JP5990177B2 - 物質を音響的に処理するためのシステム - Google Patents
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Description
図1及び図2は、音響エネルギー源2によって生成された集束音響エネルギーが、チャンバの音響窓11を通り、チャンバ10の試料物質が位置する内部容積12内に入る場合の、チャンバ10の一実施形態を描写する。以下にさらに詳細に説明されるように、音響処理システム1は、(例えば1つ又は複数のセンサ、ユーザ入力装置等からの)制御情報を受信し、それに応答して音響エネルギー源2及び/又は他のシステム部品の動作を制御する制御装置20(例えば、適切にプログラムされた汎用コンピュータ又は他のデータ処理装置を含む)を含み得る。試料物質は、入口13を介して内部容積12内に供給され、出口14を介して容積12から除去される。入口及び出口は様々な方法で配置されてよく、この実施形態では、入口13及び出口14は、それぞれチャンバ10に接続された導管を含む。いくつかの実施形態では、入口及び/又は出口は、例えば流れが断続的であり得るにもかかわらず物質の流れが常に入口から出口であるように、逆止弁、一方向弁、電子制御弁、又は、流れが所望の方法で発生することを保証することを助ける他の配置を含み得る。内部容積12は、処理対象物質に対して適切なサイズにされて形成されてよく、例えば、いくつかの音響処理アプリケーション(殺菌等)は、比較的小さな容積の物質が比較的小さな容積内で処理されれば効果的に機能し得るが、他のアプリケーション(混合等)は、内部容積12に大きな容積を使用することにより、より良い結果を生じ得る。内部容積12は様々な形状又は他の構成特徴を有することができ、例えば、内部容積12は、垂直壁によって画定されてよく、円錐形状を有してよく、湾曲形状を有してよい等である。また、チャンバ10は、処理対象物質を含む内部容積を併せて画定する多数の部品(上側の部材、下側の音響的に透明な部材、本体など)から形成されることができる。代替的に、チャンバ10は、単一の一体型ピースとして、又は、他の手段によって形成され得る。
いくつかの実施形態では、音響エネルギー源2は、例えば超音波変換器又は「超音波」周波数範囲内の音響波を生成する他の変換器を含み得る。超音波は、可聴周波数を超えた周波数(通常は約20,000Hzすなわち20kHz)で始まり、メガヘルツ(MHz)波の領域へ続く。水中の音速は毎秒約1000メートルであり、したがって水中の1000Hzの波の波長は約1メートルである。これは通常、非集束場状況では使用可能であるが直径1センチメートル未満の個々の領域上への特定の集束にとっては余りに長い。20kHzでは、波長は約5cmであり、これは比較的小さな処理容器内では有効である。試料と容器の容積とに依存して、好ましい周波数はより高くてもよく、例えばそれぞれ約1.0、0.1、0.01cmの波長を有する約100kHz、約1MHz、又は約10MHzであり得る。対照的に、音波溶接を含む従来の超音波処理に関しては、周波数は通常約数十kHzであり、撮像に関しては、周波数は通常約1MHz〜最大約20MHzである。砕石術では、パルスの繰り返し率はかなり遅くヘルツ範囲内で測定されるが、生成されるパルスの鋭さが、実効パルス波長すなわちこの場合最大約100〜300MHzすなわち0.1〜0.3ギガヘルツ(GHz)の周波数成分を有するパルス立ち上り時間を与える。
