ−ｇ
ｐ３５タンパク質のエピトープ領域であるが、組換えＤ
ＮＡ技術による大量生産が可能であり、診断用あるい
は、ワクチンとして有用である。
【００２４】〔２〕（１）配列表１３から２７に示すＣ
型肝炎患者血清由来ｃＤＮＡクローンを得る方法と該ク
ローンの塩基配列を決定する方法（ＮＳ１（ｇｐ７０）
領域） 本発明の配列表１３から２７に示す塩基配列で表される
新規なポリペプチドをコードする遺伝子またはＤＮＡ断
片は、例えば、次のような方法によって得られる。この
ＨＣＶは、血清中に微量しか存在しない上、遺伝子がＲ
ＮＡであると予想され、従来のｃＤＮＡクローニング法
であるＯｋａｙａｍａ−Ｂｅｒｇ法や、Ｇｕｂｌｅｒ−
Ｈｏｆｆｍａｎ法を基本とした方法でのクローニングに
は困難が予想されたので、少量の血清から変異の多い該
遺伝子を確実にクローニングするために、以下の方法に
よった。即ち、後述の実施例１で示すようにＣ型肝炎患
者の血清から核酸を抽出する。該血清としては、通常、
オルソ社の検査キットでの測定値でＯＤが３．５以上の
ものを使用するがこの値に限られるわけではない。血清
にはウイルスＲＮＡのキャリアとしてトランスファーＲ
ＮＡ（ｔＲＮＡ）を混ぜておくのが好ましい。キャリア
は必ずしもｔＲＮＡに限られるものではなく、ポリリボ
ヌクレオシドであれば代用できる。ただし、ｔＲＮＡを
使用すればインタクトな長さをもったｔＲＮＡが必要量
存在するかどうかを電気泳動で迅速に確認できる利点が
あり、この確認をすることで少なくとも、ウイルスＲＮ
ＡのキャリアとしてトランスファーＲＮＡを混ぜたステ
ップからはウイルスＲＮＡの分解があるかどうかが確認
することができる。
【００２５】かかる核酸からｃＤＮＡをクローニングす
る手段としては、Ｓａｉｋｉらの開発したポリメラーゼ
チェイン リアクション法｛（ＰＣＲ法） ネーチャ
ー、３２４，１２６，（１９８６）｝を利用する。ま
ず、ウイルスＲＮＡを鋳型にして逆転写酵素を反応させ
る。この時、プライマーとしては市販のランダムプライ
マーでも良いし、下記に示したプライマーのうちＭＳ１
２３、ＭＳ１５７、ＭＳ１４８のような塩基配列の合成
ＤＮＡを用いても良い。 ５′ ３′ ＭＳ１２２；ＧＡＧＧＣＣＧＴＧＡＡＣＴＧＣＧＡＴＧＡ（配列番号：１１２ ） ＭＳ１４８；ＴＴＣＴＣＴＡＡＧＧＴＧＧＣＮＴＣＮＧＣＮＴＧ（配列番号： １１３） ＭＳ１５７；ＣＣＧＧＡＣＧＣＧＴＴＧＡＡＮＣＴＮＴＧＮＧＴ（配列番号： １１４） ＭＳ１２３；ＣＡＴＣＣＡＧＧＴＡＣＡＡＣＣＧＡＡＣＣＡ（配列番号：１１ ５） ＭＳ１４６；ＡＡＣＡＣＡＣＧＧＣＣＧＣＣＮＣＡＮＧＧＮＡＡ（配列番号： １１６） ＭＳ１５６；ＣＣＧＧＡＴＣＣＣＡＣＡＡＧＣＣＧＴＮＧＴＮＧＡ（配列番号 ：１１７）
【００２６】この配列中にある「Ｎ」は、イノシンを示
している。これらの配列で５’側の配列を数塩基を他の
配列に変えても良いが、好ましくは５’側から１０塩基
以内の変異で数塩基内であれば良い、さらに好ましく
は、５’側から５塩基以内の変異が良い。また、これら
の配列で５’側の配列を４から５塩基を欠如してもよい
が、好ましくは５’側から数塩基の欠如が好ましい。ま
た、８から１２塩基程であれば５’側に任意の配列を付
加してもよいが、好ましくは５から６塩基の付加、さら
に好ましくは数塩基の付加なら良い。ＰＣＲ法は、具体
的には、実施例９に記述したような条件で実施される。
このようにして得られた第１鎖相補鎖ＤＮＡ（１ｓｔ
ｃＤＮＡ）を鋳型にして実施例９のようにＰＣＲ法を行
い目的の該ＤＮＡ断片を得ることができる。このとき、
ＰＣＲの条件は、プライマーの種類、組合せ、増幅する
長さ等によって、異なることがあるので適宜状況に応じ
て条件は変えても良い。プライマーの組合せとしては、
具体的には、例えば、次のようなものが挙げられる。
【００２７】ＭＳ１２２−ＭＳ１２３ ＭＳ１５７−ＭＳ１５６ ＭＳ１４８−ＭＳ１４６ このようにして得られたＤＮＡ断片は、常法によりクロ
ーニングベクター（例えば、pUC19）のクローニングサ
イトの１つに（例えば、SmaＩサイト）組み込まれる。
この該ＤＮＡ断片を持つプラスミドを用いて、独立に３
つ以上のクローンの塩基配列を両鎖に関して決定する。
塩基配列の決定にはデュポン社製蛍光シークエンサージ
ェネシス２０００（ＧＥＮＥＳＩＳ ２０００）システ
ムを用いて、デュポン社の該システム用のプロトコール
に従って行えば容易に決定できる。塩基配列が決定しに
くい所や、決定しようとするＤＮＡ断片が約１８０塩基
対以上ある場合には、常法に従い、サブクローニングを
行えばよい。このようにして決定された、該ＤＮＡ断片
の塩基配列は、配列表の配列番号１３から２７に表され
る通りである。
【００２８】また、クローンＮ１９−１、２、３とクロ
ーンＮ２７−１、２、３は、一人の患者Ｎの血清から得
られ、Ｈ１９−２、４、１０ とＹ１９−４、６、７も
それぞれの独立の患者Ｈ，Ｙの血清から得られたクロー
ンである。ＭＸ２４−４、５、１３は複数のＣ型肝炎患
者血清プールから得られた。さらにプライマーＭＳ１５
７とプライマーＭＳ１５６の組み合せから得られた配列
表の配列番号１３から１５に示すクローンは、ＨＣＶ遺
伝子上で同じ領域に対応する（以下、この領域をＮ２７
領域と呼ぶ）。また、同じ理由でプライマーＭＳ１２２
とプライマーＭＳ１２３を用いて得た配列表の配列番号
１６〜２４のクローンもＨＣＶ遺伝子上で同じ領域（以
下、この領域をＮ１９領域と呼ぶ）であるし、配列表の
配列番号２５から２７に示す三つのクローンもプライマ
ーＭＳ１４８とプライマーＭＳ１４６から得られ、ＨＣ
Ｖ遺伝子上で同じ領域（以下、この領域をＭＸ２４領域
と呼ぶ）に相当する。さらに、国立ガンセンター 加藤
らが、発表（プロシ−ディングスオブ ナショナル ア
カデミ− オブ サイエンス ユ−・エス・エ−（Ｐｒ
ｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ），８７，
９５２４−９５２８，１９９０）、大阪大・微研会の高
見沢ら（ジャ−ナル オブ ビロロジ−（Ｊｏｕｒｎａ
ｌ ｏｆ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，６５，３，１１０５−１
１１３，１９９１））したＣ型肝炎ウイルス遺伝子の配
列とのホモロジーから、得られた各該クローンの領域は
指定されるＨＣＶ遺伝子上で５’から順にＮ２７の領
域、Ｎ１９の領域、ＭＸ２４の領域と並んでおり、ま
た、それぞれの領域には重なり合っている部分があり、
この重なる領域を利用して次のように各ＤＮＡ断片を連
結した。
【００２９】（２）配列表の配列番号１３から２７に示
されるクローンの連結 配列表の配列番号１３から２７のＣ型肝炎患者血清由来
ｃＤＮＡクローンを以下に記述するように連結する。 配列表の配列番号１３から１５のクローンと、配列
表の配列番号１６から２４の連結 配列表の配列番号１３から１５の塩基配列、５’側から
３３０番目〜３３５番目にあるMluＩサイトで切断し、
それぞれ配列表の配列番号１６から２４の塩基配列のＤ
ＮＡの５’側から７１番目にあるMluＩサイトとライゲ
ーション反応で連結させ、５’側にＮ２７−１、２、３
由来のＤＮＡ断片、３’側にクローンＮ１９−１、２、
３、と、クローンＨ１９−２、４、１０、と、クローン
Ｙ１９−４、６、７由来のＤＮＡ断片を持つクローンを
２７種得た。例えば、Ｎ２７−３とＮ１９−１を連結し
た場合に得られるクローンは配列表の配列番号２８に示
すクローンＮ２７Ｎ１９−１である。 配列表の配列番号１６から２４のクローンと、配列
表の配列番号２５から２７のクローンの連結
【００３０】配列表の配列番号１６から２４のクローン
それぞれと、配列表１３から１５のそれぞれのクローン
とはＰＣＲ法を用いて連結させた。この方法で５４種の
クローンを得た。即ち、２７通りは、配列表の配列番号
１６から２４のＮ末端（アミノ末端）〜Ｃ末端までの１
３１残基からなるアミノ酸配列をＮ末端に持ち、１３２
番目〜Ｃ末端（カルボキシル末端）に、配列表の配列番
号２５から２７のアミノ酸配列の１６番目〜Ｃ末端まで
のアミノ酸配列をもつポリペプチドをコードするＤＮＡ
断片であり、例えばＮ１９−１とＭＸ２４−４を用いた
場合は、配列表の配列番号２９に示すクローンＮ１９Ｍ
Ｘ２４Ａ−１を得た。配列表の配列番号１６から２４の
Ｎ末端（アミノ末端）〜１１６番目までのアミノ酸配列
をＮ末端に持ち、１１７番目〜Ｃ末端（カルボキシル末
端）に、配列表の配列番号２５から２７のアミノ酸配列
のＮ末端〜Ｃ末端までの２０９残基からなるアミノ酸配
列をもつポリペプチドをコードするＤＮＡ断片であり、
例えばＮ１９−１とＭＸ２４−４を用いた場合は、配列
表の配列番号３０に示すクローンＮ１９ＭＸ２４Ｂ−１
を得た。
【００３１】配列表の配列番号１３から２７のクロー
ンの連結 配列表の配列番号１３から１５の塩基配列番号で５’側
から３３０番目〜３３５番目にあるMluＩサイトで切断
し、〓−の塩基配列のうち７１番目〜７６番目にある
MluＩサイトとライゲーション反応で連結させ、クロー
ンＮ２７ＭＸ２４シリーズが得られた。例えば、Ｎ２７
−３とＮ１９ＭＸ２４Ａ−１を連結させた場合に得られ
るクローンは配列表の配列番号３１に示すクローンＮ２
７ＭＸ２４Ａ−１である。また、Ｎ２７−３とＮ１９Ｍ
Ｘ２４Ｂ−１を連結させた場合に得られるクローンは配
列表の配列番号３２に示すクローンＮ２７ＭＸ２４Ｂ−
１である。加藤ら（プロシ−ディングス オブ ナショ
ナル アカデミ− オブ サイエンス ユ−・エス・エ
−（Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳ
Ａ），８８，５５４７−５５５１，１９９１）と、土方
ら（１９９０年度 日本分子生物学会 １１月２９
日）によって報告されたＨＣＶ遺伝子由来全アミノ酸配
列とのホモロジーにより、クローンＮ２７Ｎ１９ＭＸ２
４Ａ−１は、加藤らの報告したｇｐ７０に相当するポリ
ペプチドの遺伝子を全域含んでいる。即ち、配列表の配
列番号３１と３２のアミノ酸番号で４６番目〜３９５番
目までが加藤らの報告したｇｐ７０のポリペプチドに相
当する。
【００３２】また配列表の配列番号１３〜１５のアミノ
酸番号１番目〜４５番目までが土方ら（１９９０年度
日本分子生物学会 １１月２９日）の報告したポリペプ
チドｇｐ３５のＣ末側、４６番目から最後までが土方ら
の報告したｇｐ７０のＮ末側に相当する。また、配列表
の配列番号１３〜１５はアミノ酸番号で４６番〜Ｃ末端
が、加藤らの報告したｇｐ７０のＮ末端〜６７番目のア
ミノ酸に相当する。配列表の配列番号１６〜２４はアミ
ノ酸番号でＮ末端〜Ｃ末端が、ｇｐ７０の４２〜１７２
番目のアミノ酸に相当し、加藤らの報告したｇｐ７０の
部分ポリペプチドである。配列表の配列番号２５〜２７
のアミノ酸番号で１番目が土方らの報告したｇｐ７０の
Ｎ末端から数えて１５８番目のアミノ酸に相当し、下遠
野らの報告したｇｐ７０のＣ末端とされるアミノ酸が配
列表の配列番号２５〜２７のアミノ酸番号で３５０番目
であり、配列表の配列番号２５〜２７のアミノ酸番号で
１９４番目〜Ｃ末端は、Ｃ型肝炎ウイルスの非構造タン
パク質ＮＳ２のＮ末端側領域に相当する。
【００３３】（２）で得られた連結した各種クローン
も、土方らの報告したｇｐ７０に相当するポリペプチド
の一部またはすべてをコードしている。例えば、配列表
の配列番号３１または３２のアミノ酸番号で４６番目〜
３９５番目のポリペプチドが、土方らの報告したｇｐ７
０に相当する。また、配列表の配列番号３１または３２
のアミノ酸番号で４６番目〜３９５番目のポリペプチド
に相当する領域のＨＣＶ遺伝子から発現するタンパク質
をｇｐ７０と呼ぶが、本発明で得られたｇｐ７０を特
に、以下、Ｍ−ｇｐ７０と呼び、土方らが１９９０年度
日本分子生物学会１１月２９日で発表報告しているｇ
ｐ７０と区別する。 （３）（１）、（２）で得られた該クローンにコードさ
れるポリペプチドの発現 次に、（１）、（２）で得られた該クローンにコードさ
れるポリペプチドを発現させてＨＣＶ由来の組換えＣ型
肝炎特異抗原タンパク質を得る。本発明の発現ベクター
は、上記のようにして得られたＨＣＶ由来の組換えＣ型
肝炎特異抗原タンパク質をコードするＤＮＡを転写でき
る位置にプロモーターを含有している。例えば、大腸
菌、枯草菌等、微生物を宿主とするときは、発現ベクタ
ーは、プロモーター、リボゾーム結合（ＳＤ）配列、Ｈ
ＣＶ由来の組換えＣ型肝炎特異抗原タンパク質遺伝子、
転写終結因子、及びプロモーターを制御する遺伝子より
成ることが望ましい。
【００３４】プロモーターとしては、大腸菌、ファージ
等由来のもの、例えば、トリプトファン合成酵素（ｔｒ
ｐ）、ラクトースオペロン（ｌａｃ）、ラムダファージ
ＰL、ＰR 、Ｔ5 初期遺伝子Ｐ25、Ｐ26プロモーター等
が挙げられる。また、これらは独自に設計された配列で
も良い。リボゾーム結合配列としては、大腸菌、ファー
ジ等由来のものでも良いが、独自に設計された配列を合
成により作成した１６ＳリボゾームＲＮＡの３′末端領
域に相補的な配列を連続した４塩基以上のコンセンサス
配列を持ったものでも良い。転写終結因子は必ずしも必
要ではないが、ρ非依存性のもの、例えばリポプロテイ
ンターミネーター、ｔｒｐオペロンターミネーター、等
を有している方が望ましい。さらに、これらの発現に必
要な因子の発現プラスミド上での配列順序は、５′上流
から、プロモーター、ＳＤ配列、ＨＣＶ由来の組換えＣ
型肝炎特異抗原タンパク質遺伝子、転写終結因子の順に
並ぶことが望ましい。発現ベクターとしては、市販のｐ
ＫＫ２３３−２（ファルマシア社製）等が使用できる。
また、融合蛋白を発現させるには、発現ベクターｐＧＥ
Ｘシリーズ（ファルマシア社製）等が使用される。
【００３５】宿主の形質転換法としては、実施例１０に
示すように東洋紡社のプロトコールに従うか、常法に従
って行うことができる。形質転換体の培養は、モレキュ
ラー クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉ
ｎｇ、１９８２）に記述の方法を参考に行えばよい。培
養温度は２８℃から４２℃程度である。また、真核生
物、例えば、昆虫細胞、等における発現ベクターを構成
する基本的な単位は、前述の微生物のものと変わらない
が、次のようなものが好ましい。昆虫細胞としては、例
えば、インビトロジェン社のバキュロウイルス発現マニ
ュアルであるマックスバック（ＭＡＸＢＡＣTM、ＢＡＣ
ＵＬＯＶＩＲＵＳ ＥＸＰＲＥＳＳＩＯＮ ＳＹＳＴＥ
Ｍ ＭＡＮＵＡＬ ＶＥＲＳＩＯＮ １．４）に従い、
このキットを利用する。この時、発現量をあげるためポ
リヘドリンのプロモーターから開始コドンまでの距離を
変えることが望ましい。
【００３６】大腸菌や真核生物における発現ベクターに
該クローンを導入する際、ベクター由来の開始コドンの
フレームに合うようにすればよく、また、ベクター由来
の開始コドンを利用しない場合でも、該クローンの翻訳
フレームに合うように５’側に開始コドンを付加してか
ら発現ベクターに導入すればよい。この場合の、該クロ
ーンの翻訳フレームとは、例えば代表されるクローンと
して示した配列表の配列番号１３から３２において、ア
ミノ酸一つに対して対応している三つずつに分けられた
塩基配列の枠組みのことである。大腸菌などの微生物、
昆虫細胞で発現させた該組換えポリペプチドをＨＣＶ由
来抗原として同定するには、ＨＣＶ患者血清との免疫学
的反応性を利用する。即ち、ウエスタンブロッティング
法により同定する。また、大腸菌で、上記（１）、
（２）で得られた該クローンを発現させる場合、ｇｐ３
５、ｇｐ７０、ＮＳ２と呼ばれている、それぞれの領域
の間で切断されることなく、一本のポリペプチドが発現
される。昆虫細胞で発現させる場合は、各ポリペプチド
ｇｐ３５、ｇｐ７０、ＮＳ２と呼ばれている、それぞれ
の領域の間で切断される。クローンＮ２７ＭＸ２４Ａ−
１、クローンＮ２７ＭＸ２４Ｂ−１を昆虫細胞、動物細
胞で発現させると、クローンＮ２７ＭＸ２４Ａ−１、ク
ローンＮ２７ＭＸ２４Ｂ−１由来のポリペプチドＭ−ｇ
ｐ７０がプロセッシングされ、発現していた。また該Ｍ
−ｇｐ７０は、糖タンパク質であった。
【００３７】配列表の配列番号３１または３２のアミノ
酸配列で１４３番目〜１５５番目までの１３個のアミノ
酸から成るポリペプチド、同１７１番目〜１９１番目ま
での（少なくとも、同１８２番目〜１８７番目までを含
む）２１個のアミノ酸から成るポリペプチド、同２０２
番目〜２１５番目まで（少なくとも、同２０２番目〜２
０９番目までを含む）の１４個のアミノ酸から成るポリ
ペプチド、同２４４番目〜２５６番目までの１３個のア
ミノ酸から成るポリペプチド、及び、同２９９番目〜３
１９番目までの２１個のアミノ酸から成るポリペプチド
は、今までクローニングされた公知の他のＣ型肝炎ウイ
ルス遺伝子から予想されるアミノ酸配列と比較して、ホ
モロジーが比較的高く、親水性度も比較的高い。また、
Ｍ−ｇｐ７０はＨＣＶ遺伝子上でエンベローブタンパク
質（Ｍ−ｇｐ３５）のＣ末側に隣接し糖タンパク質であ
る。また、膜通過推定領域を持つ。これらのことから、
今だ機能がわかっていないｇｐ７０の全てあるいは１部
がウイルスのエンベローブタンパク質の１部とすると上
記５種のペプチド断片、さらにそれらを含む、配列表の
配列番号３１、３２のアミノ酸配列で１０９番目〜２１
４番目までの１０６個のアミノ酸から成るポリペプチ
ド、及び同２３３番目〜３２４番目までの９２個のアミ
ノ酸から成るポリペプチドはワクチンとして有用であ
る。
【００３８】さらに、Ｍ−ｇｐ７０のエピトープ部位と
予想される配列表の配列番号３１、３２のアミノ酸配列
で２５２番目〜２６１番目までの（少なくとも、同２５
２番目〜２５６番目までを含む）１０個のアミノ酸から
成るポリペプチド、同２５０番目〜２８３番目までの
（少なくとも、同２７３番目〜２７９番目までを含む）
３４個以下のアミノ酸から成るポリペプチド、同７７番
目〜９６番目までの２０個のアミノ酸から成るポリペプ
チド、同３０６番目〜３２３番目までの１８個のアミノ
酸から成るポリペプチド、及び、同１２２番目〜１３７
番目までの１６個のアミノ酸から成るポリペプチドは、
ワクチンとして有用である。また、配列表の配列番号３
１または３２のアミノ酸配列で１３６番目〜１４７番目
までの（少なくとも、同１３６番目〜１４２番目までを
含む）１２個のアミノ酸から成るポリペプチド、同４５
番目〜７１番目までの（少なくとも、同５３番目〜６９
番目までを含む）２７個のアミノ酸から成るポリペプチ
ド、及び、同１９３番目〜２０１番目までの９個のアミ
ノ酸から成るポリペプチドは、今までクローニングされ
た公知の他のＣ型肝炎ウイルス遺伝子から予想されるア
ミノ酸配列と比較して、極めてホモロジーが低く、親水
性度が比較的高い。これらのポリペプチドは、組換えＤ
ＮＡの技術によることなく、合成法で生産してもよい。
【００３９】前述の配列表の配列番号３１または３２の
アミノ酸配列で１０９番目〜２１４番目までの１０６個
のアミノ酸から成るポリペプチド、及び同２３３番目〜
３２４番目までの９２個のアミノ酸から成るポリペプチ
ドも組換えＤＮＡ技術による大量生産が可能である。
【００４０】〔３〕（１）配列表の配列番号３３〜４４
に示すＣ型肝炎患者血清由来ｃＤＮＡクローンを得る方
法と該クローンの塩基配列を決定する方法（ＮＳ２〜４
領域） 本発明の配列表に示す塩基配列で表される新規なポリペ
プチドをコードする遺伝子またはＤＮＡ断片は、例え
ば、次のような方法によって得られる。このＨＣＶは、
血清中に微量しか存在しないうえ、遺伝子がＲＮＡであ
ると予想され、従来のｃＤＮＡクローニング法であるＯ
ｋａｙａｍａ−Ｂｅｒｇ法や、Ｇｕｂｌｅｒ−Ｈｏｆｆ
ｍａｎ法を基本とした方法でのクローニングには困難が
予想されたので、少量の血清から変異の多い該遺伝子を
確実にクローニングするために、以下の方法によった。
即ち、後述の実施例１で示すようにＣ型肝炎患者の血清
から核酸を抽出する。該血清としては、通常、オルソ社
の検査キットでの測定値でＯＤが３．５以上のものが使
用されるが、この値に限られるわけではない。血清には
ウイルスＲＮＡのキャリアとしてトランスファーＲＮＡ
（ｔＲＮＡ）を混ぜておくのが好ましい。キャリアは必
ずしもｔＲＮＡに限られるものではなく、ポリリボヌク
レオシドであれば代用できる。ただし、ｔＲＮＡを使用
すればインタクトな長さをもったｔＲＮＡが必要量存在
するかどうかを電気泳動で迅速に確認できる利点があ
り、この確認をすることで少なくとも、ウイルスＲＮＡ
のキャリアとしてトランスファーＲＮＡを混ぜたステッ
プからはウイルスＲＮＡの分解があるかどうかを確認す
ることができる。
【００４１】かかる核酸からｃＤＮＡをクローニングす
る手段としては、Ｓａｉｋｉらの開発したポリメラーゼ
チェイン リアクション法｛（ＰＣＲ法） ネーチャ
ー、３２４，１２６，（１９８６）｝を利用することが
できる。まず、ウイルスＲＮＡを鋳型にして逆転写酵素
を反応させる。この時、プライマーとしては市販のラン
ダムプライマーでも良いし、下記に示したプライマーの
うちＭＳ４９、ＭＳ１５２、ＭＳ１５８、ＭＳ１３２、
ＭＳ１００、ＭＳ８８のような塩基配列の合成ＤＮＡを
用いても良い。
【００４２】 ５′ ３′ ＭＳ４９；ＧＡＣＡＴＧＣＡＴＧＴＣＡＴＧＡＴＧＴＡ（配列番号：１１８） ＭＳ８８；ＧＧＣＴＧＣＡＧＣＣＧＧＴＴＣＡＴＣＣＡＣＴＧＣＡＣ（配列番 号：１１９） ＭＳ１００；ＧＣＧＧＡＴＣＣＴＧＣＴＴＣＧＣＣＣＡＧＡＡＧＧＴＣ（配列 番号：１２０） ＭＳ１３２；ＧＡＣＡＣＡＴＧＴＧＴＴＧＣＡＧＴＣＧＡＴＣ（配列番号：１ ２１） ＭＳ１５２；ＣＧＧＴＣＣＮＡＧＮＡＧＴＡＴＣＴＣＮＴＴＮＣＣ（配列番号 ：１２２） ＭＳ１５８；ＡＴＧＧＧＣＣＣＧＧＧＮＧＡＮＡＧＮＡＧＮＣＴＣＣＣＣＣ ＴＮＣＴＮＴＣ（配列番号：１２３） ＭＳ４８；ＧＧＣＴＡＴＡＣＣＧＧＣＧＡＣＴＴＣＧＡ（配列番号：１２４） ＭＳ８６；ＧＣＧＧＡＴＣＣＧＧＣＣＴＣＡＣＣＣＡＣＡＴＡＧＡＴＧ（配列 番号：１２５） ＭＳ９７；ＧＣＧＧＡＴＣＣＴＣＣＡＣＣＴＣＣＡＴＣＧＴＧ（配列番号：１ ２６） ＭＳ１３５；ＣＴＧＣＴＧＴＣＧＣＣＣＮＧＮＣＣＣＡＴ（配列番号：１２７ ） ＭＳ１５１；ＡＴＣＡＣＧＴＧＧＧＧＮＧＣＡＧＡＮＡＣＮＧＣ（配列番号： １２８） ＭＳ１５５；ＴＧＴＧＣＣＴＧＮＴＴＮＴＧＧＡＴＧＡＴＧ（配列番号：１２ ９）
【００４３】この配列中にある「Ｎ」は、イノシンを示
している。これらの配列で５’側の配列の数塩基を他の
塩基に変えても良いが、この場合好ましくは５’側から
１０塩基以内の変異でかつ数塩基内であれば良く、さら
に好ましくは、５’側から５塩基以内の変異が良い。ま
た、これらの配列で５’側の配列を４から５塩基欠如さ
せてもよいが、好ましくは５’側から数塩基の欠如が好
ましい。また、８から１２塩基程であれば５’側に任意
の配列を付加してもよいが、好ましくは５から６塩基の
付加、さらに好ましくは数塩基の付加なら良い。さら
に、ＭＳ８６とＭＳ９７とＭＳ８８とＭＳ１００は、
５’末端に制限酵素認識配列を含む８塩基（ＭＳ８８に
おいては、５’ＧＧＣＴＧＣＡＧ３’、ＭＳ８６とＭＳ
９７とＭＳ１００においては、５’ＧＣＧＧＡＴＣＣ
３’）が付加されているが、この配列は目的のＤＮＡ断
片を取得するのには必ずしも必要でない。ＰＣＲ法は、
具体的には、実施例１５に記述したような条件で実施さ
れる。このようにして得られた第１鎖相補鎖ＤＮＡ（１
ｓｔ ｃＤＮＡ）を鋳型にして実施例１５のようにＰＣ
Ｒ法を行い目的の該ＤＮＡ断片を得ることができる。こ
のとき、ＰＣＲの条件は、プライマーの種類、組合せ、
増幅する長さ等によって、異なることがあるので適宜状
況に応じて条件は変えても良い。プライマーの組合せと
しては、具体的には、例えば、次のようなものが挙げら
れる。
【００４４】ＭＳ４８−ＭＳ４９ ＭＳ８６−ＭＳ１００ ＭＳ９７−ＭＳ８８ ＭＳ１３５−ＭＳ１３２ ＭＳ１５５−ＭＳ１５２ ＭＳ１５１−ＭＳ１５８ このようにして得られたＤＮＡ断片は、常法によりクロ
ーニングベクター（例えば、pUC19）のクローニングサ
イトの１つに（例えば、SmaＩサイト）組み込まれる。
この該ＤＮＡ断片を持つプラスミドを用いて、独立に３
つ以上のクローンの塩基配列を両鎖に関して決定する。
塩基配列の決定にはデュポン社製蛍光シークエンサージ
ェネシス２０００（ＧＥＮＥＳＩＳ ２０００）システ
ムを用いて、デュポン社の該システム用のプロトコール
に従って行えば容易に決定できる。塩基配列が決定しに
くい所や、決定しようとするＤＮＡ断片が約１８０塩基
対以上ある場合には、常法に従い、サブクローニングを
行えばよい。 このようにして決定された、該ＤＮＡ断
片の塩基配列は、配列表の配列番号３３から３９、４４
から５５、１０３および１０４に表わされる通りであ
る。
【００４５】また、クローンＮ１３−１とクローンＮ１
５−１とクローンＮ１６とクローンＮ２３は、一人の患
者Ｎの血清から得られ、Ｏ２６とＵ１６ー４もそれぞれ
独立の患者ＯとＵの血清から得られたクローンである。
クローンＭＸ２５は複数のＣ型肝炎患者血清プールから
得られた。さらにプライマーＭＳ４８とプライマーＭＳ
４９の組み合せから得られた配列表の配列番号３７に示
すクローンと配列表の配列番号５３〜５５に示すクロー
ンは、ＨＣＶ遺伝子上で同じ領域に対応する（以下、こ
の領域をＮ１６領域と呼ぶ）。プライマーＭＳ１５５と
プライマーＭＳ１５２を用いて得た配列表の配列番号４
４〜４６のクローンのＨＣＶ遺伝子由来の塩基配列の該
領域をＭＸ２５領域とし、配列表の配列番号４７〜４
９、５０〜５２に示すクローンＯ２６、Ｎ２３も、それ
ぞれプライマーＭＳ１５１とプライマーＭＳ１５８の組
み合せ、プライマーＭＳ１３５とプライマーＭＳ１３２
の組み合せから得られ、同じ理由でそれぞれに対応する
領域をＯ２６領域、Ｎ２３領域とした。また、配列表の
配列番号３８、および３９、１０３、１０４に示すクロ
ーンＮ１３−１、Ｎ１５ー１、Ｏ１５−１、Ｏ１５−２
も、それぞれプライマーＭＳ８６とプライマーＭＳ１０
０の組み合せ、プライマーＭＳ９７とプライマーＭＳ８
８の組み合せから得られ、同じ理由でそれぞれに対応す
る領域をＮ１３領域、Ｎ１５領域とした。
【００４６】さらに、国立ガンセンター 加藤らが、発
表（プロシ−ディングスオブ ナショナル アカデミ−
オブ サイエンス ユ−・エス・エ−（Ｐｒｏｃ．Ｎ
ａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ），８７，９５２４
−９５２８，１９９０）、大阪大・微研の高見沢ら（ジ
ャ−ナル オブ ビロロジ−（Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆＶ
ｉｒｏｌｏｇｙ，６５，３，１１０５−１１１３，１９
９１））が報告したＣ型肝炎ウイルス遺伝子の配列との
ホモロジーから、得られた各該クローンの領域は５’側
から順にＭＸ２５領域、０２６領域、Ｎ２３領域、Ｎ１
６領域、Ｎ１３領域、Ｎ１５領域と並んでおり、また、
それぞれの領域には重なり合っている部分があり、この
重なる領域を利用して次のように各ＤＮＡ断片を連結し
た。また、配列表の配列番号３６のクローンＮ１６を得
るのに一人の患者Ｎの血清から独立に３つのＮ１６領域
のＤＮＡ断片を持つプラスミドを単離し、ＨＣＶ由来の
該ＤＮＡ断片の全塩基配列を決定した。これらは、それ
ぞれ高いホモロジーを持つが、異なる塩基配列と異なる
アミノ酸配列をコードしたＤＮＡ断片であった。これは
一人の患者に複数のＣ型肝炎ウイルスが存在しているこ
とを示している。また、このことは配列表の配列番号３
３、３４、３５に示す各クローンでも同様である。コア
タンパク質領域やコアタンパク質の遺伝子のさらに５’
側に位置する領域は、Ｃ型肝炎ウイルス遺伝子の中でも
変異が少ない領域とされているが、前述と同じ方法でク
ローン化した場合でも各クローン間でほとんど変異はな
かった。
【００４７】このことからも、ＭＸ２５領域、Ｏ２６領
域、Ｎ２３領域、Ｎ１６領域はコアタンパク質領域やそ
の５’側領域よりはるかに変異しやすいこともわかっ
た。とくにＭＸ２５領域は各クローン間で塩基配列、ア
ミノ酸配列ともに変異しやすいことがわかった。 （２）配列表の配列番号３３から３９に示されるクロー
ンの連結 配列表の配列番号３３から３７および３９のＣ型肝炎患
者血清由来ｃＤＮＡクローンを以下に記述するように連
結する。 配列表の配列番号３６のクローンＮ１６と、配列表
の配列番号３９のクローンＮ１５ー１の連結 例えば、配列表の配列番号３６の塩基配列、５’側から
５７６番目〜５８２番目にあるＢｓｔＥIIサイトで切断
し、配列表の配列番号３９の塩基配列の５’側から１１
４番目〜１２０番目にあるＢｓｔＥIIサイトとライゲー
ション反応で連結させ、５’側にクローンＮ１６由来の
ＤＮＡ断片、３’側にクローンＮ１６由来のＤＮＡ断片
を持つクローンが得られる。かかるクローンの塩基配列
をまとめて配列表の配列番号４１に示す。
【００４８】 配列表の配列番号３３クローンＭＸ２
５と、配列表の配列番号３４のクローンＯ２６の連結 配列表の配列番号３３のクローンＭＸ２５に示す塩基配
列それぞれと、配列表の配列番号３４のそれぞれのクロ
ーンＯ２６とはＰＣＲ法を用いて連結させる。例えば、
配列番号３３のＮ末端（アミノ末端）〜Ｃ末端までの２
８４残基からなるアミノ酸配列をＮ末端に持ち、２８５
番目〜Ｃ末端（カルボキシル末端）に、配列番号３４の
アミノ酸配列の３２番目〜Ｃ末端までのアミノ酸配列を
もつポリペプチドをコードするＤＮＡ断片や、配列番号
３３のＮ末端（アミノ末端）〜２５２番目までのアミノ
酸配列をＮ末端に持ち、２５３番目〜Ｃ末端（カルボキ
シル末端）に、配列番号３４のアミノ酸配列のＮ末端〜
Ｃ末端までの１７４残基からなるアミノ酸配列をもつポ
リペプチドをコードするＤＮＡ断片が挙げられる。これ
らの塩基配列をまとめて配列表の配列番号４０に示す。
また、配列表の配列番号３６と３９あるいは配列表の配
列番号３７と３９のクローンも同様にＰＣＲ法を用いて
連結させることができ、これで得られたクローンもで
示した塩基配列とともに配列表の配列番号４１に示し
た。また、塩基配列の異なるＤＮＡ断片からなる配列表
の配列番号３３のクローンＭＸ２５と塩基配列の異なる
ＤＮＡ断片からなる配列表の配列番号３４のクローンＯ
２６も同様に連結され、複数の異なる塩基配列を持つＤ
ＮＡ断片からなるクローンＭＸ２５Ｏ２６が得られる。
この塩基配列をまとめて配列表の配列番号４０に示す。
【００４９】 配列表の配列番号３５と配列表の配列
番号４１のクローンの連結 で示した方法と同じ方法で、クローンＮ２３とクロー
ンＮ１６Ｎ１５が連結される。得られたＤＮＡ断片の塩
基配列は配列表の配列番号４２に示しクローン名をまと
めてＮ２３Ｎ１５とした。例えば、ＤＮＡ断片の塩基配
列をまとめた配列表の配列番号３５のＮ末端（アミノ末
端）〜Ｃ末端までの３０７残基からなるアミノ酸配列を
Ｎ末端に持ち、３０８番目〜Ｃ末端（カルボキシル末
端）に、配列表の配列番号４１のアミノ酸配列の１７番
目〜Ｃ末端までのアミノ酸配列をもつポリペプチドをコ
ードするＤＮＡ断片と、配列表の配列番号３３のＮ末端
（アミノ末端）〜２９１番目までのアミノ酸配列をＮ末
端に持ち、２９２番目〜Ｃ末端（カルボキシル末端）
に、配列表の配列番号４１のアミノ酸配列のＮ末端〜Ｃ
末端までの４７７残基からなるアミノ酸配列をもつポリ
ペプチドをコードするＤＮＡ断片が複数種得られる。
【００５０】 配列表の配列番号４０と配列番号４１
のクローンの連結 で示した方法と同じ方法で、クローンＭＸ２５Ｏ２６
とクローンＮ２３Ｎ１５が連結される。ここで得られ
た、ＤＮＡ断片の塩基配列はまとめて配列表の配列番号
４３に示した。ＨＣＶの類縁とされるフラビウイルスの
非構造タンパク質ＮＳ３のＮ末端ドメインにプロテアー
ゼ活性がある（プロシ−ディングス オブ ナショナル
アカデミ− オブ サイエンス ユ−・エス・エ−
（Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ），
８７，８８９８−８９０２，１９９０）などから、ＨＣ
ＶのＮＳ３領域と推定されている領域のＮ末端ドメイン
にもプロテアーゼ活性があることが期待される。また、
加藤らが、発表したＨＣＶ遺伝子由来全アミノ酸配列
（プロシ−ディングス オブ ナショナル アカデミ−
オブ サイエンスユ−・エス・エ−（Ｐｒｏｃ．Ｎａ
ｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ），８７，９５２４−
９５２８，１９９０）と土方ら（１９９１年日本癌学
会）によって報告されたＨＣＶ由来プロテアーゼ活性を
もつ領域より、クローンＭＸ２５Ｎ１５は、その領域を
全て含んでいる。
【００５１】また、ＨＣＶのＮＳ３領域と推定されてい
る領域はＮ末端、Ｃ末端共に確実ではないが、フラビウ
イルスの切断される領域のアミノ酸配列の１次構造と親
水性・疎水性領域のパターンからの予測とＨｏｕｇｈｔ
ｏｎらの報告（ヘパトロジイ（Ｈｅｐａｔｏｌｏｇ
ｙ）、１４、２、３８１ー３８８、１９９１）から、配
列表の配列番号４３に示すクローンＭＸ２５Ｎ１５のア
ミノ酸番号で２７６番目から８８４番目がＮＳ３領域に
相当するものと推定される。この領域を以下、ＭＫ／Ｎ
Ｓ３領域と呼ぶ。また、同様にしてＮＳ２と推定される
領域は配列表の配列番号４３に示すクローンＭＸ２５Ｎ
１５と配列表の配列番号４０に示すクローンＭＸ２５Ｏ
２６のアミノ酸番号で３番目から２７５番目からなるポ
リペプチドの領域と思われる。以下、この領域をＭＫ／
ＮＳ２領域と呼ぶ。 （３）（１）、（２）で得られた該クローンにコードさ
れるポリペプチドの発現 次に、（１）、（２）で得られた該クローンにコードさ
れるポリペプチドを発現させてＨＣＶ由来の組換えＣ型
肝炎特異抗原タンパク質を得る。
【００５２】本発明の発現ベクターは、上記のようにし
て得られたＨＣＶ由来の組換えＣ型肝炎特異抗原タンパ
ク質をコードするＤＮＡを転写できる位置にプロモータ
ーを含有している。例えば、大腸菌、枯草菌等、微生物
を宿主とするときは、発現ベクターは、プロモーター、
リボゾーム結合（ＳＤ）配列、ＨＣＶ由来の組換えＣ型
肝炎特異抗原タンパク質遺伝子、転写終結因子、及びプ
ロモーターを制御する遺伝子より成ることが望ましい。
プロモーターとしては、大腸菌、ファージ等由来のも
の、例えば、トリプトファン合成酵素（ｔｒｐ）、ラク
トースオペロン（ｌａｃ）、ラムダファージＰL、ＰR
、Ｔ5 初期遺伝子Ｐ25、Ｐ26プロモーター等が挙げら
れる。また、これらは独自に設計された配列でも良い。
リボゾーム結合配列としては、大腸菌、ファージ等由来
のものでも良いが、独自に設計された配列を合成により
作成した１６ＳリボゾームＲＮＡの３′末端領域に相補
的な配列を連続した４塩基以上のコンセンサス配列を持
ったものでも良い。転写終結因子は必ずしも必要ではな
いが、ρ非依存性のもの、例えばリポプロテインターミ
ネーター、ｔｒｐオペロンターミネーター、等を有して
いる方が望ましい。
【００５３】さらに、これらの発現に必要な因子の発現
プラスミド上での配列順序は、５′上流から、プロモー
ター、ＳＤ配列、ＨＣＶ由来の組換えＣ型肝炎特異抗原
タンパク質遺伝子、転写終結因子の順に並ぶことが望ま
しい。発現ベクターとしては、市販のｐＫＫ２３３−２
（ファルマシア社製）等が使用できる。また、融合蛋白
を発現させるには、発現ベクターｐＧＥＸシリーズ（フ
ァルマシア社製）等が使用される。宿主の形質転換法と
しては、実施例１６に示すように東洋紡績社のプロトコ
ールに従うか、常法に従って行うことができる。形質転
換体の培養は、モレキュラー クローニング（Ｍｏｌｅ
ｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ、１９８２）に記述の方法
を参考に行えばよい。培養温度は２８℃から４２℃程度
である。また、真核生物、例えば、昆虫細胞、動物（ほ
乳類）細胞等における発現ベクターを構成する基本的な
単位は、前述の微生物のものと変わらないが、次のよう
なものが好ましい。
【００５４】昆虫細胞としては、例えば、インビトロジ
ェン社のバキュロウイルス発現マニュアルであるマック
スバック（ＭＡＸＢＡＣTM、ＢＡＣＵＬＯＶＩＲＵＳ
ＥＸＰＲＥＳＳＩＯＮ ＳＹＳＴＥＭ ＭＡＮＵＡＬ
ＶＥＲＳＩＯＮ １．４）に従い、このキットを利用す
る。この時、発現量をあげるためポリヘドリンのプロモ
ーターから開始コドンまでの距離を変えることが望まし
い。動物細胞でのプロモーターとしては、アデノウイル
スＥＩＡ遺伝子による活性型プロモーター（続生化学実
験講座１ 遺伝子研究法ＩＩ、１８９ー１９０、１９８
６）、ＳＶ４０初期プロモーター、ＳＶ４０後期プロモ
ーター、アポリポプロテインＥ遺伝子プロモーター、Ｓ
Ｒαプロモーター（モレキュラー アンドセルラー バ
イオロジー、８、１、４６６ー４７２、１９８８）等が
使用される。基本的には、発現ベクターｐＫＣＲ（プロ
シーディングス オブ ナショナルアカデミー オブ
サイエンス ユー・エス・エー、７８、１５２８、（１
９８１））あるいはその基本的機能を最低限損わない程
度に改良したｐＢＰＶ ＭＴ１（プロシーディングス
オブ ナショナル アカデミー オブ サイエンスユー
・エス・エー、８０、３９８、（１９８３））等が使用
できる。
【００５５】発現ベクターで形質転換される動物細胞と
しては、ＣＨＯ細胞、ＣＯＳ細胞、ＣＶ−１細胞、マウ
スＲＩＩＩ由来細胞Ｃ１２７株等があげられる。大腸菌
や真核生物における発現ベクターに該クローンを導入す
る際、ベクター由来の開始コドンのフレームに合うよう
にすればよく、また、ベクター由来の開始コドンを利用
しない場合でも、該クローンの翻訳フレームに合うよう
に５’側に開始コドンを付加してから発現ベクターに導
入すればよい。この場合の、該クローンの翻訳フレーム
とは、例えば代表されるクローンとして示した配列表の
配列番号３３から４３において、アミノ酸一つに対して
対応している３つずつに分けられた塩基配列の枠組みの
ことである。大腸菌などの微生物、昆虫細胞、及び動物
細胞で発現させた該組換えポリペプチドをＨＣＶ由来抗
原として同定するには、ＨＣＶ患者血清との免疫学的反
応性を利用する。即ち、ウエスタンブロッティング法に
より同定する。
【００５６】配列表の配列番号４３のアミノ酸配列で２
４７番目〜２６５番目までの１９個のアミノ酸から成る
ポリペプチド；同配列で少なくとも３００番目から３０
７番目までの８個のアミノ酸で表わされるポリペプチド
を含み、配列番号４３に記載のアミノ酸配列由来で長さ
が８から２５アミノ酸残基からなるポリペプチド；同配
列で少なくとも４１０番目から４２８番目までの１３個
のアミノ酸で表わされるポリペプチドを含み、配列番号
４３に記載のアミノ酸配列由来で長さが１３から２５ア
ミノ酸残基からなるポリペプチド；同２８３番目〜２９
２番目までの１０個のアミノ酸から成るポリペプチド；
同４７７番目〜４９０番目までの１４個のアミノ酸から
成るポリペプチド；同４９８番目〜５１２番目までの１
４個のアミノ酸から成るポリペプチド；同５３８番目〜
５５０番目までの１２個のアミノ酸から成るポリペプチ
ド；配列番号４３のアミノ酸配列で少なくとも７４７番
目から７６７番目までの２１個のアミノ酸で表わされる
ポリペプチド；配列番号４３のアミノ酸配列で少なくと
も８４１番目から８５２番目までの１２個のアミノ酸で
表わされるポリペプチド；配列番号４３のアミノ酸配列
で少なくとも８６７番目から８７８番目までの１２個の
アミノ酸で表わされるポリペプチド；配列番号４３に記
載のアミノ酸配列で少なくとも６６５番目から６７２番
目までの８個のアミノ酸配列で表わされるポリペプチド
を含み、配列番号４１に記載のアミノ酸配列由来で長さ
が８から２５アミノ酸残基からなるポリペプチド；及
び、同３１５番目〜３２７番目までの１５個のアミノ酸
から成るポリペプチドは、親水性度が比較的高く、ポリ
ペプチドの高次構造の予測でもαヘリックスやβシート
構造より、いわゆるターン構造をとる確立が他より高
い。
【００５７】前述に挙げた本発明のアミノ酸配列由来ポ
リペプチドがＨＣＶ抗原としての抗原部位となる条件は
他領域よりそろっているので、本来の血清中での高次構
造は不明なため性格ではないことから全てが反応性が良
いとは限らないが、ＨＣＶ患者のＨＣＶ関連抗原に対す
る抗血清に特異的に反応する可能性は十分高いと思われ
る。これらのポリペプチドは、組換えＤＮＡの技術によ
ることなく、合成法で生産してもよい。前述の配列番号
４３のアミノ酸配列で４６１番目〜７２６番目までの２
６６個のアミノ酸から成るポリペプチドもしくはその全
てあるいは一部を含むポリペプチド；同４７７番目〜５
５０番目までの７４個のアミノ酸から成るポリペプチ
ド；同９６３番目〜１００４番目までの４２個のアミノ
酸から成るポリペプチド；さらに、同２８３番目〜３２
７番目までの４５個のアミノ酸から成るポリペプチドも
組換えＤＮＡ技術による大量生産が可能である。
【００５８】［４］（１）配列表の配列番号６４〜７５
に示すＣ型肝炎患者血清由来ｃＤＮＡクローンを得る方
法と該クローンの塩基配列を決定する方法（ＮＳ４〜Ｎ
Ｓ５領域） 本発明の配列表に示す塩基配列で表される新規なポリペ
プチドをコードする遺伝子またはＤＮＡ断片は、例え
ば、次のような方法によって得られる。このＨＣＶは、
血清中に微量しか存在しないうえ、遺伝子がＲＮＡであ
ると予想され、従来のｃＤＮＡクローニング法であるＯ
ｋａｙａｍａ−Ｂｅｒｇ法や、Ｇｕｂｌｅｒ−Ｈｏｆｆ
ｍａｎ法を基本とした方法でのクローニングには困難が
予想されたので、少量の血清から変異の多い該遺伝子を
確実にクローニングするために、以下の方法によった。
即ち、後述の実施例１で示すようにＣ型肝炎患者の血清
から核酸を抽出する。該血清としては、通常、オルソ社
の検査キットでの測定値でＯＤが３．５以上のものが使
用されるが、この値に限られるわけではない。血清には
ウイルスＲＮＡのキャリアとしてトランスファーＲＮＡ
（ｔＲＮＡ）を混ぜておくのが好ましい。キャリアは必
ずしもｔＲＮＡに限られるものではなく、ポリリボヌク
レオシドであれば代用できる。ただし、ｔＲＮＡを使用
すればインタクトな長さをもったｔＲＮＡが必要量存在
するかどうかを電気泳動で迅速に確認できる利点があ
り、この確認をすることで少なくとも、ウイルスＲＮＡ
のキャリアとしてトランスファーＲＮＡを混ぜたステッ
プからはウイルスＲＮＡの分解があるかどうかを確認す
ることができる。
【００５９】かかる核酸からｃＤＮＡをクローニングす
る手段としては、Ｓａｉｋｉらの開発したポリメラーゼ
チェイン リアクション法｛（ＰＣＲ法） ネーチャ
ー、３２４，１２６，（１９８６）｝を利用することが
できる。まず、ウイルスＲＮＡを鋳型にして逆転写酵素
を反応させる。この時、プライマーとしては市販のラン
ダムプライマーでも良いし、下記に示したプライマーの
うちＭＳ１２６、ＭＳ１１９、ＭＳ１６１、ＭＳ１６
２、ＭＳ１６３、ＭＳ１２１のような塩基配列の合成Ｄ
ＮＡを用いても良い。
【００６０】 本発明において使用した合成ＤＮＡ ５′ ３′ ＭＳ１２６；ＧＧＴＧＡＧＣＡＴＧＧＡＧＧＴＧＡＣＣＡＣ（配列番号：１３ ０） ＭＳ１１９；ＴＣＡＴＣＣＴＣＣＴＣＣＧＣＴＣＧＡＡＧＣ（配列番号：１３ １） ＭＳ１６１；ＧＴＧＧＡＣＧＣＣＴＴＮＧＣＣＴＴＣＡＴＮＴＣ（配列番号： １３２） ＭＳ１６２；ＡＣＧＧＡＴＧＴＣＮＴＴＣＴＣＮＧＴＮＡＣ（配列番号：１３ ３） ＭＳ１２１；ＧＧＣＧＧＡＡＴＴＣＣＴＧＧＴＣＡＴＡＧＣＣＴＣＣＧＴＧＡ Ａ（配列番号：１３４） ＭＳ１６３；ＧＧＧＧＮＡＴＧＧＣＣＴＡＴＴＧＧＣＣＴＧ（配列番号：１３ ５） ＭＳ１２７；ＧＧＣＡＴＧＴＧＧＧＣＣＣＡＧＧＧＧＡＧＧ（配列番号：１３ ６） ＭＳ１１８；ＴＧＴＧＡＧＣＣＣＧＡＡＣＣＧＧＡＴＧＴ（配列番号：１３７ ） ＭＳ１５９；ＧＴＧＧＴＡＮＴＣＣＴＧＧＡＣＴＣＮＴＴＮＧＡ（配列番号： １３８） ＭＳ１６０；ＡＣＴＡＣＣＧＮＧＡＣＧＴＧＣＴＮＡＡＮＧＡ（配列番号：１ ３９） ＭＳ１２０；ＴＧＧＧＧＡＴＣＣＣＧＴＡＴＧＡＴＡＣＣＣＧＣＴＧＣＴＴＴ Ｇ（配列番号：１４０） ＭＳ１７４；ＡＴＴＧＴＣＡＧＡＴＣＴＡＣＧＧＧＧＣＣＡＣＴＴ（配列番号 ：１４１） ＭＳ１７５；ＧＣＡＡＧＣＴＴＡＡＡＡＡＡＡＡＡＡＡＡＧＧＧＧＧＡＴＧＧ ＣＣＴＡＴＴＧＧＣＣＴＧＧＡ（配列番号：１４２）
【００６１】この配列中にある「Ｎ」は、イノシンを示
している。これらの配列で５’側の配列の数塩基を他の
塩基に変えても良いが、この場合好ましくは５’側から
１０塩基以内の変異でかつ数塩基内であれば良く、さら
に好ましくは、５’側から５塩基以内の変異が良い。ま
た、これらの配列で５’側の配列を４から５塩基欠如さ
せてもよいが、好ましくは５’側から数塩基の欠如が好
ましい。また、８から１２塩基程であれば５’側に任意
の配列を付加してもよいが、好ましくは５から６塩基の
付加、さらに好ましくは数塩基の付加なら良い。ＰＣＲ
法は、具体的には、実施例２１に記述したような条件で
実施される。このようにして得られた第１鎖相補鎖ＤＮ
Ａ（１ｓｔ ｃＤＮＡ）を鋳型にして実施例２１のよう
にＰＣＲ法を行い目的の該ＤＮＡ断片を得ることができ
る。このとき、ＰＣＲの条件は、プライマーの種類、組
合せ、増幅する長さ等によって、異なることがあるので
適宜状況に応じて条件は変えても良い。プライマーの組
合せとしては、具体的には、例えば、次のようなものが
挙げられる。
【００６２】ＭＳ１２７−ＭＳ１２６ ＭＳ１１８−ＭＳ１１９ ＭＳ１５９−ＭＳ１６１ ＭＳ１６０−ＭＳ１６２ ＭＳ１２０−ＭＳ１６３ ＭＳ１２０−ＭＳ１２１ このようにして得られたＤＮＡ断片は、常法によりクロ
ーニングベクター（例えば、pUC19）のクローニングサ
イトの１つに（例えば、SmaＩサイト）組み込まれる。
この該ＤＮＡ断片を持つプラスミドを用いて、独立に３
つ以上のクローンの塩基配列を両鎖に関して決定する。
塩基配列の決定にはデュポン社製蛍光シークエンサージ
ェネシス２０００（ＧＥＮＥＳＩＳ ２０００）システ
ムを用いて、デュポン社の該システム用のプロトコール
に従って行えば容易に決定できる。塩基配列が決定しに
くい所や、決定しようとするＤＮＡ断片が約１８０塩基
対以上ある場合には、常法に従い、サブクローニングを
行えばよい。 このようにして決定された、該ＤＮＡ断
片の塩基配列は、配列表の配列番号６４から６９および
７６から１００に表わされる通りである。
【００６３】また、クローンＮ２２−１、３とクローン
Ｎ１７−１、２、３とクローンＮ２９ー１、２、３とク
ローンＮ１８ー２、３、４は、一人の患者Ｎの血清から
得られ、クローンＨ２２−３、８、９とクローンＨ１７
−１、３とクローンＨ１８ー１、２、３は、一人の患者
Ｈの血清から得られ、さらに、クローンＯ２８ー１、
２、４とクローンＯ３０ー２、３、４は、一人の患者Ｏ
の血清から得られた。一方、コアタンパク質領域やコア
タンパク質の遺伝子のさらに５’側に位置する領域の場
合は、Ｃ型肝炎ウイルス遺伝子の中でも変異が少ない領
域とされているが、前述と同じ方法でコアタンパク質領
域やコアタンパク質の遺伝子のさらに５’側に位置する
領域をクローン化した場合でも各クローン間でほとんど
変異はなかった。しかし、本発明においては、同一患者
からＨＣＶ遺伝子上で同じ領域を持つ複数のクローンを
得、それらはそれぞれ高いホモロジーを持ちながらも、
異なる塩基配列と異なるアミノ酸配列をコードしたＤＮ
Ａ断片であった。これは一人の患者に複数のＣ型肝炎ウ
イルスが存在していることを示している。このことから
も、Ｎ２２領域、Ｎ１７領域、Ｏ２８領域、Ｎ１８領
域、Ｎ２９領域、Ｏ３０領域はＨＣＶのコアタンパク質
領域やその５’上流領域より塩基配列を調べた結果で
は、はるかに変異しやすいこともわかった。
【００６４】また、各クロ−ンに相当するＨＣＶ遺伝子
領域を以下のように名付けた。クローンＮ２２−１、３
とクローンＨ２２−３、８、９はプライマーＭＳ１２７
とＭＳ１２６の組み合せから得られた。このＨＣＶ遺伝
子上での領域をＮ２２領域とする。同様に、クローンＮ
１７−１、２、３とクローンＨ１７−１、３は、プライ
マーＭＳ１１８とＭＳ１１９の組み合せから得られ、ク
ローンＯ２８ー１、２、４は、プライマーＭＳ１５９と
ＭＳ１６１の組み合せからであり、クローンＮ２９ー
１、２、３はプライマーＭＳ１６０とＭＳ１６２の組み
合せ、クローンＮ１８ー２、３、４とクローンＨ１８ー
１、２、３はプライマーＭＳ１２０とＭＳ１２１の組み
合せ、クローンＯ３０ー２、３、４はプライマーＭＳ１
２０とＭＳ１６３の組み合せから、それぞれ得られた。
これらのＨＣＶ遺伝子上での各領域をＮ１７，Ｏ２８，
Ｎ２９，Ｎ１８，Ｏ３０とした。
【００６５】さらに、国立ガンセンター 加藤らが、発
表（プロシ−ディングスオブ ナショナル アカデミ−
オブ サイエンス ユ−・エス・エ−（Ｐｒｏｃ．Ｎ
ａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ），８７，９５２４
−９５２８，１９９０）、大阪大・微研の高見沢ら（ジ
ャ−ナル オブ ビロロジ−（Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆＶ
ｉｒｏｌｏｇｙ，６５，３，１１０５−１１１３，１９
９１））が報告したＣ型肝炎ウイルス遺伝子の配列との
ホモロジーから、得られた各該クローンの領域は５’側
から順にＮ２２領域、Ｎ１７領域、Ｏ２８領域、Ｎ２９
領域、Ｏ３０領域と並んでおり（Ｎ１８領域はＯ３０領
域の１部である）、また、それぞれの隣あっている各領
域には重なり合っている部分があり、この重なる領域を
利用して次のように各ＤＮＡ断片を連結した。
【００６６】（２）配列表の配列番号６４から６９に示
されるクローンの連結 クローンＮ１５（前記［３］参照）の領域、Ｎ２２領
域、Ｎ１７領域、Ｏ２８領域、Ｎ２９領域、Ｎ１８領
域、Ｏ３０領域のＣ型肝炎患者血清由来ｃＤＮＡクロー
ンをＰＣＲや制限酵素サイトを用いて、以下に記述する
ように連結する。 １）Ｎ１７領域と、Ｏ２８領域の連結 Ｎ１７領域とＯ２８領域の連結に、例えば配列表の配列
番号８１のクローンＮ１７−３に示す塩基配列と、配列
表の配列番号８６のクローンＯ２８−１を用いる。連結
にはＰＣＲ法を用いて連結させる。クローンＮ１７−３
とクローンＯ２８−１のＤＮＡ断片を鋳型として同じ反
応溶液にほぼ等モル加え、プライマーＭＳ１１８とＭＳ
１６１によりＰＣＲ反応を行う。これによりクローンＮ
１７−３とクローンＯ２８−１が連結されたクローン１
７２８が得られる。 ２）Ｎ２９領域と、Ｎ１８領域の連結 １）と同様に、Ｎ２９領域とＮ１８領域の連結に、例え
ば配列表の配列番号８９のクローンＮ２９−１と配列表
の配列番号９２のＮ１８−４のＤＮＡ断片、プライマー
ＭＳ１６０とＭＳ１２１を用い、連結されたクローン２
９１８が得られる。
【００６７】３）Ｎ１７領域からＮ１８領域までの連結 クローン１７２８とクローン２９１８のＤＮＡ断片を用
い、プライマーはＭＳ１１８とＭＳ１２１を用い、５’
側からＮ１７、Ｏ２８、Ｎ２９、Ｎ１８とつながったク
ローン１７１８をＰＣＲ法で連結させる。クローン１７
１８は、プラスミドｐＵＣ１９のＳｍａＩサイトにクロ
ーニングされ、（Ｎ１７領域側がＨＣＶ遺伝子の５’末
端側であるが）５’末端側にｐＵＣ１９のＥｃｏＲＩサ
イトがくるように構築された。このプラスミドをｐＵＣ
１７１８とする。 ４）Ｎ２２領域と、Ｎ１７領域の連結 １）と同様に、例えば配列表の配列番号７６のクローン
Ｎ２２−１と配列表の配列番号８１のクローンＮ１７−
３のＤＮＡ断片とプライマーＭＳ１２７とＭＳ１１９を
使って、ＰＣＲ反応で５’側からＮ２２領域、Ｎ１７領
域と構成されるＤＮＡ断片を得る。このクローンをクロ
ーン２２１７とした。４）と同様に、５’末端側にｐＵ
Ｃ１９のＥｃｏＲＩサイトがくるようにプラスミドｐＵ
Ｃ１９へ構築された。該プラスミドをｐＵＣ２２１７と
する。
【００６８】５）クローン２２１７とクローン１７１８
の連結。クローン１７１８はＮ１７領域にあるＸｂａＩ
サイトで１カ所だけ切断される。そこで、ｐＵＣ１７１
８をｐＵＣ１９由来のＸｂａＩサイトとともにＸｂａＩ
で切断し、切り出されたクローン１７１８由来のＤＮＡ
断片をｐＵＣ２２１７のＮ１７領域由来のＸｂａＩサイ
トとｐＵＣ１９由来のＸｂａＩサイトにＮ１７領域の塩
基配列がつながるように挿入した。このプラスミドをｐ
ＵＣ２２１８とする。 ６）Ｎ１５領域とＨＣＶ３’末端に相当するＯ３０領域
の順方向の連結 Ｏ３０領域のＤＮＡ断片は、例えばクローンＯ３０−３
として配列表の配列番号９８に示される。この配列をも
つクローンＯ３０−３のＤＮＡ断片は、ｐＵＣ１９のＳ
ｍａＩサイトに、クローンＯ３０−３の５’側にＥｃｏ
ＲＩサイトがある向きに挿入されている（ｐＵＣＯ３
０）。また、クローンＮ１５（前記［３］）のＨＣＶ遺
伝子の順方向で５’側にＥｃｏＲＩサイトがある向きに
クローンＯ３０−３と同じくｐＵＣ１９のＳｍａＩサイ
トに挿入されている（ｐＵＣＮ１５）。ｐＵＣＯ３０が
ＳａｃＩで切断された後、平滑末端化され、ＨｉｎｄＩ
ＩＩで切り出されたＨＣＶ遺伝子由来ＤＮＡ断片を、Ｘ
ｂａＩで切断された後、平滑末端化され、ＨｉｎｄＩＩ
Ｉで切り出されたｐＵＣＮ１５のベクター由来のＤＮＡ
断片と連結させた。得られたプラスミドをｐＵＣ１５−
３０と呼ぶ。該プラスミドがＢｇｌＩＩとＨｉｎｄＩＩ
Ｉでそれぞれ１カ所でしか切断されないのを利用し、ク
ローンＯ３０−３由来の配列にあるＢｇｌＩＩサイトを
含むプライマーＭＳ１７４で以下のようにＰＣＲを行
い、クローンＯ３０−３の３’末へのポリＵ付加を行っ
た。
【００６９】ｐＵＣ１５−３０を鋳型としてプライマー
ＭＳ１７４とＭＳ１７５でＰＣＲ反応を行い、このＰＣ
Ｒ断片をＢｇｌＩＩ、ＨｉｎｄＩＩＩで切断後、Ｂｇｌ
ＩＩ、ＨｉｎｄＩＩＩで切断されたｐＵＣＯ１５−３０
のベクター部を含むＤＮＡ断片とつなげられ、クローン
Ｏ３０−３の３’末端側にポリＵを持つＤＮＡ断片を含
むプラスミドｐＵＣ１５−３０Ｕを得た。 ７）Ｎ１５領域から、Ｏ３０領域までの連結 Ｎ１５領域とＮ２２領域の共通領域にＡｐａＩサイトが
ある。また、Ｎ１８領域とＯ３０領域の共通領域にもＡ
ｐａＩサイトがある。両方がかみ合うように、ｐＵＣ２
２１８からＡｐａＩで切り出されたクローン２２１８由
来のＤＮＡ断片をｐＵＣ１５３０ＵのＡｐａＩサイトに
挿入しプラスミドｐＵＣ１５−３０Ｕを得た。このよう
に連結されたＮ１５領域からＯ３０領域は、ＨＣＶの類
縁とされるフラビウイルスの非構造タンパク質ＮＳ４の
１部、ＮＳ５とホモロジーが高いアミノ酸配列をコード
している。また、前述のカイロン社の他、国立ガンセン
タ−の下遠野ら、大阪大・微研の高見沢らによって、Ｃ
型肝炎ウイルスの全遺伝子の配列からも該領域はＮＳ４
の途中からＮＳ５の全部をコードする遺伝子配列とホモ
ロジーをもつことから、本発明の配列表に記載のクロー
ンはＣ型肝炎ウイルスのＮＳ４領域とＮＳ５領域の遺伝
子配列であると予想される。そこで、該クローンを発現
プラスミドに組み込み、該クローンにコードされるポリ
ペプチドを生産させ、Ｃ型肝炎患者の血清と免疫的に反
応するかどうか試みた。 （３）（２）で得られた該クローンにコードされるポリ
ペプチドの発現 次に、（２）で得られた該クローンにコードされるポリ
ペプチドを発現させてＨＣＶ由来の組換えＣ型肝炎特異
抗原タンパク質を得る。
【００７０】本発明の発現ベクターは、上記のようにし
て得られたＨＣＶ由来の組換えＣ型肝炎特異抗原タンパ
ク質をコードするＤＮＡを転写できる位置にプロモータ
ーを含有している。例えば、大腸菌、枯草菌等、微生物
を宿主とするときは、発現ベクターは、プロモーター、
リボゾーム結合（ＳＤ）配列、ＨＣＶ由来の組換えＣ型
肝炎特異抗原タンパク質遺伝子、転写終結因子、及びプ
ロモーターを制御する遺伝子より成ることが望ましい。
プロモーターとしては、大腸菌、ファージ等由来のも
の、例えば、トリプトファン合成酵素（ｔｒｐ）、ラク
トースオペロン（ｌａｃ）、ラムダファージＰL、ＰR
、Ｔ5 初期遺伝子Ｐ25、Ｐ26プロモーター等が挙げら
れる。また、これらは独自に設計された配列でも良い。
リボゾーム結合配列としては、大腸菌、ファージ等由来
のものでも良いが、独自に設計された配列を合成により
作成した１６ＳリボゾームＲＮＡの３′末端領域に相補
的な配列を連続した４塩基以上のコンセンサス配列を持
ったものでも良い。
【００７１】転写終結因子は必ずしも必要ではないが、
ρ非依存性のもの、例えばリポプロテインターミネータ
ー、ｔｒｐオペロンターミネーター、等を有している方
が望ましい。さらに、これらの発現に必要な因子の発現
プラスミド上での配列順序は、５′上流から、プロモー
ター、ＳＤ配列、ＨＣＶ由来の組換えＣ型肝炎特異抗原
タンパク質遺伝子、転写終結因子の順に並ぶことが望ま
しい。発現ベクターとしては、市販のｐＫＫ２３３−２
（ファルマシア社製）等が使用できる。また、融合蛋白
を発現させるには、発現ベクターｐＧＥＸシリーズ（フ
ァルマシア社製）等が使用される。宿主の形質転換法と
しては、実施例２２に示すように東洋紡績社のプロトコ
ールに従うか、常法に従って行うことができる。形質転
換体の培養は、モレキュラー クローニング（Ｍｏｌｅ
ｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ、１９８２）に記述の方法
を参考に行えばよい。培養温度は２８℃から４２℃程度
である。
【００７２】また、真核生物、例えば、昆虫細胞、動物
（ほ乳類）細胞等における発現ベクターを構成する基本
的な単位は、前述の微生物のものと変わらないが、次の
ようなものが好ましい。昆虫細胞としては、例えば、イ
ンビトロジェン社のバキュロウイルス発現マニュアルで
あるマックスバック（ＭＡＸＢＡＣTM、ＢＡＣＵＬＯＶ
ＩＲＵＳ ＥＸＰＲＥＳＳＩＯＮ ＳＹＳＴＥＭ ＭＡ
ＮＵＡＬ ＶＥＲＳＩＯＮ １．４）に従い、このキッ
トを利用する。この時、発現量をあげるためポリヘドリ
ンのプロモーターから開始コドンまでの距離を変えるこ
とが望ましい。動物細胞でのプロモーターとしては、ア
デノウイルスＥＩＡ遺伝子による活性型プロモーター
（続生化学実験講座１ 遺伝子研究法ＩＩ、１８９ー１
９０、１９８６）、ＳＶ４０初期プロモーター、ＳＶ４
０後期プロモーター、アポリポプロテインＥ遺伝子プロ
モーター、ＳＲαプロモーター（モレキュラー アンド
セルラー バイオロジー、８、１、４６６ー４７２、１
９８８）等が使用される。基本的には、発現ベクターｐ
ＫＣＲ（プロシーディングス オブ ナショナルアカデ
ミー オブ サイエンス ユー・エス・エー、７８、１
５２８、（１９８１））あるいはその基本的機能を最低
限損わない程度に改良したｐＢＰＶ ＭＴ１（プロシー
ディングス オブ ナショナル アカデミー オブ サ
イエンスユー・エス・エー、８０、３９８、（１９８
３））等が使用できる。発現ベクターで形質転換される
動物細胞としては、ＣＨＯ細胞、ＣＯＳ細胞、ＣＶ−１
細胞、マウス由来細胞Ｃ１２７株等があげられる。
【００７３】大腸菌や真核生物における発現ベクターに
該クローンを導入する際、ベクター由来の開始コドンの
フレームに合うようにすればよく、また、ベクター由来
の開始コドンを利用しない場合でも、該クローンの翻訳
フレームに合うように５’側に開始コドンを付加してか
ら発現ベクターに導入すればよい。この場合の、該クロ
ーンの翻訳フレームとは、例えば代表されるクローンと
して示した配列表の配列番号６４から７５において、ア
ミノ酸一つに対して対応している３つずつに分けられた
塩基配列の枠組みのことである。大腸菌などの微生物、
昆虫細胞、及び動物細胞で発現させた該組換えポリペプ
チドをＨＣＶ由来抗原として同定するには、ＨＣＶ患者
血清との免疫学的反応性を利用する。即ち、ウエスタン
ブロッティング法により同定する。
【００７４】配列表の配列番号７５のアミノ酸配列で少
なくとも３２４番目〜３４３番目までの２０個のアミノ
酸から成るポリペプチド；同配列で少なくとも３５６番
目から３６９番目までの１４個のアミノ酸残基からなる
ポリペプチド；同配列で少なくとも５８４番目から６０
１番目までの１８個のアミノ酸で表わされるポリペプチ
ド；同５８８番目〜５９７番目までの１０個のアミノ酸
から成るポリペプチド；同６２０番目〜６２９番目まで
の１０個のアミノ酸から成るポリペプチド；同９０１番
目〜９１８番目までの１８個のアミノ酸から成るポリペ
プチド、及び、上記に記載された、それぞれの長さのポ
リペプチドを少なくとも含む配列表の配列番号７５由来
アミノ酸配列最大２５アミノ酸からなるポリペプチドは
親水性度が比較的高く、ポリペプチドの高次構造の予測
でもαヘリックスやβシート構造より、いわゆるターン
構造をとる確立が他より高いとも予想される。前述に挙
げた本発明のアミノ酸配列由来ポリペプチドがＨＣＶ抗
原としての抗原部位となる条件は他領域よりそろってい
るので、本来の血清中での高次構造は不明なため性格で
はないことから全てが反応性が良いとは限らないが、Ｈ
ＣＶ患者のＨＣＶ関連抗原に対する抗血清に特異的に反
応する可能性は十分高いと思われる。
【００７５】これらのポリペプチドは、組換えＤＮＡの
技術によることなく、合成法で生産してもよい。前述の
配列番号７５のアミノ酸配列で４１３番目〜４８６番目
までの７４個のアミノ酸から成るポリペプチドもしくは
その全てあるいは一部を含むポリペプチド；同４１５番
目〜１４１１番目までの９９７個のアミノ酸から成るポ
リペプチド；同６５５番目〜７２８番目までの７４個の
アミノ酸から成るポリペプチド；同８５８番目〜９５５
番目までの９８個のアミノ酸から成るポリペプチド；同
１００９番目〜１１００番目までの９２個のアミノ酸か
ら成るポリペプチド；同１１６０番目〜１２２５番目ま
での６６個のアミノ酸から成るポリペプチド；さらに、
同７６３番目〜８１６番目までの５４個のアミノ酸から
成るポリペプチドも組換えＤＮＡ技術による大量生産が
可能である。
【００７６】〔５〕配列表の配列番号１０１に示すＣ型
肝炎患者血清由来ｃＤＮＡクローンＴ７Ｎ１−３０Ｕを
得る方法 本発明の配列表の配列番号１０１に示す塩基配列で表さ
れる新規なポリペプチドをコードする遺伝子またはＤＮ
Ａ断片は、例えば、次のような方法によって得られる。
クローンＮ１９ＭＸ２４Ａ−１とクローンＭＸ２５−１
がＰＣＲ法を利用した連結によりオーバーラップするＭ
Ｘ２４領域の３’部とＭＸ２５領域の５’部のどちらか
の配列が優先されたＤＮＡ断片が得られる（この得られ
たクローンをクローン１９２５とする）。また、クロー
ンＮ１−１の５’側に制限酵素サイトＨｉｎｄＩＩＩ、
ＳｐｅＩ、Ｔ７プロモーター配列の順に５’側から導入
するため合成ＤＮＡを作成し、カセットライゲーション
によってクローンＴ７Ｎ１−１を得る。またクローンＮ
１Ｎ３Ｎ１０を得た方法と同じようにして、クローンＮ
１−１の代わりにクローンＴ７Ｎ１−１を用いることに
よりクローンＴ７Ｎ１Ｎ３Ｎ１０を得る。このクローン
とクローンＮ２７Ｎ１９−１を制限酵素ＢａｍＨＩで連
結してクローンＴ７Ｎ１１９を得る。このクローンＴ７
Ｎ１１９とクローン１９２５はＮ１９領域を持ち、この
Ｎ１９領域内にある制限酵素サイトＰｖｕＩを利用し
て、この２つのクローンを連結しクローンＴ７Ｎ１ー２
５を得る。
【００７７】次に、〔４〕の５）で得たクローン１５３
０Ｕを持つｐＵＣ１５３０Ｕの３’末端にあるＨｉｎｄ
ＩＩＩサイトにＥｃｏＲＩ−ＮｏｔＩ−ＢａｍＨＩアダ
プター（東洋紡績社製）を導入しクローン１５３０Ｕの
３’末端にＮｏｔＩサイトを持つクローン１５３０ＵＮ
ｏｔを得る。クローンＴ７Ｎ１ー２５とクローン１５３
０ＵＮｏｔと〔３〕で得たクローンＭＸ２５Ｎ１５−１
を連結するために、クローンＴ７Ｎ１ー２５とＭＸ２５
Ｎ１５−１が重複するＭＸ２５領域内のＰｓｔＩサイト
と、ＭＸ２５Ｎ１５−１とクローン１５３０ＵＮｏｔが
重複するＮ１５領域内のＥｃｏＴ２２Ｉサイトで３つの
ＤＮＡ断片を１つに連結する。また、クローンＴ７Ｎ１
ー２５は５’末端にＳｐｅＩサイトを持ち、クローン１
５３０ＵＮｏｔは３’末端にＮｏｔＩサイトを持つ。
【００７８】ＨＣＶの遺伝子配列は、クローンＴ７Ｎ１
ー２５、クローンＭＸ２５Ｎ１５−１、クローン１５３
０ＵＮｏｔの順に重なり合うことなく連結させることで
作成できる。よって、クローンＴ７Ｎ１ー２５をＳｐｅ
ＩとＰｓｔＩ、クローンＭＸ２５Ｎ１５−１をＰｓｔＩ
とＥｃｏＴ２２Ｉ、クローン１５３０ＵＮｏｔをＥｃｏ
Ｔ２２ＩとＮｏｔＩ、λＺａｐＩＩ（ストラテージーン
社製）をＳｐｅＩとＮｏｔＩでそれぞれ切断後、連結さ
せることでλＺａｐＩＩのＳｐｅＩサイトとＮｏｔＩサ
イトの間にＨＣＶの遺伝子配列を持つＤＮＡ断片が１つ
だけ入った（５’末端からクローンＴ７Ｎ１ー２５、ク
ローンＭＸ２５Ｎ１５−１、クローン１５３０ＵＮｏｔ
の順に連結された）ファージを得る（連結されたＨＣＶ
由来のクローンをＴ７Ｎ１ー３０Ｕとする）。λＺａｐ
ＩＩ（ストラテージーン社製）へのライゲーション、フ
ァージＤＮＡの単離、ブルースクリプトＩＩ（ｐＢｌｕ
ｅｓｃｒｉｐｔ ＩＩ）へのサブクローニングなどは、
添付のプロトコールに準じて行うことができる。また、
ファージ粒子作成のためのパッケージはギガパックＩＩ
ゴールド（Ｇｉｇａｐａｃｋ ＩＩ Ｐａｃｋａｇｉ
ｎｇ Ｅｘｔｒａｃｔｓ／ストラテージーン社製）を用
いて、添付のプロトコールに準じて行うことができる。
このクローンＴ７Ｎ１ー３０Ｕは、ＨＣＶ由来ｃＤＮＡ
の５’末端に人工的にＴ７ファージのプロモーター配列
を導入し、３’末端にはポリＴ配列を持つＤＮＡ断片で
ある。
【００７９】〔６〕 Ｃ型肝炎患者血清由来ｃＤＮＡに
コードされるポリペプチドを連結した融合発現 〔１〕、〔２〕、〔３〕、〔４〕で得られた各クローン
にコードされるポリペプチドや、〔５〕で得られたＨＣ
Ｖ由来の全タンパク質をコードするＤＮＡ配列からある
特定の領域のポリペプチドを発現させてＨＣＶ由来の組
換えＣ型肝炎特異抗原タンパク質を得ることができる。
本発明の発現ベクターは、上記のようにして得られたＨ
ＣＶ由来の組換えＣ型肝炎特異抗原タンパク質をコード
するＤＮＡを転写できる位置にプロモーターを含有して
いる。例えば、大腸菌、枯草菌等、微生物を宿主とする
ときは、発現ベクターは、プロモーター、リボゾーム結
合（ＳＤ）配列、ＨＣＶ由来の組換えＣ型肝炎特異抗原
タンパク質遺伝子、転写終結因子、及びプロモーターを
制御する遺伝子より成ることが望ましい。プロモーター
としては、大腸菌、ファージ等由来のもの、例えば、ト
リプトファン合成酵素（ｔｒｐ）、ラクトースオペロン
（ｌａｃ）、ラムダファージＰL、ＰR 、Ｔ5 初期遺伝
子Ｐ25、Ｐ26プロモーター等が挙げられる。また、これ
らは独自に設計された配列でも良い。
【００８０】リボゾーム結合配列としては、大腸菌、フ
ァージ等由来のものでも良いが、独自に設計された配列
を合成により作成した１６ＳリボゾームＲＮＡの３′末
端領域に相補的な配列を連続した４塩基以上のコンセン
サス配列を持ったものでも良い。転写終結因子は必ずし
も必要ではないが、ρ非依存性のもの、例えばリポプロ
テインターミネーター、ｔｒｐオペロンターミネータ
ー、等を有している方が望ましい。さらに、これらの発
現に必要な因子の発現プラスミド上での配列順序は、
５′上流から、プロモーター、ＳＤ配列、ＨＣＶ由来の
組換えＣ型肝炎特異抗原タンパク質遺伝子、転写終結因
子の順に並ぶことが望ましい。発現ベクターとしては、
市販のｐＫＫ２３３−２（ファルマシア社製）等が使用
できる。また、融合蛋白を発現させるには、発現ベクタ
ーｐＧＥＸシリーズ（ファルマシア社製）等が使用され
る。宿主の形質転換法としては、実施例３０に示すよう
に東洋紡績社のプロトコールに従うか、常法に従って行
うことができる。
【００８１】形質転換体の培養は、モレキュラー クロ
ーニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ、１９
８２）に記述の方法を参考に行えばよい。培養温度は２
８℃から４２℃程度である。また、真核生物、例えば、
昆虫細胞、動物（ほ乳類）細胞等における発現ベクター
を構成する基本的な単位は、前述の微生物のものと変わ
らないが、次のようなものが好ましい。昆虫細胞として
は、例えば、インビトロジェン社のバキュロウイルス発
現マニュアルであるマックスバック（ＭＡＸＢＡＣTM、
ＢＡＣＵＬＯＶＩＲＵＳ ＥＸＰＲＥＳＳＩＯＮ ＳＹ
ＳＴＥＭ ＭＡＮＵＡＬ ＶＥＲＳＩＯＮ １．４）に
従い、このキットを利用する。この時、発現量をあげる
ためポリヘドリンのプロモーターから開始コドンまでの
距離を変えることが望ましい。動物細胞でのプロモータ
ーとしては、アデノウイルスＥＩＡ遺伝子による活性型
プロモーター（続生化学実験講座１ 遺伝子研究法Ｉ
Ｉ，１８９ー１９０，１９８６）、ＳＶ４０初期プロモ
ーター、ＳＶ４０後期プロモーター、アポリポプロテイ
ンＥ遺伝子プロモーター、ＳＲαプロモーター（モレキ
ュラー アンドセルラー バイオロジー，８（１），４
６６ー４７２，１９８８）等が使用される。基本的に
は、発現ベクターｐＫＣＲ（プロシーディングス オブ
ナショナル アカデミー オブ サイエンス ユー・
エス・エー，７８，１５２８，１９８１）あるいはその
基本的機能を最低限損わない程度に改良したｐＢＰＶ
ＭＴ１（プロシーディングス オブ ナショナル アカ
デミー オブ サイエンスユー・エス・エー，８０，３
９８，１９８３）等が使用できる。
【００８２】発現ベクターで形質転換される動物細胞と
しては、ＣＨＯ細胞、ＣＯＳ細胞、ＣＶ−１細胞、マウ
スＲＩＩＩ由来細胞Ｃ１２７株等があげられる。大腸菌
や真核生物における発現ベクターに該クローンを導入す
る際、ベクター由来の開始コドンのフレームに合うよう
にすればよく、また、ベクター由来の開始コドンを利用
しない場合でも、該クローンの翻訳フレームに合うよう
に５’側に開始コドンを付加してから発現ベクターに導
入すればよい。この場合の、該クローンの翻訳フレーム
とは、例えば代表されるクローンとして示した配列表の
配列番号１から１０４において、アミノ酸一つに対して
対応している３つずつに分けられた塩基配列の枠組みの
ことである。大腸菌などの微生物、昆虫細胞、及び動物
細胞で発現させた該組換えポリペプチドをＨＣＶ由来抗
原として同定するには、ＨＣＶ患者血清との免疫学的反
応性を利用する。即ち、ウエスタンブロッティング法に
より同定する。
【００８３】Ｃ型肝炎患者血清由来ｃＤＮＡにコードさ
れるポリペプチドでＨＣＶ患者血清との免疫学的反応性
の高いと予想される領域をそれぞれ連結して、各種細胞
で大量に発現させた。例えば、〔１〕で示した配列表の
配列番号３のアミノ酸番号で１番目から１１５番目のア
ミノ酸配列からなるポリペプチドを発現させるのに発現
ベクターｐＣＺＣＯＲＥを用いたが、このポリペプチド
のエピトープ部位を残してＣ末端側にクローンＮ２３の
コードするポリペプチドを連結して、融合蛋白として発
現させる。また、さらにそのＣ末端側に配列番号４３の
アミノ酸番号で９６３番目から１００５番目のアミノ酸
配列を含むポリペプチドを連結するなど、ＨＣＶ患者血
清との免疫学的反応性の高いと予想される領域をｃＤＮ
Ａ上で連結し、発現ベクターに組み込み、該ポリペプチ
ドを発現させる。具体的に、後述の実施例３０に示すよ
うに、ＨＣＶ由来コア蛋白のエピトープと、非構造蛋白
領域ＮＳ３の１部でありクローンＮ２３がコードするポ
リペプチドでＨＣＶ患者血清との免疫学的反応性の高い
と予想されるエピトープを含む領域を連結したポリペプ
チドＣＮ２３を大腸菌でダイレクトに大量発現させた。
すなわち、ｐＣＺＣＯＲＥのコア遺伝子内にあるＳａｃ
ＩＩサイトに翻訳フレームが合うようにクローンＮ２３
を１０７番目のＧからつないだ。このコア蛋白Ｎ末端の
遺伝子の３’末端側にクローンＮ２３の１部をつない
で、コア蛋白とクローンＮ２３のコードするポリペプチ
ドのエピトープ部位同士を連結して融合蛋白として発現
させることのできる発現ベクターｐＣＺＣＮ２３を作成
した。さらに、ＳＤ配列を５’側に持ち、ＨＣＶ由来の
タンパク質をコードするＤＮＡ断片をタンデムにつなげ
ることにより、目的のポリペプチドをさらに大量に発現
させることができた。このコア蛋白とＮ２３領域のエピ
トープ部位が連結された融合蛋白は、非常に高い確率で
ＨＣＶ患者血清との免疫学的反応した。
【００８４】
【発明の効果】本発明のＨＣＶ由来の遺伝子またはＤＮ
Ａ断片は新規であり、これらＤＮＡ又はこれらがコード
するポリペプチドを使用して得られるＨＣＶ抗原性ペプ
チドは、ＨＣＶ抗体を高率で検出でき、また、特異的に
検出できる診断法の開発に有用である。
【００８５】
【実施例】以下に実施例を挙げて本発明をより具体的に
説明するが、その要旨を越えない限り、以下の実施例に
限定されるものではない。また、実施例１から実施例３
の実験操作では、基本的に試料のコンタミネーションに
注意するため、例えば各反応液への試料の調製、試薬の
調製等の全ての操作で用いられたチップやピペットは、
１回使用する毎に交換された。また、特に方法を記さな
いで行った次に記す基本的な遺伝子操作は、それぞれの
操作の後にカッコ内に示す実験書や試薬販売会社が添付
したプロトコールに従って行った。核酸の電気泳動（モ
レキュラー・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌ
ｏｎｉｎｇ）１９８２ コールド・スプリング・ハーバ
ー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））、制限
酵素によるＤＮＡ断片の切断（モレキュラー・クローニ
ング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２
コールド・スプリング・ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒ
ｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ）、あるいは東洋紡績社製・遺伝
子工学研究用試薬総合カタログ １９９０、１９９
１）、ＤＮＡ断片どうしのライゲーション反応（宝酒造
社製・ＴＡＫＡＲＡ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｃ
ａｔａｌｏｇ １９９１ ｖｏｌ．１）、ＤＮＡ断片の
アクリルアミドゲルやアガロースゲルからの抽出（モレ
キュラー・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏ
ｎｉｎｇ）１９８２ コールド・スプリング・ハーバー
（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））、導入さ
れたプラスミドにより形質転換された大腸菌のアガロー
スプレート上での培養とそこからのコロニーの単離、プ
ラスミドにより形質転換された大腸菌（モレキュラー・
クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）
１９８２ コールド・スプリング・ハーバー（Ｃｏｌｄ
Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））
【００８６】実施例１ Ｃ型肝炎患者血清からの核酸抽
出 Ｃ型肝炎患者血清（この血清は、オルソ社製ＨＣＶ Ｅ
ＩＡ キットでＯＤ＝３．５以上の値を示した）１０ｍ
ｌにトリス緩衝液（５０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ
８．０），１ｍＭ ＥＤＴＡ，１００ｍＭ ＮａＣｌ）
２５ｍｌを加え、混和後２０，０００ｇ、２０℃で２０
分間遠心し、その上清を更に１００，０００ｇ、２０℃
で５時間遠心した。この沈澱にプロテネースＫ溶液（１
％ドデシル硫酸ナトリウム、１０ｍＭ ＥＤＴＡ，１０
ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ７．５），Ｐｒｏｔｅｎ
ａｓｅｋ（ファルマシア製）２ｍｇ／ｍｌ，ｙｅａｓｔ
ｔＲＮＡ ｍｉｘｔｕｒｅ ６．６μｇ）１．５ｍｌを
加え溶解後、９０分間４５℃で保温し、このものを等量
のフェノール／クロロホルムを加えた後、激しく混和し
遠心分離操作により核酸を含む水相を回収する操作（以
下、「フェノール／クロロホルム処理」と略す）を４回
以上行った。さらに、クロロホルム処理を２回以上行っ
た。この様にして得られた水相に１０分の１量の３Ｍ酢
酸ナトリウムもしくは等量の４Ｍ酢酸アンモニウムと水
相の２．５倍容のエタノールを加え混和し、−２０℃で
一晩もしくは−８０℃で１５分以上静置した後ＳＷ４１
Ｔｉロータ（ベックマン社製）で３５，０００ｒｐｍで
４時間遠心を行い核酸を沈澱物として回収した。
【００８７】実施例２ ｃＤＮＡの合成 〔１〕ＲＮＡサンプルの調製 実施例１で得られた核酸を乾燥させた後、水３０μｌと
リボヌクレアーゼインヒビター（１００ユニット／μ
ｌ、宝酒造社製）１０μｌを加え溶解させた。この核酸
水溶液を用い下記に示すｃＤＮＡ合成を行った。 〔２〕ランダムプライマーを用いたｃＤＮＡの合成 〔１〕で調製した核酸水溶液２μｌにランダムプライマ
ー（０．１７０Ｄ，アマシャム社製）２．７μｌ、１０
ｘＰＣＲ（Ｍｇ）緩衝液（１００ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣ
ｌ（ｐＨ８．３），６０ｍＭ ＭｇＣｌ2 ，５００ｍＭ
ＫＣｌ）２μｌ、１．２５ｍＭ ４ｄＮＴＰ ８μ
ｌ、水２μｌを加え６５℃５分、次に２５℃で５分保温
後、逆転写酵素（ライフ サイエンス社製）２５ユニッ
ト１μｌ、リボヌクレアーゼインヒビター（１００ユニ
ット／μｌ、宝酒造社製）１μｌを加え３７℃２０分、
次に４２℃３０分、最後に９５℃５分保温後、すぐに０
℃に冷却した（相補鎖ＤＮＡ合成）。このＤＮＡ試料２
μｌを用いてＳａｉｋｉらの方法〔ネーチャー（Ｎａｔ
ｕｒｅ），３２４，１２６，（１９８６）〕に準じて、
いわゆるＰＣＲ法により特異的配列を持つＤＮＡを増幅
した。即ち、このＤＮＡ試料２μｌ、１０ｘＰＣＲ緩衝
液（１００ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．３），５
００ｍＭ ＫＣｌ，１５０ｍＭ ＭｇＣｌ2 ，１％ゼラ
チン）１０μｌ、２．５ｍＭ ４ｄＮＴＰ ８μｌ、２
種の合成ＤＮＡプライマー（Ｓ１−ＡＳ１、Ｓ２−ＡＳ
１、Ｓ２−ＡＳ２またはＳ４−ＡＳ３から成る組合せを
使用）それぞれ５０ｐｍｏｌｅｓ、水で合計が１００μ
ｌになるようにして、まず９５℃に５分間保温後、０℃
に急冷した。１分後、Ｔａｑ ＤＮＡポリメラーゼ（７
ユニット／μｌ、ＡｍｐｌｉＴａｑTM宝酒造）０．５μ
ｌを加え混和後、ミネラルオイルを重層した。このサン
プルを、パーキン エルマー シータス社製のＤＮＡ
Ｔｈｅｒｍａｌ Ｃｙｃｌｅｒで９５℃１分、４０〜５
５℃１分、７２℃１〜５分で２５回処理した。
【００８８】この反応水溶液をフェノール／クロロホル
ム処理、エタノール沈澱（エタノール沈澱とは、水相に
１０分の１量の３Ｍ酢酸ナトリウムもしくは等量の４Ｍ
酢酸アンモニウムと水相の２．５倍容のエタノールを加
え混和し、半径５ｃｍ程度のロータを用いて１５，００
０ｒｐｍ，４℃で１５分間冷却遠心を行い、その沈澱を
乾燥させる処理）を行い、種々のプライマーの組み合わ
せに由来した増幅ＤＮＡ断片を得た。
【００８９】〔３〕アンチセンスプライマーを用いたｃ
ＤＮＡの合成 〔１〕で調製した核酸水溶液２μｌにアンチセンスプラ
イマー（合成ＤＮＡプライマーＡＳ１、ＡＳ２またはＡ
Ｓ３、１５ｐｍｏｌｓ／μｌ）１μｌ、１０ｘＲＴ緩衝
液（１００ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．３），５
００ｍＭ ＫＣｌ）２μｌ、２５ｍＭ ＭｇＣｌ2 ４
μｌ、２．５ｍＭ ４ｄＮＴＰ ８μｌ、水１μｌを加
え６５℃５分、次に室温５分保温後、逆転写酵素（ライ
フ サイエンス社製）２５ユニットを１μｌ、リボヌク
レアーゼインヒビター（１００ユニット／μｌ、宝酒造
社製）１μｌを加え３７℃２０分、次に４２℃３０分、
最後に９５℃２分保温後、すぐに０℃に冷却した（相補
鎖ＤＮＡ合成）。このＤＮＡ試料１０μｌを用いてＳａ
ｉｋｉらの方法〔ネーチャー（Ｎａｔｕｒｅ），３２
４，１２６，（１９８６）〕に準じて、いわゆるＰＣＲ
法により特異的配列を持つＤＮＡを増幅した。即ち、こ
のＤＮＡ試料１０μｌ、１０ｘＰＣＲ緩衝液（１００ｍ
Ｍ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．３），５００ｍＭ Ｋ
Ｃｌ，１５ｍＭ ＭｇＣｌ2 ，１％ゼラチン）１０μ
ｌ、２．５ｍＭ ４ｄＮＴＰ ８μｌ、相補鎖ＤＮＡ合
成時に使用した合成ＤＮＡプライマー（１５０ｐｍｏｌ
ｓ／μｌ）２μｌ、このプライマーに対応した合成ＤＮ
Ａプライマー（１５ｐｍｏｌｓ／μｌ、相補鎖ＤＮＡ合
成時に使用した合成ＤＮＡプライマーと対になるもの）
３μｌに水を加えて合計が１００μｌになるようにし
て、まず９５℃に５分間保温後、０℃に急冷した。１分
後、Ｔａｑ ＤＮＡポリメラーゼ（７ユニット／μｌ、
ＡｍｐｌｉＴａｑTM宝酒造）０．５μｌを加え混和後、
ミネラルオイルで重層した。このサンプルを、パーキン
エルマー シータス社製のＤＮＡ Ｔｈｅｒｍａｌ
Ｃｙｃｌｅｒで９５℃１分、４０〜５５℃１分、７２℃
１〜５分で２５回処理した。最後に７２℃で７分保温し
た後、この反応水溶液をフェノール／クロロホルム処
理、エタノール沈澱（エタノール沈澱とは、水相に１０
分の１量の３Ｍ酢酸ナトリウムもしくは等量の４Ｍ酢酸
アンモニウムと水相の２．５倍容のエタノールを加え混
和し、半径５ｃｍ程度のロータを用いて１５，０００ｒ
ｐｍ，４℃で１５分間冷却遠心を行い、その沈澱を乾燥
させる処理）を行い、種々のプライマーの組み合わせに
由来した増幅ＤＮＡ断片を得た。
【００９０】実施例３ 増幅された該ＤＮＡ断片のクロ
ーニングと塩基配列の決定 実施例２の〔２〕、〔３〕の方法によって得たＤＮＡ断
片を少なくとも１ｐｍｏｌｅ用意し、このＤＮＡをＴ４
ＤＮＡポリメラーゼ（ＴＯＹＯＢＯ社製）で平滑末端化
し（モレキュラー・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ
Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２ コールド・スプリング・
ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏ
ｒ））、ポリヌクレオチドキナーゼ（ＴＯＹＯＢＯ社
製）で５′末端にリン酸基を導入後（モレキュラー・ク
ローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）１
９８２ コールド・スプリング・ハーバー（Ｃｏｌｄ
Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））、ライゲーションキッ
ト（宝酒造社製）を用いて、ｐＵＣ１９クローニングベ
クターのマルチクローニングサイト内にあるＳｍａＩサ
イトに組み込んだ。（この時ライゲーションに用いたベ
クターＤＮＡは、次の様に用意されたものを５ｎｇ〜１
０ｎｇ使用した。即ち、ｐＵＣ１９クローニングベクタ
ーを制限酵素ＳｍａＩ（ＴＯＹＯＢＯ社製）で切断し、
フェノール／クロロホルム処理、エタノール沈澱させた
後、さらにアルカリフォスタファーゼ（ベーリンガーマ
ンハイム社製）で５′末端を脱リン酸化して（モレキュ
ラー・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉ
ｎｇ）１９８２ コールド・スプリング・ハーバー（Ｃ
ｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））、フェノール
／クロロホルム処理、エタノール沈澱させた。）このよ
うにして作成したＤＮＡを用いて大腸菌ＪＭ１０９ある
いはＤＨ５を形質転換させた（この時、コンピテントセ
ルはＴＯＹＯＢＯ社製のものを用いて行った）。
【００９１】形質転換させる方法は、ＴＯＹＯＢＯ社の
コンピテント ハイ（ＣＯＭＰＥＴＥＮＴ ＨＩＧＨ）
のプロトコールに従った。このようにして、それぞれの
プライマーの組み合わせから実施例２の〔２〕、〔３〕
の方法によって得た該ＤＮＡ断片を持つｐＵＣ１９クロ
ーニングベクターで形質転換させた形質転換体は、少な
くとも、各々２０個以上得ることができた。得られた形
質転換体からプラスミドＤＮＡを常法により調製し、デ
ュポン社製蛍光シークエンサーＧＥＮＥＳＩＳ２０００
システムを用いて、配列を決定した。シークエンスプラ
イマーとして次の２種の合成プライマー５′ｄ（ＧＴＡ
ＡＡＡＣＧＡＣＧＧＣＣＡＧＴ）３′（配列番号：１４
３），５′ｄ（ＣＡＧＧＡＡＡＣＡＧＣＴＡＴＧＡＣ）
３′（配列番号：１４４）を使用し、該ＤＮＡ断片の＋
鎖、一鎖の塩基配列を決定した。該ＤＮＡ断片は配列表
の配列番号１から４及び９から１２に示す通りの塩基配
列を有していた。配列表の配列番号１、２、３、４、
９、１０、１１及び１２に示す塩基配列は、それぞれ上
記で得られた形質転換体の内、クローンＮ１−１，Ｎ２
−１，Ｎ３−１，Ｎ１０−１，Ｎ１−２，Ｓ１−１，Ｓ
１−２，Ｓ１−３の＋鎖の塩基配列をしめす。これらの
クローンは、それぞれ前記実施例２〔２〕に示す４種の
組み合わせのプライマーをもとに実施例２、実施例３の
方法に従って得られた２本鎖ＤＮＡである。またこれら
のクローンの塩基配列を決定するために用いられたプラ
スミドをそれぞれｐＵＣＮ１−１，ｐＵＣＮ２−１，ｐ
ＵＣＮ３−１，ｐＵＣＮ１０−１，ｐＵＣＮ１−２，ｐ
ＵＣＳ１−１，ｐＵＣＳ１−２，ｐＵＣＳ１−３とし
た。これらのプラスミドは対応する該ＤＮＡ断片をそれ
ぞれ１分子ずつもっていた。
【００９２】これらの配列は、Ｃ型肝炎患者血清由来の
ＲＮＡより作成されたｃＤＮＡからクローニングされた
クローンの塩基配列を表しており、健常人の血清からは
この方法で実施してもなにも得られないか、あるいは、
実施例２〔２〕、〔３〕で示したＰＣＲ法のサイクルを
３倍か４倍にして（サイクルをおそらく６０〜１００
回）増幅して、もし仮に得たＤＮＡ断片があるとして
も、そのＤＮＡ断片の配列が前記の４種の組み合わせに
対応する配列表の配列番号１から４に示す塩基配列とは
ホモロジーのないものしか得られなかった。すなわち、
ここで得られたクローンＮ１−１，Ｎ２−１，Ｎ３−
１，Ｎ１０−１，Ｎ１−２，Ｓ１−１，Ｓ１−２，Ｓ１
−３の塩基配列はＣ型肝炎患者血清由来のものに特異的
なものであることが分った。そこで、得られた該ＤＮＡ
断片のオープンリーディングフレームが成すポリペプチ
ドがＣ型肝炎患者血清由来の抗体と反応する抗原になり
得るかどうか調べるため、実施例４以下に例示するよう
に、該ポリペプチドを発現させるための該ＤＮＡの改変
とそれの発現を行った。
【００９３】実施例４ クローンＮ１Ｎ３Ｎ１０あるい
はＮ３Ｎ１０の取得方法 〔１〕クローンＮ３Ｎ１０を得る方法 前記クローンＮ３−１およびＮ１０−１からのＤＮＡ断
片Ｎ３−１、Ｎ１０−１それぞれ１μｌずつ（約２００
〜３００ｎｇ）を１０ｘＰＣＲ緩衝液（１００ｍＭ Ｔ
ｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．３），５００ｍＭ ＫＣｌ，
１５ｍＭ ＭｇＣｌ2 ，１％ゼラチン）１０μｌ、２．
５ｍＭ ４ｄＮＴＰ ８μｌ、合成プライマーＳ２とＡ
Ｓ３（ともに２０ｐｍｏｌ／μｌ）をそれぞれ５μｌ、
水７６．５μｌの反応溶液に入れた。よく混合後、まず
９５℃に５分間保温後、０℃に急冷した。１分後、Ｔａ
ｑＤＮＡポリメラーゼ（７ユニット／μｌ、Ａｍｐｌｉ
ＴａｑTM宝酒造）０．５μｌを加え混和後、ミネラルオ
イルで重層した。このサンプルを、パーキン エルマー
シータス社製のＤＮＡ Ｔｈｅｒｍａｌ Ｃｙｃｌｅ
ｒで９５℃１分、４０℃１分、７２℃２分で２５回処理
した。次に９７℃に２分間保温後、０℃に急冷し２分間
保温した。さらに反応水溶液にＴａｑ ＤＮＡポリメラ
ーゼ（７ユニット／μｌ、ＡｍｐｌｉＴａｑTM宝酒造）
０．５μｌを加え同様にして９５℃１分、５０℃１分、
７２℃２分で２５回処理した。
【００９４】最後に７２℃で７分保温した後、この反応
水溶液をフェノール／クロロホルム処理、エタノール沈
澱させた。この増幅されたＤＮＡサンプルは、アガロー
ス電気泳動によって分離され（モレキュラー・クローニ
ング（ＭｏｌｅｃｕｌａｒＣｌｏｎｉｎｇ）１９８２
コールド・スプリング・ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉ
ｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））、目的の長さを持つＤＮＡ断片
はゲルから切り出された（モレキュラー・クローニング
（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２ コ
ールド・スプリング・ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎ
ｇ Ｈａｒｂｏｒ））。得られたＤＮＡ断片は実施例３
と同様に処理してｐＵＣ１９クローニングベクターのマ
ルチクローニングサイト内にあるＳｍａＩサイトに組み
込んだ。これをクローン化しスクリーニングして（方法
は、実施例３と同様である。）プラスミドｐＵＣＮ３Ｎ
１０を得て、これで得られたＣ型肝炎患者血清由来ｃＤ
ＮＡをクローンＮ３Ｎ１０と名付けた。その塩基配列を
配列表の配列番号５に示す。
【００９５】〔２〕クローンＮ１Ｎ３Ｎ１０を得る方法 オーバーラップするクローンＮ１−１とクローンＮ３Ｎ
１０を重複することなしに連結させるため、両方に共通
で、かつ、１つしかない制限酵素切断部位がオーバーラ
ップするところにあることを利用した。即ち、制限酵素
ＢｓｓＨIIによってクローンＮ１−１は４５５番目Ｇの
３′側で切断され、クローンＮ３Ｎ１０は１５９番目の
Ｇの３′で切断される。また、プラスミドｐＵＣＮ１、
ｐＵＣＮ３Ｎ１０ともに該ＤＮＡ断片が同じ向きに入っ
ていることを考慮して、ｐＵＣＮ１をＨｉｎｄIII 、Ｂ
ｓｓＨIIで、長さ４９２ｂｐのＤＮＡ断片（このＤＮＡ
断片は、Ｃ型肝炎患者血清由来ｃＤＮＡのクローンＮ１
−１の５′側４５５ｂｐの５′側にプラスミドｐＵＣ１
９のＨｉｎｄIIIサイトからＳｍａＩサイトまでのＤＮ
Ａ断片を付加したものである）を切り出し、ｐＵＣＮ３
Ｎ１０の長さ１５９ｂｐのＨｉｎｄIII 、ＢｓｓＨIIで
切り出されるＤＮＡ断片と入れ換え、クローン化しスク
リーニングすることによりプラスミドｐＵＣＮ１Ｎ３Ｎ
１０を得ることができた。このプラスミドはクローンＮ
１−１、Ｎ３−１、Ｎ１０−１がオーバーラップするこ
となく連結されたクローンＮ１Ｎ３６１０を保有してい
た。クローンＮ１Ｎ３Ｎ１０の塩基配列を配列表の配列
番号６に示す。
【００９６】実施例５ クローンＮ３−１、Ｎ３Ｎ１０
にコードされているＨＣＶ由来ポリペプチドを発現させ
るためのＤＮＡの改変 〔１〕クローンＮ３−１にコードされているＨＣＶ由来
ポリペプチドを大腸菌内で発現させるためのＤＮＡの改
変 クローンＮ３−１には２２番目のＡからＨＣＶの構造タ
ンパク質がコードされていると思われ、２２〜２４番目
にある開始コドンＡＴＧを利用して発現させる。ＤＮＡ
の改変はＰＣＲ法を用いた。この時、用いたプライマー
は次に示す合成ＤＮＡを使用した。５′プライマー用の
塩基配列は ５′ＧＣＡＡＧＣＴＴＡＴＧＡＧＣＡＣＡＡＡＴＣＣＡ
ＡＡＡＣＣＣＣＡＡＡＧＡ３′（配列番号：１４５） である。また、３′プライマー用の塩基配列は ５′ＧＣＧＡＡＴＴＣＡＧＡＴＣＴＴＣＡＣＣＴＡＣＧ
ＣＣＧＧＧＧＧＴＣＣＧＴＧＧＧ３′（配列番号１４
６） である。これら２つの合成ＤＮＡを２０ｐｍｏｌ／μｌ
に調製した。
【００９７】このＰＣＲ反応は、Ｓａｉｋｉらの方法に
従い行った。この反応は最終容量が１００μｌになるよ
うにし、テンプレートＤＮＡとしてプラスミドｐＵＣＮ
３を１００ｎｇ用い、プライマーは上述のように調製さ
れた溶液を５′，３′プライマー用ともに２μｌずつ使
用した。まず、調製された試料を９５℃に５分間保温
後、０℃に急冷した。１分後、Ｔａｑ ＤＮＡポリメラ
ーゼ（７ユニット／μｌ、ＡｍｐｌｉＴａｑTM宝酒造）
０．５μｌを加え混和後、ミネラルオイルで重層した。
このサンプルを、パーキン エルマー シータス社製の
ＤＮＡ Ｔｈｅｒｍａｌ Ｃｙｃｌｅｒで９５℃１分、
６０℃１分、７２℃１分で２５回処理した。このサンプ
ルを常法によりフェノール／クロロホルム処理、エタノ
ール沈澱させ、このＤＮＡ試料をＨｉｎｄIII 、Ｅｃｏ
ＲＩで切断後、目的の長さであるＤＮＡ断片をアクリル
アミドゲルで分離し、抽出した（モレキュラー・クロー
ニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８
２ コールド・スプリング・ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐ
ｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））。さらにクローニングベク
ターｐＵＣ１９のＨｉｎｄIII 、ＥｃｏＲＩサイトに常
法によりライゲーションしクローン化、スクリーニング
をして、プラスミドｐＵＣＨＮ３を得て、その塩基配列
を決定した。この方法によって得られたクローンＨＮ３
の塩基配列は、配列表の配列番号７に示される通りであ
り、５′末にＨｉｎｄIII サイトを持ち、続いて開始コ
ドンＡＴＧを保有している。また、３′末にはＥｃｏＲ
Ｉサイトがあり、その内側にＢｇｌIIサイト、終止コド
ンＴＧＡを保有している。
【００９８】〔２〕クローンＮ３Ｎ１０にコードされて
いるＨＣＶ由来ポリペプチドを大腸菌内で発現させるた
めのＤＮＡの改変 クローンＮ３Ｎ１０も２２番目のＡからＨＣＶの構造タ
ンパク質がコードされていると思われ、２２〜２４番目
にある開始コドンＡＴＧを利用して発現させた。ＤＮＡ
の改変はＰＣＲ法を用いた。この時、用いたプライマー
は次に示す合成ＤＮＡを使用した。５′プライマー用の
塩基配列は ５′ＧＣＡＡＧＣＴＴＡＴＧＡＧＣＡＣＡＡＡＴＣＣＡ
ＡＡＡＣＣＣＣＡＡＡＧＡ３′（配列番号：１４５） である。また、３′プライマー用の塩基配列は ５′ＧＣＧＡＡＴＴＣＡＧＡＴＣＴＴＣＡＧＡＴＴＣＴ
ＣＴＧＡＧＡＣＧＧＣＣＣＴＣＧＴ３′（配列番号：１
４７） である。これら２つの合成ＤＮＡを２０ｐｍｏｌ／μｌ
に調製した。
【００９９】ＰＣＲの反応溶液の調製と後処理は〔１〕
と同様に行われた。ただ、テンプレートＤＮＡにはｐＵ
ＣＮ３Ｎ１０が、プライマーは上記の２つが使用され、
ＰＣＲのサイクルは９５℃１分、５０℃１分、７２℃５
分で１０回行った後、９５℃１分、６５℃１分、７２℃
５分で２０回行った。このＤＮＡ試料をＨｉｎｄIII 、
ＥｃｏＲＩで切断後、目的の長さであるＤＮＡ断片をア
クリルアミドゲルで分離し、抽出した（モレキュラー・
クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）
１９８２ コールド・スプリング・ハーバー（Ｃｏｌｄ
Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））。さらにクローニン
グベクターｐＵＣ１９のＨｉｎｄIII 、ＥｃｏＲＩサイ
トに常法によりライゲーションしクローン化、スクリー
ニングをして、プラスミドｐＵＣＨＮ３Ｎ１０を得て、
その塩基配列を決定した。
【０１００】この方法によって得られたクローンＨＮ３
Ｎ１０は、５′末にＨｉｎｄIII サイトを持ち、続いて
開始コドンＡＴＧを保有している。また、３′末にはＥ
ｃｏＲＩサイトがあり、その内側にＢｇｌIIサイト、終
止コドンＴＧＡを保有している。クローンＨＮ３Ｎ１０
の中にあるＢａｍＨＩサイトをなくすため、そのサイト
の塩基配列５′ＧＧＡＴＣＣ３′を５′ＧＧＡＴＡＣ
３′に改変した。ＤＮＡの改変はＰＣＲ法を用いた。こ
の時、用いたプライマーとしては次に示す合成ＤＮＡを
使用した。５′プライマー用の塩基配列は ５′ＧＣＴＡＣＴＣＣＧＧＡＴＡＣＣＡＣ３′（配列番
号：１４８） である。また、３′プライマー用の塩基配列は ５′ＧＴＡＡＡＡＣＧＡＣＧＧＣＣＡＧＴ３′（配列番
号：１４３） である。これら２つの合成ＤＮＡを２０ｐｍｏｌ／μｌ
に調製した。
【０１０１】この５′プライマーのもっとも５′側のＧ
はクローンＮ３Ｎ１０の塩基配列の１０１６番目のＧに
相当する位置である。また３′プライマーはプラスミド
ｐＵＣ１９に由来する配列であり、実施例３で使用した
シークエンスプライマーの一つと同じものである。ＰＣ
Ｒ法のサイクルは９５℃１分、５５℃１分、７２℃１分
であり２５回繰返した。テンプレートＤＮＡは、プラス
ミドｐＵＣＨＮ３Ｎ１０を１００ｎｇ用いプライマーは
それぞれ３μｌづつ使用した。このサンプルを常法によ
りフェノール／クロロホルム処理、エタノール沈澱さ
せ、このＤＮＡ試料をＭｒｏＩ、ＢｇｌII、ＢａｍＨＩ
で切断後、目的の長さである２２６ｂｐのＤＮＡ断片を
アクリルアミドゲルで分離し、抽出した（モレキュラー
・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎ
ｇ）１９８２ コールド・スプリング・ハーバー（Ｃｏ
ｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））。さらに、プラ
スミドｐＵＣＨＮ３Ｎ１０のＭｒｏＩ、ＢｇｌIIサイト
に常法によりライゲーションしクローン化、スクリーニ
ングをして、プラスミドｐＵＣＨＮ３Ｎ１０△Ｂを得
て、その塩基配列を決定した。この方法によって得られ
たクローンＨＮ３Ｎ１０△Ｂの塩基配列は、配列表の配
列番号８に示される通りである。
【０１０２】〔３〕クローンＮ３Ｎ１０にコードされて
いるＨＣＶ由来ポリペプチドを昆虫細胞内で発現させる
ためのＤＮＡの改変 発現させるポリペプチドをコードするクローンＮ３Ｎ１
０には、ＨＣＶ由来の蛋白質遺伝子（コア、エンベロー
ブ（Ｍ−ｇｐ３５））が全て含まれ、２２番目のＡから
ＨＣＶの構造タンパク質がコードされていると思われ、
２２〜２４番目にある開始コドンＡＴＧを利用して昆虫
細胞内で発現させた。昆虫細胞内ではコアとエンベロー
ブ（Ｍ−ｇｐ３５）は、まず、つながって前駆体として
細胞内で発現し、その後、細胞内でプロセッシングを受
けてコアとエンベローブ（Ｍ−ｇｐ３５）に分かれ、少
なくともエンベローブ（Ｍ−ｇｐ３５）は糖鎖で不完全
ながら修飾され成熟型タンパク質として発現され細胞内
に蓄積された。発現ベクターを構築するためクローンＮ
３Ｎ１０のＤＮＡの改変はＰＣＲ法を用いた。この時、
用いたプライマーとしては次に示す合成ＤＮＡを使用し
た。
【０１０３】５′プライマー用の塩基配列は ＭＳ１０６：５′ＧＣＧＴＣＧＡＣＧＣＴＡＧＣＡＴＧ
ＡＧＣＡＣＡＡＡＴＣＣＡＡＡＡＣＣＣ３′（配列番
号：１４９） ＭＳ１０７：５′ＧＣＧＴＣＧＡＣＧＣＴＡＧＣＡＧＧ
ＴＣＴＣＧＴＡＧＡＣＣＧＴＧＣＡＴＣ３′（配列番
号：１５０） である。また、３′プライマー用の塩基配列は ＭＳ１０８：５′ＧＣＧＡＡＴＴＣＧＣＴＡＧＣＴＣＡ
ＧＧＡＴＴＣＴＣＴＧＡＧＡＣＧＧＣＣＣＴＣＧＡ３′
（配列番号：１５１） である。これら３つの合成ＤＮＡを２０ｐｍｏｌ／μｌ
に調製した。
【０１０４】ＰＣＲの反応溶液の調製と後処理は〔１〕
と同様に行われた。ただ、テンプレートＤＮＡにはｐＵ
ＣＮ３Ｎ１０が、５′プライマーとしてはＭＳ１０６あ
るいはＭＳ１０７が使用され、３′プライマーとしてＭ
Ｓ１０８が使用された。ＰＣＲのサイクルは９５℃１
分、５０℃１分、７２℃５分であり、これを１０回繰返
した後、９５℃１分、６５℃１分、７２℃５分を２０回
繰返した。５′プライマーにＭＳ１０６を用いた場合、
目的の長さ１２６５ｂｐのＤＮＡ断片１０６−１０８を
得た。また、５′プライマーにＭＳ１０７を用いた場合
には、同様にして１２８６ｂｐのＤＮＡ断片１０７−１
０８を得た。これらのＤＮＡ試料をＮｈｅＩで切断後、
目的の長さであるＤＮＡ断片をアクリルアミドゲルで分
離し、抽出した（モレキュラー・クローニング（Ｍｏｌ
ｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２ コールド・
スプリング・ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａ
ｒｂｏｒ））。さらに、トランスファーベクターｐＢｌ
ｕｅＢａｃ（インビトロジェン社）のＮｈｅＩサイト
に、常法によりライゲーションしクローン化、スクリー
ニングをして、ＤＮＡ断片１０６−１０８由来のプラス
ミドｐＢｌｕｅＮ３Ｎ１０−１とＤＮＡ断片１０７−１
０８由来のプラスミドｐＢｌｕｅＮ３Ｎ１０−２を得
た。
【０１０５】プラスミドｐＢｌｕｅＮ３Ｎ１０−１とプ
ラスミドｐＢｌｕｅＮ３Ｎ１０−２を、ＮｈｅＩあるい
はＢａｍＨＩで完全に切断させ、該ＤＮＡ断片が、トラ
ンスファーベクターｐＢｌｕｅＢａｃのＮｈｅＩサイト
に一だけ挿入されていることを確認した。また、これら
該プラスミドの発現ユニットはインビトロジェン社のプ
ロトコールに示されているものを参考にすると、ポリヘ
ドリンプロモーター下流のクローニングサイトＮｈｅＩ
切断部位にＨＣＶ由来の構造遺伝子（コア、エンベロー
ブ）が順方向に連結した構造を持っていた。 実施例６ クローンＨＮ３、ＨＮ３Ｎ１０△Ｂにコード
されるＨＣＶ由来ポリペプチドの発現 〔１〕クローンＨＮ３にコードされるポリペプチドの大
腸菌内での発現 クローンＨＮ３においてコードされるポリペプチドはＣ
型肝炎患者血清由来ｃＤＮＡにコードされるポリペプチ
ドの１部であり、これをそのまま大腸菌内で発現させ
た。これは以下に示すように発現ベクターとしてはｐＣ
Ｚ４４（特開平１−１２４３８７）が使用され、クロー
ンＨＮ３のｃＤＮＡをｐＣＺ４４にサブクローン化する
ことにより行われた。
【０１０６】まず、クローンＨＮ３がＨｉｎｄIII 、Ｂ
ｇｌIIにより充分に切断され、フェノール／クロロホル
ム処理、エタノール沈澱させ、両末端が各々ＨｉｎｄII
I 、ＢｇｌIIサイトの突出末端となった該ｃＤＮＡをを
持つＤＮＡ断片をアクリルアミドゲルで分離し、抽出さ
れた（モレキュラー・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａ
ｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２ コールド・スプリング
・ハーバー（ＣｏｌｄＳｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏ
ｒ））。同様に、発現ベクターｐＣＺ４４もＨｉｎｄII
I 、ＢｇｌIIにより充分に切断され、発現ベクター能を
持つ長い方のＤＮＡ断片を前述同様に調製し、これにク
ローンＨＮ３から用意されたＨｉｎｄIII 、ＢｇｌII断
片を１つ持つように連結され、さらに常法に従いクロー
ニングされた。得られたプラスミドはｐＣＺＣＯＲＥと
名付けられた。また、別の試みとしてｐＣＺ４４のかわ
りに融合蛋白質を発現できる発現ベクターｐＧＥＸ−２
Ｔ（ファルマシア社製）を用いて発現ベクターを構築し
た。この場合、基本的にファルマシア社の説明書に従っ
て操作を行った。まず、発現ベクターｐＧＥＸ−２Ｔを
ＢａｍＨＩで切断後、ＨｉｎｄIII リンカーを挿入しク
ローンＮ３−１のアミノ酸とコドンの読み枠が合うよう
にして、３′側のＥｃｏＲＩサイトと５′側の（リンカ
ーで作った）ＨｉｎｄIII サイトにＨＮ３のＨｉｎｄII
I 、ＥｃｏＲＩ断片を挿入した。こうして発現ベクター
ｐＧＥＸＣＯＲＥが得られた。
【０１０７】プラスミドｐＣＺＣＯＲＥを保持している
Ｋ１２株（例えばＪＭ１０９株またはＫＳ４７６株）ま
たはＢ株から誘導された大腸菌をＬ−Ｂｒｏｔｈ（モレ
キュラー・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏ
ｎｉｎｇ）１９８２ コールド・スプリング・ハーバー
（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））にて、３
７℃一晩培養した。これを５０倍希釈となるように新し
いＬ−Ｂｒｏｔｈに植菌し、２時間、３０℃で振とう培
養後、ＩＰＴＧ（イソプロピル−β−Ｄ−ガラクトピラ
ノシド）を１または２ｍＭになるように培地に加え、さ
らに３時間以上培養した。このようにＩＰＴＧの存在下
で菌を培養させることにより、単一クローン由来（この
場合、プラスミドｐＣＺＣＯＲＥのみで形質転換された
大腸菌）の組み換え体が、クローンＨＮ３から誘導され
たプラスミドｐＣＺＣＯＲＥを用いて、ＨＣＶ由来ＣＯ
ＲＥ−Ｎ３ポリペプチドを発現するように誘導された。
クローンＨＮ３のｃＤＮＡの塩基配列と該配列でコード
されるポリペプチドの推定アミノ酸配列を配列表の配列
番号７に示す。
【０１０８】また、プラスミドｐＧＥＸＣＯＲＥも同様
にしてβ−グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼ（Ｇ
ＳＴ）との融合タンパク質として発現体を得ることがで
きる。この場合、ファルマシア社の説明書にあるとおり
ＧＳＴのＣ末端にスロンビンで特異的に切断されるサイ
トを持ち、そのさらにＣ末端側にｐＣＺＣＯＲＥと同様
のクローンＨＮ３由来のポリペプチドがつながってい
る。この融合タンパク質ＧＳＴ−ＣＯＲＥを得るために
は、ｐＣＺＣＯＲＥからＨＣＶ由来ＣＯＲＥ−Ｎ３ポリ
ペプチドを発現するとき行う上記プロトコールと同様に
ＩＰＴＧの存在下でプラスミドｐＧＥＸＣＯＲＥで形質
転換させた大腸菌を培養させ、ＨＣＶ由来のタンパク質
をＣ末端に持つ融合タンパク質ＧＳＴ−ＣＯＲＥを発現
するように誘導された。
【０１０９】〔２〕クローンＨＮ３Ｎ１０△Ｂにコード
されるポリペプチドの発現 クローンＨＮ３Ｎ１０△Ｂに含まれるＣ型肝炎患者血清
由来ｃＤＮＡから、そのまま大腸菌内でポリペプチド
（ＣＭＥ−Ｎ３Ｎ１０△Ｂ）を発現させた。この発現の
方法は、〔１〕で記述されたのと同様な方法であった。
ただし、ＨＣＶｃＤＮＡの材料としてはクローンＨＮ３
Ｎ１０△Ｂに含まれるＣ型肝炎患者血清由来ｃＤＮＡで
あり、これは実施例３、実施例４〔１〕、実施例５
〔２〕で記述したように単離され塩基配列が決定された
ものである。従って、用いられた発現プラスミドは、実
施例５〔２〕で得られたプラスミドｐＵＣＨＮ３Ｎ１０
△Ｂから両末端が各々ＨｉｎｄIII 、ＢｇｌIIサイトの
突出末端となった該ｃＤＮＡを持つＤＮＡ断片をｐＣＺ
ＣＯＲＥを得たのと同様な方法でｐＣＺ４４のＨｉｎｄ
III 、ＢｇｌIIサイトに該ｃＤＮＡが１つだけ正しい方
向に入るようサブクローニング化することによりプラス
ミドｐＣＺＣＭＥ△Ｂとして得た。このプラスミドｐＣ
ＺＣＭＥ△Ｂの発現ユニットが正しく再構築されている
かどうかを、塩基配列決定と制限酵素切断地図の作成に
より確認した。
【０１１０】ＩＰＴＧの存在下で菌を培養させることに
より、単一クローン由来（例えば、プラスミドｐＣＺＣ
ＭＥ△Ｂのみで形質転換された大腸菌ＪＭ１０９株）の
組み換え体が、クローンＮ３Ｎ１０から改変されたクロ
ーンＨＮ３Ｎ１０△Ｂから誘導されたプラスミドｐＣＺ
ＣＭＥ△Ｂを用いて、ＨＣＶ由来ＣＭＥ−Ｎ３Ｎ１０△
Ｂポリペプチドを発現するように誘導された。クローン
ＨＮ３Ｎ１０△ＢのＣ型肝炎患者血清由来ｃＤＮＡの塩
基配列と該配列でコードされるポリペプチドの推定アミ
ノ酸配列を配列表の配列番号８に示す。（クローンＨＮ
３Ｎ１０△Ｂの塩基配列でコードされるポリペプチドの
推定アミノ酸配列と改変前のクローンＮ３Ｎ１０からの
推定アミノ酸配列とは同じである。）〔１〕の場合と同
様、プラスミドｐＧＥＸＣＭＥ△Ｂを構築、ファルマシ
ア社のプロトコールに従って、上記のプラスミドｐＣＺ
ＣＭＥ△Ｂと同様ににＩＰＴＧで誘導することで融合蛋
白ＧＳＴ−ＣＭＥ−Ｎ３Ｎ１０△Ｂを発現させた。
【０１１１】〔３〕クローンＮ３Ｎ１０にコードされて
いるＨＣＶ由来ポリペプチドの昆虫細胞内での発現 実施例５〔３〕で構築したプラスミドｐＢｌｕｅＮ３Ｎ
１０−１とプラスミドｐＢｌｕｅＮ３Ｎ１０−２にコー
ドされているＨＣＶ由来の構造タンパク質（コア、エン
ベローブ（Ｍ−ｇｐ３５））を昆虫細胞内で発現させる
ため、インビトロジェン社のバキュロウイルス発現マニ
ュアルであるマックスバック（ＭＡＸＢＡＣTM ＢＡＣ
ＵＬＯＶＩＲＵＳ ＥＸＰＲＥＳＳＩＯＮ ＳＹＳＴＥ
Ｍ ＭＡＮＵＡＬ ＶＥＲＳＩＯＮ １．４、以下これ
をマックスバックと呼ぶ。）に記載されている方法を基
本的に参考にして行った。実施例５〔３〕により作製さ
れた、トランスファーベクターｐＢｌｕｅＢａｃ（マッ
クスバック３７頁）の制限酵素ＮｈｅＩ切断部位にＨＣ
Ｖ構造遺伝子を含むＤＮＡ断片が挿入されたプラスミド
ｐＢｌｕｅＮ３Ｎ１０−１とプラスミドｐＢｌｕｅＮ３
Ｎ１０−２をＭａｎｉａｔｉｓらの方法（「モレキュラ
・クローニング」、コールド・スプリング・ハーバー・
ラボラトリー、８６頁〜９６頁（１９８２））に従い組
換え体の大腸菌から回収、精製しＨＣＶ構造遺伝子トラ
ンスファープラスミドＤＮＡを大量に得た。マックスバ
ック２７ページの方法に従い、キットのＡｃＮＰＶ ｖ
ｉｒａｌ ＤＮＡ １μｇとプラスミドｐＢｌｕｅＮ３
Ｎ１０−１あるいはプラスミドｐＢｌｕｅＮ３Ｎ１０−
２を２μｇを混合し、Ｓｆ９細胞同時感染してＳｆ９細
胞を形質転換した。
【０１１２】すなわち、まず直径６ｃｍのシャーレの中
でＦＣＳ（牛胎児血清）が１０％入ったＴＭＮ−ＦＨ培
地（インビトロジェン社製）中でＳｆ９細胞を２×１０
6 ／枚になるまで培養した。次にシャーレからＴＭＮ−
ＦＨ培地を除きそこに０．７５ｍｌのＦＣＳが１０％入
ったグレース（Ｇｒａｃｅ）培地（ギブコ（ＧＩＢＣ
Ｏ）社製）を加えた。先述の混合ＤＮＡに、キットに付
属のトランスフェクションバッファーを０．７５ｍｌ加
えボルテックスでよく攪拌後、グレース（Ｇｒａｃｅ）
培地上からＤＮＡ溶液をゆっくりと滴加した。２７℃４
時間静置し、その後Ｇｒａｃｅ培地を除きＦＣＳが１０
％入ったＴＭＮ−ＦＨ培地３ｍｌをシャーレに入れて２
７℃６日間培養した。３日目には幾つかの細胞中に多角
体が観察され、６日目にほとんどの細胞が多角体を形成
していた。この培養上清を遠心チューブに取り、１，０
００ｒｐｍ、１０分間遠心した上清を同時感染ウイルス
液とした。
【０１１３】この同時感染ウイルス液には１ｍｌあたり
１０8 個のウイルスが含まれており、またそのうちの約
０．５％が組換え体である。組換えウイルスを単離する
ためにプラーク単離法を用いた。その方法は以下の通り
である。同時感染ウイルス液を１０-4、１０-5に希釈し
た。予め６ｃｍシャーレに１枚当り１．５×１０6 個の
細胞をまき、吸着させたものを用意し、培地を完全に除
いた後、１０-4液、１０-5液を一枚のシャーレあたりそ
れぞれ１００μｌずつ加えた。細胞の乾燥を防ぐため、
シャーレを１５分おきに傾けてウイルス液が全面に行き
渡るようにした。このようにして室温で１時間感染させ
ている間に２．５％バキュロウイルスアガロース（ｂａ
ｃｕｌｏｖｉｒｕｓ ａｇａｒｏｓｅ）（インビトロジ
ェン（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）社製）を１０５℃、１０
分間オートクレーブし、４６℃で暖めておいた１０％Ｆ
ＣＳを含むＴＭＮ−ＦＨ培地と１対３の比率で混合し、
４６℃で保温しておいて。この保温された培地に対して
最終濃度１５０μｇ／μｌになるように５−ブロモ−４
−クロロ−３−インドリル−β−Ｄ−ガラクトシドを加
え（マックスバックの１６−１７ページに従った。）こ
の培地をアガロース含有ｘ−ｇａｌ培地と呼ぶこととし
た。
【０１１４】感染終了後、ウイルス液を完全に吸い取
り、保温されたアガロース含有ｘ−ｇａｌ培地を細胞が
はがれないようにシャーレ１枚あたり４ｍｌずつ静かに
加えた。アガロースが固化して乾燥するまでシャーレの
蓋を少しずらした状態で静置し、その後蓋をして裏返し
た状態で２７℃でインキュベーションした。６日間培養
した後、位相差顕微鏡で多角体の形成していない青いプ
ラークを見いだした。この組換えプラークをパスツール
ピペットでアガロースごと吸い取り、１ｍｌのＴＭＮ−
ＦＨ培地中で何回もピペッテイングしてウイルスを浮遊
させた。これら一連の操作（感染させてから、６日間培
養し該トランスファープラスミドＤＮＡを持つウイルス
を単離する操作）をプラーク法と呼ぶ。該ウイルス浮遊
液１００μｌをとり同様のプラーク法を行った。これら
一連の操作を３回繰り返して野性株の混入のないＨＣＶ
由来構造タンパク質遺伝子を持つ組換えウイルスを得
た。該ウイルスプラークをパスツールピペットで吸い取
り、１ｍｌのＴＭＮ−ＦＨ培地によく混和した。この初
代組換えウイルス液はウイルス濃度が低いため、そのう
ち１００μｌを取り、６ｃｍシャーレにハーフコンフル
エントに培養したＳｆ９細胞に吸着後１０％ＦＣＳを含
むＴＭＮ−ＦＨ培地４ｍｌを加え、３日後に培養上清を
回収してこれを感染用組換えウイルス液とした。
【０１１５】ＨＣＶ由来構造タンパク質を産出させるた
めに予め５×１０6 個のＳｆ９細胞を１０％ＦＣＳを含
むＴＭＮ−ＦＨ培地１０ｍｌに懸濁して９ｃｍシャーレ
に撒き、１時間吸着させた。シャーレから培地を取り除
き、感染用組換えウイルス液を２５０μｌ加え、全体に
行き渡らせたのち１０％ＦＣＳを含むＴＭＮ−ＦＨ培地
１０ｍｌを加え２７℃で４日間静置した。この細胞をか
きあつめ生理食塩水リン酸バッファー１，０００ｍｌに
よくサスペンジョンした。このようにして、該ウイルス
に感染されたＳｆ９細胞内にＨＣＶ由来構造タンパク質
を発現させた。また、プラスミドｐＢｌｕｅＮ３Ｎ１０
−１で感染させた細胞内とプラスミドｐＢｌｕｅＮ３Ｎ
１０−２で感染させた細胞内では、同じＨＣＶ由来のポ
リペプチドが発現された。 実施例７ 発現された生成物のＨＣＶ由来抗原としての
同定
【０１１６】Ｃ型肝炎ウイルスに感染したヒトの血清
が、実施例６で発現された該ポリペプチド（この場合、
〔１〕、〔２〕で示したＣＯＲＥ−Ｎ３ポリペプチドと
ＣＭＥ−Ｎ３Ｎ１０△Ｂポリペプチド、さらに〔３〕で
示した昆虫細胞内に発現されたクローンＮ３Ｎ１０にコ
ードされているＨＣＶ由来ポリペプチドを指す）と免疫
学的に反応するので、該ポリペプチドはＣ型肝炎関連抗
原として同定された。この同定は、以下に示すウエスタ
ンブロッティング法により行った。まず、実施例６
〔１〕、〔２〕で記述したＣＯＲＥ−Ｎ３ポリペプチド
とＣＭＥ−Ｎ３Ｎ１０△Ｂポリペプチドをコードする発
現用プラスミドｐＣＺＣＯＲＥ、ｐＣＺＣＭＥ△Ｂで形
質転換された大腸菌をＩＰＴＧ存在下で実施例６のよう
に３時間あるいは一昼夜培養することにより該ポリペプ
チドを発現するよう誘導した。この培養液１，０００μ
ｌを６，５００ｒ．ｐ．ｍ．で１０分間遠心分離させる
ことにより、組み換え体株を集菌した。この沈澱をＳＤ
Ｓ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動用試料処理液（２
％ＳＤＳ、５％メルカプトエタノール、１０％グリセリ
ン及び０．００５％ブロモフェノールブルーを含む５０
ｍＭトリス塩酸緩衝液、ｐＨ６．８）に最終量が０．２
ｍｌになるように溶解され調製された。
【０１１７】また、実施例６〔３〕で得られた、該感染
細胞（３回以上プラーク法を経たウイルスを持つ）をか
きあつめ生理食塩水リン酸バッファー１，０００ｍｌに
よくサスペンジョンし、そのうち１００μｌを６，５０
０ｒ．ｐ．ｍ．で１０分間遠心分離させることにより該
細胞の沈澱を得た。この沈澱をＳＤＳ−ポリアクリルア
ミドゲル電気泳動用試料処理液に最終量が０．２ｍｌに
なるように溶解され調製された。次に、これらの試料を
１００℃、１０分間煮沸した。このようにして得られた
試料１０μｌを、０．１％ＳＤＳ−１５．０％ポリアク
リルアミドゲル（７０×８５×１ｍｍ）に添加した。そ
の際、マーカータンパク質としてｐｈａｒｍａｃｉａ社
製「ＬＭＷ ＫｉｔＥ」（低分子量マーカータンパク
質）を使用した。電極液としてトリス緩衝液（２５ｍＭ
トリス ｐＨ８．３、１９２ｍＭ グリシン、０．１
％ＳＤＳ）を用い、３０ｍＡの定電流で４５分間泳動
後、常法に従い該ゲルをＳ＆Ｓ社製ニトロセルロールフ
ィルター（ＢＡ−８３）と重ね、ゲル側を陰極とし、ニ
トロセルロースフィルター側を陽極として、１２０ｍＡ
の定電流を約２０分間流して転写させた。転写されたニ
トロセルロースフィルターは、マーカータンパク質部分
と試料部分を分けるように切り取られ、マーカータンパ
ク質部分のフィルターを０．１％（Ｗ／Ｖ）アミドブラ
ック１０Ｂで染色し、また、試料部分のフィルターを、
５％（Ｗ／Ｖ）ウシ血清アルブミンを含む０．０１Ｍリ
ン酸生理食塩水（ＰＢＳ）ｐＨ７．４に浸した。次に、
５％（Ｗ／Ｖ）ウシ血清アルブミンを含む０．０１Ｍリ
ン酸生理食塩水（ＰＢＳ）ｐＨ７．４で５０倍に希釈さ
れたＣ型肝炎患者血清１０ｍｌを試料部分のフィルター
の上にのせ、室温で２時間静置後０．１％（Ｖ／Ｖ）Ｓ
ｉｇｍａ社製Ｔｗｅｅｎ２０をふくむＰＢＳで２０分ず
つ３回洗浄した。
【０１１８】次に、試料部分のフィルターの上にＰＢＳ
で１，０００倍に希釈されたパーオキシダーゼ標識抗ヒ
トＩｇＧ（Ｇａｐｐｅｌ社製）１０ｍｌをのせ、３７℃
１時間反応させ、０．１％（Ｖ／Ｖ）Ｔｗｅｅｎ２０を
含むＰＢＳで２０分ずつ３回洗浄した。次に、試料部分
のフィルター１００ｍｌのパーオキシダーゼ発色液（６
０ｍｇ４−クロロ−１−ナフトール、２０ｍｌメタノー
ル、ＰＢＳ８０ｍｌ、過酸化水素２０μｌ）に浸した。
発色したフィルターは、蒸留水で洗浄後、上記マーカー
タンパク質部分と比較した。これで発色された蛋白質
は、ＣＯＲＥ−Ｎ３ポリペプチドとＣＭＥ−Ｎ３Ｎ１０
△Ｂポリペプチドにおいてともに一つであり、また分子
量からほぼプラスミドｐＣＺＣＯＲＥ、ｐＣＺＣＭＥ△
ＢにコードされているＣ型肝炎患者血清由来ｃＤＮＡか
ら発現された蛋白質として妥当な大きさでありＣ型肝炎
関連抗原として同定できた。また、実施例６〔３〕で示
した昆虫細胞内に発現されたクローンＮ３Ｎ１０にコー
ドされているＨＣＶ由来ポリペプチドは、プラスミドｐ
ＢｌｕｅＮ３Ｎ１０−１で感染させた細胞内とプラスミ
ドｐＢｌｕｅＮ３Ｎ１０−２で感染させた細胞内で、同
じパターンのＨＣＶ由来のポリペプチドが発現されてい
た。すなわち、クローンＮ３Ｎ１０のコア遺伝子からポ
リペプチドとして発現されたときの分子量は、計算上約
２２ｋＤ（修飾されない場合）であるが、これに相当す
る約２２ｋＤのタンパク質が発現されており、これをＨ
ＣＶのコア蛋白質由来と予想されるポリペプチドＣ型肝
炎関連抗原として同定できた。
【０１１９】実施例８ 実施例２〔２〕と〔３〕の方法
で得られたクローンによる差異の検討 Ｃ型肝炎患者から採血した血清を用いて、実施例２
〔２〕に従って配列表の配列番号１に相当する領域を独
立に３クローンをクローニングし、それぞれ塩基配列を
決定した。また、同じ患者から採血した血清を用いて、
今度は、実施例２〔３〕の方法で同様に３つのクローン
の塩基配列を決定した。同じ患者血清から取得したクロ
ーンは、ランダムプライマーを使用した場合、独立に得
られた３つのクローンが配列表の配列番号１に示す塩基
配列であった。また、前述の合成ＤＮＡプライマーのＳ
１とＡＳ１を使用した場合、独立に得られた３つのクロ
ーンの内２つが配列表の配列番号１に示す塩基配列であ
り、残りの１つのクローンが配列表の配列番号１の塩基
配列番号で３４５番目のＡがＣ、３３２番目のＡがＴ、
９５番目のＡがＣと３箇所で異なっていた。この変異
は、１人の患者に感染している該ウイルスが２種以上あ
ることを示している。この結果より、実施例２〔２〕と
〔３〕の方法の違いによる得られたクローンの差異は本
質的には無いということがわかった。
【０１２０】実施例９ ｃＤＮＡの合成 〔１〕ＲＮＡサンプルの調製 実施例１で得られた核酸を乾燥させた後、水３０μｌと
リボヌクレアーゼインヒビター（１００ユニット／μ
ｌ、宝酒造社製）１０μｌを加え溶解させた。この核酸
水溶液を用い下記に示すｃＤＮＡ合成を行った。 〔２〕アンチセンスプライマーを用いたｃＤＮＡの合成 〔１〕で調製した核酸水溶液２μｌにアンチセンスプラ
イマー（合成ＤＮＡプライマーＭＳ１２２、ＭＳ１５
７、ＭＳ１４８などがアンチセンスプライマーである。
１５ｐｍｏｌｓ／μｌ）１μｌ、１０ｘＲＴ緩衝液
（１００ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．３），５０
０ｍＭ ＫＣｌ）２μｌ、２５ｍＭ ＭｇＣｌ2 ４μ
ｌ、２．５ｍＭ ４ｄＮＴＰ ８μｌ、水１μｌを加え
６５℃５分、次に室温５分保温後、逆転写酵素（ライフ
サイエンス社製）２５ユニットを１μｌ、リボヌクレ
アーゼインヒビター（１００ユニット／μｌ、宝酒造社
製）１μｌを加え３７℃２０分、次に４２℃３０分、最
後に９５℃２分保温後、すぐに０℃に冷却した（相補鎖
ＤＮＡ合成）。このＤＮＡ試料１０μｌを用いてＳａｉ
ｋｉらの方法〔ネーチャー（Ｎａｔｕｒｅ），３２４，
１２６，（１９８６）〕に準じて、いわゆるＰＣＲ法に
より特異的配列を持つＤＮＡを増幅した。即ち、このＤ
ＮＡ試料１０μｌ、１０ｘＰＣＲ緩衝液（１００ｍＭ
Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．３），５００ｍＭ ＫＣ
ｌ，１５ｍＭ ＭｇＣｌ2 ，１％ゼラチン）１０μｌ、
２．５ｍＭ ４ｄＮＴＰ ８μｌ、相補鎖ＤＮＡ合成時
に使用した合成ＤＮＡプライマー（１５０ｐｍｏｌｓ／
μｌ）２μｌ、このプライマーに対応した合成ＤＮＡプ
ライマー（１５ｐｍｏｌｓ／μｌ、相補鎖ＤＮＡ合成時
に使用した合成ＤＮＡプライマーと対になるものであ
り、前述のプライマーＭＳ１２２−ＭＳ１２３、ＭＳ１
５７−ＭＳ１５６、ＭＳ１４８−ＭＳ１４６のプライマ
ーの組み合せを使用した。）３μｌに水を加えて合計が
１００μｌになるようにして、まず９５℃に５分間保温
後、０℃に急冷した。１分後、Ｔａｑ ＤＮＡポリメラ
ーゼ（７ユニット／μｌ、ＡｍｐｌｉＴａｑTM宝酒造）
０．５μｌを加え混和後、ミネラルオイルで重層した。
このサンプルを、パーキン エルマー シータス社製の
ＤＮＡ Ｔｈｅｒｍａｌ Ｃｙｃｌｅｒで９５℃１分、
４０〜５５℃１分、７２℃１〜５分で２５回処理した。
【０１２１】最後に７２℃で７分保温した後、この反応
水溶液をフェノール／クロロホルム処理、エタノール沈
澱（エタノール沈澱とは、水相に１０分の１量の３Ｍ酢
酸ナトリウムもしくは等量の４Ｍ酢酸アンモニウムと水
相の２．５倍容のエタノールを加え混和し、半径５ｃｍ
程度のロータを用いて１５，０００ｒｐｍ，４℃で１５
分間冷却遠心を行い、その沈澱を乾燥させる処理）を行
い、種々のプライマーの組み合わせに由来した増幅ＤＮ
Ａ断片を得た。
【０１２２】実施例１０ 増幅された該ＤＮＡ断片のク
ローニングと塩基配列の決定 実施例９の〔２〕の方法によって得たＤＮＡ断片を少な
くとも１ｐｍｏｌｅ用意し、このＤＮＡをＴ４ＤＮＡポ
リメラーゼ（東洋紡社製）で平滑末端化し（モレキュラ
ー・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎ
ｇ）１９８２コールド・スプリング・ハーバー（Ｃｏｌ
ｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））、ポリヌクレオチ
ドキナーゼ（東洋紡社製）で５′末端にリン酸基を導入
後（モレキュラー・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ
Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２コールド・スプリング・ハ
ーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））、
