JP7635291B2 - 組織特異的Wntシグナル増強分子およびその使用 - Google Patents
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Description
本出願は、2017年1月26日に出願された米国仮特許出願第62/450,804号、および2017年4月19日に出願された米国仮特許出願第62/487,135号の優先権を主張し、その各々は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
配列表に関する記載
本出願に関連する配列表は、紙のコピーの代わりにテキストフォーマットで提供され、参照により本明細書に組み込まれる。配列表を含むテキストファイルの名前は、SRZN_003_02WO_ST25.txtである。テキストファイルは454KBで、2018年1月26日に作成され、EFS-Webを介して電子的に送信されている。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
(項目1)
組織特異的Wnt(「ウィングレス関連統合部位」または「ウィングレスおよびInt-1」または「ウィングレス-Int」)シグナル増強分子、またはその薬学的に許容される塩であって、ジンクリングフィンガー3(ZNRF3)およびリングフィンガータンパク質43(RNF43)から選択される1つ以上の膜貫通型E3ユビキチンリガーゼに特異的に結合する第1のドメインと、組織特異的細胞表面分子に特異的に結合する第2のドメインとを含み、前記化合物が、前記組織特異的細胞表面分子を含む前記組織においてWntシグナル伝達を増加させる、組織特異的Wntシグナル増強分子、またはその薬学的に許容される塩。
(項目2)
前記組織が、骨組織、肝臓組織、皮膚組織、胃組織、腸管組織、口腔粘膜組織、腎臓組織、中枢神経系組織、乳腺組織、味蕾組織、卵巣組織、内耳組織(蝸牛および前庭組織を含む)、毛包、膵臓組織、網膜組織、角膜組織、心臓組織および肺組織からなる群から選択される、項目1に記載の分子。
(項目3)
前記第1のドメインが、第1のポリペプチド配列を含み、かつ/または前記第2のドメインが、第2のポリペプチド配列を含む、項目1または項目2に記載の分子。
(項目4)
前記化合物が、前記第1のポリペプチド配列および前記第2のポリペプチド配列を含む融合タンパク質または抗体である、項目3に記載の分子。
(項目5)
前記第1のポリペプチド配列が、
a)R-スポンジンポリペプチド配列であって、前記R-スポンジンが、場合により、R-スポンジン-1、R-スポンジン-2、R-スポンジン-3、またはR-スポンジン-4である、R-スポンジンポリペプチド配列またはその断片もしくはバリアント、あるいは
b)R-スポンジンフリンドメイン1配列および、場合により、野生型もしくは変異型フリンドメイン2またはそれらの断片もしくはバリアントを含み、前記第1のポリペプチド配列は、場合により、全長R-スポンジンと比較してロイシンリッチリピート含有Gタンパク質共役受容体4~6(LGR4~6)への結合が減少している、項目3または項目4に記載の分子。
(項目6)
前記R-スポンジンフリンドメイン1が、配列番号1~4に存在するフリン1ドメインのうちのいずれかと少なくとも90%の同一性を有する、項目5に記載の分子。
(項目7)
前記第2のポリペプチド配列が、ペプチド、ポリペプチド、抗体もしくはその断片、あるいはリガンドまたはその断片もしくはバリアントである、項目3~6のいずれかに記載の分子。
(項目8)
a)前記組織が、骨組織であり、前記細胞表面分子が、副甲状腺ホルモン受容体1(PTH1R)であるか、
b)前記組織が、肝臓組織であり、前記細胞表面分子が、アシアロ糖タンパク質受容体1(ASGR1)、アシアロ糖タンパク質受容体2(ASGR2)、トランスフェリン受容体2(TFR2)もしくは溶質キャリアファミリー10メンバー1(SLC10A1)であるか、または
c)前記組織が、口腔粘膜であり、前記細胞表面分子が、Ly6/PLAURドメイン含有3(LYPD3)もしくはデスモグレイン(DSG3)である、項目1~7のいずれか一項に記載の分子。
(項目9)
a)前記細胞表面分子が、副甲状腺ホルモン受容体1(PTH1R)であり、前記第2のポリペプチド配列が、PTH1Rに特異的に結合するか、
b)前記細胞表面分子が、アシアロ糖タンパク質受容体1(ASGR1)であり、前記第2のポリペプチド配列が、ASGR1に特異的に結合するか、
c)前記細胞表面分子が、アシアロ糖タンパク質受容体2(ASGR2)であり、前記第2のポリペプチド配列が、ASGR2に特異的に結合するか、
d)前記細胞表面分子が、溶質キャリアファミリー10メンバー1(SLC10A1)であり、前記第2のポリペプチド配列が、溶質キャリアファミリー10メンバー1(SLC10A1)に特異的に結合するか、
e)前記細胞表面分子が、トランスフェリン受容体2(TFR2)であり、前記第2のポリペプチド配列が、TFR2に特異的に結合するか、
f)前記細胞表面分子が、Ly6/PLAURドメイン含有3(LYPD3)であり、前記第2のポリペプチド配列が、LYPD3に特異的に結合するか、または
g)前記細胞表面分子が、デスモグレイン(DSG3)であり、前記第2のポリペプチド配列が、DSG3に特異的に結合し、
前記第2のポリペプチドが、抗体もしくはその断片または抗体とは異なるペプチドもしくはポリペプチド、低分子、あるいは前記細胞表面分子のリガンドまたはその断片もしくはバリアントである、項目3~8のいずれかに記載の分子。
(項目10)
前記第1のドメインおよび前記第2のドメインが、リンカー部分によって結合している、項目1~9のいずれかに記載の分子。
(項目11)
前記リンカー部分が、ペプチジルリンカー配列である、項目10に記載の分子。
(項目12)
前記リンカー配列が、グリシン、アスパラギン、セリン、トレオニンおよびアラニンからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸を含む、項目11に記載の分子。
(項目13)
項目4~12のいずれかに記載の融合タンパク質をコードする核酸配列。
(項目14)
前記核酸配列が、DNAまたはmRNAである、項目13に記載の核酸配列。
(項目15)
項目13に記載の核酸配列を含むベクター。
(項目16)
前記ベクターが、前記核酸配列に機能的に連結されたプロモーター配列を含む発現ベクターである、項目15に記載のベクター。
(項目17)
前記ベクターが、前記核酸配列に機能的に連結されたプロモーター配列を含むウイルスである、項目15に記載のベクター。
(項目18)
項目16に記載のベクターを含む宿主細胞。
(項目19)
項目4~12のいずれかに記載の融合ポリペプチドを生成するための方法であって、前記融合ポリペプチドが前記発現ベクターによって発現される条件下で項目18に記載の宿主細胞を培養することを含む、方法。
(項目20)
生成された前記融合ポリペプチドを単離する工程をさらに含む、項目19に記載の方法。
(項目21)
(i)有効量の、項目1~12のいずれかに記載の分子、項目13~14のいずれかに記載の核酸配列、項目15~17のいずれかに記載のベクター、または項目18に記載の宿主細胞と、
(ii)薬学的に許容される希釈剤、アジュバントまたは担体と、を含む、薬学的組成物。
(項目22)
有効量の項目1~12のいずれかに記載の分子と、有効量のWntポリペプチド、ノリンポリペプチド、またはWntシグナル伝達アゴニスト分子とを含む、項目21に記載の薬学的組成物。
(項目23)
有効量の項目13~14のいずれかに記載の核酸配列と、Wntポリペプチド、ノリンポリペプチド、またはWntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする有効量の核酸配列とを含み、前記Wntポリペプチド、前記ノリンポリペプチド、または前記Wntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする前記核酸配列が、場合によりDNAまたはmRNAである、項目21に記載の薬学的組成物。
(項目24)
