JP7259985B2 - 質量分析方法及び質量分析装置 - Google Patents
質量分析方法及び質量分析装置 Download PDFInfo
- Publication number
- JP7259985B2 JP7259985B2 JP2021555644A JP2021555644A JP7259985B2 JP 7259985 B2 JP7259985 B2 JP 7259985B2 JP 2021555644 A JP2021555644 A JP 2021555644A JP 2021555644 A JP2021555644 A JP 2021555644A JP 7259985 B2 JP7259985 B2 JP 7259985B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- ions
- product
- ion
- mass
- spectrum data
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 68
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 title claims description 24
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 claims description 396
- 239000002243 precursor Substances 0.000 claims description 109
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 claims description 80
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 67
- 238000005259 measurement Methods 0.000 claims description 48
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 claims description 44
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 claims description 43
- 239000011261 inert gas Substances 0.000 claims description 42
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 claims description 31
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 claims description 31
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 21
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 12
- 238000000605 extraction Methods 0.000 claims description 12
- 230000003595 spectral effect Effects 0.000 claims description 11
- YZCKVEUIGOORGS-IGMARMGPSA-N Protium Chemical compound [1H] YZCKVEUIGOORGS-IGMARMGPSA-N 0.000 claims description 9
- 150000003254 radicals Chemical class 0.000 description 49
- 238000005040 ion trap Methods 0.000 description 38
- 101100204059 Caenorhabditis elegans trap-2 gene Proteins 0.000 description 32
- -1 hydrogen radicals Chemical class 0.000 description 26
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 26
- 238000001360 collision-induced dissociation Methods 0.000 description 25
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 14
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 11
- 239000000543 intermediate Substances 0.000 description 7
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 6
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 6
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 6
- REFJWTPEDVJJIY-UHFFFAOYSA-N Quercetin Chemical compound C=1C(O)=CC(O)=C(C(C=2O)=O)C=1OC=2C1=CC=C(O)C(O)=C1 REFJWTPEDVJJIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000001133 acceleration Effects 0.000 description 4
- 230000005684 electric field Effects 0.000 description 4
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 4
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 4
- 238000001294 liquid chromatography-tandem mass spectrometry Methods 0.000 description 4
- 150000002894 organic compounds Chemical class 0.000 description 4
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 4
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 150000001793 charged compounds Chemical class 0.000 description 3
- 229910001873 dinitrogen Inorganic materials 0.000 description 3
- 238000003385 ring cleavage reaction Methods 0.000 description 3
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 3
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 3
- XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N Argon Chemical compound [Ar] XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZVOLCUVKHLEPEV-UHFFFAOYSA-N Quercetagetin Natural products C1=C(O)C(O)=CC=C1C1=C(O)C(=O)C2=C(O)C(O)=C(O)C=C2O1 ZVOLCUVKHLEPEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HWTZYBCRDDUBJY-UHFFFAOYSA-N Rhynchosin Natural products C1=C(O)C(O)=CC=C1C1=C(O)C(=O)C2=CC(O)=C(O)C=C2O1 HWTZYBCRDDUBJY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 2
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 2
- MWDZOUNAPSSOEL-UHFFFAOYSA-N kaempferol Natural products OC1=C(C(=O)c2cc(O)cc(O)c2O1)c3ccc(O)cc3 MWDZOUNAPSSOEL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000001819 mass spectrum Methods 0.000 description 2
- 230000005405 multipole Effects 0.000 description 2
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 2
- 229960001285 quercetin Drugs 0.000 description 2
- 235000005875 quercetin Nutrition 0.000 description 2
- 238000012916 structural analysis Methods 0.000 description 2
- LLKFNPUXQZHIAE-UHFFFAOYSA-N 5-(3-aminopropyl)-8-bromo-3-methyl-2h-pyrazolo[4,3-c]quinolin-4-one Chemical compound O=C1N(CCCN)C2=CC=C(Br)C=C2C2=C1C(C)=NN2 LLKFNPUXQZHIAE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RZVAJINKPMORJF-UHFFFAOYSA-N Acetaminophen Chemical compound CC(=O)NC1=CC=C(O)C=C1 RZVAJINKPMORJF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 229910052786 argon Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 238000010504 bond cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 238000005094 computer simulation Methods 0.000 description 1
- 230000003111 delayed effect Effects 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 239000012777 electrically insulating material Substances 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 1
- 239000001307 helium Substances 0.000 description 1
- 229910052734 helium Inorganic materials 0.000 description 1
- SWQJXJOGLNCZEY-UHFFFAOYSA-N helium atom Chemical compound [He] SWQJXJOGLNCZEY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000000126 in silico method Methods 0.000 description 1
- 238000000816 matrix-assisted laser desorption--ionisation Methods 0.000 description 1
- 230000037353 metabolic pathway Effects 0.000 description 1
- 238000002705 metabolomic analysis Methods 0.000 description 1
- 230000001431 metabolomic effect Effects 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 1
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 1
- 239000005297 pyrex Substances 0.000 description 1
- 238000004088 simulation Methods 0.000 description 1
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 1
- 230000000087 stabilizing effect Effects 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- H—ELECTRICITY
- H01—ELECTRIC ELEMENTS
- H01J—ELECTRIC DISCHARGE TUBES OR DISCHARGE LAMPS
- H01J49/00—Particle spectrometers or separator tubes
- H01J49/004—Combinations of spectrometers, tandem spectrometers, e.g. MS/MS, MSn
- H01J49/0045—Combinations of spectrometers, tandem spectrometers, e.g. MS/MS, MSn characterised by the fragmentation or other specific reaction
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N27/00—Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means
- G01N27/62—Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means by investigating the ionisation of gases, e.g. aerosols; by investigating electric discharges, e.g. emission of cathode
-
- H—ELECTRICITY
- H01—ELECTRIC ELEMENTS
- H01J—ELECTRIC DISCHARGE TUBES OR DISCHARGE LAMPS
- H01J49/00—Particle spectrometers or separator tubes
- H01J49/26—Mass spectrometers or separator tubes
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Electrochemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)
Description
本発明は、質量分析方法及び質量分析装置に関する。
生体に生じる疾病の要因を特定することなどを目的として代謝物の構造解析が行われている。有機酸やアミノ酸といった低分子化合物（低分子代謝物）の網羅的な構造解析はメタボローム解析（あるいはメタボロミクス）と呼ばれる。ヒトの場合、メタボローム解析の対象となる代謝物は3000種類以上存在し、それらが誘導体化したものや代謝経路における中間体などを含めるとさらに多くの代謝物が存在する。
メタボローム解析では、液体クロマトグラフと質量分析装置を組み合わせてなる液体クロマトグラフ質量分析装置を用いたLC-MS/MS分析が行われることが多い。LC-MS/MS分析では、液体クロマトグラフのカラムに液体試料を導入して解析対象の試料成分を他の成分から分離し、質量分析装置に導入する。質量分析装置では、該試料成分をイオン化し、生成されたイオンの中から特定の質量電荷比を有するイオンをプリカーサイオンとして選別する。続いて、そのプリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成する。そして、生成したプロダクトイオンを質量電荷比に応じて分離して検出することによりプロダクトイオンスペクトルのデータを取得する。
LC-MS/MSにおいてイオンを解離させる代表的な方法として、プリカーサイオンと窒素ガス等の不活性ガス分子の衝突により該プリカーサイオンを解離させる、衝突誘起解離（CID: Collision-Induced Dissociation）法が知られている。CID法では、通常、プリカーサイオンに運動エネルギーを付与して加速し不活性ガス分子に衝突させる。CID法では不活性ガス分子との衝突のエネルギーによってイオンを解離させるため、様々な部位でプリカーサイオンを解離させることができる。
Luciano H. Di Stefano, Dimitris Papanastasiou, and Roman A. Zubarev, "Size-Dependent Hydrogen Atom Attachment to Gas-Phase Hydrogen-Deficient Polypeptide Radical Cations", J. Am. Chem. Soc. 2018, 140, 2, 531-533
Wolf, S., Schmidt, S., Muller-Hannemann, M., & Neumann, S., "In silico fragmentation for computer assisted identification of metabolite mass spectra", BMC Bioinformatics, 11, (2010), 148.