ライゲーションキット（宝酒造社製）を用いて、ｐＵＣ
１９クローニングベクターのマルチクローニングサイト
内にあるＳｍａＩサイトに組み込んだ。（この時ライゲ
ーションに用いたベクターＤＮＡは、次の様に用意され
たものを５ｎｇ〜１０ｎｇ使用した。即ち、ｐＵＣ１９
クローニングベクターを制限酵素ＳｍａＩ（東洋紡社
製）で切断し、フェノール／クロロホルム処理、エタノ
ール沈澱させた後、さらにアルカリフォスタファーゼ
（ベーリンガーマンハイム社製）で５′末端を脱リン酸
化して（モレキュラー・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌ
ａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２ コールド・スプリン
グ・ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏ
ｒ））、フェノール／クロロホルム処理、エタノール沈
澱させた。）このようにして作成したＤＮＡを用いて大
腸菌ＪＭ１０９あるいはＤＨ５を形質転換させた（この
時、コンピテントセルは東洋紡社製のものを用いて行っ
た）。
【０１２３】形質転換させる方法は、東洋紡社のコンピ
テント ハイ（ＣＯＭＰＥＴＥＮＴＨＩＧＨ）のプロト
コールに従った。このようにして、それぞれのプライマ
ーの組み合わせから実施例２の〔２〕の方法によって得
た該ＤＮＡ断片を持つｐＵＣ１９クローニングベクター
で形質転換させた形質転換体は、少なくとも、各々２０
個以上得ることができた。得られた形質転換体からプラ
スミドＤＮＡを常法により調製し、デュポン社製蛍光シ
ークエンサーＧＥＮＥＳＩＳ２０００システムを用い
て、配列を決定した。シークエンスプライマーとして次
の２種の合成プライマー５′ｄ（ＧＴＡＡＡＡＣＧＡＣ
ＧＧＣＣＡＧＴ）３′（配列番号：１４３），５′ｄ
（ＣＡＧＧＡＡＡＣＡＧＣＴＡＴＧＡＣ）３′（配列番
号：１４４）を使用し、該ＤＮＡ断片の＋鎖、一鎖の塩
基配列を決定した。該ＤＮＡ断片は配列表の配列番号１
３から２７に示す通りの塩基配列を有していた。配列表
の配列番号１３から２７に示す塩基配列は、それぞれ上
記で得られた形質転換体のプラスミドに組み込まれたＨ
ＣＶ由来遺伝子の＋鎖の塩基配列をしめす。また、該ク
ローンは２本鎖ＤＮＡであり、例えば、クローンＮ１９
−１，Ｎ１９−２，Ｎ１９−３の塩基配列を決定するた
めに用いられたプラスミドをそれぞれｐＵＣＮ１９ー
１，ｐＵＣＮ１９ー２，ｐＵＣＮ１９ー３とした。これ
らのプラスミドは対応する該ＤＮＡ断片をそれぞれ１分
子ずつもっていた。以下、該クローンを一つ持ち、塩基
配列を決定するために用いられたプラスミドをｐＵＣの
あとにクローン名を付けてあらわす。
【０１２４】これらの配列は、Ｃ型肝炎患者血清由来の
ＲＮＡより作成されたｃＤＮＡからクローニングされた
クローンの塩基配列を表しており、健常人の血清からは
この方法で実施してもなにも得られないか、あるいは、
実施例９〔２〕、〔３〕で示したＰＣＲ法のサイクルを
３倍か４倍にして（サイクルをおそらく６０〜１００
回）増幅して、もし仮に得たＤＮＡ断片があるとして
も、そのＤＮＡ断片の配列が前記の４種の組み合わせに
対応する配列表の配列番号１３から２７に示す塩基配列
とはホモロジーのないものしか得られなかった。すなわ
ち、ここで得られた配列表の配列番号１３から２７に示
された該クローンの塩基配列はＣ型肝炎患者血清由来の
ものに特異的なものであることが分った。そこで、得ら
れた該ＤＮＡ断片の塩基配列をすでに報告されたＣ型肝
炎ウイルスの遺伝子配列と比較した。 なお、実施例９
〔２〕において、例えばプライマーとしてＭＳ１２２と
ＭＳ１２３を使用し、同一患者の血清から３つのクロー
ンを得、その塩基配列を決定したクローンＮ１９−１と
Ｎ１９−２とＮ１９−３は１人の患者血清から得られた
Ｃ型肝炎患者血清由来の塩基配列を保持している、即
ち、一人の患者には複数のウイルスが存在していること
を示している。
【０１２５】実施例１１ クローンＮ２７ＭＸ２４Ａ−
１とクローンＮ２７ＭＸ２４Ｂ−１の取得方法 〔１〕クローンＮ１９ＭＸ２４Ａ−１とクローンＮ１９
ＭＸ２４Ｂ−１を得る方法 前記クローンＮ１９−１およびクローンＭＸ２４−４か
らの該ＤＮＡ断片を、それぞれ１μｌ（約０．５から１
μｇ/μｌ)ずつを１０×ＰＣＲ緩衝液（１００ｍＭ Ｔ
ｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．３），５００ｍＭ ＫＣｌ，
１５ｍＭ ＭｇＣｌ2 ，１％ゼラチン）１０μｌ、２．
５ｍＭ ４ｄＮＴＰ ８μｌ、合成プライマーＳ２とＡ
Ｓ３（ともに２０ｐｍｏｌ／μｌ）をそれぞれ５μｌ、
水７６．５μｌの反応溶液に入れた。よく混合後、まず
９５℃に５分間保温後、０℃に急冷した。１分後、Ｔａ
ｑ ＤＮＡポリメラーゼ（７ユニット／μｌ、Ａｍｐｌ
ｉＴａｑTM宝酒造）０．５μｌを加え混和後、ミネラル
オイルで重層した。このサンプルを、パーキン エルマ
ー シータス社製のＤＮＡ Ｔｈｅｒｍａｌ Ｃｙｃｌ
ｅｒで９５℃１分、４０℃１分、７２℃２分で２５回処
理した。次に９７℃に２分間保温後、０℃に急冷し２分
間保温した。さらに反応水溶液にＴａｑ ＤＮＡポリメ
ラーゼ（７ユニット／μｌ、ＡｍｐｌｉＴａｑTM宝酒
造）０．５μｌを加え同様にして９５℃１分、５０℃１
分、７２℃２分で２５回処理した。最後に７２℃で７分
保温した後、この反応水溶液をフェノール／クロロホル
ム処理、エタノール沈澱させた。この増幅されたＤＮＡ
サンプルは、アガロース電気泳動によって分離され（モ
レキュラー・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌ
ｏｎｉｎｇ）１９８２ コールド・スプリング・ハーバ
ー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））、目的
の長さを持つＤＮＡ断片はゲルから切り出された（モレ
キュラー・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏ
ｎｉｎｇ）１９８２ コールド・スプリング・ハーバー
（ＣｏｌｄＳｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））。
【０１２６】得られたＤＮＡ断片は実施例１０と同様に
処理してｐＵＣ１９クローニングベクターのマルチクロ
ーニングサイト内にあるＳｍａＩサイトに組み込んだ。
これをクローン化しスクリーニングして（この方法は、
実施例１０と同様である。）プラスミドｐＵＣＮ１９Ｍ
Ｘ２４Ａ−１とｐＵＣＮ１９ＭＸ２４Ｂ−１を得て、こ
れで得られたＣ型肝炎患者血清由来ｃＤＮＡをクローン
Ｎ１９ＭＸ２４Ａ−１とクローンＮ１９ＭＸ２４Ｂ−１
と名付けた。その塩基配列を配列表の配列番号２９と３
０に示す。 〔２〕クローンＮ２７Ｎ１９−１を得る方法 オーバーラップするクローンＮ２７−３とクローンＮ１
９−１を重複することなしに連結させるため、両方に共
通で、かつ、１つしかない制限酵素切断部位がオーバー
ラップするところにあることを利用した。即ち、制限酵
素ＭｌｕＩによってクローンＮ２７−３は、３３０番目
のＡの３′側で切断され、クローンＮ１９−１は５１番
目のＡの３′で切断される。また、プラスミドｐＵＣＮ
２７−３、ｐＵＣＮ１９ー１ともに該ＤＮＡ断片が同じ
向きに入っていることを考慮して、ｐＵＣＮ２７ー３を
ＨｉｎｄIII 、ＭｌｕIで、クローンＮ２７−３の５’
側を含むＤＮＡ断片（このＤＮＡ断片は、Ｃ型肝炎患者
血清由来ｃＤＮＡのクローンＮ２７−３の５′側にプラ
スミドｐＵＣ１９のＨｉｎｄIIIサイトからＳｍａＩサ
イトまでのＤＮＡ断片を付加したものである）を切り出
し、ｐＵＣＮ１９ー１のＨｉｎｄIII、ＭｌｕＩで切り
出されるクローンＮ１９ー１の３’側を含むＤＮＡ断片
と入れ換え、クローン化しスクリーニングすることによ
りプラスミドｐＵＣＮ２７Ｎ１９−１を得ることができ
た。このプラスミドはクローンＮ２７−３とＮ１９−１
がオーバーラップすることなく連結されたクローンＮ２
７Ｎ１９−１を保有していた。
【０１２７】クローンＮ２７Ｎ１９−１の塩基配列を配
列表の配列番号２８に示す。 〔３〕クローンＮ２７ＭＸ２４Ａ−１とクローンＮ２７
ＭＸ２４Ｂ−１を得る方法 オーバーラップするクローンＮ２７−３とクローンＮ１
９ＭＸ２４Ａ−１、クローンＮ１９ＭＸ２４Ｂ−１とを
重複することなしに連結させるため、両方に共通で、か
つ、１つしかない制限酵素切断部位がオーバーラップす
るところにあることを利用した。即ち、制限酵素Ｍｌｕ
ＩによってクローンＮ２７−３は、３３０番目のＡの
３′側で切断され、クローンＮ１９ＭＸ２４Ａ−１、ク
ローンＮ１９ＭＸ２４Ｂ−１は７１番目のＡの３′で切
断される。また、プラスミドｐＵＣＮ２７−３とｐＵＣ
Ｎ１９ＭＸ２４Ａ−１、ｐＵＣＮ１９ＭＸ２４Ｂ−１
は、ともに該ＤＮＡ断片が同じ向きに入っていることを
考慮して、ｐＵＣＮ２７ー３をＨｉｎｄIII 、ＭｌｕＩ
で、長さ３６３ｂｐのＤＮＡ断片（このＤＮＡ断片は、
Ｃ型肝炎患者血清由来ｃＤＮＡのクローンＮ２７−３の
５′側にプラスミドｐＵＣ１９のＨｉｎｄIIIサイトか
らＳｍａＩサイトまでのＤＮＡ断片を付加したものであ
る）を切り出し、ｐＵＣＮ１９ＭＸ２４Ａ−１、ｐＵＣ
Ｎ１９ＭＸ２４Ｂ−１の長さ３６３ｂｐのＨｉｎｄII
I、ＭｌｕＩで切り出されるクローンＮ１９ＭＸ２４Ａ
−１とクローンＭＸ２４Ｂ−１を含むＤＮＡ断片とをそ
れぞれ入れ換え、クローン化しスクリーニングすること
によりプラスミドｐＵＣＮ２７ＮＭＸ２４Ａ−１とプラ
スミドｐＵＣＮ２７ＮＭＸ２４Ｂ−１を得ることができ
た。このプラスミドはクローンＮ２７−３とクローンＮ
１９ＭＸ２４Ａ−１、クローンＮ１９ＭＸ２４Ｂ−１が
オーバーラップすることなく連結されたクローンＮ２７
ＭＸ２４Ａ−１とクローンＮ２７ＭＸ２４Ｂ−１を保有
していた。クローンＮ２７ＭＸ２４Ａ−１とクローンＮ
２７ＭＸ２４Ｂ−１のそれぞれの塩基配列を配列表の配
列番号３１と３２に示す。
【０１２８】実施例１２ クローンＮ２７ＭＸ２４Ａ−
１、クローンＮ２７ＭＸ２４Ｂ−１にコードされている
ＨＣＶ由来ポリペプチドを発現させるためのＤＮＡの改
変 〔１〕クローンＮ２７ＭＸ２４Ａ−１とクローンＮ２７
ＭＸ２４Ｂ−１にコードされているＨＣＶ由来ポリペプ
チドを大腸菌内で発現させるためのＤＮＡの改変 クローンＮ２７ＭＸ２４Ａ−１とクローンＮ２７ＭＸ２
４Ｂ−１には２番目のＣからＨＣＶ遺伝子由来のオープ
ンリーディングフレーム（ＯＲＦ）がコードされている
と思われ、このフレームに合わせて開始コドンＡＴＧを
該遺伝子の５’側上流に導入して発現させる。開始コド
ンＡＴＧを該遺伝子の５’側上流に導入する際、配列表
の配列番号３１、３２に記載されるアミノ酸配列のＮ末
（アミノ末端側）にＨＣＶ遺伝子にコードされるポリペ
プチド以外のポリペプチドが付加されることもある。ま
た、大腸菌における発現ベクター由来の開始コドンをも
つベクターに該クローンを導入する際、ベクター由来の
開始コドンのフレームに合うように該クローンのフレー
ムを合わせれば良い。また、ベクター由来ＤＮＡの改変
はＰＣＲ法を用いた。この時、用いたプライマーは次に
示す合成ＤＮＡを使用した。また、以下はクローンＮ２
７ＭＸ２４Ａ−１を用いて実施例を示すが、全く同様に
してクローンＮ２７ＭＸ２４Ｂ−１を用いても行うこと
ができる。
【０１２９】５′プライマー用の塩基配列は ＭＳ２７２４−１；５′ＧＣＡＡＧＣＴＴＡＴＧＣＧＧ
ＡＴＣＣＣＡＣＡＡＧＣＣＧＴＧＧＴＧＧＡＴ３′（配
列番号：１５２） である。また、発現ベクター由来の開始コドンをもつベ
クターに該ＤＮＡ断片を導入する際の５′プライマー用
の塩基配列は ＭＳ２７２４ー２；５′ＣＧＧＡＴＣＣＣＡＣＡＡＧＣ
ＣＧＴＧＧＴＧＧＡＴ３′（（配列番号：１５３） である。また、３′プライマー用の塩基配列は ＭＳ２７２４−３；５′ＧＣＧＡＡＴＴＣＡＧＡＴＣＴ
ＴＣＡＴＣＡＣＴＣＴＡＡＧＧＴＧＧＣＧＴＣＧＧＣＧ
ＴＧＧＧ３′（配列番号：１５４） である。これら２つの合成ＤＮＡを２０ｐｍｏｌ／μｌ
に調製した。このＰＣＲ反応は、Ｓａｉｋｉらの方法に
従い行った。この反応は最終容量が１００μｌになるよ
うにし、テンプレートＤＮＡとしてプラスミドｐＵＣＮ
２７ＭＸ２４Ａ−１を１００ｎｇ用い、プライマーは上
述のように調製された溶液を５′，３′プライマー用と
もに２μｌずつ使用した。まず、調製された試料を９５
℃に５分間保温後、０℃に急冷した。１分後、Ｔａｑ
ＤＮＡポリメラーゼ（７ユニット／μｌ、ＡｍｐｌｉＴ
ａｑTM宝酒造）０．５μｌを加え混和後、ミネラルオイ
ルで重層した。このサンプルを、パーキン エルマー
シータス社製のＤＮＡ Ｔｈｅｒｍａｌ Ｃｙｃｌｅｒ
で９５℃１分、６０℃１分、７２℃５分で２５回処理し
た。
【０１３０】このサンプルを常法によりフェノール／ク
ロロホルム処理、エタノール沈澱させ、このＤＮＡ試料
をＨｉｎｄIII 、ＥｃｏＲＩで切断（５’プライマーと
してＭＳ２７２４−２を用いた場合は、Ｔ４ＤＮＡポリ
メラーゼで平滑末端化した後、ＥｃｏＲＩで切断させ
た）後、目的の長さであるＤＮＡ断片をアクリルアミド
ゲルで分離し、抽出した（モレキュラー・クローニング
（ＭｏｌｅｃｕｌａｒＣｌｏｎｉｎｇ）１９８２ コー
ルド・スプリング・ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ
Ｈａｒｂｏｒ））。さらにクローニングベクターｐＵ
Ｃ１９のＨｉｎｄIII（ＭＳ２７２４−２を用いた場合
は、ＳｍａＩサイト） 、ＥｃｏＲＩサイトに常法によ
りライゲーションし、クローン化、スクリーニングをし
て、プラスミドｐＵＣＨＮ２７ＭＸ２４Ａ−１（ＭＳ２
７２４−２を用いた場合は、プラスミドｐＵＣＨ２Ｎ２
７ＭＸ２４Ａ−１が得られた）を得て、その塩基配列を
決定した。この方法によって得られたクローンＨＮ２７
ＭＸ２４Ａ−１の塩基配列は、以下に示すＤＮＡ断片が
配列表の配列番号３１、３２の５’末端のＣを除去した
ＤＮＡ断片の５’側に付加していて、
【０１３１】５′ＧＣＡＡＧＣＴＴＡＴＧ ３′ ３′ＣＧＴＴＣＧＡＡＴＡＣ ５′（配列番号：１５
５） ５′末端にＨｉｎｄIII サイトを持ち、続いて開始コド
ンＡＴＧを保有している。また、３′末端には以下に示
すＤＮＡ断片が配列表の配列番号３１の３′末端のＡが
２つを除去したＤＮＡ断片の３’側に付加していて、 ５′ＴＧＡＴＧＡＡＧＡＴＣＴＧＡＡＴＴＣＧＣ ３′ ３′ＡＣＴＡＣＴＴＣＴＡＧＡＣＴＴＡＡＧＣＧ ５′
（配列番号：１５６） 最も３’側からＥｃｏＲＩサイトがあり、その内側にＢ
ｇｌＩサイト、続いて終止コドンＴＧＡを２つを保有し
ている。プライマーＭＳ２７２４ー２とＭＳ２７２４−
３の組み合せで作成されたクローンＨ２Ｎ２７ＭＸ２４
Ａ−１の塩基配列は、５’末端にはなにも付加しておら
ず、３’末端にはクローンＨＮ２７ＭＸ２４Ａ−１と同
じ塩基配列が付加していた。
【０１３２】〔２〕 配列表の配列番号３１、３２に記
載のアミノ酸配列のうち１０９番目〜２１４番目までの
１０６個のアミノ酸配列からなるＨＣＶ由来ポリペプチ
ドを大腸菌内で発現させるための該ポリペプチドをコー
ドしているＤＮＡ断片の改変 配列表の配列番号３１、３２に記載のアミノ酸配列のう
ち１０９番目〜２１４番目までの１０６個のアミノ酸で
表わされるポリペプチドにＨＣＶ遺伝子由来のオープン
リーディングフレーム（ＯＲＦ）がコードされていると
思われ、このフレームに合わせて開始コドンＡＴＧを該
遺伝子の５’側上流に導入して発現させる。開始コドン
ＡＴＧを該遺伝子の５’側上流に導入する際、該ポリペ
プチドのアミノ酸配列のＮ末（アミノ末端側）にＨＣＶ
遺伝子にコードされるポリペプチド以外のポリペプチド
が付加されても良い。また、大腸菌における発現ベクタ
ー由来の開始コドンをもつベクターに該クローンを導入
する際、ベクター由来の開始コドンのフレームに合うよ
うに該クローンのフレームを合わせれば良い。ＤＮＡの
改変はＰＣＲ法を用いた。この時、用いたプライマーは
次に示す合成ＤＮＡを使用した。
【０１３３】５′プライマー用の塩基配列は ＭＳＨＮＳ１ー１；５′ＧＣＡＡＧＣＴＴＡＴＧＴＴＣ
ＡＡＣＧＣＧＴＣＣＧＧＡＴＧＴＣＣＧＧＡ３′（配列
番号：１５７） である。また、発現ベクター由来の開始コドンをもつベ
クターに該ＤＮＡ断片を導入する際の５′プライマー用
の塩基配列は ＭＳＨＮＳ１−２；５′ＴＴＣＡＡＣＧＣＧＴＣＣＧＧ
ＡＴＧＴＣＣＧＧＡ３′（配列番号：１５８） ３′プライマー用の塩基配列は ＭＳＨＮＳ１−３；５′ＧＣＧＡＡＴＴＣＡＧＡＴＣＴ
ＴＣＡＴＣＡＡＣＡＡＣＣＧＡＡＣＣＡＧＴＴＧＣＣＣ
ＴＧＣＧ３′（配列番号：１５９） である。これら２つの合成ＤＮＡを２０ｐｍｏｌ／μｌ
に調製した。このＰＣＲ反応は、Ｓａｉｋｉらの方法に
従い行った。この反応は最終容量が１００μｌになるよ
うにし、テンプレートＤＮＡとしてプラスミドｐＵＣＮ
２７ＭＸ２４Ａ−１（あるいは、プラスミドｐＵＣＮ２
７ＭＸ２４Ｂ−１）を１００ｎｇ用い、プライマーは上
述のように調製された溶液を５′，３′プライマー用と
もに２μｌずつ使用した。まず、調製された試料を９５
℃に５分間保温後、０℃に急冷した。１分後、Ｔａｑ
ＤＮＡポリメラーゼ（７ユニット／μｌ、ＡｍｐｌｉＴ
ａｑTM宝酒造）０．５μｌを加え混和後、ミネラルオイ
ルで重層した。このサンプルを、パーキン エルマー
シータス社製のＤＮＡ ＴｈｅｒｍａｌＣｙｃｌｅｒで
９５℃１分、６０℃１分、７２℃５分で２５回処理し
た。
【０１３４】このサンプルを常法によりフェノール／ク
ロロホルム処理、エタノール沈澱させ、このＤＮＡ試料
をＨｉｎｄIII 、ＥｃｏＲＩで切断（ＭＳＨＮＳ１−２
を用いた場合は、Ｔ４ＤＮＡポリメラーゼで平滑末端化
した後、ＥｃｏＲＩで切断させた）後、目的の長さであ
るＤＮＡ断片をアクリルアミドゲルで分離し、抽出した
（モレキュラー・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ
Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２ コールド・スプリング・ハ
ーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））。
さらにクローニングベクターｐＵＣ１９のＨｉｎｄIII
（ＭＳＨＮＳ１−２を用いた場合は、ＳｍａＩサイ
ト）、ＥｃｏＲＩサイトに常法によりライゲーションし
クローン化、スクリーニングをして、プラスミドｐＵＣ
Ｈ４８を得て（ＭＳＨＮＳ１−２とＭＳＨＮＳ１−３の
組み合せを用いた場合は、プラスミドｐＵＣＨ４８−
２）、その塩基配列を決定した。この方法によって得ら
れたクローンＨ４８の塩基配列は、以下に示すＤＮＡ断
片が配列表の配列番号３１または３２のＤＮＡ断片の塩
基配列で３２６番目のＴの５’側に付加していて、
【０１３５】５′ＧＣＡＡＧＣＴＴＡＴＧ ３′ ３′ＣＧＴＴＣＧＡＡＴＡＣ ５′（配列番号：１５
５） ５′末端にＨｉｎｄIII サイトを持ち、続いて開始コド
ンＡＴＧを保有している。（ＭＳＨＮＳ１−２を用いて
得られたクローンＨ４８−２の塩基配列は、上記のＤＮ
Ａ断片の付加がなかったが、３’側はクローンＨ４８と
同じであった。）また、３′末端には以下に示すＤＮＡ
断片が配列表の配列番号３１または３２の塩基配列で６
４３番目のＴの端の３’側に付加していて、最も３’側
からＥｃｏＲＩサイトがあり、その内側にＢｇｌＩサイ
ト、続いて終止コドンＴＧＡを２つを保有している。 ５′ＴＧＡＴＧＡＡＧＡＴＣＴＧＡＡＴＴＣＧＣ ３′ ３′ＡＣＴＡＣＴＴＣＴＡＧＡＣＴＴＡＡＧＣＧ ５′
（配列番号１５６）
【０１３６】〔３〕 配列表の配列番号３１、３２に記
載のアミノ酸配列のうち２３３番目〜３２４番目までの
９２個のアミノ酸配列からなるＨＣＶ由来ポリペプチド
を大腸菌内で発現させるための該ポリペプチドをコード
しているＤＮＡ断片の改変 配列表の配列番号３１と３２に記載のアミノ酸配列のう
ち２３３番目〜３２４番目までの９６個のアミノ酸で表
わされるポリペプチドにＨＣＶ遺伝子由来のオープンリ
ーディングフレーム（ＯＲＦ）がコードされていると思
われ、用いるプライマーを以下に記載の配列のものを用
いれば、〔２〕で用いた配列表の配列番号３１と３２に
記載のアミノ酸配列のうち１０９番目〜２１４番目まで
の１０６個のアミノ酸で表わされるポリペプチドを大腸
菌内で発現させるためのＤＮＡ断片の改変と同じ操作で
行われた。この方法によって得られたクローンはクロー
ンＨ４９（プライマーＭＳＮＳ１−４とＭＳＮＳ１−
６）とクローンＨ４９−２（プライマーＭＳＮＳ１−５
とＭＳＮＳ１−６）である。
【０１３７】５′プライマー用の塩基配列は ＭＳＮＳ１−４；５′ＧＣＡＡＧＣＴＴＡＴＧＡＴＣＧ
ＧＧＧＧＧＧＴＣＧＧＣＡＡＣＡＡＴＡＣ３′（配列番
号：１６０） である。また、発現ベクター由来の開始コドンをもつベ
クターに該ＤＮＡ断片を導入する際の５′プライマー用
の塩基配列は ＭＳＮＳ１−５；５′ＡＴＣＧＧＧＧＧＧＧＴＣＧＧＣ
ＡＡＣＡＡＴＡＣ ３′（配列番号：１６１） ３′プライマー用の塩基配列は ＭＳＮＳ１−６；５′ＧＣＧＡＡＴＴＣＡＧＡＴＣＴＴ
ＣＡＴＣＡＡＡＧＣＴＣＴＧＡＴＣＴＡＴＣＣＣＴＧＴ
ＣＣＴ ３′（配列番号：１６２） である。これら２つの合成ＤＮＡを２０ｐｍｏｌ／μｌ
に調製した。
【０１３８】〔４〕クローンＮ２７ＭＸ２４Ａ−１、ク
ローンＮ２７ＭＸ２４Ｂ−１、クローンＨ４８ー２とク
ローンＨ４９ー２にコードされているＨＣＶ由来ポリペ
プチドを昆虫細胞内で発現させるためのＤＮＡの改変 クローンＮ２７ＭＸ２４Ａ−１とクローンＮ２７ＭＸ２
４Ｂ−１には２番目のＣからＨＣＶ遺伝子由来のオープ
ンリーディングフレーム（ＯＲＦ）がコードされている
と思われる。またクローンＨ４８ー２、クローンＨ４９
−２は５’末端の１番目からＯＲＦが始まっている。こ
のフレームに合わせて開始コドンＡＴＧを該遺伝子の
５’側上流に導入して発現させる。開始コドンＡＴＧを
該遺伝子の５’側上流に導入する際、クローンＮ２７Ｍ
Ｘ２４Ａ−１、クローンＮ２７ＭＸ２４Ｂ−１、クロー
ンＨ４８ー２とクローンＨ４９ー２にコードされている
アミノ酸配列のＮ末（アミノ末端側）にＨＣＶ遺伝子に
コードされるポリペプチド以外のポリペプチドが付加さ
れても良い。また、昆虫細胞における発現ベクター由来
の開始コドンをもつベクターに該クローンを導入する
際、ベクター由来の開始コドンのフレームに合うように
該クローンのフレームを合わせれば良い。この際も、ク
ローンＮ２７ＭＸ２４Ａ−１、クローンＮ２７ＭＸ２４
Ｂ−１、クローンＨ４８ー２とクローンＨ４９ー２にコ
ードされているアミノ酸配列のＮ末（アミノ末端側）に
ＨＣＶ遺伝子にコードされるポリペプチド以外のポリペ
プチドが付加されても良い。また、ベクター由来ＤＮＡ
の改変はＰＣＲ法を用いた。以下はクローンＮ２７ＭＸ
２４Ａ−１を用いて実施例を示すが、全く同様にしてク
ローンＮ２７ＭＸ２４Ｂ−１を用いても行うことができ
る。
【０１３９】昆虫細胞内ではクローンＮ２７ＭＸ２４Ａ
−１とクローンＮ２７ＭＸ２４Ｂ−１にコードされるポ
リペプチドは、つながって前駆体として細胞内で発現
し、その後、細胞内でプロセッシングを受けて、少なく
とも糖鎖で不完全ながら修飾され成熟型タンパク質、約
７０Ｋダルトンの糖タンパク質として発現され細胞内に
蓄積された。発現ベクターを構築するためクローンＮ２
７ＭＸ２４Ａ−１、クローンＮ２７ＭＸ２４Ｂ−１、Ｈ
４８ー２とＨ４９ー２のＤＮＡの改変はＰＣＲ法を用い
た。この時、用いたプライマーとしては次に示す合成Ｄ
ＮＡを使用した。５′プライマー用の塩基配列は ＭＳ２７２４ー４；５′ＧＣＧＴＣＧＡＣＧＣＴＡＧＣ
ＡＴＧＣＧＧＡＴＣＣＣＡＣＡＡＧＣＣＧＴＧＧＴＧＧ
ＡＴ ３′（配列番号：１６３） ＭＳＮＳ１−７；５′ＧＣＧＴＣＧＡＣＧＣＴＡＧＣＡ
ＴＧＴＴＣＡＡＣＧＣＧＴＣＣＧＧＡＴＧＴＣＣＧＧＡ
３′（配列番号：１６４） ＭＳＮＳ１−８；５′ＧＣＧＴＣＧＡＣＧＣＴＡＧＣＡ
ＴＧＡＴＣＧＧＧＧＧＧＧＴＣＧＧＣＡＡＣＡＡＴＡＣ
３′（配列番号：１６５） である。
【０１４０】また、３′プライマー用の塩基配列は ＭＳ２７２４ー５；５′ＧＣＧＡＡＴＴＣＧＣＴＡＧＣ
ＴＣＡＣＴＣＴＡＡＧＧＴＧＧＣＧＴＣＧＧＣＧＴＧＧ
Ｇ ３′（配列番号：１６６） ＭＳＮＳ１−９；５′ＧＣＧＡＡＴＴＣＧＣＴＡＧＣＴ
ＣＡＡＣＡＡＣＣＧＡＡＣＣＡＧＴＴＧＣＣＣＴＧＣＧ
３′（配列番号：１６７） ＭＳＮＳ１−１０；５′ＧＣＧＡＡＴＴＣＧＣＴＡＧＣ
ＴＣＡＡＡＧＣＴＣＴＧＡＴＣＴＡＴＣＣＣＴＧＴＣＣ
Ｔ ３′（配列番号：１６８） である。これら３つの合成ＤＮＡを２０ｐｍｏｌ／μｌ
に調製した。ＰＣＲの反応溶液の調製と後処理は〔１〕
と同様に行われた。ただ、テンプレートＤＮＡにはプラ
スミドｐＵＣＨＮ２７ＭＸ２４Ａ−１（プライマーＭＳ
２７２４−４とＭＳ２７２４−５の組み合せを使用）、
プラスミドｐＵＣＨ４８（プライマーＭＳＮＳ１−７と
ＭＳＮＳ１−９の組み合せを使用）あるいは、プラスミ
ドｐＵＣＨ４９（プライマーＭＳＮＳ１−８とＭＳＮＳ
１−１０の組み合せを使用）が使用された。ＰＣＲのサ
イクルは９５℃１分、５０℃１分、７２℃５分であり、
これを１０回繰返した後、９５℃１分、６５℃１分、７
２℃５分を２０回繰返した。テンプレートＤＮＡにプラ
スミドｐＵＣＨＮ２７ＭＸ２４Ａ−１を用い、プライマ
ーＭＳ２７２４−４とＭＳ２７２４−５で目的の長さ１
２６８ｂｐのＤＮＡ断片を得た。また、テンプレートＤ
ＮＡにプラスミドｐＵＣＨ４８を用い、プライマーＭＳ
ＮＳ１−７とＭＳＮＳ１−９で目的の長さ３５２ｂｐの
ＤＮＡ断片を得た。テンプレートＤＮＡにプラスミドｐ
ＵＣＨ４９を用い、プライマーＭＳＮＳ１−８とＭＳＮ
Ｓ１−１０で目的の長さ３２２ｂｐのＤＮＡ断片を得
た。
【０１４１】これらのＤＮＡ試料をＮｈｅＩで切断後、
目的の長さであるＤＮＡ断片をアクリルアミドゲルで分
離し、抽出した（モレキュラー・クローニング（Ｍｏｌ
ｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２ コールド・
スプリング・ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａ
ｒｂｏｒ））。さらに、トランスファーベクターｐＢｌ
ｕｅＢａｃ（インビトロジェン社）のＮｈｅＩサイト
に、常法によりライゲーションしクローン化、該ＤＮＡ
断片が１つだけＮｈｅＩサイトに挿入されているクロー
ンをスクリーニングをして、プライマーＭＳ２７２４−
４とＭＳ２７２４−５で目的の長さ１２６８ｂｐの該Ｄ
ＮＡ断片由来のプラスミドｐＢｌｕｅＮ２７ＭＸ２４Ａ
−１と、プライマーＭＳＮＳ１−７とＭＳＮＳ１−９で
目的の長さ３５２ｂｐの該ＤＮＡ断片由来のプラスミド
ｐＢｌｕｅＨ４８と、プライマーＭＳＮＳ１−８とＭＳ
ＮＳ１−１０で目的の長さ３２２ｂｐの該ＤＮＡ断片由
来のプラスミドｐＢｌｕｅＨ４９を得た。これら該プラ
スミドの発現ユニットはインビトロジェン社のプロトコ
ールに示されているものを参考にすると、ポリヘドリン
プロモーター下流のクローニングサイトＮｈｅＩ切断部
位にＨＣＶ遺伝子由来のＤＮＡ断片が順方向に連結した
構造を持っていた。
【０１４２】実施例１３ クローンＨＮ２７ＭＸ２４Ａ
ー１、クローンＨＮ２７ＭＸ２４Ｂー１、クローンＨ２
Ｎ２７ＭＸ２４Ａー１、クローンＨ２Ｎ２７ＭＸ２４Ｂ
ー１、クローンＨ４８、クローンＨ４８ー２、クローン
Ｈ４９、クローンＨ４９ー２にコードされるＨＣＶ由来
ポリペプチドの発現 〔１〕クローンＨＮ２７ＭＸ２４Ａー１、クローンＨＮ
２７ＭＸ２４Ｂー１、クローンＨ４８、クローンＨ４９
にコードされるポリペプチドの大腸菌内での発現 該クローンにおいてコードされるポリペプチドはＣ型肝
炎患者血清由来ｃＤＮＡにコードされるポリペプチドの
１部であり、これをそのまま大腸菌内で発現させた。こ
れは以下に示すように発現ベクターとしてはｐＣＺ４４
（特開平１−１２４３８７号公報）が使用され、該クロ
ーンのｃＤＮＡをｐＣＺ４４にサブクローン化すること
により行われた。まず、該クローンがＨｉｎｄIII 、Ｂ
ｇｌIIにより充分に切断され、フェノール／クロロホル
ム処理、エタノール沈澱させ、両末端が各々ＨｉｎｄII
I 、ＢｇｌIIサイトの突出末端となった該ｃＤＮＡをを
持つＤＮＡ断片をアクリルアミドゲルで分離し、抽出さ
れた（モレキュラー・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａ
ｒＣｌｏｎｉｎｇ）１９８２ コールド・スプリング・
ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏ
ｒ））。同様に、発現ベクターｐＣＺ４４もＨｉｎｄII
I 、ＢｇｌIIにより充分に切断され、発現ベクター能を
持つ長い方のＤＮＡ断片を前述同様に調製し、これに該
クローンから用意されたＨｉｎｄIII 、ＢｇｌII断片を
１つ持つように連結され、さらに常法に従いクローニン
グされた。得られたプラスミドはそれぞれのクローンＨ
Ｎ２７ＭＸ２４Ａー１、クローンＨＮ２７ＭＸ２４Ｂー
１、クローンＨ４８、クローンＨ４９由来のプラスミド
ｐＣＺ２７２４Ａ−１、ｐＣＺ２７２４Ｂ−１、ｐＣＺ
４８、ｐＣＺ４９と名付けられた。
【０１４３】また、別の試みとしてｐＣＺ４４のかわり
に融合蛋白質を発現できる発現ベクターｐＧＥＸ−２Ｔ
（ファルマシア社製）を用いて発現ベクターを構築し
た。この場合、基本的にファルマシア社の説明書に従っ
て操作を行った。まず、発現ベクターｐＧＥＸ−２Ｔを
ＢａｍＨＩで切断後、ＨｉｎｄIII リンカーを挿入し該
クローンのアミノ酸とコドンの読み枠が合うようにし
て、３′側のＥｃｏＲＩサイトと５′側の（リンカーで
作った）ＨｉｎｄIII サイトに該クローンのＤＮＡ断片
から用意されたＨｉｎｄIII 、ＥｃｏＲＩ断片を挿入し
た。こうして発現ベクターｐＧＥＸ２７２４Ａ−１、ｐ
ＧＥＸ２７２４Ｂ−１、ｐＧＥＸ４８、ｐＧＥＸ４９が
得られた。
【０１４４】プラスミドｐＣＺ２７２４Ａ−１、ｐＣＺ
２７２４Ｂ−１、ｐＣＺ４８、ｐＣＺ４９を保持してい
る大腸菌ＪＭ１０９株をＬ−Ｂｒｏｔｈ（モレキュラー
・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎ
ｇ）１９８２ コールド・スプリング・ハーバー（Ｃｏ
ｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））にて、３７℃一
晩培養した。これを５０倍希釈となるように新しいＬ−
Ｂｒｏｔｈに植菌し、２時間、３０℃で振とう培養後、
ＩＰＴＧ（イソプロピル−β−Ｄ−ガラクトピラノシ
ド）を２ｍＭになるように培地に加え、さらに３時間以
上培養した。このようにＩＰＴＧの存在下で菌を培養さ
せることにより、単一クローン由来（この場合、該プラ
スミドのみで形質転換された大腸菌ＪＭ１０９株）の組
み換え体が、該クローンから誘導された該プラスミドを
用いて、ＨＣＶ由来ポリペプチドを発現するように誘導
された。クローンＨＮ２７ＭＸ２４Ａー１、クローンＨ
Ｎ２７ＭＸ２４Ｂー１のｃＤＮＡの塩基配列と該配列で
コードされるポリペプチドの推定アミノ酸配列を配列表
の配列番号３１に示す。また、クローンＨ４８、クロー
ンＨ４９のｃＤＮＡの塩基配列と該配列でコードされる
ポリペプチドの推定アミノ酸配列は、それぞれ配列表の
配列番号３１に記載のアミノ酸配列のうち１０９番目か
ら２１４番目までのアミノ酸配列と２３３番目から３２
４番目までのアミノ酸配列である。
【０１４５】また同様にしてクローンＨＮ２７ＭＸ２４
Ａ−１の代わりにクローンＨＮ２７ＭＸ２４Ｂ−１を用
いれば、該クローンにコードされるポリペプチドが得ら
れる。該ポリペプチドの推定アミノ酸配列を配列表の配
列番号３２に示す。また、プラスミドｐＧＥＸ２７２４
Ａ−１、ｐＧＥＸ２７２４Ｂ−１、ｐＧＥＸ４８、ｐＧ
ＥＸ４９も同様にしてβ−グルタチオン−Ｓ−トランス
フェラーゼ（ＧＳＴ）との融合タンパク質として発現体
を得ることができる。この場合、ファルマシア社の説明
書にあるとおりＧＳＴのＣ末端にスロンビンで特異的に
切断されるサイトを持ち、そのさらにＣ末端側にクロー
ンＨＮ２７ＭＸ２４Ａー１、クローンＨＮ２７ＭＸ２４
Ｂー１、クローンＨ４８、クローンＨ４９由来のポリペ
プチドがつながっている。該融合タンパク質を得るため
には、ｐＣＺ２７２４Ａ−１、ｐＣＺ２７２４Ｂ−１、
ｐＣＺ４８、ｐＣＺ４９からＨＣＶ由来該ポリペプチド
を発現するとき行う上記プロトコールと同様にＩＰＴＧ
の存在下でプラスミドｐＧＥＸ２７２４Ａ−１、ｐＧＥ
Ｘ２７２４Ｂ−１、ｐＧＥＸ４８、ｐＧＥＸ４９で形質
転換させた大腸菌を培養させ、ＨＣＶ由来のタンパク質
をＣ末端に持つ該融合タンパク質を発現するように誘導
された。
【０１４６】〔２〕クローンＨ２Ｎ２７ＭＸ２４Ａ−
１、クローンＨ２Ｎ２７ＭＸ２４Ｂ−１、クローンＨ４
８−２、クローンＨ４９−２にコードされるポリペプチ
ドの発現 クローンＨ２Ｎ２７ＭＸ２４Ａ−１、クローンＨ２Ｎ２
７ＭＸ２４Ｂ−１、クローンＨ４８−２、クローンＨ４
９−２に含まれるＣ型肝炎患者血清由来ｃＤＮＡから、
そのまま大腸菌内でポリペプチドを発現させた。この発
現の方法は、〔１〕で記述されたのと同様な方法であっ
た。ただし、ＨＣＶｃＤＮＡの材料としてはクローンＨ
２Ｎ２７ＭＸ２４Ａ−１、クローンＨ２Ｎ２７ＭＸ２４
Ｂ−１、クローンＨ４８−２、クローンＨ４９−２に含
まれるＣ型肝炎患者血清由来ｃＤＮＡであり、このクロ
ーンは単離され塩基配列が決定されたものである。用い
られた発現プラスミドは、ｐＯＦＡ（特開平２ー８４１
９５号広報）を用いた。上記、それぞれの該クローンの
ＤＮＡ断片を、まず、Ｔ４ＤＮＡポリメラーゼで平滑末
端化した。発現プラスミドｐＯＦＡをＫｐｎIで処理し
た後、Ｔ４ＤＮＡポリメラーゼで両末端が平滑末端化し
たものと、平滑末端化した該クローンを、常法によりラ
イゲーションしクローン化、該ＤＮＡ断片が１つだけ挿
入されているクローンをスクリーニングした。即ち、そ
れぞれのＨＣＶ由来のｃＤＮＡがＨＣＶ由来蛋白を発現
する＋鎖が翻訳される向きに正しく入るようサブクロー
ニング化することによりプラスミドｐＯＦＡ２７２４Ａ
−１、ｐＯＦＡ２７２４Ｂ−１、ｐＯＦＡ４８、ｐＯＦ
Ａ４９として得た。この該プラスミドにあるＨＣＶ由来
の該ｃＤＮＡが正しく再構築されているかどうかを、塩
基配列決定と制限酵素切断地図の作成により確認した。
【０１４７】ＩＰＴＧの存在下で菌を培養させることに
より、単一クローン由来の組み換え体（例えば、該プラ
スミドで形質転換された大腸菌ＪＭ１０９株）が、該ク
ローンがコードするＨＣＶ遺伝子由来ポリペプチドを発
現するように誘導された。クローンＨ２Ｎ２７ＭＸ２４
Ａ−１、クローンＨ２Ｎ２７ＭＸ２４Ｂ−１、クローン
Ｈ４８−２、クローンＨ４９−２のＣ型肝炎患者血清由
来ｃＤＮＡの塩基配列と該配列でコードされるポリペプ
チドの推定アミノ酸配列は、それぞれ配列表の配列番号
３１または３２に記載のアミノ酸配列、配列番号３１に
記載のアミノ酸配列のうち１０９番目から２１４番目ま
でのアミノ酸配列及び同２３３番目から３２４番目まで
のアミノ酸配列である。
【０１４８】〔３〕クローンＮ２７ＭＸ２４Ａ−１、ク
ローンＮ２７ＭＸ２４Ｂ−１、クローンＨ４８ー２とク
ローンＨ４９ー２にコードされているＨＣＶ由来ポリペ
プチドの昆虫細胞内での発現 実施例１２〔４〕で構築したプラスミドｐＢｌｕｅＮ２
７ＭＸ２４Ａ−１、プラスミドｐＢｌｕｅＨ４８とプラ
スミドｐＢｌｕｅＨ４９にコードされているＨＣＶ由来
の糖タンパク質を昆虫細胞内で発現させるため、インビ
トロジェン社のバキュロウイルス発現マニュアルである
マックスバック（ＭＡＸＢＡＣTM ＢＡＣＵＬＯＶＩＲ
ＵＳ ＥＸＰＲＥＳＳＩＯＮ ＳＹＳＴＥＭ ＭＡＮＵ
ＡＬ ＶＥＲＳＩＯＮ １．４、以下これをマックスバ
ックと呼ぶ。）に記載されている方法を基本的に参考に
して行った。
【０１４９】実施例１２〔４〕により作製された、トラ
ンスファーベクターｐＢｌｕｅＢａｃ（マックスバック
３７頁）の制限酵素ＮｈｅＩ切断部位にＨＣＶ遺伝子を
含むＤＮＡ断片が挿入された該プラスミドをＭａｎｉａ
ｔｉｓらの方法（「モレキュラ・クローニング」、コー
ルド・スプリング・ハーバー・ラボラトリー、８６頁〜
９６頁（１９８２））に従い組換え体の大腸菌から回
収、精製しＨＣＶ遺伝子トランスファープラスミドＤＮ
Ａを大量に得た。マックスバック２７ページの方法に従
い、キットのＡｃＮＰＶ ｖｉｒａｌ ＤＮＡ １μｇ
とＨＣＶ遺伝子由来のＤＮＡ断片を含む、該プラスミド
を２μｇを混合し、Ｓｆ９細胞同時感染してＳｆ９細胞
を形質転換した。すなわち、まず直径６ｃｍのシャーレ
の中でＦＣＳ（牛胎児血清）が１０％入ったＴＭＮ−Ｆ
Ｈ培地（インビトロジェン社製）中でＳｆ９細胞を２×
１０6 ／枚になるまで培養した。次にシャーレからＴＭ
Ｎ−ＦＨ培地を除きそこに０．７５ｍｌのＦＣＳが１０
％入ったグレース（Ｇｒａｃｅ）培地（ギブコ（ＧＩＢ
ＣＯ）社製）を加えた。先述の混合ＤＮＡに、キットに
付属のトランスフェクションバッファーを０．７５ｍｌ
加えボルテックスでよく攪拌後、グレース（Ｇｒａｃ
ｅ）培地上からＤＮＡ溶液をゆっくりと滴加した。２７
℃４時間静置し、その後Ｇｒａｃｅ培地を除きＦＣＳが
１０％入ったＴＭＮ−ＦＨ培地３ｍｌをシャーレに入れ
て２７℃６日間培養した。３日目には幾つかの細胞中に
多角体が観察され、６日目にほとんどの細胞が多角体を
形成していた。この培養上清を遠心チューブに取り、
１，０００ｒｐｍ、１０分間遠心した上清を同時感染ウ
イルス液とした。
【０１５０】この同時感染ウイルス液には１ｍｌあたり
１０8 個のウイルスが含まれており、またそのうちの約
０．５％が組換え体である。組換えウイルスを単離する
ためにプラーク単離法を用いた。その方法は以下の通り
である。同時感染ウイルス液を１０-4、１０-5に希釈し
た。予め６ｃｍシャーレに１枚当り１．５×１０6 個の
細胞をまき、吸着させたものを用意し、培地を完全に除
いた後、１０-4液、１０-5液を一枚のシャーレあたりそ
れぞれ１００μｌずつ加えた。細胞の乾燥を防ぐため、
シャーレを１５分おきに傾けてウイルス液が全面に行き
渡るようにした。このようにして室温で１時間感染させ
ている間に２．５％バキュロウイルスアガロース（ｂａ
ｃｕｌｏｖｉｒｕｓ ａｇａｒｏｓｅ）（インビトロジ
ェン（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）社製）を１０５℃、１０
分間オートクレーブし、４６℃で暖めておいた１０％Ｆ
ＣＳを含むＴＭＮ−ＦＨ培地と１対３の比率で混合し、
４６℃で保温しておいて。この保温された培地に対して
最終濃度１５０μｇ／μｌになるように５−ブロモ−４
−クロロ−３−インドリル−β−Ｄ−ガラクトシドを加
え（マックスバックの１６−１７ページに従った。）こ
の培地をアガロース含有ｘ−ｇａｌ培地と呼ぶこととし
た。
【０１５１】感染終了後、ウイルス液を完全に吸い取
り、保温されたアガロース含有ｘ−ｇａｌ培地を細胞が
はがれないようにシャーレ１枚あたり４ｍｌずつ静かに
加えた。アガロースが固化して乾燥するまでシャーレの
蓋を少しずらした状態で静置し、その後蓋をして裏返し
た状態で２７℃でインキュベーションした。６日間培養
した後、位相差顕微鏡で多角体の形成していない青いプ
ラークを見いだした。この組換えプラークをパスツール
ピペットでアガロースごと吸い取り、１ｍｌのＴＭＮ−
ＦＨ培地中で何回もピペッテイングしてウイルスを浮遊
させた。これら一連の操作（感染させてから、６日間培
養し該トランスファープラスミドＤＮＡを持つウイルス
を単離する操作）をプラーク法と呼ぶ。該ウイルス浮遊
液１００μｌをとり同様のプラーク法を行った。これら
一連の操作を３回繰り返して野性株の混入のないＨＣＶ
由来糖タンパク質遺伝子を持つ組換えウイルスを得た。
該ウイルスプラークをパスツールピペットで吸い取り、
１ｍｌのＴＭＮ−ＦＨ培地によく混和した。この初代組
換えウイルス液はウイルス濃度が低いため、そのうち１
００μｌを取り、６ｃｍシャーレにハーフコンフルエン
トに培養したＳｆ９細胞に吸着後１０％ＦＣＳを含むＴ
ＭＮ−ＦＨ培地４ｍｌを加え、３日後に培養上清を回収
してこれを感染用組換えウイルス液とした。ＨＣＶ由来
糖タンパク質を産出させるために予め５×１０6 個のＳ
ｆ９細胞を１０％ＦＣＳを含むＴＭＮ−ＦＨ培地１０ｍ
ｌに懸濁して９ｃｍシャーレに撒き、１時間吸着させ
た。シャーレから培地を取り除き、感染用組換えウイル
ス液を２５０μｌ加え、全体に行き渡らせたのち１０％
ＦＣＳを含むＴＭＮ−ＦＨ培地１０ｍｌを加え２７℃で
４日間静置した。この細胞をかきあつめ生理食塩水リン
酸バッファー１，０００ｍｌによくサスペンジョンし
た。このようにして、該ウイルスに感染されたＳｆ９細
胞内にＨＣＶ由来糖タンパク質を発現させた。
【０１５２】実施例１４ 発現された生成物のＨＣＶ由
来抗原としての同定 Ｃ型肝炎ウイルスに感染したヒトの血清が、実施例１３
で発現された該ポリペプチドと免疫学的に反応するの
で、該ポリペプチドはＣ型肝炎関連抗原として同定され
た。この同定は、以下に示すウエスタンブロッティング
法により行った。まず、実施例１３〔１〕、〔２〕、
〔３〕で記述したクローンＨＮ２７ＭＸ２４Ａー１、ク
ローンＨＮ２７ＭＸ２４Ｂー１、クローンＨ２Ｎ２７Ｍ
Ｘ２４Ａー１、クローンＨ２Ｎ２７ＭＸ２４Ｂー１、ク
ローンＨ４８、クローンＨ４８ー２、クローンＨ４９、
クローンＨ４９ー２にコードされる各ポリペプチドの発
現用プラスミドｐＣＺ２７２４Ａ−１、ｐＣＺ２７２４
Ｂ−１、ｐＣＺ４８、ｐＣＺ４９、プラスミドｐＯＦＡ
２７２４Ａ−１、ｐＯＦＡ２７２４Ｂ−１、ｐＯＦＡ４
８、ｐＯＦＡ４９、ｐＧＥＸ２７２４Ａ−１、ｐＧＥＸ
２７２４Ｂ−１、ｐＧＥＸ４８、ｐＧＥＸ４９、ｐＢｌ
ｕｅＮ２７ＭＸ２４Ａ−１、プラスミドｐＢｌｕｅＨ４
８とプラスミドｐＢｌｕｅＨ４９で形質転換された大腸
菌をＩＰＴＧ存在下で実施例１３のように３時間あるい
は一昼夜培養することにより該ポリペプチドを発現する
よう誘導した。
【０１５３】この培養液１，０００μｌを６，５００
ｒ．ｐ．ｍ．で１０分間遠心分離させることにより、組
み換え体株を集菌した。この沈澱をＳＤＳ−ポリアクリ
ルアミドゲル電気泳動用試料処理液（２％ＳＤＳ、５％
メルカプトエタノール、１０％グリセリン及び０．００
５％ブロモフェノールブルーを含む５０ｍＭトリス塩酸
緩衝液、ｐＨ６．８）に最終量が０．２ｍｌになるよう
に溶解され調製された。また、実施例１３〔３〕で得ら
れた、該感染細胞（３回以上プラーク法を経たウイルス
を持つ）をかきあつめ生理食塩水リン酸バッファー１，
０００ｍｌによくサスペンジョンし、そのうち１００μ
ｌを６，５００ｒ．ｐ．ｍ．で１０分間遠心分離させる
ことにより該細胞の沈澱を得た。この沈澱をＳＤＳ−ポ
リアクリルアミドゲル電気泳動用試料処理液に最終量が
０．２ｍｌになるように溶解され調製された。次に、こ
れらの試料を１００℃、１０分間煮沸した。このように
して得られた試料１０μｌを、０．１％ＳＤＳ−１５．
０％ポリアクリルアミドゲル（７０×８５×１ｍｍ）に
添加した。その際、マーカータンパク質としてｐｈａｒ
ｍａｃｉａ社製「ＬＭＷ ＫｉｔＥ」（低分子量マーカ
ータンパク質）を使用した。電極液としてトリス緩衝液
（２５ｍＭ トリス ｐＨ８．３、１９２ｍＭ グリシ
ン、０．１％ＳＤＳ）を用い、３０ｍＡの定電流で４５
分間泳動後、常法に従い該ゲルをＳ＆Ｓ社製ニトロセル
ロールフィルター（ＢＡ−８３）と重ね、ゲル側を陰極
とし、ニトロセルロースフィルター側を陽極として、１
２０ｍＡの定電流を約２０分間流して転写させた。
【０１５４】転写されたニトロセルロースフィルター
は、マーカータンパク質部分と試料部分を分けるように
切り取られ、マーカータンパク質部分のフィルターを
０．１％（Ｗ／Ｖ）アミドブラック１０Ｂで染色し、ま
た、試料部分のフィルターを、５％（Ｗ／Ｖ）ウシ血清
アルブミンを含む０．０１Ｍリン酸生理食塩水（ＰＢ
Ｓ）ｐＨ７．４に浸した。次に、５％（Ｗ／Ｖ）ウシ血
清アルブミンを含む０．０１Ｍリン酸生理食塩水（ＰＢ
Ｓ）ｐＨ７．４で５０倍に希釈されたＣ型肝炎患者血清
１０ｍｌを試料部分のフィルターの上にのせ、室温で２
時間静置後０．１％（Ｖ／Ｖ）Ｓｉｇｍａ社製Ｔｗｅｅ
ｎ２０をふくむＰＢＳで２０分ずつ３回洗浄した。次
に、試料部分のフィルターの上にＰＢＳで１，０００倍
に希釈されたパーオキシダーゼ標識抗ヒトＩｇＧ（Ｇａ
ｐｐｅｌ社製）１０ｍｌをのせ、３７℃１時間反応さ
せ、０．１％（Ｖ／Ｖ）Ｔｗｅｅｎ２０を含むＰＢＳで
２０分ずつ３回洗浄した。次に、試料部分のフィルター
１００ｍｌのパーオキシダーゼ発色液（６０ｍｇ４−ク
ロロ−１−ナフトール、２０ｍｌメタノール、ＰＢＳ８
０ｍｌ、過酸化水素２０μｌ）に浸した。発色したフィ
ルターは、蒸留水で洗浄後、上記マーカータンパク質部
分と比較した。
【０１５５】これで発色された蛋白質は、プラスミドｐ
ＣＺ２７２４Ａ−１、ｐＣＺ２７２４Ｂ−１、ｐＣＺ４
８、ｐＣＺ４９、で発現された、いずれのものでも、導
入したＨＣＶ由来の遺伝子産物、として妥当な分子量で
ありＣ型肝炎関連抗原として同定できた。プラスミドｐ
ＯＦＡ２７２４Ａ−１、ｐＯＦＡ２７２４Ｂ−１、ｐＯ
ＦＡ４８、ｐＯＦＡ４９などのプラスミドｐＯＦＡ由来
の発現産物は、ＨＣＶ由来のポリペプチドのＮ末端に大
腸菌のＯｍｐＦシグナルペプチドが付与したものであ
る。プラスミドｐＧＥＸ２７２４Ａ−１、ｐＧＥＸ２７
２４Ｂ−１、ｐＧＥＸ４８、ｐＧＥＸ４９などのプラス
ミドｐＧＥＸ由来の発現産物は、ＨＣＶ由来のポリペプ
チドのＮ末端にＧＳＴとスロンビンの切断サイトが付与
したものである。どちらも、該クロ−ンの遺伝子産物と
して妥当な分子量でありＣ型肝炎関連抗原として同定で
きた。また、実施例１３〔３〕で示した昆虫細胞内に発
現されたクローンＮ２７ＭＸ２４Ａ−１、クローンＮ２
７ＭＸ２４Ｂ−１、クローンＨ４８ー２とクローンＨ４
９ー２クローンにコードされているＨＣＶ由来ポリペプ
チドは、プラスミドｐＢｌｕｅＮ２７ＭＸ２４Ａ−１と
ｐＢｌｕｅＮ２７ＭＸ２４Ｂ−１で感染させた細胞内
で、糖タンパク質約７０ｋダルトンのものとして得られ
た。該Ｍ−ｇｐ７０のアミノ酸配列は、それぞれ配列表
の配列番号３１または３２に記載の４６番目から３９５
番目あたりまでの配列に対応している。
【０１５６】また、プラスミドｐＢｌｕｅＨ４８とプラ
スミドｐＢｌｕｅＨ４９で感染させた細胞内で、ＨＣＶ
由来の糖タンパク質が発現されていた。この糖タンパク
質は、クローンＨ４８ー２とクローンＨ４９ー２にコー
ドされた配列表の配列番号３１と３２に記載のアミノ酸
配列のうち１０９番目から２１４番目までの１０６個の
アミノ酸で表わされるポリペプチドと２３３番目から３
２４番目までの９６個アミノ酸で表わされるポリペプチ
ドであり、Ｃ型肝炎関連抗原として同定できた。
【０１５７】実施例１５ ｃＤＮＡの合成 〔１〕ＲＮＡサンプルの調製 実施例１で得られた核酸を乾燥させた後、水３０μｌと
リボヌクレアーゼインヒビター（１００ユニット／μ
ｌ、宝酒造社製）１０μｌを加え溶解させた。この核酸
水溶液を用い下記に示すｃＤＮＡ合成を行った。 〔２〕アンチセンスプライマーを用いたｃＤＮＡの合成 〔１〕で調製した核酸水溶液２μｌにアンチセンスプラ
イマー（合成ＤＮＡプライマーＭＳ１５８、ＭＳ１５
２、ＭＳ１３２、ＭＳ４９、ＭＳ８８、ＭＳ１００など
がアンチセンスプライマーである。 １５ｐｍｏｌｓ／
μｌ）１μｌ、１０ｘＲＴ緩衝液（１００ｍＭ Ｔｒｉ
ｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．３），５００ｍＭＫＣｌ）２μ
ｌ、２５ｍＭ ＭｇＣｌ2 ４μｌ、２．５ｍＭ ４ｄ
ＮＴＰ ８μｌ、水１μｌを加え６５℃５分、次に室温
５分保温後、逆転写酵素（ライフサイエンス社製）２５
ユニットを１μｌ、リボヌクレアーゼインヒビター（１
００ユニット／μｌ、宝酒造社製）１μｌを加え３７℃
２０分、次に４２℃３０分、最後に９５℃２分保温後、
すぐに０℃に冷却した（相補鎖ＤＮＡ合成）。このＤＮ
Ａ試料１０μｌを用いてＳａｉｋｉらの方法〔ネーチャ
ー（Ｎａｔｕｒｅ），３２４，１２６，（１９８６）〕
に準じて、いわゆるＰＣＲ法により特異的配列を持つＤ
ＮＡを増幅した。
【０１５８】即ち、このＤＮＡ試料１０μｌ、１０ｘＰ
ＣＲ緩衝液（１００ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．
３），５００ｍＭ ＫＣｌ，１５ｍＭ ＭｇＣｌ2 ，１
％ゼラチン）１０μｌ、２．５ｍＭ ４ｄＮＴＰ ８μ
ｌ、相補鎖ＤＮＡ合成時に使用した合成ＤＮＡプライマ
ー（１５０ｐｍｏｌｓ／μｌ）２μｌ、このプライマー
に対応した合成ＤＮＡプライマー（１５ｐｍｏｌｓ／μ
ｌ、相補鎖ＤＮＡ合成時に使用した合成ＤＮＡプライマ
ーと対になるものであり、前述のプライマーＭＳ１５５
−ＭＳ１５２、ＭＳ１５１−ＭＳ１５８、ＭＳ１３５−
ＭＳ１３２、ＭＳ４８−ＭＳ４９、ＭＳ９７−ＭＳ８
８、ＭＳ８６−ＭＳ１００のプライマーの組み合せを使
用した。）３μｌに水を加えて合計が１００μｌになる
ようにして、まず９５℃に５分間保温後、０℃に急冷し
た。１分後、Ｔａｑ ＤＮＡポリメラーゼ（７ユニット
／μｌ、ＡｍｐｌｉＴａｑTM宝酒造）０．５μｌを加え
混和後、ミネラルオイルで重層した。このサンプルを、
パーキン エルマー シータス社製のＤＮＡ Ｔｈｅｒ
ｍａｌ Ｃｙｃｌｅｒで９５℃１分、４０〜５５℃１
分、７２℃１〜５分で２５回処理した。最後に７２℃で
７分保温した後、この反応水溶液をフェノール／クロロ
ホルム処理、エタノール沈澱（エタノール沈澱とは、水
相に１０分の１量の３Ｍ酢酸ナトリウムもしくは等量の
４Ｍ酢酸アンモニウムと水相の２．５倍容のエタノール
を加え混和し、半径５ｃｍ程度のロータを用いて１５，
０００ｒｐｍ，４℃で１５分間冷却遠心を行い、その沈
澱を乾燥させる処理）を行い、種々のプライマーの組み
合わせに由来した増幅ＤＮＡ断片を得た。
【０１５９】実施例１６ 増幅された該ＤＮＡ断片のク
ローニングと塩基配列の決定 実施例１５の〔２〕の方法によって得たＤＮＡ断片を少
なくとも１ｐｍｏｌｅ用意し、このＤＮＡをＴ４ＤＮＡ
ポリメラーゼ（東洋紡績社製）で平滑末端化し（モレキ
ュラー・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎ
ｉｎｇ）１９８２ コールド・スプリング・ハーバー
（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））、ポリヌ
クレオチドキナーゼ（東洋紡績社製）で５′末端にリン
酸基を導入後（モレキュラー・クローニング（Ｍｏｌｅ
ｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２ コールド・ス
プリング・ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒ
ｂｏｒ））、ライゲーションキット（宝酒造社製）を用
いて、ｐＵＣ１９クローニングベクターのマルチクロー
ニングサイト内にあるＳｍａＩサイトに組み込んだ。
（この時ライゲーションに用いたベクターＤＮＡは、次
の様に用意されたものを５ｎｇ〜１０ｎｇ使用した。即
ち、ｐＵＣ１９クローニングベクターを制限酵素Ｓｍａ
Ｉ（東洋紡績社製）で切断し、フェノール／クロロホル
ム処理、エタノール沈澱させた後、さらにアルカリフォ
スタファーゼ（ベーリンガーマンハイム社製）で５′末
端を脱リン酸化して（モレキュラー・クローニング（Ｍ
ｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２ コール
ド・スプリング・ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ
Ｈａｒｂｏｒ））、フェノール／クロロホルム処理、エ
タノール沈澱させた）。このようにして作成したＤＮＡ
を用いて大腸菌ＪＭ１０９あるいはＤＨ５を形質転換さ
せた（この時、コンピテントセルは東洋紡績社製のもの
を用いて行った）。形質転換させる方法は、東洋紡績社
のコンピテント ハイ（ＣＯＭＰＥＴＥＮＴ ＨＩＧ
Ｈ）のプロトコールに従った。
【０１６０】このようにして、それぞれのプライマーの
組み合わせから実施例１５の〔２〕の方法によって得た
該ＤＮＡ断片を持つｐＵＣ１９クローニングベクターで
形質転換させた形質転換体は、少なくとも、各々２０個
以上得ることができた。得られた形質転換体からプラス
ミドＤＮＡを常法により調製し、デュポン社製蛍光シー
クエンサーＧＥＮＥＳＩＳ２０００システムを用いて、
配列を決定した。シークエンスプライマーとして次の２
種の合成プライマー５′ｄ（ＧＴＡＡＡＡＣＧＡＣＧＧ
ＣＣＡＧＴ）３′（配列番号：１４３），５′ｄ（ＣＡ
ＧＧＡＡＡＣＡＧＣＴＡＴＧＡＣ）３′（配列番号：１
４４）を使用し、該ＤＮＡ断片の＋鎖、一鎖の塩基配列
を決定した。それぞれの塩基配列を、配列表の配列番号
３７〜３９、４４〜５５、１０３および１０４に示す。
得られたクローンを領域別に整理して表わしたものが配
列表の配列番号３３から３６に示す塩基配列であり、得
られた複数種のクローンをまとめて示した。例えば配列
表の配列番号３３に示す配列はクローンＭＸ２５−１、
クローンＭＸ２５−２、クローンＭＸ２５−３の３つの
クローンをまとめて表したものである。以下、同様に配
列表の配列番号３４〜３６に表された各クローンの配列
は、配列表の配列番号４７から５５に示された配列を、
それぞれ得られたクローン別にまとめて示したものであ
る。
【０１６１】配列表の配列番号３３〜３９、４４および
５５に示す塩基配列は、それぞれ上記で得られた形質転
換体のプラスミドに組み込まれたＨＣＶ由来遺伝子の＋
鎖の塩基配列を示す。また、該クローンは２本鎖ＤＮＡ
であり、例えば、クローンＭＸ２５−１、クローンＭＸ
２５−２、クローンＭＸ２５−３の塩基配列を決定する
ために用いられたプラスミドをそれぞれｐＵＣＭＸ２５
−１，ｐＵＣＭＸ２５−２，ｐＵＣＭＸ２５−３とし
た。これらのプラスミドは対応する該ＤＮＡ断片をそれ
ぞれ１分子ずつもっていた。以下、該クローンを一つ持
ち、塩基配列を決定するために用いられたプラスミドＤ
ＮＡをｐＵＣのあとにクローン名を付けて表わす。これ
らの配列は、Ｃ型肝炎患者血清由来のＲＮＡより作成さ
れたｃＤＮＡからクローニングされたクローンの塩基配
列を表しており、健常人の血清からはこの方法で実施し
てもなにも得られないか、あるいは、実施例１５
〔２〕、〔３〕で示したＰＣＲ法のサイクルを３倍か４
倍にして（サイクルをおそらく６０〜１００回）増幅し
て、もし仮に得たＤＮＡ断片があるとしても、そのＤＮ
Ａ断片の配列が前記の４種の組み合わせに対応する配列
表の配列番号３３〜４３に示す塩基配列とはホモロジー
のないものしか得られなかった。すなわち、ここで得ら
れた配列表の配列番号３３〜４３に示された該クローン
の塩基配列はＣ型肝炎患者血清由来のものに特異的なも
のであることが分った。
【０１６２】そこで、得られた該ＤＮＡ断片の塩基配列
をすでに報告されたＣ型肝炎ウイルスの遺伝子配列と比
較した。 なお、実施例１５〔２〕において、例えばプ
ライマーとしてＭＳ１５５とＭＳ１５２を使用し、同一
患者の血清から３つのクローンを得、その塩基配列を決
定したクローンＭＸ２５−１とＭＸ２５−２とＭＸ２５
−３は１人の患者血清から得られたＣ型肝炎患者血清由
来の塩基配列を保持している、即ち、一人の患者には複
数のウイルスが存在していることを示している。 実施例１７ クローンＭＸ２５Ｏ２６Ａ−１とクローン
ＭＸ２５Ｏ２６Ｂ−１、クローンＮ１６Ｎ１５−１、ク
ローンＮ１６Ｎ１５Ａ−１とクローンＮ１６Ｎ１５Ｂ−
１、クローンＵ１６Ｎ１５Ａ−１とクローンＵ１６Ｎ１
５Ｂ−１、クローンＮ２３Ｎ１５Ａ−１とクローンＮ２
３Ｎ１５Ｂ−１、クローンＭＸ２５Ｎ１５Ａ−１とクロ
ーンＭＸ２５Ｎ１５Ｂ−１の取得方法
【０１６３】〔１〕クローンＭＸ２５Ｏ２６Ａ−１とク
ローンＭＸ２５Ｏ２６Ｂ−１を得る方法 実施例１６で得たクローンＭＸ２５−１およびクローン
Ｏ２６ー１からの該ＤＮＡ断片を、それぞれ１μｌ（約
０．５から１μｇ/μｌ)ずつを１０ｘＰＣＲ緩衝液（１
００ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．３），５００ｍ
Ｍ ＫＣｌ，１５ｍＭ ＭｇＣｌ2 ，１％ゼラチン）１
０μｌ、２．５ｍＭ ４ｄＮＴＰ ８μｌ、合成プライ
マーＭＳ１５５とＭＳ１５８（ともに２０ｐｍｏｌ／μ
ｌ）をそれぞれ５μｌ、水７６．５μｌの反応溶液に入
れた。よく混合後、まず９５℃に５分間保温後、０℃に
急冷した。１分後、Ｔａｑ ＤＮＡポリメラーゼ（７ユ
ニット／μｌ、ＡｍｐｌｉＴａｑTM宝酒造）０．５μｌ
を加え混和後、ミネラルオイルで重層した。このサンプ
ルを、パーキン エルマー シータス社製のＤＮＡＴｈ
ｅｒｍａｌ Ｃｙｃｌｅｒで９５℃１分、３７℃１分、
７２℃２分で２５回処理した。次に９７℃に２分間保温
後、０℃に急冷し２分間保温した。さらに反応水溶液に
Ｔａｑ ＤＮＡポリメラーゼ（７ユニット／μｌ、Ａｍ
ｐｌｉＴａｑTM宝酒造）０．５μｌを加え同様にして９
５℃１分、５０〜５５℃１分、７２℃２分で２５回処理
した。最後に７２℃で７分保温した後、この反応水溶液
をフェノール／クロロホルム処理、エタノール沈澱させ
た。この増幅されたＤＮＡサンプルは、アガロース電気
泳動によって分離され（モレキュラー・クローニング
（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２ コ
ールド・スプリング・ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎ
ｇ Ｈａｒｂｏｒ））、目的の長さを持つＤＮＡ断片は
ゲルから切り出された（モレキュラー・クローニング
（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２ コ
ールド・スプリング・ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎ
ｇ Ｈａｒｂｏｒ））。
【０１６４】得られたＤＮＡ断片は実施例１６と同様に
処理してｐＵＣ１９クローニングベクターのマルチクロ
ーニングサイト内にあるＳｍａＩサイトに組み込んだ。
これをクローン化しスクリーニングして（この方法は、
実施例１６と同様である。）プラスミドｐＵＣＭＸ２５
Ｏ２６Ａ−１とｐＵＣＭＸ２５Ｏ２６Ｂ−１を得て、こ
れで得られたＣ型肝炎患者血清由来ｃＤＮＡをクローン
ＭＸ２５Ｏ２６Ａ−１とクローンＭＸ２５Ｏ２６Ｂ−１
と名付けた。その塩基配列をまとめて配列表の配列番号
４０に示す。クローンＭＸ２５Ｏ２６Ａ−１及びクロー
ンＭＸ２５Ｏ２６Ｂ−１の塩基配列及びアミノ酸配列
を、それぞれ配列表の配列番号５６及び５７に示す。即
ち、クローンＭＸ２５Ｏ２６Ａ−１は、クローンＭＸ２
５−１とクローンＯ２６ー１のオーバーラップする領域
がクローンＭＸ２５−１由来の配列であることを示し、
クローンＭＸ２５Ｏ２６Ｂ−１は、該領域がクローンＯ
２６ー１由来の配列であることを示している。同様にし
てクローンＮ１６Ｎ１５Ａ−１とクローンＮ１６Ｎ１５
Ｂ−１、クローンＵ１６Ｎ１５Ａ−１とクローンＵ１６
Ｎ１５Ｂ−１を得た。この場合、用いたクローンは配列
表の配列番号３６のＮ１６あるいは配列番号３７のＵ１
６−４と配列表の配列番号３９のクローンＮ１５−１で
あり、連結されたＤＮＡ断片の塩基配列は、まとめて配
列表の配列番号４１に示した。クローンＮ１６Ｎ１５Ａ
−１及びクローンＮ１６Ｎ１５Ｂ−１の塩基配列及びア
ミノ酸配列を、それぞれ配列表の配列番号５８及び５９
に示す。
【０１６５】〔２〕クローンＮ１６Ｎ１５−１を得る方
法 オーバーラップするクローンＮ１６ー１とクローンＮ１
５ー１と重複することなしに連結させるため、両方に共
通で、かつ、１つしかない制限酵素切断部位がオーバー
ラップするところにあることを利用した。即ち、制限酵
素ＢｓｔＥIIによってクローンＮ１６ー１は、配列表の
配列番号３６の５７６番目のＧの３′側で切断され、ク
ローンＮ１５ー１は配列表の配列番号３９の１１４番目
のＧの３′で切断される。また、プラスミドｐＵＣＮ１
６−１とｐＵＣＮ１５−１は、ともに該ＤＮＡ断片が同
じ向きに入っていることを考慮して、ｐＵＣＮ１６−１
をＨｉｎｄIII 、ＢｓｔＥIIで、長さ６０９ｂｐのＤＮ
Ａ断片（このＤＮＡ断片は、Ｃ型肝炎患者血清由来ｃＤ
ＮＡのクローンＮ１６−１の５′側にプラスミドｐＵＣ
１９のＨｉｎｄIIIサイトからＳｍａＩサイトまでのＤ
ＮＡ断片を付加したものである）を切り出し、ｐＵＣＮ
１５−１の長さ１４７ｂｐのＨｉｎｄIII、ＢｓｔＥII
で切り出されるクローンＮ１５−１を含むＤＮＡ断片と
をそれぞれ入れ換え、クローン化しスクリーニングする
ことによりプラスミドｐＵＣＮ１６Ｎ１５−１を得るこ
とができた。このプラスミドはクローンＮ１６−１とク
ローンＮ１５−１がオーバーラップすることなく連結さ
れたクローンＮ１６Ｎ１５−１を保有していた。クロー
ンＮ１６Ｎ１５−１と同様にして得られる塩基配列をま
とめて配列表の配列番号４１に示す。クローンＮ１６Ｎ
１５−１の塩基配列及びアミノ酸配列を、配列表の配列
番号６０に示す。
【０１６６】〔３〕クローンＮ２３Ｎ１５Ａ−１とクロ
ーンＮ２３Ｎ１５Ｂ−１を得る方法 実施例１６で得たクローンＮ２３−１および実施例１７
〔１〕と〔２〕で得たクローンＮ１６Ｎ１５Ａ−１、Ｎ
１６Ｎ１５Ｂ−１、Ｎ１６Ｎ１５−１で表される該ＤＮ
Ａ断片を、それぞれ１μｌ（約０．５から１μｇ/μｌ)
ずつを１０ｘＰＣＲ緩衝液（１００ｍＭ Ｔｒｉｓ−Ｈ
Ｃｌ（ｐＨ８．３），５００ｍＭ ＫＣｌ，１５ｍＭ
ＭｇＣｌ2 ，１％ゼラチン）１０μｌ、２．５ｍＭ ４
ｄＮＴＰ８μｌ、合成プライマーＭＳ１３５とＭＳ８８
（ともに２０ｐｍｏｌ／μｌ）をそれぞれ５μｌ、水７
６．５μｌの反応溶液に入れた。よく混合後、まず９５
℃に５分間保温後、０℃に急冷した。１分後、Ｔａｑ
ＤＮＡポリメラーゼ（７ユニット／μｌ、ＡｍｐｌｉＴ
ａｑTM宝酒造）０．５μｌを加え混和後、ミネラルオイ
ルで重層した。このサンプルを、パーキン エルマー
シータス社製のＤＮＡ Ｔｈｅｒｍａｌ Ｃｙｃｌｅｒ
で９５℃ １分、３７℃ １分、７２℃３．５〜４分で
２５回処理した。次に９７℃に２分間保温後、０℃に急
冷し２分間保温した。さらに反応水溶液にＴａｑ ＤＮ
Ａポリメラーゼ（７ユニット／μｌ、ＡｍｐｌｉＴａｑ
TM宝酒造）０．５μｌを加え同様にして９５℃ １分、
５０〜５５℃ １分、７２℃ ３．５〜４分で２５回処
理した。
【０１６７】最後に７２℃で７分保温した後、この反応
水溶液をフェノール／クロロホルム処理、エタノール沈
澱させた。この増幅されたＤＮＡサンプルは、アガロー
ス電気泳動によって分離され（モレキュラー・クローニ
ング（ＭｏｌｅｃｕｌａｒＣｌｏｎｉｎｇ）１９８２
コールド・スプリング・ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉ
ｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））、目的の長さを持つＤＮＡ断片
はゲルから切り出された（モレキュラー・クローニング
（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２ コ
ールド・スプリング・ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎ
ｇ Ｈａｒｂｏｒ））。得られたＤＮＡ断片は実施例１
６と同様に処理してｐＵＣ１９クローニングベクターの
マルチクローニングサイト内にあるＳｍａＩサイトに組
み込んだ。これをクローン化しスクリーニングして（こ
の方法は、実施例１６と同様である。）プラスミドｐＵ
ＣＮ２３Ｎ１５Ａ−１とｐＵＣＮ２３Ｎ１５Ｂ−１を得
て、これで得られたＣ型肝炎患者血清由来ｃＤＮＡをク
ローンＮ２３Ｎ１５Ａ−１とクローンＮ２３Ｎ１５Ｂ−
１と名付けた。その塩基配列をまとめて配列表の配列番
号４２に示す。また、クローンＮ２３Ｎ１５Ａ−１及び
クローンＮ２３Ｎ１５Ｂ−１の塩基配列及びアミノ酸配
列を、それぞれ配列表の配列番号６１及び６２に示す。
【０１６８】即ち、クローンＮ２３Ｎ１５Ａ−１は、ク
ローンＮ２３−１とクローンＮ１６Ｎ１５Ａ−１、Ｎ１
６Ｎ１５Ｂ−１及びＮ１６Ｎ１５ー１のオーバーラップ
する領域がクローンＮ２３−１由来の配列であることを
示し、クローンＮ２３Ｎ１５Ｂ−１は、該領域がクロー
ンＮ１６Ｎ１５Ａ−１、Ｎ１６Ｎ１５Ｂ−１及びＮ１６
Ｎ１５ー１由来の配列であることを示している。 〔４〕クローンＭＸ２５Ｎ１５−１を得る方法 オーバーラップするクローンＭＸ２５Ｏ２６Ａ−１とク
ローンＮ２３Ｎ１５Ａ−１と重複することなしに連結さ
せるため、オーバーラップするところにある両方に共通
な制限酵素切断部位を利用した。即ち、制限酵素Ａｐａ
ＩによってクローンＭＸ２５Ｏ２６Ａ−１は、１２７７
番目のＣの３′側で切断され、クローンＮ２３Ｎ１５Ａ
−１は１７番目の の３′で切断される。また、プラス
ミドｐＵＣＭＸ２５Ｏ２６Ａ−１とｐＵＣＮ２３Ｎ１５
Ａ−１は、ともに該ＤＮＡ断片がプラスミドｐＵＣ１９
のマルチクローニングサイト内にあるＳｍａＩサイトに
同じ向きに入っていることを考慮して、ｐＵＣＭＸ２５
Ｏ２６Ａ−１をＨｉｎｄIII 、ＡｐａＩで、長さ１３１
０ｂｐのＤＮＡ断片（このＤＮＡ断片は、Ｃ型肝炎患者
血清由来ｃＤＮＡのクローンＭＸ２５Ｏ２６Ａ−１の
５′側にプラスミドｐＵＣ１９のＨｉｎｄIIIサイトか
らＳｍａＩサイトまでのＤＮＡ断片を付加したものであ
る）を切り出し、ｐＵＣＮ２３Ｎ１５Ａ−１の長さ５０
ｂｐのＨｉｎｄIII、ＡｐａＩで切り出されるクローン
Ｎ１５−１を含むＤＮＡ断片とをそれぞれ入れ換え、ク
ローン化しスクリーニングすることによりプラスミドｐ
ＵＣＭＸ２５Ｎ１５−１を得ることができた。このプラ
スミドはクローンＭＸ２５Ｏ２６Ａ−１とクローンＮ２
３Ｎ１５Ａ−１がオーバーラップすることなく連結され
たクローンＭＸ２５Ｎ１５−１を保有していた。クロー
ンＭＸ２５Ｎ１５−１の塩基配列並びにアミノ酸を、配
列表の配列番号６３に示す。
【０１６９】また、〔３〕と同様にＰＣＲ法を用いて連
結も行った。これら全ての方法で得られたＤＮＡ断片の
塩基配列を配列表の配列番号４３にまとめて示す。 実施例１８ クローンＭＸ２５Ｎ１５−１にコードされ
ているＨＣＶ由来ポリペプチドを発現させるためのＤＮ
Ａの改変 〔１〕クローンＭＸ２５Ｎ１５−１にコードされている
ＨＣＶ由来ポリペプチドを大腸菌内で発現させるための
ＤＮＡの改変 クローンＭＸ２５Ｎ１５には配列表の配列番号４３に示
す塩基配列の番号で７番目のＴから８２５番目のＧまで
ＨＣＶ遺伝子由来のオープンリーディングフレーム Ｎ
Ｓ２（以下、ＭＫ／ＮＳ２と呼ぶこととする）がコード
されていると思われ、また、８２６番目のＧから２６５
２番目のＧまでＨＣＶ遺伝子由来のオープンリーディン
グフレーム ＮＳ３（以下、ＭＫ／ＮＳ３と呼ぶことと
する）がコードされていると思われる。このフレームに
合わせて開始コドンＡＴＧを該遺伝子の５’側上流に導
入して発現させる。また、ＭＫ／ＮＳ２あるいはＭＫ／
ＮＳ３の１部のアミノ酸配列を発現させる場合には、該
アミノ酸配列のフレームに合わせて開始コドンＡＴＧを
該遺伝子の５’側上流に導入し、さらに終始コドンも同
様にフレームを合わせ導入した。開始コドンＡＴＧを該
遺伝子の５’側上流に導入する際、配列表の配列番号４
３に記載されるアミノ酸配列のＮ末（アミノ末端側）に
ＨＣＶ遺伝子にコードされるポリペプチド以外のポリペ
プチドが付加されることもある。また、大腸菌における
発現ベクター由来の開始コドンをもつベクターに該クロ
ーンを導入する際、ベクター由来の開始コドンのフレー
ムに合うように該クローンのフレームを合わせれば良
い。
【０１７０】また、ベクター由来ＤＮＡの改変はＰＣＲ
法を用いた。まず、ポリペプチドＭＫ／ＮＳ２を発現さ
せるために使用されるＤＮＡ断片を得るため用いられた
プライマーは、次に示す合成ＤＮＡを使用した。５′プ
ライマー用の塩基配列は ＭＳＮＳ２−１；５′ＧＣＡＡＧＣＴＴＡＴＧＴＧＧＴ
ＴＧＴＧＧＡＴＧＡＴＧＣＴＧＣＴＧ ３′（配列番
号：１６９） である。また、発現ベクター由来の開始コドンをもつベ
クターに該ＤＮＡ断片を導入する際の５′プライマー用
の塩基配列は ＭＳＮＳ２ー２；５′ＴＧＧＴＴＧＴＧＧＡＴＧＡＴＧ
ＣＴＧＣＴＧ ３′（配列番号：１７０） である。また、３′プライマー用の塩基配列は ＭＳＮＳ２−３；５′ＧＣＧＡＡＴＴＣＡＧＡＴＣＴＴ
ＣＡＴＣＡＣＣＴＣＣＧＧＧＣＧＧＡＧＡＣＮＧＧＮＡ
ＧＮＣＣ ３′（配列番号：１７１、Ｎはイノシンを表
す） である。これら２つの合成ＤＮＡを２０ｐｍｏｌ／μｌ
に調製した。
【０１７１】このＰＣＲ反応は、Ｓａｉｋｉらの方法に
従い行った。この反応は最終容量が１００μｌになるよ
うにし、テンプレートＤＮＡとしてプラスミドｐＵＣＭ
Ｘ２５Ｎ１５−１（もしくは、プラスミドｐＵＣＭＸ２
５Ｏ２６Ａ−１も同じ領域を含んでいるので使用でき
る）を１００ｎｇ用い、プライマーは上述のように調製
された溶液を５′，３′プライマー用ともに２μｌずつ
使用した。まず、調製された試料を９５℃に５分間保温
後、０℃に急冷した。１分後、Ｔａｑ ＤＮＡポリメラ
ーゼ（７ユニット／μｌ、ＡｍｐｌｉＴａｑTM宝酒造）
０．５μｌを加え混和後、ミネラルオイルで重層した。
このサンプルを、パーキン エルマー シータス社製の
ＤＮＡ Ｔｈｅｒｍａｌ Ｃｙｃｌｅｒで９５℃１分、
６０℃１分、７２℃３分で２５回処理した。このサンプ
ルを常法によりフェノール／クロロホルム処理、エタノ
ール沈澱させ、このＤＮＡ試料をＨｉｎｄIII 、Ｅｃｏ
ＲＩで切断（ＭＳＮＳ２−２を用いた場合は、Ｔ４ＤＮ
Ａポリメラーゼで平滑末端化した後、ＥｃｏＲＩで切断
させた）後、目的の長さであるＤＮＡ断片をアクリルア
ミドゲルで分離し、抽出した（モレキュラー・クローニ
ング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２
コールド・スプリング・ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒ
ｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））。さらにクローニングベクタ
ーｐＵＣ１９のＨｉｎｄIII（ＭＳＮＳ２−２を用いた
場合は、ＳｍａＩサイト） 、ＥｃｏＲＩサイトに常法
によりライゲーションし、クローン化、スクリーニング
をして、プラスミドｐＵＣＨＮＳ２−１（ＭＳＮＳ２−
２を用いた場合は、プラスミドｐＵＣＨ２ＮＳ２−１が
得られた）を得て、その塩基配列を決定した。この方法
によって得られたクローンＨＮＳ２−１の塩基配列は、
以下に示すＤＮＡ断片が配列表の配列番号４３の７番目
から８２５番目に示されるＤＮＡ断片の５’側に付加し
ていて
【０１７２】５′ＧＣＡＡＧＣＴＴＡＴＧ ３′ ３′ＣＧＴＴＣＧＡＡＴＡＣ ５′（配列番号：１５
５） ５′末端にＨｉｎｄIII サイトを持ち、続いて開始コド
ンＡＴＧを保有している。また、３′末端には以下に示
すＤＮＡ断片が配列表の配列番号４３の７番目から８２
５番目に示されるＤＮＡ断片の３’側に付加していて、 ５′ＴＧＡＴＧＡＡＧＡＴＣＴＧＡＡＴＴＣＧＣ ３′ ３′ＡＣＴＡＣＴＴＣＴＡＧＡＣＴＴＡＡＧＣＧ ５′
（配列番号：１５６） 最も３’側からＥｃｏＲＩサイトがあり、その内側にＢ
ｇｌIIサイト、続いて終止コドンＴＧＡを２つを保有し
ている。プライマーＭＳＮＳ２ー２とＭＳＮＳ２−３の
組み合せで作成されたクローンＨ２ＮＳ２−１の塩基配
列は、５’末端にはなにも付加しておらず、３’末端に
はクローンＨＮＳ２−１と同じ塩基配列が付加してい
た。
【０１７３】また、ＭＫ／ＮＳ３を発現させるために使
用されるＤＮＡ断片は、次の合成ＤＮＡをプライマーと
して得られた。方法は、プラスミドｐＵＣＨＮＳ２−
１、プラスミドｐＵＣＨ２ＮＳ２−１を得たのと同様に
して行い、プライマーＭＳＮＳ２−１、２、３には、そ
れぞれＭＳＮＳ３−１、２、３が対応している。 ＭＳＮＳ３−１；５′ＧＣＡＡＧＣＴＴＡＴＧＧＧＣＡ
ＡＣＧＡＧＮＴＮＣＴＮＣＴＮＧＧ ３′（配列番
号：１７２） ＭＳＮＳ３ー２；５′ＧＧＣＡＡＣＧＡＧＮＴＮＣＴＮ
ＣＴＮＧＧ ３′（配列番号：１７３） ＭＳＮＳ３−３；５′ＧＣＧＡＡＴＴＣＡＧＡＴＣＴＴ
ＣＡＴＣＡＣＴＴＣＡＧＣＣＧＴＡＴＧＡＧＡＣＡＣＴ
Ｔ ３′（配列番号：１７４） 得られたプラスミドは、プラスミドｐＵＣＨＮＳ２−
１、プラスミドｐＵＣＨ２ＮＳ２−１に対応して、プラ
スミドｐＵＣＨＮＳ３−１、プラスミドｐＵＣＨ２ＮＳ
３−１である。
【０１７４】〔２〕 配列表の配列番号４３に記載のア
ミノ酸配列のうち４２２番目〜７２６番目までの３０５
個のアミノ酸配列からなるＨＣＶ由来ポリペプチド（Ｍ
Ｋ１と呼ぶ）を大腸菌内で発現させるための該ポリペプ
チドをコードしているＤＮＡ断片の改変 配列表の配列番号４３に記載のアミノ酸配列のうち４２
２番目〜７２６番目までの３０５個のアミノ酸で表わさ
れるポリペプチドＭＫ１のオープンリーディングフレー
ム（ＯＲＦ）のフレームに合わせて開始コドンＡＴＧを
該遺伝子の５’側上流に導入して発現させる。開始コド
ンＡＴＧを該遺伝子の５’側上流に導入する際、該ポリ
ペプチドのアミノ酸配列のＮ末（アミノ末端側）にＨＣ
Ｖ遺伝子にコードされるポリペプチド以外のポリペプチ
ドが付加されても良い。また、大腸菌における発現ベク
ター由来の開始コドンをもつベクターに該クローンを導
入する際、ベクター由来の開始コドンのフレームに合う
ように該クローンのフレームを合わせれば良い。ＤＮＡ
の改変はＰＣＲ法を用いた。この時、用いたプライマー
は次に示す合成ＤＮＡを使用した。
【０１７５】５′プライマー用の塩基配列は ＭＳＭＫ１−１；５′ＧＣＡＡＧＣＴＴＡＴＧＣＴＧＴ
ＣＧＣＣＣＧＧＧＣＣＣＡＴＣＴＣ ３′（配列番号：
１７５） である。また、発現ベクター由来の開始コドンをもつベ
クターに該ＤＮＡ断片を導入する際の５′プライマー用
の塩基配列は ＭＳＭＫ１−２；５′ＣＴＧＴＣＧＣＣＣＧＧＧＣＣＣ
ＡＴＣＴＣ ３′（配列番号：１７６） ３′プライマー用の塩基配列は ＭＳＭＫ１−３；５′ＧＣＧＡＡＴＴＣＡＧＡＴＣＴＴ
ＣＡＴＣＡＡＣＡＴＧＴＧＴＴＧＣＡＧＴＣＧＡＴＣＡ
Ｃ ３′（配列番号：１７７） である。これら２つの合成ＤＮＡを２０ｐｍｏｌ／μｌ
に調製した。
【０１７６】ＰＣＲ反応やクローン化サブクローン化な
どは〔１〕で行われた方法に準じて行われ、ＰＣＲ反応
でＭＳＭＫ１−１とＭＳＭＫ１−３の組み合せを用いて
得られたＤＮＡ断片をクローン化した場合、プラスミド
ｐＵＣＭＫ１を得て（ＭＳＭＫ１−２とＭＳＭＫ１−３
の組み合せを用いた場合は、プラスミドｐＵＣＭＫ１ー
２）、その塩基配列を決定した。この方法によって得ら
れたクローンＭＫ１の塩基配列は、以下に示すＤＮＡ断
片が配列表の配列番号４３のＤＮＡ断片の塩基配列で１
２６４番目のＧの５’側に付加していて、 ５′ＧＣＡＡＧＣＴＴＡＴＧ ３′ ３′ＣＧＴＴＣＧＡＡＴＡＣ ５′（配列番号：１５
５） ５′末端にＨｉｎｄIII サイトを持ち、続いて開始コド
ンＡＴＧを保有している。（ＭＳＭＫ１−２を用いて得
られたクローンＭＫ１−２の塩基配列は、上記のＤＮＡ
断片の付加がなかったが、３’側はクローンＭＫ１と同
じであった。）また、３′末端には以下に示すＤＮＡ断
片が配列表の配列番号４３の塩基配列で２１７８番目の
Ｇの端の３’側に付加していて、最も３’側からＥｃｏ
ＲＩサイトがあり、その内側にＢｇｌIIサイト、続いて
終止コドンＴＧＡを２つを保有している。 ５′ＴＧＡＴＧＡＡＧＡＴＣＴＧＡＡＴＴＣＧＣ ３′ ３′ＡＣＴＡＣＴＴＣＴＡＧＡＣＴＴＡＡＧＣＧ ５′
（配列番号：１５６）
【０１７７】〔３〕 配列表の配列番号４３に記載のア
ミノ酸配列のうち７１２番目〜１０３３番目までの３２
２個のアミノ酸配列からなるＨＣＶ由来ポリペプチド
（ＭＫ２と呼ぶ）を大腸菌内で発現させるための該ポリ
ペプチドをコードしているＤＮＡ断片の改変 配列表の配列番号４３に記載のアミノ酸配列のうち７１
２番目〜１０３３番目までの３２２個のアミノ酸で表わ
されるポリペプチドＭＫ２は、ＨＣＶ患者の血清と免疫
的に高率に反応するＨＣＶ由来抗原蛋白質であると思わ
れる。該領域を発現するため、用いるプライマーを以下
に記載の配列のものにして、〔２〕で行ったポリペプチ
ドＭＫ１を大腸菌内で発現させるためのＤＮＡ断片の改
変と同じ操作で、該領域を発現するＤＮＡ断片を得られ
た。この方法によって得られたクローンはクローンＭＫ
２（プライマーＭＳＭＫ２−１とＭＳＭＫ２−３）とク
ローンＭＫ２−２（プライマーＭＳＭＫ２−２とＭＳＭ
Ｋ２−３）である。５′プライマー用の塩基配列は ＭＳＭＫ２−１；５′ＧＣＡＡＧＣＴＴＡＴＧＧＧＣＴ
ＡＴＡＣＣＧＧＮＧＡＣＴＴＮＧＡＣ３′（配列番号：
１７８）である。また、発現ベクター由来の開始コドン
をもつベクターに該ＤＮＡ断片を導入する際の５′プラ
イマー用の塩基配列は ＭＳＭＫ２−２；５′ＧＧＣＴＡＴＡＣＣＧＧＮＧＡＣ
ＴＴＮＧＡＣ ３′（配列番号：１７９） ３′プライマー用の塩基配列は ＭＳＭＫ２−３；５′ＧＣＧＡＡＴＴＣＡＧＡＴＣＴＴ
ＣＡＧＴＧＣＴＴＣＧＣＣＣＡＧＡＡＧＧＴ ３′（配
列番号：１８０）である。これら２つの合成ＤＮＡを２
０ｐｍｏｌ／μｌに調製した。
【０１７８】〔４〕クローンＭＸ２５Ｎ１５−１にコー
ドされるＨＣＶ由来ポリペプチドの１部を昆虫細胞内で
発現させるためのＤＮＡの改変 クローンＭＸ２５Ｎ１５には１番目のＴからＨＣＶ遺伝
子由来のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）がコ
ードされていると思われる。このフレームに合わせて開
始コドンＡＴＧを該遺伝子の５’側上流に導入して発現
させる。開始コドンＡＴＧを該遺伝子の５’側上流に導
入する際、クローンＭＸ２５Ｎ１５にコードされている
アミノ酸配列（または、その１部）のＮ末（アミノ末端
側）にＨＣＶ遺伝子にコードされるポリペプチド以外の
ポリペプチドが付加されても良い。また、昆虫細胞にお
ける発現ベクター由来の開始コドンをもつベクターに該
クローンを導入する際、ベクター由来の開始コドンのフ
レームに合うように該クローンのフレームを合わせれば
良い。この際も、クローンＭＸ２５Ｎ１５にコードされ
ているアミノ酸配列（または、その１部）のＮ末（アミ
ノ末端側）にＨＣＶ遺伝子にコードされるポリペプチド
以外のポリペプチドが付加されても良い。昆虫細胞内で
はクローンＭＸ２５Ｎ１５にコードされるポリペプチド
は、少なくともアミノ酸番号で１６７番目から５０２番
目のアミノ酸配列を含んだＨＣＶ由来ポリペプチドであ
れば、つながって前駆体として細胞内で発現し、その
後、細胞内でプロセッシングを受けて、糖鎖で修飾され
たのち発現され細胞内に蓄積された。発現ベクターを構
築するためクローンＭＸ２５Ｎ１５のＤＮＡの改変はＰ
ＣＲ法を用いた。この時、用いたプライマーとしては次
に示す合成ＤＮＡを使用した。
【０１７９】５′プライマー用の塩基配列は ＭＳ２５１５ー１；５′ＧＣＧＣＴＡＧＣＡＴＧＴＧＧ
ＴＴＧＴＧＧＡＴＧＡＴＧＣＴＧ ３′（配列番号：１
８１） である。また、３′プライマー用の塩基配列は ＭＳ２５１５ー２；５′ＧＣＧＡＡＴＴＣＧＣＴＡＧＣ
ＴＣＡＣＡＧＣＣＧＧＴＴＣＡＴＣＣＡＣＴＧＣＡＣ
３′（配列番号：１８２） である。これら３つの合成ＤＮＡを２０ｐｍｏｌ／μｌ
に調製した。ＰＣＲの反応溶液の調製と後処理は〔１〕
と同様に行われた。ただ、テンプレートＤＮＡにはプラ
スミドｐＵＣＭＸ２５Ｎ１５−１、プライマーにはＭＳ
２５１５ー１とＭＳ２５１５ー２の組み合せが使用され
た。ＰＣＲのサイクルは９５℃１分、５０℃１分、７２
℃５分であり、これを１０回繰返した後、９５℃１分、
６５℃１分、７２℃５分を２０回繰返し、目的の長さ３
５８６ｂｐのＤＮＡ断片を得た。該ＤＮＡ試料をＮｈｅ
Ｉで切断後、目的の長さであるＤＮＡ断片をアクリルア
ミドゲルで分離し、抽出した（モレキュラー・クローニ
ング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２
コールド・スプリング・ハーバー（ＣｏｌｄＳｐｒｉ
ｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））。さらに、トランスファーベク
ターｐＢｌｕｅＢａｃ（インビトロジェン社）のＮｈｅ
Ｉサイトに、常法によりライゲーションしクローン化、
該ＤＮＡ断片が１つだけＮｈｅＩサイトに挿入されてい
るクローンをスクリーニングをして、プライマーＭＳ２
５１５−１とＭＳ２５１５−２から得られた該ＤＮＡ断
片由来のプラスミドｐＢｌｕｅＭＸ２５Ｎ１５−１を得
た。
【０１８０】これら該プラスミドの発現ユニットはイン
ビトロジェン社のプロトコールに示されているものを参
考にすると、ポリヘドリンプロモーター下流のクローニ
ングサイトＮｈｅＩ切断部位にＨＣＶ遺伝子由来のＤＮ
Ａ断片が順方向に連結した構造を持っていた。 実施例１９ クローンＭＸ２５Ｎ１５にコードされるＨ
ＣＶ由来ポリペプチドとポリペプチドＭＫ／ＮＳ２、Ｍ
Ｋ／ＮＳ３、ＭＫ１，ＭＫ２の発現 〔１〕クローンＨＮＳ２ー１、クローンＨＮＳ３ー１、
クローンＭＫ１、クローンＭＫ２にコードされるポリペ
プチドの大腸菌内での発現 該クローンにおいてコードされるポリペプチドはＣ型肝
炎患者血清由来ｃＤＮＡにコードされるポリペプチドの
１部であり、これをそのまま大腸菌内で発現させた。以
下に示すように発現ベクターとしてはｐＣＺ４４（特開
平１−１２４３８７号公報）が使用され、該クローンの
ｃＤＮＡをｐＣＺ４４にサブクローン化することから行
われた。まず、該クローンがＨｉｎｄIII 、ＢｇｌIIに
より充分に切断され、フェノール／クロロホルム処理、
エタノール沈澱させ、両末端が各々ＨｉｎｄIII 、Ｂｇ
ｌIIサイトの突出末端となった該ｃＤＮＡをを持つＤＮ
Ａ断片をアクリルアミドゲルで分離し、抽出された（モ
レキュラー・クローニング（ＭｏｌｅｃｕｌａｒＣｌｏ
ｎｉｎｇ）１９８２ コールド・スプリング・ハーバー
（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））。同様
に、発現ベクターｐＣＺ４４もＨｉｎｄIIＩ 、ＢｇｌI
Iにより充分に切断され、発現ベクター能を持つ長い方
のＤＮＡ断片を前述同様に調製し、これに該クローンか
ら用意されたＨｉｎｄIII 、ＢｇｌII断片を１つ持つよ
うに連結され、さらに常法に従いクローニングされた。
得られたプラスミドはそれぞれのクローンＨＮＳ２ー
１、クローンＨＮＳ３ー１、クローンＭＫ１、クローン
ＭＫ２由来のプラスミドｐＣＺＨＮＳ２−１、ｐＣＺＨ
ＮＳ３−１、ｐＣＺＭＫ１、ｐＣＺＭＫ２と名付けられ
た。
【０１８１】また、別の試みとしてｐＣＺ４４のかわり
に融合蛋白質を発現できる発現ベクターｐＧＥＸ−２Ｔ
（ファルマシア社製）を用いて発現ベクターを構築し
た。この場合、基本的にファルマシア社の説明書に従っ
て操作を行った。まず、発現ベクターｐＧＥＸ−２Ｔを
ＢａｍＨＩで切断後、 ＨｉｎｄIII リンカーを挿入し
該クローンのアミノ酸とコドンの読み枠が合うようにし
て、３′側のＥｃｏＲＩサイトと５′側の（リンカーで
作った）ＨｉｎｄIIIサイトに該クローンのＤＮＡ断片
から用意されたＨｉｎｄIII 、ＥｃｏＲＩ断片を挿入
した。こうして発現ベクターｐＧＥＸＨＮＳ２−１、ｐ
ＧＥＸＨＮＳ３−１、ｐＧＥＸＭＫ１、ｐＧＥＸＭＫ２
が得られた。プラスミドｐＣＺＨＮＳ２−１、ｐＣＺＨ
ＮＳ３−１、ｐＣＺＭＫ１、ｐＣＺＭＫ２を保持してい
る大腸菌ＪＭ１０９株をＬ−Ｂｒｏｔｈ（モレキュラー
・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎ
ｇ）１９８２ コールド・スプリング・ハーバー（Ｃｏ
ｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））にて、３７℃一
晩培養した。これを５０倍希釈となるように新しいＬ−
Ｂｒｏｔｈに植菌し、２時間、３０℃で振とう培養後、
ＩＰＴＧ（イソプロピル−β−Ｄ−ガラクトピラノシ
ド）を２ｍＭになるように培地に加え、さらに３時間以
上培養した。このようにＩＰＴＧの存在下で菌を培養さ
せることにより、単一クローン由来（この場合、該プラ
スミドのみで形質転換された大腸菌ＪＭ１０９株）の組
み換え体が、該クローンから誘導された該プラスミドを
用いて、ＨＣＶ由来ポリペプチドを発現するように誘導
された。クローンＨＮＳ２ー１、クローンＨＮＳ３ー
１、クローンＭＫ１、クローンＭＫ２由来のｃＤＮＡで
コードされるポリペプチドの推定アミノ酸配列は、それ
ぞれ配列表の配列番号４３に記載のアミノ酸配列のう
ち、４２２番目から７２６番目までのアミノ酸配列と７
１２番目から１０３３番目までのアミノ酸配列である。
【０１８２】また、プラスミドｐＧＥＸＨＮＳ２−１、
ｐＧＥＸＨＮＳ３−１、ｐＧＥＸＭＫ１、ｐＧＥＸＭＫ
２も同様にしてβ−グルタチオン−Ｓ−トランスフェラ
ーゼ（ＧＳＴ）との融合タンパク質として発現体を得る
ことができる。この場合、ファルマシア社の説明書にあ
るとおりＧＳＴのＣ末端にスロンビンで特異的に切断さ
れるサイトを持ち、そのさらにＣ末端側にクローンＨＮ
Ｓ２ー１、クローンＨＮＳ３ー１、クローンＭＫ１、ク
ローンＭＫ２由来のポリペプチドがつながっている。該
融合タンパク質を得るためには、プラスミドｐＣＺＨＮ
Ｓ２−１、ｐＣＺＨＮＳ３−１、ｐＣＺＭＫ１、ｐＣＺ
ＭＫ２からＨＣＶ由来該ポリペプチドを発現するとき行
う上記プロトコールと同様にＩＰＴＧの存在下でプラス
ミドｐＧＥＸＨＮＳ２−１、ｐＧＥＸＨＮＳ３−１、ｐ
ＧＥＸＭＫ１、ｐＧＥＸＭＫ２で形質転換させた大腸菌
を培養させ、ＨＣＶ由来のタンパク質をＧＳＴのＣ末端
に持つ該融合タンパク質を発現するように誘導された。 〔２〕クローンＨ２ＮＳ２−１、クローンＨ２ＮＳ３−
１、クローンＭＫ１−２、クローンＭＫ２−２にコード
されるポリペプチドの発現 クローンＨ２ＮＳ２−１、クローンＨ２ＮＳ３−１、ク
ローンＭＫ１−２、クローンＭＫ２−２に含まれるＣ型
肝炎患者血清由来ｃＤＮＡの５’側に他の蛋白質の遺伝
子を連結した形で大腸菌内でポリペプチドを発現させ
た。例えば、以下に示す様な大腸菌の外膜蛋白質である
ＯｍｐＦのシグナルペプチドなどをこれに利用する。こ
の発現の方法は、〔１〕で記述されたのと同様な方法で
あった。ただし、ＨＣＶｃＤＮＡの材料としてはクロー
ンＨ２ＮＳ２−１、クローンＨ２ＮＳ３−１、クローン
ＭＫ１−２、クローンＭＫ２−２に含まれるＣ型肝炎患
者血清由来ｃＤＮＡであり、このクローンは単離され塩
基配列が決定されたものである。
【０１８３】用いられた発現プラスミドは、ｐＯＦＡ
（特開平２ー８４１９５号公報）を用いた。上記、それ
ぞれの該クローンのＤＮＡ断片を、まず、Ｔ４ＤＮＡポ
リメラーゼで平滑末端化した。発現プラスミドｐＯＦＡ
をＫｐｎＩで処理した後、Ｔ４ＤＮＡポリメラーゼで両
末端が平滑末端化したものと、平滑末端化した該クロー
ンを常法によりライゲーションしクローン化、該ＤＮＡ
断片が１つだけ挿入されているクローンをスクリーニン
グした。即ち、それぞれのＨＣＶ由来のｃＤＮＡがＨＣ
Ｖ由来蛋白質を発現する＋鎖が翻訳される向きに正しく
入るようサブクローニング化することによりプラスミド
ｐＯＦＡＮＳ２−１、ｐＯＦＡＮＳ３−１、ｐＯＦＡＭ
Ｋ１、ｐＯＦＡＭＫ２として得た。この該プラスミドに
ある該ＨＣＶ由来のｃＤＮＡが正しく再構築されている
かどうかを、塩基配列決定と制限酵素切断地図の作成に
より確認した。
【０１８４】ＩＰＴＧの存在下で菌を培養させることに
より、単一クローン由来の組み換え体（例えば、該プラ
スミドで形質転換された大腸菌ＪＭ１０９株）が、該ク
ローンがコードするＨＣＶ遺伝子由来ポリペプチドを発
現するように誘導された。クローンＨ２ＮＳ２−１、ク
ローンＨ２ＮＳ３−１、クローンＭＫ１−２、クローン
ＭＫ２−２のＣ型肝炎患者血清由来ｃＤＮＡの塩基配列
と該配列でコードされるポリペプチドの推定アミノ酸配
列は、それぞれ配列表の配列番号４３に記載のアミノ酸
配列のうち４２２番目から７２６番目までのアミノ酸配
列と７１２番目から１０３３番目までのアミノ酸配列で
ある。即ち、この方法で発現された該クローン由来のポ
リペプチドは、それぞれのクローンにコードされるアミ
ノ酸配列からなるポリペプチドがＯｍｐＦのシグナルペ
プチドとの融合蛋白質として翻訳されるように構築され
た。
【０１８５】〔３〕クローンＭＸ２５Ｎ１５にコードさ
れているＨＣＶ由来ポリペプチドの昆虫細胞内での発現 実施例１８〔４〕で構築したプラスミドｐＢｌｕｅＭＸ
２５Ｎ１５にコードされているＨＣＶ由来の蛋白質を昆
虫細胞内で発現させるため、インビトロジェン社のバキ
ュロウイルス発現マニュアルであるマックスバック（Ｍ
ＡＸＢＡＣTMＢＡＣＵＬＯＶＩＲＵＳ ＥＸＰＲＥＳＳ
ＩＯＮ ＳＹＳＴＥＭ ＭＡＮＵＡＬＶＥＲＳＩＯＮ
１．４、以下これをマックスバックと呼ぶ。）に記載さ
れている方法を基本的に参考にして行った。実施例１８
〔４〕により作製された、トランスファーベクターｐＢ
ｌｕｅＢａｃ（マックスバック３７頁）の制限酵素Ｎｈ
ｅＩ切断部位にＨＣＶ遺伝子を含むＤＮＡ断片が挿入さ
れた該プラスミドをＭａｎｉａｔｉｓらの方法（「モレ
キュラ・クローニング」、コールド・スプリング・ハー
バー・ラボラトリー、８６頁〜９６頁（１９８２））に
従い組換え体の大腸菌から回収、精製しＨＣＶ遺伝子ト
ランスファープラスミドＤＮＡを大量に得た。マックス
バック２７ページの方法に従い、キットのＡｃＮＰＶ
ｖｉｒａｌ ＤＮＡ １μｇとＨＣＶ遺伝子由来のＤＮ
Ａ断片を含む、該プラスミドを２μｇを混合し、Ｓｆ９
細胞同時感染してＳｆ９細胞を形質転換した。
【０１８６】すなわち、まず直径６ｃｍのシャーレの中
でＦＣＳ（牛胎児血清）が１０％入ったＴＭＮ−ＦＨ培
地（インビトロジェン社製）中でＳｆ９細胞を２×１０
6 ／枚になるまで培養した。次にシャーレからＴＭＮ−
ＦＨ培地を除きそこに０．７５ｍｌのＦＣＳが１０％入
ったグレース（Ｇｒａｃｅ）培地（ギブコ（ＧＩＢＣ
Ｏ）社製）を加えた。先述の混合ＤＮＡに、キットに付
属のトランスフェクションバッファーを０．７５ｍｌ加
えボルテックスでよく攪拌後、グレース（Ｇｒａｃｅ）
培地上からＤＮＡ溶液をゆっくりと滴加した。２７℃４
時間静置し、その後Ｇｒａｃｅ培地を除きＦＣＳが１０
％入ったＴＭＮ−ＦＨ培地３ｍｌをシャーレに入れて２
７℃６日間培養した。３日目には幾つかの細胞中に多角
体が観察され、６日目にほとんどの細胞が多角体を形成
していた。この培養上清を遠心チューブに取り、１，０
００ｒｐｍ、１０分間遠心した上清を同時感染ウイルス
液とした。
【０１８７】この同時感染ウイルス液には１ｍｌあたり
１０8 個のウイルスが含まれており、またそのうちの約
０．５％が組換え体である。組換えウイルスを単離する
ためにプラーク単離法を用いた。その方法は以下の通り
である。同時感染ウイルス液を１０-4、１０-5に希釈し
た。予め６ｃｍシャーレに１枚当り１．５×１０6 個の
細胞をまき、吸着させたものを用意し、培地を完全に除
いた後、１０-4液、１０-5液を一枚のシャーレあたりそ
れぞれ１００μｌずつ加えた。細胞の乾燥を防ぐため、
シャーレを１５分おきに傾けてウイルス液が全面に行き
渡るようにした。このようにして室温で１時間感染させ
ている間に２．５％バキュロウイルスアガロース（ｂａ
ｃｕｌｏｖｉｒｕｓ ａｇａｒｏｓｅ）（インビトロジ
ェン（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）社製）を１０５℃、１０
分間オートクレーブし、４６℃で暖めておいた１０％Ｆ
ＣＳを含むＴＭＮ−ＦＨ培地と１対３の比率で混合し、
４６℃で保温しておいて。この保温された培地に対して
最終濃度１５０μｇ／μｌになるように５−ブロモ−４
−クロロ−３−インドリル−β−Ｄ−ガラクトシドを加
え（マックスバックの１６−１７ページに従った。）こ
の培地をアガロース含有ｘ−ｇａｌ培地と呼ぶこととし
た。
【０１８８】感染終了後、ウイルス液を完全に吸い取
り、保温されたアガロース含有ｘ−ｇａｌ培地を細胞が
はがれないようにシャーレ１枚あたり４ｍｌずつ静かに
加えた。アガロースが固化して乾燥するまでシャーレの
蓋を少しずらした状態で静置し、その後蓋をして裏返し
た状態で２７℃でインキュベーションした。６日間培養
した後、位相差顕微鏡で多角体の形成していない青いプ
ラークを見いだした。この組換えプラークをパスツール
ピペットでアガロースごと吸い取り、１ｍｌのＴＭＮ−
ＦＨ培地中で何回もピペッテイングしてウイルスを浮遊
させた。これら一連の操作（感染させてから、６日間培
養し該トランスファープラスミドＤＮＡを持つウイルス
を単離する操作）をプラーク法と呼ぶ。該ウイルス浮遊
液１００μｌをとり同様のプラーク法を行った。これら
一連の操作を３回繰り返して野性株の混入のないＨＣＶ
由来糖タンパク質遺伝子を持つ組換えウイルスを得た。
該ウイルスプラークをパスツールピペットで吸い取り、
１ｍｌのＴＭＮ−ＦＨ培地によく混和した。この初代組
換えウイルス液はウイルス濃度が低いため、そのうち１
００μｌを取り、６ｃｍシャーレにハーフコンフルエン
トに培養したＳｆ９細胞に吸着後１０％ＦＣＳを含むＴ
ＭＮ−ＦＨ培地４ｍｌを加え、３日後に培養上清を回収
してこれを感染用組換えウイルス液とした。
【０１８９】ＨＣＶ由来糖タンパク質を産出させるため
に予め５×１０6 個のＳｆ９細胞を１０％ＦＣＳを含む
ＴＭＮ−ＦＨ培地１０ｍｌに懸濁して９ｃｍシャーレに
撒き、１時間吸着させた。シャーレから培地を取り除
き、感染用組換えウイルス液を２５０μｌ加え、全体に
行き渡らせたのち１０％ＦＣＳを含むＴＭＮ−ＦＨ培地
１０ｍｌを加え２７℃で４日間静置した。この細胞をか
きあつめ生理食塩水リン酸バッファー１，０００ｍｌに
よくサスペンジョンした。このようにして、該ウイルス
に感染されたＳｆ９細胞内にＨＣＶ由来糖タンパク質を
発現させた。 実施例２０ 発現された生成物のＨＣＶ由来抗原として
の同定 Ｃ型肝炎ウイルスに感染したヒトの血清が、実施例６で
発現された該ポリペプチドと免疫学的に反応するので、
該ポリペプチドはＣ型肝炎関連抗原として同定された。
この同定は、以下に示すウエスタンブロッティング法に
より行った。まず、例えば、実施例１９〔１〕、〔２〕
で記述したクローンＨＮＳ２ー１、クローンＨＮＳ３ー
１、クローンＭＫ１、クローンＭＫ２、クローンＨ２Ｎ
Ｓ２−１、クローンＨ２ＮＳ３−１、クローンＭＫ１−
２、クローンＭＫ２−２にコードされる各ポリペプチド
の発現用プラスミドｐＣＺＨＮＳ２−１、ｐＣＺＨＮＳ
３−１、ｐＣＺＭＫ１、ｐＣＺＭＫ２、ｐＧＥＸＨＮＳ
２−１、ｐＧＥＸＨＮＳ３−１、ｐＧＥＸＭＫ１、ｐＧ
ＥＸＭＫ２、ｐＯＦＡＮＳ２−１、ｐＯＦＡＮＳ３−
１、ｐＯＦＡＭＫ１、ｐＯＦＡＭＫ２で形質転換された
大腸菌をＩＰＴＧ存在下で実施例１９のように３時間あ
るいは一昼夜培養することにより該ポリペプチドを発現
するよう誘導した。
【０１９０】この培養液１，０００μｌを６，５００
ｒ．ｐ．ｍ．で１０分間遠心分離させることにより、組
み換え体株を集菌した。この沈澱をＳＤＳ−ポリアクリ
ルアミドゲル電気泳動用試料処理液（２％ＳＤＳ、５％
メルカプトエタノール、１０％グリセリン及び０．００
５％ブロモフェノールブルーを含む５０ｍＭトリス塩酸
緩衝液、ｐＨ６．８）に最終量が０．２ｍｌになるよう
に溶解され調製された。次に、これらの試料を１００
℃、１０分間煮沸した。 このようにして得られた試料
１０μｌを、０．１％ＳＤＳ−１５．０％ポリアクリル
アミドゲル（７０×８５×１ｍｍ）に添加した。その
際、マーカータンパク質としてＰｈａｒｍａｃｉａ社製
「ＬＭＷ ＫｉｔＥ」（低分子量マーカータンパク質）
を使用した。電極液としてトリス緩衝液（２５ｍＭ ト
リス ｐＨ８．３、１９２ｍＭ グリシン、０．１％Ｓ
ＤＳ）を用い、３０ｍＡの定電流で４５分間泳動後、常
法に従い該ゲルをＳ＆Ｓ社製ニトロセルロールフィルタ
ー（ＢＡ−８３）と重ね、ゲル側を陰極とし、ニトロセ
ルロースフィルター側を陽極として、１２０ｍＡの定電
流を約２０分間流して転写させた。転写されたニトロセ
ルロースフィルターは、マーカータンパク質部分と試料
部分を分けるように切り取られ、マーカータンパク質部
分のフィルターを０．１％（Ｗ／Ｖ）アミドブラック１
０Ｂで染色し、また、試料部分のフィルターを、５％
（Ｗ／Ｖ）ウシ血清アルブミンを含む０．０１Ｍリン酸
生理食塩水（ＰＢＳ）ｐＨ７．４に浸した。次に、５％
（Ｗ／Ｖ）ウシ血清アルブミンを含む０．０１Ｍリン酸
生理食塩水（ＰＢＳ）ｐＨ７．４で５０倍に希釈された
Ｃ型肝炎患者血清１０ｍｌを試料部分のフィルターの上
にのせ、室温で２時間静置後０．１％（Ｖ／Ｖ）Ｓｉｇ
ｍａ社製Ｔｗｅｅｎ２０をふくむＰＢＳで２０分ずつ３
回洗浄した。
【０１９１】次に、試料部分のフィルターの上にＰＢＳ
で１，０００倍に希釈されたパーオキシダーゼ標識抗ヒ
トＩｇＧ（Ｇａｐｐｅｌ社製）１０ｍｌをのせ、３７℃
１時間反応させ、０．１％（Ｖ／Ｖ）Ｔｗｅｅｎ２０を
含むＰＢＳで２０分ずつ３回洗浄した。次に、試料部分
のフィルター１００ｍｌのパーオキシダーゼ発色液（６
０ｍｇ４−クロロ−１−ナフトール、２０ｍｌメタノー
ル、ＰＢＳ８０ｍｌ、過酸化水素２０μｌ）に浸した。
発色したフィルターは、蒸留水で洗浄後、上記マーカー
タンパク質部分と比較した。これで発色された蛋白質
は、プラスミドｐＣＺＨＮＳ２−１、ｐＣＺＨＮＳ３−
１、ｐＣＺＭＫ１、ｐＣＺＭＫ２で発現されたいずれの
ものでも、導入したＨＣＶ遺伝子由来産物として妥当な
分子量でありＣ型肝炎関連抗原として同定できた。プラ
スミドｐＯＦＡＮＳ２−１、ｐＯＦＡＮＳ３−１、ｐＯ
ＦＡＭＫ１、ｐＯＦＡＭＫ２などのプラスミドｐＯＦＡ
由来の発現産物は、ＨＣＶ由来のポリペプチドのＮ末端
に大腸菌のＯｍｐＦシグナルペプチドが付与したもので
ある。プラスミドｐＧＥＸＨＮＳ２−１、ｐＧＥＸＨＮ
Ｓ３−１、ｐＧＥＸＭＫ１、ｐＧＥＸＭＫ２などのプラ
スミドｐＧＥＸ由来の発現産物は、ＨＣＶ由来のポリペ
プチドのＮ末端にＧＳＴとスロンビンの切断サイトが付
与したものである。どちらも、該クロ−ンの遺伝子産物
として妥当な分子量でありＣ型肝炎関連抗原として同定
できた。
【０１９２】実施例２１ ｃＤＮＡの合成 実施例２１で用いられた水は全て超純水を２回オートク
レーブされたものを用いた。 〔１〕ＲＮＡサンプルの調製 実施例１で得られた核酸を乾燥させた後、０．３Ｍ酢酸
ナトリウム（ｐＨ７．０）水溶液５０μｌに溶解し、フ
ェノール／クロロホルム処理を１回行い、続いて２．５
倍容のエタノールを加え混和し、室温で半径約５ｃｍ程
度のローターを用いて１５０００ｒｐｍ２０分の遠心を
して核酸の沈殿を得た。この沈殿を乾燥させ水３０μｌ
とリボヌクレアーゼインヒビター（１００ユニット／μ
ｌ、宝酒造社製）１０μｌを加え溶解させた。この核酸
水溶液を用い下記に示すｃＤＮＡ合成を行った。 〔２〕アンチセンスプライマーを用いたｃＤＮＡの合成 〔１〕で調製した核酸水溶液２μｌに１種類のアンチセ
ンスプライマー（表１）に示した合成ＤＮＡプライマー
ＭＳ１２６、ＭＳ１１９、ＭＳ１６１、ＭＳ１６２、Ｍ
Ｓ１２１、ＭＳ１６３がアンチセンスプライマーであ
る。各プライマーの濃度は１５ｐｍｏｌｓ／μｌに調製
した。）１μｌ、１０ｘＲＴ緩衝液（１００ｍＭ Ｔｒ
ｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．３），５００ｍＭ ＫＣｌ）２
μｌ、２５ｍＭ ＭｇＣｌ2 ４μｌ、２．５ｍＭ ４
ｄＮＴＰ ８μｌ、水１μｌを加え６５〜７０℃５分、
次に室温５分保温後、逆転写酵素（ライフ サイエンス
社製）２５ユニットを１μｌ、リボヌクレアーゼインヒ
ビター（１００ユニット／μｌ、宝酒造社製）１μｌを
加え３７℃２０分、次に４２℃３０分、最後に９５℃２
分保温後、すぐに０℃に冷却した（相補鎖ＤＮＡ合
成）。このＤＮＡ試料１０μｌを用いてＳａｉｋｉらの
方法〔ネーチャー（Ｎａｔｕｒｅ），３２４，１２６，
（１９８６）〕に準じて、いわゆるＰＣＲ法により特異
的配列を持つＤＮＡを増幅した。
【０１９３】即ち、このＤＮＡ試料１０μｌ、１０ｘＰ
ＣＲ緩衝液（１００ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．
３），５００ｍＭ ＫＣｌ，１５ｍＭ ＭｇＣｌ2 ，１
％ゼラチン）１０μｌ、２．５ｍＭ ４ｄＮＴＰ ８μ
ｌ、相補鎖ＤＮＡ合成時に使用した合成ＤＮＡプライマ
ー（１５ｐｍｏｌｓ／μｌ）２μｌ、このプライマーに
対応した合成ＤＮＡプライマー（１５ｐｍｏｌｓ／μ
ｌ、相補鎖ＤＮＡ合成時に使用した合成ＤＮＡプライマ
ーと対になるものであり、前述のプライマーの組み合せ
ＭＳ１２７−ＭＳ１２６、ＭＳ１１８−ＭＳ１１９、Ｍ
Ｓ１５９−ＭＳ１６１、ＭＳ１６０−ＭＳ１６２、ＭＳ
１２０−ＭＳ１６３、ＭＳ１２０−ＭＳ１２１を考慮し
た。）３μｌに水を加えて合計が１００μｌになるよう
にして、まず９５℃に５分間保温後、０℃に急冷した。
１分後、Ｔａｑ ＤＮＡポリメラーゼ（７ユニット／μ
ｌ、ＡｍｐｌｉＴａｑTM宝酒造）０．５μｌを加え混和
後、ミネラルオイルで重層した。このサンプルを、パー
キン エルマー シータス社製のＤＮＡ Ｔｈｅｒｍａ
ｌ Ｃｙｃｌｅｒで９５℃１分、４０〜５５℃１分、７
２℃１〜５分で２５回処理した。最後に７２℃で７分保
温した後、この反応水溶液をフェノール／クロロホルム
処理、エタノール沈殿（エタノール沈殿とは、水相に１
０分の１量の３Ｍ酢酸ナトリウムもしくは等量の４Ｍ酢
酸アンモニウムと水相の２．５倍容のエタノールを加え
混和し、半径５ｃｍ程度のロータを用いて１５，０００
ｒｐｍ，４℃で１５分間冷却遠心を行い、その沈殿を乾
燥させる処理）を行い、種々のプライマーの組み合わせ
に由来した増幅ＤＮＡ断片を得た。
【０１９４】実施例２２ 増幅された該ＤＮＡ断片のク
ローニングと塩基配列の決定 実施例２１の〔２〕の方法によって得たＤＮＡ断片を少
なくとも１ｐｍｏｌｅ用意し、このＤＮＡをＴ４ＤＮＡ
ポリメラーゼ（東洋紡績社製）で平滑末端化し（モレキ
ュラー・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎ
ｉｎｇ）１９８２ コールド・スプリング・ハーバー
（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））、ポリヌ
クレオチドキナーゼ（東洋紡績社製）で５′末端にリン
酸基を導入後（モレキュラー・クローニング（Ｍｏｌｅ
ｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２ コールド・ス
プリング・ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒ
ｂｏｒ））、ライゲーションキット（宝酒造社製）を用
いて、ｐＵＣ１９クローニングベクターのマルチクロー
ニングサイト内にあるＳｍａＩサイトに組み込んだ。
（この時ライゲーションに用いたベクターＤＮＡは、次
の様に用意されたものを５ｎｇ〜１０ｎｇ使用した。即
ち、ｐＵＣ１９クローニングベクターを制限酵素Ｓｍａ
Ｉ（東洋紡績社製）で切断し、フェノール／クロロホル
ム処理、エタノール沈殿させた後、さらにアルカリフォ
スタファーゼ（ベーリンガーマンハイム社製）で５′末
端を脱リン酸化して（モレキュラー・クローニング（Ｍ
ｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２ コール
ド・スプリング・ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ
Ｈａｒｂｏｒ））、フェノール／クロロホルム処理、エ
タノール沈殿させた。）このようにして作成したＤＮＡ
を用いて大腸菌ＪＭ１０９あるいはＤＨ５を形質転換さ
せた（この時、コンピテントセルは東洋紡績社製のもの
を用いた）。形質転換させる方法は、東洋紡績社のコン
ピテント ハイ（ＣＯＭＰＥＴＥＮＴ ＨＩＧＨ）のプ
ロトコールに従った。
【０１９５】このようにして、それぞれのプライマーの
組み合わせから実施例２１の〔２〕の方法によって得た
該ＤＮＡ断片を持つｐＵＣ１９クローニングベクターで
形質転換させた形質転換体は、少なくとも、各々２０個
以上得ることができた。得られた形質転換体からプラス
ミドＤＮＡを常法により調製し、デュポン社製蛍光シー
クエンサーＧＥＮＥＳＩＳ２０００システムを用いて、
配列を決定した。シークエンスプライマーとして次の２
種の合成プライマー５′ｄ（ＧＴＡＡＡＡＣＧＡＣＧＧ
ＣＣＡＧＴ）３′（配列番号：１４３），５′ｄ（ＣＡ
ＧＧＡＡＡＣＡＧＣＴＡＴＧＡＣ）３′（配列番号：１
４４）を使用し、該ＤＮＡ断片の＋鎖、一鎖の塩基配列
を決定した。該ＤＮＡ断片が２００塩基対以上と長い場
合、常法に従いディレーションミュータントのクローン
にサブクローン化して確実な配列決定を行った。実施例
２の各プライマーの組み合せから得られた各ＤＮＡ断片
を整理するため、本発明では以下のように各ＤＮＡ断片
を命名した。
【０１９６】
【表１】 プライマーの組み合せ 塩基配列が決定されたクローン名 ＭＳ１２７−ＭＳ１２６ Ｎ２２−１、Ｎ２２−３、Ｎ２２−４、 Ｈ２２−３、Ｈ２２−８、Ｈ２２−９ ＭＳ１１８−ＭＳ１１９ Ｎ１７−１、Ｎ１７−２、Ｎ１７−３、 Ｈ１７−１、Ｈ１７−３ ＭＳ１５９−ＭＳ１６１ Ｏ２８−１、Ｏ２８−２、０２８−４ ＭＳ１６０−ＭＳ１６２ Ｎ２９−１、Ｎ２９−２、Ｎ２９−３ ＭＳ１２０−ＭＳ１６３ Ｏ３０−２、Ｏ３０−３、Ｏ３０−４ ＭＳ１２０−ＭＳ１２１ Ｎ１８−２、Ｎ１８−３、Ｎ１８−４、 Ｈ１８−１、Ｈ１８−２、Ｈ１８−３ また、各クローン名のアルファベットは実施例１で使用
したＣ型肝炎患者血清で区別された。決定された塩基配
列から、これらのクローンが全て既に報告されたＨＣＶ
の遺伝子配列とホモロジーを持つことがわかり、各ＤＮ
Ａ断片のＨＣＶ遺伝子上での領域名を以下のようにし
た。
【０１９７】
【表２】 プライマーの組み合せ 領域名 ＭＳ１２７−ＭＳ１２６ Ｎ２２ ＭＳ１１８−ＭＳ１１９ Ｎ１７ ＭＳ１５９−ＭＳ１６１ Ｏ２８ ＭＳ１６０−ＭＳ１６２ Ｎ２９ ＭＳ１２０−ＭＳ１６３ Ｏ３０ ＭＳ１２０−ＭＳ１２１ Ｎ１８ 得られたクローンのうちクローンＮ２２ー１、Ｎ１７−
３、Ｏ２８−１、Ｎ２９−１、Ｎ１８−４、Ｏ３０−３
の塩基配列とそれにコードされたアミノ酸配列を配列表
の配列番号７６、８１、８６、８９、９２および９８に
示した。さらに、同様にして得られた他のクローンの塩
基配列を、配列表の配列番号に示したクローンの下に並
べて以下に示す。配列表の配列番号に示した各クローン
はそれぞれ一番上に示し、同じ塩基配列の場合は点で示
した。表内の数字は、その行の１番左の塩基番号。左が
５’側。各クローンとも５’末端側を塩基番号１とし
た。
【０１９８】
【表３】 Ｎ２２領域の各クローンの塩基配列 N22-1.NUC 1 : GGCATGTGGGCCCAGGGGAGGGGGCTGTGCAGTGGATGAACCGGCTGATA （配列表の配列番号：７６） N22-3.NUC 1 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ （配列表の配列番号：７７） H22-3.NUC 1 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ （配列表の配列番号：７８） H22-8.NUC 1 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ （配列表の配列番号：７９） H22-9.NUC 1 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ （配列表の配列番号：８０） N22-1.NUC 51 : GCGTTTGCTTCGCGGGGCAACCATGTCTCCCCCACGCACTATGTGCCTGA N22-3.NUC 51 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-3.NUC 51 : ・・・・・C・・・・・・・・・・・T・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・ H22-8.NUC 51 : ・・・・・C・・C・・・・・・・・T・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・ H22-9.NUC 51 : ・・・・・C・・・・・・・・・・・T・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・ N22-1.NUC 101 : AAGCGACGCCGCAGCGCGCGTCACCCAGATCCTCTCCAACCTTACCATCA N22-3.NUC 101 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-3.NUC 101 : G・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・ H22-8.NUC 101 : G・・・・・・・・・・・G・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・C・・・・・・・ H22-9.NUC 101 : G・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・ N22-1.NUC 151 : CTCAGCTGTTGAAGAGGCTTCACCAGTGGATTAATGAGGACTGCTCCACG N22-3.NUC 151 : ・・・・・T・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-3.NUC 151 : ・・・・・・・・C・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-8.NUC 151 : ・・・・・・・・C・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-9.NUC 151 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・ N22-1.NUC 201 : CCATGCTCCGGCTCGTGGCTCAGGGATGTTTGGGACTGGATATGCACGGT N22-3.NUC 201 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-3.NUC 201 : ・・・・・T・・T・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-8.NUC 201 : ・・・・・T・・T・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-9.NUC 201 : ・・・・・T・・T・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N22-1.NUC 251 : ATTGGCTGATTTCAAGACCTGGCTCCAGTCCAAGCTCCTGCCGCGGTTAC N22-3.NUC 251 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-3.NUC 251 : G・・・AG・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・ H22-8.NUC 251 : G・・・AG・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・ H22-9.NUC 251 : G・・・AG・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・ N22-1.NUC 301 : CGGGGGTCCCTTTTTTCTCATGCCAGCGTGGGTACAAGGGGGTTTGGCGG N22-3.NUC 301 : ・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-3.NUC 301 : ・・・・A・・・・・・・・CC・・・・・・・・・・A・・・・・・・・・・・・・・A・・C・・・・・・ H22-8.NUC 301 : ・・・・A・・・・・・・・CC・T・・・・・・・・A・・・・・・・・・・・・・・A・・C・・・・・・ H22-9.NUC 301 : ・・・・A・・・・・・・・CC・・・・・・・・・・A・・・・・・・・・・・・・・A・・C・・・・・・ N22-1.NUC 351 : GGAGATGGCATCATGTATACCACCTGCCCATGTGGAGCACAAATCACCGG N22-3.NUC 351 : ・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-3.NUC 351 : ・・・・・・・・・・・・・・・C・G・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・G・・・・ H22-8.NUC 351 : ・・・・・・・・・・・・・・・C・A・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・G・・・・ H22-9.NUC 351 : ・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・G・・・・ N22-1.NUC 401 : ACATGTCAAAAACGGTTCTATGAGGATCGTTGGGCCTAGAACCTGTAGCA N22-3.NUC 401 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・ H22-3.NUC 401 : ・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・AC・・・C・・C・・・・・・・・・・・・・ H22-8.NUC 401 : ・・・・・・・・・・・・T・・・・・C・・・・・・・・・AC・・・C・・C・・・・・・・・・・・・・ H22-9.NUC 401 : ・・・・・・・・・・・・T・・・・・C・・・・・・・・・AC・・・C・・C・・・・・・・・・・・・・ N22-1.NUC 451 : ACACGTGGCACGGAACATTTCCCATCAACGCGTACACCACAGGCCCCTGC N22-3.NUC 451 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-3.NUC 451 : ・・・・・・・・・・・・・・・・G・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-8.NUC 451 : ・・・・・・・・・・・・・・・・G・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-9.NUC 451 : ・・・・・・・・・G・・・・・・G・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N22-1.NUC 501 : ACACCCTCCCCGGCGCCAAACTATTCCAGGGCGTTGTGGCGGGTGGCCGC N22-3.NUC 501 : ・・・・・・・・T・・A・・・・・G・・・・・C・・・・・・・・・・・A・・・・・・・・A・・・・・ H22-3.NUC 501 : ・・・・・・・・・・・A・・・・・G・・・・・C・・・・・・・・・・・A・・・・・・・・A・・T・・ H22-8.NUC 501 : ・・・・・・・・・・・A・・・・・G・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・A・・T・・ H22-9.NUC 501 : ・・・・・・・・・・・A・・・・・G・・・・・・・・T・A・・・・・・・・・・・・・・・A・・T・・ N22-1.NUC 551 : TGAGGAGTATGTGGAGGTCACGCGGGTGGGGGATTTCCACTACGTGAC・・ N22-3.NUC 551 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-3.NUC 551 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-8.NUC 551 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-9.NUC 551 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N22-1.NUC 601 : GCATGACCACTGACAACGTGAAATGCCCATGCCAGGTTCCGGCCCCCGAA N22-3.NUC 601 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・A・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-3.NUC 601 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・ H22-8.NUC 601 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・ H22-9.NUC 601 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・ N22-1.NUC 651 : TTCTTCACAGAATTGGATGGGGTGCGGCTGCACAGGTACGCTCCGGCGTG N22-3.NUC 651 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-3.NUC 651 : ・・・・・・・・G・・G・・・・・・・・・・・A・・・・・A・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-8.NUC 651 : ・・・・・・・・G・・G・・・・・・・・・・・A・・・・・A・・・・・A・・・・・・・・・・・・・・ H22-9.NUC 651 : ・・T・・・・・G・・G・・・・・・・・・・・A・・・・・A・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N22-1.NUC 701 : CAAACCTCTCCTGCGGGATGAGGTCACATTCCAGGTCGGGCTCAACCAAT N22-3.NUC 701 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-3.NUC 701 : ・・・・・・・・・・・・A・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-8.NUC 701 : ・・・・・・・・・・・・A・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-9.NUC 701 : ・・・・・・・・・・・・A・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N22-1.NUC 751 : ATACGGTTGGGTCACAGCTCCCATGTGAGCCCGAACCGGATGTAACAGTG N22-3.NUC 751 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・ H22-3.NUC 751 : TCC・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・・ H22-8.NUC 751 : TCC・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-9.NUC 751 : TCC・・・・・・・・・・G・・・・・A・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・ N22-1.NUC 801 : GTCACCTCCATGCTCACC N22-3.NUC 801 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-3.NUC 801 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-8.NUC 801 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H22-9.NUC 801 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・
