JP6439220B2 - 補酵素の製造方法及び補酵素製造用形質転換体セット - Google Patents
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Description
本願は、2015年2月24日に、日本に出願された特願2015−33843号に基づき優先権を主張し、その内容をここに援用する。
[1] NAD+を必要とする酵素反応系に、ADP−リボースとニコチンアミドからNAD+を合成するための反応に要する1種又は2種以上の耐熱性酵素を添加することにより、前記酵素反応系内においてNAD+の合成を行う補酵素の製造方法であって、
前記耐熱性酵素が、ニコチンアミダーゼ、ニコチン酸ホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニコチン酸−ヌクレオチドアデニリルトランスフェラーゼ、NAD+シンターゼ、ADP−リボースピロホスファターゼ、及びリボースリン酸ピロホスホキナーゼである、補酵素の製造方法。
[2] NADHを必要とする酵素反応系に、ADP−リボースとニコチンアミドからNADHを合成するための反応に要する1種又は2種以上の耐熱性酵素を添加することにより、前記酵素反応系内においてNADHの合成を行う補酵素の製造方法であって、
前記耐熱性酵素が、ニコチンアミダーゼ、ニコチン酸ホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニコチン酸−ヌクレオチドアデニリルトランスフェラーゼ、NAD+シンターゼ、ADP−リボースピロホスファターゼ、リボースリン酸ピロホスホキナーゼ、及びNAD+からNADHを合成する反応を触媒する酸化還元酵素である、補酵素の製造方法。
[3] 前記酸化還元酵素が、糖、アルコール、又は有機酸を基質とするデヒドロゲナーゼである、前記[2]の補酵素の製造方法。
[4] 前記酵素反応系内に、さらに、AMP又はADPからATPを合成するための反応に要する1種又は2種以上の耐熱性酵素を添加し、前記酵素反応系内においてATPの合成を行う、前記[1]〜[3]のいずれかの補酵素の製造方法。
[5] 前記ATPを合成するための反応に要する耐熱性酵素が、アデニル酸キナーゼ及びポリリン酸キナーゼである、前記[4]の補酵素の製造方法。
[6] 前記耐熱性酵素が、非耐熱性微生物の発現系によって合成されたものである、前記[1]〜[5]のいずれかの補酵素の製造方法。
[7] 前記耐熱性酵素が、非耐熱性微生物を宿主とし、耐熱性酵素をコードしている遺伝子を導入した形質転換体が合成したものである、前記[1]〜[6]のいずれかの補酵素の製造方法。
[8] 前記形質転換体を培養して得られた菌体の加熱処理物を、前記酵素反応系に添加する、前記[7]の補酵素の製造方法。
[9] 前記非耐熱性微生物が大腸菌である、前記[6]〜[8]のいずれかの補酵素の製造方法。
[10] 前記[1]〜[9]の補酵素の製造方法に用いられる補酵素製造用形質転換体セットであって、
非耐熱性微生物を宿主とし、ADP−リボースとニコチンアミドからNAD+又はNADHを合成するための反応に要する1種又は2種以上の耐熱性酵素をコードしている遺伝子が導入された1種又は2種以上の形質転換体からなることを特徴とする、補酵素製造用形質転換体セット。
[11] 前記耐熱性酵素が、ニコチンアミダーゼ、ニコチン酸ホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニコチン酸−ヌクレオチドアデニリルトランスフェラーゼ、NAD+シンターゼ、ADP−リボースピロホスファターゼ、及びリボースリン酸ピロホスホキナーゼである、前記[10]の補酵素製造用形質転換体セット。
[12] 前記耐熱性酵素が、ニコチンアミダーゼ、ニコチン酸ホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニコチン酸−ヌクレオチドアデニリルトランスフェラーゼ、NAD+シンターゼ、ADP−リボースピロホスファターゼ、リボースリン酸ピロホスホキナーゼ、及びNAD+からNADHを合成する反応を触媒する酸化還元酵素である、前記[10]の補酵素製造用形質転換体セット。
[13] さらに、非耐熱性微生物を宿主とし、AMP又はADPからATPを合成するための反応に要する1種又は2種以上の耐熱性酵素をコードしている遺伝子が導入された1種又は2種以上の形質転換体を含む、前記[10]〜[12]のいずれかの補酵素製造用形質転換体セット。