チャンバ10内で音響エネルギーによって物質を処理するための1つの処理プロトコルは、所望の効果を達成するために試料運動及び配置と組み合わされた可変音響波形を含むことができる。変換器の音響波形は、以下のものを含む多くの効果を有し得る。例えばキャビテーション気泡の崩壊により誘起される流れであるキャビテーションによる細胞内及び細胞近傍の音響マイクロストリーミングと、流体槽の非直線的特性による衝撃波と、キャビテーション気泡による衝撃波と、試料の加熱、試料容器の加熱及び/又は音響ストリーミングによる対流熱伝達に至る熱効果と、せん断及び音圧による焦点ゾーンからの試料物質の偏向と、音圧により誘起される流れである音響ストリーミングによる混合と、を引き起こす流動効果と、化学作用と、である。集束音波の波形は、単一衝撃波パルス、一系列の個々の衝撃波パルス、それぞれがいくつかのサイクルを有する一系列の衝撃波バースト、又は連続波形である可能性がある。入射波形は、集束セラミック圧電超音波変換器(focused ceramic piezoelectric ultrasonic transducer)などの単一素子により、又はそれらの経路が焦点に集束する素子の配列により、のいずれかにより直接集束させることができる。その代わりに、多数の処理ゾーン、容器、又は井戸に対し超音波処理を施すために多数の焦点を生成することができる。追加的に、処理チャンバ10への又は処理チャンバ10からの試料物質の流れは音響効果と相互作用することができ、音響ストリーミングは望ましい方法でこの試料流れを強化するために修正することができる。
試料の可視監視
試料の処理を最適化するために光学的又は映像的な検出及び解析を採用することができる。例えば、生体組織の懸濁液中では、混合物の粘度は、処理によって及び/又は溶液中への巨大分子の遊離による粒子の減少によって処理中に増加し得る。処理中の試料の映像解析は、処理プロトコルによって引き起こされる混合の自動評価を可能にする。プロトコルは、この評価の結果としてより大きな混合を促進するために処理中に変更され得る。映像データは、処理過程を制御するコンピュータ制御システム(すなわち制御装置20の一部)により取得され解析され得る。スペクトル励起、吸収、蛍光、放射、スペクトル解析など他の光学測定がまた、チャンバ10内、流路内、又はチャンバ10の上流又は下流にかかわらず、試料の処理を監視するために使用されることができる。レーザービームは例えば、位置合わせのために及び現在の試料位置を示すために使用されることができる。いくつかの実施形態では、可視又は光学的な検知は、反応チャンバ内の窓を通して行うことができる。この窓は、チャンバ10の上側また下側の窓、容器側面自体に一体化された可視窓、又は輸送チューブ又は試料貯蔵槽に一体化された窓である可能性がある。
いくつかのアプリケーションは、処理中の試料の温度が処理中に管理されて制御されることを必要とする。例えば、多くの生体試料は、処理中に4℃を超えて加熱されてはならない。他のアプリケーションは、処理中に試料が一定の高温に維持されることを必要とする。超音波処理プロトコルは以下のいくつかの方法で試料の温度に影響を及ぼす:試料が音響エネルギーを吸収して熱に変換する;試料処理チャンバが、音響エネルギーを吸収して熱に変換し、この熱が、試料を加熱する可能性がある;音響ストリーミングが、試料処理チャンバ及び結合媒体内で成長し、試料処理チャンバと結合媒体との間の対流熱伝達を起こさせる。
いくつかの用途では、キャビテーションを生じることなくできるだけ多くのエネルギーで試料を処理することが好ましいかもしれない。この結果はキャビテーションを抑制することにより達成することができる。キャビテーションは、処理チャンバを、大気圧を超えて加圧して、いかなる負圧も音響波の希薄化段階中に成長しない点まで加圧する(「超過気圧」としてしばしば知られる)ことにより抑制することができる。キャビテーションのこの抑制は、所望の効果が生細胞を維持する一方で細胞膜を開くことである細胞形質転換等の用途では有益である。他の用途では、キャビテーションを強化することが望ましいかもしれない。これらの用途では、「負の」超過気圧又は真空を焦点ゾーンの領域に与えることができる。
キャビテーションを検出するための様々な方法が採用され得る。例えば、音響放射、光学的散乱、高速度写真、機械的損傷、音響化学を利用することができる。温度の監視について上述したように、キャビテーション検出からの情報は、情報に応じて試料の音響エネルギーへの露出を選択的に制御する出力を生成するためにシステムにより使用することができる。キャビテーションを監視するためのこれらの方法のそれぞれについて、以下により詳細に説明する。
