JP6362045B2 - L−トリプトファンの測定 - Google Patents
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Description
[1]以下の(a)、(b)又は(c)からなるポリヌクレオチド:
(a)配列番号1に示される塩基配列を有するポリヌクレオチド、
(b)配列番号2又は6記載のアミノ酸配列を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド、
(c)配列番号2又は6記載のアミノ酸配列と類似性が少なくとも90%のアミノ酸配列を有し、L−トリプトファンオキシダーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
[2][1]に記載のポリヌクレオチドを保有する組換えベクター。
[3][1]に記載のポリヌクレオチドを保有する形質転換細胞。
[4][3]記載の形質転換細胞を培養し、得られた培養物からL−トリプトファンオキシダーゼを採取することを特徴とするL−トリプトファンオキシダーゼの製造方法。
[5]以下の(i)、(ii)又は(iii)からなる可溶性L−トリプトファンオキシダーゼ:
(i)配列番号2又は6記載のアミノ酸配列を有するタンパク質、
(ii)配列番号2又は6記載のアミノ酸配列と類似性が少なくとも90%のアミノ酸配列を有し、L−トリプトファンオキシダーゼ活性を有するタンパク質、
(iii)配列番号2又は6記載のアミノ酸配列において好ましくは多くとも55個のアミノ酸の欠失、置換及び/又は付加を有するL−トリプトファンオキシダーゼ活性を有するタンパク質。
[6]L−トリプトファンに対する作用性を100%とした場合に、L−フェニルアラニン及びL−チロシンに対する作用性が1%以下である[5]記載のL−トリプトファンオキシダーゼ。
[7][5]又は[6]記載のトリプトファンオキシダーゼを使用するL−トリプトファン測定方法。
[8]L−トリプトファンに対する作用性を100%とした場合に、L−フェニルアラニン及びL−チロシンに対する作用性が1%以下である[7]記載のL−トリプトファン測定方法。
[9][7]又は[8]記載の血中L−トリプトファン測定方法。
[10][5]又は[6]記載のトリプトファンオキシダーゼを含むL−トリプトファン測定用試薬組成物。
[11]L−トリプトファンに対する作用性を100%とした場合に、L−フェニルアラニン及びL−チロシンに対する作用性が1%以下である[10]記載のL−トリプトファン測定用試薬組成物。
[12][10]又は[11]記載の血中L−トリプトファン測定用試薬組成物。
[13][5]又は[6]記載のトリプトファンオキシダーゼを含むL−トリプトファン測定用キット。
[14]L−トリプトファンに対する作用性を100%とした場合に、L−フェニルアラニン及びL−チロシンに対する作用性が1%以下である[13]記載のL−トリプトファン測定用キット。
[15][13]又は[14]記載の血中L−トリプトファン測定用キット。
(a)配列番号1に示される塩基配列を有するポリヌクレオチド、
(b)配列番号2又は6記載のアミノ酸配列を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド、
(c)配列番号2又は6記載のアミノ酸配列と類似性が少なくとも80%、好ましくは少なくとも85%、90%、92%、95%又は98%のアミノ酸配列を有し、L−トリプトファンオキシダーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド、
(d)配列番号1に示される塩基配列と同一性が少なくとも60%、好ましくは少なくとも65%、70%、75%、80%、85%、90%又は95%の塩基配列を有し、且つL−トリプトファンオキシダーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド、
(e)配列番号1のポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、且つL−トリプトファンオキシダーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド、
(f)配列番号2又は6記載のアミノ酸配列において好ましくは多くとも60個、より好ましくは多くとも55個、50個、40個、30個、20個、10個又は5個のアミノ酸の欠失、置換及び/又は付加を有するL−トリプトファンオキシダーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド、
(g)配列番号2又は6記載のアミノ酸配列と同一性が少なくとも60%、好ましくは少なくとも65%、70%、75%、80%、85%、90%又は95%のアミノ酸配列を有し、L−トリプトファンオキシダーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
