JP7426046B2 - 胃がんの検出キット又はデバイス及び検出方法 - Google Patents
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Description
iRNAと特異的に結合可能な核酸を含む胃がんの検出用キット又はデバイス、及び当該
核酸を用いて当該miRNAの発現量を測定することを含む胃がんの検出方法に関する。
分泌して消化の最初の段階を担う役割を果たす。胃は、食道につながる入口付近が噴門部
、十二指腸につながる出口付近が幽門部、それ以外の部位が胃体部に分けられる(非特許
文献1)。国立研究開発法人国立がん研究センターがん対策情報センターが開示する本国
内における部位別のがん罹患および死亡数の統計によると、胃がんの罹患者は2010年
、男性86,728人、女性39,002人の計125,730人と推定される。また胃
がんによる2012年の死亡数は男性32,206人、女性16,923人の計49,1
29人であり、日本のがんによる死因の第2位となっている。また、米国では、2014
年に22,220人が胃がんに罹患し、10,990人が胃がんによって死亡すると推測
されている(非特許文献1)。
移、遠隔転移などによってステージ0、IA、IB、IIA、IIB、IIIA、III
B、IIIC、IVに分類される。胃がんの5年相対生存率はがんの進行度に大きく依存
し、ステージIでは57~71%、ステージIIでは33~46%、ステージIIIでは
9~20%、ステージIVでは4%と報告されている(非特許文献1)。従って、胃がん
を早期に発見することは生存率の向上につながるため、早期発見を可能にする手段の提供
が強く切望されている。
ンパ節転移の疑いがない胃がんでは、内視鏡的粘膜切除術(Endoscopic Mu
cosal Resection, EMR)や内視鏡的粘膜下層剥離術(Endosc
opic Submucosal Dissection, ESD)が適応可能な場合
が多くあり、患者に負担をかけることなく治療することが可能である。
奨されている。胃がん検診の方法として「胃X線検査」の有効性が示されており、X線検
査の結果、精密検査が必要とされた場合には、胃内視鏡検査が実施される。このほか、胃
がんの発見のためには、CT、PET、MRIなどの画像診断も利用されている(非特許
文献1)。
EAおよびCA19-9などのタンパク質腫瘍マーカーが胃がんと関連することが示唆さ
れているが(非特許文献3)、スクリーニング用途として使用することを推奨する十分な
エビデンスは存在しない。また一方、研究段階ではあるが、特許文献1~3に示されるよ
うに、血液をはじめとする生体サンプル中のマイクロRNA(miRNA)の発現量、又
はmiRNAの発現量と他のタンパク質マーカーの発現量とを組み合わせることによって
、胃がんを検出するという報告がある。
検出する方法が示されている。
iR-92-2(miR-92a-1-3p、miR-92a-2-3p)並びに、mi
R-128b(miR-128-2-3p)、miR-30c(miR-30c-5p)
、miR-135-1、miR-135-2(miR-135a-5p)及びmiR-1
49(miR-149-5p)その他のmiRNAを用いて、胃がんを検出する方法が示
されている。
8-5p)を用いて胃がんを検出する方法が示されている。
能な核酸を用いて胃がんを効果的に検出できる方法を提供することである。胃がんの1次
検査には、日本において汎用されている胃X線検査をはじめとして、CT、PET、MR
Iなどの画像検査がある(非特許文献1)。しかしながら、日本においては、胃がんはな
お、がんの死亡原因の2位を占めており、必ずしも画像検査が胃がん死を抑制できている
とは言えない。
おり、一般的には、非特許文献3に示されるように、CEAについて5ng/mL、CA
19-9について37U/mLが基準値として用いられる。しかしながら、これらの腫瘍
マーカーは、胃がんの再発や、治療効果を確認するのに役立つことがあるが、早期の胃が
んでその発現が上昇することは極めて少ないため、胃がん検診としての目的には有用では
ないとされる。また、CEA、CA19-9などの腫瘍マーカーは、胃がん以外の理由で
も上昇することがあるため、これらのマーカーだけでは胃がんの有無を判定することは出
来ないと言われている。さらに、他のがんを誤って胃がんと診断してしまうと、適切な治
療の機会を逃したり、間違った医療を適用することで患者に不要な経済的、体力的負担を
強いることになる。
RNA)の発現量を用いて胃がんを判別するという報告が下記のようにあるが、いずれも
実用化に至っていない。
て胃がんを含むがんを検出する方法が示されている。しかしながら本検出方法は、胃がん
を判別する具体的な精度、感度、特異度などの検出性能についての記載が無く、産業的実
用性に乏しい。
iR-92-2(miR-92a-1-3p、miR-92a-2-3p)を用いて、ま
たさらにmiR-128(miR-128-2-5p)、miR-30c(miR-30
c-5p)、miR-135-1、miR-135-2(miR-135a-5p)、m
iR-149(miR-149-5p)およびその他のmiRNAを用いて、胃がんを検
出する方法が記載されている。
miR-92a-1-3p、miR-92a-2-3p)については、特に胃がんを検出
するためのmiRNAとして記載されている。しかしながら、血液中のマーカーの検証を
実施した記載はなく、具体的な検出例は組織中のmiRNAについてのものであり、これ
は容易なスクリーニング検査ではないため、産業的実用性に乏しい。
究段階のマーカーについては検出の方法や性能が具体的に示されていないため、これらを
利用した場合には、健常体を胃がん患者と誤検出することによる無駄な追加検査の実施や
、胃がん患者を見落とすことによる治療機会の逸失がおこる可能性がある。また、数十個
~数百個からなるmiRNAを測定することは検査費用を増大させるため、健康診断等に
おける大規模なスクリーニングには使用しづらい。また、腫瘍マーカーを測定するために
胃組織を採取することは患者に与える侵襲性が高く好ましくないため、低侵襲に採取でき
る血液からの検出が可能で、胃がん患者と健常体を正しく判別できる、精度の高い胃がん
マーカーが求められる。特に、胃がんの早期発見のために現在実施されている胃X線検査
など画像検査によるスクリーニングには放射線被ばくや高額な費用等の課題があるため、
より簡便な胃がん一次スクリーニング検査を提供することで、被験者および医療行政の利
益につながると考えられる。
胃がんの検出マーカーに使用可能な数個の遺伝子を見出し、これに特異的に結合可能な核
酸を用いることにより、胃がんを有意に検出できることを見いだし、本発明を完成するに
至った。
すなわち、本発明は、以下の特徴を有する。
(1)胃がんマーカーである、miR-4257、miR-6726-5p、miR-1
343-3p、miR-1247-3p、miR-6787-5p、miR-6875-
5p、miR-1225-3p、miR-8063、miR-6781-5p、miR-
4746-3p、miR-1908-5p、miR-6756-5p、miR-204-
3p、miR-4651、miR-6757-5p、miR-6825-5p、miR-
7108-5p、miR-4792、miR-7641、miR-3188、miR-3
131、miR-6780b-5p、miR-8069、miR-6840-3p、mi
R-8072、miR-1233-5p、miR-6887-5p、miR-1231、
miR-5572、miR-6738-5p、miR-6784-5p、miR-679
1-5p、miR-6749-5p、miR-6741-5p、miR-128-1-5
p、miR-4419b、miR-6746-5p、miR-3184-5p、miR-
3679-5p、miR-7110-5p、miR-4516、miR-6717-5p
、miR-6826-5p、miR-4433b-3p、miR-3679-3p、mi
R-3135b、miR-3622a-5p、miR-711、miR-4467、mi
R-6857-5p、miR-6515-3p、miR-1225-5p、miR-18
7-5p、miR-3185、miR-642b-3p、miR-1249、miR-7
44-5p、miR-4442、miR-1228-3p、miR-939-5p、mi
R-6845-5p、miR-887-3p、miR-7845-5p、miR-672
9-5p、miR-4632-5p、miR-615-5p、miR-6724-5p、
miR-4728-5p、miR-6732-5p、miR-6816-5p、miR-
4695-5p、miR-6088、miR-7975、miR-3197、miR-6
125、miR-4433-3p、miR-6727-5p、miR-4706、miR
-7847-3p、miR-6805-3p、miR-6766-3p、miR-191
3、miR-4649-5p、miR-602、miR-3663-3p、miR-68
93-5p、miR-6861-5p、miR-4449、miR-6842-5p、m
iR-4454、miR-5195-3p、miR-663b、miR-6765-5p
、miR-4513、miR-614、miR-6785-5p、miR-6777-5
p、miR-940、miR-4741、miR-6870-5p、miR-6131、
miR-150-3p、miR-4707-5p、miR-1915-3p、miR-3
937、miR-937-5p、miR-4443、miR-1914-3p、miR-
3620-5p、miR-1268b、miR-1227-5p、miR-6880-5
p、miR-4417、miR-6802-5p、miR-6769a-5p、miR-
663a、miR-6721-5p、miR-4532、miR-7977、miR-9
2b-5p、miR-371a-5p、miR-6126、miR-4734、miR-
4665-3p、miR-423-5p、miR-1469、miR-4675、miR
-1915-5p、miR-6716-5p、miR-718、miR-4281、mi
R-6820-5p、miR-6795-5p、miR-6779-5p、miR-71
09-5p、miR-6798-5p、miR-4648、miR-8059、miR-
6765-3p、miR-6132、miR-4492、miR-7107-5p、mi
R-3195、miR-3180、miR-296-3p、miR-564、miR-1
268a、miR-6848-5p、miR-762、miR-2861、miR-12
03、miR-1260b、miR-4476、miR-6885-5p、miR-67
69b-5p、miR-23b-3p、miR-1343-5p、miR-3621、m
iR-4688、miR-4286、miR-4640-5p、miR-4739、mi
R-1260a、miR-4276、miR-7106-5p、miR-6794-5p
、miR-6774-5p、miR-4707-3p、miR-4534、miR-42
94、miR-6850-5p、miR-6089及びmiR-671-5pからなる群
から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸を含む
、胃がんの検出用キット。
hsa-miR-6726-5pであり、miR-1343-3pがhsa-miR-1
343-3pであり、miR-1247-3pがhsa-miR-1247-3pであり
、miR-6787-5pがhsa-miR-6787-5pであり、miR-6875
-5pがhsa-miR-6875-5pであり、miR-1225-3pがhsa-m
iR-1225-3pであり、miR-8063がhsa-miR-8063であり、m
iR-6781-5pがhsa-miR-6781-5pであり、miR-4746-3
pがhsa-miR-4746-3pであり、miR-1908-5pがhsa-miR
-1908-5pであり、miR-6756-5pがhsa-miR-6756-5pで
あり、miR-204-3pがhsa-miR-204-3pであり、miR-4651
がhsa-miR-4651であり、miR-6757-5pがhsa-miR-675
7-5pであり、miR-6825-5pがhsa-miR-6825-5pであり、m
iR-7108-5pがhsa-miR-7108-5pであり、miR-4792がh
sa-miR-4792であり、miR-7641がhsa-miR-7641であり、
miR-3188がhsa-miR-3188であり、miR-3131がhsa-mi
R-3131であり、miR-6780b-5pがhsa-miR-6780b-5pで
あり、miR-8069がhsa-miR-8069であり、miR-6840-3pが
hsa-miR-6840-3pであり、miR-8072がhsa-miR-8072
であり、miR-1233-5pがhsa-miR-1233-5pであり、miR-6
887-5pがhsa-miR-6887-5pであり、miR-1231がhsa-m
iR-1231であり、miR-5572がhsa-miR-5572であり、miR-
6738-5pがhsa-miR-6738-5pであり、miR-6784-5pがh
sa-miR-6784-5pであり、miR-6791-5pがhsa-miR-67
91-5pであり、miR-6749-5pがhsa-miR-6749-5pであり、
miR-6741-5pがhsa-miR-6741-5pであり、miR-128-1
-5pがhsa-miR-128-1-5pであり、miR-4419bがhsa-mi
R-4419bであり、miR-6746-5pがhsa-miR-6746-5pであ
り、miR-3184-5pがhsa-miR-3184-5pであり、miR-367
9-5pがhsa-miR-3679-5pであり、miR-7110-5pがhsa-
miR-7110-5pであり、miR-4516がhsa-miR-4516であり、
miR-6717-5pがhsa-miR-6717-5pであり、miR-6826-
5pがhsa-miR-6826-5pであり、miR-4433b-3pがhsa-m
iR-4433b-3pであり、miR-3679-3pがhsa-miR-3679-
3pであり、miR-3135bがhsa-miR-3135bであり、miR-362
2a-5pがhsa-miR-3622a-5pであり、miR-711がhsa-mi
R-711であり、miR-4467がhsa-miR-4467であり、miR-68
57-5pがhsa-miR-6857-5pであり、miR-6515-3pがhsa
-miR-6515-3pであり、miR-1225-5pがhsa-miR-1225
-5pであり、miR-187-5pがhsa-miR-187-5pであり、miR-
3185がhsa-miR-3185であり、miR-642b-3pがhsa-miR
-642b-3pであり、miR-1249がhsa-miR-1249であり、miR
-744-5pがhsa-miR-744-5pであり、miR-4442がhsa-m
iR-4442であり、miR-1228-3pがhsa-miR-1228-3pであ
り、miR-939-5pがhsa-miR-939-5pであり、miR-6845-
5pがhsa-miR-6845-5pであり、miR-887-3pがhsa-miR
-887-3pであり、miR-7845-5pがhsa-miR-7845-5pであ
り、miR-6729-5pがhsa-miR-6729-5pであり、miR-463
2-5pがhsa-miR-4632-5pであり、miR-615-5pがhsa-m
iR-615-5pであり、miR-6724-5pがhsa-miR-6724-5p
であり、miR-4728-5pがhsa-miR-4728-5pであり、miR-6
732-5pがhsa-miR-6732-5pであり、miR-6816-5pがhs
a-miR-6816-5pであり、miR-4695-5pがhsa-miR-469
5-5pであり、miR-6088がhsa-miR-6088であり、miR-797
5がhsa-miR-7975であり、miR-3197がhsa-miR-3197で
あり、miR-6125がhsa-miR-6125であり、miR-4433-3pが
hsa-miR-4433-3pであり、miR-6727-5pがhsa-miR-6
727-5pであり、miR-4706がhsa-miR-4706であり、miR-7
847-3pがhsa-miR-7847-3pであり、miR-6805-3pがhs
a-miR-6805-3pであり、miR-6766-3pがhsa-miR-676
6-3pであり、miR-1913がhsa-miR-1913であり、miR-464
9-5pがhsa-miR-4649-5pであり、miR-602がhsa-miR-
602であり、miR-3663-3pがhsa-miR-3663-3pであり、mi
R-6893-5pがhsa-miR-6893-5pであり、miR-6861-5p
がhsa-miR-6861-5pであり、miR-4449がhsa-miR-444
9であり、miR-6842-5pがhsa-miR-6842-5pであり、miR-
4454がhsa-miR-4454であり、miR-5195-3pがhsa-miR
-5195-3pであり、miR-663bがhsa-miR-663bであり、miR
-6765-5pがhsa-miR-6765-5pであり、miR-4513がhsa
-miR-4513であり、miR-614がhsa-miR-614であり、miR-
6785-5pがhsa-miR-6785-5pであり、miR-6777-5pがh
sa-miR-6777-5pであり、miR-940がhsa-miR-940であり
、miR-4741がhsa-miR-4741であり、miR-6870-5pがhs
a-miR-6870-5pであり、miR-6131がhsa-miR-6131であ
り、miR-150-3pがhsa-miR-150-3pであり、miR-4707-
5pがhsa-miR-4707-5pであり、miR-1915-3pがhsa-mi
R-1915-3pであり、miR-3937がhsa-miR-3937であり、mi
R-937-5pがhsa-miR-937-5pであり、miR-4443がhsa-
miR-4443であり、miR-1914-3pがhsa-miR-1914-3pで
あり、miR-3620-5pがhsa-miR-3620-5pであり、miR-12
68bがhsa-miR-1268bであり、miR-1227-5pがhsa-miR
-1227-5pであり、miR-6880-5pがhsa-miR-6880-5pで
あり、miR-4417がhsa-miR-4417であり、miR-6802-5pが
hsa-miR-6802-5pであり、miR-6769a-5pがhsa-miR-
6769a-5pであり、miR-663aがhsa-miR-663aであり、miR
-6721-5pがhsa-miR-6721-5pであり、miR-4532がhsa
-miR-4532であり、miR-7977がhsa-miR-7977であり、mi
R-92b-5pがhsa-miR-92b-5pであり、miR-371a-5pがh
sa-miR-371a-5pであり、miR-6126がhsa-miR-6126で
あり、miR-4734がhsa-miR-4734であり、miR-4665-3pが
hsa-miR-4665-3pであり、miR-423-5pがhsa-miR-42
3-5pであり、miR-1469がhsa-miR-1469であり、miR-467
5がhsa-miR-4675であり、miR-1915-5pがhsa-miR-19
15-5pであり、miR-6716-5pがhsa-miR-6716-5pであり、
miR-718がhsa-miR-718であり、miR-4281がhsa-miR-
4281であり、miR-6820-5pがhsa-miR-6820-5pであり、m
iR-6795-5pがhsa-miR-6795-5pであり、miR-6779-5
pがhsa-miR-6779-5pであり、miR-7109-5pがhsa-miR
-7109-5pであり、miR-6798-5pがhsa-miR-6798-5pで
あり、miR-4648がhsa-miR-4648であり、miR-8059がhsa
-miR-8059であり、miR-6765-3pがhsa-miR-6765-3p
であり、miR-6132がhsa-miR-6132であり、miR-4492がhs
a-miR-4492であり、miR-7107-5pがhsa-miR-7107-5
pであり、miR-3195がhsa-miR-3195であり、miR-3180がh
sa-miR-3180であり、miR-296-3pがhsa-miR-296-3p
であり、miR-564がhsa-miR-564であり、miR-1268aがhsa
-miR-1268aであり、miR-6848-5pがhsa-miR-6848-5
pであり、miR-762がhsa-miR-762であり、miR-2861がhsa
-miR-2861であり、miR-1203がhsa-miR-1203であり、mi
R-1260bがhsa-miR-1260bであり、miR-4476がhsa-mi
R-4476であり、miR-6885-5pがhsa-miR-6885-5pであり
、miR-6769b-5pがhsa-miR-6769b-5pであり、miR-23
b-3pがhsa-miR-23b-3pであり、miR-1343-5pがhsa-m
iR-1343-5pであり、miR-3621がhsa-miR-3621であり、m
iR-4688がhsa-miR-4688であり、miR-4286がhsa-miR
-4286であり、miR-4640-5pがhsa-miR-4640-5pであり、
miR-4739がhsa-miR-4739であり、miR-1260aがhsa-m
iR-1260aであり、miR-4276がhsa-miR-4276であり、miR
-7106-5pがhsa-miR-7106-5pであり、miR-6794-5pが
hsa-miR-6794-5pであり、miR-6774-5pがhsa-miR-6
774-5pであり、miR-4707-3pがhsa-miR-4707-3pであり
、miR-4534がhsa-miR-4534であり、miR-4294がhsa-m
iR-4294であり、miR-6850-5pがhsa-miR-6850-5pであ
り、miR-6089がhsa-miR-6089であり、及び、miR-671-5p
がhsa-miR-671-5pである、(1)に記載のキット。
(a)配列番号1~165及び635~642のいずれかで表される塩基配列もしくは当
該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その
誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(b)配列番号1~165及び635~642のいずれかで表される塩基配列を含むポリ
ヌクレオチド、
(c)配列番号1~165及び635~642のいずれかで表される塩基配列もしくは当
該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド
、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(d)配列番号1~165及び635~642のいずれかで表される塩基配列もしくは当
該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、
及び
(e)前記(a)~(d)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハ
イブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(1)又は(2)に記載のキット。
125a-3p、miR-92a-2-5p及びmiR-486-3pからなる群から選
択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに含む
、(1)~(3)のいずれかに記載のキット。
125a-3pがhsa-miR-125a-3pであり、miR-92a-2-5pが
hsa-miR-92a-2-5pであり、及び、miR-486-3pがhsa-mi
R-486-3pである、(4)に記載のキット。
(f)配列番号166~169のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列にお
いてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は1
5以上の連続した塩基を含むその断片、
(g)配列番号166~169のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(h)配列番号166~169のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列にお
いてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、
その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(i)配列番号166~169のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列にお
いてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(j)前記(f)~(i)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハ
イブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(4)又は(5)に記載のキット。
3p、miR-4271、miR-6851-5p、miR-149-3p、miR-4
667-5p、miR-135a-3p、miR-4486、miR-4697-5p、
miR-4725-3p、miR-6510-5p、miR-5001-5p、miR-
4673、miR-4466、miR-23a-3p、miR-3656、miR-67
82-5p、miR-4689、miR-451a、miR-4446-3p、miR-
3180-3p、miR-642a-3p、miR-6889-5p、miR-3178
、miR-4665-5p、miR-6722-3p、miR-30c-1-3p、mi
R-4507、miR-3141及びmiR-1199-5pからなる群から選択される
少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに含む、(1)
~(6)のいずれかに記載のキット。
sa-miR-211-3pであり、miR-4271がhsa-miR-4271であ
り、miR-6851-5pがhsa-miR-6851-5pであり、miR-149
-3pがhsa-miR-149-3pであり、miR-4667-5pがhsa-mi
R-4667-5pであり、miR-135a-3pがhsa-miR-135a-3p
であり、miR-4486がhsa-miR-4486であり、miR-4697-5p
がhsa-miR-4697-5pであり、miR-4725-3pがhsa-miR-
4725-3pであり、miR-6510-5pがhsa-miR-6510-5pであ
り、miR-5001-5pがhsa-miR-5001-5pであり、miR-467
3がhsa-miR-4673であり、miR-4466がhsa-miR-4466で
あり、miR-23a-3pがhsa-miR-23a-3pであり、miR-3656
がhsa-miR-3656であり、miR-6782-5pがhsa-miR-678
2-5pであり、miR-4689がhsa-miR-4689であり、miR-451
aがhsa-miR-451aであり、miR-4446-3pがhsa-miR-44
46-3pであり、miR-3180-3pがhsa-miR-3180-3pであり、
miR-642a-3pがhsa-miR-642a-3pであり、miR-6889-
5pがhsa-miR-6889-5pであり、miR-3178がhsa-miR-3
178であり、miR-4665-5pがhsa-miR-4665-5pであり、mi
R-6722-3pがhsa-miR-6722-3pであり、miR-30c-1-3
pがhsa-miR-30c-1-3pであり、miR-4507がhsa-miR-4
507であり、miR-3141がhsa-miR-3141であり、及び、miR-1
199-5pがhsa-miR-1199-5pである、(7)に記載のキット。
(k)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列にお
いてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は1
5以上の連続した塩基を含むその断片、
(l)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(m)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列にお
いてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、
その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(n)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列にお
いてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(o)前記(k)~(n)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハ
イブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(7)又は(8)に記載のキット。
る少なくとも2つ以上のポリヌクレオチドのそれぞれと特異的に結合可能な少なくとも2
つ以上の核酸を含む、(1)~(9)のいずれかに記載のキット。
1343-3p、miR-1247-3p、miR-6787-5p、miR-6875
-5p、miR-1225-3p、miR-8063、miR-6781-5p、miR
-4746-3p、miR-1908-5p、miR-6756-5p、miR-204
-3p、miR-4651、miR-6757-5p、miR-6825-5p、miR
-7108-5p、miR-4792、miR-7641、miR-3188、miR-
3131、miR-6780b-5p、miR-8069、miR-6840-3p、m
iR-8072、miR-1233-5p、miR-6887-5p、miR-1231
、miR-5572、miR-6738-5p、miR-6784-5p、miR-67
91-5p、miR-6749-5p、miR-6741-5p、miR-128-1-
5p、miR-4419b、miR-6746-5p、miR-3184-5p、miR
-3679-5p、miR-7110-5p、miR-4516、miR-6717-5
p、miR-6826-5p、miR-4433b-3p、miR-3679-3p、m
iR-3135b、miR-3622a-5p、miR-711、miR-4467、m
iR-6857-5p、miR-6515-3p、miR-1225-5p、miR-1
87-5p、miR-3185、miR-642b-3p、miR-1249、miR-
744-5p、miR-4442、miR-1228-3p、miR-939-5p、m
iR-6845-5p、miR-887-3p、miR-7845-5p、miR-67
29-5p、miR-4632-5p、miR-615-5p、miR-6724-5p
、miR-4728-5p、miR-6732-5p、miR-6816-5p、miR
-4695-5p、miR-6088、miR-7975、miR-3197、miR-
6125、miR-4433-3p、miR-6727-5p、miR-4706、mi
R-7847-3p、miR-6805-3p、miR-6766-3p、miR-19
13、miR-4649-5p、miR-602、miR-3663-3p、miR-6
893-5p、miR-6861-5p、miR-4449、miR-6842-5p、
miR-4454、miR-5195-3p、miR-663b、miR-6765-5
p、miR-4513、miR-614、miR-6785-5p、miR-6777-
5p、miR-940、miR-4741、miR-6870-5p、miR-6131
、miR-150-3p、miR-4707-5p、miR-1915-3p、miR-
3937、miR-937-5p、miR-4443、miR-1914-3p、miR
-3620-5p、miR-1268b、miR-1227-5p、miR-6880-
5p、miR-4417、miR-6802-5p、miR-6769a-5p、miR
-663a、miR-6721-5p、miR-4532、miR-7977、miR-
92b-5p、miR-371a-5p、miR-6126、miR-4734、miR
-4665-3p、miR-423-5p、miR-1469、miR-4675、mi
R-1915-5p、miR-6716-5p、miR-718、miR-4281、m
iR-6820-5p、miR-6795-5p、miR-6779-5p、miR-7
109-5p、miR-6798-5p、miR-4648、miR-8059、miR
-6765-3p、miR-6132、miR-4492、miR-7107-5p、m
iR-3195、miR-3180、miR-296-3p、miR-564、miR-
1268a、miR-6848-5p、miR-762、miR-2861、miR-1
203、miR-1260b、miR-4476、miR-6885-5p、miR-6
769b-5p、miR-23b-3p、miR-1343-5p、miR-3621、
miR-4688、miR-4286、miR-4640-5p、miR-4739、m
iR-1260a、miR-4276、miR-7106-5p、miR-6794-5
p、miR-6774-5p、miR-4707-3p、miR-4534、miR-4
294、miR-6850-5p、miR-6089及びmiR-671-5pからなる
群から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸を含
む、胃がんの検出用デバイス。
がhsa-miR-6726-5pであり、miR-1343-3pがhsa-miR-
1343-3pであり、miR-1247-3pがhsa-miR-1247-3pであ
り、miR-6787-5pがhsa-miR-6787-5pであり、miR-687
5-5pがhsa-miR-6875-5pであり、miR-1225-3pがhsa-
miR-1225-3pであり、miR-8063がhsa-miR-8063であり、
miR-6781-5pがhsa-miR-6781-5pであり、miR-4746-
3pがhsa-miR-4746-3pであり、miR-1908-5pがhsa-mi
R-1908-5pであり、miR-6756-5pがhsa-miR-6756-5p
であり、miR-204-3pがhsa-miR-204-3pであり、miR-465
1がhsa-miR-4651であり、miR-6757-5pがhsa-miR-67
57-5pであり、miR-6825-5pがhsa-miR-6825-5pであり、
miR-7108-5pがhsa-miR-7108-5pであり、miR-4792が
hsa-miR-4792であり、miR-7641がhsa-miR-7641であり
、miR-3188がhsa-miR-3188であり、miR-3131がhsa-m
iR-3131であり、miR-6780b-5pがhsa-miR-6780b-5p
であり、miR-8069がhsa-miR-8069であり、miR-6840-3p
がhsa-miR-6840-3pであり、miR-8072がhsa-miR-807
2であり、miR-1233-5pがhsa-miR-1233-5pであり、miR-
6887-5pがhsa-miR-6887-5pであり、miR-1231がhsa-
miR-1231であり、miR-5572がhsa-miR-5572であり、miR
-6738-5pがhsa-miR-6738-5pであり、miR-6784-5pが
hsa-miR-6784-5pであり、miR-6791-5pがhsa-miR-6
791-5pであり、miR-6749-5pがhsa-miR-6749-5pであり
、miR-6741-5pがhsa-miR-6741-5pであり、miR-128-
1-5pがhsa-miR-128-1-5pであり、miR-4419bがhsa-m
iR-4419bであり、miR-6746-5pがhsa-miR-6746-5pで
あり、miR-3184-5pがhsa-miR-3184-5pであり、miR-36
79-5pがhsa-miR-3679-5pであり、miR-7110-5pがhsa
-miR-7110-5pであり、miR-4516がhsa-miR-4516であり
、miR-6717-5pがhsa-miR-6717-5pであり、miR-6826
-5pがhsa-miR-6826-5pであり、miR-4433b-3pがhsa-
miR-4433b-3pであり、miR-3679-3pがhsa-miR-3679
-3pであり、miR-3135bがhsa-miR-3135bであり、miR-36
22a-5pがhsa-miR-3622a-5pであり、miR-711がhsa-m
iR-711であり、miR-4467がhsa-miR-4467であり、miR-6
857-5pがhsa-miR-6857-5pであり、miR-6515-3pがhs
a-miR-6515-3pであり、miR-1225-5pがhsa-miR-122
5-5pであり、miR-187-5pがhsa-miR-187-5pであり、miR
-3185がhsa-miR-3185であり、miR-642b-3pがhsa-mi
R-642b-3pであり、miR-1249がhsa-miR-1249であり、mi
R-744-5pがhsa-miR-744-5pであり、miR-4442がhsa-
miR-4442であり、miR-1228-3pがhsa-miR-1228-3pで
あり、miR-939-5pがhsa-miR-939-5pであり、miR-6845
-5pがhsa-miR-6845-5pであり、miR-887-3pがhsa-mi
R-887-3pであり、miR-7845-5pがhsa-miR-7845-5pで
あり、miR-6729-5pがhsa-miR-6729-5pであり、miR-46
32-5pがhsa-miR-4632-5pであり、miR-615-5pがhsa-
miR-615-5pであり、miR-6724-5pがhsa-miR-6724-5
pであり、miR-4728-5pがhsa-miR-4728-5pであり、miR-
6732-5pがhsa-miR-6732-5pであり、miR-6816-5pがh
sa-miR-6816-5pであり、miR-4695-5pがhsa-miR-46
95-5pであり、miR-6088がhsa-miR-6088であり、miR-79
75がhsa-miR-7975であり、miR-3197がhsa-miR-3197
であり、miR-6125がhsa-miR-6125であり、miR-4433-3p
がhsa-miR-4433-3pであり、miR-6727-5pがhsa-miR-
6727-5pであり、miR-4706がhsa-miR-4706であり、miR-
7847-3pがhsa-miR-7847-3pであり、miR-6805-3pがh
sa-miR-6805-3pであり、miR-6766-3pがhsa-miR-67
66-3pであり、miR-1913がhsa-miR-1913であり、miR-46
49-5pがhsa-miR-4649-5pであり、miR-602がhsa-miR
-602であり、miR-3663-3pがhsa-miR-3663-3pであり、m
iR-6893-5pがhsa-miR-6893-5pであり、miR-6861-5
pがhsa-miR-6861-5pであり、miR-4449がhsa-miR-44
49であり、miR-6842-5pがhsa-miR-6842-5pであり、miR
-4454がhsa-miR-4454であり、miR-5195-3pがhsa-mi
R-5195-3pであり、miR-663bがhsa-miR-663bであり、mi
R-6765-5pがhsa-miR-6765-5pであり、miR-4513がhs
a-miR-4513であり、miR-614がhsa-miR-614であり、miR
-6785-5pがhsa-miR-6785-5pであり、miR-6777-5pが
hsa-miR-6777-5pであり、miR-940がhsa-miR-940であ
り、miR-4741がhsa-miR-4741であり、miR-6870-5pがh
sa-miR-6870-5pであり、miR-6131がhsa-miR-6131で
あり、miR-150-3pがhsa-miR-150-3pであり、miR-4707
-5pがhsa-miR-4707-5pであり、miR-1915-3pがhsa-m
iR-1915-3pであり、miR-3937がhsa-miR-3937であり、m
iR-937-5pがhsa-miR-937-5pであり、miR-4443がhsa
-miR-4443であり、miR-1914-3pがhsa-miR-1914-3p
であり、miR-3620-5pがhsa-miR-3620-5pであり、miR-1
268bがhsa-miR-1268bであり、miR-1227-5pがhsa-mi
R-1227-5pであり、miR-6880-5pがhsa-miR-6880-5p
であり、miR-4417がhsa-miR-4417であり、miR-6802-5p
がhsa-miR-6802-5pであり、miR-6769a-5pがhsa-miR
-6769a-5pであり、miR-663aがhsa-miR-663aであり、mi
R-6721-5pがhsa-miR-6721-5pであり、miR-4532がhs
a-miR-4532であり、miR-7977がhsa-miR-7977であり、m
iR-92b-5pがhsa-miR-92b-5pであり、miR-371a-5pが
hsa-miR-371a-5pであり、miR-6126がhsa-miR-6126
であり、miR-4734がhsa-miR-4734であり、miR-4665-3p
がhsa-miR-4665-3pであり、miR-423-5pがhsa-miR-4
23-5pであり、miR-1469がhsa-miR-1469であり、miR-46
75がhsa-miR-4675であり、miR-1915-5pがhsa-miR-1
915-5pであり、miR-6716-5pがhsa-miR-6716-5pであり
、miR-718がhsa-miR-718であり、miR-4281がhsa-miR
-4281であり、miR-6820-5pがhsa-miR-6820-5pであり、
miR-6795-5pがhsa-miR-6795-5pであり、miR-6779-
5pがhsa-miR-6779-5pであり、miR-7109-5pがhsa-mi
R-7109-5pであり、miR-6798-5pがhsa-miR-6798-5p
であり、miR-4648がhsa-miR-4648であり、miR-8059がhs
a-miR-8059であり、miR-6765-3pがhsa-miR-6765-3
pであり、miR-6132がhsa-miR-6132であり、miR-4492がh
sa-miR-4492であり、miR-7107-5pがhsa-miR-7107-
5pであり、miR-3195がhsa-miR-3195であり、miR-3180が
hsa-miR-3180であり、miR-296-3pがhsa-miR-296-3
pであり、miR-564がhsa-miR-564であり、miR-1268aがhs
a-miR-1268aであり、miR-6848-5pがhsa-miR-6848-
5pであり、miR-762がhsa-miR-762であり、miR-2861がhs
a-miR-2861であり、miR-1203がhsa-miR-1203であり、m
iR-1260bがhsa-miR-1260bであり、miR-4476がhsa-m
iR-4476であり、miR-6885-5pがhsa-miR-6885-5pであ
り、miR-6769b-5pがhsa-miR-6769b-5pであり、miR-2
3b-3pがhsa-miR-23b-3pであり、miR-1343-5pがhsa-
miR-1343-5pであり、miR-3621がhsa-miR-3621であり、
miR-4688がhsa-miR-4688であり、miR-4286がhsa-mi
R-4286であり、miR-4640-5pがhsa-miR-4640-5pであり
、miR-4739がhsa-miR-4739であり、miR-1260aがhsa-
miR-1260aであり、miR-4276がhsa-miR-4276であり、mi
R-7106-5pがhsa-miR-7106-5pであり、miR-6794-5p
がhsa-miR-6794-5pであり、miR-6774-5pがhsa-miR-
6774-5pであり、miR-4707-3pがhsa-miR-4707-3pであ
り、miR-4534がhsa-miR-4534であり、miR-4294がhsa-
miR-4294であり、miR-6850-5pがhsa-miR-6850-5pで
あり、miR-6089がhsa-miR-6089であり、及び、miR-671-5
pがhsa-miR-671-5pである、(11)に記載のデバイス。
(a)配列番号1~165及び635~642のいずれかで表される塩基配列もしくは当
該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その
誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(b)配列番号1~165及び635~642のいずれかで表される塩基配列を含むポリ
ヌクレオチド、
(c)配列番号1~165及び635~642のいずれかで表される塩基配列もしくは当
該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド
、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(d)配列番号1~165及び635~642のいずれかで表される塩基配列もしくは当
該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、
及び
(e)前記(a)~(d)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハ
イブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(11)又は(12)に記載のデバ
イス。
R-125a-3p、miR-92a-2-5p及びmiR-486-3pからなる群か
ら選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに
含む、(11)~(13)のいずれかに記載のデバイス。
-125a-3pがhsa-miR-125a-3pであり、miR-92a-2-5p
がhsa-miR-92a-2-5pであり、及び、miR-486-3pがhsa-m
iR-486-3pである、(14)に記載のデバイス。
(f)配列番号166~169のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列にお
いてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は1
5以上の連続した塩基を含むその断片、
(g)配列番号166~169のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(h)配列番号166~169のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列にお
いてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、
その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(i)配列番号166~169のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列にお
いてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(j)前記(f)~(i)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハ
イブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(14)又は(15)に記載のデバ
イス。
1-3p、miR-4271、miR-6851-5p、miR-149-3p、miR
-4667-5p、miR-135a-3p、miR-4486、miR-4697-5
p、miR-4725-3p、miR-6510-5p、miR-5001-5p、mi
R-4673、miR-4466、miR-23a-3p、miR-3656、miR-
6782-5p、miR-4689、miR-451a、miR-4446-3p、mi
R-3180-3p、miR-642a-3p、miR-6889-5p、miR-31
78、miR-4665-5p、miR-6722-3p、miR-30c-1-3p、
miR-4507、miR-3141及びmiR-1199-5pからなる群から選択さ
れる少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに含む、(
11)~(16)のいずれかに記載のデバイス。
hsa-miR-211-3pであり、miR-4271がhsa-miR-4271で
あり、miR-6851-5pがhsa-miR-6851-5pであり、miR-14
9-3pがhsa-miR-149-3pであり、miR-4667-5pがhsa-m
iR-4667-5pであり、miR-135a-3pがhsa-miR-135a-3
pであり、miR-4486がhsa-miR-4486であり、miR-4697-5
pがhsa-miR-4697-5pであり、miR-4725-3pがhsa-miR
-4725-3pであり、miR-6510-5pがhsa-miR-6510-5pで
あり、miR-5001-5pがhsa-miR-5001-5pであり、miR-46
73がhsa-miR-4673であり、miR-4466がhsa-miR-4466
であり、miR-23a-3pがhsa-miR-23a-3pであり、miR-365
6がhsa-miR-3656であり、miR-6782-5pがhsa-miR-67
82-5pであり、miR-4689がhsa-miR-4689であり、miR-45
1aがhsa-miR-451aであり、miR-4446-3pがhsa-miR-4
446-3pであり、miR-3180-3pがhsa-miR-3180-3pであり
、miR-642a-3pがhsa-miR-642a-3pであり、miR-6889
-5pがhsa-miR-6889-5pであり、miR-3178がhsa-miR-
3178であり、miR-4665-5pがhsa-miR-4665-5pであり、m
iR-6722-3pがhsa-miR-6722-3pであり、miR-30c-1-
3pがhsa-miR-30c-1-3pであり、miR-4507がhsa-miR-
4507であり、miR-3141がhsa-miR-3141であり、及び、miR-
1199-5pがhsa-miR-1199-5pである、(17)に記載のデバイス。
(k)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列にお
いてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は1
5以上の連続した塩基を含むその断片、
(l)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(m)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列にお
いてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、
その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(n)配列番号177~199のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列にお
いてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(o)前記(k)~(n)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハ
イブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(17)又は(18)に記載のデバ
イス。
る、(11)~(19)のいずれかに記載のデバイス。
デバイス。
択される少なくとも2つ以上のポリヌクレオチドのそれぞれと特異的に結合可能な少なく
とも2つ以上の核酸を含む、(11)~(21)のいずれかに記載のデバイス。
に記載のデバイスを用いて、被験体の検体における標的核酸の発現量を測定し、該測定さ
れた発現量と、同様に測定された健常体の対照発現量とを用いて、被験体が胃がんに罹患
していること、又は胃がんに罹患していないことをin vitroで評価することを含
む、胃がんの検出方法。
本明細書中で使用する用語は、以下の定義を有する。
列又はアミノ酸配列を含む明細書等の作成のためのガイドライン」(日本国特許庁編)及
び当技術分野における慣用に従うものとする。
キメラ)のいずれも包含する核酸に対して用いられる。なお、上記DNAには、cDNA
、ゲノムDNA、及び合成DNAのいずれもが含まれる。また上記RNAには、tota
l RNA、mRNA、rRNA、miRNA、siRNA、snoRNA、snRNA
、非コーディング(non-coding)RNA及び合成RNAのいずれもが含まれる
。本明細書において「合成DNA」及び「合成RNA」は、所定の塩基配列(天然型配列
又は非天然型配列のいずれでもよい。)に基づいて、例えば自動核酸合成機を用いて、人
工的に作製されたDNA及びRNAをいう。本明細書において「非天然型配列」は、広義
の意味に用いることを意図しており、天然型配列と異なる、例えば1以上のヌクレオチド
の置換、欠失、挿入及び/又は付加を含む配列(すなわち、変異配列)、1以上の修飾ヌ
クレオチドを含む配列(すなわち、修飾配列)、などを包含する。また、本明細書では、
ポリヌクレオチドは核酸と互換的に使用される。
るポリヌクレオチドであり、15塩基以上、好ましくは17塩基以上、より好ましくは1
9塩基以上の長さを有することが望ましい。
する正鎖(又はセンス鎖)又は相補鎖(又はアンチセンス鎖)などの各1本鎖DNAを包
含することを意図して用いられる。またその長さによって特に制限されるものではない。
る脂質二重膜に包まれた小胞である。エキソソームは多胞エンドソームに由来し、細胞外
環境に放出される際にRNA、DNA等の「遺伝子」やタンパク質などの生体物質を内部
に含むことがある。エキソソームは血液、血清、血漿、リンパ液等の体液に含まれること
が知られている。
Aのことをいう。RNAポリメラーゼが遺伝子の上流にあるプロモーターと呼ばれる部位
に結合し、DNAの塩基配列に相補的になるように3’末端にリボヌクレオチドを結合さ
せていく形でRNAが合成される。このRNAには遺伝子そのもののみならず、発現制御
領域、コード領域、エキソン又はイントロンをはじめとする転写開始点からポリA配列の
末端にいたるまでの全配列が含まれる。
ヘアピン様構造のRNA前駆体として転写され、RNase III切断活性を有するd
sRNA切断酵素により切断され、RISCと称するタンパク質複合体に取り込まれ、m
RNAの翻訳抑制に関与する15~25塩基の非コーディングRNAを意図して用いられ
る。また本明細書で使用する「miRNA」は特定の塩基配列(又は配列番号)で表され
る「miRNA」だけではなく、当該「miRNA」の前駆体(pre-miRNA、p
ri-miRNA)、これらと生物学的機能が同等であるmiRNA、例えば同族体(す
なわち、ホモログもしくはオーソログ)、遺伝子多型などの変異体、及び誘導体も包含す
る。かかる前駆体、同族体、変異体又は誘導体としては、具体的には、miRBase
release 20(http://www.mirbase.org/)により同定
することができ、後に記載したストリンジェントな条件下で、配列番号1~657のいず
れかで表されるいずれかの特定塩基配列の相補配列とハイブリダイズする塩基配列を有す
る「miRNA」を挙げることができる。さらにまた、本明細書で使用する「miRNA
」は、miR遺伝子の遺伝子産物であってもよく、そのような遺伝子産物は、成熟miR
NA(例えば、上記のようなmRNAの翻訳抑制に関与する15~25塩基、又は19~
25塩基、の非コーディングRNA)又はmiRNA前駆体(例えば、前記のようなpr
e-miRNA又はpri-miRNA)を包含する。
来するポリヌクレオチドを特異的に検出するために使用されるポリヌクレオチド及び/又
はそれに相補的なポリヌクレオチドを包含する。
由来するポリヌクレオチドを特異的に認識し、増幅するポリヌクレオチド及び/又はそれ
に相補的なポリヌクレオチドを包含する。
かによって定義される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、
からなるポリヌクレオチドの全長配列、又はその部分配列、(ここでは便宜上、これを正
鎖と呼ぶ)に対してA:T(U)、G:Cといった塩基対関係に基づいて、塩基的に相補
的な関係にあるポリヌクレオチドを意味する。ただし、かかる相補鎖は、対象とする正鎖
の塩基配列と完全に相補配列を形成する場合に限らず、対象とする正鎖とストリンジェン
トな条件でハイブリダイズできる程度の相補関係を有するものであってもよい。
よりも大きな程度(例えばバックグラウンド測定値の平均+バックグラウンド測定値の標
準誤差×2以上の測定値)で、その標的配列に対してハイブリダイズする条件をいう。ス
トリンジェントな条件は配列依存性であり、ハイブリダイゼーションが行われる環境によ
って異なる。ハイブリダイゼーション及び/又は洗浄条件のストリンジェンシーを制御す
ることにより、核酸プローブに対して100%相補的である標的配列が同定され得る。「
ストリンジェントな条件」の具体例は、後述する。
、二本鎖と一本鎖が1:1の比で存在する温度を意味する。
の変異体、あるいは配列番号1~657のいずれかの塩基配列、もしくは当該塩基配列に
おいてuがtである塩基配列、又はその部分配列において1又は2以上の塩基の欠失、置
換、付加又は挿入を含む変異体、あるいは当該塩基配列の各々又はその部分配列と約90
%以上、約95%以上、約97%以上、約98%以上、約99%以上の%同一性を示す変
異体、あるいは当該塩基配列又はその部分配列を含むポリヌクレオチド又はオリゴヌクレ
オチドと上記定義のストリンジェントな条件でハイブリダイズする核酸を意味する。
を意味する。
異導入法などの周知の技術を用いて作製可能である。
は遺伝子の検索システムを用いて、ギャップを導入して、又はギャップを導入しないで、
