JP6595071B2 - アジュバント用二重鎖リボ核酸 - Google Patents
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Description
なお、本願でいう鎖長とは、RNAの塩基数と同義である。ssRNAの鎖長の単位は塩基(base)またはキロ塩基(1 kb = 1000 base)と表記し、dsRNAの場合には、塩基対 (bp)またはキロ塩基対(1 kbp = 1000 bp)と表記する。
また、ssRNAやdsRNAの重量平均鎖長は、好ましくは、ゲルパーミエーションクロマトグラフィー(GPC)分析法により決定される鎖長である。具体的には、分子量が既知であるdsRNAやdsDNAを標準品としてGPC分析を行い、得られたデータから平均鎖長や鎖長の中央値を算出する。別法としては、密度勾配沈降速度法で沈降係数S(20,w)を求め、実験式からssRNAやdsRNAの鎖長を概算する方法もある(文献The Journal of Biochemistry (1961)50:377)。
[1]重量平均鎖長が0.1 キロ塩基対(kbp)から2.0 kbpの範囲内の二重鎖リボ核酸(dsRNA)またはその塩であって、
該dsRNAの第1の鎖は2以上の一本鎖リボ核酸(ssRNA)からなり、該第1の鎖を構成する2以上のssRNAの全ては、同種のリボヌクレオチドからなるホモポリマーであること、
該dsRNAの第2の鎖は1つのssRNAからなること、該第1の鎖を構成する2以上のssRNAの各々は、該第2の鎖を構成する1つのssRNAの部分領域に対して二重鎖を形成できる程度の相補性を有する塩基配列を有すること、および
該第1の鎖を構成する2以上のssRNAの重量平均鎖長は該第2の鎖を構成する1つのssRNAの重量平均鎖長の1/2以下であることを特徴とする、dsRNAまたはその塩。
[2]該第1の鎖が、重量平均鎖長が0.02〜1.0 キロ塩基(kb)である2以上のssRNAから構成されている、上記[1]に記載のdsRNAまたはその塩。
[3]該dsRNAまたはその塩を70℃に加熱後2℃/hの降下率で35℃まで冷却する操作を行った後、再び70℃に加熱後5℃/minの平均降下率で35℃まで冷却する操作を行った場合、2 kbp以上の鎖長を有するdsRNAの重量比率が10%以下となる、上記[1]または[2]に記載のdsRNAまたはその塩。
[4]該第1の鎖を構成する2以上のssRNAがポリイノシン酸であり、かつ該第2の鎖を構成する1つのssRNAがシチジル酸を80%以上の割合で含むssRNAである、上記[1]〜[3]のいずれか1つに記載のdsRNAまたはその塩。
[5]上記[1]〜[4]のいずれか1つに記載のdsRNAまたはその塩を含有してなる免疫刺激物質、アジュバント、または医薬品。
[6]重量平均鎖長が0.1 キロ塩基対(kbp)から2.0 kbpの範囲内の二重鎖リボ核酸(dsRNA)またはその塩の製造方法であって、該方法は、
(1)同種のリボヌクレオチドからなるssRNAを調製する工程、
(2)前記(1)のssRNAに対して二重鎖を形成できる程度の相補性を有する塩基配列を有するssRNAを調製する工程、および
(3)前記(1)のssRNAと前記(2)のssRNAとをアニーリングさせる工程を含み、前記(1)のssRNAの重量平均鎖長が、前記(2)のssRNAの重量平均鎖長の1/2以下であってかつ0.02〜1.0 キロ塩基(kb)である、方法。
[7]前記(1)のssRNAがポリイノシン酸であり、かつ前記(2)のssRNAがシチジル酸を80%以上の割合で含むssRNAである、上記[6]に記載の方法。
本発明は新規のdsRNAまたはその塩(以下、これらを総称して「本発明のdsRNA」と呼称することもある)を提供する。本発明のdsRNAは、重量平均鎖長が0.1 キロ塩基対(kbp)から2.0 kbpの範囲内であって、かつ
該dsRNAの第1の鎖は2以上の一本鎖リボ核酸(ssRNA)からなり、該第1の鎖を構成する2以上のssRNAの全ては、同種のリボヌクレオチドからなるホモポリマーであること、