【０１９９】 Ｎ１７領域の各クローンの塩基配列 N17-3.NUC 1 : TGTGAGCCCGAACCGGATGTAACAGTGGTCACCTCCATGCTCACCGACCC （配列表の配列番号：８１） N17-1.NUC 1 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ （配列表の配列番号：８２） N17-2.NUC 1 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ （配列表の配列番号：８３） H17-1.NUC 1 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・ （配列表の配列番号：８４） H17-3.NUC 1 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・ （配列表の配列番号：８５） N17-3.NUC 51 : CTCCCACATTACAGCAGAGGCGGCTAGGCGTAGGCTGGCCAGAGGGTCTC N17-1.NUC 51 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N17-2.NUC 51 : ・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H17-1.NUC 51 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・A・・・・・・A・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H17-3.NUC 51 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N17-3.NUC 101 : CCCCTTCCTTGGCCAGTTCTTCAGCTAGTCAGTTGTCTGCGCTTTCTTTG N17-1.NUC 101 : ・T・・・・・T・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・CA・・・・・・ N17-2.NUC 101 : ・T・・・・・T・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・CA・・・・・・ H17-1.NUC 101 : ・・・・・C・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・CC・・CC・・ H17-3.NUC 101 : ・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・CC・・・C・・ N17-3.NUC 151 : AAGGCGACATGCACTACCCATCATGGCGCCCCAGACACTGACCTCATCGA N17-1.NUC 151 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・A・T・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・ N17-2.NUC 151 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・A・T・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・ H17-1.NUC 151 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・A・T・・・・G・・・G・・・・・・・・・・・・・ H17-3.NUC 151 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・A・T・・・・G・・・G・・・・・・・・・・・・・ N17-3.NUC 201 : GGCCAACCTCCTGTGGCGGCAGGAGATGGGCGGAAACATCACCCGCGTGG N17-1.NUC 201 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・・・ N17-2.NUC 201 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・・・ H17-1.NUC 201 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・A・・G・・・・・・・・・・・T・・・・ H17-3.NUC 201 : ・・・・・・・・・・・・A・・・・・・・・・・・・・・・・・A・・G・・・・・・・・・・・・・・・・ N17-3.NUC 251 : AGTCAGAGAACAAGATAGTAATTCTAGACTCTTTTGAACCGCTTCGAGCG N17-1.NUC 251 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・ N17-2.NUC 251 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H17-1.NUC 251 : ・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・G・・・・・・・・C・・C・・・・・・・・・・・・ H17-3.NUC 251 : ・・・・・・・・・G・・・・G・・・・・・・・・・G・・・・・・・・C・・C・・・・・・・・・・・・ N17-3.NUC 301 : GAGGAGGATGA N17-1.NUC 301 : ・・・・・・・・・・・ N17-2.NUC 301 : ・・・・・・・・・・・ H17-1.NUC 301 : ・・・・・・・・・・・ H17-3.NUC 301 : ・・・・・・・・・・・
【０２００】 Ｏ２８領域の各クローンの塩基配列 O28-1.NUC 1 : GTGGTAGTCCTGGACTCGTTGGAGCCGCTTCAAGCGAAGGAAGGTGAGAG （配列表の配列番号：８６） O28-2.NUC 1 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・G・・・・G・・・・・・A・・・・・・ （配列表の配列番号：８７） O28-4.NUC 1 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・G・・・・G・・・・・・A・・・・・・ （配列表の配列番号：８８） O28-1.NUC 51 : GGAAGTGTCCGTTGCGGCGGAGATCCTGCGGAAGACCAGGAAATTCCCCG O28-2.NUC 51 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・A・・・・・・・A・・・・・・・・・・・ O28-4.NUC 51 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・A・・・・・・・A・・・・・・・・・・・ O28-1.NUC 101 : CAGCGATGCCCGTATGGGCACGCCCGGACTACAACCCACCATTACTAGAG O28-2.NUC 101 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O28-4.NUC 101 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O28-1.NUC 151 : TCTTGGAAGAACCCGGACTACGTCCCTCCAGTGGTACACGGGTGCCCATT O28-2.NUC 151 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O28-4.NUC 151 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O28-1.NUC 201 : GCCGCCTACCAAGGCCCCTCCAATACCACCTCCACGGAGAAAGAGAACGG O28-2.NUC 201 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・ O28-4.NUC 201 : ・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・ O28-1.NUC 251 : TTGTCCTGACAGAATCCACCGTGTCCTCTGCCTTGGCGGAGCTTGCTACA O28-2.NUC 251 : ・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O28-4.NUC 251 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O28-1.NUC 301 : AAGACCTTTGGCAGTTCCGGATCGTCGGCCGTCGACAGCGGCACGGCGAC O28-2.NUC 301 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O28-4.NUC 301 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O28-1.NUC 351 : CGGCCCTCCTGACCAGGCCTCCGCCGAAGGAGATGCAGGATCCGACGCTG O28-2.NUC 351 : T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O28-4.NUC 351 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O28-1.NUC 401 : AGTCGTACTCCTCCATGCCCCCCCTTGAGGGAGAGCCGGGGGACCCCGAT O28-2.NUC 401 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・ O28-4.NUC 401 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・ O28-1.NUC 451 : CTCAACGACGGGTCTTGGTCTACCGTAAGCGAGGAGGCCAGCGAGGACGT O28-2.NUC 451 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・ O28-4.NUC 451 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・ O28-1.NUC 501 : CGTCTGCTGCTCGATGTCCTACACATGGACAGGCGCCTTAATTACACCAT O28-2.NUC 501 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O28-4.NUC 501 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O28-1.NUC 551 : GCGCCGCGGAGGAGAGCAAGCTGCCCATTAATGCGCTGAGCAACCCTTTG O28-2.NUC 551 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・ O28-4.NUC 551 : ・・A・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・ O28-1.NUC 601 : CTGCGCCACCACAACATGGTCTATGCCACAACATCCCGCAGCGCAAGCCA O28-2.NUC 601 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O28-4.NUC 601 : ・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O28-1.NUC 651 : GCGGCAGAAAAAGGTCACATTTGACAGACTGCAAGTCCTGGATGACCACT O28-2.NUC 651 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O28-4.NUC 651 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O28-1.NUC 701 : ACCGGGACGTGCTCAAGGACATGAAGGCCAAGGCGTCCAC O28-2.NUC 701 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O28-4.NUC 701 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・
【０２０１】 Ｎ２９領域の各クローンの塩基配列 N29-1.NUC 1 : ACTACCGGGACGTGCTGAAGGAGATGAAGGCGAAGGCGTCCACAGTTAAG （配列表の配列番号：８９） N29-2.NUC 1 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ （配列表の配列番号：９０） N29-3.NUC 1 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ （配列表の配列番号：９１）
【０２０２】 N29-1.NUC 51 : GCTAAACTTCTATCTGTAGAGGAAGCCTGCAAGCTGACGCCCCCACACTC N29-2.NUC 51 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N29-3.NUC 51 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N29-1.NUC 101 : GGCCAGATCTAAATTTGGCTACGGGGCAAAGGACGTCCGGAGCCTGTCCA N29-2.NUC 101 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N29-3.NUC 101 : ・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N29-1.NUC 151 : GCAAGGCCGTTAACCACATCCGCTCCGTGTGGAAGGACTTGCTGGAAGAC N29-2.NUC 151 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N29-3.NUC 151 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・・・ N29-1.NUC 201 : ACTGAGACACCAATTGACACCACCATCATGGCAAAAAATGAGGTTTTCTG N29-2.NUC 201 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N29-3.NUC 201 : ・・・・・A・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N29-1.NUC 251 : TGTTCAACCAGAGAAAGGAGGCCGCAAGCCAGCTCGCCTTATCGTATTCC N29-2.NUC 251 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N29-3.NUC 251 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N29-1.NUC 301 : CAGACTTGGGGGTTCGTGTGTGCGAGAAAATGGCCCTCTACGACGTGGTC N29-2.NUC 301 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N29-3.NUC 301 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N29-1.NUC 351 : TCCACTCTTCCTCAGGCCGTGATGGGCTCCTCATACGGATTCCAGTACTC N29-2.NUC 351 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N29-3.NUC 351 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N29-1.NUC 401 : CCCTGGACAGCGGGTCGAGTTCCTGGTGAATGCCTGGAAGTCAAAGAAGA N29-2.NUC 401 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N29-3.NUC 401 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N29-1.NUC 451 : GCCCTATGGGCTTTGCATATGACACCCGCTGTTTTGACTCAACGGTCACC N29-2.NUC 451 : ・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N29-3.NUC 451 : ・T・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N29-1.NUC 501 : GAGAACGACATCCGT N29-2.NUC 501 : ・・・・・・・・・・・・・・・ N29-3.NUC 501 : ・・・
【０２０３】 Ｏ３０領域の各クローンの塩基配列 O30-3.NUC 1 : TGGGGATCCCGTATGATACCCGCTGCTTTGACTCAACGGTCACTGAGAAT （配列表の配列番号：９８） O30-2.NUC 1 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ （配列表の配列番号：９９） O30-4.NUC 1 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・A・・・・・・・・・・・・ （配列表の配列番号：１００） O30-3.NUC 51 : GACATCCGTGTCGAGGAGTCAATTTACCAATGTTGTGACTTGGCCCCCGA O30-2.NUC 50 : ・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 51 : ・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 101 : GGCCAGACAGGCCATAAGGTCACTCACAGAGCGGCTTTACATCGGGGGCC O30-2.NUC 100 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 101 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 151 : CCCTGACTAATTCAAAGGGGCAGAACTGCGGTTATCGCCGGTGCCGCGTC O30-2.NUC 150 : ・・・・・・・・・・・・・・・・A・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 151 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・C・ O30-3.NUC 201 : AGCGGCGTGCTGACGACTAGCTGCGGTAATACCCTCACATGTTACTTGAA O30-2.NUC 200 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 201 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 251 : GGCCTCTGCAGCCTGTCGAGCTGCAAAGCTCCAGGACTGCACGATGCTTG O30-2.NUC 250 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 251 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 301 : TGTGCGGAGACGACCTTGTCGTTATCTGTGATAGCGCGGGAACTCAGGAG O30-2.NUC 300 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・A・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 301 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・A・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 351 : GACGCGGCGAGCCTACGAGTCTTCACGGAGGCTATGACTAGGTACTCTGC O30-2.NUC 350 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 351 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 401 : CCCCCCCGGGGACCCGCCCCAACCAGAATACGACTTGGAGCTGATAACAT O30-2.NUC 400 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 401 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 451 : CATGCTCCTCCAATGTGTCGGTCGCGCACGACGCATCAGGCAAACGGGTG O30-2.NUC 450 : ・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 451 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 501 : TACTATCTCACCCGTGACCCCACCACCCCCCTAGCGCGGGCTGCGTGGGA O30-2.NUC 500 : ・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 501 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 551 : GACAGCTAGACACACTCCAGTCAACTCCTGGCTAGGCAACATCATCATGT O30-2.NUC 550 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 551 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 601 : ACGCGCCCACCTTATGGGCAAGGATGATTCTGATGACCCACTTCTTCTCC O30-2.NUC 600 : ・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 601 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 651 : ATCCTTCTAGCCCAGGAGCAACTTGAAAAAGCCCTAGATTGTCAGATCTA O30-2.NUC 650 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 651 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 701 : CGGGGCCACTTACTCCATTGAGCCACTTGACCTACCTCAGATCATTCAAC O30-2.NUC 700 : T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 701 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 751 : GACTCCACGGTCTTAGCGCATTTTCACTCCATAGTTACTCTCCAGGTGAG O30-2.NUC 750 : ・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 751 : ・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 801 : ATCAATAGGGTGGCTTCATGCCTCAGGAAACTTGGGGTACCGCCCTTGCG O30-2.NUC 800 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 801 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 851 : AGTCTGGAGACATCGGGCCAGAAGCGTCCGCGCTAAGCTACTGTCCCAGG O30-2.NUC 850 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 851 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 901 : GGGGGAGGGCCGCCACCTGTGGCAAATACCTCTTCAACTGGGCAGTAAAG O30-2.NUC 900 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 901 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 951 : ACCAAGCTCAAACTCACTCCAATCCCAGAAGCGTCCCAGCTGGACTTGTC O30-2.NUC 950 : ・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 951 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 1001 : CGGCTGGTTCGTTGCTGGTTACAGCGGGGGAGACATATATCACAGCCTGT O30-2.NUC 1000 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 1001 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 1051 : CTCGTGCCCGACCCCGCTGGTTCATGTGGTGCCTACTCCTACTTTCCGTA O30-2.NUC 1050 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 1051 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 1101 : GGGGTAGGCATCTACCTGCTCCCCAACCGATGAGCGGGGAGCTAAACACT O30-2.NUC 1100 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 1101 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-3.NUC 1151 : CCAGGCCAATAGGCCATCCCC O30-2.NUC 1150 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ O30-4.NUC 1151 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・
【０２０４】 Ｎ１８領域の各クローンの塩基配列 N18-4.NUC 1 : TGGGGATCCCGTATGATACCCGCTGCTTTGACTCAACGGTCACTGAGAAT （配列表の配列番号：９２） N18-2.NUC 1 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・A・・・・・・・・・・・C （配列表の配列番号：９３） N18-3.NUC 1 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ （配列表の配列番号：９４） H18-1.NUC 1 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・A・・・・・・・・・・G・ （配列表の配列番号：９５） H18-2.NUC 1 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・A・・・・・・・・・・G・ （配列表の配列番号：９６） H18-3.NUC 1 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・A・・・・・C・・・・G・ （配列表の配列番号：９７） N18-4.NUC 51 : GACATCCGTACTGAGGAGTCAATTTATCAATGTTGTGACTTGGACCCCGA N18-2.NUC 51 : ・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・T・・・・・・ N18-3.NUC 51 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H18-1.NUC 51 : ・・T・・・・・・GT・・・・・・・・・・・・C・・C・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・ H18-2.NUC 51 : ・・T・・・・・・GT・・・・・・・・・・・・C・・C・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・ H18-3.NUC 51 : ・・T・・・・・・GT・・・・・・・・・・・・C・・C・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・ N18-4.NUC 101 : GGCCAGACAGGCCATAAGGTCGCTCACAGAGCGGCTTTATATCGGGGGCC N18-2.NUC 101 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N18-3.NUC 101 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H18-1.NUC 101 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H18-2.NUC 101 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H18-3.NUC 101 : ・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N18-4.NUC 151 : CCTTGACCAATTCAAAAGGGCAAAACTGCGGCTATCGCCGGTGCCGCGCC N18-2.NUC 151 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N18-3.NUC 151 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H18-1.NUC 151 : ・・C・・・・T・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・T・ H18-2.NUC 151 : ・・C・・・・T・・・・・・・・G・・・・・G・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・T・ H18-3.NUC 151 : ・・C・・・・T・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・・・T・ N18-4.NUC 201 : AGCGGCGTGCTGACGACTAGCTGCGGTAATACCCTCACATGTTACTTGAA N18-2.NUC 201 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N18-3.NUC 201 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・ H18-1.NUC 201 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・T・・T・・・・・・・・・・・・・・ H18-2.NUC 201 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・ H18-3.NUC 201 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・T・・・・・・・・・・・・・・ N18-4.NUC 251 : GGCCTCTGCAGCCTGTCGAGCTGCGAAGCTCCAGGACTGCACGATGCTCG N18-2.NUC 251 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・・・・ N18-3.NUC 251 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H18-1.NUC 251 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・A・・・・・・・・・・・・・・・・・A・・・・・・・ H18-2.NUC 251 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・A・・・・・・・・・・・・・・・・・A・・・・・・・ H18-3.NUC 251 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・A・・・・・・・・・・・・・・・・・A・・・・・・・ N18-4.NUC 301 : TGTGCGGAGACGACCTTGTCGTTATCTGTGAAAGCGCGGGAACCCAGGAG N18-2.NUC 301 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・ N18-3.NUC 301 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H18-1.NUC 301 : ・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H18-2.NUC 301 : ・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H18-3.NUC 301 : ・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・C・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N18-4.NUC 351 : GACGCGGCAAACCTACGAGTCTTCACGGAGGCTATGACCAGGAATTCCGC N18-2.NUC 351 : ・・・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N18-3.NUC 351 : ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H18-1.NUC 351 : ・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H18-2.NUC 351 : ・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ H18-3.NUC 351 : ・・・・・・・・G・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ N18-4.NUC 401 : C N18-2.NUC 401 : ・ N18-3.NUC 401 : ・ H18-1.NUC 401 : ・ H18-2.NUC 401 : ・ H18-3.NUC 401 : ・
【０２０５】得られたクローンを領域別に整理して表し
たものが配列表の配列番号６４〜６９である。配列表の
配列番号６４〜６９、７６〜１００に示す塩基配列は、
それぞれ上記で得られた形質転換体のプラスミドに組み
込まれたＨＣＶ遺伝子由来ＤＮＡ断片の＋鎖の塩基配列
を示す。また、該クローンは２本鎖ＤＮＡであり、例え
ば、クローンＮ２２−１の塩基配列を決定するために用
いられたプラスミドをｐＵＣＮ２２−１とした。これら
のプラスミドは対応する該ＤＮＡ断片をそれぞれ１分子
ずつもっていた。以下、該クローンを一つ持ち、塩基配
列を決定するために用いられたプラスミドＤＮＡをｐＵ
Ｃのあとにクローン名を付けて表わす。
【０２０６】これらの配列は、Ｃ型肝炎患者血清由来の
ＲＮＡより作成されたｃＤＮＡからクローニングされた
クローンの塩基配列を表しており、健常人の血清からは
この方法で実施してもなにも得られないか、あるいは、
実施例２１〔２〕で示したＰＣＲ法のサイクルを３倍か
４倍にして（サイクルをおそらく６０〜１００回）増幅
して、もし仮に得たＤＮＡ断片があるとしても、そのＤ
ＮＡ断片の配列が配列表の配列番号６４〜６９、７６〜
１００に示す塩基配列とはホモロジーのないものしか得
られなかった。すなわち、ここで得られた配列表の配列
番号６４〜６９、７６〜１００に示された該クローンの
塩基配列はＣ型肝炎患者血清由来のものに特異的なもの
である。また、上記より、１人の患者には複数のウイル
スが存在していることがわかる。 実施例２３ クローン１５３０Ｕの取得方法 〔１〕クローン１７２８、クローン２２１７、クローン
２９１８を得る方法 実施例２２で得たクローンＮ１７−３およびクローンＯ
２８−１のオーバーラップする領域を利用してＰＣＲ反
応によって連結する。クローンＮ１７−３およびクロー
ンＯ２８−１の塩基配列を持つ該ＤＮＡ断片（それぞれ
３１１塩基対、７４０塩基対）を、それぞれ１μｌ（約
０．５から１μｇ/μｌ)ずつ、１０ｘＰＣＲ緩衝液（１
００ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．３），５００ｍ
Ｍ ＫＣｌ，１５ｍＭ ＭｇＣｌ2 ，１％ゼラチン）１
０μｌ、２．５ｍＭ ４ｄＮＴＰ８μｌ、合成プライマ
ーＭＳ１１８とＭＳ１６１（ともに２０ｐｍｏｌ／μ
ｌ）をそれぞれ５μｌ、水７６．５μｌの反応溶液に入
れた。よく混合後、まず９５℃に５分間保温後、０℃に
急冷した。１分後、Ｔａｑ ＤＮＡポリメラーゼ（７ユ
ニット／μｌ、ＡｍｐｌｉＴａｑTM宝酒造）０．５μｌ
を加え混和後、ミネラルオイルで重層した。
【０２０７】このサンプルを、パーキン エルマー シ
ータス社製のＤＮＡ Ｔｈｅｒｍａｌ Ｃｙｃｌｅｒで
９５℃１分、３７℃１分、７２℃２分で２５回処理し
た。次に９７℃に２分間保温後、０℃に急冷し２分間保
温した。さらに反応水溶液にＴａｑ ＤＮＡポリメラー
ゼ（７ユニット／μｌ、ＡｍｐｌｉＴａｑTM宝酒造）
０．５μｌを加え同様にして９５℃１分、５５℃１分、
７２℃２分で２５回処理した。最後に７２℃で７分保温
した後、この反応水溶液をフェノール／クロロホルム処
理、エタノール沈殿させた。２種類の該ＤＮＡ断片はＰ
ＣＲ反応により連結され、増幅もされた。連結されたＤ
ＮＡサンプルは、アガロース電気泳動によって分離され
（モレキュラー・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ
Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２ コールド・スプリング・ハ
ーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））、
約１０００塩基対の長さを持つＤＮＡ断片はゲルから切
り出された（モレキュラー・クローニング（Ｍｏｌｅｃ
ｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２ コールド・スプ
リング・ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂ
ｏｒ））。得られたＤＮＡ断片は実施例２２と同様に処
理してｐＵＣ１９クローニングベクターのマルチクロー
ニングサイト内にあるＳｍａＩサイトに組み込んだ。こ
れをクローン化しスクリーニングして（この方法は、実
施例２２と同様である。）プラスミドｐＵＣ１７２８を
得た。これで得られたＣ型肝炎患者血清由来クローンを
クローン１７２８と名付けた。その塩基配列をまとめて
配列表の配列番号８に示す。
【０２０８】同様にしてクローンＮ２２−１及びクロー
ンＮ１７−３よりＰＣＲ反応を利用して連結し、プラス
ミドｐＵＣ２２１７を得た。このプラスミドはＳｍａＩ
サイトにＣ型肝炎患者血清由来のＤＮＡ断片を持つ。該
ＤＮＡ断片の向きは、クローンＮ２２−１由来の塩基配
列の５’側にｐＵＣ１９のＥｃｏＲＩサイトがあり、ク
ローンＮ１７−３由来の塩基配列の３’側にＨｉｎｄＩ
ＩＩサイトがある。該クローン２２１７の塩基配列及び
アミノ酸配列を、それぞれ配列表の配列番号７０に示
す。同様にしてクローンＮ２９−１とクローンＮ１８−
４からクローン２９１８を得た。連結されたクローンの
塩基配列及びアミノ酸配列は、配列表の配列番号７２に
示した。 〔２〕クローン１７１８を得る方法 〔１〕で得られたクローン１７２８とクローン２９１８
は、４３塩基対が重なり合う。それぞれ長さ１００４塩
基対と８５７塩基対から成るＤＮＡ断片をＰＣＲ反応に
よって連結させた。反応の条件や手順は〔１〕で示した
方法に準じたが、ＰＣＲ反応におけるＴａｑ ｐｏｌｙ
ｍｅｒａｓｅの伸長反応ステップである７２℃の反応時
間は、５分に変えた。これで、長さ１８１８塩基対の、
ＨＣＶ遺伝子由来の塩基配列を持つＤＮＡ断片をＳｍａ
Ｉサイトに持つプラスミドｐＵＣ１７１８を得た。この
時、Ｎ１７領域側がＮ１８領域よりＨＣＶ遺伝子上では
５’側だが、クローンＮ１７−３の５’側にｐＵＣ１９
のＥｃｏＲＩサイト側がくるようなものをｐＵＣ１７１
８とした。また該クローンをクローン１７１８とし、こ
の塩基配列及びアミノ酸配列は、配列表の配列番号７３
に示した。
【０２０９】〔３〕クローン２２１８を得る方法 オーバーラップするクローン２２１７とクローン１７１
８とを重複することなしに連結させるため、両方に共通
で、かつ、１つしかない制限酵素切断部位がオーバーラ
ップするところにあることを利用した。即ち、制限酵素
ＸｂａＩによってｐＵＣ２２１７は、クローンＮ１７−
３由来の配列とｐＵＣ１９由来の配列の２箇所で切断さ
れ、短い約４０塩基対弱のＤＮＡ断片がアガロース電気
泳動によって分離されベクターとクローン２２１７由来
の大部分の配列を持つ大きい方のＤＮＡ断片ｐＵＣ２２
１７／ＸｂａＩを常法により抽出した。ｐＵＣ１７１８
もクローンＮ１７−３由来の配列とｐＵＣ１９由来の配
列の２箇所で切断され、クローン１７１８由来の配列の
大部分を含む約１５４５塩基対のＤＮＡ断片１７１８／
ＸｂａＩを常法により、アガロース電気泳動によって分
離、抽出した。プラスミドｐＵＣ２２１７とｐＵＣ１７
１８は、ともに該ＤＮＡ断片が同じ向きに入っているこ
とを考慮して、ｐＵＣ２２１７／ＸｂａＩ １０ｎｇと
１７１８／ＸｂａＩ ５０ｎｇをＴ４ＤＮＡライゲース
でライゲーションさせ、この反応溶液を大腸菌ＪＭ１０
９のコンピテントセルとインキュベーションし、実施例
２２と同様に形質転換された大腸菌からクローン化し、
クローンＮ１７ー３由来の配列が元通りにつながり、ｐ
ＵＣ１９由来のＸｂａＩサイトどうしで連結されたプラ
スミドｐＵＣ２２１８を持つ形質転換体を得た。
【０２１０】該プラスミドはｐＵＣ１９のＳｍａＩサイ
トにＥｃｏＲＩサイト側からクローンＮ２２−１、Ｎ１
７−３、Ｏ２８−１、Ｎ２９−１、Ｎ１８−４の順にオ
ーバーラップする領域が重複されずに連結されたＤＮＡ
断片を持っている。該クローンをクローン２２１８とす
る。クローン２２１８の塩基配列及びアミノ酸配列を、
配列表の配列番号７４に示す。 〔４〕Ｎ１５領域とＨＣＶ３’末端に相当するＯ３０領
域の順方向の連結 クローンＯ３０−３は配列表９８に示される。この配列
をもつクローンＯ３０−３のＤＮＡ断片は、ｐＵＣ１９
のＳｍａＩサイトに、クローンＯ３０−３の５’側にＥ
ｃｏＲＩサイトがある向きに挿入されている（ｐＵＣＯ
３０）。また、クローンＮ１５（実施例１６）のＨＣＶ
遺伝子の順方向で５’側にＥｃｏＲＩサイトがある向き
にクローンＯ３０−３と同じくｐＵＣ１９のＳｍａＩサ
イトに挿入されている（ｐＵＣＮ１５）。ｐＵＣＯ３０
がｐＵＣ１９のクローニングサイト由来のＳａｃＩサイ
トで切断された後、Ｔ４ＤＮＡポリメラーゼにより常法
に従って平滑末端化され、さらにｐＵＣ１９のクローニ
ングサイト由来のＨｉｎｄＩＩＩで切断し、ＨＣＶ遺伝
子由来ＤＮＡ断片Ｏ３０（ＳａｃＴ４／Ｈｉｎｄ）を得
た。また、プラスミドｐＵＣＮ１５をＸｂａＩで切断し
た後に、平滑末端化し、ＨｉｎｄＩＩＩで切断したｐＵ
Ｃ１９の大部分の領域とクローンＮ１５−１由来の配列
を含むＤＮＡ断片ｐＵＣＮ１５（ＸｂａＴ４／Ｈｉｎ
ｄ）を得た。ＤＮＡ断片Ｏ３０（ＳａｃＴ４／Ｈｉｎ
ｄ） 約８０ｎｇとＤＮＡ断片ｐＵＣＮ１５（ＸｂａＴ
４／Ｈｉｎｄ）約２０ｎｇは、Ｔ４ＤＮＡライゲ−スを
用い、常法に従い反応溶液２０μｌで連結反応を行っ
た。この反応溶液をコンピテント ハイ（東洋紡績社
製）ＪＭ１０９とインキュベ−ションし、添付されたプ
ロトコ−ルに従って形質転換後、目的のプラスミドｐＵ
Ｃ１５−３０を持つ形質転換体を単離した。該プラスミ
ドがＢｇｌＩＩとＨｉｎｄＩＩＩでそれぞれ１カ所でし
か切断されないのを利用し、クローンＯ３０−３由来の
配列にあるＢｇｌＩＩサイトを含むプライマーＭＳ１７
４で以下のようにＰＣＲを行い、クローンＯ３０−３の
３’末へのポリＵ付加を行った。
【０２１１】ｐＵＣ１５３０ １０ｎｇを鋳型としてプ
ライマーＭＳ１７４とＭＳ１７５でＰＣＲ反応を行い、
このＰＣＲ断片をＢｇｌＩＩ、ＨｉｎｄＩＩＩで切断
後、ＢｇｌＩＩ、ＨｉｎｄＩＩＩで切断されたｐＵＣＯ
３０のベクター部を含むＤＮＡ断片とつなげられ、クロ
ーン３０−３の３’末端にポリＵを持つＤＮＡ断片を含
むプラスミドｐＵＣ１５−３０Ｕを得た。 〔５〕Ｎ１５領域から、Ｏ３０領域までの連結 Ｎ１５領域とＮ２２領域の共通領域にＡｐａＩサイトが
ある。また、Ｎ１８領域とＯ３０領域の共通領域にもＡ
ｐａＩサイトがある。両方がかみ合うように、ｐＵＣ２
２１８からＡｐａＩで切り出されたクローン２２１８由
来のＤＮＡ断片をｐＵＣ１５−３０ＵのＡｐａＩサイト
に挿入し、プラスミドｐＵＣ１５３０Ｕを得た。この時
の実験条件として、ｐＵＣ２２１８からＡｐａＩで切り
出されたクローン２２１８由来のＤＮＡ段片をアガロー
スゲルで電気泳動後、常法により抽出し、ｐＵＣ２２１
８／ＡｐａＩ ３０μｇを取得した。既にＡｐａＩで完
全に切断され、５’末端が脱リン酸化されたプラスミド
ｐＵＣ１５−３０Ｕ由来のＤＮＡ断片２０μｇとｐＵＣ
２２１８／ＡｐａＩ ３０μｇを最終濃度１０μｌでラ
イゲーション反応させ、この反応液全部をコンピテント
ハイ（東洋紡績社製）ＤＨ５をもちいて形質転換させ
た。得られた形質転換体から、Ｎ１５領域からＯ３０領
域まで重複していた配列が重複することなしに連結した
ＤＮＡ断片クローン１５３０ＵをプラスミドｐＵＣ１９
のマルチクローニングサイト内にあるＳｍａＩサイトに
持つプラスミドｐＵＣ１５３０Ｕを調製した。クローン
１５３０Ｕの塩基配列を実施例２２で示したのと同じ方
法で決定し、その配列を配列表の配列番号７５に示す。
また、同時に、該クローンにコードされるＨＣＶ由来ポ
リペプチドのアミノ酸配列も示す。
【０２１２】このように連結されたＮ１５領域からＯ３
０領域は、ＨＣＶの類縁とされるフラビウイルスの非構
造タンパク質ＮＳ４の一部、ＮＳ５とホモロジーが高い
アミノ酸配列をコードしている。また、前述のカイロン
社の他、国立ガンセンターの下遠野ら、大阪大学・微研
の高見沢らによって報告されたＣ型肝炎ウイルスの全遺
伝子の配列からも該領域はＮＳ４の途中からＮＳ５の全
部をコードする遺伝子配列とホモロジーをもつことか
ら、本発明の配列表に記載のクローンはＣ型肝炎ウイル
スのＮＳ４領域（一部）とＮＳ５領域の遺伝子配列であ
ると予想される。そこで、該クローンを発現プラスミド
に組み込み、該クローンにコードされるポリペプチドを
生産させ、Ｃ型肝炎患者の血清と免疫的に反応するかど
うか試みた。実施例２４ クローン１５３０Ｕにコード
されているＨＣＶ由来ポリペプチドを発現させるための
ＤＮＡの改変 以下に、クローン１５３０ＵにコードされているＨＣＶ
由来ポリペプチドの１部、あるいは、ところどころ領域
を選んで、あるいは全体を発現させるために使われる手
段を示す。例として以下の方法を示し、このどれかを行
えば、クローン１５３０Ｕのどの領域でも発現させるこ
とができる。
【０２１３】〔１〕クローン１５３０Ｕにコードされて
いるＨＣＶ由来ポリペプチドの１部を大腸菌内で発現さ
せるためのＤＮＡの改変 この方法は、大腸菌内で余分なアミノ酸配列が付加する
ことなしに目的のポリペプチドのみを発現させるときに
用いる。配列表の配列番号７５に示す塩基配列の番号で
１２４６番目のＣから１６９２番目のＣまでＨＣＶ遺伝
子由来のオープンリーディングフレーム（以下、ＮＳ５
Ｎと呼ぶこととする）がコードされていると思われる。
このフレームに合わせて開始コドンＡＴＧを該遺伝子の
５’側上流に導入して発現させる。また、ＮＳ５Ｎの１
部のアミノ酸配列を発現させる場合には、該アミノ酸配
列のフレームに合わせて開始コドンＡＴＧを該遺伝子の
５’側上流に導入し、さらに終始コドンも同様にフレー
ムを合わせ導入した。開始コドンＡＴＧを該遺伝子の
５’側上流に導入する際、このＡＴＧとＨＣＶ由来の塩
基配列の間にｐＵＣ１９由来の配列が挿入されたりする
と配列表の配列番号７に記載されるアミノ酸配列のＮ末
（アミノ末端側）に、ＨＣＶ遺伝子にコードされるポリ
ペプチド以外のポリペプチドが付加されることもある。
また、ＤＮＡの改変はＰＣＲ法を用いた。まず、ポリペ
プチドＮＳ５Ｎを発現させるために使用されるＤＮＡ断
片を得るため用いられたプライマーは、次に示す合成Ｄ
ＮＡを使用した。
【０２１４】５′プライマー用の塩基配列は ＭＳＮＳ５−１；５′ＧＣＡＡＧＣＴＴＡＴＧＣＡＧＣ
ＧＴＧＧＧＴＡＣＡＡＧＧＧＧＧＴＴ ３′（配列番
号：１８３） である。また、３’プライマー用の塩基配列は ＭＳＮＳ５−２；５′ＧＣＧＡＡＴＴＣＡＧＡＴＣＴＴ
ＣＡＴＣＡＧＡＧＣＴＧＴＧＡＣＣＣＡＡＣＣＧＴＡＴ
ＡＴＴＧＧＴＴ ３′（配列番号：１８４） である。これら２つの合成ＤＮＡを２０ｐｍｏｌ／μｌ
に調製した。このＰＣＲ反応は、Ｓａｉｋｉらの方法に
従い行った。この反応は最終容量が１００μｌになるよ
うにし、テンプレートＤＮＡとしてプラスミドｐＵＣ２
２１７（もしくは、プラスミドｐＵＣＮ２２−１も同じ
領域を含んでいるので使用できる）を１００ｎｇ用い、
プライマーは上述のように調製された溶液を５′，３′
プライマー用ともに２μｌずつ使用した。まず、調製さ
れた試料を９５℃に５分間保温後、０℃に急冷した。１
分後、Ｔａｑ ＤＮＡポリメラーゼ（７ユニット／μ
ｌ、ＡｍｐｌｉＴａｑTM宝酒造）０．５μｌを加え混和
後、ミネラルオイルで重層した。このサンプルを、パー
キン エルマー シータス社製のＤＮＡＴｈｅｒｍａｌ
Ｃｙｃｌｅｒで９５℃１分、５５℃１分、７２℃１分
で２５回処理した。
【０２１５】このサンプルを、常法によりフェノール／
クロロホルム処理、エタノール沈殿させ、該ＤＮＡ断片
をＨｉｎｄＩＩＩ、ＥｃｏＲＩで切断した後アクリルア
ミドゲルで分離・抽出した。さらにクローニングベクタ
ーｐＵＣ１９のＨｉｎｄＩＩＩ 、ＥｃｏＲＩサイトに
常法によりライゲーションし、クローン化、スクリーニ
ングをして、プラスミドｐＵＣＮＳ５Ｎを得て、その塩
基配列を決定した。この方法によって得られたクローン
ＮＳ５Ｎの塩基配列は、以下に示すＤＮＡ断片が配列表
の配列番号７５の１２４６番目から１６９２番目に示さ
れるＤＮＡ断片の５’側に付加していて ５′ＧＣＡＡＧＣＴＴＡＴＧ ３′ ３′ＣＧＴＴＣＧＡＡＴＡＣ ５′（配列番号：１５
５） ５′末端にＨｉｎｄＩＩＩ サイトを持ち、続いて開始
コドンＡＴＧを保有している。また、３′末端には以下
に示すＤＮＡ断片が配列表の配列番号７５の１２４６番
目から１６９２番目に示されるＤＮＡ断片の３’側に付
加していて、 ５′ＴＧＡＴＧＡＡＧＡＴＣＴＧＡＡＴＴＣＧＣ ３′ ３′ＡＣＴＡＣＴＴＣＴＡＧＡＣＴＴＡＡＧＣＧ ５′
（配列番号：１５６） 最も３’側からＥｃｏＲＩサイトがあり、その内側にＢ
ｇｌＩＩサイト、続いて終止コドンＴＧＡを２つを保有
している。
【０２１６】〔２〕 ＭＫＣＮＳ５領域の昆虫細胞内で
発現させるためのＤＮＡの改変 ＭＫＣＮＳ５領域とは配列表の配列番号７５において４
１５番目から１４１１番目のアミノ酸配列を持つＨＣＶ
遺伝子由来のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）
である。このフレームに合わせて開始コドンＡＴＧを該
遺伝子の５’側上流に導入して発現させる。開始コドン
ＡＴＧを該遺伝子の５’側上流に導入する際、該遺伝子
にコードされているアミノ酸配列（または、その１部）
のＮ末（アミノ末端側）にＨＣＶ遺伝子にコードされる
ポリペプチド以外のポリペプチドが付加されても良い。
また、昆虫細胞における発現ベクター由来の開始コドン
をもつベクターに該クローンを導入する際、ベクター由
来の開始コドンのフレームに合うように該クローンのフ
レームを合わせれば良い。この際も、該遺伝子にコード
されているアミノ酸配列（または、その１部）のＮ末
（アミノ末端側）にＨＣＶ遺伝子にコードされるポリペ
プチド以外のポリペプチドが付加されても良い。昆虫細
胞内では該ポリペプチドは、少なくとも配列表の配列番
号７５のアミノ酸番号で４１５番目から１４１１番目の
アミノ酸配列を含んだＨＣＶ由来ポリペプチドであれ
ば、１本のポリペプチドとして細胞内で発現し、その
後、糖鎖で修飾されるなどのプロセッシングを受けて細
胞内に蓄積された。発現ベクターを構築するためのＭＫ
ＣＮＳ５領域に相当するＤＮＡの改変はＰＣＲ法を用い
た。この時、用いたプライマーとしては次に示す合成Ｄ
ＮＡを使用した。
【０２１７】５′プライマー用の塩基配列は ＭＫＣＮＳ５ー１；５′ＧＣＧＣＴＡＧＣＡＴＧＧＧＧ
ＴＡＣＡＡＧＧＧＧＧＴＴＴＧＧＣＧＧＧ ３′（配列
番号：１８５） である。また、３′プライマー用の塩基配列は ＭＫＣＮＳ５ー２；５′ＧＣＧＣＴＡＧＣＴＣＡＴＣＧ
ＧＴＴＧＧＧＧＡＧＣＡＧＧＴＡＧＡＴ ３′（配列番
号：１８６） である。これらのプライマーは該遺伝子の両端にＮｈｅ
Ｉサイトが導入されるように設計されたものである。も
ちろん、以下に示すトランスファーベクターｐＢｌｕｅ
Ｂａｃ（インビトロジェン社）のＮｈｅＩサイトに該遺
伝子を導入するためである。他の昆虫細胞発現用トラン
スファーベクターに導入する場合は、そのベクターに合
った制限酵素サイトを該遺伝子断片に導入すれば、同様
にして行える。これら２つの合成ＤＮＡを２０ｐｍｏｌ
／μｌに調製した。ＰＣＲの反応溶液の調製と後処理は
〔１〕と同様に行われた。ただ、テンプレートＤＮＡに
はプラスミドｐＵＣ１５３０Ｕ ２０ｎｇ、プライマー
にはＭＫＣＮＳ５ー１とＭＫＣＮＳ５ー２の組み合せが
使用された。ＰＣＲのサイクルは９５℃１分、５０℃１
分、７２℃５分であり、これを１０回繰返した後、９５
℃１分、６５℃１分、７２℃５分を２０回繰返し、目的
の長さ３０１３ｂｐのＤＮＡ断片を得た。
【０２１８】該ＤＮＡ試料をＮｈｅＩで切断後、目的の
長さであるＤＮＡ断片をアクリルアミドゲルで分離し、
抽出した。さらに、トランスファーベクターｐＢｌｕｅ
Ｂａｃ（インビトロジェン社）のＮｈｅＩサイトに、常
法によりライゲーションしクローン化、該ＤＮＡ断片が
１つだけＮｈｅＩサイトに挿入されているクローンをス
クリーニングをして、プライマーＭＫＣＮＳ５−１とＭ
ＫＣＮＳ５−２から得られた該ＤＮＡ断片由来のプラス
ミドｐＢｌｕｅＭＫＣＮＳ５を得た。これら該プラスミ
ドの発現ユニットはインビトロジェン社のプロトコール
に示されているものを参考にすると、ポリヘドリンプロ
モーター下流のクローニングサイトＮｈｅＩ切断部位に
ＨＣＶ遺伝子由来のＤＮＡ断片が順方向に連結した構造
を持っていた。 実施例２５ クローンＮＳ５Ｎ、クローンＭＫＣＮＳ４
ｂＮＳ５にコードされるＨＣＶ由来ポリペプチドの大腸
菌内での発現 該クローンにおいてコードされるポリペプチドはＣ型肝
炎患者血清由来ｃＤＮＡにコードされるポリペプチドの
１部であり、これをそのまま大腸菌内で発現させた。以
下に示すように発現ベクターとしてはｐＣＺ４４（特開
平１−１２４３８７号公報）が使用され、該クローンの
ｃＤＮＡをｐＣＺ４４にサブクローン化することから行
われた。
【０２１９】まず、実施例２４で得られたクローンＮＳ
５Ｎの配列を持つＤＮＡ断片がＨｉｎｄＩＩＩ 、Ｂｇ
ｌＩＩにより充分に切断され、フェノール／クロロホル
ム処理、エタノール沈殿させ、両末端が各々ＨｉｎｄＩ
ＩＩ 、ＢｇｌＩＩサイトの突出末端となった該ｃＤＮ
Ａをを持つＤＮＡ断片をアクリルアミドゲルで分離し、
抽出された。同様に、発現ベクターｐＣＺ４４もＨｉｎ
ｄＩＩＩ 、ＢｇｌＩＩにより充分に切断され、発現ベ
クター能を持つ長い方のＤＮＡ断片を前述同様に調製
し、これに該クローンから用意されたＨｉｎｄＩＩＩ
、ＢｇｌＩＩ断片を１つ持つように連結され、さらに
常法に従いクローニングされた。得られたプラスミドは
それぞれのクローンＮＳ５Ｎ由来のプラスミドｐＣＺＮ
Ｓ５Ｎと名付けられた。また、別の試みとしてｐＣＺ４
４のかわりに融合蛋白質を発現できる発現ベクターｐＧ
ＥＸ−２Ｔ（ファルマシア社製）を用いて発現ベクター
を構築した。この場合、基本的にファルマシア社の説明
書に従って操作を行った。まず、発現ベクターｐＧＥＸ
−２ＴをＢａｍＨＩ、ＥｃｏＲＩで切断後、 Ｈｉｎｄ
ＩＩＩ リンカーを挿入し該クローンのアミノ酸とコド
ンの読み枠が合うようにして、３′側のＥｃｏＲＩサイ
トと５′側の（リンカーで作った）ＨｉｎｄＩＩＩサイ
トに該クローンのＤＮＡ断片から用意されたＤＮＡ断片
を挿入した。
【０２２０】例えば次に記す領域、配列番号７５に記載
のアミノ酸配列のうち３０６番目〜１１６８番目までの
８６３個のアミノ酸配列からなるＨＣＶ由来ポリペプチ
ド（ＭＫＣＮＳ４ｂＮＳ５と呼ぶ、さらにこのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ断片をクローンＭＫＣＮＳ４ｂ
ＮＳ５とした。）を大腸菌内で発現させる。該領域はＨ
ＣＶ患者の血清と免疫的に高率に反応するＨＣＶ由来抗
原蛋白質であると思われる。該領域を発現するため、ｐ
ＣＺ４４を用いた方法と同様にして発現ベクターを構築
してもよいが、ここではＧＳＴ（β−グルタチオンーＳ
ートランスフェラーゼとつなげて融合蛋白質として発現
させた。プラスミドｐＵＣ２２１８ ２μｇをＨｉｎｄ
ＩＩＩ 、ＰｖｕＩＩ、ＳｓｐＩで完全に切断後、クロ
ーン２２１８由来の領域を含むＤＮＡ断片の方をアガロ
ースゲルで分離・抽出され、約２００ｎｇ得た。これを
平滑末端化しておいてＤＮＡ断片２２１８（Ｈｉｎ／Ｐ
ｖｕ／Ｔ４）から、ｐＧＥＸＨ１０のＨｉｎｄＩＩＩサ
イトに挿入した。則ち、ｐＧＥＸＨ１０とは、ｐＧＥＸ
−２ＴのＢａｍＨＩサイトとＥｃｏＲＩサイトにかけて
の塩基配列が ５’ ＧＧＡＴＣＣＣＣＣＣＡＡＧＣＴＴＧＧＧＧＧＡＡＴＴＣ ３’ ＢａｍＨＩ ＨｉｎｄＩＩＩ ＥｃｏＲＩ （配列番号：１８７） のようになっている。ｐＧＥＸＨ１０ １μｇをＨｉｎ
ｄＩＩＩで完全に切断後、平滑末端化し、このｐＧＥＸ
Ｈ１０由来ＤＮＡ断片２０ｎｇとＤＮＡ断片２２１８
（Ｈｉｎ／Ｐｖｕ／Ｔ４）５０μｇとライゲーション反
応させ、常法により形質転換、クローン化し、ＧＳＴ側
にＤＮＡ断片２２１８（Ｈｉｎ／Ｐｖｕ／Ｔ４）のＮ２
２領域にあたる部位にくるように構築されたプラスミド
ｐＧＥＸ２２１８を得ることができた。
【０２２１】プラスミドｐＣＺＮＳ５Ｎを保持している
大腸菌ＪＭ１０９株をＬ−Ｂｒｏｔｈ（モレキュラー・
クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）
１９８２ コールド・スプリング・ハーバー（Ｃｏｌｄ
Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ））にて、３７℃一晩培
養した。これを５０倍希釈となるように新しいＬ−Ｂｒ
ｏｔｈに植菌し、２から４時間、３０℃で振とう培養
後、ＩＰＴＧ（イソプロピル−β−Ｄ−ガラクトピラノ
シド）を２ｍＭになるように培地に加え、さらに３時間
以上培養した。このようにＩＰＴＧの存在下で菌を培養
させることにより、単一クローン由来（この場合、該プ
ラスミドのみで形質転換された大腸菌ＪＭ１０９株）の
組み換え体が、該クローンから誘導された該プラスミド
を用いて、ＨＣＶ由来ポリペプチドＮＳ５Ｎを発現する
ように誘導された。クローンＮＳ５Ｎ由来のｃＤＮＡで
コードされるポリペプチドの推定アミノ酸配列は、配列
表の配列番号７５に記載のアミノ酸配列のうち、１２４
６番目から１６９２番目までのアミノ酸配列である。ま
た、プラスミドｐＧＥＸ２２１８も同様にしてβ−グル
タチオン−Ｓ−トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）とポリペ
プチドＭＫＣＮＳ４ｂＮＳ５の融合タンパク質として発
現体を得ることができる。この場合、ファルマシア社の
説明書にあるとおりＧＳＴのＣ末端にスロンビンで特異
的に切断されるサイトを持ち、そのさらにＣ末端側にク
ローン２２１８の配列を含む（この場合、ｐＵＣ１９由
来の配列も少し持ち込んでいるが）ポリペプチドがつな
がっている。
【０２２２】該融合タンパク質を得るためには、プラス
ミドｐＣＺＮＳ５ＮからＨＣＶ由来該ポリペプチドを発
現するとき行う上記プロトコールと同様にＩＰＴＧの存
在下でプラスミドｐＧＥＸ２２１８で形質転換させた大
腸菌を培養させ、ＨＣＶ由来のタンパク質をＧＳＴのＣ
末端に持つ該融合タンパク質を発現するように誘導され
た。 実施例２６ ＭＫＣＮＳ５領域の昆虫細胞内での発現 実施例２４〔２〕で構築したプラスミドｐＢｌｕｅＭＫ
ＣＮＳ５にコードされているＨＣＶ由来の蛋白質を昆虫
細胞内で発現させるため、インビトロジェン社のバキュ
ロウイルス発現マニュアルであるマックスバック（ＭＡ
ＸＢＡＣTM ＢＡＣＵＬＯＶＩＲＵＳ ＥＸＰＲＥＳＳ
ＩＯＮ ＳＹＳＴＥＭ ＭＡＮＵＡＬＶＥＲＳＩＯＮ
１．４、以下これをマックスバックと呼ぶ。）に記載さ
れている方法を基本的に参考にして行った。実施例２４
〔２〕により作製された、トランスファーベクターｐＢ
ｌｕｅＢａｃ（マックスバック３７頁）の制限酵素Ｎｈ
ｅＩ切断部位にＨＣＶ遺伝子を含むＤＮＡ断片が挿入さ
れた該プラスミドをＭａｎｉａｔｉｓらの方法（「モレ
キュラ・クローニング」、コールド・スプリング・ハー
バー・ラボラトリー、８６頁〜９６頁（１９８２））に
従い組換え体の大腸菌から回収、精製しＨＣＶ遺伝子ト
ランスファープラスミドＤＮＡを大量に得た。マックス
バック２７ページの方法に従い、キットのＡｃＮＰＶ
ｖｉｒａｌ ＤＮＡ １μｇとＨＣＶ遺伝子由来のＤＮ
Ａ断片を含む、該プラスミドを２μｇを混合し、Ｓｆ９
細胞同時感染してＳｆ９細胞を形質転換した。
【０２２３】すなわち、まず直径６ｃｍのシャーレの中
でＦＣＳ（牛胎児血清）が１０％入ったＴＭＮ−ＦＨ培
地（インビトロジェン社製）中でＳｆ９細胞を２×１０
6 ／枚になるまで培養した。次にシャーレからＴＭＮ−
ＦＨ培地を除きそこに０．７５ｍｌのＦＣＳが１０％入
ったグレース（Ｇｒａｃｅ）培地（ギブコ（ＧＩＢＣ
Ｏ）社製）を加えた。先述の混合ＤＮＡに、キットに付
属のトランスフェクションバッファーを０．７５ｍｌ加
えボルテックスでよく攪拌後、グレース（Ｇｒａｃｅ）
培地上からＤＮＡ溶液をゆっくりと滴加した。２７℃４
時間静置し、その後Ｇｒａｃｅ培地を除きＦＣＳが１０
％入ったＴＭＮ−ＦＨ培地３ｍｌをシャーレに入れて２
７℃６日間培養した。３日目には幾つかの細胞中に多角
体が観察され、６日目にほとんどの細胞が多角体を形成
していた。この培養上清を遠心チューブに取り、１，０
００ｒｐｍ、１０分間遠心した上清を同時感染ウイルス
液とした。
【０２２４】この同時感染ウイルス液には１ｍｌあたり
１０8 個のウイルスが含まれており、またそのうちの約
０．５％が組換え体である。組換えウイルスを単離する
ためにプラーク単離法を用いた。その方法は以下の通り
である。同時感染ウイルス液を１０-4、１０-5に希釈し
た。予め６ｃｍシャーレに１枚当り１．５×１０6 個の
細胞をまき、吸着させたものを用意し、培地を完全に除
いた後、１０-4液、１０-5液を一枚のシャーレあたりそ
れぞれ１００μｌずつ加えた。細胞の乾燥を防ぐため、
シャーレを１５分おきに傾けてウイルス液が全面に行き
渡るようにした。このようにして室温で１時間感染させ
ている間に２．５％バキュロウイルスアガロース（ｂａ
ｃｕｌｏｖｉｒｕｓ ａｇａｒｏｓｅ）（インビトロジ
ェン（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）社製）を１０５℃、１０
分間オートクレーブし、４６℃で暖めておいた１０％Ｆ
ＣＳを含むＴＭＮ−ＦＨ培地と１対３の比率で混合し、
４６℃で保温しておいた。この保温された培地に対して
最終濃度１５０μｇ／μｌになるように５−ブロモ−４
−クロロ−３−インドリル−β−Ｄ−ガラクトシドを加
え（マックスバックの１６−１７ページに従った。）こ
の培地をアガロース含有ｘ−ｇａｌ培地と呼ぶこととし
た。
【０２２５】感染終了後、ウイルス液を完全に吸い取
り、保温されたアガロース含有ｘ−ｇａｌ培地を細胞が
はがれないようにシャーレ１枚あたり４ｍｌずつ静かに
加えた。アガロースが固化して乾燥するまでシャーレの
蓋を少しずらした状態で静置し、その後蓋をして裏返し
た状態で２７℃でインキュベーションした。６日間培養
した後、位相差顕微鏡で多角体の形成していない青いプ
ラークを見いだした。この組換えプラークをパスツール
ピペットでアガロースごと吸い取り、１ｍｌのＴＭＮ−
ＦＨ培地中で何回もピペッテイングしてウイルスを浮遊
させた。これら一連の操作（感染させてから、６日間培
養し該トランスファープラスミドＤＮＡを持つウイルス
を単離する操作）をプラーク法と呼ぶ。該ウイルス浮遊
液１００μｌをとり同様のプラーク法を行った。これら
一連の操作を３回繰り返して野性株の混入のないＨＣＶ
由来糖タンパク質遺伝子を持つ組換えウイルスを得た。
該ウイルスプラークをパスツールピペットで吸い取り、
１ｍｌのＴＭＮ−ＦＨ培地によく混和した。この初代組
換えウイルス液はウイルス濃度が低いため、そのうち１
００μｌを取り、６ｃｍシャーレにハーフコンフルエン
トに培養したＳｆ９細胞に吸着後１０％ＦＣＳを含むＴ
ＭＮ−ＦＨ培地４ｍｌを加え、３日後に培養上清を回収
してこれを感染用組換えウイルス液とした。ＨＣＶ由来
糖タンパク質を産出させるために予め５×１０6 個のＳ
ｆ９細胞を１０％ＦＣＳを含むＴＭＮ−ＦＨ培地１０ｍ
ｌに懸濁して９ｃｍシャーレに撒き、１時間吸着させ
た。シャーレから培地を取り除き、感染用組換えウイル
ス液を２５０μｌ加え、全体に行き渡らせたのち１０％
ＦＣＳを含むＴＭＮ−ＦＨ培地１０ｍｌを加え２７℃で
４日間静置した。この細胞をかきあつめ生理食塩水リン
酸バッファー１，０００ｍｌによくサスペンジョンし
た。
【０２２６】このようにして、該ウイルスに感染された
Ｓｆ９細胞内にＨＣＶ由来糖タンパク質を発現させた。 実施例２７ 発現された生成物のＨＣＶ由来抗原とし
ての同定 Ｃ型肝炎ウイルスに感染したヒトの血清が、実施例２
５、２６で発現された該ポリペプチドと免疫学的に反応
するので、該ポリペプチドはＣ型肝炎関連抗原として同
定された。この同定は、以下に示すウエスタンブロッテ
ィング法により行った。まず、例えば、実施例２５で記
述したｐＣＺＮＳ５Ｎ、ｐＧＥＸ２２１８で形質転換さ
れた大腸菌をＩＰＴＧ存在下で実施例２５のように３時
間あるいは一昼夜培養することにより該ポリペプチドを
発現するよう誘導した。この培養液１，０００μｌを
６，５００ｒ．ｐ．ｍ．で１０分間遠心分離させること
により、組み換え体株を集菌した。この沈澱をＳＤＳ−
ポリアクリルアミドゲル電気泳動用試料処理液（２％Ｓ
ＤＳ、５％メルカプトエタノール、１０％グリセリン及
び０．００５％ブロモフェノールブルーを含む５０ｍＭ
トリス塩酸緩衝液、ｐＨ６．８）に最終量が０．２ｍｌ
になるように溶解され調製された。次に、これらの試料
を１００℃、１０分間煮沸した。 このようにして得ら
れた試料１０μｌを、０．１％ＳＤＳ−１５．０％ポリ
アクリルアミドゲル（７０×８５×１ｍｍ）に添加し
た。その際、マーカータンパク質としてＰｈａｒｍａｃ
ｉａ社製「ＬＭＷ ＫｉｔＥ」（低分子量マーカータン
パク質）を使用した。電極液としてトリス緩衝液（２５
ｍＭ トリス ｐＨ８．３、１９２ｍＭ グリシン、
０．１％ＳＤＳ）を用い、３０ｍＡの定電流で４５分間
泳動後、常法に従い該ゲルをＳ＆Ｓ社製ニトロセルロー
ルフィルター（ＢＡ−８３）と重ね、ゲル側を陰極と
し、ニトロセルロースフィルター側を陽極として、１２
０ｍＡの定電流を約２０分間流して転写させた。
【０２２７】転写されたニトロセルロースフィルター
は、マーカータンパク質部分と試料部分を分けるように
切り取られ、マーカータンパク質部分のフィルターを
０．１％（Ｗ／Ｖ）アミドブラック１０Ｂで染色し、ま
た、試料部分のフィルターを、５％（Ｗ／Ｖ）ウシ血清
アルブミンを含む０．０１Ｍリン酸生理食塩水（ＰＢ
Ｓ）ｐＨ７．４に浸した。次に、５％（Ｗ／Ｖ）ウシ血
清アルブミンを含む０．０１Ｍリン酸生理食塩水（ＰＢ
Ｓ）ｐＨ７．４で５０倍に希釈されたＣ型肝炎患者血清
１０ｍｌを試料部分のフィルターの上にのせ、室温で２
時間静置後０．１％（Ｖ／Ｖ）Ｓｉｇｍａ社製Ｔｗｅｅ
ｎ２０をふくむＰＢＳで２０分ずつ３回洗浄した。次
に、試料部分のフィルターの上にＰＢＳで１，０００倍
に希釈されたパーオキシダーゼ標識抗ヒトＩｇＧ（Ｇａ
ｐｐｅｌ社製）１０ｍｌをのせ、３７℃１時間反応さ
せ、０．１％（Ｖ／Ｖ）Ｔｗｅｅｎ２０を含むＰＢＳで
２０分ずつ３回洗浄した。次に、試料部分のフィルター
１００ｍｌのパーオキシダーゼ発色液（６０ｍｇ４−ク
ロロ−１−ナフトール、２０ｍｌメタノール、ＰＢＳ８
０ｍｌ、過酸化水素２０μｌ）に浸した。発色したフィ
ルターは、蒸留水で洗浄後、上記マーカータンパク質部
分と比較した。これで発色された蛋白質は、プラスミド
ｐＣＺＮＳ５ＮやｐＧＥＸ２２１８から発現されたいず
れの蛋白質でも導入したＨＣＶ遺伝子由来産物として妥
当な分子量でありＣ型肝炎関連抗原としても同定でき
た。プラスミドｐＧＥＸ２２１８はｐＧＥＸ由来であり
発現産物は、ＨＣＶ由来のポリペプチドのＮ末端にＧＳ
Ｔとスロンビンの切断サイトが付与したものである。
【０２２８】実施例２８ クローンＴ７Ｎ１−２５を得
る方法 〔１〕クローン１９２５を得る方法 実施例１１〔１〕で得たクローンＮ１９ＭＸ２４Ａ−１
およびクローンＭＸ２５−１のオーバーラップする領域
を利用してＰＣＲ反応によって連結する。クローンクロ
ーンＮ１９ＭＸ２４Ａ−１およびクローンＭＸ２５−１
の塩基配列を持つ該ＤＮＡ断片（９７７塩基対と８４９
塩基対）を、それぞれ１μｌ（約０．５から１μｇ/μ
ｌ)ずつ、１０ｘＰＣＲ緩衝液（１００ｍＭ Ｔｒｉｓ
−ＨＣｌ（ｐＨ８．３），５００ｍＭ ＫＣｌ，１５ｍ
Ｍ ＭｇＣｌ2 ，１％ゼラチン）１０μｌ、２．５ｍＭ
４ｄＮＴＰ ８μｌ、合成プライマーＭＳ１２２とＭ
Ｓ１５２（ともに２０ｐｍｏｌ／μｌ）をそれぞれ５μ
ｌ、水７６．５μｌの反応溶液に入れた。よく混合後、
まず９５℃に５分間保温後、０℃に急冷した。１分後、
Ｔａｑ ＤＮＡポリメラーゼ（７ユニット／μｌ、Ａｍ
ｐｌｉＴａｑTM宝酒造）０．５μｌを加え混和後、ミネ
ラルオイルで重層した。このサンプルを、パーキン エ
ルマー シータス社製のＤＮＡ Ｔｈｅｒｍａｌ Ｃｙ
ｃｌｅｒで９５℃１分、３７℃１分、７２℃５分で１０
回処理した。次に９７℃に２分間保温後、０℃に急冷し
２分間保温した。さらに反応水溶液にＴａｑ ＤＮＡポ
リメラーゼ（７ユニット／μｌ、ＡｍｐｌｉＴａｑTM宝
酒造）０．５μｌを加え同様にして９５℃１分、５５℃
１分、７２℃５分で１５回処理した。最後に７２℃で７
分保温した後、この反応水溶液をフェノール／クロロホ
ルム処理、エタノール沈殿させた。２種類の該ＤＮＡ断
片はＰＣＲ反応により連結され、増幅もされた。連結さ
れたＤＮＡサンプルは、アガロース電気泳動によって分
離され（モレキュラー・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌ
ａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２ コールド・スプリン
グ・ハーバー（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏ
ｒ））、約１０００塩基対の長さを持つＤＮＡ断片はゲ
ルから切り出された（モレキュラー・クローニング（Ｍ
ｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ）１９８２ コール
ド・スプリング・ハーバー（ＣｏｌｄＳｐｒｉｎｇ Ｈ
ａｒｂｏｒ））。得られたＤＮＡ断片は実施例３と同様
に処理してｐＵＣ１９クローニングベクターのマルチク
ローニングサイト内にあるＳｍａＩサイトに組み込ん
だ。これをクローン化しスクリーニングして（この方法
は、実施例３と同様である。）プラスミドｐＵＣ１９２
５を得た。これで得られたＣ型肝炎患者血清由来クロー
ンをクローン１９２５と名付けた。
【０２２９】〔２〕クローンＴ７Ｎ１１９を得る方法 ｐＵＣＮ１−１はＣ型肝炎患者血清由来ｃＤＮＡクロー
ンＮ１−１がプラスミドｐＵＣ１９のＳｍａＩサイトに
入っていて、その挿入向きはＨＣＶ遺伝子の翻訳方向で
５’側にプラスミドｐＵＣ１９のＨｉｎｄＩＩＩサイト
を持っている。このプラスミドｐＵＣＮ１−１をＨｉｎ
ｄＩＩＩとＮｃｏＩで完全に切断し、ベクター機能を持
つ大きい方のＤＮＡ断片ｐＵＣＮ１ＨＮを切り出した。
該ＤＮＡ断片１０ｎｇと以下に示す合成ＤＮＡをライゲ
ーションさせた。 ＭＳ１６８ ＡＧＣＴＴＡＣＴＡＧＴＴＡＡＴＡＣＧＡ
ＣＴＣＡＣＴＡＴＡＧＧＧ（３１塩基、配列番号：１８
８） ＭＳ１６９ ＣＴＧＧＣＡＣＣＣＴＡＴＡＧＴＧＡＧＴ
ＣＧＴＡＴＴＡＡＣＴＡＧＴＡ（３３塩基、配列番号：
１８９） ＭＳ１７０ ＴＧＣＣＡＧＣＣＣＣＣＴＧＡＴＧＧＧＧ
ＧＣＧＡＣＡＣＴＣＣＡＣＣＡＴＡＧＡＴＣＡＣＴＣＣ
（４４塩基、配列番号：１９０） ＭＳ１７１ ＴＣＡＣＡＧＧＧＧＡＧＴＧＡＴＣＴＡＴ
ＧＧＴＧＧＡＧＴＧＴＣＧＣＣＣＣＣＡＴＣＡＧＧＧＧ
Ｇ（４５塩基、配列番号：１９１） ＭＳ１７２ ＣＣＴＧＴＧＡＧＧＡＡＣＴＡＣＴＧＴＣ
ＴＴＣＡＣＧＣＡＧＡＡＡＧＣＧＴＣＴＡＧＣ（４０塩
基、配列番号：１９２） ＭＳ１７３ ＣＡＴＧＧＣＴＡＧＡＣＧＣＴＴＴＣＴＧ
ＣＧＴＧＡＡＧＡＣＡＧＴＡＧＴＴＣＣ（３７塩基、配
列番号：１９３） （これらの配列は５’側から順に３’側まで記してい
る。）
【０２３０】すなわち、ＭＳ１６８とＭＳ１７３以外を
５’側に燐酸をカイネーションさせ、カイネーションさ
れたＭＳ１６９、ＭＳ１７０、ＭＳ１７１、ＭＳ１７２
をそれぞれ１００ｐｍｏｌ、ＭＳ１６８，ＭＳ１７３を
２０ｐｍｏｌずつ加え、Ｔ４ＤＮＡライゲースで常法に
より連結させ、フェノール処理、エタノール沈殿させ
る。得られたＤＮＡサンプルの４分の１量をｐＵＣＮ１
ＨＮ１０ｎｇと連結反応させ、クローンＮ１−１の５’
側に、ＨｉｎｄＩＩＩサイト、ＳｐｅＩサイト、Ｔ７Ｒ
ＮＡポリメラーゼのプロモーター配列、ＨＣＶ遺伝子の
５’非翻訳配列、ＨＣＶのコア蛋白Ｎ末端側領域の遺伝
子をコードするＤＮＡ断片の順に構成されたプラスミド
ｐＵＣＴ７Ｎ１を得た。このプラスミドｐＵＣＴ７Ｎ１
はＨｉｎｄＩＩＩサイトとＳｍａＩサイトの間にクロー
ンＴ７Ｎ１を持つ。このプラスミドｐＵＣＴ７Ｎ１をク
ローンＮ１−１を持つｐＵＣＮ１−１の代わりに用いる
ことにより、実施例４〔２〕と全く同じ作成方法でクロ
ーンＴ７Ｎ１Ｎ３Ｎ１０を得た。このクローンＴ７Ｎ１
Ｎ３Ｎ１０と実施例１１〔２〕で得られたクローンＮ２
７Ｎ１９−１がオーバーラップする領域を重複すること
なしに連結させるため、両方に共通で、かつ、１つしか
ない制限酵素切断部位がオーバーラップするところにあ
ることを利用した。
【０２３１】即ち、制限酵素ＢａｍＨＩによってクロー
ンＮ１Ｎ３Ｎ１０は、１３３２番目のＧの３′側で切断
され、クローンＮ２７Ｎ１９−１は３番目のＧの３′で
切断される。また、プラスミドｐＵＣＮ１Ｎ３Ｎ１０、
ｐＵＣＮ２７Ｎ１９−１ともに該ＤＮＡ断片がＨＣＶ遺
伝子の翻訳方向の上で同じ向きに入っていることを考慮
し（ＨＣＶ遺伝子上で５’側にｐＵＣ１９のＨｉｎｄＩ
ＩＩがある） 、ｐＵＣＮ２７Ｎ１９−１をＥｃｏＲＩ
、ＢａｍＨＩで、クローンＮ２７Ｎ１９−１の５’側
を含むＤＮＡ断片（このＤＮＡ断片は、Ｃ型肝炎患者血
清由来ｃＤＮＡのクローンＮ２７Ｎ１９−１の３′側に
プラスミドｐＵＣ１９のＥｃｏＲＩサイトからＳｍａＩ
サイトまでのＤＮＡ断片を付加したものである）を切り
出し、ｐＵＣＮ１Ｎ３Ｎ１０のＥｃｏＲＩ 、ＢａｍＨ
Ｉで切り出されるベクター機能を含むＤＮＡ断片と連結
させ、クローン化しスクリーニングすることによりプラ
スミドｐＵＣＮ１１９を得ることができた。このプラス
ミドは５’側から順にＨｉｎｄＩＩＩサイト、ＳｐｅＩ
サイト、Ｔ７ＲＮＡポリメラーゼのプロモーター配列、
ＨＣＶ遺伝子の５’非翻訳配列の１部、クローンＮ１−
１、Ｎ３−１、Ｎ１０−１、Ｎ２７−３、Ｎ１９−１が
オーバーラップすることなく連結されたクローンＴ７Ｎ
１１９を保有していた。
【０２３２】〔３〕クローンＴ７Ｎ１−２５を得る方法 オーバーラップする〔１〕で得たクローン１９２５と
〔２〕クローンＴ７Ｎ１１９を重複することなしに連結
させるため、両方に共通で、かつ、１つしかない制限酵
素切断部位がオーバーラップするところにあることを利
用した。即ち、制限酵素ＰｖｕＩによってクローンＴ７
Ｎ１１９は、Ｎ１９領域内のクローンＮ１９ー１の塩基
配列で２８８番目のＴ（配列表の配列番号１６）の３′
側１カ所のみで切断され、クローン１９２５も２８８番
目のＴの３′１カ所のみで切断される。また、プラスミ
ドｐＵＣＴ７Ｎ１１９とｐＵＣ１９２５は、ともに該Ｄ
ＮＡ断片が同じ向きに入っていることを考慮して、ｐＵ
Ｃ１９２５をＰｖｕＩとＥｃｏＲＩで、ＨＣＶ由来遺伝
子をコードしているＤＮＡ断片（このＤＮＡ断片は、Ｃ
型肝炎患者血清由来ｃＤＮＡの３’側にプラスミドｐＵ
Ｃ１９のＥｃｏＲＩサイトからＳｍａＩサイトまでのＤ
ＮＡ断片を付加したものである）を切り出し、ｐＵＣＴ
７Ｎ１１９のＰｖｕＩサイトとＥｃｏＲＩサイトの間に
あるＮ１９領域の３’部を含む領域と入れ換え、クロー
ン化しスクリーニングすることによりプラスミドｐＵＣ
Ｔ７Ｎ１−２５を得ることができた。このプラスミドは
Ｎ１９領域がオーバーラップすることなくクローンＴ７
Ｎ１１９とクローン１９２５が、制限酵素サイトＰｖｕ
Ｉによって連結されたクローンＴ７Ｎ１−２５を保有し
ていた。
【０２３３】実施例２９ クローンＴ７Ｎ１−３０Ｕを
得る方法 〔１〕クローン１５３０ＵＮｏｔを得る方法 実施例２３〔５〕で得たクローン１５３０ＵのＨｉｎｄ
ＩＩＩサイトはＨＣＶ由来のｃＤＮＡ配列のすぐ３’側
にあるが、このＨｉｎｄＩＩＩサイトにＮｏｔＩサイト
を導入するため、ｐＵＣ１５３０ＵをＨｉｎｄＩＩＩで
完全に切断した後、常法によりＴ４ＤＮＡポリメラーゼ
で平滑末端化し、該ＤＮＡ断片を１０ｎｇとＥｃｏＲＩ
−ＮｏｔＩ−ＢａｍＨＩアダプター（宝酒造社製）を１
００倍モル加え、常法によりＴ４ＤＮＡライゲースで連
結された。フェノール処理、エタノール沈殿を行った
後、さらにＮｏｔＩで切断後、連結反応を行った。クロ
ーン化しスクリーニングすることによりプラスミドｐＵ
Ｃ１５３０ＵＮｏｔを得ることができた。 〔２〕クローンＴ７Ｎ１−３０Ｕを得る方法 オーバーラップする、実施例２８で得たクローンＴ７Ｎ
１−２５と実施例１７〔４〕で得たクローンＭＸ２５Ｎ
１５−１と本実施例の〔１〕で得たクローン１５３０Ｕ
Ｎｏｔを重複することなしに連結させるため、両方に共
通で、かつ、１つしかない制限酵素切断部位がオーバー
ラップするところにあることを利用した。
【０２３４】すなわち、ｐＵＣＴ７Ｎ１−２５を制限酵
素ＳｐｅＩとＰｓｔＩで切断し、クローンＴ７Ｎ１−２
５の大部分を含むＤＮＡ断片Ｔ７Ｎ１−２５ＳＰを常法
によりゲルより切り出して約１μｇを得た。次に、ｐＵ
ＣＭＸ２５Ｎ１５−１を制限酵素ＰｓｔＩとＥｃｏＴ２
２Ｉで切断し、クローンＭＸ２５Ｎ１５−１の大部分を
含むＤＮＡ断片ＭＸ２５Ｎ１５−１ＰＥを常法によりゲ
ルより切り出して約１μｇを得た。最後に、ｐＵＣ１５
３０ＵＮｏｔを制限酵素ＥｃｏＴ２２ＩとＮｏｔＩで切
断し、クローン１５３０Ｕの大部分を含むＤＮＡ断片１
５３０ＵＥＮを常法によりゲルより切り出して約１μｇ
を得た。上記３つのＤＮＡ断片（Ｔ７Ｎ１−２５ＳＰ、
ＭＸ２５Ｎ１５−１ＰＥ、１５３０ＵＥＮ）をそれぞれ
約２００ｎｇと制限酵素ＳｐｅＩとＮｏｔＩで切断され
たλＺａｐＩＩ（ストラテージーン（Ｓｔｒａｔａｇｅ
ｎｅ）社製）１μｇを添付のプロトコールに従って連結
反応された。さらにＧＩＧＡＰＡＣＫＩＩ ＰＡＣＫＩ
ＮＧ ＥＸＴＲＡＣＴＳ、ＧＯＬＤ（ストラテージーン
社製）を用いてパッケージングを行った。ライゲーショ
ンからタイターチェック、ラムダＤＮＡの増幅、単離、
パッケージングなど、全ての操作は添付のプロトコール
に従った。組換えλファージのスクリーニングは白いプ
ラークのファージを２０個単離し、ヘルパーファージを
用いてプラスミドｐＢＬＵＥＳＣＲＩＰＴ ＳＫ（−）
にサブクローニングしてから挿入されたＤＮＡ断片につ
いて調べた。プラスミドｐＢＬＵＥＳＣＲＩＰＴ ＳＫ
（−）にサブクローニングされた２０種の内、２種のク
ローンがプラスミドｐＢＬＵＥＳＣＲＩＰＴ ＳＫ
（−）のＳｐｅＩサイトとＮｏｔＩサイトの間に、ＨＣ
Ｖ由来の３つＤＮＡ断片がＳｐｅＩサイト側からＴ７Ｎ
１−２５ＳＰ、ＭＸ２５Ｎ１５−１ＰＥ、１５３０ＵＥ
Ｎの順に１つずつ連結されていた。このプラスミドをｐ
Ｔ７Ｎ１−３０Ｕと名づけた。プラスミドｐＴ７Ｎ１−
３０ＵはＨＣＶ由来の３つＤＮＡ断片がオーバーラップ
することなく連結され、ＳｐｅＩサイトとＮｏｔＩサイ
トの間にクローンＴ７Ｎ１−３０Ｕを持っている。クロ
ーンＴ７Ｎ１−３０Ｕの塩基配列及びそれにコードされ
ているＨＣＶ由来ポリペプチドのアミノ酸配列を配列表
１０１に示す。
【０２３５】実施例３０ ポリペプチドＣＯＲＥとポリ
ペプチドＣ＋Ｎ２３の大量発現 〔１〕クローンＣＮ２３を得る方法 実施例１６で得たクローンＮ２３−１を持つｐＵＣＮ２
３−１を鋳型にしてＰＣＲ法を用いクローンＮ２３−１
の発現させる領域を作成した。まず、用いられたプライ
マーは、次に示す合成ＤＮＡを使用した。５′プライマ
ー用の塩基配列は ＭＳ１６５；５′ＧＣＡＡＧＣＴＴＡＴＧＣＴＧＣＴＧ
ＴＣＧＣＣＣＧＧＧＣＣＣＡＴＣＴ３′ （配列番号：
１９４） である。また、３′プライマー用の塩基配列は ＭＳ１６６；５′ＧＣＧＡＡＴＴＣＡＧＡＴＣＴＴＴＡ
ＴＣＡＴＧＴＧＴＴＧＣＡＧＴＣＧＡＴＣＡＣ ３′
（配列番号：１９５） である。これら２つの合成ＤＮＡを２０ｐｍｏｌ／μｌ
に調製した。このＰＣＲ反応は、Ｓａｉｋｉらの方法に
従い行った。この反応は最終容量が１００μｌになるよ
うにし、テンプレートＤＮＡとしてプラスミドｐＵＣＮ
２３ー１を１００ｎｇ用い、プライマーは上述のように
調製された溶液を５′，３′プライマー用ともに２μｌ
ずつ使用した。まず、調製された試料を９５℃に５分間
保温後、０℃に急冷した。１分後、Ｔａｑ ＤＮＡポリ
メラーゼ（７ユニット／μｌ、ＡｍｐｌｉＴａｑTM宝酒
造）０．５μｌを加え混和後、ミネラルオイルで重層し
た。このサンプルを、パーキン エルマー シータス社
製のＤＮＡ Ｔｈｅｒｍａｌ Ｃｙｃｌｅｒで９５℃１
分、５５℃１分、７２℃１分で８回処理した。さらに、
９５℃１分、６５℃１分、７２℃１分で１７回処理し
た。このサンプルを、常法によりフェノール／クロロホ
ルム処理、エタノール沈殿させ、該ＤＮＡ断片をＨｉｎ
ｄＩＩＩ、ＥｃｏＲＩで切断した後アクリルアミドゲル
で分離・抽出した。さらにクローニングベクターｐＵＣ
１９のＨｉｎｄＩＩＩ、ＥｃｏＲＩサイトに常法により
ライゲーションし、クローン化、スクリーニングをし
て、プラスミドｐＵＣＮ２３Ａを得て、その塩基配列を
決定した。この方法によって得られたクローンＮ２３Ａ
の塩基配列は、以下に示すＤＮＡ断片が配列表の配列番
号５０の１番目から９１５番目に示されるＤＮＡ断片の
５’側に付加していて ５′ＧＣＡＡＧＣＴＴＡＴＧ ３′ ３′ＣＧＴＴＣＧＡＡＴＡＣ ５′ （配列番号：１５
５） ５′末端にＨｉｎｄＩＩＩ サイトを持ち、続いて開始
コドンＡＴＧを保有している。また、３′末端には以下
に示すＤＮＡ断片が配列表の配列番号５０の１番目から
９１５番目に示されるＤＮＡ断片の３’側に付加してい
て、
【０２３６】 ５′ＴＧＡＴＡＡＡＧＡＴＣＴＧＡＡＴＴＣＧＣ ３′ ３′ＡＣＴＡＴＴＴＣＴＡＧＡＣＴＴＡＡＧＣＧ ５′
（配列番号：１９５） 最も３’側からＥｃｏＲＩサイトがあり、その内側にＢ
ｇｌＩＩサイト、続いて終止コドンを２つを保有してい
る。また、実施例６〔１〕で得られたｐＣＺＣＯＲＥを
制限酵素ＳａｃＩＩで切断し、常法によりＴ４ＤＮＡポ
リメラーゼで平滑末端化された。さらにＢｇｌＩＩで切
断し、ｐＣＺのベクター部とＨＣＶのコア蛋白のＮ末端
部を持つＤＮＡ断片ｐＣＺＣＯＲＥ／ＳＢをアクリルア
ミドゲルで分離・抽出して得た。同様にプラスミドｐＵ
ＣＮ２３Ａを制限酵素ＳｍａＩとＢｇｌＩＩで完全に切
断し、クローンＮ２３−１の配列をもつＤＮＡ断片の方
をアクリルアミドゲルで分離・抽出しＤＮＡ断片Ｎ２３
Ａ／ＳＢを得た。このＤＮＡ断片の５’端は、配列表の
配列番号５０の１０７番目のＧにあたり、そこから配列
番号５０の９１５番目のＡまでの配列を有し、その３’
側はストップコドン２つとＢｇｌＩＩサイトを持ってい
る。ＤＮＡ断片ｐＣＺＣＯＲＥ／ＳＢ １０ｎｇとＤＮ
Ａ断片Ｎ２３Ａ／ＳＢ １００ｎｇを常法によりＴ４Ｄ
ＮＡライゲースで連結され、プラスミドｐＣＺＣＮ２３
を得られた。該プラスミドは、ＨｉｎｄＩＩＩ サイト
からＢｇｌＩＩサイトの間に配列表の配列番号１０２に
示す塩基配列を持つクローンＣＮ２３を持っている。
【０２３７】〔２〕 発現ベクターの改良 発現ベクター内の発現ユニットを複数個にすることによ
り発現効率を上げるため、プラスミドｐＣＺＣＯＲＥ、
ｐＣＺＣＮ２３を制限酵素ＢａｍＨＩとＢｇｌＩＩで完
全に切断し、得られたＨＣＶ由来のポリペプチドをコー
ドするＤＮＡ断片ＣＯＲＥ／ＢＢとＣＮ２３／ＢＢを回
収した。該ＤＮＡ断片ＣＯＲＥ／ＢＢ １００ｎｇだけ
で常法によりＴ４ＤＮＡライゲースを用い、１２℃で３
０分間連結反応させた。フェノール処理、エタノール沈
殿を行い、制限酵素ＢａｍＨＩとＢｇｌＩＩで切断後、
ＢｇｌＩＩで完全に切断されアルカリフォスファターゼ
で常法により脱燐酸化されたプラスミドｐＣＺＣＯＲＥ
１０ｎｇと連結反応され、プラスミドｐＣＺＣＯＲＥ
のＢａｍＨＩサイトとＢｇｌＩＩサイトで挟まれるポリ
ペプチドＣＯＲＥの発現ユニットが順方向に２、３、
４、６、１２個がタンデムにつながっているプラスミド
ｐＣＺＣＯＲＥタンデム２、３、４、８、１６を得た。
同様にＤＮＡ断片ＣＮ２３／ＢＢとプラスミドｐＣＺＣ
Ｎ２３の組み合せにより、プラスミドｐＣＺＣＮ２３タ
ンデム２、３、４、６を得た。
【０２３８】〔３〕 ポリペプチドＣＯＲＥとポリペプ
チドＣＮ２３のダイレクト大量発現実施例６〔１〕で行
われたのと同様に本実施例〔２〕で得られた各発現ベク
ターを用いてポリペプチドＣＯＲＥとポリペプチドＣＮ
２３の大腸菌での発現を行った。 この場合、まずｐＣＺＣＯＲＥで形質転換させた系でイ
ンダクションをかける時期、ホストの種類、タンデム
数、培養温度などを検討した。例えば、ホストはＪＭ１
０９、ＤＨ５、ＫＳ４７６などＫ１２由来の株や、Ｂ株
由来の株を用いて行った。発現量はホストによってかな
り異なり、Ｂ株由来の株とＫＳ４７６が１番よく、ＤＨ
５とは約８から１０倍程度、培地あたりの発現量が異な
った。また、インダクションの時期も、時期によりかな
りの発現量の差があった。すなわち、１昼夜培養した組
換え体（ＯＤ600 ＝約１．５）を１０ｍｌ用Ｌ字管に１
０ｍｌのバクトペプトン培地（Ｄｉｆｃｏ社製；バクト
ペプトン２０ｇ／ｌ、グリセリン ０．２％ ｖ／ｖ、
０．１Ｍ ＭｇＳＯ4、ＮａＣｌ １０ｇ／ｌ、０．１
％ 塩酸チアミン １６０μｌ／ｌ、アンピシリン １
００ｍｇ／ｌ）に０．５ｍｌ加え、３０℃で培養する。
培養液の濁度がＯＤ600＝約０．５、約０．８、約１．
２、約２．０、約３．０の５点でＩＰＴＧを加えインダ
クションをかけた。その中で約ＯＤ600 ＝０．５にイン
ダクションをかけたものが１番発現量が多かった。さら
にタンデム数は、必ずしも多ければその分だけ発現量が
多いというわけでなく、発現ユニットであるＤＮＡ断片
ＣＯＲＥ／ＢＢのユニットを３つまでタンデムに持って
いても発現は少なく４つからいきなり増え始め８つと１
６つはほとんど飽和していてあまり変わらなかった。よ
って、まとめるとポリペプチドＣＯＲＥを大量に発現さ
せるためにはｐＣＺＣＯＲＥタンデム８で形質転換させ
た系でホストにＢ株由来の株かＫＳ４７６を用い、ＯＤ
600 ＝約０．５にインダクションをかけ３０℃で１昼夜
培養した。また、ポリペプチドＣＮ２３を発現させるた
めに作成したプラスミドｐＣＺＣＮ２３タンデム２、
３、４、６のうち、タンデム６のものを用い、後はｐＣ
ＺＣＯＲＥタンデム８と同じ条件で発現させた。
【０２３９】
【配列表】配列番号：１ 配列の長さ：４８３ 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：Ｎｏ 配列の種類：ｃＤＮＡ ｔｏ ｇｅｎｏｍｉｃ ＲＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 直接の起源 クローン名：Ｎ１−１ 配列 CTCCACCATA GATCACTCCC CTGTGAGGAA CTACTGTCTT CACGCAGAAA GCGTCTAGCC 60 ATGGCGTTAG TATGAGTGTC GTGCAGCCTC CAGGACCCCC CCTCCCGGGA GAGCCATAGT 120 GGTCTGCGGA ACCGGTGAGT ACACCGGAAT TGCCAGGACG ACCGGGTCCT TTCTTGGATC 180 AACCCGCTCA ATGCCTGGAG ATTTGGGCGT GCCCCCGCGA GACTGCTAGC CGAGTAGTGT 240 TGGGTCGCGA AAGGCCTTGT GGTACTGCCT GATAGGGTGC TTGCGAGTGC CCCGGGAGGT 300 CTCGTAGACC GTGCATC ATG AGC ACA AAT CCA AAA CCC CAA AGA AAA ATC 350 Met Ser Thr Asn Pro Lys Pro Gln Arg Lys Ile 1 5 10 AAA CGT AAC ACC AAC CGC CGC CCA CAG GAC GTT AAG TTC CCG GGC GGT 398 Lys Arg Asn Thr Asn Arg Arg Pro Gln Asp Val Lys Phe Pro Gly Gly 15 20 25 GGT CAG ATC GTT GGT GGA GTT TAC CTG TTG CCG CGC AGG GGC CCC AGG 446 Gly Gln Ile Val Gly Gly Val Tyr Leu Leu Pro Arg Arg Gly Pro Arg 30 35 40 TTG GGT GTG CGC GCG ACT AGG AAG ACT TCC GAG CGG T 483 Leu Gly Val Arg Ala Thr Arg Lys Thr Ser Glu Arg
【０２４０】配列番号：２ 配列の長さ：１８７ 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：Ｎｏ 配列の種類：ｃＤＮＡ ｔｏ ｇｅｎｏｍｉｃ ＲＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 直接の起源 クローン名：Ｎ２−１ 配列 AGGTCTCGTA GACCGTGCAT C ATG AGC ACA AAT CCA AAA CCC CAA AGA AAA 51 Met Ser Thr Asn Pro Lys Pro Gln Arg Lys 1 5 10 ACC AAA CGT AAC ACC AAC CGC CGC CCA CAG GAC GTC AAG TTC CCG GGC 99 Thr Lys Arg Asn Thr Asn Arg Arg Pro Gln Asp Val Lys Phe Pro Gly 15 20 25 GGT GGT CAG ATC GTT GGT GGA GTT TAC CTG TTG CCG CGC AGG GGC CCC 147 Gly Gly Gln Ile Val Gly Gly Val Tyr Leu Leu Pro Arg Arg Gly Pro 30 35 40 AGG TTG GGT GTG CGC GCG ACT AGG AAG ACT TCC GAG CGG T 187 Arg Leu Gly Val Arg Ala Thr Arg Lys Thr Ser Glu Arg 45 50 55
【０２４１】配列番号：３ 配列の長さ：５３１ 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ ｔｏ ｇｅｎｏｍｉｃ ＲＮＡ アンチセンス：Ｎｏ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 直接の起源 クローン名：Ｎ３−１ 配列 AGGTCTCGTA GACCGTGCAT C ATG AGC ACA AAT CCA AAA CCC CAA AGA AAA ACC 54 Met Ser Thr Asn Pro Lys Pro Gln Arg Lys Thr 1 5 10 AAA CGT AAC ACC AAC CGC CGC CCA CAG GAC GTC AAG TTC CCG GGC GGT 102 Lys Arg Asn Thr Asn Arg Arg Pro Gln Asp Val Lys Phe Pro Gly Gly 15 20 25 GGT CAG ATC GTT GGT GGA GTT TAC CTG TTG CCG CGC AGG GGC CCC AGG 150 Gly Gln Ile Val Gly Gly Val Tyr Leu Leu Pro Arg Arg Gly Pro Arg 30 35 40 TTG GGT GTG CGC GCG ACT AGG AAG ACT TCC GAG CGG CCG CAA CCT CGT 198 Leu Gly Val Arg Ala Thr Arg Lys Thr Ser Glu Arg Pro Gln Pro Arg 45 50 55 GGA AGG CGA CAA CCT ATC CCC AAG GCT CGC CAA CCC GAG GGT AGG GCC 246 Gly Arg Arg Gln Pro Ile Pro Lys Ala Arg Gln Pro Glu Gly Arg Ala 60 65 70 75 TGG GCT CAG CCC GGG TAC CCT TGG CCC CTC TAT GGC AAT GAG GGC TTG 294 Trp Ala Gln Pro Gly Tyr Pro Trp Pro Leu Tyr Gly Asn Glu Gly Leu 80 85 90 GGG TGG GCA GGA TGG CTC CTG TCA CCC CGC GGC TCC CGG CCT AGT TGG 342 Gly Trp Ala Gly Trp Leu Leu Ser Pro Arg Gly Ser Arg Pro Ser Trp 95 100 105 GGC CCC ACG GAC CCC CGG CGT AGG TCG CGT AAT TTG GGT AAG GTC ATC 390 Gly Pro Thr Asp Pro Arg Arg Arg Ser Arg Asn Leu Gly Lys Val Ile 110 115 120 GAT ACC CTC ACA TGC GGC TTC GCC GAC CTC ATG GGG TAC ATT CCG CTC 438 Asp Thr Leu Thr Cys Gly Phe Ala Asp Leu Met Gly Tyr Ile Pro Leu 125 130 135 GTC GGC GCC CCC CTA GGG GGC GCT GCC AGG GCT CTA GCG CAT GGC GTC 486 Val Gly Ala Pro Leu Gly Gly Ala Ala Arg Ala Leu Ala His Gly Val 140 145 150 155 CGG GTT CTG GAG GAC GGC GTG AAC TAC GCA ACA GGG AAC TTG CCC 531 Arg Val Leu Glu Asp Gly Val Asn Tyr Ala Thr Gly Asn Leu Pro 160 165 170
【０２４２】配列番号：４ 配列の長さ：７５５ 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ ｔｏ ｇｅｎｏｍｉｃ ＲＮＡ アンチセンス：Ｎｏ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 直接の起源 クローン名：Ｎ１０−１ 配列 C GTG AAC TAT GCA ACA GGG AAT CTG CCT GGT TGC TCC TTT TCT ATC TTC 49 Val Asn Tyr Ala Tyr Gly Asn Leu Pro Gly Cys Ser Phe Ser Ile Phe 1 5 10 15 CTT TTG GCT TTG CTG TCC TGT TTG ACC ATC CCA GCT TCC GCC TAC CAA 97 Leu Leu Ala Leu Leu Ser Cys Leu Thr Ile Pro Ala Ser Ala Tyr Gln 20 25 30 GTG CGC AAC GCG TCC GGG GTG TAC CAT GTC ACG AAC GAC TGC TCC AAC 145 Val Arg Asn Ala Ser Gly Val Tyr His Val Thr Asn Asp Cys Ser Asn 35 40 45 TCA AGT ATT GTG TAT GAG GCG GCG GAC GTG ATT ATG CAC ACC CCC GGG 193 Ser Ser Ila Val Thr Glu Ala Ala Asp Val Ile Met His Thr Pro Gly 50 55 60 TGC GTG CCC TGC GTC CGG GAG AAC AAT TCC TCC CGC TGC TGG GTA GCG 241 Cys Val Pro Cys Val Arg Glu Asn Asn Ser Ser Arg Cys Trp Val Ala 65 70 75 80 CTC ACT CCC ACG CTT GCG GCC AGG AAC AGC AGC ATC CCC ACT ACG ACA 289 Leu Thr Pro Thr Leu Ala Ala Arg Asn Ser Ser Ile Pro Thr Thr Thr 85 90 95 ATA CGG CGT CAT GTC GAC TTG CTC GTT GGG GCA GCT GTC CTC TGT TCC 337 Ile Arg Arg His Val Asp Leu Leu Val Gly Ala Ala Ala Leu Cys Ser 100 105 110 GCT ATG TAT GTG GGG GAT TTT TGC GGA TCT GTT TTC CTC GTC TCC CAG 385 Ala Met Tyr Val Gly Asp Phe Cys Gly Ser Val Phe Leu Val Ser Gln 115 120 125 CTG TTC ACT TTC TCA CCT CGC CGG TAT GAG ACG GTG CAA GAC TGC AAT 433 Leu Phe Thr Phe Ser Pro Arg Arg Tyr Glu Thr Val Gln Asp Cys Asn 130 135 140 TGC TCA ATC TAT CCC GGC CAT GTA TCA GGC CAT CGC ATG GCT TGG GAT 481 Cys Ser Ile Tyr Pro Gly His Val Ser Gly His Arg Met Ala Trp Asp 145 150 155 160 ATG ATA ATG AAT TGG TCA CCT ACA ACA GCC CTA GTG GTA TCG CAG CTA 529 Met Ile Met Asn Trp Ser Pro Thr Thr Ala Leu Val Val Ser Gln Leu 165 170 175 CTC CGG ATC CCA CAA GCC GTC GTG GAT ATG GTG GCG GGG GCC CAC TGG 577 Leu Arg Ile Pro Gln Ala Val Val Asp Met Val Ala Gly Ala His Trp 180 185 190 GGA GTC CTG GCG GGC CTT GCC TAC TAT TCC ATG GTG GGG AAC TGG GCT 625 Gly Val Leu Ala Gly Leu Ala Tyr Tyr Ser Met Val Gly Asn Trp Ala 195 200 205 AAG GTC TTG GTT GTG ATG CTG CTC TTC GCC GGT GTT GAC GGG GGG ACC 673 Lys Val Leu Val Val Met Leu Leu Phe Ala Gly Val Asp Gly Gly Thr 210 215 220 CAC GTG ACA GGG GGA AAG GTA GCC TAC ACC ACC CAG AGC TTT ACA TCC 721 His Val Thr Gly Gly Lys Val Ala Tyr Thr Thr Gln Ser Phe Thr Ser 225 230 235 240 TTC TTT TCA CGA GGG CCG TCT CAG AGA ATC CAG C Phe Phe Ser Arg Gly Pro Ser Gln Arg Ile Gln 245 250
【０２４３】配列番号：５ 配列の長さ：１２５８ 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ ｔｏ ｇｅｎｏｍｉｃ ＲＮＡ アンチセンス：Ｎｏ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 直接の起源 クローン名：Ｎ３Ｎ１０ 配列 AGGTCTCGTA GACCGTGCAT C ATG AGC ACA AAT CCA AAA CCC CAA AGA AAA ATC 54 Met Ser Thr Asn Pro Lys Pro Gln Arg Lys Ile 1 5 10 AAA CGT AAC ACC AAC CGC CGC CCA CAG GAC GTT AAG TTC CCG GGC GGT 102 Lys Arg Asn Thr Asn Arg Arg Pro Gln Asp Val Lys Phe Pro Gly Gly 15 20 25 GGT CAG ATC GTT GGT GGA GTT TAC CTG TTG CCG CGC AGG GGC CCC AGG 150 Gly Gln Ile Val Gly Gly Val Tyr Leu Leu Pro Arg Arg Gly Pro Arg 30 35 40 TTG GGT GTG CGC GCG ACT AGG AAG ACT TCC GAG CGG CCG CAA CCT CGT 198 Leu Gly Val Arg Ala Thr Arg Lys Thr Ser Glu Arg Pro Glu Pro Arg 45 50 55 GGA AGG CGA CAA CCT ATC CCC AAG GCT CGC CAA CCC GAG GGT AGG GCC 246 Gly Arg Arg Gln Pro Ile Pro Lys Ala Arg Gln Pro Glu Gly Arg Ala 60 65 70 75 TGG GCT CAG CCC GGG TAC CCT TGG CCC CTC TAT GGC AAT GAG GGC TTG 294 Trp Ala Gln Pro Gly Tyr Pro Trp Pro Leu Tyr Gly Asn Glu Gly Leu 80 85 90 GGG TGG GCA GGA TGG CTC CTG TCA CCC CGC GGC TCC CGG CCT AGT TGG 342 Gly Trp Ala Gly Trp Leu Leu Ser Pro Arg Gly Ser Arg Pro Ser Trp 95 100 105 GGC CCC ACG GAC CCC CGG CGT AGG TCG CGT AAT TTG GGT AAG GTC ATC 390 Gly Pro Thr Asp Pro Arg Arg Arg Ser Arg Asn Leu Gly Lys Val Ile 110 115 120 GAT ACC CTC ACA TGC GGC TTC GCC GAT CTC ATG GGG TAC ATT CCG CTC 438 Asp Thr Leu Thr Cys Gly Phe Ala Asp Leu Met Gly Tyr Ile Pro Leu 125 130 135 GTC GGC GCC CCC CTA GGG GGC GCT GCC AGG GCT CTA GCG CAT GGC GTC 486 Val Gly Ala Pro Leu Gly Gly Ala Ala Arg Ala Leu Ala His Gly Val 140 145 150 155 CGG GTT CTG GAG GAC GGC GTG AAC TAT GCA ACA GGG AAC CTG CCT GGT 534 Arg Val Leu Glu Asp Gly Val Asn Tyr Ala Thr Gly Asn Leu Pro Gly 160 165 170 TGC TCC TTT TCT ATC TTC CTT TTG GCT TTG CTG TCC TGT TTG ACC ATC 582 Cys Ser Phe Ser Ile Phe Leu Leu Ala Leu Leu Ser Cys Leu Thr Ile 175 180 185 CCA GCT TCC GCC TAC CAA GTG CGC AAC GCG TCC GGG GTG TAC CAT GTC 630 Pro Ala Ser Ala Tyr Gln Val Arg Asn Ala Ser Gly Val Tyr His Val 190 195 200 ACG AAC GAC TGC TCC AAC TCA AGT ATT GTG TAT GAG GCG GCG GAC GTG 678 Thr Asn Asp Cys Ser Asn Ser Ser Ile Val Tyr Glu Ala Ala Asp Val 205 210 215 ATT ATG CAC ACC CCC GGG TGC GTG CCC TGC GTC CGG GAG AAC AAT TCC 726 Ile Met His Thr Pro Gly Cys Val Pro Cys Val Arg Glu Asn Asn Ser 220 225 230 235 TCC CGC TGC TGG GTA GCG CTC ACT CCC ACG CTT GCG GCC AGG AAC AGC 774 Ser Arg Cys Trp Val Ala Leu Thr Pro Thr Leu Ala Ala Arg Asn Ser 240 245 250 AGC ATC CCC ACT ACG ACA ATA CGG CGT CAT GTC GAC TTG CTC GTT GGG 822 Ser Ile Pro Thr Thr Thr Ile Arg Arg His Val Asp Leu Leu Val Gly 255 260 265 GCA GCT GCT CTC TGT TCC GCT ATG TAT GTG GGG GAT TTT TGC GGA TCT 870 Ala Ala Ala Leu Cys Ser Ala Met Tyr Val Gly Asp Phe Cys Gly Ser 270 275 280 GTT TTC CTC GTC TCC CAG CTG TTC ACT TTC TCA CCT CGC CGG TAT GAG 918 Val Phe Leu Val Ser Gln Leu Phe Thr Phe Ser Pro Arg Arg Tyr Glu 285 290 295 ACG GTG CAA GAC TGC AAT TGC TCA ATC TAT CCC GGC CAT GTA TCA GGC 966 Thr Val Gln Asp Cys Asn Cys Ser Ile Tyr Pro Gly His Val Ser Gly 300 305 310 315 CAT CGC ATG GCT TGG GAT ATG ATA ATG AAT TGG TCA CCT ACA ACA GCC 1014 His Arg Met Ala Trp Asp Met Ile Met Asn Trp Ser Pro Thr Thr Ala 320 325 330 CTA GTG GTA TCG CAG CTA CTC CGG ATC CCA CAA GCC GTC GTG GAT ATG 1062 Leu Val Val Ser Gln Leu Leu Arg Ile Pro Gln Ala Val Val Asp Met 335 340 345 GTG GCG GGG GCC CAC TGG GGA GTC CTG GCG GGC CTT GCC TAC TAT TCC 1110 Val Ala Gly Ala His Trp Gly Val Leu Ala Gly Leu Ala Tyr Tyr Ser 350 355 360 ATG GTG GGG AAC TGG GCT AAG GTC TTG GTT GTG ATG CTG CTC TTC GCC 1158 Met Val Gly Asn Trp Ala Lys Val Leu Val Val Met Leu Leu Phe Ala 365 370 375 GGT GTT GAC GGG GGG ACC CAC GTG ACA GGG GGA AAG GTA GCC TAC ACC 1206 Gly Val Asp Gly Gly Thr His Val Thr Gly Gly Lys Val Ala Tyr Thr 380 385 390 395 ACC CAG AGC TTT ACA TCC TTC TTT TCA CGA GGG CCG TCT CAG AGA ATC 1254 Thr Gln Ser Phe Thr Ser Phe Phe Ser Arg Gly Pro Ser Gln Arg Ile 400 405 410 CAGC 1258 Gln
【０２４４】配列番号：６ 配列の長さ：１５５４ 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ ｔｏ ｇｅｎｏｍｉｃ ＲＮＡ アンチセンス：Ｎｏ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 直接の起源 クローン名：Ｎ１Ｎ３Ｎ１０ 配列 CTCCACCATA GATCACTCCC CTGTGAGGAA CTACTGTCTT CACGCAGAAA GCGTCTAGCC 60 ATGGCGTTAG TATGAGTGTC GTGCAGCCTC CAGGACCCCC CCTCCCGGGA GAGCCATAGT 120 GGTCTGCGGA ACCGGTGAGT ACACCGGAAT TGCCAGGACG ACCGGGTCCT TTCTTGGATC 180 AACCCGCTCA ATGCCTGGAG ATTTGGGCGT GCCCCCGCGA GACTGCTAGC CGAGTAGTGT 240 TGGGTCGCGA AAGGCCTTGT GGTACTGCCT GATAGGGTGC TTGCGAGTGC CCCGGGAGGT 300 CTCGTAGACC GTGCATC ATG AGC ACA AAT CCA AAA CCC CAA AGA AAA ATC 350 Met Ser Thr Asn Pro Lys Pro Gln Arg Lys Ile 1 5 10 AAA CGT AAC ACC AAC CGC CGC CCA CAG GAC GTT AAG TTC CCG GGC GGT 398 Lys Arg Asn Thr Asn Arg Arg Pro Gln Asp Val Lys Phe Pro Gly Gly 15 20 25 GGT CAG ATC GTT GGT GGA GTT TAC CTG TTG CCG CGC AGG GGC CCC AGG 446 Gly Gln Ile Val Gly Gly Val Tyr Leu Leu Pro Arg Arg Gly Pro Arg 30 35 40 TTG GTT GTG CGC GCG ACT AGG AAG ACT TCC GAG CGG CCG CAA CCT CGT 494 Leu Gly Val Arg Ala Thr Arg Lys Thr Ser Glu Arg Pro Gln Pro Arg 45 50 55 GGA AGG CGA CAA CCT ATC CCC AAG GCT CGC CAA CCC GAG GGT AGG GCC 542 Gly Arg Arg Gln Pro Ile Pro Lys Ala Arg Gln Pro Glu Gly Arg Ala 60 65 70 75 TGG GCT CAG CCC GGG TAC CCT TGG CCC CTC TAT GGC AAT GAG GGC TTG 590 Trp Ala Gln Pro Gly Tyr Pro Trp Pro Leu Tyr Gly Asn Glu Gly Leu 80 85 90 GGG TGG GCA GGA TGG CTC CTG TCA CCC CGC GGC TCC CGG CCT AGT TGG 638 Gly Trp Ala Gly Trp Leu Leu Ser Pro Arg Gly Ser Arg Pro Ser Trp 95 100 105 GGC CCC ACG GAC CCC CGG CGT AGG TCG CGT AAT TTG GGT AAG GTC ATC 686 Gly Pro Thr Asp Pro Arg Arg Arg Ser Arg Asn Leu Gly Lys Val Ile 110 115 120 GAT ACC CTC ACA TGC GGC TTC GCC GAT CTC ATG GGG TAC ATT CCG CTC 734 Asp Thr Leu Thr Cys Gly Phe Ala Asp Leu Met Gly Tyr Ile Pro Leu 125 130 135 GTC GGC GCC CCC CTA GGG GGC GCT GCC AGG GCT CTA GCG CAT GGC GTC 782 Val Gly Ala Pro Leu Gly Gly Ala Ala Arg Ala Leu Ala His Gly Val 140 145 150 155 CGG GTT CTG GAG GAC GGC GTG AAC TAT GCA ACA GGG AAT CTG CCT GGT 830 Arg Val Leu Glu Asp Gly Val Asn Tyr Ala Thr Gly Asn Leu Pro Gly 160 165 170 TGC TCC TTT TCT ATC TTC CTT TTG GCT TTG CTG TCC TGT TTG ACC ATC 878 Cys Ser Phe Ser Ile Phe Leu Leu Ala Leu Leu Ser Cys Leu Thr Ile 175 180 185 CCA GCT TCC GCC TAC CAA GTG CGC AAC GCG TCC GGG GTG TAC CAT GTC 926 Pro Ala Ser Ala Tyr Gln Val Arg Asn Ala Ser Gly Val Tyr His Val 190 195 200 ACG AAC GAC TGC TCC AAC TCA AGT ATT GTG TAT GAG GCG GCG GAC GTG 974 Thr Asn Asp Cys Ser Asn Ser Ser Ile Val Tyr Glu Ala Ala Asp Val 205 210 215 ATT ATG CAC ACC CCC GGG TGC GTG CCC TGC GTC CGG GAG AAC AAT TCC 1022 Ile Met His Thr Pro Gly Cys Val Pro Cys Val Arg Glu Asn Asn Ser 220 225 230 235 TCC CGC TGC TGG GTA GCG CTC ACT CCC ACG CTT GCG GCC AGG AAC AGC 1070 Ser Arg Cys Trp Val Ala Leu Thr Pro Thr Leu Ala Ala Arg Asn Ser 240 245 250 AGC ATC CCC ACT ACG ACA ATA CGG CGT CAT GTC GAC TTG CTC GTT GGG 1118 Ser Ile Pro Thr Thr Thr Ile Arg Arg His Val Asp Leu Leu Val Gly 255 260 265 GCA GCT GCT CTC TGT TCC GCT ATG TAT GTG GGG GAT TTT TGC GGA TCT 1166 Ala Ala Ala Leu Cys Ser Ala Met Tyr Val Gly Asp Phe Cys Gly Ser 270 275 280 GTT TTC CTC GTC TCC CAG CTG TTC ACT TTC TCA CCT CGC CGG TAT GAG 1214 Val Phe Leu Val Ser Gln Leu Phe Thr Phe Ser Pro Arg Arg Tyr Glu 285 290 295 ACG GTG CAA GAC TGC AAT TGC TCA ATC TAT CCC GGC CAT GTA TCA GGC 1262 Thr Val Gln Asp Cys Asn Cys Ser Ile Tyr Pro Gly His Val Ser Gly 300 305 310 315 CAT CGC ATG GCT TGG GAT ATG ATA ATG AAT TGG TCA CCT ACA ACA GCC 1310 His Arg Met Ala Trp Asp Met Ile Met Asn Trp Ser Pro Thr Thr Ala 320 325 330 CTA GTG GTA TCG CAG CTA CTC CGG ATC CCA CAA GCC GTC GTG GAT ATG 1358 Leu Val Val Ser Gln Leu Leu Arg Ile Pro Gln Ala Val Val Asp Met 335 340 345 GTG GCG GGG GCC CAC TGG GGA GTC CTG GCG GGC CTT GCC TAC TAT TCC 1406 Val Ala Gly Ala His Trp Gly Val Leu Ala Gly Leu Ala Tyr Tyr Ser 350 355 360 ATG GTG GGG AAC TGG GCT AAG GTC TTG GTT GTG ATG CTG CTC TTC GCC 1454 Met Val Gly Asn Trp Ala Lys Val Leu Val Val Met Leu Leu Phe Ala 365 370 375 GGT GTT GAC GGG GGG ACC CAC GTG ACA GGG GGA AAG GTA GCC TAC ACC 1502 Gly Val Asp Gly Gly Thr His Val Thr Gly Gly Lys Val Ala Tyr Thr 380 385 390 395 ACC CAG AGC TTT ACA TCC TTC TTT TCA CGA GGG CCG TCT CAG AGA ATC 1550 Thr Gln Ser Phe Thr Ser Phe Phe Ser Arg Gly Pro Ser Gln Arg Ile 400 405 410 CAG C 1554 Gln
【０２４５】配列番号：７ 配列の長さ：３７０ 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ ｔｏ ｇｅｎｏｍｉｃ ＲＮＡ アンチセンス：Ｎｏ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 直接の起源 クローン名：ＨＮ３ 配列 GCAAGCTT ATG AGC ACA AAT CCA AAA CCC CAA AGA AAA ACC AAA CGT 47 Met Ser Thr Asn Pro Lys Pro Gln Arg Lys Thr Lys Arg 1 5 10 AAC ACC AAC CGC CGC CCA CAG GAC GTC AAG TTC CCG GGC GGT GGT CAG 95 Asn Thr Asn Arg Arg Pro Gln Asp Val Lys Phe Pro Gly Gly Gly Gln 15 20 25 ATC GTT GGT GGA GTT TAC CTG TTG CCG CGC AGG GGC CCC AGG TTG GGT 143 Ile Val Gly Gly Val Tyr Leu Leu Pro Arg Arg Gly Pro Arg Leu Gly 30 35 40 45 GTG CGC GCG ACT AGG AAG ACT TCC GAG CGG CCG CAA CCT CGT GGA AGG 191 Val Arg Ala Thr Arg Lys Thr Ser Glu Arg Pro Gln Pro Arg Gly Arg 50 55 60 CGA CAA CCT ATC CCC AAG GCT CGC CAA CCC GAG GGT AGG GCC TGG GCT 239 Arg Gln Pro Ile Pro Lys Ala Arg Gln Pro Glu Gly Arg Ala Trp Ala 65 70 75 CAG CCC GGG TAC CCT TGG CCC CTC TAT GGC AAT GAG GGC TTG GGG TGG 287 Gln Pro Gly Tyr Pro Trp Pro Leu Tyr Gly Asn Glu Gly Leu Gly Trp 80 85 90 GCA GGA TGG CTC CTG TCA CCC CGC GGC TCC CGG CCT AGT TGG GGC CCC 335 Ala Gly Trp Leu Leu Ser Pro Arg Gly Ser Arg Pro Ser Trp Gly Pro 95 100 105 ACG GAC CCC CGG CGT AGG TGAAGATCTG AATTCGC 370 Thr Asp Pro Arg Arg Arg 110 115