決定することができる(Zheng Zhangら、2000年、J. Comput.
Biol.、7巻、p203-214;Altschul,S.F.ら、1990年、
Journal of Molecular Biology、第215巻、p403-
410;Pearson,W.R.ら、1988年、Proc. Natl. Acad
. Sci. U.S.A.、第85巻、p2444-2448)。
ベル化誘導体、修飾ヌクレオチド(例えばハロゲン、メチルなどのアルキル、メトキシな
どのアルコキシ、チオ、カルボキシメチルなどの基を含むヌクレオチド及び塩基の再構成
、二重結合の飽和、脱アミノ化、酸素分子の硫黄分子への置換などを受けたヌクレオチド
など)を含む誘導体、PNA(peptide nucleic acid; Niel
sen,P.E.ら、1991年、Science、254巻、p1497-500)、
LNA(locked nucleic acid; Obika,S.ら,1998年
、Tetrahedron Lett.、39巻、p5401-5404)などを含むこ
とを意味する。
チドと特異的に結合可能な「核酸」は、合成又は調製された核酸であり、具体的には「核
酸プローブ」又は「プライマー」を含み、被験体中の胃がんの存在の有無を検出するため
に、又は胃がんの罹患の有無、罹患の程度、胃がんの改善の有無や改善の程度、胃がんの
治療に対する感受性を診断するために、あるいは胃がんの予防、改善又は治療に有用な候
補物質をスクリーニングするために、直接又は間接的に利用される。これらには胃がんの
罹患に関連して生体内、特に血液、尿等の体液等の検体において配列番号1~657のい
ずれかで表される転写産物又はそのcDNA合成核酸を特異的に認識し結合することので
きるヌクレオチド、オリゴヌクレオチド及びポリヌクレオチドを包含する。これらのヌク
レオチド、オリゴヌクレオチド及びポリヌクレオチドは、上記性質に基づいて生体内、組
織や細胞内などで発現した上記遺伝子を検出するためのプローブとして、また生体内で発
現した上記遺伝子を増幅するためのプライマーとして有効に利用することができる。
語で置換しうる。また、本明細書において「評価」という用語は、検査結果又は測定結果
に基づいて診断又は評価を支援することを含む意味で使用される。
どのペット動物、ウシ、ウマ、ヒツジ、ヤギなどの家畜動物、マウス、ラットなどの齧歯
類などの哺乳動物を意味する。また、「健常体」もまた、このような哺乳動物であって、
検出しようとするがんに罹患していない動物を意味する。
で実際にデータから計算された統計量よりも極端な統計量が観測される確率を示す。した
がって「P」又は「P値」が小さいほど、比較対象間に有意差があるとみなせる。
意味する。感度が高ければ胃がんを早期に発見することが可能となり、完全ながん部の切
除や再発率の低下につながる。
味する。特異度が高ければ健常体を胃がん患者と誤判別することによる無駄な追加検査の
実施を防ぎ、患者の負担の軽減や医療費の削減につながる。
する。精度は全検体に対しての判別結果が正しかった割合を示しており、検出性能を評価
する第一の指標となる。
んの進行、及び胃がんに対する治療効果の発揮にともない本発明の遺伝子が発現変化する
組織及び生体材料を指す。具体的には胃組織及びその周辺の脈管、リンパ節及び臓器、ま
た転移が疑われる臓器、皮膚、及び血液、尿、唾液、汗、組織浸出液などの体液、血液か
ら調製された血清、血漿、その他、便、毛髪などを指す。更にこれらから抽出された生体
試料、具体的にはRNAやmiRNAなどの遺伝子を指す。
257」という用語は、配列番号1に記載のhsa-miR-4257遺伝子(miRB
ase Accession No.MIMAT0016878)やその他生物種ホモロ
グもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4257遺伝子は、Goff
LAら、2009年、PLoS One、4巻、e7192に記載される方法によって得
ることができる。また、「hsa-miR-4257」は、その前駆体としてヘアピン様
構造をとる「hsa-mir-4257」(miRBase Accession No
.MI0015856、配列番号200)が知られている。
R-6726-5p」という用語は、配列番号2に記載のhsa-miR-6726-5
p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027353)や
その他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6726-
5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p
1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-mi
R-6726-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6
726」(miRBase Accession No.MI0022571、配列番号
201)が知られている。
R-1343-3p」という用語は、配列番号3に記載のhsa-miR-1343-3
p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019776)や
その他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-1343-
3p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p
78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-13
43-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1343」
(miRBase Accession No.MI0017320、配列番号202)
が知られている。
R-1247-3p」という用語は、配列番号4に記載のhsa-miR-1247-3
p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0022721)や
その他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-1247-
3p遺伝子は、Morin RDら、2008年、Genome Res、18巻、p6
10-621に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1
247-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1247
」(miRBase Accession No.MI0006382、配列番号203
)が知られている。
R-6787-5p」という用語は、配列番号5に記載のhsa-miR-6787-5
p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027474)や
その他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6787-
5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p
1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-mi
R-6787-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6
787」(miRBase Accession No.MI0022632、配列番号
204)が知られている。
R-6875-5p」という用語は、配列番号6に記載のhsa-miR-6875-5
p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027650)や
その他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6875-
5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p
1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-mi
R-6875-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6
875」(miRBase Accession No.MI0022722、配列番号
205)が知られている。
R-1225-3p」という用語は、配列番号7に記載のhsa-miR-1225-3
p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0005573)や
その他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-1225-
3p遺伝子は、Berezikov Eら、2007年、Mol Cell、28巻、p
328-336に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-
1225-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-122
5」(miRBase Accession No.MI0006311、配列番号20
6)が知られている。
063」という用語は、配列番号8に記載のhsa-miR-8063遺伝子(miRB
ase Accession No.MIMAT0030990)やその他生物種ホモロ
グもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-8063遺伝子は、Wang
HJら、2013年、Shock、39巻、p480-487に記載される方法によって
得ることができる。また、「hsa-miR-8063」は、その前駆体としてヘアピン
様構造をとる「hsa-mir-8063」(miRBase Accession N
o.MI0025899、配列番号207)が知られている。
R-6781-5p」という用語は、配列番号9に記載のhsa-miR-6781-5
p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027462)や
その他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6781-
5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p
1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-mi
R-6781-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6
781」(miRBase Accession No.MI0022626、配列番号
208)が知られている。
R-4746-3p」という用語は、配列番号10に記載のhsa-miR-4746-
3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019881)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4746
-3p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、
p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4
746-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4746
」(miRBase Accession No.MI0017385、配列番号209
)が知られている。
R-1908-5p」という用語は、配列番号11に記載のhsa-miR-1908-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0007881)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-1908
-5p遺伝子は、Bar Mら、2008年、Stem Cells、26巻、p249
6-2505に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1
908-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1908
」(miRBase Accession No.MI0008329、配列番号210
)が知られている。
R-6756-5p」という用語は、配列番号12に記載のhsa-miR-6756-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027412)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6756
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6756-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6756」(miRBase Accession No.MI0022601、配列番
号211)が知られている。
-204-3p」という用語は、配列番号13に記載のhsa-miR-204-3p遺
伝子(miRBase Accession No.MIMAT0022693)やその
他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-204-3p遺
伝子は、Lim LPら、2003年、Science、299巻、p1540に記載さ
れる方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-204-3p」は、その
前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-204」(miRBase Ac
cession No.MI0000284、配列番号212)が知られている。
651」という用語は、配列番号14に記載のhsa-miR-4651遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0019715)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4651遺伝子は、Pers
son Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される
方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4651」は、その前駆体と
してヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4651」(miRBase Acces
sion No.MI0017279、配列番号213)が知られている。
R-6757-5p」という用語は、配列番号15に記載のhsa-miR-6757-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027414)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6757
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6757-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6757」(miRBase Accession No.MI0022602、配列番
号214)が知られている。
R-6825-5p」という用語は、配列番号16に記載のhsa-miR-6825-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027550)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6825
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6825-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6825」(miRBase Accession No.MI0022670、配列番
号215)が知られている。
R-7108-5p」という用語は、配列番号17に記載のhsa-miR-7108-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0028113)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-7108
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-7108-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
7108」(miRBase Accession No.MI0022959、配列番
号216)が知られている。
792」という用語は、配列番号18に記載のhsa-miR-4792遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0019964)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4792遺伝子は、Pers
son Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される
方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4792」は、その前駆体と
してヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4792」(miRBase Acces
sion No.MI0017439、配列番号217)が知られている。
641」という用語は、配列番号19に記載のhsa-miR-7641遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0029782)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-7641遺伝子は、Yoo
JKら、2013年、Arch Pharm Res、36巻、p353-358に記載
される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-7641」は、その前
駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-7641-1,hsa-mir-7
641-2」(miRBase Accession No.MI0024975、MI
0024976、配列番号218,219)が知られている。
188」という用語は、配列番号20に記載のhsa-miR-3188遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0015070)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-3188遺伝子は、Star
k MSら、2010年、PLoS One、5巻、e9685に記載される方法によっ
て得ることができる。また、「hsa-miR-3188」は、その前駆体としてヘアピ
ン様構造をとる「hsa-mir-3188」(miRBase Accession
No.MI0014232、配列番号220)が知られている。
131」という用語は、配列番号21に記載のhsa-miR-3131遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0014996)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-3131遺伝子は、Star
k MSら、2010年、PLoS One、5巻、e9685に記載される方法によっ
て得ることができる。また、「hsa-miR-3131」は、その前駆体としてヘアピ
ン様構造をとる「hsa-mir-3131」(miRBase Accession
No.MI0014151、配列番号221)が知られている。
iR-6780b-5p」という用語は、配列番号22に記載のhsa-miR-678
0b-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT00275
72)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6
780b-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、
22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「h
sa-miR-6780b-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa
-mir-6780b」(miRBase Accession No.MI00226
81、配列番号222)が知られている。
069」という用語は、配列番号23に記載のhsa-miR-8069遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0030996)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-8069遺伝子は、Wang
HJら、2013年、Shock、39巻、p480-487に記載される方法によっ
て得ることができる。また、「hsa-miR-8069」は、その前駆体としてヘアピ
ン様構造をとる「hsa-mir-8069」(miRBase Accession
No.MI0025905、配列番号223)が知られている。
R-6840-3p」という用語は、配列番号24に記載のhsa-miR-6840-
3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027583)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6840
-3p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6840-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6840」(miRBase Accession No.MI0022686、配列番
号224)が知られている。
072」という用語は、配列番号25に記載のhsa-miR-8072遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0030999)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-8072遺伝子は、Wang
HJら、2013年、Shock、39巻、p480-487に記載される方法によっ
て得ることができる。また、「hsa-miR-8072」は、その前駆体としてヘアピ
ン様構造をとる「hsa-mir-8072」(miRBase Accession
No.MI0025908、配列番号225)が知られている。
R-1233-5p」という用語は、配列番号26に記載のhsa-miR-1233-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0022943)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-1233
-5p遺伝子は、Berezikov Eら、2007年、Mol Cell、28巻、
p328-336に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR
-1233-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-12
33-1,hsa-mir-1233-2」(miRBase Accession N
o.MI0006323、MI0015973、配列番号226,227)が知られてい
る。
R-6887-5p」という用語は、配列番号27に記載のhsa-miR-6887-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027674)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6887
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6887-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6887」(miRBase Accession No.MI0022734、配列番
号228)が知られている。
231」という用語は、配列番号28に記載のhsa-miR-1231遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0005586)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-1231遺伝子は、Bere
zikov Eら、2007年、Mol Cell、28巻、p328-336に記載さ
れる方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1231」は、その前駆
体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1231」(miRBase Acc
ession No.MI0006321、配列番号229)が知られている。
572」という用語は、配列番号29に記載のhsa-miR-5572遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0022260)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-5572遺伝子は、Tand
on Mら、2012年、Oral Dis、18巻、p127-131に記載される方
法によって得ることができる。また、「hsa-miR-5572」は、その前駆体とし
てヘアピン様構造をとる「hsa-mir-5572」(miRBase Access
ion No.MI0019117、配列番号230)が知られている。
R-6738-5p」という用語は、配列番号30に記載のhsa-miR-6738-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027377)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6738
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6738-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6738」(miRBase Accession No.MI0022583、配列番
号231)が知られている。
R-6784-5p」という用語は、配列番号31に記載のhsa-miR-6784-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027468)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6784
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6784-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6784」(miRBase Accession No.MI0022629、配列番
号232)が知られている。
R-6791-5p」という用語は、配列番号32に記載のhsa-miR-6791-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027482)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6791
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6791-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6791」(miRBase Accession No.MI0022636、配列番
号233)が知られている。
R-6749-5p」という用語は、配列番号33に記載のhsa-miR-6749-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027398)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6749
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6749-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6749」(miRBase Accession No.MI0022594、配列番
号234)が知られている。
R-6741-5p」という用語は、配列番号34に記載のhsa-miR-6741-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027383)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6741
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6741-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6741」(miRBase Accession No.MI0022586、配列番
号235)が知られている。
iR-128-1-5p」という用語は、配列番号35に記載のhsa-miR-128
-1-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT00264
77)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-1
28-1-5p遺伝子は、Lagos-Quintana Mら、2002年、Curr
Biol、12巻、p735-739に記載される方法によって得ることができる。ま
た、「hsa-miR-128-1-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる
「hsa-mir-128-1」(miRBase Accession No.MI0
000447、配列番号236)が知られている。
4419b」という用語は、配列番号36に記載のhsa-miR-4419b遺伝子(
miRBase Accession No.MIMAT0019034)やその他生物
種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4419b遺伝子は、
Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載され
る方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4419b」は、その前駆
体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4419b」(miRBase Ac
cession No.MI0016861、配列番号237)が知られている。
R-6746-5p」という用語は、配列番号37に記載のhsa-miR-6746-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027392)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6746
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6746-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6746」(miRBase Accession No.MI0022591、配列番
号238)が知られている。
R-3184-5p」という用語は、配列番号38に記載のhsa-miR-3184-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0015064)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-3184
-5p遺伝子は、Stark MSら、2010年、PLoS One、5巻、e968
5に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3184-5
p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3184」(miR
Base Accession No.MI0014226、配列番号239)が知られ
ている。
R-3679-5p」という用語は、配列番号39に記載のhsa-miR-3679-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018104)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-3679
-5p遺伝子は、Creighton CJら、2010年、PLoS One、5巻、
e9637に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-36
79-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3679」
(miRBase Accession No.MI0016080、配列番号240)
が知られている。
R-7110-5p」という用語は、配列番号40に記載のhsa-miR-7110-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0028117)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-7110
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-7110-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
7110」(miRBase Accession No.MI0022961、配列番
号241)が知られている。
516」という用語は、配列番号41に記載のhsa-miR-4516遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0019053)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4516遺伝子は、Jima
DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法に
よって得ることができる。また、「hsa-miR-4516」は、その前駆体としてヘ
アピン様構造をとる「hsa-mir-4516」(miRBase Accessio
n No.MI0016882、配列番号242)が知られている。
R-6717-5p」という用語は、配列番号42に記載のhsa-miR-6717-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0025846)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6717
-5p遺伝子は、Li Yら、2012年、Gene、497巻、p330-335に記
載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6717-5p」は
、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6717」(miRBas
e Accession No.MI0022551、配列番号243)が知られている
。
R-6826-5p」という用語は、配列番号43に記載のhsa-miR-6826-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027552)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6826
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6826-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6826」(miRBase Accession No.MI0022671、配列番
号244)が知られている。
iR-4433b-3p」という用語は、配列番号44に記載のhsa-miR-443
3b-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT00304
14)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4
433b-3p遺伝子は、Ple Hら、2012年、PLoS One、7巻、e50
746に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4433
b-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4433b」
(miRBase Accession No.MI0025511、配列番号245)
が知られている。
R-3679-3p」という用語は、配列番号45に記載のhsa-miR-3679-
3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018105)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-3679
-3p遺伝子は、Creighton CJら、2010年、PLoS One、5巻、
e9637に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-36
79-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3679」
(miRBase Accession No.MI0016080、配列番号240)
が知られている。
3135b」という用語は、配列番号46に記載のhsa-miR-3135b遺伝子(
miRBase Accession No.MIMAT0018985)やその他生物
種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-3135b遺伝子は、
Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載され
る方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3135b」は、その前駆
体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3135b」(miRBase Ac
cession No.MI0016809、配列番号246)が知られている。
iR-3622a-5p」という用語は、配列番号47に記載のhsa-miR-362
2a-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT00180
03)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-3
622a-5p遺伝子は、Witten Dら、2010年、BMC Biol、8巻、
p58に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3622
a-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3622a」
(miRBase Accession No.MI0016013、配列番号247)
が知られている。
1」という用語は、配列番号48に記載のhsa-miR-711遺伝子(miRBas
e Accession No.MIMAT0012734)やその他生物種ホモログも
しくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-711遺伝子は、Artzi Sら
、2008年、BMC Bioinformatics、9巻、p39に記載される方法
によって得ることができる。また、「hsa-miR-711」は、その前駆体としてヘ
アピン様構造をとる「hsa-mir-711」(miRBase Accession
No.MI0012488、配列番号248)が知られている。
467」という用語は、配列番号49に記載のhsa-miR-4467遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0018994)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4467遺伝子は、Jima
DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法に
よって得ることができる。また、「hsa-miR-4467」は、その前駆体としてヘ
アピン様構造をとる「hsa-mir-4467」(miRBase Accessio
n No.MI0016818、配列番号249)が知られている。
R-6857-5p」という用語は、配列番号50に記載のhsa-miR-6857-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027614)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6857
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6857-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6857」(miRBase Accession No.MI0022703、配列番
号250)が知られている。
R-6515-3p」という用語は、配列番号51に記載のhsa-miR-6515-
3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0025487)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6515
-3p遺伝子は、Joyce CEら、2011年、Hum Mol Genet、20
巻、p4025-4040に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa
-miR-6515-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mi
r-6515」(miRBase Accession No.MI0022227、配
列番号251)が知られている。
R-1225-5p」という用語は、配列番号52に記載のhsa-miR-1225-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0005572)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-1225
-5p遺伝子は、Berezikov Eら、2007年、Mol Cell、28巻、
p328-336に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR
-1225-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-12
25」(miRBase Accession No.MI0006311、配列番号2
06)が知られている。
-187-5p」という用語は、配列番号53に記載のhsa-miR-187-5p遺
伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004561)やその
他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-187-5p遺
伝子は、Lim LPら、2003年、Science、299巻、p1540に記載さ
れる方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-187-5p」は、その
前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-187」(miRBase Ac
cession No.MI0000274、配列番号252)が知られている。
185」という用語は、配列番号54に記載のhsa-miR-3185遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0015065)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-3185遺伝子は、Star
k MSら、2010年、PLoS One、5巻、e9685に記載される方法によっ
て得ることができる。また、「hsa-miR-3185」は、その前駆体としてヘアピ
ン様構造をとる「hsa-mir-3185」(miRBase Accession
No.MI0014227、配列番号253)が知られている。
R-642b-3p」という用語は、配列番号55に記載のhsa-miR-642b-
3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018444)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-642b
-3p遺伝子は、Witten Dら、2010年、BMC Biol、8巻、p58に
記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-642b-3p」
は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-642b」(miRBa
se Accession No.MI0016685、配列番号254)が知られてい
る。
249」という用語は、配列番号56に記載のhsa-miR-1249遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0005901)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-1249遺伝子は、Mori
n RDら、2008年、Genome Res、18巻、p610-621に記載され
る方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1249」は、その前駆体
としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1249」(miRBase Acce
ssion No.MI0006384、配列番号255)が知られている。
-744-5p」という用語は、配列番号57に記載のhsa-miR-744-5p遺
伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004945)やその
他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-744-5p遺
伝子は、Berezikov Eら、2006年、Genome Res、16巻、p1
289-1298に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR
-744-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-744
」(miRBase Accession No.MI0005559、配列番号256
)が知られている。
442」という用語は、配列番号58に記載のhsa-miR-4442遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0018960)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4442遺伝子は、Jima
DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法に
よって得ることができる。また、「hsa-miR-4442」は、その前駆体としてヘ
アピン様構造をとる「hsa-mir-4442」(miRBase Accessio
n No.MI0016785、配列番号257)が知られている。
R-1228-3p」という用語は、配列番号59に記載のhsa-miR-1228-
3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0005583)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-1228
-3p遺伝子は、Berezikov Eら、2007年、Mol Cell、28巻、
p328-336に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR
-1228-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-12
28」(miRBase Accession No.MI0006318、配列番号2
58)が知られている。
-939-5p」という用語は、配列番号60に記載のhsa-miR-939-5p遺
伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004982)やその
他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-939-5p遺
伝子は、Lui WOら、2007年、Cancer Res、67巻、p6031-6
043に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-939-
5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-939」(miR
Base Accession No.MI0005761、配列番号259)が知られ
ている。
R-6845-5p」という用語は、配列番号61に記載のhsa-miR-6845-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027590)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6845
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6845-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6845」(miRBase Accession No.MI0022691、配列番
号260)が知られている。
-887-3p」という用語は、配列番号62に記載のhsa-miR-887-3p遺
伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004951)やその
他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-887-3p遺
伝子は、Berezikov Eら、2006年、Genome Res、16巻、p1
289-1298に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR
-887-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-887
」(miRBase Accession No.MI0005562、配列番号261
)が知られている。
R-7845-5p」という用語は、配列番号63に記載のhsa-miR-7845-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0030420)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-7845
-5p遺伝子は、Ple Hら、2012年、PLoS One、7巻、e50746に
記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-7845-5p」
は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-7845」(miRBa
se Accession No.MI0025515、配列番号262)が知られてい
る。
R-6729-5p」という用語は、配列番号64に記載のhsa-miR-6729-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027359)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6729
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6729-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6729」(miRBase Accession No.MI0022574、配列番
号263)が知られている。
R-4632-5p」という用語は、配列番号65に記載のhsa-miR-4632-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0022977)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4632
-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、
p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4
632-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4632
」(miRBase Accession No.MI0017259、配列番号264
)が知られている。
-615-5p」という用語は、配列番号66に記載のhsa-miR-615-5p遺
伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004804)やその
他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-615-5p遺
伝子は、Cummins JMら、2006年、Proc Natl Acad Sci
U S A、103巻、p3687-3692に記載される方法によって得ることがで
きる。また、「hsa-miR-615-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造を
とる「hsa-mir-615」(miRBase Accession No.MI0
003628、配列番号265)が知られている。
R-6724-5p」という用語は、配列番号67に記載のhsa-miR-6724-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0025856)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6724
-5p遺伝子は、Li Yら、2012年、Gene、497巻、p330-335に記
載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6724-5p」は
、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6724」(miRBas
e Accession No.MI0022559、配列番号266)が知られている
。
R-4728-5p」という用語は、配列番号68に記載のhsa-miR-4728-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019849)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4728
-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、
p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4
728-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4728
」(miRBase Accession No.MI0017365、配列番号267
)が知られている。
R-6732-5p」という用語は、配列番号69に記載のhsa-miR-6732-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027365)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6732
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6732-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6732」(miRBase Accession No.MI0022577、配列番
号268)が知られている。
R-6816-5p」という用語は、配列番号70に記載のhsa-miR-6816-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027532)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6816
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6816-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6816」(miRBase Accession No.MI0022661、配列番
号269)が知られている。