A.生体物質
多くの生体物質を本発明に従って処理することができる。例えば、このような処理用物質としては、限定するものではないが、根端等の成長植物組織、分裂組織、カルス、骨、酵母及び強靭な細胞壁を有する他の微生物、寒天プレート上又は培養基内の細菌細胞及び/又は培養物、幹又は血液細胞、不死化細胞株からのハイブリドーマと他の細胞、及び胚が挙げられる。追加的に、血清及びタンパク質製剤等の他の生体物質は、殺菌を含む本発明の処理により処理することができる。
多くの結合反応は本発明による処理により強化することができる。結合反応は、交配又は他の非共有結合により2つ以上の分子(例えば2つの核酸分子)を結合することに関与する。結合反応は、例えば、1つのヌクレオチド分子がプライマであり他方が複製すべき基質分子であるポリメラーゼ連鎖反応等の反応において、特定の染色反応等の結合を検出する分析において、又は、免疫学的検定などの、抗体と抗体が結合する分子とに関与する結合相互作用において、見出される。反応はまた、基質と配位子との結合に関与することができる。例えば、抗体又は受容体等の基質は、エピトープ、配位子、他の分子の浄化又は分離技術に使用される支持体表面上で固定化することができる。
有機及び無機物質は、本発明の方法に従って制御音響パルスにより処理することができる。音響パルスは、特にフィードバック制御形態下で又は多数試料の配列において固体物質を変化させるために使用され得る。生体試料と同様に、配列内の個々の有機及び無機試料は、実験チャンバ環境とほぼ隔絶した状態で処理することができる。その物理的完全性を変えることに加えて、物質は、液体及びガス等の溶媒流体中に溶解されるか、又は溶媒により抽出されることができる。例えば、溶媒中のポリマーの溶解は撹拌することなく非常に遅くなる可能性があるが、多くの試料を現行手法により撹拌することは困難であり、試料間の相互汚染の可能性を高める。しかし、試料間の相互汚染無しの多くの試料の撹拌は本発明の装置及び方法により達成されることができる。
A.細胞接近性を変えること
超音波処理器は、おおよそ20KHzの周波数を使用することにより細胞を分裂させることができる。加熱によって、及び、音波と試料中の小さな気泡との相互作用であるキャビテーションによって、超音波が細胞に影響を与える、ことができる2つの方法があると一般には考えられている。加熱は、主として媒体によって又は容器による音響エネルギーの吸収によって発生する。希薄水溶液系に関しては、それは加熱の主供給源である容器による吸収である。加熱は、本明細書に記載されるようにいくつかの処理用途では望ましくない。音波の圧縮に伴う加熱と希薄化に伴う冷却は、強い音に対しても比較的小さい。
上述の細胞の接近性を変える本方法の変形形態では、媒体中の制御パルスは、生体物質を含む試料を処理して生体物質の一部又は一部群を抽出するために使用されることができる。パルスは、植物細胞壁等の支持マトリックス、又は、骨若しくはコラーゲン等の細胞外マトリックス、又は生体物質中の剛性又は浸透性が異なる物質、と優先的に相互作用するように特に適合化され、これによりこのようなマトリクス又は物質のバリア機能を小さくするか除去する。これらのパルスは衝撃波により又は音波により生じさせることができる。波は、適用される機械的手段を介して、試料外で又は試料内で直接に、生成することができる。
マトリックスを有する試料が、十分であるが、マトリックス中に含まれる相当な数の細胞が殺される又は溶解される程度までではなく、弱められる又は減衰されると、露出ターゲット細胞又は細胞群は、形質移入(transfection)又は形質転換(transformation)等の技術により外生分子の挿入を受けるようになる。いくつかのマトリックスにより、マトリックスから細胞を孤立させ次に細胞に形質移入することは便利かもしれない。他の事例では、公知の技術の溶液及び条件を使用して、被処理組織試料に形質移入を直接行うことが特に自動システムにおいて好ましくなる。その代わりに、処理対象細胞がマトリックス内に位置しない状況では、細胞は、マトリックスを前処理する必要なく以下の処理に従って直接処理することができる。以下の処理は主に形質移入に関し説明されるが、本発明による方法と装置は、透過性細胞膜中に外生物質を導入する形質転換処理又は他の処理に等しく適用可能である。
用語「殺菌する」、「消毒する」、「保存する」、「浄化する」、「不活性化」、「消毒する」、「殺す」は、文脈上必要な場合以外は、交換可能に本明細書では使用される。「殺菌」すなわちすべての生物の死滅は、いくつかの操作において、例えば、汚染物質がタンパク質又はプリオンなどの非生物である場合、「汚染除去」と同意語ではないかもしれない。これらの用語は通常、特定の生物及び/又は粒子の任意の活動の実質的排除又はそれとの干渉を意味する。
粉末及び粒状の媒体及びガスを含む流体試料では、試料混合は、渦撹拌又は撹拌、又は、空隙を含む試料の転化、振動などの他の方法により従来通りに行われる。渦撹拌は本質的に、撹拌が被駆動装置と流体との機械的接触に関与する間の容器全体の機械的運動により実現される。撹拌は、様々な装置、例えばプロペラ、撹拌翼、櫂、磁気撹拌棒により実現される。これらの方法に関する1つの問題は、数十又は数百の試料容器を一度に扱うためにそれらの規模を増加させるのが難しいということである。これらの方法に関する別の問題は、各試料をほぼ汚染の無い状態に保ちつつ多くの試料を混合することの難しさである。以下にさらに詳細に説明するように、本発明による方法は、汚染に関する問題を回避する一方で試料を混合するために音響エネルギーを使用することができる。音響エネルギーを集束するそうでなければ音響エネルギーの音響波形を制御するなどの要素は、例えば音響ストリーミング及び/又はマイクロストリーミングにより試料を選択的に混合するために使用することができる。
いくつかの実施形態では、温度、混合、又は両者は、化学反応を強化するために超音波エネルギーにより制御されることができる。例えば、処理対象試料中に存在する配位子と細胞外供給結合パートナ(exogenously supplied binding partner)との間の会合速度を加速することができる。別の例では、分析は、温度が維持されかつ混合が周囲条件に比し2つ以上の分子の会合を改良するために増大された状態で、行われる。混合物中の内因性結合パートナから混合物中の配位子又は検体を分離するために混合物を熱と混合に最初に曝すことにより本明細書に記載の処理の様々な態様を組み合わせることが可能である。温度、混合、又は両者は、周囲温度及び混合における配位子/内因性結合パートナ複合体形成に比し、細胞外供給結合パートナにより配位子複合体形成を強化するために、初期条件から変更される。通常、第2温度及び/又は混合条件は、周囲条件と上記第1分離工程において使用される条件との中間である。第2温度及び混合条件において、分離配位子を細胞外供給結合パートナと反応させる。
PCR技術のボトルネックの1つは冷却時間である。加熱サイクルは急速であるが、冷却は対流により制限される。DNA又は別のターゲット分子がマイクロデバイス上の配列内に固定化されるバイオチップ形態においてすら、「能動的」冷却過程はない。しかしながら、このボトルネックを克服するために本発明のいくつかの実施形態を利用することができる。
分離を強化するために集束音響場を利用することができる。他の箇所で述べたように、音響集束は、ガスクロマトグラフィ、立体排除クロマトグラフィ、イオン交換クロマトグラフィを含むクロマトグラフィ、及びフィールドフローフラクショネーション(filed-flow fractionation)を含む他の公知の形態などの多くの分離処理の重要な要素である流体流れにおける壁効果を縮小する又は無くすために利用することができる。流れるストリームの速度と濃度勾配を遠隔的に変調及び/又は低減又は無くす能力は多種多様な状況において適用可能である。