【０２４６】配列番号：８ 配列の長さ：１２６４ 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ ｔｏ ｇｅｎｏｍｉｃ ＲＮＡ アンチセンス：Ｎｏ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 直接の起源 クローン名：ＨＮ３Ｎ１０△Ｂ 配列 GCAAGCTT ATG AGC ACA AAT CCA AAA CCC CAA AGA AAA ATC AAA CGT 47 Met Ser Thr Asn Pro Lys Pro Gln Arg Lys Ile Lys Arg 1 5 10 AAC ACC AAC CGC CGC CCA CAG GAC GTT AAG TTC CCG GGC GGT GGT CAG 95 Asn Thr Asn Arg Arg Pro Gln Asp Val Lys Phe Pro Gly Gly Gly Gln 15 20 25 ATC GTT GGT GGA GTT TAC CTG TTG CCG CGC AGG GGC CCC AGG TTG GGT 143 Ile Val Gly Gly Val Tyr Leu Leu Pro Arg Arg Gly Pro Arg Leu Gly 30 35 40 45 GTG CGC GCG ACT AGG AAG ACT TCC GAG CGG CCG CAA CCT CGT GGA AGG 191 Val Arg Ala Thr Arg Lys Thr Ser Glu Arg Pro Gln Pro Arg Gly Arg 50 55 60 CGA CAA CCT ATC CCC AAG GCT CGC CAA CCC GAG GGT AGG GCC TGG GCT 239 Arg Gln Pro Ile Pro Lys Ala Arg Gln Pro Glu Gly Arg Ala Trp Ala 65 70 75 CAG CCC GGG TAC CCT TGG CCC CTC TAT GGC AAT GAG GGC TTG GGG TGG 287 Gln Pro Gly Tyr Pro Trp Pro Leu Tyr Gly Asn Glu Gly Leu Gly Trp 80 85 90 GCA GGA TGG CTC CTG TCA CCC CGC GGC TCC CGG CCT AGT TGG GGC CCC 335 Ala Gly Trp Leu Leu Ser Pro Arg Gly Ser Arg Pro Ser Trp Gly Pro 95 100 105 ACG GAC CCC CGG CGT AGG TCG CGT AAT TTG GGT AAG GTC ATC GAT ACC 383 Thr Asp Pro Arg Arg Arg Ser Arg Asn Leu Gly Lys Val Ile Asp Thr 110 115 120 125 CTC ACA TGC GGC TTC GCC GAT CTC ATG GGG TAC ATT CCG CTC GTC GGC 431 Leu Thr Cys Gly Phe Ala Asp Leu Met Gly Tyr Ile Pro Leu Val Gly 130 135 140 GCC CCC CTA GGG GGC GCT GCC AGG GCT CTA GCG CAT GGC GTC CGG GTT 479 Ala Pro Leu Gly Gly Ala Ala Arg Ala Leu Ala His Gly Val Arg Val 145 150 155 CTG GAG GAC GGC GTG AAC TAT GCA ACA GGG AAC CTG GGT GGT TGC TCC 527 Leu Glu Asp Gly Val Asn Tyr Ala Thr Gly Asn Leu Pro Gly Cys Ser 160 165 170 TTT TCT ATC TTC CTT TTG GCT TTG CTG TCC TGT TTG ACC ATC CCA GCT 575 Phe Ser Ile Phe Leu Leu Ala Leu Leu Ser Cys Leu Thr Ile Pro Ala 175 180 185 TCC GCC TAC CAA GTG CGC AAC GCG TCC GGG GTG TAC CAT GTC ACG AAC 623 Ser Ala Tyr Gln Val Arg Asn Ala Ser Gly Val Tyr His Val Thr Asn 190 195 200 205 GAC TGC TCC AAC TCA AGT ATT GTG TAT GAG GCG GCG GAC GTG ATT ATG 671 Asp Cys Ser Asn Ser Ser Ile Val Tyr Glu Ala Ala Asp Val Ile Met 210 215 220 CAC ACC CCC GGG TGC GTG CCC TGC GTC CGG GAG AAC AAT TCC TCC CGC 719 His Thr Pro Gly Cys Val Pro Cys Val Arg Glu Asn Asn Ser Ser Arg 225 230 235 TGC TGG GTA GCG CTC ACT CCC ACG CTT GCG GCC AGG AAC AGC AGC ATC 767 Cys Trp Val Ala Leu Thr Pro Thr Leu Ala Ala Arg Asn Ser Ser Ile 240 245 250 CCC ACT ACG ACA ATA CGG CGT CAT GTC GAC TTG CTC GTT GGG GCA GCT 815 Pro Thr Thr Thr Ile Arg Arg His Val Asp Leu Leu Val Gly Ala Ala 255 260 265 GCT CTC TGT TCC GCT ATG TAT GTG GGG GAT TTT TGC GGA TCT GTT TTC 963 Ala Leu Cys Ser Ala Met Tyr Val Gly Asp Phe Cys Gly Ser Val Phe 270 275 280 285 CTC GTC TCC CAG CTG TTC ACT TTC TCA CCT CGC CGG TAT GAG ACG GTG 911 Leu Val Ser Gln Leu Phe Thr Phe Ser Pro Arg Arg Tyr Glu Thr Val 290 295 300 CAA GAC TGC AAT TGC TCA ATC TAT CCC GGC CAT GTA TCA GGC CAT CGC 959 Gln Asp Cys Asn Cys Ser Ile Tyr Pro Gly His Val Ser Gly His Arg 305 310 315 ATG GCT TGG GAT ATG ATA ATG AAT TGG TCA CCT ACA ACA GCC CTA GTG 1007 Met Ala Trp Asp Met Ile Met Asn Trp Ser Pro Thr Thr Ala Leu Val 320 325 330 GTA TCG CAG CTA CTC CGG ATA CCA CAA GCC GTC GTG GAT ATG GTG GCG 1015 Val Ser Gln Leu Leu Arg Ile Pro Gln Ala Val Val Asp Met Val Ala 335 340 345 GGG GCC CAC TGG GGA GTC CTG GCG GGC CTT GCC TAC TAT TCC ATG GTG 1103 Gly Ala His Trp Gly Val Leu Ala Gly Leu Ala Tyr Tyr Ser Met Val 350 355 360 365 GGG AAC TGG GCT AAG GTC TTG GTT GTG ATG CTG CTC TTC GCC GGT GTT 1151 Gly Asn Trp Ala Lys Val Leu Val Val Met Leu Leu Phe Ala Gly Val 370 375 380 GAC GGG GGG ACC CAC GTG ACA GGG GGA AAG GTA GCC TAC ACC ACC CAG 1199 Asp Gly Gly Thr His Val Thr Gly Gly Lys Val Ala Tyr Thr Thr Gln 385 390 395 AGC TTT ACA TCC TTC TTT TCA CGA GGG CCG TCT CAG AGA ATC 1247 Ser Phe Thr Ser Phe Phe Ser Arg Gly Pro Ser Gln Arg Ile 400 405 410 TGAAGATCTG AATTCGC 1264
【０２４７】配列番号：9 配列の長さ：483 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 配列の種類：cDNA to genomic RNA 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N1-2 配列 CTCCACCATA GATCACTCCC CTGTGAGGAA CTACTGTCTT CACGCAGAAA GCGTCTAGCC 60 ATGGCGTTAG TATGAGTGTC GTGCAGCCTC CAGGCCCCCC CCTCCCGGGA GAGCCATAGT 120 GGTCTGCGGA ACCGGTGAGT ACACCGGAAT TGCCAGGACG ACCGGGTCCT TTCTTGGATC 180 AACCCGCTCA ATGCCTGGAG ATTTGGGCGT GCCCCCGCGA GACTGCTAGC CGAGTAGTGT 240 TGGGTCGCGA AAGGCCTTGT GGTACTGCCT GATAGGGTGC TTGCGAGTGC CCCGGGAGGT 300 CTCGTAGACC GTGCATC ATG AGC ACA AAT CCT AAA CCC CAA AGA CAA ACC 350 Met Ser Thr Asn Pro Lys Pro Gln Arg Gln Thr 1 5 10 AAA CGT AAC ACC AAC CGC CGC CCA CAG GAC GTC AAG TTC CCG GGC GGT 398 Lys Arg Asn Thr Asn Arg Arg Pro Gln Asp Val Lys Phe Pro Gly Gly 15 20 25 GGT CAG ATC GTT GGT GGA GTT TAC CTG TTG CCG CGC AGG GGC CCC AGG 446 Gly Gln Ile Val Gly Gly Val Tyr Leu Leu Pro Arg Arg Gly Pro Arg 30 35 40 TTG GGT GTG CGC GCG ACT AGG AAG ACT TCC GAG CGG T 483 Leu Gly Val Arg Ala Thr Arg Lys Thr Ser Glu Arg 45 50
【０２４８】配列番号：10 配列の長さ：483 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 配列の種類：cDNA to genomic RNA 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：S1-1 配列 CTCCACCATA GATCACTCCC CTGTGAGGAA CTACTGTCTT CACGCAGAAA GCGTCTAGCC 60 ATGGCGTTAG TATGAGTGTC GTGCAGCCTC CAGGACCCCC CCTCCCGGGA GAGCCATAGT 120 GGTCTGCGGA ACCGGTGAGT ACACCGGAAT TGCCAGGACG ACCGGGTCCT TTCTTGGATT 180 AACCCGCTCA ATGCCTGGAG ATTTGGGCGT GCCCCCGCGA GACCGCTAGC CGAGTAGTGT 240 TGGGTCGCGA AAGGCCTTGT GGTACTGCCT GATAGGGTGC TTGCGAGTGC CCCGGGAGGT 300 CTCGTAGACC GTGCACC ATG AGC ACG AAT CCT AAA CCT CAA AGA AAA ACC 350 Met Ser Thr Asn Pro Lys Pro Gln Arg Lys Thr 1 5 10 AAA CGT AAC ACC AAC CGC CGC CCA CAG GAC GTC AAG TTC CCG GGT GGT 398 Lys Arg Asn Thr Asn Arg Arg Pro Gln Asp Val Lys Phe Pro Gly Gly 15 20 25 GGT CAG ATC GTT GGT GGA GTT TAC CTG TTG CCG CGC AGG GGC CCC AGG 446 Gly Gln Ile Val Gly Gly Val Tyr Leu Leu Pro Arg Arg Gly Pro Arg 30 35 40 TTG GGT GTG CGC GCG ACT AGG AAG ACT TCC GAG CGG T 483 Leu Gly Val Arg Ala Thr Arg Lys Thr Ser Glu Arg 45 50
【０２４９】配列番号：11 配列の長さ：483 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 配列の種類：cDNA to genomic RNA 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：S1-2 配列 CTCCACCATA GATCACTCCC CTGTGAGGAA CTACTGTCTT CACGCAGAAA GCGTCTAGCC 60 ATGGCGTTAG TATGAGTGTC GTGCAGCCTC CAGGACCCCC CCTCCCGGGA GAGCCATAGT 120 GGTCTGCGGA ACCGGTGAGT ACACCGGAAT TGCCAGGACG ACCGGGTCCT TTCTTGGATT 180 AACCCGCTCA ATGCCTGGAG ATTTGGGCGT GCCCCCGCGA GACCGCTAGC CGAGTAGTGT 240 TGGGTCGCGA AAGGCCTTGT GGTACTGCCT GATAGGGTGC TTGCGAGTGC CCCGGGAGGT 300 CTCGTAGACC GTGCACC ATG AGC ACG AAT CCT AAA CCT CAA AGA AAA ACC 350 Met Ser Thr Asn Pro Lys Pro Gln Arg Lys Thr 1 5 10 AAA CGT AAC ACC AAC CGC CGC CCA CAG GAC GTC AAG TTC CCG GGT GGT 398 Lys Arg Asn Thr Asn Arg Arg Pro Gln Asp Val Lys Phe Pro Gly Gly 15 20 25 GGT CAG ATC GTT GGT GGA GTT TAC CTG TTG CCG CGC AGG GGC CCC AGG 446 Gly Gln Ile Val Gly Gly Val Tyr Leu Leu Pro Arg Arg Gly Pro Arg 30 35 40 TTG GGT GTG CGC GCG ACT AGG AAG ACT TCC GAG CGG T 483 Leu Gly Val Arg Ala Thr Arg Lys Thr Ser Glu Arg 45 50
【０２５０】配列番号：12 配列の長さ：483 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 配列の種類：cDNA to genomic RNA 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：S1-3 配列 CTCCACCATA GATCACTCCC CTGTGAGGAA CTACTGTCTT CACGCAGAAA GCGTCTAGCC 60 ATGGCGTTAG TATGAGTGTC GTGCAGCCTC CAGGACCCCC CCTCCCGGGA GAGCCATAGT 120 GGTCTGCGGA ACCGGTGAGT ACACCGGAAT TGCCAGGACG ACCGGGTCCT TTCTTGGATT 180 AACCCGCTCA ATGCCTGGAG ATTTGGGCGT GCCCCCGCGA GACCGCTAGC CGAGTAGTGT 240 TGGGTCGCGA AAGGCCTTGT GGTACTGCCT GATGGGGTGC TTGCGAGTGC CCCGGGAGGT 300 CTCGTAGACC GTGCACC ATG AGC ACG AAT CCT AAA CCT CAA AGA AAA ACC 350 Met Ser Thr Asn Pro Lys Pro Gln Arg Lys Thr 1 5 10 AAA CGT AAC ACC AAC CGC CGC CCA CAG GAC GTC AAG TTC CCG GGT GGT 398 Lys Arg Asn Thr Asn Arg Arg Pro Gln Asp Val Lys Phe Pro Gly Gly 15 20 25 GGT CAG ATC GTT GGT GGA GTT TAC CTG TTG CCG CGC AGG GGC CCC AGG 446 Gly Gln Ile Val Gly Gly Val Tyr Leu Leu Pro Arg Arg Gly Pro Arg 30 35 40 TTG GGT GTG CGC GCG ACT AGG AAG ACT TCC GAG CGG T 483 Leu Gly Val Arg Ala Thr Arg Lys Thr Ser Glu Arg 45 50
【０２５１】配列番号：13 配列の長さ：339 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N27-1 配列 C CGG ATC CCA CAA GCC GTG GTG GAT ATG GTG GCG GGG GCC CAC TGG GGA 49 Arg Ile Pro Gln Ala Val Val Asp Met Val Ala Gly Ala His Trp Gly 5 10 15 GTC CTA GCG GGC CTT GCC TAC TAT TCC ATG GTG GGG AAC TGG GCT AAG 97 Val Leu Ala Gly Leu Ala Tyr Tyr Ser Met Val Gly Asn Trp Ala Lys 20 25 30 GTC TTG GTT GTG ATG CTG CTC TTC GCC GGT GTT GAC GGG AGG ACC CAC 145 Val Leu Val Val Met Leu Leu Phe Ala Gly Val Asp Gly Arg Thr His 35 40 45 GTG ACA GGA GGG AAG GTA GCC TAC ACC ACC CAG AGG TTT ACA TCC TTC 193 Val Thr Gly Gly Lys Val Ala Tyr Thr Thr Gln Arg Phe Thr Ser Phe 50 55 60 TTT TCA CGA GGG CCG TCC CAG AAA ATC CAA CTT GTA AAC ACT AAC GGC 241 Phe Ser Arg Gly Pro Ser Gln Lys Ile Gln Leu Val Asn Thr Asn Gly 65 70 75 80 AGC TGG CAC ATC AAC AGG ACT GCC CTG AAT TGC AAT GAC TCC CTT AAC 289 Ser Trp His Ile Asn Arg Thr Ala Leu Asn Cys Asn Asp Ser Leu Asn 85 90 95 ACC GGG TTC CTT GCC GCG CTG TTC TAC ACC CAC AGC TTC AAC GCG TCC GG 339 Thr Gly Phe Leu Ala Ala Leu Phe Tyr Thr His Ser Phe Asn Ala Ser 100 105 110
【０２５２】配列番号：14 配列の長さ：339 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N27-2 配列 C CGG ATC CCA CAA GCC GTG GTG GAT ATG GTG GCG GGG GCC CAC TGG GGA 49 Arg Ile Pro Gln Ala Val Val Asp Met Val Ala Gly Ala His Trp Gly 5 10 15 GTC CTG GCG GGC CTT GCC TAC TAT TCC ATG GTG GGG AAC TGG GCT AAG 97 Val Leu Ala Gly Leu Ala Tyr Tyr Ser Met Val Gly Asn Trp Ala Lys 20 25 30 GTC TTG GTT GTG ATG CTG CTT TTC GCC GGT GTT GAC GGG GGG ACC CAC 145 Val Leu Val Val Met Leu Leu Phe Ala Gly Val Asp Gly Gly Thr His 35 40 45 GTG ACA GGG GGG AAG GTA GCC TAC ACC ACC CAG AGC TTC ACA TCC TTC 193 Val Thr Gly Gly Lys Val Ala Tyr Thr Thr Gln Ser Phe Thr Ser Phe 50 55 60 TTT TCA CGA GGG CCG TCT CAG AGG ATC CAA CTT GTA AAC ACT AAC GGC 241 Phe Ser Arg Gly Pro Ser Gln Arg Ile Gln Leu Val Asn Thr Asn Gly 65 70 75 80 AGC TGG CAC ATC AAT AGG ACT GCC CTG AAT TGC AAT GAC TCC CTT AAC 289 Ser Trp His Ile Asn Arg Thr Ala Leu Asn Cys Asn Asp Ser Leu Asn 85 90 95 ACC GGG TTC CTT GCC GCG CTG TTC TAC ACC CAC AGC TTC AAC GCG TCC GG 339 Thr Gly Phe Leu Ala Ala Leu Phe Tyr Thr His Ser Phe Asn Ala Ser 100 105 110
【０２５３】配列番号：15 配列の長さ：339 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N27-3 配列 C CGG ATC CCA CAA GCC GTG GTG GAT ATG GTG GCA GGG GCC CAC TGG GGA 49 Arg Ile Pro Gln Ala Val Val Asp Met Val Ala Gly Ala His Trp Gly 5 10 15 GTC CTG GCG GGC CTT GCC TAC TAT TCC ATG GTG GGG AAC TGG GCT AAG 97 Val Leu Ala Gly Leu Ala Tyr Tyr Ser Met Val Gly Asn Trp Ala Lys 20 25 30 GTC TTG GTT GTG ATG CTG CTC TTC GCC GGT GTT GAC GGG GGG ACC CAC 145 Val Leu Val Val Met Leu Leu Phe Ala Gly Val Asp Gly Gly Thr His 35 40 45 GTG ACA GGG GGG AAG GTA GCC TAC ACC ACC CAG GGC TTT ACA TCC TTC 193 Val Thr Gly Gly Lys Val Ala Tyr Thr Thr Gln Gly Phe Thr Ser Phe 50 55 60 TTT TCA CGA GGG CCG TCT CAG AAA ATC CAA CTT GTA AAC ACT AAC GGC 241 Phe Ser Arg Gly Pro Ser Gln Lys Ile Gln Leu Val Asn Thr Asn Gly 65 70 75 80 AGC TGG CAC ATC AAT AGG ACT GCC CTC AAT TGC AAT GAC TCC CTT AAC 289 Ser Trp His Ile Asn Arg Thr Ala Leu Asn Cys Asn Asp Ser Leu Asn 85 90 95 ACC GGG TTC CTT GCC GCG CTG TTC TAC ACC CAC AGC TTC AAC GCG TCC GG 339 Thr Gly Phe Leu Ala Ala Leu Phe Tyr Thr His Ser Phe Asn Ala Ser 100 105 110
【０２５４】配列番号：16 配列の長さ：393 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N19-1 配列 GAG GCC GTG AAC TGC GAT GAC TCC CTT AAC ACC GGG TTC CTT GCC GCG 48 Glu Ala Val Asn Cys Asp Asp Ser Leu Asn Thr Gly Phe Leu Ala Ala 1 5 10 15 CTG TTC TAC ACG CAC AGG TTC AAC GCG TCC GGA TGT CCG GAG CGT ATG 96 Leu Phe Tyr Thr His Arg Phe Asn Ala Ser Gly Cys Pro Glu Arg Met 20 25 30 GCC GGT TGC CGC CCC ATT GAC GAG TTC GCT CAG GGG TGG GGT CCC ATC 144 Ala Gly Cys Arg Pro Ile Asp Glu Phe Ala Gln Gly Trp Gly Pro Ile 35 40 45 ACT CAT GTT GTG CCT AAC ATC TCG GAC CAG AGG CCC TAT TGC TGG CAC 192 Thr His Val Val Pro Asn Ile Ser Asp Gln Arg Pro Tyr Cys Trp His 50 55 60 TAC GCG CCT CGA CCG TGT GGT ATC GTA CCC GCG TCG CAG GTG TGT GGT 240 Tyr Ala Pro Arg Pro Cys Gly Ile Val Pro Ala Ser Gln Val Cys Gly 65 70 75 80 CCG GTG TAT TGC TTC ACC CCA AGC CCT GTT GTG GTG GGG ACG ACC GAT 288 Pro Val Tyr Cys Phe Thr Pro Ser Pro Val Val Val Gly Thr Thr Asp 85 90 95 CGT TTC GGC GCC CCC ACG TAC AAC TGG GGA AAC AAT GAG ACG GAT GTG 336 Arg Phe Gly Ala Pro Thr Tyr Asn Trp Gly Asn Asn Glu Thr Asp Val 100 105 110 CTA CTC CTC AAC AAC ACA CGG CCG CCG CAG GGC AAC TGG TTC GGT TGT 384 Leu Leu Leu Asn Asn Thr Arg Pro Pro Gln Gly Asn Trp Phe Gly Cys 115 120 125 ACC TGG ATG 393 Thr Trp Met 130
【０２５５】配列番号：17 配列の長さ：393 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N19-2 配列 GAG GCC GTG AAC TGC GAT GAC TCC CTT AAC ACC GGG TTC CTT GCC GCG 48 Glu Ala Val Asn Cys Asp Asp Ser Leu Asn Thr Gly Phe Leu Ala Ala 1 5 10 15 CTG TTC TAC ACG CAC AGG TTC AAC GCG TCC GGA TGT CCG GAG CGT ATG 96 Leu Phe Tyr Thr His Arg Phe Asn Ala Ser Gly Cys Pro Glu Arg Met 20 25 30 GCC AGT TGC CGC CCC ATT GAC GAG TTC GCT CAG GGG TGG GGT CCC ATC 144 Ala Ser Cys Arg Pro Ile Asp Glu Phe Ala Gln Gly Trp Gly Pro Ile 35 40 45 ACT CAT GTT GTG CCT AAC ATC TCG GAC CAG AGG CCC TAT TGC TGG CAC 192 Thr His Val Val Pro Asn Ile Ser Asp Gln Arg Pro Tyr Cys Trp His 50 55 60 TAC GCG CCT CGA CCG TGT GGT ATC GTA CCC GCG TCG CAG GTG TGT GGT 240 Tyr Ala Pro Arg Pro Cys Gly Ile Val Pro Ala Ser Gln Val Cys Gly 65 70 75 80 CCG GTG TAT TGC TTC ACC CCA AGC CCT GTT GTG GTG GGG ACG ACC GAT 288 Pro Val Tyr Cys Phe Thr Pro Ser Pro Val Val Val Gly Thr Thr Asp 85 90 95 CGT TTC GGC GCC CCC ACG TAT AAC TGG GGG AAC AAT GAG ACG GAT GTG 336 Arg Phe Gly Ala Pro Thr Tyr Asn Trp Gly Asn Asn Glu Thr Asp Val 100 105 110 CTA CTC CTC AAC AAC ACA CGG CCG CCG CAA GGC AAC TGG TTC GGT TGT 384 Leu Leu Leu Asn Asn Thr Arg Pro Pro Gln Gly Asn Trp Phe Gly Cys 115 120 125 ACC TGG ATG 393 Thr Trp Met 130
【０２５６】配列番号：18 配列の長さ：393 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N19-3 配列 GAG GCC GTG AAC TGC GAT GAC TCC CTT AAC ACC GGG TTC CTT GCC GCG 48 Glu Ala Val Asn Cys Asp Asp Ser Leu Asn Thr Gly Phe Leu Ala Ala 1 5 10 15 CTG TTC TAC ACG CAC AGG TTC AAC GCG TCC GGA TGT CCG GAG CGT ATG 96 Leu Phe Tyr Thr His Arg Phe Asn Ala Ser Gly Cys Pro Glu Arg Met 20 25 30 GCC AGT TGC CGC CCC ATT GAT GAG TTC GCT CAG GGG TGG GGT CCC ATC 144 Ala Ser Cys Arg Pro Ile Asp Glu Phe Ala Gln Gly Trp Gly Pro Ile 35 40 45 ACT CAT GTT GTG CCT AAC ATC TCG GAC CAG AGG CCC TAT TGC TGG CAC 192 Thr His Val Val Pro Asn Ile Ser Asp Gln Arg Pro Tyr Cys Trp His 50 55 60 TAC GCG CCT CGA CCG TGT GGT ATC GTA CCC GCG TGG CAG GTG TGT GGT 240 Tyr Ala Pro Arg Pro Cys Gly Ile Val Pro Ala Trp Gln Val Cys Gly 65 70 75 80 CCG GTG TAT TGC TTC ACC CCA AGC CCT GTT GTG GTG GGG ACG ACC GAT 288 Pro Val Tyr Cys Phe Thr Pro Ser Pro Val Val Val Gly Thr Thr Asp 85 90 95 CGT TTC GGC GCC CCC ACG TAT AAC TGG GGG AAC AAT GAG ACG GAT GTG 336 Arg Phe Gly Ala Pro Thr Tyr Asn Trp Gly Asn Asn Glu Thr Asp Val 100 105 110 CTA CTC CTC AAC AAC ACA CGG CCG CCG CAA GGC AAC TGG TTC GGT TGT 384 Leu Leu Leu Asn Asn Thr Arg Pro Pro Gln Gly Asn Trp Phe Gly Cys 115 120 125 ACC TGG ATG 393 Thr Trp Met 130
【０２５７】配列番号：19 配列の長さ：393 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：H19-2 配列 GAG GCC GTG AAC TGC GAT GAC TCC CTC CAG ACT GGG TTC CTT GCC GCG 48 Glu Ala Val Asn Cys Asp Asp Ser Leu Gln Thr Gly Phe Leu Ala Ala 1 5 10 15 CTG TTC TAC AGG CAC AGG TTC AAC GCA TCC GGG TGC CCA GAA CGC ATG 96 Leu Phe Tyr Arg His Arg Phe Asn Ala Ser Gly Cys Pro Glu Arg Met 20 25 30 GCC AGC TGC CGC CCC ATT AGC GAG TTC GCT CAG GGG TGG GGT CCT ATC 144 Ala Ser Cys Arg Pro Ile Ser Glu Phe Ala Gln Gly Trp Gly Pro Ile 35 40 45 ACT CAT GTT GTG CCT GAC GTG TCG GAC CAG AGG CCT TAT TGC TGG CAC 192 Thr His Val Val Pro Asp Val Ser Asp Gln Arg Pro Tyr Cys Trp His 50 55 60 TAC GCG CCT CGA CCG TGC GGT ATC GTA CCC GCG TCG CAG GTG TGT GGT 240 Tyr Ala Pro Arg Pro Cys Gly Ile Val Pro Ala Ser Gln Val Cys Gly 65 70 75 80 CCA GTG TAT TGC TTC ACC CCA AGC CCT GTC GTG GTG GGG ACG ACC GAT 288 Pro Val Tyr Cys Phe Thr Pro Ser Pro Val Val Val Gly Thr Thr Asp 85 90 95 CGT TCT GGC GCC CCC ACG TAC ACC TGG GGG GCG AAT GAG ACG GAC GTG 336 Arg Ser Gly Ala Pro Thr Tyr Thr Trp Gly Ala Asn Glu Thr Asp Val 100 105 110 CTA CTC CTT AAC AAC ACG CGT CCG CCA CAG GGC AAC TGG TTC GGT TGT 384 Leu Leu Leu Asn Asn Thr Arg Pro Pro Gln Gly Asn Trp Phe Gly Cys 115 120 125 ACC TGG ATG 393 Thr Trp Met 130
【０２５８】配列番号：20 配列の長さ：393 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：H19-4 配列 GAG GCC GTG AAC TGC GAT GAC TCC CTC CAG ACT GGG TTC CTT GCC GCG 48 Glu Ala Val Asn Cys Asp Asp Ser Leu Gln Thr Gly Phe Leu Ala Ala 1 5 10 15 CTG TTC TAC AGG CAC AGG TTC AAC GCA TCC GGG TGC CCA GAA CGC ATG 96 Leu Phe Tyr Arg His Arg Phe Asn Ala Ser Gly Cys Pro Glu Arg Met 20 25 30 GCC AGC TGT CGC CCC ATT AGC GAG TTC GCT CAG GGG TGG GGC CCT ATC 144 Ala Ser Cys Arg Pro Ile Ser Glu Phe Ala Gln Gly Trp Gly Pro Ile 35 40 45 ACT CAT GTT GTG CCT GAC GTG TCG GAC CAG AGG CCT TAT TGC TGG CAC 192 Thr His Val Val Pro Asp Val Ser Asp Gln Arg Pro Tyr Cys Trp His 50 55 60 TAC GCG CCT CGA CCG TGC GGT ATC GTA CCC GCG TCG CAG GTG TGT GGT 240 Tyr Ala Pro Arg Pro Cys Gly Ile Val Pro Ala Ser Gln Val Cys Gly 65 70 75 80 CCA GTG TAT TGC TTC ACC CCA AGC CCT GTC GTG GTG GGG ACG ACC GAT 288 Pro Val Tyr Cys Phe Thr Pro Ser Pro Val Val Val Gly Thr Thr Asp 85 90 95 CGC TCT GGC GCC CCC ACG TAC ACC TGG GGG GCG AAT GAG ACG GAC GTG 336 Arg Ser Gly Ala Pro Thr Tyr Thr Trp Gly Ala Asn Glu Thr Asp Val 100 105 110 CTA CTC CTT AAC AAC ACG CGT CCG CCA CAG GGC AAC TGG TTC GGT TGT 384 Leu Leu Leu Asn Asn Thr Arg Pro Pro Gln Gly Asn Trp Phe Gly Cys 115 120 125 ACC TGG ATG 393 Thr Trp Met 130
【０２５９】配列番号：21 配列の長さ：393 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：H19-10 配列 GAG GCC GTG AAC TGC GAT GAC TCC CTC CAG ACT GGG TTC CTT GCC GCG 48 Glu Ala Val Asn Cys Asp Asp Ser Leu Gln Thr Gly Phe Leu Ala Ala 1 5 10 15 CTG TTC TAC AGG CAC AGG TTC AAC GCA TCC GGG TGC CCA GAA CGC ATG 96 Leu Phe Tyr Arg His Arg Phe Asn Ala Ser Gly Cys Pro Glu Arg Met 20 25 30 GCC AGC TGC CGC CCC ATT AGC GAG TTC GCT CAG GGG TGG GGC CCT ATC 144 Ala Ser Cys Arg Pro Ile Ser Glu Phe Ala Gln Gly Trp Gly Pro Ile 35 40 45 ACT CAT GTT GTG CCT GAC GTG TCG GAC CAG AGG CCT TAT TGC TGG CAC 192 Thr His Val Val Pro Asp Val Ser Asp Gln Arg Pro Tyr Cys Trp His 50 55 60 TAC GCA CCT CGA CCG TGC GGT GTC GTA CCC GCG TCG CAG GTG TGT GGT 240 Tyr Ala Pro Arg Pro Cys Gly Val Val Pro Ala Ser Gln Val Cys Gly 65 70 75 80 CCA GTG TAT TGC TTC ACC CCA AGC CCT GTC GTG GTG GGG ACG ACC GAT 288 Pro Val Tyr Cys Phe Thr Pro Ser Pro Val Val Val Gly Thr Thr Asp 85 90 95 CGC TCT GGC GCC CCC ACG TAC ACC TGG GGG GCG AAT GAG ACG GAC GTG 336 Arg Ser Gly Ala Pro Thr Tyr Thr Trp Gly Ala Asn Glu Thr Asp Val 100 105 110 CTA CTC CTT AAC AAC ACG CGT CCG CCA CAG GGC AAC TGG TTC GGT TGT 384 Leu Leu Leu Asn Asn Thr Arg Pro Pro Gln Gly Asn Trp Phe Gly Cys 115 120 125 ACC TGG ATG 393 Thr Trp Met 130
【０２６０】配列番号：22 配列の長さ：393 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：Y19-4 配列 GAG GCC GTG AAC TGC GAT GAC TCC CTC CAG ACT GGG TTC CTT GCC GCG 48 Glu Ala Val Asn Cys Asp Asp Ser Leu Gln Thr Gly Phe Leu Ala Ala 1 5 10 15 CTG TTC TAC AGG CAC AGG TTC AAC GCA TCC GGG TGC CCA GAA CGC ATG 96 Leu Phe Tyr Arg His Arg Phe Asn Ala Ser Gly Cys Pro Glu Arg Met 20 25 30 GCC AGC TGT CGC CCC ATT AGC GAG TTC GCT CAG GGG TGG GGC CCT ATC 144 Ala Ser Cys Arg Pro Ile Ser Glu Phe Ala Gln Gly Trp Gly Pro Ile 35 40 45 ACT CAT GTT GTG CCT GAC GTG TCG GAC CAG AGG CCT TAT TGC TGG CAC 192 Thr His Val Val Pro Asp Val Ser Asp Gln Arg Pro Tyr Cys Trp His 50 55 60 TAC GCG CCT CGA CCG TGC GGT ATC GTA CCC GCG TCG CAG GTG TGT GGT 240 Tyr Ala Pro Arg Pro Cys Gly Ile Val Pro Ala Ser Gln Val Cys Gly 65 70 75 80 CCA GTG TAT TGC TTC ACC CCA AGC CCT GTC GTG GTG GGG ACG ACC GAT 288 Pro Val Tyr Cys Phe Thr Pro Ser Pro Val Val Val Gly Thr Thr Asp 85 90 95 CGC TCT GGC GCC CCC ACG TAC ACC TGG GGG GCG AAT GAG ACG GAC GTG 336 Arg Ser Gly Ala Pro Thr Tyr Thr Trp Gly Ala Asn Glu Thr Asp Val 100 105 110 CTA CTC CTT AAC AAC ACG CGT CCG CCA CAG GGC AAC TGG TTC GGT TGT 384 Leu Leu Leu Asn Asn Thr Arg Pro Pro Gln Gly Asn Trp Phe Gly Cys 115 120 125 ACC TGG ATG 393 Thr Trp Met 130
【０２６１】配列番号：23 配列の長さ：393 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：Y19-6 配列 GAG GCC GTG AAC TGC GAT GAC TCC CTC CAG ACT GGG TTC CTT GCC ACG 48 Glu Ala Val Asn Cys Asp Asp Ser Leu Gln Thr Gly Phe Leu Ala Thr 1 5 10 15 CTG TTC TAC AGG CAC AGG TTC AAC GCA TCC GGG TGC CCA GAA CGC ATG 96 Leu Phe Tyr Arg His Arg Phe Asn Ala Ser Gly Cys Pro Glu Arg Met 20 25 30 GCC AGC TGT CGC CCC ATT AGC GAG TTC GCT CAG GGG TGG GAC CCT ATC 144 Ala Ser Cys Arg Pro Ile Ser Glu Phe Ala Gln Gly Trp Asp Pro Ile 35 40 45 ACT CAT GTT GTG CCT GAC GTG TCG GAC CAG AGG CCT TAT TGC TGG CAC 192 Thr His Val Val Pro Asp Val Ser Asp Gln Arg Pro Tyr Cys Trp His 50 55 60 TAC GCG CCT CGA CCG TGC GGT ATC GTA CCC GCG TCG CAG GTG TGT GGT 240 Tyr Ala Pro Arg Pro Cys Gly Ile Val Pro Ala Ser Gln Val Cys Gly 65 70 75 80 CCA GTG TAT TGC TTC ACC CCA AGC CCT GTC GTG GTG GGG ACG ACC GAT 288 Pro Val Tyr Cys Phe Thr Pro Ser Pro Val Val Val Gly Thr Thr Asp 85 90 95 CGC TCT GGC GCC CCC ACG TAC ACC TGG GGG GCG AAT GAG ACG GAC GTG 336 Arg Ser Gly Ala Pro Thr Tyr Thr Trp Gly Ala Asn Glu Thr Asp Val 100 105 110 CTA CTC CTT AAC AAC ACG CGT CCG CCA CAG GGC AAC TGG TTC GGT TGT 384 Leu Leu Leu Asn Asn Thr Arg Pro Pro Gln Gly Asn Trp Phe Gly Cys 115 120 125 ACC TGG ATG 393 Thr Trp Met 130
【０２６２】配列番号：24 配列の長さ：393 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：Y19-7 配列 GAG GCC GTG AAC TGC GAT GAC TCC CTC CAG ACT GGG TTC CTT GCC GCG 48 Glu Ala Val Asn Cys Asp Asp Ser Leu Gln Thr Gly Phe Leu Ala Ala 1 5 10 15 CTG TTC TAC AGG CAT AGG TTC GAC GCA TCC GGG TGC CCA GAA CGC ATG 96 Leu Phe Tyr Arg His Arg Phe Asp Ala Ser Gly Cys Pro Glu Arg Met 20 25 30 GCC AGC TGT CGC CCC ATT AGC GAG TTC GCT CAG GGG TGG GGC CCT ATC 144 Ala Ser Cys Arg Pro Ile Ser Glu Phe Ala Gln Gly Trp Gly Pro Ile 35 40 45 ACT CAT GTT GTG CCT GAC GTG TCG GAC CAG AGG CCT TAT TGC TGG CAC 192 Thr His Val Val Pro Asp Val Ser Asp Gln Arg Pro Tyr Cys Trp His 50 55 60 TAC GCG CCT CGA CCG TGC GGT ATC GTA CCC GCG TCG CAG GTG TGT GGT 240 Tyr Ala Pro Arg Pro Cys Gly Ile Val Pro Ala Ser Gln Val Cys Gly 65 70 75 80 CCA GTG TAT TGC TTC ACC CCA AGC CCT GTC GTG GTG GGG ACG ACC GAT 288 Pro Val Tyr Cys Phe Thr Pro Ser Pro Val Val Val Gly Thr Thr Asp 85 90 95 CGC TCT GGC GCC CCC ACG TAC ACC TGG GGG GCG AAT GAG ACG GAC GTG 336 Arg Ser Gly Ala Pro Thr Tyr Thr Trp Gly Ala Asn Glu Thr Asp Val 100 105 110 CTA CTC CTT AAC AAC ACG CGT CCG CCA CAG GGC AAC TGG TTC GGT TGT 384 Leu Leu Leu Asn Asn Thr Arg Pro Pro Gln Gly Asn Trp Phe Gly Cys 115 120 125 ACC TGG ATG 393 Thr Trp Met 130
【０２６３】配列番号：25 配列の長さ：629 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：MX24-4 配列 AAC ACA CGG CCG CCG CAG GGG AAC TGG TTT GGC TGT ACA TGG ATG AAT 48 Asn Thr Arg Pro Pro Gln Gly Asn Trp Phe Gly Cys Thr Trp Met Asn 1 5 10 15 GGC ACT GGG TTC ACA AAG ACG TGC GGG GGC CCC CCG TGC AAC ATC GGG 96 Gly Thr Gly Phe Thr Lys Thr Cys Gly Gly Pro Pro Cys Asn Ile Gly 20 25 30 GGG GTC GGC AAC AAT ACC TTG ACT TGC CCC ACG GAC TGC TTC CGG AAG 144 Gly Val Gly Asn Asn Thr Leu Thr Cys Pro Thr Asp Cys Phe Arg Lys 35 40 45 CAC CCC GAG GCC ACT TAC ACA AAA TGT GGT TCG GGG CCT TGG TTG ACA 192 His Pro Glu Ala Thr Tyr Thr Lys Cys Gly Ser Gly Pro Trp Leu Thr 50 55 60 CCT AGG TGC CTA GTT CAT TAC CCA TAC AGG CTC TGG CAC TAT CCC TGC 240 Pro Arg Cys Leu Val His Tyr Pro Tyr Arg Leu Trp His Tyr Pro Cys 65 70 75 80 ACT GTC AAC TTT ACC ATC TTC AAG GTT AGG ATG TAT GTG GGG GGC GTG 288 Thr Val Asn Phe Thr Ile Phe Lys Val Arg Met Tyr Val Gly Gly Val 85 90 95 GAA CAC AGG CTT GAA GCT GCA TGC AAT TGG ACC CGA GGA GAG CGT TGT 336 Glu His Arg Leu Glu Ala Ala Cys Asn Trp Thr Arg Gly Glu Arg Cys 100 105 110 GAC TTG GAG GAC AGG GAT AGA TCA GAG CTT AGC CCG CTA TTG CTG TCC 384 Asp Leu Glu Asp Arg Asp Arg Ser Glu Leu Ser Pro Leu Leu Leu Ser 115 120 125 ACA ACA GAG TGG CAG GTA CTG CCC TGT TCC TTC ACC ACC CTG CCG GCT 432 Thr Thr Glu Trp Gln Val Leu Pro Cys Ser Phe Thr Thr Leu Pro Ala 130 135 140 CTG TCC ACT GGT TTG ATT CAT CTC CAT CAG AAC ATC GTG GAC GTG CAA 480 Leu Ser Thr Gly Leu Ile His Leu His Gln Asn Ile Val Asp Val Gln 145 150 155 160 TAT CTG TAC GGC ATA GGG TCG GCG GTT GTC TCC TTC GCA ATC AAA TGG 528 Tyr Leu Tyr Gly Ile Gly Ser Ala Val Val Ser Phe Ala Ile Lys Trp 165 170 175 GAA TAT ATT CTG TTG CTT TTC CTC CCC CTG GCG GAC GCG CGC GTC TGT 576 Glu Tyr Ile Leu Leu Leu Phe Leu Pro Leu Ala Asp Ala Arg Val Cys 180 185 190 GCC TGC TTG TGG ATG ATG CTG CTG ATA GCC CAC GCC GAC GCC ACC TTA 624 Ala Cys Leu Trp Met Met Leu Leu Ile Ala His Ala Asp Ala Thr Leu 195 200 205 GAG AA 629 Glu
【０２６４】配列番号：26 配列の長さ：629 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：MX24-5 配列 AAC ACA CGG CCG CCG CAG GGG AAC TGG TTT GGC TGT ACA TGG ATG AAT 48 Asn Thr Arg Pro Pro Gln Gly Asn Trp Phe Gly Cys Thr Trp Met Asn 1 5 10 15 GGC ACT GGG TTC ACA AAG ACG TGC GGG GGC CCC CCG TGC AAC ATC GGG 96 Gly Thr Gly Phe Thr Lys Thr Cys Gly Gly Pro Pro Cys Asn Ile Gly 20 25 30 GGG GTC GGC AAC AAT ACC TTG ACT TGC CCC ACG GAC TGC TTC CGG AAG 144 Gly Val Gly Asn Asn Thr Leu Thr Cys Pro Thr Asp Cys Phe Arg Lys 35 40 45 CAC CCC GAG GCC ACT TAC ACA AAA TGT GGT TCG GGG CCT TGG TTG ACG 192 His Pro Glu Ala Thr Tyr Thr Lys Cys Gly Ser Gly Pro Trp Leu Thr 50 55 60 CCT AGG TGC CTA GTT CAT TAC CCA TAC AGG CTC TGG CAC TAT CCC TGC 240 Pro Arg Cys Leu Val His Tyr Pro Tyr Arg Leu Trp His Tyr Pro Cys 65 70 75 80 ACT GTC AAC TTT ACC ATC TTC AAG GTT AGG ATG TAT GTG GGG GGC GTG 288 Thr Val Asn Phe Thr Ile Phe Lys Val Arg Met Tyr Val Gly Gly Val 85 90 95 GAA CAC AGG CTT GAA GCT GCA TGC AAT TGG ACC CGA GGA GAG CGT TGT 336 Glu His Arg Leu Glu Ala Ala Cys Asn Trp Thr Arg Gly Glu Arg Cys 100 105 110 GAC TTG GAG GAC AGG GAT AGA TCA GAG CTT AGC CCG CTA TTG CTG TCT 384 Asp Leu Glu Asp Arg Asp Arg Ser Glu Leu Ser Pro Leu Leu Leu Ser 115 120 125 ACA ACA GAG TGG CAG GTA CTG CCC TGT TCC TTC ACC ACC CTG CCG GCT 432 Thr Thr Glu Trp Gln Val Leu Pro Cys Ser Phe Thr Thr Leu Pro Ala 130 135 140 CTG TCC ACT GGT TTG ATT CAT CTC CAT CAG AAC ATC GTG GAC GTG CAA 480 Leu Ser Thr Gly Leu Ile His Leu His Gln Asn Ile Val Asp Val Gln 145 150 155 160 TAT TTG TAC GGC ATA GGG TCG GCG GTT GTC TCC TTC GCA ATC AAA TGG 528 Tyr Leu Tyr Gly Ile Gly Ser Ala Val Val Ser Phe Ala Ile Lys Trp 165 170 175 GAA TAT ATT CTG TTG CTT TTC CTT CTC CTG GCG GAC GCG CGC GTC TGT 576 Glu Tyr Ile Leu Leu Leu Phe Leu Leu Leu Ala Asp Ala Arg Val Cys 180 185 190 GCC TGC TTG TGG ATG ATG CTG CTG ATA GCC CAC GCC GAC GCC ACC TTA 624 Ala Cys Leu Trp Met Met Leu Leu Ile Ala His Ala Asp Ala Thr Leu 195 200 205 GAG AA 629 Glu
【０２６５】配列番号：27 配列の長さ：629 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：MX24-13 配列 AAC ACA CGG CCG CCG CAG GGG AAC TGG TTT GGC TGT ACA TGG ATG AAT 48 Asn Thr Arg Pro Pro Gln Gly Asn Trp Phe Gly Cys Thr Trp Met Asn 1 5 10 15 GGC ACT GGG TTC ACA AAG ACG TGC GGG GGC CCC CCG TGC AAC ATC GGG 96 Gly Thr Gly Phe Thr Lys Thr Cys Gly Gly Pro Pro Cys Asn Ile Gly 20 25 30 GGG GTC GGC AAC AAT ACC TTG ACT TGC CCC ACG GAC TGC TTC CGG AAG 144 Gly Val Gly Asn Asn Thr Leu Thr Cys Pro Thr Asp Cys Phe Arg Lys 35 40 45 CAC CCC GAG GCC ACT TAC ACA AAA TGT GGT TCG GGG CCT TGG CTG ACG 192 His Pro Glu Ala Thr Tyr Thr Lys Cys Gly Ser Gly Pro Trp Leu Thr 50 55 60 CCT AGG TGC CTA GTT CAT TAC CCA TAC AGG CTC TGG CAC TAT CCC TGC 240 Pro Arg Cys Leu Val His Tyr Pro Tyr Arg Leu Trp His Tyr Pro Cys 65 70 75 80 ACT GTC AAC TTT ACC ATC TTC AAG GTT AGG ATG TAT GTG GGG GGC GTG 288 Thr Val Asn Phe Thr Ile Phe Lys Val Arg Met Tyr Val Gly Gly Val 85 90 95 GAA CAC AGG CTT GAA GCT GCA TGC AAT TGG ACC CGC GGA GAG CGT TGT 336 Glu His Arg Leu Glu Ala Ala Cys Asn Trp Thr Arg Gly Glu Arg Cys 100 105 110 GAC TTG GAG GAC AGG GAT AGA TCA GAG CTT AGC CCG CTA TTG CTG TCT 384 Asp Leu Glu Asp Arg Asp Arg Ser Glu Leu Ser Pro Leu Leu Leu Ser 115 120 125 ACA ACA GAG TGG CAG GTA CTG CCC TGT TCC TTC ACC ACC CTG CCG GCT 432 Thr Thr Glu Trp Gln Val Leu Pro Cys Ser Phe Thr Thr Leu Pro Ala 130 135 140 CTG TCC ACT GGT TTG ATT CAT CTC CAT CAG AAC ATC GTG GAC GTG CAA 480 Leu Ser Thr Gly Leu Ile His Leu His Gln Asn Ile Val Asp Val Gln 145 150 155 160 TAT CTG TAC GGC ATA GGG TCG GCG GTT GTC TCC TTC GCA ATC AAA TGG 528 Tyr Leu Tyr Gly Ile Gly Ser Ala Val Val Ser Phe Ala Ile Lys Trp 165 170 175 GAA TAT ATT CTG TTG CTT TTC CTT CTC CTG GCG GAC GCA CGC GTC TGT 576 Glu Tyr Ile Leu Leu Leu Phe Leu Leu Leu Ala Asp Ala Arg Val Cys 180 185 190 GCC TGC TTG TGG ATG ATG CTG CTG ATA GCC CAC GCC GAC GCC ACC TTA 624 Ala Cys Leu Trp Met Met Leu Leu Ile Ala His Ala Asp Ala Thr Leu 195 200 205 GAG AA 629 Glu
【０２６６】配列番号：28 配列の長さ：652 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N27N19-1 配列 C CGG ATC CCA CAA GCC GTG GTG GAT ATG GTG GCA GGG GCC CAC TGG GGA 49 Arg Ile Pro Gln Ala Val Val Asp Met Val Ala Gly Ala His Trp Gly 1 5 10 15 GTC CTG GCG GGC CTT GCC TAC TAT TCC ATG GTG GGG AAC TGG GCT AAG 97 Val Leu Ala Gly Leu Ala Tyr Tyr Ser Met Val Gly Asn Trp Ala Lys 20 25 30 GTC TTG GTT GTG ATG CTG CTC TTC GCC GGT GTT GAC GGG GGG ACC CAC 145 Val Leu Val Val Met Leu Leu P(e Ala GLy VAl Asp Gly Gly THr His 35 40 45 GTG ACA GGG GGG AAG GTA GCC TAC ACC ACC CAG GGC TTT ACA TCC TTC 193 Val Thr Gly Gly Lys Val Ala Tyr Thr Thr Gln Gly Phe Thr Ser Phe 50 55 60 TTT TCA CGA GGG CCG TCT CAG AAA ATC CAA CTT GTA AAC ACT AAC GGC 241 Phe Ser Arg Gly Pro Ser Gln Lys Ile Gln Leu Val Asn Thr Asn Gly 65 70 75 80 AGC TGG CAC ATC AAT AGG ACT GCC CTC AAT TGC AAT GAC TCC CTT AAC 289 Ser Trp His Ile Asn Arg Thr Ala Leu Asn Cys Asn Asp Ser Leu Asn 85 90 95 ACC GGG TTC CTT GCC GCG CTG TTC TAC ACC CAC AGC TTC AAC GCG TCC 337 Thr Gly Phe Leu Ala Ala Leu Phe Tyr Thr His Ser Phe Asn Ala Ser 100 105 110 GGA TGT CCG GAG CGT ATG GCC GGT TGC CGC CCC ATT GAC GAG TTC GCT 385 Gly Cys Pro Glu Arg Met Ala Gly Cys Arg Pro Ile Asp Glu Phe Ala 115 120 125 CAG GGG TGG GGT CCC ATC ACT CAT GTT GTG CCT AAC ATC TCG GAC CAG 433 Gln Gly Trp Gly Pro Ile Thr His Val Val Pro Asn Ile Ser Asp Gln 130 135 140 AGG CCC TAT TGC TGG CAC TAC GCG CCT CGA CCG TGT GGT ATC GTA CCC 481 Arg Pro Tyr Cys Trp His Tyr Ala Pro Arg Pro Cys Gly Ile Val Pro 145 150 155 160 GCG TCG CAG GTG TGT GGT CCG GTG TAT TGC TTC ACC CCA AGC CCT GTT 529 Ala Ser Gln Val Cys Gly Pro Val Tyr Cys Phe Thr Pro Ser Pro Val 165 170 175 GTG GTG GGG ACG ACC GAT CGT TTC GGC GCC CCC ACG TAC AAC TGG GGA 577 Val Val Gly Thr Thr Asp Arg Phe Gly Ala Pro Thr Tyr Asn Trp Gly 180 185 190 AAC AAT GAG ACG GAT GTG CTA CTC CTC AAC AAC ACA CGG CCG CCG CAG 625 Asn Asn Glu Thr Asp Val Leu Leu Leu Asn Asn Thr Arg Pro Pro Gln 195 200 205 GGC AAC TGG TTC GGT TGT ACC TGG ATG 652 Gly Asn Trp Phe Gly Cys Thr Trp Met 210 215
【０２６７】配列番号：29 配列の長さ：977 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N19MX24A-1 配列 GAG GCC GTG AAC TGC GAT GAC TCC CTT AAC ACC GGG TTC CTT GCC GCG 48 Glu Ala Val Asn Cys Asp Asp Ser Leu Asn Thr Gly Phe Leu Ala Ala 1 5 10 15 CTG TTC TAC ACG CAC AGG TTC AAC GCG TCC GGA TGT CCG GAG CGT ATG 96 Leu Phe Tyr Thr His Arg Phe Asn Ala Ser Gly Cys Pro Glu Arg Met 20 25 30 GCC GGT TGC CGC CCC ATT GAC GAG TTC GCT CAG GGG TGG GGT CCC ATC 144 Ala Gly Cys Arg Pro Ile Asp Glu Phe Ala Gln Gly Trp Gly Pro Ile 35 40 45 ACT CAT GTT GTG CCT AAC ATC TCG GAC CAG AGG CCC TAT TGC TGG CAC 192 Thr His Val Val Pro Asn Ile Ser Asp Gln Arg Pro Tyr Cys Trp His 50 55 60 TAC GCG CCT CGA CCG TGT GGT ATC GTA CCC GCG TCG CAG GTG TGT GGT 240 Tyr Ala Pro Arg Pro Cys Gly Ile Val Pro Ala Ser Gln Val Cys Gly 65 70 75 80 CCG GTG TAT TGC TTC ACC CCA AGC CCT GTT GTG GTG GGG ACG ACC GAT 288 Pro Val Tyr Cys Phe Thr Pro Ser Pro Val Val Val Gly Thr Thr Asp 85 90 95 CGT TTC GGC GCC CCC ACG TAC AAC TGG GGA AAC AAT GAG ACG GAT GTG 336 Arg Phe Gly Ala Pro Thr Tyr Asn Trp Gly Asn Asn Glu Thr Asp Val 100 105 110 CTA CTC CTC AAC AAC ACA CGG CCG CCG CAG GGC AAC TGG TTC GGT TGT 384 Leu Leu Leu Asn Asn Thr Arg Pro Pro Gln Gly Asn Trp Phe Gly Cys 115 120 125 ACC TGG ATG AAT GGC ACT GGG TTC ACA AAG ACG TGC GGG GGC CCC CCG 432 Thr Trp Met Asn Gly Thr Gly Phe Thr Lys Thr Cys Gly Gly Pro Pro 130 135 140 TGC AAC ATC GGG GGG GTC GGC AAC AAT ACC TTG ACT TGC CCC ACG GAC 480 Cys Asn Ile Gly Gly Val Gly Asn Asn Thr Leu Thr Cys Pro Thr Asp 145 150 155 160 TGC TTC CGG AAG CAC CCC GAG GCC ACT TAC ACA AAA TGT GGT TCG GGG 528 Cys Phe Arg Lys His Pro Glu Ala Thr Tyr Thr Lys Cys Gly Ser Gly 165 170 175 CCT TGG TTG ACA CCT AGG TGC CTA GTT CAT TAC CCA TAC AGG CTC TGG 576 Pro Trp Leu Thr Pro Arg Cys Leu Val His Tyr Pro Tyr Arg Leu Trp 180 185 190 CAC TAT CCC TGC ACT GTC AAC TTT ACC ATC TTC AAG GTT AGG ATG TAT 624 His Tyr Pro Cys Thr Val Asn Phe Thr Ile Phe Lys Val Arg Met Tyr 195 200 205 GTG GGG GGC GTG GAA CAC AGG CTT GAA GCT GCA TGC AAT TGG ACC CGA 672 Val Gly Gly Val Glu His Arg Leu Glu Ala Ala Cys Asn Trp Thr Arg 210 215 220 GGA GAG CGT TGT GAC TTG GAG GAC AGG GAT AGA TCA GAG CTT AGC CCG 720 Gly Glu Arg Cys Asp Leu Glu Asp Arg Asp Arg Ser Glu Leu Ser Pro 225 230 235 240 CTA TTG CTG TCC ACA ACA GAG TGG CAG GTA CTG CCC TGT TCC TTC ACC 768 Leu Leu Leu Ser Thr Thr Glu Trp Gln Val Leu Pro Cys Ser Phe Thr 245 250 255 ACC CTG CCG GCT CTG TCC ACT GGT TTG ATT CAT CTC CAT CAG AAC ATC 816 Thr Leu Pro Ala Leu Ser Thr Gly Leu Ile His Leu His Gln Asn Ile 260 265 270 GTG GAC GTG CAA TAT CTG TAC GGC ATA GGG TCG GCG GTT GTC TCC TTC 864 Val Asp Val Gln Tyr Leu Tyr Gly Ile Gly Ser Ala Val Val Ser Phe 275 280 285 GCA ATC AAA TGG GAA TAT ATT CTG TTG CTT TTC CTC CCC CTG GCG GAC 912 Ala Ile Lys Trp Glu Tyr Ile Leu Leu Leu Phe Leu Pro Leu Ala Asp 290 295 300 GCG CGC GTC TGT GCC TGC TTG TGG ATG ATG CTG CTG ATA GCC CAC GCC 960 Ala Arg Val Cys Ala Cys Leu Trp Met Met Leu Leu Ile Ala His Ala 305 310 315 320 GAC GCC ACC TTA GAG AA 977 Asp Ala Thr Leu Glu 325
【０２６８】配列番号：30 配列の長さ：977 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N19MX24B-1 配列 GAG GCC GTG AAC TGC GAT GAC TCC CTT AAC ACC GGG TTC CTT GCC GCG 48 Glu Ala Val Asn Cys Asp Asp Ser Leu Asn Thr Gly Phe Leu Ala Ala 1 5 10 15 CTG TTC TAC ACG CAC AGG TTC AAC GCG TCC GGA TGT CCG GAG CGT ATG 96 Leu Phe Tyr Thr His Arg Phe Asn Ala Ser Gly Cys Pro Glu Arg Met 20 25 30 GCC GGT TGC CGC CCC ATT GAC GAG TTC GCT CAG GGG TGG GGT CCC ATC 144 Ala Gly Cys Arg Pro Ile Asp Glu Phe Ala Gln Gly Trp Gly Pro Ile 35 40 45 ACT CAT GTT GTG CCT AAC ATC TCG GAC CAG AGG CCC TAT TGC TGG CAC 192 Thr His Val Val Pro Asn Ile Ser Asp Gln Arg Pro Tyr Cys Trp His 50 55 60 TAC GCG CCT CGA CCG TGT GGT ATC GTA CCC GCG TCG CAG GTG TGT GGT 240 Tyr Ala Pro Arg Pro Cys Gly Ile Val Pro Ala Ser Gln Val Cys Gly 65 70 75 80 CCG GTG TAT TGC TTC ACC CCA AGC CCT GTT GTG GTG GGG ACG ACC GAT 288 Pro Val Tyr Cys Phe Thr Pro Ser Pro Val Val Val Gly Thr Thr Asp 85 90 95 CGT TTC GGC GCC CCC ACG TAC AAC TGG GGA AAC AAT GAG ACG GAT GTG 336 Arg Phe Gly Ala Pro Thr Tyr Asn Trp Gly Asn Asn Glu Thr Asp Val 100 105 110 CTA CTC CTC AAC AAC ACA CGG CCG CCG CAG GGG AAC TGG TTT GGC TGT 384 Leu Leu Leu Asn Asn Thr Arg Pro Pro Gln Gly Asn Trp Phe Gly Cys 115 120 125 ACA TGG ATG AAT GGC ACT GGG TTC ACA AAG ACG TGC GGG GGC CCC CCG 432 Thr Trp Met Asn Gly Thr Gly Phe Thr Lys Thr Cys Gly Gly Pro Pro 130 135 140 TGC AAC ATC GGG GGG GTC GGC AAC AAT ACC TTG ACT TGC CCC ACG GAC 480 Cys Asn Ile Gly Gly Val Gly Asn Asn Thr Leu Thr Cys Pro Thr Asp 145 150 155 160 TGC TTC CGG AAG CAC CCC GAG GCC ACT TAC ACA AAA TGT GGT TCG GGG 528 Cys Phe Arg Lys His Pro Glu Ala Thr Tyr Thr Lys Cys Gly Ser Gly 165 170 175 CCT TGG TTG ACA CCT AGG TGC CTA GTT CAT TAC CCA TAC AGG CTC TGG 576 Pro Trp Leu Thr Pro Arg Cys Leu Val His Tyr Pro Tyr Arg Leu Trp 180 185 190 CAC TAT CCC TGC ACT GTC AAC TTT ACC ATC TTC AAG GTT AGG ATG TAT 624 His Tyr Pro Cys Thr Val Asn Phe Thr Ile Phe Lys Val Arg Met Tyr 195 200 205 GTG GGG GGC GTG GAA CAC AGG CTT GAA GCT GCA TGC AAT TGG ACC CGA 672 Val Gly Gly Val Glu His Arg Leu Glu Ala Ala Cys Asn Trp Thr Arg 210 215 220 GGA GAG CGT TGT GAC TTG GAG GAC AGG GAT AGA TCA GAG CTT AGC CCG 720 Gly Glu Arg Cys Asp Leu Glu Asp Arg Asp Arg Ser Glu Leu Ser Pro 225 230 235 240 CTA TTG CTG TCC ACA ACA GAG TGG CAG GTA CTG CCC TGT TCC TTC ACC 768 Leu Leu Leu Ser Thr Thr Glu Trp Gln Val Leu Pro Cys Ser Phe Thr 245 250 255 ACC CTG CCG GCT CTG TCC ACT GGT TTG ATT CAT CTC CAT CAG AAC ATC 816 Thr Leu Pro Ala Leu Ser Thr Gly Leu Ile His Leu His Gln Asn Ile 260 265 270 GTG GAC GTG CAA TAT CTG TAC GGC ATA GGG TCG GCG GTT GTC TCC TTC 864 Val Asp Val Gln Tyr Leu Tyr Gly Ile Gly Ser Ala Val Val Ser Phe 275 280 285 GCA ATC AAA TGG GAA TAT ATT CTG TTG CTT TTC CTC CCC CTG GCG GAC 912 Ala Ile Lys Trp Glu Tyr Ile Leu Leu Leu Phe Leu Pro Leu Ala Asp 290 295 300 GCG CGC GTC TGT GCC TGC TTG TGG ATG ATG CTG CTG ATA GCC CAC GCC 960 Ala Arg Val Cys Ala Cys Leu Trp Met Met Leu Leu Ile Ala His Ala 305 310 315 320 GAC GCC ACC TTA GAG AA 977 Asp Ala Thr Leu Glu 325
【０２６９】配列番号：31 配列の長さ：1236 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N27MX24A-1 配列 C CGG ATC CCA CAA GCC GTG GTG GAT ATG GTG GCA GGG GCC CAC TGG GGA 49 Arg Ile Pro Gln Ala Val Val Asp Met Val Ala Gly Ala His Trp Gly 1 5 10 15 GTC CTG GCG GGC CTT GCC TAC TAT TCC ATG GTG GGG AAC TGG GCT AAG 97 Val Leu Ala Gly Leu Ala Tyr Tyr Ser Met Val Gly Asn Trp Ala Lys 20 25 30 GTC TTG GTT GTG ATG CTG CTC TTC GCC GGT GTT GAC GGG GGG ACC CAC 145 Val Leu Val Val Met Leu Leu Phe Ala Gly Val Asp Gly Gly Thr His 35 40 45 GTG ACA GGG GGG AAG GTA GCC TAC ACC ACC CAG GGC TTT ACA TCC TTC 193 Val Thr Gly Gly Lys Val Ala Tyr Thr Thr Gln Gly Phe Thr Ser Phe 50 55 60 TTT TCA CGA GGG CCG TCT CAG AAA ATC CAA CTT GTA AAC ACT AAC GGC 241 Phe Ser Arg Gly Pro Ser Gln Lys Ile Gln Leu Val Asn Thr Asn Gly 65 70 75 80 AGC TGG CAC ATC AAT AGG ACT GCC CTC AAT TGC AAT GAC TCC CTT AAC 289 Ser Trp His Ile Asn Arg Thr Ala Leu Asn Cys Asn Asp Ser Leu Asn 85 90 95 ACC GGG TTC CTT GCC GCG CTG TTC TAC ACC CAC AGC TTC AAC GCG TCC 337 Thr Gly Phe Leu Ala Ala Leu Phe Tyr Thr His Ser Phe Asn Ala Ser 100 105 110 GGA TGT CCG GAG CGT ATG GCC GGT TGC CGC CCC ATT GAC GAG TTC GCT 385 Gly Cys Pro Glu Arg Met Ala Gly Cys Arg Pro Ile Asp Glu Phe Ala 115 120 125 CAG GGG TGG GGT CCC ATC ACT CAT GTT GTG CCT AAC ATC TCG GAC CAG 433 Gln Gly Trp Gly Pro Ile Thr His Val Val Pro Asn Ile Ser Asp Gln 130 135 140 AGG CCC TAT TGC TGG CAC TAC GCG CCT CGA CCG TGT GGT ATC GTA CCC 481 Arg Pro Tyr Cys Trp His Tyr Ala Pro Arg Pro Cys Gly Ile Val Pro 145 150 155 160 GCG TCG CAG GTG TGT GGT CCG GTG TAT TGC TTC ACC CCA AGC CCT GTT 529 Ala Ser Gln Val Cys Gly Pro Val Tyr Cys Phe Thr Pro Ser Pro Val 165 170 175 GTG GTG GGG ACG ACC GAT CGT TTC GGC GCC CCC ACG TAC AAC TGG GGA 577 Val Val Gly Thr Thr Asp Arg Phe Gly Ala Pro Thr Tyr Asn Trp Gly 180 185 190 AAC AAT GAG ACG GAT GTG CTA CTC CTC AAC AAC ACA CGG CCG CCG CAG 625 Asn Asn Glu Thr Asp Val Leu Leu Leu Asn Asn Thr Arg Pro Pro Gln 195 200 205 GGC AAC TGG TTC GGT TGT ACC TGG ATG AAT GGC ACT GGG TTC ACA AAG 673 Gly Asn Trp Phe Gly Cys Thr Trp Met Asn Gly Thr Gly Phe Thr Lys 210 215 220 ACG TGC GGG GGC CCC CCG TGC AAC ATC GGG GGG GTC GGC AAC AAT ACC 721 Thr Cys Gly Gly Pro Pro Cys Asn Ile Gly Gly Val Gly Asn Asn Thr 225 230 235 240 TTG ACT TGC CCC ACG GAC TGC TTC CGG AAG CAC CCC GAG GCC ACT TAC 769 Leu Thr Cys Pro Thr Asp Cys Phe Arg Lys His Pro Glu Ala Thr Tyr 245 250 255 ACA AAA TGT GGT TCG GGG CCT TGG TTG ACA CCT AGG TGC CTA GTT CAT 817 Thr Lys Cys Gly Ser Gly Pro Trp Leu Thr Pro Arg Cys Leu Val His 260 265 270 TAC CCA TAC AGG CTC TGG CAC TAT CCC TGC ACT GTC AAC TTT ACC ATC 865 Tyr Pro Tyr Arg Leu Trp His Tyr Pro Cys Thr Val Asn Phe Thr Ile 275 280 285 TTC AAG GTT AGG ATG TAT GTG GGG GGC GTG GAA CAC AGG CTT GAA GCT 913 Phe Lys Val Arg Met Tyr Val Gly Gly Val Glu His Arg Leu Glu Ala 290 295 300 GCA TGC AAT TGG ACC CGA GGA GAG CGT TGT GAC TTG GAG GAC AGG GAT 961 Ala Cys Asn Trp Thr Arg Gly Glu Arg Cys Asp Leu Glu Asp Arg Asp 305 310 315 320 AGA TCA GAG CTT AGC CCG CTA TTG CTG TCC ACA ACA GAG TGG CAG GTA 1009 Arg Ser Glu Leu Ser Pro Leu Leu Leu Ser Thr Thr Glu Trp Gln Val 325 330 335 CTG CCC TGT TCC TTC ACC ACC CTG CCG GCT CTG TCC ACT GGT TTG ATT 1057 Leu Pro Cys Ser Phe Thr Thr Leu Pro Ala Leu Ser Thr Gly Leu Ile 340 345 350 CAT CTC CAT CAG AAC ATC GTG GAC GTG CAA TAT CTG TAC GGC ATA GGG 1105 His Leu His Gln Asn Ile Val Asp Val Gln Tyr Leu Tyr Gly Ile Gly 355 360 365 TCG GCG GTT GTC TCC TTC GCA ATC AAA TGG GAA TAT ATT CTG TTG CTT 1153 Ser Ala Val Val Ser Phe Ala Ile Lys Trp Glu Tyr Ile Leu Leu Leu 370 375 380 TTC CTC CCC CTG GCG GAC GCG CGC GTC TGT GCC TGC TTG TGG ATG ATG 1201 Phe Leu Pro Leu Ala Asp Ala Arg Val Cys Ala Cys Leu Trp Met Met 385 390 395 400 CTG CTG ATA GCC CAC GCC GAC GCC ACC TTA GAG AA 1236 Leu Leu Ile Ala His Ala Asp Ala Thr Leu Glu 405 410
【０２７０】配列番号：32 配列の長さ：1236 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N27MX24B-1 配列 C CGG ATC CCA CAA GCC GTG GTG GAT ATG GTG GCA GGG GCC CAC TGG GGA 49 Arg Ile Pro Gln Ala Val Val Asp Met Val Ala Gly Ala His Trp Gly 1 5 10 15 GTC CTG GCG GGC CTT GCC TAC TAT TCC ATG GTG GGG AAC TGG GCT AAG 97 Val Leu Ala Gly Leu Ala Tyr Tyr Ser Met Val Gly Asn Trp Ala Lys 20 25 30 GTC TTG GTT GTG ATG CTG CTC TTC GCC GGT GTT GAC GGG GGG ACC CAC 145 Val Leu Val Val Met Leu Leu Phe Ala Gly Val Asp Gly Gly Thr His 35 40 45 GTG ACA GGG GGG AAG GTA GCC TAC ACC ACC CAG GGC TTT ACA TCC TTC 193 Val Thr Gly Gly Lys Val Ala Tyr Thr Thr Gln Gly Phe Thr Ser Phe 50 55 60 TTT TCA CGA GGG CCG TCT CAG AAA ATC CAA CTT GTA AAC ACT AAC GGC 241 Phe Ser Arg Gly Pro Ser Gln Lys Ile Gln Leu Val Asn Thr Asn Gly 65 70 75 80 AGC TGG CAC ATC AAT AGG ACT GCC CTC AAT TGC AAT GAC TCC CTT AAC 289 Ser Trp His Ile Asn Arg Thr Ala Leu Asn Cys Asn Asp Ser Leu Asn 85 90 95 ACC GGG TTC CTT GCC GCG CTG TTC TAC ACC CAC AGC TTC AAC GCG TCC 337 Thr Gly Phe Leu Ala Ala Leu Phe Tyr Thr His Ser Phe Asn Ala Ser 100 105 110 GGA TGT CCG GAG CGT ATG GCC GGT TGC CGC CCC ATT GAC GAG TTC GCT 385 Gly Cys Pro Glu Arg Met Ala Gly Cys Arg Pro Ile Asp Glu Phe Ala 115 120 125 CAG GGG TGG GGT CCC ATC ACT CAT GTT GTG CCT AAC ATC TCG GAC CAG 433 Gln Gly Trp Gly Pro Ile Thr His Val Val Pro Asn Ile Ser Asp Gln 130 135 140 AGG CCC TAT TGC TGG CAC TAC GCG CCT CGA CCG TGT GGT ATC GTA CCC 481 Arg Pro Tyr Cys Trp His Tyr Ala Pro Arg Pro Cys Gly Ile Val Pro 145 150 155 160 GCG TCG CAG GTG TGT GGT CCG GTG TAT TGC TTC ACC CCA AGC CCT GTT 529 Ala Ser Gln Val Cys Gly Pro Val Tyr Cys Phe Thr Pro Ser Pro Val 165 170 175 GTG GTG GGG ACG ACC GAT CGT TTC GGC GCC CCC ACG TAC AAC TGG GGA 577 Val Val Gly Thr Thr Asp Arg Phe Gly Ala Pro Thr Tyr Asn Trp Gly 180 185 190 AAC AAT GAG ACG GAT GTG CTA CTC CTC AAC AAC ACA CGG CCG CCG CAG 625 Asn Asn Glu Thr Asp Val Leu Leu Leu Asn Asn Thr Arg Pro Pro Gln 195 200 205 GGG AAC TGG TTT GGC TGT ACA TGG ATG AAT GGC ACT GGG TTC ACA AAG 673 Gly Asn Trp Phe Gly Cys Thr Trp Met Asn Gly Thr Gly Phe Thr Lys 210 215 220 ACG TGC GGG GGC CCC CCG TGC AAC ATC GGG GGG GTC GGC AAC AAT ACC 721 Thr Cys Gly Gly Pro Pro Cys Asn Ile Gly Gly Val Gly Asn Asn Thr 225 230 235 240 TTG ACT TGC CCC ACG GAC TGC TTC CGG AAG CAC CCC GAG GCC ACT TAC 769 Leu Thr Cys Pro Thr Asp Cys Phe Arg Lys His Pro Glu Ala Thr Tyr 245 250 255 ACA AAA TGT GGT TCG GGG CCT TGG TTG ACA CCT AGG TGC CTA GTT CAT 817 Thr Lys Cys Gly Ser Gly Pro Trp Leu Thr Pro Arg Cys Leu Val His 260 265 270 TAC CCA TAC AGG CTC TGG CAC TAT CCC TGC ACT GTC AAC TTT ACC ATC 865 Tyr Pro Tyr Arg Leu Trp His Tyr Pro Cys Thr Val Asn Phe Thr Ile 275 280 285 TTC AAG GTT AGG ATG TAT GTG GGG GGC GTG GAA CAC AGG CTT GAA GCT 913 Phe Lys Val Arg Met Tyr Val Gly Gly Val Glu His Arg Leu Glu Ala 290 295 300 GCA TGC AAT TGG ACC CGA GGA GAG CGT TGT GAC TTG GAG GAC AGG GAT 961 Ala Cys Asn Trp Thr Arg Gly Glu Arg Cys Asp Leu Glu Asp Arg Asp 305 310 315 320 AGA TCA GAG CTT AGC CCG CTA TTG CTG TCC ACA ACA GAG TGG CAG GTA 1009 Arg Ser Glu Leu Ser Pro Leu Leu Leu Ser Thr Thr Glu Trp Gln Val 325 330 335 CTG CCC TGT TCC TTC ACC ACC CTG CCG GCT CTG TCC ACT GGT TTG ATT 1057 Leu Pro Cys Ser Phe Thr Thr Leu Pro Ala Leu Ser Thr Gly Leu Ile 340 345 350 CAT CTC CAT CAG AAC ATC GTG GAC GTG CAA TAT CTG TAC GGC ATA GGG 1105 His Leu His Gln Asn Ile Val Asp Val Gln Tyr Leu Tyr Gly Ile Gly 355 360 365 TCG GCG GTT GTC TCC TTC GCA ATC AAA TGG GAA TAT ATT CTG TTG CTT 1153 Ser Ala Val Val Ser Phe Ala Ile Lys Trp Glu Tyr Ile Leu Leu Leu 370 375 380 TTC CTC CCC CTG GCG GAC GCG CGC GTC TGT GCC TGC TTG TGG ATG ATG 1201 Phe Leu Pro Leu Ala Asp Ala Arg Val Cys Ala Cys Leu Trp Met Met 385 390 395 400 CTG CTG ATA GCC CAC GCC GAC GCC ACC TTA GAG AA 1236 Leu Leu Ile Ala His Ala Asp Ala Thr Leu Glu 405 410
【０２７１】配列番号：33 配列の長さ：849 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：MX25 配列 TGT GCC TGG TTG TGG ATG ATG CTG CTG ATA GCC CAA GCT GAG GCC GCC 48 Cys Ala Trp Leu Trp Met Met Leu Leu Ile Ala Gln Ala Glu Ala Ala 1 5 10 15 TTG GAG AAC CTG GTG GTC CTC AAT GCA GCA TCC ATG GCS GGA GCG CAT 96 Leu Glu Asn Leu Val Val Leu Asn Ala Ala Ser Met Ala Gly Ala His 20 25 30 GGC ATC CTC TCT TTC CTT GTG TTC TTC TGT GCC GCC TGG TAC ATC AAA 144 Gly Ile Leu Ser Phe Leu Val Phe Phe Cys Ala Ala Trp Tyr Ile Lys 35 40 45 GGC AGG CTG GTC CCY GGG GCG RCA TAY GCT YTC TAT GGC GTA TGG CCG 192 Gly Arg Leu Val Pro Gly Ala Xaa Tyr Ala Xab Tyr Gly Val Trp Pro 50 55 60 CTG CTC CTG CTC TTG MTG GCG CTA CCS SCA CGG GCG TAC GCC ATG GAC 240 Leu Leu Leu Leu Leu Xac Ala Leu Pro Xad Arg Ala Tyr Ala Met Asp 65 70 75 80 CGG GAS ATG GCT GCA TCG TGC GGA GGC GCG GTT TTT GTA GGT CTG GTA 288 Arg Xae Met Ala Ala Ser Cys Gly Gly Ala Val Phe Val Gly Leu Val 85 90 95 CTC YTG ACC TTG TCA CCA TAC TAC AAA GTG TTC CTC GCT ARG CTC ATA 336 Leu Leu Thr Leu Ser Pro Tyr Tyr Lys Val Phe Leu Ala Xaf Leu Ile 100 105 110 TGG TGG TTR CAA TAT CTC ATC ACC AGR GCC GAG GCG CAC YTG CAA GTG 384 Trp Trp Leu Gln Tyr Leu Ile Thr Arg Ala Glu Ala His Leu Gln Val 115 120 125 TGG ATY CCC CCY CTY AAC GTY CGG GGR GGC CGC GAY GCC ATC ATC CTY 432 Trp Ile Pro Pro Leu Asn Val Arg Gly Gly Arg Asp Ala Ile Ile Leu 130 135 140 CTC ACR TGT GCG GTC CAY CCR GAG CTR ATY TTT GAC ATC ACC AAR CTY 480 Leu Tre Cys Ala Val His Pro Glu Leu Ile Phe Asp Ile Thr Lys Leu 145 150 155 160 YTG CTC GCC ATA CTC GGT CCG CTC ATG GTR CTC CAG GCT GSC MTA ACY 528 Leu Leu Ala Ile Leu Gly Pro Leu Met Val Leu Gln Ala Xag Xah Thr 165 170 175 MRA RTG CCG TAC TTY GTR CGY GCT CAA GGG CTC ATY CGT RYG TGC ATG 576 Xai Xaj Pro Tyr Phe Val Arg Ala Gln Gly Leu Ile Arg Xak Cys Met 180 185 190 TTR GTG CGG AAA GYC GCY GGR GGT CAT TAT GTY CAR ATG GCY YTY RTG 624 Leu Val Arg Lys Xal Ala Gly Gly His Tyr Val Gln Met Ala Xam Xan 195 200 205 AAG CTG GCY GCR CTG ACA GGT ACG TAC RTT TAT GWC CAT CTT RCY CCA 672 Lys Leu Ala Ala Leu Thr Gly Thr Tyr Xao Tyr Xap His Leu Xaq Pro 210 215 220 CTG CAG SAY TGG GCC CAY GCG GGC CTA CGR GAC CTT GCG GTR GCR GTW 720 Leu Gln Xar Trp Ala His Ala Gly Leu Arg Asp Leu Ala Val Ala Val 225 230 235 240 GAG CCC GTT GYC TTC TCT GAY ATG GAG ACY AAG ATC ATC ACC TGG GGG 768 Glu Pro Val Xas Phe Ser Asp Met Glu Tre Lys Ile Ile Thr Trp Gly 245 250 255 GCA GAC ACY GCG GCG TGT GGG GAC ATC ATT TTG GGC CTA CCW GTC TCC 816 Ala Asp Thr Ala Ala Cys Gly Asp Ile Ile Leu Gly Leu Pro Val Ser 260 265 270 GCC CGG AGG GGC AAC GAG ATA CTC CTC GGA CCG 849 Ala Arg Arg Gly Asn Glu Ile Leu Leu Gly Pro 275 280 Y : C or T R : A or G M : A or C K : G or T S : G or C W : A or T H : A or C or T B : G or T or C Xaa : Ala or Thr Xab : Phe or Leu Xac : Met or Leu Xad : Ala or Pro Xae : Glu or Asp Xaf : Lys or Arg Xag : Gly or Ala Xah : Leu or Ile Xai : Gln or Arg Xaj : Met or Val Xak : Met or Ala Xal : Ala or Val Xam : Leu or Phe Xan : Met or Val Xao : Val or Ile Xap : Asp or Val Xaq : Thr or Ala Xar : Asp or His Xas : Ala or Val
【０２７２】配列番号：34 配列の長さ：524 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：O26 配列 ATC ACG TGG GGG GCA GAG ACG GCG GCG TGT GGG GAC ATC ATC TCG GGT 48 Ile Thr Trp Gly Ala Glu Thr Ala Ala Cys Gly Asp Ile Ile Ser Gly 1 5 10 15 CTA CCC GTT TCC GCC CGA AGG GGG ARG GAG CTG CTT TTG GGR CCG GCC 96 Leu Pro Val Ser Ala Arg Arg Gly Xaa Glu Leu Leu Leu Gly Pro Ala 20 25 30 GAT AGT TTT GAC GGG CAG GGG TGG CGA CTC CTT GCG CCT ATC ACG GCC 144 Asp Ser Phe Asp Gly Gln Gly Trp Arg Leu Leu Ala Pro Ile Thr Ala 35 40 45 TAC TCC CAG CAR ACG CGG GGC CTG CTT GGT TGC ATC ATC ACY AGC CTT 192 Tyr Ser Gln Gln Thr Arg Gly Leu Leu Gly Cys Ile Ile Tre Ser Leu 50 55 60 ACG GGC CGG GAT AAR AAC CAG GTC GAG GGG GAG GTT CAA GTG GTC TCT 240 Thr Gly Arg Asp Lys Asn Gln Val Glu Gly Glu Val Gln Val Val Ser 65 70 75 80 ACC GCA ACA CAA TCT TTC CTG GCG ACC TGY RTC AAC GGC GTK TGC TGG 288 Thr Ala Thr Gln Ser Phe Leu Ala Thr Cys Xab Asn Gly Val Cys Trp 85 90 95 ACT GTT TTC CAC GGY GCC GGC TCG AAG ACC TTA GCC GGC CCA AAA GGC 336 Thr Val Phe His Gly Ala Gly Ser Lys Thr Leu Ala Gly Pro Lys Gly 100 105 110 CCA ATC ACC CAA ATG TAC ACC AAT GTR GAT CAG GAC CTC GTC GGY TGG 384 Pro Ile Thr Gln Met Tyr Thr Asn Val Asp Gln Asp Leu Val Gly Trp 115 120 125 TCG GCG CCC CCC SGG GCG CGT TCC TTG ACA CCW TGC ACC TGC GGC AGC 432 Ser Ala Pro Pro Xac Ala Arg Ser Leu Thr Pro Cys Thr Cys Gly Ser 130 135 140 TCG GAC CTT TAT TTG GTC ACG AGR CAT GCT GAT GTC ATT CCG GTG CAC 480 Ser Asp Leu Tyr Leu Val Thr Arg His Ala Asp Val Ile Pro Val His 145 150 155 160 CGG CGG GGC GAC AGC AGG GGG AGC CTC CTC TCC CCC GGG CCC AT 524 Arg Arg Gly Asp Ser Arg Gly Ser Leu Leu Ser Pro Gly Pro 165 170 Y : C or T R : A or G M : A or C
K : G or T S : G or C W : A or T H : A or C or T
B : G or T or C Xaa : Arg or Lys Xab : Val or Ile
Xac : Gly or Arg
【０２７３】配列番号：35 配列の長さ：921 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N23 配列 CTG CTG TCG CCC GGG CCC ATC TCY TAC YTG AAG GGY TCC TCG GGT GGT 48 Leu Leu Ser Pro Gly Pro Ile Ser Tyr Leu Lys Gly Ser Ser Gly Gly 1 5 10 15 CCG CTG CYT TGC CCC TCG GGC CRT GTT GTG GGC ATC TTC CGG GCT GCY 96 Pro Leu Xaa Cys Pro Ser Gly Xab Val Val Gly Ile Phe Arg Ala Ala 20 25 30 GTG TGC ACC CGG GGG GTT GCG AAG GCG GTR GAC TTT GTG CCC GTT GAG 144 Val Cys Thr Arg Gly Val Ala Lys Ala Val Asp Phe Val Pro Val Glu 35 40 45 TCT ATG GAA ACC ACY ATG CGG TCT CCG GTC TTC RCG GAT AAC TCA ACC 192 Ser Met Glu Thr Thr Met Arg Ser Pro Val Phe Xac Asp Asn Ser Thr 50 55 60 CCC CCG GCC GTA CCG CAG WCA TTC CAA GTG GCC CAC CTA CAC GCT CCC 240 Pro Pro Ala Val Pro Gln Xad Phe Gln Val Ala His Leu His Ala Pro 65 70 75 80 ACT GGC AGC GGC AAA AGC ACC ARG GTG CCG GCT GCG TAT GCG GCC CAA 288 Thr Gly Ser Gly Lys Ser Thr Xae Val Pro Ala Ala Tyr Ala Ala Gln 85 90 95 GGG TAC AAG GTA CTC GTC CTG AAC CCG TCC GTT GCT GCC ACT TTG GGC 336 Gly Tyr Lys Val Leu Val Leu Asn Pro Ser Val Ala Ala Thr Leu Gly 100 105 110 TTT GGG GCG TAY ATG TCC AAG GCA CAT GGT GTT GAC CCT AAC ATC AGA 384 Phe Gly Ala Tyr Met Ser Lys Ala His Gly Val Asp Pro Asn Ile Arg 115 120 125 ACT GGG GTG AGG ACC ATC ACC ACG GGC GCT CCC RTC ACG TAC TCC ACC 432 Thr Gly Val Arg Thr Ile Thr Thr Gly Ala Pro Xaf Thr Tyr Ser Thr 130 135 140 TAC GGT AAG TTC CTC GCC GAC GGT GGC TGT TCT GGG GGT GCC TAT GAC 480 Tyr Gly Lys Phe Leu Ala Asp Gly Gly Cys Ser Gly Gly Ala Tyr Asp 145 150 155 160 ATC ATA ATA TGT GAT GAG TGT CAT TCA ACT GAC TCG ACT TCC ATC TTG 528 Ile Ile Ile Cys Asp Glu Cys His Ser Thr Asp Ser Thr Ser Ile Leu 165 170 175 GGC ATT GGT ACA GTC CTG GAC CAA GCG GAG ACG GCT GGA GCG CGC CTT 576 Gly Ile Gly Thr Val Leu Asp Gln Ala Glu Thr Ala Gly Ala Arg Leu 180 185 190 GTC GTG CTC GCC ACC GCT ACG CCT CCG GGA TCG GTC ACC GTG CCG CAT 624 Val Val Leu Ala Thr Ala Thr Pro Pro Gly Ser Val Thr Val Pro His 195 200 205 CCT AAT ATT GAG GAG GTG GCC TTG TCC AAC ACT GGA GAG ATC CCC TTC 672 Pro Asn Ile Glu Glu Val Ala Leu Ser Asn Thr Gly Glu Ile Pro Phe 210 215 220 TAT GGC AAG GCC ATC CCC CTC GAG GCC ATC AAG GGG GGG AGG CAT CTC 720 Tyr Gly Lys Ala Ile Pro Leu Glu Ala Ile Lys Gly Gly Arg His Leu 225 230 235 240 AYT TTC TGC CAT TCC AAG AAG AAA TGT GAC GAG CTC GCT GCG AAG CTG 768 Xag Phe Cys His Ser Lys Lys Lys Cys Asp Glu Leu Ala Ala Lys Leu 245 250 255 TCG GCC CTC GGA GTC AAY GCT GTA GCA TAY TAC CGG GGT CTT GAT GTG 816 Ser Ala Leu Gly Val Asn Ala Val Ala Tyr Tyr Arg Gly Leu Asp Val 260 265 270 TCC RTC ATA CCG ACA AGC GGG GAC GTC GTT GTC GTG GCA ACW GAC GCT 864 Ser Xah Ile Pro Thr Ser Gly Asp Val Val Val Val Ala Thr Asp Ala 275 280 285 CTA ATG ACG GGC TAT ACC GGT GAC TTT GAC TCR GTG ATC GAC TGY AAC 912 Leu Met Thr Gly Tyr Thr Gly Asp Phe Asp Ser Val Ile Asp Cys Asn 290 295 300 ACA TGT GTC 921 Thr Cys Val 305 Y : C or T R : A or G M : A or C
K : G or T S : G or C W : A or T H : A or C or
T B : G or T orC Xaa : Leu or Pro Xab : His or Arg
Xac : Thr orAla Xad : Ser or Thr Xae : Lys or Arg
Xaf : Ile orVal Xag : Thr or Ile Xah : Val or Ile
【０２７４】配列番号：36 配列の長さ：623 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N16 配列 GGC TAT ACC GGC GAC TTC GAC TCA GTG ATC GAC TGC AAC ACA TGT GTC 48 Gly Tyr Thr Gly Asp Phe Asp Ser Val Ile Asp Cys Asn Thr Cys Val 1 5 10 15 ACC CAA ACA GTC GAT TTC AGC TTG GAC CCT ACT TTC ACC ATY GAG ACG 96 Thr Gln Thr Val Asp Phe Ser Leu Asp Pro Thr Phe Thr Ile Glu Thr 20 25 30 ACG ACC GTA CCC CAA GAT GCG GTG TCG CGC TCG CAG CGG CGA GGC AGG 144 Thr Thr Val Pro Gln Asp Ala Val Ser Arg Ser Gln Arg Arg Gly Arg 35 40 45 ACT GGT AGG GGC AGR GGG GGC ATA TAC AGG TTT GTA ACT CCA GGG GAA 192 Thr Gly Arg Gly Arg Gly Gly Ile Tyr Arg Phe Val Thr Pro Gly Glu 50 55 60 CGG CCC TCA GGC ATG TTC GAT TCT TCG GTC CTG TGT GAA TGT TAT GAC 240 Arg Pro Ser Gly Met Phe Asp Ser Ser Val Leu Cys Glu Cys Tyr Asp 65 70 75 80 GCG GGC TGT GCT TGG TAC GAG CTC ACG YCC GCC GAG ACC TCG GTT AGG 288 Ala Gly Cys Ala Trp Tyr Glu Leu Thr Xaa Ala Glu Thr Ser Val Arg 85 90 95 TTG CGG GCT TAC CTA AAY ACA CCT GGG CTG CCC GTC TGC CAG GAC CAT 336 Leu Arg Ala Tyr Leu Asn Thr Pro Gly Leu Pro Val Cys Gln Asp His 100 105 110 CTG GAG TTC TGG GAG AGC GTC TTC ACC GGC CTC ACC CAC ATA GAT GCC 384 Leu Glu Phe Trp Glu Ser Val Phe Thr Gly Leu Thr His Ile Asp Ala 115 120 125 CAC TTC TTG TCC CAG ACY AAA CAG GCA GGA GAC AAC TTC CCC TAC CTG 432 His Phe Leu Ser Gln Thr Lys Gln Ala Gly Asp Asn Phe Pro Tyr Leu 130 135 140 GTA GCA TAC CAG GCT ACA GTG TGC GCC AGG GCC AAG GCT CCA CCT CCA 480 Val Ala Tyr Gln Ala Thr Val Cys Ala Arg Ala Lys Ala Pro Pro Pro 145 150 155 160 TCG TGG GAT CAG ATG TGG AAG TGT CTC ATA CGG CTG AAG CCT ACG CTA 528 Ser Trp Asp Gln Met Trp Lys Cys Leu Ile Arg Leu Lys Pro Thr Leu 165 170 175 CAC GGG CCA ACG CCC CTG TTG YAT AGG TTA GGA GCC GTT CAG AAC RAG 576 His Gly Pro Thr Pro Leu Leu Xab Arg Leu Gly Ala Val Gln Asn Xac 180 185 190 GTT RCC CTY ACA CAC CCY ATA ACC AAG TAC ATC ATG ACA TGC ATG TC 623 Val Xad Leu Thr His Pro Ile Thr Lys Tyr Ile Met Thr Cys Met 195 200 205 Y : C or T R : A or G M : A or C
K : G or TS : G or C W : A or T H
: A or C or T B : G or T or CXaa : Pro or Ser
Xab : Tyr or His Xac : Glu or
LysXad : Thr or Ala
