CN110438225B - 一种肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力评价试剂盒 - Google Patents
一种肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力评价试剂盒 Download PDFInfo
- Publication number
- CN110438225B CN110438225B CN201910676494.8A CN201910676494A CN110438225B CN 110438225 B CN110438225 B CN 110438225B CN 201910676494 A CN201910676494 A CN 201910676494A CN 110438225 B CN110438225 B CN 110438225B
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- mir
- tumor
- expression level
- capacity
- cells
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Images
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
- A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
- A61P35/04—Antineoplastic agents specific for metastasis
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/158—Expression markers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/178—Oligonucleotides characterized by their use miRNA, siRNA or ncRNA
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Pathology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Oncology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明提供一种肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力评价试剂盒,其特征在于,包括:检测miR‑4665‑3p、miR‑135b‑5p、miR‑4739和/或miR‑6124表达水平的试剂。本发明还提供miR‑4665‑3p在制备抑制胃癌的细胞增殖和侵袭迁移能力的药物中的应用。本发明的肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力评价试剂盒,能够简单有效的判断胃癌细胞的侵袭迁移能力和/或增殖能力,帮助判断恶性程度和指导用药。
Description
技术领域
本发明涉及一种肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力评价试剂盒,属于生物检测领域。
背景技术
胃癌的发生是一个多步骤的生物学过程,它是全球癌症死亡的第二大原因,而且胃癌过程中侵袭和转移发生率很高。
大约50%的胃癌发生在亚洲,特别是在中国,日本和韩国。鉴于缺乏早期诊断的意识和有效方法,许多患者不幸在发现时就已是晚期,发生了广泛的侵袭和转移。即使采用全面的系统治疗,晚期胃癌患者仍然预后很差,5年总生存率低于20%。我们已知幽门螺旋杆菌感染以及许多遗传和环境因素都对胃癌的发生和发展有着至关重要的影响。考虑到胃癌的复杂过程和上述不理想的预后数据,提供一种能够诊断和降低胃癌细胞侵袭迁移和增殖能力的靶点成为当务之急。
发明内容
本发明的目的在于提供一种肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力评价试剂盒以对胃癌细胞的侵袭迁移和/或增殖能力做有效的评估。
本发明采用了如下技术方案:
一种肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力评价试剂盒,其特征在于,包括:检测miR-4665-3p表达水平的试剂。
进一步,本发明的肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力评价试剂盒,还具有这样的特征:其中,所述检测miR-4665-3p表达水平的试剂为RT-PCR检测的相关试剂。
进一步,本发明的肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力评价试剂盒,还具有这样的特征:其中,所述肿瘤为胃部肿瘤、胃部肿瘤细胞、肠部肿瘤或者肠部肿瘤细胞。