[14] 1の形質転換体に1種類の耐熱性酵素をコードする遺伝子が導入されている、前記[10]〜[13]のいずれかの補酵素製造用形質転換体セット。
[15] 前記非耐熱性微生物が大腸菌である、前記[10]〜[14]のいずれかの補酵素製造用形質転換体セット。
[16] 前記形質転換体が、加熱処理されたものである、前記[10]〜[15]のいずれかの補酵素製造用形質転換体セット。
また、本発明に係る補酵素製造用形質転換体セットにより、より簡便に、前記補酵素の製造方法を実施することができる。
NAD+、ADP−リボース、ニコチンアミド、ニコチン酸、ニコチン酸モノヌクレオチド、及びデアミノNAD+は、5C18AR−IIカラム(4.6mm(内径)×250mm、ナカライテスク社製)を用いてHPLCにて定量分析した。溶出には、溶離液Aとして50mM リン酸カリウム緩衝液(pH6.5)、溶離液Bとして同緩衝液に25%(v/v)メタノールと5 mM 1−オクタンスルホン酸ナトリウムを溶解させた溶液を用いたグラジエント溶出を用いた。溶離液の流速は0.5mL/minとし、溶出開始から5分間は溶離液A単独での溶出、その後5〜11分までの間に溶離液Bの混合比率を0から100% (v/v)にまで上昇させた後、さらに、溶離液B単独で6分間の溶出を行った。カラム温度は40℃に保ち、溶出液は254nmでモニターした。
ATP、ADP、及びAMPの定量は、HILICカラム(4.6mm(内径)×250mm、ナカライテスク社製)を用いたHPLC分析により実施した。溶離液として、20mM リン酸カリウムバッファー(pH7.0)とアセトニトリルを当容量ずつ混合した溶液を用い、流速1.0mL/minで溶出した。カラム温度は40℃に保ち、溶出液は254nmでモニターした。
1分子のNAD+が熱分解されると、1分子のニコチンアミドと1分子のADP−リボースが生産される(図4)。
終濃度1mMのNAD+溶液を70℃で3時間インキュベートした後、5C18AR−IIカラムを用いたHPLC分析に供したところ、NAD+のほかに2本のピークが観察された。NAD+の構成単位となる各種化合物の分析結果と比較したところ、ニコチンアミド、ADP−リボースがそれらのピークと同じ保持時間を示すことが明らかとなった。次に、NAD+の熱分解を経時的に追跡したところ、分解に伴ってニコチンアミド、ADP−リボースが化学量論的に蓄積することが明らかとなった(図5)。この結果より、ニコチンアミド及びADP−リボースの両物質は、NAD+に比して熱に対する安定性に優れることが示唆され、サルベージ合成の出発物質として利用可能であると判断された。
なお、ここで示された分解様式は、Chenaultらの総説(Chenault and Whitesides,Applied Biochemistry and Biotechnology,1987,vol.14,p.147−197)において、アルカリ触媒下におけるNAD+分解スキームとして提唱されている知見ともよく合致した。
<NAD+サルベージ合成経路のデザイン>
ニコチンアミドを出発物質としたNAD+サルベージ合成経路をデザインしたところ、図1及び2に示す2ルートが考えられた。図1に示すNAD+サルベージ合成経路に必要とされる6種類の酵素について、超好熱菌又は好熱菌由来の酵素の中から表1に示す酵素を選択した。また、合わせて、図3に示すATP合成経路に必要とされる2種類の酵素と、グルコースデヒドロゲナーゼについて、超好熱菌又は好熱菌由来の酵素の中から表1に示す酵素を選択した。なお、グルコースデヒドロゲナーゼは、合成されたNAD+の定量のために使用するものである。表1中、「GI number」は、GenBank(NCBI(National Center for Biotechnology Information)が提供する塩基配列データベース)のアクセッション番号である。
また、デアミノNAD+のアミノ化酵素(NADシンターゼ)は、表1に記載の酵素に代えて、サーマス・サーモフィラス由来のNADシンターゼを用いてもよい。
なお、表1中のTtNMATは、ニコチン酸モノヌクレオチド(NaMN)のみならず、ニコチンアミドモノヌクレオチド(NMN)も基質としうる酵素である。
表1に記載の耐熱性酵素について、各耐熱性酵素遺伝子を大腸菌に導入して形質転換体(組換え大腸菌)を作製した。
