JP6342886B2 - Aavカプシドバリアントを使用した高効率な遺伝子導入のための組成物及び方法 - Google Patents

Aavカプシドバリアントを使用した高効率な遺伝子導入のための組成物及び方法 Download PDF

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Description

本出願は、2012年4月18日に出願された米国仮出願第61/635,273号及び2013年3月15日に出願された米国仮出願第61/794,995号に基づく優先権を主張し、そのすべての内容は、全体として参照により本明細書に組み込まれる。
本願は、遺伝子治療及び分子生物学の分野に関する。より詳細には、本発明は、治療に有益な導入遺伝子を含むAAVベクターの形質導入効率を向上させるタンパク質カプシドのバリアント(多様体)を含むアデノ随伴ウィルスベクターを提供する。
この発明が関係する技術水準を記述する目的で、複数の刊行物及び特許文献が本明細書を通じて引用される。これらの引用は参照により全体として本明細書に組み込まれる。
アデノ随伴ウィルス(AAV)は、小さな(20nm)、複製能欠失型の非エンベロープウィルスである。様々な多くのAAV血清型は、ヒト及びヒト以外の霊長類の特徴を有する。AAVゲノムは、両端に145塩基対の末端逆位繰り返し配列(inverted terminal repeats:ITR)を有する一本鎖DNAから構成されている。2つの翻訳領域(open reading frame:ORF)である、rep及びcapが存在する。AAV複製に、rep産物は必須であると同時に、3つのカプシドタンパク質(VP1、VP2及びVP3)がcap遺伝子から発現する。VP1、VP2及びVP3はそれぞれ1:1:10の比で共に存在し、正二十面体カプシドを形成する。(Xie Q他、2002年)組換えAAV(rAAVの)ベクター生成の間に、ITRが隣接した発現カセットが、AAVカプシドにパッケージ化される。AAVの複製に必要な遺伝子は、カセットに含まれていない。組換えAAVは、安全、且つ、インビボでの遺伝子導入のために最も広く使用されるウィルスベクターの一つであると考えられている。ベクターは、強力かつ持続的な導入遺伝子発現を提供する複数の組織型の細胞に感染可能である。更に、ベクターは、非病原性であり、低い免疫原性プロファイル(High KA、2011年)を有する。
遺伝子治療試験における当面の目標の一つは、ベクター投与量を最小限に抑えながら組織の形質導入を最大化するように、ベクターを最適化することである。AAVカプシドタンパク質が細胞に入ると、プロテアソーム媒介性分解の対象となる。AAVカプシドにおける表面が露出したチロシン残基のリン酸化は、ユビキチン−プロテアソーム経路を介してウィルスの劣化につながる最初のステップのうちの1つを表す(Zhong L他、2007年)。細胞内の制御されたタンパク質分解のほとんどは、この経路を介して行われる。ユビキチン(ubiquitin)は、すべての真核細胞で見つけることができる小さなタンパク質(〜8.5kDa)である。ユビキチンは、基質タンパク質のアミノ酸の側鎖に結合している。最初に結合されたユビキチンを介して、更なるユビキチンタンパク質が基質に付加された後、ポリユビキチン鎖が形成され、劣化のためにマーキングされる(Thrower JS 他 2000年、 Peng J 他2003年、Bedford L他2011年)。表面が露出しているチロシン残基の変異は、AAV2ベクターの形質導入効率の増加(Zhong L他、2008年)をもたらすことが示されている。更に最近では、いくつかのグループが、この手法は、いくつかの組織において、AAV血清6型及び8型を含む他のAAV血清型にも有効であることが示されている。
臨床的に重要な導入遺伝子を伴うAAVの患者への形質導入を改善する組成物及び方法への需要が当技術分野に明確に存在する。
本発明によれば、本明細書に開示される改変を行わないAAV血清型(例えば、AAVl、AAV2、AAV8、AAV−rh74)と比較した場合に、形質導入効率の向上を示す新規のAAVバリアントが提供される。このような改良されたベクターは、肝臓、筋肉、脳及び網膜を含む種々の組織の形質導入のために有用である。
一実施形態では、改変されたVP1カプシドタンパク質を含むアデノ随伴ウィルス(AAV)ベクターが提供され、改変されたカプシドタンパク質はリジン残基の置換を含み、それによってカプシドのユビキチン化を減少させ、標的の組織及び細胞に変異型AAVを形質導入する効率を向上させる。一実施形態において、ベクターは更に、宿主細胞における異種核酸配列からの産物の発現を指令する制御配列に作動可能に結合された異種核酸(例えば、AAV末端逆位繰り返し配列及び異種核酸配列を含むミニ遺伝子)を含む。好ましい実施形態では、AAVベクターは、以下に記す表に示されるように、VP1における1つ又は複数のリジン置換を含む。別の実施形態では、AAVベクターは、AAV8血清型のものであり、表3に示すような改変を含んでいる。