【０２７５】配列番号：37 配列の長さ：623 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：U16-4 配列 GGC TAT ACC GGC GAC TTC GAC TCG GTG ATC GAC TGT AAT ACA TGT GTC 48 Gly Tyr Thr Gly Asp Phe Asp Ser Val Ile Asp Cys Asn Thr Cys Val 1 5 10 15 ATC CAG ACA GTC GAC TTC AGC TTG GAC CCC ACC TTC ACC ATC GAG ACG 96 Ile Gln Thr Val Asp Phe Ser Leu Asp Pro Thr Phe Thr Ile Glu Thr 20 25 30 ACT ACC GTG CCC CAA GAC GCG GTG TCA CGC TCG CAA CGG CGA GGC AGG 144 Thr Thr Val Pro Gln Asp Ala Val Ser Arg Ser Gln Arg Arg Gly Arg 35 40 45 ACT GGC AGG GGC AGG CAA GGC ATT TAC AGG TTT GTG ACT CCA GGA GAA 192 Thr Gly Arg Gly Arg Gln Gly Ile Tyr Arg Phe Val Thr Pro Gly Glu 50 55 60 CGG CCC TCG GGC ATG TTC GAT TCC TCG GTC CTG TGC GAG TGC TAT GAC 240 Arg Pro Ser Gly Met Phe Asp Ser Ser Val Leu Cys Glu Cys Tyr Asp 65 70 75 80 GCG GGC TGT GCT TGG TAC GAG CTC CCG CCC GCC GAG ACC ACG GTC AGG 288 Ala Gly Cys Ala Trp Tyr Glu Leu Pro Pro Ala Glu Thr Thr Val Arg 85 90 95 TTG CGG GCT TAC CTG AAC ACC CCA GGG CTG CCC GTC TGC CAG GAC CAT 336 Leu Arg Ala Tyr Leu Asn Thr Pro Gly Leu Pro Val Cys Gln Asp His 100 105 110 CTG GAG TTC TGG GAG AGC GTC TTC ACA GGC CTC ACC CAC ATA GAT GCC 384 Leu Glu Phe Trp Glu Ser Val Phe Thr Gly Leu Thr His Ile Asp Ala 115 120 125 CAC TTC TTG TCC CAG ACC AAG CAA GCA GGA GAC AAT CTC CCT TAC CTG 432 His Phe Leu Ser Gln Thr Lys Gln Ala Gly Asp Asn Leu Pro Tyr Leu 130 135 140 GTA GCG TAC CAA GCA ACA GTG TGC GCT AGA GCT CAG GCT CCA CCT CCA 480 Val Ala Tyr Gln Ala Thr Val Cys Ala Arg Ala Gln Ala Pro Pro Pro 145 150 155 160 TCA TGG GAT CAA ATG TGG AAG TGT CTC ATA CGG CTA AAA CCT ACA CTA 528 Ser Trp Asp Gln Met Trp Lys Cys Leu Ile Arg Leu Lys Pro Thr Leu 165 170 175 CGC GGG CCA ACG CCC CTG CTG TAT AGG CTG GGA GCC GTC CAA AAT GAG 576 Arg Gly Pro Thr Pro Leu Leu Tyr Arg Leu Gly Ala Val Gln Asn Glu 180 185 190 GTC AAC CTC ACG CAC CCC GTA ACC AAA TAC ATC ATG ACA TGC ATG TC 623 Val Asn Leu Thr His Pro Val Thr Lys Tyr Ile Met Thr Cys Met 195 200 205
【０２７６】配列番号：38 配列の長さ：618 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N13-1 配列 GCGGATCC GGC CTC ACC CAC ATA GAT GCC CAC TTC CTG TCC CAG ACC AAA 50 Gly Leu Thr His Ile Asp Ala His Phe Leu Ser Gln Thr Lys 1 5 10 CAG GCA GGA GAC AAC TTC CCC TAC CTG GTA GCA TAC CAG GCT ACA GTG 98 Gln Ala Gly Asp Asn Phe Pro Tyr Leu Val Ala Tyr Gln Ala Thr Val 15 20 25 30 TGC GCC AGG GCC AAG GCT CCA CCT CCA TCG TGG GAT CAG ATG TGG AAG 146 Cys Ala Arg Ala Lys Ala Pro Pro Pro Ser Trp Asp Gln Met Trp Lys 35 40 45 TGT CTC ATA CGG CTG AAG CCT ACG CTA CAC GGG CCA ACG CCC CTG TTG 194 Cys Leu Ile Arg Leu Lys Pro Thr Leu His Gly Pro Thr Pro Leu Leu 50 55 60 TAT AGG TTA GGA GCC GTT CAG AAC GAG GTT ACC CTC ACA CAC CCC ATA 242 Tyr Arg Leu Gly Ala Val Gln Asn Glu Val Thr Leu Thr His Pro Ile 65 70 75 ACC AAG TTC ATC ATG GCA TGC ATG TCG GCT GAC CTA GAG GTC GTC ACT 290 Thr Lys Phe Ile Met Ala Cys Met Ser Ala Asp Leu Glu Val Val Thr 80 85 90 AGC ACT TGG GTG CTG GTA GGC GGG GTC CTC GCG GCT CTG GCC GCG TAC 338 Ser Thr Trp Val Leu Val Gly Gly Val Leu Ala Ala Leu Ala Ala Tyr 95 100 105 110 TGC CTG ACA ACG GGC AGC GTG GTC ATT GTG GGC AGG ATC GTC TTG TCC 386 Cys Leu Thr Thr Gly Ser Val Val Ile Val Gly Arg Ile Val Leu Ser 115 120 125 GGG AGG CCG GTT GTT ATT CCC GAC AGG GAA GTT CTC TAC CAA GAG TTC 434 Gly Arg Pro Val Val Ile Pro Asp Arg Glu Val Leu Tyr Gln Glu Phe 130 135 140 GAT GAA ATG GAA GAG TGC GCC TCG CAC CTC CCT TAC ATC GAA CAA GGA 482 Asp Glu Met Glu Glu Cys Ala Ser His Leu Pro Tyr Ile Glu Gln Gly 145 150 155 ATG CAG CTC GCC GAG CAA TTC AAG CAG AAG GCG CTC GGT TTG CTG CAA 530 Met Gln Leu Ala Glu Gln Phe Lys Gln Lys Ala Leu Gly Leu Leu Gln 160 165 170 ACA GCC ACC AAG CAA GCG GAG GCT GCT GCT CCC GTG GTG GAG TCC AAG 578 Thr Ala Thr Lys Gln Ala Glu Ala Ala Ala Pro Val Val Glu Ser Lys 175 180 185 190 TGG CGA GCC CTT GAG ACC TTC TGG GCG AAG CA GGATCCGC 618 Trp Arg Ala Leu Glu Thr Phe Trp Ala Lys 195 200
【０２７７】配列番号：39 配列の長さ：969 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N15-1 配列 GCGGATCCT CCA CCT CCA TCG TGG GAT CAA ATG TGG AAG TGT CTC ATA CGG 51 Pro Pro Pro Ser Trp Asp Gln Met Trp Lys Cys Leu Ile Arg 1 5 10 CTG AAG CCT ACG CTA CAC GGG CCA ACG CCC CTG TTG TAT AGG TTA GGA 99 Leu Lys Pro Thr Leu His Gly Pro Thr Pro Leu Leu Tyr Arg Leu Gly 15 20 25 30 GCC GTT CAG AAC GAG GTT ACC CTC ACA CAC CCC ATA ACC AAG TTC ATC 147 Ala Val Gln Asn Glu Val Thr Leu Thr His Pro Ile Thr Lys Phe Ile 35 40 45 ATG GCA TGC ATG TCG GCT GAC CTA GAG GTC GTC ACT AGC ACT TGG GTG 195 Met Ala Cys Met Ser Ala Asp Leu Glu Val Val Thr Ser Thr Trp Val 50 55 60 CTG GTA GGC GGG GTC CTC GCG GCT CTG GCC GCG TAC TGC CTG ACA ACG 243 Leu Val Gly Gly Val Leu Ala Ala Leu Ala Ala Tyr Cys Leu Thr Thr 65 70 75 GGC AGC GTG GTC ATT GTG GGC AGG ATC ATC TTG TCC GGG AGG CCG GCC 291 Gly Ser Val Val Ile Val Gly Arg Ile Ile Leu Ser Gly Arg Pro Ala 80 85 90 GTT ATT CCC GAC AGG GAA GTT CTC TAC CAA GAG TTC GAT GAA ATG GAA 339 Val Ile Pro Asp Arg Glu Val Leu Tyr Gln Glu Phe Asp Glu Met Glu 95 100 105 110 GAG TGC GCC TCG CAC CTC CCT TAC ATC GAA CAA GGA ATG CAG CTC GCC 387 Glu Cys Ala Ser His Leu Pro Tyr Ile Glu Gln Gly Met Gln Leu Ala 115 120 125 GAG CAA TTC AAG CAG AAG GCG CTC GGT TTG CTG CAA ACA GCC ACC AAG 435 Glu Gln Phe Lys Gln Lys Ala Leu Gly Leu Leu Gln Thr Ala Thr Lys 130 135 140 CAA GCG GAG GCT GCT GCT CCC GTG GTG GAG TCC AAG TGG CGA GCC CTT 483 Gln Ala Glu Ala Ala Ala Pro Val Val Glu Ser Lys Trp Arg Ala Leu 145 150 155 GAG ACC TTC TGG GCG AAG CAC ATG TGG AAT TTT ATC AGC GGG ATA CAG 531 Glu Thr Phe Trp Ala Lys His Met Trp Asn Phe Ile Ser Gly Ile Gln 160 165 170 TAC TTA GCA GGC TTG TCC ACT CTG CCT GGA AAC CCC GCA ATA GCA TCA 579 Tyr Leu Ala Gly Leu Ser Thr Leu Pro Gly Asn Pro Ala Ile Ala Ser 175 180 185 190 CTG ATG GCA TTC ACA GCC TCT ATC ACC AGC CCG CTC ACC ACC CAA TAT 627 Leu Met Ala Phe Thr Ala Ser Ile Thr Ser Pro Leu Thr Thr Gln Tyr 195 200 205 ACC CTC CTG TTT AAC ATC TTG GGG GGA TGG GTG GCC GCC CAA CTC GCC 675 Thr Leu Leu Phe Asn Ile Leu Gly Gly Trp Val Ala Ala Gln Leu Ala 210 215 220 CCC CCC AGT GCC GCT TCA GCC TTC GTG GGC GCC GGT ATA GCT GGC GCG 723 Pro Pro Ser Ala Ala Ser Ala Phe Val Gly Ala Gly Ile Ala Gly Ala 225 230 235 GCT GTT GGC AGC ATA GGC CTC GGG AAG GTG CTT GTG GAC ATT CTG GCG 771 Ala Val Gly Ser Ile Gly Leu Gly Lys Val Leu Val Asp Ile Leu Ala 240 245 250 GGT TAT GGA GCA GGG GTG GCA GGC GCG CTC GTG GCC TTT AAG GTC ATG 819 Gly Tyr Gly Ala Gly Val Ala Gly Ala Leu Val Ala Phe Lys Val Met 255 260 265 270 AGC GGT GAC ATG CCC TCC ACC GAG GAC CTG GTC AAC TTA CTC CCC GCC 867 Ser Gly Asp Met Pro Ser Thr Glu Asp Leu Val Asn Leu Leu Pro Ala 275 280 285 ATC CTC TCT CCT GGT GCC CTG GTC GTC GGG GTC GTG TGC GCA GCA ATA 915 Ile Leu Ser Pro Gly Ala Leu Val Val Gly Val Val Cys Ala Ala Ile 290 295 300 CTG CGT CGG CAT GTG GGC CCA GGG GAG GGG GCT GTG CAG TGG ATG AAC 963 Leu Arg Arg His Val Gly Pro Gly Glu Gly Ala Val Gln Trp Met Asn 305 310 315 CGG CTG C AGCC 974 Arg Leu 320
【０２７８】配列番号：40 配列の長さ：1280 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：MX25O26 配列 TGT GCC TGG TTG TGG ATG ATG CTG CTG ATA GCC CAA GCT GAG GCC GCC 48 Cys Ala Trp Leu Trp Met Met Leu Leu Ile Ala Gln Ala Glu Ala Ala 1 5 10 15 TTG GAG AAC CTG GTG GTC CTC AAT GCA GCA TCC ATG GCS GGA GCG CAT 96 Leu Glu Asn Leu Val Val Leu Asn Ala Ala Ser Met Ala Gly Ala His 20 25 30 GGC ATC CTC TCT TTC CTT GTG TTC TTC TGT GCC GCC TGG TAC ATC AAA 144 Gly Ile Leu Ser Phe Leu Val Phe Phe Cys Ala Ala Trp Tyr Ile Lys 35 40 45 GGC AGG CTG GTC CCY GGG GCG RCA TAY GCT YTC TAT GGC GTA TGG CCG 192 Gly Arg Leu Val Pro Gly Ala Xaa Tyr Ala Xab Tyr Gly Val Trp Pro 50 55 60 CTG CTC CTG CTC TTG MTG GCG CTA CCS SCA CGG GCG TAC GCC ATG GAC 240 Leu Leu Leu Leu Leu Xac Ala Leu Pro Xad Arg Ala Tyr Ala Met Asp 65 70 75 80 CGG GAS ATG GCT GCA TCG TGC GGA GGC GCG GTT TTT GTA GGT CTG GTA 288 Arg Xae Met Ala Ala Ser Cys Gly Gly Ala Val Phe Val Gly Leu Val 85 90 95 CTC YTG ACC TTG TCA CCA TAC TAC AAA GTG TTC CTC GCT ARG CTC ATA 336 Leu Leu Thr Leu Ser Pro Tyr Tyr Lys Val Phe Leu Ala Xaf Leu Ile 100 105 110 TGG TGG TTR CAA TAT CTC ATC ACC AGR GCC GAG GCG CAC YTG CAA GTG 384 Trp Trp Leu Gln Tyr Leu Ile Thr Arg Ala Glu Ala His Leu Gln Val 115 120 125 TGG ATY CCC CCY CTY AAC GTY CGG GGR GGC CGC GAY GCC ATC ATC CTY 432 Trp Ile Pro Pro Leu Asn Val Arg Gly Gly Arg Asp Ala Ile Ile Leu 130 135 140 CTC ACR TGT GCG GTC CAY CCR GAG CTR ATY TTT GAC ATC ACC AAR CTY 480 Leu Thr Cys Ala Val His Pro Glu Leu Ile Phe Asp Ile Thr Lys Leu 145 150 155 160 YTG CTC GCC ATA CTC GGT CCG CTC ATG GTR CTC CAG GCT GSC MTA ACY 528 Leu Leu Ala Ile Leu Gly Pro Leu Met Val Leu Gln Ala Xag Xah Thr 165 170 175 MRA RTG CCG TAC TTY GTR CGY GCT CAA GGG CTC ATY CGT RYG TGC ATG 576 Xai Xaj Pro Tyr Phe Val Arg Ala Gln Gly Leu Ile Arg Xak Cys Met 180 185 190 TTR GTG CGG AAA GYC GCY GGR GGT CAT TAT GTY CAR ATG GCY YTY RTG 624 Leu Val Arg Lys Xal Ala Gly Gly His Tyr Val Gln Met Ala Xam Xan 195 200 205 AAG CTG GCY GCR CTG ACA GGT ACG TAC RTT TAT GWC CAT CTT RCY CCA 672 Lys Leu Ala Ala Leu Thr Gly Thr Tyr Xao Tyr Xap His Leu Xaq Pro 210 215 220 CTG CAG SAY TGG GCC CAY GCG GGC CTA CGR GAC CTT GCG GTR GCR GTW 720 Leu Gln Xar Trp Ala His Ala Gly Leu Arg Asp Leu Ala Val Ala Val 225 230 235 240 GAG CCC GTT GYC TTC TCT GAY ATG GAG ACY AAG ATC ATC ACS TGG GGG 768 Glu Pro Val Xas Phe Ser Asp Met Glu Thr Lys Ile Ile Thr Trp Gly 245 250 255 GCA GAS ACB GCG GCG TGT GGG GAC ATC ATY TYG GGY CTA CCH GTY TCC 816 Ala Xat Thr Ala Ala Cys Gly Asp Ile Ile Xau Gly Leu Pro Val Ser 260 265 270 GCC CGR AGG GGY ARS GAG MTR CTY YTS GGR CCG GCC GAT AGT TTT GAC 864 Ala Arg Arg Gly Xav Glu Xaw Leu Xax Gly Pro Ala Asp Ser Phe Asp 275 280 285 GGG CAG GGG TGG CGA CTC CTT GCG CCT ATC ACG GCC TAC TCC CAG CAR 912 Gly Gln Gly Trp Arg Leu Leu Ala Pro Ile Thr Ala Tyr Ser Gln Gln 290 295 300 ACG CGG GGC CTG CTT GGT TGC ATC ATC ACY AGC CTT ACG GGC CGG GAT 960 Thr Arg Gly Leu Leu Gly Cys Ile Ile Thr Ser Leu Thr Gly Arg Asp 305 310 315 320 AAR AAC CAG GTC GAG GGG GAG GTT CAA GTG GTC TCT ACC GCA ACA CAA 1008 Lys Asn Gln Val Glu Gly Glu Val Gln Val Val Ser Thr Ala Thr Gln 325 330 335 TCT TTC CTG GCG ACC TGY RTC AAC GGC GTK TGC TGG ACT GTT TTC CAC 1056 Ser Phe Leu Ala Thr Cys Xay Asn Gly Val Cys Trp Thr Val Phe His 340 345 350 GGY GCC GGC TCG AAG ACC TTA GCC GGC CCA AAA GGC CCA ATC ACC CAA 1104 Gly Ala Gly Ser Lys Thr Leu Ala Gly Pro Lys Gly Pro Ile Thr Gln 355 360 365 ATG TAC ACC AAT GTR GAT CAG GAC CTC GTC GGY TGG TCG GCG CCC CCC 1152 Met Tyr Thr Asn Val Asp Gln Asp Leu Val Gly Trp Ser Ala Pro Pro 370 375 380 SGG GCG CGT TCC TTG ACA CCW TGC ACC TGC GGC AGC TCG GAC CTT TAT 1200 Xaz Ala Arg Ser Leu Thr Pro Cys Thr Cys Gly Ser Ser Asp Leu Tyr 385 390 395 400 TTG GTC ACG AGR CAT GCT GAT GTC ATT CCG GTG CAC CGG CGG GGC GAC 1248 Leu Val Thr Arg His Ala Asp Val Ile Pro Val His Arg Arg Gly Asp 405 410 415 AGC AGG GGG AGC CTC CTC TCC CCC GGG CCC AT 1280 Ser Arg Gly Ser Leu Leu Ser Pro Gly Pro 420 425 Y : C or T R : A or G M : A or C
K : G or T S : G or C W : A or T H : A or C or T
B : G or T or C Xaa : Ala or Thr Xab : Phe or Leu
Xac : Met or Leu Xad : Ala or Pro Xae : Glu or Asp
Xaf : Lys or Arg Xag : Gly or Ala Xah : Leu or Ile
Xai : Gln or Arg Xaj : Met or Val Xak : Met or Ala
Xal : Ala or Val Xam : Leu or Phe Xan : Met or Val
Xao : Val or Ile Xap : Asp or Val Xaq : Thr or Ala
Xar : Asp or His Xas : Ala or Val Xat : Asp or Glu
Xau : Leu or Ser Xav : Asn or Arg or Lys Xaw : Ile or Leu
Xax : Leu or Phe Xay : Ile or Val Xaz : Gly or Arg
【０２７９】配列番号：41 配列の長さ：1431 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N16N15 配列 GGC TAT ACC GGC GAC TTC GAC TCA GTG ATC GAC TGC AAC ACA TGT GTC 48 Gly Tyr Thr Gly Asp Phe Asp Ser Val Ile Asp Cys Asn Thr Cys Val 1 5 10 15 ACC CAA ACA GTC GAT TTC AGC TTG GAC CCT ACT TTC ACC ATY GAG ACG 96 Thr Gln Thr Val Asp Phe Ser Leu Asp Pro Thr Phe Thr Ile Glu Thr 20 25 30 ACG ACC GTA CCC CAA GAT GCG GTG TCG CGC TCG CAG CGG CGA GGC AGG 144 Thr Thr Val Pro Gln Asp Ala Val Ser Arg Ser Gln Arg Arg Gly Arg 35 40 45 ACT GGT AGG GGC AGR GGG GGC ATA TAC AGG TTT GTA ACT CCA GGG GAA 192 Thr Gly Arg Gly Arg Gly Gly Ile Tyr Arg Phe Val Thr Pro Gly Glu 50 55 60 CGG CCC TCA GGC ATG TTC GAT TCT TCG GTC CTG TGT GAA TGT TAT GAC 240 Arg Pro Ser Gly Met Phe Asp Ser Ser Val Leu Cys Glu Cys Tyr Asp 65 70 75 80 GCG GGC TGT GCT TGG TAC GAG CTC ACG YCC GCC GAG ACC TCG GTT AGG 288 Ala Gly Cys Ala Trp Tyr Glu Leu Thr Xaa Ala Glu Thr Ser Val Arg 85 90 95 TTG CGG GCT TAC CTA AAY ACA CCT GGG CTG CCC GTC TGC CAG GAC CAT 336 Leu Arg Ala Tyr Leu Asn Thr Pro Gly Leu Pro Val Cys Gln Asp His 100 105 110 CTG GAG TTC TGG GAG AGC GTC TTC ACC GGC CTC ACC CAC ATA GAT GCC 384 Leu Glu Phe Trp Glu Ser Val Phe Thr Gly Leu Thr His Ile Asp Ala 115 120 125 CAC TTC TTG TCC CAG ACY AAA CAG GCA GGA GAC AAC TTC CCC TAC CTG 432 His Phe Leu Ser Gln Thr Lys Gln Ala Gly Asp Asn Phe Pro Tyr Leu 130 135 140 GTA GCA TAC CAG GCT ACA GTG TGC GCC AGG GCC AAG GCT CCA CCT CCA 480 Val Ala Tyr Gln Ala Thr Val Cys Ala Arg Ala Lys Ala Pro Pro Pro 145 150 155 160 TCG TGG GAT CAR ATG TGG AAG TGT CTC ATA CGG CTG AAG CCT ACG CTA 528 Ser Trp Asp Gln Met Trp Lys Cys Leu Ile Arg Leu Lys Pro Thr Leu 165 170 175 CAC GGG CCA ACG CCC CTG TTG YAT AGG TTA GGA GCC GTT CAG AAC RAG 576 His Gly Pro Thr Pro Leu Leu Xab Arg Leu Gly Ala Val Gln Asn Xac 180 185 190 GTT RCC CTY ACA CAC CCY ATA ACC AAG TWC ATC ATG RCA TGC ATG TCG 624 Val Xad Leu Thr His Pro Ile Thr Lys Xae Ile Met Xaf Cys Met Ser 195 200 205 GCT GAC CTA GAG GTC GTC ACT AGC ACT TGG GTG CTG GTA GGC GGG GTC 672 Ala Asp Leu Glu Val Val Thr Ser Thr Trp Val Leu Val Gly Gly Val 210 215 220 CTC GCG GCT CTG GCC GCG TAC TGC CTG ACA ACG GGC AGC GTG GTC ATT 720 Leu Ala Ala Leu Ala Ala Tyr Cys Leu Thr Thr Gly Ser Val Val Ile 225 230 235 240 GTG GGC AGG ATC ATC TTG TCC GGG AGG CCG GCC GTT ATT CCC GAC AGG 768 Val Gly Arg Ile Ile Leu Ser Gly Arg Pro Ala Val Ile Pro Asp Arg 245 250 255 GAA GTT CTC TAC CAA GAG TTC GAT GAA ATG GAA GAG TGC GCC TCG CAC 816 Glu Val Leu Tyr Gln Glu Phe Asp Glu Met Glu Glu Cys Ala Ser His 260 265 270 CTC CCT TAC ATC GAA CAA GGA ATG CAG CTC GCC GAG CAA TTC AAG CAG 864 Leu Pro Tyr Ile Glu Gln Gly Met Gln Leu Ala Glu Gln Phe Lys Gln 275 280 285 AAG GCG CTC GGT TTG CTG CAA ACA GCC ACC AAG CAA GCG GAG GCT GCT 912 Lys Ala Leu Gly Leu Leu Gln Thr Ala Thr Lys Gln Ala Glu Ala Ala 290 295 300 GCT CCC GTG GTG GAG TCC AAG TGG CGA GCC CTT GAG ACC TTC TGG GCG 960 Ala Pro Val Val Glu Ser Lys Trp Arg Ala Leu Glu Thr Phe Trp Ala 305 310 315 320 AAG CAC ATG TGG AAT TTT ATC AGC GGG ATA CAG TAC TTA GCA GGC TTG 1008 Lys His Met Trp Asn Phe Ile Ser Gly Ile Gln Tyr Leu Ala Gly Leu 325 330 335 TCC ACT CTG CCT GGA AAC CCC GCA ATA GCA TCA CTG ATG GCA TTC ACA 1056 Ser Thr Leu Pro Gly Asn Pro Ala Ile Ala Ser Leu Met Ala Phe Thr 340 345 350 GCC TCT ATC ACC AGC CCG CTC ACC ACC CAA TAT ACC CTC CTG TTT AAC 1104 Ala Ser Ile Thr Ser Pro Leu Thr Thr Gln Tyr Thr Leu Leu Phe Asn 355 360 365 ATC TTG GGG GGA TGG GTG GCC GCC CAA CTC GCC CCC CCC AGT GCC GCT 1152 Ile Leu Gly Gly Trp Val Ala Ala Gln Leu Ala Pro Pro Ser Ala Ala 370 375 380 TCA GCC TTC GTG GGC GCC GGT ATA GCT GGC GCG GCT GTT GGC AGC ATA 1200 Ser Ala Phe Val Gly Ala Gly Ile Ala Gly Ala Ala Val Gly Ser Ile 385 390 395 400 GGC CTC GGG AAG GTG CTT GTG GAC ATT CTG GCG GGT TAT GGA GCA GGG 1248 Gly Leu Gly Lys Val Leu Val Asp Ile Leu Ala Gly Tyr Gly Ala Gly 405 410 415 GTG GCA GGC GCG CTC GTG GCC TTT AAG GTC ATG AGC GGT GAC ATG CCC 1296 Val Ala Gly Ala Leu Val Ala Phe Lys Val Met Ser Gly Asp Met Pro 420 425 430 TCC ACC GAG GAC CTG GTC AAC TTA CTC CCC GCC ATC CTC TCT CCT GGT 1344 Ser Thr Glu Asp Leu Val Asn Leu Leu Pro Ala Ile Leu Ser Pro Gly 435 440 445 GCC CTG GTC GTC GGG GTC GTG TGC GCA GCA ATA CTG CGT CGG CAT GTG 1392 Ala Leu Val Val Gly Val Val Cys Ala Ala Ile Leu Arg Arg His Val 450 455 460 GGC CCA GGG GAG GGG GCT GTG CAG TGG ATG AAC CGG CTG 1431 Gly Pro Gly Glu Gly Ala Val Gln Trp Met Asn Arg Leu 465 470 475 Y : C or T R : A or G M : A or C
K : G or T S : G or C W : A or T H : A or C or T
B : G or T or C Xaa : Pro or Ser Xab : Tyr or His
Xac : Glu or Lys Xad : Thr or Ala Xae : Tyr or Phe
Xaf : Thr or Ala
【０２８０】配列番号：42 配列の長さ：2304 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N23N15 配列 CTG CTG TCG CCC GGG CCC ATC TCY TAC YTG AAG GGY TCC TCG GGT GGT 48 Leu Leu Ser Pro Gly Pro Ile Ser Tyr Leu Lys Gly Ser Ser Gly Gly 1 5 10 15 CCG CTG CYT TGC CCC TCG GGC CRT GTT GTG GGC ATC TTC CGG GCT GCY 96 Pro Leu Xaa Cys Pro Ser Gly Xab Val Val Gly Ile Phe Arg Ala Ala 20 25 30 GTG TGC ACC CGG GGG GTT GCG AAG GCG GTR GAC TTT GTG CCC GTT GAG 144 Val Cys Thr Arg Gly Val Ala Lys Ala Val Asp Phe Val Pro Val Glu 35 40 45 TCT ATG GAA ACC ACY ATG CGG TCT CCG GTC TTC RCG GAT AAC TCA ACC 192 Ser Met Glu Thr Thr Met Arg Ser Pro Val Phe Xac Asp Asn Ser Thr 50 55 60 CCC CCG GCC GTA CCG CAG WCA TTC CAA GTG GCC CAC CTA CAC GCT CCC 240 Pro Pro Ala Val Pro Gln Xad Phe Gln Val Ala His Leu His Ala Pro 65 70 75 80 ACT GGC AGC GGC AAA AGC ACC ARG GTG CCG GCT GCG TAT GCG GCC CAA 288 Thr Gly Ser Gly Lys Ser Thr Xae Val Pro Ala Ala Tyr Ala Ala Gln 85 90 95 GGG TAC AAG GTA CTC GTC CTG AAC CCG TCC GTT GCT GCC ACT TTG GGC 336 Gly Tyr Lys Val Leu Val Leu Asn Pro Ser Val Ala Ala Thr Leu Gly 100 105 110 TTT GGG GCG TAY ATG TCC AAG GCA CAT GGT GTT GAC CCT AAC ATC AGA 384 Phe Gly Ala Tyr Met Ser Lys Ala His Gly Val Asp Pro Asn Ile Arg 115 120 125 ACT GGG GTG AGG ACC ATC ACC ACG GGC GCT CCC RTC ACG TAC TCC ACC 432 Thr Gly Val Arg Thr Ile Thr Thr Gly Ala Pro Xaf Thr Tyr Ser Thr 130 135 140 TAC GGT AAG TTC CTC GCC GAC GGT GGC TGT TCT GGG GGT GCC TAT GAC 480 Tyr Gly Lys Phe Leu Ala Asp Gly Gly Cys Ser Gly Gly Ala Tyr Asp 145 150 155 160 ATC ATA ATA TGT GAT GAG TGT CAT TCA ACT GAC TCG ACT TCC ATC TTG 528 Ile Ile Ile Cys Asp Glu Cys His Ser Thr Asp Ser Thr Ser Ile Leu 165 170 175 GGC ATT GGT ACA GTC CTG GAC CAA GCG GAG ACG GCT GGA GCG CGC CTT 576 Gly Ile Gly Thr Val Leu Asp Gln Ala Glu Thr Ala Gly Ala Arg Leu 180 185 190 GTC GTG CTC GCC ACC GCT ACG CCT CCG GGA TCG GTC ACC GTG CCG CAT 624 Val Val Leu Ala Thr Ala Thr Pro Pro Gly Ser Val Thr Val Pro His 195 200 205 CCT AAT ATT GAG GAG GTG GCC TTG TCC AAC ACT GGA GAG ATC CCC TTC 672 Pro Asn Ile Glu Glu Val Ala Leu Ser Asn Thr Gly Glu Ile Pro Phe 210 215 220 TAT GGC AAG GCC ATC CCC CTC GAG GCC ATC AAG GGG GGG AGG CAT CTC 720 Tyr Gly Lys Ala Ile Pro Leu Glu Ala Ile Lys Gly Gly Arg His Leu 225 230 235 240 AYT TTC TGC CAT TCC AAG AAG AAA TGT GAC GAG CTC GCT GCG AAG CTG 768 Xag Phe Cys His Ser Lys Lys Lys Cys Asp Glu Leu Ala Ala Lys Leu 245 250 255 TCG GCC CTC GGA GTC AAY GCT GTA GCA TAY TAC CGG GGT CTT GAT GTG 816 Ser Ala Leu Gly Val Asn Ala Val Ala Tyr Tyr Arg Gly Leu Asp Val 260 265 270 TCC RTC ATA CCG ACA AGC GGG GAC GTC GTT GTC GTG GCA ACW GAC GCT 864 Ser Xah Ile Pro Thr Ser Gly Asp Val Val Val Val Ala Thr Asp Ala 275 280 285 CTA ATG ACA GGC TAT ACC GGY GAC TTY GAC TCR GTG ATC GAC TGY AAC 912 Leu Met Thr Gly Tyr Thr Gly Asp Phe Asp Ser Val Ile Asp Cys Asn 290 295 300 ACA TGT GTC ACC CAA ACA GTC GAT TTC AGC TTG GAC CCT ACT TTC ACC 960 Thr Cys Val Thr Gln Thr Val Asp Phe Ser Leu Asp Pro Thr Phe Thr 305 310 315 320 ATY GAG ACG ACG ACC GTA CCC CAA GAT GCG GTG TCG CGC TCG CAG CGG 1008 Ile Glu Thr Thr Thr Val Pro Gln Asp Ala Val Ser Arg Ser Gln Arg 325 330 335 CGA GGC AGG ACT GGT AGG GGC AGR GGG GGC ATA TAC AGG TTT GTA ACT 1056 Arg Gly Arg Thr Gly Arg Gly Arg Gly Gly Ile Tyr Arg Phe Val Thr 340 345 350 CCA GGG GAA CGG CCC TCA GGC ATG TTC GAT TCT TCG GTC CTG TGT GAA 1104 Pro Gly Glu Arg Pro Ser Gly Met Phe Asp Ser Ser Val Leu Cys Glu 355 360 365 TGT TAT GAC GCG GGC TGT GCT TGG TAC GAG CTC ACG YCC GCC GAG ACC 1152 Cys Tyr Asp Ala Gly Cys Ala Trp Tyr Glu Leu Thr Xai Ala Glu Thr 370 375 380 TCG GTT AGG TTG CGG GCT TAC CTA AAY ACA CCT GGG CTG CCC GTC TGC 1200 Ser Val Arg Leu Arg Ala Tyr Leu Asn Thr Pro Gly Leu Pro Val Cys 385 390 395 400 CAG GAC CAT CTG GAG TTC TGG GAG AGC GTC TTC ACC GGC CTC ACC CAC 1248 Gln Asp His Leu Glu Phe Trp Glu Ser Val Phe Thr Gly Leu Thr His 405 410 415 ATA GAT GCC CAC TTC TTG TCC CAG ACY AAA CAG GCA GGA GAC AAC TTC 1296 Ile Asp Ala His Phe Leu Ser Gln Thr Lys Gln Ala Gly Asp Asn Phe 420 425 430 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K : G or T S : G or C W : A or T H : A or C or T
B : G or T or C Xaa : Leu or Pro Xab : His or Arg
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Xal : Thr or Ala Xam : Tyr or Phe Xan : Thr or Ala
【０２８１】配列番号：43 配列の長さ：3564 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：MX25N15 配列 TGT GCC TGG TTG TGG ATG ATG CTG CTG ATA GCC CAA GCT GAG GCC GCC 48 Cys Ala Trp Leu Trp Met Met Leu Leu Ile Ala Gln Ala Glu Ala Ala 1 5 10 15 TTG GAG AAC CTG GTG GTC CTC AAT GCA GCA TCC ATG GCS GGA GCG CAT 96 Leu Glu Asn Leu Val Val Leu Asn Ala Ala Ser Met Ala Gly Ala His 20 25 30 GGC ATC CTC TCT TTC CTT GTG TTC TTC TGT GCC GCC TGG TAC ATC AAA 144 Gly Ile Leu Ser Phe Leu Val Phe Phe Cys Ala Ala Trp Tyr Ile Lys 35 40 45 GGC AGG CTG GTC CCY GGG GCG RCA TAY GCT YTC TAT GGC GTA TGG CCG 192 Gly Arg Leu Val Pro Gly Ala Xaa Tyr Ala Xab Tyr Gly Val Trp Pro 50 55 60 CTG CTC CTG CTC TTG MTG GCG CTA CCS SCA CGG GCG TAC GCC ATG GAC 240 Leu Leu Leu Leu Leu Xac Ala Leu Pro Xad Arg Ala Tyr Ala Met Asp 65 70 75 80 CGG GAS ATG GCT GCA TCG TGC GGA GGC GCG GTT TTT GTA GGT CTG GTA 288 Arg Xae Met Ala Ala Ser Cys Gly Gly Ala Val Phe Val Gly Leu Val 85 90 95 CTC YTG ACC TTG TCA CCA TAC TAC AAA GTG TTC CTC 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K : G or T S : G or C W : A or T H : A or C or T
B : G or T or C Xaa : Ala or Thr Xab : Phe or Leu
Xac : Met or Leu Xad : Ala or Pro Xae : Glu or Asp
Xaf : Lys or Arg Xag : Gly or Ala Xah : Leu or Ile
Xai : Gln or Arg Xaj : Met or Val Xak : Met or Ala
Xal : Ala or Val Xam : Leu or Phe Xan : Met or Val
Xao : Val or Ile Xap : Asp or Val Xaq : Thr or Ala
Xar : Asp or His Xas : Ala or Val Xat : Asp or Glu
Xau : Leu or Ser Xav : Asn or Arg or Lys Xaw : Ile or Leu
Xax : Leu or Phe Xay : Ile or Val Xaz : Gly or Arg
Xba : Leu or Pro Xbb : His or Arg Xbc : Thr or Ala
Xbd : Ser or Thr Xbe : Lys or Arg Xbf : Ile or Val
Xbg : Thr or Ile Xbh : Val or Ile Xbi : Pro or Ser
Xbj : Tyr or His Xbk : Glu or Lys Xbl : Thr or Ala
Xbm : Tyr or Phe Xbn : Thr or Ala
【０２８２】配列番号：44 配列の長さ：849 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：MX25-1 配列 TGT GCC TGG TTG TGG ATG ATG CTG CTG ATA GCC CAA GCT GAG GCC GCC 48 Cys Ala Trp Leu Trp Met Met Leu Leu Ile Ala Gln Ala Glu Ala Ala 1 5 10 15 TTG GAG AAC CTG GTG GTC CTC AAT GCA GCA TCC ATG GCG GGA GCG CAT 96 Leu Glu Asn Leu Val Val Leu Asn Ala Ala Ser Met Ala Gly Ala His 20 25 30 GGC ATC CTC TCT TTC CTT GTG TTC TTC TGT GCC GCC TGG TAC ATC AAA 144 Gly Ile Leu Ser Phe Leu Val Phe Phe Cys Ala Ala Trp Tyr Ile Lys 35 40 45 GGC AGG CTG GTC CCT GGG GCG GCA TAC GCT TTC TAT GGC GTA TGG CCG 192 Gly Arg Leu Val Pro Gly Ala Ala Tyr Ala Phe Tyr Gly Val Trp Pro 50 55 60 CTG CTC CTG CTC TTG ATG GCG CTA CCC GCA CGG GCG TAC GCC ATG GAC 240 Leu Leu Leu Leu Leu Met Ala Leu Pro Ala Arg Ala Tyr Ala Met Asp 65 70 75 80 CGG GAG ATG GCT GCA TCG TGC GGA GGC GCG GTT TTT GTA GGT CTG GTA 288 Arg Glu Met Ala Ala Ser Cys Gly Gly Ala Val Phe Val Gly Leu Val 85 90 95 CTC TTG ACC TTG TCA CCA TAC TAC AAA GTG TTC CTC GCT AAG CTC ATA 336 Leu Leu Thr Leu Ser Pro Tyr Tyr Lys Val Phe Leu Ala Lys Leu Ile 100 105 110 TGG TGG TTG CAA TAT CTC ATC ACC AGG GCC GAG GCG CAC TTG CAA GTG 384 Trp Trp Leu Gln Tyr Leu Ile Thr Arg Ala Glu Ala His Leu Gln Val 115 120 125 TGG ATC CCC CCC CTC AAC GTT CGG GGG GGC CGC GAT GCC ATC ATC CTT 432 Trp Ile Pro Pro Leu Asn Val Arg Gly Gly Arg Asp Ala Ile Ile Leu 130 135 140 CTC ACA TGT GCG GTC CAC CCG GAG CTG ATC TTT GAC ATC ACC AAG CTC 480 Leu Thr Cys Ala Val His Pro Glu Leu Ile Phe Asp Ile Thr Lys Leu 145 150 155 160 TTG CTC GCC ATA CTC GGT CCG CTC ATG GTA CTC CAG GCT GGC CTA ACC 528 Leu Leu Ala Ile Leu Gly Pro Leu Met Val Leu Gln Ala Gly Leu Thr 165 170 175 CAA ATG CCG TAC TTT GTG CGT GCT CAA GGG CTC ATT CGT ATG TGC ATG 576 Gln Met Pro Tyr Phe Val Arg Ala Gln Gly Leu Ile Arg Met Cys Met 180 185 190 TTG GTG CGG AAA GCC GCT GGG GGT CAT TAT GTC CAG ATG GCT CTC ATG 624 Leu Val Arg Lys Ala Ala Gly Gly His Tyr Val Gln Met Ala Leu Met 195 200 205 AAG CTG GCT GCA CTG ACA GGT ACG TAC GTT TAT GAC CAT CTT ACT CCA 672 Lys Leu Ala Ala Leu Thr Gly Thr Tyr Val Tyr Asp His Leu Thr Pro 210 215 220 CTG CAG GAC TGG GCC CAC GCG GGC CTA CGA GAC CTT GCG GTA GCA GTT 720 Leu Gln Asp Trp Ala His Ala Gly Leu Arg Asp Leu Ala Val Ala Val 225 230 235 240 GAG CCC GTT GTC TTC TCT GAT ATG GAG ACT AAG ATC ATC ACC TGG GGG 768 Glu Pro Val Val Phe Ser Asp Met Glu Thr Lys Ile Ile Thr Trp Gly 245 250 255 GCA GAC ACT GCG GCG TGT GGG GAC ATC ATT TTG GGC CTA CCT GTC TCC 816 Ala Asp Thr Ala Ala Cys Gly Asp Ile Ile Leu Gly Leu Pro Val Ser 260 265 270 GCC CGG AGG GGC AAC GAG ATA CTC CTC GGA CCG 849 Ala Arg Arg Gly Asn Glu Ile Leu Leu Gly Pro 275 280
【０２８３】配列番号：45 配列の長さ：849 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：MX25-2 配列 TGT GCC TGG TTG TGG ATG ATG CTG CTG ATA GCC CAA GCT GAG GCC GCC 48 Cys Ala Trp Leu Trp Met Met Leu Leu Ile Ala Gln Ala Glu Ala Ala 1 5 10 15 TTG GAG AAC CTG GTG GTC CTC AAT GCA GCA TCC ATG GCG GGA GCG CAT 96 Leu Glu Asn Leu Val Val Leu Asn Ala Ala Ser Met Ala Gly Ala His 20 25 30 GGC ATC CTC TCT TTC CTT GTG TTC TTC TGT GCC GCC TGG TAC ATC AAA 144 Gly Ile Leu Ser Phe Leu Val Phe Phe Cys Ala Ala Trp Tyr Ile Lys 35 40 45 GGC AGG CTG GTC CCT GGG GCG ACA TAC GCT CTC TAT GGC GTA TGG CCG 192 Gly Arg Leu Val Pro Gly Ala Thr Tyr Ala Leu Tyr Gly Val Trp Pro 50 55 60 CTG CTC CTG CTC TTG ATG GCG CTA CCG CCA CGG GCG TAC GCC ATG GAC 240 Leu Leu Leu Leu Leu Met Ala Leu Pro Pro Arg Ala Tyr Ala Met Asp 65 70 75 80 CGG GAC ATG GCT GCA TCG TGC GGA GGC GCG GTT TTT GTA GGT CTG GTA 288 Arg Asp Met Ala Ala Ser Cys Gly Gly Ala Val Phe Val Gly Leu Val 85 90 95 CTC TTG ACC TTG TCA CCA TAC TAC AAA GTG TTC CTC GCT AGG CTC ATA 336 Leu Leu Thr Leu Ser Pro Tyr Tyr Lys Val Phe Leu Ala Arg Leu Ile 100 105 110 TGG TGG TTA CAA TAT CTC ATC ACC AGA GCC GAG GCG CAC CTG CAA GTG 384 Trp Trp Leu Gln Tyr Leu Ile Thr Arg Ala Glu Ala His Leu Gln Val 115 120 125 TGG ATT CCC CCT CTC AAC GTC CGG GGA GGC CGC GAC GCC ATC ATC CTC 432 Trp Ile Pro Pro Leu Asn Val Arg Gly Gly Arg Asp Ala Ile Ile Leu 130 135 140 CTC ACG TGT GCG GTC CAT CCA GAG CTA ATT TTT GAC ATC ACC AAA CTT 480 Leu Thr Cys Ala Val His Pro Glu Leu Ile Phe Asp Ile Thr Lys Leu 145 150 155 160 CTG CTC GCC ATA CTC GGT CCG CTC ATG GTG CTC CAG GCT GCC ATA ACT 528 Leu Leu Ala Ile Leu Gly Pro Leu Met Val Leu Gln Ala Ala Ile Thr 165 170 175 AGA GTG CCG TAC TTC GTA CGC GCT CAA GGG CTC ATC CGT GCG TGC ATG 576 Arg Val Pro Tyr Phe Val Arg Ala Gln Gly Leu Ile Arg Ala Cys Met 180 185 190 TTA GTG CGG AAA GCC GCC GGA GGT CAT TAT GTT CAA ATG GCC TTT GTG 624 Leu Val Arg Lys Ala Ala Gly Gly His Tyr Val Gln Met Ala Phe Val 195 200 205 AAG CTG GCC GCG CTG ACA GGT ACG TAC ATT TAT GAC CAT CTT GCC CCA 672 Lys Leu Ala Ala Leu Thr Gly Thr Tyr Ile Tyr Asp His Leu Ala Pro 210 215 220 CTG CAG CAT TGG GCC CAT GCG GGC CTA CGG GAC CTT GCG GTG GCG GTA 720 Leu Gln His Trp Ala His Ala Gly Leu Arg Asp Leu Ala Val Ala Val 225 230 235 240 GAG CCC GTT GTC TTC TCT GAC ATG GAG ACC AAG ATC ATC ACC TGG GGG 768 Glu Pro Val Val Phe Ser Asp Met Glu Thr Lys Ile Ile Thr Trp Gly 245 250 255 GCA GAC ACC GCG GCG TGT GGG GAC ATC ATT TTG GGC CTA CCA GTC TCC 816 Ala Asp Thr Ala Ala Cys Gly Asp Ile Ile Leu Gly Leu Pro Val Ser 260 265 270 GCC CGG AGG GGC AAC GAG ATA CTC CTC GGA CCG 849 Ala Arg Arg Gly Asn Glu Ile Leu Leu Gly Pro 275 280
【０２８４】配列番号：46 配列の長さ：849 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：MX25-3 配列 TGT GCC TGG TTG TGG ATG ATG CTG CTG ATA GCC CAA GCT GAG GCC GCC 48 Cys Ala Trp Leu Trp Met Met Leu Leu Ile Ala Gln Ala Glu Ala Ala 1 5 10 15 TTG GAG AAC CTG GTG GTC CTC AAT GCA GCA TCC ATG GCC GGA GCG CAT 96 Leu Glu Asn Leu Val Val Leu Asn Ala Ala Ser Met Ala Gly Ala His 20 25 30 GGC ATC CTC TCT TTC CTT GTG TTC TTC TGT GCC GCC TGG TAC ATC AAA 144 Gly Ile Leu Ser Phe Leu Val Phe Phe Cys Ala Ala Trp Tyr Ile Lys 35 40 45 GGC AGG CTG GTC CCC GGG GCG GCA TAT GCT TTC TAT GGC GTA TGG CCG 192 Gly Arg Leu Val Pro Gly Ala Ala Tyr Ala Phe Tyr Gly Val Trp Pro 50 55 60 CTG CTC CTG CTC TTG CTG GCG CTA CCC GCA CGG GCG TAC GCC ATG GAC 240 Leu Leu Leu Leu Leu Leu Ala Leu Pro Ala Arg Ala Tyr Ala Met Asp 65 70 75 80 CGG GAG ATG GCT GCA TCG TGC GGA GGC GCG GTT TTT GTA GGT CTG GTA 288 Arg Glu Met Ala Ala Ser Cys Gly Gly Ala Val Phe Val Gly Leu Val 85 90 95 CTC CTG ACC TTG TCA CCA TAC TAC AAA GTG TTC CTC GCT AAG CTC ATA 336 Leu Leu Thr Leu Ser Pro Tyr Tyr Lys Val Phe Leu Ala Lys Leu Ile 100 105 110 TGG TGG TTG CAA TAT CTC ATC ACC AGG GCC GAG GCG CAC TTG CAA GTG 384 Trp Trp Leu Gln Tyr Leu Ile Thr Arg Ala Glu Ala His Leu Gln Val 115 120 125 TGG ATC CCC CCC CTT AAC GTT CGG GGG GGC CGC GAT GCC ATC ATC CTT 432 Trp Ile Pro Pro Leu Asn Val Arg Gly Gly Arg Asp Ala Ile Ile Leu 130 135 140 CTC ACA TGT GCG GTC CAC CCG GAG CTG ATC TTT GAC ATC ACC AAG CTC 480 Leu Thr Cys Ala Val His Pro Glu Leu Ile Phe Asp Ile Thr Lys Leu 145 150 155 160 TTG CTC GCC ATA CTC GGT CCG CTC ATG GTA CTC CAG GCT GGC CTA ACC 528 Leu Leu Ala Ile Leu Gly Pro Leu Met Val Leu Gln Ala Gly Leu Thr 165 170 175 CAA ATG CCG TAC TTT GTG CGT GCT CAA GGG CTC ATT CGT ATG TGC ATG 576 Gln Met Pro Tyr Phe Val Arg Ala Gln Gly Leu Ile Arg Met Cys Met 180 185 190 TTG GTG CGG AAA GTC GCT GGG GGT CAT TAT GTC CAG ATG GCT CTC ATG 624 Leu Val Arg Lys Val Ala Gly Gly His Tyr Val Gln Met Ala Leu Met 195 200 205 AAG CTG GCT GCA CTG ACA GGT ACG TAC GTT TAT GTC CAT CTT ACT CCA 672 Lys Leu Ala Ala Leu Thr Gly Thr Tyr Val Tyr Val His Leu Thr Pro 210 215 220 CTG CAG GAC TGG GCC CAC GCG GGC CTA CGA GAC CTT GCG GTA GCA GTT 720 Leu Gln Asp Trp Ala His Ala Gly Leu Arg Asp Leu Ala Val Ala Val 225 230 235 240 GAG CCC GTT GTC TTC TCT GAT ATG GAG ACT AAG ATC ATC ACC TGG GGG 768 Glu Pro Val Val Phe Ser Asp Met Glu Thr Lys Ile Ile Thr Trp Gly 245 250 255 GCA GAC ACC GCG GCG TGT GGG GAC ATC ATT TTG GGC CTA CCT GTC TCC 816 Ala Asp Thr Ala Ala Cys Gly Asp Ile Ile Leu Gly Leu Pro Val Ser 260 265 270 GCC CGG AGG GGC AAC GAG ATA CTC CTC GGA CCG 849 Ala Arg Arg Gly Asn Glu Ile Leu Leu Gly Pro 275 280
【０２８５】配列番号：47 配列の長さ：524 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：O26-1 配列 ATC ACG TGG GGG GCA GAG ACG GCG GCG TGT GGG GAC ATC ATC TCG GGT 48 Ile Thr Trp Gly Ala Glu Thr Ala Ala Cys Gly Asp Ile Ile Ser Gly 1 5 10 15 CTA CCC GTT TCC GCC CGA AGG GGG AGG GAG CTG CTT TTG GGG CCG GCC 96 Leu Pro Val Ser Ala Arg Arg Gly Arg Glu Leu Leu Leu Gly Pro Ala 20 25 30 GAT AGT TTT GAC GGG CAG GGG TGG CGA CTC CTT GCG CCT ATC ACG GCC 144 Asp Ser Phe Asp Gly Gln Gly Trp Arg Leu Leu Ala Pro Ile Thr Ala 35 40 45 TAC TCC CAG CAG ACG CGG GGC CTG CTT GGT TGC ATC ATC ACT AGC CTT 192 Tyr Ser Gln Gln Thr Arg Gly Leu Leu Gly Cys Ile Ile Thr Ser Leu 50 55 60 ACG GGC CGG GAT AAG AAC CAG GTC GAG GGG GAG GTT CAA GTG GTC TCT 240 Thr Gly Arg Asp Lys Asn Gln Val Glu Gly Glu Val Gln Val Val Ser 65 70 75 80 ACC GCA ACA CAA TCT TTC CTG GCG ACC TGT GTC AAC GGC GTG TGC TGG 288 Thr Ala Thr Gln Ser Phe Leu Ala Thr Cys Val Asn Gly Val Cys Trp 85 90 95 ACT GTT TTC CAC GGC GCC GGC TCG AAG ACC TTA GCC GGC CCA AAA GGC 336 Thr Val Phe His Gly Ala Gly Ser Lys Thr Leu Ala Gly Pro Lys Gly 100 105 110 CCA ATC ACC CAA ATG TAC ACC AAT GTA GAT CAG GAC CTC GTC GGC TGG 384 Pro Ile Thr Gln Met Tyr Thr Asn Val Asp Gln Asp Leu Val Gly Trp 115 120 125 TCG GCG CCC CCC CGG GCG CGT TCC TTG ACA CCT TGC ACC TGC GGC AGC 432 Ser Ala Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Thr Pro Cys Thr Cys Gly Ser 130 135 140 TCG GAC CTT TAT TTG GTC ACG AGG CAT GCT GAT GTC ATT CCG GTG CAC 480 Ser Asp Leu Tyr Leu Val Thr Arg His Ala Asp Val Ile Pro Val His 145 150 155 160 CGG CGG GGC GAC AGC AGG GGG AGC CTC CTC TCC CCC GGG CCC AT 524 Arg Arg Gly Asp Ser Arg Gly Ser Leu Leu Ser Pro Gly Pro 165 170
【０２８６】配列番号：48 配列の長さ：514 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：O26-2 配列 ATC ACG TGG GGG GCA GAG ACG GCG GCG TGT GGG GAC ATC ATC TCG GGT 48 Ile Thr Trp Gly Ala Glu Thr Ala Ala Cys Gly Asp Ile Ile Ser Gly 1 5 10 15 CTA CCC GTT TCC GCC CGA AGG GGG AGG GAG CTG CTT TTG GGA CCG GCC 96 Leu Pro Val Ser Ala Arg Arg Gly Arg Glu Leu Leu Leu Gly Pro Ala 20 25 30 GAT AGT TTT GAC GGG CAG GGG TGG CGA CTC CTT GCG CCT ATC ACG GCC 144 Asp Ser Phe Asp Gly Gln Gly Trp Arg Leu Leu Ala Pro Ile Thr Ala 35 40 45 TAC TCC CAG CAG ACG CGG GGC CTG CTT GGT TGC ATC ATC ACC AGC CTT 192 Tyr Ser Gln Gln Thr Arg Gly Leu Leu Gly Cys Ile Ile Thr Ser Leu 50 55 60 ACG GGC CGG GAT AAG AAC CAG GTC GAG GGG GAG GTT CAA GTG GTC TCT 240 Thr Gly Arg Asp Lys Asn Gln Val Glu Gly Glu Val Gln Val Val Ser 65 70 75 80 ACC GCA ACA CAA TCT TTC CTG GCG ACC TGC ATC AAC GGC GTT TGC TGG 288 Thr Ala Thr Gln Ser Phe Leu Ala Thr Cys Ile Asn Gly Val Cys Trp 85 90 95 ACT GTT TTC CAC GGC GCC GGC TCG AAG ACC TTA GCC GGC CCA AAA GGC 336 Thr Val Phe His Gly Ala Gly Ser Lys Thr Leu Ala Gly Pro Lys Gly 100 105 110 CCA ATC ACC CAA ATG TAC ACC AAT GTA GAT CAG GAC CTC GTC GGC TGG 384 Pro Ile Thr Gln Met Tyr Thr Asn Val Asp Gln Asp Leu Val Gly Trp 115 120 125 TCG GCG CCC CCC GGG GCG CGT TCC TTG ACA CCT TGC ACC TGC GGC AGC 432 Ser Ala Pro Pro Gly Ala Arg Ser Leu Thr Pro Cys Thr Cys Gly Ser 130 135 140 TCG GAC CTT TAT TTG GTC ACG AGG CAT GCT GAT GTC ATT CCG GTG CAC 480 Ser Asp Leu Tyr Leu Val Thr Arg His Ala Asp Val Ile Pro Val His 145 150 155 160 CGG CGG GGC GAC AGC AGG GGG AGC CTC CTC TCC C 514 Arg Arg Gly Asp Ser Arg Gly Ser Leu Leu Ser 165 170
【０２８７】配列番号：49 配列の長さ：523 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：O26-3 配列 ATC ACG TGG GGG GCA GAG ACG GCG GCG TGT GGG GAC ATC ATC TCG GGT 48 Ile Thr Trp Gly Ala Glu Thr Ala Ala Cys Gly Asp Ile Ile Ser Gly 1 5 10 15 CTA CCC GTT TCC GCC CGA AGG GGG AAG GAG CTG CTT TTG GGA CCG GCC 96 Leu Pro Val Ser Ala Arg Arg Gly Lys Glu Leu Leu Leu Gly Pro Ala 20 25 30 GAT AGT TTT GAC GGG CAG GGG TGG CGA CTC CTT GCG CCT ATC ACG GCC 144 Asp Ser Phe Asp Gly Gln Gly Trp Arg Leu Leu Ala Pro Ile Thr Ala 35 40 45 TAC TCC CAG CAA ACG CGG GGC CTG CTT GGT TGC ATC ATC ACT AGC CTT 192 Tyr Ser Gln Gln Thr Arg Gly Leu Leu Gly Cys Ile Ile Thr Ser Leu 50 55 60 ACG GGC CGG GAT AAA AAC CAG GTC GAG GGG GAG GTT CAA GTG GTC TCT 240 Thr Gly Arg Asp Lys Asn Gln Val Glu Gly Glu Val Gln Val Val Ser 65 70 75 80 ACC GCA ACA CAA TCT TTC CTG GCG ACC TGT GTC AAC GGC GTG TGC TGG 288 Thr Ala Thr Gln Ser Phe Leu Ala Thr Cys Val Asn Gly Val Cys Trp 85 90 95 ACT GTT TTC CAC GGT GCC GGC TCG AAG ACC TTA GCC GGC CCA AAA GGC 336 Thr Val Phe His Gly Ala Gly Ser Lys Thr Leu Ala Gly Pro Lys Gly 100 105 110 CCA ATC ACC CAA ATG TAC ACC AAT GTG GAT CAG GAC CTC GTC GGT TGG 384 Pro Ile Thr Gln Met Tyr Thr Asn Val Asp Gln Asp Leu Val Gly Trp 115 120 125 TCG GCG CCC CCC GGG GCG CGT TCC TTG ACA CCA TGC ACC TGC GGC AGC 432 Ser Ala Pro Pro Gly Ala Arg Ser Leu Thr Pro Cys Thr Cys Gly Ser 130 135 140 TCG GAC CTT TAT TTG GTC ACG AGA CAT GCT GAT GTC ATT CCG GTG CAC 480 Ser Asp Leu Tyr Leu Val Thr Arg His Ala Asp Val Ile Pro Val His 145 150 155 160 CGG CGG GGC GAC AGC AGG GGG AGC CTC CTC TCC CCC GGG CCC A 523 Arg Arg Gly Asp Ser Arg Gly Ser Leu Leu Ser Pro Gly Pro 165 170
【０２８８】配列番号：50 配列の長さ：921 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N23-1 配列 CTG CTG TCG CCC GGG CCC ATC TCT TAC TTG AAG GGT TCC TCG GGT GGT 48 Leu Leu Ser Pro Gly Pro Ile Ser Tyr Leu Lys Gly Ser Ser Gly Gly 1 5 10 15 CCG CTG CCT TGC CCC TCG GGC CGT GTT GTG GGC ATC TTC CGG GCT GCC 96 Pro Leu Pro Cys Pro Ser Gly Arg Val Val Gly Ile Phe Arg Ala Ala 20 25 30 GTG TGC ACC CGG GGG GTT GCG AAG GCG GTG GAC TTT GTG CCC GTT GAG 144 Val Cys Thr Arg Gly Val Ala Lys Ala Val Asp Phe Val Pro Val Glu 35 40 45 TCT ATG GAA ACC ACC ATG CGG TCT CCG GTC TTC ACG GAT AAC TCA ACC 192 Ser Met Glu Thr Thr Met Arg Ser Pro Val Phe Thr Asp Asn Ser Thr 50 55 60 CCC CCG GCC GTA CCG CAG ACA TTC CAA GTG GCC CAC CTA CAC GCT CCC 240 Pro Pro Ala Val Pro Gln Thr Phe Gln Val Ala His Leu His Ala Pro 65 70 75 80 ACT GGC AGC GGC AAA AGC ACC AGG GTG CCG GCT GCG TAT GCG GCC CAA 288 Thr Gly Ser Gly Lys Ser Thr Arg Val Pro Ala Ala Tyr Ala Ala Gln 85 90 95 GGG TAC AAG GTA CTC GTC CTG AAC CCG TCC GTT GCT GCC ACT TTG GGC 336 Gly Tyr Lys Val Leu Val Leu Asn Pro Ser Val Ala Ala Thr Leu Gly 100 105 110 TTT GGG GCG TAC ATG TCC AAG GCA CAT GGT GTT GAC CCT AAC ATC AGA 384 Phe Gly Ala Tyr Met Ser Lys Ala His Gly Val Asp Pro Asn Ile Arg 115 120 125 ACT GGG GTG AGG ACC ATC ACC ACG GGC GCT CCC ATC ACG TAC TCC ACC 432 Thr Gly Val Arg Thr Ile Thr Thr Gly Ala Pro Ile Thr Tyr Ser Thr 130 135 140 TAC GGT AAG TTC CTC GCC GAC GGT GGC TGT TCT GGG GGT GCC TAT GAC 480 Tyr Gly Lys Phe Leu Ala Asp Gly Gly Cys Ser Gly Gly Ala Tyr Asp 145 150 155 160 ATC ATA ATA TGT GAT GAG TGT CAT TCA ACT GAC TCG ACT TCC ATC TTG 528 Ile Ile Ile Cys Asp Glu Cys His Ser Thr Asp Ser Thr Ser Ile Leu 165 170 175 GGC ATT GGT ACA GTC CTG GAC CAA GCG GAG ACG GCT GGA GCG CGC CTT 576 Gly Ile Gly Thr Val Leu Asp Gln Ala Glu Thr Ala Gly Ala Arg Leu 180 185 190 GTC GTG CTC GCC ACC GCT ACG CCT CCG GGA TCG GTC ACC GTG CCG CAT 624 Val Val Leu Ala Thr Ala Thr Pro Pro Gly Ser Val Thr Val Pro His 195 200 205 CCT AAT ATT GAG GAG GTG GCC TTG TCC AAC ACT GGA GAG ATC CCC TTC 672 Pro Asn Ile Glu Glu Val Ala Leu Ser Asn Thr Gly Glu Ile Pro Phe 210 215 220 TAT GGC AAG GCC ATC CCC CTC GAG GCC ATC AAG GGG GGG AGG CAT CTC 720 Tyr Gly Lys Ala Ile Pro Leu Glu Ala Ile Lys Gly Gly Arg His Leu 225 230 235 240 ATT TTC TGC CAT TCC AAG AAG AAA TGT GAC GAG CTC GCT GCG AAG CTG 768 Ile Phe Cys His Ser Lys Lys Lys Cys Asp Glu Leu Ala Ala Lys Leu 245 250 255 TCG GCC CTC GGA GTC AAC GCT GTA GCA TAT TAC CGG GGT CTT GAT GTG 816 Ser Ala Leu Gly Val Asn Ala Val Ala Tyr Tyr Arg Gly Leu Asp Val 260 265 270 TCC ATC ATA CCG ACA AGC GGG GAC GTC GTT GTC GTG GCA ACA GAC GCT 864 Ser Ile Ile Pro Thr Ser Gly Asp Val Val Val Val Ala Thr Asp Ala 275 280 285 CTA ATG ACG GGC TAT ACC GGT GAC TTT GAC TCG GTG ATC GAC TGC AAC 912 Leu Met Thr Gly Tyr Thr Gly Asp Phe Asp Ser Val Ile Asp Cys Asn 290 295 300 ACA TGT GTC 921 Thr Cys Val 305
【０２８９】配列番号：51 配列の長さ：921 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N23-2 配列 CTG CTG TCG CCC GGG CCC ATC TCC TAC CTG AAG GGT TCC TCG GGT GGT 48 Leu Leu Ser Pro Gly Pro Ile Ser Tyr Leu Lys Gly Ser Ser Gly Gly 1 5 10 15 CCG CTG CTT TGC CCC TCG GGC CAT GTT GTG GGC ATC TTC CGG GCT GCT 96 Pro Leu Leu Cys Pro Ser Gly His Val Val Gly Ile Phe Arg Ala Ala 20 25 30 GTG TGC ACC CGG GGG GTT GCG AAG GCG GTA GAC TTT GTG CCC GTT GAG 144 Val Cys Thr Arg Gly Val Ala Lys Ala Val Asp Phe Val Pro Val Glu 35 40 45 TCT ATG GAA ACC ACT ATG CGG TCT CCG GTC TTC ACG GAT AAC TCA ACC 192 Ser Met Glu Thr Thr Met Arg Ser Pro Val Phe Thr Asp Asn Ser Thr 50 55 60 CCC CCG GCC GTA CCG CAG TCA TTC CAA GTG GCC CAC CTA CAC GCT CCC 240 Pro Pro Ala Val Pro Gln Ser Phe Gln Val Ala His Leu His Ala Pro 65 70 75 80 ACT GGC AGC GGC AAA AGC ACC AAG GTG CCG GCT GCG TAT GCG GCC CAA 288 Thr Gly Ser Gly Lys Ser Thr Lys Val Pro Ala Ala Tyr Ala Ala Gln 85 90 95 GGG TAC AAG GTA CTC GTC CTG AAC CCG TCC GTT GCT GCC ACT TTG GGC 336 Gly Tyr Lys Val Leu Val Leu Asn Pro Ser Val Ala Ala Thr Leu Gly 100 105 110 TTT GGG GCG TAT ATG TCC AAG GCA CAT GGT GTT GAC CCT AAC ATC AGA 384 Phe Gly Ala Tyr Met Ser Lys Ala His Gly Val Asp Pro Asn Ile Arg 115 120 125 ACT GGG GTG AGG ACC ATC ACC ACG GGC GCT CCC ATC ACG TAC TCC ACC 432 Thr Gly Val Arg Thr Ile Thr Thr Gly Ala Pro Ile Thr Tyr Ser Thr 130 135 140 TAC GGT AAG TTC CTC GCC GAC GGT GGC TGT TCT GGG GGT GCC TAT GAC 480 Tyr Gly Lys Phe Leu Ala Asp Gly Gly Cys Ser Gly Gly Ala Tyr Asp 145 150 155 160 ATC ATA ATA TGT GAT GAG TGT CAT TCA ACT GAC TCG ACT TCC ATC TTG 528 Ile Ile Ile Cys Asp Glu Cys His Ser Thr Asp Ser Thr Ser Ile Leu 165 170 175 GGC ATT GGT ACA GTC CTG GAC CAA GCG GAG ACG GCT GGA GCG CGC CTT 576 Gly Ile Gly Thr Val Leu Asp Gln Ala Glu Thr Ala Gly Ala Arg Leu 180 185 190 GTC GTG CTC GCC ACC GCT ACG CCT CCG GGA TCG GTC ACC GTG CCG CAT 624 Val Val Leu Ala Thr Ala Thr Pro Pro Gly Ser Val Thr Val Pro His 195 200 205 CCT AAT ATT GAG GAG GTG GCC TTG TCC AAC ACT GGA GAG ATC CCC TTC 672 Pro Asn Ile Glu Glu Val Ala Leu Ser Asn Thr Gly Glu Ile Pro Phe 210 215 220 TAT GGC AAG GCC ATC CCC CTC GAG GCC ATC AAG GGG GGG AGG CAT CTC 720 Tyr Gly Lys Ala Ile Pro Leu Glu Ala Ile Lys Gly Gly Arg His Leu 225 230 235 240 ACT TTC TGC CAT TCC AAG AAG AAA TGT GAC GAG CTC GCT GCG AAG CTG 768 Thr Phe Cys His Ser Lys Lys Lys Cys Asp Glu Leu Ala Ala Lys Leu 245 250 255 TCG GCC CTC GGA GTC AAC GCT GTA GCA TAC TAC CGG GGT CTT GAT GTG 816 Ser Ala Leu Gly Val Asn Ala Val Ala Tyr Tyr Arg Gly Leu Asp Val 260 265 270 TCC GTC ATA CCG ACA AGC GGG GAC GTC GTT GTC GTG GCA ACT GAC GCT 864 Ser Val Ile Pro Thr Ser Gly Asp Val Val Val Val Ala Thr Asp Ala 275 280 285 CTA ATG ACG GGC TAT ACC GGT GAC TTT GAC TCA GTG ATC GAC TGC AAC 912 Leu Met Thr Gly Tyr Thr Gly Asp Phe Asp Ser Val Ile Asp Cys Asn 290 295 300 ACA TGT GTC 921 Thr Cys Val 305
【０２９０】配列番号：52 配列の長さ：921 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N23-3 配列 CTG CTG TCG CCC GGG CCC ATC TCT TAC TTG AAG GGC TCC TCG GGT GGT 48 Leu Leu Ser Pro Gly Pro Ile Ser Tyr Leu Lys Gly Ser Ser Gly Gly 1 5 10 15 CCG CTG CTT TGC CCC TCG GGC CAT GTT GTG GGC ATC TTC CGG GCT GCC 96 Pro Leu Leu Cys Pro Ser Gly His Val Val Gly Ile Phe Arg Ala Ala 20 25 30 GTG TGC ACC CGG GGG GTT GCG AAG GCG GTG GAC TTT GTG CCC GTT GAG 144 Val Cys Thr Arg Gly Val Ala Lys Ala Val Asp Phe Val Pro Val Glu 35 40 45 TCT ATG GAA ACC ACC ATG CGG TCT CCG GTC TTC GCG GAT AAC TCA ACC 192 Ser Met Glu Thr Thr Met Arg Ser Pro Val Phe Ala Asp Asn Ser Thr 50 55 60 CCC CCG GCC GTA CCG CAG ACA TTC CAA GTG GCC CAC CTA CAC GCT CCC 240 Pro Pro Ala Val Pro Gln Thr Phe Gln Val Ala His Leu His Ala Pro 65 70 75 80 ACT GGC AGC GGC AAA AGC ACC AGG GTG CCG GCT GCG TAT GCG GCC CAA 288 Thr Gly Ser Gly Lys Ser Thr Arg Val Pro Ala Ala Tyr Ala Ala Gln 85 90 95 GGG TAC AAG GTA CTC GTC CTG AAC CCG TCC GTT GCT GCC ACT TTG GGC 336 Gly Tyr Lys Val Leu Val Leu Asn Pro Ser Val Ala Ala Thr Leu Gly 100 105 110 TTT GGG GCG TAC ATG TCC AAG GCA CAT GGT GTT GAC CCT AAC ATC AGA 384 Phe Gly Ala Tyr Met Ser Lys Ala His Gly Val Asp Pro Asn Ile Arg 115 120 125 ACT GGG GTG AGG ACC ATC ACC ACG GGC GCT CCC GTC ACG TAC TCC ACC 432 Thr Gly Val Arg Thr Ile Thr Thr Gly Ala Pro Val Thr Tyr Ser Thr 130 135 140 TAC GGT AAG TTC CTC GCC GAC GGT GGC TGT TCT GGG GGT GCC TAT GAC 480 Tyr Gly Lys Phe Leu Ala Asp Gly Gly Cys Ser Gly Gly Ala Tyr Asp 145 150 155 160 ATC ATA ATA TGT GAT GAG TGT CAT TCA ACT GAC TCG ACT TCC ATC TTG 528 Ile Ile Ile Cys Asp Glu Cys His Ser Thr Asp Ser Thr Ser Ile Leu 165 170 175 GGC ATT GGT ACA GTC CTG GAC CAA GCG GAG ACG GCT GGA GCG CGC CTT 576 Gly Ile Gly Thr Val Leu Asp Gln Ala Glu Thr Ala Gly Ala Arg Leu 180 185 190 GTC GTG CTC GCC ACC GCT ACG CCT CCG GGA TCG GTC ACC GTG CCG CAT 624 Val Val Leu Ala Thr Ala Thr Pro Pro Gly Ser Val Thr Val Pro His 195 200 205 CCT AAT ATT GAG GAG GTG GCC TTG TCC AAC ACT GGA GAG ATC CCC TTC 672 Pro Asn Ile Glu Glu Val Ala Leu Ser Asn Thr Gly Glu Ile Pro Phe 210 215 220 TAT GGC AAG GCC ATC CCC CTC GAG GCC ATC AAG GGG GGG AGG CAT CTC 720 Tyr Gly Lys Ala Ile Pro Leu Glu Ala Ile Lys Gly Gly Arg His Leu 225 230 235 240 ATT TTC TGC CAT TCC AAG AAG AAA TGT GAC GAG CTC GCT GCG AAG CTG 768 Ile Phe Cys His Ser Lys Lys Lys Cys Asp Glu Leu Ala Ala Lys Leu 245 250 255 TCG GCC CTC GGA GTC AAT GCT GTA GCA TAT TAC CGG GGT CTT GAT GTG 816 Ser Ala Leu Gly Val Asn Ala Val Ala Tyr Tyr Arg Gly Leu Asp Val 260 265 270 TCC ATC ATA CCG ACA AGC GGG GAC GTC GTT GTC GTG GCA ACA GAC GCT 864 Ser Ile Ile Pro Thr Ser Gly Asp Val Val Val Val Ala Thr Asp Ala 275 280 285 CTA ATG ACA GGC TAT ACC GGT GAC TTT GAC TCG GTG ATC GAC TGT AAC 912 Leu Met Thr Gly Tyr Thr Gly Asp Phe Asp Ser Val Ile Asp Cys Asn 290 295 300 ACA TGT GTC 921 Thr Cys Val 305
【０２９１】配列番号：53 配列の長さ：623 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N16-1 配列 GGC TAT ACC GGC GAC TTC GAC TCA GTG ATC GAC TGC AAC ACA TGT GTC 48 Gly Tyr Thr Gly Asp Phe Asp Ser Val Ile Asp Cys Asn Thr Cys Val 1 5 10 15 ACC CAA ACA GTC GAT TTC AGC TTG GAC CCT ACT TTC ACC ATC GAG ACG 96 Thr Gln Thr Val Asp Phe Ser Leu Asp Pro Thr Phe Thr Ile Glu Thr 20 25 30 ACG ACC GTA CCC CAA GAT GCG GTG TCG CGC TCG CAG CGG CGA GGC AGG 144 Thr Thr Val Pro Gln Asp Ala Val Ser Arg Ser Gln Arg Arg Gly Arg 35 40 45 ACT GGT AGG GGC AGG GGG GGC ATA TAC AGG TTT GTA ACT CCA GGG GAA 192 Thr Gly Arg Gly Arg Gly Gly Ile Tyr Arg Phe Val Thr Pro Gly Glu 50 55 60 CGG CCC TCA GGC ATG TTC GAT TCT TCG GTC CTG TGT GAA TGT TAT GAC 240 Arg Pro Ser Gly Met Phe Asp Ser Ser Val Leu Cys Glu Cys Tyr Asp 65 70 75 80 GCG GGC TGT GCT TGG TAC GAG CTC ACG CCC GCC GAG ACC TCG GTT AGG 288 Ala Gly Cys Ala Trp Tyr Glu Leu Thr Pro Ala Glu Thr Ser Val Arg 85 90 95 TTG CGG GCT TAC CTA AAT ACA CCT GGG CTG CCC GTC TGC CAG GAC CAT 336 Leu Arg Ala Tyr Leu Asn Thr Pro Gly Leu Pro Val Cys Gln Asp His 100 105 110 CTG GAG TTC TGG GAG AGC GTC TTC ACC GGC CTC ACC CAC ATA GAT GCC 384 Leu Glu Phe Trp Glu Ser Val Phe Thr Gly Leu Thr His Ile Asp Ala 115 120 125 CAC TTC TTG TCC CAG ACC AAA CAG GCA GGA GAC AAC TTC CCC TAC CTG 432 His Phe Leu Ser Gln Thr Lys Gln Ala Gly Asp Asn Phe Pro Tyr Leu 130 135 140 GTA GCA TAC CAG GCT ACA GTG TGC GCC AGG GCC AAG GCT CCA CCT CCA 480 Val Ala Tyr Gln Ala Thr Val Cys Ala Arg Ala Lys Ala Pro Pro Pro 145 150 155 160 TCG TGG GAT CAG ATG TGG AAG TGT CTC ATA CGG CTG AAG CCT ACG CTA 528 Ser Trp Asp Gln Met Trp Lys Cys Leu Ile Arg Leu Lys Pro Thr Leu 165 170 175 CAC GGG CCA ACG CCC CTG TTG TAT AGG TTA GGA GCC GTT CAG AAC GAG 576 His Gly Pro Thr Pro Leu Leu Tyr Arg Leu Gly Ala Val Gln Asn Glu 180 185 190 GTT ACC CTT ACA CAC CCC ATA ACC AAG TAC ATC ATG ACA TGC ATG TC 623 Val Thr Leu Thr His Pro Ile Thr Lys Tyr Ile Met Thr Cys Met 195 200 205
【０２９２】配列番号：54 配列の長さ：623 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N16-2 配列 GGC TAT ACC GGC GAC TTC GAC TCA GTG ATC GAC TGC AAC ACA TGT GTC 48 Gly Tyr Thr Gly Asp Phe Asp Ser Val Ile Asp Cys Asn Thr Cys Val 1 5 10 15 ACC CAA ACA GTC GAT TTC AGC TTG GAC CCT ACT TTC ACC ATC GAG ACG 96 Thr Gln Thr Val Asp Phe Ser Leu Asp Pro Thr Phe Thr Ile Glu Thr 20 25 30 ACG ACC GTA CCC CAA GAT GCG GTG TCG CGC TCG CAG CGG CGA GGC AGG 144 Thr Thr Val Pro Gln Asp Ala Val Ser Arg Ser Gln Arg Arg Gly Arg 35 40 45 ACT GGT AGG GGC AGG GGG GGC ATA TAC AGG TTT GTA ACT CCA GGG GAA 192 Thr Gly Arg Gly Arg Gly Gly Ile Tyr Arg Phe Val Thr Pro Gly Glu 50 55 60 CGG CCC TCA GGC ATG TTC GAT TCT TCG GTC CTG TGT GAA TGT TAT GAC 240 Arg Pro Ser Gly Met Phe Asp Ser Ser Val Leu Cys Glu Cys Tyr Asp 65 70 75 80 GCG GGC TGT GCT TGG TAC GAG CTC ACG CCC GCC GAG ACC TCG GTT AGG 288 Ala Gly Cys Ala Trp Tyr Glu Leu Thr Pro Ala Glu Thr Ser Val Arg 85 90 95 TTG CGG GCT TAC CTA AAT ACA CCT GGG CTG CCC GTC TGC CAG GAC CAT 336 Leu Arg Ala Tyr Leu Asn Thr Pro Gly Leu Pro Val Cys Gln Asp His 100 105 110 CTG GAG TTC TGG GAG AGC GTC TTC ACC GGC CTC ACC CAC ATA GAT GCC 384 Leu Glu Phe Trp Glu Ser Val Phe Thr Gly Leu Thr His Ile Asp Ala 115 120 125 CAC TTC TTG TCC CAG ACC AAA CAG GCA GGA GAC AAC TTC CCC TAC CTG 432 His Phe Leu Ser Gln Thr Lys Gln Ala Gly Asp Asn Phe Pro Tyr Leu 130 135 140 GTA GCA TAC CAG GCT ACA GTG TGC GCC AGG GCC AAG GCT CCA CCT CCA 480 Val Ala Tyr Gln Ala Thr Val Cys Ala Arg Ala Lys Ala Pro Pro Pro 145 150 155 160 TCG TGG GAT CAG ATG TGG AAG TGT CTC ATA CGG CTG AAG CCT ACG CTA 528 Ser Trp Asp Gln Met Trp Lys Cys Leu Ile Arg Leu Lys Pro Thr Leu 165 170 175 CAC GGG CCA ACG CCC CTG TTG TAT AGG TTA GGA GCC GTT CAG AAC GAG 576 His Gly Pro Thr Pro Leu Leu Tyr Arg Leu Gly Ala Val Gln Asn Glu 180 185 190 GTT ACC CTC ACA CAC CCT ATA ACC AAG TAC ATC ATG ACA TGC ATG TC 623 Val Thr Leu Thr His Pro Ile Thr Lys Tyr Ile Met Thr Cys Met 195 200 205
【０２９３】配列番号：55 配列の長さ：623 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N16-3 配列 GGC TAT ACC GGC GAC TTC GAC TCA GTG ATC GAC TGC AAC ACA TGT GTC 48 Gly Tyr Thr Gly Asp Phe Asp Ser Val Ile Asp Cys Asn Thr Cys Val 1 5 10 15 ACC CAA ACA GTC GAT TTC AGC TTG GAC CCT ACT TTC ACC ATT GAG ACG 96 Thr Gln Thr Val Asp Phe Ser Leu Asp Pro Thr Phe Thr Ile Glu Thr 20 25 30 ACG ACC GTA CCC CAA GAT GCG GTG TCG CGC TCG CAG CGG CGA GGC AGG 144 Thr Thr Val Pro Gln Asp Ala Val Ser Arg Ser Gln Arg Arg Gly Arg 35 40 45 ACT GGT AGG GGC AGA GGG GGC ATA TAC AGG TTT GTA ACT CCA GGG GAA 192 Thr Gly Arg Gly Arg Gly Gly Ile Tyr Arg Phe Val Thr Pro Gly Glu 50 55 60 CGG CCC TCA GGC ATG TTC GAT TCT TCG GTC CTG TGT GAA TGT TAT GAC 240 Arg Pro Ser Gly Met Phe Asp Ser Ser Val Leu Cys Glu Cys Tyr Asp 65 70 75 80 GCG GGC TGT GCT TGG TAC GAG CTC ACG TCC GCC GAG ACC TCG GTT AGG 288 Ala Gly Cys Ala Trp Tyr Glu Leu Thr Ser Ala Glu Thr Ser Val Arg 85 90 95 TTG CGG GCT TAC CTA AAC ACA CCT GGG CTG CCC GTC TGC CAG GAC CAT 336 Leu Arg Ala Tyr Leu Asn Thr Pro Gly Leu Pro Val Cys Gln Asp His 100 105 110 CTG GAG TTC TGG GAG AGC GTC TTC ACC GGC CTC ACC CAC ATA GAT GCC 384 Leu Glu Phe Trp Glu Ser Val Phe Thr Gly Leu Thr His Ile Asp Ala 115 120 125 CAC TTC TTG TCC CAG ACT AAA CAG GCA GGA GAC AAC TTC CCC TAC CTG 432 His Phe Leu Ser Gln Thr Lys Gln Ala Gly Asp Asn Phe Pro Tyr Leu 130 135 140 GTA GCA TAC CAG GCT ACA GTG TGC GCC AGG GCC AAG GCT CCA CCT CCA 480 Val Ala Tyr Gln Ala Thr Val Cys Ala Arg Ala Lys Ala Pro Pro Pro 145 150 155 160 TCG TGG GAT CAG ATG TGG AAG TGT CTC ATA CGG CTG AAG CCT ACG CTA 528 Ser Trp Asp Gln Met Trp Lys Cys Leu Ile Arg Leu Lys Pro Thr Leu 165 170 175 CAC GGG CCA ACG CCC CTG TTG CAT AGG TTA GGA GCC GTT CAG AAC AAG 576 His Gly Pro Thr Pro Leu Leu His Arg Leu Gly Ala Val Gln Asn Lys 180 185 190 GTT GCC CTC ACA CAC CCC ATA ACC AAG TAC ATC ATG ACA TGC ATG TC 623 Val Ala Leu Thr His Pro Ile Thr Lys Tyr Ile Met Thr Cys Met 195 200 205
【０２９４】配列番号：56 配列の長さ：1280 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：MX25O26A-1 配列 TGT GCC TGG TTG TGG ATG ATG CTG CTG ATA GCC CAA GCT GAG GCC GCC 48 Cys Ala Trp Leu Trp Met Met Leu Leu Ile Ala Gln Ala Glu Ala Ala 1 5 10 15 TTG GAG AAC CTG GTG GTC CTC AAT GCA GCA TCC ATG GCG GGA GCG CAT 96 Leu Glu Asn Leu Val Val Leu Asn Ala Ala Ser Met Ala Gly Ala His 20 25 30 GGC ATC CTC TCT TTC CTT GTG TTC TTC TGT GCC GCC TGG TAC ATC AAA 144 Gly Ile Leu Ser Phe Leu Val Phe Phe Cys Ala Ala Trp Tyr Ile Lys 35 40 45 GGC AGG CTG GTC CCT GGG GCG GCA TAC GCT TTC TAT GGC GTA TGG CCG 192 Gly Arg Leu Val Pro Gly Ala Ala Tyr Ala Phe Tyr Gly Val Trp Pro 50 55 60 CTG CTC CTG CTC TTG ATG GCG CTA CCC GCA CGG GCG TAC GCC ATG GAC 240 Leu Leu Leu Leu Leu Met Ala Leu Pro Ala Arg Ala Tyr Ala Met Asp 65 70 75 80 CGG GAG ATG GCT GCA TCG TGC GGA GGC GCG GTT TTT GTA GGT CTG GTA 288 Arg Glu Met Ala Ala Ser Cys Gly Gly Ala Val Phe Val Gly Leu Val 85 90 95 CTC TTG ACC TTG TCA CCA TAC TAC AAA GTG TTC CTC GCT AAG CTC ATA 336 Leu Leu Thr Leu Ser Pro Tyr Tyr Lys Val Phe Leu Ala Lys Leu Ile 100 105 110 TGG TGG TTG CAA TAT CTC ATC ACC AGG GCC GAG GCG CAC TTG CAA GTG 384 Trp Trp Leu Gln Tyr Leu Ile Thr Arg Ala Glu Ala His Leu Gln Val 115 120 125 TGG ATC CCC CCC CTC AAC GTT CGG GGG GGC CGC GAT GCC ATC ATC CTT 432 Trp Ile Pro Pro Leu Asn Val Arg Gly Gly Arg Asp Ala Ile Ile Leu 130 135 140 CTC ACA TGT GCG GTC CAC CCG GAG CTG ATC TTT GAC ATC ACC AAG CTC 480 Leu Thr Cys Ala Val His Pro Glu Leu Ile Phe Asp Ile Thr Lys Leu 145 150 155 160 TTG CTC GCC ATA CTC GGT CCG CTC ATG GTA CTC CAG GCT GGC CTA ACC 528 Leu Leu Ala Ile Leu Gly Pro Leu Met Val Leu Gln Ala Gly Leu Thr 165 170 175 CAA ATG CCG TAC TTT GTG CGT GCT CAA GGG CTC ATT CGT ATG TGC ATG 576 Gln Met Pro Tyr Phe Val Arg Ala Gln Gly Leu Ile Arg Met Cys Met 180 185 190 TTG GTG CGG AAA GCC GCT GGG GGT CAT TAT GTC CAG ATG GCT CTC ATG 624 Leu Val Arg Lys Ala Ala Gly Gly His Tyr Val Gln Met Ala Leu Met 195 200 205 AAG CTG GCT GCA CTG ACA GGT ACG TAC GTT TAT GAC CAT CTT ACT CCA 672 Lys Leu Ala Ala Leu Thr Gly Thr Tyr Val Tyr Asp His Leu Thr Pro 210 215 220 CTG CAG GAC TGG GCC CAC GCG GGC CTA CGA GAC CTT GCG GTA GCA GTT 720 Leu Gln Asp Trp Ala His Ala Gly Leu Arg Asp Leu Ala Val Ala Val 225 230 235 240 GAG CCC GTT GTC TTC TCT GAT ATG GAG ACT AAG ATC ATC ACC TGG GGG 768 Glu Pro Val Val Phe Ser Asp Met Glu Thr Lys Ile Ile Thr Trp Gly 245 250 255 GCA GAC ACT GCG GCG TGT GGG GAC ATC ATT TTG GGC CTA CCT GTC TCC 816 Ala Asp Thr Ala Ala Cys Gly Asp Ile Ile Leu Gly Leu Pro Val Ser 260 265 270 GCC CGG AGG GGC AAC GAG ATA CTC CTC GGA CCG GCC GAT AGT TTT GAC 864 Ala Arg Arg Gly Asn Glu Ile Leu Leu Gly Pro Ala Asp Ser Phe Asp 275 280 285 GGG CAG GGG TGG CGA CTC CTT GCG CCT ATC ACG GCC TAC TCC CAG CAG 912 Gly Gln Gly Trp Arg Leu Leu Ala Pro Ile Thr Ala Tyr Ser Gln Gln 290 295 300 ACG CGG GGC CTG CTT GGT TGC ATC ATC ACT AGC CTT ACG GGC CGG GAT 960 Thr Arg Gly Leu Leu Gly Cys Ile Ile Thr Ser Leu Thr Gly Arg Asp 305 310 315 320 AAG AAC CAG GTC GAG GGG GAG GTT CAA GTG GTC TCT ACC GCA ACA CAA 1008 Lys Asn Gln Val Glu Gly Glu Val Gln Val Val Ser Thr Ala Thr Gln 325 330 335 TCT TTC CTG GCG ACC TGT GTC AAC GGC GTG TGC TGG ACT GTT TTC CAC 1056 Ser Phe Leu Ala Thr Cys Val Asn Gly Val Cys Trp Thr Val Phe His 340 345 350 GGC GCC GGC TCG AAG ACC TTA GCC GGC CCA AAA GGC CCA ATC ACC CAA 1104 Gly Ala Gly Ser Lys Thr Leu Ala Gly Pro Lys Gly Pro Ile Thr Gln 355 360 365 ATG TAC ACC AAT GTA GAT CAG GAC CTC GTC GGC TGG TCG GCG CCC CCC 1152 Met Tyr Thr Asn Val Asp Gln Asp Leu Val Gly Trp Ser Ala Pro Pro 370 375 380 CGG GCG CGT TCC TTG ACA CCT TGC ACC TGC GGC AGC TCG GAC CTT TAT 1200 Arg Ala Arg Ser Leu Thr Pro Cys Thr Cys Gly Ser Ser Asp Leu Tyr 385 390 395 400 TTG GTC ACG AGG CAT GCT GAT GTC ATT CCG GTG CAC CGG CGG GGC GAC 1248 Leu Val Thr Arg His Ala Asp Val Ile Pro Val His Arg Arg Gly Asp 405 410 415 AGC AGG GGG AGC CTC CTC TCC CCC GGG CCC AT 1280 Ser Arg Gly Ser Leu Leu Ser Pro Gly Pro 420 425
【０２９５】配列番号：57 配列の長さ：1280 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：MX25O26B-1 配列 TGT GCC TGG TTG TGG ATG ATG CTG CTG ATA GCC CAA GCT GAG GCC GCC 48 Cys Ala Trp Leu Trp Met Met Leu Leu Ile Ala Gln Ala Glu Ala Ala 1 5 10 15 TTG GAG AAC CTG GTG GTC CTC AAT GCA GCA TCC ATG GCG GGA GCG CAT 96 Leu Glu Asn Leu Val Val Leu Asn Ala Ala Ser Met Ala Gly Ala His 20 25 30 GGC ATC CTC TCT TTC CTT GTG TTC TTC TGT GCC GCC TGG TAC ATC AAA 144 Gly Ile Leu Ser Phe Leu Val Phe Phe Cys Ala Ala Trp Tyr Ile Lys 35 40 45 GGC AGG CTG GTC CCT GGG GCG GCA TAC GCT TTC TAT GGC GTA TGG CCG 192 Gly Arg Leu Val Pro Gly Ala Ala Tyr Ala Phe Tyr Gly Val Trp Pro 50 55 60 CTG CTC CTG CTC TTG ATG GCG CTA CCC GCA CGG GCG TAC GCC ATG GAC 240 Leu Leu Leu Leu Leu Met Ala Leu Pro Ala Arg Ala Tyr Ala Met Asp 65 70 75 80 CGG GAG ATG GCT GCA TCG TGC GGA GGC GCG GTT TTT GTA GGT CTG GTA 288 Arg Glu Met Ala Ala Ser Cys Gly Gly Ala Val Phe Val Gly Leu Val 85 90 95 CTC TTG ACC TTG TCA CCA TAC TAC AAA GTG TTC CTC GCT AAG CTC ATA 336 Leu Leu Thr Leu Ser Pro Tyr Tyr Lys Val Phe Leu Ala Lys Leu Ile 100 105 110 TGG TGG TTG CAA TAT CTC ATC ACC AGG GCC GAG GCG CAC TTG CAA GTG 384 Trp Trp Leu Gln Tyr Leu Ile Thr Arg Ala Glu Ala His Leu Gln Val 115 120 125 TGG ATC CCC CCC CTC AAC GTT CGG GGG GGC CGC GAT GCC ATC ATC CTT 432 Trp Ile Pro Pro Leu Asn Val Arg Gly Gly Arg Asp Ala Ile Ile Leu 130 135 140 CTC ACA TGT GCG GTC CAC CCG GAG CTG ATC TTT GAC ATC ACC AAG CTC 480 Leu Thr Cys Ala Val His Pro Glu Leu Ile Phe Asp Ile Thr Lys Leu 145 150 155 160 TTG CTC GCC ATA CTC GGT CCG CTC ATG GTA CTC CAG GCT GGC CTA ACC 528 Leu Leu Ala Ile Leu Gly Pro Leu Met Val Leu Gln Ala Gly Leu Thr 165 170 175 CAA ATG CCG TAC TTT GTG CGT GCT CAA GGG CTC ATT CGT ATG TGC ATG 576 Gln Met Pro Tyr Phe Val Arg Ala Gln Gly Leu Ile Arg Met Cys Met 180 185 190 TTG GTG CGG AAA GCC GCT GGG GGT CAT TAT GTC CAG ATG GCT CTC ATG 624 Leu Val Arg Lys Ala Ala Gly Gly His Tyr Val Gln Met Ala Leu Met 195 200 205 AAG CTG GCT GCA CTG ACA GGT ACG TAC GTT TAT GAC CAT CTT ACT CCA 672 Lys Leu Ala Ala Leu Thr Gly Thr Tyr Val Tyr Asp His Leu Thr Pro 210 215 220 CTG CAG GAC TGG GCC CAC GCG GGC CTA CGA GAC CTT GCG GTA GCA GTT 720 Leu Gln Asp Trp Ala His Ala Gly Leu Arg Asp Leu Ala Val Ala Val 225 230 235 240 GAG CCC GTT GTC TTC TCT GAT ATG GAG ACT AAG ATC ATC ACG TGG GGG 768 Glu Pro Val Val Phe Ser Asp Met Glu Thr Lys Ile Ile Thr Trp Gly 245 250 255 GCA GAG ACG GCG GCG TGT GGG GAC ATC ATC TCG GGT CTA CCC GTT TCC 816 Ala Glu Thr Ala Ala Cys Gly Asp Ile Ile Ser Gly Leu Pro Val Ser 260 265 270 GCC CGA AGG GGG AGG GAG CTG CTT TTG GGG CCG GCC GAT AGT TTT GAC 864 Ala Arg Arg Gly Arg Glu Leu Leu Leu Gly Pro Ala Asp Ser Phe Asp 275 280 285 GGG CAG GGG TGG CGA CTC CTT GCG CCT ATC ACG GCC TAC TCC CAG CAG 912 Gly Gln Gly Trp Arg Leu Leu Ala Pro Ile Thr Ala Tyr Ser Gln Gln 290 295 300 ACG CGG GGC CTG CTT GGT TGC ATC ATC ACT AGC CTT ACG GGC CGG GAT 960 Thr Arg Gly Leu Leu Gly Cys Ile Ile Thr Ser Leu Thr Gly Arg Asp 305 310 315 320 AAG AAC CAG GTC GAG GGG GAG GTT CAA GTG GTC TCT ACC GCA ACA CAA 1008 Lys Asn Gln Val Glu Gly Glu Val Gln Val Val Ser Thr Ala Thr Gln 325 330 335 TCT TTC CTG GCG ACC TGT GTC AAC GGC GTG TGC TGG ACT GTT TTC CAC 1056 Ser Phe Leu Ala Thr Cys Val Asn Gly Val Cys Trp Thr Val Phe His 340 345 350 GGC GCC GGC TCG AAG ACC TTA GCC GGC CCA AAA GGC CCA ATC ACC CAA 1104 Gly Ala Gly Ser Lys Thr Leu Ala Gly Pro Lys Gly Pro Ile Thr Gln 355 360 365 ATG TAC ACC AAT GTA GAT CAG GAC CTC GTC GGC TGG TCG GCG CCC CCC 1152 Met Tyr Thr Asn Val Asp Gln Asp Leu Val Gly Trp Ser Ala Pro Pro 370 375 380 CGG GCG CGT TCC TTG ACA CCT TGC ACC TGC GGC AGC TCG GAC CTT TAT 1200 Arg Ala Arg Ser Leu Thr Pro Cys Thr Cys Gly Ser Ser Asp Leu Tyr 385 390 395 400 TTG GTC ACG AGG CAT GCT GAT GTC ATT CCG GTG CAC CGG CGG GGC GAC 1248 Leu Val Thr Arg His Ala Asp Val Ile Pro Val His Arg Arg Gly Asp 405 410 415 AGC AGG GGG AGC CTC CTC TCC CCC GGG CCC AT 1280 Ser Arg Gly Ser Leu Leu Ser Pro Gly Pro 420 425