Hidenori Takahashi, Sadanori Sekiya, Takashi Nishikaze, Kei Kodera, Shinichi Iwamoto, Motoi Wada, Koichi Tanaka, "Hydrogen Attachment/Abstraction Dissociation (HAD) of Gas-Phase Peptide Ions for Tandem Mass Spectrometry.", Anal. Chem. 2016, 88 (7), pp 3810-3816
CID法では様々な部位でプリカーサイオンが解離し、解離部位の選択性が低い。メタボローム解析の対象となる代謝物は一般に有機化合物であり、その多くは環状部を有する。そのため、LC-MS/MS分析で検出されたプロダクトイオンがプリカーサイオンの環状部の解離（環開裂）と鎖状部の解離（鎖状部の切断）のいずれにより生じたものであるかは構造解析に有用な情報となるが、CID法ではそのような情報を得ることが難しいという問題があった。
本発明が解決しようとする課題は、有機化合物である試料成分由来のプリカーサイオンの解離によって生成したプロダクトイオンが、プリカーサイオンの環状部と鎖状部のいずれの解離により生じたものであるかについての情報を得ることができる技術を提供することである。
上記課題を解決するために成された本発明に係る質量分析方法は、
試料成分由来のプリカーサイオンと不活性ガス分子の衝突により該プリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成し、該プロダクトイオンを質量電荷比に応じて分離し検出することにより第１プロダクトイオンスペクトルデータを取得し、
前記プリカーサイオンと水素ラジカルの反応により該プリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成し、該プロダクトイオンを質量電荷比に応じて分離し検出することにより第２プロダクトイオンスペクトルデータを取得し、
前記第１プロダクトイオンスペクトルデータと前記第２プロダクトイオンスペクトルデータにおいて、所定の質量電荷比の差を有するプロダクトイオンの組を抽出する。
試料成分由来のプリカーサイオンと不活性ガス分子の衝突により該プリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成し、該プロダクトイオンを質量電荷比に応じて分離し検出することにより第１プロダクトイオンスペクトルデータを取得し、
前記プリカーサイオンと水素ラジカルの反応により該プリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成し、該プロダクトイオンを質量電荷比に応じて分離し検出することにより第２プロダクトイオンスペクトルデータを取得し、
前記第１プロダクトイオンスペクトルデータと前記第２プロダクトイオンスペクトルデータにおいて、所定の質量電荷比の差を有するプロダクトイオンの組を抽出する。
上記課題を解決するために成された本発明の別の一態様に係る質量分析装置は、
試料成分由来のプリカーサイオンが導入される反応室と、
前記反応室に不活性ガスを導入する不活性ガス導入部と、
前記反応室に水素ラジカルを導入する水素ラジカル導入部と、
前記反応室から出射するイオンを質量電荷比に応じて分離して検出するイオン検出部と、
前記不活性ガス導入部及び前記イオン検出部を制御する制御部であって、前記プリカーサイオンと不活性ガス分子の衝突により該プリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成し、前記イオン検出部で検出することにより第１プロダクトイオンスペクトルデータを取得する第１測定制御部と、
前記水素ラジカル導入部及び前記イオン検出部を制御する制御部であって、前記プリカーサイオンと水素ラジカルの反応により該プリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成し、前記イオン検出部で検出することにより第２プロダクトイオンスペクトルデータを取得する第２測定制御部と、
同一のプリカーサイオンについて得られた前記第１プロダクトイオンスペクトルデータと前記第２プロダクトイオンスペクトルデータにおいて、所定の質量差を有するプロダクトイオンの組を抽出するプロダクトイオン組抽出部と
を備える。
試料成分由来のプリカーサイオンが導入される反応室と、
前記反応室に不活性ガスを導入する不活性ガス導入部と、
前記反応室に水素ラジカルを導入する水素ラジカル導入部と、
前記反応室から出射するイオンを質量電荷比に応じて分離して検出するイオン検出部と、
前記不活性ガス導入部及び前記イオン検出部を制御する制御部であって、前記プリカーサイオンと不活性ガス分子の衝突により該プリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成し、前記イオン検出部で検出することにより第１プロダクトイオンスペクトルデータを取得する第１測定制御部と、
前記水素ラジカル導入部及び前記イオン検出部を制御する制御部であって、前記プリカーサイオンと水素ラジカルの反応により該プリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成し、前記イオン検出部で検出することにより第２プロダクトイオンスペクトルデータを取得する第２測定制御部と、
同一のプリカーサイオンについて得られた前記第１プロダクトイオンスペクトルデータと前記第２プロダクトイオンスペクトルデータにおいて、所定の質量差を有するプロダクトイオンの組を抽出するプロダクトイオン組抽出部と
を備える。
本発明に係る質量分析方法及び質量分析装置は、主として有機化合物である試料成分の分析に用いられるものであり、そうした試料成分由来のプリカーサイオンと不活性ガス分子の衝突によりプリカーサイオンを解離させるCID法により生成したプロダクトイオンを質量電荷比に応じて分離し検出することにより第１プロダクトイオンスペクトルデータを取得する。また、試料成分由来のプリカーサイオンと水素ラジカルの反応によりプリカーサイオンを解離させる水素付着解離（HAD: Hydrogen-Attached Dissociation）法で生成したプロダクトイオンを質量電荷比に応じて分離し検出することにより第２プロダクトイオンスペクトルデータを取得する。発明者が行った測定によれば、鎖状部でプリカーサイオンが解離して生成されたプロダクトイオンではCIDによる解離とHADによる解離でプロダクトイオンの質量電荷比に差がない一方、環状部でプリカーサイオンが解離して生成されたプロダクトイオンでは、CIDによる解離とHADによる解離で、プロダクトイオンに特定の（典型的には2Da）の質量電荷比の差が生じることが分かった。本発明に係る質量分析方法及び質量分析装置はこの知見に基づくものであり、同一のプリカーサイオンについて得られた第１プロダクトイオンスペクトルデータと第２プロダクトイオンスペクトルデータにおいて、所定の質量電荷比の差を有するプロダクトイオンの組を抽出する。これにより、抽出された組のプロダクトイオンが環状部におけるプリカーサイオンの解離により生じたものであることを推定することができる。
本発明に係るイオン分析装置の実施例について、以下、図面を参照して説明する。実施例のイオン分析装置は、イオントラップ－飛行時間型（IT-TOF型）質量分析装置である。
図１に実施例のイオントラップ－飛行時間型質量分析装置（以下、単に「質量分析装置」とも呼ぶ。）の概略構成を示す。実施例の質量分析装置は、所定の真空雰囲気に維持される図示しない真空チャンバの内部に、試料中の成分をイオン化するイオン源１と、イオン源１で生成されたイオンを高周波電場の作用により捕捉するイオントラップ２と、イオントラップ２から出射されたイオンを質量電荷比に応じて分離する飛行時間型質量分離部３と、分離されたイオンを検出するイオン検出器４とを備える。本実施例のイオントラップ質量分析装置はさらに、イオントラップ２内に水素ラジカルを導入するためのラジカル生成・照射部５と、イオントラップ２内に不活性ガスを導入する不活性ガス供給部６と、トラップ電圧発生部７１と、機器制御部７２と、制御・処理部９とを備える。
本実施例の質量分析装置のイオン源１には、ESI源やMALDIイオン源など、試料成分のイオン化に適した適宜のイオン源が用いられる。本実施例のイオントラップ２は、円環状のリング電極２１と、該リング電極２１を挟んで対向配置された一対のエンドキャップ電極（入口側エンドキャップ電極２２、出口側エンドキャップ電極２４）とを含む三次元イオントラップである。リング電極２１にはラジカル導入口２６とラジカル排出口２７が形成されている。また、入口側エンドキャップ電極２２にはイオン導入孔２３が形成されている。さらに、出口側エンドキャップ電極２４にはイオン出射孔２５が形成されている。
飛行時間型質量分離部３は複数の電極を含み、イオントラップ２から出射するイオンをイオン検出器４に入射させる。トラップ電圧発生部７１は、機器制御部７２からの指示に応じて、リング電極２１、入口側エンドキャップ電極２２、及び出口側エンドキャップ電極２４、並びに飛行時間型質量分離部３を構成する電極のそれぞれに対して所定のタイミングで高周波電圧と直流電圧のいずれか一方又はそれらを合成した電圧を印加する。
ラジカル生成・照射部５は、内部にラジカル生成室５２を有するノズル５４と、ラジカル生成室５２を排気する真空ポンプ（真空排気部）５７と、ラジカル生成室５２内で真空放電を生じさせるためのマイクロ波を供給する誘導結合型の高周波プラズマ源５３とを備えている。また、ラジカル生成・照射部５は、ラジカルの原料となる水素ガスを供給する水素ガス供給源５１を備えている。水素ガス供給源５１からラジカル生成室５２に原料ガスを供給する流路には、水素ガスの流量を調整するためのバルブ５６が設けられている。ノズル５４の噴出口の前方にはスキマー５５が設けられており、このスキマー５５によってガス分子が除去されるとともに水素ラジカルが細径のビーム状に成形される。本実施例では水素ガスを原料として水素ラジカルを生成するが、水蒸気等の他の種類のガスを原料ガスとして水素ラジカルを生成することもできる。
図２に示すように、高周波プラズマ源５３は、マイクロ波供給源５３１とスリースタブチューナー５３２を備えている。ノズル５４は外周部を構成する接地電極５４１、その内側にトーチ５４２を備えており、該トーチ５４２の内部がラジカル生成室５２となる。ラジカル生成室５２の内部では、コネクタ５４４を介して高周波プラズマ源５３と接続されたニードル電極５４３がラジカル生成室５２の長手方向に貫通している。トーチ５４２には電気絶縁性を有するもの、例えばガラス製のものを用いることができ、その一例としてパイレックス（登録商標）ガラスが挙げられる。
不活性ガス供給部６は、ヘリウムガス、窒素ガス、あるいはアルゴンガスといった不活性ガスを供給する不活性ガス供給源６１と、該不活性ガス供給源から供給される不活性ガスをイオントラップ２内に導入するガス流路６３とを備えている。イオントラップ２に供給される不活性ガスの量は、バルブ６２により調整される。
制御・処理部９は、記憶部９１のほかに、機能ブロックとして測定制御部９２、スペクトル作成部９３、プロダクトイオン組抽出部９４、化合物推定部９５、及び判定部９６を備えている。記憶部９１には、複数の既知の化合物のそれぞれについて、名称、プロダクトイオンスペクトルデータ、及びそのデータ取得に係る測定条件などを対応付けた情報を収録した化合物データベース（化合物DB）９１１が保存されている。本実施例の化合物データベースには、各化合物について衝突誘起解離（CID: Collision-Induced Dissociation）法で取得されたプロダクトイオンスペクトルデータと、水素付着解離（HAD: Hydrogen-Attached Dissociation）法で取得されたプロダクトイオンスペクトルデータの両方が収録されている。また、飛行時間型質量分離部３におけるイオンの飛行時間とイオンの質量電荷比を対応付けた飛行時間－質量電荷比変換情報も保存されている。測定制御部９２は、第１測定制御部９２１と第２測定制御部９２２を有している。制御・処理部９の実体は一般的なコンピュータであり、予めインストールされた質量分析用プログラムをプロセッサで実行することにより上記の各機能ブロックが具現化される。また、制御・処理部９には入力部９８と表示部９９が接続されている。
次に、実施例の質量分析装置における分析動作を説明する。使用者が測定開始を指示すると、第１測定制御部９２１が質量分析装置の各部を以下のように動作させる。
はじめに、真空ポンプ（図示略）により真空チャンバ内を所定の真空度まで排気する。続いて、イオン源１において試料成分をイオン化し、生成したイオンをパケット状にイオン源１から出射させる。イオン源１から出射したイオンは、入口側エンドキャップ電極２２に形成されているイオン導入孔２３を経てイオントラップ２の内部に導入される。イオントラップ２内に導入されたイオンは、トラップ電圧発生部７１からリング電極２１等に印加される電圧によってイオントラップ２内に形成される高周波電場で捕捉される。そのあと、トラップ電圧発生部７１からリング電極２１等に所定の電圧が印加され、それによって目的とする特定の質量電荷比を有するイオン以外の質量電荷比範囲に含まれるイオンは励振され、イオントラップ２から排除される。これにより、イオントラップ２内に、特定の質量電荷比を有するイオン（典型的には1価のプロトン付加分子イオン[M+H]+）を選択的に捕捉する。
続いて、不活性ガス供給部６のバルブ６２を開放し、不活性ガス供給源６１からイオントラップ２内に窒素ガスなどの不活性ガスを一定の流量で導入する。これによりプリカーサイオンがクーリングされ、イオントラップ２の中心付近に収束される。その後、トラップ電圧発生部７１からイオントラップ２を構成するリング電極２１、入口側エンドキャップ電極２２、及び出口側エンドキャップ電極２４のそれぞれに所定の高周波電圧を印加し、イオントラップ２内に高周波電場を形成してプリカーサイオンが振動させる。振動により運動エネルギーを付与されたプリカーサイオンは、イオントラップ２内に導入された不活性ガスとの衝突により解離してプロダクトイオンを生成する。プリカーサイオンは所定時間励振され、その間、不活性ガスとの衝突によりプリカーサイオンが解離してプロダクトイオンが生成される。バルブ６２の開度やプリカーサイオンを励振する時間は、予備実験の結果等に基づき事前に決めておくことができる。
生成されたプロダクトイオンは、一旦イオントラップ２内に捕捉される。その後、トラップ電圧発生部７１から入口側エンドキャップ電極２２と出口側エンドキャップ電極２４に直流電圧を印加してイオントラップ２内に電位勾配を形成する。これにより、イオントラップ２内に捕捉されたプロダクトイオンに一定の加速エネルギーが付与され、イオン出射孔２５から一斉に出射する。
一定の加速エネルギーを持ったプロダクトイオンは、飛行時間型質量分離部３の飛行空間に導入され、飛行空間を飛行する間に質量電荷比に応じて分離される。イオン検出器４は分離されたイオンを順次検出する。イオン検出器４からの出力信号は順次、記憶部９１に保存される。
第１測定制御部９２１による測定を完了すると、第２測定制御部９２２が質量分析装置の各部を以下のように動作させる。
はじめに、真空ポンプ（図示略）により真空チャンバ内を所定の真空度まで排気し、また、真空ポンプ５７によりラジカル生成室５２内を所定の真空度まで排気する。また、ラジカル生成・照射部５のバルブ５６を開放し、ラジカル生成室５２に水素ガス供給源５１から水素ガスが供給する。さらに、マイクロ波供給源５３１からマイクロ波を供給し、ラジカル生成室５２内で水素ラジカルを生成する。
続いて、イオン源１において試料成分をイオン化し、生成したイオンをパケット状にイオン源１から出射させる。イオン源１から出射したイオンは、入口側エンドキャップ電極２２に形成されているイオン導入孔２３を経てイオントラップ２の内部に導入される。イオントラップ２内に導入されたイオンは、トラップ電圧発生部７１からリング電極２１等に印加される電圧によってイオントラップ２内に形成される高周波電場で捕捉される。そのあと、トラップ電圧発生部７１からリング電極２１等に所定の電圧が印加され、それによって目的とする特定の質量電荷比を有するイオン以外の質量電荷比範囲に含まれるイオンは励振され、イオントラップ２から排除される。これにより、イオントラップ２内に、特定の質量電荷比を有するイオン（典型的には1価のプロトン付加分子イオン[M+H]+）を選択的に捕捉する。
その後、ラジカル生成・照射部５のラジカル生成室５２内で生成された水素ラジカルを含むガスをノズル５４から噴出させる。ノズル５４から噴出した水素ラジカルは、スキマー５５を通過してイオントラップ２に導入される。
このときにイオンに照射されるラジカルの流量が所定の流量になるように、バルブ５６の開度等は適宜に調整される。また、プリカーサイオンへのラジカルの照射時間も適宜に設定される。バルブ５６の開度やラジカルの照射時間は、予備実験の結果等に基づき事前に決めておくことができる。イオントラップ２に導入されたラジカルはプリカーサイオンに付着し、該プリカーサイオンに不対電子誘導型の解離を生じさせる。これによりプロダクトイオンが生成される。
生成されたプロダクトイオンは、一旦イオントラップ２内に捕捉される。その後、トラップ電圧発生部７１から入口側エンドキャップ電極２２と出口側エンドキャップ電極２４に直流電圧を印加してイオントラップ２内に電位勾配を形成する。これにより、イオントラップ２内に捕捉されたプロダクトイオンに一定の加速エネルギーが付与され、イオン出射孔２５から一斉に出射する。
一定の加速エネルギーを持ったプロダクトイオンは、飛行時間型質量分離部３の飛行空間に導入され、飛行空間を飛行する間に質量電荷比に応じて分離される。イオン検出器４は分離されたイオンを順次検出する。イオン検出器４からの出力信号は順次、記憶部９１に保存される。
第２測定制御部９２２による測定を完了すると、スペクトル作成部９３は、イオントラップ２からのイオンの出射時点を時刻ゼロとする飛行時間スペクトルを作成する。そして、記憶部９１に保存されている飛行時間－質量電荷比変換情報に基づいて飛行時間を質量電荷比に換算することにより、第１測定（CID法）のプロダクトイオンスペクトルデータと、第２測定（HAD法）のプロダクトイオンスペクトルデータを作成する。
第１測定のプロダクトイオンスペクトルデータと、第２測定のプロダクトイオンスペクトルデータが作成されると、プロダクトイオン組抽出部９４は、これらのプロダクトイオンスペクトルデータに含まれるピークの質量電荷比を相互に比較する。そして、所定の質量電荷比差を有するプロダクトイオンの組を抽出する。
ここで、CID法によるプリカーサイオンの解離とHAD法によるプリカーサイオンの解離について本発明者は以下のように推察した。
CID法によりプリカーサイオンを解離した場合、解離直後のプロダクトイオンとプリカーサイオンの残存部分（プリカーサイオンからプロダクトイオンが脱離した残りの部分）の双方が不安定なラジカル種になることがある。プリカーサイオンの環状部の開裂によってプロダクトイオンが生成される場合、2か所で環が切断されなければ、プリカーサイオンはプロダクトイオンとプリカーサイオンの残存部分に分離されない。そのため、1か所の環開裂が生じた時点では開裂部位が相互に近接した状態にあり、これらの間で水素ラジカルが受け渡される。これと同時に（あるいは多少遅れて）同じ環の別の箇所で環開裂が生じると、プロダクトイオンとプリカーサイオンの残存部分が分離されて離間する。プリカーサイオンが環状部で解離する過程でプロダクトイオンからプリカーサイオンの残存部分に対して水素ラジカルが受け渡されることにより、プロダクトイオンは非ラジカル種のイオンとなって安定化し、また、プリカーサイオンの残存部分も非ラジカル種の中性分子となって安定化する。逆に、プロダクトイオンに対してプリカーサイオンの残存部分から水素ラジカルが受け渡されることにより、プロダクトイオンは非ラジカル種のイオンとなって安定化し、また、プリカーサイオンの残存部分も非ラジカル種の中性分子となって安定化することもある（例えば非特許文献１）。
つまり、CID法では、プリカーサイオンが環状部で解離する際にラジカル種のプロダクトイオンから水素ラジカルが離脱して、又はラジカル種のプロダクトイオンに水素ラジカルが付着することによって非ラジカル種のプロダクトイオンとなるため、検出される非ラジカル種のプロダクトイオンの質量が、生成された時点のラジカル種のプロダクトイオンから±1Da変化することになる。プリカーサイオンが鎖状部で解離した場合には、プロダクトイオンとプリカーサイオンの残存部分がすぐに離間するため、上記のような水素ラジカルの受け渡しは起こりにくい。
一方、HAD法によりプリカーサイオンを解離した場合にも、解離直後には、プロダクトイオンとプリカーサイオンの残存部分（プリカーサイオンからプロダクトイオンが脱離した残りの部分）の双方が不安定なラジカル種になることがある。しかし、HAD法ではイオントラップ２内に大量の水素ラジカルが導入されるため、ラジカル種であるプロダクトイオンとラジカル種であるプリカーサイオンの残存部分の双方に水素ラジカルが付着し、プロダクトイオンは非ラジカル種のイオンとなって安定化し、また、プリカーサイオンの残存部分も非ラジカル種の中性分子となって安定化する。つまり、HAD法では、プロダクトイオンに水素ラジカルが付着するため、プロダクトイオンの質量が+1Da変化する。
CID法ではプリカーサイオンの環状部の解離により生じるプロダクトイオンの質量が±1Da変化し、HAD法ではプリカーサイオンの環状部の解離により生じるプロダクトイオンの質量が+1Da変化することから、プリカーサイオンの環状部の解離により生じるプロダクトイオンには2Daの差が生じうる。従って、これら2つの手法で取得されたプロダクトイオンスペクトルデータから、質量差が2Daであるプロダクトイオンの組を抽出することにより、該組のプロダクトイオンがプリカーサイオンの環状部の解離により生じたものであると推定することができる。
上記の質量差は解離部位ごとに生じうることから、プリカーサイオンが環状部の複数の位置で解離した場合にはさらに2Da以上の質量差が生じることになる。従って、上記所定の質量差には2Daだけでなく、4Daあるいは6Daも含めておくことができる。
プロダクトイオン組抽出部９４により、上記所定の質量差を有するプロダクトイオンの組が抽出されると、化合物推定部９５は、第１測定のプロダクトイオンスペクトルデータを化合物データベース９１１に収録されているCID法のプロダクトイオンスペクトルデータと照合する。そして、プロダクトイオンスペクトルデータに含まれるピークの位置（プロダクトイオンの質量電荷比）や強度の一致度からスコアを求め、スコアが高い順に所定数の化合物を化合物候補として選択する。スコアの算出はプロダクトイオンの組の抽出よりも先に行ってもよく、並行して行ってもよい。
次に、判定部９６は、プロダクトイオン組抽出部９４により抽出されたプロダクトイオン組のうち、CID法により生成されたプロダクトイオンの質量電荷比が、化合物候補由来の所定のプリカーサイオン（通常、1価のプロトン付加分子イオン）の環状部の解離により生じうる（即ち、環状部の解離によってその質量電荷比を有するプロダクトイオンが生成されうる）場合に、当該化合物候補のスコアに所定のスコアを加算する。加算するスコアの大きさは適宜に決めればよく、例えば、環状部の数や構造に特徴を有する化合物を同定しようとする場合には加算するスコアを大きくするとよい。これらの処理を行った後、化合物推定部９５はスコアが大きい順に所定数の化合物候補について、化合物の名称、及びCID法で取得されたマススペクトルを、第１測定のプロダクトイオンスペクトルとともに表示部９９に表示する。ここでは判定部９６による判定結果に基づいてスコアを加算するものとしたが、環状部の解離によって上記プロダクトイオンが生成されうるもののみを化合物候補として残すようにしてもよい。
ここでは、第１測定（CID法）のプロダクトイオンスペクトルデータを用いて化合物候補を選択する場合を例に説明したが、第２測定（HAD法）のプロダクトイオンスペクトルデータを用いて上記同様の処理を行うこともできる。その場合には、化合物データベース９１１に収録されている、HAD法で取得されたプロダクトイオンスペクトルデータを用いたスペクトルマッチングによりスコアを求めればよい。
また、化合物データベース９１１に収録されているプロダクトイオンスペクトルデータと実際の測定により得られたプロダクトイオンスペクトルデータのスペクトルマッチングを行って化合物候補を選択する代わりに、試料成分として推定される化学式と実際の測定により得られたマススペクトルデータに含まれるピークの位置（質量電荷比）及び強度の情報に基づいてコンピュータを用いたプリカーサイオンの解離シミュレーションを行って化合物候補を求めるようにしてもよい。そのようなソフトウェアとして、例えばMetFrag（非特許文献２参照）を用いることができる。
次に、上記実施例の質量分析装置を用いた実際の測定例を説明する。図３はケルセチンの測定結果である。上段は第１測定（CID法）で得られたプロダクトイオンスペクトル、下段は第２測定（HAD法）で得られたプロダクトイオンスペクトルである。
図３に示すとおり、第１測定で得られたプロダクトイオンスペクトルには、質量電荷比が135.01, 195.03, 257.01, 274.02である4つのピークが存在している。一方、第２測定で得られたプロダクトイオンスペクトルには、質量電荷比が137.01, 195.03, 259.04, 276.05である4つのピークが存在している。つまり、2Daの質量差を有するプロダクトイオンが3組（第１測定／第２測定：135.01/137.01, 257.01/259.04, 274.02/276.05）存在している。また、同じ質量（195.03）のプロダクトイオンが1組存在している。図３の左上に示す位置でそれぞれ示すように、2Daの質量差を有するプロダクトイオンの組はいずれも、環状部の解離により生じており、同じ質量のプロダクトイオンの組は鎖状部の解離により生じていることが分かる。なお、図３の左上に示す分子構造には、第２測定（HAD法）で生成されるプロダクトイオンの質量を記載している。
次に、上記実施例の質量分析装置を用いたモデル試料（cAMP, CAS_ID 60-92-4）の同定例を説明する。図４の下部に示す測定結果のうち、上段は第２測定（HAD法）で得られたプロダクトイオンスペクトル、下段は第１測定（CID法）で得られたプロダクトイオンスペクトルである。図４の上段は、第２測定（HAD法）で得られたプロダクトイオンスペクトルをin silico（コンピュータによるシミュレーション）フラグメント解析ツールであるMetFrag（非特許文献２参照）に入力して得られた上位5位までの化合物候補を、スコアが高い順に並べたものである。この時点では5つの化合物が候補として存在している。これらのうち、#2が正しい化合物であるが、それよりもスコアが高い化合物（#1）が存在している。
しかし、#1の化合物では環状部の解離により121.05Daのプロダクトイオンが生成されないため、本実施例では判定部９６により化合物候補から除外する（あるいは化合物候補のランクを下げる）ことができる。また、#4及び#5の化合物では、鎖状部の解離によって250.098Daのプロダクトイオンが生成されることから、これらも候補から除外する（あるいは化合物候補のランクを下げる）ことができる。こうしてモデル化合物の候補を#2と#3に絞り込むことができ、正解である#2の化合物が最も上位の候補となる。
上記実施例は一例であって、本発明の趣旨に沿って適宜に変更することができる。上記実施例は三次元イオントラップを備えた質量分析装置としたが、リニアイオントラップ（コリジョンセル）を備えた質量分析装置とすることもできる。
図５に変形例の質量分析装置の概略構成図を示す。上記実施例と同様の構成については同一の符号を付して説明を省略する。また、ラジカル生成・照射部、不活性ガス供給部６、及び制御・処理部９の構成は上記実施例と同じであるため詳細な構成要素の図示を省略する。
変形例の質量分析装置は、略大気圧であるイオン化室８０と真空ポンプ（図示なし）により真空排気された高真空の分析室８３との間に、段階的に真空度が高められた第１中間真空室８１及び第２中間真空室８２を備えた多段差動排気系の構成を有している。イオン化室８０には、例えばESIプローブ８０１が設置される。イオンを収束させつつ後段へ輸送するために、第１中間真空室８１にはイオンガイド８１１が、第２中間真空室８２にはイオンガイド８２１が、それぞれ設置されている。分析室８３には、イオンを質量電荷比に応じて分離する前段四重極マスフィルタ８３１、多重極イオンガイド８３３が内部に設置されたコリジョンセル８３２、イオンを質量電荷比に応じて分離する後段四重極マスフィルタ８３４、及びイオン検出器８３５が設置されている。
ラジカル生成・照射部５は、上記実施例と同様の構成を有している（図５では、ラジカル生成・照射部５のうち、ラジカル生成室５２、ノズル５４、及び輸送管５８のみ図示）。輸送管５８は、その先端部分がコリジョンセル８３２の壁面に沿うように配設されている。輸送管５８のうち、コリジョンセル８３２の壁面に沿って配設された部分には、５つのヘッド部が設けられており、各ヘッド部からイオンの飛行方向（イオン光軸Ｃ。イオンの飛行経路の中心軸）と交差する方向にラジカルが噴射される。変形例の質量分析装置では、イオン化室８０で生成されたイオンの中から前段四重極マスフィルタ８３１によってプリカーサイオンが選別され、コリジョンセル８３２に導入される。そして、第２測定制御部９２２によって、ラジカル生成・照射部５から水素ラジカルがコリジョンセル８３２の内部に導入され、HAD法によりプリカーサイオンを解離してプロダクトイオンを生成する。
不活性ガス供給部６も、上記実施例と同様の構成を有している（図５ではバルブ６２の図示を省略）。そして、第１測定制御部９２１によって不活性ガス供給部６から不活性ガスをコリジョンセル８３２の内部に導入し、CID法によりプリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成する。
また、上記実施例では、飛行時間型質量分離部をリニア型としたが、リフレクトロン型やマルチターン型等の飛行時間型質量分離部を用いてもよい。また、飛行時間型質量分離部以外に、例えばイオントラップ２自体のイオン分離機能を利用して質量分離を行うものやオービトラップなど、他の形態の質量分離部を用いることもできる。
上記実施例ではラジカル生成・照射部５として、誘導結合型の高周波プラズマ源５３を用いたが、熱解離型の水素ラジカル源（特許文献１、非特許文献３参照）を用いることもできる。熱解離型の水素ラジカル源を備えたラジカル生成・照射部は、水素ガスを供給する原料ガス供給源と、該水素ガスが導入されるキャピラリと、該キャピラリを加熱する加熱部と、該キャピラリに導入する水素ガスの流量を調整するバルブとを備えており、加熱されたキャピラリ内で水素ガスを熱解離させることにより水素ラジカルを生成し、イオントラップに導入する。
［態様］
上述した複数の例示的な実施形態は、以下の態様の具体例であることが当業者により理解される。
上述した複数の例示的な実施形態は、以下の態様の具体例であることが当業者により理解される。
（第１項）
本発明の一態様に係る質量分析方法は、
試料成分由来のプリカーサイオンと不活性ガス分子の衝突により該プリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成し、該プロダクトイオンを質量電荷比に応じて分離し検出することにより第１プロダクトイオンスペクトルデータを取得し、
前記プリカーサイオンと水素ラジカルの反応により該プリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成し、該プロダクトイオンを質量電荷比に応じて分離し検出することにより第２プロダクトイオンスペクトルデータを取得し、
前記第１プロダクトイオンスペクトルデータと前記第２プロダクトイオンスペクトルデータにおいて、所定の質量電荷比の差を有するプロダクトイオンの組を抽出する。
本発明の一態様に係る質量分析方法は、
試料成分由来のプリカーサイオンと不活性ガス分子の衝突により該プリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成し、該プロダクトイオンを質量電荷比に応じて分離し検出することにより第１プロダクトイオンスペクトルデータを取得し、
前記プリカーサイオンと水素ラジカルの反応により該プリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成し、該プロダクトイオンを質量電荷比に応じて分離し検出することにより第２プロダクトイオンスペクトルデータを取得し、
前記第１プロダクトイオンスペクトルデータと前記第２プロダクトイオンスペクトルデータにおいて、所定の質量電荷比の差を有するプロダクトイオンの組を抽出する。
（第７項）
本発明の別の一態様に係る質量分析装置は、
試料成分由来のプリカーサイオンが導入される反応室と、
前記反応室に不活性ガスを導入する不活性ガス導入部と、
前記反応室に水素ラジカルを導入する水素ラジカル導入部と、
前記反応室から出射するイオンを質量電荷比に応じて分離して検出するイオン検出部と、
前記不活性ガス導入部及び前記イオン検出部を制御する制御部であって、前記プリカーサイオンと不活性ガス分子の衝突により該プリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成し、前記イオン検出部で検出することにより第１プロダクトイオンスペクトルデータを取得する第１測定制御部と、
前記水素ラジカル導入部及び前記イオン検出部を制御する制御部であって、前記プリカーサイオンと水素ラジカルの反応により該プリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成し、前記イオン検出部で検出することにより第２プロダクトイオンスペクトルデータを取得する第２測定制御部と、
同一のプリカーサイオンについて得られた前記第１プロダクトイオンスペクトルデータと前記第２プロダクトイオンスペクトルデータにおいて、所定の質量差を有するプロダクトイオンの組を抽出するプロダクトイオン組抽出部と
を備える。
本発明の別の一態様に係る質量分析装置は、
試料成分由来のプリカーサイオンが導入される反応室と、
前記反応室に不活性ガスを導入する不活性ガス導入部と、
前記反応室に水素ラジカルを導入する水素ラジカル導入部と、
前記反応室から出射するイオンを質量電荷比に応じて分離して検出するイオン検出部と、
前記不活性ガス導入部及び前記イオン検出部を制御する制御部であって、前記プリカーサイオンと不活性ガス分子の衝突により該プリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成し、前記イオン検出部で検出することにより第１プロダクトイオンスペクトルデータを取得する第１測定制御部と、
前記水素ラジカル導入部及び前記イオン検出部を制御する制御部であって、前記プリカーサイオンと水素ラジカルの反応により該プリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成し、前記イオン検出部で検出することにより第２プロダクトイオンスペクトルデータを取得する第２測定制御部と、
同一のプリカーサイオンについて得られた前記第１プロダクトイオンスペクトルデータと前記第２プロダクトイオンスペクトルデータにおいて、所定の質量差を有するプロダクトイオンの組を抽出するプロダクトイオン組抽出部と
を備える。