进一步,本发明的肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力评价试剂盒,还具有这样的特征:试剂盒中包含对照组为:未处理的AGS细胞的总RNA。
进一步,本发明的肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力评价试剂盒,还具有这样的特征:还包括:检测miR-135b-5p表达水平的试剂。
进一步,本发明的肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力评价试剂盒,还具有这样的特征:还包括:检测miR-4739表达水平的试剂。
进一步,本发明的肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力评价试剂盒,还具有这样的特征:还包括:检测miR-6124表达水平的试剂。
进一步,本发明的肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力评价试剂盒,其特征在于,还包括:
当检测到miR-4665-3p的表达水平为小于等于对照组的二分之一时,判断肿瘤迁移侵袭和增殖能力为强。
进一步,本发明的肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力评价试剂盒,其特征在于:
当检测到miR-135b-5p的表达水平为小于等于对照组的二分之一时,判断肿瘤迁移侵袭和增殖能力为强,
当检测到miR-4739的表达水平为小于等于正常水平的二分之一时,判断肿瘤增殖能力为强,
当检测到miR-6124的表达水平为大于等于正常水平的四倍时,判断肿瘤增殖能力为强。
本发明还提供miR-4665-3p在制备抑制胃癌的细胞增殖和侵袭迁移能力的药物中的应用。
发明的有益效果
本发明的肿瘤迁移侵袭和/或增殖能力评价试剂盒,能够简单有效的判断胃癌细胞的侵袭迁移和增殖能力,帮助判断恶性程度和指导用药。
另外,miR-4665-3p在制备抑制胃癌中的细胞侵袭迁移和增殖能力的药物中的应用,能够有效降低胃癌细胞的侵袭迁移能力和增殖能力,达到抑制肿瘤的效果。
附图说明
图1A是胃癌AGS细胞经硫化砷处理不同时段后miR-4665-3p表达水平的RT-PCR检测结果;
图1B是胃癌AGS细胞经硫化砷处理不同时段后miR-135b-5p表达水平的RT-PCR检测结果;
图1C是胃癌AGS细胞经硫化砷处理不同时段后miR-4739表达水平的RT-PCR检测结果;
图1D是胃癌AGS细胞经硫化砷处理不同时段后miR-6124表达水平的RT-PCR检测结果;
图2A是胃癌MGC803细胞经硫化砷处理不同时段后miR-4665-3p表达水平的RT-PCR检测结果;
图2B是胃癌MGC803细胞经硫化砷处理不同时段后miR-135b-5p表达水平的RT-PCR检测结果;
图2C是胃癌MGC803细胞经硫化砷处理不同时段后miR-4739表达水平的RT-PCR检测结果;
图2D是胃癌MGC803细胞经硫化砷处理不同时段后miR-6124表达水平的RT-PCR检测结果;
图3A是肠癌HCT116细胞经硫化砷处理不同时段后miR-4665-3p表达水平的RT-PCR检测结果;
图3B是肠癌HCT116细胞经硫化砷处理不同时段后miR-135b-5p表达水平的RT-PCR检测结果;
图3C是肠癌HCT116细胞经硫化砷处理不同时段后miR-4739表达水平的RT-PCR检测结果;
图3D是肠癌HCT116细胞经硫化砷处理不同时段后miR-6124表达水平的RT-PCR检测结果;
图4A是RT-PCR检测胃癌组织与相应癌旁组织的miR-4665-3P的表达水平差异;
图4B是早期与晚期胃癌组织样本中miR-4665-3P的表达水平差异;
图5A是AGS细胞转染miR-4665-3Pmimics后迁移能力及统计结果;
图5B是MGC803细胞转染miR-4665-3Pmimics后迁移能力及统计结果;
图5C是AGS细胞转染miR-4665-3Pmimics后侵袭能力的实验结果;
图5D是MGC803细胞转染miR-4665-3P mimics后侵袭能力的实验结果;
图6A是AGS细胞转染miR-4665-3P mimics后抑制细胞上皮间充质转化(EMT)的细胞形态学影响;
图6B是MGC803细胞转染miR-4665-3P mimics后抑制细胞发生EMT转变的细胞形态学影响;
图6C是AGS细胞转染miR-4665-3P mimics后侵袭相关蛋白表达的变化;
图6D是MGC803细胞转染miR-4665-3P mimics后侵袭相关蛋白表达的变化;
图7A是miR-135b-5p和miR-4665-3p对AGS细胞中NFATc3、P53和c-myc的影响;
图7B是miR-135b-5p和miR-4665-3p对MGC803细胞中NFATc3、P53和c-myc的影响;