【０２９６】配列番号：58 配列の長さ：1431 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N16N15A-1 配列 GGC TAT ACC GGC GAC TTC GAC TCA GTG ATC GAC TGC AAC ACA TGT GTC 48 Gly Tyr Thr Gly Asp Phe Asp Ser Val Ile Asp Cys Asn Thr Cys Val 1 5 10 15 ACC CAA ACA GTC GAT TTC AGC TTG GAC CCT ACT TTC ACC ATC GAG ACG 96 Thr Gln Thr Val Asp Phe Ser Leu Asp Pro Thr Phe Thr Ile Glu Thr 20 25 30 ACG ACC GTA CCC CAA GAT GCG GTG TCG CGC TCG CAG CGG CGA GGC AGG 144 Thr Thr Val Pro Gln Asp Ala Val Ser Arg Ser Gln Arg Arg Gly Arg 35 40 45 ACT GGT AGG GGC AGG GGG GGC ATA TAC AGG TTT GTA ACT CCA GGG GAA 192 Thr Gly Arg Gly Arg Gly Gly Ile Tyr Arg Phe Val Thr Pro Gly Glu 50 55 60 CGG CCC TCA GGC ATG TTC GAT TCT TCG GTC CTG TGT GAA TGT TAT GAC 240 Arg Pro Ser Gly Met Phe Asp Ser Ser Val Leu Cys Glu Cys Tyr Asp 65 70 75 80 GCG GGC TGT GCT TGG TAC GAG CTC ACG CCC GCC GAG ACC TCG GTT AGG 288 Ala Gly Cys Ala Trp Tyr Glu Leu Thr Pro Ala Glu Thr Ser Val Arg 85 90 95 TTG CGG GCT TAC CTA AAT ACA CCT GGG CTG CCC GTC TGC CAG GAC CAT 336 Leu Arg Ala Tyr Leu Asn Thr Pro Gly Leu Pro Val Cys Gln Asp His 100 105 110 CTG GAG TTC TGG GAG AGC GTC TTC ACC GGC CTC ACC CAC ATA GAT GCC 384 Leu Glu Phe Trp Glu Ser Val Phe Thr Gly Leu Thr His Ile Asp Ala 115 120 125 CAC TTC TTG TCC CAG ACC AAA CAG GCA GGA GAC AAC TTC CCC TAC CTG 432 His Phe Leu Ser Gln Thr Lys Gln Ala Gly Asp Asn Phe Pro Tyr Leu 130 135 140 GTA GCA TAC CAG GCT ACA GTG TGC GCC AGG GCC AAG GCT CCA CCT CCA 480 Val Ala Tyr Gln Ala Thr Val Cys Ala Arg Ala Lys Ala Pro Pro Pro 145 150 155 160 TCG TGG GAT CAG ATG TGG AAG TGT CTC ATA CGG CTG AAG CCT ACG CTA 528 Ser Trp Asp Gln Met Trp Lys Cys Leu Ile Arg Leu Lys Pro Thr Leu 165 170 175 CAC GGG CCA ACG CCC CTG TTG TAT AGG TTA GGA GCC GTT CAG AAC GAG 576 His Gly Pro Thr Pro Leu Leu Tyr Arg Leu Gly Ala Val Gln Asn Glu 180 185 190 GTT ACC CTT ACA CAC CCC ATA ACC AAG TAC ATC ATG ACA TGC ATG TCG 624 Val Thr Leu Thr His Pro Ile Thr Lys Tyr Ile Met Thr Cys Met Ser 195 200 205 GCT GAC CTA GAG GTC GTC ACT AGC ACT TGG GTG CTG GTA GGC GGG GTC 672 Ala Asp Leu Glu Val Val Thr Ser Thr Trp Val Leu Val Gly Gly Val 210 215 220 CTC GCG GCT CTG GCC GCG TAC TGC CTG ACA ACG GGC AGC GTG GTC ATT 720 Leu Ala Ala Leu Ala Ala Tyr Cys Leu Thr Thr Gly Ser Val Val Ile 225 230 235 240 GTG GGC AGG ATC ATC TTG TCC GGG AGG CCG GCC GTT ATT CCC GAC AGG 768 Val Gly Arg Ile Ile Leu Ser Gly Arg Pro Ala Val Ile Pro Asp Arg 245 250 255 GAA GTT CTC TAC CAA GAG TTC GAT GAA ATG GAA GAG TGC GCC TCG CAC 816 Glu Val Leu Tyr Gln Glu Phe Asp Glu Met Glu Glu Cys Ala Ser His 260 265 270 CTC CCT TAC ATC GAA CAA GGA ATG CAG CTC GCC GAG CAA TTC AAG CAG 864 Leu Pro Tyr Ile Glu Gln Gly Met Gln Leu Ala Glu Gln Phe Lys Gln 275 280 285 AAG GCG CTC GGT TTG CTG CAA ACA GCC ACC AAG CAA GCG GAG GCT GCT 912 Lys Ala Leu Gly Leu Leu Gln Thr Ala Thr Lys Gln Ala Glu Ala Ala 290 295 300 GCT CCC GTG GTG GAG TCC AAG TGG CGA GCC CTT GAG ACC TTC TGG GCG 960 Ala Pro Val Val Glu Ser Lys Trp Arg Ala Leu Glu Thr Phe Trp Ala 305 310 315 320 AAG CAC ATG TGG AAT TTT ATC AGC GGG ATA CAG TAC TTA GCA GGC TTG 1008 Lys His Met Trp Asn Phe Ile Ser Gly Ile Gln Tyr Leu Ala Gly Leu 325 330 335 TCC ACT CTG CCT GGA AAC CCC GCA ATA GCA TCA CTG ATG GCA TTC ACA 1056 Ser Thr Leu Pro Gly Asn Pro Ala Ile Ala Ser Leu Met Ala Phe Thr 340 345 350 GCC TCT ATC ACC AGC CCG CTC ACC ACC CAA TAT ACC CTC CTG TTT AAC 1104 Ala Ser Ile Thr Ser Pro Leu Thr Thr Gln Tyr Thr Leu Leu Phe Asn 355 360 365 ATC TTG GGG GGA TGG GTG GCC GCC CAA CTC GCC CCC CCC AGT GCC GCT 1152 Ile Leu Gly Gly Trp Val Ala Ala Gln Leu Ala Pro Pro Ser Ala Ala 370 375 380 TCA GCC TTC GTG GGC GCC GGT ATA GCT GGC GCG GCT GTT GGC AGC ATA 1200 Ser Ala Phe Val Gly Ala Gly Ile Ala Gly Ala Ala Val Gly Ser Ile 385 390 395 400 GGC CTC GGG AAG GTG CTT GTG GAC ATT CTG GCG GGT TAT GGA GCA GGG 1248 Gly Leu Gly Lys Val Leu Val Asp Ile Leu Ala Gly Tyr Gly Ala Gly 405 410 415 GTG GCA GGC GCG CTC GTG GCC TTT AAG GTC ATG AGC GGT GAC ATG CCC 1296 Val Ala Gly Ala Leu Val Ala Phe Lys Val Met Ser Gly Asp Met Pro 420 425 430 TCC ACC GAG GAC CTG GTC AAC TTA CTC CCC GCC ATC CTC TCT CCT GGT 1344 Ser Thr Glu Asp Leu Val Asn Leu Leu Pro Ala Ile Leu Ser Pro Gly 435 440 445 GCC CTG GTC GTC GGG GTC GTG TGC GCA GCA ATA CTG CGT CGG CAT GTG 1392 Ala Leu Val Val Gly Val Val Cys Ala Ala Ile Leu Arg Arg His Val 450 455 460 GGC CCA GGG GAG GGG GCT GTG CAG TGG ATG AAC CGG CTG 1431 Gly Pro Gly Glu Gly Ala Val Gln Trp Met Asn Arg Leu 465 470 475
【０２９７】配列番号：59 配列の長さ：1431 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N16N15B-1 配列 GGC TAT ACC GGC GAC TTC GAC TCA GTG ATC GAC TGC AAC ACA TGT GTC 48 Gly Tyr Thr Gly Asp Phe Asp Ser Val Ile Asp Cys Asn Thr Cys Val 1 5 10 15 ACC CAA ACA GTC GAT TTC AGC TTG GAC CCT ACT TTC ACC ATC GAG ACG 96 Thr Gln Thr Val Asp Phe Ser Leu Asp Pro Thr Phe Thr Ile Glu Thr 20 25 30 ACG ACC GTA CCC CAA GAT GCG GTG TCG CGC TCG CAG CGG CGA GGC AGG 144 Thr Thr Val Pro Gln Asp Ala Val Ser Arg Ser Gln Arg Arg Gly Arg 35 40 45 ACT GGT AGG GGC AGG GGG GGC ATA TAC AGG TTT GTA ACT CCA GGG GAA 192 Thr Gly Arg Gly Arg Gly Gly Ile Tyr Arg Phe Val Thr Pro Gly Glu 50 55 60 CGG CCC TCA GGC ATG TTC GAT TCT TCG GTC CTG TGT GAA TGT TAT GAC 240 Arg Pro Ser Gly Met Phe Asp Ser Ser Val Leu Cys Glu Cys Tyr Asp 65 70 75 80 GCG GGC TGT GCT TGG TAC GAG CTC ACG CCC GCC GAG ACC TCG GTT AGG 288 Ala Gly Cys Ala Trp Tyr Glu Leu Thr Pro Ala Glu Thr Ser Val Arg 85 90 95 TTG CGG GCT TAC CTA AAT ACA CCT GGG CTG CCC GTC TGC CAG GAC CAT 336 Leu Arg Ala Tyr Leu Asn Thr Pro Gly Leu Pro Val Cys Gln Asp His 100 105 110 CTG GAG TTC TGG GAG AGC GTC TTC ACC GGC CTC ACC CAC ATA GAT GCC 384 Leu Glu Phe Trp Glu Ser Val Phe Thr Gly Leu Thr His Ile Asp Ala 115 120 125 CAC TTC TTG TCC CAG ACC AAA CAG GCA GGA GAC AAC TTC CCC TAC CTG 432 His Phe Leu Ser Gln Thr Lys Gln Ala Gly Asp Asn Phe Pro Tyr Leu 130 135 140 GTA GCA TAC CAG GCT ACA GTG TGC GCC AGG GCC AAG GCT CCA CCT CCA 480 Val Ala Tyr Gln Ala Thr Val Cys Ala Arg Ala Lys Ala Pro Pro Pro 145 150 155 160 TCG TGG GAT CAA ATG TGG AAG TGT CTC ATA CGG CTG AAG CCT ACG CTA 528 Ser Trp Asp Gln Met Trp Lys Cys Leu Ile Arg Leu Lys Pro Thr Leu 165 170 175 CAC GGG CCA ACG CCC CTG TTG TAT AGG TTA GGA GCC GTT CAG AAC GAG 576 His Gly Pro Thr Pro Leu Leu Tyr Arg Leu Gly Ala Val Gln Asn Glu 180 185 190 GTT ACC CTC ACA CAC CCC ATA ACC AAG TTC ATC ATG GCA TGC ATG TCG 624 Val Thr Leu Thr His Pro Ile Thr Lys Phe Ile Met Ala Cys Met Ser 195 200 205 GCT GAC CTA GAG GTC GTC ACT AGC ACT TGG GTG CTG GTA GGC GGG GTC 672 Ala Asp Leu Glu Val Val Thr Ser Thr Trp Val Leu Val Gly Gly Val 210 215 220 CTC GCG GCT CTG GCC GCG TAC TGC CTG ACA ACG GGC AGC GTG GTC ATT 720 Leu Ala Ala Leu Ala Ala Tyr Cys Leu Thr Thr Gly Ser Val Val Ile 225 230 235 240 GTG GGC AGG ATC ATC TTG TCC GGG AGG CCG GCC GTT ATT CCC GAC AGG 768 Val Gly Arg Ile Ile Leu Ser Gly Arg Pro Ala Val Ile Pro Asp Arg 245 250 255 GAA GTT CTC TAC CAA GAG TTC GAT GAA ATG GAA GAG TGC GCC TCG CAC 816 Glu Val Leu Tyr Gln Glu Phe Asp Glu Met Glu Glu Cys Ala Ser His 260 265 270 CTC CCT TAC ATC GAA CAA GGA ATG CAG CTC GCC GAG CAA TTC AAG CAG 864 Leu Pro Tyr Ile Glu Gln Gly Met Gln Leu Ala Glu Gln Phe Lys Gln 275 280 285 AAG GCG CTC GGT TTG CTG CAA ACA GCC ACC AAG CAA GCG GAG GCT GCT 912 Lys Ala Leu Gly Leu Leu Gln Thr Ala Thr Lys Gln Ala Glu Ala Ala 290 295 300 GCT CCC GTG GTG GAG TCC AAG TGG CGA GCC CTT GAG ACC TTC TGG GCG 960 Ala Pro Val Val Glu Ser Lys Trp Arg Ala Leu Glu Thr Phe Trp Ala 305 310 315 320 AAG CAC ATG TGG AAT TTT ATC AGC GGG ATA CAG TAC TTA GCA GGC TTG 1008 Lys His Met Trp Asn Phe Ile Ser Gly Ile Gln Tyr Leu Ala Gly Leu 325 330 335 TCC ACT CTG CCT GGA AAC CCC GCA ATA GCA TCA CTG ATG GCA TTC ACA 1056 Ser Thr Leu Pro Gly Asn Pro Ala Ile Ala Ser Leu Met Ala Phe Thr 340 345 350 GCC TCT ATC ACC AGC CCG CTC ACC ACC CAA TAT ACC CTC CTG TTT AAC 1104 Ala Ser Ile Thr Ser Pro Leu Thr Thr Gln Tyr Thr Leu Leu Phe Asn 355 360 365 ATC TTG GGG GGA TGG GTG GCC GCC CAA CTC GCC CCC CCC AGT GCC GCT 1152 Ile Leu Gly Gly Trp Val Ala Ala Gln Leu Ala Pro Pro Ser Ala Ala 370 375 380 TCA GCC TTC GTG GGC GCC GGT ATA GCT GGC GCG GCT GTT GGC AGC ATA 1200 Ser Ala Phe Val Gly Ala Gly Ile Ala Gly Ala Ala Val Gly Ser Ile 385 390 395 400 GGC CTC GGG AAG GTG CTT GTG GAC ATT CTG GCG GGT TAT GGA GCA GGG 1248 Gly Leu Gly Lys Val Leu Val Asp Ile Leu Ala Gly Tyr Gly Ala Gly 405 410 415 GTG GCA GGC GCG CTC GTG GCC TTT AAG GTC ATG AGC GGT GAC ATG CCC 1296 Val Ala Gly Ala Leu Val Ala Phe Lys Val Met Ser Gly Asp Met Pro 420 425 430 TCC ACC GAG GAC CTG GTC AAC TTA CTC CCC GCC ATC CTC TCT CCT GGT 1344 Ser Thr Glu Asp Leu Val Asn Leu Leu Pro Ala Ile Leu Ser Pro Gly 435 440 445 GCC CTG GTC GTC GGG GTC GTG TGC GCA GCA ATA CTG CGT CGG CAT GTG 1392 Ala Leu Val Val Gly Val Val Cys Ala Ala Ile Leu Arg Arg His Val 450 455 460 GGC CCA GGG GAG GGG GCT GTG CAG TGG ATG AAC CGG CTG 1431 Gly Pro Gly Glu Gly Ala Val Gln Trp Met Asn Arg Leu 465 470 475
【０２９８】配列番号：60 配列の長さ：1431 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N16N15-1 配列 GGC TAT ACC GGC GAC TTC GAC TCA GTG ATC GAC TGC AAC ACA TGT GTC 48 Gly Tyr Thr Gly Asp Phe Asp Ser Val Ile Asp Cys Asn Thr Cys Val 1 5 10 15 ACC CAA ACA GTC GAT TTC AGC TTG GAC CCT ACT TTC ACC ATC GAG ACG 96 Thr Gln Thr Val Asp Phe Ser Leu Asp Pro Thr Phe Thr Ile Glu Thr 20 25 30 ACG ACC GTA CCC CAA GAT GCG GTG TCG CGC TCG CAG CGG CGA GGC AGG 144 Thr Thr Val Pro Gln Asp Ala Val Ser Arg Ser Gln Arg Arg Gly Arg 35 40 45 ACT GGT AGG GGC AGG GGG GGC ATA TAC AGG TTT GTA ACT CCA GGG GAA 192 Thr Gly Arg Gly Arg Gly Gly Ile Tyr Arg Phe Val Thr Pro Gly Glu 50 55 60 CGG CCC TCA GGC ATG TTC GAT TCT TCG GTC CTG TGT GAA TGT TAT GAC 240 Arg Pro Ser Gly Met Phe Asp Ser Ser Val Leu Cys Glu Cys Tyr Asp 65 70 75 80 GCG GGC TGT GCT TGG TAC GAG CTC ACG CCC GCC GAG ACC TCG GTT AGG 288 Ala Gly Cys Ala Trp Tyr Glu Leu Thr Pro Ala Glu Thr Ser Val Arg 85 90 95 TTG CGG GCT TAC CTA AAT ACA CCT GGG CTG CCC GTC TGC CAG GAC CAT 336 Leu Arg Ala Tyr Leu Asn Thr Pro Gly Leu Pro Val Cys Gln Asp His 100 105 110 CTG GAG TTC TGG GAG AGC GTC TTC ACC GGC CTC ACC CAC ATA GAT GCC 384 Leu Glu Phe Trp Glu Ser Val Phe Thr Gly Leu Thr His Ile Asp Ala 115 120 125 CAC TTC TTG TCC CAG ACC AAA CAG GCA GGA GAC AAC TTC CCC TAC CTG 432 His Phe Leu Ser Gln Thr Lys Gln Ala Gly Asp Asn Phe Pro Tyr Leu 130 135 140 GTA GCA TAC CAG GCT ACA GTG TGC GCC AGG GCC AAG GCT CCA CCT CCA 480 Val Ala Tyr Gln Ala Thr Val Cys Ala Arg Ala Lys Ala Pro Pro Pro 145 150 155 160 TCG TGG GAT CAG ATG TGG AAG TGT CTC ATA CGG CTG AAG CCT ACG CTA 528 Ser Trp Asp Gln Met Trp Lys Cys Leu Ile Arg Leu Lys Pro Thr Leu 165 170 175 CAC GGG CCA ACG CCC CTG TTG TAT AGG TTA GGA GCC GTT CAG AAC GAG 576 His Gly Pro Thr Pro Leu Leu Tyr Arg Leu Gly Ala Val Gln Asn Glu 180 185 190 GTT ACC CTC ACA CAC CCC ATA ACC AAG TTC ATC ATG GCA TGC ATG TCG 624 Val Thr Leu Thr His Pro Ile Thr Lys Phe Ile Met Ala Cys Met Ser 195 200 205 GCT GAC CTA GAG GTC GTC ACT AGC ACT TGG GTG CTG GTA GGC GGG GTC 672 Ala Asp Leu Glu Val Val Thr Ser Thr Trp Val Leu Val Gly Gly Val 210 215 220 CTC GCG GCT CTG GCC GCG TAC TGC CTG ACA ACG GGC AGC GTG GTC ATT 720 Leu Ala Ala Leu Ala Ala Tyr Cys Leu Thr Thr Gly Ser Val Val Ile 225 230 235 240 GTG GGC AGG ATC ATC TTG TCC GGG AGG CCG GCC GTT ATT CCC GAC AGG 768 Val Gly Arg Ile Ile Leu Ser Gly Arg Pro Ala Val Ile Pro Asp Arg 245 250 255 GAA GTT CTC TAC CAA GAG TTC GAT GAA ATG GAA GAG TGC GCC TCG CAC 816 Glu Val Leu Tyr Gln Glu Phe Asp Glu Met Glu Glu Cys Ala Ser His 260 265 270 CTC CCT TAC ATC GAA CAA GGA ATG CAG CTC GCC GAG CAA TTC AAG CAG 864 Leu Pro Tyr Ile Glu Gln Gly Met Gln Leu Ala Glu Gln Phe Lys Gln 275 280 285 AAG GCG CTC GGT TTG CTG CAA ACA GCC ACC AAG CAA GCG GAG GCT GCT 912 Lys Ala Leu Gly Leu Leu Gln Thr Ala Thr Lys Gln Ala Glu Ala Ala 290 295 300 GCT CCC GTG GTG GAG TCC AAG TGG CGA GCC CTT GAG ACC TTC TGG GCG 960 Ala Pro Val Val Glu Ser Lys Trp Arg Ala Leu Glu Thr Phe Trp Ala 305 310 315 320 AAG CAC ATG TGG AAT TTT ATC AGC GGG ATA CAG TAC TTA GCA GGC TTG 1008 Lys His Met Trp Asn Phe Ile Ser Gly Ile Gln Tyr Leu Ala Gly Leu 325 330 335 TCC ACT CTG CCT GGA AAC CCC GCA ATA GCA TCA CTG ATG GCA TTC ACA 1056 Ser Thr Leu Pro Gly Asn Pro Ala Ile Ala Ser Leu Met Ala Phe Thr 340 345 350 GCC TCT ATC ACC AGC CCG CTC ACC ACC CAA TAT ACC CTC CTG TTT AAC 1104 Ala Ser Ile Thr Ser Pro Leu Thr Thr Gln Tyr Thr Leu Leu Phe Asn 355 360 365 ATC TTG GGG GGA TGG GTG GCC GCC CAA CTC GCC CCC CCC AGT GCC GCT 1152 Ile Leu Gly Gly Trp Val Ala Ala Gln Leu Ala Pro Pro Ser Ala Ala 370 375 380 TCA GCC TTC GTG GGC GCC GGT ATA GCT GGC GCG GCT GTT GGC AGC ATA 1200 Ser Ala Phe Val Gly Ala Gly Ile Ala Gly Ala Ala Val Gly Ser Ile 385 390 395 400 GGC CTC GGG AAG GTG CTT GTG GAC ATT CTG GCG GGT TAT GGA GCA GGG 1248 Gly Leu Gly Lys Val Leu Val Asp Ile Leu Ala Gly Tyr Gly Ala Gly 405 410 415 GTG GCA GGC GCG CTC GTG GCC TTT AAG GTC ATG AGC GGT GAC ATG CCC 1296 Val Ala Gly Ala Leu Val Ala Phe Lys Val Met Ser Gly Asp Met Pro 420 425 430 TCC ACC GAG GAC CTG GTC AAC TTA CTC CCC GCC ATC CTC TCT CCT GGT 1344 Ser Thr Glu Asp Leu Val Asn Leu Leu Pro Ala Ile Leu Ser Pro Gly 435 440 445 GCC CTG GTC GTC GGG GTC GTG TGC GCA GCA ATA CTG CGT CGG CAT GTG 1392 Ala Leu Val Val Gly Val Val Cys Ala Ala Ile Leu Arg Arg His Val 450 455 460 GGC CCA GGG GAG GGG GCT GTG CAG TGG ATG AAC CGG CTG 1431 Gly Pro Gly Glu Gly Ala Val Gln Trp Met Asn Arg Leu 465 470 475
【０２９９】配列番号：61 配列の長さ：2304 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N23N15A-1 配列 CTG CTG TCG CCC GGG CCC ATC TCT TAC TTG AAG GGT TCC TCG GGT GGT 48 Leu Leu Ser Pro Gly Pro Ile Ser Tyr Leu Lys Gly Ser Ser Gly Gly 1 5 10 15 CCG CTG CCT TGC CCC TCG GGC CGT GTT GTG GGC ATC TTC CGG GCT GCC 96 Pro Leu Pro Cys Pro Ser Gly Arg Val Val Gly Ile Phe Arg Ala Ala 20 25 30 GTG TGC ACC CGG GGG GTT GCG AAG GCG GTG GAC TTT GTG CCC GTT GAG 144 Val Cys Thr Arg Gly Val Ala Lys Ala Val Asp Phe Val Pro Val Glu 35 40 45 TCT ATG GAA ACC ACC ATG CGG TCT CCG GTC TTC ACG GAT AAC TCA ACC 192 Ser Met Glu Thr Thr Met Arg Ser Pro Val Phe Thr Asp Asn Ser Thr 50 55 60 CCC CCG GCC GTA CCG CAG ACA TTC CAA GTG GCC CAC CTA CAC GCT CCC 240 Pro Pro Ala Val Pro Gln Thr Phe Gln Val Ala His Leu His Ala Pro 65 70 75 80 ACT GGC AGC GGC AAA AGC ACC AGG GTG CCG GCT GCG TAT GCG GCC CAA 288 Thr Gly Ser Gly Lys Ser Thr Arg Val Pro Ala Ala Tyr Ala Ala Gln 85 90 95 GGG TAC AAG GTA CTC GTC CTG AAC CCG TCC GTT GCT GCC ACT TTG GGC 336 Gly Tyr Lys Val Leu Val Leu Asn Pro Ser Val Ala Ala Thr Leu Gly 100 105 110 TTT GGG GCG TAC ATG TCC AAG GCA CAT GGT GTT GAC CCT AAC ATC AGA 384 Phe Gly Ala Tyr Met Ser Lys Ala His Gly Val Asp Pro Asn Ile Arg 115 120 125 ACT GGG GTG AGG ACC ATC ACC ACG GGC GCT CCC ATC ACG TAC TCC ACC 432 Thr Gly Val Arg Thr Ile Thr Thr Gly Ala Pro Ile Thr Tyr Ser Thr 130 135 140 TAC GGT AAG TTC CTC GCC GAC GGT GGC TGT TCT GGG GGT GCC TAT GAC 480 Tyr Gly Lys Phe Leu Ala Asp Gly Gly Cys Ser Gly Gly Ala Tyr Asp 145 150 155 160 ATC ATA ATA TGT GAT GAG TGT CAT TCA ACT GAC TCG ACT TCC ATC TTG 528 Ile Ile Ile Cys Asp Glu Cys His Ser Thr Asp Ser Thr Ser Ile Leu 165 170 175 GGC ATT GGT ACA GTC CTG GAC CAA GCG GAG ACG GCT GGA GCG CGC CTT 576 Gly Ile Gly Thr Val Leu Asp Gln Ala Glu Thr Ala Gly Ala Arg Leu 180 185 190 GTC GTG CTC GCC ACC GCT ACG CCT CCG GGA TCG GTC ACC GTG CCG CAT 624 Val Val Leu Ala Thr Ala Thr Pro Pro Gly Ser Val Thr Val Pro His 195 200 205 CCT AAT ATT GAG GAG GTG GCC TTG 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【０３００】配列番号：62 配列の長さ：2304 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N23N15B-1 配列 CTG CTG TCG CCC GGG CCC ATC TCT TAC TTG AAG GGT TCC TCG GGT GGT 48 Leu Leu Ser Pro Gly Pro Ile Ser Tyr Leu Lys Gly Ser Ser Gly Gly 1 5 10 15 CCG CTG CCT TGC CCC TCG GGC CGT GTT GTG GGC ATC TTC CGG GCT GCC 96 Pro Leu Pro Cys Pro Ser Gly Arg Val Val Gly Ile Phe Arg Ala Ala 20 25 30 GTG TGC ACC CGG GGG GTT GCG AAG GCG GTG GAC TTT GTG CCC GTT GAG 144 Val Cys Thr Arg Gly Val Ala Lys Ala Val Asp Phe Val Pro Val Glu 35 40 45 TCT ATG GAA ACC ACC ATG CGG TCT CCG GTC TTC ACG GAT AAC TCA ACC 192 Ser Met Glu Thr Thr Met Arg Ser Pro Val Phe Thr Asp Asn Ser Thr 50 55 60 CCC CCG GCC GTA CCG CAG ACA TTC CAA GTG GCC CAC CTA CAC GCT CCC 240 Pro Pro Ala Val Pro Gln Thr Phe Gln Val Ala His Leu His Ala Pro 65 70 75 80 ACT GGC AGC GGC AAA AGC ACC AGG GTG CCG GCT GCG TAT GCG GCC CAA 288 Thr Gly Ser Gly Lys Ser Thr Arg Val Pro Ala Ala Tyr Ala Ala Gln 85 90 95 GGG TAC AAG GTA CTC GTC CTG AAC CCG TCC GTT 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【０３０１】配列番号：63 配列の長さ：3564 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：MX25N15-1 配列 TGT GCC TGG TTG TGG ATG ATG CTG CTG ATA GCC CAA GCT GAG GCC GCC 48 Cys Ala Trp Leu Trp Met Met Leu Leu Ile Ala Gln Ala Glu Ala Ala 1 5 10 15 TTG GAG AAC CTG GTG GTC CTC AAT GCA GCA TCC ATG GCG GGA GCG CAT 96 Leu Glu Asn Leu Val Val Leu Asn Ala Ala Ser Met Ala Gly Ala His 20 25 30 GGC ATC CTC TCT TTC CTT GTG TTC TTC TGT GCC GCC TGG TAC ATC AAA 144 Gly Ile Leu Ser Phe Leu Val Phe Phe Cys Ala Ala Trp Tyr Ile Lys 35 40 45 GGC AGG CTG GTC CCT GGG GCG GCA TAC GCT TTC TAT GGC GTA TGG CCG 192 Gly Arg Leu Val Pro Gly Ala Ala Tyr Ala Phe Tyr Gly Val Trp Pro 50 55 60 CTG CTC CTG CTC TTG ATG GCG CTA CCC GCA CGG GCG TAC GCC ATG GAC 240 Leu Leu Leu Leu Leu Met Ala Leu Pro Ala Arg Ala Tyr Ala Met Asp 65 70 75 80 CGG GAG ATG GCT GCA TCG TGC GGA GGC GCG GTT TTT GTA GGT CTG GTA 288 Arg Glu Met Ala Ala Ser Cys Gly Gly Ala Val Phe Val Gly Leu Val 85 90 95 CTC TTG ACC TTG TCA CCA TAC TAC AAA GTG TTC 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CCT TAC ATC GAA CAA GGA ATG CAG 2976 Met Glu Glu Cys Ala Ser His Leu Pro Tyr Ile Glu Gln Gly Met Gln 980 985 990 CTC GCC GAG CAA TTC AAG CAG AAG GCG CTC GGT TTG CTG CAA ACA GCC 3024 Leu Ala Glu Gln Phe Lys Gln Lys Ala Leu Gly Leu Leu Gln Thr Ala 995 1000 1005 ACC AAG CAA GCG GAG GCT GCT GCT CCC GTG GTG GAG TCC AAG TGG CGA 3072 Thr Lys Gln Ala Glu Ala Ala Ala Pro Val Val Glu Ser Lys Trp Arg 1010 1015 1020 GCC CTT GAG ACC TTC TGG GCG AAG CAC ATG TGG AAT TTT ATC AGC GGG 3120 Ala Leu Glu Thr Phe Trp Ala Lys His Met Trp Asn Phe Ile Ser Gly 1025 1030 1035 1040 ATA CAG TAC TTA GCA GGC TTG TCC ACT CTG CCT GGA AAC CCC GCA ATA 3168 Ile Gln Tyr Leu Ala Gly Leu Ser Thr Leu Pro Gly Asn Pro Ala Ile 1045 1050 1055 GCA TCA CTG ATG GCA TTC ACA GCC TCT ATC ACC AGC CCG CTC ACC ACC 3216 Ala Ser Leu Met Ala Phe Thr Ala Ser Ile Thr Ser Pro Leu Thr Thr 1060 1065 1070 CAA TAT ACC CTC CTG TTT AAC ATC TTG GGG GGA TGG GTG GCC GCC CAA 3264 Gln Tyr Thr Leu Leu Phe Asn Ile Leu Gly Gly Trp Val Ala Ala Gln 1075 1080 1085 CTC GCC CCC CCC AGT GCC GCT TCA GCC TTC GTG GGC GCC GGT ATA GCT 3312 Leu Ala Pro Pro Ser Ala Ala Ser Ala Phe Val Gly Ala Gly Ile Ala 1090 1095 1100 GGC GCG GCT GTT GGC AGC ATA GGC CTC GGG AAG GTG CTT GTG GAC ATT 3360 Gly Ala Ala Val Gly Ser Ile Gly Leu Gly Lys Val Leu Val Asp Ile 1105 1110 1115 1120 CTG GCG GGT TAT GGA GCA GGG GTG GCA GGC GCG CTC GTG GCC TTT AAG 3408 Leu Ala Gly Tyr Gly Ala Gly Val Ala Gly Ala Leu Val Ala Phe Lys 1125 1130 1135 GTC ATG AGC GGT GAC ATG CCC TCC ACC GAG GAC CTG GTC AAC TTA CTC 3456 Val Met Ser Gly Asp Met Pro Ser Thr Glu Asp Leu Val Asn Leu Leu 1140 1145 1150 CCC GCC ATC CTC TCT CCT GGT GCC CTG GTC GTC GGG GTC GTG TGC GCA 3504 Pro Ala Ile Leu Ser Pro Gly Ala Leu Val Val Gly Val Val Cys Ala 1155 1160 1165 GCA ATA CTG CGT CGG CAT GTG GGC CCA GGG GAG GGG GCT GTG CAG TGG 3552 Ala Ile Leu Arg Arg His Val Gly Pro Gly Glu Gly Ala Val Gln Trp 1170 1175 1180 ATG AAC CGG CTG 3564 Met Asn Arg Leu 1185
【０３０２】配列番号：64 配列の長さ：818 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N22-1,N22-3,H22-8,H22-9 配列 GG CAT GTG GGC CCA GGG GAG GGG GCT GTG CAG TGG ATG AAC CGG CTG 47 His Val Gly Pro Gly Glu Gly Ala Val Gln Trp Met Asn Arg Leu 1 5 10 15 ATA GCG TTY GCY TCG CGG GGY AAC CAY GTC TCC CCC ACG CAY TAT GTG 95 Ile Ala Phe Ala Ser Arg Gly Asn His Val Ser Pro Thr His Tyr Val 20 25 30 CCT GAR AGC GAC GCC GCR GCG CGY GTC ACC CAG ATC CTC TCC ARC CTY 143 Pro Glu Ser Asp Ala Ala Ala Arg Val Thr Gln Ile Leu Ser Xaa Leu 35 40 45 ACC ATC ACT CAG YTG YTG AAG AGG CTY CAC CAG TGG ATT RAT GAK GAC 191 Thr Ile Thr Gln Leu Leu Lys Arg Leu His Gln Trp Ile Asx Xac Asp 50 55 60 TGC TCC ACG CCA TGY TCY GGY TCG TGG CTC AGG GAT GTT TGG GAC TGG 239 Cys Ser Thr Pro Cys Ser Gly Ser Trp Leu Arg Asp Val Trp Asp Trp 65 70 75 ATA TGC ACG GTR TTG RST GAY TTC AAG ACC TGG CTC CAG TCC AAG CTC 287 Ile Cys Thr Val Leu Xad Asp Phe Lys Thr Trp Leu Gln Ser Lys Leu 80 85 90 95 CTG CCG CGG YTA CCG GGR GTC CCT TTY YTY TCA TGC CAR CGT GGG TAC 335 Leu Pro Arg Leu Pro Gly Val Pro Phe Xae Ser Cys Gln Arg Gly Tyr 100 105 110 AAG GGR GTY TGG CGG GGA GAY GGC ATC ATG YAD ACC ACC TGC CCA TGY 383 Lys Gly Val Trp Arg Gly Asp Gly Ile Met Xaf Thr Thr Cys Pro Cys 115 120 125 GGA GCA CAA ATC RCC GGA CAT GTC AAA AAY GGT TCY ATG AGG ATC RYT 431 Gly Ala Gln Ile Xag Gly His Val Lys Asn Gly Ser Met Arg Ile Xah 130 135 140 GGS CYY AGA ACC TGT AGC AAC ACG TGG CRC GGA ACR TTY CCC ATC AAC 479 Gly Xai Arg Thr Cys Ser Asn Thr Trp Xaj Gly Thr Phe Pro Ile Asn 145 150 155 GCG TAC ACC ACA GGC CCC TGC ACA CCC TCY CCR GCG CCR AAC TAY TCY 527 Ala Tyr Thr Thr Gly Pro Cys Thr Pro Ser Pro Ala Pro Asn Tyr Ser 160 165 170 175 ARG GCG TTR TGG CGG GTR GCY GCT GAG GAG TAT GTG GAG GTC ACG CGG 575 Xak Ala Leu Trp Arg Val Ala Ala Glu Glu Tyr Val Glu Val Thr Arg 180 185 190 GTG GGG GAY TTC CAC TAC GTG ACG GGC ATG ACC ACT GAC AAC KTR AAA 623 Val Gly Asp Phe His Tyr Val Thr Gly Met Thr Thr Asp Asn Xal Lys 195 200 205 TGC CCA TGC CAG GTY CCG GCC CCC GAA TTY TTC ACR GAR TTG GAT GGG 671 Cys Pro Cys Gln Val Pro Ala Pro Glu Phe Phe Thr Glu Leu Asp Gly 210 215 220 GTR CGG CTR CRC AGR TAC GCT CCG GCG TGC AAA CCT CTC CTR CGG GAT 719 Val Arg Leu Xaj Arg Tyr Ala Pro Ala Cys Lys Pro Leu Leu Arg Asp 225 230 235 GAG GTC ACA TTC CAG GTC GGG CTC AAC CAA TWY MCG GTT GGG TCR CAG 767 Glu Val Thr Phe Gln Val Gly Leu Asn Gln Xam Xan Val Gly Ser Gln 240 245 250 255 CTM CCA TGY GAG CCC GAA CCG GAT GTA RYR GTG GTC ACC TCC ATG CTC 815 Leu Pro Cys Glu Pro Glu Pro Asp Val Xao Val Val Thr Ser Met Leu 260 265 270 ACC 818 Thr Y : C or T R : A or G M : A or C
K : G or T S : G or C W : A or T D : G or T or A Xaa : Asn or Ser Asx : Asn or Asp
Xac : Glu or Asp Xad : Ala or Ser Xae : Phe or Leu Xaf : Tyr or Gln or His Xag : Thr or Ala
Xah : Val or Thr Xai : Pro or Leu Xaj : His or Arg
Xak : Arg or Lys Xal : Val or Leu Xam : Tyr or Phe
Xan : Thr or Pro Xao : Thr or Met or Ala
【０３０３】配列番号：65 配列の長さ：311 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N17-1,N17-2,N17-3,H17-1,H17-3 配列 TGT GAG CCC GAA CCG GAT GTA ACA GTG STC ACY TCC ATG CTC ACC GAC 48 Cys Glu Pro Glu Pro Asp Val Thr Val Xaa Thr Ser Met Leu Thr Asp 1 5 10 15 CCC TCC CAC ATY ACA GCA GAG RCG GCT RRG CGT AGG CTG GCC AGA GGG 96 Pro Ser His Ile Thr Ala Glu Xab Ala Xac Arg Arg Leu Ala Arg Gly 20 25 30 TCT CCY CCT YCY TTG GCC AGY TCT TCA GCT AGY CAG TTG TCT GCG CYH 144 Ser Pro Pro Xad Leu Ala Ser Ser Ser Ala Ser Gln Leu Ser Ala Xae 35 40 45 TCY YTG AAG GCG ACA TGC ACT ACC CAT CAT GRC KCC CCR GAC RCT GAC 192 Ser Leu Lys Ala Thr Cys Thr Thr His His Xaf Xag Pro Asp Xab Asp 50 55 60 CTC ATC GAG GCC AAC CTC CTR TGG CGG CAG GAG ATG GGM GGR AAC ATC 240 Leu Ile Glu Ala Asn Leu Leu Trp Arg Gln Glu Met Gly Gly Asn Ile 65 70 75 80 ACC CGY GTG GAG TCA GAG ARC AAG RTA GTR ATT CTR GAC TCT TYY GAM 288 Thr Arg Val Glu Ser Glu Xah Lys Xai Val Ile Leu Asp Ser Xaj Xak 85 90 95 CCG CTT CGA GCG GAG GAG GAT G A 311 Pro Leu Arg Ala Glu Glu Asp 100 Y : C or T R : A or G M : A or C
K : G or T S : G or C H : A or T or C D : G or T or A Xaa : Val or Leu Xab : Ala or Thr Xac : Arg or Lys or Gly Xad : Pro or Ser
Xae : Pro or Leu Xaf : Gly or Asp Xag : Ala or Ser
Xah : Asn or Ser Xai : Ile or Val Xaj : Phe or Ser
Xak : Glu or Asp
【０３０４】配列番号：66 配列の長さ：740 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：O28-1,O28-2,O28-4 配列 GTG GTA GTC CTG GAC TCG TTG GAS CCG CTT CRA GCG RAG GAA GRT GAG 48 Val Val Val Leu Asp Ser Leu Xaa Pro Leu Xab Ala Xac Glu Xad Glu 1 5 10 15 AGG GAA GTG TCC GTT GCG GCG GAG ATC CTG CGR AAG ACC ARG AAA TTC 96 Arg Glu Val Ser Val Ala Ala Glu Ile Leu Arg Lys Thr Xae Lys Phe 20 25 30 CCC GCA GCG ATG CCC GTA TGG GCA CGC CCG GAC TAC AAC CCA CCA TTA 144 Pro Ala Ala Met Pro Val Trp Ala Arg Pro Asp Tyr Asn Pro Pro Leu 35 40 45 CTA GAG TCT TGG AAG AAC CCG GAC TAC GTC CCT CCR GTG GTA CAC GGG 192 Leu Glu Ser Trp Lys Asn Pro Asp Tyr Val Pro Pro Val Val His Gly 50 55 60 TGC CCA TTG CCG CCT AYC AAG GCC CCT CCA ATA CCA CCT CCA CGG AGA 240 Cys Pro Leu Pro Pro Xaf Lys Ala Pro Pro Ile Pro Pro Pro Arg Arg 65 70 75 80 AAG AGR ACG GTT GYC CTG ACA GAA TCC ACC GTG TCC TCT GCC TTG GCG 288 Lys Arg Thr Val Xag Leu Thr Glu Ser Thr Val Ser Ser Ala Leu Ala 85 90 95 GAG CTT GCT ACA AAG ACC TTT GGC AGT TCC GGA TCG TCG GCC GTC GAC 336 Glu Leu Ala Thr Lys Thr Phe Gly Ser Ser Gly Ser Ser Ala Val Asp 100 105 110 AGC GGC ACG GCG ACY GGC CCT CCT GAC CAG GCC TCC GCC GAA GGA GAT 384 Ser Gly Thr Ala Thr Gly Pro Pro Asp Gln Ala Ser Ala Glu Gly Asp 115 120 125 GCA GGA TCC GAC GCT GAG TCG TAC TCC TCC ATG CCC CCC CTT GAG GGA 432 Ala Gly Ser Asp Ala Glu Ser Tyr Ser Ser Met Pro Pro Leu Glu Gly 130 135 140 GAG CCG GGG GAC CCY GAT CTC AAC GAC GGG TCT TGG TCT ACY GTA AGC 480 Glu Pro Gly Asp Pro Asp Leu Asn Asp Gly Ser Trp Ser Thr Val Ser 145 150 155 160 GAG GAG GCC RGC GAG GAC GTC GTC TGC TGC TCG ATG TCC TAC ACA TGG 528 Glu Glu Ala Xah Glu Asp Val Val Cys Cys Ser Met Ser Tyr Thr Trp 165 170 175 ACA GGC GCC TTA ATT ACA CCA TGC RCC GCG GAG GAG AGC AAG CTG CCC 576 Thr Gly Ala Leu Ile Thr Pro Cys Xai Ala Glu Glu Ser Lys Leu Pro 180 185 190 ATT AAT GCG CTG AGC AAC YCT TTG CTG CGY CAC CAC AAC ATG GTC TAT 624 Ile Asn Ala Leu Ser Asn Xaj Leu Leu Arg His His Asn Met Val Tyr 195 200 205 GCC ACA ACA TCC CGC AGC GCA AGC CAG CGG CAG AAA AAG GTC ACA TTT 672 Ala Thr Thr Ser Arg Ser Ala Ser Gln Arg Gln Lys Lys Val Thr Phe 210 215 220 GAC AGA CTG CAA GTC CTG GAT GAC CAC TAC CGG GAC GTG CTG AAG GAC 720 Asp Arg Leu Gln Val Leu Asp Asp His Tyr Arg Asp Val Leu Lys Asp 225 230 235 240 ATG AAG GCC AAG GCG TCC AC 740 Met Lys Ala Lys Ala Ser 245 Y : C or T R : A or G S : G or C Xaa : Glu or Asp Xab : Gln or Arg Xac
: Lys or Glu Xad : Gly or Asp Xae : Arg or Lys Xaf
: Thr or Ile Xag : Val or Ala Xah : Ser or Gly Xai
: Ala or Thr Xaj : Pro or Ser
【０３０５】配列番号：67 配列の長さ：515 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N29-1,N29-2,N29-3 配列 AC TAC CGG GAC GTG CTG AAG GAG ATG AAG GCG AAG GCG TCC ACA GTT 47 Tyr Arg Asp Val Leu Lys Glu Met Lys Ala Lys Ala Ser Thr Val 1 5 10 15 AAG GCT AAA CTT CTA TCT GTA GAG GAA GCC TGY AAG CTG ACG CCC CCA 95 Lys Ala Lys Leu Leu Ser Val Glu Glu Ala Cys Lys Leu Thr Pro Pro 20 25 30 CAC TCG GCC AGA TCT AAR TTT GGC TAC GGG GCA AAG GAC GTC CGG AGC 143 His Ser Ala Arg Ser Lys Phe Gly Tyr Gly Ala Lys Asp Val Arg Ser 35 40 45 CTG TCC AGC AAG GCC GTT AAC CAC ATC CGC TCC GTG TGG ARG GAC TTG 191 Leu Ser Ser Lys Ala Val Asn His Ile Arg Ser Val Trp Xaa Asp Leu 50 55 60 CTG GAA GAC ACT GAR ACA CCA ATT GAC ACC ACC ATC ATG GCA AAA AAT 239 Leu Glu Asp Thr Glu Thr Pro Ile Asp Thr Thr Ile Met Ala Lys Asn 65 70 75 GAG GTT TTC TGT GTT CAA CCA GAG AAA GGA GGC CGC AAG CCA GCT CGC 287 Glu Val Phe Cys Val Gln Pro Glu Lys Gly Gly Arg Lys Pro Ala Arg 80 85 90 95 CTT ATC GTA TTC CCA GAC TTG GGG GTT CGT GTG TGC GAG AAA ATG GCC 335 Leu Ile Val Phe Pro Asp Leu Gly Val Arg Val Cys Glu Lys Met Ala 100 105 110 CTC TAC GAC GTG GTC TCC ACT CTT CCT CAG GCC GTG ATG GGC TCC TCA 383 Leu Tyr Asp Val Val Ser Thr Leu Pro Gln Ala Val Met Gly Ser Ser 115 120 125 TAC GGA TTC CAG TAC TCC CCT GGA CAG CGG GTC GAG TTC CTG GTG AAT 431 Tyr Gly Phe Gln Tyr Ser Pro Gly Gln Arg Val Glu Phe Leu Val Asn 130 135 140 GCC TGG AAG TCA AAG AAG AGY CCT ATG GGC TTT KCA TAT GAC ACC CGC 479 Ala Trp Lys Ser Lys Lys Ser Pro Met Gly Phe Xab Tyr Asp Thr Arg 145 150 155 TGT TTT GAC TCA ACG GTC ACC GAG AAC GAC ATC CGT 515 Cys Phe Asp Ser Thr Val Thr Glu Asn Asp Ile Arg 160 165 170 Y : C or T R : A or G K : G or TXaa :
Lys or Glu Xab : Ala or Ser
【０３０６】配列番号：68 配列の長さ：401 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N18-2,N18-3,N18-4,H18-1,H18-2,H18-3 配列 TG GGG ATC CCG TAT GAT ACC CGC TGC TTT GAC TCA ACR GTC ACY GAG 47 Gly Ile Pro Tyr Asp Thr Arg Cys Phe Asp Ser Thr Val Thr Glu 1 5 10 15 ARY GAY ATC CGT RYT GAG GAG TCA ATY TAY CAA TGY TGT GAC TTG GHC 95 Xaa Asp Ile Arg Xab Glu Glu Ser Ile Tyr Gln Cys Cys Asp Leu Xac 20 25 30 CCC GAG GCC AGA CAG GCY ATA AGG TCG CTC ACA GAG CGG CTT TAT ATC 143 Pro Glu Ala Arg Gln Ala Ile Arg Ser Leu Thr Glu Arg Leu Tyr Ile 35 40 45 GGG GGC CCC YTG ACY AAT TCA AAR GGG CAR AAC TGC GGY TAT CGC CGG 191 Gly Gly Pro Leu Thr Asn Ser Lys Gly Gln Asn Cys Gly Tyr Arg Arg 50 55 60 TGC CGC GYC AGC GGC GTG CTG ACG ACY AGC TGC GGT AAT ACY CTY ACA 239 Cys Arg Xad Ser Gly Val Leu Thr Thr Ser Cys Gly Asn Thr Leu Thr 65 70 75 TGT TAC TTG AAG GCC TCT GCA GCC TGT CGA GCT GCR AAG CTC CRG GAC 287 Cys Tyr Leu Lys Ala Ser Ala Ala Cys Arg Ala Ala Lys Leu Xae Asp 80 85 90 95 TGC ACR ATG CTC GTG TGC GGR GAC GAC CTT GTC GTY ATC TGT GAR AGC 335 Cys Thr Met Leu Val Cys Gly Asp Asp Leu Val Val Ile Cys Glu Ser 100 105 110 GCG GGR ACC CAG GAG GAC GCG GCR ARC CTA CGA GTC TTC ACG GAG GCT 383 Ala Gly Thr Gln Glu Asp Ala Ala Xaa Leu Arg Val Phe Thr Glu Ala 115 120 125 ATG ACC AGG AAT TCC GCC 401 Met Thr Arg Asn Ser Ala 130 Y : C or T R : A or G H : A or T or C Xaa : Asn or Ser Xab : Thr or Ile or Val Xac : Asp or Val or Ala Xad : Ala or Val Xae
: Gln or Arg
【０３０７】配列番号：69 配列の長さ：1171 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：O30-2,O30-3,O30-4 配列 TG GGG ATC CCG TAT GAT ACC CGC TGC TTT GAC TCA ACR GTC ACT GAG 47 Gly Ile Pro Tyr Asp Thr Arg Cys Phe Asp Ser Thr Val Thr Glu 1 5 10 15 AAT GAC ATC CGT GTY GAG GAG TCA ATT TAC CAA TGT TGT GAC TTG GCC 95 Asn Asp Ile Arg Val Glu Glu Ser Ile Tyr Gln Cys Cys Asp Leu Ala 20 25 30 CCC GAG GCC AGA CAG GCC ATA AGG TCR CTC ACA GAG CGG CTT TAC ATC 143 Pro Glu Ala Arg Gln Ala Ile Arg Ser Leu Thr Glu Arg Leu Tyr Ile 35 40 45 GGG GGC CCC CTG ACT AAT TCA AAR GGG CAG AAC TGC GGY TAT CGC CGG 191 Gly Gly Pro Leu Thr Asn Ser Lys Gly Gln Asn Cys Gly Tyr Arg Arg 50 55 60 TGC CGC GYC AGC GGC GTG CTG ACG ACT AGC TGC GGY AAT ACC CTC ACA 239 Cys Arg Xaa Ser Gly Val Leu Thr Thr Ser Cys Gly Asn Thr Leu Thr 65 70 75 TGT TAC TTG AAG GCC TCT GCA GCC TGT CGA GCT GCA AAG CTC CAG GAC 287 Cys Tyr Leu Lys Ala Ser Ala Ala Cys Arg Ala Ala Lys Leu Gln Asp 80 85 90 95 TGC ACG ATG CTT GTG TGC GGA GAC GAC CTT GTC GTT ATC TGT GAW AGC 335 Cys Thr Met Leu Val Cys Gly Asp Asp Leu Val Val Ile Cys Xab Ser 100 105 110 GCG GGA ACT CAG GAG GAC GCG GCG AGC CTA CGA GTC TTC ACG GAG GCT 383 Ala Gly Thr Gln Glu Asp Ala Ala Ser Leu Arg Val Phe Thr Glu Ala 115 120 125 ATG ACT AGG TAC TCT GCC CCC CCC GGG GAC CCG CCC CAA CCA GAA TAC 431 Met Thr Arg Tyr Ser Ala Pro Pro Gly Asp Pro Pro Gln Pro Glu Tyr 130 135 140 GAC TTG GAG CTG ATA ACA TCA TGC TCC TCC AAY GTG TCG GTC GCG CAC 479 Asp Leu Glu Leu Ile Thr Ser Cys Ser Ser Asn Val Ser Val Ala His 145 150 155 GAC GCA TCA GGC AAA CGG GTG TAC TAY CTC ACC CGT GAC CCC MCC ACC 527 Asp Ala Ser Gly Lys Arg Val Tyr Tyr Leu Thr Arg Asp Pro Xac Thr 160 165 170 175 CCC CTW GCG CGG GCT GCG TGG GAG ACA GCT AGA CAC ACT CCA GTC AAC 575 Pro Leu Ala Arg Ala Ala Trp Glu Thr Ala Arg His Thr Pro Val Asn 180 185 190 TCC TGG CTA GGC AAC ATC ATC ATG TAY GCG CCC ACC TTA TGG GCA AGG 623 Ser Trp Leu Gly Asn Ile Ile Met Tyr Ala Pro Thr Leu Trp Ala Arg 195 200 205 ATG ATT CTG ATG ACC CAC TTC TTC TCC ATC CTT CTA GCC CAG GAG CAA 671 Met Ile Leu Met Thr His Phe Phe Ser Ile Leu Leu Ala Gln Glu Gln 210 215 220 CTT GAA AAA GCC CTA GAT TGT CAG ATC TAY GGG GCC ACT TAC TCC ATT 719 Leu Glu Lys Ala Leu Asp Cys Gln Ile Tyr Gly Ala Thr Tyr Ser Ile 225 230 235 GAG CCA CTT GAC CTA CCT CAG ATC ATT CAA CGA CTC CAY GGT CTT AGC 767 Glu Pro Leu Asp Leu Pro Gln Ile Ile Gln Arg Leu His Gly Leu Ser 240 245 250 255 GCA TTT TCA CTC CAT AGT TAC TCT CCA GGT GAG ATC AAT AGG GTG GCT 815 Ala Phe Ser Leu His Ser Tyr Ser Pro Gly Glu Ile Asn Arg Val Ala 260 265 270 TCA TGC CTC AGG AAA CTT GGG GTA CCG CCC TTG CGA GTC TGG AGA CAT 863 Ser Cys Leu Arg Lys Leu Gly Val Pro Pro Leu Arg Val Trp Arg His 275 280 285 CGG GCC AGA AGC GTC CGC GCT AAG CTA CTG TCC CAG GGG GGG AGG GCC 911 Arg Ala Arg Ser Val Arg Ala Lys Leu Leu Ser Gln Gly Gly Arg Ala 290 295 300 GCC ACC TGT GGC AAA TAC CTC TTC AAC TGG GCA GTA AAG ACC AAG CTC 959 Ala Thr Cys Gly Lys Tyr Leu Phe Asn Trp Ala Val Lys Thr Lys Leu 305 310 315 AAA CYC ACT CCA ATC CCR GAA GCG TCC CAG CTG GAC TTG TCC GGC TGG 1007 Lys Xad Thr Pro Ile Pro Glu Ala Ser Gln Leu Asp Leu Ser Gly Trp 320 325 330 335 TTC GTT GCT GGT TAC AGC GGG GGA GAC ATA TAT CAC AGC CTG TCT CGT 1055 Phe Val Ala Gly Tyr Ser Gly Gly Asp Ile Tyr His Ser Leu Ser Arg 340 345 350 GCC CGA CCC CGC TGG TTY ATG TGG TGC CTA CTC CTA CTT TCC GTA GGG 1103 Ala Arg Pro Arg Trp Phe Met Trp Cys Leu Leu Leu Leu Ser Val Gly 355 360 365 GTA GGC ATC TAC CTG CTC CCC AAC CGA TGA GCG GGG AGC TAA ACA CTC 1151 Val Gly Ile Tyr Leu Leu Pro Asn Arg Stop 370 375 CAG GCC AAT AGG CCA TCC C C 1171 Y : C or T R : A or G M : A or C
W : A or T Xaa : Val or Ala Xab : Asp or Glu Xac
: Thr or Pro Xad : Leu or Pro
【０３０８】配列番号：70 配列の長さ：1084 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：2217 配列 GG CAT GTG GGC CCA GGG GAG GGG GCT GTG CAG TGG ATG AAC CGG CTG 47 His Val Gly Pro Gly Glu Gly Ala Val Gln Trp Met Asn Arg Leu 1 5 10 15 ATA GCG TTT GCT TCG CGG GGC AAC CAT GTC TCC CCC ACG CAC TAT GTG 95 Ile Ala Phe Ala Ser Arg Gly Asn His Val Ser Pro Thr His Tyr Val 20 25 30 CCT GAA AGC GAC GCC GCA GCG CGC GTC ACC CAG ATC CTC TCC AAC CTT 143 Pro Glu Ser Asp Ala Ala Ala Arg Val Thr Gln Ile Leu Ser Asn Leu 35 40 45 ACC ATC ACT CAG CTG TTG AAG AGG CTT CAC CAG TGG ATT AAT GAG GAC 191 Thr Ile Thr Gln Leu Leu Lys Arg Leu His Gln Trp Ile Asn Glu Asp 50 55 60 TGC TCC ACG CCA TGC TCC GGC TCG TGG CTC AGG GAT GTT TGG GAC TGG 239 Cys Ser Thr Pro Cys Ser Gly Ser Trp Leu Arg Asp Val Trp Asp Trp 65 70 75 ATA TGC ACG GTA TTG GCT GAT TTC AAG ACC TGG CTC CAG TCC AAG CTC 287 Ile Cys Thr Val Leu Ala Asp Phe Lys Thr Trp Leu Gln Ser Lys Leu 80 85 90 95 CTG CCG CGG TTA CCG GGG GTC CCT TTT TTC TCA TGC CAG CGT GGG TAC 335 Leu Pro Arg Leu Pro Gly Val Pro Phe Phe Ser Cys Gln Arg Gly Tyr 100 105 110 AAG GGG GTT TGG CGG GGA GAT GGC ATC ATG TAT ACC ACC TGC CCA TGT 383 Lys Gly Val Trp Arg Gly Asp Gly Ile Met Tyr Thr Thr Cys Pro Cys 115 120 125 GGA GCA CAA ATC ACC GGA CAT GTC AAA AAC GGT TCT ATG AGG ATC GTT 431 Gly Ala Gln Ile Thr Gly His Val Lys Asn Gly Ser Met Arg Ile Val 130 135 140 GGG CCT AGA ACC TGT AGC AAC ACG TGG CAC GGA ACA TTT CCC ATC AAC 479 Gly Pro Arg Thr Cys Ser Asn Thr Trp His Gly Thr Phe Pro Ile Asn 145 150 155 GCG TAC ACC ACA GGC CCC TGC ACA CCC TCC CCG GCG CCA AAC TAT TCC 527 Ala Tyr Thr Thr Gly Pro Cys Thr Pro Ser Pro Ala Pro Asn Tyr Ser 160 165 170 175 AGG GCG TTG TGG CGG GTG GCC ATT GAG GAG TAT GTG GAG GTC ACG CGG 575 Arg Ala Leu Trp Arg Val Ala Ile Glu Glu Tyr Val Glu Val Thr Arg 180 185 190 GTG GGG GAT TTC CAC TAC GTG ACG GGC ATG ACC ACT GAC AAC GTG AAA 623 Val Gly Asp Phe His Tyr Val Thr Gly Met Thr Thr Asp Asn Val Lys 195 200 205 TGC CCA TGC CAG GTT CCG GCC CCC GAA TTC TTC ACA GAA TTG GAT GGG 671 Cys Pro Cys Gln Val Pro Ala Pro Glu Phe Phe Thr Glu Leu Asp Gly 210 215 220 GTG CGG CTG CAC AGG TAC GCT CCG GCG TGC AAA CCT CTC CTG CGG GAT 719 Val Arg Leu His Arg Tyr Ala Pro Ala Cys Lys Pro Leu Leu Arg Asp 225 230 235 GAG GTC ACA TTC CAG GTC GGG CTC AAC CAA TAT ACG GTT GGG TCA CAG 767 Glu Val Thr Phe Gln Val Gly Leu Asn Gln Tyr Thr Val Gly Ser Gln 240 245 250 255 CTC CCA TGT GAG CCC GAA CCG GAT GTA ACA GTG GTC ACC TCC ATG CTC 815 Leu Pro Cys Glu Pro Glu Pro Asp Val Thr Val Val Thr Ser Met Leu 260 265 270 ACC GAC CCC TCC CAC ATT ACA GCA GAG GCG GCT AGG CGT AGG CTG GCC 863 Thr Asp Pro Ser His Ile Thr Ala Glu Ala Ala Arg Arg Arg Leu Ala 275 280 285 AGA GGG TCT CCC CCT TCC TTG GCC AGT TCT TCA GCT AGT CAG TTG TCT 911 Arg Gly Ser Pro Pro Ser Leu Ala Ser Ser Ser Ala Ser Gln Leu Ser 290 295 300 GCG CTT TCT TTG AAG GCG ACA TGC ACT ACC CAT CAT GGC GCC CCA GAC 959 Ala Leu Ser Leu Lys Ala Thr Cys Thr Thr His His Gly Ala Pro Asp 305 310 315 ACT GAC CTC ATC GAG GCC AAC CTC CTG TGG CGG CAG GAG ATG GGC GGA 1007 Thr Asp Leu Ile Glu Ala Asn Leu Leu Trp Arg Gln Glu Met Gly Gly 320 325 330 335 AAC ATC ACC CGC GTG GAG TCA GAG AAC AAG ATA GTA ATT CTA GAC TCT 1055 Asn Ile Thr Arg Val Glu Ser Glu Asn Lys Ile Val Ile Leu Asp Ser 340 345 350 TTT GAA CCG CTT CGA GCG GAG GAG GAT GA 1084 Phe Glu Pro Leu Arg Ala Glu Glu Asp 355 360
【０３０９】配列番号：71 配列の長さ：1004 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：1728 配列 TGT GAG CCC GAA CCG GAT GTA ACA GTG GTC ACC TCC ATG CTC ACC GAC 48 Cys Glu Pro Glu Pro Asp Val Thr Val Val Thr Ser Met Leu Thr Asp 1 5 10 15 CCC TCC CAC ATT ACA GCA GAG GCG GCT AGG CGT AGG CTG GCC AGA GGG 96 Pro Ser His Ile Thr Ala Glu Ala Ala Arg Arg Arg Leu Ala Arg Gly 20 25 30 TCT CCC CCT TCC TTG GCC AGT TCT TCA GCT AGT CAG TTG TCT GCG CTT 144 Ser Pro Pro Ser Leu Ala Ser Ser Ser Ala Ser Gln Leu Ser Ala Leu 35 40 45 TCT TTG AAG GCG ACA TGC ACT ACC CAT CAT GGC GCC CCA GAC ACT GAC 192 Ser Leu Lys Ala Thr Cys Thr Thr His His Gly Ala Pro Asp Thr Asp 50 55 60 CTC ATC GAG GCC AAC CTC CTG TGG CGG CAG GAG ATG GGC GGA AAC ATC 240 Leu Ile Glu Ala Asn Leu Leu Trp Arg Gln Glu Met Gly Gly Asn Ile 65 70 75 80 ACC CGC GTG GAG TCA GAG AAC AAG ATA GTA ATT CTA GAC TCT TTT GAA 288 Thr Arg Val Glu Ser Glu Asn Lys Ile Val Ile Leu Asp Ser Phe Glu 85 90 95 CCG CTT CGA GCG GAG GAG GAT GAG AGG GAA GTG TCC GTT GCG GCG GAG 336 Pro Leu Arg Ala Glu Glu Asp Glu Arg Glu Val Ser Val Ala Ala Glu 100 105 110 ATC CTG CGG AAG ACC AGG AAA TTC CCC GCA GCG ATG CCC GTA TGG GCA 384 Ile Leu Arg Lys Thr Arg Lys Phe Pro Ala Ala Met Pro Val Trp Ala 115 120 125 CGC CCG GAC TAC AAC CCA CCA TTA CTA GAG TCT TGG AAG AAC CCG GAC 432 Arg Pro Asp Tyr Asn Pro Pro Leu Leu Glu Ser Trp Lys Asn Pro Asp 130 135 140 TAC GTC CCT CCA GTG GTA CAC GGG TGC CCA TTG CCG CCT ACC AAG GCC 480 Tyr Val Pro Pro Val Val His Gly Cys Pro Leu Pro Pro Thr Lys Ala 145 150 155 160 CCT CCA ATA CCA CCT CCA CGG AGA AAG AGA ACG GTT GTC CTG ACA GAA 528 Pro Pro Ile Pro Pro Pro Arg Arg Lys Arg Thr Val Val Leu Thr Glu 165 170 175 TCC ACC GTG TCC TCT GCC TTG GCG GAG CTT GCT ACA AAG ACC TTT GGC 576 Ser Thr Val Ser Ser Ala Leu Ala Glu Leu Ala Thr Lys Thr Phe Gly 180 185 190 AGT TCC GGA TCG TCG GCC GTC GAC AGC GGC ACG GCG ACC GGC CCT CCT 624 Ser Ser Gly Ser Ser Ala Val Asp Ser Gly Thr Ala Thr Gly Pro Pro 195 200 205 GAC CAG GCC TCC GCC GAA GGA GAT GCA GGA TCC GAC GCT GAG TCG TAC 672 Asp Gln Ala Ser Ala Glu Gly Asp Ala Gly Ser Asp Ala Glu Ser Tyr 210 215 220 TCC TCC ATG CCC CCC CTT GAG GGA GAG CCG GGG GAC CCC GAT CTC AAC 720 Ser Ser Met Pro Pro Leu Glu Gly Glu Pro Gly Asp Pro Asp Leu Asn 225 230 235 240 GAC GGG TCT TGG TCT ACC GTA AGC GAG GAG GCC AGC GAG GAC GTC GTC 768 Asp Gly Ser Trp Ser Thr Val Ser Glu Glu Ala Ser Glu Asp Val Val 245 250 255 TGC TGC TCG ATG TCC TAC ACA TGG ACA GGC GCC TTA ATT ACA CCA TGC 816 Cys Cys Ser Met Ser Tyr Thr Trp Thr Gly Ala Leu Ile Thr Pro Cys 260 265 270 GCC GCG GAG GAG AGC AAG CTG CCC ATT AAT GCG CTG AGC AAC CCT TTG 864 Ala Ala Glu Glu Ser Lys Leu Pro Ile Asn Ala Leu Ser Asn Pro Leu 275 280 285 CTG CGC CAC CAC AAC ATG GTC TAT GCC ACA ACA TCC CGC AGC GCA AGC 912 Leu Arg His His Asn Met Val Tyr Ala Thr Thr Ser Arg Ser Ala Ser 290 295 300 CAG CGG CAG AAA AAG GTC ACA TTT GAC AGA CTG CAA GTC CTG GAT GAC 960 Gln Arg Gln Lys Lys Val Thr Phe Asp Arg Leu Gln Val Leu Asp Asp 305 310 315 320 CAC TAC CGG GAC GTG CTG AAG GAC ATG AAG GCC AAG GCG TCC AC 1004 His Tyr Arg Asp Val Leu Lys Asp Met Lys Ala Lys Ala Ser 325 330
【０３１０】配列番号：72 配列の長さ：857 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：2918 配列 AC TAC CGG GAC GTG CTG AAG GAC ATG AAG GCC AAG GCG TCC ACA GTT 47 Tyr Arg Asp Val Leu Lys Asp Met Lys Ala Lys Ala Ser Thr Val 1 5 10 15 AAG GCT AAA CTT CTA TCT GTA GAG GAA GCC TGC AAG CTG ACG CCC CCA 95 Lys Ala Lys Leu Leu Ser Val Glu Glu Ala Cys Lys Leu Thr Pro Pro 20 25 30 CAC TCG GCC AGA TCT AAA TTT GAC TAC GGG GCA AAG GAC GTC CAG AGC 143 His Ser Ala Arg Ser Lys Phe Asp Tyr Gly Ala Lys Asp Val Gln Ser 35 40 45 CTG TCC AGC AAG GCC GTT AAC CAC ATC CAC TCC GTG TGG AAG GAC TTG 191 Leu Ser Ser Lys Ala Val Asn His Ile His Ser Val Trp Lys Asp Leu 50 55 60 CCG GAA GAC ACT GAG ACA CCA ATC GAC ACC ACC ATC ATG GCA AAA AAT 239 Pro Glu Asp Thr Glu Thr Pro Ile Asp Thr Thr Ile Met Ala Lys Asn 65 70 75 GAG GTT TTT TGT GTT CAA CCA GAG AAA GGA GGC CGC AAG CCA GCT CGC 287 Glu Val Phe Cys Val Gln Pro Glu Lys Gly Gly Arg Lys Pro Ala Arg 80 85 90 95 CTT ATC GTA TTC CCA GAC TTG GGG GTT CGT GTG TGC GAG AAA ATG GCC 335 Leu Ile Val Phe Pro Asp Leu Gly Val Arg Val Cys Glu Lys Met Ala 100 105 110 CTC TAC GAC GTG GTC TCC ACT CTT CCT CAG GCC GTG ATG GGC TCC TCA 383 Leu Tyr Asp Val Val Ser Thr Leu Pro Gln Ala Val Met Gly Ser Ser 115 120 125 TAC AGA TTT CAG TGC TCC CCT GGA CAG CGG GTC GAG TTC CTG GTG AAT 431 Tyr Arg Phe Gln Cys Ser Pro Gly Gln Arg Val Glu Phe Leu Val Asn 130 135 140 GCC TGG AAG TCA AAG AAG AGC CCT ATG GGC TTT GCA TAT GAC ACC CGC 479 Ala Trp Lys Ser Lys Lys Ser Pro Met Gly Phe Ala Tyr Asp Thr Arg 145 150 155 TGT TTT GAC TCA ACG GTC ACC GAG AAC GAC ATC CGT ACT GAG GAG TCA 527 Cys Phe Asp Ser Thr Val Thr Glu Asn Asp Ile Arg Thr Glu Glu Ser 160 165 170 175 ATT TAT CAA TGT TGT GAC TTG GAC CCC GAG GCC AGA CAG GCC ATA AGG 575 Ile Tyr Gln Cys Cys Asp Leu Asp Pro Glu Ala Arg Gln Ala Ile Arg 180 185 190 TCG CTC ACA GAG CGG CTT TAT ATC GGG GGC CCC TTG ACC AAT TCA AAA 623 Ser Leu Thr Glu Arg Leu Tyr Ile Gly Gly Pro Leu Thr Asn Ser Lys 195 200 205 GGG CAA AAC TGC GGC TAT CGC CGG TGC CGC GCC AGC GGC GTG CTG ACG 671 Gly Gln Asn Cys Gly Tyr Arg Arg Cys Arg Ala Ser Gly Val Leu Thr 210 215 220 ACT AGC TGC GGT AAT ACC CTC ACA TGT TAC TTG AAG GCC TCT GCA GCC 719 Thr Ser Cys Gly Asn Thr Leu Thr Cys Tyr Leu Lys Ala Ser Ala Ala 225 230 235 TGT CGA GCT GCG AAG CTC CAG GAC TGC ACG ATG CTC GTG TGC GGA GAC 767 Cys Arg Ala Ala Lys Leu Gln Asp Cys Thr Met Leu Val Cys Gly Asp 240 245 250 255 GAC CTT GTC GTT ATC TGT GAA AGC GCG GGA ACC CAG GAG GAC GCG GCA 815 Asp Leu Val Val Ile Cys Glu Ser Ala Gly Thr Gln Glu Asp Ala Ala 260 265 270 AAC CTA CGA GTC TTC ACG GAG GCT ATG ACC AGG AAT TCC GCC 857 Asn Leu Arg Val Phe Thr Glu Ala Met Thr Arg Asn Ser Ala 275 280 285
【０３１１】配列番号：73 配列の長さ：1818 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：1718 配列 TGT GAG CCC GAA CCG GAT GTA ACA GTG GTC ACC TCC ATG CTC ACC GAC 48 Cys Glu Pro Glu Pro Asp Val Thr Val Val Thr Ser Met Leu Thr Asp 1 5 10 15 CCC TCC CAC ATT ACA GCA GAG GCG GCT AGG CGT AGG CTG GCC AGA GGG 96 Pro Ser His Ile Thr Ala Glu Ala Ala Arg Arg Arg Leu Ala Arg Gly 20 25 30 TCT CCC CCT TCC TTG GCC AGT TCT TCA GCT AGT CAG TTG TCT GCG CTT 144 Ser Pro Pro Ser Leu Ala Ser Ser Ser Ala Ser Gln Leu Ser Ala Leu 35 40 45 TCT TTG AAG GCG ACA TGC ACT ACC CAT CAT GGC GCC CCA GAC ACT GAC 192 Ser Leu Lys Ala Thr Cys Thr Thr His His Gly Ala Pro Asp Thr Asp 50 55 60 CTC ATC GAG GCC AAC CTC CTG TGG CGG CAG GAG ATG GGC GGA AAC ATC 240 Leu Ile Glu Ala Asn Leu Leu Trp Arg Gln Glu Met Gly Gly Asn Ile 65 70 75 80 ACC CGC GTG GAG TCA GAG AAC AAG ATA GTA ATT CTA GAC TCT TTT GAA 288 Thr Arg Val Glu Ser Glu Asn Lys Ile Val Ile Leu Asp Ser Phe Glu 85 90 95 CCG CTT CGA GCG GAG GAG GAT GAG AGG GAA GTG TCC GTT GCG GCG GAG 336 Pro Leu Arg Ala Glu Glu Asp Glu Arg Glu Val Ser Val Ala Ala Glu 100 105 110 ATC CTG CGG AAG ACC AGG AAA TTC CCC GCA GCG ATG CCC GTA TGG GCA 384 Ile Leu Arg Lys Thr Arg Lys Phe Pro Ala Ala Met Pro Val Trp Ala 115 120 125 CGC CCG GAC TAC AAC CCA CCA TTA CTA GAG TCT TGG AAG AAC CCG GAC 432 Arg Pro Asp Tyr Asn Pro Pro Leu Leu Glu Ser Trp Lys Asn Pro Asp 130 135 140 TAC GTC CCT CCA GTG GTA CAC GGG TGC CCA TTG CCG CCT ACC AAG GCC 480 Tyr Val Pro Pro Val Val His Gly Cys Pro Leu Pro Pro Thr Lys Ala 145 150 155 160 CCT CCA ATA CCA CCT CCA CGG AGA AAG AGA ACG GTT GTC CTG ACA GAA 528 Pro Pro Ile Pro Pro Pro Arg Arg Lys Arg Thr Val Val Leu Thr Glu 165 170 175 TCC ACC GTG TCC TCT GCC TTG GCG GAG CTT GCT ACA AAG ACC TTT GGC 576 Ser Thr Val Ser Ser Ala Leu Ala Glu Leu Ala Thr Lys Thr Phe Gly 180 185 190 AGT TCC GGA TCG TCG GCC GTC GAC AGC GGC ACG GCG ACC GGC CCT CCT 624 Ser Ser Gly Ser Ser Ala Val Asp Ser Gly Thr Ala Thr Gly Pro Pro 195 200 205 GAC CAG GCC TCC GCC GAA GGA GAT GCA GGA TCC GAC GCT GAG TCG TAC 672 Asp Gln Ala Ser Ala Glu Gly Asp Ala Gly Ser Asp Ala Glu Ser Tyr 210 215 220 TCC TCC ATG CCC CCC CTT GAG GGA GAG CCG GGG GAC CCC GAT CTC AAC 720 Ser Ser Met Pro Pro Leu Glu Gly Glu Pro Gly Asp Pro Asp Leu Asn 225 230 235 240 GAC GGG TCT TGG TCT ACC GTA AGC GAG GAG GCC AGC GAG GAC GTC GTC 768 Asp Gly Ser Trp Ser Thr Val Ser Glu Glu Ala Ser Glu Asp Val Val 245 250 255 TGC TGC TCG ATG TCC TAC ACA TGG ACA GGC GCC TTA ATT ACA CCA TGC 816 Cys Cys Ser Met Ser Tyr Thr Trp Thr Gly Ala Leu Ile Thr Pro Cys 260 265 270 GCC GCG GAG GAG AGC AAG CTG CCC ATT AAT GCG CTG AGC AAC CCT TTG 864 Ala Ala Glu Glu Ser Lys Leu Pro Ile Asn Ala Leu Ser Asn Pro Leu 275 280 285 CTG CGC CAC CAC AAC ATG GTC TAT GCC ACA ACA TCC CGC AGC GCA AGC 912 Leu Arg His His Asn Met Val Tyr Ala Thr Thr Ser Arg Ser Ala Ser 290 295 300 CAG CGG CAG AAA AAG GTC ACA TTT GAC AGA CTG CAA GTC CTG GAT GAC 960 Gln Arg Gln Lys Lys Val Thr Phe Asp Arg Leu Gln Val Leu Asp Asp 305 310 315 320 CAC TAC CGG GAC GTG CTG AAG GAC ATG AAG GCC AAG GCG TCC ACA GTT 1008 His Tyr Arg Asp Val Leu Lys Asp Met Lys Ala Lys Ala Ser Thr Val 325 330 335 AAG GCT AAA CTT CTA TCT GTA GAG GAA GCC TGC AAG CTG ACG CCC CCA 1056 Lys Ala Lys Leu Leu Ser Val Glu Glu Ala Cys Lys Leu Thr Pro Pro 340 345 350 CAC TCG GCC AGA TCT AAA TTT GAC TAC GGG GCA AAG GAC GTC CAG AGC 1104 His Ser Ala Arg Ser Lys Phe Asp Tyr Gly Ala Lys Asp Val Gln Ser 355 360 365 CTG TCC AGC AAG GCC GTT AAC CAC ATC CAC TCC GTG TGG AAG GAC TTG 1152 Leu Ser Ser Lys Ala Val Asn His Ile His Ser Val Trp Lys Asp Leu 370 375 380 CCG GAA GAC ACT GAG ACA CCA ATC GAC ACC ACC ATC ATG GCA AAA AAT 1200 Pro Glu Asp Thr Glu Thr Pro Ile Asp Thr Thr Ile Met Ala Lys Asn 385 390 395 400 GAG GTT TTT TGT GTT CAA CCA GAG AAA GGA GGC CGC AAG CCA GCT CGC 1248 Glu Val Phe Cys Val Gln Pro Glu Lys Gly Gly Arg Lys Pro Ala Arg 405 410 415 CTT ATC GTA TTC CCA GAC TTG GGG GTT CGT GTG TGC GAG AAA ATG GCC 1296 Leu Ile Val Phe Pro Asp Leu Gly Val Arg Val Cys Glu Lys Met Ala 420 425 430 CTC TAC GAC GTG GTC TCC ACT CTT CCT CAG GCC GTG ATG GGC TCC TCA 1344 Leu Tyr Asp Val Val Ser Thr Leu Pro Gln Ala Val Met Gly Ser Ser 435 440 445 TAC AGA TTT CAG TGC TCC CCT GGA CAG CGG GTC GAG TTC CTG GTG AAT 1392 Tyr Arg Phe Gln Cys Ser Pro Gly Gln Arg Val Glu Phe Leu Val Asn 450 455 460 GCC TGG AAG TCA AAG AAG AGC CCT ATG GGC TTT GCA TAT GAC ACC CGC 1440 Ala Trp Lys Ser Lys Lys Ser Pro Met Gly Phe Ala Tyr Asp Thr Arg 465 470 475 480 TGT TTT GAC TCA ACG GTC ACC GAG AAC GAC ATC CGT ACT GAG GAG TCA 1488 Cys Phe Asp Ser Thr Val Thr Glu Asn Asp Ile Arg Thr Glu Glu Ser 485 490 495 ATT TAT CAA TGT TGT GAC TTG GAC CCC GAG GCC AGA CAG GCC ATA AGG 1536 Ile Tyr Gln Cys Cys Asp Leu Asp Pro Glu Ala Arg Gln Ala Ile Arg 500 505 510 TCG CTC ACA GAG CGG CTT TAT ATC GGG GGC CCC TTG ACC AAT TCA AAA 1584 Ser Leu Thr Glu Arg Leu Tyr Ile Gly Gly Pro Leu Thr Asn Ser Lys
515 520 525 GGG CAA AAC TGC GGC TAT CGC CGG TGC CGC GCC AGC GGC GTG CTG ACG 1632 Gly Gln Asn Cys Gly Tyr Arg Arg Cys Arg Ala Ser Gly Val Leu Thr 530 535 540 ACT AGC TGC GGT AAT ACC CTC ACA TGT TAC TTG AAG GCC TCT GCA GCC 1680 Thr Ser Cys Gly Asn Thr Leu Thr Cys Tyr Leu Lys Ala Ser Ala Ala 545 550 555 560 TGT CGA GCT GCG AAG CTC CAG GAC TGC ACG ATG CTC GTG TGC GGA GAC 1728 Cys Arg Ala Ala Lys Leu Gln Asp Cys Thr Met Leu Val Cys Gly Asp 565 570 575 GAC CTT GTC GTT ATC TGT GAA AGC GCG GGA ACC CAG GAG GAC GCG GCA 1776 Asp Leu Val Val Ile Cys Glu Ser Ala Gly Thr Gln Glu Asp Ala Ala 580 585 590 AAC CTA CGA GTC TTC ACG GAG GCT ATG ACC AGG AAT TCC GCC 1818 Asn Leu Arg Val Phe Thr Glu Ala Met Thr Arg Asn Ser Ala 595 600 605