例えば、配列番号3〜5、7〜11、16〜18記載のアミノ酸配列を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドが例示でき、該塩基配列は図3及び図4に示している。配列番号3〜5、7〜11、16〜18記載の配列と類似性が少なくとも80%、好ましくは少なくとも85%、90%、92%、95%又は98%のアミノ酸配列を有し、L−トリプトファンオキシダーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドでも良い。
(1)電子受容体存在下で、L−トリプトファンを酸化して、インドールピルビン酸、過酸化水素及びアンモニアを生成する反応を触媒する酵素であって、酸素に電子を授受することができる。
(2)補酵素としてフラビンが結合している。フラビンとしては、フラビンアデニンジヌクレオチド(FAD)、フラビンモノヌクレオチド(FMN)が挙げられる。
(3)下記(i)、(ii)、(iii)又は(iv)からなるタンパク質である。
(i)配列番号2又は6記載のアミノ酸配列を有するタンパク質である。
(ii)配列番号2又は6記載のアミノ酸配列と類似性が少なくとも80%、好ましくは少なくとも85%、88%、90%、92%、95%又は98%のアミノ酸配列を有し、L−トリプトファンオキシダーゼ活性を有するタンパク質である。
(iii)配列番号2又は6記載のアミノ酸配列において好ましくは多くとも60個、より好ましくは多くとも55個、50個、40個、30個、20個、10個又は5個のアミノ酸の欠失、置換及び/又は付加を有するL−トリプトファンオキシダーゼ活性を有するタンパク質である。
(iv)配列番号2又は6記載のアミノ酸配列と同一性が少なくとも60%、好ましくは少なくとも65%、70%、75%、80%、85%、90%又は95%のアミノ酸配列を有し、L−トリプトファンオキシダーゼ活性を有するタンパク質である。
(4)膜非結合型酵素であり、可溶性である。
(6)好ましくは多くとも650アミノ酸、多くとも630アミノ酸、多くとも600アミノ酸の配列長からなるL−トリプトファンオキシダーゼ活性を有するタンパク質である。より好ましくは、成熟タンパク質のアミノ酸配列の先端にメチオニンから始まる1〜数アミノ酸を付加させた改変酵素である。
(7)成熟タンパク質である活性酵素のアミノ酸配列において、N末端から、FAD結合モチーフ配列であるGly−Xaa−Gly−Xaa−Xaa−Glyの最初のGlyまでのアミノ酸数が、好ましくは多くとも100個、80個、70個、60個又は50個であるタンパク質である。
例えば、配列番号3〜5、7〜11、16〜18記載のアミノ酸配列を有するタンパク質、並びに該配列と類似性が少なくとも80%、好ましくは少なくとも85%、90%、92%、95%又は98%のアミノ酸配列を有し、L−トリプトファンオキシダーゼ活性を有するタンパク質でも良い。
(酵素活性測定法)
リン酸カリウム緩衝液(pH7.0)が終濃度33.3mM、4−アミノアンチピリンが終濃度0.833mM、フェノール溶液が終濃度14mM、西洋わさびペルオキシダーゼが終濃度3.33units/ml、L−トリプトファンが終濃度33.3mMになるよう石英セルに入れ、恒温セルホルダー付き分光光度計にセットして37℃で10分間インキュベートした後、酵素溶液0.1mlを加えて撹拌し(総液量3.0ml)、500nmにおける5分間の吸光度(Absorbance)変化(△ABS/min)を測定する。そして、次の式により酵素活性を算出する。尚、式中のnは酵素の希釈倍率を表す。1分間に1μmolのL−トリプトファンが酸化される酵素活性を1unit(U)と定義する。
(L−トリプトファンオキシダーゼ(TRO)の製造方法)
(1)L−トリプトファンオキシダーゼをコードするポリヌクレオチドの取得
土壌から単離したL−トリプトファンオキシダーゼを産生する株を培養し、得られた培養物から、L−トリプトファンオキシダーゼを精製した。
精製酵素のN末端及び内部アミノ酸配列を解析した結果、N末端はTDPHQだった。
内部アミノ酸配列から5’−RACE法及び3’−RACE法用のプライマーを作成し、該酵素生産株から抽出したDNAを鋳型として、5’−RACE法及び3’−RACE法を行い、該酵素をコードするポリヌクレオチドの一部の塩基配列を解明した。
解明した塩基配列より、該酵素をコードするポリヌクレオチドを含むORFを予測して、開始コドンから終始コドンまでのポリヌクレオチドを取得するプライマーを作成した。該プライマーを用いて、該酵素生産株から抽出したRNAを鋳型としてRT−PCRを行って、ORFの塩基配列を解明した。
該酵素のN末端配列より、成熟タンパク質である酵素をコードする塩基配列を予測し、配列番号1に示した。該酵素のアミノ酸配列を配列番号2に示した。
L−トリプトファンオキシダーゼ産生株から抽出したRNAを鋳型として、下記プライマー1及び2(配列番号12及び13)を用いたRT−PCRにより、インサートを調製した。インサートは、配列番号1記載の塩基配列の上流にatgが付加し、NheI制限酵素サイトを有し、また下流にXhoI制限酵素サイトを有するDNAである。該インサートをpET−21(a)+ベクターに挿入し、L−トリプトファンオキシダーゼをコードするポリヌクレオチドが挿入されたベクターpET21-Tを得た。該ベクターを、大腸菌JM109に挿入し、増幅、単離した後、大腸菌BL21(DE3)を形質転換した。その結果、配列番号1を含むDNAを保有する形質転換細胞1(組換え大腸菌)を得た。
