JP7291395B2 - IgG結合ペプチド、及び該ペプチドによる抗体の特異的修飾 - Google Patents
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Description
(1)(Xaa1)NMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNA(Xaa2)I(Xaa3)SIRDDC(配列番号1)、
(Xaa4)FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNA(Xaa2)I(Xaa3)SIRDDC(配列番号2)、又は配列番号1若しくは2のアミノ酸配列において、Xaa1~Xaa4以外の位置で1若しくは数個のアミノ酸が付加、欠失、及び/又は置換されたアミノ酸配列を含み、
Xaa1は、リシン残基、オルニチン残基、システイン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、及びジアミノプロピオン酸残基からなる群から選択され、
Xaa2及びXaa3は、それぞれ独立に、アルギニン残基、ヒスチジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、セリン残基、トレオニン残基、アスパラギン残基、グルタミン残基、チロシン残基、及びシステイン残基からなる群から選択され、
Xaa4は、グリシン残基、アラニン残基、バリン残基、ロイシン残基、イソロイシン残基、メチオニン残基、プロリン残基、フェニルアラニン残基、トリプトファン残基、リシン残基、オルニチン残基、システイン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、βアラニン残基、2-アミノスベリン酸残基、ジアミノプロピオン酸残基、及びNH2-(PEG)n-CO(n=1~50)からなる群から選択されるか、又は存在しない、
ペプチド、IgG結合ペプチド、又はIgG結合用ペプチド。
(2)Xaa1がリシン残基、オルニチン残基、システイン残基、及びジアミノプロピオン酸残基からなる群から選択される、(1)に記載のペプチド。
(3)Xaa1がリシン残基である、(2)に記載のペプチド。
(4)Xaa4がグリシン残基、アラニン残基、βアラニン残基、及びNH2-(PEG)n-CO(n=1~50)からなる群から選択されるか、又は存在しない、(1)~(3)のいずれかに記載のペプチド。
(5)Xaa4がグリシン残基であるか、又は存在しない、(4)に記載のペプチド。
(6)Xaa2及びXaa3が、それぞれ独立に、アルギニン残基、ヒスチジン残基、及びグルタミン酸残基からなる群から選択される、(1)~(5)のいずれかに記載のペプチド。
(7)Xaa2及びXaa3がアルギニン残基である、(6)に記載のペプチド。
(8)配列番号1の5位のシステイン残基と34位のシステイン残基、及び配列番号2の6位のシステイン残基と35位のシステイン残基がジスルフィド結合又はリンカーを介して連結されている、(1)~(7)のいずれかに記載のペプチド。
(9)FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号9)、
GFNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号7)、
KNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号4)、
GFNMQCQKRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号5)、
KNMQCQKRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号6)、
FNMQQQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDD(配列番号10)、又は
GKNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号11)のアミノ酸配列を含む、(1)~(8)のいずれかに記載のペプチド。
(10)標識物質又は薬剤が結合している、(1)~(9)のいずれかに記載のペプチド。
(11)配列番号1の7位のR若しくは配列番号2の8位のRがリシン残基に置換されているか、配列番号1若しくは配列番号2のC末端にリシン残基をさらに含む、(1)~(10)のいずれかに記載のペプチド。
(12)標識物質又は薬剤が、置換リシン残基又はC末端のリシン残基に結合している、(11)に記載のペプチド。
(13)N末端のアミノ酸がアセチル化又はアミノ化されている、(1)~(11)のいずれかに記載のペプチド。
(14)C末端のアミノ酸がアミド化されている、(1)~(13)のいずれかに記載のペプチド。
(15)Xaa1及びXaa4が、架橋剤で修飾されているか、又はXaa4が存在しない場合には、配列番号2の1位のフェニルアラニンが架橋剤で修飾されている、(1)~(14)のいずれかに記載のペプチド。
(16)前記架橋剤が、DSG(ジスクシンイミジルグルタレート)、DSS(ジスクシンイミジルスベレート)、DMA(アジプイミド酸ジメチル二塩酸塩)、DMP(ピメルイミド酸ジメチル二塩酸塩)、DMS(スベルイミド酸ジメチル二塩酸塩)、DTBP(3,3'-ジチオビスプロピオンイミド酸ジメチル二塩酸塩)、及びDSP(ジチオビススクシンイミジルプロピオン酸)からなる群より選択される、(15)に記載のペプチド。