【０３１２】配列番号：74 配列の長さ：2591 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：2218 配列 GG CAT GTG GGC CCA GGG GAG GGG GCT GTG CAG TGG ATG AAC CGG CTG 47 His Val Gly Pro Gly Glu Gly Ala Val Gln Trp Met Asn Arg Leu 1 5 10 15 ATA GCG TTT GCT TCG CGG GGC AAC CAT GTC TCC CCC ACG CAC TAT GTG 95 Ile Ala Phe Ala Ser Arg Gly Asn His Val Ser Pro Thr His Tyr Val 20 25 30 CCT GAA AGC GAC GCC GCA GCG CGC GTC ACC CAG ATC CTC TCC AAC CTT 143 Pro Glu Ser Asp Ala Ala Ala Arg Val Thr Gln Ile Leu Ser Asn Leu 35 40 45 ACC ATC ACT CAG CTG TTG AAG AGG CTT CAC CAG TGG ATT AAT GAG GAC 191 Thr Ile Thr Gln Leu Leu Lys Arg Leu His Gln Trp Ile Asn Glu Asp 50 55 60 TGC TCC ACG CCA TGC TCC GGC TCG TGG CTC AGG GAT GTT TGG GAC TGG 239 Cys Ser Thr Pro Cys Ser Gly Ser Trp Leu Arg Asp Val Trp Asp Trp 65 70 75 ATA TGC ACG GTA TTG GCT GAT TTC AAG ACC TGG CTC CAG TCC AAG CTC 287 Ile Cys Thr Val Leu Ala Asp Phe Lys Thr Trp Leu Gln Ser Lys Leu 80 85 90 95 CTG CCG CGG TTA CCG GGG GTC CCT TTT TTC TCA TGC CAG CGT GGG TAC 335 Leu Pro Arg Leu Pro Gly Val Pro Phe Phe Ser Cys Gln Arg Gly Tyr 100 105 110 AAG GGG GTT TGG CGG GGA GAT GGC ATC ATG TAT ACC ACC TGC CCA TGT 383 Lys Gly Val Trp Arg Gly Asp Gly Ile Met Tyr Thr Thr Cys Pro Cys 115 120 125 GGA GCA CAA ATC ACC GGA CAT GTC AAA AAC GGT TCT ATG AGG ATC GTT 431 Gly Ala Gln Ile Thr Gly His Val Lys Asn Gly Ser Met Arg Ile Val 130 135 140 GGG CCT AGA ACC TGT AGC AAC ACG TGG CAC GGA ACA TTT CCC ATC AAC 479 Gly Pro Arg Thr Cys Ser Asn Thr Trp His Gly Thr Phe Pro Ile Asn 145 150 155 GCG TAC ACC ACA GGC CCC TGC ACA CCC TCC CCG GCG CCA AAC TAT TCC 527 Ala Tyr Thr Thr Gly Pro Cys Thr Pro Ser Pro Ala Pro Asn Tyr Ser 160 165 170 175 AGG GCG TTG TGG CGG GTG GCC ATT GAG GAG TAT GTG GAG GTC ACG CGG 575 Arg Ala Leu Trp Arg Val Ala Ile Glu Glu Tyr Val Glu Val Thr Arg 180 185 190 GTG GGG GAT TTC CAC TAC GTG ACG GGC ATG ACC ACT GAC AAC GTG AAA 623 Val Gly Asp Phe His Tyr Val Thr Gly Met Thr Thr Asp Asn Val Lys 195 200 205 TGC CCA TGC CAG GTT CCG GCC CCC GAA TTC TTC ACA GAA TTG GAT GGG 671 Cys Pro Cys Gln Val Pro Ala Pro Glu Phe Phe Thr Glu Leu Asp Gly 210 215 220 GTG CGG CTG CAC AGG TAC GCT CCG GCG TGC AAA CCT CTC CTG CGG GAT 719 Val Arg Leu His Arg Tyr Ala Pro Ala Cys Lys Pro Leu Leu Arg Asp 225 230 235 GAG GTC ACA TTC CAG GTC GGG CTC AAC CAA TAT ACG GTT GGG TCA CAG 767 Glu Val Thr Phe Gln Val Gly Leu Asn Gln Tyr Thr Val Gly Ser Gln 240 245 250 255 CTC CCA TGT GAG CCC GAA CCG GAT GTA ACA GTG GTC ACC TCC ATG CTC 815 Leu Pro Cys Glu Pro Glu Pro Asp Val Thr Val Val Thr Ser Met Leu 260 265 270 ACC GAC CCC TCC CAC ATT ACA GCA GAG GCG GCT AGG CGT AGG CTG GCC 863 Thr Asp Pro Ser His Ile Thr Ala Glu Ala Ala Arg Arg Arg Leu Ala 275 280 285 AGA GGG TCT CCC CCT TCC TTG GCC AGT TCT TCA GCT AGT CAG TTG TCT 911 Arg Gly Ser Pro Pro Ser Leu Ala Ser Ser Ser Ala Ser Gln Leu Ser 290 295 300 GCG CTT TCT TTG AAG GCG ACA TGC ACT ACC CAT CAT GGC GCC CCA GAC 959 Ala Leu Ser Leu Lys Ala Thr Cys Thr Thr His His Gly Ala Pro Asp 305 310 315 ACT GAC CTC ATC GAG GCC AAC CTC CTG TGG CGG CAG GAG ATG GGC GGA 1007 Thr Asp Leu Ile Glu Ala Asn Leu Leu Trp Arg Gln Glu Met Gly Gly 320 325 330 335 AAC ATC ACC CGC GTG GAG TCA GAG AAC AAG ATA GTA ATT CTA GAC TCT 1055 Asn Ile Thr Arg Val Glu Ser Glu Asn Lys Ile Val Ile Leu Asp Ser 340 345 350 TTT GAA CCG CTT CGA GCG GAG GAG GAT GAG AGG GAA GTG TCC GTT GCG 1103 Phe Glu Pro Leu Arg Ala Glu Glu Asp Glu Arg Glu Val Ser Val Ala 355 360 365 GCG GAG ATC CTG CGG AAG ACC AGG AAA TTC CCC GCA GCG ATG CCC GTA 1151 Ala Glu Ile Leu Arg Lys Thr Arg Lys Phe Pro Ala Ala Met Pro Val 370 375 380 TGG GCA CGC CCG GAC TAC AAC CCA CCA TTA CTA GAG TCT TGG AAG AAC 1199 Trp Ala Arg Pro Asp Tyr Asn Pro Pro Leu Leu Glu Ser Trp Lys Asn 385 390 395 CCG GAC TAC GTC CCT CCA GTG GTA CAC GGG TGC CCA TTG CCG CCT ACC 1247 Pro Asp Tyr Val Pro Pro Val Val His Gly Cys Pro Leu Pro Pro Thr 400 405 410 415 AAG GCC CCT CCA ATA CCA CCT CCA CGG AGA AAG AGA ACG GTT GTC CTG 1295 Lys Ala Pro Pro Ile Pro Pro Pro Arg Arg Lys Arg Thr Val Val Leu 420 425 430 ACA GAA TCC ACC GTG TCC TCT GCC TTG GCG GAG CTT GCT ACA AAG ACC 1343 Thr Glu Ser Thr Val Ser Ser Ala Leu Ala Glu Leu Ala Thr Lys Thr 435 440 445 TTT GGC AGT TCC GGA TCG TCG GCC GTC GAC AGC GGC ACG GCG ACC GGC 1391 Phe Gly Ser Ser Gly Ser Ser Ala Val Asp Ser Gly Thr Ala Thr Gly 450 455 460 CCT CCT GAC CAG GCC TCC GCC GAA GGA GAT GCA GGA TCC GAC GCT GAG 1439 Pro Pro Asp Gln Ala Ser Ala Glu Gly Asp Ala Gly Ser Asp Ala Glu 465 470 475 TCG TAC TCC TCC ATG CCC CCC CTT GAG GGA GAG CCG GGG GAC CCC GAT 1487 Ser Tyr Ser Ser Met Pro Pro Leu Glu Gly Glu Pro Gly Asp Pro Asp 480 485 490 495 CTC AAC GAC GGG TCT TGG TCT ACC GTA AGC GAG GAG GCC AGC GAG GAC 1535 Leu Asn Asp Gly Ser Trp Ser Thr Val Ser Glu Glu Ala Ser Glu Asp 500 505 510 GTC GTC TGC TGC TCG ATG TCC TAC ACA TGG ACA GGC GCC TTA ATT ACA 1583 Val Val Cys Cys Ser Met Ser Tyr Thr Trp Thr Gly Ala Leu Ile Thr 515 520 525 CCA TGC GCC GCG GAG GAG AGC AAG CTG CCC ATT AAT GCG CTG AGC AAC 1631 Pro Cys Ala Ala Glu Glu Ser Lys Leu Pro Ile Asn Ala Leu Ser Asn 530 535 540 CCT TTG CTG CGC CAC CAC AAC ATG GTC TAT GCC ACA ACA TCC CGC AGC 1679 Pro Leu Leu Arg His His Asn Met Val Tyr Ala Thr Thr Ser Arg Ser 545 550 555 GCA AGC CAG CGG CAG AAA AAG GTC ACA TTT GAC AGA CTG CAA GTC CTG 1727 Ala Ser Gln Arg Gln Lys Lys Val Thr Phe Asp Arg Leu Gln Val Leu 560 565 570 575 GAT GAC CAC TAC CGG GAC GTG CTG AAG GAC ATG AAG GCC AAG GCG TCC 1775 Asp Asp His Tyr Arg Asp Val Leu Lys Asp Met Lys Ala Lys Ala Ser 580 585 590 ACA GTT AAG GCT AAA CTT CTA TCT GTA GAG GAA GCC TGC AAG CTG ACG 1823 Thr Val Lys Ala Lys Leu Leu Ser Val Glu Glu Ala Cys Lys Leu Thr 595 600 605 CCC CCA CAC TCG GCC AGA TCT AAA TTT GAC TAC GGG GCA AAG GAC GTC 1871 Pro Pro His Ser Ala Arg Ser Lys Phe Asp Tyr Gly Ala Lys Asp Val 610 615 620 CAG AGC CTG TCC AGC AAG GCC GTT AAC CAC ATC CAC TCC GTG TGG AAG 1919 Gln Ser Leu Ser Ser Lys Ala Val Asn His Ile His Ser Val Trp Lys 625 630 635 GAC TTG CCG GAA GAC ACT GAG ACA CCA ATC GAC ACC ACC ATC ATG GCA 1967 Asp Leu Pro Glu Asp Thr Glu Thr Pro Ile Asp Thr Thr Ile Met Ala 640 645 650 655 AAA AAT GAG GTT TTT TGT GTT CAA CCA GAG AAA GGA GGC CGC AAG CCA 2015 Lys Asn Glu Val Phe Cys Val Gln Pro Glu Lys Gly Gly Arg Lys Pro 660 665 670 GCT CGC CTT ATC GTA TTC CCA GAC TTG GGG GTT CGT GTG TGC GAG AAA 2063 Ala Arg Leu Ile Val Phe Pro Asp Leu Gly Val Arg Val Cys Glu Lys 675 680 685 ATG GCC CTC TAC GAC GTG GTC TCC ACT CTT CCT CAG GCC GTG ATG GGC 2111 Met Ala Leu Tyr Asp Val Val Ser Thr Leu Pro Gln Ala Val Met Gly 690 695 700 TCC TCA TAC AGA TTT CAG TGC TCC CCT GGA CAG CGG GTC GAG TTC CTG 2159 Ser Ser Tyr Arg Phe Gln Cys Ser Pro Gly Gln Arg Val Glu Phe Leu 705 710 715 GTG AAT GCC TGG AAG TCA AAG AAG AGC CCT ATG GGC TTT GCA TAT GAC 2207 Val Asn Ala Trp Lys Ser Lys Lys Ser Pro Met Gly Phe Ala Tyr Asp 720 725 730 735 ACC CGC TGT TTT GAC TCA ACG GTC ACC GAG AAC GAC ATC CGT ACT GAG 2255 Thr Arg Cys Phe Asp Ser Thr Val Thr Glu Asn Asp Ile Arg Thr Glu 740 745 750 GAG TCA ATT TAT CAA TGT TGT GAC TTG GAC CCC GAG GCC AGA CAG GCC 2303 Glu Ser Ile Tyr Gln 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【０３１３】配列番号：75 配列の長さ：4296 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：1530U 配列 GCGGATCCT CCA CCT CCA TCG TGG GAT CAA ATG TGG AAG TGT CTC ATA CGG 51 Pro Pro Pro Ser Trp Asp Gln Met Trp Lys Cys Leu Ile Arg 1 5 10 CTG AAG CCT ACG CTA CAC GGG CCA ACG CCC CTG TTG TAT AGG TTA GGA 99 Leu Lys Pro Thr Leu His Gly Pro Thr Pro Leu Leu Tyr Arg Leu Gly 15 20 25 30 GCC GTT CAG AAC GAG GTT ACC CTC ACA CAC CCC ATA ACC AAG TTC ATC 147 Ala Val Gln Asn Glu Val Thr Leu Thr His Pro Ile Thr Lys Phe Ile 35 40 45 ATG GCA TGC ATG TCG GCT GAC CTA GAG GTC GTC ACT AGC ACT TGG GTG 195 Met Ala Cys Met Ser Ala Asp Leu Glu Val Val Thr Ser Thr Trp Val 50 55 60 CTG GTA GGC GGG GTC CTC GCG GCT CTG GCC GCG TAC TGC CTG ACA ACG 243 Leu Val Gly Gly Val Leu Ala Ala Leu Ala Ala Tyr Cys Leu Thr Thr 65 70 75 GGC AGC GTG GTC ATT GTG GGC AGG ATC ATC TTG TCC GGG AGG CCG GCC 291 Gly Ser Val Val Ile Val Gly Arg Ile Ile Leu Ser Gly Arg Pro Ala 80 85 90 GTT ATT CCC GAC AGG GAA GTT CTC TAC CAA GAG TTC GAT GAA 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GTG GCC GCC CAA CTC GCC 675 Thr Leu Leu Phe Asn Ile Leu Gly Gly Trp Val Ala Ala Gln Leu Ala 210 215 220 CCC CCC AGT GCC GCT TCA GCC TTC GTG GGC GCC GGT ATA GCT GGC GCG 723 Pro Pro Ser Ala Ala Ser Ala Phe Val Gly Ala Gly Ile Ala Gly Ala 225 230 235 GCT GTT GGC AGC ATA GGC CTC GGG AAG GTG CTT GTG GAC ATT CTG GCG 771 Ala Val Gly Ser Ile Gly Leu Gly Lys Val Leu Val Asp Ile Leu Ala 240 245 250 GGT TAT GGA GCA GGG GTG GCA GGC GCG CTC GTG GCC TTT AAG GTC ATG 819 Gly Tyr Gly Ala Gly Val Ala Gly Ala Leu Val Ala Phe Lys Val Met 255 260 265 270 AGC GGT GAC ATG CCC TCC ACC GAG GAC CTG GTC AAC TTA CTC CCC GCC 867 Ser Gly Asp Met Pro Ser Thr Glu Asp Leu Val Asn Leu Leu Pro Ala 275 280 285 ATC CTC TCT CCT GGT GCC CTG GTC GTC GGG GTC GTG TGC GCA GCA ATA 915 Ile Leu Ser Pro Gly Ala Leu Val Val Gly Val Val Cys Ala Ala Ile 290 295 300 CTG CGT CGG CAT GTG GGC CCA GGG GAG GGG GCT GTG CAG TGG ATG AAC 963 Leu Arg Arg His Val Gly Pro Gly Glu Gly Ala Val Gln Trp Met Asn 305 310 315 CGG CTG ATA GCG TTT GCT TCG CGG GGC AAC CAT GTC TCC CCC ACG CAC 1011 Arg Leu Ile Ala Phe Ala Ser Arg Gly Asn His Val Ser Pro Thr His 320 325 330 TAT GTG CCT GAA AGC GAC GCC GCA GCG CGC GTC ACC CAG ATC CTC TCC 1059 Tyr Val Pro Glu Ser Asp Ala Ala Ala Arg Val Thr Gln Ile Leu Ser 335 340 345 350 AAC CTT ACC ATC ACT CAG CTG TTG AAG AGG CTT CAC CAG TGG ATT AAT 1107 Asn Leu Thr Ile Thr Gln Leu Leu Lys Arg Leu His Gln Trp Ile Asn 355 360 365 GAG GAC TGC TCC ACG CCA TGC TCC GGC TCG TGG CTC AGG GAT GTT TGG 1155 Glu Asp Cys Ser Thr Pro Cys Ser Gly Ser Trp Leu Arg Asp Val Trp 370 375 380 GAC TGG ATA TGC ACG GTA TTG GCT GAT TTC AAG ACC TGG CTC CAG TCC 1203 Asp Trp Ile Cys Thr Val Leu Ala Asp Phe Lys Thr Trp Leu Gln Ser 385 390 395 AAG CTC CTG CCG CGG TTA CCG GGG GTC CCT TTT TTC TCA TGC CAG CGT 1251 Lys Leu Leu Pro Arg Leu Pro Gly Val Pro Phe Phe Ser Cys Gln Arg 400 405 410 GGG TAC AAG GGG GTT TGG CGG GGA GAT GGC ATC ATG TAT ACC ACC TGC 1299 Gly Tyr Lys Gly Val Trp Arg Gly Asp Gly Ile Met Tyr Thr Thr Cys 415 420 425 430 CCA 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Leu 530 535 540 CGG GAT GAG GTC ACA TTC CAG GTC GGG CTC AAC CAA TAT ACG GTT GGG 1683 Arg Asp Glu Val Thr Phe Gln Val Gly Leu Asn Gln Tyr Thr Val Gly 545 550 555 TCA CAG CTC CCA TGT GAG CCC GAA CCG GAT GTA ACA GTG GTC ACC TCC 1731 Ser Gln Leu Pro Cys Glu Pro Glu Pro Asp Val Thr Val Val Thr Ser 560 565 570 ATG CTC ACC GAC CCC TCC CAC ATT ACA GCA GAG GCG GCT AGG CGT AGG 1779 Met Leu Thr Asp Pro Ser His Ile Thr Ala Glu Ala Ala Arg Arg Arg 575 580 585 590 CTG GCC AGA GGG TCT CCC CCT TCC TTG GCC AGT TCT TCA GCT AGT CAG 1827 Leu Ala Arg Gly Ser Pro Pro Ser Leu Ala Ser Ser Ser Ala Ser Gln 595 600 605 TTG TCT GCG CTT TCT TTG AAG GCG ACA TGC ACT ACC CAT CAT GGC GCC 1875 Leu Ser Ala Leu Ser Leu Lys Ala Thr Cys Thr Thr His His Gly Ala 610 615 620 CCA GAC ACT GAC CTC ATC GAG GCC AAC CTC CTG TGG CGG CAG GAG ATG 1923 Pro Asp Thr Asp Leu Ile Glu Ala Asn Leu Leu Trp Arg Gln Glu Met 625 630 635 GGC GGA AAC ATC ACC CGC GTG GAG TCA GAG AAC AAG ATA GTA ATT CTA 1971 Gly Gly Asn Ile Thr Arg Val Glu Ser Glu 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Ser Ser Gly Ser Ser Ala Val Asp Ser Gly Thr Ala 755 760 765 ACC GGC CCT CCT GAC CAG GCC TCC GCC GAA GGA GAT GCA GGA TCC GAC 2355 Thr Gly Pro Pro Asp Gln Ala Ser Ala Glu Gly Asp Ala Gly Ser Asp 770 775 780 GCT GAG TCG TAC TCC TCC ATG CCC CCC CTT GAG GGA GAG CCG GGG GAC 2403 Ala Glu Ser Tyr Ser Ser Met Pro Pro Leu Glu Gly Glu Pro Gly Asp 785 790 795 CCC GAT CTC AAC GAC GGG TCT TGG TCT ACC GTA AGC GAG GAG GCC AGC 2451 Pro Asp Leu Asn Asp Gly Ser Trp Ser Thr Val Ser Glu Glu Ala Ser 800 805 810 GAG GAC GTC GTC TGC TGC TCG ATG TCC TAC ACA TGG ACA GGC GCC TTA 2499 Glu Asp Val Val Cys Cys Ser Met Ser Tyr Thr Trp Thr Gly Ala Leu 815 820 825 830 ATT ACA CCA TGC GCC GCG GAG GAG AGC AAG CTG CCC ATT AAT GCG CTG 2547 Ile Thr Pro Cys Ala Ala Glu Glu Ser Lys Leu Pro Ile Asn Ala Leu 835 840 845 AGC AAC CCT TTG CTG CGC CAC CAC AAC ATG GTC TAT GCC ACA ACA TCC 2595 Ser Asn Pro Leu Leu Arg His His Asn Met Val Tyr Ala Thr Thr Ser 850 855 860 CGC AGC GCA AGC CAG CGG CAG AAA AAG GTC ACA TTT GAC AGA CTG CAA 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AAT TCA AAG GGG CAG AAC TGC GGT TAT CGC CGG TGC CGC GTC AGC 3315 Thr Asn Ser Lys Gly Gln Asn Cys Gly Tyr Arg Arg Cys Arg Val Ser 1090 1095 1100 GGC GTG CTG ACG ACT AGC TGC GGT AAT ACC CTC ACA TGT TAC TTG AAG 3363 Gly Val Leu Thr Thr Ser Cys Gly Asn Thr Leu Thr Cys Tyr Leu Lys 1105 1110 1115 GCC TCT GCA GCC TGT CGA GCT GCA AAG CTC CAG GAC TGC ACG ATG CTT 3411 Ala Ser Ala Ala Cys Arg Ala Ala Lys Leu Gln Asp Cys Thr Met Leu 1120 1125 1130 GTG TGC GGA GAC GAC CTT GTC GTT ATC TGT GAT AGC GCG GGA ACT CAG 3459 Val Cys Gly Asp Asp Leu Val Val Ile Cys Asp Ser Ala Gly Thr Gln 1135 1140 1145 1150 GAG GAC GCG GCG AGC CTA CGA GTC TTC ACG GAG GCT ATG ACT AGG TAC 3507 Glu Asp Ala Ala Ser Leu Arg Val Phe Thr Glu Ala Met Thr Arg Tyr 1155 1160 1165 TCT GCC CCC CCC GGG GAC CCG CCC CAA CCA GAA TAC GAC TTG GAG CTG 3555 Ser Ala Pro Pro Gly Asp Pro Pro Gln Pro Glu Tyr Asp Leu Glu Leu 1170 1175 1180 ATA ACA TCA TGC TCC TCC AAT GTG TCG GTC GCG CAC GAC GCA TCA GGC 3603 Ile Thr Ser Cys Ser Ser Asn Val Ser Val Ala His Asp Ala Ser Gly 1185 1190 1195 AAA CGG GTG TAC TAT CTC ACC CGT GAC CCC ACC ACC CCC CTA GCG CGG 3651 Lys Arg Val Tyr Tyr Leu Thr Arg Asp Pro Thr Thr Pro Leu Ala Arg 1200 1205 1210 GCT GCG TGG GAG ACA GCT AGA CAC ACT CCA GTC AAC TCC TGG CTA GGC 3699 Ala Ala Trp Glu Thr Ala Arg His Thr Pro Val Asn Ser Trp Leu Gly 1215 1220 1225 1230 AAC ATC ATC ATG TAC GCG CCC ACC TTA TGG GCA AGG ATG ATT CTG ATG 3747 Asn Ile Ile Met Tyr Ala Pro Thr Leu Trp Ala Arg Met Ile Leu Met 1235 1240 1245 ACC CAC TTC TTC TCC ATC CTT CTA GCC CAG GAG CAA CTT GAA AAA GCC 3795 Thr His Phe Phe Ser Ile Leu Leu Ala Gln Glu Gln Leu Glu Lys Ala 1250 1255 1260 CTA GAT TGT CAG ATC TAC GGG GCC ACT TAC TCC ATT GAG CCA CTT GAC 3843 Leu Asp Cys Gln Ile Tyr Gly Ala Thr Tyr Ser Ile Glu Pro Leu Asp 1265 1270 1275 CTA CCT CAG ATC ATT CAA CGA CTC CAC GGT CTT AGC GCA TTT TCA CTC 3891 Leu Pro Gln Ile Ile Gln Arg Leu His Gly Leu Ser Ala Phe Ser Leu 1280 1285 1290 CAT AGT TAC TCT CCA GGT GAG ATC AAT AGG GTG GCT TCA TGC CTC AGG 3939 His Ser Tyr Ser Pro Gly Glu Ile Asn Arg Val Ala Ser Cys Leu Arg 1295 1300 1305 1310 AAA CTT GGG GTA CCG CCC TTG CGA GTC TGG AGA CAT CGG GCC AGA AGC 3987 Lys Leu Gly Val Pro Pro Leu Arg Val Trp Arg His Arg Ala Arg Ser 1315 1320 1325 GTC CGC GCT AAG CTA CTG TCC CAG GGG GGG AGG GCC GCC ACC TGT GGC 4035 Val Arg Ala Lys Leu Leu Ser Gln Gly Gly Arg Ala Ala Thr Cys Gly 1330 1335 1340 AAA TAC CTC TTC AAC TGG GCA GTA AAG ACC AAG CTC AAA CTC ACT CCA 4083 Lys Tyr Leu Phe Asn Trp Ala Val Lys Thr Lys Leu Lys Leu Thr Pro 1345 1350 1355 ATC CCA GAA GCG TCC CAG CTG GAC TTG TCC GGC TGG TTC GTT GCT GGT 4131 Ile Pro Glu Ala Ser Gln Leu Asp Leu Ser Gly Trp Phe Val Ala Gly 1360 1365 1370 TAC AGC GGG GGA GAC ATA TAT CAC AGC CTG TCT CGT GCC CGA CCC CGC 4179 Tyr Ser Gly Gly Asp Ile Tyr His Ser Leu Ser Arg Ala Arg Pro Arg 1375 1380 1385 1390 TGG TTC ATG TGG TGC CTA CTC CTA CTT TCC GTA GGG GTA GGC ATC TAC 4227 Trp Phe Met Trp Cys Leu Leu Leu Leu Ser Val Gly Val Gly Ile Tyr 1395 1400 1405 CTG CTC CCC AAC CGA TGA GCGGG GAGCTAAACA CTCCAGGCCA ATAGGCCATC 4280 Leu Leu Pro Asn Arg Stop 1410 CCCCTTTTTT TTTTTT 4296
【０３１４】配列番号：76 配列の長さ：818 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N22-1 配列 GG CAT GTG GGC CCA GGG GAG GGG GCT GTG CAG TGG ATG AAC CGG CTG 47 His Val Gly Pro Gly Glu Gly Ala Val Gln Trp Met Asn Arg Leu 1 5 10 15 ATA GCG TTT GCT TCG CGG GGC AAC CAT GTC TCC CCC ACG CAC TAT GTG 95 Ile Ala Phe Ala Ser Arg Gly Asn His Val Ser Pro Thr His Tyr Val 20 25 30 CCT GAA AGC GAC GCC GCA GCG CGC GTC ACC CAG ATC CTC TCC AAC CTT 143 Pro Glu Ser Asp Ala Ala Ala Arg Val Thr Gln Ile Leu Ser Asn Leu 35 40 45 ACC ATC ACT CAG CTG TTG AAG AGG CTT CAC CAG TGG ATT AAT GAG GAC 191 Thr Ile Thr Gln Leu Leu Lys Arg Leu His Gln Trp Ile Asn Glu Asp 50 55 60 TGC TCC ACG CCA TGC TCC GGC TCG TGG CTC AGG GAT GTT TGG GAC TGG 239 Cys Ser Thr Pro Cys Ser Gly Ser Trp Leu Arg Asp Val Trp Asp Trp 65 70 75 ATA TGC ACG GTA TTG GCT GAT TTC AAG ACC TGG CTC CAG TCC AAG CTC 287 Ile Cys Thr Val Leu Ala Asp Phe Lys Thr Trp Leu Gln Ser Lys Leu 80 85 90 95 CTG CCG CGG TTA CCG GGG GTC CCT TTT TTC TCA TGC CAG CGT GGG TAC 335 Leu Pro Arg Leu Pro Gly Val Pro Phe Phe Ser Cys Gln Arg Gly Tyr 100 105 110 AAG GGG GTT TGG CGG GGA GAT GGC ATC ATG TAT ACC ACC TGC CCA TGT 383 Lys Gly Val Trp Arg Gly Asp Gly Ile Met Tyr Thr Thr Cys Pro Cys 115 120 125 GGA GCA CAA ATC ACC GGA CAT GTC AAA AAC GGT TCT ATG AGG ATC GTT 431 Gly Ala Gln Ile Thr Gly His Val Lys Asn Gly Ser Met Arg Ile Val 130 135 140 GGG CCT AGA ACC TGT AGC AAC ACG TGG CAC GGA ACA TTT CCC ATC AAC 479 Gly Pro Arg Thr Cys Ser Asn Thr Trp His Gly Thr Phe Pro Ile Asn 145 150 155 GCG TAC ACC ACA GGC CCC TGC ACA CCC TCC CCG GCG CCA AAC TAT TCC 527 Ala Tyr Thr Thr Gly Pro Cys Thr Pro Ser Pro Ala Pro Asn Tyr Ser 160 165 170 175 AGG GCG TTG TGG CGG GTG GCC GCT GAG GAG TAT GTG GAG GTC ACG CGG 575 Arg Ala Leu Trp Arg Val Ala Ala Glu Glu Tyr Val Glu Val Thr Arg 180 185 190 GTG GGG GAT TTC CAC TAC GTG ACG GGC ATG ACC ACT GAC AAC GTG AAA 623 Val Gly Asp Phe His Tyr Val Thr Gly Met Thr Thr Asp Asn Val Lys 195 200 205 TGC CCA TGC CAG GTT CCG GCC CCC GAA TTC TTC ACA GAA TTG GAT GGG 671 Cys Pro Cys Gln Val Pro Ala Pro Glu Phe Phe Thr Glu Leu Asp Gly 210 215 220 GTG CGG CTG CAC AGG TAC GCT CCG GCG TGC AAA CCT CTC CTG CGG GAT 719 Val Arg Leu His Arg Tyr Ala Pro Ala Cys Lys Pro Leu Leu Arg Asp 225 230 235 GAG GTC ACA TTC CAG GTC GGG CTC AAC CAA TAT ACG GTT GGG TCA CAG 767 Glu Val Thr Phe Gln Val Gly Leu Asn Gln Tyr Thr Val Gly Ser Gln 240 245 250 255 CTC CCA TGT GAG CCC GAA CCG GAT GTA ACA GTG GTC ACC TCC ATG CTC 815 Leu Pro Cys Glu Pro Glu Pro Asp Val Thr Val Val Thr Ser Met Leu 260 265 270 ACC 818 Thr
【０３１５】配列番号：77 配列の長さ：818 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N22-3 配列 GG CAT GTG GGC CCA GGG GAG GGG GCT GTG CAG TGG ATG AAC CGG CTG 47 His Val Gly Pro Gly Glu Gly Ala Val Gln Trp Met Asn Arg Leu 1 5 10 15 ATA GCG TTT GCT TCG CGG GGC AAC CAT GTC TCC CCC ACG CAC TAT GTG 95 Ile Ala Phe Ala Ser Arg Gly Asn His Val Ser Pro Thr His Tyr Val 20 25 30 CCT GAA AGC GAC GCC GCA GCG CGC GTC ACC CAG ATC CTC TCC AAC CTT 143 Pro Glu Ser Asp Ala Ala Ala Arg Val Thr Gln Ile Leu Ser Asn Leu 35 40 45 ACC ATC ACT CAG TTG TTG AAG AGG CTC CAC CAG TGG ATT AAT GAG GAC 191 Thr Ile Thr Gln Leu Leu Lys Arg Leu His Gln Trp Ile Asn Glu Asp 50 55 60 TGC TCC ACG CCA TGC TCC GGC TCG TGG CTC AGG GAT GTT TGG GAC TGG 239 Cys Ser Thr Pro Cys Ser Gly Ser Trp Leu Arg Asp Val Trp Asp Trp 65 70 75 ATA TGC ACG GTA TTG GCT GAT TTC AAG ACC TGG CTC CAG TCC AAG CTC 287 Ile Cys Thr Val Leu Ala Asp Phe Lys Thr Trp Leu Gln Ser Lys Leu 80 85 90 95 CTG CCG CGG TTA CCG GGG GTC CCT TTC TTC TCA TGC CAG CGT GGG TAC 335 Leu Pro Arg Leu Pro Gly Val Pro Phe Phe Ser Cys Gln Arg Gly Tyr 100 105 110 AAG GGG GTT TGG CGG GGA GAC GGC ATC ATG TAT ACC ACC TGC CCA TGT 383 Lys Gly Val Trp Arg Gly Asp Gly Ile Met Tyr Thr Thr Cys Pro Cys 115 120 125 GGA GCA CAA ATC ACC GGA CAT GTC AAA AAC GGT TCT ATG AGG ATC GTT 431 Gly Ala Gln Ile Thr Gly His Val Lys Asn Gly Ser Met Arg Ile Val 130 135 140 GGG CTT AGA ACC TGT AGC AAC ACG TGG CAC GGA ACA TTC CCC ATC AAC 479 Gly Leu Arg Thr Cys Ser Asn Thr Trp His Gly Thr Phe Pro Ile Asn 145 150 155 GCG TAC ACC ACA GGC CCC TGC ACA CCC TCT CCA GCG CCG AAC TAC TCC 527 Ala Tyr Thr Thr Gly Pro Cys Thr Pro Ser Pro Ala Pro Asn Tyr Ser 160 165 170 175 AGG GCG TTA TGG CGG GTA GCC GCT GAG GAG TAT GTG GAG GTC ACG CGG 575 Arg Ala Leu Trp Arg Val Ala Ala Glu Glu Tyr Val Glu Val Thr Arg 180 185 190 GTG GGG GAT TTC CAC TAC GTG ACG GGC ATG ACC ACT GAC AAC GTA AAA 623 Val Gly Asp Phe His Tyr Val Thr Gly Met Thr Thr Asp Asn Val Lys 195 200 205 TGC CCA TGC CAG GTT CCG GCC CCC GAA TTC TTC ACA GAA TTG GAT GGG 671 Cys Pro Cys Gln Val Pro Ala Pro Glu Phe Phe Thr Glu Leu Asp Gly 210 215 220 GTG CGG CTG CGC AGG TAC GCT CCG GCG TGC AAA CCT CTC CTG CGG GAT 719 Val Arg Leu Arg Arg Tyr Ala Pro Ala Cys Lys Pro Leu Leu Arg Asp 225 230 235 GAG GTC ACA TTC CAG GTC GGG CTC AAC CAA TAT ACG GTT GGG TCA CAG 767 Glu Val Thr Phe Gln Val Gly Leu Asn Gln Tyr Thr Val Gly Ser Gln 240 245 250 255 CTC CCA TGT GAG CCC GAA CCG GAT GTA ACG GTG GTC ACC TCC ATG CTC 815 Leu Pro Cys Glu Pro Glu Pro Asp Val Thr Val Val Thr Ser Met Leu 260 265 270 ACC 818 Thr
【０３１６】配列番号：78 配列の長さ：818 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：H22-3 配列 GG CAT GTG GGC CCA GGG GAG GGG GCT GTG CAG TGG ATG AAC CGG CTG 47 His Val Gly Pro Gly Glu Gly Ala Val Gln Trp Met Asn Arg Leu 1 5 10 15 ATA GCG TTC GCT TCG CGG GGT AAC CAC GTC TCC CCC ACG CAT TAT GTG 95 Ile Ala Phe Ala Ser Arg Gly Asn His Val Ser Pro Thr His Tyr Val 20 25 30 CCT GAG AGC GAC GCC GCA GCG CGT GTC ACC CAG ATC CTC TCC AGC CTT 143 Pro Glu Ser Asp Ala Ala Ala Arg Val Thr Gln Ile Leu Ser Ser Leu 35 40 45 ACC ATC ACT CAG CTG CTG AAG AGG CTC CAC CAG TGG ATT GAT GAG GAC 191 Thr Ile Thr Gln Leu Leu Lys Arg Leu His Gln Trp Ile Asp Glu Asp 50 55 60 TGC TCC ACG CCA TGT TCT GGT TCG TGG CTC AGG GAT GTT TGG GAC TGG 239 Cys Ser Thr Pro Cys Ser Gly Ser Trp Leu Arg Asp Val Trp Asp Trp 65 70 75 ATA TGC ACG GTG TTG AGT GAC TTC AAG ACC TGG CTC CAG TCC AAG CTC 287 Ile Cys Thr Val Leu Ser Asp Phe Lys Thr Trp Leu Gln Ser Lys Leu 80 85 90 95 CTG CCG CGG CTA CCG GGA GTC CCT TTC CTC TCA TGC CAA CGT GGG TAC 335 Leu Pro Arg Leu Pro Gly Val Pro Phe Leu Ser Cys Gln Arg Gly Tyr 100 105 110 AAG GGA GTC TGG CGG GGA GAT GGC ATC ATG CAG ACC ACC TGC CCA TGC 383 Lys Gly Val Trp Arg Gly Asp Gly Ile Met Gln Thr Thr Cys Pro Cys 115 120 125 GGA GCA CAA ATC GCC GGA CAT GTC AAA AAT GGT TCT ATG AGG ATC ACT 431 Gly Ala Gln Ile Ala Gly His Val Lys Asn Gly Ser Met Arg Ile Thr 130 135 140 GGC CCC AGA ACC TGT AGC AAC ACG TGG CAC GGA ACG TTC CCC ATC AAC 479 Gly Pro Arg Thr Cys Ser Asn Thr Trp His Gly Thr Phe Pro Ile Asn 145 150 155 GCG TAC ACC ACA GGC CCC TGC ACA CCC TCC CCA GCG CCG AAC TAC TCC 527 Ala Tyr Thr Thr Gly Pro Cys Thr Pro Ser Pro Ala Pro Asn Tyr Ser 160 165 170 175 AGG GCG TTA TGG CGG GTA GCT GCT GAG GAG TAT GTG GAG GTC ACG CGG 575 Arg Ala Leu Trp Arg Val Ala Ala Glu Glu Tyr Val Glu Val Thr Arg 180 185 190 GTG GGG GAC TTC CAC TAC GTG ACG GGC ATG ACC ACT GAC AAC TTG AAA 623 Val Gly Asp Phe His Tyr Val Thr Gly Met Thr Thr Asp Asn Leu Lys 195 200 205 TGC CCA TGC CAG GTC CCG GCC CCC GAA TTC TTC ACG GAG TTG GAT GGG 671 Cys Pro Cys Gln Val Pro Ala Pro Glu Phe Phe Thr Glu Leu Asp Gly 210 215 220 GTA CGG CTA CAC AGG TAC GCT CCG GCG TGC AAA CCT CTC CTA CGG GAT 719 Val Arg Leu His Arg Tyr Ala Pro Ala Cys Lys Pro Leu Leu Arg Asp 225 230 235 GAG GTC ACA TTC CAG GTC GGG CTC AAC CAA TTC CCG GTT GGG TCG CAG 767 Glu Val Thr Phe Gln Val Gly Leu Asn Gln Phe Pro Val Gly Ser Gln 240 245 250 255 CTC CCA TGC GAG CCC GAA CCG GAT GTA ATA GTG GTC ACC TCC ATG CTC 815 Leu Pro Cys Glu Pro Glu Pro Asp Val Met Val Val Thr Ser Met Leu 260 265 270 ACC 818 Thr
【０３１７】配列番号：79 配列の長さ：818 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：H22-8 配列 GG CAT GTG GGC CCA GGG GAG GGG GCT GTG CAG TGG ATG AAC CGG CTG 47 His Val Gly Pro Gly Glu Gly Ala Val Gln Trp Met Asn Arg Leu 1 5 10 15 ATA GCG TTC GCC TCG CGG GGT AAC CAC GTC TCC CCC ACG CAT TAT GTG 95 Ile Ala Phe Ala Ser Arg Gly Asn His Val Ser Pro Thr His Tyr Val 20 25 30 CCT GAG AGC GAC GCC GCG GCG CGT GTC ACC CAG ATC CTC TCC AGC CTC 143 Pro Glu Ser Asp Ala Ala Ala Arg Val Thr Gln Ile Leu Ser Ser Leu 35 40 45 ACC ATC ACT CAG CTG CTG AAG AGG CTC CAC CAG TGG ATT AAT GAG GAC 191 Thr Ile Thr Gln Leu Leu Lys Arg Leu His Gln Trp Ile Asn Glu Asp 50 55 60 TGC TCC ACG CCA TGT TCT GGT TCG TGG CTC AGG GAT GTT TGG GAC TGG 239 Cys Ser Thr Pro Cys Ser Gly Ser Trp Leu Arg Asp Val Trp Asp Trp 65 70 75 ATA TGC ACG GTG TTG AGT GAC TTC AAG ACC TGG CTC CAG TCC AAG CTC 287 Ile Cys Thr Val Leu Ser Asp Phe Lys Thr Trp Leu Gln Ser Lys Leu 80 85 90 95 CTG CCG CGG CTA CCG GGA GTC CCT TTC CTT TCA TGC CAA CGT GGG TAC 335 Leu Pro Arg Leu Pro Gly Val Pro Phe Leu Ser Cys Gln Arg Gly Tyr 100 105 110 AAG GGA GTC TGG CGG GGA GAT GGC ATC ATG CAA ACC ACC TGC CCA TGC 383 Lys Gly Val Trp Arg Gly Asp Gly Ile Met Gln Thr Thr Cys Pro Cys 115 120 125 GGA GCA CAA ATC GCC GGA CAT GTC AAA AAT GGT TCC ATG AGG ATC ACT 431 Gly Ala Gln Ile Ala Gly His Val Lys Asn Gly Ser Met Arg Ile Thr 130 135 140 GGC CCC AGA ACC TGT AGC AAC ACG TGG CAC GGA ACG TTC CCC ATC AAC 479 Gly Pro Arg Thr Cys Ser Asn Thr Trp His Gly Thr Phe Pro Ile Asn 145 150 155 GCG TAC ACC ACA GGC CCC TGC ACA CCC TCC CCA GCG CCG AAC TAT TCT 527 Ala Tyr Thr Thr Gly Pro Cys Thr Pro Ser Pro Ala Pro Asn Tyr Ser 160 165 170 175 AGG GCG TTG TGG CGG GTA GCT GCT GAG GAG TAT GTG GAG GTC ACG CGG 575 Arg Ala Leu Trp Arg Val Ala Ala Glu Glu Tyr Val Glu Val Thr Arg 180 185 190 GTG GGG GAT TTC CAC TAC GTG ACG GGC ATG ACC ACT GAC AAC TTG AAA 623 Val Gly Asp Phe His Tyr Val Thr Gly Met Thr Thr Asp Asn Leu Lys 195 200 205 TGC CCA TGC CAG GTC CCG GCC CCC GAA TTC TTC ACG GAG TTG GAT GGG 671 Cys Pro Cys Gln Val Pro Ala Pro Glu Phe Phe Thr Glu Leu Asp Gly 210 215 220 GTA CGG CTA CAC AGA TAC GCT CCG GCG TGC AAA CCT CTC CTA CGG GAT 719 Val Arg Leu His Arg Tyr Ala Pro Ala Cys Lys Pro Leu Leu Arg Asp 225 230 235 GAG GTC ACA TTC CAG GTC GGG CTC AAC CAA TTC CCG GTT GGG TCG CAG 767 Glu Val Thr Phe Gln Val Gly Leu Asn Gln Phe Pro Val Gly Ser Gln 240 245 250 255 CTC CCA TGC GAG CCC GAA CCG GAT GTA ACA GTG GTC ACC TCC ATG CTC 815 Leu Pro Cys Glu Pro Glu Pro Asp Val Thr Val Val Thr Ser Met Leu 260 265 270 ACC 818 Thr
【０３１８】配列番号：80 配列の長さ：818 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：H22-9 配列 GG CAT GTG GGC CCA GGG GAG GGG GCT GTG CAG TGG ATG AAC CGG CTG 47 His Val Gly Pro Gly Glu Gly Ala Val Gln Trp Met Asn Arg Leu 1 5 10 15 ATA GCG TTC GCT TCG CGG GGT AAC CAC GTC TCC CCC ACG CAT TAT GTG 95 Ile Ala Phe Ala Ser Arg Gly Asn His Val Ser Pro Thr His Tyr Val 20 25 30 CCT GAG AGC GAC GCC GCA GCG CGT GTC ACC CAG ATC CTC TCC AGC CTT 143 Pro Glu Ser Asp Ala Ala Ala Arg Val Thr Gln Ile Leu Ser Ser Leu 35 40 45 ACC ATC ACT CAG CTG TTG AAG AGG CTC CAC CAG TGG ATT AAT GAT GAC 191 Thr Ile Thr Gln Leu Leu Lys Arg Leu His Gln Trp Ile Asn Asp Asp 50 55 60 TGC TCC ACG CCA TGT TCT GGT TCG TGG CTC AGG GAT GTT TGG GAC TGG 239 Cys Ser Thr Pro Cys Ser Gly Ser Trp Leu Arg Asp Val Trp Asp Trp 65 70 75 ATA TGC ACG GTG TTG AGT GAC TTC AAG ACC TGG CTC CAG TCC AAG CTC 287 Ile Cys Thr Val Leu Ser Asp Phe Lys Thr Trp Leu Gln Ser Lys Leu 80 85 90 95 CTG CCG CGG CTA CCG GGA GTC CCT TTC CTC TCA TGC CAA CGT GGG TAC 335 Leu Pro Arg Leu Pro Gly Val Pro Phe Leu Ser Cys Gln Arg Gly Tyr 100 105 110 AAG GGA GTC TGG CGG GGA GAT GGC ATC ATG CAT ACC ACC TGC CCA TGC 383 Lys Gly Val Trp Arg Gly Asp Gly Ile Met His Thr Thr Cys Pro Cys 115 120 125 GGA GCA CAA ATC GCC GGA CAT GTC AAA AAT GGT TCC ATG AGG ATC ACT 431 Gly Ala Gln Ile Ala Gly His Val Lys Asn Gly Ser Met Arg Ile Thr 130 135 140 GGC CCC AGA ACC TGT AGC AAC ACG TGG CGC GGA ACG TTC CCC ATC AAC 479 Gly Pro Arg Thr Cys Ser Asn Thr Trp Arg Gly Thr Phe Pro Ile Asn 145 150 155 GCG TAC ACC ACA GGC CCC TGC ACA CCC TCC CCA GCG CCG AAC TAT TCT 527 Ala Tyr Thr Thr Gly Pro Cys Thr Pro Ser Pro Ala Pro Asn Tyr Ser 160 165 170 175 AAG GCG TTG TGG CGG GTA GCT GCT GAG GAG TAT GTG GAG GTC ACG CGG 575 Lys Ala Leu Trp Arg Val Ala Ala Glu Glu Tyr Val Glu Val Thr Arg 180 185 190 GTG GGG GAT TTC CAC TAC GTG ACG GGC ATG ACC ACT GAC AAC TTG AAA 623 Val Gly Asp Phe His Tyr Val Thr Gly Met Thr Thr Asp Asn Leu Lys 195 200 205 TGC CCA TGC CAG GTC CCG GCC CCC GAA TTT TTC ACG GAG TTG GAT GGG 671 Cys Pro Cys Gln Val Pro Ala Pro Glu Phe Phe Thr Glu Leu Asp Gly 210 215 220 GTA CGG CTA CAC AGG TAC GCT CCG GCG TGC AAA CCT CTC CTA CGG GAT 719 Val Arg Leu His Arg Tyr Ala Pro Ala Cys Lys Pro Leu Leu Arg Asp 225 230 235 GAG GTC ACA TTC CAG GTC GGG CTC AAC CAA TTC CCG GTT GGG TCG CAG 767 Glu Val Thr Phe Gln Val Gly Leu Asn Gln Phe Pro Val Gly Ser Gln 240 245 250 255 CTA CCA TGC GAG CCC GAA CCG GAT GTA GCA GTG GTC ACC TCC ATG CTC 815 Leu Pro Cys Glu Pro Glu Pro Asp Val Ala Val Val Thr Ser Met Leu 260 265 270 ACC 818 Thr
【０３１９】配列番号：81 配列の長さ：311 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N17-3 配列 TGT GAG CCC GAA CCG GAT GTA ACA GTG GTC ACC TCC ATG CTC ACC GAC 48 Cys Glu Pro Glu Pro Asp Val Thr Val Val Thr Ser Met Leu Thr Asp 1 5 10 15 CCC TCC CAC ATT ACA GCA GAG GCG GCT AGG CGT AGG CTG GCC AGA GGG 96 Pro Ser His Ile Thr Ala Glu Ala Ala Arg Arg Arg Leu Ala Arg Gly 20 25 30 TCT CCC CCT TCC TTG GCC AGT TCT TCA GCT AGT CAG TTG TCT GCG CTT 144 Ser Pro Pro Ser Leu Ala Ser Ser Ser Ala Ser Gln Leu Ser Ala Leu 35 40 45 TCT TTG AAG GCG ACA TGC ACT ACC CAT CAT GGC GCC CCA GAC ACT GAC 192 Ser Leu Lys Ala Thr Cys Thr Thr His His Gly Ala Pro Asp Thr Asp 50 55 60 CTC ATC GAG GCC AAC CTC CTG TGG CGG CAG GAG ATG GGC GGA AAC ATC 240 Leu Ile Glu Ala Asn Leu Leu Trp Arg Gln Glu Met Gly Gly Asn Ile 65 70 75 80 ACC CGC GTG GAG TCA GAG AAC AAG ATA GTA ATT CTA GAC TCT TTT GAA 288 Thr Arg Val Glu Ser Glu Asn Lys Ile Val Ile Leu Asp Ser Phe Glu 85 90 95 CCG CTT CGA GCG GAG GAG GAT G A 311 Pro Leu Arg Ala Glu Glu Asp 100
【０３２０】配列番号：82 配列の長さ：311 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N17-1 配列 TGT GAG CCC GAA CCG GAT GTA ACA GTG GTC ACC TCC ATG CTC ACC GAC 48 Cys Glu Pro Glu Pro Asp Val Thr Val Val Thr Ser Met Leu Thr Asp 1 5 10 15 CCC TCC CAC ATT ACA GCA GAG GCG GCT AGG CGT AGG CTG GCC AGA GGG 96 Pro Ser His Ile Thr Ala Glu Ala Ala Arg Arg Arg Leu Ala Arg Gly 20 25 30 TCT CCT CCT TCT TTG GCC AGC TCT TCA GCT AGC CAG TTG TCT GCG CCA 144 Ser Pro Pro Ser Leu Ala Ser Ser Ser Ala Ser Gln Leu Ser Ala Pro 35 40 45 TCT TTG AAG GCG ACA TGC ACT ACC CAT CAT GAC TCC CCA GAC GCT GAC 192 Ser Leu Lys Ala Thr Cys Thr Thr His His Asp Ser Pro Asp Ala Asp 50 55 60 CTC ATC GAG GCC AAC CTC CTG TGG CGG CAG GAG ATG GGC GGG AAC ATC 240 Leu Ile Glu Ala Asn Leu Leu Trp Arg Gln Glu Met Gly Gly Asn Ile 65 70 75 80 ACC CGC GTG GAG TCA GAG AAC AAG ATA GTG ATT CTA GAC TCT TCT GAA 288 Thr Arg Val Glu Ser Glu Asn Lys Ile Val Ile Leu Asp Ser Ser Glu 85 90 95 CCG CTT CGA GCG GAG GAG GAT G A 311 Pro Leu Arg Ala Glu Glu Asp 100
【０３２１】配列番号：83 配列の長さ：311 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N17-2 配列 TGT GAG CCC GAA CCG GAT GTA ACA GTG GTC ACC TCC ATG CTC ACC GAC 48 Cys Glu Pro Glu Pro Asp Val Thr Val Val Thr Ser Met Leu Thr Asp 1 5 10 15 CCC TCC CAC ATC ACA GCA GAG GCG GCT AGG CGT AGG CTG GCC AGA GGG 96 Pro Ser His Ile Thr Ala Glu Ala Ala Arg Arg Arg Leu Thr Arg Gly 20 25 30 TCT CCT CCT TCT TTG GCC AGC TCT TCA GCT AGT CAG TTG TCT GCG CCA 144 Ser Pro Pro Ser Leu Ala Ser Ser Ser Ala Ser Gln Leu Ser Ala Pro 35 40 45 TCT TTG AAG GCG ACA TGC ACT ACC CAT CAT GAC TCC CCA GAC GCT GAC 192 Ser Leu Lys Ala Thr Cys Thr Thr His His Asp Ser Pro Asp Ala Asp 50 55 60 CTC ATC GAG GCC AAC CTC CTG TGG CGG CAG GAG ATG GGC GGG AAC ATC 240 Leu Ile Glu Ala Asn Leu Leu Trp Arg Gln Glu Met Gly Gly Asn Ile 65 70 75 80 ACC CGC GTG GAG TCA GAG AAC AAG ATA GTA ATT CTA GAC TCT TTT GAA 288 Thr Arg Val Glu Ser Glu Asn Lys Ile Val Ile Leu Asp Ser Phe Glu 85 90 95 CCG CTT CGA GCG GAG GAG GAT G A 311 Pro Leu Arg Ala Glu Glu Asp 100
【０３２２】配列番号：84 配列の長さ：311 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：H17-1 配列 TGT GAG CCC GAA CCG GAT GTA ACA GTG CTC ACT TCC ATG CTC ACC GAC 48 Cys Glu Pro Glu Pro Asp Val Thr Val Leu Thr Ser Met Leu Thr Asp 1 5 10 15 CCC TCC CAC ATT ACA GCA GAG ACG GCT AAG CGT AGG CTG GCC AGA GGG 96 Pro Ser His Ile Thr Ala Glu Thr Ala Lys Arg Arg Leu Ala Arg Gly 20 25 30 TCT CCC CCT CCC TTG GCC AGC TCT TCA GCT AGT CAG TTG TCT GCG CCC 144 Ser Pro Pro Pro Leu Ala Ser Ser Ser Ala Ser Gln Leu Ser Ala Pro 35 40 45 TCC CTG AAG GCG ACA TGC ACT ACC CAT CAT GAC TCC CCG GAC GCT GAC 192 Ser Leu Lys Ala Thr Cys Thr Thr His His Asp Ser Pro Asp Ala Asp 50 55 60 CTC ATC GAG GCC AAC CTC CTG TGG CGG CAG GAG ATG GGA GGG AAC ATC 240 Leu Ile Glu Ala Asn Leu Leu Trp Arg Gln Glu Met Gly Gly Asn Ile 65 70 75 80 ACC CGT GTG GAG TCA GAG AAC AAG GTA GTA ATT CTG GAC TCT TTC GAC 288 Thr Arg Val Glu Ser Glu Asn Lys Val Val Ile Leu Asp Ser Phe Asp 85 90 95 CCG CTT CGA GCG GAG GAG GAT G A 311 Pro Leu Arg Ala Glu Glu Asp 100
【０３２３】配列番号：85 配列の長さ：311 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：H17-3 配列 TGT GAG CCC GAA CCG GAT GTA ACA GTG GTC ACT TCC ATG CTC ACC GAC 48 Cys Glu Pro Glu Pro Asp Val Thr Val Val Thr Ser Met Leu Thr Asp 1 5 10 15 CCC TCC CAC ATT ACA GCA GAG GCG GCT GGG CGT AGG CTG GCC AGA GGG 96 Pro Ser His Ile Thr Ala Glu Ala Ala Gly Arg Arg Leu Ala Arg Gly 20 25 30 TCT CCC CCT TCC TTG GCC AGC TCT TCA GCT AGT CAG TTG TCT GCG CCC 144 Ser Pro Pro Ser Leu Ala Ser Ser Ser Ala Ser Gln Leu Ser Ala Pro 35 40 45 TCT CTG AAG GCG ACA TGC ACT ACC CAT CAT GAC TCC CCG GAC GCT GAC 192 Ser Leu Lys Ala Thr Cys Thr Thr His His Asp Ser Pro Asp Ala Asp 50 55 60 CTC ATC GAG GCC AAC CTC CTA TGG CGG CAG GAG ATG GGA GGG AAC ATC 240 Leu Ile Glu Ala Asn Leu Leu Trp Arg Gln Glu Met Gly Gly Asn Ile 65 70 75 80 ACC CGC GTG GAG TCA GAG AGC AAG GTA GTA ATT CTG GAC TCT TTC GAC 288 Thr Arg Val Glu Ser Glu Ser Lys Val Val Ile Leu Asp Ser Phe Asp 85 90 95 CCG CTT CGA GCG GAG GAG GAT G A 311 Pro Leu Arg Ala Glu Glu Asp 100
【０３２４】配列番号：86 配列の長さ：740 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：O28-1 配列 GTG GTA GTC CTG GAC TCG TTG GAG CCG CTT CAA GCG AAG GAA GGT GAG 48 Val Val Val Leu Asp Ser Leu Glu Pro Leu Gln Ala Lys Glu Gly Glu 1 5 10 15 AGG GAA GTG TCC GTT GCG GCG GAG ATC CTG CGG AAG ACC AGG AAA TTC 96 Arg Glu Val Ser Val Ala Ala Glu Ile Leu Arg Lys Thr Arg Lys Phe 20 25 30 CCC GCA GCG ATG CCC GTA TGG GCA CGC CCG GAC TAC AAC CCA CCA TTA 144 Pro Ala Ala Met Pro Val Trp Ala Arg Pro Asp Tyr Asn Pro Pro Leu 35 40 45 CTA GAG TCT TGG AAG AAC CCG GAC TAC GTC CCT CCA GTG GTA CAC GGG 192 Leu Glu Ser Trp Lys Asn Pro Asp Tyr Val Pro Pro Val Val His Gly 50 55 60 TGC CCA TTG CCG CCT ACC AAG GCC CCT CCA ATA CCA CCT CCA CGG AGA 240 Cys Pro Leu Pro Pro Thr Lys Ala Pro Pro Ile Pro Pro Pro Arg Arg 65 70 75 80 AAG AGA ACG GTT GTC CTG ACA GAA TCC ACC GTG TCC TCT GCC TTG GCG 288 Lys Arg Thr Val Val Leu Thr Glu Ser Thr Val Ser Ser Ala Leu Ala 85 90 95 GAG CTT GCT ACA AAG ACC TTT GGC AGT TCC GGA TCG TCG GCC GTC GAC 336 Glu Leu Ala Thr Lys Thr Phe Gly Ser Ser Gly Ser Ser Ala Val Asp 100 105 110 AGC GGC ACG GCG ACC GGC CCT CCT GAC CAG GCC TCC GCC GAA GGA GAT 384 Ser Gly Thr Ala Thr Gly Pro Pro Asp Gln Ala Ser Ala Glu Gly Asp 115 120 125 GCA GGA TCC GAC GCT GAG TCG TAC TCC TCC ATG CCC CCC CTT GAG GGA 432 Ala Gly Ser Asp Ala Glu Ser Tyr Ser Ser Met Pro Pro Leu Glu Gly 130 135 140 GAG CCG GGG GAC CCC GAT CTC AAC GAC GGG TCT TGG TCT ACC GTA AGC 480 Glu Pro Gly Asp Pro Asp Leu Asn Asp Gly Ser Trp Ser Thr Val Ser 145 150 155 160 GAG GAG GCC AGC GAG GAC GTC GTC TGC TGC TCG ATG TCC TAC ACA TGG 528 Glu Glu Ala Ser Glu Asp Val Val Cys Cys Ser Met Ser Tyr Thr Trp 165 170 175 ACA GGC GCC TTA ATT ACA CCA TGC GCC GCG GAG GAG AGC AAG CTG CCC 576 Thr Gly Ala Leu Ile Thr Pro Cys Ala Ala Glu Glu Ser Lys Leu Pro 180 185 190 ATT AAT GCG CTG AGC AAC CCT TTG CTG CGC CAC CAC AAC ATG GTC TAT 624 Ile Asn Ala Leu Ser Asn Pro Leu Leu Arg His His Asn Met Val Tyr 195 200 205 GCC ACA ACA TCC CGC AGC GCA AGC CAG CGG CAG AAA AAG GTC ACA TTT 672 Ala Thr Thr Ser Arg Ser Ala Ser Gln Arg Gln Lys Lys Val Thr Phe 210 215 220 GAC AGA CTG CAA GTC CTG GAT GAC CAC TAC CGG GAC GTG CTG AAG GAC 720 Asp Arg Leu Gln Val Leu Asp Asp His Tyr Arg Asp Val Leu Lys Asp 225 230 235 240 ATG AAG GCC AAG GCG TCC AC 740 Met Lys Ala Lys Ala Ser 245
【０３２５】配列番号：87 配列の長さ：740 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：O28-2 配列 GTG GTA GTC CTG GAC TCG TTG GAC CCG CTT CGA GCG GAG GAA GAT GAG 48 Val Val Val Leu Asp Ser Leu Asp Pro Leu Arg Ala Glu Glu Asp Glu 1 5 10 15 AGG GAA GTG TCC GTT GCG GCG GAG ATC CTG CGA AAG ACC AAG AAA TTC 96 Arg Glu Val Ser Val Ala Ala Glu Ile Leu Arg Lys Thr Lys Lys Phe 20 25 30 CCC GCA GCG ATG CCC GTA TGG GCA CGC CCG GAC TAC AAC CCA CCA TTA 144 Pro Ala Ala Met Pro Val Trp Ala Arg Pro Asp Tyr Asn Pro Pro Leu 35 40 45 CTA GAG TCT TGG AAG AAC CCG GAC TAC GTC CCT CCG GTG GTA CAC GGG 192 Leu Glu Ser Trp Lys Asn Pro Asp Tyr Val Pro Pro Val Val His Gly 50 55 60 TGC CCA TTG CCG CCT ACC AAG GCC CCT CCA ATA CCA CCT CCA CGG AGA 240 Cys Pro Leu Pro Pro Thr Lys Ala Pro Pro Ile Pro Pro Pro Arg Arg 65 70 75 80 AAG AGG ACG GTT GCC CTG ACA GAA TCC ACC GTG TCC TCT GCC TTG GCG 288 Lys Arg Thr Val Ala Leu Thr Glu Ser Thr Val Ser Ser Ala Leu Ala 85 90 95 GAG CTT GCT ACA AAG ACC TTT GGC AGT TCC GGA TCG TCG GCC GTC GAC 336 Glu Leu Ala Thr Lys Thr Phe Gly Ser Ser Gly Ser Ser Ala Val Asp 100 105 110 AGC GGC ACG GCG ACT GGC CCT CCT GAC CAG GCC TCC GCC GAA GGA GAT 384 Ser Gly Thr Ala Thr Gly Pro Pro Asp Gln Ala Ser Ala Glu Gly Asp 115 120 125 GCA GGA TCC GAC GCT GAG TCG TAC TCC TCC ATG CCC CCC CTT GAG GGA 432 Ala Gly Ser Asp Ala Glu Ser Tyr Ser Ser Met Pro Pro Leu Glu Gly 130 135 140 GAG CCG GGG GAC CCT GAT CTC AAC GAC GGG TCT TGG TCT ACT GTA AGC 480 Glu Pro Gly Asp Pro Asp Leu Asn Asp Gly Ser Trp Ser Thr Val Ser 145 150 155 160 GAG GAG GCC GGC GAG GAC GTC GTC TGC TGC TCG ATG TCC TAC ACA TGG 528 Glu Glu Ala Gly Glu Asp Val Val Cys Cys Ser Met Ser Tyr Thr Trp 165 170 175 ACA GGC GCC TTA ATT ACA CCA TGC GCC GCG GAG GAG AGC AAG CTG CCC 576 Thr Gly Ala Leu Ile Thr Pro Cys Ala Ala Glu Glu Ser Lys Leu Pro 180 185 190 ATT AAT GCG CTG AGC AAC TCT TTG CTG CGC CAC CAC AAC ATG GTC TAT 624 Ile Asn Ala Leu Ser Asn Ser Leu Leu Arg His His Asn Met Val Tyr 195 200 205 GCC ACA ACA TCC CGC AGC GCA AGC CAG CGG CAG AAA AAG GTC ACA TTT 672 Ala Thr Thr Ser Arg Ser Ala Ser Gln Arg Gln Lys Lys Val Thr Phe 210 215 220 GAC AGA CTG CAA GTC CTG GAT GAC CAC TAC CGG GAC GTG CTG AAG GAC 720 Asp Arg Leu Gln Val Leu Asp Asp His Tyr Arg Asp Val Leu Lys Asp 225 230 235 240 ATG AAG GCC AAG GCG TCC AC 740 Met Lys Ala Lys Ala Ser 245
【０３２６】配列番号：88 配列の長さ：740 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：O28-4 配列 GTG GTA GTC CTG GAC TCG TTG GAC CCG CTT CGA GCG GAG GAA GAT GAG 48 Val Val Val Leu Asp Ser Leu Asp Pro Leu Arg Ala Glu Glu Asp Glu 1 5 10 15 AGG GAA GTG TCC GTT GCG GCG GAG ATC CTG CGA AAG ACC AAG AAA TTC 96 Arg Glu Val Ser Val Ala Ala Glu Ile Leu Arg Lys Thr Lys Lys Phe 20 25 30 CCC GCA GCG ATG CCC GTA TGG GCA CGC CCG GAC TAC AAC CCA CCA TTA 144 Pro Ala Ala Met Pro Val Trp Ala Arg Pro Asp Tyr Asn Pro Pro Leu 35 40 45 CTA GAG TCT TGG AAG AAC CCG GAC TAC GTC CCT CCG GTG GTA CAC GGG 192 Leu Glu Ser Trp Lys Asn Pro Asp Tyr Val Pro Pro Val Val His Gly 50 55 60 TGC CCA TTG CCG CCT ATC AAG GCC CCT CCA ATA CCA CCT CCA CGG AGA 240 Cys Pro Leu Pro Pro Ile Lys Ala Pro Pro Ile Pro Pro Pro Arg Arg 65 70 75 80 AAG AGG ACG GTT GTC CTG ACA GAA TCC ACC GTG TCC TCT GCC TTG GCG 288 Lys Arg Thr Val Val Leu Thr Glu Ser Thr Val Ser Ser Ala Leu Ala 85 90 95 GAG CTT GCT ACA AAG ACC TTT GGC AGT TCC GGA TCG TCG GCC GTC GAC 336 Glu Leu Ala Thr Lys Thr Phe Gly Ser Ser Gly Ser Ser Ala Val Asp 100 105 110 AGC GGC ACG GCG ACC GGC CCT CCT GAC CAG GCC TCC GCC GAA GGA GAT 384 Ser Gly Thr Ala Thr Gly Pro Pro Asp Gln Ala Ser Ala Glu Gly Asp 115 120 125 GCA GGA TCC GAC GCT GAG TCG TAC TCC TCC ATG CCC CCC CTT GAG GGA 432 Ala Gly Ser Asp Ala Glu Ser Tyr Ser Ser Met Pro Pro Leu Glu Gly 130 135 140 GAG CCG GGG GAC CCT GAT CTC AAC GAC GGG TCT TGG TCT ACT GTA AGC 480 Glu Pro Gly Asp Pro Asp Leu Asn Asp Gly Ser Trp Ser Thr Val Ser 145 150 155 160 GAG GAG GCC GGC GAG GAC GTC GTC TGC TGC TCG ATG TCC TAC ACA TGG 528 Glu Glu Ala Gly Glu Asp Val Val Cys Cys Ser Met Ser Tyr Thr Trp 165 170 175 ACA GGC GCC TTA ATT ACA CCA TGC ACC GCG GAG GAG AGC AAG CTG CCC 576 Thr Gly Ala Leu Ile Thr Pro Cys Thr Ala Glu Glu Ser Lys Leu Pro 180 185 190 ATT AAT GCG CTG AGC AAC TCT TTG CTG CGT CAC CAC AAC ATG GTC TAT 624 Ile Asn Ala Leu Ser Asn Ser Leu Leu Arg His His Asn Met Val Tyr 195 200 205 GCC ACA ACA TCC CGC AGC GCA AGC CAG CGG CAG AAA AAG GTC ACA TTT 672 Ala Thr Thr Ser Arg Ser Ala Ser Gln Arg Gln Lys Lys Val Thr Phe 210 215 220 GAC AGA CTG CAA GTC CTG GAT GAC CAC TAC CGG GAC GTG CTG AAG GAC 720 Asp Arg Leu Gln Val Leu Asp Asp His Tyr Arg Asp Val Leu Lys Asp 225 230 235 240 ATG AAG GCC AAG GCG TCC AC 740 Met Lys Ala Lys Ala Ser 245
【０３２７】配列番号：89 配列の長さ：515 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N29-1 配列 AC TAC CGG GAC GTG CTG AAG GAG ATG AAG GCG AAG GCG TCC ACA GTT 47 Tyr Arg Asp Val Leu Lys Glu Met Lys Ala Lys Ala Ser Thr Val 1 5 10 15 AAG GCT AAA CTT CTA TCT GTA GAG GAA GCC TGC AAG CTG ACG CCC CCA 95 Lys Ala Lys Leu Leu Ser Val Glu Glu Ala Cys Lys Leu Thr Pro Pro 20 25 30 CAC TCG GCC AGA TCT AAA TTT GGC TAC GGG GCA AAG GAC GTC CGG AGC 143 His Ser Ala Arg Ser Lys Phe Gly Tyr Gly Ala Lys Asp Val Arg Ser 35 40 45 CTG TCC AGC AAG GCC GTT AAC CAC ATC CGC TCC GTG TGG AAG GAC TTG 191 Leu Ser Ser Lys Ala Val Asn His Ile Arg Ser Val Trp Lys Asp Leu 50 55 60 CTG GAA GAC ACT GAG ACA CCA ATT GAC ACC ACC ATC ATG GCA AAA AAT 239 Leu Glu Asp Thr Glu Thr Pro Ile Asp Thr Thr Ile Met Ala Lys Asn 65 70 75 GAG GTT TTC TGT GTT CAA CCA GAG AAA GGA GGC CGC AAG CCA GCT CGC 287 Glu Val Phe Cys Val Gln Pro Glu Lys Gly Gly Arg Lys Pro Ala Arg 80 85 90 95 CTT ATC GTA TTC CCA GAC TTG GGG GTT CGT GTG TGC GAG AAA ATG GCC 335 Leu Ile Val Phe Pro Asp Leu Gly Val Arg Val Cys Glu Lys Met Ala 100 105 110 CTC TAC GAC GTG GTC TCC ACT CTT CCT CAG GCC GTG ATG GGC TCC TCA 383 Leu Tyr Asp Val Val Ser Thr Leu Pro Gln Ala Val Met Gly Ser Ser 115 120 125 TAC GGA TTC CAG TAC TCC CCT GGA CAG CGG GTC GAG TTC CTG GTG AAT 431 Tyr Gly Phe Gln Tyr Ser Pro Gly Gln Arg Val Glu Phe Leu Val Asn 130 135 140 GCC TGG AAG TCA AAG AAG AGC CCT ATG GGC TTT GCA TAT GAC ACC CGC 479 Ala Trp Lys Ser Lys Lys Ser Pro Met Gly Phe Ala Tyr Asp Thr Arg 145 150 155 TGT TTT GAC TCA ACG GTC ACC GAG AAC GAC ATC CGT 515 Cys Phe Asp Ser Thr Val Thr Glu Asn Asp Ile Arg 160 165 170
【０３２８】配列番号：90 配列の長さ：515 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N29-2 配列 AC TAC CGG GAC GTG CTG AAG GAG ATG AAG GCG AAG GCG TCC ACA GTT 47 Tyr Arg Asp Val Leu Lys Glu Met Lys Ala Lys Ala Ser Thr Val 1 5 10 15 AAG GCT AAA CTT CTA TCT GTA GAG GAA GCC TGT AAG CTG ACG CCC CCA 95 Lys Ala Lys Leu Leu Ser Val Glu Glu Ala Cys Lys Leu Thr Pro Pro 20 25 30 CAC TCG GCC AGA TCT AAA TTT GGC TAC GGG GCA AAG GAC GTC CGG AGC 143 His Ser Ala Arg Ser Lys Phe Gly Tyr Gly Ala Lys Asp Val Arg Ser 35 40 45 CTG TCC AGC AAG GCC GTT AAC CAC ATC CGC TCC GTG TGG AAG GAC TTG 191 Leu Ser Ser Lys Ala Val Asn His Ile Arg Ser Val Trp Lys Asp Leu 50 55 60 CTG GAA GAC ACT GAG ACA CCA ATT GAC ACC ACC ATC ATG GCA AAA AAT 239 Leu Glu Asp Thr Glu Thr Pro Ile Asp Thr Thr Ile Met Ala Lys Asn 65 70 75 GAG GTT TTC TGT GTT CAA CCA GAG AAA GGA GGC CGC AAG CCA GCT CGC 287 Glu Val Phe Cys Val Gln Pro Glu Lys Gly Gly Arg Lys Pro Ala Arg 80 85 90 95 CTT ATC GTA TTC CCA GAC TTG GGG GTT CGT GTG TGC GAG AAA ATG GCC 335 Leu Ile Val Phe Pro Asp Leu Gly Val Arg Val Cys Glu Lys Met Ala 100 105 110 CTC TAC GAC GTG GTC TCC ACT CTT CCT CAG GCC GTG ATG GGC TCC TCA 383 Leu Tyr Asp Val Val Ser Thr Leu Pro Gln Ala Val Met Gly Ser Ser 115 120 125 TAC GGA TTC CAG TAC TCC CCT GGA CAG CGG GTC GAG TTC CTG GTG AAT 431 Tyr Gly Phe Gln Tyr Ser Pro Gly Gln Arg Val Glu Phe Leu Val Asn 130 135 140 GCC TGG AAG TCA AAG AAG AGT CCT ATG GGC TTT GCA TAT GAC ACC CGC 479 Ala Trp Lys Ser Lys Lys Ser Pro Met Gly Phe Ala Tyr Asp Thr Arg 145 150 155 TGT TTT GAC TCA ACG GTC ACC GAG AAC GAC ATC CGT 515 Cys Phe Asp Ser Thr Val Thr Glu Asn Asp Ile Arg 160 165 170
【０３２９】配列番号：91 配列の長さ：503 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N29-3 配列 AC TAC CGG GAC GTG CTG AAG GAG ATG AAG GCG AAG GCG TCC ACA GTT 47 Tyr Arg Asp Val Leu Lys Glu Met Lys Ala Lys Ala Ser Thr Val 1 5 10 15 AAG GCT AAA CTT CTA TCT GTA GAG GAA GCC TGT AAG CTG ACG CCC CCA 95 Lys Ala Lys Leu Leu Ser Val Glu Glu Ala Cys Lys Leu Thr Pro Pro 20 25 30 CAC TCG GCC AGA TCT AAG TTT GGC TAC GGG GCA AAG GAC GTC CGG AGC 143 His Ser Ala Arg Ser Lys Phe Gly Tyr Gly Ala Lys Asp Val Arg Ser 35 40 45 CTG TCC AGC AAG GCC GTT AAC CAC ATC CGC TCC GTG TGG AGG GAC TTG 191 Leu Ser Ser Lys Ala Val Asn His Ile Arg Ser Val Trp Glu Asp Leu 50 55 60 CTG GAA GAC ACT GAA ACA CCA ATT GAC ACC ACC ATC ATG GCA AAA AAT 239 Leu Glu Asp Thr Glu Thr Pro Ile Asp Thr Thr Ile Met Ala Lys Asn 65 70 75 GAG GTT TTC TGT GTT CAA CCA GAG AAA GGA GGC CGC AAG CCA GCT CGC 287 Glu Val Phe Cys Val Gln Pro Glu Lys Gly Gly Arg Lys Pro Ala Arg 80 85 90 95 CTT ATC GTA TTC CCA GAC TTG GGG GTT CGT GTG TGC GAG AAA ATG GCC 335 Leu Ile Val Phe Pro Asp Leu Gly Val Arg Val Cys Glu Lys Met Ala 100 105 110 CTC TAC GAC GTG GTC TCC ACT CTT CCT CAG GCC GTG ATG GGC TCC TCA 383 Leu Tyr Asp Val Val Ser Thr Leu Pro Gln Ala Val Met Gly Ser Ser 115 120 125 TAC GGA TTC CAG TAC TCC CCT GGA CAG CGG GTC GAG TTC CTG GTG AAT 431 Tyr Gly Phe Gln Tyr Ser Pro Gly Gln Arg Val Glu Phe Leu Val Asn 130 135 140 GCC TGG AAG TCA AAG AAG AGT CCT ATG GGC TTT TCA TAT GAC ACC CGC 479 Ala Trp Lys Ser Lys Lys Ser Pro Met Gly Phe Ser Tyr Asp Thr Arg 145 150 155 TGT TTT GAC TCA ACG GTC ACC GAG 503 Cys Phe Asp Ser Thr Val Thr Glu 160 165
【０３３０】配列番号：92 配列の長さ：401 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N18-4 配列 TG GGG ATC CCG TAT GAT ACC CGC TGC TTT GAC TCA ACG GTC ACT GAG 47 Gly Ile Pro Tyr Asp Thr Arg Cys Phe Asp Ser Thr Val Thr Glu 1 5 10 15 AAT GAC ATC CGT ACT GAG GAG TCA ATT TAT CAA TGT TGT GAC TTG GAC 95 Asn Asp Ile Arg Thr Glu Glu Ser Ile Tyr Gln Cys Cys Asp Leu Asp 20 25 30 CCC GAG GCC AGA CAG GCC ATA AGG TCG CTC ACA GAG CGG CTT TAT ATC 143 Pro Glu Ala Arg Gln Ala Ile Arg Ser Leu Thr Glu Arg Leu Tyr Ile 35 40 45 GGG GGC CCC TTG ACC AAT TCA AAA GGG CAA AAC TGC GGC TAT CGC CGG 191 Gly Gly Pro Leu Thr Asn Ser Lys Gly Gln Asn Cys Gly Tyr Arg Arg 50 55 60 TGC CGC GCC AGC GGC GTG CTG ACG ACT AGC TGC GGT AAT ACC CTC ACA 239 Cys Arg Ala Ser Gly Val Leu Thr Thr Ser Cys Gly Asn Thr Leu Thr 65 70 75 TGT TAC TTG AAG GCC TCT GCA GCC TGT CGA GCT GCG AAG CTC CAG GAC 287 Cys Tyr Leu Lys Ala Ser Ala Ala Cys Arg Ala Ala Lys Leu Gln Asp 80 85 90 95 TGC ACG ATG CTC GTG TGC GGA GAC GAC CTT GTC GTT ATC TGT GAA AGC 335 Cys Thr Met Leu Val Cys Gly Asp Asp Leu Val Val Ile Cys Glu Ser 100 105 110 GCG GGA ACC CAG GAG GAC GCG GCA AAC CTA CGA GTC TTC ACG GAG GCT 383 Ala Gly Thr Gln Glu Asp Ala Ala Asn Leu Arg Val Phe Thr Glu Ala 115 120 125 ATG ACC AGG AAT TCC GCC 401 Met Thr Arg Asn Ser Ala 130
【０３３１】配列番号：93 配列の長さ：401 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N18-2 配列 TG GGG ATC CCG TAT GAT ACC CGC TGC TTT GAC TCA ACA GTC ACT GAG 47 Gly Ile Pro Tyr Asp Thr Arg Cys Phe Asp Ser Thr Val Thr Glu 1 5 10 15 AAC GAC ATC CGT ATT GAG GAG TCA ATT TAT CAA TGC TGT GAC TTG GTC 95 Asn Asp Ile Arg Ile Glu Glu Ser Ile Tyr Gln Cys Cys Asp Leu Val 20 25 30 CCC GAG GCC AGA CAG GCC ATA AGG TCG CTC ACA GAG CGG CTT TAT ATC 143 Pro Glu Ala Arg Gln Ala Ile Arg Ser Leu Thr Glu Arg Leu Tyr Ile 35 40 45 GGG GGC CCC TTG ACC AAT TCA AAA GGG CAA AAC TGC GGC TAT CGC CGG 191 Gly Gly Pro Leu Thr Asn Ser Lys Gly Gln Asn Cys Gly Tyr Arg Arg 50 55 60 TGC CGC GCC AGC GGC GTG CTG ACG ACT AGC TGC GGT AAT ACC CTC ACA 239 Cys Arg Ala Ser Gly Val Leu Thr Thr Ser Cys Gly Asn Thr Leu Thr 65 70 75 TGT TAC TTG AAG GCC TCT GCA GCC TGT CGA GCT GCG AAG CTC CGG GAC 287 Cys Tyr Leu Lys Ala Ser Ala Ala Cys Arg Ala Ala Lys Leu Arg Asp 80 85 90 95 TGC ACG ATG CTC GTG TGC GGA GAC GAC CTT GTC GTT ATC TGT GAA AGC 335 Cys Thr Met Leu Val Cys Gly Asp Asp Leu Val Val Ile Cys Glu Ser 100 105 110 GCG GGG ACC CAG GAG GAC GCG GCA AGC CTA CGA GTC TTC ACG GAG GCT 383 Ala Gly Thr Gln Glu Asp Ala Ala Ser Leu Arg Val Phe Thr Glu Ala 115 120 125 ATG ACC AGG AAT TCC GCC 401 Met Thr Arg Asn Ser Ala 130
【０３３２】配列番号：94 配列の長さ：401 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：N18-3 配列 TG GGG ATC CCG TAT GAT ACC CGC TGC TTT GAC TCA ACG GTC ACT GAG 47 Gly Ile Pro Tyr Asp Thr Arg Cys Phe Asp Ser Thr Val Thr Glu 1 5 10 15 AAT GAC ATC CGT ACT GAG GAG TCA ATT TAT CAA TGT TGT GAC TTG GAC 95 Asn Asp Ile Arg Thr Glu Glu Ser Ile Tyr Gln Cys Cys Asp Leu Asp 20 25 30 CCC GAG GCC AGA CAG GCC ATA AGG TCG CTC ACA GAG CGG CTT TAT ATC 143 Pro Glu Ala Arg Gln Ala Ile Arg Ser Leu Thr Glu Arg Leu Tyr Ile 35 40 45 GGG GGC CCC TTG ACC AAT TCA AAA GGG CAG AAC TGC GGT TAT CGC CGG 191 Gly Gly Pro Leu Thr Asn Ser Lys Gly Gln Asn Cys Gly Tyr Arg Arg 50 55 60 TGC CGC GCC AGC GGC GTG CTG ACG ACT AGC TGC GGT AAT ACC CTT ACA 239 Cys Arg Ala Ser Gly Val Leu Thr Thr Ser Cys Gly Asn Thr Leu Thr 65 70 75 TGT TAC TTG AAG GCC TCT GCA GCC TGT CGA GCT GCG AAG CTC CAG GAC 287 Cys Tyr Leu Lys Ala Ser Ala Ala Cys Arg Ala Ala Lys Leu Gln Asp 80 85 90 95 TGC ACG ATG CTC GTG TGC GGA GAC GAC CTT GTC GTT ATC TGT GAA AGC 335 Cys Thr Met Leu Val Cys Gly Asp Asp Leu Val Val Ile Cys Glu Ser 100 105 110 GCG GGA ACC CAG GAG GAC GCG GCA AAC CTA CGA GTC TTC ACG GAG GCT 383 Ala Gly Thr Gln Glu Asp Ala Ala Asn Leu Arg Val Phe Thr Glu Ala 115 120 125 ATG ACC AGG AAT TCC GCC 401 Met Thr Arg Asn Ser Ala 130
【０３３３】配列番号：95 配列の長さ：401 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：H18-1 配列 TG GGG ATC CCG TAT GAT ACC CGC TGC TTT GAC TCA ACA GTC ACT GAG 47 Gly Ile Pro Tyr Asp Thr Arg Cys Phe Asp Ser Thr Val Thr Glu 1 5 10 15 AGT GAT ATC CGT GTT GAG GAG TCA ATC TAC CAA TGT TGT GAC TTG GCC 95 Ser Asp Ile Arg Val Glu Glu Ser Ile Tyr Gln Cys Cys Asp Leu Ala 20 25 30 CCC GAG GCC AGA CAG GCC ATA AGG TCG CTC ACA GAG CGG CTT TAT ATC 143 Pro Glu Ala Arg Gln Ala Ile Arg Ser Leu Thr Glu Arg Leu Tyr Ile 35 40 45 GGG GGC CCC CTG ACT AAT TCA AAA GGG CAG AAC TGC GGT TAT CGC CGG 191 Gly Gly Pro Leu Thr Asn Ser Lys Gly Gln Asn Cys Gly Tyr Arg Arg 50 55 60 TGC CGC GTC AGC GGC GTG CTG ACG ACC AGC TGC GGT AAT ACT CTT ACA 239 Cys Arg Val Ser Gly Val Leu Thr Thr Ser Cys Gly Asn Thr Leu Thr 65 70 75 TGT TAC TTG AAG GCC TCT GCA GCC TGT CGA GCT GCA AAG CTC CAG GAC 287 Cys Tyr Leu Lys Ala Ser Ala Ala Cys Arg Ala Ala Lys Leu Gln Asp 80 85 90 95 TGC ACA ATG CTC GTG TGC GGG GAC GAC CTT GTC GTC ATC TGT GAG AGC 335 Cys Thr Met Leu Val Cys Gly Asp Asp Leu Val Val Ile Cys Glu Ser 100 105 110 GCG GGA ACC CAG GAG GAC GCG GCG AAC CTA CGA GTC TTC ACG GAG GCT 383 Ala Gly Thr Gln Glu Asp Ala Ala Asn Leu Arg Val Phe Thr Glu Ala 115 120 125 ATG ACC AGG AAT TCC GCC 401 Met Thr Arg Asn Ser Ala 130
【０３３４】配列番号：96 配列の長さ：401 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：H18-2 配列 TG GGG ATC CCG TAT GAT ACC CGC TGC TTT GAC TCA ACA GTC ACT GAG 47 Gly Ile Pro Tyr Asp Thr Arg Cys Phe Asp Ser Thr Val Thr Glu 1 5 10 15 AGT GAT ATC CGT GTT GAG GAG TCA ATC TAC CAA TGT TGT GAC TTG GCC 95 Ser Asp Ile Arg Val Glu Glu Ser Ile Tyr Gln Cys Cys Asp Leu Ala 20 25 30 CCC GAG GCC AGA CAG GCC ATA AGG TCG CTC ACA GAG CGG CTT TAT ATC 143 Pro Glu Ala Arg Gln Ala Ile Arg Ser Leu Thr Glu Arg Leu Tyr Ile 35 40 45 GGG GGC CCC CTG ACT AAT TCA AAG GGG CAG AAC TGC GGT TAT CGC CGG 191 Gly Gly Pro Leu Thr Asn Ser Lys Gly Gln Asn Cys Gly Tyr Arg Arg 50 55 60 TGC CGC GTC AGC GGC GTG CTG ACG ACC AGC TGC GGT AAT ACC CTT ACA 239 Cys Arg Val Ser Gly Val Leu Thr Thr Ser Cys Gly Asn Thr Leu Thr 65 70 75 TGT TAC TTG AAG GCC TCT GCA GCC TGT CGA GCT GCA AAG CTC CAG GAC 287 Cys Tyr Leu Lys Ala Ser Ala Ala Cys Arg Ala Ala Lys Leu Gln Asp 80 85 90 95 TGC ACA ATG CTC GTG TGC GGG GAC GAC CTT GTC GTC ATC TGT GAA AGC 335 Cys Thr Met Leu Val Cys Gly Asp Asp Leu Val Val Ile Cys Glu Ser 100 105 110 GCG GGA ACC CAG GAG GAC GCG GCG AAC CTA CGA GTC TTC ACG GAG GCT 383 Ala Gly Thr Gln Glu Asp Ala Ala Asn Leu Arg Val Phe Thr Glu Ala 115 120 125 ATG ACC AGG AAT TCC GCC 401 Met Thr Arg Asn Ser Ala 130
【０３３５】配列番号：97 配列の長さ：401 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：H18-3 配列 TG GGG ATC CCG TAT GAT ACC CGC TGC TTT GAC TCA ACA GTC ACC GAG 47 Gly Ile Pro Tyr Asp Thr Arg Cys Phe Asp Ser Thr Val Thr Glu 1 5 10 15 AGT GAT ATC CGT GTT GAG GAG TCA ATC TAC CAA TGT TGT GAC TTG GCC 95 Ser Asp Ile Arg Val Glu Glu Ser Ile Tyr Gln Cys Cys Asp Leu Ala 20 25 30 CCC GAG GCC AGA CAG GCT ATA AGG TCG CTC ACA GAG CGG CTT TAT ATC 143 Pro Glu Ala Arg Gln Ala Ile Arg Ser Leu Thr Glu Arg Leu Tyr Ile 35 40 45 GGG GGC CCC CTG ACT AAT TCA AAA GGG CAG AAC TGC GGT TAT CGC CGG 191 Gly Gly Pro Leu Thr Asn Ser Lys Gly Gln Asn Cys Gly Tyr Arg Arg 50 55 60 TGC CGC GTC AGC GGC GTG CTG ACG ACC AGC TGC GGT AAT ACC CTT ACA 239 Cys Arg Val Ser Gly Val Leu Thr Thr Ser Cys Gly Asn Thr Leu Thr 65 70 75 TGT TAC TTG AAG GCC TCT GCA GCC TGT CGA GCT GCA AAG CTC CAG GAC 287 Cys Tyr Leu Lys Ala Ser Ala Ala Cys Arg Ala Ala Lys Leu Gln Asp 80 85 90 95 TGC ACA ATG CTC GTG TGC GGG GAC GAC CTT GTC GTC ATC TGT GAA AGC 335 Cys Thr Met Leu Val Cys Gly Asp Asp Leu Val Val Ile Cys Glu Ser 100 105 110 GCG GGA ACC CAG GAG GAC GCG GCG AAC CTA CGA GTC TTC ACG GAG GCT 383 Ala Gly Thr Gln Glu Asp Ala Ala Asn Leu Arg Val Phe Thr Glu Ala 115 120 125 ATG ACC AGG AAT TCC GCC 401 Met Thr Arg Asn Ser Ala 130
【０３３６】配列番号：98 配列の長さ：1171 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：O30-3 配列 TG GGG ATC CCG TAT GAT ACC CGC TGC TTT GAC TCA ACG GTC ACT GAG 47 Gly Ile Pro Tyr Asp Thr Arg Cys Phe Asp Ser Thr Val Thr Glu 1 5 10 15 AAT GAC ATC CGT GTC GAG GAG TCA ATT TAC CAA TGT TGT GAC TTG GCC 95 Asn Asp Ile Arg Val Glu Glu Ser Ile Tyr Gln Cys Cys Asp Leu Ala 20 25 30 CCC GAG GCC AGA CAG GCC ATA AGG TCA CTC ACA GAG CGG CTT TAC ATC 143 Pro Glu Ala Arg Gln Ala Ile Arg Ser Leu Thr Glu Arg Leu Tyr Ile 35 40 45 GGG GGC CCC CTG ACT AAT TCA AAG GGG CAG AAC TGC GGT TAT CGC CGG 191 Gly Gly Pro Leu Thr Asn Ser Lys Gly Gln Asn Cys Gly Tyr Arg Arg 50 55 60 TGC CGC GTC AGC GGC GTG CTG ACG ACT AGC TGC GGT AAT ACC CTC ACA 239 Cys Arg Val Ser Gly Val Leu Thr Thr Ser Cys Gly Asn Thr Leu Thr 65 70 75 TGT TAC TTG AAG GCC TCT GCA GCC TGT CGA GCT GCA AAG CTC CAG GAC 287 Cys Tyr Leu Lys Ala Ser Ala Ala Cys Arg Ala Ala Lys Leu Gln Asp 80 85 90 95 TGC ACG ATG CTT GTG TGC GGA GAC GAC CTT GTC GTT ATC TGT GAT AGC 335 Cys Thr Met Leu Val Cys Gly Asp Asp Leu Val Val Ile Cys Asp Ser 100 105 110 GCG GGA ACT CAG GAG GAC GCG GCG AGC CTA CGA GTC TTC ACG GAG GCT 383 Ala Gly Thr Gln Glu Asp Ala Ala Ser Leu Arg Val Phe Thr Glu Ala 115 120 125 ATG ACT AGG TAC TCT GCC CCC CCC GGG GAC CCG CCC CAA CCA GAA TAC 431 Met Thr Arg Tyr Ser Ala Pro Pro Gly Asp Pro Pro Gln Pro Glu Tyr 130 135 140 GAC TTG GAG CTG ATA ACA TCA TGC TCC TCC AAT GTG TCG GTC GCG CAC 479 Asp Leu Glu Leu Ile Thr Ser Cys Ser Ser Asn Val Ser Val Ala His 145 150 155 GAC GCA TCA GGC AAA CGG GTG TAC TAT CTC ACC CGT GAC CCC ACC ACC 527 Asp Ala Ser Gly Lys Arg Val Tyr Tyr Leu Thr Arg Asp Pro Thr Thr 160 165 170 175 CCC CTA GCG CGG GCT GCG TGG GAG ACA GCT AGA CAC ACT CCA GTC AAC 575 Pro Leu Ala Arg Ala Ala Trp Glu Thr Ala Arg His Thr Pro Val Asn 180 185 190 TCC TGG CTA GGC AAC ATC ATC ATG TAC GCG CCC ACC TTA TGG GCA AGG 623 Ser Trp Leu Gly Asn Ile Ile Met Tyr Ala Pro Thr Leu Trp Ala Arg 195 200 205 ATG ATT CTG ATG ACC CAC TTC TTC TCC ATC CTT CTA GCC CAG GAG CAA 671 Met Ile Leu Met Thr His Phe Phe Ser Ile Leu Leu Ala Gln Glu Gln 210 215 220 CTT GAA AAA GCC CTA GAT TGT CAG ATC TAC GGG GCC ACT TAC TCC ATT 719 Leu Glu Lys Ala Leu Asp Cys Gln Ile Tyr Gly Ala Thr Tyr Ser Ile 225 230 235 GAG CCA CTT GAC CTA CCT CAG ATC ATT CAA CGA CTC CAC GGT CTT AGC 767 Glu Pro Leu Asp Leu Pro Gln Ile Ile Gln Arg Leu His Gly Leu Ser 240 245 250 255 GCA TTT TCA CTC CAT AGT TAC TCT CCA GGT GAG ATC AAT AGG GTG GCT 815 Ala Phe Ser Leu His Ser Tyr Ser Pro Gly Glu Ile Asn Arg Val Ala 260 265 270 TCA TGC CTC AGG AAA CTT GGG GTA CCG CCC TTG CGA GTC TGG AGA CAT 863 Ser Cys Leu Arg Lys Leu Gly Val Pro Pro Leu Arg Val Trp Arg His 275 280 285 CGG GCC AGA AGC GTC CGC GCT AAG CTA CTG TCC CAG GGG GGG AGG GCC 911 Arg Ala Arg Ser Val Arg Ala Lys Leu Leu Ser Gln Gly Gly Arg Ala 290 295 300 GCC ACC TGT GGC AAA TAC CTC TTC AAC TGG GCA GTA AAG ACC AAG CTC 959 Ala Thr Cys Gly Lys Tyr Leu Phe Asn Trp Ala Val Lys Thr Lys Leu 305 310 315 AAA CTC ACT CCA ATC CCA GAA GCG TCC CAG CTG GAC TTG TCC GGC TGG 1007 Lys Leu Thr Pro Ile Pro Glu Ala Ser Gln Leu Asp Leu Ser Gly Trp 320 325 330 335 TTC GTT GCT GGT TAC AGC GGG GGA GAC ATA TAT CAC AGC CTG TCT CGT 1055 Phe Val Ala Gly Tyr Ser Gly Gly Asp Ile Tyr His Ser Leu Ser Arg 340 345 350 GCC CGA CCC CGC TGG TTC ATG TGG TGC CTA CTC CTA CTT TCC GTA GGG 1103 Ala Arg Pro Arg Trp Phe Met Trp Cys Leu Leu Leu Leu Ser Val Gly 355 360 365 GTA GGC ATC TAC CTG CTC CCC AAC CGA TGA GCG GGG AGC TAA ACA CTC 1151 Val Gly Ile Tyr Leu Leu Pro Asn Arg Stop 370 375 CAG GCC AAT AGG CCA TCC C C 1171
【０３３７】配列番号：99 配列の長さ：1170 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：O30-2 配列 G GGG ATC CCG TAT GAT ACC CGC TGC TTT GAC TCA ACG GTC ACT GAG 46 Gly Ile Pro Tyr Asp Thr Arg Cys Phe Asp Ser Thr Val Thr Glu 1 5 10 15 AAT GAC ATC CGT GTT GAG GAG TCA ATT TAC CAA TGT TGT GAC TTG GCC 94 Asn Asp Ile Arg Val Glu Glu Ser Ile Tyr Gln Cys Cys Asp Leu Ala 20 25 30 CCC GAG GCC AGA CAG GCC ATA AGG TCG CTC ACA GAG CGG CTT TAC ATC 142 Pro Glu Ala Arg Gln Ala Ile Arg Ser Leu Thr Glu Arg Leu Tyr Ile 35 40 45 GGG GGC CCC CTG ACT AAT TCA AAA GGG CAG AAC TGC GGC TAT CGC CGG 190 Gly Gly Pro Leu Thr Asn Ser Lys Gly Gln Asn Cys Gly Tyr Arg Arg 50 55 60 TGC CGC GTC AGC GGC GTG CTG ACG ACT AGC TGC GGC AAT ACC CTC ACA 238 Cys Arg Val Ser Gly Val Leu Thr Thr Ser Cys Gly Asn Thr Leu Thr 65 70 75 TGT TAC TTG AAG GCC TCT GCA GCC TGT CGA GCT GCA AAG CTC CAG GAC 286 Cys Tyr Leu Lys Ala Ser Ala Ala Cys Arg Ala Ala Lys Leu Gln Asp 80 85 90 95 TGC ACG ATG CTT GTG TGC GGA GAC GAC CTT GTC GTT ATC TGT GAA AGC 334 Cys Thr Met Leu Val Cys Gly Asp Asp Leu Val Val Ile Cys Glu Ser 100 105 110 GCG GGA ACT CAG GAG GAC GCG GCG AGC CTA CGA GTC TTC ACG GAG GCT 382 Ala Gly Thr Gln Glu Asp Ala Ala Ser Leu Arg Val Phe Thr Glu Ala 115 120 125 ATG ACT AGG TAC TCT GCC CCC CCC GGG GAC CCG CCC CAA CCA GAA TAC 430 Met Thr Arg Tyr Ser Ala Pro Pro Gly Asp Pro Pro Gln Pro Glu Tyr 130 135 140 GAC TTG GAG CTG ATA ACA TCA TGC TCC TCC AAC GTG TCG GTC GCG CAC 478 Asp Leu Glu Leu Ile Thr Ser Cys Ser Ser Asn Val Ser Val Ala His 145 150 155 GAC GCA TCA GGC AAA CGG GTG TAC TAC CTC ACC CGT GAC CCC ACC ACC 526 Asp Ala Ser Gly Lys Arg Val Tyr Tyr Leu Thr Arg Asp Pro Thr Thr 160 165 170 175 CCC CTT GCG CGG GCT GCG TGG GAG ACA GCT AGA CAC ACT CCA GTC AAC 574 Pro Leu Ala Arg Ala Ala Trp Glu Thr Ala Arg His Thr Pro Val Asn 180 185 190 TCC TGG CTA GGC AAC ATC ATC ATG TAT GCG CCC ACC TTA TGG GCA AGG 622 Ser Trp Leu Gly Asn Ile Ile Met Tyr Ala Pro Thr Leu Trp Ala Arg 195 200 205 ATG ATT CTG ATG ACC CAC TTC TTC TCC ATC CTT CTA GCC CAG GAG CAA 670 Met Ile Leu Met Thr His Phe Phe Ser Ile Leu Leu Ala Gln Glu Gln 210 215 220 CTT GAA AAA GCC CTA GAT TGT CAG ATC TAT GGG GCC ACT TAC TCC ATT 718 Leu Glu Lys Ala Leu Asp Cys Gln Ile Tyr Gly Ala Thr Tyr Ser Ile 225 230 235 GAG CCA CTT GAC CTA CCT CAG ATC ATT CAA CGA CTC CAT GGT CTT AGC 766 Glu Pro Leu Asp Leu Pro Gln Ile Ile Gln Arg Leu His Gly Leu Ser 240 245 250 255 GCA TTT TCA CTC CAT AGT TAC TCT CCA GGT GAG ATC AAT AGG GTG GCT 814 Ala Phe Ser Leu His Ser Tyr Ser Pro Gly Glu Ile Asn Arg Val Ala 260 265 270 TCA TGC CTC AGG AAA CTT GGG GTA CCG CCC TTG CGA GTC TGG AGA CAT 862 Ser Cys Leu Arg Lys Leu Gly Val Pro Pro Leu Arg Val Trp Arg His 275 280 285 CGG GCC AGA AGC GTC CGC GCT AAG CTA CTG TCC CAG GGG GGG AGG GCC 910 Arg Ala Arg Ser Val Arg Ala Lys Leu Leu Ser Gln Gly Gly Arg Ala 290 295 300 GCC ACC TGT GGC AAA TAC CTC TTC AAC TGG GCA GTA AAG ACC AAG CTC 958 Ala Thr Cys Gly Lys Tyr Leu Phe Asn Trp Ala Val Lys Thr Lys Leu 305 310 315 AAA CCC ACT CCA ATC CCG GAA GCG TCC CAG CTG GAC TTG TCC GGC TGG 1006 Lys Pro Thr Pro Ile Pro Glu Ala Ser Gln Leu Asp Leu Ser Gly Trp 320 325 330 335 TTC GTT GCT GGT TAC AGC GGG GGA GAC ATA TAT CAC AGC CTG TCT CGT 1054 Phe Val Ala Gly Tyr Ser Gly Gly Asp Ile Tyr His Ser Leu Ser Arg 340 345 350 GCC CGA CCC CGC TGG TTT ATG TGG TGC CTA CTC CTA CTT TCC GTA GGG 1102 Ala Arg Pro Arg Trp Phe Met Trp Cys Leu Leu Leu Leu Ser Val Gly 355 360 365 GTA GGC ATC TAC CTG CTC CCC AAC CGA TGA GCG GGG AGC TAA ACA CTC 1150 Val Gly Ile Tyr Leu Leu Pro Asn Arg Stop 370 375 CAG GCC AAT AGG CCA TCC C C 1170
