JP7127008B2 - イメージングのための新規pd-l1結合ポリペプチド - Google Patents
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Description
本出願は、2014年11月25日に提出した表題「イメージングのための新規PD-L1結合ポリペプチド」なる米国仮特許出願番号第62/084,298号に対する優先権を主張するものであり、その内容は、参照により本明細書に援用される。
本発明は、少なくとも部分的には、診断用/イメージング剤として、例えばポジトロン断層法において使用するために有用である新規の抗ヒトPD-L1アドネクチンの発見に基づくものである。これらの剤は、例えば、PD-L1発現細胞と非PD-L1発現細胞、例えば腫瘍細胞とを区別するのに、ならびにPD-L1発現組織と非PD-L1発現組織、例えば癌組織とを区別するのに有用である。
(1)配列番号:6、7および8の各々;
(2)配列番号:21、22および23の各々;
(3)配列番号:36、37および38の各々;
(4)配列番号:51、52および53の各々;
(5)配列番号:66、67および68の各々;
(6)配列番号:81、82および83の各々;
(7)配列番号:97、98および99の各々;
(8)配列番号:113、114および115の各々;
(9)配列番号:124、125および126の各々;
(10)配列番号:135、136および137の各々;
(11)配列番号:146、147および148の各々;
(12)配列番号:157、158および159の各々;
(13)配列番号:168、169および170の各々;
(14)配列番号:179、180および181の各々;
(15)配列番号:190、191および192の各々;
(16)配列番号:201、202および203の各々;
(17)配列番号:212、213および214の各々;
(18)配列番号:223、224および225の各々;
(19)配列番号:234、235および236の各々;
(20)配列番号:245、246および247の各々;
(21)配列番号:256、257および258の各々;
(22)配列番号:267、268および269の各々;
(23)配列番号:278、279および280の各々;
(24)配列番号:289、290および291の各々;
(25)配列番号:300、301および302の各々;
(26)配列番号:311、312および313の各々;
(27)配列番号:322、323および324の各々;
(28)配列番号:333、334および335の各々;
(29)配列番号:344、345および346の各々;
(30)配列番号:355、356および357の各々;
(31)配列番号:366、367および368の各々;
(32)配列番号:377、378および379の各々;
(33)配列番号:388、389および390の各々;
(34)配列番号:399、400および401の各々;
(35)配列番号:410、411および412の各々;
(36)配列番号:421、422および423の各々;
(37)配列番号:432、433および434の各々;
(38)配列番号:443、444および445の各々;
(39)配列番号:454、455および456の各々;
(40)配列番号:465、466および467の各々;
(41)配列番号:476、477および478の各々;
(42)配列番号:487、488および489の各々;
(43)配列番号:498、499および500の各々;
(44)配列番号:509、510および511の各々;
(45)配列番号:520、521および522の各々;
(46)配列番号:531、530および531の各々;
(47)配列番号:542、543および544の各々;
(48)配列番号:553、554および555の各々;または
(49)配列番号:564、565および566の各々。
を有するもの、またはその医薬的に許容される塩を有する。
(式中、Xは、配列番号:13、28、43、58、73、88、104、120、131、142、153、164、175、186、197、208、219、230、241、252、263、274、285、296、307、318、329、340、351、362、373、384、395、406、417、428、439、450、461、472、483、494、505、516、527、538、549、560および571のいずれか1つのアミノ酸配列を含んでいるポリペプチドである)。ある実施態様において、前記ポリペプチドは、配列番号:88に示したアミノ酸配列を含む。ある実施態様において、前記ポリペプチドは、配列番号:104に示したアミノ酸配列を含む。
a)前記イメージング剤を対象に投与する工程;および
b)前記イメージング剤のインビボ分布を、ポジトロン断層法により画像化する工程、
を特徴とする。
(a)診断を必要とする対象に、抗PD-L1アドネクチンを含んでいるイメージング剤を投与する工程;および
(b)対象の少なくとも一部分の放射線画像を得て、イメージング剤の存在または非存在を検出する工程;
ここでバックグランドを超える前記イメージング剤の存在および位置が、疾患の存在および位置の指標であること、
を特徴とする。
(a)最初の時点で、抗PD-L1アドネクチンを含んでいるイメージング剤を、その必要のある対象に投与し、対象の少なくとも一部分の画像を得て、腫瘍のサイズを決定する工程;
(b)対象に抗腫瘍治療剤を投与する工程;および
(c)前記イメージング剤を、1以上の後続する時点で対象に投与して、各時点で対象の少なくとも一部分の画像を得る工程;ここで、各時点での腫瘍の体積および位置が疾患の進行の指標であること、
を特徴とする。
本発明はさらに以下の具体的態様を含む:
[項1]
フィブロネクチンIII型第10ドメイン(10Fn3)を含むポリペプチドであって、ここで、
(a)該10Fn3ドメインは、AB、BC、CD、DE、EFおよびFGループを含んでおり、
(b)該該BC、DEおよびFGループは、下記のアミノ酸配列:
(a) 配列番号:6、7および8の各々;
(b) 配列番号:21、22および23の各々;
(c) 配列番号:36、37および38の各々;
(d) 配列番号:51、52および53の各々;
(e) 配列番号:66、67および68の各々;
(f) 配列番号:81、82および83の各々;または
(g) 配列番号:97、98および99の各々、
を含んでおり、
(c)該ポリペプチドは、10nM以下のKDにてPD-L1に特異的に結合する、
ポリペプチド。
[項2]
該10Fn3ドメインが、配列番号:5、20、35、50、65、80および96からなる群から選択されるアミノ酸配列の非BC、DEおよびFGループ領域と、少なくとも90%、95%、98%、99%または100%同一のアミノ酸配列を含む、項1に記載のポリペプチド。
[項3]
該10Fn3ドメインが、配列番号:9-15、24-30、39-45、54-60、69-75、84-91および100-107からなる群から選択されるアミノ酸配列の非BC、DEおよびFGループ領域と、少なくとも90%、95%、98%、99%または100%同一のアミノ酸配列を含む、項2に記載のポリペプチド。
[項4]
該ポリペプチドが、ポリエチレングリコール、シアル酸、Fc、Fcフラグメント、トランスフェリン、血清アルブミン、血清アルブミン結合タンパク質および血清イムノグロブリン結合タンパク質からなる群から選択される1以上の薬物動態的(PK)部分を含む、項1~3のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[項5]
項1~4のいずれか1項記載のポリペプチドをコードする、核酸。
[項6]
該核酸が、配列番号:16-19、31-34、46-49、61-64、76-79、92-95および108-111からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む、項5記載の核酸。
[項7]
項5または6記載の核酸を含む、ベクター。
[項8]
項5または6記載の核酸を含む、細胞。
[項9]
項1~4のいずれか1項記載のポリペプチドおよび検出可能な標識を含む、イメージング剤。
[項10]
検出可能な標識が64Cu、124I、76/77Br、86Y、89Zr、68Ga、18F、11C、125I、124I、131I、123I、32Cl、33Cl、34Cl、68Ga、74Br、75Br、76Br、77Br、78Br、89Zr、186Re、188Re、90Y、177Lu、99Tcまたは153Smからなる群から選択される放射性核種である、項9記載のイメージング剤。
[項11]
検出可能な標識がDFO、DOTA、CB-DO2A、3p-C-DEPA、TCMC、DBCO、DIBO、BARAC、DIMAC、Oxo-DO3A、TE2A、CB-TE2A、CB-TE1A1P、CB-TE2P、MM-TE2A、DM-TE2A、diamsar、NODASA、NODAGA、NOTA、NETA、TACN-TM、DTPA、1B4M-DTPA、CHX-A’’-DTPA、TRAP、NOPO、AAZTA、DATA、H2dedpa、H4octapa、H2azapa、H5decapa、H6phospa、HBED、SHBED、BPCA、CP256、PCTA、HEHA、PEPA、EDTA、TETAおよびTRITAからなる群から選択されるコンジュゲート部分により前記ポリペプチドとコンジュゲートされる、項9または10記載のイメージング剤。