(17)前記架橋剤がDSG(ジスクシンイミジルグルタレート)又はDSS(ジスクシンイミジルスベレート)である、(16)に記載のペプチド。
(18)(15)~(17)のいずれかに記載のペプチドとIgGとの架橋複合体。
(19)(15)~(17)のいずれかに記載のペプチドとIgGを混合し、架橋剤で修飾されているペプチドとIgGを架橋反応させる工程を含む、ペプチドとIgGの複合体を生産する方法。
(20)(1)~(17)のいずれかに記載のペプチド、又は(18)に記載の複合体を含む、医薬組成物。
本明細書中で使用する「IgG」は、哺乳動物、例えばヒト及びチンパンジーなどの霊長類、ラット、マウス、及びウサギ等の実験動物、ブタ、ウシ、ウマ、ヒツジ、及びヤギ等の家畜動物、並びにイヌ及びネコ等の愛玩動物のIgG、好ましくはヒト、マウス、ラット、又はウサギ、さらに好ましくはラット又はマウスのIgGを指すものとする。IgGのサブクラスは限定しないが、例えばヒトIgG1、IgG2、IgG3、IgG4(好ましくはヒトIgG1、IgG2、又はIgG4)、マウスIgG1、マウスIgG2a、マウスIgG2b、マウスIgG3(好ましくはマウスIgG2a、マウスIgG2b、マウスIgG3)、ラットIgG1、ラットIgG2a、ラットIgG2b、ラットIgG3(好ましくはラットIgG1又はラットIgG2c)、及びウサギIgGが挙げられる。
以下の式:
システイン残基を2つ含むペプチドと、上記リンカーの波線部分に架橋反応に関与する反応性の官能基(例えば、ハロゲン基、イミダゾール基等)を有する化合物を、例えば酸性条件下で混合する工程を含む方法により得ることができる。
一態様において、本発明における上記IgG結合ペプチドは、架橋剤により修飾されていることが好ましい。
一態様において、本発明は、本発明の架橋剤で修飾されているIgG結合ペプチドとIgGを混合する工程を含む、IgG結合ペプチドとIgGの複合体を生産する方法に関する。本工程により、架橋剤で修飾されているIgG結合ペプチドとIgGの間で架橋反応が生じ得る。架橋反応は、特にIgG結合ペプチドの上記Xaa1又はXaa4のアミノ酸残基とIgG FcのLys248の間で部位特異的に生じ得る。
一態様において、本発明は、本発明のIgG結合ペプチドとIgGとの架橋複合体に関する。該複合体は、上記架橋反応によって形成され得る。よって、本発明は、好ましくは、IgG結合ペプチドの上記Xaa1又はXaa4のアミノ酸残基とIgG FcのLys248との間が部位特異的に架橋剤を介して結合したIgG結合ペプチドとIgGとの複合体に関する。
一態様において、本発明は上記IgG結合ペプチド、上記架橋剤で修飾されたIgG結合ペプチド、又は上記架橋剤で修飾されたIgG結合ペプチドとIgGの複合体を含む医薬組成物又は診断剤に関する。医薬組成物に含まれる場合、IgG結合ペプチドは、例えば上記の薬剤により修飾されていることが好ましく、診断剤に含まれる場合、IgG結合ペプチドは、例えば上記の標識物質により修飾されていることが好ましい。
抗体
Trasutumab(Human IgG1)は中外製薬より、Human IgG2 kappa Isotype Control、Human IgG3 kappa Isotype Control、Human IgG4 kappa Isotype Control、Mouse IgG1 kappa Isotype Control、Mouse IgG2b kappa Isotype Control、Mouse IgG3 kappa Isotype Controlは、Crown Bioscience社より購入した。また、Rabbit IgG Isotype ControlはThermo fisherより、Rat IgG1 Isotype Control, Rat IgG2b Isotype Controlは、R&D Systems社より、Rat IgG2c Isotype Control Antibodyは、LifeSpan BioSciencesより、それぞれ入手した。各抗体は、パウダーを、0.5M NaClで2.0mg/mLに希釈し、使用まで、凍結して保存した。
Z34Cペプチド変異体は、F-moc法による固相合成により調製した。合成後のZ34C誘導ペプチド5.5mg(1.29μmol)を、10μLのジメチルスルホキシド(DMSO)(Wako)に溶解させ、これに190μLの0.1M NaHCO3水溶液を加え、室温で一晩放置し、分子内SS結合を形成させた。その後、サンプルを0.1%TFAを含む1%アセトニトリル3mLに希釈し、全量を分取用クロマトグラフLC-forte/R(YMC)にアプライした。0.1%TFAを含む10-60%アセトニトリル/水のグラジエントで溶出を行い、その後、有機溶媒を減圧下で除去後、凍結乾燥した。
反応生成物の構造確認は、反応液0.1μLを4000倍に0.1%ギ酸水溶液で希釈し、そのうち18μLを、kinetex(登録商標)LCカラム(1.7μm、EVO C18 100オングストローム、Phenomenex)を接続したLCMS-8030(Shimadzu)上にアプライした。流速は0.2mL/minにて0.1%ギ酸を含む10-50%アセトニトリル/水のグラジエント溶出を行い、得られたピークの質量を解析することにより確認した。