R-4695-5p」という用語は、配列番号71に記載のhsa-miR-4695-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019788)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4695
-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、
p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4
695-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4695
」(miRBase Accession No.MI0017328、配列番号270
)が知られている。
088」という用語は、配列番号72に記載のhsa-miR-6088遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0023713)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6088遺伝子は、Yoo
JKら、2012年、Stem Cells Dev、21巻、p2049-2057に
記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6088」は、そ
の前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6088」(miRBase
Accession No.MI0020365、配列番号271)が知られている。
975」という用語は、配列番号73に記載のhsa-miR-7975遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0031178)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-7975遺伝子は、Velt
hut-Meikas Aら、2013年、Mol Endocrinol、オンライン
版、に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-7975」
は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-7975」(miRBa
se Accession No.MI0025751、配列番号272)が知られてい
る。
197」という用語は、配列番号74に記載のhsa-miR-3197遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0015082)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-3197遺伝子は、Star
k MSら、2010年、PLoS One、5巻、e9685に記載される方法によっ
て得ることができる。また、「hsa-miR-3197」は、その前駆体としてヘアピ
ン様構造をとる「hsa-mir-3197」(miRBase Accession
No.MI0014245、配列番号273)が知られている。
125」という用語は、配列番号75に記載のhsa-miR-6125遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0024598)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6125遺伝子は、Smit
h JLら、2012年、J Virol、86巻、p5278-5287に記載される
方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6125」は、その前駆体と
してヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6125」(miRBase Acces
sion No.MI0021259、配列番号274)が知られている。
R-4433-3p」という用語は、配列番号76に記載のhsa-miR-4433-
3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018949)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4433
-3p遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e
127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4433
-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4433」(m
iRBase Accession No.MI0016773、配列番号275)が知
られている。
R-6727-5p」という用語は、配列番号77に記載のhsa-miR-6727-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027355)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6727
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6727-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6727」(miRBase Accession No.MI0022572、配列番
号276)が知られている。
706」という用語は、配列番号78に記載のhsa-miR-4706遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0019806)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4706遺伝子は、Pers
son Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される
方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4706」は、その前駆体と
してヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4706」(miRBase Acces
sion No.MI0017339、配列番号277)が知られている。
R-7847-3p」という用語は、配列番号79に記載のhsa-miR-7847-
3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0030422)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-7847
-3p遺伝子は、Ple Hら、2012年、PLoS One、7巻、e50746に
記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-7847-3p」
は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-7847」(miRBa
se Accession No.MI0025517、配列番号278)が知られてい
る。
R-6805-3p」という用語は、配列番号80に記載のhsa-miR-6805-
3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027511)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6805
-3p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6805-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6805」(miRBase Accession No.MI0022650、配列番
号279)が知られている。
R-6766-3p」という用語は、配列番号81に記載のhsa-miR-6766-
3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027433)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6766
-3p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6766-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6766」(miRBase Accession No.MI0022611、配列番
号280)が知られている。
913」という用語は、配列番号82に記載のhsa-miR-1913遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0007888)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-1913遺伝子は、Bar
Mら、2008年、Stem Cells、26巻、p2496-2505に記載される
方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1913」は、その前駆体と
してヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1913」(miRBase Acces
sion No.MI0008334、配列番号281)が知られている。
R-4649-5p」という用語は、配列番号83に記載のhsa-miR-4649-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019711)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4649
-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、
p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4
649-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4649
」(miRBase Accession No.MI0017276、配列番号282
)が知られている。
2」という用語は、配列番号84に記載のhsa-miR-602遺伝子(miRBas
e Accession No.MIMAT0003270)やその他生物種ホモログも
しくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-602遺伝子は、Cummins
JMら、2006年、Proc Natl Acad Sci U S A、103巻、
p3687-3692に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-602」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-602」
(miRBase Accession No.MI0003615、配列番号283)
が知られている。
R-3663-3p」という用語は、配列番号85に記載のhsa-miR-3663-
3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018085)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-3663
-3p遺伝子は、Liao JYら、2010年、PLoS One、5巻、e1056
3に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3663-3
p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3663」(miR
Base Accession No.MI0016064、配列番号284)が知られ
ている。
R-6893-5p」という用語は、配列番号86に記載のhsa-miR-6893-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027686)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6893
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6893-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6893」(miRBase Accession No.MI0022740、配列番
号285)が知られている。
R-6861-5p」という用語は、配列番号87に記載のhsa-miR-6861-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027623)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6861
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6861-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6861」(miRBase Accession No.MI0022708、配列番
号286)が知られている。
449」という用語は、配列番号88に記載のhsa-miR-4449遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0018968)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4449遺伝子は、Jima
DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法に
よって得ることができる。また、「hsa-miR-4449」は、その前駆体としてヘ
アピン様構造をとる「hsa-mir-4449」(miRBase Accessio
n No.MI0016792、配列番号287)が知られている。
R-6842-5p」という用語は、配列番号89に記載のhsa-miR-6842-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027586)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6842
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6842-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6842」(miRBase Accession No.MI0022688、配列番
号288)が知られている。
454」という用語は、配列番号90に記載のhsa-miR-4454遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0018976)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4454遺伝子は、Jima
DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法に
よって得ることができる。また、「hsa-miR-4454」は、その前駆体としてヘ
アピン様構造をとる「hsa-mir-4454」(miRBase Accessio
n No.MI0016800、配列番号289)が知られている。
R-5195-3p」という用語は、配列番号91に記載のhsa-miR-5195-
3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0021127)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-5195
-3p遺伝子は、Schotte Dら、2011年、Leukemia、25巻、p1
389-1399に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR
-5195-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-51
95」(miRBase Accession No.MI0018174、配列番号2
90)が知られている。
63b」という用語は、配列番号92に記載のhsa-miR-663b遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0005867)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-663b遺伝子は、Taka
da Sら、2008年、Leukemia、22巻、p1274-1278に記載され
る方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-663b」は、その前駆体
としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-663b」(miRBase Acce
ssion No.MI0006336、配列番号291)が知られている。
R-6765-5p」という用語は、配列番号93に記載のhsa-miR-6765-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027430)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6765
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6765-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6765」(miRBase Accession No.MI0022610、配列番
号292)が知られている。
513」という用語は、配列番号94に記載のhsa-miR-4513遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0019050)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4513遺伝子は、Jima
DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法に
よって得ることができる。また、「hsa-miR-4513」は、その前駆体としてヘ
アピン様構造をとる「hsa-mir-4513」(miRBase Accessio
n No.MI0016879、配列番号293)が知られている。
4」という用語は、配列番号95に記載のhsa-miR-614遺伝子(miRBas
e Accession No.MIMAT0003282)やその他生物種ホモログも
しくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-614遺伝子は、Cummins
JMら、2006年、Proc Natl Acad Sci U S A、103巻、
p3687-3692に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-614」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-614」
(miRBase Accession No.MI0003627、配列番号294)
が知られている。
R-6785-5p」という用語は、配列番号96に記載のhsa-miR-6785-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027470)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6785
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6785-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6785」(miRBase Accession No.MI0022630、配列番
号295)が知られている。
R-6777-5p」という用語は、配列番号97に記載のhsa-miR-6777-
5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027454)
やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6777
-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、
p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-6777-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
6777」(miRBase Accession No.MI0022622、配列番
号296)が知られている。
0」という用語は、配列番号98に記載のhsa-miR-940遺伝子(miRBas
e Accession No.MIMAT0004983)やその他生物種ホモログも
しくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-940遺伝子は、Lui WOら、
2007年、Cancer Res、67巻、p6031-6043に記載される方法に
よって得ることができる。また、「hsa-miR-940」は、その前駆体としてヘア
ピン様構造をとる「hsa-mir-940」(miRBase Accession
No.MI0005762、配列番号297)が知られている。
741」という用語は、配列番号99に記載のhsa-miR-4741遺伝子(miR
Base Accession No.MIMAT0019871)やその他生物種ホモ
ログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4741遺伝子は、Pers
son Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される
方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4741」は、その前駆体と
してヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4741」(miRBase Acces
sion No.MI0017379、配列番号298)が知られている。
R-6870-5p」という用語は、配列番号100に記載のhsa-miR-6870
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027640
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-687
0-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻
、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-
miR-6870-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir
-6870」(miRBase Accession No.MI0022717、配列
番号299)が知られている。
131」という用語は、配列番号101に記載のhsa-miR-6131遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0024615)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6131遺伝子は、Dan
nemann Mら、2012年、Genome Biol Evol、4巻、p552
-564に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-613
1」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6131」(miR
Base Accession No.MI0021276、配列番号300)が知られ
ている。
-150-3p」という用語は、配列番号102に記載のhsa-miR-150-3p
遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004610)やそ
の他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-150-3p
遺伝子は、Lagos-Quintana Mら、2002年、Curr Biol、1
2巻、p735-739に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-
miR-150-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
150」(miRBase Accession No.MI0000479、配列番号
301)が知られている。
R-4707-5p」という用語は、配列番号103に記載のhsa-miR-4707
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019807
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-470
7-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻
、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-
4707-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-470
7」(miRBase Accession No.MI0017340、配列番号30
2)が知られている。
R-1915-3p」という用語は、配列番号104に記載のhsa-miR-1915
-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0007892
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-191
5-3p遺伝子は、Bar Mら、2008年、Stem Cells、26巻、p24
96-2505に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-
1915-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-191
5」(miRBase Accession No.MI0008336、配列番号30
3)が知られている。
937」という用語は、配列番号105に記載のhsa-miR-3937遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0018352)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-3937遺伝子は、Lia
o JYら、2010年、PLoS One、5巻、e10563に記載される方法によ
って得ることができる。また、「hsa-miR-3937」は、その前駆体としてヘア
ピン様構造をとる「hsa-mir-3937」(miRBase Accession
No.MI0016593、配列番号304)が知られている。
-937-5p」という用語は、配列番号106に記載のhsa-miR-937-5p
遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0022938)やそ
の他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-937-5p
遺伝子は、Lui WOら、2007年、Cancer Res、67巻、p6031-
6043に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-937
-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-937」(mi
RBase Accession No.MI0005759、配列番号305)が知ら
れている。
443」という用語は、配列番号107に記載のhsa-miR-4443遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0018961)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4443遺伝子は、Jim
a DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法
によって得ることができる。また、「hsa-miR-4443」は、その前駆体として
ヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4443」(miRBase Accessi
on No.MI0016786、配列番号306)が知られている。
R-1914-3p」という用語は、配列番号108に記載のhsa-miR-1914
-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0007890
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-191
4-3p遺伝子は、Bar Mら、2008年、Stem Cells、26巻、p24
96-2505に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-
1914-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-191
4」(miRBase Accession No.MI0008335、配列番号30
7)が知られている。
R-3620-5p」という用語は、配列番号109に記載のhsa-miR-3620
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0022967
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-362
0-5p遺伝子は、Witten Dら、2010年、BMC Biol、8巻、p58
に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3620-5p
」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3620」(miRB
ase Accession No.MI0016011、配列番号308)が知られて
いる。
1268b」という用語は、配列番号110に記載のhsa-miR-1268b遺伝子
(miRBase Accession No.MIMAT0018925)やその他生
物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-1268b遺伝子は
、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載さ
れる方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1268b」は、その前
駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1268b」(miRBase A
ccession No.MI0016748、配列番号309)が知られている。
R-1227-5p」という用語は、配列番号111に記載のhsa-miR-1227
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0022941
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-122
7-5p遺伝子は、Berezikov Eら、2007年、Mol Cell、28巻
、p328-336に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-mi
R-1227-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1
227」(miRBase Accession No.MI0006316、配列番号
310)が知られている。
R-6880-5p」という用語は、配列番号112に記載のhsa-miR-6880
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027660
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-688
0-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻
、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-
miR-6880-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir
-6880」(miRBase Accession No.MI0022727、配列
番号311)が知られている。
417」という用語は、配列番号113に記載のhsa-miR-4417遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0018929)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4417遺伝子は、Jim
a DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法
によって得ることができる。また、「hsa-miR-4417」は、その前駆体として
ヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4417」(miRBase Accessi
on No.MI0016753、配列番号312)が知られている。
R-6802-5p」という用語は、配列番号114に記載のhsa-miR-6802
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027504
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-680
2-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻
、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-
miR-6802-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir
-6802」(miRBase Accession No.MI0022647、配列
番号313)が知られている。
iR-6769a-5p」という用語は、配列番号115に記載のhsa-miR-67
69a-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027
438)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-
6769a-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res
、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「
hsa-miR-6769a-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hs
a-mir-6769a」(miRBase Accession No.MI0022
614、配列番号314)が知られている。
63a」という用語は、配列番号116に記載のhsa-miR-663a遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0003326)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-663a遺伝子は、Cum
mins JMら、2006年、Proc Natl Acad Sci U S A、
103巻、p3687-3692に記載される方法によって得ることができる。また、「
hsa-miR-663a」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mi
r-663a」(miRBase Accession No.MI0003672、配
列番号315)が知られている。
R-6721-5p」という用語は、配列番号117に記載のhsa-miR-6721
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0025852
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-672
1-5p遺伝子は、Li Yら、2012年、Gene、497巻、p330-335に
記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6721-5p」
は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6721」(miRBa
se Accession No.MI0022556、配列番号316)が知られてい
る。
532」という用語は、配列番号118に記載のhsa-miR-4532遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0019071)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4532遺伝子は、Jim
a DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法
によって得ることができる。また、「hsa-miR-4532」は、その前駆体として
ヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4532」(miRBase Accessi
on No.MI0016899、配列番号317)が知られている。
977」という用語は、配列番号119に記載のhsa-miR-7977遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0031180)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-7977遺伝子は、Vel
thut-Meikas Aら、2013年、Mol Endocrinol、オンライ
ン版、に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-7977
」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-7977」(miRB
ase Accession No.MI0025753、配列番号318)が知られて
いる。
-92b-5p」という用語は、配列番号120に記載のhsa-miR-92b-5p
遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004792)やそ
の他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-92b-5p
遺伝子は、Cummins JMら、2006年、Proc Natl Acad Sc
i U S A、103巻、p3687-3692に記載される方法によって得ることが
できる。また、「hsa-miR-92b-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造
をとる「hsa-mir-92b」(miRBase Accession No.MI
0003560、配列番号319)が知られている。
R-371a-5p」という用語は、配列番号121に記載のhsa-miR-371a
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004687
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-371
a-5p遺伝子は、Suh MRら、2004年、Dev Biol、270巻、p48
8-498に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-37
1a-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-371a」
(miRBase Accession No.MI0000779、配列番号320)
が知られている。
126」という用語は、配列番号122に記載のhsa-miR-6126遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0024599)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6126遺伝子は、Smi
th JLら、2012年、J Virol、86巻、p5278-5287に記載され
る方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6126」は、その前駆体
としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6126」(miRBase Acce
ssion No.MI0021260、配列番号321)が知られている。
734」という用語は、配列番号123に記載のhsa-miR-4734遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0019859)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4734遺伝子は、Per
sson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載され
る方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4734」は、その前駆体
としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4734」(miRBase Acce
ssion No.MI0017371、配列番号322)が知られている。
R-4665-3p」という用語は、配列番号124に記載のhsa-miR-4665
-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019740
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-466
5-3p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻
、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-
4665-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-466
5」(miRBase Accession No.MI0017295、配列番号32
3)が知られている。
-423-5p」という用語は、配列番号125に記載のhsa-miR-423-5p
遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004748)やそ
の他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-423-5p
遺伝子は、Kasashima Kら、2004年、Biochem Biophys
Res Commun、322巻、p403-410に記載される方法によって得ること
ができる。また、「hsa-miR-423-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構
造をとる「hsa-mir-423」(miRBase Accession No.M
I0001445、配列番号324)が知られている。
469」という用語は、配列番号126に記載のhsa-miR-1469遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0007347)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-1469遺伝子は、Kaw
aji Hら、2008年、BMC Genomics、9巻、p157に記載される方
法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1469」は、その前駆体とし
てヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1469」(miRBase Access
ion No.MI0007074、配列番号325)が知られている。
675」という用語は、配列番号127に記載のhsa-miR-4675遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0019757)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4675遺伝子は、Per
sson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載され
る方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4675」は、その前駆体
としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4675」(miRBase Acce
ssion No.MI0017306、配列番号326)が知られている。
R-1915-5p」という用語は、配列番号128に記載のhsa-miR-1915
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0007891
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-191
5-5p遺伝子は、Bar Mら、2008年、Stem Cells、26巻、p24
96-2505に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-
1915-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-191
5」(miRBase Accession No.MI0008336、配列番号30
3)が知られている。
R-6716-5p」という用語は、配列番号129に記載のhsa-miR-6716
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0025844
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-671
6-5p遺伝子は、Li Yら、2012年、Gene、497巻、p330-335に
記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6716-5p」
は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6716」(miRBa
se Accession No.MI0022550、配列番号327)が知られてい
る。
8」という用語は、配列番号130に記載のhsa-miR-718遺伝子(miRBa
se Accession No.MIMAT0012735)やその他生物種ホモログ
もしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-718遺伝子は、Artzi S
ら、2008年、BMC Bioinformatics、9巻、p39に記載される方
法によって得ることができる。また、「hsa-miR-718」は、その前駆体として
ヘアピン様構造をとる「hsa-mir-718」(miRBase Accessio
n No.MI0012489、配列番号328)が知られている。
281」という用語は、配列番号131に記載のhsa-miR-4281遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0016907)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4281遺伝子は、Gof
f LAら、2009年、PLoS One、4巻、e7192に記載される方法によっ
て得ることができる。また、「hsa-miR-4281」は、その前駆体としてヘアピ
ン様構造をとる「hsa-mir-4281」(miRBase Accession
No.MI0015885、配列番号329)が知られている。
R-6820-5p」という用語は、配列番号132に記載のhsa-miR-6820
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027540
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-682
0-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻
、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-
miR-6820-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir
-6820」(miRBase Accession No.MI0022665、配列
番号330)が知られている。
R-6795-5p」という用語は、配列番号133に記載のhsa-miR-6795
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027490
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-679
5-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻
、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-
miR-6795-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir
-6795」(miRBase Accession No.MI0022640、配列
番号331)が知られている。
R-6779-5p」という用語は、配列番号134に記載のhsa-miR-6779
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027458
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-677
9-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻
、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-
miR-6779-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir
-6779」(miRBase Accession No.MI0022624、配列
番号332)が知られている。
R-7109-5p」という用語は、配列番号135に記載のhsa-miR-7109
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0028115
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-710
9-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻
、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-
miR-7109-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir
-7109」(miRBase Accession No.MI0022960、配列
番号333)が知られている。
R-6798-5p」という用語は、配列番号136に記載のhsa-miR-6798
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027496
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-679
8-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻
、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-
miR-6798-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir
-6798」(miRBase Accession No.MI0022643、配列
番号334)が知られている。
648」という用語は、配列番号137に記載のhsa-miR-4648遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0019710)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4648遺伝子は、Per
sson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載され
る方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4648」は、その前駆体
としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4648」(miRBase Acce
ssion No.MI0017275、配列番号335)が知られている。
059」という用語は、配列番号138に記載のhsa-miR-8059遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0030986)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-8059遺伝子は、Wan
g HJら、2013年、Shock、39巻、p480-487に記載される方法によ
って得ることができる。また、「hsa-miR-8059」は、その前駆体としてヘア
ピン様構造をとる「hsa-mir-8059」(miRBase Accession
No.MI0025895、配列番号336)が知られている。
R-6765-3p」という用語は、配列番号139に記載のhsa-miR-6765
-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027431
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-676
5-3p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻
、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-
miR-6765-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir
-6765」(miRBase Accession No.MI0022610、配列
番号292)が知られている。
132」という用語は、配列番号140に記載のhsa-miR-6132遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0024616)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-6132遺伝子は、Dan
nemann Mら、2012年、Genome Biol Evol、4巻、p552
-564に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-613
2」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6132」(miR
Base Accession No.MI0021277、配列番号337)が知られ
ている。
492」という用語は、配列番号141に記載のhsa-miR-4492遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0019027)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4492遺伝子は、Jim
a DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法
によって得ることができる。また、「hsa-miR-4492」は、その前駆体として
ヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4492」(miRBase Accessi
on No.MI0016854、配列番号338)が知られている。
R-7107-5p」という用語は、配列番号142に記載のhsa-miR-7107
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0028111
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-710
7-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻
、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-
miR-7107-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir
-7107」(miRBase Accession No.MI0022958、配列
番号339)が知られている。
195」という用語は、配列番号143に記載のhsa-miR-3195遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0015079)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-3195遺伝子は、Sta