好ましい実施形態では、変異型カプシドタンパク質を含む本発明のAAVベクターは、治療用ペプチド又は治療用核酸の発現に有用である。このようなペプチドは、以下に限定されるものではないが、抗ウィルスRNAi分子、第VIII因子、第IX因子又はその機能的断片が含まれる。更なる発現産物としては、例えば、IgG、IgM、IgA、IgD、IgE、キメラ免疫グロブリン、ヒト化抗体、又は、一本鎖抗体が含まれる。一態様において、発現産物は、HCV感染及び複製を阻害するのに有用なRNAiである。別の実施形態において、発現産物は、目的の標的細胞をダウンモジュレーション(抑制)するために有用なアンチセンス核酸である。
本発明の別の実施形態では、生物学的に適合する担体中に本発明の変異型AAVベクターを含む医薬組成物が提供される。また、本明細書に開示されるベクターを含む細胞培養物も本発明に包含される。
本発明はまた、対象の細胞に導入遺伝子を送達する方法を含み、当該方法は、AAVベクターと細胞とを接触させる工程を含む。当該AAVベクターは導入遺伝子を含み、当該ベクターにおけるVP1カプシド配列におけるリジン置換の特徴の存在が、ユビキチン化の低減及び形質導入効率の上昇と関連している。
最後の形態として、本発明は、感染した細胞では効果を有さないが、2つのウィルスのバリアントの構造的類似性により、有益な導入遺伝子を担持するウィルスバリアントの抗体中和を阻止するのには有効である、おとりウィルスバリアント(decoy viral variants)を提供する。この目的の典型的なカプシドバリアントの例としては、K38R、K143R、K510R及びK709Rが含まれる。
AAV1、AAV2及びAAV8の表面に存在するリジン(Lysines)。ここで使用されるAAV血清型のPDB数は、以下の通りである。AAV1:3NG9、AAV2:1LP3、及び、AAV8:2QA0。矢印は、それぞれのリジン残基を示す。図1Aは、AAV1 VP3の表面に11個のリジンが存在する場合を示している。残基に付された色は、以下のとおりである。K258 赤、K459 青、K491 黄色、K493マゼンタ、K508 シアン、K528 ダークサーモン、K533 黄緑、K545 ライトブルー(青灰色)、K567 ダークサーモン、K666 ライトシアン、K707 灰色。図1Bは、AAV2 VP3の表面に10個のリジンが存在する場合を示している。残基に付された色は、以下のとおりである。K258 赤、K490 黄色、K507 シアン、K527 ダークサーモン、K532 黄緑、K544 ライトブルー(青灰色)、K549 明るい黄色、K556 ライトマゼンタ、K665 ライトシアン、K706 灰色。図1Cは、AAV2 VP3の表面に8個のリジンが存在する場合を示している。残基に付された色は、以下のとおりである。K259 赤、K333 緑、K510 シアン、K530 ダークサーモン、K547ライトブルー(青灰色)、K569ダークサーモン、K668 ライトシアン、K709 灰色。AAV1のK528及びK567、並びに、AAV8のK530及びK569が構造内で横に並んでおり、同じ色で示されていることに注意されたい。 AAV8カプシドの幾つかのリジン残基を、アルギニンへと変異させた。動物から血液を、尾静脈を介してウィルス注射後8週間、収集した。hF.IXレベルをELISAによって検出した。図2Aでは、高信頼度及び中信頼度でソフトウェアによってユビキチン化すると予測された残基が、アルギニンに変異した。一マウスあたり、2.5×1010のウィルス粒子が、尾静脈(B、C)から注入された。低信頼度でソフトウェアによってユビキチン化すると予測された残基が、アルギニンに変異した。一マウスあたり、2.5×109のウィルス粒子が、尾静脈から注入された。図2Bは、K569RとK668Rのカプシド変異である。図2Cは、K38R、K143R、K259R、K510R、K547Rカプシド変異の影響を、K530R変異の影響と比較したものである。 KからRまでのカプシド変異の組み合わせ。図3Aは、K137R、K33R及びK530R変異の組み合わせであり、これらは野生型よりも高いが、K530Rと統計的に異ならない。図3Bでは、K709R変異がAAV8形質導入に負の影響を及ぼし、K(137/333/530)R変異体へのK709R変異の付加も、ウィルスの形質導入を減少させる。図3Cは、複数リジンのアルギニンへの変異の組み合わせでは形質導入を増加させない。図3Dでは、3リジンのアルギニン残基への変異と、4又は6チロシンのフェニルアラニン残基への変異との組み合わせが、形質導入速度を低下させる。 AAVl形質導入を示す。図4Aは、3つの異なるMOI 5K、50K及び500KでのAAV−1リジン変異体により形質導入されたHHL5−B7肝細胞のCTLによる死滅である。ペプチド(AAV1には IPQYGYLTLを、 AAV2にはVPQYGYLTL)を陽性対照として使用した。LDH放出は、細胞死滅と相関する。図4Bは、GFP陽性細胞及びGFP発現の合計数を、50K及び500KのMOIでの異なる構造間で比較したものである。 AAV2形質導入を示す。図5Aは、AAV2 K137R、K527R又はK532R変異体と、WT AAV2とを、HHL5細胞株の形質導入率の観点で比較した。細胞を、10K、50K、100K及び500KのMOIでトランスフェクトし、24時間後にGFP発現を調べた。図5Bは、試験したバリアントのLDL放出により測定された細胞傷害性(cytotoxicity)を示すグラフである。 肝細胞を標的としたCTLアッセイを、高濃度でAAV−2ベクターを使用して形質導入した後、HLAが一致したエフェクター細胞を使用してインキュベートした。図に示すように、AAVベクターは、野生型AAV−2カプシド又は単一リジンの変異をコードしていた。エフェクターは、インビトロで、AAV−2 MHCクラスI エピトープVPQYGYLTLに対して増殖されたPBMCから得られたものであり、エフェクター対標的比は10:1とした。結果は、野生型ベクターに対するCTL活性のパーセンテージとして表されている(最大細胞傷害性対象(maximum cytotoxicity control)として10%SDSで処理した細胞と比較した、バックグラウンドを差し引いた後の%細胞傷害性)。 RH74のデータである。ヒトF.IX.専用のELISAによって測定された、血漿中のヒトF.IXの導入遺伝子発現レベルである。図7Aは、TMRの定義=K(137/333/530)R、HMFの定義=Y(253/275/447/703/707/733)F。図7Bは、HMRの定義:K(137/259/333/530/552/569)R、195/202の定義:G195A+L199V+S201P+G202N。HMR+195/202、HMR+195/202+K(38)R、HMR+195/202+K(51)R、HMR+195/202+K(61)R、及び、HMR+195/202+K(77)Rは、マウスへの注入において高いhFIX生成量となったが、HMR+195/202+K(122/123)R又はHMR+195/202+K(142/413)Rを注入した場合は、検出可能なhFIX量を生成しなかった。図7Cでは、RHM13_1変異体は、Rh74 WTと比較して同様のhFIXレベルを生成したのに対し、RHM17_1で処置されたマウスから得られたhFIXレベルは、バックグラウンドレベルを超えなかった。図7Dでは、RHM14_2変異体はRh74 WTと比較して同様のhFIXレベルを生成した。RHM15_1性能は、AAV8とAAVrh74 WTとの間であった。
本発明では、AAVカプシド上のリジン残基をアルギニン残基へと変異させることにより、AAVの形質導入効率を向上させることができることを発見した。我々の最初の実験では、ユビキチン化の標的となると予測されるリジン残基を一箇所置換した場合、改変されていないAAVベクターを投与した動物と比較して、マウスにおけるヒト第IX因子(FIX)導入遺伝子の高レベルの発現をもたらすことが示された。本明細書に説明するAAVリジン変異体は、野生型AAVカプシドと比較してより高い効率で、肝臓、中枢神経系、筋肉及び他の器官を標的とするベクターを作製するのに利用することができる。この発見は、血友病A及びB、ハンチントン病、並びに、対象の標的組織への望ましい導入遺伝子の形質導入レベルが要求されるその他のあらゆる疾患を治療するための治療薬を開発するのに使用することができると考えられる。
以下の定義は、本発明の理解を容易にするために提供される。
I.定義
「遺伝子治療(Gene therapy)」は、疾患、一般的に遺伝性疾患を治療するために、個々の細胞及び/又は組織へと遺伝子を挿入することであり、欠損変異体対立遺伝子が交換又は機能的なもので補足される。
パルボウィルス科の「アデノ随伴ウィルス(adeno−associated virus)」とは、一本鎖DNAのゲノムを有する小さなウィルスである。これらのウィルスは、19番染色体上の特定の部位に遺伝物質を挿入することができ、ヒトにおける病原性疾患と関係しないことから、好ましい。
「治療的(therapeutic)」ペプチド又はタンパク質とは、細胞又は対象におけるタンパク質中の欠損又は欠陥に起因する症状を緩和又は軽減させることができるペプチド又はタンパク質である。あるいは、「治療的」ペプチド又はタンパク質とは、対象に利益を付与するもの、例えば、抗癌効果を与えるペプチド又はタンパク質である。治療的ペプチド及びタンパク質としては、以下に限定されないが、CFTR(嚢胞性線維症膜貫通調節タンパク質)、ジストロフィン(ジストロフィンミニ遺伝子のタンパク質産物を含む、 Vincent他、(1993年)Nature Genetics 5:130、参照)、ウトロフィン(Tinsley他、(1996年)Nature 384:349)、凝固因子(第XIII因子、第IX因子、第X因子、等)、モノクローナル抗体(Lewis他、2002年)、エリスロポエチン、LDL受容体、リポタンパク質リパーゼ、オルニチントランスカルバミラーゼ、β−グロビン、α−グロビン、スペクトリン、α‐アンチトリプシン、アデノシンデアミナーゼ、ヒポキサンチングアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ、β−グルコセレブロシダーゼ、スフィンゴミエリナーゼ、リソソームヘキソサミニダーゼ、分岐鎖ケト酸脱水素酵素、ホルモン、成長因子(例えば、インスリン様成長因子1及び2、血小板由来増殖因子、上皮増殖因子、神経成長因子、神経栄養因子−3及び−4、脳由来神経栄養因子、グリア由来成長因子、形質転換成長因子α及び、等)、サイトカイン(例えば、α‐インターフェロン、β−インターフェロン、インターフェロンγ、インターロイキン‐2、インターロイキン−4、インターロイキン12、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子、リンホトキシン)、自殺遺伝子産物(例えば、単純ヘルペスウィルスチミジンキナーゼ、シトシンデアミナーゼ、ジフテリア毒素、シトクロムP450、デオキシシチジンキナーゼ、及び、腫瘍壊死因子)、癌治療、腫瘍抑制遺伝子産物で使用される薬剤に対する耐性を付与するタンパク質(例えば、p53、Rb、Wt−1、NF1、VHL、APC等)、及び、必要とする対象物において治療効果を有するその他の任意のペプチド又はタンパク質、が挙げられる。
治療用ペプチド又はタンパク質の更なる例としては、以下に限定されないが、嚢胞性線維症(及び肺の他の疾患)、血友病A、血友病B、サラセミア、貧血及び他の血液疾患、AIDS、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチントン病、筋萎縮性側索硬化症、てんかん及び他の神経疾患、癌、糖尿病、筋ジストロフィー(例えば、デュシェンヌ型、ベッカー型)、ゴーシェ病、ハーラー病、アデノシンデアミナーゼ欠損症、グリコーゲン貯蔵疾患及び他の代謝障害、網膜の変性疾患(眼の他の疾患)、並びに、固形臓器(例えば、脳、肝臓、腎臓、心臓)の疾患を含む疾患状態の治療に使用され得るペプチド又はタンパク質が含まれる。
本明細書で使用されている「プロモーター(promoter)」という用語は、組換え産物をコードするDNA配列に隣接して位置するDNA配列を指すのに使用できる。プロモーターは、好ましくは、隣接するDNA配列に作動可能に結合されている。プロモーターが存在しない場合に発現する組換え産物の量と比較して、プロモーターがある場合には、典型的には、DNA配列から発現された組換え産物の量を増加させる。一の生物からのプロモーターを、別の生物に由来するDNA配列から組換え産物の発現を増強するために利用することができる。例えば、脊椎動物のプロモーターを、脊椎動物のクラゲGFPの発現のために使用し得る。さらに、一つのプロモーターエレメントは、タンデムに接続された複数のDNA配列について発現された組換え産物の量を増加させることができる。したがって、一つのプロモーター要素は、一つ又は複数の組換え産物の発現を増強することができる。複数のプロモーターエレメントが、当業者に周知である。
一実施形態では、高レベルの構成的発現(constitutive expression)が望まれる。このようなプロモーターの例としては、以下に限定されないが、レトロウィルスラウス肉腫ウィルス(RSV)LTRプロモーター/エンハンサー、サイトメガロウィルス(CMV)前初期プロモーター/エンハンサー(Boshart他、Cell、41:521−530(1985年))、SV40プロモーター、ジヒドロ葉酸還元酵素プロモーター、細胞質のβアクチンプロモーター及びホスホグリセロールキナーゼ(PGK)プロモーター、が挙げられる。
別の実施形態では、誘導性プロモーターが所望される場合がある。誘導性プロモーターは、シス又はトランスで、外因的に供給される化合物によって制御されるものであり、以下に限定されないが、亜鉛誘導性ヒツジメタロチオネイン(MT)プロモーター、デキサメタゾン(Dex)誘導性マウス乳癌ウィルス(MMTV)プロモーター、T7ポリメラーゼプロモーターシステム(WO98/10088)、テトラサイクリン抑制性システム(Gossen他、Proc.Natl.Acad.Sci.米国、89:5547−5551(1992年))、テトラサイクリン誘導性システム(Gossen他、Science,268:1766−1769(1995年);Harvey他,Curr.Opin.Chem.Biol.2:512−518(1998年)も参照)、RU486誘導性システム(Wang他、Nat.Biotech.、15:239−243(1997年)及びWang他、Gene Ther.,4:432−441(1997年)、及び ラパマイシン誘導性システム(Magari 他,J.Clin.Invest.,100:2865−2872(1997年)、Rivera他.,Nat.Medicine.2:1028−1032(1996年))が挙げられる。これに関連して有用であり得る誘導性プロモーターの他のタイプとしては、特定の生理学的状態により調節されるものであり、例えば温度、急性期、又は、複製細胞内でのみといった状態によって調整されるものが考えられる。
別の実施形態では、目的の導入遺伝子又は核酸配列のネイティブプロモーターが使用され得る。導入遺伝子又は核酸配列の発現が天然発現(native expression)を模倣することが望まれる場合に、ネイティブプロモーターが好ましい。導入遺伝子又は他の核酸配列の発現が一時的又は発生学的に調節される、又は、組織に固有の態様で、若しくは、特定の転写刺激に応答して調整される必要がある場合に、ネイティブプロモーターを使用することができる。更なる実施形態において、エンハンサーエレメント、ポリアデニル化部位又はコザックコンセンサス配列のようなその他の天然の発現制御要素を、天然発現を模倣するために使用することができる。
一実施形態では、組換えウィルスゲノムは、組織に固有のプロモーターに作動可能に連結された導入遺伝子を含む。例えば、骨格筋での発現が所望される場合、筋肉中で活性を有するプロモーターを使用することができる。このようなプロモーターとしては、骨格α‐アクチン、ミオシン軽鎖2A、ジストロフィン、筋クレアチンキナーゼをコードする遺伝子からのプロモーター、及び、天然に存在するプロモーターよりも高い活性を有する合成筋肉プロモーターが含まれる。組織固有のプロモーターの例としては、肝臓[アルブミン(Miyatake他、J.Virol.,71:5124−32、1997年);B型肝炎ウィルスコアプロモーター(Sandig他,Gene Ther.3:1002−9、1996年)、α‐フェトプロテイン(AFP)(Arbuthnot他.,Hum.Gene Ther.,7:1503−14、1996年)、骨[オステオカルシン(Stein他,Mol.Biol.Rep.,24:185−96、1997年)、骨シアロタンパク(Chen他,J.Bone Miner.Res.11:654−64、1996年)]、リンパ球[CD2(Hansal他,J.Immunol.,161:1063−8、1998年)、免疫グロブリン重鎖、T細胞レセプター鎖)、ニューロン[ニューロン特異エノラーゼ(NSE)プロモーター(Andersen他、Cell.Mol.Neurobiol.,13:503−15、1993年)、ニューロフィラメント軽鎖遺伝子(Piccioli他,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,88:5611−5、1991年)、ニューロン特異的VGF遺伝子(Piccioli他,Neuron,15:373−84、1995年)等が挙げられる。