項目13~14のいずれかに記載の核酸配列および/または前記Wntポリペプチド、前記ノリンポリペプチド、もしくは前記Wntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする前記核酸配列が、修飾mRNAである、項目23に記載の薬学的組成物。
(項目25)
有効量の項目15~17のいずれかに記載のベクターと、Wntポリペプチド、ポリペプチド、またはWntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする核酸配列を含む有効量のベクターとを含み、ノリン前記Wntポリペプチド、前記ノリンポリペプチド、または前記Wntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする前記核酸配列を含む前記ベクターが、場合により発現ベクターである、項目22に記載の薬学的組成物。
(項目26)
(i)Wntポリペプチド、ノリンポリペプチド、またはWntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする有効量の核酸と、
(ii)薬学的に許容される希釈剤、アジュバントまたは担体と、を含む、薬学的組成物。
(項目27)
前記核酸が、DNAまたはmRNA、場合により修飾mRNAである、項目26に記載の薬学的組成物。
(項目28)
前記核酸が、発現ベクター、場合によりウイルスベクター中に存在する、項目26に記載の薬学的組成物。
(項目29)
前記Wntポリペプチドが、Wnt1、Wnt2、Wnt2B、Wnt3、Wnt3A、Wnt4、Wnt5A、Wnt5B、Wnt6、Wnt7A、Wnt7B、Wnt8A、Wnt8B、Wnt9A、Wnt9B、Ant10A、Wnt10B、Wnt11、およびWnt16、ならびにこれらのうちのいずれかの機能的バリアントおよび断片から選択される哺乳動物Wntポリペプチドである、項目22~28のいずれかに記載の薬学的組成物。
(項目30)
前記ノリンポリペプチドが、哺乳動物ノリンポリペプチドまたはその機能的バリアントもしくは断片である、項目22~28のいずれかに記載の薬学的組成物。
(項目31)
前記Wntシグナル伝達アゴニスト分子が、フリズルド(Fzd)受容体をLrp5/6と二量体化させる水溶性Wntシグナル伝達アゴニストである、項目22~28のいずれかに記載の薬学的組成物。
(項目32)
前記Wntシグナル伝達アゴニスト分子が、ポリペプチドを含む、項目31に記載の薬学的組成物。
(項目33)
前記ポリペプチドが、1つ以上のFzdタンパク質に対して高い親和性を有する結合ドメインと、Lrp5/Lrp6タンパク質に対して高い親和性を有する結合ドメインとを含み、前記結合ドメインが、場合により、直接結合しているか、またはリンカーにより結合している、項目32に記載の薬学的組成物。
(項目34)
標的組織においてWnt(「ウィングレス関連統合部位」または「ウィングレスおよびInt-1」または「ウィングレス-Int」)シグナル伝達を増加させるための方法であって、前記標的組織を、
a)項目1~12のいずれかに記載の分子、項目13~14のいずれかに記載の核酸、項目15~17のいずれかに記載のベクター、または項目18に記載の宿主細胞であって、前記第2のドメインが前記標的組織上の細胞特異的表面分子に特異的に結合し、項目1~12のいずれか一項に記載の分子が前記標的組織に結合して、前記標的組織におけるジンクリングフィンガー3(ZNRF3)およびリングフィンガータンパク質43(RNF43)から選択される1つ以上の膜貫通型E3ユビキチンリガーゼを隔離またはそのエンドサイトーシスを増加させるもの、および/または
b)Wntポリペプチド、ノリンポリペプチド、もしくはWntシグナル伝達アゴニスト分子;Wntポリペプチド、ノリンポリペプチド、もしくはWntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする核酸配列;Wntポリペプチド、ノリンポリペプチド、もしくはWntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする核酸配列を含むベクター;またはWntポリペプチド、ノリンポリペプチド、もしくはWntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする核酸配列を含む発現ベクターを含む宿主細胞であって、前記Wntポリペプチド、前記ノリンポリペプチド、または前記Wntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする前記核酸配列が、場合によりDNAまたはmRNA、場合により修飾mRNAであるもの、と接触させることを含む、方法。
(項目35)
前記標的組織を項目1~12のいずれかに記載の分子と接触させることを含む、項目34に記載の方法。
(項目36)
前記標的組織を項目13~14のいずれかに記載の核酸と接触させることを含む、項目34に記載の方法。
(項目37)
前記標的組織を項目15~17のいずれかに記載のベクターと接触させることを含む、項目34に記載の方法。
(項目38)
前記標的組織を、前記Wntポリペプチド、前記ノリンポリペプチド、または前記Wntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする前記核酸配列と接触させることを含む、項目34に記載の方法。
(項目39)
a)前記組織が、骨組織であり、前記細胞表面分子が、副甲状腺ホルモン受容体1(PTH1R)であるか、
b)前記組織が、肝臓組織であり、前記細胞表面分子が、アシアロ糖タンパク質受容体1(ASGR1)、アシアロ糖タンパク質受容体2(ASGR2)、トランスフェリン受容体2(TFR2)、もしくは溶質キャリアファミリー10メンバー1(SLC10A1)であるか、または
c)前記組織が、口腔粘膜組織であり、前記細胞表面分子が、Ly6/PLAURドメイン含有3(LYPD3)もしくはデスモグレイン(DSG3)である、項目34~39のいずれかに記載の方法。
(項目40)
疾患または状態の治療または予防を必要とする対象においてそれを行うための方法であって、前記疾患または障害が、Wnt(「ウィングレス関連統合部位」または「ウィングレスおよびInt-1」または「ウィングレス-Int」)シグナル伝達の減少と関連しているか、またはWntシグナル伝達の増加による恩恵を受けるであろうものであり、有効量の項目21~33のいずれかに記載の薬学的組成物を前記対象に提供することを含む、方法。
(項目41)
薬学的に許容される希釈剤、アジュバントまたは担体と、有効量の、
(a)Wntポリペプチド、ノリンポリペプチド、もしくはWntシグナル伝達アゴニスト分子、
(b)Wntポリペプチド、ノリンポリペプチド、もしくはWntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする核酸配列であって、場合によりDNAもしくはmRNAである、前記Wntポリペプチド、前記ノリンポリペプチド、もしくは前記Wntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする核酸配列、
(c)Wntポリペプチド、ノリンポリペプチド、もしくはWntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする核酸配列を含むベクターであって、場合により発現ベクターである、前記Wntポリペプチド、前記ノリンポリペプチド、もしくは前記Wntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする前記核酸配列を含むベクター、または
(d)Wntポリペプチド、ノリンポリペプチド、もしくはWntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする核酸を含む発現ベクターを含む宿主細胞と、を含む薬学的組成物を前記対象に提供することをさらに含む、項目40に記載の方法。
(項目42)
