JP6841661B2 - 骨折および骨障害の診断および治療のための組成物および方法 - Google Patents
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Description
近年、5つの自由に循環するmiRNAおよび骨組織miRNAが同定され、そして骨粗鬆症性骨折に関連づけられてきている(Seeligerら、2014)。
Wang Y.ら, 2012, PlosOne, 7,4, e34641は、閉経後骨粗鬆症に関連する潜在的なバイオマーカーとして、miR−133aを報告する。
本発明は、特に、特異的に上方または下方制御され、そしてしたがって、価値あるバイオマーカーとして有用であり、そして広範囲の骨疾患病期および年齢群の両方に渡って適用可能な診断シグネチャーに相当する、選択されるmiRNAセットを提供する。
a)前記被験体由来の血液または血清試料を提供し;
b)前記血清または血液試料において
1. hsa−miR−188−3p、hsa−miR−382−3p、hsa−let−7i−3p、hsa−miR−1227−3p、hsa−miR−127−3p、hsa−miR−133b、hsa−miR−135a−5p、hsa−miR−136−3p、hsa−miR−143−3p、hsa−miR−155−5p、hsa−miR−181a−3p、hsa−miR−1908、hsa−miR−190a、hsa−miR−192−5p、hsa−miR−193b−3p、hsa−miR−196b−5p、hsa−miR−199b−5p、hsa−miR−200b−3p、hsa−miR−203a、hsa−miR−205−5p、hsa−miR−20b−5p、hsa−miR−214−3p、hsa−miR−215、hsa−miR−223−5p、hsa−miR−27a−3p、hsa−miR−30e−3p、hsa−miR−323a−3p、hsa−miR−330−3p、hsa−miR−342−5p、hsa−miR−369−3p、hsa−miR−376c−3p、hsa−miR−377−3p、hsa−miR−378a−5p、hsa−miR−410、hsa−miR−454−3p、hsa−miR−487b、hsa−miR−495−3p、hsa−miR−500a−5p、hsa−miR−502−5p、hsa−miR−542−5p、hsa−miR−548a−3p、hsa−miR−550a−5p、hsa−miR−576−3p、hsa−miR−582−3p、hsa−miR−624−5p、hsa−miR−642a−5p、hsa−miR−941、hsa−miR−942またはそのアイソフォームまたは変異体からなる群II miRNA、および/または
2. hsa−miR−181a−5p、hsa−miR−32−3p、hsa−let−7b−5p、hsa−let−7g−5p、hsa−let−7i−5p、hsa−miR−106a−5p、hsa−miR−106b−5p、hsa−miR−127−3p、hsa−miR−132−3p、hsa−miR−140−3p、hsa−miR−141−3p、hsa−miR−143−3p、hsa−miR−143−5p、hsa−miR−144−3p、hsa−miR−146b−5p、hsa−miR−154−5p、hsa−miR−16−2−3p、hsa−miR−16−5p、hsa−miR−17−5p、hsa−miR−181b−5p、hsa−miR−181c−3p、hsa−miR−181c−5p、hsa−miR−185−5p、hsa−miR−18a−3p、hsa−miR−18a−5p、hsa−miR−18b−5p、hsa−miR−1908、hsa−miR−191−5p、hsa−miR−196b−5p、hsa−miR−199b−5p、hsa−miR−19b−1−5p、hsa−miR−19b−3p、hsa−miR−200b−3p、hsa−miR−203a、hsa−miR−20a−5p、hsa−miR−20b−5p、hsa−miR−210、hsa−miR−21−3p、hsa−miR−25−3p、hsa−miR−26b−5p、hsa−miR−301a−3p、hsa−miR−301b、hsa−miR−323a−3p、hsa−miR−324−5p、hsa−miR−330−3p、hsa−miR−363−3p、hsa−miR−369−3p、hsa−miR−374a−5p、hsa−miR−375、hsa−miR−376c−3p、hsa−miR−378a−5p、hsa−miR−451a、hsa−miR−454−3p、hsa−miR−486−3p、hsa−miR−486−5p、hsa−miR−493−5p、hsa−miR−500a−5p、hsa−miR−532−3p、hsa−miR−545−3p、hsa−miR−550a−3p、hsa−miR−550a−5p、hsa−miR−589−5p、hsa−miR−590−3p、hsa−miR−598、hsa−miR−627、hsa−miR−629−5p、hsa−miR−7−5p、hsa−miR−92a−3p、hsa−miR−93−3p、hsa−miR−93−5p、hsa−miR−941、hsa−miR−942、hsa−miR−96−5p、hsa−miR−98−5pまたはそのアイソフォームまたは変異体からなる群III miRNA、および/または
3. hsa−miR−10a−5p、hsa−miR−10b−5p、hsa−miR−125b−5p、hsa−miR−127−3p、hsa−miR−133a、hsa−miR−133b、hsa−miR−143−3p、hsa−miR−18a−3p、hsa−miR−194−5p、hsa−miR−30a−5p、hsa−miR−328−3p、hsa−miR−376a−3p、hsa−miR−409−3p、hsa−miR−574−3p、またはそのアイソフォームまたは変異体からなる群I miRNA
のいずれかより選択される、2またはそれより多いmiRNAのレベルを測定し、そして
c)健康な個体由来の参照血液または血清試料における対応するmiRNAのレベルと、前記miRNAのレベルを比較する、
ここで、参照試料に比較した際の前記レベルの1.5倍を超える相違が、骨粗鬆症の指標、または骨折、特に骨粗鬆症性骨折のリスクの指標である
工程を含む、前記方法を提供する。
a. 真性糖尿病、特にII型真性糖尿病を患わず、また発展させる素因も持たない被験体由来の血液試料を提供し、
b. 特に上に列挙したような、群I miRNAおよび/または群II miRNAのいずれかより選択される2またはそれより多いmiRNA、そして場合によってさらに
c. 健康な個体に比較した際、骨粗鬆症の個体において示差的に制御されている、そして/または骨形成分化および/または破骨細胞形成(osteoclastogenic)活性化に関与する1またはそれより多いさらなるmiRNA
のレベルを測定し;そして
d. 前記miRNA、またはそのアイソフォームおよび変異体のレベルを、健康な個体のコホートにおける平均レベルと比較する、ここで、参照に比較して、1標準偏差より大きい、特に約1.5、特に約2標準偏差の相違が、将来の骨粗鬆症性骨折のリスクが増加した骨粗鬆症の指標であり、一方、2.5標準偏差より大きい、特に約3、特に約3.5、さらに具体的には3.5標準偏差より大きい相違が、将来の骨折が高リスクである骨粗鬆症の指標である
工程を含む、前記方法を提供する。
a)真性糖尿病、特にII型真性糖尿病を患うか、または発展させる素因を有する被験体由来の血液試料を提供し、
b)特に上に列挙したような、群III miRNAより選択される2またはそれより多いmiRNA、そして場合によってさらに
c)健康な個体に比較した際、骨粗鬆症の個体において示差的に制御されている、そして/または骨形成分化および/または破骨細胞形成活性化に関与する1またはそれより多いさらなるmiRNA
のレベルを測定し;そして