本明細書で使用されている「エンハンサー(enhancer)」という用語は、組換え産物をコードするDNA配列に隣接して位置するDNA配列を指すのに使用できる。エンハンサーエレメントは、典型的には、プロモーターエレメントの上流に位置している、若しくは、DNAのコード配列(例えば、組換え産物又は産物に転写又は翻訳されたDNA配列)の下流又はDNAのコード配列内に位置させることができる。エンハンサーエレメントは、組換え産物をコードするDNA配列の上流又は下流の100塩基対、200塩基対、300塩基対又はそれを超える塩基対に配置することができる。エンハンサーエレメントは、プロモーターエレメントによる発現増加を上回って、DNA配列から発現された組換え産物の量を増加させることができる。複数のエンハンサーエレメントが、当業者に周知である。
本明細書で使用される「核酸(nucleic acid)」又は「核酸分子(nucleic acid molecule)」は、一本鎖又は二本鎖のいずれかである任意のDNA又はRNA分子を指し、一本鎖である場合には、直鎖又は環状の形態のその相補的配列の分子も指す。本明細書において核酸分子を説明する際には、特定の核酸分子の配列又は構造は、5’から3’の方向で配列を提供する通常の慣例に従って記載される。本発明の核酸を指して、「単離された核酸」という言葉が使用されることがある。DNAについてこの言葉が使用される場合、DNA分子が由来する生物の天然のゲノム中においてすぐ隣に位置する配列から分離されるDNA分子を意味する。例えば、「単離核酸(isolated nucleic acid)」は、プラスミド又はウィルスベクターなどのベクターに挿入されたDNA分子、又は、原核生物細胞、真核生物細胞若しくは宿主生物のゲノムDNAに組み込まれたDNA分子を含む。
「ベクター(vector)」は、添付の配列又は要素の複製をもたらすように、別の遺伝子配列又はエレメント(DNA又はRNAのいずれか)が付加され得るプラスミド、コスミド、バクミド、ファージ、又はウィルスなどの複製単位(レプリコン)である。
「発現オペロン(expression operon)」とは、例えば、プロモーター、エンハンサー、翻訳開始シグナル(例えば、ATG又はAUGコドン)、ポリアデニル化シグナル、ターミネーター等の転写及び翻訳制御配列を有していてもよい核酸セグメントを指し、宿主細胞又は生物におけるポリペプチドコード配列の発現を促進する。
「形質転換(transform)」、「トランスフェクション(transfect)」、「形質導入(transduce)」という言葉は、核酸を細胞又は宿主生物に導入することができる任意の方法又は手段を指し、これらの言葉は、同じ意味を伝達するべく交換可能に使用され得る。方法としては、トランスフェクション、エレクトロポレーション、マイクロインジェクション、感染、PEG融合等が挙げられるが、これらに限定されない。
導入された核酸は、受容細胞又は生物の核酸に組み込まれる(共有結合)場合もあるし、組み込まれない場合もある。細菌、酵母、植物及び哺乳動物の細胞では、例えば、導入された核酸は、エピソームエレメント、又は、プラスミドなどの独立したレプリコンとして維持されてもよい。これに替えて、導入された核酸は、受容細胞又は受容生物の核酸に組み込まれてもよく、当該細胞又は生物中で安定して維持され、更には、受容細胞若しくは生物の子孫細胞又は有機体に受け渡される又は継承され得る。最終的に、導入された核酸は、受容細胞又は宿主生物に一時的に存在してもよい。
「選択マーカー遺伝子(selectable marker gene)」という言葉は、発現した場合に、形質転換された細胞又は植物に、抗生物質耐性などの選択可能な表現型を付与する遺伝子を意味する。
「作動可能に結合された(operably linked)」という用語は、コード配列の発現に必要な調節配列が、コード配列の発現をもたらすような当該コード配列に対して適切な位置でDNA分子中に配置されていることを意味する。転写ユニット及び発現ベクター中のその他の転写制御エレメント(例えば、エンハンサー)の配置ついても、同様の定義が適用される。
本明細書で使用される「オリゴヌクレオチド(oligonucleotide)」という言葉は、本発明の配列、プライマー及びプローブを指し、2つ以上の好ましくは3つを超えるリボヌクレオチド又はデオキシリボヌクレオチドから構成される核酸分子として定義される。オリゴヌクレオチドの正確なサイズは、種々の要因及びオリゴヌクレオチドの特定の適用及び用途に依存する。
「特異的にハイブリダイズする(specifically hybridize)」というフレーズは、当該技術分野において一般に使用される予め決められた条件の下でハイブリダイゼーションを可能にするのに十分相補的な(しばしば「実質的に相補的」とも称される)配列の2つの一本鎖核酸分子間の関連付けを指す。特に、非相補的配列の一本鎖核酸とのオリゴヌクレオチドのハイブリダイゼーションを実質的に除外するべく、この用語は、本発明の一本鎖DNA又はRNA分子内に含まれる実質的に相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドのハイブリダイゼーションを指す。
本明細書で使用する「プライマー(primer)」は、一本鎖又は二本鎖で、生物学系に由来する、制限酵素消化により生成される又は合成的に製造されたDNAオリゴヌクレオチドを指し,適切な環境に置かれた場合、鋳型に依存する核酸合成の開始剤として機能的に作用することができる。適切な核酸鋳型、核酸の好適なヌクレオシド三リン酸前駆体、ポリメラーゼ酵素、補因子、及び、適切な温度及びpHのような適切な条件が揃った場合には、ポリメラーゼの作用又はプライマー伸長生成物を得ることができる同様の活性によりヌクレオチドを付加することによってプライマーをその3’末端で延長することができる。プライマーは、特定の条件や用途の要件に応じて長さが変化してもよい。例えば、診断用途では、オリゴヌクレオチドプライマーは、典型的には長さ15〜25ヌクレオチド又はそれ以上である。プライマーは、所望の伸長産物の合成を刺激するように所望の鋳型に対して十分な相補性を有する必要がある。すなわち、ポリメラーゼ又は類似の酵素による合成の開始に使用するために、適切な近位置に3’ヒドロキシル部分を提供できるように態様で、所望の鋳型鎖とアニーリングすることができる程度に相補性を有する必要がある。しかしながら、プライマー配列は、所望の鋳型に対して厳密な相補性を表す必要はない。例えば、非相補的なヌクレオチド配列を、相補的プライマーの5’末端に結合させることができる。これに替えて、伸長産物の合成のための鋳型−プライマー複合体を機能的に提供する程度にプライマー配列が所望の鋳型鎖の配列と十分な相補性を有するならば、非相補的塩基を、オリゴヌクレオチドプライマー配列内に散在させてもよい。
ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)は、米国特許第4683195、4800195及び4965188号広報に記載されており、その開示内容全体が参照により本明細書に組み入れられる。
「単離された(isolated)」という言葉は、自然界では結合されているであろう他の化合物から十分に分離された化合物又は錯体を指す。「単離された(isolated)」というは、他の化合物又は材料との人工的な混合物又は合成混合物を除外するものではなく、また、基本的な活性又はそれに続くアッセイと干渉しない、例えば、不完全な精製又は安定剤の添加によって存在し得る不純物の存在を除外するものではない。
「免疫応答(immune response)」は、抗原又は抗原決定基に対する脊椎動物対象の免疫系の任意の応答を意味する。本明細書で以下に定義されるように、典型的な免疫応答は、体液性免疫応答(例えば、抗原特異的抗体の産生)及び細胞媒介性免疫応答(例えば、リンパ球増殖)を含む。
II.本発明の変異型アデノ随伴ウィルスベクターの使用方法及び投与方法
本発明の方法は、分裂細胞及び非分裂細胞の両方を含む幅広い宿主細胞へと、異種核酸配列を送達する手段を提供する。治療方法又はその他の方法として、本発明のベクター及び他の試薬、方法及び医薬製剤は、タンパク質又はペプチドを、必要とする対象に投与する方法おいて更に有用である。したがって、タンパク質又はペプチドは、対象の生体内で産生され得る。治療方法として又はその他の方法として、対象はタンパク質又はペプチドの欠損を有するため、当該タンパク質又はペプチドを必要とする場合がある、又は、対象におけるタンパク質又はペプチドの生産がいくつかの治療効果を与える可能性があるために、対象が当該タンパク質又はペプチドを必要とする場合があり、以下に更に説明する。
概して、本発明は、遺伝子発現に関連する任意の疾患に関連する症状を改善する又は治療するための生物学的効果を有する任意の外来核酸を送達するために用いることができる。疾患の例としては、以下に限定されないが、嚢胞性線維症(及び肺の他の疾患)、血友病A、血友病B、サラセミア、貧血及び他の血液凝固障害、AIDS、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチントン病、筋萎縮性側索硬化症、てんかん及び他の神経疾患、癌、糖尿病、筋ジストロフィー(例えば、デュシェンヌ型、ベッカー型)、ゴーシェ病、ハーラー病、アデノシンデアミナーゼ欠損症、グリコーゲン貯蔵疾患及び他の代謝障害、網膜の変性疾患(眼の他の疾患)、並びに、固形臓器(例えば、脳、肝臓、腎臓、心臓)の疾患等が挙げられる。
また、本発明は、モノクローナル抗体又はその断片をコードする核酸を送達するために用いることができ、モノクローナル抗体又はその断片は、癌、感染症及び関節リウマチなどの自己免疫疾患に関連する症状を改善するのに有益な生物学的効果を与えることが知られている。他の配列は、例えば、疾患の経過を調節することができるインターフェロンαのようなサイトカインをコードしてもよい。
遺伝子導入は、疾患状態の治療の提供及び理解をする上で、多くの潜在的な用途がある。欠陥遺伝子が知られており、クローン化されている遺伝性疾患が多数存在する。いくつかの場合において、クローン化された遺伝子の機能が知られている。一般的には、上記の疾患状態は、二つのクラスに分類される。一つは、通常は酵素の欠乏状態であり、は一般的に劣性遺伝する欠乏状態であり、もう一つは、優性遺伝され、少なくとも一部が調節タンパク質又は構造タンパク質が関係するアンバランス状態である。欠乏状態の疾患の場合、補充療法のために、影響を受けた組織に正常な遺伝子をもたらすのに、及び、アンチセンス変異を用いた疾患の動物モデルを作成するのに、遺伝子導入を使用することができる。アンバランスな疾患状態の場合、遺伝子導入は、モデルシステムにおける疾患状態を作成するために使用することができ、更には、その疾患状態に対処する試みに使用することができる。このように、本発明の方法は、遺伝子疾患の治療を可能にする。本明細書で使用される場合、疾患を引き起こす又は疾患を重篤にする欠乏又は不均衡を部分的又は完全に改善することによって、疾患状態の治療がなされる。変異を生じさせる又は欠陥を修正する核酸配列の部位特異的組込みを使用することも可能である。
本発明は更に、一時的に又は安定して目的の遺伝子を細胞培養系で、又は、トランスジェニック動物モデルにおいて発現させることにより、診断方法及びスクリーニング方法における利用が可能である。
III.対象、医薬製剤、ワクチン及び投与様式
本発明は、獣医学分野及び医療分野の両方で利用が期待される。適切な対象としては、鳥類及び哺乳動物の両方が含まれ、哺乳類の方がより好適である。本明細書で使用される「鳥類(avian)」という言葉は、これに限定されないが、ニワトリ、アヒル、ガチョウ、ウズラ、シチメンチョウ及びキジを含む。本明細書で使用される「哺乳動物(mammal)」という言葉は、これに限定されないが、ヒト、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ウマ、ネコ、イヌ、ウサギ等が含まれる。対象は、人間が最も好ましい。人間の対象としては、胎児、新生児、乳児、未成年及び成人が含まれる。
特定の実施形態において、本発明は、薬学的に許容される担体又は他の薬剤、医薬品、担体、アジュバント、希釈剤などに含有される本発明のウィルス粒子を含む医薬組成物を提供する。注射のために、担体は、典型的には液体である。他の投与方法のために、担体は、滅菌発熱性物質除去蒸留水又は滅菌発熱性物質除去リン酸緩衝生理食塩水などの液体又は固体であってもよい。吸入投与の場合、担体は、呼吸可能な態様であり、好ましくは固体粒状形態又は液体粒状形態である。注入媒体として、注射溶液のための通常の添加剤、例えば、安定化剤、塩又は生理食塩水及び/又は緩衝剤などを含む水を使用することが好ましい。
他の実施形態において、本発明は、AAVプロウィルスがゲノムに組み込まれた細胞を薬学的に許容される担体又は他の薬剤、医薬品、担体、アジュバント、希釈剤等に含む医薬組成物を提供する。
「薬学的に許容される(pharmaceutically acceptable)」とは、生物学的に望ましくないということがない又は望ましくないことがない材料を意味し、例えば、材料が対象に投与された場合に、任意の望ましくない生物学的効果を引き起こすことがない材料を意味する。このような医薬組成物は、例えば、体外での細胞のトランスフェクション、又は、ウィルス粒子又は細胞を対象に直接的に投与するのに、使用されてもよい。
本発明は更に、核酸を細胞に送達する方法を提供する。インビトロでの方法については、当技術分野で知られているように、標準的なウィルス形質導入法によってウィルスを細胞に投与してもよい。好ましくは、ウィルス粒子は、特定の標的細胞に適した標準的な形質導入方法に従って適切な感染多重度で細胞に添加される。投与するウィルスの力価は、標的細胞の種類及び特定のウィルスベクターに依存して変えることができ、当業者であれば過度の実験をすることなく、決定することができる。これに替えて、本発明のパルボウィルスベクターの投与は、当技術分野で公知の任意の他の手段によって達成することができる。
組換えウィルスベクターは、好ましくは生物学的に有効な量で細胞に投与される。ウィルスベクターの「生物学的に有効な(biologically−effective)」量は、細胞中における異種核酸配列の感染(又は形質導入)及び発現をもたらすのに十分な量である。ウィルスがインビボで細胞に投与される(例えば、ウィルスが以下に説明するように対象に投与される)場合、ウィルスベクターの「生物学的に有効な」量とは、標的細胞において異種核酸配列の形質導入及び発現をもたらすのに十分な量である。
本発明のウィルスベクターを投与する細胞は、任意の種類のものとすることができ、これらに限定されないが、神経細胞(末梢及び中枢神経系の細胞、特に、脳細胞を含む)、肺細胞、網膜細胞、上皮細胞(例えば、腸及び呼吸上皮細胞)、筋肉細胞、膵島細胞を含む膵臓細胞、肝細胞、心筋細胞、骨細胞(例えば、骨髄幹細胞)、造血幹細胞、脾臓細胞、ケラチノサイト、線維芽細胞、内皮細胞、前立腺細胞、生殖細胞等が挙げられる。これに替えて、細胞は、任意の前駆細胞であってもよい。もしくは、細胞は、幹細胞(例えば、神経幹細胞、肝幹細胞)であり得る。更に、細胞は、上記したように、発生源の任意の種類からの細胞であり得る。
本発明の特定の実施形態において、細胞を対象から取り出し、パルボウィルスベクターをその中に導入した後、導入された細胞を対象に戻す。生体外での治療を行うために、対象から細胞を取り出し、導入後対象に戻す方法は、当技術分野で周知である。これに替えて、rAAVベクターを、別の対象からの細胞、培養細胞又は他の任意の適切な供給源からの細胞へと導入し、導入後の細胞を、必要とする対象に投与する。
生体外遺伝子治療に適した細胞としては、これらに限定されないが、肝細胞、神経細胞(中枢及び末梢神経系の細胞、特に、脳細胞を含む)、膵臓細胞、脾臓細胞、線維芽細胞(例えば、皮膚線維芽細胞)、ケラチノサイト、内皮細胞、上皮細胞、筋芽細胞、造血細胞、骨髄間質細胞、前駆細胞、及び幹細胞が挙げられる。
対象への細胞の投与量は、対象の年齢、状態及び対象の種、細胞の種類、細胞によって発現される核酸、投与の方法などに応じて変わる。典型的には、一回の投与量として、少なくとも約102から約108個の細胞、望ましくは、約103から約106個の細胞が投与される。好ましくは、細胞は、「治療有効量(therapeutically−effective amount)」で投与される。
本明細書で使用する「治療有効量」とは、疾患状態に関連する症状の少なくとも一つを緩和(例えば、最小限にする、減少させる、軽減させる)させるのに十分な量である。又は、「治療有効量」とは、対象の状態にある程度の改善を提供するのに十分な量である。
本発明の更なる態様は、本発明のウィルス粒子を生体内で利用して対象を治療する方法である。投与の対象がヒト又は動物である場合、本発明のパルボウィルス粒子の投与は、ウィルスベクターを投与するための当技術分野で周知の任意の手段によって行うことができる。