有効量の項目1~12のいずれかに記載の分子を含む薬学的組成物と、有効量のWntポリペプチド、ノリンポリペプチド、またはWntシグナル伝達アゴニスト分子を含む薬学的組成物とを前記対象に提供することを含む、項目41に記載の方法。
(項目43)
有効量の項目13~14のいずれかに記載の核酸配列を含む薬学的組成物と、Wntポリペプチド、ノリンポリペプチド、またはWntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする有効量の核酸配列を含む薬学的組成物とを前記対象に提供することを含み、前記核酸配列のうちの一方または両方が、場合によりDNAまたはmRNA、場合により修飾mRNAである、項目41に記載の方法。
(項目44)
有効量の項目15~17のいずれかに記載のベクターを含む薬学的組成物と、Wntポリペプチド、ノリンポリペプチド、またはWntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする核酸配列を含む有効量のベクターを含む薬学的組成物とを前記対象に提供することを含み、前記ベクターのうちの一方または両方が、場合により発現ベクターまたはウイルスベクターである、項目41に記載の方法。
(項目45)
疾患または状態の治療または予防を必要とする対象においてそれを行うための方法であって、前記疾患または障害が、Wnt(「ウィングレス関連統合部位」または「ウィングレスおよびInt-1」または「ウィングレス-Int」)シグナル伝達の減少と関連しているか、またはWntシグナル伝達の増加による恩恵を受けるであろうものであり、薬学的に許容される希釈剤、アジュバントまたは担体と、有効量の、
a)Wntポリペプチド、ノリンポリペプチド、もしくはWntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする核酸配列であって、場合によりDNAもしくはmRNA、場合により修飾mRNAである、前記Wntポリペプチド、前記ノリンポリペプチド、もしくは前記Wntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする核酸配列、
b)Wntポリペプチド、ノリンポリペプチド、もしくはWntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする核酸配列を含むベクターであって、場合により発現ベクターである、前記Wntポリペプチド、前記ノリンポリペプチド、もしくは前記Wntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする前記核酸配列を含むベクター、または
c)Wntポリペプチド、ノリンポリペプチド、もしくはWntシグナル伝達アゴニスト分子をコードする核酸を含む発現ベクターを含む宿主細胞と、を含む薬学的組成物を前記対象に提供することを含む、方法。
(項目46)
前記Wntポリペプチドが、Wnt1、Wnt2、Wnt2B、Wnt3、Wnt3A、Wnt4、Wnt5A、Wnt5B、Wnt6、Wnt7A、Wnt7B、Wnt8A、Wnt8B、Wnt9A、Wnt9B、Ant10A、Wnt10B、Wnt11、およびWnt16、ならびにこれらのうちのいずれかの機能的バリアントおよび断片から選択される哺乳動物Wntポリペプチドである、項目41~45のいずれかに記載の方法。(項目47)
前記ノリンポリペプチドが、哺乳動物ノリンポリペプチドまたはその機能的バリアントもしくは断片である、項目41~45のいずれかに記載の方法。
(項目48)
前記Wntシグナル伝達アゴニスト分子が、フリズルド(Fzd)受容体をLrp5/6と二量体化させる水溶性Wntシグナル伝達アゴニストである、項目41~45のいずれかに記載の方法。
(項目49)
前記Wntシグナル伝達アゴニスト分子が、ポリペプチドを含む、項目41に記載の方法。
(項目50)
前記ポリペプチドが、1つ以上のFzdタンパク質に対して高い親和性を有する結合ドメインと、Lrp5/Lrp6タンパク質に対して高い親和性を有する結合ドメインとを含み、前記結合ドメインが、場合により、直接結合しているか、またはリンカーにより結合している、項目42に記載の方法。
(項目51)
前記疾患または障害が、骨組織、肝臓組織、皮膚組織、胃組織、腸管組織、口腔粘膜組織、腎臓組織、中枢神経系組織、乳腺組織、味蕾組織、卵巣組織、内耳組織(蝸牛および前庭組織を含む)、毛包、膵臓組織、網膜組織、角膜組織、心臓組織および肺組織からなる群から選択される組織の疾患または障害である、項目40~50のいずれかに記載の方法。
(項目52)
前記疾患または障害が、
a)骨組織の疾患または障害であり、細胞表面受容体が、副甲状腺ホルモン受容体1(PTH1R)であるか、
b)肝臓組織の疾患または障害であり、細胞表面受容体が、アシアロ糖タンパク質受容体1(ASGR1)、アシアロ糖タンパク質受容体2(ASGR2)、トランスフェリン受容体2(TFR2)、もしくは溶質キャリアファミリー10メンバー1(SLC10A1)であるか、あるいは
c)口腔粘膜組織の疾患または障害であり、細胞表面受容体が、Ly6/PLAURドメイン含有3(LYPD3)またはデスモグレイン(DSG3)である、項目51に記載の方法。
(項目53)
前記疾患または状態が、骨折、骨粗鬆症、骨粗鬆症性骨折、脊椎固定術、整形外科用装置の骨結合、腱と骨の統合、歯の成長と再生、歯科インプラント術、歯周病、顎顔面再建、顎骨壊死、脱毛症、難聴、前庭機能低下、黄斑変性、硝子体網膜症、網膜変性症、フックスジストロフィー、脳卒中、外傷性脳損傷、アルツハイマー病、多発性硬化症、脊髄損傷、口腔粘膜炎、短腸症候群、炎症性腸疾患(IBD)、メタボリックシンドローム、糖尿病、膵炎、外分泌膵機能不全、創傷治癒、糖尿病性足部潰瘍、冠状動脈疾患、急性腎臓病、慢性腎臓病、慢性閉塞性肺疾患(COPD)、急性肝不全、急性アルコール性肝障害、C型肝炎ウイルス(HCV)による慢性肝疾患、HCV患者の抗ウイルス薬治療後、B型肝炎ウイルス(HBV)による慢性肝疾患、HBV患者の抗ウイルス薬治療後、慢性アルコール性肝疾患、非アルコール性脂肪性肝疾患および非アルコール性脂肪性肝炎(NASH)、肝硬変、ならびにあらゆる原因による慢性肝不全からなる群から選択される、項目40~50のいずれかに記載の方法。
(項目54)
前記薬学的組成物が、非経口的に、経口的に、筋肉内に、局所的に、または局部的に提供される、項目40~53のいずれかに記載の方法。
(項目55)
前記対象が、哺乳動物、場合によりヒトである、項目40~54のいずれか一項に記載の方法。
本明細書で使用される「ベクター」は、ポリヌクレオチドを含むかまたはそれと会合し、細胞へのポリヌクレオチドの送達を媒介するために使用することができる巨大分子または巨大分子の会合を指す。例示的なベクターには、例えば、プラスミド、ウイルスベクター、リポソーム、および他の遺伝子送達媒体が含まれる。
Applied Mathematics 2:482-489(1981))である。ギャップ生成ペナルティは、一般に、1~5、通常2~4の範囲であり、多くの実施形態では3である。ギャップ延長ペナルティは、一般に、約0.01~0.20の範囲であり、多くの場合は0.10である。プログラムは、比較されるために入力された配列によって決定されるデフォルトパラメーターを有する。好ましくは、配列同一性は、プログラムにより決定されたデフォルトパラメーターを用いて決定される。このプログラムは、米国ウィスコンシン州マディソンのGenetics Computing Group(GCG)パッケージからも入手可能である。
Enzymology」(Academic Press,Inc.);「Handbook of Experimental Immunology」(D.M.Weir
& C.C.Blackwell編);「Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells」(J.M.Miller & M.P.Calos編、1987年);「Current Protocols in Molecular Biology」(F.M.Ausubelら編、1987年);「PCR:The Polymerase Chain Reaction」(Mullisら編、1994年);および「Current Protocols in Immunology」(J.E.Coliganら編、1991年)などの文献において十分に説明されている。