图7C是miR-135b-5p和miR-4665-3p对MGC803细胞中NFATc4和NFATc2的影响;
图7D是miR-4739和miR-6124对MGC803细胞中NFATc4、NFATc3和NFATc2的影响;
图8A是miR-135b-5p和miR-4665-3p对AGS细胞增殖的影响;
图8B是miR-4739和miR-6124对AGS细胞增殖的影响;
图8C是miR-135b-5p和miR-4665-3p对MGC803细胞增殖的影响;
图8D是miR-4739和miR-6124对MGC803细胞增殖的影响。
具体实施方式
以下结合附图来说明本发明的具体实施方式。本文中所使用的名词:硫化砷,均指化学式为As4S4的化合物。
一:基因芯片检测:
1.样本准备
1)胃癌细胞株AGS分为空白对照组及1μM硫化砷分别处理2h、6h、12h、24h组,其中取空白对照组及1μM硫化砷处理12h组进行基因芯片检测。
2)细胞培养诱导结束后,控干去除培养液;
2)按每10cm2(相当于六孔板一个孔或35mm直径培养皿)细胞加1mL TRIzol试剂的比例加入TRIzol试剂;
3)使用玻璃滴管(或移液器Tip头)反复吹打细胞,直至看不见成团的细胞块,使之充分溶解于TRIzol中形成清亮不粘稠的液体;
4)将TRIzol液体全部转移到RNase-free的试管中
5)放入-80℃冰箱中保存。
2.样本质检
样品总RNA利用NanoDrop ND-2000(Thermo Scientific)定量并经AgilentBioanalyzer 2100(Agilent Technologies)检测RNA完整性。
3.安捷伦miRNA芯片
芯片杂交的操作流程:
取100ng total RNA起始,定容到2μL
1.1去磷酸化:
按下表所示的顺序配制去磷酸化混合液:
CIP Master Mix | 1× | 9× |
10×Calf Interinal Phosphatase Buffer | 0.4μl | 3.6μl |
Labeling Spike-In | 1.1μl | 9.9μl |
Calf Intestinal Phosphatase | 0.5μl | 4.5μl |
total | 2μl | 18μl |
2.PCR仪反应:
37℃ 30min
1.2样品变性:
在每管样品中添加2.8μL 100%DMSO,混匀离心;
将上述反应混合液置于100℃PCR仪中5-10分钟(7分钟);
迅速转入冰水浴中冷却。
1.3连接标记:
1.3.1将10×T4 RNA Ligase Buffer置于37℃温育并间隔涡旋,直至沉淀全部溶解,然后将其冷却至室温备用。
1.3.2按下表配制连接反应混合液:
Ligation Master Mix | 1× | 9× |
10×T4 RNA Ligase Buffer | 1μl | 9μl |
Cy3-pCp | 3μl | 27μl |
T4 RNA Ligase | 0.5μl | 4.5μl |
total | 4.5μl | 40.5μl |
1.3.3 PCR反应:16℃温育2小时。
1.3.4标记后RNA纯化:
Purify labeled RNA | |
remove to 2ml tube | |
1000×g | 2min |
remove to 1.5ml tube | |
add 38.7μl RF water to sample | →50μl |
1000×g | 4min |
close to 50μl |
1.3.5纯化后样品抽干:
1)45℃浓缩1小时(如未经纯化的样品45℃浓缩3小时)
2)将抽干的样品重新溶解在17μL无核酸酶的水中
1.3.6准备10×Blocking Agent:
1)在冻干的10×GE Blocking Agent管中加入125μL无核酸酶的水,轻微涡旋,以使其完全溶解,必要时可将其置于37℃温育4-5分钟。
2)稍离心,放置备用。配制好的10×GE Blocking Agent可放置在-20℃保存2个月,每次融化使用时,注意涡旋混匀并离心。
1.3.7准备杂交反应:
1)配置反应体系
Hybridization Mix | |
sample | 17μl |
Hyb Spike-In | 1μl |
10×GE Blocking Agent | 4.5μl |
2×Hi-RPM Hybridization Buffer | 22.5μl |
total | 45μl |
2)反应条件:
100℃ 5min
ice-water 5min
3)上芯片,55℃20小时,20rpm滚动杂交
芯片洗涤
2.1取出芯片并于Agilent Gene Expression Wash Pack洗液1中洗涤5分钟;
2.2再将芯片放入Agilent Gene Expression Wash Pack洗液2中洗涤5分钟(37℃)。芯片扫描
Agilent扫描仪中选择相应的参数扫描.