Z34C変異体のモデリング並びに修飾部位のデザインは、分子構造計算ソフトウェアMOE(The Molecular Operating Environment、CCG)を用いて行った。ヒトIgG1-FcとZ34Cペプチドの結晶構造(PDB ID :1OQO)をベースに、ペプチド上の変異部位の探索を行い、モデリングはProtein Builderのツールを用いて行った。
Z34Cペプチド変異体のN末αアミノ基もしくはLysのεアミノ基のDSG(N,N’-Disuccimidyl glutarate)による修飾は、以下の方法で行った。1-2mgのペプチドを40μLのDMSOに溶解後、0.1%ピリジンを加え、アセトニトリルに溶解した500mMのDSGを20μL加え、50℃にて4.5時間反応した。反応物は、0.1%TFAを含む1%アセトニトリル3mLに希釈し、全量を分取用クロマトグラフLC-forte/R(YMC)にアプライした。0.1%TFAを含む10-60%アセトニトリル/水のグラジエントで溶出を行い、その後、有機溶媒を減圧下で除去後、凍結乾燥し、サクシイミジルグルタル(SG)化したZ34Cペプチド変異体を得た。
Z34Cペプチド変異体親和性解析は、25℃にてBIAcore T-200(GE-Healthcare)上にて行った。すなわち、CM5センサーチップ上に、Trastuzumab(ヒトIgG1抗体)又はその他の抗体を、アミンカップリングのプロトコールに従い、RU値で約2000程度固定化した。HBS-EP緩衝液中、流速50μL/minの条件で、アナライトとして1μMから0.015μMまで計7点の異なる濃度のペプチドをインジェクトすることでセンサーグラム(会合時間: 180 sec、解離時間: 600sec)を得、付属のBIA evaluation softwareを用いて、平衡値解析から解離定数(Kd)を算出した。
10mM酢酸緩衝液(pH.5.5)14μLに溶解した各種抗体3.0μg(0.2nmol)に、DMSOに1.5mMになるように溶解したSG化Z34Cペプチド変異体ペプチドを1.33μL(10倍モル等量、2nmol)加え、室温で30分静置した。このサンプル14.4μLに2-メルカプトエタノール0.6μL(Wako)およびSDS-PAGEサンプルバッファー(4×)5μLを加え、全量で20μL(3% 2-メルカプトエタノール)とした。95℃にて10分間加熱して還元後、Super Sep TM Ace(5-20%、13well、Wako 197-15011)にて、200V,20mAで約90分間電気泳動を行った。得られたゲルの蛋白質は、CBB(Coomassie Brilliant Blue)染色を行い、検出した。
マウスIgG1、IgG2b、及びヒトIgG3(いずれもニワトリ卵白リゾチームを抗原として認識)、並びに抗HER2抗体であるTrastuzumab(ヒトIgG1)を10mM酢酸緩衝液(pH5.5)中に溶解し(最終濃度2.5μM)、DMSOに溶解したペプチド試薬αZ34C 7K、εZ34C 7Kを10倍等量加え、室温にて30分反応させた。1/10体積の1M Tris-HCl(pH8.0)を加え反応を停止させ、0.5%BSAを含むPBSにて5000倍に希釈後、ELISAに使用した。抗原であるリゾチームをPBSにて200μg/L、100μg/L、50μg/Lとなるように希釈し、各ウェルをコートした(2時間)。次に、0.5%BSAを含むPBS溶液でブロックし、洗浄後、各ウェルに、希釈した抗体溶液50μLを加え、1時間反応させた。洗浄後、ウェルに0.5%BSAを含むPBS溶液で5000倍に希釈したSA-HRP(Vector)を加え、反応後、洗浄し、TMB試薬を加え発色させた。
<実施例1:Z34Cペプチドをベースにした置換ペプチドの調製>
ヒトIgG1-FcとZ34CペプチドのX線結晶構造(PDB ID:1OQO、10)をベースに、ヒトIgG1-Fc中のLys248と近位のZ34Cペプチド上のアミノ酸残基を探したところ、N末端のフェニルアラニンの側鎖が、IgG1-Fc中のLys248と最も接近していることが分かった(図2A)。次に、Z34CペプチドのN末端のフェニルアラニンをリシンに置換し、FcのLys248と置換したZ34CペプチドのLys1のεアミノ基の距離を測定したところ、最も近い距離で6.57Åまで接近できることが分かった(図2B)ため、実際にこの2つのアミノ基間の架橋が可能であるかどうか、変異ペプチドを合成し確認を試みた。
Phe1Lysの置換を行わずに、Z34CのN末端にグリシンを1つ付加した置換ペプチドαZ34Cペプチド(Z34C(-1G,K26R,K28R))を設計した。αZ34Cのモデル構造では、N末端のグリシンのαアミノ基とIgGのFc中のLys248のεアミノ基の距離は、8.0オングストロームとなり、十分に、DSG等の架橋剤で架橋できることが示唆された。
次に、使用したビオチン化ペプチド(DSG化無)と抗体との親和性を評価した。表4に、使用したペプチドと各種IgG抗体との、BIAcore T200を使った親和性解析の結果を示す。この表3の各種ペプチドによる標識効率と表4の親和性の関係をプロットしたが、抗体とペプチドの親和性と標識効率には、明確な相関は見られないように見受けられた(データ示さず)。