特定の態様では、本開示は、組織特異的または細胞特異的様式でWnt活性を増強することができる新規の組織特異的Wntシグナル増強分子を提供する。特定の実施形態では、組織特異的Wntシグナル増強分子は、1つ以上のZNRF3および/またはRNF43リガーゼに結合する第1のドメインと、1つ以上の標的組織または細胞型に組織特異的または細胞特異的様式で結合する第2のドメインと、を含む二機能性分子である。第1のドメインおよび第2のドメインはそれぞれ、リガーゼ複合体または標的組織もしくは細胞にそれぞれ結合することができる任意の部分であり得る。例えば、第1のドメインおよび第2のドメインのそれぞれは、限定されないが、ポリペプチド(例えば、抗体もしくはその抗原結合断片、または抗体とは異なるペプチドもしくはポリペプチド)、低分子、および天然のリガンドまたはそのバリアント、断片もしくは誘導体から選択される部分であり得る。特定の実施形態では、天然リガンドは、ポリペプチド、小分子、イオン、アミノ酸、脂質、または糖分子である。第1のドメインおよび第2のドメインは、互いに同じ種類の部分であってもよく、または異なる種類の部分であってもよい。特定の実施形態では、組織特異的Wntシグナル増強分子は、組織特異的または細胞特異的な細胞表面受容体に結合する。特定の実施形態では、組織特異的Wntシグナル増強分子は、例えば、ネガティブコントロールと比較して、Wntシグナル伝達を、少なくとも50%、少なくとも2倍、少なくとも3倍、少なくとも5倍、少なくとも10倍、少なくとも20倍、少なくとも30倍、少なくとも40倍、または少なくとも50倍増加または増強させる。
RスポンジンはWntシグナルを増幅することができる。R-スポンジンの最小機能単位は、2つのフリンドメイン、ZNRF3/RNF43E3リガーゼに結合するフリンドメイン1、およびR-スポンジン、LGR、およびE3リガーゼの三元複合体をまとめる、LGR4~6に結合するフリンドメイン2から構成される。これは、複合体全体の内在化をもたらし、かつZNRF3/RNF43をこれらの破壊の標的から離して除去する。フリンドメイン1単独では機能的ではないが、それはZNRF3およびRNF43の両方に結合することができる(図1参照)。
/ RNF43に結合する抗体またはその抗原結合断片を含む。特定の実施形態では、作用ドメインはZNRF3またはRNF43のいずれかに特異的に結合する。
特定の細胞型および特定の組織内の細胞は、細胞表面受容体などの1つ以上の細胞または組織特異的表面分子を含み得る(図2参照)。本明細書で使用される場合、1つ以上の他の細胞もしくは組織型、または任意の他の細胞もしくは組織型と比較して、より多くの分子が特定の細胞または組織型に存在する場合、分子は、細胞または組織特異的であると言われる。特定の実施形態では、より多い量は、1つ以上の他の細胞もしくは組織型、または任意の他の細胞もしくは組織型における量と比較して、少なくとも2倍、少なくとも5倍、少なくとも10倍、少なくとも20倍、少なくとも50倍、または少なくとも100倍である。特定の実施形態では、細胞特異的表面分子は、標的器官、組織または細胞型、例えば、1つ以上の他の非標的器官、組織または細胞型と比較したときに例えば、疾患または障害を治療または予防するためにWntシグナル伝達を増強することが望ましい器官、組織または細胞型で発現が増加または増強している。特定の実施形態では、細胞特異的表面分子は、それぞれ1つ以上の他の器官、組織または細胞型と比較して、標的器官、組織または細胞型の表面に優先的に発現される。例えば、特定の実施形態では、細胞表面受容体は、それが1つ以上、5つ以上、他の全ての器官、組織もしくは細胞、またはそれぞれ他の全ての器官、組織もしくは細胞の平均で発現されるよりも、標的器官、組織または細胞において、少なくとも2倍、少なくとも5倍、少なくとも10倍、少なくとも20倍、少なくとも30倍、少なくとも40倍、少なくとも50倍、少なくとも100倍、少なくとも500倍、または少なくとも1000倍高いレベルで発現されている場合、組織特異的または細胞特異的細胞表面分子であると見なされる。特定の実施形態では、組織特異的または細胞特異的細胞表面分子は、細胞表面受容体、例えば、細胞表面膜内に位置する領域と標的ドメインが結合することができる細胞外領域とを含むポリペプチド受容体である。様々な実施形態では、本明細書に記載の方法は、標的組織または標的組織を含む組織のサブセット上でのみ発現される細胞表面分子を特異的に標的化することによって、または全ての、ほとんどの、またはかなりの数の他の組織と比較した場合に標的組織上でより高いレベルの発現を有する、例えば、少なくとも2、少なくとも5、少なくとも10、または少なくとも20の他の組織よりも標的組織における発現がより高い細胞表面分子を特異的に標的化することによって実施され得る。
Enns、2014、Frontiers in Pharmacology 5:34によって概説されている)。TFR2の天然および合成リガンドならびに結合パートナーの例には、二量体トランスフェリンなどのトランスフェリン、ならびにヘモクロマトーシス(HFE)タンパク質ならびにそれらの断片およびバリアントが含まれるが、これらに限定されない。
Journal of Clinical Oncology、5(4):621-32に概説される)。LYPD3発現が報告されているにもかかわらず、LYPD3遺伝子を欠く動物は生存可能で、繁殖力があり、扁平上皮の発生に明らかな欠陥がないので、その正確な機能は不明のままである。様々な分子がLYPD3の結合パートナーとして同定されている。ラミニン1、ラミニン5、およびガレクチン-3はLYPD3と会合して細胞遊走を促進する(Paret、Bourouba、Beer、Miyazaki、Schnolzer、FiedlerおよびZoller.International Journal of Cancer.2005 Jul 10;115(5):724-33)。前方勾配2、AGR2は、LYPD3と相互作用し、膵管腺癌(PDAC)における癌の増殖、転移および治療に対する抵抗性を促進する(Arumugam、Deng、Bover、Wang、LogsdonおよびRamachandran.Molecular Cancer Therapeutics.2015 Apr;14(4):941-51)。低酸素条件下では、LYPD 3はα6β4インテグリンおよびマトリックスメタロプロテイナーゼ14(MMP14)と複合体を形成し、これは限局性ラミニン332分解を通して癌細胞の運動性を促進する。(Ngora,Galli,Miyazaki and Zoller.Neoplasia.2012 Feb;14(2):95-107)。
and Waschke.Journal of Immunology.August 1,2008,181(3) 1825-1834)。
特定の実施形態では、標的ドメインおよび作用ドメインは互いに直接結合または融合しているが、他の実施形態では、それらはリンカー、例えばポリペプチドリンカー、または非ペプチジルリンカーなどで隔てられている。例えば、リンカーはFcリンカー、例えば、例えば1つ以上のジスルフィド結合を介して他のFcリンカーと二量体化することができる抗体Fcドメインの領域である。別の特定の実施形態では、リンカーはアルブミン、例えばヒト血清アルブミンであり、ここで標的ドメインおよび作用ドメインはアルブミンのN末端およびC末端にある。
本開示はさらに、Wntポリペプチド、ノリンポリペプチド、およびWntシグナル伝達アゴニスト分子、ならびにWntシグナル伝達を増強し、本明細書中に記載されるものを含むWnt関連疾患または障害を治療または予防するためのそれらの使用に関する。特定の実施形態において、Wntポリペプチド、ノリンポリペプチドおよびWntシグナル伝達アゴニスト分子は、単独でまたは本明細書に記載の1つ以上の組織特異的Wntシグナル増強分子と組み合わせて対象に提供される。
