JP6401773B2 - Ｂｅｔブロモドメイン阻害剤およびこれを用いる治療方法 - Google Patents

Ｂｅｔブロモドメイン阻害剤およびこれを用いる治療方法 Download PDF

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Description

発明の技術分野
本発明は、BETブロモドメイン阻害剤ならびにBETブロモドメインの阻害が利益を提供する状態および疾患を処置するための治療方法に関する。
発明の背景
真核生物のゲノムは細胞の核内で高度に組織化されている。二本鎖DNAの長鎖がヒストンタンパク質の8量体（通常はヒストンH2A、H2B、H3、およびH4の2つのコピーを含む）の周りに巻きついてヌクレオソームを形成し、これは次いでさらに圧縮されて高度に凝縮されたクロマチン構造を形成する。様々な異なる凝縮状態が可能で、この構造の機密度は細胞周期の間に変動する。クロマチン構造は遺伝子転写を調節する際に重大な役割を果たし、これは高度に凝縮されたクロマチンからは効率よく行うことができない。クロマチン構造はヒストンタンパク質、特にヒストンH3およびH4への一連の翻訳後修飾によって制御される。これらの修飾には、アセチル化、メチル化、リン酸化、ユビキチン化、およびSUMO化が含まれる。
修飾は静電気を変化させることによりDNAとヒストン8量体との相互作用を緩めるため、ヒストンアセチル化は通常は遺伝子転写の活性化に関連する。この物理的変化に加えて、特定のタンパク質はエピジェネティックコードを読み取るためにヒストン内のアセチル化リジン残基に結合する。ブロモドメインは、ヒストンでは一般に、しかし排他的ではなく、アセチル化リジン残基に結合するタンパク質内の小さい（約110アミノ酸）別のドメインである。ブロモドメインを含むことが公知の約50のタンパク質のファミリーがあり、これは細胞内で様々な機能を有する。
ブロモドメイン含有タンパク質のBETファミリーには、4つのタンパク質、すなわち、BRD2、BRD3、BRD4、およびBRD-tが含まれ、これらはすぐ近くの2つのアセチル化リジン残基に結合可能な直列型ブロモドメインを含み、それにより相互作用の特異性を高める。BRD2およびBRD3は活発に転写された遺伝子に沿ったヒストンに関連し、転写伸長の促進に関与しうる一方で、BRD4はpTEF-β複合体の誘導性遺伝子への動員に関与して、RNAポリメラーゼのリン酸化および転写アウトプットの増大を引き起こしうる。BRD4またはBRD3はNUT（精巣の核タンパク質）とも融合して、新規融合癌遺伝子、BRD4-NUTまたはBRD3-NUTを、上皮新形成の高度悪性型で生成しうる。データは、BRD-NUT融合タンパク質が発癌に寄与することを示唆している。BRD-tは精巣および卵巣において独特に発現される。すべてのファミリーメンバーは、細胞周期の局面を制御または実行する際にいくらかの機能を有すると報告されており、細胞分裂中、染色体との複合体のままであることが判明しており、このことはエピジェネティックメモリーの維持における役割を示唆している。加えて、いくつかのウイルスはこれらのタンパク質を利用して、ウイルス複製の過程の一部として、それらのゲノムを宿主細胞クロマチンに連結する。
BETタンパク質の議論は、それぞれ米国を指定している、国際公開公報第2012/075456号（特許文献1）、国際公開公報第2012/075383号（特許文献2）、および国際公開公報第2011/054864号（特許文献3）において見出すことができ、それぞれその全体が参照により本明細書に組み入れられる。BETブロモドメイン阻害剤、例えば、I-BET-151およびI-BET-762の議論は、Delmore et al., Cell 146:904-917 (2011)（非特許文献1）およびSeal et al., Bioorg. Med. Chem. Lett. 22:2968-2972 (2012)（非特許文献2）において見出すことができる。
BETブロモドメインおよびBETブロモドメイン阻害剤を対象とする研究にもかかわらず、BETブロモドメインの強力な、非ペプチド阻害剤の設計は、現代の薬物発見における重要な難題のままである。したがって、治療的適用において阻害剤の使用を可能にする、物理的および薬理学的特性を有するBETブロモドメイン阻害剤が、当技術分野においてまだ必要とされている。本発明は、BETブロモドメインに結合し、BETブロモドメイン活性を阻害するよう設計された化合物を提供する。
国際公開公報第2012/075456号 国際公開公報第2012/075383号 国際公開公報第2011/054864号
Delmore et al., Cell 146:904-917 (2011) Seal et al., Bioorg. Med. Chem. Lett. 22:2968-2972 (2012)
本発明は、BETブロモドメインの阻害剤、当該阻害剤を含む組成物、ならびにBETブロモドメイン活性の阻害が利益を提供する状態および疾患の治療的処置における当該阻害剤の使用法を対象とする。
1つの局面において、本発明は、構造式（I）：
Figure 0006401773
を有する化合物、またはその薬学的に許容される塩、水和物、もしくは溶媒和物を対象とする：
式中、
Xは、N(Ra)、O、またはSであり；
Y1およびY3は、独立に、CHまたはNであり；
Y2は、CH、CRaもしくはNであるか、または存在せず；
Zは、H、
Figure 0006401773
、ハロ、もしくはOHであるか、または存在せず；
Aは、無置換または置換5員複素環であり；
Bは、それぞれ無置換または置換されている、アリール、CH(Ra)-アリール、C3-10シクロアルキル、CH(Ra)-C3-10シクロアルキル、ヘテロアリール、CH(Ra)-ヘテロアリール、C3-10ヘテロシクロアルキル、またはCH(Ra)-C3-10ヘテロシクロアルキルであり；
Gは、N、O、またはSであり；
Lは、存在しないか、またはHもしくはC(Rd)3であり；
R1は、H、ハロ、OH、ORa、またはN(Ra)2であり；
Raは独立に、H、C1-3アルキル、またはベンジルであり；
Rbは独立に、C1-6アルキル、ハロ、アリール、無置換もしくは置換CH2-アリール、無置換もしくは置換C3-10シクロアルキル、無置換もしくは置換CH2-C3-10シクロアルキル、ヘテロアリール、無置換もしくは置換CH2-ヘテロアリール、無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、または無置換もしくは置換CH2-C3-10ヘテロシクロアルキル、あるいはCHOであり；
nは、整数0、1、2、または3であり；
RcおよびRdはそれぞれ独立に、水素、C1-6アルキル、無置換もしくは置換アリール、無置換もしくは置換CH2-アリール、無置換もしくは置換C3-10シクロアルキル、無置換もしくは置換CH2-C3-10シクロアルキル、ヘテロアリール、無置換もしくは置換CH2-ヘテロアリール、無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、または無置換もしくは置換CH2-C3-10ヘテロシクロアルキルである。
別の局面において、本発明は、構造式（I）：
Figure 0006401773
を有する化合物、またはその薬学的に許容される塩、水和物、もしくは溶媒和物を対象とする：
式中、
Xは、N(Ra1)、O、またはSであり；
Y1およびY3は独立にCHまたはNであり；
Y2は、CR2もしくはNであるか、または存在せず；
Zは、H、
Figure 0006401773
、ハロ、またはOHであり；
Aは、無置換または置換5員複素環であり；
Bは、それぞれ無置換または置換されている、アリール、CH(Ra2)-アリール、C3-10シクロアルキル、CH(Ra2)-C3-10シクロアルキル、ヘテロアリール、CH(Ra2)-ヘテロアリール、C3-10ヘテロシクロアルキル、CH(Ra2)-C3-10ヘテロシクロアルキル、
Figure 0006401773
であり；
Gは、N、O、またはSであり；
Lは、存在しないか、またはHもしくはC(Rd)3であり；
R1は、H、ハロ、OH、ORa3、Ra3、またはN(Ra3)2であり；
Ra1、Ra2、Ra3、Ra4、およびRa5はそれぞれ独立にH、C1-3アルキル、フェニル、またはベンジルであり；
R2は独立に
H、
C1-3アルキル、
(CH2)1-3C4-7ヘテロシクロアルキル、
C4-7ヘテロシクロアルキル、
CO2H、
CO2(C1-3アルキル)、
NH2、
NH(C1-3アルキル)、
N(C1-3アルキル)2、
(CH2)1-3NMe2、
(CH2)1-3OH、
C(Me)2OH、
CH(Me)OH、
C(Me2)NH2、
フェニル、
ベンジル、
C(=O)ORa4、
C(=O)N(Ra4)2、
C(=O)-無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
C(=O)-無置換もしくは置換ヒドロキシC3-10ヘテロシクロアルキル、
C(=O)N(Ra1)(CH2)2-3N(C1-3アルキル)2、
C(=O)N(Ra1)(CH2)2-3無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
C(=O)N(Ra1)-無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
C(=O)N(Ra1)-ヒドロキシシクロアルキル、
C(=O)N(Ra1)-C1-6ヒドロキシアルキル、
Figure 0006401773
であり；
Rbは独立に、
C1-6アルキル、
C1-6ヒドロキシアルキル、
ハロ、
アリール、
無置換もしくは置換CH2-アリール、
無置換もしくは置換C3-10シクロアルキル、
無置換もしくは置換CH2-C3-10シクロアルキル、
無置換もしくは置換ヘテロアリール、
無置換もしくは置換CH2-ヘテロアリール、
無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
無置換もしくは置換CH2-C3-10ヘテロシクロアルキル、
CF3、
CN、
ORa5、
N(Ra5)2、
N(Ra1)C1-6ヒドロキシアルキル
N(Ra1)C(=O)(C1-6アルキル)、
N(Ra1)C(=O)(CH2)1-3-無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
N(Ra1)C(=O)(CH2)1-3-ヒドロキシC3-10ヘテロシクロアルキル、
NH(CH2)2-3CO2H、
NH(CH2)2-3C(=O)N(Ra5)2、
N(Ra1)C(=O)(CH2)1-3N(H)-無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
N(Ra1)C(=O)(CH2)1-3-無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
N(Ra1)C(=O)(CH2)1-3N(H)-C1-6ヒドロキシアルキル、
N(Ra1)C(=O)N(Ra2)2、
N(Ra1)C(=O)N(Ra2)-無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル
N(Ra1)C(=O)N(Ra2)2、
N(Ra1)C(=O)N(Ra2)-無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル
NH(CH2)2-3N(C1-3アルキル)2、
NH(CH2)2-3-C3-10ヘテロシクロアルキル、
N[(CH2)2-3-C3-10ヘテロシクロアルキル]2、
O(CH2)2-3N(C1-3アルキル)2、
O(CH2)2-3-C3-10ヘテロシクロアルキル、
C(=O)N(Ra5)2
C(=O)N(Ra1)(CH2)2-3-無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
C(=O)-無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
N(Ra1)C(=O)-ヒドロキシC3-10ヘテロシクロアルキル、
C(=O)N(Ra1)(CH2)2-3-N(H)C(=O)NH2、
C(=O)N(Ra1)(CH2)2-3N(C1-3アルキル)2
C(=O)N(Ra1)(CH2)2-3-CO2Ra1、
C(=O)N(Ra1)-アルキル、
C(=O)N(Ra1)-C1-6ヒドロキシアルキル、
C(=O)N(Ra1)-無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
C(=O)N(Ra1)-C1-6ヒドロキシアルキル、
C(=O)N(Ra1)CH2CH2OCH2CH2OCH3、
C(=O)N(Ra1)CH2CH2SO2Me、
CO2Ra1、
C(Ra1)2CO2Ra2、
C(Ra1)2C(=O)N(Ra5)2、
C(Ra1)2C(=O)N(Ra2)-無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
C(Ra1)2CN、
Figure 0006401773
オキソ(=O)、または
CHOであり；
nは、整数0、1、2、または3であり；
mは、整数0、1、2、または3であり；
RcおよびRdはそれぞれ独立に、水素、C1-6アルキル、無置換もしくは置換アリール、無置換もしくは置換CH2-アリール、無置換もしくは置換C3-10シクロアルキル、無置換もしくは置換CH2-C3-10シクロアルキル、ヘテロアリール、無置換もしくは置換CH2-ヘテロアリール、無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、ヒドロキシシクロアルキル、または無置換もしくは置換CH2-C3-10ヘテロシクロアルキルであるか、あるいは
RcおよびRdは一緒に、無置換または置換C3-10ヘテロシクロアルキルまたはヒドロキシC3-10ヘテロシクロアルキルを形成し；
Q-は薬学的に許容されるアニオンである。
1つの態様において、本発明は、構造式（I）の化合物の治療的有効量を、それを必要としている個人に投与することによる、状態または疾患の処置方法を提供する。関心対象の疾患または状態は、BETブロモドメインの阻害によって処置可能であり、例えば、癌、慢性自己免疫障害、炎症状態、増殖性障害、敗血症、またはウイルス感染症である。
本発明の別の態様は、（a）構造式（I）のBETブロモドメイン阻害剤ならびに（b）BETブロモドメインの阻害が利益を提供する疾患または状態を処置する際に有用な賦形剤および/または薬学的に許容される担体を含む組成物を提供することである。
本発明の別の態様は、構造式（I）の化合物および第二の治療的活性薬剤を含む組成物を、BETブロモドメイン、例えば、BRD2、BRD3、BRD4、BRD-t、またはそのイソ型もしくは変異体の阻害が利益を提供する疾患または状態に対する個人の処置方法において使用することである。
さらなる態様において、本発明は、構造式（I）のBETブロモドメイン阻害剤および任意の第二の治療剤を含む組成物の、関心対象の疾患または状態（例えば癌）を処置するための医薬を製造するための使用を提供する。
本発明のさらに別の態様は、（a）容器、（b1）構造式（I）のBETブロモドメイン阻害剤を含むパッケージ組成物、および任意に（b2）関心対象の疾患または状態の処置において有用な第二の治療剤を含むパッケージ組成物、ならびに（c）疾患または状態の処置において、同時または逐次投与する組成物の使用のための指示を含む添付文書を含む、ヒトの薬学的使用のためのキットを提供することである。
構造式（I）のBETブロモドメイン阻害剤および第二の治療剤は、単一の単位用量として一緒に、または複数の単位用量として別々に投与することができ、ここで構造式（I）のBETブロモドメイン阻害剤は第二の治療剤の前に投与するか、または逆も同様である。構造式（I）のBETブロモドメイン阻害剤の1つもしくは複数の用量、および/または第二の治療剤の1つもしくは複数の用量を投与しうることが構想される。
1つの態様において、構造式（I）のBETブロモドメイン阻害剤および第二の治療剤を同時に投与する。関連する態様において、構造式（I）のBETブロモドメイン阻害剤および第二の治療剤を、単一の組成物から、または別々の組成物から投与する。さらなる態様において、構造式（I）のBETブロモドメイン阻害剤および第二の治療剤を逐次投与する。本発明において用いられる、構造式（I）のBETブロモドメイン阻害剤は、約0.005〜約500mg/用量、約0.05〜約250mg/用量、または約0.5〜約100mg/用量の量で投与することができる。
[本発明1001]
構造式（I）：
Figure 0006401773
を有する化合物、またはその薬学的に許容される塩、水和物、もしくは溶媒和物：
式中、
Xは、N(R a1 )、O、またはSであり；
Y 1 およびY 3 は独立に、CHまたはNであり；
Y 2 は、CR 2 もしくはNであるか、または存在せず；
Zは、H、
Figure 0006401773
、ハロ、またはOHであり；
Aは、無置換または置換5員複素環であり；
Bは、それぞれ無置換または置換されている、アリール、CH(R a2 )-アリール、C 3-10 シクロアルキル、CH(R a2 )-C 3-10 シクロアルキル、ヘテロアリール、CH(R a2 )-ヘテロアリール、C 3-10 ヘテロシクロアルキル、CH(R a2 )-C 3-10 ヘテロシクロアルキル、
Figure 0006401773
であり；
Gは、N、O、またはSであり；
Lは、存在しないか、またはHもしくはC(R d ) 3 であり；
R 1 は、H、ハロ、OH、OR a3 、R a3 、またはN(R a3 ) 2 であり；
R a1 、R a2 、R a3 、R a4 、およびR a5 はそれぞれ独立に、H、C 1-3 アルキル、フェニル、またはベンジルであり；
R 2 は、
H、
C 1-3 アルキル、
(CH 2 ) 1-3 C 4-7 ヘテロシクロアルキル、
C 4-7 ヘテロシクロアルキル、
CO 2 H、
CO 2 (C 1-3 アルキル)、
NH 2 、
NH(C 1-3 アルキル)、
N(C 1-3 アルキル) 2 、
(CH 2 ) 1-3 NMe 2 、
(CH 2 ) 1-3 OH、
C(Me) 2 OH、
CH(Me)OH、
C(Me 2 )NH 2 、
フェニル、
ベンジル、
C(=O)OR a4 、
C(=O)N(R a4 ) 2 、
C(=O)-無置換もしくは置換C 3-10 ヘテロシクロアルキル、
C(=O)-無置換もしくは置換ヒドロキシC 3-10 ヘテロシクロアルキル、
C(=O)N(R a1 )(CH 2 ) 2-3 N(C 1-3 アルキル) 2 、
C(=O)N(R a1 )(CH 2 ) 2-3 無置換もしくは置換C 3-10 ヘテロシクロアルキル、
C(=O)N(R a1 )-無置換もしくは置換C 3-10 ヘテロシクロアルキル、
C(=O)N(R a1 )-ヒドロキシシクロアルキル、
C(=O)N(R a1 )-C 1-6 ヒドロキシアルキル、
Figure 0006401773
であり；
R b は独立に、
C 1-6 アルキル、
C 1-6 ヒドロキシアルキル、
ハロ、
アリール、
無置換もしくは置換CH 2 -アリール、
無置換もしくは置換C 3-10 シクロアルキル、
無置換もしくは置換CH 2 -C 3-10 シクロアルキル、
無置換もしくは置換ヘテロアリール、
無置換もしくは置換CH 2 -ヘテロアリール、
無置換もしくは置換C 3-10 ヘテロシクロアルキル、
無置換もしくは置換CH 2 -C 3-10 ヘテロシクロアルキル、
CF 3 、
CN、
OR a5 、
N(R a5 ) 2 、
N(R a1 )C 1-6 ヒドロキシアルキル、
N(R a1 )C(=O)(C 1-6 アルキル)、
N(R a1 )C(=O)(CH 2 ) 1-3 -無置換もしくは置換C 3-10 ヘテロシクロアルキル、
N(R a1 )C(=O)(CH 2 ) 1-3 -ヒドロキシC 3-10 ヘテロシクロアルキル、
NH(CH 2 ) 2-3 CO 2 H、
NH(CH 2 ) 2-3 C(=O)N(R a5 ) 2 、
N(R a1 )C(=O)(CH 2 ) 1-3 N(H)-無置換もしくは置換C 3-10 ヘテロシクロアルキル、
N(R a1 )C(=O)(CH 2 ) 1-3 -無置換もしくは置換C 3-10 ヘテロシクロアルキル、
N(R a1 )C(=O)(CH 2 ) 1-3 N(H)-C 1-6 ヒドロキシアルキル、
N(R a1 )C(=O)N(R a2 ) 2 、
N(R a1 )C(=O)N(R a2 )-無置換もしくは置換C 3-10 ヘテロシクロアルキル、
N(R a1 )C(=O)N(R a2 ) 2 、
N(R a1 )C(=O)N(R a2 )-無置換もしくは置換C 3-10 ヘテロシクロアルキル、
NH(CH 2 ) 2-3 N(C 1-3 アルキル) 2 、
NH(CH 2 ) 2-3 -C 3-10 ヘテロシクロアルキル、
N[(CH 2 ) 2-3 -C 3-10 ヘテロシクロアルキル] 2 、
O(CH 2 ) 2-3 N(C 1-3 アルキル) 2 、
O(CH 2 ) 2-3 -C 3-10 ヘテロシクロアルキル、
C(=O)N(R a5 ) 2 、
C(=O)N(R a1 )(CH 2 ) 2-3 -無置換もしくは置換C 3-10 ヘテロシクロアルキル、
C(=O)-無置換もしくは置換C 3-10 ヘテロシクロアルキル、
N(R a1 )C(=O)-ヒドロキシC 3-10 ヘテロシクロアルキル、
C(=O)N(R a1 )(CH 2 ) 2-3 -N(H)C(=O)NH 2 、
C(=O)N(R a1 )(CH 2 ) 2-3 N(C 1-3 アルキル) 2 、
C(=O)N(R a1 )(CH 2 ) 2-3 -CO 2 R a1 、
C(=O)N(R a1 )-アルキル、
C(=O)N(R a1 )-C 1-6 ヒドロキシアルキル、
C(=O)N(R a1 )-無置換もしくは置換C 3-10 ヘテロシクロアルキル、
C(=O)N(R a1 )-C 1-6 ヒドロキシアルキル、
C(=O)N(R a1 )CH 2 CH 2 OCH 2 CH 2 OCH 3 、
C(=O)N(R a1 )CH 2 CH 2 SO 2 Me、
CO 2 R a1 、
C(R a1 ) 2 CO 2 R a2 、
C(R a1 ) 2 C(=O)N(R a5 ) 2 、
C(R a1 ) 2 C(=O)N(R a2 )-無置換もしくは置換C 3-10 ヘテロシクロアルキル、
C(R a1 ) 2 CN、
Figure 0006401773
オキソ(=O)、または
CHOであり；
nは、整数0、1、2、または3であり；
mは、整数0、1、2、または3であり；
R c およびR d はそれぞれ独立に、水素、C 1-6 アルキル、無置換もしくは置換アリール、無置換もしくは置換CH 2 -アリール、無置換もしくは置換C 3-10 シクロアルキル、無置換もしくは置換CH 2 -C 3-10 シクロアルキル、ヘテロアリール、無置換もしくは置換CH 2 -ヘテロアリール、無置換もしくは置換C 3-10 ヘテロシクロアルキル、ヒドロキシシクロアルキル、または無置換もしくは置換CH 2 -C 3-10 ヘテロシクロアルキルであるか、あるいは
R c およびR d は一緒に、無置換または置換C 3-10 ヘテロシクロアルキルまたはヒドロキシC 3-10 ヘテロシクロアルキルを形成し；
Q - は、薬学的に許容されるアニオンである。
[本発明1002]
Zが、H、
Figure 0006401773
、ハロ、またはOHであり；
Bが、それぞれ無置換または置換されている、アリール、CH(R a2 )-アリール、C 3-10 シクロアルキル、CH(R a2 )-C 3-10 シクロアルキル、ヘテロアリール、CH(R a2 )-ヘテロアリール、C 3-10 ヘテロシクロアルキル、またはCH(R a2 )-C 3-10 ヘテロシクロアルキルであり；
R 1 が、H、ハロ、OH、OR a3 、またはN(R a3 ) 2 であり；
R a2 およびR a3 が独立に、H、C 1-3 アルキル、またはベンジルであり；
R 2 が、H、C 1-3 アルキル、またはベンジルであり；
R b が独立に、C 1-6 アルキル、ハロ、アリール、無置換もしくは置換CH 2 -アリール、無置換もしくは置換C 3-10 シクロアルキル、無置換もしくは置換CH 2 -C 3-10 シクロアルキル、ヘテロアリール、無置換もしくは置換CH 2 -ヘテロアリール、無置換もしくは置換C 3-10 ヘテロシクロアルキル、無置換もしくは置換CH 2 -C 3-10 ヘテロシクロアルキル、またはCHOであり；
R c およびR d がそれぞれ独立に、水素、C 1-6 アルキル、無置換もしくは置換アリール、無置換もしくは置換CH 2 -アリール、無置換もしくは置換C 3-10 シクロアルキル、無置換もしくは置換CH 2 -C 3-10 シクロアルキル、ヘテロアリール、無置換もしくは置換CH 2 -ヘテロアリール、無置換もしくは置換C 3-10 ヘテロシクロアルキル、または無置換もしくは置換CH 2 -C 3-10 ヘテロシクロアルキルである、
本発明1001の化合物、またはその薬学的に許容される塩、水和物、もしくは溶媒和物。
[本発明1003]
環Aが、置換されていてもよいヘテロアリール環である、本発明1001または1002の化合物。
[本発明1004]
環Aが、置換されていてもよい
Figure 0006401773
であり、式中、R a は、H、C 1-3 アルキル、またはベンジルである、本発明1001〜1003のいずれかの化合物。
[本発明1005]
環Aが、置換されていてもよい
Figure 0006401773
である、本発明1001〜1004のいずれかの化合物。
[本発明1006]
環Aが、
Figure 0006401773
である、本発明1001〜1005のいずれかの化合物。
[本発明1007]
R 1 が、Hまたは-OCH 3 である、本発明1001〜1006のいずれかの化合物。
[本発明1008]
環系
Figure 0006401773
が、
Figure 0006401773
である、本発明1001〜1007のいずれかの化合物。
[本発明1009]
Zが
Figure 0006401773
である、本発明1001〜1008のいずれかの化合物。
[本発明1010]
Zが
Figure 0006401773
である、本発明1009の化合物。
[本発明1011]
B環が、置換または無置換のいずれでも、
Figure 0006401773
からなる群より選択される、本発明1010の化合物。
[本発明1012]
B環が、メチル、フェニル、フルオロ、ピリジニル、クロロ、イソプロピル、シクロプロピル、またはエチルのうちの1〜3つで置換されている、本発明1011の化合物。
[本発明1013]
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
からなる群より選択される、本発明1001の化合物、またはその薬学的に許容される塩、水和物、もしくは溶媒和物。
[本発明1014]
（a）本発明1001〜1013のいずれかの化合物、（b）BETブロモドメインタンパク質の阻害が利益を提供する疾患または状態の処置において有用な第二の治療剤、ならびに（c）任意の賦形剤および/または薬学的に許容される担体を含む、組成物。
[本発明1015]
前記第二の治療剤が、癌の処置において有用な化学療法剤を含む、本発明1014の組成物。
[本発明1016]
本発明1001〜1013のいずれかの化合物と、薬学的に許容される担体または媒体とを含む、薬学的組成物。
[本発明1017]
BETブロモドメインタンパク質の阻害が利益を提供する疾患または状態の処置方法であって、本発明1001〜1013のいずれかの化合物の治療的有効量をそれを必要としている個人に投与する段階を含む、前記方法。
[本発明1018]
前記疾患または状態の処置において有用な第二の治療剤の治療的有効量を投与する段階をさらに含む、本発明1017の方法。
[本発明1019]
前記化合物および前記第二の治療剤を同時に投与する、本発明1018の方法。
[本発明1020]
前記化合物および前記第二の治療剤を別々に投与する、本発明1018の方法。
[本発明1021]
前記疾患または状態が、癌、慢性自己免疫障害、炎症状態、増殖性障害、敗血症、またはウイルス感染症である、本発明1017の方法。
[本発明1022]
前記疾患または状態が癌であり、かつ前記第二の治療剤が、手術、化学療法剤、および放射線照射のうちの1つまたは複数である、本発明1018の方法。
[本発明1023]
前記疾患または状態が癌であり、かつ前記第二の治療剤が、アロマターゼ阻害剤；抗エストロゲン薬；抗アンドロゲン薬；ゴナドレリンアゴニスト；トポイソメラーゼI阻害剤；トポイソメラーゼII阻害剤；微小管作用剤；アルキル化剤；レチノイド、カロテノイド、またはトコフェロール；シクロオキシゲナーゼ阻害剤；MMP阻害剤；mTOR阻害剤；代謝拮抗薬；白金化合物；メチオニンアミノペプチダーゼ阻害剤；ビスホスホネート；抗増殖性抗体；ヘパラナーゼ阻害剤；Ras発癌性アイソフォームの阻害剤；テロメラーゼ阻害剤；プロテアソーム阻害剤；血液系腫瘍の処置において用いられる化合物；Flt-3阻害剤；Hsp90阻害剤；キネシンスピンドルタンパク質阻害剤；MEK阻害剤；抗腫瘍抗生物質；ニトロソ尿素；タンパク質もしくは脂質キナーゼ活性を標的化/低減する化合物；およびタンパク質もしくは脂質ホスファターゼ活性を標的化/低減する化合物からなる群より選択される、本発明1018の方法。
[本発明1024]
前記疾患または状態が癌であり、かつ前記第二の治療剤が、ガンマ線照射、中性子ビーム放射線療法、電子ビーム放射線療法、プロトン療法、近接照射療法、および全身放射性同位体からなる群より選択される放射線照射を含む、本発明1017の方法。
[本発明1025]
前記疾患または状態が、副腎癌、腺房細胞癌、聴神経腫瘍、末端黒子型黒色腫、先端汗腺腫、急性好酸球性白血病、急性赤白血病、急性リンパ性白血病、急性巨核芽球性白血病、急性単球性白血病、急性前骨髄球性白血病、腺癌、腺様嚢胞癌、腺腫、腺腫様歯原性腫瘍、腺扁平上皮癌、脂肪組織腫瘍、副腎皮質癌、成人T細胞白血病/リンパ腫、侵攻性NK細胞性白血病、エイズ関連リンパ腫、胞巣状横紋筋肉腫、胞状軟部肉腫、エナメル芽細胞線維腫、未分化大細胞型リンパ腫、甲状腺未分化癌、血管免疫芽球性T細胞性リンパ腫、血管筋脂肪腫、血管肉腫、星細胞腫、非定型奇形腫様横紋筋肉腫様腫瘍、B細胞性慢性リンパ性白血病、B細胞性前リンパ球性白血病、B細胞リンパ腫、基底細胞癌、胆道癌、膀胱癌、芽細胞腫、骨癌、ブレンナー腫瘍、褐色腫、バーキットリンパ腫、乳癌、脳癌、癌腫、上皮内癌、癌肉腫、軟骨腫瘍、セメント質腫、骨髄性肉腫、軟骨腫、脊索腫、絨毛癌、脈絡叢乳頭腫、腎臓の明細胞肉腫、頭蓋咽頭腫、皮膚T細胞リンパ腫、子宮頚癌、直腸結腸癌、デゴス病、線維形成性小円形細胞腫瘍、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、胚芽異形成性神経上皮腫瘍、未分化胚細胞腫、胚性癌腫、内分泌腺腫瘍、卵黄嚢腫瘍、腸症関連T細胞リンパ腫、食道癌、封入奇形胎児、線維腫、線維肉腫、濾胞性リンパ腫、濾胞性甲状腺癌、神経節腫、胃腸癌、胚細胞腫瘍、妊娠性絨毛癌、巨細胞線維芽腫、骨の巨細胞腫、グリア系腫瘍、多形神経膠芽腫、神経膠腫、大脳神経膠腫症、グルカゴン産生腫瘍、性腺芽腫、顆粒膜細胞腫、半陰陽性卵巣腫瘍、胆嚢癌、胃癌、有毛細胞白血病、血管芽腫、頭頚部癌、血管周囲細胞腫、造血器腫瘍、肝芽腫、肝脾T細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、浸潤性小葉癌、腸癌、腎癌、喉頭癌、悪性黒子、致死性正中線癌、白血病、ライディッヒ細胞腫、脂肪肉腫、肺癌、リンパ管腫、リンパ管肉腫、リンパ上皮腫、リンパ腫、急性リンパ性白血病、急性骨髄性白血病、慢性リンパ性白血病、肝癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、MALTリンパ腫、悪性線維性組織球腫、悪性末梢神経鞘腫、悪性トリトン腫瘍、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯B細胞リンパ腫、マスト細胞白血病、縦隔胚細胞性腫瘍、乳房髄様癌、甲状腺髄様癌、髄芽腫、黒色腫、髄膜腫、メルケル細胞癌、中皮腫、転移性尿路上皮癌、ミュラー管混合腫瘍、粘液性腫瘍、多発性骨髄腫、筋組織腫瘍、菌状息肉腫、粘液性脂肪肉腫、粘液腫、粘液肉腫、上咽頭癌、神経鞘腫、神経芽細胞腫、神経線維腫、神経腫、結節性黒色腫、眼球癌、乏突起星細胞腫、乏突起膠腫、好酸性腺腫、視神経鞘髄膜腫、視神経腫瘍、口腔癌、骨肉腫、卵巣癌、パンコースト腫瘍、乳頭様甲状腺癌、傍神経節腫、松果体芽細胞腫、松果体細胞腫、下垂体細胞腫、下垂体腺腫、下垂体腫瘍、形質細胞腫、多胎芽腫、前駆Tリンパ芽球性リンパ腫、原発性中枢神経系リンパ腫、原発性体腔性リンパ腫、原発性腹膜癌、前立腺癌、膵癌、咽頭癌、腹膜偽粘液腫、腎細胞癌、腎髄様癌、網膜芽細胞腫、横紋筋腫、横紋筋肉腫、リヒタートランスフォーメーション、直腸癌、肉腫、神経鞘腫症、精上皮腫、セルトリ細胞腫、性索性腺間質腫瘍、印環細胞癌、皮膚癌、小円形青色細胞腫瘍、小細胞癌、軟部肉腫、ソマトスタチン産生腫瘍、煤煙性いぼ、脊椎腫瘍、脾臓辺縁帯リンパ腫、扁平上皮細胞癌、滑膜肉腫、セザリー症、小腸癌、扁平上皮癌、胃癌、T細胞リンパ腫、精巣癌、莢膜細胞腫、甲状腺癌、移行上皮癌、咽頭癌、尿膜管癌、泌尿生殖器癌、尿路上皮癌、ぶどう膜黒色腫、子宮癌、疣状癌、視覚路神経膠腫、外陰癌、腟癌、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、ワルチン腫瘍、およびウィルムス腫瘍からなる群より選択される癌である、本発明1021の方法。
[本発明1026]
前記疾患または状態が、急性単球性白血病、急性骨髄性白血病、慢性骨髄性白血病、慢性リンパ性白血病、混合血統白血病、NMC（NUT正中線癌）、多発性骨髄腫、小細胞肺癌（SCLC）、神経芽細胞腫、バーキットリンパ腫、子宮頸癌、食道癌、卵巣癌、結腸直腸癌、前立腺癌、および乳癌からなる群より選択される癌である、本発明1021の方法。
[本発明1027]
本発明1001の化合物および前記第二の治療剤を単一の組成物から投与する、本発明1018の方法。
[本発明1028]
本発明1001の化合物および前記第二の治療剤を別々の組成物から投与する、本発明1018の方法。
[本発明1029]
本発明1001の化合物を前記第二の治療剤の前に投与する、本発明1020の方法。
[本発明1030]
本発明1001の化合物を前記第二の治療剤の後に投与する、本発明1020の方法。
[本発明1031]
前記疾患または状態が、良性軟部組織腫瘍、骨腫瘍、脳および脊椎腫瘍、眼瞼および眼窩腫瘍、肉芽腫、脂肪腫、髄膜腫、多発性内分泌腫瘍症、鼻茸、下垂体腫瘍、プロラクチン産生腺腫、偽脳腫瘍、脂漏性角化症、胃ポリープ、甲状腺結節、膵臓の嚢胞性腫瘍、血管腫、声帯結節、ポリープ、および嚢胞、キャッスルマン病、慢性毛巣病、皮膚線維腫、皮脂嚢胞、化膿性肉芽腫、ならびに若年性ポリープ症候群からなる群より選択される増殖性障害である、本発明1021の方法。
[本発明1032]
前記疾患または状態が、骨盤内炎症性疾患、尿道炎、皮膚の日焼け、副鼻腔炎、間質性肺炎、脳炎、髄膜炎、心筋炎、腎炎、骨髄炎、筋炎、肝炎、胃炎、腸炎、皮膚炎、歯肉炎、虫垂炎、膵炎、胆嚢炎、無ガンマグロブリン血症、乾癬、アレルギー、クローン病、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、シェーグレン病、組織移植片拒絶、移植臓器の超急性拒絶、喘息、アレルギー性鼻炎、慢性閉塞性肺疾患（COPD）、多腺性自己免疫疾患（多腺性自己免疫症候群としても公知）、自己免疫性脱毛症、悪性貧血、糸球体腎炎、皮膚筋炎、多発性硬化症、強皮症、血管炎、自己免疫性溶血状態および血小板減少状態、グッドパスチャー症候群、アテローム性動脈硬化症、アジソン病、パーキンソン病、アルツハイマー病、I型糖尿病、敗血症性ショック、全身性エリテマトーデス（SLE）、関節リウマチ、乾癬性関節炎、若年性関節炎、骨関節炎、慢性特発性血小板減少性紫斑病、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、重症筋無力症、橋本病、アトピー性皮膚炎、変性関節疾患、白斑、自己免疫性下垂体機能低下症、ギラン・バレー症候群、ベーチェット病、強皮症、菌状息肉腫、急性炎症反応（例えば、急性呼吸促迫症候群および虚血/再灌流傷害）、およびグレーブス病からなる群より選択される自己免疫障害または炎症障害である、本発明1021の方法。
[本発明1033]
前記疾患または障害が、ヒトパピローマウイルス、ヘルペスウイルス、エプスタイン・バーウイルス、ヒト免疫不全ウイルス、B型肝炎ウイルス、およびC型肝炎ウイルスからなる群より選択されるウイルス感染症である、本発明1021の方法。
[本発明1034]
生体試料中のBETブロモドメインタンパク質またはその変異体の活性を阻害する方法であって、該生体試料を本発明1001〜1013のいずれかの化合物と接触させる段階を含む、前記方法。
[本発明1035]
BETブロモドメイン阻害剤が必要とされる疾患または状態の処置用の医薬の製造における、本発明1001〜1013のいずれかの化合物の使用。
本発明のこれら、および他の態様および特徴は、以下の好ましい態様の詳細な説明から明らかになるであろう。
SCIDマウスのMDA-MB-436乳癌異種移植モデルにおける化合物番号73のインビボ抗腫瘍活性を示す線グラフである。腫瘍を皮下で平均サイズ100mm3まで成長させ、化合物番号73を示した用量およびスケジュールで経口投与した。媒体対照（PEG200）を1日2回投与した。 MDA-MB-436腫瘍を有するSCIDマウスにおける化合物番号73投与後の動物の体重を示す線グラフである。化合物番号73を示した用量およびスケジュールで経口投与した。媒体対照（PEG200）を1日2回投与した。 マウスのMDA-MB-231乳癌異種移植モデルにおける化合物番号73のインビボ抗腫瘍活性を示す線グラフである。化合物番号73を20または40mg/kgのいずれかによる経口胃管栄養法での1日1回経口投薬で、12日間投与した。各群8匹のマウスで、各マウスは1つの腫瘍を有していた。 SCIDマウスのMV-4;11異種移植腫瘍におけるBET阻害剤によるp21およびのインビボアップレギュレーションのウェスタンブロット分析を示す図である。化合物を100mg/kgで最大72時間まで経口投与した。切除した異種移植腫瘍組織を液体窒素中で粉砕して粉末とし、溶解緩衝液［1％CHAPS、150mM NaCl、20mM Tris-HCl、1mM EDTA、1mM EGTA、およびCOMPLETEプロテイナーゼ阻害剤（Roche）］中、2回の凍結-解凍（-80℃〜室温）サイクルと、次いで氷上にさらに30分間おいて溶解した。タンパク質濃度をBio-Rad Protein Assay Dye試薬を用いて決定した。全腫瘍溶解物（20μg）を4〜20％Novexゲル（Invitrogen）上で分離した。分離したタンパク質をPVDF膜（BIO-RAD）に転写し、次いでPVDF膜を5％Blotting-Grade Blocker（BIO-RAD）により室温で1時間ブロットした。用いた一次抗体は、p21Waf1/Cip1 (12D1) Rabbit mAb［Cell Signaling technology（CST）、Cat# 2947］およびPARP (46D11) Rabbit mAb［CST #9532］であった。用いた二次抗体はホースラディッシュペルオキシダーゼ結合ヤギ抗ウサギ抗体（Thermo Scientific Cat# 31460）であった。SRX-101A卓上プロセッサー（Konica Minolta）を用い、BIO-RAD Clarity Western ECL Substrates（BIO-RAD）およびHyBlot CLフィルム（Denville）を信号生成および検出のために用いた。 SCIDマウスのMV4;11急性骨髄性白血病（AML）異種移植モデルにおけるBET阻害剤のインビボ抗腫瘍活性を示す線グラフである。腫瘍を皮下で平均サイズ150mm3まで成長させ、化合物番号73を示した用量およびスケジュールで経口投与した。 MV4;11腫瘍を有するSCIDマウスにおけるBET阻害剤投与後の動物の体重を示す線グラフである。 SCIDマウスのMV-4;11異種移植腫瘍におけるBET阻害剤により誘導されるp21活性化およびアポトーシスの2つのウェスタンブロット分析を示す図である。MV4-11異種移植片を50mg/kgの薬物で6および24時間処理した。切除した異種移植腫瘍組織を液体窒素中で粉砕して粉末とし、溶解緩衝液［1％CHAPS、150mM NaCl、20mM Tris-HCl、1mM EDTA、1mM EGTA、およびCOMPLETEプロテイナーゼ阻害剤（Roche）］中、2回の凍結-解凍（-80℃〜室温）サイクルと、次いで氷上にさらに30分間おいて溶解した。タンパク質濃度をBio-Rad Protein Assay Dye試薬を用いて決定した。全腫瘍溶解物（20μg）を4〜20％Novexゲル（Invitrogen）上で分離した。分離したタンパク質をPVDF膜（BIO-RAD）に転写し、次いでPVDF膜を5％Blotting-Grade Blocker（BIO-RAD）により室温で1時間ブロットした。用いた一次抗体は、p21Waf1/Cip1 (12D1) Rabbit mAb［Cell Signaling technology（CST）、Cat# 2947］およびPARP (46D11) Rabbit mAb［CST #9532］であった。用いた二次抗体はホースラディッシュペルオキシダーゼ結合ヤギ抗ウサギ（Thermo Scientific Cat# 31460）であった。SRX-101A卓上プロセッサー（Konica Minolta）を用い、BIO-RAD Clarity Western ECL Substrates（BIO-RAD）およびHyBlot CLフィルム（Denville）を信号生成および検出のために用いた。 DMSOまたは0.5μMの示したBETブロモドメイン阻害剤で24時間処理したVCaP細胞において、QRT-PCR分析により測定したAR標的（PSA、ERG）およびMYC（陽性対照）発現を示す棒グラフである。 DMSOまたは0.5μMの示したBETブロモドメイン阻害剤で24時間処理したAR陰性DU145細胞において、QRT-PCR分析により測定したMYC mRNA発現を示す棒グラフである。 ChIP-seqにより測定したBET阻害剤によるKLK3（PSA）遺伝子座からのBRD4脱動員を示す図である。飢餓VCaP細胞を、0.5μM JQ1または化合物番号68で5時間処理した後、DHTで12時間刺激し、続いてBRD4 ChIP-seqを行った。抗アンドロゲンMDV3100（10μM）およびビカルタミド（25μM）を比較のために用いた。図は、AR調節KLK3遺伝子座におけるBRD4結合事象のゲノムブラウザの表示を示す。y軸はリード数/100万/塩基対（rpm/bp）を示す。x軸はゲノム位置を示し、右上にスケールバーを示す。 媒体、MDV3100（10μM）、JQ1（0.5uM）もしくはCD225単独または示した組み合わせで4時間と、続いてDHT（10nM）で20時間あらかじめ処理した飢餓VCaP細胞におけるPSA、ERG、およびMYCタンパク質の免疫ブロット分析を示す図である。GAPDHをローディング対照として用いた。 VCaP前立腺癌マウス異種移植モデルにおける化合物番号73のインビボ抗腫瘍活性を示す線グラフである。VCaP細胞をマウスの皮下に移植し、腫瘍が約100mm3のサイズに達するまで成長させた。異種移植マウスを無作為化し、次いで媒体または40mg/kgの化合物番号73を経口胃管栄養法で5日/週投与した。平均腫瘍体積±SEMを示す。 VCaP前立腺癌マウス異種移植モデルにおける化合物番号73のインビボ抗腫瘍活性を示す線グラフである。VCaP細胞をマウスの皮下に移植し、腫瘍が約100mm3のサイズに達するまで成長させた。異種移植マウスを無作為化し、次いで媒体または40mg/kgの化合物番号73を経口胃管栄養法で13日間投与した。処置を第13日以降停止し、動物の腫瘍成長を観察した。平均腫瘍体積±SEMを示す。
好ましい態様の詳細な説明
本発明を、好ましい態様に関して記載する。しかし、本発明は開示する態様に限定されないことが理解されるべきである。本明細書における本発明の態様の記載を考慮すると、当業者であれば様々な改変を行いうることが理解される。そのような改変は以下の特許請求の範囲に包含される。
本明細書において用いられる「BETブロモドメイン」なる用語は、BRD2、BRD3、BRD4、およびBRD-tのうちの1つまたは複数を意味する。
「BETブロモドメインの阻害が利益を提供する疾患または状態」なる用語は、BRD2、BRD3、BRD4、およびBRD-tの少なくとも1つ、ならびに/もしくはBRD2、BRD3、BRD4、およびBRD-tの少なくとも1つの作用が、例えば、疾患もしくは状態の発症、進行、発現にとって重要もしくは必須である状態、またはBETブロモドメイン阻害剤によって処置されることが公知である疾患もしくは状態に関する。そのような状態の例には、癌、慢性自己免疫疾患、炎症疾患、増殖性疾患、敗血症、およびウイルス感染症が含まれるが、それらに限定されるわけではない。当業者であれば、化合物が任意の特定の細胞型に対しBETブロモドメインによって仲介される疾患または状態を処置するかどうかを、例えば、特定の化合物の活性を評価するために都合よく使用しうる検定により、容易に判定することができる。
「第二の治療剤」なる用語は、構造式（I）のBETブロモドメイン阻害剤とは異なり、関心対象の疾患または状態を処置することが公知の、治療剤を意味する。例えば、癌が関心対象の疾患または状態である場合、第二の治療剤は、例えば、タキソールのような公知の化学療法薬、または放射線照射でありうる。
「疾患」または「状態」なる用語は、概して病的状態または機能とみなされ、特定の徴候、症状、および/または機能不全の形で現れうる障害および/または異常を意味する。以下に示すとおり、構造式（I）の化合物はBETブロモドメインの強力な阻害剤であり、BETブロモドメインの阻害が利益を提供する疾患および状態を処置する際に用いることができる。
本明細書において用いられる「処置する」、「処置すること」、「処置」などの用語は、疾患もしくは状態、および/またはそれに関連する症状を除去すること、軽減すること、または改善することを意味する。除外されることはないが、疾患または状態を処置することは、疾患、状態、またはそれに関連する症状が完全に除去されることを必要としない。本明細書において用いられる「処置する」、「処置すること」、「処置」などの用語は、「予防的処置」を含んでもよく、これは疾患または状態を有していないが、疾患もしくは状態を再発生する、または疾患もしくは状態の再発のリスクが高い、またはそれに対する感受性が高い対象において、疾患もしくは状態を再発生する、または以前に制御された疾患もしくは状態の再発の確立を低下させることを意味する。「処置する」なる用語および同義語は、本発明の化合物の治療的有効量をそのような処置を必要としている個人に投与することを企図する。
本発明の意味の範囲内で、「処置」は再発の予防または病相予防、ならびに急性または慢性の徴候、症状および/または機能不全の処置も含む。処置は、例えば、症候的に症状を抑制することを志向することもできる。これは短期間で行うこともでき、中程度の期間にわたって志向することもでき、または、例えば、維持療法の状況における長期処置であってもよい。
本明細書において用いられる場合、「治療的有効量」または「有効用量」なる用語は、本発明の方法によって投与した場合に、関心対象の状態または疾患の処置のための活性成分をそれを必要としている個人に有効に送達するのに十分な、活性成分の量を意味する。癌または他の増殖障害の場合、薬剤の治療的有効量は有害な細胞増殖を低減（すなわち、ある程度まで遅らせ、好ましくは停止する）；癌細胞の数を低減；腫瘍サイズを低減；癌細胞の末梢器官への浸潤を阻害（すなわち、ある程度まで遅らせ、好ましくは停止する）；腫瘍転移を阻害（すなわち、ある程度まで遅らせ、好ましくは停止する）；腫瘍成長を、ある程度まで阻害；標的細胞におけるBETブロモドメインシグナル伝達を低減；および/または癌に関連する症状；のうちの1つまたは複数を、ある程度まで軽減してもよい。投与した化合物または組成物が既存の癌細胞の成長を防止する、および/または死滅させる程度まで、細胞増殖抑制性および/または細胞毒性であってもよい。
「容器」なる用語は、薬学的製品を保存する、輸送する、分配する、および/または取り扱うのに適した、そのための任意の入れ物およびクロージャーを意味する。
「添付文書」なる用語は、医師、薬剤師、および患者が製品の使用に関する情報に基づく決定をくだすことを可能にするのに必要な、安全性および有効性データと共に、製品をいかに投与するかの説明を提供する、薬学的製品に添付されている情報を意味する。添付文書は一般に薬学的製品のための「ラベル」とみなされる。
「併用投与」、「組み合わせ投与」、「同時投与」、および類似の語句は、二種以上の薬剤を処置中の対象に併用で投与することを意味する。「併用で」とは、各薬剤を同時または異なる時点で任意の順に逐次のいずれかで投与することを意味する。しかし、同時投与しない場合、それらを個人に、所望の治療効果を提供し、協調して作用するような順序および十分に短い時間で投与することを意味する。例えば、構造式（I）のBETブロモドメイン阻害剤は第二の治療剤と同時または異なる時点で任意の順に逐次投与することができる。本発明のBETブロモドメイン阻害剤および第二の治療剤は、任意の適切な形で、任意の適切な経路により、別々に投与することもできる。本発明のBETブロモドメイン阻害剤および第二の治療剤を併用投与しない場合、それらをそれを必要としている対象に任意の順に投与しうることが理解される。例えば、本発明のBETブロモドメイン阻害剤は、それを必要としている個人に、第二の治療剤処置様式（例えば、放射線療法）を適用する前（例えば、5分、15分、30分、45分、1時間、2時間、4時間、6時間、12時間、24時間、48時間、72時間、96時間、1週間、2週間、3週間、4週間、5週間、6週間、8週間、または12週間前）、同時、または後（例えば、5分、15分、30分、45分、1時間、2時間、4時間、6時間、12時間、24時間、48時間、72時間、96時間、1週間、2週間、3週間、4週間、5週間、6週間、8週間、または12週間後）に投与することができる。様々な態様において、構造式（I）のBETブロモドメイン阻害剤および第二の治療剤を、1分間隔、10分間隔、30分間隔、1時間未満の間隔、1時間間隔、1時間〜2時間間隔、2時間〜3時間間隔、3時間〜4時間間隔、4時間〜5時間間隔、5時間〜6時間間隔、6時間〜7時間間隔、7時間〜8時間間隔、8時間〜9時間間隔、9時間〜10時間間隔、10時間〜11時間間隔、11時間〜12時間間隔、24時間以下の間隔または48時間以下の間隔で投与する。1つの態様において、併用療法の成分を1分〜24時間間隔で投与する。
本発明を記載する文脈において（特に特許請求の範囲の文脈において）、「a」、「an」、「the」なる用語、および類似の指示物の使用は、特に記載がないかぎり、単数および複数の両方を対象とすると解釈されるべきである。本明細書における値の範囲の列挙は単に、特に記載がないかぎり、範囲内に入るそれぞれ別々の値に個別に言及することの簡略表記法として提供することが意図され、それぞれ別々の値は本明細書において個別に列挙されたかのごとく、本明細書において組み込まれる。本明細書において提供される任意およびすべての例、または例示的言語（例えば、「などの」）の使用は、特に記載がないかぎり、本発明をより良く例示することが意図され、本発明の範囲に対する限定ではない。本明細書における言語はどれも、任意の特許請求されない因子が本発明の実施において必須であると示していると解釈されるべきではない。
研究により、小分子阻害剤を用いてBETブロモドメインを標的とすることは、実行可能な癌治療戦略であることが確立されている。先行するBETブロモドメイン阻害剤の発見および初期のデータから、BETブロモドメインの非ペプチド、小分子阻害剤は、BETブロモドメインが役割を有する多くの疾患および状態の処置のための大きい治療的可能性を有することが明らかにされている。
本発明は、BETブロモドメインの強力かつ特異的阻害剤の新しいクラスを対象とする。本発明の化合物はBETブロモドメインに結合し、BETブロモドメインの強力なアンタゴニストとして機能する。したがって、本発明のBETブロモドメイン阻害剤は、そのような処置を必要としている対象の、癌および自己免疫疾患を含む、様々な疾患および状態の処置において有用である。同様に提供されるのは、有害な増殖性細胞を有する対象の処置方法であって、本発明の化合物の治療的有効量を、そのような処置を必要としている対象に投与する段階を含む方法である。同様に提供されるのは、対象における、癌などの有害な増殖中の細胞の増殖の防止法であって、構造式（I）の化合物の治療的有効量を、有害な増殖中の細胞によって特徴付けられる状態を発生するリスクが高い対象に投与する段階を含む方法である。いくつかの態様において、構造式（I）の化合物は、有害な細胞においてアポトーシスを誘導することにより、それらの細胞の増殖を低減する。
1つの局面において、本発明は以下の特定の態様に関する。
態様I：構造式（I）：
Figure 0006401773
を有する化合物、またはその薬学的に許容される塩、水和物、もしくは溶媒和物：
式中、
Xは、N(Ra)、O、またはSであり；
Y1およびY3は、独立に、CHまたはNであり；
Y2は、CH、CRaもしくはNであるか、または存在せず；
Zは、H、
Figure 0006401773
、ハロ、もしくはOHであるか、または存在せず；
Aは、無置換または置換5員複素環であり；
Bは、それぞれ無置換または置換されている、アリール、CH(Ra)-アリール、C3-10シクロアルキル、CH(Ra)-C3-10シクロアルキル、ヘテロアリール、CH(Ra)-ヘテロアリール、C3-10ヘテロシクロアルキル、またはCH(Ra)-C3-10ヘテロシクロアルキルであり；
Gは、N、O、またはSであり；
Lは、存在しないか、またはHもしくはC(Rd)3であり；
R1は、H、ハロ、OH、ORa、またはN(Ra)2であり；
Raは独立に、H、C1-3アルキル、またはベンジルであり；
Rbは独立に、C1-6アルキル、ハロ、アリール、無置換もしくは置換CH2-アリール、無置換もしくは置換C3-10シクロアルキル、無置換もしくは置換CH2-C3-10シクロアルキル、ヘテロアリール、無置換もしくは置換CH2-ヘテロアリール、無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、または無置換もしくは置換CH2-C3-10ヘテロシクロアルキル、あるいはCHOであり；
nは、整数0、1、2、または3であり；
RcおよびRdはそれぞれ独立に、水素、C1-6アルキル、無置換もしくは置換アリール、無置換もしくは置換CH2-アリール、無置換もしくは置換C3-10シクロアルキル、無置換もしくは置換CH2-C3-10シクロアルキル、ヘテロアリール、無置換もしくは置換CH2-ヘテロアリール、無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、または無置換もしくは置換CH2-C3-10ヘテロシクロアルキルである。
態様II：環Aが、置換されていてもよいヘテロアリール環である、態様Iの化合物。
態様III：環Aが、置換されていてもよい
Figure 0006401773
である、態様Iの化合物。
態様IV：環Aが、置換されていてもよい
Figure 0006401773
である、態様Iの化合物。
態様V：環Aが
Figure 0006401773
である、態様Iの化合物。
態様VI：R1がHまたは-OCH3である、態様IからVのいずれかの化合物。
態様VII：環系
Figure 0006401773
である、態様IからVIのいずれかの化合物。
態様VIII：Zが
Figure 0006401773
である、態様IからVIIの化合物。
態様IX：B環が、置換または無置換のいずれでも、
Figure 0006401773
からなる群より選択される、態様VIIIの化合物。
態様X：B環が、メチル、フェニル、フルオロ、ピリジニル、クロロ、イソプロピル、シクロプロピル、およびエチルのうちの1〜3つで置換されている、態様IXの化合物。
態様XI：以下に示す構造を有する化合物：
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
。
態様XII：（a）態様Iの化合物、（b）BETブロモドメインタンパク質の阻害が利益を提供する疾患または状態の処置において有用な第二の治療剤、ならびに（c）任意の賦形剤および/または薬学的に許容される担体を含む、組成物。
態様XIII：第二の治療剤が癌の処置において有用な化学療法剤を含む、態様XIIの組成物。
態様XIV：態様Iの化合物および薬学的に許容される担体または媒体を含む、薬学的組成物。
態様XV：BETブロモドメインタンパク質の阻害が利益を提供する疾患または状態の処置方法であって、態様Iの化合物の治療的有効量をそれを必要としている個人に投与する段階を含む方法。
態様XVI：疾患または状態の処置において有用な第二の治療剤の治療的有効量を投与する段階をさらに含む、態様XVの方法。
態様XVII：態様Iの化合物および第二の治療剤を同時に投与する、態様XVIの方法。
態様XVIII：態様Iの化合物および第二の治療剤を別々に投与する、態様XVIの方法。
態様XIX：疾患または状態が癌、慢性自己免疫障害、炎症状態、増殖性障害、敗血症、またはウイルス感染症である、態様XVの方法。
態様XX：疾患が癌であり、第二の治療剤が手術、化学療法剤、および放射線照射のうちの1つまたは複数である、態様XVIの方法。
態様XXI：疾患が癌であり、第二の治療剤が本明細書に開示する薬剤から選択される、態様XVIの方法。
態様XXII：疾患が癌であり、第二の治療剤が本明細書に開示する放射線照射を含む、態様XVIの方法。
態様XXIII：癌が、本明細書に開示する癌から選択される、態様XIXの方法。
態様XXIV：態様Iの化合物および第二の治療剤を単一の組成物から投与する、態様XVIの方法。
態様XXV：態様Iの化合物および第二の治療剤を別々の組成物から投与する、態様XVIの方法。
態様XXVI：態様Iの化合物を第二の治療剤の前に投与する、態様XVIIIの方法。
態様XXVII：態様Iの化合物を第二の治療剤の後に投与する、態様XVIIIの方法。
態様XXVIII：増殖性障害が本明細書に開示する障害から選択される、態様XIXの方法。
態様XXIX：自己免疫障害または炎症障害が本明細書に開示する障害から選択される、態様XIXの方法。
態様XXX：ウイルス感染症が本明細書に開示する感染症から選択される、態様XIXの方法。
態様XXXI：生体試料中のBETブロモドメインタンパク質、またはその変異体の活性を阻害する方法であって、生体試料を態様I〜XIのいずれか1つの化合物または態様XIVの組成物と接触させる段階を含む方法。
態様XXXII：BETブロモドメイン阻害剤が必要とされる疾患または状態の処置用の医薬の製造における、態様I〜XIのいずれか1つの化合物の使用。
態様XXXIII：Y2がCH、CRa、またはNであり、かつZがH、
Figure 0006401773
、ハロ、またはOHである、態様Iの化合物。
態様XXXIV：環Aが無置換または置換5員ヘテロアリール環である、態様Iの化合物。
態様XXXV：Zが
Figure 0006401773
である、態様IからVIIの化合物。
別の局面において、本発明は構造式（I）：
Figure 0006401773
を有するBETブロモドメイン阻害剤、またはその薬学的に許容される塩、水和物、もしくは溶媒和物を対象とする：
式中、
Xは、N(Ra1)、O、またはSであり；
Y1およびY3は、独立に、CHまたはNであり；
Y2は、CR2もしくはNであるか、または存在せず；
Zは、H、
Figure 0006401773
、ハロ、またはOHであり；
Aは、無置換または置換5員複素環であり；
Bは、それぞれ無置換または置換されている、アリール、CH(Ra2)-アリール、C3-10シクロアルキル、CH(Ra2)-C3-10シクロアルキル、ヘテロアリール、CH(Ra2)-ヘテロアリール、C3-10ヘテロシクロアルキル、またはCH(Ra2)-C3-10ヘテロシクロアルキルであり；
Gは、N、O、またはSであり；
Lは、存在しないか、またはHもしくはC(Rd)3であり；
R1は、H、ハロ、OH、ORa3、またはN(Ra3)2であり；
Ra1、Ra2、Ra3、Ra4、およびRa5はそれぞれ独立にH、C1-3アルキル、フェニル、またはベンジルであり；
R2は独立にH、C1-3アルキル、フェニル、(CH2)1-3C4-7ヘテロシクロアルキル、C4-7ヘテロシクロアルキル、CO2H、CO2(C1-3アルキル)、NH2、NH(C1-3アルキル)、N(C1-3アルキル)2、(CH2)1-3NMe2、(CH2)1-3OH、CH(Me)OH、C(Me)2NH2、C(Me)2OH、フェニル、ベンジル、-C(=O)ORa4、-C(=O)N(Ra4)2、
Figure 0006401773
であり；
Rbは独立に、C1-6アルキル、ハロ、アリール、無置換もしくは置換CH2-アリール、無置換もしくは置換C3-10シクロアルキル、無置換もしくは置換CH2-C3-10シクロアルキル、ヘテロアリール、無置換もしくは置換CH2-ヘテロアリール、無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、無置換もしくは置換CH2-C3-10ヘテロシクロアルキル、CF3、CN、ORa5、N(Ra5)2、N(CH3)C(=O)(C1-3アルキル)、NH(CH2)2-3N(C1-3アルキル)2、C3-10ヘテロシクロアルキル、O(CH2)2-3N(C1-3アルキル)2、O(CH2)2-3-C3-10ヘテロシクロアルキル、オキソ(=O)、またはCHOであり；
nは、整数0、1、2、または3であり；
RcおよびRdはそれぞれ独立に、水素、C1-6アルキル、無置換もしくは置換アリール、無置換もしくは置換CH2-アリール、無置換もしくは置換C3-10シクロアルキル、無置換もしくは置換CH2-C3-10シクロアルキル、ヘテロアリール、無置換もしくは置換CH2-ヘテロアリール、無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、または無置換もしくは置換CH2-C3-10ヘテロシクロアルキルである。
構造式（I）の化合物はBETブロモドメインを阻害し、様々な疾患および状態の処置において有用である。特に、構造式（I）の化合物は、BETブロモドメインの阻害が利益を提供する疾患または状態、例えば、癌および増殖性疾患の処置方法において用いる。方法は、構造式(I）の化合物の治療的有効量をそれを必要としている個人に投与する段階を含む。本発明の方法は、第二の治療剤を個人に、構造式（I）の化合物に加えて投与する段階も含む。第二の治療剤は、それを必要としている個人を苦しめている疾患または状態を処置する際に有用であることが公知の薬物、例えば、特定の癌を処置する際に有用であることが公知の化学療法剤および/または放射線照射から選択される。
本明細書において用いられる場合、「アルキル」なる用語は、メチル、エチル、n-プロピル、i-プロピル、n-ブチル、sec-ブチル、t-ブチル、n-ペンチル、2-メチルブチル、3-メチルブチル、2,2-ジメチルプロピル、n-ヘキシル、2-メチルペンチル、3-メチルペンチル、4-メチルペンチル、2,2-ジメチルブチル、2,3-ジメチルブチル、3,3-ジメチルブチル、および2-エチブチルを含むが、それらに限定されるわけではない、直鎖および分枝飽和C1-10炭化水素基を意味する。Cnなる用語は、アルキル基が「n」個の炭素原子を有することを意味する。「アルキレン」なる用語は、置換基を有するアルキル基を意味する。アルキル、例えば、メチル、またはアルキレン、例えば、-CH2-基は、1つまたは複数、典型的には1〜3つの独立に選択される、例えば、ハロ、トリフルオロメチル、トリフルオロメトキシ、ヒドロキシ、アルコキシ、ニトロ、シアノ、アルキルアミノ、またはアミノ基で置換されうる。
本明細書において用いられる場合、「ハロ」なる用語は、フルオロ、クロロ、ブロモ、およびヨードと定義される。
「ヒドロキシ」なる用語は、-OHと定義される。
「アルコキシ」なる用語は、-ORと定義され、式中、Rはアルキルである。
「アミノ」なる用語は、-NH2と定義され、「アルキルアミノ」なる用語は-NR2と定義され、ここで少なくとも1つのRはアルキルであり、第二のRはアルキルまたは水素である。
「カルバモイル」なる用語は、-C(=O)NR2と定義される。
「カルボキシ」なる用語は、-C(=O)OHまたはその塩と定義される。
「ニトロ」なる用語は、-NO2と定義される。
「シアノ」なる用語は、-CNと定義される。
「トリフルオロメチル」なる用語は、-CF3と定義される。
「トリフルオロメトキシ」なる用語は、-OCF3と定義される。
「Ts」なる用語は、トシラート
Figure 0006401773
を意味する。
「Bn」なる用語は、ベンジル
Figure 0006401773
を意味する。
本明細書において用いられる場合、
Figure 0006401773
などの基は
Figure 0006401773
の略記である。
本明細書において用いられる場合、「アリール」なる用語は、単環式または多環式芳香族基、好ましくは単環式または二環式芳香族基を意味する。アリール基の例には、フェニル、ナフチル、フルオレニル、アズレニル、アントリル、フェナントリル、ピレニル、ビフェニル、およびターフェニルが含まれるが、それらに限定されるわけではない。アリールとは、1つの環が芳香族で、他は飽和、部分不飽和、または芳香族、例えば、ジヒドロナフチル、インデニル、インダニル、またはテトラヒドロナフチル（テトラリニル）である、二環式および三環式炭素環も意味する。特に記載がないかぎり、アリール基は、無置換または、例えば、ハロ、アルキル、アルケニル、-OCF3、-NO2、-CN、-NC、-OH、アルコキシ、アミノ、アルキルアミノ、-CO2H、-CO2アルキル、-OCOアルキル、アリール、およびヘテロアリールから独立に選択される、1つもしくは複数、特に1〜4つの基で置換されうる。
本明細書において用いられる場合、「複素環式」なる用語は、ヘテロアリールおよびヘテロシクロアルキル環系を意味する。
本明細書において用いられる場合、「ヘテロアリール」なる用語は、1つまたは2つの芳香環を含み、かつ芳香環内に少なくとも1つの窒素、酸素、または硫黄原子を含む、単環式または二環式環系を意味する。ヘテロアリール基の各環は、各環内のヘテロ原子の総数が4個以下で、かつ各環が少なくとも1つの炭素原子を含むとの条件で、1つもしくは2つのO原子、1つもしくは2つのS原子、および/または1〜4つのN原子を含みうる。一定の態様において、ヘテロアリール基は5〜20、5〜15、または5〜10個の環原子を有する。単環式ヘテロアリール基の例には、フラニル、イミダゾリル、イソチアゾリル、イソキサゾリル、オキサジアゾリル、オキサゾリル、ピラジニル、ピラゾリル、ピリダジニル、ピリジル、ピリミジニル、ピロリル、チアジアゾリル、チアゾリル、チエニル、テトラゾリル、トリアジニル、およびトリアゾリルが含まれるが、それらに限定されるわけではない。二環式ヘテロアリール基の例には、ベンゾフラニル、ベンズイミダゾリル、ベンゾイソキサゾリル、ベンゾピラニル、ベンゾチアジアゾリル、ベンゾチアゾリル、ベンゾチエニル、ベンゾチオフェニル、ベンゾトリアゾリル、ベンズオキサゾリル、フロピリジル、イミダゾピリジニル、イミダゾチアゾリル、インドリジニル、インドリル、インダゾリル、イソベンゾフラニル、イソベンゾチエニル、イソインドリル、イソキノリニル、イソチアゾリル、ナフチリジニル、オキサゾロピリジニル、フタラジニル、プテリジニル、プリニル、ピリドピリジル、ピロロピリジル、キノリニル、キノキサリニル、キナゾリニル、チアジアゾロピリミジル、およびチエノピリジルが含まれるが、それらに限定されるわけではない。特に記載がないかぎり、ヘテロアリール基は無置換または、例えば、ハロ、アルキル、アルケニル、-OCF3、-NO2、-CN、-NC、-OH、アルコキシ、アミノ、アルキルアミノ、-CO2H、-CO2アルキル、-OCOアルキル、アリール、およびヘテロアリールから選択される、1つもしくは複数、特に1〜4つの置換基で置換されうる。
本明細書において用いられる場合、「シクロアルキル」なる用語は、例えば、独立に選択されたハロ、トリフルオロメチル、トリフルオロメトキシ、ヒドロキシ、アルコキシ、ニトロ、シアノ、アルキルアミノ、またはアミノ基のうちの1つまたは複数、典型的には1〜3つで置換されていてもよい、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、およびシクロオクチル基を含む、3〜8個の炭素原子を含む単環式脂肪族環を意味する。
本明細書において用いられる場合、「ヘテロシクロアルキル」なる用語は、4〜12個の総原子を含み、そのうち1〜5個の原子は窒素、酸素、および硫黄から独立に選択され、残りの原子は炭素である、単環式または二環式脂肪族環を意味する。ヘテロシクロアルキル基の非限定例は、環の原子上で独立に選択されたハロ、C1-6アルキル、C1-6アルコキシ、シアノ、アミノ、カルバモイル、ニトロ、カルボキシ、C2-7アルケニル、C2-7アルキニルなどの、1つまたは複数、典型的には1〜3つでそれぞれ置換されていてもよい、アゼチジニル、ピロリジニル、ピペリジニル、ピペラジニル、ジヒドロピロリル、モルホリニル、チオモルホリニル、ジヒドロピリジニル、オキサシクロヘプチル、ジオキサシクロヘプチル、チアシクロヘプチル、ジアザシクロヘプチルである。
「アルケニル」なる用語は、炭素-炭素二重結合を含む以外は、「アルキル」と同様に定義され、例えば、エテニル、プロペニル、およびブテニルである。「アルキニル」なる用語は、炭素-炭素三重結合を含む以外は、「アルキル」と同様に定義される。
本明細書において用いられる場合、「C1-6ヒドロキシアルキル」なる用語は、1、2、3、または4つのヒドロキシ基で置換されている、直鎖および分枝飽和C1-6炭化水素基を意味する。1つの態様において、C1-6ヒドロキシアルキルは1つのヒドロキシ基で置換されている。1つの態様において、C1-6ヒドロキシアルキルは2つのヒドロキシ基で置換されている。C1-6ヒドロキシアルキル基の例には、-C(CH3)2OH、-C(H)(CH3)3CH2OH、-CH2CH2CH2CH2OH、および-CH2CH2CH(OH)CH2OHが含まれるが、それらに限定されるわけではない。
本明細書において用いられる場合、「ヒドロキシC3-10ヘテロシクロアルキル」なる用語は、1または2つのヒドロキシ基で置換されている、上で定義したヘテロシクロアルキル基を意味する。1つの態様において、ヒドロキシC3-10ヘテロシクロアルキルは1つのヒドロキシ基で置換されている。ヒドロキシC3-10ヘテロシクロアルキル基の例には、ピペリジン-4-オールおよびピロリジン-3-オールが含まれるが、それらに限定されるわけではない。
本明細書において用いられる場合、「ヒドロキシシクロアルキル」なる用語は、1または2つのヒドロキシ基で置換されている、上で定義したシクロアルキル基を意味する。1つの態様において、ヒドロキシシクロアルキルは1つのヒドロキシ基で置換されている。
本明細書において用いられる場合、「薬学的に許容されるアニオン」なる用語は、患者、例えば、哺乳動物、例えば、ヒトへの投与のために許容される、本開示の四級ピリジニウムに関連するアニオンを意味する。1つの態様において、薬学的に許容されるアニオンは、薬学的に許容される無機酸、例えば、塩酸、過塩素酸、硫酸、リン酸、臭化水素酸、ヨウ化水素酸、または硝酸などのアニオンである。1つの態様において、薬学的に許容されるアニオンは、薬学的に許容される有機酸、例えば、一価または多価有機酸、例えば、クエン酸、フマル酸、マレイン酸、リンゴ酸、アスコルビン酸、コハク酸、酒石酸、安息香酸、酢酸、フェニル酢酸、メタンスルホン酸、エタンスルホン酸、ベンゼンスルホン酸、またはp-トルエンスルホン酸などのアニオンである。
本発明に従い、環Aは、1〜4個のヘテロ原子、すなわち、独立に窒素、酸素、または硫黄を含む、ヘテロアリールまたはヘテロシクロアルキルいずれかの5員複素環である。様々な態様において、環Aは、アルキル、シクロアルキル、ハロアルキル、およびハロシクロアルキル、例えば、メチル、エチル、イソプロピル、トリフルオロメチル、シクロプロピル、またはシクロブチルからなる群より独立に選択される、1〜3つの基で置換されている。
A環の非限定例には、下記が含まれるが、それらに限定されるわけではない：
Figure 0006401773
式中、RaはH、C1-3アルキル、シクロプロピル、シクロブチル、フェニル、またはベンジルであり、それぞれ1〜3つの置換基で置換されていてもよい。
いくつかの好ましい態様において、A環は、1つまたは複数のメチルおよび/またはエチル基で置換されていてもよい、
Figure 0006401773
である。
いくつかの具体的態様において、A環は、
Figure 0006401773
である。
いくつかの態様において、Xは、-NH、-NC6H5、-NCH3、または-NCH2C6H5である。
いくつかの態様において、Y1およびY3は、NおよびN、CHおよびCH、またはCHおよびNである。
いくつかの態様において、Y2は
Figure 0006401773
である。
いくつかの好ましい態様において、R1は、Hまたは-OCH3である。
様々な態様において、環系
Figure 0006401773
は
Figure 0006401773
であり、式中、Ra4は独立に、H、C1-3アルキル、フェニル、またはベンジルである。
様々な態様において、Zは
Figure 0006401773
である。
B環の非限定例には
Figure 0006401773
Figure 0006401773
が含まれ、式中、Ra5は、H、C1-3アルキル、フェニル、またはベンジルである。
B環の炭素原子上の様々な置換基には、メチル、フェニル、ベンジル、CHO、CF3、OCH3、フルオロ、ピリジニル、クロロ、イソプロピル、シクロプロピル、エチル、C(CH3)OH、NH2、N(CH3)2、N(C2H5)2、NH(CH2)2N(CH3)2、N(CH3)C(=O)CH3、オキソ（=O）、OH、OCH(CH3)2、O(CH2)2N(CH3)2、ピロリル、ピペルジニル（piperdinyl）、ピペリジニル（piperizinyl）、モルホリノ、
Figure 0006401773
のうちの1〜3つが含まれるが、それらに限定されるわけではない。
他の態様において、Zは、N(CH3)2、H、OH、またはクロロである。
加えて、本発明の化合物の塩、水和物、および溶媒和物も本発明に含まれ、本明細書に開示の方法において用いることができる。本発明は、構造式（I）の化合物のすべての可能な立体異性体および幾何異性体をさらに含む。本発明は、ラセミ化合物および光学活性異性体の両方を含む。構造式（I）の化合物が単一の鏡像異性体として望まれる場合、これは最終生成物の分割によるか、または異性体として純粋な出発原料からの立体特異的合成もしくはキラル補助試薬の使用によるか、のいずれかで得ることができ、例えば、Z. Ma et al., Tetrahedron: Asymmetry, 8(6), pages 883-888 (1997)を参照されたい。最終生成物、中間体、または出発原料の分割は、当技術分野において公知の任意の適切な方法によって達成することができる。加えて、構造式（I）の化合物の互変異性体が可能な状況では、本発明は化合物のすべての互変異性型を含むことが意図される。
本発明の化合物は塩として存在することができる。本発明の化合物の薬学的に許容される塩が、本発明の方法において好まれることが多い。本明細書において用いられる場合、「薬学的に許容される塩」なる用語は、構造式（I）の化合物の塩または双性イオン型を意味する。式（I）の化合物の塩は、化合物の最終単離および精製中に、または化合物を適切なカチオンを有する酸と反応させることにより別に調製することができる。構造式（I）の化合物の薬学的に許容される塩は、薬学的に許容される酸と形成される酸付加塩でありうる。薬学的に許容される塩を形成するために用いうる酸の例には、硝酸、ホウ酸、塩酸、臭化水素酸、硫酸、およびリン酸などの無機酸、ならびにシュウ酸、マレイン酸、コハク酸、およびクエン酸などの有機酸が含まれる。本発明の化合物の塩の非限定例には、塩酸塩、臭化水素酸塩、ヨウ化水素酸塩、硫酸塩、硫酸水素塩、2-ヒドロキシエタンスルホン酸塩、リン酸塩、リン酸水素塩、酢酸塩、アジピン酸塩、アルギン酸塩、アスパラギン酸塩、安息香酸塩、流酸水素塩、酪酸塩、樟脳酸塩、樟脳スルホン酸塩、ジグルコン酸塩、グリセロリン酸塩（glycerolphsphate）、ヘミ硫酸塩、ヘプタン酸塩、ヘキサン酸塩、ギ酸塩、コハク酸塩、フマル酸塩、マレイン酸塩、アスコルビン酸塩、イセチオン酸塩、サリチル酸塩、メタンスルホン酸塩、メシチレンスルホン酸塩、ナフチレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、2-ナフタレンスルホン酸塩、シュウ酸塩、パモ酸塩、ペクチン酸塩、過硫酸塩、3-フェニルプロプリオン酸塩（3-phenylproprionate）、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、トリクロロ酢酸塩、トリフルオロ酢酸塩、リン酸塩、グルタミン酸塩、炭酸水素塩、パラトルエンスルホン酸塩、ウンデカン酸塩、乳酸塩、クエン酸塩、酒石酸塩、グルコン酸塩、メタンスルホン酸塩、エタンスルホン酸塩、ベンゼンスルホン酸、およびp-トルエンスルホン酸塩が含まれるが、それらに限定されるわけではない。加えて、本発明の化合物中に存在する利用可能なアミノ基は、塩化、臭化、およびヨウ化メチル、エチル、プロピル、およびブチル；硫酸ジメチル、ジエチル、ジブチル、およびジアミル；塩化、臭化、およびヨウ化デシル、ラウリル、ミリスチル、およびステリル；ならびに臭化ベンジルおよびフェネチルで四級化することができる。前記を考慮して、本明細書に出現する本発明の化合物に対する任意の言及は、構造式（I）の化合物ならびにその薬学的に許容される塩、水和物、または溶媒和物を含むことが意図される。
本発明の具体的化合物には、
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
に示す構造を有する化合物が含まれるが、それらに限定されるわけではない。
本発明のさらなる化合物には、
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
に示す構造を有する化合物が含まれるが、それらに限定されるわけではない。
本発明のさらなる化合物には、
Figure 0006401773
に示す構造を有する化合物が含まれるが、それらに限定されるわけではない。
1つの態様において、本発明は、式（II）：
Figure 0006401773
を有する化合物、またはその薬学的に許容される塩、水和物、もしくは溶媒和物を提供する：
式中、
R2は、H、C1-3アルキル、フェニル、(CH2)1-3C4-7ヘテロシクロアルキル、C4-7ヘテロシクロアルキル、CO2H、CO2(C1-3アルキル)、NH2、NH(C1-3アルキル)、N(C1-3アルキル)2、(CH2)1-3NMe2、(CH2)1-3OH、CH(Me)OH、C(Me)2NH2、C(Me)2OH、フェニル、ベンジル、-C(=O)ORa4、-C(=O)N(Ra4)2、
Figure 0006401773
であり；
Bは、それぞれ無置換または置換されている、アリール、CH(Ra2)-アリール、C3-10シクロアルキル、CH(Ra2)-C3-10シクロアルキル、ヘテロアリール、CH(Ra2)-ヘテロアリール、C3-10ヘテロシクロアルキル、またはCH(Ra2)-C3-10ヘテロシクロアルキルであり；かつ
Rbは、C1-6アルキル、ハロ、アリール、無置換もしくは置換CH2-アリール、無置換もしくは置換C3-10シクロアルキル、無置換もしくは置換CH2-C3-10シクロアルキル、ヘテロアリール、無置換もしくは置換CH2-ヘテロアリール、無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、無置換もしくは置換CH2-C3-10ヘテロシクロアルキル、CF3、CN、ORa5、N(Ra5)2、N(CH3)C(=O)(C1-3アルキル)、NH(CH2)2-3N(C1-3アルキル)2、C3-10ヘテロシクロアルキル、O(CH2)2-3N(C1-3アルキル)2、O(CH2)2-3-C3-10ヘテロシクロアルキル、オキソ（=O）、またはCHOであり；かつ
nは、0、1、2、または3である。
別の態様において、本発明は、Bがヘテロアリールであり、かつnが0である、式（II）を有する化合物、またはその薬学的に許容される塩、水和物、もしくは溶媒和物を提供する。別の態様において、Bは
Figure 0006401773
である。
別の態様において、本発明は、Bがヘテロアリールであり、かつnが1である、式（II）を有する化合物、またはその薬学的に許容される塩、水和物、もしくは溶媒和物を提供する。別の態様において、Bは
Figure 0006401773
である。
別の態様において、本発明は、
Figure 0006401773
からなる群より選択される化合物、またはその薬学的に許容される塩、水和物、もしくは溶媒和物を提供する。
本発明は、BETブロモドメインの阻害が有益な効果を有する、様々な疾患および状態の処置のための、構造式（I）の化合物によって例示されるBETブロモドメイン阻害剤を提供する。1つの態様において、本発明は、BETブロモドメインの阻害が利益を提供する疾患または状態を患っている個人の処置方法であって、構造式（I）の化合物の治療的有効量をそれを必要としている個人に投与する段階を含む方法に関する。
本発明の方法は、構造式（I）の化合物をニート化合物として、または薬学的組成物として投与することにより達成することができる。構造式（I）の薬学的組成物、またはニート化合物の投与は、関心対象の疾患または状態の発現中または発現後に実施することができる。典型的には、薬学的組成物は無菌であり、投与した場合に有害反応を引き起こす、毒性、発癌性、または変異原性化合物を含まない。さらに提供されるのは、構造式（I）の化合物、ならびに、任意に、別々または一緒に包装された、BETブロモドメインの阻害が利益を提供する疾患および状態の処置において有用な第二の治療剤、およびこれらの活性薬剤を使用するための指示を有する添付文書を含む、キットである。
多くの態様において、構造式（I）の化合物を、BETブロモドメインの阻害が利益を提供する疾患または状態の処置において有用な第二の治療剤と一緒に投与する。第二の治療剤は構造式（I）の化合物とは異なる。構造式（I）の化合物および第二の治療剤は、所望の効果を得るために、同時または逐次投与することができる。加えて、構造式（I）の化合物および第二の治療剤は、単一の組成物または2つの別々の組成物から投与することもできる。
第二の治療剤は、その所望の治療効果を提供するための量で投与される。第二の治療剤それぞれの有効用量範囲は当技術分野において公知であり、第二の治療剤は、それを必要としている個人に、そのような確立された範囲内で投与される。
構造式（I）の化合物および第二の治療剤は、単一の単位用量として一緒に、または複数の単位用量として別々に投与されることができ、ここで構造式（I）の化合物を第二の治療剤の前に投与するか、または逆も同じである。構造式（I）の化合物の1つもしくは複数の用量および/または第二の治療剤の1つもしくは複数の用量を投与することができる。したがって、構造式（I）の化合物を、1つまたは複数の第二の治療剤、例えばであるが、それらに限定されるわけではない、抗癌剤と一緒に用いることができる。
本発明の方法によって処置可能な疾患および状態には、癌および他の増殖性障害、炎症疾患、敗血症、自己免疫疾患、およびウイルス感染症が含まれるが、それらに限定されるわけではない。1つの態様において、ヒト患者を構造式（I）の化合物および任意の薬学的に許容される担体、補助剤、または賦形剤で処置し、ここで化合物は患者においてBETブロモドメイン活性を阻害するのに十分な量で投与する。
1つの態様において、本発明の化合物および方法により処置すべき疾患は癌である。処置可能な癌の例には、副腎癌、腺房細胞癌、聴神経腫瘍、末端黒子型黒色腫、先端汗腺腫、急性好酸球性白血病、急性赤白血病、急性リンパ性白血病、急性巨核芽球性白血病、急性単球性白血病、急性前骨髄球性白血病、腺癌、腺様嚢胞癌、腺腫、腺腫様歯原性腫瘍、腺扁平上皮癌、脂肪組織腫瘍、副腎皮質癌、成人T細胞白血病/リンパ腫、侵攻性NK細胞性白血病、エイズ関連リンパ腫、胞巣状横紋筋肉腫、胞状軟部肉腫、エナメル芽細胞線維腫、未分化大細胞型リンパ腫、甲状腺未分化癌、血管免疫芽球性T細胞性リンパ腫、血管筋脂肪腫、血管肉腫、星細胞腫、非定型奇形腫様横紋筋肉腫様腫瘍、B細胞性慢性リンパ性白血病、B細胞性前リンパ球性白血病、B細胞リンパ腫、基底細胞癌、胆道癌、膀胱癌、芽細胞腫、骨癌、ブレンナー腫瘍、褐色腫、バーキットリンパ腫、乳癌、脳癌、癌腫、上皮内癌、癌肉腫、軟骨腫瘍、セメント質腫、骨髄性肉腫、軟骨腫、脊索腫、絨毛癌、脈絡叢乳頭腫、腎臓の明細胞肉腫、頭蓋咽頭腫、皮膚T細胞リンパ腫、子宮頚癌、直腸結腸癌、デゴス病、線維形成性小円形細胞腫瘍、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、胚芽異形成性神経上皮腫瘍、未分化胚細胞腫、胚性癌腫、内分泌腺腫瘍、卵黄嚢腫瘍、腸症関連T細胞リンパ腫、食道癌、封入奇形胎児、線維腫、線維肉腫、濾胞性リンパ腫、濾胞性甲状腺癌、神経節腫、胃腸癌、胚細胞腫瘍、妊娠性絨毛癌、巨細胞線維芽腫、骨の巨細胞腫、グリア系腫瘍、多形神経膠芽腫、神経膠腫、大脳神経膠腫症、グルカゴン産生腫瘍、性腺芽腫、顆粒膜細胞腫、半陰陽性卵巣腫瘍、胆嚢癌、胃癌、有毛細胞白血病、血管芽腫、頭頚部癌、血管周囲細胞腫、造血器腫瘍、肝芽腫、肝脾T細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、浸潤性小葉癌、腸癌、腎癌、喉頭癌、悪性黒子、致死性正中線癌、白血病、ライディッヒ細胞腫、脂肪肉腫、肺癌、リンパ管腫、リンパ管肉腫、リンパ上皮腫、リンパ腫、急性リンパ性白血病、急性骨髄性白血病、慢性リンパ性白血病、肝癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、MALTリンパ腫、悪性線維性組織球腫、悪性末梢神経鞘腫、悪性トリトン腫瘍、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯B細胞リンパ腫、マスト細胞白血病、縦隔胚細胞性腫瘍、乳房髄様癌、甲状腺髄様癌、髄芽腫、黒色腫、髄膜腫、メルケル細胞癌、中皮腫、転移性尿路上皮癌、ミュラー管混合腫瘍、粘液性腫瘍、多発性骨髄腫、筋組織腫瘍、菌状息肉腫、粘液性脂肪肉腫、粘液腫、粘液肉腫、上咽頭癌、神経鞘腫、神経芽細胞腫、神経線維腫、神経腫、結節性黒色腫、眼球癌、乏突起星細胞腫、乏突起膠腫、好酸性腺腫、視神経鞘髄膜腫、視神経腫瘍、口腔癌、骨肉腫、卵巣癌、パンコースト腫瘍、乳頭様甲状腺癌、傍神経節腫、松果体芽細胞腫、松果体細胞腫、下垂体細胞腫、下垂体腺腫、下垂体腫瘍、形質細胞腫、多胎芽腫、前駆Tリンパ芽球性リンパ腫、原発性中枢神経系リンパ腫、原発性体腔性リンパ腫、原発性腹膜癌、前立腺癌、膵癌、咽頭癌、腹膜偽粘液腫、腎細胞癌、腎髄様癌、網膜芽細胞腫、横紋筋腫、横紋筋肉腫、リヒタートランスフォーメーション、直腸癌、肉腫、神経鞘腫症、精上皮腫、セルトリ細胞腫、性索性腺間質腫瘍、印環細胞癌、皮膚癌、小円形青色細胞腫瘍、小細胞癌、軟部肉腫、ソマトスタチン産生腫瘍、煤煙性いぼ、脊椎腫瘍、脾臓辺縁帯リンパ腫、扁平上皮細胞癌、滑膜肉腫、セザリー症、小腸癌、扁平上皮癌、胃癌、T細胞リンパ腫、精巣癌、莢膜細胞腫、甲状腺癌、移行上皮癌、咽頭癌、尿膜管癌、泌尿生殖器癌、尿路上皮癌、ぶどう膜黒色腫、子宮癌、疣状癌、視覚路神経膠腫、外陰癌、腟癌、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、ワルチン腫瘍、およびウィルムス腫瘍が含まれるが、それらに限定されるわけではない。
別の態様において、本発明は、良性軟部組織腫瘍、骨腫瘍、脳および脊椎腫瘍、眼瞼および眼窩腫瘍、肉芽腫、脂肪腫、髄膜腫、多発性内分泌腫瘍症、鼻茸、下垂体腫瘍、プロラクチン産生腺腫、偽脳腫瘍、脂漏性角化症、胃ポリープ、甲状腺結節、膵臓の嚢胞性腫瘍、血管腫、声帯結節、ポリープ、および嚢胞、キャッスルマン病、慢性毛巣病、皮膚線維腫、皮脂嚢胞、化膿性肉芽腫、ならびに若年性ポリープ症候群などであるが、それらに限定されるわけではない、良性増殖性障害の処置方法を提供する。
本発明の化合物および方法は、本発明の化合物の有効量を哺乳動物、特にそのような処置を必要としているヒトに投与することにより、感染性および非感染性炎症事象ならびに自己免疫および他の炎症疾患も処置する。本明細書に記載の化合物および方法を用いて処置する、自己免疫および炎症疾患、障害、および症候群の例には、骨盤内炎症性疾患、尿道炎、皮膚の日焼け、副鼻腔炎、間質性肺炎、脳炎、髄膜炎、心筋炎、腎炎、骨髄炎、筋炎、肝炎、胃炎、腸炎、皮膚炎、歯肉炎、虫垂炎、膵炎、胆嚢炎、無ガンマグロブリン血症、乾癬、アレルギー、クローン病、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、シェーグレン病、組織移植片拒絶、移植臓器の超急性拒絶、喘息、アレルギー性鼻炎、慢性閉塞性肺疾患（COPD）、多腺性自己免疫疾患（多腺性自己免疫症候群としても公知）、自己免疫性脱毛症、悪性貧血、糸球体腎炎、皮膚筋炎、多発性硬化症、強皮症、血管炎、自己免疫性溶血状態および血小板減少状態、グッドパスチャー症候群、アテローム性動脈硬化症、アジソン病、パーキンソン病、アルツハイマー病、I型糖尿病、敗血症性ショック、全身性エリテマトーデス（SLE）、関節リウマチ、乾癬性関節炎、若年性関節炎、骨関節炎、慢性特発性血小板減少性紫斑病、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、重症筋無力症、橋本病、アトピー性皮膚炎、変性関節疾患、白斑、自己免疫性下垂体機能低下症、ギラン・バレー症候群、ベーチェット病、強皮症、菌状息肉腫、急性炎症反応（例えば、急性呼吸促迫症候群および虚血/再灌流傷害）、およびグレーブス病が含まれる。
他の態様において、本発明は、本発明の化合物の有効量を哺乳動物、特にそのような処置を必要としているヒトに投与することによる、LPS誘導性内毒素ショックおよび/または細菌誘導性敗血症などの、全身性炎症反応症候群の処置方法を提供する。
本発明は、ウイルス感染症および疾患の処置方法をさらに提供する。本明細書に記載の化合物および方法を用いて処置する、ウイルス感染症および疾患の例には、ヒトパピローマウイルス、ヘルペスウイルス、エプスタイン・バーウイルス、ヒト免疫不全ウイルス、B型肝炎ウイルス、およびC型肝炎ウイルスを含むが、それらに限定されるわけではない、エピソーム性DNAウイルスが含まれる。
別の態様において、1つまたは複数の構造式（I）のBET阻害剤の治療的有効量をそのような治療を必要としている対象に投与することによる、前述の疾患、特に癌、炎症疾患、および/またはウイルス疾患においてインビボでタンパク質メチル化、遺伝子発現、細胞増殖、細胞分化および/またはアポトーシスを調節する治療方法が提供される。
本発明は、細胞を提供する化合物と接触させることによる、内因性または外因性プロモーター活性を調節する方法をさらに提供する。
本発明の方法において、典型的には薬学的実務に従って製剤した、1つまたは複数の化合物（I）の治療的有効量を、それを必要としているヒトに投与する。そのような処置が指示されるかどうかは、個々の症例に依存し、既存の徴候、症状、および/または機能不全、特定の徴候、症状、および/または機能不全を発生するリスク、ならびに他の因子を考慮に入れての医学的評価（診断）を必要とする。
構造式（I）の化合物は、任意の適切な経路によって、例えば、経口、口腔、吸入、舌下、直腸、膣、腰椎穿刺による大槽内もしくはくも膜下腔内、経尿道、鼻、経皮（percutaneous）、すなわち経皮（transdermal）、または非経口（静脈内、筋肉内、皮下、冠内、皮内、乳房内、腹腔内、関節内、くも膜下腔内、眼球後、肺内注射および/または特定の部位での外科的埋め込みを含む）投与によって投与することができる。非経口投与は、針およびシリンジを用いて、または高圧技術を用いて達成することができる。
薬学的組成物には、構造式（I）の化合物をその所期の目的を達成するための有効量で投与するものが含まれる。厳密な製剤、投与経路、および用量は、個々の医師により、診断された状態または疾患を考慮して決定される。投薬量および間隔は、治療効果を維持するのに十分な構造式（I）の化合物のレベルを提供するように個別に調節することができる。
構造式（I）の化合物の毒性および治療的有効性は、例えば、動物において毒性を引き起こさない最高用量と定義される、化合物の最大耐容量（MTD）を決定するための、細胞培養または実験動物における標準の薬学的手順によって決定することができる。最大耐容量と治療効果（例えば、腫瘍成長の阻害）との間の用量比が治療指数である。用量は、用いる剤形、および利用する投与経路に依存して、この範囲内で変動しうる。治療的有効量の決定は、特に本明細書において提供する詳細な開示を考慮すれば、十分に当業者の能力の範囲内である。
治療において用いるのに必要な、構造式（I）の化合物の治療的有効量は、処置中の状態の性質、その活性が望まれる期間、ならびに患者の年齢および状態によって変動し、最終的には主治医が決定する。投薬量および間隔は、所望の治療効果を維持するのに十分なBETブロモドメイン阻害剤の血漿レベルを提供するように個別に調節することができる。所望の用量を、単一用量で、または適切な間隔で投与する複数の用量、例えば、1日に1、2、3、4またはそれより多くの部分用量で投与することができる。複数用量が望まれる、または必要とされることが多い。例えば、本発明のBETブロモドメイン阻害剤を以下の頻度で投与することができる：4日間隔で1日に1用量送達して4用量（q4d×4）；3日間隔で1日に1用量送達して4用量（q3d×4）；5日間隔で1日に1用量送達（qd×5）；1週間に1用量を3週間（qwk3）；1日1用量を5日間、2日間休薬、さらに1日1用量を5日間（5/2/5）；または状況に対して適切であると決定された任意の投与計画。
本発明の方法において用いる構造式（I）の化合物を、1用量あたり約0.005〜約500mg、1用量あたり約0.05〜約250mg、または1用量あたり約0.5〜約100mgの量で投与することができる。例えば、構造式（I）の化合物を、1用量あたり、0.005〜500mgの間のすべての用量を含む、約0.005、0.05、0.5、5、10、20、30、40、50、100、150、200、250、300、350、400、450、または500mgの量で投与することができる。
構造式（I）のBETブロモドメイン阻害剤を含む組成物、またはこれを含む組成物の用量は、約1ng/kg〜約200mg/kg、約1μg/kg〜約100mg/kg、または約1mg/kg〜約50mg/kgでありうる。組成物の用量は、約1μg/kgを含むが、それに限定されるわけではない、任意の用量でありうる。組成物の用量は、約1μg/kg、10μg/kg、25μg/kg、50μg/kg、75μg/kg、100μg/kg、125μg/kg、150μg/kg、175μg/kg、200μg/kg、225μg/kg、250μg/kg、275μg/kg、300μg/kg、325μg/kg、350μg/kg、375μg/kg、400μg/kg、425μg/kg、450μg/kg、475μg/kg、500μg/kg、525μg/kg、550μg/kg、575μg/kg、600μg/kg、625μg/kg、650μg/kg、675μg/kg、700μg/kg、725μg/kg、750μg/kg、775μg/kg、800μg/kg、825μg/kg、850μg/kg、875μg/kg、900μg/kg、925μg/kg、950μg/kg、975μg/kg、1mg/kg、5mg/kg、10mg/kg、15mg/kg、20mg/kg、25mg/kg、30mg/kg、35mg/kg、40mg/kg、45mg/kg、50mg/kg、60mg/kg、70mg/kg、80mg/kg、90mg/kg、100mg/kg、125mg/kg、150mg/kg、175mg/kg、または200mg/kgを含むが、それらに限定されるわけではない、任意の用量であってもよい。前記用量は平均的症例の例示であるが、それよりも高用量または低用量が価値がある個別の場合もありえ、そのような場合は本発明の範囲内である。実際問題として、医師は、個別の患者にとって最も適切な実際の投与計画を決定し、これは特定の患者の年齢、体重、および反応によって変動しうる。
前述のとおり、構造式（I）のBETブロモドメイン阻害剤は、第二の治療的活性薬剤との組み合わせで投与することができる。いくつかの態様において、第二の治療剤は、エピジェネティック薬物である。本明細書において用いられる場合、「エピジェネティック薬物」なる用語は、エピゲノム制御因子を標的とする治療剤を意味する。エピゲノム制御因子の例には、ヒストンリジンメチルトランスフェラーゼ、ヒストンアルギニンメチルトランスフェラーゼ、ヒストンデメチラーゼ、ヒストンデアセチラーゼ、ヒストンアセチラーゼ、およびDNAメチルトランスフェラーゼが含まれる。ヒストンデアセチラーゼ阻害剤には、ボリノスタットが含まれるが、それに限定されるわけではない。
別の態様において、化学療法剤または他の抗増殖剤を本発明のBETブロモドメイン阻害剤と組み合わせて、増殖性障害および癌を処置することができる。構造式（I）の化合物との組み合わせで用いうる治療方法および抗癌剤の例には、手術、放射線療法（例えば、ガンマ線照射、中性子ビーム放射線療法、電子ビーム放射線療法、プロトン療法、近接照射療法、および全身放射性同位体）、内分泌療法、生体反応変更因子（例えば、インターフェロン、インターロイキン、腫瘍壊死因子（TNF）、温熱療法および寒冷療法、任意の有害作用を減弱する薬剤（例えば、制吐薬）、ならびに任意の他の承認された化学療法薬が含まれる。
抗増殖化合物の例には、アロマターゼ阻害剤；抗エストロゲン薬；抗アンドロゲン薬；ゴナドレリンアゴニスト；トポイソメラーゼI阻害剤；トポイソメラーゼII阻害剤；微小管作用剤；アルキル化剤；レチノイド、カロテノイド、またはトコフェロール；シクロオキシゲナーゼ阻害剤；MMP阻害剤；mTOR阻害剤；代謝拮抗薬；白金化合物；メチオニンアミノペプチダーゼ阻害剤；ビスホスホネート；抗増殖性抗体；ヘパラナーゼ阻害剤；Ras発癌性アイソフォームの阻害剤；テロメラーゼ阻害剤；プロテアソーム阻害剤；血液系腫瘍の処置において用いられる化合物；Flt-3阻害剤；Hsp90阻害剤；キネシンスピンドルタンパク質阻害剤；MEK阻害剤；抗腫瘍抗生物質；ニトロソ尿素；タンパク質もしくは脂質キナーゼ活性を標的化/低減する化合物、タンパク質もしくは脂質ホスファターゼ活性を標的化/低減する化合物、または任意のさらなる抗血管新生化合物が含まれるが、それらに限定されるわけではない。
非限定的な例示的アロマターゼ阻害剤には、アタメスタン、エキセメスタン、およびホルメスタンなどのステロイド、ならびにアミノグルテチミド、ログレチミド、ピリドグルテチミド、トリロスタン、テストラクトン、ケトコナゾール、ボロゾール、ファドロゾール、アナストロゾール、およびレトロゾールなどの非ステロイドが含まれるが、それらに限定されるわけではない。
抗エストロゲン薬には、非限定的に、タモキシフェン、フルベストラント、ラロキシフェン、およびラロキシフェン塩酸塩が含まれるが、それらに限定されるわけではない。抗アンドロゲン薬には、ビカルタミドが含まれるが、それらに限定されるわけではない。ゴナドレリンアゴニストには、アバレリックス、ゴセレリン、およびゴセレリン酢酸塩が含まれるが、それらに限定されるわけではない。
例示的トポイソメラーゼI阻害剤には、トポテカン、ジャイマテカン、イリノテカン、カンプトテシンおよびその類縁体、9-ニトロカンプトテシン、ならびに高分子カンプトテシン結合体PNU-166148が含まれるが、それらに限定されるわけではない。トポイソメラーゼII阻害剤には、ドキソルビシン、ダウノルビシン、エピルビシン、イダルビシン、およびネモルビシンなどのアントラサイクリン；ミトキサントロンおよびロソキサントロンなどのアントラキノン；ならびにエトポシドおよびテニポシドなどのポドフィロトキシンが含まれるが、それらに限定されるわけではない。
微小管作用剤には、パクリタキセルおよびドセタキセルなどのタキサン；ビンブラスチン、ビンブラスチン硫酸塩、ビンクリスチン、およびビンクリスチン硫酸塩、ならびにビノレルビンなどのビンカアルカロイド；ディスコデルモリド；コルヒチン（cochicine）およびエポチロンならびにその誘導体を含むが、それらに限定されるわけではない、微小管安定化化合物、微小管不安定化化合物、および微小管重合阻害剤が含まれる。
例示的で非限定的なアルキル化剤には、シクロホスファミド、イホスファミド、メルファラン、ならびにカルムスチンおよびロムスチンなどのニトロソ尿素が含まれる。
例示的で非限定的なシクロオキシゲナーゼ阻害剤には、セレコキシブ、ロフェコキシブ、エトリコキシブ、バルデコキシブなどのCox-2阻害剤、5-アルキル置換2-アリールアミノフェニル酢酸および誘導体、またはルミラコキシブなどの5-アルキル-2-アリールアミノフェニル酢酸が含まれる。
例示的で非限定的なマトリックスメタロプロテイナーゼ阻害剤（「MMP」阻害剤）には、コラーゲンペプチド様および非ペプチド様阻害剤、テトラサイクリン誘導体、バチマスタット、マリマスタット、プリノマスタット、メタスタット、BMS-279251、BAY 12-9566、TAA211、MMI270B、およびAAJ996が含まれる。
例示的で非限定的なmTOR阻害剤には、シロリムス、エベロリムス、CCI-779、およびABT578などの、哺乳類ラパマイシン標的タンパク質（mTOR）を阻害し、抗増殖活性を有する化合物が含まれる。
例示的で非限定的な代謝拮抗薬には、5-フルオロウラシル（5-FU）、カペシタビン、ゲムシタビン、5-アザシチジンおよびデシタビンなどのDNA脱メチル化化合物、メトトレキサートおよびエダトレキサート、ならびにペメトレキセドなどの葉酸拮抗薬が含まれる。
例示的で非限定的な白金化合物には、カルボプラチン、シスプラチン、シスプラチナム、およびオキサリプラチンが含まれる。
例示的で非限定的なメチオニンアミノペプチダーゼ阻害剤には、ベンガミドまたはその誘導体およびPPI-2458が含まれる。
例示的で非限定的なビスホスホネートには、エチドロン酸、クロドロン酸、チルドロン酸、パミドロン酸、アレンドロン酸、イバンドロン酸、リセドロン酸、およびゾレドロン酸が含まれる。
例示的で非限定的な抗増殖性抗体には、トラスツズマブ、トラスツズマブ-DMl、セツキシマブ、ベバシズマブ、リツキシマブ、PR064553、および2C4が含まれる。「抗体」なる用語は、無傷のモノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、少なくとも2つの無傷の抗体から形成された多重特異性抗体、および、それらが望まれる生物活性を示すかぎり、抗体断片を含むことになる。
例示的で非限定的なヘパラナーゼ阻害剤には、PI-88およびOGT2115などの、ヘパリン硫酸分解を標的化、低減、または阻害する化合物が含まれる。
本明細書において用いられる、H-Ras、K-RasまたはN-Rasなどの「Ras発癌性アイソフォームの阻害剤」なる用語は、Rasの発癌活性を標的化、低減または阻害する化合物、例えば、L-744832、DK8G557、チピファルニブ、およびロナファルニブなどの、ファルネシルトランスフェラーゼ阻害剤を意味する。
例示的で非限定的なテロメラーゼ阻害剤には、テロメスタチンなどのテロメラーゼ受容体を阻害する化合物などの、テロメラーゼの活性を標的化、低減または阻害する化合物が含まれる。
例示的で非限定的なプロテアソーム阻害剤には、ボルテゾミドを含むが、それに限定されるわけではない、プロテアソームの活性を標的化、低減または阻害する化合物が含まれる。
本明細書において用いられる「血液系腫瘍の処置において用いられる化合物」なる語句は、FMS様チロシンキナーゼ受容体（Flt-3R）の活性を標的化、低減または阻害する化合物である、FMS様チロシンキナーゼ阻害剤；インターフェロン、1-β-D-アラビノフラノシルシトシン（ara-c）、およびブスルファン；ならびに未分化リンパ腫キナーゼを標的化、低減または阻害する化合物である、ALK阻害剤を含む。
例示的で非限定的なFlt-3R阻害剤には、PKC412、ミドスタウリン、スタウロスポリン誘導体、SU11248、およびMLN518が含まれる。
例示的で非限定的なHSP90阻害剤には、HSP90の内因性ATPアーゼ活性を標的化、低減もしくは阻害する化合物；またはHSP90クライアントタンパク質をユビキチンプロテオソーム経路を介して分解、標的化、低減もしくは阻害する化合物が含まれる。HSP90の内因性ATPアーゼ活性を標的化、低減または阻害する化合物は、特に、HSP90のATPアーゼ活性を阻害する化合物、タンパク質、または抗体、例えば、ゲルダナマイシン誘導体である17-アリルアミノ,17-デメトキシゲルダナマイシン（17AAG）；他のゲルダナマイシン関連化合物；ラディシコールおよびHDAC阻害剤である。
本明細書において用いられる「タンパク質もしくは脂質キナーゼ活性を標的化/低減する化合物、タンパク質もしくは脂質ホスファターゼ活性を標的化/低減する化合物、または任意のさらなる抗血管新生化合物」なる用語は、下記などのタンパク質チロシンキナーゼならびに/またはセリンおよび/もしくはスレオニンキナーゼ阻害剤あるいは脂質キナーゼ阻害剤を含む：a）血小板由来成長因子受容体（PDGFR）の活性を標的化、低減または阻害する化合物、例えば、N-フェニル-2-ピリミジン-アミン誘導体、例えば、イマチニブ、SU101、SU6668、およびGFB-111などの、PDGFRの活性を標的化、低減または阻害する化合物；b）線維芽細胞成長因子受容体（FGFR）の活性を標的化、低減または阻害する化合物；c）インスリン様成長因子受容体I（IGF-IR）の活性を標的化、低減または阻害する化合物、例えば、IGF-IRの活性を標的化、低減または阻害する化合物；d）Trk受容体チロシンキナーゼファミリーの活性を標的化、低減または阻害する化合物、またはエフリンB4阻害剤；e）Axl受容体チロシンキナーゼファミリーの活性を標的化、低減または阻害する化合物；f）Ret受容体チロシンキナーゼの活性を標的化、低減または阻害する化合物；g）Kit/SCFR受容体チロシンキナーゼの活性を標的化、低減または阻害する化合物、例えば、イマチニブ；h）c-Kit受容体チロシンキナーゼの活性を標的化、低減または阻害する化合物、例えば、イマチニブ；i）c-Ablファミリーのメンバー、それらの遺伝子融合産物（例えば、Bcr-Ablキナーゼ）および変異体の活性を標的化、低減または阻害する化合物、例えば、N-フェニル-2-ピリミジン-アミン誘導体、例えば、イマチニブまたはニロチニブ；PD180970；AG957；NSC680410；PD173955；またはダサチニブ；j）セリン/スレオニンキナーゼのプロテインキナーゼC（PKC）およびRafファミリーのメンバー、MEK、SRC、JAK、FAK、PDK1、PKB/Akt、およびRas/MAPKファミリーのメンバー、ならびに/またはサイクリン依存性キナーゼファミリー（CDK）のメンバーの活性を標的化、低減または阻害する化合物、例えば、参照により本明細書に組み入れられる、米国特許第5,093,330号に開示されているスタウロスポリン誘導体、例えば、ミドスタウリン；さらなる化合物の例には、UCN-01、サフィンゴール、BAY43-9006、ブリオスタチン1、ペリホシン；イルモホシン；RO318220およびRO320432；GO6976；Isis3521；LY333531/LY379196；イソキノリン（isochinoline）化合物；ファルネシルトランスフェラーゼ阻害剤；PD184352もしくはQAN697、またはAT7519が含まれる；k）タンパク質チロシンキナーゼの活性を標的化、低減または阻害する化合物、例えば、メシル酸イマチニブまたはチルホスチン、例えば、チルホスチンA23/RG-50810；AG99；チルホスチンAG213；チルホスチンAG1748；チルホスチンAG490；チルホスチンB44；チルホスチンB44(+)鏡像異性体；チルホスチンAG555；AG494；チルホスチンAG556、AG957およびアダホスチン（4-{[(2,5-ジヒドロキシフェニル)メチル]アミノ}-安息香酸アダマンチルエステル；NSC680410、アダホスチン）；l）受容体チロシンキナーゼの上皮成長因子ファミリー（ホモまたはヘテロ二量体としてのEGFR、ErbB2、ErbB3、ErbB4）およびそれらの変異体の活性を標的化、低減または阻害する化合物、例えば、CP358774、ZD1839、ZM105180；トラスツズマブ、セツキシマブ、ゲフィチニブ、エルロチニブ、OSI-774、CI-1033、EKB-569、GW-2016、抗体E1.1、E2.4、E2.5、E6.2、E6.4、E2.11、E6.3またはE7.6.3、および7H-ピロロ-[2,3-d]ピリミジン誘導体；ならびにm）c-Met受容体の活性を標的化、低減または阻害する化合物。
タンパク質または脂質ホスファターゼの活性を標的化、低減または阻害する例示的化合物には、ホスファターゼ1、ホスファターゼ2A、またはCDC25の阻害剤、例えば、オカダ酸またはその誘導体が含まれる。
さらなる抗血管新生化合物には、タンパク質または脂質キナーゼ阻害には無関係のそれらの活性に対する別のメカニズムを有する化合物、例えば、サリドマイドおよびTNP-470が含まれる。
その1つまたは複数を本発明のBETブロモドメイン阻害剤との組み合わせで用いうる、さらなる非限定的例示的化学療法化合物には下記が含まれる：ダウノルビシン、アドリアマイシン、Ara-C、VP-16、テニポシド、ミトキサントロン、イダルビシン、カルボプラチン、PKC412、6-メルカプトプリン（6-MP）、フルダラビンリン酸塩、オクトレオチド、SOM230、FTY720、6-チオグアニン、クラドリビン、6-メルカプトプリン、ペントスタチン、ヒドロキシ尿素、2-ヒドロキシ-1H-イソインドール-1,3-ジオン誘導体、1-(4-クロロアニリノ)-4-(4-ピリジルメチル)フタラジンまたはその薬学的に許容される塩、1-(4-クロロアニリノ)-4-(4-ピリジルメチル)フタラジンコハク酸塩、アンギオスタチン、エンドスタチン、アントラニル酸アミド、ZD4190、ZD6474、SU5416、SU6668、ベバシズマブ、rhuMAb、rhuFab、マキュゲン; FLT-4阻害剤、FLT-3阻害剤、VEGFR-2 IgGI抗体、RPI 4610、ベバシズマブ、ポルフィマーナトリウム、アネコルタブ、トリアムシノロン、ヒドロコルチゾン、11-a-エピヒドロコチゾール（11-a-epihydrocotisol）、コルテキソロン（cortex olone）、17a-ヒドロキシプロゲステロン、コルチコステロン、デスオキシコルチコステロン、テストステロン、エストロン、デキサメタゾン、フルオシノロン、植物アルカロイド、ホルモン化合物および/またはアンタゴニスト、生体反応変更因子、例えば、リンホカインまたはインターフェロン、アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド誘導体、shRNA、ならびにsiRNA。
本発明のBETブロモドメイン阻害剤を同様にその1つまたは複数と組み合わせうる、第二の治療剤の他の例には、下記が含まれるが、それらに限定されるわけではない：アルツハイマー病の処置、例えば、ドネペジルおよびリバスチグミン；パーキンソン病の処置、例えば、L-DOPA/カルビドーパ、エンタカポン、ロピニロール、プラミペキソール、ブロモクリプチン、ペルゴリド、トリヘキシフェニジル、およびアマンタジン；多発性硬化症（MS）を処置するための薬剤、例えば、ベータインターフェロン（例えば、AVONEX(登録商標)およびREBIF(登録商標)）、酢酸グラチラマー、およびミトキサントロン；喘息の処置、例えば、アルブテロールおよびモンテルカスト；精神分裂病を処置するための薬剤、例えば、ジプレキサ、リスパーダル、セロクエル、およびハロペリドール；抗炎症性剤、例えば、コルチコステロイド、TNFブロッカー、IL-1 RA、アザチオプリン、シクロホスファミド、およびスルファサラジン；免疫抑制剤を含む免疫調節剤、例えば、シクロスポリン、タクロリムス、ラパマイシン、ミコフェノール酸モフェチル、インターフェロン、コルチコステロイド、シクロホスファミド、アザチオプリン、およびスルファサラジン；神経栄養因子、例えば、アセチルコリンエステラーゼ阻害剤、MAO阻害剤、インターフェロン、抗痙攣剤、イオンチャネルブロッカー、リルゾール、もしくは抗パーキンソン病薬；心血管疾患を処置するための薬剤、例えば、ベータ-ブロッカー、ACE阻害座、利尿剤、硝酸塩、カルシウムチャネルブロッカー、もしくはスタチン；肝臓疾患を処置するための薬剤、例えば、コルチコステロイド、コレスチラミン、インターフェロン、および抗ウイルス剤；血管障害を処置するための薬剤、例えば、コルチコステロイド、抗白血病剤、もしくは成長因子；または免疫不全障害を処置するための薬剤、例えば、ガンマグロブリン。
その1つまたは複数を構造式（I）のBETブロモドメイン阻害剤との組み合わせで用いうる、前述の第二の治療的活性剤は、当技術分野において記載されるとおりに調製および投与する。
本発明の化合物は、典型的には所期の投与経路および標準の薬学的実務に関して選択した薬学的担体との混合物で投与する。本発明に従って用いるための薬学的組成物は、構造式（I）の化合物の加工を容易にする賦形剤および補助剤を含む1つまたは複数の生理的に許容される担体を用いて、通常の様式で製剤する。
これらの薬学的組成物は、例えば、通常の混合、溶解、造粒、糖衣錠作製、乳化、カプセル化、捕捉、または凍結乾燥行程により製造することができる。適切な製剤は選択した投与経路に依存する。構造式（I）の化合物の治療的有効量を経口投与する場合、組成物は典型的には錠剤、カプセル剤、散剤、液剤、またはエリキシル剤の形である。錠剤の形で投与する場合、組成物はゼラチンまたは補助剤などの固体担体をさらに含みうる。錠剤、カプセル剤、および散剤は、約0.01％〜約95％、好ましくは約1％〜約50％の構造式（I）の化合物を含む。液体剤形で投与する場合、水、石油、または動物もしくは植物起源の油などの、液体担体を加えることができる。組成物の液体剤形は、生理食塩水、デキストロースもしくは他の糖溶液、またはグリコールをさらに含みうる。液体剤形で投与する場合、組成物は約0.1重量％〜約90重量％、好ましくは約1重量％〜約50重量％の構造式（I）の化合物を含む。
構造式（I）の化合物の治療的有効量を静脈内、皮膚、または皮下注射で投与する場合、組成物は発熱原を含まない、非経口的に許容される水溶液の形である。pH、等張性、安定性などに妥当な考慮を払って、そのような非経口的に許容される液剤の調製は、当業者の技術の範囲内である。静脈内、皮膚、または皮下注射のために好ましい組成物は、典型的には等張媒体を含む。
構造式（I）の化合物を、当技術分野において周知の薬学的に許容される担体と容易に混合することができる。そのような担体は、活性薬剤を、処置する患者による経口摂取のための、錠剤、丸剤、糖衣錠、カプセル剤、液剤、ゲル、シロップ、スラリー、懸濁剤などとして製剤することを可能にする。経口使用のための薬学的製剤は、構造式（I）の化合物を固体賦形剤に加え、任意に得られた混合物を粉砕し、錠剤または糖衣錠の核を得るために、望まれる場合には適切な補助剤を加えた後に、顆粒混合物を加工することにより、得ることができる。適切な賦形剤には、例えば、充填剤およびセルロース調製物が含まれる。望まれる場合、崩壊剤を加えることもできる。
構造式（I）の化合物を、注射による、例えば、ボーラス注射または持続注入による、非経口投与のために製剤することができる。注射用製剤は、単位用量剤形、例えば、保存剤を加えたアンプルまたは多用量容器で提供することができる。組成物は、油性または水性媒体中の懸濁剤、液剤、または乳剤などの形を取ることができ、懸濁化剤、安定化剤、および/または分散剤などの製剤用物質を含むことができる。
非経口投与用の薬学的組成物には、水溶性の形の活性薬剤の水溶液が含まれる。加えて、構造式（I）の化合物の懸濁剤を、適切な油性注射用懸濁剤として調製することができる。適切な親油性溶媒または媒体には、脂肪油または合成脂肪酸エステルが含まれる。水性注射用懸濁剤は、懸濁剤の粘性を高める物質を含みうる。任意に、懸濁剤は適切な安定化剤または化合物の溶解性を高め、高濃度の溶液の調製を可能にする作用物質も含むことができる。または、本発明の組成物は、使用前に適切な媒体、例えば、滅菌発熱性物質除去水と構成するための、散剤の形であってもよい。
構造式（I）の化合物は、例えば、通常の坐剤基剤を含む、坐剤または停留浣腸などの、直腸組成物に製剤することもできる。前述の製剤に加えて、構造式（I）の化合物はデポー製剤として製剤することもできる。そのような長期作用製剤は、埋め込み（例えば、皮下または筋肉内）または筋肉内注射によって投与することができる。したがって、例えば、構造式（I）の化合物を適切なポリマーもしくは疎水性材料（例えば、許容される油中の乳剤として）またはイオン交換樹脂と共に製剤することができる。
具体的には、構造式（I）の化合物を、デンプンもしくは乳糖などの賦形剤を含む錠剤の形で、または単独もしくは賦形剤との混合物のいずれかでのカプセル剤もしくはオビュール（ovule）で、または着香もしくは着色剤を含むエリキシル剤もしくは懸濁剤の形で、経口、口腔、または舌下投与することができる。そのような液体製剤は、懸濁化剤などの、薬学的に許容される添加物と共に調製することができる。構造式（I）の化合物は、非経口、例えば、静脈内、筋肉内、皮下、または冠内注射することもできる。非経口投与のために、本発明のBETブロモドメイン阻害剤は、液剤を血液と等張にするための、他の物質、例えば、塩またはマンニトールもしくはグルコースなどの単糖を含みうる、滅菌水性液剤の形で最良に用いられる。
さらなる態様として、本発明は、本発明の方法を実施するためにそれらの使用を容易にする様式で包装された、1つまたは複数の化合物または組成物を含むキットを含む。1つの単純な態様において、キットは、密封瓶または器などの容器内に包装した、方法の実施のために有用であると本明細書に記載する化合物または組成物（例えば、構造式（I）の化合物および任意の第二の治療剤を含む組成物）を、本発明の方法を実施するための化合物または組成物の使用を記載する、容器に添付した、またはキットに含まれるラベルと共に含む。好ましくは、化合物または組成物を単位剤形で包装する。キットはさらに、所期の投与経路に従って組成物を投与するのに適した装置を含むこともできる。
以前のBETブロモドメイン阻害剤は、治療剤としてのそれらの開発を妨害する性質を有していた。本発明の重要な特徴に従い、構造式（I）の化合物をBETブロモドメインの阻害剤として合成し、評価した。例えば、本発明の化合物は、典型的には、100μM未満、50μM未満、25μM未満、および5μM未満のBETブロモドメインに対する結合親和性（IC50）を有する。
化合物の合成
本発明の化合物を以下のとおりに調製した。以下の合成スキームは、構造式（I）の化合物を合成するために用いる反応の代表である。本発明のBETブロモドメイン阻害剤を調製するための改変および代替スキームは、容易に当業者の能力の範囲内である。
溶媒および試薬は商業的に入手し、それ以上精製せずに使用した。NMRスペクトルの化学シフト（δ）は、内部標準に対する低磁場へのδ値（ppm）として、通常の様式で報告する多重度と共に報告する。
特に記載がないかぎり、すべての温度は摂氏度である。
例えば、合成法において、および本明細書の全体を通して、略語は以下の意味を有する。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
すべての最終化合物はトリフルオロ酢酸塩型である。以下の構造ではカチオンは描いていない。
1. 汎用中間体：RX3またはRX103の合成
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-メトキシシクロヘキサノール。
1,4-シクロヘキサンジオール（17.5g、150mmol）およびKOH（9.3g、170mmol）の水溶液（20mL）を1時間加熱還流した。室温まで冷却した後、水を減圧下で除去し、次いでCH3I（32.0g、230mmol）を加えた。室温で24時間撹拌した後、反応混合物を100mLの水で反応停止し、CHCl3（100mL×3）で抽出した。合わせた有機分画を乾燥し、次いでフラッシュカラムクロマトグラフィ（酢酸エチル：ヘキサン＝1：1で溶出）で精製して、7.14g（36％）の淡黄色液体を標的化合物（公知の化合物、ACS登録No. 18068-06-9）として得た。
Figure 0006401773
4-メトキシシクロヘキサノン。
4-メトキシシクロヘキサノール（41.9g、322mmol）をDCM（360mL）に溶解し、クロロクロム酸ピリジニウム（138.8g、644mmol）DCM溶液（720mL）中にゆっくり加えた。得られた混合物をN2保護下で4時間撹拌した。クロロクロム酸ピリジニウムをH型シリカゲルでろ過し、ろ液を濃縮し、フラッシュカラム（溶離剤EtOAc：ヘキサン＝1：1）で精製して、38.4g（93％）の表題化合物を淡黄色油状物で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-ヒドラジニルピリジン-2(1H)-オン。
4-ヒドラジニルピリジン-2(1H)-オン（4.97g、44.7mmol）をH2N-NH2（9.19g、290mmol）の2-メトキシエタノール溶液（100mL）中にゆっくり加えた。混合物を24時間加熱還流し、その後溶媒を除去し、4.57g（81.6％）の表題化合物をエタノール中の再結晶により得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-ヒドラジニル-6-メチルピリジン-2(1H)-オン。
2-メトキシエタノール（500mL）中の4-ヒドロキシ-6-メチルピリジン-2(1H)-オン（25g、200mmol）およびヒドラジン一水和物（65g、1299mmol）混合物を24時間加熱還流した。室温まで冷却した後、生成物をエタノール（22.2g、79.8％）中で結晶化した。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(2-4-メトキシシクロヘキシリデン)ヒドラジニル)ピリジン-2(1H)-オン。
4-ヒドラジニルピリジン-2(1H)-オン（2.07g、16.5mmol）を無水エタノール（100mL）中の4-メトキシシクロヘキサノン（2.33g、18.2mmol）溶液に懸濁した。2時間加熱還流した後、反応混合物をその元の量の半分まで濃縮した。得られた沈殿をろ過し、乾燥して、3.02g（77.0％）の無色固体を得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(2-(4-メトキシシクロヘキシリデン)ヒドラジニル)-6-メチルピリジン-2(1H)-オン。
4-ヒドラジニル-6-メチルピリジン-2(1H)-オン（16.33g、117mmol）を4-メトキシシクロヘキサノン（16.5g、129mmol）のエタノール溶液に懸濁した。混合物を2時間加熱還流し、その量の半分まで濃縮した。沈澱をろ過し、ろ液を蒸発させて、無色粉末（30g）を得、これをそれ以上精製せずに次の段階で用いた。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
8-メトキシ-2,5-ジヒドロ-1H-ピリド[4,3-b]インドル-1-オン。
4-(2-(4-メトキシシクロヘキシリデン)ヒドラジニル)ピリジン-2(1H)-オン（20.1g、85.4mmol）を400mLのジフェニルエーテルに懸濁した。混合物をN2保護下で30分間加熱還流した。室温まで冷却した後、10％Pd/C（6g）を加え、混合物を再度75分間加熱還流した。次いで、ヘキサン（800mL）を冷却した混合物に加えた。得られた沈殿をろ過し、煮沸AcOH（1100mL）中に溶解し、続いて再度ろ過してPd-Cを除去した。ろ液を濃縮して、黄色固体を得、これを8mLエタノール中で煮沸した。次いで、固体をろ過して、9g（50％）の淡黄色固体を表題化合物として得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
8-メトキシ-3-メチル-5H-ピリド[4,3-b]インドル-1-オール。
4-(2-(4-メトキシシクロヘキシリデン)ヒドラジニル)-6-メチルピリジン-2(1H)-オン（1.99g、7.99mmol）を60mLのジフェニルエーテル中で30分間還流し、室温まで冷却した後、Pd-C（6.1g、0.57mmol）を加え、さらに1.25時間加熱した。これを冷却し、ヘキサン（80mL）で沈澱させる。ろ液を熱AcOH（110mL）中に溶解し、Pd-Cをろ去した。次いで、AcOHを蒸発させ、粗生成物をMeOH（16mL）中で煮沸することにより洗浄した。固体を回収し、それ以上精製せずに次の段階に持ち越した（1g、54.8％）。
Figure 0006401773
1-クロロ-8-メトキシ-5H-ピリドル[4,3-b]インドール。
POCl3（20mL）および8-メトキシ-5H-ピリドル[4,3-b]インドル-1-オールを24時間還流し、続いてPOCl3を減圧下で除去した。残渣をHClと共にさらに1時間還流した。冷却後、混合物を水酸化アンモニウムで中和し、沈澱をろ過し、フラッシュカラムクロマトグラフィ（溶離剤としてEtOAc：ヘキサン＝1：1）で精製して、0.44g（64.5％）の表題化合物を無色粉末で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
7-ブロモ-1-クロロ-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドール。
1-クロロ-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドール（377mg、1.6mmol）およびNaOAc（197mg、2.4mmol）をAcOH（40mL）に溶解した。次いで、臭素（389mg、2.4mmol）を滴加した。室温で終夜撹拌した後、反応をNa2SO3溶液で停止した。次いで、AcOHを減圧下で除去し、得られた水相をEtOAcで抽出した。合わせた有機分画を濃縮し、調製用HPLCで精製して、157mg（31.1％）の無色粉末を得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-クロロ-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（RX3）。
7-ブロモ-1-クロロ-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドール（157mg、0.5mmol）、3,5-ジメチルイソキサゾール-4-ボロン酸ピナコールエステル（655mg、2.0mmol）、およびK2CO3（345mg、2.5mmol）をDME/H2O（50mL/25mL）系に溶解した。次いで、減圧し、N2を再充填した。その後、テトラキ(トリフェニルホスフィン)パラジウム(0)を加え、続いて減圧し、N2を再充填した。反応混合物を終夜加熱還流し、室温に冷却してEtOAcで抽出し、合わせた有機分画を濃縮した後、調製用HPLCで精製した。24時間凍結乾燥した後、57mg（34.6％）の表題化合物を淡黄色粉末で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-クロロ-8-メトキシ-3-メチル-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
2. ボロン酸ピナコールエステルを含む5員複素環の一般合成法。
Figure 0006401773
R1、R2＝メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、シクロプロピル、シクロブチル、フェニル、他のアルキル、ヘテロアリール、またはアリール。
Y＝N
Z＝NH、O、N-アルキル
X＝Br、I

実施例1：
Figure 0006401773
実施例2：
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3-エチル-5-メチルイソキサゾール。
NH2OH・HCl（0.542g、7.8mmol）をMeOH/H2O（10mL/20ml）に溶解し、続いてNa2CO3（0.413g、3.9mmol）を加えた。発泡がなくなった時点で、ヘキサン-2,4-ジオンを滴加した。混合物を終夜加熱還流した。室温まで冷却した後、混合物をEt2O（40mL×2）で抽出し、無水Na2SO4で乾燥した。溶媒を除去して、0.559g（収率：57.3％）の淡黄色液体を得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
5-エチル-3-メチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-ブロモ-3-エチル-5-メチルイソキサゾール。
DMF（5mL）中の3-エチル-5-メチルイソキサゾール（0.22g、2.01mmol）およびNBS（0.39g、2.21mmol）の混合物を室温で終夜撹拌した。次いで、混合物を酢酸エチル（20mL）に加え、水（20mL×5）で抽出した。合わせた有機相を飽和食塩水（20mL）で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥した。4-ブロモ-3-エチル-5-メチルイソキサゾールをシリカゲルフラッシュカラム（酢酸エチル：ヘキサン＝1.30で溶出）で精製して、0.338g（収率：84.7％）の淡黄色液体を得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-ブロモ-5-エチル-3-メチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3-エチル-5-メチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)イソキサゾール。
合成を、ボロン酸ピナコールエステルの一般合成法を用いて実施した。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
5-エチル-3-メチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)イソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3,5-ジエチル-1H-ピラゾール。
ヘプタン-3,5-ジオン（1.128g、8.8mmol）およびヒドラジン水和物（0.44g、8.9mmol）の混合物を1時間加熱還流した。次いで、混合物を酢酸エチルで抽出し、無水Na2SO4で乾燥した。溶媒を除去して、0.96g（収率：87.8％）の明るい黄色の油状物を得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3,5-ジエチル-4-ヨード-1H-ピラゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3,5-ジエチル-4-ヨード-1H-ピラゾール-1-カルボン酸tert-ブチル。
3,5-ジエチル-4-ヨード-1H-ピラゾールおよび(Boc)2Oの混合物をTHFに溶解し、室温で1時間撹拌した。次いで、生成物をシリカゲルカラム（酢酸エチル：ヘキサン＝1：3）で精製した。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3,5-ジエチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1H-ピラゾール-1-カルボン酸tert-ブチル。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
5-シクロプロピル-3-メチル-1H-ピラゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
5-シクロプロピル-4-ヨード-3-メチル-1H-ピラゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
5-シクロプロピル-4-ヨード-3-メチル-1H-ピラゾール-1-カルボン酸tert-ブチル。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
5-シクロプロピル-3-メチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1H-ピラゾール-1-カルボン酸tert-ブチル。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-ブロモ-5-メチル-3-フェニル-1H-ピラゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-ブロモ-5-メチル-3-フェニル-1H-ピラゾール-1-カルボン酸tert-ブチル。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3,5-ジメチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1H-ピラゾール-1-カルボン酸tert-ブチル。
Figure 0006401773
3. 汎用中間体からの最終化合物の合成：
3.1 還元：
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
10％Pd-C（5mg）を4-(1-クロロ-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（15mg、0.046mmol）のMeOH溶液に懸濁した。反応はH2風船下、室温で26時間進行した。Pd-Cをろ過し、ろ液を半調製用HPLCで精製し、24時間凍結乾燥した後に、4mg（30％）の無色粉末を得た。
Figure 0006401773
3.2 鈴木カップリングの一般法：
Figure 0006401773
RX3（20mg、0.06mmol）、ボロン酸またはボロン酸ピナコールエステル（4当量）、およびK2CO3（41.5mg、0.3mmol）を15mLのH2O/DME（1：2）中で撹拌した。混合物を減圧し、Pd(PPh3)4を加えた後、N2保護下で加熱還流した。終夜灌流した後、反応混合物を室温まで冷却し、酢酸エチルで抽出した。有機相を除去した後、残渣をRP-HPLCを用いて精製し、終夜凍結乾燥した後に無色粉末を得た。
Figure 0006401773
4,4'-(8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドール-1,7-ジイル)ビス(3,5-ジメチルイソキサゾール)。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(8-メトキシ-1-(1H-ピラゾル-4-イル)-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(8-メトキシ-1-フェニル-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(8-メトキシ-1-(ピリジン-3-イル)-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-(3-クロロフェニル)-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-(2-クロロフェニル)-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-(4-クロロフェニル)-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-([1,1'-ビフェニル]-3-イル)-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-([1,1'-ビフェニル]-4-イル)-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(8-メトキシ-1-(ナフタレン-1-イル)-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(8-メトキシ-1-(ナフタレン-2-イル)-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-(2-フルオロフェニル)-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-(3-フルオロフェニル)-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-(4-フルオロフェニル)-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(8-メトキシ-1-(ピリジン-4-イル)-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-(1H-インドル-5-イル)-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-(1H-インドル-3-イル)-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-(3-シクロプロピル-1H-ピラゾル-4-イル)-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-(3-イソプロピル-1H-ピラゾル-4-イル)-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(8-メトキシ-1-(3-メチル-1H-ピラゾル-4-イル)-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-(3,5-ジメチル-1H-ピラゾル-4-イル)-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-(3,5-ジエチル-1H-ピラゾル-4-イル)-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-(3-シクロプロピル-5-メチル-1H-ピラゾル-4-イル)-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(8-メトキシ-1-(1,3,5-トリメチル-1H-ピラゾル-4-イル)-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(8-メトキシ-1-(5-メチル-3-フェニル-1H-ピラゾル-4-イル)-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-(5-シクロプロピル-1,3-ジメチル-1H-ピラゾル-4-イル)-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-(3-シクロプロピル-1,5-ジメチル-1H-ピラゾル-4-イル)-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(8-メトキシ-3-メチル-1-(2-メチル-1H-インドル-3-イル)-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(8-メトキシ-3-メチル-1-(キノリン-4-イル)-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4,4'-(8-メトキシ-3-メチル-5H-ピリド[4,3-b]インドール-1,7-ジイル)ビス(3,5-ジメチルイソキサゾール)。
Figure 0006401773
4. 他の中間体からの最終化合物の合成。
4.1 脱メトキシル化化合物の合成：
Figure 0006401773
合成法はRX3の合成において用いた反応および条件と同じである。
Figure 0006401773
4-(1-クロロ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-8-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4,4'-(3-メチル-5H-ピリド[4,3-b]インドール-1,8-ジイル)ビス(3,5-ジメチルイソキサゾール)。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-クロロ-3-メチル-5H-ピリド[4,3-b]インドル-8-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
4.2 異なる位置に3,5-ジメチルイソキサゾールを有する最終化合物の合成。
Figure 0006401773
合成法はRX3の合成において用いた反応および条件と同じである。
Figure 0006401773
6-ブロモ-1-クロロ-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-6-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
4.3 3,5-ジメチルイソキサゾールに加えて部分を有する最終化合物の合成。
Figure 0006401773
合成は上で開示した一般的な鈴木カップリング法と同じである。
Figure 0006401773
1-クロロ-8-メトキシ-7-(1,3,5-トリメチル-1H-ピラゾル-4-イル)-5H-ピリド[4,3-b]インドール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
8-メトキシ-1,7-ビス(1,3,5-トリメチル-1H-ピラゾル-4-イル)-5H-ピリド[4,3-b]インドール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
1-クロロ-7-(3,5-ジメチル-1H-ピラゾル-4-イル)-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
1,7-ビス(3,5-ジメチル-1H-ピラゾル-4-イル)-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-クロロ-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-5-エチル-3-メチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-クロロ-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3-エチル-5-メチルイソキサゾール。
Figure 0006401773
5. 9H-ピリミド[4,5-b]インドール核を含む汎用中間体の合成
Figure 0006401773
Figure 0006401773
S3（2.26g、20mmol）を無水DMF（50mL）に溶解し、溶液を0℃まで冷却した。NaH（1.2g、鉱油中60％、30mmol）を少しずつ加えた。得られた反応混合物を0℃で0.5時間撹拌し、公知の化合物S1およびS2（20mmol、参照文献：2012, J. Med. Chem. 55, 449-464）の無水DMF溶液を加えた。得られた溶液を0℃で3時間撹拌した後、1N HClで反応停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラムで精製した。所望の生成物S4を、他の位置異性体の不純物を含む、無色油状物で単離した（4.17g、収率64％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
S4（1.43g、4.2mmol）、3,5-ジメチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)イソキサゾール（2.34g、10.5mmol）、およびK2CO3（2.03g、14.7mmol）を丸底フラスコに加えた。DME（30mL）および水（15mL）を室温で加えた。溶液を脱気し、次いでPd(PPh3)4（242mg、0.21mmol）を一度に加えた。溶液を再度脱気し、次いで14時間加熱還流した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、次いで無水Na2SO4で乾燥した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラムで精製した。所望の生成物S5を＞80％の収率で得た（1.47g、異性体およびピナコール成分が混入）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
S5（1.47g）のAcOH（30mL）溶液に80℃で0.8gのZn粉末を少しずつ加えた。混合物を80℃で1時間撹拌し、さらに0.8gのZn粉末を加え、反応混合物を同じ温度で2時間維持した。反応混合物を冷却し、ろ過し、AcOHで洗浄した。AcOH溶液を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。フラッシュカラムクロマトグラムで精製して、所望の生成物S6（0.55g、収率約40％）を得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
S6（0.45g、1.4mmol）、ギ酸アンモニウム（1.06g、17mmol）、およびホルムアミド（16mL）を175℃で12時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、水を加えた。混合物をろ過してS7を褐色固体で得た（0.24g、0.77mmol、収率55％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
S7（0.24g、0.77mmol）をPOCl3（10mL）に溶解し、混合物を90℃で5時間加熱した。混合物を室温まで冷却し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。酢酸エチル（20mL）を0℃で加え、続いてNaHCO3（20mL）および水（20mL）を加えた。混合物をろ過し、所望のCD54生成物を褐色固体（0.17g）で回収した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去して、褐色固体（80mg、純度90のCD54）を得た。
Figure 0006401773
または、S5を以下に示す経路でも合成した。
Figure 0006401773
公知の化合物S1およびS2の混合物（参照文献：2012, J. Med. Chem. 55, 449-464）（3.0g、12mmol）、3,5-ジメチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)イソキサゾール（5.35g、24mmol）、およびK2CO3（5.0g、36mmol）を丸底フラスコに加えた。DME（50mL）および水（30mL）を室温で加えた。溶液を脱気した後、Pd(PPh3)4（700mg、0.6mmol）を一度に加えた。溶液を再度脱気し、次いで14時間加熱還流した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラムで精製した。所望の生成物S8およびS9を混合物として＞80％の収率で得た（3.38g）。主異性体は化合物S9である、
Figure 0006401773
S5を、塩基としてのNaHおよび溶媒としてのDMFを用い、S9のフッ素原子を2-シアノ酢酸エチルで置換することにより合成した。S4からS5の合成と同じ反応条件を用いた（単離収率＞80％）。
6. ボロン酸ピナコールエステルの一般合成法
n-ブチルリチウムを用い、金属交換中間体を介しての、ボロン酸ピナコールエステルの合成は、文献に報告されている。以下の出版物に報告されている手順を採用した：Synthesis, 2005, 20, 3581-3588、Synlett, 2006, 12, 1948-1952、およびJ. Am. Chem. Soc, 2011, 133, 15800-15802。
Figure 0006401773
4つの例を以下に示す。
Figure 0006401773
6-フルオロ-3-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1H-インドール-1-カルボン酸tert-ブチル（R＝H）の合成。6-フルオロ-3-ヨード-1H-インドール-1-カルボン酸tert-ブチル（541mg、1.5mmol）を無水THFに-78℃で溶解した。BuLi（2.5M THF溶液、1.0mL、2.55mmol）をシリンジから加え、反応混合物を20分間撹拌した。2-イソプロポキシ-4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン（558mg、3.0mmol）をシリンジから-78℃で加え、反応混合物を2時間撹拌した後、飽和NH4Cl水溶液で反応停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製した（0.35g、収率67％）。
Figure 0006401773
6-フルオロ-2-メチル-3-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1H-インドール-1-カルボン酸tert-ブチル（R＝Me、収率82％）
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1H-ピロロ[2,3-c]ピリジン-1-カルボン酸tert-ブチル（R＝H、収率57％）。
Figure 0006401773
2-メチル-3-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1H-ピロロ[2,3-c]ピリジン-1-カルボン酸tert-ブチル（R＝Me、収率89％）。
Figure 0006401773
いくつかの場合に、ボロン酸および/またはそのピナコールエステルを、i-PrMgClおよびLiCl複合体により促進される金属交換反応（Boymond, L. et. al. Angew. Chem. Int. Ed. 1998, 37, No. 12, 1701-1703およびHawkins, V. et. al. Organic Process Research & Development 2008, 12, 1265-1268）と、続くホウ酸イソプロピルピナコールエステルまたはホウ酸トリイソプロピルへのグリニャール試薬の付加により合成した。例えば、ボロン酸ピナコールエステルCD164を、以下に示す合成経路により得た。カルボン酸CD157を、以前に報告された方法（Banno, H. et. al. 国際公開公報第2010/090716 A1号）に従って合成した。酸CD157をCD164に、以前に報告された方法（Bethel, P. A. et. al. 2012, Tetrahedron, 68, 5434-5444）に従い、2段階反応で変換した。
Figure 0006401773
CD157：
Figure 0006401773
CD164：
Figure 0006401773
いくつかの態様において、この方法を用いて調製したボロン酸ピナコールエステルは、フラッシュカラムクロマトグラフィに対して十分に安定ではなく、それ以上精製せずに次のカップリング段階に直接用いた。
ボロン酸ピナコールエステルの合成は、ハロゲン化アリールとビス(ピナコラト)ジボロンとの直接カップリングを介して達成することもできる。以下の文献において報告されている手順を採用した：J. Org. Chem. 1995, 7508-7510およびAngew. Chem. Int, Ed. 2007, 46, 5359-5363。
Figure 0006401773
3つの例を以下に示す。
Figure 0006401773
3-ヨード-2-メチル-1H-インドール-1-カルボン酸tert-ブチル（1.0g 4.0mmol）およびビス(ピナコラト)ジボロンをジオキサンに溶解した。Et3Nをシリンジから加え、続いてPd(dppf)Cl2を加えた。反応混合物を3時間還流した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をエーテルに溶解した。混合物をろ過し、エーテル溶液を回収した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製した。2-メチル-3-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1H-インドール-1-カルボン酸tert-ブチル（収率＞50％）を、不純物としての2-メチル-1H-インドール-1-カルボン酸tert-ブチルと共に単離した。BuLi法を用いて、所望の生成物を収率67％で単離した（純度＞90％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-メチル-3-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1H-インドール-1-カルボン酸tert-ブチルの合成法は、2-メチル-3-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1H-インドール-1-カルボン酸tert-ブチルのものと同じである。収率は＞50％であった。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
CD143の合成法は、2-メチル-3-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1H-インドール-1-カルボン酸tert-ブチルのものと同じである。単離収率は95％である。
Figure 0006401773
7. CD54からの化合物の合成
すべての最終生成物は逆相HPLCで精製し、生成物はCF3CO2H塩（トリフルオロ酢酸塩またはTFA塩）の形であった。ほとんどの場合に、特に記載がないかぎり、対アニオンは表示の構造中に示さなかった。
いくつかの最終生成物を、以下のスキームに示す鈴木カップリングによって合成した。鈴木カップリングはハロゲン化アリール基質としてCD54を用い、カップリング相手として市販または施設内で作製したボロン酸またはボロン酸ピナコールエステルを用いた。反応収率は70％〜10％まで変動した。いくつかのボロン酸ピナコールエステルを、前述のスキームで示した一般法を用いても合成した。鈴木カップリング手順の一例を、化合物番号35の合成において例示する。
Figure 0006401773
方法A：CD54（33mg、0.1mmol）、3,5-ジメチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)イソキサゾール（66mg、0.3mmol）、およびK2CO3（70mg、0.5mmol）を丸底フラスコに加えた。DME(6mL）および水（4mL）を室温で加えた。溶液を脱気し、次いでPd(PPh3)4（10〜15mg、0.008〜0.012mmol）を一度に加えた。溶液を再度脱気し、次いで14時間加熱還流した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣を逆相HPLCで精製した。所望の生成物である化合物番号35のTFA塩を無色固体で単離した（16mg、41％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
本発明の様々な化合物を、以下に示すとおり、CD54とアミン、アルコール、またはチオールとの直接縮合により合成した。反応収率は60％〜5％まで変動した。直接縮合手順の一例を化合物番号36の合成において例示する。
Figure 0006401773
方法B：CD54（80mg、0.3mmol）、(R)-1-(ピリジン-2-イル)エタンアミン（122mg、1mmol）、およびEtN(i-Pr)2（0.3mL、1.5mmol）を丸底フラスコに加えた。NMP（3mL）を室温で加えた。溶液を140℃で14時間加熱し、次いで反応混合物を水（1mL）で反応停止した。混合物を逆相HPLCで精製した。所望の生成物である化合物番号36のTFA塩を褐色固体で単離した（16mg、20％）。
Figure 0006401773
化合物番号36：
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法A-鈴木カップリング：収率42％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法A-鈴木カップリング：収率67％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法A-鈴木カップリングと、続いて15分間のトリフルオロ酢酸（2mL）処理：収率37％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法B-調節縮合：収率11％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法A-鈴木カップリングと、続いて15分間のトリフルオロ酢酸（2mL）処理：収率44％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法A-鈴木カップリング：収率7％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法B-調節縮合：収率39％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法A-鈴木カップリングと、続いて15分間のトリフルオロ酢酸（2mL）処理：収率26％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法A-鈴木カップリング：収率28％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法A-鈴木カップリング：収率39％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法A-鈴木カップリング：収率21％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法B-調節縮合：収率42％。CD54、ピペラジン、および(iPr)2NEtをDMF中で12時間、180℃まで加熱した。HPLC精製により、化合物番号48はTFA塩として得られる。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法B-調節縮合：収率45％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法B-調節縮合：収率42％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法A-鈴木カップリングと、続いて15分間のトリフルオロ酢酸（2mL）処理：収率40％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法A-鈴木カップリング：収率40％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法A-鈴木カップリングと、続いて15分間のトリフルオロ酢酸（2mL）処理：収率52％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法A-鈴木カップリング：収率45％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法A-鈴木カップリング：収率22％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法A-鈴木カップリングと、続いて15分間のトリフルオロ酢酸（2mL）処理：収率61％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法A-鈴木カップリング：収率32％；2種の異性体の1：1混合物。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法A-鈴木カップリングと、続いて15分間のトリフルオロ酢酸（2mL）処理：収率65％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法B-調節縮合：収率45％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法A-鈴木カップリング：収率48％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法A-鈴木カップリング：収率31％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法A-鈴木カップリング：収率26％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
方法B-無水DMSO（4mL）中、塩基としてEtN(i-Pr)2（0.1mL）を用いて、170℃で16時間の、CD54とベンズイミダゾールとの直接縮合。HPLCにより収率32％でTFA塩として単離。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
以前に報告された最適化鈴木カップリング条件（Jimenez, J.-M. et. al. 2013, J. Med. Chem. DIO: 10.1021/jm301465a）に従い、化合物番号65を合成した。CD54（34mg、0.1mmol）、1-メチル-3-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1H-インダゾール（CD143、75mg、0.3mmol）、およびNa2CO3（50mg）を丸底フラスコ中で混合した。このフラスコに、MeOH（4mL）、PhMe（4mL）、および水（1mL）を加え、系を脱気し、純粋な窒素を再充填した。次いで、Pd(PPh3)4（20mg）を加えた。再度、系を脱気し、純粋な窒素を再充填した。混合物を12時間加熱還流した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣を逆相HPLCで精製した。所望の生成物である化合物番号65をTFA塩として収率23％で単離した。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Pd2(dba)3［トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0)］および(±)-BINAP［(±)-1,1'-ビナフタレン-2,2'-ジイル)ビス(ジフェニルホスフィン)］により触媒したCD54とベンゾトリアゾールとのカップリング反応により、化合物番号66を得た。この反応では、Ueda, S. et. al. (2012, J. Org. Chem. 77, 2543-2547)により以前に報告された方法を、以下の改変を加えて採用した：報告されたtBuXPhos（L3）またはMe4tBuXPhos（L1）の代わりに、BINAPをホスフィンリガンドとして用いた。CD54（34mg、0.1mmol）、ベンゾトリゾール（14mg、0.12mmol）、およびK3PO4（42mg、0.2mmol）を丸底フラスコに加えた。丸底フラスコを脱気し、純粋な窒素を再充填した。第二の丸底フラスコ中、Pd2(dba)3（9mg、0.01mmol）および(±)-BINAP（15mg、0.024mmol）を加えた。丸底フラスコを脱気し、純粋な窒素を再充填した。このフラスコに、無水トルエン（10mL）を加え、溶液を120℃で3分間加熱して、活性触媒を生成させた。活性触媒を第一のフラスコに移し、反応混合物を12時間加熱還流した。次いで、混合物を酢酸エチルで希釈し、水、食塩水で洗浄した。有機層を回収し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣を逆相HPLCで精製した。所望の生成物である化合物番号64をTFA塩として収率29％で単離した。
Figure 0006401773
8. 9H-ピリド[3,4-b]インドール核を含む汎用中間体および化合物番号67の化合物の合成
Figure 0006401773
公知の酸T1（1995, Tetrahedron, 51, 9531-9542.）を基質として用いて、T2を合成した。酸T1（193mg、0.5mmol）をAcOH-H2O（6mL-4mL）に室温で溶解した。PyHBr3（160mg、0.5mmol）を一度に加えた。反応混合物を60℃で12時間加熱し、次いでPyHBr3（80mg、0.25mmol）を追加した。反応混合物を室温で12時間撹拌した。反応を0.1mLの飽和Na2SO3で停止し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。MeOHを加え、沈澱をろ去し、MeOH溶液を回収した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣を逆相HPLCで精製した。所望の生成物T2を36mg、収率15％で得た。副生成物T3およびT4を、出発原料の変換に基づき、UPLCで決定して、約40％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
酸T2（113mg、0.24mmol）、Et3N（過剰、0.5mL）、およびt-BuOH（10mL）を丸底フラスコに室温で加えた。(PhO)2PO-N3（DPPA、124mg、0.45mmol）を一度に加え、反応混合物を室温で2時間撹拌し、次いで30時間加熱還流した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製した。所望の生成物T5を72mg、収率56％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
基質T5（72mg、0.2mmol）、CuI（76mg、0.3mmol）、およびNaH（40mg、0.4mmol、鉱油中60％）を乾燥器で乾燥した丸底フラスコに加えた。無水ジグリム（10ml）をシリンジから加え、反応混合物を120℃で14時間加熱した。反応混合物を5％NH3/H2Oで反応停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製した。所望の生成物T6を22mg、収率52％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
T6（22mg、0.06mmol）、3,5-ジメチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)イソキサゾール（44mg、0.2mmol）、およびK2CO3（55mg、0.4mmol）を丸底フラスコに加えた。DME（6mL）および水（4mL）を加え、溶液を脱気し、次いでPd(PPh3)4（10mg、0.008mmol）を一度に加えた。溶液を再度脱気し、次いで14時間加熱還流した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣を逆相HPLCで精製した。所望の生成物である化合物番号67のTFA塩を黄緑色固体で単離した（27mg、TFA塩、収率＞90％）。
Figure 0006401773
9. 5H-ピリダジノ[4,5-b]インドール核を含む汎用中間体の合成。
Figure 0006401773
10. 2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドール核を含む汎用中間体の合成。
Figure 0006401773
丸底フラスコに、S6（0.37g、1.1mmol）およびMeCN（20mL）を室温で加えた。無水HClをMeCNを通して30分間通気し、反応混合物を2.5時間加熱還流（約82℃）した。次いで、反応混合物を室温まで冷却し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。この粗製混合物に、10％NaOH水溶液（20mL）およびEtOH（50mL）を加え、溶液を6時間加熱還流した。次いで、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、水性残渣を2N HCl水溶液で酸性化した。生成物S12を0℃で沈澱させた。混合物をろ過して、純粋なS12を0.278g（収率78％、2段階）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
丸底フラスコに、S12（0.278g、0.8mmol）およびPOCl3（8mL）を加えた。混合物を90℃で6時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。水（20mL）および酢酸エチル（20mL）を加え、NaHCO3飽和水溶液を用いてpHを8に調節した。混合物をろ過して、S13を褐色固体として0.208g（収率75％）で得た。
Figure 0006401773
いくつかの最終生成物を、以下のスキームに示す鈴木カップリングによって合成した。鈴木カップリングはハロゲン化アリール基質としてS13を用い、カップリング相手として市販または施設内で作製したボロン酸またはボロン酸ピナコールエステルを用いた。反応収率は70％〜10％まで変動した。いくつかのボロン酸ピナコールエステルを、前述のスキームで示した一般法を用いても合成した。鈴木カップリング手順の一例を、化合物番号68の合成において例示する。
Figure 0006401773
方法C：S13（34mg、0.1mmol）、2-メチル-3-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1H-インドール-1-カルボン酸tert-ブチル（100mg、0.3mmol）、およびK2CO3（70mg、0.4mmol）を丸底フラスコに加えた。DME（6mL）および水（4mL）を室温で加えた。溶液を脱気し、次いでPd(PPh3)4（20mg、0.017mmol）を一度に加えた。溶液を再度脱気し、続いて14時間加熱還流した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をトリフルオロ酢酸（2mL）により室温で15分間処理した。逆相HPLCで精製して、所望の生成物である化合物番号68のTFA塩を無色固体で単離した（12mg、27％）。
Figure 0006401773
化合物番号68：
Figure 0006401773
Figure 0006401773
一般的な鈴木カップリング反応条件（方法C）に従った：収率37％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
一般的な鈴木カップリング反応条件（方法C）に従った：収率30％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
一般的な鈴木カップリング反応条件（方法C）に従った：収率47％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
一般的な鈴木カップリング反応条件（方法C）に従った：収率40％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
一般的な鈴木カップリング反応条件（方法C）に従った：収率57％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
一般的な鈴木カップリング反応条件（方法C）に従った：収率23％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
一般的な鈴木カップリング反応条件（方法C）に従った：収率22％。
Figure 0006401773
S13（30mg）、3-キノリンボロン酸（60mg）およびK2CO3（64mg）を丸底フラスコに加えた。このフラスコに、1,2-ジメトキシエタン（DME、6mL）および水（4mL）を加え、系を脱気して酸素を除去した。Pd(PPh3)4（20mg）を一度に加え、フラスコを再度脱気した。混合物を窒素雰囲気下で12時間加熱還流した。次いで、反応混合物を水で希釈し、水層を酢酸エチル（50mL×2）で抽出し、合わせた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減圧下で除去し、残渣を逆相調製用HPLCで精製して、所望の生成物である化合物番号76をCF3CO2Hの塩として収率22％で得た。
以下の化合物を同じ鈴木カップリング法［触媒として(Pd(PPh3)4および塩基としてK2CO3］に従って調製した。これらの合成に必要なボロン酸は市販されている。
Figure 0006401773
TFA塩
Figure 0006401773
Figure 0006401773
TFA塩収率：27％。鈴木カップリング-Pd(PPh3)4-K2CO3法。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
TFA塩収率：36％。鈴木カップリング-Pd(PPh3)4-K2CO3法。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
TFA塩収率：54％。鈴木カップリング-Pd(PPh3)4-K2CO3法。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
TFA塩収率：29％。鈴木カップリング-Pd(PPh3)4-K2CO3法。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
TFA塩収率：35％。鈴木カップリング-Pd(PPh3)4-K2CO3法。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
TFA塩収率：18％。鈴木カップリング-Pd(PPh3)4-K2CO3法。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
1H-インドール-2-カルボニトリル（0.5g）をDMF（10mL）に室温で溶解した。溶液を氷水浴で冷却した。N-ヨードスクシンイミド（NIS、0.9g）を少しずつ加えた。反応混合物を室温で12時間撹拌した後、水で反応停止した。水層を酢酸エチル（100mL×3）で抽出し、合わせた有機層を水（40mL×5）で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒をロータリーエバポレーターで除去した。残渣を丸底フラスコに加え、Boc2O（3.1g）およびTHF（20mL）を加えた。次いで、DMAP（900mg）を少しずつ加えた。反応混合物を室温で12時間撹拌した。溶媒をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、CD174を得た（1.52g、収率82％）。
Figure 0006401773
2-イソプロポキシ-4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン（0.6g）およびCD174（0.7g）、ならびにTHF（10m）を丸底フラスコに加えた。溶液を氷水浴で冷却した。THF中のiPrMgCl-LiCl複合体溶液（1.3M、1.60mL）をシリンジで加えた。反応混合物を室温で3時間撹拌した。反応混合物を飽和NH4Cl水溶液で反応停止した。水層を酢酸エチル（100mL×3）で抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、CD182を得た（0.18g）。
Figure 0006401773
S13およびCD182のPd(PPh3)4-K2CO3法を用いた鈴木カップリングと、続くTFA-CH2Cl2中でのBoc基の脱保護により、HPLC精製後に化合物番号90をCF3CO2Hの塩として収率2％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Ph3P-Br2（CH2Cl2中2.4g Br2および3.93g PPh3から調製、参照文献J. Org. Chem. 1976, V 41, No. 20, p. 3279参照）をMeCNに溶解した。2-メチル-4-ヒドロキシキノリン（1.5g）を一度に加え、混合物を2時間加熱還流した。溶媒を除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、4-ブロモ-2-メチルキノリンCD229を0.60g（収率41％）で得た。CD229は、2-メチル-4-ヒドロキシキノリンおよびPOBr3のトルエン溶液を4時間還流することによっても調製されている。
2-イソプロポキシ-4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン（5.20g）、4-ブロモ-2-メチルキノリン（2.23g）、およびTHF（40 m）を丸底フラスコに加えた。溶液をドライアイス-エタノール浴で-78℃まで冷却した。BuLi（2.5M THF溶液、7.2mL）をシリンジで加えた。反応混合物を-78℃で3時間撹拌した後、飽和NH4Cl水溶液で反応停止した。水層を酢酸エチル（100mL×3）で抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、2-メチルキノリン-4-ボロン酸ピナコールエステルCD231を1.67g（収率62％）で得た。
Figure 0006401773
S13（728mg）、2-メチルキノリン-4-ボロン酸ピナコールエステル（1.67g）、1,2-ジメトキシエタン（60mL）、およびNa2CO3（20mL、2M水溶液）を丸底フラスコ中で混合し、系を脱気して酸素を除去した。Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2複合体（257mg）を一度に加え、系を再度脱気した。混合物を窒素雰囲気下で12時間加熱還流した。次いで、反応混合物を水で希釈し、水層を酢酸エチル（100mL×3）で抽出し、合わせた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減圧下で除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、所望の生成物である化合物番号84を0.64g（収率63％）で得た。逆相HPLCでさらなる精製を行って、対応する生成物をCF3CO2Hの塩で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
以下の化合物を化合物番号84の調製と同じ鈴木カップリング反応条件（塩基として炭酸ナトリウムおよび触媒として(Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2複合体）を用いて調製した。これらの精製を逆相HPLCで実施して、対応する生成物をCF3CO2Hの塩で得た。
Figure 0006401773
2-トリフルオロメチル-4-ブロモキノリン（500mg）を無水THF（15mL）に溶解した。溶液をドライアイス-エタノール浴中で-78℃まで冷却した。BuLi（0.94mL、THF中2.5M）を滴加し、混合物を-78℃で15分間撹拌した。2-イソプロポキシ-4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン（506mg）をシリンジで加え、反応混合物を-78℃で3時間撹拌した後、飽和NH4Cl水溶液で反応停止した。水層を酢酸エチル（50mL×3）で抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、2-トリフルオロメチルキノリン4-ボロン酸ピナコールエステルCD194を0.35g（収率60％）で得た。
Figure 0006401773
Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2複合体-Na2CO3（2M）条件を用いて、CD194およびS13から化合物番号85-TFA塩を調製した。収率10％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-トリフルオロメチル-1H-インドール（0.5g）をDMF（15mL）に室温で溶解した。溶液を氷水浴で冷却した。N-ヨードスクシンイミド（NIS、0.726g）を少しずつ加えた。反応混合物を室温で12時間撹拌した後、水で反応停止した。水層を酢酸エチル（100mL×3）で抽出し、合わせた有機層を水（40mL×5）で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒をロータリーエバポレーターで除去した。残渣を丸底フラスコに加え、Boc2O（1.18g）およびTHF（20mL）を加えた。次いで、DMAP（488mg）を少しずつ加えた。反応混合物を室温で12時間撹拌した。溶媒をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、CC52を得た（1.52g、2段階で収率91％）。
Figure 0006401773
2-イソプロポキシ-4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン（690g）、CC52（1.015g）、およびTHF（20 m）を丸底フラスコに加えた。溶液を氷水浴で冷却した。iPrMgCl-LiCl（1.3M THF溶液、2.50mL）をシリンジで加えた。反応混合物を0℃で3時間撹拌した。反応混合物を飽和NH4Cl水溶液で反応停止した。水層を酢酸エチル（50mL×3）で抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、CD176を0.67g（収率66％）で得た。
Figure 0006401773
Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2複合体-Na2CO3（2M）条件を用いて、CD176およびS13の鈴木カップリングから化合物86-TFA塩を調製した。収率5％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3-ブロモ-2-メチルイミダゾ[1,2-a]ピリジン（2.11g）および2-イソプロポキシ-4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン（2.98g）を無水THF（40mL）に溶解し、溶液を氷水浴で冷却した。iPrMgCl-LiCl（THF中1.3M、10mL）をシリンジポンプで30分かけて加えた。反応混合物を2.5時間撹拌した後、飽和NH4Cl水溶液で反応停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、所望のボロン酸エステルCD168を1.25g（収率48％）で得た。
Figure 0006401773
Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2複合体-Na2CO3（2M）下でのS13およびCD168の鈴木カップリングにより、化合物番号87-TFA塩を収率＜7％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
TFA塩収率：45％。鈴木カップリング-Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2複合体-Na2CO3（2M）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-メトキシ-4-ブロモキノリンの調製は国際公開公報第2010/030722号に報告されており、文献中の手順に従った。2,4-ジブロモキノリン（1.8g）およびナトリウムメトキシド（MeOH中25％、1.28g）を無水MeOH（10mL）に溶解した。反応混合物を１時間加熱還流した。反応混合物を室温まで冷却し、MeOHをロータリーエバポレーターで除去した。残った残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、2-メトキシ-4-ブロモキノリンを0.715g（収率48％）で得た。
2-メトキシ-4-ブロモキノリン（357mg）を無水THF（15mL）に溶解し、ドライアイス-エタノール浴で-78℃まで冷却した。BuLi（THF中2.5M、1mL）をシリンジでゆっくり加え、混合物を-78℃で10分間撹拌した後、2-イソプロポキシ-4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン（502mg）を加えた。反応混合物をさらに3時間撹拌した後、飽和NH4Cl水溶液で反応停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、所望のボロン酸エステルCD215を0.35g（収率82％）を得た。
Figure 0006401773
Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2複合体-Na2CO3（2M）条件下でのS13およびCD215の鈴木カップリングにより、化合物番号89-TFA塩を収率35％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-ブロモ-6-クロロ-キノリン（500mg）および2-イソプロポキシ-4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン（1.04g）を無水THF（20mL）に溶解し、混合物をドライアイス-エタノール浴で-78℃まで冷却した。BuLi（THF中2.5M、1.2mL）をシリンジでゆっくり加え、反応混合物を-78℃でさらに3時間撹拌した後、飽和NH4Cl水溶液で反応停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、所望の6-クロロ-キノリン-4-ボロン酸ピナコールエステルCD224を0.37g（収率67％）を得た。
Figure 0006401773
Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2複合体-Na2CO3（2M）条件下でのS13およびCD224の鈴木カップリングにより、化合物番号90-TFA塩を収率44％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
7-フルロキノリン-4-ボロン酸ピナコールエステルCD223を4-ブロモ-7-フルロ-キノリンから、CD224の調製と同じ方法を用いて、収率75％で調製した。
Figure 0006401773
Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2複合体-Na2CO3（2M）条件下での7-フルロキノリン-4-ボロン酸ピナコールエステル（CD223）およびS13の鈴木カップリングにより、化合物番号91-TFA塩を31％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
6-フルロキノリン-4-ボロン酸ピナコールエステルCD234を4-ブロモ-6-フルロ-キノリンから、CD224の調製と同じ方法を用いて、収率85％で調製した。
Figure 0006401773
Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2複合体-Na2CO3（2M）条件下での6-フルロキノリン-4-ボロン酸ピナコールエステル（CD234）およびS13の鈴木カップリングにより、化合物番号92-TFA塩を47％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-イソプロピルピリジン-4-ボロン酸ピナコールエステルCD263を4-ブロモ-2-イソプロピルピリジンから、CD224の調製と同じ方法を用いて、収率30％で調製した。
Figure 0006401773
Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2複合体-Na2CO3（2M）条件下での2-イソプロピルピリジン-4-ボロン酸ピナコールエステル（CD263）およびS13の鈴木カップリングにより、化合物番号93-TFA塩を収率46％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-メチルピリジン-4-ボロン酸ピナコールエステルはSmall Molecules Inc.から市販されている。また、以下の手順からも調製されている：4-ブロモ-2-メチルピリジン（1.0g）、ビス(ピナコラト)ジボロン（1.4g）、酢酸カリウム（1.35g）、および無水ジオキサン（30mL）を丸底フラスコ中で混合した。系を脱気して酸素を除去し、Pd(dppf)Cl2（35mg）を一度に加えた。系を再度脱気し、100℃で12時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、黒色沈澱をろ去した。溶媒をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムで精製して、2-メチルピリジン-4-ボロン酸ピナコールエステルを得た。
Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2複合体-Na2CO3（2M）条件下での2-メチルピリジン-4-ボロン酸ピナコールエステルおよびS13の鈴木カップリングにより、化合物番号94-TFA塩を収率27％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3-メチルピリジン-4-ボロン酸ピナコールエステルCD275を4-ブロモ-3-メチルピリジンから、2-メチルピリジン-4-ボロン酸ピナコールエステルの調製と同じ方法を用いて、収率54％で調製した。ESI-MS C12H19BNO2 [M+H]+ 計算値＝220.15、実測値：220.72。
Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2複合体-Na2CO3（2M）条件下での3-メチルピリジン-4-ボロン酸ピナコールエステルおよびS13の鈴木カップリングにより、化合物番号95-TFA塩を収率27％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
TFA塩収率：29％ 鈴木カップリング-Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2複合体-Na2CO3（2M）。必要なボロン酸は市販されている。
Figure 0006401773
4-ニトロ-5,6,7,8-テトラヒドロキノリン-N-オキシドの調製は、以前に国際公開公報第02076979号に報告されており、同じ手順に従った。
Figure 0006401773
5,6,7,8-テトラヒドロキノリン（5.2g）を100mLの無水THFに溶解し、溶液を氷水浴で冷却した。m-CPBA（10.8g）を少しずつ加え、混合物を0℃で1時間撹拌した。次いで、THFをロータリーエバポレーターで除去し、残渣をCH2Cl2に溶解した。CH2Cl2溶液をNaOH（2N、20mL）およびクエン酸（10％、40mL）で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒をロータリーエバポレーターで除去し、5,6,7,8-テトラヒドロキノリン-N-オキシドの残渣を精製せずに次の段階で用いた。
5,6,7,8-テトラヒドロキノリン-N-オキシドを含む丸底フラスコに、HNO3-H2SO4（10mL（90％）：14mL（98％））の混合物を0℃で加えた。次いで、混合物を80℃で2時間加熱し、次いで、角氷に加えた。水層をCH2Cl2で抽出して、4-ニトロ-5,6,7,8-テトラヒドロキノリン-N-オキシドを得た。粗製材料をそれ以上精製せずに用いた。
粗製4-ニトロ-5,6,7,8-テトラヒドロキノリン-N-オキシドを酢酸（40mL）に溶解し、亜鉛末（20.8g）を室温でゆっくり加え、混合物を80℃で4時間加熱した。沈澱をろ去し、酢酸で洗浄した。合わせた酢酸溶液をロータリーエバポレーターで濃縮し、NaOH水溶液で中和した。水溶液をクロロホルム（50mL×8）で抽出し、合わせた有機相を無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラムで精製して、4-アミノ-5,6,7,8-テトラヒドロキノリンを1.4g（3段階で23％）で得た。
4-アミノ-5,6,7,8-テトラヒドロキノリン（1.4g）を48％HBr（6.7mL）に溶解し、溶液を-10℃まで冷却した。この溶液に、Br2をシリンジで加え、続いて水4mL中のNaNO2（3.3g）をゆっくり加え、反応混合物を室温まで加温し、室温で1時間撹拌した。次いで、反応混合物を氷上に加え、水酸化ナトリウム水溶液を用いてpHを9に調節した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒をロータリーエバポレーターで除去し、残りの残渣をフラッシュカラムクロマトグラムで精製して、4-ブロモ-5,6,7,8-テトラヒドロキノリンを1.00g（収率47％）で得た。
4-ブロモ-5,6,7,8-テトラヒドロキノリン（0.5g）、ビス(ピナコラト)ジボロン（1g）、酢酸カリウム（735mg）、および無水ジオキサン（20mL）を丸底フラスコに加えた。系を脱気して酸素を除去し、続いてPd(dffp)Cl2（176mg）を一度に加えた。系を再度脱気し、反応混合物を100℃で12時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、黒色沈澱をろ去した。溶媒をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラムで精製して、5,6,7,8-テトラヒドロキノリン-4-ボロン酸ピナコールエステルCD292を0.18g（収率28％）で得た。
Figure 0006401773
Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2複合体-Na2CO3（2M）条件下での5,6,7,8-テトラヒドロキノリン-4-ボロン酸ピナコールエステルおよびS13の鈴木カップリングにより、化合物番号97-TFA塩を収率33％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号98をS13および8-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-2,3-ジヒドロ-[1,4]ジオキシノ[2,3-b]ピリジンから、鈴木カップリング条件［触媒としてPd(dppf)Cl2-CH2Cl2および塩基としてNa2CO3 2M水溶液］を用いて合成した。HPLC精製により、化合物番号98-TFA塩を収率25％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号99をS13および3-(N,N-ジメチルアミノ)フェニルボロン酸から、鈴木カップリング条件［触媒としてPd(dppf)Cl2-CH2Cl2および塩基としてNa2CO3 2M水溶液］を用いて合成した。HPLC精製により、化合物番号99-TFA塩を収率50％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
CD303、4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1,8-ナフチリジンを、前述のスキームに示す方法に従って合成した。4-ブロモ-1,8-ナフチリジン（400mg）、ビス(ピナコラト)ジボロン（1.0g）、およびKOAc（600mg）を磁気撹拌子を入れた丸底フラスコに加えた。無水1,4-ジオキサン（20mL）を加え、混合物を5分間脱気して酸素を除去した。Pd(dppf)Cl2（140mg）を加え、系を再度脱気し、続いて窒素を再充填した。混合物を100℃で終夜（＞12時間）加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、ろ過した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣を調製用HPLCで精製して、CD303-TFA塩を0.38gで得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号100をS13および4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1,8-ナフチリジン-TFA塩から、鈴木カップリング条件［触媒としてPd(dppf)Cl2-CH2Cl2および塩基としてNa2CO3 2M水溶液］を用いて合成した。HPLC精製により、化合物番号100-TFA塩を収率5％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
N1,N1-ジメチル-N2-(4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)キノリン-2-イル)エタン-1,2-ジアミンを前述のスキームに示す方法に従って合成した。
段階1：CD298の合成。2,4-ジブロモキノリン（572mg）、N1,N1-ジメチルエタン-1,2-ジアミン（240mg）、Cs2CO3（652mg）、およびDMSO（4mL）を密封チューブに加えた。混合物を170℃で12時間加熱した。混合物を室温まで冷却し、逆相調製用HPLCで精製した。所望の生成物CD298-TFA塩を0.47g（収率57％）で単離した。4-アミノ化位置異性体も収率約40％で単離した。遊離アミンCD298もフラッシュカラムクロマトグラフィで精製したが、不満足な収率であった。CD298の構造を、2-ブロモ-N-メチルキノリン-4-アミン（Chemistry of heterocyclic compounds, vol 34, No. 7, 1998, page 837）、2-ブロモキノリン-4-アミン（J Med Chem 2009, 52, 926-931）、および4-ブロモキノリン-2-アミン（biochemistry, 2004, 43, 1440-1448）の1H NMRデータを比較することによって確認した。
Figure 0006401773
段階2：CD302の合成。CD302［N1,N1-ジメチル-N2-(4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)キノリン-2-イル)エタン-1,2-ジアミン］を、CD303［4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1,8-ナフチリジン］の調製と同じ方法を用いて、CD298とビス(ピナコラト)ジボロンとのカップリングから合成した。CD302を収率90％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号101をS13およびN1,N1-ジメチル-N2-(4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)キノリン-2-イル)エタン-1,2-ジアミンから、鈴木カップリング条件［触媒としてPd(dppf)Cl2-CH2Cl2および塩基としてNa2CO3 2M水溶液］を用いて合成した。HPLC精製により、化合物番号102-TFA塩を収率37％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号102をS13および(2,3-ジヒドロベンゾ[b][1,4]ジオキシン-5-イル)ボロン酸から、鈴木カップリング条件［触媒としてPd(dppf)Cl2-CH2Cl2および塩基としてNa2CO3 2M水溶液］を用いて合成した。HPLC精製により、化合物番号102-TFA塩を収率28％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号103をS13および2-イソプロポキシ-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ピリジンから、鈴木カップリング条件［触媒としてPd(dppf)Cl2-CH2Cl2および塩基としてNa2CO3 2M水溶液］を用いて合成した。HPLC精製により、化合物番号103-TFA塩を収率43％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
S13および2-(tert-ブトキシ)-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ピリジンの鈴木カップリング［条件：触媒としてPd(dppf)Cl2-CH2Cl2および塩基としてNa2CO3 2M水溶液］により、化合物番号104および化合物番号104のtert-Buエーテル型の混合物を得た。混合物をTFAで処理し、続いてHPLC精製して、化合物番号104-TFA塩を主生成物として得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号105をS13および4-(N,N-ジメチルアミノ)フェニルボロン酸から、鈴木カップリング条件［触媒としてPd(dppf)Cl2-CH2Cl2および塩基としてNa2CO3 2M水溶液］を用いて合成した。HPLC精製により、化合物番号105-TFA塩を収率31％で得た。
Figure 0006401773
CD278（25mg、CF3CO2H塩）をTHF（15mL）に溶解した。溶液を脱気して酸素を除去し、10％Pd/活性炭（20mg）を加えた。水素風船を反応系に適用し、12時間後に反応を停止した。Pd-炭をろ去し、溶媒をロータリーエバポレーターで除去した。残渣を逆相HPLCで精製して、所望の生成物である化合物番号106をCF3CO2H の塩として17mg（収率81％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
CD281（10mg、CF3CO2H塩）、ヨードベンゼン（204mg）、Cs2CO3（650mg）、プロリン（22mg）、CuI（40mg）、およびDMF（5mL）を丸底フラスコに加えた。混合物を脱気して酸素を除去し、次いで120℃で12時間加熱した。反応混合物を水で反応停止し、水層を酢酸エチル（50mL×3）で抽出した。合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒をロータリーエバポレーターで除去し、残渣を相HPLCで精製した。所望の生成物である化合物番号107をTFA塩として10mg（収率19％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
CD281（TFA塩、15mg）、PhB(OH)2（36mg）、Cu(OAc)2（46mg）および無水モレキュラーシーブ4Å（250mg）を丸底フラスコに加えた。ピリジン（0.05mL）およびCH2Cl2（5mL）をシリンジで加えた。酸素風船を反応混合物に適用し、反応混合物を室温で2日間撹拌した。反応混合物をセライト(登録商標)のパッドを通してろ過し、セライト(登録商標)をメタノールで洗浄した。有機層を合わせ、溶媒をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号108（4mg、22％）、化合物番号109（2mg、12％）、および化合物番号107（4mg、25％）を、化合物番号108および109はTFA塩の形で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
S13（34mg）、ベンズイミダゾール（24mg）、Cs2CO3（190mg）、およびDMSO（4mL）を磁気撹拌子を入れた密封チューブに加えた。反応混合物を170℃で12時間加熱した。反応混合物を水で希釈し、水層を酢酸エチル（50mL×2）で抽出した。合わせた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥し、溶媒をロータリーエバポレーターで除去した。残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号110をCF3CO2Hの塩で得た（18mg、収率33％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号111をS13および2-メチルベンズイミダゾールから、化合物番号110の調製と同じ縮合法を用い、CF3CO2Hの塩として収率5％で調製した。
Figure 0006401773
TFA塩
Figure 0006401773
Figure 0006401773
S6（400mg）をイソブチロニトリル（2mL）に溶解した。HClガスを溶液に40分間通気し、溶液を90℃で3時間加熱した。溶媒を減圧下で濃縮し、残渣をエタノール（40mL）に溶解した。NaOH（10％、30mL）をエタノール溶液に加え、混合物を終夜加熱還流した。溶液を室温まで冷却し、減圧下で濃縮した。酢酸エチル（20mL）を加え、続いてHClを加えて、pH＝4〜5に設定した。沈澱をろ取し、残渣をジエチルエーテルで洗浄して、CD171を0.26gで得た。
Figure 0006401773
CD171（0.26g）をオキシ塩化リン（V）（5mL）と混合し、90℃で6時間加熱した。混合物を減圧下で濃縮し、過剰のNaHCO3飽和水溶液で中和した。酢酸エチル（30mL）を加え、沈澱をろ取した。固体残渣をジエチルエーテルで洗浄して、CD177を120mg（収率43％）で得た。
Figure 0006401773
Pd(PPh3)4-K2CO3条件を用いた2-メチル-3-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1H-インドール-1-カルボン酸tert-ブチルとCD177との鈴木カップリング、およびTFA-CH2Cl2中でのBoc基の脱保護により、化合物番号112をCF3CO2Hの塩として収率36％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
S6（300mg）、テトラヒドロピラニル-4-カルボニトリル（330mg）、およびジオキサン（10mL）を丸底フラスコに加えた。HClガスを溶液に40分間通気し、溶液を80℃で5時間加熱した。溶媒を減圧下で濃縮し、残渣をエタノール（30mL）に溶解した。NaOH（10％、30mL）をエタノール溶液に加え、混合物を12時間加熱還流した。溶液を室温まで冷却し、減圧下で濃縮した。酢酸エチル（20mL）を加え、続いてHCl水溶液を加えてpH＝4〜5に設定した。沈澱をろ取し、残渣をジエチルエーテルで洗浄して、CD188を0.12g（収率33％）で得た。ESI-MS C21H23N4O4 [M+H]+ 計算値＝395.17、実測値：395.58。
CD188（0.12g）をオキシ塩化リン（V）（10mL）と混合し、90℃で6時間加熱した。混合物を減圧下で濃縮し、過剰のNaHCO3飽和水溶液で中和した。酢酸エチル（20mL）を加え、沈澱をろ取した。固体残渣をジエチルエーテルで洗浄して、CD197を80mg（収率63％）で得た。
Pd(PPh3)4-K2CO3条件を用いたキノリン-4-ボロン酸ピナコールエステルとCD197との鈴木カップリングにより、化合物番号113-TFA塩を収率8％で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3,5-ジメチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)イソキサゾール（H1）（12.2g、54.6mmol、2当量）、4-ブロモ-1-フルオロ-2-ニトロベンゼン（H2）（6g、27.3mmol、1当量）およびK2CO3（11.3g、81.9mmol、3.0当量）の混合物に、1,2-ジメトキシエタン（60mL）および水（40mL）を室温で加えた。混合物を窒素でパージした後、Pd(PPh3)4（1.6g、1.4mmol、0.05当量）を一度に加えた。反応混合物を窒素でパージし、90℃で終夜還流した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥し、濃縮した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、5.5g（23.1mmol）の中間体HK-06-203を明るい黄色の固体で得た（収率85％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
無水DMF（40mL）中のNaH（1.8g、鉱油中60％、46mmol、2.0当量）の懸濁液に、シアノ酢酸エチル（3.9g、34.5mmol、1.5当量）を0℃で滴加し、反応混合物を室温で30分間撹拌した。混合物を0℃まで冷却し、HK-06-203（5.45g、23mmol、1.0当量）の無水DMF溶液（20mL）をシリンジで加えた。反応混合物を室温まで加温し、終夜撹拌した。酢酸エチル（50ml）およびMeOH（20ml）を反応混合物に加え、pHを2N HCl水溶液で2〜3に調節した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、6.9g（21mmol）の中間体HK-06-204を明るい黄色の油状物で得た（収率91％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
HK-06-204（2.5g、7.5mmol、1.0当量）の酢酸（23mL）溶液に85℃で亜鉛末（1.21g、18.6mmol、2.5当量）を少しずつ加えた。混合物を85℃で1時間撹拌し、さらに0.73gの亜鉛末（11.2mmol、1.5当量）を追加し、反応混合物を同じ温度で終夜撹拌した。反応混合物を冷却してろ過し、ろ液を濃縮した。次いで、残渣を酢酸エチルに溶解し、pHを飽和NaHCO3水溶液で中和し、続いて酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、無水Na2SO4で乾燥し、濃縮し、残りの残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、0.96g（3.2mmol）の中間体HK-06-205を褐色固体で得た（収率43％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
中間体HK-06-205（2.92g、9.8mmol）をMeCN（30mL）に室温で溶解した。無水HClを混合物に30分間通気し、反応混合物を85℃で3時間還流した。次いで、反応混合物を室温まで冷却し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。暗褐色固体の粗製HK-06-208をそれ以上精製せずに次の段階で用いた。
Figure 0006401773
粗製混合物HK-06-208をEtOH（80mL）に溶解した。10％NaOH水溶液（40mL）を加え、続いて終夜還流した。次いで、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、水性残渣を2N HCl水溶液で酸性化した。褐色沈澱をろ取し、水およびジエチルエーテルで洗浄して、2.06gの中間体HK-06-209を褐色固体で得た（2段階で収率72％）。
Figure 0006401773
中間体HK-06-209（2g、6.8mmol）をPOCl3（20mL）と混合し、混合物を90℃で6時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。酢酸エチル（20mL）を加え、pHを過剰の飽和NaHCO3水溶液で8に調節した。混合物をろ過して、1.0gの中間体HK-06-211を褐色固体で得た（収率86％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
HK-06-211（0.03g、0.1mmol、1.0当量）、2-メチル-3-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1H-インドール-1-カルボン酸tert-ブチル（0.1g、0.3mmol、3.0当量）、およびK2CO3（0.07g、0.5mmol、5.0当量）の混合物に、DME（6mL）および水（4mL）を室温で加えた。混合物を窒素でパージした後、Pd(PPh3)4（0.02g、0.02mmol、0.02当量）を一度に加えた。反応混合物を窒素でパージし、90℃で9時間還流した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥し、濃縮した。残渣をCH2Cl2およびトリフルオロ酢酸の1：1混合物に溶解し、室温で30分間撹拌した。次いで、混合物を濃縮し、調製用HPLCで精製した。次いで、最終化合物をCH3CN：H2O（1：1）に溶解し、凍結乾燥して、0.014g（0.03mmol）の最終化合物である化合物番号114-CF3CO2H塩を明るい黄色の固体で得た（収率85％）。
Figure 0006401773
化合物番号115（TFA塩）をHK-06-211から、鈴木カップリング条件［Pd(PPh3)4-K2CO3法］を用いて調製した（収率12％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-エチル-1H-インドール（H-11、0.5g、3.4mmol、1当量）およびN-ヨードスクシンイミド（0.93g、4.13mmol、1.2当量）の混合物を無水DMF中、室温で終夜撹拌した。反応混合物を過剰の酢酸エチルで希釈し、H2Oおよび食塩水で洗浄した。有機相を無水Na2SO4で乾燥し、濃縮した。残りの粗製HK-06-230を無水THF中で二炭酸ジ-tert-ブチル（1.5g、6.9mmol）と混合した。この混合物にDMAP（0.42g、3.44mmol）を分割して加えた。反応混合物を周囲雰囲気下、室温で3時間撹拌した。次いで、混合物を濃縮し、残りの残渣をフラッシュクロマトグラフィで精製して、0.6g（1.6mmol）の中間体HK-06-231を得た（2段階で収率47％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
無水THF中の中間体HK-06-231（0.6g、1.6mmol）の溶液に、-78℃でn-BuLi（2.9mmol、1.8当量）を滴加した。反応混合物を-78℃で30分間撹拌した。次いで、この混合物に2-イソプロポキシ-4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン（0.6g、2当量）を加え、反応混合物を-78℃で2時間撹拌した。反応混合物を塩化アンモニウム水溶液で反応停止し、酢酸エチルで抽出した。有機相を無水Na2SO4で乾燥し、濃縮した。残りの粗生成物をフラッシュクロマトグラフィで精製して、0.39g（1.04mmol）の中間体HK-06-232（収率65％）を得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
S13（0.03g、0.1mmol、1.0当量）、HK-06-232（0.11g、0.3mmol、3.0当量）およびK2CO3（0.07g、0.5mmol、5.0当量）の混合物に、DME（6mL）および水（4mL）を室温で加えた。混合物を窒素でパージした後、Pd(PPh3)4（0.02g、0.02mmol、0.02当量）を一度に加えた。反応混合物を窒素でパージし、90℃で終夜還流した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥し、濃縮した。残渣をCH2Cl2およびトリフルオロ酢酸の1：1混合物に溶解し、室温で30分間撹拌した。次いで、混合物を濃縮し、調製用HPLCで精製した。次いで、最終化合物をCH3CN：H2O（1：1）に溶解し、凍結乾燥して、0.018g（0.03mmol）の最終化合物である化合物番号116（TFA塩）を明るい黄色の固体で得た（収率30％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4.5g（23.8mmol）の1-ブロモ-4-フルオロ-2-メチルベンゼンを1.5ml濃H2SO4および1.5ml発煙硝酸の混合物に0℃で加え、反応混合物を同じ温度で1時間撹拌した。反応混合物を氷水に加え、CH2Cl2に抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4で乾燥し、濃縮した。残りの残渣をフラッシュクロマトグラフィで精製して、中間体1-ブロモ-4-フルオロ-2-メチル-5-ニトロベンゼン（HK-06-237）を明るい黄色の液体で得た（収率80％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3,5-ジメチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)イソキサゾール（0.89g、4mmol、2当量）、1-ブロモ-4-フルオロ-2-メチル-5-ニトロベンゼン（0.47g、2mmol、1当量）、およびK2CO3（0.83g、6mmol、3.0当量）の混合物に、DME（24mL）および水（16mL）を室温で加えた。混合物を窒素でパージした後、Pd(PPh3)4（0.12g、0.1mmol、0.05当量）を一度に加えた。反応混合物を窒素でパージし、90℃で終夜還流した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥し、濃縮した。残渣をフラッシュクロマトグラフィで精製して、0.3g（1.2mmol）の中間体HK-06-238を明るい黄色の固体で得た（収率60％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
無水DMF（3mL）中のNaH（0.09g、鉱油中60％、2.2mmol、2.0当量）の懸濁液に、シアノ酢酸エチル（0.19g、1.65mmol、1.5当量）を0℃で滴加し、反応混合物を室温で30分間撹拌した。混合物を0℃まで冷却し、HK-06-238（0.28g、1.1mmol、1.0当量）の無水DMF溶液（2mL）をシリンジで加えた。反応混合物を室温まで加温し、終夜撹拌した。酢酸エチル（10ml）およびMeOH（5ml）を反応混合物に加え、pHを2N HCl水溶液で2〜3に調節した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュクロマトグラフィで精製して、0.34g（1mmol）の中間体HK-06-245を得た（収率90％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
HK-06-245（0.32g、1.06mmol、1.0当量）の酢酸（6mL）溶液に80℃で亜鉛末（0.17g、2.7mmol、2.5当量）を少しずつ加えた。混合物を85℃で1時間撹拌し、さらに0.10gの亜鉛末（1.6mmol、1.5当量）を追加し、反応混合物を同じ温度で3時間撹拌した。反応混合物を冷却してろ過し、その後、ろ液を濃縮した。次いで、残渣を酢酸エチルに溶解し、pHを飽和NaHCO3で中和し、続いて酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、無水Na2SO4で乾燥し、濃縮し、残りの残渣をフラッシュクロマトグラフィで精製して、0.12g（0.38mmol）の中間体HK-06-248を得た（収率43％）。
Figure 0006401773
中間体HK-06-248（0.8g、2.5mmol）を室温でMeCN（20mL）に溶解した。無水HClを混合物に30分間通気し、反応混合物を85℃で3時間還流した。次いで、反応混合物を室温まで冷却し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。褐色固体の粗生成物（HK-06-249）をそれ以上精製せずに次の段階で用いた。
Figure 0006401773
粗製混合物HK-06-249をEtOH（20mL）に溶解し、10％NaOH水溶液（10mL）を加え、続いて終夜還流した。次いで、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、水性残渣を2N HCl水溶液で酸性化した。褐色沈澱をろ過し、水およびジエチルエーテルで洗浄して、中間体HK-06-250を明るい褐色固体で得た（0.63g、2段階で収率81％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
中間体HK-06-250（0.31g、1mmol）をPOCl3（3.5mL）と混合し、混合物を90℃で6.5時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。酢酸エチル（5mL）を加え、pHを過剰の飽和NaHCO3水溶液で8に調節した。混合物をろ過して、0.33gの中間体HK-06-255を褐色固体で得た（収率99％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
HK-06-255（0.03g、0.1mmol、1.0当量）、4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)キノロン（0.05g、0.3mmol、3.0当量）、およびK2CO3（0.07g、0.5mmol、5.0当量）の混合物に、DME（6mL）および水（4mL）を室温で加えた。混合物を窒素でパージした後、Pd(PPh3)4（0.02g、0.02mmol、0.02当量）を一度に加えた。反応混合物を窒素でパージし、90℃で終夜還流した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥し、濃縮した。次いで、残渣を調製用HPLCで精製した。最終化合物をCH3CN：H2O（1：1）に溶解し、凍結乾燥して、0.01g（0.02mmol）の最終化合物である化合物番号117（TFA塩）を明るい黄色の固体で得た（収率17％）。ESI-MS C26H22N5O [M+H]+ 計算値＝420.18、実測値：420.42。
Figure 0006401773
3,5-ジエチルイソキサゾール（125mg）を無水AcOH（15mL）に溶解した。NBS（178mg）を加え、混合物を2時間加熱還流した後、飽和Na2S2O3水溶液で反応停止した。水層を酢酸エチル（50mL×3）で抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、ZBA18を183mg（収率90％）で得た。ESI-MS C7H10BrNO [M+H]+ 計算値＝204.00、実測値：204.23。
ZBA18（312mg）を無水THF（15mL）に溶解した。溶液をドライアイス-エタノール浴で-78℃まで冷却した。BuLi（0.94mL、THF中2.5M）を滴加し、混合物を-78℃で15分間撹拌した。2-イソプロポキシ-4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン（506mg）をシリンジで加え、反応混合物を-78℃で3時間撹拌した後、飽和NH4Cl水溶液で反応停止した。水層を酢酸エチル（50mL×3）で抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、2-トリフルオロメチルキノリン4-ボロン酸ピナコールエステルZBA24を310mg（収率80％）で得た。
化合物番号118-TFA塩を、Pd(PPh3)4-K2CO3（2M）条件を用いてZBA24およびS13の鈴木カップリングから調製した。収率40％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
5-エチル-3-フェニルイソキサゾール（173mg）を無水AcOH（15mL）に溶解した。NBS（178mg）を加え、混合物を2時間加熱還流した後、飽和Na2S2O3水溶液で反応停止した。水層を酢酸エチル（50mL×3）で抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、ZBA22を226mg（収率90％）で得た。ESI-MS C11H11BrNO [M+H]+ 計算値＝252.00、実測値：252.43。
ZBA22（350mg）を無水THF（15mL）に溶解した。水溶液をドライアイス-エタノール浴で-78℃まで冷却した。BuLi（0.94mL、THF中2.5M）を滴加し、混合物を-78℃で15分間撹拌した。2-イソプロポキシ-4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン（506mg）をシリンジで加え、反応混合物を-78℃で3時間撹拌した後、飽和NH4Cl水溶液で反応停止した。水層を酢酸エチル（50mL×3）で抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、2-トリフルオロメチルキノリン4-ボロン酸ピナコールエステルZBA23を291mg（収率70％）で得た。
化合物番号119-TFA塩を、Pd(PPh3)4-K2CO3（2M）条件を用いてZBA23およびS13の鈴木カップリングから調製した。収率40％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号120：DMF中の化合物番号73（43.5mg）の溶液に、NaH（4mg）およびCH3I（20mg）を加えた。混合物を室温で0.5時間撹拌した。次いで、水を加え、水層をEtOAcで抽出した。合わせたEtOAc抽出物をH2Oで洗浄し、Na2SO4で乾燥し、減圧下で濃縮し、HPLC精製後に化合物番号120（35mg）を得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号121：この化合物は化合物番号73およびBnBrから、化合物番号120と同じ調製法を用いて調製した。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
DMSO（4mL）中のS13（40mg）および2-アミノ-1H-ベンズイミダゾール（40mg）の溶液に、Cs2CO3（60mg）を加えた。混合物を100℃で12時間撹拌した。次いで、水を加え、水層をEtOAcで抽出した。合わせたEtOAc抽出物をH2Oで洗浄し、Na2SO4で乾燥し、減圧下で濃縮し、HPLC精製後に化合物番号122-TFA塩（20mg）を得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
THF（6mL）中のS13（40mg）およびオキシインドール（40mg）の溶液に、K2CO3（60mg）、Pd2(dba)3（17mg）、およびxPhos（70mg）を加えた。混合物を100℃で24時間撹拌した。次いで、水を加え、水層をEtOAcで抽出した。合わせたEtOAc抽出物をH2Oで洗浄し、Na2SO4で乾燥し、減圧下で濃縮し、HPLC精製後に化合物番号123（4mg）を得た。ESI-MS C25H22N5O3 [M+H]+ 計算値＝440.17、実測値：440.32。
Figure 0006401773
化合物番号124：この化合物はS13およびN-メチルオキシインドールから、化合物番号123と同じ調製法を用いて調製した。ESI-MS C26H24N5O3 [M+H]+ 計算値＝454.18、実測値：454.34。
Figure 0006401773
丸底フラスコに、S6（0.37g、1.1mmol）およびシアノギ酸エチル（3mL）を室温で加えた。ジオキサン中の塩化水素溶液を加え、反応混合物を2.5時間加熱還流（82℃）した。次いで、反応混合物を室温まで冷却し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。この粗製混合物に、10％NaOH水溶液（20mL）およびEtOH（50mL）を加え、溶液を6時間加熱還流した。次いで、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、水性残渣を2N HCl水溶液で酸性化した。生成物ZBA89を0℃で沈澱させた。混合物をろ過して、純粋なZBA89を0.31g（収率80％、2段階）の固体で得た。ESI-MS C17H15N4O5 [M+H]+ 計算値＝355.10、実測値：355.45。
Figure 0006401773
丸底フラスコ中、EDCI（0.7g）およびDMAP（0.1g）をMeOH（100mL）およびDCM（30mL）中のZBA89（0.2g）の溶液に室温で加えた。混合物を2日間撹拌し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。次いで、酢酸エチル（40mL）を加えた。生成物ZBA97を沈澱させた。混合物をろ過し、純粋なZBA97を0.12g（収率60％）の固体で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
丸底フラスコに、ZBA97（0.278g）およびPOCl3（8mL）を加えた。混合物を９０℃で6時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。水（20mL）および酢酸エチル（20mL）を加え、pHをNaHCO3飽和水溶液を用いて8に調節した。混合物をろ過して、ZBA104を0.208gの褐色固体で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
CH3MgBr溶液（0.13mL、Et2O中3M）を、THF中のZBA104（40mg）の溶液に室温で加えた。混合物を2時間撹拌し、NH4Cl水溶液を加えた。水層をEtOAcで抽出した。合わせたEtOAc抽出物をH2Oで洗浄し、Na2SO4で乾燥し、減圧下で濃縮して、ZBA116（37mg）を得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号125-TFA塩を、Pd(PPh3)4-K2CO3（2M）条件を用いてZBA116およびキノリン-4-イルボロン酸の鈴木カップリングから調製した。収率40％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号126-TFA塩を、Pd(PPh3)4-K2CO3（2M）条件を用いてZBA116およびCD223の鈴木カップリングから調製した。収率40％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号127-TFA塩を、Pd(PPh3)4-K2CO3（2M）条件を用いてZBA116およびCD224の鈴木カップリングから調製した。収率40％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
アゼチジン-3-カルボニトリル（1.8g）をDCM（50ml）に溶解した。TsCl（3.1g）およびEt3N（6.3mL）を加え、混合物を3時間撹拌した。食塩水を加え、水層をDCMで抽出した。合わせたDCM抽出物をH2Oで洗浄し、Na2SO4で乾燥し、減圧下で濃縮し、フラッシュカラムクロマトグラフィ後にZBA132（1.9g）を得た。
丸底フラスコに、S6（0.37g、1.1mmol）およびZBA132（2g）を室温で加えた。ジオキサン中の塩化水素溶液（40mL）を加え、反応混合物を2.5時間加熱還流（82℃）した。次いで、反応混合物を室温まで冷却し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。この粗製混合物に、10％NaOH水溶液（20mL）およびEtOH（50mL）を加え、溶液を6時間加熱還流した。次いで、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、水性残渣を2N HCl水溶液で酸性化した。水をロータリーエバポレーターで除去し、HPLC精製後に生成物である化合物番号128（40mg）を得た。ESI-MS C26H26N5O5S [M+H]+ 計算値＝520.16、実測値：520.55。
Figure 0006401773
丸底フラスコに、ZBA104（0.038g、0.1mmol）をTHF（7mL）に室温で溶解した。LiAlH4（7.6mg、0.2mmol）を加え、反応混合物を2.5時間撹拌した。次いで、水および酢酸エチルをゆっくり加えた。水層をEtOAcで抽出した。合わせたEtOAc抽出物をH2Oで洗浄し、Na2SO4で乾燥し、減圧下で濃縮して、ZBA139（27mg）を得た。ESI-MS C17H15ClN4O3 [M+H]+ 計算値＝359.09、実測値：359.43。
化合物番号129-TFA塩を、Pd(PPh3)4-K2CO3（2M）条件を用いてZBA139およびキノリン-4-イルボロン酸の鈴木カップリングから調製した。収率38％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
丸底フラスコ中、化合物番号129（0.045g、0.1mmol）をDCM（7mL）およびピリジン（0.4mL）に室温で溶解した。デス-マーチンペルヨージナン（63.6mg、0.15mmol）を加え、反応混合物を2.5時間撹拌した。次いで、水および酢酸エチルをゆっくり加えた。水層をEtOAcで抽出した。合わせたEtOAc抽出物をH2Oで洗浄し、Na2SO4で乾燥し、減圧下で濃縮して、アルデヒド中間体ZBA154を得た。中間体ZBA154、モルホリン（0.3mL）およびNaBH(OAc)3（90mg、0.4mmol）をClCH2CH2Cl（10mL）に溶解し、混合物を終夜撹拌した。次いで、水および酢酸エチルをゆっくり加えた。水層をEtOAcで抽出した。合わせたEtOAc抽出物をH2Oで洗浄し、Na2SO4で乾燥し、減圧下で濃縮して、HPLC精製後に化合物番号130（24mg）を得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号131-TFA塩を、NaBH(OAc)3条件を用いてZBA154およびジメチルアミンの還元的アミノ化から調製した。収率50％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号132-TFA塩を、NaBH(OAc)3条件を用いてZBA154および1-メチルピペラジンの還元的アミノ化から調製した。収率50％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号133-TFA塩を、NaBH(OAc)3条件を用いてZBA154およびジエチルアミンの還元的アミノ化から調製した。収率50％。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号134-TFA塩を、NaBH(OAc)3条件を用いてZBA154およびピロリジンの還元的アミノ化から調製した。収率53％。
Figure 0006401773
S13の合成と同じ反応条件を用いて、S16を合成することができる（以下のスキーム）。無水HCl存在下、S6のイソブチロニトリルとの還流により化合物14を得、これは120℃での塩基（NaOH-水-EtOH）処理後に容易に環化してS15を生じる。S15のPOCl3処理によりS16を得、主要中間体はアミンとの直接縮合/カップリング反応および芳香族ピナコールボロン酸エステルまたはビニルピナコールボロン酸エステルとの鈴木カップリング反応を起こすことができる。化合物番号135を生成する、S16および2-メチル-3-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1H-インドール-1-カルボン酸tert-ブチルの鈴木カップリングの例を、以下のスキームに示す。
Figure 0006401773
S13の合成と同じ反応条件を用いて、S20を合成することができる（以下のスキーム）。4-クロロ-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-2-アミンの2-アミノ-1H-インドール-3-カルボン酸エチルからの合成と同様の方法が、Journal of Medicinal ChemistryにおいてH. D. Hollisin Showalterらにより報告されている（J. Med. Chem. 1999, 42, 5464-5474）。1,4-ジオキサン中、濃HCl存在下、S6のシアナミドとの還流により中間体S18を得、これは還流温度での塩基（NaOH-水-EtOH）処理後に容易に環化してS19を生じる。S19の90℃でのPOCl3処理によりS20を得る。
S20は、アミンとの直接縮合/カップリング反応および芳香族ピナコールボロン酸エステルまたはビニルピナコールボロン酸エステルとの鈴木カップリング反応を起こすことができる主要中間体である。S20および市販のキノリン-4-イルボロン酸の鈴木カップリングの例を、以下のスキームに示す。
Figure 0006401773
1,2-ジクロロエタン中、NaBH(OAc)3および酢酸存在下、S21および様々なアルデヒドの標準の還元的アミンにより、対応する生成物S22を得る。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-ブロモ-2-(4-メチルピペラジン-1-イル)キノリン（CE46）
2,4-ジブロモキノリン（572mg、2.0mmol）および1-メチル-ピペラジン（200mg、2.0mmol）を無水DMSO（6mL）に溶解した。溶液を90℃で16時間加熱した。反応を水で停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、4-ブロモ-2-(4-メチルピペラジン-1-イル)キノリンおよびその位置異性体2-ブロモ-4-(4-メチルピペラジン-1-イル)キノリンを0.50g（比2：1）で得た。2つの異性体の混合物をそれ以上精製せずにCE52の合成に用いた。
Figure 0006401773
2-(4-メチルピペラジン-1-イル)-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)キノリン（CE52）
4-ブロモ-2-(4-メチルピペラジン-1-イル)キノリンおよびその位置異性体（0.50g、1.6mmol、1.0当量）、ビス(ピナコラト)ジボロン（812mg、3.2mmol、2.0当量）、および酢酸カリウム（640mg、6.4mmol、4.0当量）を丸底フラスコに加えた。無水1,4-ジオキサン（10mL）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2（112mg、0.16mmol、0.1当量）を加え、系を再度脱気し、続いて100℃で16時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、CH2Cl2で希釈した。溶液をセライトのパッドを通してろ過し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製した。表題化合物を130mg（異性体の混合物）で単離した。ESI-MS C20H29BN3O2 [M+H]+ 計算値＝354.24；実測値：354.58。
Figure 0006401773
4-(6-メトキシ-2-メチル-4-(2-(4-メチルピペラジン-1-イル)キノリン-4-イル)-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール
方法42の条件を用いた、4-(4-クロロ-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（S13、45mg）および2-(4-メチルピペラジン-1-イル)-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)キノリン（CE52、130mg）の鈴木カップリングにより、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（26mg、収率34％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
N1-(4-ブロモキノリン-2-イル)-N2,N2-ジエチルエタン-1,2-ジアミン（CE49）
2,4-ジブロモキノリン（861mg、3.0mmol）およびN1,N1-ジエチルエタン-1,2-ジアミン（348mg、3.0mmol）を無水DMSO（6mL）に溶解した。溶液を90℃で16時間加熱した。反応を水で停止した。反応混合物のpH値をCF3CO2Hを用いて1未満に調節し、混合物を逆相HPLCで精製して、N1-(4-ブロモキノリン-2-イル)-N2,N2-ジエチルエタン-1,2-ジアミンをTFAの塩として0.30g（収率33％）で得た。2つの位置異性体の比は、分析UPLCにより決定して約1：1である。
Figure 0006401773
(2-((2-(ジエチルアミノ)エチル)アミノ)キノリン-4-イル)ボロン酸（CE55）
N1-(4-ブロモキノリン-2-イル)-N2,N2-ジエチルエタン-1,2-ジアミン（0.30g、1.0mmol、1.0当量）、ビス(ピナコラト)ジボロン（500mg、2.0mmol、2.0当量）、および酢酸カリウム（400mg、4mmol、4.0当量）を丸底フラスコに加えた。無水1,4-ジオキサン（10mL）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2（70mg、0.1mmol、0.1当量）を加え、系を再度脱気し、続いて100℃で16時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、CH2Cl2で希釈した。溶液をセライトのパッドを通してろ過し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで溶離剤としてMeOH-NH3を用いて精製した。表題化合物を140mg（収率38％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
N1-(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)キノリン-2-イル)-N2,N2-ジエチルエタン-1,2-ジアミン
方法42の条件を用いた、S13（70mg）および(2-((2-(ジエチルアミノ)エチル)アミノ)キノリン-4-イル)ボロン酸（CE55、130mg）の鈴木カップリングにより、表題化合物を得た（50mg、収率38％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-ブロモ-N-(2-(ピロリジン-1-イル)エチル)キノリン-2-アミン（CE62）
2,4-ジブロモキノリン（861mg、3.0mmol）、2-(ピロリジン-1-イル)エタンアミン（342mg、3.0mmol）、およびK2CO3（414mg、3.0mmol）を無水DMF（6mL）中で混合した。溶液を90℃で16時間加熱した。反応混合物のpH値をCF3CO2Hを用いて1未満に調節し、混合物を逆相HPLCで精製して、4-ブロモ-N-(2-(ピロリジン-1-イル)エチル)キノリン-2-アミンをTFAの塩として0.48g（収率37％）で得た。2つの位置異性体の比は、分析UPLCにより決定して約1：1である。
Figure 0006401773
N-(2-(ピロリジン-1-イル)エチル)-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)キノリン-2-アミン（CE66）
4-ブロモ-N-(2-(ピロリジン-1-イル)エチル)キノリン-2-アミン（0.48g、1.11mmol）、ビス(ピナコラト)ジボロン（762mg、3.0mmol）、および酢酸カリウム（600mg、6mmol）を丸底フラスコに加えた。無水1,4-ジオキサン（10mL）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2（.105mg、0.15mmol）を加え、系を再度脱気し、続いて100℃で16時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、CH2Cl2で希釈した。溶液をセライトのパッドを通してろ過し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣を逆相HPLCで精製して、表題化合物をTFAの塩として320mg（収率44％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-(2-(ピロリジン-1-イル)エチル)キノリン-2-アミン
方法42の条件を用いた、S13（136mg、0.4mmol）およびN-(2-(ピロリジン-1-イル)エチル)-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)キノリン-2-アミン（CE66、320mg、0.66mmol）の鈴木カップリングにより、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（80mg、収率30％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-ブロモ-N-(2-モルホリノエチル)キノリン-2-アミン（CE60）
2,4-ジブロモキノリン（861mg、3.0mmol）、2-モルホリノエタンアミン（390mg、3.0mmol）、およびK2CO3（414mg、3.0mmol）を無水DMF（6mL）中で混合した。溶液を90℃で16時間加熱した。反応混合物のpH値をCF3CO2Hを用いて1未満に調節し、混合物を逆相HPLCで精製して、4-ブロモ-N-(2-モルホリノエチル)キノリン-2-アミンをTFAの塩として0.545g（1.2mmol、収率40％）で得た。2つの位置異性体の比は、分析UPLCにより決定して約1：1である。
Figure 0006401773
N-(2-モルホリノエチル)-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)キノリン-2-アミン（CE71）
4-ブロモ-N-(2-モルホリノエチル)キノリン-2-アミン（0.54g、1.2mmol）、ビス(ピナコラト)ジボロン（838mg、3.3mmol）、および酢酸カリウム（640mg、6.4mmol）を丸底フラスコに加えた。無水1,4-ジオキサン（10mL）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2（112mg、0.16mmol）を加え、系を再度脱気し、続いて100℃で16時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、CH2Cl2で希釈した。溶液をセライトのパッドを通してろ過し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣を逆相フラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物をTFAの塩として460mg（収率77％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-(2-モルホリノエチル)キノリン-2-アミン
方法42の条件を用いた、S13（205mg、0.6mmol）およびN-(2-モルホリノエチル)-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)キノリン-2-アミン（CE71、0.46g、0.93mmol）の鈴木カップリングにより、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（50mg、収率38％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(3-((4-ブロモキノリン-2-イル)オキシ)プロピル)モルホリン（CE90）
NaH（80mg、鉱油中60％、2.0mmol）および無水DMF（6mL）を丸底フラスコに加えた。このフラスコに、3-モルホリノプロパン-1-オール（300mg、2.0mmol）をシリンジで加え、混合物を室温で20分間撹拌した。2,4-ジブロモキノリン（574mg、2.0mmol）を一度に加え、混合物を70℃で16時間加熱した。反応を水で停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、4-(3-((4-ブロモキノリン-2-イル)オキシ)プロピル)モルホリンを0.168g（0.48mmol、収率24％）で得た。2つの位置異性体の比は、分析UPLCにより決定して約1：1である。
Figure 0006401773
4-(3-((4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)キノリン-2-イル)オキシ)プロピル)モルホリン（CE95）
4-(3-((4-ブロモキノリン-2-イル)オキシ)プロピル)モルホリン0.168g（0.48mmol、1.0当量）、ビス(ピナコラト)ジボロン（254mg、1.0mmol、2.0当量）、および酢酸カリウム（200mg、2.0mmol、4.0当量）を丸底フラスコに加えた。無水1,4-ジオキサン（10mL）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2（40mg、0.05mmol、0.1当量）を加え、系を再度脱気し、続いて100℃で16時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、CH2Cl2で希釈した。溶液をセライトのパッドを通してろ過し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物を80mg（収率42％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(3-((4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)キノリン-2-イル)オキシ)プロピル)モルホリン
方法42の条件を用いた、S13（40mg、0.1mmol）および4-(3-((4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)キノリン-2-イル)オキシ)プロピル)モルホリン（CE95、80mg）の鈴木カップリングにより、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（20mg、収率29％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-ブロモ-N-(3-(4-メチルピペラジン-1-イル)-プロピル)キノリン-2-アミン（CE86）
2,4-ジブロモキノリン（861mg、3.0mmol）、3-(4-メチルピペラジン-1-イル)-プロパン-1-アミン（471mg、3.0mmol）、およびNa2CO3（315mg、3.0mmol）を無水DMF（6mL）中で混合した。溶液を90℃で16時間加熱した。反応混合物のpH値をCF3CO2Hを用いて1未満に調節しし、混合物を逆相HPLCで精製して、4-ブロモ-N-(3-(4-メチルピペラジン-1-イル)-プロピル)キノリン-2-アミンをTFAの塩として0.51g（1.07mmol、収率36％）で得た。2つの位置異性体の比は、分析UPLCにより決定して約1：1である。
Figure 0006401773
N-(3-(4-メチルピペラジン-1-イル)プロピル)-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)キノリン-2-アミン（CE98）
4-ブロモ-N-(3-(4-メチルピペラジン-1-イル)-プロピル)キノリン-2-アミン（0.51g、1.07mmol）、ビス(ピナコラト)ジボロン（711mg、2.8mmol）、および酢酸カリウム（560mg、5.6mmol）を丸底フラスコに加えた。無水1,4-ジオキサン（10mL）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2（98mg、0.14mmol）を加え、系を再度脱気し、続いて100℃で16時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、CH2Cl2で希釈した。溶液をセライトのパッドを通してろ過し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣を逆相HPLCで精製して、表題化合物を600mg（収率＞90％、不純物を含む）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-(3-(4-メチルピペラジン-1-イル)プロピル)キノリン-2-アミン
方法42の条件を用いた、S13（205mg、0.6mmol）およびN-(3-(4-メチルピペラジン-1-イル)プロピル)-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)キノリン-2-アミン（CE98、600mg）の鈴木カップリングにより、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（156mg、収率37％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3-((4-ブロモキノリン-2-イル)アミノ)プロパン酸メチル（CE101）
2,4-ジブロモキノリン（861mg、3.0mmol）、β-アラニンメチルエステルHCl塩（462mg、3.3mmol）、およびK2CO3（515mg、3.7mmol）を無水DMSO（6mL）中で混合した。溶液を90℃で16時間加熱した。反応を水で停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、3-((4-ブロモキノリン-2-イル)アミノ)プロパン酸メチルを0.32g（1.0mmol、収率33％）で得た。2つの位置異性体の比は、分析UPLCにより決定して約1：1である。
Figure 0006401773
3-((4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)キノリン-2-イル)アミノ)プロパン酸メチル（CE108）
3-((4-ブロモキノリン-2-イル)アミノ)プロパン酸メチル（0.42g、1.4mmol）、ビス(ピナコラト)ジボロン（711mg、2.8mmol）、および酢酸カリウム（560mg、5.6mmol）を丸底フラスコに加えた。無水1,4-ジオキサン（10mL）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2（98mg、0.14mmol）を加え、系を再度脱気し、続いて100℃で16時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、CH2Cl2で希釈した。溶液をセライトのパッドを通してろ過し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣を逆相フラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物を620mg（不純物を含む）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3-((4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-キノリン-2-イル)アミノ)プロパン酸
方法42の条件を用いた、S13（180mg、0.5mmol）および3-((4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)キノリン-2-イル)アミノ)プロパン酸メチル（CE108、620mg、1.32mmol）の鈴木カップリングにより、表題化合物を30mg（収率9％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)キノリン-2-オール（化合物番号142A）
CD218（470mg、1.0mmol）をTHF（18mL）に溶解した。HCl水溶液（6N、30mL）を加え、溶液を75℃で16時間加熱した。HPLC精製により、表題化合物370mg（収率82％）を得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(4-(2-クロロキノリン-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（化合物番号143）
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)キノリン-2-オール（化合物番号142、370mg）およびPOCl3（10mL）を90℃で6時間加熱した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をNaHCO3飽和水溶液で中和した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。表題化合物を含む残渣を、それ以上精製せずに化合物番号143の合成に用いた。ESI-MS C26H21 35ClN5O2 [M+H]+ 計算値＝470.14；実測値：470.94。
Figure 0006401773
(2S)-4-((4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)キノリン-2-イル)アミノ)ブタン-1,2-ジオール
4-(4-(2-クロロキノリン-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（化合物番号143、100mg、0.2mmol）、(2S)-4-アミノ-1-(トリフェニルメトキシ)-2-ブタノール（200mg、0.58mmol）、K2CO3（100mg、0.72mmol）、およびDMSO（6mL）を90℃で16時間加熱した。反応を水で停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残渣をCH2Cl2に溶解し、CF3CO2Hを加えた。混合物を1時間撹拌し、続いて調製用HPLCで精製して、表題化合物を10mg（収率9％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(6-メトキシ-2-メチル-4-(3-(ピロリジン-1-イル)フェニル)-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール
方法42：4-(4-クロロ-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（S13、40mg、0.1mmol、1.0当量）および3-(ピロリジノ)フェニルボロン酸（70mg、0.3mmol、3.0当量）を1,2-ジメトキシエタン（4mL）に溶解した。炭酸ナトリウム（2.0M水溶液、2mL）を加えた。系を脱気して酸素を除去し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2（20mg、0.024mmol、0.24当量）を加え、系を再度脱気し、窒素を再充填した。反応混合物を16時間加熱還流した。反応を水で反応停止し、酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残渣を逆HPLCで精製して、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（30mg、収率52％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N,N-ジメチルアニリン
方法42の条件を用いた、S13および3-(N,N-ジメチルアミノ)フェニルボロン酸ピナコールエステルの鈴木カップリングにより、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（34mg、収率65％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(4-(5-クロロ-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-3-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール
方法42の条件を用いた、S13および5-クロロ-3-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジンの鈴木カップリングにより、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（10mg、収率10％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アニリン
丸底フラスコに、4-(4-クロロ-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（S13、347mg、1mmol）および(3-Boc-アミノフェニル)ボロン酸（711mg、3mmol）、1,2-ジメトキシエタン（20mL）、およびNa2CO3（2M、5mL）を加えた。系を脱気して酸素を除去し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2（81mg、0.1mmol）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。反応混合物を16時間加熱還流した。反応を水で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をCH2Cl2（4mL）に溶解し、CF3CO2H（4mL）を加えた。反応混合物を1時間撹拌した後、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣を逆HPLCで精製して、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（80mg、収率16％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
N-(3-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)フェニル)ピバルアミド
3-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アニリン（化合物番号148、40mg）およびピリジン（0.1mL）を無水THF（5mL）に溶解した。この溶液に、無水トリメチル酢酸（60mg、0.3mmol）をシリンジで加え、反応混合物を周囲温度で16時間撹拌した、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣を逆HPLCで精製して、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（38.2mg、収率64％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(メトキシカルボニル)ナフタレン-1-ボロン酸ピナコールエステル
1-Boc-アミノ-4-ブロモナフタレンを、PCT国際特許出願第2003005999号に報告されている先行手順に従って合成した。1-Boc-アミノ-4-ブロモナフタレン（6.13g、19mmol、1.0当量）、ビス(ピナコラト)ジボロン（9.65g、38mmol、2.0当量）、および酢酸カリウム（5.6g、57mmol、3.0当量）を丸底フラスコに加えた。無水1,4-ジオキサン（60mL）をフラスコに加え、これを脱気し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2（1.0g、1.9mmol、0.1当量）を加え、フラスコを再度脱気し、続いて100℃で16時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、CH2Cl2で希釈した。溶液をセライトのパッドを通してろ過し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製した。表題化合物を5.7g（15.4mmol、収率81％）で単離した。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-アミン（化合物番号150）。
方法40：丸底フラスコに、4-(4-クロロ-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（S13、5.4g、16mmol、1.0当量）および4-(メトキシカルボニル)ナフタレン-1-ボロン酸ピナコールエステル（13.75g、37mmol、2.0当量）、1,2-ジメトキシエタン（150mL）、およびNa2CO3（2M、50mL）を加えた。系を脱気して酸素を除去し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2（1.3g、1.6mmol、0.1当量）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。反応混合物を16時間加熱還流した。反応を水で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をCH2Cl2（10mL）に溶解し、CF3CO2H（15mL）を加えた。溶液を周囲温度で1時間撹拌した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をNaHCO3飽和溶液で中和した。水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物を2.23g（2段階で収率31％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
N-(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)-2-(ピロリジン-1-イル)アセトアミド
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-アミン（化合物番号150、10mg、0.023mmol）およびNaHCO3（26mg、0.23mmol）をTHF（4mL）に溶解した。この溶液に、塩化クロロアセチル（26mg、0.23mmol）を加え、溶液を周囲温度で16時間撹拌した。この溶液に、ピロリジン（1mL）を加え、反応混合物を12時間撹拌した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣を逆HPLCで精製して、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（10mg、収率70％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
N-(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)-2-(ピペラジン-1-イル)アセトアミド
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-アミン（化合物番号150、45mg、0.1mmol）およびNaHCO3（160mg、2mmol）を無水DMF（3mL）に溶解した。この溶液に、塩化クロロアセチル（113mg、1.0mmol、10.当量）を加え、溶液を16時間撹拌した。反応混合物を水で希釈し、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣を無水DMFに溶解し、ピペラジン（270mg、3mmol）を一度に加えた。反応混合物を周囲温度で16時間撹拌した後、水で反応停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣を逆HPLCで精製して、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（50mg、収率74％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
N-(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)-2-(3-オキソピペラジン-1-イル)アセトアミド
方法149：4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-アミン（化合物番号150、80mg、0.2mmol、1.0当量）およびNaHCO3（200mg、2.3mmol、11当量）を無水DMF（3mL）に溶解した。この溶液に、塩化クロロアセチル（113mg、1.0mmol、5.0当量）を加え、溶液を16時間撹拌した。反応混合物を水で希釈し、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣を無水DMFに溶解し、2-オキソピペラジン（40mg、0.4mmol、2.0当量）およびEtN(i-Pr)2（0.2mL）を加えた。反応混合物を周囲温度で16時間撹拌した後、水で反応停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣を逆HPLCで精製して、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（46mg、収率34％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
N-(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)-2-(ピペリジン-4-イルアミノ)アセトアミド
方法149と類似のプロトコルに従い、4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-アミン（化合物番号150）、塩化クロロアセチル、および4-アミノ-1-Bocピペリジンの反応により、Boc保護表題化合物を得た。CF3CO2Hの処理と、続いく逆相HPLC精製後に、表題化合物を39mg（2段階で28％）で単離した。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
N-(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)-2-(4-ヒドロキシピペリジン-1-イル)アセトアミド
方法149と類似のプロトコルに従い、4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-アミン（化合物番号150）、塩化クロロアセチル、および4-ヒドロキシピペリジンの反応により、表題化合物を44mg（収率32％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-(((S)-3,4-ジヒドロキシブチル)アミノ)-N-(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)アセトアミド
方法149と類似のプロトコルに従い、4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-アミン（化合物番号150）、塩化クロロアセチル、および(2S)-4-アミノ-1-(トリフェニルメトキシ)-2-ブタノールの反応により、O-Trt保護表題化合物を得た。CF3CO2Hの処理と、続く逆相HPLC精製後に、表題化合物を16mg（収率23％）で単離した。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
N-(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)-2-((S)-3-メチルピペラジン-1-イル)アセトアミド
方法149と類似のプロトコルに従い、4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-アミン（化合物番号150）、塩化クロロアセチル、およびS-1-Boc-2-メチルピペラジンの反応により、N-Boc保護表題化合物を得た。CF3CO2Hの処理と、続く逆相HPLC精製後に、表題化合物を187mg（収率90％）で単離した。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
N-(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)-2-((3R,5S)-3,5-ジメチルピペラジン-1-イル)アセトアミド
方法149と類似のプロトコルに従い、4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-アミン（化合物番号150）、塩化クロロアセチル、および2,6-シス-ジメチルピペラジンの反応により、表題化合物を60mg（収率85％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
N-(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)-2-(ピペリジン-1-イル)アセトアミド
方法149と類似のプロトコルに従い、4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-アミン（化合物番号150）、塩化クロロアセチル、およびピペリジンの反応により、表題化合物を47mg（収率78％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N,N-ビス(2-モルホリノエチル)ナフタレン-1-アミン
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-アミン（化合物番号150、27mg、0.05mmol）および3-モルホリノプロパナール-HCl（18mg、0.1mmol）をTHF（5mL）に溶解した。AcOH（0.1mL）およびNaBH(OAc)3（50mg、0.2mmol）を加え、混合物を16時間撹拌した。反応を水で停止し、酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、ロータリーエバポレーターで除去した。残渣を逆HPLCで精製して、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（14mg、収率36％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-((4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)アミノ)-4-オキソブタン酸（化合物番号161）
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-アミン（化合物番号150、120mg、0.3mmol）、無水コハク酸（60mg、0.6mmol）、およびピリジン（2mL）を無水DMF（5mL）に溶解し、混合物を70℃で16時間加熱した。反応混合物をロータリーエバポレーターで濃縮し、逆相HPLCで精製して、表題化合物を120mg（収率60％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
N1-(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)-N4-エチルスクシンアミド
4-((4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)アミノ)-4-オキソブタン酸（化合物番号161、60mg、0.1mmol）、EDCI-HCl（100mg、0.5mmol）、HOBt-H2O（70mg、0.5mmol）、および無水DMF（2.5mL）を丸底フラスコに加えた。EtNH2（THF中2M、1mL）を加え、続いてシリンジで加え、反応混合物を周囲温度で16時間撹拌した。反応混合物を逆HPLCで精製して、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（22mg、収率33％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(2-(tert-ブチル)-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)フェニル)カルバミン酸tert-ブチル（CE128）
4-ブロモ-2-(1,1-ジメチルエチル)アニリン（0.95g、4.2mmol）およびBoc無水物（1.20g、5.46mmol）を無水トルエン（10mL）に溶解し、溶液を90℃で24時間加熱した。混合物をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、(4-ブロモ-2-(tert-ブチル)フェニル)カルバミン酸tert-ブチルを得た（2.42g、Boc2O混入）。
(4-ブロモ-2-(tert-ブチル)フェニル)カルバミン酸tert-ブチル（前段階からの2.42g、4.16mmolとみなす）、ビス(ピナコラト)ジボロン（2.13g、8.4mmol、2.0当量）、および酢酸カリウム（1.6g、16mmol、4.0当量）を丸底フラスコに加えた。無水1,4-ジオキサン（20mL）をシリンジで加え、フラスコを脱気し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2（322mg、0.46mmol、0.1当量）を加え、系を再度脱気し、続いて100℃で16時間加熱した。反応混合物を周囲温度まで冷却し、CH2Cl2で希釈した。溶液をセライトのパッドを通してろ過し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製した。表題化合物を2.0gで単離した（ボロン酸ピナコールエステルが混入）。この材料をそれ以上精製せずに化合物番号162の調製に用いた。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-(tert-ブチル)-4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アニリン（化合物番号162）
方法40に類似の同じプロトコルを用いて： S13（800mg、2.16mmol）および(2-(tert-ブチル)-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)フェニル)カルバミン酸tert-ブチル（CE128、2.0g）の鈴木カップリングと、続くCF3CO2H促進性のBoc基の脱保護により、フラッシュカラムクロマトグラフィ後に表題化合物を得た（510mg、収率52％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
N-(2-(tert-ブチル)-4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)フェニル)-2-((3R,5S)-3,5-ジメチルピペラジン-1-イル)アセトアミド
42-(tert-ブチル)-4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アニリン（化合物番号162、70mg、0.2mmol、1.0当量）およびNaHCO3（170mg、2.0mmol、10当量）を無水THF（6mL）に溶解した。この溶液に、塩化クロロアセチル（120mg、1.0mmol、5.0当量）を加え、溶液を16時間撹拌した。反応混合物を水で希釈し、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣を無水DMFに溶解し、2,6-シス-ジメチルピペラジン（66mg、0.6mmol、3.0当量）およびEtN(iPr2)（0.2mL）を加えた。反応混合物を周囲温度で16時間撹拌した後、水で反応停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（86mg、収率60％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフトエ酸メチル（化合物番号164）。
4-(4-クロロ-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（S13、1.71g、5.0mmol、1.0当量）および4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1-ナフトエ酸メチル（3.0g、10mmol、2.0当量）を1,2-ジメトキシエタン（60mL）に溶解した。炭酸ナトリウム（2.0M水溶液、20mL）を加えた。系を脱気して酸素を除去し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2（408mg、0.5mmol、0.1当量）を加え、フラスコを再度脱気し、窒素を再充填した。反応混合物を16時間加熱還流した。反応を水で停止し、酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、ロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物を得た（1.04g、収率42％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフトエ酸（化合物番号165）。
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフトエ酸メチル（化合物番号164、107mg、0.22mmol）をTHF（5mL）および水（5mL）に溶解した。LiOH-H2O（90mg、2.0mmol、10.0当量）を加え、溶液を16時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチルで抽出した。続いて、水層をpH＝2まで中和し、酢酸エチルで抽出した。酸性水溶液の有機抽出物を合わせ、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を凍結乾燥して、表題化合物を100mg（収率＞90％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-(2-モルホリノエチル)-1-ナフタミド
方法64（アミド縮合）：4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフトエ酸（化合物番号165、20mg、0.05mmol）、EDCI-HCl（100mg、0.5mmol）、およびHOBt-H2O（70mg、0.5mmol）を丸底フラスコに加えた。EtN(i-Pr)2（0.1mL）を加え、続いてDMF（2.5mL）を加えた。2-モルホリニルエチルアミン（70mg、0.5mmol）を加え、反応混合物を12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（20mg、収率69％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-(2-ウレイドエチル)-1-ナフタミド
方法64のアミド縮合条件を用いて、4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフトエ酸（化合物番号165、20mg）および(2-アミノ-エチル)-尿素-HCl（20mg）の反応により、表題化合物を16mg（収率57％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)(ピペラジン-1-イル)メタノン
方法64のアミド縮合条件を用いて、4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフトエ酸（化合物番号165、20mg）およびピペラジン（63mg）の反応により、表題化合物を8mg（収率30％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3-(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフタミド)プロパン酸メチル
方法64のアミド縮合条件を用いて、4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフトエ酸（化合物番号165、30mg）およびβ-アラニンメチルエステル（28mg）の反応により、表題化合物を得た。粗生成物をそれ以上精製せずに次の段階で用いた。
Figure 0006401773
3-(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフタミド)プロパン酸
3-(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフタミド)プロパン酸メチル（化合物番号169）をTHF-H2O（1：1）に溶解した。LiOH-H2O（10当量）を加え、反応混合物を周囲温度で16時間撹拌した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣を逆相HPLCで精製して、表題化合物を得た（22mg、収率34％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)(4-モルホリノピペリジン-1-イル)メタノン
方法64のアミド縮合条件を用いて、4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフトエ酸（化合物番号165、40mg）および4-モルホリノピペリジン（34mg）の反応により、表題化合物を50mg（収率78％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)(3,3,4-トリメチルピペラジン-1-イル)メタノン
方法64のアミド縮合条件を用いて、4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフトエ酸（化合物番号165、20mg）および1,2,2-トリメチルピペリジン（20mg）の反応により、表題化合物を12mg（収率40％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)((S)-3,4-ジメチルピペラジン-1-イル)メタノン
方法64のアミド縮合条件を用いて、4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフトエ酸（化合物番号165、160mg）および(S)-1,2-ジメチル-ピペラジン（224mg）の反応により、表題化合物を150mg（収率55％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)((3R,5S)-3,5-ジメチルピペラジン-1-イル)メタノン
方法64のアミド縮合条件を用いて、4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフトエ酸（化合物番号165、160mg）およびシス-2,6-ジメチル-ピペラジン（160mg）の反応により、表題化合物を138mg（収率52％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)(4-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-1-イル)メタノン
方法64のアミド縮合条件を用いて、4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフトエ酸（化合物番号165、160mg）および1-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン（140mg）の反応により、表題化合物を172mg（収率62％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-(1-(テトラヒドロ-2H-ピラン-4-イル)ピペリジン-4-イル)-1-ナフタミド
方法64のアミド縮合条件を用いて、4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフトエ酸（化合物番号165、40mg）および1-(テトラヒドロ-2H-ピラン-4-イル)-4-ピペリジンアミン2塩酸塩（50mg）の反応により、表題化合物を87mg（収率＞90％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
N-((S)-3,4-ジヒドロキシブチル)-4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフタミド
方法77：4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフトエ酸（化合物番号165、20mg、0.05mmol）、EDCI-HCl（48mg、0.25mmol）、およびHOBt-H2O（34mg、0.25mmol）を丸底フラスコに加えた。EtN(i-Pr)2（0.1mL）を加え、続いてDMF（2.5mL）をシリンジで加えた。(2S)-4-アミノ-1-(トリフェニルメトキシ)-2-ブタノール（52mg、0.15mmol）を加え、反応混合物を16時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残渣をCH2Cl2（4mL）に溶解し、CF3CO2H（4mL）を加え、混合物を1時間撹拌した後、逆相HPLCで精製して、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（19mg、収率68％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)((S)-3-メチルピペラジン-1-イル)メタノン
方法77のアミド縮合条件を用いて、4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフトエ酸（化合物番号165、40mg）および(S)-1-Boc-2-メチル-ピペラジン（60mg）の反応と、続くCF3CO2H促進性のBoc基の脱保護により、表題化合物を27mg（収率41％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-(ピペリジン-4-イル)-1-ナフタミド
方法77のアミド縮合条件を用いて、4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフトエ酸（化合物番号165、40mg）および1-Boc-4-アミノ-ピペリジン（60mg）の反応と、続くCF3CO2H促進性のBoc基の脱保護により、表題化合物を34mg（収率51％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)(3,3-ジメチルピペラジン-1-イル)メタノン
方法77のアミド縮合条件を用いて、4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフトエ酸（化合物番号165、160mg）および1-Boc-2,2-ジメチルピペリジン（260mg）の反応と、続くCF3CO2H促進性のBoc基の脱保護により、表題化合物を150mg（収率56％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)((R)-3-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-イル)メタノン（化合物番号181）
方法77のアミド縮合条件を用いて、4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフトエ酸（化合物番号165、100mg）および(R)-1-Boc-2-ヒドロキシメチルピペラジン（80mg）の反応と、続くCF3CO2H促進性のBoc基の脱保護により、表題化合物を92mg（収率59％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)((R)-3-(ヒドロキシメチル)-4-メチルピペラジン-1-イル)メタノン（化合物番号182）
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)((R)-3-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-イル)メタノン（Co、20mg）、パラホルムアルデヒド（30mg）、酢酸（0.05mL）、および1,2-ジクロロエタン（4mL）を丸底フラスコに加えた。水素化トリアセトキシホウ素ナトリウム（400mg）を一度に加え、混合物を周囲温度で16時間撹拌した。水を加え、水層を酢酸エチルおよびCH2Cl2で抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残渣を逆相HPLCで精製して、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（11mg、収率52％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-(3-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)フェニル)プロパン-2-オール（遊離アミン）。
S13（40mg、0.1mmol、1.0当量）および3-(2-ヒドロキシ-2-プロパニル)フェニルボロン酸ピナコールエステル（90mg、0.3mmol、3.0当量）を1,2-ジメトキシエタン（4mL）に溶解した。炭酸ナトリウム（2.0M水溶液、2mL）を加えた。系を脱気して酸素を除去し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2（20mg、0.024mmol、0.24当量）を加え、系を再度脱気し、窒素を再充填した。反応混合物を16時間加熱還流した。反応を水で停止し、酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、ロータリーエバポレーターで除去した。残渣を逆相HPLCで精製した。表題化合物を含むHPLC溶出液をアンモニア溶液で中和し、酢酸エチルで抽出して、表題化合物を遊離アミンで得た（10mg、収率22％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-(tert-ブチル)-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ピリジン（CE103）
4-ブロモ-2-(tert-ブチル)ピリジン（1.0g、4.6mmol、1.0当量）を無水THF（20mL）に溶解した。溶液を-78℃で15分間冷却した後、BuLi（3.7mL、THF中2.5M、9.2mmol、2.0当量）をシリンジで加えた。反応溶液を-78℃で30分間撹拌し、2-イソプロポキシ-4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン（1.37g、7.36mmol、1.6当量）をシリンジで加えた。反応混合物を-78℃で3時間撹拌した後、飽和NH4Cl水溶液で反応停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物を70mg（収率6％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(4-(2-(tert-ブチル)ピリジン-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール
方法42の条件を用いた、S13（273mg、0.80mmol）および2-(tert-ブチル)-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ピリジン（CE103、440mg、1.68mmol）の鈴木カップリングと、続くフラッシュカラムクロマトグラフィにより、表題化合物を180mg（収率51％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-(2-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)プロパン-2-イル)-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ピリジン（CE81）
2-(4-ブロモピリジン-2-イル)プロパン-2-オール（0.57g、3.0mmol）、TBS-Cl（1.35g、9.0mmol）、およびイミダゾール（816mg、12mmol）を無水DMF（20mL）に溶解した。溶液を3日間加熱還流した後、水で反応停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、4-ブロモ-2-(2-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)プロパン-2-イル)ピリジンを得た（0.46g、収率46％）。
4-ブロモ-2-(2-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)プロパン-2-イル)ピリジン（0.46g、1.4mmol、1.0当量）、ビス(ピナコラト)ジボロン（0.711g、2.8mmol、2.0当量）、および酢酸カリウム（0.549g、5.6mmol、4.0当量）を丸底フラスコに加えた。無水1,4-ジオキサン（15mL）を加え、フラスコを脱気し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2（98mg、0.14mmol、0.1当量）を加え、系を再度脱気し、続いて100℃で16時間加熱した。反応混合物を周囲温度まで冷却し、CH2Cl2で希釈した。溶液をセライトのパッドを通してろ過し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物を0.60g（1.3mmol、収率90％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(4-(2-(2-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)プロパン-2-イル)ピリジン-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（CE83）
方法42の条件を用いた、S13（240mg、0.7mmol）および2-(2-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)プロパン-2-イル)-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ピリジン（CE81、0.62g、1.4mmol）の鈴木カップリングと、続くフラッシュカラムクロマトグラフィにより、表題化合物を0.337mg（収率87％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ピリジン-2-イル)プロパン-2-オール。
4-(4-(2-(2-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)プロパン-2-イル)ピリジン-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（CE83、0.337g）を20mLの濃HClに溶解し、混合物を室温で24時間撹拌した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（60mg、収率18％）。

Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ピリジン-2-イル)-2-メチルプロパンニトリル
方法42の条件を用いた、S13（342mg、1.0mmol）および2-メチル-2-[4-(テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ピリジン-2-イル]プロパンニトリル（0.5g、1.82mmol）の鈴木カップリングと、続く逆相HPLC精製により、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（227mg、収率41％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-(3-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)フェニル)-2-メチルプロパン酸（化合物番号187）
方法42の条件を用いた、S13（342mg、1.0mmol）および3-ボロノ-a,a-ジメチル-ベンゼン酢酸（0.42g、2.0mmol）の鈴木カップリングと、続く逆相HPLC精製により、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（88mg、収率15％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-(3-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)フェニル)-N,2-ジメチルプロパンアミド
2-(3-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)フェニル)-2-メチルプロパン酸（カルボニル番号187、20mg、0.043mmol）、EDCI-HCl（60mg、0.3mmol）、およびHOBt-H2O（45mg、0.3mmol）を丸底フラスコに加えた。EtN(i-Pr)2（0.1mL）を加え、続いてDMF（3mL）を加えた。メチルアミン-HCl（14mg、0.2mmol）を加え、反応混合物を16時間撹拌した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（17mg、収率67％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-(3-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)フェニル)-2-メチル-N-(ピペリジン-4-イル)プロパンアミド
2-(3-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)フェニル)-2-メチルプロパン酸（化合物番号187、80mg、0.17mmol）、EDCI-HCl（191mg、1mmol）、およびHOBt-H2O（135mg、1mmol）を丸底フラスコに加えた。EtN(i-Pr)2（0.3mL）を加え、続いてDMF（5mL）を加えた。4-アミノ-1-Boc-ピペリジン（80mg、0.4mmol）を加え、反応混合物を16時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層を10％クエン酸水溶液、食塩水で洗浄し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残渣をCH2Cl2（4mL）に溶解し、CF3CO2H（4mL）を加え、混合物を1時間撹拌した後、逆相HPLCで精製して、表題化合物をCF3CO2Hの塩で得た（47.6mg、収率42％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-(3-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)フェニル)-2-メチル-1-(4-モルホリノピペリジン-1-イル)プロパン-1-オン（化合物番号190）
EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法の例：化合物番号187（40mg、0.1mmol）、HOBt（0.6mmol）およびEDCI-HCl（0.6mmol）を丸底フラスコに加えた。このフラスコに、EtN(i-Pr)2（0.3mL）および無水DMF（3mL）を加えた。次いで、4-モルホリノピペリジン（50mg、0.3mmol）を一度に加えた。混合物を室温で12時間撹拌した後、水で反応停止した。混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号190をCF3CO2H塩として11mg（15％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3-ブロモ-5-(クロロメチル)安息香酸メチル（CE157）
3-ブロモ-5-(ヒドロキシメチル)安息香酸メチル（2.45g、文献の方法に従って調製、JACS, 2012, v134, 1673-1679）、ピリジン（3mL）および無水THF（50mL）を丸底フラスコ中で混合し、これを氷水浴で冷却した。MeSO2-Cl（1.55mL）をシリンジで加え、反応混合物を周囲温度で6時間加温した。混合物を水で反応停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、乾燥し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、CD157を1.2g（収率62％）で得た。
Figure 0006401773
3-ブロモ-5-(シアノメチル)安息香酸メチル（CE163）
CE157（1.2g）をDMF（30mL）に溶解した。NaCN（450mg）を加え、反応混合物を45℃で12時間加熱した。混合物を水で反応停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、乾燥し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、CE163を0.76g（収率49％）で得た。
Figure 0006401773
3-ブロモ-5-(2-シアノプロパン-2-イル)安息香酸メチル（CE169）
CE163（1.5g）を無水DMSO（10mL）に溶解し、氷水浴で冷却した。NaH（960mg、児湯中60％）を少しずつ加え、混合物をさらに20分間撹拌した。MeI（1.94mL）をシリンジで加え、混合物を室温まで加温し、終夜撹拌した。混合物を水で反応停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、乾燥し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、CE169を1.47g（収率87％）で得た。
Figure 0006401773
3-(2-シアノプロパン-2-イル)-5-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)安息香酸メチル（CE171）
CE169（1.47g、5.2mmol）、ビス(ピナコラト)ジボロン（2.54g、10mmol）、および酢酸カリウム（1.5g、15mmol）を丸底フラスコに加えた。。無水1,4-ジオキサン（20mL）を加え、フラスコを脱気し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2（183mg、0.26mmol）を加え、系を再度脱気し、続いて100℃で16時間加熱した。反応混合物を周囲温度まで冷却し、CH2Cl2で希釈した。溶液をセライトのパッドを通してろ過し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物を1.9g（不純物を含む、収率＞95％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3-(2-シアノプロパン-2-イル)-5-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)安息香酸（化合物番号191）
丸底フラスコに、4-(4-クロロ-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（S13、890mg、2.6mmol）およびCE171（1.9g、5.2mmol）、1,2-ジメトキシエタン（20mL）、およびNa2CO3（2M、9mL）を加えた。系を脱気して酸素を除去し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2（106mg、0.13mmol）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。反応混合物を16時間加熱還流した。反応を水で停止し、pH＝2まで酸性化し、続いて酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をTHF（10mL）および水（10mL）に溶解した。LiOH-H2O（420mg、10mmol）を加え、溶液を周囲温度で24時間撹拌した。反応混合物をジエチルエーテルで抽出し、続いてpH＝2まで酸性化し、その後酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣を逆相HPLCで精製して、表題化合物を328mg（2段階で収率25％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3-(2-シアノプロパン-2-イル)-5-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-(1-(テトラヒドロ-2H-ピラン-4-イル)ピペリジン-4-イル)ベンズアミド（化合物番号192）
EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法の例：化合物番号191（30mg）、HOBt（84mg、0.6mmol）、およびEDCI-HCl（120mg、0.6mmol）を丸底フラスコに加えた。このフラスコに、EtN(i-Pr)2（0.3mL）および無水DMF（3mL）を加えた。次いで、1-(テトラヒドロ-2H-ピラン-4-イル)-4-ピペリジンアミン2塩酸塩（60mg、0.3mmol）を一度に加えた。混合物を室温で12時間撹拌した後、水で反応停止した。混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号192をCF3CO2H塩として33mg（収率71％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3-(2-シアノプロパン-2-イル)-5-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-(1-メチルピペリジン-4-イル)ベンズアミド（化合物番号193）
EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法の例：化合物番号191（30mg、0.05mmol）、HOBt（60mg、0.4mmol）、およびEDCI-HCl（80mg、0.4mmol）を丸底フラスコに加えた。このフラスコに、EtN(i-Pr)2（0.2mL）および無水DMF（3mL）を加えた。次いで、N-メチルピペリジン-4-アミン（23mg、0.2mmol）を一度に加えた。混合物を室温で12時間撹拌した後、水で反応停止した。混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号193をCF3CO2H塩として40mg（収率95％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3-(2-シアノプロパン-2-イル)-5-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-(1-(オキセタン-3-イル)ピペリジン-4-イル)ベンズアミド（化合物番号194）
EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法の例：化合物番号191（40mg、0.09mmol）、HOBt（70mg、0.5mmol）、およびEDCI-HCl（100mg、0.5mmol）を丸底フラスコに加えた。このフラスコに、EtN(i-Pr)2（0.3mL）および無水DMF（3mL）を加えた。次いで、1-オキセタン-3-イルピペリジン-4-アミン（70mg、0.3mmol）を一度に加えた。混合物を室温で12時間撹拌した後、水で反応停止した。混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号194をCF3CO2H塩として37mg（収率61％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)(4-(オキセタン-3-イル)ピペラジン-1-イル)メタノン（化合物番号195）
化合物番号195を、化合物番号165（40mg）および1-オキセタン-3-イル-ピペラジン（45mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号195をCF3CO2H塩として23mg（収率38％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-(1-メチルピペリジン-4-イル)-1-ナフタミド（化合物番号196）
化合物番号196を、化合物番号165（48mg）およびN-メチルピペリジン-4-アミン（35mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号196をCF3CO2H塩として63mg（収率91％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-(1-(オキセタン-3-イル)ピペリジン-4-イル)-1-ナフタミド（化合物番号197）
化合物番号197を、化合物番号165（48mg）および1-オキセタン-3-イルピペリジン-4-アミン-2HCl（66mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号197をCF3CO2H塩として40mg（収率54％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)(4-(メチルスルホニル)ピペラジン-1-イル)メタノン（化合物番号198）
化合物番号198を、化合物番号165（48mg）および1-メエタンスルホニル-ピペラジン塩酸塩（48mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号198をCF3CO2H塩として54mg（収率73％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-(2-ヒドロキシエチル)-1-ナフタミド（化合物番号199）
化合物番号199を、化合物番号165（47mg）および2-アミノエタノール（20mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号199をCF3CO2H塩として22mg（収率35％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-(2-メトキシエチル)-1-ナフタミド（化合物番号200）
化合物番号200を、化合物番号165（40mg）および2-メトキシエチルアミン（24mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号200をCF3CO2H塩として32mg（収率58％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-(1-イソプロピルピペリジン-4-イル)-1-ナフタミド（化合物番号201）
化合物番号201を、化合物番号165（40mg）およびN-イソプロピルピペリジン-4-アミン（42mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号201をCF3CO2H塩として22mg（収率30％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-(2-(2-メトキシエトキシ)エチル)-1-ナフタミド（化合物番号202）
化合物番号202を、化合物番号165（40mg）および2-(2-メトキシエトキシ)エタンアミン（40mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号202をCF3CO2H塩として27mg（収率47％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
N-(2-シアノエチル)-4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフタミド（化合物番号203）
化合物番号203を、化合物番号165（40mg）およびアミノアセトニトリル（21mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号203をCF3CO2H塩として14mg（収率25％）で得た。ESI-MS C31H27N6O3 [M+H]+ 計算値＝531.21；実測値：531.42。
Figure 0006401773
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)(4-(テトラヒドロ-2H-ピラン-4-イル)ピペラジン-1-イル)メタノン（化合物番号204）
化合物番号204を、化合物番号165（40mg）および1-(テトラヒドロ-2H-ピラン-4-イル)ピペラジン（72mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号204をCF3CO2H塩として50mg（収率79％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-((1-メチルピペリジン-4-イル)メチル)-1-ナフタミド（化合物番号205）
化合物番号205を、化合物番号165（40mg）および(1-メチルピペリジン-4-イル)メタンアミン（39mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号205をCF3CO2H塩として33mg（収率56％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-(2-(メチルスルホニル)エチル)-1-ナフタミド（化合物番号206）
化合物番号206を、化合物番号165（40mg）および2-アミノエチルメチル スルホン（48mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号206をCF3CO2H塩として25mg（収率42％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)(4-メチルピペラジン-1-イル)メタノン（化合物番号207）
化合物番号207を、化合物番号165（40mg）および1-メチルピペラジン（30mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号207をCF3CO2H塩として50mg（収率86％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)(4-イソプロピルピペラジン-1-イル)メタノン（化合物番号208）
化合物番号208を、化合物番号165（40mg）および1-イソプロピルピペラジン（40mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号208をCF3CO2H塩として43mg（収率73％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
5-イソプロピル-1H-ピロール-2-カルボン酸メチル（CE156）
段階1：イソブチルアルデヒド（2.2g、30mmol）、L-グリシンメチルエステル（3.45g、30mmol）およびNaHCO3（3.36g、40mmol）を丸底フラスコ中で混合し、続いて無水THF（100mL）を加えた。反応混合物を室温で終夜撹拌した。固体をろ去し、溶液をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣（3.65g）の大部分はイミンで、それ以上精製せずに用いた。
段階2：Ph3P（340mg、1.3mmol）およびCu(MeCN)4PF6（483mg、1.3mmol）を乾燥丸底フラスコに加えた。無水THF（100mL）を加え、続いてEt3N（2.1mL、11.7mmol）を加えた。段階1から得たイミン（3.65g、25.5mmol）をTHF溶液として加え、トランス-1,2-ビス(フェニルスルホニル)エチレン（8.0g、26mmol）を少しずつ加えた。系を脱気し、窒素を再充填した。反応混合物を室温で終夜撹拌した。次いで、DBU（7.8mL、52mmol）をシリンジで加え、混合物を室温で4時間撹拌した。混合物を酢酸エチルで希釈し、1N HClで洗浄して、DBUを除去した。有機層を乾燥し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、CE156を1.52g（収率35％）で得た。この方法は以前にAngew. Chem. Int. Ed. 2007, 46, 9261-9264およびChem. Eur. J. 2010, 16, 9864-9873によって報告された。
Figure 0006401773
4-ブロモ-5-イソプロピル-1H-ピロール-2-カルボン酸メチル
CE156（1.52g、9.1mmol）をCH2Cl2（20mL）に溶解し、氷水浴で冷却した。NBS（1.62g、9.1mmol）を少しずつ加え、混合物を室温で1時間撹拌した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をそれ以上精製せずに用いた。
Figure 0006401773
4-ブロモ-5-イソプロピル-1H-ピロール-1,2-ジカルボン酸1-tert-ブチル 2-メチル（CE158）
4-ブロモ-5-イソプロピル-1H-ピロール-2-カルボン酸メチル（1.52g、前の粗生成物）およびBoc2O（2.94g、15mmol）を無水THF（20mL）に溶解した。DMAP（1.1g、9mmol）を少しずつ加えた。反応混合物を室温で終夜撹拌した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、CE158を2.65g（2段階で収率84％）で得た。
Figure 0006401773
5-イソプロピル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1H-ピロール-1,2-ジカルボン酸1-tert-ブチル 2-メチル（CE160）
CE158（2.65、7.66mmol）および2-イソプロポキシ-4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン（2.29g、12.3mmol）を無水THF（20mL）に溶解した。溶液を-78℃で15分間冷却した後、BuLi（4.92mL、THF中2.5M、12.3mmol）をシリンジで加えた。反応混合物を-78℃で6時間撹拌した後、飽和NH4Cl水溶液で反応停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物を1.35g（収率45％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-5-イソプロピル-1H-ピロール-2-カルボン酸メチル（化合物番号209）
丸底フラスコに、4-(4-クロロ-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（S13、342mg、0.8mmol）、CE160（632mg、1.61mmol）、1,2-ジメトキシエタン（10mL）、およびNa2CO3（2M、4mL）を加えた。系を脱気して酸素を除去し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2（70mg、0.08mmol）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。反応混合物を16時間加熱還流した。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物を140mg（収率40％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-5-イソプロピル-1H-ピロール-2-カルボン酸（化合物番号210）。
化合物番号209（140mg、0.30mmol）をTHF-H2O（10mL、3：2）に溶解した。LiOH-H2O（120mg）を一度に加え、混合物を周囲温度で終夜撹拌した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残りの残渣を逆相HPLCで精製して、表題化合物をCF3CO2Hの塩として40mg（収率23％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-5-イソプロピル-N-(1-メチルピペリジン-4-イル)-1H-ピロール-2-カルボキサミド（化合物番号211）
化合物番号211を、化合物番号210（15mg）およびN-メチルピペリジン-4-アミン（40mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号211をCF3CO2H塩として11mg（収率53％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-5-イソプロピル-N-(1-(テトラヒドロ-2H-ピラン-4-イル)ピペリジン-4-イル)-1H-ピロール-2-カルボキサミド（化合物番号212）
化合物番号212を、化合物番号210（40mg）および1-(テトラヒドロ-2H-ピラン-4-イル)-4-ピペリジンアミン2塩酸塩（54mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号212をCF3CO2H塩として47mg（収率73％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-5-イソプロピル-N-(1-(オキセタン-3-イル)ピペリジン-4-イル)-1H-ピロール-2-カルボキサミド（化合物番号213）
化合物番号213を、化合物番号210（40mg）および1-オキセタン-3-イルピペリジン-4-アミン（48mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号213をCF3CO2H塩として42mg（収率68％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-エチル-5-イソプロピル-1H-ピロール-2-カルボキサミド（化合物番号214）
化合物番号214を、化合物番号210（46mg）およびエチルアミン（THF中2M、0.3mL）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号214をCF3CO2H塩として35mg（収率58％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-5-イソプロピル-1H-ピロル-2-イル)(4-イソプロピルピペラジン-1-イル)メタノン（化合物番号215）
化合物番号215を、化合物番号210（46mg）および1-イソプロピルピペラジン（40mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号215をCF3CO2H塩として40mg（収率59％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-5-イソプロピル-1H-ピロル-2-イル)(4-メチルピペラジン-1-イル)メタノン（化合物番号216）
化合物番号216を、化合物番号210（40mg）および1-メチルピペラジン（30mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号216をCF3CO2H塩として24mg（収率43％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
tert-ブチルジメチル((4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ナフタレン-1-イル)メトキシ)シラン（CE187）
段階1：(4-ブロモナフタレン-1-イル)メタノール（10.06g、43mmol）およびTBS-Cl（8.46g、56mmol）を無水THF（100mL）に溶解し、混合物を氷水浴で冷却した。イミダゾール（4.42g、65mmol）を少しずつ加え、反応混合物を周囲温度で終夜加温した。水を加え、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、((4-ブロモナフタレン-1-イル)メトキシ)(tert-ブチル)ジメチルシランを13.82g（収率91％）で得た。
段階2：((4-ブロモナフタレン-1-イル)メトキシ)(tert-ブチル)ジメチルシラン（13.82g、39.4mmol）および2-イソプロポキシ-4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン（11.16g、60mmol）を無水THF（100mL）に溶解した。溶液を-78℃で15分間冷却した後、BuLi（24mL、THF中2.5M、60mmol）をシリンジで加えた。反応混合物を-78℃で6時間撹拌した後、飽和NH4Cl水溶液で反応停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物を12.46g（収率79％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(4-(4-(((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ナフタレン-1-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（CE191）。
丸底フラスコに、4-(4-クロロ-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（S13、5.47g、16mmol）、CE187（12.46g、31.3mmol）、1,2-ジメトキシエタン（100mL）、およびNa2CO3（2M、50mL）を加えた。系を脱気して酸素を除去し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2（1.30mg、1.6mmol）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。反応混合物を16時間加熱還流した。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を合わせ、乾燥した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物を3.86g（収率41％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)メタノール（CE192）
CE191（1.9g、3.3mmol）をTHF（20mL）に溶解し、TBAF（6mL、THF中1.0M、6mmol）をシリンジで加えた。反応混合物を周囲温度で終夜撹拌した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物を1.2g（収率78％）で得た。逆相HPLCでさらに精製して、CE192をCF3CO2H塩で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1-ナフトアルデヒド（CE194）
CE192（1.2g、2.6mmol）をDMSO（20mL）に溶解した。IBX（1.46g、5.2mmol）を少しずつ加え、混合物を室温で終夜撹拌した後、NaHCO3で反応停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を合わせ、乾燥した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物を1.19g（収率98％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-((4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)メチル)モルホリン（化合物番号217）
CE194（50mg）、モルホリン（18mg、0.2mmol）、および酢酸（0.1mL）を無水THF（3mL）に溶解した。NaBH(OAc)3（120mg、0.5mmol）を一度に加え、混合物を周囲温度で終夜撹拌した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、表題化合物である化合物番号217をCF3CO2H塩として31mg（収率47％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(6-メトキシ-2-メチル-4-(4-((4-メチルピペラジン-1-イル)メチル)ナフタレン-1-イル)-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（化合物番号218）
CE194（50mg）、1-メチルピペラジン（20mg、0.2mmol）、および酢酸（0.1mL）を無水THF（3mL）に溶解した。NaBH(OAc)3（120mg、0.5mmol）を一度に加え、混合物を周囲温度で終夜撹拌した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、表題化合物である化合物番号218をCF3CO2H塩として19mg（収率29％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(6-メトキシ-2-メチル-4-(4-(ピペラジン-1-イルメチル)ナフタレン-1-イル)-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（化合物番号219）
段階1：CE194（300mg、0.7mmol）、1-Boc-ピペラジン（260mg、1.4mmol）、および酢酸（0.2mL）を無水THF（5mL）に溶解した。NaBH(OAc)3（445mg、2.1mmol）を一度に加え、混合物を周囲温度で終夜撹拌した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣を次の段階で直接用いた。
段階2：段階1からの前の残渣をCH2Cl2（5mL）と混合し、続いてトリエチルシラン（0.1mL）およびCF3CO2H（5mL）を加えた。混合物を周囲温度で2時間撹拌し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、表題化合物である化合物番号219をCF3CO2H塩として300mg（2段階で収率80％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
1-(4-((4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)メチル)ピペラジン-1-イル)エタノン（化合物番号220）
化合物番号219（50mg）を無水THF（3mL）に溶解した。無水酢酸（0.05mL、0.2mmol）をシリンジで加え、混合物を周囲温度で4時間撹拌した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、表題化合物である化合物番号220をCF3CO2H塩として33mg（収率48％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(4-(4-((4-イソプロピルピペラジン-1-イル)メチル)ナフタレン-1-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（化合物番号221）
CE194（46mg）、1-イソプロピルピペラジン（60mg、0.3mmol）、および酢酸（0.1mL）を無水THF（5mL）に溶解した。NaBH(OAc)3（110mg、0.5mmol）を一度に加え、混合物を周囲温度で終夜撹拌した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、表題化合物である化合物番号221をCF3CO2H塩として55mg（収率80％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
N-(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)-2-(4-メチルピペラジン-1-イル)アセトアミド（化合物番号222）
方法149に類似のプロトコルに従い、4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-アミン（化合物番号150、45mg、0.1mmol）塩化クロロアセチル（113mg、1mmol）、およびN-メチルピペリジン-4-アミン（40mg、0.4mmol）の反応により、表題化合物を得た。CF3CO2Hの処理と、続く逆相HPLC精製後に、表題化合物を39mgでCF3CO2H塩として単離した（2段階で55％）。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(2S)-2-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-3,3-ジメチルブタン-1-オール（化合物番号223）
S13（70mg）、L-tertロイシノール（44mg）、NaHCO3（32mg）および無水DMSO（3mL）を150℃で16時間加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号223をCF3CO2H塩として9mg（収率9％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
N-ベンジル-7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-アミン（化合物番号224）
S13（68mg）、L-フェニルグリシン（60mg）、NaHCO3（48mg）および無水DMSO（3mL）を100℃で16時間加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号224をCF3CO2H塩として52mg（収率50％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(2S)-2-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-2-フェニルエタノール（化合物番号225）
S13（68mg）、L-フェニルグリシノール（56mg）、NaHCO3（84mg）および無水DMSO（3mL）を100℃で16時間加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号225をCF3CO2H塩として70mg（収率62％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(2S)-2-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-3-メチルブタン酸（化合物番号226）
S13（68mg）、バリン（48mg）、NaHCO3（84mg）および無水DMSO（3mL）を100℃で16時間加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号226をCF3CO2H塩として46mg（収率43％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(2S)-2-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-3-メチル-N-(1-メチルピペリジン-4-イル)ブタンアミド（化合物番号227）
化合物番号227を、化合物番号226（30mg）およびN-メチルピペリジン-4-アミン（33mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号227をCF3CO2H塩として38mg（収率85％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(2R)-2-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-2-フェニルエタノール（化合物番号228）
S13（68mg）、D-フェニルグリシノール（56mg）、EtN(i-Pr)2（0.2mL）および無水DMSO（3mL）を100℃で16時間加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号228をCF3CO2H塩として35mg（収率32％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(2S)-2-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-2-(4-フルオロフェニル)エタノール （化合物番号229）
S13（70mg）、(S)-2-アミノ-2-(4-フルオロフェニル)エタノール（60mg）、EtN(i-Pr)2（0.1mL）および無水DMSO（3mL）を100℃で16時間加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号229をCF3CO2H塩として9mg（収率8％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(2S)-2-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-4-メチルペンタン酸（化合物番号230）
S13（70mg）、L-ロイシン（52mg）、NaHCO3（84mg）および無水DMSO（3mL）を100℃で16時間加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号230をCF3CO2H塩として60mg（収率54％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(2S,3S)-2-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-3-メチルペンタン酸（化合物番号231）
S13（70mg）、L-イソロイシン（52mg）、NaHCO3（84mg）および無水DMSO（3mL）を100℃で16時間加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号231をCF3CO2H塩として54mg（収率49％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(3R)-3-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-3-フェニルプロパン酸（化合物番号232）
S13（684mg）、(R)-3-アミノ-3-フェニルプロピオン酸（660mg）、NaHCO3（800mg）および無水DMSO（10mL）を130℃で16時間加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号232をCF3CO2H塩として270mg（収率23％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(2S)-2-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-2-フェニル酢酸（化合物番号233）
段階1：S13（682mg、2.0mmol）、(S)-2-アミノ-2-フェニル酢酸tert-ブチル（1.0g、4.0mmol）、NaHCO3（800mg、8mmol）および無水DMSO（10mL）を130℃で16時間加熱した。次いで、混合物を水で希釈し、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、乾燥し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣を次の段階で直接用いた。
段階2：段階1からの前の残渣をCF3CO2H（10mL）および水（0.5mL）と混合し、続いてトリエチルシラン（1mL）を加えた。混合物を周囲温度で終夜撹拌し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、表題化合物である化合物番号233をCF3CO2H塩として87mg（収率8％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-3-(2-フルオロフェニル)プロパン酸（化合物番号234）
S13（342mg）、(R)-3-アミノ-3-（2-フルオロ-フェニル)-プロピオン酸（360mg）、NaHCO3（300mg）および無水DMSO（10mL）を130℃で16時間加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号234をCF3CO2H塩として236mg（収率39％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3-(2-クロロフェニル)-3-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)プロパン酸（化合物番号235）
S13（70mg）、(R)-3-アミノ-3-(2-クロロ-フェニル)-プロピオン酸（80mg）、NaHCO3（84mg）および無水DMSO（3mL）を130℃で16時間加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号235をCF3CO2H塩として39mg（収率31％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(3R)-3-(3-クロロフェニル)-3-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)プロパン酸（化合物番号236）
S13（68mg）、(R)-3-アミノ-3-(3-クロロフェニル)プロパン酸（80mg）、NaHCO3（100mg）および無水DMSO（3mL）を130℃で終夜加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号236をCF3CO2H塩として56mg（収率55％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-3-(ナフタレン-1-イル)プロパン酸（化合物番号237）
S13（68mg）、3-アミノ-3-(ナフタレン-1-イル)プロパン酸（86mg）、NaHCO3（100mg）および無水DMSO（3mL）を130℃で終夜加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号237をCF3CO2H塩として35mg（収率28％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-(2-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-1,2,3,4-テトラヒドロイソキノリン-1-イル)酢酸（化合物番号238）
S13（68mg）、2-(1,2,3,4-テトラヒドロイソキノリン-1-イル)酢酸（80mg）、NaHCO3（100mg）および無水DMSO（3mL）を130℃で終夜加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号238をCF3CO2H塩として55mg（収率45％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
3-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-3-(3-フルオロフェニル)プロパン酸（化合物番号239）
S13（68mg）、3-アミノ-3-(3-フルオロフェニル)プロパン酸（80mg）、NaHCO3（100mg）および無水DMSO（3mL）を130℃で終夜加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号239をCF3CO2H塩として48mg（収率41％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-シクロヘキシル-2-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)酢酸（化合物番号240）
S13（68mg）、2-アミノ-2-シクロヘキシル酢酸（80mg）、NaHCO3（100mg）および無水DMSO（3mL）を130℃で終夜加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号240をCF3CO2H塩として47mg（収率41％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
シス-1-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-2-カルボン酸（化合物番号241）
S13（68mg）、シス-1-アミノ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-2-カルボン酸（80mg）、NaHCO3（100mg）および無水DMSO（3mL）を130℃で終夜加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号241をCF3CO2H塩として47mg（収率28％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(2S)-2-シクロペンチル-2-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)酢酸（化合物番号242）
S13（68mg）、(S)-2-アミノ-2-シクロペンチル酢酸（56mg）、NaHCO3（100mg）および無水DMSO（3mL）を130℃で終夜加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号242をCF3CO2H塩として47mg（収率38％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(4-(イソインドリン-2-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチル-イソキサゾール（化合物番号243）
S13（68mg）、イソインドリン（70mg）、NaHCO3（100mg）および無水DMSO（3mL）を130℃で終夜加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号243をCF3CO2H塩として5mg（収率5％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-シクロブチル-2-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)酢酸（化合物番号244）
S13（68mg）、2-アミノ-2-シクロブチル酢酸（60mg）、NaHCO3（100mg）および無水DMSO（3mL）を130℃で終夜加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号244をCF3CO2H塩として32mg（収率29％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(3R)-3-(4-クロロフェニル)-3-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)プロパン酸（化合物番号245）
S13（68mg）、(R)-3-アミノ-3-(4-クロロフェニル)プロパン酸（80mg）、NaHCO3（100mg）および無水DMSO（3mL）を130℃で終夜加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号245をCF3CO2H塩として35mg（収率29％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2,2,2-トリフルオロ酢酸4-(ジメチルアミノ)-1-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ピリジン-1-イウム（化合物番号246）
S13（70mg）、3-メチル-4-フェニル-1H-ピロゾル-5-アミン（40mg）、EtN(i-Pr)2（0.2mL）、4-ジメチルアミノピリジン（4mg）、および無水DMSO（3mL）を130℃で終夜加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号246を14mg（収率78％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
((2S)-2-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-2-フェニルエチル)カルバミン酸tert-ブチル（CE214）
S13（684mg）、アミン（708mg）、NaHCO3（600mg）および無水DMSO（10mL）を130℃で16時間加熱した。混合物を水で希釈し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層を食塩水で洗浄し、乾燥し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。次いで、残りの残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、CE214を320mg（収率30％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
N-((2S)-2-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-2-フェニルエチル)-1-メチルピペリジン-4-カルボキサミド（化合物番号247）
段階1：CE214（120mg、0.22mmol）をCH2Cl2-CF3CO2H（10mL 2：3）に溶解し、続いてトリエチルシラン（0.1mL）を加えた。反応混合物を周囲温度で2時間撹拌した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残りの残渣をそれ以上精製せずに次の段階で用いた。
段階2：段階1からの前の粗製残渣、1-メチルピペリジン-4-カルボン酸（90mg、0.6mmol）、EDCI-HCl（191mg、1mmol）およびHOBt（135mg、1mmol）を無水DMF（3mL）に溶解し、続いてEtN(i-Pr)2（0.5mL）を加えた。反応混合物を周囲温度で終夜撹拌し、次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、表題化合物をCF3CO2Hの塩として80mg（収率59％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(1S)-N1-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N2-(1-メチルピペリジン-4-イル)-1-フェニルエタン-1,2-ジアミン（化合物番号248）
段階1：化合物番号228（70mg、0.158mmol）をDMSO（5mL）に溶解し、続いてIBX（200mg）を加えた。混合物を周囲温度で終夜撹拌した。NaHCO3飽和溶液を加え、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層を食塩水で洗浄し、乾燥し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。(2S)-2-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-2-フェニルアセトアルデヒドを含む残りの残渣を次の段階で直接用いた。
段階2：段階1からの前の粗製アルデヒド残渣、N-メチルピペリジン-4-アミン（60mg）および酢酸（0.2mL）を無水THF（4mL）に溶解し、続いてNaBH(OAc)3（400mg、2mmol）を加えた。反応混合物を周囲温度で終夜撹拌した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣を逆相HPLCで精製して、表題化合物である化合物番号248をCF3CO2Hの塩として55mg（収率53％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-N-((S)-2-(4-メチルピペラジン-1-イル)-1-フェニルエチル)-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-アミン（化合物番号249）
化合物番号248の調製法に従い、80mgの(2S)-2-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-2-フェニルアセトアルデヒドを調製し、丸底フラスコに加えた。1-メチルピペラジン（60mg、0.6mmol）、酢酸（0.1mL）、およびNaBH(OAc)3（212mg、1.0mmol）を続いて加え、反応混合物を周囲温度で終夜撹拌した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣を逆相HPLCで精製して、表題化合物である化合物番号249をCF3CO2Hの塩として22mg（収率17％）で得た。CE222もCF3CO2Hの塩として30mg（収率37％）で単離した。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-アミン（CE222）
Figure 0006401773
Figure 0006401773
7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-N-((S)-2-モルホリノ-1-フェニルエチル)-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-アミン（化合物番号250）
化合物番号248の調製法に従い、80mgの(2S)-2-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-2-フェニルアセトアルデヒドを調製し、丸底フラスコに加えた。モルホリン（54mg、0.6mmol）、酢酸（0.1mL）、およびNaBH(OAc)3（212mg、0.5mmol）を続いて加え、反応混合物を周囲温度で終夜撹拌した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣を逆相HPLCで精製して、表題化合物である化合物番号250をCF3CO2Hの塩として19mg（収率15％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(3R)-3-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-N-(1-メチルピペリジン-4-イル)-3-フェニルプロパンアミド（化合物番号251）
化合物番号251を、化合物番号232（46mg）およびN-メチルピペリジン-4-アミン（40mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号251をCF3CO2H塩として51mg（収率75％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(3R)-3-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-1-(4-メチルピペラジン-1-イル)-3-フェニルプロパン-1-オン（化合物番号252）
化合物番号252を、化合物番号232（40mg）および1-メチルピペラジン（30mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号252をCF3CO2H塩として40mg（収率70％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(3R)-3-(3-クロロフェニル)-3-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-N-エチルプロパンアミド（化合物番号253）
化合物番号253を、化合物番号236（30mg）およびエチルアミン（0.4mmol、THF中2M溶液0.2mL）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号253をCF3CO2H塩として33mg（収率85％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(3R)-3-(3-クロロフェニル)-3-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-1-(4-メチルピペラジン-1-イル)プロパン-1-オン（化合物番号254）
化合物番号254を、化合物番号236（40mg）および1-メチルピペラジン（30mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号254をCF3CO2H塩として41mg（収率72％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(3R)-3-(3-クロロフェニル)-3-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-1-モルホリノプロパン-1-オン（化合物番号255）
化合物番号255を、化合物番号236（40mg）およびモルホリン（27mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号255をCF3CO2H塩として31mg（収率56％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
2-シクロヘキシル-2-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-1-(4-メチルピペラジン-1-イル)エタノン（化合物番号256）
化合物番号256を、化合物番号240（36mg）および1-メチルピペラジン（38mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号256をCF3CO2H塩として17mg（収率33％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(2S)-2-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-N-(1-メチルピペリジン-4-イル)-2-フェニルアセトアミド（化合物番号257）
段階1：Fmoc-L-フェニルグリシン（740mg、2.0mmol）、EDCI-HCl（600mg、3.0mmol）およびHOBt（405mg、3.0mmol）をジクロロメタン（10mL）に溶解した。。EtN(i-Pr)2（0.5mL）およびN-メチルピペリジン-4-アミン（228mg、2.0mmol）をシリンジで逐次加えた。混合物を周囲温度で4時間撹拌した。水を加え、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、乾燥し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を次の段階で直接用いた。
段階2：段階1からの前の残渣をTHF（10mL）に溶解した。EtNH2（5mL、THF中2.0M）をシリンジで加え、混合物を12時間撹拌した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣を1日間減圧し、次の段階で直接用いた。
段階3：段階2からの前の残渣を無水DMSO（6mL）に溶解した。NaHCO3（200mg）およびS13（400mg、1.17mmol）を加え、混合物を130℃で終夜加熱した。水（2mL）を加え、混合物をろ過した。溶液を逆相HPLCで精製して、表題化合物である化合物番号257をCF3CO2Hの塩として55mg（収率7％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
(2S,3S)-2-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-3-メチル-N-(1-メチルピペリジン-4-イル)ペンタンアミド（化合物番号258）
化合物番号258を、化合物番号231（43mg）およびN-メチルピペリジン-4-アミン（36mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号258をCF3CO2H塩として15mg（収率23％）で得た。ESI-MS C29H40N7O3 [M+H]+ 計算値＝534.32；実測値：534.08。
4-(6-メトキシ-2-メチル-4-(4-((4-(メチルスルホニル)ピペラジン-1-イル)メチル)ナフタレン-1-イル)-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（化合物番号259）
Figure 0006401773
CE194（46mg）、1-(メチルスルホニル)ピペラジン（48mg、0.3mmol）、および酢酸（0.1mL）を無水THF（5mL）に溶解した。。NaBH(OAc)3（110mg、0.5mmol）を一度に加え、混合物を周囲温度で終夜撹拌した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、表題化合物である化合物番号259をCF3CO2H塩として71mg（収率98％）で得た。
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-5-イソプロピル-N-メチル-1H-ピロール-2-カルボキサミド（化合物番号260）
Figure 0006401773
化合物番号260を、化合物番号210（46mg）およびメチルアミン-HCl（21mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号260をCF3CO2H塩として38mg（収率65％）で得た。
Figure 0006401773
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-5-イソプロピル-1H-ピロル-2-イル)(4-ヒドロキシピペリジン-1-イル)メタノン（化合物番号261）
Figure 0006401773
化合物番号261を、化合物番号210（35mg）および4-ヒドロキシルピペリジン（30mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号261をCF3CO2H塩として22mg（収率45％）で得た。
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-(4-ヒドロキシシクロヘキシル)-5-イソプロピル-1H-ピロール-2-カルボキサミド（化合物番号262）
Figure 0006401773
化合物番号262を、化合物番号210（35mg）およびトランス-4-アミノヘキサノール（30mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号262をCF3CO2H塩として28mg（収率55％）で得た。
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-5-イソプロピル-N-(オキセタン-3-イル)-1H-ピロール-2-カルボキサミド（化合物番号263）
Figure 0006401773
化合物番号263を、化合物番号210（35mg）およびオキセタン-3-アミン（30mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号263をCF3CO2H塩として18mg（収率38％）で得た。
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-((シス)-3-ヒドロキシ-3-メチルシクロブチル)-5-イソプロピル-1H-ピロール-2-カルボキサミド（化合物番号264）
Figure 0006401773
化合物番号210（35mg）および(シス)-3-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-3-メチルシクロブタンアミン（35mg）を、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いてカップリングした。反応混合物をCF3CO2H（4mL）で処理し、室温で2時間撹拌した。混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号264をCF3CO2H塩として42mg（収率72％）で得た。
Figure 0006401773
(4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)ナフタレン-1-イル)(4-ヒドロキシピペリジン-1-イル)メタノン（化合物番号265）
Figure 0006401773
化合物番号265を、酸である化合物番号165（48mg）および4-ヒドロキシルピペリジン（30mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号265をCF3CO2H塩として60mg（収率89％）で得た。
Figure 0006401773
4-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-N-(4-ヒドロキシシクロヘキシル)-1-ナフタミド（化合物番号266）
Figure 0006401773
化合物番号266を、酸である化合物番号165（48mg）およびトランス-4-アミノヘキサノール（40mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号266をCF3CO2H塩として37mg（収率53％）で得た。
Figure 0006401773
(3R)-3-(3-クロロフェニル)-3-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-1-(4-ヒドロキシピペリジン-1-イル)プロパン-1-オン（化合物番号267）
Figure 0006401773
化合物番号267を、酸である化合物番号236（40mg）および4-ヒドロキシルピペリジン（30mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号267をCF3CO2H塩として34mg（収率60％）で得た。
Figure 0006401773
(3R)-3-(3-クロロフェニル)-3-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-N-((トランス)-4-ヒドロキシシクロヘキシル）プロパンアミド（化合物番号268）
Figure 0006401773
化合物番号268を、酸である化合物番号236（40mg）および4-ヒドロキシルピペリジン（33mg）から、EDCI-HClによって促進される一般アミド縮合法を用いて調製した。反応混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号268をCF3CO2H塩として52mg（収率90％）で得た。
Figure 0006401773
(3R)-3-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)-3-(3-メトキシフェニル)プロパン酸（化合物番号269）
Figure 0006401773
S13（70mg）、(R)-3-アミノ-3-(3-メトキシフェニル)プロパン酸（80mg）、NaHCO3（100mg）および無水DMSO（3mL）を130℃で終夜加熱した。次いで、混合物を逆相HPLCで精製して、化合物番号269をCF3CO2H塩として39mg（収率32％）で得た。
Figure 0006401773
(3R)-3-(3-クロロフェニル)-3-((7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)アミノ)プロパン-1-オール（化合物番号270）
段階1：酸である化合物番号236（220mg）をMeOH（20mL）に溶解した。濃H2SO4 4滴をガラスピペットで加えた。反応混合物を終夜加熱還流した。反応溶液を濃縮し、NaHCO3飽和溶液で処理し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層を合わせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣をそれ以上精製せずに次の段階で用いた。
段階2：前の残渣をエタノールに溶解した。水素化ホウ素ナトリウム（200mg）を周囲温度で加えた。混合物を室温で終夜撹拌した。NaHCO3飽和水溶液を加え、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層を合わせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号270をCF3CO2H塩として52mg（収率56％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(4-(1-イソプロピル-1H-ピラゾル-5-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（化合物番号271）
Figure 0006401773
丸底フラスコに、4-(4-クロロ-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（S13、1.09g、3.2mmol）、(1-イソプロピル-1H-ピラゾル-5-イル)ボロン酸（1.0g、6.5mmol）、1,2-ジメトキシエタン（18mL）、およびNa2CO3（2M水溶液、6mL）を加えた。系を脱気して酸素を除去し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2（245mg、0.3mmol）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。反応混合物を終夜加熱還流した。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物を277mg（収率21％）で得た。化合物を逆HPLCでさらに精製して、化合物番号271をCF3CO2H塩で得た。
Figure 0006401773
2-(5-ブロモ-2-メトキシフェニル)プロパン-2-オール（CE305）
Figure 0006401773
5-ブロモ-2-メトキシ安息香酸メチル（10g、40mmol）を無水THF（60mL）に溶解し、これを続いて氷水浴で冷却した。MeMgBr（エーテル中3.0M、30mL、90mmol）をシリンジから0℃で加え、反応混合物を終夜撹拌した。反応を飽和塩化アンモニウムで停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。CE305を含む残渣をそれ以上精製せずに次の段階で用いた。
Figure 0006401773
2-(2-メトキシ-5-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)フェニル)プロパン-2-オール（CE308）
Figure 0006401773
2-(5-ブロモ-2-メトキシフェニル)プロパン-2-オール（1.0g、4.0mmol）、ビス(ピナコラト)ジボロン（2.03g、8.0mmol）および酢酸カリウム（1.2g、12mmol）を丸底フラスコに加えた。無水1,4-ジオキサン（20mL）をフラスコに加え、これを脱気し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2（280mg、0.4mmol）を加え、フラスコを再度脱気し、続いて100℃で終夜加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、CH2Cl2で希釈した。溶液をセライトのパッドを通してろ過し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製した。表題化合物をいくらか不純物を含む1.27gで単離し、これをそれ以上精製せずに次の段階で用いた。
Figure 0006401773
2-(5-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)-2-メトキシフェニル)プロパン-2-オール（化合物番号272）
Figure 0006401773
丸底フラスコに、4-(4-クロロ-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（S13、680mg、2.0mmol）、CE308（1.27g、4.3mmol）、1,2-ジメトキシエタン（18mL）、およびNa2CO3（2M水溶液、6mL）を加えた。系を脱気して酸素を除去し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2（163mg、0.2mmol）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。反応混合物を終夜加熱還流した。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物を得、これを逆HPLCでさらに精製して、化合物番号272を221mg（20％）で得た。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
丸底フラスコ中、ZBA154（0.19g）をTHF（9mL）、t-BuOH（9mL）およびH2O（3mL）に室温で溶解した。NaClO2（303mg）、NaH2PO4（505mg）および2-メチル-2-ブテン（1.5mL）を加え、反応混合物を終夜撹拌した。次いで、水および酢酸エチルをゆっくり加えた。水層をEtOAcで抽出した。合わせたEtOAc抽出物をH2Oで洗浄し、Na2SO4で乾燥し、減圧下で濃縮し、HPLC精製後に、化合物番号273（140mg）を得た。ESI-MS C26H20N5O4 [M+H]+ 計算値＝466.15、実測値：466.65。
Figure 0006401773
（アミド縮合）：ZBA191（20mg）、HBTU（24mg）、HOBt-H2O（6mg）およびDMF（1mL）を丸底フラスコに加えた。EtN(i-Pr)2（0.05mL）を加え、続いて1-メチルピペラジン（10mg）を加え、反応混合物を12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号274をCF3CO2Hの塩で得た（14mg）。ESI-MS C31H30N7O3 [M+H]+ 計算値＝548.24、実測値：548.55。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号275-TFA塩を、HBTU-HOBT条件を用いたZBA191およびN,N-ジメチルエチレンジアミンのアミド縮合から調製した。収率60％。ESI-MS C30H30N7O3[M+H]+ 計算値＝536.24、実測値：536.77。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号276-TFA塩を、HBTU-HOBT条件を用いたZBA191およびメチルアミンのアミド縮合から調製した。収率60％。ESI-MS C27H23N6O3[M+H]+ 計算値＝479.18、実測値：479.22。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号277-TFA塩を、HBTU-HOBT条件を用いたZBA191およびN,N-ジエチルエチレンジアミンのアミド縮合から調製した。収率70％。ESI-MS C32H34N7O3[M+H]+ 計算値＝564.27、実測値：564.38。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号278-TFA塩を、HBTU-HOBT条件を用いたZBA191および1-(2-アミノエチル)ピロリジンのアミド縮合から調製した。収率70％。ESI-MS C32H32N7O3[M+H]+ 計算値＝562.25、実測値：562.48。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号279-TFA塩を、HBTU-HOBT条件を用いたZBA191および4-(2-アミノエチル)モルホリンのアミド縮合から調製した。収率70％。ESI-MS C32H32N7O4[M+H]+ 計算値＝578.25、実測値：578.50。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号280-TFA塩を、HBTU-HOBT条件を用いたZBA191および1-メチル-4-ピペリジンアミンのアミド縮合から調製した。収率65％。ESI-MS C32H32N7O3[M+H]+ 計算値＝562.25、実測値：562.66。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
ZBA191（20mg）、HBTU（24mg）、HOBt-H2O（6mg）およびDMF（1mL）を丸底フラスコに加えた。EtN(i-Pr)2（0.05mL）を加え、続いて4-アミノ-1-Boc-ピペリジン（20mg）を加え、反応混合物を12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をTFA（2mL）およびDCM（2mL）に溶解した。混合物を3時間撹拌し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号281をCF3CO2Hの塩で得た（13mg）。ESI-MS C31H30N7O3[M+H]+ 計算値＝548.24、実測値：548.44。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
ZBA191（20mg）、HBTU（24mg）、HOBt-H2O（6mg）およびDMF（1mL）を丸底フラスコに加えた。EtN(i-Pr)2（0.05mL）を加え、続いて(S)-1-N-Boc-2-メチルピペラジン（20mg）を加え、反応混合物を12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をTFA（2mL）およびDCM（2mL）に溶解した。混合物を3時間撹拌し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号282をCF3CO2Hの塩で得た（13mg）。ESI-MS C31H30N7O3[M+H]+ 計算値＝548.24、実測値：548.47。
Figure 0006401773
ZBA191（20mg）、HBTU（24mg）、HOBt-H2O（6mg）およびDMF（1mL）を丸底フラスコに加えた。EtN(i-Pr)2（0.05mL）を加え、続いて1-Boc-ピペラジン（18mg）を加え、反応混合物を12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をTFA（2mL）およびDCM（2mL）に溶解した。混合物を3時間撹拌し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号283をCF3CO2Hの塩で得た（12mg）。ESI-MS C30H28N7O3[M+H]+ 計算値＝534.22、実測値：534.44。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号284-TFA塩を、HBTU-HOBT条件を用いたZBA191およびモルホリンのアミド縮合から調製した。収率75％。ESI-MS C30H27N6O4[M+H]+ 計算値＝535.20、実測値：535.44。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号285-TFA塩を、HBTU-HOBT条件を用いたZBA191および4-ヒドロキシピペリジンのアミド縮合から調製した。収率75％。ESI-MS C31H29N6O4[M+H]+ 計算値＝549.22、実測値：549.64。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号286-TFA塩を、HBTU-HOBT条件を用いたZBA191およびシス-4-アミノ-シクロヘキサノールのアミド縮合から調製した。収率55％。ESI-MS C32H31N6O4[M+H]+ 計算値＝563.24、実測値：563.45。
Figure 0006401773
化合物番号287-TFA塩を、HBTU-HOBT条件を用いたZBA191および4-モルホリノピペリジンのアミド縮合から調製した。収率67％。ESI-MS C35H36N7O4[M+H]+ 計算値＝618.28、実測値：618.66。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号288-TFA塩を、Pd(PPh3)4-K2CO3（2M）条件を用いたZBA139およびCD223の鈴木カップリングから調製した。収率35％。ESI-MS C26H21FN5O3 [M+H]+ 計算値＝470.16、実測値：470.35。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
丸底フラスコ中、化合物番号288（0.045g、0.1mmol）をDCM（7mL）およびピリジン（0.4mL）に室温で溶解した。デス-マーチンペルヨージナン（63.6mg、0.15mmol）を加え、反応混合物を2.5時間撹拌した。次いで、水および酢酸エチルをゆっくり加えた。水層をEtOAcで抽出した。合わせたEtOAc抽出物をH2Oで洗浄し、Na2SO4で乾燥し、減圧下で濃縮して、アルデヒド中間体を得、次いでこれをTHF（3mL）、t-BuOH（3mL）およびH2O（1mL）に室温で溶解した。NaClO2（75mg）、NaH2PO4（125mg）および2-メチル-2-ブテン（0.5mL）を加え、反応混合物を終夜撹拌した。次いで、水および酢酸エチルをゆっくり加えた。水層をEtOAcで抽出した。合わせたEtOAc抽出物をH2Oで洗浄し、Na2SO4で乾燥し、減圧下で濃縮し、HPLC精製後に化合物番号289（25mg）を得た。ESI-MS C26H19FN5O4 [M+H]+ 計算値＝484.14、実測値：484.33。
Figure 0006401773
化合物番号289（20mg）、HBTU（24mg）、HOBt-H2O（6mg）およびDMF（1mL）を丸底フラスコに加えた。EtN(i-Pr)2（0.05mL）を加え、続いて(S)-4-アミノ-1-(トリチルオキシ)ブタン-2-オール（28mg）を加え、反応混合物を12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をTFA（2mL）およびDCM（2mL）に溶解した。混合物を3時間撹拌し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号290をCF3CO2Hの塩で得た（15mg）。ESI-MS C30H28FN6O5[M+H]+ 計算値＝571.21、実測値：571.64。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号291-TFA塩を、HBTU-HOBT条件を用いた化合物番号289および2-(4-アミノピペリジン-1-イル)エタノールのアミド縮合から調製した。収率50％。ESI-MS C33H33FN7O4[M+H]+ 計算値＝610.25、実測値：610.44。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号292-TFA塩を、HBTU-HOBT条件を用いた化合物番号289および1-イソプロピル-ピペリジン-4-イルアミンのアミド縮合から調製した。収率70％。ESI-MS C34H35FN7O3[M+H]+ 計算値＝608.27、実測値：608.66。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号293-TFA塩を、HBTU-HOBT条件を用いた化合物番号289および1-(テトラヒドロ-2H-ピラン-4-イル)-4-ピペリジンアミンのアミド縮合から調製した。収率70％。ESI-MS C36H37FN7O4[M+H]+ 計算値＝650.28、実測値：650.46。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号294-TFA塩を、HBTU-HOBT条件を用いた化合物番号289および1-(オキセタン-3-イル)ピペリジン-4-アミンのアミド縮合から調製した。収率40％。ESI-MS C34H33FN7O4[M+H]+ 計算値＝622.25、実測値：622.45。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
8-ブロモ-2,3-ジヒドロベンゾ[b][1,4]ジオキシン-5-カルボン酸メチル（1.1g、4.16mmol）、ビス(ピナコラト)ジボロン（2.13g、8.4mmol、2.0当量）、および酢酸カリウム（1.6g、16mmol、4.0当量）を丸底フラスコに加えた。無水1,4-ジオキサン（20mL）をシリンジで加え、フラスコを脱気し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2（322mg、0.46mmol、0.1当量）を加え、系を再度脱気し、続いて100℃で16時間加熱した。反応混合物を周囲温度まで冷却し、CH2Cl2で希釈した。溶液をセライトのパッドを通してろ過し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製した。表題化合物ZBA245を1.0gで単離した。ESI-MS C16H22BO6[M+H]+ 計算値＝321.15、実測値：321.44。
Figure 0006401773
丸底フラスコに、4-(4-クロロ-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（S13、5.4g、16mmol、1.0当量）およびZBA245（13.75g、37mmol、2.0当量）、1,2-ジメトキシエタン（150mL）、およびNa2CO3（2M、50mL）を加えた。系を脱気して酸素を除去し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2（1.3g、1.6mmol、0.1当量）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。反応混合物を16時間加熱還流した。反応を水で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物ZBA246を2.1g（2段階で収率26.5％）で得た。ESI-MS C27H25N4O6[M+H]+ 計算値＝501.17、実測値：501.35。
Figure 0006401773
丸底フラスコ中、ZBA246（110mg、0.22mmol）をMeOH（5mL）および水（5mL）に溶解した。NaOH（26mg、0.66mmol、3当量）を加え、溶液を100℃で3時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチルで抽出した。続いて、水層をpH＝2まで中和し、酢酸エチルで抽出した。酸性水溶液の有機抽出物を合わせ、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を凍結乾燥して、表題化合物を90mgで得た。ESI-MS C26H23N4O6[M+H]+ 計算値＝487.16、実測値：487.35。
Figure 0006401773
（アミド縮合）：ZBA249（20mg、0.05mmol）、EDCI-HCl（100mg、0.5mmol）、およびHOBt-H2O（70mg、0.5mmol）を丸底フラスコに加えた。EtN(i-Pr)2（0.1mL）を加え、続いてDMF（2.5mL）を加えた。N,N-ジメチルエチレンジアミン（40mg）を加え、反応混合物を12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、表題化合物である化合物番号295をCF3CO2Hの塩で得た（収率69％）。ESI-MS C30H33N6O5[M+H]+ 計算値＝557.25、実測値：557.44。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
ZBA249（20mg、0.05mmol）、EDCI-HCl（100mg、0.5mmol）、およびHOBt-H2O（70mg、0.5mmol）を丸底フラスコに加えた。EtN(i-Pr)2（0.1mL）を加え、続いてDMF（2.5mL）を加えた。1-Boc-ピペラジン（40mg）を加え、反応混合物を12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をTFA（2mL）およびDCM（2mL）に溶解した。混合物を3時間撹拌し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号296をCF3CO2Hの塩で得た（15mg）。ESI-MS C30H31N6O5[M+H]+ 計算値＝555.23、実測値：555.44。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号297-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA249および1-メチルピペラジンのアミド縮合から調製した。収率75％。ESI-MS C31H33N6O5[M+H]+ 計算値＝569.25、実測値：569.64。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
ZBA249（20mg、0.05mmol）、EDCI-HCl（100mg、0.5mmol）、およびHOBt-H2O（70mg、0.5mmol）を丸底フラスコに加えた。EtN(i-Pr)2（0.1mL）を加え、続いてDMF（2.5mL）を加えた。(S)-1-N-Boc-2-メチルピペラジン（40mg）を加え、反応混合物を12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をTFA（2mL）およびDCM（2mL）に溶解した。混合物を3時間撹拌し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号298をCF3CO2Hの塩で得た（17mg）。ESI-MS C31H33N6O5[M+H]+ 計算値＝569.25、実測値：569.55。
Figure 0006401773
化合物番号299-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA249および(S)-1,2-ジメチルピペラジン2塩酸塩のアミド縮合から調製した。収率75％。ESI-MS C32H35N6O5[M+H]+ 計算値＝583.26、実測値：583.37。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号300-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA249およびシス-2,6-ジメチルピペラジン2塩酸塩のアミド縮合から調製した。収率80％。ESI-MS C32H35N6O5[M+H]+ 計算値＝583.26、実測値：583.47。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号301-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA249および1-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジンのアミド縮合から調製した。収率80％。ESI-MS C32H35N6O6[M+H]+ 計算値＝599.26、実測値：599.66。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号302-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA249および1-メチル-4-ピペリジンアミンのアミド縮合から調製した。収率75％。ESI-MS C32H35N6O5[M+H]+ 計算値＝583.26、実測値：583.37。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
ZBA249（20mg、0.05mmol）、EDCI-HCl（100mg、0.5mmol）、およびHOBt-H2O（70mg、0.5mmol）を丸底フラスコに加えた。EtN(i-Pr)2（0.1mL）を加え、続いてDMF（2.5mL）を加えた。4-アミノ-1-Boc-ピペリジン（40mg）を加え、反応混合物を12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をTFA（2mL）およびDCM（2mL）に溶解した。混合物を3時間撹拌し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号303をCF3CO2Hの塩で得た（20mg）。ESI-MS C31H33N6O5[M+H]+ 計算値＝569.25、実測値：569.45。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号304-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA249および2-(4-アミノピペリジン-1-イル)エタノールのアミド縮合から調製した。収率75％。ESI-MS C33H37N6O6[M+H]+ 計算値＝613.27、実測値：613.57。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号305-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA249および1-(テトラヒドロ-2H-ピラン-4-イル)-4-ピペリジンアミンのアミド縮合から調製した。収率80％。ESI-MS C36H41N6O6[M+H]+ 計算値＝653.30、実測値：653.55。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号306-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA249および1-(オキセタン-3-イル)ピペリジン-4-アミンのアミド縮合から調製した。収率80％。ESI-MS C34H37N6O6[M+H]+ 計算値＝625.27、実測値：625.37。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号307-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA249および1-(オキセタン-3-イル)ピペラジンのアミド縮合から調製した。収率70％。ESI-MS C33H35N6O6[M+H]+ 計算値＝611.26、実測値：611.37。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号308-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA249および1-メチルスルホニル-ピペラジンのアミド縮合から調製した。収率80％。ESI-MS C31H33N6O7S[M+H]+ 計算値＝633.21、実測値：633.44。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
ZBA249（20mg、0.05mmol）、EDCI-HCl（100mg、0.5mmol）、およびHOBt-H2O（70mg、0.5mmol）を丸底フラスコに加えた。EtN(i-Pr)2（0.1mL）を加え、続いてDMF（2.5mL）を加えた。(S)-4-アミノ-1-(トリチルオキシ)ブタン-2-オール（40mg）を加え、反応混合物を12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をTFA（2mL）およびDCM（2mL）に溶解した。混合物を3時間撹拌し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号309をCF3CO2Hの塩で得た（18mg）。ESI-MS C30H32N5O7[M+H]+ 計算値＝574.23、実測値：574.47。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号310-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA249および4-ヒドロキシピペリジンのアミド縮合から調製した。収率80％。ESI-MS C31H32N5O6 [M+H]+ 計算値＝570.23、実測値：570.4。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号311-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA249およびシス-4-アミノ-シクロヘキサノールのアミド縮合から調製した。収率80％。ESI-MS C32H34N5O6 [M+H]+ 計算値＝584.25、実測値：584.5。
Figure 0006401773
化合物番号312-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA249およびモルホリンのアミド縮合から調製した。収率80％。ESI-MS C30H30N5O6 [M+H]+ 計算値＝556.21、実測値：556.4。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号313-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA249および4-モルホリノピペリジンのアミド縮合から調製した。収率80％。ESI-MS C35H39N6O6 [M+H]+ 計算値＝639.29、実測値：639.5。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
1-メチル-4-ピペリジンカルボン酸（57mg、0.4mmol）およびTHF（10mL）を丸底フラスコに加えた。塩化オキサリル（0.1mL）を加え、続いてDMF（1滴）を加えた。反応混合物を3時間撹拌し、次いでロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をDMF（1mL）に溶解した。次いで、化合物番号150（20mg）およびNaHCO3（50mg）を加えた。混合物を室温で12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号314をCF3CO2Hの塩で得た（13mg）。ESI-MS C34H35N6O3[M+H]+ 計算値＝575.27、実測値：575.47。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号150（50mg）およびピリジン（2mL）を丸底フラスコに加えた。クロロギ酸4-ニトロフェニル（33mg）を加えた。反応混合物を5時間撹拌し、次いで、1-メチル-4-ピペリジンアミン（300mg）およびDBU（300mg）を加えた。混合物を室温で12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号315をCF3CO2Hの塩で得た（30mg）。ESI-MS C34H36N7O3[M+H]+ 計算値＝590.28 実測値：590.5。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号150（50mg）およびピリジン（2mL）を丸底フラスコに加えた。クロロギ酸4-ニトロフェニル（33mg）を加えた。反応混合物を5時間撹拌し、次いで、1-メチルピペラジン（300mg）およびDBU（300mg）を加えた。混合物を室温で12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号316をCF3CO2Hの塩で得た（29mg）。ESI-MS C33H34N7O3[M+H]+ 計算値＝576.27、実測値：576.5。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号150（50mg）およびピリジン（2mL）を丸底フラスコに加えた。クロロギ酸4-ニトロフェニル（33mg）を加えた。反応混合物を5時間撹拌し、次いで、1-(オキセタン-3-イル)ピペラジン（300mg）およびDBU（300mg）を加えた。混合物を室温で12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号317をCF3CO2Hの塩で得た（32mg）。ESI-MS C35H36N7O4[M+H]+ 計算値＝618.28、実測値：618.5。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号150（50mg）およびピリジン（2mL）を丸底フラスコに加えた。クロロギ酸4-ニトロフェニル（33mg）を加えた。反応混合物を5時間撹拌し、次いで、1-(テトラヒドロ-2H-ピラン-4-イル)ピペラジン（300mg）およびDBU（300mg）を加えた。混合物を室温で12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号318をCF3CO2Hの塩で得た（5mg）。ESI-MS C37H40N7O4[M+H]+ 計算値＝646.31、実測値：646.55。
Figure 0006401773
3-ブロモ-5-(tert-ブチル)安息香酸メチル（1.1g、4.16mmol）、ビス(ピナコラト)ジボロン（2.13g、8.4mmol、2.0当量）、および酢酸カリウム（1.6g、16mmol、4.0当量）を丸底フラスコに加えた。無水1,4-ジオキサン（20mL）をシリンジで加え、フラスコを脱気し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2（322mg、0.46mmol、0.1当量）を加え、系を再度脱気し、続いて100℃で16時間加熱した。反応混合物を周囲温度まで冷却し、CH2Cl2で希釈した。溶液をセライトのパッドを通してろ過し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製した。表題化合物ZBA297を0.9gで単離した。ESI-MS C18H28BO4[M+H]+ 計算値＝319.20、実測値：319.4。
Figure 0006401773
丸底フラスコに、4-(4-クロロ-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（S13、5.4g、16mmol、1.0当量）およびZBA297（13.75g、37mmol、2.0当量）、1,2-ジメトキシエタン（150mL）、およびNa2CO3（2M、50mL）を加えた。系を脱気して酸素を除去し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2（1.3g、1.6mmol、0.1当量）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。反応混合物を16時間加熱還流した。反応を水で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物ZBA298を2.2gで得た。ESI-MS C29H31N4O4[M+H]+ 計算値＝499.23、実測値：499.6。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
丸底フラスコ中、ZBA298（110mg、0.22mmol）をMeOH（5mL）および水（5mL）に溶解した。NaOH（26mg、0.66mmol、3当量）を加え、溶液を100℃で3時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチルで抽出した。続いて、水層をpH＝2まで中和し、酢酸エチルで抽出した。酸性水溶液の有機抽出物を合わせ、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を凍結乾燥して、表題化合物を80mgで得た。ESI-MS C28H29N4O4[M+H]+ 計算値＝485.21、実測値：485.5。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号319-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA301および1-メチル-4-ピペリジンアミンのアミド縮合から調製した。収率75％。ESI-MS C34H41N6O3[M+H]+ 計算値＝581.32、実測値：581.66。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号320-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA301および1-(テトラヒドロ-2H-ピラン-4-イル)-4-ピペリジンアミンのアミド縮合から調製した。収率80％。ESI-MS C38H47N6O4[M+H]+ 計算値＝651.36、実測値：651.55。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号321-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA301および1-(オキセタン-3-イル)ピペラジンのアミド縮合から調製した。収率80％。ESI-MS C35H41N6O4[M+H]+ 計算値＝609.31、実測値：609.46。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号322-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA301および1-(オキセタン-3-イル)ピペリジン-4-アミンのアミド縮合から調製した。収率90％。ESI-MS C36H43N6O4[M+H]+ 計算値＝623.33、実測値：623.5。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号323-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA301および1-メチルピペラジンのアミド縮合から調製した。収率70％。ESI-MS C33H39N6O3[M+H]+ 計算値＝567.30、実測値：567.5。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号324-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA301および1-イソプロピルピペラジンのアミド縮合から調製した。収率80％。ESI-MS C35H43N6O3[M+H]+ 計算値＝595.33、実測値：595.55。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号325-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA301および1-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジンのアミド縮合から調製した。収率50％。ESI-MS C34H41N6O4[M+H]+ 計算値＝597.31、実測値：597.5。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号162（50mg）およびピリジン（2mL）を丸底フラスコに加えた。クロロギ酸4-ニトロフェニル（33mg）を加えた。反応混合物を5時間撹拌し、次いで、1-メチルピペラジン（300mg）およびDBU（300mg）を加えた。混合物を室温で12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号326をCF3CO2Hの塩で得た（5mg）。ESI-MS C33H40N7O3[M+H]+ 計算値＝582.31、実測値：582.55。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号162（50mg）およびピリジン（2mL）を丸底フラスコに加えた。クロロギ酸4-ニトロフェニル（33mg）を加えた。反応混合物を5時間撹拌し、次いで、1-(テトラヒドロ-2H-ピラン-4-イル)ピペラジン（300mg）およびDBU（300mg）を加えた。混合物を室温で12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号327をCF3CO2Hの塩で得た（25mg）。ESI-MS C37H46N7O4[M+H]+ 計算値＝652.36、実測値：652.45。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号162（50mg）およびピリジン（2mL）を丸底フラスコに加えた。クロロギ酸4-ニトロフェニル（33mg）を加えた。反応混合物を5時間撹拌し、次いで、1-(オキセタン-3-イル)ピペラジン（300mg）およびDBU（300mg）を加えた。混合物を室温で12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号328をCF3CO2Hの塩で得た（34mg）。ESI-MS C35H42N7O4[M+H]+ 計算値＝624.32、実測値：624.44。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