音響エネルギー放射の制御、音響エネルギー特徴及び/又は音響エネルギーに対するターゲットの位置は、特に毛細管内の液体の流量を圧送し制御し、二次反応速度を高めるなど化学反応を向上させ、流体流れにおける実効レイノルズ数を増加し、半固形物質の分注を制御するために利用することができる。
Claims (12)
- 内部容積を画定するチャンバであって、前記内部容積内への開口と、前記内部容積内への物質の流入を受け入れる入口と、前記内部容積からの物質の流出を排出する出口と、を有するチャンバと、
前記開口を密閉して閉じ、及び、前記内部容積内における物質の処理のために前記チャンバ内に集束音響エネルギーを伝達する、前記開口内の窓であって、100kHz〜100MHzの周波数を有する音響エネルギーをほぼ透過する窓と、
前記窓及び前記チャンバから離間された音響エネルギー源であって、前記内部容積内に音響エネルギーの焦点ゾーンを生成するために100kHz〜100MHzの周波数を有する音響エネルギーを放射する音響エネルギー源と、
前記内部容積の形状及びサイズを少なくとも部分的に規定する挿入子であって、外側筒形状と、物質の音響処理が行われる前記内部容積の前記形状及びサイズを規定する円錐形状の内面と、を有するスリーブを有し、前記挿入子は複数の核生成部位を含む、挿入子と、
前記音響エネルギー源から前記窓に音響エネルギーを伝達する結合媒体であって、液体又は固体である結合媒体と、
前記チャンバの壁に冷却流体を供給するために前記チャンバの少なくとも一部に関連付けられた冷却ジャケットと、を備える、音響エネルギーによって物質を処理するシステムであって、
前記システムは、1時間を超える長期間の間、200ワット以上に相当する出力エネルギーで動作する前記音響エネルギー源によって前記内部容積内で物質を音響的に処理し、前記冷却流体は前記結合媒体から離れている、システム。 - 前記窓は、前記音響エネルギー源に面する凸面を有する、請求項1に記載のシステム。
- 前記凸面の形状は、前記音響エネルギー源によって生成されて前記凸面に入射する音響エネルギーの波面と同一の形状である、請求項2に記載のシステム。
- 前記窓の形状は、前記窓によって前記内部容積内に伝達される前記音響エネルギー源からの音響エネルギーに対して集束効果を有する、請求項2に記載のシステム。
- 前記窓は前記チャンバの底面にあり、前記チャンバは、前記チャンバの上面上に前記内部容積の外観検査用の第2窓をさらに備える、請求項1に記載のシステム。
- 前記チャンバの全体が前記結合媒体によって囲まれる、請求項1に記載のシステム。
- 前記結合媒体が液体結合媒体であり、前記チャンバの全体が前記液体結合媒体中に浸漬される、請求項1に記載のシステム。
- 前記チャンバは、外面に、前記結合媒体と熱を交換する熱交換器を含む、請求項1に記載のシステム。
- 前記チャンバは樽形状を有し、前記入口及び前記出口の各々は、前記樽形状の長手方向軸線に沿って前記チャンバから離れるように延びる導管を含む、請求項1に記載のシステム。
- 内部容積と当該内部容積へのアクセスのための開口とを有する容器であって、前記開口が前記内部容積内に前記チャンバを配置するために前記チャンバを受け入れる、容器をさらに備え、前記音響エネルギー源及び前記結合媒体は前記内部容積内に配置される、請求項1に記載のシステム。
- 前記容器の前記開口を閉じるキャップをさらに備え、前記入口及び前記出口の各々が、前記チャンバから離れて前記キャップを通って延びる導管を含む、請求項10に記載のシステム。
- 前記チャンバ及び前記窓は、前記内部容積内の加圧環境を維持する、請求項1に記載のシステム。
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