[項12]
該コンジュゲート部分が、NODAGAであり、該放射性核種が64Cuである、項11記載のイメージング剤。
[項13]
ポリペプチド、18F-放射性標識された補欠分子族基および二官能性結合(BFC)基を含む、項10記載のイメージング剤であって、該イメージング剤が、以下の構造:
(ここで、(a) 18Fは、N原子に対してオルト位であり、xは1~8、2~6、3~5の整数または4であり;
(b) BFC基は、(i)タンパク質上のアミン、カルボキシル、カルボニルまたはチオール官能基と共有結合を形成している反応基および(ii)ポリエチレングリコール(PEG)yスペーサーアーム(ここで、yは1~8、2~6、または4もしくは5の整数である)を含んでいるシクロオクチンであり;
(c) タンパク質は、項1~4のいずれか1項記載のポリペプチドである)
またはその医薬上許容される塩を有する、イメージング剤。
[項14]
該シクロオクチンが、ジベンゾシクロオクチン(DIBO)、ビアリールアザシクロオクチノン(BARAC)、ジメトキシアザシクロオクチン(DIMAC)およびジベンゾシクロオクチン(DBCO)からなる群から選択される、項13記載のイメージング剤。
[項15]
該BFCが、DBCO-PEG4-NHS-エステル、DBCO-スルホ-NHS-エステル、DBCO-PEG4-酸、DBCO-PEG4-アミンまたはDBCO-PEG4-マレイミドである、項13記載のイメージング剤。
[項16]
該イメージング剤が、下記構造:
(ここで、Xが、配列番号:13、28、43、58、73、88および104のいずれか一つのアミノ酸配列を含んでいるポリペプチドであり、BFCのマレイミド基がポリペプチドのシステイン残基上のチオール基に共有結合している)
を有する、項13記載のイメージング剤。
[項17]
該ポリペプチドが、配列番号:88または配列番号:104に記載のアミノ酸配列を含む、項9~16いずれか1項に記載のイメージング剤。
[項18]
項1~4いずれか1項に記載のポリペプチドまたは項9~17いずれか1項に記載のイメージング剤、および許容できる担体、賦形剤または安定剤を含む医薬組成物。
[項19]
対象におけるPD-L1発現腫瘍の存在の検出に用いるための項9~17いずれか1項に記載のイメージング剤であって、検出が対象の少なくとも一部分の放射性画像における該イメージング剤の存在または非存在を検出する工程を含み、
ここで、バックグラウンドを超えるイメージング剤の存在および位置がPD-L1発現腫瘍の存在および位置の指標となる、イメージング剤。
[項20]
対象におけるPD-L1発現腫瘍に対する抗腫瘍治療の経過のモニタリングに用いるための項9~17いずれか1項に記載のイメージング剤であって、モニタリングが
(a)対象の少なくとも一部分の画像から腫瘍のサイズを検出する工程;
(b)その後、1以上の後続する時点における各時点の対象の少なくとも一部分の画像を得る工程を含み、
ここで、各時点での腫瘍の大きさおよび位置がPD-L1発現腫瘍に対する抗腫瘍治療の経過の指標となる、イメージング剤。
別段の記載が無ければ、本明細書に使用される全ての技術および科学用語は、当業者が一般的に理解される意味と同じ意味を示す。いずれの方法および組成物も、本明細書に述べた類似または同一方法および組成物を、本発明の実施または試験に使用され得、また好ましい方法および組成物は、本明細書に記述される。
本明細書において提供されるものは、ヒトPD-L1に結合し、かつ異種分子、例えば放射性標識に結合され得るポリペプチドである。かかるポリペプチドは、診断用アッセイとして、試料または組織(例えば、選択的にPD-L1を発現する癌組織などの組織)中のPD-L1を検出するために有用である。
Fn3は、フィブロネクチン由来のIII型ドメインをいう。Fn3ドメインは、小さく、単量体の、可溶性および安定である。ジスルフィド結合を持たず、そのため還元条件下で安定である。Fn3の全体構造は、イムノグロブリンの折り畳み(fold)構造に類似している。Fn3ドメインは、N-末端からC-末端の順に、βまたはβ様ストランド、A;ループ、AB;βまたはβ様ストランド、B;ループ、BC;βまたはβ様ストランド、C;ループ、CD;βまたはβ様ストランド、D;ループ、DE;βまたはβ様ストランド、E;ループ、EF;βまたはβ様ストランド、F;ループ、FG;およびβまたはβ様ストランド、Gを含む。7つの逆平行β-ストランドは、安定なコアを形成する2つのβシートに配置され、同時に、βまたはβ様ストランドに連結するループから成る2つの「面」が生じる。ループAB、CDおよびEFは1つの面(「南極」)に位置し、ループBC、DE、およびFGは反対の面(「北極」)に位置する。ヒトフィブロネクチンには少なくとも15個の異なるFn3モジュールが存在しており、モジュール間の配列相同性は低いが、それらは全て三次構造において高い類似性を共有している。
(94個のアミノ酸;AB、CDおよびEFループには下線が引かれる;コア10Fn3ドメインは、アミノ酸9(“E”)で始まり、アミノ酸94(“T”)で終結し、86個のアミノ酸のポリペプチドに対応している)から得られるFn3ドメインである。
コア野生型ヒト10Fn3ドメインは、配列番号:2に示されている。
ここでABループは(Z)aにより示され、CDループは(Z)bにより示され、EFループは(Z)cにより示され、BCループは(Z)xにより示され、DEループは(Z)yにより示され、FGループは(Z)zにより示される。Zは任意のアミノ酸を示し、Zに後続する下付きの文字は、アミノ酸の数(整数)を示す。特に、aは、1-15、2-15、1-10、2-10、1-8、2-8、1-5、2-5、1-4、2-4、1-3、2-3または1-2のアミノ酸の範囲であってもよい;およびb、c、x、yおよびzは、各々独立して、2-20、2-15、2-10、2-8、5-20、5-15、5-10、5-8、6-20、6-15、6-10、6-8、2-7、5-7または6-7のアミノ酸のいずれの範囲であってもよい。βストランドの配列は、配列番号:1または2に示される対応するアミノ酸に対して、全ての7つのスキャッホルド領域にわたって、0~10、0~8、0~6、0~5、0~4、0~3、0~2または0~1の範囲で置換、削除または付加を有していてもよい。ある実施態様において、βストランドの配列は、全ての7つのスキャッホルド領域にわたって、配列番号:1または2に示される対応するアミノ酸に対して0~10、0~8、0~6、0~5、0~4、0~3、0~2または0~1の範囲で保存的置換を有していてもよい。ある実施態様において、コアアミノ酸残基は決まっており、いずれの置換、保存的置換、削除または付加も、コアアミノ酸残基以外の残基でおこる。
ここで、BCループは(Z)xにより示され、DEループは(Z)yにより示され、FGループは(Z)zにより示される。Zは任意のアミノ酸を示し、Zに後続する下付き文字は、アミノ酸の数(整数)を示す。特に、x、yおよびzは、各々独立して、2-20、2-15、2-10、2-8、5-20、5-15、5-10、5-8、6-20、6-15、6-10、6-8、2-7、5-7または6-7のアミノ酸の範囲であってもよい。好ましい実施態様において、xは11個のアミノ酸であり、yは6個のアミノ酸であり、zは12個のアミノ酸である。βストランドの配列は、配列番号:1または2に示される対応するアミノ酸に対して、全ての7つのスキャッホルド領域にわたって、0~10、0~8、0~6、0~5、0~4、0~3、0~2または0~1の範囲で置換、削除または付加を有してもよい。ある実施態様において、βストランドの配列は、配列番号:1または2に示される対応するアミノ酸に対して、全ての7つのスキャッホルド領域にわたって、0~10、0~8、0~6、0~5、0~4、0~3、0~2または0~1の範囲で保存的置換を有してもよい。ある実施態様において、コアアミノ酸残基、例えば外側の1以上のループは決まっており、いずれの置換、保存的置換、削除または付加も、コアアミノ酸残基以外の残基でおこる。
本明細書において提供されるものは、例えば、SPR(Biacore)により決定される場合、10nM、1nM、0.5nM、0.1nM以下のKDにて、ヒトPD-L1に結合するアドネクチンであり、1以上の以下の特性を示す:
1.例えば、ヒトPD-1Fcタンパク質およびヒトPD-L1陽性細胞、例えばL2987細胞を用いて、例えばフローサイトメトリーにより決定される場合に、ヒトPD-L1とヒトPD-1の相互作用を少なくとも50%、70%、80%、90%以上阻害すること;
2.例えば、ELISAアッセイまたはSPR(Biacore)により決定される場合、ヒトPD-L1とヒトCD80(B7-1)の結合を少なくとも50%、70%、80%、90%以上阻害すること;
3.例えば、ELISAアッセイまたはSPR(Biacore)により決定される場合、抗PD-L1抗体12A4(例えば、米国特許第7,943,743号に記述される)とヒトPD-L1の結合を、少なくとも50%、70%、80%、90%以上阻害すること;ならびに
4.混合リンパ球反応(MLR)において細胞増殖を阻害すること。
1.例えば、ヒトPD-1Fcタンパク質およびヒトPD-L1陽性細胞、例えば、L2987細胞を用いて、例えばフローサイトメトリーにより決定される場合、ヒトPD-L1とヒトPD-1との相互作用を、少なくとも50%、70%、80%、90%以上阻害すること;