结果分析如图1A至图1D所示。
二:对基因芯片结果进行验证
1.胃癌细胞株MGC803分为空白对照组及1μM硫化砷分别处理2h、6h、12h、24h组,同时对结肠癌细胞株HCT116分为空白对照组及5μM硫化砷分别处理2h、6h、12h、24h组,行上述样本准备操作。
2.进行PT-PCR(实时定量荧光PCR)对上述芯片筛选的结果进行验证。
PT-PCR(实时定量荧光PCR)的步骤如下:
(一)样品RNA的抽提
事先准备冰,75%的乙醇,1.5ml离心管放入冰中冷却备用,离心机提前预冷,操作带口罩。
1.每孔细胞中加入1ml的Trizol,消化,移入冷却好的EP管中,离心去沉淀。
2.两相分离:按Trizol:氯仿=5:1的比例,即每1ml的TRIZOL试剂裂解的样品中加入0.2ml的氯仿,盖紧管盖。剧烈振荡管体15s后,室温静置5min。
3.4℃下12000rpm离心15分钟。
4.离心后吸水相上层加入新的EP管中,200μl-400μl,再加等体积异丙醇混合以沉淀其中的RNA,颠倒混匀15s,室温静置10min。
5.4℃下12000rpm离心10分钟。此时离心前不可见的RNA沉淀将在管底部和侧壁上形成胶状沉淀块。
6.移去上清液(注意用枪头吸,不要倒掉),加入与最初TRIZOL等量的75%乙醇,轻轻颠倒,洗净瓶壁。
7.4℃下12000rpm离心5分钟。
8.弃上清,弃掉残余(用200μl枪吸掉大部分乙醇溶液),倒置晾干,使RNA沉淀在室温空气中干燥5-10分钟。
9.加入20μl DPEC水用枪反复吹打几次,使其完全溶解,获得的RNA溶液可保存于-80℃待用。
(二)RNA质量检测
RNA溶液的A260/A280的比值即为RNA纯度,比值范围1.8到2.1。
(三)逆转录
20μl体系:
RNA量=1000μg/浓度(X);
MiXed RT试剂=4μl;
不含RNA酶的ddH2O=(16-X)μl;
先离心,震荡混匀,再离心;
数值:
Stage I 37℃*15:00min
Stage II 85℃*0.05s
Stage III 4℃
(四)Realtime-PCR
反应体系如表1所示:
表1:标准品反应体系(20μl体系)
序号 | 反应物 | 剂量 |
1 | SYBR premix Ex Taq II(2×) | 10μl |
2 | 阳性模板上游引物F | 0.4μl |
3 | 阳性模板下游引物R | 0.4μl |
4 | Rox Reference DyeIl(50×) | 0.4μl |
5 | <![CDATA[ddH<sub>2</sub>O]]> | 6.8μl |
6 | 阳性模板DNA | 2μl |
2.上机步骤如下表
表2:上机步骤表
结果如图2A至图2D和图3A至图3D所示。
三:转染
1.AGS、MGC803细胞分别铺于6孔板,每孔2000μL,每个细胞单个复孔,37℃,5%CO2培养过夜,第二天待细胞贴壁70-90%转染。
2.转染试剂的准备:将3ug mimics溶于125μL opti-mem无血清培养基,10μL转染试剂lipo2000溶于125μL opti-mem无血清培养基,静置5min后混合放置30min.