d)前記miRNA、またはそのアイソフォームおよび変異体のレベルを、健康な個体のコホートまたはプールにおける平均レベルと比較する、ここで、参照に比較して、1標準偏差より大きい、特に約1.5、特に約2標準偏差の相違が、将来の骨粗鬆症性骨折のリスクが増加した骨粗鬆症の指標であり、一方、2.5標準偏差より大きい、特に約3、特に約3.5、さらに具体的には3.5標準偏差より大きい相違が、将来の骨折が高リスクである骨粗鬆症の指標である
工程を含む、前記方法を提供する。
本発明のさらなる態様にしたがって、群I、IIまたはIIIのいずれかの少なくとも3、好ましくは少なくとも4、少なくとも5、少なくとも6、少なくとも7、・・・最大136のmiRNAのレベルを測定する。
特定の側面にしたがって、hsa−miR−127−3p、hsa−miR−133bおよびhsa−miR−143−3pのレベルを測定する方法を提供する。
i)健康な個体に比較した際、骨粗鬆症個体において示差的に制御されており、そして
ii)骨形成分化および/または破骨細胞形成活性化に関与する。
a)前記被験体由来の血液または血清試料を提供し;
b)前記血清または血液試料において、群II、IIIまたはI miRNAのいずれかより選択される、2またはそれより多いmiRNAのレベル、あるいは他の上に列挙したmiRNAのいずれか、あるいはそのアイソフォームまたは変異体のレベルを測定し、そして
c)健康な個体由来の参照血液または血清試料における対応するmiRNAのレベルと、前記miRNAのレベルを比較し、
d)参照試料に比較した際、miRNAの前記レベルにおける1.5倍より高い相違を示す被験体において、骨粗鬆症を治療する
工程を含む、前記方法を提供する。
本発明の方法を、骨折のリスクを決定しなければならない任意の被験体、特に骨折を患うかまたは骨折を発展させるリスクがある骨粗鬆症患者、あるいは真性糖尿病、特に2型真性糖尿病のリスクがあるかまたは該疾患を患う患者に関する標準試験として使用することも可能である。
a)miRNA群I、IIまたはIII由来の、アイソフォームを含む、少なくとも1つ、特に少なくとも2つの単離合成ヒトmiRNAを用いた内因性マイクロRNAの置換ならびに/あるいは
b)
i.前記miRNAに結合し、切断し、そしてしたがってそのレベルを減少させ;そして/または
ii.ターゲットmiRNAに結合し、そして隔離し、したがって前記miRNAをコードする配列の発現を下方制御する
合成アンタゴニスト/阻害剤分子の投与による、群I、IIまたはIIIのmiRNAの少なくとも2つの阻害および/または分解
からなる、骨粗鬆症または骨折を治療するかまたは防止する際に使用するための組成物も提供する。
特に、前記組成物を薬剤調製において用いてもよい。
本発明のさらなる態様にしたがって、被験体において骨粗鬆症または骨折を治療するかまたは防止するための方法であって、
a)miRNA群I、IIまたはIII由来の少なくとも2つの単離ヒトmiRNAならびに/あるいは
b)
i.前記miRNAのレベルを減少させ;そして/または
ii.前記miRNAをコードする配列の発現を阻害するかもしくは下方制御する
群I、IIまたはIIIのmiRNAの少なくとも2つのアンタゴニスト/阻害剤
の有効量を投与する工程を含む、前記方法を提供する。
用語「患者」には、予防または療法的治療のいずれかを受けたか、あるいは限定されるわけではないが、骨粗鬆症または真性糖尿病のような特定の疾患と診断されている、ヒトおよび他の哺乳動物被験体が含まれる。
本明細書において、用語「個体コホート」または「個体プール」は、健康な個体群を指すものとし、そして特に、前記個体から受け取った試料を指すことも可能である。コホートの個体数は多様であることも可能であり、すなわち、2、3、4、5、6、7、またはそれより多い個体を含むことも可能であるが、また、より大きい被験体群であることも可能であり、例えば、限定されるわけではないが、10、50、100またはそれより多い個体であることも可能である。本発明の態様にしたがって、コホートはまた、500またはそれより多い個体の巨大コホートを含むことも可能である。
さらに特定の態様にしたがって、hsa−miR−382を群IIまたはIIIのmiRNAの少なくとも1つと組み合わせる。
さらに特定の態様にしたがって、hsa−miR−502を群IIまたはIIIのmiRNAの少なくとも1つと組み合わせる。
さらに特定の態様にしたがって、hsa−miR−203を群IIまたはIIIのmiRNAの少なくとも1つと組み合わせる。
特に、群III miRNA、特に、hsa−miR−181a−5p、hsa−miR−32−3p、hsa−let−7b−5p、hsa−let−7g−5p、hsa−let−7i−5p、hsa−miR−106a−5p、hsa−miR−106b−5p、hsa−miR−127−3p、hsa−miR−132−3p、hsa−miR−140−3p、hsa−miR−141−3p、hsa−miR−143−3p、hsa−miR−143−5p、hsa−miR−144−3p、hsa−miR−146b−5p、hsa−miR−154−5p、hsa−miR−16−2−3p、hsa−miR−16−5p、hsa−miR−17−5p、hsa−miR−181b−5p、hsa−miR−181c−3p、hsa−miR−181c−5p、hsa−miR−185−5p、hsa−miR−18a−3p、hsa−miR−18a−5p、hsa−miR−18b−5p、hsa−miR−1908、hsa−miR−191−5p、hsa−miR−196b−5p、hsa−miR−199b−5p、hsa−miR−19b−1−5p、hsa−miR−19b−3p、hsa−miR−200b−3p、hsa−miR−203a、hsa−miR−20a−5p、hsa−miR−20b−5p、hsa−miR−210、hsa−miR−21−3p、hsa−miR−25−3p、hsa−miR−26b−5p、hsa−miR−301a−3p、hsa−miR−301b、hsa−miR−323a−3p、hsa−miR−324−5p、hsa−miR−330−3p、hsa−miR−363−3p、hsa−miR−369−3p、hsa−miR−374a−5p、hsa−miR−375、hsa−miR−376c−3p、hsa−miR−378a−5p、hsa−miR−451a、hsa−miR−454−3p、hsa−miR−486−3p、hsa−miR−486−5p、hsa−miR−493−5p、hsa−miR−500a−5p、hsa−miR−532−3p、hsa−miR−545−3p、hsa−miR−550a−3p、hsa−miR−550a−5p、hsa−miR−589−5p、hsa−miR−590−3p、hsa−miR−598、hsa−miR−627、hsa−miR−629−5p、hsa−miR−7−5p、hsa−miR−92a−3p、hsa−miR−93−3p、hsa−miR−93−5p、hsa−miR−941、hsa−miR−942、hsa−miR−96−5pおよびhsa−miR−98−5pまたはそのアイソフォームまたは変異体からなる前記miRNAの2またはそれより多くのレベルの増加が測定されると、II型糖尿病に罹患した被験体において、骨粗鬆症の特異的な指標であるかまたは骨粗鬆症を発展させるリスクまたは骨病変もしくは骨折のリスクの特異的な指標である可能性がある。
さらに特定の態様にしたがって、hsa−miR−486を群IIまたはIIIのmiRNAの少なくとも1つと組み合わせる。
さらに特定の態様にしたがって、hsa−miR−942を群IIまたはIIIのmiRNAの少なくとも1つと組み合わせる。
miR−188−3pおよびmiR−382−3p;
miR−188−3p、miR−382−3pおよびmiR−942;
miR−188−3p、miR−382−3p、miR−155−5p、およびmiR−942;
miR−188−3p、miR−382−3p、miR−942、hsa−miR−502−5pおよびhsa−miR−136−3p;
miR−188−3p、miR−382−3p、miR−942、hsa−miR−582−3p、hsa−miR−576−3p、hsa−miR−136−3pおよびhsa−miR−502−5p;