プライマー1:5’-CTAGCTAGCATG ACCGATCCTCACCAGCCC-3’
プライマー2:5’-CCGCTCGAGTTA TTAAGGGGTTTGCAAGTCCAACTT-3’
遠心上清にL−トリプトファンオキシダーゼ活性を確認できたことから、可溶性のL−トリプトファンオキシダーゼが取得できており、短期間の培養でL−トリプトファンオキシダーゼが得られることが分かった。
本製造法により得られたL−トリプトファンオキシダーゼは、配列番号16に記載したアミノ酸配列を有する。
次に、前記上清を40℃で1時間熱処理した後、遠心して得られた上清を回収し、L−トリプトファンオキシダーゼサンプルとした。
前記2−1で得たベクターpET21-Tを鋳型として、下記プライマー3及び4(配列番号14及び15)を用いたPCRにより、インサートを調製した。インサートは、配列番号1記載の塩基配列の上流にatgが付加し、HindIII制限酵素サイトを有し、また下流にXbaI制限酵素サイトを有するDNAである。該インサートをpColdIIIベクターに挿入し、トリプトファンオキシダーゼをコードするポリヌクレオチドが挿入されたベクターpCold−Tを得た。該ベクターを、大腸菌JM109に挿入し、増幅、単離した後、大腸菌BL21(DE3)を形質転換した。その結果、配列番号1を含むDNAを保有する形質転換細胞2(組換え大腸菌)を得た。
プライマー3:5’-CCCAAGCTT ATGACCGATCCTCACCAGCCC-3’
プライマー4:5’-CTATCTAGATTA TTAAGGGGTTTGCAAGTCCAACTT-3’
遠心上清にL−トリプトファンオキシダーゼ活性を確認できたことから、可溶性のL−トリプトファンオキシダーゼが取得できており、短期間の培養でL−トリプトファンオキシダーゼが得られることが分かった。
本製造法により得られたL−トリプトファンオキシダーゼは、配列番号17に記載したアミノ酸配列を有する。
(L−トリプトファンオキシダーゼの特性)
(1)熱安定性
実施例1(2−1)の熱処理前後の酵素活性を測定したところ、熱処理前のL−トリプトファンオキシダーゼ活性を100%とすると、熱処理後の活性は90%であり、本発明のL−トリプトファンオキシダーゼは高い熱安定性を有することが分かった。
実施例1(2−1)のL−トリプトファンオキシダーゼを用いて、L−トリプトファン、L−フェニルアラニン又はL−チロシンへの作用性を確認した。前記活性測定法において、基質として0、20、40、60及び80μMのL−トリプトファン、L−フェニルアラニン又はL−チロシンを使用した。尚、L−トリプトファンオキシダーゼは何れも0.37U使用した。
各基質に対する測定結果(検量線)を図1に示した。80μM L−トリプトファンに対する活性を100%として、各基質濃度の相対活性として示した。
各基質に対する検量線の傾きを算出し、L−トリプトファンに対する値を100%として、L−フェニルアラニン及びL−チロシンの作用性として算出したところ、0〜80μMの範囲で各基質への作用性はそれぞれ0.59%及び0.86%だった。
以上より、本発明のL−トリプトファンオキシダーゼは、L−フェニルアラニン及びL−チロシンへの作用性は何れも1%以下と低く、基質特異性の高い酵素であり、L−トリプトファンの特異的な測定に利用可能であることが分かった。
(L−トリプトファンの測定)
実施例1(2−1)のL−トリプトファンオキシダーゼを用いて、L−グルタミン存在下又は非存在下で、L−トリプトファンを測定した。前記活性測定法において、基質として0、20、40、60及び80μMのL−トリプトファンを使用し、L−グルタミン存在下では、更に600μMのL−グルタミンを添加して測定した。
尚、血中に存在するアミノ酸の内、L−グルタミンは約600μMという最も高濃度で存在することが知られている。
本発明のL−トリプトファンオキシダーゼを用いたL−トリプトファンの測定で、L−グルタミン存在下及び非存在下で、L−トリプトファンの相対活性にほとんど差は見られなかった。
よって、本発明のL−トリプトファンオキシダーゼを用いた測定では、600μM L−グルタミン存在下であっても、正確なL−トリプトファンの測定が可能であることが分かった。更に、5分間という短い測定時間であっても、L−トリプトファン濃度と相対活性との間に良好な直線性が認められた。
以上より、本発明の測定方法はL−グルタミンの影響をほとんど受けず、例えばL−グルタミン濃度の高い血液サンプルのように他のアミノ酸が夾雑する試料であっても、迅速に正確なL−トリプトファンの測定が可能であると思われる。
(L−トリプトファンオキシダーゼの製造方法2)
(1)L−トリプトファンオキシダーゼの検索
配列番号2記載のアミノ酸配列を用いて、公開配列に対してBLAST(blastp)によるホモロジー検索を行い、高い類似性を有する配列を取得した。取得した各配列と配列番号2とを比較することで、成熟タンパク質である活性酵素のアミノ酸配列を決定し、配列番号3〜11に示した。GENETYXを用いて、配列番号2記載のアミノ酸配列と各配列のホモロジー解析をした結果、配列番号2記載のアミノ酸配列と配列番号3〜11との各類似性は、配列番号3及び4が95%、配列番号5が93%、配列番号6が92%、配列番号7〜10が88%、配列番号11が87%だった。これらの配列を有するタンパク質は、L−トリプトファンオキシダーゼ活性を有すると推察された。