マウスIgG1、IgG2b、及びヒトIgG3(いずれもニワトリ卵白リゾチームを抗原として認識)、並びに抗HER2抗体であるTrastuzumab(ヒトIgG1)について、αZ34C 7K、εZ34C 7Kを反応させ、ELISAを行った。結果を図6に示す。予想されたように、マウスIgG1、IgG2bは、結合反応性が高く、ヒトIgG3についても、結合活性が見られた。一方、標的抗原が異なるヒトIgG1(抗原はHER2)では、結合活性は全く見られなかった。
以下のペプチドをF-moc法により合成し、pH5.5でのIgG1との反応性を評価した(ただしC末端はいずれもアミド化を行い、N末端はεZ34Cのみメトキシ化し、その他はアミノ化した)。
10mMのPBS(pH7.4)に溶解した各種のIgG(99μL)に、DMSOに溶解した0.5mMのSG化ペプチド試薬(Z34C 26 28R、αZ34C、及びεZ34Cの3種のペプチド試薬)を1μL加え、室温で反応させた(ただし、抗体とペプチド試薬の最終濃度は、1μMと5μM)。3時間反応後、実施例5と同様の方法で、SDS-PAGE後、CBB染色を行った。
Claims (13)
- 下記の(A)又は(B)のアミノ酸配列からなるIgG結合ペプチド;
(A)下記の(1)~(7)からなる群から選択されるいずれか1のアミノ酸配列:
(1)FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号9)、
(2)GFNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号7)、
(3)KNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号4)、
(4)GFNMQCQKRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号5)、
(5)KNMQCQKRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号6)、
(6)FNMQQQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDD(配列番号10)、及び
(7)GKNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号11)、
(B)上記(A)のアミノ酸配列において、C末端における1~5個の任意のアミノ酸残基の付加、及びその付加されたC末端におけるさらなる1個のリシン残基の付加を有するアミノ酸配列。 - 前記アミノ酸配列が
FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号9)、
GFNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号7)、
KNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号4)、
GFNMQCQKRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号5)、又は
FNMQQQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDD(配列番号10)
である、請求項1に記載のペプチド。 - 配列番号4、6、9の5位のシステイン残基と34位のシステイン残基、又は配列番号5、7、11の6位のシステイン残基と35位のシステイン残基がジスルフィド結合又はリンカーを介して連結されている、請求項1に記載のペプチド。
- 標識物質又は薬剤が結合している、請求項1~3のいずれか一項に記載のペプチド。
- 標識物質又は薬剤が、配列番号5の8位若しくは配列番号6の7位のリシン残基、又はC末端のリシン残基に結合している、請求項4に記載のペプチド。
- N末端のアミノ酸残基がアセチル化又はアミノ化されている、請求項1~5のいずれか一項に記載のペプチド。
- C末端のアミノ酸残基がアミド化されている、請求項1~6のいずれか一項に記載のペプチド。
- 前記アミノ酸配列の1位のアミノ酸残基が架橋剤で修飾されている、請求項1~7のいずれか一項に記載のペプチド。
- 前記架橋剤が、DSG(ジスクシンイミジルグルタレート)、DSS(ジスクシンイミジルスベレート)、DMA(アジプイミド酸ジメチル二塩酸塩)、DMP(ピメルイミド酸ジメチル二塩酸塩)、DMS(スベルイミド酸ジメチル二塩酸塩)、DTBP(3,3'-ジチオビスプロピオンイミド酸ジメチル二塩酸塩)、及びDSP(ジチオビススクシンイミジルプロピオン酸)からなる群より選択される、請求項8に記載のペプチド。
- 前記架橋剤がDSG(ジスクシンイミジルグルタレート)又はDSS(ジスクシンイミジルスベレート)である、請求項9に記載のペプチド。
- 請求項8~10のいずれか一項に記載のペプチドとIgGとの架橋複合体。
- 請求項8~10のいずれか一項に記載のペプチドとIgGを混合し、架橋剤で修飾されているペプチドとIgGをin vitroで架橋反応させる工程を含む、ペプチドとIgGの複合体を生産する方法。
- 請求項1~10のいずれか一項に記載のペプチド、又は請求項11に記載の架橋複合体を含む、医薬組成物。
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