miR−188−3p、miR−382−3p、miR−942、hsa−miR−582−3p、hsa−miR−576−3p、hsa−miR−136−3p、hsa−miR−502−5p、hsa−miR−550a−5p;
miR−188−3p、miR−382−3p、miR−942、hsa−miR−582−3p、hsa−miR−576−3p、hsa−miR−136−3p、hsa−miR−502−5p、hsa−miR−550a−5pおよびhsa−miR−181a−3p;
miR−188−3p、miR−382−3p、miR−942、hsa−miR−582−3p、hsa−miR−576−3p、hsa−miR−136−3p、hsa−miR−502−5p、hsa−miR−550a−5p、hsa−miR−181a−3pおよびhsa−miR−378a−5p
の組み合わせである。
miR−550a−5pおよびmiR−32−3p;
miR−550a−5p、miR−32−3pおよびmiR−96−5p;
miR−550a−5p、miR−32−3p、miR−96−5pおよびmiR−486−3p;
miR−550a−5p、miR−32−3p、miR−96−5p、miR−486−3pおよびhsa−miR−203a;
miR−550a−5p、miR−96−5p hsa−let−7g−5p、hsa−miR−141−3p、hsa−miR−323a−3pおよびhsa−miR−500a−5p;
miR−550a−5p、miR−96−5p、miR−32−3p hsa−miR−500a−5p、hsa−miR−143−5p、miR 532−3pおよびhsa−miR−92−3p;miR−550a−5p、miR−96−5p、miR−32−3p、hsa−let−7g−5p、hsa−miR−181a−5p、hsa−miR−203a、hsa−let−7g−5p、hsa−miR−92a−3p;
miR−550a−5p、miR−96−5p、miR−32−3p、hsa−let−7g−5p、hsa−miR−500a−5p、hsa−miR−181c−5p、miR−16−2−3p、hsa−let−7−5p、hsa−miR−92a−3p;
miR−550a−5p、miR−96−5p、miR−486−3p、miR 532−3p、hsa−miR−500a−5p、hsa−miR−181a−5p、hsa−miR−203a、miR−16−2−3p、hsa−let−7−5p、hsa−miR−32−3p
の組み合わせである。
miRNA検出用のプライマーは、例えばExiqonから、マイクロRNA LNATM PCRプライマーセットとして、商業的に入手可能である。
a. miRNA、hsa−miR−382−3p、hsa−miR−181a−5p、hsa−miR−32−3p、hsa−let−7b−5p、hsa−let−7g−5p、hsa−let−7i−3p、hsa−let−7i−5p、hsa−miR−106a−5p、hsa−miR−106b−5p、hsa−miR−10a−5p、hsa−miR−10b−5p、hsa−miR−1227−3p、hsa−miR−125b−5p、hsa−miR−127−3p、hsa−miR−132−3p、hsa−miR−133a、hsa−miR−133b、hsa−miR−135a−5p、hsa−miR−136−3p、hsa−miR−140−3p、hsa−miR−141−3p、hsa−miR−143−3p、hsa−miR−143−5p、hsa−miR−144−3p、hsa−miR−146b−5p、hsa−miR−154−5p、hsa−miR−155−5p、hsa−miR−16−2−3p、hsa−miR−16−5p、hsa−miR−17−5p、hsa−miR−181a−3p、hsa−miR−181b−5p、hsa−miR−181c−3p、hsa−miR−181c−5p、hsa−miR−185−5p、hsa−miR−188−3p、hsa−miR−18a−3p、hsa−miR−18a−5p、hsa−miR−18b−5p、hsa−miR−1908、hsa−miR−190a、hsa−miR−191−5p、hsa−miR−192−5p、hsa−miR−193b−3p、hsa−miR−194−5p、hsa−miR−196b−5p、hsa−miR−199b−5p、hsa−miR−19b−1−5p、hsa−miR−19b−3p、hsa−miR−200b−3p、hsa−miR−203a、hsa−miR−205−5p、hsa−miR−20a−5p、hsa−miR−20b−5p、hsa−miR−210、hsa−miR−21−3p、hsa−miR−214−3p、hsa−miR−215、hsa−miR−223−5p、hsa−miR−25−3p、hsa−miR−26b−5p、hsa−miR−27a−3p、hsa−miR−301a−3p、hsa−miR−301b、hsa−miR−30a−5p、hsa−miR−30e−3p、hsa−miR−323a−3p、hsa−miR−324−5p、hsa−miR−328−3p、hsa−miR−330−3p、hsa−miR−342−5p、hsa−miR−363−3p、hsa−miR−369−3p、hsa−miR−374a−5p、hsa−miR−375、hsa−miR−376a−3p、hsa−miR−376c−3p、hsa−miR−377−3p、hsa−miR−378a−5p、hsa−miR−409−3p、hsa−miR−410、hsa−miR−451a、hsa−miR−454−3p、hsa−miR−486−3p、hsa−miR−486−5p、hsa−miR−487b、hsa−miR−493−5p、hsa−miR−495−3p、hsa−miR−500a−5p、hsa−miR−502−5p、hsa−miR−532−3p、hsa−miR−542−5p、hsa−miR−545−3p、hsa−miR−548a−3p、hsa−miR−550a−3p、hsa−miR−550a−5p、hsa−miR−574−3p、hsa−miR−576−3p、hsa−miR−582−3p、hsa−miR−589−5p、hsa−miR−590−3p、hsa−miR−598、hsa−miR−624−5p、hsa−miR−627、hsa−miR−629−5p、hsa−miR−642a−5p、hsa−miR−7−5p、hsa−miR−92a−3p、hsa−miR−93−3p、hsa−miR−93−5p、hsa−miR−941、hsa−miR−942、hsa−miR−96−5p、hsa−miR−98−5pまたはそのアイソフォームおよび変異体の少なくとも1つ、特に少なくとも2つの単離または合成ヒトmiRNAおよび/または
b. hsa−miR−382−3p、hsa−miR−181a−5p、hsa−miR−32−3p、hsa−let−7b−5p、hsa−let−7g−5p、hsa−let−7i−3p、hsa−let−7i−5p、hsa−miR−106a−5p、hsa−miR−106b−5p、hsa−miR−10a−5p、hsa−miR−10b−5p、hsa−miR−1227−3p、hsa−miR−125b−5p、hsa−miR−127−3p、hsa−miR−132−3p、hsa−miR−133a、hsa−miR−133b、hsa−miR−135a−5p、hsa−miR−136−3p、hsa−miR−140−3p、hsa−miR−141−3p、hsa−miR−143−3p、hsa−miR−143−5p、hsa−miR−144−3p、hsa−miR−146b−5p、hsa−miR−154−5p、hsa−miR−155−5p、hsa−miR−16−2−3p、hsa−miR−16−5p、hsa−miR−17−5p、hsa−miR−181a−3p、hsa−miR−181b−5p、hsa−miR−181c−3p、hsa−miR−181c−5p、hsa−miR−185−5p、hsa−miR−188−3p、hsa−miR−18a−3p、hsa−miR−18a−5p、hsa−miR−18b−5p、hsa−miR−1908、hsa−miR−190a、hsa−miR−191−5p、hsa−miR−192−5p、hsa−miR−193b−3p、hsa−miR−194−5p、hsa−miR−196b−5p、hsa−miR−199b−5p、hsa−miR−19b−1−5p、hsa−miR−19b−3p、hsa−miR−200b−3p、hsa−miR−203a、hsa−miR−205−5p、hsa−miR−20a−5p、hsa−miR−20b−5p、hsa−miR−210、hsa−miR−21−3p、hsa−miR−214−3p、hsa−miR−215、hsa−miR−223−5p、hsa−miR−25−3p、hsa−miR−26b−5p、hsa−miR−27a−3p、hsa−miR−301a−3p、hsa−miR−301b、hsa−miR−30a−5p、hsa−miR−30e−3p、hsa−miR−323a−3p、hsa−miR−324−5p、hsa−miR−328−3p、hsa−miR−330−3p、hsa−miR−342−5p、hsa−miR−363−3p、hsa−miR−369−3p、hsa−miR−374a−5p、hsa−miR−375、hsa−miR−376a−3p、hsa−miR−376c−3p、hsa−miR−377−3p、hsa−miR−378a−5p、hsa−miR−409−3p、hsa−miR−410、hsa−miR−451a、hsa−miR−454−3p、hsa−miR−486−3p、hsa−miR−486−5p、hsa−miR−487b、hsa−miR−493−5p、hsa−miR−495−3p、hsa−miR−500a−5p、hsa−miR−502−5p、hsa−miR−532−3p、hsa−miR−542−5p、hsa−miR−545−3p、hsa−miR−548a−3p、hsa−miR−550a−3p、hsa−miR−550a−5p、hsa−miR−574−3p、hsa−miR−576−3p、hsa−miR−582−3p、hsa−miR−589−5p、hsa−miR−590−3p、hsa−miR−598、hsa−miR−624−5p、hsa−miR−627、hsa−miR−629−5p、hsa−miR−642a−5p、hsa−miR−7−5p、hsa−miR−92a−3p、hsa−miR−93−3p、hsa−miR−93−5p、hsa−miR−941、hsa−miR−942、hsa−miR−96−5p、hsa−miR−98−5p、またはそのアイソフォームおよび変異体の少なくとも1つ、特に少なくとも2つのmiRNAのアンタゴニスト/阻害剤であって
i 前記miRNAのレベルを減少させ;そして/または
ii 前記miRNAをコードする配列の発現を阻害するかまたは下方制御するか、あるいは前記miRNAを分解するかまたは切断する、特にリボザイムから選択される
前記アンタゴニスト/阻害剤
を含むことも可能である。
前記miRNAをコードする配列の発現を阻害するかまたは下方制御するか、あるいは前記miRNAを分解するかまたは切断する、特にリボザイムから選択される
その阻害剤またはアンタゴニストを含有することも可能である。
前記miRNAをコードする配列の発現を阻害するかまたは下方制御するか、あるいは前記miRNAを分解するかまたは切断する、特にリボザイムから選択される
その阻害剤またはアンタゴニストと組み合わせて含有する。
前記miRNAをコードする配列の発現を阻害するかまたは下方制御するか、あるいは前記miRNAを分解するかまたは切断する、特にリボザイムから選択される
その阻害剤またはアンタゴニストと組み合わせて含有する。
miRNA療法剤は、一般的に、ターゲティングされる成熟miRNAの配列に基づく。miRNA置換療法のための療法剤は、置換される成熟miRNAの配列と大部分を共有する必要がある。miRNAの5’シード領域には、正確な配列相同性が必要である。miRNA機能を特異的に阻害するように設計された療法剤(抗マイクロRNAオリゴヌクレオチド、AMO)は、安定なハイブリダイゼーションそしてしたがって、miRNAの隔離が達成されるように、ターゲティングされた配列に相補的である必要がある。AMOは、それぞれ、安定なRNA二重鎖形成を引き起こす化学的修飾、例えばホスホロチオエート主鎖、またはLNAおよび糖鎖の2’OMe修飾を含有することも可能である。
骨障害を有する被験体の血清/血漿において上方または下方制御されるmiRNAが、骨吸収におけるその機能のために、疾患原因として関連しうるかどうかは、破骨細胞形成に対するこれらのmiRNAの影響を評価することによって決定可能であり:RANKLおよびM−CSFを通じた破骨細胞形成の開始前に、CD14+末梢血単核細胞における合成マイクロRNAトランスフェクションを行う。破骨細胞マーカー、例えば酒石酸耐性酸ホスファターゼ(TRAP)活性、カルシトニン受容体およびRANK発現を定量化するアッセイを用いて、骨吸収に関するmiRNAの重要性に関する結論を導き出すことも可能である。損なわれていない細胞または細胞溶解物を用いて、miR前駆体からmiRNAを得ることも可能であるし、あるいは単離プロセシング酵素、例えば単離Drosha/Dgcr8およびダイサーを用いて、in vitroでmiRNAを産生することも可能である。miR前駆体からプロセシングすることなしに、miRNAを、化学合成によって産生することもまた可能である。
1. 被験体において骨粗鬆症を診断するか、または骨粗鬆症性骨折のリスクを決定するか、または治療成功を監視するin vitro法であって:
a)前記被験体由来の血液試料を提供し;
b)前記血液試料において
i. hsa−miR−188−3p、hsa−miR−382−3p、hsa−let−7i−3p、hsa−miR−1227−3p、hsa−miR−127−3p、hsa−miR−133b、hsa−miR−135a−5p、hsa−miR−136−3p、hsa−miR−143−3p、hsa−miR−155−5p、hsa−miR−181a−3p、hsa−miR−1908、hsa−miR−190a、hsa−miR−192−5p、hsa−miR−193b−3p、hsa−miR−196b−5p、hsa−miR−199b−5p、hsa−miR−200b−3p、hsa−miR−203a、hsa−miR−205−5p、hsa−miR−20b−5p、hsa−miR−214−3p、hsa−miR−215、hsa−miR−223−5p、hsa−miR−27a−3p、hsa−miR−30e−3p、hsa−miR−323a−3p、hsa−miR−330−3p、hsa−miR−342−5p、hsa−miR−369−3p、hsa−miR−376c−3p、hsa−miR−377−3p、hsa−miR−378a−5p、hsa−miR−410、hsa−miR−454−3p、hsa−miR−487b、hsa−miR−495−3p、hsa−miR−500a−5p、hsa−miR−502−5p、hsa−miR−542−5p、hsa−miR−548a−3p、hsa−miR−550a−5p、hsa−miR−576−3p、hsa−miR−582−3p、hsa−miR−624−5p、hsa−miR−642a−5p、hsa−miR−941、hsa−miR−942またはそのアイソフォームまたは変異体からなる群II miRNA、および/または