第１項に記載の質量分析方法及び第７項に記載の質量分析装置は、特に有機化合物である試料成分の分析に用いられるものであり、そうした試料成分由来のプリカーサイオンと不活性ガス分子の衝突によりプリカーサイオンを解離させるCID法で生成したプロダクトイオンを質量電荷比に応じて分離し検出することにより第１プロダクトイオンスペクトルデータを取得する。また、試料成分由来のプリカーサイオンと水素ラジカルの反応によりプリカーサイオンを解離させるHAD法で生成したプロダクトイオンを質量電荷比に応じて分離し検出することにより第２プロダクトイオンスペクトルデータを取得する。発明者が行った測定によれば、鎖状部でプリカーサイオンが解離して生成されたプロダクトイオンではCID法によるプリカーサイオンの解離とHAD法によるプリカーサイオンの解離で生成されるプロダクトイオンの質量電荷比に差がない一方、環状部でプリカーサイオンが解離して生成されたプロダクトイオンではプロダクトイオンに特定の質量差（典型的には2Da）が生じることが分かった。第１項に記載の質量分析方法及び第７項に記載の質量分析装置はこの知見に基づくものであり、同一のプリカーサイオンについて得られた第１プロダクトイオンスペクトルデータと第２プロダクトイオンスペクトルデータにおいて、所定の質量電荷比の差を有するプロダクトイオンの組を抽出する。これにより、抽出された組のプロダクトイオンが環状部におけるプリカーサイオンの解離により生じたものであることを推定することができる。
（第２項）
第１項に記載の質量分析方法において、
前記所定の質量差が2Daである。
第１項に記載の質量分析方法において、
前記所定の質量差が2Daである。
（第８項）
第７項に記載の質量分析装置において、
前記所定の質量差が2Daである。
第７項に記載の質量分析装置において、
前記所定の質量差が2Daである。
第２項に記載の質量分析方法及び第８項に記載の質量分析装置では、CID法によるプリカーサイオンの環状部の解離により生成されるプロダクトイオンと、HAD法によるプリカーサイオンの環状部の解離により生成されるプロダクトイオンの組うち、最も一般的な組である、質量差が2Daであるものを抽出することができる。
（第３項）
第１項又は第２項に記載の質量分析方法において、
前記抽出したプロダクトイオンの組が前記プリカーサイオンの環状部の解離により生成されるか否かを判定する。
第１項又は第２項に記載の質量分析方法において、
前記抽出したプロダクトイオンの組が前記プリカーサイオンの環状部の解離により生成されるか否かを判定する。
（第９項）
第７項又は第８項のいずれかに記載の質量分析装置において、さらに、
前記プロダクトイオン組抽出部により抽出された組のプロダクトイオンが前記化合物候補由来のプリカーサイオンの環状部の解離により生成されるか否かを判定する判定部
を備える。
第７項又は第８項のいずれかに記載の質量分析装置において、さらに、
前記プロダクトイオン組抽出部により抽出された組のプロダクトイオンが前記化合物候補由来のプリカーサイオンの環状部の解離により生成されるか否かを判定する判定部
を備える。
第３項に記載の質量分析方法及び第９項に記載の質量分析装置では、プロダクトイオン組抽出部により抽出された組のプロダクトイオンが化合物候補由来のプリカーサイオンの環状部の解離により生成されるか否かを判定することにより、化合物の推定の精度を高めることができる。
（第４項）
第１項から第３項のいずれかに記載の質量分析方法において、さらに、
既知の化合物について、プリカーサイオンと不活性ガス分子の衝突により生成したプロダクトイオンのスペクトルデータ、及び／又はプリカーサイオンと水素ラジカルの反応により生成したプロダクトイオンのスペクトルデータを収録した化合物データベースを用いて、前記第１プロダクトイオンスペクトルデータ及び／又は前記第２プロダクトイオンスペクトルデータを前記化合物データベースに収録されているプロダクトイオンスペクトルデータと照合することにより前記試料成分に対する化合物候補を推定する。
第１項から第３項のいずれかに記載の質量分析方法において、さらに、
既知の化合物について、プリカーサイオンと不活性ガス分子の衝突により生成したプロダクトイオンのスペクトルデータ、及び／又はプリカーサイオンと水素ラジカルの反応により生成したプロダクトイオンのスペクトルデータを収録した化合物データベースを用いて、前記第１プロダクトイオンスペクトルデータ及び／又は前記第２プロダクトイオンスペクトルデータを前記化合物データベースに収録されているプロダクトイオンスペクトルデータと照合することにより前記試料成分に対する化合物候補を推定する。
（第１０項）
第７項から第９項のいずれかに記載の質量分析装置において、さらに、
既知の化合物について、プリカーサイオンと不活性ガス分子の衝突により生成したプロダクトイオンのスペクトルデータ、及び／又はプリカーサイオンと水素ラジカルの反応により生成したプロダクトイオンのスペクトルデータを収録した化合物データベースと、
前記第１プロダクトイオンスペクトルデータ及び／又は前記第２プロダクトイオンスペクトルデータを前記化合物データベースに収録されているプロダクトイオンスペクトルデータと照合することにより前記試料成分に対する化合物候補を推定する化合物推定部と
を備える。
第７項から第９項のいずれかに記載の質量分析装置において、さらに、
既知の化合物について、プリカーサイオンと不活性ガス分子の衝突により生成したプロダクトイオンのスペクトルデータ、及び／又はプリカーサイオンと水素ラジカルの反応により生成したプロダクトイオンのスペクトルデータを収録した化合物データベースと、
前記第１プロダクトイオンスペクトルデータ及び／又は前記第２プロダクトイオンスペクトルデータを前記化合物データベースに収録されているプロダクトイオンスペクトルデータと照合することにより前記試料成分に対する化合物候補を推定する化合物推定部と
を備える。
第４項に記載の質量分析方法及び第１０項に記載の質量分析装置では、使用者自らがプロダクトイオンスペクトルデータを照合することなく、簡便に試料成分に対する化合物候補を推定することができる。
（第５項）
第４項に記載の質量分析方法において、さらに、
前記化合物候補について前記照合におけるプロダクトイオンスペクトルデータの一致度に基づくスコアを求める。
第４項に記載の質量分析方法において、さらに、
前記化合物候補について前記照合におけるプロダクトイオンスペクトルデータの一致度に基づくスコアを求める。
（第１１項）
第１０項に記載の質量分析装置において、
前記化合物推定部が、前記化合物候補について前記照合におけるスペクトルデータの一致度に基づくスコアを求める。
第１０項に記載の質量分析装置において、
前記化合物推定部が、前記化合物候補について前記照合におけるスペクトルデータの一致度に基づくスコアを求める。
第５項に記載の質量分析方法及び第１１項に記載の質量分析装置では、化合物候補の確からしさを定量的に評価することができる。
（第６項）
第３項に記載の判定を行う、第５項に記載の質量分析方法において、さらに、
前記判定の結果に基づいて前記スコアに所定の値を加算する。
第３項に記載の判定を行う、第５項に記載の質量分析方法において、さらに、
前記判定の結果に基づいて前記スコアに所定の値を加算する。
（第１２項）
第９項に記載の判定部を備えた、第１１項に記載の質量分析装置において、さらに、
前記化合物推定部が、前記判定部による判定結果に基づいて前記スコアに所定の値を加算する。
第９項に記載の判定部を備えた、第１１項に記載の質量分析装置において、さらに、
前記化合物推定部が、前記判定部による判定結果に基づいて前記スコアに所定の値を加算する。
第６項に記載の質量分析方法及び第１２項に記載の質量分析装置では、環状部の数や構造に特徴を有する化合物を同定しようとする場合には加算するスコアを大きくする等により定量的かつ高精度に試料成分を同定することができる。
１…イオン源
２…イオントラップ
２１…リング電極
２２…入口側エンドキャップ電極
２３…イオン導入孔
２４…出口側エンドキャップ電極
２５…イオン出射孔
２６…ラジカル導入口
２７…ラジカル排出口
３…飛行時間型質量分離部
４…イオン検出器
５…ラジカル生成・照射部
５１…水素ガス供給源
５２…ラジカル生成室
５２…水素ガス供給源
５３…高周波プラズマ源
５３１…マイクロ波供給源
５３２…スリースタブチューナー
５４…ノズル
５４１…接地電極
５４２…トーチ
５４３…ニードル電極
５４４…コネクタ
５５…スキマー
５６…バルブ
５８…輸送管
６…不活性ガス供給部
６１…不活性ガス供給源
６２…バルブ
６３…ガス流路
７１…トラップ電圧発生部
７２…機器制御部
８０…イオン化室
８０１…ESIプローブ
８１…第１中間真空室
８１１…イオンガイド
８２…第２中間真空室
８２１…イオンガイド
８３…分析室
８３１…前段四重極マスフィルタ
８３２…コリジョンセル
８３３…多重極イオンガイド
８３４…後段四重極マスフィルタ
８３５…イオン検出器
９…制御・処理部
９１…記憶部
９１１…化合物データベース
９２…測定制御部
９２１…第１測定制御部
９２２…第２測定制御部
９３…スペクトル作成部
９４…プロダクトイオン組抽出部
９５…化合物推定部
９８…入力部
９９…表示部
Ｃ…イオン光軸
２…イオントラップ
２１…リング電極
２２…入口側エンドキャップ電極
２３…イオン導入孔
２４…出口側エンドキャップ電極
２５…イオン出射孔
２６…ラジカル導入口
２７…ラジカル排出口
３…飛行時間型質量分離部
４…イオン検出器
５…ラジカル生成・照射部
５１…水素ガス供給源
５２…ラジカル生成室
５２…水素ガス供給源
５３…高周波プラズマ源
５３１…マイクロ波供給源
５３２…スリースタブチューナー
５４…ノズル
５４１…接地電極
５４２…トーチ
５４３…ニードル電極
５４４…コネクタ
５５…スキマー
５６…バルブ
５８…輸送管
６…不活性ガス供給部
６１…不活性ガス供給源
６２…バルブ
６３…ガス流路
７１…トラップ電圧発生部
７２…機器制御部
８０…イオン化室
８０１…ESIプローブ
８１…第１中間真空室
８１１…イオンガイド
８２…第２中間真空室
８２１…イオンガイド
８３…分析室
８３１…前段四重極マスフィルタ
８３２…コリジョンセル
８３３…多重極イオンガイド
８３４…後段四重極マスフィルタ
８３５…イオン検出器
９…制御・処理部
９１…記憶部
９１１…化合物データベース
９２…測定制御部
９２１…第１測定制御部
９２２…第２測定制御部
９３…スペクトル作成部
９４…プロダクトイオン組抽出部
９５…化合物推定部
９８…入力部
９９…表示部
Ｃ…イオン光軸
Claims (12)
- 試料成分由来のプリカーサイオンと不活性ガス分子の衝突により該プリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成し、該プロダクトイオンを質量電荷比に応じて分離し検出することにより第１プロダクトイオンスペクトルデータを取得し、
前記プリカーサイオンと水素ラジカルの反応により該プリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成し、該プロダクトイオンを質量電荷比に応じて分離し検出することにより第２プロダクトイオンスペクトルデータを取得し、
前記第１プロダクトイオンスペクトルデータと前記第２プロダクトイオンスペクトルデータにおいて、所定の質量差を有するプロダクトイオンの組を抽出する質量分析方法。 - 前記所定の質量差が2Daである、請求項１に記載の質量分析方法。
- さらに、
前記抽出したプロダクトイオンの組が前記プリカーサイオンの環状部の解離により生成されるか否かを判定する、
請求項１に記載の質量分析方法。 - さらに、
既知の化合物について、プリカーサイオンと不活性ガス分子の衝突により生成したプロダクトイオンのスペクトルデータ、及び／又はプリカーサイオンと水素ラジカルの反応により生成したプロダクトイオンのスペクトルデータを収録した化合物データベースを用いて、前記第１プロダクトイオンスペクトルデータ及び／又は前記第２プロダクトイオンスペクトルデータを前記化合物データベースに収録されているプロダクトイオンスペクトルデータと照合することにより前記試料成分に対する化合物候補を推定する、請求項３に記載の質量分析方法。 - さらに、
前記化合物候補について前記照合におけるプロダクトイオンスペクトルデータの一致度に基づくスコアを求める、請求項４に記載の質量分析方法。 - さらに、
前記判定の結果に基づいて前記スコアに所定の値を加算する、請求項５に記載の質量分析方法。 - 試料成分由来のプリカーサイオンが導入される反応室と、
前記反応室に不活性ガスを導入する不活性ガス導入部と、
前記反応室に水素ラジカルを導入する水素ラジカル導入部と、
前記反応室から出射するイオンを質量電荷比に応じて分離して検出するイオン検出部と、
前記不活性ガス導入部及び前記イオン検出部を制御する制御部であって、前記プリカーサイオンと不活性ガス分子の衝突により該プリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成し、前記イオン検出部で検出することにより第１プロダクトイオンスペクトルデータを取得する第１測定制御部と、
前記水素ラジカル導入部及び前記イオン検出部を制御する制御部であって、前記プリカーサイオンと水素ラジカルの反応により該プリカーサイオンを解離させてプロダクトイオンを生成し、前記イオン検出部で検出することにより第２プロダクトイオンスペクトルデータを取得する第２測定制御部と、
同一のプリカーサイオンについて得られた前記第１プロダクトイオンスペクトルデータと前記第２プロダクトイオンスペクトルデータにおいて、所定の質量差を有するプロダクトイオンの組を抽出するプロダクトイオン組抽出部と
を備える質量分析装置。 - 前記所定の質量差が2Daである、請求項７に記載の質量分析装置。
- さらに、
前記プロダクトイオン組抽出部により抽出された前記プロダクトイオンの組が前記プリカーサイオンの環状部の解離により生成されるか否かを判定する判定部
を備える、請求項７に記載の質量分析装置。 - さらに、
既知の化合物について、プリカーサイオンと不活性ガス分子の衝突により生成したプロダクトイオンのスペクトルデータ、及び／又はプリカーサイオンと水素ラジカルの反応により生成したプロダクトイオンのスペクトルデータを収録した化合物データベースと、
前記第１プロダクトイオンスペクトルデータ及び／又は前記第２プロダクトイオンスペクトルデータを前記化合物データベースに収録されているプロダクトイオンスペクトルデータと照合することにより前記試料成分に対する化合物候補を推定する化合物推定部と
を備える、請求項９に記載の質量分析装置。 - 前記化合物推定部が、前記化合物候補について前記照合におけるスペクトルデータの一致度に基づくスコアを求める、請求項１０に記載の質量分析装置。
- 前記化合物推定部が、前記判定部による判定結果に基づいて前記スコアに所定の値を加算する、請求項１１に記載の質量分析装置。
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| PCT/JP2019/044183 WO2021095105A1 (ja) | 2019-11-11 | 2019-11-11 | 質量分析方法及び質量分析装置 |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPWO2021095105A1 JPWO2021095105A1 (ja) | 2021-05-20 |
| JPWO2021095105A5 JPWO2021095105A5 (ja) | 2022-04-26 |
| JP7259985B2 true JP7259985B2 (ja) | 2023-04-18 |
Family
ID=75911935
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2021555644A Active JP7259985B2 (ja) | 2019-11-11 | 2019-11-11 | 質量分析方法及び質量分析装置 |
Country Status (4)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US12111285B2 (ja) |
| JP (1) | JP7259985B2 (ja) |
| CN (1) | CN114631022B (ja) |
| WO (1) | WO2021095105A1 (ja) |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JPWO2024004335A1 (ja) * | 2022-06-30 | 2024-01-04 |
Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2015133259A1 (ja) | 2014-03-04 | 2015-09-11 | 株式会社島津製作所 | イオン分析装置 |
| WO2017126006A1 (ja) | 2016-01-18 | 2017-07-27 | 株式会社島津製作所 | イオントラップ質量分析装置及び該装置を用いた質量分析方法 |
| JP2019009058A (ja) | 2017-06-28 | 2019-01-17 | 株式会社島津製作所 | 質量分析を用いた脂質解析方法及び質量分析装置 |
| WO2019155725A1 (ja) | 2018-02-06 | 2019-08-15 | 株式会社島津製作所 | 質量分析方法及び質量分析装置 |
Family Cites Families (12)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US8628974B2 (en) * | 2004-07-16 | 2014-01-14 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Protein/peptide sequencing by chemical degradation in the gas phase |