3.转染期间,将6孔板中的培养基换为无血清培养基,并将上述混合物加入培养基中,混匀。
4.将细胞放回培养箱中培养4-6h后加入完全培养基继续培养24-48小时。
四.MTT
1.AGS、MGC803细胞分为空白对照组、阴性对照组及相关miRNA转染组,用含10%胎小牛血清得培养液配成单个细胞悬液,以每孔2000个细胞接种到96孔板,每孔体积100μL。
2.培养细胞同一般培养条件,培养3-5天(可根据试验目的和要求决定培养时间)。分别在24h、48h、72h每孔加MTT溶液(5mg/mL用PBS配)10μL。
3.继续孵育4小时,终止培养。每孔加150μLDMSO,振荡10min,使结晶物充分融解。
4.比色选择490nm波长,在酶联免疫监测仪上测定各孔光吸收值,记录结果,以时间为横坐标,吸光值为纵坐标绘制细胞生长曲线。
使用四种miRNA转染相应的mimics或inhibitor后做MTT,看其与增殖的相关性,结果如图8A-8D,两株细胞综合分析,miR-4739和miR-6124对细胞增殖的影响较大。
五:划痕实验观察对细胞迁移能力的影响
1.将细胞密度为5~10×105个/mL的AGS、MGC803细胞分别铺于24孔板(每孔500μL)上,分为空白对照组、阴性对照组及相关miRNA转染组,每组设置三个复孔,然后分别加入含10%胎牛血清的F12、RMPI.1640培养液,培养16~24h,使形成单层细胞。
2.用10μL移液枪枪头(或者无菌牙签)在单层细胞上呈“十”字划痕,用PBS清洗3次,换成含10%胎牛血清的F12、RMPI.1640培养液。
3.观察并拍照:吸去培养液,用PBS清洗3次后,分别于0h、24h、48h在倒置荧光显微镜下观察并拍照。
结果如图5A和5B所示。
六:Transwell侵袭实验观察对细胞侵袭能力的影响
1.所有细胞培养试剂和Transwell小室放在37℃温育。
2.AGS、MGC803细胞分为空白对照组、阴性对照组及相关miRNA转染组,待细胞培养至对数生长期,消化细胞,用PBS和无血清培养基先后洗涤一次,用无血清培养基悬浮细胞,计数,调整浓度为2×105/mL。
3.在下室(即24孔板底部)加入600-800μL含10%血清的培养基,上室加入100-150μL细胞悬液,继续在孵箱培养24小时。
4.用镊子小心取出小室,吸干上室液体,移到预先加入约800μL甲醇的孔中,室温固定30min。
5.取出小室,吸干上室固定液,移到预先加入约800μL Giemsa染液的孔中,室温染色15-30min。
6.轻轻用清水冲洗浸泡数次,取出小室,吸去上室液体,用湿棉棒小心擦去上室底部膜表面上的细胞。
7.将小室移至载玻片上。显微镜下取9个随机视野计数,统计结果。
结果如图5C和5D所示。
七:细胞形态观察
1.AGS、MGC803细胞分为空白对照组、阴性对照组及相关miRNA转染组。
2.转染24h后弃去细胞培养基,PBS洗去细胞碎片,置于显微镜下观察并拍照。结果如图6A和图6B所示。
八:Western检测蛋白表达
1.AGS、MGC803细胞分为空白对照组、阴性对照组及相关miRNA转染组,取出细胞,弃去细胞培养基,PBS洗去细胞碎片,将细胞放于冰上。
2.加入适量预冷的含蛋白酶抑制剂(PMSF)的蛋白裂解液。对于6cm的细胞培养盘,每孔加入150μl。
3.冰上裂解细胞10-15min,用预冷的刮刀将细胞刮下。将样品转移入Ep管中。
4.超声破碎仪破碎细胞。
5. 4℃,14000转,离心15min。
6.取上清,采用BCA Protein Assay Kit测蛋白浓度后,向蛋白中加入1/5体积的5×上样缓冲液,煮沸10min。
7.根据不同蛋白的分子量,准备不同百分比的SDS-PAGE胶。一般上样总蛋白的范围在20-40μg之间。
8.将胶板装入垂直电泳槽内,检查胶板和电极架的密合度,在内池中灌满电泳液,注意不要漏液。漏液会导致各泳道之间不齐,溴酚兰带会呈“︵”或“︶”等形状。取出梳齿。
9.根据上样量计算上样体积,并用1×上样缓冲液补齐。
10.上样结束后,接上电源,将电源设为恒流300mA输出,电压80mV,待跑齐后,可改为120mV,正常情况下,电泳可以在2个小时内结束。
11.电泳结束后,将胶板卸下,同时准备好电转移所需的滤纸,PVDF膜,预冷电转移槽和电转液。用100%甲醇将PVDF膜浸湿。
12.在一个容器中倒入1000ml左右的转膜液,在转膜液中将滤纸,胶和膜叠成三明治状。从黑色负极方向到白色正极方向的顺序分别为:滤纸-胶-PVDF膜-滤纸。
13.将电转移夹插入电转移槽中,注意将靠膜的一面朝向正极,靠胶的一面朝向负极。同时插入内置的冰盒。电转移的条件设定为恒流300mA。