ii. hsa−miR−181a−5p、hsa−miR−32−3p、hsa−let−7b−5p、hsa−let−7g−5p、hsa−let−7i−5p、hsa−miR−106a−5p、hsa−miR−106b−5p、hsa−miR−127−3p、hsa−miR−132−3p、hsa−miR−140−3p、hsa−miR−141−3p、hsa−miR−143−3p、hsa−miR−143−5p、hsa−miR−144−3p、hsa−miR−146b−5p、hsa−miR−154−5p、hsa−miR−16−2−3p、hsa−miR−16−5p、hsa−miR−17−5p、hsa−miR−181b−5p、hsa−miR−181c−3p、hsa−miR−181c−5p、hsa−miR−185−5p、hsa−miR−18a−3p、hsa−miR−18a−5p、hsa−miR−18b−5p、hsa−miR−1908、hsa−miR−191−5p、hsa−miR−196b−5p、hsa−miR−199b−5p、hsa−miR−19b−1−5p、hsa−miR−19b−3p、hsa−miR−200b−3p、hsa−miR−203a、hsa−miR−20a−5p、hsa−miR−20b−5p、hsa−miR−210、hsa−miR−21−3p、hsa−miR−25−3p、hsa−miR−26b−5p、hsa−miR−301a−3p、hsa−miR−301b、hsa−miR−323a−3p、hsa−miR−324−5p、hsa−miR−330−3p、hsa−miR−363−3p、hsa−miR−369−3p、hsa−miR−374a−5p、hsa−miR−375、hsa−miR−376c−3p、hsa−miR−378a−5p、hsa−miR−451a、hsa−miR−454−3p、hsa−miR−486−3p、hsa−miR−486−5p、hsa−miR−493−5p、hsa−miR−500a−5p、hsa−miR−532−3p、hsa−miR−545−3p、hsa−miR−550a−3p、hsa−miR−550a−5p、hsa−miR−589−5p、hsa−miR−590−3p、hsa−miR−598、hsa−miR−627、hsa−miR−629−5p、hsa−miR−7−5p、hsa−miR−92a−3p、hsa−miR−93−3p、hsa−miR−93−5p、hsa−miR−941、hsa−miR−942、hsa−miR−96−5p、hsa−miR−98−5pまたはそのアイソフォームまたは変異体からなる群III miRNA、および/または
iii. hsa−miR−10a−5p、hsa−miR−10b−5p、hsa−miR−125b−5p、hsa−miR−127−3p、hsa−miR−133a、hsa−miR−133b、hsa−miR−143−3p、hsa−miR−18a−3p、hsa−miR−194−5p、hsa−miR−30a−5p、hsa−miR−328−3p、hsa−miR−376a−3p、hsa−miR−409−3p、hsa−miR−574−3p、またはそのアイソフォームまたは変異体からなる群I miRNA
のいずれかより選択される、2またはそれより多いmiRNAのレベルを測定し、そして
c)健康な個体由来の参照血液試料における対応するmiRNAのレベルと、前記miRNAのレベルを比較する、
ここで、参照試料に比較した際の前記レベルの1.5倍を超える相違が、骨粗鬆症または骨粗鬆症性骨折リスク上昇の指標であるか、または
d)健康な被験体における対応するmiRNAの平均レベルと、前記miRNAのレベルを比較する、ここで、1標準偏差を超える相違が、将来の骨粗鬆症性骨折リスクが増加した骨粗鬆症の指標である
いずれかの工程を含む、前記方法。
3. 前記の2またはそれより多いヒトmiRNAが、群I miRNAより選択される、項目1または2記載の方法。
5. 前記の2またはそれより多いヒトmiRNAが、群III miRNAより選択される、項目1〜4記載の方法。
8. hsa−miR−127−3p、hsa−miR−133b、hsa−miR−143−3pのレベルを測定する、項目1または2のいずれか一項記載の方法。
13. hsa−let−7g−5p、hsa−miR−141−3p、hsa−miR−143−5p、hsa−miR−16−2−3p、hsa−miR−181a−5p、hsa−miR−181c−3p、hsa−miR−203a、hsa−miR−323a−3p、hsa−miR−500a−5p、hsa−532−3p、hsa−miR−7−5p、hsa−miR−92a−3pからなる群より選択される少なくとも1つのさらなるmiRNAのレベルを測定する、項目12記載の方法。
18. 骨折の予後のための項目1〜16のいずれか一項記載の方法の使用。
19. 被験体が、骨折を患うかまたは骨折を発展させるリスクがある骨粗鬆症患者、あるいは2型真性糖尿病のリスクがあるかまたは該疾患を患う患者である、項目1〜16のいずれか一項記載の方法。
前記miRNAのレベルを減少させ;そして/または前記miRNAをコードする配列の発現を阻害するかもしくは下方制御するか、または前記miRNAを分解するか、または前記miRNAを分解するかもしくは切断する、群I、IIまたはIIIのmiRNAの少なくとも2つのアンタゴニスト/阻害剤
を含む、骨粗鬆症または骨折を治療するかまたは防止する際に使用するための組成物。
23. 被験体において骨粗鬆症または骨折を治療するかまたは防止するための方法であって、
miRNA群I、IIまたはIII由来の少なくとも2つの単離ヒトmiRNAならびに/あるいは
a.前記miRNAのレベルを減少させ;そして/または
b.前記miRNAをコードする配列の発現を阻害するかもしくは下方制御するか、または前記miRNAを分解するか、または前記miRNAを分解するかもしくは切断する
群I、IIまたはIIIのmiRNAの少なくとも2つのアンタゴニスト/阻害剤
の有効量を投与する工程を含む、前記方法。
非限定的に、本発明は以下の態様を含む。
[態様1]
被験体において骨粗鬆症を診断するか、または骨粗鬆症性骨折のリスクを決定するか、または治療を監視するin vitro法であって:
a)前記被験体由来の血液試料を提供し;
b)
i)hsa−miR−188−3p、hsa−miR−382−3p、hsa−let−7i−3p、hsa−miR−1227−3p、hsa−miR−127−3p、hsa−miR−133b、hsa−miR−135a−5p、hsa−miR−136−3p、hsa−miR−143−3p、hsa−miR−155−5p、hsa−miR−181a−3p、hsa−miR−1908、hsa−miR−190a、hsa−miR−192−5p、hsa−miR−193b−3p、hsa−miR−196b−5p、hsa−miR−199b−5p、hsa−miR−200b−3p、hsa−miR−203a、hsa−miR−205−5p、hsa−miR−20b−5p、hsa−miR−214−3p、hsa−miR−215、hsa−miR−223−5p、hsa−miR−27a−3p、hsa−miR−30e−3p、hsa−miR−323a−3p、hsa−miR−330−3p、hsa−miR−342−5p、hsa−miR−369−3p、hsa−miR−376c−3p、hsa−miR−377−3p、hsa−miR−378a−5p、hsa−miR−410、hsa−miR−454−3p、hsa−miR−487b、hsa−miR−495−3p、hsa−miR−500a−5p、hsa−miR−502−5p、hsa−miR−542−5p、hsa−miR−548a−3p、hsa−miR−550a−5p、hsa−miR−576−3p、hsa−miR−582−3p、hsa−miR−624−5p、hsa−miR−642a−5p、hsa−miR−941、hsa−miR−942またはそのアイソフォームまたは変異体からなる群II miRNA、および/または