| DE102005005743B4 (de) * | 2005-02-07 | 2007-06-06 | Bruker Daltonik Gmbh | Ionenfragmentierung durch Beschuss mit Neutralteilchen |
| GB0809488D0 (en) * | 2008-05-23 | 2008-07-02 | Electrophoretics Ltd | Mass spectrometric analysis |
| JP5660218B2 (ja) * | 2011-08-03 | 2015-01-28 | 株式会社島津製作所 | 質量分析データ解析方法及び装置 |
| WO2014163153A1 (ja) * | 2013-04-03 | 2014-10-09 | 株式会社島津製作所 | 質量分析方法及び質量分析データ処理装置 |
| JP6176334B2 (ja) * | 2013-11-28 | 2017-08-09 | 株式会社島津製作所 | 質量分析方法、質量分析装置、及び質量分析データ処理プログラム |
| JP6311387B2 (ja) * | 2014-03-26 | 2018-04-18 | 株式会社島津製作所 | 化合物分析方法、化合物分析装置、及び化合物分析用プログラム |
| JP6358172B2 (ja) * | 2015-05-27 | 2018-07-18 | 株式会社島津製作所 | タンパク質又はペプチドの解析方法及び解析装置 |
| JP6593243B2 (ja) * | 2016-04-14 | 2019-10-23 | 株式会社島津製作所 | イオントラップ質量分析装置 |
| JP6713646B2 (ja) * | 2017-04-04 | 2020-06-24 | 株式会社島津製作所 | イオン分析装置 |
| JP2019056598A (ja) * | 2017-09-20 | 2019-04-11 | 株式会社島津製作所 | 分析方法および分析装置 |
| US10317412B1 (en) * | 2017-12-27 | 2019-06-11 | Shimadzu Corporation | Method and device for analyzing protein or peptide |
-
2019
- 2019-11-11 CN CN201980101561.1A patent/CN114631022B/zh active Active
- 2019-11-11 WO PCT/JP2019/044183 patent/WO2021095105A1/ja active Application Filing
- 2019-11-11 US US17/767,946 patent/US12111285B2/en active Active
- 2019-11-11 JP JP2021555644A patent/JP7259985B2/ja active Active
Patent Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2015133259A1 (ja) | 2014-03-04 | 2015-09-11 | 株式会社島津製作所 | イオン分析装置 |
| WO2017126006A1 (ja) | 2016-01-18 | 2017-07-27 | 株式会社島津製作所 | イオントラップ質量分析装置及び該装置を用いた質量分析方法 |
| JP2019009058A (ja) | 2017-06-28 | 2019-01-17 | 株式会社島津製作所 | 質量分析を用いた脂質解析方法及び質量分析装置 |
| WO2019155725A1 (ja) | 2018-02-06 | 2019-08-15 | 株式会社島津製作所 | 質量分析方法及び質量分析装置 |
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| TAKAHASHI, Ｈ et al.，Hydrogen Attachment/Abstraction Dissociation (HAD) of Gas-Phase Peptide Ions for Tandem Mass Spectro，Anal. Chem，2016年03月22日，vol.88，3810-3816 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN114631022A (zh) | 2022-06-14 |
| WO2021095105A1 (ja) | 2021-05-20 |
| US20240102962A1 (en) | 2024-03-28 |
| US12111285B2 (en) | 2024-10-08 |
| CN114631022B (zh) | 2024-07-09 |
| JPWO2021095105A1 (ja) | 2021-05-20 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US12080537B2 (en) | IRMS sample introduction system and method | |
| US9048074B2 (en) | Multinotch isolation for MS3 mass analysis | |
| CN110494955B (zh) | 离子分析装置及离子裂解方法 | |
| JP2010019655A (ja) | クロマトグラフ質量分析装置 | |
| WO2008035419A1 (fr) | Procédé de spectrométrie de masse | |
| JPWO2020240908A1 (ja) | 質量分析方法及び質量分析装置 | |
| JP2015517721A (ja) | Ｍｓ／ｍｓ質量分析の方法 | |
| JP7259985B2 (ja) | 質量分析方法及び質量分析装置 | |
| US11094399B2 (en) | Method, system and program for analyzing mass spectrometoric data | |
| JP5831347B2 (ja) | 質量分析装置及び質量分析方法 | |
| JP2016223777A (ja) | タンパク質又はペプチドの解析方法及び解析装置 | |
| JP7435812B2 (ja) | 質量分析方法及び質量分析装置 | |
| JP7202581B2 (ja) | イオン分析装置 | |
| US20240177980A1 (en) | Mass spectrometer and mass spectrometry method | |
| JP7142867B2 (ja) | イオン分析装置 | |
| EP4317961A1 (en) | Mass spectrometry device and mass spectrometry method | |
| US20240038515A1 (en) | Mass Spectrometer and Mass Spectrometry Method | |
| WO2024004335A1 (ja) | 質量分析方法及び質量分析装置 | |
| JP2022048477A (ja) | イオン分析装置 | |
| JP2015173072A (ja) | 質量分析装置 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20211227 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20220415 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20230110 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20230210 |
|
| TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
| A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20230307 |
|
| A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20230320 |
|
| R151 | Written notification of patent or utility model registration |
Ref document number: 7259985 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R151 |