14.电转结束后,取出PDVF膜,可以发现原本在胶上的Marker,现在已经被转移到了膜上。立即将PVDF膜浸泡入5%的脱脂牛奶中,勿使膜变干,室温封闭PVDF膜1小时。
15.一抗孵育:用一抗稀释液稀释一抗,稀释的倍数可以参考抗体供应商的建议。4℃孵育过夜。
16.洗膜:TBST缓冲液洗膜3次,每次10分钟。二抗孵育:用含5%脱脂牛奶的TBST稀释与一抗相应的红外染料标记的二抗。于室温下孵育1小时。然后再洗膜三次,每次10min。
17.采用GelDoc XR System进行成像。
结果如图6C和图6D所示。
同样采用Western对miRNA转染后的AGS、MGC803细胞中的NFATc2、NFATc3、NFATc4、P53和c-myc进行检测。结果如图7A至图7D所示。
九:使用RT-PCR检测胃癌组织与癌旁组织的miR-4665-3p表达量
其中样品RNA的抽提、RNA质量检测及上机操作步骤与上述RT-PCR步骤相同,不同之处在于miRNA逆转录。
逆转录
20μl体系:
2×miRNA RT Solution mix 10μl
miRNA RT Enzyme mix 2μl
Total RNA/micro RNA 2μg/100ng
RNase-free water定容至20μl
先离心,震荡混匀,再离心;
数值:
Stage I 37℃*60:00min
Stage II 85℃*5min
Stage III 4℃
其相对表达数据如表3。
表3:癌组织与癌旁组织miR-4665-3p相对表达量表
癌旁 | 癌 |
4.725738 | 1 |
1.53 | 1 |
1.872 | 1 |
3.172867 | 1 |
2.857143 | 1 |
12.91667 | 1 |
6.390728 | 1 |
6.390728 | 1 |
2.212693 | 1 |
1.75 | 1 |
5.539359 | 1 |
4.986111 | 1 |
4.909091 | 1 |
6.909091 | 1 |
0.303571 | 1 |
2.830189 | 1 |
0.587002 | 1 |
1.159091 | 1 |
6.610169 | 1 |
4 | 1 |
0.536278 | 1 |
1.377593 | 1 |
0.676349 | 1 |
1.091503 | 1 |
1.284404 | 1 |
5.424658 | 1 |
3.373 | 1 |
2.27191 | 1 |
3.352381 | 1 |
8.630952 | 1 |
2.581 | 1 |
结果如图4A。
对不同期别的胃癌进行分组,如表4。
表4:△CT(miR-4665-3p在不同期别胃癌标本中的表达量)
IV期 |
0.0168 |
0.0125 |
0.00686 |
0.0168 |
0.089 |
0.218 |
0.0053 |
0.0144 |
0.011 |
0.056 |
I-II期 |
0.0237 |
0.0604 |
0.0317 |
0.0504 |
0.0583 |
0.011 |
0.0059 |
0.0135 |
0.059 |
0.105 |
结果如图4B。
Claims (7)
1.检测miR-4665-3p表达水平的检测试剂在制备评价肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力的检测试剂盒上的应用,其特征在于:
所述检测试剂盒,包含检测miR-4665-3p表达水平的检测试剂;
所述检测试剂盒,将检测到的miR-4665-3p的表达水平与对照组进行比对,当检测到的miR-4665-3p的表达水平为小于等于对照组的二分之一时,判断肿瘤迁移侵袭能力为强;
所述肿瘤为胃部肿瘤、胃部肿瘤细胞、肠部肿瘤或者肠部肿瘤细胞。
2.如权利要求1所述的检测miR-4665-3p表达水平的检测试剂在制备评价肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力的检测试剂盒上的应用,其特征在于:
其中,所述用于检测miR-4665-3p表达水平的检测试剂为RT-PCR检测的相关试剂。
3.如权利要求1所述的检测miR-4665-3p表达水平的检测试剂在制备评价肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力的检测试剂盒上的应用,其特征在于:
所述对照组为未处理的AGS细胞的总RNA。
4.检测miR-135b-5p表达水平的检测试剂在制备评价肿瘤增殖能力的检测试剂盒上的应用,其特征在于:
所述检测试剂盒,包含检测miR-135b-5p表达水平的检测试剂;
所述检测试剂盒,将检测到的miR-135b-5p的表达水平与对照组进行比对,当检测到的miR-135b-5p的表达水平为小于等于对照组的二分之一时,判断肿瘤增殖能力为强;
所述肿瘤为胃部肿瘤、胃部肿瘤细胞。
5.检测miR-6124表达水平的检测试剂在制备评价肿瘤增殖能力的检测试剂盒上的应用,其特征在于:
所述检测试剂盒,包含检测miR-6124表达水平的检测试剂;
所述检测试剂盒,将检测到的miR-6124的表达水平与对照组进行比对,当检测到miR-6124的表达水平为大于等于正常水平的四倍时,判断肿瘤增殖能力为强;
所述肿瘤为胃部肿瘤、胃部肿瘤细胞。
6.检测miR-4739表达水平的检测试剂在制备评价肿瘤增殖能力的检测试剂盒上的应用,其特征在于:
所述检测试剂盒,包含检测miR-4739表达水平的检测试剂;
所述检测试剂盒,将检测到的miR-4739的表达水平与对照组进行比对,当检测到miR-4739的表达水平为小于等于正常水平的二分之一时,判断肿瘤增殖能力为强;
所述肿瘤为胃部肿瘤、胃部肿瘤细胞。
7.miR-4665-3p在制备抑制胃癌的细胞增殖和侵袭迁移能力的药物中的应用。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201910676494.8A CN110438225B (zh) | 2019-07-25 | 2019-07-25 | 一种肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力评价试剂盒 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201910676494.8A CN110438225B (zh) | 2019-07-25 | 2019-07-25 | 一种肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力评价试剂盒 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN110438225A CN110438225A (zh) | 2019-11-12 |
CN110438225B true CN110438225B (zh) | 2023-05-12 |
Family
ID=68431514
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201910676494.8A Active CN110438225B (zh) | 2019-07-25 | 2019-07-25 | 一种肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力评价试剂盒 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN110438225B (zh) |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN106459867A (zh) * | 2014-06-18 | 2017-02-22 | 东丽株式会社 | 肝癌的检测试剂盒或装置以及检测方法 |
CN106460068A (zh) * | 2014-06-16 | 2017-02-22 | 东丽株式会社 | 胃癌的检测试剂盒或装置以及检测方法 |
Family Cites Families (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN103505743A (zh) * | 2012-06-21 | 2014-01-15 | 北京命码生科科技有限公司 | 含功能性microRNA/siRNA的细胞微粒子及其应用 |
-
2019
- 2019-07-25 CN CN201910676494.8A patent/CN110438225B/zh active Active
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN106460068A (zh) * | 2014-06-16 | 2017-02-22 | 东丽株式会社 | 胃癌的检测试剂盒或装置以及检测方法 |
CN106459867A (zh) * | 2014-06-18 | 2017-02-22 | 东丽株式会社 | 肝癌的检测试剂盒或装置以及检测方法 |
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