rk MSら、2010年、PLoS One、5巻、e9685に記載される方法によ
って得ることができる。また、「hsa-miR-3195」は、その前駆体としてヘア
ピン様構造をとる「hsa-mir-3195」(miRBase Accession
No.MI0014240、配列番号340)が知られている。
180」という用語は、配列番号144に記載のhsa-miR-3180遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0018178)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-3180遺伝子は、Cre
ighton CJら、2010年、PLoS One、5巻、e9637に記載される
方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3180」は、その前駆体と
してヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3180-4,hsa-mir-3180
-5」(miRBase Accession No.MI0016408、MI001
6409、配列番号341,342)が知られている。
-296-3p」という用語は、配列番号145に記載のhsa-miR-296-3p
遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004679)やそ
の他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-296-3p
遺伝子は、Houbaviy HBら、2003年、Dev Cell、5巻、p351
-358に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-296
-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-296」(mi
RBase Accession No.MI0000747、配列番号343)が知ら
れている。
4」という用語は、配列番号146に記載のhsa-miR-564遺伝子(miRBa
se Accession No.MIMAT0003228)やその他生物種ホモログ
もしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-564遺伝子は、Cummins
JMら、2006年、Proc Natl Acad Sci U S A、103巻
、p3687-3692に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-
miR-564」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-564
」(miRBase Accession No.MI0003570、配列番号344
)が知られている。
1268a」という用語は、配列番号147に記載のhsa-miR-1268a遺伝子
(miRBase Accession No.MIMAT0005922)やその他生
物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-1268a遺伝子は
、Morin RDら、2008年、Genome Res、18巻、p610-621
に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1268a」は
、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1268a」(miRBa
se Accession No.MI0006405、配列番号345)が知られてい
る。
R-6848-5p」という用語は、配列番号148に記載のhsa-miR-6848
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027596
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-684
8-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻
、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-
miR-6848-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir
-6848」(miRBase Accession No.MI0022694、配列
番号346)が知られている。
2」という用語は、配列番号149に記載のhsa-miR-762遺伝子(miRBa
se Accession No.MIMAT0010313)やその他生物種ホモログ
もしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-762遺伝子は、Berezik
ov Eら、2006年、Genome Res、16巻、p1289-1298に記載
される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-762」は、その前駆
体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-762」(miRBase Acce
ssion No.MI0003892、配列番号347)が知られている。
861」という用語は、配列番号150に記載のhsa-miR-2861遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0013802)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-2861遺伝子は、Li
Hら、2009年、J Clin Invest、119巻、p3666-3677に記
載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-2861」は、その
前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-2861」(miRBase A
ccession No.MI0013006、配列番号348)が知られている。
203」という用語は、配列番号151に記載のhsa-miR-1203遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0005866)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-1203遺伝子は、Mar
ton Sら、2008年、Leukemia、22巻、p330-338に記載される
方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1203」は、その前駆体と
してヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1203」(miRBase Acces
sion No.MI0006335、配列番号349)が知られている。
1260b」という用語は、配列番号152に記載のhsa-miR-1260b遺伝子
(miRBase Accession No.MIMAT0015041)やその他生
物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-1260b遺伝子は
、Stark MSら、2010年、PLoS One、5巻、e9685に記載される
方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1260b」は、その前駆体
としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1260b」(miRBase Acc
ession No.MI0014197、配列番号350)が知られている。
476」という用語は、配列番号153に記載のhsa-miR-4476遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0019003)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4476遺伝子は、Jim
a DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法
によって得ることができる。また、「hsa-miR-4476」は、その前駆体として
ヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4476」(miRBase Accessi
on No.MI0016828、配列番号351)が知られている。
R-6885-5p」という用語は、配列番号154に記載のhsa-miR-6885
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027670
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-688
5-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻
、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-
miR-6885-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir
-6885」(miRBase Accession No.MI0022732、配列
番号352)が知られている。
iR-6769b-5p」という用語は、配列番号155に記載のhsa-miR-67
69b-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027
620)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-
6769b-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res
、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「
hsa-miR-6769b-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hs
a-mir-6769b」(miRBase Accession No.MI0022
706、配列番号353)が知られている。
-23b-3p」という用語は、配列番号156に記載のhsa-miR-23b-3p
遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0000418)やそ
の他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-23b-3p
遺伝子は、Lagos-Quintana Mら、2002年、Curr Biol、1
2巻、p735-739に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-
miR-23b-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
23b」(miRBase Accession No.MI0000439、配列番号
354)が知られている。
R-1343-5p」という用語は、配列番号157に記載のhsa-miR-1343
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027038
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-134
3-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻
、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-
1343-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-134
3」(miRBase Accession No.MI0017320、配列番号20
2)が知られている。
621」という用語は、配列番号158に記載のhsa-miR-3621遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0018002)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-3621遺伝子は、Wit
ten Dら、2010年、BMC Biol、8巻、p58に記載される方法によって
得ることができる。また、「hsa-miR-3621」は、その前駆体としてヘアピン
様構造をとる「hsa-mir-3621」(miRBase Accession N
o.MI0016012、配列番号355)が知られている。
688」という用語は、配列番号159に記載のhsa-miR-4688遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0019777)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4688遺伝子は、Per
sson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載され
る方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4688」は、その前駆体
としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4688」(miRBase Acce
ssion No.MI0017321、配列番号356)が知られている。
286」という用語は、配列番号160に記載のhsa-miR-4286遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0016916)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4286遺伝子は、Gof
f LAら、2009年、PLoS One、4巻、e7192に記載される方法によっ
て得ることができる。また、「hsa-miR-4286」は、その前駆体としてヘアピ
ン様構造をとる「hsa-mir-4286」(miRBase Accession
No.MI0015894、配列番号357)が知られている。
R-4640-5p」という用語は、配列番号161に記載のhsa-miR-4640
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019699
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-464
0-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻
、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-
4640-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-464
0」(miRBase Accession No.MI0017267、配列番号35
8)が知られている。
739」という用語は、配列番号162に記載のhsa-miR-4739遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0019868)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4739遺伝子は、Per
sson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載され
る方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4739」は、その前駆体
としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4739」(miRBase Acce
ssion No.MI0017377、配列番号359)が知られている。
1260a」という用語は、配列番号163に記載のhsa-miR-1260a遺伝子
(miRBase Accession No.MIMAT0005911)やその他生
物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-1260a遺伝子は
、Morin RDら、2008年、Genome Res、18巻、p610-621
に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1260a」は
、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1260a」(miRBa
se Accession No.MI0006394、配列番号360)が知られてい
る。
276」という用語は、配列番号164に記載のhsa-miR-4276遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0016904)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4276遺伝子は、Gof
f LAら、2009年、PLoS One、4巻、e7192に記載される方法によっ
て得ることができる。また、「hsa-miR-4276」は、その前駆体としてヘアピ
ン様構造をとる「hsa-mir-4276」(miRBase Accession
No.MI0015882、配列番号361)が知られている。
R-7106-5p」という用語は、配列番号165に記載のhsa-miR-7106
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0028109
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-710
6-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻
、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-
miR-7106-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir
-7106」(miRBase Accession No.MI0022957、配列
番号362)が知られている。
iR-128-2-5p」という用語は、配列番号166に記載のhsa-miR-12
8-2-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0031
095)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-
128-2-5p遺伝子は、Lagos-Quintana Mら、2002年、Cur
r Biol、12巻、p735-739に記載される方法によって得ることができる。
また、「hsa-miR-128-2-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をと
る「hsa-mir-128-2」(miRBase Accession No.MI
0000727、配列番号363)が知られている。
R-125a-3p」という用語は、配列番号167に記載のhsa-miR-125a
-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004602
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-125
a-3p遺伝子は、Lagos-Quintana Mら、2002年、Curr Bi
ol、12巻、p735-739に記載される方法によって得ることができる。また、「
hsa-miR-125a-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa
-mir-125a」(miRBase Accession No.MI000046
9、配列番号364)が知られている。
iR-92a-2-5p」という用語は、配列番号168に記載のhsa-miR-92
a-2-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004
508)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-
92a-2-5p遺伝子は、Mourelatos Zら、2002年、Genes D
ev、16巻、p720-728に記載される方法によって得ることができる。また、「
hsa-miR-92a-2-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hs
a-mir-92a-2」(miRBase Accession No.MI0000
094、配列番号365)が知られている。
-486-3p」という用語は、配列番号169に記載のhsa-miR-486-3p
遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004762)やそ
の他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-486-3p
遺伝子は、Fu Hら、2005年、FEBS Lett、579巻、p3849-38
54に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-486-3
p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-486,hsa-m
ir-486-2」(miRBase Accession No.MI0002470
、MI0023622、配列番号366,367)が知られている。
196」という用語は、配列番号170に記載のhsa-miR-3196遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0015080)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-3196遺伝子は、Sta
rk MSら、2010年、PLoS One、5巻、e9685に記載される方法によ
って得ることができる。また、「hsa-miR-3196」は、その前駆体としてヘア
ピン様構造をとる「hsa-mir-3196」(miRBase Accession
No.MI0014241、配列番号368)が知られている。
-211-3p」という用語は、配列番号171に記載のhsa-miR-211-3p
遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0022694)やそ
の他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-211-3p
遺伝子は、Lim LPら、2003年、Science、299巻、p1540に記載
される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-211-3p」は、そ
の前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-211」(miRBase A
ccession No.MI0000287、配列番号369)が知られている。
271」という用語は、配列番号172に記載のhsa-miR-4271遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0016901)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4271遺伝子は、Gof
f LAら、2009年、PLoS One、4巻、e7192に記載される方法によっ
て得ることができる。また、「hsa-miR-4271」は、その前駆体としてヘアピ
ン様構造をとる「hsa-mir-4271」(miRBase Accession
No.MI0015879、配列番号370)が知られている。
R-6851-5p」という用語は、配列番号173に記載のhsa-miR-6851
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027602
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-685
1-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻
、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-
miR-6851-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir
-6851」(miRBase Accession No.MI0022697、配列
番号371)が知られている。
-149-3p」という用語は、配列番号174に記載のhsa-miR-149-3p
遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004609)やそ
の他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-149-3p
遺伝子は、Lagos-Quintana Mら、2002年、Curr Biol、1
2巻、p735-739に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-
miR-149-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-
149」(miRBase Accession No.MI0000478、配列番号
372)が知られている。
R-4667-5p」という用語は、配列番号175に記載のhsa-miR-4667
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019743
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-466
7-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻
、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-
4667-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-466
7」(miRBase Accession No.MI0017297、配列番号37
3)が知られている。
R-135a-3p」という用語は、配列番号176に記載のhsa-miR-135a
-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004595
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-135
a-3p遺伝子は、Lagos-Quintana Mら、2002年、Curr Bi
ol、12巻、p735-739に記載される方法によって得ることができる。また、「
hsa-miR-135a-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa
-mir-135a-1」(miRBase Accession No.MI0000
452、配列番号374)が知られている。
486」という用語は、配列番号177に記載のhsa-miR-4486遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0019020)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4486遺伝子は、Jim
a DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法
によって得ることができる。また、「hsa-miR-4486」は、その前駆体として
ヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4486」(miRBase Accessi
on No.MI0016847、配列番号375)が知られている。
R-4697-5p」という用語は、配列番号178に記載のhsa-miR-4697
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019791
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-469
7-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻
、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-
4697-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-469
7」(miRBase Accession No.MI0017330、配列番号37
6)が知られている。
R-4725-3p」という用語は、配列番号179に記載のhsa-miR-4725
-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019844
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-472
5-3p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻
、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-
4725-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-472
5」(miRBase Accession No.MI0017362、配列番号37
7)が知られている。
R-6510-5p」という用語は、配列番号180に記載のhsa-miR-6510
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0025476
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-651
0-5p遺伝子は、Joyce CEら、2011年、Hum Mol Genet、2
0巻、p4025-4040に記載される方法によって得ることができる。また、「hs
a-miR-6510-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-m
ir-6510」(miRBase Accession No.MI0022222、
配列番号378)が知られている。
R-5001-5p」という用語は、配列番号181に記載のhsa-miR-5001
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0021021
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-500
1-5p遺伝子は、Hansen TBら、2011年、RNA Biol、8巻、p3
78-383に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-5
001-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-5001
」(miRBase Accession No.MI0017867、配列番号379
)が知られている。
673」という用語は、配列番号182に記載のhsa-miR-4673遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0019755)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4673遺伝子は、Per
sson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載され
る方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4673」は、その前駆体
としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4673」(miRBase Acce
ssion No.MI0017304、配列番号380)が知られている。
466」という用語は、配列番号183に記載のhsa-miR-4466遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0018993)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4466遺伝子は、Jim
a DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法
によって得ることができる。また、「hsa-miR-4466」は、その前駆体として
ヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4466」(miRBase Accessi
on No.MI0016817、配列番号381)が知られている。
-23a-3p」という用語は、配列番号184に記載のhsa-miR-23a-3p
遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0000078)やそ
の他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-23a-3p
遺伝子は、Lagos-Quintana Mら、2001年、Science、294
巻、p853-858に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-23a-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-2
3a」(miRBase Accession No.MI0000079、配列番号3
82)が知られている。
656」という用語は、配列番号185に記載のhsa-miR-3656遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0018076)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-3656遺伝子は、Mei
ri Eら、2010年、Nucleic Acids Res、38巻、p6234-
6246に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-365
6」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3656」(miR
Base Accession No.MI0016056、配列番号383)が知られ
ている。
R-6782-5p」という用語は、配列番号186に記載のhsa-miR-6782
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027464
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-678
2-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻
、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-
miR-6782-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir
-6782」(miRBase Accession No.MI0022627、配列
番号384)が知られている。
689」という用語は、配列番号187に記載のhsa-miR-4689遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0019778)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4689遺伝子は、Per
sson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載され
る方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4689」は、その前駆体
としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4689」(miRBase Acce
ssion No.MI0017322、配列番号385)が知られている。
51a」という用語は、配列番号188に記載のhsa-miR-451a遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0001631)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-451a遺伝子は、Alt
uvia Yら、2005年、Nucleic Acids Res、33巻、p269
7-2706に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4
51a」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-451a」(m
iRBase Accession No.MI0001729、配列番号386)が知
られている。
R-4446-3p」という用語は、配列番号189に記載のhsa-miR-4446
-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018965
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-444
6-3p遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-
e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-444
6-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4446」(
miRBase Accession No.MI0016789、配列番号387)が
知られている。
R-3180-3p」という用語は、配列番号190に記載のhsa-miR-3180
-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0015058
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-318
0-3p遺伝子は、Creighton CJら、2010年、PLoS One、5巻
、e9637に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3
180-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3180
-1,hsa-mir-3180-2,hsa-mir-3180-3」(miRBas
e Accession No.MI0014214、MI0014215、MI001
4217、配列番号388,389,390)が知られている。
R-642a-3p」という用語は、配列番号191に記載のhsa-miR-642a
-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0020924
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-642
a-3p遺伝子は、Cummins JMら、2006年、Proc Natl Aca
d Sci U S A、103巻、p3687-3692に記載される方法によって得
ることができる。また、「hsa-miR-642a-3p」は、その前駆体としてヘア
ピン様構造をとる「hsa-mir-642a」(miRBase Accession
No.MI0003657、配列番号391)が知られている。
R-6889-5p」という用語は、配列番号192に記載のhsa-miR-6889
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027678
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-688
9-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻
、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-
miR-6889-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir
-6889」(miRBase Accession No.MI0022736、配列
番号392)が知られている。
178」という用語は、配列番号193に記載のhsa-miR-3178遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0015055)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-3178遺伝子は、Sta
rk MSら、2010年、PLoS One、5巻、e9685に記載される方法によ
って得ることができる。また、「hsa-miR-3178」は、その前駆体としてヘア
ピン様構造をとる「hsa-mir-3178」(miRBase Accession
No.MI0014212、配列番号393)が知られている。
R-4665-5p」という用語は、配列番号194に記載のhsa-miR-4665
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019739
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-466
5-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻
、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-
4665-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-466
5」(miRBase Accession No.MI0017295、配列番号32
3)が知られている。
R-6722-3p」という用語は、配列番号195に記載のhsa-miR-6722
-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0025854
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-672
2-3p遺伝子は、Li Yら、2012年、Gene、497巻、p330-335に
記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6722-3p」
は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6722」(miRBa
se Accession No.MI0022557、配列番号394)が知られてい
る。
iR-30c-1-3p」という用語は、配列番号196に記載のhsa-miR-30
c-1-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004
674)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-
30c-1-3p遺伝子は、Lagos-Quintana Mら、2002年、Cur
r Biol、12巻、p735-739に記載される方法によって得ることができる。
また、「hsa-miR-30c-1-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をと
る「hsa-mir-30c-1」(miRBase Accession No.MI
0000736、配列番号395)が知られている。
507」という用語は、配列番号197に記載のhsa-miR-4507遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0019044)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-4507遺伝子は、Jim
a DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法
によって得ることができる。また、「hsa-miR-4507」は、その前駆体として
ヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4507」(miRBase Accessi
on No.MI0016871、配列番号396)が知られている。
141」という用語は、配列番号198に記載のhsa-miR-3141遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0015010)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-3141遺伝子は、Sta
rk MSら、2010年、PLoS One、5巻、e9685に記載される方法によ
って得ることができる。また、「hsa-miR-3141」は、その前駆体としてヘア
ピン様構造をとる「hsa-mir-3141」(miRBase Accession
No.MI0014165、配列番号397)が知られている。
R-1199-5p」という用語は、配列番号199に記載のhsa-miR-1199
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0031119
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどを包含する。hsa-miR-119
9-5p遺伝子は、Salvi Aら、2013年、Int J Oncol、42巻、
p391-402に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR
-1199-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-11
99」(miRBase Accession No.MI0020340、配列番号3
98)が知られている。
R-6794-5p」という用語は、配列番号635に記載のhsa-miR-6794
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027488
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-67
94-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22
巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa
-miR-6794-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mi
r-6794」(miRBase Accession No.MI0022639、配
列番号643)が知られている。
R-6774-5p」という用語は、配列番号636に記載のhsa-miR-6774
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027448
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-67
74-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22
巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa
-miR-6774-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mi
r-6774」(miRBase Accession No.MI0022619、配
列番号644)が知られている。
R-4707-3p」という用語は、配列番号637に記載のhsa-miR-4707
-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019808
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-47
07-3p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71
巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR
-4707-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-47
07」(miRBase Accession No.MI0017340、配列番号6
45)が知られている。
534」という用語は、配列番号638に記載のhsa-miR-4534遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0019073)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4534遺伝子は、Ji
ma DDら、2010年、Blood.、116巻、e118-e127に記載される
方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4534」は、その前駆体と
してヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4534」(miRBase Acces
sion No.MI0016901、配列番号646)が知られている。
294」という用語は、配列番号639に記載のhsa-miR-4294遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0016849)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4294遺伝子は、Go
ff LAら、2009年、PLoS One.、4巻、e7192に記載される方法に
よって得ることができる。また、「hsa-miR-4294」は、その前駆体としてヘ
アピン様構造をとる「hsa-mir-4294」(miRBase Accessio
n No.MI0015827、配列番号647)が知られている。
R-6850-5p」という用語は、配列番号640に記載のhsa-miR-6850
-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027600
)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-68
50-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res.、2
2巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hs
a-miR-6850-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-m
ir-6850」(miRBase Accession No.MI0022696、
配列番号648)が知られている。
089」という用語は、配列番号641に記載のhsa-miR-6089遺伝子(mi
RBase Accession No.MIMAT0023714)やその他生物種ホ
モログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6089遺伝子は、Yo
o JKら、2012年、Stem Cells Dev、21巻、p2049-205
7に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6089」は
、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6089-1、hsa-m
ir-6089-2」(miRBase Accession No.MI002036
6、MI0023563、配列番号649、650)が知られている。
-671-5p」という用語は、配列番号642に記載のhsa-miR-671-5p
遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0003880)やそ
の他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-671-5
p遺伝子は、Berezikov Eら、2006年、Genome Res、16巻、
p1289-1298に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-m
iR-671-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6
71」(miRBase Accession No.MI0003760、配列番号6
51)が知られている。
Aとして切出されるときに、配列の前後1~数塩基が短く、又は長く切出されることや、
塩基の置換が生じて変異体となることがあり、isomiRと称される(Morin R
D.ら、2008年、Genome Res.、第18巻、p.610-621)。mi
RBase Release20では、配列番号1~199及び635~642のいずれ
かで表される塩基配列のほかに、数々のisomiRと呼ばれる配列番号399~634
及び652~657のいずれかで表される塩基配列の変異体及び断片も示されている。こ
れらの変異体もまた、配列番号1~199及び635~642のいずれかで表される塩基
配列を有するmiRNAとして得ることができる。
9、35、36、39、41、42、45、46、47、48、49、51、53、54
、55、56、57、58、59、60、62、65、66、67、68、71、72、
73、74、75、76、78、82、83、88、90、91、92、94、95、9
8、99、101、102、103、104、106、107、108、109、110
、113、116、117、118、120、121、122、123、125、128
、129、130、131、137、140、141、143、144、145、146
、147、150、152、153、156、159、160、161、162、163
、166、167、168、169、170、171、172、174、175、176
、177、179、180、181、182、183、184、185、187、188
、189、190、191、193、194、196、197、198、637、641
及び642で表される塩基配列もしくは該塩基配列においてuがtである塩基配列からな
るポリヌクレオチドの変異体のうち、例えばmiRBase Release 20に登
録されている最も長い変異体として、それぞれ配列番号399、401、403、405
、407、409、411、413、415、417、419、421、423、425
、427、429、431、433、435、437、439、441、443、445
、447、449、451、453、455、457、459、461、463、465
、467、469、471、473、475、477、479、481、483、485
、487、489、491、493、495、497、499、501、503、505
、507、509、511、513、515、517、519、521、523、525
、527、529、531、533、535、537、539、541、543、545
、547、549、551、553、555、557、559、561、563、565
、567、569、571、573、575、577、579、581、583、585
、587、589、591、593、595、597、599、601、603、605
、607、609、611、613、615、617、619、621、623、625
、627、629、631、633、652、654及び656で表されるポリヌクレオ
チドが挙げられる。
35、36、39、41、42、45、46、47、48、49、51、53、54、5
5、56、57、58、59、60、62、65、66、67、68、71、72、73
、74、75、76、78、82、83、88、90、91、92、94、95、98、
99、101、102、103、104、106、107、108、109、110、1
13、116、117、118、120、121、122、123、125、128、1
29、130、131、137、140、141、143、144、145、146、1
47、150、152、153、156、159、160、161、162、163、1
66、167、168、169、170、171、172、174、175、176、1
77、179、180、181、182、183、184、185、187、188、1
89、190、191、193、194、196、197、198、637、641及び
642で表される塩基配列もしくは該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポ
リヌクレオチド、の変異体のうち、例えばmiRBase Release 20に登録
されている最も短い変異体として、それぞれ配列番号400、402、404、406、
408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、
428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、
448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、
468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、
488、490、492、494、496、498、500、502、504、506、
508、510、512、514、516、518、520、522、524、526、
528、530、532、534、536、538、540、542、544、546、
548、550、552、554、556、558、560、562、564、566、
568、570、572、574、576、578、580、582、584、586、