表1に記載の耐熱性酵素のうち、サーマス・サーモフィラス HB8由来のものは、いずれも理化学研究所より提供を受けた同菌の1遺伝子発現プラスミドライブラリー(Yokoyama,et al.,Nature Structural Biology,2000,vol.7,p.943−945)に含まれるものである。同ライブラリーの発現ベクターはpET11a(Novagen社製)及びその誘導体をバックボーンとして作製されたものであり、目的遺伝子はT7プロモーター制御下に配置され、IPTGによる発現誘導を受ける。
サーマス・サーモフィラス HB27由来のポリリン酸キナーゼ(TtPKK)及びサーモプラズマ・アシドフィラム由来ニコチンアミダーゼ(TaNAase)は、各微生物のゲノムDNAよりPCR増幅した当該遺伝子をpET21aに連結し、同様にT7プロモーター制御下で発現させた。
これらの遺伝子発現ベクターは、全てE.coli Rosetta2(DE3)pLysS(Novagen社製)に導入し、形質転換体を作製した。
目的の耐熱性酵素を発現させた組換え大腸菌の湿菌体を200mg(wet cells)/mLとなるように100mM HEPES−NaOH(pH7.0)に懸濁した。得られた懸濁液を超音波破砕処理に供することにより菌体を破砕し、無細胞抽出液を得た。当該無細胞抽出液に対し、70℃、30分間の熱処理を施し、宿主由来タンパク質を変性させ、失活させた。熱処理後の懸濁液を遠心分離処理し、細胞残さと変性タンパク質を取り除いた上清を粗酵素液として活性測定に用いた。
活性測定には400mM HEPES−NaOH(pH8.0)を使用し、反応は全て60℃で実施した。各酵素の活性は、図1に示すNAD+サルベージ合成経路において下流に位置する酵素とカップリングさせることにより生じるNAD+を、さらにSsGDHによって還元し、蓄積するNADHの濃度を340nmにおける吸収をモニターすることによって測定した。各酵素の活性は、本測定条件下で1分間に1μmolの基質消費を触媒する量を1ユニット(U)と定義して表す。
TtADK、TtPPKについては、これらの粗酵素液を400mM HEPES−NaOH(pH8.0)中で、10mM MgCl2、0.2mM ATP、3.0mM AMP、1mM ポリリン酸と共に60℃でインキュベートし、ATP蓄積量及びAMP減少量をHPLCで測定した。
NAD+サルベージ合成試験は、400mM HEPES−NaOH(pH8.0)、60mM NH4Cl2、10mM MgCl2、4mM NAD+、3mM ATP、1mM ポリリン酸(平均鎖長60)、0.2mM ADP−リボース、0.2mM ニコチンアミドからなる反応液中で実施した。
反応液量0.5mLに対し、TaNAase、TtNAPRT、TtNMAT、GsNADS、TtADPRP、TtRPK、TtADK、及びTtPPKを個別に発現させた組換え大腸菌からそれぞれ調製した粗酵素液を混合し、各酵素の終濃度がそれぞれ0.02、0.18、0.25、0.51、0.02、0.03、0.05、及び0.05U/mLとなるように添加した。また、対照試験として、組換え大腸菌や粗酵素液を含まない反応液を用意し、これらを60℃でインキュベートした。経時的にサンプリングを行い、反応液中のNAD+をHPLCで定量した。
図1のNAD+サルベージ合成経路では、NAD+を1分子合成するに当たり3分子のATPが消費され、3分子のAMPが放出される。そこで、TtADKとTtPPKによるポリリン酸をリン酸基供与源としたAMPからのATP合成経路をNAD+サルベージ合成経路にカップリングさせた。この際の酵素量は、NAD+分解速度から必要と見積もられる速度(150μM/min)に比して、過剰量となるように設定した。
NAD+サルベージ合成経路及びATP合成経路に要する耐熱性酵素を用いて、NAD+サルベージ合成試験を行った。使用した各種耐熱性酵素は、実施例1で用いたものを用いた。
NADHサルベージ合成経路及びATP合成経路に要する耐熱性酵素を用いて、NADH合成試験を行った。使用した各種耐熱性酵素は、実施例1で用いたものを用いた。
Claims (16)
- NAD+を必要とする酵素反応系に、ADP−リボースとニコチンアミドからNAD+を合成するための反応に要する1種又は2種以上の耐熱性酵素を添加することにより、前記酵素反応系内においてNAD+の合成を行う補酵素の製造方法であって、
前記耐熱性酵素が、ニコチンアミダーゼ、ニコチン酸ホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニコチン酸−ヌクレオチドアデニリルトランスフェラーゼ、NAD + シンターゼ、ADP−リボースピロホスファターゼ、及びリボースリン酸ピロホスホキナーゼである、補酵素の製造方法。 - NADHを必要とする酵素反応系に、ADP−リボースとニコチンアミドからNADHを合成するための反応に要する1種又は2種以上の耐熱性酵素を添加することにより、前記酵素反応系内においてNADHの合成を行う補酵素の製造方法であって、
前記耐熱性酵素が、ニコチンアミダーゼ、ニコチン酸ホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニコチン酸−ヌクレオチドアデニリルトランスフェラーゼ、NAD + シンターゼ、ADP−リボースピロホスファターゼ、リボースリン酸ピロホスホキナーゼ、及びNAD + からNADHを合成する反応を触媒する酸化還元酵素である、補酵素の製造方法。 - 前記酸化還元酵素が、糖、アルコール、又は有機酸を基質とするデヒドロゲナーゼである、請求項2に記載の補酵素の製造方法。
- 前記酵素反応系内に、さらに、AMP又はADPからATPを合成するための反応に要する1種又は2種以上の耐熱性酵素を添加し、前記酵素反応系内においてATPの合成を行う、請求項1〜3のいずれか一項に記載の補酵素の製造方法。
- 前記ATPを合成するための反応に要する耐熱性酵素が、アデニル酸キナーゼ及びポリリン酸キナーゼである、請求項4に記載の補酵素の製造方法。
- 前記耐熱性酵素が、非耐熱性微生物の発現系によって合成されたものである、請求項1〜5のいずれか一項に記載の補酵素の製造方法。
- 前記耐熱性酵素が、非耐熱性微生物を宿主とし、耐熱性酵素をコードしている遺伝子を導入した形質転換体が合成したものである、請求項1〜5のいずれか一項に記載の補酵素の製造方法。
- 前記形質転換体を培養して得られた菌体の加熱処理物を、前記酵素反応系に添加する、請求項7記載の補酵素の製造方法。
- 前記非耐熱性微生物が大腸菌である、請求項6〜8のいずれか一項に記載の補酵素の製造方法。
- 請求項1〜9のいずれか一項に記載の補酵素の製造方法に用いられる補酵素製造用形質転換体セットであって、
非耐熱性微生物を宿主とし、ADP−リボースとニコチンアミドからNAD+又はNADHを合成するための反応に要する1種又は2種以上の耐熱性酵素をコードしている遺伝子が導入された1種又は2種以上の形質転換体からなることを特徴とする、補酵素製造用形質転換体セット。 - 前記耐熱性酵素が、ニコチンアミダーゼ、ニコチン酸ホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニコチン酸−ヌクレオチドアデニリルトランスフェラーゼ、NAD+シンターゼ、ADP−リボースピロホスファターゼ、及びリボースリン酸ピロホスホキナーゼである、請求項10に記載の補酵素製造用形質転換体セット。
- 前記耐熱性酵素が、ニコチンアミダーゼ、ニコチン酸ホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニコチン酸−ヌクレオチドアデニリルトランスフェラーゼ、NAD+シンターゼ、ADP−リボースピロホスファターゼ、リボースリン酸ピロホスホキナーゼ、及びNAD+からNADHを合成する反応を触媒する酸化還元酵素である、請求項10に記載の補酵素製造用形質転換体セット。
- さらに、非耐熱性微生物を宿主とし、AMP又はADPからATPを合成するための反応に要する1種又は2種以上の耐熱性酵素をコードしている遺伝子が導入された1種又は2種以上の形質転換体を含む、請求項10〜12のいずれか一項に記載の補酵素製造用形質転換体セット。
- 1の形質転換体に1種類の耐熱性酵素をコードする遺伝子が導入されている、請求項10〜13のいずれか一項に記載の補酵素製造用形質転換体セット。
- 前記非耐熱性微生物が大腸菌である、請求項10〜14のいずれか一項に記載の補酵素製造用形質転換体セット。
- 前記形質転換体が、加熱処理されたものである、請求項10〜15のいずれか一項に記載の補酵素製造用形質転換体セット。
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