ii)hsa−miR−181a−5p、hsa−miR−32−3p、hsa−let−7b−5p、hsa−let−7g−5p、hsa−let−7i−5p、hsa−miR−106a−5p、hsa−miR−106b−5p、hsa−miR−127−3p、hsa−miR−132−3p、hsa−miR−140−3p、hsa−miR−141−3p、hsa−miR−143−3p、hsa−miR−143−5p、hsa−miR−144−3p、hsa−miR−146b−5p、hsa−miR−154−5p、hsa−miR−16−2−3p、hsa−miR−16−5p、hsa−miR−17−5p、hsa−miR−181b−5p、hsa−miR−181c−3p、hsa−miR−181c−5p、hsa−miR−185−5p、hsa−miR−18a−3p、hsa−miR−18a−5p、hsa−miR−18b−5p、hsa−miR−1908、hsa−miR−191−5p、hsa−miR−196b−5p、hsa−miR−199b−5p、hsa−miR−19b−1−5p、hsa−miR−19b−3p、hsa−miR−200b−3p、hsa−miR−203a、hsa−miR−20a−5p、hsa−miR−20b−5p、hsa−miR−210、hsa−miR−21−3p、hsa−miR−25−3p、hsa−miR−26b−5p、hsa−miR−301a−3p、hsa−miR−301b、hsa−miR−323a−3p、hsa−miR−324−5p、hsa−miR−330−3p、hsa−miR−363−3p、hsa−miR−369−3p、hsa−miR−374a−5p、hsa−miR−375、hsa−miR−376c−3p、hsa−miR−378a−5p、hsa−miR−451a、hsa−miR−454−3p、hsa−miR−486−3p、hsa−miR−486−5p、hsa−miR−493−5p、hsa−miR−500a−5p、hsa−miR−532−3p、hsa−miR−545−3p、hsa−miR−550a−3p、hsa−miR−550a−5p、hsa−miR−589−5p、hsa−miR−590−3p、hsa−miR−598、hsa−miR−627、hsa−miR−629−5p、hsa−miR−7−5p、hsa−miR−92a−3p、hsa−miR−93−3p、hsa−miR−93−5p、hsa−miR−941、hsa−miR−942、hsa−miR−96−5p、hsa−miR−98−5pまたはそのアイソフォームまたは変異体からなる群III miRNA、および/または
iii)hsa−miR−10a−5p、hsa−miR−10b−5p、hsa−miR−125b−5p、hsa−miR−127−3p、hsa−miR−133a、hsa−miR−133b、hsa−miR−143−3p、hsa−miR−18a−3p、hsa−miR−194−5p、hsa−miR−30a−5p、hsa−miR−328−3p、hsa−miR−376a−3p、hsa−miR−409−3p、hsa−miR−574−3p、またはそのアイソフォームまたは変異体からなる群I miRNA
のいずれかより選択される、2またはそれより多いmiRNAのレベルを測定し、そして
c)健康な個体由来の参照血液試料における対応するmiRNAのレベルと、前記miRNAのレベルを比較する、
ここで、参照試料に比較した際の前記レベルの1.5倍を超える相違が、骨粗鬆症または骨折リスクの指標である
工程を含む、前記方法。
[態様2]
前記miRNAのレベルを、健康な被験体における対応するmiRNAの平均レベルに比較し、1標準偏差より大きい相違が、将来の骨折リスクが増加した骨粗鬆症の指標となる、態様1記載の方法。
[態様3]
前記の2またはそれより多いヒトmiRNAが、群I miRNAまたは群II miRNAまたは群III miRNAより選択される、態様1または2記載の方法。
[態様4]
群I、IIまたはIIIのいずれかの少なくとも3、好ましくは少なくとも4、好ましくは少なくとも5、特に最大136のmiRNAのレベルを測定する、態様1〜3のいずれか一項記載の方法。
[態様5]
群Iおよび/または群IIおよび/または群III miRNAのいずれかのすべてのmiRNAのレベルを測定する、態様1または2記載の方法。
[態様6]
hsa−miR−127−3p、hsa−miR−133bおよびhsa−miR−143−3pのレベルを測定する、態様1または2のいずれか一項記載の方法。
[態様7]
hsa−miR−106a−5p、hsa−miR−127−3p、hsa−miR−133b、hsa−miR−143−3p、hsa−miR−18a−3p、hsa−miR−196b−5p、hsa−miR−199b−5p、hsa−miR−200b−3p、hsa−miR−203a、hsa−miR−20b−5p、hsa−miR−323a−3p、hsa−miR−330−3p、hsa−miR−369−3p、hsa−miR−376c−3p、hsa−miR−378a−5p、hsa−miR−454−3p、hsa−miR−500a−5p、hsa−miR−550a−5p、hsa−miR−941、およびhsa−miR−942のレベルを測定する、態様1または2記載の方法。
[態様8]
hsa−miR−188−3p、hsa−miR−382−3p、hsa−miR−942およびhsa−miR−155−5pの少なくとも2つのレベルを測定する、態様1または2記載の方法。
[態様9]
hsa−miR−136−3p、hsa−miR−181a−3p、hsa−miR−378a−5p、hsa−miR−502−5p、hsa−miR−550a−5p、hsa−miR−576−3pおよびhsa−miR−582−3pからなる群より選択される少なくとも1つのさらなるmiRNAのレベルを測定する、態様8記載の方法。
[態様10]
miR−550a−5p、miR−32−3p、miR−96−5pおよびmiR−486−3pの少なくとも2つのレベルを測定する、態様1または2記載の方法。
[態様11]
hsa−let−7g−5p、hsa−miR−141−3p、hsa−miR−143−5p、hsa−miR−16−2−3p、hsa−miR−181a−5p、hsa−miR−181c−3p、hsa−miR−203a、hsa−miR−323a−3p、hsa−miR−500a−5p、hsa−532−3p、hsa−miR−7−5pおよびhsa−miR−92a−3pからなる群より選択される少なくとも1つのさらなるmiRNAのレベルを測定する、態様10記載の方法。
[態様12]
1またはそれより多いさらなるmiRNAを検出し、ここで前記miRNAが
a)健康な個体に比較した際、骨粗鬆症個体において示差的に制御されており、そして
b)骨形成分化および/または破骨細胞形成(osteoclastogenic)活性化に関与する
態様1〜11記載の方法。
[態様13]
前記のさらなるmiRNAが、hsa−miR−100、hsa−miR−124a、hsa−miR−148a、hsa−miR−23a、hsa−miR−24、hsa−miR−31、hsa−miR−22−3pおよびhsa−miR−93からなる群IV miRNAより選択される、態様8記載の方法。
[態様14]
前記のさらなるmiRNAが、hsa−miR−140−5p、hsa−miR−146a−5p、hsa− hsa−miR−199a−5p、hsa−miR−20a、hsa−miR−200a、hsa−miR−217、hsa−miR−218、hsa−miR−26a、hsa−miR−27a、hsa−miR−2861、hsa−miR−29a−3p、hsa−miR−29b−3p、hsa−miR−29c−3p、hsa−miR−204−5p、hsa−miR−335−5p、hsa−miR−34c、hsa−miR−370−3p、hsa−miR−3960およびhsa−miR−503−5p、またはそのアイソフォームおよび変異体からなる群V miRNAより選択される、態様12または13記載の方法。
[態様15]
被験体を、特に骨折の予後に関して監視するための、態様1〜14のいずれか一項記載の方法の使用。
[態様16]
被験体が、骨折を患うかまたは骨折を発展させるリスクがある骨粗鬆症または骨減少症患者、あるいは2型真性糖尿病のリスクがあるかまたは該疾患を患う患者である、態様1〜14のいずれか一項記載の方法。
[態様17]
miRNAレベルの相違を、定量的またはデジタルPCR、配列決定、マイクロアレイ、Luminex核酸アッセイ、または他のハイブリダイゼーションに基づく技術によって決定する、態様1〜14のいずれか一項記載の方法。
[態様18]
a)miRNA群I、IIまたはIII由来の少なくとも1つ、特に少なくとも2つの合成ヒトmiRNAならびに/あるいは
b)
i.前記miRNAのレベルを減少させ;そして/または
ii.前記miRNAをコードする配列の発現を阻害するかもしくは下方制御するか、または前記miRNAを分解するかもしくは切断する
群I、IIまたはIIIのmiRNAの少なくとも2つのアンタゴニスト/阻害剤
を含む、骨粗鬆症または骨折を治療するかまたは防止する際に使用するための組成物。
[態様19]
薬剤を調製するための、miRNA群I、IIまたはIII由来の少なくとも1つ、特に少なくとも2つの合成ヒトmiRNAならびに/あるいは前記miRNAのレベルを減少させ;そして/または前記miRNAをコードする配列の発現を阻害するかもしくは下方制御するか、または前記miRNAを分解するかもしくは切断する、群I、IIまたはIIIのmiRNAの少なくとも2つのアンタゴニスト/阻害剤を含む、組成物の使用。
研究設計
最近の骨折におけるmiRNAの分析のため、Seeligerら、2014、上記によって選択されるものより若い患者に焦点を置いたが、これは、初期の疾患発展中、すなわちより若い年齢で、診断が優先的に行われるためである。
長期保存のため、血清試料を−80℃で凍結させた。RNA単離に際して、血清を37℃で融解し、12,000xgで5分間遠心分離して、細胞破片を除去し、そして200μlの血清を、35fmolの合成cel−miR−39−3pスパイクイン対照を含有する750μl Qiazol中でホモジナイズした。RNA沈殿および精製のため、標準プロトコルから以下の逸脱を含めて、クロロホルムおよびmiRNeasy単離キット(Qiagen、ドイツ)を用いて、RNA単離を行った:200μl血漿を750μl Qiazol中にホモジナイズした。正確に500μlの水性相を採取し、1μlのグリコーゲン(Ambion、テキサス州)を最終濃度50μg/mlまで添加し、そして750μlの100%エタノールで沈殿させた。カラムをRPE緩衝液で3回洗浄し、そして血漿RNAを30μlヌクレアーゼ不含水で1回溶出し、そして−80℃で保存した。それぞれのTaqmanマイクロRNAアッセイキットおよびMastermix(Applied Biosystems)を用いて、Qiagen Rotorgene上、4つ組で、cel−miR−39−3pの定量化を行った。
血清または血漿中を循環することが繰り返し見出されてきている175の別個のヒトmiRNAを含む、384ウェルの血清/血漿フォーカスパネルを用いて、デンマークのExiqon Inc.によって、miRNA発現のスクリーニングを行った。まず、miRCURY LNA普遍的RT反応キットを用いて、20μl反応中、4μlの単離RNAを逆転写した。UniSp3およびUniSp6は、この工程で添加され、そして続いて酵素阻害剤の存在を検出するために分析される、合成対照である。qPCR分析前に、RT反応を50倍に希釈し、そしてRoche LC480リアルタイムPCR系(Roche、ドイツ)を用いて、10μl反応中、試料あたり1回、各miRNAをアッセイした。
融解曲線分析を行い、そして1より多いピークを有するmiRNA PCR反応を分析から除外した。linregソフトウェアパッケージに似たアルゴリズムを用いて、増幅効率を計算した。大部分のmiRNAに関して、効率は、1.8〜2.1の間の範囲であった。<1.6の効率を生じる個々の反応をデータセットから除外した。全血清/血漿フォーカスパネルプレート上で、「テンプレート不含」cDNA合成対照をアッセイすることによって、各miRNAに関するバックグラウンドレベルを生じた。miRNAアッセイの大部分はいかなるシグナルも生じず、そしてバックグラウンドCpを42にセットした。本発明者らは、すべてのmiRNAアッセイが、分析に含まれるバックグラウンド値よりも>5Cp低いシグナルを示すことを必要とした。すべての14の試料(124アッセイ)に渡って検出されるmiRNAアッセイの平均Cpに基づいて、Cp値の規準化を行った。Normfinderソフトウェアを用いて、平均Cpの安定性が、データセット中のいかなる個々のmiRNAアッセイの安定性よりも高いことを確認した。以下の等式を用いて規準化した:規準化Cp(dCp)=平均Cp(124アッセイ)−アッセイCp(試料)。これは、デルタCp(dCp)値を生じ、発現に関する相対log2転換測定値であり、より高い値は血漿中のより高い濃度を示し、そしてより低いdCp値はより低い濃度を示す。
既往骨粗鬆症性骨折に関する研究設計
研究実行中に、74人の月経後女性(骨折歴を含まない17人の対照(Co)、脆弱性骨折歴を有する19人の対照(Fx)、骨折を伴わない19人の2型糖尿病女性(DM)および脆弱性骨折歴を有する19人の2型糖尿病女性(DMFx))の血清試料を収集した。研究に含まれるためには、すべての女性が閉経後で、年齢50〜75歳であり、18〜37kg/m2の範囲の肥満度指数でなければならなかった。すべての被験体は動くことができ、そして歩行器なしに移動可能である必要があった。糖尿病群に登録された被験体に関しては、最低限3年間の経口投薬および/またはインスリンによる2型糖尿病治療歴を必要とした。白人、アジア系およびアフリカ系アメリカ人女性が含まれた。骨折を有する被験体は、骨折が、低エネルギー外傷、例えば立位またはそれより低い位置からの転倒によって引き起こされ、そして閉経後にも持続した場合にのみ、含まれた。局所腫瘍、腫瘍様病変またはレントゲン写真上で視覚化されるような病巣脱ミネラル化などの他の起源の病的骨折を有する患者は研究から除外した。
AGES−レイキャビク・コホートの66歳を超える443人の閉経後女性を含む、前向き入れ子症例対照研究設計を作成した。この研究の目的は、最初の骨粗鬆症性骨折(偶発的骨折)またはさらなる骨粗鬆症性骨折の予測のための循環マイクロRNAの同定であった。この目的のため、血清マイクロRNAレベルに関してベースラインで血液試料を分析し、そして5.4年での最初の追跡調査後の患者転帰と相関させる。総合すると、研究設計は4群を含み:対照群は、既往骨折を含まず、そして5.4年の追跡調査中、骨折を維持しなかった100人の健康な個体を含み、骨折群は、追跡調査中に最初の偶発的骨折を維持した100人、およびすでに1またはそれより多い既往骨折を有した後、追跡調査期間中にさらなる骨折を維持した72人の172人の患者を含み、対照糖尿病群は、2型糖尿病と診断されているが、既往骨折を伴わず、また追跡調査中に偶発的骨折を維持しなかった100人の個体を含み、そして糖尿病性骨折群は、5.4年の追跡調査内に最初の偶発的骨折を維持した35人、およびベースラインで既往骨折を有し、そして追跡期間中に1またはそれより多いさらなる偶発的骨折を有した36人の患者の71人の患者からなった。
RNA単離のため、200μlの血清を37℃で溶解し、12,000xgで5分間遠心分離し、そして小分子RNA精製効率を監視するため、3つの異なる濃度で合成RNAスパイクイン対照(Exiqon、デンマーク)を含有する、1000μl Qiazol中にホモジナイズした。標準プロトコルから以下の逸脱を含めて、RNA沈殿および精製のため、クロロホルム抽出およびmiRNeasy単離キット(Qiagen、ドイツ)を用いて、RNA単離を行った:抽出後、正確に650μlの水性相を採取し、1μlのグリコーゲン(Ambion、米国テキサス州)を最終濃度50μg/mlまで添加し、そして975μlの100%エタノールで沈殿させた。カラムをRPE緩衝液で3回洗浄し、そしてRNAを30μlヌクレアーゼ不含水で1回溶出し、そして−80℃で保存した。
Exiqonによる試薬を用いて、384ウェルプレート中で、miRNAのqPCRに基づくハイスループット定量化を行った。まず、普遍的cDNA合成キットIIを用いて、50μl反応中、10μlの単離RNAを逆転写した。この工程中に、UniSp6およびcel−miR−39−3pを添加して、酵素阻害剤の存在を監視した。カスタム設計のプレコーティングPick&Mix384ウェルプレート中で、qPCR分析前に、cDNA試料を100倍に希釈した。epMotion P5073液体取り扱いロボット(Eppendorf、ドイツ)を用いて、10μlのqPCR混合物をqPCRプレートの各ウェルに分配した。Roche LC480リアルタイムPCR系(Roche、ドイツ)を用いて、10μl反応中、試料あたり1回、各miRNAをアッセイする。
融解曲線分析を行い、そして1より多いピークを有するmiRNA PCR反応を分析から除外した。linregソフトウェアパッケージに似たアルゴリズムを用いて、増幅効率を計算した。大部分のmiRNAに関して、効率は、1.8〜2.1の間の範囲であった。<1.6の効率を生じる個々の反応をデータセットから除外した。全血清/血漿フォーカスパネルプレート上で、「テンプレート不含」cDNA合成対照をアッセイすることによって、各miRNAに関するバックグラウンドレベルを生じた。miRNAアッセイの大部分はいかなるシグナルも生じず、そしてバックグラウンドCpを42にセットした。発現データを、以下の基準にしたがって、あらかじめフィルタリングした:i)空の値を50%より多く含むフィーチャーを除外した;ii)任意の4群間の1因子ANOVA分析において、<0.05のp値を持つフィーチャーを選択した;iii)骨折および非骨折試料または糖尿病および非糖尿病試料間の陰性シグナルの不均等な分布を示す、カイ二乗検定p値<0.1を有するフィーチャーを選択した。この段階の目的は、任意の4群において制御に向かう傾向を有するフィーチャーのみをさらにプロセシングすることを可能にすることであった。残りの146フィーチャーのCt値を、スパイクイン対照レベルの全体の平均に関して補正し、そして最後に、正規分布値の仮定に基づいて、空の値を帰属値(imputed value)で置き換えた。
非糖尿病性骨折患者の分類のため、0.978のAUC値を生じる4つのマイクロRNAの組み合わせ(図1aおよびb)を同定した。この組み合わせは、miR−188−3p、miR−942、miR−155−5p、およびmiR−382−3pからなった。分類モデル中のmiRNAのさらなる取り込み(最大総数10のmiRNA)は、AUCを1.0の値まで改善することが可能であり(図2a)、このうちmiR−136−3pおよびmiR−502−5pは、分類に最強の影響を有した。
患者同意を得て、局所麻酔下で、外来腫脹脂肪吸引から得た皮下脂肪組織から、ヒト脂肪由来幹細胞(ASC)を得た。以前記載されるように(Wolbankら、2007a;Wolbankら、2007b;Wolbankら、2009a)ASCを単離し、そして4mM L−グルタミン、10%ウシ胎児血清(FCS、PAA)および1ng/mL組換えヒト塩基性線維芽細胞増殖因子(rhFGF、R&D Systems)を補ったDMEM−低グルコース/HAM F−12中、37℃、5%CO2および95%気湿で培養した。増殖率に併せて、細胞を週1回または2回、1:2のスプリット比で継代した。
24ウェル細胞培養プレートにおいて、すべての分化プロトコルを行った。骨形成分化のため、ASCをウェルあたり2x103細胞の密度で植え付けた。植え付け72時間後、細胞を骨形成分化培地(DMEM−低グルコース、10%FCS、4mM L−グルタミン、10nMデキサメタゾン、150μMアスコルビン酸−2−リン酸、10mM β−グリセロールリン酸および10nMビタミン−D3)と最長4週間インキュベーションした。
石灰化構造のアリザリン染色のため、細胞を70%エタノール中、−20℃で1時間固定した。簡単にリンスした後、細胞を40mMアリザリンレッド溶液(Sigma)で20分間染色し、そしてPBSで洗浄した。定量化のため、200μl 0.1M HCL/0.5%SDS溶液を用いて、アリザリンを30分間抽出した。抽出した色素を425nmで測定した。
siPORTTMNeoFXTMトランスフェクション試薬(Applied Biosystems)を用いて、ASCをトランスフェクションした。製造者のプロトコルにしたがって、細胞を10nM前駆体マイクロRNAまたはスクランブル化miRNA対照#2(Ambion)でトランスフェクションした。トランスフェクション3日後、上述のように分化を開始した。
hsa−miR−10b−5p、hsa−miR−203a、hsa−miR−376a−3p、およびmiR−550a−5pのトランスフェクションは、50%またはそれより多い骨形成分化の有意な阻害を生じた。hsa−miR−188−3p、hsa−miR−199b−5p、およびmiR−148a−5pのトランスフェクションは、200%より多く、そして最大400%の骨形成分化の有意な加速を生じた。
表1
Claims (7)
- 被験体において骨粗鬆症を試験するか、または骨粗鬆症性骨折のリスクを決定するか、または治療を監視するin vitro法であって:
a)前記被験体由来の血液試料を提供し;
b)hsa−miR−188−3pのレベル、並びに、
i)hsa−miR−127−3p、hsa−miR−143−3p、hsa−miR−214−3p、および、hsa−miR−30e−3pまたはその相補的成熟マイクロRNA鎖からなる群II miRNA、および
ii)hsa−miR−106b−5p、hsa−miR−141−3p、hsa−miR−19b−3p、hsa−miR−21−3p、hsa−miR−375、hsa−miR−486−3p、および、hsa−miR−532−3p、またはその相補的成熟マイクロRNA鎖からなる群III miRNA、および、
iii)hsa−miR−29b−3pおよびhsa−miR−335−5p、またはその相補的成熟マイクロRNA鎖からなる群V miRNA
のいずれかより選択される、少なくとも2つのmiRNAのレベルを測定し、そして
c)健康な個体由来の参照血液試料における対応するmiRNAのレベルと、前記miRNAのレベルを比較する、
ここで、参照試料に比較した際の前記レベルの1.5倍を超える増加または減少が、骨粗鬆症または骨折リスクの指標である、
工程を含む、
ここで、hsa−miR−188−3p、hsa−miR−127−3p、hsa−miR−214−3p、hsa−miR−21−3p、hsa−miR−375、hsa−miR−532−3pおよびhsa−miR−335−5p、あるいはこれらの相補的成熟マイクロRNA鎖のレベルについては、参照試料と比較した際の1.5倍を超える増加が、骨粗鬆症または骨折リスクの指標であり、そして、
ここで、hsa−miR−143−3p、hsa−miR−30e−3p、hsa−miR−106b−5p、hsa−miR−141−3p、hsa−miR−19b−3p、hsa−miR−486−3pおよびhsa−miR−29b−3p、あるいはこれらの相補的成熟マイクロRNA鎖のレベルについては、参照試料と比較した際の1.5倍を超える減少が、骨粗鬆症または骨折リスクの指標である、
前記方法。 - 群IIまたはIIIのいずれかの少なくとも4、好ましくは少なくとも5のmiRNAのレベルを測定する、請求項1記載の方法。
- 群IIおよび/または群III miRNAのすべてのmiRNAのレベルを測定する、請求項1または2記載の方法。
- 被験体が、骨折を患うかまたは骨折を発展させるリスクがある骨粗鬆症または骨減少症患者、あるいは2型真性糖尿病のリスクがあるかまたは該疾患を患う患者である、請求項1〜3のいずれか一項記載の方法。
- miRNAレベルの相違を、定量的またはデジタルPCR、配列決定、マイクロアレイ、または他のハイブリダイゼーションに基づく技術によって決定する、請求項1〜4のいずれか一項記載の方法。
- hsa−miR−188−3p、hsa−miR−199b−5p、およびhsa−miR−148a−5pを含む、骨粗鬆症または骨折を治療するかまたは防止する際に使用するための組成物。
- hsa−miR−188−3p、hsa−miR−199b−5p、およびhsa−miR−148a−5pを含む組成物の、骨粗鬆症または骨折を治療するかまたは防止する際に使用するための薬剤を調製するための、使用。
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