588、590、592、594、596、598、600、602、604、606、
608、610、612、614、616、618、620、622、624、626、
628、630、632、634、653、655及び657で表される配列のポリヌク
レオチドが挙げられる。また、これらの変異体及び断片以外にも、miRBaseに登録
された、配列番号1~199及び635~642の数々のisomiRであるポリヌクレ
オチドが挙げられる。さらに、配列番号1~199及び635~642のいずれかで表さ
れる塩基配列を含むポリヌクレオチドの例としては、それぞれ前駆体である配列番号20
0~398及び643~651のいずれかで表されるポリヌクレオチドが挙げられる。
No.(登録番号)を表1に記載した。
ライマーが、特定の標的核酸と結合し、他の核酸と実質的に結合できないことを意味する
明細書および/または図面に記載される内容を包含する。
定値を指標とし、容易に患者が胃がんであるか否かを検出することができる。
1.胃がんの標的核酸
本発明の上記定義の胃がん検出用の核酸プローブ又はプライマーを使用して、胃がん又
は胃がん細胞の存在及び/又は不存在を検出するための、胃がんマーカーとしての主要な
標的核酸には、hsa-miR-4257、hsa-miR-6726-5p、hsa-
miR-1343-3p、hsa-miR-1247-3p、hsa-miR-6787
-5p、hsa-miR-6875-5p、hsa-miR-1225-3p、hsa-
miR-8063、hsa-miR-6781-5p、hsa-miR-4746-3p
、hsa-miR-1908-5p、hsa-miR-6756-5p、hsa-miR
-204-3p、hsa-miR-4651、hsa-miR-6757-5p、hsa
-miR-6825-5p、hsa-miR-7108-5p、hsa-miR-479
2、hsa-miR-7641、hsa-miR-3188、hsa-miR-3131
、hsa-miR-6780b-5p、hsa-miR-8069、hsa-miR-6
840-3p、hsa-miR-8072、hsa-miR-1233-5p、hsa-
miR-6887-5p、hsa-miR-1231、hsa-miR-5572、hs
a-miR-6738-5p、hsa-miR-6784-5p、hsa-miR-67
91-5p、hsa-miR-6749-5p、hsa-miR-6741-5p、hs
a-miR-128-1-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-674
6-5p、hsa-miR-3184-5p、hsa-miR-3679-5p、hsa
-miR-7110-5p、hsa-miR-4516、hsa-miR-6717-5
p、hsa-miR-6826-5p、hsa-miR-4433b-3p、hsa-m
iR-3679-3p、hsa-miR-3135b、hsa-miR-3622a-5
p、hsa-miR-711、hsa-miR-4467、hsa-miR-6857-
5p、hsa-miR-6515-3p、hsa-miR-1225-5p、hsa-m
iR-187-5p、hsa-miR-3185、hsa-miR-642b-3p、h
sa-miR-1249、hsa-miR-744-5p、hsa-miR-4442、
hsa-miR-1228-3p、hsa-miR-939-5p、hsa-miR-6
845-5p、hsa-miR-887-3p、hsa-miR-7845-5p、hs
a-miR-6729-5p、hsa-miR-4632-5p、hsa-miR-61
5-5p、hsa-miR-6724-5p、hsa-miR-4728-5p、hsa
-miR-6732-5p、hsa-miR-6816-5p、hsa-miR-469
5-5p、hsa-miR-6088、hsa-miR-7975、hsa-miR-3
197、hsa-miR-6125、hsa-miR-4433-3p、hsa-miR
-6727-5p、hsa-miR-4706、hsa-miR-7847-3p、hs
a-miR-6805-3p、hsa-miR-6766-3p、hsa-miR-19
13、hsa-miR-4649-5p、hsa-miR-602、hsa-miR-3
663-3p、hsa-miR-6893-5p、hsa-miR-6861-5p、h
sa-miR-4449、hsa-miR-6842-5p、hsa-miR-4454
、hsa-miR-5195-3p、hsa-miR-663b、hsa-miR-67
65-5p、hsa-miR-4513、hsa-miR-614、hsa-miR-6
785-5p、hsa-miR-6777-5p、hsa-miR-940、hsa-m
iR-4741、hsa-miR-6870-5p、hsa-miR-6131、hsa
-miR-150-3p、hsa-miR-4707-5p、hsa-miR-1915
-3p、hsa-miR-3937、hsa-miR-937-5p、hsa-miR-
4443、hsa-miR-1914-3p、hsa-miR-3620-5p、hsa
-miR-1268b、hsa-miR-1227-5p、hsa-miR-6880-
5p、hsa-miR-4417、hsa-miR-6802-5p、hsa-miR-
6769a-5p、hsa-miR-663a、hsa-miR-6721-5p、hs
a-miR-4532、hsa-miR-7977、hsa-miR-92b-5p、h
sa-miR-371a-5p、hsa-miR-6126、hsa-miR-4734
、hsa-miR-4665-3p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-
1469、hsa-miR-4675、hsa-miR-1915-5p、hsa-mi
R-6716-5p、hsa-miR-718、hsa-miR-4281、hsa-m
iR-6820-5p、hsa-miR-6795-5p、hsa-miR-6779-
5p、hsa-miR-7109-5p、hsa-miR-6798-5p、hsa-m
iR-4648、hsa-miR-8059、hsa-miR-6765-3p、hsa
-miR-6132、hsa-miR-4492、hsa-miR-7107-5p、h
sa-miR-3195、hsa-miR-3180、hsa-miR-296-3p、
hsa-miR-564、hsa-miR-1268a、hsa-miR-6848-5
p、hsa-miR-762、hsa-miR-2861、hsa-miR-1203、
hsa-miR-1260b、hsa-miR-4476、hsa-miR-6885-
5p、hsa-miR-6769b-5p、hsa-miR-23b-3p、hsa-m
iR-1343-5p、hsa-miR-3621、hsa-miR-4688、hsa
-miR-4286、hsa-miR-4640-5p、hsa-miR-4739、h
sa-miR-1260a、hsa-miR-4276、hsa-miR-7106、h
sa-miR-6794-5p、hsa-miR-6774-5p、hsa-miR-4
707-3p、hsa-miR-4534、hsa-miR-4294、hsa-miR
-6850-5p、hsa-miR-6089及びhsa-miR-671-5pからな
る群から選択される少なくとも1つ以上のmiRNAが含まれる。さらにこれらのmiR
NAと組み合わせることができる他の胃がんマーカー、すなわち、hsa-miR-12
8-2-5p、hsa-miR-125a-3p、hsa-miR-92a-2-5p及
びhsa-miR-486-3pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のmiR
NAも標的核酸として好ましく用いることができる。さらにこれらのmiRNAと組み合
わせることができる他の胃がんマーカー、すなわち、hsa-miR-3196、hsa
-miR-211-3p、hsa-miR-4271、hsa-miR-6851-5p
、hsa-miR-149-3p、hsa-miR-4667-5p、hsa-miR-
135a-3p、hsa-miR-4486、hsa-miR-4697-5p、hsa
-miR-4725-3p、hsa-miR-6510-5p、hsa-miR-500
1-5p、hsa-miR-4673、hsa-miR-4466、hsa-miR-2
3a-3p、hsa-miR-3656、hsa-miR-6782-5p、hsa-m
iR-4689、hsa-miR-451a、hsa-miR-4446-3p、hsa
-miR-3180-3p、hsa-miR-642a-3p、hsa-miR-688
9-5p、hsa-miR-3178、hsa-miR-4665-5p、hsa-mi
R-6722-3p、hsa-miR-30c-1-3p、hsa-miR-4507、
hsa-miR-3141及びhsa-miR-1199-5pからなる群から選択され
る少なくとも1つ以上のmiRNAも標的核酸として好ましく用いることができる。
表される塩基配列を含むヒト遺伝子(すなわち、それぞれ、hsa-miR-4257、
hsa-miR-6726-5p、hsa-miR-1343-3p、hsa-miR-
1247-3p、hsa-miR-6787-5p、hsa-miR-6875-5p、
hsa-miR-1225-3p、hsa-miR-8063、hsa-miR-678
1-5p、hsa-miR-4746-3p、hsa-miR-1908-5p、hsa
-miR-6756-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4651
、hsa-miR-6757-5p、hsa-miR-6825-5p、hsa-miR
-7108-5p、hsa-miR-4792、hsa-miR-7641、hsa-m
iR-3188、hsa-miR-3131、hsa-miR-6780b-5p、hs
a-miR-8069、hsa-miR-6840-3p、hsa-miR-8072、
hsa-miR-1233-5p、hsa-miR-6887-5p、hsa-miR-
1231、hsa-miR-5572、hsa-miR-6738-5p、hsa-mi
R-6784-5p、hsa-miR-6791-5p、hsa-miR-6749-5
p、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-128-1-5p、hsa-m
iR-4419b、hsa-miR-6746-5p、hsa-miR-3184-5p
、hsa-miR-3679-5p、hsa-miR-7110-5p、hsa-miR
-4516、hsa-miR-6717-5p、hsa-miR-6826-5p、hs
a-miR-4433b-3p、hsa-miR-3679-3p、hsa-miR-3
135b、hsa-miR-3622a-5p、hsa-miR-711、hsa-mi
R-4467、hsa-miR-6857-5p、hsa-miR-6515-3p、h
sa-miR-1225-5p、hsa-miR-187-5p、hsa-miR-31
85、hsa-miR-642b-3p、hsa-miR-1249、hsa-miR-
744-5p、hsa-miR-4442、hsa-miR-1228-3p、hsa-
miR-939-5p、hsa-miR-6845-5p、hsa-miR-887-3
p、hsa-miR-7845-5p、hsa-miR-6729-5p、hsa-mi
R-4632-5p、hsa-miR-615-5p、hsa-miR-6724-5p
、hsa-miR-4728-5p、hsa-miR-6732-5p、hsa-miR
-6816-5p、hsa-miR-4695-5p、hsa-miR-6088、hs
a-miR-7975、hsa-miR-3197、hsa-miR-6125、hsa
-miR-4433-3p、hsa-miR-6727-5p、hsa-miR-470
6、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-6805-3p、hsa-mi
R-6766-3p、hsa-miR-1913、hsa-miR-4649-5p、h
sa-miR-602、hsa-miR-3663-3p、hsa-miR-6893-
5p、hsa-miR-6861-5p、hsa-miR-4449、hsa-miR-
6842-5p、hsa-miR-4454、hsa-miR-5195-3p、hsa
-miR-663b、hsa-miR-6765-5p、hsa-miR-4513、h
sa-miR-614、hsa-miR-6785-5p、hsa-miR-6777-
5p、hsa-miR-940、hsa-miR-4741、hsa-miR-6870
-5p、hsa-miR-6131、hsa-miR-150-3p、hsa-miR-
4707-5p、hsa-miR-1915-3p、hsa-miR-3937、hsa
-miR-937-5p、hsa-miR-4443、hsa-miR-1914-3p
、hsa-miR-3620-5p、hsa-miR-1268b、hsa-miR-1
227-5p、hsa-miR-6880-5p、hsa-miR-4417、hsa-
miR-6802-5p、hsa-miR-6769a-5p、hsa-miR-663
a、hsa-miR-6721-5p、hsa-miR-4532、hsa-miR-7
977、hsa-miR-92b-5p、hsa-miR-371a-5p、hsa-m
iR-6126、hsa-miR-4734、hsa-miR-4665-3p、hsa
-miR-423-5p、hsa-miR-1469、hsa-miR-4675、hs
a-miR-1915-5p、hsa-miR-6716-5p、hsa-miR-71
8、hsa-miR-4281、hsa-miR-6820-5p、hsa-miR-6
795-5p、hsa-miR-6779-5p、hsa-miR-7109-5p、h
sa-miR-6798-5p、hsa-miR-4648、hsa-miR-8059
、hsa-miR-6765-3p、hsa-miR-6132、hsa-miR-44
92、hsa-miR-7107-5p、hsa-miR-3195、hsa-miR-
3180、hsa-miR-296-3p、hsa-miR-564、hsa-miR-
1268a、hsa-miR-6848-5p、hsa-miR-762、hsa-mi
R-2861、hsa-miR-1203、hsa-miR-1260b、hsa-mi
R-4476、hsa-miR-6885-5p、hsa-miR-6769b-5p、
hsa-miR-23b-3p、hsa-miR-1343-5p、hsa-miR-3
621、hsa-miR-4688、hsa-miR-4286、hsa-miR-46
40-5p、hsa-miR-4739、hsa-miR-1260a、hsa-miR
-4276、hsa-miR-7106、hsa-miR-6794-5p、hsa-m
iR-6774-5p、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-4534、
hsa-miR-4294、hsa-miR-6850-5p、hsa-miR-608
9、hsa-miR-671-5p、hsa-miR-128-2-5p、hsa-mi
R-125a-3p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-486-3
p、hsa-miR-3196、hsa-miR-211-3p、hsa-miR-42
71、hsa-miR-6851-5p、hsa-miR-149-3p、hsa-mi
R-4667-5p、hsa-miR-135a-3p、hsa-miR-4486、h
sa-miR-4697-5p、hsa-miR-4725-3p、hsa-miR-6
510-5p、hsa-miR-5001-5p、hsa-miR-4673、hsa-
miR-4466、hsa-miR-23a-3p、hsa-miR-3656、hsa
-miR-6782-5p、hsa-miR-4689、hsa-miR-451a、h
sa-miR-4446-3p、hsa-miR-3180-3p、hsa-miR-6
42a-3p、hsa-miR-6889-5p、hsa-miR-3178、hsa-
miR-4665-5p、hsa-miR-6722-3p、hsa-miR-30c-
1-3p、hsa-miR-4507、hsa-miR-3141及びhsa-miR-
1199-5p)、その同族体、その転写産物、及びその変異体又は誘導体が含まれる。
ここで、遺伝子、同族体、転写産物、変異体及び誘導体は、上記定義のとおりである。
伝子、その転写産物、より好ましくは当該転写産物、すなわちmiRNA、その前駆体R
NAであるpri-miRNA又はpre-miRNAである。
写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産
物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
らの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその
転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
らの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその
転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
らの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその
転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
らの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその
転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
らの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその
転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
らの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその
転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産
物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
らの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその
転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
らの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその
転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産
物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
らの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその
転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
らの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその
転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
らの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその
転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
らの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその
転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
らの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその
転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産
物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産
物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産
物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
らの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその
転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又
はその転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない
。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
らの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその
転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
らの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその
転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又
はその転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない
。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
らの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその
転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに、その前駆
体を同じくするhsa-miR-128b(hsa-miR-128-2-3p)遺伝子
、又はその転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告が知られてい
る(特許文献2)。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告が知られている(特
許文献1)。
、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでにその前駆体
を同じくするhsa-miR-92-2(hsa-miR-92a-2-3p)遺伝子遺
伝子又はその転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告が知られて
いる(特許文献2)。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでにその前駆体を同
じくするhsa-miR-486-5p遺伝子、又はその転写産物の発現の変化が胃がん
のマーカーになりうるという報告が知られている(特許文献3)。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体であるこれまでにその前駆体を同じ
くするhsa-miR-211(hsa-miR-211-5p)遺伝子、又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告が知られている(特許文献2
)。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子、又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子、又
はその転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない
。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告が知られている(特許
文献2)。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告が知られている(特許文献
3)。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでにその前駆体
を同じくするhsa-miR-30c(hsa-miR-30c-1-5p)遺伝子、又
はその転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告が知られている(
特許文献2)。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転
写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又は
その転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はそ
の転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
の転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写
産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
れらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその
転写産物の発現の変化が胃がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
本発明においては、上記の胃がんマーカーとしての標的核酸に特異的に結合可能な核酸
を、胃がんを検出又は診断するための核酸、例えば核酸プローブ又はプライマーとして用
いることができる。
な核酸プローブ又はプライマーは、上記の胃がんマーカーとしての標的核酸、例えばヒト
由来のhsa-miR-4257、hsa-miR-6726-5p、hsa-miR-
1343-3p、hsa-miR-1247-3p、hsa-miR-6787-5p、
hsa-miR-6875-5p、hsa-miR-1225-3p、hsa-miR-
8063、hsa-miR-6781-5p、hsa-miR-4746-3p、hsa
-miR-1908-5p、hsa-miR-6756-5p、hsa-miR-204
-3p、hsa-miR-4651、hsa-miR-6757-5p、hsa-miR
-6825-5p、hsa-miR-7108-5p、hsa-miR-4792、hs
a-miR-7641、hsa-miR-3188、hsa-miR-3131、hsa
-miR-6780b-5p、hsa-miR-8069、hsa-miR-6840-
3p、hsa-miR-8072、hsa-miR-1233-5p、hsa-miR-
6887-5p、hsa-miR-1231、hsa-miR-5572、hsa-mi
R-6738-5p、hsa-miR-6784-5p、hsa-miR-6791-5
p、hsa-miR-6749-5p、hsa-miR-6741-5p、hsa-mi
R-128-1-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-6746-5p
、hsa-miR-3184-5p、hsa-miR-3679-5p、hsa-miR
-7110-5p、hsa-miR-4516、hsa-miR-6717-5p、hs
a-miR-6826-5p、hsa-miR-4433b-3p、hsa-miR-3
679-3p、hsa-miR-3135b、hsa-miR-3622a-5p、hs
a-miR-711、hsa-miR-4467、hsa-miR-6857-5p、h
sa-miR-6515-3p、hsa-miR-1225-5p、hsa-miR-1
87-5p、hsa-miR-3185、hsa-miR-642b-3p、hsa-m
iR-1249、hsa-miR-744-5p、hsa-miR-4442、hsa-
miR-1228-3p、hsa-miR-939-5p、hsa-miR-6845-
5p、hsa-miR-887-3p、hsa-miR-7845-5p、hsa-mi
R-6729-5p、hsa-miR-4632-5p、hsa-miR-615-5p
、hsa-miR-6724-5p、hsa-miR-4728-5p、hsa-miR
-6732-5p、hsa-miR-6816-5p、hsa-miR-4695-5p
、hsa-miR-6088、hsa-miR-7975、hsa-miR-3197、
hsa-miR-6125、hsa-miR-4433-3p、hsa-miR-672
7-5p、hsa-miR-4706、hsa-miR-7847-3p、hsa-mi
R-6805-3p、hsa-miR-6766-3p、hsa-miR-1913、h
sa-miR-4649-5p、hsa-miR-602、hsa-miR-3663-
3p、hsa-miR-6893-5p、hsa-miR-6861-5p、hsa-m
iR-4449、hsa-miR-6842-5p、hsa-miR-4454、hsa
-miR-5195-3p、hsa-miR-663b、hsa-miR-6765-5
p、hsa-miR-4513、hsa-miR-614、hsa-miR-6785-
5p、hsa-miR-6777-5p、hsa-miR-940、hsa-miR-4
741、hsa-miR-6870-5p、hsa-miR-6131、hsa-miR
-150-3p、hsa-miR-4707-5p、hsa-miR-1915-3p、
hsa-miR-3937、hsa-miR-937-5p、hsa-miR-4443
、hsa-miR-1914-3p、hsa-miR-3620-5p、hsa-miR
-1268b、hsa-miR-1227-5p、hsa-miR-6880-5p、h
sa-miR-4417、hsa-miR-6802-5p、hsa-miR-6769
a-5p、hsa-miR-663a、hsa-miR-6721-5p、hsa-mi
R-4532、hsa-miR-7977、hsa-miR-92b-5p、hsa-m
iR-371a-5p、hsa-miR-6126、hsa-miR-4734、hsa
-miR-4665-3p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-1469
、hsa-miR-4675、hsa-miR-1915-5p、hsa-miR-67
16-5p、hsa-miR-718、hsa-miR-4281、hsa-miR-6
820-5p、hsa-miR-6795-5p、hsa-miR-6779-5p、h
sa-miR-7109-5p、hsa-miR-6798-5p、hsa-miR-4
648、hsa-miR-8059、hsa-miR-6765-3p、hsa-miR
-6132、hsa-miR-4492、hsa-miR-7107-5p、hsa-m
iR-3195、hsa-miR-3180、hsa-miR-296-3p、hsa-
miR-564、hsa-miR-1268a、hsa-miR-6848-5p、hs
a-miR-762、hsa-miR-2861、hsa-miR-1203、hsa-
miR-1260b、hsa-miR-4476、hsa-miR-6885-5p、h
sa-miR-6769b-5p、hsa-miR-23b-3p、hsa-miR-1
343-5p、hsa-miR-3621、hsa-miR-4688、hsa-miR
-4286、hsa-miR-4640-5p、hsa-miR-4739、hsa-m
iR-1260a、hsa-miR-4276、hsa-miR-7106、hsa-m
iR-6794-5p、hsa-miR-6774-5p、hsa-miR-4707-
3p、hsa-miR-4534、hsa-miR-4294、hsa-miR-685
0-5p、hsa-miR-6089若しくはhsa-miR-671-5p、又はそれ
らの組み合わせ、又はそれらの同族体、それらの転写産物、それらの変異体若しくは誘導
体並びに、それらと場合により組み合わせることができる、hsa-miR-128-2
-5p、hsa-miR-125a-3p、hsa-miR-92a-2-5p若しくは
hsa-miR-486-3p、又はそれらの組み合わせ、又はそれらの同族体、それら
の転写産物、それらの変異体若しくは誘導体、並びに、それらと場合により組み合わせる
ことができるhsa-miR-3196、hsa-miR-211-3p、hsa-mi
R-4271、hsa-miR-6851-5p、hsa-miR-149-3p、hs
a-miR-4667-5p、hsa-miR-135a-3p、hsa-miR-44
86、hsa-miR-4697-5p、hsa-miR-4725-3p、hsa-m
iR-6510-5p、hsa-miR-5001-5p、hsa-miR-4673、
hsa-miR-4466、hsa-miR-23a-3p、hsa-miR-3656
、hsa-miR-6782-5p、hsa-miR-4689、hsa-miR-45
1a、hsa-miR-4446-3p、hsa-miR-3180-3p、hsa-m
iR-642a-3p、hsa-miR-6889-5p、hsa-miR-3178、
hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-6722-3p、hsa-miR-
30c-1-3p、hsa-miR-4507、hsa-miR-3141若しくはhs
a-miR-1199-5p、又はそれらの組み合わせ、又はそれらの同族体、それらの
転写産物、それらの変異体又は誘導体の、存在、発現量又は存在量を定性的及び/又は定
量的に測定することを可能にする。
種類に応じてそれらの発現量が増加するものもあれば、又は低下するものもある(以下、
「増加/低下」と称する。)。それゆえ、本発明の核酸は、胃がんの罹患が疑われる被験
体(例えばヒト)由来の体液と健常体由来の体液について上記標的核酸の発現量を測定し
、それらを比較して、胃がんを検出するために有効に使用することができる。
642で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドの少なくとも1つと特異的に結合可
能な核酸プローブ、あるいは、配列番号1~165及び635~642で表される塩基配
列からなるポリヌクレオチドの少なくとも1つを増幅するためのプライマーである。
表される塩基配列からなるポリヌクレオチドの少なくとも1つと特異的に結合可能な核酸
プローブ、又は、配列番号166~169で表される塩基配列からなるポリヌクレオチド
の少なくとも1つを増幅するためのプライマーを含むことができる。
表される塩基配列からなるポリヌクレオチドの少なくとも1つと特異的に結合可能な核酸
プローブ、又は、配列番号170~199で表される塩基配列からなるポリヌクレオチド
の少なくとも1つを増幅するためのプライマーをさらに含むことができる。
表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、を含むポリヌ
クレオチド群及びその相補的ポリヌクレオチド群、当該塩基配列に相補的な塩基配列から
なるDNAとストリンジェントな条件(後述)でそれぞれハイブリダイズするポリヌクレ
オチド群及びその相補的ポリヌクレオチド群、並びにそれらのポリヌクレオチド群の塩基
配列において15以上、好ましくは17以上の連続した塩基を含むポリヌクレオチド群か
ら選ばれた1又は複数のポリヌクレオチドの組み合わせを含む。これらのポリヌクレオチ
ドは、標的核酸である上記胃がんマーカーを検出するための核酸プローブ及びプライマー
として使用できる。
リヌクレオチド(a)~(e)のいずれかからなる群から選択される1又は複数のポリヌ
クレオチドである。
(a)配列番号1~165及び635~642のいずれかで表される塩基配列、もしくは
当該塩基配列においてuがtである塩基配列、からなるポリヌクレオチド、その変異体、
その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(b)配列番号1~165及び635~642のいずれかで表される塩基配列を含むポリ
ヌクレオチド、
(c)配列番号1~165及び635~642のいずれかで表される塩基配列、もしくは
当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオ
チド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(d)配列番号1~165及び635~642のいずれかで表される塩基配列、もしくは
当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチ
ド、並びに、
(e)前記(a)~(d)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハ
イブリダイズするポリヌクレオチド。
a)~(e)からなる群から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドの他に、
下記の(f)~(j)に示すポリヌクレオチドからなる群から選択されるポリヌクレオチ
ドを含むことができる。
(f)配列番号166~169のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列にお
いてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は1
5以上の連続した塩基を含むその断片、
(g)配列番号166~169のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(h)配列番号166~169のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列に
おいてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異
体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(i)配列番号166~169のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列に
おいてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、並びに、
(j)前記(f)~(i)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハ
イブリダイズするポリヌクレオチド。
a)~(j)からなる群から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドの他に、
下記の(k)~(o)に示すポリヌクレオチドからなる群から選択されるポリヌクレオチ
ドを含むことができる。
(k)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列にお
いてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は1
5以上の連続した塩基を含むその断片、
(l)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(m)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列に
おいてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異
体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(n)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列に
おいてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、並びに、
(o)前記(k)~(n)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハ
イブリダイズするポリヌクレオチド。
リヌクレオチドの塩基配列において、例えば、連続する15から配列の全塩基数未満、1
7から配列の全塩基数未満、19から配列の全塩基数未満、などの範囲の塩基数を含むこ
とができるが、これらに限定されないものとする。
しRNAでもよい。
/RNA自動合成機による方法などの一般的な技術を用いて作製することができる。
otocols in Molecular Biology, John Wille
y & Sons, US(1993); Sambrookら, Molecular
Cloning A Laboratory Manual, Cold Sprin
g Harbor Laboratory Press, US(1989)などに記載
される技術を使用することができる。
7、hsa-miR-6726-5p、hsa-miR-1343-3p、hsa-mi
R-1247-3p、hsa-miR-6787-5p、hsa-miR-6875-5
p、hsa-miR-1225-3p、hsa-miR-8063、hsa-miR-6
781-5p、hsa-miR-4746-3p、hsa-miR-1908-5p、h
sa-miR-6756-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-46
51、hsa-miR-6757-5p、hsa-miR-6825-5p、hsa-m
iR-7108-5p、hsa-miR-4792、hsa-miR-7641、hsa
-miR-3188、hsa-miR-3131、hsa-miR-6780b-5p、
hsa-miR-8069、hsa-miR-6840-3p、hsa-miR-807
2、hsa-miR-1233-5p、hsa-miR-6887-5p、hsa-mi
R-1231、hsa-miR-5572、hsa-miR-6738-5p、hsa-
miR-6784-5p、hsa-miR-6791-5p、hsa-miR-6749
-5p、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-128-1-5p、hsa
-miR-4419b、hsa-miR-6746-5p、hsa-miR-3184-
5p、hsa-miR-3679-5p、hsa-miR-7110-5p、hsa-m
iR-4516、hsa-miR-6717-5p、hsa-miR-6826-5p、
hsa-miR-4433b-3p、hsa-miR-3679-3p、hsa-miR
-3135b、hsa-miR-3622a-5p、hsa-miR-711、hsa-
miR-4467、hsa-miR-6857-5p、hsa-miR-6515-3p
、hsa-miR-1225-5p、hsa-miR-187-5p、hsa-miR-
3185、hsa-miR-642b-3p、hsa-miR-1249、hsa-mi
R-744-5p、hsa-miR-4442、hsa-miR-1228-3p、hs
a-miR-939-5p、hsa-miR-6845-5p、hsa-miR-887
-3p、hsa-miR-7845-5p、hsa-miR-6729-5p、hsa-
miR-4632-5p、hsa-miR-615-5p、hsa-miR-6724-
5p、hsa-miR-4728-5p、hsa-miR-6732-5p、hsa-m
iR-6816-5p、hsa-miR-4695-5p、hsa-miR-6088、
hsa-miR-7975、hsa-miR-3197、hsa-miR-6125、h
sa-miR-4433-3p、hsa-miR-6727-5p、hsa-miR-4
706、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-6805-3p、hsa-
miR-6766-3p、hsa-miR-1913、hsa-miR-4649-5p
、hsa-miR-602、hsa-miR-3663-3p、hsa-miR-689
3-5p、hsa-miR-6861-5p、hsa-miR-4449、hsa-mi
R-6842-5p、hsa-miR-4454、hsa-miR-5195-3p、h
sa-miR-663b、hsa-miR-6765-5p、hsa-miR-4513
、hsa-miR-614、hsa-miR-6785-5p、hsa-miR-677
7-5p、hsa-miR-940、hsa-miR-4741、hsa-miR-68
70-5p、hsa-miR-6131、hsa-miR-150-3p、hsa-mi
R-4707-5p、hsa-miR-1915-3p、hsa-miR-3937、h
sa-miR-937-5p、hsa-miR-4443、hsa-miR-1914-
3p、hsa-miR-3620-5p、hsa-miR-1268b、hsa-miR
-1227-5p、hsa-miR-6880-5p、hsa-miR-4417、hs
a-miR-6802-5p、hsa-miR-6769a-5p、hsa-miR-6
63a、hsa-miR-6721-5p、hsa-miR-4532、hsa-miR
-7977、hsa-miR-92b-5p、hsa-miR-371a-5p、hsa
-miR-6126、hsa-miR-4734、hsa-miR-4665-3p、h
sa-miR-423-5p、hsa-miR-1469、hsa-miR-4675、
hsa-miR-1915-5p、hsa-miR-6716-5p、hsa-miR-
718、hsa-miR-4281、hsa-miR-6820-5p、hsa-miR
-6795-5p、hsa-miR-6779-5p、hsa-miR-7109-5p
、hsa-miR-6798-5p、hsa-miR-4648、hsa-miR-80
59、hsa-miR-6765-3p、hsa-miR-6132、hsa-miR-
4492、hsa-miR-7107-5p、hsa-miR-3195、hsa-mi
R-3180、hsa-miR-296-3p、hsa-miR-564、hsa-mi
R-1268a、hsa-miR-6848-5p、hsa-miR-762、hsa-
miR-2861、hsa-miR-1203、hsa-miR-1260b、hsa-
miR-4476、hsa-miR-6885-5p、hsa-miR-6769b-5
p、hsa-miR-23b-3p、hsa-miR-1343-5p、hsa-miR
-3621、hsa-miR-4688、hsa-miR-4286、hsa-miR-
4640-5p、hsa-miR-4739、hsa-miR-1260a、hsa-m
iR-4276、hsa-miR-7106、hsa-miR-6794-5p、hsa
-miR-6774-5p、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-453
4、hsa-miR-4294、hsa-miR-6850-5p、hsa-miR-6
089及びhsa-miR-671-5p、hsa-miR-128-2-5p、hsa
-miR-125a-3p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-48
6-3p、hsa-miR-3196、hsa-miR-211-3p、hsa-miR
-4271、hsa-miR-6851-5p、hsa-miR-149-3p、hsa
-miR-4667-5p、hsa-miR-135a-3p、hsa-miR-448
6、hsa-miR-4697-5p、hsa-miR-4725-3p、hsa-mi
R-6510-5p、hsa-miR-5001-5p、hsa-miR-4673、h
sa-miR-4466、hsa-miR-23a-3p、hsa-miR-3656、
hsa-miR-6782-5p、hsa-miR-4689、hsa-miR-451
a、hsa-miR-4446-3p、hsa-miR-3180-3p、hsa-mi
R-642a-3p、hsa-miR-6889-5p、hsa-miR-3178、h
sa-miR-4665-5p、hsa-miR-6722-3p、hsa-miR-3
0c-1-3p、hsa-miR-4507、hsa-miR-3141及びhsa-m
iR-1199-5pは公知であり、前述のようにその取得方法も知られている。このた
め、この遺伝子をクローニングすることによって、本発明で使用可能な核酸プローブ又は
プライマーとしてのポリヌクレオチドを作製することができる。
することができる。この合成には一般にホスホアミダイト法が使用され、この方法によっ
て約100塩基までの一本鎖DNAを自動合成することができる。DNA自動合成装置は
、例えばPolygen社、ABI社、Applied BioSystems社などか
ら市販されている。
ともできる。cDNAクローニング技術は、例えばmicroRNA Cloning
Kit Wakoなどを利用できる。
るポリヌクレオチドを検出するための核酸プローブ及びプライマーの配列は、miRNA
又はその前駆体としては生体内に存在していない。例えば、配列番号7及び配列番号52
で表される塩基配列は、配列番号206で表される前駆体から生成されるが、この前駆体
は図1に示すようなヘアピン様構造を有しており、配列番号7及び配列番号52で表され
る塩基配列は互いにミスマッチ配列を有している。このため、配列番号7又は配列番号5
2で表される塩基配列に対する、完全に相補的な塩基配列が生体内で自然に生成されるこ
とはない。このため、配列番号1~199及び635~642のいずれかで表される塩基
配列を検出するための核酸プローブ及びプライマーは生体内に存在しない人工的な塩基配
列を有することになる。
本発明はまた、胃がんマーカーである標的核酸を測定するための、本発明において核酸
プローブ又はプライマーとして使用可能なポリヌクレオチド(これには、変異体、断片、
又は誘導体を含みうる。;以下、検出用ポリヌクレオチドと称することがある)の1つ又
は複数を含む胃がん検出用キット又はデバイスを提供する。
miR-4257、miR-6726-5p、miR-1343-3p、miR-12
47-3p、miR-6787-5p、miR-6875-5p、miR-1225-3
p、miR-8063、miR-6781-5p、miR-4746-3p、miR-1
908-5p、miR-6756-5p、miR-204-3p、miR-4651、m
iR-6757-5p、miR-6825-5p、miR-7108-5p、miR-4
792、miR-7641、miR-3188、miR-3131、miR-6780b
-5p、miR-8069、miR-6840-3p、miR-8072、miR-12
33-5p、miR-6887-5p、miR-1231、miR-5572、miR-
6738-5p、miR-6784-5p、miR-6791-5p、miR-6749
-5p、miR-6741-5p、miR-128-1-5p、miR-4419b、m
iR-6746-5p、miR-3184-5p、miR-3679-5p、miR-7
110-5p、miR-4516、miR-6717-5p、miR-6826-5p、
miR-4433b-3p、miR-3679-3p、miR-3135b、miR-3
622a-5p、miR-711、miR-4467、miR-6857-5p、miR
-6515-3p、miR-1225-5p、miR-187-5p、miR-3185
、miR-642b-3p、miR-1249、miR-744-5p、miR-444
2、miR-1228-3p、miR-939-5p、miR-6845-5p、miR
-887-3p、miR-7845-5p、miR-6729-5p、miR-4632
-5p、miR-615-5p、miR-6724-5p、miR-4728-5p、m
iR-6732-5p、miR-6816-5p、miR-4695-5p、miR-6
088、miR-7975、miR-3197、miR-6125、miR-4433-
3p、miR-6727-5p、miR-4706、miR-7847-3p、miR-
6805-3p、miR-6766-3p、miR-1913、miR-4649-5p
、miR-602、miR-3663-3p、miR-6893-5p、miR-686
1-5p、miR-4449、miR-6842-5p、miR-4454、miR-5
195-3p、miR-663b、miR-6765-5p、miR-4513、miR
-614、miR-6785-5p、miR-6777-5p、miR-940、miR
-4741、miR-6870-5p、miR-6131、miR-150-3p、mi
R-4707-5p、miR-1915-3p、miR-3937、miR-937-5
p、miR-4443、miR-1914-3p、miR-3620-5p、miR-1
268b、miR-1227-5p、miR-6880-5p、miR-4417、mi
R-6802-5p、miR-6769a-5p、miR-663a、miR-6721
-5p、miR-4532、miR-7977、miR-92b-5p、miR-371
a-5p、miR-6126、miR-4734、miR-4665-3p、miR-4
23-5p、miR-1469、miR-4675、miR-1915-5p、miR-
6716-5p、miR-718、miR-4281、miR-6820-5p、miR
-6795-5p、miR-6779-5p、miR-7109-5p、miR-679
8-5p、miR-4648、miR-8059、miR-6765-3p、miR-6
132、miR-4492、miR-7107-5p、miR-3195、miR-31
80、miR-296-3p、miR-564、miR-1268a、miR-6848
-5p、miR-762、miR-2861、miR-1203、miR-1260b、
miR-4476、miR-6885-5p、miR-6769b-5p、miR-23
b-3p、miR-1343-5p、miR-3621、miR-4688、miR-4
286、miR-4640-5p、miR-4739、miR-1260a、miR-4
276、miR-7106-5p、miR-6794-5p、miR-6774-5p、
miR-4707-3p、miR-4534、miR-4294、miR-6850-5
p、miR-6089及びmiR-671-5p。
択される:miR-128-2-5p、miR-125a-3p、miR-92a-2-
5p及びmiR-486-3p。場合によりさらに測定に使用しうる追加の標的核酸は、
好ましくは、以下の群3から選択される:miR-3196、miR-211-3p、m
iR-4271、miR-6851-5p、miR-149-3p、miR-4667-
5p、miR-135a-3p、miR-4486、miR-4697-5p、miR-
4725-3p、miR-6510-5p、miR-5001-5p、miR-4673
、miR-4466、miR-23a-3p、miR-3656、miR-6782-5
p、miR-4689、miR-451a、miR-4446-3p、miR-3180
-3p、miR-642a-3p、miR-6889-5p、miR-3178、miR
-4665-5p、miR-6722-3p、miR-30c-1-3p、miR-45
07、miR-3141及びmiR-1199-5p。
可能な核酸、好ましくは、上記2に記載の核酸プローブ又はプライマー、具体的には上記
2に記載したポリヌクレオチド類から選択される1又は複数のポリヌクレオチド又はその
変異体等を含む。
のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、
を含む(もしくは、からなる)ポリヌクレオチド、その相補的配列を含む(もしくは、か
らなる)ポリヌクレオチド、それらのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイ
ブリダイズするポリヌクレオチド、又はそれらのポリヌクレオチド配列の15以上の連続
した塩基を含む変異体又は断片、を少なくとも1つ以上含むことができる。
塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、を含む(もしくは、か
らなる)ポリヌクレオチド、その相補的配列を含む(もしくは、からなる)ポリヌクレオ
チド、それらのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌ
クレオチド、又はそれらのポリヌクレオチド配列の15以上の連続した塩基を含む変異体
又は断片、を1つ以上含むことができる。
塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、を含む(もしくは、か
らなる)ポリヌクレオチド、その相補的配列を含む(もしくは、からなる)ポリヌクレオ
チド、それらのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌ
クレオチド、又はそれらのポリヌクレオチド配列の15以上の連続した塩基を含む変異体
又は断片、を1つ以上含むことができる。
からなる群より選択される1つ以上、好ましくは2つ以上のポリヌクレオチドである。
(1)配列番号1~165及び635~642のいずれかで表される塩基配列においてu
がtである塩基配列又はその相補的配列において、15以上の連続した塩基を含むポリヌ
クレオチド。
(2)配列番号166~169のいずれかで表される塩基配列においてuがtである塩基
配列又はその相補的配列において、15以上の連続した塩基を含むポリヌクレオチド。
(3)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列においてuがtである塩基
配列又はその相補的配列において、15以上の連続した塩基を含むポリヌクレオチド。
42のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配
列、からなるポリヌクレオチド、その相補的配列からなるポリヌクレオチド、それらのポ
リヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、又は
それらの15以上、好ましくは17以上、より好ましくは19以上の連続した塩基を含む
変異体である。
ずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、から
なるポリヌクレオチド、その相補的配列からなるポリヌクレオチド、それらのポリヌクレ
オチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、又はそれらの
15以上、好ましくは17以上、より好ましくは19以上の連続した塩基を含む変異体で
ある。
ずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、から
なるポリヌクレオチド、その相補的配列からなるポリヌクレオチド、それらのポリヌクレ
オチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、又はそれらの
15以上、好ましくは17以上、より好ましくは19以上の連続した塩基を含む変異体で
ある。
19以上の連続した塩基を含むポリヌクレオチドであることができる。
において、例えば、連続する15から配列の全塩基数未満、17から配列の全塩基数未満
、19から配列の全塩基数未満などの範囲の塩基数である。