GeneDocを用いて、配列番号2〜11記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列同士のアライメントをとった結果を、図3及び図4に示した。
(1)の結果を基に、配列番号6記載のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを用いてL−トリプトファンオキシダーゼの組換え製造を行うこととした。
配列番号6記載のアミノ酸配列をコードし、コドンの使用頻度を最適化した塩基配列の上流に開始コドンatgを含むNdeIを付加させ、下流にXhoI制限酵素サイトを付加させたインサートDNAを合成した。該インサートをpET−21(a)+ベクターに挿入し、配列番号6記載のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドが挿入されたベクターを得た。該ベクターを、大腸菌JM109に挿入し、増幅、単離した後、大腸菌BL21(DE3)を形質転換した。その結果、配列番号6記載のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含むDNAを保有する形質転換細胞(組換え大腸菌)を得た。
遠心上清に、L−トリプトファンオキシダーゼ活性を確認できたことから、可溶性のL−トリプトファンオキシダーゼが取得できており、短期間の培養でL−トリプトファンオキシダーゼが得られることが分かった。
本製造法により得られたL−トリプトファンオキシダーゼは、配列番号18に記載したアミノ酸配列を有する。
故に、配列番号3〜5及び7〜11記載のアミノ酸配列を有するタンパク質も、L−トリプトファンオキシダーゼ活性を有すると共に、配列番号3〜5及び7〜11記載のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドからも、同様にL−トリプトファンオキシダーゼが製造可能と推察される。
Claims (15)
- 以下の(a)、(b)又は(c)からなるポリヌクレオチド:
(a)配列番号1に示される塩基配列を有するポリヌクレオチド、
(b)配列番号2記載のアミノ酸配列を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド、
(c)配列番号2記載のアミノ酸配列と同一性が少なくとも90%のアミノ酸配列を有し、L−トリプトファンオキシダーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド。 - 請求項1に記載のポリヌクレオチドを保有する組換えベクター。
- 請求項1に記載のポリヌクレオチドを保有する形質転換細胞。
- 請求項3記載の形質転換細胞を培養し、得られた培養物からL−トリプトファンオキシダーゼを採取することを特徴とするL−トリプトファンオキシダーゼの製造方法。
- 以下の(i)、(ii)又は(iii)からなる可溶性L−トリプトファンオキシダーゼ:
(i)配列番号2記載のアミノ酸配列を有するタンパク質、
(ii)配列番号2記載のアミノ酸配列と同一性が少なくとも90%のアミノ酸配列を有し、L−トリプトファンオキシダーゼ活性を有するタンパク質、
(iii)配列番号2記載のアミノ酸配列において好ましくは多くとも55個のアミノ酸の欠失、置換及び/又は付加を有するL−トリプトファンオキシダーゼ活性を有するタンパク質。 - L−トリプトファンに対する作用性を100%とした場合に、L−フェニルアラニン及びL−チロシンに対する作用性が1%以下である請求項5記載のL−トリプトファンオキシダーゼ。
- 請求項5又は6記載のトリプトファンオキシダーゼを使用するL−トリプトファン測定方法。
- L−トリプトファンに対する作用性を100%とした場合に、L−フェニルアラニン及びL−チロシンに対する作用性が1%以下である請求項7記載のL−トリプトファン測定方法。
- 請求項7又は8記載の血中L−トリプトファン測定方法。
- 請求項5又は6記載のトリプトファンオキシダーゼを含むL−トリプトファン測定用試薬組成物。
- L−トリプトファンに対する作用性を100%とした場合に、L−フェニルアラニン及びL−チロシンに対する作用性が1%以下である請求項10記載のL−トリプトファン測定用試薬組成物。
- 請求項10又は11記載の血中L−トリプトファン測定用試薬組成物。
- 請求項5又は6記載のトリプトファンオキシダーゼを含むL−トリプトファン測定用キット。
- L−トリプトファンに対する作用性を100%とした場合に、L−フェニルアラニン及びL−チロシンに対する作用性が1%以下である請求項13記載のL−トリプトファン測定用キット。
- 請求項13又は14記載の血中L−トリプトファン測定用キット。
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