該dsRNAの第2の鎖は1つのssRNAからなること、該第1の鎖を構成する2以上のssRNAの各々は、該第2の鎖を構成する1つのssRNAの部分領域に対して二重鎖を形成できる程度の相補性を有する塩基配列を有すること、および
該第1の鎖を構成する2以上のssRNAの重量平均鎖長は該第2の鎖を構成する1つのssRNAの重量平均鎖長の1/2以下であることをその特徴とする。
なお、上記の通り、第1の鎖は2以上のssRNAからなるものであり、従って本発明のdsRNAにおいては、第2の鎖であるssRNAに対して、第1の鎖である2以上のssRNAがリボヌクレオチド間の相補的な結合により結合している事象が生じ得る。その場合、該dsRNAを構成する第1の鎖は、それを構成する全てのssRNAがホスホジエステル結合で結合したものではなく、直接的には結合していない複数のssRNAを含むことになる。本明細書においては、全てのssRNAが「鎖」状に連結しているか否かに関わらず、dsRNAを構成する2つの鎖のうち、2以上のssRNAからなる側を便宜上、第1の鎖と表現し、1つのssRNAからなる側を便宜上、第2の鎖と表現する。
そのため、例えば、第2の鎖のssRNAは、第1の鎖の各ssRNAを構成するリボヌクレオチドに対して相補的なリボヌクレオチドが1種または複数種組み合わされた配列のssRNAは無論のこと、第1の鎖のssRNAとの相補的な結合を著しく阻害しない範囲で、更にそこに、第1の鎖の各ssRNAを構成するリボヌクレオチドに対して相補的ではないリボヌクレオチドが、当該ssRNAを構成する全リボヌクレオチドに対して20%未満、好ましくは10%未満、より好ましくは5%未満、更により好ましくは3%未満、特に好ましくは2%未満、最も好ましくは1%未満の頻度で組み込まれたssRNAであってもよい。リボヌクレオチドの塩基間の相補性については当該技術分野において良く知られている。
また、第1の鎖のssRNAがウリジル酸ホモポリマーの場合には、第2の鎖のssRNAとしてはアデニル酸からなる配列のssRNAは無論のこと、第1の鎖のssRNAとの相補的な結合を著しく阻害しない範囲で、更にそこにウリジル酸および/またはグアニル酸および/またはイノシン酸および/またはシチジル酸および/またはキサンチル酸が、当該ssRNAを構成する全リボヌクレオチドに対して20%未満、好ましくは10%未満、より好ましくは5%未満、更により好ましくは3%未満、特に好ましくは2%未満、最も好ましくは1%未満の頻度で組み込まれたssRNAであってもよい。
また、第1の鎖のssRNAがグアニル酸ホモポリマーの場合には、第2の鎖のssRNAとしてはシチジル酸ホモポリマーは無論のこと、第1の鎖のssRNAとの相補的な結合を著しく阻害しない範囲で、更にそこにウリジル酸および/またはアデニル酸および/またはグアニル酸および/またはイノシン酸および/またはキサンチル酸が、当該ssRNAを構成する全リボヌクレオチドに対して20%未満、好ましくは10%未満、より好ましくは5%未満、更により好ましくは3%未満、特に好ましくは2%未満、最も好ましくは1%未満の頻度で組み込まれたssRNAであってもよい。
また、第1の鎖のssRNAがシチジル酸ホモポリマーの場合には、第2の鎖のssRNAとしてはグアニル酸とイノシン酸から選ばれたリボヌクレオチドが1種または複数種組み合わされた配列のssRNAは無論のこと、第1の鎖のssRNAとの相補的な結合を著しく阻害しない範囲で、更にそこにアデニル酸および/またはウリジル酸および/またはシチジル酸および/またはキサンチル酸が、当該ssRNAを構成する全リボヌクレオチドに対して20%未満、好ましくは10%未満、より好ましくは5%未満、更により好ましくは3%未満、特に好ましくは2%未満、最も好ましくは1%未満の頻度で組み込まれたssRNAであってもよい。
また、第1の鎖のssRNAがイノシン酸ホモポリマーの場合には、第2の鎖のssRNAとしてはアデニル酸とシチジル酸から選ばれたリボヌクレオチドが1種または複数種組み合わされた配列のssRNAは無論のこと、第1の鎖のssRNAとの相補的な結合を著しく阻害しない範囲で、更にそこにウリジル酸および/またはグアニル酸および/またはイノシン酸および/またはキサンチル酸が、当該ssRNAを構成する全リボヌクレオチドに対して20%未満、好ましくは10%未満、より好ましくは5%未満、更により好ましくは3%未満、特に好ましくは2%未満、最も好ましくは1%未満の頻度で組み込まれたssRNAであってもよい。一つの実施形態では、第1の鎖のssRNAはイノシン酸ホモポリマーであり、かつ第2の鎖のssRNAはシチジル酸を80%以上の割合で含むssRNAであり、例えば、第1の鎖のssRNAがイノシン酸ホモポリマーであり、かつ第2の鎖のssRNAがシチジル酸ホモポリマーである場合等が挙げられる。
分析条件は以下の通りである。
・溶離液:10mM トリス硫酸バッファー(pH7.0)、150mM 硫酸ナトリウム
・ポンプ流速: 0.5 ml/min
・カラム:TSK-Gel G-5000PWXL
・カラム温度: 25℃
・UV検出: Abs 260 nm
ssRNAの場合
塩基数=(GPC分子量−98)/(NMP-18)
NMP:ヌクレオチド一リン酸の平均分子量
dsRNAの場合
塩基数=(GPC分子量−196)/(NMP1+NMP2−36)
NMP1:センス側のヌクレオチド一リン酸の平均分子量
NMP2:アンチセンス側のヌクレオチド一リン酸の平均分子量
本発明のdsRNAは、単独でワクチンや医薬品に配合してもよいし、他の成分との組み合わせや製剤技術と組み合わせて使用することもできる。例えば、ポリリジンやポリグルタミン酸などのカチオン性ポリマーと水素結合させたハイブリッドポリマーとしての利用や、シグナル伝達経路の異なる他の免疫刺激物質との混合、水中油型乳剤などの各種リポソーム基材に含有または吸着させたリポソーム製剤としての利用、増粘剤と混合して展着力を改善する製剤としての利用が挙げられる。さらには、ドラッグデリバリー技術や皮膚パッチ製剤技術と組み合わせることもできる。さらには、シグナル伝達経路の異なる免疫刺激物質と混合して使用することもできる。
本発明はまた、dsRNAまたはその塩の製造方法(以下、本発明の製造方法)を提供する。該方法は、
(1)同種のリボヌクレオチドからなるssRNAを調製する工程、
(2)前記(1)のssRNAに対して二重鎖を形成できる程度の相補性を有する塩基配列を有するssRNAを調製する工程、および
(3)前記(1)のssRNAと前記(2)のssRNAとをアニーリングさせる工程を含み、前記(1)のssRNAの重量平均鎖長が、前記(2)のssRNAの重量平均鎖長の1/2以下であってかつ0.02〜1.0 キロ塩基(kb)である。
工程(1)、(2)のssRNAとしては、本発明のdsRNAについてそれぞれ第1の鎖または第2の鎖を構成するssRNAとして上述したものと同様のものとすることができ、それにより本発明のdsRNAを製造することができる。
ポリリボヌクレオチドヌクレオチジルトランスフェラーゼで酵素合成したイノシン酸ホモポリマーとシチジル酸ホモポリマーを、サンプル希釈液[10mM トリス硫酸バッファー(pH7.0)、150mM 硫酸ナトリウム]で希釈し、GPC分析に供した。GPC解析システムは、TSKgel G-5000PWXLパックドカラム(東ソー株式会社製)を装着した島津製作所製のLC Solution GPCを使用し、イソクラテックモードでクロマトグラフィーを行い、Abs 260nmの吸光強度を測定した。分子量マーカーは、モノヌクレオチドと自動合成機で作製したオリゴヌクレオチド、およびλDNAを鋳型にしてPCR法で増幅させた約4000 bpから100 bpのDNA断片を使用した。
分析条件は以下のとおりである。
・溶離液: 10mM トリス硫酸バッファー(pH7.0)、150mM 硫酸ナトリウム
・ポンプ流速: 0.5 ml/min
・カラム: TSK-Gel G-5000PWXL
・カラム温度: 25℃
・検出: Abs 260nm
イノシン酸ホモポリマー: 塩基数(鎖長)=(GPC分子量−98)/330.2
シチジル酸ホモポリマー: 塩基数(鎖長)=(GPC分子量−98)/305.2
イノシン酸ホモポリマーpI-400をアニーリングバッファー[組成: 100 mM HEPESバッファー(pH6.5), 100 mM NaCl]に溶解し、50倍希釈液のAbs 260nmが1.0となる溶液を10 ml作製した。同様にシチジル酸ホモポリマーpC-400をアニーリングバッファーに溶解し、50倍希釈液のAbs 260nmが1.0となる溶液を10 ml作製した。50 ml容プラスチックチューブにpI-400溶液 5 mlとpC-400溶液 5 mlを添加して混合したものを2本作製し、室温で16時間静置した。4M NaCl溶液0.5 mlとイソプロピルアルコール 10 mlをチューブ毎に添加して混合し、2800×g、10分間の遠心分離でpolyICを沈殿させ、遠心上清を除いた。次に70% エタノールをチューブあたり 20 ml添加して混合後、2800×g、10分間の遠心分離でpolyICを再沈殿させて、遠心上清を除去した。再度70% エタノールをチューブあたり20 ml添加して混合後、2800×g、10分間の遠心分離でpolyICを再沈殿させて、遠心上清を除去し、チューブをデシケータに入れて残留エタノールを減圧乾燥で蒸発させた。その後、アニーリングバッファーをチューブあたり10 ml加え、polyIC(400:400)溶液#1、#2を得た(#1および#2は独立した操作により得られたことを表す。)。
比較例1で得られたpolyIC(400:400)#1および#2の鎖長をGPC分析で解析した。
GPC分析は試験例1に記載した装置と手順で行い、polyICの塩基対数(鎖長)と値Aの対応データを統計処理して重量平均値と中央値を求めた。さらに、2000塩基対(2 kbp)以上の重量%を計算した。
なお、polyICの鎖長は以下の計算式を使用して算出した。
polyIC: 鎖長(bp)=(GPC分子量−196)/635.4
重量平均鎖長が2kbよりも短い重量平均鎖長が389塩基のイノシン酸ホモポリマーと重量平均鎖長が344塩基のシチジル酸ホモポリマーを重合して作製したpolyICは、安全上問題視されている2kbp以上の鎖成分が重量比で42-43%も含まれていることが判明した。この2kbp以上の鎖成分は、材料として用いたシチジル酸ホモポリマーとイノシン酸ホモポリマーが、互い違いに複数個連なって形成したと推定される。
加熱冷却処理は以下の手順で行った。
比較例1で作製したpolyIC(400:400)#1および#2を、それぞれ1 mlずつ内容積1.5 mlのスクリューキャップ付きプラスチックチューブに分注し、下記、条件1、2または3の加熱冷却処理を施した。
条件1: 75℃の温浴で3分間インキュベートして品温を70℃に到達させた後、室温(約26℃)で静置した。35℃までの冷却所要時間は約7分間であり、平均降温速度は5℃/minであった。
条件2: 75℃の温浴で3分間インキュベートして品温を70℃に到達させた後、温浴のヒーター電源を切り、緩やかに35℃まで降温させた。35℃までの冷却所要時間は約2時間であった。
条件3: 75℃の温浴で3分間インキュベートして品温を70℃に到達させた後、ヒーター電源を切り湯温を70℃まで自然降下させ、プログラム式温度調節器を使用して70℃から降下速度 2℃/hで緩やかに35℃まで降温した。35℃までの冷却所要時間は20時間であった。
比較例3で得られた各サンプルの鎖長を比較例2で解説したGPC分析により調べた。結果を表3にまとめた。
条件1、2または3で加熱冷却処理したpolyIC(400:400)の平均鎖長は、#1と#2の間で極めて類似していることから、再現性のある鎖長分布データと言える。2kbp以上に長鎖化した鎖成分の比率は、温度降下が緩やかな条件ほど低下したが、今回実施した最も緩い条件3でも13%であった。また、すべてのサンプルにおいて鎖長の中央値が重量平均値を超えていることから、サンプルを構成する鎖長成分の主体は、重量平均値よりも長い鎖長成分であることがわかる。複数本のイノシン酸ホモポリマーとシチジル酸ホモポリマーが連なった鎖成分が主体になっていると推定される。
再加熱処理による鎖長の変化を調べた。比較例2と同様の手順でpolyIC(400:400) #1および#2 を1 mlずつ内容積 1.5 mlのスクリューキャップ付きプラスチックチューブに分注し条件3で加熱冷却処理を施した後に、条件1または条件2で2回目の加熱冷却処理を施した。加熱冷却処理サンプルのGPC分析と鎖長解析をおこなった。結果を表4にまとめた。
条件3の加熱冷却処理によって13%まで低下した2kbp以上の比率は、条件1または条件2の再処理によってそれぞれ32-33%、18-21%まで再上昇した。すなわち、polyIC(400:400)は、2kbp以上の鎖成分の生成を抑制する処理を施しても、それを再加熱すると2kbp以上の鎖成分の比率が急激に上昇することが明らかとなった。
イノシン酸ホモポリマーpI-25 (重量平均鎖長29塩基, 中央値 29塩基)をアニーリングバッファー[組成:100 mM HEPESバッファー(pH6.5), 100 mM NaCl]に溶解し、50倍希釈液のAbs 260nmが1.0となる溶液を10 ml作製した。同様にpC-400(重量平均鎖長344塩基, 中央値 324塩基)をアニーリングバッファーに溶解し、50倍希釈液のAbs 260nmが1.0となる液を10 ml作製した。50 ml容プラスチックチューブにpI-25溶液 5 mlとpC-400溶液 5 mlを添加して混合したものを2本作製し、室温で16時間静置した。4M NaCl溶液0.5 mlとイソプロピルアルコール10 mlをチューブ毎に添加して混合し、2800×g、10分間の遠心分離でpolyICを沈殿させ、遠心上清を除いた。次に70% エタノールをチューブあたり20 ml添加して混合後、2800×g、10分間の遠心分離でpolyICを再沈殿させて、遠心上清を除いた。再度70%エタノールをチューブあたり20 ml添加して混合後、2800×g、10分間の遠心分離でpolyICを再沈殿させて、遠心上清を除いた。チューブをデシケータに入れて残留エタノールを減圧乾燥で蒸発させた後に、アニーリングバッファーをチューブあたり10 ml加え、polyIC(25:400)溶液#1および#2を作製した(#1および#2は独立した操作により得られたことを示す。)。
比較例2と同様の手順でpolyIC(25:400)溶液のGPC分析を実施し鎖長解析を行った。
さらに、polyIC(25:400)溶液#1および#2を使用して、比較例3と同じ手順で条件1および条件2の加熱冷却処理を施したサンプルを調製し、GPC分析と鎖長解析をおこなった。解析結果を表5にまとめた。
polyIC(25:400)は、polyIC(400:400)で観察されたような鎖長の長鎖化現象は認められず、また加熱冷却処理を施しても、複数本のイノシン酸ポリマーとシチジル酸ポリマーとが連なった鎖成分が主体となる現象は観察されなかった。
実施例1のpI-25をイノシン酸ホモポリマーpI-50 (重量平均鎖長41塩基, 中央値 35塩基)に代える以外は実施例1に記載どおりの手順でpolyIC(50:400)溶液#1および#2を作製した(#1および#2は独立した操作により得られたことを表す。)。polyIC(50:400)溶液のGPC分析と鎖長解析を比較例2と同様の手順でおこなった。さらに、polyIC(50:400)溶液#1および#2を使用し、比較例3と同じ手順で条件1および条件2の加熱冷却処理を施したサンプルを調製し、GPC分析と鎖長解析をおこなった。解析結果を表6にまとめた。
polyIC(50:400)は、polyIC(400:400)で観察されたような鎖長の長鎖化現象は認められず、また加熱冷却処理を施しても、複数本のイノシン酸ポリマーとシチジル酸ポリマーとが連なった鎖成分が主体となる現象は観察されなかった。
実施例1のpI-25をイノシン酸ホモポリマーpI-100 (重量平均鎖長108塩基, 中央値 95塩基)に代える以外は実施例1に記載どおりの手順でpolyIC(100:400)溶液#1および#2を作製した(#1および#2は独立した操作により得られたことを表す。)。さらに、polyIC(100:400)#1の一部を使用し、比較例3の条件1の加熱冷却処理を施したサンプルと条件2の加熱冷却処理を施したサンプルを調製した。同様に、polyIC(100:400)#2を使用し、比較例3と同じ手順で条件1および条件2の加熱冷却処理をそれぞれ施したサンプルを調製し、各サンプルのGPC分析と鎖長解析を比較例2と同様の手順でおこなった。解析結果を表7にまとめた。
polyIC(100:400)は、polyIC(400:400)で観察されたような鎖長の長鎖化現象は認められなかった。平均鎖長は#1と#2チューブの間で若干の差異が認められたが、加熱冷却処理したチューブ間の差異はほとんどなくなった。また、加熱冷却処理サンプルの2kbp以上の長鎖成分の比率は加熱冷却未処理のサンプルと同等で、加熱冷却処理を施しても、複数本のイノシン鎖ポリマーとシチジル酸ポリマーとが連なった鎖成分が主体となる現象は観察されなかった。
polyIC(100:400)は、polyIC(400:400)で観察されたような鎖長の長鎖化現象は認められず、また再加熱冷却処理を施しても長鎖成分の増加は観察されなかった。
実施例1のpI-25をイノシン酸ホモポリマーpI-200 (重量平均鎖長188塩基, 中央値 157塩基)に代える以外は実施例1に記載どおりの手順でpolyIC(200:400)溶液#1および#2を作製した(#1および#2は独立した操作により得られたことを表す。)。次にpolyIC(200:400)溶液のGPC分析と鎖長解析を比較例2と同様の手順でおこなった。さらに、polyIC(200:400)#1および#2を使用し、比較例3と同じ手順で条件1、条件2、または条件3の加熱冷却処理を施したサンプルを調製し、GPC分析と鎖長解析をおこなった。結果を表9にまとめた。
polyIC(200:400)は、2kbp 以上の長鎖成分が12-16%まで増加したが、この長鎖化現象は加熱冷却処理により低減し、最も緩やかに冷却する条件3の加熱冷却処理でほぼ完全に抑制された。
条件3で処理したpolyIC(200:400)を条件1で再加熱冷却すると2kbp以上の比率が9%まで上昇して2kbp以上の鎖成分がやや増加する傾向が認められたが、その比率はpolyIC(200:400)を同条件で冷却加熱処理したときの2kbp以上の比率10-11%(表9)よりも低い。また、条件3で処理し条件2で再処理したサンプルにおいては、2kbp以上の比率は4%でほとんど上昇しなかった。すなわち、polyIC(200:400)では、polyIC(400:400)で観察されたような再加熱冷却処理による深刻な2kbp以上の長鎖成分の増加は観察されなかった。
動物細胞にはdsRNAを認識する3つの自然免疫受容体が備わっている。TLRファミリーに属するToll like receptor-3 (TLR-3)、およびRLRファミリーに属するRetinoic acid-inducible gene-I(RIG-I)とMelanoma differentiation-Associated protein 5 (MDA-5)である。TLR-3は、細胞のエンドソームに局在する受容体で、dsRNAが結合するとTRIFを経由するシグナル伝達が起こりI型インターフェロン(IFN)や炎症性サイトカインが誘導される。TLR-3が発現する細胞はミエロイド樹状細胞や線維芽細胞など特定の免疫担当細胞に限定される。一方、RIG-I like receptor(RLR)と総称されるRIG-IとMDA-5は、どちらも細胞の細胞質に局在する受容体で、CARDドメインと呼ばれるdsRNA結合ドメインを持つ。CARDドメインにdsRNAが結合すると、RIG-I、MDA-5問わずIPS1経由でシグナル伝達が起こり、I型IFNや炎症性サイトカインが誘導される。RLRは免疫担当細胞を含むすべての細胞で発現している受容体である。RIG-IとMDA-5は、dsRNAの鎖長や5’末端構造によって認識性に違いがある。
TLR-3とRLRの遺伝子配列と蛋白質の一次構造は既に明らかにされている。しかし、各々が認識しやすいdsRNAの二次構造や一次構造を類推できる知見はほとんどない。唯一報告されているのは、ポリA:Uは、TLR-3には認識されるがRLRには認識されにくいという報告である。今回報告するような逆の性質、すなわち、RLRに認識されるがTLR-3には認識されにくいdsRNA、については報告例がない。
我々は、鎖長の異なるポリIと約400ntのポリCをアニーリングして作製した各種ポリICのTLR-3認識性やRLR認識性をレポーター細胞を用いて調べた。そして、RLR認識性はポリIの鎖長を問わず一定であるが、TLR-3の認識性はポリI鎖長が約100nt付近から、短くなればなるほど低下する新事実を見出した。
各種dsRNAのRLR認識性をレポーター細胞を用いて比較評価した。RLRレポーター細胞C57/WT MEF(invivogen, USA)は、NF-κBおよびIRF3/7で誘導される分泌性胎盤アルカリホスファターゼ(ALP)レポーター遺伝子が導入されたマウス初代胎児線維芽細胞株である。この細胞を用いることでdsRNAのRLR認識性をALPの誘導量で相対比較できる。C57/WT MEF細胞を用いたレポーターアッセイは、メーカーのプロトコルに準じて行った。具体的には、ウシ血清10%含有DMEM培地でC57/WT MEFを継代培養し、その細胞懸濁液を12ウェルプレートに1 ml/well播種し、37℃、5% CO2環境下で約20時間静置培養した。ウシ血清を含まないDMEM培地1 ml/wellに交換後、各種dsRNA 100 ngまたはPBSをトランスフェクション試薬LyoVec(invivogen, USA)と共に添加し、37℃、5% CO2環境下で静置培養した。2時間後にウシ血清を0.1 ml/well加え、さらに22時間培養し、培養上清を採取して分泌されたALPを定量分析した。ALPの定量分析にはQuantiBlueキット(invivogen, USA)を用い、E.coli由来ALP(タカラバイオ、日本)を標準品として数値化した。その結果をまとめたのが表11である。いずれのdsRNAを用いてもALP誘導量に大差はないことから、dsRNAの構成ssRNAの鎖長比を変えてもRLR認識性はほとんど変わらないことがわかった。
各種dsRNAのTLR-3認識性をレポーター細胞アッセイで比較した。TLR-3レポーター細胞HEK-Blue hTLR3 細胞(invivogen, USA)は、NF-κBおよびAP-1誘導性ALP遺伝子とヒトTLR-3遺伝子がゲノムに組み込まれた組み換えHEK-293細胞である。この細胞を用いることでTLR-3認識性をALPの誘導量で相対比較できる。HEK-Blue hTLR3細胞を用いたレポーターアッセイは、メーカーのプロトコルに準じて行った。すなわち、抗生物質ゼオシン100 mg/mlおよび抗生物質ブラストサイジン10 mg/mlを含むウシ血清10%含有DMEM培地でHEK-Blue hTLR3を継代培養し、その細胞懸濁液を12ウェルプレートに1 ml/well播種し、37℃、5% CO2環境下で約44時間静置培養した。ウシ血清を含まず抗生物質ゼオシン100 mg/mlおよび抗生物質ブラストサイジン10 mg/mlを含むDMEM培地1 mlに交換後、各種dsRNA 100 ngまたはPBSを添加し、37℃、5% CO2環境下で静置培養した。ウシ血清はdsRNA添加2時間後に0.1 ml/well加え、24時間後の上清を採取しALPの誘導量を比較した。ALPの定量分析はQuantiBlueキット(invivogen, USA)を用い、E.coli由来ALP(タカラバイオ、日本)を標準品として数値化した。その結果をまとめたのが表12である。表12から明らかなように、ポリIの鎖長が108nt以下になると、短いほどALP誘導量が減少した。すなわちポリIの鎖長を108nt以下にすることでRLR認識性を保持しつつTLR-3認識性のみが低下するといった、まったく新しい特性を示すdsRNAを作製できることがわかった。
HEK-Blue Null1細胞(invivogen, USA)は、ヒトTLR-3遺伝子のみがトランスフェクションされていないHEK-Blue hTLR3 細胞の親細胞で、同株のネガティブコントロールにあたる。試験例2.2.で用いたHEK-Blue hTLR3 細胞をHEK-Blue Null1細胞に変え、抗生物質ブラストサイジンを培地に添加しないこと以外は試験例2.2.とまったく同様の手順で試験を実施したところ、ALPはほとんど誘導されなかった(表13)。したがって、試験例2.2.で確認されたALP誘導は、TLR-3特異的なシグナル伝達であることが確認された。
dsRNAを構成する第1の鎖の鎖長を第2の鎖の鎖長の1/2以下にしたdsRNAが自然免疫賦活剤として機能するかどうかを確認するために、インターフェロンβ誘導性の強さを細胞実験で比較評価した。さらに、同dsRNAの毒性が低減するかどうかを確認するために、マウスを用いた単回投与毒性評価を行った。これら2つの評価の結果、dsRNAを構成する第1の鎖の鎖長を第2の鎖の鎖長の1/2以下にしても自然免疫賦活活性は保持しつつ、毒性が低減することが確認できた。
アジュバントとして機能するために必須な自然免疫誘導性の強さを評価するために、自然免疫研究に用いられているヒト胎児線維芽細胞株MRC-5(Japanese Collection of Research Bioresources Cell Bank番号 9008)を用いて各種dsRNAのインターフェロン(IFN)β誘導性を評価した。具体的には、ウシ血清10%含有MEM培地でMRC-5を継代培養し、その細胞懸濁液を12ウェルプレートに1 ml/well播種し、37℃、5% CO2環境下で約20時間静置培養した。ウシ血清を含まないMEM培地 1 ml/wellに交換後、各種dsRNA 30 μgまたはPBSをトランスフェクション試薬LyoVec(invivogen, USA)と共に添加し、37℃、5% CO2環境下で静置培養した。2時間後にウシ血清を0.1 ml/well加え、さらに22時間培養した。dsRNA添加後10h、24hの培養上清を採取し、培養上清に含まれるIFNβを定量分析した。IFNβの定量分析にはIFNβ ELISAキット(株式会社鎌倉テクノサイエンス, 日本)を用いた。その結果をまとめたのが表14である。いずれのdsRNAを用いてもIFNβ誘導量に大差はないことから、dsRNA を構成するssRNAの鎖長比を変えてもIFNβ誘導性は保持されることが明らかとなった。
各種鎖長のポリIとポリCを用いて作成したpolyI:Cを生理食塩水に溶解し、5 mg/mlから20 mg/ml濃度の溶液を作製した。これらの水溶液を健康なCrlj:CD1マウスの雄に6週齢で単回腹腔内投与し、急性毒性を比較した。マウスは室温22℃±3℃、湿度55%±10%、換気回数10回以上/h、照明12時間/dayの環境下に設置されたマウス用ケージに5匹ずつ収容し、水と餌を自由に摂取できる条件で飼育した。腹腔内投与前に約1週間の馴化期間を設け、投与後は、投与日を1日目と数えて7日間飼育し、様子を観察した。表15は、polyI:Cの投与量と7日間飼育後の生存数をまとめたものである。第1の鎖の鎖長を第2の鎖の鎖長の1/2以下にすることでマウスの生存数が改善した。すなわち、毒性が低減することが確認された。
Claims (1)
- 重量平均鎖長が0.2キロ塩基対(kbp)から0.6kbpの範囲内の二重鎖リボ核酸(dsRNA)またはその塩の製造方法であって、該方法は、
(1)同種のリボヌクレオチドからなる一本鎖リボ核酸(ssRNA)を調製する工程、
(2)前記(1)のssRNAに対して二重鎖を形成できる程度の相補性を有する塩基配列を有するssRNAを調製する工程、および
(3)前記(1)のssRNAと前記(2)のssRNAとをアニーリングさせる工程
を含み、
前記(1)のssRNAの重量平均鎖長が、前記(2)のssRNAの重量平均鎖長の1/2以下であってかつ0.02〜0.2キロ塩基(kb)であり、
前記(1)のssRNAがポリイノシン酸であり、かつ前記(2)のssRNAがシチジル酸を80%以上の割合で含むssRNAであり、
前記(2)のssRNAの重量平均鎖長が0.04〜0.4kbであり、
前記(3)の工程が、前記(1)のssRNAと前記(2)のssRNAを含有する溶液を70℃に加熱し、その後該溶液を2℃/h〜5℃/minの平均降温速度で35℃まで冷却する工程である、方法。
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