イソブチルアルデヒド（0.7mL）、2-オキソピペラジン（0.5g）およびトランス-1,2-ビス(フェニルスルホニル)エチレン（1.7g）を丸底フラスコ中で混合し、続いて無水PhMe（100mL）および4Aモレキュラーシーブ（1g）を加えた。反応混合物を80℃で終夜撹拌した。固体をろ去し、溶液をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をTHF（20mL）に溶解し、DBU（1.5mL）を加えた。混合物を室温で4時間撹拌した。混合物を酢酸エチルで希釈し、1N HClで洗浄して、DBUを除去した。有機層を乾燥し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、ZBA310を450mgで得た。ESI-MS C10H15N2O [M+H]+ 計算値＝179.11、実測値：179.33。
Figure 0006401773
ZBA310（350mg）をCHCl3（20mL）に溶解した。NBS（350mg）を少しずつ加え、混合物を室温で2時間撹拌した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、ZBB12を280mgで得た。ESI-MS C10H14BrN2O [M+H]+ 計算値＝257.02、実測値：257.15。
Figure 0006401773
ZBB12（250mg）をDMF（2mL）に溶解した。NaH（40mg）を少しずつ加え、次いでMeI（0.1mL）を加えた。混合物を室温で2時間撹拌した。混合物を酢酸エチルで希釈し、NaCl水溶液で洗浄した。有機層を乾燥し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、ZBB15を230mgで得た。ESI-MS C11H16N2OBr [M+H]+ 計算値＝271.04、実測値：271.32。
Figure 0006401773
ZBB15（250mg）および2-イソプロポキシ-4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン（0.4mL）を無水THF（20mL）に溶解した。溶液を-78℃で15分間冷却した後、BuLi（0.77mL、THF中2.5M）をシリンジで加えた。反応混合物を-78℃で6時間撹拌した後、飽和NH4Cl水溶液で反応停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物ZBB19を180mgで得た。ESI-MS C17H28N2O3B[M+H]+ 計算値＝319.21、実測値：319.44。
Figure 0006401773
丸底フラスコに、4-(4-クロロ-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（S13、70mg）およびZBB19（130mg）、1,2-ジメトキシエタン（150mL）、およびNa2CO3（2M、50mL）を加えた。系を脱気して酸素を除去し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2（25mg）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。反応混合物を16時間加熱還流した。反応を水で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物である化合物番号329を15mgで得た。ESI-MS C28H31N6O3[M+H]+ 計算値＝499.24、実測値：499.55。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号329（8mg）およびLiAlH4（4mg）を無水THF（5mL）に溶解した。溶液を70℃で3時間加熱した後、飽和NH4Cl水溶液で反応停止した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号330をCF3CO2Hの塩で得た（5mg）。ESI-MS C28H33N6O2[M+H]+ 計算値＝485.26、実測値：485.44。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
5-ブロモキノリン-8-カルボン酸メチル（1.1g、4.16mmol）、ビス(ピナコラト)ジボロン（2.13g、8.4mmol、2.0当量）、および酢酸カリウム（1.6g、16mmol、4.0当量）を丸底フラスコに加えた。無水1,4-ジオキサン（20mL）をシリンジで加え、フラスコを脱気し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2（322mg、0.46mmol、0.1当量）を加え、系を再度脱気し、続いて100℃で16時間加熱した。反応混合物を周囲温度まで冷却し、CH2Cl2で希釈した。溶液をセライトのパッドを通してろ過し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製した。表題化合物ZBB23を0.7gで単離した。ESI-MS C17H21BNO4[M+H]+ 計算値＝314.15、実測値：314.33。
Figure 0006401773
丸底フラスコに、4-(4-クロロ-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（S13、5.4g、16mmol、1.0当量）およびZBB23（18.2g、37mmol、2.0当量）、1,2-ジメトキシエタン（150mL）、およびNa2CO3（2M、50mL）を加えた。系を脱気して酸素を除去し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2（1.3g、1.6mmol、0.1当量）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。反応混合物を16時間加熱還流した。反応を水で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物ZBB25を3.7gで得た。ESI-MS C28H24N5O4[M+H]+ 計算値＝494.18、実測値：494.33。
Figure 0006401773
丸底フラスコ中、ZBB25（110mg、0.22mmol）をMeOH（5mL）および水（5mL）に溶解した。NaOH（26mg、0.66mmol、3当量）を加え、溶液を100℃で3時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチルで抽出した。続いて、水層をpH＝2まで中和し、酢酸エチルで抽出した。酸性水溶液の有機抽出物を合わせ、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を凍結乾燥して、表題化合物ZBB27を80mgで得た。ESI-MS C27H22N5O4[M+H]+ 計算値＝480.16、実測値：480.33。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号331塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBB27および1-メチル-4-ピペリジンアミンのアミド縮合から調製した。収率75％。ESI-MS C33H34N7O3[M+H]+ 計算値＝576.27、実測値：576.44。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号332塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBB27および1-(テトラヒドロ-2H-ピラン-4-イル)-4-ピペリジンアミンのアミド縮合から調製した。収率80％。ESI-MS C37H40N7O4[M+H]+ 計算値＝646.31、実測値：646.44。
Figure 0006401773
化合物番号333塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBB27および1-(オキセタン-3-イル)ピペリジン-4-アミンのアミド縮合から調製した。収率80％。ESI-MS C35H36N7O4[M+H]+ 計算値＝618.28、実測値：618.33。
Figure 0006401773
化合物番号334塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBB27および1-メチルピペラジンのアミド縮合から調製した。収率80％。ESI-MS C32H32N7O3[M+H]+ 計算値＝562.25、実測値：562.33。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号335塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBB27および4-アミノテトラヒドロピランのアミド縮合から調製した。収率70％。ESI-MS C32H31N6O4[M+H]+ 計算値＝563.24、実測値：563.33。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号336塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBB27および3-オキセタンアミンのアミド縮合から調製した。収率80％。ESI-MS C30H27N6O4[M+H]+ 計算値＝535.20、実測値：535.33。
Figure 0006401773
1-ブロモナフタレン（2.8g）、Pd(OAc)2（0.6g）、P(tBu)3（0.5g）およびtBuONa（2g）を丸底フラスコに加えた。無水PhMe（60mL）をシリンジで加え、フラスコを脱気し、窒素を再充填した。1-Boc-ピペラジン（4g）を加え、系を再度脱気し、続いて60℃で16時間加熱した。反応混合物を周囲温度まで冷却し、CH2Cl2で希釈した。溶液をセライトのパッドを通してろ過し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製した。表題化合物ZBB65を3.5gで単離した。ESI-MS C19H25N2O2[M+H]+ 計算値＝313.19、実測値：313.24。
Figure 0006401773
ZBB65（4.3g）をCH3CN（80mL）に溶解した。NBS（2.7g）を少しずつ加え、混合物を室温で10時間撹拌した。揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残りの残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、ZBB66を3.5gで得た。ESI-MS C19H24BrN2O2 [M+H]+ 計算値＝391.10、実測値：391.22。
Figure 0006401773
ZBB66（1.6g、4.16mmol）、ビス(ピナコラト)ジボロン（2.13g、8.4mmol、2.0当量）、および酢酸カリウム（1.6g、16mmol、4.0当量）を丸底フラスコに加えた。無水1,4-ジオキサン（20mL）をシリンジで加え、フラスコを脱気し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2（322mg、0.46mmol、0.1当量）を加え、系を再度脱気し、続いて100℃で16時間加熱した。反応混合物を周囲温度まで冷却し、CH2Cl2で希釈した。溶液をセライトのパッドを通してろ過し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製した。表題化合物ZBB73を1.3gで単離した。ESI-MS C25H36BN2O4[M+H]+ 計算値＝439.27、実測値：439.33。
Figure 0006401773
丸底フラスコに、4-(4-クロロ-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（S13、5.4g、16mmol、1.0当量）およびZBB73 （16.75g、37mmol、2.0当量）、1,2-ジメトキシエタン（150mL）、およびNa2CO3（2M、50mL）を加えた。系を脱気して酸素を除去し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2（1.3g、1.6mmol、0.1当量）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。反応混合物を16時間加熱還流した。反応を水で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をCH2Cl2（50mL）およびTFA（50mL）に溶解した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去し、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物である化合物番号337を2.0gで得た。ESI-MS C31H31N6O2[M+H]+ 計算値＝519.25、実測値：519.33。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号337（20mg）、ホルムアルデヒド（0.2mL、37％水溶液）およびNaBH(OAc)3（65mg）をClCH2CH2Cl（10mL）に溶解し、混合物を終夜撹拌した。次いで、水および酢酸エチルをゆっくり加えた。水層をEtOAcで抽出した。合わせたEtOAc抽出物をH2Oで洗浄し、Na2SO4で乾燥し、減圧下で濃縮し、HPLC精製後に化合物番号338を得た（8mg）。ESI-MS C32H33N6O2[M+H]+ 計算値＝533.26、実測値：533.34。
Figure 0006401773
化合物番号337（20mg）、およびNaBH(OAc)3（65mg）をアセトン（1mL）に溶解し、混合物を終夜撹拌した。次いで、水および酢酸エチルをゆっくり加えた。水層をEtOAcで抽出した。合わせたEtOAc抽出物をH2Oで洗浄し、Na2SO4で乾燥し、減圧下で濃縮し、HPLC精製後に化合物番号339を得た（12mg）。ESI-MS C34H37N6O2[M+H]+ 計算値＝561.29、実測値：561.33。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号337（20mg）、および無水酢酸（5mg）をTHF（1mL）に溶解し、混合物を終夜撹拌した。次いで、水および酢酸エチルをゆっくり加えた。水層をEtOAcで抽出した。合わせたEtOAc抽出物をH2Oで洗浄し、Na2SO4で乾燥し、減圧下で濃縮し、HPLC精製後に化合物番号340を得た（6mg）。ESI-MS C33H33N6O3[M+H]+ 計算値＝561.26、実測値：561.34。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号341-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA301および3-アミノオキセタンのアミド縮合から調製した。収率50％。ESI-MS C31H34N5O4[M+H]+ 計算値＝540.26、実測値：540.33。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
ZBA301（20mg、0.05mmol）、EDCI-HCl（100mg、0.5mmol）、およびHOBt-H2O（70mg、0.5mmol）を丸底フラスコに加えた。EtN(i-Pr)2（0.1mL）を加え、続いてDMF（2.5mL）を加えた。3-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-3-メチルシクロブタン-1-アミン（40mg）を加え、反応混合物を12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をTFA（2mL）およびDCM（2mL）に溶解した。混合物を3時間撹拌し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号342をCF3CO2Hの塩で得た（9mg）。ESI-MS C33H35N5O4[M+H]+ 計算値＝568.29、実測値：568.44。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号343-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA301およびピペリジン-4-オールのアミド縮合から調製した。収率60％。ESI-MS C33H38N5O4[M+H]+ 計算値＝568.29、実測値：568.43。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
ZBA301（20mg、0.05mmol）、EDCI-HCl（100mg、0.5mmol）、およびHOBt-H2O（70mg、0.5mmol）を丸底フラスコに加えた。EtN(i-Pr)2（0.1mL）を加え、続いてDMF（2.5mL）を加えた。(S)-4-アミノ-1-(トリチルオキシ)ブタン-2-オール（40mg）を加え、反応混合物を12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をTFA（2mL）およびDCM（2mL）に溶解した。混合物を3時間撹拌し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号344をCF3CO2Hの塩で得た（10mg）。ESI-MS C32H38N5O5[M+H]+ 計算値＝572.28、実測値：572.45。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
化合物番号345-TFA塩を、EDCI-HOBT条件を用いたZBA301およびシス-4-アミノ-シクロヘキサノールのアミド縮合から調製した。収率60％。ESI-MS C34H40N5O4[M+H]+ 計算値＝582.30、実測値：582.55。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
丸底フラスコに、4-(4-クロロ-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（S13、54mg、1.0当量）および3-(tert-ブチル)-5-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ピリジン（137mg、2.0当量）、1,2-ジメトキシエタン（15mL）、およびNa2CO3（2M、5mL）を加えた。系を脱気して酸素を除去し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2（13mg）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。反応混合物を16時間加熱還流した。反応を水で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物である化合物番号346を16mgで得た。ESI-MS C26H28N5O2[M+H]+ 計算値＝442.22、実測値：442.44。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
丸底フラスコに、4-(4-クロロ-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（S13、54mg、1.0当量）および4-(tert-ブチル)-2-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ピリジン（137mg、2.0当量）、1,2-ジメトキシエタン（15mL）、およびNa2CO3（2M、5mL）を加えた。系を脱気して酸素を除去し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2（13mg）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。反応混合物を16時間加熱還流した。反応を水で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物である化合物番号347を4mgで得た。ESI-MS C26H28N5O2[M+H]+ 計算値＝442.22、実測値：442.46。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
丸底フラスコに、4-(4-クロロ-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾール（S13、54mg、1.0当量）および(4-イソプロピルピリジン-3-イル)ボロン酸（100mg、2.0当量）、1,2-ジメトキシエタン（15mL）、およびNa2CO3（2M、5mL）を加えた。系を脱気して酸素を除去し、窒素を再充填した。Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2（13mg）を加え、系を脱気し、窒素を再充填した。反応混合物を16時間加熱還流した。反応を水で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物である化合物番号348を10mgで得た。ESI-MS C25H26N5O2[M+H]+ 計算値＝428.20、実測値：428.45。
Figure 0006401773
化合物番号350（TFT塩）の合成
Figure 0006401773
丸底フラスコ中、4-アミノ-1-Boc-ピペリジン（2g）をTHF（30mL）および水（30mL）に溶解した。NaHCO3（8g）およびCbzCl（1.5mL）を加え、溶液を室温で10時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチルで抽出した。有機抽出物を合わせ、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をTFA（4mL）およびDCM（40mL）に溶解し、溶液を室温で4時間撹拌した。溶液をロータリーエバポレーターで濃縮した。次いで、NaHCO3水溶液（30mL）および反応混合物を酢酸エチルで抽出した。有機抽出物を合わせ、ロータリーエバポレーターで濃縮して、ZBA240（1.6g）を得、これを次の段階で直接用いた。
Figure 0006401773
丸底フラスコ中、ZBA240（2.3g）をDMF（30mL）に溶解した。K2CO3（2g）、(3-ブロモプロピル)カルバミン酸tert-ブチル（2.4g）およびNaI（750mg）を加え、溶液を60℃で2時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィで精製して、表題化合物ZBA241を1.8gで得た。ESI-MS C21H34N3O4[M+H]+ 計算値＝392.25、実測値：392.44。
Figure 0006401773
丸底フラスコに、ZBA241（300mg）、10％Pd/C（100mg）、MeOH（20mL）を加えた。系を脱気して酸素を除去し、水素を再充填した。溶液を室温で10時間撹拌した。溶液をセライトのパッドを通してろ過し、揮発性成分をロータリーエバポレーターで除去した。残渣ZBA241-2を精製せずに次の段階で直接用いた。
Figure 0006401773
化合物番号289（20mg）、HBTU（24mg）、HOBt-H2O（6mg）およびDMF（1mL）を丸底フラスコに加えた。EtN(i-Pr)2（0.05mL）を加え、続いてZBA241-2（37mg）を加え、反応混合物を12時間撹拌した。反応をNaHCO3飽和溶液で停止し、水層を酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣をTFA（2mL）およびDCM（2mL）に溶解した。混合物を3時間撹拌し、ロータリーエバポレーターで濃縮した。残りの残渣を逆相HPLCで精製して、化合物番号349をCF3CO2Hの塩で得た（10mg）。ESI-MS C34H36FN8O3[M+H]+ 計算値＝623.28、実測値：623.43。
Figure 0006401773
丸底フラスコ中、化合物番号349（19mg）をDMSO（1mL）に溶解した。5-FAM、SE（5-カルボキシフルオレセイン、スクシンイミジルエステル）（43mg）、DIEPS（0.03mL）を加え、溶液を室温で2時間撹拌した。混合物を逆相HPLCで精製して、トレーサーである化合物番号350をCF3CO2Hの塩で得た（6mg）。ESI-MS C55H46FN8O9[M+H]+ 計算値＝981.33、実測値：981.42。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
1-(7-(3,5-ジメチルイソキサゾル-4-イル)-6-メトキシ-2-メチル-9H-ピリミド[4,5-b]インドル-4-イル)キノリン-4(1H)-オン（化合物番号351）：
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-(3,5-ジメチル-1-フェニル-1H-ピラゾル-4-イル)-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジメチルイソキサゾールを上のセクション3.2に記載のとおりに調製した。
Figure 0006401773
Figure 0006401773
4-(1-クロロ-8-メトキシ-5H-ピリド[4,3-b]インドル-7-イル)-3,5-ジエチルイソキサゾールを上のセクション4.3に記載のとおりに調製した。
Figure 0006401773
本発明のBETブロモドメイン阻害剤のBETブロモドメインタンパク質に結合する能力を示すために、競合的FP結合検定を設計し、組換えBRD2 BD2、BRD3 BD2、およびBRD4 BD2タンパク質について実施した。
FAM標識蛍光プローブ（BRD-1F）を、公知の小分子BETブロモドメイン阻害剤に基づいて合成した。これら3つのタンパク質に対するBRD-1FのKd値を、固定濃度の蛍光プローブおよび完全飽和までの漸増濃度のタンパク質からなる混合物の全蛍光偏光をモニタリングすることにより求めた。蛍光偏光値は、Corning 384穴平底プレート（Corning Life Science）中、Infinite M-1000プレートリーダー（Tecan U.S., Research Triangle Park, NC）を用いて測定した。試験タンパク質の連続希釈液をBRD-1Fと、検定緩衝液（0.01％トリトンX-100および2.5％エチレングリコールを含む、100mMリン酸カリウム、pH7.5、100μg/mlウシγ-グロブリン、0.02％アジ化ナトリウム、Invitrogen）中で、最終量80μlとなるよう混合した。最終BRD-1F濃度は5nMであった。プレートを室温で1〜2時間、平衡を確実にするため緩やかに振盪しながらインキュベートした。ミリ偏光単位（mP）での偏光値を、励起波長485nmおよび発光波長530nmで測定した。次いで、平衡解離定数（Kd）を、Graphpad Prism 5.0ソフトウェア（Graphpad Software, San Diego, CA）を用いて、シグモイド状の用量依存的FP増大をタンパク質濃度の関数としてあてはめることにより算出した。
化合物のIC50およびKi値を競合的結合実験において求め、ここで固定濃度のタンパク質への結合についても、化合物の連続希釈液は固定濃度の蛍光プローブ（BRD-1F）に対して競合した（典型的には上で求めたKd値の2〜3倍）。エチレングリコール中の試験化合物2μlおよび検定緩衝液（0.01％トリトンX-100を含む、100mMリン酸カリウム、pH7.5、100μg/mlウシγ-グロブリン、0.02％アジ化ナトリウム、Invitrogen）中のプレインキュベートしたタンパク質/プローブ複合体溶液78μlの混合物を検定プレートに加え、室温で1時間、緩やかに振盪しながらインキュベートした。BRD2 BD2、BRD3 BD2、およびBRD4 BD2の検定中、タンパク質の最終濃度はそれぞれ200nM、150nM、および200nMであった。最終プローブ濃度はすべての検定で5nMである。タンパク質/プローブ複合体だけを含む陰性対照（0％阻害と同等）、および遊離プローブだけを含む陽性対照（100％阻害と同等）を各検定プレートに加えた。FP値を前述のとおりに測定した。IC50値を競合曲線の非線形回帰フィッティングにより求めた。競合的阻害剤のKi値を、競合検定における測定したIC50値、異なるタンパク質に対するプローブのKd値、ならびにタンパク質およびプローブの濃度に基づき、前述の誘導式を用いて算出した。
表1は、いくつかの代表的化合物のBRD2 BD2およびBRD4 BD2タンパク質に対する結合親和性を示す。
（表１）FP競合的結合検定における、代表的化合物のBRD2 BD2およびBRD4 BD2に対する結合親和性
Figure 0006401773
合成した化合物のBRD2 BD1およびBD2、BRD3 BD1およびBD2、ならびにBRD4 BD1およびBD2に対する結合親和性も、OctetREDラベルフリーバイオレイヤー干渉法（BLI）結合検定を用いたラベルフリー結合検定により決定した。
BLIは、タンパク質標的のみまたは相互作用相手と結合したタンパク質標的を含むオプティカルレイヤーおよびバイオレイヤーから反射された光の干渉パターン変化を測定する。検定の原理は、標的タンパク質が光学表面上に固定され、次いで溶液中の潜在的結合相手に曝露される、表面プラズモン共鳴（SPR）検定と同様である。結合相手と固定タンパク質との間の相互作用がバイオセンサーの光学的性質を変化させ、反射光の波長シフトを引き起こし、これが干渉パターンを変化させることになる。結合および解離速度を、適切な結合モデルに基づいてリアルタイム波長シフトを当てはめることにより得ることができ、その後これからKD値を得ることができる。
動力学検定緩衝液（PBS、pH7.4、0.1％BSAおよび0.01％トゥイーン-20）中のビオチン標識BRDタンパク質（10μg/ml）をSuper Streptavidin（SSA）センサー上に15分間固定し、続いて動力学緩衝液中で10分間洗浄して、緩い非特異的固定があれば除去した。同じ96穴プレート中で、同一の検定緩衝液中、典型的には予想Kd値の0.1〜10倍の範囲の濃度の試験化合物の連続希釈液を調製した。次いで、これらのタンパク質コーティングしたセンサーを試験化合物溶液に、最低濃度のものから出発して浸漬し、ここで化合物結合が起こり、次いで解離のために新鮮緩衝液に戻した。同じ操作を、より高濃度の次の溶液について繰り返し、最高濃度のものまで行った。同一の手順を、製造者からのプロトコルに従って調製したSAB4不活性対照タンパク質を固定した対照センサーで再度実施した。ブランク緩衝液対照を、BRDタンパク質センサーおよび不活性タンパク質センサーの実行両方に加えた。各動力学周期について、結合および解離の動力学曲線を、製造者により提供された解析プログラム（Data Analysis 7.0）に含まれる二重参照減算プロトコルを用いて、生のセンサーグラムから得、ここで非特異的相互作用および緩衝液ドリフトは両方補正された。結合および解離速度定数（konおよびkoff）を、可逆的1：1結合モデルに基づく解析プログラム中の包括フィッティングプロトコルを用いて求めた。その後、平衡結合定数（KA）を算出した。すべての結合データを30度で収集した。物質移動効果を避けるために、全実験期間中、検定プレートを1000RPMで振盪し続けた。
表2は、いくつかの代表的化合物の、BRD2 BD1、BRD2 BD2、BRD3 BD1、BRD3 BD2、BRD4 BD1およびBRD4 BD2タンパク質に対する結合親和性を示す。
（表２）バイオレイヤー干渉法（BLI）結合検定を用いる、いくつかの代表的なBETブロモドメイン阻害剤の、BRD2 BD1、BRD2 BD2、BRD3 BD1、BRD3 BD2、BRD4 BD1およびBRD4 BD2タンパク質に対する結合親和性
Figure 0006401773
代表的なBETブロモドメイン阻害剤の細胞成長阻害活性を、CellTiter-Glo(登録商標) Luminescent Cell Viability Assayを用いて決定した。白血病細胞株MV-4-11（ATCC, Manassas, VA）およびMOLM-13（DSMZ, Germany）について、細胞を96穴白色不透明細胞培養プレートで、連続希釈した化合物を含むウェルあたり10,000細胞の密度で播種し、95％空気および5％CO2の雰囲気下、37℃で4日間インキュベートした。細胞生存度を、CellTiter-Glo(登録商標) Luminescent Cell Viability Assay Kit（Promega, Madison, WI）を製造者の指示に従って用いて決定した。簡単に言うと、細胞培養培地の量と等しい量のCellTiter-Glo(登録商標) Reagentを各ウェルに加え、次いでプレートを室温で10〜20分間インキュベートした。発光シグナルを、Tecan Infinite M1000マルチモードマイクロプレートリーダー（Tecan, Morrisville, NC）を用いて測定した。最大半量阻害濃度（IC50）を、GraphPad Prism 5ソフトウェア（GraphPad Software, La Jolla, CA）を用いて算出した。
乳癌細胞株について、細胞を96穴細胞培養プレートで、連続希釈した化合物を含むウェルあたり5,000〜10,000細胞の密度で播種し、95％空気および5％CO2の雰囲気下、37℃で4日間インキュベートした。乳癌細胞株はすべてATCCから入手した。細胞生存度を、WST-8（2-(2-メトキシ-4-ニトロフェニル)-3-(4-ニトロフェニル)-5-(2,4-ジスルホフェニル)-2H-テトラゾリウム1ナトリウム塩）に基づくCell Counting-8 Kit（Dojindo Molecular Technologies, Inc., Rockville, MD）を製造者の指示に従って用いて決定した。簡単に言うと、WST-8を各ウェルに最終濃度10％（v/v）で加え、次いでプレートを発色のために37℃で1〜2時間インキュベートした。吸光度をSPECTRAmax PLUSプレートリーダー（Molecular Devices, Sunnyvale, CA）を用いて450nmで測定した。IC50を、GraphPad Prism 5ソフトウェアを用いて算出した。
表3は、白血病細胞株の細胞成長阻害における、本発明のいくつかの代表的なBETブロモドメイン阻害剤のIC50値を示す。表4は、乳癌細胞株における化合物番号68の細胞成長阻害を示す。
（表３）いくつかの代表的化合物の、急性白血病細胞株における細胞成長阻害
Figure 0006401773
（表４）化合物番号68の、乳癌細胞株における細胞成長阻害
Figure 0006401773
化合物番号350を用いる蛍光偏光（FP）競合的結合検定
蛍光偏光（FP）競合的結合試験（上記参照）を、FAM標識蛍光プローブである化合物番号350を用いて実施し、代表的化合物のBRD2、BRD3、およびBRD4タンパク質のBD1およびBD2両方に対する結合親和性を決定した。化合物番号350のこれら6つのタンパク質への平衡解離定数（Kd）を、タンパク質飽和実験から、固定濃度の蛍光プローブおよび完全飽和までの漸増濃度のタンパク質からなる混合物の全蛍光偏光をモニタリングすることにより求めた。試験タンパク質の連続希釈液を化合物番号350と検定緩衝液中で混合して、最終量200μlとした。特にBD1ブロモドメインに対し、広いダイナミックレンジを得るために、100mMリン酸緩衝液（pH＝6.5、0.01％トリトンX-100（Sigma, 282103）、検定直前に添加）を検定緩衝液として用いた。化合物番号350の最終濃度はすべてのタンパク質で1.5nMであった。プレートを室温で30分間、平衡を確実にするため緩やかに振盪しながらインキュベートした。ミリ偏光単位（mP）でのFP値を、Microfluor 1 96穴黒色丸底プレート（Thermo Scientific, Waltham, MA）中、Infinite M-1000プレートリーダー（Tecan U.S., Research Triangle Park, NC）を用いて、励起波長485nmおよび発光波長530nmで測定した。Graphpad Prism 6.0ソフトウェア（Graphpad Software, San Diego, CA）を用いて、シグモイド状の用量依存的FP増大をタンパク質濃度の関数としてあてはめることにより算出した、化合物番号350のKd値は、BRD2 BD1および2、BRD3 BD1および2、ならびにBDR4 BD1および2に対してそれぞれ2.0、2.2、6.5、0.6、5.5、および3.0nMである。
化合物のIC50およびKi値を前述のとおり競合的結合実験において求めた。40％エチレングリコール/検定緩衝液中の試験化合物10μlおよび検定緩衝液（100mMリン酸カリウム、pH6.5、0.01％トリトンX-100）中のプレインキュベートしたタンパク質/プローブ複合体溶液190μlの混合物を検定プレートに加え、室温で30分間、緩やかに振盪しながらインキュベートした。BRD2、BRD3、およびBRD4 BD2のBD1およびBD2の検定中、タンパク質の最終濃度はそれぞれ3、6、15、2、10、および6nMであった。最終プローブ濃度はすべての検定で1.5nMである。タンパク質/プローブ複合体だけを含む陰性対照（0％阻害と同等）、および遊離プローブだけを含む陽性対照（100％阻害と同等）を各検定プレートに加えた。FP値を前述のとおりに測定した。IC50値を競合曲線の非線形回帰フィッティングにより求めた。前述のとおりにIC50値から算出する代わりに、競合的阻害剤のKi値を、競合検定における異なるタンパク質に対するプローブのKd値、ならびにタンパク質およびプローブの濃度に基づき、非線形回帰フィッティングにより同様に直接得た（Wang, FEBS Lett.360; 111 (1995)；Zhang et al., Analytical Biochemistry, 331; 138 (2004)）。
（表５）化合物番号350をプローブとして用いる蛍光偏光に基づく検定における、代表的化合物の、BDR2、BRD3およびBRD4の組換えBD1およびBD2ドメインタンパク質に対する結合親和性
Figure 0006401773
Figure 0006401773
Figure 0006401773
細胞生存度検定
代表的なBETブロモドメイン阻害剤の細胞生存度に対する効果を、4日間増殖検定で決定した。細胞を、10％FBSを含む適切な培養培地中、5％CO2雰囲気下、37℃で維持した。細胞株はすべて、新鮮バイアルの解凍3ヶ月以内に用いた。
細胞を96穴平底（Corning COSTAR, Corning, NY, cat# 3595）または白色不透明細胞培養プレート（BD Falcon, cat# 353296）で、培養培地75μlのウェルあたり3,000〜10,000細胞の密度で播種した。化合物を適切な培地中で連続希釈し、希釈化合物75μlを細胞プレートの適切なウェルに加えた。化合物添加後、細胞を5％CO2雰囲気下、37℃で4日間インキュベートした。細胞生存度を、MOLM-13細胞に対してはCellTiter-Glo(登録商標) Luminescent Cell Viability Assay Kit（Promega, Madison, WI）、およびMDA-MB-436細胞に対してはWST（2-(2-メトキシ-4-ニトロフェニル)-3-(4-ニトロフェニル)-5-(2,4-ジスルホフェニル)-2H-テトラゾリウム1ナトリウム塩）Cell Counting-8 Kit（Dojindo Molecular Technologies, Inc., Rockville, MD）を製造者の指示に従って用いて決定した。
WST検定のために、WST-8試薬を各ウェルに最終濃度10％（v/v）で加え、次いでプレートを発色のために37℃で1〜2時間インキュベートした。吸光度をSPECTRAmax PLUSプレートリーダー（Molecular Devices, Sunnyvale, CA）を用いて450nmで測定した。読み取り値をDMSO処理細胞に対して規準化し、最大半量阻害濃度（IC50）を、GraphPad Prism 5ソフトウェア（GraphPad Software, La Jolla, CA）を用い、非線形回帰（可変傾斜、最小二乗フィット、および制約なしで当てはめた4パラメーターシグモイド）分析によって算出した。
CellTiter-Glo検定のために、100μlのCellTiter-Glo(登録商標) Reagentを各ウェルに加え、次いでプレートを室温で10〜20分間インキュベートした。発光シグナルを、Tecan Infinite M1000マルチモードマイクロプレートリーダー（Tecan, Morrisville, NC）を用いて測定した。読み取り値をDMSO処理細胞に対して規準化し、IC50を、GraphPad Prism 5ソフトウェアを用い、非線形回帰（可変傾斜、最小二乗フィット、および制約なしで当てはめた4パラメーターシグモイド）分析によって算出した。
（表６）代表的化合物による、白血病MOLM-13および乳癌MDA-MB-436細胞株における細胞成長阻害
Figure 0006401773
Figure 0006401773
（表７）代表的化合物による、前立腺VCaP細胞株における細胞成長阻害（細胞を薬物で4日間処理し、細胞生存度をCell TiterGLO検定により測定した）
Figure 0006401773
（表８）代表的化合物の、白血病MV4;11、AML-2およびK562細胞株における細胞成長阻害
Figure 0006401773

Claims (16)

  1. 構造式（I）：
    Figure 0006401773
    を有する化合物、またはその薬学的に許容される塩、水和物、もしくは溶媒和物：
    式中、
    Xは、N(Ra1)であり；
    Y1およびY3はNであるか、Y 1 はCHでありY 3 はNであるか、または、Y 1 はNでありY 3 はCHであり；
    Y2は、CR2 であり；
    Zは、H、
    Figure 0006401773
    、ハロ、またはOHであり；
    Aは、
    Figure 0006401773
    であり、それぞれは無置換であるかまたは置換され；
    Bは、それぞれ無置換または置換されている、アリール、CH(Ra2)-アリール、C3-10シクロアルキル、CH(Ra2)-C3-10シクロアルキル、5〜10員ヘテロアリール、CH(Ra2)-5〜10員ヘテロアリール、C3-10ヘテロシクロアルキル、CH(Ra2)-C3-10ヘテロシクロアルキル、
    Figure 0006401773
    であり；
    Gは、N、O、またはSであり；
    Lは、存在しないか、またはHもしくはC(Rd)3であり；
    R1は、-OCH 3 であり；
    Ra1、Ra2、Ra3、Ra4、およびRa5はそれぞれ独立に、H、C1-3アルキル、フェニル、またはベンジルであり；
    R2は、
    H、
    C1-3アルキル、
    (CH2)1-3C4-7ヘテロシクロアルキル、
    C4-7ヘテロシクロアルキル、
    (CH2)1-3NMe2、
    (CH2)1-3OH、
    C(Me)2OH、
    CH(Me)OH、
    C(Me2)NH2、
    C(=O)ORa4、
    C(=O)N(Ra4)2、
    C(=O)-無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
    C(=O)-無置換もしくは置換ヒドロキシC3-10ヘテロシクロアルキル、
    C(=O)N(Ra1)(CH2)2-3N(C1-3アルキル)2、
    C(=O)N(Ra1)(CH2)2-3無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
    C(=O)N(Ra1)-無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
    C(=O)N(Ra1)-ヒドロキシシクロアルキル、
    C(=O)N(Ra1)-C1-6ヒドロキシアルキル、
    Figure 0006401773
    であり；
    Rbは独立に、
    C1-6アルキル、
    C1-6ヒドロキシアルキル、
    ハロ、
    アリール、
    無置換もしくは置換CH2-アリール、
    無置換もしくは置換C3-10シクロアルキル、
    無置換もしくは置換CH2-5〜10員ヘテロアリール、
    無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
    無置換もしくは置換CH2-C3-10ヘテロシクロアルキル、
    CF3、
    CN、
    ORa5、
    N(Ra5)2、
    N(Ra1)C1-6ヒドロキシアルキル、
    N(Ra1)C(=O)(C1-6アルキル)、
    N(Ra1)C(=O)(CH2)1-3-無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
    N(Ra1)C(=O)(CH2)1-3-ヒドロキシC3-10ヘテロシクロアルキル、
    NH(CH2)2-3CO2H、
    NH(CH2)2-3C(=O)N(Ra5)2、
    N(Ra1)C(=O)(CH2)1-3N(H)-無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
    N(Ra1)C(=O)(CH2)1-3N(H)-C1-6ヒドロキシアルキル、
    N(Ra1)C(=O)N(Ra2)2、
    N(Ra1)C(=O)N(Ra2)-無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
    NH(CH2)2-3N(C1-3アルキル)2、
    NH(CH2)2-3-C3-10ヘテロシクロアルキル、
    N[(CH2)2-3-C3-10ヘテロシクロアルキル]2、
    O(CH2)2-3N(C1-3アルキル)2、
    O(CH2)2-3-C3-10ヘテロシクロアルキル、
    C(=O)N(Ra5)2、
    C(=O)N(Ra1)(CH2)2-3-無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
    C(=O)-無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
    N(Ra1)C(=O)-ヒドロキシC3-10ヘテロシクロアルキル、
    C(=O)N(Ra1)(CH2)2-3-N(H)C(=O)NH2、
    C(=O)N(Ra1)(CH2)2-3N(C1-3アルキル)2、
    C(=O)N(Ra1)(CH2)2-3-CO2Ra1、
    C(=O)N(Ra1)-アルキル、
    C(=O)N(Ra1)-C1-6ヒドロキシアルキル、
    C(=O)N(Ra1)-無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
    C(=O)N(Ra1)-C1-6ヒドロキシアルキル、
    C(=O)N(Ra1)CH2CH2OCH2CH2OCH3、
    C(=O)N(Ra1)CH2CH2SO2Me、
    CO2Ra1、
    C(Ra1)2CO2Ra2、
    C(Ra1)2C(=O)N(Ra5)2、
    C(Ra1)2C(=O)N(Ra2)-無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、
    C(Ra1)2CN、
    Figure 0006401773
    または
    CHOであり；
    nは、整数0、1、2、または3であり；
    mは、整数0、1、2、または3であり；
    RcおよびRdはそれぞれ独立に、水素、C1-6アルキル、無置換もしくは置換アリール、無置換もしくは置換CH2-アリール、無置換もしくは置換C3-10シクロアルキル、無置換もしくは置換CH2-C3-10シクロアルキル、5〜10員ヘテロアリール、無置換もしくは置換CH2-5〜10員ヘテロアリール、無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、ヒドロキシシクロアルキル、または無置換もしくは置換CH2-C3-10ヘテロシクロアルキルであるか、あるいは
    RcおよびRdは一緒に、無置換または置換C3-10ヘテロシクロアルキルまたはヒドロキシC3-10ヘテロシクロアルキルを形成し；
    Q-は、薬学的に許容されるアニオンであり、
    ここで、それぞれの置換アリールまたはヘテロアリール基は、独立して、ハロ、アルキル、アルケニル、-OCF 3 、-NO 2 、-CN、-OH、アルコキシ、アミノ、アルキルアミノ、-CO 2 H、-CO 2 アルキル、-OCOアルキル、アリール、および5〜10員ヘテロアリールからなる群から独立して選択される1つまたは複数の置換基を有し、
    それぞれの置換C 3-10 シクロアルキル基は、独立して、ハロ、トリフルオロメチル、トリフルオロメトキシ、ヒドロキシ、アルコキシ、ニトロ、シアノ、アルキルアミノ、およびアミノからなる群から独立して選択される1つまたは複数の置換基を有し、
    それぞれの置換C 3-10 ヘテロシクロアルキル基は、独立して、ハロ、C 1-6 アルキル、C 1-6 アルコキシ、シアノ、アミノ、カルバモイル、ニトロ、カルボキシ、C 2-7 アルケニル、およびC 2-7 アルキニルからなる群から独立して選択される1つまたは複数の置換基を有する。
  2. Zが、H、
    Figure 0006401773
    、ハロ、またはOHであり；
    Bが、それぞれ無置換または置換されている、アリール、CH(Ra2)-アリール、C3-10シクロアルキル、CH(Ra2)-C3-10シクロアルキル、5〜10員ヘテロアリール、CH(Ra2)-5〜10員ヘテロアリール、C3-10ヘテロシクロアルキル、またはCH(Ra2)-C3-10ヘテロシクロアルキルであり；
    R1が、-OCH 3 であり；
    Ra2およびRa3が独立に、H、C1-3アルキル、またはベンジルであり；
    R2が、H、またはC1-3アルキルであり；
    Rbが独立に、C1-6アルキル、ハロ、アリール、無置換もしくは置換CH2-アリール、無置換もしくは置換C3-10シクロアルキル、無置換もしくは置換CH2-5〜10員ヘテロアリール、無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、無置換もしくは置換CH2-C3-10ヘテロシクロアルキル、またはCHOであり；
    RcおよびRdがそれぞれ独立に、水素、C1-6アルキル、無置換もしくは置換アリール、無置換もしくは置換CH2-アリール、無置換もしくは置換C3-10シクロアルキル、無置換もしくは置換CH2-C3-10シクロアルキル、5〜10員ヘテロアリール、無置換もしくは置換CH2-5〜10員ヘテロアリール、無置換もしくは置換C3-10ヘテロシクロアルキル、または無置換もしくは置換CH2-C3-10ヘテロシクロアルキルである、
    請求項1に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩、水和物、もしくは溶媒和物。
  3. 環Aが、
    Figure 0006401773
    である、請求項1または2のいずれか一項に記載の化合物。
  4. 環系
    Figure 0006401773
    が、
    Figure 0006401773
    である、請求項1〜3のいずれか一項に記載の化合物。
  5. Zが
    Figure 0006401773
    である、請求項1〜4のいずれか一項に記載の化合物。
  6. Zが
    Figure 0006401773
    である、請求項5に記載の化合物。
  7. B環が、
    Figure 0006401773
    からなる群より選択される、請求項6に記載の化合物。
  8. B環が、メチル、フェニル、フルオロ、ピリジニル、クロロ、イソプロピル、シクロプロピル、またはエチルのうちの1〜3つで置換されている、請求項7に記載の化合物。
  9. Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    Figure 0006401773
    からなる群より選択される化合物、またはその薬学的に許容される塩、水和物、もしくは溶媒和物。
  10. 請求項1〜9のいずれか一項に記載の化合物と、薬学的に許容される担体または媒体とを含む、薬学的組成物。
  11. BETブロモドメインタンパク質の阻害が利益を提供する疾患または状態を処置するための、請求項10に記載の薬学的組成物。
  12. 前記疾患または状態が、癌、慢性自己免疫障害、炎症状態、増殖性障害、敗血症、またはウイルス感染症である、請求項11に記載の薬学的組成物。
  13. 前記疾患または状態が、副腎癌、腺房細胞癌、聴神経腫瘍、末端黒子型黒色腫、先端汗腺腫、急性好酸球性白血病、急性赤白血病、急性リンパ性白血病、急性巨核芽球性白血病、急性単球性白血病、急性前骨髄球性白血病、腺癌、腺様嚢胞癌、腺腫、腺腫様歯原性腫瘍、腺扁平上皮癌、脂肪組織腫瘍、副腎皮質癌、成人T細胞白血病/リンパ腫、侵攻性NK細胞性白血病、エイズ関連リンパ腫、胞巣状横紋筋肉腫、胞状軟部肉腫、エナメル芽細胞線維腫、未分化大細胞型リンパ腫、甲状腺未分化癌、血管免疫芽球性T細胞性リンパ腫、血管筋脂肪腫、血管肉腫、星細胞腫、非定型奇形腫様横紋筋肉腫様腫瘍、B細胞性慢性リンパ性白血病、B細胞性前リンパ球性白血病、B細胞リンパ腫、基底細胞癌、胆道癌、膀胱癌、芽細胞腫、骨癌、ブレンナー腫瘍、褐色腫、バーキットリンパ腫、乳癌、脳癌、癌腫、上皮内癌、癌肉腫、軟骨腫瘍、セメント質腫、骨髄性肉腫、軟骨腫、脊索腫、絨毛癌、脈絡叢乳頭腫、腎臓の明細胞肉腫、頭蓋咽頭腫、皮膚T細胞リンパ腫、子宮頚癌、直腸結腸癌、デゴス病、線維形成性小円形細胞腫瘍、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、胚芽異形成性神経上皮腫瘍、未分化胚細胞腫、胚性癌腫、内分泌腺腫瘍、卵黄嚢腫瘍、腸症関連T細胞リンパ腫、食道癌、封入奇形胎児、線維腫、線維肉腫、濾胞性リンパ腫、濾胞性甲状腺癌、神経節腫、胃腸癌、胚細胞腫瘍、妊娠性絨毛癌、巨細胞線維芽腫、骨の巨細胞腫、グリア系腫瘍、多形神経膠芽腫、神経膠腫、大脳神経膠腫症、グルカゴン産生腫瘍、性腺芽腫、顆粒膜細胞腫、半陰陽性卵巣腫瘍、胆嚢癌、胃癌、有毛細胞白血病、血管芽腫、頭頚部癌、血管周囲細胞腫、造血器腫瘍、肝芽腫、肝脾T細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、浸潤性小葉癌、腸癌、腎癌、喉頭癌、悪性黒子、致死性正中線癌、白血病、ライディッヒ細胞腫、脂肪肉腫、肺癌、リンパ管腫、リンパ管肉腫、リンパ上皮腫、リンパ腫、急性リンパ性白血病、急性骨髄性白血病、慢性リンパ性白血病、肝癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、MALTリンパ腫、悪性線維性組織球腫、悪性末梢神経鞘腫、悪性トリトン腫瘍、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯B細胞リンパ腫、マスト細胞白血病、縦隔胚細胞性腫瘍、乳房髄様癌、甲状腺髄様癌、髄芽腫、黒色腫、髄膜腫、メルケル細胞癌、中皮腫、転移性尿路上皮癌、ミュラー管混合腫瘍、粘液性腫瘍、多発性骨髄腫、筋組織腫瘍、菌状息肉腫、粘液性脂肪肉腫、粘液腫、粘液肉腫、上咽頭癌、神経鞘腫、神経芽細胞腫、神経線維腫、神経腫、結節性黒色腫、眼球癌、乏突起星細胞腫、乏突起膠腫、好酸性腺腫、視神経鞘髄膜腫、視神経腫瘍、口腔癌、骨肉腫、卵巣癌、パンコースト腫瘍、乳頭様甲状腺癌、傍神経節腫、松果体芽細胞腫、松果体細胞腫、下垂体細胞腫、下垂体腺腫、下垂体腫瘍、形質細胞腫、多胎芽腫、前駆Tリンパ芽球性リンパ腫、原発性中枢神経系リンパ腫、原発性体腔性リンパ腫、原発性腹膜癌、前立腺癌、膵癌、咽頭癌、腹膜偽粘液腫、腎細胞癌、腎髄様癌、網膜芽細胞腫、横紋筋腫、横紋筋肉腫、リヒタートランスフォーメーション、直腸癌、肉腫、神経鞘腫症、精上皮腫、セルトリ細胞腫、性索性腺間質腫瘍、印環細胞癌、皮膚癌、小円形青色細胞腫瘍、小細胞癌、軟部肉腫、ソマトスタチン産生腫瘍、煤煙性いぼ、脊椎腫瘍、脾臓辺縁帯リンパ腫、扁平上皮細胞癌、滑膜肉腫、セザリー症、小腸癌、扁平上皮癌、胃癌、T細胞リンパ腫、精巣癌、莢膜細胞腫、甲状腺癌、移行上皮癌、咽頭癌、尿膜管癌、泌尿生殖器癌、尿路上皮癌、ぶどう膜黒色腫、子宮癌、疣状癌、視覚路神経膠腫、外陰癌、腟癌、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、ワルチン腫瘍、およびウィルムス腫瘍からなる群より選択される癌である、請求項12に記載の薬学的組成物。
  14. 前記疾患または状態が、良性軟部組織腫瘍、骨腫瘍、脳および脊椎腫瘍、眼瞼および眼窩腫瘍、肉芽腫、脂肪腫、髄膜腫、多発性内分泌腫瘍症、鼻茸、下垂体腫瘍、プロラクチン産生腺腫、偽脳腫瘍、脂漏性角化症、胃ポリープ、甲状腺結節、膵臓の嚢胞性腫瘍、血管腫、声帯結節、ポリープ、および嚢胞、キャッスルマン病、慢性毛巣病、皮膚線維腫、皮脂嚢胞、化膿性肉芽腫、ならびに若年性ポリープ症候群からなる群より選択される増殖性障害である、請求項12に記載の薬学的組成物。
  15. 前記疾患または状態が、骨盤内炎症性疾患、尿道炎、皮膚の日焼け、副鼻腔炎、間質性肺炎、脳炎、髄膜炎、心筋炎、腎炎、骨髄炎、筋炎、肝炎、胃炎、腸炎、皮膚炎、歯肉炎、虫垂炎、膵炎、胆嚢炎、無ガンマグロブリン血症、乾癬、アレルギー、クローン病、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、シェーグレン病、組織移植片拒絶、移植臓器の超急性拒絶、喘息、アレルギー性鼻炎、慢性閉塞性肺疾患（COPD）、多腺性自己免疫疾患（多腺性自己免疫症候群としても公知）、自己免疫性脱毛症、悪性貧血、糸球体腎炎、皮膚筋炎、多発性硬化症、強皮症、血管炎、自己免疫性溶血状態および血小板減少状態、グッドパスチャー症候群、アテローム性動脈硬化症、アジソン病、パーキンソン病、アルツハイマー病、I型糖尿病、敗血症性ショック、全身性エリテマトーデス（SLE）、関節リウマチ、乾癬性関節炎、若年性関節炎、骨関節炎、慢性特発性血小板減少性紫斑病、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、重症筋無力症、橋本病、アトピー性皮膚炎、変性関節疾患、白斑、自己免疫性下垂体機能低下症、ギラン・バレー症候群、ベーチェット病、強皮症、菌状息肉腫、急性炎症反応（例えば、急性呼吸促迫症候群および虚血/再灌流傷害）、およびグレーブス病からなる群より選択される自己免疫障害または炎症障害である、請求項12に記載の薬学的組成物。
  16. 前記疾患または障害が、ヒトパピローマウイルス、ヘルペスウイルス、エプスタイン・バーウイルス、ヒト免疫不全ウイルス、B型肝炎ウイルス、およびC型肝炎ウイルスからなる群より選択されるウイルス感染症である、請求項12に記載の薬学的組成物。
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