Biol.2002;3(1):3001.1~3001.15)。関心のある他の天然配列Wntポリペプチドは、家畜および家畜動物を含む任意の哺乳動物、ならびにイヌ、ネコ、ウシ、ウマ、ヒツジ、ブタ、ヤギ、ウサギ、ラットなどの動物または実験動物またはペット動物由来の上記のオルソログを含む。マウス、カエル、シマウマ、ミバエ、ワームなど
al.(1996) Curr.Biol.6:1302-1306;Bhanot,P.et al.(1996) Nature 382:225-230)。Fzファミリーには10の既知のメンバー(Fz1からFz10)があり、そのうちのどれでもWntsのレセプターとして機能することができる。ヒトfrizzled参照配列のGenbank登録番号は以下の通りである:FZD1(NM_003505)、FZD2(NM_001466)、FZD3(NM_145866)、FZD4(NM_012193)、FZD5(NM_003468)、FZD6(NM_003506)、FZD7(NM_003507)、FZD8(NM_031866)、FZD9(NM_003508)、FZD10(NM_007197)。[0076]フリズルド結合ドメインの非限定的な例には、Biolegendから入手可能な抗体、例えば、ヒトフリズルド4に特異的なクローンCH3A4A7(CD344)、ヒトFz9に特異的なクローンW3C4E11(CD349)、Abeamから入手可能な抗体、例えば、Fz7に特異的なab64636、ヒトFz4に特異的なab83042、ヒトFz7に特異的なab77379、ヒトFz8に特異的なab75235、ヒトFz9に特異的なab102956などが含まれる。適切な抗体の他の例は、とりわけ、米国特許出願第20140105917号、米国特許出願第20130230521号、米国特許出願第20080267955号、米国特許出願第20080038272号、米国特許出願第20030044409号に記載されている。
本明細書に記載の組織特異的Wntシグナル増強分子および1つ以上の薬学的に許容される希釈剤、担体、または賦形剤を含む薬学的組成物も開示されている。特定の実施形態では、薬学的組成物は、本明細書に記載の1つ以上のWntポリペプチド、ノリンポリペプチドまたはWntシグナル伝達アゴニスト分子をさらに含む。
融合タンパク質に関して本明細書に例示される組織特異的Wntシグナル増強分子は、標的組織または細胞型におけるWntシグナル伝達を増加させるために使用され得る。特定の実施形態では、Wntシグナル伝達は標準Wntシグナル伝達である。したがって、いくつかの態様では、本発明は、標的組織または細胞におけるWnt増加またはWntシグナル伝達の増強方法であって、標的組織または細胞を有効量の本発明の組織特異的Wntシグナル増強分子と接触させることを含み、該分子は、標的組織または細胞上の細胞表面受容体に組織特異的または細胞特異的様式で結合する標的ドメインを含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、接触はインビトロ、エクスビボ、またはインビボで起こり、例えば、対象の組織特異的Wntシグナル増強分子が対象に投与または提供される。特定の実施形態では、細胞は培養細胞であり、接触はインビトロで起こる。
本明細書中で融合タンパク質に関して例示される組織特異的Wntシグナル増強分子は、例えば標的細胞、組織または器官におけるWntシグナル伝達を増加させることによって、疾患、障害または状態を処置するために使用され得る。したがって、いくつかの態様では、本発明は、それを必要とする対象における疾患または状態、例えばWntシグナル伝達の低下に関連するか、またはWntシグナル伝達の増加が治療上の恩恵をもたらすであろう疾患または障害を治療するための方法であって、対象を有効量の本開示の組成物と接触させることを含む、方法を提供する。特定の実施形態では、組成物は、以下のいずれかを含む薬学的組成物である:組織特異的Wntシグナル増強分子、例えば、小分子またはポリペプチド;組織特異的Wntシグナル増強分子、例えばDNAまたはmRNA、必要に応じて修飾mRNAをコードする核酸配列を含むポリヌクレオチド;組織特異的Wntシグナル増強分子をコードする核酸配列を含むベクター;例えば発現ベクターまたはウイルスベクター;または組織特異的Wntシグナル増強分子をコードする核酸配列を含む細胞、例えば、組織特異的Wntシグナル増強分子をコードする発現ベクターまたはウイルスベクターで形質導入された細胞。特定の実施形態では、疾患または状態は病的な疾患または障害、または損傷、例えば創傷から生じる損傷である。特定の実施形態では、創傷は別の治療的処置の結果であり得る。特定の実施形態では、疾患または状態は、組織修復の障害、治癒または再生を含むか、または組織修復の増加、治癒または再生の恩恵を受けるであろう。いくつかの実施形態では、接触はインビボで起こる、すなわち、対象組成物は対象に投与される。
Cloning:A Laboratory Manual,3rd Ed」(Sambrook et al.,Harbor Laboratory Press 2001)、「Short Protocols in Molecular Biology,4th Ed.」(Ausubel et al.eds.,John Wiley & Sons 1999)、「Protein Methods」(Bollag et
al.,John Wiley & Sons 1996)、「Nonviral Vectors for Gene Therapy」(Wagner et al.eds.,Academic Press 1999)、「Viral Vectors」(Kaplift & Loewy eds.,Academic Press 1995)、「Immunology Methods Manual」(I.Lefkovits ed.,Academic Press 1997)、および「Cell and Tissue Culture:Laboratory Procedures in Biotechnology」(Doyle & Griffiths,John Wiley & Sons 1998)などの標準的な教科書に見出すことができ、これらの開示は、参照により本明細書に組み込まれる。本開示において言及される試薬、クローニングベクター、および遺伝子操作のためのキットは、BioRad、Stratagene、Invitrogen、Sigma-Aldrich、およびClonTechなどの市販業者から入手可能である。
SCFVフォーマットにおけるWNTシグナリングのASGR1特有の強化
Wntシグナル伝達の組織特異的増強は、変異型ヒトRspo2(アミノ酸残基)に融合したヒトASGR1に対するscFv抗体(特許WO2014/023709A1に基づいて設計された、クローン4F3)を含む組織特異的Wntシグナル増強分子を用いて初めて実証された。2つの点変異(F105AおよびF109A)を有する(α-ASGR-mtRspo2)。ヒトRspo2におけるこれらの変異は、図1に図解されるように、ZNRF3/RNF43との相互作用を妥協することなくLGR4-6への結合を減少/廃止し、図2に図解されるようにRspo2を作用ドメインとして機能させる。標的ドメインに対する陰性対照として(図2参照)、緑色蛍光タンパク質(GFP)に対するscFv抗体を同じ変異型ヒトRspo2(α-GFP-mtRspo2)に融合した。Wntシグナル増強活性についての陽性対照として、GFP抗体を野生型ヒトRspo2(アミノ酸残基37~143)(α-GFP-Rspo2)に融合した。これらの構築物を図5Aに図示し、それらのアミノ酸配列およびそれをコードするポリヌクレオチド配列を以下の通りに示す:α-GFP-mtRspo2(それぞれ配列番号8および7)、α-ASGR-mt-Rspo2(それぞれ配列番号10および9)。これらの組織特異的Wntシグナル増強分子はまた、分泌のためにN末端にシグナリングペプチドを、検出のためにC末端にFLAGタグを含み、続いてアフィニティー精製のために(His)8タグを含んだ。組織特異的Wntシグナル増強融合タンパク質および対照をコードする発現構築物を標準的な分子クローニング技術によって作製した。
行動領域のメカニズムと行動の動的範囲の変調
組織特異的Wntシグナル増強分子の融合構築物設計の作用機序を検証するために、追加の変異をRspo2(これは作用ドメインとして機能する)に導入し、これらの構築物の活性を、実施例1に記載したのと同じ一過性トランスフェクションに基づくレポーターアッセイにおいてHuh-7細胞中で分析した。ZNRF3/RNF43相互作用の役割は、S47、N50、R65、R69、およびQ70などのZNRF3/RNF43に結合することが知られているRspo2内の残基に(F105AおよびF109A変異に加えて)点変異を導入することによって最初に試験された。F105A/F109A/S47A/N50A変異を含むα-GFP-mtRspo2のアミノ酸配列を配列番号12に提供し、コードポリヌクレオチド配列を配列番号11に提供する。F105A/F109A/S47A/N50A変異を含むα-ASGR1-mtRspo2のアミノ酸配列は配列番号14に提供され、コードポリヌクレオチド配列は配列番号13に提供される。F105A/F109A/R65A/R69A/Q70A変異を含むα-GFP-mtRspo2のアミノ酸配列は配列番号16に提供され、コードポリヌクレオチド配列は配列番号15に提供される。F105A/F109A/R65A/R69A/Q70A変異を含むα-ASGR1-mtRspo2のアミノ酸配列は配列番号18に提供され、コードポリヌクレオチド配列は配列番号17に提供される。図6Aに示すように、S47A/N50AまたはR65A/R69A/Q70Aの変異の導入は、抗GFPおよび抗ASGR1構築物の両方のWntシグナル増強活性を無効にした。これらの結果は、これらの2つのE3リガーゼが作用ドメインによって標的とされるというメカニズムと一致している。
他の細胞表面受容体を用いた標的化戦略の検証
組織特異的Wntシグナル増強分子の抗ASGR1に基づく設計が単なる特定の場合ではなく、むしろ一般原則を表す例であることを検証するために、変異体(F105A/F109A)Rspo2断片(アミノ酸残基37~143)を、他の細胞表面受容体、ヒトトランスフェリン受容体1(TFR1)(特許WO2016/081640、クローン7A4に基づいて設計されている)に対するscFv抗体に融合した。構築物のアミノ酸配列は、配列番号28に提供されている。実施例1に記載の一過性トランスフェクションおよびレポーターアッセイを使用して、この新しい構築物は、野生型Rspo2に融合したポジティブコントロール抗GFP(配列番号6、図7Aおよび7B)の活性と同等またはそれを超える活性を有することが実証された。これは、標的戦略の一般化を支持するだけでなく、適切な細胞表面受容体を認識する標的ドメインが使用される限り、特異的Wntシグナル増強活性を有意に増強するこのアプローチの十分な可能性を証明した。TFR1受容体の広範な分布はまた、このWntシグナル増強戦略に感受性のある組織/細胞についてスクリーニングするためにこの融合構築物を使用する機会を提供した。
組織/細胞特異的WNTエンハンサーとしての精製融合タンパク質(SCFVフォーマット)
設計された融合タンパク質の活性を直接試験するために、構築物をバキュロウイルストランスファーベクターpAcGP67-Aにサブクローニングし、以前に記載されたように(Jandaら、2017 Nature)発現させSF9/hi5細胞から精製した。発現されたタンパク質を、complete hisタグ精製樹脂(Sigma-Aldrich)を使用して、販売元推奨手順に従ってHisタグを介して精製し、次いでサイズ排除カラム(S200、GE Healthcare)分画によってさらに精製した。図8Aは、表示された標的ドメインおよび作用ドメインを有する精製融合タンパク質(サイズ排除カラムによって抗TFR1構築物はさらに精製されなかった)のクマシー染色ゲル画像の代表例を示し、推定純度は>90%である。
一過性トランスフェクションによって実証された全長IGGフォーマットにおけるアクティブWNT信号エンハンサー
完全IgGフォーマットの抗体は、他の利点の中でも、優れた薬物動態学的特性および安定性と関連している。先の実施例に記載の組織特異的Wntシグナル増強分子が完全IgGフォーマットで活性であることを実証するために、これらの組織特異的Wntシグナル増強融合タンパク質を完全IgGフォーマットに変換した。TFR1結合剤は、本出願の先の例からのその最高の活性のために、IgGフォーマットのWntシグナル増強分子のための概念実証として選択された。図9Aの図に示すように、変異体(F105R/F109A)Rspo2をTFR1抗体(または陰性対照としてのGFP抗体、両方ともIgG2として)の軽鎖または重鎖のN末端に融合させた。これらの分子の活性は、Wntシグナル伝達に応答するレポーターを用いた293細胞への一過性トランスフェクションによって決定された。α-GFP IgGの重鎖のN末端に付加されたRspo2(F105R/F109A)ドメインを有する構築物については、α-GFP軽鎖のアミノ酸配列を配列番号36に提供し、そのコードポリヌクレオチド配列は配列番号35に提供され、Rspo2(F105R/F109A)、α-GFP重鎖IgG2のアミノ酸配列は配列番号38に提供され、そのコードポリヌクレオチド配列は配列番号37に提供される。α-TFR1 IgGの重鎖のN末端に付加されたRspo2(F105R/F109A)ドメインを有する構築物については、α-TFR1軽鎖のアミノ酸配列を配列番号40に提供し、そのコードポリヌクレオチド配列は配列番号39に提供され、Rspo2(F105R/F109A)、α-TFR1重鎖IgG2のアミノ酸配列は配列番号42に提供され、そのコードポリヌクレオチド配列は配列番号41に提供される。α-GFP IgGの軽鎖のN末端に付加されたRspo2(F105R/F109A)ドメインを有する構築物については、α-GFP二本鎖IgG2のアミノ酸配列を配列番号46に提供し、そのコード化ポリヌクレオチド配列は配列番号45に提供され、Rspo2(F105R/F109A)、α-GFP軽鎖のアミノ酸配列は配列番号44に提供され、そのコード化ポリヌクレオチド配列は配列番号43に提供される。α-TFR1 IgGの軽鎖のN末端に付加されたRspo2(F105R/F109A)ドメインを有する構築物については、α-TFR1二本鎖IgG2のアミノ酸配列を配列番号50に提供し、そのコードポリヌクレオチド配列は配列番号49に提供され、Rspo2(F105R/F109A)、α-TFR1軽鎖のアミノ酸配列は配列番号48に提供され、そのコード化ポリヌクレオチド配列は配列番号47に提供される。
対象となるWNT信号強化活動をサポートするための追加のRSPO変異体
RspoとLGRタンパク質との間の相互作用にとって最も重要であることが知られている2つの疎水性残基(ヒトRspo2の場合はF105およびF109)に加えて、さらなる残基も相互作用に寄与し得る。これらの残基には、例えば、Rspo2のK58、H76、S77、R86、N91、およびR121が含まれる。これらの残基における変異は、Fs105/F109変異と組み合わせて使用されて、RspoとLGRタンパク質との相互作用を廃止/妥協することができる。種々の構築物のアミノ酸配列およびそれをコードするポリヌクレオチド配列は以下の通り提供される:抗ASGR1、Rspo2(F105R/F109A)、配列番号52および51;抗GFP、Rspo2(R86E/F105R/F109A)、配列番号54および53;抗ASGR1、Rspo2(R86E/F105R/F109A)、配列番号56および55;抗TFR1、Rspo2(R86E/F105R/F109A)、配列番号58および57;抗GFP、Rspo2(R86E/F105R/F109A/R121E)、配列番号60および59;抗ASGR1、Rspo2(R86E/F105R/F109A/R121E)、配列番号62および61;抗TFR1、Rspo2(R86E/F105R/F109A/R121E)、配列番号64および63;抗GFP、Rspo2(K58E/R86E/F105R/F109A/R121E)、配列番号66および65;抗ASGR1、Rspo2(K58E/R86E/F105R/F109A/R121E)、配列番号68および67;抗TFR1、Rspo2(K58E/R86E/F105R/F109A/R121E)、配列番号70および69。