例示的な投与様式は、経口、直腸、経粘膜、局所、経皮、吸入、非経口(例えば、静脈内、皮下、皮内、筋肉内及び関節内)投与など、ならびに、組織又は器官への直接注射、あるいは、髄腔内、直接筋肉内、脳室内、静脈内、腹腔内、鼻腔内又は眼内への注射が挙げられる。注射剤は、従来の形態で準備することができ、注射前に、液体溶液又は懸濁液、液体の溶液又は懸濁液に適した固体の状態、又は、エマルジョンとして調剤される。デポの例又は持続放出製剤のために、全身的な方法よりも局所的にウィルスを投与することができる。
本発明の特に望ましい実施形態では、治療に使用されるヌクレオチド配列が、対象の肝臓に送達される。肝臓への投与は、当技術分野で周知の任意の方法によって達成されてもよく、これらに限定されないが、静脈内投与、門脈内投与、胆管内投与、動脈内投与、及び肝実質内への直接注入が挙げられる。
望ましくは、細胞(例えば、肝細胞)は、ペプチド又はタンパク質をコードする組換えパルボウィルスベクターに感染し、感染した細胞はコードされたペプチド又はタンパク質を発現して、(上記で定義したような)治療上有効な量の当該ペプチド又はタンパク質を循環系に分泌する。あるいは、ベクターが送達されて、これらに限定されないが、脳、膵臓、脾臓又は筋肉を含む別の細胞又は組織によって発現される。
他の好ましい実施形態において、本発明のパルボウィルス粒子は、筋肉内投与されるが、より好ましくは、筋肉内注射又は(上記で定義したような)局所投与によって投与される。他の好ましい態様において、本発明のパルボウィルス粒子は、肺に投与される。
本明細書に開示されるパルボウィルスベクターは、任意の適切な手段によって対象の肺に投与することができるが、好ましくは、本発明のパルボウィルスベクターを含有する吸入可能な粒子のエアロゾル懸濁液を被験者が吸入することによって投与される。吸入可能な粒子は、液体又は固体であってもよい。例えば、米国特許第4501729号広報に記載されているように、当業者に周知の任意の適切な手段によって、本発明のパルボウィルスベクターを含む液体粒子のエアロゾルを生成してもよく、例えば、圧力駆動エアロゾルネブライザー又は超音波ネブライザーを使用して生成してもよい。本発明のウィルスベクターを含む固体粒子のエアロゾルも同様に、製薬分野で周知の技術により、任意の固体粒子状薬剤エアロゾル発生器を用いて生成することができる。
本発明のパルボウィルス粒子の用量は、投与の方法、治療すべき疾患又は状態、個々の治療対象の状態に依存し、送達すべき特定のウィルスベクター及び遺伝子を、通常の方法で決定することができる。治療効果を達成するための例示的な用量は、少なくとも約105、106、107、108、109、1010、1011、1012、1013、1014、1015、1016のトランスダクションユニット(transducting units)又はこれを超えるウィルス力価であり、望ましくは、約108から1013トランスダクションユニット、より望ましくは、1012トランスダクションユニットのウィルス力価である。
以上のように、本発明のパルボウィルスベクター、試薬及び方法を使用することにより、核酸を分裂細胞又は非分裂細胞へと誘導し、そこで安定して異種核酸を発現させることができる。このベクターシステムを使用して、インビトロ又はインビボで、細胞生理機能に影響を与えるタンパク質をコードする遺伝子を、細胞中に導入することが可能である。したがって、本発明のベクターは、このような疾患状態又は細胞生理機能の実験的改変のための遺伝子治療において有用であり得る。
続く例は、本発明の特定の実施形態を説明するために提供される。したがって、本発明を限定することを意図していない。
[実施例1]
リジンからアルギニンへの変異による、AAV形質導入率及びMHC送達への影響
AAV1ベクター及びAAV8ベクターにおいて標的とすべきリジン残基の特定
AAV1、AAV2、AAV8とRh74カプシドタンパク質(Radivojac P他、2010年)におけるユビキチン化部位の候補を予測するUbPredソフトウェアを使用した。UbPredは、http://www.ubpred.org/index.htmlにてオンラインで入手可能であり、解析の出力は、指示されたAAV血清型カプシド配列内のユビキチン化に重要なリジン残基の予測結果である。図1及び表1を参照されたい。結果は以下の通りである。
AAV1カプシドタンパク質VP1配列:MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWDLKPGAPKPKANQQKQDDGRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLRYNHADAEFQERLQEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEGAKTAPGKKRPVEQSPQEPDSSSGIGKTGQQPAKKRLNFGQTGDSESVPDPQPLGEPPATPAAVGPTTMASGGGAPMADNNEGADGVGNASGNWHCDSTWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSASTGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTTNDGVTTIANNLTSTVQVFSDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEEVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLNRTQNQSGSAQNKDLLFSRGSPAGMSVQPKNWLPGPCYRQQRVSKTKTDNNNSNFTWTGASKYNLNGRESIINPGTAMASHKDDEDKFFPMSGVMIFGKESAGASNTALDNVMITDEEEIKATNPVATERFGTVAVNFQSSSTDPATGDVHAMGALPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKNPPPQILIKNTPVPANPPAEFSATKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEVQYTSNYAKSANVDFTVDNNGLYTEPRPIGTRYLTRP
リジン
位置 スコア ユビキチン化
26 0.59 No
31 0.55 No
33 0.47 No
38 0.61 No
51 0.54 No
61 0.72 Yes 中信頼度
77 0.63 Yes 低信頼度
84 0.72 Yes 中信頼度
122 0.17 No
123 0.26 No
137 0.90 Yes 高信頼度
142 0.62 Yes 低信頼度
143 0.81 Yes 中信頼度
161 0.70 Yes 中信頼度
168 0.25 No
169 0.26 No
258 0.49 No
310 0.14 No
315 0.15 No
322 0.48 No
459 0.81 Yes 中信頼度
476 0.43 No
491 0.20 No
493 0.28 No
508 0.62 Yes 低信頼度
528 0.67 Yes 低信頼度
533 0.70 Yes 中信頼度
545 0.65 Yes 低信頼度
567 0.66 Yes 低信頼度
621 0.50 No
641 0.50 No
650 0.45 No
666 0.58 No
689 0.65 Yes 低信頼度
693 0.65 Yes 低信頼度
707 0.78 Yes 中信頼度
凡例:
表示 スコア範囲 感度 特異度
低信頼度 0.62<s<0.69 0.464 0.903
中信頼度 0.69<s<0.84 0.346 0.950
高信頼度 0.84<s<1.00 0.197 0.989
AAV8カプシドタンパク質VP1配列:
MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWALKPGAPKPKANQQKQDDGRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLQAGDNPYLRYNHADAEFQERLQEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEGAKTAPGKKRPVEPSPQRSPDSSTGIGKKGQQPARKRLNFGQTGDSESVPDPQPLGEPPAAPSGVGPNTMAAGGGAPMADNNEGADGVGSSSGNWHCDSTWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISNGTSGGATNDNTYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLSFKLFNIQVKEVTQNEGTKTIANNLTSTIQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFQFTYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTQTTGGTANTQTLGFSQGGPNTMANQAKNWLPGPCYRQQRVSTTTGQNNNSNFAWTAGTKYHLNGRNSLANPGIAMATHKDDEERFFPSNGILIFGKQNAARDNADYSDVMLTSEEEIKTTNPVATEEYGIVADNLQQQNTAPQIGTVNSQGALPGMVWQNRDVYLQGPIWAKIPHTDGNFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPADPPTTFNQSKLNSFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYYKSTSVDFAVNTEGVYSEPRPIGTRYLTRNL
リジン
位置 スコア ユビキチン化
26 0.52 No
31 0.51 No
33 0.16 No
38 0.62 Yes 低信頼度
51 0.56 No
61 0.68 Yes 低信頼度
77 0.65 Yes 低信頼度
122 0.17 No
123 0.32 No
137 0.92 Yes 高信頼度
142 0.53 No
143 0.65 Yes 低信頼度
162 0.28 No
163 0.29 No
170 0.24 No
259 0.49 No
312 0.09 No
317 0.12 No
324 0.43 No
333 0.75 Yes 中信頼度
478 0.59 No
510 0.50 No
530 0.71 Yes 中信頼度
547 0.40 No
569 0.66 Yes 低信頼度
623 0.47 No
643 0.44 No
652 0.51 No
668 0.64 Yes 低信頼度
691 0.66 Yes 低信頼度
695 0.67 Yes 低信頼度
709 0.68 Yes 低信頼度
凡例:
表示 スコア範囲 感度 特異度
低信頼度 0.62<s<0.69 0.464 0.903
中信頼度 0.69<s<0.84 0.346 0.950
高信頼度 0.84<s<1.00 0.197 0.989
添付の表3は、本発明のAAV8を含む様々なカプシド変異体を使用して得られたベクターの生成率を示す。表3には、同じ血清型の野生種のベクターの場合と比較して、変異体の形質導入効率が高い、低い又は同等であったかについても示されている。
AAV2カプシドタンパク質VP1配列:
MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERHKDDSRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNEADAAALEHDKAYDRQLDSGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEPVKTAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGDADSVPDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGNRQAATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSVNVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL
リジン
位置 スコア ユビキチン化
24 0.20 No
26 0.49 No
33 0.38 No
39 0.89 Yes 高信頼度
51 0.53 No
61 0.67 Yes 低信頼度
77 0.68 Yes 低信頼度
92 0.56 No
105 0.58 No
122 0.14 No
123 0.18 No
137 0.87 Yes 高信頼度
142 0.58 No
143 0.77 Yes 中信頼度
161 0.70 Yes 中信頼度
169 0.31 No
258 0.51 No
309 0.14 No
314 0.17 No
321 0.46 No
490 0.73 Yes 中信頼度
507 0.61 No
527 0.78 Yes 中信頼度
532 0.75 Yes 中信頼度
544 0.61 No
549 0.68 Yes 低信頼度
556 0.62 Yes 低信頼度
620 0.47 No
640 0.45 No
649 0.42 No
665 0.54 No
688 0.68 Yes 低信頼度
692 0.68 Yes 低信頼度
706 0.66 Yes 低信頼度
凡例:
表示 スコア範囲 感度 特異度
低信頼度 0.62≦s≦0.69 0.464 0.903
中信頼度 0.69≦s≦0.84 0.346 0.950
高信頼度 0.84≦s≦1.00 0.197 0.989
AAV‐Rh74カプシドタンパク質VP1配列:
MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWDLKPGAPKPKANQQKQDNGRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLQAGDNPYLRYNHADAEFQERLQEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVESPVKTAPGKKRPVEPSPQRSPDSSTGIGKKGQQPAKKRLNFGQTGDSESVPDPQPIGEPPAGPSGLGSGTMAAGGGAPMADNNEGADGVGSSSGNWHCDSTWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISNGTSGGSTNDNTYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNEGTKTIANNLTSTIQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFEFSYNFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTQSTGGTAGTQQLLFSQAGPNNMSAQAKNWLPGPCYRQQRVSTTLSQNNNSNFAWTGATKYHLNGRDSLVNPGVAMATHKDDEERFFPSSGVLMFGKQGAGKDNVDYSSVMLTSEEEIKTTNPVATEQYGVVADNLQQQNAAPIVGAVNSQGALPGMVWQNRDVYLQGPIWAKIPHTDGNFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPADPPTTFNQAKLASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYYKSTNVDFAVNTEGTYSEPRPIGTRYLTRNL
リジン
位置 スコア ユビキチン化
26 0.60 No
31 0.53 No
33 0.27 No
38 0.23 No
51 0.38 No
61 0.68 Yes 低信頼度
77 0.65 Yes 低信頼度
122 0.17 No
123 0.30 No
137 0.90 Yes 高信頼度
142 0.35 No
143 0.35 No
162 0.36 No
163 0.33 No
169 0.27 No
170 0.25 No
259 0.46 No
312 0.13 No
317 0.16 No
324 0.46 No
333 0.77 Yes 中信頼度
478 0.51 No
510 0.49 No
530 0.67 Yes 低信頼度
547 0.52 No
552 0.69 Yes 中信頼度
569 0.67 Yes 低信頼度
623 0.49 No
643 0.44 No
652 0.54 No
668 0.56 No
691 0.68 Yes 低信頼度
695 0.67 Yes 低信頼度
709 0.69 Yes 中信頼度
凡例:
表示 スコア範囲 感度 特異度
低信頼度 0.62<s<0.69 0.464 0.903
中信頼度 0.69<s<0.84 0.346 0.950
高信頼度 0.84<s<1.00 0.197 0.989
本発明のカプシドバリアントを含むリジンを生成するのに、以下のプライマーのセットを利用した。
変異誘発に使用したプライマー
AAV1プライマー:

AAV1 K61R
センス:5’− CTT CAA CGG ACT CGA CAG GGG GGA GCC −3’
アンチセンス:5’− GGC TCC CCC CTG TCG AGT CCG TTG AAG −3’

AAV1 K84R
センス:5’− GCC TAC GAC CAG CAG CTC AGA GCG GGT GAC −3’
アンチセンス:5’− GTC ACC CGC TCT GAG CTG CTG GTC GTA GGC −3’

AAV1 K137R
センス:5’− TGG TTG AGG AAG GCG CTA GGA CGG CTC CT −3’
アンチセンス:5’− AGG AGC CGT CCT AGC GCC TTC CTC AAC CA −3’

AAV1 K143R
センス:5’− CTA AGA CGG CTC CTG GAA AGA GAC GTC CGG TAG −3’
アンチセンス:5’− CTA CCG GAC GTC TCT TTC CAG GAG CCG TCT TAG −3’

AAV1 K161R
センス:5’− CGG GCA TCG GCA GGA CAG GCC AGC A −3’
アンチセンス:5’− TGC TGG CCT GTC CTG CCG ATG CCC G −3’

AAV1 K459R
センス:5’− AGT CCG GAA GTG CCC AAA ACA GGG ACT TGC TGT −3’
アンチセンス:5’− ACA GCA AGT CCC TGT TTT GGG CAC TTC CGG ACT −3’

AAV1 K528R
センス:5’− GCA CTG CTA TGG CCT CAC ACA GAG ACG ACG AAG −3’
アンチセンス:5’− CTT CGT CGT CTC TGT GTG AGG CCA TAG CAG TGC −3’

AAV1 K533R
センス:5’− CAA AGA CGA CGA AGA CAG GTT CTT TCC CAT GAG CG −3’
アンチセンス:5’−CGC TCA TGG GAA AGA ACC TGT CTT CGT CGT CTT TG −3’

AAV1 K707R
センス:5’− TGCAGTACACATCCAATTATGCAAGATCTGCCAACG TTG −3’
アンチセンス:5’− CAACGTTGGCAGATCTTGCATAATTGGATGTGTACTGCA −3’
AAV8プライマー

AAV8 K137R
センス:5’− GGT TGA GGA AGG CGC TAG GAC GGC TCC TGG −3’
アンチセンス:5’− CCA GGA GCC GTC CTA GCG CCT TCC TCA ACC −3’

AAV8 K333R
センス:5’− GCA GAA TGA AGG CAC CAG GAC CAT CGC CAA TAA CC −3’
アンチセンス:5’− GGT TAT TGG CGA TGG TCC TGG TGC CTT CAT TCT GC −3’

AAV8 K530R
センス:5’− GCA TCG CTA TGG CAA CAC ACA GAG ACG ACG AGG −3’
アンチセンス:5’− CCT CGT CGT CTC TGT GTG TTG CCA TAG CGA TGC −3’

AAV8 K709R
センス: 5’− GTACACCTCCAACTACTACAGATCTACAAGTGTGGACTTTG −3’
アンチセンス:5’− CAAAGTCCACACTTGTAGATCTGTAGTAGTTGGAGGTGTAC −3’
AAV2プライマー

AAV2 K39R
センス:5’−GCCCGCAGAGCGGCATAGGGACGACAG−3’
アンチセンス:5’−CTGTCGTCCCTATGCCGCTCTGCGGGC−3’

AAV2 K137R
センス:5’−CCTGGTTGAGGAACCTGTTAGGACGGCTCCGG−3’
アンチセンス:5’−CCGGAGCCGTCCTAACAGGTTCCTCAACCAGG−3’

AAV2 K143R
センス:5’−AGACGGCTCCGGGAAAAAGGAGGCCGGTA−3’
アンチセンス:5’−TACCGGCCTCCTTTTTCCCGGAGCCGTCT−3’

AAV2 K161R
センス:5’−CCTCGGGAACCGGAAGGGCGGGCC−3’
アンチセンス:5’−GGCCCGCCCTTCCGGTTCCCGAGG−3’

AAV2 K490R
センス:5’−CCGCCAGCAGCGAGTATCAAGGACATCTGCGG−3’
アンチセンス:5’−CCGCAGATGTCCTTGATACTCGCTGCTGGCGG−3’

AAV2 K527R
センス:5’−CGGCCATGGCAAGCCACAGGGACGATGAA−3’
アンチセンス:5’−TTCATCGTCCCTGTGGCTTGCCATGGCCG−3’

AAV2 K532R
センス:5’−ACAAGGACGATGAAGAAAGGTTTTTTCCTCAGAGCGG−3’
アンチセンス:5’−CCGCTCTGAGGAAAAAACCTTTCTTCATCGTCCTTGT−3’

AAV−rh74プライマー

AAV−rh74 K137R
センス:5’−CTGGTTGAATCGCCGGTTAGGACGGCTCCTG−3’
アンチセンス:5’−GACCAACTTAGCGGCCAATCCTGCCGAGGAC−3’

AAV−rh74 K333R
センス:5’−GCAGAATGAAGGCACCAGGACCATCGCCAATAACC−3’
アンチセンス:5’−GGTTATTGGCGATGGTCCTGGTGCCTTCATTCTGC−3’

AAV−rh74 K530R
センス:5’−GTTGCCATGGCTACCCACAGGGACGACGAA−3’
アンチセンス:5’−TTCGTCGTCCCTGTGGGTAGCCATGGCAAC−3’

AAV−rh74 K552R
センス:5’−GGAAACAGGGAGCTGGAAGAGACAACGTGGACTAT−3’
アンチセンス:5’−ATAGTCCACGTTGTCTCTTCCAGCTCCCTGTTTCC−3’

AAV−rh74 K569R
センス:5’−CTAACCAGCGAGGAAGAAATAAGGACCACCAACCC−3’
アンチセンス:5’−GGGTTGGTGGTCCTTATTTCTTCCTCGCTGGTTAG−3’

AAV−rh74 K691R
センス:5’−CGAGTGGGAGCTGCAGAGGGAGAACAGCAA−3’
アンチセンス:5’−TTGCTGTTCTCCCTCTGCAGCTCCCACTCG−3’

AAV−rh74 K695R
センス:5’−GCTGCAGAAGGAGAACAGCAGACGCTGGAACC−3’
アンチセンス:5’−GGTTCCAGCGTCTGCTGTTCTCCTTCTGCAGC−3’

AAV−rh74 K709R
センス:5’−AGTACACTTCCAACTACTACAGATCTACAAATGTGGACTTTGC−3’
アンチセンス:5’−GCAAAGTCCACATTTGTAGATCTGTAGTAGTTGGAAGTGTACT−3’
表5には、FIXのための肝臓特異的AAV導入遺伝子発現カセットをパッケージ化するのに使用された変異誘発から得られた一連のAAVベクターが示されている。パッケージ化効率は、野生種、非改変型AAV8ベクターで観察されるパッケージ化効率と変わらなかった。
形質導入効率を更に向上させるべく、本明細書に記載されるカプシドタンパク質の任意のものに2、3、4、5、6、7又はそれ以上の個数の改変されたリジン残基を含むカプシド変異体についても、本発明の範囲に含まれる。データはまた、特定の変異が、形質導入効率を大幅に減少させるバリアントをもたらすこともあることを明らかにした。投与するベクターに対する免疫反応に向けられた抗体を中和する又は飽和させるためのおとり(decoy)として機能させるべく、このような変異体を、形質導入効率を向上させるバリアントと組み合わせて使用することができ、所望の導入遺伝子をより効率的に細胞に導入することが可能となる。
図1は、カプシド表面を概略的に示した図である。図2A、2B及び2Cに示したデータからは、AAV8におけるVP1カプシド中のリジン残基を改変することにより、形質導入レベルが変更され、生成される導入遺伝子のレベルが変更されることが示された。図3A、3B及び3Cは、形質導入された細胞におけるHF.IX生成に対する一の又は複数の変異の影響を示している。図3Dでは、変異の組み合わせ、例えば、3リジンのアルギニン残基への変異と、4又は6チロシンのフェニルアラニン残基への変異との組み合わせが、形質導入速度を低下させることが示されている。
AAVリジン変異体を使用したHHL5−B7肝細胞のCTL傷害
本明細書に開示されるAAVリジン変異体のうちの特定のものを使用して形質導入された肝細胞のCTL傷害を評価した。形質導入された肝細胞のCTL傷害を評価するのに、次に記すような材料及び方法を用いた。
ベクター生成
上記で説明したようなトリプルトランスフェクション法(Matsushita、1998年)を使用してHEK−239細胞にてAAVベクターを生成し、塩化セシウム勾配遠心分離法(Ayuso、2010)を用いて精製した。Genemed Synthesis社によって合成されたAAVエピトープペプチドを、100%DMSO中5mg/mlの濃度で再懸濁した。
T細胞のインビトロでの拡大
ヒトPBMC(Cellular Technology LTD)を、解凍し、洗浄し、計数し、3%ヒト血清(Bioreclamation社)、1%Lグルタミン(Gibco社)及び1%ペニシリン/ストレプトマイシン(Gibco社)を含むAIM−Vリンパ球培地(Gibco社)中に、2×106細胞/mlの濃度で再懸濁した。拡張条件それぞれについて、500μlの体積の24ウェルプレート(BD Falcon社)の各ウェル毎に、1x106(500μl)細胞が添加された。2.5μg/mlのβ−2−ミクログロブリン(Lee Biosolutions社)及び10 ng/mlのヒト組換えIL−7(R&D Systems社)と共に、1x106(500μl)の自家照射脾細胞(3000rad)が更に各ウェルにフィーダー細胞として添加した。細胞が最終的に10μg/mlの濃度でAAVペプチド中に存在し、5%CO2中温度37℃で拡大された。
CTLアッセイ
上記に記載したように、CLTアッセイを行った(Pien, 2009年)。
簡単に説明すると、CTL媒介標的の細胞溶解の後、乳酸脱水素酵素(LDH)の放出をCytoTox 96非放射性細胞傷害性アッセイ(Promega)を用いて測定した。4000個のHHL5肝細胞の標的細胞を、Microtest Primariaの平底96ウェルプレート(BDファルコン社)の各ウェルの、血清を含まないDMEM中に播種した。標的細胞は、5000、50,000及び500,000MOIのAAVカプシドで形質導入され、5%CO2で37℃で18時間インキュベートされた。処理及びインキュベーションの後、播種された標的細胞は、上記で説明したように拡大されたエピトープ特異的細胞傷害性Tリンパ球を添加する前に、培地で一回洗浄された。5%CO2で37℃で4時間、10:1のエフェクター‐標的細胞比で、CLTを添加し、室温で30分間酵素基質を使用してインキュベートした後、分光光度計(スペクトラマックス)を用いて490nmでLDHを測定した。
フローサイトメトリー
AAVの形質導入後、GFP発現をフローサイトメトリーにより測定した。
細胞株HHL5又はHuh7からのヒト肝細胞が、10%ウシ胎児血清、1%L−グルタミン(Gibco)及びび1%ペニシリン/ストレプトマイシン(Gibco)を含有するDMEM中に、Primaria Multiwell 24ウェルプレート(BD Falcon)において250,000細胞/ウェルの密度で播種された。細胞は、5000、 50000及び5000000MOIのAAVベクターで形質導入され、5%CO2で37℃で18時間インキュベートされた。インキュベーションの後、細胞を、トリプシン処理し、PBS2%FBSで2回洗浄し、2%パラホルムアルデヒドで固定した。FACSDiva(登録商標)(BD Biosciences)を使用して、FACS Canto II フローサイトメーターでサンプルを取得し、Flowjo(登録商標)ソフトウェア(Treestar)を使用して分析を行った。
CTLアッセイの結果
ウィルス形質導入におけるリジン変異の効果についてさらに試験するために、我々はAAVベクターの機能性をテストするべく我々の研究室によって以前に開発されたインビトロでのCTL媒介細胞傷害性アッセイを利用した(PIEN他)。図4、5及び6に、AAV1及びAAV2形質導入の結果が示されている。図4には、AAV−1カプシドにおけるリジン変異が全て、標的のセルのCLT媒介傷害の減少をもたらしており、リジンの変異が、形質導入における効率的な処理を妨げ、表面抗原の存在につながっていることが示唆される。更に、リジン変異の効果は、相加的であるように思われ、3重及び4重リジン変異体の場合、CLT媒介傷害が最も減少している(図4A及び4B)。AAV−2カプシドへの変異も、同様な効果を示した。図5及び図6を参照されたい。図7は、Rh74変異体が試験された時に得られた形質導入の結果を示す。
本発明では、AAVカプシド上のリジン残基をアルギニン残基へと変異させることにより、AAVの形質導入効率を向上させることができることを発見した。我々の実験では、改変されていないAAVベクターを受けた動物と比較して、形質導入の際に、マウスにおけるヒト第IX因子(FIX)導入遺伝子の発現レベルが高くなる、いくつかのバリアントを特定した。
引用文献
Xie Q, Bu W, Bhatia S, Hare J, Somasundaram T, Azzi A, et al. The atomic structure of adeno−associated virus (AAV−2), a vector for human gene therapy. Proc Natl Acad Sci USA. 2002年;99:10405?10410
High KA, Aubourg P “rAAV human trial experience” Methods Mol Biol.2011年;807:429−57.
Zhong L, Zhao W, Wu J, Li B, Zolotukhin S, Govindasamy L, Agbandje−McKenna M,
Srivastava A. “A dual role of EGFR protein tyrosine kinase signaling in ubiquitination of AAV2 capsids and viral second−strand DNA synthesis.” Mol Ther.2007年7月;15(7):1323−30. Epub 2007年4月17日
Zhong L, Li B, Mah CS, Govindasamy L, Agbandje−McKenna M, Cooper M, Herzog RW, Zolotukhin I, Warrington KH Jr, Weigel−Van Aken KA, Hobbs JA, Zolotukhin S, Muzyczka N, Srivastava A. “Next generation of adeno−associated virus 2 vectors: point mutations in tyrosines lead to high−efficiency transduction at lower doses.” Proc Natl Acad Sci U S A. 2008年1月3日;105(22):7827−32.
Thrower JS, Hoffman L, Rechsteiner M, and Pickart C M “Recognition of the polyubiquitin proteolytic signal.” EMBO J. 2000年1月4日; 19(1): 94?102.
Bedford L, Lowe J, Dick LR, Mayer RJ, Brownell JE. “Ubiquitin−like protein conjugation and the ubiquitin?proteasome system as drug targets” Nat Rev Drug Discov.2011年1月;10(1):29−46
Peng, J; Schwartz; Elias; Thoreen; Cheng; Marsischky; Roelofs; Finley et al (Aug 2003). “A proteomics approach to under
standing protein ubiquitination”. Nature
biotechnology 21 (8): 921-6.
Radivojac, P., Vacic, V., Haynes, C., Cocklin, R. R., Mohan, A., Heyen, J. W., Goebl, M. G., and Iakoucheva, L. M. Identification, Analysis and Prediction of Protein Ubiquitination Sites. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 78(2):365−380.(2010年)
本発明の好適な実施形態の幾つかが具体的に例示されたが、本発明はかかる実施形態に限定されるものではない。添付の特許請求の範囲に記載される本発明から逸脱することなく本発明の精神内において様々な変形が可能である。

Claims (23)

  1. の又は複数のリジン置換を有するVP1カプシドタンパク質を含むアデノ随伴ウィルス(AAV)ベクターであって、
    前記一の又は複数のリジン置換は、AAV1 VP1カプシドタンパク質のK137Rの置換、K459Rの置換、K528Rの置換、K533Rの置換、K707Rの置換、及び、K137R/K459R/K533Rの置換からなる群から選択され、
    前記ベクターは更に、AAV末端逆位繰り返し配列及び異種核酸配列を含むミニ遺伝子を含み、
    前記異種核酸配列は、宿主細胞における当該異種核酸配列からの産物の発現を指令する制御配列に作動可能に結合され、
    前記リジン置換は、前記カプシドタンパク質のユビキチン化を阻害するのに有効であり、それによって前記AAVベクターの標的細胞への形質導入を、前記一の又は複数のリジン置換を有しないAAV1 VP1カプシドタンパク質を含むAAVベクターよりも増加させる、AAVベクター。
  2. の又は複数のリジン置換を有するVP1カプシドタンパク質を含むアデノ随伴ウィルス(AAV)ベクターであって、
    前記一の又は複数のリジン置換は、AAV2 VP1カプシドタンパク質のK137Rの置換、K527Rの置換、及び、K532Rの置換からなる群から選択され、
    前記ベクターは更に、AAV末端逆位繰り返し配列及び異種核酸配列を含むミニ遺伝子を含み、
    前記異種核酸配列は、宿主細胞における当該異種核酸配列からの産物の発現を指令する制御配列に作動可能に結合され、
    前記リジン置換は、前記カプシドタンパク質のユビキチン化を阻害するのに有効であり、それによって前記AAVベクターの標的細胞への形質導入を、前記一の又は複数のリジン置換を有しないAAV2 VP1カプシドタンパク質を含むAAVベクターよりも増加させる、AAVベクター。
  3. の又は複数のリジン置換を有するVP1カプシドタンパク質を含むアデノ随伴ウィルス(AAV)ベクターであって、
    前記一の又は複数のリジン置換は、AAV8 VP1カプシドタンパク質のK137Rの置換、K259Rの置換、K333Rの置換、K530Rの置換、K569Rの置換、K668Rの置換、及び、K(137/333/530)Rの置換からなる群から選択され、
    前記ベクターは更に、AAV末端逆位繰り返し配列及び異種核酸配列を含むミニ遺伝子を含み、
    前記異種核酸配列は、宿主細胞における当該異種核酸配列からの産物の発現を指令する制御配列に作動可能に結合され、
    前記リジン置換は、前記カプシドタンパク質のユビキチン化を阻害するのに有効であり、それによって前記AAVベクターの標的細胞への形質導入を、前記一の又は複数のリジン置換を有しないAAV−8 VP1カプシドタンパク質を含むAAVベクターよりも増加させる、AAVベクター。
  4. の又は複数のリジン置換を有するVP1カプシドタンパク質を含むアデノ随伴ウィルス(AAV)ベクターであって、
    前記一の又は複数のリジン置換は、AAV−rh74 VP1カプシドタンパク質のK(137/333/530)Rの置換、K(137/333/530/552)Rの置換、K(137/259/333/530/552/569)R+G195A+L199V+S201P+G202Nの置換、K(137/259/333/530/552/569)R+G195A+L199V+S201P+G202N+K38Rの置換、K(137/259/333/530/552/569)R+G195A+L199V+S201P+G202N+K51Rの置換、K(137/259/333/530/552/569)R+G195A+L199V+S201P+G202N+K61Rの置換、及び、K(137/259/333/530/552/569)R+G195A+L199V+S201P+G202N+K77Rの置換からなる群から選択され、
    前記ベクターは更に、AAV末端逆位繰り返し配列及び異種核酸配列を含むミニ遺伝子を含み、
    前記異種核酸配列は、宿主細胞における当該異種核酸配列からの産物の発現を指令する制御配列に作動可能に結合され、
    前記リジン置換は、前記カプシドタンパク質のユビキチン化を阻害するのに有効であり、それによって前記AAVベクターの標的細胞への形質導入を、前記一の又は複数のリジン置換を有しないAAV−rh74 VP1カプシドタンパク質を含むAAVベクターよりも増加させる、AAVベクター。
  5. 前記異種核酸配列の発現産物は、治療用ペプチド又は治療用核酸である、請求項1から4の何れか一項に記載のAAVベクター。
  6. 前記治療用ペプチドは、第VIII因子、第IX因子又はこれらの機能的断片からなる群から選択される凝固因子である、請求項5に記載のAAVベクター。
  7. 前記異種核酸配列の発現産物は、IgG、IgM、IgA、IgD、IgE、キメラ免疫グロブリン、ヒト化抗体又は一本鎖抗体である、請求項1〜4のいずれか1項に記載のAAVベクター。
  8. 前記異種核酸配列の前記発現産物は、キメラ免疫グロブリンである請求項7に記載のAAVベクター。
  9. 前記異種核酸配列の発現産物は、一本鎖抗体である請求項1〜4のいずれか1項に記載のAAV8ベクター。
  10. 前記発現産物は、抗ウィルス性RNAiである、請求項1〜4のいずれか1項に記載のAAVベクター。
  11. 阻害性RNAが、HCV感染及びHCV複製を阻害するのに有効である請求項10に記載のAAVベクター。
  12. 阻害性RNAが、真核生物の標的遺伝子の発現を阻害するのに有効である請求項10に記載のAAVベクター。
  13. 前記異種核酸配列の発現産物は、疾患の経過を調節することができるサイトカインである請求項1〜4のいずれか1項に記載のAAVベクター。
  14. 前記異種核酸配列の発現産物は、一対のジンクフィンガーヌクレアーゼである請求項1〜4のいずれか1項に記載のAAVベクター。
  15. 2つ、3つ又は4つのリジン置換を含む、請求項1〜4のいずれか1項に記載のAAVベクター。
  16. 請求項1〜4のいずれか1項に記載の前記AAVベクター及びその生理学的に適合する担体を含む医薬組成物。
  17. 請求項1〜4のいずれか1項に記載の前記AAVベクターを含む細胞培養物。
  18. 血液、中枢神経系、代謝、筋肉、眼の病気若しくは疾患、又は、感染性の病気若しくは遺伝性の病気の治療に使用するための請求項16に記載の前記医薬組成物。
  19. 前記異種核酸配列の発現産物は第IX因子である、請求項18に記載の医薬組成物。
  20. 請求項1〜4のいずれか1項に記載の前記AAVベクター及びその生理学的に適合する担体を含む医薬組成物。
  21. 血液、中枢神経系、代謝、筋肉、眼の病気若しくは疾患、又は、感染性の病気若しくは遺伝性の病気の治療において使用するためのものであり、対象の細胞に異種核酸配列の発現産物を送達するためのものである、請求項20に記載の医薬組成物
  22. 前記異種核酸配列の発現産物は、第IX因子である、請求項21に記載の医薬品組成物。
  23. 前記異種核酸配列の発現産物は、第VIII因子である、請求項18又は21に記載の医薬品組成物。

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Families Citing this family (102)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ES2525067T3 (es) * 2005-04-07 2014-12-17 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Método de incremento de la función de un vector de AAV
US9725485B2 (en) * 2012-05-15 2017-08-08 University Of Florida Research Foundation, Inc. AAV vectors with high transduction efficiency and uses thereof for gene therapy
PL2191001T3 (pl) 2007-04-09 2017-01-31 University Of Florida Research Foundation, Inc. Kompozycje wektora RAAV mające białka kapsydu zmodyfikowane tyrozyną i sposoby ich zastosowania
US8734809B2 (en) 2009-05-28 2014-05-27 University Of Massachusetts AAV's and uses thereof
EA027410B1 (ru) 2011-04-29 2017-07-31 Селекта Байосайенсиз, Инк. Наноносители, вызывающие иммунную толерантность, для снижения ответной реакции цитотоксических t-лимфоцитов
PT2839014T (pt) 2012-04-18 2021-03-19 Childrens Hospital Philadelphia ¿composição e métodos para transferência de genes altamente eficiente com a utilização de variantes de capsídeo de aav
US10294281B2 (en) 2012-05-15 2019-05-21 University Of Florida Research Foundation, Incorporated High-transduction-efficiency rAAV vectors, compositions, and methods of use
CA2907799A1 (en) * 2013-05-31 2014-12-04 The Regents Of The University Of California Adeno-associated virus variants and methods of use thereof
WO2015013313A2 (en) * 2013-07-22 2015-01-29 The Children's Hospital Of Philadelphia Variant aav and compositions, methods and uses for gene transfer to cells, organs and tissues
EP3049527A4 (en) 2013-09-26 2017-08-16 University of Florida Research Foundation, Inc. Synthetic combinatorial aav capsid library for targeted gene therapy
GB201403684D0 (en) * 2014-03-03 2014-04-16 King S College London Vector
EP3113787B1 (en) * 2014-03-04 2019-12-04 University of Florida Research Foundation, Inc. Improved raav vectors and methods for transduction of photoreceptors and rpe cells
WO2015191508A1 (en) 2014-06-09 2015-12-17 Voyager Therapeutics, Inc. Chimeric capsids
CA2957737A1 (en) 2014-09-07 2016-03-10 Selecta Biosciences, Inc. Methods and compositions for attenuating gene expression modulating anti-viral transfer vector immune responses
CN107073051B (zh) 2014-10-21 2021-08-24 马萨诸塞大学 重组aav变体及其用途
MX2017005834A (es) 2014-11-05 2017-11-17 Voyager Therapeutics Inc Polinucleotidos aad para el tratamiento de la enfermedad de parkinson.
GB201420139D0 (en) 2014-11-12 2014-12-24 Ucl Business Plc Factor IX gene therapy
CN112375760A (zh) 2014-11-14 2021-02-19 沃雅戈治疗公司 调节性多核苷酸
AU2015346162B2 (en) 2014-11-14 2022-02-10 Voyager Therapeutics, Inc. Compositions and methods of treating amyotrophic lateral sclerosis (ALS)
WO2016094783A1 (en) 2014-12-12 2016-06-16 Voyager Therapeutics, Inc. Compositions and methods for the production of scaav
US20180030096A1 (en) 2015-02-03 2018-02-01 University Of Florida Research Foundation, Inc. Recombinant aav1, aav5, and aav6 capsid mutants and uses thereof
US10648000B2 (en) 2015-02-16 2020-05-12 University Of Florida Research Foundation, Incorporated rAAV vector compositions, methods for targeting vascular endothelial cells and use in treatment of type I diabetes
WO2016134337A1 (en) * 2015-02-19 2016-08-25 University Of Florida Research Foundation, Inc. Site-specific integrating recombinant aav vectors for gene therapy and improved production methods
JP6519080B2 (ja) * 2015-06-22 2019-05-29 ライオン株式会社 繊維製品用抗ウイルス組成物
KR102415896B1 (ko) 2015-06-23 2022-06-30 더 칠드런스 호스피탈 오브 필라델피아 변형된 인자 ix, 및 세포, 기관 및 조직으로 유전자를 전달하기 위한 조성물, 방법 및 용도
PL3356390T3 (pl) 2015-09-28 2021-07-05 The University Of North Carolina At Chapel Hill Sposoby i kompozycje dla wektorów wirusowych unikających przeciwciał
EP4316512A3 (en) 2015-10-28 2024-04-24 The Trustees of The University of Pennsylvania Intrathecal administration of adeno-associated-viral vectors for gene therapy
CA3006569A1 (en) 2015-12-02 2017-06-08 Voyager Therapeutics, Inc. Assays for the detection of aav neutralizing antibodies
KR102598289B1 (ko) * 2016-04-16 2023-11-06 유니버시티 오브 플로리다 리서치 파운데이션, 인코포레이티드 바큘로바이러스 시스템-생산된 재조합 아데노-연관 바이러스의 생물학적 효력을 증진시키는 방법
WO2017189959A1 (en) 2016-04-29 2017-11-02 Voyager Therapeutics, Inc. Compositions for the treatment of disease
EP3448987A4 (en) 2016-04-29 2020-05-27 Voyager Therapeutics, Inc. COMPOSITIONS FOR THE TREATMENT OF DISEASES
CN115925999A (zh) 2016-05-13 2023-04-07 4D分子治疗有限公司 腺相关病毒变体衣壳和其使用方法
RU2764587C2 (ru) 2016-05-18 2022-01-18 Вояджер Терапьютикс, Инк. Способы и композиции для лечения хореи гентингтона
SG11201809699XA (en) 2016-05-18 2018-12-28 Voyager Therapeutics Inc Modulatory polynucleotides
TN2019000047A1 (en) * 2016-08-15 2020-07-15 Genzyme Corp Methods for detecting aav
US11298041B2 (en) 2016-08-30 2022-04-12 The Regents Of The University Of California Methods for biomedical targeting and delivery and devices and systems for practicing the same
US11578340B2 (en) 2016-10-13 2023-02-14 University Of Massachusetts AAV capsid designs
KR20190104194A (ko) 2017-01-07 2019-09-06 셀렉타 바이오사이언시즈, 인크. 합성 나노담체에 커플링된 면역억제제의 패턴화된 투여
CN110462037A (zh) * 2017-01-30 2019-11-15 学校法人日本医科大学 腺相关病毒(aav)衣壳蛋白的突变体
CA3114549A1 (en) * 2017-02-21 2018-08-30 University Of Florida Research Foundation, Incorporated Modified aav capsid proteins and uses thereof
JOP20190200A1 (ar) 2017-02-28 2019-08-27 Univ Pennsylvania تركيبات نافعة في معالجة ضمور العضل النخاعي
CA3054711A1 (en) 2017-03-15 2018-09-20 The University Of North Carolina At Chapel Hill Polyploid adeno-associated virus vectors and methods of making and using the same
US10550405B2 (en) 2017-03-15 2020-02-04 The University Of North Carolina At Chapel Hill Rational polyploid adeno-associated virus vectors and methods of making and using the same
EP3601367A4 (en) 2017-03-30 2020-09-16 The University of Queensland CHEMERICAL MOLECULES AND ASSOCIATED USES
SG11201909868YA (en) 2017-05-05 2019-11-28 Voyager Therapeutics Inc Compositions and methods of treating huntington's disease
JP2020518258A (ja) 2017-05-05 2020-06-25 ボイジャー セラピューティクス インコーポレイテッドVoyager Therapeutics,Inc. 筋萎縮性側索硬化症(als)治療組成物および方法
JOP20190269A1 (ar) 2017-06-15 2019-11-20 Voyager Therapeutics Inc بولي نوكليوتيدات aadc لعلاج مرض باركنسون
CN111132626B (zh) 2017-07-17 2024-01-30 沃雅戈治疗公司 轨迹阵列引导系统
US20210228738A1 (en) 2017-07-17 2021-07-29 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Compositions and methods for increasing or enhancing transduction of gene therapy vectors and for removing or reducing immunoglobulins
WO2019060454A2 (en) 2017-09-20 2019-03-28 4D Molecular Therapeutics Inc. CAPSID VARIANT ADENO-ASSOCIATED VIRUSES AND METHODS OF USE
JP7427584B2 (ja) 2017-10-13 2024-02-05 セレクタ バイオサイエンシーズ インコーポレーテッド 抗ウイルス導入ベクターigm応答を減弱化するための方法および組成物
JP2021502060A (ja) 2017-10-16 2021-01-28 ボイジャー セラピューティクス インコーポレイテッドVoyager Therapeutics,Inc. 筋萎縮性側索硬化症(als)の治療
WO2019079242A1 (en) 2017-10-16 2019-04-25 Voyager Therapeutics, Inc. TREATMENT OF AMYOTROPHIC LATERAL SCLEROSIS (ALS)
ES2946747T3 (es) 2017-11-27 2023-07-25 4D Molecular Therapeutics Inc Variantes de cápsides de virus adenoasociado y su utilización para inhibir la angiogénesis
WO2019126356A1 (en) 2017-12-19 2019-06-27 The University Of North Carolina At Chapel Hill Methods and compositions for delivery of viral vectors across the blood-brain barrier
US10610606B2 (en) 2018-02-01 2020-04-07 Homology Medicines, Inc. Adeno-associated virus compositions for PAH gene transfer and methods of use thereof
WO2019161365A1 (en) 2018-02-19 2019-08-22 Homology Medicines, Inc. Adeno-associated virus compositions for restoring f8 gene function and methods of use thereof
WO2019165436A1 (en) 2018-02-26 2019-08-29 Antolrx Tolerogenic liposomes and methods of use thereof
EP3758724A4 (en) * 2018-02-27 2022-07-06 The Trustees of The University of Pennsylvania NOVEL ADENO-ASSOCIATED VIRUS (AAV) VECTORS, AAV VECTORS WITH REDUCED CAPSID DEAMIDATION AND USES THEREOF
EP3765624A4 (en) * 2018-03-16 2022-05-25 Research Institute at Nationwide Children's Hospital INCREASE IN TISSUE-SPECIFIC GENE DELIVERY BY CAPSID MODIFICATION
JP7406677B2 (ja) 2018-04-03 2023-12-28 ギンコ バイオワークス インコーポレイテッド 抗体を回避するウイルスベクター
CN112004925A (zh) 2018-04-05 2020-11-27 吉尼松公司 具有降低的肝向性的AAV9和AAVrh74的杂合重组腺相关病毒血清型
WO2019210267A2 (en) * 2018-04-27 2019-10-31 Spark Therapeutics, Inc. Engineered aav capsids with increased tropism and aav vectors comprising the engineered capsids and methods of making and using same
KR20210021310A (ko) * 2018-05-16 2021-02-25 스파크 테라퓨틱스, 인코포레이티드 코돈-최적화된 산 알파-글루코시다제 발현 카세트 및 이를 사용하는 방법
CA3106639A1 (en) 2018-07-16 2020-01-23 Selecta Biosciences, Inc. Methods and compositions of otc constructs and vectors
JP2021530571A (ja) 2018-07-16 2021-11-11 セレクタ バイオサイエンシーズ インコーポレーテッドSelecta Biosciences, Inc. Mmaコンストラクトおよびベクターの方法および組成物
US11702673B2 (en) 2018-10-18 2023-07-18 University Of Florida Research Foundation, Incorporated Methods of enhancing biological potency of baculovirus system-produced recombinant adeno-associated virus
WO2020174369A2 (en) 2019-02-25 2020-09-03 Novartis Ag Compositions and methods to treat bietti crystalline dystrophy
CR20210444A (es) 2019-02-25 2021-11-02 Novartis Ag Composiciones y métodos para tratar distrofia cristalina de bietti
CA3138525A1 (en) 2019-04-28 2020-11-05 Selecta Biosciences, Inc. Methods for treatment of subjects with preexisting immunity to viral transfer vectors
US20200390718A1 (en) 2019-05-28 2020-12-17 Selecta Biosciences, Inc. Methods and compositions for attenuated anti-viral transfer vector immune response
RU2751592C2 (ru) 2019-08-22 2021-07-15 Общество С Ограниченной Ответственностью "Анабион" Выделенный модифицированный белок VP1 капсида аденоассоциированного вируса 5 серотипа (AAV5), капсид и вектор на его основе
WO2021067598A1 (en) 2019-10-04 2021-04-08 Ultragenyx Pharmaceutical Inc. Methods for improved therapeutic use of recombinant aav
CA3157700A1 (en) 2019-10-17 2021-04-22 Stridebio, Inc. Adeno-associated viral vectors for treatment of niemann-pick disease type c
CA3165911A1 (en) 2020-01-03 2021-07-08 Sarepta Therapeutics, Inc. Methods for analyzing aav capsid proteins
TW202140791A (zh) 2020-01-13 2021-11-01 美商霍蒙拉奇醫藥公司 治療苯酮尿症之方法
BR112022015921A2 (pt) 2020-02-14 2022-10-04 Ultragenyx Pharmaceutical Inc Terapia gênica para tratar o transtorno de deficiência de cdkl5
JP2023518415A (ja) 2020-03-19 2023-05-01 ウルトラジェニックス ファーマシューティカル インコーポレイテッド 組換えaavにおいてcapおよびrep配列の逆パッケージングを低減するための組成物および方法
EP4127189A1 (en) 2020-03-31 2023-02-08 Ultragenyx Pharmaceutical Inc. Gene therapy for treating propionic acidemia
KR20230085170A (ko) 2020-10-15 2023-06-13 에프. 호프만-라 로슈 아게 동시 유전자 활성화를 위한 핵산 구조체
CA3197730A1 (en) 2020-10-15 2022-04-21 F. Hoffman-La Roche Ag Nucleic acid constructs for va rna transcription
AU2022206197A1 (en) 2021-01-05 2023-07-13 Selecta Biosciences, Inc. Viral vector dosing protocols
BR112023021495A2 (pt) * 2021-04-23 2023-12-19 Univ Florida Vetores aavrh74 para terapia gênica de distrofias musculares
WO2023019168A1 (en) 2021-08-11 2023-02-16 Ultragenyx Pharmaceutical Inc. Compositions and methods for treating a muscular dystrophy
AR126840A1 (es) 2021-08-20 2023-11-22 Llc «Anabion» Proteína de la cápside vp1 modificada aislada del virus adeno-asociado de serotipo 5 (aav5), cápside y vector basado en esta
AR126839A1 (es) 2021-08-20 2023-11-22 Llc «Anabion» Proteína de la cápside vp1 modificada aislada del virus adeno-asociado de serotipo 9 (aav9), cápside y vector basado en esta
AU2022328531A1 (en) 2021-08-20 2024-03-14 Joint Stock Company "Biocad" Method of obtaining a modified adeno-associated virus capsid
US20230086710A1 (en) * 2021-09-14 2023-03-23 California Institute Of Technology Aav capsid variants
CA3235269A1 (en) 2021-10-12 2023-04-20 Cartesian Therapeutics, Inc. Viral vector dosing protocols
WO2023064367A1 (en) 2021-10-12 2023-04-20 Selecta Biosciences, Inc. Methods and compositions for attenuating anti-viral transfer vector igm responses
WO2023086615A1 (en) 2021-11-14 2023-05-19 Selecta Biosciences, Inc. Multiple dosing with viral vectors
CN116554278A (zh) * 2022-01-30 2023-08-08 上海玮美基因科技有限责任公司 变异型腺相关病毒及其在疾病治疗中的应用
WO2023172491A1 (en) 2022-03-07 2023-09-14 Ultragenyx Pharmaceutical Inc. Modified batch aav production systems and methods
US20230357437A1 (en) 2022-03-09 2023-11-09 Selecta Biosciences, Inc. Immunosuppressants in combination with anti-igm agents and related dosing
WO2023198685A1 (en) 2022-04-13 2023-10-19 F. Hoffmann-La Roche Ag Method for determining aav genomes
WO2023220287A1 (en) * 2022-05-11 2023-11-16 The Children's Hospital Of Philadelphia Adeno-associated viral vectors for targeting deep brain structures
WO2023227438A1 (en) 2022-05-23 2023-11-30 F. Hoffmann-La Roche Ag Raman-based method for the differentiation of aav particle serotype and aav particle loading status
WO2023232922A1 (en) 2022-06-03 2023-12-07 F. Hoffmann-La Roche Ag Method for producing recombinant aav particles
WO2024013239A1 (en) 2022-07-14 2024-01-18 F. Hoffmann-La Roche Ag Method for producing recombinant aav particles
WO2024036324A1 (en) 2022-08-11 2024-02-15 Selecta Biosciences, Inc. Compositions and methods related to immunoglobulin proteases and fusions thereof
WO2024038002A1 (en) 2022-08-15 2024-02-22 F. Hoffmann-La Roche Ag Prevention or mitigation of adverse effects related to recombinant viral vectors
WO2024056561A1 (en) 2022-09-12 2024-03-21 F. Hoffmann-La Roche Ag Method for separating full and empty aav particles

Family Cites Families (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA1202962A (en) 1982-10-19 1986-04-08 David P. Clifford Substituted n-phenyl-n'-benzoyl ureas and their use as insecticides and acaricides
US4501729A (en) 1982-12-13 1985-02-26 Research Corporation Aerosolized amiloride treatment of retained pulmonary secretions
US4683195A (en) 1986-01-30 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences
US4965188A (en) 1986-08-22 1990-10-23 Cetus Corporation Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences using a thermostable enzyme
US6127525A (en) * 1995-02-21 2000-10-03 Cornell Research Foundation, Inc. Chimeric adenoviral coat protein and methods of using same
WO1998010088A1 (en) 1996-09-06 1998-03-12 Trustees Of The University Of Pennsylvania An inducible method for production of recombinant adeno-associated viruses utilizing t7 polymerase
EP1486567A1 (en) * 2003-06-11 2004-12-15 Deutsches Krebsforschungszentrum Stiftung des öffentlichen Rechts Improved adeno-associated virus (AAV) vector for gene therapy
JP4888876B2 (ja) 2003-06-13 2012-02-29 田平 武 アルツハイマー病の治療のための組換えアデノ随伴ウィルスベクター
ES2525067T3 (es) * 2005-04-07 2014-12-17 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Método de incremento de la función de un vector de AAV
ES2400235T3 (es) 2006-04-28 2013-04-08 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Método de producción escalable de AAV
CA2793633A1 (en) * 2010-03-29 2011-10-13 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Pharmacologically induced transgene ablation system
US9434928B2 (en) 2011-11-23 2016-09-06 Nationwide Children's Hospital, Inc. Recombinant adeno-associated virus delivery of alpha-sarcoglycan polynucleotides
PT2839014T (pt) 2012-04-18 2021-03-19 Childrens Hospital Philadelphia ¿composição e métodos para transferência de genes altamente eficiente com a utilização de variantes de capsídeo de aav

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