2.例えば、ELISAアッセイまたはSPR(Biacore)により決定される場合、ヒトCD80(B7-1)とヒトPD-L1との結合を少なくとも50%、70%、80%、90%以上阻害すること;
3.例えば、ELISAアッセイまたはSPR(Biacore)により決定される場に、抗PD-L1抗体12A4とヒトPD-L1の結合を少なくとも50%、70%、80%、90%以上阻害すること;ならびに
4.混合リンパ球反応(MLR)において細胞増殖を阻害すること。
1.例えば、フローサイトメトリーにより、例えば、ヒトPD-1Fcタンパク質およびヒトPD-L1陽性細胞、例えばL2987細胞を用いて決定される場合、ヒトPD-L1とヒトPD-1の相互作用を少なくとも50%、70%、80%、90%以上阻害すること;
2.例えば、ELISAアッセイまたはSPR(Biacore)により決定された場合、ヒトCD80(B7-1)とヒトPD-L1との結合を少なくとも50%、70%、80%、90%以上阻害すること;
3.例えば、ELISAアッセイまたはSPR(Biacore)により決定された場合、抗PD-L1抗体12A4とヒトPD-L1との結合を少なくとも50%、70%、80%、90%以上阻害すること;
4.混合型リンパ球反応(MLR)における細胞増殖を阻害すること;ならびに
5.ヒトPD-L1への結合に対して、本明細書において記述された抗PD-L1抗体と競合すること。
1.例えば、フローサイトメトリーにより、例えば、ヒトPD-1Fcタンパク質およびヒトPD-L1陽性細胞、例えばL2987細胞を用いて決定される場合、ヒトPD-L1とヒトPD-1の相互作用を少なくとも50%、70%、80%、90%以上阻害すること;
2.例えば、ELISAアッセイまたはSPR(Biacore)により決定される場合、ヒトCD80(B7-1)とヒトPD-L1との結合を少なくとも50%、70%、80%、90%以上阻害すること;
3.例えば、ELISAアッセイまたはSPR(Biacore)により決定される場合、ヒトPD-L1への抗PD-L1抗体12A4の結合を少なくとも50%、70%、80%、90%以上阻害すること;
4.混合型リンパ球反応(MLR)において細胞増殖を阻害すること;ならびに
5.ヒトPD-L1に対する結合に対して、本明細書において記述された抗PD-L1抗体と競合すること。
ある実施態様において、抗PD-L1アドネクチンは、例えば、診断用イメージングに使用される場合に、短い半減期を有するのが望ましい。
ある実施態様において、抗PD-L1アドネクチンは、ポリエチレングリコール(PEG)を含む。PEGは、周知の水溶性ポリマーであり、市販されているか、または当技術分野において周知の方法(Sandler and Karo, Polymer Synthesis, Academic Press, New York,Vol.3, pages 138-161)に従ってエチレングリコールの開環重合によって製造されうる。用語「PEG」は、大きさ、またはPEGの末端修飾に関わらず、あらゆるポリエチレングリコール分子を広く含むように用いられ、式:X-O(CH2CH2O)n-1CH2CH2OHによって示され得、ここでnは20から2300であり、XはHまたは末端修飾、例えばC1-4アルキルである。PEGは、当該分子の化学合成により生じるか;または当該分子の一部を最適な距離に保つためのスペーサーとして働く、結合反応に必要なさらなる化学基を含みうる。さらに、このようなPEGは、互いに結合された1つ以上のPEG側鎖から成りうる。1つ以上のPEG鎖を有するPEGは、多分岐または分岐型PEGと称されうる。分岐型PEGは、例えば、欧州公開出願第473084A号、および米国特許第5,932,462号に記述される。
ある実施態様において、抗PD-L1アドネクチンは、イムノグロブリン Fcドメインまたはそのフラグメントまたはバリアントと融合される。本明細書中において使用される、「機能的Fc領域」とは、FcRnに結合する能力を保持するFcドメインまたはそのフラグメントである。ある実施態様において、機能的Fc領域は、FcRnに結合するが、エフェクター機能を持たない。Fc領域またはそのフラグメントがFcRnに結合する能力は、当業者には既知の標準的な結合アッセイにより決定され得る。ある実施態様において、Fc領域またはそのフラグメントは、FcRnに結合し、ネイティブなFc領域の少なくとも1つの「エフェクター機能」を有する。代表的な「エフェクター機能」には、C1q結合;補体依存性細胞毒性(CDC);Fc受容体結合;抗体依存性細胞媒介細胞毒性(ADCC);食作用;細胞表面受容体の下方調節(例えば、B細胞受容体;BCR)などが挙げられる。前記エフェクター機能は、一般的には、Fc領域と、結合ドメイン(例えば、抗PD-L1アドネクチン)と組み合わせられることが必要であり、そのような抗体のエフェクター機能を評価するためには当業者には既知の様々なアッセイを用いて評価され得る。
ある実施態様において、PK部位とは、例えば、US2012/0094909に記述されるような血清タンパク質(例えば、人血清アルブミン)に対して特異的な別のアドネクチンであり、この全ての内容を出典明示により本明細書に全て組み込まれる。本明細書において記述されるアドネクチンと共に使用され得る他のPK部位は、上掲したKontermann et al.(Current Opinion in Biotechmical 2011;22:868-76)に記述されている。
1)目的とするタンパク質と結合する場合に、1以上のタンパク質ドメインの結合に関する立体障害の低下または増加、2)タンパク質の安定性または可溶性の増加、3)タンパク質凝集の低下、および4)タンパク質の全体的な結合力または親和性の増加。
一局面において、本発明は、PD-L1を結合するフィブロネクチンIII型ドメインを含むアドネクチンを提供する。特異的な結合特性を有するFn3ドメインを迅速に製造かつ試験するための方法の一つは、Adnexus(Bristol-Myers Squibb R&D Company)による核酸-タンパク質融合技術である。本開示は、「プロフュージョン(PROfusion)」と呼ばれる核酸-タンパク質融合体(RNA-およびDNA-タンパク質融合体)を用いるインビトロ発現およびターゲティング技術を利用して、タンパク質との結合に重要な新規ポリペプチドおよびアミノ酸モチーフを同定する。核酸-タンパク質融合技術は、タンパク質を、そのコードしている遺伝子情報を共有結合させる技術である。RNA-タンパク質融合技術およびフィブロネクチンベースのスキャッホルドタンパク質ライブラリースクリーニング方法の詳細な記述については、Szostak et al., 米国特許番号第6,258,558号、第6,261,804号、第6,214,553号、第6,281,344号、第6,207,446号、第6,518,018号および第6,818,418号;Roberts et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 1997;94:12297-12302;およびKurz et al., Molecules, 2000;5:1259-64を参照されたい。これらの全ての文献は、出典明示により本明細書に組み込まれる。
本開示に含まれるものは、本明細書に記述したタンパク質のいずれかをコードしている核酸配列である。当業者には認識されるように、第3番目の位置の縮重のため、殆どの個々のアミノ酸は、コードしているヌクレオチド配列において1以上のトリプレットコドンにより表される。さらに、マイナーな塩基対の変更は、コードされたアミノ酸配列中の保存的置換に至り得るが、その遺伝子生成物の生物学的活性を実質的に変えるとは考えられない。それ故に、本明細書に記述したタンパク質をコードしている核酸配列は、配列中でわずかに改変されてもよいが、その個々の遺伝子生成物を依然としてコードしているものである。本明細書に記述された抗PD-L1アドネクチンをコードしている特定の核酸およびその融合物の例には、配列番号:16-19、31-34、46-49、61-64、76-79、92-95および108-111に示される配列を有する核酸が挙げられる。
また、本明細書において記述されるものは、抗PD-L1アドネクチンまたはその融合ポリペプチドを発現する細胞系である。抗PD-L1アドネクチンを産生する細胞系の創出および単離は、当業者には既知の標準技術、例えば、本明細書に述べた技術を用いて達成され得る。
選択したバインダーが、HIS6 tagのPET9dベクター上流にクローニングされ、E.coli BL21 DE3 plysS細胞中で形質転換され、24ウェル形態の50μg/mLのカナマイシン含有LB培地(5ml)に植菌されて、37℃で終夜培養された。新しく5mlのLB培養培地(50μg/mL カナマイシン)を、終夜培養物から200μlを吸引採取して、適切なウェルにそれを分配することにより、誘導性発現用として調製した。培養物を、37℃にてA6000.6-0.9となるまで増殖させた。1mM イソプロピル-β-チオガラクトシド(IPTG)を用いて誘導した後に、この培養物を、30℃で6時間発現させて、4℃で10分間、2750g遠心分離により収集した。
不溶性クローンの発現のために、このクローン後続してHIS6tagを、pET9d(EMD Bioscience, San Diego, CA)ベクター中にクローニングし、E.coli HMS174細胞内で発現させた。植菌培養物(1つの播種したコロニーから作成)(20ml)を使用して、50μg/mlカルベニシリンおよび34μg/mlクロラムフェニコールを含有するLB培地(1リットル)に植菌した。培養物を、A6000.6-1.0となるまで37℃で増殖させた。1mM イソプロピル-β-チオガラクトシド(IPTG)を用いた誘導後に、培養物を、4時間30℃で増殖させて、4℃で30分間>10,000gにて遠心分離により収集した。細胞ペレットを、-80℃で凍結させた。細胞ペレットを、氷上でULTRA-TURRAX(登録商標)ホモジナイザー(IKA works)を用いて、25mlの溶解緩衝液(20mM aH2P04, 0.5M NaCl, 1x完全プロテアーゼ阻害剤カクテル-EDTA不含(Roche)、ImM PMSF、pH7.4)に再懸濁させた。細胞の溶解を、Model M-l 10S MICROFLUIDIZER(登録商標)(Microfluidics)を用いて、高圧ホモジナイゼーション(>18,000psi)により達成した。不溶性画分を、4℃で30分間、23,300にて遠心分離により分離した。溶解物の遠心分離から回収した不溶性ペレットを、20mMリン酸ナトリウム/500mM NaCl(pH7.4)を用いて洗った。ペレットを、6.0M グアニジン塩酸塩/20mMリン酸ナトリウム塩/500M NaCl(pH7.4)中に再溶解して、ソニケーションの後に37℃で1~2時間インキュベーションした。再溶解したペレットを、0.45μmに濾過して、20mM リン酸ナトリウム/500M NaCl/6.0M グアニジン(pH7.4緩衝液)を用いて平衡化したHistrapカラムに重層した。重層後に、カラムを、更なる25CVのために、同じ緩衝液で洗った。結合したタンパク質を、50mM イミダゾール/20mMリン酸ナトリウム塩/500mM NaCl/6.0Mのグアニジン-HCl(pH7.4)で溶出した。精製タンパク質を、50mM 酢酸ナトリウム/150mM NaCl(pH4.5)の透析により、再度フォールディングさせた。
可溶性クローンの発現のために、このクロ-ンに後続してHIS6tagを、pET9d(EMD Bioscience, San Diego, CA)ベクターにクローニングして、E.coli HMS174細胞内で発現させた。植菌培養物(1つの播種したコロニーから作成)(20ml)を用いて、50μg/mlカルベニシリンおよび34μg/mlクロラムフェニコールを含有する1リットルのLB培地に植菌した。培養物を、A6000.6-1.0となるまで37℃で増殖させた。1mM イソプロピル-β-チオガラクトシド(IPTG)を用いた誘導後に、培養物を、4時間30℃で増殖させて、4℃で30分間、>10,000gにて遠心分離により収集した。細胞ペレットを、-80℃で凍結させた。細胞ペレットを、氷上でULTRA-TURRAX(登録商標)ホモジナイザー(IKA works)を用いて、25mlの溶解緩衝液(20mM NaH2P04、0.5M NaCl、lx 完全プロテアーゼ阻害剤カクテル-EDTA不含(Roche)、ImM PMSF、pH7.4)に再懸濁させた。細胞の溶解を、Model M-l 10S MICROFLUIDIZER(登録商標)(Microfluidics)を用いて、高圧ホモジナイゼーション(>18,000psi)により達成した。可溶性画分を、4℃で30分間23,300gにて遠心分離により分離した。上清を、0.45 μmフィルターを通して清澄にした。清澄化された溶解物を、20mM リン酸ナトリウム/500M NaCl(pH7.4)で予め平衡化したHistrapカラム(GE)に重層した。次いで、カラムを、同じ緩衝液で25のカラム体積、その後20mM リン酸ナトリウム/500M NaCl/25mM イミダゾール(pH7.4)で20カラム体積、その後20mM リン酸ナトリウム/500M NaCl/40mM イミダゾール(pH7.4)で35カラム体積にて洗った。タンパク質を、15カラム体積の20mM リン酸ナトリウム/500M NaCl/500mM イミダゾール(pH7.4)を用いて溶出して、画分を、吸光度A2SOに基づいて収集して、lXPBS、50mM Tris、150mM NaCl;pH8.5または50mM NaOAc;150mM NaCl;pH4.5で透析した。全ての沈殿物を、0.22μmで濾過することにより除去した。
本発明はさらに、本明細書中に記述された抗PD-L1アドネクチンまたはその融合タンパク質を含んでいる組成物、例えば、医薬組成物および放射性医薬品組成物を提供するものであり、該組成物は、主に、エンドトキシンを含まないか、または少なくとも、妥当な規制当局(例えば、FDA)により決定されたようなエンドトキシンの許容レベル未満で含む。
本明細書に記述した抗PD-L1アドネクチンとPD-L1との結合は、平衡定数(例えば、解離KD)および速度定数(例えば、結合速度定数、konおよび解離速度定数、koff)により評価されうる。koffが十分に小さいか、またはkonが十分に大きい場合には、大きなKD値は許容されうるが、アドネクチンは、一般にKDが500nM、100nM、10nM、1nM、500pM、200pMまたは100pMにて、標的分子に結合する。
PD-L1に結合かつ競合する抗PD-L1アドネクチンは、様々なインビトロアッセイを用いて同定され得る。ある実施態様において、このアッセイは、複数の候補であるアドネクチンを同時にスクリーニングできるハイスループットアッセイである。
イメージング剤
本明細書に記述した抗PD-L1アドネクチンは、多様な診断的適用およびイメージング的適用に有用でもある。ある実施態様において、抗PD-L1アドネクチンは、インビボで検出できる部位を用いて標識され、標識されたアドネクチンは、インビボイメージング剤として、例えば、全身のイメージングのために使用され得る。例えば、一実施形態において、対象におけるPD-L1陽性腫瘍を検出す方法は、対象に、検出可能な標識と結合された抗PD-L1アドネクチンを投与して、その後適切な時間、対象中の標識を検出することを特徴とする。
ある実施態様において、標識された抗PD-L1アドネクチンを使用して、PD-L1-陽性細胞または組織、例えば、PD-L1発現腫瘍を画像化する。例えば、標識された抗PD-L1アドネクチンは、標識されたアドネクチンを目的とする組織(例えば、PD-L1発現腫瘍)に取り込むために十分な量で対象に投与される。その後対象は、イメージングシステム、例えばPETを使用して、使用される特定の放射性核種にとって好適な時間、画像化される。次いで、標識された抗PD-L1アドネクチンと結合したPD-L1発現細胞または組織、例えばPD-L1発現腫瘍は、イメージングシステムにより検出される。
(a)本明細書において記述された抗PD-L1イメージング剤を、それを必要とする対象に投与する工程;および
(b)対象の少なくとも一部分の放射線画像を得て、イメージング剤の存在または非存在を検出する工程;
ここで、バックグラウンドを超える前記イメージング剤の存在および位置は、疾患の存在および位置の指標である。
(a)最初の時点での本明細書において記述された抗PD-L1イメージング剤を、それを必要とする対象に投与して、対象の少なくとも一部分の画像を得て、腫瘍のサイズを決定する工程;
(b)対象に抗腫瘍治療剤を投与する工程;
(c)その後の1以上の時点で対象に、前記イメージング剤を投与して、各時点で対象の少なくとも一部分の画像を得る工程;
ここで、各時点で腫瘍の体積および位置は、疾患の経過の指標である。
一般に、PETイメージングのために、単一の静脈内注入として約1mgから200mgの範囲のアドネクチンの用量を患者に投与することが望ましいが、低容量または高容量もまた状況に応じて投与されうる。一般に、典型的な大人に対して、体表面積の平方メートルあたり約1mgから10mgのタンパク質またはペプチドの範囲の用量を患者に投与することが望ましいが、低容量または高容量もまた状況に応じて投与されうる。イメージングの目的のためにヒトの患者に投与されうるタンパク質またはペプチドの用量の例としては、約1から200mg、約1から70mg、約1から20mg、約1から10mgが挙げられるが、高容量または低容量もまた用いられうる。
以下の例示的方法は、医院内で患者にPETイメージング試験を行う場合に利用されてもよい。20G2-インチ静脈カテーテルが対側尺骨静脈に挿入される。PETトレーサーの投与は、抗PD-L1アドネクチン血中濃度の最大値(Tmax)または最小値(Tmin)の時点と同時に測定される。
PD-L1をインビボで検出することに加えて、抗PDL1アドネクチン、例えば本明細書に記述されたものは、試料中の標的分子を検出するために使用され得る。この方法は、試料を本明細書に記述された抗PD-L1アドネクチンと接触させることを特徴とし得る、ここで前記の接触とは、抗PD-L1アドネクチン標的コンジュゲートを形成できる条件下で実施される;および前記コンジュゲートを検出して、これにより前記試料中の前記標的を検出する。検出は、任意の当分野で認識される技術、例えば、ラジオグラフィー、免疫学的アッセイ、蛍光検出、質量分析または表面プラズモン共鳴を用いて実施され得る。この試料は、ヒトまたは他の哺乳類にから得られ得る。診断を目的として、適切な剤は、全身画像のために放射性同位体および試験サンプルのための放射性同位体、酵素、蛍光性標識および他の適切な抗体tagを包含する検出可能な標識である。
18F-標識抗PD-L1アドネクチンは、最初に18F放射性標識された補欠分子族を調製して、アドネクチンを二官能性キレーターに結合させ、次いでこれらの2つの試薬(参照、例えば図9)を組み合わせて合成される。
一局面において、本明細書において提供されるものは、水許容条件下において、選択的に進行するアジドおよびシクロオクチンの間の1,3-双極子環付加に関与する生体直交性反応において使用するための補欠分子族を含有する18F-放射性標識された化合物である。本明細書に開示された18F-放射性標識された補欠分子族は、100%水に可溶性であり、前記補欠分子族を抗PD-L1アドネクチンに結合させるために有機相は必要でない。前記補欠分子族を抗PD-L1アドネクチンに結合させるために有機相を必要としないという特徴は、抗PD-L1アドネクチンが少量の有機溶媒であっても許容できずに、変性および凝集の問題を与えるため、特に有利である。
(式中、xは1~8の整数である)
を有するアジドに共有結合されるPEG化18F-ピリジンである。ある実施態様において、xは、2~6の整数である。ある実施態様において、xは、3~5の整数である。ある実施態様において、xは4である。ある実施態様において、18Fは、N原に対してオルト位にてピリジンと結合される。ある実施態様において、[O(CH2)2]x部分は、ピリジン環上の窒素に対して、1~3位に存在する。ある実施態様において、[O(CH2)2]x部分は、ピリジン環上の窒素に対して、1~2位に存在する。ある実施態様において、[O(CH2)2]x部分は、ピリジン環上の窒素に対して、1~4位に存在する。
(式中、xは1~8の整数である)。
ある実施態様において、xは2~6の整数である。ある実施態様において、xは3~5の整数である。ある実施態様において、xは4である。
(式中、xは1~8の整数である)。
ある実施態様において、xは2~6の整数である。ある実施態様において、xは3~5の整数である。ある実施態様において、xは4である。
(式中、“OPEG”は、[O(CH2)2]xであり、およびxは1~8の整数である)。
ある実施態様において、xは2~6の整数である。ある実施態様において、xは3~5の整数である。ある実施態様において、xは4である。
(式中、xは1~8の整数である)
を有するアジドに共有結合的に付加されたPEG化18F-ピリジンを製造するための方法であって、下記工程:
(a)以下の構造:
(式中、
xは、1~8の整数であり、
Rは、NO、Br、Fまたは
であり、かつピリジン環のN原子に対してオルト位である)
を有する化合物aの溶液を提供する工程;
(b)18F/18O水、4,7,13,16,21,24-ヘキサオキサ-1,10-ジアザビシクロ[8.8.8]ヘキサコサンおよび弱塩基の混合物を提供する工程;
(c)工程b)の混合物を乾燥させて、固体を形成させる工程;ならびに
(d)工程a)の溶液を、工程c)から得た固体と反応させて、18F-標識化合物を形成する工程、
を含む。
(式中、18Fは、N原子に対してオルト位である)
を有する18F-ピリジン補欠分子族を提供するものであって、かつ下記工程:
a)下記構造の化合物の溶液を提供する工程:
(ここで、Xは、N原子に対してオルト位であり、かつXは、NO2、Brまたは
である);
b)18F/18O水、4,7,13,16,21,24-ヘキサオキサ-1,10-ジアザビシクロ[8.8.8]ヘキサコサンおよび弱塩基、例えば、K2CO3の混合物を提供する工程;
c)工程b)の混合物を乾燥させて、固体を形成させる;ならびに
d)工程a)から得た溶液を、工程c)から得た固体と反応させて、18F-標識化合物を形成する工程、
を含む。
以下の反応条件に従って:
dから得たeである
18F-ピリジン補欠分子族[18F]-3-(2-(2-(2-(2-アジドエトキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)-2-フルオロピリジン(18F-FPPEGA)を製造する工程を含む。
幾つかの局面において、本明細書において提供されるものは、以下の構造:
を有する18F-放射性標識されたプローブまたは薬剤である。
(式中、前記タンパク質は、PD-L1アドネクチンであり、xは1~8の整数である)。
ある実施態様において、xは、2~6の整数である。ある実施態様において、xは、3~5の整数である。ある実施態様において、xは4である。
本明細書に開示された18F-放射性標識組成物に使用される二官能性キレーターまたは結合(BFC)基は、市販購入し得る(例えば、Sigma Aldrich;Click Chemistry Tools)か、または十分既知の化学反応に従って合成され得る。
抗PD-L1アドネクチンを用いる癌患者の免疫治療
PD-L1は、固形腫瘍のなかで主にPD-1リガンド上方調節しており、それは阻害するPD-1-陽性、腫瘍-浸潤性CD4+およびCD8+T-細胞の各々のサイトカイン産生および細胞溶解活性を阻害することができる(Dong et al, 2002;Hino et al, 2010;Taube et al, 2012)。これらの特性により、PD-L1は、癌免疫治療についての有望な標的となる。例えば、WO2013/173223に記載したような抗PD-L1免疫治療による臨床試験では、免疫阻害剤リガンド、PD-L1のmAb遮断により、転移性NSCLC、MEL、RCCおよびOVに罹患している患者における耐性腫瘍の退縮および長期化した(>24週間)疾病安定化の双方を提供できる(広範囲の事前治療を受けた患者も含まれる)ことが示されており、この公報の全てを、出典明示により本明細書に組み込む。従って、PD-L1を標的化すること、例えば、PD-L1アドネクチンを使用することは、抗腫瘍応答を誘起するのに適切である。
ヒトPD-L1に対する高い親和性、つまり、T-細胞増殖を増強する、IL-2分泌(例えばT細胞由来のIL-2分泌)を増強する、インターフェロン-γ産生の増加(例えば、T細胞由来のインターフェロン-γ産生の増加)、PD-L1とPD-1との結合を阻害する、およびT調節細胞の抑制効果をT細胞のエフェクター細胞および/または樹状細胞に対して反転させる。
本明細書に記述したアドネクチンは、システイン、例えばC-末端システインを介して、治療薬にコンジュゲートされて、イムノコンジュゲート、例えばアドネクチン-薬剤コンジュゲート(「アドネクチン-DC」)を形成できる。
(a)エネジン類、例えば、カリケアマイシン(例えば、Lee et al., J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 3464および3466を参照されたい)およびウンシアラマイシン(例えば、Davies et al., WO 2007/038868 A2(2007)およびChowdari et al., US 8,709,431 B2(2012));
(b)ツブリシン類(例えば、Domling et al., US 7,778,814 B2(2010);Cheng et al., US 8,394,922 B2(2013);およびCong et al., US 2014/0227295 A1を参照されたい;
(c)CC-1065およびデュオカルマイシン(例えば、Boger, US 6,5458,530 B1(2003);Sufi et al., US 8,461,117 B2(2013);およびZhang et al., US 2012/0301490 A1(2012))を参照されたい;
(d)エポシロン類(例えば、Vite et al., US 2007/0275904 A1(2007)およびUS RE42930 E(2011)を参照されたい);
(e)オーリスタチン類(例えば、Senter et al., US 6,844,869 B2(2005)およびDoronina et al., US 7,498,298 B2(2009)を参照されたい);
(f)ピロロベンゾジアゼピン(PBD)ダイマー(例えば、Howard et al., US 2013/0059800 A1(2013);US 2013/0028919 A1(2013);およびWO 2013/041606 A1(2013)を参照されたい);ならびに
(g)メイタンシノイド類、例えば、DM1およびDM4(例えば、Chari et al., US 5,208,020(1993)およびAmphlett et al., US 7,374,762 B2(2008)を参照されたい)。
本明細書に記述されたPD-L1アドネクチンは、一般的には免疫応答性であると考えられない難治性転移型NSCLCを含めた広範囲の癌の治療に使用するために適切である。本明細書に記述されたPD-L1アドネクチンを使用して治療され得る癌の例には、MEL(例えば、転移性悪性黒色腫)、RCC、扁平上皮NSCLC、非扁平上皮NSCLC、CRC、卵巣癌(OV)、胃癌(GC)、乳癌(BC)、膵臓癌(PC)および食道の癌腫が挙げられる。さらに、本明細書に記述されたPD-L1アドネクチンは、難治性または再発性悪性腫瘍を治療する際に使用するのに適切である。
ある実施態様において、本明細書に記述されたPD-L1アドネクチンは、免疫原性剤、例えば癌性細胞の調製物、精製された腫瘍抗原(組換えタンパク質、ペプチド、および炭水化物分子を含む)、抗原提示細胞、例えば腫瘍関連抗原有する樹状細胞、および免疫刺激サイトカインをコードする遺伝子でトランスフェクトされた細胞(He et ah, 2004)と組み合わせられ得る。非使用することができる腫瘍ワクチンの非限定的な例は、黒色腫抗原のペプチド、例えば、gp100のペプチド、MAGE抗原、Trp-2、MART1および/またはチロシナーゼ、またはサイトカインGM-CSFを発現するようにトランスフェクトされた腫瘍細胞を含む。PD-L1遮断はまた、化学療法レジメン、放射線療法、外科処置、ホルモン喪失および血管形成阻害剤を含む標準癌処置、ならびに別の免疫治療抗体(例えば、抗PD-1、抗CTLA-4および抗LAG-3 Ab)と有効に組み合わせられ得る。
本明細書に記述した抗PD-L1アドネクチンは、癌に罹患している対象における内因性免疫応答を高めることができるように、PD-1/PD-L1経路からのシグナル伝達を阻害するための医薬品製造のために使用され得る。この開示内容は、癌に罹患している対象の免疫治療のための医薬製造のための、本明細書に記述した抗PD-L1アドネクチンの使用である。本開示は、本明細書に記述されたPD-L1アドネクチンを用いる治療方法の実施態様の全てに対応しているあらゆる本明細書に記述した抗PD-L1アドネクチンの医薬用途を提供する。
本明細書において記述されるものは、特定毒素または病原体に暴露さている患者を治療する方法でもある。例えば、ある局面において、この開示内容は、対象における感染症の治療方法を提供するものであって、本明細書に記述した抗PD-L1アドネクチンを、対象(この対象は感染症について治療される)に投与することを特徴とする、対象における感染症の治療方法を提供するものである。
本明細書に記述された抗PD-L1アドネクチンは、本明細書に記述された治療または診断方法において使用するために、指示書と共に、予め決定された量の個装された試薬の組み合せられ得る。
本明細書において記述された特許文献およびウェブサイトを含めた全ての文書および文献は、参照により、あたかも本明細書に記載されたものと同じ程度に全てまたは一部分を各々組み込まれる。
抗PD-L1アドネクチンを、ヒトPD-L1タンパク質を用いてスクリーニングしたアドネクチンライブラリーから単離して、ライブラリー中で同定されたクローンから、PROfusionによりアフィニティーマチュレーションを行った。これらのアドネクチンの全長配列、コア配列、BC、DEおよびFGループ配列、ならびに「PC」改変されたC-末端を有するバリアントは、図1および表3に示される。
全てのDNA構築体は、N-末端のhis tagに後続してTVMV認識配列を含有している。上掲した抗PD-L1アドネクチンの発現プラスミド(pET-28NMベクター)を、BL21(DE3)細胞にトランスフォームした(New England Biolabs)。細胞を、1L 振盪フラスコの発現自己誘導性培地(Novagen)中で、37℃で6時間終夜増殖させて、20℃で、16時間220RPMにて行った。細胞を、遠心分離により回収して、PBS(pH7.2)中に再懸濁させた。細胞を機械的に溶解させて、次いで遠心分離により清澄させた。可溶性分画を、Ni-NTA Agarose resin(Qiagen)に自重重層して、20mM Tris+10mM イミダゾール(pH8.0)、次いで20mM Tris+40mM イミダゾール(pH8.0)で洗い、20mM Tris+400mM イミダゾール(pH8.0)で溶出した。ニッケル溶出物を、1:23倍モル過剰のアドネクチンにてTVMVプロテアーゼを用いてスパイクした。TVMV-アドネクチン溶出混合物を、20mM Tris(pH8.0, 4℃で16時間)で透析した。TVMVプロテアーゼと開裂したhis tagフラグメントを分離するために、試料を、10mL HisTrap FFカラム(GE Healthcare)に重層して、流出画分を集めた。
-フローサイトメトリーにより、ヒトPD-1Fcの、PD-L1陽性細胞L2987への結合の阻害を測定することにより決定されたような、かつ例えば、アドネクチンATI-964、ATI-965、ATI-966、ATI-967、ATI-968、A02およびE01について示されたような、ヒトPD-1のヒトPD-L1への結合の阻害;
-ELISAにより決定されたような、ヒトCD80(B7-1)のヒトPD-L1への結合の阻害。例えば、ATI-964は41pMのEC50にて結合を阻害する;ATI-965は210pMのEC50にて結合を阻害する;ATI-966は、28pMのEC50にて結合を阻害する;およびATI-968は56pMのEC50にて結合を阻害する);
-ELISAにより決定されたような、抗PD-L1抗体12A4の、ヒトPD-L1への結合の阻害。
3-(2-(2-(2-(2-アジドエトキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)-2-フルオロピリジン(160mg、0.509mmol)、炭酸カリウム(K2CO3、84mg、0.611mmol)、およびジメチルアミン(水中40%、0.097mL、0.764mmol)のジメチルスルホキシド(DMSO、2.5mL)中の混合物を、密閉された耐圧容器において110℃で14時間加熱した。加熱が完了すると、粗製反応混合物の溶媒を真空で除去した。粗製反応物を50mLの酢酸エチルに再溶解し2×50mLのブラインで洗浄し、有機層を硫酸マグネシウムで乾燥させ、濾過し、真空で濃縮した。粗製反応物を、順相クロマトグラフィーを用いて精製し、3-(2-(2-(2-(2-アジドエトキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)-N,N-ジメチルピリジン-2-アミン(140mg、0.413mmol、収率81%)を無色の油状物として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ 7.86(dd,J=4.9,1.5Hz,1H)、7.02(dd,J=7.8,1.5Hz,1H)、6.73(dd,J=7.8,4.9Hz,1H)、4.20-4.07(m,2H)、3.98-3.86(m,2H)、3.81-3.61(m,9H)、3.38(t,J=5.1Hz,2H)、3.13-2.94(m,6H)、1.69(s,2H)。HRMS(ESI)理論値:C15H26N5O4+ m/z 340.1980;実測値 340.1979。
4-PEG-トシル-アジド前駆体のフッ素化による、[ 18 F]-FPPEGAの生成
900mCiの18Fの18O水(3ml)の放射能(IBA Molecularから購入)を、4,7,13,16,21,24-ヘキサオキサ-1,10-ジアザビシクロ[8.8.8]ヘキサコサン(2.8mg、7.44μmol)および炭酸カリウム(1.7mg、0.012mmol)を含むマイクロバイアル(no QMA)に直接移した。追加の2.0mlのアセトニトリルをこの粗製反応混合物に加え、全ての混合物を共沸によって乾燥させた。98℃の油浴を用いて溶液を蒸発させることによって、並びにN2の穏やかな気流を加えることおよび部分真空によって、乾燥を完了させた。溶液の体積は約2mlに減少した。追加の2mlのアセトニトリルを加え、このプロセスを40分にわたり3回繰り返した。液体の体積が0.3ml未満まで減少した時、0.7mlの分取量のアセトニトリルを加え、溶液をさらに共沸蒸留することで体積を~0.1mlにまで減少させた。追加の0.9mlのアセトニトリルを加え、このプロセスを白色の固形物が生成するまで行った。このプロセスには~55分要した。最後の手順の間は、溶液が乾燥する前にバイアルを油浴から外し、バイアル中の残留物を20分間室温で、完全真空(窒素気流なし)下に設置した。[18F]-FPPEGAクリプタンド混合物の移行および乾燥に要した合計時間は65分であった。
この実施例では、E01抗PD-L1アドネクチンのPEG4-DBCOへの結合を記述する。
[18F]-E01-4PEG-DBCO-FPPEGAの合成スキームは、図2および9に示される。
逆相HPLC
カラム:PLRPS 8 micron 1000 A 4.6×250mm
溶媒A:DI水中の0.1%ギ酸
溶媒B:アセトニトリル
流量:1ml/分
圧力:1351 PSI
勾配:
0分 90%A 10%B
30分 45%A 55%B
32分 25%A 75%B
36分 25%A 75%B
50分 90%A 10%B
この実施例は、E01およびA02抗PD-L1アドネクチンとNODAGAとの結合を記述する。マレイミド化学はアドネクチンとNODAGAとの結合に使用されるので、双方のアドネクチンは、そのC-末端(上記E01について述べたとおり)上にプロリンに続いてシステインを使用した。改変されたE01およびA02アドネクチンのアミノ酸配列を、配列番号:104および88各々に示した。システインは、アドネクチンとNODAGAとの結合のために使用される。アドネクチンの64Cu標識のために、50倍モル過剰のマレイミド-NODAGA(CheMatech)を、PBS(pH7.4)に溶解して、精製したアドネクチンに1mM TCEP存在下で加えた。最終DMSO濃度は、コンジュゲーション混合物において5%を超えなかった。コンジュゲーション混合物を、室温にて1時間放置して、質量分光分析を行った。コンジュゲーションのMSによる確認の後に、試料を、PBS(pH7.2)により平衡化したHiLoad 26/60 Superdex 75 column(GE Healthcare)を用いるサイズ排除クロマトグラフィーにより精製した。
64Cu-A02-NODAGAの合成
[64Cu]-塩化銅(64CuCl2)/0.1N 塩酸溶液を、0.1N 酢酸ナトリウム(NaOAc)水溶液(0.8mL)を用いて4分間周囲温度で中和した。64Cu/NaOAc溶液(1mL)を、A02-NODAGA(30μL, 1.6 mg/mL)に加えて、粗製反応を、穏やかにピペッティングを行い、混合して、周囲温度で30分間静置した。粗製反応混合物の内容物を、試料を重層する前に1xリン酸塩緩衝生理食塩水(PBS, pH7.4)緩衝液(20mL)を用いて予め活性化したPD-10脱塩カラムに移した。更に1xPBS(1.5mL)、次いで更に1XPBS溶液(0.8ml)をカラムに加えて、これらの画分を廃棄した。次いで[64Cu]-A02-NODAGAを集めた。PD-10カラムの1.2mL溶出後に集めて、10.79mCiを目的とする生成物として得た。クオリティーコントロールを、Agilent PLRP-S HPLCカラムサイズ:250 x 4.60 mm, 8 μm, 280 nmおよび移動相、0.1%ギ酸/蒸留水およびアセトニトリルを用いる逆相HPLCシステムを用いて測定した。グラジエント方法を使用したが、この場合アセトニトリルの%は、30分の時間をかけて10%~45%まで直線的に増加させた。[64Cu]-A02-NODAGAは、HPLCクロマトグラムで22分にて参照標準の出現と共に同時に溶出した。放射性化学的な純度は、この方法を用いて96%であると測定された。[64Cu]-A02-NODAGAはまた、サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)カラム:GE Superdex 200 GL Size:10 x 300 mm, 280 nmを用いて、20分時に参照物質と共に共溶出された。Nanodropタンパク質濃度と単離された精製試料の放射活性に基づいて、計算された比活性は956.8mCi/μmolであった。
[64Cu]-塩化銅([64Cu]CuCl2)/0.1N 塩酸溶液(20mCi/0.25 mL)を、0.1N 酢酸アンモニウム緩衝液(1.10 mL)を用いてpH調整して、次いで混合し、1XPBS水溶液(40μL, 1.2mg/mL, 4.62nmol)中で30分間周囲温度にてE01-NODAGAアドネクチンとインキュベートした。インキュベーション30分後に、この反応混合物(~1250μL)を、PD-10脱塩カラム(GE Healthcare Life Science, Sephadex G25 Medium, 14.5 x 50 mm - 1X PBS(40 mL)を用いて平衡化)および試料を、カラムに全て入れて、1XPBS(1.1 mL)と共に付した。液体をカラムに完全に通過させた後に、この生成物を、試料バイアルあたり1X PBSの1mLで漸増溶出により集めた。64Cu-E01-NODAGAを、二番目の1ml画分中に単離し、9.26 mCi/1mlの1XPBSであると測定した。この試料を、UV/vis検出機器(λ=280nm)、posi-ram検出機器およびSuperdex 200 10/300 GLサイズ排除カラム(GE Healthecare Life Science, グラジエント13 μm)を備えたAgilent HPLCシステムを用いる分析用サイズ排除HPLC方法を用いて分析した。流量は0.5mL/分であり、水性移動相は、60分間の1X PBS(0.02% NaN3を用いたイソクラティックである。放射性化学純度は、この系を用いて99%であり、生成物は、非放射性の参照標準と共溶出した。比活性は、3点校正曲線(y=656978x)方程式に基づいて計算された。バイアル3からの約100μLの生成物溶液を、Superdex-200 サイズ排除カラムに入れた。生成物のピークを集めて、測定すると0.74mCiであり、生成物ピークのUVカウントは156367ユニットであり、比活性は3.1mCi/nmolであった。
この実験において、64Cu-E01 抗PD-L1アドネクチン(NODAGAをキレート剤として使用した)が、インビトロでのhPD-L1-陽性細胞およびhPD-L1-陰性細胞を識別するその能力について試験した。hPD-L1-陰性HT-29細胞(hPD-L1-陽性L2987細胞と比較して、細胞に関連する比活性が44.6×高い)と比較して、64Cu-E01とhPD-L1-陽性L2987細胞との示差的会合により明らかであるが、細胞標識化は特異的であった。過剰量の450nMのコールド(非標識)E01アドネクチン(99.6%の低下)と共に共インキュベーションした場合、細胞に会合した64Cu-E01の顕著な低下により、比活性を更に確認した。細胞を450nMのコールド(非標識)非-PD-L1結合アドネクチン(図3)と共インキュベーションした場合、細胞に会合した18F-E01が最小の減少を示した(9.9%低下、有意ではない)。
ヒトの肺腫瘍組織をOCTに設置し、2-メチルブタン中で2-5分間、冷凍するまで冷却した。使用までサンプルを-80℃の冷凍庫に保存した。ヒトの異種移植片組織もまた、当該アッセイにおいてインキュベートした。両側性の異種移植片を有するマウスは、4×106のhPD-L1(+)L2987細胞および1.5×106のhPD-L1(-)HT-29t細胞を、nu/nuマウスの両側に皮下投与することで生成した。異種移植腫瘍が適切な大きさ(およそ200-300mm3)に到達した後に、マウスを2%イソフルランによって麻酔し、頸椎脱臼によって犠牲にした。新たな腫瘍組織を切除し、OCTに浸し、2-メチルブタン中で2-5分間、冷凍するまで冷却した。次いで組織をfoil/ZIPLOC(登録商標)袋に包み、使用まで-80℃で保存した。全ての組織(ヒトの肺腫瘍および異種移植片)について、5μmの厚さの切片(2切片/スライドを回収した)を低温保持装置を用いて切り取り、顕微鏡のガラススライド上で解凍し、およそ30分間空気乾燥させた。
手順:
非カセット型のGE TRACERlab FX2 N合成モジュールを用いて、[18F]-3-(2-(2-(2-(2-アジドエトキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)-2-フルオロピリジンの自動合成を行った。合成ユニットの配置は表4にまとめられる。[18F]-フルオライド水溶液(2.0ml、29.6GBq/800mCi)が、Sep-Pak light QMAに移された[Sep-Pak light QMAカートリッジは使用前に、5mlの0.5Mの炭酸水素カリウム、5mlの脱イオン水、および5mlのアセトニトリルの順で前処理を行った]。この移動が完了すると、反応容器に溶出混合液を加えることによって(「V1」から)、[18F]フルオライド水溶液をQMA Sep-Pakから溶出させた。溶媒を窒素の穏やかな気流および真空下で蒸発させた。前駆体の溶液を(「V3」から)乾燥クリプタンド残留物に加え、この反応混合物を120℃で10分間加熱した。次いで、4mlの蒸留水を(「V4」から)反応容器中の粗製反応混合物に加え、混合物を、ローディングの終わりを制御する液体センサーを介して、セミ-分取HPLCの5mlサンプル注入ループに移した。混合物をセミ-分取HPLCカラム(Luna C18(2).250x10mm、Phenomenex)にロードした。0.1%トリフルオロ酢酸水溶液中の35%アセトニトリルの混合液を、毎分4.6mlの速度でカラムに通した。生成物をこのHPLCカラムから、15mlの蒸留水を含む希釈フラスコに回収し、全ての内容物を、tC18 1グラムの固相抽出カートリッジに移した。3mlのエタノールによって、このカートリッジから352mCi(13GBq)の[18F]-3-(2-(2-(2-(2-アジドエトキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)-2-フルオロピリジンが溶出され(「V14」から)、アルキンを含む適切な生体分子との「クリック」アジド-アルキン反応を利用した18F標識生物学的製剤の生成に用いられうる。
手順:
カセット型のIBA Synthera合成モジュールおよび適切に組み立てた流体プロセッサー積算キットを用いて、[18F]-3-(2-(2-(2-(2-アジドエトキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)-2-フルオロピリジンの自動合成を行った。この合成のために、流体プロセッサー積算(IFP)キットは適切な前駆体とともにロードされ、表2にまとめられる。精製は、VarianのHPLCユニットにおいて行われた。HPLCの注入ループの充填は、HPLCユニットの安定窒素気流によってコントロールされた。両方の自動装置の組み立ては、表2にまとめられる。[18F]-フルオライド水溶液(2.0ml、29.6GBq/800mCi)が、Sep-Pak light QMAに移された[Sep-Pak light QMAカートリッジは使用前に、5mlの0.5Mの炭酸水素カリウム、5mlの脱イオン水、および5mlのアセトニトリルの順で前処理を行った]。この移動が完了すると、反応容器に溶出混合液を加えることによって(「V1」から)、[18F]フルオライド水溶液をQMA Sep-Pakから溶出させた。溶媒を窒素の穏やかな気流および真空下で蒸発させた。前駆体の溶液を(「V2」から)乾燥クリプタンド残留物に加え、この反応混合物を120℃で10分間加熱した。次いで、3mlの蒸留水を(「V4」から)反応容器中の粗製反応混合物に加え、混合物を、ローディングの終わりを制御する液体センサーを介して、セミ-分取HPLCの5mlサンプル注入ループに移した。混合物をセミ-分取HPLCカラム(Luna C18(2).250x10mm、Phenomenex)にロードした。0.1%トリフルオロ酢酸水溶液中の35%アセトニトリルの混合液を、毎分4.6mlの速度でカラムに通した。生成物をこのHPLCカラムから、15mlの蒸留水を含む希釈フラスコに回収し、全ての内容物を、tC18 1グラムの固相抽出カートリッジに移した。3mlのエタノールによって、このカートリッジから352mCi(12GBq)の[18F]-3-(2-(2-(2-(2-アジドエトキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)-2-フルオロピリジンが溶出され、アルキンを含む適切な生体分子との「クリック」アジド-アルキン反応を利用した18F標識生物学的製剤の生成に用いられうる。
68Ga-E01-NODAGAの合成
[68Ga]-ガリウムクロリド/0.1N 塩酸溶液を、4分間周囲温度で、酢酸ナトリウム(NaOAc)(32mg)を用いて中和して、得られる溶液を撹拌して、確実に全容量を適切に混和した。次いで、この溶液を、E01-NODAGA(15μL, 1.3mg/mL)溶液に加えて、粗製反応を、穏やかにピペッティングして、混合し、周囲温度で15分間静置した。粗製反応混合物を、試料を重層する前に1xリン酸塩緩衝生理食塩緩衝液(PBS, pH7.4)(20mL)を用いて予め活性化されたPD-10脱塩カラムに移した。追加の1XPBS(1.5mL)を、カラムに加えて、その後更なる0.8ml 1XPBS溶液を加えて、これらの画分を廃棄した。次いで、PD-10カラムの1.4mL溶出後の[68Ga]-E01-NODAGAを集めて、5.78mCi(214MBq)を目的とする生成物として得た。クオリティーコントロールを、Agilent PLRP-S HPLC column サイズ:250 x 4.60 mm、8μm、280 nmおよび0.1%ギ酸/蒸留水およびアセトニトリルの移動相を用いる逆相HPLCシステムを用いて測定した。グラジエント方法を用いたが、この場合アセトニトリルのパーセントを、30分間かけて10%から45%に直線的に増加させた。[68Ga]-E01-NODAGAは、22分にて、HPLCクロマトグラム参照標準と共に共溶出した。放射性化学純度を、この方法を用いて測定すると98%であった。[68Ga]-E01-NODAGAは、サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)カラム:GE Superdex 200 GL サイズ:10 x 300 mm, 280 nmを用いて、20分間で参照物質と共に共溶出した。
当業者は、明細書に記述した特定の実施態様に関する多くの等価物を認識するか、または通常の実験を用いて達成することができるであろう。そのような等価物は、本発明の範囲内に含まれ得ることを意図する。
Claims (21)
- フィブロネクチンIII型第10ドメイン(10Fn3)を含むポリペプチドであって、ここで、(a)該10Fn3ドメインは、AB、BC、CD、DE、EFおよびFGループを含み、(b)該BC、DEおよびFGループは、それぞれ配列番号:81、82および83で示されるアミノ酸配列を有し、(c)該 10 Fn3ドメインは、配列番号:574-583からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むN-末端リーダーおよび/又は配列番号:584-618からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むC-末端領域を含み、ならびに該ポリペプチドは、10nM以下のK D にてPD-L1に特異的に結合する、ポリペプチド。
- 該10Fn3ドメインの非BC、DEおよびFGループ領域のアミノ酸配列が配列番号:80で示されるアミノ酸配列の非BC、DEおよびFGループ領域のアミノ酸配列と、少なくとも90%同一である、請求項1に記載のポリペプチド。
- 該10Fn3ドメインが配列番号:80で示されるアミノ酸配列を含む、請求項2に記載のポリペプチド。
- 該 10 Fn3ドメインがアミノ酸PmXnを含むC-末端部分を含んでおり、ここでPはプロリンであり、Xは任意のアミノ酸であり、該PmXnを含むC-末端部分がPI、PC、PID、PIE、PIDK(配列番号:605)、PIEK(配列番号:606)、PIDKP(配列番号:607)、PIEKP(配列番号:608)、PIDKPS(配列番号:609)、PIEKPS(配列番号:610)、PIDKPC(配列番号:611)、PIEKPC(配列番号:612)、PIDKPSQ(配列番号:613)、PIEKPSQ(配列番号:614)、PIDKPCQ(配列番号:615)、PIEKPCQ(配列番号:616)、PHHHHHH(配列番号:617)およびPCHHHHHH(配列番号:618)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項1~3のいずれか1項に記載のポリペプチド。
- PmXn部分のアミノ酸配列がPCである、請求項4に記載のポリペプチド。
- 該10Fn3ドメインが配列番号:88のアミノ酸配列を含む、請求項1に記載のポリペプチド。
- 検出可能な標識を含む、請求項1~6のいずれか1項に記載のポリペプチドを含むイメージング剤。
- 検出可能な標識が 46 Cu、124I、 76/77 Br、 86Y、89Zr、 86 Ga、 18 F、11C、 251 I、124I、131I、123I、 23 Cl、33Cl、34Cl、74Br、75Br、76Br、77Br、78Br、89Zr、186Re、188Re、 09 Y、177Lu、99Tc、または153Smからなる群から選択される放射性核種である、請求項7に記載のイメージング剤。
- 検出可能な標識が1以上のアミノ酸残基で10Fn3ドメインとコンジュゲートしている、請求項7又は8に記載のイメージング剤。
- 検出可能な標識がキレート剤により10Fn3ドメインと結合される、請求項8又は9に記載のイメージング剤。
- キレート剤がDFO、DOTA、CB-DO2A、3p-C-DEPA、TCMC、オキソ-DO3A、DBCO、DIBO、BARAC、DIMAC、TE2A、CB-TE2A、CB-TE1A1P、CB-TE2P、MM-TE2A、DM-TE2A、diamsar、NODASA、NODAGA、NOTA、NETA、TACN-TM、DTPA、1B4M-DTPA、CHX-A''-DTPA、TRAP、NOPO、AAZTA、DATA、H2dedpa、H4octapa、H2azapa、H5decapa、H6phospa、HBED、SHBED、BPCA、CP256、PCTA、HEHA、PEPA、EDTA、TETAおよびTRITAからなる群から選択される、請求項10に記載のイメージング剤。
- キレート剤がジベンゾシクロオクチン(DIBO)、ビアリールアザシクロオクチノン(BARAC)、ジメトキシアザシクロオクチン(DIMAC)およびジベンゾシクロオクチン(DBCO)からなる群から選択される、請求項10に記載のイメージング剤。
- キレート剤がDBCO-PEG4-NHS-エステル、DBCO-スルホ-NHS-エステル、DBCO-PEG4-酸、DBCO-PEG4-アミン又はDBCO-PEG4-マレイミドである、請求項10に記載のイメージング剤。
- 放射性核種が64Cuである、請求項8~13のいずれか1項に記載のイメージング剤。
- 放射性核種が68Gaである、請求項8~13のいずれか1項に記載のイメージング剤。
- キレート剤のマレイミド基がポリペプチドのC-末端システイン残基上のチオール基に共有結合している、請求項16に記載のイメージング剤。
- 請求項1~6のいずれか1項に記載のポリペプチドまたは請求項7~17のいずれか1項に記載のイメージング剤および許容できる担体を含む医薬組成物。
- 放射活性物質にコンジュゲートした配列番号:88で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドを含む医薬組成物。
- 対象におけるPD-L1発現腫瘍の存在を検出する方法に用いるための請求項18又は19に記載の医薬組成物であって、該方法が、該対象の少なくとも一部分の放射線画像におけるイメージング剤の存在又は非存在を検出する工程を含み、
ここで、バックグラウンドを超える前記イメージング剤の存在および位置は、PD-L1発現腫瘍の存在および位置の指標である、医薬組成物。 - 対象におけるPD-L1発現腫瘍に対する抗腫瘍治療の経過をモニターする方法に用いるための請求項18又は19に記載の医薬組成物であって、該方法が
(a)該対象の少なくとも一部分の画像から腫瘍のサイズを検出する工程;次いで
(b)その後の1以上の時点で該対象の少なくとも一部分の画像を得る工程を含み、
ここで、各時点での腫瘍の体積および位置は、PD-L1発現腫瘍に対する抗腫瘍治療の経過の指標である、医薬組成物。
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