【０３３８】配列番号：100 配列の長さ：1171 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：O30-4 配列 TG GGG ATC CCG TAT GAT ACC CGC TGC TTT GAC TCA ACA GTC ACT GAG 47 Gly Ile Pro Tyr Asp Thr Arg Cys Phe Asp Ser Thr Val Thr Glu 1 5 10 15 AAT GAC ATC CGT GTT GAG GAG TCA ATT TAC CAA TGT TGT GAC TTG GCC 95 Asn Asp Ile Arg Val Glu Glu Ser Ile Tyr Gln Cys Cys Asp Leu Ala 20 25 30 CCC GAG GCC AGA CAG GCC ATA AGG TCG CTC ACA GAG CGG CTT TAC ATC 143 Pro Glu Ala Arg Gln Ala Ile Arg Ser Leu Thr Glu Arg Leu Tyr Ile 35 40 45 GGG GGC CCC CTG ACT AAT TCA AAG GGG CAG AAC TGC GGT TAT CGC CGG 191 Gly Gly Pro Leu Thr Asn Ser Lys Gly Gln Asn Cys Gly Tyr Arg Arg 50 55 60 TGC CGC GCC AGC GGC GTG CTG ACG ACT AGC TGC GGT AAT ACC CTC ACA 239 Cys Arg Ala Ser Gly Val Leu Thr Thr Ser Cys Gly Asn Thr Leu Thr 65 70 75 TGT TAC TTG AAG GCC TCT GCA GCC TGT CGA GCT GCA AAG CTC CAG GAC 287 Cys Tyr Leu Lys Ala Ser Ala Ala Cys Arg Ala Ala Lys Leu Gln Asp 80 85 90 95 TGC ACG ATG CTT GTG TGC GGA GAC GAC CTT GTC GTT ATC TGT GAA AGC 335 Cys Thr Met Leu Val Cys Gly Asp Asp Leu Val Val Ile Cys Glu Ser 100 105 110 GCG GGA ACT CAG GAG GAC GCG GCG AGC CTA CGA GTC TTC ACG GAG GCT 383 Ala Gly Thr Gln Glu Asp Ala Ala Ser Leu Arg Val Phe Thr Glu Ala 115 120 125 ATG ACT AGG TAC TCT GCC CCC CCC GGG GAC CCG CCC CAA CCA GAA TAC 431 Met Thr Arg Tyr Ser Ala Pro Pro Gly Asp Pro Pro Gln Pro Glu Tyr 130 135 140 GAC TTG GAG CTG ATA ACA TCA TGC TCC TCC AAT GTG TCG GTC GCG CAC 479 Asp Leu Glu Leu Ile Thr Ser Cys Ser Ser Asn Val Ser Val Ala His 145 150 155 GAC GCA TCA GGC AAA CGG GTG TAC TAT CTC ACC CGT GAC CCC CCC ACC 527 Asp Ala Ser Gly Lys Arg Val Tyr Tyr Leu Thr Arg Asp Pro Pro Thr 160 165 170 175 CCC CTT GCG CGG GCT GCG TGG GAG ACA GCT AGA CAC ACT CCA GTC AAC 575 Pro Leu Ala Arg Ala Ala Trp Glu Thr Ala Arg His Thr Pro Val Asn 180 185 190 TCC TGG CTA GGC AAC ATC ATC ATG TAC GCG CCC ACC TTA TGG GCA AGG 623 Ser Trp Leu Gly Asn Ile Ile Met Tyr Ala Pro Thr Leu Trp Ala Arg 195 200 205 ATG ATT CTG ATG ACC CAC TTC TTC TCC ATC CTT CTA GCC CAG GAG CAA 671 Met Ile Leu Met Thr His Phe Phe Ser Ile Leu Leu Ala Gln Glu Gln 210 215 220 CTT GAA AAA GCC CTA GAT TGT CAG ATC TAC GGG GCC ACT TAC TCC ATT 719 Leu Glu Lys Ala Leu Asp Cys Gln Ile Tyr Gly Ala Thr Tyr Ser Ile 225 230 235 GAG CCA CTT GAC CTA CCT CAG ATC ATT CAA CGA CTC CAT GGT CTT AGC 767 Glu Pro Leu Asp Leu Pro Gln Ile Ile Gln Arg Leu His Gly Leu Ser 240 245 250 255 GCA TTT TCA CTC CAT AGT TAC TCT CCA GGT GAG ATC AAT AGG GTG GCT 815 Ala Phe Ser Leu His Ser Tyr Ser Pro Gly Glu Ile Asn Arg Val Ala 260 265 270 TCA TGC CTC AGG AAA CTT GGG GTA CCG CCC TTG CGA GTC TGG AGA CAT 863 Ser Cys Leu Arg Lys Leu Gly Val Pro Pro Leu Arg Val Trp Arg His 275 280 285 CGG GCC AGA AGC GTC CGC GCT AAG CTA CTG TCC CAG GGG GGG AGG GCC 911 Arg Ala Arg Ser Val Arg Ala Lys Leu Leu Ser Gln Gly Gly Arg Ala 290 295 300 GCC ACC TGT GGC AAA TAC CTC TTC AAC TGG GCA GTA AAG ACC AAG CTC 959 Ala Thr Cys Gly Lys Tyr Leu Phe Asn Trp Ala Val Lys Thr Lys Leu 305 310 315 AAA CTC ACT CCA ATC CCG GAA GCG TCC CAG CTG GAC TTG TCC GGC TGG 1007 Lys Leu Thr Pro Ile Pro Glu Ala Ser Gln Leu Asp Leu Ser Gly Trp 320 325 330 335 TTC GTT GCT GGT TAC AGC GGG GGA GAC ATA TAT CAC AGC CTG TCT CGT 1055 Phe Val Ala Gly Tyr Ser Gly Gly Asp Ile Tyr His Ser Leu Ser Arg 340 345 350 GCC CGA CCC CGC TGG TTC ATG TGG TGC CTA CTC CTA CTT TCC GTA GGG 1103 Ala Arg Pro Arg Trp Phe Met Trp Cys Leu Leu Leu Leu Ser Val Gly 355 360 365 GTA GGC ATC TAC CTG CTC CCC AAC CGA TGA GCG GGG AGC TAA ACA CTC 1151 Val Gly Ile Tyr Leu Leu Pro Asn Arg Stop 370 375 CAG GCC AAT AGG CCA TCC C C 1171
【０３３９】配列番号：101 配列の長さ：9471 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：T7N1-30 配列 ACTAGTTAAT ACGACTCACT ATAGGGTGCC AGCCCCCTGA TGGGGGCGAC ACTCCACCAT 60 AGATCACTCC CCTGTGAGGA ACTACTGTCT TCACGCAGAA AGCGTCTAGC CATGGCGTTA 120 GTATGAGTGT CGTGCAGCCT CCAGGACCCC CCCTCCCGGG AGAGCCATAG TGGTCTGCGG 180 AACCGGTGAG TACACCGGAA TTGCCAGGAC GACCGGGTCC TTTCTTGGAT CAACCCGCTC 240 AATGCCTGGA GATTTGGGCG TGCCCCCGCG AGACTGCTAG CCGAGTAGTG TTGGGTCGCG 300 AAAGGCCTTG TGGTACTGCC TGATAGGGTG CTTGCGAGTG CCCCGGGAGG TCTCGTAGAC 360 CGTGCATC ATG AGC ACA AAT CCA AAA CCC CAA AGA AAA ATC AAA CGT AAC 410 Met Ser Thr Asn Pro Lys Pro Gln Arg Lys Ile Lys Arg Asn 1 5 10 ACC AAC CGC CGC CCA CAG GAC GTT AAG TTC CCG GGC GGT GGT CAG ATC 458 Thr Asn Arg Arg Pro Gln Asp Val Lys Phe Pro Gly Gly Gly Gln Ile 15 20 25 30 GTT GGT GGA GTT TAC CTG TTG CCG CGC AGG GGC CCC AGG TTG GGT GTG 506 Val Gly Gly Val Tyr Leu Leu Pro Arg Arg Gly Pro Arg Leu Gly Val 35 40 45 CGC GCG ACT AGG AAG ACT TCC GAG CGG CCG CAA CCT CGT GGA AGG CGA 554 Arg Ala Thr Arg Lys Thr Ser Glu Arg Pro Gln Pro Arg Gly Arg Arg 50 55 60 CAA CCT ATC CCC AAG GCT CGC CAA CCC GAG GGT AGG GCC TGG GCT CAG 602 Gln Pro Ile Pro Lys Ala Arg Gln Pro Glu Gly Arg Ala Trp Ala Gln 65 70 75 CCC GGG TAC CCT TGG CCC CTC TAT GGC AAT GAG GGC TTG GGG TGG GCA 650 Pro Gly Tyr Pro Trp Pro Leu Tyr Gly Asn Glu Gly Leu Gly Trp Ala 80 85 90 GGA TGG CTC CTG TCA CCC CGC GGC TCC CGG CCT AGT TGG GGC CCC ACG 698 Gly Trp Leu Leu Ser Pro Arg Gly Ser Arg Pro Ser Trp Gly Pro Thr 95 100 105 110 GAC CCC CGG CGT AGG TCG CGT AAT TTG GGT AAG GTC ATC GAT ACC CTC 746 Asp Pro Arg Arg Arg Ser Arg Asn Leu Gly Lys Val Ile Asp Thr Leu 115 120 125 ACA TGC GGC TTC GCC GAC CTC ATG GGG TAC ATT CCG CTC GTC GGC GCC 794 Thr Cys Gly Phe Ala Asp Leu Met Gly Tyr Ile Pro Leu Val Gly Ala 130 135 140 CCC CTA GGG GGC GCT GCC AGG GCT CTA GCG CAT GGC GTC CGG GTT CTG 842 Pro Leu Gly Gly Ala Ala Arg Ala Leu Ala His Gly Val Arg Val Leu 145 150 155 GAG GAC GGC GTG AAC TAT GCA ACA GGG AAT CTG CCT GGT TGC TCC TTT 890 Glu Asp Gly Val Asn Tyr Ala Thr Gly Asn Leu Pro Gly Cys Ser Phe 160 165 170 TCT ATC TTC CTT TTG GCT TTG CTG TCC TGT TTG ACC ATC CCA GCT TCC 938 Ser Ile Phe Leu Leu Ala Leu Leu Ser Cys Leu Thr Ile Pro Ala Ser 175 180 185 190 GCC TAC CAA GTG CGC AAC GCG TCC GGG GTG TAC CAT GTC ACG AAC GAC 986 Ala Tyr Gln Val Arg Asn Ala Ser Gly Val Tyr His Val Thr Asn Asp 195 200 205 TGC TCC AAC TCA AGT ATT GTG TAT GAG GCG GCG GAC GTG ATT ATG CAC 1034 Cys Ser Asn Ser Ser Ile Val Tyr Glu Ala Ala Asp Val Ile Met His 210 215 220 ACC CCC GGG TGC GTG CCC TGC GTC CGG GAG AAC AAT TCC TCC CGC TGC 1082 Thr Pro Gly Cys Val Pro Cys Val Arg Glu Asn Asn Ser Ser Arg Cys 225 230 235 TGG GTA GCG CTC ACT CCC ACG CTT GCG GCC AGG AAC AGC AGC ATC CCC 1130 Trp Val Ala Leu Thr Pro Thr Leu Ala Ala Arg Asn Ser Ser Ile Pro 240 245 250 ACT ACG ACA ATA CGG CGT CAT GTC GAC TTG CTC GTT GGG GCA GCT GCT 1178 Thr Thr Thr Ile Arg Arg His Val Asp Leu Leu Val Gly Ala Ala Ala 255 260 265 270 CTC TGT TCC GCT ATG TAT GTG GGG GAT TTT TGC GGA TCT GTT TTC CTC 1226 Leu Cys Ser Ala Met Tyr Val Gly Asp Phe Cys Gly Ser Val Phe Leu 275 280 285 GTC TCC CAG CTG TTC ACT TTC TCA CCT CGC CGG TAT GAG ACG GTG CAA 1274 Val Ser Gln Leu Phe Thr Phe Ser Pro Arg Arg Tyr Glu Thr Val Gln 290 295 300 GAC TGC AAT TGC TCA ATC TAT CCC GGC CAT GTA TCA GGC CAT CGC ATG 1322 Asp Cys Asn Cys Ser Ile Tyr Pro Gly His Val Ser Gly His Arg Met 305 310 315 GCT TGG GAT ATG ATA ATG AAT TGG TCA CCT ACA ACA GCC CTA GTG GTA 1370 Ala Trp Asp Met Ile Met Asn Trp Ser Pro Thr Thr Ala Leu Val Val 320 325 330 TCG CAG CTA CTC CGG ATC CCA CAA GCC GTG GTG GAT ATG GTG GCA GGG 1418 Ser Gln Leu Leu Arg Ile Pro Gln Ala Val Val Asp Met Val Ala Gly 335 340 345 350 GCC CAC TGG GGA GTC CTG GCG GGC CTT GCC TAC TAT TCC ATG GTG GGG 1466 Ala His Trp Gly Val Leu Ala Gly Leu Ala Tyr Tyr Ser Met Val Gly 355 360 365 AAC TGG GCT AAG GTC TTG GTT GTG ATG CTG CTC TTC GCC GGT GTT GAC 1514 Asn Trp Ala Lys Val Leu Val Val Met Leu Leu Phe Ala Gly Val Asp 370 375 380 GGG GGG ACC CAC GTG ACA GGG GGG AAG GTA GCC TAC ACC ACC CAG GGC 1562 Gly Gly Thr His Val Thr Gly Gly Lys Val Ala Tyr Thr Thr Gln Gly 385 390 395 TTT ACA TCC TTC TTT TCA CGA GGG CCG TCT CAG AAA ATC CAA CTT GTA 1610 Phe Thr Ser Phe Phe Ser Arg Gly Pro Ser Gln Lys Ile Gln Leu Val 400 405 410 AAC ACT AAC GGC AGC TGG CAC ATC AAT AGG ACT GCC CTC AAT TGC AAT 1658 Asn Thr Asn Gly Ser Trp His Ile Asn Arg Thr Ala Leu Asn Cys Asn 415 420 425 430 GAC TCC CTT AAC ACC GGG TTC CTT GCC GCG CTG TTC TAC ACC CAC AGC 1706 Asp Ser Leu Asn Thr Gly Phe Leu Ala Ala Leu Phe Tyr Thr His Ser 435 440 445 TTC AAC GCG TCC GGA TGT CCG GAG CGT ATG GCC GGT TGC CGC CCC ATT 1754 Phe Asn Ala Ser Gly Cys Pro Glu Arg Met Ala Gly Cys Arg Pro Ile 450 455 460 GAC GAG TTC GCT CAG GGG TGG GGT CCC ATC ACT CAT GTT GTG CCT AAC 1802 Asp Glu Phe Ala Gln Gly Trp Gly Pro Ile Thr His Val Val Pro Asn 465 470 475 ATC TCG GAC CAG AGG CCC TAT TGC TGG CAC TAC GCG CCT CGA CCG TGT 1850 Ile Ser Asp Gln Arg Pro Tyr Cys Trp His Tyr Ala Pro Arg Pro Cys 480 485 490 GGT ATC GTA CCC GCG TCG CAG GTG TGT GGT CCG GTG TAT TGC TTC ACC 1898 Gly Ile Val Pro Ala Ser Gln Val Cys Gly Pro Val Tyr Cys Phe Thr 495 500 505 510 CCA AGC CCT GTT GTG GTG GGG ACG ACC GAT CGT TTC GGC GCC CCC ACG 1946 Pro Ser Pro Val Val Val Gly Thr Thr Asp Arg Phe Gly Ala Pro Thr 515 520 525 TAC AAC TGG GGA AAC AAT GAG ACG GAT GTG CTA CTC CTC AAC AAC ACA 1994 Tyr Asn Trp Gly Asn Asn Glu Thr Asp Val Leu Leu Leu Asn Asn Thr 530 535 540 CGG CCG CCG CAG GGC AAC TGG TTC GGT TGT ACC TGG ATG AAT GGC ACT 2042 Arg Pro Pro Gln Gly Asn Trp Phe Gly Cys Thr Trp Met Asn Gly Thr 545 550 555 GGG TTC ACA AAG ACG TGC GGG GGC CCC CCG TGC AAC ATC GGG GGG GTC 2090 Gly Phe Thr Lys Thr Cys Gly Gly Pro Pro Cys Asn Ile Gly Gly Val 560 565 570 GGC AAC AAT ACC TTG ACT TGC CCC ACG GAC TGC TTC CGG AAG CAC CCC 2138 Gly Asn Asn Thr Leu Thr Cys Pro Thr Asp Cys Phe Arg Lys His Pro 575 580 585 590 GAG GCC ACT TAC ACA AAA TGT GGT TCG GGG CCT TGG TTG ACA CCT AGG 2186 Glu Ala Thr Tyr Thr Lys Cys Gly Ser Gly Pro 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Glu Asn Asp Ile Arg Thr 2640 2645 2650 GAG GAG TCA ATT TAT CAA TGT TGT GAC TTG GAC CCC GAG GCC AGA CAG 8378 Glu Glu Ser Ile Tyr Gln Cys Cys Asp Leu Asp Pro Glu Ala Arg Gln 2655 2660 2665 2670 GCC ATA AGG TCG CTC ACA GAG CGG CTT TAT ATC GGG GGC CCC CTG ACT 8426 Ala Ile Arg Ser Leu Thr Glu Arg Leu Tyr Ile Gly Gly Pro Leu Thr 2675 2680 2685 AAT TCA AAG GGG CAG AAC TGC GGT TAT CGC CGG TGC CGC GTC AGC GGC 8474 Asn Ser Lys Gly Gln Asn Cys Gly Tyr Arg Arg Cys Arg Val Ser Gly 2690 2695 2700 GTG CTG ACG ACT AGC TGC GGT AAT ACC CTC ACA TGT TAC TTG AAG GCC 8522 Val Leu Thr Thr Ser Cys Gly Asn Thr Leu Thr Cys Tyr Leu Lys Ala 2705 2710 2715 TCT GCA GCC TGT CGA GCT GCA AAG CTC CAG GAC TGC ACG ATG CTT GTG 8570 Ser Ala Ala Cys Arg Ala Ala Lys Leu Gln Asp Cys Thr Met Leu Val 2720 2725 2730 TGC GGA GAC GAC CTT GTC GTT ATC TGT GAT AGC GCG GGA ACT CAG GAG 8618 Cys Gly Asp Asp Leu Val Val Ile Cys Asp Ser Ala Gly Thr Gln Glu 2735 2740 2745 2750 GAC GCG GCG AGC CTA CGA GTC TTC ACG GAG GCT ATG ACT AGG TAC TCT 8666 Asp Ala Ala Ser Leu Arg Val Phe Thr Glu Ala Met Thr Arg Tyr Ser 2755 2760 2765 GCC CCC CCC GGG GAC CCG CCC CAA CCA GAA TAC GAC TTG GAG CTG ATA 8714 Ala Pro Pro Gly Asp Pro Pro Gln Pro Glu Tyr Asp Leu Glu Leu Ile 2770 2775 2780 ACA TCA TGC TCC TCC AAT GTG TCG GTC GCG CAC GAC GCA TCA GGC AAA 8762 Thr Ser Cys Ser Ser Asn Val Ser Val Ala His Asp Ala Ser Gly Lys 2785 2790 2795 CGG GTG TAC TAT CTC ACC CGT GAC CCC ACC ACC CCC CTA GCG CGG GCT 8810 Arg Val Tyr Tyr Leu Thr Arg Asp Pro Thr Thr Pro Leu Ala Arg Ala 2800 2805 2810 GCG TGG GAG ACA GCT AGA CAC ACT CCA GTC AAC TCC TGG CTA GGC AAC 8858 Ala Trp Glu Thr Ala Arg His Thr Pro Val Asn Ser Trp Leu Gly Asn 2815 2820 2825 2830 ATC ATC ATG TAC GCG CCC ACC TTA TGG GCA AGG ATG ATT CTG ATG ACC 8906 Ile Ile Met Tyr Ala Pro Thr Leu Trp Ala Arg Met Ile Leu Met Thr 2835 2840 2845 CAC TTC TTC TCC ATC CTT CTA GCC CAG GAG CAA CTT GAA AAA GCC CTA 8954 His Phe Phe Ser Ile Leu Leu Ala Gln Glu Gln Leu Glu Lys Ala Leu 2850 2855 2860 GAT TGT CAG ATC TAC GGG GCC ACT TAC TCC ATT GAG CCA CTT GAC CTA 9002 Asp Cys Gln Ile Tyr Gly Ala Thr Tyr Ser Ile Glu Pro Leu Asp Leu 2865 2870 2875 CCT CAG ATC ATT CAA CGA CTC CAC GGT CTT AGC GCA TTT TCA CTC CAT 9050 Pro Gln Ile Ile Gln Arg Leu His Gly Leu Ser Ala Phe Ser Leu His 2880 2885 2890 AGT TAC TCT CCA GGT GAG ATC AAT AGG GTG GCT TCA TGC CTC AGG AAA 9098 Ser Tyr Ser Pro Gly Glu Ile Asn Arg Val Ala Ser Cys Leu Arg Lys 2895 2900 2905 2910 CTT GGG GTA CCG CCC TTG CGA GTC TGG AGA CAT CGG GCC AGA AGC GTC 9146 Leu Gly Val Pro Pro Leu Arg Val Trp Arg His Arg Ala Arg Ser Val 2915 2920 2925 CGC GCT AAG CTA CTG TCC CAG GGG GGG AGG GCC GCC ACC TGT GGC AAA 9194 Arg Ala Lys Leu Leu Ser Gln Gly Gly Arg Ala Ala Thr Cys Gly Lys 2930 2935 2940 TAC CTC TTC AAC TGG GCA GTA AAG ACC AAG CTC AAA CTC ACT CCA ATC 9242 Tyr Leu Phe Asn Trp Ala Val Lys Thr Lys Leu Lys Leu Thr Pro Ile 2945 2950 2955 CCA GAA GCG TCC CAG CTG GAC TTG TCC GGC TGG TTC GTT GCT GGT TAC 9290 Pro Glu Ala Ser Gln Leu Asp Leu Ser Gly Trp Phe Val Ala Gly Tyr 2960 2965 2970 AGC GGG GGA GAC ATA TAT CAC AGC CTG TCT CGT GCC CGA CCC CGC TGG 9338 Ser Gly Gly Asp Ile Tyr His Ser Leu Ser Arg Ala Arg Pro Arg Trp 2975 2980 2985 2990 TTC ATG TGG TGC CTA CTC CTA CTT TCC GTA GGG GTA GGC ATC TAC CTG 9386 Phe Met Trp Cys Leu Leu Leu Leu Ser Val Gly Val Gly Ile Tyr Leu 2995 3000 3005 CTC CCC AAC CGA TGA GCGGGGAGC TAAACACTCC AGGCCAATAG GCCATCCCCC 9440 Leu Pro Asn Arg Stop 3010 TTTTTTTTTT TTAAGCTGGA TCCGCGGCCG C 9471
【０３４０】配列番号：102 配列の長さ：1123 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：CN23 配列 AAGCTT ATG AGC ACA AAT CCA AAA CCC CAA AGA AAA ACC AAA CGT AAC 48 Met Ser Thr Asn Pro Lys Pro Gln Arg Lys Thr Lys Arg Asn 1 5 10 ACC AAC CGC CGC CCA CAG GAC GTC AAG TTC CCG GGC GGT GGT CAG ATC 96 Thr Asn Arg Arg Pro Gln Asp Val Lys Phe Pro Gly Gly Gly Gln Ile 15 20 25 30 GTT GGT GGA GTT TAC CTG TTG CCG CGC AGG GGC CCC AGG TTG GGT GTG 144 Val Gly Gly Val Tyr Leu Leu Pro Arg Arg Gly Pro Arg Leu Gly Val 35 40 45 CGC GCG ACT AGG AAG ACT TCC GAG CGG TCG CAA CCT CGT GGA AGG CGA 192 Arg Ala Thr Arg Lys Thr Ser Glu Arg Ser Gln Pro Arg Gly Arg Arg 50 55 60 CAA CCT ATC CCC AAG GCT CGC CAA CCC GAG GGC AGG GCC TGG GCT CAG 240 Gln Pro Ile Pro Lys Ala Arg Gln Pro Glu Gly Arg Ala Trp Ala Gln 65 70 75 CCC GGG TAC CCT TGG CCC CTC TAT GGC AAT GAG GGC TTG GGG TGG GCA 288 Pro Gly Tyr Pro Trp Pro Leu Tyr Gly Asn Glu Gly Leu Gly Trp Ala 80 85 90 GGA TGG CTC CTG TCA CCC CGG GGG GTT GCG AAG GCG GTG GAC TTT GTG 336 Gly Trp Leu Leu Ser Pro Arg Gly Val Ala Lys Ala Val Asp Phe Val 95 100 105 110 CCC GTT GAG TCT ATG GAA ACC ACC ATG CGG TCT CCG GTC TTC ACG GAT 384 Pro Val Glu Ser Met Glu Thr Thr Met Arg Ser Pro Val Phe Thr Asp 115 120 125 AAC TCA ACC CCC CCG GCC GTA CCG CAG ACA TTC CAA GTG GCC CAC CTA 432 Asn Ser Thr Pro Pro Ala Val Pro Gln Thr Phe Gln Val Ala His Leu 130 135 140 CAC GCT CCC ACT GGC AGC GGC AAA AGC ACC AGG GTG CCG GCT GCG TAT 480 His Ala Pro Thr Gly Ser Gly Lys Ser Thr Arg Val Pro Ala Ala Tyr 145 150 155 GCG GCC CAA GGG TAC AAG GTA CTC GTC CTG AAC CCG TCC GTT GCT GCC 528 Ala Ala Gln Gly Tyr Lys Val Leu Val Leu Asn Pro Ser Val Ala Ala 160 165 170 ACT TTG GGC TTT GGG GCG TAC ATG TCC AAG GCA CAT GGT GTT GAC CCT 576 Thr Leu Gly Phe Gly Ala Tyr Met Ser Lys Ala His Gly Val Asp Pro 175 180 185 190 AAC ATC AGA ACT GGG GTG AGG ACC ATC ACC ACG GGC GCT CCC ATC ACG 624 Asn Ile Arg Thr Gly Val Arg Thr Ile Thr Thr Gly Ala Pro Ile Thr 195 200 205 TAC TCC ACC TAC GGT AAG TTC CTC GCC GAC GGT GGC TGT TCT GGG GGT 672 Tyr Ser Thr Tyr Gly Lys Phe Leu Ala Asp Gly Gly Cys Ser Gly Gly 210 215 220 GCC TAT GAC ATC ATA ATA TGT GAT GAG TGT CAT TCA ACT GAC TCG ACT 720 Ala Tyr Asp Ile Ile Ile Cys Asp Glu Cys His Ser Thr Asp Ser Thr 225 230 235 TCC ATC TTG GGC ATT GGT ACA GTC CTG GAC CAA GCG GAG ACG GCT GGA 768 Ser Ile Leu Gly Ile Gly Thr Val Leu Asp Gln Ala Glu Thr Ala Gly 240 245 250 GCG CGC CTT GTC GTG CTC GCC ACC GCT ACG CCT CCG GGA TCG GTC ACC 816 Ala Arg Leu Val Val Leu Ala Thr Ala Thr Pro Pro Gly Ser Val Thr 255 260 265 270 GTG CCG CAT CCT AAT ATT GAG GAG GTG GCC TTG TCC AAC ACT GGA GAG 864 Val Pro His Pro Asn Ile Glu Glu Val Ala Leu Ser Asn Thr Gly Glu 275 280 285 ATC CCC TTC TAT GGC AAG GCC ATC CCC CTC GAG GCC ATC AAG GGG GGG 912 Ile Pro Phe Tyr Gly Lys Ala Ile Pro Leu Glu Ala Ile Lys Gly Gly 290 295 300 AGG CAT CTC ATT TTC TGC CAT TCC AAG AAG AAA TGT GAC GAG CTC GCT 960 Arg His Leu Ile Phe Cys His Ser Lys Lys Lys Cys Asp Glu Leu Ala 305 310 315 GCG AAG CTG TCG GCC CTC GGA GTC AAC GCT GTA GCA TAT TAC CGG GGT 1008 Ala Lys Leu Ser Ala Leu Gly Val Asn Ala Val Ala Tyr Tyr Arg Gly 320 325 330 CTT GAT GTG TCC ATC ATA CCG ACA AGC GGG GAC GTC GTT GTC GTG GCA 1056 Leu Asp Val Ser Ile Ile Pro Thr Ser Gly Asp Val Val Val Val Ala 335 340 345 350 ACA GAC GCT CTA ATG ACG GGC TAT ACC GGT GAC TTT GAC TCG GTG ATC 1104 Thr Asp Ala Leu Met Thr Gly Tyr Thr Gly Asp Phe Asp Ser Val Ile 355 360 365 GAC TGC AAC ACA TGA TAA AGATCT 1128 Asp Cys Asn Thr StopStop 370
【０３４１】配列番号：103 配列の長さ：974 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：O15-1 配列 GCGGATCCT CCA CCT CCA TCG TGG GAC CAA ATG TGG AAG TGT CTC ATA CGG 51 Pro Pro Pro Ser Trp Asp Gln Met Trp Lys Cys Leu Ile Arg 1 5 10 CTG AAA CCT ACG CTA CAC GGG CCA ACA CCC CTG TTG TAT AGG TTA GGA 99 Leu Lys Pro Thr Leu His Gly Pro Thr Pro Leu Leu Tyr Arg Leu Gly 15 20 25 30 GCC GTT CAA AAC GAG GTC ACC CTC ACA CAC CCC ATA ACC AAA TTC ATC 147 Ala Val Gln Asn Glu Val Thr Leu Thr His Pro Ile Thr Lys Phe Ile 35 40 45 ATG GCA TGC ATG TCG GCT GAC CTA GAG GTC GTC ACT AGC ACC TGG GTG 195 Met Ala Cys Met Ser Ala Asp Leu Glu Val Val Thr Ser Thr Trp Val 50 55 60 CTG GTA GGC GGG GTC CTC GCA GCT CTG GCC GCG TAC TGC CTG ACA ACG 243 Leu Val Gly Gly Val Leu Ala Ala Leu Ala Ala Tyr Cys Leu Thr Thr 65 70 75 GGC AGC GTG GTC ATC GTG GGC AGG ATC ATC TTG TCC GGG AGG CCG GCT 291 Gly Ser Val Val Ile Val Gly Arg Ile Ile Leu Ser Gly Arg Pro Ala 80 85 90 ATC ATT CCC GAC AGG GAA GTT CTC TAC CGT GAG TTC GAT GAA ATG GAG 339 Ile Ile Pro Asp Arg Glu Val Leu Tyr Arg Glu Phe Asp Glu Met Glu 95 100 105 110 GAG TGC GCC TCA CAC CTC CCC TAC ATC GAA CAG GGA ATG CAG CTC GCC 387 Glu Cys Ala Ser His Leu Pro Tyr Ile Glu Gln Gly Met Gln Leu Ala 115 120 125 GAG CAG TTC AAG CAG AAG GCG CTC GGT TTG TTG CAA ACA GCT ACC CAG 435 Glu Gln Phe Lys Gln Lys Ala Leu Gly Leu Leu Gln Thr Ala Thr Gln 130 135 140 CAA GCG GAG GCT GCT GCT CCC GTG GTG GAG TCC AAA TGG CGA GCC CTA 483 Gln Ala Glu Ala Ala Ala Pro Val Val Glu Ser Lys Trp Arg Ala Leu 145 150 155 GAG GCC TTC TGG GCA AAG CAC ATG TGG AAT TTC ATC AGC GGG ATA CAG 531 Glu Ala Phe Trp Ala Lys His Met Trp Asn Phe Ile Ser Gly Ile Gln 160 165 170 TAC TTG GCA GGC TTG TCC ACT CTG CCT GGA AAC CCC GCG ATA GCA TCA 579 Tyr Leu Ala Gly Leu Ser Thr Leu Pro Gly Asn Pro Ala Ile Ala Ser 175 180 185 190 CTG ATG GCA TTC ACA GCC TCT ATC ACC AGC CCT CTC ACC ACC CAA CAT 627 Leu Met Ala Phe Thr Ala Ser Ile Thr Ser Pro Leu Thr Thr Gln His 195 200 205 ACC CTC CTG TTT AAC ATC TTG GGG GGA TGG GTA GCC GCC CAA CTC GCC 675 Thr Leu Leu Phe Asn Ile Leu Gly Gly Trp Val Ala Ala Gln Leu Ala 210 215 220 CCT CCC AGC GCT GCT TCA GCT TTT GTG GGC GCC GGC ATA GCT GGC GCG 723 Pro Pro Ser Ala Ala Ser Ala Phe Val Gly Ala Gly Ile Ala Gly Ala 225 230 235 GCT GTT GGC AGC ATA GGC CTT GGG AAG GTG CTT GTG GAC ATC CTG GCG 771 Ala Val Gly Ser Ile Gly Leu Gly Lys Val Leu Val Asp Ile Leu Ala 240 245 250 GGT TAT GGA GCA GGG GTG GCA GGC GCA CTC GTG GCC TTT AAG GTC ATG 819 Gly Tyr Gly Ala Gly Val Ala Gly Ala Leu Val Ala Phe Lys Val Met 255 260 265 270 AGT GGC GAG ATG CCC TCC ACC GAG GAC TTG GTC AAC CTA CTC CCT GCC 867 Ser Gly Glu Met Pro Ser Thr Glu Asp Leu Val Asn Leu Leu Pro Ala 275 280 285 ATC CTC TCT CCT GGC GCC CTG GTC GTC GGA GTC GTG TGC GCA GCA ATA 915 Ile Leu Ser Pro Gly Ala Leu Val Val Gly Val Val Cys Ala Ala Ile 290 295 300 CTG CGT CGA CAT GTG GGC CCA GGG GAG GGG GCT GTG CAG TGG ATG AAC 963 Leu Arg Arg His Val Gly Pro Gly Glu Gly Ala Val Gln Trp Met Asn 305 310 315 CGG CTG C AGCC 974 Arg Leu 320
【０３４２】配列番号：104 配列の長さ：974 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 アンチセンス：No 起源：Hepatitis C virus 直接の起源 クローン名：O15-2 配列 GCGGATCCT CCA CCT CCA TCG TGG GAC CAA ATG TGG AAG TGT CTC ATA CGG 51 Pro Pro Pro Ser Trp Asp Gln Met Trp Lys Cys Leu Ile Arg 1 5 10 CTA AAA CCT ACG CTA CAC GGG CCA ACA CCC CTG TTG TAT AGG TTA GGA 99 Leu Lys Pro Thr Leu His Gly Pro Thr Pro Leu Leu Tyr Arg Leu Gly 15 20 25 30 GCC GTT CAA AAC GAG GTC ACC CTC ACA CAC CCC ATA ACC AAG TTC ATC 147 Ala Val Gln Asn Glu Val Thr Leu Thr His Pro Ile Thr Lys Phe Ile 35 40 45 ATG GCA TGC ATG TCG GCT GAC CTA GAG GTC GTC ACT AGC ACC TGG GTG 195 Met Ala Cys Met Ser Ala Asp Leu Glu Val Val Thr Ser Thr Trp Val 50 55 60 CTG GTA GGC GGG GTC CTC GCA GCT CTG GCC GCG TAC TGC CTG ACA ACG 243 Leu Val Gly Gly Val Leu Ala Ala Leu Ala Ala Tyr Cys Leu Thr Thr 65 70 75 GGC AGC GTG GTC ATC GTG GGC AGA ATC ATC TTG TCC GGG AGG CCG GCT 291 Gly Ser Val Val Ile Val Gly Arg Ile Ile Leu Ser Gly Arg Pro Ala 80 85 90 ATC ATT CCC GAC AGG GAG GTT CTC TAC CGG GAG TTC GAT GAA ATG GAG 339 Ile Ile Pro Asp Arg Glu Val Leu Tyr Arg Glu Phe Asp Glu Met Glu 95 100 105 110 GAG TGC GCC TCA CAC CTC CCC TAC ATC GAA CAG GGA ATG CAG CTC GCC 387 Glu Cys Ala Ser His Leu Pro Tyr Ile Glu Gln Gly Met Gln Leu Ala 115 120 125 GAG CAA TTC AAG CAG AAG GCG CTC GGT TTG TTG CAA ACA GCT ACC AAG 435 Glu Gln Phe Lys Gln Lys Ala Leu Gly Leu Leu Gln Thr Ala Thr Lys 130 135 140 CAA GCG GAG GCT GCT GCT CCC GTG GTG GAG TCC AAA TGG CGA GCC CTT 483 Gln Ala Glu Ala Ala Ala Pro Val Val Glu Ser Lys Trp Arg Ala Leu 145 150 155 GAG ACC TTC TGG GCA AAG CAC ATG TGG AAT TTC ATC AGC GGG ATA CAG 531 Glu Thr Phe Trp Ala Lys His Met Trp Asn Phe Ile Ser Gly Ile Gln 160 165 170 TAC TTG GCA GGC TTG TCC ACT CTG CCT GGA AAC CCC GCG ATA GCA TCA 579 Tyr Leu Ala Gly Leu Ser Thr Leu Pro Gly Asn Pro Ala Ile Ala Ser 175 180 185 190 CTG ATG GCA TTC ACA GCC TCT ATC ACC AGC CCT CTC ACC ACC CAA CAT 627 Leu Met Ala Phe Thr Ala Ser Ile Thr Ser Pro Leu Thr Thr Gln His 195 200 205 ACC CTC CTG TTT AAC ATC TTT GGG GGA TGG GTG GCC GCC CAA CTC GCC 675 Thr Leu Leu Phe Asn Ile Phe Gly Gly Trp Val Ala Ala Gln Leu Ala 210 215 220 CCT CCC AGC GCT GCT TCA GCT TTT GTG GGC GCC GGC ATA GCT GGC GCG 723 Pro Pro Ser Ala Ala Ser Ala Phe Val Gly Ala Gly Ile Ala Gly Ala 225 230 235 GCT GTT GGC AGC ATA GGC CTT GGG AAG GTG CTT GTG GAC ATC CTG GCG 771 Ala Val Gly Ser Ile Gly Leu Gly Lys Val Leu Val Asp Ile Leu Ala 240 245 250 GGT TAT GGA GCA GGG GTG GCA GGC GCA CTC GTG GCC TTT AAG GTC ATG 819 Gly Tyr Gly Ala Gly Val Ala Gly Ala Leu Val Ala Phe Lys Val Met 255 260 265 270 AGT GGC GAG ATG CCC TCC ACC GAG GAC TTG GTC AAC TTA CTC CCT GCC 867 Ser Gly Glu Met Pro Ser Thr Glu Asp Leu Val Asn Leu Leu Pro Ala 275 280 285 ATC CTC TCT CCT GGC GCC CTG GTC GTC GGA GTC GTG TGC GCA GCA ATA 915 Ile Leu Ser Pro Gly Ala Leu Val Val Gly Val Val Cys Ala Ala Ile 290 295 300 CTG CGT CGA CAT GTG GGC CCA GGG GAG GGG GCT GTG CAG TGG ATG AAC 963 Leu Arg Arg His Val Gly Pro Gly Glu Gly Ala Val Gln Trp Met Asn 305 310 315 CGG CTG C AGCC 974 Arg Leu 320
【０３４３】配列番号：１０５ 配列の長さ：１９ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 CTCCACCATAGATCACTCC 19
【０３４４】配列番号：１０６ 配列の長さ：１８ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 AGGTCTAGTAGACCGTGC 18
【０３４５】配列番号：１０７ 配列の長さ：１８ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 AGGAAGACTTCCGAGCGG 18
【０３４６】配列番号：１０８ 配列の長さ：１９ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 CGTGAACTATGCAACAGGG 19
【０３４７】配列番号：１０９ 配列の長さ：１８ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 ACCGCTCGGAAGTCTTCC 18
【０３４８】配列番号：１１０ 配列の長さ：１８ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GGGCAAGTTCCCTGTTGC 18
【０３４９】配列番号：１１１ 配列の長さ：１８ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCTGGATTCTCTGAGACG 18
【０３５０】配列番号：１１２ 配列の長さ：２３ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GAGGCCGTGAACTGCGATGA 23
【０３５１】配列番号：１１３ 配列の長さ：２３ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 TTCTCTAAGGTGGCNTCNGCNTG 23 Ｎ：イノシン
【０３５２】配列番号：１１４ 配列の長さ：２１ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 CCGGACGCGTTGAANCTNGNGT 21 Ｎ：イノシン
【０３５３】配列番号：１１５ 配列の長さ：２３ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 CATCCAGGTACAACCGAACCA 23
【０３５４】配列番号：１１６ 配列の長さ：２４ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 AACACACGGCCGCCNCANGGNAA 24 Ｎ：イノシン
【０３５５】配列番号：１１７ 配列の長さ：１９ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 CCGGATCCCACAAGCCGTNGTNGA 19 Ｎ：イノシン
【０３５６】配列番号：１１８ 配列の長さ：２０ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GACATGCATGTCATGATGTA 20
【０３５７】配列番号：１１９ 配列の長さ：２６ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GGCTGCAGCCGGTTCATCCACTGCAC 26
【０３５８】配列番号：１２０ 配列の長さ：２６ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGGATCCTGCTTCGCCCAGAAGGTC 26
【０３５９】配列番号：１２１ 配列の長さ：２２ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GACACATGTGTTGCAGTCGATC 22
【０３６０】配列番号：１２２ 配列の長さ：２４ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 CGGTCCNAGNAGTATCTCNTTNCC 24 Ｎ：イノシン
【０３６１】配列番号：１２３ 配列の長さ：３５ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 ATGGGCCCGGGNGANAGNAGNCTCCCCCTNCTNTC 35 Ｎ：イノシン
【０３６２】配列番号：１２４ 配列の長さ：２０ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GGCTATACCGGCGACTTCGA 20
【０３６３】配列番号：１２５ 配列の長さ：２７ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGGATCCGGCCTCACCCACATAGATG 27
【０３６４】配列番号：１２６ 配列の長さ：２３ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGGATCCTCCACCTCCATCGTG 23
【０３６５】配列番号：１２７ 配列の長さ：２０ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 CTGCTGTCGCCCNGNCCCAT 20 Ｎ：イノシン
【０３６６】配列番号：１２８ 配列の長さ：２３ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 ATCACGTGGGGNGCAGANACNGC 23 Ｎ：イノシン
【０３６７】配列番号：１２９ 配列の長さ：２１ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 TGTGCCTGNTTNTGGATGATG 21 Ｎ：イノシン
【０３６８】配列番号：１３０ 配列の長さ：２１ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GGTGAGCATGGAGGTGACCAC 21
【０３６９】配列番号：１３１ 配列の長さ：２１ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 TCATCCTCCTCCGCTCGAAGC 21
【０３７０】配列番号：１３２ 配列の長さ：２３ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GTGGACGCCTTNGCCTTCATNTC 23 Ｎ：イノシン
【０３７１】配列番号：１３３ 配列の長さ：２１ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 ACGGATGTCNTTCTCNGTNAC 21 Ｎ：イノシン
【０３７２】配列番号：１３４ 配列の長さ：３０ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GGCGGAATTCCTGGTCATAGCCTCCGTGAA 30
【０３７３】配列番号：１３５ 配列の長さ：２１ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GGGGNATGGCCTATTGGCCTG 21 Ｎ：イノシン
【０３７４】配列番号：１３６ 配列の長さ：２１ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GGCATGTGGGCCCAGGGGAGG 21
【０３７５】配列番号：１３７ 配列の長さ：２０ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 TGTGAGCCCGAACCGGATGT 20
【０３７６】配列番号：１３８ 配列の長さ：２３ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GTGGTANTCCTGGACTCNTTNGA 23 Ｎ：イノシン
【０３７７】配列番号：１３９ 配列の長さ：２２ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 ACTACCGNGACGTGCTNAANGA 22 Ｎ：イノシン
【０３７８】配列番号：１４０ 配列の長さ：３０ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 TGGGGATCCCGTATGATACCCGCTGCTTTG 30
【０３７９】配列番号：１４１ 配列の長さ：２４ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 ATTGTCAGATCTACGGGGCCACTT 24
【０３８０】配列番号：１４２ 配列の長さ：４３ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCAAGCTTAAAAAAAAAAAAGGGGGATGGCCTATTGGCCTGGA 43
【０３８１】配列番号：１４３ 配列の長さ：１７ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GTAAAACGACGGCCAGT 17
【０３８２】配列番号：１４４ 配列の長さ：１７ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 CAGGAAACAGCTATGAC 17
【０３８３】配列番号：１４５ 配列の長さ：３５ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCAAGCTTATGAGCACAAATCCAAAACCCCAAAGA 35
【０３８４】配列番号：１４６ 配列の長さ：３８ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGAATTCAGATCTTCACCTACGCCGGGGGTCCGTGGG 38
【０３８５】配列番号：１４７ 配列の長さ：３９ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGAATTCAGATCTTCAGATTCTCTGAGACGGCCCTCGT 39
【０３８６】配列番号：１４８ 配列の長さ：１７ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCTACTCCGGATACCAC 17
【０３８７】配列番号：１４９ 配列の長さ：３５ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGTCGACGCTAGCATGAGCACAAATCCAAAACCC 35
【０３８８】配列番号：１５０ 配列の長さ：３５ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGTCGACGCTAGCAGGTCTCGTAGACCGTGCATC 35
【０３８９】配列番号：１５１ 配列の長さ：４０ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGAATTCGCTAGCTCAGGATTCTCTGAGACGGCCCTCGA 40
【０３９０】配列番号：１５２ 配列の長さ：３５ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCAAGCTTATGCGGATCCCACAAGCCGTGGTGGAT 35
【０３９１】配列番号：１５３ 配列の長さ：２４ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 CGGATCCCACAAGCCGTGGTGGAT 24
【０３９２】配列番号：１５４ 配列の長さ：４３ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGAATTCAGATCTTCATCACTCTAAGGTGGCGTCGGCGTGGG 43
【０３９３】配列番号：１５５ 配列の長さ：１１ 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCAAGCTTATG 11
【０３９４】配列番号：１５６ 配列の長さ：２０ 配列の型：核酸 鎖の数：二本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列TGATGAAGATCTGAATTCGC 20
【０３９５】配列番号：１５７ 配列の長さ：３４ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCAAGCTTATGTTCAACGCGTCCGGATGTCCGGA 34
【０３９６】配列番号：１５８ 配列の長さ：２３ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 TTCAACGCGTCCGGATGTCCGGA 23
【０３９７】配列番号：１５９ 配列の長さ：４３ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGAATTCAGATCTTCATCAACAACCGAACCAGTTGCCCTGCG 43
【０３９８】配列番号：１６０ 配列の長さ：３４ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCAAGCTTATGATCGGGGGGGTCGGCAACAATAC 34
【０３９９】配列番号：１６１ 配列の長さ：２３ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 ATCGGGGGGGTCGGCAACAATAC 23
【０４００】配列番号：１６２ 配列の長さ：４３ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGAATTCAGATCTTCATCAAAGCTCTGATCTATCCCTGTCCT 43
【０４０１】配列番号：１６３ 配列の長さ：４１ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGTCGACGCTAGCATGCGGATCCCACAAGCCGTGGTGGAT 41
【０４０２】配列番号：１６４ 配列の長さ：４０ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGTCGACGCTAGCATGTTCAACGCGTCCGGATGTCCGGA 40
【０４０３】配列番号：１６５ 配列の長さ：４０ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGTCGACGCTAGCATGATCGGGGGGGTCGGCAACAATAC 40
【０４０４】配列番号：１６６ 配列の長さ：４０ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGAATTCGCTAGCTCACTCTAAGGTGGCGTCGGCGTGGG 40
【０４０５】配列番号：１６７ 配列の長さ：４０ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGAATTCGCTAGCTCAACAACCGAACCAGTTGCCCTGCG 40
【０４０６】配列番号：１６８ 配列の長さ：４０ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGAATTCGCTAGCTCAAAGCTCTGATCTATCCCTGTCCT 40
【０４０７】配列番号：１６９ 配列の長さ：３２ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCAAGCTTATGTGGTTGTGGATGATGCTGCTG 32
【０４０８】配列番号：：１７０ 配列の長さ：２１ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 TGGTTGTGGATGATGCTGCTG 21
【０４０９】配列番号：１７１ 配列の長さ：４４ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGAATTCAGATCTTCATCACCTCCGGGCGGAGACNGGNAGNCC 44 Ｎ：イノシン
【０４１０】配列番号：１７２ 配列の長さ：３１ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCAAGCTTATGGGCAACGAGNTNCTNCTNGG 31Ｎ：イノシン
【０４１１】配列番号：１７３ 配列の長さ：２０ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GGCAACGAGNTNCTNCTNGG 20 Ｎ：イノシン
【０４１２】配列番号：１７４ 配列の長さ：４１ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGAATTCAGATCTTCATCACTTCAGCCGTATGAGACACTT 41
【０４１３】配列番号：１７５ 配列の長さ：３１ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCAAGCTTATGCTGTCGCCCGGGCCCATCTC 31
【０４１４】配列番号：１７６ 配列の長さ：２０ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 CTGTCGCCCGGGCCCATCTC 20
【０４１５】配列番号：１７７ 配列の長さ：４１ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGAATTCAGATCTTCATCAACATGTGTTGCAGTCGATCAC 41
【０４１６】配列番号：１７８ 配列の長さ：３２ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCAAGCTTATGGGCTATACCGGNGACTTNGAC 32 Ｎ：イノシン
【０４１７】配列番号：１７９ 配列の長さ：２１ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GGCTATACCGGNGACTTNGAC 21 Ｎ：イノシン
【０４１８】配列番号：１８０ 配列の長さ：３５ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGAATTCAGATCTTCAGTGCTTCGCCCAGAAGGT 35
【０４１９】配列番号：１８１ 配列の長さ：２９ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGCTAGCATGTGGTTGTGGATGATGCTG 29
【０４２０】配列番号：１８２ 配列の長さ：３８ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGAATTCGCTAGCTCACAGCCGGTTCATCCACTGCAC 38
【０４２１】配列番号：１８３ 配列の長さ：３２ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCAAGCTTATGCAGCGTGGGTACAAGGGGGTT 32
【０４２２】配列番号：１８４ 配列の長さ：４７ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ
ｖｉｒｕｓ 配列 GCGAATTCAGATCTTCATCAGAGCTGTGACCCAACCGTATATTGGTT 47
【０４２３】配列番号：１８５ 配列の長さ：３３ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGCTAGCATGGGGTACAAGGGGGTTTGGCGGG 33
【０４２４】配列番号：１８６ 配列の長さ：３２ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGCTAGCTCATCGGTTGGGGAGCAGGTAGAT 32
【０４２５】配列番号：１８７ 配列の長さ：２６ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GGATCCCCCCAAGCTTGGGGGAATTC 26
【０４２６】配列番号：１８８ 配列の長さ：３１ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 AGCTTACTAGTTAATACGACTCACTATAGGG 31
【０４２７】配列番号：１８９ 配列の長さ：３３ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 CTGGCACCCTATAGTGAGTCGTATTAACTAGTA 33
【０４２８】配列番号：１９０ 配列の長さ：４４ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 TGCCAGCCCCCTGATGGGGGCGACACTCCACCATAGATCACTCC 44
【０４２９】配列番号：１９１ 配列の長さ：４５ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 TCACAGGGGAGTGATCTATGGTGGAGTGTCGCCCCCATCAGGGGG 45
【０４３０】配列番号：１９２ 配列の長さ：４０ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 CCTGTGAGGAACTACTGTCTTCACGCAGAAAGCGTCTAGC 40
【０４３１】配列番号：１９３ 配列の長さ：３７ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 CATGGCTAGACGCTTTCTGCGTGAAGACAGTAGTTCC 37
【０４３２】配列番号：１９４ 配列の長さ：３３ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCAAGCTTATGCTGCTGTCGCCCGGGCCCATCT 33
【０４３３】配列番号：１９５ 配列の長さ：３８ 配列の型：核酸 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 GCGAATTCAGATCTTCATCATGTGTTGCAGTCGATCAC 38
【０４３４】配列番号：１９６ 配列の長さ：２０ 配列の型：核酸 トポロジー：二本鎖 配列の種類：ｃＤＮＡ 起源：Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ 配列 ＴＧＡＴＡＡＡＧＡＴＣＴＧＡＡＴＴＣＧＣ ２０
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.5 識別記号 庁内整理番号 ＦＩ 技術表示箇所 Ｃ０７Ｋ 13/00 8619−4Ｈ Ｃ１２Ｎ 5/10 15/11 15/85 Ｃ１２Ｐ 21/02 Ｃ 8214−4Ｂ // Ａ６１Ｋ 39/29 9284−4Ｃ (Ｃ１２Ｐ 21/02 Ｃ１２Ｒ 1:91） Ｃ０７Ｋ 99:00 (72)発明者 村上 智子 神奈川県横浜市緑区鴨志田町1000番地 三 菱化成株式会社総合研究所内 (72)発明者 寺西 豊 神奈川県横浜市緑区鴨志田町1000番地 三 菱化成株式会社総合研究所内 (72)発明者 林 紀夫 兵庫県川西市水明台１−１−112

Claims (223)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項１】 配列表の配列番号１に記載のアミノ酸配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチドをコ
    ードする遺伝子。
  2. 【請求項２】 配列表の配列番号２に記載のアミノ酸配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチドをコ
    ードする遺伝子。
  3. 【請求項３】 配列表の配列番号３に記載のアミノ酸配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチドをコ
    ードする遺伝子。
  4. 【請求項４】 配列表の配列番号４に記載のアミノ酸配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチドをコ
    ードする遺伝子。
  5. 【請求項５】 配列表の配列番号５に記載のアミノ酸配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチドをコ
    ードする遺伝子。
  6. 【請求項６】 配列表の配列番号６に記載のアミノ酸配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチドをコ
    ードする遺伝子。
  7. 【請求項７】 配列表の配列番号７に記載のアミノ酸配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチドをコ
    ードする遺伝子。
  8. 【請求項８】 配列表の配列番号８に記載のアミノ酸配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチドをコ
    ードする遺伝子。
  9. 【請求項９】 配列表の配列番号９に記載のアミノ酸配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチドをコ
    ードする遺伝子。
  10. 【請求項１０】 配列表の配列番号１０に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  11. 【請求項１１】 配列表の配列番号１１に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  12. 【請求項１２】 配列表の配列番号１２に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  13. 【請求項１３】 配列表の配列番号１３に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  14. 【請求項１４】 配列表の配列番号１４に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  15. 【請求項１５】 配列表の配列番号１５に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  16. 【請求項１６】 配列表の配列番号１６に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  17. 【請求項１７】 配列表の配列番号１７に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  18. 【請求項１８】 配列表の配列番号１８に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  19. 【請求項１９】 配列表の配列番号１９に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  20. 【請求項２０】 配列表の配列番号２０に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  21. 【請求項２１】 配列表の配列番号２１に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  22. 【請求項２２】 配列表の配列番号２２に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  23. 【請求項２３】 配列表の配列番号２３に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  24. 【請求項２４】 配列表の配列番号２４に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  25. 【請求項２５】 配列表の配列番号２５に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  26. 【請求項２６】 配列表の配列番号２６に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  27. 【請求項２７】 配列表の配列番号２７に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  28. 【請求項２８】 配列表の配列番号２８に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  29. 【請求項２９】 配列表の配列番号２９に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  30. 【請求項３０】 配列表の配列番号３０に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  31. 【請求項３１】 配列表の配列番号３１に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  32. 【請求項３２】 配列表の配列番号３２に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  33. 【請求項３３】 配列表の配列番号３３に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  34. 【請求項３４】 配列表の配列番号３４に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  35. 【請求項３５】 配列表の配列番号３５に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  36. 【請求項３６】 配列表の配列番号３６に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  37. 【請求項３７】 配列表の配列番号３７に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  38. 【請求項３８】 配列表の配列番号３８に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  39. 【請求項３９】 配列表の配列番号３９に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  40. 【請求項４０】 配列表の配列番号４０に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  41. 【請求項４１】 配列表の配列番号４１に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  42. 【請求項４２】 配列表の配列番号４２に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  43. 【請求項４３】 配列表の配列番号４３に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  44. 【請求項４４】 配列表の配列番号６４に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  45. 【請求項４５】 配列表の配列番号６５に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  46. 【請求項４６】 配列表の配列番号６６に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  47. 【請求項４７】 配列表の配列番号６７に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  48. 【請求項４８】 配列表の配列番号６８に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  49. 【請求項４９】 配列表の配列番号６９に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  50. 【請求項５０】 配列表の配列番号７０に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  51. 【請求項５１】 配列表の配列番号７１に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  52. 【請求項５２】 配列表の配列番号７２に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  53. 【請求項５３】 配列表の配列番号７３に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  54. 【請求項５４】 配列表の配列番号７４に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  55. 【請求項５５】 配列表の配列番号７５に記載のアミノ
    酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチド
    をコードする遺伝子。
  56. 【請求項５６】 配列表の配列番号１０１に記載のアミ
    ノ酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチ
    ドをコードする遺伝子。
  57. 【請求項５７】 配列表の配列番号１０２に記載のアミ
    ノ酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチ
    ドをコードする遺伝子。
  58. 【請求項５８】 配列表の配列番号１０３に記載のアミ
    ノ酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチ
    ドをコードする遺伝子。
  59. 【請求項５９】 配列表の配列番号１０４に記載のアミ
    ノ酸配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のポリペプチ
    ドをコードする遺伝子。
  60. 【請求項６０】 配列表の配列番号１に記載の塩基配列
    で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  61. 【請求項６１】 配列表の配列番号２に記載の塩基配列
    で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  62. 【請求項６２】 配列表の配列番号３に記載の塩基配列
    で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  63. 【請求項６３】 配列表の配列番号４に記載の塩基配列
    で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  64. 【請求項６４】 配列表の配列番号５に記載の塩基配列
    で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  65. 【請求項６５】 配列表の配列番号６に記載の塩基配列
    で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  66. 【請求項６６】 配列表の配列番号７に記載の塩基配列
    で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  67. 【請求項６７】 配列表の配列番号８に記載の塩基配列
    で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  68. 【請求項６８】 配列表の配列番号９に記載の塩基配列
    で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  69. 【請求項６９】 配列表の配列番号１０に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  70. 【請求項７０】 配列表の配列番号１１に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  71. 【請求項７１】 配列表の配列番号１２に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  72. 【請求項７２】 配列表の配列番号１３に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  73. 【請求項７３】 配列表の配列番号１４に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  74. 【請求項７４】 配列表の配列番号１５に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  75. 【請求項７５】 配列表の配列番号１６に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  76. 【請求項７６】 配列表の配列番号１７に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  77. 【請求項７７】 配列表の配列番号１８に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  78. 【請求項７８】 配列表の配列番号１９に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  79. 【請求項７９】 配列表の配列番号２０に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  80. 【請求項８０】 配列表の配列番号２１に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  81. 【請求項８１】 配列表の配列番号２２に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  82. 【請求項８２】 配列表の配列番号２３に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  83. 【請求項８３】 配列表の配列番号２４に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  84. 【請求項８４】 配列表の配列番号２５に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  85. 【請求項８５】 配列表の配列番号２６に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  86. 【請求項８６】 配列表の配列番号２７に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  87. 【請求項８７】 配列表の配列番号２８に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  88. 【請求項８８】 配列表の配列番号２９に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  89. 【請求項８９】 配列表の配列番号３０に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  90. 【請求項９０】 配列表の配列番号３１に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  91. 【請求項９１】 配列表の配列番号３２に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  92. 【請求項９２】 配列表の配列番号３３に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  93. 【請求項９３】 配列表の配列番号３４に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  94. 【請求項９４】 配列表の配列番号３５に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  95. 【請求項９５】 配列表の配列番号３６に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  96. 【請求項９６】 配列表の配列番号３７に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  97. 【請求項９７】 配列表の配列番号３８に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  98. 【請求項９８】 配列表の配列番号３９に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  99. 【請求項９９】 配列表の配列番号４０に記載の塩基配
    列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  100. 【請求項１００】 配列表の配列番号４１に記載の塩基
    配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  101. 【請求項１０１】 配列表の配列番号４２に記載の塩基
    配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  102. 【請求項１０２】 配列表の配列番号４３に記載の塩基
    配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  103. 【請求項１０３】 配列表の配列番号６４に記載の塩基
    配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  104. 【請求項１０４】 配列表の配列番号６５に記載の塩基
    配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  105. 【請求項１０５】 配列表の配列番号６６に記載の塩基
    配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  106. 【請求項１０６】 配列表の配列番号６７に記載の塩基
    配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  107. 【請求項１０７】 配列表の配列番号６８に記載の塩基
    配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  108. 【請求項１０８】 配列表の配列番号６９に記載の塩基
    配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  109. 【請求項１０９】 配列表の配列番号７０に記載の塩基
    配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  110. 【請求項１１０】 配列表の配列番号７１に記載の塩基
    配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  111. 【請求項１１１】 配列表の配列番号７２に記載の塩基
    配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  112. 【請求項１１２】 配列表の配列番号７３に記載の塩基
    配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  113. 【請求項１１３】 配列表の配列番号７４に記載の塩基
    配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  114. 【請求項１１４】 配列表の配列番号７５に記載の塩基
    配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  115. 【請求項１１５】 配列表の配列番号１０１に記載の塩
    基配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  116. 【請求項１１６】 配列表の配列番号１０２に記載の塩
    基配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  117. 【請求項１１７】 配列表の配列番号１０３に記載の塩
    基配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  118. 【請求項１１８】 配列表の配列番号１０４に記載の塩
    基配列で表されるＣ型肝炎ウイルス由来のＤＮＡ断片。
  119. 【請求項１１９】 配列表の配列番号１、９、１０、１
    １または１２に記載のアミノ酸配列のうち１番目から１
    ８番目までの１８個のアミノ酸で表されるポリペプチ
    ド。
  120. 【請求項１２０】 請求項１１９に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  121. 【請求項１２１】 配列表の配列番号３に記載のアミノ
    酸配列のうち４０番目から７３番目までの３４個のアミ
    ノ酸で表されるポリペプチド。
  122. 【請求項１２２】 請求項１２１に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  123. 【請求項１２３】 配列表の配列番号３に記載のアミノ
    酸配列のうち８１番目から１１５番目までの３５個のア
    ミノ酸で表されるポリペプチド。
  124. 【請求項１２４】 請求項１２３に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  125. 【請求項１２５】 配列表の配列番号３に記載のアミノ
    酸配列のうち１番目から１９１番目までの１９１個のア
    ミノ酸で表されるポリペプチド。
  126. 【請求項１２６】 請求項１２５に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  127. 【請求項１２７】 配列表の配列番号３及び７に記載の
    アミノ酸配列のうち１番目から１１５番目までの１１５
    個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  128. 【請求項１２８】 請求項１２７に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  129. 【請求項１２９】 配列表の配列番号４に記載のアミノ
    酸配列のうち３１番目から２２２番目までの１９２個の
    アミノ酸で表されるポリペプチド。
  130. 【請求項１３０】 請求項１２９に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  131. 【請求項１３１】 配列表の配列番号４に記載のアミノ
    酸配列のうち１３４番目から１５２番目までの１９個の
    アミノ酸で表されるポリペプチド。
  132. 【請求項１３２】 配列表の配列番号４に記載のアミノ
    酸配列のうち２２３番目から２３９番目までの１７個の
    アミノ酸で表されるポリペプチド。
  133. 【請求項１３３】 配列表の配列番号４に記載のアミノ
    酸配列のうち９２番目から１０９番目までの１８個のア
    ミノ酸で表されるポリペプチド。
  134. 【請求項１３４】 配列表の配列番号４に記載のアミノ
    酸配列のうち４０番目から５７番目までの１８個のアミ
    ノ酸で表されるポリペプチド。
  135. 【請求項１３５】 配列表の配列番号４に記載のアミノ
    酸配列のうち２４０番目から２５１番目までの１２個の
    アミノ酸で表されるポリペプチド。
  136. 【請求項１３６】 配列表の配列番号４に記載のアミノ
    酸配列のうち３１番目から１０６番目までの７６個のア
    ミノ酸で表されるポリペプチド。
  137. 【請求項１３７】 請求項１３６に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  138. 【請求項１３８】 配列表の配列番号４に記載のアミノ
    酸配列のうち１３４番目から１６９番目までの３６個の
    アミノ酸で表されるポリペプチド。
  139. 【請求項１３９】 請求項１３８に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  140. 【請求項１４０】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち１４３番目から１５５番目ま
    での１３個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  141. 【請求項１４１】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち１７１番目から１９１番目ま
    での２１個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  142. 【請求項１４２】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち、少なくとも１８２番目から
    １８７番目までの６個のアミノ酸で表されるポリペプチ
    ドを含み、配列番号３１または３２に記載のアミノ酸配
    列由来で長さが１０から２５アミノ酸残基からなるポリ
    ペプチド。
  143. 【請求項１４３】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち２０２番目から２１５番目ま
    での１４個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  144. 【請求項１４４】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち、少なくとも２０２番目から
    ２０９番目までの８個のアミノ酸で表されるポリペプチ
    ドを含み、配列番号３１または３２に記載のアミノ酸配
    列由来で長さが１０から２５アミノ酸残基からなるポリ
    ペプチド。
  145. 【請求項１４５】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち２４４番目から２５６番目ま
    での１３個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  146. 【請求項１４６】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち２９９番目から３１９番目ま
    での２１個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  147. 【請求項１４７】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち１０９番目から２１４番目ま
    での１０６個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  148. 【請求項１４８】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち２３３番目から３２４番目ま
    での９２個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  149. 【請求項１４９】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち２５２番目から２６１番目ま
    での１０個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  150. 【請求項１５０】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち、少なくとも２５２番目から
    ２５６番目までの５個のアミノ酸で表されるポリペプチ
    ドを含み、配列番号３１または３２に記載のアミノ酸配
    列由来で長さが１０から２５アミノ酸残基からなるポリ
    ペプチド。
  151. 【請求項１５１】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち２５０番目から２８３番目ま
    での３４個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  152. 【請求項１５２】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち、少なくとも２７３番目から
    ２７９番目までの７個のアミノ酸で表されるポリペプチ
    ドを含み、配列番号３１または３２に記載のアミノ酸配
    列由来で長さが１０から２５アミノ酸残基からなるポリ
    ペプチド。
  153. 【請求項１５３】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち７７番目から９６番目までの
    ２０個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  154. 【請求項１５４】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち１２２番目から１３７番目ま
    での１６個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  155. 【請求項１５５】 請求項１４７に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  156. 【請求項１５６】 請求項１４８に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  157. 【請求項１５７】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち１３６番目から１４７番目ま
    での１２個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  158. 【請求項１５８】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち、少なくとも１３６番目から
    １４２番目までの７個のアミノ酸で表されるポリペプチ
    ドを含み、配列番号３１または３２に記載のアミノ酸配
    列由来で長さが１０から２５アミノ酸残基からなるポリ
    ペプチド。
  159. 【請求項１５９】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち４５番目から７１番目までの
    ２７個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  160. 【請求項１６０】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち３０６番目から３２３番目ま
    での１８個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  161. 【請求項１６１】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち、少なくとも５３番目から６
    ９番目までの１７個のアミノ酸で表されるポリペプチド
    を含み、配列番号３１または３２に記載のアミノ酸配列
    由来で長さが１７から２５アミノ酸残基からなるポリペ
    プチド。
  162. 【請求項１６２】 配列表の配列番号３１または３２に
    記載のアミノ酸配列のうち１９３番目から２０１番目ま
    での９個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  163. 【請求項１６３】 配列表の配列番号４３に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、４６１番目から７２６番目までの２６
    ６個のアミノ酸で表されるポリペプチドもしくはその全
    てあるいは一部を含むポリペプチド。
  164. 【請求項１６４】 配列表の配列番号４３に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、９６３番目から１００４番目までの４
    ２個のアミノ酸で表されるポリペプチドもしくはその全
    てあるいは一部を含むポリペプチド。
  165. 【請求項１６５】 配列表の配列番号４３に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、２４７番目から２６５番目までの１９
    個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  166. 【請求項１６６】 配列表の配列番号４３に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、２８３番目から３２７番目までの４５
    個のアミノ酸で表されるポリペプチドもしくはその全て
    あるいは一部を含むポリペプチド。
  167. 【請求項１６７】 配列表の配列番号４３に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、２８３番目から２９２番目までの１０
    個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  168. 【請求項１６８】 配列表の配列番号４３に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、少なくとも３００番目から３０７番目
    までの８個のアミノ酸で表されるポリペプチドを含み、
    配列番号４３に記載のアミノ酸配列由来で長さが８から
    ２５アミノ酸残基からなるポリペプチド。
  169. 【請求項１６９】 配列表の配列番号４３に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、３１５番目から３２７番目までの１５
    個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  170. 【請求項１７０】 配列表の配列番号４３に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、少なくとも４１０番目から４２８番目
    までの１３個のアミノ酸で表されるポリペプチドを含
    み、配列番号４３に記載のアミノ酸配列由来で長さが１
    ３から２５アミノ酸残基からなるポリペプチド。
  171. 【請求項１７１】 配列表の配列番号４３に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、少なくとも４７７番目から５５０番目
    までの７４個のアミノ酸で表されるポリペプチドもしく
    はその全てあるいは一部を含むポリペプチド。
  172. 【請求項１７２】 配列表の配列番号４３に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、４７７番目から４９０番目までの１４
    個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  173. 【請求項１７３】 配列表の配列番号４３に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、４９８番目から５１２番目までの１４
    個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  174. 【請求項１７４】 配列表の配列番号４３に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、５３８番目から５５０番目までの１２
    個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  175. 【請求項１７５】 配列表の配列番号４３に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、少なくとも６６５番目から６７２番目
    までの８個のアミノ酸で表されるポリペプチドを含み、
    配列番号４３に記載のアミノ酸配列由来で長さが８から
    ２５アミノ酸残基からなるポリペプチド。
  176. 【請求項１７６】 配列表の配列番号４３に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、７４７番目から７６７番目までの２１
    個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  177. 【請求項１７７】 配列表の配列番号４３に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、８４１番目から８５２番目までの１２
    個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  178. 【請求項１７８】 配列表の配列番号４３に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、少なくとも８６７番目から８７８番目
    までの１２個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  179. 【請求項１７９】 配列表の配列番号４３に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、２１５番目から２７５番目までの６１
    個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  180. 【請求項１８０】 請求項１６３に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  181. 【請求項１８１】 請求項１６４に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  182. 【請求項１８２】 請求項１６６に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  183. 【請求項１８３】 請求項１７１に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  184. 【請求項１８４】 請求項１７９に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  185. 【請求項１８５】 配列表の配列番号７５に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、４１３番目から４８６番目までの７４
    個のアミノ酸で表されるポリペプチドもしくはその全て
    あるいは一部を含むポリペプチド。
  186. 【請求項１８６】 配列表の配列番号７５に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、４１５番目から１４１１番目までの９
    ９７個のアミノ酸で表されるポリペプチドもしくはその
    全てあるいは一部を含むポリペプチド。
  187. 【請求項１８７】 配列表の配列番号７５に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、２４７番目から２６５番目までの１９
    個のアミノ酸で表されるポリペプチドもしくはその全て
    あるいは一部を含むポリペプチド。
  188. 【請求項１８８】 配列表の配列番号７５に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、６５５番目から７２８番目までの７４
    個のアミノ酸で表されるポリペプチドもしくはその全て
    あるいは一部を含むポリペプチド。
  189. 【請求項１８９】 配列表の配列番号７５に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、７６３番目から８１６番目までの５４
    個のアミノ酸で表されるポリペプチドもしくはその全て
    あるいは一部を含むポリペプチド。
  190. 【請求項１９０】 配列表の配列番号７５に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、少なくとも３２４番目から３４３番目
    までの２０個のアミノ酸で表されるポリペプチドで、長
    さが少なくとも８アミノ酸残基からなるポリペプチド。
  191. 【請求項１９１】 配列表の配列番号７５に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、８５８番目から９５５番目までの９８
    個のアミノ酸で表されるポリペプチドもしくはその全て
    あるいは一部を含むポリペプチド。
  192. 【請求項１９２】 配列表の配列番号７５に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、少なくとも３５６番目から３６９番目
    までの１４個のアミノ酸で表されるポリペプチドを含
    み、配列番号７５に記載のアミノ酸配列由来で長さが１
    ４から２５アミノ酸残基からなるポリペプチド。
  193. 【請求項１９３】 配列表の配列番号７５に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、少なくとも１００９番目から１１００
    番目までの９２個のアミノ酸で表されるポリペプチドも
    しくはその全てあるいは一部を含むポリペプチド。
  194. 【請求項１９４】 配列表の配列番号７５に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、１１６０番目から１２２５番目までの
    ６６個のアミノ酸で表されるポリペプチドもしくはその
    全てあるいは一部を含むポリペプチド。
  195. 【請求項１９５】 配列表の配列番号７５に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、５８４番目から６０１番目までの１８
    個のアミノ酸で表されるポリペプチドを含み、配列番号
    ７５に記載のアミノ酸配列由来で長さが１８から２５ア
    ミノ酸残基からなるポリペプチド。
  196. 【請求項１９６】 配列表の配列番号７５に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、６１５番目から６５６番目までの４２
    個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  197. 【請求項１９７】 配列表の配列番号７５に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、少なくとも３２６番目から３３７番目
    までの１１個のアミノ酸で表されるポリペプチドを含
    み、配列番号７５に記載のアミノ酸配列由来で長さが１
    １から２５アミノ酸残基からなるポリペプチド。
  198. 【請求項１９８】 配列表の配列番号７５に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、５８８番目から５９７番目までの１０
    個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  199. 【請求項１９９】 配列表の配列番号７５に記載のアミ
    ノ酸配列のうち、６２０番目から６２９番目までの１０
    個のアミノ酸で表されるポリペプチド。
  200. 【請求項２００】 請求項１８５に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  201. 【請求項２０１】 請求項１８６に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  202. 【請求項２０２】 請求項１８８に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  203. 【請求項２０３】 請求項１９１に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  204. 【請求項２０４】 請求項１９３に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  205. 【請求項２０５】 請求項１９４に記載のポリペプチド
    をコードするＤＮＡ断片。
  206. 【請求項２０６】 プロモーターの下流に請求項６０、
    ６１、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、６
    ９、７０、７１、１２０、１２２、１２４、１２６また
    は１２８に記載のＣ型肝炎ウイルス由来ＤＮＡ断片を、
    該ＤＮＡ断片によってコードされるポリペプチドが発現
    するように組み込んだ発現ベクター。
  207. 【請求項２０７】 請求項２０６に記載の発現ベクター
    で形質転換された宿主細胞を培養して該ポリペプチドを
    産生させる方法。
  208. 【請求項２０８】 請求項２０６に記載の発現ベクター
    で形質転換された宿主細胞。
  209. 【請求項２０９】 プロモーターの下流に請求項１２
    ９、１３７または１３９に記載のＣ型肝炎ウイルス由来
    ＤＮＡ断片を、該ＤＮＡ断片によってコードされるポリ
    ペプチドが発現するように組み込んだ発現ベクター。
  210. 【請求項２１０】 請求項２０９に記載の発現ベクター
    で形質転換された宿主細胞を培養して該ポリペプチドを
    産生させる方法。
  211. 【請求項２１１】 請求項２０９に記載の発現ベクター
    で形質転換された宿主細胞。
  212. 【請求項２１２】 プロモーターの下流に請求項７２、
    ７３、７４、７５、７６、７７、７８、７９、８０、８
    １、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８
    ９、９０、９１、１５５または１５６に記載のＣ型肝炎
    ウイルス由来ＤＮＡ断片を、該ＤＮＡ断片によってコー
    ドされるポリペプチドが発現するように組み込むか、あ
    るいは該ＤＮＡを含むＤＮＡによって該ポリペプチドを
    含むポリペプチドが発現するように組み込んだ発現ベク
    ター。
  213. 【請求項２１３】 請求項２１２に記載の発現ベクター
    で形質転換された宿主細胞を培養して該ポリペプチドを
    産生させる方法。
  214. 【請求項２１４】 請求項２１２に記載の発現ベクター
    で形質転換された宿主細胞。
  215. 【請求項２１５】 プロモーターの下流に請求項９２、
    ９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、１００、
    １０１、１０２、１１７、１１８、１７１または１８４
    に記載のＣ型肝炎ウイルス由来ＤＮＡ断片を、該ＤＮＡ
    断片によってコードされるポリペプチドが発現するよう
    に組み込むか、あるいは該ＤＮＡを含むＤＮＡによって
    該ポリペプチドを含むポリペプチドが発現するように組
    み込んだ発現ベクター。
  216. 【請求項２１６】 請求項２１５に記載の発現ベクター
    で形質転換された宿主細胞を培養して該ポリペプチドを
    産生させる方法。
  217. 【請求項２１７】 請求項２１５に記載の発現ベクター
    で形質転換された宿主細胞。
  218. 【請求項２１８】 プロモーターの下流に請求項１８
    ５、１８６、１８８、１８９、１９１、１９３、１９４
    または１９６に記載のＣ型肝炎ウイルス由来ＤＮＡ断片
    を、該ＤＮＡ断片によってコードされるポリペプチドが
    発現するように組み込むか、あるいは該ＤＮＡを含むＤ
    ＮＡによって該ポリペプチドを含むポリペプチドが発現
    するように組み込んだ発現ベクター。
  219. 【請求項２１９】 請求項２１８に記載の発現ベクター
    で形質転換された宿主細胞を培養して該ポリペプチドを
    産生させる方法。
  220. 【請求項２２０】 請求項２１８に記載の発現ベクター
    で形質転換された宿主細胞。
  221. 【請求項２２１】 配列表の配列番号１、９、１０、１
    １または１２に記載の塩基配列で、１番目から３１７番
    目までの３１７個のヌクレオチドから選ばれる少なくと
    も１５塩基以上からなる１本鎖ＤＮＡ断片またはそのア
    ンチセンスＤＮＡ断片。
  222. 【請求項２２２】 １６から３０塩基の長さからなるこ
    とを特徴とする請求項２２１に記載のＤＮＡ断片。
  223. 【請求項２２３】 １７から２３塩基の長さからなるこ
    とを特徴とする請求項２２１に記載のＤＮＡ断片。
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* Cited by examiner, † Cited by third party
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CN116285833A (zh) * 2022-12-27 2023-06-23 旭川化学（苏州）有限公司 一种服装革用粘结层材料及其制备方法和应用

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