Arsenic sulfide inhibits cell migration and invasion of gastric cancer in vitro and in vivo;Lian Zhang等;《Drug Design, Development and Therapy》;20151009;第9卷;全文 * |
miR-135b-5p promotes gastric cancer progression by targeting CMTM3;Mingdong Lu等;《INTERNATIONAL JOURNAL OF ONCOLOGY》;20181231;第52卷;摘要、讨论 * |
miR-135b-5p调控TIMP3的表达对鼻咽癌细胞迁移和侵袭的影响;赵辉等;《临床和实验医学杂志》;20181110(第21期);全文 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN110438225A (zh) | 2019-11-12 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN107012145B (zh) | 一种长非编码rna及其在诊断/治疗胆管癌中的应用 | |
CN108660214B (zh) | 检测circ_CLASP2的试剂在制备鼻咽癌诊断制剂中的应用及试剂盒 | |
CN109097477A (zh) | 一种用于乳腺癌诊断的circRNA标志物及其应用 | |
CN107475440A (zh) | 一种血浆外泌体生物标志物在乳腺癌诊断中的应用 | |
Matossian et al. | In-depth characterization of a new patient-derived xenograft model for metaplastic breast carcinoma to identify viable biologic targets and patterns of matrix evolution within rare tumor types | |
CN109022580B (zh) | 一种作为犬乳腺肿瘤诊断标志物的犬环状rna基因 | |
CN110438225B (zh) | 一种肿瘤迁移侵袭能力和/或增殖能力评价试剂盒 | |
Rani | MicroRNA profiling of exosomes isolated from biofluids and conditioned media | |
CN117286251A (zh) | 生物标志物nedd4在小细胞肺癌中的应用 | |
CN116165383A (zh) | 一种子宫内膜癌诊断标志物及其应用 | |
CN106755406A (zh) | 一种卵巢癌检测产品及试剂盒 | |
CN106544421A (zh) | Spag6基因作为卵巢肿瘤诊断和治疗标志物的用途 | |
CN112430663B (zh) | 一种用于膀胱癌诊治的生物标志物及其应用 | |
CN115252637B (zh) | 一种具有抑制肝癌转移功能的基因抑制剂 | |
CN109852692B (zh) | circ_3480及其在制备鼻咽癌诊断制剂中的应用和诊断试剂 | |
KR20150059449A (ko) | 광분해성 폴리머를 이용한 세포의 가역적 고정 또는 선택적 용해 방법 | |
CN108531486A (zh) | 一种犬环状rna基因作为犬乳腺肿瘤诊断标志物的应用 | |
CN111996252A (zh) | Dyrk2基因在制备胃癌药物及其诊断试剂盒中的应用 | |
CN105483255A (zh) | Top2a基因检测探针及其制备方法和试剂盒 | |
CN104388541B (zh) | miR‑1914*和miR‑1915的用途 | |
CN104740649B (zh) | Plekha5在制备肿瘤诊断试剂中的应用 | |
CN116200488B (zh) | LncRNA RPAR在胶质瘤诊治中的应用 | |
CN109762818B (zh) | circ_2157及其在制备鼻咽癌诊断制剂中的应用和诊断试剂 | |
CN109758472B (zh) | circ_2157在制备鼻咽癌治疗制剂中的应用和治疗制剂 | |
CN114113603B (zh) | Cytl1作为胃癌预后标志物的应用 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant |