JP7224690B2 - 糖尿病網膜症の診断用複合マーカーおよびその用途 - Google Patents
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Description
本発明は、糖尿病網膜症(diabetic retinopathy)の診断用複合マーカーおよびその用途に関し、より詳細には、糖尿病網膜症の診断に特異的な2個以上の血液マーカーで構成されていて、診断能が増加した糖尿病網膜症の診断用複合マーカーに関する。また、前記複合マーカーを用いた糖尿病網膜症の診断用組成物、診断キットおよび糖尿病網膜症の診断に必要な情報を提供する方法に関する。
[背景技術]
[発明の概要]
[発明が解決しようとする課題]
[課題を解決するための手段]
(b)前記mRNAまたはタンパク質発現レベルを対照群試料と比較する段階と、を含む糖尿病網膜症の診断のための情報提供方法を提供する。
[発明の効果]
(b)前記mRNAまたはタンパク質発現レベルを対照群試料と比較する段階と、を含む糖尿病網膜症の診断のための情報提供方法に関する。
糖尿病網膜症患者の血漿試料は、韓国の盆唐ソウル大学校病院の臨床試験審査委員会の承認を受けて採取した。血漿タンパクを用いてバイオマーカーの定量的検出のために、合計155個の血漿試料を分析し、分析対象である正常群(Non DMR)および糖尿病網膜症(DMR)疾患群の臨床的特徴は、下記の表1に示した。
2-1:ペプチドの選定および合成ペプチドの設計
本発明では、糖尿病網膜症を診断するためのバイオマーカーとして、IGFBP2(insulin like growth factor binding protein 2)、ADAMTSL2(ADAMTS-like protein 2)、CFH(Complement factor H)、Cp(Ceruloplasmin)、DDI2(Protein DDI1 homolog2)、FCN2(Ficolin 2)、LGALS3BP(galectin 3 binding protein)、MBL2(mannose-binding protein C)、PNLIP(pancreatic triacylglycerol lipase)、SELE(E-selectin)、SIGLEC14(Sialic acid-binding Ig-like lectin 14)、THBS1(Thrombospodin-1)およびZG16B(Zymogen granule protein 16 homolog B)の13個を選別した。
タンパク質当たり感度の高い1個以上のペプチドを測定し、これを基礎として質量分析計に注入して、各トランジション当たり破片化エネルギー最適値を得て、強度を基準として3個以上の上位断片化イオンを選択した(表2)。
前記実施例1で収得した各血漿をそのまま使用したり、さらに正確なタンパク質定量をしたりするために、多量(high abundant)で存在するタンパク質14種(Albumin、IgG、Antitrypsin、IgA、Transferrin、Haptoglobin、Fibrinogen、Alpha2-Macroglobulin、Alpha1-Acid glycoprotein、IgM、Apolipoprotein AI、Apolipoprotein AII、Complement C3、Transthyretin)を除去する欠損過程(depletion)を実施した。欠損は、MARS(Multiple affinity removal system、Agilent、米国)カラムを製造社の方法によって用いて14種のタンパク質を除去し、残りの少量で存在するタンパク質を溶出させて分析に使用した。この溶出された欠損試料に8Mになるように尿素(urea)を添加した後、80mMになるように2-カルボキシエチルトリスホスフィン(Tris(2-carboxyethyl)-phosphine、TECP)および320mMになるように2-クロロアセトアミド(2-chloroacetamide)を添加し、25℃で1時間反応させて、二硫化結合を還元およびアルキル化をした。そこへ血漿タンパク質とLys-C(wako)酵素の質量比が100:1になるようにLys-C酵素を入れ、室温で4時間反応させた。その後、50mMトリス(Tris、pH8.0)溶液で10倍希釈し、シーケンシングが可能なレベルのトリプシン(Promega)をタンパク質とトリプシンの質量比が50:1になるように添加して、37℃で12時間以上反応させて、ペプチド切片に分解した。0.3%になるようにギ酸(formic acid)溶液を加えて、pH2.0以下に酸性化させ、トリプシン反応を中止させた。
スカイライン(Skyline;McCoss lab、University of Washington、米国)を用いて生データ(raw data)をプロセッシングして、トランジションのピーク面積を計算した。内部標準物質ペプチド(endogenous/heavy labeled peptide)に対してピーク面積を使用して相対濃度を比較した。このように測定された結果値を用いて各タンパク質ペプチドの疾患予測能力(predictive ability)を測定するために、T検定(T-test)およびAUROC(Area under the receiver operating characteristic)数値を生成し、複合バイオマーカー群の結果と臨床情報が結合した予測能力を確認するために、ロジスティック回帰分析(logistic regression)モデルを用いて前記発現量変換情報および前記表1の臨床情報変換程度を入力して糖尿病網膜症に分類される確率値を推定した。MedCal ver 17.1(MedCalc)を使用してすべての統計分析を行った。
本発明では、13個の複合バイオマーカー群の結果および臨床情報を結合した場合、診断能の向上効果を確認するために、ロジスティック回帰モデルを用いてバイオマーカー発現量変換情報および臨床情報変換程度を入力して糖尿病網膜症に分類される確率値を推定した。
本発明では、13個のバイオマーカーの組み合わせによって糖尿病網膜症の診断能の差異が示すかを確認した。13個のバイオマーカーのうち、MBL2、PNLIP、LGALS3BPおよびIGFBP2の組み合わせおよびADAMTSL2、Cp、FCN2、DDI2、SELE、SIGLEC14、THBS1、ZG16BおよびCFHの組み合わせに分けて分析を行い、前記実施例3のSTAGE1と同一に臨床情報とともに分析を行った。
本発明で提供する糖尿病網膜症の診断用複合マーカーは、他のマーカーの組み合わせに比べて感度および診断能に優れていると共に、複合マーカーのタンパク質定量値と基本的な臨床情報を結合して分析すると、初期糖尿病網膜症で高い診断能を示すので、糖尿病網膜症の早期診断に有用に使用できる。
Claims (10)
- MBL2(mannose-binding protein C)、PNLIP(pancreatic triacylglycerol lipase)、LGALS3BP(galectin-3-binding protein)およびIGFBP2(insulin like growth factor binding protein 2)を含む、糖尿病網膜症の診断用複合マーカー。
- 前記複合マーカーは、ADAMTSL2(ADAMTS-like protein 2)、Cp(Ceruloplasmin)、CFH(complement factor H)、DDI2(Protein DDI1 homolog2)、FCN2(Ficolin 2)、SELE(E-selectin)、SIGLEC14(Sialic acid-binding Ig-like lectin 14)、THBS1(Thrombospondin-1)およびZG16B(Zymogen granule protein 16 homolog B)からなる群から選択された1種以上のマーカーをさらに含むことを特徴とする請求項1に記載の糖尿病網膜症の診断用複合マーカー。
- MBL2(mannose-binding protein C)、PNLIP(pancreatic triacylglycerol lipase)、LGALS3BP(galectin-3-binding protein)およびIGFBP2(insulin like growth factor binding protein 2)を含む糖尿病網膜症の診断用複合マーカーのmRNAまたはタンパク質レベルを測定する製剤を含む、糖尿病網膜症の診断用組成物。
- 前記組成物は、ADAMTSL2(ADAMTS-like protein 2)、Cp(Ceruloplasmin)、CFH(complement factor H)、DDI2(Protein DDI1 homolog2)、FCN2(Ficolin 2)、SELE(E-selectin)、SIGLEC14(Sialic acid-binding Ig-like lectin 14)、THBS1(Thrombospondin-1)およびZG16B(Zymogen granule protein 16 homolog B)からなる群から選択された1種以上のマーカーに対するmRNAまたはタンパク質レベルを測定する製剤をさらに含むことを特徴とする請求項3に記載の糖尿病網膜症の診断用組成物。
- 前記複合マーカーのmRNAレベルを測定する製剤は、前記複合マーカーの遺伝子に特異的に結合するプライマーペア、プローブまたはアンチセンスヌクレオチドであることを特徴とする請求項3または4に記載の糖尿病網膜症の診断用組成物。
- 前記複合マーカーのタンパク質レベルを測定する製剤は、前記複合マーカーのタンパク質またはペプチド断片に特異的に結合する抗体、相互作用タンパク質、リガンド、ナノ粒子(nanoparticles)またはアプタマー(aptamer)であることを特徴とする請求項3~5のいずれか一項に記載の糖尿病網膜症の診断用組成物。
- 請求項3~6のいずれか一項に記載の糖尿病網膜症の診断用組成物を含む、糖尿病網膜症の診断用キット。
- 前記キットは、RT-PCR(Reverse transcription polymerase chain reaction)キット、DNAチップキット、ELISA(Enzymelinked immunosorbent assay)キット、タンパク質チップキット、ラピッド(rapid)キットまたはMRM(Multiple reaction monitoring)キットであることを特徴とする請求項7に記載の糖尿病網膜症の診断用キット。
- (a)患者の生物学的試料から請求項1または2に記載の糖尿病網膜症の診断用複合マーカーのmRNAまたはタンパク質レベルを測定する段階と、
(b)前記mRNAまたはタンパク質発現レベルを対照群試料と比較する段階と、を含む、糖尿病網膜症の診断のための情報提供方法。 - 前記糖尿病網膜症の診断のための情報提供方法は、患者の年齢、BMI(body mass index)、喫煙の有無、Hb1Ac検査結果、インスリン治療の有無、高血圧の有無、高脂血症の有無および心血管疾患の有無からなる群から選択された1種以上の臨床情報をさらに含んで対照群と比較することを特徴とする請求項9に記載の糖尿病網膜症の診断のための情報提供方法。
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