合わせとしては、具体的には表1に示される配列番号(表1中のmiRNAマーカーに対
応する、配列番号1~199及び635~642)のいずれかで表される塩基配列からな
る上記のポリヌクレオチドの組み合わせを挙げることができるが、それらはあくまでも例
示であり、他の種々の可能な組み合わせのすべてが本発明に包含されるものとする。
ける標的核酸の組合せとしては、表1に示される配列番号のいずれかに表される塩基配列
からなる上記のポリヌクレオチドを2個以上組み合わせることが望ましく、通常、2個の
組み合わせで充分な性能を得ることができる。
るポリヌクレオチドの2個の組み合わせとして、配列番号1~199及び635~642
のいずれかで表される塩基配列からなる上記のポリヌクレオチドの2個の組み合わせのう
ち、新規に見出された配列番号1~165及び635~642のいずれかで表される塩基
配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ以上含む組み合わせが好ましい。
るポリヌクレオチドの組み合わせとして、例えば配列番号9、13、21、27、34、
36、66、75、95、98、108、130、135、143、155、183、1
85、187、191、193、194、635、636、637、638、639、6
40、641及び642のポリヌクレオチドからなる群(以降、本群を「がん種特異性ポ
リヌクレオチド群1」とする)から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチドと、そ
の他の配列番号のポリヌクレオチドとの複数個の組み合わせが好ましい。
るポリヌクレオチドの組み合わせとして、がん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択さ
れる複数個のポリヌクレオチドの組み合わせがより好ましい。
るポリヌクレオチドの組み合わせとして、がん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択さ
れる複数個のポリヌクレオチドの組み合わせのうち、がん種特異性ポリヌクレオチド群1
に含まれる、配列番号21、34、36、98、155のポリヌクレオチドからなる群(
以降、本群を「がん種特異性ポリヌクレオチド群2」とする)から選択されるポリヌクレ
オチドを少なくとも1つ以上含む組み合わせがより好ましい。
、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個又はそれ以上の個数の組み合わせが可能
であるが、より好ましくは6個以上の組み合わせであり、通常、6個の組み合わせで充分
な性能を得ることができる。
るポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される5つのポリヌク
レオチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチ
ドとの組み合わせを例示する。
(1)配列番号9、21、36、98、130、637(マーカー:hsa-miR-6
781-5p、hsa-miR-3131、hsa-miR-4419b、hsa-mi
R-940、hsa-miR-718、hsa-miR-4707-3p)の組み合わせ
(2)配列番号9、21、34、36、98、637(マーカー:hsa-miR-67
81-5p、hsa-miR-3131、hsa-miR-6741-5p、hsa-m
iR-4419b、hsa-miR-940、hsa-miR-4707-3p)の組み
合わせ
(3)配列番号9、21、34、36、98、155(マーカー:hsa-miR-67
81-5p、hsa-miR-3131、hsa-miR-6741-5p、hsa-m
iR-4419b、hsa-miR-940、hsa-miR-6769b-5p)の組
み合わせ
(4)配列番号21、36、75、98、155、635(マーカー:hsa-miR-
3131、hsa-miR-4419b、hsa-miR-6125、hsa-miR-
940、hsa-miR-6769b-5p、hsa-miR-6794-5p)の組み
合わせ
(5)配列番号9、21、36、98、108、155(マーカー:hsa-miR-6
781-5p、hsa-miR-3131、hsa-miR-4419b、hsa-mi
R-940、hsa-miR-1914-3p、hsa-miR-6769b-5p)の
組み合わせ
ポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される5つのポリヌクレ
オチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチド
との組み合わせを例示する。
(1)配列番号34、36、143、155、187、635(マーカー:hsa-mi
R-6741-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-3195、hsa
-miR-6769b-5p、hsa-miR-4689、hsa-miR-6794-
5p)の組み合わせ
(2)配列番号9、34、36、66、98、187(マーカー:hsa-miR-67
81-5p、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-4419b、hsa-
miR-615-5p、hsa-miR-940、hsa-miR-4689)の組み合
わせ
(3)配列番号9、34、36、98、187、637(マーカー:hsa-miR-6
781-5p、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-4419b、hsa
-miR-940、hsa-miR-4689、hsa-miR-4707-3p)の組
み合わせ
(4)配列番号9、34、36、98、185、637(マーカー:hsa-miR-6
781-5p、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-4419b、hsa
-miR-940、hsa-miR-3656、hsa-miR-4707-3p)の組
み合わせ
(5)配列番号9、34、36、98、637、639(マーカー:hsa-miR-6
781-5p、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-4419b、hsa
-miR-940、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-4294)の組
み合わせ
ポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される5つのポリヌクレ
オチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチド
との組み合わせを例示する。
(1)配列番号9、36、98、108、638、639(マーカー:hsa-miR-
6781-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-940、hsa-mi
R-1914-3p、hsa-miR-4534、hsa-miR-4294)の組み合
わせ
(2)配列番号36、98、155、194、635、642(マーカー:hsa-mi
R-4419b、hsa-miR-940、hsa-miR-6769b-5p、hsa
-miR-4665-5p、hsa-miR-6794-5p、hsa-miR-671
-5p)の組み合わせ
(3)配列番号9、34、36、75、98、637(マーカー:hsa-miR-67
81-5p、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-4419b、hsa-
miR-6125、hsa-miR-940、hsa-miR-4707-3p)の組み
合わせ
(4)配列番号21、36、98、155、185、635(マーカー:hsa-miR
-3131、hsa-miR-4419b、hsa-miR-940、hsa-miR-
6769b-5p、hsa-miR-3656、hsa-miR-6794-5p)の組
み合わせ
(5)配列番号9、36、98、108、155、635(マーカー:hsa-miR-
6781-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-940、hsa-mi
R-1914-3p、hsa-miR-6769b-5p、hsa-miR-6794-
5p)の組み合わせ
ポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される5つのポリヌクレ
オチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチド
との組み合わせを例示する。
(1)配列番号9、36、98、130、194、637(マーカー:hsa-miR-
6781-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-940、hsa-mi
R-718、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-4707-3p)の組
み合わせ
(2)配列番号21、36、98、108、155、635(マーカー:hsa-miR
-3131、hsa-miR-4419b、hsa-miR-940、hsa-miR-
1914-3p、hsa-miR-6769b-5p、hsa-miR-6794-5p
)の組み合わせ
(3)配列番号9、36、98、108、155、639(マーカー:hsa-miR-
6781-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-940、hsa-mi
R-1914-3p、hsa-miR-6769b-5p、hsa-miR-4294)
の組み合わせ
(4)配列番号9、36、98、155、187、639(マーカー:hsa-miR-
6781-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-940、hsa-mi
R-6769b-5p、hsa-miR-4689、hsa-miR-4294)の組み
合わせ
(5)配列番号9、36、98、155、187、637(マーカー:hsa-miR-
6781-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-940、hsa-mi
R-6769b-5p、hsa-miR-4689、hsa-miR-4707-3p)
の組み合わせ
るポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される5つのポリヌク
レオチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチ
ドとの組み合わせを例示する。
(1)配列番号9、36、75、98、155、635(マーカー:hsa-miR-6
781-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-6125、hsa-mi
R-940、hsa-miR-6769b-5p、hsa-miR-6794-5p)の
組み合わせ
(2)配列番号36、98、130、155、185、635(マーカー:hsa-mi
R-4419b、hsa-miR-940、hsa-miR-718、hsa-miR-
6769b-5p、hsa-miR-3656、hsa-miR-6794-5p)の組
み合わせ
(3)配列番号9、13、143、155、194、639(マーカー:hsa-miR
-6781-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-3195、hsa
-miR-6769b-5p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-42
94)の組み合わせ
(4)配列番号9、13、34、36、98、155(マーカー:hsa-miR-67
81-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-6741-5p、hsa
-miR-4419b、hsa-miR-940、hsa-miR-6769b-5p)
の組み合わせ
(5)配列番号36、98、108、155、193、635(マーカー:hsa-mi
R-4419b、hsa-miR-940、hsa-miR-1914-3p、hsa-
miR-6769b-5p、hsa-miR-3178、hsa-miR-6794-5
p)の組み合わせ
れには、変異体、断片又は誘導体を包含しうる。)に加えて、胃がん検出を可能とする既
知のポリヌクレオチド又は将来見出されるであろうポリヌクレオチドも含めることができ
る。
又はその断片に加えて、CEA、CA19-9などの公知の胃がん検査用マーカーを測定
するための抗体も含めることができる。
なる容器に包装されうる。
出するためのキット、標識用蛍光物質、核酸増幅用酵素及び培地、使用説明書、などを含
めることができる。
えば、固相に結合又は付着されたがんマーカー測定のためのデバイスである。固相の材質
の例は、プラスチック、紙、ガラス、シリコン、などであり、加工のしやすさから、好ま
しい固相の材質はプラスチックである。固相の形状は、任意であり、例えば方形、丸形、
短冊形、フィルム形などである。本発明のデバイスには、例えば、ハイブリダイゼーショ
ン技術による測定のためのデバイスが含まれ、具体的にはブロッティングデバイス、核酸
アレイ(例えばマイクロアレイ、DNAチップ、RNAチップなど)などが例示される。
能基導入などの表面処理が施された固相の表面に、スポッター又はアレイヤーと呼ばれる
高密度分注機を用いて核酸をスポットする方法、ノズルより微少な液滴を圧電素子などに
より噴射するインクジェットを用いて核酸を固相に吹き付ける方法、固相上で順次ヌクレ
オチド合成を行う方法などの方法を用いて、上記の核酸を1つずつ結合又は付着させるこ
とによりチップなどのアレイを作製し、このアレイを用いてハイブリダイゼーションを利
用して標的核酸を測定する技術である。
くとも1つ以上、好ましくは少なくとも2つ以上、さらに好ましくは少なくとも3つ以上
、最も好ましくは少なくとも5つ以上から全部のポリヌクレオチドのそれぞれと特異的に
結合可能な核酸を含む。本発明のキット又はデバイスはさらに、場合により、上記の群2
の胃がんマーカーであるmiRNAの少なくとも1つ以上、好ましくは少なくとも2つ以
上、さらに好ましくは少なくとも3つ以上、最も好ましくは少なくとも5つ以上から全部
のポリヌクレオチドのそれぞれと特異的に結合可能な核酸を含むことができる。本発明の
キット又はデバイスはさらに、場合により、上記の群3の胃がんマーカーであるmiRN
Aの少なくとも1つ以上、好ましくは少なくとも2つ以上、さらに好ましくは少なくとも
3つ以上、最も好ましくは少なくとも5つ以上から全部のポリヌクレオチドのそれぞれと
特異的に結合可能な核酸を含むことができる。
。
本発明はさらに、上記3で説明した本発明のキット又はデバイス(本発明で使用可能な
上記の核酸を含む。)を用いて、検体中の、以下の群:miR-4257、miR-67
26-5p、miR-1343-3p、miR-1247-3p、miR-6787-5
p、miR-6875-5p、miR-1225-3p、miR-8063、miR-6
781-5p、miR-4746-3p、miR-1908-5p、miR-6756-
5p、miR-204-3p、miR-4651、miR-6757-5p、miR-6
825-5p、miR-7108-5p、miR-4792、miR-7641、miR
-3188、miR-3131、miR-6780b-5p、miR-8069、miR
-6840-3p、miR-8072、miR-1233-5p、miR-6887-5
p、miR-1231、miR-5572、miR-6738-5p、miR-6784
-5p、miR-6791-5p、miR-6749-5p、miR-6741-5p、
miR-128-1-5p、miR-4419b、miR-6746-5p、miR-3
184-5p、miR-3679-5p、miR-7110-5p、miR-4516、
miR-6717-5p、miR-6826-5p、miR-4433b-3p、miR
-3679-3p、miR-3135b、miR-3622a-5p、miR-711、
miR-4467、miR-6857-5p、miR-6515-3p、miR-122
5-5p、miR-187-5p、miR-3185、miR-642b-3p、miR
-1249、miR-744-5p、miR-4442、miR-1228-3p、mi
R-939-5p、miR-6845-5p、miR-887-3p、miR-7845
-5p、miR-6729-5p、miR-4632-5p、miR-615-5p、m
iR-6724-5p、miR-4728-5p、miR-6732-5p、miR-6
816-5p、miR-4695-5p、miR-6088、miR-7975、miR
-3197、miR-6125、miR-4433-3p、miR-6727-5p、m
iR-4706、miR-7847-3p、miR-6805-3p、miR-6766
-3p、miR-1913、miR-4649-5p、miR-602、miR-366
3-3p、miR-6893-5p、miR-6861-5p、miR-4449、mi
R-6842-5p、miR-4454、miR-5195-3p、miR-663b、
miR-6765-5p、miR-4513、miR-614、miR-6785-5p
、miR-6777-5p、miR-940、miR-4741、miR-6870-5
p、miR-6131、miR-150-3p、miR-4707-5p、miR-19
15-3p、miR-3937、miR-937-5p、miR-4443、miR-1
914-3p、miR-3620-5p、miR-1268b、miR-1227-5p
、miR-6880-5p、miR-4417、miR-6802-5p、miR-67
69a-5p、miR-663a、miR-6721-5p、miR-4532、miR
-7977、miR-92b-5p、miR-371a-5p、miR-6126、mi
R-4734、miR-4665-3p、miR-423-5p、miR-1469、m
iR-4675、miR-1915-5p、miR-6716-5p、miR-718、
miR-4281、miR-6820-5p、miR-6795-5p、miR-677
9-5p、miR-7109-5p、miR-6798-5p、miR-4648、mi
R-8059、miR-6765-3p、miR-6132、miR-4492、miR
-7107-5p、miR-3195、miR-3180、miR-296-3p、mi
R-564、miR-1268a、miR-6848-5p、miR-762、miR-
2861、miR-1203、miR-1260b、miR-4476、miR-688
5-5p、miR-6769b-5p、miR-23b-3p、miR-1343-5p
、miR-3621、miR-4688、miR-4286、miR-4640-5p、
miR-4739、miR-1260a、miR-4276、miR-7106-5p、
miR-6794-5p、miR-6774-5p、miR-4707-3p、miR-
4534、miR-4294、miR-6850-5p、miR-6089及びmiR-
671-5pから選択される胃がん由来の遺伝子の発現量、並びに場合により、以下の群
:miR-128-2-5p、miR-125a-3p、miR-92a-2-5p及び
miR-486-3pから選択される胃がん由来の遺伝子の発現量、並びに場合により、
以下の群:miR-3196、miR-211-3p、miR-4271、miR-68
51-5p、miR-149-3p、miR-4667-5p、miR-135a-3p
、miR-4486、miR-4697-5p、miR-4725-3p、miR-65
10-5p、miR-5001-5p、miR-4673、miR-4466、miR-
23a-3p、miR-3656、miR-6782-5p、miR-4689、miR
-451a、miR-4446-3p、miR-3180-3p、miR-642a-3
p、miR-6889-5p、miR-3178、miR-4665-5p、miR-6
722-3p、miR-30c-1-3p、miR-4507、miR-3141及びm
iR-1199-5pから選択される胃がん由来の遺伝子の発現量、の1つ以上で表され
る胃がん由来の遺伝子の発現量、をin vitroで測定し、さらに、胃がんの罹患が
疑われる被験体と、健常体(非胃がん患者を含む)とから採取した血液、血清、血漿等の
検体について、検体中の上記遺伝子の発現量と、健常体の対照発現量とを用いて、例えば
両発現量を比較して、当該検体中の標的核酸の発現量に統計学的に有意に差がある場合、
被験体が、胃がんに罹患していると評価することを含む、胃がんの検出方法を提供する。
、これにより、早期の治療及び予後の改善をもたらし、さらに、疾病憎悪のモニターや外
科的、放射線療法的、及び化学療法的な治療の有効性のモニターを可能にする。
-Gene(登録商標)RNA extraction reagent from l
iquid sample kit(東レ株式会社)中のRNA抽出用試薬を加えて調製
するのが特に好ましいが、一般的な酸性フェノール法(Acid Guanidiniu
m-Phenol-Chloroform(AGPC)法)を用いてもよいし、Triz
ol(登録商標)(Life Technologies社)用いてもよいし、Triz
ol(life technologies社)やIsogen(ニッポンジーン社)な
どの酸性フェノールを含むRNA抽出用試薬を加えて調製してもよい。さらに、miRN
easy(登録商標)Mini Kit(Qiagen社)などのキットを利用できるが
、これらの方法に限定されない。
iRNA遺伝子の発現産物のin vitroでの検出のための使用を提供する。
で使用可能なポリヌクレオチドを単一であるいはあらゆる可能な組み合わせで含むものが
使用される。
まれるポリヌクレオチドは、プローブ又はプライマーとして用いることができる。プライ
マーとして用いる場合には、Life Technologies社のTaqMan(登
録商標)MicroRNA Assays、Qiagen社のmiScript PCR
Systemなどを利用できるが、これらの方法に限定されない。
ザンブロット法、in situ ハイブリダイゼーション法、ノーザンハイブリダイゼ
ーション法、サザンハイブリダイゼーション法などのハイブリダイゼーション技術、定量
RT-PCR法などの定量増幅技術などの、特定遺伝子を特異的に検出する公知の方法に
おいて、定法に従ってプライマー又はプローブとして利用することができる。測定対象検
体としては、使用する検出方法の種類に応じて、被験体の血液、血清、血漿、尿等の体液
を採取する。あるいは、そのような体液上記の方法によって調製したtotal RNA
を用いてもよいし、さらに当該RNAをもとにして調製される、cDNAを含む各種のポ
リヌクレオチドを用いてもよい。
る。具体的には、当該キット又はデバイスを使用した胃がんの検出は、胃がんの罹患が疑
われる被験体から、血液、血清、血漿、尿等の検体を用いて、当該キット又はデバイスに
含まれる核酸プローブ又はプライマーで検出される遺伝子の発現量をin vitroで
検出することによって行うことができる。胃がんの罹患が疑われる被験体の血液、血清、
血漿、尿等の検体中の、配列番号1~165及び635~642の少なくとも1つ以上で
表される塩基配列若しくはその相補的配列、並びに場合により配列番号166~169の
1つ以上で表される塩基配列若しくはその相補的配列、並びに場合により配列番号170
~199の1つ以上で表される塩基配列若しくはその相補的配列、からなるポリヌクレオ
チド(その変異体、断片又は誘導体を包含する。)によって測定される標的miRNAマ
ーカーの発現量が、健常体の血液、血清、又は血漿、尿等の検体中のそれらの発現量と比
べて統計学的に有意に差がある場合、当該被験体は胃がんに罹患していると評価すること
ができる。
査などの画像診断法と組み合わせることができる。本発明の方法は、胃がんを特異的に検
出することが可能であり、胃がん以外のがんから胃がんを実質的に識別することができる
。
れないこと、又は胃がん由来の遺伝子の発現産物が含まれること、の検出方法は、被験体
の血液、血清、血漿、尿等の体液を採取して、そこに含まれる標的遺伝子の発現量を、本
発明のポリヌクレオチド群から選ばれた単数又は複数のポリヌクレオチド(変異体、断片
又は誘導体を包含する。)を用いて測定することにより、胃がんの有無を評価する又は胃
がんを検出することを含む。また本発明の胃がんの検出方法を用いて、例えば胃がん患者
において、該疾患の改善のために治療薬を投与した場合における当該疾患の改善の有無又
は改善の程度を評価又は診断することもできる。
(a)被験体由来の検体を、in vitroで、本発明のキット又はデバイス中のポリ
ヌクレオチドと接触させるステップ、
(b)検体中の標的核酸の発現量を、上記ポリヌクレオチドを核酸プローブ又はプライマ
ーとして用いて測定するステップ、
(c)(b)の結果をもとに、当該被験体中の胃がん(細胞)の存在又は不存在を評価す
るステップ、
を含むことができる。
3-3p、miR-1247-3p、miR-6787-5p、miR-6875-5p
、miR-1225-3p、miR-8063、miR-6781-5p、miR-47
46-3p、miR-1908-5p、miR-6756-5p、miR-204-3p
、miR-4651、miR-6757-5p、miR-6825-5p、miR-71
08-5p、miR-4792、miR-7641、miR-3188、miR-313
1、miR-6780b-5p、miR-8069、miR-6840-3p、miR-
8072、miR-1233-5p、miR-6887-5p、miR-1231、mi
R-5572、miR-6738-5p、miR-6784-5p、miR-6791-
5p、miR-6749-5p、miR-6741-5p、miR-128-1-5p、
miR-4419b、miR-6746-5p、miR-3184-5p、miR-36
79-5p、miR-7110-5p、miR-4516、miR-6717-5p、m
iR-6826-5p、miR-4433b-3p、miR-3679-3p、miR-
3135b、miR-3622a-5p、miR-711、miR-4467、miR-
6857-5p、miR-6515-3p、miR-1225-5p、miR-187-
5p、miR-3185、miR-642b-3p、miR-1249、miR-744
-5p、miR-4442、miR-1228-3p、miR-939-5p、miR-
6845-5p、miR-887-3p、miR-7845-5p、miR-6729-
5p、miR-4632-5p、miR-615-5p、miR-6724-5p、mi
R-4728-5p、miR-6732-5p、miR-6816-5p、miR-46
95-5p、miR-6088、miR-7975、miR-3197、miR-612
5、miR-4433-3p、miR-6727-5p、miR-4706、miR-7
847-3p、miR-6805-3p、miR-6766-3p、miR-1913、
miR-4649-5p、miR-602、miR-3663-3p、miR-6893
-5p、miR-6861-5p、miR-4449、miR-6842-5p、miR
-4454、miR-5195-3p、miR-663b、miR-6765-5p、m
iR-4513、miR-614、miR-6785-5p、miR-6777-5p、
miR-940、miR-4741、miR-6870-5p、miR-6131、mi
R-150-3p、miR-4707-5p、miR-1915-3p、miR-393
7、miR-937-5p、miR-4443、miR-1914-3p、miR-36
20-5p、miR-1268b、miR-1227-5p、miR-6880-5p、
miR-4417、miR-6802-5p、miR-6769a-5p、miR-66
3a、miR-6721-5p、miR-4532、miR-7977、miR-92b
-5p、miR-371a-5p、miR-6126、miR-4734、miR-46
65-3p、miR-423-5p、miR-1469、miR-4675、miR-1
915-5p、miR-6716-5p、miR-718、miR-4281、miR-
6820-5p、miR-6795-5p、miR-6779-5p、miR-7109
-5p、miR-6798-5p、miR-4648、miR-8059、miR-67
65-3p、miR-6132、miR-4492、miR-7107-5p、miR-
3195、miR-3180、miR-296-3p、miR-564、miR-126
8a、miR-6848-5p、miR-762、miR-2861、miR-1203
、miR-1260b、miR-4476、miR-6885-5p、miR-6769
b-5p、miR-23b-3p、miR-1343-5p、miR-3621、miR
-4688、miR-4286、miR-4640-5p、miR-4739、miR-
1260a、miR-4276、miR-7106-5p、miR-6794-5p、m
iR-6774-5p、miR-4707-3p、miR-4534、miR-4294
、miR-6850-5p、miR-6089及びmiR-671-5pからなる群から
選択される少なくとも1つ以上、好ましくは少なくとも2つ以上のポリヌクレオチドと特
異的に結合可能な核酸を用いて、被験体の検体における標的核酸の発現量を測定し、該測
定された発現量と、同様に測定された健常体の対照発現量とを用いて被験体が胃がんに罹
患していること、又は胃がんに罹患していないことをin vitroで評価することを
含む、胃がんの検出方法を提供する。
検査による結果に基づいた評価支援である。
iR-4257がhsa-miR-4257であり、miR-6726-5pがhsa-
miR-6726-5pであり、miR-1343-3pがhsa-miR-1343-
3pであり、miR-1247-3pがhsa-miR-1247-3pであり、miR
-6787-5pがhsa-miR-6787-5pであり、miR-6875-5pが
hsa-miR-6875-5pであり、miR-1225-3pがhsa-miR-1
225-3pであり、miR-8063がhsa-miR-8063であり、miR-6
781-5pがhsa-miR-6781-5pであり、miR-4746-3pがhs
a-miR-4746-3pであり、miR-1908-5pがhsa-miR-190
8-5pであり、miR-6756-5pがhsa-miR-6756-5pであり、m
iR-204-3pがhsa-miR-204-3pであり、miR-4651がhsa
-miR-4651であり、miR-6757-5pがhsa-miR-6757-5p
であり、miR-6825-5pがhsa-miR-6825-5pであり、miR-7
108-5pがhsa-miR-7108-5pであり、miR-4792がhsa-m
iR-4792であり、miR-7641がhsa-miR-7641であり、miR-
3188がhsa-miR-3188であり、miR-3131がhsa-miR-31
31であり、miR-6780b-5pがhsa-miR-6780b-5pであり、m
iR-8069がhsa-miR-8069であり、miR-6840-3pがhsa-
miR-6840-3pであり、miR-8072がhsa-miR-8072であり、
miR-1233-5pがhsa-miR-1233-5pであり、miR-6887-
5pがhsa-miR-6887-5pであり、miR-1231がhsa-miR-1
231であり、miR-5572がhsa-miR-5572であり、miR-6738
-5pがhsa-miR-6738-5pであり、miR-6784-5pがhsa-m
iR-6784-5pであり、miR-6791-5pがhsa-miR-6791-5
pであり、miR-6749-5pがhsa-miR-6749-5pであり、miR-
6741-5pがhsa-miR-6741-5pであり、miR-128-1-5pが
hsa-miR-128-1-5pであり、miR-4419bがhsa-miR-44
19bであり、miR-6746-5pがhsa-miR-6746-5pであり、mi
R-3184-5pがhsa-miR-3184-5pであり、miR-3679-5p
がhsa-miR-3679-5pであり、miR-7110-5pがhsa-miR-
7110-5pであり、miR-4516がhsa-miR-4516であり、miR-
6717-5pがhsa-miR-6717-5pであり、miR-6826-5pがh
sa-miR-6826-5pであり、miR-4433b-3pがhsa-miR-4
433b-3pであり、miR-3679-3pがhsa-miR-3679-3pであ
り、miR-3135bがhsa-miR-3135bであり、miR-3622a-5
pがhsa-miR-3622a-5pであり、miR-711がhsa-miR-71
1であり、miR-4467がhsa-miR-4467であり、miR-6857-5
pがhsa-miR-6857-5pであり、miR-6515-3pがhsa-miR
-6515-3pであり、miR-1225-5pがhsa-miR-1225-5pで
あり、miR-187-5pがhsa-miR-187-5pであり、miR-3185
がhsa-miR-3185であり、miR-642b-3pがhsa-miR-642
b-3pであり、miR-1249がhsa-miR-1249であり、miR-744
-5pがhsa-miR-744-5pであり、miR-4442がhsa-miR-4
442であり、miR-1228-3pがhsa-miR-1228-3pであり、mi
R-939-5pがhsa-miR-939-5pであり、miR-6845-5pがh
sa-miR-6845-5pであり、miR-887-3pがhsa-miR-887
-3pであり、miR-7845-5pがhsa-miR-7845-5pであり、mi
R-6729-5pがhsa-miR-6729-5pであり、miR-4632-5p
がhsa-miR-4632-5pであり、miR-615-5pがhsa-miR-6
15-5pであり、miR-6724-5pがhsa-miR-6724-5pであり、
miR-4728-5pがhsa-miR-4728-5pであり、miR-6732-
5pがhsa-miR-6732-5pであり、miR-6816-5pがhsa-mi
R-6816-5pであり、miR-4695-5pがhsa-miR-4695-5p
であり、miR-6088がhsa-miR-6088であり、miR-7975がhs
a-miR-7975であり、miR-3197がhsa-miR-3197であり、m
iR-6125がhsa-miR-6125であり、miR-4433-3pがhsa-
miR-4433-3pであり、miR-6727-5pがhsa-miR-6727-
5pであり、miR-4706がhsa-miR-4706であり、miR-7847-
3pがhsa-miR-7847-3pであり、miR-6805-3pがhsa-mi
R-6805-3pであり、miR-6766-3pがhsa-miR-6766-3p
であり、miR-1913がhsa-miR-1913であり、miR-4649-5p
がhsa-miR-4649-5pであり、miR-602がhsa-miR-602で
あり、miR-3663-3pがhsa-miR-3663-3pであり、miR-68
93-5pがhsa-miR-6893-5pであり、miR-6861-5pがhsa
-miR-6861-5pであり、miR-4449がhsa-miR-4449であり
、miR-6842-5pがhsa-miR-6842-5pであり、miR-4454
がhsa-miR-4454であり、miR-5195-3pがhsa-miR-519
5-3pであり、miR-663bがhsa-miR-663bであり、miR-676
5-5pがhsa-miR-6765-5pであり、miR-4513がhsa-miR
-4513であり、miR-614がhsa-miR-614であり、miR-6785
-5pがhsa-miR-6785-5pであり、miR-6777-5pがhsa-m
iR-6777-5pであり、miR-940がhsa-miR-940であり、miR
-4741がhsa-miR-4741であり、miR-6870-5pがhsa-mi
R-6870-5pであり、miR-6131がhsa-miR-6131であり、mi
R-150-3pがhsa-miR-150-3pであり、miR-4707-5pがh
sa-miR-4707-5pであり、miR-1915-3pがhsa-miR-19
15-3pであり、miR-3937がhsa-miR-3937であり、miR-93
7-5pがhsa-miR-937-5pであり、miR-4443がhsa-miR-
4443であり、miR-1914-3pがhsa-miR-1914-3pであり、m
iR-3620-5pがhsa-miR-3620-5pであり、miR-1268bが
hsa-miR-1268bであり、miR-1227-5pがhsa-miR-122
7-5pであり、miR-6880-5pがhsa-miR-6880-5pであり、m
iR-4417がhsa-miR-4417であり、miR-6802-5pがhsa-
miR-6802-5pであり、miR-6769a-5pがhsa-miR-6769
a-5pであり、miR-663aがhsa-miR-663aであり、miR-672
1-5pがhsa-miR-6721-5pであり、miR-4532がhsa-miR
-4532であり、miR-7977がhsa-miR-7977であり、miR-92
b-5pがhsa-miR-92b-5pであり、miR-371a-5pがhsa-m
iR-371a-5pであり、miR-6126がhsa-miR-6126であり、m
iR-4734がhsa-miR-4734であり、miR-4665-3pがhsa-
miR-4665-3pであり、miR-423-5pがhsa-miR-423-5p
であり、miR-1469がhsa-miR-1469であり、miR-4675がhs
a-miR-4675であり、miR-1915-5pがhsa-miR-1915-5
pであり、miR-6716-5pがhsa-miR-6716-5pであり、miR-
718がhsa-miR-718であり、miR-4281がhsa-miR-4281
であり、miR-6820-5pがhsa-miR-6820-5pであり、miR-6
795-5pがhsa-miR-6795-5pであり、miR-6779-5pがhs
a-miR-6779-5pであり、miR-7109-5pがhsa-miR-710
9-5pであり、miR-6798-5pがhsa-miR-6798-5pであり、m
iR-4648がhsa-miR-4648であり、miR-8059がhsa-miR
-8059であり、miR-6765-3pがhsa-miR-6765-3pであり、
miR-6132がhsa-miR-6132であり、miR-4492がhsa-mi
R-4492であり、miR-7107-5pがhsa-miR-7107-5pであり
、miR-3195がhsa-miR-3195であり、miR-3180がhsa-m
iR-3180であり、miR-296-3pがhsa-miR-296-3pであり、
miR-564がhsa-miR-564であり、miR-1268aがhsa-miR
-1268aであり、miR-6848-5pがhsa-miR-6848-5pであり
、miR-762がhsa-miR-762であり、miR-2861がhsa-miR
-2861であり、miR-1203がhsa-miR-1203であり、miR-12
60bがhsa-miR-1260bであり、miR-4476がhsa-miR-44
76であり、miR-6885-5pがhsa-miR-6885-5pであり、miR
-6769b-5pがhsa-miR-6769b-5pであり、miR-23b-3p
がhsa-miR-23b-3pであり、miR-1343-5pがhsa-miR-1
343-5pであり、miR-3621がhsa-miR-3621であり、miR-4
688がhsa-miR-4688であり、miR-4286がhsa-miR-428
6であり、miR-4640-5pがhsa-miR-4640-5pであり、miR-
4739がhsa-miR-4739であり、miR-1260aがhsa-miR-1
260aであり、miR-4276がhsa-miR-4276であり、及び、miR-
7106-5pがhsa-miR-7106-5pであり、miR-6794-5pがh
sa-miR-6794-5pであり、miR-6774-5pがhsa-miR-67
74-5pであり、miR-4707-3pがhsa-miR-4707-3pであり、
miR-4534がhsa-miR-4534であり、miR-4294がhsa-mi
R-4294であり、miR-6850-5pがhsa-miR-6850-5pであり
、miR-6089がhsa-miR-6089であり、及び、miR-671-5pが
hsa-miR-671-5pである。
ローブ又はプライマー)は、下記の(a)~(e)に示すポリヌクレオチド:
(a)配列番号1~165及び635~642のいずれかで表される塩基配列、もしくは
当該塩基配列においてuがtである塩基配列、からなるポリヌクレオチド、その変異体、
その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(b)配列番号1~165及び635~642のいずれかで表される塩基配列を含むポリ
ヌクレオチド、
(c)配列番号1~165及び635~642のいずれかで表される塩基配列、もしくは
当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオ
チド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(d)配列番号1~165及び635~642のいずれかで表される塩基配列、もしくは
当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチ
ド、及び
(e)前記(a)~(d)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハ
イブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択される。
R-92a-2-5p、miR-486-3pから選択される少なくとも1つ以上のポリ
ヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸を用いることができる。
hsa-miR-128-2-5pであり、miR-125a-3pがhsa-miR-
125a-3pであり、miR-92a-2-5pがhsa-miR-92a-2-5p
であり、及び、miR-486-3pがhsa-miR-486-3pである。
)に示すポリヌクレオチド:
(f)配列番号166~169のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列に
おいてuがtである塩基配列、からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又
は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(g)配列番号166~169のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(h)配列番号166~169のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列に
おいてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異
体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(i)配列番号166~169のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列に
おいてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(j)前記(f)~(i)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハ
イブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択される。
1、miR-6851-5p、miR-149-3p、miR-4667-5p、miR
-135a-3p、miR-4486、miR-4697-5p、miR-4725-3
p、miR-6510-5p、miR-5001-5p、miR-4673、miR-4
466、miR-23a-3p、miR-3656、miR-6782-5p、miR-
4689、miR-451a、miR-4446-3p、miR-3180-3p、mi
R-642a-3p、miR-6889-5p、miR-3178、miR-4665-
5p、miR-6722-3p、miR-30c-1-3p、miR-4507、miR
-3141、miR-1199-5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のポ
リヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸を用いることができる。
miR-3196であり、miR-211-3pがhsa-miR-211-3pであり
、miR-4271がhsa-miR-4271であり、miR-6851-5pがhs
a-miR-6851-5pであり、miR-149-3pがhsa-miR-149-
3pであり、miR-4667-5pがhsa-miR-4667-5pであり、miR
-135a-3pがhsa-miR-135a-3pであり、miR-4486がhsa
-miR-4486であり、miR-4697-5pがhsa-miR-4697-5p
であり、miR-4725-3pがhsa-miR-4725-3pであり、miR-6
510-5pがhsa-miR-6510-5pであり、miR-5001-5pがhs
a-miR-5001-5pであり、miR-4673がhsa-miR-4673であ
り、miR-4466がhsa-miR-4466であり、miR-23a-3pがhs
a-miR-23a-3pであり、miR-3656がhsa-miR-3656であり
、miR-6782-5pがhsa-miR-6782-5pであり、miR-4689
がhsa-miR-4689であり、miR-451aがhsa-miR-451aであ
り、miR-4446-3pがhsa-miR-4446-3pであり、miR-318
0-3pがhsa-miR-3180-3pであり、miR-642a-3pがhsa-
miR-642a-3pであり、miR-6889-5pがhsa-miR-6889-
5pであり、miR-3178がhsa-miR-3178であり、miR-4665-
5pがhsa-miR-4665-5pであり、miR-6722-3pがhsa-mi
R-6722-3pであり、miR-30c-1-3pがhsa-miR-30c-1-
3pであり、miR-4507がhsa-miR-4507であり、miR-3141が
hsa-miR-3141であり、及び、miR-1199-5pがhsa-miR-1
199-5pである。
(k)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列に
おいてuがtである塩基配列、からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又
は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(l)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(m)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列に
おいてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異
体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(n)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列に
おいてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(o)前記(k)~(n)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハ
イブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである。
液、血清、血漿、尿等の体液など、から調製される検体を挙げることができる。具体的に
は、当該組織から調製されるRNA含有検体、それからさらに調製されるポリヌクレオチ
ドを含む検体、血液、血清、血漿、尿等の体液、被験体の生体組織の一部又は全部をバイ
オプシーなどで採取するか、手術によって摘出した生体組織、などであり、これらから、
測定のための検体を調製することができる。
を指し、好ましくはヒトである。
できる。
ップ(a)、(b)及び(c):
(a)被験体の検体から調製されたRNA又はそれから転写された相補的ポリヌクレオチ
ド(cDNA)を、本発明のキット又はデバイス中のポリヌクレオチドと結合させるステ
ップ、
(b)当該ポリヌクレオチドに結合した検体由来のRNA又は当該RNAから合成された
cDNAを、上記ポリヌクレオチドを核酸プローブとして用いるハイブリダイゼーション
によって、あるいは、上記ポリヌクレオチドをプライマーとして用いる定量RT-PCR
によって測定するステップ、
(c)上記(b)の測定結果に基づいて、胃がん(由来の遺伝子発現)の存在又は不存在
を評価するステップ、
を含むことができる。
は診断するために、例えば種々のハイブリダイゼーション法を使用することができる。こ
のようなハイブリダイゼーション法には、例えばノーザンブロット法、サザンブロット法
、RT-PCR法、DNAチップ解析法、in situハイブリダイゼーション法、ノ
ーザンハイブリダイゼーション法、サザンハイブリダイゼーション法などを使用すること
ができる。
ことによって、RNA中の各遺伝子発現の有無やその発現量を検出、測定することができ
る。具体的には、核酸プローブ(相補鎖)を放射性同位元素(32P、33P、35Sな
ど)や蛍光物質などで標識し、それを常法にしたがってナイロンメンブレンなどにトラン
スファーした被検者の生体組織由来のRNAとハイブリダイズさせたのち、形成されたD
NA/RNA二重鎖の標識物(放射性同位元素又は蛍光物質)に由来するシグナルを放射
線検出器(BAS-1800II(富士写真フィルム株式会社)、などを例示できる)又
は蛍光検出器(STORM 865(GEヘルスケア社)、などを例示できる)で検出、
測定する方法を例示することができる。
ことによって、RNA中の遺伝子発現の有無やその発現量を検出、測定することができる
。具体的には、被検体の生体組織由来のRNAから常法にしたがってcDNAを調製して
、これを鋳型として標的の各遺伝子の領域が増幅できるように、本発明の1対のプライマ
ー(上記cDNAに結合する正鎖と逆鎖からなる)をcDNAとハイブリダイズさせて常
法によりPCR法を行い、得られた二本鎖DNAを検出する方法を例示することができる
。なお、二本鎖DNAの検出法としては、上記PCRをあらかじめ放射性同位元素や蛍光
物質で標識しておいたプライマーを用いて行う方法、PCR産物をアガロースゲルで電気
泳動し、エチジウムブロマイドなどで二本鎖DNAを染色して検出する方法、産生された
二本鎖DNAを常法にしたがってナイロンメンブレンなどにトランスファーさせ、標識し
た核酸プローブとハイブリダイズさせて検出する方法を含むことができる。
(固相)に貼り付けたRNAチップ又はDNAチップを用いる。核酸プローブを貼り付け
た領域をプローブスポット、核酸プローブを貼り付けていない領域をブランクスポットと
称する。遺伝子群を基板に固相化したものには、一般に核酸チップ、核酸アレイ、マイク
ロアレイなどという名称があり、DNAもしくはRNAアレイにはDNAもしくはRNA
マクロアレイとDNAもしくはRNAマイクロアレイが包含されるが、本明細書ではチッ
プといった場合、当該アレイを含むものとする。DNAチップとしては3D-Gene(
登録商標)Human miRNA Oligo chip(東レ株式会社)を用いるこ
とができるが、これに限られない。
ルを画像検出器(Typhoon 9410(GEヘルスケア社)、3D-Gene(登
録商標)スキャナー(東レ株式会社)などを例示できる)で検出、測定する方法を例示す
ることができる。
他の配列に対するよりも大きな程度(例えばバックグラウンド測定値の平均+バックグラ
ウンド測定値の標準誤差×2以上の測定値)で、その標的配列に対してハイブリダイズす
る条件である。
定される。そのハイブリダイゼーションの条件は、限定されないが、例えば30℃~60
℃で、SSC、界面活性剤、ホルムアミド、デキストラン硫酸塩、ブロッキング剤などを
含む溶液中で1~24時間の条件とする。ここで、1×SSCは、150mM塩化ナトリ
ウム及び15mMクエン酸ナトリウムを含む水溶液(pH7.0)であり、界面活性剤は
SDS(ドデシル硫酸ナトリウム)、Triton、又はTweenなどを含む。ハイブ
リダイゼーション条件としては、より好ましくは3~10×SSC、0.1~1%SDS
を含む。ストリンジェントな条件を規定するもうひとつの条件である、ハイブリダイゼー
ション後の洗浄条件としては、例えば、30℃の0.5×SSCと0.1%SDSを含む
溶液、及び30℃の0.2×SSCと0.1%SDSを含む溶液、及び30℃の0.05
×SSC溶液による連続した洗浄などの条件を挙げることができる。相補鎖はかかる条件
で洗浄しても対象とする正鎖とハイブリダイズ状態を維持するものであることが望ましい
。具体的にはこのような相補鎖として、対象の正鎖の塩基配列と完全に相補的な関係にあ
る塩基配列からなる鎖、並びに当該鎖と少なくとも80%、好ましくは少なくとも85%
、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、例えば少なくとも98%又は
少なくとも99%の同一性を有する塩基配列からなる鎖を例示することができる。
ては、例えばSambrook, J. & Russel, D.著、Molecul
ar Cloning, A LABORATORY MANUAL、Cold Spr
ing Harbor Laboratory Press、2001年1月15日発行
、の第1巻7.42~7.45、第2巻8.9~8.17などに記載されており、本発明
において利用できる。
件の例としては、例えば10mM Tris-HCL(pH8.3)、50mM KCL
、1~2mM MgCl2などの組成のPCRバッファーを用い、当該プライマーの配列
から計算されたTm値+5~10℃において15秒から1分程度処理することなどが挙げ
られる。かかるTm値の計算方法としてTm値=2×(アデニン残基数+チミン残基数)
+4×(グアニン残基数+シトシン残基数)などが挙げられる。
NA Assays(Life Technologies社):LNA(登録商標)-
based MicroRNA PCR(Exiqon社):Ncode(登録商標)m
iRNA qRT-PCT キット(invitrogen社)などの、miRNAを定
量的に測定するために特別に工夫された市販の測定用キットを用いてもよい。
al analysis of gene expression microarra
y data(Speed T.著、Chapman and Hall/CRC)、及
びA beginner’s guide Microarray gene expr
ession data analysis(Causton H.C.ら著、Blac
kwell publishing)などに記載された統計学的処理を、利用できる。例
えばDNAチップ上のブランクスポットの測定値の平均値に、ブランクスポットの測定値
の標準偏差の2倍、好ましくは3倍、より好ましくは6倍を加算し、その値以上のシグナ
ル値を有するプローブスポットを検出スポットとみなすことができる。さらに、ブランク
スポットの測定値の平均値をバックグラウンドとみなし、プローブスポットの測定値から
減算し、遺伝子発現量とすることができる。遺伝子発現量の欠損値については、解析対象
から除外するか、好ましくは各DNAチップにおける遺伝子発現量の最小値で置換するか
、より好ましくは遺伝子発現量の最小値の対数値から0.1を減算した値、で置換するこ
とができる。さらに、低シグナルの遺伝子を除去するために、測定サンプル数の20%以
上、好ましくは50%以上、より好ましくは80%以上において2の6乗、好ましくは2
の8乗、より好ましくは2の10乗以上の遺伝子発現量を有する遺伝子のみを解析対象と
して選択することができる。遺伝子発現量の正規化(ノーマライゼーション)としては、
限定されないが、例えばglobal normalizationやquantile
normalization(Bolstad, B. M.ら、2003年、Bio
informatics、19巻、p185-193)、などが挙げられる。
、又はそれらの組み合わせを用いて、被験体由来の検体中の標的遺伝子又は遺伝子の発現
量を測定し、胃がん患者由来の検体と健常体由来の検体の遺伝子発現量を教師サンプルと
して判別式(判別関数)を作成し、検体が胃がん由来の遺伝子を含むこと及び/又は含ま
ないことを決定又は評価する方法を提供する。
えばチップ)、又はそれらの組み合わせを用いて、検体が胃がん由来の遺伝子を含むこと
/又は胃がん由来の遺伝子を含まないことを決定又は評価することが既知の複数の検体中
の標的遺伝子(標的核酸)の発現量をin vitroで測定する第1のステップ、前記
第1のステップで得られた当該標的遺伝子の発現量の測定値を教師サンプルとした判別式
を作成する第2のステップ、被験体由来の検体中の当該標的遺伝子の発現量を第1のステ
ップと同様にin vitroで測定する第3のステップ、前記第2のステップで得られ
た判別式に第3のステップで得られた当該標的遺伝子の発現量の測定値を代入し、当該判
別式から得られた結果に基づいて、検体が胃がん由来の遺伝子を含むこと/又は胃がん由
来の遺伝子を含まないことを決定又は評価する第4のステップを含み、ここで、当該標的
遺伝子が当該ポリヌクレオチド、キット又はデバイス(例えばチップ)に含まれる検出用
ポリヌクレオチドによって検出可能なものである、前記方法を提供する。ここで、フィッ
シャーの判別分析、マハラノビス距離による非線形判別分析、ニューラルネットワーク、
Support Vector Machine(SVM)などを用いて判別式を作成で
きるが、これらに限定されない。
いて群の所属を判別する方法である。ここで、xは説明変数、wは説明変数の係数、w0
は定数項とする。
変数として当該判別式に代入し、判別得点の符号で群分けを判別することができる。
を選択するための次元削減法であり、合成変数の分散に着目して、同じラベルを持つデー
タの分散を最小化することで識別力の高い合成変数を構成する(Venables,W.
N.ら著 Modern Applied Statistics with S.