SCFVフォーマットにおける追加組換えタンパク質のWNTシグナル増強活性
一過性トランスフェクション実験によって観察されたscFv抗TFR1ベースの構築物のWntシグナル増強活性(図6C)は、精製タンパク質を用いてさらに検証された。抗hTFR1-Rspo2(F105R/F109A)および抗GFP対照(それぞれ配列番号30および32)の融合タンパク質をコードするプラスミドベクターをExpi293F細胞(Thermo Fisher Scientific)にトランスフェクトし、販売元推奨手順に従って、cOmplete hisタグ精製樹脂(Sigma-Aldrich)を用いて精製した。図11Aは、精製タンパク質のクマシー染色ゲル画像を示す。図11Bに示すように、TFR1標的組換えタンパク質は、抗GFP融合対照よりはるかに強力な活性を示した。さらに、この標的分子のEmaxは、Rspo2陽性対照のものと同等である。
精製タンパク質で実証された細胞表面受容体依存性
設計したWntシグナル増強分子の特異的細胞表面受容体の存在への依存性をさらに実証するために、ヒトASGR1標的分子(抗ASGR1-Rspo2(F105A/F109A);配列番号10)をASGR1レセプターを天然には発現しないA431細胞上でSTFアッセイで試験した。細胞を最初に、Lipofectamine 2000(Invitrogen)を使用してヒトASGR1またはヒトTFR2のいずれかを発現するベクターで、販売元推奨手順に従って96ウェルプレート中で一過性にトランスフェクトした。24時間後、トランスフェクトされた細胞を、陽性対照としてのRspo2と共に、hASGR1標的融合タンパク質で処理した。ASGR1発現ベクターによる一過性トランスフェクションはA431細胞を応答性にすることが見出されたが、TFR2発現ベクターによるコントロールトランスフェクションはWntシグナル増強分子に応答しなかった(図12)。
添付IGGフォーマットにおける精製タンパク質のWNTシグナル増強活性
一過性トランスフェクション実験(図9)によって実証されたTFR1標的付加IgG分子のWntシグナル増強活性をさらに検証するために、これらの分子をExpi293F細胞(Thermo Fisher Scientific)を用いて組換えタンパク質として発現させた。組換えタンパク質を最初にプロテインAアフィニティー樹脂(標準的手法)によって精製し、次いでサイズ排除カラム(S200、GE Healthcare)分画によって磨いた。精製タンパク質をSTFアッセイを用いてHuh-7および293T細胞上で直接試験した。これらは両方ともヒトTFR1受容体を発現する。図13に示すように、TFR1を標的とした分子は、抗GFP融合対照よりも3~4桁優れた効力およびより高いEmaxを示した。
追加IGGスキャフォールドの構造活性相関解析
完全長IgGのフォーマットの標的ドメインを用いて、作用ドメインを結合する複数の方法を比較した。試験した様々なIgG2足場の活性の要約を図14A~14Bに示し、ここで変異体Rspo2(F105R/F109A)は重鎖のN末端、軽鎖のN末端に結合している。標的ドメインとして抗ASGR1または抗TFR1のいずれかの軽鎖のC末端、または対照抗体として抗GFPまで。使用したいくつかの構築物は実施例5に記載されており、試験した追加の構築物は以下を含んでいた:α-ASGR1 IgGの重鎖のN末端に付加されたRspo2(F105R/F109A)ドメイン;軽鎖は配列番号72で提供され、そのコードポリヌクレオチド配列は配列番号71で提供され、Rspo2(F105R/F109A)のアミノ酸配列α-ASGR1重鎖IgGは配列番号74で提供されおよびそのコードポリヌクレオチド配列は、配列番号73に提供され;α-GFP IgG2の軽鎖のC末端に付加されたRspo2(F105R/F109A)ドメイン(ここで、α-GFP重鎖IgG2のアミノ酸配列は配列番号46に提供されている)およびそのコード化ポリヌクレオチド配列は配列番号45に提供され、Rspo2(F105R/F109A)、α-GFP軽鎖のアミノ酸配列は配列番号76に提供され、そのコードポリヌクレオチド配列は配列番号76に提供され;α-ASGR1 IgG2の軽鎖のC末端に付加されたRspo2(F105R/F109A)ドメイン(ここで、α-ASGR1二本鎖IgG2のアミノ酸配列は、配列番号80に提供される)およびそのコード化ポリヌクレオチド配列は配列番号79に提供され、Rspo2(F105R/F109A)、α-ASGR1軽鎖のアミノ酸配列は配列番号78に提供され、そのコードポリヌクレオチド配列は配列番号78に提供され;α-TFR1 IgG2の軽鎖のC末端に付加されたRspo2(F105R/F109A)ドメイン(ここで、α-TFR1二本鎖IgG2のアミノ酸配列は配列番号50に提供される)およびそのコード化ポリヌクレオチド配列は、配列番号49に提供されている;Rspo2のアミノ酸配列(F105R/F109A)、α-TFR1軽鎖は配列番号82に提供され、そのコードポリヌクレオチド配列は配列番号81に提供される。
行動領域としての4つのRスポンジンの構造活性相関解析
ヒトは、特にフリンドメイン内に、高い配列相同性を有する4つのR-スポンジンタンパク質を有する(図4)。インビトロでのWntシグナル伝達の増強におけるそれらの能力を直接比較するために、4つのヒトR-スポンジンの各々のFu1-Fu2ドメインを、一過性トランスフェクションによるExpi293F細胞におけるASGR1、TFR1およびGFPへのscFvバインダーのC末端への融合として発現させた。標準的なHisタグおよびサイズ排除クロマトグラフィー精製手順。抗GFP、Rspo1野生型融合タンパク質のアミノ酸配列およびコードポリヌクレオチド配列は、それぞれ配列番号96および95に提供されている。抗GFP、Rspo2野生型融合タンパク質のアミノ酸配列およびコードポリヌクレオチド配列は、それぞれ配列番号6および5に提供されている。抗GFP、Rspo3野生型融合タンパク質のアミノ酸配列およびコードポリヌクレオチド配列は、それぞれ配列番号98および97に提供されている。抗GFP、Rspo4野生型融合タンパク質のアミノ酸配列およびコードポリヌクレオチド配列は、それぞれ配列番号100および99に提供されている。次に精製タンパク質を、Wnt3a馴化培地の存在下でHuh-7および293T細胞中でSTFアッセイにより試験した。図15Aに示すように、Rspo2および3は、Rspo4および1よりも強力であり、以前の報告と一致していた。
追加されたIGGフォーマットにおける特定のWNT信号強化活動をサポートする多様なRSPO変異体
Wntシグナル増強分子の構築を支持し得る変異の多様性およびそれらの組み合わせをさらに実証するために、抗GFPまたは抗ASGR1に融合した一連の追加のRspo3変異体に基づく分子を作製し、それらの活性をHuh-7細胞において試験した。STFアッセイを使用する。これらの変異は、F106R/F110A(RA)、F106R/F110R(RR)、F106E/F110E(EE)、F106R/F110A(RE)、F106E/F110A(EA)、R60E/R88E/N93A/F106R/F110A(EEARA)を含んだ。R60、R88、およびN93は、他のRspoタンパク質との相同性に基づいて、LGR相互作用に関与している残基である(図16A)。これらの構築物のアミノ酸およびコードポリヌクレオチド配列は以下の通りである:抗GFP Rspo3野生型、配列番号98および97;抗GFP Rspo3 RA、配列番号104および103;抗GFP Rspo3 RR、配列番号114および113;抗GFP Rspo3 EE、配列番号116および115; 抗GFP Rspo3 RE、配列番号118および117;抗GFP Rspo3 EA、配列番号120および119;抗GFP Rspo3 EEARA、配列番号122および121; 抗ASGR1 Rspo3 RA、配列番号108および107;抗ASGR1 Rspo3 RR、配列番号124および123;抗ASGR1 Rspo3 EE、配列番号126および125;抗ASGR1 Rspo3 RE、配列番号128および127;抗ASGR1 Rspo3 EA、配列番号130および129;抗ASGR1 Rspo3 EEARA、配列番号132および131。