Fourth edition. Springer.、2002年)。フィッシャーの
判別分析では式2を最大にするような射影方向wを求める。ここで、μは入力の平均、n
gはクラスgに属するデータ数、μgはクラスgに属するデータの入力の平均とする。分
子・分母はそれぞれデータをベクトルwの方向に射影したときのクラス間分散、クラス内
分散となっており、この比を最大化することで判別式係数wiを求める(金森敬文ら著、
「パターン認識」、共立出版(2009年)、Richard O.ら著、Patter
n Classification Second Edition.、Wiley-I
nterscience、2000年)。
距離の近い群を所属群として判別する非線形判別分析として用いることができる。ここで
、μは各群の中心ベクトル、S-1はその群の分散共分散行列の逆行列である。中心ベク
トルは説明変数xから算出され、平均ベクトルや中央値ベクトルなどを用いることができ
る。
f Statistical Leaning Theory、Springer、19
95年)。分類すべき群分けが既知のデータセットの特定のデータ項目を説明変数、分類
すべき群分けを目的変数として、当該データセットを既知の群分けに正しく分類するため
の超平面と呼ばれる境界面を決定し、当該境界面を用いてデータを分類する判別式を決定
する。そして当該判別式は、新たに与えられるデータセットの測定値を説明変数として当
該判別式に代入することにより、群分けを判別することができる。また、このときの判別
結果は分類すべき群でも良く、分類すべき群に分類されうる確率でも良く、超平面からの
距離でも良い。SVMでは非線形な問題に対応するための方法として、特徴ベクトルを高
次元へ非線形変換し、その空間で線形の識別を行う方法が知られている。非線形に写像し
た空間での二つの要素の内積がそれぞれのもとの空間での入力のみで表現されるような式
のことをカーネルと呼び、カーネルの一例としてリニアカーネル、RBF(Radial
Basis Function)カーネル、ガウシアンカーネルを挙げることができる
。カーネルによって高次元に写像しながら、実際には写像された空間での特徴の計算を避
けてカーネルの計算のみで最適な判別式、すなわち判別式を構成することができる(例え
ば、麻生英樹ら著、統計科学のフロンテイア6「パターン認識と学習の統計学 新しい概
念と手法」、岩波書店(2004年)、Nello Cristianiniら著、SV
M入門、共立出版(2008年))。
on(C-SVC)は、2群の説明変数で学習を行って超平面を作成し、未知のデータセ
ットがどちらの群に分類されるかを判別する(C. Cortesら、1995年、Ma
chine Learning、20巻、p273-297)。
胃がん患者と健常体の2群に群分けする。被験体が胃がん患者である、又は健常体である
と判断するには、例えば胃組織検査を用いることができる。
以下、学習検体群)を用意し、当該2群の間で遺伝子発現量に明確な差が見られる遺伝子
を説明変数、当該群分けを目的変数(例えば-1と+1)としたC-SVCによる判別式
を決定する。式4は最適化する目的関数であり、ここで、eは全ての入力ベクトル、yは
目的変数、aはLagrange未定乗数ベクトル、Qは正定値行列、Cは制約条件を調
整するパラメータを表す。
を決定できる。ここで、xはサポートベクトル、yは群の所属を示すラベル、aは対応す
る係数、bは定数項、Kはカーネル関数である。
ここで、xはサポートベクトル、γは超平面の複雑さを調整するカーネルパラメータを表
す。
又は含まないことを決定又は評価する、あるいはその発現量を健常体由来の対照と比較し
評価する方法として、ニューラルネットワーク、k-近傍法、決定木、ロジスティック回
帰分析などの手法を選択することができる。
(a)胃がん患者由来の胃がん由来遺伝子を含む組織及び/又は健常体由来の胃がん由来
遺伝子を含まない組織であることが既に知られている検体中の標的遺伝子の発現量を、本
発明による検出用ポリヌクレオチド、キット又はデバイス(例えばDNAチップ)を用い
て測定するステップ、
(b)(a)で測定された発現量の測定値から、上記の式1~3、5及び6の判別式を作
成するステップ、
(c)被験体由来の検体中の当該標的遺伝子の発現量を、本発明による診断(検出)用ポ
リヌクレオチド、キット又はデバイス(例えばDNAチップ)を用いて測定し、(b)で
作成した判別式にそれらを代入して、得られた結果に基づいて検体が胃がん由来の標的遺
伝子を含むこと及び/又は含まないことを決定又は評価する、あるいはその発現量を健常
体由来の対照と比較し評価する、ステップ、
を含むことができる。ここで、式1~3、5及び6の式中のxは説明変数であり、上記2
節に記載したポリヌクレオチド類から選択されるポリヌクレオチド又はその断片等を測定
することによって得られる値を含み、具体的には本発明の胃がん患者と健常体を判別する
ための説明変数は、例えば下記の(1)~(3)より選択される遺伝子発現量である。
(1)配列番号1~165及び635~642のいずれかで表される塩基配列又はその相
補的配列において、15以上の連続した塩基を含むDNAのいずれかによって測定される
胃がん患者もしくは健常体の血清における遺伝子発現量。
(2)配列番号166~169のいずれかで表される塩基配列又はその相補的配列におい
て、15以上の連続した塩基を含むDNAのいずれかによって測定される胃がん患者もし
くは健常体の血清における遺伝子発現量。
(3)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列又はその相補的配列におい
て、15以上の連続した塩基を含むDNAのいずれかによって測定される胃がん患者もし
くは健常体の血清における遺伝子発現量。
ないことを決定又は評価する方法として、判別式の作成には、学習検体群から作成した判
別式が必要であり、当該判別式の判別精度を上げるためには、学習検体群中の2群間に明
確な差がある遺伝子を判別式に用いることが必要である。
ず、学習検体群である、胃がん患者群の網羅的遺伝子発現量と健常体群の網羅的遺伝子発
現量をデータセットとし、パラメトリック解析であるt検定のP値、ノンパラメトリック
解析であるMann-WhitneyのU検定のP値、又はWilcoxon検定のP値
などを利用して、当該2群間における各遺伝子の発現量の差の大きさを求める。
り小さい場合に統計学的に有意とみなすことができる。
方法、例えばボンフェローニ、ホルムなどの方法によって補正することができる(例えば
、永田靖ら著、「統計的多重比較法の基礎」、サイエンティスト社(2007年))。ボ
ンフェローニ補正を例示すると、例えば検定によって得られたP値を検定の繰り返し回数
、即ち、解析に用いる遺伝子数で乗じ、所望の有意水準と比較することにより検定全体で
の第一種の過誤を生じる確率を抑制できる。
々の遺伝子発現量の中央値の発現比の絶対値(Fold change)を算出し、判別
式の説明変数に用いる遺伝子を選択してもよい。また、胃がん患者群と健常体群の遺伝子
発現量を用いてROC曲線を作成し、AUROC値を基準にして判別式の説明変数に用い
る遺伝子を選択してもよい。
の方法で算出することができる判別式を作成する。最大の判別精度を得る判別式を構築す
る方法として、例えばP値の有意水準を満たした遺伝子のあらゆる組み合わせで判別式を
構築する方法や、判別式を作成するために使用する遺伝子を、遺伝子発現量の差の大きい
順に一つずつ増やしながら繰り返して評価する方法などがある(Furey TS.ら、
2000年、Bioinformatics.、16巻、p906-14)。この判別式
に対し、別の独立の胃がん患者もしくは健常体の遺伝子発現量を説明変数に代入して、こ
の独立の胃がん患者もしくは健常体について所属する群の判別結果を算出する。すなわち
、見出した診断用遺伝子セット及び診断用遺伝子セットを用いて構築した判別式を、独立
の検体群で評価することにより、より普遍的な胃がんを検出することができる診断用遺伝
子セット及び胃がんを判別する方法を見出すことができる。
いることが好ましい。すなわち、データセットを学習検体群とテスト検体群に分割し、学
習検体群で統計学的検定による遺伝子の選択と判別式作成を行い、該判別式でテスト検体
群を判別した結果とテスト検体群が所属する真の群を用いて精度・感度・特異度を算出し
、判別性能を評価する。一方、データセットを分割せずに、全検体を用いて統計学的検定
による遺伝子の選択と判別式作成を行い、新規に用意した検体を該判別式で判別して精度
・感度・特異度を算出し、判別性能を評価することもできる。
該ポリヌクレオチドを用いた胃がんの検出方法、並びに当該ポリヌクレオチドを含む胃が
んの検出キット及びデバイスを提供する。特に、既存の腫瘍マーカーCEAやCA19-
9による胃がん診断法を超える精度を示す診断用遺伝子の選定と判別式の作成を実施する
ため、本発明の方法において、例えば、CEAやCA19-9によって陰性と判断された
にもかかわらず、造影剤を用いたコンピュータ断層撮影等の精密検査によって最終的に胃
がんが存在することが明らかとなった患者由来の血清中の発現遺伝子と、胃がんが存在し
ない患者由来の血清中の発現遺伝子を比較することによって、CEAおよびCA19-9
を超える精度を示す、診断用遺伝子セット及び判別式を構築できる。
れる塩基配列若しくはその相補的配列、に基づく1又は2以上の上記ポリヌクレオチド、
並びに場合により、配列番号166~169のいずれかで表される塩基配列若しくはその
相補的配列、に基づく1又は2以上の上記ポリヌクレオチド、並びに場合により、配列番
号170~199のいずれかで表される塩基配列若しくはその相補的配列、に基づく1又
は2以上の上記ポリヌクレオチド、からの任意の組み合わせを診断用遺伝子セットとする
。さらに、組織診断の診断結果がクラスIの胃がん患者由来の検体と、クラスIIの健常
体由来の検体における該診断用遺伝子セットの発現量を用いて判別式を構築する。その結
果、未知の検体の該診断用遺伝子セットの発現量を測定することにより、未知の検体が胃
がん由来遺伝子を含むこと又は胃がん由来遺伝子を含まないことを最高で100%の精度
で見分けることができる。
の実施例によって制限されないものとする。
[参考例1]
<胃がん患者と健常体の検体の採取>
インフォームドコンセントを得た健常体100人と胃がん以外の原発がんが認められて
いない胃がん患者34人(ステージIAが19例、ステージIBが5例、ステージIIA
が2例、ステージIIBが2例、ステージIIIAが3例、ステージIIICが3例)か
らベノジェクトII真空採血管VP-AS109K60(テルモ株式会社)を用いてそれ
ぞれ血清を採取し、学習検体群とした。同様に、インフォームドコンセントを得た健常体
50人と胃がん以外の原発がんが認められていない胃がん患者16人(ステージIAが9
例、ステージIBが2例、ステージIIAが2例、ステージIIBが1例、ステージII
IAが1例、ステージIIICが1例)からベノジェクトII真空採血管VP-AS10
9K60(テルモ株式会社)を用いてそれぞれ血清を採取し、テスト検体群とした。
検体として上記学習検体群、テスト検体群合わせて健常体150人と胃がん患者50人
の合計200人からそれぞれ得られた血清300μLから、3D-Gene(登録商標)
RNA extraction reagent from liquid sampl
e kit(東レ株式会社)中のRNA抽出用試薬を用いて、同社の定めるプロトコール
に従ってtotal RNAを得た。
検体として上記学習検体群、テスト検体群合わせて健常体150人と胃がん患者50人
の合計200人の血清から得たtotal RNAに対して、3D-Gene(登録商標
) miRNA Labeling kit(東レ株式会社)を用いて同社が定めるプロ
トコール(ver2.20)に基づいてmiRNAを蛍光標識した。オリゴDNAチップ
として、miRBase release 20に登録されているmiRNAの中で、2
,555種のmiRNAと相補的な配列を有するプローブを搭載した3D-Gene(登
録商標)Human miRNA Oligo chip(東レ株式会社)を用い、同社
が定めるプロトコールに基づいてストリンジェントな条件で、total RNA中のm
iRNAとDNAチップ上のプローブとのハイブリダイゼーション及びハイブリダイゼー
ション後の洗浄を行った。DNAチップを3D-Gene(登録商標)スキャナー(東レ
株式会社)を用いてスキャンし、画像を取得して3D-Gene(登録商標)Extra
ction(東レ株式会社)にて蛍光強度を数値化した。数値化された蛍光強度を、底が
2の対数値に変換して遺伝子発現量とし、ブランク値の減算を行い、欠損値は各DNAチ
ップにおける遺伝子発現量の最小値の対数値から0.1を減算した値で置換した。その結
果、胃がん患者50人の血清及び健常体150人の血清に対する、網羅的なmiRNAの
遺伝子発現量を得た。数値化されたmiRNAの遺伝子発現量を用いた計算及び統計解析
は、R言語3.0.2(R Development Core Team(2013)
. R: A language and environment for stat
istical computing. R Foundation for Stat
istical Computing, URL http://www.R-proj
ect.org/)及びMASSパッケージ7.3-30(Venables, W.
N. & Ripley, B. D.(2002) Modern Applied
Statistics with S. Fourth Edition. Sprin
ger, New York. ISBN 0-387-95457-0)を用いて実施
した。
<胃がん以外のがん患者の検体の採取>
インフォームドコンセントを得た他の臓器にがんが認められていない、膵臓がん患者6
3人、胆道がん患者65人、大腸がん患者35人、肝がん患者32人、及び膵胆道良性疾
患患者17人からベノジェクトII真空採血管VP-AS109K60(テルモ株式会社
)を用いてそれぞれ血清を採取し、参考例1の胃がん患者34人と健常体102人と合わ
せて学習検体群とした。同様に、インフォームドコンセントを得た他の臓器にがんが認め
られていない、膵臓がん患者37人、胆道がん患者33人、大腸がん患者15人、肝がん
患者20人、及び膵胆道良性疾患患者4人からベノジェクトII真空採血管VP-AS1
09K60(テルモ株式会社)を用いてそれぞれ血清を採取し、参考例1の胃がん以外の
臓器にがんが認められていない胃がん患者16人、健常体48人と合わせてテスト検体群
とした。以降の操作は参考例1と同様に行った。
<学習検体群の検体を用いた遺伝子マーカーの選定とテスト検体群の検体を用いた単独の
遺伝子マーカーの胃がん判別性能の評価方法>
本実施例では、学習検体群から胃がんを健常体と判別するための遺伝子マーカーを選定
し、学習検体群とは独立したテスト検体群の検体において選定した遺伝子マーカーについ
てそれぞれ単独での胃がん判別性能を評価する方法を検討した。
合わせてquantile normalizationで正規化した。
断マーカーを獲得するため、学習検体群の胃がん患者群又は学習検体群の健常体群のいず
れかにおいて、50%以上の検体で2の6乗以上の遺伝子発現量を有する遺伝子のみを選
択した。更に胃がん患者群と健常体群を判別するための統計的有意性がある遺伝子として
、各々の遺伝子発現量について等分散を仮定した両側t検定で得られたP値をボンフェロ
ーニ補正し、p<0.01を満たす遺伝子を、判別式の説明変数に用いる遺伝子マーカー
として獲得し、表2に記載した。
a-miR-1343-3p、hsa-miR-1247-3p、hsa-miR-67
87-5p、hsa-miR-6875-5p、hsa-miR-1225-3p、hs
a-miR-8063、hsa-miR-6781-5p、hsa-miR-4746-
3p、hsa-miR-1908-5p、hsa-miR-6756-5p、hsa-m
iR-204-3p、hsa-miR-4651、hsa-miR-6757-5p、h
sa-miR-6825-5p、hsa-miR-7108-5p、hsa-miR-4
792、hsa-miR-7641、hsa-miR-3188、hsa-miR-31
31、hsa-miR-6780b-5p、hsa-miR-8069、hsa-miR
-6840-3p、hsa-miR-8072、hsa-miR-1233-5p、hs
a-miR-6887-5p、hsa-miR-1231、hsa-miR-5572、
hsa-miR-6738-5p、hsa-miR-6784-5p、hsa-miR-
6791-5p、hsa-miR-6749-5p、hsa-miR-6741-5p、
hsa-miR-128-1-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-6
746-5p、hsa-miR-3184-5p、hsa-miR-3679-5p、h
sa-miR-7110-5p、hsa-miR-4516、hsa-miR-6717
-5p、hsa-miR-6826-5p、hsa-miR-4433b-3p、hsa
-miR-3679-3p、hsa-miR-3135b、hsa-miR-3622a
-5p、hsa-miR-711、hsa-miR-4467、hsa-miR-685
7-5p、hsa-miR-6515-3p、hsa-miR-1225-5p、hsa
-miR-187-5p、hsa-miR-3185、hsa-miR-642b-3p
、hsa-miR-1249、hsa-miR-744-5p、hsa-miR-444
2、hsa-miR-1228-3p、hsa-miR-939-5p、hsa-miR
-6845-5p、hsa-miR-887-3p、hsa-miR-7845-5p、
hsa-miR-6729-5p、hsa-miR-4632-5p、hsa-miR-
615-5p、hsa-miR-6724-5p、hsa-miR-4728-5p、h
sa-miR-6732-5p、hsa-miR-6816-5p、hsa-miR-4
695-5p、hsa-miR-6088、hsa-miR-7975、hsa-miR
-3197、hsa-miR-6125、hsa-miR-4433-3p、hsa-m
iR-6727-5p、hsa-miR-4706、hsa-miR-7847-3p、
hsa-miR-6805-3p、hsa-miR-6766-3p、hsa-miR-
1913、hsa-miR-4649-5p、hsa-miR-602、hsa-miR
-3663-3p、hsa-miR-6893-5p、hsa-miR-6861-5p
、hsa-miR-4449、hsa-miR-6842-5p、hsa-miR-44
54、hsa-miR-5195-3p、hsa-miR-663b、hsa-miR-
6765-5p、hsa-miR-4513、hsa-miR-614、hsa-miR
-6785-5p、hsa-miR-6777-5p、hsa-miR-940、hsa
-miR-4741、hsa-miR-6870-5p、hsa-miR-6131、h
sa-miR-150-3p、hsa-miR-4707-5p、hsa-miR-19
15-3p、hsa-miR-3937、hsa-miR-937-5p、hsa-mi
R-4443、hsa-miR-1914-3p、hsa-miR-3620-5p、h
sa-miR-1268b、hsa-miR-1227-5p、hsa-miR-688
0-5p、hsa-miR-4417、hsa-miR-6802-5p、hsa-mi
R-6769a-5p、hsa-miR-663a、hsa-miR-6721-5p、
hsa-miR-4532、hsa-miR-7977、hsa-miR-92b-5p
、hsa-miR-371a-5p、hsa-miR-6126、hsa-miR-47
34、hsa-miR-4665-3p、hsa-miR-423-5p、hsa-mi
R-1469、hsa-miR-4675、hsa-miR-1915-5p、hsa-
miR-6716-5p、hsa-miR-718、hsa-miR-4281、hsa
-miR-6820-5p、hsa-miR-6795-5p、hsa-miR-677
9-5p、hsa-miR-7109-5p、hsa-miR-6798-5p、hsa
-miR-4648、hsa-miR-8059、hsa-miR-6765-3p、h
sa-miR-6132、hsa-miR-4492、hsa-miR-7107-5p
、hsa-miR-3195、hsa-miR-3180、hsa-miR-296-3
p、hsa-miR-564、hsa-miR-1268a、hsa-miR-6848
-5p、hsa-miR-762、hsa-miR-2861、hsa-miR-120
3、hsa-miR-1260b、hsa-miR-4476、hsa-miR-688
5-5p、hsa-miR-6769b-5p、hsa-miR-23b-3p、hsa
-miR-1343-5p、hsa-miR-3621、hsa-miR-4688、h
sa-miR-4286、hsa-miR-4640-5p、hsa-miR-4739
、hsa-miR-1260a、hsa-miR-4276、hsa-miR-7106
、hsa-miR-128-2-5p、hsa-miR-125a-3p、hsa-mi
R-92a-2-5p及びhsa-miR-486-3p遺伝子、これらに関連する配列
番号1~169の塩基配列からなるポリヌクレオチドを見出した。
号1~165に表される塩基配列からなるポリヌクレオチドである。
有無を判別する判別式を作成した。すなわち、学習検体群において新規に見出された配列
番号1~169のいずれかで表される塩基配列からなるポリヌクレオチドを式2に入力し
て判別式を作成し、算出した精度・感度・特異度を表3に示した。またそのときの判別式
係数と定数項を表4に示した。ここで、配列番号1~169で表される塩基配列からなる
ポリヌクレオチドは全て、胃がんの主要なタイプである乳頭腺がん、管状腺がん(3例)
や低分化腺がん、印環細胞がん、粘液がんをいずれも判別できるマーカーとして選定した
。
し、選定されたポリヌクレオチドの判別性能を独立した検体で検証した(表3)。例えば
、配列番号1で示される塩基配列の発現量測定値を学習検体群の健常体(100人)と胃
がん患者(34人)で比較した場合、健常体群に対し胃がん患者群の遺伝子発現量測定値
が有意に低いことが示され(図2左参照)、更にこの結果はテスト検体群の健常体(50
人)と胃がん患者(16人)でも再現できた(図2右参照)。同様に配列番号2~169
に示される他のポリヌクレオチドにおいても、健常体群に対し胃がん患者群の遺伝子発現
量が測定値が有意に低い(-)又は高い(+)結果(表2)が得られ、これらの結果はテ
スト検体群で検証ができた。また、例えばこの配列番号1で示される塩基配列に関し、学
習検体群で設定した両群を判別する閾値(6.29)を用いて胃がん検出の的中率を算出
したところ、真陽性14例、真陰性49例、偽陽性1例、偽陰性2例であり、これらの値
から検出性能として、精度95.5%、感度87.5%、特異度98%が得られた。この
ようにして配列番号1~169に示される全てのポリヌクレオチドの検出性能を算出し、
表3に記載した。表3に示す配列番号1~169で表される塩基配列からなるポリヌクレ
オチドは、テスト検体群においてそれぞれ感度87.5%、93.8%、93.8%、8
1.2%、93.8%、87.5%、87.5%、81.2%、68.8%、87.5%
、75.0%、81.2%、87.5%、75.0%、81.2%、93.8%、68.
8%、81.2%、56.2%、68.8%、87.5%、56.2%、62.5%、6
2.5%、62.5%、75.0%、56.2%、87.5%、93.8%、62.5%
、87.5%、62.5%、68.8%、81.2%、81.2%、62.5%、81.
2%、81.2%、62.5%、87.5%、62.5%、75.0%、56.2%、7
5.0%、62.5%、56.2%、68.8%、62.5%、56.2%、93.8%
、62.5%、62.5%、56.2%、81.2%、68.8%、56.2%、43.
8%、75.0%、75.0%、68.8%、81.2%、75.0%、68.8%、6
8.8%、43.8%、62.5%、50.0%、50.0%、62.5%、62.5%
、50.0%、68.8%、37.5%、50.0%、37.5%、68.8%、68.
8%、56.2%、12.5%、75.0%、50.0%、50.0%、37.5%、6
8.8%、25.0%、81.2%、43.8%、56.2%、62.5%、37.5%
、43.8%、43.8%、37.5%、43.8%、31.2%、43.8%、50.
0%、25%、43.8%、37.5%、37.5%、31.2%、25.0%、25.
0%、56.2%、31.2%、43.8%、56.2%、50.0%、37.5%、3
1.2%、31.2%、37.5%、50.0%、12.5%、31.2%、56.2%
、18.8%、43.8%、18.8%、37.5%、31.2%、37.5%、50.
0%、50.0%、12.5%、31.2%、31.2%、31.2%、31.2%、5
0.0%、37.5%、18.8%、37.5%、50.0%、43.8%、18.8%
、43.8%、31.2%、18.8%、50.0%、25.0%、31.2%、31.
2%、18.8%、43.8%、6.2%、25.0%、12.5%、31.2%、12
.5%、18.8%、37.5%、6.2%、31.2%、6.2%、18.8%、6.
2%、18.8%、6.2%、12.5%、18.8%、6.2%、12.5%、6.2
%、50.0%、68.8%、31.2%、25.0%、を示した。ここで、後述の比較
例から、テスト検体群における既存マーカーCEAの感度は12.5%(CEAの異常値
を5ng/ml以上とした場合)、CA19-9の感度は12.5%(CA19-9の異
常値を37U/ml以上とした場合)であったことから、テスト検体群において、配列番
号1~169で表される塩基配列からなる全てのポリヌクレオチドは、単独でCEAおよ
びCA19-9を上回る感度で胃がんを判別することが証明できた。
レオチドは、テスト検体群に含まれていたステージIAの胃がん9検体を正しく胃がんと
判別することができた。従ってこれらのポリヌクレオチドは、早期の胃がんも検出するこ
とができ、胃がんの早期診断に貢献する。
<テスト検体群検体を用いた複数の遺伝子マーカーの組合せによる胃がん判別性能の評価
方法>
本実施例では、実施例1で選定された遺伝子マーカーを組合せて胃がん判別性能を評価
する方法を検討した。具体的には、実施例1において選択された配列番号1~169で表
される塩基配列からなるポリヌクレオチドのいずれのうち、新規に見出された配列番号1
~165で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドのいずれかの発現量の測定値を少
なくとも1つ以上含む2種の組み合わせ14,190通りについてフィッシャーの判別分
析を行い、胃がんの存在の有無を判別する判別式を構築した。次に、上記で作成した判別
式を用いてテスト検体群における精度・感度・特異度を算出し、選定されたポリヌクレオ
チドの判別性能を独立した検体で検証した。
常体(100人)と胃がん患者(34人)で比較した場合、健常体群と胃がん患者群の発
現量測定値が有意に分離する散布図が得られ(図3左参照)、更にこの結果はテスト検体
群の健常体(50人)と胃がん患者(16人)でも再現できた(図3右参照)。同様に、
配列番号1~169で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドのうち、新規に見出さ
れた配列番号1~165で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドのいずれかの発現
量測定値を少なくとも1つ以上含む2個の他の組み合わせにおいても、健常体群と胃がん
患者群の遺伝子発現量測定値を有意に分離する散布図が得られ、これらの結果はテスト検
体群で検証ができた。また、例えばこの配列番号1と配列番号2で示される塩基配列に関
し、学習検体群で設定した両群を判別する関数(0=0.83x+y-14.78)を用
いて胃がん検出の的中率を算出したところ、真陽性15例、真陰性50例、偽陽性0例、
偽陰性1例であり、これらの値から検出性能として精度98.5%、感度93.8%、特
異度100%が得られた。このようにして、配列番号1~169で表される塩基配列から
なるポリヌクレオチドのうち、新規に見出された配列番号1~165で表される塩基配列
からなるポリヌクレオチドのいずれかの発現量測定値を少なくとも1つ以上含む2個の組
み合わせ全通りの検出性能を算出した。このうち例として、配列番号1で表される塩基配
列からなるポリヌクレオチドの発現量測定値を含む組み合わせ168通りとその検出性能
について表6に記載した。例えば配列番号1と配列番号14で表される塩基配列からなる
ポリヌクレオチドの発現量測定値の組み合わせについては、テスト検体群において感度1
00%を示した。また配列番号1と配列番号2、4、14、17、22、24、27、3
2、39、43、46、48、53、65、66、67、78、89、91、98、99
、113、116、122、129、141、144、148、150、154、156
、で表される2個の塩基配列からなるポリヌクレオチドの組み合わせについては全て特異
度100%を示した。また、既存マーカーであるCEA又はCA19-9の感度(表5よ
りいずれも12.5%)を上回るポリヌクレオチドの発現量測定値の組み合わせはテスト
検体群で14,159通り得られ、この組み合わせには実施例1で得られた表2に記載の
塩基配列1~165の全てが少なくとも1回は使用された。すなわち、配列番号1~18
0で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドは、2個組み合わせて用いた場合も既存
マーカーより優れた性能で胃がんの判別を可能にすることが証明できた。従って、2個の
塩基配列からなるポリヌクレオチドの発現量測定値を組み合わせた場合においても、優れ
た胃がんの検出感度が得られた。
定値を3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個又はそれ以上の個数を組み合
わせることで、さらに優れた感度で胃がんを検出するマーカーが得られる。例えば、実施
例1で選択された配列番号1~169で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドのう
ち新規に見出された配列番号1~165で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドに
ついて、テスト検体群における健常体群と胃がん群の間で測定された発現量値を得て、群
間の差の統計的有意性を示すStudent’sのt-testによるP値の降順に全ポ
リヌクレオチドを順位付けし(P値が最も低いものが1位となる)、上位のポリヌクレオ
チドから1個ずつ組み合わせに加えることにより、1個から複数個のポリヌクレオチドの
組み合わせの胃がん検出感度を評価した。すなわち、この評価におけるポリヌクレオチド
の組み合わせの順番は、配列番号で示すと、表2に示す配列番号165から、164、1
63、と順番にさかのぼった順となる。その結果、テスト検体群における感度は、1個の
ポリヌクレオチド(配列番号165)で6.2%、2個のポリヌクレオチド(配列番号1
65及び164)で62.5%、4個のポリヌクレオチド(配列番号162~165)で
68.8%、8個のポリヌクレオチド(配列番号158~165)で75.0%、13個
のポリヌクレオチド(配列番号153~165)で87.5%、15個のポリヌクレオチ
ド(配列番号151~165)で93.8%、23個のポリヌクレオチド(配列番号14
3~165)で100%、50個のポリヌクレオチド(配列番号116~165)で10
0%、80個のポリヌクレオチド(配列番号86~165)で100%、100個のポリ
ヌクレオチド(配列番号666~165)で100%、150個のポリヌクレオチド(配
列番号16~165)で100%、165個のポリヌクレオチド(配列番号1~165)
で100%であった。
のポリヌクレオチドを組み合わせた場合の方が、高い胃がん判別性能を得ることが可能で
あることが示された。ここで、複数のポリヌクレオチドの組み合わせは、上記のように統
計的有意差の順に組み合わせる場合に限らず、どのような複数個のポリヌクレオチドの組
み合わせを用いても胃がんの検出に用いることができる。
チドは、優れた胃がんの検出用マーカーであるといえる。
<全検体を用いた場合の遺伝子マーカーの選定と獲られた遺伝子マーカーの胃がん判別性
能の評価方法>
本実施例では、上記実施例1及び実施例2で用いた学習検体群及びテスト検体群の検体
を統合し全検体を用いて、遺伝子マーカーの選定、及びその胃がん判別性能評価を行った
。
対するmiRNA発現量について、quantile normalizationで正
規化した。より信頼性の高い診断マーカーを獲得するため、遺伝子マーカーの選定では胃
がん患者群又は健常体群のいずれかにおいて、50%以上の検体で2の6乗以上の遺伝子
発現量を有する遺伝子のみを選択した。更に胃がん患者群と健常体群を判別するための統
計的有意性を得るために、各々の遺伝子発現量について等分散を仮定した両側t検定で得
られたP値をボンフェローニ補正し、p<0.01を満たす遺伝子を判別式の説明変数に
用いる遺伝子マーカーとして選択し表7に記載した。このようにして、表2に記載した遺
伝子に加え、hsa-miR-3196、hsa-miR-211-3p、hsa-mi
R-4271、hsa-miR-6851-5p、hsa-miR-149-3p、hs
a-miR-4667-5p、hsa-miR-135a-3p、hsa-miR-44
86、hsa-miR-4697-5p、hsa-miR-4725-3p、hsa-m
iR-6510-5p、hsa-miR-5001-5p、hsa-miR-4673、
hsa-miR-4466、hsa-miR-23a-3p、hsa-miR-3656
、hsa-miR-6782-5p、hsa-miR-4689、hsa-miR-45
1a、hsa-miR-4446-3p、hsa-miR-3180-3p、hsa-m
iR-642a-3p、hsa-miR-6889-5p、hsa-miR-3178、
hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-6722-3p、hsa-miR-
30c-1-3p、hsa-miR-4507、hsa-miR-3141及びhsa-
miR-1199-5p遺伝子、これらに関連する配列番号170~199の塩基配列を
見出した。配列番号1~169に示される塩基配列と同様に、配列番号170~199に
示されるポリヌクレオチドにおいても、健常体群に対し胃がん患者の測定値が有意に低い
(-)又は高い(+)結果(表7)が得られ、これらの結果はテスト検体群で検証ができ
た。従って、表7に記載した遺伝子発現量の測定値を単独又は組合せて用いることにより
、実施例1及び実施例2に記載した方法で新規に得た検体を判別することができる。
<テスト検体群検体を用いた複数の遺伝子マーカーの組み合わせによる胃がん特異的な判
別性能の評価方法>
本実施例では、実施例1で選定された遺伝子マーカーを使用して、参考例2に記載した
検体群の学習検体群を対象とし、実施例1に記載の方法と同様の方法で、胃がん患者と健
常体、膵臓がん患者、胆道がん患者、大腸がん患者、肝がん患者及び膵胆道良性疾患患者
からなる対照群との血清中のmiRNAの遺伝子発現量の比較を行い、診断用遺伝子を選
択した。その結果選択された、配列番号635~642で表される塩基配列からなるポリ
ヌクレオチドを更に組合せて胃がん特異的な判別性能を評価する方法を検討した。
を合わせてquantile normalizationで正規化した。次に、配列番
号1~165及び635~642で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドのいずれ
かの発現量測定値を少なくとも1つ以上含む1~6個の組み合わせについてフィッシャー
の判別分析を行い、胃がんの存在の有無を判別する判別式を構築した。次に、胃がん患者
群を陽性検体群とし、一方で、健常体群、膵臓がん患者群、胆道がん患者群、大腸がん患
者群、肝がん患者群及び膵胆道良性疾患患者群を陰性検体群として、上記で作成した判別
式を用いてテスト検体群における精度・感度・特異度を算出し、選定されたポリヌクレオ
チドの判別性能を独立した検体で検証した。
5~642)のいずれかで表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレ
オチドの多くが胃がんの存在の有無の判別において比較的高い精度、感度、特異度を提供
することができるうえに、胃がんをその他のがんから特異的に識別可能であった。標的マ
ーカーと特異的に結合可能なポリヌクレオチドとして、例えば、配列番号9、13、21
、27、34、36、66、75、95、98、108、130、135、143、15
5、183、185、187、191、193、194、635、636、637、63
8、639、640、641及び642で表される塩基配列もしくはその相補的配列から
なるポリヌクレオチドからなる群(がん種特異性ポリヌクレオチド群1)から選択される
複数個のポリヌクレオチドの組み合わせのうち、がん種特異性ポリヌクレオチド群1に含
まれる、配列番号21、34、36、98及び155で表される塩基配列もしくはその相
補的配列からなるポリヌクレオチドからなる群(がん種特異性ポリヌクレオチド群2)か
ら選択されるポリヌクレオチドを少なくとも1つ以上含む組み合わせにおいて、高精度に
、胃がんをその他のがんから特異的に識別可能であった。
、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個又はそれ以上の個数を組み合わせが可能
であるが、6個以上の組み合わせにおいて判別精度80%以上を示すことができた。
発現量測定値を用いて、学習検体群の胃がん患者34人、健常体102人、膵臓がん患者
63人、胆道がん患者65人、大腸がん患者35人、肝がん患者32人、及び膵胆道良性
疾患患者17人を比較した場合、学習検体群では胃がん患者群とその他の群の判別得点が
有意に分離する散布図が得られ(図4上図参照)、更にこの結果はテスト検体群でも再現
ができた(図4下図参照)。
<既存血中腫瘍マーカーの胃がん判別性能>
上記の参考例で得た学習検体群とテスト検体群について、既存の腫瘍マーカーCEAお
よびCA19-9の血中濃度を測定した。これらの腫瘍マーカーは、原則、Kim,H.
J.ら、Acta Oncologica、2009年、48号、p.385~390に
記載される基準値(CEAは5ng/mL、CA19-9は37U/mL)よりも血中濃
度が高いとがんの疑いがあるとされる。従って、各検体毎にCEAおよびCA19-9の
血中濃度が基準値を超えているか否かを確認し、その結果から胃がん患者をがんと判定で
きるか見定め、学習検体群及びテスト検体群における各既存マーカーの感度を算出した。
この結果を表5に示した。CEAおよびCA19-9の感度は学習検体群においていずれ
も2.9%、テスト検体群においてはCEAの感度は12.5%、CA19-9の感度も
12.5%しかなく、いずれのマーカーも胃がんの検出には有用でないことが分かった(
表5)。
9で表される塩基配列からなる全てのポリヌクレオチドは、既存の胃がんマーカー以上の
感度を示す1個又は2個の組み合わせが存在し、優れた診断マーカーであるといえる。
マーカーよりも胃がんを感度よく検出できるので、胃がんを早期に発見し治療することが
可能となり、その結果、再発リスクの低減による生存率の向上や、胃温存療法という治療
選択肢の提供も可能となる。
胃がんの早期発見、診断及び治療が可能になる。また、本発明の方法により、患者血液を
用いて胃がんを低侵襲的に検出できるため、胃がんを簡便かつ迅速に検出することが可能
になる。
にとり入れるものとする。
Claims (17)
- 胃がんマーカーであるmiR-1915-5pのポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸を含む、胃がんの検出用キット。
- miR-1915-5pがhsa-miR-1915-5pである、請求項1に記載のキット。
- 前記核酸が、下記の(a)~(d)に示すポリヌクレオチドからなる群から選択される、請求項1又は2に記載のキット:
(a)配列番号128で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、
(b)配列番号128で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号128で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、及び
(d)配列番号128で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド。 - 前記キットが、別の胃がんマーカーである、miR-6726-5p、miR-1343-3p、miR-1247-3p、miR-6787-5p、miR-6875-5p、miR-1225-3p、miR-8063、miR-6781-5p、miR-4746-3p、miR-1908-5p、miR-6756-5p、miR-204-3p、miR-4651、miR-6757-5p、miR-6825-5p、miR-7108-5p、miR-4792、miR-7641、miR-3188、miR-3131、miR-6780b-5p、miR-8069、miR-6840-3p、miR-8072、miR-1233-5p、miR-6887-5p、miR-1231、miR-5572、miR-6738-5p、miR-6784-5p、miR-6791-5p、miR-6749-5p、miR-6741-5p、miR-128-1-5p、miR-4419b、miR-6746-5p、miR-3184-5p、miR-3679-5p、miR-7110-5p、miR-4516、miR-6717-5p、miR-6826-5p、miR-4433b-3p、miR-3679-3p、miR-3135b、miR-3622a-5p、miR-711、miR-4467、miR-6857-5p、miR-6515-3p、miR-1225-5p、miR-187-5p、miR-3185、miR-642b-3p、miR-1249、miR-744-5p、miR-4442、miR-1228-3p、miR-939-5p、miR-6845-5p、miR-887-3p、miR-7845-5p、miR-6729-5p、miR-4632-5p、miR-615-5p、miR-6724-5p、miR-4728-5p、miR-6732-5p、miR-6816-5p、miR-4695-5p、miR-6088、miR-7975、miR-3197、miR-6125、miR-4433-3p、miR-6727-5p、miR-4706、miR-7847-3p、miR-6805-3p、miR-6766-3p、miR-1913、miR-4649-5p、miR-602、miR-3663-3p、miR-6893-5p、miR-6861-5p、miR-4449、miR-6842-5p、miR-4454、miR-5195-3p、miR-663b、miR-6765-5p、miR-4513、miR-614、miR-6785-5p、miR-6777-5p、miR-940、miR-4741、miR-6870-5p、miR-6131、miR-150-3p、miR-4707-5p、miR-1915-3p、miR-3937、miR-937-5p、miR-4443、miR-1914-3p、miR-3620-5p、miR-1268b、miR-1227-5p、miR-6880-5p、miR-4417、miR-6802-5p、miR-6769a-5p、miR-663a、miR-6721-5p、miR-4532、miR-7977、miR-92b-5p、miR-371a-5p、miR-6126、miR-4734、miR-4665-3p、miR-423-5p、miR-1469、miR-4675、miR-6716-5p、miR-718、miR-4281、miR-6820-5p、miR-6795-5p、miR-6779-5p、miR-7109-5p、miR-6798-5p、miR-4648、miR-8059、miR-6765-3p、miR-6132、miR-4492、miR-7107-5p、miR-3195、miR-3180、miR-296-3p、miR-564、miR-1268a、miR-6848-5p、miR-762、miR-2861、miR-1203、miR-1260b、miR-4476、miR-6885-5p、miR-6769b-5p、miR-23b-3p、miR-1343-5p、miR-3621、miR-4688、miR-4286、miR-4640-5p、miR-4739、miR-1260a、miR-4276、miR-7106-5p、miR-6794-5p、miR-6774-5p、miR-4707-3p、miR-4534、miR-4294、miR-6850-5p、miR-6089、miR-671-5p、miR-128-2-5p、miR-125a-3p、miR-92a-2-5p及びmiR-486-3pからなる群、及び/又は、miR-3196、miR-211-3p、miR-4271、miR-6851-5p、miR-149-3p、miR-4667-5p、miR-135a-3p、miR-4486、miR-4697-5p、miR-4725-3p、miR-6510-5p、miR-5001-5p、miR-4673、miR-4466、miR-23a-3p、miR-3656、miR-6782-5p、miR-4689、miR-451a、miR-4446-3p、miR-3180-3p、miR-642a-3p、miR-6889-5p、miR-3178、miR-4665-5p、miR-6722-3p、miR-30c-1-3p、miR-4507、miR-3141及びmiR-1199-5pからなる群から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに含む、請求項1~3のいずれか1項に記載のキット。
- miR-6726-5pがhsa-miR-6726-5pであり、miR-1343-3pがhsa-miR-1343-3pであり、miR-1247-3pがhsa-miR-1247-3pであり、miR-6787-5pがhsa-miR-6787-5pであり、miR-6875-5pがhsa-miR-6875-5pであり、miR-1225-3pがhsa-miR-1225-3pであり、miR-8063がhsa-miR-8063であり、miR-6781-5pがhsa-miR-6781-5pであり、miR-4746-3pがhsa-miR-4746-3pであり、miR-1908-5pがhsa-miR-1908-5pであり、miR-6756-5pがhsa-miR-6756-5pであり、miR-204-3pがhsa-miR-204-3pであり、miR-4651がhsa-miR-4651であり、miR-6757-5pがhsa-miR-6757-5pであり、miR-6825-5pがhsa-miR-6825-5pであり、miR-7108-5pがhsa-miR-7108-5pであり、miR-4792がhsa-miR-4792であり、miR-7641がhsa-miR-7641であり、miR-3188がhsa-miR-3188であり、miR-3131がhsa-miR-3131であり、miR-6780b-5pがhsa-miR-6780b-5pであり、miR-8069がhsa-miR-8069であり、miR-6840-3pがhsa-miR-6840-3pであり、miR-8072がhsa-miR-8072であり、miR-1233-5pがhsa-miR-1233-5pであり、miR-6887-5pがhsa-miR-6887-5pであり、miR-1231がhsa-miR-1231であり、miR-5572がhsa-miR-5572であり、miR-6738-5pがhsa-miR-6738-5pであり、miR-6784-5pがhsa-miR-6784-5pであり、miR-6791-5pがhsa-miR-6791-5pであり、miR-6749-5pがhsa-miR-6749-5pであり、miR-6741-5pがhsa-miR-6741-5pであり、miR-128-1-5pがhsa-miR-128-1-5pであり、miR-4419bがhsa-miR-4419bであり、miR-6746-5pがhsa-miR-6746-5pであり、miR-3184-5pがhsa-miR-3184-5pであり、miR-3679-5pがhsa-miR-3679-5pであり、miR-7110-5pがhsa-miR-7110-5pであり、miR-4516がhsa-miR-4516であり、miR-6717-5pがhsa-miR-6717-5pであり、miR-6826-5pがhsa-miR-6826-5pであり、miR-4433b-3pがhsa-miR-4433b-3pであり、miR-3679-3pがhsa-miR-3679-3pであり、miR-3135bがhsa-miR-3135bであり、miR-3622a-5pがhsa-miR-3622a-5pであり、miR-711がhsa-miR-711であり、miR-4467がhsa-miR-4467であり、miR-6857-5pがhsa-miR-6857-5pであり、miR-6515-3pがhsa-miR-6515-3pであり、miR-1225-5pがhsa-miR-1225-5pであり、miR-187-5pがhsa-miR-187-5pであり、miR-3185がhsa-miR-3185であり、miR-642b-3pがhsa-miR-642b-3pであり、miR-1249がhsa-miR-1249であり、miR-744-5pがhsa-miR-744-5pであり、miR-4442がhsa-miR-4442であり、miR-1228-3pがhsa-miR-1228-3pであり、miR-939-5pがhsa-miR-939-5pであり、miR-6845-5pがhsa-miR-6845-5pであり、miR-887-3pがhsa-miR-887-3pであり、miR-7845-5pがhsa-miR-7845-5pであり、miR-6729-5pがhsa-miR-6729-5pであり、miR-4632-5pがhsa-miR-4632-5pであり、miR-615-5pがhsa-miR-615-5pであり、miR-6724-5pがhsa-miR-6724-5pであり、miR-4728-5pがhsa-miR-4728-5pであり、miR-6732-5pがhsa-miR-6732-5pであり、miR-6816-5pがhsa-miR-6816-5pであり、miR-4695-5pがhsa-miR-4695-5pであり、miR-6088がhsa-miR-6088であり、miR-7975がhsa-miR-7975であり、miR-3197がhsa-miR-3197であり、miR-6125がhsa-miR-6125であり、miR-4433-3pがhsa-miR-4433-3pであり、miR-6727-5pがhsa-miR-6727-5pであり、miR-4706がhsa-miR-4706であり、miR-7847-3pがhsa-miR-7847-3pであり、miR-6805-3pがhsa-miR-6805-3pであり、miR-6766-3pがhsa-miR-6766-3pであり、miR-1913がhsa-miR-1913であり、miR-4649-5pがhsa-miR-4649-5pであり、miR-602がhsa-miR-602であり、miR-3663-3pがhsa-miR-3663-3pであり、miR-6893-5pがhsa-miR-6893-5pであり、miR-6861-5pがhsa-miR-6861-5pであり、miR-4449がhsa-miR-4449であり、miR-6842-5pがhsa-miR-6842-5pであり、miR-4454がhsa-miR-4454であり、miR-5195-3pがhsa-miR-5195-3pであり、miR-663bがhsa-miR-663bであり、miR-6765-5pがhsa-miR-6765-5pであり、miR-4513がhsa-miR-4513であり、miR-614がhsa-miR-614であり、miR-6785-5pがhsa-miR-6785-5pであり、miR-6777-5pがhsa-miR-6777-5pであり、miR-940がhsa-miR-940であり、miR-4741がhsa-miR-4741であり、miR-6870-5pがhsa-miR-6870-5pであり、miR-6131がhsa-miR-6131であり、miR-150-3pがhsa-miR-150-3pであり、miR-4707-5pがhsa-miR-4707-5pであり、miR-1915-3pがhsa-miR-1915-3pであり、miR-3937がhsa-miR-3937であり、miR-937-5pがhsa-miR-937-5pであり、
miR-4443がhsa-miR-4443であり、miR-1914-3pがhsa-miR-1914-3pであり、miR-3620-5pがhsa-miR-3620-5pであり、miR-1268bがhsa-miR-1268bであり、miR-1227-5pがhsa-miR-1227-5pであり、miR-6880-5pがhsa-miR-6880-5pであり、miR-4417がhsa-miR-4417であり、miR-6802-5pがhsa-miR-6802-5pであり、miR-6769a-5pがhsa-miR-6769a-5pであり、miR-663aがhsa-miR-663aであり、miR-6721-5pがhsa-miR-6721-5pであり、miR-4532がhsa-miR-4532であり、miR-7977がhsa-miR-7977であり、miR-92b-5pがhsa-miR-92b-5pであり、miR-371a-5pがhsa-miR-371a-5pであり、miR-6126がhsa-miR-6126であり、miR-4734がhsa-miR-4734であり、miR-4665-3pがhsa-miR-4665-3pであり、miR-423-5pがhsa-miR-423-5pであり、miR-1469がhsa-miR-1469であり、miR-4675がhsa-miR-4675であり、miR-6716-5pがhsa-miR-6716-5pであり、miR-718がhsa-miR-718であり、miR-4281がhsa-miR-4281であり、miR-6820-5pがhsa-miR-6820-5pであり、miR-6795-5pがhsa-miR-6795-5pであり、miR-6779-5pがhsa-miR-6779-5pであり、miR-7109-5pがhsa-miR-7109-5pであり、miR-6798-5pがhsa-miR-6798-5pであり、miR-4648がhsa-miR-4648であり、miR-8059がhsa-miR-8059であり、miR-6765-3pがhsa-miR-6765-3pであり、miR-6132がhsa-miR-6132であり、miR-4492がhsa-miR-4492であり、miR-7107-5pがhsa-miR-7107-5pであり、miR-3195がhsa-miR-3195であり、miR-3180がhsa-miR-3180であり、miR-296-3pがhsa-miR-296-3pであり、miR-564がhsa-miR-564であり、miR-1268aがhsa-miR-1268aであり、miR-6848-5pがhsa-miR-6848-5pであり、miR-762がhsa-miR-762であり、miR-2861がhsa-miR-2861であり、miR-1203がhsa-miR-1203であり、miR-1260bがhsa-miR-1260bであり、miR-4476がhsa-miR-4476であり、miR-6885-5pがhsa-miR-6885-5pであり、miR-6769b-5pがhsa-miR-6769b-5pであり、miR-23b-3pがhsa-miR-23b-3pであり、miR-1343-5pがhsa-miR-1343-5pであり、miR-3621がhsa-miR-3621であり、miR-4688がhsa-miR-4688であり、miR-4286がhsa-miR-4286であり、miR-4640-5pがhsa-miR-4640-5pであり、miR-4739がhsa-miR-4739であり、miR-1260aがhsa-miR-1260aであり、miR-4276がhsa-miR-4276であり、miR-7106-5pがhsa-miR-7106-5pであり、miR-6794-5pがhsa-miR-6794-5pであり、miR-6774-5pがhsa-miR-6774-5pであり、miR-4707-3pがhsa-miR-4707-3pであり、miR-4534がhsa-miR-4534であり、miR-4294がhsa-miR-4294であり、miR-6850-5pがhsa-miR-6850-5pであり、miR-6089がhsa-miR-6089であり、miR-671-5pがhsa-miR-671-5pであり、miR-128-2-5pがhsa-miR-128-2-5pであり、miR-125a-3pがhsa-miR-125a-3pであり、miR-92a-2-5pがhsa-miR-92a-2-5pであり、miR-486-3pがhsa-miR-486-3pであり、miR-3196がhsa-miR-3196であり、miR-211-3pがhsa-miR-211-3pであり、miR-4271がhsa-miR-4271であり、miR-6851-5pがhsa-miR-6851-5pであり、miR-149-3pがhsa-miR-149-3pであり、miR-4667-5pがhsa-miR-4667-5pであり、miR-135a-3pがhsa-miR-135a-3pであり、miR-4486がhsa-miR-4486であり、miR-4697-5pがhsa-miR-4697-5pであり、miR-4725-3pがhsa-miR-4725-3pであり、miR-6510-5pがhsa-miR-6510-5pであり、miR-5001-5pがhsa-miR-5001-5pであり、miR-4673がhsa-miR-4673であり、miR-4466がhsa-miR-4466であり、miR-23a-3pがhsa-miR-23a-3pであり、miR-3656がhsa-miR-3656であり、miR-6782-5pがhsa-miR-6782-5pであり、miR-4689がhsa-miR-4689であり、miR-451aがhsa-miR-451aであり、miR-4446-3pがhsa-miR-4446-3pであり、miR-3180-3pがhsa-miR-3180-3pであり、miR-642a-3pがhsa-miR-642a-3pであり、miR-6889-5pがhsa-miR-6889-5pであり、miR-3178がhsa-miR-3178であり、miR-4665-5pがhsa-miR-4665-5pであり、miR-6722-3pがhsa-miR-6722-3pであり、miR-30c-1-3pがhsa-miR-30c-1-3pであり、miR-4507がhsa-miR-4507であり、miR-3141がhsa-miR-3141であり、及び、miR-1199-5pがhsa-miR-1199-5pである、請求項4に記載のキット。 - 前記核酸が、下記の(e)~(l)に示すポリヌクレオチドからなる群から選択される、請求項4又は5に記載のキット:
(e)配列番号2~127、129~165、635~642、及び166~169のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、
(f)配列番号2~127、129~165、635~642、及び166~169のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(g)配列番号2~127、129~165、635~642、及び166~169のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、
(h)配列番号2~127、129~165、635~642、及び166~169のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(i)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、
(j)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(k)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、及び
(l)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド。 - 請求項1~6のいずれか1項に記載のキットを用いて、被験体の検体における標的核酸の発現量を測定し、該測定された発現量と、同様に測定された健常体の対照発現量とを用いて、被験体が胃がんに罹患していること、又は胃がんに罹患していないことをin vitroで評価することを含む、胃がんの検出を補助する方法。
- 胃がんマーカーであるmiR-1915-5pのポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸を含む、胃がんの検出用デバイスを用いて、被験体の検体における標的核酸の発現量を測定し、該測定された発現量と、同様に測定された健常体の対照発現量とを用いて、被験体が胃がんに罹患していること、又は胃がんに罹患していないことをin vitroで評価することを含む、胃がんの検出を補助する方法。
- miR-1915-5pがhsa-miR-1915-5pである、請求項8に記載の方法。
- 前記核酸が、下記の(a)~(d)に示すポリヌクレオチドからなる群から選択される、請求項8又は9に記載の方法:
(a)配列番号128で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、
(b)配列番号128で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号128で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、及び
(d)配列番号128で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド。 - 前記デバイスが、別の胃がんマーカーである、miR-6726-5p、miR-1343-3p、miR-1247-3p、miR-6787-5p、miR-6875-5p、miR-1225-3p、miR-8063、miR-6781-5p、miR-4746-3p、miR-1908-5p、miR-6756-5p、miR-204-3p、miR-4651、miR-6757-5p、miR-6825-5p、miR-7108-5p、miR-4792、miR-7641、miR-3188、miR-3131、miR-6780b-5p、miR-8069、miR-6840-3p、miR-8072、miR-1233-5p、miR-6887-5p、miR-1231、miR-5572、miR-6738-5p、miR-6784-5p、miR-6791-5p、miR-6749-5p、miR-6741-5p、miR-128-1-5p、miR-4419b、miR-6746-5p、miR-3184-5p、miR-3679-5p、miR-7110-5p、miR-4516、miR-6717-5p、miR-6826-5p、miR-4433b-3p、miR-3679-3p、miR-3135b、miR-3622a-5p、miR-711、miR-4467、miR-6857-5p、miR-6515-3p、miR-1225-5p、miR-187-5p、miR-3185、miR-642b-3p、miR-1249、miR-744-5p、miR-4442、miR-1228-3p、miR-939-5p、miR-6845-5p、miR-887-3p、miR-7845-5p、miR-6729-5p、miR-4632-5p、miR-615-5p、miR-6724-5p、miR-4728-5p、miR-6732-5p、miR-6816-5p、miR-4695-5p、miR-6088、miR-7975、miR-3197、miR-6125、miR-4433-3p、miR-6727-5p、miR-4706、miR-7847-3p、miR-6805-3p、miR-6766-3p、miR-1913、miR-4649-5p、miR-602、miR-3663-3p、miR-6893-5p、miR-6861-5p、miR-4449、miR-6842-5p、miR-4454、miR-5195-3p、miR-663b、miR-6765-5p、miR-4513、miR-614、miR-6785-5p、miR-6777-5p、miR-940、miR-4741、miR-6870-5p、miR-6131、miR-150-3p、miR-4707-5p、miR-1915-3p、miR-3937、miR-937-5p、miR-4443、miR-1914-3p、miR-3620-5p、miR-1268b、miR-1227-5p、miR-6880-5p、miR-4417、miR-6802-5p、miR-6769a-5p、miR-663a、miR-6721-5p、miR-4532、miR-7977、miR-92b-5p、miR-371a-5p、miR-6126、miR-4734、miR-4665-3p、miR-423-5p、miR-1469、miR-4675、miR-6716-5p、miR-718、miR-4281、miR-6820-5p、miR-6795-5p、miR-6779-5p、miR-7109-5p、miR-6798-5p、miR-4648、miR-8059、miR-6765-3p、miR-6132、miR-4492、miR-7107-5p、miR-3195、miR-3180、miR-296-3p、miR-564、miR-1268a、miR-6848-5p、miR-762、miR-2861、miR-1203、miR-1260b、miR-4476、miR-6885-5p、miR-6769b-5p、miR-23b-3p、miR-1343-5p、miR-3621、miR-4688、miR-4286、miR-4640-5p、miR-4739、miR-1260a、miR-4276、miR-7106-5p、miR-6794-5p、miR-6774-5p、miR-4707-3p、miR-4534、miR-4294、miR-6850-5p、miR-6089、miR-671-5p、miR-128-2-5p、miR-125a-3p、miR-92a-2-5p及びmiR-486-3pからなる群、及び/又は、miR-3196、miR-211-3p、miR-4271、miR-6851-5p、miR-149-3p、miR-4667-5p、miR-135a-3p、miR-4486、miR-4697-5p、miR-4725-3p、miR-6510-5p、miR-5001-5p、miR-4673、miR-4466、miR-23a-3p、miR-3656、miR-6782-5p、miR-4689、miR-451a、miR-4446-3p、miR-3180-3p、miR-642a-3p、miR-6889-5p、miR-3178、miR-4665-5p、miR-6722-3p、miR-30c-1-3p、miR-4507、miR-3141及びmiR-1199-5pからなる群から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに含む、請求項8~10のいずれか1項に記載の方法。
- miR-6726-5pがhsa-miR-6726-5pであり、miR-1343-3pがhsa-miR-1343-3pであり、miR-1247-3pがhsa-miR-1247-3pであり、miR-6787-5pがhsa-miR-6787-5pであり、miR-6875-5pがhsa-miR-6875-5pであり、miR-1225-3pがhsa-miR-1225-3pであり、miR-8063がhsa-miR-8063であり、miR-6781-5pがhsa-miR-6781-5pであり、miR-4746-3pがhsa-miR-4746-3pであり、miR-1908-5pがhsa-miR-1908-5pであり、miR-6756-5pがhsa-miR-6756-5pであり、miR-204-3pがhsa-miR-204-3pであり、miR-4651がhsa-miR-4651であり、miR-6757-5pがhsa-miR-6757-5pであり、miR-6825-5pがhsa-miR-6825-5pであり、miR-7108-5pがhsa-miR-7108-5pであり、miR-4792がhsa-miR-4792であり、miR-7641がhsa-miR-7641であり、miR-3188がhsa-miR-3188であり、miR-3131がhsa-miR-3131であり、miR-6780b-5pがhsa-miR-6780b-5pであり、miR-8069がhsa-miR-8069であり、miR-6840-3pがhsa-miR-6840-3pであり、miR-8072がhsa-miR-8072であり、miR-1233-5pがhsa-miR-1233-5pであり、miR-6887-5pがhsa-miR-6887-5pであり、miR-1231がhsa-miR-1231であり、miR-5572がhsa-miR-5572であり、miR-6738-5pがhsa-miR-6738-5pであり、miR-6784-5pがhsa-miR-6784-5pであり、miR-6791-5pがhsa-miR-6791-5pであり、miR-6749-5pがhsa-miR-6749-5pであり、miR-6741-5pがhsa-miR-6741-5pであり、miR-128-1-5pがhsa-miR-128-1-5pであり、miR-4419bがhsa-miR-4419bであり、miR-6746-5pがhsa-miR-6746-5pであり、miR-3184-5pがhsa-miR-3184-5pであり、miR-3679-5pがhsa-miR-3679-5pであり、miR-7110-5pがhsa-miR-7110-5pであり、miR-4516がhsa-miR-4516であり、miR-6717-5pがhsa-miR-6717-5pであり、miR-6826-5pがhsa-miR-6826-5pであり、miR-4433b-3pがhsa-miR-4433b-3pであり、miR-3679-3pがhsa-miR-3679-3pであり、miR-3135bがhsa-miR-3135bであり、miR-3622a-5pがhsa-miR-3622a-5pであり、miR-711がhsa-miR-711であり、miR-4467がhsa-miR-4467であり、miR-6857-5pがhsa-miR-6857-5pであり、miR-6515-3pがhsa-miR-6515-3pであり、miR-1225-5pがhsa-miR-1225-5pであり、miR-187-5pがhsa-miR-187-5pであり、miR-3185がhsa-miR-3185であり、miR-642b-3pがhsa-miR-642b-3pであり、miR-1249がhsa-miR-1249であり、miR-744-5pがhsa-miR-744-5pであり、miR-4442がhsa-miR-4442であり、miR-1228-3pがhsa-miR-1228-3pであり、miR-939-5pがhsa-miR-939-5pであり、miR-6845-5pがhsa-miR-6845-5pであり、miR-887-3pがhsa-miR-887-3pであり、miR-7845-5pがhsa-miR-7845-5pであり、miR-6729-5pがhsa-miR-6729-5pであり、miR-4632-5pがhsa-miR-4632-5pであり、miR-615-5pがhsa-miR-615-5pであり、miR-6724-5pがhsa-miR-6724-5pであり、miR-4728-5pがhsa-miR-4728-5pであり、miR-6732-5pがhsa-miR-6732-5pであり、miR-6816-5pがhsa-miR-6816-5pであり、miR-4695-5pがhsa-miR-4695-5pであり、miR-6088がhsa-miR-6088であり、miR-7975がhsa-miR-7975であり、miR-3197がhsa-miR-3197であり、miR-6125がhsa-miR-6125であり、miR-4433-3pがhsa-miR-4433-3pであり、miR-6727-5pがhsa-miR-6727-5pであり、miR-4706がhsa-miR-4706であり、miR-7847-3pがhsa-miR-7847-3pであり、miR-6805-3pがhsa-miR-6805-3pであり、miR-6766-3pがhsa-miR-6766-3pであり、miR-1913がhsa-miR-1913であり、miR-4649-5pがhsa-miR-4649-5pであり、miR-602がhsa-miR-602であり、miR-3663-3pがhsa-miR-3663-3pであり、miR-6893-5pがhsa-miR-6893-5pであり、miR-6861-5pがhsa-miR-6861-5pであり、miR-4449がhsa-miR-4449であり、miR-6842-5pがhsa-miR-6842-5pであり、miR-4454がhsa-miR-4454であり、miR-5195-3pがhsa-miR-5195-3pであり、miR-663bがhsa-miR-663bであり、miR-6765-5pがhsa-miR-6765-5pであり、miR-4513がhsa-miR-4513であり、miR-614がhsa-miR-614であり、miR-6785-5pがhsa-miR-6785-5pであり、miR-6777-5pがhsa-miR-6777-5pであり、miR-940がhsa-miR-940であり、miR-4741がhsa-miR-4741であり、miR-6870-5pがhsa-miR-6870-5pであり、miR-6131がhsa-miR-6131であり、miR-150-3pがhsa-miR-150-3pであり、miR-4707-5pがhsa-miR-4707-5pであり、miR-1915-3pがhsa-miR-1915-3pであり、miR-3937がhsa-miR-3937であり、miR-937-5pがhsa-miR-937-5pであり、
miR-4443がhsa-miR-4443であり、miR-1914-3pがhsa-miR-1914-3pであり、miR-3620-5pがhsa-miR-3620-5pであり、miR-1268bがhsa-miR-1268bであり、miR-1227-5pがhsa-miR-1227-5pであり、miR-6880-5pがhsa-miR-6880-5pであり、miR-4417がhsa-miR-4417であり、miR-6802-5pがhsa-miR-6802-5pであり、miR-6769a-5pがhsa-miR-6769a-5pであり、miR-663aがhsa-miR-663aであり、miR-6721-5pがhsa-miR-6721-5pであり、miR-4532がhsa-miR-4532であり、miR-7977がhsa-miR-7977であり、miR-92b-5pがhsa-miR-92b-5pであり、miR-371a-5pがhsa-miR-371a-5pであり、miR-6126がhsa-miR-6126であり、miR-4734がhsa-miR-4734であり、miR-4665-3pがhsa-miR-4665-3pであり、miR-423-5pがhsa-miR-423-5pであり、miR-1469がhsa-miR-1469であり、miR-4675がhsa-miR-4675であり、miR-6716-5pがhsa-miR-6716-5pであり、miR-718がhsa-miR-718であり、miR-4281がhsa-miR-4281であり、miR-6820-5pがhsa-miR-6820-5pであり、miR-6795-5pがhsa-miR-6795-5pであり、miR-6779-5pがhsa-miR-6779-5pであり、miR-7109-5pがhsa-miR-7109-5pであり、miR-6798-5pがhsa-miR-6798-5pであり、miR-4648がhsa-miR-4648であり、miR-8059がhsa-miR-8059であり、miR-6765-3pがhsa-miR-6765-3pであり、miR-6132がhsa-miR-6132であり、miR-4492がhsa-miR-4492であり、miR-7107-5pがhsa-miR-7107-5pであり、miR-3195がhsa-miR-3195であり、miR-3180がhsa-miR-3180であり、miR-296-3pがhsa-miR-296-3pであり、miR-564がhsa-miR-564であり、miR-1268aがhsa-miR-1268aであり、miR-6848-5pがhsa-miR-6848-5pであり、miR-762がhsa-miR-762であり、miR-2861がhsa-miR-2861であり、miR-1203がhsa-miR-1203であり、miR-1260bがhsa-miR-1260bであり、miR-4476がhsa-miR-4476であり、miR-6885-5pがhsa-miR-6885-5pであり、miR-6769b-5pがhsa-miR-6769b-5pであり、miR-23b-3pがhsa-miR-23b-3pであり、miR-1343-5pがhsa-miR-1343-5pであり、miR-3621がhsa-miR-3621であり、miR-4688がhsa-miR-4688であり、miR-4286がhsa-miR-4286であり、miR-4640-5pがhsa-miR-4640-5pであり、miR-4739がhsa-miR-4739であり、miR-1260aがhsa-miR-1260aであり、miR-4276がhsa-miR-4276であり、miR-7106-5pがhsa-miR-7106-5pであり、miR-6794-5pがhsa-miR-6794-5pであり、miR-6774-5pがhsa-miR-6774-5pであり、miR-4707-3pがhsa-miR-4707-3pであり、miR-4534がhsa-miR-4534であり、miR-4294がhsa-miR-4294であり、miR-6850-5pがhsa-miR-6850-5pであり、miR-6089がhsa-miR-6089であり、miR-671-5pがhsa-miR-671-5pであり、miR-128-2-5pがhsa-miR-128-2-5pであり、miR-125a-3pがhsa-miR-125a-3pであり、miR-92a-2-5pがhsa-miR-92a-2-5pであり、miR-486-3pがhsa-miR-486-3pであり、miR-3196がhsa-miR-3196であり、miR-211-3pがhsa-miR-211-3pであり、miR-4271がhsa-miR-4271であり、miR-6851-5pがhsa-miR-6851-5pであり、miR-149-3pがhsa-miR-149-3pであり、miR-4667-5pがhsa-miR-4667-5pであり、miR-135a-3pがhsa-miR-135a-3pであり、miR-4486がhsa-miR-4486であり、miR-4697-5pがhsa-miR-4697-5pであり、miR-4725-3pがhsa-miR-4725-3pであり、miR-6510-5pがhsa-miR-6510-5pであり、miR-5001-5pがhsa-miR-5001-5pであり、miR-4673がhsa-miR-4673であり、miR-4466がhsa-miR-4466であり、miR-23a-3pがhsa-miR-23a-3pであり、miR-3656がhsa-miR-3656であり、miR-6782-5pがhsa-miR-6782-5pであり、miR-4689がhsa-miR-4689であり、miR-451aがhsa-miR-451aであり、miR-4446-3pがhsa-miR-4446-3pであり、miR-3180-3pがhsa-miR-3180-3pであり、miR-642a-3pがhsa-miR-642a-3pであり、miR-6889-5pがhsa-miR-6889-5pであり、miR-3178がhsa-miR-3178であり、miR-4665-5pがhsa-miR-4665-5pであり、miR-6722-3pがhsa-miR-6722-3pであり、miR-30c-1-3pがhsa-miR-30c-1-3pであり、miR-4507がhsa-miR-4507であり、miR-3141がhsa-miR-3141であり、及び、miR-1199-5pがhsa-miR-1199-5pである、請求項11に記載の方法。 - 前記核酸が、下記の(e)~(l)に示すポリヌクレオチドからなる群から選択される、請求項11又は12に記載の方法:
(e)配列番号2~127、129~165、635~642、及び166~169のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、
(f)配列番号2~127、129~165、635~642、及び166~169のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(g)配列番号2~127、129~165、635~642、及び166~169のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、
(h)配列番号2~127、129~165、635~642、及び166~169のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(i)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、
(j)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(k)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、及び
(l)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド。 - 前記デバイスが、ハイブリダイゼーション技術による測定のためのデバイスである、請求項8~13のいずれか1項に記載の方法。
- 前記ハイブリダイゼーション技術が、核酸アレイ技術である、請求項14に記載の方法。
- 前記被験体が、ヒトである、請求項7~15のいずれか1項に記載の方法。
- 前記検体が、血液、血清又は血漿である、請求項7~16のいずれか1項に記載の方法。
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