非RSPOベースの作用ドメイン
作用ドメインとして非Rspoベースの構造を使用することの実現可能性を実証するために、抗ヒトZNRF3 mAbのFab断片(特許WO2013054307A2からのAb2)を抗ASGR1、抗TFR1、または抗GFPのIgGに融合した「Fab-IgG」融合タンパク質を設計した(図17A)。抗ZNRF3抗GFP構築物は、示されたポリペプチド配列およびコードポリヌクレオチド配列を有する以下のポリペプチドを含んでいた:抗GFP軽鎖(S176K)(配列番号134および133)、抗ZNRF3軽鎖(S176E)(配列番号136および135)、ならびに抗ZNRF3-抗GFP融合重鎖(配列番号138および137)。抗ZNRF3-抗ASGR1構築物は、示されたポリペプチド配列およびコードポリヌクレオチド配列を有する以下のポリペプチドを含んでいた:抗ASGR1軽鎖(S176K)(配列番号140および139)、抗ZNRF3軽鎖(S176E)(配列番号136および135)、ならびに抗ZNRF3-抗ASGR1融合重鎖(配列番号142および141)。抗ZNRF3-抗TFR1構築物は、示されたポリペプチド配列およびコードポリヌクレオチド配列を有する以下のポリペプチドを含んでいた:抗TFR1軽鎖(S176K)(配列番号144および143)、抗ZNRF3軽鎖(S176E)(配列番号1136および135)、ならびに抗ZNRF3-抗TFR1融合重鎖(配列番号146および145)。
肝臓を標的としたWNTエンハンサーに加えて、組織を標的としたWNTエンハンサー
上記に提供された例は、様々な用途のために肝臓を標的とする能力を有するWntシグナル伝達増強分子を生成するためにASGR1結合剤を利用した。TFR1結合剤はまた、肝臓、ならびにそれが発現されるより広範囲の組織を標的とし得る。肝臓を超えた組織標的を提供するために、公共の遺伝子発現データベース(https://www.proteinatlas.org/)を検索することによって、追加の組織特異的細胞表面分子を同定した。LYPD3、Ly6/PLAURドメイン含有タンパク質3、およびDSG3、デスモグレイン3は、それらが口腔粘膜、皮膚および扁桃腺由来の粘膜上皮細胞において非常に豊富かつ特異的に発現されるので、標的分子として選択された。さらに、それらの特異的抗体配列は以前に公開されていた(US20170158775A1、mAbクローンM31-B01がLYPD3結合剤として選択され;US20100092457A1、mAbクローンDF364cがDSG3結合剤として選択された)。
Healthcare)分画を用いて精製し、典型的な推定純度は>90%であった。これらのタンパク質のWntシグナル増強活性を、2つの口腔粘膜細胞株CAL27およびSCC25、ならびに対照A431細胞株で試験した。
組織特異的WNTシグナルエンハンサーによるWNT応答遺伝子のインビボ誘導
設計したWntシグナルエンハンサーのインビボ活性を調べるために、Wnt応答遺伝子であるAxin2の誘導を調べた。図19Aに示したように、AAV-hASGR1を最初に動物当たり1E11の力価で8週齢のオスのマウスに静脈内注射した。これはマウス肝臓におけるヒトASGR1遺伝子発現をもたらした。7日後、精製したタンパク質を特定の用量で8つの群に分けて静脈内注射した。単独で、またはWntシグナルと組み合わせてのいずれかで、0.46mg/kgのRspo2陽性対照、1mg/kgの抗GFP-Rspo2(F105R/F109A)、および1mg/kgの抗ASGR1-Rspo2(F105R/F109A)3mg/kgのアゴニスト18R5-Dkk1c(Janda et al.、2017 Nature)。8時間後、マウスを安楽死させ、肝臓サンプルを遺伝子発現の定量的PCR分析のために採取した。抗GFP構築物は、示されたポリペプチドおよびコードポリヌクレオチド配列を有する以下のポリペプチドを含んでいた:抗GFP軽鎖(配列番号36および35)および抗GFP重鎖IgG1(LALA-PG)(配列番号156および155)。抗GFP Rspo2(F105R/F109A)、N-HC構築物は、配列番号35~38に提供されるポリペプチドを含んでいた。抗ASGR1 IgG2 N-HC構築物は、配列番号71~74に提供されるポリペプチドを含んでいた。18R5-Dkk1c構築物は、配列番号158に開示されているポリペプチド配列を有し、配列番号157に開示されているポリヌクレオチド配列によってコードされていた。
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Claims (10)
- 組織特異的Wntシグナル増強分子、またはその薬学的に許容される塩であって、該組織特異的Wntシグナル増強分子、またはその薬学的に許容される塩が、
(a)2つのR-スポンジン-2ポリペプチドまたはそのバリアントを含む第1のドメインであって、該R-スポンジン-2ポリペプチドまたはそのバリアントが、該R-スポンジン-2ポリペプチドのフリン1ドメインを含み、該R-スポンジン-2ポリペプチドが、ヒトR-スポンジン-2のF105およびF109のアミノ酸置換を含む、第1のドメイン;および
(b)2つの重鎖ポリペプチドおよび2つの軽鎖ポリペプチドを含む、アシアロ糖タンパク質受容体1(ASGR1)に結合する抗体を含む、第2のドメイン
を含み、該分子が、
i)それぞれ配列番号72に対して100%の同一性を有する2つのポリペプチドおよびそれぞれ配列番号74に対して100%の同一性を有する2つのポリペプチド;
ii)それぞれ配列番号78に対して100%の同一性を有する2つのポリペプチドおよびそれぞれ配列番号80に対して100%の同一性を有する2つのポリペプチド;
iii)それぞれ配列番号72に対して100%の同一性を有する2つのポリペプチドおよびそれぞれ配列番号86に対して100%の同一性を有する2つのポリペプチド;または
iv)それぞれ配列番号78に対して100%の同一性を有する2つのポリペプチドおよびそれぞれ配列番号94に対して100%の同一性を有する2つのポリペプチド
を含む、組織特異的Wntシグナル増強分子、またはその薬学的に許容される塩。 - 前記分子が、配列番号72の2つのポリペプチドおよび配列番号86の2つのポリペプチドを含む、請求項1に記載の分子。
- 前記分子が融合タンパク質である、請求項1または2に記載の分子。
- 前記融合タンパク質が、第1のポリペプチド配列を含む前記第1のドメインおよび第2のポリペプチド配列を含む前記第2のドメインを含み、前記第1のドメインおよび前記第2のドメインがリンカー部分によって結合している、請求項3に記載の分子。
- 前記リンカー部分が、ペプチドリンカー配列である、請求項4に記載の分子。
- 前記リンカー配列が、グリシン、アスパラギン、セリン、トレオニンおよびアラニンからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸を含む、請求項5に記載の分子。
- (i)有効量の、請求項1~6のいずれか一項に記載の分子と、
(ii)薬学的に許容される希釈剤、アジュバントまたは担体と、
を含む、薬学的組成物。 - Wntシグナル伝達の減少と関連している疾患または障害の治療における使用のための、請求項7に記載の薬学的組成物。
- 前記疾患または障害が、肝組織の疾患または障害である、請求項8に記載の使用のための薬学的組成物。
- 前記疾患または障害が、急性肝不全、急性アルコール性肝障害、C型肝炎ウイルス(HCV)による慢性肝疾患、B型肝炎ウイルス(HBV)による慢性肝疾患、慢性アルコール性肝疾患、非アルコール性脂肪性肝疾患、非アルコール性脂肪性肝炎(NASH)、肝硬変、およびあらゆる原因による慢性肝不全からなる群から選択される、請求項9に記載の使用のための薬学的組成物。
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